CN115725715A - 用于检测mybpc3突变基因的试剂在制备肥厚型心肌病试剂盒的应用 - Google Patents
用于检测mybpc3突变基因的试剂在制备肥厚型心肌病试剂盒的应用 Download PDFInfo
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Abstract
本发明涉及基因检测技术领域,具体涉及了用于检测MYBPC3突变基因的试剂在制备肥厚型心肌病试剂盒的应用,试剂包括引物SEQ ID NO:5至SEQ ID NO:8;与野生型MYBPC3基因相比,MYBPC3突变基因具有c.1724G>A杂合错义变异,编码核苷酸序列为SEQ ID NO:1;或MYBPC3突变基因具有c.197T>C杂合错义变异,编码核苷酸序列为SEQ ID NO:3。本发明提供的携带c.1724G>A或c.197T>C杂合错义的MYBPC3突变基因可以作为临床辅助诊断的生物标志物,对于协助临床早期诊断肥厚型心肌病,辅助临床判断,指导临床治疗和提前干预心血管恶性事件的发生具有重要意义;对有生育需求的突变基因携带者或患者,提供优生优育指导和遗传咨询,减少患儿出生。
Description
技术领域
本发明涉及基因检测技术领域,尤其涉及用于检测MYBPC3突变基因的试剂在制备肥厚型心肌病试剂盒的应用。
背景技术
肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)在我国患病率约1/500,是最为常见的单基因遗传性心血管疾病,是青少年和运动员心脏性猝死的主要原因之一,主要表现为左心室壁增厚。心脏性猝死(sudden cardiac death,SCD)常见于10~35岁的年轻患者,心力衰竭(心衰)死亡多发生于中年患者,HCM相关的心房颤动(房颤)导致的卒中则以老年患者多见。SCD的危险性随年龄增长而逐渐下降,但不会消失。在三级医疗中心就诊的HCM患者年死亡率为2~4%,SCD是最常见的死因之一。绝大部分HCM呈常染色体显性遗传,约60%的家族性和30%的散发性HCM患者可检测到明确的致病基因突变。目前,已发现27个致病基因与HCM相关,其中,MYBPC3是心脏型肌球蛋白结合蛋白C编码基因,MYBPC3基因突变会导致显著的肌节紊乱和发育不良,从而引发心肌病。《中国成人肥厚型心肌病诊断与治疗指南》建议:推荐所有临床诊断为HCM的患者进行基因筛查。通过基因筛查发现患者致病基因突变,结合临床表型,帮助确诊和鉴别诊断。
MYBPC3基因编码序列长3825bp,目前已发现许多MYBPC3基因的突变位点,但是在前人的研究基础上,进一步发现新的MYBPC3突变基因将有助于进一步研究肥厚型心肌病,对肥厚型心肌病的早期诊断,或者辅助临床判断具有重要意义。
发明内容
本发明的目的在于针对上述缺陷,提供用于检测MYBPC3突变基因的试剂在制备肥厚型心肌病试剂盒的应用。
本发明目的在于提供:用于检测MYBPC3突变基因的试剂在制备肥厚型心肌病试剂盒的应用,所述试剂包括引物SEQ ID NO:5至SEQ ID NO:8;与野生型MYBPC3基因相比,所述MYBPC3突变基因具有c.1724G>A杂合错义变异,编码核苷酸序列为SEQ ID NO:1,编码蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:2;或所述MYBPC3突变基因具有c.197T>C杂合错义变异,编码核苷酸序列为SEQ ID NO:3,编码蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:4。
优选地,所述MYBPC3突变基因编码蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:2或SEQ IDNO:4。
优选地,所述肥厚型心肌病试剂盒还包括PCR预混液、阴性对照试剂和阳性对照试剂。
本发明经过大量试验、研究和分析成功地筛选出MYBPC3突变基因,并利用MYBPC3突变基因开发出能够用于快速、灵敏、有效的检测MYBPC3突变基因的肥厚型心肌病试剂盒。MYBPC3突变基因具体信息见下表:
本发明有益效果在于:本发明公开的MYBPC3突变基因可以作为临床辅助诊断肥厚型心肌病的生物标志物,对肥厚型心肌病的早期诊断,或者辅助临床判断具有重要意义;基于MYBPC3突变基因的试剂开发的试剂盒,能够将携带MYBPC3 c.1724G>A或MYBPC3 c.197T>C杂合错义突变的患者和正常人群区分开,为受试者提供优生优育指导和遗传咨询,减少患儿出生。
附图说明
图1为实施例1中携带MYBPC3 c.1724G>A的先证者Sanger测序图;
图2为实施例2中携带MYBPC3 c.197T>C的先证者Sanger测序图;
图3为实施例3中肥厚型心肌病家系图;
图4为实施例4中肥厚型心肌病家系图。
具体实施方式
下面通过具体实施方式进一步详细说明,但并不因此而限制本发明。
下述实施例中的实验方法,如无特别说明,均为常规方法。下述实施例中所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,均可通过商业途径获得。
试剂来源:PCR预混液:2×Taq MasterMix(Dye),购自江苏康为世纪生物科技有限公司,货号:l01037/70335;包含如下成分:Taq DNA Polymerase、PCR Buffer、Mg2+、dNTPs、PCR稳定剂和增强剂等常规PCR所需要的组分。Agencourt AMPure XP磁珠:购自贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司,货号:311303。扩增用引物均委托生工生物工程(上海)股份有限公司合成。RNase-Free H2O:购自北京索莱宝科技有限公司。磁珠法全血基因组DNA提取试剂盒:购自江苏百世诺医疗科技有限公司,批号:20031886-01C。
实施例1:MYBPC3 c.1724G>A验证实验
在临床诊断为肥厚型心肌病先证者(女,39岁)及其家属自愿签署知情同意书的前提下,寄送5-10mL人类全血EDTA抗凝样本,建立病历资料库,详细记录先证者病情、家系情况等资料。本研究已得到本单位伦理委员会批准。随机收集200名与该肥厚型心肌病先证者家系无关的健康样本作为验证样本,每位采集2-4mL人类全血EDTA抗凝样本,-80℃保存。
S1、提取基因组DNA:对先证者和验证样本的人类全血EDTA抗凝样本进行全基因组DNA的提取,采用江苏百世诺医疗科技有限公司磁珠法全血基因组DNA提取试剂盒,操作步骤按照产品说明书进行。对DNA的浓度和纯度进行检测,作为PCR扩增的模板DNA。
S2、准备PCR反应体系
该PCR反应体系用于扩增包含目的基因位点在内的一段DNA序列,其组成为:PCR预混液25μL、正向引物(10μM)2μL、反向引物(10μM)2μL、模板DNA<1000ng,加RNase-Free H2O补至50μL。所用的正、反向引物信息如下:
正向引物(MYBPC3-E18-F,SEQ ID NO:5):5'CGCCACACCCACACACCCTCCC 3';反向引物(MYBPC3-E18-R,SEQ ID NO:6):5'TGTCTCCATCTCAGTCTCCACC 3'。长度:268bp。
S3、扩增目的片段:将反应体系混合,在PCR仪上进行目的基因片段的扩增反应,扩增程序为:95℃预变性2min;94℃变性30s,58℃退火30s,72℃延伸30s,共35循环。72℃终延伸2min。
S4、PCR产物的检测:取2μL的PCR产物,使用1.5%的琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物,选用1000bp Marker作为参考,检测验证扩增产物为预期的大小。
S5、PCR产物纯化:PCR产物检测后,使用Agencourt AMPure XP磁珠对PCR产物进行纯化,纯化步骤按照产品说明书进行,具体步骤如下:(1)涡旋振荡磁珠30s,使其彻底混匀为均一溶液。(2)向1.5mL的离心管中加入待纯化的PCR产物,然后加入2倍样品体积的磁珠溶液。涡旋振荡混匀后,室温下在1400rpm的Thermomixer上振荡5min。(3)将上一步的离心管放于磁力架上约1min,直至磁珠完全吸附。(4)保持离心管固定于磁力架上,弃去溶液,期间避免接触磁珠。(5)向上一步的离心管中加入500μL Buffer PW后,将离心管从磁力架上取下,涡旋振荡10s后将离心管重新放回磁力架,静置1min,待磁珠完全吸附于离心管侧壁后彻底弃去漂洗液。(6)重复步骤(5)。(7)保持离心管固定于磁力架上静置10min,使乙醇完全挥发干净。(8)将离心管从磁力架上取下,加入20-100μL Buffer EB,涡旋振荡将磁珠重悬于洗脱液中后将离心管放于65℃、1400rpm的Thermomixer上振荡洗脱5min。(9)将离心管放于磁力架上约1min,直至磁珠完全吸附。(10)将洗脱液转移至一个新的1.5mL离心管中,此时,可弃去磁珠。
S6、使用AppliedBiosystems 3500Dx系列基因分析仪对扩增产物进行Sanger测序。
S7、测序结果进行生物信息学分析:将测序结果和在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中获取的野生型MYBPC3基因序列在软件Chromas中进行序列比对,确定检测位点是否发生变异。
所述野生型MYBPC3基因的编码核苷酸序列如下:
ATGCCTGAGCCGGGGAAGAAGCCAGTCTCAGCTTTTAGCAAGAAGCCACGGTCAGTGGAAGTGGCCGCAGGCAGCCCTGCCGTGTTCGAGGCCGAGACAGAGCGGGCAGGAGTGAAGGTGCGCTGGCAGCGCGGAGGCAGTGACATCAGCGCCAGCAACAAGTACGGCCTGGCCACAGAGGGCACACGGCATACGCTGACAGTGCGGGAAGTGGGCCCTGCCGACCAGGGATCTTACGCAGTCATTGCTGGCTCCTCCAAGGTCAAGTTCGACCTCAAGGTCATAGAGGCAGAGAAGGCAGAGCCCATGCTGGCCCCTGCCCCTGCCCCTGCTGAGGCCACTGGAGCCCCTGGAGAAGCCCCGGCCCCAGCCGCTGAGCTGGGAGAAAGTGCCCCAAGTCCCAAAGGGTCAAGCTCAGCAGCTCTCAATGGTCCTACCCCTGGAGCCCCCGATGACCCCATTGGCCTCTTCGTGATGCGGCCACAGGATGGCGAGGTGACCGTGGGTGGCAGCATCACCTTCTCAGCCCGCGTGGCCGGCGCCAGCCTCCTGAAGCCGCCTGTGGTCAAGTGGTTCAAGGGCAAATGGGTGGACCTGAGCAGCAAGGTGGGCCAGCACCTGCAGCTGCACGACAGCTACGACCGCGCCAGCAAGGTCTATCTGTTCGAGCTGCACATCACCGATGCCCAGCCTGCCTTCACTGGCAGCTACCGCTGTGAGGTGTCCACCAAGGACAAATTTGACTGCTCCAACTTCAATCTCACTGTCCACGAGGCCATGGGCACCGGAGACCTGGACCTCCTATCAGCCTTCCGCCGCACGAGCCTGGCTGGAGGTGGTCGGCGGATCAGTGATAGCCATGAGGACACTGGGATTCTGGACTTCAGCTCACTGCTGAAAAAGAGAGACAGTTTCCGGACCCCGAGGGACTCGAAGCTGGAGGCACCAGCAGAGGAGGACGTGTGGGAGATCCTACGGCAGGCACCCCCATCTGAGTACGAGCGCATCGCCTTCCAGTACGGCGTCACTGACCTGCGCGGCATGCTAAAGAGGCTCAAGGGCATGAGGCGCGATGAGAAGAAGAGCACAGCCTTTCAGAAGAAGCTGGAGCCGGCCTACCAGGTGAGCAAAGGCCACAAGATCCGGCTGACCGTGGAACTGGCTGACCATGACGCTGAGGTCAAATGGCTCAAGAATGGCCAGGAGATCCAGATGAGCGGCAGCAAGTACATCTTTGAGTCCATCGGTGCCAAGCGTACCCTGACCATCAGCCAGTGCTCATTGGCGGACGACGCAGCCTACCAGTGCGTGGTGGGTGGCGAGAAGTGTAGCACGGAGCTCTTTGTGAAAGAGCCCCCTGTGCTCATCACGCGCCCCTTGGAGGACCAGCTGGTGATGGTGGGGCAGCGGGTGGAGTTTGAGTGTGAAGTATCGGAGGAGGGGGCGCAAGTCAAATGGCTGAAGGACGGGGTGGAGCTGACCCGGGAGGAGACCTTCAAATACCGGTTCAAGAAGGACGGGCAGAGACACCACCTGATCATCAACGAGGCCATGCTGGAGGACGCGGGGCACTATGCACTGTGCACTAGCGGGGGCCAGGCGCTGGCTGAGCTCATTGTGCAGGAAAAGAAGCTGGAGGTGTACCAGAGCATCGCAGACCTGATGGTGGGCGCAAAGGACCAGGCGGTGTTCAAATGTGAGGTCTCAGATGAGAATGTTCGGGGTGTGTGGCTGAAGAATGGGAAGGAGCTGGTGCCCGACAGCCGCATAAAGGTGTCCCACATCGGGCGGGTCCACAAACTGACCATTGACGACGTCACACCTGCCGACGAGGCTGACTACAGCTTTGTGCCCGAGGGCTTCGCCTGCAACCTGTCAGCCAAGCTCCACTTCATGGAGGTCAAGATTGACTTCGTACCCAGGCAGGAACCTCCCAAGATCCACCTGGACTGCCCAGGCCGCATACCAGACACCATTGTGGTTGTAGCTGGAAATAAGCTACGTCTGGACGTCCCTATCTCTGGGGACCCTGCTCCCACTGTGATCTGGCAGAAGGCTATCACGCAGGGGAATAAGGCCCCAGCCAGGCCAGCCCCAGATGCCCCAGAGGACACAGGTGACAGCGATGAGTGGGTGTTTGACAAGAAGCTGCTGTGTGAGACCGAGGGCCGGGTCCGCGTGGAGACCACCAAGGACCGCAGCATCTTCACGGTCGAGGGGGCAGAGAAGGAAGATGAGGGCGTCTACACGGTCACAGTGAAGAACCCTGTGGGCGAGGACCAGGTCAACCTCACAGTCAAGGTCATCGACGTGCCAGACGCACCTGCGGCCCCCAAGATCAGCAACGTGGGAGAGGACTCCTGCACAGTACAGTGGGAGCCGCCTGCCTACGATGGCGGGCAGCCCATCCTGGGCTACATCCTGGAGCGCAAGAAGAAGAAGAGCTACCGGTGGATGCGGCTGAACTTCGACCTGATTCAGGAGCTGAGTCATGAAGCGCGGCGCATGATCGAGGGCGTGGTGTACGAGATGCGCGTCTACGCGGTCAACGCCATCGGCATGTCCAGGCCCAGCCCTGCCTCCCAGCCCTTCATGCCTATCGGTCCCCCCAGCGAACCCACCCACCTGGCAGTAGAGGACGTCTCTGACACCACGGTCTCCCTCAAGTGGCGGCCCCCAGAGCGCGTGGGAGCAGGAGGCCTGGATGGCTACAGCGTGGAGTACTGCCCAGAGGGCTGCTCAGAGTGGGTGGCTGCCCTGCAGGGGCTGACAGAGCACACATCGATACTGGTGAAGGACCTGCCCACGGGGGCCCGGCTGCTTTTCCGAGTGCGGGCACACAATATGGCAGGGCCTGGAGCCCCTGTTACCACCACGGAGCCGGTGACAGTGCAGGAGATCCTGCAACGGCCACGGCTTCAGCTGCCCAGGCACCTGCGCCAGACCATTCAGAAGAAGGTCGGGGAGCCTGTGAACCTTCTCATCCCTTTCCAGGGCAAGCCCCGGCCTCAGGTGACCTGGACCAAAGAGGGGCAGCCCCTGGCAGGCGAGGAGGTGAGCATCCGCAACAGCCCCACAGACACCATCCTGTTCATCCGGGCCGCTCGCCGCGTGCATTCAGGCACTTACCAGGTGACGGTGCGCATTGAGAACATGGAGGACAAGGCCACGCTGGTGCTGCAGGTTGTTGACAAGCCAAGTCCTCCCCAGGATCTCCGGGTGACTGACGCCTGGGGTCTTAATGTGGCTCTGGAGTGGAAGCCACCCCAGGATGTCGGCAACACGGAGCTCTGGGGGTACACAGTGCAGAAAGCCGACAAGAAGACCATGGAGTGGTTCACCGTCTTGGAGCATTACCGCCGCACCCACTGCGTGGTGCCAGAGCTCATCATTGGCAATGGCTACTACTTCCGCGTCTTCAGCCAGAATATGGTTGGCTTTAGTGACAGAGCGGCCACCACCAAGGAGCCCGTCTTTATCCCCAGACCAGGCATCACCTATGAGCCACCCAACTATAAGGCCCTGGACTTCTCCGAGGCCCCAAGCTTCACCCAGCCCCTGGTGAACCGCTCGGTCATCGCGGGCTACACTGCTATGCTCTGCTGTGCTGTCCGGGGTAGCCCCAAGCCCAAGATTTCCTGGTTCAAGAATGGCCTGGACCTGGGAGAAGACGCCCGCTTCCGCATGTTCAGCAAGCAGGGAGTGTTGACTCTGGAGATTAGAAAGCCCTGCCCCTTTGACGGGGGCATCTATGTCTGCAGGGCCACCAACTTACAGGGCGAGGCACGGTGTGAGTGCCGCCTGGAGGTGCGAGTGCCTCAGTGA
所述野生型MYBPC3基因编码蛋白的氨基酸序列如下:
MPEPGKKPVSAFSKKPRSVEVAAGSPAVFEAETERAGVKVRWQRGGSDISASNKYGLATEGTRHTLTVREVGPADQGSYAVIAGSSKVKFDLKVIEAEKAEPMLAPAPAPAEATGAPGEAPAPAAELGESAPSPKGSSSAALNGPTPGAPDDPIGLFVMRPQDGEVTVGGSITFSARVAGASLLKPPVVKWFKGKWVDLSSKVGQHLQLHDSYDRASKVYLFELHITDAQPAFTGSYRCEVSTKDKFDCSNFNLTVHEAMGTGDLDLLSAFRRTSLAGGGRRISDSHEDTGILDFSSLLKKRDSFRTPRDSKLEAPAEEDVWEILRQAPPSEYERIAFQYGVTDLRGMLKRLKGMRRDEKKSTAFQKKLEPAYQVSKGHKIRLTVELADHDAEVKWLKNGQEIQMSGSKYIFESIGAKRTLTISQCSLADDAAYQCVVGGEKCSTELFVKEPPVLITRPLEDQLVMVGQRVEFECEVSEEGAQVKWLKDGVELTREETFKYRFKKDGQRHHLIINEAMLEDAGHYALCTSGGQALAELIVQEKKLEVYQSIADLMVGAKDQAVFKCEVSDENVRGVWLKNGKELVPDSRIKVSHIGRVHKLTIDDVTPADEADYSFVPEGFACNLSAKLHFMEVKIDFVPRQEPPKIHLDCPGRIPDTIVVVAGNKLRLDVPISGDPAPTVIWQKAITQGNKAPARPAPDAPEDTGDSDEWVFDKKLLCETEGRVRVETTKDRSIFTVEGAEKEDEGVYTVTVKNPVGEDQVNLTVKVIDVPDAPAAPKISNVGEDSCTVQWEPPAYDGGQPILGYILERKKKKSYRWMRLNFDLIQELSHEARRMIEGVVYEMRVYAVNAIGMSRPSPASQPFMPIGPPSEPTHLAVEDVSDTTVSLKWRPPERVGAGGLDGYSVEYCPEGCSEWVAALQGLTEHTSILVKDLPTGARLLFRVRAHNMAGPGAPVTTTEPVTVQEILQRPRLQLPRHLRQTIQKKVGEPVNLLIPFQGKPRPQVTWTKEGQPLAGEEVSIRNSPTDTILFIRAARRVHSGTYQVTVRIENMEDKATLVLQVVDKPSPPQDLRVTDAWGLNVALEWKPPQDVGNTELWGYTVQKADKKTMEWFTVLEHYRRTHCVVPELIIGNGYYFRVFSQNMVGFSDRAATTKEPVFIPRPGITYEPPNYKALDFSEAPSFTQPLVNRSVIAGYTAMLCCAVRGSPKPKISWFKNGLDLGEDARFRMFSKQGVLTLEIRKPCPFDGGIYVCRATNLQGEARCECRLEVRVPQ
S8、基因变异论证:200名表型健康的对照成员均未检测到该变异;肥厚型心肌病先证者检测到MYBPC3 c.1724G>A杂合错义变异,Sanger测序图如图1所示。
检索千人基因组(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/):无。ClinVar(https://www.snpedia.com/index.php/ClinVar):无。ESP6500(https://esp.gs.washington.edu/drupal/):无。ExAC(http://exac.hms.harvard.edu/):无。HGMD(http://www.hgmd.c.ac.uk/ac/index.php):无。百世诺本地人群数据库中的心肌病患者和对照人群均未携带该变异。根据现有证据:该变异为罕见变异、该变异为肥厚型心肌病的可疑致病突变。
实施例2:MYBPC3突变基因c.197T>C验证实验
在临床诊断为肥厚型心肌病先证者(男,45岁)及其家属自愿签署知情同意书的前提下,寄送5-10mL人类全血EDTA抗凝样本,建立病历资料库,详细记录先证者病情、家系情况等资料。本研究已得到本单位伦理委员会批准。随机收集200名与该肥厚型心肌病先证者家系无关的健康样本作为验证样本,每位采集2-4mL人类全血EDTA抗凝样本,-80℃保存。采用实施例1的方法对MYBPC3突变基因c.197T>C进行实验,所用的正、反向引物信息如下:
正向引物(MYBPC3-E2F,SEQ ID NO:7):5'CTCTCCCGACTGCTAGCTG 3';反向引物(MYBPC3-E2R,SEQ ID NO:8):5'GAAAGCACCTCCTGTTCCCT 3'。长度:591bp。扩增程序:94℃预变性2min;94℃变性30s,61℃退火30s,72℃延伸30s,共35循环。72℃终延伸2min。
同样,200名表型健康的对照成员均未检测到该变异;肥厚型心肌病先证者检测到MYBPC3c.197T>C杂合错义变异,Sanger测序图如图2所示。
检索千人基因组(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/variation/tools/1000genomes/):无。ClinVar(https://www.snpedia.com/index.php/ClinVar):无。ESP6500(https://esp.gs.washington.edu/drupal/):无。ExAC(http://exac.hms.harvard.edu/):无。HGMD(http://www.hgmd.c.ac.uk/ac/index.php):无。百世诺本地人群数据库中的心肌病患者和对照人群均未携带该变异。根据现有证据:该变异为罕见变异、该变异为肥厚型心肌病的可疑致病突变。
实施例3:无关样本验证实验--携带MYBPC3 c.1724G>A的肥厚型心肌病家系筛查
招募1个肥厚型心肌病家系(家系图如图3所示),对所有的家系成员进行实验室检查、心电图和动态心电图检查、运动心电图检查和影像学检查,初步确认其符合肥厚型心肌病家系特征。通过基因检测,在该家系中检查到有3名肥厚型心肌病病人。另外招募了1200名未患有肥厚型心肌病的健康人群作为对照。使用实施例1中的方法扩增该家系每个成员以及对照人群的MYBPC3 c.1724G>A,扩增完成后进行Sanger测序后进行分析。
基于样本信息保密,现公开部分样本信息。样本可公开信息:(1)肥厚型心肌病家系;国别/地区:中国/北京;家系成员男女比例:4﹕2;家系成员年龄分布:10-75岁;(2)对照人群国别/地区:中国/北京;对照人群男女比例:1﹕1;对照人群年龄分布:12-78岁。
招募的肥厚型心肌病家系中患病成员均携带MYBPC3 c.1724G>A杂合错义变异;而家系内非患病成员和正常对照人群未见前述任一位点的突变。
实施例4:无关样本验证实验--携带MYBPC3 c.197T>C的肥厚型心肌病家系筛查
招募1个肥厚型心肌病家系(家系图如图4所示),对所有的家系成员进行实验室检查、心电图和动态心电图检查、运动心电图检查和影像学检查,初步确认其符合肥厚型心肌病家系特征。通过基因检测,在该家系中检查到有3名肥厚型心肌病病人。另外招募了1000名未患有肥厚型心肌病的健康人群作为对照。使用实施例1中的方法扩增该家系每个成员以及对照人群的MYBPC3 c.197T>C,扩增完成后进行Sanger测序后进行分析。
基于样本信息保密,现公开部分样本信息。样本可公开信息:(1)肥厚型心肌病家系;国别/地区:中国/北京;家系成员男女比例:3﹕2;家系成员年龄分布:9-65岁;(2)对照人群国别/地区:中国/北京;对照人群男女比例:1﹕1;对照人群年龄分布:12-66岁。
招募的肥厚型心肌病家系中患病成员均携带c.197T>C杂合错义变异;而家系内非患病成员和正常对照人群未见前述任一位点的突变。
实施例5:肥厚型心肌病试剂盒
1.组成:
表2.组成
2.使用方法:
(1)基因组DNA提取:使用DNA提取试剂盒提取外周血液样本基因组DNA;(2)PCR扩增:采用上述的试剂盒进行PCR扩增,反应体系和反应条件参照实施例1;(3)对PCR扩增产物进行纯化;(4)对纯化的PCR扩增产物进行Sanger测序;(5)分析测序结果,比对是否有MYBPC3 c.1724G>A或MYBPC3 c.197T>C杂合错义变异。
以上详细描述了本发明的较佳具体实施例。应当理解,本领域的普通技术人员无需创造性劳动就可以根据本发明的构思作出诸多修改和变化。因此,凡本技术领域中技术人员依本发明的构思在现有技术的基础上通过逻辑分析、推理或者有限的实验可以得到的技术方案,皆应在由权利要求书所确定的保护范围内。
Claims (3)
1.用于检测MYBPC3突变基因的试剂在制备肥厚型心肌病试剂盒的应用,其特征在于,所述试剂包括引物SEQ ID NO:5至SEQ ID NO:8;与野生型MYBPC3基因相比,所述MYBPC3突变基因具有c.1724G>A杂合错义变异,编码核苷酸序列为SEQ ID NO:1;或所述MYBPC3突变基因具有c.197T>C杂合错义变异,编码核苷酸序列为SEQ ID NO:3。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述MYBPC3突变基因编码蛋白的氨基酸序列为SEQ ID NO:2或SEQ ID NO:4。
3.根据权利要求1或2所述的应用,其特征在于,所述肥厚型心肌病试剂盒还包括PCR预混液、阴性对照试剂和阳性对照试剂。
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WARING A 等: "Data-driven modelling of mutational hotspots and in silico predictors in hypertrophic cardiomyopathy", 《J MED GENET》, vol. 58, pages 15 * |
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