CN116004650B - 一种调控水稻雄性不育的基因OsPK7及其编码蛋白和应用 - Google Patents

一种调控水稻雄性不育的基因OsPK7及其编码蛋白和应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种调控水稻雄性不育的基因OsPK7及其编码蛋白和应用。该基因OsPK7的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,其编码的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明通过CRISPR/Cas9基因编辑技术对OsPK7基因进行敲除后,敲除株系表现为雄性不育性,表明该基因在花粉中具有至关重要的功能,能够为水稻雄性不育系的培育提供基因资源,并且也对雄性不育调控机理进行补充。

Description

一种调控水稻雄性不育的基因OsPK7及其编码蛋白和应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种调控水稻雄性不育的基因OsPK7及其编码蛋白和应用。
背景技术
水稻是全世界大部分人口赖以生存的主要口粮,也是我国最重要的主食作物。随着经济发展对劳动力的需求,全世界人口不断增加,我国人口数量也增加到全世界人口的四分之一,然而农村年轻劳动力进城务工,导致农村从事农业生产人员大量减少,耕地面积急剧减少,水稻产量的提升急需解决。利用杂种优势的水稻三系杂交育种是提高水稻产量的重要途径,三系杂交育种包含恢复系、保持系和不育系,其中不育系是雄性不育水稻,雄性不育种质资源的发掘和利用对于杂交育种至关重要,因此,水稻雄性不育基因的研究有利于拓展不育系种质资源。具有重要的理论意义和生产应用潜力。
目前,关于影响水稻雄性不育的基因被克隆了很多,相关的基因根据其作用的时期分为二类,一类是影响花粉发育时期的减数分裂、花药绒毡层降解和花粉壁形成的相关基因,如OsRAD1编码核酸外切酶同源蛋白,参与减数分裂时期抑制非同源末端连接,影响花粉粒育性,导致不育(Hu et al,Plant Physiology,2016)。OsRAD21-3编码姐妹染色单体粘连和分离关键因子,参与减数分裂中姐妹染色单体的粘连和分离(Tao et al,The PlantJournal,2007)。TIP2编码bHLH转录因子,影响花药绒毡层细胞程序化死亡的中断,导致花粉无活性,完全雄性不育(Fu et al,The Plant Cell,2014)。OsDEX1编码钙离子结合蛋白,基因功能丧失导致花药中绒毡层退化延迟,不能形成成熟花粉粒,完全雄性不育(Yu etal,Plant Physiology,2016)。OsABCG15编码ABC转运蛋白,参与花药中绒毡层细胞脂质分子向花药药室运输,进而影响花粉外壁发育(Zhao et al,Plant Physiology,2015)。OsOSC12编码氧化鲨烯环化酶,影响花粉外壁中花粉包被物质积累,导致花粉粒快速失水,表现出不育(Xue et al,Nature Communications,2018)。第二类影响花粉粒水合萌发和花粉管伸长,例如OsmLO12编码七跨膜结构域蛋白,可能通过与钙调素相互作用调控花粉水合作用(Yi et al,Plant Reproduction,2014)。OsRopGEF2/3/6/8编码鸟嘌呤核苷酸交换因子,在水稻花粉粒萌发中起着至关重要的作用(Xu et al,Development,Growth&Differentiation,2021)。RUPO编码类受体激酶,通过磷酸化OsHAK1/19/20三个钾离子转运蛋白,调控花粉管K+稳态影响花粉管伸长(Liu et al,PLoS Genetics,2016)。GORI编码WD-40基序蛋白,介导水稻花粉管生长的内吞和外排复合体中起着关键作用(Kim et al ThePlant Journal,2020)。虽然雄性不育相关基因报道不少,但是花粉中糖酵解相关酶导致水稻完全雄性不育很少报道。
发明内容
针对现有技术中的上述不足,本发明提供一种调控水稻雄性不育的基因OsPK7及其编码蛋白和应用。
为实现上述目的,本发明解决其技术问题所采用的技术方案是:
一种调控水稻雄性不育的基因OsPK7,该基因OsPK7的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。具体如下:
ATGGCGGTGATGGAGGAGCAGCAGGAGGGAGCCGCGGGGGTGATGCGGCGGAGGCCCAAGACGAAGATCGTGTGCACGCTGGGGCCGGCGTCGAGGTCGGTGGAGATGATCGGGCGGCTGCTCCGCGCCGGGATGTGCGTCGCGCGCTTCAACTTCTCCCACGGATCCCACGAGTACCACCAGGAGACGCTCGACAACCTCCGCGCCGCCATGGAGAGCACCGGCATCCTCTGCGCCGTCATGCTCGACACCAAGGGGCCAGAGATCCGAACTGGATTTCTGAAAGATGGAAAACCCGTACAGTTGAAGAAGGGTCAAGAAATCACAGTTTCAACTGATTATAGCATAAAGGGTGATGACAACATGATATCAATGAGCTACAAGAAGCTAGCGGTGGATCTGAAGCCAGGCAGTGTAATATTATGTGCTGATGGCACCATCACTCTTACTGTCCTTCACTGTGATAAAGAGCAAGGCTTGGTTCGCTGCCGTTGTGAGAACACTGCTATGCTTGGTGAGAGGAAGAATGTTAACCTTCCAGGAGTTATTGTTGATCTCCCGACACTTACTGAGAAGGACAAGGAGGATATTCTTAAATGGGGTGTCCCAAACAAGATTGACATGATTGCTCTGTCTTTTGTTCGTAAAGGCTCAGACCTTGTAGAGGTCAGGAAGGTGCTTGGGAAGCATGCAAAGTCAATAATGCTGATGTCAAAGGTTGAGAATCAAGAGGGAGTGGCTAACTTTGATGATATCCTGGCACAATCTGATGCTTTTATGGTTGCAAGGGGTGATTTGGGAATGGAAATTCCGATAGAGAAGATCTTTTATGCACAGAAGGTGATGATTTTCAAGTGCAATATTCAGGGCAAGCCAGTTGTGACTGCAACCCAGATGTTGGAATCTATGATCAAGTCTCCCCGCCCTACTAGAGCAGAAGCGACTGATGTTGCCAATGCAGTTCTTGATGGCACTGACTGTGTCATGCTCAGTGGTGAGACAGCTGCTGGGGCTTACCCGGAACTGGCTGTACGGACCATGGCCAAGATCTGCCTGCAAGCGGAGTCATGCGTCGACCATGCCGCTGTTTTCAAGTCCATTACCGCATCAGCTCCAATTCCCATGAGCCCATTGGAGAGCCTTGCATCATCAGCTGTGCGTACAGCGAACTCTGCCAAGGCGGCGCTCATCTTGGTCCTGACTAGGGGAGGAACAACTGCTAGGCTGGTGGCCAAGTACAGGCCATCCATGCCGATTCTGTCCGTCGTGGTTCCTGAGCTGAAACAGACCGACTCCTTCGACTGGACCTGCAGCGACGAAGCTCCTGCGCGGCACAGCCTCATCGTCAGGGGAGTGATCCCGATGCTGAGTGCAGCCACTGCCAAGGCCTTCGACAACGAAGCCACTGAAGAAGCTCTCGGGTTCGCCATCAGCAACGCCAAGGCGATGGGGCTCTGCAACTCCGGTGAGTCCGTCGTCGCCCTCCACCGGATCGGAACTGCATCTGTCATCAAGCTCCTGACAGCGAACTAG。
进一步地,基因OsPK7的序列为与SEQ ID NO.1所示核苷酸序列具有80%以上同源性,且编码相同功能蛋白的序列。
上述基因OsPK7编码的蛋白,该蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,具体如下:
MAVMEEQQEGAAGVMRRRPKTKIVCTLGPASRSVEMIGRLLRAGMCVARFNFSHGSHEYHQETLDNLRAAMESTGILCAVMLDTKGPEIRTGFLKDGKPVQLKKGQEITVSTDYSIKGDDNMISMSYKKLAVDLKPGSVILCADGTITLTVLHCDKEQGLVRCRCENTAMLGERKNVNLPGVIVDLPTLTEKDKEDILKWGVPNKIDMIALSFVRKGSDLVEVRKVLGKHAKSIMLMSKVENQEGVANFDDILAQSDAFMVARGDLGMEIPIEKIFYAQKVMIFKCNIQGKPVVTATQMLESMIKSPRPTRAEATDVANAVLDGTDCVMLSGETAAGAYPELAVRTMAKICLQAESCVDHAAVFKSITASAPIPMSPLESLASSAVRTANSAKAALILVLTRGGTTARLVAKYRPSMPILSVVVPELKQTDSFDWTCSDEAPARHSLIVRGVIPMLSAATAKAFDNEATEEALGFAISNAKAMGLCNSGESVVALHRIGTASVIKLLTAN*。
一种表达盒、表达载体或克隆载体,其包括上述核苷酸序列。
含有上述基因OsPK7、或者表达盒、表达载体或克隆载体的工程菌。
上述基因OsPK7在水稻雄性不育品种筛选中的应用。
上述基因OsPK7在制备转基因植物中的应用。
一种调控水稻雄性不育的制剂,该制剂包括抑制上述基因表达,或敲除上述基因的活性成分。
进一步地,活性成分为小分子化合物、shRNA、gRNA或短肽。
本发明的有益效果:
本发明通过CRISPR/Cas9基因编辑技术对OsPK7基因进行敲除后,敲除株系表现为雄性不育性,表明该基因在花粉中具有至关重要的功能,能够为水稻雄性不育系的培育提供基因资源,并且也对雄性不育调控机理进行补充。
附图说明
图1为OsPK7基因CRISPR/Cas9靶位点信息;
图2为野生型ZH11和敲除突变体植株及穗部表型;
图3为野生型ZH11和敲除突变体植株花粉碘染;
图4为OsPK7基因在水稻全生育期时空表达谱分析;
图5为报告基因GUS载体图谱;
图6为OsPK7 GUS转基因材料染色观察及半薄切片;
图7为野生型ZH11和敲除突变体植株正反交结果。
具体实施方式
下面对本发明的具体实施方式进行描述,以便于本技术领域的技术人员理解本发明,但应该清楚,本发明不限于具体实施方式的范围,对本技术领域的普通技术人员来讲,只要各种变化在所附的权利要求限定和确定的本发明的精神和范围内,这些变化是显而易见的,一切利用本发明构思的发明创造均在保护之列。
实施例1OsPK7基因敲除体的构建
1、OsPK7基因敲除载体构建及转化
利用华南农业大学刘耀光老师建立的网站(http://skl.scau.edu.cn/)设计向导RNA(guide RNA,gRNA)靶位点序列,并构建到植物抗性为潮霉素的pYLCRISPR/Cas9 Pubi-H载体上,具体方法参照(Yao-Guang Liu,Current Protocols in Molecular Biology,2016),基因编辑载体转化材料受体为野生型ZH11,实验转化由百格基因公司完成(见图1)。
2、花粉碘染
采集野生型ZH11和敲除突变体植株将要开花的成熟颖花,取出花药置于载玻片上,加1-2滴I2-KI溶液,用镊子充分捣碎,盖上盖玻片,用显微镜观察花粉染色情况。结果显示敲除突变体花粉碘染成功,说明敲除突变体花粉有淀粉积累。(见图2和图3,其中,KO1和KO2为敲除突变体)
实施例2OsPK7基因在水稻全生育期时空表达谱分析
荧光实时定量PCR分析具体过程:采用Vazyme公司生产的ChamQ SYBR qPCRMaster Mix进行实验,以OsActin基因为内参,前引物为ACCATTGGTGCTGAGCGTTT,后引物为CGCAGCTTCCATTCCTATGAA,OsPK7基因为检测基因,前引物为GGCACCATCACTCTTACTGT,后引物为GGTCTGAGCCTTTACGAAC,使用10μL反应体系,其中包含1μL反转录产物,5μLChamQ SYBRqPCR Master Mix和4μL 1μM基因引物。荧光实时定量PCR检测目的基因设置三个技术重复,实验所需仪器为Bio-Rad CFX96,试验过程枪头,离心管均为无DNase和RNase型。
提取R498背景的水稻根、叶、节、节间、幼穗、开花后5d、10d、15d、20d、25d颖果中总RNA,以及ZH11背景花药发育时期为6-7、7-8、8-9、9-10、10-11、12-13颖花总RNA。使用Nanodrop测定各个样品RNA浓度,取500ng总RNA用FORE GENE公司生产的RT EasyTMII(WithgDNase)反转录成cDNA,利用荧光实时定量PCR进行表达量分析,见图4。
图4中,(A)为从R498背景下提取的R(根);N(孕穗期倒一节);IN(孕穗期倒一节节间);L1(苗期叶片);L2(灌浆期叶片);P1(孕穗期2cm长幼穗);P2(孕穗期12cm长幼穗);5DAF-25DAF(受精后5-25天胚乳)颖果中RNA的表达量分析检测。
(B)为ZH11野生型植株花药发育不同时期的颖花,St6-7(花药发育第6-7期颖花);St7-8(花药发育第7-8期颖花);St8-9(花药发育第8-9期颖花);St9-10(花药发育第9-10期颖花);St10-11(花药发育第10-11期颖花);St12-13(花药发育第12-13期颖花)中RNA的表达量分析检测。
如图4所示,由于OsPK7基因敲除突变体为雄性不育,因此提取了ZH11背景花药发育时期为6-7、7-8、8-9、9-10、10-11、12-13颖花RNA,反转录后定量分析,结果显示OsPK7基因表达量在颖花中逐渐增加,花药后期表达量更高。
实施例3OsPK7基因在水稻各时期组织中的表达
1、GUS载体构建及转化
以NIP的DNA为模板,通过PCR扩增ATG起始密码子上游的1kb(OsPK7)基因组片段,并将PCR产物胶回收用单片段重组酶连接到以线性化(HindIII,BamhI)的DX2181载体上。并送百格基因转粳稻ZH11材料(如图6所示)。
2、GUS材料染色
取阳性GUS转基因植株的各个组织器官进行GUS染色分析。
(1)按1:50的比例将X-Gluc Solution(50x)和GUS Buffer充分混匀,配成X-Gluc染色液。
(2)将各个组织放入5mL离心管中,加入适量染色液,使组织完全浸没于染液中。
(3)37℃避光孵育1-24h,直至组织上显现蓝色。
(4)用70%乙醇反复脱去组织中的叶绿素,直至叶绿素被彻底清除。
(5)样品保存于70%乙醇中,并用体式显微镜(LEICA S60,Germany)进行观察和拍照。
3、GUS材料半薄切片
(1)取材及固定:将GUS染色成功的叶片和颖花放入FAA固定液中固定24h以上。
(2)冲洗和脱水:将固定好的材料,先用蒸馏水清洗30min,再依次用30%、50%、70%、80%、85%、90%、95%、100%的乙醇进行梯度脱水,每级处理30min,除100%酒精重复三次外,其余浓度均处理一次。
(3)透明:将脱水后的材料放入二甲苯与无水乙醇体积比为1:1的透明剂中,处理45min。然后转入纯二甲苯中,处理45min。
(4)预渗透:各取等体积的无水乙醇与7100基液(base liquid)混合,制成混合树脂,然后将透明后的样品放入适量混合液中60℃孵育1-2h。
(5)渗透:将1g hardener I加入到100mL基液(base liquid)中,充分溶解配成制备液。然后将样品放入足量的制备液中室温浸泡12h。
(6)聚合反应:按照hardener II与制备液体积比为1:15的比例将两种试剂混匀。吸取500μl混合液到胶囊模具中,接着放入渗透过的样品,调整好位置,室温2h即可凝固。
(7)切片与烘片:将修整好的树脂块用半薄切片机(Leica RM2255,Germany)切成厚度2μm的薄片,用镊子移至盛有水滴的载玻片上展片,然后将载玻片置于42℃烤片机上过夜烤片。
(8)染色:对烤片完成后的切片依次做以下处理:高碘酸溶液处理5-10min;流水冲洗5min,擦干切片上多余的水分;滴加Schiff试剂,染色10-15min;流水冲洗5min,擦干切片上多余的水分;滴加0.1%的考马斯亮蓝R250溶液,染色1min;流水冲洗5min,擦干切片上多余的水分,置于烤片机上烘干。
(9)拍照:用莱卡光学显微镜(Leica,DM2700P,Germany)进行观察及拍照(见图7)。
由图5和图6的GUS染色显示,OsPK7基因在叶片,节,节间,花药中的花粉中有明显的GUS信号,其在水稻生长发育的各个时期均有表达。
实施例2敲除OsPK7基因对雄性的影响
采用正反交技术验证敲除OsPK7基因后雄性植株的可育性,具体如下:
田间早上6点半时,剪去颖花二分之一左右,喷水使花粉吸水失活,然后去点雄蕊的花药。并用杂交袋套袋,避免雌蕊授粉,待田间少量ZH11开花时,取作父本的穗子喷水,使穗子湿润,放入黑色塑料袋中,10分钟左右取出,将花粉抖落到相应的母本穗子上,最后使用回形针封口。正反交为母本野生型ZH11和父本敲除突变体、母本敲除突变体和父本野生型ZH11。通过正反交分析OsPK7敲除突变体不育表型是雄性不育还是雌性不育,见图7。
如图7所示,母本野生型ZH11和父本敲除突变体不结实,母本敲除突变体和父本野生型ZH11正常结实,说明OsPK7敲除突变体花粉障碍,表现为雄性不育表型。
以上所述仅为本发明的若干个具体实施方式,应当指出,对于本领域的普通技术人员能从本发明公开的内容直接导出或联想到的所有变形,均应认为是本发明的保护范围。

Claims (2)

1.基因OsPK7在水稻雄性不育品种筛选中的应用,其特征在于,所述基因OsPK7编码的蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述基因OsPK7的核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示。
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