CN1692162A - 用于检测基因多态性的方法 - Google Patents
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Abstract
用于检测遗传多态性的方法,包括:生成寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得该寡核苷酸探针和/或引物包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点,或者,当编码受体的所述基因和与其互补的所述序列至少其中之一得到扩增时,使得多态位点包含在扩增片段中;并使用由此生成的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物检测编码靶受体的基因中的至少一种遗传多态性。
Description
技术领域
本发明涉及遗传多态性信息;用于检测遗传多态性信息的方法;使用遗传多态性评估药物的方法;和用于筛选药物的方法。
技术背景
与人类个体的身体外观变化无穷一样,在个体之间进行比较后发现,由三十亿(3,000,000,000)个碱基对组成的人类遗传密码在相当多的位点处存在变化。遗传密码中的这些差异称为遗传多态性,而单核苷酸多态性是具有代表性的多态性。
单核苷酸多态性(SNP)指个体间一个DNA字母的差异。就像人类个体的相貌和体型变化无穷一样,个体的核苷酸序列(即遗传密码)在相当多的位点处存在变化。根据SNP的位置,它们分成cSNP(编码SNP)和gSNP(基因组SNP);cSNP进一步分成sSNP(沉默SNP)、rSNP(调控SNP)、和iSNP(内含子SNP)。
这些SNP可以作为多态标记用于搜索那些与疾病的发展或恶化有关的基因;最后,在临床领域,这些SNP直接涉及疾病的风险诊断或者治疗性药物的选择和使用。同样,根据使用引发物作为靶分子获得的证据来开发药物已经成为世界趋势。在对患有相同疾病的患者施用药物后,他们的响应度是多样性的。有些患者显示显著效果;有些患者显示较低效果;而有些患者显示没有效果。因此,对药物的响应度随患者存在极大变化。即使患者的状况是相同的,而且诊断患有相同疾病,然而引起该疾病的路径可能是不同的;或者,药物结合其受体的能力、受体的信号转导能力、或受体自身的表达水平可能在患者间存在极大变化。因此,希望根据诸如SNP等遗传多态性而针对目标疾病选择合适药物并开发合适治疗方法(即希望所谓的个性化医学)。
除了对药物的响应度以外,有时可能致命的强烈副作用也是医务人员应当考虑的主要问题之一。即使没有由药方错误等引起的过量施用,仍然可能发生意外的致命副作用。因此,在对药物的响应方面,只考虑药物的代谢和给药是不够的;还应当考虑到诸如SNP等遗传多态性,在药物受体的响应度和那些与副作用有关的受体的敏感性方面测定个体差异。
发明描述
本发明的目标是提供用于检测遗传多态性信息的方法、根据该信息评估药物的功效和安全性的方法、以及用于筛选药物的方法。
作为解决上述问题的广泛且深入研究的结果,本发明人成功建立了如下方法,包括:检测编码受体的基因中的遗传多态性,并根据由此得到的信息评估由受体介导的药物的敏感性和副作用的发生,其中并不认为该受体是药物的作用靶。由此完成了本发明。
本发明描述如下。
(1)用于检测遗传多态性的方法,包括:生成寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得探针和/或引物包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点,或者,当编码受体的所述基因和与其互补的所述序列至少其中之一得到扩增时,使得多态位点包含在扩增片段中;并使用由此生成的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物检测编码受体的受试者基因中的至少一种遗传多态性。
(2)用于检测遗传多态性的方法,包括:生成寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得探针和/或引物包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点,或者,当编码受体的所述基因和与其互补的所述序列至少其中之一得到扩增时,使得多态位点包含在扩增片段中;并且使用由此生成的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物检测编码受体的受试者基因中的至少一种遗传多态性;其中所述多态位点是在SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列或与其互补的序列中存在的至少一种多态位点。
(3)用于检测遗传多态性的方法,包括:生成寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得探针和/或引物包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点,或者,当编码受体的所述基因和与其互补的所述序列至少其中之一得到扩增时,使得多态位点包含在扩增片段中;并且使用由此生成的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物检测编码受体的受试者基因中的至少一种遗传多态性;其中所述寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物至少其中之一是选自具有SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列中含多态位点的至少13个核苷酸的序列或与该含多态位点的至少13个核苷酸的序列互补的序列的探针和引物。
上文所述寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物的长度可以是13-60个核苷酸。
(4)在上文(1)-(3)所述方法中,表1所示信息(如表1所示SEQID NO:1-1168序列信息)可以用作多态位点信息。作为上文所述含多态位点的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物的具体实例,可以给出这样生成的探针和/或引物,使得位于其5′或3′末端或其中心部分的核苷酸是多态位点。同样包括在本发明中作为含多态位点的寡核苷酸探针的是由彼此相连的两个片段组成的寡核苷酸探针,其中一个片段能够与编码受体的基因或与其互补的序列杂交,另一个片段不能与其杂交,而且多态位点位于可杂交片段的5′或3′末端。
在本发明中,对遗传多态性的类型没有特别的限制。例如,可以列举单核苷酸多态性、由多个核苷酸的缺失、替代、或插入引起的多态性、或VNTR或微卫星多态性。
(5)用于评估药物的方法,包括:根据通过上文(1)-(4)任一种方法获得的检测结果评估由受体介导的药物的功效和安全性。
(6)用于评估药物的方法,包括:根据通过上文(1)-(4)任一种方法获得的检测结果评估由受体介导的药物的敏感程度。
(7)用于选择药物的方法,包括:使用通过上文(5)或(6)的方法获得的评估结果来选择将要使用的药物。
(8)用于选择药物的方法,包括:将编码受体的基因或与其互补的序列中的多态性信息与由受试者获得的编码受体的基因或与其互补的序列中的多态性信息进行比较;在由受体介导的药物的功效和/或安全性方面分析个体差异;并根据获得的分析结果选择将要使用的药物和/或药物的剂量。
(9)在上文(1)-(4)的检测方法、上文(5)和(6)的评估方法、或上文(7)和(8)的选择方法中,选自下组的至少一种可以用作受体:CD20,CD33,CSF3R,IL1R1,IL1R2,IL2R,HER2,IFNAR1,PGR,ACTH,ICAM1,VCAM1,ITGB2,PTGDR,PTGER1,PTGER2,PTGER3,PTGFR,GNA12,TBXA2R,BLTR2,CYSLT1,CYSLT2,PTAFR,BDKRB1,BDKRB2,ADRB1,ADRB2,HRH1,HRH2,HRH3,HTR3A,AGTR1,AGTRL1,AGTR2,AVPR1A,AVPR2,PTGIR,DRD1,ITGA2B,FOLR1,TNFR1,ADORA1,ADORA2A,ADORA2B,ADORA3,AVPR1B,ADRA1A,ADRA2A,ADRA2B,EDG1,EDG4,EDG5,GPR1,GPR2,GPR3,GPR4,GPR10,MC1R,MC2R,MC3R,MC4R,OXTR,SSTR1和SSTR3。
(10)这样生成的寡核苷酸,使得它包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点。
(11)这样生成的寡核苷酸,使得它包含在编码选自下组的任何受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点:CD20,CD33,CSF3R,IL1R1,IL1R2,IL2R,HER2,IFNAR1,PGR,ACTH,ICAM1,VCAM1,ITGB2,PTGDR,PTGER1,PTGER2,PTGER3,PTGFR,GNA12,TBXA2R,BLTR2,CYSLT1,CYSLT2,PTAFR,BDKRB1,BDKRB2,ADRB1,ADRB2,HRH1,HRH2,HRH3,HTR3A,AGTR1,AGTRL1,AGTR2,AVPR1A,AVPR2,PTGIR,DRD1,ITGA2B,FOLR1,TNFR1,ADORA1,ADORA2A,ADORA2B,ADORA3,AVPR1B,ADRA1A,ADRA2A,ADRA2B,EDG1,EDG4,EDG5,GPR1,GPR2,GPR3,GPR4,GPR10,MC1R,MC2R,MC3R,MC4R,OXTR,SSTR1和SSTR3。
(12)这样生成上文(10)或(11)的寡核苷酸,例如,使得位于其5′或3′末端或其中心部分的核苷酸是多态位点。或者,可以生成上文所述含多态位点的寡核苷酸,使得寡核苷酸是由彼此相连的两个片段组成的,其中一个片段能够与编码受体的基因或与其互补的序列杂交,另一个片段不能与其杂交,而且多态位点位于可杂交片段的5′或3′末端。作为本发明寡核苷酸的更加具体的实例,可以给出包含至少一个在SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列或与其互补的序列中存在的多态位点的寡核苷酸。这些寡核苷酸可以是长度为13-35个核苷酸的寡核苷酸,或者是由包含SEQ ID NO:1-1168所示任一核苷酸序列中第21个核苷酸的至少13个核苷酸的序列或与该至少13个核苷酸的序列互补的序列组成的寡核苷酸。选自SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列和与其互补的序列的寡核苷酸也包括在本发明内。
(13)长度为13-60个核苷酸、在包含SEQ ID NO:1-1168所示任何核苷酸序列或与其互补的序列中的多态位点的基因组DNA区域中设计的寡核苷酸,使得它位于该基因组DNA区域5′和/或3′末端的多态位点的1000bp距离内。
(14)微阵列,其中上文(12)或(13)的寡核苷酸固定在支持物上。
(15)包含上文(12)或(13)的寡核苷酸和/或上文(14)的微阵列的遗传多态性检测试剂盒。
下面,将更加详细的描述本发明。
本发明涉及使用受体的遗传多态性信息来检测受试者中的遗传多态性的方法。本发明还表征为分析由受体介导的药物的功效存在与否或强度和安全性;根据分析结果评估疾病与药物之间的相关性。即使多名患者患有相同疾病,然而相当普遍的是遗传多态性信息在各个患者间仍然存在变化。因此,由患者间不同的遗传多态性信息分析受体对药物的敏感性的差异;然后评估药物的功效和/或安全性(即当患者具有这样那样的遗传多态性信息时,认可或不认可特定药物有功效;或者,当患者具有这样那样的遗传多态性信息时,常常或很少发生副作用)。根据这些结果有可能确定哪种药物应当用于特定疾病,并根据患者个人的遗传多态性信息施用适合于他/她的药物(定制药物)。
1.遗传多态性
遗传多态性包括单核苷酸多态性、插入/缺失多态性、以及由核苷酸序列重复次数差异引起的多态性。一般而言,单核苷酸多态性(SNP)指在基因或其互补链(互补序列)区域中用其它核苷酸替代一个特定核苷酸引起的多态性。然而,在本发明中,除了由上述替代引起的多态性以外,术语SNP还包括由核苷酸缺失引起的多态性和通过向核苷酸添加一个或多个核苷酸引起的多态性。
插入/缺失型多态性指由缺失或插入多个核苷酸(如两个至几十个核苷酸)引起的多态性。有时,可以缺失或插入几百个至几千个核苷酸。由核苷酸序列重复次数差异引起的多态性具有两个至几十个核苷酸的序列的重复,而且重复次数在个体间存在变化。重复单元由几个至几十个核苷酸组成的那些多态性称为VNTR(重复片段串联数目可变)多态性,而重复单元由大约两个至四个核苷酸组成的那些多态性称为微卫星多态性。在VNTR或微卫星多态性中,这些重复片段的数目在个体等位基因间存在差异,从而获得变异。
此处应当注意的是,遗传多态性信息包括基因中的多态性信息及其互补序列中的多态性信息二者。术语“互补链”或“互补序列”指在碱基配对关系的多核苷酸。例如,序列5′-A-G-T-3′与序列3′-T-C-A-5′互补。互补可以是部分的(即多核苷酸中只有一定数目的核苷酸是依照碱基配对规则匹配的),或者整个序列可以是完全互补的。这种互补程度显著影响杂交的效力和强度。这在利用多核苷酸之间结合的扩增反应和检测方法中是特别重要的。
核苷酸序列的互补指在将寡核苷酸的一种序列与其它序列进行比对以使得前者的5′末端与后者的3′末端成对后,寡核苷酸序列彼此反向平行。互补不必是完全的;双链螺旋体是稳定的,即使它包含错配碱基对或不匹配碱基。考虑例如寡核苷酸的长度、核苷酸组成和寡核苷酸序列、离子强度、以及错配碱基的存在等,本领域普通技术人员能够凭经验确定双链螺旋体的稳定性。
2.受体
“受体”是一般术语,指应答特定配体诸如激素、自身活性物质(autacoid)、神经递质等的接受者。作为代表性受体,已知有细胞膜受体和核受体。有些药物抑制或拮抗特定配体与这种受体的结合,或者以与其配体相同的方式结合受体,由此刺激受体负责的信号转导。因此,当配体结合受体的能力、受体的信号转导能力、或受体自身的表达水平受到遗传多态性的影响时,药物的功效或副作用发生个体差异。
在本发明中,由进行遗传多态性分析的靶基因表达的受体的实例包括下列受体。
CD20,CD33,CSF3R,IL1R1,IL1R2,IL2R,HER2,IFNAR1,PGR,ACTH,ICAM1,VCAM1,ITGB2,PTGDR,PTGER1,PTGER2,PTGER3,PTGFR,GNA12,TBXA2R,BLTR2,CYSLT1,CYSLT2,PTAFR,BDKRB1,BDKRB2,ADRB1,ADRB2,HRH1,HRH2,HRH3,HTR3A,AGTR1,AGTRL1,AGTR2,AVPR1A,AVPR2,PTGIR,DRD1,ITGA2B,FOLR1,TNFR1,ADORA1,ADORA2A,ADORA2B,ADORA3,AVPR1B,ADRA1A,ADRA2A,ADRA2B,EDG1,EDG4,EDG5,GPR1,GPR2,GPR3,GPR4,GPR10,MC1R,MC2R,MC3R,MC4R,OXTR,SSTR1和SSTR3。
受体指只是单独地控制特定配体的信号转导的接受者。
(1)CD20代表CD20抗原的受体。
(2)CD33代表CD33抗原的受体。
(3)CSF3R代表集落刺激因子3的受体。
(4)IL1R1代表白介素-1的受体。
(5)IL1R2代表白介素-1的受体。
(6)IL2R代表白介素-2的受体。
(7)HER2代表c-erb-B-2的受体。
(8)IFNAR1代表干扰素α、β、和ω的受体。
(9)PGR代表孕酮的受体。
(10)ACTH代表黑皮质素2的受体。
(11)ICAM1代表人细胞间粘附分子1(CD54)的受体。
(12)VCAM1代表脉管细胞粘附分子1的受体。
(13)ITGB2代表整合蛋白β2[抗原CD18(p95),淋巴细胞功能相关抗原1;巨噬细胞抗原1(mac-1)β亚基]的受体。
(14)PTGDR代表前列腺素D2的受体。
(15)PTGER1代表前列腺素E1的受体。
(16)PTGER2代表前列腺素E2的受体。
(17)PTGER3代表前列腺素E3的受体。
(18)PTGFR代表前列腺素F的受体。
(19)GNA12代表血栓烷A2的受体。
(20)TBXA2R代表血栓烷A2的受体。
(21)BLTR2代表白三烯B4的受体。
(22)CYSLT1代表半胱氨酰白三烯的受体。
(23)CYSLT2代表半胱氨酰白三烯的受体。
(24)PTAFR代表血小板激活因子的受体。
(25)BDKRB1代表缓激肽的受体。
(26)BDKRB2代表缓激肽的受体。
(27)ADRB1代表儿茶酚胺β-1的受体。
(28)ADRB2代表儿茶酚胺β-2的受体。
(29)HRH1代表组胺H1受体。
(30)HRH2代表组胺H2受体。
(31)HRH3代表组胺H3受体。
(32)HTR3A代表5-羟色胺(血清素)的受体。
(33)AGTR1代表血管紧张素受体1。
(34)AGTRL1代表血管紧张素样受体。
(35)AGTR2代表血管紧张素的受体。
(36)AVPR1A代表精氨酸血管升压素的受体。
(37)AVPR2代表精氨酸血管升压素的受体。
(38)PTGIR代表前列腺素I2(前列环素)的受体。
(39)DRD1代表多巴胺的受体。
(40)ITGA2B代表整合蛋白α2b(IIb/IIIa复合物的血小板糖蛋白IIb,抗原CD41B)的受体。
(41)FOLR1代表叶酸受体1。
(42)TNFR1代表肿瘤坏死因子受体1(编号:AC006057.5)。
(43)ADORA1代表腺苷A1受体。
(44)ADORA2A代表腺苷A2受体。
(45)ADORA2B代表腺苷A2B受体。
(46)ADORA3代表腺苷A3受体。
(47)AVPR1B代表精氨酸血管升压素受体1B。
(48)ADRA1A代表肾上腺素能α-1A受体。
(49)ADRA2A代表肾上腺素能α-2A受体。
(50)ADRA2B代表肾上腺素能α-2B受体。
(51)EDG1代表内皮分化、鞘脂G-蛋白偶联受体1。
(52)EDG4代表内皮分化、鞘脂G-蛋白偶联受体4。
(53)EDG5代表内皮分化、鞘脂G-蛋白偶联受体5。
(54)GPR1代表G蛋白偶联受体1。
(55)GPR2代表G蛋白偶联受体2。
(56)GPR3代表G蛋白偶联受体3。
(57)GPR4代表G蛋白偶联受体4。
(58)GPR10代表G蛋白偶联受体10。
(59)MC1R代表黑皮质素1受体。
(60)MC2R代表黑皮质素2受体。
(61)MC3R代表黑皮质素3受体。
(62)MC4R代表黑皮质素4受体。
(63)OXTR代表催产素受体。
(64)SSTR1代表抑生长素受体1。
(65)SSTR3代表抑生长素受体3。
3.遗传多态性信息
可以通过用于检测遗传多态性的常规方法来获得遗传多态性信息。例如,可以采用测序法、PCR法、片段长度多态性测定法、使用等位基因特异性寡核苷酸作为模板的杂交法(如TaqMan PCR法、侵入者法、DNA芯片法)、使用引物延伸反应的方法、测序法、MALDI-TOF/MS法、DNA芯片法、等。PCR法和测序法可用于检测任何类型的遗传多态性。其它方法主要可用于检测SNP。
TaqMan PCR法是使用荧光标记的等位基因特异性寡核苷酸和TaqDNA聚合酶进行PCR反应的一种方法(Livak,K.J.,Genet.Anal.,14:143,1999;Morris,T.等人,J.Clin.Microbiol.,34:2933,1996)。侵入者法是将对各自SNP等位基因特异的两种报道者探针和一种侵入者探针与模板DNA的杂交与具有特异性内切核酸酶活性(在识别DNA结构的基础上进行切割)的酶进行的DNA切割相联合的一种方法(例如参阅Livak,K.J.,Biomol.Eng.,14:143-149,1999;Morris,T.等人,J.Clin.Microbiol.,34:2933,1996;Lyamichev,V.等人,Science:260:778-783,1993)。
作为使用引物延伸反应的方法,可以采用例如SniPer法。SniPer法的基本原理是称为RCA(滚动环状扩增)法的技术,其中聚合酶在作为模板的环状单链DNA上移动,从而连续合成它的互补链。根据这种方法,可以通过检测DNA扩增进行时发生的显色反应的存在与否来判断SNP(Lizardi,P.M.等人,Nature Genet.,19:225-232,1998;Piated,A.S.等人,Nature Biotech.,16:359-363,1998)。
测序法指通过PCR扩增含多态性的区域并使用Dye Terminator等对扩增产物的DNA序列测序从而分析遗传多态性(尤其是SNP)的频率的一种方法。
MALDI-TOF/MS法是使用质谱仪的一种方法。基本上,这是利用不同核苷酸的质量差异来进行SNP基因定型的方法。还有使用PCR扩增的方法和使用多链体(multiplex)的方法(Haff,L.A.、Smirnov,I.P.,Genome Res.,7:378-,1997;Little,D.P.等人,Eur.J.Clinica.Chem.Clin.Biochem.,35:545-,1997;Ross,P.等人,Nat.Biotechnol.,16:1347-,1998)。
DNA芯片法是将很多种DNA探针排列并固定在基片诸如玻璃片上;然后在它上面进行标记DNA的杂交;并且通过检测探针上标记信号(诸如荧光)的方法可区分地检测完全匹配和单核苷酸错配的一种方法。
可用于本发明方法的遗传多态性信息,特别是SNP信息,如下文表1所示。
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
CD20 | 1 | 5′侧翼区 -462 | cttaagtgtgagccaatgag G/A acaatatttggggaccccta | 1 |
CD20 | 2 | 5′侧翼区 -327 | aggtaaaagtcagtgctaac G/A gcccatctttgaccaacttc | 2 |
CD20 | 3 | 内含子1 750 | tccagtatataagtgattcc C/T tttccctgtttcccataaaa | 3 |
CD20 | 4 | 内含子1 793 | gcttaatctcactgagaatc C/T ggtggaaagaaatgtttaat | 4 |
CD20 | 5 | 内含子1 937 | ctcaggggatccacctgcct C/T ggcttcccaaagtgctggga | 5 |
CD20 | 6 | 内含子1 1064 | tgtaactgagctcatagtac A/C tagaaaacaggttccctatg | 6 |
CD20 | 7 | 内含子1 3234 | aacaattgatgacctttgca T/C tttaagttatcttcactaaa | 7 |
CD20 | 8 | 内含子1 3831 | agtttcttctctctttcctc T/C agccC/Gatgcgccagacagat | 8 |
CD20 | 9 | 内含子1 3836 | cttctctctttcctcT/Cagcc C/G atgcgccagacagataatac | 9 |
CD20 | 10 | 内含子2 215 | cttatgtcaccttttggttt T/G ggggcttgtatatgcagggg | 10 |
CD20 | 11 | 内含子3 128 | ggaaatattattgggttaaa G/T taattaagaagacaggttga | 11 |
CD20 | 12 | 内含子3 472 | gcactcttttggctgtttta C/T gtacatgttttccaaatctg | 12 |
CD20 | 13 | 内含子4 169 | atgaaaaacttagaagcgag G/A tctatctgaagtatgttcat | 13 |
CD20 | 14 | 内含子4 508 | tggtgcttcacaggctataa A/G gtactacactgtggtcttgc | 14 |
CD20 | 15 | 内含子4 -556 | gctgactggggctgattgca A/G cctatgtcagcaggaataga | 15 |
CD20 | 16 | 内含子4 -383 | cttcactctcttccctctac C/G tatttatgaaggcagataat | 16 |
CD20 | 17 | 3′非翻译区 1077 | tagagaatgtagccattgta G/A cagcttgtgttgtcacgctt | 17 |
CD20 | 18 | 3′侧翼区 258 | tatctctattttacaagtaa T/C tcaaagaggccaaataactt | 18 |
CD20 | 19 | 3′侧翼区 857 | tgatatttctacatttttag C/T gaccactagtggaagacatt | 19 |
CD20 | 20 | 3′侧翼区 1585 | aagaagtagaagatatattc T/C ctagccttagtttttcctcc | 20 |
CD20 | 21 | 5′侧翼区 (-1161)~(-1151) | ctaatgaacggctccaacaa (T)10-12 agagtggcatctttttaaat | 21 |
CD20 | 22 | 内含子1 249 | ttccacaaaagtagtagatt G/Δ cagcatatatattaaatcat | 22 |
CD20 | 23 | 内含子1 2919 | tttccataagaaataaaaaa A/Δ cagagaaagcactcatgtgt | 23 |
CD20 | 24 | 内含子1 3032~3049 | ccattttaacagagaaatat (CA)8-10 gccctcatggtcattattgc | 24 |
CD20 | 25 | 内含子6 625~626 | atggttgaaggttgaaggct (GACT) aagtcactagttctttggtt | 25 |
CD20 | 25 | 内含子6 625~626 | atggttgaaggttgaaggct aagtcactagttctttggtt | 26 |
CD20 | 26 | 3′非翻译区 1354~1363 | atcattgttttaaggatgat (A)8-9 taacaactagggacaataca | 27 |
CD33 | 1 | 5′侧翼区 -1750 | atgcagctacctctctatta G/A taaggatgaatgaagagtta | 28 |
CD33 | 2 | 5′侧翼区 -401 | tcctgctggactaaacaccc C/A atggatctaggtgaggctgc | 29 |
CD33 | 3 | 编码区 41 | ccctcgtttccccacagggg C/T cctggctatggatccaaatt | 30 |
CD33 | 4 | 内含子4 6773 | caggccctaattgtgggaga G/C tggcctttgggcaggccaga | 31 |
CD33 | 5 | 内含子4 7511 | gctgccctcctgggtttcca A/G ttaccacaggtaactctcca | 32 |
CD33 | 6 | 3′非翻译区 1104 | aggacccagtgaggaaccca C/T aagagcatcaggctcagcta | 33 |
CD33 | 7 | 3′侧翼区 773 | tagatgtctaaattgagatg G/T cagaaagaagctcacaatca | 34 |
CSF3R | 1 | 5′侧翼区 -936 | agtccatgggactcactgag C/T gagcagagcctgtgggatat | 35 |
CSF3R | 2 | 5′侧翼区 -865 | atttgacttggaactagaac T/G acagccctggtctgcagcat | 36 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
CSF3R | 3 | 内含子7 58 | ggggcagggggcagggtaag T/A cgggctcgagctggccctag | 37 |
CSF3R | 4 | 内含子9 253 | gtttcttcctgccctccttc C/A tagaacctagcacaagggaa | 38 |
CSF3R | 5 | 内含子9 275 | agaacctagcacaagggaac A/G gagggaaaaggggagggggg | 39 |
CSF3R | 6 | 编码区 1260 | gccgggacctctcgtcccac T/C ccggtggtcttctcagaaag | 40 |
CSF3R | 7 | 内含子11 125 | tccagcctttcttgatcctt C/T gttgttctcatttcatatcc | 41 |
CSF3R | 8 | 内含子14 106 | tgactttgaatcccctggtc G/A gagggaggagacccagcctt | 42 |
CSF3R | 9 | 内含子1 496~505 | gggctccaggcctccgagtg (C)8-10 gcccactctctgggtcggcg | 43 |
CSF3R | 10 | 内含子2 1771 | tccaggcactgtgaaaagcc C/Δ ttgacttgcatcattttgtg | 44 |
CSF3R | 11 | 内含子3 3412 | gctggtgctggcttgcaaaa A/Δ ctaattgtgcacatctcttc | 45 |
CSF3R | 12 | 内含子3 3494~3495 | agctacagtgagagcactta (A) caccgcggaaaggcacacac | 46 |
CSF3R | 12 | 内含子3 3494~3495 | agctacagtgagagcactta caccgcggaaaggcacacac | 47 |
IL1R1 | 1 | 内含子1a -581 | tgctgtataaaggaatattg A/G gagctgggattgttaaggaa | 48 |
IL1R1 | 2 | 内含子1a -491 | ggaaaaggaaccataaaagc T/A tctggaaacagattgtttaa | 49 |
IL1R1 | 3 | 5′非翻译区 -571 | atgtattagctcattttttt T/A A/Taaaaactgttttcaaccac | 50 |
IL1R1 | 4 | 5′非翻译区 -570 | tgtattagctcatttttttT/A A/T aaaaactgttttcaaccact | 51 |
IL1R1 | 5 | 内含子1c 1238 | tggggtttgctggggcaggg G/A tgtggaactctgatttattt | 52 |
IL1R1 | 6 | 内含子1c 1760 | agaggacaccactcagcagc C/T ccaatggagaggacgaggag | 53 |
IL1R1 | 7 | 内含子1c 2058 | gacaattgcggtgaaactac C/T atagcatagtgggtggagaa | 54 |
IL1R1 | 8 | 内含子1c 2287 | gcacaagacaaggatctgca C/A tgtcagcagcctttttctcc | 55 |
IL1R1 | 9 | 内含子1c 3714 | ggggggctaggcttcaaaca T/C tgtaaatatgtttccG/Atcag | 56 |
IL1R1 | 10 | 内含子1c 3730 | aacaT/Ctgtaaatatgtttcc G/A tcagtatgaacgtctgtgag | 57 |
IL1R1 | 11 | 内含子1c 4357 | gagaaacagctgttcttgcc T/C gactgggaggcagtgctcca | 58 |
IL1R1 | 12 | 内含子1c 5298 | atcattaggggtaggtcact C/G cctctaatttgccccacagg | 59 |
IL1R1 | 13 | 内含子1c 5537 | tagatcgtggagatttttct T/C tctgcttcataatatagccg | 60 |
IL1R1 | 14 | 内含子1c 5961 | caaacaaacaaacaaacaaa C/G gggtaacaggaagacatcat | 61 |
IL1R1 | 15 | 内含子1c 6020 | agtactgtaacacattcccc G/A tacatgtttccaccgatttt | 62 |
IL1R1 | 16 | 内含子1c 7152 | gaagctgtttaataaatgca C/A tgtggctacacagcaggaaa | 63 |
IL1R1 | 17 | 内含子1c 7712 | atgaccagcctaggccttgg G/A tcaccctaggatctggctga | 64 |
IL1R1 | 18 | 内含子1c 9657 | tataattcccagcagctgct T/G tcatatctggggcatactca | 65 |
IL1R1 | 19 | 内含子1c 9822 | tatgctgtgtactgcctcaa A/G gtgaataatagcttgggatt | 66 |
IL1R1 | 20 | 内含子2 3071 | ttttcctttcctcttttttt C/A atacaaagttcgttgtagat | 67 |
IL1R1 | 21 | 编码区 351 | gcaaaatttgtggagaatga G/A cctaacttatgttataatgc | 68 |
IL1R1 | 22 | 内含子5 315 | actatttattacaaaacata C/T tatgtgtgttttattgaaga | 69 |
IL1R1 | 23 | 内含子5 567 | ttcaaacatgtttttcttgc A/C aaataaattggccttcactt | 70 |
IL1R1 | 24 | 内含子6 2092 | tttcagtagcaccccactct A/G tgaattcggaaggtctagct | 71 |
IL1R1 | 25 | 内含子7 19 | gggtaagtgggcttcagtga G/C ggtatgctggaatcgG/Ttttt | 72 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
IL1R1 | 26 | 内含子7 35 | gtgaG/Cggtatgctggaatcg G/T ttttttttttttaaaacata | 73 |
IL1R1 | 27 | 内含子7 3002 | actaatggtggttttctctg G/T gtggtgggtttagggtaatt | 74 |
IL1R1 | 28 | 内含子8 396 | actgctcatctatgggacaa G/A gatctcctggcttcccatga | 75 |
IL1R1 | 29 | 编码区 1031 | catgattggtatatgtgtca C/T gttgacagtcataattgtgt | 76 |
IL1R1 | 30 | 编码区 1129 | cctgctatgattttctccca A/T taaaaggtataattttgtat | 77 |
IL1R1 | 31 | 内含子11 655 | gtgtggctttggttcaggag A/G gaatgatgataaatagaatt | 78 |
IL1R1 | 32 | 3′非翻译区 314 | gtcaggagttcgagaccagc C/G cagccaacatggcaaaaccc | 79 |
IL1R1 | 33 | 3′非翻译区 827 | agaagttagtgtccgaagac C/A gaattttattttacagagct | 80 |
IL1R1 | 34 | 3′非翻译区 998 | ttcctccctggcatgaccat C/G ctgtcctttgttattatcct | 81 |
IL1R1 | 35 | 3′非翻译区 1059 | aacagctccctagtggcttc C/T tccG/Atctgcaatgtcccttg | 82 |
IL1R1 | 36 | 3′非翻译区 1300 | ggtggccatgtcgcctgccc C/T cagcactcctctgtctctgc | 83 |
IL1R1 | 37 | 3′非翻译区 1384 | cgcattttctctagctgatc A/G gaattttaccaaaattcaga | 84 |
IL1R1 | 38 | 内含子1c 2966 | gcaaagtgctcaggaaaaaa A/Δ gcattcttggcacagagaga | 85 |
IL1R1 | 39 | 内含子1c 4659~4660 | agtggtcaagaggcttgggg (G) taggtccatccccatctgtg | 86 |
IL1R1 | 39 | 内含子1c 4659~4660 | agtggtcaagaggcttgggg taggtccatccccatctgtg | 87 |
IL1R1 | 40 | 内含子1c 5926~5961 | cagagcaagactctgtctca (AAAC)6-11 gggtaacaggaagacatcat | 88 |
IL1R1 | 41 | 内含子1c 9968~9978 | cccaaagaaatgattcagac (A)9-12 ttagactccaaaatactaaa | 89 |
IL1R1 | 42 | 内含子7 36~47 | tgaG/CggtatgctggaatcgG/T (T)11-13 aaaacataagagtaagataa | 90 |
IL1R1 | 43 | 内含子7 316~328 | tacaggattggatttctttc (T)10-14 cacagagttaaaatatttaa | 91 |
IL1R1 | 44 | 内含子8 114~138 | tgctcctaacctttgctgcc (T)20-26 gctaagctaagtagaattta | 92 |
IL1R1 | 45 | 内含子9 1735 | tattttttctcctttttttt T/Δ ctttttgctatagtcactaa | 93 |
IL1R1 | 46 | 内含子10 365~372 | cttcatgcatcagggaggtt (CT)4-6 cctttgtttaaactttgcga | 94 |
IL1R1 | 47 | 内含子10 392~403 | tcctttgtttaaactttgcg (A)10-12 ggaataccacaatatctaaa | 95 |
IL1R1 | 48 | 3′侧翼区 1912~1920 | aagattgtgtgtgtgtgtgt (G)7-11 cggggtgtttaaattttaag | 96 |
IL1R2 | 1 | 内含子1a 1802 | aactctgctgtaagatcttt G/C tcaagaccctacattgccct | 97 |
IL1R2 | 2 | 内含子1a 1883 | accttcctggaacctcccag C/T gccgcatggctgcagtggga | 98 |
IL1R2 | 3 | 内含子1a 2169 | agggcagctatcctctctcc C/A ggggtcttcagttggcctgg | 99 |
IL1R2 | 4 | 内含子1a 2248 | tacatccccactcccacccc G/A acctccaaagcctgtttgac | 100 |
IL1R2 | 5 | 内含子1a 2355 | gagttggcctctagcagcaa C/T aggactgaagcagagcagac | 101 |
IL1R2 | 6 | 内含子1a 4377 | ggtctgtggaaacccagcaa A/G tctgggctatcttcaagttg | 102 |
IL1R2 | 7 | 内含子1a 5073 | acattgtgtccccagggagt C/G gtgggcagctgatccacacg | 103 |
IL1R2 | 8 | 内含子1a 5179 | cctgtggaatctactgctgg C/T gtctgtgactgggaaaaccc | 104 |
IL1R2 | 9 | 内含子1a 5250 | tgctccatccgaggtcaccc C/T gctgtgcctctccctggctc | 105 |
IL1R2 | 10 | 内含子1a 5422 | tgctgcacctgaagagctcc G/A aggagcaccaggaaagccaa | 106 |
IL1R2 | 11 | 内含子1a 5454 | gaaagccaagggagcagaag G/A tggagaG/Actcagggccttgg | 107 |
IL1R2 | 12 | 内含子1a 5461 | aagggagcagaagG/Atggaga G/A ctcagggccttggggaagtg | 108 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
IL1R2 | 13 | 内含子1a 5564 | atatcctgaagctgtggcta C/T aggtcatcttgtctttcatc | 109 |
IL1R2 | 14 | 内含子1a 6184 | gtgattcaaggaaatcatta G/A gagcatcaattgttttgtgc | 110 |
IL1R2 | 15 | 内含子1b 752 | gtgtgtttatatgttaagca C/T gcaacatttatattgtgtat | 111 |
IL1R2 | 16 | 内含子1b 1167 | ctcctgtagtgcacaccagg G/T tatgcccatttcacagatga | 112 |
IL1R2 | 17 | 内含子1b 1400 | tgaagttaagagggaggaaa T/A tttgggatccaaaatgG/Acag | 113 |
IL1R2 | 18 | 内含子1b 1417 | aaaT/Atttgggatccaaaatg G/A cagacatttctaattatgga | 114 |
IL1R2 | 19 | 内含子1b 1626 | aaccaaggattgtgtaggct T/C gggtttacatcctatttgtc | 115 |
IL1R2 | 20 | 内含子1b 2792 | tgactcagtgataggtgtaa A/G gcctgatagctatgtgactt | 116 |
IL1R2 | 21 | 内含子3 5364 | ggatatggtttcctggatca T/C gaagttggagtatgcggggg | 117 |
IL1R2 | 22 | 内含子4 61 | ctttttttactagccataaa A/G gaaagacT/Ataaaatatcgat | 118 |
IL1R2 | 23 | 内含子4 69 | actagccataaaA/Ggaaagac T/A taaaatatcgattttctgaa | 119 |
IL1R2 | 24 | 内含子4 284 | tgtcacatgctgcatgacaa A/T gtttcagtcaacagtaggct | 120 |
IL1R2 | 25 | 内含子4 368 | aatttctattgcctagtgac A/G tcatagctgtctcaacatca | 121 |
IL1R2 | 26 | 内含子4 432 | atgtttagatatgtttatat G/A tacaaaaactgaccactgtg | 122 |
IL1R2 | 27 | 内含子5 68 | gcatgcagagaacaaatgac G/A gtgcaC/Tgtagaattccttgc | 123 |
IL1R2 | 28 | 内含子6 2160 | ttgagaaaactaaattttct A/G ccaaggaaagaattgggtgg | 124 |
IL1R2 | 29 | 内含子7 71 | ttttggagacagttatcact A/G tgacccacataccacattaa | 125 |
IL1R2 | 30 | 内含子7 997 | tgcaggtttccagagtgaga G/A T/Ccagcagtagagatgagaag | 126 |
IL1R2 | 31 | 内含子7 1036 | agagacggcaccactgaggg C/T tggagtcctggaaactccct | 127 |
IL1R2 | 32 | 内含子8 1746 | cttgcccacttaccctacga T/C gtttctaacagattttgccc | 128 |
IL1R2 | 33 | 5′侧翼区 (-1044)~(-1043) | ggcccatgggcccttctgac TT/Δ agccatttgttctgggtatg | 129 |
IL1R2 | 34 | 内含子1a 78~97 | gagggagagagagagagaaa (GA)10-11 gggaggcagagagagaggga | 130 |
IL1R2 | 35 | 内含子1a 1569~1570 | gtttctctctgtctgcctgt TT/Δ ctctctctctctctgtctct | 131 |
IL1R2 | 36 | 内含子1a 4475~4494 | atccctgggtgttttcagtg (T)19-22 gggggggagaatggctgact | 132 |
IL1R2 | 37 | 内含子1a 4899 | aggccctttcccactagggc T/Δ ggggaattaagcctgctgct | 133 |
IL1R2 | 38 | 内含子1b 5377~5394 | gtgaaacatggttatttgac (A)15-18 gatagaattctaactcaaat | 134 |
IL1R2 | 39 | 内含子7 1249~1435 | caatcataattaagtgaatg (A)7-8 aactcagggaatattcagaa | 135 |
IL2R | 1 | 5′侧翼区 -606 | ccactttttgcatgatcctt T/C aagagaaagaaatctggaag | 136 |
IL2R | 2 | 内含子1 7909 | tttaacacgggagatgaaac T/C gctgctgaatggctcccatt | 137 |
IL2R | 3 | 内含子1 9486 | ctggagtcgtgtacatggac C/T gtgttccatgagtagtgagc | 138 |
IL2R | 4 | 内含子1 9887 | cagtgcttttgtcctgacag A/C ccattctcccactcccacac | 139 |
IL2R | 5 | 内含子1 9964 | ccgcctgcagccctcgaccc G/A gatccaggcatcctgcttaa | 140 |
IL2R | 6 | 内含子1 10250 | gcaagaacaagctggtgcaa T/C tggactagcagcaattgagt | 141 |
IL2R | 7 | 内含子1 13993 | caagttaatctcccctgaaa G/A cacctgtcgtgatgcccttt | 142 |
IL2R | 8 | 内含子1 14031 | tttcggctgcaagagctcca G/A tcatttccattgcctcaggg | 143 |
IL2R | 9 | 内含子1 14443 | gatacagtagggtgagtgcc G/A tgtaaagaaaagggagcaaa | 144 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
IL2R | 10 | 内含子1 17118 | taactacttgtcccacaccc G/A agtaaaaagcaggatcttct | 145 |
IL2R | 11 | 内含子1 23690 | ttcaaccatggtgatttggt T/G ggcagcaatcagagaattga | 146 |
IL2R | 12 | 内含子1 26240 | ttattaaacagtaaacctca C/T ctcactatcaaagatagcct | 147 |
IL2R | 13 | 内含子1 26607 | ttcctgtgctccgtgcgtta T/C tctaatcttcactgggtaca | 148 |
IL2R | 14 | 内含子1 26742 | ctggattcacccaaggggca A/G agaatcttatctcagactcg | 149 |
IL2R | 15 | 内含子1 27547 | attccacgtcagggaagagc C/T gctggcctgcccaggctgct | 150 |
IL2R | 16 | 内含子1 27696 | agtgacgcggaaggcaaaga C/T cacctcatttcaccaagttc | 151 |
IL2R | 17 | 内含子1 28241 | gatcgtgtatttcagccaca A/C tgatggaggtgaggtggaaa | 152 |
IL2R | 18 | 内含子1 28290 | gaacaagtgggattctgccc G/A tgtctgtctaatgagcatcc | 153 |
IL2R | 19 | 内含子1 28325 | gcatccacagcaaactccaa C/T ggaagatgtgaaacacgctc | 154 |
IL2R | 20 | 内含子1 28758 | ggaagcccacctagaacttg G/A cctggcgccagtcacccact | 155 |
IL2R | 21 | 内含子1 28895 | gaacccctggctctctcagg G/C tcccattcaagtttctgggc | 156 |
IL2R | 22 | 内含子3 7 | agcgagccttccaggtgaga G/C atgaatctgtcctccagcta | 157 |
IL2R | 23 | 内含子3 12 | gccttccaggtgagagatga A/T tctgtcctccagctaactcc | 158 |
IL2R | 24 | 内含子3 409 | taagcacaagacaacgcacc G/A caaaaaaattacttgcttcc | 159 |
IL2R | 25 | 内含子4 122 | acaagacccttgatctccct G/A ggcttccattttttctcatt | 160 |
IL2R | 26 | 内含子5 52 | ggcctagtccaaaagggcag G/A ggtgaccaggagccaggctc | 161 |
IL2R | 27 | 内含子6 761 | atctggaagggctgtacccc G/A ggcctctgccaggggtcaag | 162 |
IL2R | 28 | 内含子6 958 | gaaaacccgacctctttcag G/A agatgttaatgtgcttctca | 163 |
IL2R | 29 | 内含子6 968 | cctctttcaggagatgttaa T/G gtgcttctcatcatcttcat | 164 |
IL2R | 30 | 内含子7 3049 | cagggcctccctgacccctg C/T cagcatccactctggccaac | 165 |
IL2R | 31 | 内含子7 3267 | agtgcaaatgataagccccc T/C agggttattgtagcaggaat | 166 |
IL2R | 32 | 3′非翻译区 1946 | ggaaggaaagaaagaaggaa G/A tgaagagggagaagggatgg | 167 |
IL2R | 33 | 3′非翻译区 1985 | ggaggtcacactggtagaac G/A taaccacggaaaagagcgca | 168 |
IL2R | 34 | 内含子1 11233 | acccccagagcagcttgggg G/Δ catctttagagaaagcggca | 169 |
IL2R | 35 | 内含子1 11481 | cctctgaggcgtgagggggg G/Δ cgcgttttctcccctgggaa | 170 |
IL2R | 36 | 内含子1 13053~13066 | aagcaaaacaaacaattacc (A)12-14/Δ gttggaggggtgtttcagaa | 171 |
IL2R | 37 | 内含子1 29574~29575 | catataagtggaatcctcct (T) gttattactgtgcaagactt | 172 |
IL2R | 37 | 内含子1 29574~29575 | catataagtggaatcctcct gttattactgtgcaagactt | 173 |
IL2R | 38 | 内含子3 1590~1591 | caaaacacaagttcagtcgt (T) gatgttcaaggtgccacatg | 174 |
IL2R | 38 | 内含子3 1590~1591 | caaaacacaagttcagtcgt gatgttcaaggtgccacatg | 175 |
IL2R | 39 | 内含子4 160 | attctgagaaaaaaaaaaaa A/Δ tttaaatagaccagatcaga | 176 |
IL2R | 40 | 内含子5 102 | ggcggaggtgacctgtaggg G/Δ agaagcccacagcagcctcc | 177 |
IL2R | 41 | 内含子6 1219 | cctccgccttgctctttggg G/Δ atgtcctcagcctgccctgt | 178 |
HER2 | 1 | 内含子1 5529 | cctgaatctgcatgtagcct G/A tgggaggcggagcagtgacc | 179 |
HER2 | 2 | 内含子9 14 | ttgatgggtaagagtgggca C/T gatgacctgagacagtgtca | 180 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
HER2 | 3 | 编码区 1269 | gacagcctgcctgacctcag C/T gtcttccagaacctgcaagt | 181 |
HER2 | 4 | 编码区 3757 | cagagtacctgggtctggac G/A tgccagtgtgaaccagaagg | 182 |
IFNAR1 | 1 | 5′侧翼区 -786 | gcatattttcacaatgcact G/T gatC/GT/Gattactgaggaattt | 183 |
IFNAR1 | 2 | 5′侧翼区 -782 | attttcacaatgcactG/Tgat C/G T/Gattactgaggaatttaatt | 184 |
IFNAR1 | 3 | 5′侧翼区 -416 | gaagagcgccgggccgcgac C/T aggagcccacccgcgccctc | 185 |
IFNAR1 | 4 | 内含子1 6161 | gcctaagctgaagtggtata C/T ggcattccagggaaacaggg | 186 |
IFNAR1 | 5 | 内含子1 6267 | aatcagtgccctggccaaac C/T gagcagctatgcatcccagg | 187 |
IFNAR1 | 6 | 内含子6 648 | gcaggaggattacttgaggc C/T aggaattgaggctgcagtgt | 188 |
IFNAR1 | 7 | 内含子9 177 | ttttagaaaatatttgtaac G/A cttaactctcaagtcggtgt | 189 |
IFNAR1 | 8 | 5′侧翼区 (-85)~(-76) | ggcgcgtgcgcggaggggcg (GT)5-14 cagaagaggcggcgcgtgcg | 190 |
IFNAR1 | 9 | 内含子10 1208~1218 | acaaacatttttattatttc (A)9-11 gtcatgatcccagagtccgc | 191 |
PGR | 1 | 内含子2 432 | tatacatatttgtacataca C/T gaacatatatcacaacatgt | 192 |
PGR | 2 | 内含子2 -266 | atactgacaccattaagaag A/T taaacagaaatctcttgcaa | 193 |
PGR | 3 | 内含子4 9145 | aagtgtatgaagagaagagc C/T ttcttttttgctacctacct | 194 |
PGR | 4 | 内含子5 535 | aagtatataactcacactta T/C ataagtctttacagttttta | 195 |
PGR | 5 | 内含子2 730~731 | tcagatttacttgcatagtg (TG) tttcagattttaactttcaa | 196 |
PGR | 5 | 内含子2 730~731 | tcagatttacttgcatagtg tttcagattttaactttcaa | 197 |
PGR | 6 | 内含子2 -5123 | tgaactcccctatttatcat T/Δ atgccatgtaacctgtttgt | 198 |
PGR | 7 | 内含子4 2238~2254 | acttgcttatttacagtgag (AC)7-8 gcacacacacacaatataaa | 199 |
ACTH | 1 | 5′侧翼区 -3123 | gaacccagagctcaggagca C/T agtcctacactggctctctc | 200 |
ACTH | 2 | 5′侧翼区 -2842 | gtagcattaactcccttcct A/G aaccacaagtggtgtctaca | 201 |
ACTH | 3 | 5′侧翼区 -1089 | ggttgagtgagtgaatgcat C/G tggagaattaggtggtgccc | 202 |
ACTH | 4 | 5′非翻译区 -1211 | actggtgcactgccgcagtc C/T gccttcaccccagagacaca | 203 |
ACTH | 5 | 5′非翻译区 -807 | ggcaaagaataatctttgct A/G tcatctctcggctcaaaatt | 204 |
ACTH | 6 | 5′非翻译区 -601 | ctgtcatcagaataacatac G/A tgttacccatagggtaattt | 205 |
ACTH | 7 | 5′非翻译区 -524 | aatgtccattccacactcta T/C atccacgtgtatgcattatt | 206 |
ACTH | 8 | 5′非翻译区 -194 | gggaatagagtttctttaag C/T gagtgtggctggtttttatt | 207 |
ACTH | 9 | 3′非翻译区 952 | cgttgccaagtgccagaata G/A tgtaacattccaacaaatgc | 208 |
ACTH | 10 | 3′非翻译区 1005 | ctggccttccttccctaatg G/A atgcaaggatgatcccacca | 209 |
ACTH | 11 | 3′非翻译区 1012 | tccttccctaatggatgcaa G/C gatgatcccaccagctagtg | 210 |
ACTH | 12 | 3′非翻译区 1509 | gttagtctgatgtattgatg C/T cacctcagtttcagaaagta | 211 |
ACTH | 13 | 3′非翻译区 1579 | acgagcttcgagtttccaat G/A ataaatggaccttctctgtt | 212 |
ACTH | 14 | 3′非翻译区 1774 | actatttgaagaagctgtaa C/T caaactatgtgtgttacaat | 213 |
ACTH | 15 | 3′非翻译区 1991 | aaaaccaaaccaaagcagac A/T tcaagcaatggtgctgttat | 214 |
ACTH | 16 | 3′非翻译区 2777 | aatgtataacatattttatg T/C gattaaagtgcgtattctca | 215 |
ACTH | 17 | 3′非翻译区 2788 | tattttatgtgattaaagtg C/T gtattctcaataagaggtaa | 216 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
ACTH | 18 | 3′侧翼区 160 | actgcctttgatttgttgca G/T ttaatctaagaaacaaaatg | 217 |
ACTH | 19 | 3′侧翼区 416 | gtgtgaggaagatcaacaag C/G ttcagacttttcccatgagg | 218 |
ACTH | 20 | 5′侧翼区 -2838 | cattaactcccttcctaaac C/Δ acaagtggtgtctacaggtc | 219 |
ACTH | 21 | 3′非翻译区 1787~1788 | gctgtaaccaaactatgtgt (TT) gttacaatgtagaagtacaa | 220 |
ACTH | 21 | 3′非翻译区 1787~1788 | gctgtaaccaaactatgtgt gttacaatgtagaagtacaa | 221 |
ACTH | 22 | 3′非翻译区 1863 | gagagagacagagacagaca (GA)3-30(GT)3-30 attttccccatgcttttgga | 222 |
ICAM1 | 1 | 内含子2 39 | agggctggactaggcagacc C/G ggtgggagagacgtgcaggg | 223 |
ICAM1 | 2 | 编码区 1095 | aaggccaccccagaggacaa C/T gggcgcagcttctcctgctc | 224 |
ICAM1 | 3 | 3′非翻译区 1972 | gcctattgggtatgctgagg C/T cccacagacttacagaagaa | 225 |
ICAM1 | 4 | 3′非翻译区 2707 | tgtgtagacaagctctcgct C/T tgtcacccaggctggagtgc | 226 |
ICAM1 | 5 | 3′非翻译区 2859 | atttgatttttttttttttt C/T cagagacggggtctC/Tgcaac | 227 |
ICAM1 | 6 | 3′侧翼区 112 | aaaacattgtgggttgatgg C/T cataccctgaggttctggtc | 228 |
ICAM1 | 7 | 3′侧翼区 376 | ctggctctctggcgcggggc C/T ccttagtccgggctttttgc | 229 |
ICAM1 | 8 | 3′侧翼区 541 | tccgggacctcagtgccctt C/A tgggtgcgcatgagcccgga | 230 |
ICAM1 | 9 | 3′非翻译区 2845~2858 | accacacctggcaaatttga (T)12-14 C/TcagagacggggtctC/Tgcaa | 231 |
VCAM1 | 1 | 内含子2 912 | cttaattgattctgcaacaa A/G ccgcatgtgttgctcaagct | 232 |
VCAM1 | 2 | 内含子2 1014 | tgtctgtgcagcctcccgag C/T tccttgaaagcttcccttat | 233 |
VCAM1 | 3 | 内含子4 2547 | ctcaagtgaccaggaaagat A/G ttatactaataaaagtgtgt | 234 |
VCAM1 | 4 | 内含子5 721 | agttatttttttttgagggg G/T tcactctgccttgttttatt | 235 |
VCAM1 | 5 | 内含子5 1495 | tgtgaaatatatacttacta A/T A/Gtaagatggtggaaactgat | 236 |
VCAM1 | 6 | 内含子5 1496 | gtgaaatatatacttactaA/T A/G taagatggtggaaactgatg | 237 |
VCAM1 | 7 | 内含子7 468 | attatgagtagccatgactc C/T gtcctttggttcatcagcct | 238 |
VCAM1 | 8 | 内含子8 284 | aatgtttaaccatattttca A/G accttttcccgggaggttat | 239 |
VCAM1 | 9 | 内含子8 823 | ttggctattggagtgagcaa T/A cacttgtcaatgcagagaaa | 240 |
VCAM1 | 10 | 内含子8 1898 | aatattgatgcctatccata A/G tcatgttgatggacatccca | 241 |
VCAM1 | 11 | 内含子8 1932 | catcccattcaaatattacc T/C ttatactttgactagctcag | 242 |
VCAM1 | 12 | 内含子8 2030 | tttttcttcaataatttgaa A/G aagtgacttcacattatctg | 243 |
VCAM1 | 13 | 内含子8 2277 | cttcagctgctcttataaag T/G taagatgttaagcagtatag | 244 |
VCAM1 | 14 | 内含子8 3071 | tgttcttgttaaaaacttgt A/T ccctcccttccattttacaa | 245 |
VCAM1 | 15 | 编码区 2208 | agtcttgtagaagcacagaa G/A tcaaaagtgtagctaatgct | 246 |
VCAM1 | 16 | 3′侧翼区 46 | aaactgcctcctttagtcac A/G ttgtagctctttctgaagtg | 247 |
VCAM1 | 17 | 3′侧翼区 130 | gatactcaaaatgtgaccct T/C agactactattattaaaatt | 248 |
VCAM1 | 18 | 内含子1 393~396 | tgattccataaacttttttg GCAG/Δ tgacttcggtgctttttggc | 249 |
VCAM1 | 19 | 内含子2 102~103 | ttaaaatggatattcatgta CA/Δ gattcttggctaaagaacat | 250 |
VCAM1 | 20 | 内含子2 561 | acacatttaggatttttttt T/Δ ggtttttttggtgccatgaa | 251 |
VCAM1 | 21 | 内含子2 570 | ggatttttttttggtttttt T/Δ ggtgccatgaagccttggtg | 252 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
VCAM1 | 22 | 内含子3 81~94 | aataaacttagcagaaaagt (A)12-15 cttgtatatagtttgtattc | 253 |
VCAM1 | 23 | 内含子5 28~38 | gttttcagaattgtttactg (T)10-12 cagttctattggaagaaaaa | 254 |
VCAM1 | 24 | 内含子5 714 | accataaagttatttttttt T/Δ gaggggG/Ttcactctgccttg | 255 |
VCAM1 | 25 | 内含子8 2864 | cattggcaagattttttttt T/Δ ctcttacgatcttatttgtg | 256 |
ITGB2 | 1 | 内含子1 793 | gtgcgattctggtcgagttg G/A ttcagctggtgaccctggcc | 257 |
ITGB2 | 2 | 内含子1 1521 | gagtgggggagtccctctgc C/T gggaagaggtccctggctac | 258 |
ITGB2 | 3 | 内含子1 2540 | gggccccccttgctgcactc G/A tgtcctgtgtcagagaaccg | 259 |
ITGB2 | 4 | 内含子1 3472 | cagctctcagcccctgcgcc G/A tgcctagaggagaggctggc | 260 |
ITGB2 | 5 | 内含子1 4976 | ccctgacccttgggaaaata C/T gcttttgcagggtcgcaggt | 261 |
ITGB2 | 6 | 内含子1 5328 | catcgtccatcacttcccgc G/A cacctccgagtcactttgat | 262 |
ITGB2 | 7 | 内含子1 5336 | atcacttcccgcgcacctcc G/A agtcactttgatgcgagtgc | 263 |
ITGB2 | 8 | 内含子1 6419 | ggggaaggatgacctcgtcc C/G cctggtcctgccccctcagc | 264 |
ITGB2 | 9 | 内含子1 6661 | gcccgcccttagatggggga T/A gtccagagctggaggatgag | 265 |
ITGB2 | 10 | 内含子1 7293 | ccagggctgctcatggagga G/C caacagtggggagaaggtgg | 266 |
ITGB2 | 11 | 内含子1 7668 | acctgggggagtcctgaagc C/T ggctggaccctgcaccctgg | 267 |
ITGB2 | 12 | 内含子1 7983 | ccctgggggagtcctgaagc C/T ggctggaccctgcaccctgg | 268 |
ITGB2 | 13 | 内含子1 8052 | accctggggtagctccagca T/C gcacagggcctccgatcagc | 269 |
ITGB2 | 14 | 内含子1 9074 | cgtcattttgcctctggggc C/T gagggcctgtgagtgaccac | 270 |
ITGB2 | 15 | 编码区 117 | tgccgggaatgcatcgagtc G/A gggcccggctgcacctggtg | 271 |
ITGB2 | 16 | 内含子3 16 | agctggtaagtgcctcctgg A/G cccctccccacctgcccagc | 272 |
ITGB2 | 17 | 内含子3 3173 | gtggccccctcctgacccct G/T actccccctccccagaactt | 273 |
ITGB2 | 18 | 内含子5 7 | gtccggccgcattggtgagg C/T ccaggcactgcaggacaaaa | 274 |
ITGB2 | 19 | 内含子6 181 | aggaaagggcaggaggaagg G/A agggtgaccacgagggctcg | 275 |
ITGB2 | 20 | 内含子6 200 | ggagggtgaccacgagggct C/T gaaaatcatgcgctgatttc | 276 |
ITGB2 | 21 | 内含子6 919 | gggggacccacaccagcctc C/T gggccaccccaccagctctg | 277 |
ITGB2 | 22 | 编码区 849 | gccatcctgacccccaacga C/T ggccgctgtcacctggagga | 278 |
ITGB2 | 23 | 内含子7 39 | cacccaggcaccgcctggca G/A gacaccactgacggaggaga | 279 |
ITGB2 | 24 | 内含子7 270 | ggtctccagccccactgccc G/C cctacctgggctgacagctg | 280 |
ITGB2 | 25 | 内含子7 312 | tgtggaggtatagtaaccgc C/T cccaggctacggctgcaccc | 281 |
ITGB2 | 26 | 编码区 906 | tcctctctccaggactaccc A/G tcggtgggccagctggcgca | 282 |
ITGB2 | 27 | 内含子8 379 | agataaaattacacaaaaac G/T ttcacaagcttggagtgcgg | 283 |
ITGB2 | 28 | 内含子8 1856 | ccagctacaagctcaacctc G/A tggtgtgttggggccgacag | 284 |
ITGB2 | 29 | 内含子8 2342 | cacacgtgccacgccccctc C/T gagtgtgtttctgcaccaag | 285 |
ITGB2 | 30 | 内含子10 178 | ggcacacaggcatcagaggc T/A gtctgggagcaggcagcatc | 286 |
ITGB2 | 31 | 内含子10 179 | gcacacaggcatcagaggct G/A tctgggagcaggcagcatcc | 287 |
ITGB2 | 32 | 内含子10 333 | gtgagagggtgctgggaggg T/C tcttcacacacgccttggcc | 288 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
ITGB2 | 33 | 内含子10 1253 | gccggctgactttggctctc G/A gatctgagcatcagctcttc | 289 |
ITGB2 | 34 | 内含子11 954 | gactgtaggggtgactcagt C/T ggaacacttggcaggtgtcg | 290 |
ITGB2 | 35 | 内含子11 1055 | aggagagcccgtggcagtgc C/A gtctctgaggatgcctcagg | 291 |
ITGB2 | 36 | 内含子13 193 | ccctcctgtgcgcacctgcc G/A cgggccctgggatcaggctt | 292 |
ITGB2 | 37 | 内含子14 860 | ctctgagcctgtaggtgaca T/C gcctggagctcacaacccac | 293 |
ITGB2 | 38 | 内含子15 57 | cacgtgcgtcccacactatg C/T gacctcctgctgcgggaggc | 294 |
ITGB2 | 39 | 内含子7 272 | tctccagccccactgccccc C/Δ tacctgggctgacagctgct | 295 |
ITGB2 | 40 | 内含子7 759~760 | ctccgccgggagccacagac AG/Δ gggagggacggccctcgggt | 296 |
ITGB2 | 41 | 内含子10 384~385 | tactcatcaacctggagccc (C) aaatccctgggtcaggccac | 297 |
ITGB2 | 41 | 内含子10 384~385 | tactcatcaacctggagccc aaatccctgggtcaggccac | 298 |
ITGB2 | 42 | 编码区 1325~1328 | catagtgaccgtgcaggttc TTCC/Δ ccagtgtgagtgccggtgcc | 299 |
ITGB2 | 43 | 内含子13 340 | gcccccgttgccggagcccc C/Δ gcacaccctggcaccgatgc | 300 |
PTGDR | 1 | 5′侧翼区 -1933 | agttaaagatataaaatcac G/A cttatcacaattaactccct | 301 |
PTGDR | 2 | 5′侧翼区 -1766 | aactgcagttaaacatcagc T/C accaaaacacccttctatca | 302 |
PTGDR | 3 | 5′侧翼区 -1525 | ctgctaaccatgcccttccc C/T ccagctctctacagtcaatg | 303 |
PTGDR | 4 | 5′侧翼区 -1257 | accgtgaatgccccaaattg C/T gctgatctagtagagaagag | 304 |
PTGDR | 5 | 5′侧翼区 -1085 | cagttcaaacaccagcacca C/T tgccctcctctcaggtggct | 305 |
PTGDR | 6 | 5′侧翼区 -69 | cagatggtccacgaggaggg C/T tcgctgtcggtgctggggta | 306 |
PTGDR | 7 | 内含子1 5041 | tgggaaaaatgcatcttctc C/T aggagatgctctctgattgc | 307 |
PTGDR | 8 | 内含子1 5553 | atatttccaatctcttcaca T/C tgattaaaagcttccattct | 308 |
PTGDR | 9 | 内含子1 5592 | ctattggtgtctccatacat G/A tgacatttcacaggtgtgac | 309 |
PTGDR | 10 | 3′侧翼区 410 | attgattttatatcattgcc G/A atgtttagttcatttctttg | 310 |
PTGDR | 11 | 3′侧翼区 439 | ttcatttctttgccaattga T/C ctaagcatagcctgaattat | 311 |
PTGDR | 12 | 3′侧翼区 903 | caggacttagcctcagttga C/T gatagtaacaatggccttaa | 312 |
PTGDR | 13 | 内含子1 777~779 | gcgatggaaatgaaattatc TCC/Δ tcattttgaaggcatttgtt | 313 |
PTGDR | 14 | 内含子1 5416~5426 | tgccttctagattgaacaag (A)10-11 ggatgtcaaccatgaaaaag | 314 |
PTGDR | 15 | 内含子1 5515~5519 | gtatttttttccaagtcatc TCAGG/Δ tcttttcattgtcatatttc | 315 |
PTGDR | 16 | 3′侧翼区 252~263 | atttgtgcttggtggcccta (T)11-12 agagaggccttgagacatac | 316 |
PTGER1 | 1 | 5′侧翼区 -1852 | ggaaggggcgctgggccaga A/G ggccccacaggaatgcttgg | 317 |
PTGER1 | 2 | 5′侧翼区 -1626 | cgggcacctgtgggctcctc A/G ggtgtctG/Ctgctgggagccg | 318 |
PTGER1 | 3 | 5′侧翼区 -1618 | tgtgggctcctcA/Gggtgtct G/C tgctgggagccgcttgcggt | 319 |
PTGER1 | 4 | 5′侧翼区 -1272 | ggggtgttgctgtttcctgg G/A tgggggtgctggctaggtct | 320 |
PTGER1 | 5 | 5′侧翼区 -1159 | ctaggtctctggtgtccagc G/A gcggggggtgtcacttcttg | 321 |
PTGER1 | 6 | 5′侧翼区 -1072 | tgaggggtcattgaaagtca A/T acagagtgtggtcaggggca | 322 |
PTGER1 | 7 | 5′侧翼区 -1017 | gagtgtgtgtgcgtgtgtgt A/G tctctcggggtgccaagtga | 323 |
PTGER1 | 8 | 5′侧翼区 -849 | cctgagttcagggatgtggc G/A gcagcaacctggctgtgctg | 324 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
PTGER1 | 9 | 5′侧翼区 -762 | tcttagggtgtgaggctgtg C/A cagtgtgaccctacttctca | 325 |
PTGER1 | 10 | 5′侧翼区 -730 | tacttctcagggcaggaggc G/A agtctttgtgtcttaggacg | 326 |
PTGER1 | 11 | 内含子1 328 | gagagaccgcagtggagcag A/G ggcaggtccatggggcaggg | 327 |
PTGER1 | 12 | 内含子1 634 | tggcagagatgcctgagggc G/A gggctggggggaatcttgca | 328 |
PTGER1 | 13 | 3′侧翼区 242 | ggggctccgctgggagcaga G/C acagagggtgtgtggggcgt | 329 |
PTGER1 | 14 | 5′侧翼区 (-1654)~(-1653) | ccgcagtcctggtgactcag GG/Δ catccccgggcacctgtggg | 330 |
PTGER1 | 15 | 5′侧翼区 (-1016)~(-1015) | gtgtgtgtgcgtgtgtgtA/Gt (TG) ctctcggggtgccaagtgag | 331 |
PTGER1 | 15 | 5′侧翼区 (-1016)~(-1015) | gtgtgtgtgcgtgtgtgtA/Gt ctctcggggtgccaagtgag | 332 |
PTGER1 | 16 | 内含子2 394~401 | tgtttgtttctttgcccccc (T)7-8 ccgcatccgtttctcatC/Gtg | 333 |
PTGER2 | 1 | 5′侧翼区 -1386 | tgcttgttctagtgggaacc C/A ccccC/Acccaactccgcattc | 334 |
PTGER2 | 2 | 5′侧翼区 -1391 | gttctagtgggaaccA/Ccccc A/C cccaactccgcattccaatc | 335 |
PTGER2 | 3 | 5′侧翼区 -361 | accccgaggaagcgagaaac G/A ccgctcccgccggtcgcggg | 336 |
PTGER2 | 4 | 内含子1 1032 | gagaatgtgctggcctctta C/T gggggctaggaattgggagt | 337 |
PTGER2 | 5 | 内含子1 3529 | aacttttgcattaacccatt A/G tcttcacaG/Acaccgtaggaa | 338 |
PTGER2 | 6 | 内含子1 3538 | attaacccattA/Gtcttcaca G/A caccgtaggaaatagtatga | 339 |
PTGER2 | 7 | 内含子1 4107 | attctgcatggaaccaacaa C/T atattccaaactgtttattc | 340 |
PTGER2 | 8 | 3′侧翼区 748 | caccccaccttacT/Cgccccc C/T taaaatcccagaataatgcc | 341 |
PTGER2 | 9 | 3′侧翼区 1517 | caaagtgggttggacccatg A/G caacccagagcaagacC/Tgaa | 342 |
PTGER2 | 10 | 3′侧翼区 1628 | tcgagacctctgcaagcatc C/T ctcaaagtgcactgatgctg | 343 |
PTGER2 | 11 | 5′侧翼区 (-1390)~(-1383) | gcttgttctagtgggaacca (C)6-9 aactccgcattccaatcccc | 344 |
PTGER2 | 12 | 内含子1 2254 | caatttcctgtttatggctt A/Δ gggggagccagatggagact | 345 |
PTGER2 | 13 | 内含子1 5872~5880 | aataatctccccccaaaatg (T)9-10 aaagaatgaattaggcaaag | 346 |
PTGER2 | 14 | 内含子1 9877 | gaattgcttcatcctctaca A/Δ ccaattttcacttctcatta | 347 |
PTGER2 | 15 | 内含子1 10732 | attattccattccttccaac C/Δ tgcccaaacatttatgttgc | 348 |
PTGER2 | 16 | 3′非翻译区 1842~1845 | attctcattaatactcttta TTTA/Δ tcctatttctgggggaggat | 349 |
PTGER2 | 17 | 3′侧翼区 301~312 | ttattggatagccactcctt (A)12-14 gagatgcttgttttctccaa | 350 |
PTGER3 | 1 | 5′侧翼区 -1478 | agacaacagcacataaagta T/A gcagagggacatatcccatt | 351 |
PTGER3 | 2 | 内含子1+3257 | ccaacagctacaagttcaca C/T tacataaatacttaaataga | 352 |
PTGER3 | 3 | 内含子1+3402 | tatgtcaccatgatagatga C/T ctacagtttttagttactgc | 353 |
PTGER3 | 4 | 内含子1+3762 | caaacagtttctcatcatca A/G tcttggaactggataaaagc | 354 |
PTGER3 | 5 | 内含子1+7686 | tcttcctgttatcctatatg T/G gcacaaacctattctcaatg | 355 |
PTGER3 | 6 | 内含子1+16011 | tcacttgtctgacagtaact T/C gttaaatgattccattcacc | 356 |
PTGER3 | 7 | 内含子1+17665 | actttttcacttgttgagta A/G gcaacttgctttaaggccac | 357 |
PTGER3 | 8 | 内含子1+17999 | caagaaaacagttgctctaa T/C gcctggtgtttaaagacgga | 358 |
PTGER3 | 9 | 内含子1+18069 | cctggggataacaattaaac A/C tgaggaatttcggcgacaat | 359 |
PTGER3 | 10 | 内含子1+20439 | ggtcagggactgtgagtatt A/G ctcagttcctatttacagtc | 360 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
PTGER3 | 11 | 内含子1+20474 | acagtcaacaggacaagagt T/A agctgtaaagaaagctggtt | 361 |
PTGER3 | 12 | 内含子1+20594 | tgagtacaagcctaacctgg G/A gagggaattttgcaagtgct | 362 |
PTGER3 | 13 | 内含子1+20649 | ctgatgtgttatctcagatt C/T tggggggtattttaaatatt | 363 |
PTGER3 | 14 | 内含子1+20653 | tgtgttatctcagattctgg G/A gggtattttaaatatttatt | 364 |
PTGER3 | 15 | 内含子1+20875 | tttaacccacaattttactg C/T ttggctcttgtgaagggaaa | 365 |
PTGER3 | 16 | 内含子1+20907 | gaagggaaaaagttgcaacc A/C aatatttctggtgactttct | 366 |
PTGER3 | 17 | 内含子1+20991 | caactcactcacctcacagg C/T aagcatagtctcttatagta | 367 |
PTGER3 | 18 | 内含子1+21184 | taagtattagaaatttgatg A/G tatcctcattaaagactgtg | 368 |
PTGER3 | 19 | 内含子1+24229 | tgcattgtgtacccactatg T/G cacaggaagggattcttttg | 369 |
PTGER3 | 20 | 内含子1+24355 | gatcaagctaaatgttttga A/T catacagagtgtcagactgc | 370 |
PTGER3 | 21 | 内含子1+24579 | tgtaaagaatttggggaaaa C/A atacagagaagaaaatagat | 371 |
PTGER3 | 22 | 内含子1+24879 | ctaggtttttctaactttct A/C tttttatattgaggtgacta | 372 |
PTGER3 | 23 | 内含子1+28007 | tgtgaattttcctgatcaca A/G aaagttagagaaatccaatt | 373 |
PTGER3 | 24 | 内含子1+31425 | gatgcctgctagtattgtct A/G tctgtctatctactacaaat | 374 |
PTGER3 | 25 | 内含子1+31566 | agtctcagaagtagaaatga T/C gaggattaaaagtgttgcag | 375 |
PTGER3 | 26 | 内含子1+31770 | gttcgatggacaatgggaag A/G cattgatgattttctagttg | 376 |
PTGER3 | 27 | 内含子1+34150 | tacagtgtagaggagatgca T/C atgaccttactaatctttga | 377 |
PTGER3 | 28 | 编码区+956 | tgagcactgcaagacacaca C/T ggagaagcagaaagaatgca | 378 |
PTGER3 | 29 | 内含子2+5145 | agtctatctatagacctctt C/T ggcatttatgcccataggtt | 379 |
PTGER3 | 30 | 内含子2+5599 | ataatgtagctatttaaaaa A/T tcaataaaaatgtcatctac | 380 |
PTGER3 | 31 | 内含子2+10157 | aaatatggtacttatccacc A/G tcatcataataagcaccatc | 381 |
PTGER3 | 32 | 内含子2+11215 | attggaattggtgtaaaaga C/G aaagatttgtctgaatatag | 382 |
PTGER3 | 33 | 内含子2+11437 | ttaaaaagagctacagcaat T/C actttccaataattaaatca | 383 |
PTGER3 | 34 | 内含子2+15654 | agggtgtcataagctctatc G/A cacagacatattcacccatg | 384 |
PTGER3 | 35 | 内含子2+15655 | gggtgtcataagctctatcg C/T acagacatattcacccatgt | 385 |
PTGER3 | 36 | 内含子2+19655 | agtgcttctcccagtgaaac A/G taagtgagcaccaaaatgat | 386 |
PTGER3 | 37 | 内含子2+20814 | aaggttttgcctgaagatca C/T agttactatgttattaagaa | 387 |
PTGER3 | 38 | 内含子2+21153 | tgtcttacacatgaaagata T/C gtaatcaatgagtgctaaat | 388 |
PTGER3 | 39 | 内含子2+21709 | atacaacaaaacataactta T/C acgttttgtcagacttaatt | 389 |
PTGER3 | 40 | 内含子2+22136 | gtagaagagtaggagatggg T/C tcttgatcttgcggttgaag | 390 |
PTGER3 | 41 | 内含子2+30625 | attttatgtcacgaacaata T/C aaaatttagttctaccctta | 391 |
PTGER3 | 42 | 内含子2+31570 | agtgtaggtgagcagaaaga A/C ctattaatgacatgatggaa | 392 |
PTGER3 | 43 | 内含子2+31622 | ccctgtggtacagctgggtc A/G ttctggaaggaatctcgtag | 393 |
PTGER3 | 44 | 内含子2+31639 | gtcattctggaaggaatctc G/A tagacaaactagcatagtgt | 394 |
PTGER3 | 45 | 内含子2+33612 | tatgaggaattcattttatt G/C tgtctttttcttataagaca | 395 |
PTGER3 | 46 | 内含子2+34542 | aaaacatccatattgatcat A/C gccaatgtgactttgatatg | 396 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
PTGER3 | 47 | 内含子3+390 | atggctagcacactctcagt C/T gcatttttgattagatctat | 397 |
PTGER3 | 48 | 内含子4+2603 | aagaaatgaactgctgccta C/T tccagcccccattgtattgc | 398 |
PTGER3 | 49 | 内含子4+3159 | cgcttatcattatattttta G/A ttatgactacagaagtgttt | 399 |
PTGER3 | 50 | 内含子4+3433 | cacctacagagaacctatag A/G gcctagcagagtcagtacta | 400 |
PTGER3 | 51 | 内含子4+14314 | ttcatcactgtatttgtgta C/T tcatgccccactttttaaag | 401 |
PTGER3 | 52 | 内含子5+207 | acaaatccccaagtcttagc A/G tttaaaaatgacaaaaggtc | 402 |
PTGER3 | 53 | 3′非翻译区+1501 | gtaagaatagcacatggttc A/C gaattgccaagactgctgct | 403 |
PTGER3 | 54 | 内含子6+2207 | ccttcttcgtgtcttccttc A/G ctccttaactcctgccagta | 404 |
PTGER3 | 55 | 内含子6+7951 | aaaaattgctttgacttctc A/G caatttctcagaagttctag | 405 |
PTGER3 | 56 | 内含子6+14688 | tttcaagtacatccaaattc C/G aaattctcaggatcttcttc | 406 |
PTGER3 | 57 | 内含子6+16591 | atatatatatatatatatat T/A tatatttgtatccttagtac | 407 |
PTGER3 | 58 | 内含子6+23063 | taggaaaagtgcggaatcaa A/T acacagctgtatttattcgt | 408 |
PTGER3 | 59 | 内含子6+32319 | ggcaagatatcttaccttag G/A ctagcggaactcaatacttt | 409 |
PTGER3 | 60 | 内含子6+33012 | agaactggcaaaattattac T/C ttttcatcatttcaaaactc | 410 |
PTGER3 | 61 | 内含子6+33272 | tctacttcttactacaaact G/A gaacctctatttgtatctct | 411 |
PTGER3 | 62 | 内含子6+40302 | tgatttttttctttgatcat A/G atggtgaatatttgggatca | 412 |
PTGER3 | 63 | 内含子6+40328 | gaatatttgggatcacgaaa G/C tacaaaaaattttacaggtc | 413 |
PTGER3 | 64 | 内含子6+40427 | tgtgctgaaagtgaaaaatg A/G ttataaacatttatcatctg | 414 |
PTGER3 | 65 | 内含子6+40916 | gacatttttgttttccaatc G/T aaaaactggagcacatgttt | 415 |
PTGER3 | 66 | 内含子6+49588 | tccgttgtactttcctaccc T/C gtgcaattcctttgatgcct | 416 |
PTGER3 | 67 | 内含子6+49671 | tgtgaagtatttctaatcat T/C aagaaagactgctctctctt | 417 |
PTGER3 | 68 | 内含子6+50579 | aaagcttttccttttgaagc G/A aacacctgtctcagaatctc | 418 |
PTGER3 | 69 | 内含子6+50944 | tcacaattcctgttcttcat A/G tccaacctccacataacagc | 419 |
PTGER3 | 70 | 内含子6+54203 | actaaatacacactattaag G/C taaaaaatatccatagagac | 420 |
PTGER3 | 71 | 内含子6+54225 | aaaaaatatccatagagacc T/C tctttccaattacccactcc | 421 |
PTGER3 | 72 | 内含子6+54253 | aattacccactccccaaccc T/G cacttttttttttaaatcag | 422 |
PTGER3 | 73 | 内含子6+54298 | gaccacatgttcaaatacat T/C aagtgatatgttcaaataga | 423 |
PTGER3 | 74 | 内含子6+54716 | caggcagcttgatagaatgg C/A aacagcagacacgtgggagt | 424 |
PTGER3 | 75 | 内含子6+54974 | taaatgagtgaatggattgc C/T ggttagattttcttcaagct | 425 |
PTGER3 | 76 | 内含子6+55123 | ctgggaggacaaaggaaagg G/A gaacggggtctcaagatcgc | 426 |
PTGER3 | 77 | 内含子6+55365 | tccgcatttagagtatcaag C/A catattgtgggatattttct | 427 |
PTGER3 | 78 | 内含子6+55480 | cagtcctggaggaacactaa C/T gcctagtcaaaaaattagaa | 428 |
PTGER3 | 79 | 内含子6+56279 | gagtagctggaatcttacac C/A agacaacatgcacatatgca | 429 |
PTGER3 | 80 | 内含子6+56626 | gtttctgtgaaacagaaact T/C gtttttgtgaaatctcacat | 430 |
PTGER3 | 81 | 内含子6+57032 | acacaaagagtgtggactat C/T acttgtcaaatattttgaga | 431 |
PTGER3 | 82 | 内含子6+57280 | tgaatcatcaaacagcccac C/T actcagtgagatgtcaagag | 432 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
PTGER3 | 83 | 内含子6+57329 | tgagagaaaactaagggaat G/A ctaagaaagtcatgctgtag | 433 |
PTGER3 | 84 | 内含子6+57372 | gaagagattggattttggtg T/G cagatataggtggtttaacc | 434 |
PTGER3 | 85 | 内含子6+57484 | tcctatacaatggaattaac G/A tctactccttaagactgtta | 435 |
PTGER3 | 86 | 内含子6+57610 | tttgcctaaaggtgaggctt G/A atcaaattccacaggaattg | 436 |
PTGER3 | 87 | 内含子6+57802 | ctgaaatataataaactatc C/T aaggtcatgtagaaaactag | 437 |
PTGER3 | 88 | 内含子6+60265 | ttcaacattaactcagccct G/C ttgtggatttcccctttcag | 438 |
PTGER3 | 89 | 内含子6+60515 | actaagattacaagaaagtc C/A atgctatttttataattgtt | 439 |
PTGER3 | 90 | 内含子6+64293 | gttattgcttcattgctttc T/C ggtcaggaacaaacacatat | 440 |
PTGER3 | 91 | 内含子6+64294 | ttattgcttcattgctttct G/A gtcaggaacaaacacatatg | 441 |
PTGER3 | 92 | 内含子6+64589 | aatgcaccacagagaaaata G/C caagaatttgaaatttatat | 442 |
PTGER3 | 93 | 内含子6+64593 | caccacagagaaaatagcaa G/T aatttgaaatttatatacag | 443 |
PTGER3 | 94 | 内含子6+64610 | caagaatttgaaatttatat A/G cagagaaaaattatttagag | 444 |
PTGER3 | 95 | 内含子6+64817 | ggggaggcaggaatgttacc G/A acaggacaaattacacacat | 445 |
PTGER3 | 96 | 内含子6+64877 | agaactgtaataagcataac T/C agcaacatgcagaaaatcag | 446 |
PTGER3 | 97 | 内含子6+64992 | gaaaagtgccaggaaggaat G/A tatttactaaattatccact | 447 |
PTGER3 | 98 | 内含子6+69776 | taagattgatctatcctcat T/C tcattggacagggctcacta | 448 |
PTGER3 | 99 | 内含子6+69938 | accaggtggacaatgcctgt T/C agagcttccagccgaacagt | 449 |
PTGER3 | 100 | 内含子6+70308 | tggaaacacccagatggcag G/A gtgggcaattccacctaccc | 450 |
PTGER3 | 101 | 内含子6+77002 | agtaacctgtcaaaccccag G/A gaggttgatcacacccttca | 451 |
PTGER3 | 102 | 内含子6+77882 | aggaagataacccatggcaa C/G acgcaattgagtcaatattt | 452 |
PTGER3 | 103 | 内含子6+77979 | aattctctccggtcctgaag G/T gtggggaagctcaggtctgc | 453 |
PTGER3 | 104 | 内含子6+78043 | gtgtgagtacatgcagttct G/A cactgagctctgcttgctgc | 454 |
PTGER3 | 105 | 内含子6+78044 | tgtgagtacatgcagttctg C/A actgagctctgcttgctgca | 455 |
PTGER3 | 106 | 内含子6+79523 | gacttcaactgaattctcta C/T cactctagcaaaatagacta | 456 |
PTGER3 | 107 | 内含子6+80422 | ttgaaaattgaatgacccta G/A atatggatttagtagttgta | 457 |
PTGER3 | 108 | 内含子6+82760 | gatgaaactttggacttaga C/T tttagacttggaacttttga | 458 |
PTGER3 | 109 | 编码区+1113 | tccccaatgtaggagatggg G/T cctgatggaaggtgtttttg | 459 |
PTGER3 | 110 | 内含子7+492 | tctgatgatgattggaactc A/G tgcatgagtttccactaatg | 460 |
PTGER3 | 111 | 内含子7+2862 | aattggcctctgaaataaga T/C taggacttcagaaggtaatt | 461 |
PTGER3 | 112 | 内含子7+3115 | gacccccaaggtgcttacag C/T gaagcattaagacgggcgtt | 462 |
PTGER3 | 113 | 内含子8+2178 | tttaaagattttttcatgat C/A tatgattttgaagagggttg | 463 |
PTGER3 | 114 | 内含子8+2970 | ctcctccttgtcttctcttc C/T gccattcatcttctaccctc | 464 |
PTGER3 | 115 | 内含子8+3112 | cttatccttccttcaaaaca C/T atcttggatatttcattcct | 465 |
PTGER3 | 116 | 内含子8+3138 | ggatatttcattccttgagc T/C ttctaagtcaaagccatgag | 466 |
PTGER3 | 117 | 内含子9+46 | accagttactattaatattt T/C tttttacttagtatgtttaa | 467 |
PTGER3 | 118 | 内含子9+525 | agaaaacaccaagtaagttt T/C atgaatgataaatattctga | 468 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
PTGER3 | 119 | 内含子9+626 | taatggaaccatgaagattc T/C cattgcatccactcacattt | 469 |
PTGER3 | 120 | 内含子9+896 | gtgttgatgggtggtcaaca T/C ttacaggttgtgctgattat | 470 |
PTGER3 | 121 | 内含子9+1143 | gctattcctgtaacatattt G/C ctttataatacgttatccct | 471 |
PTGER3 | 122 | 内含子9+2689 | aatcactagcctgtgttttc G/A cccgttatgtcaaagcattt | 472 |
PTGER3 | 123 | 3′非翻译区+1603 | gtcctattgttttgtgaatt T/C atatttgcgtatacattatc | 473 |
PTGER3 | 124 | 3′非翻译区+1624 | atatttgcgtatacattatc A/G tatgtaaaatttgcattttt | 474 |
PTGER3 | 125 | 3′非翻译区+1735 | gctatagagtattccataat T/A tgaataaagcataatttgtt | 475 |
PTGER3 | 126 | 内含子10+1264 | ctagctctatctctacctat T/C tctatctctatctcgatctc | 476 |
PTGER3 | 127 | 内含子10+1281 | tatttctatctctatctcga T/G ctctatatctatctcgatct | 477 |
PTGER3 | 128 | 内含子1+21135~21138 | gtgctagaatcatatataac ACTT/Δ acagtaataaaaggactttt | 478 |
PTGER3 | 129 | 内含子1+24357~24358 | caagctaaatgttttgaaca (CA) tacagagtgtcagactgctt | 479 |
PTGER3 | 129 | 内含子1+24357~24358 | caagctaaatgttttgaaca tacagagtgtcagactgctt | 480 |
PTGER3 | 130 | 内含子1+26410~26416 | aatggcacaaattctactaa (T)7-8 aatgtttatgagctgtttat | 481 |
PTGER3 | 131 | 内含子2+28977 | cttatgaaacctcaactccc C/Δ tcaattactttaatatttcc | 482 |
PTGER3 | 132 | 内含子2+29706~29717 | gcaagtcaacttcactcagc (T)11-13 cacctataaaatagaaataa | 483 |
PTGER3 | 133 | 内含子2+32894~32905 | gcagtgcctcttactttagg (T)10-12 aatctcctgctatttgacat | 484 |
PTGER3 | 134 | 内含子2+33657 | ctgagaaatttataaaaaaa A/Δ ggaatcgtttttctgctgtg | 485 |
PTGER3 | 135 | 内含子4+14396~14407 | agtgatgcaactatttttgg (T)10-12 tgaaactttaagcatatttc | 486 |
PTGER3 | 136 | 内含子4+15935~15942 | agtagtatatttgtagtttc (T)8-9 aacggtcatgtgttttttct | 487 |
PTGER3 | 137 | 3′非翻译区+1887~1890 | ttactacaagaactttaatt AATT/Δ ctgaatctttcaggccattt | 488 |
PTGER3 | 138 | 内含子6+2270~2271 | ctttgacacatttactcttt (T) agatttgttatgtcccacat | 489 |
PTGER3 | 138 | 内含子6+2270~2271 | ctttgacacatttactcttt agatttgttatgtcccacat | 490 |
PTGER3 | 139 | 内含子6+16571~16590 | taaaaggcagaaagcagaac (AT)9-11 ttatatttgtatccttagta | 491 |
PTGER3 | 140 | 内含子6+40105 | gggaaaatttcacataattt T/Δ gtaacattttgtaatgatgt | 492 |
PTGER3 | 141 | 内含子6+51356~51357 | actggtccatcatacatact (CACT) tgcaataaataatcaaatag | 493 |
PTGER3 | 141 | 内含子6+51356~51357 | actggtccatcatacatact tgcaataaataatcaaatag | 494 |
PTGER3 | 142 | 内含子6+51724 | aacctctttccgctctaaat T/Δ catcatttgtatattaatat | 495 |
PTGER3 | 143 | 内含子6+53921~53923 | gatgagcaggctgtggagaa GAA/Δ tctaccaccttgatctggag | 496 |
PTGER3 | 144 | 内含子6+54266~54267 | caaccctcactttttttttt (T) aaatcagtgaggaccacatg | 497 |
PTGER3 | 144 | 内含子6+54266~54267 | caaccctcactttttttttt aaatcagtgaggaccacatg | 498 |
PTGER3 | 145 | 内含子6+60745 | caaatttttctttttttttt T/Δ cttaagatagacttttacca | 499 |
PTGER3 | 146 | 内含子6+77446 | ctgtttcaaataaaaaaaaa A/Δ cataaaatgaattattctga | 500 |
PTGER3 | 147 | 内含子6+79170 | cttaaaagagattttttttt T/Δ gtcatattagaacttcttga | 501 |
PTGER3 | 148 | 内含子8+1985~1996 | cctatccatgcttgtttcac (A)10-15 tccatttgctatatatgtga | 502 |
PTGER3 | 149 | 内含子8+2527 | ctgagactgagaaaaaaaaa A/Δ tcctcttttagcaaataaat | 503 |
PTGER3 | 150 | 内含子9+42~43 | cttaccagttactattaata (A) tttttttttacttagtatgt | 504 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
PTGER3 | 150 | 内含子9+42~43 | cttaccagttactattaata tttttttttacttagtatgt | 505 |
PTGER3 | 151 | 内含子9+603 | gaagtttttgtttttttttt T/Δ gctaatggaaccatgaagat | 506 |
PTGFR | 1 | 5′侧翼区 -325 | tgcaagctaccatccgacag T/C ctaacacaccatcttaggct | 507 |
PTGFR | 2 | 内含子1 520 | gtagcctaggcagttccact C/A gggctgggcgcaggaaaggc | 508 |
PTGFR | 3 | 内含子1 556 | aaggctggctccggaattcc C/T agcctccgggaaagctagct | 509 |
PTGFR | 4 | 内含子1 629 | aagagtggccgtggccttgt G/A tatccagtgtctgtgcctca | 510 |
PTGFR | 5 | 内含子1 938 | ttaacatcaatgaacttgct G/T gtccccttccaaagtttgga | 511 |
PTGFR | 6 | 内含子1 1356 | gataaaacccatcccaccac C/T gggtgctggggcacgtcagt | 512 |
PTGFR | 7 | 内含子2 2218 | gcaaaatttcatactcttgg T/C gtggatattttgaatgtatg | 513 |
PTGFR | 8 | 内含子2 2464 | gtgttagatgggtagtagat C/A caccacaggtA/Gttactttat | 514 |
PTGFR | 9 | 内含子2 2475 | gtagtagatC/Acaccacaggt A/G ttactttatgggctgatatt | 515 |
PTGFR | 10 | 内含子2 6558 | tatctctgagagaatcatgt T/C gggggacaagaggagaactt | 516 |
PTGFR | 11 | 内含子2 6635 | tgtcataaaatgaaagctct G/A tggtaaatatggaaatttgt | 517 |
PTGFR | 12 | 内含子2 10721 | aaatcttccaaatcccacta C/T ccagaaataactactgttag | 518 |
PTGFR | 13 | 内含子2 10761 | gtattctgggtgcatctatc T/C ttttacctagctaatgggga | 519 |
PTGFR | 14 | 内含子2 22053 | caaatctgagtttttttatt G/A gagaaattacaattctggac | 520 |
PTGFR | 15 | 内含子2 25198 | aattaaaaaaatttttttca T/C gattgattttaatatcacag | 521 |
PTGFR | 16 | 内含子2 25362 | aagtaaaagagacagagcac C/T gtagctaacctcagtgaatt | 522 |
PTGFR | 17 | 内含子2 27893 | tgttctaaatattttgacta T/C gaccattgataggacatgta | 523 |
PTGFR | 18 | 内含子2 31049 | cactggcaatacaacctgat C/G agaatttatctaccttagct | 524 |
PTGFR | 19 | 内含子2 32835 | gctaaacatgttctagtgct C/G ttgccttttgctgtatgttt | 525 |
PTGFR | 20 | 内含子2 32953 | caccatagccacagacatcc A/G ggcatcctaacattttgtcc | 526 |
PTGFR | 21 | 内含子2 33311 | attaaaagggatagaacaca A/T ctgtgctgatcgtagaatta | 527 |
PTGFR | 22 | 内含子2 35696 | tttttgctattaaaacgacg T/C tgccagT/Cggtcaaataaagt | 528 |
PTGFR | 23 | 内含子2 39361 | taaaaatattaagtaagagg T/A tatttcttgtaatgtactat | 529 |
PTGFR | 24 | 内含子2 39533 | tttctgtccagtgtattttc T/C taaagaaagattgagaaaac | 530 |
PTGFR | 25 | 内含子2 40043 | gcggtagtgccatctagcac G/A atgcctacatacagcagaca | 531 |
PTGFR | 26 | 内含子2 40570 | atacaactgtaatgtgccaa T/C gttcacaggaagagatttta | 532 |
PTGFR | 27 | 内含子2 42768 | acaatagcatcactctgtgg A/T aagtgaaatgaatgtcatct | 533 |
PTGFR | 28 | 编码区 1031 | cattaaaaattccttaaagg T/G tgctgctatttctgagtcac | 534 |
PTGFR | 29 | 3′非翻译区 2007 | cagagaacaaaagaaacaga A/G tcaatatataaaattcaaag | 535 |
PTGFR | 30 | 内含子2 347~348 | acatttgaacagattgcagt (T) aagtcttgatagaaagtcac | 536 |
PTGFR | 30 | 内含子2 347~348 | acatttgaacagattgcagt aagtcttgatagaaagtcac | 537 |
PTGFR | 31 | 内含子2 6530 | ttcataatgtattttttttt T/Δ ggtattttatctctgagaga | 538 |
PTGFR | 32 | 内含子2 7472 | aaaacatgaccttttttttt T/Δ aagaagaaagacttataaaa | 539 |
PTGFR | 33 | 内含子2 23217 | tttgtacataattttttttt T/Δ cctttgagaagtcgtttttc | 540 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
PTGFR | 34 | 内含子2 31366~31399 | cactttggacaaatgcaaga (T)21-37 actgttaatgtatttgaccc | 541 |
PTGFR | 35 | 内含子2 34754~34781 | agtaagttcagaaagttagc (A)21-28 gcacaacactcaaattgtct | 542 |
PTGFR | 36 | 内含子2 41157~41165 | gaacaaaattacatatttgg (T)8-10 caaaaatggaatcacacaat | 543 |
PTGFR | 37 | 3′非翻译区 2927~2939 | agaagtagacatcaaaaatt (A)9-13 ggaatgtgttttcattgttt | 544 |
PTGFR | 38 | 3′侧翼区 610~620 | gtgaaagaaatgggccctta (T)9-11 ccctagaggcagaaagttac | 545 |
GNA12 | 1 | 内含子1 10240 | atgcaaaaacatctttttcc G/C tcagctaactaagtccagag | 546 |
GNA12 | 2 | 内含子1 10253 | tttttccgtcagctaactaa G/A tccagagagactcctctggc | 547 |
GNA12 | 3 | 内含子1 10818 | tgtgatgggttagtctttct C/G tctgtgaggataaatgctca | 548 |
GNA12 | 4 | 内含子1 11254 | tggtggaagtgtgccaggca T/C gggtaatcaatagctactta | 549 |
GNA12 | 5 | 内含子1 20198 | aaagatcctttgacattgag T/G attgcatttttatttttcct | 550 |
GNA12 | 6 | 内含子1 29241 | aggaaaaggaaataaggaat T/C ttttggtgggagttgcggct | 551 |
GNA12 | 7 | 内含子1 32030 | tggcctgccggactgtcttt T/G cagctgtcagcagaacccct | 552 |
GNA12 | 8 | 内含子1 32463 | gccaaggctgggaaactaga G/C ttctggcagctttgttgctc | 553 |
GNA12 | 9 | 内含子1 36276 | ttttttttttttctctctta T/C accttattttaatgctcatt | 554 |
GNA12 | 10 | 内含子1 36481 | ttttcttactggaaacaaga G/A actagaaattcaaacatgtt | 555 |
GNA12 | 11 | 内含子1 36510 | ttcaaacatgtttgtgaaat T/G taagcatttttattactaat | 556 |
GNA12 | 12 | 内含子1 40521 | ccttttccaaagccctcgat C/A gtcccctttctcacacagac | 557 |
GNA12 | 13 | 内含子1 41460 | accccaccccccaccccccc A/C aaaaaaatctacatccccag | 558 |
GNA12 | 14 | 内含子1 42654 | atttctgtatttgagttgga C/T gagcagggccttcccggata | 559 |
GNA12 | 15 | 内含子1 47187 | gtagtttctcatcacaaacg A/G tggtgacgttaaatctagaa | 560 |
GNA12 | 16 | 内含子1 47226 | aacatgatcccctggctccc G/A ttttggtgggcgggctactt | 561 |
GNA12 | 17 | 内含子2 7986 | cagtggcatctggtgtcttc C/T ttgccgggggcttggctctc | 562 |
GNA12 | 18 | 内含子2 16662 | aggttttgtgagaattttgc G/A tttaagccaaatgaaatgct | 563 |
GNA12 | 19 | 内含子2 19828 | tactctgtgcatgtattgtc T/C atccaaaaacttgaaagatg | 564 |
GNA12 | 20 | 内含子2 19927 | taactctttaagccacgtct G/A gtgccaccaaattgggaagg | 565 |
GNA12 | 21 | 内含子2 26464 | tttcatttcacgcagtcctc G/A aatgcagttagtgtttttct | 566 |
GNA12 | 22 | 内含子2 30404 | tgtgaagtaaacgctgagcc C/G gaccacaaccactgtgaata | 567 |
GNA12 | 23 | 内含子2 31563 | ggaactcggccttctccgcc C/G gatgaagcaaacaaactgtg | 568 |
GNA12 | 24 | 内含子2 36858 | gctgctgactcatcctgttg G/A ttttgagttagggagtgact | 569 |
GNA12 | 25 | 内含子2 58844 | aacctggcccttttaatgag C/T tgctgctgtaagacttgagg | 570 |
GNA12 | 26 | 内含子2 59773 | ggagagcaggaggaggcagg A/C gagagaggcgctgaggaagg | 571 |
GNA12 | 27 | 内含子2 60096 | ctctagagagccggtggtca C/T gaggtgcacgtgctcgcccc | 572 |
GNA12 | 28 | 编码区 534 | ccttcctgacagggggagtc G/A gtgaagtacttcctggacaa | 573 |
GNA12 | 29 | 编码区 1062 | caccacttcaccaccgccat C/T gacaccgagaacgtccgctt | 574 |
GNA12 | 30 | 3′侧翼区 341 | ttgaggaccgtgttgtgtgt G/C tatgtgtgtacacacgctct | 575 |
GNA12 | 31 | 3′侧翼区 1504 | tatcccagggccctcgtccc G/A aggccgtgctgccccgagcc | 576 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
GNA12 | 32 | 3′侧翼区 1880 | cctcggggtggtctcaggtc C/A catttgcagtctgcaacagt | 577 |
GNA12 | 33 | 3′侧翼区 1918 | agtgacgcgcagcccggtcc G/A gagcgtggtgagctttgttt | 578 |
GNA12 | 34 | 内含子1 6012 | aaaattgtcccttttttttt T/Δ attacctattctgatggtct | 579 |
GNA12 | 35 | 内含子1 10112~10113 | gcttctggggtctggaagca CA/Δ gtttggtttttatggccttg | 580 |
GNA12 | 36 | 内含子1 15929~15930 | ctttcattaattaaaaaaaa (A) ttttaaataaagtatcgggg | 581 |
GNA12 | 36 | 内含子1 15929~15930 | ctttcattaattaaaaaaaa ttttaaataaagtatcgggg | 582 |
GNA12 | 37 | 内含子1 20154 | ttaatttttaattttttttt T/Δ agcttgcctagccaactaga | 583 |
GNA12 | 38 | 内含子1 22589~22590 | cctgtgttgaacaggcggag AG/Δ cagcaagacagtcaccttgc | 584 |
GNA12 | 39 | 内含子1 36255~36267 | gctgtgttatcctggctagg (T)12-15 ctctcttataccttatttta | 585 |
GNA12 | 40 | 内含子1 40754~40755 | tttaccgccttttgggtttt (T) ccccattcgttacccaccac | 586 |
GNA12 | 40 | 内含子1 40754~40755 | tttaccgccttttgggtttt ccccattcgttacccaccac | 587 |
GNA12 | 41 | 内含子2 26399~26400 | cctttgttttcctgagtgtt (AAA) acatccatgattttaagggc | 588 |
GNA12 | 41 | 内含子2 26399~26400 | cctttgttttcctgagtgtt acatccatgattttaagggc | 589 |
GNA12 | 42 | 内含子2 32564~32565 | gggaaccgccataccgtgtc (C) tggattcggtgggatcgtgt | 590 |
GNA12 | 42 | 内含子2 32564~32565 | gggaaccgccataccgtgtc tggattcggtgggatcgtgt | 591 |
GNA12 | 43 | 内含子2 32721~32723 | acgaagcccttacaacttct CCT/Δ agaaacgaagcctgggttga | 592 |
GNA12 | 44 | 内含子2 59812~59813 | gaacttgtcgtaaatcaggg (G) agtgagtgcacccaacggct | 593 |
GNA12 | 44 | 内含子2 59812~59813 | gaacttgtcgtaaatcaggg agtgagtgcacccaacggct | 594 |
GNA12 | 45 | 3′侧翼区 319~322 | ctctttttctgacgcagttt AATT/Δ gaggaccgtgttgtgtgtgt | 595 |
TBXA2R | 1 | 5′侧翼区 -2646 | tgcaccccaagggagatggc T/C gtcctccaactggcaagaca | 596 |
TBXA2R | 2 | 5′侧翼区 -2565 | ggggccctgggacccctgaa G/C ggtcacgggcactgagcctg | 597 |
TBXA2R | 3 | 5′侧翼区 -2521 | agacgggctgctggccgaga A/C gggtgacggctgccttgcag | 598 |
TBXA2R | 4 | 5′侧翼区 -2275 | ccatgactctccaccatggc C/T cgaggtccacctggtgtcct | 599 |
TBXA2R | 5 | 5′侧翼区 -1054 | gaatacccctcactcacagc C/T tggactagcagccctcccgg | 600 |
TBXA2R | 6 | 5′侧翼区 -951 | ccctaactcaaggttctgtc C/T ggctcgggtgtacaaacaag | 601 |
TBXA2R | 7 | 5′侧翼区 -863 | cctgcgtccggcaccttctc A/T gccattcctgttgggctcca | 602 |
TBXA2R | 8 | 5′侧翼区 -226 | ccggcgtgcggggggcaccc A/G ctgactccaagtcagccagg | 603 |
TBXA2R | 9 | 内含子1 1627 | caggcatgggagggtctggc C/T ggtccctgaagtttcagtcc | 604 |
TBXA2R | 10 | 内含子1 1628 | aggcatgggagggtctggcc G/A gtccctgaagtttcagtccc | 605 |
TBXA2R | 11 | 内含子1 2524 | agttattcaacatcgaaaag C/G gatcttgggtccacacctct | 606 |
TBXA2R | 12 | 内含子1 2600 | agccgcagtgctgctctact G/C ccccaccgcgtgggggcccc | 607 |
TBXA2R | 13 | 内含子1 3028 | accagctctcgagggaggaa C/T gccttgtcccaggggaaatc | 608 |
TBXA2R | 14 | 内含子1 3301 | gccagaagccaggccaaagc G/A tcacaagtgagatggggagt | 609 |
TBXA2R | 15 | 编码区 179 | gcaggggggttcgcacacgc G/T ctcctccttcctcaccttcc | 610 |
TBXA2R | 16 | 3′侧翼区 4779 | gggatgtcagtgagggcact C/T cccgcgcccaacttcccgct | 611 |
TBXA2R | 17 | 3′侧翼区 4783 | tgtcagtgagggcactcccc G/A cgcccaacttcccgctggga | 612 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
TBXA2R | 18 | 3′侧翼区 5009 | ggagccctccagcccagccc C/T ctcccgacccccacccctaa | 613 |
TBXA2R | 19 | 3′侧翼区 5342 | tctggccaatcatatctgga G/A ggaacagagtgagggatggc | 614 |
TBXA2R | 20 | 3′侧翼区 5364 | gaacagagtgagggatggcc A/G tgggttctgggtggagccac | 615 |
TBXA2R | 21 | 3′侧翼区 5438 | cctttctagaatcttcctcc C/T cttcaaagtcctccttacat | 616 |
TBXA2R | 22 | 3′侧翼区 8738 | aatatctaggggtccgctag T/C cctaagacctgcccatcttt | 617 |
TBXA2R | 23 | 3′侧翼区 9258 | cttcctgcagcctcccctcc C/T ccggcccagggcgcgacagc | 618 |
BLTR2 | 1 | 5′侧翼区 -1167 | cctgcctatatcccctaaag G/A tggagggtagagcggagggt | 619 |
BLTR2 | 2 | 3′非翻译区 1361 | attatgagggtggtgatggt C/T cctgttaaggactattgtgt | 620 |
CYSLT1 | 1 | 编码区 927 | aggaaaaggctgtctacatt C/T agaaagcattctttgtccag | 621 |
CYSLT1 | 2 | 3′侧翼区 667 | ttctctccatccatgacata T/C aattcttccttaagaagcca | 622 |
CYSLT1 | 3 | 3′侧翼区 835 | agaaaattgtgaatgttcac A/G ttacaaattcttttaagaag | 623 |
CYSLT1 | 4 | 3′侧翼区 1313 | aaggcatagtaatagcttgt G/A cccatttatttttaatatac | 624 |
CYSLT1 | 5 | 3′侧翼区 1662 | gtaaaactcaaatgagatca G/A gaatgttaaagtttttaaaa | 625 |
CYSLT1 | 6 | 3′侧翼区 1684 | aatgttaaagtttttaaaaa C/T atataacaagatataatgtt | 626 |
CYSLT1 | 7 | 3′侧翼区 1940 | ccttcaattacttgcaagcc C/T atcataaatttgcttttttt | 627 |
CYSLT1 | 8 | 3′侧翼区 1158~1159 | ttacctcagaagaaataaat (GAT) aactataaagaaaaaagaaa | 628 |
CYSLT1 | 8 | 3′侧翼区 1158~1159 | ttacctcagaagaaataaat aactataaagaaaaaagaaa | 629 |
CYSLT1 | 9 | 3′侧翼区 1630~1631 | atacttatcctgcatttttt (T) atagggcatttgtaaaactc | 630 |
CYSLT1 | 9 | 3′侧翼区 1630~1631 | atacttatcctgcatttttt atagggcatttgtaaaactc | 631 |
CYSLT2 | 1 | 5′侧翼区 -556 | ttttgttttgttttgttgtt G/T ttttttttttttttgagatg | 632 |
CYSLT2 | 2 | 5′侧翼区 -317 | actcctgacctcaggtgatc T/C gccagcctcagcttcccaaa | 633 |
CYSLT2 | 3 | 3′非翻译区 2077 | gagaggttcctttctgtcca C/T tgaaacaaggctaaggatac | 634 |
CYSLT2 | 4 | 5′侧翼区 (-542)~(-555) | tttgttttgttttgttgttG/T (T)12-15 gagatggagtttcgctcttg | 635 |
PTAFR | 1 | 内含子2 321~346 | acagagcgagattccttttc (A)22-26 gctttgggcaactactctca | 636 |
BDKRB1 | 1 | 5′侧翼区 -1069 | gcctgttgacaatttttttt T/A attaaaaatcccacccagga | 637 |
BDKRB1 | 2 | 5′非翻译区 -148 | acccaactacagttgtgaac G/A ccttcattttctgcctgagt | 638 |
BDKRB1 | 3 | 内含子1 240 | gagggaaaggttttagaact C/G gtaggaaggttccagtagct | 639 |
BDKRB1 | 4 | 内含子1 3069 | aaattcatgaacaactttat C/G acaagtttgtagttcagtaa | 640 |
BDKRB1 | 5 | 内含子1 3129 | cattttgtaaattttgtcac G/A tacgtctataaatgtcaatt | 641 |
BDKRB1 | 6 | 内含子1 5485 | tctgaagattgtctggagcc G/A cataaatcccgcagtgtagg | 642 |
BDKRB1 | 7 | 内含子1 5818 | ctcctccagcaagcgtggga G/A gccagtcagctgcatggctg | 643 |
BDKRB1 | 8 | 内含子1 5883 | cagaccaaggttcctggcgt A/G gcactgtaaccaccacctag | 644 |
BDKRB1 | 9 | 内含子1 6116 | ctcaattttctaattggcca A/G ctggagatgacaatggcccc | 645 |
BDKRB1 | 10 | 5′非翻译区 -126 | tgttgttgttgagacagggt C/T tcagtccgtcggcccagact | 646 |
BDKRB1 | 11 | 内含子2 191 | ttcaagcctgtaagaggaac C/T tcctagcactgtccccaccc | 647 |
BDKRB1 | 12 | 编码区 462 | cagcagcggcggaggcaggc C/T cgggtcacctgcgtgctcat | 648 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
BDKRB1 | 13 | 编码区 699 | gcctccctgcgaacgcggga G/A gaggtcagcaggacaaggtg | 649 |
BDKRB1 | 14 | 3′侧翼区 1017 | ccagcatcttgcgccttcag C/A gagaaaggG/AG/Tatgggttccc | 650 |
BDKRB1 | 15 | 3′侧翼区 1026 | tgcgccttcagC/Agagaaagg G/A G/Tatgggttccctctcaggtt | 651 |
BDKRB1 | 16 | 3′侧翼区 1027 | gcgccttcagC/AgagaaaggG/A G/T atgggttccctctcaggtta | 652 |
BDKRB1 | 17 | 3′侧翼区 1250 | agacccaacggtgagcctaa C/T ggtgtctctaccctccaggg | 653 |
BDKRB1 | 18 | 3′侧翼区 1275 | tctctaccctccaggggctc A/G cagcaaccaggacaataatt | 654 |
BDKRB1 | 19 | 3′侧翼区 1432 | ggaagagacacataaactga A/G tcccaaaaaatgagaagctg | 655 |
BDKRB1 | 20 | 3′侧翼区 1792 | agccagatagacggccatac G/A tcatgggagttggggatcct | 656 |
BDKRB1 | 21 | 5′侧翼区 (-1069)~(-1068) | cctgttgacaattttttttt (T) attaaaaatcccacccagga | 657 |
BDKRB1 | 21 | 5′侧翼区 (-1069)~(-1068) | cctgttgacaattttttttt attaaaaatcccacccagga | 658 |
BDKRB1 | 22 | 内含子1 27 | aaatgaccaccttttttttt T/Δ cttttatgagagtacaatat | 659 |
BDKRB1 | 23 | 内含子1 2980~2989 | ttaggatgctgagactcaat (GTCCACTAAA) attgattgataatgggaaaa | 660 |
BDKRB1 | 23 | 内含子1 2980~2989 | ttaggatgctgagactcaat attgattgataatgggaaaa | 661 |
BDKRB1 | 23 | 内含子1 2980~2989 | ttaggatgctgagactcaat (GTCCACTAAATGATTGATAATTG) attgattgataatgggaaaa | 662 |
BDKRB1 | 23 | 内含子1 2980~2989 | ttaggatgctgagactcaat (TGATTGATAATTG) attgattgataatgggaaaa | 663 |
BDKRB1 | 24 | 内含子1 3014 | attgataatgggaaaataaa A/Δ gagaaaacacatgtgaaagt | 664 |
BDKRB1 | 25 | 内含子1 6307~6326 | ttttctctctctctctctcc (T)16-18 gttgttgttgttgttgttga | 665 |
BDKRB1 | 26 | 内含子1 6327 | tttttttttttttttttttt G/Δ ttgttgttgttgttgttgag | 666 |
BDKRB2 | 1 | 内含子1 165 | gtccaagtccctgtaggcct G/A ttgggagcagagggaatgtt | 667 |
BDKRB2 | 2 | 内含子1 189 | ggagcagagggaatgttctg C/T ggaactagaggaagaggggc | 668 |
BDKRB2 | 3 | 3′非翻译区 2836 | acctggagggctagaacctg G/A agggctagaatctggagagc | 669 |
BDKRB2 | 4 | 3′侧翼区 1920 | ggcaaaaaaagaaaaaaaaa A/Δ tgctgggagagcctccccag | 670 |
ADRB1 | 1 | 5′侧翼区 -1451 | acatttcactgcagcctcaa C/T tcctgggctcaagtgatcct | 671 |
ADRB1 | 2 | 5′侧翼区 -1309 | aatctcttacctatgtctcg T/C tttatttactacgaataggt | 672 |
ADRB1 | 3 | 5′侧翼区 -535 | aaagcagcattttggaaata C/T tcctttggttatgatatgcc | 673 |
ADRB1 | 4 | 5′非翻译区 -2831 | agaaaagcaatgccttccac C/A cttcgggggcatttaaggtt | 674 |
ADRB1 | 5 | 5′非翻译区 -2146 | atcactccccagttttaaca T/C actgatgctgaggtttgggc | 675 |
ADRB1 | 6 | 3′侧翼区 1254 | taataggtttccatgactca A/G taacatagcaaaatgcctcc | 676 |
ADRB1 | 7 | 3′侧翼区 1354 | cggattcaaggtgttctaga C/T tacttgtaggcactttcaag | 677 |
ADRB1 | 8 | 3′侧翼区 1488 | aactcagctgcaacttttca C/T ggaaatgcaggaaagactaa | 678 |
ADRB1 | 9 | 5′侧翼区 (-138)~(-127) | gttaggctaaaaaaaaagtt (A)11-13 caccaatcataaaatgtagg | 679 |
ADRB1 | 10 | 5′非翻译区 (-1807)~(-1797) | agatttttttaattttttta (T)10-12 atttcaggcctgagctgagg | 680 |
ADRB1 | 11 | 5′非翻译区 (-1633)~(-1611) | agcaattcatttgccaactc (A)19-24 ccacagatacaactttaaat | 681 |
ADRB1 | 12 | 3′侧翼区 10 | gttccttgttgttttttttt (T)/Δ cttttcttttctttcttctt | 682 |
ADRB1 | 13 | 3′侧翼区 32~53 | ttttcttttctttcttcttc (T)15-22 ctgtttgtggtccggccttc | 683 |
ADRB1 | 14 | 3′侧翼区 705~712 | atgtggataaaaacaaaaac (A)7-9 ggagtggttcaaaatgccat | 684 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
ADRB1 | 15 | 3′侧翼区 1429~1452 | tttgtgattgcgtagctcct (A)20-28 gtgacgcggtcatttaactc | 685 |
ADRB2 | 1 | 5′侧翼区 -687 | cctttagagacaatggaaat C/T aggtacttcgtgatttctct | 686 |
ADRB2 | 2 | 5′侧翼区 -199 | aaattaatttcactttagca G/A taaagtcacatgccagatgg | 687 |
ADRB2 | 3 | 5′非翻译区 -1429 | tagcttcaaaatgttcttaa T/A gttaagacattcttaatact | 688 |
ADRB2 | 4 | 5′非翻译区 -839 | aagccagcgtgtgtttactt T/G ctgtgtgtgtcaccatgtct | 689 |
ADRB2 | 5 | 5′非翻译区 -654 | ctgtggttcggtataagtct G/A agcatgtctgccagggtgta | 690 |
ADRB2 | 6 | 3′非翻译区 1274 | tacttttaaagacccccccC/G C/G ccaacagaacactaaacaga | 691 |
ADRB2 | 7 | 3′侧翼区 757 | gcaaaagagcccctgaggtg C/T gaattagcccctggttgaga | 692 |
ADRB2 | 8 | 5′侧翼区 (-652)~(-665) | ggtacttcgtgatttctctt (A)11-14 tgaactagaaagctccaagt | 693 |
ADRB2 | 9 | 3′非翻译区 1266~1276 | agtttttctacttttaaaga (C)10-13 aacagaacactaaacagact | 694 |
HRH1 | 1 | 3′侧翼区 83 | tacagagggcactcctatgc A/G tttttaaaacatgctgagca | 695 |
HRH1 | 2 | 5′侧翼区 (-758)~(-739) | ccacaacagtgatgtaagcc (A)18-21 gcaaagccaagcaaaacaaa | 696 |
HRH1 | 3 | 3′非翻译区 2800~2810 | acagagcaagactctgtctc (A)10-12 tacaatattttaacaatgtg | 697 |
HRH1 | 4 | 3′侧翼区 880~884 | acagagagagactctgtctt AAAAT/Δ gaaatgaaatgaaatgaaat | 698 |
HRH1 | 5 | 3′侧翼区 904~905 | gaaatgaaatgaaatgaaat (GAAAT) ataaaataaaataaaatata | 699 |
HRH1 | 5 | 3′侧翼区 904~905 | gaaatgaaatgaaatgaaat ataaaataaaataaaatata | 700 |
HRH2 | 1 | 5′侧翼区 -6616 | ttcctgcctatgggctttga C/T caaatgtcctgccaggaagg | 701 |
HRH2 | 2 | 5′侧翼区 -5244 | actgctgggtcagtagtctg A/C gtgattttaacattaacggg | 702 |
HRH2 | 3 | 5′侧翼区 -5128 | acatccacgcccgcacgtgc A/G cacacacagagctgttgctt | 703 |
HRH2 | 4 | 5′侧翼区 -2185 | agggccttgaaaactcaaaa C/T tctgcccaatgggattaaaa | 704 |
HRH2 | 5 | 5′侧翼区 2168 | aaactctgcccaatgggatt A/T aaaaaacaccccctttctgt | 705 |
HRH2 | 6 | 5′非翻译区 (-142)~(-122) | gccttccccaccccctggcc (A)18-24 ctggacacattttggatctg | 706 |
HRH3 | 1 | 5′侧翼区 -1211 | gctataagtaggggagtgac G/A gtgcatgtcagcgcccgggg | 707 |
HRH3 | 2 | 5′侧翼区 -1161 | agcccctcccccagacacgc G/A cactctggcctctttgaggc | 708 |
HRH3 | 3 | 内含子1 945 | gaggggtggtaagatgagga T/C ggctagttccagaaaagcag | 709 |
HRH3 | 4 | 编码区 978 | ctcaagaggggctccaagcc G/A tcggcgtcctcggcctcgct | 710 |
HRH3 | 5 | 编码区 996 | ccgtcggcgtcctcggcctc G/A ctggagaagcgcatgaagat | 711 |
HRH3 | 6 | 5′侧翼区 -1238 | gcaggtccccacagtatggg G/Δ aagctgctataagtagggga | 712 |
HTR3A | 1 | 编码区 30 | tgggtccagcaggcgctgct C/T gccttgctcctccccacact | 713 |
HTR3A | 2 | 内含子1 173 | catttgaggcatcatggtta A/G gctagagagagttaggaatg | 714 |
HTR3A | 3 | 内含子1 790 | agagctctgggtaagatgtc C/T ttcctcccgggagcggtcgt | 715 |
HTR3A | 4 | 内含子1 1079 | ctcacctttctggtgcttgg G/A gatccttgtgtgcaaatagc | 716 |
HTR3A | 5 | 内含子1 1431 | ccatctcccctttgctgccc G/A tatgctggccctctaggttg | 717 |
HTR3A | 6 | 内含子2 1241 | acaaggaagcccctccttta G/T gggctggcatgtgcagggtg | 718 |
HTR3A | 7 | 内含子4 1625 | ttgaaaactagccttgacaa C/T ggcaggtcaggaagcctaag | 719 |
HTR3A | 8 | 内含子4 1666 | ataggaaggttggaaaaacc G/A aggccaggcaaaacatccag | 720 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
HTR3A | 9 | 内含子5 85 | ggagtgctccccagggcgcc T/C tctcacgtatccagcctact | 721 |
HTR3A | 10 | 内含子5 2666 | ctgtgtcccatcatcacagg G/T tccagcaggctctgggtact | 722 |
HTR3A | 11 | 编码区 1182 | atgggaggaccccaggactt C/T gagaagagcccgagggacag | 723 |
HTR3A | 12 | 3′侧翼区 1899 | tttccctcccacctgttata C/A ctcctggaagctgcttcctc | 724 |
HTR3A | 13 | 5′侧翼区 (-758)~(-741) | acagagcgagactctgtctc (A)15-17 gaaagaaagaaaagaaaaga | 725 |
HTR3A | 14 | 内含子1 1181~1216 | agacacttaaaaaatagttt (GT)15-21 tctctctgctcctctctgtc | 726 |
HTR3A | 15 | 内含子3 1699 | tgactgacttccttcctggg G/Δ caaggctacatctagccgag | 727 |
HTR3A | 16 | 3′侧翼区 18 | aaactctcttcttttttttt T/Δ ctttttttgtatttatacat | 728 |
AGTR1 | 1 | 5′侧翼 - (283-274) | taaaagttttccaagttcag (A)9-11 tgttgaagaacacgaatctc | 729 |
AGTR1 | 2 | 内含子1 + 868 | tccttctgcaccgttttttt T/C tttgggcaaccatttgtgac | 730 |
AGTR1 | 3 | 内含子1 + (869-871) | ccttctgcaccgtttttttc (T)2-4 gggcaaccatttgtgacctg | 731 |
AGTR1 | 4 | 内含子1 + 1128 | gttgagcaacttgtgcttcc G/C gctgaagatgctgcatccca | 732 |
AGTR1 | 5 | 内含子1 + (1457-1460) | cttaacttgctgtgtgatag TAAG/Δ agcattatttcacaactctg | 733 |
AGTR1 | 6 | 内含子1 + 1642 | tttgcttaagttttgtgatt C/G ttagtttcaagtctgttacc | 734 |
AGTR1 | 7 | 内含子1 + 2037 | ggatcagagttgtgtgagta T/C ttgtgtatataattttgttt | 735 |
AGTR1 | 8 | 内含子1 + 2254 | gtttaaatgcatgatgcatg T/C ctgctgtcattttatctgtg | 736 |
AGTR1 | 9 | 内含子1 + 3279 | tgctcagatgaggaaaaact T/C tcttgcatatgaaaatcaaa | 737 |
AGTR1 | 10 | 内含子1 + 4602 | aactcctttgacagtatgga C/T ggcacctaacgcatccttgt | 738 |
AGTR1 | 11 | 内含子1 + (7313-7314) | agctttaataatctaactct (CTTT)cccattcaaatgatgtcact | 739 |
AGTR1 | 11 | 内含子1 + (7313-7314) | agctttaataatctaactct cccattcaaatgatgtcact | 740 |
AGTR1 | 12 | 内含子1 + 7480 | ttatctactgagttaccaga G/A tggatttttgagagaacaca | 741 |
AGTR1 | 13 | 内含子1 + (8087-8095) | aaatctgaccctttctgtca (T)8-9 cctgtggtacactagtgtct | 742 |
AGTR1 | 14 | 内含子1 + 8229 | taacattattctgtataaca G/A tgctaaagttggtatgccta | 743 |
AGTR1 | 15 | 内含子1 + 9042 | tgctgatgtaggaaatctgc T/A agccatcataagtaaaataa | 744 |
AGTR1 | 16 | 内含子1 + 9464 | cacaagtaaaaatccaatct A/G ttttcatattcttacattta | 745 |
AGTR1 | 17 | 内含子1 + (9485-9479) | ttttcatattcttacattta TAGACATTTCTTA/GTAGC catgtctatagaaagaaatg | 746 |
AGTR1 | 18 | 外显子2 + (25-28) | gatatttgacaaattgatct (A)4-5 tggctgggtttttatctgaa | 747 |
AGTR1 | 19 | 内含子2 + 174 | ccaatatacagattaagagc G/A tttgtatttatatggtttta | 748 |
AGTR1 | 20 | 内含子2 + 353 | gaggaccagaagggaaatga T/C tgtactctcttgtcagctac | 749 |
AGTR1 | 21 | 内含子2 + 658 | agcagggttagccaggactg T/C tttgtctatctaactcttct | 750 |
AGTR1 | 22 | 内含子2 + 747 | taactaataagatttcccca C/T gcccctccttacaaaaactc | 751 |
AGTR1 | 23 | 内含子2 + 1082 | tctttagggatgttttgttt T/G gggaggttttttttctgatt | 752 |
AGTR1 | 24 | 内含子2 + (1144-1145) | aagcttgggaatctggactg TG/Δ cagattttctgcaaaaatcc | 753 |
AGTR1 | 25 | 内含子2 + 1220 | aggatgacacaaagacagta T/C gctttattttacatcttaaa | 754 |
AGTR1 | 26 | 内含子2 + 1317 | agcaggacacttacccaggg G/T gttcctgctggaaatgattc | 755 |
AGTR1 | 27 | 内含子2 + 1528 | aataagcaaaacatacttaa G/T tctaagaagctattttttgt | 756 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
AGTR1 | 28 | 内含子2 + 2542 | agattttctttagttttcca A/G taatgataaacatttcacca | 757 |
AGTR1 | 29 | 内含子2 + 4314 | tttcctgaatctaaacaaat G/A ttcatctcacccagagaact | 758 |
AGTR1 | 30 | 内含子2 + 4432 | ccaaaatacttctgcacaca G/C tatagacaccagaaaaaaac | 759 |
AGTR1 | 31 | 内含子2 + 4440 | cttctgcacacagtatagac A/G ccagaaaaaaacagagccac | 760 |
AGTR1 | 32 | 内含子2 + 4953 | gcgccccctggacttctgct A/G gaatttagatttaaatagat | 761 |
AGTR1 | 33 | 内含子2 + (5294-5311) | atattggttggaggggggga (AT)8-9 gtatgtctcccaagagaaag | 762 |
AGTR1 | 34 | 内含子2 + 6760 | ccttctggatactcagctac A/C ttatttggtgcttttggtat | 763 |
AGTR1 | 35 | 内含子2 + 6778 | acattatttggtgcttttgg T/C atacttcaaatatgcattgc | 764 |
AGTR1 | 36 | 内含子2 + 6918 | aatgaaagctttgccctttt A/G gataaatacagcaatgtatt | 765 |
AGTR1 | 37 | 内含子2 + 7150 | aaaaatgtacagataatctg A/G atgagagaaaactatcctca | 766 |
AGTR1 | 38 | 内含子2 + 7186 | cctcactttgtgttattttt C/T aatggtagcattttctcata | 767 |
AGTR1 | 39 | 内含子2 + 7852 | tagtgagaacctgtgactat A/G ttaattaatttaatttaatc | 768 |
AGTR1 | 40 | 内含子2 + 7972 | tttgttaacccagatcacag C/G tgcatacttaaatgctatgc | 769 |
AGTR1 | 41 | 内含子2 + 8819 | gaaaatggtttctgtccctg G/T tggactcttgtttcaatgca | 770 |
AGTR1 | 42 | 内含子2 + 8886 | gttaagctgtcattcagatc A/C gaaaaaataaaagagagaga | 771 |
AGTR1 | 43 | 内含子2 + 9698 | attcatatgccaccagccat C/T ggcagaaatgtaacaggaaa | 772 |
AGTR1 | 44 | 内含子2 + 9939 | aatttttaaaaggattggga T/C gagttattttcccctctgtt | 773 |
AGTR1 | 45 | 内含子2 + 10392 | atggctctgtaaatgggatg C/T ctcatgttcaggtttctgga | 774 |
AGTR1 | 46 | 内含子2 + 10494 | atctccaggtgaacatggaa C/T gcagtgaaaacctggggtat | 775 |
AGTR1 | 47 | 内含子2 + 10643 | ctgaaaggacattagttttt A/T aacctatatattatgaccta | 776 |
AGTR1 | 48 | 内含子2 + (11267-11275) | aaattcacatatttcatagg (T)8-10 gccagaatgggcttcaaggg | 777 |
AGTR1 | 49 | 内含子2 + 12010 | agttttgagaagttgatctc A/T cattttaaaaatagattcag | 778 |
AGTR1 | 50 | 内含子2 + (12243-12256) | aagcagaaacacacacacac (CA)6-7 gaggctcaaagcataagtgt | 779 |
AGTR1 | 51 | 内含子2 + 12377 | tcatagcatgttgtcgacct C/T atttttcaaatccataattt | 780 |
AGTR1 | 52 | 内含子2 + (12691-12695) | tttattatttttttactcac GTTAC/Δ tactttagtgtgttggaatt | 781 |
AGTR1 | 53 | 内含子2 + 15806 | agccatgaatcgctgcatgt G/A gaatggaagggggaatgtct | 782 |
AGTR1 | 54 | 内含子2 + 18823 | atcagtatacagaaaaggct G/A cactctgagataagaaagaa | 783 |
AGTR1 | 55 | 内含子2 + 21150 | gtaataaaagcagaagtcac G/A tgctgaacgtgaaggtgagc | 784 |
AGTR1 | 56 | 内含子2 + 21942 | tctcttacccaaatttgctc A/G cagggaaaaaaataaattaa | 785 |
AGTR1 | 57 | 内含子3 + 3115 | tgccatgtggccaataaccc C/T aacataatactcataatgca | 786 |
AGTR1 | 58 | 内含子3 + 3213 | tttcctgcccaataactttc C/T tcacaccccttaaaatggaa | 787 |
AGTR1 | 59 | 内含子3 + 3323 | tatacaaaatctgtagtttt T/G ttcacaaattggatgaagca | 788 |
AGTR1 | 60 | 内含子3 + 4569 | tcgtggctgccaggattccc G/A gtatagaggcaaatacaacc | 789 |
AGTR1 | 61 | 内含子3 + 4604 | acaacctgtaaaggctcaaa C/T gcttcatcaaaagccatgac | 790 |
AGTR1 | 62 | 内含子3 + 4685 | attatcaccttcaaataaca T/C gtagggcaacctcagtagag | 791 |
AGTR1 | 63 | 内含子3 + 4838 | ctagatacacagctgagata A/C agttccagtgactttggcag | 792 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
AGTR1 | 64 | 内含子3 + 4876 | cagtgtgaaagtcaggacca G/C taggcacatatactgaaggc | 793 |
AGTR1 | 65 | 内含子3 + 4994 | ctgaagaccagacagagttt C/G agagtggtatagttactaat | 794 |
AGTR1 | 66 | 内含子3 + 5094 | ctcagaaatgagcattaaaa A/G cttttccagatcaagggagt | 795 |
AGTR1 | 67 | 内含子3 + 5222 | acagtcaaagattacaaaac C/T taagcagaagtccattatca | 796 |
AGTR1 | 68 | 内含子3 + 5458 | agcctagaaatattagtgcc A/G atttctatgggtcaatgatt | 797 |
AGTR1 | 69 | 内含子3 + 5789 | aactatggggaatttttttt T/Δ ctttagattgcaaactagtt | 798 |
AGTR1 | 70 | 内含子3 + 6065 | tatgtttgccacagacttag A/G ttcccacctcactcatggca | 799 |
AGTR1 | 71 | 内含子3 + 6794 | gttcagcttcaaagaaaaaa G/C agccctactgtttcccactc | 800 |
AGTR1 | 72 | 内含子3 + 6994 | gatcccacacccccaagagc G/T ttgtgcaatatctgttaatt | 801 |
AGTR1 | 73 | 内含子3 + 7175 | accatccttcccccaaaccc C/A acactccccaccaatctggg | 802 |
AGTR1 | 74 | 外显子4 + 56 | atctggggacctgctcctgg T/C agagcaataggatctgtgtg | 803 |
AGTR1 | 75 | 外显子5 + 620 | gagtcccaaaattcaaccct T/C ccgatagggctgggcctgac | 804 |
AGTR1 | 76 | 外显子5 + 1213 | cacttcactaccaaatgagc A/C ttagctacttttcagaattg | 805 |
AGTR1 | 77 | 外显子5 + 1831 | tagtatattagtttgattta A/G tatctgagaagtgtatatag | 806 |
AGTR1 | 78 | 外显子5 + 1925 | tatatattctacacatatat A/G tatatgtatatctatatctc | 807 |
AGTR1 | 79 | 外显子5 + (1930-1931) | ttctacacatatatgtatat (AT) gtatatctatatctctaaac | 808 |
AGTR1 | 79 | 外显子5 + (1930-1931) | ttctacacatatatgtatat gtatatctatatctctaaac | 809 |
AGTR1 | 80 | 3′侧翼 + (454-455) | cattcattatacacacatat AT/Δ gtgtcaatcctgatactgaa | 810 |
AGTR1 | 81 | 3′侧翼 + 511 | gtactttgtatacagatctt T/C cacttaatgtcatagcatag | 811 |
AGTRL1 | 1 | 5′侧翼 - (1796-1813) | caaactacactcttggcctg (T)11-18 gcaggtatttgagtttgagt | 812 |
AGTRL1 | 2 | 5′侧翼 - 1433 | ggaaagggtgcgtatttttt A/T aaaaaaatcttacgtcgtgc | 813 |
AGTRL1 | 3 | 5′侧翼 - 1176 | cacgtagtaattcttacact C/T gttcttccatctatggattc | 814 |
AGTRL1 | 4 | 5′侧翼 - 799 | tacgacatgccaggtactgt G/A ttatgttcgtgtttggagaa | 815 |
AGTRL1 | 5 | 5′侧翼 - 279 | gtcccatttagattggatgg G/A agggggtgagaacaggaggg | 816 |
AGTRL1 | 6 | 5′侧翼 - (47-55) | acttgctcagtgacaaaaag (A)8-9 gtgggctgtcactaaagatt | 817 |
AGTRL1 | 7 | 内含子1 + (1045-1048) | tgcctgcctcttgtctgtgt GTGT/Δ tgtacttatatgtctatatg | 818 |
AGTR2 | 1 | 5′侧翼 - 151 | gctgttatgattggagacag T/C gagaatttcagattaatgtt | 819 |
AGTR2 | 2 | 5′侧翼 - 125 | tttcagattaatgttttgca G/C acaaaaaaaaacctctctgg | 820 |
AGTR2 | 3 | 5′侧翼 - (122-114) | cagattaatgttttgcagac (A)8-9 cctctctggaaagctggcaa | 821 |
AGTR2 | 4 | 内含子2 + 55 | ttatgttaatttgttaggtc A/T aaagaaaaatctttagagca | 822 |
AGTR2 | 5 | 内含子2 + (209-219) | gcttatctttagctaatgtg (T)10-12 ggttttaaaataatgcttct | 823 |
AGTR2 | 6 | 内含子2 + (1122-1130) | tgttttctataatcactcac (T)8-9 gcttttgacaaacattcaaa | 824 |
AGTR2 | 7 | 外显子3 + 1628 | ggcatatgcttctttaaaaa A/C gctataaattatattcctct | 825 |
AGTR2 | 8 | 3′侧翼 + 424 | aacattcgtgcttttaaaaa G/T tttttttaactacttctaag | 826 |
AGTR2 | 9 | 3′侧翼 + 531 | atactacttagtttcagctc C/G gattattactcacctggcct | 827 |
AGTR2 | 10 | 3′侧翼 + 634 | aaagcaaaatccaactttct T/C cgagtctgcaagaccttggg | 828 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
AGTR2 | 11 | 3′侧翼 + 1611 | tacttcagtatccataacct C/T ggtaatacaagtgcttctgt | 829 |
AVPR1A | 1 | 5′侧翼 - 1058 | ttccatgaactgaagtactt C/T tcaaatatctggaattatga | 830 |
AVPR1A | 2 | 5′侧翼 - 723 | ggcatatgagtagtgcctca T/C atgtaatagtcctgctttcc | 831 |
AVPR1A | 3 | 5′侧翼 - 649 | acatgtttaaaactatatgg A/G ttaaacaaagggactggttc | 832 |
AVPR1A | 4 | 外显子1 + (16-21) | ttacctaattgcttgaagga (T)6-7 ccagacaggtggtctggaaa | 833 |
AVPR1A | 5 | 外显子1 + 1733 | gctcaccttcccgacctcgc C/T gaagttgaaaaaaggcagag | 834 |
AVPR1A | 6 | 内含子1 + (40-67) | aggaaagtgcagggatagga (GT)13-15 gagagagagagagagagaga | 835 |
AVPR1A | 7 | 内含子1 + 462 | ctgctttttgttggattgtg A/G aaagtattacaattaatttt | 836 |
AVPR1A | 8 | 内含子1 + 1295 | ttacactcaagtaataaaaa C/T ttcaattgtgcatagatatg | 837 |
AVPR1A | 9 | 内含子1 + 1509 | ttgattattcttatttttag A/G aaaggtatattatcagcact | 838 |
AVPR1A | 10 | 内含子1 + 1933 | tatagaagatagagattttt T/A aaatcaattacttaatagtc | 839 |
AVPR1A | 11 | 外显子2 + 592 | ttatattttgttgttagttt C/T ttttattttcatttctaaca | 840 |
AVPR1A | 12 | 外显子2 + 950 | cctcacatattattggtcaa G/T aaaagcatgaaaactgagat | 841 |
AVPR1A | 13 | 外显子2 + 1130 | tttctcttggacattgtaaa C/T gtattttgatcagtgttaca | 842 |
AVPR1A | 14 | 外显子2 + 1131 | ttctcttggacattgtaaac G/A tattttgatcagtgttacaa | 843 |
AVPR1A | 15 | 3′侧翼 + 523 | atttccagtgactgctcagc T/C tgacttctcctgcctgacta | 844 |
AVPR1A | 16 | 3′侧翼 + (800-812) | taagaggaagtaatagttgc (T)11-13 gaaacagagtcttgctcttt | 845 |
AVPR1A | 17 | 3′侧翼 + 1453 | aatccatttccaaagtaaga A/Δ cctcagaacctatagatctt | 846 |
AVPR1A | 18 | 3′侧翼 + 1570 | aaagtgcatatcaccctacc C/G agttgtattttctcctttta | 847 |
AVPR1A | 19 | 3′侧翼 + 1758 | tatgtacccagaaatggacg C/T cacatatctcaaaacaatat | 848 |
AVPR1A | 20 | 3′侧翼 + 1941 | aaaatgtgttgcagcacctt A/G ttttatttttcacagttaac | 849 |
AVPR1A | 21 | 3′侧翼 + 2094 | tattaactgatgatggtaaa T/G aaacaatttagagtgcatta | 850 |
AVPR1A | 22 | 3′侧翼 + (2320-2326) | ggaagggtatggttttagag (A)6-7 tactaagcagtcttaatgat | 851 |
AVPR2 | 1 | 5′侧翼 - 2680 | ggaaggttctgatcatgggg G/A accggtagatagagagggac | 852 |
AVPR2 | 2 | 5′侧翼 - 2216 | cttgcatcccagaggagacc G/A ccatgcgggcccttcctcca | 853 |
AVPR2 | 3 | 5′侧翼 - 15 | cactcccaaacccgggactc A/C tgggctgcctgggggatcct | 854 |
AVPR2 | 4 | 外显子2 + 724 | gcctggggggcgccgcaggg G/A acgccggacaggcagccccg | 855 |
AVPR2 | 5 | 3′侧翼 + 643 | agcctttgttcctgcccagg C/T ggctgctgggcggggccttt | 856 |
AVPR2 | 6 | 3′侧翼 + 1335 | gtacagagcacggagcaggg C/T cccccaggttgtgcgcttgc | 857 |
PTGIR | 1 | 5′侧翼 - 1390 | aggggttgtggtcacacacc G/A gggtacagagggcaagacgg | 858 |
PTGIR | 2 | 5′侧翼 - (1326-1327) | gggttggacacatccctcct (CCT) ggccttggacaagagacacc | 859 |
PTGIR | 2 | 5′侧翼 - (1326-1327) | gggttggacacatccctcct ggccttggacaagagacacc | 860 |
PTGIR | 3 | 5′侧翼 - 1241 | gcaggccgaggctggccacc A/G ggtccctgaggcccgtgtta | 861 |
PTGIR | 4 | 5′侧翼 - 1238 | ggccgaggctggccaccagg T/C ccctgaggcccgtgttaccc | 862 |
PTGIR | 5 | 外显子2 + 394 | tgagccacccctacctctac G/A cgcagctggacgggccccgc | 863 |
DRD1 | 1 | 5′侧翼 - 1942 | cggctcccgcgtgagctgtg T/C gactttgagcaggccccact | 864 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
DRD1 | 2 | 5′侧翼 - 1826 | gaacaacgtaaggcgtgcac C/A ggggaacacggatgctgctg | 865 |
DRD1 | 3 | 5′侧翼 - 1754 | agtaaggcttgcgtctcgcc T/C gctctagcgccccaggtttg | 866 |
DRD1 | 4 | 5′侧翼 - 976 | tggcgaggtaaccagggagg G/C caagcactcaccggggcgtc | 867 |
DRD1 | 5 | 外显子1 + 2480 | aaagattttgaaaaatttaa A/G aaagtatagctactactgtg | 868 |
DRD1 | 6 | 外显子1 + 3210 | ttaacatttagatgcaatcc G/A tgaaaagaaaaaaaaatctg | 869 |
DRD1 | 7 | 3′侧翼 + (112-120) | cattttcaagtatatattac (T)8-9 ctttaatggaagtttcttca | 870 |
DRD1 | 8 | 3′侧翼 + 126 | tattactttttttttcttta A/G tggaagtttcttcagttatg | 871 |
DRD1 | 9 | 3′侧翼 + 505 | tgatgctgagcttatcaaaa C/T gtcttatgaggcacatccgt | 872 |
DRD1 | 10 | 3′侧翼 + 748 | gcacccaaaaagcatgatgc C/T ttttctttctgtttcataac | 873 |
DRD1 | 11 | 3′侧翼 + 955 | gttcaataattataaaattc A/C atacaccttcaatgagacta | 874 |
ITGA2B | 1 | 5′侧翼 - 931 | aggagccttgctcccaaggg A/T ctcatttacacaatcctgtg | 875 |
ITGA2B | 2 | 内含子20 + 138 | tttttattttttttttaatt T/Δ ggaggaggaatacttgctaa | 876 |
ITGA2B | 3 | 内含子21 + (34-35) | tcgtggtaccgggtctccac (CAGGGGCTC) atgaataaccagattttagg | 877 |
ITGA2B | 3 | 内含子21 + (34-35) | tcgtggtaccgggtctccac atgaataaccagattttagg | 878 |
ITGA2B | 4 | 内含子22 + (397-407) | gcgagattctatctcaaaag (A)10-11 ggtctttgaagaagcctggt | 879 |
FOLR1 | 1 | 5′侧翼区 - 1227 | ttcttcctgcccaaacctgc C/T cctccctctcccttttccca | 880 |
FOLR1 | 2 | 内含子1 + 18 | aaggttagtgagtgagcagg T/A ccacaggggcatgattggat | 881 |
FOLR1 | 3 | 内含子1 + 160 | gaattcaattccaggcttat A/C tgagccctgctgtgcagtcg | 882 |
FOLR1 | 4 | 内含子1 + 560 | gctgtcccctgccagcaccc A/G tgtcctgtgaccccacccca | 883 |
FOLR1 | 5 | 内含子2 + 2863 | aggactaagaggggagacac T/C gcatgtggaatattctggct | 884 |
FOLR1 | 6 | 编码区 + 396 | aaagagcgggtactgaacgt G/A cccctgtgcaaagaggactg | 885 |
FOLR1 | 7 | 5′非翻译区 - 229 | tatcatttgttgatttcccc C/Δ ttcttacatttaatccttgc | 886 |
TNFR1 | 1 | 5′侧翼区 - 1931 | tgatggtggtgagctgcttc C/T tttctgaatccagcttcaac | 887 |
TNFR1 | 2 | 5′侧翼区 - 1786 | gccaggaagagccaggggac G/A gtggacttggggctgggagg | 888 |
TNFR1 | 3 | 内含子1 + 364 | agtgggagtaggaagattag T/C gctcggggagtccagacggt | 889 |
TNFR1 | 4 | 内含子1 + 3420 | cccaggaatgcggagaggac C/T gagagatcacagggggaggc | 890 |
TNFR1 | 5 | 内含子1 + 3505 | tggggccctggggagagagc G/A tggcaagttctcagcattcg | 891 |
TNFR1 | 6 | 内含子1 + 3952 | tggaggtctggttctgggag C/T tgagaggacaccaggggagg | 892 |
TNFR1 | 7 | 内含子1 + 3957 | gtctggttctgggagctgag A/G ggacaccaggggaggataag | 893 |
TNFR1 | 8 | 内含子1 + 5979 | cagcgtctccccgtggctga C/G tcagggtgactggcctcctg | 894 |
TNFR1 | 9 | 编码区 + 269 | gtgtgagagcggctccttca C/T cgcttcagaaaaccacctca | 895 |
TNFR1 | 10 | 内含子7 + 294 | tttatgatgctttctttctt T/C ttcctcagtttgtgggaaat | 896 |
TNFR1 | 11 | 5′侧翼区 - 1702~-1707 | aagttccaaagccctaggac CTCCCT/Δ cttctctgtctgcctgcatt | 897 |
TNFR1 | 12 | 内含子1 + 4002~4003 | ttctgaccaagacatttttt (T) gatctctcatcttataaggt | 898 |
TNFR1 | 12 | 内含子1 + 4002~4003 | ttctgaccaagacatttttt gatctctcatcttataaggt | 899 |
TNFR1 | 13 | 3′非翻译区 + 1741~1745 | ttttgttttgttttgttttg TTTTT/Δ aaatcaatcatgttacacta | 900 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
TNFR1 | 14 | 3′侧翼区 + 768~769 | ctctttctatactacacccc (CC) accaccatacagacatcccc | 901 |
TNFR1 | 14 | 3′侧翼区 + 768~769 | ctctttctatactacacccc accaccatacagacatcccc | 902 |
TNFR1 | 15 | 5′侧翼区 (-1663)-(-1662) | ttctagcagcctcagcagct (AGAAATTTCTAGCTGCCTGCATTTCTAGCAGCCCA)gcaggcccttgggcggggct | 903 |
TNFR1 | 15 | 5′侧翼区 (-1663)-(-1662) | ttctagcagcctcagcagct gcaggcccttgggcggggct | 904 |
ADORA2A | 1 | 5′侧翼区 -1470 | ggcaggtggtggcggctggc A/C acacactcatagggccccat | 905 |
ADORA2A | 2 | 内含子1 64 | ccaggctttggtctgtgccc G/A gagccagggtgagcctggga | 906 |
ADORA2A | 3 | 内含子1 2674 | ctctccattaactttttttt T/A aaaaaaaagaactcagtttt | 907 |
ADORA2A | 4 | 内含子1 3460 | ccccagaaaggggcagcctg C/T aagccgggggacacagagct | 908 |
ADORA2A | 5 | 内含子1 4028 | gggactttctttgcagagta C/T ggtggaagactccccttgtg | 909 |
ADORA2A | 6 | 内含子1 4056 | gactccccttgtgggttccc T/G tttctgtacaagtcaacaat | 910 |
ADORA2A | 7 | 编码区 1083 | gagcggaggcccaatggcta T/C gccctggggctggtgagtgg | 911 |
ADORA2A | 8 | 3′侧翼区 27 | cgtctgagttcgtttcctac T/A ccatagctaggcctgtgcac | 912 |
ADORA2A | 9 | 3′非翻译区 1696-1697 | aggtgacatttgactttttt T/Δ ccaggaaaaatgtaagtgtg | 913 |
AVPR1B | 1 | 5′侧翼区 -388 | accggctagccggctggcag A/G gggcgcgccaacagccgcca | 914 |
AVPR1B | 2 | 5′非翻译区 -356 | ccagaaaagtttggagaaag A/T gaatttgaggcggattggag | 915 |
AVPR1B | 3 | 编码区 571 | tggactgctgggcagacttc G/C gcttcccttgggggccacgg | 916 |
AVPR1B | 4 | 编码区 821 | cagcatcaacaccatctcac G/A ggccaagatccgaacagtga | 917 |
AVPR1B | 5 | 内含子1 25 | gtggggtctatgtgggggca G/T tgaggtgggagagacagaaa | 918 |
AVPR1B | 6 | 内含子1 1721 | caggccaccaattcccacca G/C tggtccccttcctttgtatt | 919 |
AVPR1B | 7 | 内含子1 2475 | tgtcccaaagggttatctta C/T agacaatgtgctcccagaaa | 920 |
AVPR1B | 8 | 内含子1 2847 | ttcctaaatgaaggaacctg T/C ggaactcctttgtccctggc | 921 |
AVPR1B | 9 | 内含子1 4769 | gtatgtaaaagctgccccct T/C ggctgtagggggcaatgatg | 922 |
AVPR1B | 10 | 内含子1 4966 | tgtgaatccatgatgtataa T/C gtaagtggggatggagatgg | 923 |
AVPR1B | 11 | 内含子1 4987 | gtaagtggggatggagatgg G/A cggggcctgagcttggttat | 924 |
AVPR1B | 12 | 内含子1 5156 | cttctcaattaaacttggag G/C aaacctcagctcctaccttc | 925 |
AVPR1B | 13 | 编码区 1091 | gggtccccagcccaggatgc G/A ccggcggctctccgacggca | 926 |
AVPR1B | 14 | 编码区 1119 | ctctccgacggcagcctctc G/A agccgccacaccacgctgct | 927 |
AVPR1B | 15 | 3′非翻译区 1284 | atcatcttttaggaaagact C/G G/Actggggtctggtactgccc | 928 |
AVPR1B | 16 | 3′非翻译区 1285 | tcatcttttaggaaagactC/G G/A ctggggtctggtactgcccc | 929 |
AVPR1B | 17 | 3′非翻译区 1336 | ggaggttctctgcccacctc G/A ggcactggaaatgagagctg | 930 |
AVPR1B | 18 | 3′非翻译区 1393 | gagttagaggagccctgtct A/G aagcG/Agagcgaaaaggccag | 931 |
AVPR1B | 19 | 3′非翻译区 1398 | agaggagccctgtctA/Gaagc G/A gagcgaaaaggccagaatgg | 932 |
AVPR1B | 20 | 3′非翻译区 1563 | gtgtccatgcacacatggtg T/A cccagagatctaggcaggcc | 933 |
AVPR1B | 21 | 3′侧翼区 2101 | cctcattgttcctcccatgg A/G aaggctacacttgatctttt | 934 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
AVPR1B | 22 | 3′侧翼区 2145 | gaaagctggttctgtcctgt G/A atatggacagtggggagcga | 935 |
AVPR1B | 23 | 3′侧翼区 2303 | agtctgggccagtggaaggg C/G cttggatagggttcaaggag | 936 |
AVPR1B | 24 | 3′侧翼区 2393 | tcccatttctgacggctaac C/G ccaggagaaactgaacaatg | 937 |
AVPR1B | 25 | 3′侧翼区 2415 | caggagaaactgaacaatgc C/T gtctctggctgggcacttgt | 938 |
AVPR1B | 26 | 3′侧翼区 2595 | agaatcgttatgttgtttgg C/T acaggccagtactttcccag | 939 |
AVPR1B | 27 | 3′侧翼区 2650 | ttttgtatgtaaatagatca C/T ttatctactacagggctata | 940 |
AVPR1B | 28 | 3′侧翼区 2717 | ttcctgggtcagaaacccag G/C ttgaaattcaccaataaaaa | 941 |
AVPR1B | 29 | 3′侧翼区 2762 | taatatccaggaaattcctg C/T gcatctttagttttctaggg | 942 |
AVPR1B | 30 | 3′侧翼区 2966 | gggcctggcctccgctgggc T/C tgacttggcagctcctgcct | 943 |
AVPR1B | 31 | 3′侧翼区 2997 | gctcctgcctaagaatcagg G/T taaggccctttctctagcca | 944 |
AVPR1B | 32 | 3′侧翼区 3024 | cctttctctagccaaatatt G/A ctgagatccagtG/Tcacattc | 945 |
AVPR1B | 33 | 3′侧翼区 3037 | aaatattG/Actgagatccagt G/T cacattctttaactctcctg | 946 |
AVPR1B | 34 | 3′侧翼区 3078 | gaggatatgaagcagtaatg A/T ctaacagggaaggctaggaa | 947 |
AVPR1B | 35 | 3′侧翼区 3111 | gctaggaaagtcacccagcc T/A cttagcttgtgagtcctcaa | 948 |
AVPR1B | 36 | 内含子1 4643 | tggcatcctcacattttgac T/Δ gcccaagagagaaattagtt | 949 |
AVPR1B | 37 | 3′非翻译区 1744-1769 | tctatttggatcctggattt (GTT)8-9 agagagaaaattgcttcatg | 950 |
MC2R | 1 | 5′侧翼区 -3123 | gaacccagagctcaggagca C/T agtcctacactggctctctc | 951 |
MC2R | 2 | 5′侧翼区 -2842 | gtagcattaactcccttcct A/G aacC/Δacaagtggtgtctaca | 952 |
MC2R | 3 | 5′侧翼区 -1089 | ggttgagtgagtgaatgcat C/G tggagaattaggtggtgccc | 953 |
MC2R | 4 | 5′非翻译区 -1211 | actggtgcactgccgcagtc C/T gccttcaccccagagacaca | 954 |
MC2R | 5 | 5′非翻译区 -807 | ggcaaagaataatctttgct A/G tcatctctcggctcaaaatt | 955 |
MC2R | 6 | 5′非翻译区 -601 | ctgtcatcagaataacatac G/A tgttacccatagggtaattt | 956 |
MC2R | 7 | 5′非翻译区 -524 | aatgtccattccacactcta T/C atccacgtgtatgcattatt | 957 |
MC2R | 8 | 5′非翻译区 -194 | gggaatagagtttctttaag C/T gagtgtggctggtttttatt | 958 |
MC2R | 9 | 3′非翻译区 952 | cgttgccaagtgccagaata G/A tgtaacattccaacaaatgc | 959 |
MC2R | 10 | 3′非翻译区 1005 | ctggccttccttccctaatg G/A atgcaaG/Cgatgatcccacca | 960 |
MC2R | 11 | 3′非翻译区 1012 | tccttccctaatgG/Aatgcaa G/C gatgatcccaccagctagtg | 961 |
MC2R | 12 | 3′非翻译区 1509 | gttagtctgatgtattgatg C/T cacctcagtttcagaaagta | 962 |
MC2R | 13 | 3′非翻译区 1579 | acgagcttcgagtttccaat G/A ataaatggaccttctctgtt | 963 |
MC2R | 14 | 3′非翻译区 1774 | actatttgaagaagctgtaa C/T caaactatgtgt TT/Δ gtta | 964 |
MC2R | 15 | 3′非翻译区 1991 | aaaccaaaaccaaagcagac A/T tcaagcaatggtgctgttat | 965 |
MC2R | 16 | 3′非翻译区 1992 | aaccaaaaccaaagcaagac A/T tcaagcaatggtgctgttat | 966 |
MC2R | 17 | 3′非翻译区 2777 (2778) | aatgtataacatattttatg T/C gattaaagtgC/Tgtattctca | 967 |
MC2R | 18 | 3′非翻译区 2788 (2789) | tattttatgT/Cgattaaagtg C/T gtattctcaataagaggtaa | 968 |
MC2R | 19 | 3′非翻译区 3030 (3031) | actgcctttgatttgttgca G/T ttaatctaagaaacaaaatg | 969 |
MC2R | 20 | 3′非翻译区 3286 (3287) | gtgtgaggaagatcaacaag C/G ttcagacttttcccatgagg | 970 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
MC2R | 21 | 5′侧翼区 -2838 | cattaactcccttcctA/Gaac C/Δacaagtggtgtctacaggtc | 971 |
MC2R | 22 | 3′非翻译区 1787~1788 | gctgtaaC/Tcaaactatgtgt (TT) gttacaatgtagaagtacaa | 972 |
MC2R | 22 | 3′非翻译区 1787~1788 | gctgtaaC/Tcaaactatgtgt gttacaatgtagaagtacaa | 973 |
MC2R | 23 | 3′非翻译区 1863~1983 | gagagagacagagacagaca (GA)3-30(GT)3-30 attttccccatgcttttgga | 974 |
CD20 | 27 | 内含子1 250 | ttccacaaaagtagtagatt G/Δ cagcatatatattaaatcat | 975 |
IL1R1 | 49 | 3′非翻译区 2024 | gtcaggagttcgagaccagc C/G cagccaacatggcaaaaccc | 976 |
IL1R1 | 50 | 3′非翻译区 2537 | agaagttagtgtccgaagac C/A gaattttattttacagagct | 977 |
IL1R1 | 51 | 3′非翻译区 2708 | ttcctccctggcatgaccat C/G ctgtcctttgttattatcct | 978 |
IL1R1 | 52 | 3′非翻译区 2769 | aacagctccctagtggcttc C/T tccG/Atctgcaatgtcccttg | 979 |
IL1R1 | 53 | 3′非翻译区 3010 | ggtggccatgtcgcctgccc C/T cagcactcctctgtctctgc | 980 |
IL1R1 | 54 | 3′非翻译区 3094 | cgcattttctctagctgatc A/G gaattttaccaaaattcaga | 981 |
IL1R2 | 40 | 内含子7 1429~1435 | caatcataattaagtgaatg (A)7-8 aactcagggaatattcagaa | 982 |
IL2R | 42 | 内含子1 5874 | tttaacacgggagatgaaac T/C gctgctgaatggctcccatt | 983 |
IL2R | 43 | 内含子1 7451 | ctggagtcgtgtacatggac C/T gtgttccatgagtagtgagc | 984 |
IL2R | 44 | 内含子1 7852 | cagtgcttttgtcctgacag A/C ccattctcccactcccacac | 985 |
IL2R | 45 | 内含子1 7929 | ccgcctgcagccctcgaccc G/A gatccaggcatcctgcttaa | 986 |
IL2R | 46 | 内含子1 8215 | gcaagaacaagctggtgcaa T/C tggactagcagcaattgagt | 987 |
IL2R | 47 | 内含子1 11958 | caagttaatctcccctgaaa G/A cacctgtcgtgatgcccttt | 988 |
IL2R | 48 | 内含子1 11996 | tttcggctgcaagagctcca G/A tcatttccattgcctcaggg | 989 |
IL2R | 49 | 内含子1 12408 | gatacagtagggtgagtgcc G/A tgtaaagaaaagggagcaaa | 990 |
IL2R | 50 | 内含子1 15083 | taactacttgtcccacaccc G/A agtaaaaagcaggatcttct | 991 |
IL2R | 51 | 内含子1 21655 | ttcaaccatggtgatttggt T/G ggcagcaatcagagaattga | 992 |
IL2R | 52 | 内含子1 24205 | ttattaaacagtaaacctca C/T ctcactatcaaagatagcct | 993 |
IL2R | 53 | 内含子1 24572 | ttcctgtgctccgtgcgtta T/C tctaatcttcactgggtaca | 994 |
IL2R | 54 | 内含子1 24707 | ctggattcacccaaggggca A/G agaatcttatctcagactcg | 995 |
IL2R | 55 | 内含子1 25512 | attccacgtcagggaagagc C/T gctggcctgcccaggctgct | 996 |
IL2R | 56 | 内含子1 25661 | agtgacgcggaaggcaaaga C/T cacctcatttcaccaagttc | 997 |
IL2R | 57 | 内含子1 26206 | gatcgtgtatttcagccaca A/C tgatggaggtgaggtggaaa | 998 |
IL2R | 58 | 内含子1 26255 | gaacaagtgggattctgccc G/A tgtctgtctaatgagcatcc | 999 |
IL2R | 59 | 内含子1 26290 | gcatccacagcaaactccaa C/T ggaagatgtgaaacacgctc | 1000 |
IL2R | 60 | 内含子1 26723 | ggaagcccacctagaacttg G/A cctggcgccagtcacccact | 1001 |
IL2R | 61 | 内含子1 26860 | gaacccctggctctctcagg G/C tcccattcaagtttctgggc | 1002 |
IL2R | 62 | 3′非翻译区 1788 | ggaaggaaagaaagaaggaa G/A tgaagagggagaagggatgg | 1003 |
IL2R | 63 | 3′非翻译区 1827 | ggaggtcacactggtagaac G/A taaccacggaaaagagcgca | 1004 |
IL2R | 64 | 内含子1 9198 | acccccagagcagcttgggg G/Δ catctttagagaaagcggca | 1005 |
IL2R | 65 | 内含子1 9446 | cctctgaggcgtgagggggg G/Δ cgcgttttctcccctgggaa | 1006 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
IL2R | 66 | 内含子1 11018~11031 | aagcaaaacaaacaattacc (A)12-14 gttggaggggtgtttcagaa | 1007 |
IL2R | 67 | 内含子1 27539~27540 | catataagtggaatcctcct (T) gttattactgtgcaagactt | 1008 |
IL2R | 67 | 内含子1 27539~27540 | catataagtggaatcctcct gttattactgtgcaagactt | 1009 |
PGR | 8 | 内含子4 2239~2254 | acttgcttatttacagtgag (AC)7-8 gcacacacacacaatataaa | 1010 |
ITGB2 | 44 | 内含子1 792 | gtgcgattctggtcgagttg G/A ttcagctggtgaccctggcc | 1011 |
ITGB2 | 45 | 内含子1 1520 | G/Tagtgggggagtccctctgc C/T gggaagaggtccctggctac | 1012 |
ITGB2 | 46 | 内含子1 2539 | gggccccccttgctgcactc G/A tgtcctgtgtcagagaaccg | 1013 |
ITGB2 | 47 | 内含子1 3171 | cagctctcagcccctgcgcc G/A tgcctagaggagaggctggc | 1014 |
ITGB2 | 48 | 内含子1 4975 | ccctgacccttgggaaaata C/T gcttttgcagggtcgcaggt | 1015 |
ITGB2 | 49 | 内含子1 5327 | catcgtccatcacttcccgc G/A cacctccG/Aagtcactttgat | 1016 |
ITGB2 | 50 | 内含子1 5335 | atcacttcccgcgcacctcc G/A agtcactttgatgcgagtgc | 1017 |
ITGB2 | 51 | 内含子1 6418 | ggggaaggatgacctcgtcc C/G cctggtcctgccccctcagc | 1018 |
ITGB2 | 52 | 内含子1 6660 | gcccgcccttagatggggga T/A gtccagagctggaggatgag | 1019 |
ITGB2 | 53 | 内含子1 7292 | ccagggctgctcatggagga G/C caacagtggggagaaggtgg | 1020 |
ITGB2 | 54 | 内含子1 7667 | acctgggggagtcctgaagc C/T ggctggaccctgcaccctgg | 1021 |
ITGB2 | 55 | 内含子1 7982 | ccctgggggagtcctgaagc C/T ggctggaccctgcaccctgg | 1022 |
ITGB2 | 56 | 内含子1 8051 | accctggggtagctccagca T/C gcacagggcctccgatcagc | 1023 |
ITGB2 | 57 | 内含子1 9072 | cgtcattttgcctctggggc C/T gagggcctgtgagtgaccac | 1024 |
PTGER2 | 18 | 5′侧翼区 -1391 | tgcttgttctagtgggaacc A/C ccccC/Acccaactccgcattc | 1025 |
PTGER2 | 19 | 5′侧翼区 -1386 | gttctagtgggaaccA/Ccccc C/A cccaactccgcattccaatc | 1026 |
PTGER2 | 20 | 3′侧翼区 1628 | aactgattcacatcactaca C/T gctcatgtaactcagttaca | 1027 |
CYSLT2 | 5 | 5′侧翼区 (-555)~(-542) | tttgttttgttttgttgttG/T (T)12-15 gagatggagtttcgctcttg | 1028 |
ADRB1 | 16 | 5′非翻译区 -2827 | agaaaagcaatgccttccac C/A cttcgggggcatttaaggtt | 1029 |
ADRB1 | 17 | 5′非翻译区 -2142 | atcactccccagttttaaca T/C actgatgctgaggtttgggc | 1030 |
ADRB1 | 18 | 5′侧翼区 (-138)~(-128) | gttaggctaaaaaaaaagtt (A)11-13 caccaatcataaaatgtagg | 1031 |
ADRB1 | 19 | 5′非翻译区 (-1803)~(-1792) | agatttttttaattttttta (T)10-12 atttcaggcctgagctgagg | 1032 |
ADRB1 | 20 | 5′非翻译区 (-1629)~(-1610) | agcaattcatttgccaactc (A)19-24 ccacagatacaactttaaat | 1033 |
ADRB2 | 10 | 3′非翻译区 1273 | ctacttttaaagaccccccc C/G C/Gccaacagaacactaaacag | 1034 |
ADRB2 | 11 | 5′侧翼区 (-665)~(-652) | ggtacttcgtgatttctctt (A)11-14 tgaactagaaagctccaagt | 1035 |
HRH1 | 6 | 内含子2 (5025)~(5044) | ccacaacagtgatgtaagcc (A)18-21 gcaaagccaagcaaaacaaa | 1036 |
HRH2 | 7 | 5′侧翼区 -2168 | aaC/Ttctgcccaatgggattt A/T aaaaaacaccccctttctgt | 1037 |
HRH3 | 7 | 5′侧翼区 -1212 | gctataagtaggggagtgac G/A gtgcatgtcagcgcccgggg | 1038 |
TBXA2R | 24 | 3′非翻译区 1196 | tccaacccggggacccccaa C/T tcctccctgatccttttacc | 1039 |
TBXA2R | 25 | 3′侧翼区 5703 | cagaacccggcttagtgtca G/C gactgaggtgctagaaacac | 1040 |
TBXA2R | 26 | 3′侧翼区 8234 | tccaggcctatctgaccccc C/T aggagcttctgcatgtccac | 1041 |
TBXA2R | 27 | 3′侧翼区 8306 | ttcccgggggagaaggagcc T/C agagttagccagggcatgca | 1042 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
TBXA2R | 28 | 内含子1 2099~2100 | agaggcctgctgtttgggaa (A) ccaaggatcacattccactg | 1043 |
TBXA2R | 28 | 内含子1 2099~2100 | agaggcctgctgtttgggaa ccaaggatcacattccactg | 1044 |
ADORA1 | 1 | 5′侧翼区 -54 | gtccaccttcttcctccaca C/T atggggaaatggaggcccag | 1045 |
ADORA1 | 2 | 内含子2 79 | tgtcatactcacttgtggat T/G tgcccccctggctgtcccct | 1046 |
ADORA1 | 3 | 内含子2 533 | tctctttcactgtgggcttc G/A tttttctatctttaaagtgc | 1047 |
ADORA1 | 4 | 内含子2 8904 | gtttgtttgtttgtttgttt T/C aaattcttgaacctagagcc | 1048 |
ADORA1 | 5 | 内含子2 24377 | ctggggcaggggagaacaag G/C cctgctcttccaggagataa | 1049 |
ADORA1 | 6 | 内含子2 30037 | aaatagagtcatctttgcct C/T ctcagtcccccagccactat | 1050 |
ADORA1 | 7 | 内含子2 30138 | tcctcttaggtttaactttt C/T gtcatctttgaccatgattg | 1051 |
ADORA1 | 8 | 内含子2 34431 | ccagagctgaagatgctgtc A/C atagttagacagggtgaccc | 1052 |
ADORA1 | 9 | 内含子5 145 | tccagtcctcactctgcctt T/C ccgtgctccgctctgcaggg | 1053 |
ADORA1 | 10 | 内含子5 508 | aggcacgctttggctctctc A/G ttcaccaggtatctctgtgc | 1054 |
ADORA1 | 11 | 内含子5 567 | agggctttccagctgaaccc A/G acagtctgattacctttgcc | 1055 |
ADORA1 | 12 | 内含子5 2547 | aagcagggatcctggctgag G/C tgttgggccattctgggctc | 1056 |
ADORA1 | 13 | 内含子5 2763 | gagtcgtactgaccgagcac T/A ggtgaggcgtgtctggggca | 1057 |
ADORA1 | 14 | 内含子5 11491 | ggtgccttcagccactccag C/T tgctctctttccaccttact | 1058 |
ADORA1 | 15 | 内含子5 15885~15886 | aggagtttgaattcagtcca (CA) gtcaaggctggaagaaaaaa | 1059 |
ADORA1 | 15 | 内含子5 15885~15886 | aggagtttgaattcagtcca gtcaaggctggaagaaaaaa | 1060 |
ADORA2B | 1 | 5′侧翼区 -2304 | acaggaaatgctagagcaga G/T cccaggcccagcagctgcag | 1061 |
ADORA2B | 2 | 5′侧翼区 -2252 | accactcatagcaaccagcc A/G gacaccgttcgcctcctctc | 1062 |
ADORA2B | 3 | 内含子1 224 | gtcgctctaaggagatctgc G/T tagggacagctctagggggt | 1063 |
ADORA2B | 4 | 内含子1 249 | gacagctctagggggtccgg G/A gagtgcggtccccggcgccc | 1064 |
ADORA2B | 5 | 内含子1 1967 | agaacactgaggctcgcccc A/G tcctgccttcctggcccgtc | 1065 |
ADORA2B | 6 | 内含子1 20174 | cagctggcactcccgtagaa A/G gccacatcctagcctgctgg | 1066 |
ADORA2B | 7 | 编码区 454~456 | acagtaaagacagtgccacc AAC/Δ aactgcacagaaccctggga | 1067 |
ADORA2B | 9 | 编码区 457~459 | gtaaagacagtgccaccaac AAC/Δ tgcacagaaccctgggatgg | 1068 |
ADORA3 | 1 | 5′侧翼区 -1622 | gcctgaggcaccgagtagga G/A gctgcagcatctcctacttg | 1069 |
ADORA3 | 2 | 5′侧翼区 -602 | gtctcccttatgccccactc C/T gaagtgtttgttagtaaaca | 1070 |
ADORA3 | 3 | 5′侧翼区 -377 | caagtgggtccccaaataac A/T atggcgtgcaagtgtctggt | 1071 |
ADORA3 | 4 | 5′侧翼区 -283 | agacagtcgcctgttcctgc G/T gggatggggctgaggcttgg | 1072 |
ADORA3 | 5 | 编码区 322 | tgctggccatcgctgtggac C/T gatacttgcgggtcaagctt | 1073 |
ADORA3 | 6 | 内含子1 164 | ggtctgtgagggggttagca T/A caatgggctgggactcagga | 1074 |
ADRA1A | 1 | 5′非翻译区 -50 | ctcccgcctccgcgccagcc C/A gggaggtggccctggacagc | 1075 |
ADRA1A | 2 | 内含子1 370 | cttaggctgactgtggaatg C/T cattttcactctgctacaga | 1076 |
ADRA1A | 3 | 内含子1 4850 | aaaatgtgagcagaagaata A/C atatactatcatattattat | 1077 |
ADRA1A | 4 | 内含子1 5395 | ggtgtcagccttcaacctac A/G aaagagaaggaaggataaga | 1078 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
ADRA1A | 5 | 5′侧翼区(-479)~(-478) | tttggggatttgtttttttt (T) gtttgtttttcgcttcggat | 1079 |
ADRA1A | 5 | 5′侧翼区(-479)~(-478) | tttggggatttgtttttttt gtttgtttttcgcttcggat | 1080 |
ADRA1A | 6 | 5′侧翼区(-76)~(-75) | cgggccaggagcagcgccca (ACCTGTAGCGCTGCGCTACCCAA) (GATG/Δ) ccatcggtccctgcctttg | 1081 |
ADRA1A | 6 | 5′侧翼区(-76)~(-75) | cgggccaggagcagcgccca (GATG/Δ) ccatcggtccctgcctttg | 1082 |
ADRA1A | 7 | 5′侧翼区(-75)~(-72) | gggccaggagcagcgccca(ACCTGTAGCGCTGCGCTACCCAA) GATG/Δ ccatcggtccctgcctttga | 1083 |
ADRA1A | 7 | 5′侧翼区(-75)~(-72) | gggccaggagcagcgccca(ACCTGTAGCGCTGCGCTACCCAA) ccatcggtccctgcctttga | 1084 |
ADRA1A | 8 | 内含子1-7161 | tgccctgagcctgtctcctt C/T ggggatgtgtgcccagcaca | 1085 |
ADRA1A | 9 | 内含子1-6406 | gctcttaaactttgactcta C/T agcttgtctctggggtttaa | 1086 |
ADRA1A | 10 | 内含子1-5614 | cttccatatcaagtcaccct T/C attctgagagaaacagttga | 1087 |
ADRA1A | 11 | 内含子1-135 | ataggagctagtcagtcaaa T/C gtgagaaactcatatgtgtt | 1088 |
ADRA1A | 12 | 内含子1(-335)~(-334) | ttacttttcaatttaggcaa TTTTCAATTAGGCAA/Δ aacaatttacatatgtggac | 1089 |
ADRA1A | 13 | 内含子2 2933~2934 | cctttaagcatgccaaaaaa A/Δ tatctaaaattgttgcagtt | 1090 |
ADRA1A | 14 | 内含子2 4319~4320 | gtgacatcgcttgttcctaa TTTCTTTTCACAA/Δ gtgaaaactggatatcccaa | 1091 |
ADRA1A | 15 | 3′侧翼 region 126 | aaagagcaatggaagaccca A/T tggtcttgatctaccaaaga | 1092 |
ADRA1A | 16 | 3′非翻译区 1567 | caccgtgcccggcccaacta T/Δ tttttttttttatctttttt | 1093 |
ADRA1A | 17 | 3′侧翼 region 2321 | tgccatccacatgaagggca G/Δ gggggatcctgccactctat | 1094 |
ADRA2A | 1 | 5′非翻译区-1536 | tccattccgccccaggggtt C/T catccgaagccgcgccttcc | 1095 |
ADRA2A | 2 | 3′非翻译区 1569 | atccccagttgttggtttgg C/A cactcttgacctggagccat | 1096 |
ADRA2A | 3 | 3′非翻译区 2372 | tgactatggggaaatctttt G/A gctgctgtttttagactcca | 1097 |
ADRA2B | 1 | 5′侧翼区-1661 | gtgggctgtgaataagaggc C/A tggctcgaggcggggcttat | 1098 |
ADRA2B | 2 | 5′侧翼区-1447 | ttccactgtcacccccagaa G/A ggcttcagtgtgtatgtggg | 1099 |
ADRA2B | 3 | 编码区 36 | ccctactccgtgcaggccac A/G gcggccatagcggcggccat | 1100 |
ADRA2B | 4 | 3′非翻译区 3223~3224 | gtggtgtttttttttttttt (T) aaactctgagctattttatc | 1101 |
ADRA2B | 4 | 3′非翻译区 3223~3224 | gtggtgtttttttttttttt aaactctgagctattttatc | 1102 |
EDG1 | 1 | 5′侧翼区-1117 | ctcagcctcacgttcttaag T/C agcatctaagcaaaagaaaa | 1103 |
EDG1 | 2 | 5′侧翼区-1068 | aaagtgctagtaatgagatt T/C gaggcctctgagtcgactcc | 1104 |
EDG1 | 3 | 5′侧翼区-3 | gagggaggggaccccgactc C/G a(G/Δ)taagtttgcgagagcact | 1105 |
EDG1 | 4 | 3′侧翼区 53 | tattgagtcatctactggat T/C gtgtagctctttggaatcaa | 1106 |
EDG1 | 5 | 3′侧翼区 497 | attaaatcatgtgttttttt T/G tttttttttt(T)caggacact | 1107 |
EDG1 | 5 | 3′侧翼区 497 | attaaatcatgtgttttttt T/G tttttttttt caggacgct | 1108 |
EDG1 | 6 | 3′侧翼区 869 | ggacacagttgggacatgaa G/A ataaacctcacctaatagag | 1109 |
EDG1 | 7 | 5′侧翼区-1 | gggaggggaccccgactc(C/G)a G/Δ taagtttgcgagagcactac | 1110 |
EDG1 | 8 | 3′侧翼区 507~508 | tgttttttt(T/G)tttttttttt (T) caggacactgtcttggcttc | 1111 |
EDG1 | 8 | 3′侧翼区 507~508 | tgttttttt(T/G)tttttttttt caggacactgtcttggcttc | 1112 |
EDG1 | 9 | 3′侧翼区 1507 | gaagtaagaatgagaaaaaa A/Δ tcttagtaattatatgtttg | 1113 |
EDG4 | 1 | 5′侧翼区 -447 | tggcaaagccgaagctgggc G/A ggggtccgggcggtgggagc | 1114 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
EDG4 | 2 | 编码区 408 | caccgcagtgtgatggccgt G/A cagctgcacagccgcctgcc | 1115 |
EDG4 | 3 | 3′非翻译区 1388 | ctggttcctgctgtgtgatg C/G tgagggttttaaggtgggga | 1116 |
EDG5 | 1 | 5′侧翼区 -1141 | ttgctctctgggtaggtggg C/Δ aaggtttctggaagtccaca | 1117 |
EDG5 | 2 | 5′侧翼区 -534 | gtgccgcagcactccagcct G/T ggcaacagagggagactcca | 1118 |
EDG5 | 3 | 编码区 882 | tacacgtggcgcagccggga C/T ctgcggcgggaggtgcttcg | 1119 |
GPR1 | 1 | 编码区 706 | tcatcttcaaggtgaagaag C/T gaagcatcctgatctccagt | 1120 |
GPR2 | 1 | 5′侧翼区 -786 | gttcctggtcctccgctctt G/C tctctctatcctctcctttc | 1121 |
GPR3 | 1 | 3′侧翼区 724 | ggttttttatttttttaaga A/C gccatcacctgagcaaccaa | 1122 |
GPR3 | 2 | 3′侧翼区 229~238 | ctactcagaaatgtctcaca GCCCAGCTGG/Δ gttgcaattccagaatgctg | 1123 |
GPR4 | 1 | 5′非翻译区 -277 | gttgacacactgactccata C/T ataacctccttgaaaaacct | 1124 |
GPR4 | 2 | 5′非翻译区 -60 | ggccccatggcctcccgctc C/T ctgtggccccacagcccccg | 1125 |
GPR4 | 3 | 3′非翻译区 1044 | tgggcggccactccgccctc C/T cagggggaccaggtgcagct | 1126 |
GPR4 | 4 | 3′非翻译区 1720 | tctgtgactcgggggaaagt G/A gaaggagaaatgcagccgat | 1127 |
MC1R | 1 | 5′侧翼区 -448 | ggcaggtcccggggaagctc C/T ggactcctagaggggcggcc | 1128 |
MC1R | 2 | 编码区 200 | ggccaccatcgccaagaacc G/A gaacctgcactcacccatgt | 1129 |
MC1R | 3 | 编码区 359 | gcagcagctggacaatgtca T/C tgacgtgatcacctgcagct | 1130 |
MC1R | 4 | 3′非翻译区 968 | ctggtgagcgcggtgcacgc G/A gctttaagtgtgctgggcag | 1131 |
MC1R | 5 | 3′侧翼区 746 | ctccccaggtgaggaagcca C/T agccccagaggccccaaatg | 1132 |
MC3R | 1 | 5′侧翼区 -939 | gaagtcaaagcataggtgct C/G cttcctccaggaactttgac | 1133 |
MC3R | 2 | 5′侧翼区 -803 | gagttcggggaagcctgaga T/C agtggctgttgtcttgctca | 1134 |
MC3R | 3 | 5′侧翼区 -373 | gtcttgccatgaaaagagct T/G taactgtagcagccggtggc | 1135 |
MC3R | 4 | 3′侧翼区 1006 | gtgtgactttcttgggagcc C/T ttgtttttgcttatagtaat | 1136 |
MC3R | 5 | 3′侧翼区 1504 | attctggtgactcctgcaca C/G ggccatggtatgtttcactg | 1137 |
MC4R | 1 | 5′侧翼区 -1207 | gtatttgtcggttcaactta C/T gatacgttaaactctggagg | 1138 |
MC4R | 2 | 5′侧翼区 -1005 | ggatattagtgcattaaaat C/T aaccccttttgaacccattc | 1139 |
MC4R | 3 | 5′侧翼区 -896 | ctgtttttcaggtattttaa C/T tgaaccactactggctgggt | 1140 |
MC4R | 4 | 5′侧翼区 -178 | tgatgattagagtcgtacct A/C aaagagactaaaaactccat | 1141 |
MC4R | 5 | 3′侧翼区 1151 | gatgtcatgcaataaactag C/G cttccacagccacttcttga | 1142 |
MC4R | 6 | 5′侧翼区 (-1157)~(-1156) | agttgcttaaaaaaaaaaaa (A) cagaatgcagcttattattt | 1143 |
MC4R | 6 | 5′侧翼区 (-1157)~(-1156) | agttgcttaaaaaaaaaaaa cagaatgcagcttattattt | 1144 |
OXTR | 1 | 内含子1 397 | tcttagaaaagggggttaga C/T ggggaaggaccagagctggg | 1145 |
OXTR | 2 | 内含子3 1088 | tgctggtggtgaatgattta T/C aagtttttgtttgaaggcaa | 1146 |
OXTR | 3 | 内含子3 2638 | cagttagaacaccagccgtg T/C gtccacttggccttaatttg | 1147 |
OXTR | 4 | 内含子3 3350 | caggcagtagggagaagaaa A/G ggaaaaaaaactattacaat | 1148 |
OXTR | 5 | 内含子3 3586 | gacttggtgaggctggtgag A/C ctggatgccccatgcagggt | 1149 |
OXTR | 6 | 内含子3 5157 | ctgggtgaggtctgtggccc C/T gggctggcgtgtctgggtgt | 1150 |
表1
基因名称 | 编号 | 位置 | 序列 | SEQ ID NO: |
OXTR | 7 | 内含子3 9108 | ctctgcctcccacccctcca T/G gaatcatggtgccaagtaga | 1151 |
OXTR | 8 | 编码区 1126 | cctcctttgtcctgagccat C/G gcagctccagccagaggagc | 1152 |
OXTR | 9 | 3′非翻译区 2817 | tcaagaaggtgaaaagataa C/A ctgcagaatgggagaaaata | 1153 |
OXTR | 10 | 3′侧翼区 866 | tgagctctgggtgcaaatgc A/C gcagcagtggggtctgttag | 1154 |
SSTR1 | 1 | 5′非翻译区 -239 | tcctggcctctcctctccac G/A gtcgcctgtgcccgggcacc | 1155 |
SSTR1 | 2 | 5′非翻译区 -103 | ccggaggcgctgggcggctg T/G gggctgcaggcaagcggtcg | 1156 |
SSTR1 | 3 | 3′非翻译区 1486 | gaccctccttctattttccc T/C accctgcaacttctatcctt | 1157 |
SSTR1 | 4 | 3′非翻译区 2054 | ctcctactgcgcgttttcaa A/G gaccaagcgctgggcgctcc | 1158 |
SSTR1 | 5 | 3′非翻译区 2146 | cccggggttcggggttcggg G/A ttcggttgcagggctgcagc | 1159 |
SSTR1 | 6 | 3′侧翼区 993 | taaacaaatagtcaaacatc C/T agttgagctgataatttaaa | 1160 |
SSTR1 | 7 | 5′侧翼区 -823 | tcagccgtatgaaatttcaa A/Δ ttccatcctagcacattcct | 1161 |
SSTR1 | 8 | 5′侧翼区 (-297)~(-288) | agttgcatggagtgtgattc TTCCTTCCAC/Δ aggaacagttggaaagccaa | 1162 |
SSTR3 | 1 | 5′侧翼 region -1463 | tggggcaggggtagccaggc G/A tgctcagaggcgtttgtttg | 1163 |
SSTR3 | 2 | 5′侧翼 region -867 | aagcacctggagtgcggggg G/C gctcttgcttatgctgcaaa | 1164 |
SSTR3 | 3 | 5′侧翼 region -725 | aaccccagccggcctctggg G/T agaaggggcctcagccacct | 1165 |
SSTR3 | 4 | 3′侧翼 region 1280 | gtggaacagccagggtgcaa C/T ggcaaatgcacagagtacag | 1166 |
GPR10 | 1 | 5′侧翼 region -517 | ctagttctctaagcaccagg C/T atggcagagcgcgctccacc | 1167 |
GPR10 | 2 | 编码区 615 | tatcacgtggagctcaagcc G/T cacgacgtgcgcctctgcga | 1168 |
在表1中,“基因名称”栏显示编码受体的基因的名称。“序列”栏中以大写字母表述的核苷酸(即“序列”栏中第21位核苷酸)即多态性信息。该表中的序列基本上显示了SNP之前和之后各20个核苷酸。然而,有些序列在第21位多态位点之前或之后20个核苷酸中具有额外的多态性。例如,CD20的No.9(SEQ ID NO:9)中第16位的“T/C”或IL1R的No.10(SEQ ID NO:57)中第5位的“T/C”也是多态性。记号“/”两侧的两个核苷酸表示核苷酸的纯合或杂合SNP。例如,“A/G”表示等位基因是A/A或G/G纯合子或A/G杂合子。然而,括号中的核苷酸[如CSF3R的No.12(SEQ ID NO:46)中的(A)]表示由插入引起的多态性。记号“Δ”[如参见IL1R2的No.37(SEQ ID NO:133)]表示由缺失一个或多个核苷酸引起的多态性。括号中的核苷酸连同数字指括号中的核苷酸重复了该数字的次数。例如,SEQ ID NO:43(表1,CSF3R的No.9)中出现的“(C)8-10”指序列中C重复8-10次。应当注意的是,表1“序列”栏中所述核苷酸序列中解释位置关系的所用术语“第21位”指遗传多态性位点的位置。因此,在缺失SNP(Δ)的情况中,缺失的假想核苷酸是“第21位”。在多个核苷酸位于多态位点的情况中,那些核苷酸作为一组是“第21位”。例如,在VCAM1的No.18(SEQ ID NO:249)的情况中,多态位点“GCAG”或缺失位点是第21位;在IL1R的No.41(SEQ ID NO:89)的情况中,多态位点“(A)9-12”是第21位。
“位置”显示SNP在基因组中的位置。SNP在5′侧翼区、内含子区、和3′侧翼区中的位置的表述以位于外显子1的5′最末端核苷酸上游1bp的核苷酸为-1位置。然后,朝着基因的5′端,核苷酸的编号是-2、-3、-4、...。内含子区指跨越位于外显子3′末端下游1bp的核苷酸至下一个外显子的区域。内含子的编号与位于该内含子5′端的外显子的编号相同。例如,位于外显子3与外显子4之间的内含子(即位于外显子3的3′端的内含子)称为内含子3。内含子区中SNP的位置的计数以紧挨着位于该内含子5′端的外显子/内含子相接处3′的第一个核苷酸为内含子核苷酸序列的位置1。带有“+”记号或无任何记号的数字指它们是朝着基因的3′端计数的;带有“-”记号的数字指它们是朝着基因的5′端计数的。例如,若由外显子3/内含子3相接处朝着基因3′端计数的第三个核苷酸是多态的,则该位置表述为“内含子3,+3”。相似的,若由内含子3/外显子4相接处朝着基因的5′端计数的第五个核苷酸是多态的,则该位置表述为“内含子3,-5”。位于最后一个外显子的3′端的区域称为3′侧翼区。此区中SNP的位置的计数以位于最后一个外显子的3′最末端核苷酸下游1bp的核苷酸为位置1。应当注意的是,在表1“位置”栏中关于MC2R17-MC2R20(SEQID NO:967-970)出现的数字是数据库中指出的数字;通过本发明的分析获得的数字显示在括号中。在“编号”栏中出现的数字对应于显示SNP位置的相应基因图谱(图9-73)中出现的数字。在图9-73中,还提供了多态性在公开的基因组数据库中的编号。通过使用表1、附图、和数据库中给出的信息,可以说明与多态性相邻的序列。这些信息是有用的,例如可用于制备与多态性相邻的PCR引物。
上述基因组数据库的实例包括但不限于由NCBI(国家生物技术信息中心,美国)和IMS-JST JSNP数据库网站(基因定型实验室,SNP研究中心,日本理化研究所,日本)提供的服务列表。
4.寡核苷酸探针或寡核苷酸引物的制备
可以根据表1所述核苷酸序列(SEQ ID NO:1-1168)来制备作为引物和/或探针用于本发明检测方法的寡核苷酸,例如在需要检测SNP时,而且可以合成这些序列本身,或者可以设计并合成引物和/或探针,使得它们编码这些序列的一部分。然而,此处应当注意的是,这些引物或探针的核苷酸序列必须包含SNP(表1“序列”栏中以大写字母指示的部分)。本发明还包括这些序列的互补链。
出于例示目的以SNP作为范例,设计引物或探针,使得SNP位点位于引物或探针的核苷酸序列的3′或5′端;或者,设计引物或探针,使得SNP位点位于与其核苷酸序列互补的序列的3′或5′端。或者,设计引物或探针,使得SNP位点位于其核苷酸序列或与其互补的序列的3′或5′端四个核苷酸、优选两个核苷酸以内。或者,设计引物或探针,使得SNP位点位于寡核苷酸全长核苷酸序列的中央。“中央”指中央区,其中由此朝着5′端计数的核苷酸数目与由此朝着3′端计数的核苷酸数目几乎相等。若寡核苷酸的核苷酸数目是奇数,“中央”指中央五个核苷酸,优选中央三个核苷酸,最优选真正中央的一个核苷酸。例如,若寡核苷酸由41个核苷酸组成,则“中央”指第19位至第23位核苷酸,优选第20位至第22位核苷酸,最优选第21位核苷酸。若寡核苷酸的核苷酸数目是偶数,则“中央”指中央四个核苷酸,优选中央两个核苷酸。例如,若寡核苷酸由40个核苷酸组成,则“中央”指第19位至第22位核苷酸,优选第20位核苷酸。在表1“序列”栏所示核苷酸序列中,若多态性是缺失多态性,则这些序列的实际长度是40,一个偶数。因此,若根据这些序列来设计由40个核苷酸组成的寡核苷酸,则“中央”指第19位至第22位核苷酸,优选第20位核苷酸。
当多态位点由多个核苷酸组成时,将探针或引物设计并制备成使得多态位点的核苷酸序列或与其互补的序列的整个或部分包含在探针或引物的核苷酸序列中。当由此制备的寡核苷酸用作探针时,有可能通过杂交或差异杂交的存在与否来测定等位基因。在下文中,将探针或引物DNA中那些与多态位点或其外围位点形成互补链的核苷酸称为“相应核苷酸”。可以设计探针或引物,使得相应核苷酸位于构成多态性的序列上的任何核苷酸处。“外围位点”指构成多态性的序列5′最末端外侧(5′侧)1-3个核苷酸的区域或构成多态性的序列3′最末端外侧(3′侧)1-3个核苷酸的区域。具体而言,可以设计探针或引物中的相应核苷酸,使得5′或3′端核苷酸在形成互补链时位于构成多态性的序列的5′末端侧、3′末端侧、或中央。在本发明中,优选的是,上文所述5′或3′端核苷酸位于构成多态性的序列的中央。还有可能设计相应核苷酸,使得它们位于构成多态性的序列的外围区。
例如,在制备侵入者探针和等位基因探针并通过稍后所述侵入者法来检测表1中PTGDR的No.13(SEQ ID NO:313)中的遗传多态性(TCC)时,可将等位基因探针设计成与多态位点TCC互补的核苷酸(即5′至3′方向的G、G、或A)是等位基因探针的相应核苷酸并杂交(见图4B的小图a-c)。例如,在图4B的小图(a)中,形成互补链的5′最末端相应核苷酸“G”位于构成多态性的核苷酸(TCC)的中央;在图4B的小图(b)中,形成互补链的5′最末端相应核苷酸“A”位于构成多态性的核苷酸(TCC)的“T”处。在图4B的小图(d)中,显示了等位基因探针,它被设计成它的相应核苷酸位于多态位点(下划线部分)的外围区(三个核苷酸)。
设计侵入者探针,使得它的3′端核苷酸“N”(A、T、C、或G之任一)的位置在杂交时对应于多态位点(TCC)任一核苷酸的位置。然而,最有效的是将侵入者探针设计成侵入者探针与等位基因探针之间存在一个核苷酸的重叠(图4C)。另一方面,为了检测另一种多态性(即TCC的缺失),可以设计侵入者探针和等位基因探针,使得在考虑TCC缺失(即由序列进行缺失)后位于缺失位点5′侧或3′侧1-3个核苷酸处的核苷酸将是重叠核苷酸。图4B的小图(e)显示了等位基因探针,它被设计成使得缺失位点两侧的两个核苷酸与其杂交。至于TaqMan探针,它们被设计成使得任何这些核苷酸TCC或缺失位点位于探针的中央。
设计核苷酸序列的长度,使得探针包含至少13个核苷酸,优选13-60个核苷酸,更优选15-40个核苷酸,最优选18-30个核苷酸。此寡核苷酸序列可以作为探针用于检测靶基因,而且它可以用作正向(有义)引物或反向(反义)引物。
本发明中所使用的寡核苷酸可以是由串联的两个区域组成的寡核苷酸,一个区域能够与基因组DNA杂交,而另一个区域不能与其杂交。连接的次序没有特别的限制;任何一个区域都可以位于上游或下游。根据表1所述含SNP序列的信息来设计此寡核苷酸的可杂交区。制备寡核苷酸,使得位于能够与基因组DNA杂交的区域的5′或3′最末端的核苷酸对应于目的SNP。随意设计上述寡核苷酸中不能与基因组DNA杂交的区域,使得它不与表1所述含SNP的序列杂交。此寡核苷酸可以作为探针主要用于在侵入者法中检测SNP。
另外,设计本发明中所使用的引物,使得出于检查由SNP导致的功能变化、判断有效或无效、以及检查副作用的发生的目的而通过PCR进行扩增时表1给出的核苷酸序列包含SNP。设计引物的长度,使得引物包含至少15个核苷酸,优选15-30个核苷酸,更优选18-24个核苷酸。由模板DNA适当选择引物序列,使得扩增片段的长度为1000bp或更少,优选500bp以内(如120-500bp),更优选200bp以内(如120-200bp)。
例如,设计引物,使得有义或反义引物至少其中之一包含在由紧挨着SNP的5′或3′端的核苷酸分别朝着基因的5′或3′末端计数的1000bp、优选200bp、更优选100bp以内的区域中。
可以依照已知技术化学合成由此设计的寡核苷酸引物或探针。通常,用商品化化学合成仪来合成这些引物或探针。
还有可能预先用荧光物质(如FAM、VIC、雷德蒙染料、等)标记探针,从而使检测流程自动化。
5.试剂盒
上文所述寡核苷酸可以包括在遗传多态性检测试剂盒中。本发明的遗传多态性检测试剂盒包含实践本发明所必需的一种或多种成分。例如,本发明的检测试剂盒包含用于保存或供应进行切割测定法(如侵入者测定法)所必需的酶和/或反应成分的成分。本发明的试剂盒包含预定测定法所必需(合适)的任何和所有成分酶或成分。这些成分的实例包括但不限于寡核苷酸、聚合酶(如Taq聚合酶)、缓冲液(如Tris缓冲液)、dNTP、对照试剂(如组织样品、用作阳性和阴性对照的靶寡核苷酸、等)、标记和/或检测试剂(荧光染料诸如VIC、FAM)、固体支持物、指南、例示性图表和/或产品信息、抑制剂、和包装环境调节剂(如冰、干燥剂)。本发明的试剂盒可以是只包含部分必需成分的部分试剂盒。在这种情况中,使用者可以提供其余成分。本发明的试剂盒可以包含两个或多个分开的容器,每个都包含将要使用的部分成分。例如,在试剂盒中,第一个容器包含酶,而第二个容器包含寡核苷酸。酶的具体实例包括在适当保存缓冲液或容器中的结构特异性切割酶。寡核苷酸的具体实例包括侵入者寡核苷酸、探针寡核苷酸、用作对照的靶寡核苷酸、等。或者,可以以这样的方式提供一种或多种反应成分,使得它们预先分成特数量的部分。既然这些试剂盒包含早就定量确定用于本发明方法一个步骤的成分,那么不必再次测量或再次分装。还可以混合选定的反应成分并分成几份特定量。优选的是,反应成分应当预先分成几份并装在反应器中。反应器的具体实例包括但不限于反应管或孔或微量滴定板。尤其优选的是,预先分装的反应成分应当在反应器中通过例如脱水或冻干等手段保持干燥。
6.检测
使用如上所述制备的寡核苷酸作为引物,用DNA聚合酶扩增编码受体的基因(模板DNA)。或者,将如上所述制备的探针与模板DNA杂交,从而检测那些具有目的遗传多态性的DNA。可以依照常规方法来制备模板DNA,如氯化铯梯度离心、SDS裂解法、或酚/氯仿抽提。
(1)通过PCR进行的检测
可以通过聚合酶链式反应(PCR)来进行扩增。有用的DNA聚合酶的具体实例包括LA Taq DNA聚合酶(Takara)、Ex Taq聚合酶(Takara)、Gold Taq聚合酶(Perkin Elmer)、AmpliTaq(Perkin Elmer)、PfuDNA聚合酶(Stratagene)等。
扩增条件如下。变性步骤是于85-105℃保温10-40秒钟,优选于94℃保温20-30秒钟;退火步骤是于50-72℃保温20秒钟至1分钟,优选于60℃保温20秒钟至1分钟;而延伸步骤是于65-75℃保温1-4分钟,优选于72℃保温2-3分钟,以上构成一个循环,进行30-40个循环。然而,为了使模板DNA和引物充分变性,可以在开始上文所述扩增循环之前添加预变性步骤,即于95℃保温1-5分钟[若使用Gold Taq聚合酶(Perkin Elmer),则至少保温8-15分钟,优选10-12分钟]。同样,为了完全延伸扩增的DNA,可以在上述扩增循环之后添加延伸步骤,即于72℃保温1-10分钟。此外,如果不是立即对扩增产物进行检测,那么需要添加保存步骤,即将扩增产物保存于4℃以避免非特异扩增。由此,可以扩增编码受体的基因。
随后,将扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳,随后用溴化乙锭、SYBR绿色溶液等染色,从而以一、二或三条条带(DNA片段)的形式检测扩增产物。由此,可以以DNA片段的形式检测编码受体的基因中包含遗传多态性的一部分。除了琼脂糖凝胶电泳以外,也可以进行聚丙烯酰胺凝胶电泳或毛细管电泳。还有可能使用预先经诸如荧光染料等物质标记的引物进行PCR,并检测扩增产物。还可以采用不需要电泳的检测方法;在这种方法中,将扩增产物结合到固体支持物诸如微型板上,并通过荧光、酶反应、等等手段来检测目的DNA片段。
(2)通过TaqMan PCR进行的检测
TaqMan PCR指使用荧光标记的等位基因特异性寡聚物和Taq DNA聚合酶进行PCR反应的方法。可以根据上文所述SNP信息来设计TaqMan PCR中所使用的等位基因特异性寡聚物(称为“TaqMan探针”)。用荧光报道染料R(如FAM或VIC)标记TaqMan探针的5′末端,同时用淬灭剂Q(淬灭物质)标记它的3′末端(图1)。因此,在这些条件下无法检测到荧光,因为淬灭剂吸收了荧光能量。由于TaqMan探针的3′末端是磷酸化的,因此TaqMan探针在PCR反应过程中不发生延伸反应(图1)。然而,在使用这种TaqMan探针连同Taq DNA聚合酶和设计用于扩增含SNP区域的引物一起进行PCR反应时,发生了下文所述反应。
首先,TaqMan探针与模板DNA中的特定序列发生杂交(图2a),同时由PCR引物发生延伸反应(图2b)。此时,具有5′核酸酶活性的Taq DNA聚合酶在PCR引物进行延伸反应时切割发生杂交的TaqMan探针。在切除TaqMan探针后,荧光染料脱离了淬灭剂的影响。然后,能够检测到荧光(图2c)。
例如,如图3所示,假设有两个等位基因:一个等位基因在SNP位点具有A(等位基因1),而另一个等位基因在SNP位点具有G(等位基因2)。用FAM标记对等位基因1特异的一种TaqMan探针,并用VIC标记对等位基因2特异的另一种TaqMan探针(图3)。将这两种等位基因特异性寡聚物加到PCR试剂中,然后对需要检测SNP的模板DNA进行TaqMan PCR。随后,用荧光检测仪测定FAM和VIC的荧光强度。当等位基因的SNP位点与TaqMan探针内与SNP对应的位点互补时,探针与等位基因发生杂交;并且Taq聚合酶切割探针的荧光染料,使其脱离淬灭剂的影响。结果是,检测到荧光强度。
若模板是等位基因1的纯合子,则辨认出FAM的强烈荧光强度,但是VIC的荧光几乎辨认不出。若模板是等位基因1与等位基因2的杂合子,则可以检测到FAM和VIC二者的荧光。
(3)通过侵入者法进行的SNP检测
侵入者法指通过等位基因特异性寡聚物与模板杂交来检测SNP的方法。在侵入者法中,使用两种未标记的寡聚物和一种荧光标记的寡聚物。两种未标记寡聚物之一称为“等位基因探针”。等位基因探针由两个区域组成,一个区域与基因组DNA(模板DNA)杂交而形成互补双链,另一个区域(称为“flap”)的序列与模板DNA的序列完全无关因,因而不与基因组DNA杂交。位于可杂交区域5′或3′最末端的核苷酸对应于SNP(图4A的小图(a))。上文所述flap序列是序列与稍后所述FRET探针互补的寡核苷酸。另一种寡聚物称为“侵入者探针”。此寡聚物被设计成与由SNP位点朝着基因组DNA的3′端互补杂交(图4A的小图(b))。然而,与SNP对应的核苷酸(图4A的小图(b)中的“N”)可以是任何核苷酸。由此,当基因组DNA(模板)与上文所述两种探针杂交时,侵入者探针的一个核苷酸(N)侵入SNP位点(图4A的小图(c))。结果是,在SNP位点形成三链。
另一方面,荧光标记的寡聚物的序列与等位基因完全无关。不管SNP的类型,该序列是共同的。该探针称为“FRET”探针(荧光共振能量转移探针)(图5)。用荧光染料R标记位于FRET探针(报道剂)5′端的核苷酸,同时将淬灭剂Q连接在报道剂的上游。因此,在这些条件下,淬灭剂吸收荧光染料,因而检测不到荧光。同样设计FRET探针中由5′端报道剂核苷酸起始的某个区域(称为“区域1”),使得它与探针中位于区域1的3′端的某个区域(称为“区域2”)在彼此面对时互补。因此,区域1和区域2在FRET探针内形成互补链(图5)。同样,设计位于此互补链形成区的3′端的区域,使得它与等位基因探针的flap杂交而形成互补链(图5)。
在侵入者法中,使用称为切割酶的一种酶,它是具有独特的内切核酸酶活性(在识别特定DNA结构的基础上进行切割)的酶之一(5′核苷酸酶)。切割酶是在基因组DNA、等位基因探针、和侵入者探针在SNP位点形成三链时在紧挨着SNP位点3′端的点切割等位基因探针的酶。因此,如图4A的小图(c)所示,当三种核苷酸形成三链时,切割酶识别5′flap并切除此flap。结果是,此SNP位点的结构得到切割酶的识别(图6的小图(a)),而且等位基因探针在其flap位点得到切割而释放flap(图6的小图(b))。随后,由等位基因探针释放的flap互补结合FRET探针,因为它具有与FRET探针互补的序列(图6的小图(c))。此时,fla 的SNP位点侵入FRET探针中早就形成了互补结合区的部分。切割酶再次识别此结构,并切除被荧光染料标记的核苷酸。由此切除的荧光染料不再受淬灭剂的影响,并发出荧光(图6的小图(d))。当SNP与等位基因探针中与SNP对应的核苷酸不匹配时,不形成切割酶能够识别的特定DNA结构,如图7所示。因此,探针不受切割,也检测不到荧光。
例如,当SNP是T/C时,制备T的侵入者探针和等位基因探针,以及具有与SNP对应的FAM相连报道剂的FRET探针。另外,同样制备C的侵入者探针和等位基因探针,以及具有与SNP对应的VIC相连报道剂的FRET探针。然后,将它们混合以进行SNP检测。结果是,若SNP是T/T纯合子,则发出FAM的荧光;若SNP是C/C纯合子,则发出VIC的荧光;而若SNP是T/C杂合子,则发出FAM和VIC二者的荧光。因为FAM和VIC具有不同的荧光波长,所以可以将它们区分开来。可以用荧光读板仪或用于收集反应过程中生成的荧光数据的装置(实时荧光检测仪)来检测被荧光染料标记的产物。实时荧光检测仪的具体实例包括ABI 7700序列检测系统(Applied Biosystems)。
(4)通过SniPer法进行的检测
为了通过SniPer法检测SNP,有可能通过检查RCA扩增的存在与否来区分等位基因。简而言之,将将要用作模板的基因组DNA线性化。然后,将探针与此基因组DNA杂交。当探针序列和作为模板的基因组DNA的序列彼此互补并形成互补链时,基因组DNA可以通过连接反应而转变成环状DNA。结果是,环状DNA进行RCA。另一方面,当探针的末端与基因组DNA不匹配时,DNA不连接成为环状DNA。因此,不进行RCA反应。由此,在Sniper法中,设计与基因组DNA退火且能够环化的单链探针。此单链探针称为挂锁探针(padlock probe)。设计此挂锁探针两个末端的序列,使得它们对应于将要检测的SNP。然后,将此挂锁探针与基因组DNA混合以进行连接。若挂锁探针的两个末端与基因组DNA的SNP位点彼此互补,则挂锁探针的两个末端通过连接相连,生成环状探针。若挂锁探针的两个末端与基因组DNA的SNP位点彼此不互补,则探针不变成环状。因此,只有那些与待检测SNP互补的挂锁探针变成环状,并通过DNA聚合酶得到扩增。通过检测这种扩增的存在与否,可以检测SNP。为了检测,使用在它们的相应末端分别具有荧光染料和淬灭剂且还具有发夹结构的合成寡核苷酸。
(5)通过MALDI-TOF/MS法进行的检测
MALDI-TOF/MS(Matrix Assisted Laser Disorption-Time ofFlight/Mass Spectrometry)是一种在SNP定型中使用质谱仪的方法。
此方法由下列步骤组成。
(i)含SNP的DNA片段的PCR扩增和纯化
设计PCR引物,使得它们与SNP位点的核苷酸之间没有重叠。然后扩增DNA片段。通过外切核酸酶、碱性磷酸酶等处理除去引物、dNTP等,从而由扩增反应产物纯化扩增片段。
(ii)引物延伸(热循环)和纯化
向靶区(即PCR产物)的模板中加入十倍或更多的引物,并通过热循环进行引物延伸。设计此处所用引物,使得它们的3′末端与SNP位点的核苷酸毗邻。引物的长度为15-30个核苷酸,优选20-25个核苷酸。在进行多聚体(multiplex)反应时,向5′末端添加与模板不互补的序列。在85-105℃(优选94℃)与35-40℃(优选37℃)这两个温度之间进行20-30个循环(优选25个循环)的热循环。用纯化试剂盒等纯化由此得到的反应产物,使之适于质谱仪。
(iii)用质谱仪对DNA进行质谱术
将纯化后的延伸反应产物施加到质谱仪上以测定目标产物的质量。简而言之,将纯化产物与基质混匀,并将0.5-1.0μl混合液点到MALDI板上。将板干燥后,将激光施加到样品上以制备光谱图。
(6)通过DNA测序法进行检测
在本发明中,可以通过单核苷酸延伸反应来检测多态性。简而言之,向含有目的基因的反应系统中加入用不同荧光化合物标记的四种双脱氧核苷酸。然后,进行单核苷酸延伸反应。在这种情况中,待延伸的核苷酸即多态位点。同样,进行终止DNA合成和用荧光标记DNA分子的3′末端这两种反应。将四种反应液在测序胶的相同泳道或毛细管上进行电泳。用荧光检测仪检测用于标记的荧光染料的差异,从而将DNA条带测序。或者,用荧光检测系统或质谱系统等等检查经过单核苷酸延伸的寡核苷酸,从而根据荧光染料的差异确定哪种核苷酸得到延伸。除了荧光标记的双脱氧核苷酸以外,引物也可以是荧光标记的,并且与未标记的双脱氧核苷酸一起使用。
(7)DNA微阵中的检测
DNA微阵指上面固定了核苷酸探针的固体支持物,包括DNA芯片、基因芯片、微型芯片、珠阵等。
作为DNA微阵(如DNA芯片)测定法的具体实例,可以给出GeneChip测定法(Affymetrix;美国专利号6,045,996、5,925,525、和5,858,659)。GeneChip技术使用固定在芯片上的寡核苷酸探针的小型、高密度微阵。例如,通过光照化学合成法(Affymetrix)(这是固相化学合成法和半导体工业中使用的光刻生产技术的联合应用)来制造探针阵列。通过使用光刻掩模使得芯片化学反应位点的边界清楚,并进行特定化学合成步骤,由此可以构建将寡核苷酸探针固定在设计位置的高密度阵列。在大型玻璃基板上同时合成多探针阵列。随后,将此基板干燥,并将单个探针阵列包装在注射塑造的塑料盒中。此盒保护阵列免于外界环境的影响,还担当杂交室。
首先,将待分析的多核苷酸进行分离、通过PCR扩增、并用荧光报道基团标记。然后,使用流体站将经标记DNA与阵列一起保温。将此阵列插入扫描仪中以检测杂交模式。以结合在探针阵列上(即掺入靶序列)的荧光报道基团的发光的形式收集杂交数据。通常,与靶序列完全匹配的探针产生的信号比有些部分与靶序列不匹配的那些探针要强。由于阵列上各个探针的序列和位置是已知的,因此有可能根据互补来确定与探针阵列反应的靶多核苷酸的序列。
在本发明中,还有可能使用具有电子方式捕获的探针的DNA微型芯片(Nanogen;参阅例如美国专利号6,017,696、6,068,818、和6,051,380)。通过使用微电子学,Nanogen的技术能够向/由半导体微型芯片上的特定测试位点转移带电分子,并将它们浓缩。将对某些SNP或变异特异的DNA捕获型探针以电子方式排列在微型芯片的特定位点上或分派地址。由于DNA带强烈负电,因此它能够以电方式移动至带正电区域。
首先,用正电荷以电子手段激活微型芯片上的测试位点或一排测试位点。然后,将含DNA探针的溶液加到微型芯片上。由于带负电荷的探针快速移动至带正电区域,因此探针在微型芯片的该位点上浓缩并与其化学结合。清洗此微型芯片,并将另一种DNA探针溶液加到微型芯片上,使得DNA探针特异结合芯片。
随后,分析测试样品中是否存在靶DNA分子。通过判断与测试样品中互补DNA杂交的DNA捕获探针的类型来进行这种分析。测试样品可以有例如通过PCR扩增的目的基因。通过使用电荷,靶分子可以移动至微型芯片上的一个或多个测试位点并浓缩。由于样品DNA在各个测试位点处的电子浓缩,样品DNA和与其互补的捕获探针之间的杂交快速进行。例如,由于这些操作,杂交在几分钟内发生。为了由各个测试位点清除未结合的DNA或非特异结合的DNA,将该位点的极性或电荷转变成负电荷,从而使未结合的DNA或非特异结合的DNA返回溶液。在这种方法中,可以使用例如利用激光的荧光扫描仪来检测特异结合。
另外,在本发明中,还有可能使用利用因表面张力差异而在平面(芯片)上的流体分离现象的阵列技术(ProtoGene;参阅例如美国专利号6,001,311、5,985,551、和5,474,796)。ProtoGene技术基于流体因化学涂层造成的表面张力差异而在平面上彼此分离的事实。由于可以根据上文所述原理来分离寡核苷酸探针,因此有可能通过含探针试剂的喷墨印刷而直接在芯片上合成探针。将具有由表面张力限定的反应位点的阵列安置在位于一组(4个)压电喷管下面的X/Y移动台上。每个压电喷管分别含有四种标准DNA核苷酸。此移动台沿阵列的每行移动,从而向每个反应位点供应适当试剂(如amidite)。将阵列的整个表面浸泡在对阵列中的测试位点共同的试剂中,然后是清洗液。随后,旋转阵列以除去这些溶液。
使用Protogene技术将对待检测的SNP或变异特异的DNA探针固定在芯片上。然后,使芯片接触通过PCR扩增的目的基因。杂交后,清除未结合的DNA,随后通过适当方法来检测杂交。
另外,有可能使用“珠阵”(Illumina公司;参阅例如PCT国际公开号WO 99/67641和WO 00/39587)来检测多态性。Illumina公司利用了珠阵技术,其中联合使用了经历自我联合的光纤束与珠和阵列。根据光纤束的直径,每个光纤束具有数百万条纤维。用对于检测某些SNP或变异特异的寡核苷酸包被珠。将各种类型的珠以特定量混合从而形成阵列特异集合。为了测定,使珠阵接触由受试者制备的样品。然后,通过任何适当方法来检测杂交。
7.药物评估
在本发明中,根据如上所述获得的SNP的检测结果等等,有可能评估由受体介导的药物的功效和安全性。
药物评估可以通过定型系统来进行。简而言之,依照上文所述任一种检测方法,比较毒性(副作用)发生组与未发生组之间的等位基因频率。选择导致两组之间等位基因频率差异的多态性作为认可毒性发生的指标。作为统计学检验,通常进行χ方检验,但是也可以使用其它统计学处理,诸如Fisher检验。使用这些结果作为指标,也有可能允许配体对受体的结合活性、药物对结合活性的抑制效果的强度、配体刺激具有受体的细胞等等后的细胞应答和药物对效果的抑制活性、受体的表达水平等反应配体的结合水平、抗受体抗体的结合水平等。对于所有遗传多态性,检查与作用或毒性的因果关系。然后,只选择那些显示与作用或毒性有关的遗传多态性位点。通过在反应板、卡、玻璃基片等上预先制备用于分析遗传多态性的所有探针或引物以及每种技术所必需的试剂,并添加人类受试者的基因组DNA用于反应,由此可以检查等位基因模式。当受试者具有与作用或毒性有关的遗传多态性时,有可能预测药物在该受试者中是否会展示功效或毒性。可以以相似方式评估药物的功效。同样,与副作用或功效有关的遗传多态性随药物而变化。因此,通过对每种药物的相关遗传多态性进行定型,有可能预测相关药物的功效或副作用。
由此,将相关遗传多态性的频率与有效/无效或存在/缺乏副作用进行比较。当存在等位基因频率差异时,可以对相关药物做出判断。
例如,若在施用药物A后显示毒性(副作用)的个体的SNP分析结果在统计学上显示90%的那些个体具有T/T(如检测FAM的荧光强度),而且若未显示毒性(副作用)的个体的SNP分析结果显示只有10%的那些个体具有T/T而他们的90%具有C/C,则可以将药物A评估为不应当对具有T/T的个体进行给药。
8.药物筛选
可以将本发明中如上所述获得的遗传多态性信息与编码相应受体的受试者基因或与其互补的序列的遗传多态性信息进行比较。由此,上述信息可以作为指标用于分析作用于受体的药物(即由受体介导的药物)的功效和安全性。还可能使用上文所述遗传多态性信息来分析药物功效和安全性方面的个体差异。因此,本发明中获得的遗传多态性信息可以作为信息源,用于选择最有效的药物来治疗疾病,或者用于选择将要使用的药物和/或药物的剂量。
至于方法,可以使用“7.药物的评估”中描述的评估方法。简而言之,可以这样说,在上述分部中认为与副作用或功效有关的遗传多态性影响配体结合相关受体的能力、受体的信号转导能力、以及由转录/翻译衍生的受体表达水平。同样,遗传多态性与副作用或功效的发生机制具有任何因果关系,甚至是间接的。药物制造商等在临床前试验或临床试验中检查并确认了药物的敏感性。因此,若位于编码酶的基因中的遗传多态性中存在与严重副作用有关的多态性,则有可能缺失它或有条件的使用药物。在功效方面,可以进行相似评估。根据关于副作用和功效的这些信息,有可能进行药物筛选。
另外,通过在临床试验(由I期至III期试验)中对有副作用发生的志愿者的病例和无副作用发生的病例进行遗传多态性频率分析,有可能检测与副作用或功效有关的上文所述多态性以外的新遗传多态性。通过以与上文所述相同的方式检查这些多态性,有可能进行药物筛选。
附图简述
图1显示了TaqMan探针。
图2显示了TaqMan PCR法的略图。
图3显示了用荧光染料标记的探针。
图4A显示了侵入者法的略图。
图4B显示了侵入者探针与等位基因探针之间的位置关系。
图4C显示了侵入者探针与等位基因探针之间的位置关系。
图5显示了FRET探针。
图6显示了侵入者法的略图。
图7显示了不与等位基因匹配的探针。
图8显示了通过连接反应区分等位基因的略图。
图9显示了CD20(CD20抗原基因)的结构和SNP的位置。
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图10显示了CD33[CD33抗原(gp67)基因的结构和SNP的位置。
登录号:AC063977.5
图11显示了CSF3R[集落刺激因子3受体(粒细胞)基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AL445245.3
图12显示了IL1R1(I型白介素1受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC007271.3
图13显示了IL1R2(II型白介素1受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC005035.1、AC007165.3
图14显示了IL2R(白介素-2受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL157395.16、AL137186.18
图15显示了HER2(c-erb-B-2基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC079199.3
图16显示了IFNAR1[干扰素(α、β、和ω)受体1基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AP001716.1
图17显示了PGR(孕酮受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC020735.5
图18显示了ACTH[黑皮质素2受体(MC2R)基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AP001086.4和Y10259.1
图19显示了ICAM1[细胞间粘附分子1(CD54),人鼻病毒受体基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AC011511.9
图20显示了VCAM1(脉管细胞粘附分子1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL157715.5
图21显示了ITGB2[白细胞整合蛋白,β2(抗原CD18(p95);淋巴细胞功能相关抗原1;巨噬细胞抗原1(mac-1)β亚基)基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AL163300.2
图22显示了PTGDR[前列腺素D2受体(DP)基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AL355833.4
图23显示了PTGER1[前列腺素E受体1(亚型EP1),42kD基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AC008569.6
图24显示了PTGER2[前列腺素E受体2(亚型EP2),53kD基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AL365475.1
图25显示了PTGER3(前列腺素E受体3基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL031429.11、AL158087.11
图26显示了PTGFR[前列腺素F受体(FP)基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AL136324.6
图27显示了GNA12(血栓烷A2受体/G蛋白α12基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC006028.3
图28显示了TBXA2R(血栓烷A2受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC005175.1
图29显示了BLTR2(七跨膜受体BLTR2基因;白三烯B4受体BLT2基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL096870.5
图30显示了CYSLT1(半胱氨酰白三烯受体1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL445202.21
图31显示了CYSLT2(半胱氨酰白三烯受体2基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL137118.20
图32显示了PTAFR(血小板激活因子受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC027421.3
图33显示了BDKRB1(缓激肽受体B1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL355102.5
图34显示了BDKRB2(缓激肽受体B2基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AF378542.2
图35显示了ADRB1(肾上腺素能β-1-受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC005886.2
图36显示了ADRB2(肾上腺素能β-2-受体表面基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC011334.4
图37显示了HRH1(组胺H1受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC020750.3
图38显示了HRH2(组胺H2受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AB023486.1
图39显示了HRH3(组胺H3受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL078633.32
图40显示了HTR3A[5-羟色胺(血清素)受体3A基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AP001874.3
图41显示了AGTR1(血管紧张素受体1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC024897.23
图42显示了AGTRL1(血管紧张素受体样1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AP001786.4
图43显示了AGTR2(血管紧张素受体2基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC069480.2
图44显示了AVPR1A(精氨酸血管升压素受体1A基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC025525.3
图45显示了AVPR2(精氨酸血管升压素受体2基因)的结构和SNP的位置。
登录号:U52112.1
图46显示了PTGIR[前列腺素I2(前列环素)受体(IP)基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AC025983.3
图47显示了DRD1(多巴胺受体D1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC091393.1
图48显示了ITGA2B[整合蛋白α2b(IIb/IIIa复合物的血小板糖蛋白IIb,抗原CD41B)基因]的结构和SNP的位置。
登录号:AC019152.5
图49显示了FOLR1(叶酸受体1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:U20391.1
图50显示了TNFR1(肿瘤坏死因子受体1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC006057.5
图51显示了ADORA2A(腺苷A2a受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AP000355.1
图52显示了AVPR1B(精氨酸血管升压素受体1B基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AF152238.1
图53显示了MC2R(黑皮质素2受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AP001086.4和Y10259.1
图54显示了ADORA1(腺苷A1受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC105940.2
图55显示了ADORA2B(腺苷A2b受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC006251.3
图56显示了ADORA3(腺苷A3受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL390195.10
图57显示了ADRA1A(肾上腺素能α-1A-受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC025712.4
图58显示了ADRA2A(肾上腺素能α-2A-受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL158163.11
图59显示了ADRA2B(肾上腺素能α-2B-受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC092603.2
图60显示了EDG1(内皮分化、鞘脂G-蛋白偶联受体1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL109741.19
图61显示了EDG4(内皮分化、溶血磷脂酸G-蛋白偶联受体4基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC011458.7
图62显示了EDG5(内皮分化、鞘脂G-蛋白偶联受体5基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC011511.12
图63显示了GPR1(G蛋白偶联受体1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC007383.4
图64显示了GPR2(G蛋白偶联受体2基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC027146.1
图65显示了GPR3(G蛋白偶联受体3基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL096774.9
图66显示了GPR4(G蛋白偶联受体4基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC011480.3
图67显示了MC1R(黑皮质素1受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC092143.3
图68显示了MC3R(黑皮质素3受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL139824.22
图69显示了MC4R(黑皮质素4受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC091576.11
图70显示了OXTR(催产素受体基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AF176315.2
图71显示了SSTR1(抑生长素受体1基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AL450109.3
图72显示了SSTR3(抑生长素受体3基因)的结构和SNP的位置。
登录号:Z82188.2
图73显示了GPR10(G蛋白偶联受体10基因)的结构和SNP的位置。
登录号:AC067895.2
用于执行本发明的最佳模式
下面,将参照下文实施例更具体的描述本发明。然而,本发明的技术范围不限于此实施例。
实施例1:SNP信息的获取
(1)DNA提取
在存在EDTA时由彼此没有血缘关系的48名个体采集血样。如下所述,依照《Genome Analysis Laboratory Manual》即基因组分析实验室手册(Yusuke Nakamura编,Springer Verlag,东京)所述方法进行DNA提取。
将10ml血样转移到50ml Falcon管中,并于室温以3000rpm离心5分钟。用移液器除去上清液(血清)后,加入30ml RBC裂解缓冲液(10mM NH4HCO3、144mM NH3Cl),并混匀直至沉淀松开。然后,将混合物于室温静置20分钟。于室温以3000rpm离心5分钟后,用移液器除去上清液(血清),获得白细胞沉淀。加入30ml RBC裂解缓冲液,并将上述操作重复两次。向由此得到的白细胞沉淀中加入4ml蛋白酶K缓冲液(50mM Tris-HCl(pH7.4)、100mM NaCl、1mM EDTA(pH8.0))、200μl 10% SDS、和200μl 10mg/ml蛋白酶K,并颠倒混匀。将由此得到的混合物于37℃静置过夜。随后,向混合物中加入4ml酚,然后在旋转器(Rotat或T-50,Taitec)中缓慢颠倒4小时混匀。于室温以3000rpm离心10分钟后,将由此得到的上层收集到一个新管中。向管中加入4ml酚/氯仿/异戊醇(体积比25∶24∶1),并以与上文所述相同的方式颠倒2小时混匀。然后,将混合物离心。将由此得到的上层收集到一个新管中,向管中加入4ml氯仿/异戊醇(体积比24∶1),并以与上文所述相同的方式颠倒30分钟混匀。然后,将混合物离心。将由此得到的上层收集到一个新管中,向管中加入400μl 8M醋酸铵和4ml异丙醇,并颠倒混匀。将白色丝状沉淀(DNA)回收到2ml管中,向管中加入1ml 70%乙醇,并颠倒混匀。将DNA回收到新的2ml管中,并晾干。然后,加入500μl TE溶液(10mM Tris-HCl(pH7.4)、1mMEDTA(pH7.4))进行裂解,从而得到基因组DNA样品。
(2)PCR
由GenBank DNA数据库获得基因组序列。使用RepMask电脑程序清除重复序列后,设计PCR引物,使得PCR产物的长度为大约1kb。使用由彼此没有血缘关系的48名个体获得的且配制成相同浓度的DNA样品作为基因组DNA。每三名个体的DNA样品在一个管中等量混匀。在PCR中使用60ng这种混合物。使用Ex-Taq(2.5U;Takara)和GeneAmpPCR System 9700(PE Applied Biosystems)进行PCR。于94℃反应2分钟后,进行35个循环:于94℃变性30秒钟,于60℃或55℃退火30秒钟,并于72℃延伸1分钟。
(3)测序
使用ArrayIt(Telechem)纯化PCR产物,并使用BigDyeTerminator RR Mix(PE Applied Biosystems)进行测序反应。简而言之,使用GeneAmp PCR System 9700(PE Applied Biosystems),于96℃反应2分钟后,进行25个循环:于96℃变性20秒钟,于50℃退火30秒钟,并于60℃延伸4分钟。测序反应后,使用ABI PRISM3700 DNA分析仪分析序列。
(4)SNP的检测
使用PolyPhred电脑程序(Nickerson等人,1997,Nucleic AcidsRes.,25:2745-2751)检测并分析SNP。
(5)结果
关于SNP获得的结果如表1所示。图9-73显示了经过分析的受体的名称、缩写、和GenBank数据库登录号、编码它们的基因的结构、以及SNP的位置。在图9-73中,外显子在以水平线表示的相关基因上以空心方框或黑线表示。在基因的上面用实线指出了SNP的位置,并提供了数字。在图9-40和49-73中,在相关基因的下面用实线指出了SNP以外的多态性的位置,并提供了数字。
工业适用性
依照本发明,提供了用于分析SNP的方法。依照本发明的方法,有可能选择适用于目标疾病的药物。因此,本发明的方法极其有用。
序列表
SEQ ID NO:21:n代表t重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:22:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:23:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:24:n代表ca重复8-10次(第21位)。
SEQ ID NO:25:n代表插入gact(第21位)。
SEQ ID NO:27:n代表a重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:43:n代表c重复8-10次(第21位)。
SEQ ID NO:44:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:45:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:46:n代表插入a(第21位)。
SEQ ID NO:85:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:86:n代表插入g(第21位)。
SEQ ID NO:88:n代表aaac重复6-11次(第21位)。
SEQ ID NO:89:n代表a重复9-12次(第21位)。
SEQ ID NO:90:n代表t重复11-13次(第21位)。
SEQ ID NO:91:n代表t重复10-14次(第21位)。
SEQ ID NO:92:n代表t重复20-26次(第21位)。
SEQ ID NO:93:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:94:n代表ct重复4-6次(第21位)。
SEQ ID NO:95:n代表a重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:96:n代表g重复7-11次(第21位)。
SEQ ID NO:129:n代表tt或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:130:n代表ga重复10-11次(第21位)。
SEQ ID NO:131:n代表tt或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:132:n代表t重复19-22次(第21位)。
SEQ ID NO:133:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:134:n代表a重复15-18次(第21位)。
SEQ ID NO:135:n代表a重复7-8次(第21位)。
SEQ ID NO:169:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:170:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:171:n代表a重复12-14次或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:172:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:174:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:176:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:177:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:178:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:190:n代表gt重复5-14次(第21位)。
SEQ ID NO:191:n代表a重复9-11次(第21位)。
SEQ ID NO:196:n代表插入tg(第21位)。
SEQ ID NO:198:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:199:n代表ac重复7-8次(第21位)。
SEQ ID NO:219:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:220:n代表插入tt(第21位)。
SEQ ID NO:222:n代表ga重复3-30次和gt重复3-30次(第21位)。
SEQ ID NO:231:n代表t重复12-14次(第21位)。
SEQ ID NO:249:n代表gcag或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:250:n代表ca或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:251:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:252:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:253:n代表a重复12-15次(第21位)。
SEQ ID NO:254:n代表t重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:255:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:256:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:295:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:296:n代表ag或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:297:n代表插入c(第21位)。
SEQ ID NO:299:n代表ttcc或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:300:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:313:n代表tcc或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:314:n代表a重复10-11次(第21位)。
SEQ ID NO:315:n代表tcagg或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:316:n代表t重复11-12次(第21位)。
SEQ ID NO:330:n代表gg或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:331:n代表插入tg(第21位)。
SEQ ID NO:333:n代表t重复7-8次(第21位)。
SEQ ID NO:344:n代表c重复6-9次(第21位)。
SEQ ID NO:345:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:346:n代表t重复9-10次(第21位)。
SEQ ID NO:347:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:348:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:349:n代表ttta或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:350:n代表a重复12-14次(第21位)。
SEQ ID NO:478:n代表actt或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:479:n代表插入ca(第21位)。
SEQ ID NO:481:n代表t重复7-8次(第21位)。
SEQ ID NO:482:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:483:n代表t重复11-13次(第21位)。
SEQ ID NO:484:n代表t重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:485:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:486:n代表t重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:487:n代表t重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:488:n代表aatt或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:489:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:491:n代表at重复9-11次(第21位)。
SEQ ID NO:492:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:493:n代表插入cact(第21位)。
SEQ ID NO:495:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:496:n代表gaa或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:497:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:499:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:500:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:501:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:502:n代表a重复10-15次(第21位)。
SEQ ID NO:503:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:504:n代表插入a(第21位)。
SEQ ID NO:506:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:536:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:538:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:539:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:540:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:541:n代表t重复21-37次(第21位)。
SEQ ID NO:542:n代表a重复21-28次(第21位)。
SEQ ID NO:543:n代表t重复8-10次(第21位)。
SEQ ID NO:544:n代表a重复9-13次(第21位)。
SEQ ID NO:545:n代表t重复9-11次(第21位)。
SEQ ID NO:579:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:580:n代表ca或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:581:n代表插入a(第21位)。
SEQ ID NO:583:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:584:n代表ag或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:585:n代表t重复12-15次或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:586:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:588:n代表插入aaa(第21位)。
SEQ ID NO:590:n代表插入c(第21位)。
SEQ ID NO:592:n代表cct或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:593:n代表插入g(第21位)。
SEQ ID NO:595:n代表aatt或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:628:n代表插入gat(第21位)。
SEQ ID NO:630:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:635:n代表t重复12-15次(第21位)。
SEQ ID NO:636:n代表a重复22-26次(第21位)。
SEQ ID NO:657:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:659:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:660:n代表插入gtccactaaa(第21位)。
SEQ ID NO:662:n代表插入gtccactaaatgattgataattg(第21位)。
SEQ ID NO:663:n代表插入tgattgataattg(第21位)。
SEQ ID NO:664:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:665:n代表t重复16-18次(第21位)。
SEQ ID NO:666:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:670:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:679:n代表a重复11-13次(第21位)。
SEQ ID NO:680:n代表t重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:681:n代表a重复19-24次(第21位)。
SEQ ID NO:682:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:683:n代表t重复15-22次(第21位)。
SEQ ID NO:684:n代表a重复7-9次(第21位)。
SEQ ID NO:685:n代表a重复20-28次(第21位)。
SEQ ID NO:693:n代表a重复11-14次(第21位)。
SEQ ID NO:694:n代表c重复10-13次(第21位)。
SEQ ID NO:696:n代表a重复18-21次(第21位)。
SEQ ID NO:697:n代表a重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:698:n代表aaaat或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:699:n代表插入gaaat(第21位)。
SEQ ID NO:706:n代表a重复18-24次(第21位)。
SEQ ID NO:712:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:725:n代表a重复15-17次(第21位)。
SEQ ID NO:726:n代表gt重复15-21次(第21位)。
SEQ ID NO:727:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:728:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:729:n代表a重复9-11次(第21位)。
SEQ ID NO:731:n代表t重复2-4次(第21位)。
SEQ ID NO:733:n代表taag或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:739:n代表插入cttt(第21位)。
SEQ ID NO:742:n代表t重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:746:n代表tagacatttctta或gtagc(第21位)。
SEQ ID NO:747:n代表a重复4-5次(第21位)。
SEQ ID NO:753:n代表tg或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:762:n代表at重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:777:n代表t重复8-10次(第21位)。
SEQ ID NO:779:n代表ca重复6-7次(第21位)。
SEQ ID NO:781:n代表gttac或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:798:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:808:n代表插入at(第21位)。
SEQ ID NO:810:n代表at或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:812:n代表t重复11-18次(第21位)。
SEQ ID NO:817:n代表a重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:818:n代表gtgt或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:821:n代表a重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:823:n代表t重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:824:n代表t重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:833:n代表t重复6-7次(第21位)。
SEQ ID NO:835:n代表gt重复13-15次(第21位)。
SEQ ID NO:845:n代表t重复11-13次(第21位)。
SEQ ID NO:846:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:851:n代表a重复6-7次(第21位)。
SEQ ID NO:859:n代表插入cct(第21位)。
SEQ ID NO:870:n代表t重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:876:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:877:n代表插入caggggctc(第21位)。
SEQ ID NO:879:n代表a重复10-11次(第21位)。
SEQ ID NO:886:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:897:n代表ctccct或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:898:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:900:n代表ttttt或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:901:n代表插入cc(第21位)。
SEQ ID NO:903:n代表插入agaaatttctagctgcctgcatttctagcagccca(第21位)。
SEQ ID NO:913:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:949:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:950:n代表gtt重复8-9次(第21位)。
SEQ ID NO:952:n代表c或缺失(location:25)。
SEQ ID NO:964:n代表tt或缺失(location:34)。
SEQ ID NO:971:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:972:n代表插入tt(第21位)。
SEQ ID NO:974:n代表ga重复3-30次和gt重复3-30次(第21位)。
SEQ ID NO:975:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:982:n代表a重复7-8次(第21位)。
SEQ ID NO:1005:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1006:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1007:n代表a重复12-14次(第21位)。
SEQ ID NO:1008:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:1010:n代表ac重复7-8次(第21位)。
SEQ ID NO:1028:n代表t重复12-15次(第21位)。
SEQ ID NO:1031:n代表a重复11-13次(第21位)。
SEQ ID NO:1032:n代表t重复10-12次(第21位)。
SEQ ID NO:1033:n代表a重复19-24次(第21位)。
SEQ ID NO:1035:n代表a重复11-14次(第21位)。
SEQ ID NO:1036:n代表a重复18-21次(第21位)。
SEQ ID NO:1043:n代表插入a(第21位)。
SEQ ID NO:1059:n代表插入ca(第21位)。
SEQ ID NO:1067:n代表aac或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1068:n代表aac或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1079:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:1081:n(第21位)代表acctgtagcgctgcgctacccaa,并且n(第22位)代表插入gatg或缺失。
SEQ ID NO:1082:n代表插入gatg或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1083:n(第20位)代表插入acctgtagcgctgcgctacccaa,并且n(第21位)代表插入gatg或缺失。
SEQ ID NO:1084:n代表插入acctgtagcgctgcgctacccaa(第20位)。
SEQ ID NO:1089:n代表ttttcaattaggcaa或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1090:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1091:n代表tttcttttcacaa或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1093:n代表t或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1094:n代表g或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1101:n代表插入t(第21位)。
SEQ ID NO:1105:n代表插入g或缺失(第23位)。
SEQ ID NO:1107:n代表插入t(第32位)。
SEQ ID NO:1110:n(第19位)代表插入c或g,n(第21位)代表g或缺失。
SEQ ID NO:1111:n(第10位)代表插入t或g,n(第21位)代表插入t。
SEQ ID NO:1112:n代表插入t或g(第10位)。
SEQ ID NO:1113:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1117:n代表c或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1123:n代表gcccagctgg或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1143:n代表插入a(第21位)。
SEQ ID NO:1161:n代表a或缺失(第21位)。
SEQ ID NO:1162:n代表ttccttccac或缺失(第21位)。
Claims (24)
1.用于检测遗传多态性的方法,包括:生成寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得探针和/或引物包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点,或者,当编码受体的所述基因和与其互补的所述序列至少其中之一得到扩增时,使得多态位点包含在扩增片段中;并使用由此生成的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物检测编码受体的受试者基因中的至少一种遗传多态性。
2.用于检测遗传多态性的方法,包括:生成寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得探针和/或引物包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点,或者,当编码受体的所述基因和与其互补的所述序列至少其中之一得到扩增时,使得多态位点包含在扩增片段中;并且使用由此生成的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物检测编码受体的受试者基因中的至少一种遗传多态性;其中所述多态位点是在SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列或与其互补的序列中存在的至少一种多态位点。
3.用于检测遗传多态性的方法,包括:生成寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得探针和/或引物包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点,或者,当编码受体的所述基因和与其互补的所述序列至少其中之一得到扩增时,使得多态位点包含在扩增片段中;并且使用由此生成的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物检测编码受体的受试者基因中的至少一种遗传多态性;其中所述寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物是至少一种选自具有SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列中含多态位点的至少13个核苷酸的序列或与含多态位点的至少13个核苷酸的序列互补的序列的探针和引物组的类型。
4.依照权利要求3的方法,其中寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物的长度是13-60个核苷酸。
5.依照权利要求1-4任一项的方法,其中关于多态位点的信息如表1所示。
6.依照权利要求1-5任一项的方法,其中生成含多态位点的寡核苷酸探针和/或寡核苷酸引物,使得位于其5′或3′末端或其中央部分的核苷酸是多态位点。
7.依照权利要求1-5任一项的方法,其中含多态位点的寡核苷酸探针是由彼此相连的两个片段组成的,一个片段能够与编码受体的基因或与其互补的序列杂交,另一个片段不能与其杂交,而且所述多态位点位于可杂交片段的5′或3′末端。
8.依照权利要求1-7任一项的方法,其中多态性是单核苷酸多态性、由多个核苷酸的缺失、替代、或插入引起的多态性、或VNTR或微卫星多态性。
9.用于评估药物的方法,包括:根据通过依照权利要求1-8任一项的方法获得的检测结果评估由受体介导的药物的功效和安全性。
10.用于评估药物的方法,包括:根据通过依照权利要求1-8任一项的方法获得的检测结果评估由受体介导的药物的敏感程度。
11.用于选择药物的方法,包括:使用通过依照权利要求9或10的方法获得的评估结果作为指标来选择将要使用的药物。
12.用于选择药物的方法,包括:将编码受体的基因或与其互补的序列中的多态性信息与由受试者获得的编码受体的基因或与其互补的序列中的多态性信息进行比较;在由受体介导的药物的功效和/或安全性方面分析个体差异;并根据获得的分析结果选择将要使用的药物和/或药物的剂量。
13.依照权利要求1-12任一项的方法,其中受体是选自下组的至少一种:CD20,CD33,CSF3R,IL1R1,IL1R2,IL2R,HER2,IFNAR1,PGR,ACTH,ICAM1,VCAM1,ITGB2,PTGDR,PTGER1,PTGER2,PTGER3,PTGFR,GNA12,TBXA2R,BLTR2,CYSLT1,CYSLT2,PTAFR,BDKRB1,BDKRB2,ADRB1,ADRB2,HRH1,HRH2,HRH3,HTR3A,AGTR1,AGTRL1,AGTR2,AVPR1A,AVPR2,PTGIR,DRD1,ITGA2B,FOLR1,TNFR1,ADORA1,ADORA2A,ADORA2B,ADORA3,AVPR1B,ADRA1A,ADRA2A,ADRA2B,EDG1,EDG4,EDG5,GPR1,GPR2,GPR3,GPR4,GPR10,MC1R,MC2R,MC3R,MC4R,OXTR,SSTR1和SSTR3。
14.一种寡核苷酸,它被制备成包含在编码受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点。
15.一种寡核苷酸,它被制备成包含在编码选自下组的任何受体的基因或与其互补的序列中存在的多态位点:CD20,CD33,CSF3R,IL1R1,IL1R2,IL2R,HER2,IFNAR1,PGR,ACTH,ICAM1,VCAM1,ITGB2,PTGDR,PTGER1,PTGER2,PTGER3,PTGFR,GNA12,TBXA2R,BLTR2,CYSLT1,CYSLT2,PTAFR,BDKRB1,BDKRB2,ADRB1,ADRB2,HRH1,HRH2,HRH3,HTR3A,AGTR1,AGTRL1,AGTR2,AVPR1A,AVPR2,PTGIR,DRD1,ITGA2B,FOLR1,TNFR1,ADORA1,ADORA2A,ADORA2B,ADORA3,AVPR1B,ADRA1A,ADRA2A,ADRA2B,EDG1,EDG4,EDG5,GPR1,GPR2,GPR3,GPR4,GPR10,MC1R,MC2R,MC3R,MC4R,OXTR,SSTR1和SSTR3。
16.依照权利要求14或15的寡核苷酸,它被制备成位于其5′或3′末端或其中央部分的核苷酸是多态位点。
17.依照权利要求14或15的寡核苷酸,其中含多态位点的寡核苷酸是由彼此相连的两个片段组成的,一个片段能够与编码受体的基因或与其互补的序列杂交,另一个片段不能与其杂交,而且所述多态位点位于可杂交片段的5′或3′末端。
18.一种寡核苷酸,其中包含在SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列或与其互补的序列中存在的至少一个多态位点。
19.一种寡核苷酸,其由SEQ ID NO:1-1168所示任何核苷酸序列中的至少13个核苷酸的序列或与所述至少13个核苷酸的序列互补的序列组成,所述至少13个核苷酸的序列包含第21位核苷酸。
20.依照权利要求19的寡核苷酸,其长度为13-35个核苷酸。
21.一种寡核苷酸,其选自由SEQ ID NO:1-1168所示核苷酸序列和与其互补的序列组成的组。
22.一种寡核苷酸,其长度为13-60个核苷酸,在包含SEQ ID NO:1-1168所示任何核苷酸序列或其互补序列中的多态位点的基因组DNA区域中设计的,使得它位于多态位点朝基因组DNA区域的5′和/或3′末端1000bp距离内。
23.一种微阵列,其中依照权利要求14-22任一项的寡核苷酸固定在支持物上。
24.一种遗传多态性检测试剂盒,其中包含依照权利要求14-22任一项的寡核苷酸和/或依照权利要求23的微阵列。
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CN109694915A (zh) * | 2019-01-08 | 2019-04-30 | 甘肃农业大学 | 一种与绵羊尾脂重相关的分子标记及其应用 |
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