CN115210236A - 作为Toll样受体7(TLR7)激动剂的1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶化合物 - Google Patents
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Abstract
根据式I的化合物可用作Toll样受体7(TLR7)的激动剂。此类化合物可以用于癌症治疗,尤其是与抗癌免疫治疗剂组合,或用作疫苗佐剂。
Description
相关申请的交叉引用
本申请根据35 U.S.C.§119(e)要求2020年7月28日提交的美国临时申请序列号63/057,644和2020年1月27日提交的美国临时申请序列号62/966,085的权益;将其公开内容通过引用并入本文。
背景技术
本公开文本涉及Toll样受体7(“TLR7”)激动剂及其缀合物以及用于此类激动剂及其缀合物的制备和使用方法。
Toll样受体(“TLR”)是识别病原体相关分子模式(“PAMP”)的受体,所述病原体相关分子模式是在某些种类的病原体中保守的小分子基序。TLR可以位于细胞表面或细胞内。通过结合其同源PAMP而激活TLR传递了宿主内存在相关病原体(即感染)的信号并且刺激宿主的免疫系统以抵抗感染。人具有10种TLR,称为TLR1、TLR2、TLR3等。
通过激动剂激活TLR-TLR7是被研究最多的-可以对疫苗和免疫治疗剂通过刺激总体免疫应答而在治疗除实际病原体感染以外的多种病症中的作用产生积极效果。因此,对TLR7激动剂在癌症免疫疗法中作为疫苗佐剂或作为增强剂的用途存在很大兴趣。参见例如,Vasilakos和Tomai 2013、Sato-Kaneko等人2017、Smits等人2008、和Ota等人2019。
TLR7(位于内体膜上的细胞内受体)识别与单链RNA病毒相关的PAMP。它的激活会诱导I型干扰素(诸如IFNα和IFNβ)的分泌(Lund等人2004)。TLR7具有两个结合位点,一个用于结合单链RNA配体(等人2007)并且一个用于结合小分子(诸如鸟苷)(Zhang等人2016)。
TLR7可以结合基于1H-咪唑并[4,5-c]喹啉骨架的鸟苷样合成激动剂(诸如咪喹莫特、瑞喹莫德和嘎德莫特)并且被其激活。关于小分子TLR7激动剂的综述,参见Cortez和Va2018。
基于喋啶酮分子骨架的合成TLR7激动剂也是已知的,如通过维沙莫德(vesatolimod)例示(Desai等人2015)。
经常根据通式(A)公开基于嘌呤样骨架的其他合成TLR7激动剂:
其中R、R’和R”是结构变量,并且R”典型地含有未取代的或取代的芳族或杂芳族环。
具有嘌呤样骨架的生物活性分子及其在治疗诸如纤维化、炎性障碍、癌症或病原性感染的病症中的用途的公开文本包括:Akinbobuyi等人2015和2016;Barberis等人2012;Carson等人2014;Ding等人2016、2017a、和2017b;Graupe等人2015;Hashimoto等人2009;He等人2019a和2019b;Holldack等人2012;Isobe等人2009a和2012;Poudel等人2019a和2019b;Pryde 2010;和Young等人2019。
基团R”可以是吡啶基:Bonfanti等人2015a和2015b;Halcomb等人2015;Hirota等人2000;Isobe等人2002、2004、2006、2009a、2009b、2011、和2012;Kasibhatla等人2007;Koga-Yamakawa等人2013;Musmuca等人2009;Nakamura 2012;Ogita等人2007;和Yu等人2013。
公开了其中式(A)的6,5-稠合环系统-与咪唑五元环稠合的嘧啶六元环-被修饰的相关分子。(a)Dellaria等人2007、Jones等人2010和2012、和Pilatte等人2017公开了其中嘧啶环被吡啶环替代的化合物。(b)Chen等人2011、Coe等人2017、Poudel等人2020a和2020b、和Zhang等人2018公开了其中咪唑环被吡唑环替代的化合物。(c)Cortez等人2017和2018;Li等人2018;和McGowan等人2016a、2016b、和2017公开了其中咪唑环被吡咯环替代的化合物。
Bonfanti等人2015b和2016以及Purandare等人2019公开了其中大环跨越嘌呤部分的两个环的TLR7调节剂:
TLR7激动剂可以与配偶体分子缀合,所述配偶体分子可以是例如磷脂、聚(乙二醇)(“PEG”)、抗体或另一种TLR(通常是TLR2)。示例性的公开文本包括:Carson等人2013、2015、和2016;Chan等人2009和2011;Cortez等人2017;Gadd等人2015;Lioux等人2016;Maj等人2015;Vernejoul等人2014;和Zurawski等人2012。频繁的缀合位点是在式(A)的R”基团处。
Jensen等人2015公开了阳离子脂质媒介物用于递送TLR7激动剂的用途。
一些TLR7激动剂(包括瑞喹莫德)是双重TLR7/TLR8激动剂。参见例如,Beesu等人2017、Embrechts等人2018、Lioux等人2016和Vernejoul等人2014。
本说明书的结尾处列出了通过第一作者或发明人和年份对本文中引用的文献的完全引用。
发明内容
本说明书涉及具有1H-吡唑并[4,3d]嘧啶芳族系统的化合物,其具有作为TLR7激动剂的活性。
在一方面,提供了一种具有根据式I的结构的化合物
其中
每个X独立地是N或CR2;
X1是O、CH2、NH、S或N(C1-C3烷基);
R1是(C1-C5烷基)、
(C2-C5烯基)、
(C1-C8烷二基)0-1(C3-C6环烷基)、
(C1-C8烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
(C2-C8烷二基)OH、
(C2-C8烷二基)O(C1-C3烷基)、
(C1-C4烷二基)0-1(5-6元杂芳基)、
(C1-C4烷二基)0-1苯基、
(C1-C4烷二基)CF3、
(C2-C8烷二基)N[C(=O)](C1-C3烷基)、
或
(C2-C8烷二基)NRxRy;
每个R2独立地是H、O(C1-C3烷基)、S(C1-C3烷基)、SO2(C1-C3烷基)、C1-C3烷基、O(C3-C4环烷基)、S(C3-C4环烷基)、SO2(C3-C4环烷基)、C3-C4环烷基、Cl、F、CN、或[C(=O)]0-1NRxRy;
R3是H、卤基、OH、CN、
NH2、
NH[C(=O)]0-1(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
O(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C4-C8双环烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C1-C6烷基)、
N[C1-C3烷基]C(=O)(C1-C6烷基)、
NH(SO2)(C1-C5烷基)、
NH(SO2)(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH(SO2)(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH(SO2)(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
6元芳族或杂芳族部分、
5元杂芳族部分、或
具有以下结构的部分:
R4是NH2、
NH(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
或
具有以下结构的部分:
R5是H、C1-C5烷基、C2-C5烯基、C3-C6环烷基、卤基、O(C1-C5烷基)、(C1-C4烷二基)OH、(C1-C4烷二基)O(C1-C3烷基)、苯基、NH(C1-C5烷基)、5或6元杂芳基、
R6是NH2、
(NH)0-1(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
(NH)0-1(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
(NH)0-1(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
(NH)0-1(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
或
具有以下结构的部分:
Rx和Ry独立地是H或C1-C3烷基或者Rx和Ry与它们所键合的氮组合以形成3至7元杂环;
m是0或1;
n是1、2或3;
并且
p是0、1、2或3;
其中在R1、R2、R3、R4、R5和R6中
烷基、环烷基、烷二基、双环烷基、螺烷基、环胺、6元芳族或杂芳族部分、5元杂芳族部分或式
的部分任选地被一个或多个选自以下的取代基取代:OH、卤基、CN、(C1-C3烷基)、O(C1-C3烷基)、C(=O)(C1-C3烷基)、SO2(C1-C3烷基)、NRxRy、
(C1-C4烷二基)OH、(C1-C4烷二基)O(C1-C3烷基);
并且
烷基、烷二基、环烷基、双环烷基、螺烷基、或式
的部分可以具有被以下替代的CH2基团:O、SO2、CF2、C(=O)、NH、
N[C(=O)]0-1(C1-C3烷基)、
N[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1CF3、
或
N[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C3-C5环烷基)。
本文公开的化合物具有作为TLR7激动剂的活性,并且一些化合物可以与抗体缀合,用于靶向递送至预期作用的靶组织或器官。还可以将其聚乙二醇化,以调节其药物特性。
本文公开的化合物或其缀合物或其聚乙二醇化衍生物可以用于通过向患有顺从通过激活免疫系统的治疗的病症的受试者施用治疗有效量的此类化合物或其缀合物或其聚乙二醇化衍生物(尤其是与疫苗或癌症免疫治疗剂组合)来治疗此类受试者。
具体实施方式
化合物
在式(I)的一个实施方案中,m是0。
在一方面,在式(I)中,
在另一方面,在式(I)中,部分
在另一方面,在式(I)中,部分
在另一方面,在式(I)中,部分
在一方面,本公开文本的化合物是根据式(I’)的,其中R1、R5、X和W是如关于式(I)所定义的:
在一方面,本公开文本的化合物是根据式(Ia)的,其中R1、R5和W是如关于式(I)所定义的:
在另一方面,本公开文本的化合物是根据式(Ib)的,其中R1、R5和R3是如关于式(I)所定义的:
R2的示例性实施方案包括H、OMe、OCHF2和OCF3,其中OMe是优选实施方案。
在根据式(Ib)的化合物的一个实施方案中,R3是
NH(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
N[C1-C3烷基](C1-C6烷基)、
或
具有以下结构的环胺部分:
在根据式(Ib)的化合物的另一个实施方案中,R3是
NH[C(=O)](C1-C5烷基)、
NH[C(=O)](C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH[C(=O)](C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
或
NH[C(=O)](C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)。
R5的示例性实施方案包括H、Me、OMe、CH2OH、环丙基、F、Cl和CF3,其中H是优选实施方案。
在根据式(Ib)的化合物的另一个实施方案中,R3是
O(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C4-C8双环烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
或
O(C1-C4烷二基)0-1(C1-C6烷基)。
在另一方面,本公开文本的化合物是根据式(Ic)的,其中R3和R5是如关于式(I)所定义的:
在另一方面,本公开文本的化合物是根据式(Id)的,其中R3和R5是如关于式(I)所定义的:
在另一方面,本公开文本的化合物是根据式(Ie)的,其中R1、R4和R5是如关于式(I)所定义的:
在另一方面,本公开文本提供了一种化合物,所述化合物具有根据式(If)的结构
其中
R1是
并且
W是
在另一方面,本公开文本提供了一种化合物,所述化合物具有根据式(Ig)的结构:
其中R1和R3是如关于式(I)所定义的。
在另一方面,本公开文本提供了一种化合物,所述化合物具有根据式(Ih)的结构:
其中一个X是N并且另两个是CH并且R1和R3是如关于式(I)所定义的。
基团R1的例子是
优选地,R1选自以下基团(“优选的R1基团”),由以下组成:
示例性基团R3包括
在另一方面,
R3是H、卤基、OH、CN、
NH2、
NH[C(=O)]0-1(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
N[C1-C3烷基]C(=O)(C1-C6烷基)、
6元芳族或杂芳族部分、
5元杂芳族部分、或
具有以下结构的部分:
优选的基团R3是
示例性基团R4包括:
优选的R4是
示例性基团R5是H、
优选地,R5是H或Me。
通过举例而非限制的方式,式
的部分包括
通过举例而非限制的方式,螺烷基包括
通过举例而非限制的方式,式
的部分包括
通过举例而非限制的方式,双环烷基包括
通过举例而非限制的方式,式
的部分包括
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
尤其是
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
尤其是
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
尤其是
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
尤其是
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
尤其是
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
尤其是
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,W是,优选与式(I’)、(Ia)、(If)、或(Ig)组合,
其中特定的示例性实施方案是
在一方面,本公开文本的化合物是根据式(If)的
其中
R1是
并且
W是
一些上述示例性烷基、环烷基、螺烷基、双环烷基等,式
的基团和部分携带任选的取代基和/或任选地具有一个或多个由O、SO2等替代的CH2基团,如上文发明内容中所述。
本文公开的根据式(Ia)的化合物的特定例子示出于下表A1中。所述表还提供了按下文提供的程序确定的关于以下生物学活性的数据:人全血中的人TLR7激动作用报告物测定和/或CD69基因的诱导。最右边的列含有分析数据(质谱,LC/MS保留时间和NMR)。在一个实施方案中,本公开文本的化合物具有(a)小于1,000nM的人TLR7(hTLR7)报告物测定EC50值和(b)小于1,000nM的人全血(hWB)CD69诱导EC50值。(在多次进行测定的情况下,报告值为平均值。)
本公开文本的另外的化合物示于表A2中,连同其生物学特性和分析数据。
药物组合物和施用
在另一方面,提供了一种药物组合物,所述药物组合物包含与药学上可接受的载体或赋形剂一起配制的如本文公开的化合物或其缀合物。它可以任选地含有一种或多种另外的药物活性成分,诸如生物制剂或小分子药物。所述药物组合物可以在组合疗法中与另一种治疗剂(尤其是抗癌剂)一起施用。
所述药物组合物可以包含一种或多种赋形剂。可以使用的赋形剂包括载体、表面活性剂、增稠剂或乳化剂、固体粘合剂、分散或悬浮助剂、增溶剂、着色剂、调味剂、包衣、崩解剂、润滑剂、甜味剂、防腐剂、等渗剂、及其组合。Gennaro,编辑,Remington:The Scienceand Practice of Pharmacy,第20版(Lippincott Williams&Wilkins 2003)中教导了合适的赋形剂的选择和使用。
优选地,药物组合物适用于静脉内、肌内、皮下、肠胃外、脊髓或表皮施用(例如,通过注射或输注)。根据施用途径,可以将活性化合物包被在材料中以保护所述化合物免受可能使其失活的酸和其他天然条件的作用。短语“肠胃外施用”意指除了肠施用和外用施用之外的施用方式,通常通过注射进行,并且包括而不限于静脉内、肌内、动脉内、鞘内、囊内、眼眶内、心脏内、皮内、腹膜内、经气管、皮下、表皮下、关节内、囊下、蛛网膜下、脊柱内、硬膜外以及胸骨内注射和输注。可替代地,所述药物组合物可以经由非肠胃外途径施用,所述非肠胃外途径诸如外用、表皮或粘膜施用途径,例如鼻内、口服、阴道、直肠、舌下或外用。
药物组合物可以呈无菌水性溶液或分散体的形式。它们也可以配制成微乳液、脂质体、或适合于实现高药物浓度的其他有序结构。所述组合物也可以以冻干物(用于在施用前在水中重构)的形式提供。
可以与载体材料组合以产生单一剂型的活性成分的量将根据正在被治疗的受试者和特定的施用方式而变化并且将总体上是产生治疗效果的组合物量。通常,按100%计,该量范围将为约0.01%至约99%的活性成分,优选约0.1%至约70%、最优选约1%至约30%的活性成分,所述活性成分与药学上可接受的载体相组合。
调整剂量方案以提供治疗反应。例如,可以施用单次推注,可以随时间施用几个分开的剂量,或者可以如根据情况的紧急程度所指示,按比例减少或增加剂量。以剂量单位形式配制肠胃外组合物是尤其有利的,以便于施用和剂量的均匀。“剂量单位形式”是指适合作为单位剂量用于待治疗的受试者的物理上离散的单位;每个单位含有与所需的药物载体联合的经计算产生所希望的治疗反应的预定量的活性化合物。
剂量在从约0.0001至100mg/kg宿主体重并且更通常0.01至5mg/kg宿主体重的范围内。例如,剂量可以是0.3mg/kg体重、1mg/kg体重、3mg/kg体重、5mg/kg体重或10mg/kg体重或者在1-10mg/kg或可替代地0.1至5mg/kg的范围内。示例性的治疗方案是每周一次、每两周一次、每三周一次、每四周一次、每月一次、每3个月一次、或每3至6个月一次的施用。优选的剂量方案包括使用以下给药时间表中的一种经由静脉内施用1mg/kg体重或3mg/kg体重:(i)每四周,持续六个剂量,然后每三个月;(ii)每三周;(iii)一次3mg/kg体重,然后是每三周1mg/kg体重。在一些方法中,调整剂量以达到约1-1000μg/mL的血浆抗体浓度,并且在一些方法中达到约25-300μg/mL。
本发明化合物的“治疗有效量”优选地导致疾病症状的严重程度的降低、无疾病症状时期的频率和持续时间的增加、或对由于疾病困扰而引起的损伤或残疾的预防。例如,对于荷瘤受试者的治疗,相对于未治疗的受试者,“治疗有效量”优选地抑制肿瘤生长至少约20%、更优选至少约40%、甚至更优选至少约60%、以及还更优选至少约80%。治疗有效量的治疗化合物可以减小肿瘤大小、或在其他方面改善受试者的症状,所述受试者典型地是人,但是可以是另一种哺乳动物。在组合治疗中施用两种或更多种治疗剂的情况下,“治疗有效量”是指组合作为整体的功效,而不是单独地每种药剂的功效。
药物组合物可以是控释或缓释配制品,包括植入物、透皮贴剂和微囊化递送系统。可以使用可生物降解的可生物相容的聚合物,诸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯和聚乳酸。参见例如,Sustained and Controlled Release Drug DeliverySystems,J.R.Robinson,编辑,Marcel Dekker,Inc.,纽约,1978。
可以经由诸如(1)无针皮下注射装置;(2)微量输注泵;(3)透皮装置;(4)输注装置;和(5)渗透装置的医疗装置施用治疗组合物。
在某些实施方案中,可以配制所述药物组合物以确保在体内的适当分布。例如,为了确保本发明的治疗化合物穿过血脑屏障,可以将它们配制在脂质体中,所述脂质体可以另外地包含靶向部分以增强向特定细胞或器官的选择性转运。
工业实用性和用途
本文公开的TLR7激动剂化合物可以用于治疗可通过激活TLR7而改善的疾病或病症。
在一个实施方案中,将TLR7激动剂与抗癌免疫治疗剂-也称为免疫肿瘤学药剂-组合使用。抗癌免疫治疗剂通过刺激身体的免疫系统以攻击和破坏癌细胞,尤其是通过激活T细胞来工作。免疫系统具有许多检查点(调节)分子,以帮助维持其攻击正当的靶细胞与防止其攻击健康的正常细胞之间的平衡。一些分子是刺激剂(上调剂),这意味着它们的参与会促进T细胞激活并且增强免疫应答。其他分子是抑制剂(下调剂或制止剂),这意味着它们的参与会抑制T细胞激活并且减轻免疫应答。激动性免疫治疗剂与刺激性检查点分子的结合可以导致后者的激活和针对癌细胞的免疫应答增强。相反,拮抗性免疫治疗剂与抑制性检查点分子的结合可以防止免疫系统被后者下调并且帮助维持针对癌细胞的强烈应答。刺激性检查点分子的例子是B7-1、B7-2、CD28、4-1BB(CD137)、4-1BBL、ICOS、CD40、ICOS-L、OX40、OX40L、GITR、GITRL、CD70、CD27、CD40、DR3和CD28H。抑制性检查点分子的例子是CTLA-4、PD-1、PD-L1、PD-L2、LAG-3、TIM-3、半乳糖凝集素9、CEACAM-1、BTLA、CD69、半乳糖凝集素-1、CD113、GPR56、VISTA、2B4、CD48、GARP、PD1H、LAIR1、TIM-1、CD96和TIM-4。
无论抗癌免疫治疗剂的作用方式是哪种,均可以通过总体上调免疫系统(诸如通过激活TLR7)来提高其有效性。因此,在一个实施方案中,本说明书提供了一种治疗癌症的方法,所述方法包括向患有此类癌症的患者施用抗癌免疫治疗剂和如本文公开的TLR7激动剂的治疗有效组合。施用时间可以是同时、顺序或交替的。施用方式可以是全身的或局部的。所述TLR7激动剂可以经由缀合物以靶向的方式递送。
可以通过如上所述的组合治疗进行治疗的癌症包括急性髓性白血病、肾上腺皮质癌、卡波西肉瘤、淋巴瘤、肛门癌、阑尾癌、畸胎样/横纹肌样瘤、基底细胞癌、胆管癌、膀胱癌、骨癌、脑癌、乳腺癌、支气管肿瘤、类癌瘤、心脏肿瘤、子宫颈癌、脊索瘤、慢性淋巴细胞白血病、慢性骨髓增生性肿瘤、结肠癌、结直肠癌、颅咽管瘤、胆管癌、子宫内膜癌、室管膜瘤、食管癌、鼻腔神经胶质瘤、尤因肉瘤、眼癌、输卵管癌、胆囊癌、胃肠道类癌瘤、胃肠道间质瘤、生殖细胞瘤、毛细胞白血病、头颈癌、心脏癌、肝癌、下咽癌、胰腺癌、肾癌、喉癌、慢性髓性白血病、唇和口腔癌、肺癌、黑素瘤、默克尔细胞癌、间皮瘤、口癌、口腔癌、骨肉瘤、卵巢癌、阴茎癌、鼻咽癌、前列腺癌、直肠癌、唾液腺癌、皮肤癌、小肠癌、软组织肉瘤、睾丸癌、喉癌、甲状腺癌、尿道癌、子宫癌、阴道癌和外阴癌。
可以用于如本文公开的组合疗法的抗癌免疫治疗剂包括:AMG 557、AMP-224、阿替利珠单抗(atezolizumab)、阿维鲁单抗(avelumab)、BMS 936559、西米普利单抗(cemiplimab)、CP-870893、达西珠单抗(dacetuzumab)、度伐鲁单抗(durvalumab)、依诺妥珠单抗(enoblituzumab)、加利昔单抗(galiximab)、IMP321、伊匹单抗、鲁卡木单抗(lucatumumab)、MEDI-570、MEDI-6383、MEDI-6469、莫罗单抗(muromonab)-CD3、纳武单抗、派姆单抗、匹地利珠单抗(pidilizumab)、斯巴达珠单抗(spartalizumab)、曲美目单抗(tremelimumab)、乌瑞鲁单抗(urelumab)、乌托鲁单抗(utomilumab)、瓦立鲁单抗(varlilumab)、珀伽利珠单抗(vonlerolizumab)。下表B列出了它们的一个或多个替代名称(商标名称、曾用名、研究代码或同义词)和各自的靶检查点分子。
在用TLR7激动剂的组合治疗的一个实施方案中,所述抗癌免疫治疗剂是拮抗性抗CTLA-4、抗PD-1或抗PD-L1抗体。所述癌症可以是肺癌(包括非小细胞肺癌)、胰腺癌、肾癌、头颈癌、淋巴瘤(包括霍奇金淋巴瘤)、皮肤癌(包括黑素瘤和默克尔皮肤癌)、尿路上皮癌(包括膀胱癌)、胃癌、肝细胞癌、或结直肠癌。
在用TLR7激动剂的组合治疗的另一个实施方案中,所述抗癌免疫治疗剂是拮抗性抗CTLA-4抗体,优选伊匹单抗。
在用TLR7激动剂的组合治疗的另一个实施方案中,所述抗癌免疫治疗剂是拮抗性抗PD-1抗体,优选纳武单抗或派姆单抗。
本文公开的TLR7激动剂还可用作疫苗佐剂。
通过参考以下实施例可以进一步理解本发明的实践,所述实施例是作为说明而非限制来提供的。
分析程序
NMR
使用以下条件获得质子核磁共振(NMR)波谱:在400Mz或500MHz Bruker仪器中使用DMSO-d6或CDCl3作为溶剂和内标得到NMR波谱。通过使用ADC Labs的ACD Spectrus2015-01版或MestReNova软件分析原始NMR数据。
从内部四甲基硅烷(TMS)或从通过氘代NMR溶剂的低场以百万分率(ppm)报告化学位移。明显的多重性报告为:单重态-s,双重态-d,三重态-t,四重态-q或多重态-m。展现出变宽的峰进一步表示为br。积分是近似的。应当注意,积分强度、峰形状、化学位移和耦合常数可以取决于溶剂、浓度、温度、pH和其他因素。此外,与NMR波谱中的水峰或溶剂峰重叠或交换的峰可能无法提供可靠的积分强度。在一些情况下,可以使用水峰抑制获得NMR波谱,这可能导致重叠的峰不可见或形状改变和/或整合。
液相色谱法
使用以下制备型和/或分析型(LC/MS)液相色谱法。
LC/MS条件A:柱:Waters XBridge C18,2.1mm x 50mm,1.7μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含10mM NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含10mM NH4OAc);温度:50℃;梯度:经3min 0%B至100%B,然后在100%B下保持0.50min;流速:1mL/min;检测:MS和UV(220nm)。
LC/MS条件B:柱:Waters XBridge C18,2.1mm x 50mm,1.7μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);温度:50℃;梯度:经3min 0%B至100%B,然后在100%B下保持0.50min;流速:1mL/min;检测:MS和UV(220nm)。
LC/MS条件C:柱:Waters XBridge C18,2.1mm x 50mm,1.7μm颗粒;流动相A:含0.1%TFA的乙腈;流动相B:含0.1%TFA的水;温度:37℃;梯度:经3min 0%B至100%B,然后在100%B下保持0.50min;流速:1mL/min;检测:MS和UV(240nm)。
LC/MS条件D:柱:Waters XBridge C18,2.1mm x 50mm,1.7μm颗粒;流动相A:含0.1%甲酸的乙腈;流动相B:含0.1%甲酸的水;温度:37℃;梯度:经2.5min 0%B至100%B,然后在100%B下保持0.50min;流速:1mL/min;检测:MS和UV(240nm)。
LC/MS条件E:柱:Waters X-Bridge BEH C18 XP(50x2.1mm)2.5μm;流动相A:5:95乙腈:水(含10mM NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含10mM NH4OAc);温度:50℃;梯度:经3分钟0-100%B;流速:1.1ml/min)。
合成-通用程序
通常,本文所公开的程序产生了在吡唑并嘧啶环系统的1H或2H位置处烷基化的区域异构体(分别也称为N1和N2(暗示了烷基化的氮)区域异构体)的混合物。为简洁起见,出于便利没有显示N2区域异构体,但是应当理解,它们存在于最初的产物混合物中并且例如通过制备型HPLC在稍后的时间分离。
可以在合成的早期阶段分离区域异构体的混合物,并且与1H区域异构体一起进行剩余的合成步骤,或者可替代地,可以带着区域异构体的混合物进行合成并且根据需要在稍后的阶段进行分离。
本公开文本的化合物可以通过合成有机化学领域的技术人员熟知的多种方法来制备。这些方法包括以下所述的方法或其变体。优选的方法包括但不限于以下方案中下文所描述的那些。所述方案旨在是通用的,但是在一些情况下,出于便利描绘了特定基团(例如甲酯或甲氧基)。
方案1
在方案1和其出现的其他情况中,Ra可以是例如
在方案1和其出现的其他情况中,RbNHRc是伯胺或仲胺。Ra、Rb和/或Rc可以具有被保护基团掩蔽的官能团,所述保护基团在合成方法期间在适当的时间被去除。
可以通过如上文方案1中概述的合成顺序制备化合物8。吡唑并嘧啶1通过与NBS反应转化为溴化物2。用3-溴甲基-4-甲氧基苯甲酸甲酯烷基化后,获得化合物3。将化合物3在H2下氢化以得到化合物4。将化合物4用LiAlH4还原为醇5。将醇5用处理以提供胺6。胺6与SOCl2的反应得到氯化物7。在方案1的最后一步中,通过氯化物7与RbNHRc的烷基化制备化合物8。
方案2
上文方案2示出了通过以下方式制备中间体5的替代方法:将4-氨基-1H-吡唑-5-甲酸甲酯(CAS登记号923283-54-9)与1,3-双(甲氧基羰基)-2-甲基-2-硫代假脲(CAS登记号34840-23-8)偶联以形成化合物10。通过将化合物10用NBS(N-溴琥珀酰亚胺)溴化获得化合物11。用3-溴甲基-4-甲氧基苯甲酸甲酯烷基化后,获得化合物12。将化合物12在H2下氢化以得到化合物13。将化合物13通过与LiAlH4反应还原为醇14。通过在BOP和DBU的存在下使化合物14与RaNH2反应合成中间体5。
方案3
上述方案3示出了用于通过以下方式制备中间体4的替代方法:4-硝基-1H-吡唑-5-甲酸甲酯15(CAS登记号1345513-95-2)与3-溴甲基-4-甲氧基苯甲酸甲酯的烷基化以形成化合物16。将化合物16在H2下氢化以得到化合物17。通过化合物17与1,3-双(甲氧基羰基)-2-甲基-2-硫代假脲的反应获得化合物18。通过在BOP和DBU的存在下使化合物18与RaNH2反应合成中间体4。
方案4
可以将化合物1用3-溴甲基-4-甲氧基苯甲酸甲酯直接烷基化以形成中间体4。然而,在这种方法中,N1异构体与N2异构体的比率通常不太有利。
方案5
上文方案5示出了用于制备中间体4的替代方法。将吡唑并嘧啶1用NIS(N-碘代琥珀酰亚胺)或NCS(N-氯代琥珀酰亚胺)转化为碘化物或氯化物19。用3-溴甲基-4-甲氧基苯甲酸甲酯烷基化后,获得化合物20。将化合物20在H2下氢化以得到化合物4。
方案6
上文方案6示出了用于制备产物8的替代方法。化合物5与SOCl2的反应得到氯化物21。将氯化物7用RbNHRc处理以得到化合物22。通过将化合物22用NaOH脱保护获得产物8。
方案7
上文方案7示出了用于制备产物8的替代方法。化合物14与SOCl2的反应得到氯化物23。将氯化物7用RbNHRc处理以得到化合物24。通过将化合物24用NaOH脱保护获得化合物25。通过在BOP和DBU的存在下使化合物25与RaNH2反应合成产物8。
方案8
可以通过如上文方案8所概述的偶联化合物8制备化合物26(在Rc是H并且酸RdCOOH的情况下)。
方案9
可以通过上文方案9中概述的合成顺序制备化合物28。将化合物4使用NaOH水解以形成酸27。将化合物27与RbNHRc偶联得到产物28。
方案10
可以通过如上文方案10中所概述的氯化物7与醇RgOH的反应获得化合物29。
方案11
可以通过上文方案11中概述的合成顺序制备化合物32。通过化合物2的烷基化获得化合物30。化合物30的脱保护得到化合物31。通过用NaOH水解化合物31获得产物32。
方案12
可以通过上文方案12中概述的合成顺序制备化合物36。化合物2的烷基化后获得化合物33。将化合物33在H2下氢化以得到化合物34。化合物34通过与格氏试剂RiMgBr(其中Ri是例如低级烷基)反应转化为化合物35。通过使用NaOH将化合物35脱保护获得产物36。
本领域技术人员能够通过参考上文通用程序,采用本领域已知的试剂、溶剂和条件,或通过修改以下特定实施例的程序(细节上作必要的修改)来制造本公开文本的化合物。
合成-特定实施例
为了进一步说明上述内容,包括以下非限制性以下示例性合成方案。在权利要求范围内的这些实施例的变化在本领域技术人员的能力范围内,并且被认为落入本公开文本的范围内。读者应认识到,被提供本公开文本的技术人员和相关领域的技术人员将能够在没有穷举实施例的情况下制备和使用本文公开的化合物。
编号为101和更大的化合物的分析数据可以在表A1或表A2中找到。
实施例A-化合物105
步骤1.向(7-(丁基氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(4g,15.13mmol)在DMF(7mL)中的悬浮液中添加NBS(2.96g,16.65mmol)在乙腈(14mL)中的溶液。将反应混合物在室温下搅拌1小时。添加水(33mL)。通过过滤收集沉淀物。将固体用水(3x20mL)洗涤,并且空气干燥过夜,得到(3-溴-7-(丁基氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。
LC-MS m/z 343.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.89(s,1H),9.79(s,1H),7.58(s,1H),3.62(s,3H),3.54(q,J=6.8Hz,2H),1.68–1.56(m,2H),1.47–1.33(m,2H),0.94(t,J=7.4Hz,3H)。
步骤2.在室温下将Cs2CO3(5.73g,17.59mmol)添加到(3-溴-7-(丁基氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(3.32g,9.67mmol)和3-(溴甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(2.279g,8.79mmol)在DMF(21.72ml)中的混合物中。将反应混合物在室温下搅拌2h,用EtOAc稀释,用水洗涤,干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在己烷中的0-20%EtOAc纯化以提供呈白色固体的3-((3-溴-7-(丁基氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯。
LC-MS m/z 521.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.87(s,1H),7.98–7.90(m,1H),7.50(d,J=2.2Hz,1H),7.40(t,J=5.6Hz,1H),7.16(d,J=8.7Hz,1H),5.75(s,2H),3.83(s,3H),3.78(s,3H),3.63(s,3H),3.55(q,J=6.6Hz,2H),1.65–1.53(m,2H),1.31-1.23(m,2H),0.87(t,J=7.4Hz,3H)。
步骤3.在室温下将Pd/C(10wt%,30mg,0.403mmol)添加到3-((3-溴-7-(丁基氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.21g,0.403mmol)在MeOH(5mL)中的溶液中。将反应混合物在H2下搅拌过夜。将催化剂滤除,并且将滤液浓缩以得到呈白色固体的3-((7-(丁基氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯。
LC-MS m/z 443.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.77(t,J=5.8Hz,1H),8.09(s,1H),7.96(dd,J=8.8,2.2Hz,1H),7.77(d,J=2.1Hz,1H),6.90(d,J=8.7Hz,1H),6.03(s,2H),3.93–3.75(m,11H),1.73–1.63(m,2H),1.31(h,J=7.6Hz,2H),0.89(t,J=7.4Hz,3H)。
步骤4.在0℃下将在THF中的LiAlH4(1M)(1.549mL,1.549mmol)添加到3-((7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(60mg,0.155mmol)在THF(8mL)中的混合物中。将反应混合物在室温下搅拌3h,通过缓慢添加甲醇淬灭并且与罗谢尔盐(Rochelle salt)(1M,3mL)一起搅拌1h。将水溶液用EtOAC萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在DCM中的0-20%MeOH纯化以提供呈白色固体的(7-(丁基氨基)-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。
LC-MS m/z 443.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.08(s,1H),7.78(s,1H),7.33–7.26(m,1H),6.96(d,J=2.1Hz,1H),6.89(d,J=8.5Hz,1H),5.70(t,J=5.4Hz,1H),5.57(s,2H),5.29(s,2H),4.47(s,2H),3.90(s,3H),3.73(s,3H),3.44(td,J=7.0,5.3Hz,3H),1.52–1.39(m,2H),1.29–1.15(m,2H),0.87(t,J=7.4Hz,3H)。
步骤5.在室温下将NaOH(10M,5.02mL,50.2mmol)添加到(7-(丁基氨基)-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(1.04g,2.509mmol)在二噁烷(25mL)中的混合物中。将反应混合物在54℃下加热过夜,用水稀释,并且用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在DCM中的0-30%MeOH纯化以提供呈白色固体的化合物140。
LC-MS m/z 357.2[M+H]+。
步骤6.在室温下将SOCl2(0.410ml,5.61mmol)添加到(3-((5-氨基-7-(丁基氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯基)甲醇(0.1g,0.281mmol)在THF(4.60ml)中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌2h。蒸发溶剂以得到呈白色固体的N7-丁基-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺。
LC-MS m/z 375.2[M+H]+。
步骤7.将N7-丁基-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺(10mg,0.027mmol)和3-甲氧基氮杂环丁烷(13.94mg,0.160mmol)在DMF(0.5mL)中的混合物在室温下搅拌过夜。将粗产物用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物105的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
类似地制备以下化合物:化合物101、化合物102、化合物103、化合物104、化合物106、化合物107、化合物108、化合物109、化合物110、化合物111、化合物112、化合物113、化合物114、化合物115、化合物116、化合物117、化合物118、化合物119、化合物120、化合物121、化合物122、化合物123、化合物124、化合物125、化合物126、化合物127、化合物129、化合物130、化合物131、化合物132、化合物133、化合物134、化合物135、化合物137、化合物138、化合物142和化合物151。
实施例B-化合物128
在室温下将DIEA(6.07μl,0.035mmol)添加到N7-丁基-1-(2-甲氧基-5-((甲基氨基)甲基)苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺(化合物132,9.9mg,0.027mmol)、3-(二甲基氨基)丙酸(3.45mg,0.029mmol)和HATU(12.22mg,0.032mmol)在DMF(1mL)中的混合物中。将反应混合物在室温下搅拌过夜。将粗材料用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物128的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
类似地制备以下化合物:化合物136、化合物146、化合物147和化合物148。
实施例C-化合物139
在室温下将NaH(60%)(6.40mg,0.160mmol)添加到氧杂环丁烷-3-醇(11.86mg,0.160mmol)在DMF(0.5mL)中的溶液中。将混合物在室温下搅拌10min并且在室温下添加到N7-丁基-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺(10mg,0.027mmol)在DMF(0.5mL)中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌2h。将粗产物用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。将含有化合物的级分(通过MS和UV信号触发收集)合并并且经由离心蒸发干燥。
类似地制备以下化合物:化合物141、化合物143和化合物144。
实施例D-化合物145
步骤1.在室温下将Cs2CO3(0.380g,1.166mmol)添加到(3-溴-7-(丁基氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.2g,0.583mmol)和3-(溴甲基)-4-甲氧基苄腈(0.132g,0.583mmol)在DMF(2mL)中的混合物中。将反应混合物在室温下搅拌过周末。将反应混合物用EtOAc稀释,用水洗涤,干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在己烷中的0-70%EtOAc纯化以得到呈白色固体的(3-溴-7-(丁基氨基)-1-(4-氰基-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。
LC-MS m/z 488.1[M+H]+。
步骤2.将(3-溴-7-(丁基氨基)-1-(5-氰基-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(81mg,0.166mmol)和Pd/C 10wt%(20mg,0.166mmol)在甲醇(2mL)中的混合物在H2下搅拌过夜。将催化剂滤除后,将滤液浓缩以得到呈白色固体的(7-(丁基氨基)-1-(4-氰基-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。
LC-MS m/z 410.2[M+H]+。
步骤3.将(7-(丁基氨基)-1-(5-氰基-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(42.6mg,0.104mmol)和10N NaOH(0.208mL,2.081mmol)在二噁烷(1.5mL)中的混合物在54℃下搅拌过夜。将粗产物用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridgeC18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物145的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
实施例E-化合物149
步骤1.将3-(溴甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(3.6g,13.89mmol)、4-硝基-1H-吡唑-5-甲酸甲酯(2.377g,13.89mmol)和K2CO3(2.496g,18.06mmol)在DMF(30mL)中的混合物在室温下搅拌3h。将反应混合物用水稀释并且用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在己烷中的0-50%EtOAc纯化以得到呈白色固体的1-(2-甲氧基-5-(甲氧基羰基)苄基)-4-硝基-1H-吡唑-5-甲酸甲酯。
LC-MS m/z 350.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.38(s,1H),7.98(dd,J=8.6,2.2Hz,1H),7.89(d,J=2.2Hz,1H),7.15(d,J=8.7Hz,1H),5.52(s,2H),3.98(s,3H),3.82(d,J=5.1Hz,6H)。
步骤2.在室温下向1-(2-甲氧基-5-(甲氧基羰基)苄基)-4-硝基-1H-吡唑-5-甲酸甲酯(1g,2.86mmol)和甲酸铵(0.903g,14.31mmol)在THF(9mL)和MeOH(9mL)中的混合物中添加Zn(0.599g,9.16mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1h。将固体滤出。将滤液浓缩以产出呈白色固体的4-氨基-1-(2-甲氧基-5-(甲氧基羰基)苄基)-1H-吡唑-5-甲酸甲酯。
LC-MS m/z 320.1[M+H]+。
步骤3.在室温下将1,3-双(甲氧基羰基)-2-甲基-2-硫代假脲(0.452g,2.192mmol)和4-氨基-1-(2-甲氧基-5-(甲氧基羰基)苄基)-1H-吡唑-5-甲酸甲酯(0.7g,2.192mmol)的混合物吸收在MeOH(18mL)中并且用乙酸(0.627mL,10.96mmol)处理。将反应混合物搅拌过夜。然后将在甲醇中的甲醇钠(4.37M)(5.02mL,21.92mmol)添加到反应混合物中,然后将其在室温下搅拌过夜。通过缓慢添加乙酸将pH调节至5。将沉淀物通过过滤收集,用水和乙腈洗涤并且干燥以提供呈白色固体的3-((7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯。
LC-MS m/z 388.1[M+H]+。
步骤4.将螺[2.3]己-5-基甲胺(0.201g,1.808mmol)、3-((7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.35g,0.904mmol)在DMSO(5mL)中的溶液用DBU(0.545mL,3.61mmol)和BOP(0.799g,1.807mmol)处理。将反应混合物在40℃下加热1h。添加水以将反应淬灭。将水溶液用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在DCM中的0-20%MeOH纯化以得到白色固体的4-甲氧基-3-((5-((甲氧基羰基)氨基)-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)苯甲酸甲酯。
LC-MS m/z 481.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.65(s,1H),7.96–7.87(m,2H),7.25(d,J=2.2Hz,1H),7.23–7.03(m,2H),5.76(s,2H),3.88(d,J=6.6Hz,3H),3.74(s,3H),3.69–3.52(m,5H),2.84–2.68(m,1H),2.08–1.90(m,2H),1.86–1.77(m,2H),0.34(s,4H)。
步骤5.将4-甲氧基-3-((5-((甲氧基羰基)氨基)-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)苯甲酸甲酯(0.122g,0.254mmol)在THF(3mL)中的溶液冷却至0℃并且用LiAlH4(0.127mL,0.254mmol)逐滴处理。20min后,将反应通过缓慢添加甲醇淬灭并且与罗谢尔盐(1M,3mL)一起搅拌1h。将水溶液用EtOAC萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在DCM中的0-30%MeOH纯化以得到呈白色固体的(1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。
LC-MS m/z 453.2[M+H]+。
步骤6.在室温下将NaOH(10N,0.350mL,3.50mmol)添加到(1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(79.1mg,0.175mmol)在二噁烷(2mL)和DMSO(1mL)中的混合物中。将反应混合物在54℃下加热过夜。将反应混合物用水稀释并且用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在DCM中的0-30%MeOH纯化以得到呈白色固体的(3-((5-氨基-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯基)甲醇。
LC-MS m/z 395.2[M+H]+。
步骤7.在室温下将SOCl2(0.221mL,3.04mmol)添加到(3-((5-氨基-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯基)甲醇(60mg,0.152mmol)在THF(1.5mL)中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌2h。将溶液蒸发掉以得到呈白色固体的1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-N7-(螺[2.3]己-5-基甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺。
LC-MS m/z 413.2[M+H]+。
步骤8.将1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-N7-(螺[2.3]己-5-基甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺(10mg,0.024mmol)和3-甲氧基氮杂环丁烷(2.110mg,0.024mmol)在DMF(0.5mL)中的混合物在室温下搅拌2h。将粗材料用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物149的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
根据此实施例类似地制备化合物150。
实施例F-化合物152
步骤1.在室温下将NaOH(10N,0.237mL,2.372mmol)添加到在DMSO(1mL)中的4-甲氧基-3-((5-((甲氧基羰基)氨基)-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)苯甲酸甲酯(57mg,0.119mmol)中。将反应混合物在54℃下加热过夜并且通过添加6N HCl中和。蒸发溶剂以得到呈白色固体的3-((5-氨基-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸。
LC-MS m/z 409.2[M+H]+。
步骤2.在室温下将DIEA(8.53μl,0.049mmol)添加到1-甲基哌啶-4-胺(16.77mg,0.147mmol)、3-((5-氨基-7-((螺[2.3]己-5-基甲基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸(10mg,0.024mmol)和HATU(12.10mg,0.032mmol)在DMF(0.5mL)中的混合物中。将反应混合物在室温下搅拌2h。将粗材料用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物152的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
根据此实施例类似地制备化合物153。
实施例G-化合物154
步骤1.将3-((3-溴-7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.5g,1.072mmol)在DMSO(5mL)中的混合物用(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-胺(0.763g,2.145mmol)、2,3,4,6,7,8,9,10-八氢嘧啶并[1,2-a]氮杂卓(0.5mL,3.32mmol)处理,然后用((1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)氧基)三(二甲基氨基)鏻六氟磷酸盐(V)(0.949g,2.145mmol)处理。将反应混合物在70℃下加热2h,用EtOAc稀释,并且用水洗涤。将溶剂混合物经Na2SO4干燥并且将溶剂去除。将残余物用MeOH稀释并且过滤以去除起始材料。将溶剂去除并且将材料在硅胶(干加载)己烷-EtOAc 0-100%上纯化以得到(S)-3-((3-溴-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.59g,0.734mmol,68.4%产率)。
LC-MS m/z 803.3[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.84(s,1H),7.98-7.81(m,1H),7.66-7.31(m,10H),7.30-7.19(m,2H),7.14-7.06(m,1H),6.71-6.58(m,1H),5.87-5.59(m,2H),4.77-4.53(m,1H),3.80-3.75(m,3H),3.75-3.71(m,3H),3.67-3.61(m,2H),3.60-3.56(m,3H),1.95-1.77(m,2H),1.64-1.42(m,2H),1.29-1.10(m,2H),0.92(s,9H),0.78(br t,J=7.3Hz,3H)
步骤2.向帕尔瓶(Parr bottle)中添加(S)-3-((3-溴-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.59g,0.734mmol)、甲醇(10mL)和Pd/C(20mg,0.188mmol)。允许氢化反应在50psi下在25℃下进行2h。将材料过滤并且将溶剂去除以得到(S)-3-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(466g,0.624mmol,85%产率)。
LC-MS m/z 725.4[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.76-7.66(m,3H),7.62(s,5H),7.55-7.42(m,8H),7.42-7.33(m,2H),7.31-7.06(m,1H),5.93-5.68(m,1H),3.85-3.68(m,5H),1.98-1.80(m,2H),1.79-1.68(m,1H),1.62-1.39(m,3H),1.38-1.23(m,2H),1.01(s,9H),0.92(s,3H),0.87(t,J=7.3Hz,3H),0.83-0.77(m,1H)
步骤3.将20mL闪烁小瓶用(S)-3-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(460mg,0.635mmol)、二噁烷(4mL)和三乙胺三氢氟酸盐(TREAT-HFTM,1.3mL,7.98mmol)装载。将反应混合物在50℃下搅拌2小时。添加NaOH(6mL,30.0mmol),然后在80℃下搅拌1h。冷却后,将反应混合物用5N HCl中和,并且在V10蒸发器上蒸发至干。快速色谱法(EZPrep.,50g柱,加载在DMSO/水中,在含有0.05%TFA的水中0至60%MeCN经14分钟)得到呈白色冻干固体的(S)-3-((5-氨基-7-((1-羟基己-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸(100mg,0.241mmol,38.0%产率)。
LC-MS m/z 451.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ12.74-12.22(m,2H),7.81-7.62(m,3H),7.57(s,1H),7.47-7.35(m,1H),7.16-7.06(m,1H),6.96-6.84(m,1H),5.56(br d,J=14.7Hz,2H),4.53-4.17(m,2H),3.61(s,3H),1.51(br d,J=6.4Hz,2H),1.36-1.17(m,2H),1.01-0.80(m,2H),0.56(t,J=7.4Hz,3H)。
步骤4.向20mL闪烁小瓶中装载用(S)-3-((5-氨基-7-((1-羟基己-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸(30mg,0.072mmol)、HATU(33.0mg,0.087mmol)、(R)-1-甲基吡咯烷-3-胺(14.50mg,0.145mmol)和DMF(1.5mL)。添加DIPEA(0.038mL,0.217mmol),并且将反应在室温下搅拌1小时。将粗产物用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在30 100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物154的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
实施例H-化合物157
步骤1a.将3-((3-溴-7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(1.1g,2.359mmol)和Pd/C(0.500g,2.359mmol,在先前的专利中制备)在DMSO(30mL)和EtOH(10mL)的混合物在80℃下在H2下搅拌3天。将催化剂滤除,并且将滤液浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的0-10%MeOH纯化以提供呈白色固体的3-((5-氨基-7-羟基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯。LC-MSm/z 330.1[M+H]+。1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ10.99(s,1H),7.90(dd,J=8.6,2.2Hz,1H),7.61(s,1H),7.21–7.12(m,2H),6.10(s,2H),5.65(s,2H),3.91(s,3H),3.75(s,3H)。
步骤1b.将3-((7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.1g,0.258mmol,通过BBRC制备)和K2CO3(0.107g,0.774mmol)在DMSO(2mL)中的混合物在80℃下搅拌90min。冷却后,通过添加水将反应混合物淬灭。将水溶液用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的0-10%MeOH纯化以提供呈白色固体的3-((5-氨基-7-羟基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯。
LC-MS m/z 330.1[M+H]+。
步骤2.将3-((5-氨基-7-羟基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.274g,0.832mmol)在THF(20mL)中的溶液冷却至0℃,并且然后用LiAlH4(在THF中的2M)(0.416mL,0.832mmol)逐滴处理。1h后LCMS显示反应完成。通过缓慢添加甲醇将反应淬灭,并且然后与罗谢尔盐(1M,10mL)一起搅拌1h。将水溶液用EtOAC萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的0-10%MeOH纯化以提供呈白色固体的5-氨基-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-7-醇。
LC-MS m/z 302.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.55(s,1H),7.17(dd,J=8.3,2.1Hz,1H),6.96(d,J=8.4Hz,1H),6.51(d,J=2.1Hz,1H),6.10(s,2H),5.62(s,2H),4.96(t,J=5.8Hz,1H),4.28(d,J=5.4Hz,2H),3.81(s,3H)。
步骤3.将5-氨基-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-7-醇(0.13g,0.431mmol)、(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-胺(0.307g,0.863mmol)在DMSO(5mL)中的溶液用BOP(0.382g,0.863mmol)和DBU(0.260mL,1.726mmol)处理。将反应混合物在60℃下加热过夜。添加水以将反应淬灭。将水溶液用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的0-10%MeOH纯化以提供呈白色固体的(S)-(3-((5-氨基-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯基)甲醇。
LC-MS m/z 639.3[M+H]+。
步骤4.将(S)-(3-((5-氨基-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯基)甲醇(0.24g,0.376mmol)和SOCl2(0.545mL,7.51mmol)在THF(2mL)中的混合物在室温下搅拌30min。蒸发溶剂以得到呈白色固体的(S)-N7-(1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺。LC-MS m/z 657.3[M+H]+。
步骤5.(S)-3-((5-氨基-1-(2-甲氧基-5-((4-甲基哌嗪-1-基)甲基)苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-7-基)氨基)己-1-醇(化合物157)。将(S)-N7-(1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺(15mg,0.023mmol)和1-甲基哌嗪(13.71mg,0.137mmol)在DMF(0.5mL)中的溶液在室温下搅拌2h。添加三乙胺三氢氟酸盐(0.022mL,0.137mmol)和DMSO(0.5mL)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。将粗材料用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含NH4OAc);梯度:在5%B下保持0分钟,经20分钟5%-45%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS信号触发级分收集。将含有化合物157的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
根据此实施例类似地制备以下化合物:化合物155、化合物156和化合物158。
实施例I-化合物164
步骤1.将3-((3-溴-7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.6g,1.287mmol,在先前的专利中制备)、Pd(dppf)2Cl2(0.094g,0.129mmol)、K2CO3(0.534g,3.86mmol)和三甲基硼氧六环(0.899mL,6.43mmol)的混合物在120℃下搅拌过夜。冷却后,通过添加水将反应淬灭。将水溶液用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的0-10%MeOH纯化以提供呈白色固体的3-((5-氨基-7-羟基-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯。
LC-MS m/z 344.2[M+H]+。
1H NMR(500MHz,DMSO-d6)δ10.91(s,1H),7.87(dd,J=8.5,2.0Hz,1H),7.19–7.12(m,2H),6.08(s,2H),5.55(s,2H),3.88(s,3H),3.73(s,3H),2.21(s,3H)。
步骤2.将3-((5-氨基-7-羟基-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.12g,0.350mmol)在THF(20mL)中的溶液冷却至0℃并且然后用LiAlH4(在THF中的2M)(0.175mL,0.350mmol)逐滴处理。2h后LCMS显示反应完成。通过缓慢添加甲醇将反应淬灭,并且然后与罗谢尔盐(1M,10mL)一起搅拌1h。将水溶液用EtOAC萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的0-20%MeOH纯化以提供呈白色固体的5-氨基-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-7-醇。
LC-MS m/z 316.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.16(d,J=8.3Hz,1H),6.96(d,J=8.3Hz,1H),6.54(s,1H),6.09(s,2H),5.54(s,2H),4.96(t,J=5.7Hz,1H),4.28(d,J=5.5Hz,2H),3.80(s,3H),2.22(s,3H)。
步骤3.向5-氨基-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-7-醇(74.8mg,0.237mmol)和BOP(210mg,0.474mmol)在DMSO(2mL)中的溶液中添加(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-胺(506mg,1.423mmol)和DBU(0.143mL,0.949mmol)在DMSO(2mL)中的溶液。将反应混合物在60℃下加热6h。添加水以淬灭反应。将水溶液用EtOAc萃取。将合并的有机层干燥,过滤并且浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在CH2Cl2中的0-20%MeOH纯化以提供呈浅黄色油状物的(S)-(3-((5-氨基-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯基)甲醇。
LC-MS m/z 653.5[M+H]+。
步骤4.在室温下将SOCl2(0.333mL,4.59mmol)添加到(S)-(3-((5-氨基-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯基)甲醇(0.15g,0.230mmol)在THF(2mL)中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌20min。蒸发溶剂以得到呈白色固体的(S)-N7-(1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺。
LC-MS m/z 671.5[M+H]+。
步骤5.将1-甲基哌嗪(17.90mg,0.179mmol)添加到(S)-N7-(1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-3-甲基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5,7-二胺(20mg,0.030mmol)在DMF(0.5mL)中的溶液中。将反应混合物在室温下搅拌3h。添加在DMSO(0.5mL)中的三乙胺三氢氟酸盐(0.029mL,0.179mmol)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。将粗材料用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含NH4OAc);梯度:在10%B下保持0分钟,经20分钟10%-50%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS信号触发级分收集。将含有所需产物的级分合并并且经由离心蒸发干燥以得到化合物164。
根据此实施例类似地制备以下化合物:化合物159、化合物161和化合物162。
实施例J-化合物169
步骤1.将5-溴-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(2.239g,8.51mmol,根据US2015/0299104制备)和磷酸钾(5.42g,25.5mmol)在1,4-二噁烷(38.3ml)和H2O(4.26ml)中的室温混合物用N2鼓泡30min。添加甲基硼酸(0.764g,12.77mmol)和XPhos Pd G2(0.167g,0.213mmol)。将混合物用N2鼓泡2min并且在80℃下搅拌22h。将反应冷却至室温,用EtOAc(200mL)稀释,用H2O(200mL)和饱和NaCl水溶液(200mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并且在真空中浓缩。将粗材料通过快速色谱法(40g硅胶;线性梯度0-25%EtOAc-己烷)纯化。将混合级分浓缩并且通过快速色谱法(40g硅胶;线性梯度0-25%EtOAc-己烷)进一步纯化。将来自两个柱的产物合并以提供2-氟-4-甲氧基-5-甲基苯甲酸甲酯(1.563g,93%)。
LC-MS m/z 199[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ7.67(dd,J=8.6,0.7Hz,1H),6.95(d,J=13.2Hz,1H),3.87(s,3H),3.80(s,3H),2.13(s,3H)。
步骤2.向2-氟-4-甲氧基-5-甲基苯甲酸甲酯(1.563g,7.89mmol)在CCl4(19.72ml)中的室温溶液中添加N-溴琥珀酰亚胺(1.474g,8.28mmol)和2,2'-偶氮双(2-甲基丙腈)(0.130g,0.789mmol)。将悬浮液在75℃下搅拌20h。将反应冷却至室温并且过滤。将固体用CCl4(2x 2mL)洗涤。将合并的滤液在真空中浓缩。将粗材料通过快速色谱法(40g硅胶;线性梯度0-25%EtOAc-己烷)纯化。将混合级分浓缩并且通过快速色谱法(40g硅胶;线性梯度0-15%EtOAc-己烷)进一步纯化。将来自两个柱的产物合并以提供5-(溴甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(1.73g,79%)。
LC-MS m/z 277/279[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.00(d,J=8.5Hz,1H),7.09(d,J=13.2Hz,1H),4.67(s,2H),3.95(s,3H),3.82(s,3H)。
步骤3.向(3-溴-7-羟基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(1.60g,5.55mmol)(方案2,化合物11,上文)在DMF(27.8ml)中的室温溶液中添加Cs2CO3(5.43g,16.66mmol)。将反应在0℃下搅拌10min,然后添加5-(溴甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(1.539g,5.55mmol)。将反应在0℃下搅拌30min,然后移除冷却浴并且将其在室温下搅拌1h。将反应添加到H2O(150mL)中,并且将固体通过真空过滤收集并且用H2O(3x 10mL)、MeOH(3x10mL)和Et2O(3x10mL)洗涤以提供呈灰白色固体的5-((3-溴-7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(1.191g,44%)。
LC-MS m/z 484/486[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.82-11.58(m,1H),11.51-11.31(m,1H),7.59(d,J=8.3Hz,1H),7.07(d,J=13.1Hz,1H),5.68(s,2H),3.84(s,3H),3.79(s,3H),3.75(s,3H)。
步骤4.向5-((3-溴-7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(569mg,1.175mmol)在DMSO(7834μl)中的室温悬浮液中添加(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-胺,HCl(691mg,1.763mmol)(US2020/0038403A1,图8,化合物71a)和(苯并三唑-1-基氧基)三(二甲基氨基)鏻六氟磷酸盐(780mg,1.763mmol),然后添加1,8-二氮杂双环[5.4.0]十一-7-烯(879μl,5.88mmol)。将反应在室温下搅拌4h。添加另外的(苯并三唑-1-基氧基)三(二甲基氨基)鏻六氟磷酸盐(52mg,0.12mmol),并且将反应在室温下搅拌19h。将反应添加到H2O(80mL)的搅拌烧瓶中,并且将不溶性材料通过真空过滤收集并且用H2O(2x5mL)洗涤,并且然后将其溶解于EtOAc(100mL)中。将所得溶液用饱和NaCl水溶液(100mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并且在真空中浓缩。将粗材料通过快速色谱法(80g硅胶;线性梯度0-40%EtOAc-CH2Cl2)纯化。将此材料通过快速色谱法(40g硅胶;线性梯度0-50%EtOAc-己烷)进一步纯化以提供呈棕色泡沫的(S)-5-((3-溴-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(455mg,47%)。
LC-MS m/z 821/823[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.80(s,1H),7.55(dd,J=7.9,1.5Hz,2H),7.50-7.46(m,2H),7.46-7.32(m,5H),7.27-7.21(m,2H),7.03(d,J=13.1Hz,1H),6.68(br d,J=8.5Hz,1H),5.77-5.69(m,1H),5.67-5.59(m,1H),4.70-4.60(m,1H),3.74(s,6H),3.65(t,J=6.5Hz,2H),3.58(s,3H),1.91-1.83(m,2H),1.61-1.43(m,2H),1.27-1.13(m,2H),0.91(s,9H),0.80(t,J=7.4Hz,3H)。
步骤5.将(S)-5-((3-溴-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.455g,0.554mmol)在EtOH(22.15ml)中的室温溶液排空并且然后用N2(3x)回填,并且然后添加钯碳(10wt%(干基),湿支持物)(0.088g)。将混合物排空并且然后用H2回填,并且在H2(气球)的气氛下搅拌2h。将反应混合物用N2吹扫30min,然后将其在N2气氛下通过CELITETM过滤并且用EtOH(2x15mL)洗涤。将合并的滤液在真空中浓缩以提供呈白色泡沫的(S)-5-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(423mg,定量)。
LC-MS m/z 743[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ8.03(s,1H),7.56-7.49(m,3H),7.50-7.46(m,2H),7.43-7.32(m,4H),7.29-7.24(m,2H),7.04(d,J=13.1Hz,1H),5.85-5.78(m,1H),5.73-5.66(m,1H),4.68-4.58(m,1H),3.76(s,3H),3.77(br s,3H),3.73(s,3H),3.70-3.62(m,2H),1.92(br dd,J=5.3,3.2Hz,2H),1.67-1.51(m,2H),1.29-1.14(m,2H),0.91(s,9H),0.82(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤6.向(S)-5-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-2-氟-4-甲氧基苯甲酸甲酯(422mg,0.568mmol)在THF(5112μl)和MeOH(568μl)中的混合物中的0℃溶液中逐滴添加硼氢化锂(在THF中的2M溶液)(2840μl,5.68mmol)。将反应在室温下搅拌17h。添加另外的硼氢化锂(284μL,0.568mmol)并且将反应在室温下搅拌30min。添加另外的硼氢化锂(1.14mL,2.28mmol),并且将反应在室温下搅拌30min,并且然后在40℃下搅拌5h。将反应冷却至0℃并且通过缓慢添加MeOH(2mL)淬灭。将混合物在室温下搅拌15min,并且然后将其用H2O(50mL)稀释并且用EtOAc(2x50mL)萃取。将合并的有机层用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并且在真空中浓缩。将粗材料通过快速色谱法(40g硅胶;线性梯度0-100%EtOAc-CH2Cl2)纯化以提供呈白色泡沫的(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(4-氟-5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(197.6mg,49%)。
LC-MS m/z 715[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ9.50(s,1H),7.88(s,1H),7.57-7.54(m,2H),7.50-7.46(m,2H),7.44-7.33(m,4H),7.27-7.22(m,2H),6.89(d,J=12.1Hz,1H),6.78(d,J=8.5Hz,1H),6.07(d,J=8.5Hz,1H),5.70-5.64(m,1H),5.61-5.55(m,1H),5.03(t,J=5.6Hz,1H),4.61-4.51(m,1H),4.32-4.22(m,2H),3.74(s,3H),3.65-3.59(m,2H),3.58(s,3H),1.89-1.72(m,2H),1.52-1.41(m,2H),1.21-1.05(m,2H),0.92(s,9H),0.78(t,J=7.3Hz,3H)。
步骤7.向亚硫酰氯(104μl,1.427mmol)在THF(2853μl)中的0℃溶液中逐滴添加在THF(2853μl)中的(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(4-氟-5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(204mg,0.285mmol)。将反应在室温下搅拌20min,并且然后将其在真空中浓缩。将粗材料与THF混合并且在真空中浓缩(2x)以提供粗(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(5-(氯甲基)-4-氟-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。此材料不经进一步纯化而使用。
LC-MS m/z 733[M+H]+。
步骤8.将(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(5-(氯甲基)-4-氟-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.042g,0.057mmol)在MeCN(1.140ml)中的室温溶液添加到甲胺(在THF中的2M溶液)(0.086ml,0.171mmol)中,并且然后添加N,N-二异丙基乙胺(0.060ml,0.342mmol)。将反应在60℃下搅拌2h,然后在70℃下搅拌1h。将反应冷却至室温并且浓缩。将残余物吸收在EtOAc(2mL)中并且用饱和NaHCO3水溶液(2mL)洗涤。将水层用EtOAc(2x2mL)萃取。将合并的有机层用饱和NaCl水溶液(2mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并且在真空中浓缩以提供粗(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)-氧基)己-3-基)氨基)-1-(4-氟-2-甲氧基-5-((甲基氨基)甲基)苄基)-1H-吡唑并-[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。此材料不经进一步纯化而使用。
LC-MS m/z 728[M+H]+。
步骤9.向来自步骤8的粗材料在1,4-二噁烷(570μl)中的室温溶液中添加在1,4-二噁烷(570μl)中的4N HCl。将反应在室温下搅拌5h,并且浓缩。将残余物与1,4-二噁烷(0.3mL)混合并且浓缩以提供粗(S)-(1-(4-氟-2-甲氧基-5-((甲基氨基)甲基)苄基)-7-((1-羟基己-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。此材料不经进一步纯化而使用。
LC-MS m/z 490[M+H]+。
步骤10.向来自步骤9的粗材料在1,4-二噁烷(570μl)和MeOH(0.285mL)的混合物中的室温溶液中添加10M NaOH水溶液(57.0μl,0.570mmol)。将反应在70℃下搅拌3h。将反应冷却至室温并且通过添加乙酸(32.6μl,0.570mmol)中和。将混合物浓缩,并且然后将其溶解于H2O(0.3mL)和DMF(1.7mL)的混合物中,过滤(0.45μm尼龙注射筒式过滤器),并且用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含NH4OAc);梯度:在4%B下保持0分钟,经20分钟4%-44%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物169的级分合并并且经由离心蒸发干燥(10.4mg,41%)。
类似地制备这些化合物:化合物165、化合物166、化合物167、化合物168、化合物171、化合物172、化合物173、化合物175和化合物176。(在一些情况下,对步骤8进行以下修改:如果起始胺是盐,则添加i-Pr2NEt的另外的等效物;反应的温度范围为从60℃至80℃)。
实施例K-化合物170
步骤1.将6-甲氧基-5-甲基烟酸甲酯(491mg,2.71mmol)、NBS(627mg,3.52mmol)和AIBN(111mg,0.677mmol)在四氯化碳(20mL)中的混合物加热至80℃持续16h。将反应混合物在减压下蒸发并且在硅胶柱上用在己烷中的0%至50%的乙酸乙酯的梯度纯化以提供5-(溴甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(493mg)。
1H NMR(400MHz,氯仿-d)δ8.84-8.74(m,1H),8.28-8.18(m,1H),4.54-4.46(m,2H),4.15-4.07(m,3H),3.98-3.89(m,3H)
步骤2.向5-(溴甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(233mg,0.896mmol)和(3-溴-7-羟基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(215mg,0.747mmol)在DMF(5mL)中的混合物中添加Cs2CO3(730mg,2.240mmol)。16h后,将反应在乙酸乙酯(50mL)/LiCl(10%水溶液,50mL)之间分配。将有机层用Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩。将产物通过与甲醇一起研磨分离以提供5-((3-溴-7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(133mg)。将此产物不经进一步纯化使用。
LC-MS m/z 469.1[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ11.69(br s,1H),11.45(br s,1H),8.72(d,J=2.2Hz,1H),7.85(d,J=2.2Hz,1H),5.73(s,2H),3.99-3.92(m,3H),3.83(s,3H),3.76(s,3H)。
步骤3.将5-((3-溴-7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(215mg,0.460mmol)、(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-胺(245mg,0.690mmol)、BOP(305mg,0.690mmol)和DBU(0.312mL,2.071mmol)在DMSO(5mL)中的溶液在室温下搅拌16h。添加BOP(305mg,0.690mmol)和DBU(0.312mL,2.071mmol)。将反应混合物在室温下搅拌3h并且在DCM(50mL)与水(50mL)之间分配。将有机层用Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在己烷中的0%至100%乙酸乙酯的梯度纯化以提供(S)-5-((3-溴-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(191mg)。
LC-MS m/z 804.4[M+H]+。
步骤4.将(S)-5-((3-溴-7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(191mg,0.237mmol)和Pd-C(200mg,0.094mmol)在MeOH(10mL)中的悬浮液用N2吹扫3次(每两次之间排空),然后用H2吹扫三次(每两次之间排空)。将混合物在氢气下搅拌1h。将反应混合物通过CELITETM过滤并且在减压下蒸发以提供(S)-5-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(172mg),不经进一步纯化使用。
LC-MS m/z 726.3[M+H]+。
步骤5.向(S)-5-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-6-甲氧基烟酸甲酯(172mg,0.237mmol)在THF(3mL)和甲醇(0.600mL)的混合物中的溶液中添加LiBH4(2M THF)(0.592mL,1.185mmol)。1h后,添加更多LiBH4(2M THF)(0.592mL,1.185mmol)。16h后,将反应在乙酸乙酯(50mL)与1%酒石酸K/Na水溶液(10mL)之间分配。将有机层用Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩。将粗产物在硅胶柱上用在己烷中的0%至100%乙酸乙酯的梯度纯化以提供(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((5-(羟基甲基)-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(165mg)。
LC-MS m/z 698.5[M+H]+。
步骤6.向(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((5-(羟基甲基)-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(165mg,0.236mmol)在DCM(10mL)中的溶液中添加戴斯-马丁高碘化物(Dess-Martinperiodinane)(201mg,0.473mmol)。30min后,将反应在减压下蒸发并且在高真空下干燥。将粗产物在硅胶柱上用在己烷中的0%至100%EtOAc的梯度纯化以提供(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((5-甲酰基-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(66mg)。
LC-MS m/z 696.5[M+H]+。
步骤7.向(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((5-甲酰基-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(33mg,0.047mmol)和N1,N1,N2-三甲基乙烷-1,2-二胺(24.23mg,0.237mmol)在DCM(3mL)中的溶液中添加三乙酰氧基硼氢化钠(70.4mg,0.332mmol)以得到溶液。2h后,添加2mL饱和碳酸钠。将所得混合物用20mL甲醇稀释。将有机层用Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩以提供(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((5-(((2-(二甲基氨基)乙基)(甲基)氨基)甲基)-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(37mg)。将此产物不经进一步纯化使用。
LC-MS m/z 782.5[M+H]+。
步骤8.向(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((5-(((2-(二甲基氨基)乙基)(甲基)氨基)甲基)-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.037g,0.047mmol)的溶液中添加HCl(4N二噁烷)(3ml,12.00mmol)。16h后在减压下蒸发溶剂并且将残余物在高真空下干燥以提供(S)-(1-((5-(((2-(二甲基氨基)乙基)(甲基)氨基)甲基)-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-7-((1-羟基己-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯盐酸盐(26mg),不经进一步纯化使用。
LC-MS m/z 544.3[M+H]+。
步骤9.将(S)-(1-((5-(((2-(二甲基氨基)乙基)(甲基)氨基)甲基)-2-甲氧基吡啶-3-基)甲基)-7-((1-羟基己-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(25.6mg,0.047mmol)和NaOH(10N)(50μl,0.500mmol)在二噁烷(3mL)中的溶液加热至50℃。24h后,在减压下蒸发溶剂并且将残余物在高真空下干燥并且用2mL的DMF:HOAc(1:1)稀释。将粗材料用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含NH4OAc);梯度:在7%B下保持0分钟,经20分钟7%-47%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物170的级分合并并且经由离心蒸发干燥(11mg)。
实施例L-化合物160
步骤1.向在DMF(3mL)中的(1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-7-羟基-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(化合物23,130mg,0.344mmol)中添加3-甲氧基氮杂环丁烷(90mg,1.032mmol)和DIPEA(0.240mL,1.376mmol)。将反应在25C下搅拌过夜。经由V-10去除溶剂并且将材料在硅胶(干加载)0-20%DCM-MeOH上纯化以得到(7-羟基-1-(2-甲氧基-5-((3-甲氧基氮杂环丁烷-1-基)甲基)苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(130mg,0.303mmol,88%产率)。
LC-MS m/z 429.4[M+H]+。
步骤2.向在DMSO(1.5mL)中的(7-羟基-1-(2-甲氧基-5-((3-甲氧基氮杂环丁烷-1-基)甲基)苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(65mg,0.152mmol)中添加(S)-3-氨基-1-环丙基丙-1-醇(34.9mg,0.303mmol)、DBU(0.091mL,0.607mmol)和bop(134mg,0.303mmol)。将混合物在70C下搅拌1h。将混合物用5M NaOH(1mL,5.00mmol)处理并且在70度下加热1h。将粗产物用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.1%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.1%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在30 100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物160的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
实施例M-化合物163
步骤1.将3-((7-羟基-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.53g,1.368mmol)在DMSO(8mL)中的混合物用(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)戊-3-胺(1.402g,4.10mmol)、2,3,4,6,7,8,9,10-八氢嘧啶并[1,2-a]氮杂卓(0.619mL,4.10mmol)处理,然后用((1H-苯并[d][1,2,3]三唑-1-基)氧基)三(二甲基氨基)鏻六氟磷酸盐(V)(1.210g,2.74mmol)处理并且在室温下搅拌过夜。将反应用EtOAc稀释并且用水洗涤。经Na2SO4干燥溶剂混合物。去除溶剂并且将材料在40gCOMBIFLASH硅胶柱上纯化。将80%EtOAc/己烷级分浓缩以得到呈白色固体的(S)-3-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)戊-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(0.32g,0.450mmol,32.9%产率)。
LC/MS[M+H]=711.5。
步骤2.向(S)-3-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)戊-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(590mg,0.830mmol)在THF(7469μl)和MeOH(830μl)中的溶液中逐滴添加硼氢化锂(在THF中的2M溶液)(4150μl,8.30mmol)(添加期间气体逸出)。将反应在室温下搅拌30min。将反应冷却至0℃并且通过添加H2O淬灭,导致固体沉淀。将混合物用H2O(50mL)稀释并且用EtOAc(2x50mL)萃取(摇动各层直到所有固体溶解)。将合并的有机层用饱和NaCl水溶液(50mL)洗涤,经Na2SO4干燥,过滤并且在真空中浓缩。将粗材料通过快速色谱法(加载为在CH2Cl2中的溶液;40g硅胶;线性梯度0-100%EtOAc-CH2Cl2,然后0-10%MeOH-CH2Cl2)纯化。将杂质洗脱在EtOAc梯度中并且将产物洗脱在MeOH梯度中。将产物级分浓缩以提供呈白色固体的产物。将其吸收在THF(2mL)中并且用亚硫酰氯(0.062mL,0.843mmol)处理。蒸发溶剂并且重新溶解于DMF(2mL)中。添加三乙胺三氢氟酸盐(0.343mL,2.109mmol)并且在室温下搅拌过夜,此时LCMS显示反应完成。在COMBIFLASH 24g柱上纯化。5%MeOH/DCM级分提供了呈浓稠油状物的(S)-(1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-7-((1-羟基戊-3-基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(140mg,0.302mmol,36%产率)。15%MeOH/DCM级分提供了(S)-3-((5-氨基-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-7-基)氨基)戊-1-醇(40mg,0.099mmol,12%产率)。
LC/MS[M+H]=405.3。
步骤3.向(S)-3-((5-氨基-1-(5-(氯甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-7-基)氨基)戊-1-醇(0.099mmol,40mg)在DMSO(1mL)中的溶液中添加1-甲基哌嗪(0.494mmol,49.5mg)。将反应混合物在80℃下加热1h并且用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.05%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.05%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经20分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS和UV信号触发级分收集。将含有化合物163的级分合并并且经由离心蒸发干燥(白色固体,6.7mg,9%产率)。
实施例N-化合物178
步骤1.将2-氯-5-甲基吡啶-4-醇(5.00g,34.8mmol)在DMF(50mL)中的搅拌溶液在0℃下冷却。添加NaH(1.39g,34.8mmol)。10min后,添加碘甲烷(2.61mL,41.8mmol)。将反应混合物在室温下搅拌16h并且在水与乙酸乙酯之间分配。将有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且在真空下浓缩以得到呈浅黄色油状物的粗产物,将其使用CombiFlash(硅胶60-120目;在石油醚中的15%乙酸乙酯作为洗脱剂)纯化。将级分使用高真空在50℃下浓缩以得到呈黄色液体的2-氯-4-甲氧基-5-甲基吡啶(5.2g,32.7mmol,94%产率)。
LC-MS[M+H]+158.2。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=8.00(s,1H),7.33(s,1H),3.89(s,3H),2.17(s,3H)。
步骤2.向2-氯-4-甲氧基-5-甲基吡啶(5.750g,36.5mmol)在DMF(100mL)和甲醇(100mL)中的搅拌溶液中添加TEA(15.26mL,109mmol)。用氮气吹扫5min后,添加PdCl2(dppf)-CH2Cl2加合物(5.96g,7.30mmol)。在CO气(10kg压力)下将反应混合物在100℃下搅拌12h。将反应混合物通过CELITETM床过滤。将滤液用甲醇洗涤并且在真空下浓缩以得到呈浅黄色油状物的粗产物。将此使用Combi Flash(硅胶60-120目;在石油醚中的25%乙酸乙酯作为洗脱剂)纯化。将含有产物的级分在50℃下使用高真空浓缩以得到呈棕色固体的4-甲氧基-5-甲基吡啶甲酸甲酯(5.00g,27.6mmol,76%产率)。
LC-MS[M+H]+182.2。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=8.36(s,1H),7.90(s,1H),3.99(s,3H),3.84(s,3H),2.22(s,3H)。
步骤3.向5-甲氧基-4-甲基吡啶甲酸甲酯(5.00g,27.6mmol)在四氯化碳(100mL)中的溶液中添加AIBN(0.906g,5.52mmol)和NBS(5.89g,33.1mmol)。将反应混合物在65℃下搅拌16h并且在真空下浓缩。将残余物溶解于乙酸乙酯中并且在水与乙酸乙酯之间分配。将有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且在真空下浓缩以得到呈浅黄色油状物的粗产物,将其使用Combi Flash(硅胶60-120目;在石油醚中的25%乙酸乙酯作为洗脱剂)纯化。将含有产物的级分在50℃下使用高真空浓缩以得到呈浅黄色固体的4-(溴甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(5.1g,14.51mmol,52.6%产率)。
LC-MS[M+H]+:260.1。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=8.59(s,1H),8.13(s,1H),4.66(s,2H),4.03(s,3H),3.86(s,3H)。
步骤4.向(7-羟基-3-碘(1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(1.600g,4.78mmol)在DMF(20mL)中的搅拌溶液中添加Cs2CO3(3.11g,9.55mmol)和4-(溴甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.242g,4.78mmol)。将反应混合物在0℃下搅拌1h。将反应混合物在水与乙酸乙酯之间分配。将有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且在真空下浓缩以得到呈浅黄色固体的粗产物,将其使用Combi Flash(硅胶60-120目;在氯仿中的10%乙酸乙酯作为洗脱剂)纯化。将含有产物的级分在50℃下使用高真空浓缩以得到呈灰白色固体的4-((7-羟基-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.100g,1.968mmol,41.2%产率)。
LC-MS m/z 515.2[M+H]+。
1H NMR(400MHz,DMSO-d6)δ=11.71(s,1H),11.40(s,1H)8.51(s,1H),7.43(s,1H),5.73(s,2H),4.04(s,3H),3.80(s,3H),3.73(s,3H)。
步骤5.向4-((7-羟基-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.100g,2.139mmol)在DMSO(10mL)中的搅拌溶液中按顺序添加DBU(0.967mL,6.42mmol)、BOP(1.419g,3.21mmol)和(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-胺(0.761g,2.139mmol)。将反应混合物在45℃下搅拌4h并且然后在水与乙酸乙酯之间分配。将有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且在真空下浓缩以得到呈浅黄色油状物的粗产物,将其使用Combi Flash(硅胶60-120目;在氯仿中的25%乙酸乙酯作为洗脱剂)纯化。将级分在50℃下使用高真空浓缩以得到呈黄色固体的(S)-4-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.10g,1.188mmol,55.5%产率)。
LC-MS m/z 852.8[M+H]+。
步骤6.向(S)-4-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.30g,1.526mmol)在甲醇(15mL)中的搅拌溶液中添加10%钯碳(0.812g,0.763mmol)。将反应混合物在室温下在H2下搅拌14h。将混合物通过CELITETM床过滤。将滤液用甲醇和DCM(400mL)洗涤并且在真空50℃下浓缩以得到呈棕色固体的(S)-4-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.050g,1.418mmol,93%产率)。
LC-MS m/z 726.3[M+H]+。
步骤7.向在0℃下的(S)-4-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.00g,1.378mmol)在THF(10mL):甲醇(3mL)中的搅拌溶液中添加LiBH4(10.33mL,20.66mmol)。将反应混合物在45℃下搅拌16h并且用氯化铵溶液淬灭并且用乙酸乙酯萃取。将有机层用盐水洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并在真空下浓缩以得到呈灰白色固体的粗产物。将粗产物使用Combi Flash(硅胶60-120目;在氯仿中的5%甲醇作为洗脱剂)纯化。将级分在50℃下使用高真空浓缩以得到呈灰白色固体的(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((2-(羟基甲基)-5-甲氧基吡啶-4-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.170g,0.173mmol,12.55%产率)。
LC-MS m/z 698.3[M+H]+。
步骤8.在0℃下向(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((2-(羟基甲基)-5-甲氧基吡啶-4-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.200g,0.287mmol)在THF(3mL)中的搅拌溶液中添加亚硫酰氯(0.105mL,1.433mmol)。将反应混合物在0℃下搅拌1h。将反应混合物浓缩以得到呈黄色油状物的(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((2-(氯甲基)-5-甲氧基吡啶-4-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.226g,0.271mmol,95%产率)。
LC-MS m/z 718.2[M+H]+。
步骤9.向(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((2-(氯甲基)-5-甲氧基吡啶-4-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.112g,0.156mmol)在DMF(2mL)中的搅拌溶液中添加甲胺HCl(0.021g,0.313mmol)和K2CO3(0.065g,0.469mmol)。将反应混合物在50℃下搅拌14h。将反应混合物在真空中浓缩。将残余物溶解于甲醇(2mL)中。添加在水(1mL)中的HCl(5.21μl,0.172mmol)。将反应混合物在室温下搅拌并且在真空中浓缩。将粗品吸收在1,4-二噁烷(1mL)中,向其中添加在水(1mL)中的NaOH(0.044g,1.100mmol)。将反应混合物在70℃下搅拌3h。将反应混合物在水与乙酸乙酯之间分配。将有机层用盐水溶液洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并且在真空下浓缩以得到呈浅棕色油状物的粗产物。将粗产物通过制备型LC/MS(柱:Waters XBridge C18,150mm x19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含10-mM NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含10-mMNH4OAc);梯度:在10%B下保持0分钟,经25分钟10%-45%B,然后在100%B下保持5分钟;流速:15mL/min;柱温:25℃)纯化以得到化合物178(0.04g,2.4%产率)。
类似地制备化合物177。
实施例O-化合物174
步骤1.向2-甲基吡啶-3-醇(10.0g,92mmol)在乙腈(150.0mL)中的搅拌溶液中经1h缓慢添加NBS(33.4g,188mmol)在乙腈(350.0mL)中的溶液。将反应混合物在85℃下搅拌2h。将反应混合物在减压下浓缩以得到粗产物,将其吸收在硅胶上并且通过ISCOCOMBIFLASHTM色谱法通过用在氯仿中的0-100%乙酸乙酯洗脱纯化以得到呈浅黄色固体的4,6-二溴-2-甲基吡啶-3-醇(11.0g,39.6mmol,43.2%产率)。
LC-MS m/z 268.0[M+H]+。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ=9.98(s,1H),7.70(s,1H),2.41(s,3H)。
步骤2.在-78℃下向4,6-二溴-2-甲基吡啶-3-醇(10.0g,37.5mmol)在THF(150.0mL)中的搅拌溶液中添加n-BuLi(31.5mL,79mmol)。将反应混合物在相同温度下搅拌3h。在相同温度下向此混合物中添加H2O(30.0mL,1665mmol)然后添加1.5N HCl溶液(30.0mL)。将反应混合物在相同温度下搅拌10min,用饱和氯化铵溶液稀释并且用DCM萃取。将有机层用盐水洗涤并且经Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩以得到呈浅棕色固体的6-溴-2-甲基吡啶-3-醇(5.1g,25.5mmol,68.1%产率)。
LC-MS m/z 188.1[M]+。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)d=10.10(br s,1H),7.24(d,J=8.7Hz,1H),7.08(d,J=8.3Hz,1H),2.34-2.23(m,3H)。
步骤3.向6-溴-2-甲基吡啶-3-醇(4.0g,21.27mmol)在乙腈(40.0mL)中的搅拌溶液中添加Cs2CO3(20.79g,63.8mmol)。向此混合物中添加MeI(1.995mL,31.9mmol)。将反应混合物在50℃下搅拌16h。将反应混合物在EtOAc与水之间分配。将有机层用盐水溶液洗涤并且经Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩以得到粗化合物。将粗化合物用石油醚冲洗,将滤液在减压下浓缩以得到呈棕色固体的6-溴-3-甲氧基-2-甲基吡啶(4.0g,18.81mmol,88%产率)。
LC-MS m/z 202.0[M+H]+。
1H NMR(300MHz,氯仿-d)δ=7.23-7.14(m,1H),6.90(d,J=8.7Hz,1H),3.75(s,3H),2.37(s,3H)。
步骤4.在氮气吹扫下,向6-溴-3-甲氧基-2-甲基吡啶(4.0g,19.80mmol)在DMF(40.0mL):MeOH(40.0mL)中的搅拌溶液中添加TEA(8.28mL,59.4mmol)、PdCl2(dppf)-CH2Cl2(3.23g,3.96mmol)。将反应混合物在高压釜中在CO气体(10巴压力)下在100℃下搅拌16h。将反应混合物在减压下浓缩以得到残余物。将残余物用DCM稀释并且然后通过CELITETM床过滤并且用过量的DCM洗涤。将滤液在减压下浓缩以得到粗化合物。将粗化合物通过ISCOCombiflash色谱法通过用在石油醚中的0-100%乙酸乙酯洗脱纯化以得到呈浅棕色固体的5-甲氧基-6-甲基吡啶甲酸甲酯(2.62g,14.32mmol,72.3%产率)。
LC-MS m/z 182.0[M+H]+。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ=7.98-7.91(m,1H),7.49-7.40(m,1H),3.92-3.87(m,3H),3.86-3.80(m,3H),2.42-2.36(m,3H)。
步骤5.向5-甲氧基-6-甲基吡啶甲酸甲酯(2.5g,13.80mmol)在氯仿(25.0mL)中的搅拌溶液中添加NBS(2.95g,16.56mmol)和AIBN(0.453g,2.76mmol)。将反应混合物在65℃下搅拌16h。将反应混合物通过CELITETM床过滤并且用过量的DCM洗涤并且将滤液在减压下浓缩以得到粗化合物。将粗化合物通过ISCO Combiflash色谱法通过用在石油醚中的0-100%乙酸乙酯洗脱纯化以得到浅棕色固体,将其在水中搅拌15分钟,然后将固体过滤并且在真空下干燥以得到呈浅棕色固体的6-(溴甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.6g,5.84mmol,42.4%产率)。
LC-MS m/z 262.0[M+H]+。
1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ=11.17-10.94(m,1H),8.08(d,J=8.7Hz,1H),7.66-7.57(m,1H),4.73-4.58(m,2H),3.99-3.97(m,3H),3.87-3.84(m,3H),2.57-2.56(m,1H),2.57(s,5H)。
步骤6.向(7-羟基-3-碘(1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(2.0g,5.97mmol)在DMF(20.0mL)中的搅拌溶液中添加Cs2CO3(3.89g,11.94mmol)。在0℃下向此混合物中添加6-(溴甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.552g,5.97mmol)。将反应混合物在0℃下搅拌1h。将反应混合物在EtOAc与水之间分配。将有机层用盐水溶液洗涤并且经Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩以得到粗化合物。将粗化合物通过ISCO combiflash色谱法通过用在氯仿中的0-100%乙酸乙酯洗脱纯化以得到呈浅棕色固体的6-((7-羟基-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(1.08g,1.764mmol,29.6%产率)。
LC-MS m/z 515.0[M+H]+。
步骤7.向6-((7-羟基-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(0.32g,0.622mmol)在DMSO(3.0mL)中的搅拌溶液中添加DBU(0.281mL,1.867mmol)、BOP(0.413g,0.933mmol)和(S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-胺(0.266g,0.747mmol)。将反应混合物在45℃下搅拌3h。将反应混合物用水处理。将沉淀物收集并且在真空下干燥以得到粗化合物。将粗化合物通过ISCO combiflash色谱法通过用在石油醚中的0-100%乙酸乙酯洗脱纯化以得到呈浅棕色固体的(S)-6-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(0.189g,0.220mmol,35.3%产率)。
LC-MS m/z 852.2[M+H]+。
步骤8.向(S)-6-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-3-碘(5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(0.16g,0.188mmol)在MeOH(5.0mL)中的搅拌溶液中添加Pd-C(0.100g,0.094mmol)。将反应混合物在室温下在氢气(囊袋)下搅拌4h。将反应混合物通过CELITETM床过滤并且用过量的甲醇:DCM(1:1)洗涤并且将滤液在减压下浓缩以得到粗化合物。将粗化合物与乙醚和石油醚一起研磨,将固体在真空下干燥以得到呈浅棕色固体的(S)-6-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(0.118g,0.135mmol,71.8%产率)。
LC-MS m/z 726.3[M+H]+。
步骤9.向(S)-6-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-5-甲氧基吡啶甲酸甲酯(0.1g,0.138mmol)在THF(3.5mL):MeOH(1.5mL)中的搅拌溶液中添加LiBH4(在THF中的2M)(0.344mL,0.689mmol)。将反应混合物在45℃下搅拌16h。向此混合物中添加LiBH4(在THF中的2M)(0.689mL,1.378mmol)。将反应混合物在45℃下搅拌18h并且用饱和NH4Cl水溶液淬灭。将有机层分离,用盐水洗涤,并且经Na2SO4干燥,过滤并且在减压下浓缩以得到呈灰白色半固体的(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((6-(羟基甲基)-3-甲氧基吡啶-2-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.11g,0.128mmol,93%产率)。
LC-MS m/z 698.3[M+H]+
步骤10.在0℃下向(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-((6-(羟基甲基)-3-甲氧基吡啶-2-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.1g,0.143mmol)在MeOH(1.5mL)中的搅拌溶液中添加HCl水溶液(0.1mL,1.152mmol)。将反应混合物在室温下搅拌2h。将反应混合物在减压下完全浓缩并且与DCM共蒸馏以得到粗化合物。将粗化合物与乙醚和石油醚一起研磨,将固体在真空下干燥以得到呈浅绿色半固体的(S)-(7-((1-羟基己-3-基)氨基)-1-((6-(羟基甲基)-3-甲氧基吡啶-2-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯,HCl(85mg,0.141mmol,98%产率)。
LC-MS m/z 460.2[M+H]+。
步骤11.向(S)-(7-((1-羟基己-3-基)氨基)-1-((6-(羟基甲基)-3-甲氧基吡啶-2-基)甲基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯,HCl(80mg,0.161mmol)在二噁烷(1.0mL):水(1.0mL)中的搅拌溶液中添加NaOH(32.3mg,0.807mmol)。将反应混合物在70℃下搅拌90分钟。将有机层分离并且在减压下浓缩以得到粗化合物。将粗产物通过反相制备型HPLC(柱:Waters XBridge C18,150mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含10-mM NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含10-mM NH4OAc);梯度:在7%B下保持0分钟,经20分钟7%-25%B,然后在100%B下保持5分钟;流速:15mL/min;柱温:25℃)纯化以得到化合物174(26.4mg,0.064mmol,40.0%产率)。
实施例P-化合物179
步骤1.在0℃下将在THF/己烷中的0.25M二异丁基叔丁氧基氢化铝锂溶液(50mL,12.50mmol)经5min添加到(S)-3-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苯甲酸甲酯(1.87g,2.58mmol)在THF(25.8mL)中的溶液中。将反应在25℃下搅拌过夜(3h,98%转化)。将溶液用冷水稀释并且用AcOEt萃取3次。最后,将有机层经Na2SO4干燥并且在真空下蒸发。将材料在硅胶(己烷-EtOAc 0-100%)上纯化以得到(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(1.56g,2.238mmol,87%产率)。
LC-MS m/z 697.5[M+H]+。
步骤2.在25℃下将(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(5-(羟基甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.51g,0.732mmol)溶解于在25mL圆底烧瓶中的无水CH2Cl2(5mL)中以得到澄清溶液。将溶液冷却至0℃后,添加Et3N(0.306ml,2.195mmol)和Ms-Cl(0.114ml,1.464mmol)。15min后反应完成并且将反应用冰水和DCM淬灭。将有机层用盐水洗涤并且经Na2SO4干燥。将溶液浓缩以得到(S)-(7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(2-甲氧基-5-(甲氧基甲基)苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯(0.35g,67.3%产率)。将材料不经进一步纯化使用。
步骤3.将(3S,4S)-4-氨基四氢-2H-吡喃-3-醇盐酸盐(70mg,0.456mmol)和DIPEA(0.073mL,0.418mmol)添加到在DMF(1mL)中的(S)-3-((7-((1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-5-((甲氧基羰基)氨基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-1-基)甲基)-4-甲氧基苄基甲烷磺酸盐(108mg,0.139mmol)中。将反应在25℃下搅拌12h。LC/MS确认形成第一中间体(7-(((S)-1-((叔丁基二苯基甲硅烷基)氧基)己-3-基)氨基)-1-(5-((((3S,4S)-3-羟基四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。将在1,4-二噁烷中的HCl(3mL,12.00mmol)添加到反应混合物中,然后在25℃下搅拌2h。将溶剂去除并且LC/MS确认形成第二中间体(7-(((S)-1-羟基己-3-基)氨基)-1-(5-((((3S,4S)-3-羟基四氢-2H-吡喃-4-基)氨基)甲基)-2-甲氧基苄基)-1H-吡唑并[4,3-d]嘧啶-5-基)氨基甲酸甲酯。将溶剂去除并且将残余物用在MeOH中的5M NaOH稀释,然后在80℃下搅拌1h。LC/MS确认所需材料并且将溶剂去除。
将粗材料用以下条件经由制备型LC/MS纯化:柱:XBridge C18,200mm x 19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含NH4OAc);梯度:在3%B下保持0分钟,经30分钟3%-43%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS信号触发级分收集。将含有所需产物的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
将材料用以下条件经由制备型LC/MS进一步纯化:柱:XBridge C18,200mm x19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含0.05%TFA);流动相B:95:5乙腈:水(含0.05%TFA);梯度:在0%B下保持0分钟,经25分钟0-40%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS信号触发级分收集。将含有所需产物的级分合并并且经由离心蒸发干燥。
将材料仍用以下条件经由制备型LC/MS进一步纯化:柱:XBridge C18,200mm x19mm,5-μm颗粒;流动相A:5:95乙腈:水(含NH4OAc);流动相B:95:5乙腈:水(含NH4OAc);梯度:在1%B下保持0分钟,经25分钟1%-41%B,然后在100%B下保持0分钟;流速:20mL/min;柱温:25℃。通过MS信号触发级分收集。将含有所需产物的级分合并,并且经由离心蒸发干燥以得到化合物179(15.9mg,0.031mmol,22.38%产率)。
类似地制备以下化合物:化合物180、化合物181、化合物182、化合物183和化合物184。
实施例Q-起始材料和中间体
下图示出了用于制造这样的化合物的方案,所述化合物可用作用于制备本文公开的TLR7激动剂的起始材料或中间体。这些方案可以适用于制造可用作起始材料或中间体的其他类似的化合物。所采用的试剂是本领域中熟知的,并且在许多情况下,它们在前述实施例中已经得到了证明。
图解1
图解2
图解3
生物活性
本文公开作为TLR7激动剂的化合物的生物活性可以通过以下程序测定。
人TLR7激动剂活性测定
此程序描述了一种用于测定在本说明书中公开的化合物的人TLR7(hTLR7)激动剂活性的方法。
将具有人TLR7分泌型胚胎碱性磷酸酶(SEAP)报告转基因的工程化人胚肾蓝细胞(HEK-BlueTMTLR细胞;Invivogen)悬浮在非选择性培养基(补充有10%胎牛血清(Sigma)的DMEM高葡萄糖(Invitrogen))中。将HEK-BlueTMTLR7细胞添加到384孔组织培养板的每个孔中(15,000个细胞/孔),并且在37℃、5%CO2下孵育16-18h。将化合物(100nl)分配到含有HEK-BlueTMTLR细胞的孔中,并且将经处理的孔在37℃、5%CO2下孵育。在处理18h后,将十微升的新鲜制备的Quanti-BlueTM试剂(Invivogen)添加到每个孔中,孵育30min(37℃,5%CO2),并且使用Envision读板仪(OD=620nm)测量SEAP水平。计算半数最大有效浓度值(EC50;在测定基线与最大值之间引起反应的一半的化合物浓度)。
人血液中I型干扰素基因(MX-1)和CD69的诱导
I型干扰素(IFN)MX-1基因和B细胞激活标记物CD69的诱导是在TLR7通路激活后发生的下游事件。以下是人全血测定,其测量响应于TLR7激动剂的诱导。
从人类受试者中收获肝素化的人全血,并且将其用1mM的测试TLR7激动剂化合物处理。将血液用RPMI 1640培养基稀释,并且使用Echo预加样(predot)10nL/孔,从而得到1uM的最终浓度(在10uL血液中有10nL)。在摇床上混合30秒后,将板盖住并且置于37℃室中过夜=17h。制备固定/裂解缓冲液(在H20中5x->1x,在37℃下温热;目录号BD 558049),并且保持perm缓冲液(在冰上),以备后用。
对于表面标记物(CD69)染色:制备表面Ab:0.045ul hCD14-FITC(ThermoFisher目录号MHCD1401)+0.6ul hCD19-ef450(ThermoFisher目录号48-0198-42)+1.5ul hCD69-PE(目录号BD555531)+0.855ul FACS缓冲液。添加3ul/孔,1000rpm旋转1min,并且在摇床上混合30秒,置于冰上30min。在用70uL预温热的1x固定/裂解缓冲液30分钟后停止刺激,并且使用Feliex伴侣重悬(15次,对每个板更换吸头)并且在37C下孵育10分钟。
在2000rpm下离心5分钟,用HCS板清洗器抽出,在摇床上混合30秒,并且然后在dPBS中用70uL洗涤并且沉淀2次(2000rpm,持续5min),并且在FACS缓冲液中用50ul洗涤,沉淀1次(2000rpm,持续5min)。在摇床上混合30秒。对于细胞内标记物(MX-1)染色:添加50ulBD Perm缓冲液III,并且在摇床上混合30秒。在冰上孵育30分钟(在黑暗中)。用50uL FACS缓冲液洗涤2次(在perm后,在2300rpm下旋转5min),然后在摇床上混合30秒。重悬在20ul的FACS缓冲液中,所述FACS缓冲液含有MX1抗体()(4812)-Alexa 647:Novus Biologicals#NBP2-43704AF647)20ul FACS bf+0.8ul hIgG+0.04ul MX-1。1000rpm旋转1min,在摇床上混合30秒,并且将样品在黑暗中在室温下孵育45分钟,然后FACS缓冲液洗涤2x(在perm后,在2300rpm下旋转5min)。20ul(每孔总计35uL)的FACS缓冲液重悬,并且用箔纸覆盖,并且置于4℃下,以在第二天读数。在iQuePlus上读取板。将结果加载到工具集中,并且在curvemaster中生成IC50曲线。将y轴100%设置为1uM的瑞喹莫德。
小鼠血液中TNF-α和I型IFN反应基因的诱导
TNF-α和I型IFN反应基因的诱导是在TLR7通路激活后发生的下游事件。以下是测量在全小鼠血液中响应于TLR7激动剂的其诱导的测定。
将肝素化的小鼠全血用含青霉素-链霉素的RPMI 1640培养基以5:4的比率稀释(50uL全血和40uL培养基)。将90uL体积的稀释血液转移到Falcon平底96孔组织培养板的孔中,并且将板在4℃下孵育1h。将在100%DMSO储备液中的测试化合物在相同培养基中稀释20倍用于浓度反应测定,并且然后将10uL稀释的测试化合物添加到孔中,使得最终DMSO浓度为0.5%。对照孔接受10uL含5%DMSO的培养基。然后将板在37℃的5%CO2培养箱中培养17h。孵育后,将100uL培养基添加到每个孔中。将板离心,并且取出130uL上清液用于通过ELISA(Invitrogen,目录号88-7324,Thermo-Fisher Scientific)测定TNFa的产生。将来自Invitrogen mRNA Catcher Plus试剂盒(目录号K1570-02)的70uL体积的含DTT的mRNA捕获裂解缓冲液(1x)添加到孔中剩余的70uL样品中,并且通过上下移液5次进行混合。然后将板在室温下摇动5-10min,然后向每个孔中添加2uL蛋白酶K(20mg/mL)。然后将板在室温下摇动15-20min。然后将板在-80℃下储存直到进一步处理。
将冷冻样品解冻,并且根据制造商的说明书,使用Invitrogen mRNA CatcherPlus试剂盒(目录号K1570-02)提取mRNA。使用Invitrogen SuperScript IV VILO MasterMix(目录号11756500),使用来自RNA提取的一半产率的mRNA在20μL逆转录酶反应中合成cDNA。使用来自ThermoFisher(Applied Biosystems)的QuantStudio实时PCR系统进行实时PCR。使用针对小鼠IFIT1、IFIT3、MX1和PPIA基因表达的商业化预设计的TaqMan测定和TaqMan Master Mix一式两份地运行所有实时PCR反应。将PPIA用作管家基因。遵循制造商的建议。通过平均管家基因(Ct)归一化所有原始数据(Ct),然后利用比较Ct(ΔΔCt)方法量化相对基因表达(RQ)用于进行实验分析。
定义
“脂族”意指直链或支链的饱和或不饱和的非芳族烃部分,其具有指定数量的碳原子(例如,如在“C3脂族”、“C1-5脂族”、“C1-C5脂族”或“C1至C5脂族”中,后三个短语与具有从1至5个碳原子的脂族部分同义)或者在未明确指定碳原子数量的情况下从1至4个碳原子(在不饱和脂族部分的情况下2至4个碳)。类似的理解也适用于诸如C2-4烯烃、C4-C7脂环族等其他类型中的碳原子数。以类似的方式,诸如“(CH2)1-3”的术语应理解为对下标是1、2或3的简写,使得这样的术语代表CH2、CH2CH2和CH2CH2CH2。
“烷基”意指饱和的脂族部分,其中用于指定碳原子数量的相同惯例是可适用的。通过说明的方式,C1-C4烷基部分包括但不限于甲基、乙基、丙基、异丙基、异丁基、叔丁基、1-丁基、2-丁基等。“烷二基”(有时也称为“亚烷基”)意指烷基的二价对应物,诸如
“烯基”意指具有至少一个碳-碳双键的脂族部分,其中用于指定碳原子数量的相同惯例是可适用的。通过说明的方式,C2-C4烯基部分包括但不限于乙烯基(ethenyl/vinyl)、2-丙烯基(烯丙基或丙-2-烯基)、顺式-1-丙烯基、反式-1-丙烯基、E-(或Z-)2-丁烯基、3-丁烯基、1,3-丁二烯基(丁-1,3-二烯基)等。
“炔基”意指具有至少一个碳-碳三键的脂族部分,其中用于指定碳原子数量的相同惯例是可适用的。通过说明的方式,C2-C4炔基包括乙炔基(ethynyl/acetylenyl)、炔丙基(丙-2-炔基)、1-丙炔基、丁-2-炔基等。
“脂环族”意指具有从1至3个环的饱和或不饱和的非芳族烃部分,每个环具有从3至8个(优选地从3至6个)碳原子。“环烷基”意指每个环是饱和的脂环族部分。“环烯基”意指至少一个环具有至少一个碳-碳双键的脂环族部分。“环炔基”意指至少一个环具有至少一个碳-碳三键的脂环族部分。通过说明的方式,脂环族部分包括但不限于环丙基、环丁基、环戊基、环戊烯基、环己基、环己烯基、环庚基、环辛基和金刚烷基。优选的脂环族部分是环烷基部分,尤其是环丙基、环丁基、环戊基和环己基。“环烷二基”(有时也称为“环亚烷基”)意指环烷基的二价对应物。类似地,“双环烷二基”(或“双环亚烷基”)和“螺烷二基”(或“螺亚烷基”)是指双环烷基和螺烷基(或“螺环烷基”)的二价对应物。通过说明方式,
部分的例子是
并且
部分的例子是
“杂脂环族”意指这样的脂环族部分,其中在其至少一个环中,至多三个(优选地1至2个)碳已经被独立地选自N、O或S的杂原子替代,其中N和S任选地可以被氧化并且N任选地可以被季铵化。优选的脂环族部分由一个大小为5至6元的环组成。类似地,“杂环烷基”、“杂环烯基”和“杂环炔基”分别意指其至少一个环已经被如此修饰的环烷基、环烯基或环炔基部分。示例性杂脂环族部分包括氮杂环丙烷基、氮杂环丁烷基、1,3-二噁烷基、氧杂环丁烷基、四氢呋喃基、吡咯烷基、哌啶基、哌嗪基、四氢吡喃基、四氢噻喃基、四氢噻喃基砜、吗啉基、硫代吗啉基、硫代吗啉基亚砜、硫代吗啉基砜、1,3-二氧戊环基、四氢-1,1-二氧代噻吩基、1,4-二噁烷基、硫杂环丁烷基等。“杂环亚烷基”意指杂环烷基的二价对应物。
“烷氧基”、“芳氧基”、“烷硫基”和“芳硫基”分别意指-O(烷基)、-O(芳基)、-S(烷基)和-S(芳基)。例子分别是甲氧基、苯氧基、甲硫基和苯硫基。
除非指示较窄的含义,否则“卤素”或“卤代”意指氟、氯、溴或碘。
“芳基”意指具有单、双或三环环系统(优选地单环)的烃部分,其中每个环具有从3至7个碳原子,并且至少一个环是芳族的。环系统中的环可以彼此稠合(如在萘基中)或彼此键合(如在联苯基中),并且可以与非芳族环稠合或键合(如在茚满基或环己基苯基中)。通过进一步说明的方式,芳基部分包括但不限于苯基、萘基、四氢萘基、茚满基、联苯基、菲基、蒽基和苊基。“亚芳基”意指芳基的二价对应物,例如1,2-亚苯基、1,3-亚苯基或1,4-亚苯基。
“杂芳基”意指具有单、双或三环环系统(优选5至7元单环)的部分,其中每个环具有从3至7个碳原子,并且至少一个环是含有从1至4个独立地选自N、O或S的杂原子的芳族环,其中N和S任选地可以被氧化并且N任选地可以被季铵化。这样的至少一个含有杂原子的芳族环可以与其他类型的环稠合(如在苯并呋喃基或四氢异喹啉基中),或者与其他类型的环直接键合(如在苯基吡啶基或2-环戊基吡啶基中)。通过进一步说明的方式,杂芳基部分包括吡咯基、呋喃基、噻吩基(thiophenyl/thienyl)、咪唑基、吡唑基、噁唑基、异噁唑基、噻唑基、异噻唑基、三唑基、四唑基、吡啶基、N-氧代吡啶基、哒嗪基、嘧啶基、吡嗪基、喹啉基、异喹啉炔基(isoquinolynyl)、喹唑啉基、噌啉基、喹唑啉基(quinozalinyl)、萘啶基、苯并呋喃基、吲哚基、苯并噻吩基、噁二唑基、噻二唑基、吩噻唑基(phenothiazolyl)、苯并咪唑基、苯并三唑基、二苯并呋喃基、咔唑基、二苯并噻吩基、吖啶基等。“杂亚芳基”意指杂芳基的二价对应物。
在指示部分可以被取代(诸如通过使用如在“未经取代或经取代的C1-C5烷基”或“任选经取代的杂芳基”中的短语“未经取代或经取代的”或“任选经取代的”)的情况下,这样的部分可以具有一个或多个独立选择的取代基,优选地数量为1至5、更优选地数量为1或2。考虑到取代基所附接的部分,本领域普通技术人员可以选择取代基和取代模式,以提供化学稳定的并且可以通过本领域已知的技术以及本文列出的方法合成的化合物。在部分被鉴定为“未经取代或经取代的”或“任选经取代的”的情况下,在一个优选实施方案中,这样的部分是未经取代的。
“芳基烷基”、“(杂脂环族)烷基”、“芳基烯基”、“芳基炔基”、“联芳基烷基”等意指被芳基、杂脂环族、联芳基等部分(视情况而定)取代的烷基、烯基或炔基部分(视情况而定),其中开放的(未满足的)化合价在烷基、烯基或炔基部分处,例如如在苄基、苯乙基、N-咪唑基乙基、N-吗啉代乙基等中。相反,“烷基芳基”、“烯基环烷基”等意指被烷基、烯基等部分(视情况而定)取代的芳基、环烷基等部分(视情况而定),例如如在甲基苯基(甲苯基)或烯丙基环己基中。“羟基烷基”、“卤代烷基”、“烷基芳基”、“氰基芳基”等意指被一个或多个鉴定的取代基(羟基、卤代等,视情况而定)取代的烷基、芳基等部分(视情况而定)。
例如,允许的取代基包括但不限于烷基(尤其是甲基或乙基)、烯基(尤其是烯丙基)、炔基、芳基、杂芳基、脂环族、杂脂环族、卤代(尤其是氟)、卤代烷基(尤其是三氟甲基)、羟基、羟基烷基(尤其是羟基乙基)、氰基、硝基、烷氧基、-O(羟基烷基)、-O(卤代烷基)(尤其是-OCF3)、-O(环烷基)、-O(杂环烷基)、-O(芳基)、烷硫基、芳硫基、=O、=NH、=N(烷基)、=NOH、=NO(烷基)、-C(=O)(烷基)、-C(=O)H、-CO2H、-C(=O)NHOH、-C(=O)O(烷基)、-C(=O)O(羟基烷基)、-C(=O)NH2、-C(=O)NH(烷基)、-C(=O)N(烷基)2、-OC(=O)(烷基)、-OC(=O)(羟基烷基)、-OC(=O)O(烷基)、-OC(=O)O(羟基烷基)、-OC(=O)NH2、-OC(=O)NH(烷基)、-OC(=O)N(烷基)2、叠氮基、-NH2、-NH(烷基)、-N(烷基)2、-NH(芳基)、-NH(羟基烷基)、-NHC(=O)(烷基)、-NHC(=O)H、-NHC(=O)NH2、-NHC(=O)NH(烷基)、-NHC(=O)N(烷基)2、-NHC(=NH)NH2、-OSO2(烷基)、-SH、-S(烷基)、-S(芳基)、-S(环烷基)、-S(=O)烷基、-SO2(烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(烷基)、-SO2N(烷基)2等。
在被取代的部分是脂族部分的情况下,优选的取代基是芳基、杂芳基、脂环族、杂脂环族、卤代、羟基、氰基、硝基、烷氧基、-O(羟基烷基)、-O(卤代烷基)、-O(环烷基)、-O(杂环烷基)、-O(芳基)、烷硫基、芳硫基、=O、=NH、=N(烷基)、=NOH、=NO(烷基)、-CO2H、-C(=O)NHOH、-C(=O)O(烷基)、-C(=O)O(羟基烷基)、-C(=O)NH2、-C(=O)NH(烷基)、-C(=O)N(烷基)2、-OC(=O)(烷基)、-OC(=O)(羟基烷基)、-OC(=O)O(烷基)、-OC(=O)O(羟基烷基)、-OC(=O)NH2、-OC(=O)NH(烷基)、-OC(=O)N(烷基)2、叠氮基、-NH2、-NH(烷基)、-N(烷基)2、-NH(芳基)、-NH(羟基烷基)、-NHC(=O)(烷基)、-NHC(=O)H、-NHC(=O)NH2、-NHC(=O)NH(烷基)、-NHC(=O)N(烷基)2、-NHC(=NH)NH2、-OSO2(烷基)、-SH、-S(烷基)、-S(芳基)、-S(=O)烷基、-S(环烷基)、-SO2(烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(烷基)和-SO2N(烷基)2。更优选的取代基是卤代、羟基、氰基、硝基、烷氧基、-O(芳基)、=O、=NOH、=NO(烷基)、-OC(=O)(烷基)、-OC(=O)O(烷基)、-OC(=O)NH2、-OC(=O)NH(烷基)、-OC(=O)N(烷基)2、叠氮基、-NH2、-NH(烷基)、-N(烷基)2、-NH(芳基)、-NHC(=O)(烷基)、-NHC(=O)H、-NHC(=O)NH2、-NHC(=O)NH(烷基)、-NHC(=O)N(烷基)2和-NHC(=NH)NH2。尤其优选的是苯基、氰基、卤代、羟基、硝基、C1-C4烷氧基、O(C2-C4烷二基)OH和O(C2-C4烷二基)卤代。
在被取代的部分是脂环族、杂脂环族、芳基或杂芳基部分的情况下,优选的取代基是烷基、烯基、炔基、卤代、卤代烷基、羟基、羟基烷基、氰基、硝基、烷氧基、-O(羟基烷基)、-O(卤代烷基)、-O(芳基)、-O(环烷基)、-O(杂环烷基)、烷硫基、芳硫基、-C(=O)(烷基)、-C(=O)H、-CO2H、-C(=O)NHOH、-C(=O)O(烷基)、-C(=O)O(羟基烷基)、-C(=O)NH2、-C(=O)NH(烷基)、-C(=O)N(烷基)2、-OC(=O)(烷基)、-OC(=O)(羟基烷基)、-OC(=O)O(烷基)、-OC(=O)O(羟基烷基)、-OC(=O)NH2、-OC(=O)NH(烷基)、-OC(=O)N(烷基)2、叠氮基、-NH2、-NH(烷基)、-N(烷基)2、-NH(芳基)、-NH(羟基烷基)、-NHC(=O)(烷基)、-NHC(=O)H、-NHC(=O)NH2、-NHC(=O)NH(烷基)、-NHC(=O)N(烷基)2、-NHC(=NH)NH2、-OSO2(烷基)、-SH、-S(烷基)、-S(芳基)、-S(环烷基)、-S(=O)烷基、-SO2(烷基)、-SO2NH2、-SO2NH(烷基)和-SO2N(烷基)2。更优选的取代基是烷基、烯基、卤代、卤代烷基、羟基、羟基烷基、氰基、硝基、烷氧基、-O(羟基烷基)、-C(=O)(烷基)、-C(=O)H、-CO2H、-C(=O)NHOH、-C(=O)O(烷基)、-C(=O)O(羟基烷基)、-C(=O)NH2、-C(=O)NH(烷基)、-C(=O)N(烷基)2、-OC(=O)(烷基)、-OC(=O)(羟基烷基)、-OC(=O)O(烷基)、-OC(=O)O(羟基烷基)、-OC(=O)NH2、-OC(=O)NH(烷基)、-OC(=O)N(烷基)2、-NH2、-NH(烷基)、-N(烷基)2、-NH(芳基)、-NHC(=O)(烷基)、-NHC(=O)H、-NHC(=O)NH2、-NHC(=O)NH(烷基)、-NHC(=O)N(烷基)2和-NHC(=NH)NH2。尤其优选的是C1-C4烷基、氰基、硝基、卤代和C1-C4烷氧基。
在陈述范围的情况下,如在“C1-C5烷基”或“5%至10%”中,这样的范围包括所述范围的端点,如在第一个实例中的C1和C5以及在第二个实例中的5%和10%。
除非具体指示特定的立体异构体(例如,通过在结构式中的相关立体中心处的加粗或加虚线的键,通过在结构式中将双键描绘为具有E或Z构型,或通过使用立体化学指定的命名法或符号),否则作为纯化合物及其混合物的所有立体异构体都包括在本发明的范围内。除非另外指示,否则外消旋体、单独的对映体(不论是光学纯的还是部分拆分的)、非对映体、几何异构体及其组合和混合物都被本发明涵盖。
本领域技术人员应理解,化合物可以具有互变异构体形式(例如,酮和烯醇形式)、共振形式和两性离子形式,所述形式等效于在本文使用的结构式中描绘的那些,并且所述结构式涵盖此类互变异构体形式、共振形式或两性离子形式。
“药学上可接受的酯”意指在体内(例如在人体中)水解产生母体化合物或其盐或者本身具有与母体化合物类似的活性的酯。合适的酯包括C1-C5烷基、C2-C5烯基或C2-C5炔基酯,尤其是甲基、乙基或正丙基酯。
“药学上可接受的盐”意指适用于药物配制品的化合物的盐。在化合物具有一个或多个碱性基团的情况下,所述盐可以是酸加成盐,诸如硫酸盐、氢溴酸盐、酒石酸盐、甲磺酸盐、马来酸盐、柠檬酸盐、磷酸盐、乙酸盐、双羟萘酸盐(恩波酸盐(embonate))、氢碘酸盐、硝酸盐、盐酸盐、乳酸盐、甲基硫酸盐、富马酸盐、苯甲酸盐、琥珀酸盐、甲磺酸盐、乳糖醛酸盐、辛二酸盐、甲苯磺酸盐等。在化合物具有一个或多个酸性基团的情况下,所述盐可以是诸如以下的盐:钙盐、钾盐、镁盐、葡甲胺盐、铵盐、锌盐、哌嗪盐、氨丁三醇盐、锂盐、胆碱盐、二乙胺盐、4-苯基环己胺盐、苯乍生盐、钠盐、四甲基铵盐等。多晶型结晶形式和溶剂化物也涵盖在本发明的范围内。
“受试者”是指动物,包括但不限于灵长类动物(例如,人)、猴、牛、猪、绵羊、山羊、马、狗、猫、兔、大鼠或小鼠。关于例如哺乳动物受试者(诸如人)的术语“受试者”和“患者”在本文中可互换地使用。
在治疗疾病或障碍的上下文中,术语“治疗”(“treat”、“treating”和“treatment”)意在包括减轻或消除障碍、疾病或病症,或与障碍、疾病或病症相关的一种或多种症状;或减慢障碍、疾病或病症或其一种或多种症状的进展、扩散或恶化。“癌症的治疗”是指以下作用中的一种或多种:(1)在一定程度上抑制肿瘤生长,包括(i)减慢和(ii)完全阻止生长;(2)减少肿瘤细胞的数量;(3)维持肿瘤大小;(4)减小肿瘤大小;(5)抑制,包括(i)减少、(ii)减慢或(iii)完全防止肿瘤细胞浸润到外周器官中;(6)抑制,包括(i)减少、(ii)减慢或(iii)完全防止转移;(7)增强抗肿瘤免疫应答,这可以导致(i)维持肿瘤大小、(ii)减小肿瘤大小、(iii)减慢肿瘤生长、(iv)减少、减慢或防止侵袭和/或(8)在一定程度上缓解与障碍相关的一种或多种症状的严重程度或数量。
在本说明书的式中,在其两个碳之间横穿芳族环的键意指附接至所述键的基团可以位于所述芳族环的任何位置,所述任何位置是通过除去隐含地在那里(或明确地在那里,如果画出来的话)的氢而变得可用的。作为说明,式
在其他说明中,
并且
本公开文本包括在本文描述的化合物中出现的原子的所有同位素。同位素包括原子数相同但质量数不同的那些原子。通过一般举例而非限制的方式,氢的同位素包括氘和氚。碳的同位素包括13C和14C。本发明的同位素标记的化合物通常可以通过本领域技术人员已知的常规技术或通过与本文所述的那些类似的方法使用适当的同位素标记的试剂代替原本采用的未标记的试剂来制备。通过举例的方式,C1-C3烷基可以是未氘化的、部分氘化的或完全氘化的,并且“CH3”包括CH3、13CH3、14CH3、CH2T、CH2D、CHD2、CD3等。在一个实施方案中,化合物中的各种元素以其天然同位素丰度存在。
本领域技术人员应理解,某些结构可以绘制呈一种互变异构体形式或另一种互变异构体形式,例如酮与烯醇,并且这两种形式是等效的。
首字母缩略词和缩写
这是本说明书中使用的首字母缩略词和缩写及其含义的列表。
参考文献
下文提供了在本说明书中较早以缩写方式通过第一作者(或发明人)和日期引用的以下参考文献的完整引用。将这些参考文献中的每一个出于所有目的通过引用并入本文。
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前述具体实施方式包括主要或专门涉及本发明的特定部分或方面的段落。应理解,这是为了清楚和方便,特定特征可能在不只是公开它的段落中是相关的,并且本文中的公开内容包括在不同段落中找到的信息的所有适当组合。类似地,尽管本文中的各种附图和描述涉及本发明的具体实施方案,但是应当理解,在特定附图或实施方案的背景下公开了具体特征的情况下,也可以在另一个附图或实施方案的背景下、与另一个特征组合、或总体上在本发明中在适当的程度上使用此类特征。
此外,虽然已经根据某些优选实施方案具体描述了本发明,但本发明不限于此类优选实施方案。而是,本发明的范围由所附权利要求限定。
Claims (17)
1.一种化合物,所述化合物具有根据式I的结构
其中
每个X独立地是N或CR2;
X1是O、CH2、NH、S或N(C1-C3烷基);
R1是(C1-C5烷基)、
(C2-C5烯基)、
(C1-C8烷二基)0-1(C3-C6环烷基)、
(C1-C8烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
(C2-C8烷二基)OH、
(C2-C8烷二基)O(C1-C3烷基)、
(C1-C4烷二基)0-1(5-6元杂芳基)、
(C1-C4烷二基)0-1苯基、
(C1-C4烷二基)CF3、
(C2-C8烷二基)N[C(=O)](C1-C3烷基)、
或
(C2-C8烷二基)NRxRy;
每个R2独立地是H、O(C1-C3烷基)、S(C1-C3烷基)、SO2(C1-C3烷基)、C1-C3烷基、O(C3-C4环烷基)、S(C3-C4环烷基)、SO2(C3-C4环烷基)、C3-C4环烷基、Cl、F、CN、或[C(=O)]0-1NRxRy;
R3是H、卤基、OH、CN、
NH2、
NH[C(=O)]0-1(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
O(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C4-C8双环烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
O(C1-C4烷二基)0-1(C1-C6烷基)、
N[C1-C3烷基]C(=O)(C1-C6烷基)、
NH(SO2)(C1-C5烷基)、
NH(SO2)(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH(SO2)(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH(SO2)(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
6元芳族或杂芳族部分、
5元杂芳族部分、或
具有以下结构的部分:
R4是NH2、
NH(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
NH(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
或
具有以下结构的部分:
R5是H、C1-C5烷基、C2-C5烯基、C3-C6环烷基、卤基、O(C1-C5烷基)、
(C1-C4烷二基)OH、(C1-C4烷二基)O(C1-C3烷基)、苯基、NH(C1-C5烷基)、5或6元杂芳基、
R6是NH2、
(NH)0-1(C1-C5烷基)、
N(C1-C5烷基)2、
(NH)0-1(C1-C4烷二基)0-1(C3-C8环烷基)、
(NH)0-1(C1-C4烷二基)0-1(C4-C10双环烷基)、
(NH)0-1(C1-C4烷二基)0-1(C5-C10螺烷基)、
N(C3-C6环烷基)2、
或
具有以下结构的部分:
Rx和Ry独立地是H或C1-C3烷基或者Rx和Ry与它们所键合的氮组合以形成3至7元杂环;
m是0或1;
n是1、2或3;
并且
p是0、1、2或3;
其中在R1、R2、R3、R4、R5和R6中
烷基、环烷基、烷二基、双环烷基、螺烷基、环胺、6元芳族或杂芳族部分、5元杂芳族部分或式
的部分任选地被一个或多个选自以下的取代基取代:OH、卤基、CN、(C1-C3烷基)、O(C1-C3烷基)、C(=O)(C1-C3烷基)、SO2(C1-C3烷基)、NRxRy、
(C1-C4烷二基)OH、(C1-C4烷二基)O(C1-C3烷基);
并且
烷基、烷二基、环烷基、双环烷基、螺烷基、或式
的部分可以具有被以下替代的CH2基团:O、SO2、CF2、C(=O)、NH、
N[C(=O)]0-1(C1-C3烷基)、
N[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1CF3、
或
N[C(=O)]0-1(C1-C4烷二基)0-1(C3-C5环烷基)。
12.一种治疗癌症的方法,所述方法包括向患有此类癌症的患者施用抗癌免疫治疗剂和根据权利要求1或权利要求11所述的化合物的治疗有效组合。
13.根据权利要求12所述的方法,其中所述抗癌免疫治疗剂是拮抗性抗CTLA-4、抗PD-1、或抗PD-L1抗体。
14.根据权利要求12所述的方法,其中所述癌症是肺癌(包括非小细胞肺癌)、胰腺癌、肾癌、头颈癌、淋巴瘤(包括霍奇金淋巴瘤)、皮肤癌(包括黑素瘤和默克尔皮肤癌)、尿路上皮癌(包括膀胱癌)、胃癌、肝细胞癌、或结直肠癌。
15.根据权利要求14所述的方法,其中所述抗癌免疫治疗剂是伊匹单抗、纳武单抗、或派姆单抗。
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