CN115820618A - Sc1-70抗原截短体、其制备方法和应用 - Google Patents
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Abstract
本申请公开了一种SC1‑70抗原截短体、其制备方法和应用。本申请中开发了基于基因工程的SC1‑70抗原截短体的制备方法,实现了在大肠杆菌表达系统中高效稳定的可溶性表达,并且所得的SC1‑70抗原截短体活性与SC1‑70抗原相当。
Description
技术领域
本发明涉及基因工程领域,特别涉及SC1-70抗原截短体、其制备方法和应用。
背景技术
Sc1-70的本质为DNA拓扑异构酶I(topisomeraseI,TOP1)的C末端片段的70kDa大小的蛋白,因其抗原分子量为70kDa而得名。DNA拓扑异构酶I天然分子量为100kDa,位于核浆及核仁,核仁中浓度最高,在DNA复制及转录中起松解局部螺旋的作用。Sc1-70抗体属于抗可提取性核抗原抗体范畴,识别的抗原为DNA拓扑异构酶I,并且该抗体见于多种自身免疫病,是系统性硬皮症相对特异性的抗体。因此,检测Sc1-70抗体可提高系统性硬皮症的诊断率,有利于系统性硬皮症的鉴别诊断和治疗效果的提高。
目前临床上对于Sc1-70抗体的检测方法有多种,如间接免疫荧光法、免疫双扩散法、酶联免疫吸附法等。这些方法均需用到Sc1-70蛋白。现有技术中,获取Sc1-70蛋白的常见方法是提取法和重组蛋白法。纯化提取天然的Sc1-70蛋白存在工艺繁琐、产量低和纯度低,无法满足日益增长的检测需求;基于基因工程的重组Sc1-70蛋白法,虽然克服了提取法原材料短缺的缺陷,但制备所得的蛋白均以包涵体形式表达,产率极低、所得蛋白活性低且纯化困难,无法满足生产需要。
因此,本领域尚需开发一种产率高、所得蛋白活性高且易于纯化的Sc1-70蛋白制备方法。
发明内容
本发明的目的在于提供一种SC1-70抗原截短体。
本发明的目的在于提供一种重组SC1-70抗原截短体的制备方法。
本发明的另一目的在于提供一种编码SC1-70抗原截短体的多核苷酸序列。
本发明的另一目的在于提供与编码SC1-70抗原截短体的多核苷酸序列适配的载体。
本发明的另一目的在于提供含有编码SC1-70抗原截短体的多核苷酸序列的试剂盒。
为解决上述技术问题,本发明第一方面,一种SC1-70抗原截短体,所述SC1-70抗原截短体选自以下任一种:
(i)具有如SEQ ID NO.2所示序列的多肽;和
(ii)具有与SEQ ID NO.2的同源性大于95%的多肽。
本发明的第二方面,提供了一种编码SC1-70抗原截短体的多核苷酸,所述多核苷酸经密码子优化,且所述多核苷酸选自以下任一种:
(i)具有如SEQ ID NO.3所示序列的多核苷酸;
(ii)具有与如SEQ ID NO.3所示序列的同源性大于95%的多核苷酸;和
(iii)具有与(i)或(ii)中所述的多核苷酸序列互补的多核苷酸。
本发明第三方面,提供了一种表达载体,所述表达载体包括本发明第一方面提供的多核苷酸。
在一些优选的方案中,所述表达载体包括表达His×6标签的多核苷酸序列,更优选地,所述表达载体中,所述的多核苷酸的5’端连接于表达His×6标签的多核苷酸序列。
在一些优选的方案中,所述表达载体为大肠杆菌表达载体,更优选为pET-28a(+)。
本发明第四方面,提供了一种宿主细胞,所述宿主细胞包括本发明第二方面提供的表达载体;或者
所述宿主细胞的基因组中整合有如本发明第一方面提供的多核苷酸。
在一些优选的方案中,所述宿主细胞为大肠杆菌(Escherichia coli)。
在一些优选的方案中,所述宿主细胞为大肠杆菌Rosetta(DE3)菌株。
本发明第五方面提供了一种制备SC1-70抗原截短体的方法,所述方法包括步骤:培养本发明第三方面所述的宿主细胞,以表达出目的蛋白;和
分离所述目的蛋白,即得所述SC1-70抗原截短体;
其中,所述目的蛋白具有如氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列。
在一些优选的方案中,所述宿主细胞通过含有本发明第一方面所述多核苷酸的质粒转化大肠杆菌获得。
在一些优选的方案中,用SB、TB或SOC培养基培养所述的宿主细胞。为获得大量可溶性表达,在更优选的方案中,用SB培养基培养所述的宿主细胞。
在一些优选的方案中,在振荡的环境中培养所述的宿主细胞。
在一些优选的方案中,培养所述的宿主细胞时,所用培养基中含有卡那霉素抗性基因。
在一些优选的方案中,培养所述的宿主细胞时,使用IPTG进行诱导,以表达出目的蛋白。
在一些优选的方案中,培养所述的宿主细胞时,培养至OD600在0.6至0.8,后使用IPTG进行诱导,以表达出目的蛋白。
在一些优选的方案中,所述分离所述目的蛋白的步骤包括:
将经破碎的目的蛋白上清液通过层析柱,进行洗脱,收集洗脱液。
在一些优选的方案中,所述层析柱为Ni-柱亲和层析柱,例如HisTrapTMFF。
本发明第六方面提供了一种试剂盒,所述试剂盒包括:如本发明第一方面提供的的多核苷酸;或者
如本发明第二方面提供的表达载体;或者
如本发明第三方面所述的宿主细胞;或者
或者根据本发明第四方面所述的方法制备的SC1-70抗原截短体。
本发明相对于现有技术而言,至少具有下述优点:
(1)本发明开发了基于基因工程的SC1-70抗原截短体的制备方法,实现了在大肠杆菌表达系统中高效稳定的可溶性表达,并且所得的SC1-70抗原截短体活性与SC1-70抗原相当;
(2)本发明优选的实施方式N端携带编码(His)6标签的多核苷酸序列,进一步提升了体系产生可溶性表达的量,且无需再进行切除标签和二次纯化等步骤,一步法获得高纯度、高产率目的蛋白,简化了纯化步骤,提高回收率及纯度,能够获得高活性的重组Sc1-70蛋白,为临床上对系统性硬皮症的鉴别诊断提供诊断试剂原料,为研制Sc1-70抗体的快速检测试剂盒奠定基础;
(3)本发明优选的实施方式中,通过对宿主细胞培养方式的优化,例如使用优化诱导条件、优化培养基和培养温度,使目的蛋白可溶性表达增加进一步增加。
应理解,在本发明范围内中,本发明的上述各技术特征和在下文(如实施例)中具体描述的各技术特征之间都可以互相组合,从而构成新的或优选的技术方案。限于篇幅,在此不再一一累述。
附图说明
一个或多个实施例通过与之对应的附图中的图片进行示例性说明,这些示例性说明并不构成对实施例的限定。
图1是根据本发明实施例中SC1-70抗原的SDS-PAGE鉴定结果图;
图2是根据本发明实施例中SC1-70抗原电泳图。
具体实施方式
现有技术中虽然已经开发了基于基因工程的重组SC1-70蛋白表达体系,但是产量低、产物稳定性差且产物中包涵体比例大,可溶性蛋白比例太小以至于难以纯化。本发明人在研究中意外发现,SC1-70蛋白截短体不仅具有与SC1-70蛋白相当的活性,且使用重组蛋白法制备时,所得产物可溶性蛋白比例明显变高。基于此,本发明人开发了SC1-70蛋白截短体的表达体系,并进一步通过同义密码子偏好性优化,得到了能够在大肠杆菌表达系统中大量表达目的蛋白的编码SC1-70截短体的多核苷酸序列,所表达的可溶性目的蛋白产量达、活性高,稳定性好。
在本发明的更优选的实施方式中,发明人在经同义密码子偏好性优化后的编码SC1-70抗原的多核苷酸序列的N端增加了编码(His)6标签的多核苷酸序列,使可溶性表达的量进一步幅增加。
在本发明的更优选的实施方式中,发明人通过对宿主细胞培养方式的优化,通过使用卡那抗性的SB培养基组合IPTG诱导的培养方式,使得目的蛋白的可溶性表达量相对提高。
获取目的基因/获取目的蛋白有关的核酸序列
本发明中目的蛋白或其元件的核苷酸全长序列或其片段通常可以用PCR扩增法、重组法或人工合成的方法获得。对于PCR扩增法,可根据已公开的有关核苷酸序列,尤其是开放阅读框序列来设计引物,并用市售的cDNA库或按本领域技术人员已知的常规方法所制备的cDNA库作为模板,扩增而得有关序列。当序列较长时,常常需要进行两次或多次PCR扩增,然后再将各次扩增出的片段按正确次序拼接在一起。
一旦获得了有关的序列,就可以用重组法来大批量地获得有关序列。这通常是将其克隆入载体,再转入细胞,然后通过常规方法从增殖后的宿主细胞中分离得到有关序列。
此外,还可用人工合成的方法来合成有关序列,尤其是片段长度较短时。通常,通过先合成多个小片段,然后再进行连接可获得序列很长的片段。
应用PCR技术扩增DNA/RNA的方法被优选用于获得本发明的基因。用于PCR的引物可根据本文所公开的本发明的序列信息适当地选择,并可用常规方法合成。可用常规方法如通过凝胶电泳分离和纯化扩增的DNA/RNA片段。
在本发明的一个实施方式中,通过NCBI数据库对目的蛋白的氨基酸序列(SEQ IDNO:1),然后对其进行截短,获取201-765aa目的蛋白截短序列(SEQ ID NO:3)进行分析,获得目的基因序列信息。
同义密码子偏好性优化
为克服在大肠杆菌中表达异源蛋白时产量降低的潜在问题,本发明涉及经同义密码子偏好性优化的多核苷酸序列。对获取的201-765aa目的基因序列进行同义密码子偏好性优化,经同义密码子偏好性优化的目的基因序列(SEQ ID NO:4)可表达与目的蛋白相同的氨基酸序列,但表达过程稳定性和效率得以提升,最终所得目的蛋白维持了较高的活性。
本发明还涉及与SEQ ID NO:4所示序列的同源性大于95%的多核苷酸;和与SEQID NO:3所示序列互补的多核苷酸。
本发明还涉及与SEQ ID NO:4所示序列的同源性大于95%的多核苷酸;和与SEQID NO:3所示序列互补的多核苷酸。
目的基因的载体
本发明还涉及包含本发明的多核苷酸的载体。本发明中“载体”表示线性或环状DNA分子,其包含编码目的蛋白的片段,所述目的蛋白可操作地连接到提供其转录的其它片段。这样的附加片段可以包括启动子和终止子序列,并且可以任选地包括一个或多个复制起点,一个或多个可选择标记,增强子,多腺苷酸化信号,载体等。载体片段可以衍生自宿主生物体,另一生物体,质粒或病毒DNA,或可以是合成的。载体可以是合成的或方便地进行重组DNA操作的任何表达载体,载体的选择通常取决于载体要导入的宿主细胞。因此,载体可以是自主复制载体,即载体,其作为染色体外实体存在,染色体外实体的复制与染色体复制无关,例如质粒。或者,载体可以是当引入宿主细胞时整合到宿主细胞基因组中并与其整合的染色体一起复制的载体。在一个实施方案中,本发明的载体是表达载体。本发明的一个实施例中选择pET-28a(+)作为载体,以获取更高效的表达效率。
本领域的技术人员熟知的方法能用于构建含本发明蛋白的编码DNA序列和合适的转录/翻译控制信号的表达载体。这些方法包括体外重组DNA技术、DNA合成技术、体内重组技术等。所述的DNA序列可有效连接到表达载体中的适当启动子上,以指导mRNA合成。表达载体还包括翻译起始用的核糖体结合位点和转录终止子。示例性地,使用DNA内切酶将载体DNA分子切割成可与外源基因连接的线性分子,然后将经密码子优化的目的基因片段连接于载体,可选用单酶切位点的黏端连接、双酶切片段的定向克隆、不同限制酶切位点的黏端连接、平端连接、人工接头连接或同寡核苷酸末端连接实现外源DNA片段的插入。
本发明的一个实施例中,载体还包含表达His×6标签的多核苷酸序列,优选地,表达His×6标签的多核苷酸序列连接在目的基因序列的5’端(N端),提升了目的基因的可溶性表达的,便于后续分离纯化。
含有目的基因的载体转化宿主细胞
本发明还涉及用本发明的载体或融合蛋白编码序列经基因工程产生的宿主细胞。含有经密码子优化的目的基因的载体可以通过已知的方法插入、转染或以其他方式转化到宿主细胞中,从而获得含有本发明经密码子优化的目的基因并能够表达目的蛋白的转化体。本发明中“宿主细胞”是引入了外源多核苷酸和/或载体的细胞。宿主细胞可以是真核宿主细胞或原核宿主细胞,宿主细胞优选是细菌,并且优选是大肠杆菌,更优选是大肠杆菌ROSETTA(DE3)菌种(Escherichia coli Rosetta(DE3)strain)。
制备目的蛋白的方法
本发明还涉及制备目的蛋白的方法,可利用本发明的多核苷酸序列表达或生产重组蛋白。一般来说有以下步骤:
(1)用本发明的编码本发明蛋白的多核苷酸(或变异体),或用含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞;
(2)在合适的培养基中培养的宿主细胞;
(3)从培养基或细胞中分离、纯化蛋白质。
其中,步骤(1)含有该多核苷酸的重组表达载体转化或转导合适的宿主细胞可通过本领域技术人员熟知的常规技术进行,当宿主是大肠杆菌时,可选用热击法和电转化法等。
获得的转化子可以用常规方法培养,表达本发明的基因所编码的多肽。根据所用的宿主细胞,培养中所用的培养基可选自各种常规培养基,优选为SB、TB或SOC培养基。在适于宿主细胞生长的条件下进行培养。当宿主细胞生长到适当的细胞密度后,用合适的方法(如温度转换或化学诱导)诱导选择的启动子,将细胞再培养一段时间。为促进目的蛋白的表达并提升可溶蛋白的表达量,本发明的一个优选的实施方式,使用SB培养基培养的宿主细胞,且所用培养基中含有卡那霉素抗性基因。
在上面的方法中的蛋白质可在细胞内、或在细胞膜上表达、或分泌到细胞外。如果需要,可利用其物理的、化学的和其它特性通过各种分离方法分离和纯化蛋白。这些方法是本领域技术人员所熟知的。这些方法的例子包括但并不限于:常规的复性处理、用蛋白沉淀剂处理(盐析方法)、离心、渗透破菌、超处理、超离心、分子筛层析(凝胶过滤)、吸附层析、离子交换层析、高效液相层析(HPLC)和其它各种液相层析技术及这些方法的结合。在本发明的一个实施方式中,使用亲和层析法分子目的蛋白。
在本发明中,使用针对本文中的某些实施例提供的任何示例性或示例性措辞(例如,“”)只是为了更好地呈现本发明,而不限制以其它方式要求权利的本发明的范围。本文中的任何措辞都不应被解释为表示本发明实施中不可缺少的权利要求中未描述的要素。
如果引用文献中的术语的定义或使用与本文中描述的术语的定义不一致或不一致,则使用本文中描述的术语的定义,而不使用引用文献中的术语的定义。
本文中使用的各种术语如下所示。如果权利要求中使用的术语未在下文中定义,则应给出本领域技术人员给出的该术语的最广泛定义,以反映在申请时印刷的出版物或所发布的专利中。
如本文中所用的,术语“分离的”是指与核酸或多肽在其天然来源中存在的至少一种其它组分(例如核酸或多肽)分离的核酸或多肽。在一个实施方案中,发现核酸或多肽仅存在(如果有的话)通常存在于其溶液中的溶剂,缓冲液,离子或其它组分。术语“分离的”和“纯化的”不包括存在于其天然来源中的核酸或多肽。
如本文中所用的,术语“多核苷酸”和“多核苷酸序列”可以是DNA形式或RNA形式。DNA形式包括cDNA、基因组DNA或人工合成的DNA。DNA可以是单链的或是双链的。DNA可以是编码链或非编码链。
本发明还涉及上述多核苷酸的变异体,其编码与本发明有相同的氨基酸序列的蛋白质片段、类似物和衍生物。此多核苷酸的变异体可以是天然发生的等位变异体或非天然发生的变异体。这些核苷酸变异体包括取代变异体、缺失变异体和插入变异体。如本领域所知的,等位变异体是一个多核苷酸的替换形式,它可能是一个或多个核苷酸的取代、缺失或插入,但不会从实质上改变其编码多肽的功能。
如本文中所用的,术语“密码子优化”是指根据实际做蛋白表达或生产的生物(包括大肠杆菌、酵母、哺乳动物血细胞、植物细胞、昆虫细胞等)表现出的密码子利用差异,避免使用低利用率或稀有的密码子,来提高基因合成效率的方式。
如本文中所用的,术语“同源性”和“同一性”可互换使用,是指两个或更多个多核苷酸或多肽之间相同(即相同)核苷酸或氨基酸的百分比。可以通过以下方法测量两个或多个多核苷酸或多肽之间的序列同一性。排列多核苷酸或多肽的核苷酸或氨基酸序列,对排列的多核苷酸或多肽中含有相同核苷酸或氨基酸残基的位置的数量进行评分,并将其与排列的多核苷酸或多肽中含有不同核苷酸或氨基酸残基的位置的数量进行比较。多核苷酸可以在一个位置上不同,例如,根据包含不同的核苷酸(即,替换或变异)或核苷酸的缺失(即,在多核苷酸中插入或缺失一个或两个核苷酸)。多肽可以例如通过含有氨基酸(即,取代或变异)或氨基酸的缺失(即,插入一个或两个多肽中的氨基酸或氨基酸的缺失)在一个位置上不同。可以通过将含有相同核苷酸或氨基酸残基的位置的数量除以多核苷酸或多肽中氨基酸残基的总数来计算序列同一性。例如,百分比同一性可通过将含有相同核苷酸或氨基酸残基的位置的数量除以多核苷酸或多肽中核苷酸或氨基酸残基的总数,然后乘以100来计算。
如本文中所用的,术语“序列互补”和“反向序列互补”可互换使用,指的是与原多核苷酸序列的方向相反,且与原多核苷酸序列互补的序列。例如,如果原始多核苷酸序列是ACTGAAC,则其反向互补序列是GTTCAT。
如本文中所用的,术语“表达”包括涉及宿主细胞中多肽产生的任何步骤,包括但不限于转录,翻译,翻译后修饰和分泌。表达后可收获,即回收宿主细胞或表达产物。
为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚,下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件,或按照制造厂商所建议的条件。除非另外说明,否则百分比和份数是重量百分比和重量份数。以下实施例中所用的实验材料和试剂如无特别说明均可从市售渠道获得。
除非另有指明,本文所用的技术和科学术语具有与本申请所属技术领域的普通技术人员通常理解的相同含义,需要注意的是,本文所用的术语仅为了描述具体实施方式,而非意图限制本申请的示例性实施方式。
实施例1、构建SC1-70质粒并转染宿主细胞
(1)获取人TOP1蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示,截取201-765aa(SEQ IDNO:3所示),分析获取其基因序列,并进行同义密码子偏好性优化,经大肠杆菌同义密码子偏好性优化后得到的SEQ ID NO.2(编码完全TOP1蛋白)、SEQ ID NO:4(编码201-765aa截短体)、SEQ ID NO:5(编码201-755aa截短体)、SEQ ID NO:6(编码188-765aa截短体),分别连接载体为pET-28a(+),N端融合表达(His)6标签,合成重组表达质粒。
(2)重组质粒导入宿主大肠杆菌
取1μL步骤(1)中制备的表达质粒,在冰浴条件下,加入到30μL大肠杆菌感受态Rosetta(DE3)中,冰浴放置20min,热激90s,立刻冰上放置2min,加入400μL不含抗生素的SOC培养基,37℃、220rpm振荡培养50min。取100μL菌液均匀涂布到含100μg/mL卡那抗性的LB平板上,37℃培养箱培养过夜。
人TOP1蛋白的氨基酸序列SEQ ID NO:1:
MSGDHLHNDSQIEADFRLNDSHKHKDKHKDREHRHKEHKKEKDREKSKHSNSEHKDSEKKHKEKEKTKHKDGSSEKHKDK
HKDRDKEKRKEEKVRASGDAKIKKEKENGFSSPPQIKDEPEDDGYFVPPKEDIKPLKRPRDEDDADYKPKKIKTEDTKKE
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LNYLDPRITVAWCKKWGVPIEKIYNKTQREKFAWAIDMADEDYEF;
经密码子优化的编码人TOP1蛋白多核苷酸序列SEQ ID NO:2:
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TOP1蛋白201-765aa截短体氨基酸序列SEQ ID NO:3:
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DWRKEMTNEEKNIITNLSKCDFTQMSQYFKAQTEARKQMSKEEKLKIKEENEKLLKEYGFCIMDNHKERIANFKIEPPGL
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EDYEF
经密码子优化的编码TOP1蛋白201-765aa截短体多核苷酸序列SEQ ID NO:4:
CAAAAATGGAAGTGGTGGGAAGAAGAGAGGTACCCGGAGGGCATCAAGTGGAAGTTCCTGGAACATAAGGGTCCGGTGTT
TGCTCCGCCGTATGAGCCGCTGCCGGAGAACGTCAAATTCTACTATGATGGTAAAGTTATGAAGTTGTCCCCGAAAGCGG
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CAAGGAAATGAAAGTGCGCCAGCGTGCTGTGGCCCTGTACTTCATCGACAAATTGGCGCTGCGTGCCGGTAATGAGAAGG
AGGAGGGCGAGACTGCTGATACCGTTGGCTGCTGCAGCCTGCGTGTTGAGCACATTAATCTGCACCCGGAACTGGATGGC
CAGGAATACGTTGTTGAGTTCGACTTCTTGGGTAAGGACTCAATCCGTTATTACAATAAAGTCCCGGTTGAGAAGCGCGT
TTTTAAAAACCTGCAGTTGTTCATGGAAAACAAACAACCGGAGGATGACTTATTTGATCGTCTGAACACCGGTATTCTGA
ACAAGCACCTGCAAGATTTAATGGAAGGTCTGACGGCAAAGGTCTTTCGCACCTACAACGCTAGCATTACCCTGCAACAG
CAGTTGAAAGAACTGACTGCGCCTGATGAAAATATCCCGGCAAAAATTTTGTCGTATAACCGCGCGAATCGTGCGGTCGC
GATTCTTTGCAATCATCAACGCGCGCCGCCGAAGACCTTTGAAAAATCCATGATGAATTTGCAAACGAAAATCGACGCGA
AAAAAGAACAGCTGGCTGACGCGCGTCGTGATCTGAAATCTGCAAAAGCGGACGCGAAGGTGATGAAGGACGCCAAGACG
AAGAAGGTGGTTGAGAGCAAGAAGAAGGCGGTGCAGCGCTTAGAAGAGCAGCTTATGAAATTGGAAGTTCAGGCAACCGA
TCGCGAAGAGAACAAGCAAATTGCGCTCGGCACCAGCAAGCTGAACTATCTGGACCCGCGTATCACGGTTGCCTGGTGTA
AAAAATGGGGGGTGCCGATCGAAAAAATCTATAACAAAACGCAACGTGAGAAATTCGCCTGGGCAATTGATATGGCTGAC
GAAGACTACGAATTT
经密码子优化的编码TOP1蛋白201-755aa截短体多核苷酸序列SEQ ID NO:5:
CAAAAATGGAAGTGGTGGGAAGAGGAAAGGTACCCGGAGGGTATTAAGTGGAAGTTTCTGGAGCACAAGGGTCCGGTGTT
TGCGCCGCCGTATGAACCGCTGCCGGAGAATGTTAAATTTTATTATGACGGTAAAGTTATGAAATTGAGTCCGAAGGCTG
AAGAAGTTGCGACGTTTTTTGCGAAGATGCTGGACCATGAATACACCACTAAGGAAATTTTTCGTAAAAATTTCTTCAAA
GACTGGCGTAAAGAAATGACCAACGAAGAAAAAAATATCATTACAAACTTGTCTAAGTGCGATTTCACCCAGATGTCCCA
ATATTTCAAAGCACAGACGGAAGCGCGTAAACAGATGAGCAAGGAGGAAAAGCTCAAAATCAAGGAGGAGAACGAAAAAT
TGCTGAAGGAGTACGGCTTTTGCATCATGGATAACCACAAAGAACGTATAGCGAACTTCAAGATTGAGCCGCCGGGTCTG
TTTCGTGGTCGTGGCAACCATCCGAAAATGGGTATGCTTAAACGTCGCATCATGCCGGAGGACATCATTATCAACTGCTC
TAAGGACGCCAAGGTCCCAAGCCCGCCGCCTGGTCATAAGTGGAAGGAAGTGCGTCATGATAATAAGGTGACCTGGCTGG
TTAGCTGGACCGAAAACATTCAGGGCTCGATCAAATACATCATGCTGAATCCAAGCAGCCGTATTAAAGGCGAAAAGGAC
TGGCAGAAATACGAGACTGCGAGAAGATTAAAGAAATGCGTTGATAAAATTCGTAACCAGTATCGTGAAGACTGGAAGTC
CAAAGAGATGAAGGTGCGCCAACGCGCGGTAGCACTGTACTTCATCGACAAACTGGCCTTGCGAGCGGGTAATGAGAAGG
AGGAGGGCGAAACCGCCGATACCGTGGGTTGTTGTAGCCTGCGTGTCGAGCACATTAACCTGCACCCGGAATTGGACGGC
CAAGAATACGTGGTGGAGTTTGACTTCCTCGGCAAAGATAGCATCCGTTACTACAACAAAGTTCCGGTCGAGAAACGCGT
GTTTAAAAACCTCCAATTGTTCATGGAAAACAAACAGCCGGAAGACGACTTGTTCGATCGCCTGAACACCGGTATTCTGA
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CAACTCAAAGAGTTGACGGCTCCGGATGAGAATATCCCGGCAAAGATCTTGAGCTACAACCGTGCTAACCGTGCGGTTGC
GATCCTTTGCAACCACCAGCGCGCACCACCGAAAACCTTCGAGAAGTCCATGATGAATTTGCAAACCAAAATTGATGCCA
AGAAGGAGCAGTTGGCAGACGCTCGTCGCGATCTGAAGTCAGCGAAAGCGGATGCCAAAGTCATGAAAGACGCGAAGACC
AAAAAGGTGGTTGAAAGCAAAAAAAAGGCGGTGCAACGTCTGGAGGAGCAGCTTATGAAACTGGAGGTGCAGGCTACGGA
CCGCGAGGAGAATAAGCAGATCGCTCTGGGCACCTCCAAGCTGAATTATCTGGATCCGCGTATTACCGTTGCCTGGTGTA
AAAAGTGGGGTGTTCCGATCGAGAAGATCTATAACAAGACCCAACGTGAAAAATTCGCGTGGGCA
经密码子优化的编码TOP1蛋白188-765aa截短体多核苷酸序列SEQ ID NO:6:
CCCGATAATAAAAAAAAGAAGCCAAAAAAAGAGGAGGAGCAGAAGTGGAAATGGTGGGAGGAAGAGCGCTACCCGGAGGG
TATTAAGTGGAAATTCCTGGAACATAAAGGTCCGGTGTTCGCTCCGCCTTATGAACCGCTGCCGGAAAATGTTAAATTTT
ATTATGATGGTAAAGTGATGAAACTCTCCCCGAAAGCGGAAGAGGTGGCGACCTTTTTTGCGAAAATGCTGGACCACGAA
TACACCACCAAGGAAATTTTTCGTAAGAATTTTTTCAAAGACTGGCGTAAGGAAATGACGAACGAAGAAAAGAACATCAT
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GGAAAGAAGTGCGCCATGACAACAAGGTCACCTGGCTGGTTAGCTGGACCGAAAACATCCAAGGTAGCATCAAATACATC
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TCATCGACAAACTGGCGCTGCGTGCGGGTAATGAAAAAGAGGAGGGCGAAACGGCCGACACCGTAGGTTGTTGTTCACTG
CGTGTTGAGCACATTAATCTGCACCCGGAGCTAGACGGCCAAGAATACGTTGTCGAGTTCGACTTCCTGGGTAAAGACAG
CATTCGTTACTACAATAAGGTGCCGGTTGAAAAACGCGTGTTCAAAAATTTGCAACTGTTTATGGAAAACAAGCAACCGG
AAGACGATTTATTCGACCGTCTGAACACCGGCATTCTGAACAAACACCTTCAAGATCTGATGGAAGGCCTGACCGCGAAA
GTCTTTCGGACCTACAACGCGTCCATCACTTTGCAACAACAACTGAAGGAGCTGACGGCTCCGGATGAAAATATCCCGGC
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AAAAGTCTATGATGAACCTGCAGACCAAAATTGATGCTAAAAAAGAGCAGTTAGCCGATGCTCGTCGTGATCTGAAAAGC
GCGAAGGCTGACGCCAAGGTCATGAAGGACGCAAAAACCAAAAAGGTGGTTGAAAGCAAGAAGAAGGCCGTTCAGCGCTT
GGAGGAACAGCTGATGAAACTAGAGGTTCAGGCAACCGATCGTGAAGAGAATAAACAGATTGCACTGGGAACCAGCAAGT
TGAACTATTTGGATCCGCGTATCACCGTTGCGTGGTGCAAAAAATGGGGTGTTCCGATCGAGAAAATTTATAACAAGACC
CAGAGAGAAAAGTTTGCATGGGCAATCGATATGGCGGACGAGGACTACGAGTTC
实施例2、目的基因的表达
挑取步骤实施例1中制备的单克隆,无菌操作接种于含100μg/mL卡那抗性的TB培养基中,37℃220rpm振荡培养至OD600在0.6-0.8之间,IPTG进行诱导,分别放置于18℃振荡培养过夜。取等量的菌液进行超声破碎,并离心后,分别收集上清与沉淀,再对上清与沉淀进行SDS-PAGE鉴定,鉴定结果见图1。
如图1所示,1-2列:表达201-755aa截短体的大肠杆菌破碎的上清、沉淀;3-4列:表达201-765aa截短体的大肠杆菌破碎的上清、沉淀;5-6列:表达188-765aa截短体的大肠杆菌破碎的上清、沉淀。
结合预测分子量69.09KD,结果显示3-4列201-765aa截短体表达效果显著优于188-765aa截短体和201-755aa截短体。
实施例3、表达产物的纯化
摇瓶培养1.5L菌液(201-765aa截短体),离心收集菌体湿重为:69.09g。约取称4g菌体,加入20ml Lysis Buffer在冰上重悬。超声破碎后离心,20000rpm,4℃离心30min,取上清,0.22μm针式过滤器过滤得到过滤后菌液。滤后过Ni-柱亲和层析,用50mM Tris-HCl、50mM NaCl、200mM咪唑pH7.0洗脱的蛋白即为目的蛋白,电泳图如图2所示。
计算目的蛋白表达含量为66.0mg/L,纯度达到95%。
实施例4、化学发光法鉴定目的蛋白活性
(1)制备抗原抗体夹心复合物:本发明所表达Sc1-70抗原、Sc1-70抗原(购于其他公司)包被的磁株用作包被原料,加入Sc1-70单抗及二抗(菲鹏)温育条件下反应,抗体捕获样本中的抗原,形成复合物。
(2)检测读数:温育结束后,加磁场沉淀,去掉上清液,用清洗液清洗沉淀复合物,并吸干废液,除去未与磁性微粒结合的物质,再将反应杯送入测量室中。仪器自动泵入两种激发液,使复合物产生化学发光信号,测量发光强度。按照以上检测方法,分别对两种不同来源的Sc1-70抗原进行抗原性能检测。
采用化学发光法结果由表1、表2可知,市售Sc1-70抗原的发光值最高可达到456万,本发明Sc1-70抗原的发光值最高为425万,说明两种抗原性能均较好。浓度与RLU值的线性回归方程如下:y1=1E+09x+370549,R2=0.9162;y2=1E+09x+256579,R2=0.9592,说明本发明抗原的线性比市售抗原好。
表1
表2
本领域的普通技术人员可以理解,上述各实施方式是实现本发明的具体实施例,而在实际应用中,可以在形式上和细节上对其作各种改变,而不偏离本发明的精神和范围。
Claims (10)
1.一种SC1-70抗原截短体,其特征在于,所述SC1-70抗原截短体选自以下任一种:
(i)具有如SEQ ID NO.3所示序列的多肽;和
(ii)具有与SEQ ID NO.3的同源性大于95%的多肽。
2.一种编码如权利要求1所述的SC1-70抗原截短体的分离的多核苷酸,其特征在于,所述多核苷酸经密码子优化,且所述多核苷酸选自以下任一种:
(i)具有如SEQ ID NO.3所示序列的多核苷酸;
(ii)具有与如SEQ ID NO.3所示序列的同源性大于95%的多核苷酸;和
(iii)具有与(i)或(ii)中所述的多核苷酸序列互补的多核苷酸。
3.一种表达载体,其特征在于,所述表达载体包括如权利要求2所述的多核苷酸。
4.根据权利要求3所述的表达载体,其特征在于,所述表达载体包括表达His×6标签的多核苷酸序列。
5.根据权利要求3所述的表达载体,其特征在于,所述表达载体为大肠杆菌表达载体,优选为pET-28a(+)。
6.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞包括如权利要求3至5中任一项所述的表达载体;或者
所述宿主细胞的基因组中整合有如权利要求2所述的多核苷酸。
7.一种制备SC1-70抗原截短体的方法,其特征在于,所述方法包括步骤:
使含有如权利要求2所述的多核苷酸载体转化宿主细胞;
培养所述宿主细胞,以表达所述SC1-70抗原截短体。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,用SB、TB或SOC培养基培养所述的宿主细胞;
和/或,培养所述宿主细胞时,所用培养基中含有卡那霉素抗性基因。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,培养所述宿主细胞时,通过IPTG诱导以表达出目的蛋白。
10.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括:如权利要求1所述的多核苷酸;或者
如权利要求3至5中任一项所述的表达载体;或者
如权利要求7所述的宿主细胞;或者
根据权利要求8至9中任一项所述的方法所制备的SC1-70抗原截短体。
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