CZ2023132A3 - Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití - Google Patents

Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití Download PDF

Info

Publication number
CZ2023132A3
CZ2023132A3 CZ2023-132A CZ2023132A CZ2023132A3 CZ 2023132 A3 CZ2023132 A3 CZ 2023132A3 CZ 2023132 A CZ2023132 A CZ 2023132A CZ 2023132 A3 CZ2023132 A3 CZ 2023132A3
Authority
CZ
Czechia
Prior art keywords
general formula
compound
galectin
galectins
group
Prior art date
Application number
CZ2023-132A
Other languages
English (en)
Inventor
Roman Hrstka
Hrstka Roman doc. Mgr., Ph.D.
Jitka Holčáková
Holčáková Jitka Mgr., Ph.D.
Jindřich Karban
Karban Jindřich Mgr., Ph.D.
Vojtěch Hamala
Vojtěch Ing. et Ing. Hamala
Martin Kurfiřt
Martin Ing. Kurfiřt
Original Assignee
Ústav Chemických Procesů Av Čr, V. V. I.
Masarykův onkologický ústav
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ústav Chemických Procesů Av Čr, V. V. I., Masarykův onkologický ústav filed Critical Ústav Chemických Procesů Av Čr, V. V. I.
Priority to CZ2023-132A priority Critical patent/CZ2023132A3/cs
Priority to PCT/CZ2024/050020 priority patent/WO2024208383A1/en
Publication of CZ2023132A3 publication Critical patent/CZ2023132A3/cs

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/056Triazole or tetrazole radicals
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H23/00Compounds containing boron, silicon or a metal, e.g. chelates or vitamin B12
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K31/00Medicinal preparations containing organic active ingredients
    • A61K31/70Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
    • A61K31/7042Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
    • A61K31/7052Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
    • A61K31/7056Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing five-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P11/00Drugs for disorders of the respiratory system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/18Antivirals for RNA viruses for HIV
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H17/00Compounds containing heterocyclic radicals directly attached to hetero atoms of saccharide radicals
    • C07H17/02Heterocyclic radicals containing only nitrogen as ring hetero atoms

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • AIDS & HIV (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

Předkládané řešení se týká sloučenin obecného vzorce (I), kde R1, R2, R3, R4 a Rm jsou nezávisle vybrané ze skupiny zahrnující H a (C1 až C6)alkyl; n je 1 nebo 2; X je CH nebo N; D, Y a Z jsou nezávisle CH, N nebo O; B je vybrané ze skupiny zahrnující monovalentní záporně nabité ligandy a neutrální ligandy; a A je vybrané ze skupiny zahrnující struktury (II) a (III). Řešení se dále týká způsobu přípravy uvedených sloučenin a jejich použití.

Description

Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití
Oblast techniky
Předkládaný vynález se týká komplexů ruthenia, které vykazují významnou afinitu a selektivitu vůči lidskému galektinu 1 a mají tedy potenciál stát se aktivními látkami léčiv inhibujících galektin 1 pro použití například při léčbě nádorových onemocnění, fibrotických onemocnění, infekce HIV.
Dosavadní stav techniky
Galektiny jsou proteiny ze skupiny lektinů definované sekvenční homologií a schopností nekovalentně vázat β-galaktosidy. U savců je popsáno 16 druhů galektinů, přičemž 13 z nich se vyskytuje u člověka. Všechny typy galektinů mají evolučně konzervovanou doménu rozpoznávající sacharidy (tzv. carbohydrate recognition domain, CRD) složenou z přibližně 130 aminokyselin poskládaných do β-sendvičové struktury tvořené pěti- a šestičetnými antiparalelními strukturami β-skládaného listu.
Na základě typu kvarterní struktury se galektiny dělí do 3 skupin:
1. Prototypické galektiny: obsahují jednu CRD, která ve fyziologických podmínkách samovolně vytváří nekovalentní homodimer. Patří mezi ně galektiny 1, 2, 5, 7, 10, 11, 13, 14, 15 a 16.
2. Tandemové galektiny: disponují dvěma CRD propojenými krátkou peptidovou spojkou. Do této skupiny patří galektiny 4, 6, 8, 9 a 12.
3. Chimerický galektin 3, který ve své struktuře obsahuje CRD a N-terminální polypeptidový řetězec tvořený asi 120 aminokyselinami, pomocí kterého je schopen vytvářet nekovalentně vázáné oligomerní struktury.
Typické endogenní ligandy jsou disacharidy N-acetyllaktosamin (Ga^MCic-NAc) a laktóza (Ga^^Clc). Vazba mezi galektinem a disacharidy probíhá v relativně mělkém vazebném místě na vysoce konzervovaných vazebných segmentech (anglicky subsites) C a D. Vlastní interakci zajišťuje 6 aminokyselin vazebné kavity, a to jak prostřednictvím vodíkových vazeb mezi těmito aminokyselinami (typicky histidinem, argininem a asparaginem) a hydroxylovými skupinami disacharidu, tak i CH-π interakcí mezi nepolární α-stranou β-galaktosidu a aminokyselinou tryptofanem. V sousedství segmentů C a D se nachází méně konzervované segmenty A, B a E, které se ve větší míře než segmenty C a D liší v závislosti na typu galektinu a mohou se zapojovat do interakce s rozsáhlejšími ligandy, než jsou disacharidy.
Galektiny v organismu vykonávají řadu biologických funkcí, mimo jiné se podílí na udržování buněčné homeostázy, regulaci buněčné apoptózy nebo angiogenezi. Zároveň je změna exprese galektinů (velmi často jde o jejich nadprodukci) spojena s mnoha patologickými stavy: rakovinou, HIV infekcí, plicní fibrózou, záněty či autoimunitními onemocněními. V nádorových buňkách a tkáních jsou galektiny spoluzodpovědné za buněčnou maligní transformaci a následné vymanění se nádorové tkáně imunitnímu dozoru (anglicky immune escape), což je spojeno s progresí nádorového onemocnění včetně zesílené invazivity, angiogeneze, migrace nádorových buněk a tvorbou metastáz. Proto jsou galektiny v současné době považovány za slibný terapeutický cíl.
Přirozené a syntetické ligandy galektinů
Mezi přirozené (endogenní) ligandy galektinů patří kromě výše zmíněných disacharidů struktury vzniklé jejich další modifikací (např. Lewisovy antigeny) a oligomerizací (např. poly-N- 1 CZ 2023 - 132 A3 acetyllaktosamin). Mezi syntetické sacharidové ligandy s vazbou na galektiny patří např. αthiogalaktosidy a thiodigalaktosidy (Cummings R. D.; Liu F. T.; Rabinovich G. A.; et al. Galectins. In: Varki A.; Cummings R. D.; Esko J. D.; et al., editors. Essentials of Glycobiology [Internet]. 4th edition. Cold Spring Harbor (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press; 2022. Chapter 36. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK579987/ doi:
10.1101/glycobiology.4e.36). Protože některé hydroxylové skupiny se neúčastní interakce s galektinem, mohou být modifikovány s cílem zvýšit afinitu nebo selektivitu interakce (Denavit, V.; Lainé, D.; Tremblay, T.; St-Gelais, J.; Giguere, D., Synthetic inhibitors of galectins: Structures and syntheses. Trends in Glycoscience and Glycotechnology 2018, 30 (172), SE21-SE40; Kurfiřt, M.; Dračínský, M.; Červenková Šťastná, L.; Cuřínová, P.; Hamala, V.; Hovorková, M.; Bojarová, P.; Karban, J., Selectively Deoxyfluorinated N-Acetyllactosamine Analogues as 19F NMR Probes to Study Carbohydrate-Galectin Interactions. Chemistry A European Journal 2021, 27 (51), 13040-13051).
Náhradou některých z těchto nevazebných hydroxylů arenovými strukturami nesoucími halogenové substituenty vznikají látky s výrazně vyšší afinitou ke galektinům, než mají jejich přirozené ligandy. Silnější afinita těchto inhibitorů ke galektinům je zapříčiněna jak π-π interakcemi mezi arenovými strukturami a aromatickými aminokyselinami galektinů, tak i dalšími interakcemi mezi halogeny a polárními skupinami aminokyselin. Většina syntetických inhibitorů s farmakologickým potenciálem má výrazně vyšší afinitu ke galektinu-3 než ke galektinu 1. Naopak vysoce afinitní a zároveň vysoce selektivní inhibitory galektinu 1 dosud nebyly připraveny. Mezi nejsilnější a klinicky nejslibnější inhibitory galektinů patří selektivní inhibitory galektinu-3: GB139 (Hirani, N.; MacKinnon, A. C.; Nicol, L.; Ford, P.; Schambye, H.; Pedersen, A.; Nilsson, U. J.; Leffler, H.; Sethi, T.; Tantawi, S., Target inhibition of galectin-3 by inhaled TD139 in patients with idiopathic pulmonary fibrosis. European Respiratory Journal 2021, 57 (5)), nyní ve 2. fázi klinických testů pro léčbu plicní fibrózy, a GB1211 (Zetterberg, F. R.; MacKinnon, A.; Brimert, T.; Gravelle, L.; Johnsson, R. E.; Kahl-Knutson, B.; Leffler, H.; Nilsson, U. J.; Pedersen, A.; Peterson, K., Discovery and Optimization of the First Highly Effective and Orally Available Galectin-3 Inhibitors for Treatment of Fibrotic Disease. Journal of Medicinal Chemistry 2022, 65 (19), 12626-12638), nyní ve 2. fázi klinických testů pro léčbu poškození jater a ve 2. fázi klinických testů pro léčbu nemalobunčného karcinomu plic. V přípravě jsou klinické studie pro léčbu myelofibrózy a spinocelulárního karcinomu hlavy a krku.
Struktura látky GB139 a jejích analog vychází z thiodigalaktosidového skeletu modifikovaného na obou galakto j ednotkách na uhlíku C3. Substituce C3 hydroxylů za arenové motivy výrazně navýší afinitu ke galektinům, obzvláště galektinu-3. Arenové motivy mohou být na thiodigalaktosidový skelet navázány pomocí éterické, esterové nebo amidické vazby, případně přes 1,2,3-triazol vytvořený azid-alkynovou cykloadiční reakcí, jak je tomu u GB139. Struktury thiodigalaktosidu a GB139 zobrazuje Schema 1 níže.
- 2 CZ 2023 - 132 A3
Lidský Galektin 1
Galektin 1 je kódován genem LGASL1 a vyskytuje se cytoplazmě, buněčném jádře i v extracelulámím prostoru. Jedná se o prototypický galektin, který se v extracelulámím prostoru vyskytuje převážně ve formě homodimeru. V této formě se může galektin 1 podílet na buněčné signalizaci, adhezi a dalších buněčných procesech. Galektin 1 hraje prominentní roli v řízení imunitního systému: reguluje proliferaci B-buněk a udržuje homeostázu T-buněk, přičemž vysoké koncentrace galektinu 1 mohou vyvolat apoptózu T-buněk. Zároveň hladina galektinu-1 ovlivňuje fagocytózu a aktivaci peritoneálních makrofágů.
Zvýšená koncentrace galektinu 1 byla pozorována u rakoviny prostaty, plic, mléčné žlázy, tlustého střeva, močových cest, ledvin, lymfatických uzlin, kůže, slinivky břišní, horních částí zažívacího traktu, štítné žlázy, žaludku, mozku, míchy, vaječníků, jater, bílých krvinek a dělohy. Nadprodukce galektinu-1 je asociována s nekontrolovaným růstem a tvorbou metastáz u nádorových onemocnění, podporuje angiogenezi v nádorových tkáních a zvyšuje odolnost nádoru vůči imunitnímu dozoru. Potlačení exprese galektinu 1 v nádorových buňkách v in vitro i in vivo experimentech včetně inhibice galektinu 1 pomocí syntetických inhibitorů snižuje schopnost nádorů metastázovat a zároveň zvyšuje účinnost další protinádorové léčby, jakou je radioterapie či chemoterapie (Astorgues-Xerri, L.; Riveiro, Μ. E.; Tijeras-Raballand, A.; Serova, M.; Neuzillet, C.; Albert, S.; Raymond, E.; Faivre, S., Unraveling galectin-1 as a novel therapeutic target for cancer. Cancer treatment reviews 2014, 40 (2), 307-319), např. inhibice galektinu 1 zvýšila sensitivitu nádorových buněk karcinomu vaječníků vůči protinádorověrnu léčivu Paclitaxel (Shih, T.-C.; Liu, R.; Fung, G.; Bhardwaj, G.; Ghosh, P. M.; Lam, K. S., A Novel Galectin-1 Inhibitor Discovered through One-Bead Two-Compound Library Potentiates the Antitumor Effects of Paclitaxel in. Molecular cancer therapeutics 2017,16 (7), 1212-1223). Potlačení exprese galektinu 1 rovněž zvýšilo sensitivitu nádorových buněk rakoviny prsu vůči protinádorovým léčivům Paclitaxel a Adriamycin (Wang, F.; Lv, P.; Gu, Y.; Li, L.; Ge, X.; Guo, G., Galectin-1 knockdown
-3 CZ 2023 - 132 A3 improves drug sensitivity of breast cancer by reducing P-glycoprotein expression through inhibiting the Raf-l/AP-1 signaling pathway. Oncotarget 2017, 8 (15), 25097). Inhibice galektinu 1 zvyšuje sensitivitu nádorových buněk při radioterapii a zároveň snižuje radiačně indukovanou lymfopenii (Welsh, J. W.; Seyedin, S. N.; Cortez, M. A.; Maity, A.; Hahn, S. M., Galectin-1 and Immune Suppression during Radiotherapy. Clinical Cancer Research 2014, 20 (24), 6230-6232).
Přítomnost galektinu 1 taktéž napomáhá adhezi viru lidské imunodeficience typu 1 (HIV-1) na makrofágy, čímž výrazně zvyšuje riziko infekce a rychlost jejího šíření v napadeném organizmu. Homodimer galektinu 1 může pomocí jedné ze svých dvou CRD vázat sacharidové struktury na povrchu makrofágu a druhou CRD vázat sacharidové struktury na povrchu HIV-1, čímž usnadní interakci mezi glykoproteinem CD4 napadené buňky a HIV glykoproteinem gbl20 nutnou k fůzi viru s napadenou buňkou. Tento efekt byl prokázán pouze u galektinu 1, nikoliv u galektinu 3. U pacientů infikovaných HIV-1 dochází současně k dalšímu patologickému stavu spojenému s galektinem 1. Infekce HIV-1 u T-lymfocytů zapříčiní aberantní glykosylaci membránových proteinů vedoucí ke kumulaci (poly)laktosaminových struktur, které patří mezi přirozené ligandy galektinu 1. Interakce (poly)laktosaminových struktur napadených buněk s galektinem 1 následně indukuje apoptózu napadených i nenapadených T-lymfocytů a uvolnění virionů do okolního prostředí.
Potřeba nových a účinných inhibitorů galektinů, zejména se selektivitou vůči galektinu 1, tedy přetrvává.
Podstata vynálezu
Předkládaný vynález se týká sloučenin (komplexů ruthenia), u kterých bylo zjištěno, že selektivně inhibují galektin 1, a jsou tedy významné jak pro farmaceutický průmysl a přípravu nových léčiv, tak pro studium funkce galektinů v základním i aplikovaném výzkumu, in vitro a in vivo. Na rozdíl od dosud známých inhibitorů galektinů jsou sloučeniny dle předkládaného vynálezu selektivní vůči galektinu 1, dokáží tedy inhibovat galektin 1 v přítomnosti ostatních galektinů. Na rozdíl od planámích arenů, které jsou součástí dosud známých inhibitorů galektinů (GB 139 a jeho analoga), se organokovové komplexy vyznačují třírozměrnou strukturou, velmi obtížně dosažitelnou pomocí pouze organických (neorganometallických) struktur. Tyto 3D komplexy umožňují strukturně daleko bohatší prostorovou organizaci substituentů a funkčních skupin, než dovolují čistě organické inhibitory, a tím i účinnější obsazení vazebné kavity a formování dalších interakcí inhibitoru ve vazebném místě cílového proteinu a tím jeho silnější inhibici. Kladně nabitý kation ruthenia může navíc vytvářit další elektrostatické interakce se záporně nabitými aminokyselinami proteinu.
Předmětem předkládaného vynálezu jsou sloučeniny obecného vzorce (I), které mají následující strukturu:
-4CZ 2023 - 132 A3
Jedná se o kladně nabitý komplex ruthenia, jehož kladný náboj je kompenzován v podstatě jakýmkoliv farmaceuticky akceptovatelným anionem, vhodnými aniony jsou například halogeny (F-, Cl, Br, I), PFe, ZrrCLr. BF4 nebo BR4. přičemž R je phenyl substituovaný elektronakceptomími skupinami jako jsou halogeny (F, Cl), CFs, CN nebo NO2.
Jedním z ligandů kationtu ruthenia je cyklopentadienylový anion (n=l) nebo benzen (n=2), které mohou být substituované či nesubstituované, a které jsou koordinované k ionu ruthenia pomocí (rý-CsHs) nebo (η'-CH,,) vazby. R1, R2, R3, R4 a Rm tedy mohou být nezávisle vybrané ze skupiny, zahrnující H a (Ci až Ce)alkyl.
Dalším ligandem je B, vybrané ze skupiny zahrnující monovalentní záporně nabité ligandy a neutrální ligandy, s výhodou je B vybrané ze skupiny zahrnující F', CF, Br, F, CN', pokud je prvním ligandem neutrální derivát benzenu, neboje B vybrané ze skupiny zahrnující CO, CH3CN, pokud je prvním ligandem záporně nabitý derivát cyklopentadienylu.
Třetí ligand obsahuje dva aromatické dusíkaté heterocykly, které se koordinují ke kationu ruthenia dusíkovými atomy. Kromě koordinujícího se atomu dusíku mohou tyto heterocykly dále obsahovat i další heteroatomy (N, O) nebo CH, popřípadě uhlík. V obecném vzorci (I) jsou možné následující kombinace:
Xje CH nebo N;
D, Y a Z jsou nezávisle CH, N nebo O, s výhodou jsou D, Y a Z nezávisle CH nebo N; A je vybrané ze skupiny zahrnující struktury (II) a (III)
NHAc (Π)
přičemž skupiny B, X, Z, Y, D, R1, R2, R3, R4 a Rm jsou definované výše, n je 1 nebo 2.
V jednom provedení platí, že alespoň jeden z X, Y, a Z je CH.
V jednom provedení alespoň dva z X, Y a Z jsou CH.
V jednom provedení X, Y a Z jsou CH.
V jednom provedení platí, že alespoň dvě D jsou CH.
V jednom provedení alespoň tři D jsou CH.
-5CZ 2023 - 132 A3
V jednom provedení všechna D jsou CH, výsledným šestičlenným heterocyklem je tedy pyridinový heterocyklus.
V jednom provedení jsou R1, R2, R3, R4 a Rm nezávisle vybrané ze skupiny, zahrnující H, CH, nebo -CH(CH3)2.
Ve výhodném provedení je Y pětičlenného heterocyklu CH a současně X a Z jsou N, výsledným pětičlenným heterocyklem je tedy triazolový heterocyklus, výhodněji 1,2,3-triazolový heterocyklus.
V jednom provedení je strukturní jednotka (IV)
(IV) vybraná ze skupiny zahrnující cyklopentadien, pentamethylcyklopentadien, benzen, p-cymen, 1,3,5-trimethylbenzen, hexamethylbenzen. S výhodou je strukturní jednotkou (IV) p-cymen.
V jednom provedení je předmětem vynálezu sloučenina obecného vzorce (la)
(la),
jsou definovány výše a E je nebo
S výhodou D je CH. S výhodou strukturní jednotka (IV) je vybraná ze skupiny zahrnující cyklopentadien, pentamethylcyklopentadien, benzen, p-cymen, 1,3,5-trimethylbenzen, hexamethylbenzen. Výhodněji je strukturní jednotkou (IV) p-cymen.
Nejvýhodněji je sloučenina obecného vzorce (I) vybraná ze skupiny sestávající z:
-6CZ 2023 - 132 A3
přičemž kladný náboj sloučeniny je kompenzován aniontem, vybraným z Cl a PFe.
Sloučeniny obecného vzorce (I), ve kterých je pětičlenným dusíkatým heterocyklem 1,2,3triazolový heterocyklus, lze připravit z azidového prekurzoru obecného vzorce (V)
(V),
kde R’ je H nebo Ac (Ac značí skupinu CH3-C(=O)-); a kde A’ je R'O
NHAc nebo
reakcí s ethynyl derivátem šestičlenného dusíkatého heterocyklu, například 2-ethynylpyridinem, při které dojde k Huisgenově cykloadici azidové skupiny na trojnou vazbu za vzniku triazolu. Typicky lze tuto reakci provést v přítomnosti modré skalice a kyseliny askorbové, jako rozpouštědlo může sloužit například dimethylformamid, dimethylsulfoxid, methanol či jiné alkoholy, tetrahydrofuran či jiné ethery, aceton, voda či jejich směsi. Reakce proběhne při teplotě v rozmezí od 20 do 50 °C, doba reakce je v rozmezí 0,5 až 5 hodin, za vzniku meziproduktu obecného vzorce (Via)
-7CZ 2023 - 132 A3
nebo
Výchozí prekurzor obecného vzorce (V) je komerčně dostupný nebo jej lze získat standardními postupy dle Mandal, S.; Nilsson, U. J., Tri-isopropylsilyl thioglycosides as masked glycosyl thiol nucleophiles for the synthesis of S-linked glycosides and glyco-conjugates. Organic & Biomolecular Chemistry 2014,12 (27), 4816-4819; WO 2013/110704 Al; Kurfiřt, M.; Dračínský, M.; Červenková Šťastná, L.; Cuřínová, P.; Hamala, V.; Hovorková, M.; Bojarová, P.; Karban, J., Selectively Deoxyfluorinated N-Acetyllactosamine Analogues as 19F NMR Probes to Study Carbohydrate-Galectin Interactions. Chemistry--A European Journal 2021, 27 (51), 13040-13051.
Pokud R’ je Ac, následuje v dalším kroku hydrolýza OAc skupin na skupiny OH. Tento krok lze provést například bazickou hydrolýzou pomocí methanolátu sodného v methanolu (například při pH 8 až 10 při laboratorní teplotě po dobu 10 až 24 hodin). Výsledkem tohoto krokuje sloučenina obecného vzorce (VIb)
a A’” je nebo
Posledním krokem je reakce sloučeniny obecného vzorce (VIb) s komplexem ruthenia obecného vzorce [RuIJTT, kde Lje strukturní jednotka (IV), jakje definována výše, aB je definováno výše, za vzniku sloučeniny obecného vzorce (I). Komplexem ruthenia obecného vzorce [RuLB2]2 může být například [Ru(p-cymen)C12]2. Tato reakce probíhá typicky při laboratorní teplotě, v organickém rozpouštědle, ve kterém je [RuLB2]2 rozpustný, například v dichlormethanu, chloroformu, methanolu či jiných alkoholů, acetonu, vodě, nebo jejich směsích. V provedení, kdy anion kompenzující kladně nabitý komplex ruthenia připravované sloučeniny obecného vzorce (I) má být jiný než Cl', potom se krok reakce sloučeniny obecného vzorce (VIb) s komplexem ruthenia
-8CZ 2023 - 132 A3 provede v přítomnosti tohoto aniontu, tedy například v přítomnosti KI, KPFe, KBF4, KBR4, NaBR4 nebo L1BR4, přičemž Rje fenyl substituovaný elektronakceptomími skupinami jako jsou halogeny (F, Cl), CF3, CN nebo NO2, a dalšími. Doba této reakce je řádově v jednotkách minut, s výhodou v rozmezí od 1 do 20 minut, výhodněji od 2 do 15 minut, ještě výhodněji od 5 do 10 minut.
Uvedeným způsobem lze připravit sloučeniny obecného vzorce (la)
kde B, D, E, R1, R2, R3, R4 a Rm jsou definovány výše.
Předmětem předkládaného vynálezu je dále použití sloučenin obecného vzorce (I), definovaných výše. Uvedené sloučeniny lze použít jako součást analytické sondy pro stanovení afinit ligandů ke galektinům, zejména ke galektinu-1. Využití sloučenin (I) pro analytické účely buď využívá elektroaktivity atomu ruthenia při designu analytické metody, nebo se opírá o možnost kovalentně navázat na látku obecného vzorce (I) fluorescenčně aktivní substituent, například fluorescein. Látka obecného vzorce (I) nesoucí fluorescenčně aktivní substituent se využije jako kompetitivní fluorescenční sonda při stanovení afinit jiných látek ke galektinům metodou fluorescenční anisotropic.
Další použití sloučenin obecného vzorce (I) je v medicíně, zejména při léčení onemocnění spojených s nadprodukcí galektinů, zejména galektinu 1, s výhodou vybraných ze skupiny zahrnující nádorová onemocnění, fibrotická onemocnění, infekce HIV-1.
Další použití sloučenin obecného vzorce (I) je pro inhibici galektinů, in vivo nebo in vitro.
Příklady uskutečnění vynálezu
Materiály a metody
Chemikálie byly použity ve stavu, ve kterém byly dodány od dodavatelů Merck KGaA, Thermo Fisher Scientific a Fluorochem Ltd. Buněčné linie HEK-293, A2780, SK-OV-3, MDA-MB-231, MCF-7 a MCF-10A byly získány z ATCC sbírky. Dichlormethan byl sušen destilací s CaFE a stáním nad 3 Á molekulovými síty. Petrolether byl před použitím předestilován. TLC analýza byla prováděna pomocí TLC desek Sigma-Aldrich TLC Silica gel 60 F254 a látky byly detekovány pomocí UV lampy při 254 nm nebo obarvením pomocí roztoku anýzaldehydu (EtOH, AcOH, H2SO4). Sloupcová chromatografie byla prováděna na silikagelu 60 (70-230 mesh, Material Harvest). Roztoky byly koncentrovány na rotačních vakuových odparkách při teplotách nižších než 45 °C. NMR spektra byla pořízena na NMR spektrometru Bruker Avance 400 (Ή při 400,1 MHz, 19F při 376,4 MHz, 13C při 100,6 MHz, 31P při 162,0 MHz) při 25 °C. Ή a 13C{’H} NMR spektra byla referencována na použité rozpouštědlo (δ/ppm; 5H/5C: CDCE, 7,26/77,16, McOH-č/4. 3,31/49,00 DMSO-í/„. 2,50/39,52). 19F NMR spektra byla referencována na přidaný vnitřní standard hexafluorobenzen (-166.62 v McOH-č/4). Kombinace ID a 2D experimentů (Ή,ΉCOSY, ’H,13C-HSQC a ’H,13C-HMBC) byla použita k přiřazení všech vodíkových a uhlíkových
-9CZ 2023 - 132 A3 signálů. HRMS analýza byla provedena pomocí Bruker MicrOTOF-QIII, za použití APCI nebo ESI ionizace v pozitivním či negativním módu. EtOAc značí ethyl acetát, PE petrolether, DCM dichloromethan, MeOH methanol, EtOH ethanol, AcOH kyselinu octovou, AC2O acetanhydrid a DMF dimethylformamid. GB 139 byla připravena podle známého postupu (Organic &
Biomolecular Chemistry 2014,12 (27), 4816-4819).
Schéma syntézy:
CuSO4 5H2O kyselina askorbová DMF, 2 h, 10 'C 64%
1. NaBrOa, Na2S2O4 EtOAc, H2O, rt, 6 h 2.H2N(CHz)gNH2, CHjOH, reflux, 4 ti
3. ACjO.CHjOH, rt. 2 ti 79%
NPhth
PhSTMS,Znl2l AcO^OAc CICHiCHgCl.rt. 12 sp.
2. AcžO py rl, 12 h
74% 7 0Ac
1. Ac2O. py. rt. 12 h
NIS.TÍOH ch2ci2 O'C,1b’ 80%
CuSO45H2O kyselina askorbová DMF. 2 ti, 40 X
3. MeONa. MeOH, rt. 12 h 89%
rt = laboratorní teplota
Příklad 1: Klonování a příprava galektinů 1 a 3
- 10 CZ 2023 - 132 A3
Kódující sekvence lidského galektinu 1 a 3 (NM_002305.4 aNM_002306) byly klonovány pomocí technologie Gateway rekombinace (Invitrogen) do vektoru pDEST15 obsahujícího N-koncovou His6-GST značku štěpitelnou TEV proteázou (Tobacco Etch Virus nuclear-inclusion-a endopeptidase). Oba klonované geny byly exprimovány v E. coli BL21 RILP. Bakterie byly kultivovány ve 100 ml LB média (10 g/1 trypton, 5 g/1 kvasinkový extrakt, 5 g/1 NaCl) s ampicilinem (100 pg/ml) a chloramfenikolem (30 pg /ml) přes noc při 37 °C, 220 ot./min. Kultura byla naředěna do celkového objemu 2,5 1 v LB médiu (doplněno o ampicilin a chloramfenikol) na optickou hustotu Aeoo= 0,1 a kultivována 2-3 hodiny. Po dosažení optické hustoty Aeoo= 0,5 byla provedena indukce genové exprese přidáním isopropyl-P-D-thiogalaktopyranosidu do kultury (konečná koncentrace, 1 mM). Bakteriální kultura byla kultivována další 4 hodiny při 30 °C, 140 ot./min. a poté poletována centrifugací (4000 g/4 °C/10 min). Bakteriální pelety byly resuspendovány ve vazebném pufru (50 mM Tris-HCl , pH 7,5; 0,15 M NaCI, 0,75% CHAPS). Buněčné suspenze byly následně obohaceny lysozymem (1 mg/ml), fenylmethylsulfónylfluoridem (1 mM), turbonukleázou (1:1000) a MgC 12 (ImM) a poté sonikovány ultrazvukovým sonikátorem Sonoplus, sondou VS 70T, 15 cykly (10 s sonikace, 50 s pauza, 35W) při 4 °C. Bakteriální lyzáty byly získány centrifugací po dobu 30 minut při 10 000 g/ 4 °C. Hise-GST-značené proteiny byly zachyceny na GSTrap glutathionagarózové koloně (GE Healthcare), eluovány vazebným pufrem obohaceným o 20 mM glutathion a podrobeny štěpení TEV proteázou (1 mg proteázy na 10 mg purifikovaného proteinu) přes noc při 4 °C. Pro odstranění Hise-GST a Hise-TEV proteázy byly směsi proteinů aplikovány na kolonu HisTrap (GE Healthcare). Frakce obsahující purifikované proteiny byla sesbíraná do 96 jamkové desky prostřednictvím frakcionátoru. Po zakoncentrování byly proteiny solubilizovány ve finálních testovacích pufrech (50 mM fosfát, 150 mM NaCl, ImM TCEP) pomocí Zeba spin odsolovacích kolon oddělujících molekuly s hmotností do 10 kDa (Thermo Fisher Scientific). Čistota všech izolovaných proteinů byla ověřena pomocí SDS-PAGE elektroforézy a obarvením pomocí Coomassie Brilliant Blue. Proteáza TEV byla připravena v laboratoři podle modifikované metody Tropea et al. (Tropea, J. E., Cherry, S., and Waugh, D. S. (2009) Expression and purification of soluble His6-tagged TEV protease. Methods Mol. Biol. 498, 297-307).
Příklad 2: Syntézy
2,2’,4,4’,6,6’-tetra-O-acetyl-3,3’-diazido-3,3’-dideoxy-l,l’-sulfanediyl-di-P-Dgalaktopyranosid (1)
Látka 1 byla připravena dle postupu z lit. (Mandal, S.; Nilsson, U. J., Tri-isopropylsilyl thioglycosides as masked glycosyl thiol nucleophiles for the synthesis of S-linked glycosides and glyco-conjugates. Organic & Biomolecular Chemistry 2014,12 (27), 4816-4819).
2,2’,4,4’,6,6’-tetra-O-acetyl-3,3’-dideoxy-3,3’-bis-[4-(pyridin-2-yl)-lH-l,2,3-triazol-l-yl]1,1 ’ -sulfanediyl-di-P-D-galaktopyranosid (2)
- 11 CZ 2023 - 132 A3
2-Ethynylpyridine (88 μΐ, 0,87 mmol) byl přidán do směsi 1 (240 mg, 0,36 mmol), modré skalice (18 mg, 0,07 mmol) a kyseliny askorbové (13 mg, 0,07 mmol) v dimethylformamidu (3 ml) a reakční směs byla míchána a zahřívána v olejové lázni při 40 °C po dobu 2 h. Po ochlazení reakční směsi na laboratorní teplotu byla reakční směs zředěna 30 ml dichlormethanu a promyta vodou (30 ml), vodná fáze byla promyta 2* 30 ml dichlormethanu. Spojené organické fáze byly sušeny bezvodým síranem sodným. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce. Sloupcová chromatografie na 40 g silikagelu v gradientově směsi EtOAc až EtOAc/CHOH 10:1 poskytla 2 (203 mg, 64%) ve formě bílé amorfní látky. Rf 0,30 (EtOAc). 'H NMR (dmso-í/,. 400 MHz, 'Η-'Η COSY): δ 8,61 (ddd, 2H, J= 4,8, 1,8, 1,2 Hz, CHk). 8,61 (s, 2H, CHTria), 8,02 (dt, 2H, J= 7,9, 1,2 Hz, CHpy), 7,90 (ddd, 2H, J= 7,9, 7,6, 1,8 Hz, 7,36 (ddd, 2H, J= 7,6, 4,8, 1,2 Hz, CHk). 5,75-5,67 (m, 4H, H-2, H-3), 5,52 (dd, 2H, J= 2,8, 1,2 Hz, H-4), 5,25 (d, 2H, J= 9,6 Hz, H-l), 4,34 (ddd, 2H, J= 6,7, 5,9, 1,2 Hz, H-5), 4,14 (dd, 2H, J= 11,4, 6,7 Hz, H-6), 4,08 (dd, 2H, J = 11,4, 5,9 Hz, H-6'), 2,05, 2,02, 1,87 (3xs, 3/6Η.ΛΑ). 13C{’H} NMR (dmso-d6, 101 MHz, ’H-13C HSQC, ’H-13C HMBC): δ 170,0, 169,3, 169,0 (3xCO), 149,7 (CHpy), 149,5 (Cq(Py)), 147,3 (Cq(Ttria)), 137,3, 123,3 (2xGHpy), 122,9 (CHTria), 119,6 (CHpy), 81,6 (C-l), 74,6 (C-5), 68,8 (C-4), 66,8 (C2), 61,6 (C-3), 61,4 (C-6), 20,6, 20,3, 20,2 (3xAfe). HRMS-ESI (m/z): [M + Na]+ vypočteno pro Css^NsOwSNa, 889,2433; nalezeno 889,2437.
3,3’-dideoxy-3,3’-bis-[4-(pyridin-2-yl)-lH-l,2,3-triazol-l-yl]-l,l’-sulfanediyl-di-P-Dgalaktopyranosid (3)
0,1 M roztok methanolátu sodného v methanolu byl přikapán do roztoku 2 (180 mg, 0,21 mmol) ve směsi methanolu (10 ml) a dichlormethanu (10 ml) až do dosažení pH = 9. Reakční směs byla za laboratorní teploty míchána přes noc. Neutralizace kyselým iontoměničem DOVEX H+, filtrace a odpaření rozpouštědel poskytlo 3 (126 mg, 99%) jako bílou amorfní látku bez nutnosti další purifikace. R/0,10 (CH2CI2/CH3OH 7:1). ΉNMR (dmso-í/6, 400 MHz, Ή-Ή COSY): δ 8,60 (dt, 2H, J= 4,8, 1,5 Hz, CHk). 8,47 (s, 2H, CHTna), 8,04 (dt, 2H, J= 8,0, 1,2 Hz, 7,90 (ddd, 2H, J= 8,0, 7,6, 1,5 Hz, CHpy), 7,34 (ddd, 2H, J= 7,6, 4,8, 1,2 Hz, CHy), 5,53 (d, 2H, J= 6,9 Hz, OH2), 5,32 (d, 2H, J= 7,4 Hz, OH-4), 4,96 (d, 2H, J= 9,5 Hz, H-l), 4,92 (dd, 2H, J= 10,6, 3,1 Hz, H-3), 4,77 (br s, 2H, OH-6), 4,19 (ddd, 2H, J= 10,6, 9,5, 6,9 Hz, H-2), 3,99 (dd, 2H, J= 7,4, 3,1 Hz, H-4), 3,74 (t, 2H, J= 6,4 Hz, H-5), 3,56-3,54 (m, 4H, H-6). 13C{’H} NMR (McOH-í/4. 101 MHz, ’H-13C HSQC, ’H-13C HMBC): δ 150,2 (Cq(Py)), 149,6 (CHpy), 146,6 (Cq(Tria)), 137,2, 122,8 (2xCHpy), 122,5 (CHTna), 119,3 (CHpy), 83,5 (C-l), 79,3 (C-5), 67,6 (C-4), 67,0 (C-3), 66,9 (C-2), 60,1 (C-6). HRMS-ESI (m/z): [M + Na]+ vypočteno pro C26H3oNsOsSNa, 637,1800; nalezeno 637,1812.
-12 CZ 2023 - 132 A3
Komplex Ru s Cl- (4)
Tmavě červený roztok dichloro(p-cymene)ruthenatého dimeru (39 mg, 0,06 mmol) v dichlormethanu (1 ml) byl přidán k suspenzi 3 (39 mg, 0,06 mmol) ve směsi methanol/dichlormethan 1:1 (2 ml). Skoro okamžitě bylo možné pozorovat změnu barvy z červené do žluto-oranžové a kompletní rozpuštění výchozího materiálu. Směs byla míchána za laboratorní teploty po dobu 10 min. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce, surová směs byla rozpuštěna v minimálním množství metanolu a produkt byl vysrážen pomalým přídavkem mcthyl(/č’/'c'.biityl)cthcru ve formě žluté pevné látky (52 mg, 67%) jako směs 4 diastereomerů v poměru 1:1:1:1. Pro získání analytického vzorku beze stop zbytkových rozpouštědel byl produkt rozpuštěn v malém množství methanolu a 3* kodestilován s chloroformem. Rf 0,05 (CH2CI2/CH3OH 1:1). Ή NMR (McOH-í/4. 400 MHz, ’H-’H COSY): δ 9,42-9,41 (m, 4χ1Η, CHpy), 9,15 (s, 1H, CHTria), 9,14 (s, 2χ 1H, CHTna), 9,12 (s, 1H, CHTna), 8,17-8,09 (m, 4x2H, CH^), 7,67-7,64 (m, 4xlH, Chhy). 6,14-6,12, 6,08-6,03, 5,94-5,90, 5,85-5,81 (4xm, 4χ4χ1Η, CHp.cym), 5,23, 5,22 (2xdd, 2χ 1H, J= 10,6, 2,9 Hz, H-3), 5,17 (dd, 2χ 1H, J= 10,6, 2,9 Hz, H-3), 5,02 (4xd, 4χ 1H, J= 9,6 Hz, H-l), 4,78-4,68 (m, 4χ 1H, H-2), 4,33, 4,32, 4,27, 4,26 (4xd, 4χ 1H, J= 2,9 Hz, H-4), 3,96-3,93 (m, 4xlH, H-5), 3,87-3,70 (m, 4x2H, H-6a/b), 2,76 (hept, 4xlH, J= 6,9 Hz, CHt. Pr), 2,24 (s, 2x3H,M^.cym), 2,22, 2,21 (2xs, 2x3H, Mep.cym), 1,17, 1,16 (2xd, 4x3H, J= 6,9 Hz, Afeí-Pr), 1,11, l,10(2xd,2x3H,J=6,9Hz,Afe,.Pr), 1,07 (d,2x3H, J=6,9Hz,Afe,.Pr). 13C{’H} NMR (MeOH-í/4, 101 MHz, ’H-13C HSQC, ’H-13C HMBC): δ 156,8, 156,74, 156,71 (4/CWk). 150,0, 149,92, 149,91 (4xCq(Py)), 147,73, 147,71, 147,6 (4xCq(Tria)), 141,5, 141,41, 141,40, 141,37 (4xCHpy), 127,39, 127,36, 127,3 (dxCHy), 126,0, 125,8, 125,7 (4xCHTna), 123,51, 123,48, 123,4, 123,3 (4xCHpy), 106,51, 106,47, 106,45 (4xCqCH.Pr), 103,9, 103,72, 103,67 (4xCqMe), 87,4, 87,3 (4xCH^.cym), 86,32, 86,30, 86,25 (4xC-l), 86,0, 85,9 (4xCH^.cym), 85,6, 85,4 (4xCH^.cym), 84,8, 84,7, 84,6 (4xCH^.cym), 81,12, 81,07, 81,0 (4xC-5), 71,1, 70,9, 70,8 (4xC-3), 69,6, 69,4 (4xC-4), 68,43, 68,41, 68,2 (4xC-2), 62,53, 62,51, 62,48 (4xC-6), 32,33, 32,26 (4xCH.pt), 22,7, 22,64, 22,61 (4xAfe,.Pr), 21,96, 21,95, 21,84 18,80, 18,78, 18,75 (4xM^.cym). HRMS-APCI (m/z): [M - CL]24 vypočteno pro C46H58Q2N8O8RU2S, 578,0781; nalezeno 578,0781.
Komplex Ru s PFň (5)
- 13 CZ 2023 - 132 A3
Tmavě červený roztok dichloro(p-cymene)ruthenatého dimeru (33 mg, 0,05 mmol) v dichlormethanu (1 ml) byl přidán k suspenzi 3 (33 mg, 0,05 mmol) a KPFe (20 mg, 0,10 mmol) ve směsi methanol/dichlormethan 1:1 (2 ml). Skoro okamžitě bylo možné pozorovat změnu barvy z červené do žluto-oranžové, kompletní rozpuštění výchozího materiálu a vysrážení krystalků KC1. Směs byla míchána za laboratorní teploty po dobu 10 min a zfíltrována. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vaukové odparce, surová směs byla rozpuštěna v minimálním množství metanolu a produkt 5 byl vysrážen pomalým přídavkem methyl(terc. butyl)etheru ve formě žluté pevné látky (45 mg, 58%) jako směs 4 diastereomerů v poměru 1:1:1:1. Pro získání analytického vzorku beze stop zbytkových rozpouštěděl byl produkt rozpuštěn v malém množství methanolu a 3x kodestilován s chloroformem. Rf 0,15 (CH2C12/CH3OH 3:1). Ή NMR (McOH-í/4. 400 MHz, Ή-’Η COSY): δ 9,42-9,40 (m, 4χ1Η, CT/κ). 9,13, 9,12 (2xs, 2xlH, C77Tna), 9,10 (2xs, 2xlH, CTÍTria), 8,18-8,14 (m, 2x2H, Cřfpy), 8,10-8,08 (m, 2x2H, Cřfpy), 7,67-7,64 (m, 4xlH, Cřfpy), 6,14-6,11, 6,07-6,03, 5,93-5,89, 5,85-5,81 (4xm, 4χ4χ1Η, C77^.cym), 5,22, 5,21 (2xdd, 2xlH, J= 10,7, 2,9 Hz, H-3), 5,16 (dd, 2xlH, J= 10,6, 2,9 Hz, H-3), 5,02 (d, 2xlH, J= 9,5 Hz, H-l), 5,01 (2xd, 2xlH, J= 9,5 Hz, H-l), 4,78-4,67 (m, 4xlH, H-2), 4,32, 4,31, 4,27, 4,26 (4xd, 4xlH, J = 2,9 Hz, H-4), 3,97-3,92 (m, 4xlH, H-5), 3,89-3,72 (m, 4x2H, H-6a/b), 2,76 (hept, 4xlH, J= 6,9 Hz, C77/_Pr), 2,23 (s, 2x3H,M^.cym), 2,22. 2,21 (2xs, 2x3H, A7^.cym), 1,17, 1,16 (2xd, 2x6H, J = 6,9 Hz, Afeí-Pr), 1,11, 1,07 (2xd, 2x6H, J = 6,9 Hz, 13C{’H} NMR (McOH-í/4. 101 MHz, ’H-13C HSQC, ’H-13C HMBC): δ 156,79, 156,76, 156,7 (4xC77py), 150,0, 149,91, 149,89 (4xCq(Py)), 147,74, 147,72, 147,6 (4xCq(Tria)), 141,5 141,41, 141,37(4x077^), 127,40, 127,35 (4x077^), 126,0, 125,9, 125,7, 125,6 (CHTna), 123,49, 123,45, 123,3 (4x077^), 106,50, 106,49, 106,47 (4xCqCH. a), 103,91, 103,90, 103,7 (4xCqMe), 87,5, 87,3 (4xCH^.cym), 86,33, 86,31, 86,25 (4xC-l), 86,04, 86,03, 85,9 (4xCH^.cym), 85,6, 85,4 (4xCH^.cym), 84,8, 84,6 (4xCH^.cym), 81,13, 81,08, 81,07, 81,06 (4xC-5), 71,1, 70,9, 70,8 (4xC-3), 69,63, 69,60, 69,4 (4xC-4), 68,41, 68,38, 68,23, 68,20 (4xC-2), 62,5 (4xC-6), 32,32, 32,26 (4xCH!.Pr), 22,64, 22,62, 22,60 (4xA7e!.Pr), 22,0, 21,9, 21,8 (4xAfe,.Pr), 18,77, 18,75, 18,7 (4xA7^.cym). HRMS-APCI (m/z): [M - Cl2]2+ vypočteno pro C46H58C12N8O8Ru2S, 578,0781; nalezeno 578,0787.
l,6-anhydro-2,4-di-O-acetyl-3-azido-3-deoxy-P-D-galaktopyranos (6)
O Ac
Látka 6 byla připravena dle postupu z lit. (Mandal, S.; Nilsson, U. J., Tri-isopropylsilyl thioglycosides as masked glycosyl thiol nucleophiles for the synthesis of S-linked glycosides and glyco-conjugates. Organic & Biomolecular Chemistry 2014,12 (27), 4816-4819).
Fenyl 2,4,6-tri-O-acetyl-3-azido-l-thio-P-D-galaktopyranosid (7)
SPh OAc
SI
-14 CZ 2023 - 132 A3
Trimethylsilyl thiofenol (1,4 ml, 7,14 mmol) a jodid zinečnatý (1,27 g, 4,48 mmol) byly postupně přidány do roztoku 6 (600 mg, 2,24 mmol) v dichlorethanu (20 ml) a reakční směs byla míchána za rt přes noc. Reakční směs byla zředěna 60 ml dichlormethanu a promyta vodou (80 ml). Vodná fáze byla 2* promyta 50 ml dichloromethanu. Organické fáze byly spojeny a vysušeny bezvodým síranem sodným, surová směs byla zahuštěna na rotační vakuové odparce, rozpuštěna v 50 ml methanolu, okyselena 5 kapkami kyseliny octové a ponechána míchat 20 minut. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce. Sloupcová chromatografie na 100 g silikagelu ve směsi EtOAc/PE 2:3 první poskytla fenyl 2,4-di-O-acetyl-3-azido-l-thio-a-D-galaktopyranosidu a-Sl (130 mg, 15%) následované fenyl 2,4-di-O-acetyl-3-azido-l-thio-P-D-galaktopyranosidu β-Sl (630 mg, 74%). K β-Sl rozpuštěném v 40 ml pyridine byl přidán AC2O (30 ml, 0,27 mol) a směs byla ponechána míchat přes noc. Odpaření rozpouštědel a kodestilace s toluenem (3x) poskytla 7 (700 mg, 100% pouze acetylační krok, 74% oba kroky dohromady) jako bílou krystalickou látku, mp 105-106 °C (EtOAc/PE), Rf 0.50 (EtOAc/PE 1:1). NMR spektra jsou v souladu s lit. (WO 2013/110704 AI).
Methyl 4-0-(2,4,6-tri-O-acetyl-3-azido-3-deoxy^-D-galaktopyranosyl)-3,6-di-O-benzyl-2 deoxy-2-ftalimido^-D-glukopyranosid (8)
Methyl 3,6-di-O-benzyl-2-deoxy-2-ftalimido-P-D-glukopyranoside (připraven dle: Kurfiřt, M.; Dračínský, M.; Červenková Šťastná, L.; Cuřínová, P.; Hamala, V.; Hovorková, M.; Bojarová, P.; Karban, J., Selectively Deoxyfluorinated N-Acetyllactosamine Analogues as 19F NMR Probes to Study Carbohydrate-Galectin Interactions. Chemistry--A European Journal 2021, 27 (51), 1304013051) (150 mg, 0,30 mmol) byl spolu s glykosyl donorem 7 (170 mg, 0,40 mmol) kodestilován s toluenem (3χ) a sušen na vakuové olejové pumpě po dobu 15 min. Pod ochrannou atmosférou argonu byl přidán destilovaný dichlormethan (10 ml) a 3 Á molekulová síta (1 g) a směs byla míchána za laboratorní teploty po dobu Ih. Do reakční směsi ochlazené na 0 °C byl přidán Njodsukcinimid (134 mg, 0,60 mmol), přikapána trifluormethansulfonová kyselina (20 μΐ) a směs byla ponechána míchat při 0 °C po dobu Ih. Reakční směs byla zředěna 30 ml dichlormethanu, nasyceným roztokem NaHCOs do neutrálního pH a 10% roztokem ^282()3 do odbarvení; zfiltrována, převedena do děličky a promyta vodou (30 ml). Vodná fáze byla extrahována 2χ 30 ml dichlormethanu. Spojené organické fáze byly vysušeny bezvodým síranem sodným a rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce. Sloupcová chromatografie na 30 g silikagelu ve směsi EtOAc/PE 2:3 poskytla 8 (220 mg, 80%) ve formě bezbarvého gelu. R/0.50 (EtOAc/PE 1:1). NMR spektra jsou v souladu s lit. (Holland, A.-C.; Hindsgaul, O.; Palcic, Μ. M.; Stults, C. L.; Macher, B. A., Methyl 3-amino-3-deoxy-P-D-galactopyranosyl-(I—> 4)-2-acetamido2-deoxy-P-D-glucopyranoside: An inhibitor of UDP-D-galactose: P-d-galactopyranosyl-( I—> 4)-2acetamido-2-deoxy-d-glucose (I—> 3)-a-d-galactopyranosyltransferase. Carbohydrate research 1995, 276(1), 91-98.).
Methyl 4-č?-(3-azido-3-deoxy^-D-galaktopyranosyl)-2-acetamido-2-deoxy^-Dglukopyranosid (9)
- 15 CZ 2023 - 132 A3
Roztok Na2S2O4 (226 mg, 1,29 mmol) ve vodě (8 ml) byl pomalu přikapán ke směsi 8 (210 mg, 0,26 mmol) a NaBrOs (196 mg, 1,29 mmol)) v EtOAc (5 ml) a vodě (4 ml). Směs byla intenzivně míchána po dobu 6h, přičemž reakční směs změnila barvu z bezbarvé na oranžovo-červenou a zpátky na bezbarvou, což indikovalo konec reakce. Směs byla zředěna 40 ml dichlormethanu, převedena do děličky a promyta vodou (30 ml). Vodná fáze byla extrahována 4* 30 ml dichlormethanu. Spojené organické fáze byly vysušeny bezvodým síranem sodným a rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce. Sloupcová chromatografie na 30 g silikagelu ve směsi EtOAc/PE 2:1 poskytla meziprodukt S2 (145 mg, 89%) ve formě bezbarvého gelu. Rf 0,10 (EtOAc/PE 1:1). Ή NMR (CDC13, 400 MHz, ’H-’H COSY): δ 7,84, 7,72 (2xdd, 2χ2Η, J= 5,3, 3,1 Hz, CHph), 5,37 (d, 1H, J= 3,4 Hz, H-4), 5,21 (dd, 1H, J= 10,6, 8,0 Hz, H-2), 5,19 (d, 1H, J = 8,6 Hz, H-l),4,64 (d, 1H, J= 8,0 Hz, H-l), 4,42 (dd, 1H,J= 10,8, 8,4 Hz, H-3), 4,15-4,11 (m, 1H, H-6'a), 4,09 (dd, 1H, J= 10,8, 8,6 Hz, H-2), 3,99-3,94 (m, 2H, H-5', H-6'b), 3,91 (dd, 1H, J = 12,2, 2,1 Hz, H-6a), 3,72 (dd, 1H, J= 9,5, 8,4 Hz, H-4), 3,69 (dd, 1H, J= 12,2, 3,1 Hz, H-6b), 3,61 (dd, 1H,J= 10,6, 3,4 Hz, H-3 ), 3,56 (ddd, 1H, J= 9,5, 3,1, 2,1 Hz, H-5), 3,44 (s, 3H, OMe), 2,20, 2,15, 1,85 (3xs, 3x3H, MeAc). 13C{’H} NMR (CDC13, 101 MHz, ’H-13C HSQC, ’H-13C HMBC): δ 170,6, 170,0, 169,5 (3xCO), from HMBC 168,1 (2CO), 134,2 (2CHPh), 131,9 (2Cq), 123,5 (2CHph), 101,2 (C-l), 99,5 (C-l), 82,2 (C-4), 74,2 (C-5), 72,5 (C-5), 69,8 (C-3, C-2'), 67,7 (C-4), 61,9 (C-6), 61,8 (C-3'), 60,9 (C-6), 57,3 (OMe), 56,0 (C-2), 20,9, 20,7, 20,3 (3xMeAc).
Ethylendiamin (1,5 ml, 22,46 mmol) byl přidán ke roztoku S2 (300 mg, 0,47 mmol) v methanolu (5 ml) a směs byla míchána za refluxu po dobu 4h. Rozpouštědla byla odpařena, surová směs byla kodestilována s toluenem (3x), rozpuštěna v 20 ml methanolu a po přidání AC2O (5 ml, 52,94 mmol) míchána další 2h. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce. Sloupcová chromatografie na 25 g silikagelu ve směsi dichlormethan/methanol 6:1 poskytla 9 (178 mg, 89% tyto 2 kroky, 79% všechny 3 kroky dohromady) ve formě bílých krystalků. ///().05 (DCM/MeOH 10:1), mp 254-256 °C (decomp., EtOAc/MeOH), Ή NMR (McOH-A. 400 MHz, ’H-’H COSY): δ 4,45 (d, 1H, 7= 7,7 Hz, H-l), 4,32 (d, 1H, J= 8,3 Hz, H-l), 3,93 (dd, 1H, J= 12,2, 2,5 Hz, H6a), 3,90 (dd, 1H, J= 3,1, 0,9 Hz, H-4), 3,87 (dd, 1H, J= 12,2, 4,3 Hz, H-6b), 3,73 (dd, 1H, J = 11,5, 7,4 Hz, H-6'a), 3,75-3,61 (m, 6H, H-2, H-3, H-4, H-2', H-5', H-6'b), 3,46 (s, 3H, OMe), 3,40 (ddd, 1H, J= 9,2, 4,3, 2,5 Hz, H-5), 3,33 (dd, 1H, J= 10,6, 3,1 Hz, H-3 ), 1,97 (s, 3H, MeAc). 13C{’H} NMR (McOH-A. 101 MHz, ’H-13C HSQC, ’H-13C HMBC): δ 173,6 (CO), 105,1 (C-l ), 103,6 (C-l), 80,7 (C-4), 77,8 (C-3), 76,6 (C-5), 74,3 (C-5'), 70,7 (C-2'), 69,4 (C-4'), 66,7 (C-3'), 62,4 (C-6'), 61,8 (C-6), 57,0 (OMe), 56,6 (C-2), 22,9 (MeAc). HRMS-APCI (m/z): [M - N2+ H]+ vypočteno pro C15H27N2O10, 395,1660; nalezeno 395,1656.
Methyl 4-č?-{3-[4-(pyridin-2-yl)-lH-l,2,3-triazol-l-yl]-3-deoxy-P-D-galaktopyranosyl}-2acetamido-2-deoxy-P-D-glukopyranosid (10)
- 16 CZ 2023 - 132 A3
AC2O (5 ml, 52,94 mmol) byl přidán k roztoku 9 (135 mg, 0,32 mmol) v pyridinu (7 ml) a směs byla míchána za laboratorní teploty přes noc. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce, surová směs byla kodestilována s toluenem (3 *) a znovu rozpuštěna v dimethylformamidu (2 ml). Postupně byla přidána modrá skalice (16 mg, 0,06 mmol), kyselina askorbová (11 mg, 0,06 mmol), 2-ethynylpyridine (39 μΐ, 0,38 mmol) a reakční směs byla míchána a zahřívána v olejové lázni při 40 °C po dobu 2 h. Po ochlazení reakční směsi na laboratorní teplotu byla reakční směs zředěna 30 ml dichlormethanu a promyta vodou (30 ml), vodná fáze byla promyta 2* 30 ml dichlormethanu. Spojené organické fáze byly sušeny bezvodým síranem sodným. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vakuové odparce. Sloupcová chromatografie na 25 g siligalu v EtOAc poskytla S3 (209 mg, 89%) ve formě bílé amorfní látky.
0,1 M roztok methanolátu sodného v methanolu byl přikapán do roztoku S3 (209 mg, 0,28 mmol) v methanolu (10 ml) až do dosažení pH = 9. Reakční směs byla za laboratorní teploty míchána přes noc. Neutralizace kyselým iontoměničem DOVEX H+, filtrace a odpaření rozpouštědel poskytlo 10 (149 mg, 100% tento krok, 89% všechny kroky dohromady) jako nažloutlou amorfní látku bez nutnosti další purifikace. Rf 0,35 (DCM/MeOH 3:1), Ή NMR (McOH-í/4. 400 MHz, Ή-Ή COSY): δ 8,56 (br s, 2H, C//l4. CHTna), 8,10 (d, 1H, J= 6,0 Hz, C//l4). 7,93 (dd, 1H, J= 6,0, 8,4 Hz, CHpy), 7,38 (br s, 1H, C//l4). 4,90 (dd, 1H, J= 11,1, 3,2 Hz, H-3), 4,68 (d, 1H, J= 7,5 Hz, H1), 4,35 (d, 1H, 7= 8,2 Hz, H-l), 4,22 (dd, 1H,7 = 11,1, 7,5 Hz, H-2), 4,09 (d, 1H, 7 =3,2 Hz, H-4), 3,95 (dd, 1H, 7= 12,2, 2,5 Hz, H-6a), 3,91-3,87 (m, 2H, H-6b, H-5), 3,80 (dd, 1H, 7 = 11,4, 7,1 Hz, H-6'a), 3,76 (dd, 1H, 7= 10,4, 8,2 Hz, H-2), 3,75-3,64 (m, 3H, H-3, H-4, H-6'b), 3,47 (s, 3H, OAfe), 3,43 (ddd, 1H, 7= 9,4, 4,2, 2,5 Hz, H-5), 1,98 (s, 3H, MeAc). 13C{’H} NMR (MeOH-í/4, 101 MHz, ’H-13C HSQC, ’H-13C HMBC): δ 173,6 (CO), from HMBC 151,3 (Cq(Py)), 150,4 (CHpy), from HMBC 148,1 (Cq(Tria)), 139,0 (CHiy), from HSQC 124,4 (CHiy), 123,8 (CHTria), from HSQC 121,7 (CHiy), 105,3 (C-E), 103,6 (C-l), 80,7 (C-4), 77,9 (C-5), 76,6 (C-5), 74,4 (C3), 69,5/69,4 (C-274'), 67,7 (C-3 ), 62,3 (C-6), 61,7 (C-6), 57,1 (OMe), 56,6 (C-2), 22,9 (AfeAc). HRMS-ESI (m/z): [M + Na]+ vypočteno pro C22H3iN50ioNa, 548,1963; nalezeno 548,1971.
LacNAc komplex s Ru (11)
- 17 CZ 2023 - 132 A3
Tmavě červený roztok dichloro(p-cymene)ruthenatého dimeru (18 mg, 0,03 mmol) v dichlormethanu (1 ml) byl přidán k roztoku 10 (31 mg, 0,06 mmol) ve směsi methanol/dichlormethan 1:1 (2 ml). Skoro okamžitě bylo možné pozorovat změnu barvy z červené do žluto-oranžové. Směs byla míchána za laboratorní teploty po dobu 10 min. Rozpouštědla byla odpařena na rotační vaukové odparce, surová směs byla rozpuštěna v minimálním množství metanolu a produkt byl vysrážen pomalým přídavkem methyl( terc. butyl)etheru ve formě žluté pevné látky (42 mg, 86%) jako směs dvou diastereomerů v poměru 1:0,6. Pro získání analytického vzorku beze stop zbytkových rozpouštěděl byl produkt rozpuštěn v malém množství methanolu a 3* kodestilován s chloroformem. Rf 0.25 (CH2Q2/CH3OH 3:1). Hlavní diastereomer: 1H NMR (MeOH-d4, 400 MHz, Ή-Ή COSY): δ 9,42-9,40 (m, 1H, CHPy), 9,13 (s, 1H, CHTria), 8,20-8,14 (m, 2H, CHPy), 7,68-7,64 (m, 1H, CHPy), 6,12 (dd, 1H, J = 6,3, 1,2 Hz, CHp -cym), 6,03, 5,92 (2*dd, 2*1H, J = 6,1, 1,2 Hz, CHp-cym), 5,81 (dd, 1H, J = 6,3, 1,2 Hz, CHp-cym), 5,16 (dd, 1H, J = 11,1, 3,1 Hz, H-3'), 4,74 (d, 1H, J = 7,6 Hz, H-1'), 4,38 (d, 1H, J = 8,2 Hz, H-1), 4,27 (dd, 1H, J = 11,1, 7,6 Hz, H-2'), 4,15 (dd, 1H, J = 3,1, 1,1 Hz, H-4'), 3,97-3,88 (m, 3H, H-6a/b, H-5'), 3,85-3,65 (m, 5H, H-2, H-3, H-4, H-6'a/b), 3,47 (s, 3H, OMe), 3,45 (dt, 1H, J = 9,6, 3,3 Hz, H-5), 2,78-2,71 (m, 1H, CHi-Pr), 2,23 (s, 3H, Mep-cym), 1,16, 1,06 (2*d, 2*3H, J = 6,9 Hz, Met-Pr). 13C{1H} NMR (MeOH- d4, 101 MHz, 1H-13C HSQC, 1H-13C HMBC, 1H-13C HSQCTOCSY): δ 172,3 (C O), 155,3 (CHpy), 148,6 (Cq(Py)), 146,3 (Cq(Tria)), 140,0, 125,9 (2* CHPy), 124,5 ( CHt™), 122,0 (CHPy), 105,0 (C qCH i -Pr), 103,7 (C-1'), 102,5 (C qMe), 102,2 (C-1), 85,9, 84,5, 84,1, 83,3 (4* CHp -cym), 79,3 (C4), 76,4 (C-5'), 75,2 (C-5), 72,9 (C-3), 68,2 (C-3'), 67,9 (C-2'), 67,7 (C-4'), 60,7 (C-6'), 60,4 (C6), 55,7 (OMe), 55,5 (C-2), 30,8 (CH i-Pr), 21,5, 21,2 (2*2Mei -Pr), 17,3 (Mep-cym).
Minor diastereomere: 1H NMR (MeOH-d4, 400 MHz, Ή-Ή COSY): δ 9,42-9,40 (m, 1H, CHPy), 9,09 (s, 1H, CHTria), 8,20-8,14 (m, 2H, CHPy), 7,68-7,64 (m, 1H, CHPy), 6,11 (dd, 1H, J = 6,3, 1,2 Hz, CHp -cym), 6,06, 5,89 (2*dd, 2*1H, J = 6,1, 1,2 Hz, CHp-cym), 5,83 (dd, 1H, J = 6,3, 1,2 Hz, CHp cym), 5,09 (dd, 1H, J = 11,0, 2,9 Hz, H-3'), 4,73 (d, 1H, J = 7,5 Hz, H-1'), 4,37 (d, 1H, J = 8,2 Hz, H-1), 4,34 (dd, 1H, J = 11,0, 7,5 Hz, H-2'), 4,20 (dd, 1H, J = 2,9, 1,1 Hz, H-4'), 3,97-3,88 (m, 3H, H-6a/b, H-5'), 3,85-3,65 (m, 5H, H-2, H-3, H-4, H-6'a/b), 3,47 (s, 3H, OMe), 3,44 (dt, 1H, J = 9,6, 3,3 Hz, H-5), 2,78-2,71 (m, 1H, CHi-Pr), 2,22 (s, 3H, Mep -cym), 1,15, 1,09 (2*d, 2*3H, J = 6,9 Hz, Mei-Pr). 13C{1H} NMR (MeOH-d4, 101 MHz, 1H-13C HSQC, 1H-13C HMBC, 1H-13C
HSQCTOCSY): δ 172,3 (C O), 155,3 (CHPy), 148,6 (Cq(Py)), 146,2 (Cq(Tria)), 140,0, 125,9 (2* CHPy), 124,8 (CHTria), 122,0 (CHPy), 105,0 (CqCH i-Pr), 103,7 (C-1'), 102,5 (C qMe), 102,2 (C-1), 86,0, 84,6, 84,0, 83,2 (4* CHp -cym), 79,2 (C-4), 76,2 (C-5'), 75,2 (C-5), 73,0 (C-3), 68,5 (C-3'), 68,0 (C-4'), 67,5 (C-2'), 60,7 (C-6'), 60,3 (C-6), 55,7 (OMe), 55,4 (C-2), 30,9 (CH i-Pr), 20,5, 20,4 (2*2Mei -Pr), 17,4 (Mep-cym). HRMS-APCI (m/z): [M - Cl]+ vypočteno pro ( I LVlYO-Ru, 796,1899; nalezeno 796,1904.
Příklad 3: Stanovení afinit látek 4, 5 a 11 k lidským galektinům 1 a 3
Inhibiční potenciál připravených látek 4, 5, 11 a standardu GB139 byl stanoven pomocí fluorescenční anisotropie podle Sorme, P.; Kahl-Knutsson, B.; Huflejt, M.; Nilsson, U. J.; Leffler, H., Fluorescence polarization as an analytical tool to evaluate galectin-ligand interactions. Analytical Biochemistry 2004, 334 (1), 36-47, strana 39, odstavec „Fluorecence polarization“. Jako kompetitivní fluorescenční sonda byla při měření použita látka 3,3'-dideoxy-3-[4-(fluorescein-5yl-karbonylaminomethyl)-1 H- 1,2,3-triazol-1 -yl] -3'-[4-(3-fluorophenyl)-1H- 1,2,3-triazol-1 -yl] 1,1'-sulfanediyl-di-e-D-galaktopyranosid. Fluorescenční anisotropie byla měřena pomocí přístroje Tecan Spark multimode microplate reader vybaveného vybaveného flitry pro fluorescenční polarizaci av mikrotitračních destičkách (Corning®, 384 jamek z černého polystyrenu s kulatým dnem) ve vzorcích o finálním objemu 200 μΜ. Vzorky byly inkubovány 30 minut ve tmě před měřením. Disociační konstanta (Kd) fluorescenční sondy byla stanovena pomocí série měření s konstantní koncentrací sondy (50 nM při měření s galektinem 1 a 5 nM při měření s galektinem 3) a narůstající koncentrací galektinu (6 nM-60000 nM pro galektin 1 a 0,3 nM-3000 nM pro galektin 3).
- 18 CZ 2023 - 132 A3
Hodnota Kd byla získána pomocí nelineární regrese provedené pomocí software Prism 9.3.0 (GraphPad, San Diego, CA) pro přímou interakci ligand-protein s využitím vzorce: A = Ao + (AmaxAo) x (|G}/(Kd + [G]), přičemž Ao je anisotropic sondy bez přítomnosti galektinů, Amax je maximální dosažená anisotropic sondy se zvyšující se koncentrací galektinů, [G] je celková koncentrace galektinů v konkrétním vzorku a A je naměřená anisotropic konkrétního vzorku. Inhibiční eseje připravených látek ke galektinů 1 byly provedeny s konstantní koncentrací proteinu 500 nM, konstantní koncentrací sondy 100 nM a vzrůstající koncentrací připraveného inhibitoru (1 nM-10000 nM pro látky 4, 5 a GB139, 10 nM-100000 nM pro látku 11). Inhibiční eseje připravených látek ke galektinů 3 byly provedeny s konstantní koncentrací proteinu 50 nM, konstantní koncentrací sondy 5 nM a vzrůstající koncentrací připraveného inhibitoru (0,1 μΜ2500 μΜ pro látky 4, 5 a 11, 1 nM-10000 nM pro látku GB 139). Hodnoty ICso pro jednotlivá měření byly získány pomocí nelineární regrese provedené softwarem Prism 9.3.0 (GraphPad, San Diego, CA) pro kompetitivní interakci dvou ligandů a jednoho vazebného místa proteinu s využitím předefinovaného modelu: čtyřparametrová závislost odpovědi na logaritmu koncentrace inhibitoru (logl vs. response—Variable slope, four parametres). Model využívá rovnici: A=A ± Amm+(Amax-Amm)/(l+10A((log7C50-logI)*HillSlope)), přičemž A je hodnota anisotropic naměřená v daném titračním kroku, Amm je minimálního hodnota anisotropic (Anisotropic naměřená při kompletním vytěsnění sondy inhibitorem) a Amax je hodnota maximální anisotropic (Anisotropic sondy v přítomnosti galektinů a bez přítomnosti inhibitoru), logl je dekadický logaritmu celkové koncentrace inhibitoru v daném titračním kroku a HillSlope je bezrozměrný parametr Hillovi směrnice. Závislost A na logl byla fitována pomocí metody nejmeších čtverců, což poskytlo hodnoty čtyřech parametrů: log/ČA, Amin, Amax HillSlope.
Z takto získaných hodnot ICso byly vypočteny hodnoty inhibičních konstant Ki dle online dostupného modelu: http://websites.umich.edu/~shaomengwanglab/software/calc_ki/index.html. Model je popsán v následující publikaci: Development and optimization of a binding assay for the XIAP BIR3 domain using fluorescence polarization, Analytical Biochemistry, 2004, 332 (2), 261273. Naměřená data v porovnání se známým inhibitorem galektinů GB139 jsou zobrazena v Tabulce 1. Látka 5 má výrazně lepší afinitu ke galektinů-1 než použitá fluorescenční sonda a touto metodou není možné přesnou hodnotu K stanovit a je proto uvedena pouze jako možný rozsah hodnot.
Tabulka 1: Hodnoty K připravených látek a standardu GB 139 vůči lidským galektinům 1 a 3 stanovené pomocí fluorescenční anizotropie. Uvedené hodnoty jsou průměry a směrodatné odchylky ze čtyř nezávislých měření.
Látka Ki vůči lidskému galektinů 1 (μΜ) Ki vůči lidskému galektinů 3 (μΜ)
GB139 0,077 ± 0,027 0,009 0 ±0,001
4 0,018 ±0,011 21,2 ±2,7
5 <0,005 15,2 ±0,2
11 1,17 ±0,16 167,2 ±4,2
Inhibiční potenciál připravených látek 4, 5 a standardu GB 139 vůči lidským galektinům 1 a 3 byl zároveň stanoven pomocí kompetitivní enzymové imunoanalýzy (ELISA). Jako imobilizovaný kompetitivní ligand byl použit asialofetuin (ASF), glykoprotein zakončený zbytky LacNAc, který interaguje s galektiny. Jamky mikrotitrační destičky (96- w BRAND plates-F-pureGrade, BRAND, Germany) byly potaženy ASF (5 mg/ml v pufru 0,lM C Os /HCO pH 9-9,8; 50 pl na jamku) a inkubovány přes noc ve vlhké komůrce při 40 °C. Poté byly jamky promyty 1 x 200 μΐ PBS. Po každém z dalších kroků následovalo promytí PBS-Tween 3 x 5 min. Jamky byly blokovány 3% BSA v PBS (200 μΐ na jamku) a inkubovány po dobu 1 hodiny při pokojové teplotě. Zvyšující se koncentrace inhibitorů v pufru PBS byly smíchány s Hise-GST-Gal-3 nebo Hise-GST-Gal-l (cílová
-19 CZ 2023 - 132 A3 koncentrace 5 nebo 10 μΜ) a inkubovány v jamkách s ASF po dobu 1 hodiny. Anti-GST-protilátka konjugovaná s křenovou peroxidázou (připravená v laboratoři) zředěná 1:1000 v 1% BSA v PBS byla použita pro značení N-terminálního GST-tag galektinů a následnou kolorimetrickou imunodetekcí. Jako substrát pro peroxidázovou reakci byl použit TMB (0,1mg/ml TMB v citrát fosfátovém pufru pH 6,0: 75mM Na2HPO4, 25 mM kyselina citrónová; 50 μl na jamku), a inkubován do viditelné modré zbarvení (20 min). Reakce byla zastavena přidáním 1M roztoku H2SO4 (50 μl na jamku) a barevným posunem do žluté. Intenzita signálu byla měřena spektrofotometricky pomocí Multidetekčního readeru Infinititte M1000 PRO (Tecan Group Ltd, CH) při 450 nm a odpovídá množství navázaného galektinu. Příslušná inhibiční konstanta (IC50) byla vypočtena z nelineární regrese (směrnice inhibice odezvy na dávku) sigmoidálních křivek pomocí GraphPad Prism 7 (GraphPad Software, USA). Naměřená data v porovnáním se známým inhibitorem galektinů GB139 jsou zobrazena v Tabulce 2.
Tabulka 2: Hodnoty IC50 látek 4, 5 a standardu GB139 vůči lidským galektinům 1 a 3 stanovené pomocí imunoanalytické metody ELISA. Uvedené hodny jsou průměry a směrodatné odchylky ze 3 nezávislých měření.
Látka IC50 vůči lidskému galektinu 1 (μΜ) IC50 vůči lidskému galektinu 3 (μΜ)
GB139 0,148 ± 0,059 0,028 ± 0,016
4 0,026 ± 0,004 87,2 ± 4,4
5 0,006 0 ± 0,000 8 103,8 ± 38
Příklad 4: Stanovení cytotoxických vlastností připravených látek
Pomocí MMT eseje byly stanoveny cytotoxické vlastnosti připravených látek vůči nádorovým a nenádorovým buněčným liniím a vyjádřeny jako hodnoty IC50. Tato esej je založena na redukci žlutého solubilního 3-[4,5-dimethylthiazol-2-yl]-2,5-difenyl tetrazolium bromidu (MTT) na nerozpustný formazan (modré krystaly hvězdicovitého tvaru). Reakce probíhá na mitochondriální membráně živých buněk. Následně se formazan rozpustí přidáním silného detergentu (DMSO) a zabarvení se vyhodnocuje spektrofotometricky při vlnové délce 570-595 nm. Hodnota absorbance roztoku odpovídá množství živých buněk (čím tmavší barva a tedy vyšší absorbance, tím vyšší procento živých resp. metabolicky aktivních buněk).
K testu toxicity byly použity lidské buněčné linie odvozené od karcinomu vaječníků (A2780, SKOV-3), karcinomu prsu (MDA-MB-231, MCF-7), jako kontrolní byla použita nenádorová epiteliální linie MCF-10A a buněčná linie odvozená z embryonálních buněk ledvin HEK293. Buňky A2780 byly kultivovány v médiu RPMI 1640 (Sigma-Aldrich), které obsahovalo 10% fetální bovinní sérum (Biochrom AG), 2 mM L-glutamin (Gibco) a 100 U/ml penicilin/streptomycin (Biosera). Buňky SK-OV-3 byly kultivovány v médiu McCoy’s (SigmaAldrich) obsahujícím 10% fetální bovinní sérum (Biochrom AG) a 100 U/ml penicilin/streptomycin (Biosera).
Buněčné linie MDA-MB-231, MCF-7 a HEK293 byly kultivovány v médiu HG-DMEM (SigmaAldrich), které obsahovalo 10% fetální bovinní sérum (Biochrom AG), 100 U/ml penicilin/streptomycin (Biosera) a 100 mg/L pyruvát (Invitrogen). Buněčná linie MCF-10A byla kultivována v médiu D-MEM F12 (Gibco) obsahujícím 5% koňské sérum (Gibco), 20 ng/ml EGF (Sigma), 100 μg/ml hydrokortizon (UVAB Pharma), 10 μg/ml inzulin (Eli Lilly) a 100 U/ml penicilin/streptomycin (Biosera).
Test probíhá podle následujícího postupu:
- 20 CZ 2023 - 132 A3
1. Buňky byly nasazeny do jamek 96 jamkové desky v suspenzi 5000 buněk / 100 μΐ (MDAMB-231, MCF-7, SK-OV-3, HEK293), 8000 buněk / 100 μΐ (A2780, MCF-10A) kultivačního média a inkubovány přes noc v termostatu při 37 °C, 5% CO2.
2. Druhý den byla do jamek přidána testovaná látka v objemu 50 μΐ (koncentrační řada látky: 300 μΜ, 75 μΜ, 30 μΜ, 15 μΜ, 7,5 μΜ, 3 μΜ, 0,6 μΜ, 0,15 μΜ) a buňky byly inkubovány v termostatu 72 hodin.
3. Do jamek bylo přidáno 20 Dl roztoku MTT (2,5 mg/1 ml PBS) a buňky inkubovány 3 h v termostatu při 37 °C, 5% CO2.
4. Po inkubaci bylo odstraněno médium a přidáno 50 Dl DMSO (Dimethylsulfoxid).
5. Po rozpuštění modrých krystalků byla měřena absorbance v jamkách desky na ELISA Readeru při vlnové délce 570-595 nm.
6. Vyhodnocení IC50 (přežití 50 % buněk) jako inflexní bod křivky naměřených hodnot absorbance pomocí programu Graphpad Prism.
Stanovené hodnoty IC50 jsou zobrazeny v Tabulce 3.
Tabulka 3: Cytotoxické působení připravených látek vyjádřené jako hodnoty IC50 vůči vybraným nádorovým i nenádorovým buněčným liniím stanoveným pomocí MMT eseje.
Látka IC50 vůči HEK- 293 (μΜ) IC50 vůči A2780 (μΜ) IC50 vůči SK-OV-3 (μΜ) IC50 vůči MDAMB-231 (μΜ) IC50 vůči MCF-7 (μΜ) IC50 vůči MCF-10A (μΜ)
4 158±42 >200 >200 >200 >200 >200
5 174±28 n.d. >200 141±8 n.d. n.d.
11 >200 >200 n.d. >200 n.d. n.d.

Claims (13)

1. Sloučenina obecného vzorce (I)
kde
R1, R2, R3, R4 a Rm jsou nezávisle vybrané ze skupiny, zahrnující H a (Ci až C,)alkyl: n je 1 nebo 2;
Xje CH nebo N;
D, Y a Z jsou nezávisle CH, N nebo O;
A je vybrané ze skupiny zahrnující struktury (II) a (III)
NHAc (Π)
(III)
B je vybrané ze skupiny zahrnující monovalentní záporně nabité ligandy a neutrální ligandy, s výhodou je B vybrané ze skupiny zahrnující F, Cl', Br, I, CN', CO, CFFCN:
a přičemž kladný náboj sloučeniny obecného vzorce (I) je kompenzován aniontem, s výhodou vybraným ze skupiny zahrnující F', CF, Br, I, PFe', ZrrCL, 2‘, BF4 ' a BR4 ', kde R je fenyl, který může být dále nezávisle substituovaný jednou až pěti elektronakceptomími skupinami, s výhodou vybranými z F, Cl, CF3, CN a/nebo NO2.
2. Sloučenina obecného vzorce (I) podle nároku 1, kde alespoň jeden z X, Y a Z je CH; a/nebo alespoň dvě D jsou CH.
-22CZ 2023 - 132 A3
3. Sloučenina obecného vzorce (I) podle nároku 1 nebo 2, kde R1, R2, R3, R4 a Rm jsou nezávisle vybrané ze skupiny, zahrnující H, CH, nebo -CHíCHý.
4. Sloučenina obecného vzorce (I) podle nároku 1, 2 nebo 3, kde všechna D jsou CH.
5. Sloučenina obecného vzorce (I) podle kteréhokoliv z předchozích nároků, kde Y je CH a
5 současně X a Z j sou N.
6. Sloučenina obecného vzorce (I) podle kteréhokoliv z předchozích nároků, kde strukturní jednotka (IV)
10 je vybraná ze skupiny zahrnující cyklopentadien, pentamethylcyklopentadien, benzen, p-cymen, 1,3,5-trimethylbenzen a hexamethylbenzen.
7. Sloučenina obecného vzorce (I) podle kteréhokoliv z předchozích nároků, vybraná ze skupiny sestávající z:
přičemž kladný náboj sloučeniny je kompenzován aniontem, vybraným z Cl' a PFe
8. Způsob přípravy sloučeniny obecného vzorce (la)
-23 CZ 2023 - 132 A3
(la) kde B, D, R1, R2, R3, R4 a Rm jsou definovány v nároku 1;
vyznačený tím, že zahrnuje následující kroky:
(a) Huisgenova cykloadice azidového prekurzoru obecného vzorce (V) kde R’ je H nebo Ac; a kde A’ je
(V),
15 a ethynyl derivátu šestičlenného dusíkatého heterocyklu obecného vzorce (VII)
(VII), kde D je definováno v nároku za vzniku meziproduktu obecného vzorce (Via)
-24CZ 2023 - 132 A3
(Via),
kde R’ a D jsou definované výše a A” je nebo
(b) pokud R’ je Ac, potom bazická hydrolýza skupin OR’ za vzniku meziproduktu obecného vzorce (VIb)
(VIb),
kde D jsou definované výše; a A”’ je nebo
(c) reakce sloučeniny obecného vzorce (VIb) s komplexem ruthenia obecného vzorce [RuLEhh, kde L je strukturní jednotka (IV), jak je definována v nároku 6, a B je definováno v nároku 1, za vzniku sloučeniny obecného vzorce (la).
9. Použití sloučeniny obecného vzorce (I) jako analytické sondy pro stanovení afinit ligandů ke galektinům, zejména ke galektinu-1.
10. Sloučenina obecného vzorce (I) podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 7 pro použití jako léčivo.
-25 CZ 2023 - 132 A3
11. Sloučenina obecného vzorce (I) podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 7 pro použití při léčení onemocnění spojených s nadprodukcí galektinů, zejména galektinu 1, s výhodou vybraných ze skupiny zahrnující nádorová onemocnění, fibrotická onemocnění, infekce HIV-1.
12. Sloučenina obecného vzorce (I) podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 7 pro použití k 5 inhibici galektinů in vivo.
13. Použití sloučeniny obecného vzorce (I) podle kteréhokoliv z předchozích nároků 1 až 7 pro inhibici galektinů in vitro, zejména pro inhibici galektinu-1.
CZ2023-132A 2023-04-04 2023-04-04 Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití CZ2023132A3 (cs)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ2023-132A CZ2023132A3 (cs) 2023-04-04 2023-04-04 Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití
PCT/CZ2024/050020 WO2024208383A1 (en) 2023-04-04 2024-03-28 Ruthenium complexes for inhibition of galectins, method of their preparation, and use thereof

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CZ2023-132A CZ2023132A3 (cs) 2023-04-04 2023-04-04 Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CZ2023132A3 true CZ2023132A3 (cs) 2024-10-16

Family

ID=90924416

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CZ2023-132A CZ2023132A3 (cs) 2023-04-04 2023-04-04 Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití

Country Status (2)

Country Link
CZ (1) CZ2023132A3 (cs)
WO (1) WO2024208383A1 (cs)

Family Cites Families (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2620443A1 (en) 2012-01-25 2013-07-31 Galecto Biotech AB Novel galactoside inhibitors of galectins
JP6366598B2 (ja) * 2012-11-15 2018-08-01 タフツ ユニバーシティー ガレクチンタンパク質阻害剤を用いて被験体の眼の血管新生または繊維症を処置し、調節し、または、予防する方法、組成物、およびキット
EP3484903A1 (en) * 2016-07-12 2019-05-22 Galecto Biotech AB Alpha-d-galactoside inhibitors of galectins

Also Published As

Publication number Publication date
WO2024208383A1 (en) 2024-10-10

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR102626669B1 (ko) 질환의 예방 및 치료를 위한 화합물 및 이의 용도
JP6892859B2 (ja) 新規ガラクトシドによるガレクチン阻害剤
JP7216634B2 (ja) ガレクチンのα-D-ガラクトシド阻害剤
JP7038099B2 (ja) ガレクチンのα-D-ガラクトシド阻害剤
Dondoni et al. C-glycoside clustering on calix [4] arene, adamantane, and benzene scaffolds through 1, 2, 3-triazole linkers
Wang et al. Design, synthesis and biological evaluation of a novel series of glycosylated platinum (iv) complexes as antitumor agents
EP2807176B1 (en) Novel galactoside inhibitors of galectins
Huczyński et al. Synthesis and biological activity of salinomycin conjugates with floxuridine
US20210380623A1 (en) Prodrug galactoside inhibitor of galectins
CA3116515A1 (en) Alpha-d-galactoside inhibitors of galectins
JP6707548B2 (ja) ガレクチンの新規なガラクトシド阻害剤
WO2020078808A1 (en) Galactoside inhibitor of galectins
CN114555620A (zh) 半乳糖凝集素的新型半乳糖苷抑制剂
EP3166956A1 (en) Novel hybrid galactoside inhibitor of galectins
KR20200108303A (ko) 갈렉틴의 신규 갈락토시드 억제제
JP7086008B2 (ja) ガレクチンに関連する疾患を予防および処置するためのセレノガラクトシド化合物およびその使用
Srour et al. Synthesis and cytotoxic properties of new substituted glycosides-indole conjugates as apoptosis inducers in cancer cells
El Malah et al. Synthesis of Some 1, 2, 3-triazole-bridged glycosides with benzoquniline-3-carbonitriles via click chemistry for anticancer, and docking evaluation
CZ2023132A3 (cs) Komplexy ruthenia pro inhibici galektinů, způsob jejich výroby a jejich použití
Al-Sahaly et al. Synthesis, Molecular Docking and Anticancer Activity of New Substituted Pyridine-1, 2, 3-Triazole Hybrid N-glycosides Via Click Chemistry
Sarkar et al. Expedient and Facile One-Pot Syntheses of Triazole-Linked Glycoconjugates under Microwave Irradiation
WO2021023512A1 (en) Bifunctional compound and its use in immunotherapy
JP2021504402A (ja) 薬剤とグルコース感知タンパク質に結合し得る部分との新規のコンジュゲート
Zhang Inhibition of Galectins and O-GlcNAc Transferase with Di-and Multivalent Ligands