CN116559466A - 微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统 - Google Patents

微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统 Download PDF

Info

Publication number
CN116559466A
CN116559466A CN202310485933.3A CN202310485933A CN116559466A CN 116559466 A CN116559466 A CN 116559466A CN 202310485933 A CN202310485933 A CN 202310485933A CN 116559466 A CN116559466 A CN 116559466A
Authority
CN
China
Prior art keywords
positive
mass
peak
spectrogram
detected
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
CN202310485933.3A
Other languages
English (en)
Inventor
张竞辉
王伟毅
刘哲夫
于传延
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Zhongyuan Huiji Biotechnology Co Ltd
Original Assignee
Zhongyuan Huiji Biotechnology Co Ltd
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Zhongyuan Huiji Biotechnology Co Ltd filed Critical Zhongyuan Huiji Biotechnology Co Ltd
Priority to CN202310485933.3A priority Critical patent/CN116559466A/zh
Publication of CN116559466A publication Critical patent/CN116559466A/zh
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
    • G16B50/30—Data warehousing; Computing architectures
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N27/00—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means
    • G01N27/62—Investigating or analysing materials by the use of electric, electrochemical, or magnetic means by investigating the ionisation of gases, e.g. aerosols; by investigating electric discharges, e.g. emission of cathode
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
    • Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Theoretical Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Medical Informatics (AREA)
  • Evolutionary Biology (AREA)
  • Databases & Information Systems (AREA)
  • Bioethics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Electrochemistry (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本申请公开了一种微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统。该数据库的构建方法包括：采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集；采用微生物富集方法分别对血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集；采用质谱法分别对阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图；根据阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰；根据阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。利用构建的数据库，可以消除血培养瓶内血浆蛋白、血小板、细胞碎片等干扰因素的影响，提高了鉴定准确性，缩短鉴定时间，提高鉴定效率。

Description

微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统
技术领域
本申请涉及微生物鉴定技术领域，尤其涉及一种微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统。
背景技术
血流感染(bloodstream infection)作为一种严重的全身感染性疾病，易诱发脓毒症(sepsis)及多器官功能障碍综合征(multiple organ dysfunction syndrome，MODS)，病死率高，已经成为全球范围内主要的公共卫生负担之一。血流感染病死率高，及时准确鉴定血流感染病菌对优化抗菌药物治疗和改善患者预后至关重要。目前，国内外诊断血流感染的“金标准”仍然是血培养，血培养报阳后传统的鉴定方法至少需要48h，病原菌鉴定时间长，且血液中的白细胞、血小板等干扰因素会对从血培养中分离出的微生物谱图造成干扰从而影响鉴定，导致病原菌的鉴定成功率低下。
发明内容
鉴于现有技术中的上述缺陷或不足，期望提供一种微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统、电子设备及存储介质。
第一方面，提供一种微生物鉴定用数据库的构建方法，包括：
采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集；
采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集；
采用质谱法分别对所述阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图；
根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰；
根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。
第二方面，提供一种微生物鉴定用数据库的构建装置，包括：
采集模块，用于采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集；
处理模块，用于采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集；
质谱鉴定模块，用于采用质谱法分别对所述阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图；
第一获取模块，用于根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰；
第二获取模块，用于根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。
第三方面，提供一种微生物的鉴定方法，包括：
构建数据库，所述数据库包括阴性样本的非病原菌蛋白特征峰和至少一个阳性微生物对应的保守特征峰和专属特征峰；
获取待测阳性样本质谱图；
对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图；
将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，对待测阳性样本进行鉴定，确定待测阳性样本的种属。
第四方面，提供一种微生物的鉴定系统，包括：
数据库构建模块，用于构建微生物鉴定用数据库；
待测样本获取模块，用于获取待测阳性样本质谱图；
预处理模块，用于对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图；
微生物鉴定模块，用于将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，对待测阳性样本进行鉴定，确定待测阳性样本的种属。
第五方面，提供一种电子设备，包括：
一个或多个处理器；
存储器，用于存储一个或多个程序，
当一个或多个程序被一个或多个处理器执行时，使得一个或多个处理器执行如本申请各实施例提供的微生物鉴定用数据库的构建方法，或者执行如本申请各实施例提供的微生物的鉴定方法。
第六方面，提供一种存储有计算机程序的计算机可读存储介质，该程序被处理器执行时实现如本申请各实施例提供的微生物鉴定用数据库的构建方法，或者执行如本申请各实施例提供的微生物的鉴定方法。
根据本申请实施例提供的技术方案，本申请提供了一种微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统、电子设备及存储介质，利用本申请的微生物鉴定用数据库的构建方法构建的数据库，包括非病原菌蛋白特征峰，在对血流感染的病原菌进行鉴定时，可以消除因血培养瓶内血浆蛋白、血小板、细胞碎片等干扰物质引入的非病原菌蛋白干扰，提高了鉴定准确性，缩短鉴定时间，提高鉴定效率。且构建的数据库内包含每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰，在对血流感染的病原菌进行鉴定时，可以对病原菌的具体类型进行快速鉴定，提高鉴定结果的准确性和效率。
附图说明
通过阅读参照以下附图所作的对非限制性实施例所作的详细描述，本申请的其它特征、目的和优点将会变得更明显：
图1为本申请实施例提供的微生物鉴定用数据库的构建方法的一种示例性流程框图；
图2为本申请实施例提供的血培养瓶中加入不同浓度大肠埃希菌的谱图；
图3为本申请实施例提供的6个血培养阴性样本的峰矩阵分析图；
图4为本申请实施例提供的1例血培养阳性样本采集谱图与标准培养参考图谱对比的峰矩阵分析图；
图5为本申请实施例提供的微生物鉴定用数据库的构建装置的一种示例性结构框图；
图6为本申请实施例提供的微生物鉴定方法的一种示例性流程框图；
图7为本申请实施例提供的微生物鉴定系统的一种示例性结构框图；
图8为本申请实施例提供的一种电子设备的结构示意图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本申请作进一步的详细说明。可以理解的是，此处所描述的具体实施例仅仅用于解释相关发明，而非对该发明的限定。另外还需要说明的是，为了便于描述，附图中仅示出了与发明相关的部分。
需要说明的是，在不冲突的情况下，本申请中的实施例及实施例中的特征可以相互组合。下面将参考附图并结合实施例来详细说明本申请。
现有的血培养报阳后，阳性血培养瓶中成分复杂，除了培养基与各种细胞代谢产物外，血液中的白细胞和血浆会影响离心后细菌细胞沉淀的大小，从而干扰质谱鉴定。正常人血含有红细胞约(3.5～5.5)×109/mL，白细胞约(4～10)×106/mL，而当血培养系统报阳时，瓶内含有微生物浓度可能在106-109CFU/ml之间，过量的血细胞和相关蛋白会影响微生物核糖体蛋白的检测。因此，在质谱鉴定中，血液中的其他成分(如白细胞、血浆)会对从血培养中分离出的微生物谱图造成干扰从而影响鉴定，干扰因素还包括血小板、脂质颗粒、血浆酶和细胞碎片等，均可能导致鉴定成功率的下降。
为了解决上述技术问题，请参考图1，示出了根据本申请实施例提供的微生物鉴定用数据库的构建方法的示例性流程框图。
如图1所示，在本实施例中，本发明提供的微生物鉴定用数据库的构建方法100，所述构建方法100包括：
S110：采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集；
S120：采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集；
S130：采用质谱法分别对所述阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图；
S140：根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰；
S150：根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。
具体的，本申请实施例利用获取的非病原菌蛋白特征峰、每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰构建数据库，利用构建的数据库内的非病原菌蛋白特征峰，在对血流感染的病原菌进行鉴定时，可以消除因血培养瓶内血浆蛋白、血小板、细胞碎片等干扰物质引入的非病原菌蛋白干扰，提高了鉴定准确性，缩短鉴定时间，提高鉴定效率。且构建的数据库内包含每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰，在对血流感染的病原菌进行鉴定时，可以对病原菌的具体类型进行快速鉴定，提高鉴定结果的准确性和效率。
具体的，步骤S110中，血培养：是采集患者血液标本并接种到培养瓶中，用以发现、识别引起菌血症或真菌血症的病原微生物，是诊断血流感染病因的途径。自动血培养系统是通过选择合适的培养瓶，再辅以合适的培养方式和各种现代化检测技术，自动连续监测接种后培养瓶内的各种变化，以判别培养瓶内有无微生物存在。
血培养阳性：血培养是一项实验室试验，从患者体内采血，并将其装入含有培养基的瓶中，以此来确定导致患者感染的微生物(细菌或真菌)是否已经侵入患者的血液。对于患者，血培养阳性能确定存在血流感染。
血培养阴性样本集：是将不同患者的血液，放入培养瓶中培养5天后，将生长报告为阴性的血培养样本收集，获得血培养阴性样本集。
血培养阳性样本集：是指将感染有不同微生物的血液，放入培养瓶中培养，来获取对应微生物的血培养阳性样本。
血培养阳性样本集中的阳性微生物包括但不限于：金黄色葡萄球菌、肺炎链球菌、肠杆菌科细菌、铜绿假单胞菌、白色念珠菌、化脓性链球菌、无乳链球菌、单核细胞增生李斯特菌、脑膜炎奈瑟菌、淋病奈瑟菌、流感嗜血杆菌、脆弱拟杆菌、新型隐球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、草绿色链球菌、微球菌、痤疮丙酸杆菌、芽孢杆菌和棒状杆菌。肠杆菌科细菌包括但不限于：大肠杆菌、沙门氏菌、志贺菌、耶尔森氏菌、克雷伯氏菌、变形杆菌、爱德华氏菌、枸橼酸杆菌等。棒状杆菌包括但不限于：白喉棒状杆菌、假白喉棒状杆菌、结膜干燥棒状杆菌、溃疡棒状杆菌、溶血状棒状杆菌、化脓棒状杆菌、杰克群棒状杆菌等。
本申请实施例中，培养瓶包括但不限于：树脂需氧瓶、树脂厌氧瓶与儿童瓶。
在一些实施方式中，步骤S120中，所述血培养阳性样本集中，每种阳性样本的菌密度不低于108CFU/mL。
具体的，刚报阳的血培养瓶因其菌密度较低，可能无法富集到符合鉴定要求的最低菌量，从而影响病原菌的鉴定性能。本申请中，血培报阳后继续培养1-2小时，此时菌密度不低于108CFU/mL，菌量高，从而可以提高检出率。需要说明的是，血培报阳后培养的时间也不宜过长，长时间的血培养也会增加上质谱的非细菌样品成分(例如细胞碎片)的数量，在鉴定过程中会掩盖细菌信号而降低谱图质量，影响检出率。
本申请实施例中，血培养报阳后继续培养1-2小时，可以使菌密度不低于108CFU/mL，可以提高鉴定性能。如图2所示，本申请通过实验证实，随着细菌浓度的降低，鉴定性能显著降低。图2示出了血培养瓶中不同浓度菌液对鉴定结果的影响。将在血平板上纯培养的大肠埃希菌(Escherichia coli,E.coli)单克隆重悬于生理盐水，调整McF至0.5，稀释1000倍后，接种100μL至树脂需氧瓶(阳性瓶)，并在阳性瓶中加入10mL脱纤维羊血，另外平行注射10mL脱纤维羊血于一瓶未接种细菌的树脂需氧瓶(对照瓶)中，同时置于全自动血培养系统，于35℃振摇生长。培养过夜后，在全自动血培养系统观察到阳性瓶已生长至平台期，使用无菌注射器取出阳性瓶培养物，使用对照瓶中的培养液对阳性瓶培养物进行10倍稀释，稀释5个梯度，并进行涂板计数。将5个梯度的稀释物与对照瓶样本分别使用血培养阳性样本预处理试剂盒进行提取，使用提取物进行质谱检测。
在一些实施方式中，步骤S120中，所述微生物富集方法至少包括如下一种：血培养阳性样本预处理试剂盒法、分离胶促凝管法、差速离心法。
具体的，血培养阳性样本预处理试剂盒法包括：梅里埃MS BloodCulture Kit(RUO)、布鲁克MBT/>IVD Kit、专利公开号为CN 111778175 A所提供的血培养阳性样本预处理试剂盒中的任意一种试剂盒法。除梅里埃为裂解过滤法外，常规的商用版本血培养阳性样本前处理试剂盒均为裂解离心法。本申请实施例中也可以采用分离胶促凝管法或者差速离心法对血培养阳性样本集进行处理，使血培养阳性样本中的细菌能够富集，满足鉴定要求的最低菌量。
本申请实施例中，采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，使阴性样本和阳性样本的处理条件相同，有利于后续数据库的构建。
在一些实施方式中，步骤S130中，采用质谱法对处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阴性样本集质谱图，包括：
所述处理后的阴性样本集包括M个阴性样本，对每个阴性样本至少点样N次，获得M×N个阴性样本质谱图，即所述阴性样本集质谱图包括M×N个阴性样本质谱图；其中，M、N分别为大于等于1的自然数。
具体的，质谱法采用MALDI-TOF MS(Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry，基质辅助激光解析电离飞行时间质谱)，MALDI-TOF MS是一种微生物鉴定的新技术，其具有鉴定快速、准确、方便等优点。采用微生物富集方法对血培养阳性样本集进行处理，可直接使用MALDI-TOF MS进行鉴定，大大提高了鉴定速度，缩短报告时间，满足临床快速诊断的需求。
其中，质谱法具体为：对步骤S120中处理后的阴性样本集中的每个阴性样本采用甲酸直涂法或者提取法进行点样，每个阴性样本点样的次数为N，优选的N为三次，再设置MALDI-TOF MS质谱仪的参数，对每个阴性样本进行质谱测量，每个阴性样本对应获得N张质谱图。
示例性的，提取法为：
在样本(阴性样本或者阳性样本)中加入20μL 70％甲酸，用移液枪吹打混匀；加入20μL乙腈，充分混匀后，12000rpm离心2min；吸取1μL上清液至样本靶，干燥后覆盖1μL基质溶液，干燥后上机(质谱仪)检测。
质谱仪的参数：线性模式、加速电压20kV、采集频率1G Hz脉冲电压1.3kV、激光频率50Hz、图谱累加数200shots、单次采集数50shots、累计每张谱图轰击数4、初始激光强度7％、寻峰容差1000ppm。本申请实施例中，质谱仪参数只是示例性说明，本领域的技术人员也可以根据实际需求对质谱仪的参数进行调整。
本申请实施例中，处理后的阴性样本集包括M个阴性样本，M数值设置越大越好，优选的，M设置不小于20。
在一些实施方式中，步骤S140中，根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰，包括：
从所述阴性样本集质谱图中获取每个质荷比对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在所述阴性样本集质谱图中出现的次数，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度；
若所述阴性样本集质谱图内，存在同一质荷比对应的离子峰平均强度不小于第一强度阈值，且该质荷比在每个阴性样本对应的N张质谱图中至少出现一次，在所述阴性样本集质谱图内出现的次数m为：M≤m≤M×N；则该质荷比对应的离子峰为非病原菌蛋白特征峰，获得阴性样本的所有非病原菌蛋白特征峰。
具体的，同一质荷比对应的离子峰平均强度为：同一质荷比在阴性样本集质谱图中对应的离子峰强度之和除以该质荷比在阴性样本集质谱图中出现的次数。第一强度阈值可以设置为1000，也可以设置为其他值。
示例性的，以6个血培养阴性样本为例，来说明非病原菌蛋白特征峰的获取方法，具体如下：
使用血培养阳性样本预处理试剂盒对收集的6个阴性样本(6个阴性样本为不同患者的血液，不包含细菌和真菌等微生物)进行处理，每个阴性样本点三个平行靶点进行质谱数据采集，每三个连续靶点数据为同一样本的三个重复结果；在质谱软件峰矩阵视图内，将阴性血培养瓶数据分批次拖放其中，每个阴性样本三张谱图，共18张阴性样本谱图；使用统计分析软件EX-Smartspec，对18张阴性样本谱图的数据进行对齐并进行谱峰分析，如图3所示。
在18张阴性样本谱图内，获取每个质荷比(m/z，相当于出峰位置)对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在18张阴性样本谱图内出现的次数，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度。如图3所示，质荷比3509.1在18张阴性样本谱图内的出现次数为16，对应的离子峰平均强度为2170；质荷比为3488在18张阴性样本谱图内的出现次数为16，对应的离子峰平均强度为5077。
若在18张阴性样本谱图内，存在同一质荷比对应的离子峰平均强度不小于第一强度阈值(如1000)，且该质荷比在每个阴性样本对应的三张质谱图中至少出现一次，在18张阴性样本谱图内出现的次数m为：6≤m≤18；则该质荷比对应的离子峰为非病原菌蛋白特征峰，获得阴性样本的所有非病原菌蛋白特征峰。如图3所示，获得的非病原菌蛋白特征峰对应的质荷比包括：3509.1、3488.0、3373.0、7565.2、5044.1等。
需要说明的是，本申请实施例是以6例阴性样本作为示例性说明数据库内非病原菌蛋白特征峰的获取方法，在实际应用中，也可以采用更多例的阴性样本，如8、15、30、50等，同样可以获取非病原菌蛋白特征峰。
在一些实施方式中，步骤S130中，采用质谱法对所述阳性微生物集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图；
所述阳性微生物集包括G个阳性样本，每个阳性样本至少包括Q种菌株，对每种菌株至少点样B次；其中，G、Q、B分别为大于等于1的自然数；
则每个阳性样本对应获得Q×B个阳性样本质谱图，G个阳性样本对应获得G×Q×B个阳性样本质谱图，即阳性样本集质谱图包括G×Q×B个阳性样本质谱图。
具体的，质谱法MALDI-TOF MS质谱仪，具体处理过程如上述阴性样本的处理过程，本申请不再一一赘述。本申请可以根据实际需求设置G、Q、B的值，示例性的，如G为5，Q不小于5，B为3。
在一些实施方式中，步骤S150中，根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰，包括：
S151：从每个阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图内，获取每个质荷比对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在Q×B个阳性样本质谱图中出现的次数n，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度；
S152：将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图在相同的出峰位置出现的离子峰定义为该阳性微生物的保守特征峰，依次获得G个阳性微生物的所有保守特征峰。
具体的，标准培养参考图谱为常规培养条件下，比如在血平板培养条件下进行的建库谱图，目前现有数据库内的所有谱图均为标准培养参考图谱。同一质荷比对应的离子峰平均强度的计算方法如上所述，本申请实施例不再一一赘述。将同一阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，若两者在相同的出峰位置(质荷比)出现满足一定条件的离子峰，即两者在相同的出峰位置均存在对应的离子峰，可将该质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的保守特征峰，从而获得每个阳性微生物的所有保守特征峰。采用同样的方法获得所有阳性微生物对应的所有保守特征峰，完成数据库内每种阳性微生物对应的保守特征峰的建库。
在一些实施方式中，步骤S152中，将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图在相同的出峰位置出现的离子峰定义为该阳性微生物的保守特征峰，包括：
若Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内的离子峰平均强度均不小于第二强度阈值，且该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图中出现的次数n：在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不小于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之二；
将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的保守特征峰。
具体的，第二强度阈值可以设置为500或者400，本领域的技术人员可以根据实际需求设置为其他值。通过本申请实施例设置的判断条件，可以识别出血培养条件下生长的阳性微生物的保守特征峰。
示例性的，以一例血培养阳性样本提取的大肠埃希菌为例，说明本申请的大肠埃希菌的保守特征峰的获取方法，具体如下：
大肠埃希菌，包括菌株A4-A6、B4、B6、C4-C6共八种菌株，每种菌株点样3次，采用MALDI-TOF MS质谱仪进行质谱进行，获得24张大肠埃希菌质谱图。将24张大肠埃希菌质谱图与标准培养参考图谱内大肠埃希菌ATCC 25922谱图(B1-B12，每个靶点采集2张，共24张谱图)进行比对，比对结果如图4所示。
在24张大肠埃希菌质谱图内，获取每个质荷比(m/z，相当于出峰位置)对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在24张大肠埃希菌质谱图内出现的次数，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度。如图4所示，质荷比4284.1在24张大肠埃希菌质谱图内的出现次数为23，对应的离子峰平均强度为513；质荷比为4431.7在24张大肠埃希菌质谱图内的出现次数为24，对应的离子峰平均强度为626。
在标准培养参考图谱内24张大肠埃希菌ATCC 25922谱图内，质荷比46122在24张大肠埃希菌质谱图内的出现次数为24，对应的离子峰平均强度为1826。
若血培养获取的24张大肠埃希菌质谱图与标准培养图谱内24张大肠埃希菌ATCC25922谱图存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在血培养获取的24张大肠埃希菌质谱图和标准培养图谱内24张大肠埃希菌ATCC 25922谱图内的离子峰平均强度均不小于第二强度阈值(如400)，且该质荷比在血培养获取的24张大肠埃希菌质谱图中出现的次数n：16≤n≤24，在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数：不小于16，且不大于24；将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的保守特征峰。由图4可知，获得的大肠埃希菌的保守特征峰对应的质荷比包括：3932、4611、4769、6250等。
需要说明的是，本申请实施例是以1例大肠埃希菌作为示例性说明数据库内大肠埃希菌的保守特征峰的获取方法，在实际应用中，也可以采用更多例的阳性样本，如4、10、15、17等，同样可以获取大肠埃希菌的保守特征峰。本申请实施例是以大肠埃希菌作为示例性说明数据库内大肠埃希菌的保守特征峰的获取方法，对数据库内其他微生物的获取方法类似，本申请实施例不再一一列举。
在一些实施方式中，步骤S150中，根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的专属特征峰，包括：
S153：将每个阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图内的非病原菌蛋白特征峰和保守特征峰去除，得到处理后的Q×B个阳性样本质谱图；
S154：将所述处理后的Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，若处理后的Q×B个阳性样本质谱图在某一出峰位置存在的离子峰，而标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内对应出峰位置不存在离子峰，则该出峰位置对应的离子峰为该阳性微生物的专属特征峰，依次获得G个阳性微生物的所有专属特征峰。
具体的，先根据数据库的非病原菌蛋白特征峰，将同一阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图内的非病原菌蛋白特征峰去除，再将处理后的Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，若两者在相同的出峰位置(质荷比)出现满足一定条件的离子峰，即标准培养参考图谱不在的离子峰，而血培养的阳性样本质谱图内存在离子峰，可将该质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的专属特征峰，从而获得每个阳性微生物的所有专属特征峰。采用同样的方法获得所有阳性微生物对应的所有专属特征峰，完成数据库内每种阳性微生物对应的专属特征峰的建库。
在一些实施方式中，步骤S154中，若处理后的Q×B个阳性样本质谱图在某一出峰位置存在的离子峰，而标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内对应出峰位置不存在离子峰，则该出峰位置对应的离子峰为该阳性微生物的专属特征峰，包括：
若处理后的Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在处理后的Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内的离子峰平均强度均不小于第三强度阈值，且该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图内的出现次数n：在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不大于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之一；
将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的专属特征峰。
具体的，第三强度阈值可以设置为500或者400，本领域的技术人员可以根据实际需求设置为其他值。通过本申请实施例设置的判断条件，可以识别出血培养条件下生长的阳性微生物的专属特征峰。
由上述示例图4可知，若血培养获取的24张大肠埃希菌质谱图与标准培养图谱内24张大肠埃希菌ATCC 25922谱图存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在血培养获取的24张大肠埃希菌质谱图和标准培养图谱内24张大肠埃希菌ATCC 25922谱图内的离子峰平均强度均不小于第三强度阈值(如400)，且该质荷比在血培养获取的24张大肠埃希菌质谱图中出现的次数n：16≤n≤24，在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数：不大于8；将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的专属特征峰。由图4可知，获得的大肠埃希菌的专属特征峰对应的质荷比包括：4431、7151、7558等。
需要说明的是，本申请实施例是以1例大肠埃希菌作为示例性说明数据库内大肠埃希菌的专属特征峰的获取方法，在实际应用中，也可以采用更多例的阳性样本，如3、5、10、17等，同样可以获取大肠埃希菌的专属特征峰。本申请实施例是以大肠埃希菌作为示例性说明数据库内大肠埃希菌的专属特征峰的获取方法，对数据库内其他微生物的获取方法类似，本申请实施例不再一一列举。
在一些实施方式中，所述方法100还包括：
S160：对G个阳性微生物的所有专属特征峰分别设置权重值，并根据所述专属特征峰对应的权重值设置修正规则，利用所述修正规则对待测微生物对应离子峰的评分进行修正，得到待测微生物对应离子峰的修正得分。
具体的，每个阳性微生物拥有的专属特征峰的数量可以为0、1、3、5等。给每个阳性微生物拥有的每个专属特征峰赋予一个权重值，权重值的设置规则为：若某一专属特征峰在所有阳性微生物中出现的次数越多，则该专属特征峰设置的权重值越小；相反，则设置的权重值越大。将所有阳性微生物的专属特征峰进行纵向比对，若某专属特征峰仅出现在一种微生物中，则对该专属特征峰赋予较大的权重值。
本申请实施例中，将各微生物的专属特征峰进行纵向比对，通过对微生物的不同专属特征峰赋予不同的权重值，利用权重值对待测微生物对应的离子峰进行评分修正，可以针对血培养阳性样本的独有特征进行打分优化，增加鉴定准确度。
在一些实施方式中，步骤S160中，所述修正规则为：
若阳性微生物存在某一专属特征峰，待测微生物在对应专属特征峰对应的出峰位置也存在离子峰，且该离子峰的强度不小于第四强度阈值，则待测微生物对应离子峰的修正得分＝待测微生物对应离子峰的评分值+待测微生物对应离子峰的评分值×专属特征峰对应的权重值；
若阳性微生物存在某一专属特征峰，待测微生物在对应专属特征峰对应的出峰位置不存在离子峰，则待测微生物对应离子峰的修正得分＝待测微生物对应离子峰的评分值-待测微生物对应离子峰的评分值×专属特征峰对应的权重值。
具体的，第四强度阈值可以为400或500，本领域的技术人员也可以设置为其他值。利用上述修正规则，可以对待测微生物的匹配打分结果进行二次修正，根据鉴定过程中采集谱图与修正规则的匹配情况，辅以预设好的权重值对精细打分结果进行校正，增加待测微生物鉴定的准确度。
本申请实施例的第二方面，如图5所示，提供一种微生物鉴定用数据库的构建装置200，所述构建装置200包括：
采集模块210，用于采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集；
处理模块220，用于采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集；
质谱鉴定模块230，用于采用质谱法分别对所述阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图；
第一获取模块240，用于根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰；
第二获取模块250，用于根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。
具体的，本申请实施例提供的微生物鉴定用数据库的构建装置200，用于本申请任意实施例所提供的微生物鉴定用数据库的构建方法100。利用本申请实施例提供的微生物鉴定用数据库的构建装置200可以构建数据库，数据库内包括非病原菌蛋白特征峰、每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰，利用构建的数据库内的非病原菌蛋白特征峰，在对血流感染的病原菌进行鉴定时，可以消除因血培养瓶内血浆蛋白、血小板、细胞碎片等干扰物质引入的非病原菌蛋白干扰，提高了鉴定准确性，缩短鉴定时间，提高鉴定效率。且构建的数据库内包含每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰，在对血流感染的病原菌进行鉴定时，可以对病原菌的具体类型进行快速鉴定，提高鉴定结果的准确性和效率。
在一些实施方式中，所述第一获取模块240，配置用于：
从所述阴性样本集质谱图中获取每个质荷比对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在所述阴性样本集质谱图中出现的次数，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度；
若所述阴性样本集质谱图内，存在同一质荷比对应的离子峰平均强度不小于第一强度阈值，且该质荷比在每个阴性样本对应的N张质谱图中至少出现一次，在所述阴性样本集质谱图内出现的次数m为：M≤m≤M×N；则该质荷比对应的离子峰为非病原菌蛋白特征峰，获得阴性样本的所有非病原菌蛋白特征峰。
在一些实施方式中，所述第二获取模块250，配置用于：
从每个阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图内，获取每个质荷比对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在Q×B个阳性样本质谱图中出现的次数n，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度；
将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图在相同的出峰位置出现的离子峰定义为该阳性微生物的保守特征峰，依次获得G个阳性微生物的所有保守特征峰。
在一些实施方式中，所述第二获取模块250，配置用于：
若Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内的离子峰平均强度均不小于第二强度阈值，且该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图中出现的次数n：在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不小于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之二；
将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的保守特征峰。
在一些实施方式中，所述第二获取模块250，配置用于：
将每个阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图内的非病原菌蛋白特征峰和保守特征峰去除，得到处理后的Q×B个阳性样本质谱图；
将所述处理后的Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，若处理后的Q×B个阳性样本质谱图在某一出峰位置存在的离子峰，而标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内对应出峰位置不存在离子峰，则该出峰位置对应的离子峰为该阳性微生物的专属特征峰，依次获得G个阳性微生物的所有专属特征峰。
在一些实施方式中，所述第二获取模块250，配置用于：
若处理后的Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在处理后的Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内的离子峰平均强度均不小于第三强度阈值，且该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图内的出现次数n：在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不大于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之一；
将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的专属特征峰。
在一些实施方式中，所述构建装置200还包括：
权重设置模块260，用于对G个阳性微生物的所有专属特征峰分别设置权重值，并根据所述专属特征峰对应的权重值设置修正规则，利用所述修正规则对待测微生物对应离子峰的评分进行修正，得到待测微生物对应离子峰的修正得分。
本申请实施例的第三方面，如图6所示，提供一种微生物的鉴定方法300，所述鉴定方法300包括：
S310：构建数据库，所述数据库包括阴性样本的非病原菌蛋白特征峰和至少一个阳性微生物对应的保守特征峰和专属特征峰；
S320：获取待测阳性样本质谱图；
S330：对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图；
S340：将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，对待测阳性样本进行鉴定，确定待测阳性样本的种属。
具体的，利用本申请任意实施例提供的数据库的构建方法构建的数据库，在对待测阳性样本进行鉴定时，可以消除因血培养瓶内血浆蛋白、血小板、细胞碎片等干扰物质引入的非病原菌蛋白干扰，且利用数据库内的保守特征峰和专属特征峰，可以进一步提高鉴定的准确性，缩短鉴定时间，提高鉴定成功率，降低血流感染诊断的TAT(缩短测定周期)。
具体的，步骤S310中，本申请实施例中对数据库的具体构建方法不做特别限定，只要保证构建的数据库内包括阴性样本的非病原菌蛋白特征峰和至少一个阳性微生物对应的保守特征峰和专属特征峰，利用阴性样本的非病原菌蛋白特征峰和阳性微生物对应的保守特征峰和专属特征峰可以快速对待测微生物进行鉴定，缩短鉴定周期，提高鉴定的成功率。优选的，数据库的构建方法可以利用本申请任意实施例所提供的微生物鉴定用数据库的构建方法来构建数据库。
在一些实施方式中，步骤S320中，所述待测阳性样本质谱图的获取方法包括：
对待测阳性样本进行质谱鉴定，预先采集待测阳性样本的质谱图；
根据所述数据库，识别预先采集的待测阳性样本的质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将非病原菌蛋白特征峰去除，得到处理后的待测阳性样本质谱图；
对所述处理后的待测阳性样本质谱图进行均一化，得到均一化后的待测阳性样本质谱图；
在所述均一化后的待测阳性样本质谱图内，若相对信号强度>2％的离子峰的数量少于预设数量，则对质谱的激光强度参数进行调整，直至相对信号强度>2％的离子峰不少于预设数量，或者，直至质谱的激光强度参数达到激光强度阈值；
在调整后的激光强度参数下，重新获取待测阳性样本质谱图。
具体的，当血培养标本报阳时，将标本从血培养仪中取出，使用质谱系统血培养阳性样本预处理试剂盒进行前处理，处理后待测阳性标本在不锈钢靶板上进行点样，覆盖基质，干燥后上机。在质谱鉴定软件Ex-accuspec中，选择进入血培养阳性样本模块，选择样本信息，获取待测阳性样本的离子峰值信号。预先采集50shots，质谱鉴定软件将实时把采集到的信号转换为谱图，得到预先采集待测阳性样本的质谱图。将预先采集待测阳性样本的质谱图与数据库内的非病原菌蛋白特征峰对应的谱图进行比较，识别预先采集待测阳性样本的质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将其去除，得到处理后的待测阳性样本质谱图。对处理后的待测阳性样本质谱图进行均一化，得到均一化后的待测阳性样本质谱图，均一化之后，离子峰的相对信号强度介于0-1之间。在均一化后的待测阳性样本质谱图内，判断相对信号强度>2％的离子峰的数量是否达到预设数量，并动态调整后续采集步骤的质谱的激光强度参数。
示例性的，如，当扣除非病原菌蛋白特征峰之后，相对信号强度>2％特征峰少于10根时，增加激光强度。初始激光强度为7％，调整步距以0.5％为梯度，每调整一次激光强度采集50shot，直至相对信号强度>2％特征峰大于10根，或者激光强度到达15％。本申请中以10根为预设数量，本领域的技术人员也可以根据实际需求设置为其他值，如12、15等。信号强度阈值是以2％为示例性说明，也可以设置为其他值，如1.5％、2.5％等。对于激光参数如何调整，也可以根据实际需求设置为其他值。
其中，均一化操作是指：先获取待测阳性样本质谱图内强度最大的离子峰，将待测阳性样本质谱图内强度最大的离子峰的强度置为1，剩余的离子峰的强度对应除以强度最大的离子峰的强度。
在调整后的激光强度参数下，对谱图进行连续采集，单次采集50shots需要满足谱图标准，上限采集10次，直到采集到四次通过标准的合格谱图，累计所有合格采集谱图生成累加谱图，总共累计200shots。若十次采集仍无法采到一张合格谱图，则累加十次信号生成累加谱图，即得到待测阳性样本质谱图。
本申请实施例中，在数据库比对之前，先识别预先采集的待测阳性样本的质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将非病原菌蛋白特征峰去除，再通过动态激光调整技术，对激光强度进行补偿，提高了特征蛋白峰的出峰强度，进而提高血培养阳性样本的鉴定成功率。
在一些实施方式中，步骤S330中，对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图，包括：
对所述待测阳性样本质谱图进行第一次均一化，得到均一后的待测阳性样本质谱图；
根据构建的数据库，识别所述均一后的待测阳性样本质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将非病原菌蛋白特征峰去除，得到处理后的待测阳性样本质谱图；
对所述处理后的待测阳性样本质谱图进行第二次均一化，得到预处理后的待测阳性样本质谱图。
具体的，在待测阳性样本质谱图与数据库进行比对之前，先对待测阳性样本质谱图做如下处理，先将待测阳性样本质谱图进行第一次均一化，再剔除识别的非病原菌蛋白特征峰(非病原菌蛋白峰识别容差为±1000ppm)，接着对处理后的待测阳性样本质谱图进行第二次均一化，进行第二次均一化可以使得到的质谱图内能出现较多的离子峰，便于后续进行待测阳性微生物的鉴定，提高鉴定成功率。其中，第一次均一化和第二次均一化的具体操作如上述均一化的方法，本申请不再一一赘述。
示例性的，如将采集完成的待测阳性样本质谱图转化为棒状图，以强度最高的峰，如7565.2，将其强度设定为1，将其余谱峰强度进行均一化。然后识别血培养背景非病原菌蛋白特征谱峰，如15127、7565.2、5044.1等，将这些谱峰删除。最后，以剩余谱峰中强度最高的峰，如3678.1的强度设定为1，将剩余的谱峰强度进行二次均一化。二次均一化的谱图包括谱峰位置与强度信息，用于谱图比对。
在一些实施方式中，步骤S340中，将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，确定待测阳性样本的种属，包括：
先采用常规匹配算法将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰进行比较，初步确定待测阳性样本的种属；
再根据所述数据库内设置的修正规则，将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的专属特征峰进行比较，最终确定待测阳性样本的种属。
具体的，先通过常规匹配获得待测阳性样本的得分靠前的若干(如前十)匹配结果，常规匹配算法为：1)快速初筛，将待测阳性样本初步锁定在几个可能的属或种之中，初筛使用待测阳性样本强度最高的n根峰，与数据库中各属或种或复合群的特征峰进行匹配，按特征峰涵盖率快速排序，将结果锁定在排名靠前的若干属或种或复合群；2)针对初筛获取的排名靠前的若干属或种或复合群，进行精细匹配打分，涉及三个方面，待测阳性样本没有的离子峰而数据库有的离子峰，待测阳性样本与数据库匹配上的离子峰，待测阳性样本有而数据库没有的离子峰，从这三个方面将预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库的离子峰进行对比，来进行打分，得到得分靠前的若干匹配结果。需要说明的是，此处数据库中的离子峰指的是数据库中的保守特征峰，也可以是数据库中的全部特征峰，如包括专属特征峰和保守特征峰以及其他的特征峰。
再根据数据库内设置的修正规则，将预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的专属特征峰进行比较，具体如下：
若阳性微生物存在某一专属特征峰，待测微生物在对应专属特征峰对应的出峰位置也存在离子峰，且该离子峰的强度不小于第四强度阈值，则待测微生物对应离子峰的修正得分Z修正＝Z得分+ω·Z得分；
若阳性微生物存在某一专属特征峰，待测微生物在对应专属特征峰对应的出峰位置不存在离子峰，则待测微生物对应离子峰的修正得分Z修正＝Z得分-ω·Z得分；其中，Z得分为待测微生物对应离子峰的评分值；ω为专属特征峰对应的权重值。
根据上述修正规则，对得分靠前的若干匹配结果的得分进行修正，得到若干匹配结果的修正得分，将修正得分最高的匹配结果作为最终的待测阳性微生物的最终鉴定结果。本申请中，通过得分靠前的若干微生物的得分，利用预先根据待测阳性微生物与数据库内的专属特征峰的匹配情况建立的修正规则，对得分靠前的若干微生物的得分进行修正，可以针对血培养阳性样本的独有特征进行打分优化，增加鉴定准确度。
本申请实施例的第四方面，如图6所示，提供一种微生物的鉴定系统400，所述鉴定系统400包括：
数据库构建模块410，用于构建微生物鉴定用数据库；
待测样本获取模块420，用于获取待测阳性样本质谱图；
预处理模块430，用于对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图；
微生物鉴定模块440，用于将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，对待测阳性样本进行鉴定，确定待测阳性样本的种属。
具体的，本申请实施例提供的微生物的鉴定系统400，用于执行本申请任意实施例提供的微生物的鉴定方法300。采用本申请实施例提供的微生物的鉴定系统400，可以消除因血培养瓶内血浆蛋白、血小板、细胞碎片等干扰物质引入的非病原菌蛋白干扰，且利用数据库内的保守特征峰和专属特征峰，可以进一步提高鉴定的准确性，缩短鉴定时间，提高鉴定成功率，降低血流感染诊断的TAT(缩短测定周期)。
需要说明的是，数据库构建模块410可以为本申请任意实施例所提供的微生物鉴定用数据库的构建装置200。
在一些实施方式中，所述待测样本获取模块420，配置用于：
对待测阳性样本进行质谱鉴定，预先采集待测阳性样本的质谱图；
根据所述数据库，识别预先采集的待测阳性样本的质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将非病原菌蛋白特征峰去除，得到处理后的待测阳性样本质谱图；
对所述处理后的待测阳性样本质谱图进行均一化，得到均一化后的待测阳性样本质谱图；
在所述均一化后的待测阳性样本质谱图内，若相对信号强度>2％的离子峰的数量少于预设数量，则对质谱的激光强度参数进行调整，直至相对信号强度>2％的离子峰不少于预设数量，或者，直至质谱的激光强度参数达到激光强度阈值；
在调整后的激光强度参数下，重新获取待测阳性样本质谱图。
在一些实施方式中，所述预处理模块430，配置用于：
对所述待测阳性样本质谱图进行第一次均一化，得到均一后的待测阳性样本质谱图；
根据构建的数据库，识别所述均一后的待测阳性样本质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将非病原菌蛋白特征峰去除，得到处理后的待测阳性样本质谱图；
对所述处理后的待测阳性样本质谱图进行第二次均一化，得到预处理后的待测阳性样本质谱图。
在一些实施方式中，所述微生物鉴定模块440，配置用于：
先采用常规匹配算法将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰进行比较，初步确定待测阳性样本的种属；
再根据所述数据库内设置的修正规则，将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的专属特征峰进行比较，最终确定待测阳性样本的种属。
需要说明的是，本申请任意实施例所提供的微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统适用于对血液中的微生物进行鉴定。
图8示出了根据本申请实施例提供的一种电子设备的结构示意图。
如图8所示，作为另一方面，本申请还提供了一种电子设备500，包括一个或多个中央处理单元(CPU)501，其可以根据存储在只读存储器(ROM)502中的程序或者从存储部分508加载到随机访问存储器(RAM)503中的程序而执行各种适当的动作和处理。在RAM 503中，还存储有系统操作所需的各种程序和数据。CPU 501、ROM 502以及RAM 503通过总线504彼此相连。输入/输出(I/O)接口505也连接至总线504。
以下部件连接至I/O接口305：包括键盘、鼠标等的输入部分506；包括诸如阴极射线管(CRT)、液晶显示器(LCD)等以及扬声器等的输出部分507；包括硬盘等的存储部分508；以及包括诸如LAN卡、调制解调器等的网络接口卡的通信部分509。通信部分509经由诸如因特网的网络执行通信处理。驱动器510也根据需要连接至I/O接口505。可拆卸介质511，诸如磁盘、光盘、磁光盘、半导体存储器等等，根据需要安装在驱动器510上，以便于从其上读出的计算机程序根据需要被安装入存储部分508。
特别地，根据本公开的实施例，上文参考图1和图6描述的过程可以被实现为计算机软件程序。例如，本公开的实施例包括一种计算机程序产品，其包括有形地包含在机器可读介质上的计算机程序，计算机程序包含用于执行微生物鉴定用数据库的构建方法的程序代码。在这样的实施例中，该计算机程序可以通过通信部分509从网络上被下载和安装，和/或从可拆卸介质511被安装。
附图中的流程图和框图，图示了按照本发明各种实施例的系统、方法和计算机程序产品的可能实现的体系架构、功能和操作。在这点上，流程图或框图中的每个方框可以代表一个模块、程序段、或代码的一部分，所述模块、程序段、或代码的一部分包含一个或多个用于实现规定的逻辑功能的可执行指令。也应当注意，在有些作为替换的实现中，方框中所标注的功能也可以以不同于附图中所标注的顺序发生。例如，两个接连地表示的方框实际上可以基本并行地执行，它们有时也可以按相反的顺序执行，这依所涉及的功能而定。也要注意的是，框图和/或流程图中的每个方框、以及框图和/或流程图中的方框的组合，可以用执行规定的功能或操作的专用的基于硬件的系统来实现，或者可以用专用硬件与计算机指令的组合来实现。
作为又一方面，本申请还提供了一种计算机可读存储介质，该计算机可读存储介质可以是上述实施例中所述装置中所包含的计算机可读存储介质；也可以是单独存在，未装配入设备中的计算机可读存储介质。计算机可读存储介质存储有一个或者一个以上程序，所述程序被一个或者一个以上的处理器用来执行描述于本申请的微生物鉴定用数据库的构建方法。
附图中的流程图和框图，图示了按照本发明各种实施例的系统、方法和计算机程序产品的可能实现的体系架构、功能和操作。在这点上，流程图或框图中的每个方框可以代表一个模块、程序段、或代码的一部分，该模块、程序段、或代码的一部分包含一个或多个用于实现规定的逻辑功能的可执行指令。也应当注意，在有些作为替换的实现中，方框中所标注的功能也可以以不同于附图中所标注的顺序发生。例如，两个接连地表示的方框实际上可以基本并行地执行，它们有时也可以按相反的顺序执行，这根据所涉及的功能而定。也要注意的是，框图和/或流程图中的每个方框、以及框图和/或流程图中的方框的组合，可以通过执行规定的功能或操作的专用的基于硬件的系统来实现，或者可以通过专用硬件与计算机指令的组合来实现。
描述于本申请实施例中所涉及到的单元或模块可以通过软件的方式实现，也可以通过硬件的方式来实现。所描述的单元或模块也可以设置在处理器中，例如，各所述单元可以是设置在计算机或移动智能设备中的软件程序，也可以是单独配置的硬件装置。其中，这些单元或模块的名称在某种情况下并不构成对该单元或模块本身的限定。
以上描述仅为本申请的较佳实施例以及对所运用技术原理的说明。本领域技术人员应当理解，本申请中所涉及的发明范围，并不限于上述技术特征的特定组合而成的技术方案，同时也应涵盖在不脱离所述发明构思的情况下，由上述技术特征或其等同特征进行任意组合而形成的其它技术方案。例如上述特征与本申请中公开的(但不限于)具有类似功能的技术特征进行互相替换而形成的技术方案。

Claims (19)

1.一种微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，所述构建方法包括：
采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集；
采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集；
采用质谱法分别对所述阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图；
根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰；
根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。
2.根据权利要求1所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，采用质谱法对处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阴性样本集质谱图，包括：
所述处理后的阴性样本集包括M个阴性样本，对每个阴性样本至少点样N次，获得M×N个阴性样本质谱图，即所述阴性样本集质谱图包括M×N个阴性样本质谱图；其中，M、N分别为大于等于1的自然数。
3.根据权利要求2所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰，包括：
从所述阴性样本集质谱图中获取每个质荷比对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在所述阴性样本集质谱图中出现的次数，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度；
若所述阴性样本集质谱图内，存在同一质荷比对应的离子峰平均强度不小于第一强度阈值，且该质荷比在每个阴性样本对应的N张质谱图中至少出现一次，在所述阴性样本集质谱图内出现的次数m为：M≤m≤M×N；则该质荷比对应的离子峰为非病原菌蛋白特征峰，获得阴性样本的所有非病原菌蛋白特征峰。
4.根据权利要求1-3任一项所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，采用质谱法对所述阳性微生物集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图；
所述阳性微生物集包括G个阳性样本，每个阳性样本至少包括Q种菌株，对每种菌株至少点样B次；其中，G、Q、B分别为大于等于1的自然数；
则每个阳性样本对应获得Q×B个阳性样本质谱图，G个阳性样本对应获得G×Q×B个阳性样本质谱图，即阳性样本集质谱图包括G×Q×B个阳性样本质谱图。
5.根据权利要求4所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰，包括：
从每个阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图内，获取每个质荷比对应的离子峰强度，并记录同一质荷比在Q×B个阳性样本质谱图中出现的次数n，求取同一质荷比对应的离子峰平均强度；
将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图在相同的出峰位置出现的离子峰定义为该阳性微生物的保守特征峰，依次获得G个阳性微生物的所有保守特征峰。
6.根据权利要求5所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，将Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图在相同的出峰位置出现的离子峰定义为该阳性微生物的保守特征峰，包括：
若Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内的离子峰平均强度均不小于第二强度阈值，且该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图中出现的次数n：在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不小于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之二；
将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的保守特征峰。
7.根据权利要求5或6所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的专属特征峰，包括：
将每个阳性样本对应的Q×B个阳性样本质谱图内的非病原菌蛋白特征峰和保守特征峰去除，得到处理后的Q×B个阳性样本质谱图；
将所述处理后的Q×B个阳性样本质谱图与标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图进行对比，若处理后的Q×B个阳性样本质谱图在某一出峰位置存在的离子峰，而标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内对应出峰位置不存在离子峰，则该出峰位置对应的离子峰为该阳性微生物的专属特征峰，依次获得G个阳性微生物的所有专属特征峰。
8.根据权利要求7所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，若处理后的Q×B个阳性样本质谱图在某一出峰位置存在的离子峰，而标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内对应出峰位置不存在离子峰，则该出峰位置对应的离子峰为该阳性微生物的专属特征峰，包括：
若处理后的Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内存在同一质荷比满足如下条件：
该质荷比在处理后的Q×B个阳性样本质谱图和标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内的离子峰平均强度均不小于第三强度阈值，且该质荷比在Q×B个阳性样本质谱图内的出现次数n：在标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图内出现次数不大于标准培养参考图谱内对应阳性样本的谱图总数量的三分之一；
将满足以上条件的质荷比对应的离子峰作为对应阳性微生物的专属特征峰。
9.根据权利要求7或8所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，所述方法还包括：
对G个阳性微生物的所有专属特征峰分别设置权重值，并根据所述专属特征峰对应的权重值设置修正规则，利用所述修正规则对待测微生物对应离子峰的评分进行修正，得到待测微生物对应离子峰的修正得分。
10.根据权利要求9所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，其特征在于，所述修正规则为：
若阳性微生物存在某一专属特征峰，待测微生物在对应专属特征峰对应的出峰位置也存在离子峰，且该离子峰的强度不小于第四强度阈值，则待测微生物对应离子峰的修正得分Z修正＝Z得分+ω·Z得分；
若阳性微生物存在某一专属特征峰，待测微生物在对应专属特征峰对应的出峰位置不存在离子峰，则待测微生物对应离子峰的修正得分Z修正＝Z得分-ω·Z得分；其中，Z得分为待测微生物对应离子峰的评分值；ω为专属特征峰对应的权重值。
11.一种微生物鉴定用数据库的构建装置，其特征在于，所述构建装置包括：
采集模块，用于采集血培养阳性样本集和血培养阴性样本集；
处理模块，用于采用微生物富集方法分别对所述血培养阳性样本集和血培养阴性样本集进行处理，得到阳性微生物集和处理后的阴性样本集；
质谱鉴定模块，用于采用质谱法分别对所述阳性微生物集和处理后的阴性样本集进行质谱鉴定，获得阳性样本集质谱图和阴性样本集质谱图；
第一获取模块，用于根据所述阴性样本集质谱图获取非病原菌蛋白特征峰；
第二获取模块，用于根据所述阳性样本集质谱图和标准培养参考图谱获取每个阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰。
12.一种微生物的鉴定方法，其特征在于，所述鉴定方法包括：
构建数据库，所述数据库包括阴性样本的非病原菌蛋白特征峰和至少一个阳性微生物对应的保守特征峰和专属特征峰；
获取待测阳性样本质谱图；
对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图；
将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，对待测阳性样本进行鉴定，确定待测阳性样本的种属。
13.根据权利要求12所述的微生物的鉴定方法，其特征在于，所述数据库利用权利要求1-10任一项所述的微生物鉴定用数据库的构建方法构建。
14.根据权利要求12所述的微生物的鉴定方法，其特征在于，所述待测阳性样本质谱图的获取方法包括：
对待测阳性样本进行质谱鉴定，预先采集待测阳性样本的质谱图；
根据所述数据库，识别预先采集的待测阳性样本的质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将非病原菌蛋白特征峰去除，得到处理后的待测阳性样本质谱图；
对所述处理后的待测阳性样本质谱图进行均一化，得到均一化后的待测阳性样本质谱图；
在所述均一化后的待测阳性样本质谱图内，若相对信号强度>2％的离子峰的数量少于预设数量，则对质谱的激光强度参数进行调整，直至相对信号强度>2％的离子峰不少于预设数量，或者，直至质谱的激光强度参数达到激光强度阈值；
在调整后的激光强度参数下，重新获取待测阳性样本质谱图。
15.根据权利要求14所述的微生物的鉴定方法，其特征在于，对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图，包括：
对所述待测阳性样本质谱图进行第一次均一化，得到均一后的待测阳性样本质谱图；
根据构建的数据库，识别所述均一后的待测阳性样本质谱图内的非病原菌蛋白特征峰，并将非病原菌蛋白特征峰去除，得到处理后的待测阳性样本质谱图；
对所述处理后的待测阳性样本质谱图进行第二次均一化，得到预处理后的待测阳性样本质谱图。
16.根据权利要求12-15任一项所述的微生物的鉴定方法，其特征在于，将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，确定待测阳性样本的种属，包括：
先采用常规匹配算法将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰进行比较，初步确定待测阳性样本的种属；
再根据所述数据库内设置的修正规则，将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的专属特征峰进行比较，最终确定待测阳性样本的种属。
17.一种微生物的鉴定系统，其特征在于，所述鉴定系统包括：
数据库构建模块，用于构建微生物鉴定用数据库；
待测样本获取模块，用于获取待测阳性样本质谱图；
预处理模块，用于对所述待测阳性样本质谱图进行预处理，并根据构建的数据库，识别非病原菌蛋白特征峰，得到预处理后的待测阳性样本质谱图；
微生物鉴定模块，用于将所述预处理后的待测阳性样本质谱图内的离子峰与所述数据库内阳性微生物的保守特征峰和专属特征峰进行比较，对待测阳性样本进行鉴定，确定待测阳性样本的种属。
18.一种电子设备，其特征在于，包括：
一个或多个处理器；
存储器，用于存储一个或多个程序，
当所述一个或多个程序被所述一个或多个处理器执行时，使得所述一个或多个处理器执行如权利要求1-10中任一项所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，或者执行如权利要求12-16中任一项所述的微生物的鉴定方法。
19.一种计算机可读存储介质，其上存储有计算机程序，其特征在于，所述计算机程序被处理器执行时实现权利要求1-11中任一项所述的微生物鉴定用数据库的构建方法，或者执行如权利要求12-16中任一项所述的微生物的鉴定方法。
CN202310485933.3A 2023-04-28 2023-04-28 微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统 Pending CN116559466A (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202310485933.3A CN116559466A (zh) 2023-04-28 2023-04-28 微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN202310485933.3A CN116559466A (zh) 2023-04-28 2023-04-28 微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统

Publications (1)

Publication Number Publication Date
CN116559466A true CN116559466A (zh) 2023-08-08

Family

ID=87495818

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN202310485933.3A Pending CN116559466A (zh) 2023-04-28 2023-04-28 微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN116559466A (zh)

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011067516A1 (fr) * 2009-12-03 2011-06-09 Assistance Publique - Hopitaux De Marseille Procede d'identification rapide des virus par spectrometrie de masse
CN106199003A (zh) * 2016-07-21 2016-12-07 郑州安图生物工程股份有限公司 基于飞行时间质谱原理的微生物肽质量指纹图谱库的构建方法
CN109154018A (zh) * 2016-03-31 2019-01-04 株式会社岛津制作所 微生物的识别方法

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2011067516A1 (fr) * 2009-12-03 2011-06-09 Assistance Publique - Hopitaux De Marseille Procede d'identification rapide des virus par spectrometrie de masse
CN109154018A (zh) * 2016-03-31 2019-01-04 株式会社岛津制作所 微生物的识别方法
CN106199003A (zh) * 2016-07-21 2016-12-07 郑州安图生物工程股份有限公司 基于飞行时间质谱原理的微生物肽质量指纹图谱库的构建方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
YIYANG: "Direct MALDI-TOF MS Identification of bacterial Mixtures", 《ANAL.CHEM》, vol. 90, no. 17, 9 August 2018 (2018-08-09), pages 10400 - 10408 *
李媛睿;俞静;刘婧娴;陈峰;皇甫昱婵;陶晓勤;刘瑛;: "应用MSK试剂盒-质谱法直接鉴定阳性血培养标本", 上海交通大学学报(医学版), no. 02, 28 February 2016 (2016-02-28), pages 256 - 263 *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Azrad et al. Cheap and rapid in-house method for direct identification of positive blood cultures by MALDI-TOF MS technology
DE102010006450B4 (de) Gestufte Suche nach Mikrobenspektren in Referenzbibiliotheken
EP0589634A1 (en) Enhanced detection of microorganisms in samples
US10774361B2 (en) Microbe identification by mass spectrometry and infrared spectrometry
US20110318776A1 (en) Method for identifying germs in a liquid medium
CN112858454B (zh) 用于诊断新冠肺炎的特征多肽组合物
CN107024530A (zh) 通过内部标准物质谱检测微生物的方法及其产品
CN111239235A (zh) 一种巴尔通体菌株maldi-tof ms的数据库建立方法和鉴定方法
CN107219110A (zh) 适用于maldi‑tof检测的微生物培养液处理方法及快速鉴定方法
Angaali et al. Direct identification and susceptibility testing of Gram-negative bacilli from turbid urine samples using VITEK2
CN116559466A (zh) 微生物鉴定用数据库的构建方法及装置、鉴定方法及系统
CN116626147A (zh) 一种奥默柯达菌的检测方法及其蛋白指纹图谱的构建
Gu et al. A new method aimed to quickly identify pathogen and drug susceptibility test based on matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry combined with flow cytometry
CN113470752B (zh) 一种基于纳米孔测序仪的细菌测序数据鉴定方法
Bardelli et al. A side-by-side comparison of the performance and time-and-motion data of VITEK MS
TWI775205B (zh) 鑑定抗甲氧西林金黃色葡萄球菌的方法
CN115678958A (zh) 一种快速鉴定耐碳青霉烯肺炎克雷伯杆菌的方法
CN113130074A (zh) 一种以肠道菌群特征为核心的健康评价方法
CN113390853A (zh) 利用拉曼光谱鉴别细菌和真菌的方法及系统
WO2011015631A1 (en) Method of identifying micro-organisms and their species in blood culture
CN116337986B (zh) 一种基于maldi-tof ms的肯塔基沙门氏菌的快速鉴定方法
US11352655B2 (en) Method of identification of methicillin-resistant Staphylococcus aureus
JP2021529537A (ja) 懸濁液源からブロスを直接接種する方法
CN114657091B (zh) 一种弯曲菌增菌培养液及其制备方法、应用
US20220415447A1 (en) Method for assessing drug-resistant microorganism and drug-resistant microorganism assessing system

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination