CN117866104A - 一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用 - Google Patents
一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN117866104A CN117866104A CN202310752257.1A CN202310752257A CN117866104A CN 117866104 A CN117866104 A CN 117866104A CN 202310752257 A CN202310752257 A CN 202310752257A CN 117866104 A CN117866104 A CN 117866104A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- pet
- protein
- disassembly
- protein cage
- cage
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 168
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 title claims abstract description 167
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 title claims abstract description 73
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims abstract description 13
- 230000004044 response Effects 0.000 title abstract description 29
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims abstract description 44
- 108010087294 GALA peptide Proteins 0.000 claims abstract description 31
- PNXSUXRNBHUCSF-HSYVXBRLSA-N 107658-43-5 Chemical compound C([C@@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](C)C(=O)OC(=O)CC[C@@H](C(=O)N[C@@H](C)C(=O)OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)OC(=O)[C@H](CCC(=O)OC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC=1C2=CC=CC=C2NC=1)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCC(O)=O)NC(=O)[C@H](C)N)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CC(C)C)NC(=O)[C@H](C)N)C1C=NC=N1 PNXSUXRNBHUCSF-HSYVXBRLSA-N 0.000 claims abstract description 30
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 12
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 claims description 25
- 238000005538 encapsulation Methods 0.000 claims description 17
- 241000205156 Pyrococcus furiosus Species 0.000 claims description 12
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 11
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 11
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 claims description 9
- 102000008857 Ferritin Human genes 0.000 claims description 9
- 108050000784 Ferritin Proteins 0.000 claims description 9
- 238000008416 Ferritin Methods 0.000 claims description 9
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 claims description 8
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 claims description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 7
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims description 5
- 241000192700 Cyanobacteria Species 0.000 claims description 4
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 claims description 3
- 241000187747 Streptomyces Species 0.000 claims description 3
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 3
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 claims description 3
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 claims description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 abstract description 9
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 29
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 23
- 108020004459 Small interfering RNA Proteins 0.000 description 19
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 14
- 108010048367 enhanced green fluorescent protein Proteins 0.000 description 13
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 13
- 238000004806 packaging method and process Methods 0.000 description 11
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 7
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 7
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 7
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 6
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 6
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 6
- 102100026277 Alpha-galactosidase A Human genes 0.000 description 5
- 101000718525 Homo sapiens Alpha-galactosidase A Proteins 0.000 description 5
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 5
- 238000013461 design Methods 0.000 description 5
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 5
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 description 4
- 235000002566 Capsicum Nutrition 0.000 description 4
- 101710093543 Probable non-specific lipid-transfer protein Proteins 0.000 description 4
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 4
- NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M coomassie brilliant blue Chemical compound [Na+].C1=CC(OCC)=CC=C1NC1=CC=C(C(=C2C=CC(C=C2)=[N+](CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=2C=CC(=CC=2)N(CC)CC=2C=C(C=CC=2)S([O-])(=O)=O)C=C1 NKLPQNGYXWVELD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 4
- 238000011282 treatment Methods 0.000 description 4
- 239000006002 Pepper Substances 0.000 description 3
- 241000722363 Piper Species 0.000 description 3
- 235000016761 Piper aduncum Nutrition 0.000 description 3
- 235000017804 Piper guineense Nutrition 0.000 description 3
- 235000008184 Piper nigrum Nutrition 0.000 description 3
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- 238000001338 self-assembly Methods 0.000 description 3
- 241000893512 Aquifex aeolicus Species 0.000 description 2
- 241001669241 Quasibacillus thermotolerans Species 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000003917 TEM image Methods 0.000 description 2
- 241000204666 Thermotoga maritima Species 0.000 description 2
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 2
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 239000003086 colorant Substances 0.000 description 2
- 238000010828 elution Methods 0.000 description 2
- 210000001163 endosome Anatomy 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 125000001449 isopropyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 239000002105 nanoparticle Substances 0.000 description 2
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 2
- 239000011148 porous material Substances 0.000 description 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 2
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 2
- 230000006798 recombination Effects 0.000 description 2
- 238000005215 recombination Methods 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001960 triggered effect Effects 0.000 description 2
- DLZKEQQWXODGGZ-KCJUWKMLSA-N 2-[[(2r)-2-[[(2s)-2-amino-3-(4-hydroxyphenyl)propanoyl]amino]propanoyl]amino]acetic acid Chemical compound OC(=O)CNC(=O)[C@@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CC1=CC=C(O)C=C1 DLZKEQQWXODGGZ-KCJUWKMLSA-N 0.000 description 1
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 4',6-Diamino-2-phenylindol Chemical compound C1=CC(C(=N)N)=CC=C1C1=CC2=CC=C(C(N)=N)C=C2N1 FWBHETKCLVMNFS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000724254 Cowpea chlorotic mottle virus Species 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 241000758706 Piperaceae Species 0.000 description 1
- 102100021904 Potassium-transporting ATPase alpha chain 1 Human genes 0.000 description 1
- 108010083204 Proton Pumps Proteins 0.000 description 1
- 230000004570 RNA-binding Effects 0.000 description 1
- 235000010726 Vigna sinensis Nutrition 0.000 description 1
- 244000042314 Vigna unguiculata Species 0.000 description 1
- 241000700605 Viruses Species 0.000 description 1
- 239000003929 acidic solution Substances 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000027455 binding Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 230000003592 biomimetic effect Effects 0.000 description 1
- 239000007853 buffer solution Substances 0.000 description 1
- 210000000234 capsid Anatomy 0.000 description 1
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 1
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 1
- 239000011248 coating agent Substances 0.000 description 1
- 238000000576 coating method Methods 0.000 description 1
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 1
- 230000008876 conformational transition Effects 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000805 cytoplasm Anatomy 0.000 description 1
- 230000007547 defect Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 230000001687 destabilization Effects 0.000 description 1
- 238000002059 diagnostic imaging Methods 0.000 description 1
- 238000009792 diffusion process Methods 0.000 description 1
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 1
- 230000002121 endocytic effect Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000012239 gene modification Methods 0.000 description 1
- 230000005017 genetic modification Effects 0.000 description 1
- 235000013617 genetically modified food Nutrition 0.000 description 1
- 229960000789 guanidine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N guanidinium chloride Chemical compound [Cl-].NC(N)=[NH2+] PJJJBBJSCAKJQF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- -1 hydrogen ions Chemical class 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000001788 irregular Effects 0.000 description 1
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 1
- 229920002521 macromolecule Polymers 0.000 description 1
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 238000006386 neutralization reaction Methods 0.000 description 1
- 235000001968 nicotinic acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 1
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 230000009465 prokaryotic expression Effects 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 238000005086 pumping Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 230000035440 response to pH Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 230000006918 subunit interaction Effects 0.000 description 1
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 1
- 238000004627 transmission electron microscopy Methods 0.000 description 1
Landscapes
- Peptides Or Proteins (AREA)
Abstract
本发明属于纳米生物技术领域,涉及一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用。本发明提供了一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的各亚基交界面的loop区,插入有GALA肽;所述GALA肽的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明所述蛋白笼能够保护内部封装药物免受外界极端条件的侵害,且在机体内通过响应生理pH变化能够触发可逆性拆卸,进而在靶部位有效释放内部封装的药物。
Description
技术领域
本发明属于纳米生物技术领域,具体涉及一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用。
背景技术
笼状蛋白是由有限数量的亚基精确自组装而成的球形大分子。这种组装是由大量的亚单元、亚单元之间的相邻亚单元相互作用介导的。在仿生纳米颗粒合成中,蛋白笼容器作为纳米级平台发挥了作用,并在生物医学方面提供了广泛的可能应用,包括医学成像和药物传递等。蛋白笼一旦组装完成,封装则表现出显著的稳定性。虽然这通常是一个理想的特性以保护封装的分子或药物免受外界条件的侵害,但也排除了蛋白笼在生理条件下的简单拆卸,特别是封装的固有稳定性阻止了笼内分子或药物的释放。因此,设计通过响应机体内部环境并触发组装或拆卸的蛋白笼对于分子或药物的有效递送和释放具有重要价值。
据报道,一些蛋白笼的组装可以被pH变化调节。例如,CCMV(豇豆绿斑病毒)和诺沃克衣壳在低pH值下组装,在高pH值下解体。铁蛋白在广泛的pH范围内保持完整,并在酸性盐酸胍或强酸性溶液下可逆分解。然而,还没有任何天然蛋白笼在生理pH值下可逆组装解离的报道。
发明内容
本发明的目的在于提供一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用。本发明所述蛋白笼能够保护内部封装药物免受外界极端条件的侵害,且在机体内通过响应生理pH变化能够触发可逆性拆卸,进而在靶部位有效释放内部封装的药物。
本发明提供了一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的各亚基交界面的loop区,插入有GALA肽;所述GALA肽的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。
优选的是,用于构建所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的基础蛋白笼包括但不限于来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn、来自Thermotoga maritima的60聚体封装蛋白Tm、来自Aquifex aeolicus的60聚体蛋白笼AaLS、来自Pyrococcus furiosus的180聚体封装蛋白Pf或来自Quasibacillus thermotolerans的420聚体封装蛋白Qt。
优选的是,当用于构建所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的基础蛋白笼为来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn时,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
本发明还提供了一种用于制备pH响应可逆性组装拆卸毒蛋白笼的表达载体,所述表达载体含有编码上述技术方案所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的核苷酸序列。
优选的是,用于构建所述表达载体的基础载体包括pET-3a、pET-3d、pET-9a、pET-11a、pET-11b、pET-14b、pET-15b、pET-16b、pET-17b、pET-19b、pET-20b(+)、pET-20d、pET-21A、pET-21b、pET-21d、pET-22b、pET-23a、pET-24a、pET-24b、pET-24c、pET-24d、pET-26b、pET-27b、pET-28a、pET-28b、pET-29a、pET-29b、pET-30a、pET-30b、pET-31b、pET-32a或pET-32b。
本发明还提供了一种用于制备pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的重组菌株,所述重组菌株含有上述技术方案所述的表达载体。
优选的是,用于构建所述重组菌株的宿主菌包括芽孢杆菌、链霉菌、大肠杆菌或蓝细菌。
本发明还提供了上述技术方案所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的制备方法,包括以下步骤:
将编码上述技术方案所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的核苷酸序列构建到表达载体上,转化宿主菌,培养,诱导,收获细胞,提取纯化蛋白,获得所述蛋白笼。
本发明还提供了上述技术方案所述蛋白笼或上述技术方案所述表达载体或上述技术方案所述重组菌株或上述技术方案所述制备方法制备得到的蛋白笼在制备用于药物递送和释放的产品中的应用。
优选的是,所述药物包括RNA类药物和/或蛋白类药物。
本发明提供了一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼。本发明所述pH响应蛋白笼能够可逆性拆卸和组装,可用于有效释放笼内部封装药物。本发明通过GALA肽酸诱导分子开关对蛋白笼进行设计,使其能够响应生理pH变化触发可逆性拆卸,克服了蛋白笼递送系统在体内无法有效释放内部封装客体的缺陷;本发明构建的蛋白笼可逆性拆卸封装系统可在原核或真核表达系统中快速、简单生产,具有较高的经济性。本发明所述蛋白笼具有以下有益效果:一方面保护内部封装药物免受外界极端条件的侵害,另一方面在机体内通过响应生理pH变化触发可逆性拆卸,进而在靶部位有效释放内部封装的药物。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动性的前提下,还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为本发明提供的pH响应的可逆性拆卸蛋白笼设计示意图;
图2为本发明提供的Fn蛋白笼可逆性拆卸封装系统构建示意图;
图3为本发明提供的SDS-PAGE/考马斯亮蓝染色纯度鉴定结果图;
图4为本发明提供的Fn和GALA-Fn的TEM图;
图5为本发明提供的Fn和GALA-Fn在不同pH条件下的SEC图;
图6为本发明提供的Fn和GALA-Fn在pH变化下的SEC图;
图7为本发明提供的不同处理后细胞内的相对荧光强度结果图;
图8为本发明提供的不同EGFP组处理后细胞内的相对荧光强度结果图。
具体实施方式
本发明提供了一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的各亚基交界面的loop区,插入有GALA肽;所述GALA肽的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示:EALAEALAEALAEALA。
本发明采用仿生学和合成生物学相关理论与技术,将GALA肽插入到蛋白笼结构的合适部位(各亚基结合面的loop区),该肽作为酸诱导分子开关会启动蛋白笼的pH响应可逆性拆卸,进而促使蛋白笼释放内部封装的药物,可建立一种pH响应蛋白笼可逆性拆卸用于有效释放笼内部封装药物的方法。当携带外源性药物的蛋白笼通过内吞途径进入机体细胞,经过脱包被作用与第一胞内体融合。此时胞内体上有ATP驱动的质子泵,将氢离子泵入胞内体腔内,使腔内pH由约6.2降低至约5.5。而GALA在pH高于6时下呈无规则线圈状,当pH降低至6以下时形成α-螺旋,一方面扰乱结构完整性诱导蛋白质笼的分解进而释放药物,另一方面此构象与胞内体膜融合,导致囊泡内容物—即笼中释放的药物扩散到细胞质中。
在本发明中,用于构建所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的基础蛋白笼(即可用于蛋白笼可逆性拆卸封装系统设计的纳米蛋白颗粒)优选包括来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn、来自Thermotoga maritima的60聚体封装蛋白Tm、来自Aquifexaeolicus的60聚体蛋白笼AaLS、来自Pyrococcus furiosus的180聚体封装蛋白Pf或来自Quasibacillus thermotolerans的420聚体封装蛋白Qt。在本发明中,所述基础蛋白笼更优选为来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn。在本发明中,上述基础蛋白笼均可在原核或真核系统中过表达和纯化为空载或负载状态。本发明针对上述蛋白笼的空间结构进行分析,以寻找对蛋白质笼组装重要的可工程化改造特征,这些特征既不影响蛋白笼的自组装,也不会干扰货物装载。与此同时,为了给蛋白笼配备酸诱导分子开关GALA肽,将该肽段移植于蛋白笼的可工程化改造结构区域,进而将蛋白笼设计为可响应pH进行可逆性拆卸的封装与递送系统。具体的,如图1(pH响应的可逆性拆卸蛋白笼设计示意图)所示,本发明将GALA肽插入到蛋白笼各亚基交界面,交界面对于蛋白笼的结构形成至关重要。在高于6的pH下,GALA肽不会发生构象变化,蛋白笼稳定。在低于pH6时,GALA肽发生构象变化,导致交界面发生构象变化例如扭曲,蛋白笼空间结构不稳定,发生拆卸。
在本发明中,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的N端优选融合纯化标签。本发明对所述纯化标签的类型没有特殊限定,能够纯化出所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼即可。在本发明中,所述GALA肽插入时,两端优选融合柔性linker。在本发明中,所述纯化标签两端优选也融合柔性linker。本发明所述柔性linker优选包括GGGG。
在本发明中,当用于构建所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的基础蛋白笼为来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn时,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。在本发明中,来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn的亚基的氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示:MLSERMLKALNDQLNRELYSAYLYFAMAAYFEDLGLEGFANWMKAQAEEERNGRVELDEIPKPPKEWESPLKAFEAAYEHEKLDKLKFAKDSAEEEKDYSTRIGHALRFYNYIYDAFLEWFIFISKSIYELAALNEQVEEEASVKKILDKLKFAKDSPQILFMLDKELSARAPKLPG,其中,加粗部分为E-LOOP区。本发明优选使用含柔性linker的GALA替换E-LOOP区。在本发明中,所述含柔性linker的GALA的氨基酸序列如GGGGEALAEALAEALAEALAGGGG所示(SEQ ID NO.4)。在本发明中,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的N端优选融合组氨酸标签,便于下游蛋白纯化。在本发明中,所述所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的氨基酸序列优选如下所示:MGGGGHHHHHHGGGGLSERMLKALNDQLNRELYSAYLYFAMAAYFEDLGLEGFANWMKAQAEEERNGRVELDEIPKPPKEWESPLKAFEAAYEHEKLDKLKFAKDSAEEEKDYSTRIGHALRFYNYIYDAFLEWFIFISKSIYELAALNEQVEEEASVKKILDKLKFAKDSGGGGEALAEALAEALAEALAGGGGRAPKLPG(SEQ ID NO.2);加粗的GGGG为柔性linker,柔性linker之间分别为组氨酸标签和GALA肽。本发明所述GALA肽插入到了亚基的E-loop区。
本发明还提供了一种用于制备pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的表达载体,所述表达载体含有编码上述技术方案所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的核苷酸序列。在本发明中,用于构建所述表达载体的基础载体优选包括pET-3a、pET-3d、pET-9a、pET-11a、pET-11b、pET-14b、pET-15b、pET-16b、pET-17b、pET-19b、pET-20b(+)、pET-20d、pET-21A、pET-21b、pET-21d、pET-22b、pET-23a、pET-24a、pET-24b、pET-24c、pET-24d、pET-26b、pET-27b、pET-28a、pET-28b、pET-29a、pET-29b、pET-30a、pET-30b、pET-31b、pET-32a或pET-32b。在本发明中,用于构建所述表达载体的基础载体更优选包括pET28a。
本发明还提供了一种用于制备pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的重组菌株,所述重组菌株含有上述技术方案所述的表达载体。在本发明中,用于构建所述重组菌株的宿主菌优选包括大肠杆菌。在本发明中,用于构建所述重组菌株的宿主菌优选包括芽孢杆菌、链霉菌、大肠杆菌或蓝细菌(蓝藻)等。在本发明中,所述大肠杆菌更优选为BL21(DE3)。
本发明还提供了上述技术方案所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的制备方法,包括以下步骤:
将编码上述技术方案所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的核苷酸序列构建到表达载体上,转化宿主菌,培养,诱导,收获细胞,提取纯化蛋白,获得所述蛋白笼。
将编码上述技术方案所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的核苷酸序列构建到表达载体上。本发明对表达载体的构建方法没有特殊限定,采用常规表达载体构建方法进行构建即可。在本发明中,用于构建所述表达载体的基础载体优选包括pET28a。得到表达载体后,本发明将表达载体转化到宿主菌中。在本发明中,用于构建所述重组菌株的宿主菌优选包括大肠杆菌。在本发明中,所述大肠杆菌优选为BL21(DE3)。得到重组菌株后,本发明优选用500μM异丙基β-d-1-硫代糖基糖苷(IPTG)在22℃过夜诱导蛋白表达。诱导后,本发明优选离心收获细胞。本发明优选通过超声、亲和层析和尺寸排阻色谱法提取和纯化目的蛋白。本发明对超声、亲和层析(Ni-NTA)和尺寸排阻色谱法(SEC)提取和纯化的具体操作条件没有特殊限定,采用本领域技术人员熟知的常规操作即可。
本发明还提供了上述技术方案所述蛋白笼或上述技术方案所述表达载体或上述技术方案所述重组菌株或上述技术方案所述制备方法制备得到的蛋白笼在制备用于药物递送和释放的产品中的应用。在本发明中,所述药物优选包括RNA类药物和/或蛋白类药物。在本发明中,所述RNA类药物优选包括siRNA药物,更优选包括带有荧光适配体标签的siRNA。在本发明中,所述siRNA核苷酸序列优选为uaaggcuaugaagagauac(SEQ ID NO.5)。在本发明中,所述蛋白类药物优选以EGFP代表。
为了进一步说明本发明,下面结合附图和实施例对本发明提供的一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用进行详细地描述,但不能将它们理解为对本发明保护范围的限定。
本发明以常用药物RNA和蛋白类为例,验证一种pH响应蛋白笼可逆性拆卸用于有效释放笼内部封装药物的方法。
实施例1
蛋白笼可逆性拆卸封装系统表达纯化与结构表征
选择可形成12面体的来自Pyrococcus furiosus的24聚体Fn用于构建蛋白笼可逆性拆卸封装系统。为了给Fn配备GALA肽,针对Fn的空间结构进行分析。Fn的笼型结构有24个亚基,每个亚基都由四螺旋束(包括A-螺旋、B-螺旋、C-螺旋、D-螺旋)和E-螺旋(连接在C末端)组成。有研究表明,后22个C端残基(E-螺旋的位置)的缺失不能阻止Fn自组装。因此,通过基因修饰将GALA肽连接到D-螺旋和E-螺旋之间的Loop区末端以替代E-螺旋。Fn的亚基N端暴露在笼外表面,通过融合组氨酸标签便于下游蛋白纯化。
图2为Fn蛋白笼可逆性拆卸封装系统构建示意图,其中,a:Fn单体由四螺旋束A/B/C/D和第五个E-螺旋组成;以不同的颜色展示;b:Fn 24聚体笼状颗粒的单个亚基分别以不同的颜色在3和4重对称轴周围表示(左和右);沿水平轴旋转90°后,以虚线圆放大4倍对称轴周围的孔隙结构(下)。为了清晰起见,在四重对称关系中的一个单体被简化,三个E-螺旋被染成绿色;c:GALA肽与蛋白笼结合;pH 7.4时GALA肽的随机卷曲结构(黄色)不阻碍蛋白笼的组装,但pH 6.0时转变为螺旋结构时,在狭窄的人工孔中GALA肽之间产生分子排斥(洋红色);d:Fn单体中GALA肽和RNA结合肽的合理插入;N端引入His标签用于后续纯化(红色);E螺旋(绿色)被替换为GALA肽(黄色)。Fn的氨基酸序列为:MLSERMLKALNDQLNRELYSAYLYFAMAAYFEDLGLEGFANWMKAQAEEERNGRVELDEIPKPPKEWESPLKAFEAAYEHEKLDKLKFAKDSAEEEKDYSTRIGHALRFYNYIYDAFLEWFIFISKSIYELAALNEQVEEEASVKKILDKLKFAKDSPQILFMLDKELSARAPKLPG(SEQ ID NO.3),本发明将加粗部分E-LOOP区PQILFMLDKELSA(SEQ ID NO.6)替换为GGGGEALAEALAEALAEALAGGGG(SEQ ID NO.4),GGGG为柔性linker,EALAEALAEALAEALA(SEQID NO.1)为GALA肽;并且融合组氨酸标签。最终得到本发明pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的氨基酸序列:MGGGGHHHHHHGGGGLSERMLKALNDQLNRELYSAYLYFAMAAYFEDLGLEGFANWMKAQAEEERNGRVELDEIPKPPKEWESPLKAFEAAYEHEKLDKLKFAKDSAEEEKDYSTRIGHALRFYNYIYDAFLEWFIFISKSIYELAALNEQVEEEASVKKILDKLKFAKDSGGGGEALAEALAEALAEALAGGGGRAPKLPG(SEQ IDNO.2)。斜体部分为融合的组氨酸标签和替换的GALA肽。
蛋白笼可逆性拆卸封装系统表达与纯化
将Fn蛋白笼亚基编码用核苷酸序列和图2构建的Fn可逆性拆卸封装系统中的pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼亚基的编码用核苷酸序列分别委托公司进行基因合成,cDNA序列分别亚克隆到原核表达质粒pET28a中。质粒分别转化到BL21(DE3)大肠杆菌中进行扩大培养。用500μM异丙基β-d-1-硫代糖基糖苷在22℃过夜诱导蛋白表达。离心收获细胞,通过超声细胞、亲和层析(Ni-NTA)和尺寸排阻色谱法纯化目的蛋白(分别命名为Fn和GALA-Fn),浓缩后采用SDS-PAGE的考马斯亮蓝染色和负染色透射电镜进行蛋白纯度和颗粒形态鉴定。
Fn可逆性拆卸蛋白笼的一般表征
(1)SDS-PAGE/考马斯亮蓝染色进行纯度鉴定
结果如图3所示,图3为SDS-PAGE/考马斯亮蓝染色纯度鉴定结果图。
(2)负染色透射电镜(TEM)观察Fn和GALA-Fn的空间结构
结果如图4所示,图4为Fn和GALA-Fn的TEM图。
SDS-PAGE结果显示,Fn和GALA-Fn以高纯度纯化。负染色TEM结果显示,Fn和GALA-Fn镜下显示均匀一致的纳米颗粒球状形态。上述均表明GALA肽替换E-螺旋对于Fn的蛋白表达和结构自组装未产生明显影响。
实施例2
蛋白笼可逆性拆卸封装系统拆卸与重组
pH响应的Fn-GALA蛋白笼拆卸
为了验证GALA肽的配备使Fn蛋白笼具备酸敏感性分解的特征,GALA-Fn样品在不同的酸性条件下(pH<6.0(3,4,5)、pH=6.0、pH=6.5、pH=6.8、pH=7.0、pH=8.0)透析,然后在SEC色谱柱上进行分析。
图5为Fn和GALA-Fn在不同pH条件下的SEC图;其中,a为SEC色谱图,b为从a图SEC色谱中富集各流出组分,分析各组分的占比结果图。a中,横坐标代表流出体积,颗粒越大在体积越小处流出,相应的峰值则越高,可以看出在10ml处主要流出的为pH>6.0条件下的蛋白笼颗粒,表明蛋白笼粒径较大没有发生拆卸,而pH≤6.0条件下,主要在大于15ml处流出,表明此时的颗粒粒径较小,蛋白发生了拆卸。b中可以看出pH≤6时,GALA-Fn没有蛋白笼生成,即纵坐标为0;而高于pH6时,纵坐标增加,表明蛋白笼生成,其中Fn不受pH影响。
pH响应的Fn-GALA蛋白笼重组
药物或货物在重组过程中需要被分离的亚基封装,因此重组能力在药物输送系统的应用中非常重要。为了验证是否可以简单地通过缓冲液pH条件改变将被分解的亚基重新组装成固定的粒子,样品在pH<6.0的缓冲液体系下在SEC柱上进样后,对应的分离亚基峰被汇聚。为了中和样品,混合组分在含有50mM Tris-HCl(pH 7.0)和100mM NaCl的缓冲液中透析,然后浓缩到1mg/mL,最后在pH 7.0的SEC柱上再次注入样品,分析样品流出峰。
图6为Fn和GALA-Fn在pH变化下的SEC图。图5结果表明,与pH 7.0和8.0时相比,随着pH从7.0降至6.0,Fn-GALA在SEC柱上产生了移位的洗脱峰,这意味着从24-mer到小的构建块的构象转变,在pH 6.0及低于pH 6.0时,笼状颗粒完全解离,表明GALA作为酸诱导开关可促使Fn笼状蛋白的拆卸。图6结果表明,当pH响应的解离亚基恢复至原有pH条件时(pH7.0),可以观察到与拆卸前相同的24-mer洗脱峰,表明pH响应的蛋白笼拆卸是可逆的,解离的亚基可以通过pH中和重新组装成笼状蛋白。
实施例3
蛋白笼可逆性拆卸封装系统药物递送与释放评估
为了验证GALA肽修饰的Fn蛋白笼能够在生理pH条件下触发可逆性拆卸,以常用的两种药物RNA和蛋白类药物为例,本发明不限于以上两种递送药物,分别采用GALA-Fn蛋白笼对两种药物进行封装(GALA-Fn蛋白笼经pH为4.0或5.0处理后发生拆卸,此时加入药物RNA(荧光适配体标记的siRNA)或蛋白类药物(增强型荧光蛋白EGFP),恢复pH(7.0或8.0),蛋白笼重新组装,此时形成内部封装有siRNA的蛋白笼颗粒),探究其是否通过响应内体pH变化触发可逆性拆卸。
蛋白笼可逆性拆卸封装系统递送RNA类药物
为了进一步探讨构建的GALA-Fn可逆性拆卸蛋白笼是否可以真正响应细胞内的生理pH变化,以递送货物siRNA为例,将封装带有荧光适配体标签(携带Pepper,购自纳莹生物)的siRNA;siRNA核苷酸序列为uaaggcuaugaagagauac,构建方法为常规方法)的GALA-Fn用于感染Hela细胞,通过荧光追踪封装siRNA在细胞内的释放情况。Hela细胞分为阴性对照组、游离siRNA组(携带Pepper,购自纳莹生物)、Fn-siRNA组和GALA-Fn-siRNA组。游离siRNA组与Fn-siRNA、GALA-Fn-siRNA组中封装的siRNA等摩尔,阴性对照组为常规培养细胞。孵育12h后(加入HBC染料,与Pepper荧光适配体结合,用于激发荧光产生;DAPI用于显示细胞核,pepper用于显示细胞中的siRNA。),荧光显微镜下观察细胞内siRNA的释放情况。
图7为不同siRNA组处理后细胞内的相对荧光强度结果图。结果表明,与游离siRNA组相比,GALA-Fn-siRNA组显示出更强的荧光强度,表明经GALA肽修饰的Fn可将siRNA递送至细胞内并有效释放;而Fn-siRNA组的细胞内几乎无荧光,表明野生型Fn在细胞内无法响应内体环境启动拆卸,导致内部的siRNA无法释放。
蛋白笼可逆性拆卸封装系统递送蛋白类药物
为了直观观察蛋白类药物经蛋白笼递送和释放的效果,采用增强型荧光蛋白EGFP代替常规蛋白类药物。将封装有EGFP的GALA-Fn蛋白笼用于感染HK293细胞,通过荧光蛋白跟踪蛋白的释放情况。HK293分为游离EGFP组、Fn-EGFP组和GALA-Fn-EGFP组。游离EGFP组与Fn-EGFP、GALA-Fn-EGFP组中封装的EGFP等量。孵育12h后,荧光显微镜下观察细胞内EGFP的释放情况。
图8为不同EGFP组处理后细胞内的相对荧光强度结果图。结果显示,与游离EGFP组相比,GALA-Fn-EGFP组显示出更强的荧光强度,表明经GALA肽修饰的Fn可将EGFP递送至细胞内并有效释放;而Fn-EGFP组的细胞内几乎无荧光,表明野生型Fn在细胞内无法响应内体环境启动拆卸,导致内部的EGFP无法释放。
综上,经酸诱导分子开关GALA修饰的Fn蛋白笼能够响应生理pH条件变化进而启动可逆性拆卸,可将其内部封装的药物(siRNA或EGFP等)递送至细胞内并有效释放,进而更好的发挥药物作用。与游离药物相比,药物经蛋白笼的递送效率更高;与未经修饰的蛋白笼相比,蛋白笼可有效响应内体pH环境变化进而触发可逆性拆卸和重新组装。GALA-Fn蛋白笼封装系统可在原核系统中快速、简单生成,具有产量高和经济性优势。上述均表明构建一种响应生理pH的可逆性拆卸蛋白笼用于有效释放笼内部封装药物的方法具有重要应用价值。
尽管上述实施例对本发明做出了详尽的描述,但它仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部实施例,人们还可以根据本实施例在不经创造性前提下获得其他实施例,这些实施例都属于本发明保护范围。
Claims (10)
1.一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼,其特征在于,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的各亚基交界面的loop区,插入有GALA肽;所述GALA肽的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。
2.根据权利要求1所述的pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼,其特征在于,用于构建所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的基础蛋白笼包括来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn、来自Thermotogamaritima的60聚体封装蛋白Tm、来自Aquifexaeolicus的60聚体蛋白笼AaLS、来自Pyrococcusfuriosus的180聚体封装蛋白Pf或来自Quasibacillusthermotolerans的420聚体封装蛋白Qt。
3.根据权利要求2所述的pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼,其特征在于,当用于构建所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的基础蛋白笼为来自Pyrococcus furiosus的24聚体铁蛋白Fn时,所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
4.一种用于制备pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的表达载体,所述表达载体含有编码权利要求1~3任一项所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的核苷酸序列。
5.根据权利要求4所述的表达载体,其特征在于,用于构建所述表达载体的基础载体包括pET-3a、pET-3d、pET-9a、pET-11a、pET-11b、pET-14b、pET-15b、pET-16b、pET-17b、pET-19b、pET-20b(+)、pET-20d、pET-21A、pET-21b、pET-21d、pET-22b、pET-23a、pET-24a、pET-24b、pET-24c、pET-24d、pET-26b、pET-27b、pET-28a、pET-28b、pET-29a、pET-29b、pET-30a、pET-30b、pET-31b、pET-32a或pET-32b。
6.一种用于制备pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的重组菌株,其特征在于,所述重组菌株含有权利要求4或5所述的表达载体。
7.根据权利要求6所述的重组菌株,其特征在于,用于构建所述重组菌株的宿主菌包括芽孢杆菌、链霉菌、大肠杆菌或蓝细菌。
8.权利要求1~3任一项所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的制备方法,包括以下步骤:
将编码权利要求1~3任一项所述pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼的亚基的核苷酸序列构建到表达载体上,转化宿主菌,培养,诱导,收获细胞,提取纯化蛋白,获得所述蛋白笼。
9.权利要求1~3任一项所述蛋白笼或权利要求4或5所述表达载体或权利要求6或7所述重组菌株或权利要求8所述制备方法制备得到的蛋白笼在制备用于药物递送和释放的产品中的应用。
10.根据权利要求9所述的应用,其特征在于,所述药物包括RNA类药物和/或蛋白类药物。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202310752257.1A CN117866104A (zh) | 2023-06-25 | 2023-06-25 | 一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202310752257.1A CN117866104A (zh) | 2023-06-25 | 2023-06-25 | 一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN117866104A true CN117866104A (zh) | 2024-04-12 |
Family
ID=90585251
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202310752257.1A Pending CN117866104A (zh) | 2023-06-25 | 2023-06-25 | 一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN117866104A (zh) |
-
2023
- 2023-06-25 CN CN202310752257.1A patent/CN117866104A/zh active Pending
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Ferrer-Miralles et al. | Engineering protein self-assembling in protein-based nanomedicines for drug delivery and gene therapy | |
JP6279005B2 (ja) | アルブミン変異体及び複合体 | |
EP2916873B1 (en) | Nanocomplex containing amphipathic peptide useful for efficient transfection of biomolecules | |
JP5902679B2 (ja) | IL−4Rαに結合する涙液リポカリンムテイン | |
US6852834B2 (en) | Fusion peptides isolatable by phase transition | |
CN102066405B (zh) | 用于细胞穿透的超荷电蛋白 | |
Kao et al. | The coat protein leads the way: an update on basic and applied studies with the Brome mosaic virus coat protein | |
JP2016008217A (ja) | 細胞透過のための過剰に荷電されたタンパク質 | |
JP2011523353A5 (zh) | ||
JPH03502935A (ja) | 組換え的に調製された官能的な合成タンパク質ポリマー | |
Unzueta et al. | Sheltering DNA in self-organizing, protein-only nano-shells as artificial viruses for gene delivery | |
KR101647804B1 (ko) | 신규 세포투과 펩타이드 및 이의 용도 | |
Pärn et al. | The antimicrobial and antiviral applications of cell-penetrating peptides | |
Solovyev et al. | Subcellular localization and self-interaction of plant-specific Nt-4/1 protein | |
CN104395475B (zh) | 基于jcv-病毒样颗粒的新型药物递送系统 | |
JP2021532803A (ja) | ナノ粒子に自己組織化するポリペプチド | |
Gunasekar et al. | Assembly of bioinspired helical protein fibers | |
EP4006057A1 (en) | Complex for intracellular delivery of molecules | |
CN113121704A (zh) | 基于纳米颗粒的冠状病毒疫苗 | |
CN117866104A (zh) | 一种pH响应可逆性组装拆卸蛋白笼及制备方法和应用 | |
Zhu et al. | Highly secretory expression of recombinant cowpea chlorotic mottle virus capsid proteins in Pichia pastoris and in-vitro encapsulation of ruthenium nanoparticles for catalysis | |
EP2004680B1 (en) | N-terminal vdac variants and uses thereof | |
Peng et al. | Design of a reversible inversed pH-responsive caged protein | |
CN117547618A (zh) | 内腔装载小核酸药物的铁蛋白纳米笼载体及应用 | |
CN112608366A (zh) | 超正电荷聚多肽及其制备方法、应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination |