CN115232855A - 一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法 - Google Patents
一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN115232855A CN115232855A CN202210799165.4A CN202210799165A CN115232855A CN 115232855 A CN115232855 A CN 115232855A CN 202210799165 A CN202210799165 A CN 202210799165A CN 115232855 A CN115232855 A CN 115232855A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- intestinal flora
- screening
- xanthine oxidase
- drug
- flora
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
- 239000003814 drug Substances 0.000 title claims abstract description 65
- 230000000968 intestinal effect Effects 0.000 title claims abstract description 62
- 229940079593 drug Drugs 0.000 title claims abstract description 56
- 108010093894 Xanthine oxidase Proteins 0.000 title claims abstract description 48
- 102100033220 Xanthine oxidase Human genes 0.000 title claims abstract description 48
- 238000012216 screening Methods 0.000 title claims abstract description 31
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims abstract description 28
- 230000000694 effects Effects 0.000 title claims abstract description 26
- 230000008685 targeting Effects 0.000 title claims abstract description 13
- LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N Uric Acid Chemical compound N1C(=O)NC(=O)C2=C1NC(=O)N2 LEHOTFFKMJEONL-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 24
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 claims abstract description 22
- 230000000813 microbial effect Effects 0.000 claims abstract description 17
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 claims description 26
- 230000002550 fecal effect Effects 0.000 claims description 22
- 244000005700 microbiome Species 0.000 claims description 15
- 239000002609 medium Substances 0.000 claims description 14
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 claims description 13
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 claims description 12
- OFCNXPDARWKPPY-UHFFFAOYSA-N allopurinol Chemical compound OC1=NC=NC2=C1C=NN2 OFCNXPDARWKPPY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 11
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims description 11
- 239000000725 suspension Substances 0.000 claims description 11
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 10
- 229960003459 allopurinol Drugs 0.000 claims description 10
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 claims description 10
- 239000013641 positive control Substances 0.000 claims description 8
- VLSOAXRVHARBEQ-UHFFFAOYSA-N [4-fluoro-2-(hydroxymethyl)phenyl]methanol Chemical compound OCC1=CC=C(F)C=C1CO VLSOAXRVHARBEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 230000008859 change Effects 0.000 claims description 7
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 claims description 7
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- BHQCQFFYRZLCQQ-UHFFFAOYSA-N (3alpha,5alpha,7alpha,12alpha)-3,7,12-trihydroxy-cholan-24-oic acid Natural products OC1CC2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(CCC(O)=O)C)C1(C)C(O)C2 BHQCQFFYRZLCQQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- RUDATBOHQWOJDD-UHFFFAOYSA-N (3beta,5beta,7alpha)-3,7-Dihydroxycholan-24-oic acid Natural products OC1CC2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(CCC(O)=O)C)C1(C)CC2 RUDATBOHQWOJDD-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000004380 Cholic acid Substances 0.000 claims description 5
- 239000001888 Peptone Substances 0.000 claims description 5
- 108010080698 Peptones Proteins 0.000 claims description 5
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 claims description 5
- RUDATBOHQWOJDD-BSWAIDMHSA-N chenodeoxycholic acid Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)CC1 RUDATBOHQWOJDD-BSWAIDMHSA-N 0.000 claims description 5
- 229960001091 chenodeoxycholic acid Drugs 0.000 claims description 5
- BHQCQFFYRZLCQQ-OELDTZBJSA-N cholic acid Chemical compound C([C@H]1C[C@H]2O)[C@H](O)CC[C@]1(C)[C@@H]1[C@@H]2[C@@H]2CC[C@H]([C@@H](CCC(O)=O)C)[C@@]2(C)[C@@H](O)C1 BHQCQFFYRZLCQQ-OELDTZBJSA-N 0.000 claims description 5
- 229960002471 cholic acid Drugs 0.000 claims description 5
- 235000019416 cholic acid Nutrition 0.000 claims description 5
- KXGVEGMKQFWNSR-UHFFFAOYSA-N deoxycholic acid Natural products C1CC2CC(O)CCC2(C)C2C1C1CCC(C(CCC(O)=O)C)C1(C)C(O)C2 KXGVEGMKQFWNSR-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 229940025294 hemin Drugs 0.000 claims description 5
- BTIJJDXEELBZFS-QDUVMHSLSA-K hemin Chemical compound CC1=C(CCC(O)=O)C(C=C2C(CCC(O)=O)=C(C)\C(N2[Fe](Cl)N23)=C\4)=N\C1=C/C2=C(C)C(C=C)=C3\C=C/1C(C)=C(C=C)C/4=N\1 BTIJJDXEELBZFS-QDUVMHSLSA-K 0.000 claims description 5
- 238000011081 inoculation Methods 0.000 claims description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 claims description 5
- 235000019319 peptone Nutrition 0.000 claims description 5
- 235000010482 polyoxyethylene sorbitan monooleate Nutrition 0.000 claims description 5
- 229920000053 polysorbate 80 Polymers 0.000 claims description 5
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 claims description 5
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 claims description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 claims description 5
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 claims description 5
- SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N phylloquinone Natural products CC(C)CCCCC(C)CCC(C)CCCC(=CCC1=C(C)C(=O)c2ccccc2C1=O)C SHUZOJHMOBOZST-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- ABSPRNADVQNDOU-UHFFFAOYSA-N Menaquinone 1 Natural products C1=CC=C2C(=O)C(CC=C(C)C)=C(C)C(=O)C2=C1 ABSPRNADVQNDOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 claims description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 claims description 3
- 235000019175 phylloquinone Nutrition 0.000 claims description 3
- 239000011772 phylloquinone Substances 0.000 claims description 3
- MBWXNTAXLNYFJB-NKFFZRIASA-N phylloquinone Chemical compound C1=CC=C2C(=O)C(C/C=C(C)/CCC[C@H](C)CCC[C@H](C)CCCC(C)C)=C(C)C(=O)C2=C1 MBWXNTAXLNYFJB-NKFFZRIASA-N 0.000 claims description 3
- 229960001898 phytomenadione Drugs 0.000 claims description 3
- 239000002904 solvent Substances 0.000 claims description 3
- BXVSAYBZSGIURM-UHFFFAOYSA-N 2-phenoxy-4h-1,3,2$l^{5}-benzodioxaphosphinine 2-oxide Chemical compound O1CC2=CC=CC=C2OP1(=O)OC1=CC=CC=C1 BXVSAYBZSGIURM-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 claims description 2
- 108090000854 Oxidoreductases Proteins 0.000 claims description 2
- 241000411851 herbal medicine Species 0.000 claims description 2
- 238000000265 homogenisation Methods 0.000 claims description 2
- 238000002798 spectrophotometry method Methods 0.000 claims description 2
- QIJRTFXNRTXDIP-UHFFFAOYSA-N (1-carboxy-2-sulfanylethyl)azanium;chloride;hydrate Chemical compound O.Cl.SCC(N)C(O)=O QIJRTFXNRTXDIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 229960001305 cysteine hydrochloride Drugs 0.000 claims 1
- 239000008363 phosphate buffer Substances 0.000 claims 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 claims 1
- 229940088594 vitamin Drugs 0.000 claims 1
- 229930003231 vitamin Natural products 0.000 claims 1
- 235000013343 vitamin Nutrition 0.000 claims 1
- 239000011782 vitamin Substances 0.000 claims 1
- TVWHNULVHGKJHS-UHFFFAOYSA-N Uric acid Natural products N1C(=O)NC(=O)C2NC(=O)NC21 TVWHNULVHGKJHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 abstract description 19
- 229940116269 uric acid Drugs 0.000 abstract description 19
- 238000011160 research Methods 0.000 abstract description 10
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 abstract description 9
- 201000010099 disease Diseases 0.000 abstract description 5
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 abstract description 5
- 230000004060 metabolic process Effects 0.000 abstract description 5
- 238000010874 in vitro model Methods 0.000 abstract description 4
- 238000003501 co-culture Methods 0.000 abstract description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 abstract description 2
- 230000009916 joint effect Effects 0.000 abstract 1
- COCYGNDCWFKTMF-UHFFFAOYSA-N 7,8-dihydroxyflavone Chemical compound OC=1C(O)=CC=C(C(C=2)=O)C=1OC=2C1=CC=CC=C1 COCYGNDCWFKTMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 47
- WWGFXSLWIRYIBP-UHFFFAOYSA-N 7,8-dihydroxy-4H-chromen-4-one Natural products O1C=CC(=O)C=2C1=C(O)C(O)=CC=2 WWGFXSLWIRYIBP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 22
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 16
- 241000894007 species Species 0.000 description 11
- LRFVTYWOQMYALW-UHFFFAOYSA-N 9H-xanthine Chemical compound O=C1NC(=O)NC2=C1NC=N2 LRFVTYWOQMYALW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 244000005709 gut microbiome Species 0.000 description 10
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 241000186660 Lactobacillus Species 0.000 description 9
- 229940039696 lactobacillus Drugs 0.000 description 9
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 8
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 8
- 241000588921 Enterobacteriaceae Species 0.000 description 7
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 7
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 6
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 6
- 230000001580 bacterial effect Effects 0.000 description 5
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 5
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 5
- 230000004144 purine metabolism Effects 0.000 description 5
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 5
- 229940075420 xanthine Drugs 0.000 description 5
- 241000605059 Bacteroidetes Species 0.000 description 4
- 241000192125 Firmicutes Species 0.000 description 4
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 4
- 238000007877 drug screening Methods 0.000 description 4
- 230000029142 excretion Effects 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 4
- 241000186000 Bifidobacterium Species 0.000 description 3
- 241000194033 Enterococcus Species 0.000 description 3
- 201000001431 Hyperuricemia Diseases 0.000 description 3
- 241000605861 Prevotella Species 0.000 description 3
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 3
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 3
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 3
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 3
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 3
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 3
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 3
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 241001156739 Actinobacteria <phylum> Species 0.000 description 2
- 241000702462 Akkermansia muciniphila Species 0.000 description 2
- 241000606126 Bacteroidaceae Species 0.000 description 2
- 241000606125 Bacteroides Species 0.000 description 2
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- 241000588722 Escherichia Species 0.000 description 2
- 241001468155 Lactobacillaceae Species 0.000 description 2
- 241000192142 Proteobacteria Species 0.000 description 2
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 2
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 2
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 2
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 2
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 2
- 238000002651 drug therapy Methods 0.000 description 2
- 210000003608 fece Anatomy 0.000 description 2
- 230000006870 function Effects 0.000 description 2
- FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N hypoxanthine Chemical compound O=C1NC=NC2=C1NC=N2 FDGQSTZJBFJUBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 2
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 2
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 2
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 2
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 2
- 230000035484 reaction time Effects 0.000 description 2
- 238000012353 t test Methods 0.000 description 2
- 229910021642 ultra pure water Inorganic materials 0.000 description 2
- 239000012498 ultrapure water Substances 0.000 description 2
- 239000012224 working solution Substances 0.000 description 2
- 241000702460 Akkermansia Species 0.000 description 1
- 241000692822 Bacteroidales Species 0.000 description 1
- 201000005569 Gout Diseases 0.000 description 1
- UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N Hypoxanthine nucleoside Natural products OC1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 UGQMRVRMYYASKQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 241000160321 Parabacteroides Species 0.000 description 1
- 241000896231 Phocaeicola Species 0.000 description 1
- 235000009936 Pteridium aquilinum Nutrition 0.000 description 1
- 108010092464 Urate Oxidase Proteins 0.000 description 1
- 229930003448 Vitamin K Natural products 0.000 description 1
- 238000000246 agarose gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 230000004888 barrier function Effects 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 1
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000008482 dysregulation Effects 0.000 description 1
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 1
- 230000036541 health Effects 0.000 description 1
- 230000007366 host health Effects 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 210000000936 intestine Anatomy 0.000 description 1
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 1
- 230000002503 metabolic effect Effects 0.000 description 1
- 230000007269 microbial metabolism Effects 0.000 description 1
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 1
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 239000008055 phosphate buffer solution Substances 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 238000007781 pre-processing Methods 0.000 description 1
- DBABZHXKTCFAPX-UHFFFAOYSA-N probenecid Chemical compound CCCN(CCC)S(=O)(=O)C1=CC=C(C(O)=O)C=C1 DBABZHXKTCFAPX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229960003081 probenecid Drugs 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 1
- 239000002096 quantum dot Substances 0.000 description 1
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229940043263 traditional drug Drugs 0.000 description 1
- 235000019168 vitamin K Nutrition 0.000 description 1
- 239000011712 vitamin K Substances 0.000 description 1
- 150000003721 vitamin K derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 229940046010 vitamin k Drugs 0.000 description 1
- 238000003260 vortexing Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/025—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/26—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving oxidoreductase
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
- G01N2333/902—Oxidoreductases (1.)
- G01N2333/9029—Oxidoreductases (1.) acting on -CH2- groups (1.17)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明属于生物医药技术领域,尤其涉及一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法。本发明将来源于机体的肠道菌群作为研究对象,以群体为单位构建体外模型,保持肠道菌群的多样性,研究微生物群落的共同作用,促进更精准的肠道菌群导向性研究,并进一步将药物与肠道菌群共培养后通过快速、易行的实验方法获得初步筛选结果,大大缩短了获得结果的时间,再根据所得结果使用更精密的检测手段进行深入研究,提高了筛选意义。本发明将肠道菌群体外模型与黄嘌呤氧化酶活性抑制实验相结合,提供一种靶向肠道菌群的影响尿酸代谢药物的筛选方法,肠道菌群与尿酸代谢关系的研究还可为相关疾病提供新的临床治疗靶点。
Description
技术领域
本发明涉及生物医药技术领域,尤其涉及一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法。
背景技术
肠道中有各种各样的共生细菌和其他微生物。近年来,越来越多的研究表明肠道菌群与机体健康和疾病密切相关。药物治疗正在成为影响肠道菌群的一个重要因素,微生物与药物之间存在复杂的相互作用,即肠道菌群能通过代谢药物从而影响药理作用,而药物反过来也会改变肠道微生物的组成和功能,潜在地影响宿主的健康。随着肠道微生物生态系统和微生物途径逐渐成为药物治疗的新靶点,“药物微生物学”的理论随即被提出。“药物微生物学”即通过了解肠道菌群在药物治疗中的作用,促进靶向肠道菌群的治疗从而提高药物疗效
肠道菌群是一个复杂的微生物生态系统,参与机体的多项生理代谢活动,其中也包括嘌呤代谢,当嘌呤代谢紊乱时会导致尿酸升高,尿酸是嘌呤代谢的终产物,其中黄嘌呤氧化酶(Xanthine Oxidase,XO)是嘌呤代谢中一个关键的限速酶,可以将次黄嘌呤氧化为黄嘌呤,也可以将黄嘌呤氧化为尿酸。尿酸的产生和排泄失衡不仅会影响机体正常生理活动也会导致血液中尿酸水平升高引起高尿酸血症,长期的高尿酸血症会引起痛风并伴发多种疾病。肠道中嘌呤代谢失调也会影响肠道屏障促进肠道炎症。目前临床医学对于体内尿酸过高的治疗药物主要为以下几种:(1)通过抑制黄嘌呤氧化酶进而抑制尿酸生成(别嘌呤醇);(2)促进尿酸排泄(丙磺舒);(3)促进尿酸分解(普瑞凯希)。虽然这些药物对病情能起到缓解作用,但其对机体的副作用也较大,因此开发有效、副作用较小的方法来降低尿酸水平在临床治疗上非常重要。
目前有关影响尿酸代谢药物的研究,还是主要依赖于动物模型体内实验。通过促进尿酸生成、抑制尿酸排泄或抑制尿酸酶活性,从而建立高尿酸血症的动物模型,然后使用药物治疗,进行降尿酸药物的体内筛选,在药物筛选时不仅实验周期长、重复性差,还会存在成本高、操作复杂、效率低等问题;而且,目前药物的筛选较多针对于药物本身对酶活性的抑制作用,不同药物的体内代谢不同,药物进入肠道后与菌群相互作用的研究比较少。
肠道菌群可促进嘌呤和尿酸的分解代谢和排泄,在治疗中起着至关重要的作用,当肾脏出现问题时,肠道便成为代谢尿酸的主要途径,因此研究肠道菌群与尿酸代谢的关系可为相关疾病提供新的临床治疗靶点。基于此,我们提出了一种快速易行、简单高效的基于肠道菌群体外模型建立靶向肠道菌群的降尿酸药物体外筛选方法。
发明内容
本发明目的在于针对上述问题,提出一种基于肠道菌群体外模型建立靶向肠道菌群的降尿酸药物体外筛选方法,提供一种靶向肠道菌群的影响黄嘌呤氧化酶活性体外药物筛选方法。
为了实现上述目的,本发明采用了以下技术方案:
一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法,包括如下步骤:
S1、配制肠道菌群体外模型培养基;
S2、收集小鼠新鲜粪便样本进行预处理,制备粪便微生物悬液,均在厌氧条件下进行;
S3、将步骤S2制备的粪便微生物接种至步骤S1所述培养基后加入供筛选药物共孵育,然后离心收集上清液;
S4、以别嘌呤醇为阳性对照,通过紫外分光光度法测定步骤S3所述供筛选药物自身及步骤S3所得上清液对黄嘌呤氧化酶的抑制活性,排除所述供筛选药物自身对黄嘌呤氧化酶的抑制作用,筛选出靶向肠道菌群影响黄嘌呤氧化酶活性的药物;
S5、检测步骤S4筛选出的药物与步骤S2制备的粪便微生物共孵育后样品中肠道菌群差异及优势菌群相对丰度的变化,判断所述供筛选药物对肠道菌群的影响。
作为本发明一种优选的技术方案,步骤S1所述培养基的配制方法包括如下步骤:在水中加入蛋白胨水、酵母提取物、L-半胱氨酸盐酸盐、NaCl、K2HPO4、KH2PO4、MgSO4·7H2O、CaCl2·2H2O、NaHCO3、氯化血红素、维生素K1、胆酸、鹅去氧胆酸、吐温80,其中不溶于水的物质均使用相应溶剂完全溶解后再加入培养基中,超声溶解,调节pH值至6.5±0.2,过滤除菌后,避光保存。
作为本发明一种优选的技术方案,所述培养基中各物质浓度为:蛋白胨水2.0g/L、酵母提取物2.0g/L、L-半胱氨酸盐酸盐0.5g/L、NaCl 1.0g/L、K2HPO4 0.4g/L、KH2PO4 0.4g/L、MgSO4·7H2O 0.1g/L、CaCl2·2H2O 0.1g/L、NaHCO3 4.0g/L、氯化血红素5mg/L、维生素K110μL/L、胆酸0.25g/L、鹅去氧胆酸0.25g/L、吐温80 2mL/L。
作为本发明一种优选的技术方案,步骤S2所述粪便微生物悬液制备方法为:将粪便样品加入含有L-半胱氨酸盐酸盐磷酸盐缓冲液中混匀,经步骤S1所述培养基重复均质离心、合并上清液离心收集沉淀,使用所述培养基进行重悬,沉淀与培养基的比例为80:1~100:1(mg/mL)。
作为本发明一种优选的技术方案,步骤S3所述供筛选药物选自中草药提取物、化学合成药物、生物制剂中的一种。
作为本发明一种优选的技术方案,步骤S3所述粪便微生物接种的最终接种浓度为18%~23%(w/v),所述供筛选药物终浓度为95~100μM,厌氧共孵育48h。
本发明还提供了上述方法在筛选靶向肠道菌群的降尿酸药物中的应用。
与现有技术相比,本发明的有益效果是:
(1)本发明将肠道菌群体外模型与黄嘌呤氧化酶活性抑制实验相结合,提供一种靶向肠道菌群的影响尿酸代谢药物的筛选方法。弥补传统药物研究的不足,为体外研究药物与微生物互作、微生物代谢以及药物筛选提供理论与实践基础。
(2)本发明将来源于机体的菌群作为研究对象,以群体为单位构建体外模型,尽可能的保持菌群的多样性,研究微生物群落的共同作用,促进更精准的菌群导向性研究,并进一步将药物与菌群共培养后通过快速、易行的实验方法获得初步筛选结果,大大缩短了获得结果的时间,再根据所得结果使用更精密的检测手段进行深入研究,提高了研究意义。
附图说明
图1为本发明所述的筛选方法流程示意图。
图2为实施例1中大黄酸与肠道菌群共孵育后上清液对XO的相对抑制率柱状图。
图3为实施例1中大黄酸单独对XO的相对抑制率柱状图。
图4为实施例1中大黄酸处理后在肠道菌群微生物丰度变化图。
图5为实施例1中大黄酸处理后在肠道菌群微生物物种差异分析图。
图6为为实施例1中大黄酸处理组优势菌属相对丰度的变化图,t检验:*:P<0.05;**:P<0.01;***:P<0.001。
图7为本发明实施例2中7,8-二羟基黄酮与肠道菌群共孵育后上清液对XO的相对抑制率柱状图。
图8为本发明实施例2中7,8-二羟基黄酮单独对XO的相对抑制率柱状图。
图9为本发明实施例2中7,8-二羟基黄酮处理后肠道菌群平均相对丰度柱状图,其中,图9a是门水平微生物丰度分析(Phylum);图9b是科水平微生物丰度分析(Family);图9c是属水平微生物丰度分析(Genus);Control:空白对照组;7,8-DHF:7,8-二羟基黄酮组。
图10为本发明实施例2中7,8-二羟基黄酮处理后肠道菌群中差异物种LEfSe分析图。
图11为本发明实施例2中7,8-二羟基黄酮处理组菌属相对丰度的变化图,t检验:*:P<0.05;**:P<0.01;***:P<0.001。
具体实施方式
下面将结合本发明实施例,对本发明的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。基于本发明中的实施例,本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明保护的范围。
本发明实施例中所使用的实验方法如无特殊说明,均为常规方法;所使用的材料、试剂等,如无特殊说明,为可从商业途径得到的试剂和材料。
实施例1
在本实施案例中,我们选择以大黄酸作为待筛选药物,具体筛选方法包括以下步骤:
1、配制肠道菌群体外模型培养基
在灭菌超纯水中加入蛋白胨水(2.0g/L)、酵母提取物(2.0g/L)、L-半胱氨酸盐酸盐(0.5g/L)、NaCl(1.0g/L)、K2HPO4(0.4g/L)、KH2PO4(0.4g/L)、MgSO4·7H2O(0.1g/L)、CaCl2·2H2O(0.1g/L)、NaHCO3(4.0g/L)、氯化血红素(5mg/L)、维生素K1(10μL/L)、胆酸(0.25g/L)、鹅去氧胆酸(0.25g/L)、吐温80(2mL/L),其中不溶于水的物质均使用相应的溶剂完全溶解后再加入培养基中,超声完全溶解,使用pH计用稀盐酸调节pH值至6.5±0.2(25℃),用0.22μm滤头过滤除菌,4℃避光保存备用。
2、制备粪便微生物悬液
收集小鼠新鲜粪便样本:样品采集后的预处理均在厌氧工作站(10%H2,10%CO2和80%N2,37℃)中进行,实验中所需的所有材料及试剂等均提前放入厌氧工作站中进行预还原处理,具体方法步骤如下:
(1)收集新鲜小鼠粪便0.1g放入含有250μL0.1%L-半胱氨酸盐酸盐PBS溶液的无菌2mL离心管中。
(2)迅速转移至厌氧工作站,打开管盖,进行气体交换,充分涡旋混匀至接近均质状态。
(3)加入750μL培养基,以最大转速涡旋15s;室温,1000rpm,离心30s。
(4)将离心得到的上清(约750μL)转移至洁净无菌的2mL离心管A中。
(5)剩余沉淀中加入750μL培养基,以最大转速涡旋15s;室温,1000rpm,离心30s。
(6)将离心得到的上清(约750μL)转移至步骤“4”中的2mL离心管A中。
(7)剩余沉淀中加入750μL培养基,以最大转速涡旋15s;室温,1000rpm,离心30s。
(8)将离心得到的上清(约750μL)转移至洁净无菌的2mL离心管B中。
(9)剩余沉淀中加入750μL培养基,以最大转速涡旋15s;室温,1000rpm,离心30s。
(10)将离心得到的上清(约750μL)转移至步骤“8”中的2mL离心管B中(此时应有2个含有约1.5mL上清液的2mL离心管)。
(11)将含有约1.5mL上清液的2mL离心管A,室温,4,000×g离心5min。
(12)将离心后的上清液小心移出弃去,将含有约1.5mL上清液的2mL离心管B中液体转移至离心管A;室温,4,000×g离心5min。
(13)将离心后的上清液小心移出弃去,用1mL培养基重悬,得到小鼠粪便微生物悬液。
3、药物处理(大黄酸与肠道菌群共孵育)
(1)将按照处理后的小鼠粪便微生物悬液按照最终接种浓度为40%(w/v)立即接种至优化后的Mipro培养基中,涡旋充分混匀。
(2)药物处理组:吸取500μL浓度为40%(w/v)的小鼠粪便微生物悬液至96深孔板中;每孔加入浓度为1mM的大黄酸工作液100μL以及400μL培养基。
(3)阳性对照组:吸取500μL浓度为40%(w/v)的小鼠粪便微生物悬液至96深孔板中;每孔加入浓度为1mM的别嘌呤醇工作液100μL以及400μL培养基。
(4)空白对照组:以不加药仅含有DMSO处理的小鼠粪便悬液作为空白对照,实验条件下DMSO的最终浓度为1%。
(5)静置在37℃、厌氧条件下共孵育48h。
4、大黄酸与肠道菌群孵育后上清对黄嘌呤氧化酶抑制活性的测定
(1)将各处理组样品孵育48h后快速取出并转移至洁净无菌的2mL离心管中,在室温下,5,000rpm离心10min,吸取样品上清进行检测,剩余样品于-80℃保存。
(2)取样品上清100μL加入96孔板中,再加入50μL黄嘌呤氧化酶(0.04U/mL),吹打混匀后,于37℃静置60min;加入50μL黄嘌呤(400μmol/L)启动反应,吹打混匀注意不要有气泡。
(3)使用多功能酶标仪检测20min内290nm处吸光值随时间的变化,每120s检测一次。实验结果经过三个生物学重复后进行统计分析。以反应时间为横坐标,吸光值为纵坐标作图并计算出曲线斜率,即样品组反应速率为As;空白对照组反应速率为Ac;相对抑制率计算方法如下:
结果分析
大黄酸与菌群共孵育后上清液对XO的相对抑制率计算结果如图2所示,阳性对照组别嘌呤醇与菌群共孵育后的上清液对黄嘌呤氧化酶的相对抑制率为(60.15%±0.66)%。大黄酸与菌群共孵育后的上清液对黄嘌呤氧化酶的相对抑制率为(57.50%±4.51)%。
5、大黄酸单独对黄嘌呤氧化酶活性的抑制效果
(1)实验中阳性对照组为别嘌呤醇,空白对照组为含有1%DMSO的培养基,取大黄酸、别嘌呤醇(100μM)100μL加入96孔板中,再加入50μL黄嘌呤氧化酶(0.04U/mL),吹打混匀后,于37℃静置60min;加入50μL黄嘌呤(400μmol/L)启动反应,吹打混匀注意不要有气泡。
(2)使用多功能酶标仪检测20min内290nm处吸光值随时间的变化,每120s检测一次。实验结果经过三个生物学重复后进行统计分析。以反应时间为横坐标,吸光值为纵坐标作图并计算出曲线斜率,即样品组反应速率为As;空白对照组反应速率为Ac;相对抑制率计算方法如下:
结果分析
大黄酸单独对XO的相对抑制率计算结果如图3所示,阳性对照组别嘌呤醇单独对黄嘌呤氧化酶的相对抑制率为(74.75%±4.63)%。大黄酸单独对黄嘌呤氧化酶无明显抑制作用,其相对抑制率为0%,排除了大黄酸自身对黄嘌呤氧化酶活性的抑制作用,判定该待筛选药物大黄酸为靶向肠道菌群影响黄嘌呤氧化酶活性的药物。
6、大黄酸对肠道菌群的调节效果检测
1实验材料
QIAamp PowerFecal Pro DNA Kit,凯杰生物科技有限公司;SYBR qPCR MasterMix,南京诺唯赞生物科技股份有限公司。
2宏基因组测序
(1)文库构建及上机测序
使用DNA提取试剂盒提取样本DNA并检测合格后,使用超声破碎仪随机打断后进行文库构建。构建完成后,用Qubit 2.0进行初步定量,稀释文库,随后检测文库的插入片段,并对文库的有效浓度进行定量。库检合格后,按照有效浓度及目标下机数据量的需求使用Illumina PE150(2x150)平台测序。
(2)数据预处理
对测序获得的原始数据(Raw Data),进行预处理,包括质控和去宿主序列获取用于后续分析的有效序列(Clean Data)。
(3)物种及功能注释与评估
使用Kraken2软件对有效序列进行物种注释分类,用Bracken软件对样本中物种的实际丰度进行估计。使用HUMAnN2软件将质控和去宿主之后的序列与UniRef 90进行比对,根据UniRef 90ID和各功能数据库的对应关系,得到各个功能数据库的注释信息和相对丰度表。
(4)数据处理
采用LEfSe(Linear discriminant analysis Effect Size,LEfSe)分析方法进行差异显著性分析,并根据线性判别分析(LDA)对数据进行分类和评估差异显著物种的影响力(即LDA score),LDA阈值默认为2~4,绘制LDA柱状图。
结果分析
药物处理后在肠道菌群微生物丰度变化结果如图4所示:
图4a展示了大黄酸处理后菌群在门分类水平上物种丰度的变化情况。从图中可以看出菌群主要分属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及放线菌门(Actinobacteria)。与空白对照组相比,大黄酸处理后引起菌群中厚壁菌门的丰度升高以及拟杆菌门丰度降低。
图4b展示了大黄酸处理后肠道菌群在科分类水平上物种丰度的变化情况。从各组在科水平下的菌群相对丰度可知,肠杆菌科(Enterobacteriaceae)在各组的检出率相似。与空白对照组相比,大黄酸处理组菌群中乳杆菌科(Lactobacillaceae)平均相对丰度增加,拟杆菌科(Bacteroidaceae)平均相对丰度降低。
图4c展示了大黄酸处理后肠道菌群在属分类水平上物种丰度的变化情况。从各组在属水平下的菌群相对丰度可知,肠杆菌科的埃希菌属(Escherichia)在各组的占比较为接近。而药物处理组的乳杆菌科的三个菌属(Lactobacillus、Limosilactobacillus以及Ligilactobacillus)的平均相对丰度均高于空白对照组。
药物处理后在菌群微生物物种差异分析结果:
由图5可知,与空白对照组相比,经过大黄酸处理后肠道菌群中乳杆菌科Lactobacillus菌属、Limosilactobacillus菌属以及Ligilactobacillus菌属的丰度显著升高,而菌群中Phocaeicola菌属和Parabacteroides菌属的丰度下降。
3通过实时荧光定量PCR检测菌群中调节菌属在药物处理后相对丰度的变化:
(1)药物与菌群培养后的沉淀物于-80℃储存的样品取出自然解冻。
(2)按照QIAamp○R PowerFecal○R Pro DNA Kit粪便基因组提取试剂盒的说明书,提取样品DNA。
(3)通过琼脂糖凝胶电泳检测DNA提取质量,并使用Nano Drop微量紫外分光光度计检测DNA浓度和纯度,保存于-20℃冰箱备用。
(4)采用SYBR荧光染料法进行qPCR实验,将质检合格后的样本总DNA,用无菌超纯水稀释至10ng/μL作为qPCR待测DNA模板,检测拟杆菌属(Bacteroides)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)、乳杆菌属(Lactobacillus)、普雷沃菌属(Prevotella);嗜黏蛋白阿克曼菌(Akkermansia)、肠球菌属(Enterococcus)、以及肠杆菌科(Enterobacteriaceae),所有检测模板的不同引物均设置3个技术重复,且每个引物组都包含一个非模板阴性对照。
(5)采用2-ΔΔCt法分析各菌属目的基因的相对差异倍数即相对丰度。ΔΔCt=(实验组目的基因Ct值-实验组内参基因Ct值)-(对照组目的基因Ct值-对照组内参基因Ct值),实验组与对照组目的基因相对表达的差异倍数计算公式为:
Fold Change=2-ΔΔCt
结果分析
实时荧光定量PCR检测结果如图6所示,经大黄酸处理后肠道菌群中拟杆菌属(P<0.001)、普雷沃菌属(P<0.001)、肠杆菌科(P<0.01)细菌相对丰度显著下降,乳杆菌属、肠球菌属细菌相对丰度显著上升(P<0.001),对双歧杆菌属、嗜黏蛋白阿克曼菌丰度的影响差异不显著(P>0.05)。
实施例2
在本实施案例中,我们选择以7,8-二羟基黄酮作为待筛选药物,具体筛选方法及步骤与实施例1相同。
结果分析
7,8-二羟基黄酮与肠道菌群共孵育后上清液对XO的相对抑制率计算结果如图7所示,阳性对照组别嘌呤醇与肠道菌群共孵育后的上清液对黄嘌呤氧化酶的相对抑制率为(60.15%±0.66)%。7,8-二羟基黄酮与肠道菌群共孵育后的上清液对黄嘌呤氧化酶的相对抑制率为(50.57%±1.15)%。
7,8-二羟基黄酮单独对XO的相对抑制率计算结果如图8所示,阳性对照组别嘌呤醇单独对黄嘌呤氧化酶的相对抑制率为(74.75%±4.63)%。7,8-二羟基黄酮单独对黄嘌呤氧化酶无明显抑制作用,其相对抑制率为(1.40%±1.80)%,判定该待筛选药物7,8-二羟基黄酮为靶向肠道菌群影响黄嘌呤氧化酶活性的药物。
7,8-二羟基黄酮处理后在肠道菌群微生物丰度变化结果如图9所示:
图9a展示了7,8-二羟基黄酮处理后肠道菌群在门分类水平上物种丰度的变化情况。从图中可以看出菌群主要分属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)以及放线菌门(Actinobacteria)。与空白对照组相比,7,8-二羟基黄酮处理后引起菌群中厚壁菌门的丰度升高以及拟杆菌门丰度降低。
图9b展示了7,8-二羟基黄酮处理后肠道菌群在科分类水平上物种丰度的变化情况。从各组在科水平下的菌群相对丰度可知,肠杆菌科(Enterobacteriaceae)在各组的检出率相似。与空白对照组相比,7,8-二羟基黄酮处理组菌群中乳杆菌科(Lactobacillaceae)平均相对丰度增加,拟杆菌科(Bacteroidaceae)平均相对丰度降低。
图9c展示了7,8-二羟基黄酮处理后肠道菌群在属分类水平上物种丰度的变化情况。从各组在属水平下的菌群相对丰度可知,肠杆菌科的埃希菌属(Escherichia)在各组的占比较为接近。而药物处理组的乳杆菌科的三个菌属(Lactobacillus、Limosilactobacillus以及Ligilactobacillus)的平均相对丰度均高于空白对照组。
7,8-二羟基黄酮处理后在菌群微生物物种差异分析结果:
由图10可知,与空白对照组相比,经过7,8-二羟基黄酮处理后肠道菌群中乳杆菌科Lactobacillus菌属以及Ligilactobacillus菌属的丰度显著升高;拟杆菌目(Bacteroidales)的细菌丰度显著下降。
实时荧光定量PCR检测结果如图11所示,7,8-二羟基黄酮处理后肠道菌群中拟杆菌属(P=0.004)相对丰度显著下降,乳杆菌属相对丰度显著上升(P=0.004),对双歧杆菌属、普雷沃菌属、嗜黏蛋白阿克曼菌、肠球菌属和肠杆菌科的影响差异不显著(P>0.05)。
综上,大黄酸和7,8-二羟基黄酮单独对黄嘌呤氧化酶无明显抑制作用,而是通过调节肠道菌群对黄嘌呤氧化酶活性产生了抑制作用。至此,本发明利用构建的筛选方法实现了对化合物大黄酸和7,8-二羟基黄酮靶向肠道菌群影响黄嘌呤氧化酶活性进行了筛选与效果验证。
显然,本发明的上述实施例仅仅是为了清楚地说明本发明技术方案的所作的举例,而并非是对本发明的具体实施方式的限定。凡在本发明权利要求书的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明权利要求的保护范围之内。
Claims (7)
1.一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1、配制肠道菌群体外模型培养基;
S2、收集小鼠新鲜粪便样本进行预处理,并制备粪便微生物悬液,均在厌氧条件下进行;
S3、将步骤S2制备的粪便微生物接种至步骤S1所述培养基后加入供筛选药物共孵育,然后离心收集上清液;
S4、以别嘌呤醇为阳性对照,通过紫外分光光度法测定步骤S3所述供筛选药物自身及步骤S3所得上清液对黄嘌呤氧化酶的抑制活性,排除所述供筛选药物自身对黄嘌呤氧化酶的抑制作用,筛选出靶向肠道菌群影响黄嘌呤氧化酶活性的药物;
S5、检测步骤S4筛选出的药物与步骤S2制备的粪便微生物共孵育后样品中肠道菌群差异及优势菌群相对丰度的变化,判断所述供筛选药物对肠道菌群的影响。
2.根据权利要求1所述的一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法,其特征在于,步骤S1所述培养基的配制方法包括如下步骤:在水中加入蛋白胨水、酵母提取物、L-半胱氨酸盐酸盐、NaCl、K2HPO4、KH2PO4、MgSO4·7H2O、CaCl2·2H2O、NaHCO3、氯化血红素、维生素K1、胆酸、鹅去氧胆酸、吐温80,其中不溶于水的物质均使用相应溶剂完全溶解后再加入培养基中,超声溶解,调节pH值至6.5±0.2,过滤除菌后,避光保存。
3.根据权利要求2所述的一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法,其特征在于,所述培养基中各物质浓度为:蛋白胨水2.0g/L、酵母提取物2.0g/L、L-半胱氨酸盐酸盐0.5g/L、NaCl 1.0g/L、K2HPO4 0.4g/L、KH2PO4 0.4g/L、MgSO4·7H2O 0.1g/L、CaCl2·2H2O 0.1g/L、NaHCO3 4.0g/L、氯化血红素5mg/L、维生素K1 10μL/L、胆酸0.25g/L、鹅去氧胆酸0.25g/L、吐温80 2mL/L。
4.根据权利要求1所述的一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法,其特征在于,步骤S2所述粪便微生物悬液制备方法为:将粪便样品加入含有L-半胱氨酸盐酸盐磷酸盐缓冲液中混匀,经步骤S1所述培养基重复均质离心、合并上清液离心收集沉淀,使用所述培养基进行重悬,沉淀与培养基的比例为80:1~100:1(mg/mL)。
5.根据权利要求1所述的一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法,其特征在于,步骤S3所述供筛选药物选自中草药提取物、化学合成药物、生物制剂中的一种。
6.根据权利要求1所述的一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法,其特征在于,步骤S3所述粪便微生物接种的最终接种浓度为18%~23%(w/v),所述供筛选药物终浓度为95~100μM,厌氧共孵育48h。
7.权利要求1-6任一所述方法在筛选靶向肠道菌群的降尿酸药物中的应用。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202210799165.4A CN115232855B (zh) | 2022-07-08 | 2022-07-08 | 一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202210799165.4A CN115232855B (zh) | 2022-07-08 | 2022-07-08 | 一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN115232855A true CN115232855A (zh) | 2022-10-25 |
CN115232855B CN115232855B (zh) | 2025-04-04 |
Family
ID=83671075
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202210799165.4A Active CN115232855B (zh) | 2022-07-08 | 2022-07-08 | 一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN115232855B (zh) |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2019068854A (ja) * | 2019-01-22 | 2019-05-09 | 国立大学法人宇都宮大学 | 血中尿酸値低下作用を有する物質のスクリーニング法 |
CN110643686A (zh) * | 2019-10-24 | 2020-01-03 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 | 在体筛选具有潜在微生物调节能力的药物的方法 |
CN111307982A (zh) * | 2020-03-17 | 2020-06-19 | 中国科学院微生物研究所 | 一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台 |
CN112458027A (zh) * | 2020-12-16 | 2021-03-09 | 江南大学 | 一株格氏乳杆菌及其缓解和治疗高尿酸血症的用途 |
CN113140266A (zh) * | 2021-05-20 | 2021-07-20 | 东北农业大学 | 一种用于降尿酸的黄嘌呤氧化酶抑制剂的筛选方法 |
CN114149947A (zh) * | 2021-12-02 | 2022-03-08 | 山东宝来利来生物工程股份有限公司 | 一株产尿酸氧化酶并抑制黄嘌呤氧化酶的植物乳杆菌及其应用 |
CN114277083A (zh) * | 2021-12-10 | 2022-04-05 | 南京美新诺医药科技有限公司 | 研究药物肠道菌群代谢的体外模型的构建和分析方法 |
-
2022
- 2022-07-08 CN CN202210799165.4A patent/CN115232855B/zh active Active
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
JP2019068854A (ja) * | 2019-01-22 | 2019-05-09 | 国立大学法人宇都宮大学 | 血中尿酸値低下作用を有する物質のスクリーニング法 |
CN110643686A (zh) * | 2019-10-24 | 2020-01-03 | 上海交通大学医学院附属仁济医院 | 在体筛选具有潜在微生物调节能力的药物的方法 |
CN111307982A (zh) * | 2020-03-17 | 2020-06-19 | 中国科学院微生物研究所 | 一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台 |
CN112458027A (zh) * | 2020-12-16 | 2021-03-09 | 江南大学 | 一株格氏乳杆菌及其缓解和治疗高尿酸血症的用途 |
CN113140266A (zh) * | 2021-05-20 | 2021-07-20 | 东北农业大学 | 一种用于降尿酸的黄嘌呤氧化酶抑制剂的筛选方法 |
CN114149947A (zh) * | 2021-12-02 | 2022-03-08 | 山东宝来利来生物工程股份有限公司 | 一株产尿酸氧化酶并抑制黄嘌呤氧化酶的植物乳杆菌及其应用 |
CN114277083A (zh) * | 2021-12-10 | 2022-04-05 | 南京美新诺医药科技有限公司 | 研究药物肠道菌群代谢的体外模型的构建和分析方法 |
Non-Patent Citations (6)
Title |
---|
HUI YIN ET AL.: "The Role of the Intestine in the Development of Hyperuricemia", 《FRONT IMMUNOL》, vol. 13, 24 February 2022 (2022-02-24), pages 1 - 8 * |
JING WANG ET AL.: "The gut microbiota as a target to control hyperuricemia pathogenesis: Potential mechanisms and therapeutic strategies", 《CRIT REV FOOD SCI NUTR》, vol. 62, no. 14, 22 January 2021 (2021-01-22), pages 3979 - 3989 * |
万茵 等: "体外模拟消化对车前子来源毛蕊花苷抑制黄嘌呤氧化酶活性的影响", 《食品科学》, vol. 38, no. 17, 1 December 2016 (2016-12-01), pages 10 * |
周蓓蓓 等: "高尿酸血症与肠道菌群的相关性", 《中华临床免疫和变态反应杂志》, vol. 14, no. 01, 29 February 2020 (2020-02-29), pages 76 - 80 * |
朱发伟 等: "桑抹茶对高尿酸血症模型大鼠血尿酸水平及肠道菌群的影响", 《中国现代应用药学》, vol. 34, no. 8, 20 August 2017 (2017-08-20), pages 1084 * |
王琨 等: "茯苓对高尿酸血症大鼠肾损伤及肠道菌群的影响", 《食品科学》, vol. 43, no. 21, 11 March 2022 (2022-03-11), pages 171 - 179 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN115232855B (zh) | 2025-04-04 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
AU2015226811B2 (en) | Composition and method for stabilizing nucleic acids in biological samples | |
CN113186309B (zh) | 泌尿系统细菌感染检测体系及其试剂盒和应用 | |
CN108265120B (zh) | 一种16联牛乳房炎致病菌核酸分型试剂盒及其检测方法 | |
Li et al. | Modulation of gut microbiota, short-chain fatty acid production, and inflammatory cytokine expression in the cecum of porcine deltacoronavirus-infected chicks | |
CN106987626A (zh) | 用于快速检测多种真菌并鉴定菌种的引物和探针及其应用 | |
Wang et al. | Lactococcus cremoris D2022 alleviates hyperuricemia and suppresses renal inflammation via potential gut-kidney axis | |
CN117004510A (zh) | 乳酸乳球菌乳脂亚种及在制备高尿酸血症预防或治疗药物中的应用 | |
Nissen et al. | Sourdough process and spirulina-enrichment can mitigate the limitations of colon fermentation performances of gluten-free breads in non-celiac gut model | |
CN115747092B (zh) | 两株具有显著降血压功能的植物乳杆菌sr37-3和sr61-2及应用 | |
CN116064331A (zh) | 戊糖乳杆菌及在制备抗高尿酸血症预防或治疗药物中的应用 | |
Yan et al. | Cultivation and genomic characterization of the bile bacterial species from cholecystitis patients | |
Sun et al. | Wild-type Escherichia coli Nissle 1917 improves hyperuricemia by anaerobically degrading uric acid and maintaining gut microbiota profile of mice | |
Yu et al. | Comparison of metagenomic next-generation sequencing and blood culture for diagnosis of bloodstream infections | |
CN109266764B (zh) | 一种检测常见益生菌丰度的试剂盒 | |
CN115232855A (zh) | 一种靶向肠道菌群筛选影响黄嘌呤氧化酶活性药物的方法 | |
CN117736929A (zh) | 一株戊糖片球菌及其应用 | |
CN106755470A (zh) | 一种利用q‑pcr检测混合益生菌中益生菌种类和含量的方法 | |
CN101469316B (zh) | 检测类/抗维甲酸化合物的双杂交酵母以及生物测试方法 | |
CN112618578B (zh) | 肠膜明串珠菌tci007或其代谢产物用于改善过敏状况的用途 | |
CN115252600A (zh) | 一种靶向肠道菌群的黄嘌呤氧化酶抑制剂及其应用 | |
CN110616163B (zh) | 能够降低三甲胺浓度的粪肠球菌及其制备方法和应用 | |
CN111307982A (zh) | 一种药物候选物对肠道菌群作用效果的体外高通量筛选平台 | |
Hamed et al. | Conventional and Molecular Diagnosisof Salmonella typhi isolated from Iraqi Patients with Typhoid Fever | |
CN117701742A (zh) | 多氏拟杆菌的种特异性分子靶标及其快速检测方法 | |
CN114940987A (zh) | 一种无差别适用于真菌、革兰氏阳性菌及阴性菌的核酸提取裂解液及其应用 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |