CN117120418A - 化合物(i)的制备方法 - Google Patents

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Abstract

本申请总体上涉及(6R,10S)‑10‑{4‑[5‑氯‑2‑(4‑氯‑1H‑1,2,3‑三唑‑1‑基)苯基]‑6‑氧代‑1(6H)‑嘧啶基}‑1‑(二氟甲基)‑6‑甲基‑1,4,7,8,9,10‑六氢‑11,15‑(亚甲桥基)吡唑并[4,3‑b][1,7]二氮杂环十四炔‑5(6H)‑酮的若干制备方法:

Description

化合物(I)的制备方法
技术领域
本发明总体上涉及(6R,10S)-10-{4-[5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯基]-6-氧代-1(6H)-嘧啶基}-1-(二氟甲基)-6-甲基-1,4,7,8,9,10-六氢-11,15-(亚甲桥基)吡唑并[4,3-b][1,7]二氮杂环十四炔-5(6H)-酮(一种适用于治疗血栓栓塞病症的FXIa抑制剂)的若干制备方法,所述血栓栓塞病症包括静脉血栓及深静脉血栓。
背景技术
因子XIa为一种参与调控血凝结的血浆丝氨酸蛋白酶,该血凝结为通过组织因子(TF)与因子VII(FVII)结合以产生因子VIIa(FVIIa)而体内引发。所得TF:FVIIa复合物活化因子IX(FIX)及因子X(FX),其使得产生因子Xa(FXa)。所产生的FXa催化凝血酶原转化为少量凝血酶,之后此路径通过组织因子路径抑制剂(TFPI)中断。凝血过程然后经由催化量的凝血酶回馈活化因子V、VIII及XI而进一步传播。(Gailani,D.等人,Arterioscler.Thromb.Vasc.Biol.,27:2507-2513(2007)。)所得凝血酶爆发将血纤维蛋白原转化为血纤维蛋白,该纤维蛋白聚合以形成血凝块的结构骨架且活化血小板,所述血小板为凝血的关键细胞组分(Hoffman,M.,Blood Reviews,17:S1-S5(2003))。因此,因子XIa在传播此扩增回路中发挥关键作用,且因这是抗血栓疗法的有吸引力的目标。
美国专利第9,453,018号公开作为适用于治疗血栓栓塞病症的因子XIa抑制剂的巨环化合物。所述化合物中之一者具有以下结构:
然而,存在与以下情形相关的困难:使公开于美国专利第9,453,018号中的多步合成适应于较大规模合成,诸如在实验工厂中或在制造规模上生产。一个困难为古露比斯(Grubbs)(II)试剂由于其较高成本而并不容易适应于商业规模合成。此外,持续地需要寻找一种提供较高产率以便改良制造经济和/或减少浪费的方法。优选地,新方法将采用较不昂贵的起始材料。
相较于通过实验室标度方法通常所制备的量,本申请为针对适用于制备更大量的化合物(I)的方法。相较于先前所公开的在制造规模上的方法的产率,本申请亦针对提供更高化合物(I)产率的方法。
具体言之,采用替代新颖化合物以达成化合物(I),所述新颖化合物减少合成步骤的量,不太昂贵,且最终提供较高产率。
发明内容
本文中描述了(6R,10S)-10-{4-[5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯基]-6-氧代-1(6H)-嘧啶基}-1-(二氟甲基)-6-甲基-1,4,7,8,9,10-六氢-11,15-(亚甲桥基)吡唑并[4,3-b][1,7]二氮杂环十四炔-5(6H)-酮的若干制备方法。
因此,在第一方面中,本发明提供一种用于制备化合物的晶体溶剂合物形式的方法,该化合物由以下表示:
该方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物A:
与N,N-二甲基甲酰胺二甲缩醛在合适的溶剂中反应,以得到含有甲醇作为副产物的混合物;
(b)向步骤(a)的该混合物中添加具有以下结构的化合物C:
以得到化合物(I)的晶体溶剂合物形式:
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的一个实施方案中,在步骤(b)之前移除甲醇。
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的一个实施方案中,在自步骤(a)的混合物移除甲醇之后添加乙酸。
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的另一个实施方案中,在步骤(b)中添加化合物C之后添加三甲胺。
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的一个实施方案中,使化合物(I)在甲醇与水的混合物中结晶,接着用丙酮水溶液进行冲洗以得到化合物(I)的晶体丙酮溶剂合物形式。
在第二方面中,本发明提供一种以下的晶体溶剂合物形式:
在化合物(I)的晶体溶剂合物形式的X射线粉末衍射图案的一个实施方案中,该X射线粉末衍射图案包含一、二、三或四个选自按以下°2θ值表述的峰的峰:20.0±0.2、21.3±0.2、21.6±0.2及23.9±0.2。
在化合物(I)的晶体丙酮溶剂合物形式的一个实施方案中,该晶体形式展现出具有以倒数波数单位(cm-1)表述为以下值的特征峰的傅立叶(Fourier)变换红外光谱:约1709、约1676、约1532、约1485、约1457、约1441、约1432、约1370、约1291、约1219、约1189、约1135、约1119、约1068、约1039、约994、约942、约883、约827、约801及约696。
附图说明
借助于实施例给出但并不意欲将本发明仅限制于所描述的特定实施方案的以下实施方式可结合附图予以最佳理解。
图1说明化合物(I)的晶体形式作为丙酮溶剂合物的XRPD光谱。
图2说明化合物(I)的晶体形式作为丙酮溶剂合物的IR光谱。
具体实施方式
参考与附图及实施例结合的以下实施方式可更容易地理解本发明,所述附图及实施例形成本发明的一部分。应理解,本发明不限于本文中所描述和/或展示的特定装置、方法、应用、条件或参数,且本文中所使用的术语仅出于借助于实施例来描述特定实施方案的目的,且不意欲限制所主张的发明。另外,如包括随附权利要求书的本说明书中所使用,除非上下文另外清楚地规定,否则单数形式“一(a/an)”及“该”包括复数,且对特定数值的参考包括至少该特定值。
如本文中所使用,术语“包含”、“包括”、“具有(having/has)”、“可”、“含有”及其变化形式意欲为需要经命名成分/步骤的存在且准许其他成分/步骤的存在的开放式过渡词组、术语或字语。然而,此描述应理解为亦描述如“由”所枚举化合物“组成”及“基本上由”所枚举化合物“组成”的组合物或方法,其仅允许经命名化合物以及任何药学载剂的存在,且不包括其他化合物。
定义
如本文中所使用,“药学上可接受的盐”是指本发明化合物的衍生物,其中母化合物通过制成其酸盐或碱盐而经改质。这些最终产物的游离形式及盐皆在本发明的范围内。
除非另外指示,否则所有手性(对映异构体及非对映异构体)及外消旋形式在本发明的范围内。化合物中亦可存在C=C双键、C=N双键、环系统及其类似者的诸多几何异构物,且所有此类稳定异构物均涵盖于本发明中。描述本发明的化合物的顺式及反式(或E型及Z型)几何异构物,且所述顺式及反式几何异构物可以异构物混合物形式或以经分离的异构物形式进行分离。本发明化合物可以光学活性或外消旋形式进行分离。光学活性形式可通过拆分外消旋形式或通过自光学活性起始材料合成来制备。
术语“立体异构体”是指具有相同构成的异构物,其不同之处在于所述异构物的原子在空间中的排列。对映异构体及非对映异构体为立体异构体的实施例。术语“对映异构体”是指为彼此的镜像且不可重叠的一对分子物质中之一者。术语“非对映异构体”是指不为镜像的立体异构体。术语“外消旋体”或“外消旋混合物”是指由等摩尔量的两种对映异构体种构成的组合物,其中组合物不含光学活性。
符号“R”及“S”代表手性碳原子周围的取代基的构型。异构物描述符“R”及“S”如本文中所描述用于指示相对于核心分子的原子构型,且意欲如文献中所定义来使用(IUPACRecommendations 1996,Pure and Applied Chemistry,68:2193-2222(1996))。
术语“手性”是指使得不可能将分子叠印于其镜像上的分子结构特性。术语“同手性”是指对映异构体纯度的状态。术语“光学活性”是指同手性分子或手性分子的非外消旋混合物旋转偏振光的平面的角度。
本发明的化合物、其游离形式及盐可以多种互变异构象式存在,其中氢原子转置至分子的其他部分且分子的原子之间的化学键因此重排。应理解,所有互变异构象式只要其可能存在则皆包括于本发明内。
IR光谱分析,尤其FT-IR为可用以与X射线粉末衍射一起或与X射线粉末衍射分开表征固体形式的技术。在IR光谱中,经吸收光以“波数”单位(cm-1)标绘于曲线图的x轴上,其中强度在y轴上。IR峰的位置的变化亦存在,且可归因于样本条件以及数据收集与处理。本文中所报导的IR光谱的典型变异性为约±2.0cm-1。因此,当参考IR峰时,字语“约”的使用意谓包括此变异性,且本文中所公开的所有IR峰意欲报导具有此变异性。
术语“还原剂”是指将通过向起始材料中的碳原子中添加氢原子或向此碳中添加电子而降低此碳的氧化态的任何试剂,且由此对于一般熟习此项技术及知识者将显而易见。“还原剂”的定义包括但不限于:硼烷-二甲硫复合物、9-硼双环[3.3.1]壬烷(9-BBN)、儿茶酚硼烷、硼氢化锂、硼氢化钠、硼氢化钠-甲醇复合物、硼氢化钾、羟基硼氢化钠、三乙基硼氢化锂、正丁基硼氢化锂、氰基硼氢化钠、硼氢化钙(II)、氢化锂铝、氢化二异丁基铝、氢化正丁基-二异丁基铝、氢化钠双甲氧基乙氧基铝、三乙氧基硅烷、二乙氧基甲基硅烷、氢化锂、锂、钠、氢Ni/B及其类似者。某些酸及路易斯酸(Lewis acidic)试剂增强还原试剂的活性。此类酸性试剂的实施例包括:乙酸、甲烷磺酸、氢氯酸及其类似者。此类路易斯酸试剂的实施例包括:三甲氧基硼烷、三乙氧基硼烷、三氯化铝、氯化锂、三氯化钒、二氯化二环戊二烯基钛、氟化铯、氟化钾、氯化锌(II)、溴化锌(II)、碘化锌(II)及其类似者。
术语“氧化剂”是指经历获得一个或多个电子的化学反应的化学物种。氧化剂亦指增加与氧的键合数目或减少与氢的键合数目的任何物质。氧化剂的实施例包括但不限于:氧气(O2)、臭氧(O3)、过氧化氢(H2O2)及其他无机过氧化物、芬顿试剂(Fenton's reagent)、氟气(F2)、氯气(Cl2)及其他卤素、硝酸(HNO3)及硝酸盐化合物、硫酸(H2SO4)、过二硫酸(H2S2O8)、过一硫酸(H2SO5)、次氯酸盐、亚氯酸盐、氯酸盐、过氯酸盐,及其他类似卤素化合物,如家用漂白剂(NaClO);六价铬化合物,诸如铬酸及二铬酸以及三氧化铬、氯铬酸吡片(PCC)及铬酸盐/重铬酸盐化合物;高锰酸化合物,诸如高锰酸钾(KMnO4);过硼酸钠(NaBO3);氧化亚氮(N2O);二氧化氮/四氧化二氮(NO2/N2O4);硝酸钾(KNO3);黑色粉末铋酸钠(NaBiO3)中的氧化剂;铈(IV)化合物,诸如硝酸铈铵及硫酸铈、二氧化铅(PbO2)。
术语“脱水剂”是指自材料脱水或移除水的任何物质。在发生脱水的化学反应中,反应分子失去水分子。脱水剂也可指驱动脱水反应的任何物质。实施例包括但不限于:磷酰氯(POCl3)、(COCl)2、PCl5、SOCl2、PCl3、氯化二甲基氯甲亚胺盐(dimethylchloroformiminium chloride)(ClCH=N(CH3)2Cl)、N,N'-二环己基碳化二亚胺(DCC)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳化二亚胺(EDC)、N,N'-二异丙基碳化二亚胺(DIC)、1-环己基-(2-吗啉基乙基)碳化二亚胺甲-对甲苯磺酸盐(CMCT)、甲磺酰氯(MsCl)或4-甲苯磺酰氯(TsCl)与有机碱、TiCl4与有机碱、PPh3与CCl4或CBr4、SO3·Py、特戊酰氯与有机碱及三聚氯化氰与有机碱。
术语“可移除保护基”或“保护基”是指当结合至诸如羟基或羧基的氧原子或氨基的氮原子的官能基时防止在这些官能基处发生反应的任何基团,且该保护基可通过常规化学或酶促步骤移除以重建官能基。所采用的特定可移除保护基不为关键的。
如本文中所使用的术语“配位体”是指接合钯的膦衍生物,诸如单齿或双齿芳基或烷基膦,该膦衍生物能够与钯原子络合。该术语为熟悉特定技术者所熟知的。
术语“氯化剂”或“氯化”是指向底物添加氯原子的任何物质。氯化剂为氧化剂的特定类型。实施例包括但不限于:1,3-二氯-5,5-二甲基乙内酰脲、NCS、NaClO、三氯异氰脲酸、亚硫酰氯(SOCl2)、草酰氯((COCl)2)。
如本文中所使用,缩写定义如下:
Me 甲基
Et 乙基
Pr 丙基
i-Pr 异丙基
Bu 丁基
i-Bu 异丁基
t-Bu 叔丁基
Ph 苯基
Bn 苄基
Boc或BOC 叔丁氧基羰基
Boc2O 二碳酸二叔丁酯
AcOH或HOAc 乙酸
AlCl3 氯化铝
AIBN 偶氮二异丁腈
水溶液 aq
BBr3 三溴化硼
BCl3 三氯化硼
BEMP 2-叔丁亚氨基-2-二乙氨基-1,3-二甲基全氢-1,3,2-二氮杂磷杂苯
BOP试剂 六氟磷酸苯并三唑-1-基氧基三(二甲氨基)鏻柏杰士试剂(Burgess 1-甲氧基-N-三乙基铵基磺酰基-甲酰亚胺酯reagent)
Cbz 苄氧基羰基
DCM或CH2Cl2 二氯甲烷
CH3CN或ACN 乙腈
CDCl3 氘-氯仿
CHCl3 氯仿
mCPBA或m-CPBA 间氯过苯甲酸
Cs2CO3 碳酸铯
Cu(OAc)2 乙酸铜(II)
CuI 碘化铜(I)
CuSO4 硫酸铜(II)
Cy2NMe N-环己基-N-甲基环己胺
DBU 1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一碳-7-烯
DCE 1,2-二氯乙烷
DEA 二乙胺
戴斯-马丁(Dess-Martin) 1,1,1-三(乙酰氧基)-1,1-二氢-1,2-苯碘酰-3-(1H)-酮
DIC或DIPCDI 二异丙基碳化二亚胺
DIEA、DIPEA或Hünig碱 二异丙基乙胺
(Hunig's base)
DMAP 4-二甲基氨基吡啶
DME 1,2-二甲氧基乙烷
DMF 二甲基甲酰胺
DMSO 二甲亚砜
cDNA 互补DNA
Dppp (R)-(+)-1,2-双(二苯膦基)丙烷
DuPhos (+)-1,2-双((2S,5S)-2,5-二乙基磷烷基)苯
EDC N-(3-二甲氨基丙基)-N'-乙基碳化二亚胺
EDCI N-(3-二甲氨基丙基)-N'-乙基碳化二亚胺氢氯酸盐
EDTA 乙二胺四乙酸
(S,S)-EtDuPhosRh(I) (+)-1,2-双((2S,5S)-2,5-二乙基磷烷基)苯(1,5-环辛二烯)三氟甲烷磺酸铑(I)
Et3N或TEA 三乙胺
EtOAc 乙酸乙酯
Et2O 二乙醚
EtOH 乙醇
GMF 玻璃微纤维过滤器
Grubbs II (1,3-双(2,4,6-三甲基苯基)-2-咪唑啶亚基)二氯(苯基亚甲基)(三环己基膦)钌
HCl 氢氯酸
HATU 六氟磷酸O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N',N'-四甲基脲鎓
HEPES 4-(2-羟基乙基))哌嗪-1-乙磺酸
Hex 己烷
HOBt或HOBT 1-羟基苯并三唑
H2O2 过氧化氢
H2SO4 硫酸
IBX 2-碘氧基苯甲酸
InCl3 氯化铟(III)
琼斯试剂(Jones reagent) 含CrO3的H2SO4水溶液,2M
K2CO3 碳酸钾
K2HPO4 磷酸氢二钾
K3PO4 磷酸三钾
KOAc 乙酸钾
K3PO4 磷酸钾
LAH 氢化锂铝
LG 离去基
LiOH 氢氧化锂
MeOH 甲醇
MgSO4 硫酸镁
MsOH或MSA 甲基磺酸
NaCl 氯化钠
NaH 氢化钠
NaHCO3 碳酸氢钠
Na2CO3 碳酸钠
NaOH 氢氧化钠
Na2SO3 亚硫酸钠
Na2SO4 硫酸钠
NBS N-溴丁二酰亚胺
NCS N-氯丁二酰亚胺
NH3
NH4Cl 氯化铵
NH4OH 氢氧化铵
NH4COOH 甲酸铵
NMM N-甲基吗啉
OTf 三氟甲磺酸盐或三氟甲烷磺酸盐
Pd(烯丙基)(CatacxiumA)Cl烯丙基氯化钯二(1-金刚烷基)-正丁基膦
Pd2(dba)3 三(二苯亚甲基丙酮)二钯(0)
Pd(OAc)2 乙酸钯(II)
Pd/C 钯/碳
Pd(dppf)Cl2 [1,1'-双(二苯膦基)-二茂铁]二氯钯(II)
Ph3PCl2 三苯基二氯化膦
PG 保护基
POCl3 氧氯化磷
PMDTA N,N,N',N”,N”-五甲基二乙烯三胺
i-PrOH或IPA 异丙醇
PS 聚苯乙烯
rt 室温
SEM-Cl 2-(三甲基硅基)乙氧基甲基氯化物
SiO2 二氧化硅
SnCl2 氯化锡(II)
TBAI 碘化四-正丁基铵
TBN 亚硝酸叔丁酯
TFA 三氟乙酸
THF 四氢呋喃
TMEDA 四甲基乙二胺
TMSCHN2 三甲基硅基重氮甲烷
丙烷膦酸酐
TRIS 三(羟甲基)氨基甲烷
pTsOH 对甲苯磺酸
如本文中所使用的额外缩写如下:“℃”针对摄氏度,“eq”或“equiv”针对当量(equivalent/equivalents),“aq”针对水溶液,“g”针对公克(gram/grams),“mg”针对毫克(milligram/milligrams),“L”针对公升(liter/liters),“mL”针对毫升(milliliter/milliliters),“μL”针对微升(microliter/microliters),“N”针对“标准”,“M”针对摩尔,“mmol”针对毫摩尔(millimole/millimoles),“min”针对分钟(minute/minutes),“h”针对小时(hour/hours),“rt”针对室温,“RT”针对保留时间,“RBF”针对圆底烧瓶,“atm”针对氛围,“psi”针对磅/平方吋,“conc”针对浓缩,“RCM”针对死循环复分解,“sat”或“sat'd”针对饱和,“MW”针对分子量,“mp”针对熔点,“ee”针对对映异构过量,“MS”或“Mass Spec”针对质谱,“ESI”针对电喷雾电离质谱,“HR”针对高分辨率,“HRMS”针对高分辨率质谱,“LCMS”针对液相色谱质谱,“HPLC”针对高压液相色谱,“RP HPLC”针对反相HPLC,“TLC”或“tlc”针对薄层色谱,“NMR”针对核磁共振光谱,“nOe”针对核奥氏效应(Overhauser)光谱分析,“1H”针对质子,“δ”针对差量,“s”针对单重峰,“d”针对二重峰,“t”针对三重峰,“q”针对四重峰,“m”针对多重峰,“br”针对宽峰,“Hz”针对赫兹,且“α”、“β”、“R”、“S”、“E”及“Z”为本领域技术人员所熟悉的立体化学标示。
实施方案
本申请为针对多种合成中间体及用于制备那些中间体及化合物(I)的方法。
这些例示性方法的一般方面描述于流程及实施例中。以下方法的产物中的每一者任选在其用于后续方法之前经分离(separated)、分离(isolated)和/或纯化。
一般而言,诸如温度、反应时间、溶剂、处理程序及其类似者的反应条件将为本领域常用于待执行的特定反应的那些者。通常,温度将为-100℃至200℃,溶剂将为非质子性或质子性的,且反应时间将为10秒至10天。处理通常由以下操作组成:淬灭任何未反应试剂,接着进行水/有机层系统之间的分隔(萃取),以及分离含有产物的层。
氧化及还原反应通常在接近室温(约20℃)的温度下进行,但对于金属氢化物还原,温度通常降低至0℃至-100℃,溶剂针对还原通常为非质子性的,且针对氧化可为质子性或非质子性的。反应时间经调整以达成所要转化率。
在一个实施方案中,本发明提供一种用于制备化合物(I)的方法。在一个实施方案中制备化合物(I)·丙酮:
包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物A:
与N,N-二甲基甲酰胺二甲缩醛在合适的溶剂中反应,以得到含有甲醇作为副产物的混合物;
(b)向步骤(a)的混合物中添加具有以下结构的化合物C:
以得到化合物(I)的晶体溶剂合物形式:
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的一个实施方案中,在步骤(b)之前移除甲醇。
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的一个实施方案中,在自步骤(a)的混合物移除甲醇之后添加乙酸。
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的另一个实施方案中,在步骤(b)中添加化合物C之后添加三乙胺。
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的一个实施方案中,使化合物(I)在丙酮与水的混合物中结晶,接着用丙酮水溶液进行冲洗以得到化合物(I)的晶体丙酮溶剂合物形式。
在用于制备化合物(I)的丙酮溶剂合物形式的方法的一个实施方案中,用于化合物A与N,N-二甲基甲酰胺二甲缩醛的反应的合适的溶剂选自乙腈(ACN)、二氯甲烷(DCM)、甲苯、四氢呋喃(THF)、叔丁基甲基醚(MTBE)及乙酸乙酯。
在一相关方面中,本发明提供一种用于制备化合物A的方法,该化合物A具有以下结构:
该方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物1:
与氨(NH3)在合适的溶剂中反应以得到具有以下结构的化合物2:
(b)使化合物2与脱水剂反应以得到具有以下结构的化合物3:
(c)使化合物3与乙基丙二酸钾、碱和路易斯酸反应以得到化合物A:
在用于制备化合物A的方法的一个实施方案中,在步骤(a)中添加氯化钙作为催化剂。
在用于制备化合物A的方法的另一个实施方案中,步骤(b)的脱水剂选自磷酰氯(POCl3)、(COCl)2、PCl5、SOCl2、PCl3、氯化二甲基氯甲亚胺盐(ClCH=N(CH3)2Cl)、N,N'-二环己基碳二亚胺(DCC)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳化二亚胺(EDC)、N,N'-二异丙基碳化二亚胺(DIC)、1-环己基-(2-吗啉基乙基)碳化二亚胺甲-对甲苯磺酸盐(CMCT)、甲磺酰氯(MsCl)或4-甲苯磺酰氯(TsCl)与有机碱、TiCl4与有机碱、PPh3与CCl4或CBr4、SO3·Py、特戊酰氯与有机碱及三聚氯化氰与有机碱。在另一个实施方案中,步骤(b)的脱水剂选自磷酰氯、(POCl3)、(COCl)2、PCl5、SOCl2、PCl3及氯化二甲基氯甲亚胺盐(ClCH=N(CH3)2Cl)。
在用于制备化合物A的方法的一个实施方案中,步骤(c)的路易斯酸选自氯化锌(ZnCl2)、三氯化铝(AlCl3)及三氟化硼(BF3)。
在用于制备化合物A的方法的另一个实施方案中,步骤(c)的碱选自三乙胺、N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)、1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一-7-烯(DBU)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)、1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷(DABCO)、四甲基乙二胺(TMEDA)及N,N,N',N”,N”-五甲基二乙烯三胺(PMDTA)。
在用于制备化合物A的方法的一个实施方案中,用于溶解氨的合适的溶剂选自甲醇、二噁烷、乙醇、异丙醇、四氢呋喃(THF)及水。
在一相关方面中,本发明提供一种用于制备化合物C的方法,该化合物C具有以下结构:
该方法包括以下步骤:
(a)将具有以下结构的化合物15的氢氯酸盐:
溶解于合适的溶剂中,
(b)然后添加转氨酶ATA-486及酶促催化剂以得到化合物C:
在用于制备化合物C的方法的一个实施方案中,酶促催化剂为5'-磷酸吡哆醛水合物(5-PLP)。
在制备化合物C的一个方面中,本申请提供一种用于制备化合物15的氢氯酸盐的方法,该化合物15具有以下结构:
该方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物8:
与2-甲基环戊酮及强碱反应,以得到具有以下结构的化合物9:
(b)使化合物9与酸水溶液反应以得到具有以下结构的化合物10:
(c)使化合物10与(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇反应以得到化合物10A的非对映体盐:
(d)用酸水溶液及合适的有机溶剂溶解化合物10A的非对映体盐以得到化合物10A:
(e)使化合物10A与氯化三甲基硅烷反应,接着与原甲酸三甲酯反应,且然后与强碱反应以得到化合物11:
/>
(f)将化合物11与二环己胺(DCHA)混合以得到化合物11的盐:
(g)使化合物11的二环己胺盐与偶联剂及的氢氯酸盐反应,以形成具有以下结构的化合物14:
(h)使化合物14与金属催化剂反应,接着与氢氯酸反应以得到化合物15的氢氯酸盐:
在用于制备化合物15的方法的一个实施方案中,步骤(g)的偶联剂选自1,1'-羰基二咪唑(CDI)、二环己基碳化二亚胺(DCC)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳化二亚胺(EDCI)及1,1'-硫羰基二咪唑(TCDI)。
在用于制备化合物15的方法的一个实施方案中,用于制备化合物10的步骤的酸水溶液选自甲磺酸水溶液、硫酸水溶液及氯化氢水溶液。
在用于制备化合物15的方法的一个实施方案中,用于制备化合物10A的步骤的合适的有机溶剂选自甲醇、乙醇及2-丁酮。
在用于制备化合物15的方法的一个实施方案中,用于制备化合物11的步骤的强碱选自氢氧化钠、氢氧化锂、氢氧化钾及氢氧化钡。
在一个实施方案中,本发明提供一种用于获得化合物10的(R)-对映异构体的方法,其包括用非外消旋2-氨基-1,2-二芳基乙醇使所述(R)-对映异构体自化合物10的对映异构体的混合物于溶剂中的溶液或悬浮液中分步结晶为其非对映体盐,其中非外消旋2-氨基-1,2-二芳基乙醇优选地为非外消旋赤-2-氨基-1,2-二芳基乙醇,且尤其为(1R,2S)-2-氨基-1,2-二芳基乙醇。此处尤其优选为用非外消旋2-氨基-1,2-二苯基乙醇,优选地非外消旋赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇,且具体言之(1R,2S)-2-氨基-1,2-二苯基乙醇使(R)-化合物10分步结晶为其非对映体盐。
同样,本发明亦提供一种用于获得化合物10的(S)-对映异构体的方法,其包括用非外消旋2-氨基-1,2-二芳基乙醇使该(S)-对映异构体自化合物10的对映异构体的混合物于溶剂中的溶液或悬浮液中分步结晶为其非对映体盐,其中非外消旋2-氨基-1,2-二芳基乙醇优选地为非外消旋赤-2-氨基-1,2-二芳基乙醇,且尤其为(1S,2R)-2-氨基-1,2-二苯基乙醇。
在用于获得化合物10的(R)-对映异构体的分步结晶方法的一个实施方案中,用于分步结晶方法的溶剂选自含或不含水的甲醇、乙醇及2-丁酮。
本发明进一步涉及一种用于使化合物10的对映异构体的非外消旋混合物外消旋化的方法。此非外消旋混合物含于例如母液中,该母液产生自通过用非外消旋2-氨基-1,2-二芳基乙醇使化合物10的对映异构体中之一分步结晶来使化合物10进行对映异构体富集的前述方法。
在本发明的此外消旋化方法的第一步骤中,化合物10通过将其羧酸基转化为酯基而受保护。在后续步骤中,通过用诸如叔丁醇钾、叔戊醇化钾、TBD(三氮杂双环癸烯)及MTBD(7-甲基-1,5,7-三氮杂双环(4.4.0)癸-5-烯)的强碱处理,使由此获得的受保护衍生物(化合物41)在其手性中心处外消旋化以得到化合物11。用于外消旋化反应的合适溶剂为甲苯、乙腈、MTBE及乙酸甲酯。在最终步骤中,使化合物11去保护以获得化合物10的对映异构体的外消旋混合物。
在用于制备化合物15的方法的一个实施方案中,步骤(h)的金属催化剂选自钯及钌。在用于制备化合物15的方法的一个实施方案中,步骤(h)的金属催化剂包含选自以下的钯催化剂:Pd(OAc)2/Cy3P-HBF4、[Pd(烯丙基)Cl]2/Ad2nBuP及Pd(OAc)2/BippyPhos。在用于制备化合物15的方法的一个实施方案中,步骤(h)的金属催化剂包含选自以下的钌催化剂:Ru3(CO)12、RuH2(CO)(PPh3)3及[RuCl2(C6H6)]2
在一方面中,本发明提供一种以下化合物的晶体溶剂合物形式:
在化合物(I)的晶体溶剂合物形式的X射线粉末衍射图案的一个实施方案中,X射线粉末衍射图案包含一、二、三或四个选自按以下°2θ值表述的峰的峰:20.0±0.2、21.3±0.2、21.6±0.2及23.9±0.2。
在化合物(I)的晶体丙酮溶剂合物形式的一个实施方案中,晶体形式展现出具有以倒数波数单位(cm-1)表述为以下值的特征峰的傅立叶变换红外光谱:约1709、约1676、约1532、约1485、约1457、约1441、约1432、约1370、约1291、约1219、约1189、约1135、约1119、约1068、约1039、约994、约942、约883、约827、约801及约696。
在本发明的一个实施方案中,本申请提供一种用于经由克莱森(Claisen)重排来制备化合物C的替代方法。
在一个实施方案中,用于制备具有以下结构的化合物C的方法:
包含以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物17:
与具有以下结构的化合物18反应:
(b)随后添加非亲核碱,接着添加氯化三甲基硅烷以得到具有以下结构的化合物20的双氢氯酸盐:
(c)使化合物20与氨基甲酸酯保护基(PG)试剂反应,接着与丙酸酐反应,然后与非亲核碱反应以得到具有以下结构的化合物21:
(d)使化合物21与非亲核碱反应以得到具有以下结构的化合物22:
(e)使化合物22与金属氢化催化剂反应以得到具有以下结构的化合物23:
(f)使化合物23与1-(二氟甲基)-4-硝基-1H-吡唑(化合物12)及金属催化剂反应,以得到具以下结构的化合物24:
(g)使化合物24与金属氢化催化剂反应以得到具有以下结构的化合物25:
(h)使化合物25与偶联剂反应以得到具有以下结构的化合物26:
(i)使化合物26与酸反应以得到化合物C:
在用于制备化合物C的方法的一个实施方案中,非亲核碱选自1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一-7-烯(DBU)、双(三甲基硅基)氨基锂(LiHMDS)、双(三甲基硅基)氨基钾(KHMDS)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)及N,N-二异丙基乙胺(Hünig碱)。
在用于制备化合物C的方法的一个实施方案中,步骤(c)的氨基甲酸酯保护基(PG)试剂选自二碳酸二叔丁酯(Boc2)、羧基苄基氯(Cbz-Cl)及氯化氨基甲酸甲酯(CH3CO2Cl)。
在用于制备化合物C的方法的一个实施方案中,金属氢化催化剂为选自碳负载钌、克拉布特利(Crabtree's)催化剂([C8H12IrP(C6H11)3C5H5N]PF6)及碳负载钯。
在用于制备化合物C的方法的一个实施方案中,用于步骤(f)中的化合物12的反应的金属催化剂选自Pd(烯丙基)Cl]2/X-Phos、XPHos Pd G3及SPhos PD G3。
在用于制备化合物C的方法的一个实施方案中,用于步骤(h)中的化合物25的反应的偶联剂选自1,1'-羰基二咪唑(CDI)、二环己基碳化二亚胺(DCC)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳化二亚胺(EDCI)及1,1'-硫羰基二咪唑(TCDI)以及六氟磷酸氯-N,N,N',N'-四甲基甲脒鎓(TCFH)。
在本发明的一个实施方案中,本申请提供一种用于经由乳酸衍生物作为起始材料来制备化合物11的方法。
在一个实施方案中,用于制备具有以下结构的化合物11的方法:
包含以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物27:
与(3-(1,3-二氧戊环-2-基)丙基)氯化镁反应以得到具有以下结构的化合物28:
(b)使化合物28与氧化剂反应以得到具有以下结构的化合物29:
(c)使化合物29与N,O-二甲基羟胺及偶联剂反应以得到具有以下结构的化合物30:
(d)使化合物30与4-氯吡啶-2-基溴化镁反应以得到具有以下结构的化合物31:
(e)随后添加强酸/醇溶液以得到化合物32:
在用于制备化合物11的方法的一个实施方案中,步骤(b)中的氧化剂选自KMnO4、单过硫酸氢钾复合盐(Oxone)及NaClO2
在用于制备化合物11的方法的一个实施方案中,步骤(e)中的强酸/醇溶液中的强酸选自TMSCl、MeOH、MeOH/H2SO4、AcCl/MeOH。
在用于制备化合物11的方法的一个实施方案中,步骤(e)中的强酸/醇溶液中的醇溶剂选自甲醇、乙醇、2-异丙醇、正丙醇、正丁醇及其组合。
在本发明的一个实施方案中,本申请提供一种用于经由假麻黄素衍生物作为起始材料来制备化合物40的方法。
在一个实施方案中,用于制备具有以下结构的化合物40的方法:
包含以下步骤
(a)使具有以下结构的化合物34:
与2-(3-溴丙基)-1,3-二氧戊环反应以得到具有以下结构的化合物35:
(b)使化合物35与强碱在合适的溶剂中反应以得到具有以下结构的化合物36:
(c)使化合物36与苄醇及偶联剂反应以得到具有以下结构的化合物37:
(d)使强酸与化合物37反应,接着添加手性助剂与金属催化剂以得到具有以下结构的化合物38:
(e)使化合物38与(4-氯吡啶-2-基)溴化镁反应以得到具有以下结构的化合物39:
(f)将酯水解,接着添加保护基以得到化合物40:
在用于制备化合物40的方法的一个实施方案中,步骤(c)的偶联剂选自1,1'-羰基二咪唑(CDI)、二环己基碳化二亚胺(DCC)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳化二亚胺(EDCI)及1,1'-硫羰基二咪唑(TCDI)。
在用于制备化合物40的方法的一个实施方案中,步骤(b)中的合适的溶剂选自乙醇、甲醇、叔丁醇及其组合。
在用于制备化合物40的方法的一个实施方案中,步骤(d)中的金属催化剂选自Ti(OEt)4、CuSO4及Ti(OiPr)4
在用于制备化合物40的方法的一个实施方案中,所述方法还在步骤(e)中包括选自ZrCl4和BF3·OEt2的路易斯酸。
在本发明的一个实施方案中,本申请提供一种经由分批合成方法来制备化合物1的方法。
在一个实施方案中,用于制备具有以下结构的化合物1的方法:
包含以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物4:
(i)与亚硝酸钠及酸在合适的溶剂中反应以形成第一混合物;
(ii)然后将第一混合物添加至包含叠氮化钠及弱碱的溶液中以形成第二混合物;
(iii)使第二混合物与三甲基硅基乙炔及碘化铜(I)(CuI)以及配位体反应以得到具有以下结构的化合物7:
(b)用氯化剂使化合物7氯化以得到化合物1:
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(a)(i)的酸选自甲磺酸、HBF4、TsOH、H2SO4及HCl。
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(a)(ii)的弱碱选自碳酸氢钠(NaHCO3)、碳酸钾、吡啶、2,6-二甲基吡啶、甲胺、三乙胺及DMF。
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(a)(iii)的配位体选自四甲基乙二胺(TMEDA)、NEt2、DIPEA、TMEDTA、三乙胺、N,N-二异丙基乙胺及N,N,N',N”,N”-五甲基二乙烯三胺。
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(a)(i)的合适的溶剂选自水、离子化水、DMF、ACN及其组合。
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(a)(ii)的水溶液中的溶剂选自水、离子化水、DMF、ACN及其组合。
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(b)的氯化剂选自1,3-二氯-5,5-二甲基乙内酰脲、NCS、NaClO及三氯异氰脲酸。
在本发明的一个实施方案中,本申请提供一种经由连续流合成方法来制备化合物1的方法。
在一个实施方案中,用于制备具有以下结构的化合物1的方法:
包含以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物4:
(i)与酸及亚硝酸钠在合适的溶剂中反应;
(ii)与叠氮化钠及弱碱水溶液的混合物反应以形成具有以下结构的化合物6:
(b)随后使化合物6与氯乙炔及金属催化剂偶联以得到化合物1:
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(a)(ii)的弱碱选自碳酸氢钠(NaHCO3)、碳酸钾、吡啶、2,6-二甲基吡啶、甲胺、三乙胺及DMF。
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,金属催化剂选自碘化铜(I)、CuBr、CuCl、Cu2O、CuSO4、CuSO4(5H2O)、Cu(OAc)2、Cu(acac)2及CuCl2
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,配位体选自四甲氨基乙二胺(TMEDA)、NEt2、DIPEA、TMEDTA、三乙胺、N,N-二异丙基乙胺及N,N,N',N”,N”-五甲基二乙烯三胺。
在用于制备化合物1的方法的一个实施方案中,步骤(a)(i)的酸选自甲磺酸、HBF4、TsOH、H2SO4及HCl。
在本发明的一个实施方案中,本申请提供一种用于制备化合物33的方法。
在一个实施方案中,用于制备具有以下结构的化合物的方法:
包含以下步骤:
使具有以下结构的化合物32:
与甲酸乙酯反应以得到化合物33:
在一方面中,本发明提供一种化合物,其选自:
或其立体异构体或互变异构体。
实施例
以下实施例为出于说明的目的而提供,且并不意欲限制本文中所提供的权利要求书的范围。出于待由此服务的所有法律目的,这些实施例及整个本说明书中的所有文献引用均以引用的方式并入本文中。
这些例示性方法的一般方面描述于流程及实施例中。以下方法的产物中的每一者任选在其用于后续方法之前经分离(separated)、分离(isolated)和/或纯化。
亦将认识到,在本领域中,任何合成途径的规划中的另一主要考虑因素为审慎选择用于保护本发明所描述的化合物中存在的反应性官能基的保护基。向受培训的从业者描述许多替代方案的权威账户为Greene等人(Protective Groups in Organic Synthesis,第4版,Wiley-Interscience(2006))。
除非指定,否则所有反应均在氮气下执行。用于萃取及反应的溶剂为未经纯化的ACS试剂级。1H NMR及13C NMR光谱记录于Bruker Advance DRX 400光谱仪、Bruker AdvanceIII 400光谱仪、Bruker Advance 500MHz光谱仪及Bruker Advance III 400光谱仪上。化学位移以ppm(δ)给出;多峰性由s(单峰)、d(二重峰)、t(三重峰)、q(四重峰)、m(多重峰)或br(宽峰)指示。偶合常数J以赫兹为单位报告。溶剂移除受真空(约25至40mmHg)旋转蒸发影响。
流程1
实施例1:合成化合物(I)·丙酮
步骤(a):偶联反应
向1L反应器中馈入(Z)-3-氨基-3-(5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯基)丙烯酸乙酯(化合物A)(1.07当量,104.4g)、乙腈(6.8L/kg,680mL)及N,N-二甲基甲酰胺二甲缩醛(1.26当量,50.1mL),且将所得溶液加热至75℃持续30分钟,接着对甲醇副产物进行常压蒸馏。使反应物冷却至30℃,之后添加乙酸(10当量,170.9mL),且在40℃下搅拌5小时。在30℃下,馈入(5R,9S)-9-氨基-21-(二氟甲基)-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮(化合物C)(1.0当量,100mL)及乙腈(2.5L/kg,250mL),且然后加热至65℃持续2小时。使反应物冷却至40℃,然后添加254mL(6.1当量)三乙胺。
步骤(b):处理
通过在真空(200mbar)下共蒸馏而由三甲胺置换乙腈。蒸馏355mL(3.55L/kg),然后馈入145mL(3.5当量)三乙胺。在200mbar下蒸馏240mL(2.4L/kg),然后馈入145mL(3.5当量)三乙胺。最后在200mbar下蒸馏225mL(2.25L/kg),然后馈入112mL(2.7当量)三乙胺。
步骤(c):过滤
在45℃下,馈入水(0.32L/kg,32mL)及丙酮(4.4L/kg,440mL)。然后使反应物冷却至25℃,接着经由木炭过滤,且用65mL(0.65L/kg)丙酮冲洗。
步骤(d):结晶
在45℃下,馈入甲醇(0.68L/kg,68mL)及水(0.59L/kg,59mL),接着馈入1.0重量%(1g)晶种材料。将混合物搅拌2小时。在4小时内投配水(140mL(1.24L/kg))。在3小时内再投配275mL(2.75L/kg)的水。然后在4小时内使反应混合物冷却至10℃且保持隔夜,之后过滤。用570mL丙酮水混合物(47/53)冲洗湿滤饼,且在50℃下在真空下干燥16小时。以89%至95%产率(>99.5%纯度)获得呈丙酮溶剂合物形式的化合物(I)。
流程2
实施例2:合成化合物1-分批合成方法
步骤(a):制备重氮中间体(化合物5)
向50L反应器中馈入水(18L,3.6L/kg)、2-氨基-5-氯苯甲酸甲酯(化合物4)(5.00kg,1当量),且使所得浆液冷却至0℃至5℃。在1小时内馈入70%甲磺酸水溶液(8.14kg,2.2当量),同时将温度保持在0℃至5℃下。在4小时内将含有亚硝酸钠(2.05kg,1.1当量)及水(5.25kg,1.05V)的溶液投配至反应混合物中,同时将温度保持在0℃至5℃下。将所得浆液在0℃至5℃下搅拌8小时。
步骤(b):制备叠氮中间体(化合物6)
向100L反应器中馈入水(20L,4L/kg)、碳酸氢钠(0.91kg,0.4当量)、叠氮化钠(1.8kg,1.0当量)、2-甲基四氢呋喃(21.5kg,5.0V),且将所得混合物在20℃下搅拌30min。在4小时内将步骤a)的重氮溶液添加至此溶液中,同时将温度保持在20℃至25℃下,且使混合物在此温度下老化2小时。沉降二相混合物,且分离两层。将有机层用18.6w%氯化钠水溶液(12.3kg,2kg/kg)洗涤两次。将硫酸镁(1.43kg,0.285kg/kg)添加至MeTHF中的叠氮化物溶液中,且搅拌1小时。
步骤(c):制备化合物7
在20℃至25℃下将N,N,N',N'-四甲基乙二胺(0.16kg,0.05当量)、碘化铜(0.26kg,0.05当量)及三甲基硅基乙炔(2.91kg,1.1当量)馈入反应器中,且在1小时内将反应混合物加热至45℃,且在此温度下搅拌10小时。在反应完成之后,过滤混合物,且将滤饼用2-甲基四氢呋喃(2×2.6kg,2×0.6V)洗涤两次。
在独立反应器中,制备含有氯化钠(2.9kg)、水(10.0kg)及20重量%氨水(9.2kg)的溶液。
将11.0kg的该溶液添加至滤液(2.0V)中,且将所得混合物在20至25℃下搅拌30min,经由硅藻土(1.25kg,0.25kg/kg)过滤,且将滤饼用2-甲基四氢呋喃(2×2.6kg,2×0.6V)洗涤两次。然后沉降二相混合物,且分离两层。将有机层再次用氯化钠/氨水溶液(11.0kg,2.0V)洗涤且再次用饱和氯化钠水溶液(8.5kg,1.5V)洗涤一次。然后将含有粗5-氯-2-(4-(三甲基硅基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酸甲酯(化合物7)的2-甲基四氢呋喃溶液在真空下浓缩至2.5V(12.5L)。将2-丙醇(11.8kg,3.0V)馈入混合物中,在30min内将其加热至60℃至65℃。一旦所有化合物溶解,则在4小时内使溶液冷却至0℃至5℃,且在3小时内在0℃至5℃下馈入水(32.5kg,6.5V),且在此温度下老化2小时。在过滤之后,且将湿滤饼用2-丙醇/水混合物(14.75kg,50/50v/v比率)洗涤,且在40℃下在真空下干燥12小时。以85%至88%产率、>99.5%纯度及分析法获得5-氯-2-(4-(三甲基硅基)-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酸甲酯(化合物7)。1H NMR(CDCl3,300MHz):δ=7.87(d,J=2.4Hz,1H),7.77(s,1H),7.55(dd,J=8.5,2.4Hz,1H),7.38(d,J=8.4Hz,1H),3.61(s,3H),0.32(s,9H)ppm.13C NMR(CDCl3,75MHz):δ=164.4,146.3,135.3,134.4,132.3,130.8,130.5,128.6,127.7,52.5,-1.3ppm。
步骤(d):制备化合物1
向50L反应器中馈入DMF(33.3kg,5L/kg)、化合物7(1当量,7.1kg)、水(0.41kg,1.0当量),且将所得溶液冷却至0℃至5℃。在6小时内逐份馈入1,3-二氯-5,5-二甲基乙内酰脲(3.4kg,0.75当量),同时将温度保持低于10℃,且将反应物在0℃至5℃下再搅拌15小时。在达至完全转化之后,在2小时内将反应混合物加热至30℃,且在此温度下老化2小时。
向独立反应器中馈入水(35.3kg,5L/kg),且加热至30℃。然后在5小时内将反应混合物投配至此第二反应器中,同时将温度控制在30℃至35℃之间。在20min老化之后,在2小时内将浆液冷却至15℃至20℃,且在此温度下老化2小时。在过滤之后,将湿滤饼用甲醇/水(1L/kg甲醇,1.2L/kg水)洗涤,且在40℃下在真空下干燥16小时。以89%至93%产率、>99.5%纯度及分析法获得5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酸甲酯(化合物1)。
实施例3:合成化合物1-连续流方法
步骤(a):制备重氮中间体
在-0℃下,在具有亚硝酸钠(331g,1.2当量)及水(2964g)的溶液的连续流反应器中混合2-氨基-5-氯苯甲酸甲酯(化合物4)(741.0g,1当量)、甲磺酸(844g,2.2当量)、水(2223g)及乙腈(1747g)的溶液。
步骤(b):制备叠氮中间体
在室温下使步骤a)的重氮溶液与水(2964g)、碳酸氢钠(134g 0.4当量)、叠氮化钠(272g,1.05当量)及2-甲基四氢呋喃(2549g)的混合物反应。舍弃水层。将有机流直接用于下一步骤中(原位产率99%)。
步骤(c):制备氯乙炔
将1,1-二氯乙烯(871g,2.25当量)于THF(1635g)中的混合物与用THF(3257g)稀释的LDA溶液(2.0M,2431g,3.0当量)混合(在-20℃下)。将反应物用水(5988g)淬灭,且舍弃水层。将有机层直接用于下一步骤中。
步骤(d):制备化合物1
首先将步骤(b)的芳基叠氮化物溶液与N,N,N',N'-四甲基乙二胺(101g,0.22当量)、碘化铜(38g,0.05当量)及THF(1159g)的溶液混合。然后在60℃下将叠氮铜溶液与步骤c)的氯乙炔溶液混合。用氯化铵于氢氧化铵中的溶液淬灭反应混合物。将层分离,且用THF反萃取水层。用盐水溶液洗涤合并的有机层。反萃取水层,且合并有机层。将THF通过蒸馏移除且由MeOH置换。通过加热至60℃,冷却至15℃,且通过添加水而使产物结晶,从而得到化合物1。(92.6%总产率,纯度>99%)。
流程4
实施例3a:合成化合物1-连续流方法
步骤1:用于化合物6的连续流合成的程序
流动参数设定:
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使用再循环冷却器将连续流反应器预冷却至0℃。连续流反应器的平衡通过将苯胺(化合物4)及NaNO2流动速率分别设定为6g/min及1.78g/min而开始,同时将流出物分流以废弃。在约1分钟之后,来自反应器的流出物自深红色变为淡黄色,其指示反应器的完全平衡。2-Me-THF及NaN3流分别以3.2g/min及2.84g/min的流动速率开始,同时将所述流分流以废弃。一旦各泵已达至设定点,则切换所有阀以将流体分流至淬灭反应器回路。立即观测到N2(气体)快速逸出。将来自淬灭反应器的流出物分流以废弃,直至已过去约1分钟为止。然后将来自淬灭反应器的流出物分流至沉降器单元。一旦沉降器中的有机相已达至有机物收集泵的液浸管,则启动收集泵,且将其设定为维持沉降器内的恒定体积的速率。收集有机物流出物持续总共50分钟。收集到总共266g的有机物。有机物的1H-NMR分析显示溶液为17.02重量%的化合物6。检定产量:45.3g,99%产率。HPLC分析显示溶液为>99A%的化合物6。
步骤2:用于化合物1的连续流合成的程序
在氮气下,将THF(300mL)添加至CuI(5.71g,30mmol)中。然后添加PMDTA(5.20g,30mmol),且对混合物进行超音波处理以促进完全溶解。(CuI溶液)
流动参数设定
在连续流反应器中,依序开始氯乙炔溶液(3.87g/min)、化合物6溶液(1.91g/min)及CuI溶液(0.763mL/min)的递送。材料流动通过系统持续两个驻留体积(10分钟),之后开始收集。在运行期间执行一次停止,在此之前将来自塞流反应器(PFR)的流出物分流以废弃。与上文所描述类似地执行重新启动系统,且使系统重新平衡持续2个驻留体积(10分钟),之后在淬灭容器中收集材料。总共收集材料131分钟,此对应于193.4mmol的化合物6耗尽。将来自淬灭容器的材料转移至分液漏斗,且分离有机相。用额外THF(155mL,3.8体积)萃取水相。然后用50%盐水溶液(155mL,3.8体积)洗涤合并的有机相,且用额外THF(78mL,1.9体积)萃取所得水相。然后通过1H NMR光谱测定法使用1,3,5-三甲氧基苯作为内部标准物分析合并的有机相以确定化合物1的效力。总共收集到871.6g的有机物。移出小样本(约20mL)以用于额外分析,且在减压下浓缩其余材料以得到54.7公克的褐色固体,通过定量NMR分析发现该褐色固体为95%化合物1,其余为5%残余乙苯。
分离:通过蒸馏将溶剂移除至5L/kg,且冷却至35℃。在接种之后,添加庚烷(11L/kg),且将反应混合物冷却至10℃。在过滤之后,获得呈白色固体的化合物1(90%产率)。
实施例4:合成(Z)-3-氨基-3-(5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯基)丙烯酸乙酯(化合物A)
向50L反应器中馈入含7mol/L氨的甲醇(30.2kg,7L/kg)、无水氯化钙(1.13kg,0.5当量)、5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酸甲酯(化合物1)(5.7kg,1.0当量),且将所得浆液在25℃下搅拌20小时。在反应完成之后,将混合物浓缩至3L/kg总体积,且然后将所得浆液加热至回流直至完全溶解。在3小时内在60℃下投配水(27.7kg,5L/kg),且在4小时内将混合物冷却至0℃至5℃。在过滤之后,将湿滤饼用甲醇/水(0.75L/kg甲醇,1.25L/kg水)洗涤,且在40℃下在真空下干燥20小时。以92%至95%产率、>99.5%纯度及分析法获得5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲酰胺(化合物2)。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ=8.71(s,1H),8.12-8.05(br s,1H),7.80-7.73(m,2H),7.72-7.66(m,1H),7.66-7.59(br s,1H)ppm。
向50L反应器中馈入乙腈(8.5kg,3L/kg)及化合物2(3.7kg,1.0当量)。然后在20min内投配磷酰氯(1.6kg,0.75当量),且在90min内将所得浆液加热至75℃至80℃,且在此温度下老化5小时。在反应完成之后,将混合物冷却至60℃至65℃,且在1小时内添加水(17.0kg,4.7L/kg)。在进一步冷却至50℃至54℃之后,在1小时内投配15%氢氧化钠水溶液(6.4kg,1.8kg/kg)。在2小时内将所得浆液冷却至20℃至25℃。在过滤之后,将湿滤饼用水(2×1L/kg)洗涤两次,且在50℃下在真空下干燥19小时。以95%至98%产率、>99.5%纯度及分析法获得5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯甲腈(化合物3)。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ=9.06(s,1H),8.38(d,J=2.4Hz,1H),8.08(dd,J=8.5,2.4Hz,1H),7.94(d,J=8.4Hz,1H)ppm.13C NMR(DMSO-d6,75MHz):δ=136.2,135.2,134.8,134.5,134.2,127.5,123.8,114.4,108.9ppm。
向30L反应器中馈入乙酸乙酯(6.1kg,5L/kg)、化合物3(1.6kg,1.0当量)、乙基丙二酸钾(2.25kg,2.0当量)、三乙胺(1.67kg,2.5当量)及氯化锌(1.13kg,1.25当量)。在2小时内将所得混合物加热至75℃至78℃,且在此温度下老化20小时。在反应完成之后,将混合物冷却至20℃至25℃,且在1小时内馈入15%氨水(7.5kg,5.2L/kg)。在添加硅藻土(0.32kg,0.2kg/kg)之后,过滤混合物,且将湿滤饼用乙酸乙酯(2×2.85kg,2L/kg)洗涤两次。在分离两层之后,将有机层浓缩至3.1L/kg总体积,馈入乙醇(7.5kg,6L/kg),且将混合物浓缩至4.1L/kg总体积。然后将所得浆液加热至60℃直至完全溶解,在4小时内在60℃下投配水(4.75kg,3L/kg),且在4小时内将混合物冷却至0℃至5℃,且在此温度下老化4小时。在过滤之后,将湿滤饼用乙醇/水(0.8L/kg MeOH,1.2L/kg水)洗涤,且在40℃下在真空下干燥20小时。以92%至95%产率、>99.5%纯度及分析法获得(Z)-3-氨基-3-(5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯基)丙烯酸乙酯(化合物A)。1H NMR(DMSO-d6,300MHz):δ=8.63(s,1H),7.86-7.50(m,3H),7.50-7.02(br s,1H),4.24(s,1H),3.99(q,J=7.1Hz,2H),1.14(t,J=7.1Hz,3H)ppm.13C NMR(DMSO-d6,75MHz):δ=168.5,156.4,135.5,134.9,133.6,132.8,130.3,129.7,128.3,124.3,84.4,58.2,14.4ppm。
流程5
实施例5:合成巨环“C”
在-30℃下,向2-甲基环戊酮(93.30g,931.7mmol,98质量%)、4-氯吡啶甲酸甲酯(化合物8)(158.02g,902.55mmol)的混合物于THF(1500mL,18400mmol)中的浆液中添加含叔丁醇钾(1mol/L)的THF(1200g,1330mmol,1mol/L)。在-24℃至30℃之间将所得黄色浆液搅拌1h。在独立4L反应器中馈入含硫酸(13.14mol/L)的水(92g,660.2mmol,13.14mol/L)及水(800g,44407.9mmol),且预冷却至0℃。将含有(Z)-(4-氯吡啶-2-基)(3-甲基-2-氧代环亚戊基)甲醇化钾(化合物9的阴离子)的黄色浆液倒入冷酸溶液中,且产生浆液。在15℃下蒸馏出THF,其中将夹套设定为在真空115mbar下45℃。向浆液(约1公升)中添加500mL的水。收集沉淀固体,且舍弃水溶液。将所收集固体以及320mL的MSA及1公升的水馈入回反应器中。将浆液加热至65℃,且所有固体在60分钟之后溶解。将暗色溶液在65℃下保持3h,之后将其冷却至室温,然后冷却至0℃。形成浆液,且然后进行过滤。收集残余物,且在室温下进行干燥,获得总量139.8g的米色6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(外消旋-化合物10)。将滤液馈入回反应器中,且用28重量%NH4OH将pH调整至5.1。在pH调整期间形成固体,且在室温下进行过滤。获得额外41g的灰白色6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(外消旋-化合物10)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6):δ12.07(1H,s),8.70(d,J=5.31Hz,1H),7.94(dd,J=7.94,1.77Hz,1H),7.82(dd,J=5.18,2.15Hz,1H),3.15(m,2H),2.35(m,1H),1.60(m,3H),1.42(m,1H),1.05(d,J=6.82Hz,3H).LRMS:[C12H14ClNO3+H]+,258.24,256.25。
实施例6:通过用(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇使(R)-对映异构体分步结晶而对外消旋-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(外消旋-化合物10)进行手性拆分
在70℃的温度下,将487g(1.905mol)的外消旋-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(外消旋-化合物10)及223g(1.048摩尔)的(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇溶解于4.8kg的乙醇(96体积%)中。将溶液缓慢冷却至室温,且之后冷却至0℃。过滤出所形成的沉淀物,用冷乙醇(96体积%)进行洗涤,且干燥以得到呈白色针状物的(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸·(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯乙醇·H2O,亦即(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(化合物10A)的非对映体盐及呈其单水合物形式的(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇。产量:407g,91%(基于(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸的原始量)。S/R比率:19.1:80.9。
流程6
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实施例7:对由实施例6的分步结晶所产生的母液中含有的6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸进行外消旋化
步骤1:保护6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸
将来自实施例6的分步结晶的母液浓缩且干燥。用TBME(叔丁基甲醚)与0.33M氢氯酸水溶液的混合物处理所获得残余物,且然后分离有机相,与实施例9的程序类似地进行干燥且浓缩,以便移除剩余2-氨基-1,2-二苯基乙醇。将以此方式获得的639g(2.50mol)的6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(化合物10)溶解于1.95kg的无水甲醇中。向此溶液中添加271g(2.50mol)的氯化三甲基硅烷。将反应混合物在室温下搅拌12小时。之后,添加1.95kg的TBME,且用饱和碳酸氢钠水溶液(NaHCO3)中和混合物的pH。将有机相分离,用盐水洗涤,经硫酸钠干燥,且在真空中浓缩以得到干燥产物,该干燥产物含有作为主要产物的6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6,6-二甲氧基己酸甲酯(化合物41)及作为副产物的6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸甲酯(化合物42)。产量:587g(约87%)。
步骤2:外消旋化
将步骤1中所获得的具有大约75:25的S/R比率的587g(约1.86mol)的产物溶解于3.34kg的无水甲苯中,且将溶液冷却至0℃。添加104g(0.93mol)的叔丁醇钾,且在室温下将反应混合物搅拌12小时。之后,将混合物冷却至0℃,且添加1kg的饱和NaH2PO4水溶液。将有机相分离,用1kg盐水洗涤,且在真空中浓缩以得到外消旋化产物(化合物11),该外消旋化产物可含有如通过1H-NMR所测定的至多10重量%的6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6,6-二甲氧基己酸的叔丁酯。产量:500g(约85%)。
步骤3:通过使步骤2中所获得的外消旋物去保护来制备外消旋6-(4-氯吡啶-2- 基)-2-甲基-6-氧代己酸
将500g(约1.58mol)的步骤2的外消旋产物溶解于2.5kg THF中,且添加溶解于1.58kg水中的158g氢氧化钠(3.96mol)。将溶液在室温下搅拌12小时。然后,缓慢添加524ml的浓盐酸(6.33mol)。在完全转化(约12小时)之后,添加溶解于600g水中的300g NaH2PO4,且然后通过添加2M氢氧化钠溶液而将pH值调整至大约4至5。将有机相分离,用盐水洗涤,经硫酸钠干燥,且在真空中浓缩以得到外消旋6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(外消旋-化合物10)。产量:331g(82%)。
实施例8:使前一步骤中所获得的盐(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸·(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇H2O再结晶
通过在70℃的温度下使盐溶解,且然后将溶液缓慢冷却至10℃的温度,使前一步骤(实施例6)中所获得的407g的非对映体盐(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸·(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯乙醇·H2O(化合物10A的非对映体盐)自4.0kg的乙醇(96体积%)中再结晶。将所获得的晶体沉淀物过滤,用冷乙醇(96体积%)洗涤且干燥以得到纯化(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸·(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯乙醇·H2O。产率:326g(80%)。S/R比率:7.7:92.3。
实施例9:将(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇·H2O转化为(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸
将182g的(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸·(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯乙醇·H2O溶解于2.7kg的TBME及3.5kg的0.33M氢氯酸水溶液中,直至形成两种均质相为止。将有机相分离,经硫酸钠干燥,且在真空中浓缩以得到游离酸(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(化合物10A)。产量:93.2g(98%)。
实施例10:将(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酸转化为(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酸DCHA盐
步骤(a)
将(R)6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸(化合物10A)(5.0g)溶解于无水甲醇(20g)中且冷却至0℃。缓慢添加氯化三甲基硅烷(3.1mL),接着添加原甲酸三甲酯(6.4mL)。将混合物在室温下搅拌12h,且然后在40℃下搅拌12h,直至转化完成为止。当反应完成时,将反应混合物冷却至0℃。添加悬浮于水(50g)中的氢氧化钡(9.5g;亦可使用八水合物),且将反应物在室温下搅拌隔夜。当转化完成时,添加饱和磷酸二氢钠溶液直至达到pH=4至5为止。然后用TBME(2×20g)萃取混合物,将有机相用盐水(2×20g)洗涤,经硫酸钠干燥,且在真空中移除挥发物以得到呈浅黄色油状物的产物。产量:5.78g(98%)。
步骤(b)
将(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酸(化合物11)(368g)溶解于TBME(2400g)中,且升温至40℃。缓慢添加二环己胺(175g),且在形成沉淀之后,继续搅拌15min直至搅拌性改良为止。然后缓慢添加剩余二环己胺(174g)。将混合物缓慢冷却至室温,且过滤出固体,并用TBME洗涤以得到呈白色针状物的产物。产量:671.0g,其中具有大约1.25当量DCHA及14.5% TBME。570g产物(88.5%)
实施例11:硝基吡唑还原
步骤(a)
将1-(二氟甲基)-4-硝基-吡唑(化合物12)(50g)、Pt/V/C(2.5g)及THF(100mL)馈入氢化反应器中。在清偿程序之后,在氢气氛围(0.27至0.34MPa)下对反应器加压,且在30℃至35℃下在H2流下搅拌直至完全转化为止。在完全转化之后,过滤有机层以移除催化剂,且浓缩至干燥以得到定量产率的1-(二氟甲基)-4-氨基-吡唑(化合物13)。
步骤(b)
在0℃至5℃下,在含HCl的2-丙醇(22mL)的存在下将1-(二氟甲基)-4-氨基-吡唑(10g)溶解于2-丙醇(80mL)中。在30分钟内将反应混合物缓慢升温至25℃,且馈入庚烷(100mL)。在10分钟搅拌之后,将反应混合物过滤,用庚烷洗涤。将所分离材料在40℃下在减压下干燥。以60%产率分离出7.9g的1-(二氟甲基)-4-氨基-吡唑·HCl盐(化合物13的HCl盐)。
实施例12:酰胺偶联步骤
在500mL RBF反应器中,将(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酸DCHA盐(化合物11DHCA)(50g)悬浮于正丁腈(300mL)中,且用酸性水(300mL+H3PO485重量%,5.21g)洗涤,直至达成pH 5为止。在相分离之后,将有机层浓缩至200mL。在第二反应中,将1,1'-羰基二咪唑(1.2当量,17.6g)悬浮于正丁腈(100mL)中,且将温度升高至40℃。在2小时内将含有(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酸的200mL溶液逐滴添加至CDI悬浮液中。在完全转化之后,一次性添加1-(二氟甲基)-1H-吡唑-4-胺.HCl盐(1.2当量,18.4g),且在40℃下将反应混合物搅拌6小时。在完成且冷却至25℃之后,首先用氢氧化钠水溶液洗涤有机层直至pH 12,然后用磷酸水溶液(300mL,含5.21g磷酸的水),且第二次用磷酸水溶液(300mL,含0.521g磷酸的水),且最后用氢氧化钠水溶液(300mL,1.45g NaOH)洗涤。浓缩有机层直至200mL,其含有对应于90%产率的34g的(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-N-(1-(二氟甲基)-1H-吡唑-4-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酰胺(化合物14)。
实施例13:合成(R)-21-(二氟甲基)-9,9-二甲氧基-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮·HCl
步骤(a)
在具有顶置式搅拌器的RBF中,馈入K2CO3(1.2当量,12.05g)、正丁腈(300mL)、Pd(烯丙基)(CatacxiumA)Cl(0.01当量,0.393g)及特戊酸(0.1当量,0.822mL)。在于氮气氛围下清偿之后,将反应混合物加热至115℃,且在5小时内逐滴添加(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-N-(1-(二氟甲基)-1H-吡唑-4-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酰胺(化合物14)(135.7g)。将反应混合物保持在115℃下直至完全转化。在冷却至室温之后,经由非晶硅石(0.1g/g,100质量%)过滤反应混合物,且用丁腈洗涤滤饼以得到90%产率的(R)-21-(二氟甲基)-9,9-二甲氧基-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮(化合物15)。
步骤(b)
在15℃下向具有顶置式搅拌器的100mL反应器中搅拌含有(R)-21-(二氟甲基)-9,9-二甲氧基-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮(化合物15)(70g,通过4.089重量%检定)。在30分钟内逐滴添加HCl于2-丙醇中的溶液(2.06mL,1.0当量·HCl),且在15℃下再搅拌2小时。将反应混合物过滤且用正丁腈洗涤。将所分离材料在45℃下在减压下干燥隔夜。以96%产率分离出(R)-21-(二氟甲基)-9,9-二甲氧基-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮·HCl(化合物15的HCl盐)(3g)盐。
实施例14:将(R)-21-(二氟甲基)-9,9-二甲氧基-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮·HCl转化为(5R,9S)-氨基-21-(二氟甲基)-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮
将(R)-21-(二氟甲基)-9,9-二甲氧基-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮·HCl(10g)溶解于水(75mL)中,且将反应混合物加热18小时。在减压下,通过在减压下蒸馏而移除25%的溶剂,且用水置换。将反应混合物冷却至5℃,且添加2.35当量HCl(pH=0.98),接着添加4.05当量异丙胺,同时将温度缓慢升高至20℃。最后,添加1重量%5'-磷酸吡哆醛水合物(5-PLP)及1.1重量%转氨酶CDX-050(也称为转氨酶ATA-486),且将反应混合物加热至50℃且搅拌24小时。在完全转化之后,添加浓HCl直至达成pH7为止。馈入硅藻土(4重量%),且将反应混合物加热至80℃持续2小时。将悬浮液冷却至20℃且过滤。向所获得滤液中逐滴添加NaOH 1M直至达成pH 10为止。在2小时搅拌之后,过滤反应混合物,且将滤饼用水洗涤两次以得到所要产物83%产率(化合物C)(6.7g)。
流程7
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实施例15:合成化合物(1R,2S)-1-氨基-1-(4-氯吡啶-2-基)丁-3-烯-2-醇双氢氯酸盐
将苯甲酸(E)-3-溴丙-1-烯-1-基酯(化合物17)(198g,821mmol)添加至反应器中,接着在20℃下添加THF(1L)及铟(94.18g,821mmol)。使溶液在20℃下搅拌不少于12h。将溶液冷却至不超过5℃。添加(S,E)-N-((4-氯吡啶-2-基)亚甲基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(化合物18)(100g,408.5mmol)于THF(300mL)中的溶液以便将温度维持在不超过10℃。在添加之后,使溶液在10℃下搅拌不少于1h。将溶液过滤,且用MTBE(500mL)稀释。然后用柠檬酸水溶液(200g于1L水中)洗涤有机物。将此操作重复一次。然后将有机物用水(500mL)洗涤两次,接着用饱和NaHCO3水溶液(500mL)洗涤。将有机物浓缩至1至2V,且然后用MeOH(10V)稀释。将此操作重复直至MeOH中存在不超过2% MTBE。一旦MTBE不超过2%,则将有机物调整为总共3V MeOH。向溶液中添加DBU(81.7mmol,0.20当量)。将溶液加热至50℃,且在50℃下保持不少于2h。一旦通过HPLC完成,则在50℃下添加TMSCl(2043mmol,5.0当量)。将溶液保持在50℃下不超过30min。一旦通过HPLC完成,则将溶液浓缩至总共5V。在50℃下,在不少于1h内添加iPrOAc(3V)。然后将溶液冷却至不超过15℃。将溶液保持在不超过15℃下持续不少于2h。过滤浆液以得到呈白色固体的(1R,2S)-1-氨基-1-(4-氯吡啶-2-基)丁-3-烯-2-醇双氢氯酸盐(化合物20)(100g,90%产率)。1H NMR(DMSO-d6,600MHz):δ8.81(宽峰s,1H),8.57(d,J=5.4Hz,1H),7.77(d,J=1.92Hz,1H),7.58(dd,J=1.92,5.4Hz,1H),5.85(m,1H),5.17(dt,J=1.42,17.3Hz,1H),5.11(dt,J=1.42,10.5Hz,1H),4.60(m,1H),4.49(m,1H).13C NMR(DMSO-d6,151MHz):δ155.4,149.4,143.6,136.3,124.0,123.9,117.3,71.5,58.0。HRMS:ESI正HRMS[M+H]+:C9H12N2OCl,计算值:199.0633,观测值:199.0633。
实施例16:合成化合物(2R,6S,E)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己-4-烯酸(化合物22)
步骤1
将(1R,2S)-1-氨基-1-(4-氯吡啶-2-基)丁-3-烯-2-醇双氢氯酸盐(5.5g)、甲苯(55mL)、饱和NaHCO3(水溶液)(55mL)及Boc2O(4.6g)添加至具有搅拌棒的圆底烧瓶中。使反应物在20℃下搅拌4h。用盐水(30mL)稀释反应物,且分离各层。
步骤2
将丙酸酐(3.5g)添加至有机物中,接着添加DMAP(250mg)。将反应物在室温下搅拌2h。添加MeOH(3mL)以淬灭过量酸酐。在30min之后,用盐水洗涤样本以移除DMAP,接着用1:1NaHCO3:盐水,然后用盐水洗涤。在旋转蒸发器(10托尔,40C)上对甲苯进行蒸馏,然后再添加50mL甲苯,且重复蒸馏以通过同沸蒸馏移除t-BuOH及水,以得到透明残余物。
步骤3
将残余物溶解于THF(100mL)及DMPU(68mL)中,且添加含1M TBSCl的THF(35mL,2.1当量)。向反应氛围中馈入氮气(N2)的惰性氛围,然后将反应物冷却至-78℃。逐滴添加含1.5M LiHMDS的THF(23mL)。将反应物在-78℃下老化30min,然后在约1h的时程内随着缓慢升温的浴液而升温至-10℃。通过添加固体NH4F(2.4g),然后添加水(20mL)来淬灭反应物。然后持续添加水直至所有固体NH4F溶解,且观测到单一均匀溶液为止(总共50mL水)。添加甲苯(100mL),接着添加更多水(100mL)及饱和盐水(20mL)。收集水相,且用饱和NaHCO3(水溶液)(50mL)洗涤有机物。用磷酸将合并的水性洗脱份调整至pH=5。将产物萃取至1:1甲苯:MTBE(300mL)中,然后用2:1水:盐水(200mL)洗涤。在减压下移除挥发物以得到粗固体。在70℃下将粗固体溶解于甲苯(40mL)中,然后添加己烷(40mL)。将反应物冷却至55℃,且添加产物的晶种(50mg)。使反应物在50℃下保持搅拌4h。使样本在一小时内冷却至室温,且在室温下再搅拌一小时。过滤出晶体,且用1:1己烷甲苯(20mL),然后用己烷(20mL)进行洗涤。1HNMR(DMSO-d6,600MHz):δ8.46(d,J=5.4Hz,1H),7.48(宽峰s,部分重叠,1H),7.47(d,J=1.92Hz,1H),7.39(dd,J=1.92,5.4Hz,1H),5.61(m,1H),5.56(m,1H),5.17(m,1H),2.35(m,1H),2.27(m,1H),2.04(m,1H),1.37(s,9H),1.00(d,J=6.9Hz,3H).13C NMR(DMSO-d6,151MHz):δ176.7,163.5,154.8,150.3,143.3,130.9,129.0,122.2,120.8,78.2,57.4,38.4,35.5,28.1,16.3。HRMS(C17H24O4N2Cl):理论质谱355.1419,δ(ppm)-0.43,RDP当量6.5实验值:m/z 355.1418。
实施例17:合成化合物((5R,9S)-21-(二氟甲基)-5-甲基-4-氧代-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-9-基)胺甲酸叔丁酯(化合物26)
在含有(2R,6S,E)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己-4-烯酸(化合物22)(226.1mg)的40mL小瓶中添加克拉布特利催化剂(12.7mg)及DCM(4.5mL)。使约2.25mL的该溶液经历约10次氮气循环,接着在搅拌下经历10次H2循环。施加40psi氢压,且将混合物以500rpm摇晃2天。过滤所得浆液,且进一步用正庚烷洗涤湿滤饼(2R,6S)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸(化合物23)。
在4mL小瓶中,添加烯丙基氯化钯(II)二聚体(3.5mg)、X-Phos(10.2mg)及2-MeTHF(2.8mL)。在30min之后,获得溶液。向8mL小瓶中添加(2R,6S)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸(化合物23)(67.2mg)、1-(二氟甲基)-4-硝基-1H-吡唑(化合物12)(41.4mg)及三甲基乙酸钾(114.8mg)。向此小瓶中添加Pd/Xphos溶液(1.34mL),且在搅拌下将反应混合物加热至80℃。此时,反应物质为白色浆液。在17h之后,将橙棕色浆液冷却至20℃。添加三甲基乙酸钾(54.9mg)的投掷馈入物,且将反应物质加热回至80℃持续23h。在冷却至20℃之后,添加烯丙基氯化钯(II)二聚体(3.5mg)、X-Phos(10.2mg)及2-Me THF(0.2mL)的0.1mL溶液。在再加热至80℃持续18h之后,认为反应完成,且将棕色浆液冷却至20℃。用20重量%K3PO4洗涤有机相,且分离各相。再次用20重量%K3PO4萃取有机相,且分离各相。向合并的水相中添加2-MeTHF及darco以及20重量%柠檬酸水溶液直至达成pH 4为止。经由过滤器过滤二相反应物质,且分离各相。将有机顶部层用NaCl水溶液洗涤,且然后经MgSO4干燥,过滤且浓缩。通过柱色谱法(SiO2)使用20%至100%丙酮/己烷的梯度来纯化油性残余物以分离(2R,6S)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-(1-(二氟甲基)-4-硝基-1H-吡唑-5-基)吡啶-2-基)-2-甲基己酸(化合物24)。LC/MS显示M+1484.15的质量。
然后将(2R,6S)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-(1-(二氟甲基)-4-硝基-1H-吡唑-5-基)吡啶-2-基)-2-甲基己酸(化合物24)(43.7mg)溶解于2-MeTHF(0.43mL)中。在额外0.43mL的2-MeTHF之后,添加Pd/C(5.1mg)。使反应物质在25psi H2压力下经历氢化,且摇晃18h。然后过滤反应物质,且用DCM冲洗固体。然后将滤液浓缩至干燥。
然后使所得(2R,6S)-6-(4-(4-氨基-1-(二氟甲基)-1H-吡唑-5-基)吡啶-2-基)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-2-甲基己酸(化合物25)如下经历巨环内酰胺化:在2h内通过注射泵送至TCFH(0.158g)及DIPEA(0.135mL)于THF(15mL)中的溶液中而添加含(2R,6S)-6-(4-(4-氨基-1-(二氟甲基)-1H-吡唑-5-基)吡啶-2-基)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-2-甲基己酸(100mg)的THF(2.0mL)。在0.5h之后,将反应混合物浓缩至干燥,且再溶解于EtOAc(15mL)中。用15% NH4Cl水溶液洗涤所得混合物。在相分离之后,使有机相经MgSO4干燥,过滤且浓缩。通过ISCO(30%至90% EtOAc/庚烷)纯化残余物,且在对洗脱份进行溶剂蒸发之后,获得85mg的((5R,9S)-21-(二氟甲基)-5-甲基-4-氧代-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-9-基)胺甲酸叔丁酯(化合物26)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)9.32(s,IH),8.71(d,J=5.0Hz,IH),7.96(t,J=58Hz,IH),7.43(s,IH),7.32(d,J=4.8Hz,IH),7.22(d,J=7.3Hz,IH),4.66(d,J=8.3Hz,IH),2.62(br.s.,IH),1.88(d,J=12.8Hz,IH),1.77-1.59(m,2H),1.42-1.28(m,9H),1.15(d,J=18.2Hz,2H),0.83(d,J=7.0Hz,3H).MS(ESI)m/z:436.3[M+H]+
实施例18:合成(5R,9S)-9-氨基-21-(二氟甲基)-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮(化合物C)
在清洁反应器中,馈入MeOH(24.2Kg)、((5R,9S)-21-(二氟甲基)-5-甲基-4-氧代-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-9-基)胺甲酸叔丁酯(化合物26)(3kg)及6NIPA/HCl(6.2L)。将温度升高至45℃至55℃持续至少2h或直至认为反应完成为止。然后在55℃下在450mmHg下将反应物质浓缩至9L。然后馈入MeOH(48.2Kg),且将反应物质浓缩至9L。再重复一次上述操作。用无水甲醇(各48kg)将Dowex monoshere Monosphere550A(OH)洗涤3次直至KF为<3.0重量%为止。然后向(5R,9S)-9-氨基-21-(二氟甲基)-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮的甲醇溶液添加甲醇(4L)及用dowex Dowex树脂干燥,且搅拌直至pH>8.5。经由硅藻土过滤反应物质。分别用甲醇(6.0L及50.70kg)洗涤反应器及硅藻土。
将合并流浓缩至15L。此时,添加ACN(47.3kg),且将反应物质浓缩至30L。将该操作再重复3次。一旦反应溶液显示KF<0.5重量%,则使温度下降至20℃。在1h老化之后,过滤所得浆液,且用ACN(9L)洗涤湿滤饼。将湿滤饼在80℃下干燥至少6h直至认为化合物干燥为止。以76.3%产率或1.57kg获得(5R,9S)-9-氨基-21-(二氟甲基)-5-甲基-21H-3-氮杂-1(4,2)-吡啶-2(5,4)-吡唑环壬蕃-4-酮(化合物C)。
流程8
经由乳酸合成(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酸
实施例19:合成(R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基戊酸苄酯(化合物32)
向烧瓶中添加以下各者:THF(3.75mL)、ZnCl2(含0.5M的THF,1mL)。将溶液冷却至0℃。在5min内添加以下各者:氯-[3-(1,3-二氧戊环-2-基)丙基]镁(4.80mmol,8.0mL)及(2R)-2-(三氟甲基磺酰氧基)丙酸苄酯(3.20mmol,1.00g)。然后使溶液在0℃下搅拌不少于12h。然后将溶液用饱和NH4Cl水溶液(5V)稀释,且用MTBE(10V)萃取。将有机物浓缩为残余物,且通过iSCO[1%至40% EtOAc/己烷]进行纯化以得到呈油状物的(2R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基-戊酸苄酯(化合物28)(39%产率,0.351g,0.351g)。1H NMR:1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.42-7.32(m,5H),5.14(s,2H),4.87-4.80(m,1H),4.00-3.82(m,4H),2.57-2.48(m,1H),1.81-1.70(m,1H),1.70-1.62(m,2H),1.55-1.40(m,3H),1.20(d,J=7.0Hz,3H).13C NMR:13C NMR(126MHz,CDCl3)δ176.5,136.2,128.5,128.1,128.0,104.3,66.0,64.8,39.5,33.7,33.6,21.7,17.0。HRMS.ESI正HRMS[M+H]+C16H23O4。理论值:279.1591[M+H]。实验值:279.1588[M+H]
实施例20:合成(R)-6-(苄氧基)-5-甲基-6-氧代己酸(化合物29)
在圆底烧瓶中将(R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基戊酸苄酯(化合物28)(10g,36mmol)溶解于THF(100mL)中。添加水(100mL)及单过硫酸氢钾复合盐(22.3g)。将混合物在室温下搅拌48h。添加庚烷(50mL),且分离水相。用水(50mL),然后用盐水(50mL)洗涤有机相。通过使用旋转蒸发器将有机物浓缩为残余物。在二氧化硅上用100% DCM-含20%丙酮的DCM对残余物进行色谱分析。获得呈油状物形式的(R)-6-(苄氧基)-5-甲基-6-氧代己酸(化合物29)(8.8g,97%产率)。1H NMR(DMSO-d6,600MHz):δ7.31-7.39(m,5H),5.10(s,2H),2.49(m,1H),2.19(t,J=7.1Hz,2H),1.60(m,1H),1.48(m,2H),1.41(m,1H),1.09(d,J=7.1Hz,3H).13C NMR(DMSO-d6,151MHz):δ175.5,174.3,136.4,128.5,128.0,127.8,65.4,38.6,33.5,32.7,22.2,16.8。HRMS数据:C14H19O4[M+H]+期望值:251.1278,实验值:251.1286。
实施例21:合成(R)-6-(甲氧基(甲基)氨基)-2-甲基-6-氧代己酸苄酯(化合物30)
将(R)-6-(苄氧基)-5-甲基-6-氧代己酸(1g)、N,O-二甲基羟胺氢氯酸盐(470mg)、三乙胺(1.7mL)、1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳化二亚胺氢氯酸盐(930mg)及二氯甲烷(10mL)置于具有搅拌棒的圆底烧瓶中。将反应物在室温下搅拌16h。将有机相置于分液漏斗中,且用水洗涤,然后用1N HCl(水溶液)洗涤,然后用NaHCO3(水溶液)洗涤。然后使有机物经MgSO4干燥,过滤,且通过使用旋转蒸发器浓缩为残余物。用100% DCM-含10%MTBE的DCM对残余物进行色谱分析。以57%产率(化合物30)(665mg)获得(R)-6-(甲氧基(甲基)氨基)-2-甲基-6-氧代己酸苄酯。1H NMR(DMSO-d6,600MHz):δ7.28-7.35(m,5H),5.05(s,2H),3.57(s,3H),3.03(s,3H),2.45(m,1H),2.30(bs,2H),1.55(m,1H),1.44(m,2H),1.37(m,1H),1.05(d,J=7.1Hz,3H).13C NMR(DMSO-d6,151MHz):δ176.3,173.8,136.7,129.0,128.5,128.2,65.9,61.4,39.1,33.2,32.1,31.3,22.2,17.2。HRMS数据:C16H24O4N[M+H]+期望值:294.1700,实验值:294.1708
实施例22:合成(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸苄酯(化合物31)
在氮气的惰性氛围下将2-溴-4-氯吡啶(240mg)及THF(3mL)置于具有搅拌棒的圆底烧瓶中。在室温下将含1.3M turbo格氏试剂的THF(870μl)添加至烧瓶中。将反应物在室温下搅拌1h。然后将反应物冷却至-78℃,且经由注射器添加溶解于THF(1mL)中的(R)-6-(甲氧基(甲基)氨基)-2-甲基-6-氧代己酸苄酯(300mg)。在10分钟之后,自冷却浴移除烧瓶,且升温至室温,之后用NaHCO3(水溶液)淬灭,且用EtOAc稀释。将有机相置于分液漏斗中,且分离各相。然后使有机物经MgSO4干燥,过滤,且通过使用旋转蒸发器浓缩为残余物。用1:9EtOAc:庚烷对残余物进行色谱分析。获得呈透明油状物形式的(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸苄酯(化合物31)(170mg,48%产率)。1H NMR(DMSO-d6,600MHz):δ8.68(宽峰d,J=5.4Hz,1H),7.92(m,1H),7.79(m,1H),7.29-7.36(m,5H),5.09(s,2H),3.13(t,J=7.4Hz,2H),2.52(m,1H),1.62(m,3H),1.46(m,1H),1.10(d,J=7.1Hz,3H).13C NMR(DMSO-d6,151MHz):δ199.8,175.4,154.1,150.7,144.3,136.3,128.4,127.9,127.7,127.4,121.2,65.3,38.6,36.9,32.7,20.9,16.7。
HRMS数据:
实施例23:合成(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-6,6-二甲氧基-2-甲基己酸(化合物32)
将(R)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸苄酯(30mg)溶解于MeOH(300μl)中。添加TMSCl(20μl)及TMOF(100μl),且将反应物在室温下维持12小时。通过使用旋转蒸发器将反应物浓缩为残余物。将1N NaOH(水溶液)(1mL)及MeOH(1mL)添加至残余物中,且将反应物在室温下维持1h。将反应物置于分液漏斗中,且用己烷洗涤水相。然后用1N HCl(水溶液)将水相酸化至pH 3,且然后用EtOAc进行萃取。使有机物经MgSO4干燥,过滤,且通过使用旋转蒸发器浓缩为残余物。以77%产率(22mg)分离产物。NMR符合真实产物,且通过手性HPLC测量出ee为94%。
流程9
经由假麻黄素合成(2R,6S)-6-(叔丁氧基羰基)氨基-6-(4-氯吡啶-2基)-2-甲基己酸(化合物40)
实施例24:合成(2R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基-戊酸(化合物36)
将氯化锂(2.1g,51mmol)添加至烧瓶中。将烧瓶置于真空(约25mmHg)下,且用热风枪(+100℃,不少于30min)进行加热以移除任何痕量的水。将烧瓶冷却至20℃,且添加THF(22mL),接着添加二异丙胺(5.9g,58mmol)。将溶液冷却至-20℃。在不少于1h内添加n-BuLi[2.5M于己烷中](23mL)。逐滴添加N-[(1S,2S)-2-羟基-1-甲基-2-苯基-乙基]-N-甲基-丙酰胺(化合物34)(25mmol,5.6g)于THF(11mL)中的溶液以便将温度维持在不超过-10℃。然后将溶液冷却至-20℃,且保持不少于1h。然后将其升温至0℃,且保持不少于3h。然后将溶液升温至20℃,且保持不少于45min。然后将溶液再冷却至0℃,且逐滴添加2-(3-溴丙基)-1,3-二氧戊环(50.61mmol,10.39g)。然后在不少于10h内使溶液升温至20℃。经由添加饱和NH4Cl水溶液(5V)且接着添加水(5V)来淬灭反应物。添加MTBE(10V),且分离并移除水相。用盐水(5V)洗涤有机物。然后将有机物浓缩为残余物。将残余物溶解至t-BuOH(78mL)及Bu4NOH(40重量%于水中)(82mL,125mmol)以及水(233mmol)中。将二相混合物加热至回流持续不少于24h。将溶液冷却至20℃。添加MTBE(5V),且分离水相。舍弃有机相。使用H3PO4将水层酸化至pH 5.0。一旦处于pH 5.0,则用MTBE(5V,3×)萃取水相。将合并的有机物干燥(Na2SO4),过滤且浓缩以得到呈油状物的粗(2R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基-戊酸(化合物36)(96%产率,4.52g)。1H NMR(500MHz,CHCl3-d)δ4.87(t,J=4.7Hz,1H),4.03-3.80(m,4H),2.58-2.41(m,1H),1.81-1.64(m,4H),1.56-1.40(m,4H),1.19-1.19(m,1H),1.20(d,J=7.0Hz,3H).13C NMR(126MHz,CDCl3)δ182.3,104.3,64.8,39.3,33.7,33.3,21.6,16.8。HRMS:ESI正HRMS[M-18+H]+C9H15O3[M-18+H]理论值:171.1016。实验值:171.1014
实施例25:合成(2R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基-戊酸苄酯(化合物37)
将以下各者添加至烧瓶中:(2R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基-戊酸(106.3mmol,20.00g)、二氯甲烷(6631mmol,563.2g,425.0mL)、苄醇(127.5mmol,13.79g,13.20mL)、4-二甲氨基吡啶(10.63mmol,1.298g)。将溶液冷却至0℃,且添加以下:1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳化二亚胺氢氯酸盐(117.9mmol,22.61g)。使溶液在0℃下搅拌2h,且然后升温至20℃并保持隔夜。用以下各者洗涤溶液:饱和NaHCO3水溶液(5V)、水(5V)及盐水(5v)。将有机物浓缩且通过ISCO[0%至40% EtOAc]纯化以得到呈透明油状物的(2R)-5-(1,3-二氧戊环-2-基)-2-甲基-戊酸苄酯(化合物37)(90.0%产率,4.10g,4.10g)。1H NMR(500MHz,氯仿-d)δ7.42-7.32(m,5H),5.14(s,2H),4.87-4.80(m,1H),4.00-3.82(m,4H),2.57-2.48(m,1H),1.81-1.70(m,1H),1.70-1.62(m,2H),1.55-1.40(m,3H),1.20(d,J=7.0Hz,3H).13C NMR(126MHz,CDCl3)δ176.5,136.2,128.5,128.1,128.0,104.3,66.0,64.8,39.5,33.7,33.6,21.7,17.0。HRMS ESI正HRMS[M+H]+C16H23O4理论值:279.1591[M+H]。实验值:279.1588[M+H]。
实施例26:合成(R,E)-6-(((R)-叔丁基亚磺酰基)亚氨基)-2-甲基己酸苄酯(化合物38)
1H NMR(500MHz,CDCl3)δ8.12-7.97(m,1H),7.41-7.31(m,6H),5.16-5.10(m,2H),2.57-2.47(m,3H),1.84-1.71(m,1H),1.71-1.60(m,2H),1.58-1.46(m,1H),1.19(s,12H).13C NMR(126MHz,CDCl3)δ176.1,169.0,136.1,128.6,128.2,66.1,56.50,39.3,35.9,33.2,23.0,22.3,17.0。HRMS:ESI正HRMS[M+H]+C18H28O3NS[M+H]理论值:338.1784[M+H]。实验值:338.1784[M+H]
实施例27:合成(2R,6S)-6-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸苄酯(化合物39)
在氮气的惰性氛围下将2-溴-4-氯吡啶(350mg)及THF(2.5mL)置于具有搅拌棒的圆底烧瓶中。在室温下将含1.3M turbo格氏试剂的THF(1.4mL)添加至烧瓶中。将反应物在室温下搅拌30min。然后将反应物冷却至-78℃,且经由注射器添加溶解于THF(2mL)中的(R,E)-6-(((R)-叔丁基亚磺酰基)亚氨基)-2-甲基己酸苄酯(500mg)。使反应物在一小时的时程内升温至室温,之后用NaHCO3(水溶液)淬灭,且用EtOAc稀释。将有机相置于分液漏斗中,且分离各相。然后使有机物经MgSO4干燥,过滤,且在减压下移除挥发物以得到浓缩残余物。用1:1EtOAc:己烷-100% EtOAc对残余物进行色谱分析,且获得呈透明油状物形式的(2R,6S)-6-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸苄酯(化合物39)(530mg,79%产率)。1H NMR(DMSO-d6,600MHz):δ8.46(d,J=5.4Hz,1H),7.56(d,J=1.8Hz,1H),7.40(dd,J=1.8,5.4Hz,1H),7.31-7.38(m,5H),5.54(d,J=6.8Hz,1H),5.06(s,2H),4.28(m,2H),2.45(m,1H),1.82(m,2H),1.58(m,1H),1.38(m,2H),1.07(s,9H),1.05(d,J=7.1Hz,3H).13C NMR(DMSO-d6,151MHz):δ175.5,164.9,150.1,143.2,136.3,128.4,127.9,127.7,122.3,121.4,65.3,61.2,55.3,38.5,36.1,32.8,23.0,22.5,16.7。
HRMS数据:
实施例28:合成(2R,6S)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸(化合物40)
步骤1
在圆底烧瓶中将(2R,6S)-6-(((R)-叔丁基亚磺酰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸苄酯(300mg)溶解于MeOH(4mL)中,且添加2N NaOH(水溶液)(1mL)。将反应物在室温下搅拌直至起始材料耗尽为止。将反应物用水稀释,且用己烷洗涤以移除苄醇。用柠檬酸将混合物酸化至pH 3,且将产物萃取至MTBE中。通过使用旋转蒸发器将有机物浓缩为残余物。
步骤2
在圆底烧瓶中将残余物溶解于MeOH(2.5mL)中,且添加3当量的TMSCl(250μL)。在起始材料耗尽之后,在真空下移除挥发物。
步骤3
将残余物溶解于THF(2.5mL)中,且添加1.5当量Boc2O(220mg)及3当量三乙胺(280μl)。在中间体耗尽之后,用1N NaOH(10mL)及己烷(10mL)稀释反应物,且自水溶液分离有机层。将水相用饱和柠檬酸水溶液酸化至pH 3,且沉淀出白色固体。过滤出白色固体,且用水(10mL)进行洗涤,然后在空气流下干燥隔夜。以86%产率(203mg)获得(2R,6S)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸。(特征符和先前针对(2R,6S)-6-((叔丁氧基羰基)氨基)-6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基己酸所记录的特征。)
流程10
实施例29:合成6-(5-氯-2-(4-氯-1H-1,2,3-三唑-1-基)苯基)嘧啶-4-醇(化合物32)
在具有红色压力释放盖的4mL小瓶中,称取(Z)-3-氨基-3-[5-氯-2-(4-氯三唑-1-基)苯基]丙-2-烯酰胺(化合物32)(50mg,0.15262mmol,91质量%,1.0当量)。向小瓶的内容物中添加甲酸乙酯(0.25mL,3.1mmol,100质量%,20当量),接着添加含乙醇钠(21重量%)的乙醇(0.15mL,0.40mmol,21质量%,2.6当量)。将反应混合物加热至55℃持续2h。此后添加含HCl(1mol/L)的去离子水(0.23mL,0.23mmol,1mol/L,1.5)、二相2-甲基四氢呋喃(0.5mL,5mmol,100质量%,30),摇晃,分相。用盐水(0.5mL)洗涤有机层且分相,接着用Na2SO4进一步干燥有机层,浓缩至大约5V,馈入10V的庚烷,过滤,干燥(80%产率)。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.64(br s,1H),8.75(s,1H),8.06(d,J=1.0Hz,1H),7.88(d,J=2.3Hz,1H),7.85-7.71(m,2H),6.34(d,J=1.0Hz,1H)。
实施例30:化合物(I)的晶体丙酮溶剂合物形式的XRPD数据
表1:峰值清单(高于5%)相对强度
/>
程序:在PANalytical(Philips)X'PertPRO MPD衍射仪上进行X射线粉末衍射(XRPD)分析。该仪器装配有Cl LFF X射线管。将化合物填充于16mm腔体固持器中。
实施例31:化合物(I)的晶体丙酮溶剂合物形式的红外数据
表2:IR数据
(vs=极强,s=强,m=中等强度)
程序:使用微衰减全反射(microATR),且使用合适的microATR附件及以下测量条件来分析样本:
设备:Thermo Nexus 670FTIR光谱仪
扫描次数:32
分辨率:1cm-1
波长范围:4000至400cm-1
检测器:具有KBr窗的DTGS
分束器:KBr上的Ge
微ATR附件:具有Si晶体的Harrick Split Pea
本文中所描述的实施例及实施方案仅出于说明性目的,且在一些实施方案中,各种修改或变化将包括于本发明的范围及所附权利要求书的范围内。

Claims (34)

1.一种用于制备化合物的晶体溶剂合物形式的方法,所述化合物由以下表示:
所述方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物A:
与N,N-二甲基甲酰胺二甲缩醛在合适的溶剂中反应,以得到含有甲醇作为副产物的混合物;
(b)向步骤(a)的所述混合物中添加具有以下结构的化合物C:
以得到化合物(I)的所述晶体溶剂合物形式:
2.根据权利要求1所述的方法,其中在步骤(b)之前移除所述甲醇。
3.根据权利要求2所述的方法,其中在自步骤(a)的所述混合物移除甲醇之后添加乙酸。
4.根据权利要求1所述的方法,其中在添加化合物C之后添加三乙胺。
5.根据权利要求1所述的方法,其中使化合物(I)在甲醇与水的混合物中结晶,接着用丙酮水溶液进行冲洗以得到化合物(I)的晶体丙酮溶剂合物形式。
6.根据权利要求1所述的方法,其中具有以下结构的化合物A:
通过以下方法来制备,所述方法包括:
(a)使具有以下结构的化合物1:
与氨(NH3)在合适的溶剂中反应以得到具有以下结构的化合物2:
(b)使化合物2与脱水剂反应以得到具有以下结构的化合物3:
(c)使化合物3与乙基丙二酸钾、碱和路易斯酸反应以得到化合物A:
7.根据权利要求6所述的方法,其中在步骤(a)中添加氯化钙作为催化剂。
8.根据权利要求6所述的方法,其中步骤(b)的所述脱水剂选自磷酰氯(POCl3)、(COCl)2、PCl5、SOCl2、PCl3及氯化二甲基氯甲亚胺盐(ClCH=N(CH3)2Cl)。
9.根据权利要求6所述的方法,其中步骤(c)的所述路易斯酸选自氯化锌(ZnCl2)、三氯化铝(AlCl3)及三氟化硼(BF3)。
10.根据权利要求6所述的方法,其中步骤(c)的所述碱选自三乙胺、N,N-二异丙基乙胺(DIPEA)、1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一-7-烯(DBU)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)、1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷(DABCO)、四甲基乙二胺(TMEDA)及N,N,N',N”,N”-五甲基二乙烯三胺(PMDTA)。
11.根据权利要求1所述的方法,其中具有以下结构的化合物C:
通过以下方法来制备,所述方法包括:
(a)将具有以下结构的化合物15的氢氯酸盐:
溶解于合适的溶剂中,
(b)然后添加转氨酶ATA-486及酶促催化剂以得到化合物C:
12.根据权利要求11所述的方法,其中所述酶促催化剂为5'-磷酸吡哆醛水合物(5-PLP)。
13.根据权利要求11所述的方法,其中具有以下结构的化合物15的所述氢氯酸盐:
通过以下方法来制备,所述方法包括:
(a)使具有以下结构的化合物8:
与2-甲基环戊酮及强碱反应,以得到具有以下结构的化合物9:
(b)使化合物9与酸水溶液反应以得到具有以下结构的化合物10:
(c)使化合物10与(1R,2S)-赤-2-氨基-1,2-二苯基乙醇反应以得到化合物10A的非对映体盐:
(d)用酸水溶液及合适的有机溶剂溶解化合物10A的非对映体盐以得到化合物10A:
(e)使化合物10A与氯化三甲基硅烷反应,接着与原甲酸三甲酯反应,且然后与强碱反应以得到化合物11:
(f)将化合物11与二环己胺(DCHA)混合以得到化合物11的盐:
(g)使化合物11的二环己胺盐与偶联剂及的氢氯酸盐反应,以形成具有以下结构的化合物14:
(h)使化合物14与金属催化剂反应,接着与氢氯酸反应以得到化合物15的氢氯酸盐:
14.根据权利要求13所述的方法,其中步骤(g)的所述偶联剂选自1,1'-羰基二咪唑(CDI)、二环己基碳化二亚胺(DCC)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳化二亚胺(EDCI)及1,1'-硫羰基二咪唑(TCDI)。
15.根据权利要求13所述的方法,其中步骤(h)的所述金属催化剂选自钯及钌。
16.一种以下化合物的晶体形式:
17.根据权利要求16所述的晶体形式,其具有X射线粉末衍射图案,所述X射线粉末衍射图案包含一、二、三或四个选自按以下°2θ值表述的峰的峰:20.0±0.2、21.3±0.2、21.6±0.2及23.9±0.2。
18.根据权利要求16所述的化合物(I)的晶体形式,其展现出具有以倒数波数单位(cm-1)表述为以下值的特征峰的傅立叶变换红外光谱:约1709、约1676、约1532、约1485、约1457、约1441、约1432、约1370、约1291、约1219、约1189、约1135、约1119、约1068、约1039、约994、约942、约883、约827、约801及约696。
19.一种用于制备化合物的方法,所述化合物由以下表示:
所述方法包括:
(a)使具有以下结构的化合物17:
与具有以下结构的化合物18反应:
(b)随后添加非亲核碱,接着添加氯化三甲基硅烷以得到具有以下结构的化合物20的双氢氯酸盐:
(c)使化合物20与氨基甲酸酯保护基(PG)试剂反应,接着与丙酸酐反应,然后与非亲核碱反应以得到具有以下结构的化合物21:
(d)使化合物21与非亲核碱反应以得到具有以下结构的化合物22:
(e)使化合物22与金属氢化催化剂反应以得到具有以下结构的化合物23:
(f)使化合物23与1-(二氟甲基)-4-硝基-1H-吡唑(化合物12)及金属催化剂反应,以得到具有以下结构的化合物24:
(g)使化合物24与金属氢化催化剂反应以得到具有以下结构的化合物25:
(h)使化合物25与偶联剂反应以得到具有以下结构的化合物26:
(i)使化合物26与酸反应以得到化合物C:
20.根据权利要求19所述的方法,其中所述非亲核碱选自1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一-7-烯(DBU)、双(三甲基硅基)氨基锂(LiHMDS)、双(三甲基硅基)氨基钾(KHMDS)、1,5-二氮杂双环[4.3.0]壬-5-烯(DBN)及N,N-二异丙基乙胺(Hünig碱)。
21.根据权利要求19所述的方法,其中步骤(c)的所述氨基甲酸酯保护基试剂选自二碳酸二叔丁酯(Boc2)、羧基苄基氯(Cbz-Cl)及氯化氨基甲酸甲酯(CH3CO2Cl)。
22.根据权利要求19所述的方法,其中所述金属氢化催化剂选自碳负载钌、克拉布特利催化剂及碳负载钯。
23.一种用于制备化合物11的方法,所述化合物11具有以下结构:
所述方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物27:
与(3-(1,3-二氧戊环-2-基)丙基)氯化镁反应以得到具有以下结构的化合物28:
(b)使化合物28与氧化剂反应以得到具有以下结构的化合物29:
(c)使化合物29与N,O-二甲基羟胺及偶联剂反应以得到具有以下结构的化合物30:
(d)使化合物30与4-氯吡啶-2-基溴化镁反应以得到具有以下结构的化合物31:
(e)随后添加强酸/醇溶液以得到化合物32:
24.一种用于制备化合物40的方法,所述化合物40具有以下结构:
所述方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物34:
与2-(3-溴丙基)-1,3-二氧戊环反应以得到具有以下结构的化合物35:
(b)使化合物35与强碱在合适的溶剂中反应以得到具有以下结构的化合物36:
(c)使化合物36与苄醇及偶联剂反应以得到具有以下结构的化合物37:
(d)使强酸与化合物37反应,接着添加手性助剂与金属催化剂以得到具有以下结构的化合物38:
(e)随后使化合物38与(4-氯吡啶-2-基)溴化镁反应以得到具有以下结构的化合物39:
(f)随后将酯水解,接着添加保护基以得到化合物40:
25.根据权利要求24所述的方法,其中步骤(c)的所述偶联剂选自1,1'-羰基二咪唑(CDI)、二环己基碳化二亚胺(DCC)、1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳化二亚胺(EDCI)及1,1'-硫羰基二咪唑(TCDI)。
26.一种用于对6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸进行对映异构体富集的方法,其包括用非外消旋2-氨基-1,2-二苯基乙醇使6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸自6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸的对映异构体的混合物于溶剂中的溶液或悬浮液分步结晶为其盐。
27.根据权利要求26所述的方法,其包括用2-氨基-1,2-二苯基乙醇使6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸分步结晶,以获得6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸与2-氨基-1,2-二苯基乙醇的非对映异构体富集盐和含有非外消旋6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸的母液,其中所述方法进一步包括经由以下步骤使所述母液中含有的所述6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸外消旋化:
a)通过将6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸的羧酸转化为对应C1-C4-烷基酯基来保护所述羧酸;
b)通过用不具有或具有较低亲核性的强碱进行处理,使步骤a)中所获得的6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸的羧酸受保护衍生物外消旋化,所述强碱优选地选自酰胺碱、叔烷醇的碱金属盐及氢化钠;
c)使步骤b)中所获得的外消旋化合物去保护以产生呈其外消旋体形式的6-(4-氯吡啶-2-基)-2-甲基-6-氧代己酸。
28.一种用于制备化合物1的方法,所述化合物1具有以下结构:
所述方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物4:
(i)与亚硝酸钠及酸在合适的溶剂中反应以形成第一混合物;
(ii)然后将第一混合物添加至包含叠氮化钠及弱碱的水溶液中以形成第二混合物;
(iii)使所述第二混合物与三甲基硅基乙炔及碘化铜(I)(CuI)以及配位体反应以得到具有以下结构的化合物7:
以及
(b)用氯化剂使化合物7氯化以得到化合物1。
29.根据权利要求28所述的方法,其中步骤(a)(i)的所述酸选自甲磺酸、HBF4、TsOH、H2SO4及HCl;且步骤(a)(ii)的所述弱碱选自碳酸氢钠(NaHCO3)、碳酸钾、吡啶、2,6-二甲基吡啶、甲胺、三乙胺及DMF。
30.根据权利要求28所述的方法,其中步骤(a)(iii)的所述配位体选自四甲基乙二胺(TMEDA)、NEt2、DIPEA、TMEDTA、三乙胺、N,N-二异丙基乙胺及N,N,N',N”,N”-五甲基-二乙三胺。
31.根据权利要求28所述的方法,其中步骤(b)的所述氯化剂选自1,3-二氯-5,5-二甲基乙内酰脲、NCS、NaClO及三氯异氰脲酸。
32.一种用于制备化合物1的方法,所述化合物1具有以下结构:
所述方法包括以下步骤:
(a)使具有以下结构的化合物4:
(i)与酸及亚硝酸钠在合适的溶剂中反应;
(ii)与叠氮化钠与弱碱水溶液的混合物水溶液反应以形成具有以下结构的化合物6:
(b)随后在金属催化剂及配位体的存在下使化合物6与氯乙炔偶联以得到化合物1。
33.根据权利要求32所述的方法,其中步骤(a)(i)的所述酸选自甲磺酸、HBF4、TsOH、H2SO4及HCl;且步骤(a)(ii)的所述弱碱选自碳酸氢钠(NaHCO3)、碳酸钾、吡啶、2,6-二甲基吡啶、甲胺、三乙胺及DMF。
34.根据权利要求32所述的方法,其中在步骤(b)中,所述金属催化剂选自碘化铜(I)、CuBr、CuCl、Cu2O、CuSO4、CuSO4(5H2O)、Cu(OAc)2、Cu(acac)2及CuCl2,且所述配位体选自四甲基乙二胺(TMEDA)、NEt2、DIPEA、TMEDTA、三乙胺、N,N-二异丙基乙胺及N,N,N',N”,N”-五甲基二乙烯三胺。
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