CN117363777B - 与棉花纤维长度和强度相关的kasp分子标记及应用 - Google Patents
与棉花纤维长度和强度相关的kasp分子标记及应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN117363777B CN117363777B CN202311381204.XA CN202311381204A CN117363777B CN 117363777 B CN117363777 B CN 117363777B CN 202311381204 A CN202311381204 A CN 202311381204A CN 117363777 B CN117363777 B CN 117363777B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- seq
- strength
- base
- length
- kasp
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 title claims abstract description 27
- 239000003147 molecular marker Substances 0.000 title claims abstract description 16
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims abstract description 5
- 244000299507 Gossypium hirsutum Species 0.000 claims description 12
- 235000009429 Gossypium barbadense Nutrition 0.000 claims description 11
- 235000018322 upland cotton Nutrition 0.000 claims description 11
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 5
- 230000003321 amplification Effects 0.000 claims description 2
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 claims description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 abstract description 7
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 27
- 241000219146 Gossypium Species 0.000 description 9
- 238000009395 breeding Methods 0.000 description 9
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 description 9
- 239000000463 material Substances 0.000 description 9
- 239000003550 marker Substances 0.000 description 7
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 6
- 238000011161 development Methods 0.000 description 5
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 5
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 3
- 238000007844 allele-specific PCR Methods 0.000 description 2
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 102100021391 Cationic amino acid transporter 3 Human genes 0.000 description 1
- 235000009432 Gossypium hirsutum Nutrition 0.000 description 1
- 108091006230 SLC7A3 Proteins 0.000 description 1
- 238000012896 Statistical algorithm Methods 0.000 description 1
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 1
- 230000009418 agronomic effect Effects 0.000 description 1
- 238000012098 association analyses Methods 0.000 description 1
- 230000002860 competitive effect Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 230000002596 correlated effect Effects 0.000 description 1
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 1
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 1
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 1
- 230000004907 flux Effects 0.000 description 1
- 231100000221 frame shift mutation induction Toxicity 0.000 description 1
- 230000037433 frameshift Effects 0.000 description 1
- 238000003205 genotyping method Methods 0.000 description 1
- 238000003306 harvesting Methods 0.000 description 1
- 238000012165 high-throughput sequencing Methods 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 230000004807 localization Effects 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 102000054765 polymorphisms of proteins Human genes 0.000 description 1
- 230000000750 progressive effect Effects 0.000 description 1
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 238000012353 t test Methods 0.000 description 1
- 239000004753 textile Substances 0.000 description 1
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000001521 two-tailed test Methods 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6858—Allele-specific amplification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/13—Plant traits
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Botany (AREA)
- Mycology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种与棉花纤维长度和强度相关的KASP分子标记,所述分子标记为D5染色体上第4953849碱基和第5166088碱基处的突变;其中,第4953849处为基G/C突变,第5166088处为基A/T突变,在实际鉴定时,以SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.3和/或SEQ ID NO.4~SEQ ID NO.6所示引物对待测样品的基因组进行扩增,判断标准为:4953849位点为碱基G,则为长强株系,4953849位点为碱基C,则为短弱株系;5166088位点为碱基A,则为长强株系,5166088位点为碱基T,则为短弱株系。
Description
技术领域
本发明涉及与棉花纤维长度和强度相关的KASP分子标记技术领域,更具体的说是涉及与棉花纤维长度和强度相关的KASP分子标记及应用。
背景技术
陆地棉(Gossypium hirsutum L.)占所有种植棉花的90%-95%。育种家致力于提高陆地棉的纤维质量,特别是纤维长度(FL)和强度(FS),同时稳定产量以满足现代纺织业的需求。有限的遗传背景和纤维质量与产量之间的负遗传相关性是使用常规育种程序进一步改良棉花品种的主要制约因素。因此,了解纤维发育的复杂遗传基础,精细定位FL和FS的稳定数量性状位点(QTL)是当前棉花生物学的一个重要目标。尽管目前已经定位了许多纤维品质QTL,但在分子育种中有筛选效果的分子标记很少,所以,亟须发掘一些新的、有效的分子标记应用于优质棉选育。
竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive allele specific PCR,KASP)技术是基于引物末端碱基的特异匹配对SNP位点进行精准的双等位基因判断,对SNP分型准确性高,且兼具成本低,通量高的优点,可用于品种鉴定、遗传图谱构建、种质遗传多样性分析、分子标记辅助育种等方面,而有关陆地棉纤维品质KASP标记开发及利用的研究很少。
因此,如何提供一种与棉花纤维长度和强度相关的KASP分子标记用于棉花纤维强度、长度分子标记辅助育种是本领域技术人员亟需解决的问题。
发明内容
有鉴于此,本发明提供了一种与棉花纤维长度和强度相关的KASP分子标记及应用。
为了实现上述目的,本发明采用如下技术方案:
与棉花纤维长度和强度相关的KASP分子标记,所述分子标记为D5染色体上第4953849碱基和第5166088碱基处的突变;其中,第4953849处为基G/C突变,第5166088处为基A/T突变。
作为与上述技术方案相同的发明构思,本发明还请求保护所述的与棉花纤维长度和强度相关的KASP分子标记在鉴定棉花纤维长度和强度中的应用,以SEQ ID NO.1~SEQID NO.3和/或SEQ ID NO.4~SEQ ID NO.6所示引物对待测样品的基因组进行扩增,判断标准为:
4953849位点为碱基G,则为长强株系,4953849位点为碱基C,则为短弱株系;
5166088位点为碱基A,则为长强株系,5166088位点为碱基T,则为短弱株系。
作为与上述技术方案相同的发明构思,本发明还请求保护一种鉴定棉花纤维长度和强度的引物,所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.3和/或SEQ ID NO.4~SEQ ID NO.6所示。
作为与上述技术方案相同的发明构思,本发明还请求保护一种鉴定棉花纤维长度和强度的试剂盒,所述试剂盒包括SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.3和/或SEQ ID NO.4~SEQ IDNO.6所示的引物。
经由上述的技术方案可知,与现有技术相比,本发明以国审杂交棉冀1518稳定的分离后代(F2:9)为材料,构建纤维品质分离群体(次级F2,次级F2:3群体),通过混池重测序对纤维品质进行关联分析,在D5染色体上获得了一个同时与纤维强度和长度关联的候选区域,总长度为0.54Mb,该区域内非同义突变SNP位点30个,移码突变位点4个。上述差异位点可能同时和纤维品质相关,在此基础上,开发并鉴证了2个KASP标记在多环境下稳定与纤维强度、长度紧密连锁,可用于棉花纤维强度、长度的分子标记辅助育种,加快优质棉的育种进程。
本发明提供的纤维品质相关的KASP标记,可以区分大量材料的基因型,而G-A基因型棉花的纤维长度和纤维比强度高于C-T基因型棉花,据此,该SNP标记辅助育种,能够更快的得到高品质棉花,KASP标记可用于大量材料的快速检测,可以利用根茎花叶等任一器官提取DNA,与测序、芯片等方式相比,成本低且高效。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案,下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍,显而易见地,下面描述中的附图仅仅是本发明的实施例,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据提供的附图获得其他的附图。
图1附图为KASP1标记D5_4953849-G/C分型图;
图2附图为KASP2标记D5_5166088-A/T分型图;
图3附图为实施例1中KASP标记对纤维长度(a)和强度(b)的筛选效果;图中:**代表数值达到极显著(P<0.01)差异水平。
图4附图为实施例2中KASP标记对纤维长度(a)和强度(b)的筛选效果;图中:**代表数值达到极显著(P<0.01)差异水平。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例中的附图,对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
实施例1KASP标记的获得
由国审杂交棉冀1518的自交后代产生的两个品系A1(长强)和A29(短弱)因其相似的农艺性状但纤维品质不同而被指定为亲本。因此,866个F2:3后代具有分离的纤维品质值,这种值在各种环境中持续存在。在每种环境下对纤维品质的统计表明其正态分布,因此适合于QTL分析。随后,结合三个环境中的数据进行了BLUP分析,以消除环境影响。
作为遗传图谱的另一个组成部分,分子标记是通过BSA-seq获得的。具体而言,制备了四个DNA文库,包括两个亲本(A1和A29)和两个后代群体(L-池和S-池)。A1亲本和L-池代表优质材料,而A29线和S-池代表短弱材料。然后将这四个文库分别置于IlluminaHiSeqTM 2500平台上进行高通量测序。总共产生了181048812-195933384个干净的读数,这代表了至少20倍的深度覆盖率和99%以上的陆地棉参考基因组的作图率(表1)。这保证了下游单核苷酸多态性(SNPs)的检测和标记物的开发。结果,检测到273993个SNPs和74813个插入/缺失(InDels)。
表1四个BSA-seq库的测序数据汇总和与陆地棉参考基因组的比对
样品编号 | 测序读长 | GC含量(%) | Q30(%) | 匹配度(%) | 测序深度(×) |
A1 | 181115186 | 34.38 | 93.17 | 99.32 | 21 |
A29 | 181048812 | 34.68 | 93.37 | 99.69 | 22 |
H-bulk | 183163440 | 34.41 | 93.63 | 99.56 | 22 |
L-bulk | 195933384 | 34.63 | 93.52 | 99.49 | 23 |
基于高质量的SNPs,结合ED和SNP指数方法,将纤维长度、强度QTL定位到0.71Mb范围(表2)。在上述0.71Mb区域均匀选择23个纯合SNPs和一个InDel来开发KASP标记,24个标记中的20个在亲本(A1和A29)和群体(L-池和S-池)之间效果良好。所有20个标记都用于对具有280个F2:3株系进行基因分型,其中KASP1和KASP2分别可以准确鉴定D5_4953849-G/C分型(图1)和D5_5166088-A/T分型(图2),结合2年3个重复的纤维品质数据,利用t-test双尾测验函数检测上述分型位点与纤维长度、强度的相关性,结果表明,上述标记位点与纤维长度、强度显著相关(图3)。
表2基于SNPs和InDels的两种统计算法的QTL区域的交集
染色体ID | 开始(bp) | 结尾(bp) | 区间(Mb) | 基因数量 |
D05 | 4494901 | 4508703 | 0.01 | 2 |
D05 | 4514667 | 4983123 | 0.47 | 56 |
D05 | 5092145 | 5115029 | 0.02 | 2 |
D05 | 5116036 | 5119404 | 0.00 | 2 |
D05 | 5128544 | 5168646 | 0.04 | 6 |
D08 | 66692538 | 66865933 | 0.17 | 20 |
Total | - | - | - | 88 |
KASP1鉴定D5_4953849处碱基(G/C)鉴定的KASP引物对如下:
Primer_AlleleX:
5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTGGAGATCTCTGAAAGGGTTTACC-3’,如SEQ ID NO.1所示;
Primer_AlleleY:
5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTGGAGATCTCTGAAAGGGTTTAC G-3’,如SEQ ID NO.2所示;
Primer_Common:
5’-GTCCAAATTAGTAACATTCATGGAAGCAAA-3’,如SEQ ID NO.3所示。
通过KASP1可快速鉴定D5_4953849位点,此位点碱基G为长强株系,碱基C为短弱株系;
同理,KASP2鉴定D5_5166088处碱基(A/T),鉴定的KASP引物对如下:
Primer_AlleleX:
5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCTACCGAAAGAGGAAGCTTTAGTG CAA-3’,如SEQ ID NO.4所示;
Primer_AlleleY:
5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATTACCGAAAGAGGAAGCTTTAGTG CAT-3’,如SEQ ID NO.5所示;
Primer_Common:
5’-CACGTTCTTGGCTACCCCTGTAATT-3’,如SEQ ID NO.6所示。
通过KASP2可快速鉴定D5_5166088位点,此位点碱基A为长强株系,碱基T为短弱株系.
实施例2验证KASP标记对育种材料纤维长度、强度的筛选效果
调查380份棉花骨干育种材料在威县、衡水和石家庄2021和2022的纤维品质数据,随机区组种植,7米行长,三行区,收获期取中部30铃测定纤维品质指标(长度、强度、马克隆值、伸长率、整齐度),利用最佳线性无偏预测(Best LinearUnbiasedPrediction,BLUP)处理表型数据降低环境影响。同时提取380份骨干材料的DNA利用KASP标记检测D5_4953849和D5_5166088分型位点,并利用t-test双尾测验函数检测分型位点与纤维长度、强度的相关性。
具体过程为:
(1)提取陆地棉不同材料种子、嫩叶或其他组织的基因组DNA,同时测定不同材料的纤维品质表型
(2)纤维品质KASP标记开发。本研究中与纤维长度、强度均紧密连锁的KASP引物序列如上
(3)KASP基因分型
KASP-PCR反应在Douglas ArrayPlatform进行,在NEXAR液体处理工作站上DNA和PCR mix加入arraytape,在SOELLEX高通量PCR水浴中完成PCR反应,ARAYA荧光阅读仪上读取荧光信号,然后将结果导入数据库在Douglas Scientific Dashboard按照分型明确、NTC(无样品阴性对照)无特异性扩增的原则进行样品SNP分型。
(4)利用2个KASP分子标记分别判定纤维长度和强度。
结果显示2个KASP标记均对陆地棉纤维长度和强度有显著的影响(图4),上述两个KASP标记每一个均可单独用于优质棉后代株系筛选,可用于分子标记辅助选择。2个KASP标记联合检测可以鉴定分型误差,提高筛选的准确率,在筛选长强材料时,优先选择D5_4953849为G,D5_5166088位点为A的株系。
本说明书中各个实施例采用递进的方式描述,每个实施例重点说明的都是与其他实施例的不同之处,各个实施例之间相同相似部分互相参见即可。
对所公开的实施例的上述说明,使本领域专业技术人员能够实现或使用本发明。对这些实施例的多种修改对本领域的专业技术人员来说将是显而易见的,本文中所定义的一般原理可以在不脱离本发明的精神或范围的情况下,在其它实施例中实现。因此,本发明将不会被限制于本文所示的这些实施例,而是要符合与本文所公开的原理和新颖特点相一致的最宽的范围。
Claims (1)
1.与陆地棉纤维长度和强度相关的KASP分子标记在鉴定陆地棉纤维长度和强度中的应用,所述分子标记为陆地棉D5染色体上第4953849位点和第5166088位点处的突变碱基;其中,第4953849位点处的突变碱基为G/C,第5166088位点处的突变碱基为A/T;其特征在于,以SEQ ID NO.1-SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4-SEQ ID NO.6所示的引物序列组合对待测陆地棉样品的基因组进行扩增,扩增结果的判断标准为:
第4953849位点处的突变碱基为G,则为长强株系,第4953849位点处的突变碱基为C,则为短弱株系;
第5166088位点处的突变碱基为A,则为长强株系,第5166088位点处的突变碱基为T,则为短弱株系。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202311381204.XA CN117363777B (zh) | 2023-10-24 | 2023-10-24 | 与棉花纤维长度和强度相关的kasp分子标记及应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202311381204.XA CN117363777B (zh) | 2023-10-24 | 2023-10-24 | 与棉花纤维长度和强度相关的kasp分子标记及应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN117363777A CN117363777A (zh) | 2024-01-09 |
CN117363777B true CN117363777B (zh) | 2024-05-28 |
Family
ID=89407381
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202311381204.XA Active CN117363777B (zh) | 2023-10-24 | 2023-10-24 | 与棉花纤维长度和强度相关的kasp分子标记及应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN117363777B (zh) |
Citations (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106868131A (zh) * | 2017-02-22 | 2017-06-20 | 中国农业科学院棉花研究所 | 陆地棉6号染色体与纤维强度相关的snp分子标记 |
CN107043813A (zh) * | 2017-02-22 | 2017-08-15 | 中国农业科学院棉花研究所 | 陆地棉25号染色体与纤维强度相关的snp分子标记 |
CN107338247A (zh) * | 2017-07-21 | 2017-11-10 | 河北农业大学 | 与陆地棉纤维强度关联的snp分子标记及其应用 |
CN111218524A (zh) * | 2020-03-30 | 2020-06-02 | 河南农业大学 | 棉花纤维品质相关的GhJMJ12基因SNP标记及其应用 |
CN111218525A (zh) * | 2020-03-30 | 2020-06-02 | 中国农业科学院棉花研究所 | 棉花纤维品质相关的GhCYSb基因SNP标记及其应用 |
CN112094935A (zh) * | 2020-09-23 | 2020-12-18 | 河北省农林科学院粮油作物研究所 | 鉴定棉花纤维比强度和马克隆值的snp分子标记及应用 |
WO2022198939A1 (zh) * | 2021-03-23 | 2022-09-29 | 浙江大学 | 一个同时改良棉花纤维长度、强度、伸长率的b3转录因子基因及其应用 |
CN115992288A (zh) * | 2022-11-14 | 2023-04-21 | 新疆农业大学 | 陆地棉GhRF09基因的抗旱性相关分子标记及应用 |
-
2023
- 2023-10-24 CN CN202311381204.XA patent/CN117363777B/zh active Active
Patent Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN106868131A (zh) * | 2017-02-22 | 2017-06-20 | 中国农业科学院棉花研究所 | 陆地棉6号染色体与纤维强度相关的snp分子标记 |
CN107043813A (zh) * | 2017-02-22 | 2017-08-15 | 中国农业科学院棉花研究所 | 陆地棉25号染色体与纤维强度相关的snp分子标记 |
CN107338247A (zh) * | 2017-07-21 | 2017-11-10 | 河北农业大学 | 与陆地棉纤维强度关联的snp分子标记及其应用 |
CN111218524A (zh) * | 2020-03-30 | 2020-06-02 | 河南农业大学 | 棉花纤维品质相关的GhJMJ12基因SNP标记及其应用 |
CN111218525A (zh) * | 2020-03-30 | 2020-06-02 | 中国农业科学院棉花研究所 | 棉花纤维品质相关的GhCYSb基因SNP标记及其应用 |
CN112094935A (zh) * | 2020-09-23 | 2020-12-18 | 河北省农林科学院粮油作物研究所 | 鉴定棉花纤维比强度和马克隆值的snp分子标记及应用 |
AU2020104241A4 (en) * | 2020-09-23 | 2021-03-11 | Institute Of Cereal And Oil Crops, Hebei Academy Of Agriculture And Forestry Sciences | SNP Molecular Markers for Identifying Fiber Specific Strength and Micronaire Value of Cotton and Application |
WO2022198939A1 (zh) * | 2021-03-23 | 2022-09-29 | 浙江大学 | 一个同时改良棉花纤维长度、强度、伸长率的b3转录因子基因及其应用 |
CN115992288A (zh) * | 2022-11-14 | 2023-04-21 | 新疆农业大学 | 陆地棉GhRF09基因的抗旱性相关分子标记及应用 |
Non-Patent Citations (4)
Title |
---|
Aspartyl proteases identified as candidate genes of a fiber length QTL, qFLD05, that regulates fiber length in cotton (Gossypium hirsutum L.);Sujun Zhang等;Theoretical and Applied Genetics;20240226;第137卷(第59期);第1-13页 * |
Genome-wide association study reveals novel SNPs and genes in Gossypium hirsutum underlying Aphis gossypii resistance;Jun Yang等;Theor Appl Genet;20230707;第136卷(第8期);第1-17页 * |
High Resolution Consensus Mapping of Quantitative Trait Loci for Fiber Strength, Length and Micronaire on Chromosome 25 of the Upland Cotton (Gossypium hirsutum L.);Zhen Zhang等;PLoS One;20150811;第10卷(第8期);第1-17页 * |
QTL controlling fiber quality traits under salt stress in upland cotton (Gossypium hirsutum L.);An-Hui Guo等;Theor Appl Genet;20210228;第134卷(第2期);第661-685页 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN117363777A (zh) | 2024-01-09 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN111218524B (zh) | 棉花纤维品质相关的GhJMJ12基因SNP标记及其应用 | |
CN110042172B (zh) | 一种基于snp标记的柑橘杂种快速鉴定引物及方法 | |
WO2008154472A2 (en) | Methods for sequence-directed molecular breeding | |
CN108977441B (zh) | 一种辅助鉴定小麦粒重性状的方法及其专用引物组 | |
CN112795691B (zh) | 与玉米茎粗连锁的分子标记及其应用 | |
CN110872633B (zh) | 一种基于snp标记鉴定京科968玉米杂交种纯度的方法 | |
WO2022165853A1 (zh) | 一种大豆snp分型检测芯片及其在分子育种与基础研究中的应用 | |
US20210285063A1 (en) | Genome-wide maize snp array and use thereof | |
CN112094935A (zh) | 鉴定棉花纤维比强度和马克隆值的snp分子标记及应用 | |
CN110777216B (zh) | 一种基于snp标记鉴定京科糯2000玉米杂交种纯度的方法 | |
CN110724758A (zh) | 一种基于snp标记鉴定京农科728玉米杂交种纯度的方法 | |
US20170022574A1 (en) | Molecular markers associated with haploid induction in zea mays | |
CN111235282B (zh) | 一种与猪总乳头数相关的snp分子标记及其应用和获取方法 | |
AU2019257719B2 (en) | Methods for genotyping haploid embryos | |
US20130040826A1 (en) | Methods for trait mapping in plants | |
CN117363777B (zh) | 与棉花纤维长度和强度相关的kasp分子标记及应用 | |
Xu et al. | Enhancement of plant variety protection and regulation using molecular marker technology | |
CN109439788B (zh) | 与小麦株高主效基因位点紧密连锁的kasp分子标记及其应用 | |
US5332408A (en) | Methods and reagents for backcross breeding of plants | |
CN112795693B (zh) | 与玉米叶片叶绿素含量相关的分子标记及其应用 | |
EP0972079A1 (en) | A method to identify and breed corn with increased kernel oil concentration | |
US20140199694A1 (en) | Major qtls conferring resistance of corn to fijivirus | |
CN118127208A (zh) | 一种小麦条锈病基因Yr30连锁的KASP分子标记及其应用 | |
CN115820895A (zh) | 与玉米叶绿素含量紧密连锁的分子标记及其应用 | |
CN117737288A (zh) | 一种与陆地棉纤维长度性状相关的InDel分子标记及其应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |