CN116042840A - 混合型胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备 - Google Patents
混合型胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备 Download PDFInfo
- Publication number
- CN116042840A CN116042840A CN202310345247.6A CN202310345247A CN116042840A CN 116042840 A CN116042840 A CN 116042840A CN 202310345247 A CN202310345247 A CN 202310345247A CN 116042840 A CN116042840 A CN 116042840A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- gastric adenocarcinoma
- mixed
- her2
- patient
- lauren
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- 201000006585 gastric adenocarcinoma Diseases 0.000 title claims abstract description 111
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 title claims abstract description 6
- 101150029707 ERBB2 gene Proteins 0.000 claims abstract description 73
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 claims abstract description 47
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 37
- 238000007901 in situ hybridization Methods 0.000 claims abstract description 16
- 239000000523 sample Substances 0.000 claims description 22
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 claims description 18
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 claims description 16
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims description 14
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 11
- 239000013610 patient sample Substances 0.000 claims description 10
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 3
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 3
- HEVGGTGPGPKZHF-UHFFFAOYSA-N Epilaurene Natural products CC1C(=C)CCC1(C)C1=CC=C(C)C=C1 HEVGGTGPGPKZHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 39
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 18
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 18
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 13
- 238000002509 fluorescent in situ hybridization Methods 0.000 description 12
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 10
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 9
- 230000035945 sensitivity Effects 0.000 description 9
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 8
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 8
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 description 8
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 8
- 238000004422 calculation algorithm Methods 0.000 description 7
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 7
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 7
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 6
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 5
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 5
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 5
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 5
- 208000009956 adenocarcinoma Diseases 0.000 description 4
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 4
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 4
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 3
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 3
- 239000000463 material Substances 0.000 description 3
- 230000000877 morphologic effect Effects 0.000 description 3
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 3
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 3
- 230000007170 pathology Effects 0.000 description 3
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 3
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 3
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 3
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N (+)-Biotin Chemical compound N1C(=O)N[C@@H]2[C@H](CCCCC(=O)O)SC[C@@H]21 YBJHBAHKTGYVGT-ZKWXMUAHSA-N 0.000 description 2
- WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N Formaldehyde Chemical compound O=C WSFSSNUMVMOOMR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000011460 HER2-targeted therapy Methods 0.000 description 2
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 2
- 108020004711 Nucleic Acid Probes Proteins 0.000 description 2
- 102100030086 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Human genes 0.000 description 2
- 230000004791 biological behavior Effects 0.000 description 2
- 239000012472 biological sample Substances 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000004069 differentiation Effects 0.000 description 2
- 239000002853 nucleic acid probe Substances 0.000 description 2
- 230000003287 optical effect Effects 0.000 description 2
- 230000008569 process Effects 0.000 description 2
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 2
- 201000007423 tubular adenocarcinoma Diseases 0.000 description 2
- 208000010507 Adenocarcinoma of Lung Diseases 0.000 description 1
- 108090001008 Avidin Proteins 0.000 description 1
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101100314454 Caenorhabditis elegans tra-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 230000004544 DNA amplification Effects 0.000 description 1
- LTMHDMANZUZIPE-AMTYYWEZSA-N Digoxin Natural products O([C@H]1[C@H](C)O[C@H](O[C@@H]2C[C@@H]3[C@@](C)([C@@H]4[C@H]([C@]5(O)[C@](C)([C@H](O)C4)[C@H](C4=CC(=O)OC4)CC5)CC3)CC2)C[C@@H]1O)[C@H]1O[C@H](C)[C@@H](O[C@H]2O[C@@H](C)[C@H](O)[C@@H](O)C2)[C@@H](O)C1 LTMHDMANZUZIPE-AMTYYWEZSA-N 0.000 description 1
- 101001012157 Homo sapiens Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 1
- 206010058467 Lung neoplasm malignant Diseases 0.000 description 1
- 102000007999 Nuclear Proteins Human genes 0.000 description 1
- 108010089610 Nuclear Proteins Proteins 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 101710100968 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 208000002495 Uterine Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 1
- 125000003277 amino group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 229960002685 biotin Drugs 0.000 description 1
- 235000020958 biotin Nutrition 0.000 description 1
- 239000011616 biotin Substances 0.000 description 1
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 1
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 1
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 1
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 1
- 238000004132 cross linking Methods 0.000 description 1
- 238000013500 data storage Methods 0.000 description 1
- 230000018044 dehydration Effects 0.000 description 1
- 238000006297 dehydration reaction Methods 0.000 description 1
- LTMHDMANZUZIPE-PUGKRICDSA-N digoxin Chemical compound C1[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](C)O[C@H]1O[C@@H]1[C@@H](C)O[C@@H](O[C@@H]2[C@H](O[C@@H](O[C@@H]3C[C@@H]4[C@]([C@@H]5[C@H]([C@]6(CC[C@@H]([C@@]6(C)[C@H](O)C5)C=5COC(=O)C=5)O)CC4)(C)CC3)C[C@@H]2O)C)C[C@@H]1O LTMHDMANZUZIPE-PUGKRICDSA-N 0.000 description 1
- 229960005156 digoxin Drugs 0.000 description 1
- LTMHDMANZUZIPE-UHFFFAOYSA-N digoxine Natural products C1C(O)C(O)C(C)OC1OC1C(C)OC(OC2C(OC(OC3CC4C(C5C(C6(CCC(C6(C)C(O)C5)C=5COC(=O)C=5)O)CC4)(C)CC3)CC2O)C)CC1O LTMHDMANZUZIPE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000008029 eradication Effects 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 239000000835 fiber Substances 0.000 description 1
- GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N fluorescein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 GNBHRKFJIUUOQI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001917 fluorescence detection Methods 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 238000012333 histopathological diagnosis Methods 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 230000000984 immunochemical effect Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 1
- 201000007270 liver cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000014018 liver neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 201000005249 lung adenocarcinoma Diseases 0.000 description 1
- 201000005202 lung cancer Diseases 0.000 description 1
- 208000020816 lung neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000013178 mathematical model Methods 0.000 description 1
- 239000011159 matrix material Substances 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 1
- 238000011227 neoadjuvant chemotherapy Methods 0.000 description 1
- 238000010606 normalization Methods 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000012188 paraffin wax Substances 0.000 description 1
- 229960002087 pertuzumab Drugs 0.000 description 1
- 238000004393 prognosis Methods 0.000 description 1
- 238000011158 quantitative evaluation Methods 0.000 description 1
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 1
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 1
- 210000001581 salivary duct Anatomy 0.000 description 1
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 1
- 238000002626 targeted therapy Methods 0.000 description 1
- 229960000575 trastuzumab Drugs 0.000 description 1
- 206010046766 uterine cancer Diseases 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/112—Disease subtyping, staging or classification
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明属于生物技术领域,具体涉及用于混合型胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备。本发明通过荧光原位杂交技术的方法,检测混合型胃腺癌患者中Her2/CEP17比值,从而鉴定具有肠型特征的混合型(Lauren分型)胃腺癌。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及用于混合型(Lauren分型)胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备。
背景技术
胃腺癌是常见的恶性肿瘤之一,其发病率位居我国消化道肿瘤的第 2 位,病死率占我国恶性肿瘤的第 3 位,仅低于肺癌和肝癌。胃腺癌的诊断与治疗均依赖于病理组织学诊断与明确的分型。修订版的Lauren分型分为肠型、弥漫型、混合型和实性型(实体癌),并且将混合型各成分所占比例定义为≥5%,同时还指出混合型胃腺癌的生物学行为确实与单一形态成分组成的癌有很大不同,发现其患者的生存率明显低于其他三种亚型。2010年WHO分型将胃腺癌分为乳头状型、管状型、黏液型、弥漫型(包括印戒细胞)、混合型和其他少见类型。考虑到肿瘤的分化程度又将乳头状型和管状型分为高、中、低分化腺癌。修订版的Lauren分型和WHO分型各具特点,二者均提出了混合型胃腺癌的概念,但从形态学分析,胃腺癌具有高度异质性,给病理学分型带来极大的困扰,至今对于混合型胃腺癌中各成分所占的比例尚无统一的定义。混合型胃腺癌定义的混乱给这部分胃腺癌的深化研究和临床个体化治疗带来困难。
发明内容
本发明涉及针对Her2/CEP17比值的检测试剂在制备用于对混合型(Lauren分型)胃腺癌患者进行分型的设备中的用途,所述分型包括:
1)在所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者的样品中,通过荧光原位杂交技术确定Her2/CEP17比值;
2)如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型。
另一方面,本发明涉及针对Her2/CEP17比值的检测试剂在制备用于辅助混合型(Lauren分型)胃腺癌患者治疗的设备中的用途,所述辅助混合型(Lauren分型)胃腺癌患者治疗包括:
1)在所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者的样品中,通过荧光原位杂交技术确定Her2/CEP17比值;
2)如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型;
3)混合型(Lauren分型)胃腺癌肠型患者可接受抗Her2治疗。
另一方面,本发明涉及一种对混合型(Lauren分型)胃腺癌患者进行分型的设备,其包括:
1)分析单元,适合于通过荧光原位杂交技术确定所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值;和
2)含数据处理器的评估单元,如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型。
另一方面,本发明涉及一种辅助混合型(Lauren分型)胃腺癌患者治疗的设备,其包括:
1)分析单元,适合于通过荧光原位杂交技术确定所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值;和
2)含数据处理器的评估单元,如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型;混合型(Lauren分型)胃腺癌肠型患者可接受抗Her2治疗。
本发明的产品和方法之前,应理解本发明不限于所述的特定产品或方法,因而当然可改变。还应理解,本文所用的术语仅用于描述特定实施方案的目的,而不欲具限制性,因为本发明的范围将仅由所附权利要求书限制。
在提供数值范围时,应理解,除非上下文另有明确说明,否则还特定公开介于所述范围的上限和下限之间的每一中间值。介于所述范围中的任何所述值或中间值与所述范围中的任何其它所述值或中间值之间的每一较小范围涵盖在本发明内。这些较小范围的上限和下限可独立地包括在范围中或排除在范围外,并且其中任一界限、无一界限或两个界限包括在较小范围内的每一范围也涵盖在本发明内,受制于所述范围中任何明确排除的界限。在所述范围包括一个或两个界限时,排除那些所包括界限的任一个或两个的范围也包括在本发明中。特别地,“大于”、“小于”理解为不包括本数,“在……之间”理解为包括上限值和下限值。
除非另外定义,否则本文使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。虽然与本文所述类似或等效的任何方法和材料可以用于实施或测试本发明,但现在描述一些潜在和优选的方法和材料。本文所提及的所有公开案通过引用的方式并入本文中以结合所引用的公开案来公开和描述方法和/或材料。应理解,在存在冲突的程度上,本公开取代所并入的公开案的任何公开内容。
本领域技术人员在阅读本公开内容后将显而易见,本文所描述和说明的每一单独的实施方案具有分立成分和特征,在不偏离本发明的范围或精神的情况下,其可容易地与任何其它若干个实施方案的特征分离或组合。可以所述事件的顺序或以逻辑上可能的任何其它顺序进行任何所述方法。
人表皮生长因子受体2(HER2)(又称CD340(分化簇340)、原癌基因Neu、Erbb2(啮齿动物)或ERBB2(人)),是由erbB2基因编码的蛋白。这个癌基因的扩增或过度表达在侵袭性类型的乳腺癌的进展中起着重要作用。也已知erbB2基因的过度表达发生在卵巢癌、胃腺癌、肺腺癌、侵袭性子宫癌和30%的涎腺导管癌中。还确定了在没有过度表达的情况下导致受体不依赖配体的激发的结构改变。
存在许多针对这种突变及其相关疾病的已经批准的以及正在开发的靶向疗法,包括曲妥珠单抗、帕妥珠单抗、玛格妥昔单抗等。
荧光原位杂交(FISH),是利用报告分子(如生物素、地高辛等)标记核酸探针,然后将探针与染色体或DNA纤维切片上的靶DNA杂交,若两者同源互补,即可形成靶DNA与核酸探针的杂交体。此时可利用该报告分子与荧光素标记的特异亲和素之间的免疫化学反应,经荧光检测体系在镜下对待DNA进行定性、定量或相对定位分析。
术语“受试者”、“个体”或“患者”在本文中可互换使用。“受试者”可以是含有表达的遗传物质的生物实体。受试者可以为哺乳动物。该哺乳动物可以为人类。受试者可被诊断出疾病或怀疑处于疾病的高风险下。该疾病可为癌症。该癌症可为胃腺癌。在一些情况下,受试者不一定被诊断出疾病或怀疑处于疾病的高风险下。
术语“样品”指体液样品,分离的细胞样品,或来自组织或器官的样品。可由任意的组织或器官,通过例如活体组织检查(活检)或者手术切取或切除,获取组织或器官样品。
福尔马林固定和石蜡包埋后的组织切片(FFPE),是为了维持细胞核蛋白结构,先用福尔马林固定然后固体石蜡包埋,以便使用超薄切片机切成5-10微米厚的薄片的组织样品(通常是疑似肿瘤组织)。福尔马林与蛋白氨基发生了不可逆交联,保护细胞结构完整性,染色显示组织中肿瘤带来的畸形结构。
术语“分型”是指根据不同的分类标准对疾病类型进行细分。在本文中,以混合型(Lauren分型)胃腺癌(Lauren分型)患者Her2表达(IHC 1+,2+,3+)为研究对象,以修订版Lauren分型为基本框架,参照WHO分型,对混合型中肠型与非肠型表型特征进行准确分型。修订版的Lauren分型分为肠型、弥漫型、混合型和实性型(实体癌),并且将混合型各成分所占比例定义为≥5%,同时还指出混合型胃腺癌的生物学行为确实与单一形态成分组成的癌有很大不同,发现其患者的生存率明显低于其他三种亚型。2010年WHO分型将胃腺癌分为乳头状型、管状型、黏液型、弥漫型(包括印戒细胞)、混合型和其他少见类型。考虑到肿瘤的分化程度又将乳头状型和管状型分为高、中、低分化腺癌。修订版的Lauren分型和WHO分型各具特点,二者均提出了混合型胃腺癌的概念,但至今对于混合型胃腺癌中各成分所占的比例尚无统一的定义。混合型胃腺癌定义的混乱给这部分胃腺癌的深化研究和临床个体化治疗带来困难。
本发明的方法可以对混合型(Lauren分型)胃腺癌患者进行分型,具体包括在所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者的样品中,通过荧光原位杂交技术确定样品中Her2/CEP17比值;如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型。
如本领域技术人员将理解的,这种预测、评估、诊断、鉴定、分型虽然是优选的,但可能不会对100%的被研究的受试者都是正确的。然而,该术语要求能够正确地评估具有统计学意义的部分的受试者,从而将其识别为是否有患病的风险,患病的风险高低以及是否患有胃腺癌。
本发明中临床性能分为灵敏度,特异性,阳性预测值(PPV),阴性预测值(NPV)。
“灵敏度”可用来衡量某种试验检测出有病者的能力,灵敏度是将实际有病的人正确地判定为真阳性的比例。灵敏度=真阳性人数/(真阳性人数+假阴性人数)*100%。
“特异性”是衡量试验正确地判定无病者的能力,特异性是将实际无病的人正确地判定为真阴性的比例。特异性=真阴性人数/(真阴性人数+假阳性人数)*100%。
阳性预测值(PPV)=真阳性人数/(真阳性人数+假阳性人数)*100%。
阴性预测值(NPV)=真阴性人数/(真阴性人数+假阴性人数)*100%。
本发明所述的方法可以以高灵敏度和高特异性中的至少一种对胃腺癌进行分型。例如,本文提供的设备可以以至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或约100%的灵敏度对胃腺癌进行Her2表达阳性的鉴定或对胃腺癌进行分型。
本发明所述的方法可以以至少50%、至少55%、至少60%、至少65%、至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或约100%的特异性对胃腺癌进行分型。
在一些情况下,本发明所述的方法以至少70%、至少75%、至少80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或约100%的灵敏度和特异性对胃腺癌进行分型。
术语“治疗”或“处理”在本文中可互换使用。这些术语可指用于获得有益或所需结果的方法,该有益或所需结果包括但不限于治疗益处和/或预防益处。治疗益处可指正在治疗的潜在病症的根除或减轻。另外,治疗益处也可如下实现:与该潜在病症有关的一种或多种生理学症状得到根除或减轻,使得在受试者中观察到改善,尽管该受试者可能仍患有该潜在病症。预防益处包括延缓、防止或消除疾病或状况的出现,延缓或消除疾病或状况的症状的发作,减慢、中止或逆转疾病或状况的进展,或上述的任意组合。为了获得预防益处,处于发展成特定疾病的风险下的受试者或报告有疾病的一种或多种生理学症状的受试者可接受治疗,即使可能尚未作出该疾病的诊断。
本发明的方法可以辅助混合型(Lauren分型)胃腺癌患者治疗,具体包括在所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者的样品中,通过荧光原位杂交技术确定样品中Her2/CEP17比值;如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型;该肠型患者可接受抗Her2治疗。
本发明中使用的术语“设备”可包括一个或以上的用于实践本发明的主题的分析单元,优选反应监测靶向蛋白质组学技术相关的分析单元。分析单元可以包括较大设备中用于预测目的的样品检测,例如定性和/或定量评估之一或两者的独立的装置或元件。例如,分析单元可以执行或辅助样品和/或试剂的移液,计量,混合。分析单元可包括用来夹持试剂以进行测定的试剂夹持单元。试剂的安排可以是,例如在盛有单独的试剂或一组试剂的容器或匣子里,置于储藏室或输送器中合适的托座或位置之中。检测试剂还可以固定在与样品相接触的固体支持物上。分析单元还可以包括对于特定的分析最优化的处理和/或检测组件。
本发明的分析单元还可以包含检测器,其用于确定与所述生物标志物特异性结合的检测试剂的量。本发明测定获得的值可手动计算并存储。或者,本发明的步骤可完全或部分地由计算机程序产品进行。本发明的分析单元可通过已知的任何连接方式与本发明所公开的含数据处理器的评估单元可操作地通讯,将经确定的量转移到所述评估单元。所述评估单元包括带有执行算法的数据处理元件,例如计算机,所述数据处理元件通过执行基于计算机的算法,与符合分析目的的阈值进行比较并得出比较结果。
因此,本发明提供了包括计算机可读存储介质的计算机程序产品,该计算机可读存储介质具有存储在其上的计算机程序。该程序在被计算机读取时,可基于从来自个体的一个或多个生物样品的分析获得的值(例如,基因或蛋白质表达水平、归一化、标准化、取阈和从测定的值到临床结果得分和/或临床状态或阶段的文本或图形描述的转换以及相关信息)来执行相关计算。该计算机程序产品在其中存储用于执行计算的计算机程序。
本发明提供了用于执行数据采集和处理或计算上述软件程序的系统,该系统通常包括:a)中央计算环境;b)输入设备,其可操作地连接到所述计算环境,以接收患者数据,其中所述患者数据可以包括,例如基因或蛋白质表达水平或从使用来自患者的生物样品的测定获得的其他值,或质谱数据或由本公开提供的任何测定的数据;c)输出设备,其连接至所述计算环境,以向用户(例如,医务人员)提供信息;以及d)由中央计算环境(例如,处理器)执行的算法,其中该算法基于由所述输入设备接收的数据来执行,并且其中所述算法计算表达得分、取阈或本文描述的其他功能。本公开提供的方法也可以是整体或部分自动化的。
本发明的比较结果可作为参数化的预测原始数据输出而给出。可以理解这些数据通常需要经过医生的解读。但是也可以预计专家系统设备,其中上述的输出包含无需专业医生进行解读的、经处理的预测原始数据。
当本发明的方法用于商业诊断目的,例如用于医疗领域中时,通常将生成从该方法获得的信息的报告或汇总。该方法的报告或汇总可包含关于一种或多种基因或蛋白质的表达水平、息肉或肿瘤的分类、患者的风险水平(如高、中或低)、患者的预后、治疗选择、治疗建议、生物标志物表达以及如何确定生物标志物水平、生物标志物谱、临床和病理因素的信息和/或与患者疾病状态相关的患者或群组的其他标准临床信息。
所述方法和报告可存储在数据库中。该方法可以在数据库中创建受试者的记录并将数据填入该记录。该报告可以是纸质报告、音频报告或电子记录。该报告可以显示和/或存储在计算设备(例如,手持设备、台式计算机、智能设备、网站等)上。可以预期,报告将提供给医师和/或患者。报告的接收可进一步包括建立与包含所述数据和报告的服务器计算机的网络连接,并从该服务器计算机请求该数据和报告。
本发明中使用的术语“试剂盒”指本发明所述组件的集合,优选地,其单独地或在单一的容器内提供。所述的容器内还包括实施本发明的方法的操作指南。这些操作指南可以是使用手册的形式,也可以通过计算机程序代码提供,当在计算机或数据处理设备上运行所述计算机程序代码时,其能够执行本发明的方法中的计算和比较,并相应地建立预测。所述的计算机程序代码可以是在数据存储介质或设备上,例如光学存储介质(例如光盘),或者直接在计算机或数据处理设备上提供。
本发明定义基于FISH检测胃腺癌Her2/CEP17比值时,可将Her2/CEP17比值2.5作为混合型(Lauren分型)胃腺癌患者中肠型与非肠型判断的指标或一个诊断指标,是混合型(Lauren分型)胃腺癌肠型患者在抗Her2靶向治疗中可能获益的阈值标准或一种指导参照标准,亦可作为胃腺癌病理疑难病例诊断时一个重要的实验佐证。
附图说明
图1 显示混合型有无肠型特征组别间Her2/CEP17比值。
图2显示Her2/CEP17比值预测病理是否具有肠型特征的受试者工作特征(receiver operating characteristic, ROC)曲线。
具体实施方式
下面结合附图和实施例,对本发明的具体实施方式作进一步详细描述。以下实施例仅用于更加清楚地说明本发明的技术方案,从而使本领域技术人员能很好地理解和利用本发明,而不是限制本发明的保护范围。
本发明实施例中涉及到的实验方法、生产工艺、仪器以及设备,其名称和简称均属于本领域内常规的名称,在相关用途领域内均非常清楚明确,本领域内技术人员能够根据该名称理解常规工艺步骤并应用相应的设备,按照常规条件或制造商建议的条件进行实施。
实施例1
患者信息、样本处理、数据采集
1、患者信息
本研究选择了27例混合型(Lauren分型)胃腺癌患者石蜡标本,排除接受新辅助化疗的患者。
我们将27例样本分设两组进行研究:一组为具有相对典型管状腺癌肠型结构特征的样本 11例;另一组为不具有典型管状腺癌肠型结构特征的样本16例,见表1。
表1 27例混合型(Lauren分型)胃腺癌样本的临床病理特征
2、胃腺癌Her2表达量的检测- 荧光原位杂交(FISH)
标本采用FISH法对Her2基因扩增检测的Her2/CEP17比值进行确认。采用武汉康录生物技术公司的人类Her2检测试剂盒。方法简述:组织切片脱蜡、逐级脱水、变性。在原位杂交仪(杭州瑞诚仪器有限公司,型号:SH2000)进行变性、杂交。载片复染,显微镜(蔡司科技,Axio Scope.AI)下计数,记录每例样本的Her2/CEP17比值。
胃腺癌标本 Her2 FISH判读标准Her2/CEP17<1.8,判为阴性;1.8≤Her2/CEP17<2.2,重新计数20个细胞,若比值≥2.0判为阳性;若比值<2.0判为阴性;Her2/CEP17≥2.2或信号成簇时,判为阳性。
实施例2
基于荧光原位杂交方法对混合型(Lauren分型)胃腺癌患者精准分型(分群)的临床研究结果
以混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为研究对象,以Lauren分型为基本框架,参照WHO分型,对混合型中肠型与非肠型表型特征进行准确的分型(分群)的临床研究。
以下对混合型中肠型与非肠型表型特征分型模型进行建模与统计学分析。结果显示,具有肠型表型特征的混合型患者样本Her2/CEP17比值明显高于不具有典型肠型表型特征的混合型患者样本Her2/CEP17比值(p<0.05),并且两者间在纵轴上重合部分较小,具备使用以Her2/CEP17比值为线性数学模型来区分两组患者的基础(图1)。
以Her2/CEP17比值作为线性模型预测判读混合型(Lauren分型)胃腺癌是否具有肠型表型特征的ROC 曲线(如图2),表明Her2/CEP17比值对混合型胃腺癌是否具有肠型表型特征病理学上的判读有较高的分类性能,AUC为0.733。
在假设混合型(Lauren分型)胃腺癌在病理学上判断是否具有肠型表型特征结果良好的基础上,经过对不同判读标准下敏感性和特异性的权衡和取舍,我们认为Her2/CEP17比值为2.5时,其特异性为75.0%,敏感性为81.8%,特异性和敏感性均良好。如表2中所示,除合计的行与列外,从左上至右下的斜对角线上的数字之和为FISH与病理学上的判读一致的病例,而在右上至左下对角线上的数字之和为FISH与病理学上的判读不一致的病例,在27例研究样本中FISH与病理学上的判读仅有6例出现异议,剩余21例均准确预测,显示出FISH方法对混合型(Lauren分型)胃腺癌病理学上是否具有肠型表型特征的准确性判读良好。
表2 病理学和FISH判读是否具有肠型表型特征混淆矩阵
因此,我们定义基于FISH检测胃腺癌Her2/CEP17比值时,可将Her2/CEP17比值2.5作为混合型(Lauren分型)胃腺癌患者中肠型与非肠型判断的指标或一个诊断指标,是混合型(Lauren分型)胃腺癌肠型患者在抗Her2靶向治疗中可能获益的阈值标准或一种指导参照标准,亦可作为胃腺癌病理疑难病例诊断时一个重要的实验佐证。
实施例3
一种对混合型(Lauren分型)胃腺癌患者进行分型的设备,其包括:
1)分析单元,适合于通过荧光原位杂交技术确定所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值;和
2)含数据处理器的评估单元,如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型。
所述分析单元包括样品和试剂的移液、计量和混合装置,试剂夹持装置,检测器和数据处理装置,检测器获取胃腺癌患者样品中Her2和CEP17数值,数据处理装置处理胃腺癌患者样品中Her2和CEP17数据,确定胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值,并将该比值发送到所述评估单元。所述评估单元包括计算机、计算机系统及带有执行算法的数据处理程序,通过执行算法,与阈值进行比较并得出比较结果,该比较结果在计算机上存储并可以输出。
实施例4
一种辅助混合型(Lauren分型)胃腺癌患者治疗的设备,其包括:
1)分析单元,适合于通过荧光原位杂交技术确定所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值;和
2)含数据处理器的评估单元,如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型(Lauren分型)胃腺癌患者为非肠型;混合型(Lauren分型)胃腺癌肠型患者可接受抗Her2治疗。
所述分析单元包括样品和试剂的移液、计量和混合装置,试剂夹持装置,检测器和数据处理装置,检测器获取胃腺癌患者样品中Her2和CEP17数值,数据处理装置处理胃腺癌患者样品中Her2和CEP17数据,确定胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值,并将该比值发送到所述评估单元。所述评估单元包括计算机、计算机系统及带有执行算法的数据处理程序,通过执行算法,与阈值进行比较并得出比较结果,该比较结果在计算机上存储并可以输出。
Claims (4)
1.针对Her2/CEP17比值的检测试剂在制备用于对Lauren分型混合型胃腺癌患者进行分型的设备中的用途,所述分型包括:
1)在所述混合型胃腺癌患者的样品中,通过荧光原位杂交技术确定Her2/CEP17比值;
2)如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型胃腺癌患者为非肠型。
2.针对Her2/CEP17比值的检测试剂在制备用于辅助Lauren分型混合型胃腺癌患者治疗的设备中的用途,所述混合型胃腺癌患者治疗包括:
1)在所述混合型胃腺癌患者的样品中,通过荧光原位杂交技术确定Her2/CEP17比值;
2)如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型胃腺癌患者为非肠型;
3)混合型胃腺癌肠型患者可接受抗Her2治疗。
3. 一种对Lauren分型混合型胃腺癌患者进行分型的设备,其包括:
1)分析单元,适合于通过荧光原位杂交技术确定所述混合型胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值;和
2)含数据处理器的评估单元,如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型胃腺癌患者为非肠型。
4. 一种辅助Lauren分型混合型胃腺癌患者治疗的设备,其包括:
1)分析单元,适合于通过荧光原位杂交技术确定所述混合型胃腺癌患者样品中Her2/CEP17比值;和
2)含数据处理器的评估单元,如果所述Her2/CEP17比值≥2.5,则所述混合型胃腺癌患者为肠型;如果所述Her2/CEP17比值<2.5,则所述混合型胃腺癌患者为非肠型;混合型胃腺癌肠型患者可接受抗Her2治疗。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202310345247.6A CN116042840A (zh) | 2023-04-03 | 2023-04-03 | 混合型胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202310345247.6A CN116042840A (zh) | 2023-04-03 | 2023-04-03 | 混合型胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN116042840A true CN116042840A (zh) | 2023-05-02 |
Family
ID=86118620
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202310345247.6A Pending CN116042840A (zh) | 2023-04-03 | 2023-04-03 | 混合型胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN116042840A (zh) |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102421448A (zh) * | 2009-05-29 | 2012-04-18 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | Her2信号传导调控剂在表达her2的胃癌患者中 |
CN112837815A (zh) * | 2021-02-04 | 2021-05-25 | 复旦大学附属中山医院 | 基于Lauren分型和术后残留淋巴结评估胃癌预后的模型及应用 |
-
2023
- 2023-04-03 CN CN202310345247.6A patent/CN116042840A/zh active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102421448A (zh) * | 2009-05-29 | 2012-04-18 | 霍夫曼-拉罗奇有限公司 | Her2信号传导调控剂在表达her2的胃癌患者中 |
CN112837815A (zh) * | 2021-02-04 | 2021-05-25 | 复旦大学附属中山医院 | 基于Lauren分型和术后残留淋巴结评估胃癌预后的模型及应用 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
侯绍章等: "胃腺癌中Ki-67、HER2、P53、CEA、HIF-1α、EGFR和VEGF的表达及意义", 《宁夏医科大学学报》, vol. 39, no. 11, pages 1267 - 1271 * |
展瑞: "胃腺癌中P53、HER2和Ki-67的表达及相关分析", 《中国当代医药》, vol. 23, no. 27, pages 153 - 155 * |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Pinzani et al. | Isolation by size of epithelial tumor cells in peripheral blood of patients with breast cancer: correlation with real-time reverse transcriptase–polymerase chain reaction results and feasibility of molecular analysis by laser microdissection | |
Wang et al. | Automated quantitative RNA in situ hybridization for resolution of equivocal and heterogeneous ERBB2 (HER2) status in invasive breast carcinoma | |
CN101027412B (zh) | 用于膀胱癌检测的尿标记物 | |
CN104024436B (zh) | 用于前列腺癌分类的标志物基因 | |
CN104704128A (zh) | 预测乳腺癌结果的nano46基因和方法 | |
JP2014531046A (ja) | 疾病バイオマーカーの同定及び試料品質の評価のための好ましい試料操作及び加工プロトコルの選択 | |
CN111172279B (zh) | 外周血甲基化基因及idh1联合检测诊断肺癌模型 | |
US20190018930A1 (en) | Method for building a database | |
JP2022512890A (ja) | 試料の品質評価方法 | |
Horii et al. | Comparison of dual-color in-situ hybridization and fluorescence in-situ hybridization in HER2 gene amplification in breast cancer | |
CN115216520A (zh) | 一种用于泛肿瘤ctDNA-MRD检测的质控品、制备方法及其应用 | |
CN112763474B (zh) | 一种预测或检测急性白血病的生物标志物 | |
CN114360721A (zh) | 代谢相关子宫内膜癌的预后模型及构建方法 | |
Pang et al. | Assessment of programmed cell death ligand-1 expression with multiple immunohistochemistry antibody clones in non-small cell lung cancer | |
CN116148482A (zh) | 用于乳腺癌患者鉴定的设备及其制备用途 | |
Kerger et al. | Microscopic assessment of fresh prostate tumour specimens yields significantly increased rates of correctly annotated samples for downstream analysis | |
CN116042840A (zh) | 混合型胃腺癌患者精准分型和辅助治疗的设备及制备 | |
CN115612742A (zh) | 一种预测中晚期直肠癌新辅助治疗疗效的分子标志物模型及其应用 | |
EP3315594B1 (en) | Inspection system | |
CN115128285A (zh) | 一种蛋白质组合对甲状腺滤泡性肿瘤鉴别评估的试剂盒、系统 | |
EP1934367A1 (en) | Molecular method for diagnosis of prostate cancer | |
EP2856166B1 (en) | Method for the diagnosis of mammals | |
RU2763839C1 (ru) | Способ многофакторного прогноза рака молочной железы | |
RU2805941C1 (ru) | Способ комплексной дооперационной дифференциальной диагностики доброкачественных и злокачественных узловых образований щитовидной железы | |
CN115602313B (zh) | 用于疾病疗效与生存预后预测的生物标志物及其用途 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20230502 |