CN1160465C - 其中areA、pepC和/或pepE基因已被灭活的真菌 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及不产生蛋白酶的真菌。本发明的真菌作为产生蛋白质的宿主是有用的,所说的蛋白质易于被通常产生的蛋白酶所酶解。因此,本发明包括利用本发明的真菌以高产率产生兴趣蛋白质的方法。本发明也包括产生这种真菌的方法以及用于这些方法中的DNA构建体。
Description
发明所属技术领域
本发明涉及不产生蛋白酶的真菌。本发明的真菌作为产生蛋白质的宿主是有用的,所说的蛋白质易于被通常产生的蛋白酶所酶解。因此,本发明包括利用本发明的真菌以高产率产生兴趣蛋白质的方法。本发明也包括产生这种真菌的方法以及用于这些方法中的DNA构建体。
发明背景
真菌(尤其是丝状真菌)在商业上广泛地被使用,这是因为它们具有分泌很高水平的蛋白质的能力。
在丝状真菌中,属于曲霉属的物种用于产生内源性蛋白质(后来也用于产生异源蛋白质)的商业用途已具有很长的历史。
大多数微生物用于产生蛋白质的一个缺点是固有的蛋白酶产生,该蛋白酶使目的产物降解(由于蛋白酶解)。
已研究了避免这一现象发生的各种方法。在这些解决方案中,已经有人提出缺失或破坏编码各种蛋白酶的基因。遗憾地是,真菌产生大量种类的蛋白酶,使得这种解决方案或多或少地有些不现实。
因此需要寻求显示出没有蛋白酶产生或十分低水平的蛋白酶产生的丝状真菌菌株。
一些年来,已知调节基因araA(在构巢曲霉中其介导氮代谢物阻抑)影响胞外蛋白酶的产生(Arst & Cove,molec.gen.Genet.126,(1973)111-141)。
已克隆了构巢曲霉的araA基因(Caddick等,EMBO杂志5,(1986)1087-1090),并且已对它进行了各种修饰,以评价在由这一基因编码的激活物蛋白质中不同区的功能(Stankovitch等,分子微生物学(Mol.Microbiol.)7,(1993)81-87)。此外,最近似乎已克隆了在烟曲霉中编码相应功能的基因(Hensel等,真菌遗传学的第二次欧洲会议(2nd EuropeanConference on Fungal Genetics),1994年4月28日至5月1日,摘要册,E11)。
从文献中,基因型argB areAl的构巢曲霉菌株作为产生t-PA的宿主的单一用途是已知的(Upshall等,生物技术(Biotechnology)5,(1987)1301-1304)。在这一例子中,仅araB基因型通过其精氨酸原养型用作选择标记,而araA基因型只是巧合。
国际专利出版物号WO 95/35385公开了作为在丝状真菌中减少蛋白酶水平的一种手段的araA基因的缺失方法。
除胞外蛋白酶之外,真菌也产生一些胞内蛋白酶(也称为内质蛋白酶)。
在这些中间,枯草菌素型丝氨酸蛋白酶(由黑曲霉产生,指定为PepC)已有描述,并克隆表达它的基因,在EP574 347和Frederick等,基因,125 57-64(1993)中描述了一种缺失突变体。
在Jarai等,基因,145 171-178(1994)中公开了另一种这样的天冬氨酸型蛋白酶(指定为PepE)。该文献公开了pepE基因的克隆与鉴定,并推测了pepE与pepC基因的调节作用。
本发明的目的是缓解对无蛋白酶的丝状真菌的需要。
发明概要
本发明因而涉及这样的真菌,其中的areA、pepC和/或pepE基因已由重组DNA技术修饰,由此它们不能以提供功能性AreA激活物和功能性PepC和/或PepE蛋白酶的方式表达。
此外本发明涉及产生这样的真菌的方法,所说真菌是通过缺失areA、pepC和/或pepE基因获得的。
这可以通过包括以下步骤的方法获得:
i)克隆兴趣真菌的areA、pepC和/或pepE基因,
ii)产生各包含areA基因、pepC基因和/或pepE基因中之一的DNA构建体,其中一个内部部分已被取代、缺失,或者额外的DNA已被插入,
iii)用所说的构建体转化所说的真菌,和
iv)分离areA-、pepC和/或pepE的转化体。
从以上提到的克隆areA、pepC和/或pepE基因获得的信息也可以用于与熟知的反义技术相连系,以构建表达质粒并用它转化兴趣真菌,所说的质粒导致一种RNA分子的合成,该RNA分子互补于从areA基因、pepC基因和/或pepE基因转录的mRNA。
此外,本发明涉及意欲用于以上提到的方法中的DNA构建体。
另外,本发明涉及产生所需蛋白质或基因产物(尤其是分泌蛋白质)的方法,该方法为在合适的条件下在适当的生长培养基中培养真菌,并回收和纯化所说的所需基因产物,其中所说的真菌是用DNA构建体修饰过的和任选转化过的,所说的DNA构建体包含至少一种编码兴趣蛋白质或基因产物的DNA序列。
当完成本发明时,惊人地发现本发明的真菌以得到很大改进的产率产生这样的分泌蛋白质。
也惊人地发现,能够使米曲霉areA-菌株生长良好的仅有的氮源是谷氨酰胺。
本发明还涉及用上述方法产生的蛋白质产物。
本发明也涉及编码米曲霉pepC基因或其功能性等位基因的DNA序列(SEQ ID No.1)。
本发明也包括米曲霉PepC蛋白酶(SEQ ID No.2),以及产生PepC蛋白酶的方法,该方法包括用编码PepC蛋白酶的DNA序列的DNA构建体转化合适的宿主,选择能够产生所说的PepC蛋白酶的转化体,在适当的生长培养基中培养所说的转化体,并且从所说的培养物中回收所说的PepC蛋白酶。
此外,本发明涉及编码米曲霉pepE基因或其功能性等位基因的DNA序列(SEQ ID No.3)。
同时,本发明涉及米曲霉PepE蛋白酶(SEQ ID No.4),以及产生PepE蛋白酶的方法,该方法包括用编码该蛋白酶的DNA序列的DNA构建体转化合适的宿主,选择能够产生所说的PepE蛋白酶的转化体,在适当的生长培养基中培养所说的转化体,并且从所说的培养物中回收所说的PepE蛋白酶。
按照这些方面,所说的宿主优选地是按照本发明的真菌,尤其是米曲霉,并且其中所说的DNA构建体提供编码所说PepC或PepE蛋白酶的基因的一个额外拷贝。
附图简要描述
参照实施例和附图,在说明书的以下部分中详细描述本发明,其中
图1显示了HowB101的构建中所涉及的步骤,
图2显示了pToC345的构建,
图3显示了pToC315的构建中所涉及的步骤。
图4图示了pyrG基因的两步基因缺失。
图5显示了pJaL235的构建,
图6显示了pJaL335的构建中所涉及的步骤,
图7显示了pJaL363的构建中所涉及的步骤,
图8显示了pJaLz的构建中所涉及的步骤,
图9显示了pSKS和pSK9的构建,
图10a和10b显示了pToC243和pToC266的构建中所涉及的步骤,
图11显示了pMT1606的构建中所涉及的步骤,
图12显示了pToC56的构建,
图13a和13b显示了pJaL368的构建中所涉及的步骤,和
图14a和14b显示了pToC338的构建。
定义
在本说明书中使用了下列定义:
符号areAD意指其中araA基因被缺失的菌株,类似的符号用于其中pepC和/或pepE基因被缺失的菌株。
符号areA-意指不产生功能性AreA激活物的菌株。术语″功能丧失″也常用于该目的。类似的符号用于不产生功能性PepC和/或PepE蛋白酶的菌株。
术语″反义技术″描述了在例如US 5,190,931中公开的方法。
发明详述
如上所述,本发明的第一方面涉及真菌,其中的areA基因已由重组DNA技术修饰,使它不能以提供功能性AreA激活物的方式表达,并且其中的编码胞外蛋白酶PepC和/或PepE的基因已被灭活,使它们不能表达产生功能性蛋白酶。
这一目的具体来说可以通过缺失或破裂areA、pepC和/或pepE基因达到。
在实施例中描述了areA、pepC和/或pepE基因的克隆。
其它真菌的AreA类似物可以通过与一种已知的基因杂交或者通过areA突变体(例如在本说明书中描述的构巢曲霉areA-18或米曲霉areA菌株)的互补作用来克隆。
用于缺失或破坏基因的方法具体地说是在WO 90/00192(Genencor)中有描述。
用于在基因中置换DNA的方法一般来说是已知的,并且该置换可以通置换个基因的一个或多个连续的部分来完成,但是它也可以由定点诱变(产生编码非功能性AreA激活物变体的DNA序列)来达到。
可以达到这样的目的另一种方法是通过利用反义技术。
反义技术以及如何使用它在以上提及的US 5,190,931(纽约大学)中有详细描述。
获得灭活的另一种方法是通过在araA基因内插入额外的DNA,从而导致无功能的激活物蛋白质的表达。
与这一方法相结合,由克隆所提供的信息可以用于制备可被整合进araA基因的DNA构建体,并且甚至用另一种基因(例如pyrG基因)取代araA基因。
避免存在araA激活物的方法是通过干扰表达信号的调节作用,该表达信号调节araA基因自身的表达。
以上所描述的原则可等同地用于pepC和/或pepE基因。
按照本发明,优选的真菌属于选自下组的属,该组包括曲霉属(Aspergillus)、木霉属(Trichoderma)、腐质霉属(Humicola)、假丝酵母属(Candida)、顶孢霉属(Acremonium)、镰刀菌属(Fusarium)以及青霉属(Penicillium)。
在这些属中,选自下组的种是优选的,该组包括米曲霉(A.oryzae)、黑曲霉(A.niger)、泡盛曲霉(A.awamori)、A.phoenicis、日本曲霉(A.japonicus)、臭曲霉(A.foetidus)、构巢曲霉(A.nidulans)、T.reesei、T.harzianum、H.insolens、H.lanuginosa、禾谷镰孢(F.graminearum)、腐皮镰孢(F.solani)、产黄青霉(P.chrysogenum)等。
如上所述,本发明也包括产生本发明的第一方面的真菌的方法,其中所说的灭活已由缺失araA、pepC和/或pepE基因获得,该方法包括
i)克隆兴趣真菌的areA、pepC和/或pepE基因,
ii)产生各包含areA基因、pepC基因和/或pepE基因中之一的DNA构建体,其中一个内部部分已被取代、缺失,或者额外的DNA已被插入,
iii)用所说的构建体转化所说的真菌,和
iv)分离areA-、pepC-和/或pepE-的转化体。
因为人们相信,PepC蛋白酶的成熟是由PepE蛋白酶控制的,所以本发明也包括产生本发明的真菌的方法,其中所说的灭活已由缺失araA和/或pepE基因获得,该方法包括
i)克隆兴趣真菌的areA和pepE基因,
ii)产生各包含areA基因和pepE基因中之一的DNA构建体,其中一个内部部分已被取代、缺失,或者额外的DNA已被插入,
iii)用所说的构建体转化所说的真菌,和
iv)分离areA-和pepE-的转化体。
本发明也包括产生真菌的方法,其中所说的灭活已利用反义技术获得,该方法包括
i)构建表达质粒,各个这样的质粒导致一种RNA分子的合成,所说的RNA分子互补于从areA基因、pepC基因和/或pepE基因转录的mRNA,
ii)用所说的表达质粒和适当的标记转化所说的宿主真菌,该表达质粒和标记两者在不同的质粒上或者在相同的质粒上,
iii)用所说的标记选择转化体,和
iv)筛选所选择的转化体,以获得显示AreA、PepC和/或PepE产物的合成降低的菌株。
本发明的另一方面包括用于以上提到的方法中的DNA构建体。
就前述方法而言,所说的DNA构建体可以包含araA、pepC和/或pepE基因,其中一个内部部分已被取代、缺失,或者额外的DNA已被插入。
这些DNA构建体的至少一个也可以进一步包含编码兴趣蛋白质产物的DNA序列,例如以下提到的那些。
就后面的反义方法而言,所说的DNA构建体可以包含连接到功能性启动子上的araA、pepC和/或pepE基因的反向DNA序列,从而使其mRNA至少部分互补于从araA、pepC和/或pepE基因产生的mRNA。
本发明的另一方面涉及一种产生所需基因产物(优选地是分泌产物)的方法,该方法通过在适当的条件下在合适的生长培养基中培养按照本发明的真菌,并回收和纯化所需的基因产物。
在基因产物由异源基因表达的情况下,编码所需基因产物的DNA序列可以是用于产生所说的真菌的DNA构建体的一部分。
然而,通常进行本发明真菌的单独的转化,以便制备能够产生所需产物的真菌。
用于转化真菌的方法是本领域已知的,参见例如EP 0 184 438A2(Gist-Brocades N.V.)和EP专利公开号0 98 993(Novo Nordisk A/S)。
对于本来的产物,这当然是不必要的,但是,为了增加产生量,提供掺入到宿主中的编码兴趣蛋白质的基因的多拷贝可能是有利的。
所需基因产物一般是肽或蛋白质,优选地是酶。
优选的酶选自包括蛋白酶(如胰蛋白酶和凝乳酶)、脂肪酶、角质酶、纤维素酶、木聚糖酶、漆酶、果胶酶等的组。
另一种类型的所需基因产物一般是有治疗活性的肽或蛋白质。
在有治疗活性的肽或蛋白质中,优选的蛋白质选自包括胰岛素,生长激素、胰高血糖素、促生长素抑制素、干扰素、PDGF、因子VII、因子VIII、尿激酶、t-PA、CSF、乳铁蛋白、TPO等。
本发明的另一方面涉及编码米曲霉pepC基因(SEQ ID No.1)、米曲霉pepE基因(SEQ ID No.3)或其功能性等位基因的DNA序列。本发明也包括对应的PepC和PepE蛋白酶和它们的产生方法(优选重组方法)。
在这一方面,本发明涉及用于产生米曲霉PepC蛋白酶或PepE蛋白酶的方法,该方法包括用包含编码兴趣蛋白酶的DNA序列的DNA构建体转化合适的宿主,选择能够产生所说的蛋白酶的转化体,在适当的生长培养基中培养转化体,并且从培养物中回收PepC或PepE蛋白酶。
用于这样一种方法的宿主是按照本发明的上述方面的宿主。
在产生PepC或PepE蛋白酶的方法的某些实施方案中,所说的宿主是米曲霉。在这种情况下,更为理想的是DNA构建体(包含编码蛋白酶的DNA序列)提供已经存在于宿主中的基因的额外的拷贝。
DNA构建体(包含编码蛋白酶的DNA序列)通常也包含调节元件,以便在宿主中适当地表达和加工蛋白酶。
在以下给出的实施例中进一步详细地解释本发明。然而,这些实施例不以任何方式限制由所附权利要求限定的本发明的范围。
实施例
材料和方法
菌株
米曲霉,IFO 4177:可从大阪发酵研究所(17-25 Juso Hammachi 2-Chome Yodogawa-Ku,大阪,日本)获得。
ToC913:这一菌株的构建在实施例中描述。
基因
araA:这一基因编码一种控制氮分解代谢的调节蛋白质。
pepC:这一基因编码枯草菌素型丝氨酸蛋白酶。
pepE:这一基因编码天冬氨酸蛋白酶。
pyrG:这一基因编码乳清酸核苷-S′-磷酸脱羧酶,一种在尿苷的生物合成中所涉及的酶。
bar:这一基因最初从吸水链霉菌中分离得到,其编码膦丝菌素乙酰转移酶。该酶修饰膦丝菌素(=glufosinate),从而灭活这一化合物(该化合物对细菌、真菌和植物是毒性的)。
质粒
pUC118:Viera和Mesing,酶学方法杂志,1987 153 3-11。
pSO2:这一质粒的构建在实施例中描述。
pJers4:pSO2在pUC118中的2.0kb亚克隆。pjers4含有功能性米曲霉pyrG基因。
pSO5:在实施例中描述从pSO2构建这一质粒。
pToC56:这一质粒的构建在EP出版物0 98 993中描述。
pToC68:这一质粒的构建在WO 91/17243中描述。
pToC90:p3 SR2的亚克隆,携带作为2.7kb Xba I片段的构巢曲霉amdS基因[Corrick等,基因1987 53 63-71],其在pUC19载体[Yannisch-Perron等,基因1985 33 103-119]上,是按照WO 91/17243中描述的方法制备的。
pToC266:这一质粒的构建在实施例中描述。
pToC299:这一质粒的构建在实施例中描述。
pToC338:这一质粒的构建在实施例中描述。
pMT1606:在实施例中描述从pBP1T(B.Straubinger等,真菌遗传学新闻39(1992):82-83)和p775(EP专利公开号0 98 993)构建这一质粒。
p775:这一质粒的构建在EP专利公开号0 98 993中描述。
p777:这一质粒的构建在EP专利公开号0 98 993中描述。
pHW470:这一质粒的构建在实施例中描述。
实施例1 克隆和缺失米曲霉pepE基因
通过与黑曲霉基因的交叉杂交克隆米曲霉pepE基因。从PCR反应以700bp PCR片段获得部分黑曲霉基因,所说的PCR反应使用黑曲霉染色体DNA和pepE特异性引物,该引物是按照由G.Jarai等,基因145(1994)171-178发表的pepE序列制造的。通过DNA测序,显示所说的片段含有pepE序列。在严格条件下其杂交到米曲霉染色体DNA上,Southern分析显示,米曲霉含有单一的类pepE基因。
用基因置换法和两步基因置换法(G.May,在″丝状真菌的应用分子遗传学″(1992)pp.1-25.编者J.R.Kinghorn和G.Turner;BlackieAcademic and Professional)两种方法缺失pepE基因。当米曲霉pyrG基因用作标记时,该米曲霉菌株是pyrG-菌株(由缺失pyrG基因制备的)。
克隆米曲霉pepE基因
基本上按照″SuperCosl粘粒载体试剂盒″的供给者(Stratagene)的说明构建米曲霉粘粒文库。
由标准的方法(Christensen,T.等,生物技术6(1988)1419-1422)从原生质体制备米曲霉IFO4177基因组DNA。在分离原生质体后,将它们在Labofuge T(Heto)中以2500rpm离心5分钟进行离心沉淀。如Supercos1粘粒载体试剂盒手册中所述,将沉淀悬浮在10mM NaCl,20mMTris-HCl(pH8.0),1mM EDTA,100μg/ml蛋白酶K,0.5%SDS中,DNA制备的其它过程按照试剂盒的说明进行。采用Biorad的CHEF-凝胶装置经电泳分析基因组DNA的大小。在200伏特下用10-50秒脉冲进行1%琼脂糖凝胶电泳20小时。凝胶经溴化乙锭染色并摄影。DNA大小是50->100kb。将DNA用Sau3A部分限制性消化。当用以上相同类型的CHEF-凝胶分析测定时,限制性消化的DNA的大小是20-50kb。按照所说的手册制备CsCl梯度分离的SuperCosl载体。同样地按照所描述的方法进行连接和包装。在滴度文库后,将来源于一次连接和包装的所有的包装混合物转染进宿主细胞XL1-Blue MR中,并平板接种到50μg/ml氨苄青霉素LB平板上。获得大约3800个菌落。10个菌落的粘粒制品显示出它们都具有预期大小的插入片段。单个挑取菌落,接种到具有100μL LB(100μg/ml氨苄青霉素)的微量滴定板孔中,并在37℃下培养一夜。将100μl 50%的甘油添加至每一孔中,在-80℃下冻结整个文库。贮存总共3822个菌落。它代表约4.4倍米曲霉基因组。
通过利用适配于微量滴定板一半的具有6乘8针的多针装置,将单个冻结的文库菌落接种到LB-平板(100μg/ml氨苄青霉素)上。制备包含文库中所有克隆的菌落的平板。将平板在37℃培养过夜。将剪切至培养皿大小的灭菌的Whatman 540滤膜置于菌落上,菌落在37℃下再培养2个小时。将滤膜转移到含有200μg/ml氯霉素的LB平板上,平板在37℃下培养一夜。第二天,用0.5M NaOH洗涤滤膜两次(5分钟),然后用2×SCC洗涤两次(5分钟)。将滤膜用乙醇润湿并通风干燥。
使滤膜与0.7kb 32P标记的PCR片段杂交,所述片段含有黑曲霉pepE基因的一部分。通过用两种引物(在DNA序列中相隔700bp)在黑曲霉染色体DNA上进行PCR获得PCR片段。在10×Denhart,5×SSC,0.02MEDTA,1%SDS,0.15mg/ml polyA以及0.05mg/ml酵母tRNA中于65℃下进行杂交16小时。杂交后,在45℃下用2×SSC,0.1%SDS洗涤滤膜两次,并放置在X-光胶片上。5个菌落与探针杂交,它们中的4个随后经分离的粘粒DNA的Southern分析(利用相同的探针)显示含有米曲霉pepE基因。三种粘粒是相同的,由此分离到两种含有pepE的不同的粘粒克隆,将它们称为7C7和33C1,以它们在贮存文库中的位置命名。将两个重叠片段,4.3kb EcoRI片段(pToC299)和2.4kbHindIII(pToC301)片段亚克隆并部分测序。SEQ ID No.1显示了DNA序列和推定的蛋白酶的氨基酸序列,该基因显示出与黑曲霉基因的强同源性。
克隆米曲霉pyrG基因
通过与黑曲霉pyrG基因(W.van Hartingsveldt等,Mol.Gen.Genet206:71-75(1987))交叉杂交克隆米曲霉pyrG基因。在低严格性条件下用1kb黑曲霉pyrG基因的DNA片段探查SauIIIA部分消化的米曲霉IFO4177 DNAλ文库。将阳性克隆的3.8kb HindIII片段亚克隆进pUC118载体。所形成的质粒pSO2显示含有pyrG基因(经黑曲霉pyrG-突变体的互补作用)。
构建米曲霉pyrG阴性菌株
从质粒pSO2构建pyrG缺失质粒pSO5,该质粒在各末端含有约1kb的pyrG侧翼序列。用这一构建体转化米曲霉IFO4177,由对5-氟-乳清酸(FOA)的抗性(pyrG突变体的表型特征)选择转化体。经Southern分析,一种转化体(HowB 101)显示出在pyrG基因座上具有预期的缺失。由于是pyrG突变体,HowB101的生长需要尿苷。通过就无尿苷下的生长能力进行筛选,可以用wt pyrG基因转化HowB101。
在HowB101的构建中所涉及的步骤在图1中说明。
经基因置换法在米曲霉中缺失pepE基因
构建质粒pToC345,其被设计来用pyrG基因替代pepE基因。
以pToC299为模板进行两个PCR反应;第一套引物是:
19819 GAAGATCTGCGCGGATGTAC ATTGTAG
19821 TTAGTCAGAAATTCGTCCCG
第二套引物是:
19820 CCCAAGCTTCATGCTCGACCAGGGCCTCCT
19818 GGTCTGTGTTAACCAAAGAAC
用Bgl II/HindIII切割约800bp的片段(其是用19819/19821获得的),并与用19820/19818获得的1.1kb片段一起克隆,用HindIII/PstI切割并连入BglII/PstI切割的pIC19R中(J.L.Marsh等,基因32(1984)481-484)。在唯一的HindIII位点切割所形成的质粒,脱磷酸化插入来源于pJaL335的3.5kb含pyrG的片段(在实施例2中描述)。pToC345的构建在图2中说明。
利用标准方法以EcoRI切割的pToC345转化HowB101,通过在不添加尿苷的条件下它们的生长能力选择转化体。通过分生孢子再分离一次100个转化体。从再分离平板上的单一菌落收集孢子,重悬于含0.01%曲通X-100的100ml水中。将各转化体和IFO4177(包括其作为对照)的1ml孢子悬浮液涂布到Whatmann540滤膜上,该滤膜位于它们各自的YPD平板的顶端。将平板在30℃下温育18小时。从平板上移走滤膜,并且在室温下放置在20%SDS中两小时。然后将它们在600瓦微波炉中烘烤3分钟。接着在10%SDS中洗涤滤膜5分钟,在0.5M NaOH,1.5M NaC1中洗涤两次(每次5分钟),用0.5M Tris-HC1(pH=7.5),1.5M NaC1洗涤一次(5分钟),用20xSSC洗涤一次(5分钟),并通风干燥。通过标准方法将两套滤膜用他们的32P-标记的探针杂交,将一套与600bp BbuI/HindIII片段杂交,该片段来源于pToC299,含有欲被缺失的pepE基因的一部分。将其它的滤膜与米曲霉tpi基因的DNA片段杂交。可以使用以一个拷贝存在的任何基因(但不是pepE),因为这是结合到滤膜上的DNA量的对照。
在杂交之后,在65℃用0.1xSS,0.1%SDS洗涤滤膜,经PhospoImager显现结合到滤膜上的放射活性。收集13个转化体用于进一步的分析,因为与对照探针的杂交相比,它们显示很少与pepE探针杂交。由标准方法制备染色体DNA,将EcoRI限制消化的DNA的Southern印迹与32P-标记的1.1kb BbuI片段杂交,所说片段来源于pToC299,含有没有被缺失的pepE基因的3’部分。在wt菌株中,4.3kb片段应该与探针杂交,在正确置换的菌株展中,4.3kb片段应该由7.2kb片段所置换。在两个看上去正确的转化体,一个根本没有杂交带,另一个具有wt带以及可能的一个其它带,说明转化的DNA整合在非同源基因座上。
为了分离pepE缺失菌株的pyrG-衍生物,把107个分生孢子涂布在包含FOA在平板上,选择抗性菌落。再分离FOA抗性菌落,制备DNA,并进行Southern分析,以鉴别其中pyrG基因丧失(经侧翼于pToC345中的基因的重复序列之间的重组)的菌株。
通过两步基因置换法缺失米曲霉中的pepE基因
构建质粒pToC315,其设计来用于pepE基因的两步基因缺失。将含有pepE基因上游序列的pToC299的1.6kb EcoRI/HindIII(通过用DNA聚合酶的克列诺片段处理使HindIII位点成为平端)与含有pepE基因3’末端的1.4kb SalI/BbuI(BbuI片段是平端化的)一起克隆进EcoRI/SalI切割的载体pUC19中。在pUC19接头中的唯一的HindIII位点切割所形成的质粒,脱磷酸化,插入来源于pJers4的含1.8kb pyrG的片段。pToC315的构建在图3中说明。
利用标准方法以pToC315转化HowB101,通过在不添加尿苷的条件下它们的生长能力选择转化体。在再分离后,从12个转化体制备染色体DNA,用Asp718切割DNA,并以含有部分pepE基因的pToC3的BbuI片段作为放射性标记探针,用Southern分析进行分析。一个转化体具有整合到内源性pepE基因中质粒,如由pepE特异性Asp 718片段消失(其已经被两个新的带所替代,如所预料的,在pToC315已由同源重组在pepE基因座上以单一拷贝整合时)揭示的。该转化体被命名为ToC1089。将ToC1089的5×107个分生孢子涂布在选择pyrG基因丧失的包含5-氟-乳清酸的平板上。这是两步基因缺失中的第二个步骤,pyrG基因可以通过与两对相同序列(其中之一也导致pepE基因的缺失)之一的重组丧失掉。图4中描述这一方法。5-氟-乳清酸的抗性的频率是大约10-5。再分离5-氟-乳清酸抗性菌落,经Southern分析鉴别缺失pepE基因的菌株。
实施例2 克隆和断裂米曲霉丝氨酸蛋白酶pepC
通过与黑曲霉基因的交叉杂交克隆米曲霉pepC基因。从PCR反应以1.1kb PCR片段获得黑曲霉基因,所说的PCR反应使用黑曲霉染色体DNA和pepC特异性引物,该引物是按照由Frederick G.D等,基因125(1993)57-64发表的pepC序列制备的。通过DNA测序,所说的片段显示含有pepC序列。在严格条件下其杂交到米曲霉染色体DNA上,Southern分析显示,米曲霉含有单一的类pepC基因。
用两步基因置换法(G.May,在″丝状真菌的应用分子遗传学″(1992)pp.1-25.编者J.R.Kinghorn和G.Turner;Blackie Academic andProfessional)缺失pepC基因。在米曲霉pyrG基因用作标记时,该米曲霉菌株是pyrG-菌株(通过缺失pyrG基因制备)。
克隆黑曲霉丝氨酸蛋白酶pepC
从已出版的编码黑曲霉pepC的cDNA核苷酸序列(Frederick G.D等,基因125(1993)57-64)设计两种寡核苷酸,以便在PCR反应中扩增pepC基因的编码部分。这里制备引物#5258(5’-CTAGGATCCAAGGCATTT
ATGAAGGGCATCCTCGGCCTTT CC),核苷酸序列的3’末端相应于pepC基因的N-端部分(下划线),5’末端是为了易于克隆(含有BamHI限制性内切核酸酶位点)。这里制备引物#5259(5’-CTACTCGAG
TCAAAAAA AAACCAAGTCTTCCGATCTA CG),核苷酸序列的3’末端相应于pepC基因的C-端部分(下划线)和5’末端是为了易于克隆(含有XhoI限制性内切核酸酶位点)。
在PCR反应中将黑曲霉基因组DNA用作模板。扩增反应在包含2.5单位Taq-聚合酶,100ng黑曲霉基因组DNA,50mM KCl,10mMTris-HCl(pH 8.0),1.5mM MgCl2,250nM各种dNTP以及以上描述的两种引物各100pM的100微升总体积中进行。
扩增反应在Perkin-Elmer Cetus DNA Termal 480中进行,并且由在94℃下3分钟的1个循环,接着在94℃下1分钟,55℃下30秒钟和72℃下1分钟的25个循环组成。PCR反应产生一个长度约1.1kb的DNA片段。采用分子生物学领域已知的标准方法经凝胶电泳分离这一片段,纯化,克隆进载体pCR°II(Invitrogen公司)并测序。所形成的质粒称为pJaL197。
克隆米曲霉丝氨酸蛋白酶pepC
将米曲霉IFO 4177基因组DNA的Southern印迹与pJaL197克隆的32P标记的EcoRI DNA片段(含有黑曲霉pepC基因)杂交。用下列限制酶切割基因组DNA:EcoRI,BamHI,XhoI以及HindIII。杂交在65℃下在包含下列物质的溶液中进行16小时:10xDenhart,5xSSC,0.02MEDTA,1%SDS,0.15mg/ml polyA以及0.05mg/ml酵母tRNA。在杂交之后,在65℃下用2xSSC,0.1%SDS洗涤滤膜两次,并置于X-光胶片上。在4个消化物的每一个中,该探针杂交到单一大小的片段上,表明pepC基因以单拷贝存在于米曲霉IFO 4177中。
构建米曲霉基因组DNA的部分文库(包含具有4.5-5.5kb大小的BamHI片段),并连接到载体pIC19H上。放射性标记上述黑曲霉pepC基因克隆,并用于探查部分米曲霉BamHI基因组文库。如上所述进行杂交。筛选约4000个大肠杆菌菌落,获得4个阳性克隆。经限制酶消化分析,显示这4个克隆是相同的。这些克隆中的一个被成为pJaL235(图5),具有4.6kb插入片段,用限制性作图和Southern印迹进一步分析该克隆。该克隆显示pepC基因位于2.9kb BamHI/Sall片段中。这一2.9kbBamHI/SalI片段的测序揭示存在一个495个氨基酸长的开放读框,其由具有指示内含子剪接的共有序列的2个内含子所间断。米曲霉pepC基因的序列在SEQ ID No.3中显示。
构建侧翼有重复序列的米曲霉基因
采用以下两种引物经PCR在质粒pSO2上扩增一个432bp的片段,所说的引物是引物#7659(5’-GGAGGAAGATCT
CTCTGGTACTCT TCGATCTC) 和引物#7656(5’-GGAGGAGAATTCAAGCTT
CTTCTA CATCACAGTTTGAAAGC),在前者中,核苷酸序列的3’末端相应于pSO2中的7-26位(下划线),5’末端用来帮助克隆(含有BglII限制性内切核酸酶位点),在后者中,核苷酸序列的3’末端相应于pSO2中的385-407位(下划线),5’末端用来帮助克隆(含有EcoRI和HindIII限制性内切核酸酶位点)。以BglII和EcoRI消化该片段,经凝胶电泳分离,纯化并克隆到pSO2中的相应位点,形成质粒pJaL335(其构建在图6中概述)。
构建米曲霉pepC断裂质粒
以PvuI消化质粒pJaL235,并且用Klenow聚合酶处理,以制造平端,然后以HindIII消化。经凝胶电泳分离2.6kb片段,并纯化。将2.6kb片段克隆进以SmaI和HindIII消化的pUC12中,产生质粒pJaL308。
以SmaI消化质粒pJaL308,并且按照制造商的说明用细菌碱性磷酸酶处理(以除去5’磷酸基),用苯酚提取并沉淀。
以HindIII消化质粒pSO2,并且用Klenow聚合酶处理,以制造平端。经凝胶电泳分离编码米曲霉pyrG基因的3.8kb片段,并纯化。
将两种片段混合在一起并连接。在转化大肠杆菌后,经小质粒制品的限制性酶切分析鉴别携带有正确质粒的菌落。pJaL363的构建在图7中说明。
质粒pJaL3包含pUC12载体,该载体含有携带侧翼有EcoRI位点和HindIII的pepC基因的片段,其中的pepC由编码米曲霉pyrG基因的3.8kbDNA间断。
以HindIII消化质粒pJaL335,并且用Klenow聚合酶处理,以制造平端。经凝胶电泳分离编码米曲霉pyrG基因的3.5kb片段,并纯化。将该片段克隆进pJaL308的SmaI限制酶切位点。pJaLz的构建在图8中概述。该质粒包含pUC12载体,该载体含有携带侧翼有EcoRI位点和HindIII的pepC基因的片段,其中的pepC由编码米曲霉pyrG基因的3.8kb DNA间断。
转化米曲霉菌株HowB101
用HindIII和EcoRI将15μg断裂质粒之一完全消化,通过在凝胶上展开小份试样检查消化的完全程度,剩下的DNA用苯酚提取,沉淀并重悬于10μl无菌水中。
经原生质体方法(Christensen等,生物技术(1988)6:1419-1422)进行米曲霉HowB101宿主菌株的转化。典型地,将米曲霉菌丝体在富含营养物的培养液中生长。通过过滤从培养液分离菌丝体。将酶制剂Novozyme(Novo Nordisk)添加到菌丝体中,所说的菌丝体在渗透稳定缓冲液中,例如用磷酸钠缓冲至pH5.0的1.2M MgSO4中。在搅拌下于37℃温育悬液60分钟。经mira布过滤原生质体,以除去菌丝体碎片。收获原生质体,并用STC(1.2M山梨醇,10mM CaCl2,10mM Tris-HClpH7.5)洗涤两次。最终将原生质体重悬于200-1000μl STC中。
为了转化,将5μg DNA加至100μl原生质体悬液中,然后加入200μlPEG溶液(60%PEG4000,10mM CaCl2,10mM Tris-HCI pH7.5),在室温下温育混合物20分钟。收获原生质体,以1.2M山梨醇洗涤两次。最后将原生质体重悬于200ml 1.2M山梨醇中,平板接种到选择性平板(基本培养基+10g/l Bacto-琼脂(Difco)),并于37℃培养。在37℃培养3-4天后,稳定的转化体显示出旺盛的生长和孢子形成性菌落。
鉴别pepC缺失菌株
将稳定的菌落个体孢子划线培养在新鲜的基本平板上。选择单一菌落,并再划线培养,产生纯的培养物。将其用于接种10ml液体YPM培养基(1%酵母提取物,1%蛋白胨,2%麦芽糖)。于30℃下在180rpm下振荡18小时之后,将菌丝体收集到滤纸上。然后将菌丝体转移到2ml微量管中,并且冻结干燥。在冷冻干燥之后,从单个菌丝体制备DNA。在试管中用研杵将菌丝体研磨成细小粉末。经涡旋将这种粉末重悬于0.5ml50mM EDTA(pH8.0),0.2%SDS,1μl DEP中。将其在65℃温育20分钟。然后加入0.1ml5M KAc pH6.5,混合并在冰上温育5分钟。通过在20,000rpm下离心5分钟从DNA溶液分离出细胞碎片。用0.3ml异丙醇沉淀0.4ml上清液,并在20,000rpm下离心10分钟。将DNA沉淀再溶解于100μl包含0.1mg/ml RNA酶A的无菌TE缓冲液中。
以EcoRI消化每一种DNA3μg,经琼脂糖凝胶电泳分级分离,将其转移到Immobilan-N滤膜上,用包含部分pepC蛋白酶基因的pJaL335的1.5kb 32P标记的NcoI DNA片段探查。携带有断裂pepC的菌株易于识别,因为3.6kb上的野生型带在转化体中变换成7.4kb带。
将断裂的米曲霉pepC菌株制成pyrG-菌株,通过选择5-氟-乳清酸抗性(pyrG突变体的表型特征)自发突变体进行选择。由于是pyrG突变体,菌株的生长需要尿苷。用wt pyrG基因转化该菌株,通过选择在没有尿苷下的生长能力进行选择。
实施例3 构建米曲霉areAΔ菌株
areAΔ菌株的构建如下:克隆米曲霉araA基因。用携带pyrG基因(在araA基因上游和下游的DNA片段之间插入)的质粒转化也缺损pepC或pepE或pepC加pepE的pyrG-菌株。araA的编码区不存在于质粒上。就它们在缺少尿苷和存在氯酸盐的情况下的生长能力选择转化体。这一双选择法选择功能性pyrG基因和araA-两者。最终经Southern分析筛选由这种选择方法获得的菌株,以鉴别其中染色体araA基因由pyrG基因取代的那些。
克隆araA基因
通过与构巢曲霉araA基因(B.Kudla等,EMBO J.9:1355-1364(1990))交叉杂交克隆米曲霉araA基因。通过用SauIIIA部分消化染色体DNA制备米曲霉IFO 4177基因组文库,并将所获得的DNA片段克隆进载体1GEM-II(从Promega获得)。于37℃在40%甲酰胺中完成文库与构巢曲霉araA基因的交叉杂交。分离杂交1的克隆,并从中将片段亚克隆进载体pBluescript SK+(从Stratagene获得),给出图9中所示的质粒pSK5与pSK9。克隆的基因能够补充构巢曲霉araA突变体,证明它确实是米曲霉araA的同系物。对此克隆的5643bp测序,米曲霉与构巢曲霉araA基因序列的比较显示它们是高度同源的。米曲霉araA基因序列在SEQID No.5中显示。
构建araA缺失质粒
为了从米曲霉染色体缺失araA基因,构建了质粒pToC266。pToC266含有源于araA基因上游的2.1kb DNA片段(从pSK5分离)和源于araA基因下游的1.4kb DNA片段(从pSK9分离)。在基因组中这两个片段被约3.2kb分离,编码区位于基因的这一部分中。将pJers4的米曲霉pyrG基因插入araA上游和下游DNA片段之间。pToC266的构建在图10a和10b中说明。pToC266有一个唯一的EcoRI位点,在用于转化之前,经采用这一限制酶切割线性化。
选择米曲霉araA菌株
用线性化的pToC266转化也缺损pepC或pepE或pepC加pepE的pyrG-菌株。在基本平板(Cove,生物化学生物物理学报(1966)113:51-56)上选择转化体,该平板上含有作为氮源的谷氨酰胺,作为碳源的葡萄糖。在相同类型的平板上再分离转化体两次,然后在不同的氮源上进行生长试验。在谷氨酰胺上生长良好(但在硝酸盐,铵或尿素上则不然)的转化体预期是缺失araA的。这一缺失由Southern分析确认。
实施例4 构建pMT1606
构建了一种质粒,该质粒包含在米曲霉TAKA-淀粉酶启动子之后插入的Streptomyces hygroscopius的bar基因(C.J.Thompson等,EMBO J.6:2519-2523(1987))和其后的包含黑曲霉gla基因的转录终止子和聚腺苷酸化信号的片段。
质粒pMT1606可以用于选择米曲霉的glufosinate抗性转化体。通过从质粒pBP1T(B.Straubinger等,真菌遗传学新闻(1992)39:82-83)分离bar基因,并将它克隆进真菌表达质粒p775(在EP公开号0 098 993 Al中描述)构建pMT1606。图11说明了pMT1606的构建。
实施例5 在米曲霉(areAΔ,pepEΔ,pepC-)中产生凝乳酶
通过与pMT1606的共转化,用质粒pToC56(图12)转化米曲霉areAΔ,pepEΔ,pep-C菌株,所述质粒是哺乳动物凝乳酶的真菌表达质粒。质粒pToC56的构建在EP公开号0 98 993中描述。
在包含10mM铵和1mg/ml glufosinate的基本培养基上选择转化体,并且通过产生凝乳酶的能力筛选pToC56的存在。在摇瓶中于30℃下培养转化体4天,摇瓶中具有含麦芽糖糊精和谷氨酰胺的基本培养基。经SDS-Page和Western印迹分析上清液中的凝乳酶含量。
实施例6 在米曲霉中产生PepC
构建pepC表达质粒。用AatII和NsiI消化质粒pJaL235,并且用Klenow聚合酶处理以制造平端。经凝胶电泳分离1.7kb片段,并纯化。将1.7kb片段克隆进用SmaI消化的pIC19H,给出pJaL365。
用BamHI和XhoI消化质粒pJaL365,经凝胶电泳分离1.7kb片段,并纯化。将1.7kb片段克隆进用BamHI和XhoI消化的pToC68,给出pJaL368(图13a和13b)。
通过与pToC90的共转化,用质粒pJaL368转化米曲霉菌株,该质粒是蛋白酶PepC的真菌表达质粒。
在包含10mM乙酰胺的基本培养基上选择转化体,并且通过产生蛋白酶PepC的能力筛选pJaL368的存在。
实施例7 超量表达pepE
构建了称为pToC338的质粒,其携带有融合进米曲霉TAKA-淀粉酶启动子的pepE基因。图14a和14b描述这一构建过程。
将pToC299的EcoRI/SalI片段(含有pepE的大多数的编码区和约430bp的3’非翻译区)与具有下列序列的合成DNA片段一起克隆进EcoRI/BamHI切割的pUC19中:
8681 GATCCACCATGAAG
8747 GTGGTACTTCAGCT
用BamHI/EcoRI切割所形成的称为pToC334的质粒,分离含有pepE的整个结构基因的片段,其具有融合在紧靠起始密码子的上游的BamHI位点。约430bp非翻译3’序列也存在于该片段中。将该片段与质粒p775的大约1.1kb SalI/BamHI片段(含有米曲霉TAKA-淀粉酶启动子)一道克隆进EcoRI/SalI切割的pUC19中。所形成的质粒命名为pToC338。
利用标准方法(例如在EP 0 098 993 Al中描述的),将pToC338与pToC90(含有构巢曲霉乙酰胺酶(amdS)基因)共转化进米曲霉JaL125(米曲霉alp阴性菌株,在丹麦专利申请0354/96中描述)中。通过它们利用作为唯一氮源的乙酰胺的能力选择转化体。通过分生孢子再分离11个转化体。在10ml YPM(具有2%麦芽糖的YP)中于30℃下发酵培养转化体3天,通过SDS-page分离发酵液。一种转化体产生与由pepE基因编码的蛋白质大小相同的蛋白质,蛋白酶活性测量证实来源于这一转化体的培养液与宿主菌株JaL125相比,在pH5.5下具有对酪蛋白的较高活性。纯化所说的蛋白质,N端测序显示它确实是pepE基因编码的蛋白质。该分泌蛋白质的N端是:
gly*-arg-his-asp-val-leu-val-asp-asn-phe-leu-asn-ala-gln-tyr-
phe-ser-glu-ile-glu-ile-gly-thr-pro-pro-gln-lys-phe-lys
*这一残基也可以是赖氨酸。
这证实了PepE蛋白酶的表达。
序列表
(1)一般信息:
(i)申请人:
(A)名称:Novo Nordisk A/S
(B)街道:Novo Aile
(C)城市:Bagsvaerd
(E)国家:丹麦
(F)邮区代码(ZIP):DK-2880
(G)电话:+45 4444 8888
(H)传真:+45 4449 3256
(ii)发明名称:新的微生物
(iii)序列数:12
(iv)计算机可读形式:
(A)介质类型:软盘
(B)计算机:IBM PC兼容机
(C)操作系统:PC-DOS/MS-DOS
(D)软件:PatentIn Release#1.0,版本#1.30(EPO)
(2)SEQ ID NO:1的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:2454个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA(基因组)
(iii)假设:否
(iv)反义:否
(vi)原始来源:
(A)生物体:米曲霉
(ix)特征:
(A)名称/关键词:外显子
(B)位置:603..701
(ix)特征:
(A)名称/关键词:内含子
(B)位置:702..791
(ix)特征:
(A)名称/关键词:外显子
(B)位置:792..942
(ix)特征:
(A)名称/关键词:内含子
(B)位置:943..1001
(ix)特征:
(A)名称/关键词:外显子
(B)位置:1002..1656
(ix)特征:
(A)名称/关键词:内含子
(B)位置:1657..1713
(ix)特征:
(A)名称/关键词:外显子
(B)位置:1714..2001
(ix)特征:
(A)名称/关键词:CDS
(B)位置:连接处(603-701,792-942,1002-1656,1714-2001)
(ix)特征:
(A)名称/关键词:mat_肽
(B)位置:603..2001
(xi)序列描述:SEQ ID NO:1:
GCGCGGATGT ACATTGTAGG TACATGGATA GTATGTACTG TATATACCGT CATTTAGTAA 60
GGCAACTAAC TAACTTATCA GCCTAGCTCC CGAGACGGCC TTACATCATC CGCAGCGGCA 120
ATCAGCTCCA CACCCTTGGA TAGTGATAAG AGACACAAGG AGTTCTGAGT ATGGTATTAT 180
AAGTGCAGTG AGTTGGGATG AAACAGAGAG ATAGAGGGAA TACTCCTATT TATCAATGAA 240
CGTATACAGA CATACCCCAG CAGCGTTCCT GGCGGTATTG TAAAAGGGCC GTACCTTGGA 300
GATCAAGTGA TGAGACACCC GTGATGCAGG AACTCCACTT CAATCCAATG ACGCATCGAG 360
TTGCTCCCTG ATTGGTTGAT ACGCAGGTCG CTCCGCAACC GGTCCGCATC ACCTCACTTC 420
CCTCCCCCAG ACCTGGAGGT ACCTCTCCCG TCCTTCTCTC CCTCTCCATC CCATCATCTA 480
TCCCTCTCCA GACCCTGATT GTATTTCATC ATTCCTATCG TCCCATATTA ATAGAGTATT 540
GCTAGTTTTC TTTTGATTTC GTCTGTTGAG GTGCTGCTTT TTTGTCGCCG TTGTCGCCCA 600
CC ATG AAG TCG ACC TTG GTT ACG GCC TCT GTG CTG TTG GGC TGT GCT 647
Met Lys Ser Thr Leu Val Thr Ala Ser Val Leu Leu Gly Cys Ala
1 5 10 15
TCC GCC GAG GTT CAC AAG CTG AAG CTC AAC AAG GTG CCC GTG TCC GAG 695
Ser Ala Glu Val His Lys Leu Lys Leu Asn Lys Val Pro Val Ser Glu
20 25 30
CAA TTT GTGAGTAGAC CTTACTATTC CGGCCATGAA AATATTCATC TACCCATCTG 751
Gln Phe
AAAGCTTGTC GGGACGAATT TCTGACTAAA TCGTATCCAG AAC TTG CAC AAC ATC 806
Asn Leu His Asn Ile
GAC ACC CAT GTG CAG GCT CTC GGC CAG AAG TAC ATG GGA ATC CGT CCC 854
Asp Thr His Val Gln Ala Leu Gly Gln Lys Tyr Met Gly Ile Arg Pro
40 45 50
AAC ATC AAG CAA GAT CTT CTC AAT GAG AAC CCG ATT AAC GAT ATG GGA 902
Asn Ile Lys Gln Asp Leu Leu Asn Glu Asn Pro Ile Asn Asp Met Gly
55 60 65 70
CGT CAT GAT GTC CTT GTT GAC AAC TTC CTG AAT GCA CAA T 942
Arg His Asp Val Leu Val Asp Asn Phe Leu Asn Ala Gln
75 80
GTACGAAACC CTAGTAATAC TTGAAGGGGG GCTCCAACTT ACGCGTAGAT TCTCTAAAG AC 1003
Tyr
TTC TCC GAA ATC GAG ATC GGT ACT CCT CCA CAG AAG TTC AAG GTG GTC 1051
Phe Ser Glu Ile Glu Ile Gly Thr Pro Pro Gln Lys Phe Lys Val Val
85 90 95 100
CTT GAC ACT GGC AGC TCA AAC CTA TGG GTG CCC TCT TCG GAG TGT GGT 1099
Leu Asp Thr Gly Ser Ser Asn Leu Trp Val Pro Ser Ser Glu Cys Gly
105 110 115
TCT ATC GCC TGC TAT TTG CAT AAC AAG TAC GAC TCA TCC TCG TCC TCC 1147
Ser Ile Ala Cys Tyr Leu His Asn Lys Tyr Asp Ser Ser Ser Ser Ser
120 125 130
ACG TAC CAG AAG AAT GGC AGC GAA TTT GCC ATC AAG TAC GGC TCT GGT 1195
Thr Tyr Gln Lys Asn Gly Ser Glu Phe Ala Ile Lys Tyr Gly Ser Gly
135 140 145
AGC CTG AGT GGT TTT GTT TCT CAG GAT ACT CTC AAG ATC GGT GAC CTG 1243
Ser Leu Ser Gly Phe Val Ser Gln Asp Thr Leu Lys Ile Gly Asp Leu
150 155 160
AAG GTG AAG GAT CAG CTG TTC GCC GAG GCT ACT AGT GAG CCC GGC CTT 1291
Lys Val Lys Asp Gln Leu Phe Ala Glu Ala Thr Ser Glu Pro Gly Leu
165 170 175 180
GCT TTT GCC TTT GGC CGC TTT GAT GGT ATC CTT GGG TTG GGA TTT GAC 1339
Ala Phe Ala Phe Gly Arg Phe Asp Gly Ile Leu Gly Leu Gly Phe Asp
185 190 195
ACA ATT TCC GTC AAC AAG ATT CCT CCA CCC TTC TAT AGC ATG CTC GAC 1387
Thr Ile Ser Val Asn Lys Ile Pro Pro Pro Phe Tyr Ser Met Leu Asp
200 205 210
CAG GGC CTC CTC GAC GAG CCA GTC TTT GCT TTC TAC CTT GGA GAC ACT 1435
Gln Gly Leu Leu Asp Glu Pro Val Phe Ala Phe Tyr Leu Gly Asp Thr
215 220 225
AAC AAG GAA GGT GAT GAC TCC GTA GCG ACA TTC GGC GGT GTT GAC AAG 1483
Asn Lys Glu Gly Asp Asp Ser Val Ala Thr Phe Gly Gly Val Asp Lys
230 235 240
GAT CAC TAC ACC GGC GAG TTG GTC AAG ATT CCC CTT CGC CGC AAG GCC 1531
Asp His Tyr Thr Gly Glu Leu Val Lys Ile Pro Leu Arg Arg Lys Ala
245 250 255 260
TAC TGG GAG GTT GAC CTT GAT GCT ATC GCC CTT GGC GAT AGC GTT GCT 1579
Tyr Trp Glu Val Asp Leu Asp Ala Ile Ala Leu Gly Asp Ser Val Ala
265 270 275
GAA CTC GAT AAC ACC GGT GTC ATT CTG GAT ACC GGC ACT TCC CTT ATC 1627
Glu Leu Asp Asn Thr Gly Val Ile Leu Asp Thr Gly Thr Ser Leu Ile
280 285 290
GCC TTG GCC ACC ACC CTT GCC GAG CTT AT GTAAGTCAAG CCAGTGTACT 1676
Ala Leu Ala Thr Thr Leu Ala Glu Leu Ile
295 300
GTGCATGTCT GTCATACTCT TACTAACTAT TCTGAAG T AAC AAG GAA ATC GGT 1729
Asn Lys Glu Ile Gly
305
GCC AAG AAG GGC TTC ACC GGC CAA TAC TCG GTT GAC TGT GAC AAG CGC 1777
Ala Lys Lys Gly Phe Thr Gly Gln Tyr Ser Val Asp Cys Asp Lys Arg
310 315 320
GAT TCC TTG CCT GAC CTC ACC TTC ACC CTG AGC GGA TAC AAC TTC ACC 1825
Asp Ser Leu Pro Asp Leu Thr Phe Thr Leu Ser Gly Tyr Asn Phe Thr
325 330 335
ATT GGT CCC TAC GAC TAC ACT CTT GAA GTC CAG GGA TCT TGC ATC AGC 1873
Ile Gly Pro Tyr Asp Tyr Thr Leu Glu Val Gln Gly Ser Cys Ile Ser
340 345 350 355
GCC TTC ATG GGC ATG GAC TTC CCT GAA CCC GTT GGC CCC TTG GCC ATC 1921
Ala Phe Met Gly Met Asp Phe Pro Glu Pro Val Gly Pro Leu Ala Ile
360 365 370
CTG GGT GAC GCG TTC CTC AGG AAG TGG TAC AGT GTG TAC GAC CTC GCC 1969
Leu Gly Asp Ala Phe Leu Arg Lys Trp Tyr Ser Val Tyr Asp Leu Ala
375 380 385
AAC GGT GCT GTT GGC CTG GCC AAG GCT AAG TAACCAAGTA ATCTACCATG 2019
Asn Gly Ala Val Gly Leu Ala Lys Ala Lys
390 395
CTATGTTCTT ATTGGTTGCT TGTGTATGTG AGACAATGGT ACATGATAGC CTGCCTCGGT 2079
AGTTGGTTGG CCTTTTTCTG TTACGGGAAA TCGGCAAAGC CTTGTTTTCG CTTATGACCT 2139
CTATCCTGTT TGTTATTGAT ATTTTGTGTG ACTCAGTGAG CCACTGGCTA TGCTCTAATG 2199
ACATTCATTG GATGCCGATA GTTCTATATA CATTGCGATT TTAACGCGTA TCTTTGATCT 2259
ATCGGTACAA TGATTCCCTA CTAAAGGTAG CCCAACTAGA CAACTATGCC TACGACCTCT 2319
CTACATTCTT CATAGCTCCG TGTGGAGTCC GTCTCATACA ACCTCGAGCA ACCTGCAGTT 2379
CTTTGGTTAA CACAGACCAC ACCTTAAAAC GGCACGATCC ATTCGAATAG ACAAGCCCTC 2439
TTAATATTTG AATTC 2454
(2)SEQ ID NO:2的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:397个氨基酸
(B)类型:氨基酸
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:蛋白质
(xi)序列描述:SEQ ID NO:2:
Met Lys Ser Thr Leu Val Thr Ala Ser Val Leu Leu Gly Cys Ala Ser
1 5 10 15
Ala Glu Val His Lys Leu Lys Leu Asn Lys Val Pro Val Ser Glu Gln
20 25 30
Phe Asn Leu His Asn Ile Asp Thr His Val Gln Ala Leu Gly Gln Lys
35 40 45
Tyr Met Gly Ile Arg Pro Asn Ile Lys Gln Asp Leu Leu Asn Glu Asn
50 55 60
Pro Ile Asn Asp Met Gly Arg His Asp Val Leu Val Asp Asn Phe Leu
65 70 75 80
Asn Ala Gln Tyr Phe Ser Glu Ile Glu Ile Gly Thr Pro Pro Gln Lys
85 90 95
Phe Lys Val Val Leu Asp Thr Gly Ser Ser Asn Leu Trp Val Pro Ser
100 105 110
Ser Glu Cys Gly Ser Ile Ala Cys Tyr Leu His Asn Lys Tyr Asp Ser
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Thr Tyr Gln Lys Asn Gly Ser Glu Phe Ala Ile Lys
130 135 140
Tyr Gly Ser Gly Ser Leu Ser Gly Phe Val Ser Gln Asp Thr Leu Lys
145 150 155 160
Ile Gly Asp Leu Lys Val Lys Asp Gln Leu Phe Ala Glu Ala Thr Ser
165 170 175
Glu Pro Gly Leu Ala Phe Ala Phe Gly Arg Phe Asp Gly Ile Leu Gly
180 185 190
Leu Gly Phe Asp Thr Ile Ser Val Asn Lys Ile Pro Pro Pro Phe Tyr
195 200 205
Ser Met Leu Asp Gln Gly Leu Leu Asp Glu Pro Val Phe Ala Phe Tyr
210 215 220
Leu Gly Asp Thr Asn Lys Glu Gly Asp Asp Ser Val Ala Thr Phe Gly
225 230 235 240
Gly Val Asp Lys Asp His Tyr Thr Gly Glu Leu Val Lys Ile Pro Leu
245 250 255
Arg Arg Lys Ala Tyr Trp Glu Val Asp Leu Asp Ala Ile Ala Leu Gly
260 265 270
Asp Ser Val Ala Glu Leu Asp Asn Thr Gly Val Ile Leu Asp Thr Gly
275 280 285
Thr Ser Leu Ile Ala Leu Ala Thr Thr Leu Ala Glu Leu Ile Asn Lys
290 295 300
Glu Ile Gly Ala Lys Lys Gly Phe Thr Gly Gln Tyr Ser Val Asp Cys
305 310 315 320
Asp Lys Arg Asp Ser Leu Pro Asp Leu Thr Phe Thr Leu Ser Gly Tyr
325 330 335
Asn Phe Thr Ile Gly Pro Tyr Asp Tyr Thr Leu Glu Val Gln Gly Ser
340 345 350
Cys Ile Ser Ala Phe Met Gly Met Asp Phe Pro Glu Pro Val Gly Pro
355 360 365
Leu Ala Ile Leu Gly Asp Ala Phe Leu Arg Lys Trp Tyr Ser Val Tyr
370 375 380
Asp Leu Ala Asn Gly Ala Val Gly Leu Ala Lys Ala Lys
385 390 395
(2)SEQ ID NO:3的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:3224个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA(基因组)
(iii)假设:否
(iv)反义:否
(vi)原始来源:
(A)生物体:米曲霉
(ix)特征:
(A)名称/关键词:外显子
(B)位置:388..756
(ix)特征:
(A)名称/关键词:内含子
(B)位置:757..817
(ix)特征:
(A)名称/关键词:外显子
(B)位置:818..1753
(ix)特征:
(A)名称/关键词:内含子
(B)位置:1754..1814
(ix)特征:
(A)名称/关键词:外显子
(B)位置:1815..1997
(ix)特征:
(A)名称/关键词:mat_肽
(B)位置:388..1997
(ix)特征:
(A)名称/关键词:CDS
(B)位置:连接处(388..756,818..1753,1815..1997)
(xi)序列描述:SEQ ID NO:3:
GGATCCATTA CCCTCTTACC GCCATACCCC AGGTCTTGCG ACCGCGCTAA TCGGGAGCGA 60
TCGACGCGCG GCACCTCCTC AGTAAAGCTG TGTCATCATT GTAAATTACC GTATCCCGGT 120
TGCATCATCC TCCGCTGCCC TTGCCTGCTT GGGGGATCGA CCTATTAAGC CCAGCTATCT 180
TACACCTGCT CCCATCCTCC TCTTCTCCAA CTCCTCATCC ATCCTTCCTC CTCCTTCTTC 240
CTTTTAACCC CCCCAACTCA GCATCGTTCC ATCCTCCCAT CTTTCCTTTC TTTTTACCTC 300
AAATCTCCAT CTGTATTCTT TCCTCTTAGA ACTCTTCCTT TCCCCCCTTC TGTACCTTGT 360
GTTTAGACGT CACTCTTGTT GCCCATC ATG AGA GGC ATC CTC GGC CTT TCC 411
Met Arg Gly Ile Leu Gly Leu Ser
1 5
CTG CTG CCA CTA CTA GCA GCG GCC TCC CCC GTT GCT GTT GAC TCC ATC 459
Leu Leu Pro Leu Leu Ala Ala Ala Ser Pro Val Ala Val Asp Ser Ile
10 15 20
CAC AAC GGA GCG GCT CCC ATT CTT TCG GCC TCA AAT GCC AAA GAG GTT 507
His Asn Gly Ala Ala Pro Ile Leu Ser Ala Ser Asn Ala Lys Glu Val
25 30 35 40
CCA GAC TCT TAC ATT GTC GTC TTC AAG AAG CAT GTT TCC GCT GAA ACG 555
Pro Asp Ser Tyr Ile Val Val Phe Lys Lys His Val Ser Ala Glu Thr
45 50 55
GCT GCT GCT CAT CAC ACC TGG GTG CAG GAC ATC CAC GAT TCG ATG ACT 603
Ala Ala Ala His His Thr Trp Val Gln Asp Ile His Asp Ser Met Thr
60 65 70
GGA CGC ATC GAC CTG AAG AAG CGC TCT CTT TTT GGT TTC AGT GAT GAC 651
Gly Arg Ile Asp Leu Lys Lys Arg Ser Leu Phe Gly Phe Ser Asp Asp
75 80 85
CTT TAC CTC GGT CTC AAG AAC ACC TTC GAT ATC GCC GGG TCC CTA GCG 699
Leu Tyr Leu Gly Leu Lys Asn Thr Phe Asp Ile Ala Gly Ser Leu Ala
90 95 100
GGC TAC TCC GGA CAT TTC CAT GAG GAT GTG ATC GAG CAG GTC CGG AGA 747
Gly Tyr Ser Gly His Phe His Glu Asp Val Ile Glu Gln Val Arg Arg
105 110 115 120
CAT CCT GAT GTAGGTTCCC CCCTCGGCCC ACCCGTTTTT GTAGAGCCCT 796
His Pro Asp
TGGTCTAACT TGATTTTCAA G GTT GAA TAC ATC GAG AAA GAC ACC GAA GTC 847
Val Glu Tyr Ile Glu Lys Asp Thr Glu Val
125 130
CAC ACC ATG GAG GAG ACA ACC GAG AAG AAT GCT CCC TGG GGC TTG GCT 895
His Thr Met Glu Glu Thr Thr Glu Lys Asn Ala Pro Trp Gly Leu Ala
135 140 145
CGT ATC TCT CAC CGT GAC AGC CTC TCG TTC GGT ACC TTT AAC AAG TAC 943
Arg Ile Ser His Arg Asp Ser Leu Ser Phe Gly Thr Phe Asn Lys Tyr
150 155 160 165
CTG TAT GCT TCG GAA GGC GGT GAG GGT GTC GAT GCT TAT ACT ATT GAC 991
Leu Tyr Ala Ser Glu Gly Gly Glu Gly Val Asp Ala Tyr Thr Ile Asp
170 175 180
ACT GGT ATC AAC ATT GAG CAT GTC GAT TTC GAG GAT CGA GCA CAC TGG 1039
Thr Gly Ile Asn Ile Glu His Val Asp Phe Glu Asp Arg Ala His Trp
185 190 195
GGA AAG ACC ATC CCT AGC AAT GAT GAG GAT GCG GAT GGC AAC GGA CAC 1087
Gly Lys Thr Ile Pro Ser Asn Asp Glu Asp Ala Asp Gly Asn Gly His
200 205 210
GGA ACT CAC TGC TCC GGA ACC ATT GCT GGT AAG AAG TAC GGT GTT GCC 1135
Gly Thr His Cys Ser Gly Thr Ile Ala Gly Lys Lys Tyr Gly Val Ala
215 220 225
AAG AAG GCC AAC ATC TAT GCC GTC AAG GTC TTG AGG TCC AGC GGT TCT 1183
Lys Lys Ala Asn Ile Tyr Ala Val Lys Val Leu Arg Ser Ser Gly Ser
230 235 240 245
GGC ACT ATG TCC GAT GTC GTT CTG GGT GTC GAG TGG GCC GTC CAG TCC 1231
Gly Thr Met Ser Asp Val Val Leu Gly Val Glu Trp Ala Val Gln Ser
250 255 260
CAC CTC AAG AAG GCT AAG GAC GCC AAA GAT GCC AAG GTC AAG GGT TTC 1279
His Leu Lys Lys Ala Lys Asp Ala Lys Asp Ala Lys Val Lys Gly Phe
265 270 275
AAG GGC AGC GTT GCC AAC ATG AGT CTT GGT GGT GCC AAG TCC AGG ACC 1327
Lys Gly Ser Val Ala Asn Met Ser Leu Gly Gly Ala Lys Ser Arg Thr
280 285 290
CTT GAG GCT GCT GTC AAT GCT GGT GTT GAG GCT GGT CTT CAC TTC GCC 1375
Leu Glu Ala Ala Val Asn Ala Gly Val Glu Ala Gly Leu His Phe Ala
295 300 305
GTT GCT GCT GGT AAC GAC AAT GCC GAT GCC TGC AAC TAC TCC CCT GCT 1423
Val Ala Ala Gly Asn Asp Asn Ala Asp Ala Cys Asn Tyr Ser Pro Ala
310 315 320 325
GCC GCT GAG AAT GCC ATC ACT GTC GGT GCC TCG ACC CTT CAG GAT GAG 1471
Ala Ala Glu Asn Ala Ile Thr Val Gly Ala Ser Thr Leu Gln Asp Glu
330 335 340
CGT GCT TAC TTC TCC AAC TAC GGA AAG TGC ACT GAC ATC TTT GCC CCG 1519
Arg Ala Tyr Phe Ser Asn Tyr Gly Lys Cys Thr Asp Ile Phe Ala Pro
345 350 355
GGT CCC AAC ATT CTT TCC ACC TGG ACT GGC AGC AAG CAC GCT GTC AAC 1567
Gly Pro Asn Ile Leu Ser Thr Trp Thr Gly Ser Lys His Ala Val Asn
360 365 370
ACC ATC TCT GGA ACC TCT ATG GCT TCT CCT CAC ATT GCT GGT CTG CTG 1615
Thr Ile Ser Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro His Ile Ala Gly Leu Leu
375 380 385
GCC TAC TTC GTT TCT CTG CAG CCT GCT CAG GAC TCT GCT TTC GCT GTC 1663
Ala Tyr Phe Val Ser Leu Gln Pro Ala Gln Asp Ser Ala Phe Ala Val
390 395 400 405
GAT GAG CTT ACT CCT GCC AAG CTC AAG AAG GAT ATC ATC TCC ATC GCC 1711
Asp Glu Leu Thr Pro Ala Lys Leu Lys Lys Asp Ile Ile Ser Ile Ala
410 415 420
ACC CAG GGT GCC CTT ACT GAT ATC CCA TCT GAC ACC CCC AAC 1753
Thr Gln Gly Ala Leu Thr Asp Ile Pro Ser Asp Thr Pro Asn
425 430 435
GTAAGTTATA TTATCCATTT TGGTATAATG AAACAGAAAG TGGCTAACTG TTTTATTCTA 1813
G CTT CTC GCC TGG AAC GGC GGT GGT GCC GAC AAC TAC ACC CAG ATT 1859
Leu Leu Ala Trp Asn Gly Gly Gly Ala Asp Asn Tyr Thr Gln Ile
440 445 450
GTC GCC AAG GGT GGA TAC AAG GCC GGC AGT GAC AAC CTT AAG GAC CGC 1907
Val Ala Lys Gly Gly Tyr Lys Ala Gly Ser Asp Asn Leu Lys Asp Arg
455 460 465
TTT GAC GGA CTA GTC AAC AAG GCC GAG AAG TTG CTC GCT GAG GAG CTT 1955
Phe Asp Gly Leu Val Asn Lys Ala Glu Lys Leu Leu Ala Glu Glu Leu
470 475 480
GGA GCT ATT TAC AGT GAG ATC CAG GGT GCT GTT GTT GCA TAG 1997
Gly Ala Ile Tyr Ser Glu Ile Gln Gly Ala Val Val Ala *
485 490 495
ATGCAAGACA AGACTTGATT TAGAGTGACG TAACTAGTTT CGTTTATGGC AGGGTATGGG 2057
AATTGGCTAA CCGAACACTG GCGCTGGTAT TTGTTTTTGC TGCTGCTTTT TGGTAACACG 2117
GAGAAGCCGA TGCATTGACT GCATTGGGTA CATTATCCTG ACATGGTTTA CCTGGTCTTT 2177
CATTATTATT ATAGCATACA TGTCCACAAC AATCTTTGAC ATCCTATCTA GAGATACATG 2237
TGCTTGCTTT TAACAGACTG CCAAATCAAT TATGCGACTG TTCTGCACAG ATAATCGTGG 2297
CTTGGTTTGA AGGCTGCCAT AAAGTCTAAC GCTGGCTACC AATTAGGTAG GAGTGTCCCC 2357
TTCCTGCCAG GTTGCTCCAG TCGTAGAAGT AGACTGATAT ATTGAAGATT GCCCATATAC 2417
CATGGACGCT CGTCTTATTC TACATCATAT ATGTCACTCC TAGTGACCAT ATAGACATGC 2477
TAACCATTGC ACAACCCCCC ACAGGTTCAA TCCAACCCAT GACCCCCTCT CATCTTCTGT 2537
TGTATTTTCA GGTTCTAGAT TTGCATACAT ACTACCCATC ATCGGAAGAC GGGTGAGGAG 2597
GCAGATGACC CGACATTATA TTTATTAATT GCTTAGGATG TTTCAACAAC ATTAAAAGTA 2657
TATCAATAAG CTTTTCCAGT TTATATTTAC TACCTAAGAT TACGGCATAT AGTGTATTCT 2717
GTGTGCGTAA GAGGTCGCCC TTAAATGGAA ACAGTTCGCG GTTGGAGATA TATATTTGTA 2777
GTGTTCAGGC GGAACGAGTA AAAAAAAAAA AAAATGAGAA GCTGGTGATA TTAACTCCGA 2837
TGTTTATCTT ACATATACCA ATGGATGTAG TCTCATTATA ACGCTTTCTC TGTAGTTTGG 2897
TTGTCATAGA ACTGAATGAC AGGTAAGTGT GTATGTATGT ACAGTACGCA CGGGGGGCCA 2957
TGTGGTCAAC CACACCCAAT GGGCGGTCTT GTCACTTTCC GGACTGGAAA TGAAACGTTC 3017
CATGGAAGAA ATCTGGATGA TTACCTTGAG TACGAGAGAA CTATGGTTGC CGGTAATGGG 3077
TGATTGCCAC AATCATCAGT TCGGTTGAGG CGTTCAACAT CTACGGTACG TTCAGTCACA 3137
TGAATCTGGG AATTCGGGCC TGGTATGCTG GTTTTCGCAA GAGATCCACC CGGCGTGTGC 3197
CAGGTATGCT ACATTTTCTC AGTCGAC 3224
(2)SEQ ID NO:4的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:496个氨基酸
(B)类型:氨基酸
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:蛋白质
(xi)序列描述:SEQ ID NO:4:
Met Arg Gly Ile Leu Gly Leu Ser Leu Leu Pro Leu Leu Ala Ala Ala
1 5 10 15
Ser Pro Val Ala Val Asp Ser Ile His Asn Gly Ala Ala Pro Ile Leu
20 25 30
Ser Ala Ser Asn Ala Lys Glu Val Pro Asp Ser Tyr Ile Val Val Phe
35 40 45
Lys Lys His Val Ser Ala Glu Thr Ala Ala Ala His His Thr Trp Val
50 55 60
Gln Asp Ile His Asp Ser Met Thr Gly Arg Ile Asp Leu Lys Lys Arg
65 70 75 80
Ser Leu Phe Gly Phe Ser Asp Asp Leu Tyr Leu Gly Leu Lys Asn Thr
85 90 95
Phe Asp Ile Ala Gly Ser Leu Ala Gly Tyr Ser Gly His Phe His Glu
100 105 110
Asp Val Ile Glu Gln Val Arg Arg His Pro Asp Val Glu Tyr Ile Glu
115 120 125
Lys Asp Thr Glu Val His Thr Met Glu Glu Thr Thr Glu Lys Asn Ala
130 135 140
Pro Trp Gly Leu Ala Arg Ile Ser His Arg Asp Ser Leu Ser Phe Gly
145 150 155 160
Thr Phe Asn Lys Tyr Leu Tyr Ala Ser Glu Gly Gly Glu Gly Val Asp
165 170 175
Ala Tyr Thr Ile Asp Thr Gly Ile Asn Ile Glu His Val Asp Phe Glu
180 185 190
Asp Arg Ala His Trp Gly Lys Thr Ile Pro Ser Asn Asp Glu Asp Ala
195 200 205
Asp Gly Asn Gly His Gly Thr His Cys Ser Gly Thr Ile Ala Gly Lys
210 215 220
Lys Tyr Gly Val Ala Lys Lys Ala Asn Ile Tyr Ala Val Lys Val Leu
225 230 235 240
Arg Ser Ser Gly Ser Gly Thr Met Ser Asp Val Val Leu Gly Val Glu
245 250 255
Trp Ala Val Gln Ser His Leu Lys Lys Ala Lys Asp Ala Lys Asp Ala
260 265 270
Lys Val Lys Gly Phe Lys Gly Ser Val Ala Asn Met Ser Leu Gly Gly
275 280 285
Ala Lys Ser Arg Thr Leu Glu Ala Ala Val Asn Ala Gly Val Glu Ala
290 295 300
Gly Leu His Phe Ala Val Ala Ala Gly Asn Asp Asn Ala Asp Ala Cys
305 310 315 320
Asn Tyr Ser Pro Ala Ala Ala Glu Asn Ala Ile Thr Val Gly Ala Ser
325 330 335
Thr Leu Gln Asp Glu Arg Ala Tyr Phe Ser Asn Tyr Gly Lys Cys Thr
340 345 350
Asp Ile Phe Ala Pro Gly Pro Asn Ile Leu Ser Thr Trp Thr Gly Ser
355 360 365
Lys His Ala Val Asn Thr Ile Ser Gly Thr Ser Met Ala Ser Pro His
370 375 380
Ile Ala Gly Leu Leu Ala Tyr Phe Val Ser Leu Gln Pro Ala Gln Asp
385 390 395 400
Ser Ala Phe Ala Val Asp Glu Leu Thr Pro Ala Lys Leu Lys Lys Asp
405 410 415
Ile Ile Ser Ile Ala Thr Gln Gly Ala Leu Thr Asp Ile Pro Ser Asp
420 425 430
Thr Pro Asn Leu Leu Ala Trp Asn Gly Gly Gly Ala Asp Asn Tyr Thr
435 440 445
Gln Ile Val Ala Lys Gly Gly Tyr Lys Ala Gly Ser Asp Asn Leu Lys
450 455 460
Asp Arg Phe Asp Gly Leu Val Asn Lys Ala Glu Lys Leu Leu Ala Glu
465 470 475 480
Glu Leu Gly Ala Ile Tyr Ser Glu Ile Gln Gly Ala Val Val Ala *
485 490 495
(2)SEQ ID NO:5的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:5643个碱基对
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA(基因组)
(iii)假设:否
(iii)反义:否
(vi)原始来源:
(A)生物体:米曲霉
(B)菌株:IFO4177
(ix)特征:
(A)名称/关键词:内含子
(B)位置:2701..2769
(ix)特征:
(A)名称/关键词:CDS
(B)位置:连接处(2282..2700,2770..4949)
(xi)序列描述:SEQ ID NO:5:
AAGCTTCGTC CTCGCATCTC GGCCGGGTGA GTAAGGTATG GTATTATTCA TGAAGGGATC 60
TCGTTGGTTA CCGTTGTCTA TCCCTAAACA AAGGATTCAA GAGAACAACT CGGAATGCTC 120
CCTCCGCTTA AACCCCTTGA CTCACTGATG GTGTATGTAC TATGGGTACG ACGTTCGGGA 180
TGTGGACTAC CAACCAGAGA GTGATTAGAG AGTCCGGGTT CTCAGTCCAT GATTTTTGCA 240
TCTTTGAAAC AGACGATGCG GAGCGGTCAT TGGCGGAGTT TACTCCCAAA TACGGCCGAA 300
CGGGGTACTT TAAGTGGAAT CTCCGATTTT GGATCTAAGC TCATGAAGGA AAAGTACTAC 360
TAATGCGTAC CTGTGCCTAA TGTTAGTGCT AGTTCGTCTG TTGCATTTTA CCCGTCGGTT 420
AAGACGAATG GATCCGTTCA GGTTTTAAAA TAACTATCTA TGAAATATTT TAGATTTCCC 480
GACATAGTGG TTGGGATGTC TCGATTAACA CTAGGTACAT CAGGCTCAAT TGATTTTGGT 540
TTTAACGAAA CATGATATAG GTCAGGGTCG TGGACCACCC TCCGCCAGGG ATCAGGGGAC 600
GGTTACATGC GAAGGATTCT GATTATATTC ATGATTATGT CAAGCCTTTT CTCTCGTGTG 660
AAGAGGAGCA GAGAATCCGT ACGGGTTTAA TTTAATTTAG CGCCCTGCAG CTTCGAGAAC 720
ATCCCCAGCA ACGTTAAAAA CCACGAGCTA AAATGGGTCG CCACCGGAAG CACTCGAGTC 780
GAGAGATCGG TCGGCTCAGT ATTCGTAATA CCTGCGTTCC AGACGGTTTT GGTCGTTGGT 840
TTCACTCAGG GAACTTAATT CCAGCGGGAC CCAATATAAT TTGAATGATT CATGATACAT 900
CCATTCGTTT GAACCGATCC TGCAAGAGTT CTGTCTGATT TGGTCAACAT AGTTTTCCTC 960
TGGGGGAGAC TGGGGAAGAG TCAACACAAT GGTCAGGGAG AGAAGAATGA AAGCTCTCGC 1020
AAGTGGATGA TCATGCTACG TACTGTAGGA ATAAAATTAA TTAATGCGAG GCTGCAAGTA 1080
TCCCTGCGCC GATTTTCTCT TCTTACGGCG GGAACCAAAA AATGTGACGC TGTGATTTTC 1140
TGGAAAAGGT AAGGATGTTT AGTTTCCCAG GATTATTACT GGTTCCGTAT GTGTATGTGT 1200
ATGGATATCA TTCCGTATGG ATACGCCCGT TTCCTCCGCC CAGAACCAGT CCGTCATCCA 1260
TCCTCCACTC TTTCTTCTCT TAGAGCCTTT CCACCTCTCT TCACTTTCTT TTTCTTTCCC 1320
CCCTCCCTCT TTGCTTTCCC TCTCCCAGTA TTATTCTTAT ATTATCGGTT TGACCGTCGC 1380
CTCAGTATCG GCCCCCCGTG AATCACTTTT CGTTTCTCTT GTATTTTACT TTCCTATCTG 1440
GGATTGCTCC TCGATTAGCA GCTCTACTTC ATTCGGCCAT GTGCGTCTAG AGGGTCTAGC 1500
CCCTCTCTCT CTTTGCACTG ACTGTCAGCC ATACCATAGT ATCATCCCGG AATTAAGAAA 1560
AAAAAAGAAA TTATTCTACC TCCGATCTGG ACAAATTATA ACCAGGAGAA AATCAAGCGA 1620
AAGAGGGGCA AAGGAGGAGA CACCATTAAA ACTGGGTCTG GTTTGATTCA TGACATACAT 1680
TCGTCGTCTT GAATTTCAAT AGGTACGGAC TGATGCATTC CACTCGAGCC TTTTTAGCTG 1740
CGTGTCCGTC TCCAATCGCA CTTCTTTTCT TATTTCCTTG TGGGATAAAT TGATTATTTA 1800
CCGTTTCGTT TTCTCTATAT TGCGGTGGTG GTGCGACCCA TCCAACTATT ATTATTATAA 1860
TTGGAATTTG ATTTGGATTT TGATTCCTGT GACGGATCTC AGACCAAGTG CCTAAACTAT 1920
AACTGACTTG GACCCCCTTC AGATCCTAGC TTCCCGATTC TTTTCCACCA CTGCTGCATC 1980
CTCTTCCTGC ACGCAGCGTT CGTTTAGGGC GGGTAGACTG GAATTTATTC CTTGCGCCAC 2040
GGACCAATCG CTCCCTCGAC GCTCTCATTC CTGCGTCGAG CTCTTTTTCC CTCGACTCTC 2100
ATTGCTTGCT GGGCTGGTTC TTGAACCTCT TCAATCGTCC TTATCTCTTT CCCCCCATCC 2160
GGCCTGTGAT TCCTATCTTT CCTTTTTTTC TTCCCTTTCT TGTTTGATCC CCCCTCCTCC 2220
CCGTCTTATC GCCTACTATC GTGATCCCCG CCCTTCCCAA TAAAGAGTAG GGCGTGTGAA 2280
C ATG TCC GGG TTA ACC CTC GGG CGA GGC CCT GGG GGC GTG CGA CCG 2326
Met Ser Gly Leu Thr Leu Gly Arg Gly Pro Gly Gly Val Arg Pro
1 5 10 15
ACT CAA ACC GCA ACT TTT ACC ACC CAC CAC CCG TCC GCC GAT GCT GAC 2374
Thr Gln Thr Ala Thr Phe Thr Thr His His Pro Ser Ala Asp Ala Asp
20 25 30
CGC TCC TCC AAC AAC CTC CCC CCT ACC TCC TCG CAG CTG TCC GAT GAC 2422
Arg Ser Ser Asn Asn Leu Pro Pro Thr Ser Ser Gln Leu Ser Asp Asp
35 40 45
TTT TCT TTC GGT TCC CCT CTG AGC CCC GCC GAC TCA CAG GCC CAT GAC 2470
Phe Ser Phe Gly Ser Pro Leu Ser Pro Ala Asp Ser Gln Ala His Asp
50 55 60
GGC CTA CTT CAG GAC TCC CTC TTC CCT GAA TGG GGG TCT GGT GCG CCT 2518
Gly Leu Leu Gln Asp Ser Leu Phe Pro Glu Trp Gly Ser Gly Ala Pro
65 70 75
CGA CCC GGC ATT GAC AGT CCG GAT GAG ATG CAG AGG CAA GAT CCG CTA 2566
Arg Pro Gly Ile Asp Ser Pro Asp Glu Met Gln Arg Gln Asp Pro Leu
80 85 90 95
GCG ACT CAA ATA TGG AAG CTC TAT TCT AGG ACC AAG GCC CAG TTG CCC 2614
Ala Thr Gln Ile Trp Lys Leu Tyr Ser Arg Thr Lys Ala Gln Leu Pro
100 105 110
AAC CAG GAG CGT ATG GAA AAC CTG ACC TGG CGG ATG ATG GCG ATG AGT 2662
Asn Gln Glu Arg Met Glu Asn Leu Thr Trp Arg Met Met Ala Met Ser
115 120 125
TTG AAA CGT AAG GAG CGG GAA CGT GCT CAA CAG TCC AT GTAGGTGTTC 2710
Leu Lys Arg Lys Glu Arg Glu Arg Ala Gln Gln Ser Met
130 135 140
TCCCTCTGTA GAGGAACGGC TGGACCCGCT CATCATTAAT TTTTTTTTTG TCTGTGAAG G 2770
TTT CCT GCG AGA CGC GGT AGC GCT GGC CCC AGT GGT ATC GCT CAA CTG 2818
Phe Pro Ala Arg Arg Gly Ser Ala Gly Pro Ser Gly Ile Ala Gln Leu
145 150 155
CGC ATT TCC GAC CCG CCC GTT GCC ACC GGT AAC CCT CAG TCA ACC GAC 2866
Arg Ile Ser Asp Pro Pro Val Ala Thr Gly Asn Pro Gln Ser Thr Asp
160 165 170
CTG ACC GCC GAC CCT ATG AAC CTC GAC GAT TTC ATC GTG CCC TTC GAA 2914
Leu Thr Ala Asp Pro Met Asn Leu Asp Asp Phe Ile Val Pro Phe Glu
175 180 185
TCT CCT TCG GAC CAC CCC TCG CCC AGT GCC GTC AAG ATT TCC GAC TCC 2962
Ser Pro Ser Asp His Pro Ser Pro Ser Ala Val Lys Ile Ser Asp Ser
190 195 200
ACG GCG TCC GCG GCC ATT CCC ATC AAG TCC CGG AAA GAC CAG CTG AGA 3010
Thr Ala Ser Ala Ala Ile Pro Ile Lys Ser Arg Lys Asp Gln Leu Arg
205 210 215 220
GAT TCT ACC CCG GTG CCG GCC TCG TTC CAC CAT CCG GCT CAG GAT CAA 3058
Asp Ser Thr Pro Val Pro Ala Ser Phe His His Pro Ala Gln Asp Gln
225 230 235
CGG AAG AAC AGT GAA TTT GGC TAC GTC CCC CGT CGC GTG CGC AAG ACG 3106
Arg Lys Asn Ser Glu Phe Gly Tyr Val Pro Arg Arg Val Arg Lys Thr
240 245 250
AGT ATC GAC GAG CGT CAA TTT TTC TCA CTG CAG GTG CCG ACC CGA AAG 3154
Ser Ile Asp Glu Arg Gln Phe Phe Ser Leu Gln Val Pro Thr Arg Lys
255 260 265
CGA CCG GCC GAA TCC TCG CCC CAG GTA CCC CCC GTT TCC AAC TCG ATG 3202
Arg Pro Ala Glu Ser Ser Pro Gln Val Pro Pro Val Ser Asn Ser Met
270 275 280
TTG GCC CAC GAT CCG GAC CTC GCT TCC GGC GTG CCC GAT TAT GCC TTG 3250
Leu Ala His Asp Pro Asp Leu Ala Ser Gly Val Pro Asp Tyr Ala Leu
285 290 295 300
GAC GCC CCG TCC TCG GCC TTT GGC TTC CAT CAG GGT AAC CAC CAT CCG 3298
Asp Ala Pro Ser Ser Ala Phe Gly Phe His Gln Gly Asn His His Pro
305 310 315
GTC AAT CAT CAC AAC CAC ACC TCC CCC GGG GCA CCG TTT GGC TTG GAT 3346
Val Asn His His Asn His Thr Ser Pro Gly Ala Pro Phe Gly Leu Asp
320 325 330
ACG TTC GGC CTG GGA GAT GAT CCA ATC TTG CCC TCC GCG GGC CCC TAC 3394
Thr Phe Gly Leu Gly Asp Asp Pro Ile Leu Pro Ser Ala Gly Pro Tyr
335 340 345
CAG TCG CAA TTC ACC TTC TCA CCC AGC GAG TCT CCG ATG GCC TCC GGT 3442
Gln Ser Gln Phe Thr Phe Ser Pro Ser Glu Ser Pro Met Ala Ser Gly
350 355 360
CAT CCG TTT GCG AAC CTC TAT TCG CAT ACC CCG GTG GCT TCG TCC CTC 3490
His Pro Phe Ala Asn Leu Tyr Ser His Thr Pro Val Ala Ser Ser Leu
365 370 375 380
AAC TCG ACG GAT TTC TTC TCT CCA CCG CCA TCA GGC TAC CAG TCC ACG 3538
Asn Ser Thr Asp Phe Phe Ser Pro Pro Pro Ser Gly Tyr Gln Ser Thr
385 390 395
GCA TCC ACG CCG CAG CCC ACC TAC GAC GGG GAC CAT TCC GTT TAT TTC 3586
Ala Ser Thr Pro Gln Pro Thr Tyr Asp Gly Asp His Ser Val Tyr Phe
400 405 410
GAT ATG CCG TCG GGC GAC GCG CGC ACC CAG CGC CGC ATT CCG AAC TAT 3634
Asp Met Pro Ser Gly Asp Ala Arg Thr Gln Arg Arg Ile Pro Asn Tyr
415 420 425
ATT TCG CAT CGG TCC AAC TTG TCT GCT TCG CTG CAG CCT CGG TAT ATG 3682
Ile Ser His Arg Ser Asn Leu Ser Ala Ser Leu Gln Pro Arg Tyr Met
430 435 440
TTC AAC CAG AAC AAC CAT GAA CAG GCC AGT TCG TCG ACG GTG CAT TCG 3730
Phe Asn Gln Asn Asn His Glu Gln Ala Ser Ser Ser Thr Val His Ser
445 450 455 460
CCG AGC TAC CCC ATT CCC CAG CCG CAA CAT GTG GAC CCC ACT CAG GTG 3778
Pro Ser Tyr Pro Ile Pro Gln Pro Gln His Val Asp Pro Thr Gln Val
465 470 475
TTG AAC GCC ACC AAT TAC TCG ACC GGC AAC TCC CAC CAT ACC GGC GCC 3826
Leu Asn Ala Thr Asn Tyr Ser Thr Gly Asn Ser His His Thr Gly Ala
480 485 490
ATG TTT TCA TTT GGA GCC GAT TCA GAT AAC GAG GAT GAC GAT GGT CAT 3874
Met Phe Ser Phe Gly Ala Asp Ser Asp Asn Glu Asp Asp Asp Gly His
495 500 505
CAG CTG TCC GAG CGG GCT GGT CTG GCG ATG CCG ACT GAA TAT GGG GAC 3922
Gln Leu Ser Glu Arg Ala Gly Leu Ala Met Pro Thr Glu Tyr Gly Asp
510 515 520
GAG GAC GGG TTC TCG TCG GGC ATG CAG TGG GAT GGG CAG TTC CCG GGC 3970
Glu Asp Gly Phe Ser Ser Gly Met Gln Trp Asp Gly Gln Phe Pro Gly
525 530 535 540
TCC TTC CAT TCG CTG CCG GGC TTT GGC CCT CAA CAT CGC AAG CAT GTT 4018
Ser Phe His Ser Leu Pro Gly Phe Gly Pro Gln His Arg Lys His Val
545 550 555
ACC ATC GGG TCC ACG GAC ATG ATG GAC ACC CCC GAG GAG TGG AAT CAC 4066
Thr Ile Gly Ser Thr Asp Met Met Asp Thr Pro Glu Glu Trp Asn His
560 565 570
GGT GGC AGT TTG GGT CGG ACT CAT GGG TCG GTG GCT TCG GTC AGT GAG 4114
Gly Gly Ser Leu Gly Arg Thr His Gly Ser Val Ala Ser Val Ser Glu
575 580 585
GTG CGC AAC CGA GAG CAG GAC CCT CGC CGG CAG AAG ATT GCC CGC ACC 4162
Val Arg Asn Arg Glu Gln Asp Pro Arg Arg Gln Lys Ile Ala Arg Thr
590 595 600
ACG TCC ACC CCC AAT ACG GCC CAG CTG TTG CGC CAA AGC ATG CAC TCT 4210
Thr Ser Thr Pro Asn Thr Ala Gln Leu Leu Arg Gln Ser Met His Ser
605 610 615 620
AAT AAC AAT ACG TCT CAT ACC TCC CCT AAT ACG CCG CCC GAG TCC GCC 4258
Asn Asn Asn Thr Ser His Thr Ser Pro Asn Thr Pro Pro Glu Ser Ala
625 630 635
CTG AGC AGC GCA GTT CCG TCC CGC CCG GCC AGT CCC GGG GGC AGC AAG 4306
Leu Ser Ser Ala Val Pro Ser Arg Pro Ala Ser Pro Gly Gly Ser Lys
640 645 650
AAC GGC GAC CAA GGC AGC AAC GGA CCG ACC ACC TGC ACG AAC TGC TTC 4354
Asn Gly Asp Gln Gly Ser Asn Gly Pro Thr Thr Cys Thr Asn Cys Phe
655 660 665
ACT CAA ACC ACT CCG CTG TGG CGT CGG AAC CCA GAG GGC CAG CCA CTG 4402
Thr Gln Thr Thr Pro Leu Trp Arg Arg Asn Pro Glu Gly Gln Pro Leu
670 675 680
TGC AAT GCC TGC GGG TTG TTT TTG AAA TTG CAC GGT GTC GTG CGC CCT 4450
Cys Asn Ala Cys Gly Leu Phe Leu Lys Leu His Gly Val Val Arg Pro
685 690 695 700
CTG TCC CTG AAA ACG GAC GTT ATC AAA AAG CGC AAC CGT AGC AGT GCC 4498
Leu Ser Leu Lys Thr Asp Val Ile Lys Lys Arg Asn Arg Ser Ser Ala
705 710 715
AAC AGC TTG GCG GTT GGG ACC TCC CGT GCG TCG AAG AAG ACA GCC CGC 4546
Asn Ser Leu Ala Val Gly Thr Sar Arg Ala Ser Lys Lys Thr Ala Arg
720 725 730
AAG AAC TCG GTG CAG CAA GCA TCC GTC ACG ACT CCG ACA TCA AGC CGC 4594
Lys Asn Ser Val Gln Gln Ala Ser Val Thr Thr Pro Thr Ser Ser Arg
735 740 745
GCT CAG AAT GGG ACT TCC TTC GAA TCC CCG CCC GCC GGC TTT AGT GCT 4642
Ala Gln Asn Gly Thr Ser Phe Glu Ser Pro Pro Ala Gly Phe Ser Ala
750 755 760
GCC GCG GGA CGG TCG AAT GGG GTG GTA CCC ATT GCC GCC GCT CCT CCG 4690
Ala Ala Gly Arg Ser Asn Gly Val Val Pro Ile Ala Ala Ala Pro Pro
765 770 775 780
AAG GCA GCT CCC TCC GCA GCC GCC TCC CCT AGC ACG GGC CAG ACC CGC 4738
Lys Ala Ala Pro Ser Ala Ala Ala Ser Pro Ser Thr Gly Gln Thr Arg
785 790 795
AAC CCG ATC CAG GCT GCC CCG AAA CGT CAA CGA CGG CTG GAA AAG GCC 4786
Asn Pro Ile Gln Ala Ala Pro Lys Arg Gln Arg Arg Leu Glu Lys Ala
800 805 810
ACG GAG ATG GAA ACG GAC GAG GCT AAC AAG TCC GCG GGA GGC CGA TCC 4834
Thr Glu Met Glu Thr Asp Glu Ala Asn Lys Ser Ala Gly Gly Arg Ser
815 820 825
AAG GTG GTG CCT CTG GCA CCC GCC ATG CCA CCG GCA GCA GCC AAT CCG 4882
Lys Val Val Pro Leu Ala Pro Ala Met Pro Pro Ala Ala Ala Asn Pro
830 835 840
GCG AAC CAT AGT ATT GCC GGA GGC CAA GGG GCT AGT CAG GAA TGG GAG 4930
Ala Asn His Ser Ile Ala Gly Gly Gln Gly Ala Ser Gln Glu Trp Glu
845 850 855 860
TGG TTG ACG ATG AGT CTGTAATGGC CGCGCTTACC TCTCTACTTC TCTACACTCG 4985
Trp Leu Thr Met Ser Leu
865
TTTCTTAATA TCTTTCTTGA ACCCCCCCTT ATATTTTCCC ACCGTTGATG CTACGCCATG 5045
ACCGATAGAG ATGATGAATA CTGCAACCAA TGGAATCTCG CTAGACGAGA GGTGTTAGAT 5105
GACGTGGCCC GCGATGCACT TAATGAGATA CGAGGAGGTG CAATGCGTTG GTTACGCTAG 5165
TTTAATGGTA ACATGACGAG GGATATTCGC TCTGTTATTT CGGGCTTTGA TCTGTTTCAG 5225
TCTGCGATTT AACAGCGACT GATCCTCTGC TGTGACAATA CACAGCTTGT CTTGTGGTTC 5285
TGTTGTGGCT TTCTGTTTGT TTGGCTGATT TGATTTATGC TTGATACAAT CGCGTCTGTC 5345
CGGACCCCGG CCTTTGTTTT GTTTTCAGTT CTGATTCTTC ACTGTTTCTG ATTCTCTTGT 5405
TCATGTTTTT GATTTGTTCA AGGCTTGGGG CCGGGCAGAA GTGCGCATCT CTGCTTTGTG 5465
TTTTCCGTCA CCGTGCATAG ACGCTGTATG TATATGCTAC AGCAAGATTC TACTTATCCA 5525
GTCTGAGCCT GTATTCATTG AAGTGTAGCC AGCTGTCGAA TGAGCTTTTT AACGATATTG 5585
TTTTGTTGAG TAGTCAACAA GTAGTATCTG TATATTCCGG AGTCTAAGTA AGACACTT 5643
(2)SEQ ID NO:6的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:866个氨基酸
(B)类型:氨基酸
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:蛋白质
(xi)序列描述:SEQ ID NO:6:
Met Ser Gly Leu Thr Leu Gly Arg Gly Pro Gly Gly Val Arg Pro Thr
1 5 10 15
Gln Thr Ala Thr Phe Thr Thr His His Pro Ser Ala Asp Ala Asp Arg
20 25 30
Ser Ser Asn Asn Leu Pro Pro Thr Ser Ser Gln Leu Ser Asp Asp Phe
35 40 45
Ser Phe Gly Ser Pro Leu Ser Pro Ala Asp Ser Gln Ala His Asp Gly
50 55 60
Leu Leu Gln Asp Ser Leu Phe Pro Glu Trp Gly Ser Gly Ala Pro Arg
65 70 75 80
Pro Gly Ile Asp Ser Pro Asp Glu Met Gln Arg Gln Asp Pro Leu Ala
85 90 95
Thr Gln Ile Trp Lys Leu Tyr Ser Arg Thr Lys Ala Gln Leu Pro Asn
100 105 110
Gln Glu Arg Met Glu Asn Leu Thr Trp Arg Met Met Ala Met Ser Leu
115 120 125
Lys Arg Lys Glu Arg Glu Arg Ala Gln Gln Ser Met Phe Pro Ala Arg
130 135 140
Arg Gly Ser Ala Gly Pro Ser Gly Ile Ala Gln Leu Arg Ile Ser Asp
145 150 155 160
Pro Pro Val Ala Thr Gly Asn Pro Gln Ser Thr Asp Leu Thr Ala Asp
165 170 175
Pro Met Asn Leu Asp Asp Phe Ile Val Pro Phe Glu Ser Pro Ser Asp
180 185 190
His Pro Ser Pro Ser Ala Val Lys Ile Ser Asp Ser Thr Ala Ser Ala
195 200 205
Ala Ile Pro Ile Lys Ser Arg Lys Asp Gln Leu Arg Asp Ser Thr Pro
210 215 220
Val Pro Ala Ser Phe His His Pro Ala Gln Asp Gln Arg Lys Asn Ser
225 230 235 240
Glu Phe Gly Tyr Val Pro Arg Arg Val Arg Lys Thr Ser Ile Asp Glu
245 250 255
Arg Gln Phe Phe Ser Leu Gln Val Pro Thr Arg Lys Arg Pro Ala Glu
260 265 270
Ser Ser Pro Gln Val Pro Pro Val Ser Asn Ser Met Leu Ala His Asp
275 280 285
Pro Asp Leu Ala Ser Gly Val Pro Asp Tyr Ala Leu Asp Ala Pro Ser
290 295 300
Ser Ala Phe Gly Phe His Gln Gly Asn His His Pro Val Asn His His
305 310 315 320
Asn His Thr Ser Pro Gly Ala Pro Phe Gly Leu Asp Thr Phe Gly Leu
325 330 335
Gly Asp Asp Pro Ile Leu Pro Ser Ala Gly Pro Tyr Gln Ser Gln Phe
340 345 350
Thr Phe Ser Pro Ser Glu Ser Pro Met Ala Ser Gly His Pro Phe Ala
355 360 365
Asn Leu Tyr Ser His Thr Pro Val Ala Ser Ser Leu Asn Sar Thr Asp
370 375 380
Phe Phe Ser Pro Pro Pro Ser Gly Tyr Gln Ser Thr Ala Ser Thr Pro
385 390 395 400
Gln Pro Thr Tyr Asp Gly Asp His Ser Val Tyr Phe Asp Met Pro Ser
405 410 415
Gly Asp Ala Arg Thr Gln Arg Arg Ile Pro Asn Tyr Ile Ser His Arg
420 425 430
Ser Asn Leu Ser Ala Ser Leu Gln Pro Arg Tyr Met Phe Asn Gln Asn
435 440 445
Asn His Glu Gln Ala Ser Ser Ser Thr Val His Ser Pro Ser Tyr Pro
450 455 460
Ile Pro Gln Pro Gln His Val Asp Pro Thr Gln Val Leu Asn Ala Thr
465 470 475 480
Asn Tyr Ser Thr Gly Asn Ser His His Thr Gly Ala Met Phe Ser Phe
485 490 495
Gly Ala Asp Ser Asp Asn Glu Asp Asp Asp Gly His Gln Leu Ser Glu
500 505 510
Arg Ala Gly Leu Ala Met Pro Thr Glu Tyr Gly Asp Glu Asp Gly Phe
515 520 525
Ser Ser Gly MetGln Trp Asp Gly Gln Phe Pro Gly Ser Phe His Ser
530 535 540
Leu ProGly Phe Gly Pro Gln His Arg Lys His Val Thr Ile Gly Ser
545 550 555 560
Thr Asp Met Met Asp Thr Pro Glu Glu Trp Asn His Gly Gly Ser Leu
565 570 575
Gly Arg Thr His Gly Ser Val Ala Ser Val Ser Glu Val Arg Asn Arg
580 585 590
Glu Gln Asp Pro Arg Arg Gln Lys Ile Ala Arg Thr Thr Ser Thr Pro
595 600 605
Asn Thr Ala Gln Leu Leu Arg Gln Ser Met His Ser Asn Asn Asn Thr
610 615 620
Ser His Thr Ser Pro Asn Thr Pro Pro Glu Ser Ala Leu Ser Ser Ala
625 630 635 640
Val Pro Ser Arg Pro Ala Ser Pro Gly Gly Ser Lys Asn Gly Asp Gln
645 650 655
Gly Ser Asn Gly Pro Thr Thr Cys Thr Asn Cys Phe Thr Gln Thr Thr
660 665 670
Pro Leu Trp Arg Arg Asn Pro Glu Gly Gln Pro Leu Cys Asn Ala Cys
675 680 685
Gly Leu Phe Leu Lys Leu His Gly Val Val Arg Pro Leu Ser Leu Lys
690 695 700
Thr Asp Val Ile Lys Lys Arg Asn Arg Ser Ser Ala Asn Ser Leu Ala
705 710 715 720
Val Gly Thr Ser Arg Ala Ser Lys Lys Thr Ala Arg Lys Asn Ser Val
725 730 735
Gln Gln Ala Ser Val Thr Thr Pro Thr Ser Ser Arg Ala Gln Asn Gly
740 745 750
Thr Ser Phe Glu Ser Pro Pro Ala Gly Phe Ser Ala Ala Ala Gly Arg
755 760 765
Ser Asn Gly Val Val Pro Ile Ala Ala Ala Pro Pro Lys Ala Ala Pro
770 775 780
Ser Ala Ala Ala Ser Pro Ser Thr Gly Gln Thr Arg Asn Pro Ile Gln
785 790 795 800
Ala Ala Pro Lys Arg Gln Arg Arg Leu Glu Lys Ala Thr Glu Met Glu
805 810 815
Thr Asp Glu Ala Asn Lys Ser Ala Gly Gly Arg Ser Lys Val Val Pro
820 825 830
Leu Ala Pro Ala Met Pro Pro Ala Ala Ala Asn Pro Ala Asn His Ser
835 840 845
Ile Ala Gly Gly Gln Gly Ala Ser Gln Glu Trp Glu Trp Leu Thr Met
850 855 860
Ser Leu
865
(2)SEQ ID NO:7的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:27个核苷酸
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA引物19819
(iii)假设:是
(iii)反义:否
(xi)序列描述:SEQ ID NO:7
GAAGATCTGC GCGGATGTAC ATTGTAG 27
(2)SEQ ID NO:8的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:20个核苷酸
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA引物19821
(iii)假设:是
(iii)反义:否
(xi)序列描述:SEQ ID NO:8
TTAGTCAGAA ATTCGTCCCG 20
(2)SEQ ID NO:9的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:30个核苷酸
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA引物19820
(iii)假设:是
(iii)反义:否
(xi)序列描述:SEQ ID NO:9
CCCAAGCTTC ATGCTCGACC AGGGCCTCCT 30
(2)SEQ ID NO:10的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:21个核苷酸
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA引物19818
(iii)假设:是
(iii)反义:否
(xi)序列描述:SEQ ID NO:10
GGTCTGTGTT AACCAAAGAA C 21
(2)SEQ ID NO:11的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:14个核苷酸
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA引物8681
(iii)假设:是
(iii)反义:否
(xi)序列描述:SEQ ID NO:11
GATCCACCAT GAAG 14
(2)SEQ ID NO:12的信息:
(i)序列特征:
(A)长度:14个核苷酸
(B)类型:核酸
(C)链型:单链
(D)拓扑结构:线性
(ii)分子类型:DNA引物8747
(iii)假设:是
(iii)反义:否
(xi)序列描述:SEQ ID NO:12GTGGTACTTC AGCT 14
Claims (29)
1.一种真菌,其中的areA基因已由重组DNA技术修饰,使它不能以提供功能性AreA激活物的方式表达,并且其中的编码胞外蛋白酶PepC和/或PepE的基因已被灭活,使它们不能表达产生功能性蛋白酶。
2.权利要求1的真菌,其中所说的灭活已通过缺失areA、pepC和/或pepE基因获得。
3.权利要求1的真菌,其中所说的灭活已通过缺失areA和pepE基因获得。
4.权利要求1的真菌,其中所说的灭活已通过利用反义技术获得。
5.权利要求1的真菌,其是丝状真菌。
6.权利要求5的真菌,其属于选自下组的属:曲霉属(Aspergillus)、木霉属(Trichoderma)、腐质霉属(Humicola)、假丝酵母属(Candida)、顶孢霉属(Acremonium)、镰刀菌属(Fusarium)以及青霉属(Penicillium)。
7.权利要求6的真菌,其属于选自下组的种:米曲霉(A.oryzae)、黑曲霉(A.niger)、泡盛曲霉(A.awamori)、A.phoenicis、日本曲霉(A.japonicus)、臭曲霉(A.foetidus)、构巢曲霉(A.nidulans)、T.reesei、T.harzianum、H.insolens、H.lanuginosa、禾谷镰孢(F.graminearum)、腐皮镰孢(F.solani)、产黄青霉(P.chrysogenum)。
8.一种产生权利要求1的真菌的方法,其中所说的灭活已通过采用反义技术获得,该方法包括:
i)构建表达质粒,各个这样的质粒导致一种RNA分子的合成,所说的RNA分子互补于从areA基因、pepC基因和/或pepE基因转录的mRNA,
ii)用所说的表达质粒和适当的标记转化所说的宿主真菌,该表达质粒和标记两者在不同的质粒上或者在相同的质粒上,
iii)用所说的标记选择转化体,和
iv)筛选所选择的转化体,以获得显示AreA、PepC和/或PepE产物的合成降低的菌株。
9.一种产生权利要求1的真菌的方法,其中所说的灭活已通过采用反义技术获得,该方法包括:
i)构建表达质粒,各个这样的质粒导致一种RNA分子的合成,所说的RNA分子互补于从areA基因和pepE基因转录的mRNA,
ii)用所说的表达质粒和适当的标记转化所说的宿主真菌,该表达质粒和标记两者在不同的质粒上或者在相同的质粒上,
iii)用所说的标记选择转化体,和
iv)筛选所选择的转化体,以获得显示AreA和PepE产物的合成降低的菌株。
10.一种产生所需蛋白质或肽的方法,其通过在适当的条件下在合适的生长培养基中培养权利要求1的真菌,并回收和纯化所说的所需蛋白质或肽。
11.一种产生所需蛋白质或肽的方法,其通过在适当的条件下在合适的生长培养基中培养权利要求1的真菌,并回收和纯化所说的所需蛋白质或肽,所说的真菌已被转化,使编码所说的所需蛋白质或肽的DNA序列以功能性方式整合进该真菌的基因组中。
12.一种产生所需多肽的方法,该方法包括在适当的生长培养基中培养真菌,并从所说的培养物中回收所说的多肽,所说的真菌携带有一种重组DNA构建体,该构建体能够引起所说的多肽或其前体在所说在真菌中表达,所说的真菌还以比其野生型产生较低量的功能性AreA、PepC和/或PepE为特征。
13.权利要求12的方法,其中所说的真菌已通过一种方法修饰,以比野生型产生较低量的AreA、PepC和/或PepE,所说的修饰方法包括用DNA构建体转化所说的真菌,该DNA构建体在整合进所说真菌基因组中时,能够引起功能性AreA、PepC和/或PepE产量的降低。
14.权利要求12的方法,其中所说的多肽由所说的真菌分泌到胞外基质中。
15.权利要求12的方法,其中所说的真菌比类似真菌产生较高量的所说多肽,这里所说的类似真菌以与所说真菌的野生型类似的产量产生AreA,PepC和/或PepE,所说的类似真菌在所有其它方面与所说的真菌相同。
16.权利要求10-12中任一项的方法,其中所说的蛋白质是一种分泌蛋白质。
17.权利要求10-12中任一项的方法,其中所说的蛋白质或肽是一种酶。
18.权利要求17的方法,其中所说的酶选自包括下列酶的组:蛋白酶、脂肪酶、角质酶、纤维素酶、凝乳酶。
19.权利要求10-12中任一项的方法,其中所说的所需蛋白质或肽是一种有治疗活性的肽或蛋白质。
20.权利要求19的方法,其中所说的有治疗活性的肽或蛋白质选自包括下列物质的组:胰岛素、生长激素、胰高血糖素、促生长素抑制素、干扰素、PDGF、因子VII、因子VIII、尿激酶、tPA、EPO或TPO。
21.一种蛋白质或肽,其是用权利要求10-12中任一项的方法产生的。
22.一种DNA序列,该序列编码米曲霉IFO 4177的pepC基因SEQIDNo.1。
23.一种米曲霉IFO 4177的PepC蛋白酶SEQ ID No.2。
24.一种产生权利要求23的PepC蛋白酶的方法,该方法包括用包含权利要求22的DNA序列的DNA构建体转化宿主,选择能够产生所说的PepC蛋白酶的转化体,在适当的生长培养基中培养所说的转化体,并且从所说的培养物中回收所说的PepC蛋白酶。
25.一种DNA序列,该序列编码米曲霉的pepE基因SEQ ID No.3。
26.一种米曲霉IFO 4177的PepE蛋白酶SEQ ID No.4。
27.一种产生权利要求26的PepE蛋白酶的方法,该方法包括用包含权利要求25的DNA序列的DNA构建体转化宿主,选择能够产生所说的PepE蛋白酶的转化体,在适当的生长培养基中培养所说的转化体,并且从所说的培养物中回收所说的PepE蛋白酶。
28.权利要求24或27的方法,其中所说的宿主是权利要求1的真菌。
29.权利要求24或27的方法,其中所说的宿主是米曲霉,并且其中所说的DNA构建体包含权利要求22或25的DNA序列,其提供编码PepC或PepE蛋白酶之基因的额外拷贝。
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