CN115260161A - 一种具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂及其制备方法和应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开一种具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂及其制备方法和应用,E3泛素连接酶配体泊马度胺与溴代酰氯反应,然后再与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体;或E3泛素连接酶配体VH032与溴代羧酸发生酰胺缩合反应生成溴代化合物,溴代化合物与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体;将带有炔基的靶蛋白配体和带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体进入细胞中,发生生物正交反应即可。本发明构建的细胞内自组装蛋白降解剂的制备方法简单,易于实现,收率较高,且具有一定的肿瘤细胞靶向性,能够用于制备治疗癌症的药物中。
Description
技术领域
本发明属于降解剂制备技术领域,涉及一种具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂及其制备方法和应用。
背景技术
索拉菲尼(Sorafenib)是一种新型多靶点抗肿瘤药物,可同时作用于肿瘤细胞和肿瘤血管,具有双重的抗肿瘤作用:既可通过阻断由RAF/MEK/ERK介导的细胞信号传导通路而直接抑制肿瘤细胞的增殖,还可通过抑制血管内皮生长因子受体VEGFR和血小板衍生生长因子受体PDGFR而阻断肿瘤新生血管的形成,间接地抑制肿瘤细胞的生长,但是临床治疗中常发生严重不良反应,且长期应用极易产生耐药性。
蛋白降解靶向嵌合体(Proteolysis Targeting Chimera,PROTAC)是一种能够同时结合靶蛋白和E3泛素连接酶的双功能分子,通过同时结合靶蛋白和E3泛素连接酶,拉近靶蛋白和E3连接酶之间的距离,从而诱导靶蛋白的泛素化,泛素化的靶蛋白能够被26S蛋白酶体识别并降解,达到彻底清除疾病相关蛋白的目的。与小分子抑制剂相比,PROTAC具有用量少,不易产生耐药性等优点,所以在新药研发领域呈现出蓬勃发展的态势。但蛋白降解靶向嵌合体固有的特性——分子量大导致其理化性质及细胞渗透性差,限制了其进一步发展,因此亟需对其药代动力学性质进行优化。
发明内容
本发明的目的在于提供一种具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂及其制备方法和应用,该降解剂的制备方法简单,易于实现,并且收率较高,可在制备抗肿瘤药物中应用。
为达到上述目的,本发明采用以下技术方案:
一种具有肿瘤细胞特异性的细胞内自组装蛋白降解剂,该降解剂结构式如下:
其中,X=1~5,Y=1~4;
一种如上所述的具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂的制备方法,包括以下步骤:
将索拉菲尼水解后与炔丙胺通过酰胺缩合反应,得到带有炔基的靶蛋白配体;
E3泛素连接酶配体泊马度胺与溴代酰氯反应,然后再与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体;或E3泛素连接酶配体VH032与溴代羧酸发生酰胺缩合反应生成溴代化合物,溴代化合物与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体;
将带有炔基的靶蛋白配体和带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体进入细胞中,发生生物正交反应,自组装形成具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂。
进一步的,带有炔基的靶蛋白配体的结构式如下:
其中,X=1~5。
进一步的,带有炔基的靶蛋白配体通过以下过程制得:
索拉菲尼经水解得到带有活性反应基团羧基的化合物,然后与炔胺经酰胺缩合反应,得到带有炔基的靶蛋白配体。
进一步的,带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体的结构式如下:
其中,Y=1~4;
带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体通过以下过程制得:
E3泛素连接酶配体泊马度胺与溴代酰氯反应,反应产物与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体。
进一步的,带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体的结构式如下:
其中,Y=1~4;带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体通过以下过程制得:
E3泛素连接酶配体VH032与溴代羧酸发生酰胺缩合反应生成溴代化合物,溴代化合物与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体。
进一步的,将带有炔基的靶蛋白配体溶液和带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体溶液同时加到含有肿瘤细胞的培养皿中,孵育,发生生物正交反应,自组装形成具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂。
一种如上所述的具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂在制备抗肿瘤药物中的应用。
进一步的,抗肿瘤药物为抗肺癌或抗神经胶质瘤药物。
进一步的,抗肿瘤药物为可诱导VEGFR-2、PDGFR-β以及EphB4蛋白降解的药物。
与现有技术相比,本发明具有以下有益效果:
本发明中带有炔基的靶蛋白配体分子与带有叠氮的E3泛素连接酶配体分子进入肿瘤细胞后,利用肿瘤细胞内铜离子含量明显高于正常细胞的特性,在肿瘤细胞内发生生物正交反应自组装形成蛋白降解靶向嵌合体,最终利用泛素-蛋白酶体系统将靶蛋白进行降解。本发明通过利用肿瘤细胞内铜离子含量明显高于正常细胞的特性,使得带有炔基的靶蛋白配体分子与带有叠氮的E3泛素连接酶配体分子能够在肿瘤细胞特异性地发生生物正交反应自组装形成蛋白降解剂。本发明构建的细胞内自组装形成蛋白降解剂的制备方法简单,易于实现,并且收率较高。
本发明构建的自组装型蛋白降解剂不仅能够利用蛋白降解靶向嵌合体的作用机制降解疾病相关蛋白,还能够以自组装的方式减小化合物的分子量,解决整体蛋白降解剂分子量大的问题,增加细胞渗透性,优化其理化性质,增强作用效果;最重要的,本发明利用肿瘤细胞内铜离子含量明显高于正常细胞的特性,使得自组装形成的蛋白降解剂过程主要发生在肿瘤细胞中,而正常细胞由于其铜离子含量较低,所以在正常细胞内自组装形成的蛋白降解剂含量较低或者不能生成蛋白降解剂,从而减少对正常细胞相关蛋白的降解。因此本发明自催化蛋白降解剂具有毒副作用低,靶向性强的优点。
本发明的小分子蛋白降解靶向嵌合体能够用于制备治疗癌症的药物中,尤其用于制备以PDGFR-β和EphB4为靶点的抗肿瘤药物中。
附图说明
图1为本发明构建的带有炔基的靶向识别分子SA与带有叠氮的E3泛素连接酶分子PA发生生物正交反应的高效液相色谱图;
图2为本发明构建的带有炔基的靶向识别分子SA与带有叠氮的E3泛素连接酶分子VA发生生物正交反应的高效液相色谱图;
图3为本发明构建的用于肿瘤细胞内自组装形成蛋白降解剂的靶向识别分子SA和PA对U87细胞的蛋白降解效果考察结果;
图4为本发明构建的用于肿瘤细胞内自组装形成蛋白降解剂的靶向识别分子SA和PA对A549细胞的蛋白降解效果考察结果;
图5为本发明构建的用于肿瘤细胞内自组装形成蛋白降解剂的靶向识别分子SA和VA对U87细胞的蛋白降解效果考察结果;
图6为本发明构建的用于肿瘤细胞内自组装形成蛋白降解剂的靶向识别分子SA和VA对A549细胞的蛋白降解效果考察结果。
具体实施方式
下面结合附图和具体的实施例对本发明做进一步的详细说明,所述是对本发明的解释而不是限定。
本发明的一种具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂的制备方法,包括以下步骤:
通过使用不同长度的烷基链将靶蛋白配体索拉菲尼和生物正交基团炔基连接,获得带有生物正交基团炔基的靶蛋白配体;
通过不同类型的连接链将叠氮基团修饰在E3泛素连接酶配体上,得到带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体。
带有生物正交基团炔基的靶蛋白配体分子和带有叠氮的E3泛素连接酶配体在进入肿瘤细胞后,在肿瘤细胞内高水平的铜离子催化下,发生生物正交反应,自组装形成蛋白降解剂,从而达到减小分子量,增加药物的细胞渗透性和靶向性,减小毒副作用,优化传统蛋白降解剂固有缺陷的目的。可利用泛素-蛋白酶体系统将靶蛋白进行降解。
所述带有生物正交基团炔基的靶蛋白配体的结构式如下:
其中X=1~5。
所述带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体泊马度胺的结构式如下:
其中,Y=1~4。
带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体VH032的结构式如下:
其中,Y=1~4。
细胞内自组装蛋白降解剂的结构式如下:
其中X=1~5,Y=1~4。
本发明涉及的自组装型蛋白降解靶向嵌合体(PROTACs)能够诱导VEGFR-2、PDGFR-β和EphB4蛋白的降解。
本发明提供了一种细胞内自组装蛋白降解剂,该蛋白降解剂在体外具有抗肿瘤活性,可应用于制备用于抗肿瘤的药物。
抗肿瘤的药物为抗肺癌或抗神经胶质瘤的药物。
下面结合图中所示的合成路线和具体的合成实施例来详细说明本发明的一类用于细胞内自组装形成蛋白降解剂的靶向识别分子的制备方法和活性筛选方法。
实施例1
一种带有生物正交基团炔基的靶蛋白配体分子SA的制备方法,包括以下合成步骤:
1)在氮气保护下,1.9mmol Sorafenib,29mmol氢氧化钠以及20mL无水乙醇于80℃回流反应10h。TLC检测反应完毕后,减压旋除无水乙醇,加入少量水,用2mol/L盐酸调节pH至3,有黄色固体析出,抽滤,滤饼干燥,得黄褐色粉末,即为化合物1(0.8g),结构式如下,产率91.45%。LC-MS(ESI,m/z):452.00[M+H]+,450.00[M-H]-。
2)将0.44mmol化合物1溶于20mL干燥二氯甲烷中,加入1mL DMF(N,N-二甲基甲酰胺)助溶,加入0.66mmol EDCI,0.66mmol HOBt,0.66mmol DMAP,室温搅拌30min,在冰浴条件下,逐滴加入1.32mmol三乙胺,搅拌15min后,加入0.53mmol炔丙胺,室温搅拌,TLC检测反应完毕后,减压旋除溶剂,加水,二氯甲烷萃取(3×),饱和氯化钠洗涤,无水Na2SO4干燥。抽滤除去干燥剂,经柱色谱分离得白色产物,即带有生物正交基团炔基的靶蛋白配体分子SA(0.17g),结构式如下,产率78.70%。LC-MS(ESI,m/z):511.05[M+Na]+,487.10[M-H]-。
将实施例1中的炔丙胺更换为6-庚炔-1-胺即可制备带有生物正交基团炔基的靶蛋白配体,具有如下结构式:
实施例2
一种带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体分子PA的制备方法,包括以下合成步骤:
1)将0.37mmol泊马度胺、1.10mmol 4-溴丁酰氯溶于6mL干燥四氢呋喃溶液中,置于65℃回流12h,反应液冷却至室温,旋干有机相,加水,二氯甲烷萃取2次,合并有机相,并用饱和碳酸氢钠溶液洗涤,饱和氯化钠洗涤,无水Na2SO4干燥。抽滤除去干燥剂,经柱层析分离得到白色粉末2(0.14g),结构如下所示,产率为90.9%,LC-MS(ESI,m/z):444.00[M+Na]+。
2)将0.33mmol化合物2溶于7mL DMF中,随后加入0.66mmol的叠氮化钠,反应混合溶液置于80℃反应12h,待反应结束后,加水,乙酸乙酯萃取3次,合并有机相,饱和氯化钠洗涤,无水Na2SO4干燥。抽滤除去干燥剂,经柱层析分离得到白色粉末,即带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体分子PA(0.067g),结构如下所示,产率为52.34%,LC-MS(ESI,m/z):407.10[M+Na]+,383.10[M-H]-。
将实施例2中的4-溴丁酰氯更换为6-溴己酰氯即可制备带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体,具有如下结构式:
实施例3
一种带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体分子VA的制备方法,包括以下合成步骤:
1)将0.56mmol 5-溴戊酸、0.47mmol VH032以及0.70mmol HATU混溶于20mL干燥二氯甲烷溶液中,在冰浴条件下,滴加1.86mmol DIPEA,滴加完毕后,撤去冰浴,置于室温搅拌反应1h,减压旋除有机相,加水,二氯甲烷萃取2次,合并有机相,饱和氯化钠洗涤,无水Na2SO4干燥。抽滤除去干燥剂,经柱层析分离得到无色透明油状物质,即化合物3(0.277g),结构如下所示,产率为99.6%,LC-MS(ESI,m/z):593.20[M+H]+,591.20[M-H]-。
2)将0.47mmol化合物3溶于7mL DMF中,随后加入0.94mmol的叠氮化钠,反应混合溶液置于60℃油浴中反应5h,待反应结束后,加水,乙酸乙酯萃取3次,合并有机相,饱和氯化钠洗涤,无水Na2SO4干燥。抽滤除去干燥剂,经柱层析分离得到浅黄色物质,带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体分子VA(0.18g),结构如下所示,产率为71.15%,LC-MS(ESI,m/z):556.30[M+H]+,554.45[M-H]-。
将实施例3中的5-溴戊酸换为9-溴壬酸即可制备带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体,具有如下结构式:
实施例4
带有生物正交基团(降冰片烯)的靶蛋白配体分子与带有生物正交基团(四嗪)的E3泛素连接酶配体分子在细胞内经自组装形成蛋白降解剂。
1)生物正交反应生成蛋白降解剂
采用高效液相色谱在体外监测两部分靶向识别分子能否发生生物正交反应、反应速率以及反应进程。等摩尔的两部分靶向识别分子(1N),CuSO4·5H2O(0.25N)以及抗坏血酸钠(0.5N)的置于二甲基亚砜和超纯水(V:V=2:1)混合体系中混匀,置于37℃恒温摇床上反应,一定时间后取样使用高效液相色谱进行检测,结果如图1~图2所示,两部分靶向识别分子在铜离子的催化下能够发生生物正交反应形成蛋白降解剂。
2)细胞内自组装生成蛋白降解剂
带有生物正交基团(炔基)的靶蛋白配体分子(终浓度为10μM)和带有生物正交基团(叠氮)的E3泛素连接酶配体分子(终浓度为10μM)联合应用处理细胞后,将细胞置于37℃,5%CO2恒温培养箱中孵育48h,之后将细胞消化离心收集,用PBS洗涤细胞三次,加入1ml甲醇:乙腈:水(V:V:V=2:2:1)并置于液氮中快速淬灭15min,冰上复溶,用细胞破碎仪进行破碎(超2s,停1s,共超20min),置于-20℃孵育1h沉淀蛋白,4℃,13000rpm,离心15min,取上清冻干,再进行电喷雾质谱测定,验证自组装蛋白降解剂的生成。
实施例5
前体分子以及自组装降解剂的细胞增殖抑制活性测定。
采用MTT检测法检测带有生物正交基团炔基的靶向识别分子索拉菲尼SA,带有生物正交基团叠氮的E3泛素连接酶配体PA、VA以及两部分联合应用对细胞活力的影响。将处于对数增长期的U87细胞,A549细胞用0.25%胰蛋白酶消化,制成单细胞悬液,接种于96孔板(4000个/孔),每孔180μL。放入37℃,5%CO2恒温培养箱中培养,24h后待细胞贴壁后加药。每组设置4个复孔,6个浓度的待测样品。阴性对照组和空白组加入20μL/孔无血清培养基,单一给药的实验组每孔加入10μL的不同浓度的药物(以无血清培养基稀释药物)以及10μL的不含药培养基,联合给药的实验组每孔各加入10μL的不同浓度的药物(以无血清培养基稀释药物),之后置于37℃,5%CO2恒温培养箱中继续培养。药物作用48h后,加入MTT溶液(终浓度为0.5mg/mL)22μL/孔,37℃孵育4h后,小心吸弃上清液,加入DMSO 150μL/孔,置于摇床上充分振摇15min。用酶联免疫检测仪于490nm波长下测定各孔吸光度(OD)值。
数值处理:抑制率=(OD阴性组-OD给药组)/(OD阴性组-OD空白组)×100%;
部分化合物的实验结果见表1:
表1活性分子的细胞增殖抑制活性
从表1可以看出,本发明制备靶向识别分子SA及其SA与PA或VA联合应用时均具有较好的细胞增殖抑制活性。此外,化合物对A549细胞的增殖抑制活性好于对U87的增殖抑制活性。
实施例6
细胞内自组装型蛋白降解剂对靶蛋白降解效果的考察。
将处于对数增长期的A549细胞或U87细胞,用0.25%胰蛋白酶消化,制成单细胞悬液,接种于6孔板(5×105个/孔),每孔2mL。放入37℃,5%CO2恒温培养箱中培养,24h后待细胞贴壁后加药。用相同浓度的SA和PA或SA和VA同时处理细胞后,置于37℃,5%CO2恒温培养箱中孵育48h,然后进行蛋白提取,再采用Western Blot免疫印迹法检测相关蛋白水平。参见图3~图6,可以看出,所构建的细胞内自组装型蛋白降解剂对蛋白降解有一定的效果,对于U87细胞,带有炔基的靶向识别分子SA对VEGFR-2、PDGFR-β、EphB4蛋白均有一定的降解效果,当其与带有叠氮的E3泛素连接酶联合应用时,仍然能够降解VEGFR-2、PDGFR-β以及BRAF蛋白,但作用效果明显增强,并且SA与VA联合使用的蛋白降解作用效果好于SA与PA联合使用时的蛋白降解效果;对于A549细胞,带有炔基的靶向识别分子SA对EphB和BRAF蛋白有一定的降解效果,当其与带有叠氮的E3泛素连接酶VA联合应用时,降解EphB4蛋白的作用效果更加明显。表明以SA为靶向识别分子构建的具有肿瘤靶向性的自组装型蛋白降解剂具有良好的应用前景,可用于神经胶质瘤等抗肿瘤药物的制备。
Claims (10)
2.一种如权利要求1所述的具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
将索拉菲尼水解后与炔丙胺通过酰胺缩合反应,得到带有炔基的靶蛋白配体;
E3泛素连接酶配体泊马度胺与溴代酰氯反应,然后再与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体;或E3泛素连接酶配体VH032与溴代羧酸发生酰胺缩合反应生成溴代化合物,溴代化合物与叠氮化钠发生亲核取代反应,得到带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体;
将带有炔基的靶蛋白配体和带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体进入细胞中,发生生物正交反应,自组装形成具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂。
4.根据权利要求2所述的一种具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂的制备方法,其特征在于,带有炔基的靶蛋白配体通过以下过程制得:
索拉菲尼经水解得到带有活性反应基团羧基的化合物,然后与炔胺经酰胺缩合反应,得到带有炔基的靶蛋白配体。
7.根据权利要求1所述的一种细胞内自组装蛋白降解剂的制备方法,其特征在于,将带有炔基的靶蛋白配体溶液和带有叠氮基团的E3泛素连接酶配体溶液同时加到含有肿瘤细胞的培养皿中,孵育,发生生物正交反应,自组装形成具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂。
8.一种如权利要求1所述的具有肿瘤细胞特异性的自组装蛋白降解剂在制备抗肿瘤药物中的应用。
9.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,抗肿瘤药物为抗肺癌或抗神经胶质瘤药物。
10.根据权利要求8所述的应用,其特征在于,抗肿瘤药物为可诱导VEGFR-2、PDGFR-β以及EphB4蛋白降解的药物。
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Legal Events
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PB01 | Publication | ||
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SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
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GR01 | Patent grant | ||
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