CN117651770A - 使用溶质载剂家族9同工型a3调控因子2(slc9a3r2)抑制剂治疗高血压 - Google Patents

使用溶质载剂家族9同工型a3调控因子2(slc9a3r2)抑制剂治疗高血压 Download PDF

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CN117651770A CN202280050580.8A CN202280050580A CN117651770A CN 117651770 A CN117651770 A CN 117651770A CN 202280050580 A CN202280050580 A CN 202280050580A CN 117651770 A CN117651770 A CN 117651770A
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M·A·R·费雷拉
J·巴克曼
A·李
L·A·洛塔
G·阿贝卡西斯
A·巴拉斯
J·尼尔森
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Abstract

本公开提供了治疗患有高血压、冠心病和/或心房颤动或处于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险中的受试者的方法、鉴定具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险的受试者的方法,以及检测溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)变体核酸分子和变体多肽的方法。

Description

使用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂治 疗高血压
序列表的引用
本申请包括以电子方式作为文本文件提交的序列表,其命名为18923807902SEQ,创建于2022年6月25日,大小为225千字节。所述序列表以引用的方式并入本文。
技术领域
本公开总体涉及用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂治疗患有高血压、冠心病和/或心房颤动或处于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动风险中的受试者,以及鉴定具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动风险的受试者的方法。
背景技术
高血压是所有心血管疾病中最常见的,约10%至20%的成年人群罹患高血压。高血压及其随之而来的疾病(动脉硬化、心肌梗塞、中风、心脏肥大和心功能不全)是所有西方工业国家最常见的疾病和死亡原因,甚至领先于恶性退行性疾病(癌症)。高血压是由于血管过度收缩或肾脏排泄液体不足造成的。许多中枢神经机制和激素系统参与血管平滑肌组织肌张力的调节,从而调节血管宽度以及肾脏的液体排泄。上述机制和激素系统控制和调节与体力劳动、恐惧、压力、兴奋等相关的生理性升高的血压。那些系统中的一个或多个脱轨最终会导致高血压。在许多情况下,高血压的真正原因尚不清楚(原发性肌张力过高)。然而,由于编码参与血压调节系统的蛋白质的基因突变,有时仅与外部因素(压力、吸烟、超重、缺乏身体运动、不良饮食)相结合而导致的遗传易感性是很有可能的。
SLC9A3R2是PDZ(PSD-95/DLG/ZO-1)支架蛋白Na+–H+交换调控因子(NHERF)家族的成员。这些蛋白质通过结合并调节膜受体和转运蛋白的膜表达以及蛋白质-蛋白质相互作用来介导许多细胞过程。SLC9A3R2在肾脏中表达,并将质膜蛋白与埃兹蛋白/根蛋白/膜突蛋白(ezrin/moesin/radixin)家族的成员连接起来,从而有助于将它们与肌动蛋白细胞骨架连接并调节其表面表达。SLC9A3R2还通过调节钠/氢交换器3的活性在肠道钠吸收中发挥作用,并且还可以调节囊性纤维化跨膜调节器(CFTR)离子通道,并且是cAMP介导的磷酸化和抑制SLC9A3所必需的。
发明内容
本公开提供了治疗患有高血压或处于发展出高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有原发性高血压或处于发展出原发性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有继发性高血压或处于发展出继发性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有顽固性高血压或处于发展出顽固性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有恶性高血压或处于发展出恶性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有冠心病或处于发展出冠心病的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有心房颤动或处于发展出心房颤动的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂治疗受试者的方法,其中受试者患有高血压、冠心病和/或心房颤动或处于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险中,所述方法包括:通过以下方式确定受试者是否具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子:从受试者获得或已经获得生物样品;以及对生物样品进行或已经进行序列分析以确定受试者是否具有包含编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的基因型;以及以标准剂量量向作为SLC9A3R2参考的受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向受试者施用SLC9A3R2抑制剂;以及以同于或低于标准剂量量的量向对于SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向受试者施用SLC9A3R2抑制剂;其中具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的基因型的存在指示受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。
本公开还提供了鉴定具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险的受试者的方法,所述方法包括:确定或已经确定在从受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子;其中:当受试者是SLC9A3R2参考时,则受试者具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险;并且当受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的或纯合的时,则受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。
本公开还提供了治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,用于治疗或预防被鉴定为具有以下各项的受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动:i)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述基因组核酸分子具有包含以下的核苷酸序列:i)在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;ii)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的mRNA分子或其互补序列,其中所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;或iii)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的cDNA分子或其互补序列,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
本公开还提供了用于治疗或预防受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动的SLC9A3R2抑制剂,所述受试者:a)对于SLC9A3R2基因组核酸分子、SLC9A3R2 mRNA分子或SLC9A3R2 cDNA分子是参考;或b)对于以下各项是杂合的:i)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述基因组核酸分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;ii)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的mRNA分子或其互补序列,其中所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;或iii)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的cDNA分子或其互补序列,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
具体实施方式
在整个说明书和权利要求书中使用与本公开的多个方面相关的各种术语。除非另外指示,否则此类术语将被赋予其在本领域中的普通含义。其他具体定义的术语应以与本文提供的定义一致的方式解释。
除非另外明确说明,否则不意图将本文陈述的任何方法或方面解释为要求以特定顺序执行其步骤。因此,在权利要求书或说明书中,当方法权利要求没有特别地说明步骤是限于特定顺序时,在任何方面并非意图推断顺序。这适用于任何可能的非表达解释基础,包括相对于步骤排列或操作流程的逻辑事项、从语法组织或标点中得到的普通含义或者在说明书中描述的方面的编号或类型。
如本文所用,除非上下文另外明确指出,否则单数形式“一个(种)(a/an)”和“所述(the)”包括复数指代物。
如本文所用,术语“约”意指所列举的数值是近似值并且小的变化不会显著影响所公开的实施方案的实践。在使用数值的情况下,除非上下文另外指明,否则术语“约”意指数值可变化±10%且仍在所公开的实施方案的范围内。
如本文所用,根据需要,在特定实施方案中,术语“包含”可替换为“由……组成”或“基本上由……组成”。
如本文所用,关于核酸分子或多肽的术语“分离的”意指核酸分子或多肽处于不同于其天然环境的条件下,诸如远离血液和/或其他组织。在一些实施方案中,分离的核酸分子或多肽基本上不含其他核酸分子或其他多肽,特别是动物来源的其他核酸分子或多肽。在一些实施方案中,核酸分子或多肽可呈高度纯化的形式,即大于95%纯或大于99%纯。当在此上下文中使用时,术语“分离的”不排除存在呈替代物理形式,例如二聚体或可替代地磷酸化或衍生化形式的相同核酸分子或多肽。
如本文所用,术语“核酸”、“核酸分子”、“核酸序列”、“多核苷酸”或“寡核苷酸”可包括任何长度的核苷酸的聚合物形式,可包括DNA和/或RNA,且可以是单链的、双链的或多链的。核酸的一条链还是指其互补序列。
如本文所用,术语“受试者”包括任何动物,包括哺乳动物。哺乳动物包括但不限于农场动物(诸如例如,马、牛、猪)、伴侣动物(诸如例如,狗、猫)、实验室动物(诸如例如,小鼠、大鼠、兔)和非人灵长类动物(诸如例如,猿和猴)。在一些实施方案中,受试者是人。在一些实施方案中,受试者是在医生护理下的患者。
根据本公开已经鉴定了与人发展出高血压的风险降低相关的SLC9A3R2基因中的罕见的推定功能丧失(LOF)和有害错义变体的负担。例如,已观察到将SLC9A3R2参考基因组核酸分子(参见SEQ ID NO:1)中的位置9,519处的胞嘧啶改变为胸腺嘧啶的遗传改变,表明具有此类改变的受试者发展出高血压的风险可能降低。据信,SLC9A3R2基因或蛋白的变体与高血压不具有任何已知的相关性。总而言之,本文所述的遗传分析令人惊讶地表明SLC9A3R2基因,并且特别是SLC9A3R2基因中的pLOF和有害错义变体与发展出高血压的风险降低相关。因此,可治疗具有增加的发展出高血压,诸如原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压或恶性高血压、冠心病和/或心房颤动风险的作为SLC9A3R2参考的受试者,从而预防高血压、冠心病和/或心房颤动,减轻其症状,和/或抑制症状的发展。因此,本公开提供了利用受试者中此类变体的鉴定来鉴定或分层此类受试者中发展出高血压,诸如原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压或恶性高血压、冠心病和/或心房颤动的风险,或诊断受试者具有增加的发展出高血压,诸如原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压或恶性高血压、冠心病和/或心房颤动的风险,使得处于风险中的受试者或患有活动性疾病的受试者可以得到相应治疗的方法。
根据本公开进一步观察到,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子(无论这些变异在特定受试者中是纯合的还是杂合的)与降低的发展出高血压的风险相关。此外,通过本公开对另外的变体和基因负荷掩码之间的关联的鉴定表明SLC9A3R2本身(而不是与另一基因中的变体的连锁不平衡)负责高血压的保护作用。
出于本公开的目的,任何特定的受试者都可归类为具有以下三种SLC9A3R2基因型之一:i)SLC9A3R2参考;ii)对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的;或iii)对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是纯合的。当受试者不具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的拷贝时,所述受试者是SLC9A3R2参考。当受试者具有SLC9A3R2错义变体核酸分子的单个拷贝时,所述受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的。如本文所用,SLC9A3R2错义变体核酸分子是编码具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的SLC9A3R2多肽的任何SLC9A3R2核酸分子(诸如基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)。具有编码具有部分功能丧失(或预测的部分功能丧失)的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的受试者对于SLC9A3R2是亚等位基因的。编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子可以是编码SLC9A3R2Arg171Trp-长、Arg171Trp-短、Arg65Trp、Arg58Trp、Arg60Trp-短、Arg60Trp-长或Arg170Trp的任何核酸分子。在一些实施方案中,SLC9A3R2错义变体核酸分子编码SLC9A3R2 Arg171Trp-长或Arg171Trp-短。当受试者具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的两个拷贝时,所述受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是纯合的。
对于基因分型或确定为SLC9A3R2参考的受试者,此类受试者具有增加的发展出高血压,诸如原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压或恶性高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。对于基因分型或确定为SLC9A3R2参考或对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的受试者,可用SLC9A3R2抑制剂治疗此类受试者。
在本公开通篇描述的任何实施方案中,SLC9A3R2错义变体核酸分子可以是编码具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的SLC9A3R2多肽的任何SLC9A3R2核酸分子(诸如例如基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)。例如,SLC9A3R2错义变体核酸分子可以是编码SLC9A3R2 Arg171Trp-长、Arg171Trp-短、Arg65Trp、Arg58Trp、Arg60Trp-短、Arg60Trp-长或Arg170Trp的任何核酸分子。在一些实施方案中,SLC9A3R2错义变体核酸分子编码SLC9A3R2 Arg171Trp-长或Arg171Trp-短。
在本公开通篇描述的任何实施方案中,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽可以是具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的任何SLC9A3R2多肽。在本公开通篇描述的任何实施方案中,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽可以是本文所述的任一SLC9A3R2多肽,包括例如SLC9A3R2 Arg171Trp-长、Arg171Trp-短、Arg65Trp、Arg58Trp、Arg60Trp-短、Arg60Trp-长或Arg170Trp。在一些实施方案中,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽是SLC9A3R2 Arg171Trp-长或Arg171Trp-短。
编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子中的任一种或多种(即,任何组合)可用于本文所述的任何方法中以确定受试者是否具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。特定变体的组合可形成用于统计分析SLC9A3R2的特定相关性和降低发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险的掩码。
在本公开通篇描述的任何实施方案中,高血压是原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压或恶性高血压。在本公开通篇描述的任何实施方案中,高血压是原发性高血压。在本公开通篇描述的任何实施方案中,高血压是继发性高血压。在本公开通篇描述的任何实施方案中,高血压是顽固性高血压。在本公开通篇描述的任何实施方案中,高血压是恶性高血压。
高血压的症状包括但不限于血压升高、头痛、气短、流鼻血、潮红、头晕、胸痛、视力改变和/或尿中带血。
本公开提供了治疗患有高血压或处于发展出高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有原发性高血压或处于发展出原发性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有继发性高血压或处于发展出继发性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有顽固性高血压或处于发展出顽固性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有恶性高血压或处于发展出恶性高血压的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有冠心病或处于发展出冠心病的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
本公开还提供了治疗患有心房颤动或处于发展出心房颤动的风险中的患者的方法,所述方法包括向所述患者施用SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,SLC9A3R2抑制剂包含抑制性核酸分子。在一些实施方案中,抑制性核酸分子包含反义分子、小干扰RNA(siRNA)分子或短发夹RNA(shRNA)分子。在一些实施方案中,抑制性核酸分子包含反义分子。在一些实施方案中,抑制性核酸分子包含siRNA分子。在一些实施方案中,抑制性核酸分子包含shRNA分子。此类抑制性核酸分子可以设计成靶向SLC9A3R2核酸分子(诸如mRNA分子)的任何区域。在一些实施方案中,抑制性核酸分子与SLC9A3R2基因组核酸分子或mRNA分子内的序列杂交,并降低受试者细胞中SLC9A3R2多肽的表达。在一些实施方案中,SLC9A3R2抑制剂包含与SLC9A3R2基因组核酸分子或mRNA分子杂交并降低受试者的细胞中的SLC9A3R2多肽的表达的反义RNA。在一些实施方案中,SLC9A3R2抑制剂包含与SLC9A3R2基因组核酸分子或mRNA分子杂交并降低受试者的细胞中的SLC9A3R2多肽的表达的siRNA。在一些实施方案中,SLC9A3R2抑制剂包含与SLC9A3R2基因组核酸分子或mRNA分子杂交并降低受试者的细胞中的SLC9A3R2多肽的表达的shRNA。
抑制性核酸分子可包括RNA、DNA、或RNA和DNA两者。抑制性核酸分子还可与异源核酸序列(诸如载体中的异源核酸序列)或异源标记连接或融合。例如,抑制性核酸分子可在包含抑制性核酸分子和异源核酸序列的载体内或作为包含抑制性核酸分子和异源核酸序列的外源供体序列。抑制性核酸分子还可与异源标记连接或融合。标记可以是直接可检测的(诸如例如荧光团)或间接可检测的(诸如例如半抗原、酶或荧光团淬灭剂)。此类标记可通过光谱学、光化学、生物化学、免疫化学或化学手段检测。此类标记包括例如放射性标记、颜料、染料、色原、自旋标记和荧光标记。标记也可以是例如化学发光物质;含金属物质;或酶,其中发生依赖于酶的二次信号生成。术语“标记”也可指“标签”或半抗原,其可选择性地与缀合分子结合,使得缀合分子在随后与底物一起添加时用于生成可检测信号。例如,生物素可与辣根过氧化物(HRP)的亲和素或链霉亲和素缀合物一起用作标签以与标签结合,并使用量热底物(诸如例如四甲基联苯胺(TMB))或荧光底物进行检查以检测HRP的存在。可用作标签来促进纯化的示例性标记包括但不限于myc、HA、FLAG或3XFLAG、6XHis或聚组氨酸、谷胱甘肽-S-转移酶(GST)、麦芽糖结合蛋白、表位标签或免疫球蛋白的Fc部分。许多标记包括例如颗粒、荧光团、半抗原、酶及其量热、荧光和化学发光底物和其他标记。
抑制性核酸分子可包括例如核苷酸或非天然或修饰的核苷酸,诸如核苷酸类似物或核苷酸替代物。此类核苷酸包括含有修饰的碱基、糖或磷酸基团的核苷酸,或者在其结构中掺入有非天然部分的核苷酸。非天然核苷酸的实例包括但不限于双脱氧核苷酸、生物素化的、胺化的、脱氨基的、烷基化的、苄基化的和荧光团标记的核苷酸。
抑制性核酸分子还可包含一种或多种核苷酸类似物或取代。核苷酸类似物是含有对碱基、糖或磷酸部分的修饰的核苷酸。对碱基部分的修饰包括但不限于A、C、G和T/U以及不同的嘌呤或嘧啶碱基(诸如例如假尿苷、尿嘧啶-5-基、次黄嘌呤-9-基(I)和2-氨基腺嘌呤-9-基)的天然和合成修饰。修饰的碱基包括但不限于5-甲基胞嘧啶(5-me-C)、5-羟甲基胞嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、2-氨基腺嘌呤、腺嘌呤和鸟嘌呤的6-甲基和其他烷基衍生物、腺嘌呤和鸟嘌呤的2-丙基和其他烷基衍生物、2-硫代尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶和2-硫代胞嘧啶、5-卤代尿嘧啶和胞嘧啶、5-丙炔基尿嘧啶和胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、胞嘧啶和胸腺嘧啶、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、4-硫代尿嘧啶、8-卤代、8-氨基、8-硫代、8-硫代烷基、8-羟基和其他8-取代的腺嘌呤和鸟嘌呤、5-卤代(例如5-溴)、5-三氟甲基和其他5-取代的尿嘧啶和胞嘧啶、7-甲基鸟嘌呤、7-甲基腺嘌呤、8-氮杂鸟嘌呤、8-氮杂腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、7-脱氮腺嘌呤、3-脱氮鸟嘌呤和3-脱氮腺嘌呤。
核苷酸类似物还可包括对糖部分的修饰。对糖部分的修饰包括但不限于核糖和脱氧核糖的天然修饰以及合成修饰。糖修饰包括但不限于在2’位置处的以下修饰:OH;F;O-、S-或N-烷基;O-、S-或N-烯基;O-、S-或N-炔基;或O-烷基-O-烷基,其中烷基、烯基和炔基可以是取代或未取代的C1-10烷基或C2-10烯基和C2-10炔基。示例性的2’糖修饰还包括但不限于-O[(CH2)nO]mCH3、-O(CH2)nOCH3、-O(CH2)nNH2、-O(CH2)nCH3、-O(CH2)n-ONH2和-O(CH2)nON[(CH2)nCH3)]2,其中n和m独立地为1至约10。2’位置处的其他修饰包括但不限于C1-10烷基、取代的低级烷基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基或O-芳烷基、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、O NO2、NO2、N3、NH2、杂环烷基、杂环烷芳基、氨基烷基氨基、聚烷基氨基、取代的甲硅烷基、RNA切割基团、报告基团、嵌入剂、用于改善寡核苷酸的药代动力学特性的基团或用于改善寡核苷酸的药效动力学特性的基团,以及具有类似特性的其他取代基。还可在糖上的其他位置上做出类似的修饰,具体地在3'末端核苷酸上或在2'-5'连接的寡核苷酸中的糖的3'位置和5'末端核苷酸的5'位置。修饰的糖还可包括在桥环氧处含有修饰(诸如CH2和S)的那些糖。核苷酸糖类似物还可具有替代呋喃戊糖的糖模拟物诸如环丁基部分。
核苷酸类似物还可在磷酸酯部分处进行修饰。修饰的磷酸酯部分包括但不限于可被修饰以使得两个核苷酸之间的键联含有以下的修饰的磷酸酯部分:硫代磷酸酯、手性硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、氨基烷基磷酸三酯、甲基和其他烷基膦酸酯(包括3'-亚烷基膦酸酯和手性膦酸酯)、次膦酸酯、氨基磷酸酯(包括3'-氨基氨基磷酸酯和氨基烷基氨基磷酸酯)、硫羰氨基磷酸酯、硫羰烷基膦酸酯、硫羰烷基磷酸三酯和硼烷磷酸酯。两个核苷酸之间的这些磷酸酯或修饰的磷酸酯键联可通过3’-5’键联或2’-5’键联,并且所述键联可含有反转的极性,诸如3’-5’至5’-3’或2’-5’至5’-2’。还包括各种盐、混合盐以及游离酸形式。核苷酸替代物还包括肽核酸(PNA)。
在一些实施方案中,反义核酸分子是间隔体(gapmer),由此在5'和3'端的前一至七个核苷酸各自具有2'-甲氧基乙基(2'-MOE)修饰。在一些实施方案中,5'和3'端的前五个核苷酸各自具有2'-MOE修饰。在一些实施方案中,5'和3'端的前一至七个核苷酸是RNA核苷酸。在一些实施方案中,5'和3'端的前五个核苷酸是RNA核苷酸。在一些实施方案中,核苷酸之间的每个骨架键联是硫代磷酸酯键联。
在一些实施方案中,siRNA分子具有末端修饰。在一些实施方案中,反义链的5’端被磷酸化。在一些实施方案中,使用不能水解的5’-磷酸酯类似物,诸如5’-(E)-乙烯基膦酸酯。
在一些实施方案中,siRNA分子具有骨架修饰。在一些实施方案中,已证明连接连续核糖核苷的修饰的磷酸二酯基团会增强siRNA的稳定性和体内生物利用率。磷酸二酯键联的非酯类基团(-OH、=O)可被硫、硼或乙酸酯替换,得到硫代磷酸酯、硼酸磷酸酯和膦酰基乙酸酯键联。另外,用磷酸三酯取代磷酸二酯基团可促进siRNA的细胞摄取并通过消除它们的负电荷而保留在血清组分上。在一些实施方案中,siRNA分子具有糖修饰。在一些实施方案中,糖被去质子化(由外切和内切核酸酶催化的反应),由此2’-羟基可充当亲核试剂并攻击磷酸二酯键中相邻的磷。此类替代方案包括2’-O-甲基、2’-O-甲氧基乙基和2’-氟修饰。
在一些实施方案中,siRNA分子具有碱基修饰。在一些实施方案中,碱基可被修饰的碱基,诸如假尿苷、5’-甲基胞苷、N6-甲基腺苷、肌苷和N7-甲基鸟苷取代。
在一些实施方案中,siRNA分子与脂质缀合。脂质可缀合到siRNA的5'或3'末端,以通过允许它们与血清脂蛋白缔合来提高它们的体内生物利用率。代表性的脂质包括但不限于胆固醇和维生素E,以及脂肪酸,诸如棕榈酸酯和生育酚。
在一些实施方案中,代表性siRNA具有下式:
有义:mN*mN*/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/*mN*/32FN/
反义:/52FN/*/i2FN/*mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN/i2FN/mN*N*N
其中:“N”是碱基;“2F”是2'-F修饰;“m”是2'-O-甲基修饰,“I”是内部碱基;并且“*”是硫代磷酸酯骨架键联。
本公开还提供了包含抑制性核酸分子中的任一种或多种的载体。在一些实施方案中,载体包含抑制性核酸分子中的任一种或多种和异源核酸。载体可以是能够转运核酸分子的病毒或非病毒载体。在一些实施方案中,载体是质粒或粘粒(诸如例如可将额外的DNA区段连接到其中的环状双链DNA)。在一些实施方案中,载体是病毒载体,其中额外的DNA区段可连接到病毒基因组中。表达载体包括但不限于质粒、粘粒、逆转录病毒、腺病毒、腺相关病毒(AAV)、植物病毒(诸如花椰菜花叶病毒和烟草花叶病毒)、酵母人工染色体(YAC)、Epstein-Barr(EBV)来源的附加体以及本领域已知的其他表达载体。
本公开还提供了包含抑制性核酸分子中的任一种或多种的组合物。在一些实施方案中,组合物是药物组合物。在一些实施方案中,组合物包含载剂和/或赋形剂。载剂的实例包括但不限于聚(乳酸)(PLA)微球、聚(D,L-乳酸-共乙醇酸)(PLGA)微球、脂质体、胶束、反胶束、脂质螺旋物和脂质微管。载剂可包括缓冲盐溶液,诸如PBS、HBSS等。
在一些实施方案中,SLC9A3R2抑制剂包含在(多个)识别序列处诱导一个或多个切口或双链断裂的核酸酶剂或与SLC9A3R2基因组核酸分子内的识别序列结合的DNA结合蛋白。识别序列可位于SLC9A3R2基因的编码区内或影响所述基因的表达的调控区内。DNA结合蛋白或核酸酶剂的识别序列可位于内含子、外显子、启动子、增强子、调节区域或任何非蛋白质编码区中。识别序列可包括或接近SLC9A3R2基因的起始密码子。例如,识别序列可位于距起始密码子约10、约20、约30、约40、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处。作为另一实例,可使用两种或更多种核酸酶剂,每种核酸酶剂均靶向包括或接近起始密码子的核酸酶识别序列。作为另一实例,可使用两种核酸酶剂,一种靶向包括或接近起始密码子的核酸酶识别序列,且一种靶向包括或接近终止密码子的核酸酶识别序列,其中核酸酶剂的切割可导致两个核酸酶识别序列之间的编码区的缺失。将切口或双链断裂诱导到所需识别序列中的任何核酸酶剂均可用于本文公开的方法和组合物中。结合所需识别序列的任何DNA结合蛋白均可用于本文公开的方法和组合物中。
用于本文的合适的核酸酶剂和DNA结合蛋白包括但不限于锌指蛋白或锌指核酸酶(ZFN)对、转录激活因子样效应物(TALE)蛋白或转录激活因子样效应物核酸酶(TALEN),或成簇规则散布的短回文重复序列(CRISPR)/CRISPR相关(Cas)系统。识别序列的长度可变化,并且包括例如对于锌指蛋白或ZFN对为约30至约36bp、对于每个ZFN为约15至约18bp、对于TALE蛋白或TALEN为约36bp且对于CRISPR/Cas指导RNA为约20bp的识别序列。
在一些实施方案中,CRISPR/Cas系统可用于修饰细胞内的SLC9A3R2基因组核酸分子。本文公开的方法和组合物可通过利用CRISPR复合物(包含与Cas蛋白复合的指导RNA(gRNA))而使用CRISPR-Cas系统,用于SLC9A3R2核酸分子的位点定向切割。
Cas蛋白通常包含至少一个可与gRNA相互作用的RNA识别或结合域。Cas蛋白还可包含核酸酶结构域(诸如例如DNA酶或RNA酶结构域)、DNA结合结构域、解旋酶结构域、蛋白质-蛋白质相互作用结构域、二聚化结构域和其他结构域。合适的Cas蛋白包括例如野生型Cas9蛋白和野生型Cpf1蛋白(诸如例如FnCpf1)。Cas蛋白可具有完全切割活性以在SLC9A3R2基因组核酸分子中产生双链断裂,或者其可以是在SLC9A3R2基因组核酸分子中产生单链断裂的切口酶。Cas蛋白的另外的实例包括但不限于Cas1、Cas1B、Cas2、Cas3、Cas4、Cas5、Cas5e(CasD)、Cas6、Cas6e、Cas6f、Cas7、Cas8a1、Cas8a2、Cas8b、Cas8c、Cas9(Csn1或Csx12)、Cas10、Cas10d、CasF、CasG、CasH、Csy1、Csy2、Csy3、Cse1(CasA)、Cse2(CasB)、Cse3(CasE)、Cse4(CasC)、Csc1、Csc2、Csa5、Csn2、Csm2、Csm3、Csm4、Csm5、Csm6、Cmr1、Cmr3、Cmr4、Cmr5、Cmr6、Csb1、Csb2、Csb3、Csx17、Csx14、Csx10、Csx16、CsaX、Csx3、Csx1、Csx15、Csf1、Csf2、Csf3、Csf4和Cu1966,以及它们的同源物或修饰型式。Cas蛋白也可作为融合蛋白可操作地连接至异源多肽。例如,Cas蛋白可与切割结构域、表观遗传修饰结构域、转录激活结构域或转录抑制结构域融合。Cas蛋白可以任何形式提供。例如,Cas蛋白可以蛋白,诸如与gRNA复合的Cas蛋白的形式提供。替代地,Cas蛋白可以编码Cas蛋白的核酸分子,诸如RNA或DNA的形式提供。
在一些实施方案中,SLC9A3R2基因组核酸分子的靶向遗传修饰可通过使细胞与Cas蛋白和一种或多种gRNA接触来产生,所述一种或多种gRNA与所述SLC9A3R2基因组核酸分子中的靶基因组基因座内的一个或多个gRNA识别序列杂交。例如,gRNA识别序列可以位于SEQ ID NO:1的区域内。所述gRNA识别序列还可包括或接近对应于:根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置。例如,gRNA识别序列可位于距对应于:根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处。所述gRNA识别序列可包括或接近SLC9A3R2基因组核酸分子的起始密码子或终止密码子。例如,gRNA识别序列可位于距起始密码子或终止密码子约10、约20、约30、约40、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处。
SLC9A3R2基因组核酸分子中的靶基因组基因座内的gRNA识别序列位于原间隔序列邻近基序(PAM)序列附近,PAM序列是紧随Cas9核酸酶靶向的DNA序列之后的2-6个碱基对的DNA序列。经典PAM是序列5'-NGG-3',其中“N”是后接两个鸟嘌呤(“G”)核碱基的任何核碱基。gRNA可将Cas9转运至基因组中的任何位置用于基因编辑,但在除了Cas9识别PAM的位点之外的任何位点都不会发生编辑。另外,5'-NGA-3'可作为人体细胞的高效非经典PAM。一般地,PAM在gRNA靶向的DNA序列下游约2至约6个核苷酸处。PAM可侧接gRNA识别序列。在一些实施方案中,gRNA识别序列可在3’端被PAM侧接。在一些实施方案中,gRNA识别序列可在5’端被PAM侧接。例如,Cas蛋白的切割位点可在PAM序列上游或下游约1个至约10个碱基对、约2个至约5个碱基对,或3个碱基对处。在一些实施方案中(例如当使用来自酿脓链球菌(S.pyogenes)的Cas9或密切相关的Cas9时),非互补链的PAM序列可为5'-NGG-3',其中N是任何DNA核苷酸并且紧邻靶DNA的非互补链的gRNA识别序列的3'。因而,互补链的PAM序列将是5'-CCN-3',其中N是任何DNA核苷酸并紧邻靶DNA的互补链的gRNA识别序列的5'。
gRNA是与Cas蛋白结合并将Cas蛋白靶向SLC9A3R2基因组核酸分子内的特定位置的RNA分子。示例性gRNA是有效指导Cas酶结合于或切割SLC9A3R2基因组核酸分子的gRNA,其中所述gRNA包含DNA靶向区段,其与SLC9A3R2基因组核酸分子内的gRNA识别序列杂交,所述gRNA识别序列包含或接近对应于:根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置。例如,可选择gRNA以使其与位于距对应于:根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置约5、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处的gRNA识别序列杂交。其他示例性gRNA包含DNA靶向区段,其与SLC9A3R2基因组核酸分子内存在的gRNA识别序列杂交,所述gRNA识别序列包含或接近起始密码子或终止密码子。例如,可选择gRNA以使其与位于距起始密码子约5、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处或位于距终止密码子约5、约10、约15、约20、约25、约30、约35、约40、约45、约50、约100、约200、约300、约400、约500或约1,000个核苷酸处的gRNA识别序列杂交。合适的gRNA可包含约17至约25个核苷酸、约17至约23个核苷酸、约18至约22个核苷酸或约19至约21个核苷酸。在一些实施方案中,gRNA包含20个核苷酸。
位于SLC9A3R2参考基因内的合适gRNA识别序列的实例在表1中作为SEQ ID NO:93-112列出。
表1:SLC9A3R2变异附近的指导RNA识别序列
gRNA识别序列 SEQ ID NO:
- AGGTTGAACCCATAGCCCTG 93
+ CACCTGCGAAAGGGACCTCA 94
+ GTCAACGGCGTCAACGTGGA 95
+ GGATGTCAGTGGGCCCCTGA 96
- TGACGCCGTTGACCTCGACC 97
+ ACCTGCATAGTGACAAGTCC 98
+ TGGTGGCCAGCATCAAGGCA 99
- GCCGGGACTTGTCACTATGC 100
+ GTGAACGGGCAGAATGTGGA 101
+ TTCCACCTGCACGGCGAGAA 102
+ AAGCCAGACTGGGCACACAC 103
+ CGGCCAGTACATCCGCTCTG 104
+ TACATCCGCTCTGTGGACCC 105
+ CGAGGTCAACGGCGTCAACG 106
- ACAGAGCGGATGTACTGGCC 107
- CGCGCCGGATGAACTGCCCG 108
+ GCGGCAGCTGACCTGTACCG 109
- GGGCCGGTACCTCAATGAGC 110
+ AGGCTGTGGAGGGGCAGACT 111
- GCAGCGCGGCGGCCTCGGCG 112
Cas蛋白和gRNA形成复合物,并且Cas蛋白切割靶SLC9A3R2基因组核酸分子。Cas蛋白可以在gRNA的DNA靶向区段将与之结合的靶SLC9A3R2基因组核酸分子中存在的核酸序列内或外的位点处切割核酸分子。例如,CRISPR复合物(包含与gRNA识别序列杂交并与Cas蛋白复合的gRNA)的形成可导致在gRNA的DNA靶向区段将结合的SLC9A3R2基因组核酸分子中存在的核酸序列中或附近(诸如例如来自所述核酸序列的1个、2个、3个、4个、5个、6个、7个、8个、9个、10个、20个、50个或更多个碱基对内)的一条或两条链的切割。
此类方法可产生例如SLC9A3R2基因组核酸分子,其中SEQ ID NO:1的区域被破坏,起始密码子被破坏,终止密码子被破坏,或者编码序列被破坏或缺失。任选地,细胞可进一步与一种或多种另外的gRNA接触,所述另外的gRNA与SLC9A3R2基因组核酸分子中靶基因组基因座内另外的gRNA识别序列杂交。通过使所述细胞与一种或多种另外的gRNA(诸如例如与第二gRNA识别序列杂交的第二gRNA)接触,由Cas蛋白切割可产生两个或更多个双链断裂或者两个或更多个单链断裂。
在一些实施方案中,SLC9A3R2抑制剂包括小分子。
在一些实施方案中,治疗的方法还包括检测从受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子。如本公开通篇所用,“SLC9A3R2错义变体核酸分子”是编码具有部分功能丧失、完全功能丧失、预测的部分功能丧失或预测的完全功能丧失的SLC9A3R2多肽的任何SLC9A3R2核酸分子(诸如例如,基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)。
本公开还提供了用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂治疗受试者的方法。在一些实施方案中,受试者患有高血压。在一些实施方案中,受试者处于发展出高血压的风险中。在一些实施方案中,受试者患有冠心病。在一些实施方案中,受试者处于发展出冠心病的风险中。在一些实施方案中,受试者患有心房颤动。在一些实施方案中,受试者处于发展出心房颤动的风险中。在一些实施方案中,所述方法包括通过以下方式确定受试者是否具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子:获得或已经获得从所述受试者获得的生物样品,并且对所述生物样品进行或已经进行序列分析以确定所述受试者是否具有包含所述SLC9A3R2错义变体核酸分子的基因型。当受试者是SLC9A3R2参考时,以标准剂量量向受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向受试者施用SLC9A3R2抑制剂。当受试者对于SLC9A3R2错义变体是杂合的时,以同于或低于标准剂量量的量向受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向受试者施用SLC9A3R2抑制剂。具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的基因型的存在指示受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。在一些实施方案中,受试者是SLC9A3R2参考。在一些实施方案中,受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的。
对于基因分型或确定为SLC9A3R2参考或对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的受试者,可用SLC9A3R2抑制剂治疗此类受试者,如本文所述。
检测从受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子和/或确定受试者是否具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子可通过本文所述的任何方法进行。在一些实施方案中,这些方法可在体外进行。在一些实施方案中,这些方法可原位进行。在一些实施方案中,这些方法可在体内进行。在这些实施方案中的任一项中,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子可存在于从受试者获得的细胞内。
在一些实施方案中,当受试者是SLC9A3R2参考时,还以标准剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。在一些实施方案中,当受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的时,以同于或低于标准剂量量的剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。
在一些实施方案中,治疗方法还包括检测从受试者获得的生物样品中SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的存在或不存在。在一些实施方案中,当受试者不具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽时,以标准剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。在一些实施方案中,当受试者具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽时,以同于或低于标准剂量量的剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。
本公开还提供了用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂治疗受试者的方法。在一些实施方案中,受试者患有高血压。在一些实施方案中,受试者处于发展出高血压的风险中。在一些实施方案中,受试者患有冠心病。在一些实施方案中,受试者处于发展出冠心病的风险中。在一些实施方案中,受试者患有心房颤动。在一些实施方案中,受试者处于发展出心房颤动的风险中。在一些实施方案中,方法包括通过以下方式确定受试者是否具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽:从受试者获得或已经获得生物样品,并且对生物样品进行或已经进行测定以确定受试者是否具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。当受试者不具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽时,以标准剂量量向受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向受试者施用SLC9A3R2抑制剂。当受试者具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽时,以同于或低于标准剂量量的量向受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向受试者施用SLC9A3R2抑制剂。SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的存在指示受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。在一些实施方案中,受试者具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。在一些实施方案中,受试者不具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
检测从受试者获得的生物样品中存在或不存在SLC9A3R2预测的功能丧失多肽和/或确定受试者是否具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽可通过本文所述的任何方法进行。在一些实施方案中,这些方法可在体外进行。在一些实施方案中,这些方法可原位进行。在一些实施方案中,这些方法可在体内进行。在这些实施方案中的任一项中,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽可存在于从受试者获得的细胞内。
治疗或预防高血压的治疗剂的实例包括但不限于:噻嗪类利尿剂(诸如氯噻酮、氯噻嗪、氢氯噻嗪、吲达帕胺(indapamide)或美托拉宗(metolazone));保钾利尿剂(诸如阿米洛利(amiloride)、螺内酯或氨苯蝶啶);袢利尿剂(诸如布美他尼(bumetanide)、呋塞米(furosemide)或托拉塞米(torsemide));β阻滞剂(诸如醋丁洛尔(acebutolol)、阿替洛尔(atenolol)、倍他洛尔(betaxolol)、比索洛尔(bisoprolol)、比索洛尔/氢氯噻嗪、酒石酸美托洛尔(metoprolol tartrate)、琥珀酸美托洛尔、纳多洛尔(nadolol)、吲哚洛尔(pindolol)、普萘洛尔(propranolol)、索洛尔(solotol)或噻吗洛尔(timolol));血管紧张素转换酶(ACE)抑制剂(诸如贝那普利(benazepril)、卡托普利(captopril)、依那普利(enalapril)、福辛普利(fosinopril)、赖诺普利(lisinopril)、莫昔普利(moexipril)、培哚普利(perindopril)、喹那普利(quinapril)、雷米普利(ramipril)或群多普利(trandolapril));血管紧张素II受体阻滞剂(ARB)(诸如坎地沙坦(candesartan)、依普罗沙坦(eprosartan)、厄贝沙坦(irbesartan)、氯沙坦(losartan)、替米沙坦(telmisartan)或缬沙坦(valsartan));钙通道阻滞剂(诸如氨氯地平(amlodipine)、地尔硫卓(diltiazem)、非洛地平(felodipine)、伊拉地平(nicardipine)、尼卡地平(nifedipine)、硝苯地平(nifedipine)、尼索地平(nisoldipine)或维拉帕米(verapamil));α-阻滞剂(诸如多沙唑嗪(doxazosin)、哌唑嗪(prazosin)或特拉唑嗪(terazosin));α-β-阻滞剂(诸如卡维地洛(carvedilol)或拉贝洛尔(labetalol));中枢激动剂(诸如甲基多巴(methyldopa)、可乐定(clonidine)或胍法辛(guanfacine));血管扩张剂(诸如肼屈嗪(hydralazine)或米诺地尔(minoxidil));醛固酮受体拮抗剂(诸如依普利酮(eplerenone)或螺内酯)和肾素抑制剂(诸如阿利吉仑(aliskiren))。
在一些实施方案中,治疗或预防高血压的治疗剂是噻嗪类利尿剂、保钾利尿剂、袢利尿剂、β阻滞剂、ACE抑制剂、ARB、钙通道阻滞剂、α-阻滞剂、α-β-阻滞剂、中枢激动剂、血管扩张剂、醛固酮受体拮抗剂或肾素抑制剂。在一些实施方案中,噻嗪利尿剂是氯噻酮、氯噻嗪、氢氯噻嗪、吲达帕胺或美托拉宗。在一些实施方案中,保钾利尿剂是阿米洛利、螺内酯或氨苯蝶啶。在一些实施方案中,袢利尿剂是布美他尼、呋塞米或托拉塞米。在一些实施方案中,β阻滞剂是醋丁洛尔、阿替洛尔、倍他洛尔、比索洛尔、比索洛尔/氢氯噻嗪、酒石酸美托洛尔、琥珀酸美托洛尔、纳多洛尔、吲哚洛尔、普萘洛尔、索洛尔或噻吗洛尔。在一些实施方案中,ACE抑制剂是贝那普利、卡托普利、依那普利、福辛普利、赖诺普利、莫昔普利、培哚普利、喹那普利、雷米普利或群多普利。在一些实施方案中,ARB是坎地沙坦、依普罗沙坦、厄贝沙坦、氯沙坦、替米沙坦或缬沙坦。在一些实施方案中,钙通道阻断剂是氨氯地平、地尔硫卓、非洛地平、伊拉地平、尼卡地平、硝苯地平、尼索地平或维拉帕米。在一些实施方案中,α-阻滞剂是多沙唑嗪、哌唑嗪或特拉唑嗪。在一些实施方案中,α-β-阻滞剂是卡维地洛或拉贝洛尔。在一些实施方案中,中枢激动剂是甲基多巴、可乐定或胍法辛。在一些实施方案中,血管扩张剂是肼屈嗪或米诺地尔。在一些实施方案中,醛固酮受体拮抗剂是依普利酮或螺内酯。在一些实施方案中,肾素抑制剂是阿利吉仑。
在一些实施方案中,与作为SLC9A3R2参考的受试者(其可接受标准剂量量)相比,对于对编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的受试者,治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂的剂量可减少约10%、约20%、约30%、约40%、约50%、约60%、约70%、约80%或约90%(即,低于标准剂量量)。在一些实施方案中,治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂的剂量可减少约10%、约20%、约30%、约40%或约50%。另外,与作为SLC9A3R2参考的受试者相比,在对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的受试者中,治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂的剂量可以较低频率施用。
治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂和/或SLC9A3R2抑制剂的施用可例如在一天、两天、三天、五天、一周、两周、三周、一个月、五周、六周、七周、八周、两个月或三个月后重复。重复施用可按相同的剂量或按不同的剂量。施用可重复一次、两次、三次、四次、五次、六次、七次、八次、九次、十次或更多次。例如,根据某些剂量方案,受试者可接受较长时间段的治疗,诸如例如6个月、1年或更长时间。另外,治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂和/或SLC9A3R2抑制剂可依序或同时施用。另外,治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂和/或SLC9A3R2抑制剂可在单独的组合物中施用或者可在同一组合物中一起施用。
治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂和/或SLC9A3R2抑制剂的施用可通过任何合适的途径进行,包括但不限于肠胃外、静脉内、口服、皮下、动脉内、颅内、鞘内、腹膜内、局部、鼻内或肌内。用于施用的药物组合物理想地是无菌且基本上等渗的,并且在GMP条件下制造。药物组合物可以单位剂型(即单次施用的剂量)提供。药物组合物可使用一种或多种生理上和药学上可接受的载剂、稀释剂、赋形剂或助剂来配制。制剂取决于所选的施用途径。术语“药学上可接受的”意指载剂、稀释剂、赋形剂或助剂与制剂的其他成分相容,且对其接受者基本上无害。
如本文所用,术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”和“治疗(treatment)”以及“预防(prevent)”、“预防(preventing)”和“预防(prevention)”分别是指引发期望的生物反应,诸如治疗效果和预防效果。在一些实施方案中,在施用所述剂或包含所述剂的组合物后,治疗效果包括以下中的一种或多种:高血压的降低/减轻,高血压的严重程度的降低/减轻(诸如例如减轻或抑制高血压的发展),症状和高血压相关效应的降低/减轻,延迟症状和高血压相关效应的发作,减轻高血压相关效应的症状的严重程度,减轻急性发作的严重程度,减少症状和高血压相关效应的数目,减少症状和高血压相关效应的潜伏期,症状和高血压相关效应的改善,减少继发性症状,减少继发性感染,预防高血压复发,降低复发发作的次数或频率,增加症状发作间隔的潜伏期,增加持续进展的时间,加快缓解,诱导缓解,加强缓解,加速恢复,或增加替代治疗剂的功效或降低对替代治疗剂的抗性,和/或增加受影响宿主动物的存活时间。预防效果可包括在治疗方案的施用后完全或部分避免/抑制或延迟高血压发展/进展(诸如例如完全或部分避免/抑制或延迟),以及增加受影响宿主动物的存活时间。高血压的治疗涵盖治疗已经被诊断为患有处于任何临床阶段或表现的任何形式的高血压的受试者,延迟高血压的症状或体征的发作或演变或加重或恶化,和/或预防和/或减轻高血压的严重程度。
本公开还提供了鉴定具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险的受试者的方法。在一些实施方案中,所述方法包括确定或已经确定在从受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子(诸如基因组核酸分子、mRNA分子和/或cDNA分子)。当受试者缺乏编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子(即,受试者在基因型上被归类为SLC9A3R2参考)时,则受试者具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。当受试者具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子(即,受试者对于SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合或纯合的)时,则与作为SLC9A3R2参考的受试者相比,所述受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。
与不具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的拷贝相比,具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的单个拷贝更能保护受试者免于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动。无意受限于任何特定的理论或作用机制,据信SLC9A3R2错义变体核酸分子的单个拷贝(即,对于SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的)保护受试者免于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动,并且还据信具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的两个拷贝(即,对于SLC9A3R2错义变体核酸分子是纯合的)相对于具有单个拷贝的受试者可更能保护受试者免于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动。因此,在一些实施方案中,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的单个拷贝可能不具完全保护性,而是可能部分或不完全地保护受试者免于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动。虽然不希望受任何特定理论约束,但可能存在涉及高血压、冠心病和/或心房颤动的发展的其他因子或分子,其仍存在于具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的单个拷贝的受试者中,因此导致对高血压、冠心病和/或心房颤动的发展的保护不太完全。
检测从受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子和/或确定受试者是否具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子可通过本文所述的任何方法进行。在一些实施方案中,这些方法可在体外进行。在一些实施方案中,这些方法可原位进行。在一些实施方案中,这些方法可在体内进行。在这些实施方案中的任一项中,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子可存在于从受试者获得的细胞内。
在一些实施方案中,当受试者被鉴定为发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险增加时,受试者进一步如本文所述用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂和/或SLC9A3R2抑制剂治疗。例如,当受试者是SLC9A3R2参考,并因此具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险时,将SLC9A3R2抑制剂施用给受试者。在一些实施方案中,还向此类受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。在一些实施方案中,当受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的时,以同于或低于标准剂量量的剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或施用SLC9A3R2抑制剂。在一些实施方案中,受试者是SLC9A3R2参考。在一些实施方案中,受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的。
在一些实施方案中,本文所述的任何方法还可包括确定受试者具有与发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险降低相关的编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子和/或SLC9A3R2预测的功能丧失变体多肽的总负荷。总负荷是SLC9A3R2基因中所有变体的总和,其可在与高血压、冠心病和/或心房颤动的关联分析中进行。在一些实施方案中,受试者对于与发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险降低相关的编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的一个或多个SLC9A3R2错义变体核酸分子是纯合的。在一些实施方案中,受试者对于与发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险降低相关的编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的一个或多个SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的。关联分析的结果表明,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子与发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险降低相关。当受试者具有较小总负荷时,受试者发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险较高,并且以标准剂量量向受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或SLC9A3R2抑制剂。当受试者具有较大的总负荷时,受试者发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险较低,并且以同于或低于标准剂量量的量向受试者施用或继续施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。总负荷越大,发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险就越低。
可用于总负荷分析的SLC9A3R2变体包括以下任一项或多项或任意组合:
在一些实施方案中,受试者具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的任何一个或多个SLC9A3R2错义变体核酸分子的总负荷代表多个编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的任何SLC9A3R2错义变体核酸分子的加权和。在一些实施方案中,使用存在于SLC9A3R2基因中或其周围(至多10Mb)的至少约2、至少约3、至少约4、至少约5、至少约10、至少约20、至少约30、至少约40、至少约50、至少约60、至少约70、至少约80、至少约100、至少约120、至少约150、至少约200、至少约250、至少约300,至少约400、至少约500、至少约1,000、至少约10,000、至少约100,000或至少约或大于1,000,000种遗传变体计算总负荷,其中遗传负荷是等位基因的数量乘以与高血压、冠心病和/或心房颤动的关联估计或每个等位基因的相关结果(例如加权多基因负荷评分)。这可包括靠近SLC9A3R2基因(基因周围至多10Mb)的任何遗传变异,无论其基因组注释如何,所述变异在遗传关联分析中显示出与高血压相关性状的非零关联。在一些实施方案中,当受试者具有高于所需阈值分数的总负荷时,受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。在一些实施方案中,当受试者具有低于所需阈值分数的总负荷时,受试者具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。
在一些实施方案中,总负荷可分为五分位数,例如最高五分位数、中间五分位数和最低五分位数,其中总负荷的最高五分位数对应于最低风险组,且总负荷的最低五分位数对应于最高风险组。在一些实施方案中,具有较大总负荷的受试者包括最高加权总负荷,包括但不限于受试者群体的总负荷的前10%、前20%、前30%、前40%或前50%。在一些实施方案中,遗传变体包括在相关性p值范围的前10%、前20%、前30%、前40%或前50%中的与高血压、冠心病和/或心房颤动相关的遗传变体。在一些实施方案中,每个鉴定的遗传变体包括与高血压、冠心病和/或心房颤动相关的遗传变体,其p值不大于约10-2、约10-3、约10-4、约10-5、约10-6、约10-7、约10-8、约10-9、约10-10、约10-11、约10-12、约10-13、约10-14或约10-15。在一些实施方案中,鉴定的遗传变体包括p值小于5×10-8的与高血压、冠心病和/或心房颤动相关的遗传变体。在一些实施方案中,鉴定的遗传变体包括与高风险受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动相关的遗传变体,与参考群体的剩余部分相比具有以下比值比(OR):对于分布的前20%为约1.5或更大、约1.75或更大、约2.0或更大、或约2.25或更大;或约1.5或更大、约1.75或更大、约2.0或更大、约2.25或更大、约2.5或更大、或约2.75或更大。在一些实施方案中,比值比(OR)的范围可为约1.0至约1.5、约1.5至约2.0、约2.0至约2.5、约2.5至约3.0、约3.0至约3.5、约3.5至约4.0、约4.0至约4.5、约4.5至约5.0、约5.0至约5.5、约5.5至约6.0、约6.0至约6.5、约6.5至约7.0、或大于7.0。在一些实施方案中,高风险受试者包括具有参考群体中的最低十分位数、五分位数或三分位数的总负荷的受试者。总负荷的阈值是根据预期实际应用的性质以及会被认为对所述实际应用有意义的风险差异来确定的。
在一些实施方案中,当受试者被鉴定为发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险增加时,进一步如本文所述向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或SLC9A3R2抑制剂。例如,当受试者是SLC9A3R2参考,并因此具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险时,向受试者施用SLC9A3R2抑制剂。在一些实施方案中,还向此类受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。在一些实施方案中,当受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的时,以同于或低于标准剂量量的剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或施用SLC9A3R2抑制剂。在一些实施方案中,受试者是SLC9A3R2参考。在一些实施方案中,受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的。此外,当受试者因具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子而具有较低的总负荷,并因此具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险时,向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。在一些实施方案中,当受试者因具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子而具有较低的总负荷时,以同于或高于向因具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子而具有较大的总负荷的受试者施用的标准剂量量的剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。
本公开还提供了检测从受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子,和/或从受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体mRNA分子,和/或从受试者获得的生物样品中存在或不存在由mRNA分子产生的编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体cDNA分子的方法。应理解,群体内的基因序列和由此类基因编码的mRNA分子可因多态性诸如单核苷酸多态性(SNP)而变化。本文提供的SLC9A3R2变体基因组核酸分子、SLC9A3R2变体mRNA分子和SLC9A3R2变体cDNA分子的序列仅为示例性序列。SLC9A3R2变体基因组核酸分子、变体mRNA分子和变体cDNA分子的其他序列也是可能的。
生物样品可来源于来自受试者的任何细胞、组织或生物流体。生物样品可包括任何临床相关组织,诸如例如骨髓样品、肿瘤活检、细针抽吸物或体液样品,诸如血液、龈沟液、血浆、血清、淋巴、腹水、囊液或尿液。在一些实施方案中,生物样品包括口腔拭子。本文所公开的方法中使用的生物样品可基于测定形式、检测方法的性质以及用作样品的组织、细胞或提取物而变化。生物样品可根据所采用的测定进行不同处理。例如,当检测任何SLC9A3R2变体核酸分子时,可采用被设计用于分离SLC9A3R2变体核酸分子或使生物样品富集所述分子的初步处理。多种技术可用于此目的。当检测任何SLC9A3R2变体mRNA分子的水平时,可使用不同的技术富集生物样品的mRNA分子。可使用各种方法来检测mRNA分子的存在或水平或特定变体基因组DNA位点的存在。
本公开还提供了在受试者中检测编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子或其互补序列的方法。所述方法包括测定从受试者获得的生物样品以确定生物样品中的核酸分子是否是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子或其互补序列是具有包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列的基因组核酸分子。
在一些实施方案中,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子或其互补序列是具有包含以下的核苷酸序列的mRNA分子:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶。
在一些实施方案中,编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子或其互补序列是生物样品中由mRNA分子产生的cDNA分子,其具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,SLC9A3R2错义变体核酸分子具有包含以下的核苷酸序列:对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列(对于基因组核酸分子)的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列(对于mRNA分子)的位置615的位置处的尿嘧啶;或对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列(对于从mRNA分子获得的cDNA分子)的位置615的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,生物样品包含细胞或细胞裂解物。此类方法还可包括,例如,从受试者获得包含SLC9A3R2基因组核酸分子或mRNA分子的生物样品,并且如果是mRNA,则任选地将mRNA逆转录成cDNA。此类测定可包括,例如确定特定SLC9A3R2核酸分子的这些位置的身份。在一些实施方案中,所述方法是体外方法。
在一些实施方案中,测定包括对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的至少一部分进行测序。在一些实施方案中,所述测定包括对以下各者的至少一部分进行测序:生物样品中SLC9A3R2基因组核酸分子的核苷酸序列,其中测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;生物样品中SLC9A3R2 mRNA分子的核苷酸序列,其中测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置;和/或生物样品中由mRNA产生的SLC9A3R2 cDNA分子的核苷酸序列,其中测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置。当生物样品中SLC9A3R2核酸分子的测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶时,则生物样品中的SLC9A3R2核酸分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子。
在一些实施方案中,所述测定包括对生物样品中的SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置。当生物样品中的SLC9A3R2基因组核酸分子的测序部分包含:对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶时,则生物样品中的SLC9A3R2基因组核酸分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子。
在一些实施方案中,所述测定包括对生物样品中SLC9A3R2mRNA分子的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中测序部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQID NO:29或其互补序列的位置126。当生物样品中的SLC9A3R2 mRNA分子的测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;则生物样品中的SLC9A3R2mRNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体mRNA分子。
在一些实施方案中,所述测定包括对生物样品中由mRNA分子产生的SLC9A3R2cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中测序部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126。当生物样品中的SLC9A3R2 cDNA分子的测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;则生物样品中由mRNA分子产生的SLC9A3R2 cDNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体cDNA分子。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置;和/或SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列,对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519;SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ IDNO:23或其互补序列的位置589;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQID NO:60或其互补序列的位置589;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ IDNO:24或其互补序列的位置353;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQID NO:61或其互补序列的位置353;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置230;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQID NO:62或其互补序列的位置230;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ IDNO:26或其互补序列的位置236;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQID NO:63或其互补序列的位置236;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ IDNO:27或其互补序列的位置236;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQID NO:64或其互补序列的位置236;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置604;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQID NO:65或其互补序列的位置604;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与以下的核苷酸序列的一部分杂交:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置;b)将所述引物延伸至少通过以下的核苷酸序列的位置:SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列,对应于根据SEQ IDNO:29或其互补序列的位置126;和/或SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列,对应于根据SEQID NO:66或其互补序列的位置126;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;b)将所述引物延伸至少通过SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;对应于根据SEQID NO:25或其互补序列的位置230;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;b)将所述引物延伸至少通过SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;对应于根据SEQID NO:27或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)使生物样品与引物接触,所述引物与SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;b)将所述引物延伸至少通过SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:对应于根据SEQID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;以及c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,测定包括对整个核酸分子进行测序。在一些实施方案中,仅分析SLC9A3R2基因组核酸分子。在一些实施方案中,仅分析SLC9A3R2 mRNA。在一些实施方案中,仅分析获自SLC9A3R2 mRNA的SLC9A3R2 cDNA。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针(alteration-specific probe)的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中扩增的部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中的SLC9A3R2mRNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:a)对生物样品中由mRNA分子产生的SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ IDNO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;b)用可检测标记来标记扩增的核酸分子;c)将标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及d)检测可检测标记。
在一些实施方案中,样品中的核酸分子是mRNA,并且在扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;和/或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中的SLC9A3R2mRNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,所述测定包括:使生物样品中由mRNA分子产生的SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中改变特异性探针包含在严格条件下与SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及检测可检测标记。
在一些实施方案中,SLC9A3R2核酸分子存在于从受试者获得的细胞内。
改变特异性聚合酶链反应技术可用于检测核苷酸序列中的突变,诸如SNP。可使用改变特异性引物是因为当与模板存在失配时,DNA聚合酶将不延伸。
在一些实施方案中,测定包括RNA测序(RNA-Seq)。在一些实施方案中,测定还包括诸如通过逆转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)将mRNA逆转录成cDNA。
在一些实施方案中,所述方法利用核苷酸长度足以与靶核苷酸序列结合并特异性地检测和/或鉴定包含SLC9A3R2变体基因组核酸分子、变体mRNA分子或变体cDNA分子的多核苷酸的探针和引物。杂交条件或反应条件可由操作人员确定以实现此结果。核苷酸长度可为足以用于所选择的检测方法(包括本文描述或例示的任何测定)的任何长度。此类探针和引物可在高严格杂交条件下与靶核苷酸序列特异性杂交。探针和引物可具有与靶核苷酸序列内连续核苷酸的完全核苷酸序列同一性,但可通过常规方法设计不同于靶核苷酸序列并保留特异性检测和/或鉴定靶核苷酸序列的能力的探针。探针和引物可与靶核酸分子的核苷酸序列具有约80%、约85%、约90%、约91%、约92%、约93%、约94%、约95%、约96%、约97%、约98%、约99%或100%序列同一性或互补性。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列:所述核苷酸序列包含对应于根据SEQ ID NO:2(基因组核酸分子)的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶、对应于根据SEQID NO:22(mRNA分子)的位置615的位置处的尿嘧啶、或对应于根据SEQ ID NO:59(cDNA分子)的位置615的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶相邻、与对应于根据SEQID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶相邻或与对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶相邻、与对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶相邻或与对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下项的位置处存在SNP:对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶、对应于根据SEQID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶或对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接以下区域,所述区域包括包含对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶、对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶或对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶的位置,以及包含对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶、对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶或对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶的位置处的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列,所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:23(mRNA分子)的位置589的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:60(cDNA分子)的位置589的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下的位置处存在SNP:在对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接包括以下位置的区域,所述位置包含在对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶,以及包含在对应于根据SEQID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶的位置的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列,所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:24(mRNA分子)的位置353的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:61(cDNA分子)的位置353的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下的位置处存在SNP:在对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接包括以下位置的区域,所述位置包含在对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶,以及包含在对应于根据SEQID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶的位置的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列,所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:25(mRNA分子)的位置230的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:62(cDNA分子)的位置230的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下的位置处存在SNP:在对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接包括以下位置的区域,所述位置包含在对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶,以及包含在对应于根据SEQID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶的位置的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列,所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:26(mRNA分子)的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:63(cDNA分子)的位置236的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下的位置处存在SNP:在对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接包括以下位置的区域,所述位置包含在对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶,以及包含在对应于根据SEQID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶的位置的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列,所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:27(mRNA分子)的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:64(cDNA分子)的位置236的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下的位置处存在SNP:在对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接包括以下位置的区域,所述位置包含在对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶,以及包含在对应于根据SEQID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶的位置的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列,所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:28(mRNA分子)的位置604的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:65(cDNA分子)的位置604的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下的位置处存在SNP:在对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接包括以下位置的区域,所述位置包含在对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶,以及包含在对应于根据SEQID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶的位置的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
在一些实施方案中,为了确定生物样品中的SLC9A3R2核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子)或其互补序列是否包含以下核苷酸序列,所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:29(mRNA分子)的位置126的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:66(cDNA分子)的位置126的位置处的胸腺嘧啶,可使用引物对使生物样品经历扩增方法,以产生扩增子,所述引物对包含源自5'侧接序列的第一引物和源自3'侧接序列的第二引物,所述第一引物与对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述第二引物与对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶相邻,或与对应于根据SEQ ID NO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶相邻,所述扩增子指示在编码以下的位置处存在SNP:在对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶。在一些实施方案中,扩增子的长度范围可从引物对加上一个核苷酸碱基对的组合长度至可通过DNA扩增方案产生的扩增子的任何长度。此距离的范围可从一个核苷酸碱基对至扩增反应的极限,或约两万个核苷酸碱基对。任选地,所述引物对侧接包括以下位置的区域,所述位置包含在对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶,以及包含在对应于根据SEQID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶的位置的每一侧上的至少1、2、3、4、5、6、7、8、9、10个或更多个核苷酸。
可由mRNA和/或cDNA序列产生类似的扩增子。PCR引物对可例如通过使用意图用于此目的的计算机程序衍生自已知的序列,所述计算机程序诸如Vector NTI版本10的PCR引物分析工具(Informax Inc.,Bethesda Md.);PrimerSelect(DNASTAR Inc.,Madison,Wis.);以及Primer3(版本0.4.0.COPYRGT.,1991,Whitehead Institute for BiomedicalResearch,Cambridge,Mass.)。另外,可视觉扫描序列并使用已知指南手动鉴定引物。
核酸测序技术的说明性实例包括但不限于链终止子(Sanger)测序和染料终止子测序。其他方法涉及除了测序以外的核酸杂交方法,其包括使用针对纯化的DNA、扩增的DNA和固定细胞制品的标记的引物或探针(荧光原位杂交(FISH))。在一些方法中,可在检测之前或在检测的同时对靶核酸分子进行扩增。核酸扩增技术的例示性实例包括但不限于聚合酶链反应(PCR)、连接酶链反应(LCR)、链置换扩增反应(SDA)以及基于核酸序列的扩增反应(NASBA)。其他方法包括但不限于连接酶链反应、链置换扩增反应和嗜热SDA(tSDA)。
在杂交技术中,可采用严格条件,使得探针或引物特异性地与其靶标杂交。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶序列杂交,其程度可检测地比与其他非靶序列的杂交大诸如至少2倍、至少3倍、至少4倍或更多倍(相对于背景),包括大超过10倍(相对于背景)。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大至少2倍。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大至少3倍。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大至少4倍。在一些实施方案中,在严格条件下的多核苷酸引物或探针将与其靶核苷酸序列杂交,其程度可检测地比与其他核苷酸序列的杂交大超过10倍(相对于背景)。严格条件是序列依赖性的且在不同的环境中将是不同的。
促进DNA杂交的适当严格性条件(例如6X氯化钠/柠檬酸钠(SSC),在约45℃下,接着在50℃下进行2X SSC的洗涤)是已知的且可见于Current Protocols in MolecularBiology,John Wiley&Sons,N.Y.(1989),6.3.1-6.3.6。通常,用于杂交和检测的严格条件将是其中如下所述的那些:在pH 7.0至8.3时的盐浓度低于约1.5M Na+离子、通常约0.01至1.0M Na+离子浓度(或其他盐),并且温度对于短探针(诸如例如10至50个核苷酸)是至少约30℃,且对于较长探针(诸如例如大于50个核苷酸)是至少约60℃。还可通过添加去稳定剂诸如甲酰胺来实现严格条件。任选地,洗涤缓冲液可包含约0.1%至约1%SDS。杂交的持续时间通常少于约24小时,通常为约4至约12小时。洗涤时间的持续时间将是至少足以达到平衡的时间长度。
本公开还提供检测SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的存在的方法,其包括对从受试者获得的生物样品进行测定以确定生物样品中的SLC9A3R2多肽是否含有致使多肽具有功能丧失(部分或完全)或预测的功能丧失(部分或完全)的一种或多种变异。SLC9A3R2预测的功能丧失多肽可以是本文所述的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽中的任一种。在一些实施方案中,所述方法检测SLC9A3R2 Arg171Trp-长、Arg171Trp-短、Arg65Trp、Arg58Trp、Arg60Trp-短、Arg60Trp-长或Arg170Trp的存在。在一些实施方案中,所述方法检测SLC9A3R2Arg171Trp-长或Arg171Trp-短的存在。
在一些实施方案中,所述方法包括对从受试者获得的生物样品进行测定以确定生物样品中的SLC9A3R2多肽是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:86的位置171的位置处的色氨酸;在对应于根据SEQ ID NO:87的位置171的位置处的色氨酸;在对应于根据SEQ ID NO:88的位置65的位置处的色氨酸;在对应于根据SEQ ID NO:89的位置58的位置处的色氨酸;在对应于根据SEQ ID NO:90的位置60的位置处的色氨酸;在对应于根据SEQ ID NO:91的位置60的位置处的色氨酸;或在对应于根据SEQ ID NO:92的位置60的位置处的色氨酸。
在一些实施方案中,所述测定包括对包含对应于以下的位置的SLC9A3R2多肽的至少一部分进行测序:根据SEQ ID NO:86或SEQ ID NO:77的位置171;根据SEQ ID NO:87或SEQ ID NO:78的位置171;根据SEQ ID NO:88或SEQ ID NO:79的位置65;根据SEQ ID NO:89或SEQ ID NO:80的位置58;根据SEQ ID NO:90或SEQ ID NO:81的位置60;根据SEQ ID NO:91或SEQ ID NO:82的位置60;或根据SEQ ID NO:92或SEQ ID NO:83的位置60。
在一些实施方案中,所述测定是用于检测SLC9A3R2多肽的存在的免疫测定,所述SLC9A3R2多肽包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:86或SEQ ID NO:77的位置171;根据SEQ ID NO:87或SEQ ID NO:78的位置171;根据SEQ ID NO:88或SEQ ID NO:79的位置65;根据SEQ ID NO:89或SEQ ID NO:80的位置58;根据SEQ ID NO:90或SEQ ID NO:81的位置60;根据SEQ ID NO:91或SEQ ID NO:82的位置60;或根据SEQ ID NO:92或SEQ ID NO:83的位置60。
在一些实施方案中,当受试者不具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽时,受试者具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动,或原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压或恶性高血压中的任一种的风险。在一些实施方案中,当受试者具有SLC9A3R2预测的功能丧失多肽时,受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动,或原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压或恶性高血压中的任一种的风险。
本公开还提供了与SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子、SLC9A3R2错义变体mRNA分子和/或SLC9A3R2错义变体cDNA分子(诸如本文所公开的基因组错义变体核酸分子、mRNA错义变体分子和cDNA错义变体分子中的任一种)杂交的分离的核酸分子。在一些实施方案中,此类分离的核酸分子在严格条件下与SLC9A3R2错义变体核酸分子杂交。此类核酸分子可例如用作探针、引物、改变特异性探针或改变特异性引物,如本文所述或例示。
在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:2的位置9,519、根据SEQ ID NO:22的位置615或根据SEQ ID NO:59的位置615。在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于根据SEQ ID NO:23的位置589或根据SEQ IDNO:60的位置589的位置。在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于根据SEQ ID NO:24的位置353或根据SEQ ID NO:61的位置353的位置。在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于根据SEQ ID NO:25的位置230或根据SEQ ID NO:62的位置230的位置。在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于根据SEQ ID NO:26位置236或根据SEQ ID NO:63的位置236的位置。在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于根据SEQ ID NO:27位置236或根据SEQ ID NO:64的位置236的位置。在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于根据SEQ ID NO:28位置604或根据SEQ ID NO:65的位置604的位置。在一些实施方案中,分离的核酸分子与SLC9A3R2错义核酸分子的一部分杂交,所述部分包括对应于根据SEQ ID NO:29位置126或根据SEQ ID NO:66的位置126的位置。
在一些实施方案中,此类分离的核酸分子包含至少约5个、至少约8个、至少约10个、至少约11个、至少约12个、至少约13个、至少约14个、至少约15个、至少约16个、至少约17个、至少约18个、至少约19个、至少约20个、至少约21个、至少约22个、至少约23个、至少约24个、至少约25个、至少约30个、至少约35个、至少约40个、至少约45个、至少约50个、至少约55个、至少约60个、至少约65个、至少约70个、至少约75个、至少约80个、至少约85个、至少约90个、至少约95个、至少约100个、至少约200个、至少约300个、至少约400个、至少约500个、至少约600个、至少约700个、至少约800个、至少约900个、至少约1000个、至少约2000个、至少约3000个、至少约4000个或至少约5000个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,此类分离的核酸分子包含至少约5个、至少约8个、至少约10个、至少约11个、至少约12个、至少约13个、至少约14个、至少约15个、至少约16个、至少约17个、至少约18个、至少约19个、至少约20个、至少约21个、至少约22个、至少约23个、至少约24个或至少约25个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含至少约18个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含至少约15个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约10个至约35个、约10个至约30个、约10个至约25个、约12个至约30个、约12个至约28个、约12个至约24个、约15个至约30个、约15个至约25个、约18个至约30个、约18个至约25个、约18个至约24个或约18个至约22个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约18个至约30个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含至少约15个核苷酸至至少约35个核苷酸或由其组成。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码溶质载剂家族9同工型A3调控因子2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义核酸分子或其互补序列的一部分的核苷酸序列互补的核苷酸序列。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;或根据SEQ IDNO:59或其互补序列的位置615。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;或根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;或根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;或根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;或根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;或根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126。
在一些实施方案中,分离的核酸分子与同SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子、SLC9A3R2错义变体mRNA分子和/或SLC9A3R2错义变体cDNA分子具有至少约70%、至少约75%、至少约80%、至少约85%、至少约90%、至少约95%、至少约96%、至少约97%、至少约98%、至少约99%或100%同一性的核酸分子的至少约15个连续核苷酸杂交。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约15个至约100个核苷酸或约15个至约35个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约15个至约100个核苷酸或由其组成。在一些实施方案中,分离的核酸分子包含约15个至约35个核苷酸或由其组成。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;或根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519-9,521;根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615-617;和/或根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615-617。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;或根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ IDNO:23或其互补序列的位置589-591;和/或根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589-591。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;或根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ IDNO:24或其互补序列的位置353-355;和/或根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353-355。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;或根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ IDNO:25或其互补序列的位置230-232;和/或根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230-232。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;或根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ IDNO:26或其互补序列的位置236-238;和/或根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236-238。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;或根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ IDNO:27或其互补序列的位置236-238;和/或根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236-238。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置604-606;和/或根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604-606。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子的核苷酸序列的一部分互补的核苷酸序列,其中所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ IDNO:29或其互补序列的位置126-128;和/或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126-128。
在一些实施方案中,分离的改变特异性探针或改变特异性引物包含至少约15个核苷酸,其中改变特异性探针或改变特异性引物包含与编码溶质载剂家族9同工型A3调控因子2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义核酸分子或其互补序列的一部分的核苷酸序列互补的核苷酸序列。在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519。
在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519-9,521。
在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQID NO:29或其互补序列的位置126。
在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615-617;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589-591;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353-355;对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230-232;对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236-238;对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236-238;对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604-606;或对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126-128。
在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQID NO:66或其互补序列的位置126。
在一些实施方案中,所述部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615-617;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589-591;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353-355;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230-232;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236-238;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236-238;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604-606;或对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126-128。
在一些实施方案中,改变特异性探针和改变特异性引物包含DNA。在一些实施方案中,改变特异性探针和改变特异性引物包含RNA。
在一些实施方案中,本文所述的探针和引物(包括改变特异性探针和改变特异性引物)具有与本文公开的任何核酸分子或其互补序列特异性杂交的核苷酸序列。在一些实施方案中,所述探针和引物在严格条件下与本文公开的任何核酸分子特异性地杂交。
在一些实施方案中,引物(包括改变特异性引物)可用于第二代测序或高通量测序中。在一些情况下,可修饰引物,包括改变特异性引物。特别地,引物可包含在例如大规模平行签名测序(MPSS)、聚合酶克隆测序(Polony sequencing)和454焦磷酸测序的不同步骤中使用的各种修饰。可在所述过程的几个步骤中使用修饰的引物,包括在克隆步骤中使用生物素酰化的引物,并且在珠粒装载步骤和检测步骤中使用荧光标记的引物。通常使用双端测序(paired-end)标签文库进行聚合酶克隆测序,其中每个DNA模板分子的长度为约135bp。在珠粒装载步骤和乳液PCR中使用生物素酰化的引物。在检测步骤中使用荧光标记的简并九聚物寡核苷酸。衔接子可含有用于将DNA文库固定到链霉亲和素包被的珠粒上的5'-生物素标签。
本文所述的探针和引物可用于检测本文所公开的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子、SLC9A3R2错义变体mRNA分子和/或SLC9A3R2错义变体cDNA分子中的任一种内的核苷酸变异。本文所述的引物可用于扩增SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子、SLC9A3R2错义变体mRNA分子或SLC9A3R2错义变体cDNA分子,或其片段。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考基因组核酸分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子的存在。在一些实施方案中,与在对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:3的位置615的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3’端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:40的位置615的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3’-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中对应于根据SEQ ID NO:4的位置589的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:41的位置589的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3’-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中对应于根据SEQ ID NO:5的位置353的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:42的位置353的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3’-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中对应于根据SEQ ID NO:6的位置230的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:43的位置230的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3’端。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3’-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中对应于根据SEQ ID NO:7的位置236的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:44的位置236的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3’端。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3’-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中对应于根据SEQ ID NO:8的位置236的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:45的位置236的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3’端。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3’-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中对应于根据SEQ ID NO:9的位置604的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3’端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:46的位置604的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3’端。
本公开还提供了包含上述引物中的任一种的引物对。例如,如果引物的3’-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中对应于根据SEQ ID NO:10的位置126的位置处的胞嘧啶(而不是尿嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考mRNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 mRNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体mRNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3'端。另外,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2核酸分子中在对应于根据SEQ ID NO:47的位置126的位置处的胞嘧啶(而不是胸腺嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2参考cDNA分子的存在。相反地,如果引物的3'-端之一与特定SLC9A3R2 cDNA分子中在对应于根据SEQ ID NO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶(而不是胞嘧啶)杂交,则扩增片段的存在将指示SLC9A3R2错义变体cDNA分子的存在。在一些实施方案中,与对应于根据SEQ ID NO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶互补的引物的核苷酸可在引物的3’端。
在本公开的上下文中,“特异性杂交”意指探针或引物(诸如例如,改变特异性探针或改变特异性引物)不与编码SLC9A3R2参考基因组核酸分子、SLC9A3R2参考mRNA分子和/或SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列杂交。
在本公开通篇描述的实施方案中的任一项中,探针(诸如例如,改变特异性探针)可包含标记。在一些实施方案中,所述标记是荧光标记、放射性标记或生物素。
本公开还提供了包含本文所公开的探针中的任一种或多种所附接的基底的支持物。固体支持物是分子(诸如本文公开的探针中的任一种)可与其结合的固态基底或支持物。固体支持物的一种形式是阵列。固体支持物的另一种形式是阵列检测物。阵列检测物是多种不同的探针以阵列、网格或其他组织化模式与其偶联的固体支持物。固态基底的一种形式是微量滴定皿,诸如标准96孔类型。在一些实施方案中,可采用通常每孔含有一个阵列的多孔玻璃载片。在一些实施方案中,所述支持物是微阵列。
本公开还提供了包含本文所述的SLC9A3R2错义核酸分子中的任一种(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子),或其互补序列以及本文所述的改变特异性引物或改变特异性探针的任一种,或者由其组成的分子复合物。在一些实施方案中,分子复合物中的SLC9A3R2错义核酸分子(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子),或其互补序列是单链的。在一些实施方案中,SLC9A3R2错义核酸分子是本文所述的基因组核酸分子中的任一种。在一些实施方案中,SLC9A3R2错义核酸分子是本文所述的mRNA分子中的任一种。在一些实施方案中,SLC9A3R2错义核酸分子是本文所述的cDNA分子中的任一种。在一些实施方案中,分子复合物包含本文所述的SLC9A3R2错义核酸分子中的任一种(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子),或其互补序列以及本文所述的改变特异性引物中的任一种,或者由其组成。在一些实施方案中,分子复合物包含本文所述的SLC9A3R2错义核酸分子中的任一种(基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子),或其互补序列以及本文所述的改变特异性探针中的任一种,或者由其组成。
在一些实施方案中,分子复合物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2基因组核酸分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中改变特异性引物或改变特异性探针与在对应于以下的位置处的SLC9A3R2基因组核酸分子杂交:根据SEQ IDNO:2或其互补序列的位置9,519。
在一些实施方案中,分子复合物中的改变特异性引物或改变特异性探针与以下杂交:在对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519-9,521的位置处的TGG密码子杂交。
在一些实施方案中,分子复合物中的基因组核酸分子包含SEQ ID NO:2。
在一些实施方案中,分子复合物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2 mRNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中改变特异性引物或改变特异性探针与SLC9A3R2mRNA分子在对应于以下的位置处杂交:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQID NO:29或其互补序列的位置126。
在一些实施方案中,分子复合物中的改变特异性引物或改变特异性探针与以下杂交:在对应于根据SEQ ID NO:22的位置615-617的位置处的UGG密码子、在对应于根据SEQID NO:23的位置589-591的位置处的UGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:24的位置353-355的位置处的UGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:25的位置230-232的位置处的UGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:26的位置236-238的位置处的UGG密码子、在对应于根据SEQID NO:27的位置236-238的位置处的UGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:28的位置604-606的位置处的UGG密码子或在对应于根据SEQ ID NO:29的位置126-128的位置处的UGG密码子。
在一些实施方案中,分子复合物中的mRNA分子包含SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28或SEQ ID NO:29。
在一些实施方案中,分子复合物包含与编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2 cDNA分子杂交的改变特异性引物或改变特异性探针,其中改变特异性引物或改变特异性探针与SLC9A3R2cDNA分子在对应于以下的位置处杂交:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQID NO:66或其互补序列的位置126。
在一些实施方案中,分子复合物中的改变特异性引物或改变特异性探针与以下杂交:在对应于根据SEQ ID NO:59的位置615-617的位置处的TGG密码子、在对应于根据SEQID NO:60的位置589-591的位置处的TGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:61的位置353-355的位置处的TGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:62的位置230-232的位置处的TGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:63的位置236-238的位置处的TGG密码子、在对应于根据SEQID NO:64的位置236-238的位置处的TGG密码子、在对应于根据SEQ ID NO:65的位置604-606的位置处的TGG密码子或在对应于根据SEQ ID NO:66的位置126-128的位置处的TGG密码子。
在一些实施方案中,分子复合物中的cDNA分子包含SEQ ID NO:59、SEQ ID NO:60、SEQ ID NO:61、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:65或SEQ ID NO:66。
在一些实施方案中,分子复合物包含含有标记的改变特异性探针或改变特异性引物。在一些实施方案中,所述标记是荧光标记、放射性标记或生物素。在一些实施方案中,分子复合物还包含非人聚合酶。
SLC9A3R2参考基因组核酸分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:1中(ENSG00000065054.14包含GRCh38/hg38人类基因组组装中的chr16:2,026,902-2,039,026)。参考SEQ ID NO:1,位置9,519是胞嘧啶。
存在SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子,其中位置9,519处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:2中。
SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:3中。参考SEQ ID NO:3,位置615是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:4中。参考SEQ ID NO:4,位置589是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQID NO:5中。参考SEQ ID NO:5,位置353是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:6中。参考SEQ ID NO:6,位置230是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:7中。参考SEQ ID NO:7,位置236是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:7中。参考SEQ ID NO:7,位置236是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:8中。参考SEQ IDNO:8,位置236是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:9中。参考SEQ ID NO:9,位置604是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:10中。参考SEQ ID NO:10,位置126是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:11中。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:12中。参考SEQ ID NO:12,位置625是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:13中。参考SEQ ID NO:13,位置622是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:14中。参考SEQ ID NO:14,位置618是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:15中。参考SEQID NO:15,位置527是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ IDNO:16中。参考SEQ ID NO:16,位置511是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:17中。参考SEQ ID NO:17,位置649是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:18中。参考SEQ ID NO:18,位置615是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:19中。参考SEQ ID NO:19,位置602是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:20中。参考SEQ ID NO:20,位置260是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQID NO:21中。参考SEQ ID NO:21,位置259是胞嘧啶。
存在一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置615处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:22中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置589处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:23中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置353处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:24中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置230处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:25中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置236处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:26中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置236处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:27中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置604处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:28中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置126处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:29中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置625处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:30中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置622处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:31中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置618处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:32中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置527处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:33中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置511处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:34中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置649处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:35中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置615处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:36中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置602处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:37中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置260处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:38中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体mRNA分子,其中位置259处的胞嘧啶被尿嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体mRNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:39中。
SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:40中。参考SEQ ID NO:40,位置615是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:41中。参考SEQ ID NO:41,位置589是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:42中。参考SEQ ID NO:42,位置353是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:43中。参考SEQ ID NO:43,位置230是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:44中。参考SEQ ID NO:44,位置236是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:45中。参考SEQID NO:45,位置236是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ IDNO:46中。参考SEQ ID NO:46,位置604是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:47中。参考SEQ ID NO:47,位置126是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:48中。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:49中。参考SEQ ID NO:49,位置625是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:50中。参考SEQ ID NO:50,位置622是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:51中。参考SEQ ID NO:51,位置618是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:52中。参考SEQ ID NO:52,位置527是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQID NO:53中。参考SEQ ID NO:53,位置511是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:54中。参考SEQ ID NO:54,位置649是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:55中。参考SEQ ID NO:55,位置615是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:56中。参考SEQ ID NO:56,位置602是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:57中。参考SEQ ID NO:57,位置260是胞嘧啶。另一种SLC9A3R2参考cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:58中。参考SEQ ID NO:58,位置259是胞嘧啶。
存在一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置615处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:59中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置589处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:60中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置353处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:61中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置230处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:62中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置236处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:63中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置236处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:64中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置604处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:65中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置126处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:66中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置625处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:67中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置622处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:68中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置618处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列在SEQ ID NO:69中列出。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置527处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:70中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置511处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:71中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置649处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:72中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置615处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:73中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置602处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:74中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置602处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:75中。
存在另一种SLC9A3R2错义变体cDNA分子,其中位置259处的胞嘧啶被胸腺嘧啶替换。此SLC9A3R2错义变体cDNA分子的核苷酸序列列示于SEQ ID NO:76中。
基因组核酸分子、mRNA分子和cDNA分子可来自任何生物体。例如,基因组核酸分子、mRNA分子和cDNA分子可以是人的或来自另一生物体(诸如非人哺乳动物、啮齿动物、小鼠或大鼠)的直系同源物。应理解,群体内的基因序列可由于多态性(诸如单核苷酸多态性)而变化。本文提供的实例仅为示例性序列。其他序列也是可能的。
本文还提供了可与所公开的核酸分子相互作用的功能性多核苷酸。功能性多核苷酸的实例包括但不限于反义分子、适体、核酶、三链体形成分子以及外部指导序列。功能性多核苷酸可充当靶分子所具有的特定活性的影响剂、抑制剂、调节剂和刺激剂,或者功能性多核苷酸可具有独立于任何其他分子的全新活性。
本文公开的分离的核酸分子可包括RNA、DNA或RNA和DNA两者。所述分离的核酸分子还可连接或融合至异源核酸序列(诸如在载体中)或异源标记。例如,本文所公开的分离的核酸分子可在载体中或作为包含分离的核酸分子和异源核酸序列的外源供体序列。分离的核酸分子还可与异源标记连接或融合。标记可以是直接可检测的(诸如例如荧光团)或间接可检测的(诸如例如半抗原、酶或荧光团淬灭剂)。此类标记可通过光谱学、光化学、生物化学、免疫化学或化学手段检测。此类标记包括例如放射性标记、颜料、染料、色原、自旋标记和荧光标记。标记也可以是例如化学发光物质;含金属物质;或酶,其中发生依赖于酶的二次信号生成。术语“标记”也可指“标签”或半抗原,其可选择性地与缀合分子结合,使得缀合分子在随后与底物一起添加时用于生成可检测信号。例如,生物素可与辣根过氧化物(HRP)的亲和素或链霉亲和素缀合物一起用作标签以与标签结合,并使用量热底物(诸如例如四甲基联苯胺(TMB))或荧光底物进行检查以检测HRP的存在。可用作标签来促进纯化的示例性标记包括但不限于myc、HA、FLAG或3XFLAG、6XHis或聚组氨酸、谷胱甘肽-S-转移酶(GST)、麦芽糖结合蛋白、表位标签或免疫球蛋白的Fc部分。许多标记包括例如颗粒、荧光团、半抗原、酶及其量热、荧光和化学发光底物和其他标记。
分离的核酸分子或其互补序列也可存在于宿主细胞内。在一些实施方案中,宿主细胞可包含载体,所述载体包含本文所述的任何核酸分子或其互补序列。在一些实施方案中,核酸分子可操作地连接至在宿主细胞中具有活性的启动子。在一些实施方案中,启动子是外源启动子。在一些实施方案中,启动子是诱导型启动子。在一些实施方案中,宿主细胞是细菌细胞、酵母细胞、昆虫细胞或哺乳动物细胞。在一些实施方案中,宿主细胞是细菌细胞。在一些实施方案中,宿主细胞是酵母细胞。在一些实施方案中,宿主细胞是昆虫细胞。在一些实施方案中,宿主细胞是哺乳动物细胞。
所公开的核酸分子可包括例如核苷酸或非天然或修饰的核苷酸,诸如核苷酸类似物或核苷酸替代物。此类核苷酸包括含有修饰的碱基、糖或磷酸酯基团的核苷酸,或者在其结构中掺入非天然部分的核苷酸。非天然核苷酸的实例包括但不限于双脱氧核苷酸、生物素酰化的、胺化的、脱氨基的、烷基化的、苄化的和荧光团标记的核苷酸。
本文公开的核酸分子还可包含一种或多种核苷酸类似物或取代。核苷酸类似物是含有对碱基、糖或磷酸酯部分的修饰的核苷酸。对碱基部分的修饰包括但不限于A、C、G和T/U以及不同的嘌呤或嘧啶碱基(诸如例如假尿苷、尿嘧啶-5-基、次黄嘌呤-9-基(I)和2-氨基腺嘌呤-9-基)的天然和合成修饰。修饰的碱基包括但不限于5-甲基胞嘧啶
(5-me-C)、5-羟甲基胞嘧啶、黄嘌呤、次黄嘌呤、2-氨基腺嘌呤、腺嘌呤和鸟嘌呤的6-甲基和其他烷基衍生物、腺嘌呤和鸟嘌呤的2-丙基和其他烷基衍生物、2-硫代尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶和2-硫代胞嘧啶、5-卤代尿嘧啶和胞嘧啶、
5-丙炔基尿嘧啶和胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、胞嘧啶和胸腺嘧啶、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、
4-硫代尿嘧啶、8-卤代、8-氨基、8-硫代、8-硫代烷基、8-羟基和其他8-取代的腺嘌呤和鸟嘌呤、5-卤代(例如5-溴)、5-三氟甲基和其他5-取代的尿嘧啶和胞嘧啶、7-甲基鸟嘌呤、7-甲基腺嘌呤、8-氮杂鸟嘌呤、8-氮杂腺嘌呤、7-脱氮鸟嘌呤、7-脱氮腺嘌呤、3-脱氮鸟嘌呤和3-脱氮腺嘌呤。
核苷酸类似物还可包括对糖部分的修饰。对糖部分的修饰包括但不限于核糖和脱氧核糖的天然修饰以及合成修饰。糖修饰包括但不限于在2’位置处的以下修饰:OH;F;O-、S-或N-烷基;O-、S-或N-烯基;O-、S-或N-炔基;或O-烷基-O-烷基,其中烷基、烯基和炔基可以是取代或未取代的C1-10烷基或C2-10烯基和C2-10炔基。示例性的2’糖修饰还包括但不限于-O[(CH2)nO]mCH3、-O(CH2)nOCH3、-O(CH2)nNH2、-O(CH2)nCH3、-O(CH2)n-ONH2和-O(CH2)nON[(CH2)nCH3)]2,其中n和m独立地为1至约10。2’位置处的其他修饰包括但不限于C1-10烷基、取代的低级烷基、烷芳基、芳烷基、O-烷芳基或O-芳烷基、SH、SCH3、OCN、Cl、Br、CN、CF3、OCF3、SOCH3、SO2CH3、O NO2、NO2、N3、NH2、杂环烷基、杂环烷芳基、氨基烷基氨基、聚烷基氨基、取代的甲硅烷基、RNA切割基团、报告基团、嵌入剂、用于改善寡核苷酸的药代动力学特性的基团或用于改善寡核苷酸的药效动力学特性的基团,以及具有类似特性的其他取代基。还可在糖上的其他位置上做出类似的修饰,具体地在3'末端核苷酸上或在2'-5'连接的寡核苷酸中的糖的3'位置和5'末端核苷酸的5'位置。修饰的糖还可包括在桥环氧处含有修饰(诸如CH2和S)的那些糖。核苷酸糖类似物还可具有替代呋喃戊糖的糖模拟物诸如环丁基部分。
核苷酸类似物还可在磷酸酯部分处进行修饰。修饰的磷酸酯部分包括但不限于可被修饰以使得两个核苷酸之间的键联含有以下的修饰的磷酸酯部分:硫代磷酸酯、手性硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、氨基烷基磷酸三酯、甲基和其他烷基膦酸酯(包括3'-亚烷基膦酸酯和手性膦酸酯)、次膦酸酯、氨基磷酸酯(包括3'-氨基氨基磷酸酯和氨基烷基氨基磷酸酯)、硫羰氨基磷酸酯、硫羰烷基膦酸酯、硫羰烷基磷酸三酯和硼烷磷酸酯。两个核苷酸之间的这些磷酸酯或修饰的磷酸酯键联可通过3’-5’键联或2’-5’键联,并且所述键联可含有反转的极性,诸如3’-5’至5’-3’或2’-5’至5’-2’。还包括各种盐、混合盐以及游离酸形式。核苷酸替代物还包括肽核酸(PNA)。
本公开还提供包含本文公开的核酸分子中的任一者或多者的载体。在一些实施方案中,载体包含本文公开的任何一种或多种核酸分子和异源核酸。所述载体可为能够转运核酸分子的病毒或非病毒载体。在一些实施方案中,载体是质粒或粘粒(诸如例如可将额外的DNA区段连接到其中的环状双链DNA)。在一些实施方案中,载体是病毒载体,其中额外的DNA区段可连接到病毒基因组中。表达载体包括但不限于质粒、粘粒、逆转录病毒、腺病毒、腺相关病毒(AAV)、植物病毒(诸如花椰菜花叶病毒和烟草花叶病毒)、酵母人工染色体(YAC)、Epstein-Barr(EBV)衍生的附加体以及本领域已知的其他表达载体。
用于哺乳动物宿主细胞表达的所需调控序列可包括例如指导哺乳动物细胞中的高水平多肽表达的病毒元件,例如衍生自逆转录病毒LTR、巨细胞病毒(CMV)(例如CMV启动子/增强子)、猿猴病毒40(SV40)(例如SV40启动子/增强子)、腺病毒(例如腺病毒主要晚期启动子(AdMLP))的启动子和/或增强子、多瘤病毒和哺乳动物强启动子(例如天然免疫球蛋白和肌动蛋白启动子)。在细菌细胞或真菌细胞(例如酵母细胞)中表达多肽的方法也是众所周知的。启动子可为例如组成型活性启动子、条件启动子、诱导型启动子、时间受限型启动子(例如发育调控型启动子)或空间受限型启动子(例如细胞特异性或组织特异性启动子)。
核酸分子内的核苷酸序列或多肽内的氨基酸序列的特定伸长段之间的同一性百分比(或互补性百分比)可使用BLAST程序(基本局部比对搜索工具)和PowerBLAST程序(Altschul等人,J.Mol.Biol.,1990,215,403-410;Zhang和Madden,Genome Res.,1997,7,649-656)或通过使用Gap程序(Wisconsin序列分析包,用于Unix的版本8,GeneticsComputer Group,University Research Park,Madison Wis.)使用默认设置(其使用Smith和Waterman的算法(Adv.Appl.Math.,1981,2,482-489))来常规确定。在本文中,如果对序列同一性百分比进行参考,则较高的序列同一性百分比相对于较低的序列同一性百分比是优选的。
本公开还提供包含本文公开的分离的核酸分子、基因组核酸分子、mRNA分子和/或cDNA分子中的任一者或多者的组合物,或包含它们的载体。在一些实施方案中,组合物是药物组合物。在一些实施方案中,组合物包含载剂和/或赋形剂。载剂的实例包括但不限于聚(乳酸)(PLA)微球、聚(D,L-乳酸-共乙醇酸)(PLGA)微球、脂质体、胶束、反胶束、脂质螺旋物和脂质微管。载剂可包括缓冲盐溶液,诸如PBS、HBSS等。
如本文所用,当在对特定核苷酸或核苷酸序列或位置的编号的语境中使用时,短语“对应于”或其语法变型是指当将特定核苷酸或核苷酸序列与参考序列进行比较时对指定参考序列的编号(诸如例如SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:40)。换句话说,特定聚合物的残基(诸如例如核苷酸或氨基酸)编号或残基(诸如例如核苷酸或氨基酸)位置相对于参考序列来指定,而不是通过残基在特定核苷酸或核苷酸序列内的实际数值位置来指定。例如,特定核苷酸序列可通过引入缺口以优化两个序列之间的残基匹配来与参考序列比对。在这些情况下,虽然存在缺口,但是对特定核苷酸或核苷酸序列中的残基的编号是相对于其所比对的参考序列来进行的。
例如,包含编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的SLC9A3R2错义核酸分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶意味着如果将SLC9A3R2基因组核酸分子的核苷酸序列与SEQ ID NO:2的序列比对,则SLC9A3R2序列具有在对应于SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶残基。这同样适用于包含编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的SLC9A3R2 mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶,以及包含编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的SLC9A3R2 cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶。这些短语是指编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义核酸分子,其中所述基因组核酸分子具有包含与SEQ ID NO:2的位置9,519处的胸腺嘧啶残基同源的胸腺嘧啶残基的核苷酸序列(或其中所述mRNA分子具有包含与SEQ ID NO:22的位置615处的尿嘧啶残基同源的尿嘧啶残基的核苷酸序列,或其中所述cDNA分子具有包含与SEQ ID NO:59的位置615处的胸腺嘧啶残基同源的胸腺嘧啶残基的核苷酸序列)。在本文中,此类序列也称为“具有Arg171Trp-长改变的SLC9A3R2序列”或“具有Arg171Trp-长变异的SLC9A3R2序列”。
如本文所述,SLC9A3R2错义基因组核酸分子内对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置,例如,可通过在特定SLC9A3R2核酸分子的核苷酸序列与SEQ ID NO:2的核苷酸序列之间进行序列比对来鉴定。存在多种计算算法可用于进行序列比对以鉴定对应于例如SEQ ID NO:2中的位置9,519的核苷酸位置。例如,通过使用NCBI BLAST算法(Altschul等人,Nucleic Acids Res.,1997,25,3389-3402)或CLUSTALW软件(Sievers和Higgins,Methods Mol.Biol.,2014,1079,105-116),可进行序列比对。然而,序列也可手动地进行比对。
SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:77中。参考SEQ ID NO:77,SLC9A3R2参考多肽的长度是337个氨基酸。参考SEQ ID NO:77,位置171是精氨酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:78中。参考SEQ ID NO:78,SLC9A3R2参考多肽的长度是326个氨基酸。参考SEQ ID NO:78,位置171是精氨酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:79中。参考SEQ ID NO:79,SLC9A3R2参考多肽的长度是231个氨基酸。参考SEQ ID NO:79,位置65是精氨酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:80中。参考SEQ ID NO:80,SLC9A3R2参考多肽的长度是224个氨基酸。参考SEQ ID NO:80,位置58是精氨酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:81中。参考SEQ ID NO:81,SLC9A3R2参考多肽的长度是215个氨基酸。参考SEQ ID NO:81,位置60是精氨酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:82中。参考SEQ ID NO:82,SLC9A3R2参考多肽的长度是226个氨基酸。参考SEQ ID NO:82,位置60是精氨酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:83中。参考SEQ ID NO:83,SLC9A3R2参考多肽的长度是450个氨基酸。参考SEQ ID NO:83,位置170是精氨酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:84中。参考SEQ ID NO:84,SLC9A3R2参考多肽的长度是122个氨基酸。
另一种SLC9A3R2参考多肽的氨基酸序列列示于SEQ ID NO:85中。参考SEQ ID NO:85,SLC9A3R2参考多肽的长度是151个氨基酸。
存在一种SLC9A3R2预测的功能丧失多肽(Arg171Trp-长),其氨基酸序列列示于SEQ ID NO:86中。参考SEQ ID NO:86,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的长度是337个氨基酸。参考SEQ ID NO:86,位置171是色氨酸。
存在另一种SLC9A3R2预测的功能丧失多肽(Arg171Trp-短),其氨基酸序列列示于SEQ ID NO:87中。参考SEQ ID NO:87,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的长度是326个氨基酸。参考SEQ ID NO:87,位置171是色氨酸。
存在另一种SLC9A3R2预测的功能丧失多肽(Arg65Trp),其氨基酸序列列示于SEQID NO:88中。参考SEQ ID NO:88,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的长度是231个氨基酸。参考SEQ ID NO:88,位置65是色氨酸。
存在另一种SLC9A3R2预测的功能丧失多肽(Arg58Trp),其氨基酸序列列示于SEQID NO:89中。参考SEQ ID NO:89,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的长度是224个氨基酸。参考SEQ ID NO:89,位置58是色氨酸。
存在另一种SLC9A3R2预测的功能丧失多肽(Arg60Trp-短),其氨基酸序列列示于SEQ ID NO:90中。参考SEQ ID NO:90,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的长度是215个氨基酸。参考SEQ ID NO:90,位置60是色氨酸。
存在另一种SLC9A3R2预测的功能丧失多肽(Arg60Trp-长),其氨基酸序列列示于SEQ ID NO:91中。参考SEQ ID NO:91,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的长度是226个氨基酸。参考SEQ ID NO:91,位置60是色氨酸。
存在另一种SLC9A3R2预测的功能丧失多肽(Arg170Trp),其氨基酸序列列示于SEQID NO:92中。参考SEQ ID NO:92,SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的长度是450个氨基酸。参考SEQ ID NO:92,位置60是色氨酸。
所附序列表中列出的核苷酸序列和氨基酸序列是使用核苷酸碱基的标准字母缩写和氨基酸的三字母代码示出的。所述核苷酸序列遵循从序列的5’端开始且前进(即在每一行中从左到右)至3’端的标准惯例。仅示出了每一个核苷酸序列的一条链,但应理解的是,互补链是通过对所展示链的任何参考而被包括在内的。氨基酸序列遵循从序列的氨基末端开始且前进(即在每一行中从左到右)至羧基末端的标准惯例。
本公开还提供了治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,其用于治疗或预防受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动(或用于制备用于治疗或预防受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动的药物),其中所述受试者具有编码本文所述的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子、错义变体mRNA分子和/或错义变体cDNA分子中的任一种。治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂可以是本文所述的治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的任何治疗剂。高血压可以是原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压和恶性高血压中的任一种。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述基因组核酸分子具有包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的mRNA分子或其互补序列,其中所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的cDNA分子或其互补序列,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:86的位置171的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:87的位置171的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:88的位置65的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:89的位置58的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:90的位置60的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:91的位置60的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:92的位置60的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;或具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
本公开还提供了SLC9A3R2抑制剂,其用于治疗或预防受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动(或用于制备用于治疗或预防受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动的药物),其中所述受试者对于编码本文所述的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子、错义变体mRNA分子和/或错义变体cDNA分子中的任一种是杂合的,或者其中所述受试者是SLC9A3R2基因组核酸分子、mRNA分子或cDNA分子的参考。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。高血压可以是原发性高血压、继发性高血压、顽固性高血压和恶性高血压中的任一种。
在一些实施方案中,受试者是SLC9A3R2基因组核酸分子、SLC9A3R2 mRNA分子或SLC9A3R2 cDNA分子的参考。
在一些实施方案中,受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的基因组核酸分子或其互补序列是杂合的,其中所述基因组核酸分子具有包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列。
在一些实施方案中,受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的mRNA分子或其互补序列是杂合的,其中所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶。
在一些实施方案中,受试者对于编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的cDNA分子或其互补序列是杂合的,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:86的位置171的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ IDNO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:87的位置171的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ IDNO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:88的位置65的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ IDNO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:89的位置58的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ IDNO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:90的位置60的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ IDNO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:91的位置60的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ IDNO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或包含在对应于根据SEQ ID NO:92的位置60的位置处的色氨酸的SLC9A3R2预测的功能丧失多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为对于以下是杂合的:具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的基因组核酸分子,其中所述核苷酸序列包含具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的mRNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;或具有编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的核苷酸序列的cDNA分子,其中所述核苷酸序列包含在对应于根据SEQID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
在一些实施方案中,受试者被鉴定为具有:包含SEQ ID NO:1的SLC9A3R2参考基因组核酸分子、包含一个或多个SEQ ID NO:3-21的SLC9A3R2参考mRNA分子、包含一个或多个SEQ ID NO:40-58的SLC9A3R2参考cDNA分子,或包含一个或多个SEQ ID NO:77-85的SLC9A3R2参考多肽。所述SLC9A3R2抑制剂可以是本文所述的任何SLC9A3R2抑制剂。
以上或以下所引用的所有专利文献、网站、其他出版物、登录号等均出于所有目的以引用的方式整体并入,其程度犹如每个单独项目均具体地且单独地被指示为以引用的方式如此并入一样。如果序列的不同版本与不同时间的登录号相关,则意指与本申请的有效提交日期的登录号相关的版本。有效提交日期意指实际提交日期或参考登录号的优先权申请的提交日期(如果适用)中较早的日期。同样,如果出版物、网站等的不同版本在不同时间公布,则除非另有说明,否则意指在本申请的有效提交日期最近公布的版本。除非另有特别说明,否则本公开的任何特征、步骤、要素、实施方案或方面可与任何其他特征、步骤、要素、实施方案或方面组合使用。尽管出于清楚和理解的目的已通过说明和实例详细描述本公开,但将显而易见的是,可在所附权利要求的范围内实施某些变化和修改。
提供以下实施例来更详细地描述实施方案。它们意图说明但不限制所要求保护的实施方案。以下实施例为本领域普通技术人员提供本文所述的化合物、组合物、制品、装置和/或方法如何制备和评价的公开和描述,并且意图仅仅是示例性的且不意图限制任何权利要求的范围。已经努力确保关于数字(诸如例如量、温度等)的准确性,但可考虑一些误差和偏差。除非另有说明,否则份数是重量份,温度是以℃计或处于环境温度,且压力处于或接近大气压。
实施例
实施例1:SLC9A3R2中罕见的pLOF和有害错义变体与较低的高血压风险相关
如前所述,对454,787名UKB研究参与者的外显子组进行了测序,95.8%的目标碱基覆盖深度为20倍或更大(Szustakowski,Advancing Human Genetics Research andDrug Discovery through Exome Sequencing of the UK Biobank.bioRxiv,2021;和VanHout等人,Nature,2020)。在18,659个基因的编码区的3900万个碱基对中发现了一千二百万个变体(数据未示出)。在已鉴定的变体中,有3,375,252个(每个个体中位数为10,260个)同义变体、7,689,495个(每个个体9,284个)错义变体和889,957个(每个个体212个)推定功能丧失(pLOF)变体(数据未示出),其中约一半是在此数据集中仅观察到一次(单例变体;数据未示出)。
在较低的高血压风险与SLC9A3R2中的罕见pLOF和有害错义变体的负荷之间发现了一种新的关联(5,873名携带者;OR=0.81,95% CI 0.76至0.87,P=2.2x10-10)。另外,还与较低的收缩压(SBP;效应=-1.85mmHg,95% CI=-2.22至-1.48,P=2.0x10-19)和较低的舒张压(效应=-1.01mmHg,95% CI=-1.31至-0.80,P=3.7x10-18)相关联,并且SBP关联在GHS队列中复制(1,517名携带者;效应=-0.077SD单位,95%CI-0.118至-0.0356,P=2.6x10-4)。
SLC9A3R2中的低频错义变体(rs139491786,Arg171Trp,MAF=0.7%)先前在血压GWAS中被鉴定出,但所述信号归因于附近的PKD1基因变体(rs140869992,Arg2200Cys)(Giri等人,Nat Genet.,2019,51,51-62)。UKB WES证明,在对PKD1中的Arg2200Cys进行调节后,SLC9A3R2中罕见的pLOF和有害错义变体以及Arg171Trp的负荷仍然与SBP、DBP和高血压高度相关(表2)。总体而言,所述信号与钠平衡在调节血压中的既定作用一致,并表明阻断SLC9A3R2可为控制血压提供一种有吸引力的方法。
表2
除了本文所述的修改之外,所描述主题的各种修改对于本领域技术人员来说将从前述描述中显而易见。此类修改也意图落在随附权利要求书的范围内。本申请中引用的每篇参考文献(包括但不限于期刊文章、美国和非美国专利、专利申请公布、国际专利申请公布、基因库登录号等)均通过引用以其整体且出于所有目的并入本文中。
序列表
<110> 雷杰纳荣制药公司(Regeneron Pharmaceuticals, Inc.)
M·A·R·费雷拉(Ferreira, Manuel Allen Revez)
J·巴克曼(Backman, Josh)
A·李(Li, Alexander)
L·A·洛塔(Lotta, Luca Andrea)
G·阿贝卡西斯(Abecasis, Goncalo)
A·巴拉斯(Baras, Aris)
J·尼尔森(Nielsen, Jonas)
<120> 使用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂治疗高血压
<130> 189238.07902 (3527) (11026WO01)
<160> 112
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 12125
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 1
gaacaggagc cgccgctgaa gccaccgccg ggtgcccagc gccgccgccg cccccgagct 60
cccccgcgcc cctgcccgcg ggcggccggt gggcagcggg cgccatggcc gcgccggagc 120
cgctgcggcc gcgcctgtgc cgcttggtgc gcggagagca gggctacggc ttccacctgc 180
acggcgagaa gggccgccgc gggcagttca tccggcgcgt ggaacccggt tcccccgccg 240
aggccgccgc gctgcgcgct ggggaccgcc tggtcgaggt caacggcgtc aacgtggagg 300
gcgagacgca ccaccaggtg ggggccagcg ctcgcccccg gcccgccgcc ccctccccga 360
gcgcgtcccc ctggggcgag caggggtcgc acgggggccc gagggggctc ccgcggggag 420
gacgcggacg ttgtcgggag gcagcggccc ggcgccttcg gagtcccggc gcaggaagct 480
cagtcctgca cgggggtggg ggggggcatc ctggcaggga ggggcccgca ctgcggctcc 540
tggccgctgg cctcgccctt tggtcgcgtt ttggcctcag tgtgccgtga aggagggtgt 600
tgggccgcct ggagcccctc cggaaaggtg aagacctggg tgcttttgcc tgggtgtgtg 660
tgtacacgtg tgcgtgtgaa cacagctggg cgtgtgtatg caggtccctt tggggtcagc 720
catgtgtgca tgcgcctgcc tgtgcgtacc caggaggggt cgcagtaaag gcatcagtgt 780
gtctgcacct gtgtgtgctg tagtgtgtgt gtgagtatac aggtctgcac gtgtgcctgt 840
gtgtgtgcag gtctggactc ctgggcgtat gggagctggg ctctgtgtgt gtgcacgcct 900
ggctagtgta ctcatcactg tctgcaggcc ggtgagtctt tgtgtctgta ctctagtgtg 960
tcccagctgg tgtgtctggg accgggctga gttggtcatt gctggcaacc acattcctta 1020
gctacaaagg cactactcct cctcagaggc tgcctagcct ggctggggtt actggccgaa 1080
gcctcctgcc tcctggctaa ggagaacaga gccttttctc tgtgggttct gacccctgag 1140
gtgtgtctgt ctcccacagg ccagggactc cctccagacc ctggttgggg tccagcgtcc 1200
acacacccct tttcctccag gtcccctgtc cctcacagca ccgatgaatc cataacctgt 1260
ctacatggct ggtcctggaa cctagagatt agcaggttgg ttcagctgga cctggagctg 1320
gtctcctgtt tacctggtgc cttgtctgtc actctgtcgg ccggccccat gccttccacc 1380
cagagtgtct gctgtgtaag gttgtttgct gaagaatgtg gggatcaggc caggggcctg 1440
gacctgaggg attgagggta gggctgccag ggctggggcc aggctgctgt tggatagtca 1500
ctgccaccct cgccctggga acacctgctt ttccaaggcc ctgtggggct ggtctctgag 1560
gactggacac acagaccatg gtggactctc cccactgccc caggagggca agaggggcag 1620
ttactgcccc atttgacagt tgaggaaact gatgccagag attgagggta acttgtctgg 1680
gacacatagt caagaagcag ctgggcactg ggttcctctt gtctcactct gggtcatggg 1740
gagagaggag ggctggggga agatgggcct ggctcagtcc ctcctatctg ttcaccaccc 1800
ctgctgagcc cggcagctgg tggggagcct tgtccaccct cccccaggcc gcaggtggga 1860
gtagggctgc ccctcttcct gcccacttcc cagtgggcac tgctttctct ccgcgggtgt 1920
gcgctggccc cccgcgtggt ccagacactt cacaggcacc tgcacgcaca caccgacggc 1980
caccaagcca cagctgtcca caggtgcacc tgcctctccc cctcgccggc tgcacctgaa 2040
tcctgcttcc ctggctgtgt gtgggtgccc gagccaggag cccagccctt cccctctctg 2100
cagatccaga gggaatgggc ccatggccat ggcctggagg tagatataag gcctagggtc 2160
aggagtttag actcccacac tgcacggcag agaatgacgg gaatgggcac agacacactc 2220
aaactggggc ccagggagac acacctctcc ttcaaacctg gacggagaca cagactttga 2280
aacagatgga tgcatgcgcg cacagggaca ggcagactga aaacctgaag gtccactgtg 2340
caccattttt gtcacttcca gacaggactt acccagcggc cctatcctgc agccccttcc 2400
cagccccgcc tggagaagac cctgggctaa gggcaaggct ctgggagcac cctgaagccc 2460
tcacagcctg ggcctcagtg tccggagcct gagtgcagag ggagggagcc gctggagtcc 2520
gggggtgggg ggcggggccg gcaggcctct tggtgcagcc acccgcccat gcagaccagc 2580
cgcctgtccg cacgcctggg ccagcccaga gtggtgccac tgcccatgtg ctgcccggaa 2640
tgtgggccac tgacccgctc ctatcgccca ttcgccccag gtggtgcaaa ggatcaaggc 2700
tgtggagggg cagactcggc tgctggtggt ggaccaggag acagatgagg agctccgccg 2760
gcggcagctg acctgtaccg aggagatggc ccagcgaggg ctcccacccg cccacgaccc 2820
ctgggagccg aagccagact gggcacacac cggcagccac agctccgaag ctggcaagaa 2880
ggtatggcgg gcttggccca cagggaccac cctagcctct cccagaggct ctctcagctt 2940
ttgacgacga tctttgcctt tggtcacctc cagaagtctt ggtctcttct gccttttggg 3000
gctccttttc tgccccaggg accatcttgt tggccactgg gggccactgt ttctaccctc 3060
agcctgtgtt ttaaactggg tagggtcagg gcagcctggc ctgttcctct tctccaggat 3120
gctccagagc cacttgccct atcgaggggt cactctgaca agctgccgcc tccccagccc 3180
ccagcctcgt ggctgaggaa ccctgggaag aggcattcca ggtctgcgtg tgcgcagctc 3240
tgtgcctgtg ctgggtgtca tccgtggctc tgtctttgtc tctgttgaag gcgcctgcat 3300
gctgggaagg cctgggagag ggccggcctt ctccacaggc agcgccgtgg ttggggaagc 3360
ctaggaggcc actctgccag gcctggcgta ggtggggctg ggagcatggg agtggagttg 3420
ggggtccagg aggctccagg gtgagcccac tcctccccct agatacaagg gagggccctg 3480
ggaccctgtc tgctgttcct cctggactcc tgctgggtag tacttcctcc ttcccctgcc 3540
cttgctccca gccaggagac ccagaaaagt acaggggcgg cctgctccac ctcctgctag 3600
gtggccgact gggaggggcg gcctggcagg ccttggggac caggaggaac agcctgaagc 3660
tgtctgtctt atcttcctgg aggccctgat ggcattatct ccatgttctc tcctaccttt 3720
tttttttttt ttttttcatt ttcaaagaga accctggccg ggtgcggtgg ctcacgcctg 3780
taatcccaac acttcgggag gctgagatgg gtggatcacc tgaggtcagg aattttgaga 3840
ccagcttgac taatgtggtg aaacccccgt ctctactaaa aatacaaaaa tcagttgggc 3900
atggtggggc acgcctatag tcccagctac ttgggaggct gaggcaggag agtcgcttga 3960
acccggcagg cggaggtttc agtgagccga gatcccgcca tagcactcca gcctaggcga 4020
cagagtgaga ctgtctcaaa aaaaaacaaa aaaaggaaaa gaaagaaatc ccttcagggg 4080
atatgagtcc aggggttggc cagaccccac tgtgagaacc gcgcttgggg caggggtgtg 4140
ggatctggag ttctgagggt gcaggggata tacacattca ctttctccct ttcccagacg 4200
tcactgctga agctggctgc ccctaggagc tgagcccggg gggagcggct tggcagggag 4260
acagcattcc ctgtggggag cccagcctgg gcgcaggcct gcccgtggga cctgtgggac 4320
ccgttttgtt cctggggctt gagggcgggc cacagtggtg ctcagggcca aggtgcccag 4380
cccagggctg gtgggggggc tggccttgca ggggggctgg ctggtcctaa gcccctgtct 4440
ccaggctgag ggttggggcc tccctctttc ccagccacct tccctccccc aggaggaagc 4500
tccccctctg cctcaggcgt ttgtccattg atttggacac aaacgcatgg ttcaccttcc 4560
tgtggaaaaa tccggccctc ggactttatc tggagggtgc agtggcccag gcaccttgcc 4620
ttgggtggga ccttccccct ctgctatttc aggctctggg ggctgcagga agccctagga 4680
ggggcttcct ctgggtgtat ttttagagga acaaagggtg gcctgagtgg caggtccctt 4740
tgtgcatgag tctggctggg gacaggggct ccaggaggtc agggggcacc caaggaacag 4800
ggtctcccct tctctcttct ggcatcaaga cctgaggttt ctttttcttt ttctttcttg 4860
gctcactaca acctccgctg tctgggttca agcgattctc ttgcctcacc ctccccagta 4920
gctgggatta caggcgcgca ccaccacacc tgactaattt ttgtgttttt agtagagacg 4980
gggtttcacc atgttgctca agctggtctc gaactcctga tctcaggtga tctgccctcc 5040
tcgacctccc aaagttctgg gattacaggt gtgagccact gtacccggcc cctgaggtct 5100
gaggtttcat ttctttcttt cttttttttt ttttttgaga cggagtttca ctctgtcgcc 5160
caggctggag tgctgtggtg cgatctcggc tcactgcaag ctccgcctcc tgggttcaag 5220
caattcttat gtctcagcct gctgagtagc tgggattaca ggcgtgtacc accacacctg 5280
gctaattttt gtgtttttgg tagagacagg gtttcaccgt gttggccagg ctggtctcaa 5340
actcttgggc tcaagtgatc cgcctgcctc agcctcccaa agtgctggga ttacaggtgt 5400
gagcccctgc gcctggctca ggacctgagg tttcttcacc tgagctccca gcatgggcag 5460
gaagaggtgg gcctcacctg acctccacag agcaggctca gatcctgccc ttctcagcct 5520
gggttcaggg catgcctcag atggtcaggg agcccaggag ggcaaagctt accttgcggg 5580
gatggctcca gtgggggcac tggtggcaga gaggcagagc tctggaaggg atgtgtgtag 5640
tttgtctttg gtgaaggatg gagagggccc aactttgggt gccccctggg agctaagggt 5700
ggctctcagt gtcctctgtc ctggctgggg ataggggagg tgggcagggg aggacactga 5760
tgtggttggc ccctcctttt gggggccgtg aaggcctagt tagtgatgac tcagccctgg 5820
gccacaccag gctgggggtg gccgcagctg cagtgcagct gatcctagta gtgacgacag 5880
gggacagccc ccaaacagag acggggtggc cagcggtgcc aggccctgga ggtggtggca 5940
gaccctgagc cctctgcccc ctgcccctag cccatgtctc cacccccatc tggagggcct 6000
tgggggctaa gagcaggtgt gaggggtgac agttctgcgg gaggcggctg tgtggttggg 6060
gcgcggtgcc tgcgggggct tccgggcttc cctggctctt gctcctctgg agcctcaaca 6120
ggaccgtcct gtgttctggg gccgggactc ctccctgtcc cctcagccct gggtcctggg 6180
gcagggcagg gccttccagc agcttccttc cttcctttct tgggacggaa gcctagctgg 6240
gtggggggcg ccaggctgga gccttcgcag gggagcgggc tcagtcatca ccctgctccc 6300
cagagtgact cagcccccac gtccccaccc atccccgggg agccagggcc gcagagggag 6360
gtagataagt ggggtggcag cctgggtcgg ccagagagtt caggccaccc cggccggacg 6420
cctgccactt gctgtcactg tgccgctgtc atggcacgct ccgggagtgc cacgccacct 6480
gcccgggctc cgggagcccc tccacggagc ccaccccaga ggctggtaca ggtcaggtgg 6540
ggtgggagga agggagggct aggaggaacc ggcagccgct cagcctcccg gggtggaagg 6600
aggggactcc gggaccttga tgtaagcagg ctggtcgctg agcaacaatg aaggcctttc 6660
tctgccaggg ctggtgcgtc accatctggg ggggtgccca gggtaccccc atgccagcct 6720
ctttgtccgg acacaggcat ggctggggga ccagggatgg tccagctctg tgctggccgc 6780
cggcagggag ggagcctgga gcccgtggga gcccgagggc ctggcgggag gcggcaggaa 6840
gtgtgtgctg agccagggca gggaggagga atgtgagcta tgaacgccgc ccgagctcct 6900
cggctctctg ggcccccctt ccccacgagc ccatgtgctg ccagcagccc accctggccc 6960
ctccattgca gcccctccac ctgaggtttt agtgctgtgc ctggcgccac tgggaccctg 7020
ctgacaatga aggggtttag gtttgatagg cagaacttct tgccttgtag agtgaaagac 7080
ggctgcttct ggacagaggc agaggggtgg ccagaatgac cctgagaaca ctgaggggtc 7140
cttggcctgg cctcagggcc ccagacaccc accagatcct gcttcctgtc tggtgccctg 7200
agaaaccctg ccccgcaggc cgctgtgcag gcgtgggaag ggctgccggg ccagcactgt 7260
ggggctggcc gcatgtgtgg gctgctgtgc gtgtttgcag gtgtgtgtgg acgtcttgtg 7320
tctgtggctg tgtgatgtgt ctttgcggac tgggcccata tcacgctccc acctcctcca 7380
ctgaattggg ctcctgtccc cacgccttcc ctgcgtccca ggccagcctg ggggccgtgc 7440
tccacctccc ctcccgaact ggactcctgt ccccacgcct tccctccgtc ccaggccagc 7500
ctgggggccg tgctccacct cccctcccga actggactcc tgtccccacg ccttccctcc 7560
gtcccaggcc agcctggggg ccgtgctcca cctcccctcc cgaactggac tcctgtcccc 7620
acgccttccc tccgtcccag gccagcctgg gggccgtgct ccacctcccc tcccgaactg 7680
ggctcctgtc cccacgcctt ccctccgtcc caggccagcc tgggggccgt gctccacctc 7740
ccctcccgaa ctggactcct gtccccacgc cttccctccg tcccaggcca gcctgggggc 7800
cgtgctccac ctcccctccc gaactgggct cctgtcccca cgccttccct ccgtcccagg 7860
ccagcctggg ggctgtgctc cacttcccct cccgaactgg actcctgtcc ccacgccttc 7920
cctgcgtccc aggccagcct gggggccgtg ctgtgactgc atccctgagg ggcactttgg 7980
tgggcaggtg tcagggtcag ccttgaagcc ccacgcctgt gccaccaggt gtgtctgggg 8040
gaggagtgag tctatgtggt ggggccctgg agattttggg ggtcttgcac cctctaattc 8100
agcccatgtg gcccagctga gcccctgtgg ggccagggag ccacaggctt gtccctggag 8160
tttctggtgt gacgggctgg gtggtggcca tgcagagagg gttcagaggg tgggcaggag 8220
gcttcagatg aggcatctgg caggctggac aggagaaggg tgttccagac caagggcagg 8280
tcctgagccc aggggacaga gcactagctg tgtggagaag gacccccttg ctcccttggc 8340
ggggcggtcc cccccgctga catggccgtt tctggtccat tggggtttgg agcgagcttg 8400
aaggtgggtg gctggagggg ttgggggtgt ctgaggcctg gagacctgcc ctcctgaggt 8460
ctgagcgccc ccttgccatg ccgccccagc cctggcctgg cctggcctgt ggtccctcag 8520
ggacacacag ggaggtagga ggtgagggaa gggccctggc agcccccagc ccgcctgcac 8580
agtctcccct gcgcacgccc tcaagcttgg cgctccctgg aaacctgagc tgcctcctgc 8640
ctgctccggc caccgccatg tttaactgag cacgggcagc cgctggccac cgccgccgca 8700
ccctggccca ccccctggct gggaggtggt cattgggcct ggccttgcct gcatggtccc 8760
ctggcccaga gccctaccgc aggatgccag aggtaacatg gggcagggcc tgggatggta 8820
gcggggggtc cttccgggca ccaggaggcc ctctgtgccc tgtccacact aagctcctgc 8880
cccagcccct gcttgctggg cccacggggg tggggcggct cattttcctg gaatgtgaaa 8940
gcaaacagag ccgccaccgc agccagcccc acggaggcct ctggagagaa aacaaaactg 9000
ctggcctagg agcgcctgcc ccacgctctg gaggagagcc cggggcaggg ggacgcacag 9060
gcagagccct cagggacaac cgccccagga ggccaacggc gacagttcat cccacctggt 9120
gcttcctccc accctgcctg tgcgccacgc tggcctcgag ccaaaggaat tctcccagca 9180
acccgggaag gcggctgggc ccgtcgggga ggcttctggg tttgaaaaca ggctttgccc 9240
aagttcccac agctaaagct ctgtcacagg cagcctgggt gcccggagtg tttgccactg 9300
agacctgggc ctgcccgtgg ggggcacggt accgagtttg ggcagtggcg gcaccaccgg 9360
ggagtggcct ctggaggcgg gaggctggag caagagactg accctgtccg ttgggcctgc 9420
aggatgtcag tgggcccctg agggagctgc gccctcggct ctgccacctg cgaaagggac 9480
ctcagggcta tgggttcaac ctgcatagtg acaagtcccg gcccggccag tacatccgct 9540
ctgtggaccc gggctcacct gccgcccgct ctggcctccg cgcccaggac cggctcattg 9600
aggtaccggc ccaccagggc tgcggggtgc cgagtgcccc gcacctgtcc acactggggc 9660
cctgggtcct tgcagggagg agggagacgc tgggaacctg agctggtgcg cctcctgctg 9720
cctcggtggg cggtggctgt gatgaatatt tgatgccaca cctggccacg cggcgttggg 9780
ggctgtctgg gcccatggcg gggctgatac atgctggtgg cggcaggtga acgggcagaa 9840
tgtggaggga ctgcgccatg ctgaggtggt ggccagcatc aaggcacggg aggacgaggc 9900
ccggctgctg gtcgtggacc ccgagacaga tgaacacttc aagcggcttc gggtcacacc 9960
caccgaggag cacgtggaag gtgggccacg gcccagggca cagggtgggt gcggtgtggt 10020
ggctgagcag ccactgacac gctgtcccca caggtcctct gccgtcaccc gtcaccaatg 10080
gaaccagccc tgcccaggta agagggtggg gtgcccatga gacacagggt gcctctgggg 10140
gtacccaggc ccgacagagg cccccttctc cctggagatc cgtcctcgag gtgtgctagt 10200
gacacccgat tttagccctg tcacctccct ttaatgcccc tgtgggtctc atcctgggtc 10260
gtgccacaca caagccacgt ggggcccctg gggtcggggc cactgccttc tgtcctctcc 10320
tgggcaccac ctggtaagga gttgccctcc agtctctgcc tcctcaggga gctggcggtg 10380
gcctcacccc aggcgttgct cacgccggcc attcctgcac ctgaaccccc tctgcaccat 10440
gagccggcca ggccacctgc ctgtcactgc caggcgcccg gtgcctgccc cgccgcatct 10500
ggagtccacc agaggcccga ggccccctgc cgagtggagg agcacacact gggggggggt 10560
gtgcctctgt gcacatgtgt gcgtgtgcag gtgttgtgtg tgtctgtgaa accacaatct 10620
gcccttggtt tcccagctca atggtggctc tgcgtgctcg tcccgaagtg acctgcctgg 10680
ttccgacaag gacactgagg tatggatgtt ctccactcct gagctcacac gtggggttgc 10740
tagaggcctt ggggtaggcg tctgtggaga tgtcagcccg ggcagtgggg tctctgttca 10800
ggaagtcctc gtgagcccca gccccagcag gcagcctctg ttggttgctc cctaggaggg 10860
gccaccgtct ggggtgtggg actagggctc actccagaca ccccacccac cgtgctcacc 10920
ccaggatggc agtgcctgga agcaagatcc cttccaggag agcggcctcc acctgagccc 10980
cacggcggcc gaggccaagg agaaggctcg agccatgcga gtcaacaagc gcgcgccaca 11040
gatggactgg aacaggaagc gtgaaatctt cagcaacttc tgagcccctt cctgcctgtc 11100
tcgggaccct gggacccctc ccgcacggac cttgggcctc agcctgcccc gagctccccc 11160
agcctcagtg gactggaggg tggtcctgcc attgcccaga aatcagcccc agccccggtg 11220
agcccccatc ctgcccctgc ccaccaggta ctgggggcct gtggcagcaa gataggggga 11280
gagagaccca gagatgtgag agagagtcag agacagagac agagagagag agagagagac 11340
acagagagag acagagagag agcgagcgag cgcgcggcag ccgcggggcg agggcctttg 11400
ctgctctgcc ggggcctgct gactgaaagg aatttgtgtt tttgcttttt ttccaaaaag 11460
atctccagct ccacacatgt ttccacttaa taccagagac cccccccctt cccctccccc 11520
ttcccctccc ccttgggacg cgctctaaat aattgcaata aaacaaacct ttctctgcaa 11580
accatttcct ccccgccccc tcccctcagc agcggccgtc ctgagtggga gtccctggga 11640
cttcccagtg gccaagttgg ggcgcccagc ctcttcgtgg ggaccttggg taaggccagg 11700
gaggcctgat gtggccgtag gagctgcccc tgcccacctg ccctggtgtg ggggtcccta 11760
ggccacaccc tgctccccac ccagctaccc tgtgcgcctg tgccctgctg ggggcctggg 11820
ctctccgagg ggcctgagga tggaggcccc acgtccccga ggagggcggc ctctggacag 11880
gcccctcatt ccgcgcggca gctcccaggc ctggggaacg taggtgtgtg agagcggcac 11940
ccgggaagga cgcctggcct ctggctcagc cctgcttggc gggctccccc gtggacaccc 12000
tgttgacttt gcacttccct cccgggcccc gcacccccga accgaccacc gatcgaccgg 12060
caccgctgtt gcctcgtaag ccatagcgca tgcgcgctct caggataaac aggccctgcc 12120
tggga 12125
<210> 2
<211> 12125
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 2
gaacaggagc cgccgctgaa gccaccgccg ggtgcccagc gccgccgccg cccccgagct 60
cccccgcgcc cctgcccgcg ggcggccggt gggcagcggg cgccatggcc gcgccggagc 120
cgctgcggcc gcgcctgtgc cgcttggtgc gcggagagca gggctacggc ttccacctgc 180
acggcgagaa gggccgccgc gggcagttca tccggcgcgt ggaacccggt tcccccgccg 240
aggccgccgc gctgcgcgct ggggaccgcc tggtcgaggt caacggcgtc aacgtggagg 300
gcgagacgca ccaccaggtg ggggccagcg ctcgcccccg gcccgccgcc ccctccccga 360
gcgcgtcccc ctggggcgag caggggtcgc acgggggccc gagggggctc ccgcggggag 420
gacgcggacg ttgtcgggag gcagcggccc ggcgccttcg gagtcccggc gcaggaagct 480
cagtcctgca cgggggtggg ggggggcatc ctggcaggga ggggcccgca ctgcggctcc 540
tggccgctgg cctcgccctt tggtcgcgtt ttggcctcag tgtgccgtga aggagggtgt 600
tgggccgcct ggagcccctc cggaaaggtg aagacctggg tgcttttgcc tgggtgtgtg 660
tgtacacgtg tgcgtgtgaa cacagctggg cgtgtgtatg caggtccctt tggggtcagc 720
catgtgtgca tgcgcctgcc tgtgcgtacc caggaggggt cgcagtaaag gcatcagtgt 780
gtctgcacct gtgtgtgctg tagtgtgtgt gtgagtatac aggtctgcac gtgtgcctgt 840
gtgtgtgcag gtctggactc ctgggcgtat gggagctggg ctctgtgtgt gtgcacgcct 900
ggctagtgta ctcatcactg tctgcaggcc ggtgagtctt tgtgtctgta ctctagtgtg 960
tcccagctgg tgtgtctggg accgggctga gttggtcatt gctggcaacc acattcctta 1020
gctacaaagg cactactcct cctcagaggc tgcctagcct ggctggggtt actggccgaa 1080
gcctcctgcc tcctggctaa ggagaacaga gccttttctc tgtgggttct gacccctgag 1140
gtgtgtctgt ctcccacagg ccagggactc cctccagacc ctggttgggg tccagcgtcc 1200
acacacccct tttcctccag gtcccctgtc cctcacagca ccgatgaatc cataacctgt 1260
ctacatggct ggtcctggaa cctagagatt agcaggttgg ttcagctgga cctggagctg 1320
gtctcctgtt tacctggtgc cttgtctgtc actctgtcgg ccggccccat gccttccacc 1380
cagagtgtct gctgtgtaag gttgtttgct gaagaatgtg gggatcaggc caggggcctg 1440
gacctgaggg attgagggta gggctgccag ggctggggcc aggctgctgt tggatagtca 1500
ctgccaccct cgccctggga acacctgctt ttccaaggcc ctgtggggct ggtctctgag 1560
gactggacac acagaccatg gtggactctc cccactgccc caggagggca agaggggcag 1620
ttactgcccc atttgacagt tgaggaaact gatgccagag attgagggta acttgtctgg 1680
gacacatagt caagaagcag ctgggcactg ggttcctctt gtctcactct gggtcatggg 1740
gagagaggag ggctggggga agatgggcct ggctcagtcc ctcctatctg ttcaccaccc 1800
ctgctgagcc cggcagctgg tggggagcct tgtccaccct cccccaggcc gcaggtggga 1860
gtagggctgc ccctcttcct gcccacttcc cagtgggcac tgctttctct ccgcgggtgt 1920
gcgctggccc cccgcgtggt ccagacactt cacaggcacc tgcacgcaca caccgacggc 1980
caccaagcca cagctgtcca caggtgcacc tgcctctccc cctcgccggc tgcacctgaa 2040
tcctgcttcc ctggctgtgt gtgggtgccc gagccaggag cccagccctt cccctctctg 2100
cagatccaga gggaatgggc ccatggccat ggcctggagg tagatataag gcctagggtc 2160
aggagtttag actcccacac tgcacggcag agaatgacgg gaatgggcac agacacactc 2220
aaactggggc ccagggagac acacctctcc ttcaaacctg gacggagaca cagactttga 2280
aacagatgga tgcatgcgcg cacagggaca ggcagactga aaacctgaag gtccactgtg 2340
caccattttt gtcacttcca gacaggactt acccagcggc cctatcctgc agccccttcc 2400
cagccccgcc tggagaagac cctgggctaa gggcaaggct ctgggagcac cctgaagccc 2460
tcacagcctg ggcctcagtg tccggagcct gagtgcagag ggagggagcc gctggagtcc 2520
gggggtgggg ggcggggccg gcaggcctct tggtgcagcc acccgcccat gcagaccagc 2580
cgcctgtccg cacgcctggg ccagcccaga gtggtgccac tgcccatgtg ctgcccggaa 2640
tgtgggccac tgacccgctc ctatcgccca ttcgccccag gtggtgcaaa ggatcaaggc 2700
tgtggagggg cagactcggc tgctggtggt ggaccaggag acagatgagg agctccgccg 2760
gcggcagctg acctgtaccg aggagatggc ccagcgaggg ctcccacccg cccacgaccc 2820
ctgggagccg aagccagact gggcacacac cggcagccac agctccgaag ctggcaagaa 2880
ggtatggcgg gcttggccca cagggaccac cctagcctct cccagaggct ctctcagctt 2940
ttgacgacga tctttgcctt tggtcacctc cagaagtctt ggtctcttct gccttttggg 3000
gctccttttc tgccccaggg accatcttgt tggccactgg gggccactgt ttctaccctc 3060
agcctgtgtt ttaaactggg tagggtcagg gcagcctggc ctgttcctct tctccaggat 3120
gctccagagc cacttgccct atcgaggggt cactctgaca agctgccgcc tccccagccc 3180
ccagcctcgt ggctgaggaa ccctgggaag aggcattcca ggtctgcgtg tgcgcagctc 3240
tgtgcctgtg ctgggtgtca tccgtggctc tgtctttgtc tctgttgaag gcgcctgcat 3300
gctgggaagg cctgggagag ggccggcctt ctccacaggc agcgccgtgg ttggggaagc 3360
ctaggaggcc actctgccag gcctggcgta ggtggggctg ggagcatggg agtggagttg 3420
ggggtccagg aggctccagg gtgagcccac tcctccccct agatacaagg gagggccctg 3480
ggaccctgtc tgctgttcct cctggactcc tgctgggtag tacttcctcc ttcccctgcc 3540
cttgctccca gccaggagac ccagaaaagt acaggggcgg cctgctccac ctcctgctag 3600
gtggccgact gggaggggcg gcctggcagg ccttggggac caggaggaac agcctgaagc 3660
tgtctgtctt atcttcctgg aggccctgat ggcattatct ccatgttctc tcctaccttt 3720
tttttttttt ttttttcatt ttcaaagaga accctggccg ggtgcggtgg ctcacgcctg 3780
taatcccaac acttcgggag gctgagatgg gtggatcacc tgaggtcagg aattttgaga 3840
ccagcttgac taatgtggtg aaacccccgt ctctactaaa aatacaaaaa tcagttgggc 3900
atggtggggc acgcctatag tcccagctac ttgggaggct gaggcaggag agtcgcttga 3960
acccggcagg cggaggtttc agtgagccga gatcccgcca tagcactcca gcctaggcga 4020
cagagtgaga ctgtctcaaa aaaaaacaaa aaaaggaaaa gaaagaaatc ccttcagggg 4080
atatgagtcc aggggttggc cagaccccac tgtgagaacc gcgcttgggg caggggtgtg 4140
ggatctggag ttctgagggt gcaggggata tacacattca ctttctccct ttcccagacg 4200
tcactgctga agctggctgc ccctaggagc tgagcccggg gggagcggct tggcagggag 4260
acagcattcc ctgtggggag cccagcctgg gcgcaggcct gcccgtggga cctgtgggac 4320
ccgttttgtt cctggggctt gagggcgggc cacagtggtg ctcagggcca aggtgcccag 4380
cccagggctg gtgggggggc tggccttgca ggggggctgg ctggtcctaa gcccctgtct 4440
ccaggctgag ggttggggcc tccctctttc ccagccacct tccctccccc aggaggaagc 4500
tccccctctg cctcaggcgt ttgtccattg atttggacac aaacgcatgg ttcaccttcc 4560
tgtggaaaaa tccggccctc ggactttatc tggagggtgc agtggcccag gcaccttgcc 4620
ttgggtggga ccttccccct ctgctatttc aggctctggg ggctgcagga agccctagga 4680
ggggcttcct ctgggtgtat ttttagagga acaaagggtg gcctgagtgg caggtccctt 4740
tgtgcatgag tctggctggg gacaggggct ccaggaggtc agggggcacc caaggaacag 4800
ggtctcccct tctctcttct ggcatcaaga cctgaggttt ctttttcttt ttctttcttg 4860
gctcactaca acctccgctg tctgggttca agcgattctc ttgcctcacc ctccccagta 4920
gctgggatta caggcgcgca ccaccacacc tgactaattt ttgtgttttt agtagagacg 4980
gggtttcacc atgttgctca agctggtctc gaactcctga tctcaggtga tctgccctcc 5040
tcgacctccc aaagttctgg gattacaggt gtgagccact gtacccggcc cctgaggtct 5100
gaggtttcat ttctttcttt cttttttttt ttttttgaga cggagtttca ctctgtcgcc 5160
caggctggag tgctgtggtg cgatctcggc tcactgcaag ctccgcctcc tgggttcaag 5220
caattcttat gtctcagcct gctgagtagc tgggattaca ggcgtgtacc accacacctg 5280
gctaattttt gtgtttttgg tagagacagg gtttcaccgt gttggccagg ctggtctcaa 5340
actcttgggc tcaagtgatc cgcctgcctc agcctcccaa agtgctggga ttacaggtgt 5400
gagcccctgc gcctggctca ggacctgagg tttcttcacc tgagctccca gcatgggcag 5460
gaagaggtgg gcctcacctg acctccacag agcaggctca gatcctgccc ttctcagcct 5520
gggttcaggg catgcctcag atggtcaggg agcccaggag ggcaaagctt accttgcggg 5580
gatggctcca gtgggggcac tggtggcaga gaggcagagc tctggaaggg atgtgtgtag 5640
tttgtctttg gtgaaggatg gagagggccc aactttgggt gccccctggg agctaagggt 5700
ggctctcagt gtcctctgtc ctggctgggg ataggggagg tgggcagggg aggacactga 5760
tgtggttggc ccctcctttt gggggccgtg aaggcctagt tagtgatgac tcagccctgg 5820
gccacaccag gctgggggtg gccgcagctg cagtgcagct gatcctagta gtgacgacag 5880
gggacagccc ccaaacagag acggggtggc cagcggtgcc aggccctgga ggtggtggca 5940
gaccctgagc cctctgcccc ctgcccctag cccatgtctc cacccccatc tggagggcct 6000
tgggggctaa gagcaggtgt gaggggtgac agttctgcgg gaggcggctg tgtggttggg 6060
gcgcggtgcc tgcgggggct tccgggcttc cctggctctt gctcctctgg agcctcaaca 6120
ggaccgtcct gtgttctggg gccgggactc ctccctgtcc cctcagccct gggtcctggg 6180
gcagggcagg gccttccagc agcttccttc cttcctttct tgggacggaa gcctagctgg 6240
gtggggggcg ccaggctgga gccttcgcag gggagcgggc tcagtcatca ccctgctccc 6300
cagagtgact cagcccccac gtccccaccc atccccgggg agccagggcc gcagagggag 6360
gtagataagt ggggtggcag cctgggtcgg ccagagagtt caggccaccc cggccggacg 6420
cctgccactt gctgtcactg tgccgctgtc atggcacgct ccgggagtgc cacgccacct 6480
gcccgggctc cgggagcccc tccacggagc ccaccccaga ggctggtaca ggtcaggtgg 6540
ggtgggagga agggagggct aggaggaacc ggcagccgct cagcctcccg gggtggaagg 6600
aggggactcc gggaccttga tgtaagcagg ctggtcgctg agcaacaatg aaggcctttc 6660
tctgccaggg ctggtgcgtc accatctggg ggggtgccca gggtaccccc atgccagcct 6720
ctttgtccgg acacaggcat ggctggggga ccagggatgg tccagctctg tgctggccgc 6780
cggcagggag ggagcctgga gcccgtggga gcccgagggc ctggcgggag gcggcaggaa 6840
gtgtgtgctg agccagggca gggaggagga atgtgagcta tgaacgccgc ccgagctcct 6900
cggctctctg ggcccccctt ccccacgagc ccatgtgctg ccagcagccc accctggccc 6960
ctccattgca gcccctccac ctgaggtttt agtgctgtgc ctggcgccac tgggaccctg 7020
ctgacaatga aggggtttag gtttgatagg cagaacttct tgccttgtag agtgaaagac 7080
ggctgcttct ggacagaggc agaggggtgg ccagaatgac cctgagaaca ctgaggggtc 7140
cttggcctgg cctcagggcc ccagacaccc accagatcct gcttcctgtc tggtgccctg 7200
agaaaccctg ccccgcaggc cgctgtgcag gcgtgggaag ggctgccggg ccagcactgt 7260
ggggctggcc gcatgtgtgg gctgctgtgc gtgtttgcag gtgtgtgtgg acgtcttgtg 7320
tctgtggctg tgtgatgtgt ctttgcggac tgggcccata tcacgctccc acctcctcca 7380
ctgaattggg ctcctgtccc cacgccttcc ctgcgtccca ggccagcctg ggggccgtgc 7440
tccacctccc ctcccgaact ggactcctgt ccccacgcct tccctccgtc ccaggccagc 7500
ctgggggccg tgctccacct cccctcccga actggactcc tgtccccacg ccttccctcc 7560
gtcccaggcc agcctggggg ccgtgctcca cctcccctcc cgaactggac tcctgtcccc 7620
acgccttccc tccgtcccag gccagcctgg gggccgtgct ccacctcccc tcccgaactg 7680
ggctcctgtc cccacgcctt ccctccgtcc caggccagcc tgggggccgt gctccacctc 7740
ccctcccgaa ctggactcct gtccccacgc cttccctccg tcccaggcca gcctgggggc 7800
cgtgctccac ctcccctccc gaactgggct cctgtcccca cgccttccct ccgtcccagg 7860
ccagcctggg ggctgtgctc cacttcccct cccgaactgg actcctgtcc ccacgccttc 7920
cctgcgtccc aggccagcct gggggccgtg ctgtgactgc atccctgagg ggcactttgg 7980
tgggcaggtg tcagggtcag ccttgaagcc ccacgcctgt gccaccaggt gtgtctgggg 8040
gaggagtgag tctatgtggt ggggccctgg agattttggg ggtcttgcac cctctaattc 8100
agcccatgtg gcccagctga gcccctgtgg ggccagggag ccacaggctt gtccctggag 8160
tttctggtgt gacgggctgg gtggtggcca tgcagagagg gttcagaggg tgggcaggag 8220
gcttcagatg aggcatctgg caggctggac aggagaaggg tgttccagac caagggcagg 8280
tcctgagccc aggggacaga gcactagctg tgtggagaag gacccccttg ctcccttggc 8340
ggggcggtcc cccccgctga catggccgtt tctggtccat tggggtttgg agcgagcttg 8400
aaggtgggtg gctggagggg ttgggggtgt ctgaggcctg gagacctgcc ctcctgaggt 8460
ctgagcgccc ccttgccatg ccgccccagc cctggcctgg cctggcctgt ggtccctcag 8520
ggacacacag ggaggtagga ggtgagggaa gggccctggc agcccccagc ccgcctgcac 8580
agtctcccct gcgcacgccc tcaagcttgg cgctccctgg aaacctgagc tgcctcctgc 8640
ctgctccggc caccgccatg tttaactgag cacgggcagc cgctggccac cgccgccgca 8700
ccctggccca ccccctggct gggaggtggt cattgggcct ggccttgcct gcatggtccc 8760
ctggcccaga gccctaccgc aggatgccag aggtaacatg gggcagggcc tgggatggta 8820
gcggggggtc cttccgggca ccaggaggcc ctctgtgccc tgtccacact aagctcctgc 8880
cccagcccct gcttgctggg cccacggggg tggggcggct cattttcctg gaatgtgaaa 8940
gcaaacagag ccgccaccgc agccagcccc acggaggcct ctggagagaa aacaaaactg 9000
ctggcctagg agcgcctgcc ccacgctctg gaggagagcc cggggcaggg ggacgcacag 9060
gcagagccct cagggacaac cgccccagga ggccaacggc gacagttcat cccacctggt 9120
gcttcctccc accctgcctg tgcgccacgc tggcctcgag ccaaaggaat tctcccagca 9180
acccgggaag gcggctgggc ccgtcgggga ggcttctggg tttgaaaaca ggctttgccc 9240
aagttcccac agctaaagct ctgtcacagg cagcctgggt gcccggagtg tttgccactg 9300
agacctgggc ctgcccgtgg ggggcacggt accgagtttg ggcagtggcg gcaccaccgg 9360
ggagtggcct ctggaggcgg gaggctggag caagagactg accctgtccg ttgggcctgc 9420
aggatgtcag tgggcccctg agggagctgc gccctcggct ctgccacctg cgaaagggac 9480
ctcagggcta tgggttcaac ctgcatagtg acaagtcctg gcccggccag tacatccgct 9540
ctgtggaccc gggctcacct gccgcccgct ctggcctccg cgcccaggac cggctcattg 9600
aggtaccggc ccaccagggc tgcggggtgc cgagtgcccc gcacctgtcc acactggggc 9660
cctgggtcct tgcagggagg agggagacgc tgggaacctg agctggtgcg cctcctgctg 9720
cctcggtggg cggtggctgt gatgaatatt tgatgccaca cctggccacg cggcgttggg 9780
ggctgtctgg gcccatggcg gggctgatac atgctggtgg cggcaggtga acgggcagaa 9840
tgtggaggga ctgcgccatg ctgaggtggt ggccagcatc aaggcacggg aggacgaggc 9900
ccggctgctg gtcgtggacc ccgagacaga tgaacacttc aagcggcttc gggtcacacc 9960
caccgaggag cacgtggaag gtgggccacg gcccagggca cagggtgggt gcggtgtggt 10020
ggctgagcag ccactgacac gctgtcccca caggtcctct gccgtcaccc gtcaccaatg 10080
gaaccagccc tgcccaggta agagggtggg gtgcccatga gacacagggt gcctctgggg 10140
gtacccaggc ccgacagagg cccccttctc cctggagatc cgtcctcgag gtgtgctagt 10200
gacacccgat tttagccctg tcacctccct ttaatgcccc tgtgggtctc atcctgggtc 10260
gtgccacaca caagccacgt ggggcccctg gggtcggggc cactgccttc tgtcctctcc 10320
tgggcaccac ctggtaagga gttgccctcc agtctctgcc tcctcaggga gctggcggtg 10380
gcctcacccc aggcgttgct cacgccggcc attcctgcac ctgaaccccc tctgcaccat 10440
gagccggcca ggccacctgc ctgtcactgc caggcgcccg gtgcctgccc cgccgcatct 10500
ggagtccacc agaggcccga ggccccctgc cgagtggagg agcacacact gggggggggt 10560
gtgcctctgt gcacatgtgt gcgtgtgcag gtgttgtgtg tgtctgtgaa accacaatct 10620
gcccttggtt tcccagctca atggtggctc tgcgtgctcg tcccgaagtg acctgcctgg 10680
ttccgacaag gacactgagg tatggatgtt ctccactcct gagctcacac gtggggttgc 10740
tagaggcctt ggggtaggcg tctgtggaga tgtcagcccg ggcagtgggg tctctgttca 10800
ggaagtcctc gtgagcccca gccccagcag gcagcctctg ttggttgctc cctaggaggg 10860
gccaccgtct ggggtgtggg actagggctc actccagaca ccccacccac cgtgctcacc 10920
ccaggatggc agtgcctgga agcaagatcc cttccaggag agcggcctcc acctgagccc 10980
cacggcggcc gaggccaagg agaaggctcg agccatgcga gtcaacaagc gcgcgccaca 11040
gatggactgg aacaggaagc gtgaaatctt cagcaacttc tgagcccctt cctgcctgtc 11100
tcgggaccct gggacccctc ccgcacggac cttgggcctc agcctgcccc gagctccccc 11160
agcctcagtg gactggaggg tggtcctgcc attgcccaga aatcagcccc agccccggtg 11220
agcccccatc ctgcccctgc ccaccaggta ctgggggcct gtggcagcaa gataggggga 11280
gagagaccca gagatgtgag agagagtcag agacagagac agagagagag agagagagac 11340
acagagagag acagagagag agcgagcgag cgcgcggcag ccgcggggcg agggcctttg 11400
ctgctctgcc ggggcctgct gactgaaagg aatttgtgtt tttgcttttt ttccaaaaag 11460
atctccagct ccacacatgt ttccacttaa taccagagac cccccccctt cccctccccc 11520
ttcccctccc ccttgggacg cgctctaaat aattgcaata aaacaaacct ttctctgcaa 11580
accatttcct ccccgccccc tcccctcagc agcggccgtc ctgagtggga gtccctggga 11640
cttcccagtg gccaagttgg ggcgcccagc ctcttcgtgg ggaccttggg taaggccagg 11700
gaggcctgat gtggccgtag gagctgcccc tgcccacctg ccctggtgtg ggggtcccta 11760
ggccacaccc tgctccccac ccagctaccc tgtgcgcctg tgccctgctg ggggcctggg 11820
ctctccgagg ggcctgagga tggaggcccc acgtccccga ggagggcggc ctctggacag 11880
gcccctcatt ccgcgcggca gctcccaggc ctggggaacg taggtgtgtg agagcggcac 11940
ccgggaagga cgcctggcct ctggctcagc cctgcttggc gggctccccc gtggacaccc 12000
tgttgacttt gcacttccct cccgggcccc gcacccccga accgaccacc gatcgaccgg 12060
caccgctgtt gcctcgtaag ccatagcgca tgcgcgctct caggataaac aggccctgcc 12120
tggga 12125
<210> 3
<211> 2160
<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 3
gaacaggagc cgccgcugaa gccaccgccg ggugcccagc gccgccgccg cccccgagcu 60
cccccgcgcc ccugcccgcg ggcggccggu gggcagcggg cgccauggcc gcgccggagc 120
cgcugcggcc gcgccugugc cgcuuggugc gcggagagca gggcuacggc uuccaccugc 180
acggcgagaa gggccgccgc gggcaguuca uccggcgcgu ggaacccggu ucccccgccg 240
aggccgccgc gcugcgcgcu ggggaccgcc uggucgaggu caacggcguc aacguggagg 300
gcgagacgca ccaccaggug gugcaaagga ucaaggcugu ggaggggcag acucggcugc 360
ugguggugga ccaggagaca gaugaggagc uccgccggcg gcagcugacc uguaccgagg 420
agauggccca gcgagggcuc ccacccgccc acgaccccug ggagccgaag ccagacuggg 480
cacacaccgg cagccacagc uccgaagcug gcaagaagga ugucaguggg ccccugaggg 540
agcugcgccc ucggcucugc caccugcgaa agggaccuca gggcuauggg uucaaccugc 600
auagugacaa gucccggccc ggccaguaca uccgcucugu ggacccgggc ucaccugccg 660
cccgcucugg ccuccgcgcc caggaccggc ucauugaggu gaacgggcag aauguggagg 720
gacugcgcca ugcugaggug guggccagca ucaaggcacg ggaggacgag gcccggcugc 780
uggucgugga ccccgagaca gaugaacacu ucaagcggcu ucgggucaca cccaccgagg 840
agcacgugga agguccucug ccgucacccg ucaccaaugg aaccagcccu gcccagcuca 900
augguggcuc ugcgugcucg ucccgaagug accugccugg uuccgacaag gacacugagg 960
auggcagugc cuggaagcaa gaucccuucc aggagagcgg ccuccaccug agccccacgg 1020
cggccgaggc caaggagaag gcucgagcca ugcgagucaa caagcgcgcg ccacagaugg 1080
acuggaacag gaagcgugaa aucuucagca acuucugagc cccuuccugc cugucucggg 1140
acccugggac cccucccgca cggaccuugg gccucagccu gccccgagcu cccccagccu 1200
caguggacug gagggugguc cugccauugc ccagaaauca gccccagccc cggugagccc 1260
ccauccugcc ccugcccacc agguacuggg ggccuguggc agcaagauag ggggagagag 1320
acccagagau gugagagaga gucagagaca gagacagaga gagagagaga gagacacaga 1380
gagagacaga gagagagcga gcgagcgcgc ggcagccgcg gggcgagggc cuuugcugcu 1440
cugccggggc cugcugacug aaaggaauuu guguuuuugc uuuuuuucca aaaagaucuc 1500
cagcuccaca cauguuucca cuuaauacca gagacccccc cccuuccccu cccccuuccc 1560
cucccccuug ggacgcgcuc uaaauaauug caauaaaaca aaccuuucuc ugcaaaccau 1620
uuccuccccg cccccucccc ucagcagcgg ccguccugag ugggaguccc ugggacuucc 1680
caguggccaa guuggggcgc ccagccucuu cguggggacc uuggguaagg ccagggaggc 1740
cugauguggc cguaggagcu gccccugccc accugcccug gugugggggu cccuaggcca 1800
cacccugcuc cccacccagc uacccugugc gccugugccc ugcugggggc cugggcucuc 1860
cgaggggccu gaggauggag gccccacguc cccgaggagg gcggccucug gacaggcccc 1920
ucauuccgcg cggcagcucc caggccuggg gaacguaggu gugugagagc ggcacccggg 1980
aaggacgccu ggccucuggc ucagcccugc uuggcgggcu cccccgugga cacccuguug 2040
acuuugcacu ucccucccgg gccccgcacc cccgaaccga ccaccgaucg accggcaccg 2100
cuguugccuc guaagccaua gcgcaugcgc gcucucagga uaaacaggcc cugccuggga 2160
<210> 4
<211> 1564
<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 4
gccgggugcc cagcgccgcc gccgcccccg agcucccccg cgccccugcc cgcgggcggc 60
cggugggcag cgggcgccau ggccgcgccg gagccgcugc ggccgcgccu gugccgcuug 120
gugcgcggag agcagggcua cggcuuccac cugcacggcg agaagggccg ccgcgggcag 180
uucauccggc gcguggaacc cgguuccccc gccgaggccg ccgcgcugcg cgcuggggac 240
cgccuggucg aggucaacgg cgucaacgug gagggcgaga cgcaccacca gguggugcaa 300
aggaucaagg cuguggaggg gcagacucgg cugcuggugg uggaccagga gacagaugag 360
gagcuccgcc ggcggcagcu gaccuguacc gaggagaugg cccagcgagg gcucccaccc 420
gcccacgacc ccugggagcc gaagccagac ugggcacaca ccggcagcca cagcuccgaa 480
gcuggcaaga aggaugucag ugggccccug agggagcugc gcccucggcu cugccaccug 540
cgaaagggac cucagggcua uggguucaac cugcauagug acaagucccg gcccggccag 600
uacauccgcu cuguggaccc gggcucaccu gccgcccgcu cuggccuccg cgcccaggac 660
cggcucauug aggugaacgg gcagaaugug gagggacugc gccaugcuga ggugguggcc 720
agcaucaagg cacgggagga cgaggcccgg cugcuggucg uggaccccga gacagaugaa 780
cacuucaagc ggcuucgggu cacacccacc gaggagcacg uggaaggucc ucugccguca 840
cccgucacca auggaaccag cccugcccag cucaauggug gcucugcgug cucgucccga 900
agugaccugc cugguuccga caaggacacu gaggagagcg gccuccaccu gagccccacg 960
gcggccgagg ccaaggagaa ggcucgagcc augcgaguca acaagcgcgc gccacagaug 1020
gacuggaaca ggaagcguga aaucuucagc aacuucugag ccccuuccug ccugucucgg 1080
gacccuggga ccccucccgc acggaccuug ggccucagcc ugccccgagc ucccccagcc 1140
ucaguggacu ggaggguggu ccugccauug cccagaaauc agccccagcc ccggugagcc 1200
cccauccugc cccugcccac cagguacugg gggccugugg cagcaagaua gggggagaga 1260
gacccagaga ugugagagag agucagagac agagacagag agagagagag agagacacag 1320
agagagacag agagagagcg agcgagcgcg cggcagccgc ggggcgaggg ccuuugcugc 1380
ucugccgggg ccugcugacu gaaaggaauu uguguuuuug cuuuuuuucc aaaaagaucu 1440
ccagcuccac acauguuucc acuuaauacc agagaccccc ccccuucccc ucccccuucc 1500
ccucccccuu gggacgcgcu cuaaauaauu gcaauaaaac aaaccuuucu cugcaaacca 1560
uuuc 1564
<210> 5
<211> 1037
<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 5
augugcugcc cggaaugugg gccacugacc cgcuccuauc gcccauucgc cccagguggu 60
gcaaaggauc aaggcugugg aggggcagac ucggcugcug gugguggacc aggagacaga 120
ugaggagcuc cgccggcggc agcugaccug uaccgaggag auggcccagc gagggcuccc 180
acccgcccac gaccccuggg agccgaagcc agacugggca cacaccggca gccacagcuc 240
cgaagcuggc aagaaggaug ucagugggcc ccugagggag cugcgcccuc ggcucugcca 300
ccugcgaaag ggaccucagg gcuauggguu caaccugcau agugacaagu cccggcccgg 360
ccaguacauc cgcucugugg acccgggcuc accugccgcc cgcucuggcc uccgcgccca 420
ggaccggcuc auugagguga acgggcagaa uguggaggga cugcgccaug cugagguggu 480
ggccagcauc aaggcacggg aggacgaggc ccggcugcug gucguggacc ccgagacaga 540
ugaacacuuc aagcggcuuc gggucacacc caccgaggag cacguggaag guccucugcc 600
gucacccguc accaauggaa ccagcccugc ccagcucaau gguggcucug cgugcucguc 660
ccgaagugac cugccugguu ccgacaagga cacugaggau ggcagugccu ggaagcaaga 720
ucccuuccag gagagcggcc uccaccugag ccccacggcg gccgaggcca aggagaaggc 780
ucgagccaug cgagucaaca agcgcgcgcc acagauggac uggaacagga agcgugaaau 840
cuucagcaac uucugagccc cuuccugccu gucucgggac ccugggaccc cucccgcacg 900
gaccuugggc cucagccugc cccgagcucc cccagccuca guggacugga gggugguccu 960
gccauugccc agaaaucagc cccagccccg gugagccccc auccugcccc ugcccaccag 1020
guacuggggg ccugugg 1037
<210> 6
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<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 6
agagaguuca ggccaccccg gccggacgcc ugccacuugc ugucacugug ccgcugucau 60
ggcacgcucc gggagugcca cgccaccugc ccgggcuccg ggagccccuc cacggagccc 120
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gcgaaaggga ccucagggcu auggguucaa ccugcauagu gacaaguccc ggcccggcca 240
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ccggcucauu gaggugaacg ggcagaaugu ggagggacug cgccaugcug aggugguggc 360
cagcaucaag gcacgggagg acgaggcccg gcugcugguc guggaccccg agacagauga 420
acacuucaag cggcuucggg ucacacccac cgaggagcac guggaagguc cucugccguc 480
acccgucacc aauggaacca gcccugccca gcucaauggu ggcucugcgu gcucgucccg 540
aagugaccug ccugguuccg acaaggacac ugaggauggc agugccugga agcaagaucc 600
cuuccaggag agcggccucc accugagccc cacggcggcc gaggccaagg agaaggcucg 660
agccaugcga gucaacaagc gcgcgccaca gauggacugg aacaggaagc gugaaaucuu 720
cagcaacuuc ugagccccuu ccugccuguc ucgggacccu gggaccccuc ccgcacggac 780
cuugggccuc agccugcccc gagcuccccc agccucagug gacuggaggg ugguccugcc 840
auugcccaga aaucagcccc agccccggug agcccccauc cugccccugc ccaccaggua 900
cugggggccu guggcagcaa gauaggggga gagagaccca gagaugugag agagagucag 960
agacagagac agagagagag agagagagac acagagagag acagagagag agcgagcgag 1020
cgcgcggcag ccgcggggcg agggccuuug cugcucugcc ggggccugcu gacugaaagg 1080
aauuuguguu uuugcuuuuu uuccaaaaag aucuccagcu ccacacaugu uuccacuuaa 1140
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aauugcaaua aaacaaaccu uucucugcaa accauuuccu ccccgccccc uccccucagc 1260
agcggccguc cugaguggga gucccuggga cuucccagug gccaaguugg ggcgcccagc 1320
cucuucgugg ggaccuuggg uaaggccagg gaggccugau guggccguag gagcugcccc 1380
ugcccaccug cccuggugug ggggucccua ggccacaccc ugcuccccac ccagcuaccc 1440
ugugcgccug ugcccugcug ggggccuggg cucuccgagg ggccugagga uggaggcccc 1500
acguccccga ggagggcggc cucuggacag gccccucauu ccgcgcggca gcucccaggc 1560
cuggggaacg uaggugugug agagcggcac ccgggaagga cgccuggccu cuggcucagc 1620
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<210> 7
<211> 1748
<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 7
agagaguuca ggccaccccg gccggacgcc ugccacuugc ugucacugug ccgcugucau 60
ggcacgcucc gggagugcca cgccaccugc ccgggcuccg ggagccccuc cacggagccc 120
accccagagg cugguacagg augucagugg gccccugagg gagcugcgcc cucggcucug 180
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gacacagaga gagacagaga gagagcgagc gagcgcgcgg cagccgcggg gcgagggccu 1020
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<212> RNA
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gcgaaaggga ccucagggcu auggguucaa ccugcauagu gacaaguccu ggcccggcca 240
guacauccgc ucuguggacc cgggcucacc ugccgcccgc ucuggccucc gcgcccagga 300
ccggcucauu gaggugaacg ggcagaaugu ggagggacug cgccaugcug aggugguggc 360
cagcaucaag gcacgggagg acgaggcccg gcugcugguc guggaccccg agacagauga 420
acacuucaag cggcuucggg ucacacccac cgaggagcac guggaagguc cucugccguc 480
acccgucacc aauggaacca gcccugccca gcucaauggu ggcucugcgu gcucgucccg 540
aagugaccug ccugguuccg acaaggacac ugaggauggc agugccugga agcaagaucc 600
cuuccaggag agcggccucc accugagccc cacggcggcc gaggccaagg agaaggcucg 660
agccaugcga gucaacaagc gcgcgccaca gauggacugg aacaggaagc gugaaaucuu 720
cagcaacuuc ugagccccuu ccugccuguc ucgggacccu gggaccccuc ccgcacggac 780
cuugggccuc agccugcccc gagcuccccc agccucagug gacuggaggg ugguccugcc 840
auugcccaga aaucagcccc agccccggug agcccccauc cugccccugc ccaccaggua 900
cugggggccu guggcagcaa gauaggggga gagagaccca gagaugugag agagagucag 960
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aauuuguguu uuugcuuuuu uuccaaaaag aucuccagcu ccacacaugu uuccacuuaa 1140
uaccagagac ccccccccuu ccccuccccc uuccccuccc ccuugggacg cgcucuaaau 1200
aauugcaaua aaacaaaccu uucucugcaa accauuuccu ccccgccccc uccccucagc 1260
agcggccguc cugaguggga gucccuggga cuucccagug gccaaguugg ggcgcccagc 1320
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ccugcuuggc gggcuccccc guggacaccc uguugacuuu gcacuucccu cccgggcccc 1680
gcacccccga accgaccacc gaucgaccgg caccgcuguu gccucguaag ccauagcgca 1740
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<210> 26
<211> 1748
<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 26
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ccaggaccgg cucauugagg ugaacgggca gaauguggag ggacugcgcc augcugaggu 360
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gucccgaagu gaccugccug guuccgacaa ggacacugag gagagcggcc uccaccugag 600
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gucucgggac ccugggaccc cucccgcacg gaccuugggc cucagccugc cccgagcucc 780
cccagccuca guggacugga gggugguccu gccauugccc agaaaucagc cccagccccg 840
gugagccccc auccugcccc ugcccaccag guacuggggg ccuguggcag caagauaggg 900
ggagagagac ccagagaugu gagagagagu cagagacaga gacagagaga gagagagaga 960
gacacagaga gagacagaga gagagcgagc gagcgcgcgg cagccgcggg gcgagggccu 1020
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cccuuccccu cccccuuggg acgcgcucua aauaauugca auaaaacaaa ccuuucucug 1200
caaaccauuu ccuccccgcc cccuccccuc agcagcggcc guccugagug ggagucccug 1260
ggacuuccca guggccaagu uggggcgccc agccucuucg uggggaccuu ggguaaggcc 1320
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<212> RNA
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ggggccugug gcagcaagau agggggagag agacccagag augugagaga gagucagaga 1260
cagagacaga gagagagaga gagagacaca gagagagaca gagagagagc gagcgagcgc 1320
gcggcagccg cggggcgagg gccuuugcug cucugccggg gccugcugac ugaaaggaau 1380
uuguguuuuu gcuuuuuuuc caaaaagauc uccagcucca cacauguuuc cacuuaauac 1440
cagagacccc ccccuucccc ucccccuucc ccucccccuu gggacgcgcu cuaaauaauu 1500
gcaauaaaac aaaccuuucu cugc 1524
<210> 34
<211> 1357
<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 34
auggccgcgc cggagccgcu gcggccgcgc cugugccgcu uggugcgcgg agagcagggc 60
uacggcuucc accugcacgg cgagaagggc cgccgcgggc aguucauccg gcgcguggaa 120
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ggcgucaacg uggagggcga gacgcaccac cagguggugc aaaggaucaa ggcuguggag 240
gggcagacuc ggcugcuggu gguggaccag gagacagaug aggagcuccg ccggcggcag 300
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<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 35
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<212> RNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 36
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<400> 39
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acccgcccac gacccctggg agccgaagcc agactgggca cacaccggca gccacagctc 240
cgaagctggc aagaaggatg tcagtgggcc cctgagggag ctgcgccctc ggctctgcca 300
cctgcgaaag ggacctcagg gctatgggtt caacctgcat agtgacaagt cccggcccgg 360
ccagtacatc cgctctgtgg acccgggctc acctgccgcc cgctctggcc tccgcgccca 420
ggaccggctc attgaggtga acgggcagaa tgtggaggga ctgcgccatg ctgaggtggt 480
ggccagcatc aaggcacggg aggacgaggc ccggctgctg gtcgtggacc ccgagacaga 540
tgaacacttc aagcggcttc gggtcacacc caccgaggag cacgtggaag gtcctctgcc 600
gtcacccgtc accaatggaa ccagccctgc ccagctcaat ggtggctctg cgtgctcgtc 660
ccgaagtgac ctgcctggtt ccgacaagga cactgaggat ggcagtgcct ggaagcaaga 720
tcccttccag gagagcggcc tccacctgag ccccacggcg gccgaggcca aggagaaggc 780
tcgagccatg cgagtcaaca agcgcgcgcc acagatggac tggaacagga agcgtgaaat 840
cttcagcaac ttctgagccc cttcctgcct gtctcgggac cctgggaccc ctcccgcacg 900
gaccttgggc ctcagcctgc cccgagctcc cccagcctca gtggactgga gggtggtcct 960
gccattgccc agaaatcagc cccagccccg gtgagccccc atcctgcccc tgcccaccag 1020
gtactggggg cctgtgg 1037
<210> 43
<211> 1775
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 43
agagagttca ggccaccccg gccggacgcc tgccacttgc tgtcactgtg ccgctgtcat 60
ggcacgctcc gggagtgcca cgccacctgc ccgggctccg ggagcccctc cacggagccc 120
accccagagg ctggatgtca gtgggcccct gagggagctg cgccctcggc tctgccacct 180
gcgaaaggga cctcagggct atgggttcaa cctgcatagt gacaagtccc ggcccggcca 240
gtacatccgc tctgtggacc cgggctcacc tgccgcccgc tctggcctcc gcgcccagga 300
ccggctcatt gaggtgaacg ggcagaatgt ggagggactg cgccatgctg aggtggtggc 360
cagcatcaag gcacgggagg acgaggcccg gctgctggtc gtggaccccg agacagatga 420
acacttcaag cggcttcggg tcacacccac cgaggagcac gtggaaggtc ctctgccgtc 480
acccgtcacc aatggaacca gccctgccca gctcaatggt ggctctgcgt gctcgtcccg 540
aagtgacctg cctggttccg acaaggacac tgaggatggc agtgcctgga agcaagatcc 600
cttccaggag agcggcctcc acctgagccc cacggcggcc gaggccaagg agaaggctcg 660
agccatgcga gtcaacaagc gcgcgccaca gatggactgg aacaggaagc gtgaaatctt 720
cagcaacttc tgagcccctt cctgcctgtc tcgggaccct gggacccctc ccgcacggac 780
cttgggcctc agcctgcccc gagctccccc agcctcagtg gactggaggg tggtcctgcc 840
attgcccaga aatcagcccc agccccggtg agcccccatc ctgcccctgc ccaccaggta 900
ctgggggcct gtggcagcaa gataggggga gagagaccca gagatgtgag agagagtcag 960
agacagagac agagagagag agagagagac acagagagag acagagagag agcgagcgag 1020
cgcgcggcag ccgcggggcg agggcctttg ctgctctgcc ggggcctgct gactgaaagg 1080
aatttgtgtt tttgcttttt ttccaaaaag atctccagct ccacacatgt ttccacttaa 1140
taccagagac cccccccctt cccctccccc ttcccctccc ccttgggacg cgctctaaat 1200
aattgcaata aaacaaacct ttctctgcaa accatttcct ccccgccccc tcccctcagc 1260
agcggccgtc ctgagtggga gtccctggga cttcccagtg gccaagttgg ggcgcccagc 1320
ctcttcgtgg ggaccttggg taaggccagg gaggcctgat gtggccgtag gagctgcccc 1380
tgcccacctg ccctggtgtg ggggtcccta ggccacaccc tgctccccac ccagctaccc 1440
tgtgcgcctg tgccctgctg ggggcctggg ctctccgagg ggcctgagga tggaggcccc 1500
acgtccccga ggagggcggc ctctggacag gcccctcatt ccgcgcggca gctcccaggc 1560
ctggggaacg taggtgtgtg agagcggcac ccgggaagga cgcctggcct ctggctcagc 1620
cctgcttggc gggctccccc gtggacaccc tgttgacttt gcacttccct cccgggcccc 1680
gcacccccga accgaccacc gatcgaccgg caccgctgtt gcctcgtaag ccatagcgca 1740
tgcgcgctct caggataaac aggccctgcc tggga 1775
<210> 44
<211> 1748
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 44
agagagttca ggccaccccg gccggacgcc tgccacttgc tgtcactgtg ccgctgtcat 60
ggcacgctcc gggagtgcca cgccacctgc ccgggctccg ggagcccctc cacggagccc 120
accccagagg ctggtacagg atgtcagtgg gcccctgagg gagctgcgcc ctcggctctg 180
ccacctgcga aagggacctc agggctatgg gttcaacctg catagtgaca agtcccggcc 240
cggccagtac atccgctctg tggacccggg ctcacctgcc gcccgctctg gcctccgcgc 300
ccaggaccgg ctcattgagg tgaacgggca gaatgtggag ggactgcgcc atgctgaggt 360
ggtggccagc atcaaggcac gggaggacga ggcccggctg ctggtcgtgg accccgagac 420
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gccgtcaccc gtcaccaatg gaaccagccc tgcccagctc aatggtggct ctgcgtgctc 540
gtcccgaagt gacctgcctg gttccgacaa ggacactgag gagagcggcc tccacctgag 600
ccccacggcg gccgaggcca aggagaaggc tcgagccatg cgagtcaaca agcgcgcgcc 660
acagatggac tggaacagga agcgtgaaat cttcagcaac ttctgagccc cttcctgcct 720
gtctcgggac cctgggaccc ctcccgcacg gaccttgggc ctcagcctgc cccgagctcc 780
cccagcctca gtggactgga gggtggtcct gccattgccc agaaatcagc cccagccccg 840
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ggagagagac ccagagatgt gagagagagt cagagacaga gacagagaga gagagagaga 960
gacacagaga gagacagaga gagagcgagc gagcgcgcgg cagccgcggg gcgagggcct 1020
ttgctgctct gccggggcct gctgactgaa aggaatttgt gtttttgctt tttttccaaa 1080
aagatctcca gctccacaca tgtttccact taataccaga gacccccccc cttcccctcc 1140
cccttcccct cccccttggg acgcgctcta aataattgca ataaaacaaa cctttctctg 1200
caaaccattt cctccccgcc ccctcccctc agcagcggcc gtcctgagtg ggagtccctg 1260
ggacttccca gtggccaagt tggggcgccc agcctcttcg tggggacctt gggtaaggcc 1320
agggaggcct gatgtggccg taggagctgc ccctgcccac ctgccctggt gtgggggtcc 1380
ctaggccaca ccctgctccc cacccagcta ccctgtgcgc ctgtgccctg ctgggggcct 1440
gggctctccg aggggcctga ggatggaggc cccacgtccc cgaggagggc ggcctctgga 1500
caggcccctc attccgcgcg gcagctccca ggcctgggga acgtaggtgt gtgagagcgg 1560
cacccgggaa ggacgcctgg cctctggctc agccctgctt ggcgggctcc cccgtggaca 1620
ccctgttgac tttgcacttc cctcccgggc cccgcacccc cgaaccgacc accgatcgac 1680
cggcaccgct gttgcctcgt aagccatagc gcatgcgcgc tctcaggata aacaggccct 1740
gcctggga 1748
<210> 45
<211> 1781
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 45
agagagttca ggccaccccg gccggacgcc tgccacttgc tgtcactgtg ccgctgtcat 60
ggcacgctcc gggagtgcca cgccacctgc ccgggctccg ggagcccctc cacggagccc 120
accccagagg ctggtacagg atgtcagtgg gcccctgagg gagctgcgcc ctcggctctg 180
ccacctgcga aagggacctc agggctatgg gttcaacctg catagtgaca agtcccggcc 240
cggccagtac atccgctctg tggacccggg ctcacctgcc gcccgctctg gcctccgcgc 300
ccaggaccgg ctcattgagg tgaacgggca gaatgtggag ggactgcgcc atgctgaggt 360
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aatcttcagc aacttctgag ccccttcctg cctgtctcgg gaccctggga cccctcccgc 780
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cccagcctct tcgtggggac cttgggtaag gccagggagg cctgatgtgg ccgtaggagc 1380
tgcccctgcc cacctgccct ggtgtggggg tccctaggcc acaccctgct ccccacccag 1440
ctaccctgtg cgcctgtgcc ctgctggggg cctgggctct ccgaggggcc tgaggatgga 1500
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ctcagccctg cttggcgggc tcccccgtgg acaccctgtt gactttgcac ttccctcccg 1680
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agcgcatgcg cgctctcagg ataaacaggc cctgcctggg a 1781
<210> 46
<211> 1600
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 46
gccgccgctg aagccaccgc cgggtgccca gcgccgccgc cgcccccgag ctcccccgcg 60
cccctgcccg cgggcggccg gtgggcagcg ggcgccatgg ccgcgccgga gccgctgcgg 120
ccgcgcctgt gccgcttggt gcgcggagag cagggctacg gcttccacct gcacggcgag 180
aagggccgcc gcgggcagtt catccggcgc gtggaacccg gttcccccgc cgaggccgcc 240
gcgctggctg gggaccgcct ggtcgaggtc aacggcgtca acgtggaggg cgagacgcac 300
caccaggtgg tgcaaaggat caaggctgtg gaggggcaga ctcggctgct ggtggtggac 360
caggagacag atgaggagct ccgccggcgg cagctgacct gtaccgagga gatggcccag 420
cgagggctcc cacccgccca cgacccctgg gagccgaagc cagactgggc acacaccggc 480
agccacagct ccgaagctgg caagaaggat gtcagtgggc ccctgaggga gctgcgccct 540
cggctctgcc acctgcgaaa gggacctcag ggctatgggt tcaacctgca tagtgacaag 600
tcccggcccg gccagtacat ccgctctgtg gacccgggct cacctgccgc ccgctctggc 660
ctccgcgccc aggaccggct cattgaggtg aacgggcaga atgtggaggg actgcgccat 720
gctgaggtgg tggccagcat caaggcacgg gaggacgagg cccggctgct ggtcgtggac 780
cccgagacag atgaacactt caagcggctt cgggtcacac ccaccgagga gcacgtggaa 840
ggtcctctgc cgtcacccgt caccaatgga accagccctg cccagctcaa tggtggctct 900
gcgtgctcat cccgaagtga cctgcctggt tccgacaagg acactgagga tggcagtgcc 960
tggaagcaag atcccttcca ggagagcggc ctccacctga gccccacggc ggccgaggca 1020
aggagaaggc tcgagccatg cgagtcaaca agcgcgcgcc acagatggac tggaacagga 1080
agcgtgaaat cttcagcaac ttctgagccc cttcctgcct gtctcgggac cctgggaccc 1140
ctcccgcacg gaccttgggc ctcagcctgc cccgagctcc cccagcctca gtggactgga 1200
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<210> 47
<211> 738
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 47
gcagccacag ctccgaagct ggcaagaagg atgtcagtgg gcccctgagg gagctgcgcc 60
ctcggctctg ccacctgcga aagggacctc agggctatgg gttcaacctg catagtgaca 120
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accccgagac agatgaacac ttcaagcggc ttcgggtcac acccaccgag gagcacgtgg 360
aaggtcctct gccgtcaccc gtcaccaatg gaaccagccc tgcccagctc aatggtggct 420
ctgcgtgctc gtcccgaagt gacctgcctg gttccgacaa ggacactgag gaggggccac 480
cgtctggggt gtgggactag ggctcactcc agacacccca cccaccgtgc tcaccccagg 540
atggcagtgc ctggaagcaa gatcccttcc aggagagcgg cctccacctg agccccacgg 600
cggccgaggc caaggagaag gctcgagcca tgcgagtcaa caagcgcgcg ccacagatgg 660
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accctgggac ccctcccg 738
<210> 48
<211> 578
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 48
agagagatgg aagcggccgg ccgggcggga gcctgaagca gccttaccca ggaattgcag 60
gggttggggt ggcgagcagt cgcggcgcct cagcctaagt ggcttttagg ggcagctgcc 120
gggatatggg cacccagggg gccatggccc aggaggctgc ccagaggcga gccctgtgct 180
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ctgggaacca ggtggtgcaa aggatcaagg ctgtggaggg gcagactcgg ctgctggtgg 360
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ccggcagcca cagctccgaa gctggcaaga aggatgtcag tgggcccctg agggagctgc 540
gccctcggct ctgccacctg cgaaagggac ctcagggc 578
<210> 49
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<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 49
gacgggagcc gaacatgagc cgccgctgaa gccaccgcgg ggtgcccagc gccgccgccg 60
cccccgagct cccccgcgcc cctgcccgcg ggcggccggt gggcagcggg cgccatggcc 120
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aacgtggagg gcgagacgca ccaccaggtg gtgcaaagga tcaaggctgt ggaggggcag 360
actcggctgc tggtggtgga ccaggagaca gatgaggagc tccgccggcg gcagctgacc 420
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ccagactggg cacacaccgg cagccacagc tccgaagctg gcaagaagga tgtcagtggg 540
cccctgaggg agctgcgccc tcggctctgc cacctgcgaa agggacctca gggctatggg 600
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tcacctgccg cccgctctgg cctccgcgcc caggaccggc tcattgaggt gaacgggcag 720
aatgtggagg gactgcgcca tgctgaggtg gtggccagca tcaaggcacg ggaggacgag 780
gcccggctgc tggtcgtgga ccccgagaca gatgaacact tcaagcggct tcgggtcaca 840
cccaccgagg agcacgtgga aggtcctctg ccgtcacccg tcaccaatgg aaccagccct 900
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ccacagatgg actggaacag gaagcgtgaa atcttcagca acttctgagc cccttcctgc 1140
ctgtctcggg accctgggac ccctcccgca cggaccttgg gcctcagcct gccccgagct 1200
cccccagcct cagtggactg gagggtggtc ctgccattgc ccagaaatca gccccagccc 1260
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gagacacaga gagagacaga gagagagcga gcgagcgcgc ggcagccgcg gggcgagggc 1440
ctttgctgct ctgccggggc ctgctgactg aaaggaattt gtgtttttgc tttttttcca 1500
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aaaaaaaa 1628
<210> 50
<211> 1639
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 50
gggagccgaa caggagccgc cgctgaagcc accgccgggt gcccagcgcc gccgccgccc 60
ccgagctccc ccgcgcccct gcccgcgggc ggccggtggg cagcgggcgc catggccgcg 120
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gtggagggac tgcgccatgc tgaggtggtg gccagcatca aggcacggga ggacgaggcc 780
cggctgctgg tcgtggaccc cgagacagat gaacacttca agcggcttcg ggtcacaccc 840
accgaggagc acgtggaagg tcctctgccg tcacccgtca ccaatggaac cagccctgcc 900
cagctcaatg gtggctctgc gtgctcgtcc cgaagtgacc tgcctggttc cgacaaggac 960
actgaggatg gcagtgcctg gaagcaagat cccttccagg agagcggcct ccacctgagc 1020
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cagatggact ggaacaggaa gcgtgaaatc ttcagcaact tctgagcccc ttcctgcctg 1140
tctcgggacc ctgggacccc tcccgcacgg accttgggcc tcagcctgcc ccgagctccc 1200
ccagcctcag tggactggag ggtggtcctg ccattgccca gaaatcagcc ccagccccgg 1260
tgagccccca tcctgcccct gcccaccagg tactgggggc ctgtggcagc aagatagggg 1320
gagagagacc cagagatgtg agagagagtc agagacagag acagagagag agagagagag 1380
acacagagag agacagagag agagcgagcg agcgcgcggc agccgcgggg cgagggcctt 1440
tgctgctctg ccggggcctg ctgactgaaa ggaatttgtg tttttgcttt ttttccaaaa 1500
agatctccag ctccacacat gtttccactt aataccagag accccccccc cttcccctcc 1560
cccttcccct cccccttggg acgcgctcta aataattgca ataaaacaaa cctttctctg 1620
caaaaaaaaa aaaaaaaaa 1639
<210> 51
<211> 1622
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 51
gccgaacagg agccgccgct gaagccaccg ccgggtgccc agcgccgccg ccgcccccga 60
gctcccccgc gcccctgccc gcgggcggcc ggtgggcagc gggcgccatg gccgcgccgg 120
agccgctgcg gccgcgcctg tgccgcttgg tgcgcggaga gcagggctac ggcttccacc 180
tgcacggcga gaagggccgc cgcgggcagt tcatccggcg cgtggaaccc ggttcccccg 240
ccgaggccgc cgcgctgcgc gctggggacc gcctggtcga ggtcaacggc gtcaacgtgg 300
agggcgagac gcaccaccag gtggtgcaaa ggatcaaggc tgtggagggg cagactcggc 360
tgctggtggt ggaccaggag acagatgagg agctccgccg gcggcagctg acctgtaccg 420
aggagatggc ccagcgaggg ctcccacccg cccacgaccc ctgggagccg aagccagact 480
gggcacacac cggcagccac agctccgaag ctggcaagaa ggatgtcagt gggcccctga 540
gggagctgcg ccctcggctc tgccacctgc gaaagggacc tcagggctat gggttcaacc 600
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ccgcccgctc tggcctccgc gcccaggacc ggctcattga ggtgaacggg cagaatgtgg 720
agggactgcg ccatgctgag gtggtggcca gcatcaaggc acgggaggac gaggcccggc 780
tgctggtcgt ggaccccgag acagatgaac acttcaagcg gcttcgggtc acacccaccg 840
aggagcacgt ggaaggtcct ctgccgtcac ccgtcaccaa tggaaccagc cctgcccagc 900
tcaatggtgg ctctgcgtgc tcgtcccgaa gtgacctgcc tggttccgac aaggacactg 960
aggatggcag tgcctggaag caagatccct tccaggagag cggcctccac ctgagcccca 1020
cggcggccga ggccaaggag aaggctcgag ccatgcgagt caacaagcgc gcgccacaga 1080
tggactggaa caggaagcgt gaaatcttca gcaacttctg agccccttcc tgcctgtctc 1140
gggaccctgg gacccctccc gcacggacct tgggcctcag cctgccccga gctcccccag 1200
cctcagtgga ctggagggtg gtcctgccat tgcccagaaa tcagccccag ccccggtgag 1260
cccccatcct gcccctgccc accaggtact gggggcctgt ggcagcaaga tagggggaga 1320
gagacccaga gatgtgagag agagtcagag acagagacag agagagagag agagagacac 1380
agagagagac agagagagag cgagcgagcg cgcggcagcc gcggggcgag ggcctttgct 1440
gctctgccgg ggcctgctga ctgaaaggaa tttgtgtttt tgcttttttt ccaaaaagat 1500
ctccagctcc acacatgttt ccacttaata ccagagaccc ccccccttcc cctccccctt 1560
gggacgcgct ctaaataatt gcaataaaac aaacctttct ctgcaaaaaa aaaaaaaaaa 1620
aa 1622
<210> 52
<211> 1524
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 52
gtgggcagcg ggcgccatgg ccgcgccgga gccgctgcgg ccgcgcctgt gccgcttggt 60
gcgcggagag cagggctacg gcttccacct gcacggcgag aagggccgcc gcgggcagtt 120
catccggcgc gtggaacccg gttcccccgc cgaggccgcc gcgctgcgcg ctggggaccg 180
cctggtcgag gtcaacggcg tcaacgtgga gggcgagacg caccaccagg tggtgcaaag 240
gatcaaggct gtggaggggc agactcggct gctggtggtg gaccaggaga cagatgagga 300
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ccacgacccc tgggagccga agccagactg ggcacacacc ggcagccaca gctccgaagc 420
tggcaagaag gatgtcagtg ggcccctgag ggagctgcgc cctcggctct gccacctgcg 480
aaagggacct cagggctatg ggttcaacct gcatagtgac aagtcccggc ccggccagta 540
catccgctct gtggacccgg gctcacctgc cgcccgctct ggcctccgcg cccaggaccg 600
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catcaaggca cgggaggacg aggcccggct gctggtcgtg gaccccgaga cagatgaaca 720
cttcaagcgg cttcgggtca cacccaccga ggagcacgtg gaaggtcctc tgccgtcacc 780
cgtcaccaat ggaaccagcc ctgcccagct caatggtggc tctgcgtgct catcccgaag 840
tgacctgcct ggttccgaca aggacactga ggatggcagt gcctggaagc aagatccctt 900
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catgcgagtc aacaagcgcg cgccacagat ggactggaac aggaagcgtg aaatcttcag 1020
caacttctga gccccttcct gcctgtctcg ggaccctggg acccctcccg cacggacctt 1080
gggcctcagc ctgccccgag ctcccccagc ctcagtggac tggagggtgg tcctgccatt 1140
gcccagaaat cagccccagc cccggtgagc ccccatcctg cccctgccca ccaggtactg 1200
ggggcctgtg gcagcaagat agggggagag agacccagag atgtgagaga gagtcagaga 1260
cagagacaga gagagagaga gagagacaca gagagagaca gagagagagc gagcgagcgc 1320
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ttgtgttttt gctttttttc caaaaagatc tccagctcca cacatgtttc cacttaatac 1440
cagagacccc ccccttcccc tcccccttcc cctccccctt gggacgcgct ctaaataatt 1500
gcaataaaac aaacctttct ctgc 1524
<210> 53
<211> 1357
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 53
atggccgcgc cggagccgct gcggccgcgc ctgtgccgct tggtgcgcgg agagcagggc 60
tacggcttcc acctgcacgg cgagaagggc cgccgcgggc agttcatccg gcgcgtggaa 120
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ctgacctgta ccgaggagat ggcccagcga gggctcccac ccgcccacga cccctgggag 360
ccgaagccag actgggcaca caccggcagc cacagctccg aagctggcaa gaaggatgtc 420
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<210> 54
<211> 2194
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 54
ggagcccgag ccggatcccg aggcgacggg agccgaacag gagccgccgc tgaagccacc 60
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tggggaacgt aggtgtgtga gagcggcacc cgggaaggac gcctggcctc tggctcagcc 2040
ctgcttggcg ggctcccccg tggacaccct gttgactttg cacttccctc ccgggccccg 2100
cacccccgaa ccgaccaccg atcgaccggc accgctgttg cctcgtaagc catagcgcat 2160
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<210> 55
<211> 2127
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 55
gaacaggagc cgccgctgaa gccaccgccg ggtgcccagc gccgccgccg cccccgagct 60
cccccgcgcc cctgcccgcg ggcggccggt gggcagcggg cgccatggcc gcgccggagc 120
cgctgcggcc gcgcctgtgc cgcttggtgc gcggagagca gggctacggc ttccacctgc 180
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aggccgccgc gctgcgcgct ggggaccgcc tggtcgaggt caacggcgtc aacgtggagg 300
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agatggccca gcgagggctc ccacccgccc acgacccctg ggagccgaag ccagactggg 480
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cccgctctgg cctccgcgcc caggaccggc tcattgaggt gaacgggcag aatgtggagg 720
gactgcgcca tgctgaggtg gtggccagca tcaaggcacg ggaggacgag gcccggctgc 780
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atggtggctc tgcgtgctcg tcccgaagtg acctgcctgg ttccgacaag gacactgagg 960
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tctgagcccc ttcctgcctg tctcgggacc ctgggacccc tcccgcacgg accttgggcc 1140
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tgtgccctgc tgggggcctg ggctctccga ggggcctgag gatggaggcc ccacgtcccc 1860
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ctcaggataa acaggccctg cctggga 2127
<210> 56
<211> 1578
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 56
gaattcggca cgagccgggt gcccagcgcc gccgccgccc ccgagctccc ccgcgcccct 60
gcccgcgggc ggccggtggg cagcgggcgc catggccgcg ccggagccgc tgcggccgcg 120
cctgtgccgc ttggtgcgcg gagagcaggg ctacggcttc cacctgcacg gcgagaaggg 180
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gcgcgctggg gaccgcctgg tcgaggtcaa cggcgtcaac gtggagggcg agacgcacca 300
ccaggtggtg caaaggatca aggctgtgga ggggcagact cggctgctgg tggtggacca 360
ggagacagat gaggagctcc gccggcggca gctgacctgt accgaggaga tggcccagcg 420
agggctccca cccgcccacg acccctggga gccgaagcca gactgggcac acaccggcag 480
ccacagctcc gaagctggca agaaggatgt cagtgggccc ctgagggagc tgcgccctcg 540
gctctgccac ctgcgaaagg gacctcaggg ctatgggttc aacctgcata gtgacaagtc 600
ccggcccggc cagtacatcc gctctgtgga cccgggctca cctgccgccc gctctggcct 660
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cgagacagat gaacacttca agcggcttcg ggtcacaccc accgaggagc acgtggaagg 840
tcctctgccg tcacccgtca ccaatggaac cagccctgcc cagctcaatg gtggctctgc 900
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<210> 57
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<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 57
agataagtgg ggtggcagcc tgggtcggcc agagagttca ggccaccccg gccggacgcc 60
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<210> 58
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<400> 58
tggggtggca gcctgggtcg gccagagagt tcaggccacc ccggccggac gcctgccact 60
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acggcgagaa gggccgccgc gggcagttca tccggcgcgt ggaacccggt tcccccgccg 240
aggccgccgc gctgcgcgct ggggaccgcc tggtcgaggt caacggcgtc aacgtggagg 300
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cacacaccgg cagccacagc tccgaagctg gcaagaagga tgtcagtggg cccctgaggg 540
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gactgcgcca tgctgaggtg gtggccagca tcaaggcacg ggaggacgag gcccggctgc 780
tggtcgtgga ccccgagaca gatgaacact tcaagcggct tcgggtcaca cccaccgagg 840
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atggcagtgc ctggaagcaa gatcccttcc aggagagcgg cctccacctg agccccacgg 1020
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<211> 1564
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 60
gccgggtgcc cagcgccgcc gccgcccccg agctcccccg cgcccctgcc cgcgggcggc 60
cggtgggcag cgggcgccat ggccgcgccg gagccgctgc ggccgcgcct gtgccgcttg 120
gtgcgcggag agcagggcta cggcttccac ctgcacggcg agaagggccg ccgcgggcag 180
ttcatccggc gcgtggaacc cggttccccc gccgaggccg ccgcgctgcg cgctggggac 240
cgcctggtcg aggtcaacgg cgtcaacgtg gagggcgaga cgcaccacca ggtggtgcaa 300
aggatcaagg ctgtggaggg gcagactcgg ctgctggtgg tggaccagga gacagatgag 360
gagctccgcc ggcggcagct gacctgtacc gaggagatgg cccagcgagg gctcccaccc 420
gcccacgacc cctgggagcc gaagccagac tgggcacaca ccggcagcca cagctccgaa 480
gctggcaaga aggatgtcag tgggcccctg agggagctgc gccctcggct ctgccacctg 540
cgaaagggac ctcagggcta tgggttcaac ctgcatagtg acaagtcctg gcccggccag 600
tacatccgct ctgtggaccc gggctcacct gccgcccgct ctggcctccg cgcccaggac 660
cggctcattg aggtgaacgg gcagaatgtg gagggactgc gccatgctga ggtggtggcc 720
agcatcaagg cacgggagga cgaggcccgg ctgctggtcg tggaccccga gacagatgaa 780
cacttcaagc ggcttcgggt cacacccacc gaggagcacg tggaaggtcc tctgccgtca 840
cccgtcacca atggaaccag ccctgcccag ctcaatggtg gctctgcgtg ctcgtcccga 900
agtgacctgc ctggttccga caaggacact gaggagagcg gcctccacct gagccccacg 960
gcggccgagg ccaaggagaa ggctcgagcc atgcgagtca acaagcgcgc gccacagatg 1020
gactggaaca ggaagcgtga aatcttcagc aacttctgag ccccttcctg cctgtctcgg 1080
gaccctggga cccctcccgc acggaccttg ggcctcagcc tgccccgagc tcccccagcc 1140
tcagtggact ggagggtggt cctgccattg cccagaaatc agccccagcc ccggtgagcc 1200
cccatcctgc ccctgcccac caggtactgg gggcctgtgg cagcaagata gggggagaga 1260
gacccagaga tgtgagagag agtcagagac agagacagag agagagagag agagacacag 1320
agagagacag agagagagcg agcgagcgcg cggcagccgc ggggcgaggg cctttgctgc 1380
tctgccgggg cctgctgact gaaaggaatt tgtgtttttg ctttttttcc aaaaagatct 1440
ccagctccac acatgtttcc acttaatacc agagaccccc ccccttcccc tcccccttcc 1500
cctccccctt gggacgcgct ctaaataatt gcaataaaac aaacctttct ctgcaaacca 1560
tttc 1564
<210> 61
<211> 1037
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 61
atgtgctgcc cggaatgtgg gccactgacc cgctcctatc gcccattcgc cccaggtggt 60
gcaaaggatc aaggctgtgg aggggcagac tcggctgctg gtggtggacc aggagacaga 120
tgaggagctc cgccggcggc agctgacctg taccgaggag atggcccagc gagggctccc 180
acccgcccac gacccctggg agccgaagcc agactgggca cacaccggca gccacagctc 240
cgaagctggc aagaaggatg tcagtgggcc cctgagggag ctgcgccctc ggctctgcca 300
cctgcgaaag ggacctcagg gctatgggtt caacctgcat agtgacaagt cctggcccgg 360
ccagtacatc cgctctgtgg acccgggctc acctgccgcc cgctctggcc tccgcgccca 420
ggaccggctc attgaggtga acgggcagaa tgtggaggga ctgcgccatg ctgaggtggt 480
ggccagcatc aaggcacggg aggacgaggc ccggctgctg gtcgtggacc ccgagacaga 540
tgaacacttc aagcggcttc gggtcacacc caccgaggag cacgtggaag gtcctctgcc 600
gtcacccgtc accaatggaa ccagccctgc ccagctcaat ggtggctctg cgtgctcgtc 660
ccgaagtgac ctgcctggtt ccgacaagga cactgaggat ggcagtgcct ggaagcaaga 720
tcccttccag gagagcggcc tccacctgag ccccacggcg gccgaggcca aggagaaggc 780
tcgagccatg cgagtcaaca agcgcgcgcc acagatggac tggaacagga agcgtgaaat 840
cttcagcaac ttctgagccc cttcctgcct gtctcgggac cctgggaccc ctcccgcacg 900
gaccttgggc ctcagcctgc cccgagctcc cccagcctca gtggactgga gggtggtcct 960
gccattgccc agaaatcagc cccagccccg gtgagccccc atcctgcccc tgcccaccag 1020
gtactggggg cctgtgg 1037
<210> 62
<211> 1775
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 62
agagagttca ggccaccccg gccggacgcc tgccacttgc tgtcactgtg ccgctgtcat 60
ggcacgctcc gggagtgcca cgccacctgc ccgggctccg ggagcccctc cacggagccc 120
accccagagg ctggatgtca gtgggcccct gagggagctg cgccctcggc tctgccacct 180
gcgaaaggga cctcagggct atgggttcaa cctgcatagt gacaagtcct ggcccggcca 240
gtacatccgc tctgtggacc cgggctcacc tgccgcccgc tctggcctcc gcgcccagga 300
ccggctcatt gaggtgaacg ggcagaatgt ggagggactg cgccatgctg aggtggtggc 360
cagcatcaag gcacgggagg acgaggcccg gctgctggtc gtggaccccg agacagatga 420
acacttcaag cggcttcggg tcacacccac cgaggagcac gtggaaggtc ctctgccgtc 480
acccgtcacc aatggaacca gccctgccca gctcaatggt ggctctgcgt gctcgtcccg 540
aagtgacctg cctggttccg acaaggacac tgaggatggc agtgcctgga agcaagatcc 600
cttccaggag agcggcctcc acctgagccc cacggcggcc gaggccaagg agaaggctcg 660
agccatgcga gtcaacaagc gcgcgccaca gatggactgg aacaggaagc gtgaaatctt 720
cagcaacttc tgagcccctt cctgcctgtc tcgggaccct gggacccctc ccgcacggac 780
cttgggcctc agcctgcccc gagctccccc agcctcagtg gactggaggg tggtcctgcc 840
attgcccaga aatcagcccc agccccggtg agcccccatc ctgcccctgc ccaccaggta 900
ctgggggcct gtggcagcaa gataggggga gagagaccca gagatgtgag agagagtcag 960
agacagagac agagagagag agagagagac acagagagag acagagagag agcgagcgag 1020
cgcgcggcag ccgcggggcg agggcctttg ctgctctgcc ggggcctgct gactgaaagg 1080
aatttgtgtt tttgcttttt ttccaaaaag atctccagct ccacacatgt ttccacttaa 1140
taccagagac cccccccctt cccctccccc ttcccctccc ccttgggacg cgctctaaat 1200
aattgcaata aaacaaacct ttctctgcaa accatttcct ccccgccccc tcccctcagc 1260
agcggccgtc ctgagtggga gtccctggga cttcccagtg gccaagttgg ggcgcccagc 1320
ctcttcgtgg ggaccttggg taaggccagg gaggcctgat gtggccgtag gagctgcccc 1380
tgcccacctg ccctggtgtg ggggtcccta ggccacaccc tgctccccac ccagctaccc 1440
tgtgcgcctg tgccctgctg ggggcctggg ctctccgagg ggcctgagga tggaggcccc 1500
acgtccccga ggagggcggc ctctggacag gcccctcatt ccgcgcggca gctcccaggc 1560
ctggggaacg taggtgtgtg agagcggcac ccgggaagga cgcctggcct ctggctcagc 1620
cctgcttggc gggctccccc gtggacaccc tgttgacttt gcacttccct cccgggcccc 1680
gcacccccga accgaccacc gatcgaccgg caccgctgtt gcctcgtaag ccatagcgca 1740
tgcgcgctct caggataaac aggccctgcc tggga 1775
<210> 63
<211> 1748
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 63
agagagttca ggccaccccg gccggacgcc tgccacttgc tgtcactgtg ccgctgtcat 60
ggcacgctcc gggagtgcca cgccacctgc ccgggctccg ggagcccctc cacggagccc 120
accccagagg ctggtacagg atgtcagtgg gcccctgagg gagctgcgcc ctcggctctg 180
ccacctgcga aagggacctc agggctatgg gttcaacctg catagtgaca agtcctggcc 240
cggccagtac atccgctctg tggacccggg ctcacctgcc gcccgctctg gcctccgcgc 300
ccaggaccgg ctcattgagg tgaacgggca gaatgtggag ggactgcgcc atgctgaggt 360
ggtggccagc atcaaggcac gggaggacga ggcccggctg ctggtcgtgg accccgagac 420
agatgaacac ttcaagcggc ttcgggtcac acccaccgag gagcacgtgg aaggtcctct 480
gccgtcaccc gtcaccaatg gaaccagccc tgcccagctc aatggtggct ctgcgtgctc 540
gtcccgaagt gacctgcctg gttccgacaa ggacactgag gagagcggcc tccacctgag 600
ccccacggcg gccgaggcca aggagaaggc tcgagccatg cgagtcaaca agcgcgcgcc 660
acagatggac tggaacagga agcgtgaaat cttcagcaac ttctgagccc cttcctgcct 720
gtctcgggac cctgggaccc ctcccgcacg gaccttgggc ctcagcctgc cccgagctcc 780
cccagcctca gtggactgga gggtggtcct gccattgccc agaaatcagc cccagccccg 840
gtgagccccc atcctgcccc tgcccaccag gtactggggg cctgtggcag caagataggg 900
ggagagagac ccagagatgt gagagagagt cagagacaga gacagagaga gagagagaga 960
gacacagaga gagacagaga gagagcgagc gagcgcgcgg cagccgcggg gcgagggcct 1020
ttgctgctct gccggggcct gctgactgaa aggaatttgt gtttttgctt tttttccaaa 1080
aagatctcca gctccacaca tgtttccact taataccaga gacccccccc cttcccctcc 1140
cccttcccct cccccttggg acgcgctcta aataattgca ataaaacaaa cctttctctg 1200
caaaccattt cctccccgcc ccctcccctc agcagcggcc gtcctgagtg ggagtccctg 1260
ggacttccca gtggccaagt tggggcgccc agcctcttcg tggggacctt gggtaaggcc 1320
agggaggcct gatgtggccg taggagctgc ccctgcccac ctgccctggt gtgggggtcc 1380
ctaggccaca ccctgctccc cacccagcta ccctgtgcgc ctgtgccctg ctgggggcct 1440
gggctctccg aggggcctga ggatggaggc cccacgtccc cgaggagggc ggcctctgga 1500
caggcccctc attccgcgcg gcagctccca ggcctgggga acgtaggtgt gtgagagcgg 1560
cacccgggaa ggacgcctgg cctctggctc agccctgctt ggcgggctcc cccgtggaca 1620
ccctgttgac tttgcacttc cctcccgggc cccgcacccc cgaaccgacc accgatcgac 1680
cggcaccgct gttgcctcgt aagccatagc gcatgcgcgc tctcaggata aacaggccct 1740
gcctggga 1748
<210> 64
<211> 1781
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 64
agagagttca ggccaccccg gccggacgcc tgccacttgc tgtcactgtg ccgctgtcat 60
ggcacgctcc gggagtgcca cgccacctgc ccgggctccg ggagcccctc cacggagccc 120
accccagagg ctggtacagg atgtcagtgg gcccctgagg gagctgcgcc ctcggctctg 180
ccacctgcga aagggacctc agggctatgg gttcaacctg catagtgaca agtcctggcc 240
cggccagtac atccgctctg tggacccggg ctcacctgcc gcccgctctg gcctccgcgc 300
ccaggaccgg ctcattgagg tgaacgggca gaatgtggag ggactgcgcc atgctgaggt 360
ggtggccagc atcaaggcac gggaggacga ggcccggctg ctggtcgtgg accccgagac 420
agatgaacac ttcaagcggc ttcgggtcac acccaccgag gagcacgtgg aaggtcctct 480
gccgtcaccc gtcaccaatg gaaccagccc tgcccagctc aatggtggct ctgcgtgctc 540
gtcccgaagt gacctgcctg gttccgacaa ggacactgag gatggcagtg cctggaagca 600
agatcccttc caggagagcg gcctccacct gagccccacg gcggccgagg ccaaggagaa 660
ggctcgagcc atgcgagtca acaagcgcgc gccacagatg gactggaaca ggaagcgtga 720
aatcttcagc aacttctgag ccccttcctg cctgtctcgg gaccctggga cccctcccgc 780
acggaccttg ggcctcagcc tgccccgagc tcccccagcc tcagtggact ggagggtggt 840
cctgccattg cccagaaatc agccccagcc ccggtgagcc cccatcctgc ccctgcccac 900
caggtactgg gggcctgtgg cagcaagata gggggagaga gacccagaga tgtgagagag 960
agtcagagac agagacagag agagagagag agagacacag agagagacag agagagagcg 1020
agcgagcgcg cggcagccgc ggggcgaggg cctttgctgc tctgccgggg cctgctgact 1080
gaaaggaatt tgtgtttttg ctttttttcc aaaaagatct ccagctccac acatgtttcc 1140
acttaatacc agagaccccc ccccttcccc tcccccttcc cctccccctt gggacgcgct 1200
ctaaataatt gcaataaaac aaacctttct ctgcaaacca tttcctcccc gccccctccc 1260
ctcagcagcg gccgtcctga gtgggagtcc ctgggacttc ccagtggcca agttggggcg 1320
cccagcctct tcgtggggac cttgggtaag gccagggagg cctgatgtgg ccgtaggagc 1380
tgcccctgcc cacctgccct ggtgtggggg tccctaggcc acaccctgct ccccacccag 1440
ctaccctgtg cgcctgtgcc ctgctggggg cctgggctct ccgaggggcc tgaggatgga 1500
ggccccacgt ccccgaggag ggcggcctct ggacaggccc ctcattccgc gcggcagctc 1560
ccaggcctgg ggaacgtagg tgtgtgagag cggcacccgg gaaggacgcc tggcctctgg 1620
ctcagccctg cttggcgggc tcccccgtgg acaccctgtt gactttgcac ttccctcccg 1680
ggccccgcac ccccgaaccg accaccgatc gaccggcacc gctgttgcct cgtaagccat 1740
agcgcatgcg cgctctcagg ataaacaggc cctgcctggg a 1781
<210> 65
<211> 1600
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 65
gccgccgctg aagccaccgc cgggtgccca gcgccgccgc cgcccccgag ctcccccgcg 60
cccctgcccg cgggcggccg gtgggcagcg ggcgccatgg ccgcgccgga gccgctgcgg 120
ccgcgcctgt gccgcttggt gcgcggagag cagggctacg gcttccacct gcacggcgag 180
aagggccgcc gcgggcagtt catccggcgc gtggaacccg gttcccccgc cgaggccgcc 240
gcgctggctg gggaccgcct ggtcgaggtc aacggcgtca acgtggaggg cgagacgcac 300
caccaggtgg tgcaaaggat caaggctgtg gaggggcaga ctcggctgct ggtggtggac 360
caggagacag atgaggagct ccgccggcgg cagctgacct gtaccgagga gatggcccag 420
cgagggctcc cacccgccca cgacccctgg gagccgaagc cagactgggc acacaccggc 480
agccacagct ccgaagctgg caagaaggat gtcagtgggc ccctgaggga gctgcgccct 540
cggctctgcc acctgcgaaa gggacctcag ggctatgggt tcaacctgca tagtgacaag 600
tcctggcccg gccagtacat ccgctctgtg gacccgggct cacctgccgc ccgctctggc 660
ctccgcgccc aggaccggct cattgaggtg aacgggcaga atgtggaggg actgcgccat 720
gctgaggtgg tggccagcat caaggcacgg gaggacgagg cccggctgct ggtcgtggac 780
cccgagacag atgaacactt caagcggctt cgggtcacac ccaccgagga gcacgtggaa 840
ggtcctctgc cgtcacccgt caccaatgga accagccctg cccagctcaa tggtggctct 900
gcgtgctcat cccgaagtga cctgcctggt tccgacaagg acactgagga tggcagtgcc 960
tggaagcaag atcccttcca ggagagcggc ctccacctga gccccacggc ggccgaggca 1020
aggagaaggc tcgagccatg cgagtcaaca agcgcgcgcc acagatggac tggaacagga 1080
agcgtgaaat cttcagcaac ttctgagccc cttcctgcct gtctcgggac cctgggaccc 1140
ctcccgcacg gaccttgggc ctcagcctgc cccgagctcc cccagcctca gtggactgga 1200
gggtggtcct gccattgccc agaaatcagc cccagccccg gtgagccccc atcctgcccc 1260
tgcccaccag gtactggggg cctgtggcag caagataggg ggagagagac ccagagatgt 1320
gagagagagt cagagacaga gacagagaga gagagagaga gacacagaga gagacagaga 1380
gagagcgagc gagcgcgcgg cagccgcggg gcgagggcct ttgctgctct gccggggcct 1440
gctgactgaa aggaatttgt gtttttgctt tttttccaaa aagatctcca gctccacaca 1500
tgtttccact taataccaga gacccccccc ttcccctccc ccttcccctc ccccttggga 1560
cgcgctctaa ataattgcaa taaaacaaac ctttctctgc 1600
<210> 66
<211> 738
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 66
gcagccacag ctccgaagct ggcaagaagg atgtcagtgg gcccctgagg gagctgcgcc 60
ctcggctctg ccacctgcga aagggacctc agggctatgg gttcaacctg catagtgaca 120
agtcctggcc cggccagtac atccgctctg tggacccggg ctcacctgcc gcccgctctg 180
gcctccgcgc ccaggaccgg ctcattgagg tgaacgggca gaatgtggag ggactgcgcc 240
atgctgaggt ggtggccagc atcaaggcac gggaggacga ggcccggctg ctggtcgtgg 300
accccgagac agatgaacac ttcaagcggc ttcgggtcac acccaccgag gagcacgtgg 360
aaggtcctct gccgtcaccc gtcaccaatg gaaccagccc tgcccagctc aatggtggct 420
ctgcgtgctc gtcccgaagt gacctgcctg gttccgacaa ggacactgag gaggggccac 480
cgtctggggt gtgggactag ggctcactcc agacacccca cccaccgtgc tcaccccagg 540
atggcagtgc ctggaagcaa gatcccttcc aggagagcgg cctccacctg agccccacgg 600
cggccgaggc caaggagaag gctcgagcca tgcgagtcaa caagcgcgcg ccacagatgg 660
actggaacag gaagcgtgaa atcttcagca acttctgagc cccttcctgc ctgtctcggg 720
accctgggac ccctcccg 738
<210> 67
<211> 1628
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 67
gacgggagcc gaacatgagc cgccgctgaa gccaccgcgg ggtgcccagc gccgccgccg 60
cccccgagct cccccgcgcc cctgcccgcg ggcggccggt gggcagcggg cgccatggcc 120
gcgccggagc cgctgcggcc gcgcctgtgc cgcttggtgc gcggagagca gggctacggc 180
ttccacctgc acggcgagaa gggccgccgc gggcagttca tccggcgcgt ggaacccggt 240
tcccccgccg aggccgccgc gctgcgcgct ggggaccgcc tggtcgaggt caacggcgtc 300
aacgtggagg gcgagacgca ccaccaggtg gtgcaaagga tcaaggctgt ggaggggcag 360
actcggctgc tggtggtgga ccaggagaca gatgaggagc tccgccggcg gcagctgacc 420
tgtaccgagg agatggccca gcgagggctc ccacccgccc acgacccctg ggagccgaag 480
ccagactggg cacacaccgg cagccacagc tccgaagctg gcaagaagga tgtcagtggg 540
cccctgaggg agctgcgccc tcggctctgc cacctgcgaa agggacctca gggctatggg 600
ttcaacctgc atagtgacaa gtcctggccc ggccagtaca tccgctctgt ggacccgggc 660
tcacctgccg cccgctctgg cctccgcgcc caggaccggc tcattgaggt gaacgggcag 720
aatgtggagg gactgcgcca tgctgaggtg gtggccagca tcaaggcacg ggaggacgag 780
gcccggctgc tggtcgtgga ccccgagaca gatgaacact tcaagcggct tcgggtcaca 840
cccaccgagg agcacgtgga aggtcctctg ccgtcacccg tcaccaatgg aaccagccct 900
gcccagctca atggtggctc tgcgtgctcg tcccgaagtg acctgcctgg ttccgacaag 960
gacactgagg atggcagtgc ctggaagcaa gatcccttcc aggagagcgg cctccacctg 1020
agccccacgg cggccgaggc caaggagaag gctcgagcca tgcgagtcaa caagcgcgcg 1080
ccacagatgg actggaacag gaagcgtgaa atcttcagca acttctgagc cccttcctgc 1140
ctgtctcggg accctgggac ccctcccgca cggaccttgg gcctcagcct gccccgagct 1200
cccccagcct cagtggactg gagggtggtc ctgccattgc ccagaaatca gccccagccc 1260
cggtgagccc ccatcctgcc cctgcccacc aggtactggg ggcctgtggc agcaagatag 1320
ggggagagag acccagagat gtgagagaga gtcagagaca gagacagaga gagagagaga 1380
gagacacaga gagagacaga gagagagcga gcgagcgcgc ggcagccgcg gggcgagggc 1440
ctttgctgct ctgccggggc ctgctgactg aaaggaattt gtgtttttgc tttttttcca 1500
aaaagatctc cagctccaca catgtttcca cttaatacca gagacccccc ccccttcccc 1560
tcccccttgg gacgcgctct aaataattgc aataaaacaa acctttctct gcaaaaaaaa 1620
aaaaaaaa 1628
<210> 68
<211> 1639
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 68
gggagccgaa caggagccgc cgctgaagcc accgccgggt gcccagcgcc gccgccgccc 60
ccgagctccc ccgcgcccct gcccgcgggc ggccggtggg cagcgggcgc catggccgcg 120
ccggagccgc tgcggccgcg cctgtgccgc ttggtgcgcg gagagcaggg ctacggcttc 180
cacctgcacg gcgagaaggg ccgccgcggg cagttcatcc ggcgcgtgga acccggttcc 240
cccgccgagg ccgccgcgct gcgcgctggg gaccgcctgg tcgaggtcaa cggcgtcaac 300
gtggagggcg agacgcacca ccaggtggtg caaaggatca aggctgtgga ggggcagact 360
cggctgctgg tggtggacca ggagacagat gaggagctcc gccggcggca gctgacctgt 420
accgaggaga tggcccagcg agggctccca cccgcccacg acccctggga gccgaagcca 480
gactgggcac acaccggcag ccacagctcc gaagctggca agaaggatgt cagtgggccc 540
ctgagggagc tgcgccctcg gctctgccac ctgcgaaagg gacctcaggg ctatgggttc 600
aacctgcata gtgacaagtc ctggcccggc cagtacatcc gctctgtgga cccgggctca 660
cctgccgccc gctctggcct ccgcgcccag gaccggctca ttgaggtgaa cgggcagaat 720
gtggagggac tgcgccatgc tgaggtggtg gccagcatca aggcacggga ggacgaggcc 780
cggctgctgg tcgtggaccc cgagacagat gaacacttca agcggcttcg ggtcacaccc 840
accgaggagc acgtggaagg tcctctgccg tcacccgtca ccaatggaac cagccctgcc 900
cagctcaatg gtggctctgc gtgctcgtcc cgaagtgacc tgcctggttc cgacaaggac 960
actgaggatg gcagtgcctg gaagcaagat cccttccagg agagcggcct ccacctgagc 1020
cccacggcgg ccgaggccaa ggagaaggct cgagccatgc gagtcaacaa gcgcgcgcca 1080
cagatggact ggaacaggaa gcgtgaaatc ttcagcaact tctgagcccc ttcctgcctg 1140
tctcgggacc ctgggacccc tcccgcacgg accttgggcc tcagcctgcc ccgagctccc 1200
ccagcctcag tggactggag ggtggtcctg ccattgccca gaaatcagcc ccagccccgg 1260
tgagccccca tcctgcccct gcccaccagg tactgggggc ctgtggcagc aagatagggg 1320
gagagagacc cagagatgtg agagagagtc agagacagag acagagagag agagagagag 1380
acacagagag agacagagag agagcgagcg agcgcgcggc agccgcgggg cgagggcctt 1440
tgctgctctg ccggggcctg ctgactgaaa ggaatttgtg tttttgcttt ttttccaaaa 1500
agatctccag ctccacacat gtttccactt aataccagag accccccccc cttcccctcc 1560
cccttcccct cccccttggg acgcgctcta aataattgca ataaaacaaa cctttctctg 1620
caaaaaaaaa aaaaaaaaa 1639
<210> 69
<211> 1622
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 69
gccgaacagg agccgccgct gaagccaccg ccgggtgccc agcgccgccg ccgcccccga 60
gctcccccgc gcccctgccc gcgggcggcc ggtgggcagc gggcgccatg gccgcgccgg 120
agccgctgcg gccgcgcctg tgccgcttgg tgcgcggaga gcagggctac ggcttccacc 180
tgcacggcga gaagggccgc cgcgggcagt tcatccggcg cgtggaaccc ggttcccccg 240
ccgaggccgc cgcgctgcgc gctggggacc gcctggtcga ggtcaacggc gtcaacgtgg 300
agggcgagac gcaccaccag gtggtgcaaa ggatcaaggc tgtggagggg cagactcggc 360
tgctggtggt ggaccaggag acagatgagg agctccgccg gcggcagctg acctgtaccg 420
aggagatggc ccagcgaggg ctcccacccg cccacgaccc ctgggagccg aagccagact 480
gggcacacac cggcagccac agctccgaag ctggcaagaa ggatgtcagt gggcccctga 540
gggagctgcg ccctcggctc tgccacctgc gaaagggacc tcagggctat gggttcaacc 600
tgcatagtga caagtcctgg cccggccagt acatccgctc tgtggacccg ggctcacctg 660
ccgcccgctc tggcctccgc gcccaggacc ggctcattga ggtgaacggg cagaatgtgg 720
agggactgcg ccatgctgag gtggtggcca gcatcaaggc acgggaggac gaggcccggc 780
tgctggtcgt ggaccccgag acagatgaac acttcaagcg gcttcgggtc acacccaccg 840
aggagcacgt ggaaggtcct ctgccgtcac ccgtcaccaa tggaaccagc cctgcccagc 900
tcaatggtgg ctctgcgtgc tcgtcccgaa gtgacctgcc tggttccgac aaggacactg 960
aggatggcag tgcctggaag caagatccct tccaggagag cggcctccac ctgagcccca 1020
cggcggccga ggccaaggag aaggctcgag ccatgcgagt caacaagcgc gcgccacaga 1080
tggactggaa caggaagcgt gaaatcttca gcaacttctg agccccttcc tgcctgtctc 1140
gggaccctgg gacccctccc gcacggacct tgggcctcag cctgccccga gctcccccag 1200
cctcagtgga ctggagggtg gtcctgccat tgcccagaaa tcagccccag ccccggtgag 1260
cccccatcct gcccctgccc accaggtact gggggcctgt ggcagcaaga tagggggaga 1320
gagacccaga gatgtgagag agagtcagag acagagacag agagagagag agagagacac 1380
agagagagac agagagagag cgagcgagcg cgcggcagcc gcggggcgag ggcctttgct 1440
gctctgccgg ggcctgctga ctgaaaggaa tttgtgtttt tgcttttttt ccaaaaagat 1500
ctccagctcc acacatgttt ccacttaata ccagagaccc ccccccttcc cctccccctt 1560
gggacgcgct ctaaataatt gcaataaaac aaacctttct ctgcaaaaaa aaaaaaaaaa 1620
aa 1622
<210> 70
<211> 1524
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 70
gtgggcagcg ggcgccatgg ccgcgccgga gccgctgcgg ccgcgcctgt gccgcttggt 60
gcgcggagag cagggctacg gcttccacct gcacggcgag aagggccgcc gcgggcagtt 120
catccggcgc gtggaacccg gttcccccgc cgaggccgcc gcgctgcgcg ctggggaccg 180
cctggtcgag gtcaacggcg tcaacgtgga gggcgagacg caccaccagg tggtgcaaag 240
gatcaaggct gtggaggggc agactcggct gctggtggtg gaccaggaga cagatgagga 300
gctccgccgg cggcagctga cctgtaccga ggagatggcc cagcgagggc tcccacccgc 360
ccacgacccc tgggagccga agccagactg ggcacacacc ggcagccaca gctccgaagc 420
tggcaagaag gatgtcagtg ggcccctgag ggagctgcgc cctcggctct gccacctgcg 480
aaagggacct cagggctatg ggttcaacct gcatagtgac aagtcctggc ccggccagta 540
catccgctct gtggacccgg gctcacctgc cgcccgctct ggcctccgcg cccaggaccg 600
gctcattgag gtgaacgggc agaatgtgga gggactgcgc catgctgagg tggtggccag 660
catcaaggca cgggaggacg aggcccggct gctggtcgtg gaccccgaga cagatgaaca 720
cttcaagcgg cttcgggtca cacccaccga ggagcacgtg gaaggtcctc tgccgtcacc 780
cgtcaccaat ggaaccagcc ctgcccagct caatggtggc tctgcgtgct catcccgaag 840
tgacctgcct ggttccgaca aggacactga ggatggcagt gcctggaagc aagatccctt 900
ccaggagagc ggcctccacc tgagccccac ggcggccgag gccaaggaga aggctcgagc 960
catgcgagtc aacaagcgcg cgccacagat ggactggaac aggaagcgtg aaatcttcag 1020
caacttctga gccccttcct gcctgtctcg ggaccctggg acccctcccg cacggacctt 1080
gggcctcagc ctgccccgag ctcccccagc ctcagtggac tggagggtgg tcctgccatt 1140
gcccagaaat cagccccagc cccggtgagc ccccatcctg cccctgccca ccaggtactg 1200
ggggcctgtg gcagcaagat agggggagag agacccagag atgtgagaga gagtcagaga 1260
cagagacaga gagagagaga gagagacaca gagagagaca gagagagagc gagcgagcgc 1320
gcggcagccg cggggcgagg gcctttgctg ctctgccggg gcctgctgac tgaaaggaat 1380
ttgtgttttt gctttttttc caaaaagatc tccagctcca cacatgtttc cacttaatac 1440
cagagacccc ccccttcccc tcccccttcc cctccccctt gggacgcgct ctaaataatt 1500
gcaataaaac aaacctttct ctgc 1524
<210> 71
<211> 1357
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 71
atggccgcgc cggagccgct gcggccgcgc ctgtgccgct tggtgcgcgg agagcagggc 60
tacggcttcc acctgcacgg cgagaagggc cgccgcgggc agttcatccg gcgcgtggaa 120
cccggttccc ccgccgaggc cgccgcgctg cgcgctgggg accgcctggt cgaggtcaac 180
ggcgtcaacg tggagggcga gacgcaccac caggtggtgc aaaggatcaa ggctgtggag 240
gggcagactc ggctgctggt ggtggaccag gagacagatg aggagctccg ccggcggcag 300
ctgacctgta ccgaggagat ggcccagcga gggctcccac ccgcccacga cccctgggag 360
ccgaagccag actgggcaca caccggcagc cacagctccg aagctggcaa gaaggatgtc 420
agtgggcccc tgagggagct gcgccctcgg ctctgccacc tgcgaaaggg acctcagggc 480
tatgggttca acctgcatag tgacaagtcc tggcccggcc agtacatccg ctctgtggac 540
ccgggctcac ctgccgcccg ctctggcctc cgcgcccagg accggctcat tgaggtgaac 600
gggcagaatg tggagggact gcgccatgct gaggtggtgg ccagcatcaa ggcacgggag 660
gacgaggccc ggctgctggt cgtggacccc gagacagatg aacacttcaa gcggcttcgg 720
gtcacaccca ccgaggagca cgtggaaggt cctctgccgt cacccgtcac caatggaacc 780
agccctgccc agctcaatgg tggctctgcg tgctcgtccc gaagtgacct gcctggttcc 840
gacaaggaca ctgaggatgg cagtgcctgg aagcaagatc ccttccagga gagcggcctc 900
cacctgagcc ccacggcggc cgaggccaag gagaaggctc gagccatgcg agtcaacaag 960
cgcgcgccac agatggactg gaacaggaag cgtgaaatct tcagcaactt ctgagcccct 1020
tcctgcctgt ctcgggaccc tgggacccct cccgcacgga ccttgggcct cagcctgccc 1080
cgagctcccc cagcctcagt ggactggagg gtggtcctgc cattgcccag aaatcagccc 1140
cagccccggt gagcccccat cctgcccctg cccaccaggt actgggggcc tgtggcagca 1200
agataggggg agagagaccc agagatgtga gagagagtca gagacagaga cagagagaga 1260
gagagagaga cacagagaga gacagagaga gagcgagcga gcgcgcggca gccgcggggc 1320
gagggccttt gctgctctgc cggggcctgc tgactga 1357
<210> 72
<211> 2194
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 72
ggagcccgag ccggatcccg aggcgacggg agccgaacag gagccgccgc tgaagccacc 60
gccgggtgcc cagcgccgcc gccgcccccg agctcccccg cgcccctgcc cgcgggcggc 120
cggtgggcag cgggcgccat ggccgcgccg gagccgctgc ggccgcgcct gtgccgcttg 180
gtgcgcggag agcagggcta cggcttccac ctgcacggcg agaagggccg ccgcgggcag 240
ttcatccggc gcgtggaacc cggttccccc gccgaggccg ccgcgctgcg cgctggggac 300
cgcctggtcg aggtcaacgg cgtcaacgtg gagggcgaga cgcaccacca ggtggtgcaa 360
aggatcaagg ctgtggaggg gcagactcgg ctgctggtgg tggaccagga gacagatgag 420
gagctccgcc ggcggcagct gacctgtacc gaggagatgg cccagcgagg gctcccaccc 480
gcccacgacc cctgggagcc gaagccagac tgggcacaca ccggcagcca cagctccgaa 540
gctggcaaga aggatgtcag tgggcccctg agggagctgc gccctcggct ctgccacctg 600
cgaaagggac ctcagggcta tgggttcaac ctgcatagtg acaagtcctg gcccggccag 660
tacatccgct ctgtggaccc gggctcacct gccgcccgct ctggcctccg cgcccaggac 720
cggctcattg aggtgaacgg gcagaatgtg gagggactgc gccatgctga ggtggtggcc 780
agcatcaagg cacgggagga cgaggcccgg ctgctggtcg tggaccccga gacagatgaa 840
cacttcaagc ggcttcgggt cacacccacc gaggagcacg tggaaggtcc tctgccgtca 900
cccgtcacca atggaaccag ccctgcccag ctcaatggtg gctctgcgtg ctcgtcccga 960
agtgacctgc ctggttccga caaggacact gaggatggca gtgcctggaa gcaagatccc 1020
ttccaggaga gcggcctcca cctgagcccc acggcggccg aggccaagga gaaggctcga 1080
gccatgcgag tcaacaagcg cgcgccacag atggactgga acaggaagcg tgaaatcttc 1140
agcaacttct gagccccttc ctgcctgtct cgggaccctg ggacccctcc cgcacggacc 1200
ttgggcctca gcctgccccg agctccccca gcctcagtgg actggagggt ggtcctgcca 1260
ttgcccagaa atcagcccca gccccggtga gcccccatcc tgcccctgcc caccaggtac 1320
tgggggcctg tggcagcaag atagggggag agagacccag agatgtgaga gagagtcaga 1380
gacagagaca gagagagaga gagagagaca cagagagaga cagagagaga gcgagcgagc 1440
gcgcggcagc cgcggggcga gggcctttgc tgctctgccg gggcctgctg actgaaagga 1500
atttgtgttt ttgctttttt tccaaaaaga tctccagctc cacacatgtt tccacttaat 1560
accagagacc cccccccttc ccctccccct tcccctcccc cttgggacgc gctctaaata 1620
attgcaataa aacaaacctt tctctgcaaa ccatttcctc cccgccccct cccctcagca 1680
gcggccgtcc tgagtgggag tccctgggac ttcccagtgg ccaagttggg gcgcccagcc 1740
tcttcgtggg gaccttgggt aaggccaggg aggcctgatg tggccgtagg agctgcccct 1800
gcccacctgc cctggtgtgg gggtccctag gccacaccct gctccccacc cagctaccct 1860
gtgcgcctgt gccctgctgg gggcctgggc tctccgaggg gcctgaggat ggaggcccca 1920
cgtccccgag gagggcggcc tctggacagg cccctcattc cgcgcggcag ctcccaggcc 1980
tggggaacgt aggtgtgtga gagcggcacc cgggaaggac gcctggcctc tggctcagcc 2040
ctgcttggcg ggctcccccg tggacaccct gttgactttg cacttccctc ccgggccccg 2100
cacccccgaa ccgaccaccg atcgaccggc accgctgttg cctcgtaagc catagcgcat 2160
gcgcgctctc aggataaaca ggccctgcct ggga 2194
<210> 73
<211> 2127
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 73
gaacaggagc cgccgctgaa gccaccgccg ggtgcccagc gccgccgccg cccccgagct 60
cccccgcgcc cctgcccgcg ggcggccggt gggcagcggg cgccatggcc gcgccggagc 120
cgctgcggcc gcgcctgtgc cgcttggtgc gcggagagca gggctacggc ttccacctgc 180
acggcgagaa gggccgccgc gggcagttca tccggcgcgt ggaacccggt tcccccgccg 240
aggccgccgc gctgcgcgct ggggaccgcc tggtcgaggt caacggcgtc aacgtggagg 300
gcgagacgca ccaccaggtg gtgcaaagga tcaaggctgt ggaggggcag actcggctgc 360
tggtggtgga ccaggagaca gatgaggagc tccgccggcg gcagctgacc tgtaccgagg 420
agatggccca gcgagggctc ccacccgccc acgacccctg ggagccgaag ccagactggg 480
cacacaccgg cagccacagc tccgaagctg gcaagaagga tgtcagtggg cccctgaggg 540
agctgcgccc tcggctctgc cacctgcgaa agggacctca gggctatggg ttcaacctgc 600
atagtgacaa gtcctggccc ggccagtaca tccgctctgt ggacccgggc tcacctgccg 660
cccgctctgg cctccgcgcc caggaccggc tcattgaggt gaacgggcag aatgtggagg 720
gactgcgcca tgctgaggtg gtggccagca tcaaggcacg ggaggacgag gcccggctgc 780
tggtcgtgga ccccgagaca gatgaacact tcaagcggct tcgggtcaca cccaccgagg 840
agcacgtgga aggtcctctg ccgtcacccg tcaccaatgg aaccagccct gcccagctca 900
atggtggctc tgcgtgctcg tcccgaagtg acctgcctgg ttccgacaag gacactgagg 960
agagcggcct ccacctgagc cccacggcgg ccgaggccaa ggagaaggct cgagccatgc 1020
gagtcaacaa gcgcgcgcca cagatggact ggaacaggaa gcgtgaaatc ttcagcaact 1080
tctgagcccc ttcctgcctg tctcgggacc ctgggacccc tcccgcacgg accttgggcc 1140
tcagcctgcc ccgagctccc ccagcctcag tggactggag ggtggtcctg ccattgccca 1200
gaaatcagcc ccagccccgg tgagccccca tcctgcccct gcccaccagg tactgggggc 1260
ctgtggcagc aagatagggg gagagagacc cagagatgtg agagagagtc agagacagag 1320
acagagagag agagagagag acacagagag agacagagag agagcgagcg agcgcgcggc 1380
agccgcgggg cgagggcctt tgctgctctg ccggggcctg ctgactgaaa ggaatttgtg 1440
tttttgcttt ttttccaaaa agatctccag ctccacacat gtttccactt aataccagag 1500
accccccccc ttcccctccc ccttcccctc ccccttggga cgcgctctaa ataattgcaa 1560
taaaacaaac ctttctctgc aaaccatttc ctccccgccc cctcccctca gcagcggccg 1620
tcctgagtgg gagtccctgg gacttcccag tggccaagtt ggggcgccca gcctcttcgt 1680
ggggaccttg ggtaaggcca gggaggcctg atgtggccgt aggagctgcc cctgcccacc 1740
tgccctggtg tgggggtccc taggccacac cctgctcccc acccagctac cctgtgcgcc 1800
tgtgccctgc tgggggcctg ggctctccga ggggcctgag gatggaggcc ccacgtcccc 1860
gaggagggcg gcctctggac aggcccctca ttccgcgcgg cagctcccag gcctggggaa 1920
cgtaggtgtg tgagagcggc acccgggaag gacgcctggc ctctggctca gccctgcttg 1980
gcgggctccc ccgtggacac cctgttgact ttgcacttcc ctcccgggcc ccgcaccccc 2040
gaaccgacca ccgatcgacc ggcaccgctg ttgcctcgta agccatagcg catgcgcgct 2100
ctcaggataa acaggccctg cctggga 2127
<210> 74
<211> 1578
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 74
gaattcggca cgagccgggt gcccagcgcc gccgccgccc ccgagctccc ccgcgcccct 60
gcccgcgggc ggccggtggg cagcgggcgc catggccgcg ccggagccgc tgcggccgcg 120
cctgtgccgc ttggtgcgcg gagagcaggg ctacggcttc cacctgcacg gcgagaaggg 180
ccgccgcggg cagttcatcc ggcgcgtgga acccggttcc cccgccgagg ccgccgcgct 240
gcgcgctggg gaccgcctgg tcgaggtcaa cggcgtcaac gtggagggcg agacgcacca 300
ccaggtggtg caaaggatca aggctgtgga ggggcagact cggctgctgg tggtggacca 360
ggagacagat gaggagctcc gccggcggca gctgacctgt accgaggaga tggcccagcg 420
agggctccca cccgcccacg acccctggga gccgaagcca gactgggcac acaccggcag 480
ccacagctcc gaagctggca agaaggatgt cagtgggccc ctgagggagc tgcgccctcg 540
gctctgccac ctgcgaaagg gacctcaggg ctatgggttc aacctgcata gtgacaagtc 600
ctggcccggc cagtacatcc gctctgtgga cccgggctca cctgccgccc gctctggcct 660
ccgcgcccag gaccggctca ttgaggtgaa cgggcagaat gtggagggac tgcgccatgc 720
tgaggtggtg gccagcatca aggcacggga ggacgaggcc cggctgctgg tcgtggaccc 780
cgagacagat gaacacttca agcggcttcg ggtcacaccc accgaggagc acgtggaagg 840
tcctctgccg tcacccgtca ccaatggaac cagccctgcc cagctcaatg gtggctctgc 900
gtgctcgtcc cgaagtgacc tgcctggttc cgacaaggac actgaggaga gcggcctcca 960
cctgagcccc acggcggccg aggccaagga gaaggctcga gccatgcgag tcaacaagcg 1020
cgcgccacag atggactgga acaggaagcg tgaaatcttc agcaacttct gagccccttc 1080
ctgcctgtct cgggaccctg ggacccctcc cgcacggacc ttgggcctca gcctgccccg 1140
agctccccca gcctcagtgg actggagggt ggtcctgcca ttgcccagaa atcagcccca 1200
gccccggtga gcccccatcc tgcccctgcc caccaggtac tgggggcctg tggcagcaag 1260
atagggggag agagacccag agatgtgaga gagagtcaga gacagagaca gagagagaga 1320
gagagagaca cagagagaga cagagagaga gcgagcgagc gcgcggcagc cgcggggcga 1380
gggcctttgc tgctctgccg gggcctgctg actgaaagga atttgtgttt ttgctttttt 1440
tccaaaaaga tctccagctc cacacatgtt tccacttaat accagagacc ccccccttcc 1500
cctccccctt cccctccccc ttgggacgcg ctctaaataa ttgcaataaa acaaaccttt 1560
ctctgcaaaa aggaattc 1578
<210> 75
<211> 759
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 75
agataagtgg ggtggcagcc tgggtcggcc agagagttca ggccaccccg gccggacgcc 60
tgccacttgc tgtcactgtg ccgctgtcat ggcacgctcc gggagtgcca cgccacctgc 120
ccgggctccg ggagcccctc cacggagccc accccagagg ctggatgtca gtgggcccct 180
gagggagctg cgccctcggc tctgccacct gcgaaaggga cctcagggct atgggttcaa 240
cctgcatagt gacaagtcct ggcccggcca gtacatccgc tctgtggacc cgggctcacc 300
tgccgcccgc tctggcctcc gcgcccagga ccggctcatt gaggtgaacg ggcagaatgt 360
ggagggactg cgccatgctg aggtggtggc cagcatcaag gcacgggagg acgaggcccg 420
gctgctggtc gtggaccccg agacagatga acacttcaag cggcttcggg tcacacccac 480
cgaggagcac gtggaaggtc ctctgccgtc acccgtcacc aatggaacca gccctgccca 540
gctcaatggt ggctctgcgt gctcgtcccg aagtgacctg cctggttccg acaaggacac 600
tgaggatggc agtgcctgga agcaagatcc cttccaggag agcggcctcc acctgagccc 660
cacggcggcc gaggccaagg agaaggctcg agccatgcga gtcaacaagc gcgcgccaca 720
gatggactgg aacaggaagc gtgaaatctt cagcaactt 759
<210> 76
<211> 1199
<212> DNA
<213> 智人(homo sapien)
<400> 76
tggggtggca gcctgggtcg gccagagagt tcaggccacc ccggccggac gcctgccact 60
tgctgtcact gtgccgctgt catggcacgc tccgggagtg ccacgccacc tgcccgggct 120
ccgggagccc ctccacggag cccaccccag aggctggtac aggatgtcag tgggcccctg 180
agggagctgc gccctcggct ctgccacctg cgaaagggac ctcagggcta tgggttcaac 240
ctgcatagtg acaagtcctg gcccggccag tacatccgct ctgtggaccc gggctcacct 300
gccgcccgct ctggcctccg cgcccaggac cggctcattg aggtgaacgg gcagaatgtg 360
gagggactgc gccatgctga ggtggtggcc agcatcaagg cacgggagga cgaggcccgg 420
ctgctggtcg tggaccccga gacagatgaa cacttcaagc ggcttcgggt cacacccacc 480
gaggagcacg tggaaggtcc tctgccgtca cccgtcacca atggaaccag ccctgcccag 540
ctcaatggtg gctctgcgtg ctcgtcccga agtgacctgc ctggttccga caaggacact 600
gaggatggca gtgcctggaa gcaagatccc ttccaggaga gcggcctcca cctgagcccc 660
acggcggccg aggccaagga gaaggctcga gccatgcgag tcaacaagcg cgcgccacag 720
atggactgga acaggaagcg tgaaatcttc agcaacttct gagccccttc ctgcctgtct 780
cgggaccctg ggacccctcc cgcacggacc ttgggcctca gcctgccccg agctccccca 840
gcctcagtgg actggagggt ggtcctgcca ttgcccagaa atcagcccca gccccggtga 900
gcccccatcc tgcccctgcc caccaggtac tgggggcctg tggcagcaag atagggggag 960
agagacccag agatgtgaga gagagtcaga gacagagaca gagagagaga gagagagaca 1020
cagagagaga cagagagaga gcgagcgagc gcgcggcagc cgcggggcga gggcctttgc 1080
tgctctgccg gggcctgctg actgaaagga atttgtgttt ttgctttttt tccaaaaaga 1140
tctccagctc cacacatgtt tccacttaat accagagacc cccccccttc ccctccccc 1199
<210> 77
<211> 337
<212> PRT
<213> 智人(homo sapien)
<400> 77
Met Ala Ala Pro Glu Pro Leu Arg Pro Arg Leu Cys Arg Leu Val Arg
1 5 10 15
Gly Glu Gln Gly Tyr Gly Phe His Leu His Gly Glu Lys Gly Arg Arg
20 25 30
Gly Gln Phe Ile Arg Arg Val Glu Pro Gly Ser Pro Ala Glu Ala Ala
35 40 45
Ala Leu Arg Ala Gly Asp Arg Leu Val Glu Val Asn Gly Val Asn Val
50 55 60
Glu Gly Glu Thr His His Gln Val Val Gln Arg Ile Lys Ala Val Glu
65 70 75 80
Gly Gln Thr Arg Leu Leu Val Val Asp Gln Glu Thr Asp Glu Glu Leu
85 90 95
Arg Arg Arg Gln Leu Thr Cys Thr Glu Glu Met Ala Gln Arg Gly Leu
100 105 110
Pro Pro Ala His Asp Pro Trp Glu Pro Lys Pro Asp Trp Ala His Thr
115 120 125
Gly Ser His Ser Ser Glu Ala Gly Lys Lys Asp Val Ser Gly Pro Leu
130 135 140
Arg Glu Leu Arg Pro Arg Leu Cys His Leu Arg Lys Gly Pro Gln Gly
145 150 155 160
Tyr Gly Phe Asn Leu His Ser Asp Lys Ser Arg Pro Gly Gln Tyr Ile
165 170 175
Arg Ser Val Asp Pro Gly Ser Pro Ala Ala Arg Ser Gly Leu Arg Ala
180 185 190
Gln Asp Arg Leu Ile Glu Val Asn Gly Gln Asn Val Glu Gly Leu Arg
195 200 205
His Ala Glu Val Val Ala Ser Ile Lys Ala Arg Glu Asp Glu Ala Arg
210 215 220
Leu Leu Val Val Asp Pro Glu Thr Asp Glu His Phe Lys Arg Leu Arg
225 230 235 240
Val Thr Pro Thr Glu Glu His Val Glu Gly Pro Leu Pro Ser Pro Val
245 250 255
Thr Asn Gly Thr Ser Pro Ala Gln Leu Asn Gly Gly Ser Ala Cys Ser
260 265 270
Ser Arg Ser Asp Leu Pro Gly Ser Asp Lys Asp Thr Glu Asp Gly Ser
275 280 285
Ala Trp Lys Gln Asp Pro Phe Gln Glu Ser Gly Leu His Leu Ser Pro
290 295 300
Thr Ala Ala Glu Ala Lys Glu Lys Ala Arg Ala Met Arg Val Asn Lys
305 310 315 320
Arg Ala Pro Gln Met Asp Trp Asn Arg Lys Arg Glu Ile Phe Ser Asn
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Gly Gln Phe Ile Arg Arg Val Glu Pro Gly Ser Pro Ala Glu Ala Ala
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180 185 190
Asp Arg Leu Ile Glu Val Asn Gly Gln Asn Val Glu Gly Leu Arg His
195 200 205
Ala Glu Val Val Ala Ser Ile Lys Ala Arg Glu Asp Glu Ala Arg Leu
210 215 220
Leu Val Val Asp Pro Glu Thr Asp Glu His Phe Lys Arg Leu Arg Val
225 230 235 240
Thr Pro Thr Glu Glu His Val Glu Gly Pro Leu Pro Ser Pro Val Thr
245 250 255
Asn Gly Thr Ser Pro Ala Gln Leu Asn Gly Gly Ser Ala Cys Ser Ser
260 265 270
Arg Ser Asp Leu Pro Gly Ser Asp Lys Asp Thr Glu Asp Gly Ser Ala
275 280 285
Trp Lys Gln Asp Pro Phe Gln Glu Ser Gly Leu His Leu Ser Pro Thr
290 295 300
Ala Ala Glu Ala Arg Arg Arg Leu Glu Pro Cys Glu Ser Thr Ser Ala
305 310 315 320
Arg His Arg Trp Thr Gly Thr Gly Ser Val Lys Ser Ser Ala Thr Ser
325 330 335
Glu Pro Leu Pro Ala Cys Leu Gly Thr Leu Gly Pro Leu Pro His Gly
340 345 350
Pro Trp Ala Ser Ala Cys Pro Glu Leu Pro Gln Pro Gln Trp Thr Gly
355 360 365
Gly Trp Ser Cys His Cys Pro Glu Ile Ser Pro Ser Pro Gly Glu Pro
370 375 380
Pro Ser Cys Pro Cys Pro Pro Gly Thr Gly Gly Leu Trp Gln Gln Asp
385 390 395 400
Arg Gly Arg Glu Thr Gln Arg Cys Glu Arg Glu Ser Glu Thr Glu Thr
405 410 415
Glu Arg Glu Arg Glu Arg His Arg Glu Arg Gln Arg Glu Ser Glu Arg
420 425 430
Ala Arg Gly Ser Arg Gly Ala Arg Ala Phe Ala Ala Leu Pro Gly Pro
435 440 445
Ala Asp
450
<210> 93
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 93
aggttgaacc catagccctg 20
<210> 94
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 94
cacctgcgaa agggacctca 20
<210> 95
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 95
gtcaacggcg tcaacgtgga 20
<210> 96
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 96
ggatgtcagt gggcccctga 20
<210> 97
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 97
tgacgccgtt gacctcgacc 20
<210> 98
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 98
acctgcatag tgacaagtcc 20
<210> 99
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 99
tggtggccag catcaaggca 20
<210> 100
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 100
gccgggactt gtcactatgc 20
<210> 101
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 101
gtgaacgggc agaatgtgga 20
<210> 102
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 102
ttccacctgc acggcgagaa 20
<210> 103
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 103
aagccagact gggcacacac 20
<210> 104
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 104
cggccagtac atccgctctg 20
<210> 105
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 105
tacatccgct ctgtggaccc 20
<210> 106
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 106
cgaggtcaac ggcgtcaacg 20
<210> 107
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 107
acagagcgga tgtactggcc 20
<210> 108
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 108
cgcgccggat gaactgcccg 20
<210> 109
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 109
gcggcagctg acctgtaccg 20
<210> 110
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 110
gggccggtac ctcaatgagc 20
<210> 111
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 111
aggctgtgga ggggcagact 20
<210> 112
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(artificial sequence)
<220>
<223> 合成序列;gRNA识别序列
<400> 112
gcagcgcggc ggcctcggcg 20

Claims (99)

1.一种治疗患有高血压或处于发展出高血压的风险中的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂。
2.一种治疗患有原发性高血压或处于发展出原发性高血压的风险中的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂。
3.一种治疗患有继发性高血压或处于发展出继发性高血压的风险中的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂。
4.一种治疗患有顽固性高血压或处于发展出顽固性高血压的风险中的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂。
5.一种治疗患有恶性高血压或处于发展出恶性高血压的风险中的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂。
6.一种治疗患有冠心病或处于发展出冠心病的风险中的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂。
7.一种治疗患有心房颤动或处于发展出心房颤动的风险中的受试者的方法,所述方法包括向所述受试者施用溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂。
8.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2抑制剂包含抑制性核酸分子。
9.根据权利要求8所述的方法,其中所述抑制性核酸分子包含与SLC9A3R2核酸分子杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
10.根据权利要求1至7中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2抑制剂包含与SLC9A3R2基因组核酸分子内的指导RNA(gRNA)识别序列杂交的Cas蛋白和gRNA。
11.根据权利要求10所述的方法,其中所述Cas蛋白是Cas9或Cpf1。
12.根据权利要求10或权利要求11所述的方法,其中所述gRNA识别序列包括或接近对应于根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置。
13.根据权利要求10或权利要求11所述的方法,其中所述gRNA识别序列位于距对应于根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处。
14.根据权利要求10或权利要求11所述的方法,其中原间隔序列邻近基序(PAM)序列位于所述gRNA识别序列下游约2至约6个核苷酸处。
15.根据权利要求10至14中任一项所述的方法,其中所述gRNA包含约17个核苷酸至约23个核苷酸。
16.根据权利要求10至14中任一项所述的方法,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQID NO:93-112中任一个的核苷酸序列。
17.根据权利要求1至16中任一项所述的方法,其还包括检测从所述受试者获得的生物样品中存在或不存在编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子。
18.根据权利要求17所述的方法,其还包括以标准剂量量向受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子不存在于所述生物样品中。
19.根据权利要求17所述的方法,其还包括以同于或低于标准剂量量的剂量量向对于所述SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂。
20.根据权利要求17至19中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子编码Arg171Trp-长、Arg171Trp-短、Arg65Trp、Arg58Trp、Arg60Trp-短、Arg60Trp-长或Arg170Trp。
21.根据权利要求17至19中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子编码Arg171Trp-长或Arg171Trp-短。
22.根据权利要求20所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子是:
基因组核酸分子,所述基因组核酸分子具有包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列;
mRNA分子,所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;或
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
23.根据权利要求17至22中任一项所述的方法,其中所述检测步骤在体外进行。
24.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子的所述测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶时,则所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子。
25.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子的所述测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;则所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体mRNA分子。
26.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2 cDNA分子的所述测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ IDNO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;则所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2 cDNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体cDNA分子。
27.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶。
28.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶。
29.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
30.根据权利要求24至29中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括对整个核酸分子进行测序。
31.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)对所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
32.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)对所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
33.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
a)对所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
34.根据权利要求33所述的方法,其中所述样品中的所述核酸分子是mRNA,并且在所述扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
35.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
36.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
37.根据权利要求17至23中任一项所述的方法,其中所述检测步骤包括:
使所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
38.一种用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂治疗受试者的方法,其中所述受试者患有高血压、冠心病和/或心房颤动或处于发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险中,所述方法包括:
通过以下方式确定所述受试者是否具有编码溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子:
从所述受试者获得或已经获得生物样品;以及
对所述生物样品进行或已经进行序列分析以确定所述受试者是否具有包含编码所述SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的所述SLC9A3R2错义变体核酸分子的基因型;以及
以标准剂量量向作为SLC9A3R2参考的受试者施用或继续施用所述治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向所述受试者施用SLC9A3R2抑制剂;以及
以同于或低于标准剂量量的量向对于所述SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的受试者施用或继续施用所述治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,和/或向所述受试者施用SLC9A3R2抑制剂;
其中具有编码所述SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的所述SLC9A3R2错义变体核酸分子的基因型的存在指示所述受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。
39.根据权利要求38所述的方法,其中所述受试者是SLC9A3R2参考,并且以标准剂量量向所述受试者施用或继续施用所述治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,且施用SLC9A3R2抑制剂。
40.根据权利要求38所述的方法,其中所述受试者对于SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的,并且以同于或低于标准剂量量的量向所述受试者施用或继续施用所述治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,且施用SLC9A3R2抑制剂。
41.根据权利要求38至40中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子编码Arg171Trp-长、Arg171Trp-短、Arg65Trp、Arg58Trp、Arg60Trp-短、Arg60Trp-长或Arg170Trp。
42.根据权利要求38至40中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子编码Arg171Trp-长或Arg171Trp-短。
43.根据权利要求41所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子是:
基因组核酸分子,所述基因组核酸分子具有包含在对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列;
mRNA分子,所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶;或
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
44.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的所述测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶时,则所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子。
45.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子的所述测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;则所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体mRNA分子。
46.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ IDNO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2 cDNA分子的所述测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ IDNO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;则所述生物样品中的所述SLC9A3R2cDNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义cDNA分子。
47.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶。
48.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶。
49.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
50.根据权利要求44至48中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括对整个核酸分子进行测序。
51.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)对所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
52.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)对所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
53.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
a)对所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
54.根据权利要求53所述的方法,其中所述样品中的所述核酸分子是mRNA,并且在所述扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
55.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
使所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
56.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
使所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
57.根据权利要求38至43中任一项所述的方法,其中所述序列分析包括:
使所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
58.根据权利要求38至57中任一项所述的方法,其中所述核酸分子存在于从所述受试者获得的细胞内。
59.根据权利要求38至58中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2抑制剂包含抑制性核酸分子。
60.根据权利要求59所述的方法,其中所述抑制性核酸分子包含与SLC9A3R2核酸分子杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
61.根据权利要求38至58中任一项所述的方法,其中所述SLC9A3R2抑制剂包含与SLC9A3R2基因组核酸分子内的指导RNA(gRNA)识别序列杂交的Cas蛋白和gRNA。
62.根据权利要求61所述的方法,其中所述Cas蛋白是Cas9或Cpf1。
63.根据权利要求61或权利要求62所述的方法,其中所述gRNA识别序列包括或接近对应于根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置。
64.根据权利要求61或权利要求62所述的方法,其中所述gRNA识别序列位于距对应于根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处。
65.根据权利要求61或权利要求62所述的方法,其中原间隔序列邻近基序(PAM)序列位于所述gRNA识别序列下游约2至约6个核苷酸处。
66.根据权利要求61至65中任一项所述的方法,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
67.根据权利要求61至66中任一项所述的方法,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQID NO:93-112中任一个的核苷酸序列。
68.一种鉴定具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险的受试者的方法,所述方法包括:
确定或已经确定在从所述受试者获得的生物样品中存在或不存在编码溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子;
其中:
当所述受试者是SLC9A3R2参考时,则所述受试者具有增加的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险;并且
当所述受试者对于编码所述SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的或纯合的时,则所述受试者具有降低的发展出高血压、冠心病和/或心房颤动的风险。
69.根据权利要求68所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子编码Arg171Trp-长、Arg171Trp-短、Arg65Trp、Arg58Trp、Arg60Trp-短、Arg60Trp-长或Arg170Trp。
70.根据权利要求68所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子编码Arg171Trp-长或Arg171Trp-短。
71.根据权利要求69所述的方法,其中所述SLC9A3R2错义变体核酸分子是:
基因组核酸分子,所述基因组核酸分子具有包含在对应于根据SEQ ID NO:2的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列;
mRNA分子,所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:22的位置615的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:23的位置589的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:24的位置353的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:25的位置230的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:26的位置236的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:27的位置236的位置处的尿嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:28的位置604的位置处的尿嘧啶,或在对应于根据SEQ ID NO:29的位置126的位置处的尿嘧啶;或
由mRNA分子产生的cDNA分子,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59的位置615的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:60的位置589的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:61的位置353的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:62的位置230的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:63的位置236的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:64的位置236的位置处的胸腺嘧啶,在对应于根据SEQ ID NO:65的位置604的位置处的胸腺嘧啶,或在对应于根据SEQ IDNO:66的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
72.根据权利要求68至71中任一项所述的方法,其中所述确定步骤在体外进行。
73.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子的所述测序部分包含:对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶时;则所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体基因组核酸分子。
74.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子的所述测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;则所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体mRNA分子。
75.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2cDNA分子的核苷酸序列的至少一部分进行测序,其中所述测序部分包含对应于以下的位置:对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;
其中当所述生物样品中的所述SLC9A3R2 cDNA分子的所述测序部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ IDNO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;则所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2 cDNA分子是编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的SLC9A3R2错义变体cDNA分子。
76.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶。
77.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶。
78.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)使所述生物样品与引物接触,所述引物与所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的一部分杂交,所述部分接近对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;
b)将所述引物延伸至少通过所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列的对应于以下的位置:根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615;根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589;根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353;根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230;根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236;根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604;或根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126;以及
c)确定所述引物的所述延伸产物是否包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
79.根据权利要求73至78中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括对整个核酸分子进行测序。
80.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)对所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
81.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)对所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
82.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
a)对所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的至少一部分进行扩增,其中所述部分包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;
b)用可检测标记来标记所述扩增的核酸分子;
c)使所述标记的核酸分子与包含改变特异性探针的支持物接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述扩增的核酸分子的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述扩增的核酸分子的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及
d)检测所述可检测标记。
83.根据权利要求82所述的方法,其中所述样品中的所述核酸分子是mRNA,并且在所述扩增步骤之前将所述mRNA逆转录成cDNA。
84.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
使所述生物样品中的所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2基因组核酸分子或其互补序列的核苷酸序列包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
85.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
使所述生物样品中的所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2 mRNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
86.根据权利要求68至72中任一项所述的方法,其中所述确定步骤包括:
使所述生物样品中由mRNA分子产生的所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列与包含可检测标记的改变特异性探针接触,其中所述改变特异性探针包含在严格条件下与所述SLC9A3R2 cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列杂交的核苷酸序列,所述SLC9A3R2cDNA分子或其互补序列的核苷酸序列包含:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ IDNO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶;以及
检测所述可检测标记。
87.根据权利要求68至86中任一项所述的方法,其中所述受试者是SLC9A3R2参考,并且所述方法还包括以标准剂量量向所述受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,以及向所述受试者施用SLC9A3R2抑制剂。
88.根据权利要求68至86中任一项所述的方法,其中所述受试者对于SLC9A3R2错义变体核酸分子是杂合的,并且所述方法还包括以同于或低于标准剂量量的量向所述受试者施用治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,以及向所述受试者施用SLC9A3R2抑制剂。
89.一种治疗或预防高血压、冠心病和/或心房颤动的治疗剂,其用于治疗或预防被鉴定为具有以下的受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动:
编码溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)预测的功能丧失多肽的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述基因组核酸分子具有在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列;
编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的mRNA分子或其互补序列,其中所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;或
编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的cDNA分子或其互补序列,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
90.一种溶质载剂家族9同工型A3调控因子2(SLC9A3R2)抑制剂,其用于治疗或预防受试者的高血压、冠心病和/或心房颤动,所述受试者:
a)是SLC9A3R2基因组核酸分子、SLC9A3R2 mRNA分子或SLC9A3R2 cDNA分子的参考;或者
b)对于以下是杂合的:
i)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的基因组核酸分子或其互补序列,其中所述基因组核酸分子具有包含在对应于根据SEQ ID NO:2或其互补序列的位置9,519的位置处的胸腺嘧啶的核苷酸序列;
ii)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的mRNA分子或其互补序列,其中所述mRNA分子具有包含以下的核苷酸序列:
在对应于根据SEQ ID NO:22或其互补序列的位置615的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:23或其互补序列的位置589的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:24或其互补序列的位置353的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:25或其互补序列的位置230的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:26或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:27或其互补序列的位置236的位置处的尿嘧啶;
在对应于根据SEQ ID NO:28或其互补序列的位置604的位置处的尿嘧啶;或在对应于根据SEQ ID NO:29或其互补序列的位置126的位置处的尿嘧啶;或
iii)编码SLC9A3R2预测的功能丧失多肽的cDNA分子或其互补序列,其中所述cDNA分子具有包含以下的核苷酸序列:在对应于根据SEQ ID NO:59或其互补序列的位置615的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:60或其互补序列的位置589的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:61或其互补序列的位置353的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:62或其互补序列的位置230的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:63或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;
在对应于根据SEQ ID NO:64或其互补序列的位置236的位置处的胸腺嘧啶;在对应于根据SEQ ID NO:65或其互补序列的位置604的位置处的胸腺嘧啶;或在对应于根据SEQ IDNO:66或其互补序列的位置126的位置处的胸腺嘧啶。
91.根据权利要求90所述的SLC9A3R2抑制剂,其是抑制性核酸分子。
92.根据权利要求91所述的SLC9A3R2抑制剂,其中所述抑制性核酸分子是与SLC9A3R2核酸分子杂交的反义核酸分子、小干扰RNA(siRNA)或短发夹RNA(shRNA)。
93.根据权利要求90所述的SLC9A3R2抑制剂,其包含与SLC9A3R2基因组核酸分子内的指导RNA(gRNA)识别序列杂交的Cas蛋白和gRNA。
94.根据权利要求93所述的SLC9A3R2抑制剂,其中所述Cas蛋白是Cas9或Cpf1。
95.根据权利要求93或权利要求94所述的SLC9A3R2抑制剂,其中所述gRNA识别序列包括或接近根据SEQ ID NO:1的位置9,519。
96.根据权利要求93或权利要求94所述的SLC9A3R2抑制剂,其中所述gRNA识别序列位于距对应于根据SEQ ID NO:1的位置9,519的位置约1000、约500、约400、约300、约200、约100、约50、约45、约40、约35、约30、约25、约20、约15、约10或约5个核苷酸处。
97.根据权利要求93或权利要求94所述的SLC9A3R2抑制剂,其中原间隔序列邻近基序(PAM)序列位于所述gRNA识别序列下游约2至约6个核苷酸处。
98.根据权利要求93至97中任一项所述的SLC9A3R2抑制剂,其中所述gRNA包含约17至约23个核苷酸。
99.根据权利要求93至98中任一项所述的SLC9A3R2抑制剂,其中所述gRNA识别序列包含根据SEQ ID NO:93-112中任一个的核苷酸序列。
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