CN116768966A - 单甲基澳瑞他汀e单晶、其制备方法和应用 - Google Patents

单甲基澳瑞他汀e单晶、其制备方法和应用 Download PDF

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乔凌翔
倪小军
喻耀
王念
刘陆平
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Hubei Shihe Pharmaceutical Technology Co ltd
Sino Us Huashitong Biomedical Technology Wuhan Co ltd
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Hubei Shihe Pharmaceutical Technology Co ltd
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    • C07KPEPTIDES
    • C07K5/00Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof
    • C07K5/02Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing at least one abnormal peptide link
    • C07K5/0205Peptides containing up to four amino acids in a fully defined sequence; Derivatives thereof containing at least one abnormal peptide link containing the structure -NH-(X)3-C(=0)-, e.g. statine or derivatives thereof
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    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
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    • G01N33/96Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving blood or serum control standard

Abstract

本发明涉及单晶制备技术领域,具体而言,涉及单甲基澳瑞他汀E单晶、其制备方法和应用。单甲基澳瑞他汀E单晶的分子中手性中心的绝对构型为:{C2(S),C7(S),C13(S),C14(S),C18(R),C25(S),C26(R),C28(R),C31(R),C33(S)}2。本发明提供一种新的单甲基澳瑞他汀E单晶,其能够作为对照品或者标准品确认单甲基澳瑞他汀E的手性结构。

Description

单甲基澳瑞他汀E单晶、其制备方法和应用
技术领域
本发明涉及单晶制备技术领域,具体而言,涉及单甲基澳瑞他汀E单晶、其制备方法和应用。
背景技术
单甲基澳瑞他汀E(MMAE,Monomethyl auristatin E,CAS:474645-27-7)是一种新型抗有丝分裂的Auristatin衍生物,通常被用于抗体偶联药。单甲基澳瑞他汀E手性中心较多,而手性的确认对单甲基澳瑞他汀E的结构确认以及药效等都有显著影响,而现有技术中还没有确认的单甲基澳瑞他汀E的单晶以及其制备方法。
鉴于此,特提出本发明。
发明内容
本发明的目的在于提供单甲基澳瑞他汀E单晶、其制备方法和应用。本发明提供一种新的单甲基澳瑞他汀E单晶,其能够作为对照品或者标准品确认单甲基澳瑞他汀E的手性结构。
本发明是这样实现的:
第一方面,本发明提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶,其分子中手性中心的绝对构型为:{C2(S),C7(S),C13(S),C14(S),C18(R),C25(S),C26(R),C28(R),C31(R),C33(S)}2
在可选的实施方式中,所述单甲基澳瑞他汀E单晶属于单斜晶,P21空间群;
优选地,所述单甲基澳瑞他汀E单晶的单胞参数1为:{ α=90°,β=90.1530(10)°,γ=90°,}。
在可选的实施方式中,所述单甲基澳瑞他汀E单晶为水合物;
优选地,所述单甲基澳瑞他汀E单晶中不对称单元由6个MMAE分子以及8个水分子所构成。
第二方面,本发明提供一种前述实施方式所述的单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:将单甲基澳瑞他汀E样品制备为无定形样品,而后再利用缓慢挥发混合溶剂进行单晶培养。
在可选的实施方式中,形成所述无定形样品的步骤包括:将所述单甲基澳瑞他汀E样品与溶解溶剂混合溶解形成澄清溶液,而后让所述溶解溶剂快速挥发形成胶状的无定形样品;其中,所述溶解溶剂包括烷烃类溶剂。
在可选的实施方式中,所述溶解溶剂包括C1-C10取代或未取代烷烃溶剂;
优选地,所述溶解溶剂包括C1-C6取代或未取代烷烃溶剂;
优选地,所述溶解溶剂包括二氯甲烷、氯仿、正戊烷和正己烷中的任意一种。
在可选的实施方式中,单晶培养的步骤包括:将所述无定形样品与混合溶剂混合溶解,而后过滤,并进行密封,密封后在密封口设置一个小孔,接着,在室温下使得溶剂缓慢挥发,其中,所述混合溶剂选自醇类溶剂或腈类溶剂和水的混合溶剂。
在可选的实施方式中,所述醇类溶剂选自C1-C5一元醇,优选为甲醇、乙醇、正丙醇和异丙醇中的任意一种;
所述腈类溶剂选自乙腈。
在可选的实施方式中,所述混合溶剂中所述醇类溶剂或所述腈类溶剂与所述水的体积比为1-10:1;优选为5-8:1。
第三方面,本发明提供一种前述实施方式所述的单甲基澳瑞他汀E单晶作为标准品或对照品中的应用。
本发明具有以下有益效果:本发明实施例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶,其能够作为对照品或者标准品确认单甲基澳瑞他汀E的手性结构。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例的技术方案,下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍,应当理解,以下附图仅示出了本发明的某些实施例,因此不应被看作是对范围的限定,对于本领域普通技术人员来讲,在不付出创造性劳动的前提下,还可以根据这些附图获得其他相关的附图。
图1为本发明实施例1提供的单甲基澳瑞他汀E单晶的照片;
图2为本发明实施例1提供的单甲基澳瑞他汀E单晶的不对称单元示意图;
图3为本发明实施例1提供的单甲基澳瑞他汀E单晶的不对称单元示意图;
图4为本发明实施例1提供的单甲基澳瑞他汀E单晶的XPRD图;
图5为本发明对比例1提供的单甲基澳瑞他汀E单晶的照片;
图6为本发明对比例6提供的单甲基澳瑞他汀E单晶的照片。
具体实施方式
为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将对本发明实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述。实施例中未注明具体条件者,按照常规条件或制造商建议的条件进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市售购买获得的常规产品。
本发明实施例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶,其结构式为:
可见,其分子中手性中心的绝对构型为:{C2(S),C7(S),C13(S),C14(S),C18(R),C25(S),C26(R),C28(R),C31(R),C33(S)}2
进一步地,SCXRD表征显示该单晶属于单斜晶系,P21空间群,其单胞参数1为:{α=90°,β=90.1530(10)°,γ=90°,/>}。单晶结构解析显示该单晶结构的不对称单元由6个MMAE分子以及8个水分子所构成。这表明该晶体为水合物(该分子与结晶水分子的化学计量比为3:4)。
第二方面,本发明提供一种前述实施方式所述的单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
S1、形成无定形样品;
将单甲基澳瑞他汀E样品与溶解溶剂混合溶解形成澄清溶液,而后让所述溶解溶剂快速挥发形成胶状的无定形样品。
具体地,将单甲基澳瑞他汀E样品置于一个单晶生长瓶中加入溶解溶剂溶解,适当超声振动促进固体样品完全溶解,形成澄清溶液。随后将该单晶瓶敞口静置于通风橱内让溶解溶剂快速的挥发。数小时后得到了胶状的化合物,无定形样品。
可见,本发明实施例提供的快速挥发溶解溶剂,也就是在室温下将装呈有澄清溶液的器件的开口完全敞开,并在通风橱内,使得溶解溶剂自然挥发。例如,1~10毫升的混合液,3~8小时溶解溶剂挥发完全。
溶解溶剂的量使得其完全溶解单甲基澳瑞他汀E样品即可,不过最好采用饱和溶液。例如;所述溶解溶剂与所述单甲基澳瑞他汀E样品的用量为1-10:1。
其中,所述溶解溶剂包括烷烃类溶剂。C1-C10取代或未取代烷烃溶剂;优选为C1-C6取代或未取代烷烃溶剂;例如溶解溶剂包括二氯甲烷、氯仿、正戊烷和正己烷中的任意一种。
先形成无定形样品才能在单晶培养过程中形成单晶。
S2、单晶培养;
将无定形样品与混合溶剂混合溶解,而后过滤,并进行密封,密封后在密封口设置一个小孔,接着,在室温下使得溶剂缓慢挥发。
具体地,将上述无定形样品置于玻璃瓶中,加入的混合溶剂使得无定形样品溶解,可以适当采用超声振荡促进固体样品溶解。随后采用注射器及注射器式过滤头进行过滤。所得滤液转移至一个洁净的单晶生长瓶中。然后采用PE材质的单晶瓶塞将单晶瓶进行封口,并在该塞子上扎一个小孔。随后将该单晶瓶静置于通风橱内进行室温溶剂缓慢挥发,数天后观察到体系中析出板状的单晶样品,并聚集成簇。
需要说明的是,上述本发明实施例提供的过滤装置和过程仅仅是举例,也可以采用其他的过滤装置。
本发明实施例提供的缓慢挥发,也就是仅在封口处开设一个小孔,而后在室温下,混合溶剂自行通过小孔缓慢挥发。孔的大小根据溶剂沸点不同而适当调整。例如,1~10毫升的混合液,3~8天溶解溶剂挥发完全。
进一步地,混合溶剂选自醇类溶剂或腈类溶剂和水的混合溶剂。其中,所述醇类溶剂选自C1-C5一元醇,优选为甲醇、乙醇、正丙醇和异丙醇中的任意一种;所述腈类溶剂选自乙腈;无定形样品与所述混合溶剂的质量比为1:1-10。
进一步地,上述混合溶剂中所述醇类溶剂或所述腈类溶剂与所述水的体积比为1-10:1;例如有机溶剂:水的体积比为1:1、2:1、3:1、4:1、5:1、6:1、7:1、8:1、9:1以及10:1等1-10:1之间的任意数值或者任意两个数值之间的范围值。
本发明实施例通过采用特定地混合溶剂以及溶剂缓慢挥发,能够形成单甲基澳瑞他汀E单晶,且保证形成单晶的结构和形态。
进一步地,本发明提供一种前述实施方式所述的单甲基澳瑞他汀E单晶作为标准品或对照品中的应用。
以下结合实施例对本发明的特征和性能作进一步的详细描述。
实施例1
本实施例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
MMAE的制备,参照下述合成路径:
步骤1:Fmoc-MMAE的合成。
将化合物1(300mg,0.93mmol)和化合物2(Fmoc-(N-Me)-L-Val-L-Val-Dil-OH)(464mg,0.73mmol)溶于15mL的DCM中,依次加入HATU(461mg,1.2mmol)和DIEA 600μL,室温下搅拌反应过夜。反应完毕后,加入DCM萃取三遍,合并有机相,分别用2%的柠檬酸溶液和饱和NaCl溶液各萃取一遍,加入无水Na2SO4干燥过夜。抽滤并旋干DCM,加入乙醚洗涤3次,无需进一步纯化,得微黄色固体495mg。
步骤2:MMAE的合成。
将350mg Fmoc-MMAE溶于10mL DCM中,加入300μL二乙胺,室温下搅拌反应过夜,反应结束后旋干反应溶剂,使用制备液相进行分离纯化,色谱条件如下:A相H2O+0.08%TFA,B相乙腈+0.08%TFA,0-35min B相45%等梯度洗脱,收集纯品,冻干反应产物。
称取77.0mg上述MMAE样品置于4-mL单晶生长瓶中,加入0.1mL正庚烷溶剂,适当超声促其溶解后形成澄清溶液,随后将单晶瓶敞口静置于通风橱内进行快速挥发,挥发约5小时后得到胶状的无定形样品。
称取上述第一步中制备得到的5.6mg毫克无定形样品置于4ml玻璃瓶中,加入0.5ml乙腈和水的混合溶液,其中乙腈和水的体积比为5:1,并适当超声振荡促进固体样品溶解。随后采用注射器及注射器式过滤头(0.45μm PTFE滤膜)进行过滤。所得滤液转移至一个洁净的4mL单晶生长瓶中。然后采用PE材质的单晶瓶塞将单晶瓶进行封口,并在该塞子上扎一个小孔。随后将该4mL单晶瓶静置于通风橱内进行室温溶剂缓慢挥发。六天后观察到体系中析出板状的单晶样品,并聚集成簇。
对该板状单晶样品进行拍照、X射线衍射以及单晶结构分析,参见图1-图4和表1。其中,图1为板状单晶样品的照片,图2为板状单晶样品的不对称单元示意图,图3为板状单晶样品的另一张不对称单元示意图,图4为板状单晶样品的XPRD图。
图2的单晶结构解析显示该晶体的不对称单元由6个MMAE分子(它们在晶体学上独立,分别以MMAE分子(A)~(F)表示,它们的原子标签分别以(A)~(F)作为尾缀)以及8个水分子(图中分别以水分子(1)~(8)标示)所构成。这表明该晶体为化合物MMAE的水合物晶型,其晶格中MMAE分子与结晶水的化学计量比为3:4。
为了更清晰的展示该单晶结构特征,在另一张不对称单元示意图(图3)中,这6个晶体学独立的MMAE分子(A)~(F)分别以蓝色、青色、绿色、黄色、橙色以及红色高亮显示。它们具有相同的绝对构型,仅在构象上由于单键的旋转而存在差异,基于该MMAE水合物的单晶结构数据,项目确证了化合物MMAE的立体化学如结构式所示,其分子中手性中心的绝对构型为{C2(S),C7(S),C13(S),C14(S),C18(R),C25(S),C26(R),C28(R),C31(R),C33(S)}1。
表1单晶的晶体结构数据及结构精修参数
实施例2
本实施例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
称取60毫克化合物MMAE置于4-mL玻璃瓶中,加入0.1ml相应氯仿,适当超声促其溶解后形成澄清溶液。所得样品溶液转移至洁净4-mL单晶瓶中,随后将单晶瓶敞口静置于通风橱内进行挥发,挥发约3小时后得到胶状的无定形样品。
称取上述第一步中制备得到的5.8毫克无定形样品置于一4-mL玻璃瓶中,加入乙醇和水的混合溶液0.5mL,其中乙醇和水的体积比为8:1,并适当超声振荡促进固体样品溶解。随后采用注射器及注射器式过滤头(0.45μm PTFE滤膜)进行过滤。所得滤液转移至一个洁净的4mL单晶生长瓶中。然后采用PE材质的单晶瓶塞将单晶瓶进行封口,并在该塞子上扎一个小孔。随后将该4mL单晶瓶静置于通风橱内进行室温溶剂缓慢挥发,五天后观察到体系中析出板状的单晶样品,并聚集成簇。
实施例3
本实施例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
称取56.0mg MMAE样品置于4-mL单晶生长瓶中,加入0.1mL正庚烷溶剂,适当超声促其溶解后形成澄清溶液,随后将单晶瓶敞口静置于通风橱内进行快速挥发,挥发约5小时后得到胶状的无定形样品。
称取上述第一步中制备得到的6.3mg毫克无定形样品置于4ml玻璃瓶中,加入0.5ml乙腈和水的混合溶液,其中乙腈和水的体积比为5:1,并适当超声振荡促进固体样品溶解。随后采用注射器及注射器式过滤头(0.45μm PTFE滤膜)进行过滤。所得滤液转移至一个洁净的4mL单晶生长瓶中。然后采用PE材质的单晶瓶塞将单晶瓶进行封口,并在该塞子上扎一个小孔。随后将该4mL单晶瓶静置于通风橱内进行室温溶剂缓慢挥发。五天后观察到体系中析出板状的单晶样品,并聚集成簇。
实施例4
本实施例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
称取56毫克化合物MMAE置于4-mL玻璃瓶中,加入0.3毫升相应二氯甲烷适当超声促其溶解后形成澄清溶液。所随后将单晶瓶敞口静置于通风橱内进行快速挥发,挥发约3小时后得到胶状的无定形样品。
称取上述第一步中制备得到的8.3毫克无定形样品置于一4-mL单晶生长瓶中,加入异丙醇和水的混合溶液0.6mL,其中异丙醇和水的体积比为4:1,并适当超声振荡促进固体样品溶解。随后采用注射器及注射器式过滤头(0.45μm PTFE滤膜)进行过滤。所得滤液转移至一个洁净的4mL单晶生长瓶中。然后采用PE材质的单晶瓶塞将单晶瓶进行封口,并在该塞子上扎一个小孔。随后将该4mL单晶瓶静置于通风橱内进行室温溶剂缓慢挥发。四天后观察到体系中析出板状的单晶样品,并聚集成簇。
实施例5
称取58.0毫克化合物MMAE置于4-mL玻璃瓶中,加入0.5毫升相应正戊烷适当超声促其溶解后形成澄清溶液。适当超声促其溶解后形成澄清溶液,随后将单晶瓶敞口静置于通风橱内进行快速挥发,挥发约4小时后得到胶状的无定形样品。
称取上述第一步中制备得到的6.3毫克无定形样品置于一4-mL单晶生长瓶中,加入甲醇和水的混合溶液0.7mL,其中异丙醇和水的体积比为3:1,并适当超声振荡促进固体样品溶解。随后采用注射器及注射器式过滤头(0.45μm PTFE滤膜)进行过滤。所得滤液转移至一个洁净的4mL单晶生长瓶中。然后采用PE材质的单晶瓶塞将单晶瓶进行封口,并在该塞子上扎一个小孔。随后将该4mL单晶瓶静置于通风橱内进行室温溶剂缓慢挥发。六天后观察到体系中析出板状的单晶样品,并聚集成簇。
对比例1
本对比例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
将实施例1的装呈有无定形样品的单晶瓶装入预盛有5m乙醇:水=8:1的20mL玻璃瓶中,最后将玻璃瓶加盖密封,静置于通风橱内进行常温气液扩散培养,最终得到板状单晶样品。
对该板状单晶样品进行拍照,结果参见图5,根据图1和图5可知,以无定形的MMAE样品为起始,在乙醇/水(8:1,v/v)的缓慢挥发实验体系中培养得到板状单晶。
对比例2-4
本对比例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
称取适量的化合物MMAE置于3-mL玻璃瓶中,加入相应溶剂,适当超声促进固体溶解后过滤,滤液转移至一4-mL单晶生长瓶中,使用单晶瓶塞封口并在塞子上扎一小孔。将单晶瓶静置于通风橱内进行溶剂缓慢挥发。具体见下表。
实验编号 物料(mg) 溶剂(v:v),ml 温度 结果
对比例2 5.1 乙腈:水(5:1) RT 澄清
对比例3 5.0 异丙醇:水(4:1) RT 澄清
对比例4 5.1 甲醇:水(3:1) RT 澄清
可见,对比例2-4中,随着溶剂的减少,晶体在单晶瓶内缓慢生长,未析出晶体,说明直接从MMAE培养单晶是不成功的,需要先制备出无定型,在进行单晶培养。
对比例5-7
本对比例提供一种单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,包括:
称取适量的化合物MMAE置于3-mL玻璃瓶中,加入一定量的相应正溶剂溶解样品。所得样品溶液转移至洁净4-mL单晶瓶中,将该4-mL单晶瓶用PE材质的瓶塞封口,并在瓶塞上扎一个小孔。随后将单晶瓶装入预盛有3ml反溶剂的20-mL玻璃瓶中,最后将20-mL玻璃瓶加盖密封,静置于通风橱内进行常温气液扩散培养实验。
对对比例6的单晶进行拍照,参见图6,根据上述结果可知,以无定型为起始状态,用反溶剂进行常温气液扩散培养单晶,在正溶剂乙酸乙酯,反溶剂环己烷条件下,能得到薄片装晶体堆叠。
以上所述仅为本发明的优选实施例而已,并不用于限制本发明,对于本领域的技术人员来说,本发明可以有各种更改和变化。凡在本发明的精神和原则之内,所作的任何修改、等同替换、改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (10)

1.一种单甲基澳瑞他汀E单晶,其特征在于,其分子中手性中心的绝对构型为:{C2(S),C7(S),C13(S),C14(S),C18(R),C25(S),C26(R),C28(R),C31(R),C33(S)}2
2.根据权利要求1所述的单甲基澳瑞他汀E单晶,其特征在于,所述单甲基澳瑞他汀E单晶属于单斜晶,P21空间群;
优选地,所述单甲基澳瑞他汀E单晶的单胞参数1为:{ α=90°,β=90.1530(10)°,γ=90°,}。
3.根据权利要求1所述的单甲基澳瑞他汀E单晶,其特征在于,所述单甲基澳瑞他汀E单晶为水合物;
优选地,所述单甲基澳瑞他汀E单晶中不对称单元由6个MMAE分子以及8个水分子所构成。
4.一种权利要求1所述的单甲基澳瑞他汀E单晶的制备方法,其特征在于,包括:将单甲基澳瑞他汀E样品制备为无定形样品,而后再利用缓慢挥发混合溶剂进行单晶培养。
5.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于,形成所述无定形样品的步骤包括:将所述单甲基澳瑞他汀E样品与溶解溶剂混合溶解形成澄清溶液,而后让所述溶解溶剂快速挥发形成胶状的无定形样品;其中,所述溶解溶剂包括烷烃类溶剂。
6.根据权利要求5所述的制备方法,其特征在于,所述溶解溶剂包括C1-C10取代或未取代烷烃溶剂;
优选地,所述溶解溶剂包括C1-C6取代或未取代烷烃溶剂;
优选地,所述溶解溶剂包括二氯甲烷、氯仿、正戊烷和正己烷中的任意一种。
7.根据权利要求4所述的制备方法,其特征在于,单晶培养的步骤包括:将所述无定形样品与混合溶剂混合溶解,而后过滤,并进行密封,密封后在密封口设置一个小孔,接着,在室温下使得溶剂缓慢挥发,其中,所述混合溶剂选自醇类溶剂或腈类溶剂和水的混合溶剂。
8.根据权利要求7所述的制备方法,其特征在于,所述醇类溶剂选自C1-C5一元醇,优选为甲醇、乙醇、正丙醇和异丙醇中的任意一种;
所述腈类溶剂选自乙腈。
9.根据权利要求7所述的制备方法,其特征在于,所述混合溶剂中所述醇类溶剂或所述腈类溶剂与所述水的体积比为1-10:1;优选为5-8:1。
10.一种权利要求1所述的单甲基澳瑞他汀E单晶作为标准品或对照品中的应用。
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