发明内容
本发明的目的之一在于提供用于筛选TNT抗体的克隆,目的之二在于提供该克隆的制备方法,目的之三在于提供该克隆的用途即用该克隆筛选出新的TNT抗体,目的之四在于提供TNT抗体的制备方法。
本发明的技术构思如下:
1.本发明采用噬菌体表面展示文库(Phage Surface Display)技术构建人源自身抗体噬菌体表面呈现文库。构建噬菌体抗体文库已是一项成熟的技术,已有大量应用该技术成功制备针对不同抗原的抗体或片段抗体的报道(Sharifi J,Khawli LA,Hu P,King S,Epstein AL.Characterization of a phage display-derived human monoclonal antibody(NHS76)counterpart tochimeric TNT-1 directed against necrotic regions of solid tumors.Hybrid Hybridomics.2001;20(5-6):305-12)。该项技术的优势为:一是从人的抗体基因的克隆开始,得到的完全是人源性抗体,无需进行人源化处理;二是在供体选择恰当的情况下,获得阳性克隆的几率高,而且可以同时获取多个克隆;三是在阳性株选定后,由阳性克隆到表达、修饰的过程简单,便于产品的开发。
2.本发明采用自身免疫病患者的B淋巴细胞的抗体基因构建噬菌体表面呈现文库。多种自身免疫病患者的B淋巴细胞和浆细胞高表达自身抗体,其中以抗DNA、抗组蛋白、抗核膜抗体等为多见,而且有些患者自身抗体呈高效价(>1∶10,000)、高亲和力特征,为在该类患者的抗体文库中筛检出理想抗体提供了极佳条件。
本发明对以上的构思进行了逐一验证,研究结果均证明本构思的正确性。
本发明应用噬菌体表面展示文库技术制备用于筛选TNT抗体的克隆,该克隆是用以下方法制备得到的,该方法包括以下两个主要步骤:
①构建人源自身抗体噬菌体表面呈现文库;
A.选择供体与提取RNA:选择的供体是自身免疫病患者,且其自身抗体的效价在1∶1,000以上;提取高表达自身抗体的B淋巴细胞和浆细胞,再按常规方法提取RNA;
所述的患者一般是指患有一种自身免疫病的患者,优选患有多种自身免疫病的患者;
所述的患者数量一般选择2~10个自身免疫病患者,优选3~6个自身免疫病患者,进一步优选5个自身免疫病患者;
所述患者的自身抗体的效价优选在1∶10,000以上;
提取B淋巴细胞和浆细胞有多种途径与方法,常规方法如如常用的梯密度离心法,具体操作是从外周血中、骨髓液中或淋巴组织中直接提取单个核细胞(主要包括单核细胞、淋巴细胞和少量的其它细胞等);
为得到较特异的抗原特异B淋巴细胞,还能够在常规方法的基础上,进一步采用分选方法,如通过抗原包被载体法或免疫磁珠分离细胞法等,优选免疫磁珠分离细胞法;
多个自身免疫病患者骨髓的B淋巴细胞和浆细胞高表达自身抗体中,以抗DNA、抗组蛋白、抗核膜抗体等为多见,而且有些患者自身抗体的呈高效价(>1∶10,000)、高亲和力特征,这是实验的极佳条件,在该类患者的抗体文库中容易筛检出理想的TNT抗体;
B.扩增与克隆抗体基因:按常规方法设计相应引物,分别扩增编码抗体的重链Fv和C1基因以及轻链基因(见图1),分步克隆到pComb3载体系统(见图2);
一般根据自身抗体的常见形式(如IgG1、IgG3)设计相应引物,分别扩增编码抗体的重链Fv和C1基因以及轻链基因,分步克隆到pComb3载体系统;
C.应用Helper噬菌体(M13OK7),构建完成表面展示文库;
②从该文库中筛选阳性克隆;
A.应用固相包被抗原,对文库进行多轮重复筛选(Bio-panning);
所述的抗原如dsDNA、ssDNA和histone等;
所述的多轮重复筛选一般进行3~6轮,优选4轮;
B.纯化噬粒载体酶切去除gpIII基因片段,重新连接后转化感受态菌进行可溶性表达;
噬菌体表面展示是抗原特异性富集的手段,而后续抗体片段的鉴定则需要个体细胞株的可溶性表达;
C.选取单克隆抗体进行增菌表达,按常规方法挑选阳性克隆。
一般选用酶联免疫吸附分析法(enzyme linked immunosorbent assay,简称ELISA)挑选阳性克隆。
本发明采用噬菌体表面展示文库技术构建人源自身抗体噬菌体表面呈现文库,能够得到一种新的人源性抗体,无需进行人源化处理;所选择供体合适,其自身抗体效价高,为筛检出理想的TNT抗体提供了极佳条件,获得阳性克隆的几率高,并能够同时获取多个克隆,使产品TNT抗体的生产成本大幅度降低;在选定阳性株后,由阳性克隆到表达、修饰的过程简单,便于产品的开发;因此,本发明所述的制备技术操作简单易用,能够快速实现产业化。
具体实施方式
本发明公开的是用于筛选有临床应用价值的TNT抗体的克隆及其制备方法,以及用该克隆筛选出新的TNT抗体及该抗体的制备方法,以满足人们疾病治疗、科学研究、药物开发等方面的需要。
使用该克隆制备新的TNT抗体的方法:
本发明应用噬菌体表面展示文库技术制备出用于筛选TNT靶向抗体的克隆,使用该克隆制备新的TNT抗体的方法,主要包括以下二个步骤:
①对阳性克隆进行表达,采用的方法是摇瓶或发酵等常规方法,得到表达产物;
②对表达产物进行纯化,可以使用现有的各种公知方法,如果离子交换法、分子筛、亲和纯化法等方法,优选亲和纯化法;
对表达的抗体片段以亲和纯化法作初步纯化后,就能够进行生物活性与亲和力等指标的全面测定。
以上所述的使用该克隆制备新的TNT抗体的方法是常规的方法,所得产品的效率不够高,在工业化生产上不够经济,因此,本发明对此进一步进行了改进,该方法主要包括采用以下二个步骤:
①对阳性克隆进行载体转换(见图3)
所述的载体包括常见的pComb3载体系统、自建的pBAD/dpp系统(已申请专利《人源片段抗体的pBAD表达系统》。申请日:2003年4月8日,申请号:03116231.2,公开日:2003年9月17日)等,优选自建的pBAD/dpp系统;
②抗体的表达与纯化:pBAD/dpp系统载有his-tag,阳性株在诱导表达后应用Qiagen的his-tag纯化系统进行亲和纯化(见图4);
TNT抗体采用全面鉴定与标记方法进行抗体质量验证,以确保产品质量的稳定可靠。
使用该克隆制备得到的TNT抗体的全面鉴定与标记方法如下:
按常规方法,对TNT抗体作生物活性、抗原亲合力、基本结构与序列方面的全面鉴定;用125I标记纯化抗体,能够进行细胞内核抗原结合活性测定与组织内代谢动力学测定。
TNT抗体的全面鉴定与标记,需要通过制备实体瘤荷瘤动物模型,然后再测定抗体生物活性,完成初步药物动力学的研究,以确证产品,并保证产品质量的稳定与可靠。下面,以两种实体瘤荷瘤动物模型的具体制备方法及其在抗体生物活性与初步药物动力学研究的应用为例,进行详细阐述。
①制备两种实体瘤荷瘤动物模型
实体瘤荷瘤动物模型之一:
A.材料:
BALB/c小鼠,6~8周龄;
MM45T.Li细胞;
B.肿瘤模型的建立:
对数生长期的肿瘤细胞用生理盐水重新混悬,制成单细胞悬液,台盼兰染色,计数活细胞数>95%,在BALB/c小鼠背部皮下接种2×106/0.2ml/只。小鼠接种肿瘤细胞后,检查肿瘤接种点,3次/周,触摸有无结节形成。在接种肿瘤细胞的小鼠生长肿瘤后第12天可触及接种位点有肿瘤结节生长,成瘤后,测量肿瘤直径,3次/周,计算肿瘤体积(按标准球形计算):V=4π×R3/3(直径6~7mm肿瘤体积大约100mm3);
对照组小鼠不作疫苗接种,仅在背部皮下注射RPMI-1640培养基0.2ml/只。
实体瘤荷瘤动物模型之二:
A.材料:
裸鼠12只,由第二军医大学动物实验中心提供,20克,4~5周龄;
Raji细胞1×108/ml,源自上海细胞生物所;
B.实肿瘤模型的建立:
12只裸鼠分别于右臀接种Raji细胞(1×108/ml)100ul,观察2~3周。肿瘤生长至0.4×0.4cm大小后,每日记录肿瘤变化。各组情况同时以数据与照片记录。
②抗体生物活性与初步药物动力学研究
应用已建荷瘤动物模型,通过核素标记抗体片段的瘤内注射、静脉注射、肌肉注射方式等目前已公开的常规方法,检测抗体的抗原结合、血液中的半衰期、组织阔清、细胞内滞留、杀瘤活性等。
本发明不但能够得到了高效、低毒、突变的TNT抗体,并且不增加机体的异源反应,具有广泛的医用前景。
下面通过实施例来进一步具体说明本发明的内容,所述的实施例是为了更好地阐述本发明,并不是用来限制本发明的范围。
实施例1、一种选择供体与提取RNA
1、筛选患者
①在住院的自身免疫病患者中,筛选6个自身抗体强阳性的患者,标准是自身抗体效价大于1∶1,000;
②行骨穿术,分别抽取骨髓液3ml,磷酸盐缓冲液(简称PBS)倍比稀释;
2、淋巴细胞分离液分离法常规分离单个核细胞
①取淋巴细胞分离液(上海化学试剂厂,分析纯)5ml,置无菌离心管;
②用吸管将稀释的骨髓液轻铺于分离液面之上;
③水平离心机离心,2,000rpm(转/分钟),20分钟;
④吸取血清下细胞层细胞,PBS洗3次;
⑤调整细胞浓度待用;
3、RNA的抽提与cDNA合成
①应用RNA抽提试剂盒(Qiagen)按说明制备RNA;
②用洗脱液混悬,OD260测定所获产品的纯度和含量;
③将3人的全部RNA合并;
④以RT试剂(TaKaRa)反转录RNA为cDNA(使用抗体片段特异引物)。
实施例2、另一种选择供体与提取RNA
1、筛选患者
①在住院的自身免疫病患者中,筛选3个均患有多种自身免疫病、自身抗体强阳性的患者,标准是自身抗体效价大于1∶10,000;
②行骨穿术,分别抽取骨髓液3ml,磷酸盐缓冲液(简称PBS)倍比稀释;
2、免疫磁珠分离细胞法分离单个核细胞
①充分混悬免疫磁珠液(无磁场状态);
②取Tosyl,活化的磁珠0.1ml(M-450,Dynal公司);
③置磁场下静放4分钟;
④B取出试管,去上清,B缓冲液洗2次;
⑤以B缓冲液稀释抗原(核蛋白组分)至0.1ml(约30微克/ml);
⑥充分混悬磁珠并与抗原液混合,震悬1分钟;
⑦将试管置室温旋转10’,加BSA到0.5%;
⑧将试管斜置37℃旋转24小时;
⑨置试管于磁场4分钟,去上清;
⑩洗磁珠4次,分别为缓冲液C 2次 4℃ 5分钟,缓冲液D 1次 37℃ 4小时,缓冲液C 1次 4℃ 5分钟;
(11)将Ficoll分离的单个核细胞与磁珠混悬,4℃ 2~6小时;
(12)置磁场分离靶细胞,PBS洗3次;
(13)收集细胞待用;
3、RNA的抽提与cDNA合成
①应用RNA抽提试剂盒(Qiagen)按说明制备RNA;
②用洗脱液混悬,OD260测定所获产品的纯度和含量;
③将3人的全部RNA合并;
④以RT试剂(TaKaRa)反转录RNA为cDNA(使用抗体片段特异引物)。
实施例3、扩增与克隆TNT抗体基因
1、抗体基因扩增引物的设计与合成
过去的有关文献报道,自身抗体中IgG1和IgG3的比例最高,因而可以参照常规的实验手册等文献设计引物如下:
VH+CH1(IgG1)的特异性引物序列为:
5’端正向引物:5’-CAG GTG CAG CTG
CTC GAG TCG GG
3’端反向引物:5’-GCA TGT
ACT AGT TTT GTC ACA AGA TTT GGG
VH+CH1(IgG3)的特异性引物序列为:
5’端正向引物:5’,CAG GTG CAG CTG
CTC GAG TCG GG
3’端反向引物:5’-TGT GTG
ACT AGT GTC ACC AAG TGG GGT TTT
VL+CL(κ)的特异性引物序列为:
5’端正向引物:5’-GAA ATT
GAG CTC ACG CAG TCT CCA
3’端反向引物:5’-GCG CCG
TCT AGA ATT AAC ACT CTC CCC TGT TGA
VL+CL(λ)的特异性引物序列为:
5’端正向引物:5’-TCT GAA
GAG CTC CAG GAC CCT GTT GTG TCT GTG
3’端反向引物:5’CG CCG
TCT AGA ACT ATG AAC ATT CTG TAG G
划线处为设计的与克隆载体相应的酶切位点。
2、TNT抗体编码基因的PCR扩增
以上述制备的cDNA为模版,在试管中分别加入IgG1、IgG3引物,VL+CL(κ)和VL+CL(λ)的引物用PCR试剂(Qiagen)扩增,1.0%的琼脂糖胶纯化扩增产物;
PCR(Polymerasa Chain Reaction),即聚合酶链反应,通常又称之为体外基因扩增技术。
3、PCR纯化产物与pMD18-T Vector的连接
①连接反应体系:
pMD18-T Vector 1
Insert DNA 1
dH2O 3
Solution I 5
Total 10μl
②16℃连接30min;
③全量转化至JM109感受态细胞中;
④在含有X-Gal、IPTG、Amp的琼脂平板培养基上培养,形成单菌落;
⑤挑选白色菌落于含50ng/mlAmp的10ml LB培养液中培养过夜,以待提取重组质粒;
4、重组质粒DNA的抽提
按华舜生物技术有限公司的质粒抽提试剂盒抽提上述重组质粒DNA,并于BACKMAN UV600上测定质粒的含量与纯度;具体操作如下:
①在细菌沉淀中加入250μl P1液,振荡至彻底悬浮;
②加入250μl P2液,立即温和颠倒离心管5~10次以混匀;室温静置4分钟;
③加入350μl P3液,立即温和颠倒离心管5~10次以混匀;
④12000rpm离心10分钟。将上清液小心移入吸附柱,离心15秒;倒掉收集管中的液体;
⑤在吸附柱中加入500μl洗涤液,离心15秒。倒掉收集管中的液体;
⑥在吸附柱中加入500μl洗涤液,静置1分钟后,离心15秒;倒掉收集管中的液体;
⑦离心1分钟;
⑧将吸附柱放入一个干净的1.5ml离心管中,在吸附膜中央加入50μl洗脱液,室温静置1分钟后,离心1分钟。将DNA溶液于-20℃保存;
5、重组质粒的特异性酶切并胶回收
①重链(IgG)酶切反应体系:
重组质粒 speI xhoI 10×Buffer ddH2O Total
3μg 51U 210U 10μl 适量 100μl
轻链(κ,λ)酶切反应体系:
重组质粒 SacI xbaI 10×Buffer ddH2O Total
3μg 105U 210U 10μl 适量 100μl
②37℃酶切3小时;
③胶回收660bp的酶切片段;
6、pCombHSS载体的制备
于含15ng/ml Tet的10ml LB培养液中加入10μl pCombHSS/XL-1 Blue甘油菌,37℃摇床225rpm增菌过夜;按华舜生物技术有限公司的质粒抽提试剂盒纯化pCombHSS质粒,并于BACKMAN UV600上测定质粒的含量与纯度;
7、pCombHSS质粒的双酶切和较回收
①酶切反应体系:
pCombHSS产物 speI xhoI 10×Buffer ddH2O Total
30μg 90U 300U 20μl 适量 200μl
②37℃酶切3小时;
③胶回收3500bp的酶切片段;
8、pCombHSS与IgG(VH+CH1)的连接
①连接反应体系:
pCombHSS IgG T4连接酶 10×Buffer ddH2O Total
2μg 0.7μg 5μl 10μl 适量 200μl
②16℃连接过夜;
9、制备XL-1 Blue感受态细胞
取XL-1 Blue甘油菌2μl接种于2ml LB培养基(tet)中,37℃,225rpm增菌过夜。取XL-1 Blue过夜菌2ml加到200ml LB中,37℃,225rpm增菌至OD600=0.8~1.0,冰浴15分钟,4℃,4000rpm离心20分钟,弃尽培养基。将细胞悬浮于100ml预冷的10%甘油溶液中,4℃×4000rpm离心20分钟,弃尽上清。将细胞悬浮于10ml预冷的10%甘油溶液中,4℃×4000rpm离心20分钟,弃尽上清。用2ml 10%甘油溶液悬浮细胞,300μl/管分装,-70℃贮存备用;
10、连接产物的转化和扩增
100μl连接产电穿孔转化到300μl感受态细胞中,加入3ml Soc培养基,37℃增菌1小时,转种于100ml LB(Amp 20μg/ml,Tet 10μg/ml)增菌过夜。
11、重复步骤4~10完成抗体轻链基因的克隆;
12、应用Help噬菌体(M13K07)完成表面展示文库的构建;
13、应用固相包被抗原(如dsDNA、Nmantigen和histone等),对文库进行4轮的重复筛选;
14、可溶性表达的转换:纯化载体切去gpIII基因片段,重新连接后转化细胞;
15、选取单克隆进行增菌表达,ELISA挑选阳性克隆;
16、对阳性克隆进行载体转换(自建的pBAD/dpp系统,已申请专利《人源片段抗体的pBAD表达系统》。申请日:2003年4月8日,申请号:03116231.2,公开日:2003年9月17日);
17、抗体的表达与纯化:pBAD/dpp系统载有his-tag,在表达后进行亲和纯化;
18、抗体的全面鉴定与标记:对抗体作生物活性、抗原亲合力、基本结构与序列方面的鉴定;
19、实体瘤动物模型的制备与抗体的初步药学、药物动力学研究:应用核素标记抗体作瘤内注射、静脉注射、肌肉注射,检测抗体的抗原结合,组织阔清,细胞内滞留,杀瘤活性等;
这里所述的全部的数名自身免疫病患者的抗体编码基因文库,包括正常与异常的IgG1和IgG3与轻链(κ,λ)随机组合的若干种抗体中的数种抗细胞核组分的抗体。