CN114787159A - Brm靶向化合物及相关使用方法 - Google Patents

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Abstract

本公开涉及双官能化合物,所述双官能化合物可用作SMARCA2或BRM(靶蛋白)的调节剂。具体地讲,本公开涉及双官能化合物,所述双官能化合物在一端上含有结合Von Hippel‑Lindau E3泛素连接酶的配体,并且在另一端上含有结合靶蛋白的部分,使得所述靶蛋白被置于所述泛素连接酶附近,以实现靶蛋白的降解(和抑制)。本公开展现出与靶蛋白的降解/抑制相关的广泛范围的药理学活性。使用本公开的化合物和组合物治疗或预防由靶蛋白的聚集或积累导致的疾病或病症。

Description

BRM靶向化合物及相关使用方法
相关申请的交叉引用
本申请要求2020年10月1日提交的名称为BRM TARGETING COMPOUNDS ANDASSOCIATED METHODS OF USE的美国非临时专利申请序列第16/590329号的优先权,该美国非临时专利申请序是2019年4月1日提交的名称为BRM TARGETING COMPOUNDS ANDASSOCIATED METHODS OF USE的美国非临时申请序列第16/372345号的部分继续申请,该美国非临时申请要求2018年4月1日提交的名称为BRM TARGETING PROTAC COMPOUNDS ANDASSOCIATED METHODS OF USE的美国临时专利申请序列第62/651,186号以及2019年1月28日提交的名称为BRMTARGETING PROTAC COMPOUNDS AND ASSOCIATED METHODS OF USE的美国临时专利申请序列第62/797,754号的优先权和权益,其中的每篇申请以引用方式全文并入本文。
技术领域
本说明书提供了包含靶蛋白结合部分和E3泛素连接酶结合部分的双官能化合物,以及相关使用方法。双官能化合物可用作靶向泛素化的调节剂,尤其是关于酵母交配型转换/蔗糖不发酵复合物(SWI/SNF)相关的染色质亚家族A成员2的基质相关肌动蛋白依赖调节剂(SMARCA2)(即,BRAHMA或BRM),它们被根据本公开的双官能化合物降解和/或以其他方式抑制。
背景技术
大多数小分子药物在紧密和明确界定的口袋中结合酶或受体。另一方面,由于其大接触表面以及所牵涉的浅沟或平坦界面,蛋白质-蛋白质相互作用众所周知难以使用小分子靶向。E3泛素连接酶(其中数百种在人中已知)赋予关于泛素化的底物特异性,并且因此,由于其对于某些蛋白质底物的特异性,是比一般蛋白酶体抑制剂更有吸引力的治疗靶标。E3连接酶配体的开发已证明是挑战性的,部分是由于它们必须破坏蛋白质-蛋白质相互作用的事实。然而,最近的发展已提供了与这些连接酶结合的特异性配体。例如,自从发现第一个小分子E3连接酶抑制剂nutlin以来,已报道了靶向E3连接酶的另外化合物,但该领域仍是发展不完全的。例如,自从发现第一个小分子E3连接酶小鼠双微体2同源物(MDM2)抑制剂Nutlin以来,已报道了靶向MDM2(即人双微体2或HDM2)E3连接酶的另外化合物(J.Di等人,Current Cancer Drug Targets(2011),11(8),987-994)。
具有令人兴奋的治疗潜力的一种E3连接酶是希佩尔-林道(von Hippel-Lindau,VHL)肿瘤抑制因子,E3连接酶复合物VCB的底物识别亚基,其也由延伸蛋白B和C、Cu12和Rbx1组成。VHL的主要底物是缺氧诱导因子1·(HIF-1α),其是响应低氧水平上调基因例如促血管生成生长因子VEGF和红血细胞诱导细胞因子促红细胞生成素的转录因子。生成针对E3连接酶的底物识别亚基的希佩尔-林道(VHL)的第一个小分子配体,并且获得晶体结构,证实该化合物模拟转录因子HIF-1α(VHL的主要底物)的结合模式。
双官能化合物(诸如美国专利申请公布2015-0291562和2014-0356322(以引用方式并入本文)中描述的那些)用于将内源蛋白质募集到E3泛素连接酶上以进行降解。确切地说,本公布提供了双官能或蛋白分解靶向嵌合(PROTAC)化合物,其适用作多种多肽和其他蛋白质的靶向泛素化调节剂,所述多肽和其他蛋白质在靶向泛素化之后被双官能化合物降解和/或以其他方式抑制。
酵母交配型转换/蔗糖不发酵复合物(SWI/SNF)是一种多亚基复合物,其通过两个相互排斥的解旋酶/ATP酶催化亚基SWI/SNF相关的染色质亚家族A成员2的基质相关肌动蛋白依赖调节剂(SMARCA2、BRAHMA或BRM)和SWI/SNF相关的染色质亚家族A成员4的基质相关肌动蛋白依赖调节剂(SMARCA4或BRG1)的活性来调节染色质结构。核心和调节亚基将ATP水解与组蛋白-DNA接触的扰动偶联起来,从而提供了转录因子和同源DNA元件的接入点,其促进了基因激活和抑制。
在将近20%的所有癌症中观察到编码二十个典型SWI/SNF亚基的基因中的突变,其中在横纹肌样瘤、女性癌症(包括卵巢癌、子宫癌、子宫颈癌和子宫内膜癌)、肺腺癌、胃腺癌、黑素瘤、食道癌和特征性透明细胞癌中观察到最高频率突变。尽管SMARCA2和SMARCA4具有高度的同源性和推测的重叠功能,但据报道它们在癌症中具有不同的作用。例如,SMARCA4在原发性肿瘤中经常发生突变,而SMARCA2失活在肿瘤发展中很少发生。实际上,已经显示许多类型的癌症是SMARCA4相关的(例如,具有SMARCA4突变或SMARCA4缺陷(诸如缺乏表达)的癌症),包括例如肺癌(诸如非小细胞癌)。
SMARCA2已被证明是SMARCA4相关或突变癌细胞系中最重要的必需基因之一。这是因为SMARCA4缺陷患者群体或细胞仅依赖SMARCA2活性,即,SMARCA2更多地掺入复合物中以补偿SMARCA4缺陷。因此,SMARCA2可以靶向SMARCA4相关/缺陷性癌症。导致细胞死亡的两个(或多个)基因表达缺陷的共同发生被称为合成致死性。因此,在某些SMARCA2/SMARCA4相关的癌症的治疗中,可以利用合成致死性。
对于可通过抑制或降解SMARCA2(即BRAHMA或BRM)治疗的疾病的有效治疗存在持续的需求。然而,非特异性作用以及不能靶向和调节SMARCA2仍然阻碍着有效治疗剂的开发。因此,靶向SMARCA2并且利用或增强VHL的底物特异性的小分子治疗剂将是非常有用的。
发明内容
本公开描述了双官能化合物及其使用方法,所述双官能化合物用于将内源蛋白质募集到E3泛素连接酶上以进行降解。确切地说,本公开提供了双官能或蛋白分解靶向嵌合(PROTAC)化合物,其适用作多种多肽和其他蛋白质的靶向泛素化调节剂,所述多肽和其他蛋白质在靶向泛素化之后被如本文所述的双官能化合物降解和/或以其他方式抑制。本文所提供化合物的优势在于,与来自几乎任何蛋白质类别或家族的靶向多肽的降解/抑制一致,可以存在广谱药理学活性。另外,本说明书提供了使用有效量的如本文所述的化合物来治疗或改善疾病状况的方法,所述疾病状况诸如癌症,例如SMARCA4相关/缺陷性癌症,诸如肺癌或非小细胞肺癌。
因此,在一个方面,本公开提供了双官能或PROTAC化合物,该化合物包含E3泛素连接酶结合部分(即,E3泛素连接酶的配体或“ULM”基团)和靶蛋白结合部分(即,蛋白质/多肽靶向配体或“PTM”基团),使得靶蛋白/多肽被置于泛素连接酶附近以实现该蛋白的降解(和抑制)。在一个优选的实施方案中,ULM(泛素化连接酶调节剂)可以是希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL)结合部分(VLM)。例如,双官能化合物的结构可以描绘为:
Figure BDA0003676261880000041
如本文中所图示的PTM和ULM部分的相应位置以及其数目仅为了举例而提供,并非旨在以任何方式限制所述化合物。如本领域技术人员所理解的,可以合成如本文所述的双官能化合物,使得各个官能部分的数目和位置可以根据需要而变。
在某些实施方案中,双官能化合物还包含化学接头(“L”)。在该实例中,双官能化合物的结构可以描绘为:
Figure BDA0003676261880000051
其中PTM是蛋白质/多肽靶向部分,L是接头,例如偶联PTM和ULM的键或化学基团,并且ULM是希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL)结合部分(VLM)。
例如,双官能化合物的结构可以描绘为:
Figure BDA0003676261880000052
其中:PTM是蛋白质/多肽靶向部分;“L”是偶联PTM和VLM的接头(例如,键或化学接头基团),其中VLM是结合VHL E3连接酶的希佩尔-林道E3泛素连接酶结合部分。
在某些实施方案中,如本文所述的化合物包含多个独立选择的ULM、多个PTM、多个化学接头或它们的组合。
在另外的实施方案中,VLM可以是羟脯氨酸或其衍生物。此外,其他设想的VLM包含在美国专利申请公布No.2014/03022523中,如上所述,该申请公布全文并入本文。
在某些实施方案中,“L”是键。在另外的实施方案中,接头“L”是具有1至20范围内的线性非氢原子数的接头。接头“L”可包含但不限于官能团,例如醚、酰胺、烷烃、烯烃、炔烃、酮、羟基、羧酸、硫醚、亚砜和砜。接头可包含芳族、杂芳族、环状、双环和三环部分。卤素如Cl、F、Br和I的取代可包含在接头中。在氟取代的情况下,可包含单个或多个氟。
在某些实施方案中,VLM是反式-3-羟脯氨酸的衍生物,其中反式-3-羟脯氨酸中的氮和羧酸都被官能化为酰胺。
在另一方面,本说明书提供了治疗组合物,其包含有效量的如本文所述化合物或其盐形式和药学上可接受的载体。治疗组合物调节患者或受试者(例如动物,例如人)中的蛋白质降解和/或抑制,并且可以用于治疗或改善通过降解/抑制的蛋白质调节的疾病状态或状况。在某些实施方案中,如本文所述的治疗组合物可用于实现目标蛋白质的降解,以治疗或改善疾病,例如癌症(包括SWI/SNF相关癌症、具有SMARCA4突变的癌症、具有SMARCA4缺陷的癌症或它们的组合中的至少一种),诸如肺癌(例如非小细胞肺癌)。在又一方面,本公开提供了泛素化/降解细胞中的靶蛋白的方法。在某些实施方案中,该方法包括施用如本文所述的双官能化合物,该双官能化合物包含优选通过接头部分连接的VLM,如本文其他地方所述,其中VLM通过接头偶联至PTM以靶向蛋白质以进行降解。当靶蛋白被置于E3泛素连接酶附近时,将发生靶蛋白的降解,从而导致靶蛋白的作用的降解/抑制和蛋白质水平的控制。通过本公开提供的蛋白质水平的控制提供了疾病状态或状况的治疗,其通过降低患者细胞中该蛋白质的水平而通过靶蛋白调节。
在另一方面,本说明书提供了用于治疗或改善受试者或患者(例如动物,例如人类)的疾病、病症或其症状的方法,该方法包括向有需要的受试者施用组合物,该组合物包含有效量(例如治疗有效量)的本文所述化合物或其盐形式,和药学上可接受的载体,其中所述组合物能够有效治疗或改善受试者的疾病或病症或其症状。
在另一方面,本说明书提供了使用根据本公开的化合物鉴别生物系统中的目标蛋白质降解的影响的方法。
前述一般实用领域仅为了举例而给出,并且不希望对本公开的范围和所附权利要求书构成限制。根据本权利要求、说明书和实例,本领域普通技术人员将了解与本公开的组合物、方法和方法相关的另外目的和优点。例如,本公开的各个方面和实施方案可以众多组合利用,所有这些组合都由本说明书明确地加以考虑。这些另外的方面和实施方案明确地包含在本公开的范围内。本文用于阐明本公开的背景并且在特定情况下提供关于实践的另外细节的出版物和其他材料以引用方式并入。
附图说明
并入本说明书中且构成本说明书的一部分的附图示出了本公开的若干实施方案,并且连同本说明书一起用于解释本公开的原理。附图仅用于示出本公开的实施方案的目的,并且不应理解为对本公开的限制。根据与附图结合的下述详细描述,本公开的另外的目的、特征和优点将变得显而易见,所述附图示出了本公开的例示性实施方案,其中:
图1A和图1B。PROTAC功能的一般原理的图示。(A)示例性PROTAC包含蛋白质靶向部分(PTM;深色阴影矩形)、泛素连接酶结合部分(ULM;浅色阴影三角形)和任选的将PTM偶联或束缚至ULM的接头部分(L;黑线)。(B)示出了如本文所述的PROTAC的功能用途。简而言之,ULM识别并结合特定的E3泛素连接酶,并且PTM结合并募集靶蛋白,使其紧密接近E3泛素连接酶。典型地,E3泛素附接酶与E2泛素结合的蛋白质复合,且单独或通过E2蛋白质催化泛素(深色圆圈)附接到靶蛋白上的赖氨酸,此附接是通过异肽键达成。然后靶向聚泛素化蛋白质(最右侧)以便细胞的蛋白酶体机器使其降解。
具体实施方式
下述是提供以帮助本领域技术人员实践本公开的详细描述。本领域普通技术人员可以在本文描述的实施方案中进行修改和变化,而不脱离本公开的实质或范围。本文提及的所有出版物、专利申请、专利、附图和其他参考文献均全文以引用方式明确并入。
本发明描述了组合物和方法,所述组合物和方法涉及E3泛素连接酶蛋白(例如,希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL))一旦与靶蛋白通过结合E3泛素连接酶蛋白和靶蛋白的双官能或嵌合构建体邻近定位就会使靶蛋白泛素化的惊人和意外发现。因此,本公开提供了此类化合物和组合物,其包含偶联至蛋白质靶标结合部分(“PTM”)的E3泛素连接酶靶向部分(“ULM”),这将引起所选靶蛋白的泛素化,从而导致靶蛋白被蛋白酶体降解(参见图1)。本公开还提供了组合物文库及其用途。
在某些方面,本公开提供了包含配体诸如小分子配体(即,分子量低于2,000、1,000、500或200道尔顿)的化合物,所述配体能够与泛素连接酶诸如VHL结合。该化合物还包含能够与靶蛋白结合的部分,以这样的方式使得靶蛋白置于泛素连接酶附近,以实现该蛋白的降解(和/或抑制)。除上述之外,小分子还可以意指该分子是非肽基的,即,它一般不视为肽,例如包含少于4、3或2个氨基酸。根据本说明书,PTM、ULM或PROTAC分子可以是小分子。
除非另外定义,否则本文所用的所有技术和科学术语具有与本公开所属领域的普通技术人员通常所理解相同的含义。本说明书中所用的术语仅用于描述特定实施方案,并非旨在限制本公开。
在提供值范围时,应当理解,在本公开内涵盖了每个中间值,至下限单位的十分之一,除非上下文另有明确规定(例如在含有多个碳原子的基团的情况下,在这种情况下,提供了落入该范围内的每个碳原子数),在该范围的上限和下限之间,以及在该所述范围内的任何其他所述值或中间值。可以独立地包括在较小范围内的这些较小范围的上限和下限也涵盖在本公开内,遭受在所述范围内的任何特别排除的限制。当所述范围包括限制之一或两者时,排除这两个限制中任一的范围也包括在本公开中。
下述术语用于描述本公开。在其中术语在本文中没有具体定义的情况下,该术语给予由普通技术人员在描述本公开中其使用的背景下应用该术语的领域公认含义。
如本文和所附权利要求中使用的冠词“一个”和“一种”在本文中用于指冠词的一个或多于一个(即,至少一个)语法对象,除非上下文另有明确说明。例如,“要素”意指一个要素或多于一个要素。
如本文在说明书和权利要求中所用,短语“和/或”应理解为意指如此结合的要素中的“任一者或两者”,即在某些情况下结合地存在且在其它情况下分离地存在的要素。用“和/或”列出的多个要素应该以相同的方式加以解释,即,如此结合的“一个或多个”要素。除了由“和/或”子句具体鉴定的要素之外,可以任选地存在其他要素,无论与具体鉴定的那些要素相关还是不相关。因此,作为非限制性实例,当与开放式语言例如“包含”结合使用时,对“A和/或B”的提及可以在一个实施方案中仅指A(任选地包括除了B之外的要素);在另一个实施方案中仅指B(任选地包括除了A之外的要素);在再一个实施方案中指A和B两者(任选地包括其他要素);等。
如本文在说明书和权利要求中使用的,“或”应该理解为具有与如上定义的“和/或”相同的含义。例如,当分开列表中的项目时,“或”或“和/或”应该解释为包含性的,即包含至少一个,但也包括许多要素或要素列表的多于一个,以及任选地,另外未列出的项目。只有明确指出相反的术语,例如“仅一个”或“恰好一个”,或者,当在权利要求中使用时,“由......组成”指许多要素或要素列表的恰好一个要素。一般而言,当之前为排他性术语例如“任一”、“之一”、“仅一个”或“恰好一个”时,如本文使用的,术语“或”应该仅解释为指示排他性替代物(即“一个或另一个但不是两者”)。
在权利要求以及上文说明书中,所有过渡短语、例如“包含”、“包括”、“携带”、“具有”、“含有”、“涉及”、“持有”、“组成”等等应理解为开放式的,即,意指包括但不限于。仅过渡短语“由......组成”和“基本上由......组成”应该分别为闭合式或半闭合式过渡短语,如美国专利局专利审查程序手册(United States Patent Office Manual of PatentExamining Procedures)第2111.03节中所述。
如本文在说明书和权利要求中使用的,提及一个或多个要素的列表,短语“至少一个”应该理解为意指选自要素列表中的任何一个或多个要素的至少一个要素,但不一定包括要素列表中具体列出的每个和每一个要素中的至少一个,并且不排除要素列表中的任何要素组合。该定义还允许除了在短语“至少一个”所指的要素列表内具体鉴定的要素之外,可以任选地存在无论与具体鉴定的那些要素相关还是不相关的要素。因此,作为非限制性实例,“A和B中的至少一个”(或等价地,“A或B中的至少一个”,或等价地“A和/或B中的至少一个”)在一个实施方案中,可以指至少一个,任选地包括多于一个A,而不存在B(并且任选地包括除了B之外的要素);在另一个实施方案中,指至少一个,任选地包括多于一个B,而不存在A(并且任选地包括除了A之外的要素);在再一个实施方案中,指至少一个,任选地包括多于一个A,以及至少一个,任选地包括多于一个B(以及任选地包括其他要素);等。
还应该理解,在本文描述的包括多于一个步骤或动作的某些方法中,该方法的步骤或动作的次序不一定限于其中叙述该方法的步骤或动作的次序,除非上下文另有说明。
术语“共同施用”或“联合疗法”指并行施用(同时施用两种或更多种治疗剂)和不同时间施用(一种或多种治疗剂的施用时间不同于其他治疗剂或药剂的施用时间),只要治疗剂在一定程度上,优选按照有效量同时存在于患者中。在某些优选方面,本文所述的一种或多种本发明化合物与至少一种其他生物活性剂(尤其包括抗癌剂)联合共同施用。在特别优选的方面,化合物的共同施用产生协同活性和/或治疗(包括抗癌)活性。
除非另外说明,否则如本文所用,术语“化合物”是指本文所公开的任何具体化合物,并且包括其互变异构体、区域异构体、几何异构体和适用的立体异构体,包括光学异构体(对映体)和其他立体异构体(非对映体),以及在上下文中,适用的可药用盐及其衍生物(包括前药形式)。设想的氘代小分子是其中药物分子中包含的一个或多个氢原子已被氘取代的那些。
在其在上下文中的使用内,术语化合物一般指单一化合物,但也可包括其他化合物,例如立体异构体、区域异构体和/或光学异构体(包括外消旋混合物)以及所公开化合物的特定对映体或富含对映体的混合物。在上下文中,该术语还指已进行修饰以促进化合物对活性部位的施用和递送的化合物的前药形式。应注意,在描述本文化合物中,尤其描述了许多取代基以及与其相关的变量。普通技术人员应理解,本文所述的分子是如下文一般描述的稳定化合物。示出键时,双键和单键均在所示化合物和众所周知的价态相互作用规则的背景内表示或理解。
术语“泛素连接酶”是指促进泛素向特定底物蛋白质的转移以靶向底物蛋白质从而进行降解的蛋白质家族。例如,E3泛素附接酶蛋白,其单独或与E2泛素缀合酶组合引起泛素与靶蛋白上的赖氨酸的附接,并且随后靶向特定蛋白质底物以被蛋白酶体降解。因此,单独或与E2泛素缀合酶复合的E3泛素连接酶负责泛素至靶蛋白的转移。一般而言,泛素附接酶涉及多泛素化,使得第二泛素附接于第一泛素;第三泛素附接于第二泛素,如此等等。多泛素化将蛋白质标记用于被蛋白酶体降解。然而,存在一些泛素化事件,其限于单泛素化,其中仅单个泛素通过泛素连接酶加入底物分子。单泛素化蛋白质不被靶向蛋白酶体进行降解,而是可以在其细胞位置或功能方面改变,例如,经由结合具有能够结合泛素的结构域的其他蛋白质。更复杂的是,泛素的不同赖氨酸可被E3靶向以制备链。最常见的赖氨酸是泛素链上的Lys48。这是用于制备被蛋白酶体识别的聚泛素的赖氨酸。如本文所用,除非另有说明,否则术语“烷基”本身或作为另一种取代基的一部分意指具有指定碳原子数的直链或支链烃基(即C1-8意指一至八个碳)。缺少特定数目的碳原子,假定本文提供的烷基基团具有一至十二个碳、一至八个碳、一至六个碳或一至四个碳。烷基基团的实例包括甲基、乙基、正丙基、异丙基、正丁基、叔丁基、异丁基、仲丁基、正戊基、正己基、正庚基、正辛基等。烷基基团可以如本文所提供的被任选地取代。在一些实施方案中,烷基基团为C1-6烷基;在一些实施方案中,其为C1-4烷基。
2016年8月5日提交的美国专利申请序列号15/230,354;以及2014年7月11日提交的美国专利申请序列号14/371,956,公布为美国专利申请公布号2014/0356322;以及2016年3月18日提交的美国专利申请序列号15/074,820,公布为美国专利申请公布号2016/0272639;以及2016年2月24日提交的国际专利申请号PCT/US2016/019328,公布为国际专利申请公布号WO2016/138114;以及2016年3月18日提交的国际专利申请号PCT/US2016/023258,公布为国际专利申请公布号WO2016/149668;以及2018年1月31日提交的美国非临时专利申请号15/885,671,公布为美国专利申请公布号2018/0215731,这些文献全部以引用方式全文并入本文。此外,本文引用的所有参考文献都以引用的方式整体并入本文。
如与本文定义的取代基结合使用的,术语“任选被取代的”是指该取代基可以但不必须被一个或多个合适的官能团或本文提供的其他取代基取代。例如,取代基可任选地被以下基团中的一个或多个取代:卤代、氰基、C1-6烷基、C3-6环烷基、C2-6烯基、C2-6炔基、卤代(C1-6)烷基、C1-6烷氧基、卤代(C1-6烷氧基)、C1-6烷硫基、C1-6烷基氨基、NH2、NH(C1-6烷基)、N(C1-6烷基)2、NH(C1-6烷氧基)、N(C1-6烷氧基)2、-C(O)NHC1-6烷基、-C(O)N(C1-6烷基)2、-C(O)NH2、-C(O)C1-6烷基、-C(O)2C1-6烷基、-NHCO(C1-6烷基)、-N(C1-6烷基)CO(C1-6烷基)、-S(O)C1-6烷基、-S(O)2C1-6烷基、氧代、苯基、苄基、吡啶基、吡唑基、噻唑基、异噻唑基或其他5-6元杂芳基基团。在一些实施方案中,每个以上任选的取代基本身任选地被一个或两个基团取代。
如本文所用,术语“环烷基”是指C3-12环烷基基团,并且包括桥环和螺环(例如,金刚烷)。环烷基基团的实例包括环丙基、环丁基、环戊基、环庚基、环己基、环庚基、环辛基、双环[2.2.1]庚基、双环[3.1.1]庚基、双环[4.1.0]庚基、螺[3.3]庚基和螺[3.4]辛基。在一些实施方案中,环烷基基团是C3-6环烷基。
如本文所用,术语“烯基”是指C2-12烷基,其中至少两个碳原子被sp2杂化并在它们之间形成碳-碳双键。本文提供的烯基基团可包含多于一个碳-碳双键,但优选一个。本文提供的烯基基团的烷基部分可如上所述被取代。在一些实施方案中,烯基基团为C2-6烯基。
如本文所用,术语“炔基”是指C2-12烷基,其中至少两个碳原子被sp杂化并在它们之间形成碳-碳三键。本文提供的炔基基团可包含多于一个碳-碳三键,但优选一个。本文提供的炔基基团的烷基部分可如上所述被取代。在一些实施方案中,炔基基团为℃2-6炔基。
术语“烷氧基”、“烷基氨基”和“烷硫基”以其常规含义使用,并且是指经由氧原子(氧代”)、氨基基团(“氨基”)或硫代基团与分子的其余部分附接的那些烷基。术语“烷基氨基”包括单烷基氨基基团、二烷基氨基基团,烷基部分可以相同或不同。
除非另有说明,否则术语“卤代”本身或作为另一取代基的一部分是指氟、氯、溴或碘原子,但优选氟或氯。
术语“卤代(C1-x烷基)”是指具有1-x个碳原子并且被一个或多个(例如1、2、3、4、5或6个)卤代基团取代的烷基。例如,该术语包括被一个或多个卤代基团取代的具有1-6个碳原子的烷基。术语卤代(C1-C6烷基)的非限制性实例包括氟甲基、二氟甲基、三氟甲基、氯甲基和2,2,2-三氟乙基。
术语“卤代(C1-x烷氧基)”是指具有1-x个碳原子并且被一个或多个(例如1、2、3、4、5或6个)卤代基团取代的烷氧基基团。例如,该术语包括被一个或多个卤代基团取代的具有1-6个碳原子的烷氧基。术语卤代(C1-C6烷基)的非限制性实例包括氟甲氧基、二氟甲氧基、三氟甲氧基、氯甲氧基和2,2,2-三氟乙氧基。
术语“杂烷基”是指直链或支链烷基基团,例如在链中具有2至14个碳(例如2至10个碳),其中一个或多个已被选自S、O、P和N的杂原子取代。示例性杂烷基包括烷基醚、仲烷基胺和叔烷基胺、烷基酰胺、烷基硫化物等。该基团可以是末端基团或桥联基团。如本文所用,当在桥联基团的上下文中使用时,提及正链是指连接桥联基团的两个末端位置的原子的直接链。
如本文所用,术语“芳基”是指单个全碳芳环或多个稠合全碳环体系,其中至少一个环是芳族环。例如,在某些实施方案中,芳基基团具有6至12个碳原子。芳基包括苯基。芳基还包括具有约9至12个碳原子的多稠环体系(例如,包含2、3或4个环的环体系),其中至少一个环是芳族环,并且其中其他环可以是芳族环或不是芳族环。这样的多稠环体系任选地在该多稠环体系的任何碳环部分上被一个或多个(例如1、2或3)氧代基团取代。当价数要求允许时,多稠环体系的环可以通过稠合、螺环和桥键相互连接。应当理解,如上文所定义的,多稠环体系的附接点可以在环体系的任何位置,包括环的芳族部分或碳环部分。芳基基团的非限制性实例包括但不限于苯基、茚基、萘基、1,2,3,4-四氢萘基等。
如本文所用,术语“杂芳基”是指在环中具有除碳以外的至少一个原子的单个芳族环,其中该原子选自氧、氮和硫;“杂芳基”还包括具有至少一个这样的芳族环的多稠环体系,该多稠环体系在下面进一步描述。因此,“杂芳基”包括具有约1至6个碳原子和选自氧、氮和硫的约1-4个杂原子的单芳环。如果环是芳族环,则硫和氮原子也可以氧化形式存在。示例性杂芳基环体系包括但不限于吡啶基、嘧啶基、噁唑基或呋喃基。“杂芳基”还包括多稠环体系(例如,包含2、3或4个环的环体系),其中如上定义的杂芳基与选自杂芳基(形成例如萘啶基诸如1,8-萘啶)、杂环(形成例如1,2,3,4-四氢萘啶基诸如1,2,3,4-四氢-1,8-萘啶)、碳环(形成例如5,6,7,8-四氢喹啉基)和芳基(形成例如吲唑基)的一个或多个环稠合,形成多稠环体系。因此,杂芳基(单芳环或多稠环体系)在杂芳基环内具有约1-20个碳原子和约1-6个杂原子。杂芳基(单芳环或多稠环体系)在杂芳基环内还可具有约5至12或约5至10个成员。多稠环体系可任选地被稠环的碳环或杂环部分上的一个或多个(例如1、2、3或4)氧代基团取代。当价数要求允许时,多稠环体系的环可以通过稠合、螺环和桥键相互连接。应当理解,多稠环体系的各个环可以以任何顺序相对于彼此连接。还应理解,多稠环体系(如上对于杂芳基所定义)的附接点可以在多稠环体系的任何位置,包括多稠环体系的杂芳基、杂环、芳基或碳环部分。还应理解,杂芳基或杂芳基多稠环体系的附接点可以在杂芳基或杂芳基多稠环体系的任何合适的原子处,包括碳原子和杂原子(例如氮)。示例性杂芳基包括但不限于吡啶基、吡咯基、吡嗪基、嘧啶基、哒嗪基、吡唑基、噻吩基、吲哚基、咪唑基、噁唑基、异噁唑基、噻唑基、呋喃基、噁二唑基、噻二唑基、喹啉基、异喹啉基、苯并噻唑基、苯并噁唑基、吲唑基、喹喔啉基、喹唑啉基、5,6,7,8-四氢异喹啉基苯并呋喃基、苯并咪唑基、硫杂萘基、吡咯并[2,3-b]吡啶基、喹唑啉基-4(3H)-酮、三唑基、4,5,6,7-四氢-1H-吲唑和3b,4,4a,5-四氢-1H-环丙[3,4]环戊[1,2-c]吡唑。在一个实施方案中,术语“杂芳基”是指包含至少一个杂原子的单个芳环。例如,该术语包括包含一个或多个杂原子的5元和6元单环芳环。杂芳基的非限制性实例包括但不限于吡啶基、呋喃基、噻唑、嘧啶、噁唑和噻二唑。
如本文所用,术语“杂环基”或“杂环”是指在环中具有除碳以外的至少一个原子的单个饱和或部分不饱和的环,其中该原子选自氧、氮和硫;该术语还包括具有至少一个这样的饱和或部分不饱和环的多稠环体系,该多稠环体系在下面进一步描述。因此,该术语包括在环中具有约1至6个碳原子和约1至3个选自氧、氮和硫的杂原子的单个饱和或部分不饱和环(例如,3、4、5、6或7元环)。该环可被一个或多个(例如1、2或3个)氧代基团取代,并且硫和氮原子也可以其氧化形式存在。示例性杂环包括但不限于氮杂环丁烷基、四氢呋喃基和哌啶基。术语“杂环”还包括多稠环体系(例如,包含2、3或4个环的环体系),其中单个杂环(如上所定义)可以与选自杂环(形成例如1,8-十氢萘啶)、碳环(形成例如十氢喹啉基)和芳基的一个或多个基团稠合,形成多稠合环体系。因此,杂环(单个饱和或单个部分不饱和的环或多稠环体系)在杂环内具有约2-20个碳原子和1-6个杂原子。这样的多稠环体系可任选地被多稠环的碳环或杂环部分上的一个或多个(例如1、2、3或4)氧代基团取代。当价数要求允许时,多稠环体系的环可以通过稠合、螺环和桥键相互连接。应当理解,多稠环体系的各个环可以以任何顺序相对于彼此连接。因此,杂环(单个饱和或单个部分不饱和的环或多稠环体系)在杂环体系内具有约3-20个原子,包括约1-6个杂原子。还应理解,多稠环体系(如上文对于杂环所定义)的附接点可以在多稠环体系的任何位置,包括环的杂环、芳基和碳环部分。还应理解,杂环或杂环多稠环体系的附接点可以在杂环或杂环多稠环体系的任何合适的原子处,包括碳原子和杂原子(例如氮)。在一个实施方案中,术语杂环包括C2-20杂环。在一个实施方案中,术语杂环包括C2-7杂环。在一个实施方案中,术语杂环包括C2-5杂环。在一个实施方案中,术语杂环包括C2-4杂环。示例性杂环包括但不限于吖丙啶基、氮杂环丁烷基、吡咯烷基、哌啶基、高哌啶基、吗啉基、硫代吗啉基、哌嗪基、四氢呋喃基、二氢噁唑基、四氢吡喃基、四氢噻喃基、1,2,3,4-四氢喹啉基、苯并噁嗪基、二氢噁唑基、色满基、1,2-二氢吡啶基、2,3-二氢苯并呋喃基、1,3-苯并二噁唑基、1,4-苯并二噁烷基、螺[环丙烷-1,1′-异二氢吲哚基]-3′-酮、异二氢吲哚基-1-酮、2-氧杂-6-氮杂螺[3.3]庚烷基、咪唑烷-2-酮N-甲基哌啶、咪唑烷、吡唑烷、丁内酰胺、戊内酰胺、咪唑烷酮、乙内酰脲、二氧戊环、邻苯二甲酰亚胺、1,4-二噁烷、硫代吗啉、硫代吗啉-S-氧化物、硫代吗啉-S,S-氧化物、吡喃、3-吡咯啉、噻喃、吡喃酮、四氢噻吩、奎宁环、托烷、2-氮杂螺[3.3]庚烷、(1R,5S)-3-氮杂双环[3.2.1]辛烷、(1S,4S)-2-氮杂双环[2.2.2]辛烷、(1R,4R)-2-氧杂-5-氮杂双环[2.2.2]辛烷和吡咯烷-2-酮。在一个实施方案中,术语“杂环”是指具有至少一个杂原子的单环、饱和或部分不饱和的3-8元环。例如,该术语包括具有至少一个杂原子的单环、饱和或部分不饱和的4、5、6或7元环。杂环的非限制性实例包括氮杂环丙烷、氮杂环丁烷、吡咯烷、哌啶、哌啶、哌嗪、环氧乙烷、吗啉和硫代吗啉。如本文所用,术语“9元或10元杂双环”是指具有至少一个杂原子的部分不饱和或芳族稠合双环体系。例如,术语9元或10元杂二环包括具有稠合到含有一个或多个杂原子的5元或6元饱和、部分不饱和或芳族环上的苯并环的双环体系。
如本文所用,术语“杂原子”是指包括氧(O)、氮(N)、硫(S)和硅(Si)。可行时,氮和硫可以是氧化形式。
如本文所用,术语“手性”是指具有镜像配偶体的不可重叠性的分子,而术语“非手性”是指可重叠在其镜像配体上的分子。
如本文所用,术语“立体异构体”是指具有相同化学组成,但是原子或基团在空间上的排列不同的化合物。如本文所用,交叉线
Figure BDA0003676261880000181
表示E和Z立体异构体的混合物。
如本文所用,与化学结构中的键相交的波浪线
Figure BDA0003676261880000182
或虚线“----”表示在化学结构中与分子的其余部分相交的波浪键的附接点。
“非对映体”是指具有两个或更多个手性中心并且其分子不是彼此镜像的立体异构体。非对映体具有不同的物理性质,例如熔点、沸点、光谱性质和反应性。非对映体的混合物可以在高分辨率分析程序(诸如电泳和色谱法)下分离。
“对映体”是指化合物的两种立体异构体,它们是彼此不可重叠的镜像。
本文所用的立体化学定义和惯例通常遵循S.P.Parker编辑,McGraw-HillDictionary of Chemical Terms(1984)McGraw-Hill Book Company,New York;以及Eliel,E.和Wilen,S.,″Stereochemistry of Organic Compounds″,John Wiley&Sons,Inc.,New York,1994。本发明的化合物可以包含不对称或手性中心,因此以不同的立体异构形式存在。意图是本发明化合物的所有立体异构形式,包括但不限于非对映体,对映体和阻转异构体以及它们的混合物,诸如外消旋混合物,均构成本发明的一部分。许多有机化合物以旋光活性形式存在,即它们具有旋转平面偏振光平面的能力。在描述旋光活性化合物时,前缀D和L或R和S用于表示分子围绕其手性中心的绝对构型。前缀d和l或(+)和(-)用来表示化合物对平面偏振光的旋转符号,其中(-)或1表示该化合物是左旋的。带有(+)或d前缀的化合物是右旋的。对于给定的化学结构,这些立体异构体是相同的,不同之处在于它们是彼此的镜像。特定的立体异构体也可以被称为对映体,并且这种异构体的混合物通常被称为对映体混合物。对映体的50∶50混合物称为外消旋混合物或外消旋体,它们可以发生在化学反应或过程中没有立体选择或立体特异性的地方。术语“外消旋混合物”和“外消旋物”是指两种对映体物质的等摩尔混合物,没有旋光活性。
当以非立体化学方式(例如平坦)绘制本文化合物式中的键时,与该键附接的原子包括所有立体化学可能性。当本文化合物式中的键以定义的立体化学方式(例如粗体、粗体-楔形、虚线或虚线-楔形)绘制时,应理解,除非另有说明,否则立体化学键所附接的原子富含所描绘的绝对立体异构体。在一个实施方案中,该化合物可以是所描绘的绝对立体异构体的至少51%。在另一个实施方案中,该化合物可以是所描绘的绝对立体异构体的至少80%。在另一个实施方案中,该化合物可以是所描绘的绝对立体异构体的至少90%。在另一个实施方案中,该化合物可以是所描绘的绝对立体异构体的至少95%。在另一个实施方案中,该化合物可以是所描绘的绝对立体异构体的至少97%。在另一个实施方案中,该化合物可以是所描绘的绝对立体异构体的至少98%。在另一个实施方案中,该化合物可以是所描绘的绝对立体异构体的至少99%。
如本文所用,术语“互变异构体”或“互变异构形式”是指经由低能垒可相互转化的不同能量的结构异构体。例如,质子互变异构体(也称为质子异变互变异构体)包括经由质子迁移的相互转化,诸如酮-烯醇和亚胺-烯胺异构化。价互变异构体包括通过一些成键电子的重组而进行的相互转化。
如本文所用,术语“溶剂化物”是指一种或多种溶剂分子与本发明化合物的缔合或复合物。形成溶剂化物的溶剂的实例包括但不限于水、异丙醇、乙醇、甲醇、DMSO、乙酸乙酯、乙酸和乙醇胺。术语“水合物”是指其中溶剂分子是水的复合物。
如本文所用,术语“保护基”是指通常用于阻断或保护化合物上的特定官能团的取代基。例如,“氨基保护基”是附接至氨基基团的取代基,其阻断或保护化合物中的氨基官能度。合适的氨基保护基包括乙酰基、三氟乙酰基、叔丁氧羰基(BOC)、苄氧羰基(CBZ)和9-芴基亚甲基氧羰基(Fmoc)。类似地,“羟基保护基”是指阻断或保护羟基官能度的羟基的取代基。合适的保护基包括乙酰基和甲硅烷基。“羧基保护基”是指阻断或保护羧基官能度的羧基基团取代基。常见的羧基保护基包括苯基磺酰基乙基、氰基乙基、2-(三甲基硅烷基)乙基、2-(三甲基硅烷基)乙氧基甲基、2-(对甲苯磺酰基)乙基、2-(对硝基苯基亚磺酰基)乙基、2-(二苯基膦基)-乙基、硝基乙基等。有关保护基及其使用的一般描述,参见P.G.M.Wuts和T.W.Greene,Greene′s Protective Groups in Organic Synthesis第4版,Wiley-Interscience,New York,2006。
如本文所用,术语“药学上可接受的盐”是指包括根据本文所述化合物上存在的特定取代基,用相对无毒的酸或碱制备的活性化合物的盐。当本发明的化合物含有相对酸性的官能团时,可以通过使此类化合物的中性形式与足够量的纯净的或在合适的惰性溶剂中的所需碱接触来获得碱加成盐。衍生自药学上可接受的无机碱的盐的实例包括铝、铵、钙、铜、铁、亚铁、锂、镁、三价锰、二价锰、钾、钠、锌等。衍生自药学上可接受的有机碱的盐包括伯、仲和叔胺的盐,包括取代的胺、环胺、天然存在的胺等,诸如精氨酸、甜菜碱、咖啡因、胆碱、N,N′-二苄基乙二胺、二乙胺、2-二乙基氨基乙醇、2-二甲基氨基乙醇、乙醇胺、乙二胺、N-乙基吗啉、N-乙基哌啶、还原葡糖胺、葡糖胺、组氨酸、海巴明、异丙胺、赖氨酸、甲基葡糖胺、吗啉、哌嗪、哌啶、聚胺树脂、普鲁卡因、嘌呤、可可碱、三乙胺、三甲胺、三丙胺、氨丁三醇等。当本发明的化合物含有相对碱性的官能团时,可以通过使此类化合物的中性形式与足够量的纯净的或在合适的惰性溶剂中的所需酸接触来获得酸加成盐。药学上可接受的酸加成盐的实例包括衍生自无机酸的那些酸加成盐,这些无机酸如盐酸、氢溴酸、硝酸、碳酸、一氢碳酸、磷酸、一氢磷酸、二氢磷酸、硫酸、一氢硫酸、氢碘酸或亚磷酸等;以及衍生自相对无毒的有机酸的盐,这些相对无毒的有机酸如乙酸、丙酸、异丁酸、丙二酸、苯甲酸、琥珀酸、辛二酸、富马酸、扁桃酸、邻苯二甲酸、苯磺酸、对甲苯磺酸、柠檬酸、酒石酸、甲基磺酸等。还包括氨基酸的盐(诸如精氨酸盐等)和有机酸(如葡萄糖醛酸或半乳糖醛酸等)的盐(参见例如,Berge,S.M.等人,“Pharmaceutical Salts”,Journal of Pharmaceutical Science,1977,66,1-19)。本发明的某些特定化合物含有允许化合物转化成碱加成盐或酸加成盐的碱性和酸性官能团。
化合物的中性形式可通过使盐与碱或酸接触并以常规方式分离母体化合物来再生。化合物的母体形式在某些物理性质(诸如在极性溶剂中的溶解度)方面与各种盐形式不同,但是对于本发明的目的而言,这些盐与化合物的母体形式等效。
除盐形式外,本发明还提供前药形式的化合物。如本文所用,术语“前药”是指在生理条件下容易经历化学变化以提供本发明的化合物的那些化合物。另外,可以在离体环境中通过化学或生化方法将前药转化为本发明的化合物。例如,当将前药与合适的酶或化学试剂一起置于透皮贴剂储库中时,前药可被缓慢转化为本发明的化合物。
本发明的前药包括这样的化合物,其中氨基酸残基或两个或更多个(例如,两个、三个或四个)氨基酸残基的多肽链通过酰胺或酯键共价连接到本发明化合物的游离氨基、羟基或羧酸基团。氨基酸残基包括但不限于通常由三字母符号表示的20种天然存在的氨基酸,并且还包括磷酸丝氨酸、磷酸苏氨酸、磷酸酪氨酸、4-羟基脯氨酸、羟基赖氨酸、锁链素、异锁链素、γ-羧基谷氨酸、马尿酸、八氢吲哚-2-羧酸、抑胃酶氨酸、1,2,3,4-四氢异喹啉-3-羧酸、青霉胺、鸟氨酸、3-甲基组氨酸、正缬氨酸、β-丙氨酸、γ一氨基丁酸、瓜氨酸、同型半胱氨酸、高丝氨酸、甲基丙氨酸、对苯甲酰基苯丙氨酸、苯基甘氨酸、炔丙基甘氨酸、肌氨酸、蛋氨酸砜和叔丁基甘氨酸。
还包括其他类型的前药。例如,本发明化合物的游离羧基基团可被衍生为酰胺或烷基酯。作为另一个实例,包含自由羟基基团的本发明化合物可以通过将羟基基团转化为例如但不限于磷酸酯、半琥珀酸酯、二甲基氨基乙酸酯或磷酰氧基甲基氧羰基基团的基团而衍生为前药,如Fleisher,D.等人,(1996)Improved oral drug delivery:solubilitylimitations overcome by the use of prodrugs Advanced Drug Delivery Reviews,19∶115中概述的。还包括羟基和氨基基团的氨基甲酸酯前药,以及羟基基团的碳酸酯前药、磺酸酯和硫酸酯。羟基基团衍生为(酰氧基)甲基和(酰氧基)乙基醚,其中所述酰基基团可以是任选地被包括但不限于醚、胺和羧酸官能团的基团取代的烷基酯,或者其中酰基基团为还包括如上所述的氨基酸酯。这种类型的前药描述于J.Med.Chem.,(1996),39∶10中。更具体的实例包括用一个基团取代醇基基团的氢原子,所述基团诸如(C1-6)烷酰氧基甲基、1-((C1-6)烷酰氧基)乙基、1-甲基-1-((C1-6)烷酰氧基)乙基、(C1-6)烷氧基羰氧基甲基、N-(C1-6)烷氧基羰基氨基甲基、琥珀酰基、(C1-6)烷酰基、α-氨基(C1-4)烷酰基、芳基酰基和α-氨基酰基或α-氨基酰基-α-氨基酰基,其中每个α-氨基酰基基团均独立地选自天然存在的L-氨基酸,P(O)(OH)2、-P(O)(O(C1-6)烷基)2或糖基(通过除去碳水化合物的半缩醛形式的羟基基团产生的基团)。
对于前药衍生物的其他实例,参见例如a)Design of Prodrugs,由H.Bundgaard编辑,(Elsevier,1985)和Methods in Enzymology,第42卷,第309-396页,由K.Widder等人编辑,(Academic Press,1985);b)A Textbook of Drug Design and Development,由Krogsgaard-Larsen和H.Bundgaard编辑,第5章,″Design and Application ofProdrugs″,由H.Bundgaard所写,第113-191页(1991);c)H.Bundgaard,Advanced DrugDelivery Reviews,8:1-38(1992);d)H.Bundgaard等人,Journal of PharmaceuticalSciences,77:285(1988);以及e)N.Kakeya等人,Chem.Pharm.Bull.,32:692(1984),这些文献中的每一篇均特别地以引用方式并入本文。
另外,本发明提供了本发明化合物的代谢物。如本文所用,“代谢物”是指通过特定化合物或其盐在体内代谢产生的产物。这样的产物可以例如由所施用化合物的氧化、还原、水解、酰胺化、脱酰胺、酯化、脱酯化、酶促裂解等产生。
代谢产物通常通过制备放射性标记(例如14C或3H)的本发明化合物同位素来鉴定,将其以可检测的剂量(例如大于约0.5mg/kg)肠胃外施用于动物诸如大鼠、小鼠、豚鼠、猴子或人,给予足够时间发生代谢(通常约30秒至30小时),并从尿液、血液或其他生物样品中分离其转化产物。这些产物由于已被标记而易于分离(其他抗体是通过使用能够结合在代谢物中存活的表位的抗体来分离的)。以常规方式,例如通过MS、LC/MS或NMR分析来确定代谢物的结构。通常,以与本领域技术人员众所周知的常规药物代谢研究相同的方式进行代谢物的分析。只要在体内没有发现代谢产物,就可用于本发明化合物的治疗剂量的诊断测定。
术语“患者”或“受试者”在说明书自始至终用于描述用根据本公开的组合物对其提供治疗,包括预防性治疗的动物,优选人或驯养动物。对于特定动物(例如人患者)特异性的那些感染、状况或疾病状态的治疗,术语患者指该特定动物,包括驯养动物如犬或猫或者农场动物如马、牛、绵羊等。一般而言,在本公开中,除非另有说明或由该术语使用的上下文暗示,否则术语患者指人类患者。
术语“有效”用于描述化合物、组合物或组分的量,当在其预期用途的上下文内使用时,所述量实现预期结果。术语有效包含在本申请中另外描述或使用的所有其他有效量或有效浓度项。
化合物和组合物
在一个方面,本说明书提供了包含E3泛素连接酶结合部分(“ULM”)的化合物,所述ULM是希佩尔-林道E3泛素连接酶(VHL)结合部分(VLM)。在一个示例性实施方案中,根据以下结构,ULM经由化学接头(L)偶联至靶蛋白结合部分(PTM):
(A)PTM-L-ULM
其中L是键或化学接头基团,ULM是E3泛素连接酶结合部分,并且PTM是靶蛋白结合部分。本文示出的化合物中的部分的数目和/或相对位置仅为了举例而提供。如技术人员将理解的那样,本文所述的化合物可以按照各个官能部分的任何所需数目和/或相对位置来合成。
在另一方面,本公开提供了可用于通过诱导靶蛋白的降解来调节蛋白质活性的双官能或多官能化合物(例如PROTAC)。在某些实施方案中,该化合物包含偶联(例如,共价、直接或间接连接)至结合靶蛋白的部分(即,蛋白质靶向部分或“PTM”)的VLM。在某些实施方案中,VLM和PTM经由化学接头(L)接合或偶联。VLM结合VHL,并且PTM识别靶蛋白,各个部分与其靶标的相互作用有利于通过将靶蛋白置于泛素连接酶蛋白附近来降解靶蛋白。示例性双官能化合物可以描绘为:PTM-VLM。
在某些实施方案中,双官能化合物还包含化学接头(“L”)。例如,双官能化合物可以描绘为:PTM-L-VLM,
其中PTM是蛋白质/多肽靶向部分,L是化学接头,并且VLM是VHL结合部分。
在某些实施方案中,ULM(例如,VLM)显示活性或以小于约200μM的IC50结合E3泛素连接酶(例如,VHL)。IC50可根据本领域已知的任何方法测定,例如荧光偏振分析。
在某些另外的实施方案中,本文所述的双官能化合物显示出IC50小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001mM或小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001μM或小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001nM或小于约100、50、10、1、0.5、0.1、0.05、0.01、0.005、0.001pM的活性。
在其中化合物包含多个ULM的某些实施方案中,ULM是相同的。在化合物包含多个ULM(例如,ULM、ULM’等)的另外的实施方案中,至少一个PTM直接或经由化学接头(L)或这两者偶联至ULM。在某些另外的实施方案中,包含多个ULM的化合物还包含多个PTM。在另外的实施方案中,PTM是相同的或任选地不同的。在其中PTM不同的另外的实施方案中,各个PTM可以结合相同的蛋白质靶标或特异性地结合至不同的蛋白质靶标。
在某些实施方案中,化合物可包含多个ULM和/或多个ULM′。在化合物包含至少两个不同ULM的另外的实施方案中,多个ULM和/或多个ULM’还包含直接偶联或经由化学接头偶联或以这两种方式偶联至ULM或ULM’的至少一个PTM。在本文所述的任何实施方案中,包含至少两个不同ULM的化合物还可以包含多个PTM。在另外的实施方案中,PTM是相同的或任选地不同的。在其中PTM不同的另外的实施方案中,各个PTM可以结合相同的蛋白质靶标或特异性地结合至不同的蛋白质靶标。
在另外的实施方案中,本说明书提供了如本文所述的化合物,包括其对映体、非对映体、溶剂化物和多晶型物,包括其药学上可接受的盐形式,例如酸和碱盐形式。
示例性VLM
在某些实施方案中,如本文所述的化合物包括用于结合E3泛素连接酶(例如,希佩尔-林道E3泛素连接酶)的部分。在某些实施方案中,ULM是VLM并且包含选自组ULM-a的化学结构:
Figure BDA0003676261880000261
其中:
虚线指示至少一个PTM、另一个ULM或VLM(即VLM’)或者将至少一个PTM、ULM’或VLM’与接头的另一端附接的化学接头部分;
式ULM-a的X1、X2各自独立地选自键、O、NRY3、CRY3RY4、C=O、C=S、SO和SO2
式ULM-a的RY3、RY4各自独立地选自H、任选被1个或多个卤代取代的直链或支链C1-6烷基、任选被取代的C1-6烷氧基(例如,任选被0-3个RP基团取代);
式ULM-a的RP是0、1、2或3个基团,各自独立地选自H、卤代、-OH、C1-3烷基、C=O、烷基、烷氧基或它们的组合;
式ULM-a的W3选自任选被取代的T、任选被取代的-T-N(R1aR1b)X3、任选被取代的-T-N(R1aR1b)、任选被取代的-T-芳基、任选被取代的-T-杂芳基、任选被取代的T-二杂芳基、任选被取代的-T-杂环基、任选被取代的-T-二杂环基、任选被取代的-NR1-T-芳基、任选被取代的-NR1-T-杂芳基或任选被取代的-NR1-T-杂环基;
式ULM-a的X3是C=O、R1、R1a、R1b
R1、R1a、R1b各自独立地选自H、任选被1个或多个卤代或-OH基团取代的直链或支链的C1-C6烷基、RY3C=O、RY3C=S、RY3SO、RY3SO2、N(RY3RY4)C=O、N(RY3RY4)C=S、N(RY3RY4)SO和N(RY3RY4)SO2
式ULM-a的T选自任选被取代的烷基、-(CH2)n-基团、任选被取代的直链、支链-(CH2)n-O-C1-C6烷基或任选被取代的-(CH2)n-O-杂环基,其中亚甲基中的每一个任选被一个或两个选自卤素、甲基、任选被1个或多个卤素或-OH基团取代的直链或支化C1-C6烷基、任选被取代的氨基酸侧链或任选被取代的杂环基的取代基取代;
式ULM-a的W4是任选被取代的-NR1-T-芳基,其中芳基可以任选被任选被取代的5-6元杂芳基或任选被取代的芳基、任选被取代的-NR1-T-杂芳基取代,其中杂芳基任选被任选被取代的芳基或任选被取代的杂芳基或任选被取代的-NR1-T-杂环基取代,其中-NR1共价键合至X2,并且R1是H或CH3,优选H。
在某些实施方案中,RP被修饰以形成前药,包括通过酯或醚键。
在本文所述的任何方面或实施方案中,T选自任选被取代的烷基、-(CH2)n-基团,其中亚甲基中的每一个任选被一个或两个选自卤素、甲基、任选被取代的烷氧基、任选被1个或多个卤素取代的直链或支链C1-C6烷基、C(O)NR1R1a或NR1R1a的取代基取代,或者R1和R1a连接形成任选被取代的杂环基或-OH基团或任选被取代的氨基酸侧链;并且n是0至6,通常是0、1、2或3,优选是0或1。
在本文所述的任何方面或实施方案中,式ULM-a的W4
Figure BDA0003676261880000281
Figure BDA0003676261880000282
其中R14a、R14b各自独立地选自H、卤代烷基(例如,氟代烷基)、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的酰胺、任选被取代的烷基-酰胺、任选被取代的烷基-氰基、任选被取代的烷基-磷酸根、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、烷基-COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷。
在任何实施方案中,式ULM-a的W5选自任选被取代的苯基、任选被取代的萘基或任选被取代的5-10元杂芳基,
式ULM-a的R15选自H、卤素、CN、OH、C·CH、OH、NO2、NR14aR14b、OR14a、CONR14aR14b、NR14aCOR14b、SO2NR14aR14b、NR14aSO2R14b、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基;
在另外的实施方案中,用于本公开中的W4取代基还具体地包括(并且不限于所公开的具体化合物)W4取代基,其在本文公开的鉴定的化合物中发现。这些W4取代基中的每一个可以与也在本文公开的任何数目的W3取代基结合使用。
在某些另外的实施方案中,ULM-a任选被吡咯烷部分中的0-3个RP基团取代。每个RP独立地是H、卤代、-OH、C1-3烷基、C=O。
在本文所述的任何实施方案中,式ULM-a的W3、W4可以独立地共价偶联至附接一个或多个PTM基团的接头。
并且其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM′或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在某些实施方案中,ULM是VHL,并且由以下结构表示:
Figure BDA0003676261880000291
其中:
式ULM-b的W3选自任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基或
Figure BDA0003676261880000292
式ULM-b的R9和R10独立地为氢、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基,或者R9、R10以及它们所附接的碳原子形成任选被取代的环烷基;
式ULM-b的R11选自任选被取代的杂环、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、
Figure BDA0003676261880000301
Figure BDA0003676261880000302
式ULM-b的R12选自H或任选被取代的烷基;
式ULM-b的R13选自H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基;
式ULM-b的R14a、R14b各自独立地选自H、卤代烷基(例如,氟代烷基)、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、氨基甲基、烷基氨基甲基、烷氧基甲基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的酰胺、任选被取代的烷基-酰胺、任选被取代的烷基-氰基、任选被取代的烷基-磷酸根、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、烷基-COR26、CONR27aR27b、CH2NHCOR26或(CH2)N(CH3)COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至6元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
式ULM-b的W5选自苯基、萘基或5-10元杂芳基,
式ULM-b的R15选自H、卤素、CN、C·CH、OH、NO2、NR27aR27b、OR27a、CONR27aR27b、NR27aCOR27b、SO2NR27aR27b、NR27aSO2R27b,任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基;
式ULM-b的每个R16独立地选自卤代、CN、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的卤代烷基、羟基或任选被取代的卤代烷氧基;
式ULM-b的o是0、1、2、3或4;
式ULM-b的R18独立地选自H、卤代、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头;
每个R26独立地选自H、OH、任选被取代的烷基或NR27aR27b
每个R27a和R27b独立地是H、任选被取代的烷基、任选被取代的3至5元环烷基,或者R27a和R27b与它们所附接的氮原子一起形成4至6元杂环基;
并且
式ULM-b的p是0、1、2、3或4,并且其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM′或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在某些实施方案中,式ULM-b的R15
Figure BDA0003676261880000311
其中R17是H、卤代、任选被取代的C3-6环烷基、任选被取代的C1-6烷基、任选被取代的C1-6烯基和C1-6卤代烷基;并且Xa是S或O。
在某些实施方案中,式ULM-b的R17选自甲基、乙基、异丙基和环丙基。
在某些另外的实施方案中,式ULM-b的R15选自:
Figure BDA0003676261880000321
在某些实施方案中,式ULM-b的R11选自:
Figure BDA0003676261880000331
在本文所述的任何方面或实施方案中,式ULM-b的R14a、R14b各自独立地选自H、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的酰胺、任选被取代的烷基-酰胺、任选被取代的烷基-氰基、任选被取代的烷基-磷酸根、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、烷基-COR26、CH2OR30、CH2NHR30、CH2NCH3R30、CONR27aR27b、CH2CONR27aR27b、CH2NHCOR26或CH2NCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b、与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至6元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷,所述螺环烷基或螺杂环烷基本身任选被烷基、卤代烷基或-COR33取代,其中R33是烷基或卤代烷基,
其中R30选自H、烷基、炔基烷基、环烷基、杂环烷基、环烷基烷基、杂环烷基烷基、芳基烷基或杂芳基烷基,其进一步任选被取代;R26和R27如上所述。
在本文所述的任何方面或实施方案中,式ULM-b的R15选自H、卤素、CN、C·CH、OH、NO2、NR27aR27b、OR27a、CONR27aR27b、NR27aCOR27b、SO2NR27aR27b、NR27aSO2R27b、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基(例如,任选被取代的氟代烷基)、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基,其中所述芳基、杂芳基、环烷基和杂环烷基的任选取代包括CH2OR30、CH2NHR30、CH2NCH3R30、CONR27aR27b、CH2CONR27aR27b、CH2NHCOR26、CH2NCH3COR26
Figure BDA0003676261880000341
其中R26、R27、R30和R14a如上所述。
在本文所述的任何方面或实施方案中,式ULM-b的R14a、R14b各自独立地选自H、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷基、CH2OR30、CH2NHR30、CH2NCH3R30、CONR27aR27b、CH2CONR27aR27b、CH2NHCOR26或CH2NCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至6元螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷,所述螺环烷基或螺杂环烷基本身任选被烷基、卤代烷基或-COR33,其中R33是烷基或卤代烷基,其中R30选自H、烷基、炔基烷基、环烷基、杂环烷基、环烷基烷基、杂环烷基烷基、芳基烷基或杂芳基烷基,其进一步任选被取代;
式ULM-b的R15选自H、卤素、CN、C·CH、OH、NO2、NR27aR27b、OR27a、CONR27aR27b、NR27aCOR27b、SO2NR27aR27b、NR27aSO2R27b、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基,其中所述芳基、杂芳基、环烷基和杂环烷基的任选取代包括CH2OR30、CH2NHR30、CH2NCH3R30、CONR27aR27b、CH2CONR27aR27b、CH2NHCOR26、CH2NCH3COR26
Figure BDA0003676261880000351
其中R26、R27、R30和R14a如上所述。
在某些实施方案中,ULM具有选自以下的化学结构:
Figure BDA0003676261880000352
其中:
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R1是H、乙基、异丙基、叔丁基、仲丁基、环丙基、环丁基、环戊基或环己基;任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基;
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R14a为H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基;
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R15选自H、卤素、CN、C·CH、OH、NO2、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基;任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基;
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的X是C、CH2或C=O;
式ULM-c、ULM-d和ULM-e的R3不存在或者为任选被取代的5或6元杂芳基;并且
所述虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM′或两者与ULM偶联的化学接头部分的附着位点。
在某些实施方案中,ULM包含根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000361
其中:
式ULM-f的R14a是H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基;
式ULM-f的R9是H;
式ULM-f的R10是H、乙基、异丙基、叔丁基、仲丁基、环丙基、环丁基、环戊基或环己基;
式ULM-f的R11
Figure BDA0003676261880000371
Figure BDA0003676261880000372
或任选被取代的杂芳基;
式ULM-f的p是0、1、2、3或4;
式ULM-f的每个R18独立地是卤代、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头;
式ULM-f的R12是H、C=O;
式ULM-f的R13是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基,
R15式ULM-f的选自H、卤素、Cl、CN、C、CH、OH、NO2、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基;
Figure BDA0003676261880000373
Figure BDA0003676261880000381
Figure BDA0003676261880000382
并且
其中式ULM-f的虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM′或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。在某些实施方案中,ULM选自下述结构:
Figure BDA0003676261880000383
Figure BDA0003676261880000391
其中n是0或1。
在某些实施方案中,ULM选自下述结构:
Figure BDA0003676261880000392
Figure BDA0003676261880000401
Figure BDA0003676261880000411
Figure BDA0003676261880000421
其中ULM-a1至ULM-a15、ULM-b1至ULM-b12、ULM-c1至ULM-c15和ULM-d1至ULM-d9中的苯环任选被氟、低级烷基和烷氧基取代,并且其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM′或两者与ULM-a偶联的化学接头部分的附接位点。
在一个实施方案中,ULM-a1至ULM-a15、ULM-b1至ULM-b12、ULM-c1至ULM-c15和ULM-d1至ULM-d9中的苯环可以被官能化为酯,以使得其成为前药的部分。
在某些实施方案中,ULM-a1至ULM-a15、ULM-b1至ULM-b12、ULM-c1至ULM-c15和ULM-d1至ULM-d9的吡咯烷环上的羟基分别包含酯连接的前药部分。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM和存在的ULM′各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000431
或其药学上可接受的盐,其中:
ULM-g的R1’是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的-(CH2)nOH、任选被取代的-(CH2)nSH、任选被取代的(CH2)n-O-(C1-C6)烷基、任选被取代的(CH2)n-WCOCW-(C0-C6)烷基,其含有环氧化物部分WCOCW,其中每个W独立地是H或C1-C3烷基、任选被取代的-(CH2)nCOOH、任选被取代的-(CH2)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2)nNHC(O)-R″、任选被取代的-(CH2)nC(O)-N(R″)2、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-N(R″)2、-(CH2O)nH、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2)nC(O)-O-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2O)nCOOH、任选被取代的-(OCH2)nO-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2O)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(OCH2)nNHC(O)-R″、任选被取代的-(CH2O)nC(O)-N(R″)2、-(CH2CH2O)nH、任选被取代的-(CH2CH2O)nCOOH、任选被取代的-(OCH2CH2)nO-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2CH2O)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(OCH2CH2)nNHC(O)-R″、任选被取代的-(CH2CH2O)nC(O)-N(R″)2、任选被取代的-SO2RS、任选被取代的S(O)RS、NO2、CN或卤素(F、Cl、Br、I,优选F或Cl);
ULM-g的每个R″独立地是H或可任选被一个或两个羟基或至多三个卤素基团(优选氟)取代的C1-C6烷基;
ULM-g的RS是C1-C6烷基、任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基或-(CH2)mN(R″)2基团;
ULM-g的X和X’各自独立地是C=O、C=S、-S(O)、S(O)2,(优选地X和X’均为C=O);
ULM-g的R2’是任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w烷基、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)wNR1NR2N基团、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)vNR″(SO2)w-杂环基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基或任选被取代的-NR″-(CH2)n-(C=O)vNR″(SO2)w-杂环基、任选被取代的-XR2’-烷基;任选被取代的-XR2’-芳基;任选被取代的-XR2’-杂芳基;任选被取代的-XR2’-杂环基;
ULM-g的R3’是任选被取代的烷基、任选被取代的-(CH2)n-(O)u(NR″)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(S02)w-C(O)(R″)2、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂环基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(S02)w-烷基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂环基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基或任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂环基;-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-烷基、任选被取代的-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-芳基、任选被取代的-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-杂环基’基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-烷基、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-芳基、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-杂环基、任选被取代的-XR3’-烷基;任选被取代的-XR3’-芳基;任选被取代的-XR3’-杂芳基;任选被取代的-XR3’-杂环基;
ULM-g的R1N和R2N各自独立地是H、任选被一个或两个羟基和至多三个卤素基团取代的C1-C6烷基或任选被取代的-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基或-(CH2)n-杂环基;
ULM-g的V是O、S或NR1
ULM-g的每个R1’独立地是H或C1-C3烷基;
ULM-g的XR2’和XR3’各自独立地任选被取代的-CH2)n-、-CH2)n-CH(Xv)=CH(Xv)-(顺式或反式)、-CH2)n-CH≡CH-、-(CH2CH2O)n-或C3-C6环烷基,其中Xv是H、卤代或任选被取代的C1-C3烷基;
ULM-g的每个m独立地是0、1、2、3、4、5、6;
ULM-g的每个m′独立地是0或1;
ULM-g的每个n独立地是0、1、2、3、4、5、6;
ULM-g的每个n′独立地是0或1;
ULM-g的每个u独立地是0或1;
ULM-g的每个v独立地是0或1;
ULM-g的每个w独立地是0或1;并且
当PTM不是ULM’时,ULM-g的R1’、R2’、R3’、X和X’中的任何一个或多个被任选地修饰为通过接头基团共价结合至PTM基团,或当PTM是ULM’时,ULM和ULM’中每一者的R1’、R2’、R3’、X和X’中的任何一个或多个被任选地修饰为直接或通过接头基团彼此共价结合,或者其药学上可接受的盐、立体异构体、溶剂化物或多晶型物。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM和存在的ULM′各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000471
其中:
ULM-h的R1’,R2’和R3’中的每一者与上文相同,并且X是C=O、C=S、-S(O)...基团或S(O)2基团,更优选C=O基团,并且
当PTM不是ULM’时,ULM-h的R1’、R2’和R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为结合与PTM基团进一步共价结合的接头基团,或者当PTM是ULM’时,ULM和ULM’中每一者的R1’、R2’、R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为直接或通过接头基团彼此共价结合,或者
其药学上可接受的盐、对映体、非对映体、溶剂化物或多晶型物。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM和存在的ULM′各自独立地根据化学结构:
Figure BDA0003676261880000472
其中:
当PTM不是ULM’时,ULM-I的R1’、R2’和R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为结合与PTM基团进一步共价结合的接头基团,或者当PTM是ULM’时,ULM和ULM’中每一者的R1’、R2’、R3’中的任何一个或多个被任选地修饰为直接或通过接头基团彼此共价结合,或者
其药学上可接受的盐、对映体、非对映体、溶剂化物或多晶型物。
在本公开进一步优选的方面,ULM-g至ULM-i的R1’优选为羟基或者可代谢为羟基或羧基的基团,使得该化合物表示活性化合物的前药形式。示例性优选的R1’基团包括例如-(CH2)nOH、(CH2)n-O-(C1-C6)烷基、-(CH2)nCOOH、-(CH2O)nH、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-(C1-C6烷基)或任选被取代的-(CH2)nC(O)-O-(C1-C6烷基),其中n是0或1。当R1’是或含有羧酸基团时,可以进一步化学修饰羟基或胺基、羟基、羧酸基或胺(其各自可以是任选被取代的),以提供与PTM基团(包括ULM)和之键合的接头基团的共价连接;
当存在时,ULM-g和ULM-h的X和X’优选地是C=O、C=S、-S(O)基团或S(O)2基团,更优选地是C=O基团;
ULM-g至ULM-i的R2’优选为任选被取代的-NH-T-芳基、任选被取代的-N(CH3)-T-芳基、任选被取代的-NH-T-杂芳基、任选被取代的-N(CH3)-T-杂芳基、任选被取代的-NH-T-杂环基或任选被取代的-N(CH3)-T-杂环基,优选H和T是任选被取代的-(CH2)n-基团,其中所述亚甲基中的每一个可以任选被一个或两个取代基取代,所述取代基优选选自卤素、如本文其他地方所述的氨基酸侧链或C1-C3烷基,优选一个或两个甲基,其可以是任选被取代的;并且n是0至6,通常是0、1、2或3,优选是0或1。可替代地,T也可以是-(CH2O)n-基团、-(OCH2)n-基团、-(CH2CH2O)n-基团、-(OCH2CH2)n-基团,所有这些基团都是任选被取代的。
ULM-g至ULM-i的R2’的优选芳基包括任选被取代的苯基或萘基,优选为苯基,其中所述苯基或萘基通过接头基团连接至PTM(包括ULM’基团),并且/或者任选地被卤素(优选F或Cl)、胺、单烷基胺或二烷基胺(优选二甲基胺)、F、Cl、OH、COOH、C1-C6烷基,优选CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2或CN基团(其中每一者可以在苯环的邻位、间位和/或对位中被取代,优选对位)、任选被取代的苯基(苯基本身任选地通过接头基团连接至PTM基团,包括ULM’)取代,并且/或者任选地被F、Cl、OH、COOH、CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2或CN基团中的至少一者(在苯环的邻位、间位和/或对位中,优选对位)、任选被取代的萘基、任选被取代的杂芳基、优选任选被取代的异噁唑(包括被甲基取代的异噁唑)、任选被取代的噁唑(包括被甲基取代的噁唑)、任选被取代的噻唑(包括被甲基取代的噻唑)、任选被取代的异噻唑(包括被甲基取代的异噻唑)、任选被取代的吡咯(包括被甲基取代的吡咯)、任选被取代的咪唑(包括甲基咪唑)、任选被取代的苯并咪唑或甲氧基苯并咪唑、任选被取代的氧杂咪唑或甲基氧杂咪唑、任选被取代的二唑基团(包括甲基二唑基团)、任选被取代的三唑基团(包括被甲基取代的三唑基团)、任选被取代的吡啶基团(包括被卤代(优选F)或甲基取代的吡啶基团或氧杂吡啶基团,其中吡啶基团通过氧连接到苯基)、任选被取代的呋喃、任选被取代的苯并呋喃、任选被取代的二氢苯并呋喃、任选被取代的吲哚、吲哚嗪或氮杂吲哚嗪(2-氮杂吲哚嗪、3-氮杂吲哚嗪或4-氮杂吲哚嗪)、任选被取代的喹啉、根据以下化学结构的任选被取代的基团取代:
Figure BDA0003676261880000501
其中:
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O;
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤代(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代);
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基),所述基团各自任选被一个或两个羟基或者至多三个卤素取代,优选氟基团,或任选被取代的苯基、任选被取代的杂芳基、或任选被取代的杂环基,优选例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃);
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基),选自以下的杂芳基或杂环基:噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代基团,优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪;
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基;并且
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1),或任选被取代的杂环基,优选四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪或吗啉(当被取代时,所述基团各自优选被甲基或卤代(F、Br、Cl)取代,所述基团各自可以任选地经由接头基团与PTM基团(包括ULM′基团)附接。
在某些优选的方面,ULM-g至ULM-i的
Figure BDA0003676261880000511
Figure BDA0003676261880000512
基团,
其中ULM-g至ULM-i的RPRO和n与上文相同。
关于ULM-g至ULM-i的R2’的优选杂芳基包括任选被取代的喹啉(其可以附接至药效团或在喹啉环内的任何碳原子上被取代),任选被取代的吲哚,任选被取代的吲嗪,任选被取代的氮杂吲嗪,任选被取代的苯并呋喃,包括任选被取代的苯并呋喃,任选被取代的异噁唑,任选被取代的噻唑,任选被取代的异噻唑,任选被取代的噻吩,任选被取代的吡啶(2-、3或4-吡啶),任选被取代的咪唑,任选被取代的吡咯,任选被取代的二唑,任选被取代的三唑、四唑,任选被取代的氧杂咪唑,或根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000521
其中:
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O;
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中ULM-g至ULM-i的Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤代(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代);
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基),所述基团各自任选被一个或两个羟基或至多三个卤素取代,优选氟基团,或任选被取代的杂环基,例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪,其各自是任选被取代的,并且
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC,其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基),所述基团各自可以任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
对于ULM-g至ULM-i的R2’,优选的杂环基包括四氢呋喃、四氢噻吩、四氢喹啉、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吗啉、噁烷或噻烷,所述基团各自可以是任选被取代的,或者根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000531
优选地,
Figure BDA0003676261880000532
基团,
其中:
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或者任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基;
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基,并且
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(通常是0或1),所述基团中的每一个可任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
ULM-g至ULM-i的优选R2’取代基还具体地包括(并且不限于所公开的具体化合物)R2’取代基,其在本文公开的鉴定的化合物(其包括在本说明书以及与其所附的附图中公开的具体化合物)中发现。这些R2′取代基中的每一个可以与也在本文中公开的任何数目的R3′取代基结合使用。
ULM-g至ULM-i的ULM-g的R3’优选为任选被取代的-NH-T-芳基、任选被取代的-N(C1-C3烷基)-T-芳基、任选被取代的-NH-T-杂芳基、任选被取代的-N(C1-C3烷基)-T-杂芳基、任选被取代的-NH-T-杂环基或任选被取代的-N(C1-C3烷基)-T-杂环基,其中T是任选被取代的-(CH2)n-基团,其中所述亚甲基中的每一个可以任选被一个或两个取代基取代,所述取代基优选选自卤素、C1-C3烷基或如本文其他地方所述的氨基酸侧链,优选甲基,其可以是任选被取代的;并且n使0至6,通常是0、1、2或3,优选是0或1。可替代地,T也可以是-(CH2O)n-基团、-(OCH2)n-基团、-(CH2CH2O)n-基团、-(OCH2CH2)n-基团,这些基团各自是任选被取代的。
ULM-g至ULM-i的R3’的优选芳基包括任选被取代的苯基或萘基,优选苯基,其中所述苯基或萘基任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团),并且/或者任选被卤素(优选F或Cl)、胺、单烷基胺或二烷基胺(优选二甲基胺)、酰胺基(优选-(CH2)m-NR1C(O)R2基团,其中m、R1和R2与上述相同)、卤代(通常F或Cl)、OH、CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2、CN或S(O)2RS基团(RS是C1-C6烷基、任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基或-(CH2)m(R″)2基团,其各自可以在苯环的邻位、间位和/或对位中被取代,优选对位)、或芳基(优选苯基)、杂芳基或杂环基取代。优选地,所述取代基苯基是任选被取代的苯基(即,取代基苯基本身优选被F、Cl、OH、SH、COOH、CH3、CF3、OMe、OCF3、NO2、CN或PTM基团(包括ULM′基团)与之附接的接头基团中的至少一者取代,其中所述取代在苯环的邻位、间位和/或对位中发生,优选对位),可以任选被取代的包括如上所述的萘基;任选被取代的杂芳基(优选任选被取代的异噁唑,包括甲基取代的异噁唑;任选被取代的噁唑,包括被甲基取代的噁唑;任选被取代的噻唑,包括被甲基取代的噻唑;任选被取代的吡咯,包括被甲基取代的吡咯;任选被取代的咪唑,包括甲基咪唑、苯并咪唑或甲氧基苯并咪唑、氧杂咪唑或甲基氧杂咪唑;任选被取代的二唑基团,包括甲基二唑基团;任选被取代的三唑基团,包括被甲基取代的三唑基团;吡啶基团,包括被卤代(优选F)或甲基取代的吡啶基团或氧杂吡啶基团(其中吡啶基团通过氧与苯基附接)或任选被取代的杂环基(四氢呋喃、四氢噻吩、吡咯烷、哌啶、吗啉、哌嗪、四氢喹啉、噁烷或噻烷。芳基、杂芳基或杂环基各自可任选地经由接头基团附接到PTM基团(包括ULM′基团)。
ULM-g至ULM-i的R3’的优选杂芳基包括任选被取代的喹啉(其可以附接至药效团或在喹啉环内的任何碳原子上被取代),任选被取代的吲哚(包括二氢吲哚),任选被取代的吲哚嗪,任选被取代的氮杂吲哚嗪(2、3或4-氮杂吲哚嗪),任选被取代的苯并咪唑、苯并二唑、苯并呋喃,任选被取代的咪唑,任选被取代的异噁唑,任选被取代的噁唑(优选被甲基取代),任选被取代的二唑,任选被取代的三唑、四唑,任选被取代的苯并呋喃,任选被取代的噻吩,任选被取代的噻唑(优选被甲基和/或硫醇取代的),任选被取代的异噻唑,任选被取代的三唑(优选被甲基、三异丙基甲硅烷基、任选被取代的-(CH2)m-O-C1-C6烷基或任选被取代的-(CH2)m-C(O)-O-C1-C6烷基取代的1,2,3-三唑),任选被取代的吡啶(2-吡啶、3-吡啶或4-吡啶)或根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000561
其中:
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRUPE或O;
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤代(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代);
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基),所述基团各自任选被一个或两个羟基或至多三个卤素取代,优选氟基团,或任选被取代的杂环基,例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪,其各自是任选被取代的,并且
ULM-g至ULM-i的yC是N或C-RYC,其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基),所述杂芳基各自可以任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
ULM-g至ULM-i的R3’的优选杂环基包括四氢喹啉、哌啶、哌嗪、吡咯烷、吗啉、四氢呋喃、四氢噻吩、噁烷和噻烷,所述基团中的每一个可以是任选被取代的,或者根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000571
优选地,
Figure BDA0003676261880000572
基团,
其中:
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基),选自以下的杂芳基或杂环基:噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代基团,优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪;
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基,并且
ULM-g至ULM-i中的每个n是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1),其中所述杂环基团各自可以任选地经由接头基团与PTM基团(包括ULM’基团)连接。
ULM-g至ULM-i的优选R3’取代基还具体地包括(并且不限于所公开的具体化合物)R3’取代基,其在本文公开的鉴定的化合物(其包括在本说明书以及与其所附的附图中公开的具体化合物)中发现。这些R3’取代基中的每一个可以与也在本文中公开的任何数目的R2’取代基结合使用。
在某些替代的优选实施方案中,ULM-g至ULM-i的R2’是任选被取代的-NR1-XR2’-烷基、-NR1-XR2’-芳基、任选被取代的-NR1-XR2’-HET、任选被取代的-NR1-XR2’-芳基-HET或任选被取代的-NR1-XR2’-HET-芳基,
其中:
ULM-g至ULM-i的R1是H或C1-C3烷基(优选H);
ULM-g至ULM-i的XR2’是任选被取代的-CH2)n-、-CH2)n-CH(Xv)=CH(Xv)-(顺式或反式)、-(CH2)n-CH≡CH-、-(CH2CH2O)n-或C3-C6环烷基;并且
ULM-g至ULM-i的Xv是H、卤代或者任选被一个或两个羟基或至多三个卤素基团取代的C1-C3烷基;
ULM-g至ULM-i的烷基是任选被取代的C1-C10烷基(优选C1-C6烷基)基团(在某些优选的实施方案中,烷基用卤代基团(通常是Cl或Br)封端);
ULM-g至ULM-i的芳基是任选被取代的苯基或萘基(优选苯基);并且
ULM-g至ULM-i的HET为任选被取代的噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪、喹啉(当被取代时,各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代,优选F或Cl取代)或根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000591
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O;
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤代(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代);
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C1-C6烷基),所述基团各自任选被一个或两个羟基或至多三个卤素取代,优选氟基团,或任选被取代的杂环基,例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪,其各自是任选被取代的;
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC,其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基),选自以下的杂芳基或杂环基:噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代基团,优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪;
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基,并且
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1)。
所述基团中的每一个可以任选地经由接头基团与PTM基团(包括ULM’基团)连接。
在本公开的某些替代的优选实施方案中,ULM-g至ULM-i的R3’是任选被取代的-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-RS3’基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-RS3’基团、任选被取代的-XR3’-烷基、任选被取代的-XR3’-芳基、任选被取代的-XR3’-HET基团、任选被取代的-XR3’-芳基-HET基团或任选被取代的-XR3’-HET-芳基,
其中:
RS3’是任选被取代的烷基(C1-C10,优选C1-C6烷基)、任选被取代的芳基或HET基团;
R1’是H或C1-C3烷基(优选H);
V是O、S或NR1’
XR3’是-(CH2)n-、-(CH2CH2O)n-、-CH2)n-CH(Xv)=CH(Xv)-(顺式或反式)、-CH2)n-CH≡CH-或C3-C6环烷基,全都是任选被取代的;
Xv是H、卤代或者任选被一个或两个羟基或至多三个卤素基团取代的C1-C3烷基;
烷基是任选被取代的C1-C10烷基(优选C1-C6烷基)基团(在某些优选的实施方案中,烷基用卤代基团(通常是Cl或Br)封端);
芳基是任选被取代的苯基或萘基(优选苯基);并且
HET为任选被取代的噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪、喹啉(当被取代时,各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代,优选F或Cl取代)或根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000621
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O;
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤代(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代);
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C0-C6烷基),所述基团各自任选被一个或两个羟基或至多三个卤素取代,优选氟基团,或任选被取代的杂环基,例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪,其各自是任选被取代的;
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC,其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基),选自以下的杂芳基或杂环基:噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代基团,优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪;
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基;
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1);
ULM-g至ULM-i的每个m’是0或1;并且
ULM-g至ULM-i的每个n’是0或1;
其中所述化合物各自,优选在烷基、芳基或Het基团上,任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
在替代的实施方案中,ULM-g至ULM-i的R3’是-(CH2)n-芳基、-(CH2CH2O)n-芳基、-(CH2)n-HET或-(CH2CH2O)n-HET,
其中:
ULM-g至ULM-i的所述芳基是任选被一个或两个取代基取代的苯基,其中所述取代基优选选自(CH2)nOH、其本身进一步任选被CN取代的C1-C6烷基、卤代(至多三个卤代基团)、OH、-(CH2)nO(C1-C6)烷基、胺、单-或二-(C1-C6烷基)胺,其中所述胺上的烷基任选被1或2个羟基或至多三个卤代(优选F、Cl)基团取代,或者
ULM-g至ULM-i的所述芳基被-(CH2)nOH、-(CH2)n-O-(C1-C6)烷基、-(CH2)n-O-(CH2)n-(C1-C6)烷基、-(CH2)n-C(O)(C0-C6)烷基、-(CH2)n-C(O)O(C0-C6)烷基、-(CH2)n-OC(O)(C0-C6)烷基、胺、单-或二-(C1-C6烷基)胺取代,其中所述胺上的烷基任选被1或2个羟基或至多三个卤代(优选F、Cl)基团、CN、NO2、任选被取代的-(CH2)n-(V)m’-CH2)n-(V)m’-(C1-C6)烷基、-(V)m’-(CH2CH2O)n-RPEG基团取代,其中V是O、S或NR1’,R1’是H或C1-C3烷基(优选H),并且RPEG是H或任选被取代(包括任选被羧基取代)的C1-C6烷基,或者
ULM-g至ULM-i的所述芳基基团任选被杂环基取代,所述杂环基包括杂芳基,选自噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪(当取代时,各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代基团,优选F或Cl取代)、或根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000651
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O;
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤代(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代);
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C0-C6烷基),所述基团各自任选被一个或两个羟基或至多三个卤素取代,优选氟基团,或任选被取代的杂环基,例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪,其各自是任选被取代的;
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC,其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或任选被取代的芳基(苯基或萘基),选自以下的杂芳基或杂环基:噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代基团,优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪;
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基;
ULM-g至ULM-i的HET优选为噁唑、异噁唑、噻唑、异噻唑、咪唑、二唑、氧杂咪唑、吡咯、吡咯烷、呋喃、二氢呋喃、四氢呋喃、噻吩、二氢噻吩、四氢噻吩、吡啶、哌啶、哌嗪、吗啉、喹啉(各自优选被C1-C3烷基,优选甲基或卤代基团,优选F或Cl取代)、苯并呋喃、吲哚、吲嗪、氮杂吲嗪、或根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000671
ULM-g至ULM-i的Sc是CHRSS、NRURE或O;
ULM-g至ULM-i的RHET是H、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RSS是H、CN、NO2、卤代(优选F或Cl)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)、或任选被取代的-C(O)(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代);
ULM-g至ULM-i的RURE是H、C1-C6烷基(优选H或C1-C3烷基)或-C(O)(C0-C6烷基),所述基团各自任选被一个或两个羟基或至多三个卤素取代,优选氟基团,或任选被取代的杂环基,例如哌啶、吗啉、吡咯烷、四氢呋喃、四氢噻吩、哌啶、哌嗪,其各自是任选被取代的;
ULM-g至ULM-i的YC是N或C-RYC,其中RYC是H、OH、CN、NO2、卤代(优选Cl或F)、任选被取代的C1-C6烷基(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团(例如CF3)取代)、任选被取代的O(C1-C6烷基)(优选被一个或两个羟基或至多三个卤代基团取代)或任选被取代的炔基-C≡C-Ra,其中Ra是H或C1-C6烷基(优选C1-C3烷基);
ULM-g至ULM-i的RPRO是H、任选被取代的C1-C6烷基或者任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基;
ULM-g至ULM-i的RPRO1和RPRO2各自独立地是H、任选被取代的C1-C3烷基或一起形成酮基;
ULM-g至ULM-i的每个m’独立地是0或1;并且
ULM-g至ULM-i的每个n独立地是0、1、2、3、4、5或6(优选0或1),其中所述化合物各自优选在所述烷基或HET基团上任选地经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
在另外的实施方案中,优选的化合物包括根据以下化学结构的化合物:
Figure BDA0003676261880000681
其中:
ULM-i的R1’是OH或在患者中代谢或经受OH的基团;
ULM-i的R2′是-NH-CH2-芳基-HET(优选地,与甲基取代的噻唑直接连接的苯基);
ULM-i的R3’是-CHRCR3’-NH-C(O)-R3P1基团或-CHRCR3’-R3P2基团;
ULM-i的RCR3’是C1-C4烷基,优选甲基、异丙基或叔丁基;
ULM-i的R3P1是C1-C3烷基(优选甲基)、任选被取代的氧杂环丁烷基团(优选甲基取代的,-(CH2)nOCH3基团,其中n是1或2(优选2)、或
Figure BDA0003676261880000691
基团(乙基醚基团优选在苯基部分上被取代)、吗啉代基团(在2-或3-位处与羰基连接;
ULM-i的R3P2
Figure BDA0003676261880000692
基团;
ULM-i的芳基是苯基;
ULM-i的HET是任选被取代的噻唑或异噻唑;并且
ULM-i的RHET是H或卤代基团(优选H);
或其药学上可接受的盐、立体异构体、溶剂化物或多晶型物,其中所述化合物中的每一种任选经由接头基团连接至PTM基团(包括ULM’基团)。
在某些方面,双官能化合物包含泛素E3连接酶结合部分(ULM),其中ULM是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000693
Figure BDA0003676261880000701
其中:
ULM-j的每个R5和R6独立地是OH、SH或任选被取代的烷基,或者R5、R6和它们所附接的碳原子形成羰基;
ULM-j的R7是H或任选被取代的烷基;
ULM-j的E是键、C=O或C=S;
ULM-j的G是键、任选被取代的烷基、-COOH或C=J;
ULM-j的J是O或N-R8
ULM-j的R8是H、CN、任选被取代的烷基或任选被取代的烷氧基;
ULM-j的M是任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的杂环基或
Figure BDA0003676261880000702
ULM-j的每个R9和R10独立地是H;任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的硫代烷基、二硫化物附接的ULM、任选被取代的杂芳基或卤代烷基;或者R9、R10和它们所附接的碳原子形成任选被取代的环烷基;
ULM-j的R11是任选被取代的杂环基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基或
Figure BDA0003676261880000703
ULM-j的R12是H或任选被取代的烷基;
ULM-j的R13是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基;任选被取代的(氧代烷基)氨基甲酸酯,
ULM-j的每个R14独立地是H、卤代烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的烷基、氮杂环丁烷、任选被取代的烷氧基或任选被取代的杂环基;
ULM-j的R15是H、CN、任选被取代的杂芳基、卤代烷基、任选被取代的芳基、任选被取代的烷氧基或任选被取代的杂环基;
ULM-j的每个R16独立地是卤代、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的CN或任选被取代的卤代烷氧基;
ULM-j的每个R25独立地是H或任选被取代的烷基;或两个R25基团可以一起形成氧代或任选被取代的环烷基;
ULM-j的R23是H或OH;
ULM-j的Z1、Z2、Z3和Z4独立地是C或N;并且
ULM-j的o是0、1、2、3或4,或者其药学上可接受的盐、立体异构体、溶剂化物或多晶型物。
在某些实施方案中,其中ULM-j的G是C=J,J是O,R7是H,每个R14是H,并且o是0。
在某些实施方案中,其中ULM-j的G是C=J,J是O,R7是H,每个R14是H,R15是任选被取代的杂芳基,并且o是0。在其他情况下,E是C=O且M是
Figure BDA0003676261880000711
在某些实施方案中,其中ULM-j的E是C=O,R11是任选被取代的杂环或
Figure BDA0003676261880000712
并且M是
Figure BDA0003676261880000713
在某些实施方案中,其中ULM-j的E是C=O,M是
Figure BDA0003676261880000721
并且R11
Figure BDA0003676261880000722
每个R18独立地是H、卤代、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基或卤代烷氧基;并且p是0、1、2、3或4。
在某些实施方案中,每个R14独立地被H、羟基、卤代、胺、酰胺、烷氧基、烷基、卤代烷基或杂环基中的至少一者取代。
在某些实施方案中,ULM-j的R15是根据
Figure BDA0003676261880000723
Figure BDA0003676261880000724
Figure BDA0003676261880000725
CN或卤代烷基的基团,并且每个R18独立地是H、卤代、任选被取代的烷氧基、氰基、氨基烷基、酰胺基烷基、任选被取代的烷基、卤代烷基或卤代烷氧基;并且p是0、1、2、3或4。
在某些实施方案中,ULM和存在的ULM′各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000731
其中:
ULM-k的G是C=J,J是O;
ULM-k的R7是H;
ULM-k的每个R14独立地是H、酰胺、烷基,例如甲基,其任选被一个或多个C1-C6烷基或C(O)NR’R″取代;
R’和R”各自独立地是H、任选被取代的烷基或环烷基;
ULM-k的o是0;
ULM-k的R15如以上针对ULM-j所定义;
ULM-k的R16如以上针对ULM-j所定义;并且
ULM-k的R17是H、卤代、任选被取代的环烷基、任选被取代的烷基、任选被取代的烯基和卤代烷基。
在其他情况下,ULM-k的R17是烷基(例如甲基)或环烷基(例如环丙基)。
在其他实施方案中,ULM和存在的ULM′各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000732
其中:
ULM-k的G是C=J,J是O;
ULM-k的R7是H;
ULM-k的每个R14是H;
ULM-k的o是0;并且
ULM-k的R15选自任选被取代的:
Figure BDA0003676261880000741
Figure BDA0003676261880000751
其中ULM-k的R30是H或任选被取代的烷基。
在其他实施方案中,ULM和存在的ULM′各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000752
其中:
ULM-k的E是C=O;
ULM-k的M是
Figure BDA0003676261880000753
并且
ULM-k的R11选自任选被取代的:
Figure BDA0003676261880000754
Figure BDA0003676261880000761
在另外其他实施方案中,具有以下化学结构的化合物,
Figure BDA0003676261880000762
其中:
ULM-k的E是C=O;
ULM-k的R11
Figure BDA0003676261880000763
并且
ULM-k的M是
Figure BDA0003676261880000764
ULM-k的q是1或2;
ULM-k的R20是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的芳基或
Figure BDA0003676261880000771
ULM-k的R21是H或任选被取代的烷基;并且
ULM-k的R22是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基或卤代烷基。
在本文所述的任何实施方案中,ULM-j或ULM-k的R11选自:
Figure BDA0003676261880000772
Figure BDA0003676261880000781
Figure BDA0003676261880000791
在某些实施方案中,ULM-j或ULM-k的R11选自:
Figure BDA0003676261880000792
Figure BDA0003676261880000801
在某些实施方案中,ULM(或存在的ULM′)是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000811
其中:
ULM-1的X是O或S;
ULM-1的Y是H、甲基或乙基;
ULM-1的R17是H、甲基、乙基、羟甲基或环丙基;
ULM-1的M是任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基或
Figure BDA0003676261880000812
ULM-1的R9是H;
ULM-1的R10是H、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的硫代烷基或环烷基;
ULM-1的R11是任选被取代的杂芳族、任选被取代的杂环基、任选被取代的芳基或
Figure BDA0003676261880000813
ULM-1的R12是H或任选被取代的烷基;并且
ULM-1的R13是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基;任选被取代的(氧代烷基)氨基甲酸酯。
在一些实施方案中,ULM和存在的ULM′各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000821
其中:
ULM-m的Y是H、甲基或乙基;
ULM-m的R9是H;
R10是异丙基、叔丁基、仲丁基、环戊基或环己基;
ULM-m的R11是任选被取代的酰胺、任选被取代的异吲哚啉酮、任选被取代的异噁唑、任选被取代的杂环。
在本公开的其他优选实施方案中,ULM和存在的ULM’各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000831
其中:
ULM-n的R17是甲基、乙基或环丙基;并且
ULM-n的R9、R10和R11如上文所定义。在其他情况下,R9是H;并且
ULM-n的R10是H、烷基或环烷基(优选异丙基、叔丁基、仲丁基、环戊基或环己基)。
在本公开的其他优选实施方案中,ULM和存在的ULM’各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000832
或其药学上可接受的盐,其中:
R1是H、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基;
R3是任选被取代的5-6元杂芳基;
W5是任选被取代的苯基、任选被取代的萘基或任选被取代的吡啶基;
R14a和R14b中的一者是H、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基(例如,氟代烷基)、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至6元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
R15是CN、任选被取代的氟代烷基、
Figure BDA0003676261880000841
Figure BDA0003676261880000842
Figure BDA0003676261880000843
任选被取代的
Figure BDA0003676261880000844
(例如
Figure BDA0003676261880000845
Figure BDA0003676261880000846
其中R28a是卤代、任选被取代的烷基或氟代烷基)或
Figure BDA0003676261880000847
每个R16独立地选自卤代、CN、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、羟基或卤代烷氧基;
每个R26独立地是H、任选被取代的烷基或NR27aR27b
每个R27a和R27b独立地是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基(例如,任选被取代的3至5元环烷基),或者R27a和R27b与它们所附接的氮原子一起形成4至6元杂环基;
每个R28独立地是H、卤素、CN、任选被取代的氨基烷基、任选被取代的酰胺基烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的羟烷基、胺、任选被取代的炔基或任选被取代的环烷基;
o是0、1或2;并且
p是0、1、2、3或4。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM具有式:
Figure BDA0003676261880000851
其中:
X4、X5和X6各自选自CH和N,其中不超过2者是N;
R1是C1-6烷基;
R3与针对ULM-o和ULM-p所定义的相同
R14a和R14b中的一者是H、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的酰胺、任选被取代的烷基-酰胺、任选被取代的烷基-氰基、任选被取代的烷基-磷酸根、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a和R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
每个R27a和R27b独立地是H C1-6烷基或环烷基(例如,任选被取代的3至5元环烷基);
o是0、1或2;
q是1、2、3或4;
R15是任选被取代的
Figure BDA0003676261880000861
或CN;
R28是H、甲基、CH2N(Me)2、CH2OH、CH2O(C1-4烷基)、CH2NHC(O)C1-4烷基、NH2
Figure BDA0003676261880000862
R28C是H、甲基、氟或氯;并且
R16是H、C1-4烷基、氟、氯、CN或C1-4烷氧基。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b选自:H、C1-4烷基、C1-4环烷基、C1-4卤代烷基、C1-4羟烷基、C1-4烷氧基烷基、C1-4烷基-NR27aR27b和CONR27aR27b
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的至少一个是H(例如,R14a和R14b都是H)。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的至少一个是任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26。可替代地,在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的至少一个是任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一个是H。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b与它们所附接的碳原子一起形成
Figure BDA0003676261880000871
其中R23选自H、C1-4烷基、-C(O)C1-4烷基。
在本公开的其他优选实施方案中,ULM和存在的ULM’各自独立地是根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880000872
或其药学上可接受的盐,其中:
X是CH或N;并且
ULM-q和ULM-r的R1、R3、R14a、R14b和R15与针对ULM-o和ULM-p所定义的相同。
在本文所述的任何方面或实施方案中,如本文所述的ULM(或存在的ULM’)可以是其药学上可接受的盐、对映体、非对映体、溶剂化物或多晶型物。另外,在本文所述的任何方面或实施方案中,如本文所述的ULM(或存在的ULM’)可经由键或化学接头直接偶联至PTM。
在本公开的某些方面,ULM部分选自:
Figure BDA0003676261880000901
Figure BDA0003676261880000911
Figure BDA0003676261880000921
Figure BDA0003676261880000931
Figure BDA0003676261880000941
Figure BDA0003676261880000951
Figure BDA0003676261880000961
Figure BDA0003676261880000971
Figure BDA0003676261880000981
Figure BDA0003676261880000991
Figure BDA0003676261880001001
Figure BDA0003676261880001011
Figure BDA0003676261880001021
Figure BDA0003676261880001031
Figure BDA0003676261880001041
Figure BDA0003676261880001051
Figure BDA0003676261880001061
Figure BDA0003676261880001071
Figure BDA0003676261880001081
Figure BDA0003676261880001091
Figure BDA0003676261880001101
Figure BDA0003676261880001111
Figure BDA0003676261880001121
Figure BDA0003676261880001131
其中VLM可以经由如本文所述的接头在任何适当的位置处连接至PTM,包括例如吲哚基团的芳基、杂芳基、苯基或苯基,任选地经由任何适当的官能团,例如胺、酯、醚、烷基或烷氧基。
示例性接头
在某些实施方案中,如本文所述的化合物包括用于将PTM化学偶联至ULM的部分,例如经由化学接头(L)化学连接或偶联至一个或多个ULM(例如VLM中的至少一个)的一个或多个PTM。在某些实施方案中,接头基团L是包含一个或多个共价连接的结构单元(例如,-AL 1...(AL)q-或-(AL)q-)的基团,其中AL 1是偶联至PTM的基团,并且(AL)q是偶联至ULM的基团。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM(例如,VLM、ILM、CLM或MLM)的接头(L)连接或偶联是稳定的L-ULM连接。例如,在本文所述的任何方面或实施方案中,当接头(L)和ULM经由杂原子连接时,任何随后的杂原子(如果存在)被至少一个单碳原子(例如,-CH2-)隔开,诸如与缩醛或氨基隔开。又如,在本文所述的任何方面或实施方案中,当接头(L)和ULM经由杂原子连接时,杂原子不是酯的一部分。
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头基团L是由式-(AL)q-表示的键或化学接头基团,其中A是化学部分,并且q是1-100的整数,并且其中L与PTM和ULM共价结合,并提供PTM与蛋白靶标以及ULM与E3泛素连接酶的充分结合,从而导致靶蛋白的泛素化。
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头基团L是-(AL)q-,其中:
(AL)q是连接至ULM(诸如VLM)、PTM部分或它们的组合中的至少一个的基团;
接头的q是大于或等于1的整数;
每个AL独立地选自键、CRL1RL2、O、S、SO、SO2、NRL3、SO2NRL3、SONRL3、CONRL3、NRL3CONRL4、NRL3SO2NRL4、CO、CRL1L1=CRL2、C≡C、SiRL1RL2、P(O)RL1、P(O)ORL1、NRL3C(=NCN)NRL4、NRL3C(=NCN)、NRL3C(=CNO2)NRL4、任选被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11环烷基、C5-13螺环烷基任选被0-9个RL1和/或RL2基团取代的、任选被0-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11杂环基、任选被0-8个RL1和/或RL2基团取代的C5-13螺杂环基、任选被0-6个RL1和/或RL2基团取代的芳基、任选被0-6个RL1和/或RL2基团取代的杂芳基,其中RL1或RL2各自独立地任选连接至其他基团而形成任选被0-4个RL5基团取代的环烷基和/或杂环基部分;并且
RL1、RL2、RL3、RL4和RL5各自独立地是H、卤代、C1-8烷基、OC1-8烷基、SC1-8烷基、NHC1-8烷基、N(C1-8烷基)2、C3-11环烷基、芳基、杂芳基、C3-11杂环基、OC1-8环烷基、SC1-8环烷基、NHC1-8环烷基、N(C1-8环烷基)2、N(C1-8环烷基)(C1-8烷基)、OH、NH2、SH、SO2C1-8烷基、P(O)(OC1-8烷基)(C1-8烷基)、P(O)(OC1-8烷基)2、CC-C1-8烷基、CCH、CH=CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)=CH(C1-8烷基)C(C1-8烷基)=C(C1-8烷基)2、Si(OH)3、Si(C1-8烷基)3、Si(OH)(C1-8烷基)2、COC1-8烷基、CO2H、卤素、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1-8烷基、SO2N(C1-8烷基)2、SONHC1-8烷基、SON(C1-8烷基)2、CONHC1-8烷基、CON(C1-8烷基)2、N(C1-8烷基)CONH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)CON(C1-8烷基)2、NHCONH(C1-8烷基)、NHCON(C1-8烷基)2、NHCONH2、N(C1-8烷基)SO2NH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)SO2N(C1-8烷基)2、NH SO2NH(C1-8烷基)、NH SO2N(C1-8烷基)2、NH SO2NH2
在某些实施方案中,接头的q是大于或等在0的整数。在某些实施方案中,q是大于或等于1的整数。
在某些实施方案中,例如,当接头的q大于2时,(AL)q是至AL 1和(AL)q的基团,其中单元AL将PTM偶联至ULM。
在某些实施方案中,例如,当接头的q为2时,(AL)q为连接至AL 1和ULM或PTM的基团。
在某些实施方案中,例如,当接头的q为1时,接头基团L的结构是-AL 1-,并且AL 1是连接至ULM部分和PTM部分的基团。
在某些实施方案中,接头(L)的单元AL包含由选自以下的通式结构表示的基团:
-NR(CH2)n-(低级烷基)-、-NR(CH2)n-(低级烷氧基)-、-NR(CH2)n-(低级烷氧基)-OCH2-、-NR(CH2)n-(低级烷氧基)-(低级烷基)-OCH2-、-NR(CH2)n-(环烷基)-(低级烷基)-OCH2-、-NR(CH2)n-(杂环烷基)-、-NR(CH2CH2O)n-(低级烷基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(杂环烷基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-芳基-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(杂芳基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(环烷基)-O-(杂芳基)-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(环烷基)-O-芳基-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(低级烷基)-NH-芳基-O-CH2-、-NR(CH2CH2O)n-(低级烷基)-O-芳基-CH2、-NR(CH2CH2O)n-环烷基-O-芳基-、-NR(CH2CH2O)n-环烷基-O-(杂芳基)1-、-NR(CH2CH2)n-(环烷基)-O-(杂环基)-CH2、-NR(CH2CH2)n-(杂环基)-(杂环基)-CH2、-N(R1R2)-(杂环基)-CH2;其中
接头的n可以是0至10;
接头的R可以是H、低级烷基;
接头的R1和R2可通过连接的N形成环。
在某些实施方案中,接头(L)的单元AL包含由选自以下的通式结构表示的基团:
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-、
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-、
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-、
-N(R)-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-、
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O-、
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-OCH2-、
Figure BDA0003676261880001161
Figure BDA0003676261880001171
Figure BDA0003676261880001181
Figure BDA0003676261880001182
其中
所述接头的m、n、o、p、q和r独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20;
当数目为零时,不存在N-O或O-O键
所述接头的R是H、甲基和乙基;
所述接头的X是H和F
Figure BDA0003676261880001183
其中所述接头的m可以是2、3、4、5
Figure BDA0003676261880001191
Figure BDA0003676261880001201
Figure BDA0003676261880001211
Figure BDA0003676261880001221
Figure BDA0003676261880001231
Figure BDA0003676261880001241
Figure BDA0003676261880001251
Figure BDA0003676261880001261
Figure BDA0003676261880001271
其中所述接头的每个n和m可以独立地是0、1、2、3、4、5、6。
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头(L)的单元AL选自:
Figure BDA0003676261880001281
Figure BDA0003676261880001291
Figure BDA0003676261880001301
Figure BDA0003676261880001311
其中每个n和m独立地选自0、1、2、3、4、5或6。
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头(L)的单元AL选自:
Figure BDA0003676261880001312
Figure BDA0003676261880001321
Figure BDA0003676261880001331
Figure BDA0003676261880001341
Figure BDA0003676261880001351
Figure BDA0003676261880001361
Figure BDA0003676261880001371
Figure BDA0003676261880001381
Figure BDA0003676261880001391
Figure BDA0003676261880001401
Figure BDA0003676261880001411
Figure BDA0003676261880001421
Figure BDA0003676261880001431
Figure BDA0003676261880001441
Figure BDA0003676261880001451
Figure BDA0003676261880001461
Figure BDA0003676261880001471
Figure BDA0003676261880001481
Figure BDA0003676261880001491
Figure BDA0003676261880001501
Figure BDA0003676261880001511
Figure BDA0003676261880001521
Figure BDA0003676261880001531
Figure BDA0003676261880001541
Figure BDA0003676261880001551
Figure BDA0003676261880001561
Figure BDA0003676261880001571
Figure BDA0003676261880001581
Figure BDA0003676261880001591
Figure BDA0003676261880001601
Figure BDA0003676261880001611
Figure BDA0003676261880001612
其中每个m、n、o、p、q、r和s独立地是0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20。
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头(L)的单元AL选自:
Figure BDA0003676261880001613
Figure BDA0003676261880001621
Figure BDA0003676261880001631
Figure BDA0003676261880001641
Figure BDA0003676261880001651
Figure BDA0003676261880001661
Figure BDA0003676261880001671
Figure BDA0003676261880001681
Figure BDA0003676261880001691
Figure BDA0003676261880001701
Figure BDA0003676261880001711
Figure BDA0003676261880001721
Figure BDA0003676261880001731
Figure BDA0003676261880001741
Figure BDA0003676261880001751
Figure BDA0003676261880001761
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头(L)的接头单元包含由选自以下的结构表示的基团:
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O(CH2)t-、
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O-、
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O(CH2)t-、
-CH=CH(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O(CH2)t-
-O(CH2)nNCH3C(=O)(CH2)m-;
Figure BDA0003676261880001771
Figure BDA0003676261880001781
Figure BDA0003676261880001791
Figure BDA0003676261880001801
Figure BDA0003676261880001811
Figure BDA0003676261880001821
Figure BDA0003676261880001822
其中m、n、o、p、q、r、s和t各自独立地选自整数0、1、2、3和4。
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头(L)选自:
Figure BDA0003676261880001823
Figure BDA0003676261880001831
Figure BDA0003676261880001841
Figure BDA0003676261880001851
Figure BDA0003676261880001861
Figure BDA0003676261880001871
Figure BDA0003676261880001881
Figure BDA0003676261880001891
Figure BDA0003676261880001901
Figure BDA0003676261880001911
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头(L)选自:
Figure BDA0003676261880001921
在另外的实施方案中,接头(L)包含选自但不限于下文所示结构的结构,其中虚线指示与PTM或ULM部分的附接点:
Figure BDA0003676261880001922
其中:
WL1和WL2各自独立地不存在,是具有0-4个杂原子的4-8元环,任选被RQ取代,每个RQ独立地是H、卤代、OH、CN、CF3、任选被取代的直链或支链C1-C6烷基、任选被取代的直链或支链C1-C6烷氧基,或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环体系;
YL1各自独立地是键、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的)并且任选地一个或多个C原子替换为O;或C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的);
n是0-10;并且
Figure BDA0003676261880001931
脂示与所述PTM或ULM部分的附接点。
在另外的实施方案中,接头(L)包含选自但不限于下文所示结构的结构,其中虚线指示与PTM或ULM部分的附接点:
Figure BDA0003676261880001932
其中:
WL1和WL2各自独立地不存在,是芳基、杂芳基、环基、杂环基,C1-6烷基和任选地一个或多个C原子被替换为O或N,C1-6烯基和任选地一个或多个C原子被替换为O,C1-6炔基和任选地一个或多个C原子被替换为O、双环基、联芳基、联杂芳基或联杂环基,各自任选地被RQ取代,每个RQ独立地是H、卤代、OH、CN、CF3、羟基、硝基、C≡CH、C2-6烯基、C2-6炔基、任选被取代的直链或支链C1-C6烷基、任选被取代的直链或支链C1-C6烷氧基、任选被取代的OC1-3烷基(例如,任选被1个或多个-F取代)、OH、NH2、NRY1RY2、CN,或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环体系;
YL1各自独立地是键、NRYL1、O、S、NRYL2、CRYL1RYL2、C=O、C=S、SO、SO2、C1-C6烷基(直链、支链、任选被取代的),并且任选地一个或多个C原子被替换为O;C1-C6烷氧基(直链、支链、任选被取代的);
QL是具有0-4个杂原子的3-6元脂环或芳环,任选桥联,任选被0-6个RQ取代,每个RQ独立地是H、直链或支链C1-6烷基(任选被1个或多个卤代或C1-6烷氧基取代),或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环体系;
RYL1、RYL2各自独立地是H、OH、C1-6烷基(直链、支链,任选被1个或多个卤代、C1-6烷氧基取代),或者R1、R2与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环系);
n是0-10;并且
Figure BDA0003676261880001941
指示与所述PTM或ULM部分的附接点。
在其他实施方案中,接头基团是任选被取代的(聚)乙二醇,其具有1到约100个乙二醇单元,约1到约50个乙二醇单元,1到约25个乙二醇单元,约1到10个乙二醇单元,1到约8个乙二醇单元和1到6个乙二醇单元,2到4个乙二醇单元;或任选被取代的烷基,其内散杂有任选被取代的O、N、S、P或Si原子。在某些实施方案中,接头被芳基、苯基、苯甲基、烷基、亚烷基或杂环基取代。在某些实施方案中,接头可以是不对称或对称的。
在本文所述化合物的任何实施方案中,接头基团可以是如本文所述的任何合适部分。在一个实施方案中,接头是取代或未取代的聚乙二醇基团,其大小范围是约1到约12个乙二醇单元、1到约10个乙二醇单元、约2到约6个乙二醇单元、约2到5个乙二醇单元、约2到4个乙二醇单元。
在另一个实施方案中,本公开涉及一种化合物,其包含结合到靶蛋白或多肽(例如SMARCA2、BRAHMA或BRM)的如上文所述的PTM基团,所述PTM基团通过泛素连接酶发生泛素化并且在直接化学连接到或通过接头部分L连接到ULM基团,或者PTM替代地是ULM’基团,所述ULM’基团也是泛素连接酶结合部分,可以与如上文所述的ULM基团相同或不同并且直接连接到ULM基团或通过接头部分连接到ULM基团;并且L是如上文所述的接头部分,可以存在或不存在并且使ULM化学(共价)连接至PTM;或其药学上可接受的盐、对映体、立体异构体、溶剂化物或多晶型物。
在某些实施方案中,接头基团L是包含一个或多个共价连接的结构单元的基团,所述结构单元独立地选自:
Figure BDA0003676261880001951
X选自O、N、S、S(O)和SO2;n是1到5的整数;RL1是氢或烷基,
Figure BDA0003676261880001952
是任选被1-3个取代基取代的单环或双环芳基或杂芳基,所述取代基选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基或氰基;
Figure BDA0003676261880001953
是任选被1-3个取代基取代的单环或双环环烷基或杂环基,所述取代基选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基或氰基;并且苯环片段可以任选被1、2或3个取代基取代,所述取代基选自烷基、卤素、卤代烷基、羟基、烷氧基和氰基。在一个实施方案中,接头基团L包含多至10个共价连接的结构单元,如上所述。
尽管ULM基团和PTM基团可通过对于接头化学性质来说适当且稳定的任何基团共价连接至接头基团,但在本公开的优选方面,接头独立地共价结合至ULM基团和PTM基团,优选地通过酰胺、酯、硫酯、酮基、氨基甲酸酯(氨甲酸酯)、碳或醚共价结合,所述基团中的每一个可插入到ULM基团和PTM基团上的任何地方,以使得泛素连接酶上的ULM基团与待降解的靶蛋白上的PTM基团达成最大的结合。(需注意,在其中PTM基团是ULM基团的某些方面,用于降解的靶蛋白可以是泛素连接酶本身)。在某些优选方面,接头可连接到ULM和/或PTM基团上的任选被取代的烷基、亚烷基、烯基或炔基、芳基或杂环基。
示例性PTM
在本公开的任何方面或实施方案中,PTM基团是结合靶蛋白的部分,所述靶蛋白诸如是酵母交配型转换/蔗糖不发酵复合物(SWI/SNF)相关的染色质亚家族A成员2的基质相关肌动蛋白依赖调节剂(SMARCA2)或BRM。因此,在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM基团是特异性结合SMARCA2或BRM蛋白(结合靶蛋白SMARCA2、BRAHMA或BRM)的任何部分。
在某些实施方案中,本文所述的化合物包括用于结合靶蛋白例如Brm的部分。这样,在某些方面,本公开提供了一种双官能化合物,其具有用于结合Brm的部分、用于结合VHL的部分以及用于将用于结合Brm的部分化学偶联至用于结合VHL的部分的部分。
下文所述的组合物举例说明了小分子靶蛋白结合部分的一些成员。此类小分子靶蛋白结合部分还包括这些组合物的药学上可接受的盐、对映体、溶剂化物和多晶型物,以及可靶向SMARCA2的其他小分子。这些结合部分优选通过接头连接至泛素连接酶结合部分,以便在泛素连接酶附近呈递靶蛋白(蛋白质靶标部分与之结合)以进行泛素化和降解。根据本公开的靶蛋白是可结合至蛋白质靶标部分或PTM基团并作用于泛素连接酶或被其降解的任何蛋白质(即,SMARCA2、BRAHMA或BRM)。
本公开可以用于治疗众多疾病状态和/或状况,包括其中蛋白质失调(例如SMARCA4缺陷/突变)以及其中患者将受益于蛋白质(诸如SMARCA2、BRAHMA或BRM)的降解和/或抑制的任何疾病状态和/或状况。
在另一方面,本说明书提供了治疗组合物,其包含有效量的如本文所述化合物或其盐形式,以及药学上可接受的载体、添加剂或赋形剂,和任选地另外的生物活性剂。治疗组合物调节患者或受试者(例如动物,例如人)中的蛋白质降解,并且可以用于治疗或改善通过降解的蛋白质调节的疾病状态或状况。在某些实施方案中,本文所述的治疗组合物可用于实现目标蛋白质的降解,以治疗或改善疾病,例如癌症,诸如SWI/SNF相关癌症、SMARCA4突变相关癌症、SMARCA4缺陷性癌症或SMARCA4表达相对于正常SMARCA4表达降低(例如,相对于具有野生型SMARCA4的类似位置的非癌细胞中的非突变SMARCA4或SMARCA4的表达降低)的癌症中的至少一种,所述疾病包括肺癌或非小细胞肺癌。在本文所述的任何方面或实施方案中,所述疾病是SWI/SNF相关癌症、具有SMARCA4突变的癌症、具有SMARCA4缺陷的癌症或它们的组合中的至少一种,其可以是肺癌或非小细胞肺癌。
在某些另外的实施方案中,如本文所述的治疗组合物可用于实现目标蛋白质的降解,以治疗或改善疾病,例如癌症,诸如SWI/SNF相关癌症、SMARCA2相关癌症或SMARCA2正常表达或过度表达的癌症中的至少一种。
在替代的方面,本公开涉及一种通过降解用以调节疾病状态或状况的蛋白质或多肽来治疗有需要的受试者的疾病状态或者改善疾病或病症的症状的方法,该方法包括向所述患者或受试者施用有效量例如治疗有效量的至少一种如上所述的化合物,任选地与药学上可接受的载体、添加剂或赋形剂和任选地另外的生物活性剂组合,其中所述组合物能够有效治疗或改善受试者的疾病或病症或其症状。根据本公开的方法可用于通过施用有效量的至少一种本文所述化合物治疗多种疾病状态或状况,包括癌症。疾病状态或状况可以是由微生物剂或其他外源性剂(例如病毒、细菌、真菌、原生动物或其他微生物)引起的疾病,或者可以是由蛋白质的过表达引起的疾病状态,其导致疾病状态和/或状况。
在另一方面,本说明书提供了使用根据本公开的化合物鉴别生物系统中的目标蛋白质降解的影响的方法。
术语“靶蛋白”用于描述蛋白质或多肽,其是用于结合根据本公开的化合物和通过下文的泛素连接酶降解的靶标。此类小分子靶蛋白结合部分还包括这些组合物的药学上可接受的盐、对映体、溶剂化物和多晶型物,以及可靶向目标蛋白质的其他小分子。这些结合部分通过至少一个接头基团L连接到至少一个ULM基团(例如VLM)。
所述蛋白质靶标可用于鉴定与蛋白质结合的化合物部分的筛查中,并且通过将该部分掺入根据本公开的化合物内,可以改变蛋白质的活性水平以实现治疗最终结果。
术语“蛋白质靶标部分”或PTM用于描述这样的小分子,其与靶蛋白或者其他目标蛋白质或多肽(诸如SMARCA2或BRM)结合,并且将该蛋白质或多肽置于/呈递于泛素连接酶附近,使得可发生通过泛素连接酶的蛋白质或多肽的降解。下文所述的组合物举例说明了小分子靶蛋白的一些成员。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM具有由以下表示的化学结构:
Figure BDA0003676261880001991
其中:
WPTM1是任选被取代的5-6元芳基环或杂芳基环(例如,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、磷酸根、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的5-6元芳基环或杂芳基环);
WPTM2是任选被取代的5-6元芳基环或杂芳基环(例如,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-6元芳基环或杂芳基环);
WPTM3是任选被取代的3-9元芳基或杂芳基环(例如,任选被取代的5-6元芳基或杂芳基环,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的3-9或5-6元芳基或杂芳基),或任选被取代的4-9元环烷基或杂环基,诸如任选被取代的桥联双环烷基和桥联双杂环基环(例如,被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的4-9元环烷基或杂环基);
WPTM5不存在(使得WPTM3直接连接至L(接头)或ULM)或是任选被取代的烷基、任选被取代的5-6元环烷基、杂环、芳基或杂芳基环(例如被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-6元环烷基、杂环、芳基或杂芳基);并且
Figure BDA0003676261880002001
是至接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团VLM’基团的附接点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,WPTM5是哌啶。
在某些实施方案中,WPTM1包含磷酸根取代。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PROTAC的PTM由式I表示,其中满足以下中的至少一种情况:
WPTM1是任选被取代的苯基或吡啶基(例如,如本文所述被取代,诸如被羟基或磷酸根取代基取代的苯基,其具有或不具有如本文所述选择的另外的任选取代基,例如被0、1、2、或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代);
WPTM2是任选被取代的6元杂芳基环(例如,如本文所述被取代,诸如被氨基取代的哒嗪);
WPTM3是任选被取代的5-6元杂芳基(例如,吡唑、吡咯、咪唑、噁唑、噁二唑或三唑);
WPTM5如本文所述的任何方面或实施方案中所述(例如,WPTM5可以不存在或者是吡啶环);或
它们的组合。
在本文所述的任何方面或实施方案中,例如,包括式I的PTM的实施方案,WPTM3是吡唑或6-8元杂环基(例如,哌嗪或二氮杂双环辛烷)。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM具有由以下表示的化学结构:
Figure BDA0003676261880002011
其中:
WPTM1、WPTM2和WPTM5如本文所述的任何其他方面或实施方案所述(例如,WPTM5可以存在或可以不存在,使得WPTM4可以直接连接至L(接头)或ULM);
WPTM4是与WPTM2环稠合的任选被取代的3-7环烷基或杂环基(例如,任选被取代的5-7环烷基或杂环基,或被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-7环烷基或杂环基);并且
Figure BDA0003676261880002012
是至接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团VLM’基团的附接点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM由式II表示,其中WPTM1、WPTM2和WPTM5如本文所述的任何方面或实施方案中所述,并且WPTM4是哌嗪环。例如,在本文所述的任何方面或实施方案中,式II的WPTM2和WPTM4一起构成如下所示的二氢吡嗪并[2,3-e]哒嗪:
Figure BDA0003676261880002013
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM具有由以下表示的化学结构:
Figure BDA0003676261880002021
其中:
WPTM1和WPTM2如本文所述的任何方面或实施方案中所述;
WPTM6和WPTM7独立地是任选的4-7环烷基或杂环基(例如,各自独立地是被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的4-7环烷基或杂环基),并且WPTM6和WPTM7的环稠合或经由螺环连接而连接;并且
Figure BDA0003676261880002022
是至接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团VLM’基团的附接点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM具有由式III表示的化学结构,其中WPTM1和WPTM2各自如本文所述的任何方面或实施方案中所述独立地选择(例如,WPTM1是被羟基取代基取代的苯基,其具有或不具有如本文所述选择的另外的任选取代基,WPTM2是被氨基取代的哒嗪),并且WPTM6和WPTM7是螺环体系,例如选自以下的螺环:
Figure BDA0003676261880002023
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM由以下化学结构表示:
Figure BDA0003676261880002031
其中:
WPTM1、WPTM2和WPTM5如本文所述的任何其他方面或实施方案中所述;
RPTM1和RPTM2各自是H、卤代、HO、C1-C3烷基、C1-C3卤代烷基或C1-C3烷氧基;以及
Figure BDA0003676261880002032
是至接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团VLM’基团的附接点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM具有由式IV表示的化学结构,其中满足以下中的至少一种情况:
WPTM1是被羟基或磷酸根取代基取代的苯基,其具有或不具有如本文所述的另外的任选取代基;
WPTM2是被氨基取代的哒嗪;
WPTM5不存在、是吡唑环或吡啶环;或
它们的组合。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM由以下化学结构表示:
Figure BDA0003676261880002041
式V
或其药学上可接受的盐,其中:
WPTM3不存在或是任选被取代的5-6元杂芳基、任选被取代的4-9环烷基或杂环基环、任选被取代的桥联双环烷基和桥联双杂环基环;并且
WPTM5是任选被取代的5-6元杂芳基或芳基,例如吡啶或哒嗪。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM由以下化学结构表示:
Figure BDA0003676261880002051
或其药学上可接受的盐,其中:
WPTM5是苯基、吡啶、嘧啶或吡嗪。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM由以下化学结构表示:
Figure BDA0003676261880002052
或其药学上可接受的盐。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM由以下化学结构表示:
Figure BDA0003676261880002061
式Vb
或其药学上可接受的盐,
其中:
WPTM3是任选被取代的5-6元杂芳基、任选被取代的4-9环烷基或杂环基环、任选被取代的桥联双环烷基和桥联双杂环基环;
WPTM5是任选被取代的5-6元杂芳基或芳基,例如吡啶或哒嗪;
Rv是0、1、2或3个独立地选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、磷酸根、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基。
在某些实施方案中,羟基被磷酸根基团(即,磷酸酯基团)修饰。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM具有由以下表示的化学结构:
Figure BDA0003676261880002062
其中:WPTM1和WPTM2如本文所述的任何其他方面或实施方案所述(例如,WPTM5可以存在或可以不存在,使得WPTM4可以直接连接至L(接头)或ULM);
WPTM3不存在,或是与WPTM2环稠合的任选被取代的5--7环烷基或杂环基(例如,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5--7环烷基或杂环基);
WPTM4是任选被取代的3-7元芳基或杂芳基环(例如,任选被取代的5-7环烷基或杂环基,或者被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的3-7或5-6元芳基或杂芳基),或任选被取代的4-9环烷基或杂环基,诸如任选被取代的桥联双环烷基和桥联双杂环基环(例如,被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的4-9环烷基或杂环基);
WPTM5不存在(使得WPTM3直接连接至L(接头)或ULM)或是任选被取代的烷基、任选被取代的5-6元环烷基、杂环、芳基或杂芳基环(例如被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-6元环烷基、杂环、芳基或杂芳基),例如,任选被取代的吡唑环或吡啶环;并且
Figure BDA0003676261880002071
是至接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团VLM’基团的附接点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,本公开的PTM具有由以下表示的化学结构:
Figure BDA0003676261880002081
其中:
WPTM1、WPTM2、WPTM3和WPTM4如本文所述的任何其他方面或实施方案中所述;
LPTM是C1-C6烷基,其任选被C1-C4烷基或C1-C3烷氧基取代;并且
Figure BDA0003676261880002082
是至接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团VLM’基团的附接点。
在本文描述的任何方面或实施方案中,PTM选自:
Figure BDA0003676261880002091
Figure BDA0003676261880002101
Figure BDA0003676261880002111
Figure BDA0003676261880002121
其中
Figure BDA0003676261880002122
是到接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团、VLM’基团的附接点。
在本文描述的任何方面或实施方案中,PTM选自:
Figure BDA0003676261880002131
Figure BDA0003676261880002141
Figure BDA0003676261880002151
Figure BDA0003676261880002152
其中
Figure BDA0003676261880002153
是到接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团、VLM’基团的附接点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM选自由以下化学结构组成的组:
Figure BDA0003676261880002161
Figure BDA0003676261880002171
Figure BDA0003676261880002181
其中
Figure BDA0003676261880002182
是到接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团、VLM’基团的附接点。
本文描述的组合物例证了这些类型的小分子靶蛋白结合部分的一些成员。此类小分子靶蛋白结合部分还包括这些组合物的药学上可接受的盐、对映体、溶剂化物和多晶型物,以及可靶向目标蛋白质的其他小分子。下文引用的参考文献以引用的方式整体并入本文。
治疗组合物
药物组合物代表本公开的另外方面,所述药物组合物包含与药学有效量的载体、添加剂或赋形剂组合的、有效量的如本文所述的至少一种双官能化合物和本文其他地方所述的一种或多种化合物的组合。
适用时,本公开包括包含药学上可接受的盐,特别是如本文所述的化合物的酸或碱加成盐的组合物。用于制备可根据此方面使用的上述基础化合物的药学上可接受的酸加成盐的酸是形成无毒酸加成盐的那些酸,即含有药学上可接受的阴离子的盐,例如盐酸盐、氢溴酸盐、氢碘酸盐、硝酸盐、硫酸盐、硫酸氢盐、磷酸盐、酸式磷酸盐、乙酸盐、乳酸盐、柠檬酸盐、酸式柠檬酸盐、酒石酸盐、酒石酸氢盐、琥珀酸盐、马来酸盐、富马酸盐、葡糖酸盐、蔗糖酸盐、苯甲酸盐、甲磺酸盐、乙磺酸盐、苯磺酸盐、对甲苯磺酸盐和双羟萘酸盐[即1,1′-亚甲基-双-(2-羟基-3萘甲酸)]盐等等。
药学上可接受的碱加成盐也可以用于制备根据本公开的化合物或衍生物的药学上可接受的盐形式。在性质中为酸性的、可以用作制备本文化合物的药学可接受的碱性盐的试剂的化学碱是与此类化合物形成无毒碱性盐的那些化学碱。此类无毒碱性盐包括但不限于源自此类药学上可接受的阳离子的那些,所述阳离子例如碱金属阳离子(例如钾和钠)和碱土金属阳离子(例如钙、锌和镁)、铵或水溶性胺加成盐如N-甲基葡糖胺-(葡甲胺),以及低级烷醇铵和药学上可接受的有机胺的其他碱性盐等等。
如本文所述的化合物可根据本公开通过经口、肠胃外或局部途径以单一剂量或分份剂量施用。活性化合物的施用范围可以从连续(静脉内滴注)到每天几次经口施用(例如,Q.I.D.),并且可以包括经口、局部、肠胃外、肌内、静脉内、皮下、透皮(其可以包括渗透增强剂)、经颊、舌下和栓剂施用,以及其他施用途径。肠溶衣经口片剂也可以用于增强来自经口施用途径的化合物的生物利用度。最有效的剂型取决于所选择的特定药剂的药代动力学以及患者中的疾病的严重程度。也可以使用作为用于鼻内、气管内或肺部施用的喷雾剂、薄雾或气溶胶的根据本公开的化合物施用。因此,本公开还涉及药物组合物,其包含有效量的如本文所述的化合物,任选地与药学上可接受的载体、添加剂或赋形剂组合。根据本公开的化合物可以立即释放、中间释放或持续或控制释放形式施用。持续或控制释放形式优选经口施用,也可以栓剂和透皮或其他局部形式施用。以脂质体形式的肌内注射也可以用于控制或维持化合物在注射部位处的释放。
如本文所述的组合物可使用一种或多种药学上可接受的载体以常规方式配制,并且还可以在控制释放制剂中施用。可以用于这些药物组合物中的药学可接受的载体包括但不限于离子交换剂、氧化铝、硬脂酸铝、卵磷脂、血清蛋白例如人血清白蛋白、缓冲物质例如磷酸盐、甘氨酸、山梨酸、山梨酸钾、饱和植物脂肪酸的偏甘油酯混合物、水、盐或电解质例如硫酸醇溶蛋白、磷酸氢二钠、磷酸氢钾、氯化钠、锌盐、胶体二氧化硅、三硅酸镁、聚乙烯吡咯烷酮、纤维素基物质、聚乙二醇、羧甲基纤维素钠、聚丙烯酸酯、蜡、聚乙烯-聚氧丙烯嵌段聚合物、聚乙二醇和羊毛脂。
如本文所述的组合物可以经口、肠胃外、吸入喷雾、局部、直肠、鼻腔、口腔、阴道或经由植入的储库施用。如本文所用的术语“肠胃外”包括皮下、静脉内、肌内、关节内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、病灶内和颅内注射或输注技术。优选地,组合物经口、腹膜内或静脉内施用。
如本文所述的组合物的无菌可注射形式可以是水性或油性悬浮液。可以根据本领域已知的技术,使用合适的分散剂或润湿剂和悬浮剂配制这些悬浮液。无菌可注射制剂还可以是在无毒的肠胃外可接受的稀释剂或溶剂中的无菌可注射溶液或悬浮液,例如作为在1,3-丁二醇中的溶液。在可以采用的可接受的媒介物和溶剂有水、林格氏溶液和等渗氯化钠溶液。另外,无菌的不挥发性油照常规用作溶剂或悬浮介质。为此目的,可以采用任何温和的不挥发性油,包括合成的甘油单酯或甘油二酯。脂肪酸,例如油酸及其甘油酯衍生物可用于制备注射剂,如天然的药学上可接受的油,例如橄榄油或蓖麻油一样,尤其以其聚氧乙基化形式。这些油溶液或悬浮液也可以含有长链醇稀释剂或分散剂,例如Ph.Helv或类似的醇。
如本文所述的药物组合物可以以任何经口可接受的剂型经口施用,包括但不限于胶囊、片剂、水性悬浮液或溶液。在用于经口使用的片剂的情况下,常用的载体包括乳糖和玉米淀粉。通常还添加润滑剂,如硬脂酸镁。对于以胶囊形式的经口施用,有用的稀释剂包括乳糖和干玉米淀粉。当需要水性悬浮液用于经口使用时,将活性成分与乳化剂和悬浮剂混合。需要时,还可以加入某些甜味剂、调味剂或着色剂。
可替代地,如本文所述的药物组合物可以以栓剂的形式施用,用于直肠施用。这些可以通过将试剂与合适的非刺激性赋形剂混合来制备,所述赋形剂在室温下为固体但在直肠温度下为液体,并且因此将在直肠中融化以释放药物。此类材料包括可可脂、蜂蜡和聚乙二醇。
如本文所述的药物组合物也可以局部施用。对于这些区域或器官中的每一个,容易制备合适的局部制剂。对于下肠道的局部施用可以以直肠栓剂制剂(参见上文)或以合适的灌肠剂制剂实现。也可以使用局部可接受的透皮贴剂。
对于局部应用,药物组合物可以配制成合适的软膏,所述软膏含有悬浮或溶解于一种或多种载体中的活性组分。用于局部施用本公开的化合物的载体包括但不限于矿物油、液体凡士林、白凡士林、丙二醇、聚氧乙烯、聚氧丙烯化合物、乳化蜡和水。在本公开的某些优选方面,可以将化合物涂布到支架上,所述支架将要手术植入患者体内,以便抑制或减少支架在患者中发生阻塞的可能性。
可替代地,可以将药物组合物配制成合适的洗剂或乳膏,所述洗剂或乳膏含有悬浮或溶解于一种或多种药学可接受的载体中的活性组分。合适的载体包括但不限于矿物油、脱水山梨糖醇单硬脂酸酯、聚山梨醇酯60、十六烷基酯蜡、鲸蜡硬脂醇、2-辛基十二烷醇、苯甲醇和水。
对于眼部使用,药物组合物可以配制为在等渗、pH调节的无菌盐水中的微粉化悬浮液,或者优选地,配制为在等渗、pH调节的无菌盐水中的溶液,使用或不使用防腐剂如苯扎氯铵。可替代地,对于眼部使用,可以将药物组合物配制成软膏例如凡士林。
如本文所述的药物组合物还可通过鼻气溶胶或吸入施用。此类组合物根据药物制剂领域众所周知的技术制备,并且可以制备为在盐水中的溶液,采用苯甲醇或其他合适的防腐剂、增强生物利用度的吸收促进剂、碳氟化合物和/或其他常规增溶剂或分散剂。
可以与载体材料组合以制备单一剂型的如本文所述的药物组合物中化合物的量将根据所治疗的宿主和疾病以及特定的施用模式而变。优选地,组合物应配制成包含约0.05毫克至约750毫克或更多、更优选地约1毫克至约600毫克、甚至更优选地约10毫克至约500毫克的活性成分,该活性成分单独存在或与至少一种根据本公开的其他化合物组合。
还应该理解,用于任何特定患者的具体剂量和治疗方案将取决于各种因素,包括所采用的特定化合物的活性、年龄、体重、一般健康、性别、饮食、施用时间、排泄率、药物组合、以及治疗医师的判断和待治疗的特定疾病或状况的严重程度。
需要使用根据本文所述方法的化合物的治疗的患者或受试者可以通过向患者(受试者)施用单独或与如本文其他地方鉴定的其他已知治疗剂组合的有效量的根据本公开的化合物来治疗,所述化合物包括其药学上可接受的盐、溶剂化物或多晶型物,任选地在药学上可接受的载体或稀释剂中。
这些化合物可通过任何适当的途径施用,例如经口、肠胃外、静脉内、皮内、皮下或局部,包括透皮、在液体中、乳膏、凝胶或固体形式或通过气溶胶形式。
活性化合物包括在药学可接受的载体或稀释剂中,其量足以向患者递送对于所需适应症的治疗有效量,而不在所治疗的患者中引起严重的毒性效应。用于所有本文提及状况的活性化合物的优选剂量在约10ng/kg至300mg/kg的范围内,优选地0.1至100mg/kg/天,更一般地0.5至约25mg/千克接受者/患者的体重/天。典型的局部剂量范围为在合适的载体中0.01-5重量%。
该化合物方便地以任何合适的单位剂型施用,包括但不限于每单位剂型含有小于1mg、1mg至3000mg,优选5至500mg的活性成分的单位剂型。约25-250mg的经口剂量通常是方便的。
优选施用活性成分以达到约0.00001-30mM,优选约0.1-30μM的活性化合物的峰值血浆浓度。这可以例如通过任选地在盐水或含水介质中的活性成分溶液或制剂的静脉内注射来实现,或作为活性成分的推注来施用。经口施用也适合于生成活性剂的有效血浆浓度。
药物组合物中活性化合物的浓度将取决于药物的吸收、分布、失活和排泄速率,以及本领域技术人员已知的其他因素。应注意,剂量值也将随着待缓解的状况的严重程度而变。还应理解,对于任何特定受试者,应该根据个体需要和施用或监督组合物施用的个人的专业判断,随着时间过去调整特定剂量方案,并且本文所述的浓度范围仅为示例性的,并且不预期限制请求保护的组合物的范围或实践。活性成分可以一次施用,或者可以分成许多较小的剂量,以不同的时间间隔施用。
经口组合物通常将包含惰性稀释剂或可食用载体。它们可以包封在明胶胶囊中或压制成片剂。为了经口治疗施用的目的,可以将活性化合物或其前药衍生物与赋形剂混合,并且以片剂、锭剂或胶囊的形式使用。可包含药学上相容的粘合剂和/或佐剂材料作为组合物的一部分。
片剂、丸剂、胶囊、锭剂等等可以含有下述成分或类似性质的化合物中的任一种:粘合剂如微晶纤维素、黄蓍胶或明胶;赋形剂如淀粉或乳糖,分散剂如海藻酸、Primogel或玉米淀粉;润滑剂如硬脂酸镁或Sterotes;助流剂如胶体二氧化硅;甜味剂如蔗糖或糖精;或调味剂如薄荷、水杨酸甲酯或橙子调味料。当剂量单位形式是胶囊时,除上述类型的材料之外,它还可以含有液体载体如脂肪油。另外,剂量单位形式可以含有修改剂量单位的物理形式的各种其他物质,例如糖包衣、虫胶或肠溶剂。
活性化合物或其药学上可接受的盐可以作为酏剂、悬浮液、糖浆剂、糯米纸囊剂、口香糖等等的组分施用。除活性化合物之外,糖浆剂还可以含有蔗糖作为甜味剂与某些防腐剂、染料以及着色剂和调味料。
活性化合物或其药学上可接受的盐也可以与不损害所需作用的其他活性材料混合,或与补充所需作用的材料诸如抗癌剂(包括帕博利珠单抗)混合。在本公开的某些优选方面,根据本公开的一种或多种化合物与另一种生物活性剂,例如抗癌剂或伤口愈合剂包括抗生素共施用,如本文其他地方描述的。
用于肠胃外、皮内、皮下或局部施用的溶液或悬浮液可包含下列组分:无菌稀释剂如注射用水、盐水溶液、不挥发性油、聚乙二醇、丙三醇、丙二醇或其他合成溶剂;抗菌剂如苯甲醇或对羟基苯甲酸甲酯;抗氧化剂如抗坏血酸或亚硫酸氢钠;螯合剂如乙二胺四乙酸;缓冲剂如乙酸盐、柠檬酸盐或磷酸盐和用于调节张力的试剂如氯化钠或葡萄糖。肠胃外制剂可以包封在由玻璃或塑料制成的安瓿、一次性注射器或多剂量小瓶中。
如果静脉内施用,则优选的载体是生理盐水或磷酸盐缓冲盐水(PBS)。
在一个实施方案中,活性化合物与载体一起制备,所述载体将保护化合物免于从体内快速消除,例如控制释放制剂,包括植入物和微囊化递送系统。可以使用可生物降解的、生物相容的聚合物,例如乙烯乙酸乙烯酯、聚酐、聚乙醇酸、胶原、聚原酸酯和聚乳酸。用于制备此类制剂的方法对于本领域技术人员是显而易见的。
脂质体悬浮液也可以是药学上可接受的载体。这些可以根据本领域技术人员已知的方法制备,例如,如美国专利号4,522,811中所述(其以引用的方式整体并入本文)。例如,脂质体制剂可以通过将适当的脂质(例如硬脂酰磷脂酰乙醇胺、硬脂酰磷脂酰胆碱、花生四烯酰基磷脂酰胆碱和胆固醇)溶解于有机溶剂中来制备,然后蒸发所述有机溶剂,在容器的表面上留下干燥脂质的薄膜。然后将活性化合物的水溶液引入容器中。然后用手旋转容器,以从容器的侧面释放脂质材料且分散脂质聚集体,从而形成脂质体悬浮液。
治疗方法
在另一方面,本说明书提供了治疗组合物,其包含有效量的如本文所述化合物或其盐形式和药学上可接受的载体。治疗组合物调节患者或受试者(例如动物,例如人)中的蛋白质降解,并且可以用于治疗或改善通过降解的蛋白质调节的疾病状态或状况。
如本文使用的,术语“治疗(treat)”、“治疗(treating)”和“治疗(treatment)”等指对患者提供益处的任何动作,对于所述患者可以施用本文化合物,所述益处包括通过本文化合物与之结合的蛋白质调节的任何疾病状态或状况的治疗。上文阐述了可以使用根据本公开的化合物治疗的疾病状态或病症,包括癌症诸如肺癌,包括非小细胞肺癌。
本说明书提供了如本文所述的治疗组合物,用于实现目标蛋白质的降解,以治疗或改善疾病,例如癌症。在某些另外的实施方案中,疾病是多发性骨髓瘤。因此,在另一方面,本说明书提供了泛素化/降解细胞中的靶蛋白的方法。在某些实施方案中,该方法包括施用如本文所述的双官能化合物,该双官能化合物包含例如优选通过如本文另外所述的接头部分连接的ULM和PTM,其中ULM与PTM偶联且其中ULM识别泛素路径蛋白质(例如,泛素连接酶,诸如VHL E3泛素连接酶)并且PTM识别靶蛋白,使得当靶蛋白被置于泛素连接酶附近时,将发生靶蛋白的降解,从而实现靶蛋白的降解/靶蛋白效应的抑制及蛋白质水平的控制。通过本公开提供的蛋白质水平的控制提供了疾病状态或状况的治疗,其通过降低细胞(例如,患者的细胞)中该蛋白质的水平而通过靶蛋白调节。在某些实施方案中,该方法包括施用有效量的如本文所述的化合物,任选地包含药学上可接受的赋形剂、载体、佐剂、另一种生物活性剂或它们的组合。
在另外的实施方案中,本说明书提供了用于治疗或改善受试者或患者(例如动物,例如人类)的疾病、病症或其症状的方法,该方法包括向有需要的受试者施用组合物,该组合物包含有效量(例如治疗有效量)的本文所述化合物或其盐形式,和药学上可接受的赋形剂、载体、助剂、另一种生物活性剂或它们的组合,其中所述组合物能够有效治疗或改善受试者的疾病或病症或其症状。
在另一方面,本说明书提供了使用根据本公开的化合物鉴别生物系统中的目标蛋白质降解的影响的方法。
在另一个实施方案中,本公开涉及治疗需要治疗通过蛋白质调节的疾病状态或状况治疗的人类患者的方法,其中该蛋白质的降解在该患者中产生治疗效果,所述方法包括向有需要的患者施用有效量的根据本公开的化合物,任选地与另一种生物活性剂组合。疾病状态或状况可以是由微生物剂或其他外源性剂(例如病毒、细菌、真菌、原生动物或其他微生物)引起的疾病,或者可以是由蛋白质的过表达引起的疾病状态,其导致疾病状态和/或状况。
术语“疾病状态或状况”用于描述任何疾病状态或状况,其中发生蛋白质失调(即,患者中表达的蛋白质的量升高),并且其中患者中一种或多种蛋白质的降解可以为对此有需要的患者提供有益疗法或症状的缓解。在某些情况下,疾病状态或状况可以被治愈。
可使用根据本公开的化合物治疗的疾病状态或状况包括例如哮喘、自体免疫疾病如多发性硬化症、各种癌症、纤毛病、腭裂、糖尿病、心脏病、高血压、发炎性肠病、智力迟钝、情绪障碍、肥胖症、屈光不正、不育症、Angelman综合征、Canavan病、乳糜泻、夏-马-图三氏病(Charcot-Marie-Tooth disease)、囊肿性纤维化、杜氏肌营养不良、血色病、血友病、克氏综合征、神经纤维瘤病、苯丙酮尿症、多囊性肾病(PKD1)或4(PKD2)、Prader-Willi综合征、镰状细胞病、Tay-Sachs病、Turner综合征。
在整个说明书中使用术语“瘤形成”或“癌症”是指导致癌性或恶性肿瘤(即,通过细胞增殖而生长的异常组织)形成和生长的病理过程,所述形成和生长通常比正常组织更快并且在引发新增长的刺激停止后继续生长。恶性肿瘤显示出部分或完全缺乏与正常组织的结构组织和功能协调,并且大多数侵入周围组织,转移到若干个部位,并且在尝试移除后可能复发并且除非充分治疗,否则导致患者死亡。如本文所用,术语瘤形成用于描述所有癌性疾病状态,并且包括或涵盖与恶性血源性、腹水和实体肿瘤相关的病理过程。可用本发明的化合物单独地或与至少一种另外的抗癌剂组合地治疗的示例性癌症包括鏻状细胞癌、基底细胞癌、腺癌、肝细胞癌和肾细胞癌;膀胱、肠道、乳房、子宫颈、结肠、食道、头、肾、肝、肺、颈、卵巢、胰腺、前列腺和胃的癌症;白血病;良性和恶性淋巴瘤,尤其是伯基特氏淋巴瘤(Burkitt’s lymphoma)和非霍奇金淋巴瘤(Non-Hodgkin’s lymphoma);良性和恶性黑素瘤;骨髓增生性疾病;肉瘤,包括尤文氏肉瘤(Ewing’s sarcoma)、血管内皮瘤、卡波西肉瘤(Kaposi’s sarcoma)、脂肪肉瘤、肌肉瘤、外周神经上皮瘤、滑膜肉瘤、神经胶质瘤、星形细胞瘤、少突神经胶质瘤、室管膜瘤、胶质母细胞瘤、神经母细胞瘤、节细胞神经瘤、神经节细胞胶质瘤、髓母细胞瘤、松果体细胞肿瘤、脑膜瘤、脑膜肉瘤、神经纤维瘤和许旺细胞瘤(Schwannomas);肠道癌、乳癌、前列腺癌、子宫颈癌、子宫癌、肺癌、卵巢癌、睾丸癌、甲状腺癌、星形细胞瘤、食道癌、胰脏癌、胃癌、肝癌、结肠癌、黑素瘤;癌肉瘤、霍奇金病、维尔姆斯瘤和畸胎癌。可使用根据本公开的化合物治疗的另外的癌症包括例如T-谱系急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、T谱系淋巴母细胞淋巴瘤(T-LL)、外周T细胞淋巴瘤、成人T细胞白血病、Pre-B ALL、Pre-B淋巴瘤、大B细胞淋巴瘤、Burkitts淋巴瘤、B细胞ALL、费城染色体阳性ALL和费城染色体阳性CML。
术语“生物活性剂”用于描述除了根据本公开的化合物之外的试剂,其与本发明化合物组合用作具有生物活性的试剂,以帮助实现对于其使用本发明化合物的预期疗法、抑制和/或防止/预防。本文使用的优选生物活性剂包括药理学活性与所用或所施用的本发明化合物类似的那些试剂,并且包括例如抗癌剂、抗病毒剂,尤其包括抗HIV剂和抗HCV剂、抗微生物剂、抗真菌剂等。
术语“另外的抗癌剂”用于描述可以与根据本公开的化合物组合以治疗癌症的抗癌剂。这些试剂包括例如依维莫司、曲贝替定、白蛋白结合型紫杉醇、TLK 286、AV-299、DN-101、帕唑帕尼、GSK690693、RTA 744、ON0910.Na、AZD6244(ARRY-142886)、AMN-107、TKI-258、GSK461364、AZD 1152、恩扎妥林(enzastaurin)、凡德他尼、ARQ-197、MK-0457、MLN8054、PHA-739358、R-763、AT-9263、FLT-3抑制剂、VEGFR抑制剂、EGFR TK抑制剂、极光激酶抑制剂、PIK-1调节剂、Bcl-2抑制剂、HDAC抑制剂、c-MET抑制剂、PARP抑制剂、Cdk抑制剂、EGFR TK抑制剂、IGFR-TK抑制剂、抗HGF抗体、PI3激酶抑制剂、AKT抑制剂、mTORC1/2抑制剂、JAK/STAT抑制剂、检查点-1或2抑制剂、局灶性粘附激酶抑制剂、Map激酶(mek)抑制剂、VEGF捕获剂抗体、培美曲塞、埃罗替尼、达沙替尼、尼洛替尼、达卡替尼、帕尼单抗、氨柔比星、奥戈伏单抗、Lep-etu、洛拉曲塞、azd2171、巴巴布林(batabulin)、奥法木单抗、扎木单抗(zanolimumab)、edotecarin、倒地拱素、鲁比替康、替米利芬、奥利默森、ticilimumab、易普利单抗、棉酚、Bio 111、131-I-TM-601、ALT-110、BIO140、CC 8490、西仑吉肽、吉马替康、IL13-PE38QQR、INO 1001、IPdR1 KRX-0402、硫蒽酮、LY317615、neuradiab、vitespan、Rta744、Sdx 102、他仑帕奈、阿曲生坦、Xr 311、罗咪酯肽、ADS-100380、舒尼替尼、5-氟尿嘧啶、伏立诺他、依托泊苷、吉西他滨、阿霉素、阿霉素脂质体、5′-脱氧-5-氟尿苷、长春新碱、替莫唑胺、ZK-304709、seliciclib;PD0325901、AZD-6244、卡培他滨、L-谷氨酸、N-[4-[2-(2-氨基-4,7-二氢-4-氧代-1H-吡咯并[2,3-d]嘧啶-5-基)乙基]苯甲酰基]-、二钠盐、七水化物、喜树碱、PEG标记的依立替康、他莫昔芬、柠檬酸托瑞米芬、阿那曲唑、依西美坦、来曲唑、DES(己烯雌酚)、雌二醇、雌激素、结合雌激素、贝伐单抗、IMC-1C11、CHIR-258);3-[5-(甲基磺酰基哌啶甲基)-吲哚基-喹诺酮、瓦他拉尼碱、AG-013736、AVE-0005、醋酸性瑞林、醋酸亮丙瑞林、双羟萘酸曲普瑞林、醋酸甲羟孕酮、己酸羟孕酮、乙酸甲地孕酮、雷洛昔芬、比卡鲁胺、氟他胺、尼鲁米特、乙酸甲地孕酮、CP-724714;TAK-165、HKI-272、埃罗替尼、拉帕替尼、卡奈替尼、ABX-EGF抗体、爱必妥、EKB-569、PKI-166、GW-572016、艾那法尼(Ionafarnib)、BMS-214662、替吡法尼;氨磷汀、NVP-LAQ824、辛二酰苯胺异羟肟酸(suberoyl analidehydroxamic acid)、丙戊酸、曲古抑菌素A、FK-228、SU11248、索拉非尼、KRN951、氨鲁米特、arnsacrine、阿那格雷、L-天冬酰胺酶、卡介苗(BCG)疫苗、阿霉素、博来霉素、布舍瑞林、白消安、卡铂、卡莫司汀、氮芥苯丁酸、顺铂、克拉屈滨、氯膦酸盐、环丙孕酮、阿糖胞苷、氮烯唑胺、放线菌素、柔红霉素、己烯雌酚、表柔比星、氟达拉滨、氟氢可的松、氟烃甲基睾丸素、氟他胺、格列卫、吉西他滨、羟基脲、伊达比星、异环磷酰胺、伊马替尼、亮丙瑞林、左旋四咪唑、洛莫司汀、氮芥、美法仑、6-巯基嘌呤、美司钠、氨甲蝶呤、丝裂霉素、米托坦、米托蒽醌、尼鲁米特、奥曲肽、奥沙利铂、帕米膦酸二钠、喷司他丁、普卡霉素、卟菲尔钠、甲基苄肼、雷替曲塞、利妥昔单抗、链脲霉素、替尼泊苷、睾酮、沙利度胺、硫鸟嘌呤、硫替派、维甲酸、长春地辛、13-顺式-视黄酸、苯基丙氨酸氮芥、尿嘧啶氮芥、雌氮芥、六甲蜜胺、氟尿苷、5-脱氧尿苷、阿糖胞苷、6-硫基嘌呤、脱氧柯福霉素、钙三醇、戊柔比星、光神霉素、长春花碱、长春瑞滨、拓扑替康、雷佐生、马立马司他、COL-3、癌立消、BMS-275291、角鲨胺、内皮抑素、SU5416、SU6668、EMD121974、白介素-12、IM862、制管张素、vitaxin、屈洛昔芬、idoxyfene、螺甾内酯、非那雄胺、甲腈咪胍、曲妥单抗、地尼白介素(denileukin diftitox)、吉非替尼、硼替佐米(bortezimib)、紫杉醇、无克列莫佛的紫杉醇、多西他赛、epithilone B、BMS-247550、BMS-310705、屈洛昔芬、4-羟基他莫昔芬、哌喷昔芬、ERA-923、阿佐昔芬、氟维司群、阿考比芬、拉索昔芬、艾多昔芬、TSE-424、HMR-3339、ZK186619、拓扑替康、PTK787/ZK 222584、VX-745、PD 184352、雷帕霉素、40-O-(2-羟基乙基)-雷帕霉素、替西罗莫司、AP-23573、RAD001、ABT-578、BC-210、LY294002、LY292223、LY292696、LY293684、LY293646、渥曼青霉素、ZM336372、L-779,450、PEG-非格司亭、达贝泊汀、促红细胞生成素、粒细胞集落刺激因子、唑来膦酸盐(zolendronate)、强的松、西妥昔单抗、粒细胞巨噬细胞集落刺激因子、组氨瑞林、聚乙二醇化干扰素α-2a、干扰素α-2a、聚乙二醇化干扰素α-2b、干扰素α-2b、阿扎胞苷、PEG-L-天冬酰胺酶、来那度胺、吉妥单抗、氢化可的松、白介素-11、右雷佐生、阿来组单抗、全反式维甲酸、酮康唑、白细胞介素-2、甲地孕酮、免疫球蛋白、氮芥、甲基强的松龙、替伊莫单抗、雄激素、地西他滨、六甲蜜胺、蓓萨罗丁、托西莫单抗、三氧化二砷、可的松、editronate、米托坦、环孢菌素、柔红霉素脂质体、Edwina-天冬酰胺酶、锶89、卡索匹坦、奈妥吡坦、NK-1受体拮抗剂、帕洛诺司琼、阿瑞匹坦、苯海拉明、羟嗪、灭吐灵、氯羟安定、阿普唑仑、氟哌丁苯、达哌啶醇、屈大麻酚、地塞米松、甲基强的松龙、丙氯拉嗪、格拉司琼、昂丹司琼、多拉司琼、托烷司琼、乙二醇化非格司亭、促红细胞生成素、阿法依泊汀(darbepoetin alfa)、达依泊汀α以及它们的混合物。
术语“抗HIV剂”或“另外的抗HIV剂”包括例如核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、其他非核苷类逆转录酶抑制剂(即不能代表本公开的那些)、蛋白酶抑制剂、融合抑制剂等,其示例性化合物可包括例如3TC(拉米夫定)、AZT(齐多夫定),(-)-FTC、ddI(地达诺新)、ddC(扎西他滨)、阿巴卡韦(ABC)、替诺福韦(PMPA)、D-D4FC(Reverset)、D4T(司他夫定)、Racivir、L-FddC、L-FD4C、NVP(奈韦拉平)、DLV(地拉夫定)、EFV(依法韦仑)、SQVM(甲磺酸沙奎那韦)、RTV(利托那韦)、IDV(茚地那韦)、SQV(沙奎那韦)、NFV(奈非那韦)、APV(安普那韦)、LPV(洛匹那韦)、融合抑制剂如T20等、其融合物和混合物,包括目前正处于临床试验或开发阶段的抗HIV化合物。
可用于与根据本公开内容的化合物共同施用的其它抗HIV剂包括,例如,其它NNRTI(即,除了根据本公开内容的NNRTI之外),可选自由以下组成的组:奈韦拉平(BI-R6-587)、地拉韦啶(U-90152S/T)、依法韦仑(DMP-266)、UC-781(N-[4-氯-3-(3-甲基-2-丁烯氧基)苯基]-2甲基3-呋喃硫代甲酸硫羰胺)、依曲韦林(TMC125)、曲韦定(Ly300046.HCl)、MKC-442(乙米韦林,coactinon)、HI-236、HI-240、HI-280、HI-281、利匹韦林(TMC-278)、MSC-127、HBY 097、DMP266、黄芩苷(TJN-151)ADAM-II(3’,3’-二氯-4’,4”-二甲氧基-5’,5″-双(甲氧羰基)-6,6-2苯基己烯酸甲酯)、3-溴-5-(1-5-溴-4-甲氧基-3-(甲氧羰基)苯基)庚-1-烯基)-2-甲氧基苯甲酸甲酯(烯基二芳基甲烷类似物,Adam类似物)、(5-氯-3-(苯基亚硫酰基)-2’-吲哚甲酰胺)、AAP-BHAP(U-104489或PNU-104489)、Capravirine(AG-1549,S-1153)、阿替韦啶(U-87201E)、金精三羧酸(SD-095345)、1-[(6-氰基-2-吲哚基)羰基]-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、1-[5-[[N-(甲基)甲基磺酰基氨基]-2-吲哚基羰基-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、1-[3-(乙基氨基)-2-[吡啶基]-4-[(5-羟基-2-吲哚基)羰基]哌嗪、1-[(6-甲酰基-2-吲哚基)羰基]-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、1-[[5-(甲基磺酰氧基)-2-吲哚基)羰基]-4-[3-(异丙基氨基)-2-吡啶基]哌嗪、U88204E、双(2-硝基苯基)砜(NSC 633001)、胡桐内酯A(NSC675451)、胡桐内酯B、6-苄基-5-甲基-2-(环己氧基)嘧啶-4-酮(DABO-546)、DPC 961、E-EBU、E-EBU-dm、E-EPSeU、E-EPU、膦甲酸钠(Foscavir)、HEPT(1-[(2-羟基乙氧基)甲基]-6-(苯硫基)胸腺嘧啶)、HEPT-M(1-[(2-羟基乙氧基)甲基]-6-(3-甲基苯基)硫代)胸腺嘧啶)、HEPT-S(1-[(2-羟基乙氧基)甲基]-6-(苯硫基)-2-硫代胸腺嘧啶)、海棠果素P、L-737,126、米歇尔胺A(NSC650898)、米歇尔胺B(NSC649324)、米歇尔胺F、6-(3,5-二甲基苄基)-1-[(2-羟基乙氧基)甲基]-5-异丙基尿嘧啶、6-(3,5-二甲基苄基)-1-(乙氧基甲基)-5-异丙基尿嘧啶、NPPS、E-BPTU(NSC648400)、奥替普拉(4-甲基-5-(吡嗪基)-3H-1,2-二硫杂环戊二烯-3-硫酮)、N-{2-(2-氯-6-氟苯乙基]-N’-(2-噻唑基)硫脲(PETT Cl、F衍生物)、N-{2-(2,6-二氟苯乙基]-N’-[2-(5-溴吡啶基)]硫脲{PETT衍生物)、N-{2-(2,6-二氟苯乙基]-N’-[2-(5-甲基吡啶基)]硫脲{PETT吡啶基衍生物)、N-[2-(3-氟代呋喃基)乙基]-N’-[2-(5-氯吡啶基)]硫脲、N-[2-(2-氟-6-乙氧基苯乙基)]-N’-[2-(5-溴吡啶基)]硫脲、N-(2-苯乙基)-N′-(2-噻唑基)硫脲(LY-73497)、L-697,639、L-697,593、L-697,661、3-[2-(4,7-二氟苯并噁唑-2-基)乙基}-5-乙基-6-甲基(吡啶-2(1H)-硫酮(2-吡啶酮衍生物)、3-[[(2-甲氧基-5,6-二甲基-3-吡啶基)甲基]胺]-5-乙基-6-甲基(吡啶-2(1H)-硫酮、R82150、R82913、R87232、R88703、R89439(洛韦胺)、R90385、S-2720、舒拉明钠、TBZ(噻唑并苯并咪唑,NSC625487)、噻唑并异吲哚-5-酮、(+)(R)-9b-(3,5-二甲基苯基-2,3-二氢噻唑并[2,3-a]异吲哚-5(9bH)-酮、替韦拉平(R86183)、UC-38及UC-84等等。
适用时,术语“药学上可接受的盐”在本说明书中通篇用于描述本文所述的一种或多种化合物的盐形式,其用于增加化合物在患者的胃肠道的胃液中的溶解度,以便促进化合物的溶出度和生物利用度。适用时,药学上可接受的盐包括源自药学上可接受的无机或有机碱和酸的盐。合适的盐包括源自碱金属如钾和钠的盐,碱土金属如钙、镁和铵盐,以及制药领域中众所周知的众多其他酸和碱。钠盐和钾盐作为根据本公开的磷酸盐的中和盐是特别优选的。
术语“药学上可接受的衍生物”在本说明书中通篇用于描述任何药学上可接受的前药形式(例如酯、酰胺、其他前药基团),在施用于患者时,其直接或间接提供本发明化合物或本发明化合物的活性代谢产物。
一般合成方法
如本文所述的双官能分子的合成实现和优化可以逐步或模块化的方式进行。例如,如果不能立即获得合适的配体,则鉴定与靶分子结合的化合物可涉及高通量或中通量的筛查活动。初始配体需要迭代设计和优化循环来改善次优方面并不罕见,如通过合适的体外和药理学和/或ADMET测定所确定的那样。优化/SAR活动的一部分将是探测配体的耐受取代的位置,并且可能是附接本文先前提到的化学接头的合适位置。在可获得晶体学或NMR结构数据的情况下,这些可用于集中这样的合成任务。
以非常类似的方式,可以鉴定和优化E3连接酶的配体,即ULM/VLM。
利用PTM和ULM(例如VLM),本领域技术人员可以使用已知的合成方法将它们在有或没有接头部分的情况下进行组合。接头部分可以合成为具有一系列组成、长度和柔韧性,并且被官能化,使得PTM和ULM基团可以顺序地附接至接头的远端。因此,可以在体外和体内药理学和ADMET/PK研究中实现和分析双官能分子文库。与PTM和ULM基团一样,最终的双官能分子可以进行迭代设计和优化循环,以鉴定具有期望特性的分子。
在一些情况下,为了促进所需材料的制备,可能需要保护基团策略和/或官能团相互转化(FGI)。此类化学工艺是有机合成化学工作者众所周知的并且其中许多可见于教材中,例如“Greene’s Protective Groups in Organic Synthesis”,Peter G.M.Wuts和Theodora W.Greene(Wiley),以及“Organic Synthesis:The Disconnection Approach″,Stuart Warren和Paul Wyatt(Wiley)。
缩写:
ACN:乙腈
ADDP:1,1’-(偶氮二羰基)二哌啶
BAST:N,N-双(2-甲氧基乙基)氨基三氟化硫
BPO:过氧化苯甲酰
Cbz:羰基苄氧基
DAST:二乙氨基三氟化硫
DBE:1,2-二溴乙烷
DCM:二氯甲烷
DEAD:偶氮二甲酸二乙酯
DIAD:偶氮二甲酸二异丙酯
DIBAL:二异丁基氢化铝
DIEA或DIPEA:二异丙基乙胺
DMA:N,N-二甲基乙酰胺
DMF:N,N-二甲基甲酰胺
DMP:戴斯-马丁过碘烷
EA:乙酸乙酯
EDCI:1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺
HBTU:N,N,N’N’-四甲基-O-(1H-苯并三唑-1-基)脲六氟磷酸酯
HMDS:双(三甲基甲硅烷基)胺
HMPA:六甲基磷酰胺
LDA:二异丙基氨基锂
MCPBA:间-氯过氧苯甲酸
MsCl:甲磺酰氯
M.W:微波
NBS:N-溴代琥珀酰亚胺
NMP:N-甲基吡咯烷酮
PCC:氯铬酸吡啶鎓
Pd-118或Pd(dtpf)Cl2:1,1’-双(二叔丁基膦基)二茂铁二氯化钯
Pd(dppf)Cl2:1,1’-双(二苯基膦基)二茂铁二氯化钯
Pd(dba)2:双(二亚苄基丙酮)钯
Pd2(dba)3:三(二亚苄基丙酮)二钯
PPTS:对甲苯磺酸吡啶鎓
PTSA:对甲苯磺酸
RuPhos-Pd-G3:XPhos-Pd-G3:[(2-二环己基膦基-2′,6′-二异丙氧基-1,1′-联苯基)-2-(2′-氨基-1,1′-联苯基)]钯(II)甲磺酸盐
RuPhos-Pd-G2:氯[(2-二环己基膦基-2′,6′-二异丙氧基-1,1′-联苯基)-2-(2′-氨基-1,1′-联苯基)]钯(II)
SFC:超临界流体色谱
t-BuXPhos-Pd-G3:[(2-二-叔-丁基膦基-2′,4′,6′-三异丙基-1,1′-联苯基)-2-(2′-氨基-1,1′-联苯基)]钯(II)甲磺酸盐
TEA:三甲胺
TFA:三氟乙酸
TLC:薄层色谱
TMP:2,2,6,6-四甲基哌啶
TEMPO:2,2,6,6-四甲基哌啶-N-氧化物
TosCl或TsCl:对甲苯磺酰氯
TsOH:对甲苯磺酸
XantPhos:4,5-双(二苯基膦基)-9,9-二甲基呫吨
XPhos:2-二环己基膦基-2′4′6′-三异丙基联苯
XPhos-Pd-G3:[(2-二环己基膦基-2′,4′,6′-三异丙基-1,1′-联苯基)-2-(2′-氨基-1,1′-联苯基)]钯(II)甲磺酸盐
12354-85-7:双(五甲基环戊二烯基二氯化铑)
方案1
Figure BDA0003676261880002371
如方案1所示,具有WPTM5部分的化合物包含连接基团L,该连接基团L包括亲核基团,诸如氨基基团。与具有良好离去基团LG(例如,全氟磺酰基基团C4F9SO3-)的化合物反应时,形成偶联产物。偶联产物在钯催化的条件下与单保护的胺分子WPTM3反应,附接WPTM3片段。胺脱保护后,选自WPTM5-WPTM3中Z′和Z″的更具反应性的卤素原子经历游离氨基的亲核取代,形成WPTM5-WPTM3-WPTM2,然后其与WPTM2硼酸反应得到PTM结合基团,包括WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM1片段。碱性催化的酯水解后,将所得酸与带有氨基基团的ULM部分偶联,以在一个分子中结合PTM和ULM结合部分。
方案2
Figure BDA0003676261880002381
如方案2所示,含羟基的部分R3与包括连接基团L的单保护的二醇之间的Mitsunobu反应产生偶联产物。O-脱保护后,游离羟基被活化,例如作为磺酸酯,随后用在WPTM5处带有氨基的WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM1部分置换。酯水解后,将所得酸与带有氨基基团的ULM部分偶联,以在一个分子中结合PTM和ULM结合部分。
方案3
Figure BDA0003676261880002382
如方案3所示,首先将乙烯基基团引入双卤代衍生物WPTM2中。然后,所得产物与带有连接基团L′的卤代部分WPTM2进行钯催化的Heck偶联反应,所述连接基团L′包括任选保护的氨基基团。为了引入WPTM1部分,WPTM2-WPTM5的卤化物部分与合适的硼酸在Suzuki条件下偶联,所得胺与含ULM的醛反应,得到PTM-ULM偶联产物。
方案4
Figure BDA0003676261880002391
方案4示出了用于将PTM结合部分WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM1与含ULM的部分连接的示例性偶联反应。这样的反应可包括使用氰基硼氢化钠作为还原剂的还原性胺化或羧酸与二胺之间的缩合偶联反应。本领域普通技术人员将能够选择合适的试剂和条件来进行所需的转化。
方案5
Figure BDA0003676261880002401
如方案5所示,含羟基的部分R3与WPTM5之间的Mitsunobu型反应产生偶联产物。然后在Suzuki或Buchwald条件下,用单保护的二胺WPTM3置换在WPTM5处的卤素原子。第二氨基脱保护后,附接到WPTM2部分的更具反应性的卤素原子被置换形成WPTM5-WPTM3-WPTM2片段。然后将所得单卤化物与适当的硼酸在Suzuki条件下反应,得到PTM结合部分WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM2。酯水解后,然后将所得酸与带有氨基基团的ULM部分偶联,以在一个分子中结合PTM和ULM结合部分。
方案6
Figure BDA0003676261880002411
如方案6所示,含乙缩醛的ULM部分可在足够温和的条件下进行酸催化的水解形成醛,然后使其与具有含氨基基团接头L′的WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM2片段在还原胺化条件下反应,形成PTM-ULM偶联产物。本领域普通技术人员将能够选择合适的试剂和条件来进行所需的转化。
方案7
Figure BDA0003676261880002421
如方案7所示,含羟基的部分R3与单保护的氟化二醇之间的Mitsunobu型反应得到含氟的中间体。O-脱保护后,游离羟基被活化(例如作为磺酸酯)随后用在WPTM5处带有氨基的WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM1部分置换。酯水解后,将所得酸与带有氨基基团的ULM部分偶联,以在一个分子中结合PTM和ULM结合部分。
方案8
Figure BDA0003676261880002431
如方案8所示,用包含R3的含羟基基团的酯亲核取代L′-OLG中的离去基团,产生结合接头L′和L”的偶联产物。随后的碱性水解和所得酸与带有氨基的ULM部分的偶联得到ULM片段,两个顺序附接的基团L′和L″附接到该ULM片段上。对L′的氨基基团进行N-脱保护,然后用WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM1-L″′醛还原胺化或与WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM1-L″′羧酸缩合,得到PTM-ULM偶联产物。
方案9
Figure BDA0003676261880002441
如方案9所示,用具有R3的含羟基基团的化合物亲核取代部分WPTM5中的氟原子,得到WPTM5-L-R3卤化物,其在Suzuki或Buchwald条件下与单保护的二胺WPTM5偶联。第二氨基基团脱保护后,然后通过亲核芳族取代使WPTM3-WPTM5-L-R3部分与双卤代WPTM2反应,得到单卤化物。随后与适当的硼酸进行Suzuki反应,得到WPTM1-WPTM2-WPTM3-WPTM5-L-R3酯。碱性水解并与带有氨基基团的ULM部分偶联,得到PTM-ULM偶联产物。
合成本公开的示例性化合物的一种可能方法是通过遵循以下方案中详述的一般合成路线:
Figure BDA0003676261880002451
本领域的技术人员应当理解,可以采用改进的方法来经由不同的化学接头附接PTM。例如,在WPTM5经由CH2基团(在上述方案中X=CH2)连接到L’的情况下,可以设想以下方案中描述的方法:
Figure BDA0003676261880002452
替代地,如果不存在WPTM5,则可以根据以下一般方案合成由式I表示的示例性化合物的PTM:
Figure BDA0003676261880002461
本领域技术人员应当理解,可以修改本文所述的一般方法以适应WPTM1、WPTM2、WPTM3、WPTM4、WPTM5、WPTM6和WPTM7环的特定性质。例如,在一些实施方案中,由式II表示的示例性化合物可以如以下一般合成方案中所述制备,其中本领域技术人员将认识到,取决于示例性化合物的特定化学性质,可能需要额外的保护/脱保护步骤:
Figure BDA0003676261880002462
在一个实施方案中,其中X表示NH,取决于是否存在WPTM5,可以根据以下两种方案中的一种制备示例性化合物:
Figure BDA0003676261880002471
当不存在WPMT5时,可以按照针对式I的化合物描述的一般方法来制备由通式III表示的示例性PTM。
由通式IV表示的示例性PTM可根据以下一般方案制备:
Figure BDA0003676261880002481
示例性化合物11的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002482
在0·C下,向2-(2-(2-羟基乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.5g,6.8mmol)和TEA(2.07g,20.5mmol)在DCM(5mL)的混合物中添加TsCl(1.95g,10.23mmol)。将所得混合物升温至室温,并搅拌3小时。将该溶液用水(20mL)淬灭,并用DCM萃取。用盐水(20mL x2)洗涤有机相。将有机相经Na2SO4干燥,过滤并浓缩。通过快速色谱法(CH2Cl2∶MeOH 40∶1)纯化残余物,得到2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(2.14g,84%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880002491
将4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(1.11g,5.722mmol)、2-(2-(2-(甲苯磺酰氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(2.14g,5.722mmol)和Cs2CO3(3.73g,11.444mmol)在无水DMF(10mL)中的混合物加热至75℃,保持3小时。然后将反应混合物冷却至室温,并用EtOAc(30mL)稀释。将有机层用水(10mL)和盐水(10mL x2)洗涤,干燥(Na2SO4),过滤并浓缩。将粗残余物(2.8g)用于下一反应中,无需进一步纯化。
步骤3
Figure BDA0003676261880002492
将2-(2-(2-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(1.5g,3.79mmol)、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(1.1g,5.69mmol)、PdCl2(dppf)(555mg,0.758mmol)、tBuPHBF4(441mg,1.52mmol)和Cs2CO3(3.09g,9.48mmol)在二噁烷(10mL)和水(1ml)中的混合物加热至100℃,在N2下搅拌3小时。滤出固体,并将滤液浓缩。通过色谱法(CH2Cl2∶MeOH 30∶1)纯化残余物,得到2-(2-(2-(4-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(800mg,53%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880002493
将2-(2-(2-(4-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(800mg,2.02mmol)、(2-羟苯基)硼酸(418mg,3.03mmol)、碳酸铯(1.65g,5.05mmol)、PdCl2(dppf)(444mg,0.606mmol)和tBu3PHBF4(352mg,1.212mmol)在二噁烷(10mL)和水(1mL)中的悬浮液在氮气下加热至100·C,保持3小时。将混合物冷却至室温,并将固体滤出。将滤液浓缩并通过色谱法(CH2Cl2∶MeOH 40∶1)纯化,得到2-(2-(2-(4-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁酯(400mg,44%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880002501
在0·C下,向2-(2-(2-(4-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酸叔丁基酯(400mg,0.88mmol)在THF/H2O(5mL,2∶1)中的溶液中添加LiOH(111mg,2.64mm0l)。将该混合物在0·C下搅拌2小时。用1M HCl淬灭反应溶液。将溶液干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩,得到粗制的2-(2-(2-(4-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酸(600mg),将其用于下一步,无需进一步纯化。
步骤6
Figure BDA0003676261880002502
在0·C下,向2-(2-(2-(4-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酸(200mg,粗品)、(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(430mg,1mmol)和DIPEA(516mg,4mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加HATU(570mg,1.5mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。用乙酸乙酯(50mL)萃取混合物。将合并的有机相用盐水(8mL x2)洗涤,干燥(Na2SO4),并过滤。将有机层减压浓缩。通过制备型TLC(6%MeOH的DCM溶液)纯化残余物,得到(2S,4R)-1-((S)-2-(2-(2-(2-(4-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙氧基)乙氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(22mg)。
1HNMR(400MHz,MeOD):δ8.83(s,1H),8.32(s,1H),8.04(d,J=9.6Hz,2H),7.78(d,J=7.6Hz,1H),7.65(d,J=10.0Hz,1H),7.39(d,J=8.0Hz,2H),7.32-7.34(m,2H),7.28(m,1H),6.95(d,J=7.6Hz 2H),4.69(d,J=9.6Hz 1H),4.44-4.57(m,6H),4.25-4.35(m,1H),3.60-3.99(m,11H),2.46(s,3H),2.23(m,1H),2.08(m,1H),1.01(s,9H)。
根据下面的方案,使用类似于上文对于示例性化合物11所述的程序以及本领域技术人员已知和理解的程序来制备示例性化合物5:
Figure BDA0003676261880002521
使用针对示例性化合物11和示例性化合物5所述的程序来制备:示例性化合物1、示例性化合物2、示例性化合物3、示例性化合物4。
示例性化合物9的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002531
在0·C下,向3,6,9,12-四氧杂十四烷-1,14-二醇(13.5g,56.8mmol)在无水DMF(30mL)中的溶液中添加60%NaH(1.25g,31.2mmol)。将反应混合物在室温下搅拌0.5小时。然后向该混合物中滴加4-溴-2-氟吡啶(5g,28.4mmol),并将该混合物加热至75℃,保持2小时。将反应混合物用水(10mL)淬灭,并用EA(200mL)萃取。将有机相用盐水(10mL)洗涤,干燥(Na2SO4)并减压浓缩。通过硅胶柱纯化残余物,得到14-((4-溴吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12-四氧杂十四烷-1-醇(9.0g,22.9mmol,81%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880002532
在0·C下,向14-((4-溴吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12-四氧杂十四烷-1-醇(5.0g,12.7mmol)在无水THF(50mL)中的溶液中添加60%NaH(660mg,16.5mmol)。将反应混合物在室温下搅拌40分钟。然后向该混合物中滴加2-溴乙酸叔丁酯(4.9g,25.4mmol),并在室温下搅拌过夜。将反应混合物用2NNH4Cl(10mL)淬灭,并用EA(200mL)萃取。然后将有机相用盐水(10mL)洗涤,干燥(Na2SO4),并减压浓缩。通过硅胶柱纯化残余物,得到17-((4-溴吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸叔丁酯(2.6g,5.13mmol,40%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880002541
将17-((4-溴吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸叔丁酯(250mg,1.18mmol)、3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(718mg,1.4mmol)、碳酸铯(769mg,2.36mmol)、Pd2(dba)3(110mg,0.12mmol)和XantPhos(138mg,0.24mmol)在二噁烷(5mL)中的混合物在密封管中在氮气下加热至110·C过夜。用EA(100mL)萃取该混合物。然后将有机相用水(10mL)、盐水(10mL)洗涤,干燥(Na2SO4),并减压浓缩。通过硅胶柱纯化残余物,得到8-(2-((19,19-二甲基-17-氧代-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十烷基)氧基)吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(550mg,0.86mmol,73%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880002542
在室温下,向8-(2-((19,19-二甲基-17-氧代-3,6,9,12,15,18-六氧杂二十烷基)氧基)吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(550mg,0.86mmol)在MeOH(15mL)中的溶液中添加HCl的二噁烷溶液(6N的二噁烷溶液)(5ml,30mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。减压浓缩混合物,得到粗制17-((4-(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸甲酯(0.55g)。
步骤5
Figure BDA0003676261880002551
向粗制的17-((4-(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸甲酯(550mg粗品)在DMSO(5mL)中的溶液中添加5-溴-6-氯哒嗪-3-胺(526mg,2.71mmol)和DIPEA(1.87g,14.5mmol)。将该溶液在150·C下搅拌过夜。用EA(60mL)萃取该混合物。用水(8mL)和盐水(8mL)洗涤有机相。将有机层干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物,得到17-((4-((1R,5S)-3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸甲酯(400mg)。
步骤6
Figure BDA0003676261880002552
向17-((4-((1R,5S)-3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸甲酯(325mg,0.52mmol)和(2-羟苯基)硼酸(93mg,0.68mmol)在二噁烷(12mL)和水(1.2mL)中的溶液中添加碳酸铯(542mg,1.66mmol)、PdCl2(dppf)(73.2mg,0.1mmol)和t-Bu3PHBF4(58mg,0.2mmol)。将该溶液于100·C在氮气气氛下搅拌4小时。用1N HCl将溶液的pH调节至5。过滤混合物,并将滤液减压浓缩,得到粗制的17-((4-((1R,5S)-3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸(300mg),将其用于下一步,无需进一步纯化。
步骤7
Figure BDA0003676261880002561
在0·C下,向粗制的17-((4-((1R,5S)-3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酸(80mg,0.12mmol)和(2S,4R)-1-((S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(108mg,0.24mmol)在DMF(5mL)中的溶液中添加DIPEA(124mg,0.96mmol)和HATU(92mg,0.24mmol)。将反应混合物在室温下搅拌30分钟。用EA(50mL)萃取该混合物。用水(8mL)和盐水(8mL)洗涤有机相。将有机层干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩。通过制备型TLC(6%MeOH的DCM溶液)纯化残余物,得到(2S,4R)-1-((S)-20-((4-((1R,5S)-3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-2-(叔丁基)-4-氧代-6,9,12,15,18-五氧杂-3-氮杂二十酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(20mg,0.018mmol,15.0%收率)。
1H NMR(400MHz,MeOD):δ8.74(s,1H),7.68-7.66(m,2H),7.34-7.28(m,5H),7.18-7.10(m,1H),6.80-6.78(m,2H),6.43-6.40(m,1H),6.10(s,1H),4.60-4.20(m,9H),3.92-3.89(m,2H),3.80-3.64(m,4H),3.71-3.45(m,16H),3.10-3.00(m,1H),3.00-2.90(m,2H),2.37-2.34(m,1H),2.35(s,3H),2.18-1.99(m,6H),0.92(s,9H).
使用类似程序,制备示例性化合物7、8、10和35。
示例性化合物6的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002571
向2-(2-(2-(2-((4-溴吡啶-2-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙-1-醇(3.49g,10mmol)[使用类似于实施例A2979所述的程序制备]在DCM(50mL)和H2O(25mL)中的溶液中添加PhI(OAc)2(9.66g,30mmol)和TEMPO(312mg,2mmol)。将反应混合物在室温下搅拌2小时。用EA(100mL)萃取该混合物。用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤有机相。将有机层干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物,得到2-(2-(2-(2-((4-溴吡啶-2-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(3.5g,9.64mmol,96%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880002572
在0·C下,向2-(2-(2-(2-((4-溴吡啶-2-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸(3.0g,8.26mmol)在MeOH(30mL)中的溶液中滴加SOCl2(4.0g,33.9mmol)。将反应混合物在室温下搅拌4小时。用饱和NaHCO3将溶液的pH调节至~8。用DCM(100mL)萃取该混合物。用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤有机相。将有机层干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩,得到2-(2-(2-(2-((4-溴吡啶-2-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸甲酯(2.9g,7.69mmol,93%收率)。
使用类似于示例性化合物9所述的程序,将2-(2-(2-(2-((4-溴吡啶-2-基)氧基)乙氧基)乙氧基)乙氧基)乙酸甲酯转化为最终化合物(2S,4R)-1-((2S)-14-((4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)-2-(叔丁基)-4-氧代-6,9,12-三氧杂-3-氮杂十四酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺(示例性化合物6)。
1HNMR(400MHz,MeOD):δ8.82(s,1H),7.76-7.74(m,2H),7.42-7.34(m,5H),7.22-7.18(m,1H),6.89-6.86(m,2H),6.53-6.52(m,1H),6.16(s,1H),4.66-4.28(m,9H),4.01-4.00(m,2H),3.82-3.60(m,12H),3.31-3.29(m,1H),3.10-3.08(m,2H),2.51-2.50(m,1H),2.49(s,3H),2.29-2.05(m,6H),2.42-2.29(m,2H),1.01(s,9H)。
示例性化合物20的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002581
向3,6,9,12,15-五氧杂十七烷-1,17-二醇(4g,14.2mmol)和Et3N(8.6g,85.2mmol)在DCM(50mL)中的溶液中添加TsCl(8.1g,42.6mmol)。将反应混合物在室温下搅拌1小时。将混合物在EtOAc(100mL)和水(10mL)之间分配。用盐水(10mL)洗涤有机相。将合并的有机层干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物,得到3,6,9,12,15-五氧杂十七烷-1,17-二基双(4-甲基苯磺酸酯)(6.0g,10.2mmol,72%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880002582
向3,6,9,12,15-五氧杂十七烷-1,17-二基双(4-甲基苯磺酸酯)(3.5g,5.93mmol)在无水DMF(20mL)中的溶液中添加4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(1.15g,5.93mmol)和Cs2CO3(3.87g,11.86mmol)。将反应混合物在75·C下搅拌0.5小时。将混合物冷却至室温,并在EtOAc(200mL)和水(20mL)之间分配。用盐水(20mL)洗涤有机相。将合并的有机层干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物,得到4-甲基苯磺酸17-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酯(0.6g,0.98mmol,收率16.5%)。
步骤3
Figure BDA0003676261880002591
向4-甲基苯磺酸17-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷酯(0.3g,0.49mmol)和(2S,4R)-4-羟基-N-(2-羟基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(268mg,0.49mmol)在DMF(5mL)中的的溶液中添加K2CO3(135mg,0.98mmol)。将该混合物于80·C在氮气气氛下搅拌2小时。用EA(80mL)萃取该混合物。用水(10mL)和盐水(10mL)洗涤有机相。将有机层干燥(Na2SO4),过滤并减压浓缩。通过硅胶柱色谱纯化残余物,得到(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)-2-((17-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氧基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺和(1-(17-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酰胺基)甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)-1H-吡唑-4-基)硼酸的混合物(270mg,0.27mmol,56%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880002601
向(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)-2-((17-(4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氧基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺和(1-(17-(2-(((2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-羧酰胺基)甲基)-5-(4-甲基噻唑-5-基)苯氧基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)-1H-吡唑-4-基)硼酸的混合物(270mg,0.27mmol)和5-溴-6-氯哒嗪-3-胺(85mg,0.41mmol)在二噁烷(20mL)和水(2mL)中的溶液中添加碳酸铯(220mg,0.68mmol)、PdCl2(dppf)(40mg,0.054mmol)和t-Bu3PHBF4(31mg,0.11mmol)。将该溶液于100·C在氮气气氛下搅拌4小时。减压浓缩该混合物。通过硅胶柱色谱纯化残余物,得到(2S,4R)-N-(2-((17-(4-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(175mg,0.18mmnol,67%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880002611
向(2S,4R)-N-(2-((17-(4-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(175mg,0.18mmol)和(2-羟苯基)硼酸(32mg,0.23mmol)在二噁烷(15mL)和水(1.5mL)中的溶液中添加碳酸铯(176mg,0.54mmol)、PdCl2(dppf)(53mg,0.072mmol)和t-Bu3PHBF4(42mg,0.144mmol)。将该溶液于100·C在氮气气氛下搅拌4小时。减压浓缩该混合物。通过硅胶柱色谱纯化残余物,得到(2S,4R)-N-(2-((17-(4-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)-3,6,9,12,15-五氧杂十七烷基)氧基)-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(1-氧代异吲哚啉-2-基)丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(24mg,0.023mmol,13%收率)。
1HNMR(400MHz,MeOD):δ8.84(s,1H),8.28(s,1H),8.05(d,J=12.4Hz,2H),7.38-7.81(m,6H),7.36-7.37(m,1H),6.98-7.00(m,2H),6.92(d,J=7.6Hz,2H),4.37-4.59(m,9H),4.15-4.16(m,2H),3.83-3.96(m,6H),3.46-3.56(m,16H),2.46(s,3H),2.44-2.45(m,1H),2.21-2.22(m,1H),2.09-2.10(m,1H),1.03(d,J=6.4Hz,3H),0.82(d,J=6.4Hz,3H)。
使用类似于示例性化合物20所述的程序制备示例性化合物12、13和21。
示例性化合物14的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002621
在250mL圆底烧瓶中置入4-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(1.5g,7.73mmol,1.00当量)在二噁烷/H2O(1∶1)(60mL)中的溶液、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(1.7g,8.16mmol,1.20当量)、Pd(PPh3)4(800mg,0.69mmol,0.10当量)、碳酸钾(2.9g,20.98mmol,3.00当量)。将所得溶液在100·C下在油浴中搅拌过夜。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)的硅胶柱上。得到1.0g(66%)呈白色固体的6-氯-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺。
步骤2
Figure BDA0003676261880002622
在10mL密封管中置入6-氯-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺(390mg,1.99mmol,1.00当量)在二噁烷(4mL)中的溶液、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(546mg,3.00mmol,1.50当量)、Pd(PPh3)4(300mg,0.26mmol,0.20当量)、碳酸钾(552mg,3.99mmol,2.00当量)在水(2mL)中的溶液。将所得溶液在100℃下在油浴中搅拌12小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)的硅胶柱上。得到120mg(20%)呈黄色固体的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺。
步骤3
Figure BDA0003676261880002631
在50mL圆底烧瓶中置入6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺(100mg,0.34mmol,1.00当量)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)中的溶液、2-[2-(2-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙-1-醇(100mg,0.33mmol,1.00当量)、碳酸钾(91mg,0.66mmol,2.00当量)。将所得溶液在70℃下在油浴中搅拌12小时。用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)的硅胶柱上。得到100mg(69%)呈黄色油状物的2-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]乙-1-醇。
步骤4
Figure BDA0003676261880002632
在100mL圆底烧瓶中置入2-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]乙-1-醇(100mg,0.23mmol,1.00当量)在二氯甲烷(20mL)中的溶液、4-甲苯磺酰氯(66.0mg,0.35mmol,1.50当量)、三乙胺(47mg,0.46mmol,2.00当量)、4-二甲基氨基吡啶(10mg,0.08mmol,0.30当量)。将所得溶液在室温下搅拌16小时。用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到100mg(74%)呈黄色油状物的4-甲基苯-1-磺酸2-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]乙酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880002641
在50mL圆底烧瓶中置入4-甲基苯-1-磺酸2-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]乙酯(120mg,0.2mmol,1.00当量)在N,N-二甲基甲酰胺(5mL)中的溶液、(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(130mg,0.2mmol,1.00当量)[如Qian,Y.等人在WO 2017/030814中所述制备]、碳酸钾(100mg,0.4mmol,2.00当量)。将所得溶液在70℃下搅拌12小时。用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到90mg呈无色油状物的(2S,4R)-1-[2-[3-(2-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤6
Figure BDA0003676261880002651
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-[3-(2-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(90.0mg,0.10mmol,1.00当量)在异丙醇(2mL)和四氢呋喃(2mL)中的溶液,然后添加浓氯化氢溶液(12N,2mL)。在室温下搅拌所得溶液1小时。真空浓缩所得混合物。通过制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱:XBridge C18 OBD制备型柱,
Figure BDA0003676261880002661
5μm,19mm X250mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流速:20mL/min;梯度:在8分钟内32%B升至41%B;254nm;室温:70min。得到56mg(65%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[2-(3-[2-[2-(2-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
通过手性-制备型HPLC纯化产物,条件如下:柱,CHIRAL ARTCellulose-SB,2*25cm,5um;流动相,Hex--HPLC和乙醇--HPLC(在24分钟内保持50%乙醇-HPLC);检测器,UV220/254nm。得到17.8mg(34%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-(3-[2-[2-(2-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺[1HNMR(300MHz,CD3OD):δ8.82(d,J=11.1Hz,1H),8.29-8.18(m,1H),8.11-7.89(m,2H),7.80(d,J=8.2Hz,1H),7.48-7.41(m,1H),7.37-7.30(m,3H),7.30-7.19(m,1H),6.95-6.83(m,2H),5.89(s,1H),4.59-4.41(m,2H),4.40-4.30(m,4H),4.27-4.11(m,2H),3.86(q,J=5.3Hz,2H),3.75-3.59(m,6H),3.56(s,3H),2.42(d,J=5.0Hz,3H),2.36-2.10(m,2H),2.04-2.01(m,J=13.1,8.1,4.7Hz,1H),1.26(s,1H),0.99(d,J=6.6Hz,3H),0.83(d,J=6.8Hz,3H)]和24.4mg(47%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-(3-[2-[2-(2-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(300MHz,CD3OD):δ8.82(d,J=6.6Hz,1H),8.26(dd,J=3.1,0.8Hz,1H),8.10-7.96(m,2H),7.86-7.75(m,1H),7.45-7.30(m,4H),7.25-7.22(m,1H),6.96-6.84(m,2H),5.88(s,1H),4.70-4.42(m,3H),4.41-4.33(m,3H),4.28-4.17(m,2H),3.87(t,J=5.0Hz,3H),3.85-3.63(m,2H),3.59-3.57(m,6H),2.41(d,J=12.2Hz,3H),2.38-2.33(m,1H),2.25-2.12(m,1H),2.06-2.02(m,1H),1.26(s,1H),0.97(dd,J=6.6,1.8Hz,3H),0.80(dd,J=6.6,1.8Hz,3H)]。
使用上文用于示例性化合物14和示例性化合物15所述的程序制备示例性化合物16、17、18和19。
示例性化合物22的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002671
在250mL圆底烧瓶中置入(Z)-4-(苄基氧基)-N-羟基丁碳亚氨基酰氯(8.7g,38.21mmol,1.00当量)、丁-3-炔-1-醇(3.3g,47.08mmol,1.23当量)、乙酸乙酯(70mL)、水(70mL)、碳酸氢钠(4.0g,47.61mmol,1.25当量)。将所得溶液在25·C下搅拌2小时。将所得溶液用乙酸乙酯萃取,并用饱和氯化钠水溶液洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到5.9g(59%)呈黄色油状物的2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]乙-1-醇。
步骤2
Figure BDA0003676261880002672
在100mL圆底烧瓶中置入2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]乙-1-醇(550.0mg,2.10mmol,1.00当量)、丙酮(30mL)、Cr2O3(100.0mg)、硫酸(0.25mL)、水(1mL)。将所得溶液在25·C下搅拌1小时。用水稀释所得溶液。将所得溶液用乙酸乙酯萃取,并用饱和氯化钠水溶液洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。得到420mg(72%)呈黄色油状物的2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]乙酸。
步骤3
Figure BDA0003676261880002681
在250mL圆底烧瓶中置入2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]乙酸乙酯(8.0g,26.37mmol,1.00当量)、乙醇(50mL)、硫酸(0.1mL)。将所得溶液在70·C下搅拌1.5小时。真空浓缩所得混合物。通过快速-制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱,C18硅胶;流动相,在49分钟内将乙腈∶水=0∶100增加至乙腈∶水=60∶40;检测器,UV 220nm。得到4.5g(56%)呈浅黄色油状物的2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]乙酸乙酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880002682
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL 3颈圆底烧瓶中置入2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]乙酸乙酯(4.5g,14.83mmol,1.00当量)和四氢呋喃(70mL)。然后在20分钟内,在0·C下,一边搅拌一边滴加t-BuOK(2.0g,17.82mmol,1.20当量)在四氢呋喃(17.8mL)中的溶液。在2分钟内,在0·C下,一边搅拌一边向其中滴加2-碘丙烷(3.01g,17.71mmol,1.19当量)。将所得溶液在25·C下搅拌2小时。然后用水淬灭该反应。将所得溶液用乙酸乙酯萃取,并用饱和氯化钠水溶液洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。得到4.3g(84%)呈橙色油状物的2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸乙酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880002691
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL 3颈圆底烧瓶中置入2-[3-[3-(苄基氧基)丙基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸乙酯(4.2g,12.16mmol,1.00当量)和二氯甲烷(100mL)。然后在30分钟内,在-78·C下,一边搅拌一边滴加BBr3(5.17g,20.64mmol,1.70当量)在二氯甲烷(20.7mL)中的溶液。将所得溶液在-78·C下搅拌2小时。然后淬灭该反应。将所得溶液用二氯甲烷萃取,并用饱和氯化钠水溶液洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。通过快速-制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱,C18硅胶;流动相,在25分钟内将乙腈∶水=0∶100增加至乙腈∶水=23∶76;检测器,UV 220nm。得到2.6g(84%)呈橙色油状物的2-[3-(3-羟基丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸乙酯。
步骤6
Figure BDA0003676261880002692
在100mL圆底烧瓶中置入2-[3-(3-羟基丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸乙酯(1.2g,4.70mmol,1.00当量)、乙醇(20mL)、水(10mL)、氢氧化钠(1.9g,47.50mmol,10.0当量)。将所得溶液在室温下搅拌1夜。用氯化氢(2M)将溶液的pH值调节至6。将所得溶液用乙酸乙酯萃取,并用饱和氯化钠洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。得到800mg(75%)呈黄色油状物的2-[3-(3-羟基丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸。
步骤7
Figure BDA0003676261880002701
在100mL圆底烧瓶中置入2-[3-(3-羟基丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸(800mg,3.52mmol,1.00当量)、(2S,4R)-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(1.24g,3.50mmol,1.00当量)、N,N-二甲基甲酰胺(15mL)、N-乙基-N-异丁基丙-2-胺(1.82g,14.08mmol,4.00当量),T3P(1.77g,1.20当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。然后用水淬灭该反应。将所得溶液用乙酸乙酯萃取,并用饱和氯化钠洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(5∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到870mg(53%)呈黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-1-[[3-(3-羟基丙基)-1,2-噁唑-5-基]羰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤8
Figure BDA0003676261880002711
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-4-羟基-1-[2-[3-(3-羟基丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(870mg,1.65mmol,1.00当量)、二氯甲烷(10mL)、4-甲基苯-1-磺酰氯(377mg,1.98mmol,1.20当量)、三乙胺(334.0mg,3.30mmol,2.00当量)、4-二甲基氨基吡啶(40mg,0.33mmol,0.20当量)。将所得溶液在室温下搅拌4小时。将所得溶液用二氯甲烷萃取,并用水和饱和氯化钠洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到600mg(53%)呈黄色固体的4-甲基苯-1-磺酸3-(5-[1-[(2S,4R)-4-羟基-2-([[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酰基)吡咯烷-1-基]-3-甲基-1-氧代丁烷-2-基]-1,2-噁唑-3-基)丙酯。
步骤9
Figure BDA0003676261880002712
在50mL圆底烧瓶中置入2-(2-羟基乙氧基)乙-1-醇(273.0mg,2.57mmol,5.00当量)和N,N-二甲基甲酰胺(5mL)。在0·C下添加氢化钠(41.0mg,1.71mmol,2.00当量),然后在20分钟后添加4-甲基苯-1-磺酸3-(5-[1-[(4S)-4-羟基-1-([[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酰基)吡咯烷-2-基]-3-甲基-1-氧代丁烷-2-基]-1,2-噁唑-3-基)丙酯(350.0mg,0.51mmol,1.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌4小时。将反应混合物用水稀释并用DCM萃取。将有机相经硫酸钠干燥并浓缩,并将残余物进行快速色谱。得到160mg(51%)呈黄色油状物的(4S)-4-羟基-2-[2-(3-[3-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]丙基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-1-甲酰胺。
步骤10
Figure BDA0003676261880002721
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-[3-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]丙基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(160mg,0.26mmol,1.00当量)、二氯甲烷(5mL)、4-甲基苯-1-磺酰氯(59mg,0.31mmol,1.20当量)、三乙胺(53mg,0.52mmol,2.00当量)、4-二甲基氨基吡啶(6mg,0.05mmol,0.20当量)。将所得溶液在室温下搅拌5小时。用二氯甲烷萃取所得溶液。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(12∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到72mg(36%)呈黄色油状物的4-甲基苯-1-磺酸2-[2-[3-(5-[1-[(2S,4R)-4-羟基-2-([[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酰基)吡咯烷-1-基]-3-甲基-1-氧代丁烷-2-基]-1,2-噁唑-3-基)丙氧基]乙氧基]乙酯。
步骤11
Figure BDA0003676261880002731
在50mL圆底烧瓶中置入4-甲基苯-1-磺酸2-[2-[3-(5-[1-[(2S,4R)-4-羟基-2-([[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酰基)吡咯烷-1-基]-3-甲基-1-氧代丁烷-2-基]-1,2-噁唑-3-基)丙氧基]乙氧基]乙酯(70mg,0.09mmol,1.00当量)、6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺(27mg,0.09mmol,1.00当量)、乙腈(2mL)、碳酸钾(38mg,0.27mmol,3.00当量)。将所得溶液在80·C下搅拌1夜。将所得溶液用乙酸乙酯萃取,并用水洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到30mg(37%)呈黄色油状物的(2S,4R)-1-[2-[3-(3-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤12
Figure BDA0003676261880002741
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-[3-(3-[2-[2-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙氧基]乙氧基]丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(27.0mg,0.03mmol,1.00当量)、甲醇(2mL)、氯化氢(水溶液)(0.5mL)。将所得溶液在室温下搅拌1夜。用水稀释所得溶液。用碳酸钠将溶液的pH值调节至8。将所得溶液用乙酸乙酯萃取,并用水洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱:XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(0.05%NH3H2O),流动相B:乙腈;流速:20mL/min;梯度:在8分钟内34%B降至47%B;220nm。得到7.6mg(30%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[2-(3-[3-[2-(2-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙氧基)乙氧基]丙基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
1H-NMR:(400MHz,CD3OD)δ8.89-8.83(m,1H),8.31-8.26(m,1H),8.08-8.03(m,2H),7.85-7.81(m,1H),7.46-7.21(m,5H),6.96-6.87(m,2H),6.15(s,1H),4.52-4.44(m,5H),4.41-4.31(m,3H),3.91-3.80(m,2H),3.72-3.65(m,1H),3.61-3.35(m,6H),2.62-2.51(m,2H),2.45-2.33(m,3H),2.22-2.15(m,1H),2.10-2.01(m,1H),1.84-1.72(m,2H),1.30-1.24(m,1H),1.03-0.97(m,3H),0.91-0.75(m,3H)。
示例性化合物23和示例性化合物24的示例性合成
Figure BDA0003676261880002751
在25mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-[3-(3-[2-[2-(2-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(87mg,0.10mmol,1.00当量)[如示例性化合物22所述制备]和甲醇(10mL)。将所得溶液在25·C下搅拌1小时。通过手性-制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱,CHIRALPAK ID-3;流动相,MtBE(0.1%DEA)∶EtOH=80∶20,尺寸:0.46*10cm;3um;检测器,UV-254nm。得到17mg(20%)呈灰白色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-(3-[2-[2-(2-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.83(s,1H),8.33(s,1H),8.23(s,1H),7.99(s,1H),7.70-7.67(d,J=9Hz,1H),7.48-7.45(d,J=9Hz,1H),7.37-7.32(m,4H),7.00-6.97(m,2H),6.19(s,1H),4.61-4.58(m,1H),4.50-4.38(m,5H),3.91-3.86(m,3H),3.60-3.51(m,8H),3.50-3.43(m,2H),3.40-3.34(m,2H),2.57-2.52(m,2H),2.46-2.43(m,4H),2.30-2.23(m,1H),2.10-2.04(m,1H),1.73-1.69(m,2H),1.07-1.05(d,J=6.6Hz,3H),0.88-0.86(d,J=6.9Hz,3H)]和21mg(24%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(3-[2-[2-(2-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]丙基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(300MHz,CD3OD,ppm):δ8.88(s,1H),8.37(s,1H),8.31(s,1H),8.04(s,1H),7.69-7.67(d,J=8.1Hz,ppm),7.43-7.39(m,5H),7.03-6.99(m,2H),6.21-6.00(m,1H),4.53-4.48(m,3H),4.44-4.40(m,3H),3.92-3.89(m,3H),3.79-3.76(m,1H),3.62-3.54(m,7H),3.50-3.48(m,2H),3.42-3.40(m,2H),2.64-2.61(m,2H),2.46-2.44(m,4H),2.26-2.18(m,1H),2.13-2.04(m,1H),1.82-1.78(m,2H),1.05-1.02(d,J=6.6Hz,3H),0.85-0.82(d,J=6.9Hz,3H)]。
使用类似于上述用于示例性化合物22、23和24的程序制备示例性化合物25和26。
示例性化合物27的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002761
在50mL圆底烧瓶中置入2-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]乙-1-醇(257mg,1.71mmol,3.00当量)和N,N-二甲基甲酰胺(5mL)。然后在10分钟内,在0·C下,添加氢化钠(34mg,1.42mmol,1.50当量)。向其中添加4-溴-2-氟吡啶(100mg,0.57mmol,1.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌3小时。然后通过添加5mL水/冰来淬灭反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到90mg(52%)呈浅黄色液体的2-(2-[2-[(4-溴吡啶-2-基)氧基]乙氧基]乙氧基)乙-1-醇。
步骤2
Figure BDA0003676261880002771
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-(2-[2-[(4-溴吡啶-2-基)氧基]乙氧基]乙氧基)乙-1-醇(500mg,1.63mmol,1.00当量)、3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(347mg,1.64mmol,1.00当量)、Cs2CO3(1599mg,4.91mmol,3.00当量)、甲苯(8mL)、Ruphos(69mg,0.05当量)。将所得溶液在100·C下在油浴中搅拌5小时。然后通过添加10mL水来淬灭反应。用二氯甲烷/MeOH萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到419mg(59%)呈黄色油状物的8-(2-[2-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]乙氧基]吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880002781
在50mL圆底烧瓶中置入8-(2-[2-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]乙氧基]吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(419mg,0.96mmol,1.00当量)和1M HCl的甲醇溶液(8mL)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。得到319mg(99%)呈黄色油状物的2-(2-[2-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙氧基]乙氧基)乙-1-醇。
步骤4
Figure BDA0003676261880002782
在10mL微波管中置入2-(2-[2-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙氧基]乙氧基)乙-1-醇(319mg,0.95mmol,1.00当量)、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(780mg,3.74mmol,4.00当量)、DMSO(10mL)、DIEA(2mL)。将最终反应混合物在130·C下用微波辐射照射3小时。然后通过添加10mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到260mg(59%)呈黄色固体的2-[2-[2-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)乙氧基]乙氧基]乙-1-醇。
步骤5
Figure BDA0003676261880002791
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的10mL微波管中置入2-[2-[2-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)乙氧基]乙氧基]乙-1-醇(295mg,0.63mmol,1.00当量)、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(223mg,1.23mmol,2.00当量)、碳酸钾(254mg,1.84mmol,3.00当量)、二噁烷(4mL)、水(1mL)、Pd(PPh3)4(70mg,0.06mmol,0.10当量)。将所得溶液在100·C下搅拌过夜。然后,通过添加水来淬灭该反应。用二氯甲烷/MeOH萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到221mg(61%)呈黄色固体的2-[2-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙-1-醇。
步骤6
Figure BDA0003676261880002792
在50mL圆底烧瓶中置入2-[2-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙-1-醇(100mg,0.18mmol,1.00当量)、TsCl(50mg,0.26mmol,1.50当量)、二氯甲烷(5mL)、三乙胺(0.3mL)、4-二甲基氨基吡啶(2mg,0.02mmol,0.10当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。然后,通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到97mg(76%)呈黄色固体的4-甲基苯-1-磺酸2-[2-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙酯。
步骤7
Figure BDA0003676261880002801
在50mL圆底烧瓶中置入4-甲基苯-1-磺酸2-[2-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙酯(87mg,0.12mmol,1.00当量)、N,N-二甲基甲酰胺(54mg,0.75mmol,1.00当量)、(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基吡咯烷-2-甲酰胺(79mg,0.16mmol,2.00当量)、Cs2CO3(5g,15.35mmol,127.15当量)。将所得溶液在室温下搅拌4小时。用二氯甲烷/MeOH萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(5∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到124mg(99%)呈黄色固体的(2S,4R)-1-[2-(3-[2-[2-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤8
Figure BDA0003676261880002811
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-(3-[2-[2-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(131mg,0.13mmol,1.00当量)、甲醇(5mL)和1M HCl的甲醇溶液(1.5mL)。将所得溶液在室温下搅拌7小时。用5mL H2O稀释所得溶液。用Na2CO3水溶液(2M)将溶液的pH值调节至7。用二氯甲烷萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。通过制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱,XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相,水(0.05%NH3H2O)和乙腈(在9分钟内39.0%乙腈升至50.0%);检测器,UV 220nm。得到60mg(48%)呈黄色固体的(2S,4R)-1-(2-[3-[2-(2-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙氧基]乙氧基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺,将其通过手性-制备型HPLC进一步纯化,条件如下:柱,Chiralpak ID-2,2*25cm,5um;流动相(0.1%DEA)和乙醇(在30分钟内保持30%乙醇);检测器,UV254/220nm。得到13.9mg(23%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[2-(2-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙氧基]乙氧基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.85(m,1H),7.78-7.72(m,2H),7.47-7.45(m,2H),7.40-7.34(m,3H),7.23-7.22(m,1H),6.92-6.88(m,2H),6.55-6.53(m,1H),6.23(s,1H),5.97(s,1H),4.64-4.59(m,2H),4.50(s,3H),4.40(s,2H),4.33-4.24(m,4H),3.81-3.79(m,2H),3.75-3.65(m,8H),3.29(m,1H),3.10-3.07(m,2H),2.48-2.46(m,3H),2.23-2.20(m,1H),2.13-2.06(m,6H),1.05(s,1H),0.90-0.89(d,J=6.8Hz,3H),0.78-0.76(d,J=8Hz,3H)]和17.9mg(29%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(2-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙氧基]乙氧基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(400MHz,CD3OD):δ8.88(m,1H),7.79-7.75(m,2H),7.49-7.39(m,5H),7.24(m,1H),6.92-6.90(m,2H),6.56-6.54(m,1H),6.25-6.24(M,1H),6.00(s,1H),4.53-4.29(m,10H),3.88-3.81(m,5H),3.70-3.63(m,6H),3.33(m,2H),3.14-3.12(m,2H),2.48-2.44(m,3H),2.42-2.29(m,1H),2.25-2.12(m,6H),1.04-1.02(d,J=6.4Hz,3H),0.88-0.86(d,J=6.4Hz,3H)]。
使用类似于示例性化合物27和28所述的程序制备示例性化合物29和30。
示例性化合物31的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002831
在50mL圆底烧瓶中置入2-(噁烷-2-基氧基)乙-1-醇(4.5g,30.78mmol,1.00当量)、四氢呋喃(10mL)、t-BuOK(3.6g,32.08mmol,2.00当量)在四氢呋喃(60mL)中的溶液。然后在0·C下,一边搅拌一边滴加3-溴丙-1-炔(2.61mL,1.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。然后,通过添加水/冰来淬灭该反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到2.8g(49%)呈黄色油状物的2-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基]噁烷。
步骤2
Figure BDA0003676261880002832
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的10mL微波管中置入2-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基]噁烷(2.8g,15.20mmol,1.00当量)、ZrCp2HCl(390mg,0.10当量)、三乙胺(153mg,1.52mmol,0.10当量)、频哪醇硼烷(2.5mL)。将所得溶液在68℃下在油浴中搅拌过夜。然后,通过添加NH4Cl来淬灭该反应。用水/冰浴将反应混合物冷却至0·C。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到3.01g(63%)呈黄色液体的4,4,5,5-四甲基-2-[(1E)-3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]丙-1-烯-1-基]-1,3,2-二氧杂戊硼烷。
步骤3
Figure BDA0003676261880002841
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的10mL微波管中置入4,4,5,5-四甲基-2-[(1E)-3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]丙-1-烯-1-基]-1,3,2-二氧杂戊硼烷(1g,3.20mmol,1.00当量)、Pd(PPh3)4(800mg,0.69mmol,1.00当量)、碳酸钾(8g,57.88mmol,18.07当量)、二噁烷(2g)、8-(2-溴吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(902mg,2.45mmol,3.00当量)、水(252mg,0.10当量)。将所得溶液在100·C下在油浴中搅拌1夜。然后,通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到639mg(42%)呈黄色油状物的8-[2-[(1E)-3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]丙-1-烯-1-基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880002851
在50mL圆底烧瓶中置入8-[2-[(1E)-3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]丙-1-烯-1-基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(639mg,1.35mmol,1.00当量)、碳载钯(200mg)和甲醇(15mL),并将混合物在氢气气氛下于室温搅拌过夜。滤出固体,并将滤液浓缩。得到639mg(100%)呈黄色油状物的8-(2-[3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]丙基]吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880002852
在50mL圆底烧瓶中置入8-(2-[3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]丙基]吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(639mg,1.34mmol,1.00当量)、甲醇(15mL),并向溶液中鼓泡通入氯化氢气体。将所得溶液在室温下搅拌3小时。真空浓缩所得混合物。得到387mg(100%)呈黄色油状物的2-[3-(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙氧基]乙-1-醇。
步骤6
Figure BDA0003676261880002861
在10mL微波管中置入2-[3-(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙氧基]乙-1-醇(387mg,1.85mmol,1.00当量)、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(1.54g,7.39mmol,4.00当量)、DMSO(8mL)、DIEA(1.53mL,5.00当量)。将最终反应混合物在130·C下用微波辐射照射3小时。然后,通过添加水来淬灭该反应。用二氯甲烷/MeOH=10∶1萃取所得溶液,合并水层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(7:3)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到519mg(67%)呈黄色油状物的2-(3-[4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]丙氧基)乙-1-醇。
步骤7
Figure BDA0003676261880002871
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-(3-[4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]丙氧基)乙-1-醇(650mg,1.55mmol,1.00当量)、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(566mg,3.11mmol,2.00当量)、二噁烷(8mL)、水(2mL)、碳酸钾(644mg,4.66mmol,3.00当量)、Pd(PPh3)4(180mg,0.16mmol,0.10当量)。将所得溶液在100·C下在油浴中搅拌3小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用甲醇/H2O(85∶15)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到400mg(50%)呈黄色油状物的2-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基]乙-1-醇。
步骤8
Figure BDA0003676261880002872
在50mL圆底烧瓶中置入2-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基]乙-1-醇(400mg,0.77mmol,1.00当量)、二氯甲烷(15mL)、TsCl(219mg,1.15mmol,1.50当量)、三乙胺(155mg,1.53mmol,2.00当量)、4-二甲基氨基吡啶(9.4mg,0.08mmol,0.10当量)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。然后,通过添加水来淬灭该反应。用二氯甲烷萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到330mg(64%)呈黄色固体的4-甲基苯-1-磺酸2-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基]乙酯。
步骤9
Figure BDA0003676261880002881
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-(6-氯代吡啶-3-基)乙酸甲酯(500mg,2.69mmol,1.00当量)、哌嗪-1-羧酸叔丁酯(502mg,2.70mmol,1.00当量)、Cs2CO3(2.63g,8.07mmol,3.00当量)、甲苯(10mL)、RuPhosPd(115mg,0.05当量)。将所得溶液在100·C下在油浴中搅拌过夜。然后,通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。用饱和氯化钠洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到319mg(35%)呈黄色固体的4-[5-(2-甲氧基-2-氧代乙基)吡啶-2-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯。
步骤10
Figure BDA0003676261880002891
在50mL圆底烧瓶中置入4-[5-(2-甲氧基-2-氧代乙基)吡啶-2-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(319mg,0.95mmol,1.00当量)、二氯甲烷(8mL)、三氟乙酸(2mL)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。得到223mg(100%)呈黄色油状物的2-[6-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基]乙酸甲酯。
步骤11
Figure BDA0003676261880002892
在50mL圆底烧瓶中置入2-[6-(哌嗪-1-基)吡啶-3-基]乙酸甲酯(101mg,0.43mmol,1.00当量)、4-甲基苯-1-磺酸2-3-[4-(3-3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基乙酯(320mg,0.47mmol,1.10当量)、乙腈(4mL)、碳酸钾(298mg,2.16mmol,5.00当量)、NaI(193mg,3.00当量)。将所得溶液在60·C下搅拌过夜。真空浓缩所得混合物。将残余物在二氯甲烷和水之间分配,分离有机层,并用饱和氯化钠洗涤。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(5∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到94mg(30%)呈黄色固体的2-[6-[4-(2-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基]乙基)哌嗪-1-基]吡啶-3-基]乙酸甲酯。
步骤12
Figure BDA0003676261880002901
在50mL圆底烧瓶中置入2-[6-[4-(2-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基]乙基)哌嗪-1-基]吡啶-3-基]乙酸甲酯(94mg,0.13mmol,1.00当量)、甲醇(5mL)、水(2mL)和LiOH(15mg,0.64mmol,5.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌2天。真空浓缩所得混合物。用10mL H2O稀释所得溶液。用二氯甲烷萃取所得溶液,合并水层并真空浓缩。将残余物溶于10mL甲醇中。滤出固体。真空浓缩所得混合物。得到72mg(78%)呈黄色固体的2-[6-[4-(2-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基]乙基)哌嗪-1-基]吡啶-3-基]乙酸。
根据以下方案并使用上述用于先前实施例的程序,将2-[6-[4-(2-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙氧基]乙基)哌嗪-1-基]吡啶-3-基]乙酸转化为最终化合物(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(6-(4-(2-(3-(4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)丙氧基)乙基)哌嗪-1-基)吡啶-3-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880002911
使用针对示例性化合物31所述的程序制备示例性化合物50。
示例性化合物32的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002921
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL圆底烧瓶中置入2-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]乙-1-醇(10.0g,66.59mmol,1.00当量)在二氯甲烷(100mL)中的溶液、(二乙基氧瓮)三氟硼酸酯(1.9g,13.33mmol,0.20当量)和2-重氮乙酸乙酯(3.8g,0.50当量)。将所得溶液在室温下搅拌3小时。然后,通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。所得混合物用盐水洗涤。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到3.6g(23%)呈黄色油状物的2-[2-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]乙氧基]乙酸乙酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880002922
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-[2-[2-(2-羟基乙氧基)乙氧基]乙氧基]乙酸乙酯(1.0g,4.23mmol,1.00当量)在二氯甲烷(20mL)中的溶液、4-甲基苯-1-磺酰氯(970mg,5.09mmol,1.20当量)、三乙胺(860.0mg,8.50mmol,2.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌5小时。然后,通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。所得混合物用盐水洗涤。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到1.1g(65%)呈黄色油状物的2-[2-[2-(2-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]乙酸乙酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880002931
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-[2-[2-(2-[[(4-甲基苯)磺酰基]氧基]乙氧基)乙氧基]乙氧基]乙酸乙酯(1.0g,2.56mmol,1.20当量)在N,N-二甲基甲酰胺(20mL)中的溶液、6-溴吡啶-2-醇(370mg,2.13mmol,1.00当量)、Cs2CO3(2.1g,6.45mmol,3.00当量)。将所得溶液在80·C下搅拌12小时。然后,通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。所得混合物用盐水洗涤。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到800mg(96%)呈黄色固体的1-(6-溴吡啶-2-基)-1,4,7,10-四氧杂十二烷-12-酸乙酯。
根据以下方案并使用类似于上述用于其他实施例的程序,将1-(6-溴吡啶-2-基)-1,4,7,10-四氧杂十二烷-12-酸乙酯转化为最终化合物(2S,4R)-1-[(2S)-2-(1-[6-[(1R,4R)-5-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-2,5-二氮杂双环[2.2.1]庚烷-2-基]吡啶-2-基]-1,4,7,10-四氧杂十二烷-12-酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880002941
示例性化合物33的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880002951
在250mL圆底烧瓶中置入1-溴-4-乙苯(5.5g,29.8mmol,1.0当量)、CCl4(100mL)、AIBN(490mg,3.0mmol,0.1当量)、N-溴琥珀酰亚胺(5.34g,30.0mmol,1.0当量)。将所得溶液在90℃下搅拌3小时。真空浓缩所得混合物。得到5.4g(68%)呈黄色油状物的1-溴-4-(1-溴乙基)苯。
步骤2
Figure BDA0003676261880002952
在100mL圆底烧瓶中置入6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺(300mg,1.0mmol,1.0当量)、N,N-二甲基甲酰胺(5.0mL)、1-溴-4-(1-溴乙基)苯(400.0mg,1.5mmol,1.5当量)、碳酸钾(414mg,3.0mmol,3.0当量)。将所得溶液在60℃下搅拌3小时。然后通过添加10mL水来淬灭该反应。用乙酸乙酯(20.0mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(1∶10)洗脱的硅胶柱上。得到300mg(62%)呈棕色固体的4-[1-[1-(4-溴苯基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺。
步骤3
Figure BDA0003676261880002961
在250mL圆底烧瓶中置入丙-2-炔-1-醇(10g,178.4mmol,1.0当量)、四氢呋喃(100.0mL)、氢化钠(6.4g,266.7mmol,0.9当量)和2-溴乙酸叔丁酯(28g,143.6mmol,0.8当量)。将所得溶液在室温下搅拌3小时。然后通过添加20mL氯化铵水溶液来淬灭该反应。真空浓缩所得混合物。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。得到24.0g(90%)呈黄色固体的2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙酸叔丁酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880002962
在250mL圆底烧瓶中置入2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙酸叔丁酯(6.6g,38.8mmol,1.0当量)、三乙胺(400.0mg,3.9mmol,0.1当量)、频哪醇硼烷(20.0mL)、ZrCp2HCl(1g,0.1当量)。将所得溶液在60℃下搅拌12分钟。然后通过添加10mL冰/来淬灭该反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,再合并有机层。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱上。得到5.0g(43%)呈黄色油状物的2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙酸叔丁酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880002963
在10mL密封管中置入4-[1-[1-(4-溴苯基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(300mg,0.6mmol,1.0当量)、2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙酸叔丁酯(279mg,0.9mmol,1.5当量)、Pd(PPh3)4(72mg,0.06mmol,0.1当量)、碳酸钾(259mg,1.9mmol,3.0当量)、二噁烷(4.0mL)和H2O(1.0mL)。将所得溶液在90℃下搅拌5小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到200mg(56%)呈黄色固体的2-[[(2E)-3-[4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]丙-2-烯-1-基]氧基]乙酸叔丁酯。
步骤6
Figure BDA0003676261880002971
在100mL圆底烧瓶中置入2-[[(2E)-3-[4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]丙-2-烯-1-基]氧基]乙酸叔丁酯(93mg,0.2mmol,1.0当量)、甲醇(5.0mL)、碳载钯(100mg)。将所得溶液于室温在氢气气氛下搅拌1小时。滤出固体。真空浓缩所得混合物。得到56mg(60%)呈黄色固体的2-(3-[4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]丙氧基)乙酸叔丁酯。
步骤7
Figure BDA0003676261880002972
在100mL圆底烧瓶中置入2-(3-[4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]丙氧基)乙酸叔丁酯(56mg,0.1mmol,1.0当量)、二氯甲烷(10.0mg)、三氟乙酸(5mL)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。得到45mg(90%)呈棕色固体的2-(3-[4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]丙氧基)乙酸。
步骤8
Figure BDA0003676261880002981
在25mL圆底烧瓶中置入2-[3-[4-(1-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙基)苯基]丙氧基]乙酸(26mg,0.06mmol,1.0当量)、N,N-二甲基甲酰胺(5mL)、(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基吡咯烷-2-甲酰胺(30mg,0.07mmol,1.2当量)、DIEA(21mg,0.2mmol,3.0当量)、T3P(53mg,1.2当量)。在室温下搅拌所得溶液1小时。然后通过添加0.5mL水来淬灭反应。滤出固体。通过制备型HPLC纯化粗产物(5mL),条件如下:柱,XBridge Prep C18 OBD柱,150mm5um;流动相,水(10MMOL/L碳酸氢盐胺)和ACN(在7分钟内45.0%ACN升至52.0%);检测器,UV 254/220nm。得到6mg(12%)呈灰色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-(2-[3-[4-(1-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基]乙基)苯基]丙氧基]乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
1H NMR(300MHz,甲醇-d4)δ8.79(s,1H),8.35-8.23(m,1H),8.09-7.97(m,2H),7.80(d,J=7.7Hz,1H),7.43-7.37(m,2H),7.31(d,J=8.1Hz,2H),7.24(d,J=8.1Hz,1H),7.20(s,4H),6.89(t,J=7.6Hz,2H),5.64-5.52(m,1H),4.66(s,1H),4.60-4.44(m,3H),4.27(d,J=15.5Hz,1H),3.92(d,J=4.6Hz,2H),3.88-3.74(m,2H),3.52(d,J=6.2Hz,2H),2.71(t,J=7.6Hz,2H),2.37(s,3H),2.18(d,J=7.7Hz,1H),2.07(dd,J=9.4,4.2Hz,1H),1.89(dd,J=7.3,1.2Hz,6H),1.26(s,1H),1.10-0.95(d,J=1.6Hz,9H),0.95-0.90(m,1H)。
示例性化合物34的示例性合成
根据以下方案使用上文用于其他实施例的程序以及本领域技术人员已知和理解的程序制备示例性化合物34。
Figure BDA0003676261880003001
示例性化合物36和示例性化合物37的示例性合成
根据以下方案使用上文用于其他实施例的程序以及本领域技术人员已知和理解的程序制备示例性化合物36和37。
Figure BDA0003676261880003011
Figure BDA0003676261880003021
示例性化合物38和示例性化合物39的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003031
在500mL圆底烧瓶中置入2-(哌嗪-1-基)乙-1-醇(26.0g,199.7mmol,1.0当量)、二氯甲烷(200.0mL)、三乙胺(40.4g,399.3mmol,2.0当量)、氯甲酸苄酯(40.8g,239.2mmol,1.2当量)。将所得溶液在0℃下搅拌2h。然后通过添加10mL水来淬灭该反应。用二氯甲烷(100mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到22g(42%)呈黄色油状物的4-(2-羟乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880003032
在100mL圆底烧瓶中置入4-(2-羟乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(5.3g,20.1mmol,1.0当量)和N,N-二甲基甲酰胺(30.0mL)。然后在5分钟内添加氢化钠(1.6g,66.7mmol,1.2当量)。在20分钟内向其中添加4-溴-2-氟吡啶(3.9g,22.2mmol,1.1当量)。将所得溶液在0℃下搅拌4小时。然后通过添加10mL氯化铵水溶液来淬灭该反应。用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到5.2g(62%)呈黄色油状物的4-[2-[(4-溴吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880003041
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL圆底烧瓶中置入4-[2-[(4-溴吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(2.1g,5.0mmol,1.0当量)、RuphosPd II(775.0mg,1.0mmol,0.2当量)和Cs2CO3(4.89g,15.0mmol,3.0当量)在PhMe(100mL)中的溶液。将所得混合物在100℃下在油浴中搅拌过夜。将反应混合物用水(100mL)淬灭,并用乙酸乙酯(100mL x2)萃取。将有机层合并并减压浓缩,并将残余物施加到使用100%乙酸乙酯洗脱的硅胶柱上。得到670mg(32%)呈黄色固体的8-[2-(2-[4-[(苄基氧基)羰基]哌嗪-1-基]乙氧基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880003042
在100mL圆底烧瓶中置入8-[2-(2-[4-[(苄基氧基)羰基]哌嗪-1-基]乙氧基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(670mg,1.2mmol,1.0当量)的甲醇(10.0mL)溶液。然后添加氯化氢的1,4-二噁烷溶液(4M,10mL)。将所得溶液在室温下搅拌5小时。真空浓缩所得混合物。得到410mg(69%)呈黄色固体的4-[2-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯盐酸盐。
步骤5
Figure BDA0003676261880003051
在10mL密封管中置入4-[2-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯盐酸盐(200.0mg,0.4mmol,1.0当量)、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(137.0mg,0.7mmol,1.5当量)、甲基亚砜(3.0mL)和N,N-二异丙基乙胺(1mL)。将最终反应混合物在130℃下用微波辐射照射6小时。然后通过添加1mL水来淬灭该反应。用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到100mg(42%)呈棕色固体的4-[2-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤6
Figure BDA0003676261880003052
在100mL圆底烧瓶中置入4-[2-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(390mg,0.7mmol,1.0当量)、二噁烷(8.0mL)、水(2.0mL)、碳酸钾(279mg,2.0mmol,3.0当量)、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(184.0mg,1.0mmol,1.50当量)、Pd(PPh3)4(78mg,0.07mmol,0.1当量)。将所得溶液在100℃下搅拌2小时。用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到120mg(26%)呈棕色固体的4-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤7
Figure BDA0003676261880003061
在氮气气氛下,在100mL圆底烧瓶中,向4-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(200mg,0.29mmol,1.00当量)在10mL异丙醇中的溶液中添加氢氧化钯(100mg,0.71mmol,2.42当量)。然后将烧瓶抽真空并用氢气冲洗。将所得溶液在室温下搅拌12小时。滤出固体。真空浓缩所得混合物。得到70mg(44%)呈棕色油状物的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[2-(哌嗪-1-基)乙氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺。
步骤8
Figure BDA0003676261880003062
在100mL圆底烧瓶中置入4-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(1.9g,10.0mmol,1.00当量)、N,N-二甲基甲酰胺(30mL)、2-溴-3-甲基丁酸乙酯(2.1g,10.0mmol,1.0当量)和碳酸铯(10.0g,30.7mmol,3.0当量)。将所得溶液在90℃下搅拌12小时。然后通过添加10mL水来淬灭该反应。用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶6)洗脱的硅胶柱上。得到3.3g(93%)呈白色固体的3-甲基-2-[4-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基]丁酸乙酯。
步骤9
Figure BDA0003676261880003071
在250mL圆底烧瓶中置入3-甲基-2-[4-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基]丁酸乙酯(3.0g,9.3mmol,1.0当量)、四氢呋喃(30mL)、水(30mL)、过硼酸钠(3.5g,23.3mmol,2.5当量)。将所得溶液在室温下搅拌12小时。真空浓缩所得混合物。用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到1740mg(88%)呈白色固体的2-(4-羟基-1H-吡唑-1-基)-3-甲基丁酸乙酯。
步骤10
Figure BDA0003676261880003072
在50mL圆底烧瓶中置入2-(4-羟基-1H-吡唑-1-基)-3-甲基丁酸乙酯(3.5g,16.5mmol,1.0当量)、甲醇(10mL)、水(10mL)和氢氧化钠(2.7g,67.5mmol,4.0当量)。将所得溶液在室温下搅拌12小时。用2M HCl将溶液的pH值调节至2。通过制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱,XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相,水(0.1%FA)和乙腈(在2分钟内0.0%乙腈升至4.0%,在8分钟内升至20.0%);检测器,UV 254nm。得到1.5g(49%)呈白色油状物的2-(4-羟基-1H-吡唑-1-基)-3-甲基丁酸。
步骤11
Figure BDA0003676261880003081
在100mL圆底烧瓶中置入2-(4-羟基-1H-吡唑-1-基)-3-甲基丁酸(500mg,2.7mmol,1.0当量)、N,N-二甲基甲酰胺(20mL)、(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(900mg,2.5mmol,0.9当量)、DIEA(1.1g,8.5mmol,3.0当量)、T3P(2.6g,1.5当量)。在室温下搅拌所得溶液1小时。然后通过添加5mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)的硅胶柱上。得到800mg(59%)呈黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(4-羟基-1H-吡唑-1-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤12
Figure BDA0003676261880003082
在5mL密封管中置入(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(4-羟基-1H-吡唑-1-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(300mg,0.60mmol,1.0当量)、N,N-二甲基甲酰胺(5.0mL)、1,2-二溴乙烷(222mg,1.2mmol,2.0当量)、碳酸钾(250mg,1.8mmol,3.0当量)。将所得溶液在70℃下搅拌12小时。然后通过添加1mL水来淬灭该反应。通过制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱,XBridge Shield RP18OBD柱,5um,19*150mm;流动相,水(10mmol/L碳酸氢铵)和乙腈(在8分钟内35.0%乙腈升至47.0%);检测器,UV 254nm。得到120mg(33%)呈黄色固体的(2S,4R)-1-[2-[4-(2-溴乙氧基)-1H-吡唑-1-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤13
Figure BDA0003676261880003091
在100mL圆底烧瓶中置入6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[2-(哌嗪-1-基)乙氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(54.6mg,0.1mmol,1.0当量)、乙腈(10.0mL)、碳酸钾(41mg,0.30mmol,3.0当量)、碘化钠(18mg,0.1mmol,1.2当量)、(2S,4R)-1-2-[4-(2-溴乙氧基)-1H-吡唑-1-基]-3-甲基丁酰基-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(60mg,0.1mmol,1.0当量)。将所得溶液在70℃下搅拌12小时。然后通过添加3mL水来淬灭该反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10/1)洗脱的硅胶柱上。得到30mg(29%)呈浅棕色固体的(2S,4R)-1-(2-[4-[2-(4-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1H-吡唑-1-基]-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤14
Figure BDA0003676261880003101
在25mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-(4-[2-[4-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙基)哌嗪-1-基]乙氧基]-1H-吡唑-1-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(40mg,0.04mmol,1.0当量)、甲醇(8mL)、氯化氢(150mL)。将所得溶液在室温下搅拌6小时。然后通过添加1mL水来淬灭反应。通过制备型HPLC纯化粗产物(5mL),条件如下:柱,XBridge Shield RP18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相,水(0.1%甲酸)和乙腈(在8分钟内13.0%乙腈升至27.0%);检测器,UV 254nm。得到30mg(78%)呈白色固体的(2S,4R)-1-(2-[4-[2-(4-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1H-吡唑-1-基]-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
通过手性制备型HPLC纯化(2S,4R)-1-(2-[4-[2-(4-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟基苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1H-吡唑-1-基]-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺,条件如下:柱,Chiralpak IC,2*25cm,5um;流动相,DCM和甲醇(在11分钟内保持50.0%甲醇);检测器,UV220/254nm。这产生5.6mg呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[4-[2-(4-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1H-吡唑-1-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(300MHz,甲醇-d4)δ8.89(s,1H),7.85-7.72(m,2H),7.56-7.36(m,6H),7.31-7.16(m,2H),6.97-6.85(m,2H),6.58(dd,J=6.2,2.2Hz,1H),6.24(d,J=2.1Hz,1H),5.05(q,J=6.9Hz,1H),4.67(d,J=10.6Hz,1H),4.60-4.47(m,3H),4.46(s,1H),4.39(t,J=5.4Hz,2H),4.06(t,J=5.3Hz,2H),3.87(dd,J=10.9,4.2Hz,1H),3.76(s,1H),3.73-3.55(m,2H),3.19-2.99(m,2H),2.92-2.69(m,12H),2.50(s,4H),2.30-2.14(m,5H),1.98(ddd,J=13.2,8.7,4.6Hz,1H),1.54(d,J=7.0Hz,3H),1.41-1.26(m,4H),1.20(t,J=7.0Hz,2H),1.08(d,J=6.5Hz,3H),0.93(d,J=4.1Hz,1H)]和8.1mg呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[4-[2-(4-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1H-吡唑-1-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(300MHz,甲醇-d4)δ8.88(d,J=13.8Hz,1H),7.85-7.69(m,2H),7.59-7.30(m,6H),7.32-7.18(m,2H),6.97-6.84(m,2H),6.57(dd,J=6.1,2.1Hz,1H),6.23(t,J=2.7Hz,1H),4.99(q,J=7.0Hz,1H),4.78(d,J=8.8Hz,1H),4.60(t,J=8.2Hz,1H),4.53(s,2H),4.37(dd,J=6.8,4.1Hz,3H),4.04(t,J=5.3Hz,2H),3.64(p,J=6.7Hz,3H),3.40-3.24(m,1H),3.11(dd,J=15.8,4.6Hz,2H),2.88-2.64(m,12H),2.49(d,J=13.8Hz,4H),2.34-2.10(m,6H),2.06(s,1H),1.95(td,J=8.5,4.2Hz,1H),1.50(d,J=7.0Hz,3H),1.33(td,J=7.8,7.4,4.4Hz,5H),1.20(t,J=7.0Hz,3H),1.08(d,J=6.7Hz,3H),0.93(q,J=6.8Hz,1H),0.74(dd,J=19.3,6.7Hz,3H)]。
示例性化合物43和示例性化合物44的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003121
在250mL圆底烧瓶中置入2-溴-4-氟吡啶(7.8g,44.32mmol,1.05当量)、3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(9g,42.4mmol,1.00当量)、DIEA(25g,193mmol,4.00当量)在NMP(120mL)中的溶液。将所得溶液在150·C下搅拌3小时。冷却反应混合物。然后,通过添加水(200mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得溶液,再合并有机层。用水(50mL x1)和盐水(50mL x1)洗涤所得混合物。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶2)洗脱的硅胶柱上。得到11.7g(75%)呈黄色固体的8-(2-溴吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880003131
在250mL圆底烧瓶中置入[(丙-2-炔-1-基氧基)甲基]苯(10g,68.4mmol,1.00当量)、频哪醇硼烷(10mL)、ZrCp2HCl(2g)、三乙胺(850mg,8.40mmol,0.12当量)的混合物。将所得溶液在65·C下在油浴中搅拌16小时。用水(30mL)淬灭所得混合物,然后用乙酸乙酯(50mL x3)萃取,并合并有机层。用盐水(50mL x1)洗涤所得混合物。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到12.5g(67%)呈黄色固体的2-[(1E)-3-(苄基氧基)丙-1-烯-1-基]-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷。
步骤3
Figure BDA0003676261880003132
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL圆底烧瓶中置入8-(2-溴吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(4.0g,10.9mmol,1.00当量)、2-[(1E)-3-(苄基氧基)丙-1-烯-1-基]-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷(4.48g,16.3mmol,1.50当量)、Pd(dppf)2Cl2二氯甲烷(890mg,1.09mmol,0.10当量)和碳酸钾(4.5g,32.6mmol,3.00当量)在二噁烷/H2O(80/20mL)中的溶液。将所得溶液在90·C下搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到4.55g(96%)呈黄色固体的8-[2-[(1E)-3-(苄基氧基)丙-1-烯-1-基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880003141
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL圆底烧瓶中置入8-[2-[(1E)-3-(苄基氧基)丙-1-烯-1-基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(12.9g,29.6mmol,1.00当量)在甲醇/HOAc(200/0.5mL)中的溶液。在氮气气氛下添加碳载钯(6g)。然后将烧瓶抽真空并用氢气冲洗。使用氢气球于50·C在氢气气氛下将反应混合物氢化20小时。通过硅藻土垫过滤出固体,并减压浓缩滤液。得到10.2g(99%)呈黄色油状物的8-[2-(3-羟基丙基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880003142
在100mL圆底烧瓶中置入8-[2-(3-羟基丙基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(700mg,2.0l mmol,1.00当量)在二氯甲烷(30mL)中的溶液,并在0~5·C下添加戴斯-马丁氧化剂(1.7g,2.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌6小时。在15·C下真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(5∶1)洗脱的硅胶柱上。得到500mg(72%)呈白色固体的8-[2-(3-氧代丙基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤6
Figure BDA0003676261880003151
在50mL圆底烧瓶中置入8-[2-(3-氧代丙基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(1.4g,4.05mmol,1.00当量)、哌嗪-1-羧酸苄酯(1.07g,4.86mmol,1.20当量)的二氯甲烷(20mL)溶液。将其搅拌20分钟,并在0·C下添加NaBH(OAc)3(2.58g,12.2mmol,3.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌4小时。然后,通过添加水/冰(50mL)来淬灭该反应。用二氯甲烷(50mL x3)萃取所得溶液,将有机层合并并经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10/1)洗脱的硅胶柱上。得到2.19g(98%)呈浅黄色油状物的8-[2-(3-[4-[(苄基氧基)羰基]哌嗪-1-基]丙基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤7
Figure BDA0003676261880003152
在100mL圆底烧瓶中置入8-[2-(3-[4-[(苄基氧基)羰基]哌嗪-1-基]丙基)吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(2.19g,3.98mmol,1.00当量)的甲醇(20mL)溶液。向所得溶液中鼓泡通入氯化氢气体,同时在室温下搅拌1h。真空浓缩所得混合物。得到1.79g(92%)呈浅黄色固体的4-[3-(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙基]哌嗪-1-羧酸苄酯盐酸盐。
步骤8
Figure BDA0003676261880003161
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL微波管中置入4-[3-(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙基]哌嗪-1-羧酸苄酯盐酸盐(1.79g,3.68mmol,1.00当量)、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(2.47g,11.9mmol,3.00当量)、DIEA(5.0mL)的DMSO(10mL)溶液。将所得溶液在130·C下在油浴中搅拌16小时。然后,通过添加水/冰(50mL)来淬灭该反应。用二氯甲烷(50mL x3)萃取所得溶液,将有机层合并并经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(5/1)洗脱的硅胶柱上。得到1.21g(57%)呈棕色固体的4-(3-[4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]丙基)哌嗪-1-羧酸苄酯。根据以下方案并使用上述用于其他实施例的程序,将4-(3-[4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]丙基)哌嗪-1-羧酸苄酯转化为6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[3-(哌嗪-1-基)丙基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(用于步骤10)。
步骤9
Figure BDA0003676261880003171
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(480mg,1.0mmol,1.0当量)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)中的溶液、碳酸钾(300mg,2.2mmol,2.2当量)和1,2-二溴乙烷(300mg,1.6mmol,1.6当量)。将所得溶液在70℃下在油浴中搅拌2小时。然后通过添加20mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯(3x30mL)萃取所得溶液,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶0)洗脱的硅胶柱上。得到235mg(40%)呈浅黄色固体的(2S,4R)-1-[2-[3-(2-溴乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤10
Figure BDA0003676261880003172
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL微波管中置入6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[3-(哌嗪-1-基)丙基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(92mg,0.17mmol,1.00当量)[根据以下方案并使用上述用于其他实施例的程序,由来自步骤8的4-(3-[4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]丙基)哌嗪-1-羧酸苄酯制备]、(2S,4R)-1-2-[3-(2-溴乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基-4-羟基-N-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基吡咯烷-2-甲酰胺(100mg,0.17mmol,1.00当量)、碳酸钾(70mg,0.51mmol,3.00当量)、NaI(25mg,0.17mmol,1.00当量)的乙腈(10mL)溶液。将所得混合物在70·C下在油浴中搅拌12小时。用二氯甲烷(100mL)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(30mL)洗涤所得混合物。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。得到180mg(粗品)呈浅黄色固体的(2S,4R)-1-(2-[3-[2-(4-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
根据以下方案并使用类似于上述用于其他实施例的程序,将(2S,4R)-1-(2-[3-[2-(4-[3-[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]丙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-(2-[4-[3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙基]哌嗪-1-基]乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺和(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(2-[4-[3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙基]哌嗪-1-基]乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880003201
示例性化合物40的示例性合成
根据以下方案使用上文用于其他实施例的程序以及本领域技术人员理解的程序制备示例性化合物40。
Figure BDA0003676261880003211
示例性化合物41和示例性化合物42的示例性合成
根据以下方案使用上述用于其他示例性化合物的程序制备示例性化合物41和42。
Figure BDA0003676261880003221
示例性化合物45的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003222
在250mL圆底烧瓶中置入2-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基]乙-1-醇(1g,6.94mmol,1.00当量)在二氯甲烷(80mL)中的溶液、三乙胺(2.8g,27.67mmol,3.00当量)、4-二甲基氨基吡啶(270mg,2.21mmol,0.30当量)和4-甲苯磺酰氯(1.9g,9.97mmol,1.50当量)。将所得溶液在室温下搅拌12小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶2)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到1.4g(68%)呈黄色油状物的4-甲基苯-1-磺酸2-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基]乙酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880003231
在25mL密封管中置入4-甲基苯-1-磺酸2-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基]乙酯(1.4g,4.69mmol,1.00当量)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)中的溶液、碳酸钾(1.6g,11.58mmol,3.00当量)、碘化钠(280mg,0.50当量)和2-(哌嗪-1-基)乙酸叔丁酯(898mg,4.48mmol,1.20当量)。将所得溶液在70·C下在油浴中搅拌12小时。用乙酸乙酯萃取所得溶液,并合并有机层。将所得混合物用盐水洗涤,并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到910mg(59%)呈黄色油状物的2-(4-[2-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙酸叔丁酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880003232
在25mL密封管中置入2-(4-[2-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙酸叔丁酯(910mg,2.79mmol,1.00当量)在四氢呋喃(10mL)中的溶液、频哪醇硼烷(630mg,2.00当量)、ZrCp2HCl(70mg,0.10当量)和三乙胺(1mL,3.00当量)。将所得溶液在80·C下在油浴中搅拌12小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到720mg(57%)呈黄色油状物的2-[4-[2-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙氧基)乙基]哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880003241
在100mL圆底烧瓶中置入3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(2.0g,9.42mmol,1.00当量)在二甲亚砜(40mL)中的溶液、N,N-二异丙基乙胺(714.0mg,5.52mmol,4.00当量)、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(3.0g,14.39mmol,1.50当量)。将所得溶液在130·C下在油浴中搅拌3小时。然后,通过添加水(90mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(80mL x3)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(100mL x1)洗涤所得混合物。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10/1)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到1.7g(53%)呈黄色固体的3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880003251
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL 3颈圆底烧瓶中置入3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(1.7g,5.00mmol,1.00当量)在二噁烷/水(50/10mL)中的溶液、碳酸钾(2.1g,15.19mmol,3.00当量)、(2-羟苯基)硼酸(1.04g,7.54mmol,1.50当量)、四(三苯基膦)钯(0)(578mg,0.50mmol,0.10当量)。将所得溶液在100·℃下在油浴中搅拌2小时。然后,通过添加水(60mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(40mLx3)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(60mL x1)洗涤所得混合物。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10/1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到1.62g(81%)呈黄色固体的3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯。
步骤6
Figure BDA0003676261880003252
在250mL圆底烧瓶中置入3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(1.62g,4.08mmol,1.00当量)在二噁烷(50mL)中的溶液。向上述溶液中引入氯化氢(气体)。将所得溶液在室温下搅拌5小时。真空浓缩所得混合物。得到1.2g(88%)呈黄色油状物的2-(6-氨基-5-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基)苯酚盐酸盐。
步骤7
Figure BDA0003676261880003261
在100mL圆底烧瓶中置入2-(6-氨基-5-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基)苯酚(400mg,1.35mmol,1.00当量)在1-甲基-2-吡咯烷酮(30mL)中的溶液、N,N-二异丙基乙胺(693mg,5.36mmol,4.00当量)、2-溴-4-氟吡啶(355.0mg,2.02mmol,1.50当量)。将所得溶液在130·C下在油浴中搅拌2小时。然后,通过添加水(40mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(40mL x1)洗涤所得混合物。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(4/1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到410mg(67%)呈黄色固体的2-[6-氨基-5-[8-(2-溴吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚。
步骤8
Figure BDA0003676261880003271
在20mL密封管中置入2-[4-[2-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙氧基)乙基]哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯(628mg,1.38mmol,1.00当量)在二噁烷/水(5∶1mL)中的溶液、四(三苯基膦)钯(108mg,0.15mmol,0.10当量)、碳酸钾(286mg,2.07mmol,1.50当量)、2-(6-氨基-5-((1R,5S)-8-(2-溴吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-基)苯酚(500mg,1.10mmol,0.80当量)。将所得溶液在80·C下在油浴中搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。得到540mg(56%)呈黄色固体的2-[4-[2-(2-[[(2E)-3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙氧基)乙基]哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯。
步骤9
Figure BDA0003676261880003272
在100mL圆底烧瓶中置入2-[4-[2-(2-[[(2E)-3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙氧基)乙基]哌嗪-l-基]乙酸叔丁酯(200mg,0.29mmol,1.00当量)在2-丙醇(30mL)和PtO2(10mg,0.10当量)中的溶液。将所得溶液于室温在氢气气氛下搅拌12小时。将所得溶液用50mL 2-丙醇稀释,然后真空浓缩。得到190mg(95%)呈黄色固体的2-[4-(2-[2-[3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙氧基]乙氧基]乙基)哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯。
步骤10
Figure BDA0003676261880003281
在100mL圆底烧瓶中置入2-[4-(2-[2-[3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙氧基]乙氧基]乙基)哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯(190mg,0.27mmol,1.00当量)在二噁烷(20mL)中的溶液。向上述溶液中引入氯化氢(气体)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。得到160mg(92%)呈黄色固体的2-[4-(2-[2-[3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙氧基]乙氧基]乙基)哌嗪-1-基]乙酸。
步骤11
Figure BDA0003676261880003291
在100mL圆底烧瓶中置入2-[4-(2-2-[3-(4-3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基吡啶-2-基)丙氧基]乙氧基乙基)哌嗪-1-基]乙酸(160mg,0.25mmol,1.00当量)、N,N-二异丙基乙胺(0.3mL,0.30当量)、(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(139mg,0.30mmol,1.20当量)在乙腈(20mL)中的溶液和T3P(188mg,3.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。通过制备型HPLC纯化粗产物(100mL),条件如下:柱,XBridge Prep C18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相,水(10mmol/L碳酸氢铵)和乙腈(在8分钟内26.0%乙腈升至49.0%);检测器,UV 254nm。这产生28.5mg(11%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[2-[4-(2-[2-[3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙氧基]乙氧基]乙基)哌嗪-1-基]乙酰胺基]-3,3-二甲基丁酰基]-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺。
1H NMR(300MHz,CD3OD):δ8.88-8.66(m,1H),8.09-7.88(m,1H),7.76-7.57(m,1H),7.52-7.01(m,6H),6.92-6.62(m,4H),4.66-4.21(m,6H),3.94-3.72(m,2H),3.69-3.33(m,12H),3.14-2.89(m,4H),2.81-2.34(m,14H),2.32-1.78(m,8H),1.32-0.74(m,12H)。
示例性化合物46和示例性化合物47的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003301
在50mL圆底烧瓶中置入2-(3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸(2.0g,10.0mmol,1.0当量)在N,N-二甲基甲酰胺(20mL)中的溶液、N,N,N′,N′-四甲基-O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)六氟磷酸铀(4.1g,10.8mmol,1.1当量)、N,N-二异丙基乙胺(6.0g,46.4mmol,4.6当量)和(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(3.5g,9.5mmol,1.0当量)。在室温下搅拌所得溶液30分钟。然后通过添加30mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到2.1g(41%)呈浅黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤2
Figure BDA0003676261880003311
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(2.1g,4.1mmol,1.0当量)和48%溴化氢水溶液(15mL)。将所得溶液在60·C下在油浴中搅拌过夜。真空浓缩所得混合物,生成1.9g粗产物。
步骤3
Figure BDA0003676261880003312
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(1.9g,3.8mmol,1.0当量)在CH3CN(20mL)中的溶液,碳酸钾(3.5g,25.3mmol,6.6当量)、碘化钠(800.0mg,5.3mmol,1.4当量)和1,2-二溴乙烷(1g,5.3mmol,1.4当量)。将所得溶液在60·C下在油浴中搅拌过夜。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到1.1g(48%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[2-[3-(2-溴乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤4
Figure BDA0003676261880003321
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-[3-(2-溴乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(200mg,0.3mmol,1.0当量)在CH3CN(20mL)中的溶液、碳酸钾(400mg,2.9mmol,8.8当量)、碘化钠(80mg,0.53mmol,1.6当量)和6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-2-[2-(哌嗪-1-基)乙氧基]吡啶-4-基-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(190mg,0.4mmol,1.1当量)[如以上针对其他实施例所述制备]。将所得溶液在60℃下在油浴中搅拌过夜。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(5∶1)洗脱的硅胶柱上。得到180mg(51%)呈浅黄色固体的(2S,4R)-1-[2-(3-[2-[4-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙基)哌嗪-1-基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤5
Figure BDA0003676261880003331
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-(3-[2-[4-(2-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]乙基)哌嗪-1-基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(180mg,0.17mmol,1.0当量)在甲醇(5mL)中的溶液和氯化氢(0.068mL 4M的二噁烷溶液,0.27mmol,1.6当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩所得混合物。通过手性-制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱;流动相,柱:CHIRALPAK ID-03,2.0cm I.D*25cm L(5um);流动相A:MTBE(0.2%IPA)--HPLC,流动相B:甲醇--HPLC;流速:18mL/min;梯度:在18分钟内50B至50B;254/220nm。这产生46.7mg呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[2-(4-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.10(s,1H),8.99-8.83(m,1H),8.25(d,J=7.8Hz,1H),7.92-7.83(m,2H),7.75-7.12(m,6H),6.81(td,J=8.4,2.2Hz,2H),6.49(dd,J=6.1,2.0Hz,1H),6.15-5.93(m,4H),5.06(d,J=3.6Hz,1H),4.98-4.79(m,1H),4.38(t,J=7.7Hz,3H),4.19(dt,J=21.0,5.6Hz,5H),3.98(m,1H),3.71(d,J=8.6Hz,2H),3.57-3.34(m,2H),3.33-3.15(m,2H),2.97(d,J=11.6Hz,4H),2.57-2.40(d,J=8.0Hz,11H),2.31-2.07(m,1H),2.06-1.97(m,2H),1.91-1.66(m,3H),1.42(d,J=7.0Hz,1H),1.31(d,J=7.0Hz,3H),0.92-0.67(m,6H)]和54.4mg呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-(4-[2-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]乙基]哌嗪-1-基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺[1H NMR(300MHz,DMSO-d6)δ14.11(s,1H),8.95(s,1H),8.37(d,J=7.6Hz,1H),7.88-7.75(d,J=5.9Hz,2H),7.49-7.28(m,6H),7.18(ddd,J=8.3,7.0,1.6Hz,1H),6.88-6.75(m,2H),6.49(dd,J=6.2,2.0Hz,1H),6.16-6.02(m,2H),5.93(s,2H),5.05(d,J=3.7Hz,1H),5.00-4.81(m,1H),4.46(s,2H),4.39-4.13(m,6H),3.72-3.55(m,2H),3.45-3.35(m,1H),3.21(d,J=11.7Hz,2H),2.98(d,J=11.6Hz,2H),2.59(q,J=6.5Hz,4H),2.42(s,6H),2.17(dd,J=20.0,8.3Hz,3H),1.94(s,4H),1.75(t,J=9.6Hz,1H),1.37(dd,J=20.9,7.0Hz,3H),1.17(d,J=14.9Hz,1H),1.05-0.87(m,3H),0.77(dd,J=10.6,6.7Hz,3H)]。
示例性化合物48的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003351
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL圆底烧瓶中置入2-(6-氯代吡啶-3-基)乙酸甲酯(1.86g,10.0mmol,1.00当量)、甲苯(50mL)、Cs2CO3(10.0g,30.0mmol,3.00当量)、1-苄基哌嗪(2.11g,12.0mmol,1.2当量)和RuPhosPd(0.39g,0.05当量)。将所得溶液在100℃下在油浴中搅拌10小时。将反应混合物冷却至室温。然后,通过添加水(50mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(100mL x2)萃取所得溶液,再合并有机层。所得混合物用盐水洗涤。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(v∶v=1/3)的硅胶柱上。得到1.1g(32%)呈黄色固体的2-[6-(4-苄基哌嗪-1-基)吡啶-3-基]乙酸甲酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880003352
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL 3颈圆底烧瓶中置入四氢呋喃(30mL)、氢化铝锂(0.34g,3.00当量)。然后在5分钟内,在0℃下,一边搅拌一边滴加2-[6-(4-苄基哌嗪-1-基)吡啶-3-基]乙酸甲酯(1.0g,3.01mmol,1.00当量)在四氢呋喃(5mL)中的溶液。将所得溶液在25℃下搅拌10小时。然后在0℃下通过一边搅拌一边添加水(3mL)、氢氧化钠水溶液(5%)、水(3mL)来淬灭该反应。滤出固体。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=1∶10)的硅胶柱上。得到750mg(81%)呈浅黄色固体的2-[6-(4-苄基哌嗪-1-基)吡啶-3-基]乙-1-醇。
步骤3
Figure BDA0003676261880003361
在0℃下,在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-[6-(4-苄基哌嗪-1-基)吡啶-3-基]乙-1-醇(750g,2.5mmol,1.00当量)、N,N-二甲基甲酰胺(20mL)、氢化钠(60%)(200mg,8.4mmol,2.00当量)。将所得溶液在0℃下搅拌0.5小时。然后在0℃下,一边搅拌一边滴加3-溴丙-1-炔(390mg,3.3mmol,1.30当量)。使所得溶液在搅拌下于25℃下再反应12小时。然后通过在0℃下添加水(20mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(20mL x2)萃取所得溶液,再合并有机层。混合物经无水硫酸钠脱水并且在真空下浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(v∶v=1∶3)洗脱的硅胶柱上。得到602mg(71%)呈黄色油状物的1-苄基-4-[5-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙基]吡啶-2-基]哌嗪。
步骤4
Figure BDA0003676261880003362
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的25mL密封管中置入1-苄基-4-[5-[2-(丙-2-炔-1-基氧基)乙基]吡啶-2-基]哌嗪(1.0g,3.00mmol,1.00当量)、四氢呋喃(15mL)、频哪醇硼烷(2mL)、ZrCp2HCl(0.077g,0.10当量)、三乙胺(0.030g,0.10当量)。将所得溶液在70℃下在油浴中搅拌12小时。然后,通过添加水(5mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(10mL x2)萃取所得溶液,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到1.05g(75%)呈橙色油状物的1-苄基-4-[5-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-基]哌嗪。
步骤5
Figure BDA0003676261880003371
在100mL圆底烧瓶中置入1-苄基-4-[5-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-基]哌嗪(928mg,2.00mmol,1.00当量)、二氯甲烷(25mL)。然后在0℃下,一边搅拌一边滴加氯甲酸1-氯乙基酯(568.0mg,3.97mmol,2.00当量)。将所得溶液在25℃下搅拌1小时。真空浓缩所得混合物。添加乙醇(5mL)。使所得溶液在搅拌下再反应2小时,同时在油浴中将温度保持在80℃。真空浓缩所得混合物。得到0.71g(95%)呈黄色油状物的1-[5-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-基]哌嗪。
步骤6
Figure BDA0003676261880003372
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL 3颈圆底烧瓶中置入N-(2-氨基乙基)-N-(2-氯代乙基)-5-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-胺(410mg,1.00mmol,1.00当量)的二氯甲烷溶液、N,N-二异丙基乙胺(645mg,4.99mmol,5.00当量),并添加2-溴乙酸叔丁酯(585mg,3.00mmol,3.00当量)。将所得溶液在25·C下搅拌12小时。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到0.32g(66%)呈黄色油状物的2-[4-[5-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-基]哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯。
步骤7
Figure BDA0003676261880003381
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的25mL密封管中置入2-6-氨基-5-[8-(2-溴吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基苯酚(158mg,0.35mmol,1.00当量)的二噁烷/水溶液(v∶v=4∶1)、2-[4-[5-(2-[[(2E)-3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-基]哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯(205mg,0.42mmol,1.20当量)、碳酸钾(145mg,1.05mmol,3.00当量),并添加Pd(dppf)Cl2(12mg,0.02mmol,0.05当量)。将所得溶液在80℃下在油浴中搅拌3小时。将反应混合物冷却至25℃。然后通过添加水(5mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(20mL x2)萃取所得溶液,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)的硅胶柱上。得到0.16g(63%)呈浅黄色固体的2-[4-[5-(2-[[(2E)-3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-基]哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序以及本领域技术人员所理解的程序,将2-[4-[5-(2-[[(2E)-3-(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]乙基)吡啶-2-基]哌嗪-1-基]乙酸叔丁酯转化为最终化合物(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-(4-(5-(2-(3-(4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)丙氧基)乙基)吡啶-2-基)哌嗪-1-基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880003391
示例性化合物49的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003401
在0·C下,在100mL圆底烧瓶中置入3-羟基氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(3.11g,15.01mmol,1.00当量)、二氯甲烷(30mL)、2-溴乙酸叔丁酯(4.37g,22.40mmol,1.50当量)、氢氧化钠(37%水溶液)(30mL)和TBAC(4.17g,1.00当量)。将所得溶液在25·C下搅拌3小时。用二氯甲烷(2x30mL)萃取所得溶液,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/5)洗脱的硅胶柱上。得到3.6g(75%)呈无色油状物的3-[2-(叔丁氧基)-2-氧代乙氧基]氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880003402
在250mL圆底烧瓶中置入3-[2-(叔丁氧基)-2-氧代乙氧基]氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(3.22g,10.02mmol,1.00当量)、乙醇(100mL)、碳载钯(0.322g)。将所得溶液于25·C在H2气氛下搅拌12小时。滤出固体。真空浓缩所得混合物。得到1.75g(93%)呈无色油状物的2-(氮杂环丁烷-3-基氧基)乙酸叔丁酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880003411
在50mL圆底烧瓶中置入2-(氮杂环丁烷-3-基氧基)乙酸叔丁酯(374mg,2.00mmol,1.00当量)、N,N-二甲基甲酰胺(15mL)、碳酸钾(828mg,5.99mmol,3.00当量)和1,2-二溴乙烷(1.86g,9.90mmol,5.00当量)。将所得溶液在25·C下搅拌12小时。然后,通过添加水(10mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(2x20mL)萃取所得溶液,并且将有机层合并,再经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/3)洗脱的硅胶柱上。得到80mg(14%)呈无色油状物的2-[[1-(2-溴乙基)氮杂环丁烷-3-基]氧基]乙酸叔丁酯。
使用上述用于其他实施例的程序以及对本领域技术人员显而易见的程序,将2-[[1-(2-溴乙基)氮杂环丁烷-3-基]氧基]乙酸叔丁酯转化为最终化合物(2S,4R)-1-((2S)-2-(2-((1-(2-(4-(3-(4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)丙基)哌嗪-1-基)乙基)氮杂环丁烷-3-基)氧基)乙酰胺基)-3,3-二甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880003421
示例性化合物51的示例性合成
根据以下方案使用来自上述实施例(例如,示例性化合物37)的程序和本领域技术人员理解的其他程序制备示例性化合物51。
Figure BDA0003676261880003431
示例性化合物52的示例性合成
根据以下方案制备示例性化合物52。
Figure BDA0003676261880003441
示例性化合物53的示例性合成
根据以下方案制备示例性化合物53。
Figure BDA0003676261880003451
示例性化合物54和示例性化合物55的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003452
在100mL圆底烧瓶中置入2-(3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸(2.1g,10.5mmol,1.00当量)、乙醇(20.0g,434mmol,41.2当量)、硫酸(2.0g,20.4mmol,1.9当量)。将所得溶液在70℃下在油浴中搅拌12小时。真空浓缩所得混合物。得到1.9g(79%)呈白色固体的2-(3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸乙酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880003461
在50mL圆底烧瓶中置入2-(3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸乙酯(1.9g,8.4mmol,1.0当量)和硫酰氯(20mL)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。真空浓缩所得混合物。然后通过添加30mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,再合并有机层。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到1.5g(69%)呈黄色油状物的2-(4-氯-3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸乙酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880003462
在50mL圆底烧瓶中置入2-(4-氯-3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸乙酯(1.5g,5.7mmol,1.0当量)在甲醇/H2O(5/5mL)中的溶液和氢氧化锂(300mg,12.5mmol,2.2当量)。将所得溶液在50℃下在油浴中搅拌过夜。用1M HCl将溶液的pH值调节至6。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,合并有机层并真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱;流动相,柱:XBridge Prep C18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相A:水(0.1%FA),流动相B:ACN;流速:20mL/min;梯度:在8分钟内34%B降至48%B;220nm。得到300mg(22.4%)呈白色固体的2-(4-氯-3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸。
步骤4
Figure BDA0003676261880003471
在50mL圆底烧瓶中置入2-(4-氯-3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸(260mg,1.1mmol,1.0当量)在N,N-二甲基甲酰胺(20mL)中的溶液、N,N,N′,N′-四甲基-O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)六氟磷酸铀(360mg,1.0mmol,0.9当量)、N,N-二异丙基乙胺(350mg,2.7mmol,2.4当量)和(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(350mg,1.1mmol,1.0当量)。在室温下搅拌所得溶液30分钟。然后通过添加30mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到275mg(45%)呈白色固体的(2S,4R)-1-[2-(4-氯-3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤5
Figure BDA0003676261880003481
在50mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-1-[2-(4-氯-3-甲氧基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(275mg,0.5mmol,1.0当量)和4M氯化氢的二噁烷(25mL)溶液。将所得溶液在60℃下在油浴中搅拌96小时。真空浓缩所得混合物。得到259mg(97%)呈黄色固体的(2S,4R)-1-[2-(4-氯-3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺。
根据以下实施方案并使用上述用于较早实施例的程序,将(2S,4R)-1-[2-(4-氯-3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物(2S,4R)-1-((2S)-2-(3-(2-(4-(2-((4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-4-氯代异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺和(2S,4R)-1-((2R)-2-(3-(2-(4-(2-((4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)乙基)哌嗪-1-基)乙氧基)-4-氯代异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880003491
示例性化合物56的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003501
在250mL圆底烧瓶中置入3-(苄基氧基)环丁-1-酮(6.0g,34.05mmol,1.0当量)在乙醇(100mL)中的溶液。然后在0℃下分数批添加硼氢化钠(1.25g,33.94mmol,1.00当量)。将所得溶液在0℃下搅拌3小时。然后通过添加水(100mL)来淬灭该反应。反应。用乙酸乙酯(50mL x2)萃取所得溶液,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。得到6.0g(99%)呈浅黄色油状物的(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁-1-醇。
步骤2
Figure BDA0003676261880003502
用在氮气惰性气氛下吹扫并保持的500mL圆底烧瓶中置入(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁-1-醇(8.0g,44.89mmol,1.10当量)在N,N-二甲基甲酰胺(100mL)中的溶液。然后在0℃下分数批添加氢化钠(60%)(2.15g,89.58mmol,1.20当量)。向其中添加4-溴-2-氟吡啶(70.0g,39.78mmol,1.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。然后,通过添加水/冰来淬灭该反应。用乙酸乙酯(80mLx2)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(80mL x2)洗涤所得混合物。减压浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到7.0g(53%)呈浅黄色油状物的4-溴-2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶。
步骤3
Figure BDA0003676261880003511
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的500mL圆底烧瓶中置入4-溴-2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶(8.4g,25.13mmol,1.30当量)在甲苯(200mL)中的溶液、3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(4.11g,19.36mmol,1.00当量)、叔丁醇钠(3.2g,33.2mmol,1.5当量)、xantphos(2.32g,4.01mmol,0.20当量)和Pd2(dba)3CH2Cl2(430.0mg,0.40mmol,0.02当量)。将所得溶液在100℃下搅拌过夜。然后通过添加水(100mL)将来淬灭该反应。用乙酸乙酯(80mL x2)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(100mL x2)洗涤所得混合物。将混合物经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/己烷(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到8.0g(89%)呈浅黄色油状物的8-[2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880003512
在氮气气氛下,在250ml圆底烧瓶中,向8-[2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(7.0g,15.03mmol,1.00当量)在150mL乙醇中的溶液中添加氢氧化钯(7.0g,49.85mmol,3.32当量)和乙酸(2mL)。然后将烧瓶抽真空并用氢气冲洗。将反应混合物在氢气气氛下使用氢气球在50℃下氢化3天,然后通过硅藻土垫过滤并减压浓缩。得到5.4g(96%)呈浅黄色油状物的8-[2-[(1s,3s)-3-羟基环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880003521
在100mL圆底烧瓶中置入8-[2-[(1s,3s)-3-羟基环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(5.0g,13.32mmol,1.00当量)在乙酸乙酯和甲醇的混合溶剂(10∶1)(50mL)中的溶液。将氯化氢(气体)通入溶液。将所得混合物在室温下搅拌3小时,并减压浓缩。得到4.0g(96%)呈灰白色固体的(1s,3s)-3-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁-1-醇盐酸盐。
步骤6
Figure BDA0003676261880003522
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL压力罐反应器中置入(1s,3s)-3-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁-1-醇盐酸盐(1.0g,3.21mmol,1.00当量)在二甲亚砜(10mL)中的溶液。然后添加N,N-二异丙基乙胺(5mL)和4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(3.01g,14.44mmol,4.00当量)。将所得溶液在130·C下搅拌16小时。然后,通过添加水(50mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(3x30mL)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(3x50mL)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到490mg(38%)呈黄色油状物的(1s,3s)-3-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)环丁-1-醇。
步骤7
Figure BDA0003676261880003531
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL压力罐反应器中置入(1s,3s)-3-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)环丁-1-醇(800mg,1.99mmol,1.00当量)在二噁烷和水的混合溶剂(4∶1)(15mL)中的溶液,[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(544mg,2.99mmol,1.50当量)、碳酸钾(824mg,6.0mmol,3.00当量)和Pd(PPh3)4(230mg,0.20mmol,0.10当量)。将所得溶液在90℃下搅拌2小时。然后,通过添加水(30mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(50mL x2)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(50mLx2)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到820mg(82%)呈黄色固体的(1s,3s)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁-1-醇。
步骤8
Figure BDA0003676261880003541
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL 3颈圆底烧瓶中置入三苯膦(351mg,1.34mmol,2.00当量)在四氢呋喃(蒸馏的)(30mL)中的溶液。然后,在0℃下,一边搅拌一边滴加偶氮二羧酸二异丙酯(270mg,1.34mmol,2.00当量),同时出现白色沉淀。在0℃下,向其中添加(1s,3s)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁-1-醇(338mg,0.67mmol,1.00当量)和6-溴吡啶-3-醇(232mg,1.33mmol,1.50当量)。将所得溶液在50℃下搅拌过夜。真空浓缩所得混合物。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到389mg(88%)呈黄色固体的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-溴吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺。
步骤9
Figure BDA0003676261880003542
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL压力罐反应器中置入6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-溴吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(155mg,0.23mmol,1.00当量)在二噁烷和水的混合溶剂(3∶1)(8mL)中的溶液、叔丁基二甲基{[3-(四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基}硅烷(140mg,0.47mmol,2.00当量)、碳酸钾(95mg,0.69mmol,0.15当量)、Pd(PPh3)4Cl2CH2Cl2(28mg,0.03mmol,2.00当量)。将所得溶液在80℃下搅拌1小时。然后通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(30mL x2)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到130mg(74%)呈浅黄色油状物的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-[3-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]丙-1-烯-1-基]吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺。
步骤10
Figure BDA0003676261880003551
在25mL圆底烧瓶中置入6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-[3-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]丙-1-烯-1-基]吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(120mg,0.16mmol,1.00当量)在四氢呋喃(2mL)中的溶液、氟化四丁基铵(1M的四氢呋喃溶液)(3.2mL,2.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。然后,通过添加水来淬灭该反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,并且将有机层合并,再经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。通过快速-制备型HPLC进一步纯化粗产物,条件(CombiFlash-1)如下:柱,C18硅胶;流动相,ACN的水溶液,在30分钟内0%ACN增加至40%ACN;检测器,UV 220nm。得到70mg(69%)呈浅黄色固体的3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-醇。
步骤11
Figure BDA0003676261880003561
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL 3颈圆底烧瓶中置入三丁基膦(149mg,0.74mmol,10.00当量)在四氢呋喃(20mL)中的溶液。然后在-5℃下,一边搅拌一边滴加四甲基偶氮二甲酰胺(126mg,0.73mmol,10.00当量)在四氢呋喃(5mL)中的溶液。向该混合物中添加(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]吡咯烷-2-甲酰胺(42mg,0.09mmol,1.20当量)和(2E)-3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-醇(47mg,0.07mmol,1.00当量)。将所得溶液在50℃下搅拌过夜。然后通过添加水将来淬灭该反应。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(50mL)洗涤所得混合物。减压蒸发有机相,并将其施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到32mg(39%)呈浅黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]-1-[3-甲基-2-(3-[[(2E)-3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-基]氧基]-1,2-噁唑-5-基)丁酰基]吡咯烷-2-甲酰胺。
步骤12
Figure BDA0003676261880003571
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的25mL圆底烧瓶中置入(2S,4R)-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]-1-(3-甲基-2-[3-[(3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-基)氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(23mg,0.02mmol,1.00当量)在甲醇(3mL)和37%盐酸(1.5mL)中的溶液。将所得溶液在室温下搅拌2小时。用水/冰浴将反应混合物冷却至0℃。用NH4HCO3将溶液的pH值调节至7。用二氯甲烷(30mL×3)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(50mL x3)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。通过制备型HPLC纯化粗产物,条件如下:柱,XBridge PrepC18 OBD柱,5um,19*150mm;流动相,水(10mmoL/L NH4HCO3)和乙腈(在8分钟内41.0%ACN升至62.0%);检测器,UV 254nm。得到8.1mg(37%)呈浅黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-N-[[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]-1-(3-甲基-2-[3-[(3-[5-[(1r,3r)-3-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-基)氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺。
示例性化合物57的示例性合成
根据以下方案使用上述用于制备其他示例性化合物的程序制备示例性化合物57。
Figure BDA0003676261880003591
示例性化合物47的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003592
在0℃下,向2-哌嗪-1-基乙醇(60g,460mmol,1当量)、碳酸氢钠(116g,1.38mol,3当量)在二噁烷(300mL)和水(300mL)中的溶液中添加(2,5-二氧代吡咯烷-1-基)碳酸苄酯(137g,553mmol,1.2当量)。然后将反应混合物在20℃下搅拌2小时。将反应混合物用水(300mL)稀释,然后用乙酸乙酯(300mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(乙酸乙酯∶甲醇=500∶1至100∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的化合物4-(2-羟乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(74g,279mmol,60%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003601
在0℃下,向氢化钠(6.26g,156mmol,1.3当量)在二甲基甲酰胺(240mL)中的溶液中添加4-(2-羟乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯(35g,132mmol,1.1当量)0.5小时。然后将4-溴-2-氟吡啶(21.18g,120mmol,1当量)添加到反应中,并在25℃下搅拌1h。通过添加饱和氯化铵溶液(500mL)来淬灭反应混合物,然后用乙酸乙酯(300mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(二氯甲烷∶甲醇=1∶0至200∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的化合物4-[2-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(39.2g,92mmol,76%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880003602
在小瓶中装入4-[2-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(18.15g,43mmol,1当量)、3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(11g,51mmol,1.2当量)、[2-(2-氨基苯基)苯基]-氯-钯二环己基-[2-(2,6-二异丙氧基苯基)苯基]膦酸酯(1.68g,2.16mmol,0.05当量),将碳酸铯(28.14g,86.36mmol,2当量)添加到甲苯(350mL)中。将混合物用氮气吹扫5分钟,然后加热至110℃保持12小时。将反应混合物用水(200mL)稀释,并用乙酸乙酯(300mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=10∶1至0∶1)纯化残余物。得到呈苍黄色固体的8-[2-[2-(4-苄氧基羰基哌嗪-1-基)乙氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(18.37g,31.30mmol,72%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880003611
向8-[2-[2-(4-苄氧基羰基哌嗪-1-基)乙氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(18.3g,33.17mmol,1当量)在甲醇(150mL)中的混合物中添加盐酸/甲醇(4M,360mL,43.41当量)。然后将反应混合物在25℃下搅拌2小时。减压浓缩反应混合物,得到化合物,无需纯化。得到呈黄色固体的化合物4-[2-[[4-(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)-2-吡啶基]氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(19g,粗品)。
步骤5
Figure BDA0003676261880003612
将4-[2-[[4-(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)-2-吡啶基]氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(19g,42.08mmol,1当量)、4-溴6-氯-哒嗪-3-胺(10.52g,50.49mmol,1.2当量)在二甲亚砜(190mL)中的混合物中添加二异丙基乙胺(54.38g,420.76mmol,10当量)。然后将反应混合物在130℃下搅拌5小时。通过添加水(600mL)来淬灭反应混合物,然后用乙酸乙酯(150mL)稀释并用乙酸乙酯(300mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL x5)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=1∶1至二氯甲烷∶甲醇=50∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的化合物4-[2-[[4-[3-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(12.6g,21mmol,50%收率)。
步骤6
Figure BDA0003676261880003621
向4-[2-[[4-[3-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(10.6g,18.30mmol,1当量)、(2-羟苯基)硼酸(5.05g,36.61mmol,2当量)在二噁烷(160mL)和水(25mL)中的混合物中添加四[三苯基膦]钯(0)(2.12g,1.83mmol,0.1当量)和碳酸钾(5.06g,36.61mmol,2当量)。然后将反应混合物在110℃下搅拌2小时。将反应混合物用水(200mL)稀释,然后用乙酸乙酯(200mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC纯化残余物(碱性条件:柱:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10um;流动相:[水(0.05%氢氧化氨v/v)-乙腈];B%:50%-80%,20MIN60%min),得到所需化合物。得到呈黄色固体的化合物4-[2-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(7g,10.22mmol,55%收率)。
步骤7
Figure BDA0003676261880003631
在氮气下,向4-[2-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸苄酯(7g,10.99mmol,1当量)在四氢呋喃(100mL)中的溶液中添加活性炭载氢氧化钯催化剂(0.7g,0.49mmol,0.04当量)。然后将反应混合物于60℃在氢气(50Psi)下搅拌48小时。然后将150mL乙醇添加到反应混合物中。将反应混合物过滤并减压浓缩,得到2-[6-氨基-5-[8-[2-(2-哌嗪-1-基乙氧基)-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚(5g,9.68mmol,88%收率)。
步骤8
Figure BDA0003676261880003632
向2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(3.5g,17.57mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(40mL)中的溶液中添加2-溴-1,1-二乙氧基-乙烷(5.19g,26.35mmol,1.5当量)和碳酸钾(4.86g,35.14mmol,2当量)。将反应混合物在70℃下搅拌12小时。通过添加水50mL来淬灭反应混合物,然后用水100mL稀释,并用乙酸乙酯(80mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至50∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的所需化合物2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(4.38g,12.50mmol,71%收率)。
步骤9
Figure BDA0003676261880003641
向2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(4.38g,12.5mmol,1当量)在甲醇(30mL)和水(15mL)中的溶液中添加氢氧化锂一水合物(2.10g,50mmol,4当量)。将反应混合物在40℃下搅拌2小时。用1M氯化氢将pH调节至4~5,并用乙酸乙酯(50mL x2)萃取反应混合物。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈无色油状物的2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(4g,粗品)。
步骤10
Figure BDA0003676261880003642
向2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(3.84g,11.99mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(20mL)中的溶液中添加O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲鎓六氟磷酸酯(5.47g,14.38mmol,1.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌0.5小时。然后向混合物中添加(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(4-41g,11.99mmol,1当量)和三乙胺(3.64g,35.96mmol,5mL,3当量)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)中的溶液。将反应混合物在20℃下搅拌0.15小时。通过添加水(30mL)来淬灭反应混合物,然后用水80mL稀释,并用乙酸乙酯(60mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(80mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过硅胶色谱法(二氯甲烷∶甲醇=100∶1至50∶1)纯化残余物。得到呈白色固体的所需化合物(2S,4R)-1-[2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(7g,10.96mmol,91%收率)。
步骤11
Figure BDA0003676261880003651
通过SFC分离(2S,4R)-1-[2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(7g,11.39mmol,1当量)。条件是柱:DAICEL CHIRALPAK AD(250mm*30mm,10um);流动相:[0.1%NH3H2O IPA];B%:35%-35%,2.4min:550min。得到呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(3.2g,5.08mmol,89%收率)和(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基
-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(2.67g,4.17mmol,73%收率)。
步骤12
Figure BDA0003676261880003661
向(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(2g,3.25mmol,1当量)在四氢呋喃(40mL)中的溶液中添加硫酸(1M,40mL,12.3当量)。将该溶液加热至50℃保持7小时。将溶液冷却至20℃,并用饱和碳酸氢钠溶液淬灭至pH=8。用乙酸乙酯(30mL x3)萃取混合物。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,并经硫酸钠干燥。然后过滤该混合物,并将滤液真空浓缩。粗产物直接用于下一步。得到呈白色固体的(2S,4R)-4-羟基-1-[(2R)-3-甲基-2-[3-(2-氧代乙氧基)异噁唑-5-基]丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(1.7g,2.52mmol,77%收率)。
步骤13
Figure BDA0003676261880003671
向(2S,4R)-4-羟基-1-[(2R)-3-甲基-2-[3-(2-氧代乙氧基)异噁唑-5-基]丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(930mg,1.38mmol,1当量)和2-[6-氨基-5-[8-[2-(2-哌嗪-1-基乙氧基)-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚(691mg,1.38mmol,1当量在甲醇(15mL)和二氯甲烷(5mL)中的溶液中添加乙酸(82mg,1.38mmol,1当量)。将该溶液在30℃下搅拌0.5小时。然后将氰基硼氢化钠(129mg,2.06mmol,1.5当量)添加到溶液中,并在30℃下搅拌7小时。真空除去溶剂,并通过制备型HPLC纯化粗产物(柱:Phenomenex Synergi Max-RP250*50mm*10um;流动相:[水(10mM NH4HCO3)-ACN];B%:45ACN%-75ACN%,28min,78%min)。得到呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[2-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]乙基]哌嗪-1-基]乙氧基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(840mg,0.8mmol,58%收率,98%纯度)。
示例性化合物59和60的示例性合成
Figure BDA0003676261880003672
使用上述用于其他实施例的程序,如以下方案所述制备。
Figure BDA0003676261880003681
示例性化合物61的示例性合成
Figure BDA0003676261880003682
步骤1
Figure BDA0003676261880003691
在室温下,在500mL圆底烧瓶中,向1-(6-溴吡啶-3-基)乙-1-酮(10g,49.99mmol,1当量)在EtOH(200mL)中的溶液中添加硼氢化钠(4g,105.73mmol,2.11当量)的水(80ml)溶液。在室温下搅拌所得混合物30分钟。真空浓缩混合物。将残余物通过使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈黄色油状物的1-(6-溴吡啶-3-基)乙-1-醇(9.2g,91%)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003692
在0℃下,在100mL圆底烧瓶中,向1-(6-溴吡啶-3-基)乙-1-醇(2g,9.90mmol,1当量)和三乙胺(3g,0.03mmol)的二氯甲烷(30mL)溶液中添加甲磺酰氯(1.3g,11.35mmol,1.15当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。用二氯甲烷(30mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(20mL x1)洗涤,经无水硫酸钠干燥。过滤后,减压浓缩滤液。得到呈黄色固体的甲磺酸1-(6-溴吡啶-3-基)乙酯(1.6g,23%)。
步骤3
Figure BDA0003676261880003693
在室温下,在25mL密封管中,将甲磺酸1-(6-溴吡啶-3-基)乙酯(1.4g,1.2当量)、6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺(350mg,1当量)和碳酸钾(490mg,3.0当量)添加到N,N-二甲基甲酰胺(15mL)中。将所得混合物于60℃在氮气气氛下搅拌2小时。用二氯甲烷(50mL x3)萃取水层。将残余物用盐水(20mL x1)洗涤,经无水硫酸钠干燥。过滤后,减压浓缩滤液。将残余物通过使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈黄色固体的4-[1-[1-(6-溴吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(90mg,16%)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将4-[1-[1-(6-溴吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880003701
示例性化合物62的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880003711
将6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺(300mg,1.01mmol,1当量)、1-溴-2-(2-溴乙氧基)乙烷(702mg,3.03mmol,3当量)在二甲基甲酰胺(3mL)中的混合物添加到碳酸钾(418mg,3.03mmol,3当量)中。然后将反应混合物在70℃下搅拌2小时。添加水(10mL),并用乙酸乙酯(20mL x3)萃取反应混合物。将合并的有机层用盐水(15mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过制备型TLC(二氯甲烷∶甲醇=10∶1)纯化残余物。得到呈黄色油状物的4-[1-[2-(2-溴乙氧基)乙基]吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(100mg,0.22mmol,22%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003712
向4-[1-[2-(2-溴乙氧基)乙基]吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(100mg,0.22mmol,1当量)和哌嗪-1-羧酸叔丁酯(83mg,0.44mmol,2当量)在乙腈(2mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(86.49mg,0.66mmol,3当量)。然后将反应混合物在100℃下搅拌12小时。添加水(5mL),并用乙酸乙酯(15mL x3)萃取反应混合物。将合并的有机层用盐水(10mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过制备型TLC(二氯甲烷∶甲醇=10∶1)纯化残余物。得到呈黄色固体的化合物4-[2-[2-[4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]吡唑-1-基]乙氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(93mg,0.15mmol,71%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将4-[2-[2-[4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]吡唑-1-基]乙氧基]乙基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880003721
使用类似的程序制备示例性化合物165和124。
示例性化合物64的示例性合成
Figure BDA0003676261880003722
步骤1
Figure BDA0003676261880003731
在10℃下在氮气下,向吡啶-4-醇(3.20g,33.66mmol,1.5当量)和3-苄氧基环丁醇(4g,22.44mmol,1当量)在四氢呋喃(200mL)中的溶液中一次性添加三苯基膦(7.06g,26.93mmol,1.2当量)和偶氮二羧酸二异丙酯(5.45g,26.93mmol,1.2当量)。将该混合物在50℃下搅拌12小时。减压浓缩反应混合物,以去除四氢呋喃。将水(50mL)倒入混合物内且搅拌1分钟。用二氯甲烷(50mL x3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(50mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶柱色谱法(石油醚/四氢呋喃=20∶1至5∶1)纯化残余物。通过快速C18柱色谱[乙腈∶水(0.5%氢氧化铵)=5%~50%]纯化残余物。得到呈白色固体的化合物4-(3-苄氧基环丁氧基)吡啶(3.2g,12.53mmol,55%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003732
向4-(3-苄氧基环丁氧基)吡啶(4.2g,16.45mmol,1当量)在甲苯(65mL)中的溶液中添加苄基溴(2.81g,16.45mmol,1当量)。将该混合物在80℃下搅拌12小时。减压浓缩反应混合物,以去除甲苯。将粗产物用石油醚(80mL)研磨。得到呈白色固体的化合物1-苄基-4-(3-苄氧基环丁氧基)吡啶-1-鎓溴化物(6.5g,15.25mmol,92%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880003733
在0℃下,向1-苄基-4-(3-苄氧基环丁氧基)吡啶-1-鎓溴化物(6.5g,15.25mmol,1当量)在乙醇(120mL)中的溶液中添加硼氢化钠(3.46g,91.47mmol,6当量)。将混合物在15℃下搅拌4小时。减压浓缩反应混合物,以去除乙醇。将残余物用水(25mL)稀释,并用乙酸乙酯(50mL x2)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(40mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。得到呈无色油状物的化合物1-苄基-4-(3-苄氧基环丁氧基)-3,6-二氢-2H-吡啶(4.5g,12.88mmol,84%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880003741
在氮气气氛下,向1-苄基-4-(3-苄氧基环丁氧基)-3,6-二氢-2H-吡啶(4.5g,12.88mmol,1当量)在四氢呋喃(95mL)和乙醇(70mL)中的溶液中添加活性炭载钯催化剂(0.5g,10%纯度)。将悬浮液脱气并用氢气吹扫3次。将混合物在氢气(50Psi)下在25℃下搅拌24小时,然后在35℃下搅拌12小时。过滤反应混合物且浓缩滤液。通过硅胶柱色谱法(二氯甲烷∶甲醇∶氢氧化铵=20∶1∶0,10∶1∶0.1)纯化残余物。获得呈无色油的化合物3-[(1-苄基-4-哌啶基)氧基]环丁醇(2.8g,10.71mmol,83%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880003742
在氮气气氛下,向3-[(1-苄基-4-哌啶基)氧基]环丁醇(1.1g,4.21mmol,1当量)在甲醇(10mL)中的溶液中添加氢氧化钯(591mg)和二碳酸二叔丁酯(1.84g,8.42mmol,2当量)。将悬浮液脱气并用氢气吹扫3次。将混合物在氢气(50psi)下在25℃下搅拌12小时。过滤反应混合物并浓缩滤液。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=20∶1至2∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的化合物4-(3-羟基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(820mg,3.02mmol,71%收率)。
步骤6
Figure BDA0003676261880003751
将4-(3-羟基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(1g,3.69mmol,1当量)、4-溴-2-氟-吡啶(778mg,4.42mmol,1.2当量)、碳酸铯(2.40g,7.37mmol,2当量)在乙腈(10mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在90℃在氮气气氛下搅拌12小时。将反应混合物过滤并浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至10∶1)纯化粗产物。得到呈无色油状物的化合物4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.36g,3.18mmol,86%收率)。
步骤7
Figure BDA0003676261880003752
向3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-羧酸叔丁酯(10g,47.11mmol,1当量)在二氯甲烷(140mL)中的溶液中添加CbzCl(9.64g,56.53mmol,8.04mL,1.2当量)和三乙胺(8.58g,84.79mmol,11.80mL,1.8当量)。将该混合物在20℃下搅拌20小时。TLC(二氯甲烷∶甲醇=10∶1)显示反应物1未完全消耗,因此再次添加CbzCl(1.61g,9.42mmol,1.34mL,0.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌2小时。将反应混合物用水(80mL)洗涤两次,将有机层经无水硫酸钠干燥,并浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至4∶1)纯化粗产物。得到呈无色油状物的化合物3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3,8-二羧酸8-苄基3-(叔丁基)酯(11.48g,33.14mmol,70%收率)。
步骤8
Figure BDA0003676261880003761
向3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3,8-二羧酸8-苄基3-(叔丁基)酯(6.20g,17.90mmol,1当量)在二氯甲烷(80mL)中的溶液中添加三氟乙酸(12.32g,108.05mmol,8.00mL,6.04当量)。将该混合物在20℃下搅拌2小时。用饱和碳酸氢钠水溶液调节反应混合物直至pH=8,用氯仿和异丙醇(80mL×3,5∶1)萃取。将合并的层经无水硫酸钠干燥,浓缩,得到呈黄色油状物的3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸苄酯(4.7g,17.68mmol,98%收率,92%纯度)。
步骤9
Figure BDA0003676261880003762
将3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸苄酯(784mg,3.18mmol,1当量)、4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.36g,3.18mmol,1当量)、[2-(2-氨基苯基)苯基]-氯代钯二环己基-[2-(2,6-二异丙氧基苯基)苯基]膦酸酯(148mg,0.19mmol,0.06当量)和碳酸铯(2.07g,6.37mmol,2当量)在甲苯(27mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在110℃在氮气气氛下搅拌12小时。将反应混合物用水(30mL)稀释,并用乙酸乙酯(40mL)萃取两次。将合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至1∶1)纯化粗产物。得到呈无色油状物的化合物8-[2-[3-[(1-叔丁氧基羰基-4-哌啶基)氧基]环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸苄酯(1.35g,2.28mmol,71%收率)。
步骤10
Figure BDA0003676261880003771
在氮气下,向8-[2-[3-[(1-叔丁氧基羰基-4-哌啶基)氧基]环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸苄酯(1.35g,2.28mmol,1当量)在四氢呋喃(27mL)和乙醇(27mL)的混合物中的溶液中添加活性炭载氢氧化钯催化剂(320mg,10%纯度)。将悬浮液真空脱气并用氢气吹扫数次。将混合物在氢气(50psi)下在60℃下搅拌12小时。过滤反应混合物且浓缩滤液。得到呈棕色固体的化合物4-[3-[[4-(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(932mg,2.03mmol,89%收率)。
步骤11
Figure BDA0003676261880003772
将4-[3-[[4-(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(932mg,2.03mmol,1当量)、4-溴-6-氯-哒嗪-3-胺(508mg,2.44mmol,1.2当量)、N,N-二异丙基乙胺(2.63g,20.32mmol,3.54mL,10当量)在二甲亚砜(30mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在130℃在氮气气氛下搅拌3小时。将反应混合物用水(30mL)稀释,并用乙酸乙酯(30mL)萃取两次。将合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(30mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥并浓缩,得到粗产物。通过半制备型反相HPLC(柱:Phenomenex Gemini C18 250*50 10um;流动相:[水(0.05%氢氧化氨v/v)-ACN];B%:45%-70%,24MIN;53%min)纯化残余物。得到呈黄色油状物的化合物4-[3-[[4-[3-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(772mg,1.32mmol,64%收率)。
步骤12
Figure BDA0003676261880003781
将4-[3-[[4-[3-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(772mg,1.32mmol,1当量)、(2-羟苯基)硼酸(218mg,1.58mmol,1.2当量)、四[三苯基膦]钯(0)(152mg,0.13mmol,0.1当量)、碳酸钾(364mg,2.63mmol,2当量)在二噁烷(12mL)和水(2mL)的混合物中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在90℃在氮气气氛下搅拌10小时。浓缩反应混合物,得到粗产物。通过半制备型反相HPLC(柱:Kromasil 250*50mm*10um;流动相:[水(0.1%三氟乙酸)-ACN];B%:20ACN%-50ACN%,20min)纯化残余物。得到呈黄色固体的化合物4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(500mg,0.71mmol,54%收率,91%纯度)。
步骤13
Figure BDA0003676261880003791
向4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(500mg,0.78mmol,1当量)在二氯甲烷(5mL)中的溶液中添加盐酸/二噁烷(4M,5mL,25.75当量)。将该混合物在20℃下搅拌2小时。浓缩混合物,得到粗产物。得到呈黄色固体的化合物2-[6-氨基-5-[8-[2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚(500mg,粗制三盐酸盐)。
步骤14
Figure BDA0003676261880003792
向2-[6-氨基-5-[8-[2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚三盐酸盐(400mg,612umol,1当量)和(2S,4R)-4-羟基-1-[(2R)-3-甲基-2-[3-(2-氧代乙氧基)异噁唑-5-基]丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(331mg,0.61mmol,1当量)在二氯甲烷(16mL)和甲醇(16mL)的混合物中的溶液中添加乙酸钠(201mg,2.45mmol,4当量),然后添加乙酸直至pH=6,然后再添加氰基硼氢化钠(192mg,3.06mmol,5当量)。将该混合物在20℃下搅拌10小时。将反应混合物用水(20mL)稀释,并用二氯甲烷(20mL)萃取三次。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,浓缩,得到粗产物,其通过半制备型反相HPLC纯化(柱:Phenomenex SynergiC18 150*25*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:18%-48%,9min)。得到呈灰白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[2-[4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]乙氧基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺双三氟乙酸酯(321mg,0.28mmol,45%收率)。
使用类似的程序制备示例性化合物63和146。
示例性化合物67和68的示例性合成
Figure BDA0003676261880003801
步骤1
Figure BDA0003676261880003802
在室温下,向NaOH(10g,0.250mol,2.7当量)在水(500mL)的搅拌溶液中添加苯甲醇(10g,92.47mmol,1当量)、1,4-二溴丁烷(39.93g,184.9mmol,2.00当量)和Bu4NHSO4(0.78g,2.297mmol,0.02当量)。将所得混合物在70℃下搅拌2小时,然后用己烷(100mL)稀释。用3x50mL水洗涤所得混合物。将有机层经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。通过使用PE/EtOAc(10∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化残余物。得到呈无色油状物的[(4-溴丁氧基)甲基]苯(10g,44%)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003811
在0℃在氮气气氛下,向2-(2-羟基乙氧基)乙-1-醇(14.18g,133.7mmol,5当量)在DMF(100mL)中的溶液中添加氢化钠(60%的油溶液,2.15g,2.5当量)。15分钟后,向反应混合物中添加[(4-溴丁氧基)甲基]苯(6.5g,26.7mmol,1当量)。将所得混合物在25℃下搅拌3小时,然后通过添加水(250mL)淬灭。用EA(3x200mL)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。通过使用PE/EtOAc(60%)洗脱的硅胶柱色谱纯化残余物。得到呈无色油状物的2-[2-[4-(苄基氧基)丁氧基]乙氧基]乙-1-醇(4g,72%)。
步骤3
Figure BDA0003676261880003812
在室温下,向2-[2-[4-(苄基氧基)丁氧基]乙氧基]乙-1-醇(2.4g,8.94mmol,1当量)和DMAP(218mg,1.79mmol,0.2当量)在DCM(50mL)中的搅拌溶液中添加TsCl(5.1g,26.83mmol,3当量)和TEA(2.7g,26.83mmol,3当量)。将所得混合物在40℃下搅拌过夜。用DCM(100mL)稀释反应混合物,并用2×50mL盐水洗涤。将有机层经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。通过使用PE/EtOAc(3∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化残余物。得到呈浅黄色固体的4-甲基苯-1-磺酸2-[2-[4-(苄基氧基)丁氧基]乙氧基]乙酯(2.4g,64%)。
步骤4
Figure BDA0003676261880003813
在氮气气氛下,向4-甲基苯-1-磺酸2-[2-[4-(苄基氧基)丁氧基]乙氧基]乙酯(3.5g,8.28mmol,1当量)在100mL EtOH中的溶液中添加10%Pd/C(3.5g)和CH3COOH(0.95mL,15.88mmol,2.01当量)。将烧瓶抽真空并用氢气冲洗。将所得混合物在氢气气氛下使用氢气球在40℃下氢化过夜,然后通过硅藻土垫过滤并减压浓缩。在以下条件下,通过反相柱色谱纯化残余物:柱,C18硅胶;流动相,ACN的水溶液,在30分钟内10%至50%梯度。得到呈无色油状物的4-(2-[2-[(4-甲基苯磺酰基)氧基]乙氧基]乙氧基)丁-1-醇(2.2g,80%)。
步骤5
Figure BDA0003676261880003821
在室温和氮气气氛下,向2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯(1.5g,7.53mmol,1当量)和4-(2-[2-[(4-甲基苯磺酰基)氧基]乙氧基]乙氧基)丁-1-醇(3.0g,9.04mmol,1.2当量)在丙酮(50mL)中的搅拌溶液中添加Cs2CO3(4.9g,15.04mmol,2.00当量)。将所得混合物在60℃下搅拌4小时,然后减压浓缩。通过使用CH2Cl2/MeOH(10∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的2-(3-[2-[2-(4-羟基丁氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯(800mg,30%)。
步骤6
Figure BDA0003676261880003822
在0℃下,向2-(3-[2-[2-(4-羟基丁氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯(550mg,1.53mmol,1当量)在DCM(20mL)中的搅拌溶液中添加戴斯-马丁过碘烷(1298mg,3.06mmol,2当量)。将所得混合物在30℃下搅拌2小时,然后通过添加饱和硫代硫酸钠溶液淬灭。用DCM(3x20mL)萃取所得混合物。将合并的有机层用饱和碳酸氢钠溶液洗涤,经硫酸钠干燥并减压浓缩。通过制备型-TLC(CH2Cl2/MeOH 10∶1)纯化残余物,得到呈浅黄色固体的3-甲基-2-(3-[2-[2-(4-氧代丁氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)丁酸甲酯(440mg,80%)。
根据以下方案使用类似于针对该系列其他实施例(例如,示例性化合物91)所述并且对本领域技术人员而言显而易见的程序,将3-甲基-2-(3-[2-[2-(4-氧代丁氧基)乙氧基]乙氧基]-1,2-噁唑-5-基)丁酸甲酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880003831
使用类似的程序制备示例性化合物65、66、71、73和74。
示例性化合物69和70的示例性合成
Figure BDA0003676261880003841
步骤1
Figure BDA0003676261880003842
在250mL圆底烧瓶中置入3-(苄基氧基)环丁-1-酮(6.0g,34.05mmol,1.0当量)在乙醇(100mL)中的溶液。然后在0℃下分数批添加硼氢化钠(1.25g,33.94mmol,1.00当量)。将所得溶液在0℃下搅拌3小时。然后通过添加水(100mL)来淬灭该反应。反应。用乙酸乙酯(50mL x2)萃取所得溶液,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。得到6.0g(99%)呈浅黄色油状物的(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁-1-醇。
步骤2
Figure BDA0003676261880003843
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的500mL圆底烧瓶中置入(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁-1-醇(8.0g,44.89mmol,1.10当量)在N,N-二甲基甲酰胺(100mL)中的溶液。然后在0℃下分数批添加氢化钠(60%)(2.15g,89.58mmol,1.20当量)。向其中添加4-溴-2-氟吡啶(70.0g,39.78mmol,1.00当量)。将所得溶液在室温下搅拌过夜。然后,通过添加水/冰来淬灭该反应。用乙酸乙酯(80mL x2)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(80mL x2)洗涤所得混合物。减压浓缩所得混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)的硅胶柱上。得到7.0g(53%)呈浅黄色油状物的4-溴-2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶。
步骤3
Figure BDA0003676261880003851
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的500mL圆底烧瓶中置入4-溴-2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶(8.4g,25.13mmol,1.30当量)在甲苯(200mL)中的溶液、3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(4.11g,19.36mmol,1.00当量)、叔丁醇钠(3.2g,33.2mmol,1.5当量)、xantphos(2.32g,4.01mmol,0.20当量)、Pd2(dba)3CH2Cl2(430.0mg,0.40mmol,0.02当量)。将所得溶液在100℃下搅拌过夜。然后通过添加水(100mL)将来淬灭该反应。用乙酸乙酯(80mL x2)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(100mL x2)洗涤所得混合物。将混合物经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/己烷(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到8.0g(89%)呈浅黄色油状物的8-[2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880003852
在氮气气氛下,在250ml圆底烧瓶中,向8-[2-[(1s,3s)-3-(苄基氧基)环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(7.0g,15.03mmol,1.00当量)在150mL乙醇中的溶液中添加氢氧化钯催化剂(7.0g,49.85mmol,3.32当量)和乙酸(2mL)。然后将烧瓶抽真空并用氢气冲洗。将反应混合物在氢气气氛下使用氢气球在50℃下氢化3天,然后通过硅藻土垫过滤并减压浓缩。得到5.4g(96%)呈浅黄色油状物的8-[2-[(1s,3s)-3-羟基环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880003861
在100mL圆底烧瓶中置入8-[2-[(1s,3s)-3-羟基环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯(5.0g,13.32mmol,1.00当量)在乙酸乙酯和甲醇的混合溶剂(10∶1)(50mL)中的溶液。通入氯化氢(g)。将所得混合物在室温下搅拌3小时,并减压浓缩。得到4.0g(96%)呈灰白色固体的(1s,3s)-3-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁-1-醇盐酸盐。
步骤6
Figure BDA0003676261880003862
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL压力罐反应器中置入(1s,3s)-3-[(4-[3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁-1-醇盐酸盐(1.0g,3.21mmol,1.00当量)在二甲亚砜(10mL)中的溶液。然后添加N,N-二异丙基乙胺(5mL)和4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(3.01g,14.44mmol,4.00当量)。将所得溶液在130℃下搅拌16小时。然后通过添加水(50mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(3x30mL)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(3x50mL)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)的硅胶柱上。得到490mg(38%)呈黄色油状物的(1s,3s)-3-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)环丁-1-醇。
步骤7
Figure BDA0003676261880003871
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL压力罐反应器中置入(1s,3s)-3-([4-[3-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基]氧基)环丁-1-醇(800.0mg,1.99mmol,1.00当量)在二噁烷和水的混合溶剂(4∶1)(15mL)中的溶液、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(543.5mg,2.99mmol,1.50当量)、碳酸钾(823.9mg,6.0mmol,3.00当量)、Pd(PPh3)4(230.0mg,0.20mmol,0.10当量)。将所得溶液在90℃下搅拌2小时。然后,通过添加水(30mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(50mL x2)萃取所得溶液,再合并有机层。用盐水(50mL x2)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)的硅胶柱上。得到820.0mg(82%)呈黄色固体的(1s,3s)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁-1-醇。
步骤8
Figure BDA0003676261880003872
在0℃和氮气气氛下,向6-溴吡啶-3-醇(12.70g,72.9mmol,1.00当量)和咪唑(7.45g,109.5mmol,1.50当量)在DMF(100mL)中的搅拌溶液中分批添加TBSCl(16.50g,109.47mmol,1.50当量)。在室温和氮气气氛下,将所得混合物搅拌3小时。在室温下用水(100mL)淬灭反应,并将所得混合物用EtOAc(50mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mLx2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用PE/EtOAc(5∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈无色油状物的2-溴-5-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]吡啶(19g,90%)。
步骤9
Figure BDA0003676261880003881
在室温和氮气气氛下,向2-溴-5-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]吡啶(4.00g,13.88mmol,1.00当量)和NaI(10.40g,69.38mmol,5.00当量)在1,4-二噁烷(20mL)中的搅拌混合物中滴加CuI(0.26g,1.365mmol,0.10当量)和甲基[2-(甲基氨基)乙基]胺(0.12g,1.361mmol,0.10当量)。将所得混合物在110℃和氮气气氛下搅拌5小时。过滤反应混合物,并将滤饼用1,4-二噁烷冲洗。将滤液减压浓缩。将残余物通过使用己烷/EtOAc(5∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈灰白色固体的5-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]-2-碘吡啶(4.2g,90%)。
步骤10
Figure BDA0003676261880003882
在0℃在氢气气氛下,向5-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]-2-碘吡啶(4.20g,12.53mmol,1.00当量)在THF(20mL)中的搅拌溶液中滴加TBAF(1mol/L,27mL,27mmol,2.00当量)。在室温和氮气气氛下,将所得混合物搅拌2小时。在室温下用水(50mL)淬灭反应。用EtOAc(50mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用己烷/EtOAc(2∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈浅黄色固体的6-碘吡啶-3-醇(2.3g,83%)。
步骤11
Figure BDA0003676261880003891
在0℃和氮气气氛下,向PPh3(523mg,2.00mmol,2.00当量)在THF(10mL)中的溶液中添加DIAD(403mg,2.00mmol,2.00当量)、(1s,3s)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁-1-醇(504mg,1.00mmol,1当量)和6-碘吡啶-3-醇(265mg,1.20mmol,1.20当量)。将所得混合物在0℃下搅拌5分钟,加热至50℃,并在50℃和氮气气氛下下搅拌2小时。通过在室温下添加水(20mL)来淬灭该反应,并用EtOAc(20mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈浅黄色固体的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-碘吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(382mg,54%)。
步骤12
Figure BDA0003676261880003901
在室温下,向(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(780mg,1.56mmol,1.00当量)在丙酮(40mL)中的溶液中添加Cs2CO3(1019mg,3.13mmol,2.00当量)和3-溴丙-1-炔(558mg,4.69mmol,3.00当量)。将所得混合物于50℃在氮气气氛下搅拌3小时。过滤混合物,并用THF(50mL x2)冲洗滤饼。将滤液减压浓缩。将残余物通过使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈灰白色固体的(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-[3-甲基-2-[3-(丙-2-炔-1-基氧基)-1,2-噁唑-5-基]丁酰基]吡咯烷-2-甲酰胺(520mg,62%)。
步骤13
Figure BDA0003676261880003902
在室温和氮气气氛下,向6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-碘吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(224mg,0.317mmol,1.00当量)和CuI(6.0mg,0.032mmol,0.10当量)在DMF(5mL)的搅拌混合物中添加TEA(96mg,0.950mmol,3.00当量)和Pd(PPh3)2Cl2(22.2mg,0.032mmol,0.10当量)。将所得混合物在室温下搅拌5分钟,然后添加到(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-[3-甲基-2-[3-(丙-2-炔-1-基氧基)-1,2-噁唑-5-基]丁酰基]吡咯烷-2-甲酰胺(170mg,0.317mmol,1.00当量)在DMF(2mL)中的溶液中。将反应混合物于65℃在氮气气氛下搅拌2小时。通过添加水(30mL)来淬灭该反应。用EtOAc(20mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(30mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用二氯甲烷/甲醇(9∶1)洗脱的制备型-TLC纯化,得到呈浅黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-(3-甲基-2-[3-[(3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-炔-1-基)氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺(175mg,49%)。
通过手性HPLC分离(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-(3-甲基-2-[3-[(3-[5-[(1r,3r)-3-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-炔-1-基)氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酰基)吡咯烷-2-甲酰胺的两种非对映体(620mg),条件如下:柱:CHIRALPAK IG,2.0cm I.D*25cm(5um);流动相A:MeOH(8mmol/L NH3.MeOH),流动相B:DCM;流速:20mL/min;梯度:在17分钟内30%B至30%B;220/254nm;RT1:8.495min;RT2:12.854min。得到137mg(22%)初步确定为(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-[(2S)-3-甲基-2-[3-[(3-[5-[(1r,3r)-3-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-炔-1-基)氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酰基]吡咯烷-2-甲酰胺(浅黄色固体)的异构体1和199mg(32%)初步确定为(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-[(2R)-3-甲基-2-[3-[(3-[5-[(lr,3r)-3-[(4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]吡啶-2-基)氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-炔-1-基)氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酰基]吡咯烷-2-甲酰胺(灰白色固体)的异构体2。
使用类似的程序制备示例性化合物226、227、231、232、236和237。
示例性化合物76的示例性合成
Figure BDA0003676261880003921
步骤1
Figure BDA0003676261880003922
在0℃下,向(1S)-1-(4-溴苯基)乙胺(5g,24.99mmol,1.0当量)在二氯甲烷(100mL)中的溶液中添加三乙胺(2.53g,24.99mmol,1.0当量)。然后将混合物在0℃下搅拌30分钟。然后添加二碳酸二叔丁酯(5.45g,24.99mmol,1.0当量),并将混合物在0℃下搅拌30分钟,然后在20℃下搅拌2小时。将混合物用饱和碳酸氢钠水溶液(20mL)淬灭,用水(50mL)稀释,用二氯甲烷(100mL x2)萃取,用盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩。将残余物与石油醚∶乙酸乙酯(50mL,v/v=5/1)一起搅拌,然后过滤。得到呈白色固体的N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(6.4g,20.68mmol,82%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003931
在氮气气氛下,向N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(3g,9.99mmol,1.0当量)和2-甲基-1H-咪唑(902mg,10.99mmol,1.1当量)在二甲亚砜(15mL)中的溶液中添加L-脯氨酸(1.38g,11.99mmol,1.2当量)、碳酸铯(9.77g,29.98mmol,3.0当量)和碘化亚铜(2.28g,11.99mmol,1.2当量)。然后将混合物在130℃下搅拌12小时。将混合物用水(200mL)稀释,过滤,然后用乙酸乙酯(200mLx3)萃取,用盐水(200mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤,然后浓缩。通过反相快速色谱法(甲酸)纯化残余物。得到呈黄色油状物的N-[(1S)-1-[4-(2-甲基咪唑-1-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(250mg,0.83mmol,8%收率)。
如以下方案中所述使用上述用于示例性化合物47和64的程序,将N-[(1S)-1-[4-(2-甲基咪唑-1-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880003932
Figure BDA0003676261880003941
使用类似的程序制备示例性化合物75。
示例性化合物116的示例性合成
Figure BDA0003676261880003942
步骤1
Figure BDA0003676261880003943
在氮气气氛下,向1-(6-溴-3-吡啶基)乙酮(11.88g,59.41mmol,1.2当量)和四乙氧基钛(22.58g,99.01mmol,2当量)在四氢呋喃(50mL)中的溶液中添加(R)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(6g,49.50mmol,1当量)。将反应混合物在70℃下搅拌12小时。通过添加水(30mL)来淬灭反应混合物,然后用水(100mL)进一步稀释,过滤并用乙酸乙酯(80mL×3)萃取。经合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到呈浅黄色固体的所需化合物(R,E)-N-(1-(6-溴吡啶-3-基)亚乙基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(16g,43.27mmol,87%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003951
在0℃下,向(R,E)-N-(1-(6-溴吡啶-3-基)亚乙基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(16g,52.77mmol,1当量)在四氢呋喃(160mL)中的溶液中添加三仲丁基硼氢化锂(1M,158mL,3当量)。将反应混合物加热并在20℃下搅拌3小时。通过添加水(100mL)来淬灭反应混合物,然后用水(100mL)进一步稀释,过滤并用乙酸乙酯(100mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到粗产物,将其通过从石油醚∶乙酸乙酯=1∶1(10mL)中重结晶来纯化。然后通过半制备型反相HPLC(FA条件:柱:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:20%-55%,30min)纯化残余物。得到呈白色固体的N-[(1S)-1-(6-溴-3-吡啶基)乙基]-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰胺(4.7g,12.89mmol,24%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880003952
向N-[(1S)-1-(6-溴-3-吡啶基)乙基]-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰胺(2.6g,8.52mmol,1当量)在二氯甲烷(20mL)中的溶液中添加盐酸/甲醇(4M,21.3mL,10当量)。将反应混合物在20℃下搅拌0.15小时。减压浓缩反应混合物,得到呈白色固体的(1S)-1-(6-溴-3-吡啶基)乙胺(1.9g,粗品,盐酸盐)。
步骤4
Figure BDA0003676261880003961
在0℃下,向(1S)-1-(6-溴-3-吡啶基)乙胺盐酸盐(1.9g,8.00mmol,1当量)在二氯甲烷(20mL)中的溶液中添加三乙胺(2.43g,24.00mmol,3.34mL,3当量)0.5小时,然后在0℃下,添加二碳酸二叔丁酯(2.62g,12.00mmol,2.76mL,1.5当量)0.5小时。将反应混合物在20℃下搅拌12小时。通过添加水(20mL)来淬灭反应混合物,然后用水60mL进一步稀释,并用乙酸乙酯(80mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物,将其通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=50∶1至3∶1)纯化。得到呈白色固体的N-[(1S)-1-(6-溴-3-吡啶基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(2.2g,7.06mmol,88%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880003962
向5-溴-4-甲基-噻唑(800mg,4.49mmol,1当量)和4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3,2-二氧杂戊硼烷(1.37g,5.39mmol,1.2当量)在二噁烷(10mL)中的溶液中添加1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁-二氯化钯(II)(164mg,0.22mmol,0.05当量)和乙酸钾(882mg,8.99mmol,2当量)。将反应混合物在100℃下搅拌12小时。将反应混合物过滤并减压浓缩,得到呈棕色油状物的4-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)噻唑(1g,粗品),其无需纯化即可使用。
步骤6
Figure BDA0003676261880003971
向4-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)噻唑(617mg,2.74mmol,1.5当量)和N-[(1S)-1-(6-溴-3-吡啶基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(550mg,1.83mmol,1当量)在二噁烷(12mL)和水(2mL)中的溶液中添加1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁-二氯化钯(II)(134mg,0.18mmol,0.1当量)和碳酸钾(505mg,3.65mmol,2当量)。将反应混合物在100℃下搅拌12小时。通过添加水(10mL)来淬灭反应混合物,然后用水(30mL)稀释,过滤并用乙酸乙酯(30mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(60mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物,将其通过制备型-TLC(石油醚∶乙酸乙酯=1∶1)纯化。得到呈浅黄色固体的所需化合物N-[(1S)-1-[6-(4-甲基噻唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(200mg,0.62mmol,34%收率)。
如上针对示例性化合物76所述,将N-[(1S)-1-[6-(4-甲基噻唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化成最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物160。
示例性化合物117的示例性合成
Figure BDA0003676261880003981
步骤1
Figure BDA0003676261880003982
在-78℃下,向N-[(1S)-1-(6-溴-3-吡啶基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(1g,3.32mmol,1当量)在四氢呋喃(10mL)中的溶液中添加正丁基锂(2.5M,2.9mL,2.2当量)。将混合物在-78℃下搅拌0.5小时,然后在-78℃下向混合物中添加N,N-二甲基甲酰胺(728mg,9.96mmol,0.8mL,3当量),并将混合物在-78℃下搅拌0.5小时。然后将混合物加热至15℃并保持1小时。通过添加饱和氯化铵(10mL)来淬灭反应混合物,然后用水(20mL)稀释,过滤并用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(60mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=10∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的所需化合物N-[(1S)-1-(6-甲酰基-3-吡啶基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(550mg,2.20mmol,66%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880003983
向N-[(1S)-1-(6-甲酰基-3-吡啶基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(550mg,2.20mmol,1当量)和1-(1-异氰基乙基磺酰基)-4-甲基-苯(506mg,2.42mmol,1.1当量)在甲醇(10mL)中的溶液中添加碳酸钾(607mg,4.39mmol,2当量)。将反应混合物在70℃下搅拌12小时。通过添加水(20mL)来淬灭反应混合物,然后用水(10mL)稀释,过滤并用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(60mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=50∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈白色固体的所需化合物N-[(1S)-1-[6-(4-甲基噁唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(570mg,1.65mmol,75%收率,87%纯度)。
如上针对示例性化合物76所述,将N-[(1S)-1-[6-(4-甲基噁唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物161、229和230。
示例性化合物81的示例性合成
Figure BDA0003676261880003991
步骤1
Figure BDA0003676261880003992
在250mL圆底烧瓶中置入1-(4-羟苯基)乙-1-酮(6.0g,44.08mmol,1当量)、叔丁基(氯)二甲基硅烷(10g,66.1mmol,1.5当量)和K2CO3(12g,88.14mmol,2当量)的DMF(100mL)溶液。将所得混合物在室温下搅拌过夜。然后,通过添加水(100mL)来淬灭该反应。用二氯甲烷(100mL x3)萃取所得混合物,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶10)洗脱的硅胶柱上。得到5.2g(47%)呈灰白色固体的1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙-1-酮。
步骤2
Figure BDA0003676261880004001
在250mL圆底烧瓶中置入1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙-1-酮(5g,20.0mmol,1当量)的MeOH(100mL)溶液,在室温下向其中分批添加硼氢化钠(1.5g,39.94mmol,2当量)。将所得溶液在室温下搅拌5h,然后减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗脱的硅胶柱上。得到3.8g(76%)呈黄色油状物的1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙-1-醇。
步骤3
Figure BDA0003676261880004002
在250mL圆底烧瓶中置入1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙-1-醇(3.8g,15.05mmol,1当量)和TEA(6.1g,60.21mmol,4当量)的二氯甲烷(100mL)溶液,在室温下向其中缓慢添加甲磺酰氯(2.1g,18.07mmol,1.20当量)。将所得混合物在室温下搅拌2小时。减压浓缩该混合物。得到3.6g呈黄色固体的粗制甲磺酸1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880004011
在氮气气氛下,在250mL圆底烧瓶中置入甲磺酸1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙酯(5.0g,15.13mmol,1当量)、2-(环戊-1,4-二烯-1-基)-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷(3.5g,18.17mmol,1.20当量)和K2CO3(6.3g,45.38mmol,3当量)的DMF(150mL)溶液。将所得混合物在90℃下搅拌过夜。然后通过添加水(150mL)来淬灭该反应。用二氯甲烷(150mL x3)萃取所得混合物,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱上。得到600mg(9%)呈黄色固体的1-(1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑。
根据以下方案使用类似于针对其他实施例所述的程序,将1-(1-[4-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]苯基]乙基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004012
使用类似的程序制备示例性化合物156。
示例性化合物162的示例性合成
Figure BDA0003676261880004021
步骤1
Figure BDA0003676261880004022
在250mL的圆底烧瓶中置入1-(6-氟吡啶-3-基)乙-1-酮(4.17g,29.97mmol,1当量)在EtOH(60mL)中的溶液。将该溶液在水/冰浴中冷却至0℃,并滴加硼氢化钠(2.27g,61.65mmol,2.06当量)在H2O(10mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌0.5小时。将反应混合物小心地用水(400mL)淬灭,并且用乙酸乙酯(200mL x3)萃取。将有机层合并,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到3.87g(91%)呈浅黄色油状物的1-(6-氟吡啶-3-基)乙-1-醇。
步骤2
Figure BDA0003676261880004023
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的500mL 3颈圆底烧瓶中置入1-(6-氟吡啶-3-基)乙-1-醇(4.06g,28.76mmol,1当量)的二氯甲烷(200mL)溶液。将该溶液在水/冰浴中冷却至0℃,并在0℃下依次添加PPh3(11.28g,43.01mmol,1.50当量)和NBS(7.66g,43.04mmol,1.50当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩反应混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶9)洗脱的硅胶柱上。得到5.83g(99%)呈浅黄色液体的5-(1-溴乙基)-2-氟吡啶。
步骤3
Figure BDA0003676261880004031
在100mL圆底烧瓶中置入5-(1-溴乙基)-2-氟吡啶(3.06g,15.00mmol,1当量)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(3.20g,16.49mmol,1.10当量)和K2CO3(4.15g,30.03mmol,2.00当量)在DMF(50mL)中的溶液。将所得溶液在60℃下在油浴中搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温,并用水(400mL)稀释。用乙酸乙酯(100mL x4)萃取混合物,并将合并的有机层用盐水(300mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。得到3.43g(72%)呈浅黄色固体的2-氟-5-[1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基]乙基]吡啶。
步骤4
Figure BDA0003676261880004032
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL圆底烧瓶中置入2-氟-5-[1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基]乙基]吡啶(2.54g,8.01mmol,1当量、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(2.00g,9.60mmol,1.20当量)、Na2CO3(2.12g,20.00mmol,2.50当量)和Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(327mg,0.40mmol,0.05当量)在二噁烷(50mL)和H2O(8mL)中的溶液。将所得溶液在90℃下在油浴中搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温,并用水(200mL)稀释。将混合物用乙酸乙酯(300mL×2)萃取,合并有机层,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到硅胶柱上,用二氯甲烷/甲醇(20∶1)洗脱。这产生1.88g(74%)呈棕色固体的6-氯-4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]哒嗪-3-胺。
步骤5
Figure BDA0003676261880004041
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的30mL密封管中置入6-氯-4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]哒嗪-3-胺(765mg,2.40mmol,1当量)、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(524mg,2.88mmol,1.20当量)、K2CO3(829mg,6.00mmol,2.50当量)和Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(196mg,0.24mmol,0.10当量)的二噁烷(18mL)和H2O(3mL)溶液。将所得溶液在100℃下在油浴中搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温,并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(20∶1)洗脱的硅胶柱上。得到860mg(85%)呈棕色固体的4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺。
步骤6
Figure BDA0003676261880004042
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入乙烷-1,2-二醇(1.48g,23.84mmol,10.03当量)的DMF(15mL)溶液。将该溶液在水/冰浴中冷却至0℃,并在0℃下向其中分批添加NaH(0.76g,19.00mmol,7.99当量,60%)。将所得混合物在室温下搅拌1.5小时,然后在0℃下滴加4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(1.00g,2.38mmol,1当量)在DMF(5mL)中的溶液。将反应混合物再搅拌3小时,同时在油浴中将温度保持在55℃。将反应混合物冷却至室温,然后通过添加水(200mL)淬灭。用乙酸乙酯(300mL x2)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(200mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(15∶1)洗脱的硅胶柱上。得到361mg(33%)呈浅黄色固体的2-([5-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]吡啶-2-基]氧基)乙-1-醇。
步骤7
Figure BDA0003676261880004051
在0℃下,在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入四甲基偶氮二甲酰胺(861mg,5.00mmol,10.00当量)和三丁基膦(1.01g,4.99mmol,9.98当量)在THF(15mL)中的溶液。向混合物中添加2-([5-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]吡啶-2-基]氧基)乙-1-醇(231.3mg,0.50mmol,1当量)和(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(249mg,0.50mmol,1.00当量)。将所得溶液在0℃下搅拌10分钟,然后在50℃下在油浴中再搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温,并用水(150mL)稀释。用乙酸乙酯(150mL)萃取所得混合物,并将有机层用盐水(150mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10/1)洗脱的硅胶柱上。通过制备型HPLC进一步纯化所得产物,条件如下:柱,XBridge Prep OBD C18柱,19x150mm,5um;流动相,水(含10mmol/L NH4HCO3)和乙腈,在8分钟内,35%ACN升至53%。得到68mg(14%)呈灰白色固体的(2S,4R)-1-(2-(3-(2-(5-(1-(4-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙基)-2-氧代吡啶-1(2H)-基)乙氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺。
使用类似于上述用于其他实施例的程序,将(2S,4R)-1-(2-(3-(2-(5-(1-(4-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙基)-2-氧代吡啶-l(2H)-基)乙氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物157。
示例性化合物100的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880004061
在氮气气氛下,向乙醇(350mL,7.60mmol,0.04当量)和水(60mL,3.33mmol,0.02当量)的搅拌混合物中分批添加无水乙酸钠(18g,264.71mmol,1.47当量)。将所得混合物于70℃在氮气气氛下搅拌16小时。减压浓缩所得混合物。用水(500mL)稀释所得混合物。用乙酸乙酯(300mL x2)萃取水层。将残余物用盐水(100mL x2)洗涤,干燥并减压浓缩。将残余物通过使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈白色固体的1-(4-溴苯基)-2-羟基乙-1-酮(32g,83%)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004071
在室温和氮气气氛下,向1L圆底烧瓶中添加1-(4-溴苯基)-2-羟基乙-1-酮(32g,148.8mmol,1当量)、二氯甲烷(500mL)、咪唑(30g,440.7mmol,2.96当量)、4-二甲基氨基吡啶(1.8g,14.73mmol,0.10当量)和叔丁基二甲基甲硅烷基氯(26.8g,177.8mmol,1.19当量)。在室温和氮气气氛下,将所得混合物搅拌2小时。在室温下用水淬灭反应。用二氯甲烷(200mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(100mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用乙酸乙酯/石油醚(1∶20)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈浅黄色固体的1-(4-溴苯基)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]乙-1-酮(29g,59%)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004072
在室温下,向1L 3颈圆底烧瓶中添加1-(4-溴苯基)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]乙-1-酮(27g,81.99mmol,1当量)、四氢呋喃(500mL)和(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(19.5g,160.9mmol,1.96当量)。在室温和氮气气氛下向搅拌的溶液中滴加Ti(i-PrO)4(70g,246.5mmol,3.01当量)。将所得混合物于70℃在氮气气氛下搅拌16小时。使混合物冷却至室温。过滤所得混合物,并用乙酸乙酯(200mL x2)洗涤滤饼。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用乙酸乙酯/石油醚(1∶15)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈黄色油状物的(S)-N-[(1Z)-1-(4-溴苯基)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]亚乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(16g,45%)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004081
在室温下,向500mL 3颈圆底烧瓶中添加(S)-N-[(1Z)-1-(4-溴苯基)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]亚乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(15g,34.68mmol,1当量)和四氢呋喃(150mL)。在-70℃在氮气气氛下向搅拌的溶液中滴加BH3.THF(52mL,52mmol,1.5当量)。将所得混合物在-70℃在氮气气氛下搅拌1小时。在室温下用甲醇淬灭反应。过滤所得混合物,并用乙酸乙酯(100mL x2)洗涤滤饼。将滤液用盐水(50mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物通过使用乙酸乙酯/石油醚(1∶2)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈黄色固体的(S)-N-[(1R)-1-(4-溴苯基)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(5.6g,37%)。
步骤5
Figure BDA0003676261880004091
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL圆底烧瓶中置入(S)-N-[(1R)-1-(4-溴苯基)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.6g,5.98mmol,1.00当量)、二噁烷(30mL)、4-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3-噻唑(2g,8.88mmol,1.48当量)、碳酸钾(2.5g,18.09mmol,3.02当量)、水(5mL)和Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(440mg,0.51mmol,0.09当量)。将所得溶液在90℃下搅拌2小时。滤出固体。将滤液用水(50mL)稀释,并用乙酸乙酯(50mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(35mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱上。得到2.5g(92%)呈橙色油状物的(S)-N-[(1R)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺。
步骤6
Figure BDA0003676261880004092
在250mL圆底烧瓶中置入(S)-N-[(1R)-2-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.6g,5.74mmol,1.00当量)和氯化氢的二噁烷(100mL,4M)溶液。将所得溶液在室温下搅拌过夜。真空浓缩所得混合物。得到1.5g(96%)呈黄色油状物的(2R)-2-氨基-2-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙-1-醇盐酸盐。
步骤7
Figure BDA0003676261880004101
在250mL圆底烧瓶中置入2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸乙酯(1g,4.69mmol,1当量)、Cs2CO3(4.5g,13.81mmol,3.0当量)和1,2-二溴乙烷(2.60g,13.84mmol)的丙酮(100mL)溶液。将所得混合物在室温下搅拌过夜。然后用水(100mL)淬灭该反应。用乙酸乙酯(100mL×3)萃取所得混合物,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(3∶10)洗脱的硅胶柱上。得到600mg(40%)呈浅黄色油状物的2-[3-(2-溴乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸乙酯。
根据以下方案使用针对其他实施例所述并对本领域技术人员显而易见的程序,将(2R)-2-氨基-2-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙-1-醇和2-[3-(2-溴乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸乙酯转化为(2S,4R)-1-(2-(3-(2-溴乙氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((R)-2-羟基-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880004111
使用类似于针对示例性化合物47所述的程序,将(2S,4R)-1-(2-(3-(2-溴乙氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((R)-2-羟基-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物158。
示例性化合物115的示例性合成
Figure BDA0003676261880004112
步骤1
Figure BDA0003676261880004113
在烧瓶中装入N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.4g,4.66mmol,1当量)、4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3,2-二氧杂戊硼烷(1.42g,5.60mmol,1.2当量)、(1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁)二氯化钯(II)(170mg,0.23mmol,0.05当量)、乙酸钾(915mg,9.33mmol,2当量)和二噁烷(30mL)。将混合物用氮气吹扫10min,然后加热至80℃保持1h。将反应混合物冷却至20℃,并通过硅藻土垫过滤。真空浓缩滤液。通过柱(石油醚∶乙酸乙酯=10∶1)纯化粗产物。得到呈无色油状物的N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.9g,粗品)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004121
在烧瓶中装入N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.90g,5.47mmol,1.1当量)、2-溴-1-甲基-咪唑(800mg,4.97mmol,1当量)、(1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁)二氯化钯(II)(181mg,0.24mmol,0.05当量)、碳酸钠(1.05g,9.94mmol,2当量)、二噁烷(18mL)和水(3mL)。将混合物用氮气吹扫5min,并加热至110℃保持12h。将混合物用水(50mL)稀释,并用乙酸乙酯(20mL x3)萃取。将有机层用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥并过滤。真空浓缩滤液。通过柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=1∶0至3∶1)纯化粗残余物。得到呈灰色固体的N-[(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(850mg,2.82mmol,56%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004131
向N-[(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(850mg,2.82mmol,1当量)在二噁烷(2mL)中的溶液中添加氯化氢溶液(4M的二噁烷溶液,10mL,14.18当量)。将该溶液在20℃下搅拌1小时。真空去除溶剂。得到呈灰色固体的(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙胺(670mg,粗品,盐酸盐)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004132
向(2S,4R)-1-叔丁氧基羰基-4-羟基-吡咯烷-2-羧酸(651mg,2.82mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(2mL)中的溶液中添加1-羟基苯并三唑(456mg,3.38mmol,1.2当量)、1-(3-二甲基氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐(648mg,3.38mmol,1.2当量)。将该溶液在20℃下搅拌0.5h,然后将(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙胺(670mg,2.82mmol,1当量,盐酸盐)和N,N-二异丙基乙胺(1.09g,8.46mmol,1.47mL,3当量)在N,N-二甲基甲酰胺(3mL)中的溶液添加到该溶液中并搅拌11.5h。真空去除溶剂。通过半制备型反相HPLC(柱:Phenomenex Gemini C18 250*5010um;流动相:[水(0.05%氢氧化氨v/v)-ACN];B%:20%-50%,20min;60%min)纯化粗残余物。得到呈无色油状物的(2S,4R)-4-羟基-2-[[(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(800mg,1.93mmol,68%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880004141
向(2S,4R)-4-羟基-2-[[(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(350mg,0.84mmol,1当量)在二氯甲烷(3mL)中的溶液中添加盐酸/二噁烷(4M的二噁烷溶液,3mL,14.21当量)。然后将反应混合物在20℃下搅拌2h。减压浓缩反应混合物,得到呈浅黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(400mg,粗品,盐酸盐)。
使用针对实施例示例性化合物47所述的程序,将(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(1-甲基咪唑-2-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物。
使用类似的程序制备化合物159。
示例性化合物162的示例性合成
Figure BDA0003676261880004151
步骤1
Figure BDA0003676261880004152
在250mL的圆底烧瓶中置入1-(6-氟吡啶-3-基)乙-1-酮(4.17g,29.97mmol,1当量)在EtOH(60mL)中的溶液。将该溶液在水/冰浴中冷却至0℃,并滴加硼氢化钠(2.27g,61.65mmol,2.06当量)在H2O(10mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌0.5h。将反应混合物小心地用水(400mL)淬灭,并且用乙酸乙酯(200mL x3)萃取。将有机层合并,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到3.87g(91%)呈浅黄色油状物的1-(6-氟吡啶-3-基)乙-1-醇。
步骤2
Figure BDA0003676261880004153
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的500mL 3颈圆底烧瓶中置入1-(6-氟吡啶-3-基)乙-1-醇(4.06g,28.76mmol,1当量)的二氯甲烷(200mL)溶液。将该溶液在水/冰浴中冷却至0℃,并在0℃下依次添加PPh3(11.28g,43.01mmol,1.50当量)和NBS(7.66g,43.04mmol,1.50当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。真空浓缩反应混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶9)洗脱的硅胶柱上。得到5.83g(99%)呈浅黄色液体的5-(1-溴乙基)-2-氟吡啶。
步骤3
Figure BDA0003676261880004161
在100mL圆底烧瓶中置入5-(1-溴乙基)-2-氟吡啶(3.06g,15.00mmol,1当量)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(3.20g,16.49mmol,1.10当量)和K2CO3(4.15g,30.03mmol,2.00当量)在DMF(50mL)中的溶液。将所得混合物在60℃下在油浴中搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温,并用水(400mL)稀释。用乙酸乙酯(100mL x4)萃取混合物,并将合并的有机层用盐水(300mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。得到3.43g(72%)呈浅黄色固体的2-氟-5-[1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基]乙基]吡啶。
步骤4
Figure BDA0003676261880004162
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL圆底烧瓶中置入2-氟-5-[1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑-1-基]乙基]吡啶(2.54g,8.01mmol,1当量、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(2.00g,9.60mmol,1.20当量)、Na2CO3(2.12g,20.00mmol,2.50当量)和Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(327mg,0.40mmol,0.05当量)在二噁烷(50mL)和H2O(8mL)中的溶液。将所得溶液在90℃下在油浴中搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温,并用水(200mL)稀释。将混合物用乙酸乙酯(300mL×2)萃取,合并有机层,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到硅胶柱上,用二氯甲烷/甲醇(20∶1)洗脱。这产生1.88g(74%)呈棕色固体的6-氯-4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]哒嗪-3-胺。
步骤5
Figure BDA0003676261880004171
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的30mL密封管中置入6-氯-4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]哒嗪-3-胺(765mg,2.40mmol,1当量)、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(524mg,2.88mmol,1.20当量)、K2CO3(829mg,6.00mmol,2.50当量)和Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(196mg,0.24mmol,0.10当量)的二噁烷(18mL)和H2O(3mL)溶液。将所得混合物在100℃下在油浴中搅拌2小时。将反应混合物冷却至室温,并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(20∶1)洗脱的硅胶柱上。得到860mg(85%)呈棕色固体的4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺。
步骤6
Figure BDA0003676261880004181
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入乙烷-1,2-二醇(1.48g,23.84mmol,10.03当量)的DMF(15mL)溶液。将该溶液在水/冰浴中冷却至0℃,并在0℃下向其中分批添加NaH(0.76g,19.00mmol,7.99当量,60%)。将所得混合物在室温下搅拌1.5h,然后在0℃下滴加4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(1.00g,2.38mmol,1当量)在DMF(5mL)中的溶液。将反应混合物再搅拌3h,同时在油浴中将温度保持在55℃。将反应混合物冷却至室温,然后通过添加水(200mL)淬灭。用乙酸乙酯(300mL x2)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(200mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(15∶1)洗脱的硅胶柱上。得到361mg(33%)呈浅黄色固体的2-([5-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]吡啶-2-基]氧基)乙-1-醇。
步骤7
Figure BDA0003676261880004182
在0℃下,在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入四甲基偶氮二甲酰胺(861mg,5.00mmol,10.00当量)和三丁基膦(1.01g,4.99mmol,9.98当量)在THF(15mL)中的溶液。向混合物中添加2-([5-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]吡啶-2-基]氧基)乙-1-醇(231.3mg,0.50mmol,1当量)和(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(249mg,0.50mmol,1.00当量)。将所得溶液在0℃下搅拌10min,然后在50℃下在油浴中再搅拌2h。将反应混合物冷却至室温,并用水(150mL)稀释。用乙酸乙酯(150mL)萃取所得混合物,并将有机层用盐水(150mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10/1)洗脱的硅胶柱上。通过制备型HPLC进一步纯化所得产物,条件如下:柱,XBridge Prep OBD C18柱,19x150mm,5um;流动相,水(含10mmol/LNH4HCO3)和乙腈,在8分钟内,35%ACN升至53%。得到68mg(14%)呈灰白色固体的(2S,4R)-1-(2-(3-(2-(5-(1-(4-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙基)-2-氧代吡啶-1(2H)-基)乙氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺。
使用类似于上述用于其他实施例的程序,将(2S,4R)-1-(2-(3-(2-(5-(1-(4-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙基)-2-氧代吡啶-1(2H)-基)乙氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物157。
示例性化合物82的示例性合成
Figure BDA0003676261880004201
步骤1
Figure BDA0003676261880004202
在100mL圆底烧瓶中置入2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯(498mg,2.50mmol,1当量)、2-(2-溴乙氧基)噁烷(627.3mg,3.00mmol,1.20当量)、Cs2CO3(1.63g,5.00mmol,2.00当量)和NaI(37.5mg,0.25mmol,0.10当量)的丙酮(20mL)溶液。将所得溶液在50℃下在油浴中搅拌16小时。将反应混合物冷却至室温,并用水(150mL)稀释。用乙酸乙酯(100mL x2)萃取混合物,并且将有机层合并,经无水硫酸钠干燥,真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶9)洗脱的硅胶柱上。得到570mg(70%)呈浅黄色油状物的3-甲基-2-[3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酸甲酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880004203
在100mL圆底烧瓶中置入3-甲基-2-[3-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]丁酸甲酯(520mg,1.59mmol,1当量)的二噁烷(6mL)溶液,在室温下向其中添加HCl溶液(4M的二噁烷溶液,6mL)。将所得溶液在室温下搅拌3小时。用饱和NaHCO3将溶液的pH值调节至~8。用二氯甲烷(100mL x4)萃取所得混合物,并且将合并,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗脱的硅胶柱上。得到332mg(86%)呈浅黄色油状物的2-[3-(2-羟基乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸甲酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880004211
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-[3-(2-羟基乙氧基)-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸甲酯(375mg,1.54mmol,1.20当量)的DMF(6mL)溶液。将该溶液在水/冰浴中冷却至0℃,并添加NaH(128.4mg,3.21mmol,2.50当量,60%)。将所得混合物在室温下搅拌1小时,然后在0℃下滴加4-[1-[1-(6-氟吡啶-3-基)乙基]-1H-吡唑-4-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(540mg,1.28mmol,1当量)在DMF(4mL)中的溶液。将所得混合物再搅拌1小时,同时在油浴中将温度保持在35℃。然后通过添加饱和NH4Cl溶液(30mL)来淬灭该反应混合物,并用饱和NaHCO3溶液将所得混合物的pH值调节至~8。用乙酸乙酯(100mL x2)萃取混合物。将有机层合并,并用盐水(100mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(30/1)洗脱的硅胶柱上。得到540mg(65%)呈浅棕色固体的2-[3-[2-([5-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]吡啶-2-基]氧基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸甲酯。
使用类似于上述用于其他实施例的程序,将2-[3-[2-([5-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]吡啶-2-基]氧基)乙氧基]-1,2-噁唑-5-基]-3-甲基丁酸甲酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物163。
示例性化合物93和示例性化合物164的示例性合成
Figure BDA0003676261880004221
步骤1
Figure BDA0003676261880004222
在0℃下,向2-羟基-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸叔丁酯(1.8g,7.46mmol,1当量)在DMF(20mL)中的溶液中添加氢化钠(60%的油溶液,358mg,14.9mmol,2当量)。将混合物搅拌15分钟。然后添加2-(2-溴乙氧基)噁烷(2.3g,11.00mmol,1.47当量),并将混合物加热至50℃并搅拌16h。将反应混合物用水(100mL)淬灭,并用DCM(100mL x3)萃取,用水(50mL x3)和盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(v∶v=1∶7)的硅胶柱上。得到1.0g(36%)呈无色油状物的2-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸叔丁酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880004223
在100mL圆底烧瓶中置入2-[2-(噁烷-2-基氧基)乙氧基]-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸叔丁酯(1.0g,2.71mmol,1当量)在二噁烷(15mL)中的溶液,向其中添加氯化氢的1,4-二噁烷溶液(4.0M,15mL)。将所得溶液在室温下搅拌16h,然后减压浓缩。得到800mg(53%)呈黄色油状物的2-[7-氮杂螺[3.5]壬烷-2-基氧基]乙-1-醇。
步骤3
Figure BDA0003676261880004231
在100mL圆底烧瓶中置入2-[7-氮杂螺[3.5]壬烷-2-基氧基]乙-1-醇(600mg,3.24mmol,1当量)、Et3N(983mg,9.72mmol,3当量)的DCM(30.0mL)溶液,在室温下向其中添加CbzCl(663mg,3.89mmol,1.2当量)。将所得混合物在室温下搅拌16h。然后将反应混合物用50mL水稀释,并用乙酸乙酯(50mL x2)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到210mg(20%)呈黄色油状物的2-(2-羟基乙氧基)-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸苄酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880004232
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的50mL圆底烧瓶中置入2-(2-羟基乙氧基)-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸苄酯(400mg,1.25mmol,1当量)、Et3N(380mg,3.76mmol,3当量)的DCM(20mL)溶液,在0℃下向其中添加MsCl(287mg,2.50mmol,2.00当量)。将所得混合物在0℃下在水/冰浴中搅拌1h。通过添加水(30mL)来淬灭反应混合物,并用二氯甲烷(30mL x2)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并浓缩。得到420mg(85%)呈黄色油状物的2-[2-(甲磺酰氧基)乙氧基]-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸苄酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880004241
在100mL圆底烧瓶中置入2-[2-(甲磺酰氧基)乙氧基]-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸苄酯(300mg,0.75mmol,1当量)、6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-[1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-基]哒嗪-3-胺(291mg,0.75mmol,1当量)、K2CO3(313mg,2.26mmol,3当量)、NaI(113mg,0.75mmol,1当量)在MeCN(15mL)中的溶液。将所得混合物在75℃下在油浴中搅拌16小时。滤出固体,并减压浓缩滤液。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到130mg(25%)呈黄色油状物的2-[2-(9-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)乙氧基]-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸苄酯。
步骤6
Figure BDA0003676261880004242
在0℃下,在100mL圆底烧瓶中置入2-[2-(9-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)乙氧基]-7-氮杂螺[3.5]壬烷-7-羧酸苄酯(230mg,0.33mmol,1当量)在THF(5mL)中的溶液,向其中添加三乙基硼氢化锂(1.0M的THF溶液,1.65mmol,5.0当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时,然后用水(50mL)淬灭,并用二氯甲烷(50mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。得到140mg(76%)呈黄色油状物的4-[4-(2-[7-氮杂螺[3.5]壬烷-2-基氧基]乙基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将4-[4-(2-[7-氮杂螺[3.5]壬烷-2-基氧基]乙基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004251
使用类似的程序制备示例性化合物164。
示例性化合物113的示例性合成
Figure BDA0003676261880004261
步骤1
Figure BDA0003676261880004262
向丁-2-炔-1,4-二醇(10g,116.16mmol,1当量)、2,3-二氢-2H-吡喃(9.77g,116.16mmol,10.6mL,1当量)在二氯甲烷(200mL)中的溶液中添加对甲苯磺酸吡啶鎓(2.92g,11.62mmol,0.1当量)。将反应混合物在40℃下搅拌1小时。向混合物中添加水(200mL),并用二氯甲烷(150mLx2)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的4-四氢吡喃-2-基氧基丁-2-炔-1-醇(10.2g,59.93mmol,51%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004263
在0℃下,向4-四氢吡喃-2-基氧基丁-2-炔-1-醇(5g,29.38mmol,1当量)、三苯基膦(7.70g,29.38mmol,1当量)在二氯甲烷(100mL)中的溶液中添加四溴化碳(10.72g,32.31mmol,1.1当量)。将反应混合物在20℃下搅拌1小时。真空浓缩混合物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至100∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的2-(4-溴丁-2-炔氧基)四氢吡喃(4g,17.16mmol,58%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004271
向4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-lH-吡唑(3g,15.46mmol,1当量)、2-(4-溴丁-2-炔氧基)四氢吡喃(3.96g,17.01mmol,1.1当量)在乙腈(30mL)中的溶液中添加碳酸钾(2.56g,18.55mmol,1.2当量)。将反应混合物在70℃下搅拌12小时。向混合物中添加水(100mL),并用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=200∶1至3∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的1-(4-四氢吡喃-2-基氧基丁-2-炔基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)吡唑(4.5g,13.00mmol,84%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004272
在氮气下,向1-(4-四氢吡喃-2-基氧基丁-2-炔基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)吡唑(2g,5.78mmol,1当量)、4-溴-6-氯-哒嗪-3-胺(1.20g,5.78mmol,1当量)在二噁烷(60mL)和水(20mL)中的溶液中添加碳酸钠(1.53g,14.44mmol,2.5当量)和(1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁)二氯化钯(II)(422mg,0.58mmol,0.1当量)。将反应混合物在110℃下搅拌3小时。向混合物中添加水(200mL),并用乙酸乙酯(100mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(二氯甲烷∶甲醇=1∶0至50∶1)纯化残余物。得到呈黄色固体的6-氯-4-[1-(4-四氢吡喃-2-基氧基丁-2-炔基)吡唑-4-基]哒嗪-3-胺(1.3g,3.40mmol,58%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880004281
向6-氯-4-[1-(4-四氢吡喃-2-基氧基丁-2-炔基)吡唑-4-基]哒嗪-3-胺(1.6g,4.60mmol,1当量)在甲醇(15mL)中的溶液中添加盐酸溶液(4M的甲醇溶液,15mL,13.04当量)。将反应混合物在20℃下搅拌1小时。向混合物中添加饱和碳酸氢钠(50mL)以将pH调节至约6,然后用乙酸乙酯(30mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。得到呈浅黄色固体的4-[4-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)吡唑-1-基]丁-2-炔-1-醇(1.0g,3.79mmol,82%收率)。
步骤6
Figure BDA0003676261880004282
向4-[4-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)吡唑-1-基]丁-2-炔-1-醇(1.0g,3.79mmol,1当量)、三苯基膦(1.19g,4.55mmol,1.2当量)在四氢呋喃(20mL)中的溶液中添加四溴化碳(1.51g,4.55mmol,1.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌1小时。真空浓缩混合物。通过硅胶色谱法(二氯甲烷∶甲醇=1∶0至50∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的4-[1-(4-溴丁-2-炔基)吡唑-4-基]-6-氯-哒嗪-3-胺(1.0g,1.87mmol,49%收率)。
步骤7
Figure BDA0003676261880004291
向4-[1-(4-溴丁-2-炔基)吡唑-4-基]-6-氯-哒嗪-3-胺(1g,1.87mmol,1当量)和哌嗪-1-羧酸叔丁酯(696mg,3.74mmol,2当量)在乙腈(10mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(724mg,5.60mmol,1.0mL,3当量)。将该混合物在80℃下搅拌12小时。向混合物中添加水(30mL),并用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(20mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(二氯甲烷∶甲醇=1∶0至20∶1)纯化残余物。得到呈棕色固体的4-[4-[4-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)吡唑-1-基]丁-2-炔基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(600mg,1.34mmol,71%收率)。
步骤8
Figure BDA0003676261880004292
在氮气气氛下,向4-[4-[4-(3-氨基-6-氯-哒嗪-4-基)吡唑-1-基]丁-2-炔基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(500mg,1.16mmol,1当量)、(2-羟苯基)硼酸(192mg,1.39mmol,1.2当量)在二噁烷(10mL)和水(2mL)中的溶液中添加碳酸钾(400mg,2.89mmol,2.5当量)和四[三苯基膦]钯(0)(134mg,0.12mmol,0.1当量)。将反应混合物在110℃下搅拌10小时。向混合物中添加水(100mL),并用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过制备型薄层色谱(二氯甲烷∶甲醇=10∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的4-[4-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]吡唑-1-基]丁-2-炔基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(340mg,0.65mmol,56%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将4-[4-[4-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]吡唑-1-基]丁-2-炔基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004301
示例性化合物83的示例性合成
Figure BDA0003676261880004302
步骤1
Figure BDA0003676261880004303
在250mL圆底烧瓶中置入4-(1-羟乙基)苯甲酸甲酯(2.5g,13.87mmol,1当量)、二溴三苯基膦(5.9g,13.87mmol,1当量)在DCM(100mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌3小时。减压浓缩反应混合物,并将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(v∶v=1∶12)洗脱的硅胶柱上。得到2.3g(68%)呈无色油状物的4-(1-溴乙基)苯甲酸甲酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880004311
在30mL小瓶中置入4-(1-溴乙基)苯甲酸甲酯(1.2g,4.94mmol,1当量)、6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-胺(1.2g,3.95mmol,0.80当量)、K2CO3(2.0g,14.81mmol,3.00当量)、NaI(739.9mg,4.94mmol,1.00当量)的DMF(15mL)溶液。将所得溶液在60℃下在油浴中搅拌3小时。然后将反应混合物用水(50mL)稀释,并用二氯甲烷(50mLx3)萃取。将合并的有机层用水(50mL x2)和盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到600mg(26%)呈黄色油状物的4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯甲酸甲酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880004312
在100mL圆底烧瓶中置入4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯甲酸甲酯(600mg,1.31mmol,1当量)在THF(20mL)中的溶液,在0℃下向其中添加LiAlH4(495.6mg,13.06mmol,10.00当量)。将所得混合物在室温下搅拌3小时。然后通过添加Na2SO4.10H2O(4.8g,15.0mmol)来淬灭该反应。将所得混合物在室温下搅拌3小时。滤出反应混合物中的固体,并减压浓缩滤液。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到310mg(55%)呈黄色油状物的[4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]甲醇。
步骤4
Figure BDA0003676261880004321
在100mL圆底烧瓶中置入[4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]甲醇(310mg,0.72mmol,1当量)在DCM(10.0mL,117mmol,218当量)中的溶液,在室温下向其中添加二氧化锰(1.2g,14.37mmol,20当量)。将所得混合物在室温下搅拌16小时。滤出固体,并减压浓缩滤液。得到286mg(93%)呈黄色固体的4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯甲醛。
步骤5
Figure BDA0003676261880004322
在100mL圆底烧瓶中置入4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯甲醛(300.0mg,0.70mmol,1当量)、哌嗪-1-甲酸苄酯(185mg,0.84mmol,1.2当量)、HOAc(0.1mL,1.75mmol,2.50当量)的DCM(10mL)溶液。将所得混合物搅拌0.5小时,然后添加NaBH(OAc)3(444.1mg,2.10mmol,3当量)。将所得混合物在室温下再搅拌16小时。然后将反应混合物用水(20mL)淬灭,并用二氯甲烷(20mL x3)萃取。将合并的有机层用水(20mL x2)和盐水(20mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(v∶v=10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到260mg(59%)呈黄色油状物的4-([4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]甲基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤6
Figure BDA0003676261880004331
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的100mL圆底烧瓶中置入4-([4-[1-(4-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1H-吡唑-1-基)乙基]苯基]甲基)哌嗪-1-羧酸苄酯(260.0mg,0.41mmol,1当量)在THF(8mL)中的溶液,在0℃下向其中添加三乙基硼氢化锂(2.1mL,2.05mmol,5.00当量)。将反应混合物在室温下搅拌16小时。然后将反应混合物用水(30mL)淬灭,并用二氯甲烷(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并浓缩。得到200mg(98%)呈黄色油状物的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-[1-(1-[4-[(哌嗪-1-基)甲基]苯基]乙基)-1H-吡唑-4-基]哒嗪-3-胺。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-[1-(1-[4-[(哌嗪-1-基)甲基]苯基]乙基)-1H-吡唑-4-基]哒嗪-3-胺转化为标题化合物。
Figure BDA0003676261880004341
示例性化合物167的示例性合成
Figure BDA0003676261880004342
步骤1
Figure BDA0003676261880004343
向N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(5g,16.7mmol,1当量)和4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3,2-二氧杂戊硼烷(5.08g,20.0mmol,1.2当量)在二噁烷(100mL)中的溶液中添加[1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)(975mg,1.33mmol,0.08当量)和乙酸钾(3.27g,33.31mmol,2当量)。将该混合物在90℃下搅拌2小时。浓缩反应混合物,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至10∶1)纯化粗产物。得到呈黄色油状物的化合物N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(8.2g,16.44mmol,99%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004351
将5-溴噻唑-4-羧酸乙酯(3.49g,14.77mmol,0.9当量)、N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(5.70g,16.41mmol,1当量)、[1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)(120mg,0.16mmol,0.01当量)、碳酸钾(4.54g,32.83mmol,2当量)在二噁烷(130mL)和水(22mL)的混合物中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在80℃在氮气气氛下搅拌10小时。将反应混合物浓缩并添加水(50mL),然后用乙酸乙酯(60mL)萃取两次。将合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(50mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥,浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至1∶1)纯化粗产物。得到呈黄色固体的化合物5-[4-[(1S)-1-(叔丁氧基羰基氨基)乙基]苯基]噻唑-4-羧酸乙酯(5.07g,13.48mmol,82%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004361
在氮气气氛下,将5-[4-[(1S)-1-(叔丁氧基羰基氨基)乙基]苯基]噻唑-4-羧酸乙酯(4g,10.63mmol,1当量)在四氢呋喃(60mL)中的溶液冷却至-78℃。然后在-78℃下滴加二异丁基氢化铝THF溶液(1M,11.69mL,1.1当量)。将反应混合物在-78℃下搅拌0.5小时。添加甲醇(2mL)以淬灭反应,然后添加水(50mL)。用乙酸乙酯(40mL×2)萃取混合物。将有机层经硫酸钠干燥,然后真空浓缩,得到残余物。通过硅胶柱色谱法(10%-50%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化残余物。得到呈白色固体的化合物N-[(1S)-1-[4-(4-甲酰基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(3.2g,9.63mmol,91%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004362
向盐酸二甲胺(368mg,4.51mmol,0.41mL,3当量)在二氯甲烷(30mL)中的溶液中添加三乙胺(609mg,6.02mmol,0.84mL,4当量)、N-[(1S)-1-[4-(4-甲酰基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(500mg,1.50mmol,1当量)在二氯甲烷(10mL)中的溶液和三乙酰氧基硼氢化钠(1.28g,6.02mmol,4当量),并将混合物在20℃下搅拌2小时。通过添加水(50mL)来淬灭反应混合物,并用二氯甲烷(40mL)萃取两次。将合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(60mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥并浓缩,得到产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至0∶1)纯化粗产物。得到呈黄色油状物的化合物N-[(1S)-1-[4-[4-[(二甲基氨基)甲基]噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(364mg,1.01mmol,67%收率)。
使用针对示例性化合物76所述的程序,将N-[(1S)-1-[4-[4-[(二甲基氨基)甲基]噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终产物。
示例性化合物168的示例性合成
Figure BDA0003676261880004371
步骤1
Figure BDA0003676261880004372
在0℃在氮气下,向5-[4-[(1S)-1-(叔丁氧基羰基氨基)乙基]苯基]噻唑-4-羧酸乙酯(900mg,2.39mmol,1当量)和氯化钙(796mg,7.17mmol,3当量)在水(40mL)和四氢呋喃(20mL)中的混合物中添加硼氢化钠(181mg,4.78mmol,2当量)。将混合物加热至5℃并搅拌2小时。在0℃下添加盐酸(5M,4.50mL)和丙酮(4.95mL),并将反应混合物在5℃下再搅拌0.5小时。用5M氢氧化钠将pH调节至5。用乙酸乙酯(20mL×4)萃取水相。将合并的有机相用盐水(20mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过半制备型反相HPLC纯化残余物(碱性条件,柱:Waters Xbridge 150*5010um;流动相:[水(0.05%氢氧化氨v/v)-ACN];B%:25%-55%,11.5min)。得到呈白色固体的化合物N-[(1S)-1-[4-[4-(羟甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(400mg,1.20mmol,50%收率)。
使用针对示例性化合物76所述的程序,将N-[(1S)-1-[4-[4-(羟甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终产物。
也使用类似于上述那些的程序制备示例性化合物211和219。
示例性化合物169的示例性合成
Figure BDA0003676261880004381
步骤1
Figure BDA0003676261880004382
使用针对示例性化合物168所述的程序制备。
步骤2
Figure BDA0003676261880004383
在0℃在氮气下,向(5-溴噻唑-4-基)甲醇(980mg,5.05mmol,1当量)在THF(30mL)中的溶液中添加氢化钠(404mg,10.10mmol,2当量)。将混合物在0℃下搅拌30分钟,然后在0℃下添加碘甲烷(3.58g,25.25mmol,1.57mL,5当量)。将混合物在15℃在氮气下搅拌2小时。将混合物冷却至0℃,用饱和氯化铵水溶液缓慢淬灭,然后用乙酸乙酯(50mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(25mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=20/1至10/1)纯化残余物,得到呈黄色固体的5-溴-4(甲氧基甲基)噻唑(910mg,4.37mmol,86%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004391
在烧瓶中装入N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.4g,4.66mmol,1当量)、4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3,2-二氧杂戊硼烷(1.42g,5.60mmol,1.2当量)、(1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁)二氯化钯(II)(170mg,0.23mmol,0.05当量)、乙酸钾(915mg,9.33mmol,2当量)和二噁烷(30mL)。将混合物用氮气吹扫10分钟,然后加热至80℃保持1小时。将反应混合物冷却至20℃,并通过硅藻土垫过滤。真空浓缩滤液。通过快速色谱(石油醚∶乙酸乙酯=10∶1)纯化粗产物。得到呈无色油状物的N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.9g,粗品)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004401
于15℃在氮气下,向5-溴-4-(甲氧基甲基)噻唑(900mg,4.33mmol,1当量)和N-[(1S)-1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(2.25g,6.49mmol,1.5当量)在二噁烷(30mL)和水(5mL)中的混合物中一次性添加碳酸钾(1.20g,8.65mmol,2当量)和[1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(II)(316mg,0.43mmol,0.1当量)。将该混合物在90℃下搅拌3小时。将混合物冷却至15℃,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=10/1至1/1)纯化残余物,得到呈黄色固体的N-[(1S)-1-[4-[4-(甲氧基甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.87g,粗品)。
使用针对示例性化合物76所述的程序,将N-[(1S)-1-[4-[4-(甲氧基甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯N-[(1S)-1-[4-[4-(羟甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终产物。
也使用类似于上述那些的程序制备示例性化合物184和185。
示例性化合物170和134的示例性合成
Figure BDA0003676261880004402
步骤1
Figure BDA0003676261880004411
向2-[3-(3-羟基丙基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(460mg,1.91mmol,1当量)在二氯甲烷(5mL)中的溶液中添加戴斯-马丁过碘烷(970mg,2.29mmol,1.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌1小时。向混合物中添加乙酸乙酯(50mL),并将混合物过滤,并真空浓缩滤液。将有机相用水(20mL)和盐水(20mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至50∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的3-甲基-2-[3-(3-氧代丙基)异噁唑-5-基]丁酸甲酯(300mg,1.25mmol,65%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将3-甲基-2-[3-(3-氧丙基)异噁唑-5-基]丁酸甲酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004412
使用类似于上述那些的程序制备示例性化合物190和191。
示例性化合物112的示例性合成
Figure BDA0003676261880004421
在15℃下,向丁-3-炔-1-醇(5g,71.34mmol,1当量)在二氯甲烷(150mL)中的溶液中添加对甲苯磺酸吡啶鎓(1.9g,7.56mmol,0.1当量)和3,4-二氢-2H-吡喃(9.48g,112.70mmol,10.3mL,1.58当量),并将混合物在15℃下搅拌18小时。浓缩混合物,得到残余物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至10∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的2-丁-3-炔氧基四氢吡喃(10.6g,68.74mmol,96%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004422
在-78℃下,向2-丁-3-炔氧基四氢吡喃(2g,12.97mmol,1当量)在四氢呋喃(20mL)中的溶液中添加正丁基锂(2.5M,5.7mL,1.1当量),然后将混合物在-78℃下搅拌1小时。然后向混合物中添加低聚甲醛(2.10g,23.35mmol,1.8当量),并在-78℃下搅拌30分钟,在20℃下搅拌15小时。将混合物用饱和氯化铵溶液(80mL)淬灭,并用乙酸乙酯(2x40mL)萃取。将合并的有机相经硫酸钠干燥,然后浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=3∶1至0∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的5-四氢吡喃-2-基氧基戊-2-炔-1-醇(1.4g,7.60mmol,58%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004431
向5-四氢吡喃-2-基氧基戊-2-炔-1-醇(1.4g,7.60mmol,1当量)和对甲苯磺酰氯(2.90g,15.20mmol,2当量)在四氢呋喃(15mL)中的混合物中添加氢氧化钾(2.13g,38.00mmol,5当量)。然后将反应混合物在20℃下搅拌2小时。将反应混合物用水(30mL)稀释,然后用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL x2)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=50∶1至10∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的化合物5-四氢吡喃-2-基氧基戊-2-炔基4-甲基苯磺酸酯(2.5g,7.39mmol,97%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004432
向4-甲基苯磺酸5-四氢吡喃-2-基氧基戊-2-炔酯(2.5g,7.39mmol,1当量)、4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(1.72g,8.86mmol,1.2当量)在乙腈(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(2.04g,14.77mmol,2当量)。然后将反应混合物在80℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(30mL)稀释,然后用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(20mL x2)洗涤,在硫酸钠上干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=50∶1至10∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的化合物1-(5-四氢吡喃-2-基氧基戊-2-炔基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)吡唑(2g,5.55mmol,75%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将1-(5-四氢吡喃-2-基氧基戊-2-炔基)-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷-2-基)吡唑转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004441
示例性化合物131的示例性合成
Figure BDA0003676261880004442
根据以下方案使用上述用于其他实施例并对本领域技术人员显而易见的程序,制备(2S,4R)-N-((R)-2-(二甲基氨基)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)-2-氧代乙基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880004451
使用上述用于其他实施例的程序,将(2S,4R)-N-((R)-2-(二甲基氨基)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)-2-氧代乙基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物171。
示例性化合物172的示例性合成
Figure BDA0003676261880004452
步骤1
Figure BDA0003676261880004453
在0℃下,向N-[(1S)-1-[4-(4-甲酰基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(2g,6.02mmol,1当量)和1-重氮-1-二甲氧基磷酰基-丙烷-2-酮(1.16g,6.02mmol,1当量)在甲醇(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(1.66g,12.03mmol,2当量)。将反应混合物在15℃下搅拌16小时。然后添加1-重氮-1-二甲氧基磷酰基-丙烷-2-酮(116mg,0.60mmol,0.1当量),并将反应混合物在15℃下再搅拌1小时。添加乙酸乙酯(50mL)和水(40mL),并分离混合物。将有机层经硫酸钠干燥,然后真空浓缩,得到残余物,将其通过硅胶柱色谱法(10%-30%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化,得到呈白色固体的N-[(1S)-1-[4-(4-乙炔基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.8g,5.48mmol,91%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004461
在0℃下,向N-[(1S)-1-[4-(4-乙炔基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(400mg,1.22mmol,1当量)、二甲胺(1.37g,12.18mmol,1.54mL,10当量)和三聚甲醛(362mg,4.02mmol,3.3当量)在二噁烷(8mL)中的溶液中添加碘化亚铜(232mg,1.22mmol,1当量)。将反应混合物脱气并充入氮气3次,然后在30℃下搅拌4小时。真空浓缩反应溶液,得到残余物。通过硅胶柱色谱法(0-8%甲醇的二氯甲烷溶液)纯化残余物,得到呈浅黄色胶状物的N-[(1S)-1-[4-[4-[3-(二甲基氨基)丙-1-炔基]噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(274mg,0.71mmol,58%收率)。
使用针对示例性化合物76所述的程序,将N-[(1S)-1-[4-[4-[3-(二甲基氨基)丙-1-炔基]噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
示例性化合物132的示例性合成
Figure BDA0003676261880004471
步骤1
Figure BDA0003676261880004472
于15℃在氮气下,向2,2-二乙氧基乙醇(22.87g,170mmol,1.5当量)和4-溴-2-氟-吡啶(20g,113.65mmol,1当量)在乙腈(200mL)中的的混合物中一次性添加碳酸铯(74.06g,227mmol,2当量)。将该混合物在90℃下搅拌3小时。将混合物冷却至20℃,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚)纯化残余物,得到呈黄色油状物的4-溴-2-(2,2-二乙氧基乙氧基)吡啶(22.8g,74.7mmol,66%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004473
于15℃在氮气下,向4-溴-2-(2,2-二乙氧基乙氧基)吡啶(10g,34.46mmol,1当量)和3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸苄酯(8.49g,34.46mmol,1当量)在甲苯(200mL)中的混合物中一次性添加碳酸铯(22.46g,68.93mmol,2当量)和[2-(2-氨基苯基)苯基]-氯-钯二环己基-[2-(2,6-二异丙氧基苯基)苯基]膦酸酯(1.61g,2.07mmol,0.06当量)。将该混合物在110℃下搅拌12小时。将混合物冷却至20℃,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=10/1,3/1)纯化残余物,得到呈黄色油状物的8-[2-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸苄酯(12.1g,26.6mmol,77%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004481
在氮气下,向8-[2-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸苄酯(13.1g,28.76mmol,1当量)在四氢呋喃(300mL)和乙醇(300mL)中的溶液中添加碳载10%氢氧化钯(4.04g,2.88mmol,0.1当量)。将悬浮液真空脱气并用氢气吹扫数次。将混合物在氢气(50psi)下在60℃下搅拌12小时。过滤反应混合物且浓缩滤液。得到呈棕色油状物的粗制8-[2-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷(8.27g,25.73mmol,89.47%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序以及对本领域技术人员显而易见的标准程序,将8-[2-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004491
使用类似于针对示例性化合物132所述的程序制备以下示例性化合物:135、136、139、141、133、140、142和210。
示例性化合物173和102的示例性合成
Figure BDA0003676261880004492
步骤1
Figure BDA0003676261880004493
在-78℃下,在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL 3颈圆底烧瓶中置入1,4-二溴苯(12.0g,50.8mmol,1.0当量)的THF(150.0mL)溶液。然后在-78℃下添加正丁基锂溶液(1M的己烷溶液,60.9mL,60.9mmol,1.2当量)。将所得混合物在-78℃下搅拌30分钟,然后在-78℃下缓慢添加2,2-二氟乙酸乙酯(12.6g,101.5mmol,2.0当量)。除去冷却浴,并将所得混合物在室温下再搅拌1小时。然后通过添加50mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯(250mL x3)萃取所得混合物,并且将有机层合并,用盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶10)洗脱的硅胶柱上。得到7.6g(64%)浅黄色半固体的1-(4-溴苯基)-2,2-二氟乙-1-酮。
步骤2
Figure BDA0003676261880004501
在氮气气氛下,在用氮气惰性气氛吹扫并保持的30mL密封管中置入1-(4-溴苯基)-2,2-二氟乙-1-酮(3.5g,14.9mmol,1.0当量)、(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(3.6g,29.8mmol,2.0当量)和四(丙-2-基氧基)钛(12.7g,44.7mmol,3.0当量)的THF(10mL)溶液。将所得混合物于80℃在氮气气氛下在油浴中搅拌14小时。减压浓缩该混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱上。得到2.8g(56%)呈黄色油状物的(S)-N-[(1Z)-1-(4-溴苯基)-2,2-二氟亚乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺。
步骤3
Figure BDA0003676261880004511
在0℃下,在用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL 3颈圆底烧瓶中置入(S)-N-[(1Z)-1-(4-溴苯基)-2,2-二氟亚乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(2.8g,8.3mmol,1当量)和BH3-THF(40.0mL,40.0mmol,1.0M,4.8当量)的THF(40.0mL)溶液。将所得混合物在0℃下搅拌1h,然后升温至室温,并在室温下再搅拌6小时。通过添加100mL水来淬灭反应。用乙酸乙酯(100mL x2)萃取所得混合物。将有机层合并,并减压浓缩。将残余物施加到使用二氯丙烷/石油醚(1/1)洗脱的硅胶柱上。得到呈白色固体的1.3g(45%)的(S)-N-[(1R)-1-(4-溴苯基)-2,2-二氟乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺。
步骤4
Figure BDA0003676261880004512
在氮气气氛下,在用氮气惰性气氛吹扫并保持的30mL密封管中置入(S)-N-[(1R)-1-(4-溴苯基)-2,2-二氟乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(1.3g,3.8mmol,1.0当量)、4-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3-噻唑(1.25g,5.5mmol,1.5当量)、K2CO3(1.5g,11.3mmol,3.0当量)和Pd(dppf)Cl2CH2Cl2(62.0mg,0.08mmol,0.02当量)的二噁烷(15.0mL)和水(3.0mL)溶液。将所得悬浮液于90℃在氮气气氛下在油浴中搅拌12小时。减压浓缩该混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到750.0mg(56%)呈浅黄色固体的(S)-N-[(1R)-2,2-二氟-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)-苯基]乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺。
根据以下方案使用类似于针对本申请中其他实施例所述的程序,将(S)-N-[(1R)-2,2-二氟-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)-苯基]乙基]-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004521
使用类似的程序制备示例性化合物267和268。
示例性化合物174的示例性合成
Figure BDA0003676261880004531
步骤1
Figure BDA0003676261880004532
在0℃下,向N-[(1S)-1-[4-[4-(羟甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(400mg,1.20mmol,1当量)、异吲哚啉-1,3-二酮(352mg,2.39mmol,2当量)和三苯基膦(471mg,1.79mmol,1.5当量)在四氢呋喃(8mL)中的溶液中添加偶氮二甲酸N,N-二异丁酯(290mg,1.44mmol,0.27mL,1.2当量)。将混合物在15℃下搅拌16小时。浓缩反应混合物,得到粗产物,将其通过制备型-TLC(石油醚∶乙酸乙酯=1∶1)纯化,得到呈白色固体的N-[(1S)-1-[4-[4-[(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甲基]噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(560mg)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004541
将N-[(1S)-1-[4-[4-[(1,3-二氧代异吲哚啉-2-基)甲基]噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(600mg,1.29mmol,1当量)和水合肼(661mg,12.94mmol,0.64mL,98%纯度,10当量)在乙醇(24mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在70℃在氮气气氛下搅拌3小时。过滤反应混合物,并用乙醇(30mL)洗涤滤饼。浓缩滤液,得到粗产物。得到呈白色固体的化合物N-[(1S)-1-[4-[4-(氨基甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(530mg,粗品)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004542
在0℃下,在N-[(1S)-1-[4-[4-(氨基甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(618mg,1.85mmol,1当量)和三乙胺(563mg,5.56mmol,0.77mL,3当量)在二氯甲烷(30mL)中的溶液中添加乙酸酐(227mg,2.22mmol,0.21mL,1.2当量)。将混合物在15℃下搅拌3小时。用水(30mL)稀释反应混合物,然后浓缩有机层,得到粗产物。通过制备型TLC(二氯甲烷∶甲醇=10∶1)纯化粗产物。得到呈白色固体的化合物N-[(1S)-1-[4-[4-(乙酰胺基甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(400mg,1.07mmol,58%收率)。
使用针对示例性化合物76所述的程序,将N-[(1S)-1-[4-[4-(乙酰氨基甲基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
示例性化合物175的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880004551
在-78℃在氮气下,向N-[(1S)-1-[4-(4-乙炔基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.73g,5.27mmol,1当量)在四氢呋喃(50mL)中的溶液中添加正丁基锂(2.5M,4.42mL,2.1当量)。将反应混合物在-50℃下搅拌2小时。然后添加三甲酚(474mg,5.27mmol,1当量),并使反应混合物升温至10℃,保持22h。将反应混合物在10℃下再搅拌20小时。添加水(40mL),并用乙酸乙酯(40mL)萃取混合物。将有机层经硫酸钠干燥,然后真空浓缩。通过硅胶柱色谱法(10%-80%乙酸乙酯的石油醚溶液)纯化残余物,得到呈白色固体的N-[(1S)-1-[4-[4-(3-羟基丙-1-炔基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(480mg,1.34mmol,25%收率)。回收了950mg起始材料。
使用上述用于示例性化合物174的程序,将N-[(1S)-1-[4-[4-(3-羟基丙-1-炔基)噻唑-5-基]苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为(S)-(1-(4-(4-(3-乙酰胺基丙-1-炔-1-基)噻唑-5-基)苯基)乙基)氨基甲酸叔丁酯。
Figure BDA0003676261880004561
使用类似于针对示例性化合物76所述的程序,将(S)-(1-(4-(4-(3-乙酰胺基丙-1-炔-1-基)噻唑-5-基)苯基)乙基)氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
示例性化合物178的示例性合成
Figure BDA0003676261880004562
根据以下方案使用上述程序制备。
Figure BDA0003676261880004563
使用类似的程序制备示例性化合物176。
示例性化合物180的示例性合成
Figure BDA0003676261880004571
根据以下方案使用上述程序制备。
Figure BDA0003676261880004572
使用类似的程序制备示例性化合物179。
示例性化合物183的示例性合成
Figure BDA0003676261880004573
步骤1
Figure BDA0003676261880004574
在0℃下,向2,2-二乙氧基乙醇(2.06g,15.38mmol,1.5当量)在THF(50mL)中的溶液中添加氢化钠(615mg,15.38mmol,60%纯度,1.5当量),并将混合物在0℃下搅拌30分钟。然后在0℃下向其中添加2-溴乙酸叔丁酯(2g,10.25mmol,1.52mL,1当量)在THF(50mL)中的溶液,并将反应混合物于15℃在氮气下搅拌2小时。将混合物冷却至0℃,并用饱和氯化铵水溶液淬灭。用乙酸乙酯(20mL×3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(15mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=50/1至20/1)纯化残余物,得到呈黄色油状物的2-(2,2-二乙氧基乙氧基)乙酸叔丁酯(883mg,3.56mmol,34%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004581
于15℃在氮气下,向2-(2,2-二乙氧基乙氧基)乙酸叔丁酯(0.7g,2.82mmol,1当量)在THF(3mL)、甲醇(3mL)和水(6mL)的混合物中的溶液中一次性添加氢氧化锂一水合物(1.18g,28.19mmol,10当量)。将该混合物搅拌2小时。用1M盐酸将pH调节至6。用乙酸乙酯(35mL×4)萃取水相。将合并的有机相用盐水(20mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。得到呈黄色油状物的粗产物2-(2,2-二乙氧基乙氧基)乙酸(460mg,粗品)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004591
于15℃在氮气气氛下,向(2S,4R)-1-[(2S)-2-氨基-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(0.2g,0.45mmol,1当量)和2-(2,2-二乙氧基乙氧基)乙酸(87mg,0.45mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)中的混合物中一次性添加O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲鎓六氟磷酸酯(222mg,0.59mmol,1-3当量)和三乙胺(137mg,1.35mmol,0.19mL,3当量)。将该混合物在15℃下搅拌1小时。将该混合物倒入冰水(w/w=1/1,20mL)中,并搅拌5分钟。用乙酸乙酯(20mL×4)萃取水相。将合并的有机相用盐水(15mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过半制备型反相HPLC(甲酸条件;柱:PhenomenexSynergi C18 150*25*10um,流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%-60%,9min)纯化残余物。得到呈黄色油状物的产物(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-(2,2-二乙氧基乙氧基)乙酰基]氨基]-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(230mg,0.37mmol,82%收率)。
根据以下方案并使用上述用于其他实施例的程序,将(2S,4R)-1-[(2S)-2-[[2-(2,2-Di乙氧基乙氧基)乙酰基]氨基]-3,3-二甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004601
示例性化合物86的示例性合成
Figure BDA0003676261880004602
步骤1
Figure BDA0003676261880004603
在0℃在氮气气氛下,向PPh3(4.68g,17.836mmol,3.0当量)在THF(100mL)中的溶液中添加DIAD(3.61g,17.836mmol,3.0当量)和(1s,3s)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁-1-醇(3.0g,5.945mmol,1当量)。在0℃和氮气气氛下,在5分钟内向上述混合物中滴加6-溴吡啶-3-醇(2.07g,11.891mmol,2.0当量)。将所得混合物在0℃下搅拌5分钟,然后加热至50℃并在50℃下搅拌2小时。用水(25mL)淬灭反应,并将所得混合物用EtOAc(50mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用CH2Cl2/MeOH(10∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈浅黄色固体的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-溴吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(2.3mg,59%)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004611
以下反应以4个平行相等的批次进行,并将其合并用于后处理和纯化。在每批中,在室温和氮气气氛下,向6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-[(6-溴吡啶-3-基)氧基]环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(571mg,0.864mmol,1.00当量)和叔丁基二甲基[[(2E)-3-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)丙-2-烯-1-基]氧基]硅烷(387mg,1.297mmol,1.50当量)在1,4-二噁烷(15mL)和水(5mL)中的溶液中添加K2CO3(1.07g,0.008mmol,3.0当量)和Pd(dppf)Cl2-CH2Cl2(105mg,0.130mmol,0.15当量)。将所得混合物在80℃和氮气气氛下搅拌2小时。通过在室温下添加水(50mL)来淬灭每个反应,并将所得混合物合并并用EtOAc(90mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物通过使用CH2Cl2/MeOH(10∶1)洗脱的硅胶柱色谱纯化,得到呈浅黄色固体的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-([6-[(1E)-3-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]丙-1-烯-1-基]吡啶-3-基]氧基)环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(总计2.1g,76%)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004621
在0℃在氮气气氛下,向6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-(8-[2-[(1r,3r)-3-([6-[(1E)-3-[(叔丁基二甲基甲硅烷基)氧基]丙-1-烯-1-基]吡啶-3-基]氧基)环丁氧基]吡啶-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)哒嗪-3-胺(2.10g,2.79mmol,1.00当量)在THF(20mL)中的搅拌溶液中滴加TBAF(1mol/L,8.3mL,8.3mmol,3.0当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。然后,通过添加水(25mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(30mLx3)萃取所得混合物。将有机层合并,经无水硫酸钠干燥并浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到呈浅黄色固体的3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-醇(1.1g,62%)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004622
在-10℃和氮气气氛下,向三丁基膦(634mg,3.14mmol,10.00当量)和四甲基偶氮二甲酰胺(588mg,3.14mmol,10.00当量)在THF中的溶液中添加(2S,4R)-4-羟基-1-[2-(3-羟基-1,2-噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(172mg,0.345mmol,1.10当量)和(2E)-3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-醇(70mg,0.11mmol,1当量)。在室温和氮气气氛下,将所得混合物搅拌16小时。通过在室温下添加水(50mL)来淬灭该反应,并用EtOAc(30mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。通过硅胶柱色谱法纯化残余物,用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱,得到呈浅黄色固体的(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-[3-甲基-2-(3-[[(2E)-3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-基]氧基]-1,2-噁唑-5-基)丁酰基]吡咯烷-2-甲酰胺(120mg,34%)。
使用上述用于其他实施例的标准程序,将(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]乙基]-1-[3-甲基-2-(3-[[(2E)-3-[5-[(1r,3r)-3-[[4-(3-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基]氧基]环丁氧基]吡啶-2-基]丙-2-烯-1-基]氧基]-1,2-噁唑-5-基)丁酰基]吡咯烷-2-甲酰胺转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物186、206和207。
示例性化合物189的示例性合成
Figure BDA0003676261880004641
步骤1
Figure BDA0003676261880004642
在0℃下,向4-(3-羟基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(2g,7.37mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(40mL)中的溶液中添加氢化钠(353mg,8.84mmol,60%纯度,1.2当量)。将混合物在25℃下搅拌1小时。然后添加4-甲基苯磺酸2-苄氧基乙酯(3.39g,11.06mmol,1.5当量)的N,N-二甲基甲酰胺(2mL)溶液。将该混合物在60℃下搅拌15小时。通过添加水(200mL)来淬灭反应混合物,并用乙酸乙酯(200mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mLx3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC(柱:Phenomenex Synergi Max-RP 250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:50ACN%-80ACN%,26min,20%min)纯化残余物。得到呈无色油状物的化合物4-[3-(2-苄氧基乙氧基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.1g,5.18mmol,70%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004643
在氮气下,向4-[3-(2-苄氧基乙氧基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.1g,5.18mmol,1当量)在乙醇(20mL)和四氢呋喃(20mL)中的溶液中添加活性炭载5%钯催化剂(500mg)。将悬浮液真空脱气并用氢气吹扫3次。将混合物在氢气(15Psi)下在25℃下搅拌16小时。将反应混合物过滤并减压浓缩,得到残余物。得到呈无色油状物的4-[3-(2-羟基乙氧基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.6g,5.07mmol,97%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将4-[3-(2-羟基乙氧基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004651
示例性化合物194的示例性合成
Figure BDA0003676261880004652
步骤1
Figure BDA0003676261880004661
在0℃和氮气气氛下,向1,4-二甲基-1H-吡唑(2.5g,26.0mmol,1当量)在四氢呋喃(50mL)中的溶液中滴加正丁基锂的己烷溶液(2.5M的己烷溶液,78.0mmol,31mL,3当量)。将所得溶液在室温下搅拌1h,然后冷却至-78℃。添加2-异丙氧基-4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂硼烷(14.52g,78.017mmol,3当量),并将反应混合物在-78℃下搅拌0.5小时,然后缓慢升温至0℃。用盐水淬灭反应,并用EtOAc(250mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水洗涤,经Na2SO4干燥并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶5)洗脱的硅胶柱上。得到2.6g(45%)呈白色固体的1,4-二甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑。
步骤2
Figure BDA0003676261880004662
在250mL圆底烧瓶中置入N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.0g,3.331mmol,1当量)、1,4-二甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑(1.48g,6.664mmol,2.00当量)、K2CO3(1.38g,9.963mmol,2.99当量)和Pd(dppf)Cl2(244.0mg,0.333mmol,0.10当量)的二噁烷(16mL)和H2O(2mL)溶液。将所得混合物在90℃和氮气气氛下搅拌3小时。减压浓缩该混合物。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到1.63g(99%)呈浅黄色固体的N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸苄酯。
使用上述用于其他实施例的程序,将N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸苄酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物193。
示例性化合物144的示例性合成
Figure BDA0003676261880004671
步骤1
Figure BDA0003676261880004672
在0℃下,向2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸(1g,5.40mmol,1当量)在甲醇(10mL)中的溶液中添加亚硫酰氯(2.57g,21mmol,1.57mL,4当量)。将反应混合物在70℃下搅拌3小时。减压浓缩反应混合物。将残余物用水(50mL)稀释,并用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(80mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。得到呈黄色油状物的2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(1g,5.02mmol,92%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004681
向2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(800mg,4.02mmol,1当量)在乙腈(5mL)中的溶液中添加碳酸钾(1.11g,8.03mmol,2当量)和全氟丁基磺酰氟(1.46g,4.82mmol,1.2当量)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(50mL)稀释,并用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(80mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=100/1至20/1)纯化。得到呈无色油状物的3-甲基-2-[3-(1,1,2,2,3,3,4,4,4-九氟丁基磺酰基氧基)异噁唑-5-基]丁酸甲酯(530mg,1.10mmol,27%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004682
将3-甲基-2-[3-(1,1,2,2,3,3,4,4,4-九氟丁基磺酰基氧基)异噁唑-5-基]丁酸甲酯(400mg,0.83mmol,1当量)和哌嗪-1-羧酸叔丁酯(154mg,0.83mmol,1当量)在二甲基甲酰胺(5mL)中的溶液在130℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(30mL)稀释,并用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL x3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将残余物通过制备型TLC(石油醚∶乙酸乙酯=3∶1)纯化。得到呈无色油状物的4-[5-(1-甲氧基羰基-2-甲基-丙基)异噁唑-3-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(130mg,0.35mmol,42%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004691
向4-[5-(1-甲氧基羰基-2-甲基-丙基)异噁唑-3-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(130mg,0.35mmol,1当量)在甲醇(2mL)、四氢呋喃(2mL)和水(2mL)中的溶液中添加氢氧化锂(44mg,1.06mmol,3当量)。将反应混合物在15℃下搅拌1小时。添加水(3mL)。用盐酸(1M的水溶液)将pH调节至6,然后用乙酸乙酯(10mL x5)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL x1)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。得到呈白色固体的2-[3-(4-叔丁氧基羰基哌嗪-1-基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(100mg,0.28mmol,79%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880004692
向2-[3-(4-叔丁氧基羰基哌嗪-1-基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(100mg,0.28mmol,1当量)和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲鎓六氟磷酸酯(129mg,0.33mmol,1.2当量)在二甲基甲酰胺(5mL)中的溶液中添加(2S,4R)-4-羟基N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(104mg,0.28mmol,1当量)和二异丙基乙胺(109mg,0.84mmol,3当量)。将反应混合物在15℃下搅拌0.5小时。将反应混合物倒入水(20mL)中,用乙酸乙酯(30mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mLx3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。通过制备型TLC(二氯甲烷∶甲醇=10∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的4-[5-[1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2-甲基-丙基]异噁唑-3-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(180mg,0.26mmol,92%收率)。
步骤6
Figure BDA0003676261880004701
通过手性超临界流体色谱法分离4-[5-[1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2-甲基-丙基]异噁唑-3-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(200mg,0.29mmol,1当量)。仪器:CASWH-Prep-SFC-C,SFC柱:DAICELChiralpak AS(250mm*30mm,10um);流动相:乙醇(0.1%NH3·H2O)的CO2溶液,25%至25%;流速:55g/min;波长:220nm。得到呈白色固体的4-[5-[(1S)-1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2-甲基-丙基]异噁唑-3-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(80mg,0.11mmol,76%收率,95%纯度)。得到呈白色固体的4-[5-[(1R)-1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2-甲基-丙基]异噁唑-3-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(70mg,0.1mmol,68%收率,98%纯度)。
步骤7
Figure BDA0003676261880004711
向4-[5-[(1R)-1-[(2S,4R)-4-羟基-2-[[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羰基]-2-甲基-丙基]异噁唑-3-基]哌嗪-1-羧酸叔丁酯(70mg,0.1mmol,1当量)在二氯甲烷(2mL)中的溶液中添加盐酸(4M的二噁烷溶液,3mL)。将反应混合物在15℃下搅拌1小时。减压浓缩反应混合物。得到呈白色固体的(2S,4R)-4-羟基-1-[(2R)-3-甲基-2-(3-哌嗪-1-基异噁唑-5-基)丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(55mg,0.09mmol,91%收率)。
步骤8
Figure BDA0003676261880004721
向(2S,4R)-4-羟基-1-[(2R)-3-甲基-2-(3-哌嗪-1-基异噁唑-5-基)丁酰基]-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(100mg,0.16mmol,1当量,盐酸盐)、1,2-二溴乙烷(31mg,0.16mmol,1当量)和2-[6-氨基-5-[8-[2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚二盐酸盐(102mg,0.16mmol,1当量)在乙腈(12mL)中的混合物中添加N,N-二异丙基乙胺(128mg,0.99mmol,6当量)。将该混合物在100℃在微波下搅拌2h。减压浓缩该反应混合物,得到残余物。通过制备型HPLC(柱:Phenomenex Synergi C18 150*25*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:5%-35%,10min)纯化残余物。得到呈灰白色固体的化合物(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[2-[4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]乙基]哌嗪-1-基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺甲酸酯(24.6mg,0.02mmol,12%收率)。
使用与示例性化合物195类似的程序制备。
示例性化合物197和352的示例性合成
Figure BDA0003676261880004731
使用类似于针对示例性化合物112和116所述的程序制备。
示例性化合物114的示例性合成
Figure BDA0003676261880004732
步骤1
Figure BDA0003676261880004733
向2-氟-3-氧代-丁酸乙酯(33.6g,226.82mmol,28.47mL,1当量)和乙二醇(70.39g,1.13mol,63.42mL,5当量)在甲苯(500mL)中的溶液中添加三氟化硼乙醚(3.36g,23.67mmol,2.92mL,0.1当量)。将该混合物在80℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(300mL)稀释,并用乙酸乙酯(300mL)萃取两次。将合并的有机相用盐水(300mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥,过滤并浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至10∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的化合物2-氟-2-(2-甲基-1,3-二氧戊环-2-基)乙酸乙酯(29.3g,152.5mmol,67%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004741
在0℃在1小时内,向2-氟-2-(2-甲基-1,3-二氧戊环-2-基)乙酸乙酯(29.3g,152.46mmol,1当量)和盐酸羟胺(21.19g,304.92mmol,2当量)在吡啶(164mL)中的溶液中滴加甲醇钠(28%)的甲醇(61mL)溶液。将该混合物在20℃下搅拌1小时。过滤反应混合物,并将滤液用四氢呋喃(500mL)稀释并另外过滤。浓缩滤液,得到粗产物,将其通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至0∶1)纯化,得到产物。得到呈橙色油状物的化合物2-氟-2-(2-甲基-1,3-二氧戊环-2-基)乙烷异羟肟酸(10.4g,58.1mmol,38%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004742
将2-氟-2-(2-甲基-l,3-二氧戊环-2-基)乙烷异羟肟酸(10.35g,57.77mmol,1当量)在硫酸(18M,50mL,15.58当量)中的溶液在70℃下搅拌2小时。将反应混合物倒入冰水(250mL)中,然后用乙酸乙酯(250mL)萃取两次。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,浓缩,得到粗产物。将粗产物直接用于下一步,无需纯化。得到呈黄色固体的化合物4-氟-5-甲基-异噁唑-3-醇(4.60g,39.29mmol)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004751
向4-氟-5-甲基-异噁唑-3-醇(5.7g,48.69mmol,1当量)在二氯甲烷(228mL)中的溶液中添加对甲苯磺酸一水合物(926mg,4.87mmol,0.1当量)和3,4-二氢-2H-吡喃(20.48g,243.43mmol,22.26mL,5当量)。将该混合物在20℃下搅拌10小时。将反应混合物倒入水(100mL)中,并用饱和碳酸氢钠溶液(60mL)将pH调节至7。然后将混合物用二氯甲烷(200mL)萃取两次。将合并的有机层用饱和氯化钠水溶液(200mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥并过滤。浓缩滤液,得到粗产物,将其通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至8∶1)纯化。得到呈黄色固体的化合物4-氟-5-甲基-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑(7.94g,39.5mmol,81%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880004752
在-78℃在氮气下,向4-氟-5-甲基-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑(8.07g,40.13mmol,1当量)在四氢呋喃(115mL)中的溶液中滴加双(三甲基甲硅烷基)氨基钾(1M,60.20mL,1.5当量),并且将反应混合物在-78℃下搅拌0.5小时。然后在-78℃下向反应混合物中鼓泡通入二氧化碳(15psi)1小时,并将混合物在20℃下搅拌1小时。将反应混合物用饱和氯化铵水溶液(150mL)淬灭,并用乙酸乙酯(100mL)萃取两次。在0℃下用盐酸水溶液(1M)将水层调节至pH=3,然后用氯仿和异丙醇(v/v=5∶1,150mL,三次)萃取。将合并的层经无水硫酸钠干燥,过滤,并浓缩滤液,得到粗产物。得到呈黄色固体的化合物2-(4-氟-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑-5-基)乙酸(8.07g,32.91mmol)。
步骤6
Figure BDA0003676261880004761
在-10℃下,向2-(4-氟-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑-5-基)乙酸(7.87g,32.10mmol,1当量)在甲醇(70mL)和乙酸乙酯(70mL)的混合物中的溶液中滴加三甲基甲硅烷基重氮甲烷醚溶液(2M,24.07mL,1.5当量),并将混合物在-10℃下搅拌1小时。用乙酸调节反应混合物直至pH=7,并添加乙酸乙酯(150mL)。将有机层用饱和碳酸氢钠溶液(50mL)洗涤,并经无水硫酸钠干燥,过滤,并浓缩滤液,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至5∶1)纯化粗产物。得到呈无色油状物的化合物2-(4-氟-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑-5-基)乙酸甲酯(4.51g,17.40mmol,54%收率)。
步骤7
Figure BDA0003676261880004762
在0℃下,向2-(4-氟-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑-5-基)乙酸甲酯(4.42g,17.05mmol,1当量)在二甲基甲酰胺(66mL)中的溶液中添加叔丁醇钾(2.87g,25.58mmol,1.5当量),然后添加2-碘丙烷(3.48g,20.46mmol,2.05mL,1.2当量)。将该混合物在20℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(60mL)稀释,并用乙酸乙酯(80mL)萃取三次。将合并的层用饱和氯化钠水溶液(100mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥并浓缩,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚)纯化粗产物。得到呈黄色油状物的化合物2-(4-氟-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(5.25g)。
步骤8
Figure BDA0003676261880004771
向2-(4-氟-3-四氢吡喃-2-基氧基-异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(5.48g,18.19mmol,1当量)在二氯甲烷(20mL)、四氢呋喃(5mL)和水(5mL)中的混合物中的溶液中添加盐酸/二噁烷(4M,30.00mL,6.60当量)。将该混合物在20℃下搅拌20小时。将反应混合物倒入饱和碳酸钠溶液(300mL)中,然后用甲基叔丁基醚(100mL)萃取三次。通过添加盐酸溶液(3M)直至pH=2来调节水层pH。将水层用氯仿(150mL)萃取三次,经无水硫酸钠干燥并浓缩,得到粗产物。通过半制备型反相(柱:Kromasil 250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN)-ACN];B%:21ACN%-51ACN%,29min,79%min)纯化残余物。得到呈白色固体的化合物2-(4-氟-3-羟基-异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(1.27g,5.86mmol,32%收率)。
步骤9
Figure BDA0003676261880004772
将2-(4-氟-3-羟基-异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(0.5g,2.30mmol,1当量)、2-溴-1,1-二乙氧基-乙烷(907mg,4.60mmol,0.69mL,2当量)和碳酸钾(636mg,4.60mmol,2当量)溶于微波管中的二甲亚砜(8mL)中。将密封管在微波辐射下在80℃下加热2小时。LCMS显示起始材料料仍然残留后,将密封管在微波辐射下于80℃再加热2小时。将混合物过滤并真空浓缩。通过半制备型反相(柱:Phenomenex Synergi C18 150*25*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:40%70%,9min)纯化残余物。得到呈黄色油状物的化合物2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-氟-异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(266mg,0.80mmol,35%收率),并且回收了46mg 2-(4-氟-3-羟基-异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯。
使用类似于上述用于示例性化合物76的程序,将2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)-4-氟-异噁唑-5-基]-3-甲基丁酸甲酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物198、208、209、269和270。
示例性化合物200的示例性合成
Figure BDA0003676261880004781
步骤1
Figure BDA0003676261880004782
向(2R)-2-氨基-2-(4-溴苯基)乙醇(1.74g,6.89mmol,1当量,盐酸盐)在四氢呋喃(25mL)中的溶液中添加三乙胺(2.79g,27.56mmol,3.84mL,4当量)和碳酸叔丁氧羰基叔丁酯(1.80g,8.27mmol,1.90mL,1.2当量)。将该混合物在30℃下搅拌12小时。减压浓缩反应混合物,以去除四氢呋喃。用乙酸乙酯(50mL x2)萃取残余物。将合并的有机层用盐水溶液(40mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。将粗产物用石油醚/乙酸乙酯(22mL,v∶v=10∶1)研磨。得到呈白色固体的化合物N-[(1R)-1-(4-溴苯基)-2-羟基-乙基]氨基甲酸叔丁酯(2g,6.33mmol,91%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004791
将N-[(1R)-1-(4-溴苯基)-2-羟基-乙基]氨基甲酸叔丁酯(2.0g,6.33mmol,1当量)、4-甲基噻唑(1.25g,12.65mmol,1.15mL,2当量)、乙酸钾(1.24g,12.65mmol,2当量)和乙酸钯(142mg,0.63mmol,0.1当量)在二甲基乙酰胺(40mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫3次,然后将混合物在100℃在氮气气氛下搅拌12小时。减压浓缩反应混合物,以去除二甲基乙酰胺。将残余物用乙酸乙酯(40mL x2)萃取,并用饱和盐水(40mL x2)洗涤。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=5/1至1/2)纯化残余物。得到呈黄色油状物的化合物N-[(1R)-2-羟基-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.45g,3.98mmol,63%收率)。
使用类似于上述用于示例性化合物180的程序,将N-[(1R)-2-羟基-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物199、158和100。
示例性化合物202的示例性合成
Figure BDA0003676261880004801
步骤1
Figure BDA0003676261880004802
向1-(4-溴-2-羟基-苯基)乙酮(10g,46.50mmol,1.0当量)在二甲基甲酰胺(50mL)中的溶液中添加碳酸钾(9.64g,69.75mmol,1.5当量)。然后在0℃下向混合物中添加碘甲烷(13.20g,93.00mmol,2.0当量)。然后将混合物在20℃下搅拌12小时。将混合物用水(200mL)稀释,用乙酸乙酯(100mlx3)萃取,用盐水(50mlx2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤,然后浓缩。得到呈黄色固体的1-(4-溴-2-甲氧基-苯基)乙酮(10.5g,45.84mmol,98%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004803
向1-(4-溴-2-甲氧基-苯基)乙酮(10g,43.65mmol,1.18当量)在四氢呋喃(50mL)中的溶液中添加四乙醇钛(16.94g,74.26mmol,2.0当量)。然后将2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(4.5g,37.13mmol,1.0当量)添加到混合物中,并将混合物用N2吹扫3次。然后将该混合物在70℃下搅拌12小时。将混合物用水(100mL)淬灭,用水(200mL)稀释,过滤,然后用乙酸乙酯(200mlx3)萃取,用盐水(200mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤,然后浓缩。通过硅胶柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=20∶1至3∶1)纯化残余物。得到呈黄色油状物的((R,E)-N-(1-(4-溴-2-甲氧基苯基)亚乙基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(9g,27.09mmol,73%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004811
在0℃下,向((R,E)-N-(1-(4-溴-2-甲氧基苯基)亚乙基)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(9g,27.09mmol,1.0当量)在四氢呋喃(90mL)中的溶液中添加三仲丁基硼氢化锂(1M,81.26mL,3.0当量)。然后将混合物在20℃下搅拌2小时。将混合物用水(100mL)淬灭,用水(20mL)稀释,用乙酸乙酯(300mlx3)萃取,用盐水(200mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤,然后浓缩。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=20∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈黄色油状物的N-[(1S)-1-(4-溴-2-甲氧基-苯基)乙基]-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰胺(5.5g,16.45mmol,60%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004821
向N-[(1S)-1-(4-溴-2-甲氧基-苯基)乙基]-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰胺(4.7g,14.06mmol,1.0当量)和4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3,2-二氧杂戊硼烷(5.36g,21.09mmol,1.5当量)在二噁烷(12mL)中的溶液中添加[1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯(ii)(1.03g,1.41mmol,0.1当量)和乙酸钾(2.76g,28.12mmol,2.0当量)。然后将混合物用N2吹扫3次。然后将混合物在90℃下搅拌5小时。将混合物用水(20mL)稀释,过滤,然后用乙酸乙酯(50mL x3)萃取,用盐水(30mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤,然后浓缩。通过硅胶柱色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=10∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈黄色油状物的N-[(1S)-1-[2-甲氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰胺(4.5g,11.80mmol,84%收率)。
根据以下方案,将N-[(1S)-1-[2-甲氧基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]-2-甲基-丙烷-2-亚磺酰胺转化为(S)-1-(2-甲氧基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙-1-胺。
Figure BDA0003676261880004822
使用类似于上述用于其他实施例(例如,示例性化合物64)的程序,将(S)-1-(2-甲氧基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙-1-胺转化为最终化合物。
使用类似于上述那些的程序制备示例性化合物201。
示例性化合物203的示例性合成
Figure BDA0003676261880004831
步骤1
Figure BDA0003676261880004832
向N-[(1S)-1-(4-溴苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(2g,6.66mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(20mL)中的溶液中添加四三苯基苯基膦钯(770mg,0.67mmol,0.1当量)和氰化锌(782mg,6.66mmol,0.4mL,1当量)。将反应溶液在80℃下搅拌14小时。将溶液用水(80ml)淬灭,并用乙酸乙酯(50mL x3)萃取。用盐水(20mL x3)洗涤合并的有机层。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=30/1至3∶1)纯化残余物,得到产物。得到呈无色胶状物的N-[(1S)-1-(4-氰基苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.6g,6.50mmol,97.50%收率)。
使用上述程序,将N-[(1S)-1-(4-氰基苯基)乙基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物204。
示例性化合物91的示例性合成
Figure BDA0003676261880004841
步骤1
Figure BDA0003676261880004842
在100mL圆底烧瓶中置入1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-羧酸叔丁酯(3.5g,13.7mmol,1.0当量)和TEA(4.1g,0.1mmol,3.0当量)的DCM(8mL)溶液,向其中缓慢添加CbzCl(2.8g,0.1mmol,1.2当量)。将所得混合物在室温下搅拌12小时。然后通过添加20mL水将反应混合物淬灭,并用DCM(20mL x2)萃取。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶0)洗脱的硅胶柱上。得到4.0g(75%)呈白色油状物的1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4,9-二羧酸4-苄基9-叔丁酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880004843
在100mL圆底烧瓶中置入1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4,9-二羧酸4-苄基9-叔丁酯(4.0g,10.2mmol,1.0当量)的二噁烷(15mL)溶液,然后添加氯化氢的1,4-二噁烷溶液(4.0M,4mL)。将所得混合物在室温下搅拌3小时,然后减压浓缩。得到2.9g(87%)呈固体的1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸苄酯盐酸盐。
步骤3
Figure BDA0003676261880004851
在30mL密封管中置入1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸苄酯盐酸盐(2.9g,8.9mmol,1.0当量)、4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(2.1g,0.1mmol)和DIEA(3.9g,0.1mmol)的DMSO(8mL)溶液。将所得溶液在130℃下在油浴中搅拌12小时。然后通过添加20mL水/冰来淬灭反应混合物。用乙酸乙酯(20mL x2)萃取所得混合物。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶0)洗脱的硅胶柱上。得到3.1g(84%)呈黄色固体的9-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸苄酯。
步骤4
Figure BDA0003676261880004852
在30mL密封管中置入9-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸苄酯(3.1g,7.4mmol,1.0当量)、[2-(甲氧基甲氧基)苯基]硼酸(2.7g,0.1mmol,2.0当量)、Pd(PPh3)4(859.4mg,0.7mmol,0.1当量)和K2CO3(3.1g,0.1mmol,3.0当量)的二噁烷(5mL)和H2O(1mL)溶液。将所得混合物在100℃下在油浴中搅拌12小时,然后用乙酸乙酯(20mL x2)萃取。将合并的有机相经无水硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10∶1)洗脱的硅胶柱上。得到3.2g(83%)呈黄色固体的9-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸苄酯。
步骤5
Figure BDA0003676261880004861
在氮气气氛下,在100ml圆底烧瓶中,向9-[3-氨基-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-4-基]-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-羧酸苄酯(3.2g,6.2mmol,1.0当量)在甲醇(10mL)中的溶液中添加Pd(OH)2/C(10%,500mg)。然后将烧瓶抽真空并用氢气冲洗。将反应混合物在氢气气氛下使用氢气球在室温下氢化6小时,然后通过硅藻土垫过滤并减压浓缩。得到1.8g(76%)呈黄色固体的6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]-4-[1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-基]哒嗪-3-胺。
步骤6
Figure BDA0003676261880004862
在250mL圆底烧瓶中置入丁-2-炔-1,4-二醇(2.58g,30.00mmol,1.00当量)、氧化银(10.35g,45.00mmol,1.50当量)和碘化钾(498mg,3.00mmol,0.10当量)在二氯甲烷(80mL)中的溶液。然后添加4-甲基苯磺酰氯(5.70g,30.00mmol,1.00当量)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。滤出不溶性固体,并将滤液浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶2)洗脱的硅胶柱上。得到6.13g(85%)呈黄色油状物的4-甲基苯磺酸4-羟基丁-2-炔-1-基酯。
步骤7
Figure BDA0003676261880004871
在250mL圆底烧瓶中置入4-甲基苯磺酸4-羟基丁-2-炔-1-基酯(6.13g,25.54mmol,1.10当量)、哌嗪-1-羧酸苄酯(5.11g,23.22mmol,1.00当量)和碳酸钾(12.82g,92.88mmol,4.00当量)在DMF(40mL)中的溶液。将所得混合物在室温下搅拌过夜。然后将反应混合物用水(400mL)淬灭,并且用乙酸乙酯(200mL x2)萃取。将合并的有机相经硫酸钠干燥并浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到2.01g(30%)呈黄色油状物的4-(4-羟基丁-2-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤8
Figure BDA0003676261880004872
在250mL圆底烧瓶中置入4-(4-羟基丁-2-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(2.01g,6.98mmol,1.00当量)和氢氧化钾(3.91g,69.80mmol,10.00当量)在二乙醚(100mL)中的溶液。然后添加4-甲基苯磺酰氯(1.99g,10.47mmol,1.50当量)。将反应混合物在室温下搅拌过夜。滤出不溶性固体。将滤液用水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并真空浓缩。得到1.80g(59%)呈黄色油状物的4-(4-(甲苯磺酰氧基)丁-2-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤9
Figure BDA0003676261880004873
在250mL圆底烧瓶中置入4-(4-(甲苯磺酰氧基)丁-2-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(1.80g,4.07mmol,2.50当量)、6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)-4-(1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-基)哒嗪-3-胺(627mg,1.63mmol,1.00当量)、碘化钠(366mg,2.44mmol,1.50当量)、碳酸钾(900mg,6.52mmol,4.0当量)在乙腈(70mL)中的溶液。将所得混合物在70℃下搅拌过夜。将反应混合物用水(100mL)稀释,用乙酸乙酯(200mL x2)萃取。浓缩合并的有机相,并将残余物施加到使用甲醇/二氯甲烷(1∶10)洗脱的硅胶柱上。得到180mg(17%)呈棕色固体的4-(4-(9-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)丁-2-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤10
Figure BDA0003676261880004881
在氮气气氛下,在100mL圆底烧瓶中,向4-(4-(9-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)丁-2-炔-1-基)哌嗪-1-羧酸苄酯(1.60g,2.44mmol,1.00当量)在甲醇(40mL)中的溶液中添加二氧化铂(221.8mg,0.98mmol,0.40当量)。将烧瓶抽真空并用氢气冲洗。使用氢气球,于室温在氢气气氛下,将反应混合物氢化4小时。通过硅藻土垫过滤混合物,并减压浓缩滤液。将残余物施加到使用甲醇/二氯甲烷(1∶10)洗脱的硅胶柱上。得到444.0mg(28%)呈棕色固体的4-(4-(9-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)丁基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
步骤11
Figure BDA0003676261880004882
在100mL圆底烧瓶中置入4-(4-(9-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)丁基)哌嗪-1-羧酸苄酯(444mg,0.67mmol,1.00当量)在THF(8mL)中的溶液,向其中添加三乙基硼氢化锂在THF(1.0M,8mL)中的溶液。将所得溶液在室温下搅拌3小时。将反应混合物用饱和NH4Cl溶液(30mL)淬灭,并用二氯甲烷(30mL x2)萃取。将合并的有机相经硫酸钠干燥,并减压浓缩。得到292mg(83%)呈棕色油状物的6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)-4-(4-(4-(哌嗪-1-基)丁基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-基)哒嗪-3-胺。
根据以下方案使用类似于上述用于其他实施例的程序,将6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)-4-(4-(4-(哌嗪-1-基)丁基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-9-基)哒嗪-3-胺转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880004892
使用类似的程序制备示例性化合物205。
示例性化合物188的示例性合成
Figure BDA0003676261880004901
根据以下方案使用类似于上述用于示例性化合物91的程序制备。
Figure BDA0003676261880004902
使用类似的程序制备示例性化合物187。
示例性化合物192的示例性合成
Figure BDA0003676261880004903
根据以下方案使用针对其他实施例所述的程序以及对本领域技术人员显而易见的程序,制备4-(2-((1r,3r)-3-(2-(9-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)乙氧基)环丁氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯。
Figure BDA0003676261880004911
使用类似于针对示例性化合物91所述的程序,将4-(2-((1r,3r)-3-(2-(9-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1-氧杂-4,9-二氮杂螺[5.5]十一烷-4-基)乙氧基)环丁氧基)乙基)哌嗪-1-羧酸苄酯转化为最终化合物。
示例性化合物212和213的示例性合成
Figure BDA0003676261880004912
使用类似于示例化合物117的步骤1和步骤2中所述的程序,然后使用示例性化合物180所述的步骤中所述的程序制备。
示例性化合物214和215的示例性合成
Figure BDA0003676261880004921
根据以下方案使用对本领域技术人员显而易见的标准程序,制备(2S,4R)-4-羟基-2-((2-甲氧基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲酰基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯。
Figure BDA0003676261880004922
使用上述用于其他实施例的标准程序,将(2S,4R)-4-羟基-2-((2-甲氧基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苄基)氨基甲酰基)吡咯烷-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
示例性化合物238的示例性合成
Figure BDA0003676261880004923
步骤1
Figure BDA0003676261880004931
向3-羟基环丁烷羧酸甲酯(14.2g,109.11mmol,1.00当量)在DMF(150mL)中的溶液中添加氢化钠(5.24g,130.93mmol,60%纯度,1.20当量),并将混合物在0℃下搅拌0.5小时。随后,添加苄基溴(20.53g,120.02mmol,14.26mL,1.1当量),并将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应混合物在25℃下用饱和氯化铵溶液(200mL)淬灭,然后用水(100mL)稀释并用乙酸乙酯(80mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(150mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过快速硅胶色谱法(0~20%乙酸乙酯/石油醚梯度)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的3-苄氧基环丁烷羧酸甲酯(8.9g,40.41mmol,37%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880004932
在0℃下,向氢化铝锂(1.53g,40.41mmol,1.00当量)在四氢呋喃(80mL)中的溶液中添加3-苄氧基环丁烷羧酸甲酯(8.90g,40.41mmol,1.00当量),并将混合物在25℃下搅拌2小时。将反应混合物在25℃下用水(1mL)、氢氧化钠溶液(15%,2mL)和水(3mL)淬灭,然后用乙酸乙酯(80mL)稀释并用乙酸乙酯(15mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(50mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。.通过快速硅胶色谱法(0~50%乙酸乙酯/石油醚)纯化残余物。得到呈无色油状物的化合物(3-苄氧基环丁基)甲醇(7.4g,38.5mmol,95%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880004941
向(3-苄氧基环丁基)甲醇(7.4g,38.49mmol,1.00当量)和3,4-二氢-2H-吡喃(16.19g,192.5mmol,17.6mL,5.00当量)在二氯甲烷(125mL)中的溶液中添加对甲苯磺酸吡啶鎓(967mg,3.85mmol,0.10当量),并将该混合物在25℃下搅拌12小时。向混合物中添加水(200mL),并用二氯甲烷(100mL×2)萃取所得混合物。然后将合并的有机层用盐水(150mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过柱色谱法(SiO2,石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至20∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的化合物2-[(3-苄氧基环丁基)甲氧基]四氢吡喃(10.20g,36.9mmol,95%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880004942
在氮气下,向2-[(3-苄氧基环丁基)甲氧基]四氢吡喃(10.20g,36.9mmol,1.00当量)在甲醇(100mL)中的溶液中添加10%碳载钯(2g,36.91mmol)。将悬浮液真空脱气并用氢气吹扫数次。将混合物在氢气(15psi)下在25℃下搅拌16小时。将反应过滤并减压浓缩,得到残余物。得到呈无色油状物的化合物3-(四氢吡喃-2-基氧基甲基)环丁醇(6.28g,33.7mmol,91%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880004943
在0℃在氮气下,向吡啶-4-醇(4g,42.06mmol,1当量)、3-(四氢吡喃-2-基氧基甲基)环丁醇(8.62g,46.27mmol,1.1当量)和三苯膦(33.10g,126.18mmol,3当量)在甲苯(40mL)中的溶液中滴加偶氮二羧酸二异丙酯(25.52g,126.18mmol,24.5mL,3当量)的甲苯(20mL)溶液。将反应混合物在100℃下搅拌12小时。将混合物真空浓缩以去除大部分甲苯。向混合物中添加水(150mL)和乙酸乙酯(100mL),向混合物中添加盐酸溶液(2M)以将pH调节至约3,然后用乙酸乙酯(100mL x2)萃取所得混合物。向水相添加饱和碳酸氢钠以将pH调节至约8,并用乙酸乙酯(150mL x5)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过制备型HPLC纯化粗产物(柱:Kromasil Eternity XT250*80mm*10um;流动相:[水(0.05%氢氧化氨v/v)-ACN];B%:5%-30%,31min)。得到呈浅黄色油状物的((1r,3r)-3-(吡啶-4-基氧基)环丁基)甲醇(4.2g,23.0mmol,54%收率)。
步骤6
Figure BDA0003676261880004951
向((1r,3r)-3-(吡啶-4-基氧基)环丁基)甲醇(4.2g,23.44mmol,1当量)在甲苯(40mL)中的溶液中添加苄基溴(4.41g,25.78mmol,3.1mL,1.1当量)。将反应混合物在80℃下搅拌4小时。真空浓缩混合物。将残余物用石油醚和乙酸乙酯(40mL,V/V=1/1)研磨。得到呈白色固体的1-苄基-4-((1r,3r)-3-(羟甲基)环丁氧基)吡啶-1-鎓(8g,22.8mmol,97%收率)。
步骤7
Figure BDA0003676261880004952
在0℃下,向1-苄基-4-((1r,3r)-3-(羟甲基)环丁氧基)吡啶-1-鎓(8g,22.84mmol,1当量)在乙醇(100mL)中的溶液中添加硼氢化钠(1.73g,45.68mmol,2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌4小时。向混合物中添加水(100mL)以淬灭反应。用乙酸乙酯(100mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=50∶1至0∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的((1r,3r)-3-((1-苄基-1,2,3,6-四氢吡啶-4-基)氧基)环丁基)甲醇(5.2g,19.02mmol,83%收率)。
步骤8
Figure BDA0003676261880004961
在氮气下,向[3-[(1-苄基-3,6-二氢-2H-吡啶-4-基)氧基]环丁基]甲醇(5.2g,19.02mmol,1当量)和二碳酸二叔丁酯(8.30g,38.04mmol,8.7mL,2当量)在甲醇(100mL)中的溶液中添加活性炭载10%钯催化剂(0.7g)和碳载20%氢氧化钯(0.7g)。将反应混合物于40℃在氢气(50psi)下搅拌16小时。通过硅藻土垫过滤混合物,并浓缩滤液,得到粗产物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至0∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的4-((1r,3r)-3-(羟甲基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(4.5g,15.77mmol,83%收率)。
步骤9
Figure BDA0003676261880004962
在0℃下,向4-((1r,3r)-3-(羟甲基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.5g,8.76mmol,1当量)在二氯甲烷(25mL)中的溶液中添加戴斯-马丁过碘烷(4.46g,10.51mmol,1.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌2小时。过滤混合物,并向混合物中添加饱和碳酸氢钠(50mL)。用乙酸乙酯(50mL x3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(80mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至5∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的4-((1r,3r)-3-甲酰基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.0g,7.06mmol,80%收率)。
步骤10
Figure BDA0003676261880004971
在0℃下,向4-((1r,3r)-3-甲酰基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.0g,7.06mmol,1当量)在甲醇(20mL)中的溶液中添加碳酸钾(1.95g,14.12mmol,2当量)和1-重氮-1-二甲氧基磷酰基-丙烷-2-酮(1.42g,7.41mmol,1.05当量)。将反应混合物在20℃下搅拌12小时。向混合物中添加水(100mL),用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至20∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的4-((1r,3r)-3-乙炔基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.3g,4.65mmol,66%收率)。
步骤11
Figure BDA0003676261880004972
在-78℃下,向4-((1r,3r)-3-乙炔基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.7g,6.09mmol,1当量)在四氢呋喃(17mL)中的溶液中添加正丁基锂(2.5M,3.6mL,1.5当量)。将混合物在-78℃下搅拌0.5小时。然后向混合物中添加氯甲酸异丁酯(1.66g,12.17mmol,1.6mL,2当量),并将反应混合物在-78℃下搅拌0.5小时,并在20℃下搅拌1小时。向混合物中添加饱和氯化铵(80mL),并用乙酸乙酯(80mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(100mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至5∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的4-((1r,3r)-3-(3-异丁氧基-3-氧代丙-1-炔-1-基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(2g,5.27mmol,86%收率)。
步骤12
Figure BDA0003676261880004981
在-78℃下,向4-[3-(3-异丁氧基-3-氧代-丙-1-炔基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(2g,5.27mmol,1当量)在二氯甲烷(20mL)中的溶液中滴加二异丁基氢化铝的DCM(1M,6.3mL,1.2当量)溶液。将反应混合物在-78℃下搅拌1小时。向混合物中添加饱和碳酸氢钠(10mL),并向混合物中添加乙酸乙酯(100mL)。将混合物通过硅藻土垫过滤,并用乙酸乙酯(50mL x3)萃取。将合并的有机相用盐水(70mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至5∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的4-((1r,3r)-3-(3-氧代丙-1-炔-1-基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.2g,3.90mmol,74%收率)。
步骤13
Figure BDA0003676261880004982
在0℃下,向4-[3-(3-氧代丙-1-炔基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.2g,3.90mmol,1当量)在乙醇(10mL)中的溶液中分三份添加硼氢化钠(177mg,4.68mmol,1.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌1小时。向混合物中添加水(100mL),并用乙酸乙酯(50mLx3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=50∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的4-((1r,3r)-3-(3-羟基丙-1-炔-1-基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.06g,3.43mmol,87%收率)。
步骤14
Figure BDA0003676261880004991
在0℃下,向4-((1r,3r)-3-(3-羟基丙-1-炔-1-基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(1.06g,3.43mmol,1当量)在二氯甲烷(10mL)中的溶液中添加三苯基膦(1.08g,4.11mmol,1.2当量)和四溴化碳(1.36g,4.11mmol,1.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌3小时。真空浓缩混合物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至20∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的4-[3-(3-溴丙-1-炔基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1g,2.69mmol,78%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将4-((1r,3r)-3-(3-羟基丙-1-炔-1-基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880005001
示例性化合物216的示例性合成
Figure BDA0003676261880005002
步骤1
Figure BDA0003676261880005003
将2-溴-4-氟-吡啶(310mg,1.76mmol,1.2当量)、4-(3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基)-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(500mg,1.46mmol,1当量)和二异丙基乙胺(2.27g,17.57mmol,3mL,12当量)在二甲亚砜(30mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在130℃在氮气气氛下搅拌5小时。将反应混合物用水(50mL)稀释,并用乙酸乙酯(50mL)萃取三次。将合并的有机层经无水硫酸钠干燥并浓缩,得到粗产物。通过半制备型反相色谱(柱:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:15%-45%,10min)纯化残余物。得到呈黄色固体的4-[8-(2-溴-4-吡啶基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(562mg,1.13mmol,77%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005011
将4-[8-(2-溴-4-吡啶基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]-6-[2-(甲氧基甲氧基)苯基]哒嗪-3-胺(568mg,1.14mmol,1当量)、4-((1r,3r)-3-乙炔基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(479mg,1.71mmol,1.5当量)、二氯二(三苯基膦)钯(II)(80mg,0.1mmol,0.1当量)、碘化亚铜(22mg,0.1mmol,0.1当量)和N-异丙基丙-2-胺(8.13g,80.38mmol,11.36mL,70.39当量)在二甲基甲酰胺(35mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫三次,然后将混合物在75℃和氮气气氛下搅拌12小时。将反应混合物用水(30mL)稀释,并用乙酸乙酯(60mL)萃取三次。将合并的有机层用盐水(50mL)洗涤两次,经无水硫酸钠干燥并浓缩,得到粗产物。通过半制备型反相色谱纯化残余物(柱:Phenomenex luna C18 250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:15%-45%,25min)。得到呈黄色固体的4-((1r,3r)-3-((4-(3-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)乙炔基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(581mg,0.8mmol,73%收率)。
如上文其他实施例所述,将4-((1r,3r)-3-((4-(3-(3-氨基-6-(2-(甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)乙炔基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
示例性化合物217和218的示例性合成
Figure BDA0003676261880005021
步骤1
Figure BDA0003676261880005022
在20℃下,向2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基-丁酸甲酯(500mg,2.51mmol,1当量)和3-溴丙烷-1-醇(523mg,3.77mmol,0.34mL,1.5当量)在N,N-二甲基甲酰胺(5mL)中的溶液中添加碳酸钾(693mg,5.02mmol,2当量),并将混合物在80℃下搅拌4小时。将反应混合物用水(20mL)淬灭,然后用乙酸乙酯(10mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=20∶1至4∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的2-[3-(3-羟基丙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(370mg,1.44mmol,57%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005031
在20℃下,向2-[3-(3-羟基丙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(370mg,1.44mmol,1当量)在二氯甲烷(5mL)中的溶液中依次添加三乙胺(291mg,2.88mmol,0.40mL,2当量)和对甲苯磺酰氯(411mg,2.16mmol,1.5当量),然后在20℃下搅拌16h。浓缩反应混合物,得到残余物。通过制备型-TLC(石油醚/乙酸乙酯=3/1)纯化残余物。得到呈无色油状物的3-甲基-2-[3-[3-(对甲苯磺酰氧基)丙氧基]异噁唑-5-基]丁酸甲酯(438mg,1.06mmol,74%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880005032
在20℃下,向3-甲基-2-[3-[3-(对甲苯磺酰氧基)丙氧基]异噁唑-5-基]丁酸甲酯(250mg,0.61mmol,1当量)和2-[6-氨基-5-[8-[2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚(386mg,0.61mmol,1当量,2三氟乙酸盐)在二甲亚砜(3mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(314mg,2.43mmol,0.42mL,4当量)和碘化钾(10mg,0.06mmol,0.1当量),并将混合物在80℃下搅拌12小时。将反应混合物用水(20mL)稀释,然后用乙酸乙酯(10mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。通过硅胶柱色谱法(二氯甲烷:甲醇=10/1)纯化残余物。得到呈黄色油状物的2-[3-[3-[4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]丙氧基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(90mg,0.11mmol,17%收率)。
根据以下方案使用上述用于其他实施例的程序,将2-[3-[3-[4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]丙氧基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880005041
示例性化合物223的示例性合成
Figure BDA0003676261880005051
步骤1
Figure BDA0003676261880005052
向2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(500mg,1.59mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)中的溶液中添加N-氯代琥珀酰亚胺(423mg,3.17mmol,2当量)。将反应混合物在70℃下搅拌3小时。将反应混合物用水(50mL)稀释,并用乙酸乙酯(60mL x3)萃取。用盐水(20mL x2)洗涤合并的有机层。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC纯化残余物(柱:Phenomenex SynergiC18 150*25*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:65%-95%,9min),得到呈无色油状物的2-[4-氯-3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(337mg,0.965mmol,61%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005053
向2-[4-氯-3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(377mg,1.08mmol,1当量)在甲醇(2mL)和水(1mL)中的溶液中添加氢氧化锂一水合物(181mg,4.31mmol,4当量)。将反应混合物在20℃下搅拌2小时。将该混合物冷却至0℃,并用1M氯化氢将pH调节至6,然后将该溶液真空浓缩,得到残余物。通过制备型HPLC纯化残余物(柱:Phenomenex luna C18 150*2510um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:54%-74%,7.8min),得到产物。得到呈白色固体的2-[4-氯-3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(229mg,0.68mmol,63%收率)。
使用上述用于其他实施例的程序,将2-[4-氯-3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物222。
示例性化合物225的示例性合成
Figure BDA0003676261880005061
步骤1
Figure BDA0003676261880005062
在氮气下,向5-溴-2-甲基-苄氰(5g,25.50mmol,1当量)在四氯化碳(50mL)中的溶液中添加N-溴代琥珀酰亚胺(4.77g,26.78mmol,1.05当量)和2,2-偶氮双(2-甲基丙氰)(419mg,2.55mmol,0.1当量)。将反应混合物在80℃下搅拌16小时。过滤该混合物,并将滤液真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚:乙酸乙酯=1∶0至10∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的5-溴-2-(溴甲基)苄氰(4.5g,16.37mmol,64%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005071
向5-溴-2-(溴甲基)苄氰(4.4g,16.00mmol,1当量)和N-叔丁氧基羰基氨基甲酸叔丁酯(4.17g,19.20mmol,1.2当量)在乙腈中的溶液(50mL)中添加碳酸钾(4.42g,32.01mmol,2当量)。将反应混合物在50℃下搅拌12小时。LCMS显示大部分5-溴-2-(溴甲基)苄腈被消耗。向混合物中添加水(100mL),并用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至5∶1)纯化残余物。得到呈无色油状物的N-[(4-溴-2-氰基-苯基)甲基]-N-叔丁氧基羰基-氨基甲酸叔丁酯(6.4g,15.56mmol,97%收率)。
步骤3
Figure BDA0003676261880005072
在氮气下,向N-[(4-溴-2-氰基-苯基)甲基]-N-叔丁氧基羰基-氨基甲酸叔丁酯(2g,4.86mmol,1当量)、4,4,5,5-四甲基-2-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3,2-二氧杂戊硼烷(1.36g,5.35mmol,1.1当量)在二噁烷(20mL)中的溶液中添加乙酸钾(1.19g,12.16mmol,2.5当量)和(1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁)二氯化钯(II)(356mg,0.49mmol,0.1当量)。将反应混合物在90℃下搅拌12小时。通过硅藻土垫过滤混合物,并将滤液浓缩,得到呈黑色油状物的N-叔丁氧基羰基-N-[[2-氰基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(2.2g,粗品)。
步骤4
Figure BDA0003676261880005081
在氮气下,向N-叔丁氧基羰基-N-[[2-氰基-4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(2.2g,4.80mmol,1当量)、5-溴-4-甲基-噻唑(940mg,5.28mmol,1.1当量)在二噁烷(20mL)和水(4mL)中的溶液中添加碳酸钾(1.66g,12.00mmol,2.5当量)和(1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁)二氯化钯(II)(351mg,0.48mmol,0.1当量)。将反应混合物在100℃下搅拌12小时。向混合物中添加水(100mL),用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(50mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的N-叔丁氧基羰基-N-[[2-氰基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(1.7g,3.96mmol,82%收率)。
如上文其他实施例所述,将N-叔丁氧基羰基-N-[[2-氰基-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物224。
示例性化合物126的示例性合成
Figure BDA0003676261880005091
步骤1
Figure BDA0003676261880005092
于15℃在氮气下,向3-氧代氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(25g,122mmol,1当量)和2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(14.8g,122mmol,1当量)在THF(250mL)中的混合物中一次性添加异丙醇钛(IV)(38.9g,171mmol,35.4mL,1.4当量)。将该混合物在60℃下搅拌2小时。将混合物倒入乙酸乙酯和冰水(1000mL)中,搅拌20分钟,过滤。用乙酸乙酯(500mL×3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(200mL×3)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=30/1至8/1)纯化残余物,得到呈黄色固体的3-叔丁基亚磺酰基亚氨基氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(39g,粗品)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005093
在-70℃在氮气下,向1-溴-4-碘-苯(35.78g,126mmol,1当量)在THF(350mL)中的溶液中滴加正丁基锂(2.5M,50.6mL,1当量),将混合物在该温度下搅拌30分钟。然后在氮气下滴加3-叔丁基亚磺酰基亚氨基氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(39g,126.46mmol,1当量)在THF(70mL)中的溶液。将反应混合物在-70℃下搅拌1小时。用冰水(200mL)淬灭该混合物。用乙酸乙酯(500mL x3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(200mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=3/1至1/1)纯化残余物。通过半制备型反相HPLC纯化粗产物(柱:Phenomenex luna c18 250mm*100mm*10um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:40ACN%-70ACN%,45min),得到呈黄色油状物的3-(4-溴苯基)-3-(叔丁基亚磺酰基氨基)氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(4.62g,9.93mmol,7%收率)。另外,收集到4.16g呈黄色油状物的稍微不纯的产物(纯度86%)。
步骤3
Figure BDA0003676261880005101
于20℃在氮气下,向3-(4-溴苯基)-3-(叔丁基亚磺酰基氨基)氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(4.62g,9.93mmol,1当量)、乙酸钾(1.95g,19.85mmol,2当量)和4-甲基噻唑(1.97g,19.85mmol,1.8mL,2当量)在二甲基乙酰胺(60mL)中的溶液中一次性添加乙酸钯(II)(223mg,0.99mmol,0.1当量)。将该混合物在100℃下搅拌16小时。将混合物冷却至20℃,倒入冰水(w/w=1/1,100mL)中,并搅拌5分钟。用乙酸乙酯(50mL×4)萃取水相。将合并的有机相用盐水(30mL x2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过半制备型反相HPLC纯化残余物(甲酸条件;柱:Phenomenex Synergi Max-RP250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:45ACN%-75ACN%,29min),得到呈黄色固体的3-(叔丁基亚磺酰基氨基)-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(2.3g,4.76mmol,48%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880005111
将3-(叔丁基亚磺酰基氨基)-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯(3.4g,7.03mmol,1当量)和盐酸/甲醇(4M,30mL,17.07当量)在二氯甲烷(5mL)中的溶液在25℃下搅拌2h。得到呈白色固体的化合物3-氨基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯盐酸盐(3g,粗品)。
步骤5
Figure BDA0003676261880005112
于15℃在氮气下,向3-氨基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-1-羧酸苄酯盐酸盐(3g,7.21mmol,1当量)、O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N′,N′-四甲基脲鎓六氟磷酸酯(4.11g,10.82mmol,1.5当量)和(2S,4R)-1-叔丁氧基羰基-4-羟基-吡咯烷-2-羧酸(1.67g,7.21mmol,1当量)在N,N-二甲基甲酰胺(40mL)中的混合物中一次性添加三乙胺(2.19g,21.64mmol,3.0mL,3当量)。将该混合物在15℃下搅拌1小时。将混合物倒入冰水(w/w=1/1,100mL)中,并搅拌5分钟。用乙酸乙酯(60mL×3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(30mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过半制备型反相HPLC(柱:Phenomenex Synergi Max-RP 250*80mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:30%60%,30min)纯化残余物。得到呈白色固体的化合物(2S,4R)-2-[[1-苄氧基羰基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]-4-羟基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(3.32g,5.60mmol,77%收率)。
步骤6
Figure BDA0003676261880005121
在0℃在氮气下,向(2S,4R)-2-[[1-苄氧基羰基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]-4-羟基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(1.1g,1.86mmol,1当量)和三乙胺(666mg,6.59mmol,0.9mL,3.55当量)在二氯甲烷(100mL)中的混合物中一次性添加氯化钯(ii)(329.10mg,1.86mmol,1当量)。添加三乙基硅烷(2.81g,24.13mmol,3.8mL,13当量),并将反应混合物在20℃下搅拌2小时。向反应中添加三氟乙酸(4.23g,37.14mmol,2.75mL,20.01当量),并将混合物在20℃下再搅拌1小时。将混合物过滤并在40℃下减压浓缩。通过半制备型反相HPLC纯化残余物(甲酸条件;柱:Kromasil250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:26ACN%-56ACN%,28min)。得到呈白色固体的(2S,4R)-4-羟基-2-[[3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(336mg,0.73mmol,39%收率)。
步骤7
Figure BDA0003676261880005131
将(2S,4R)-4-羟基-2-[[3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(390mg,0.85mmol,1当量)和甲醛(138mg,1.70mmol,0.1mL,37%纯度,2当量)在二氯甲烷(15mL)中的混合物在20℃下搅拌30分钟。添加乙酸(51mg,0.85mmol,1当量)和三乙酰氧基硼氢化钠(901mg,4.25mmol,5当量),并将混合物在20℃下搅拌5小时。将混合物在40℃下减压浓缩。通过半制备型反相HPLC纯化残余物(甲酸条件;柱:Phenomenex Synergi C18 150*25*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:0%-30%,10min)。得到呈黄色油状物的(2S,4R)-4-羟基-2-[[1-甲基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(300mg,0.63mmol,74%收率)。
使用类似于上述实施例的程序,将(2S,4R)-4-羟基-2-[[1-甲基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物228。
示例性化合物233和234的示例性合成
Figure BDA0003676261880005132
根据以下方案使用类似于针对示例性化合物76和70所述的程序制备。
Figure BDA0003676261880005141
示例性化合物127的示例性合成
Figure BDA0003676261880005142
步骤1
Figure BDA0003676261880005151
在25℃在氮气下,向(2S,4R)-4-羟基-2-[[3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(300mg,0.65mmol,1当量)和三乙胺(198mg,1.96mmol,3当量)在二氯甲烷(60mL)中的混合物中一次性添加乙酸酐(100.18mg,0.98mmol,91.9uL,1.5当量)。将该混合物在25℃下搅拌16小时。将混合物在45℃下减压浓缩。通过半制备型反相HPLC纯化残余物(碱性条件;柱:Waters Xbridge150*255um;流动相:[水(0.05%氢氧化氨v/v)-ACN];B%:10%-40%,10min)。得到呈黄色油状物的粗产物(2S,4R)-2-[[1-乙酰基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]-4-羟基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯(232mg,0.46mmol,71%收率)。
使用上述实施例的程序,将(2S,4R)-2-[[1-乙酰基-3-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]氮杂环丁烷-3-基]氨基甲酰基]-4-羟基-吡咯烷-1-羧酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物235。
示例性化合物240的示例性合成
Figure BDA0003676261880005161
根据以下方案使用类似于针对示例性化合物202所述的程序制备(S)-(1-(2-氟-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)氨基甲酸叔丁酯。
Figure BDA0003676261880005162
类似于其他实施例所述的程序,将(S)-(1-(2-氟-4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物239。
示例性化合物243和244的示例性合成
Figure BDA0003676261880005163
步骤1
Figure BDA0003676261880005171
在-78℃下,向三氟乙酸乙酯(21.31g,150mmol,20.7mL,1.5当量)在四氢呋喃(300mL)中的溶液中添加双(三甲基甲硅烷基)酰胺锂(1M,120mL,1.2当量)。将混合物在-78℃下搅拌1小时。然后在-78℃下将1-(6-溴-3-吡啶基)乙酮(20g,100mmol,1当量)的四氢呋喃(20mL)溶液滴加到该混合物中。将反应混合物在20℃下搅拌2小时。添加饱和氯化铵(200mL)以淬灭反应,向混合物中添加水(500mL)。用乙酸乙酯(300mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(500mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物用石油醚和乙酸乙酯(255mL,石油醚∶乙酸乙酯=50∶1)研磨,过滤,得到浅黄色固体。真空浓缩滤液。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=10∶1至0∶1)纯化残余物。得到呈黄色固体的1-(6-溴-3-吡啶基)-4,4,4-三氟-丁烷-1,3-二酮(28g,94.6mmol,94%收率)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005172
向1-(6-溴-3-吡啶基)-4,4,4-三氟-丁烷-1,3-二酮(15g,50.67mmol,1当量)在乙腈(150mL)中的溶液中添加1-(氯甲基)-4-氟-1,4-二氮杂双环[2.2.2]辛烷;二四氟硼酸酯(44.87g,126.7mmol,2.5当量)。将反应混合物在90℃下搅拌3小时。然后向混合物中添加水(1.83g,101.3mmol,1.8mL,2当量),并将反应混合物在90℃下搅拌15分钟。然后在20℃下向混合物中添加三乙胺(25.64g,253.3mmol,35.2mL,5当量),并将反应混合物在20℃下搅拌16小时。向混合物中添加水(300mL)。用乙酸乙酯(300mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(500mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(二氯甲烷∶甲醇=1∶0至10∶1)纯化残余物。得到呈棕色油状物的1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙酮(7.9g,粗品)。
步骤3
Figure BDA0003676261880005181
在0℃下,向1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙酮(7.9g,33.47mmol,1当量)在乙醇(80mL)中的溶液中分三份添加硼氢化钠(1.27g,33.47mmol,1当量)。将反应混合物在0℃下搅拌1小时。向混合物中添加水(200mL),并用乙酸乙酯(100mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(150mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至1∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色油状物的1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙醇(5.3g,21.20mmol,63%收率)。
步骤4
Figure BDA0003676261880005182
在0℃在氮气下,向1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙醇(3.3g,13.86mmol,1当量)和异吲哚啉-1,3-二酮(2.45g,16.64mmol,1.2当量)在四氢呋喃(30mL)中的溶液中添加三苯基膦(4.36g,16.64mmol,1.2当量),然后滴加偶氮二羧酸二异丙酯(3.36g,16.64mmol,3.2mL,1.2当量)的四氢呋喃(5mL)溶液。将反应混合物在20℃下搅拌12小时。真空浓缩混合物。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=1∶0至5∶1)纯化残余物。得到呈浅黄色固体的2-[1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙基]异吲哚啉-1,3-二酮(2.8g,6.89mmol,49%收率)。
步骤5
Figure BDA0003676261880005191
向2-[1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙基]异吲哚啉-1,3-二酮(2g,5.45mmol,1当量)在乙醇(20mL)中的溶液中添加水合肼(1.36g,27.24mmol,1.3mL,5当量)。将反应混合物在80℃下搅拌2小时。向混合物中添加乙醇(30mL),过滤混合物,并真空浓缩滤液。将残余物直接用于下一步。得到呈浅黄色固体的1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙胺(1.2g,粗品)。
步骤6
Figure BDA0003676261880005192
向1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙胺(1.2g,5.06mmol,1当量)和碳酸氢钠(850mg,10.12mmol,2当量)在四氢呋喃(5mL)和水(5mL)中的溶液中添加二碳酸二叔丁酯(2.21g,10.12mmol,2.3mL,2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌2小时。向混合物中添加水(100mL),并用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(60mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=3∶1)纯化残余物。通过制备型高性能液体纯化粗产物(柱:Phenomenex Gemini C18 250*50mm*10um;流动相:[水(0.05%氢氧化氨v/v)-ACN];B%:40%-65%,22min)。得到呈浅黄色固体的N-[1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙基]氨基甲酸叔丁酯(1.4g,4.15mmol,82%收率)。
步骤7
Figure BDA0003676261880005201
在氮气下,向N-[1-(6-溴-3-吡啶基)-2,2-二氟-乙基]氨基甲酸叔丁酯(2g,5.93mmol,1当量)、4-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)噻唑(3.34g,14.83mmol,2.5当量)在二噁烷(50mL)和水(10mL)中的溶液中添加碳酸钾(2.05g,14.83mmol,2.5当量)和(1,1′-双(二苯基phosphino)二茂铁)二氯化钯(II)(434mg,0.59mmol,0.1当量)。将反应混合物在100℃下搅拌12小时。向混合物中添加水(150mL),并用乙酸乙酯(50mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(80mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过硅胶色谱法(石油醚∶乙酸乙酯=100∶1至1∶1)纯化残余物。然后通过制备型HPLC再次纯化残余物(柱:Phenomenex Synergi C18 150*30mm*4um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:35%-65%,10min)。得到呈浅黄色固体的N-[2,2-二氟-1-[6-(4-甲基噻唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(480mg,1.33mmol,22%收率)。
步骤8
Figure BDA0003676261880005211
通过制备型-SFC纯化N-[2,2-二氟-1-[6-(4-甲基噻唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(480mg,1.35mmol,1当量)(SFC柱:DAICEL CHIRALPAK AY 250×50mm,I.D.,10um;流动相:乙醇的CO2溶液,30%至30%;流速:60g/min;波长:220nm)。得到呈浅黄色固体的异构体1(暂时命名为N-[(1S)-2,2-二氟-1-[6-(4-甲基噻唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯;200mg,0.56mmol,82%收率)。得到呈浅黄色固体的异构体2(暂时命名为N-[(1R)-2,2-二氟-1-[6-(4-甲基噻唑-5-基)-3-吡啶基]乙基]氨基甲酸叔丁酯;210mg,0.59mmol,87%收率)。
步骤9
Figure BDA0003676261880005212
在0℃下,向2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(400mg,1.33mmol,1当量)和(2S,4R)-4-羟基吡咯烷-2-羧酸甲酯(241mg,1.33mmol,1当量,盐酸盐)在N,N-二甲基甲酰胺(5mL)中的溶液中添加N,N-二异丙基乙胺(686mg,5.31mmol,0.9mL,4当量)和O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N’,N’-四甲基脲鎓六氟磷酸酯(605mg,1.59mmol,1.2当量)。将反应混合物在20℃下搅拌1小时。向混合物中添加水(50mL),并用乙酸乙酯(20mL x3)萃取所得混合物。将合并的有机相用盐水(30mL x2)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。通过制备型HPLC(柱:Phenomenex Synergi C18 150*25*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:36%-66%,10min)纯化残余物。得到呈无色油状物的(2S,4R)-1-[2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-吡咯烷-2-羧酸甲酯(450mg,1.05mmol,78%收率)。
步骤10
Figure BDA0003676261880005221
通过制备SFC纯化混合物(SFC柱:DAICEL CHIRALPAK IC 250×30mm,内径,10um;流动相:甲醇(0.1%NH4OH)的CO2溶液,30%至30%;流速:50g/min;波长:220nm)。得到呈无色油状物的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-吡咯烷-2-羧酸甲酯(180mg,0.36mmol,69%收率)。得到呈无色油状物的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-吡咯烷-2-羧酸甲酯(220mg,0.51mmol,96%收率)。
根据以下方案使用类似于上述用于其他实施例的程序,将(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(2,2-二乙氧基乙氧基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-吡咯烷-2-羧酸甲酯转化为最终化合物。
Figure BDA0003676261880005231
使用类似的程序制备示例性化合物243。
示例性化合物246的示例性合成
Figure BDA0003676261880005232
步骤1
Figure BDA0003676261880005233
在50mL圆底烧瓶中置入(2R)-2-(4-溴苯基)-2-[[(叔丁氧基)羰基]氨基]乙酸(1g,3.029mmol,1当量)的DMF(15mL)溶液,向其中依次添加二异丙基乙胺(1.57g,12.115mmol,4当量)、N-甲基环丁胺盐酸盐(368mg,3.03mmol,1当量)和BOP(1.61g,3.63mmol,1.2当量)。将所得溶液在室温下搅拌2小时。然后,通过添加水(10mL)来淬灭该反应。用乙酸乙酯(4x30mL)萃取所得混合物,并将合并的有机层用盐水(2x10mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥并浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗脱的硅胶柱上。得到1.1g(91%)呈黄色固体的N-[(R)-(4-溴苯基)[环丁基(甲基)氨基甲酰基]甲基]氨基甲酸叔丁酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880005241
在氮气气氛下,在100mL圆底烧瓶中置入N-[(R)-(4-溴苯基)[环丁基(甲基)氨基甲酰基]甲基]氨基甲酸叔丁酯(1g,2.52mmol,1当量)、K2CO3(1.04g,7.55mmol,3当量)、4-甲基-5-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1,3-噻唑(850mg,3.78mmol,1.5当量)和Pd(dppf)Cl2(184mg,0.25mmol,0.1当量)的二噁烷(10mL)和H2O(2mL)溶液。将所得混合物于90℃和氮气气氛下在油浴中搅拌3小时。浓缩混合物,并将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/1)洗脱的硅胶柱上。得到480mg(46%)呈黄色固体的N-[(R)-[环丁基(甲基)氨基甲酰基][4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酸叔丁酯。
使用类似于上述其他实施例的程序,将N-[(R)-[环丁基(甲基)氨基甲酰基][4-(4-甲基-1,3-噻唑-5-基)苯基]甲基]氨基甲酸叔丁酯转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物245。
示例性化合物248的示例性合成
Figure BDA0003676261880005251
步骤1
Figure BDA0003676261880005252
在250mL圆底烧瓶中置入4-(三氟甲基)苯甲醛(3.0g,17.2mmol,1.0当量)、(S)-2-甲基丙烷-2-亚磺酰胺(4.2g,0.035mmol,2.0当量)和异丙氧基钛(14.9g,0.052mmol,3.0当量)在THF(50mL)中的溶液。将所得溶液在80℃下在油浴中搅拌16小时。然后通过添加200mL水淬灭反应,并用乙酸乙酯(100mL x3)萃取混合物。将合并的有机相用盐水洗涤,经硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到3.1g(65%)呈黄色油状物的(S)-2-甲基-N-[[4-(三氟甲基)苯基]亚甲基]丙烷-2-亚磺酰胺。
步骤2
Figure BDA0003676261880005253
在-48℃和氮气气氛下,在20分钟内向(S)-2-甲基-N-[[4-(三氟甲基)苯基]亚甲基]丙烷-2-亚磺酰胺(3.1g,11.2mmol,1.0当量)在DCM(20mL)中的溶液中滴加甲基氯化镁溶液(3.0M的乙醚溶液,5mL)。然后将所得混合物在室温下搅拌2小时。然后通过添加50mL饱和NH4Cl溶液将反应混合物淬灭,并用二氯甲烷(50mL x3)萃取。将合并的有机相用盐水洗涤,经硫酸钠干燥,并减压浓缩。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1∶1)洗脱的硅胶柱上。得到1.83g(56%)呈白色固体的(S)-2-甲基-N-[(1S)-1-[4-(三氟甲基)苯基]乙基]丙烷-2-亚磺酰胺。
步骤3
Figure BDA0003676261880005261
在100mL圆底烧瓶中置入(S)-2-甲基-N-[(1S)-1-[4-(三氟甲基)苯基]乙基]丙烷-2-亚磺酰胺(1.8g,6.2mmol,1.0当量)的甲醇(10mL)溶液。然后添加氯化氢水溶液(37%,5mL)。将所得溶液在室温下搅拌2小时,然后减压浓缩。得到970mg(82%)呈白色固体的(1S)-1-[4-(三氟甲基)苯基]乙-1-胺。
使用类似于上述其他实施例的程序,将(1S)-1-[4-(三氟甲基)苯基]乙-1-胺转化为最终化合物。
使用类似的程序制备示例性化合物247。
示例性化合物404的示例性合成
Figure BDA0003676261880005271
如以上方案所示,在酸性条件下使4-((1R,3R)-3-((4-溴吡啶-2-基)氧基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯脱保护,并使所得游离环胺与活化的异噁唑衍生物反应,形成3-甲基-2-(3-(((全氟丁基)磺酰基)氧基)异噁唑-5-基)丁酸甲酯作为偶联产物。产物中的吡啶基溴化物片段与3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯进行钯催化反应,然后使叔丁氧羰基(Boc)保护基裂解,得到游离胺,其在胺的存在下在DMSO中在加热下与4-溴-6-氯哒嗪-3-胺进行亲核偶联反应。哒嗪溴化物与(2-羟基苯基)硼酸的Suzuki偶联反应完成PTM结合部分的组装。酯水解,然后与(2S,4R)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺缩合,得到所需的最终产物,其为非对映异构体的混合物,通过超临界流体色谱法(SFC)分离。
示例性化合物411的示例性合成
Figure BDA0003676261880005281
如以上方案中所示,2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯与(1R,3R)-3-(苄氧基)环丁醇之间进行Mitsunobu反应,然后苄氧基裂解,得到2-(3-((1S,3S)-3-羟基环丁氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯。用三氟甲磺酸酐活化羟基,然后用包含WPTM5-WPTM3-WPTM2-WPTM1片段的环胺置换三氟甲磺酸酯,得到偶联产物,其包括连接基团L。酯水解,然后与(2S,4R)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺缩合,得到所需的最终产物。
示例性化合物428的示例性合成
Figure BDA0003676261880005291
如以上方案所示,将4-溴-6-氯哒嗪-3-胺转化为4-乙烯基衍生物,使其与4-((1R,3R)-3-((4-溴吡啶-2-基)氧基)环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯进行Heck偶联反应,生成偶联产物。然后在Suzuki条件下,使产物中的6-氯哒嗪部分与(2-羟苯基)硼酸反应,组装WPTM5-WPTM3片段。随后进行Boc脱保护,然后用(2S,4R)-4-羟基-1-((R)-3-甲基-2-(3-(2-氧代乙氧基)异噁唑-5-基)丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺还原胺化,得到所需的最终产物。
示例性化合物445的示例性合成
Figure BDA0003676261880005301
如以上方案所示,将4-(2-羟乙基)哌啶-1-羧酸叔丁酯中的羟基基团用对甲苯磺酰氯活化,并将所得甲苯磺酸酯用2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯进行亲核置换。使产物中的Boc-基团裂解,并使游离环胺与3-(羟甲基)环丁酮和三乙酰氧基硼氢化钠反应,形成2-(3-(2-(1-(3-(羟甲基)环丁基)哌啶-4-基)乙氧基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯。将羟基进行戴斯-马丁氧化,然后用螺-胺将所得醛还原胺化,得到偶联产物,该偶联产物将PTM结合部分和连接基团L结合。酯水解,然后与(2S,4R)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺缩合,得到所需的最终产物。
示例性化合物449-456的示例性合成
Figure BDA0003676261880005311
如以上方案中所示,第一偶联片段的组装以4-乙酰基哌啶-1-羧酸叔丁酯开始,其被还原为醇并转化为甲苯磺酸酯。用4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)-1H-吡唑置换甲苯磺酰基基团,并在Suzuki条件下将产物与4-溴-6-氯哒嗪-3-胺偶联,得到4-(1-(4-(3-氨基-6-(2-甲氧基甲氧基)苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙基)哌啶-1-羧酸叔丁酯的外消旋混合物,其通过使用手性超临界流体色谱法(SFC)分离。随后进行Boc脱保护,得到对映体纯状态的所需第一偶联片段。
第二偶联片段的形成以3-亚甲基环丁烷腈开始,后者水解为羧酸并被保护为苄基酯。内型双键进行硼氢化反应,然后氧化,得到醇的非对映体混合物,其通过使用超临界流体色谱法(SFC)分离。用戴斯-马丁过碘烷氧化各个醇,得到所需的异构醛。
用硼氢化钠还原胺化第一偶联片段和第二偶联片段,然后碱水解,得到(1R,3S)-3-((4-((S)-1-(4-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-1H-吡唑-1-基)乙基)哌啶-1-基)甲基)环丁烷羧酸,其与(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(3-(2-(哌啶-4-基)乙氧基)异噁唑-5-基)丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺进行缩合,得到所需产物。通过使用具有适当立体化学的试剂和中间体,该方法可方便地用于合成所需产物的所有对映体纯的异构体。
示例性化合物458的示例性合成
Figure BDA0003676261880005331
如以上方案所示,将4-甲酰基哌啶-1-甲酸叔丁酯在Boc脱保护后用(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(3-(哌嗪-1-基)异噁唑-5-基)丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺和氰基硼氢化钠进行还原胺化,得到(2S,4R)-4-羟基-1-((S)-3-甲基-2-(3-(4-(哌啶-4-基甲基)哌嗪-1-基)异噁唑-5-基)丁酰基)-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺。随后在类似条件下用(1R,3R)-3-((4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)环丁烷甲醛还原胺化所得化合物,得到所需的最终产物。
示例性化合物474的示例性合成
Figure BDA0003676261880005341
如以上方案所示,4-羟基吡啶和4-羟基哌啶-1-羧酸叔丁酯之间的Mitsunobu反应得到4-(吡啶-4-基氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯,通过用苄基溴将吡啶氮烷基化将其转化为盐。随后通过两步程序还原吡啶环以形成双哌啶衍生物,其与3-甲基-2-(3-(((全氟丁基)磺酰基)氧基)异噁唑-5-基)丁酸甲酯在杂芳族亲核取代条件下反应,形成偶联产物。酯水解,然后将所得酸与(2S,4R)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺缩合,得到非对映体最终产物,其通过超临界流体色谱法(SFC)分离。
示例性化合物494、495的示例性合成
Figure BDA0003676261880005351
如以上方案所示,PTM结合部分的合成以3-((4-甲氧基苄基)氧基)丙-1-醇开始,其用氢化钠处理以打开(S)-2-甲基环氧乙烷。将所得醇溴化,然后用衍生自2-(3-甲基异噁唑-5-基)乙酸甲酯的烯醇化物进行溴化物置换,得到(3R)-4-(3-羟基丙氧基)-3-甲基-2-(3-甲基异噁唑-5-基)丁酸甲酯。产物与4-溴吡啶-2-醇进行Mitsunobu反应,然后吡啶基溴化物部分与单-Boc-保护的3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷进行钯催化偶联,得到8-(2-(3-((2R)-4-甲氧基-2-甲基-3-(3-甲基异噁唑-5-基)-4-氧代丁氧基)丙氧基)吡啶-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-羧酸叔丁酯。随后Boc-基团裂解提供了游离胺,其通过在胺(DIEA)的存在下在质子惰性双极性溶剂(DMSO)中加热,与4-溴-6-氯哒嗪-3-胺进行亲核偶联反应。哒嗪溴化物与(2-羟基苯基)硼酸的Suzuki偶联反应完成PTM结合部分的组装。酯水解,然后与(2S,4R)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺缩合,得到所需的最终产物,其为非对映异构体的混合物,通过超临界流体色谱法(SFC)分离。
示例性化合物496、497的示例性合成
Figure BDA0003676261880005361
如以上方案所示,所需产物通过在氰基硼氢化钠的存在下用2-(6-氨基-5-(1-((R)-4-((1r,3R)-3-(哌啶-4-基氧基)环丁基)丁-3-炔-2-基)-1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-基)苯酚还原胺化(2S,4R)-1-((R)-2-(3-(4-甲酰基哌啶-1-基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基-N-((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)吡咯烷-2-甲酰胺而获得。通过使用具有适当立体化学的偶联对应物,该方法可方便地用于合成所需产物的所有对映体纯的异构体。
示例性化合物499的示例性合成
Figure BDA0003676261880005371
如以上方案所示,将4-(5-(1-((2S,4R)-4-羟基-2-(((S)-1-(4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基)乙基)氨基甲酰基)吡咯烷-1-基)-3-甲基-1-氧代丁-2-基)异噁唑-3-基)哌嗪-1-甲酸叔丁酯作为非对映体混合物分离为单独的异构体。然后,这些异构体中的每一种与(1R,3R)-3-((4-(3-(3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基)-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基)吡啶-2-基)氧基)环丁烷甲醛反应,得到对映体纯形式的所需最终产物。通过使用具有适当立体化学的偶联对应物,该方法可方便地用于合成所需产物的所有对映体纯的异构体。
示例性化合物143的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880005381
向2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯(265g,1.33mol)[如针对示例性化合物144所述制备]在MeCN(1.6L)的溶液中添加K2CO3(367.71g,2.66mol)和1,1,2,2,3,3,4,4,4-九氟丁烷-1-磺酰氟(482.25g,1.60mol,280.38mL)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。减压浓缩反应混合物,以去除MeCN。将残余物用水(1.5L)稀释并用乙酸乙酯(500mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤并经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到呈棕色油状物的3-甲基-2-(3-(((全氟丁基)磺酰基)氧基)异噁唑-5-基)丁酸甲酯(458g,886.42mmol)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005382
在25℃于氮气下,向3-甲基-2-(3-(((全氟丁基)磺酰基)氧基)异噁唑-5-基)丁酸甲酯(160g,332.44mmol)和4-(二甲氧基甲基)哌啶(79.40g,498.66mmol)在DMF(1.6L)的混合物中一次性添加DIEA(128.90g,997.32mmol,173.72mL)。将该混合物在80℃下搅拌12小时。将混合物冷却至25℃,并且倒入冰水(w∶w=1∶1)(3L)内且搅拌15分钟。用乙酸乙酯(1L×5)萃取水相。将合并的有机相用盐水(300mL×3)洗涤,用无水硫酸钠干燥,过滤且真空浓缩。将混合物溶解在EtOAc(70mL)中,过滤除去不溶物质。将残余物通过柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=80∶1至0∶1)纯化,得到(34g,100mmol)呈橙色浆状物的2-(3-(4-(二甲氧基甲基)哌啶-1-基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880005391
在氮气下,向2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(350mg,1.03mmol,1当量)在四氢呋喃(1mL)和甲醇(1mL)的混合物中一次性添加氢氧化锂(2M,1mL,1.95当量)。将混合物在25℃下搅拌1小时。用三氟乙酸将pH调节至5-6,并在45℃下减压浓缩。将混合物通过制备型HPLC(柱:Phenomenex Synergi C18 150*25*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:40%-70%,9min)纯化,得到呈黄色油状物的2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(190mg)。
步骤4
Figure BDA0003676261880005392
在0℃和氮气下,向2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(190mg,0.58mmol,1当量),N,N-二异丙基乙胺(225mg,1.75mmol,0.3mL,3当量)和(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(257mg,0.70mmol,1.2当量,盐酸盐)在N,N-二甲基甲酰胺(10mL)的混合物中一次性添加O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,N,N-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(288mg,0.76mmol,1.3当量)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将混合物倒入冰水(w/w=1/1)(30mL)内且搅拌15分钟。将水相用乙酸乙酯(30mL×3)萃取,合并的有机相用盐水洗涤(30mL×3),经硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(二氯甲烷∶甲醇=10∶1)纯化,得到呈黄色油状物的(2S,4R)-1-[2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(208mg)。
步骤5
Figure BDA0003676261880005401
将(2S,4R)-1-[2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(200mg,0.31mmol,1当量)通过SFC(柱:DAICEL CHIRALPAKAD(250mm*30mm,10um);流动相:[0.1%NH3H2O IPA];B%:45%-45%33.0min;65min)纯化。将混合物在45℃下减压浓缩。
获得呈黄色油状物的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(90mg)(在手性SFC中的保留时间:1.884min)。
获得呈黄色油状物的(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(90mg,0.13mmol,42%收率,94%纯度)(在手性SFC中的保留时间:2.230min)。
步骤6
Figure BDA0003676261880005411
向(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(80mg,0.13mmol,1当量)在四氢呋喃(2mL)的溶液中添加硫酸溶液(1M,2mL,16.00当量)。将反应混合物在50℃搅拌5小时。将混合物加入饱和碳酸氢钠(10mL),将混合物用乙酸乙酯(20mL×3)萃取。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤,经硫酸钠干燥,过滤,真空浓缩,并直接用于下一步。获得呈浅黄色固体的粗(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(4-甲酰基-1-哌啶基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(68mg)并且直接用于下一步。
步骤7
Figure BDA0003676261880005421
向2-[6-氨基-5-[8-[2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚二盐酸盐(2.08g,3.37mmol,1当量)在甲醇(40mL)的溶液中添加乙酸钠(829mg,10.11mmol,3当量),然后向混合物中添加(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(4-甲酰基-1-哌啶基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(2g,3.37mmol,1当量)和乙酸(23mg,0.33mmol,0.1当量)。将混合物在25℃搅拌0.5小时,然后向混合物中加入氰基硼氢化钠(1.06g,16.84mmol,5当量)。将混合物在25℃下搅拌2小时。减压浓缩反应混合物。将残余物通过制备型HPLC(柱:Phenomenex luna C18 250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%-40%,22min)纯化。获得呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[[4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]甲基]-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺甲酸酯(1196mg,1.02mmol)。
示例性化合物143的示例性合成
Figure BDA0003676261880005422
向2-(3-羟基异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯(265g,1.33mol)[如针对示例性化合物144所述制备]在MeCN(1.6L)的溶液中添加K2CO3(367.71g,2.66mol)和1,1,2,2,3,3,4,4,4-九氟丁烷-1-磺酰氟(482.25g,1.60mol,280.38mL)。将反应混合物在25℃下搅拌12小时。减压浓缩反应混合物,以去除MeCN。将残余物用水(1.5L)稀释并用乙酸乙酯(500mL x3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤并经Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到呈棕色油状物的3-甲基-2-(3-(((全氟丁基)磺酰基)氧基)异噁唑-5-基)丁酸甲酯(458g,886.42mmol)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005431
在25℃于氮气下,向3-甲基-2-(3-(((全氟丁基)磺酰基)氧基)异噁唑-5-基)丁酸甲酯(160g,332.44mmol)和4-(二甲氧基甲基)哌啶(79.40g,498.66mmol)在DMF(1.6L)的混合物中一次性添加DIEA(128.90g,997.32mmol,173.72mL)。将混合物在80℃搅拌12小时。将混合物冷却至25℃,并且倒入冰水(w∶w=1∶1)(3L)内且搅拌15分钟。用乙酸乙酯(1L×5)萃取水相。将合并的有机相用盐水(300mL×3)洗涤,用无水硫酸钠干燥,过滤且真空浓缩。将混合物溶解在EtOAc(70mL)中,过滤除去不溶物质。将残余物通过柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=80∶1至0∶1)纯化,得到(34g,100mmol)呈橙色浆状物的2-(3-(4-(二甲氧基甲基)哌啶-1-基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酸甲酯。
步骤3
Figure BDA0003676261880005441
向2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸甲酯(10g,29.38mmol,1当量)在MeOH(30mL)的溶液中添加LiOH水溶液(6M,30.00mL,6.13当量)和THF(30mL)。将混合物在25℃下搅拌1小时。将反应混合物的pH用1M HCl(200mL)调节,用水(200mL)稀释,然后用EtOAc(200mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(200mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩。获得呈黄色油状物的粗2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(9.5g,29.11mmol)。
步骤4
Figure BDA0003676261880005442
在0℃和氮气下,向(2S,4R)-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺盐酸盐(10.71g,29.11mmol,1当量),DIPEA(11.29g,87.32mmol,15.21mL,3当量)和2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酸(9.5g,29.11mmol,1当量)在DMF(100mL)的溶液中添加HATU(16.60g,43.66mmol,1.5当量)。将混合物升温至25℃且搅拌1小时。将反应混合物用水(300mL)稀释,用EtOAc(150mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(100mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,产生残余物。将残余物通过制备型HPLC(柱:Phenomenex luna C18 250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-MeCN];B%:30%-60%,15min)纯化。获得呈白色固体的(2S,4R)-1-[2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(18g,27.57mmol)。
步骤5
Figure BDA0003676261880005451
将(2S,4R)-1-[2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(5g,7.81mmol,1当量)通过制备型SFC分离两次(柱:DAICEL CHIRALPAK AD-H 250mm×30mm,I.D.,5um;流动相:异丙醇(0.1%NH3H2O)在CO2中,40%-40%;流速:70g/min;波长:220nm)和(柱:DAICEL CHIRALPAK AD250mm×30mm,I.D.,10um;流动相∶异丙醇(0.1%NH3H2O)在CO2中,40%-40%;流速:70g/min;波长:220nm)。
获得呈白色固体的化合物(2S,4R)-1-[(2S)-2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(2.5g,3.91mmol)。
获得呈白色固体的化合物(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(2.4g,3.68mmol)。
步骤6
Figure BDA0003676261880005461
向的溶液中(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-(二甲氧基甲基)-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(1.2g,1.88mmol,1当量)在THF(15mL)的溶液中添加H2SO4(1M,13.85mL,7.38当量)。将混合物在50℃下搅拌2小时。通过添加饱和NaHCO3水溶液(30mL)淬灭反应混合物,然后用水(30mL)稀释,用盐水(50mL×3)萃取。将合并的有机层用盐水(30mL)洗涤,经无水Na2SO4干燥,过滤并减压浓缩,得到残余物。获得呈白色固体的粗(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(4-甲酰基-1-哌啶基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(1.05g,1.77mmol)。
步骤7
Figure BDA0003676261880005471
向2-[6-氨基-5-[8-[2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]-4-吡啶基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-3-基]哒嗪-3-基]苯酚二盐酸盐(2.08g,3.37mmol,1当量)在甲醇(40mL)的溶液中添加乙酸钠(829mg,10.11mmol,3当量),然后向混合物中添加(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-(4-甲酰基-1-哌啶基)异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺(2g,3.37mmol,1当量)和乙酸(23mg,0.33mmol,0.1当量)。将混合物在25℃搅拌0.5h,然后向混合物中加入氰基硼氢化钠(1.06g,16.84mmol,5当量)。将混合物在25℃下搅拌2小时。减压浓缩反应混合物。将残余物通过制备型HPLC(柱:Phenomenex luna C18 250*50mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:10%-40%,22min)纯化。获得呈白色固体的(2S,4R)-1-[(2R)-2-[3-[4-[[4-[3-[[4-[3-[3-氨基-6-(2-羟苯基)哒嗪-4-基]-3,8-二氮杂双环[3.2.1]辛烷-8-基]-2-吡啶基]氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]甲基]-1-哌啶基]异噁唑-5-基]-3-甲基-丁酰基]-4-羟基-N-[(1S)-1-[4-(4-甲基噻唑-5-基)苯基]乙基]吡咯烷-2-甲酰胺甲酸酯(1196mg,1.02mmol)。
示例性化合物594的示例性合成
根据以下方案使用类似于以上其他实施例所述的那些程序制备。
Figure BDA0003676261880005472
Figure BDA0003676261880005481
可使用类似的程序制备示例性化合物596。
示例性化合物602的示例性合成
根据以下方案使用与针对示例性化合物143描述的那些类似的程序制备。
Figure BDA0003676261880005491
示例性化合物607的示例性合成
使用如针对示例性化合物143和示例性化合物178所述的程序制备。
示例性化合物610的示例性合成
根据以下方案使用类似于针对示例性化合物143和示例性化合物188以及以上其他实施例描述的那些的程序制备。
Figure BDA0003676261880005492
Figure BDA0003676261880005501
示例性化合物616的示例性合成
根据以下方案使用类似于以上实施例所述的那些程序制备。
Figure BDA0003676261880005502
Figure BDA0003676261880005511
示例性化合物618的示例性合成
根据以下方案使用针对示例性化合物610、示例性化合物143和以上其他实施例描述的程序制备。
Figure BDA0003676261880005521
示例性化合物626的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880005522
在0℃下,向用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL圆底烧瓶中置入4-[(1r,3r)-3-羟基环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(5g,18.43mmol,1.0当量),DMF(100mL),添加NaH(2.22g,55.42mmol,3.0当量,60%在油中)。在室温下反应15分钟。然后添加4-溴-2-氟吡啶(3.57g,20.27mmol,1.1当量)。将所得溶液在室温下搅拌4小时。然后通过添加100mL水/冰来淬灭反应。用(100mL x3)乙酸乙酯萃取所得溶液,合并有机层。用盐水(100mL×1)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/2)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。这产生6.3g(80%)呈黄色油状物的4-[(1r,3r)-3-[(4-溴吡啶-2-基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。
步骤2
Figure BDA0003676261880005531
向用氮气惰性气氛吹扫并保持的250mL圆底烧瓶中置入4-溴-6-氯哒嗪-3-胺(5g,24.0mmol,1.0当量),正丙醇(100mL),TEA(7.28g,72.0mmol,3当量),三氟乙烯基硼酸钾(2.39g,25.0mmol,1.05当量)和Pd(dppf)Cl2.CH2Cl2(1.96g,2.39mmol,0.10当量)。所得溶液在油浴中、在100℃下搅拌4小时。滤出固体。将残余物施加到使用乙酸乙酯/石油醚(1/1)的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。这产生2.3g(62%)呈黄色固体的6-氯-4-乙烯基1哒嗪-3-胺。
步骤3
Figure BDA0003676261880005532
在用氮气惰性气氛吹扫并保持的20mL密封管中置入6-氯-4-乙烯基1哒嗪-3-胺(910mg,5.84mmol,1.0当量)、DMF(14mL)、TEA(1775mg,17.5mmol,3.0当量)、4-[(1r,3r)-3-[(4-溴吡啶-2-基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(2.50g,5.849mmol,1.0当量)、三邻甲苯基膦(1780mg,5.85mmol,1.0当量)、Pd(OAc)2(131mg,0.585mmol,0.10当量)。所得溶液在油浴中、在130℃下搅拌16小时。然后通过添加30mL水来淬灭反应。用(20mL x3)乙酸乙酯萃取所得溶液,合并有机层。用盐水(20mL×3)洗涤所得混合物。将该混合物经无水硫酸钠干燥。将残余物施加到使用二氯甲烷/甲醇(10/1)洗脱的硅胶柱上。合并所收集的级分并真空浓缩。这产生呈棕色固体的625mg(21%)of 4-[(1r,3r)-3-([4-[(E)-2-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)乙烯基1]吡啶-2-基]氧基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯。
使用针对示例性化合物143和以上其它实施例描述的程序,将4-[(1r,3r)-3-([4-[(E)-2-(3-氨基-6-氯哒嗪-4-基)乙烯基1]吡啶-2-基]氧基)环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯转化成最终化合物。
Figure BDA0003676261880005541
示例性化合物630的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880005542
在25℃和氮气下,向4-氨基噻唑-5-羧酸甲酯(0.4g,2.53mmol,1当量)和三乙胺(512mg,5.06mmol,0.7mL,2当量)在二氯甲烷(30mL)的溶液中一次性添加二碳酸二叔丁酯(1.10g,5.06mmol,1.2mL,2当量)和4-二甲基氨基吡啶(62mg,0.50mmol,0.2当量)。将该混合物在25℃下搅拌16小时。将混合物在45℃下减压浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=20/1至8/1)纯化,得到呈黄色油状物的4-[双(叔-丁氧基羰基)氨基]噻唑-5-羧酸甲酯(850mg)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005551
在25℃下,向4-[双(叔-丁氧基羰基)氨基]噻唑-5-羧酸甲酯(850mg,2.37mmol,1当量)在乙醇(20mL)和四氢呋喃(10mL)的溶液中添加氢氧化钠的水溶液(1M,30mL),并将混合物在70℃下搅拌3小时。将反应混合物冷却至25℃,用2M盐酸将pH调节至4~5,用乙酸乙酯(30mL×3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(20mL×2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。获得呈白色固体的化合物4-(叔-丁氧基羰基氨基)噻唑-5-羧酸(620mg,粗品)。
步骤3
Figure BDA0003676261880005552
在30℃和氮气下,向4-(叔-丁氧基羰基氨基)噻唑-5-羧酸(600mg,2.46mmol,1当量)和磷酸钾(521mg,2.46mmol,1当量)在乙腈(30mL)的混合物中一次性添加四丁基三溴化铵(2.37g,4.91mmol,2当量)。将混合物在50℃下搅拌16h。将混合物冷却至20℃并倒入饱和硫代硫酸钠水溶液(20mL)和饱和碳酸钠水溶液(20mL)的混合物中。用乙酸乙酯(40mL×2)萃取水相。将合并的有机相用盐水(30mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶柱色谱法(石油醚/乙酸乙酯=30/1至8/1)纯化,得到呈黄色油状物的N-(5-溴噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(460mg)。
步骤4
Figure BDA0003676261880005561
在20℃和氮气下,向N-[(1R)-1-[4-(4,4,5,5-四甲基-1,3,2-二氧杂戊硼烷-2-基)苯基]乙基]氨基甲酸叔丁酯(572mg,1.65mmol,1当量)、碳酸钾(455mg,3.30mmol,2当量)和N-(5-溴噻唑-4-基)氨基甲酸叔丁酯(460mg,1.65mmol,1当量)在水(3mL)和二噁烷(18mL)的混合物中一次性添加[1,1′-双(二苯基膦基)二茂铁]二氯化钯](96mg,0.13mmol,0.08当量)。将混合物在90℃下搅拌2小时。将混合物冷却至20℃,并且倒入冰水(w/w=1/1,20mL)内且搅拌10min。用乙酸乙酯(30mL×3)萃取水相。将合并的有机相用盐水(10mLx2)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=30/1至5/1),得到呈黄色固体的N-[5-[4-[(1S)-1-(叔-丁氧基羰基氨基)乙基]苯基]噻唑-4-基]氨基甲酸叔丁酯(620mg,粗品)。
步骤5
Figure BDA0003676261880005571
将N-[5-[4-[(1S)-1-(叔-丁氧基羰基氨基)乙基]苯基]噻唑-4-基]氨基甲酸叔丁酯(620mg,1.48mmol,1当量)在盐酸/甲醇(4M,10mL)中的溶液在20℃下搅拌2h。在45℃下减压浓缩混合物。获得呈黄色固体的粗产物5-[4-[(1S)-1-氨基乙基]苯基]噻唑-4-胺盐酸盐(406mg,粗品)。
根据以下方案使用针对以上其他实施例描述的程序,将5-[4-[(1S)-1-氨基乙基]苯基]噻唑-4-胺转化为标题化合物。
Figure BDA0003676261880005572
示例性化合物638的示例性合成
根据以下方案使用类似于针对其他实施例(特别是针对示例性化合物238和示例性化合物607)描述的那些的程序制备。
Figure BDA0003676261880005573
Figure BDA0003676261880005581
示例性化合物640的示例性合成
根据以下方案使用针对示例性化合物203、示例性化合物143和以上其他实施例描述的程序制备。
Figure BDA0003676261880005582
示例性化合物642的示例性合成
根据以下方案使用针对示例性化合物143和以上其他实施例描述的程序制备。
Figure BDA0003676261880005591
示例性化合物664的示例性合成
根据以下方案使用类似于针对上述其他实施例所述的那些程序来制备中间体2-(6-氨基-5-(1-(1-(1-(((1s,3s)-3-(哌啶-4-基氧基)环丁基)甲基)哌啶-4-基)乙基)-1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-基)苯酚。
Figure BDA0003676261880005592
使用针对示例性化合物143和以上其它实施例描述的程序,将2-(6-氨基-5-(1-(1-(1-(((1s,3s)-3-(哌啶-4-基氧基)环丁基)甲基)哌啶-4-基)乙基)-1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-基)苯酚转化为标题化合物。
示例性化合物665的示例性合成
根据以下方案制备中间体2-(6-氨基-5-(1-(1-(1-((1s,3s)-3-(哌啶-4-基氧基)环丁基)哌啶-4-基)乙基)-1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-基)苯酚。
Figure BDA0003676261880005601
使用针对示例性化合物143和以上其它实施例描述的程序,将2-(6-氨基-5-(1-(1-(1-((1s,3s)-3-(哌啶-4-基氧基)环丁基)哌啶-4-基)乙基)-1H-吡唑-4-基)哒嗪-3-基)苯酚转化为标题化合物。
示例性化合物678的示例性合成
根据以下方案制备中间体(2S,4R)-N-((S)-1-(4-乙炔基苯基)乙基)-1-((R)-2-(3-(4-甲酰基哌啶-1-基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酰胺。
Figure BDA0003676261880005602
使用上述针对示例性化合物143所述的程序,将(2S,4R)-N-((S)-1-(4-乙炔基苯基)乙基)-1-((R)-2-(3-(4-甲酰基哌啶-1-基)异噁唑-5-基)-3-甲基丁酰基)-4-羟基吡咯烷-2-甲酰胺转化为标题化合物。
示例性化合物692的示例性合成
步骤1
Figure BDA0003676261880005611
将3-苄基氧基环丁醇(100g,561.08mmol,1当量)和4-氧代哌啶-1-羧酸苄酯(143.97g,617.19mmol,123.1mL,1.1当量)在乙腈(2000mL)中的混合物脱气并用氮气吹扫3次。然后在0℃下向混合物中添加氯(二甲基)硅烷(53.09g,561.08mmol,1当量)。在氮气氛下,将混合物在25℃下搅拌12小时。将反应将混合物用水(2L)稀释。将有机层用乙酸乙酯(1L×2)萃取。用盐水(500mL)洗涤合并有机层。将有机层经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩,得到残余物。通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=30/1至20/1)纯化残余物,得到产物。获得无色油状物的4-(3-苄基氧基环丁氧基)哌啶-1-羧酸苄酯(89g,225.04mmol)。
步骤2
Figure BDA0003676261880005612
在氮气气氛下,向4-(3-苄基氧基环丁氧基)哌啶-1-羧酸苄酯(65g,164.35mmol,1当量)在乙醇(300mL)和四氢呋喃(300mL)的溶液中添加活性炭载钯催化剂(6g,1.44mmol,10%纯度)、活性炭载氢氧化钯催化剂(6g,8.54mmol,20%纯度)和二碳酸二叔丁酯(53.80g,246.53mmol,56.6mL,1.5当量)。将悬浮液脱气并用氢气吹扫三次。将混合物在氢(50Psi)下在40℃下搅拌16小时。将反应混合物过滤并减压浓缩,得到残余物。将粗产物通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=50/1,0/1)纯化。获得呈白色固体的粗产物4-(3-羟基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(30.8g,113.5mmol)。
步骤3
Figure BDA0003676261880005621
将4-(3-羟基环丁氧基)哌啶-1-羧酸叔丁酯(5g,18.43mmol,1当量)、4-溴吡啶-2-醇(3.85g,22.11mmol,1.2当量)、三苯基膦(7.25g,27.64mmol,1.5当量)和偶氮二羧酸二异丙酯(5.59g,27.64mmol,5.4mL,1.5当量)在甲苯(40mL)中的混合物脱气,并用氮气吹扫3次,然后在氮气气氛下将混合物在110℃搅拌12小时。将反应混合物冷却至20℃,然后过滤并减压浓缩,得到残余物。将残余物通过硅胶色谱法(石油醚/乙酸乙酯=50/1至10/1)纯化,得到产物。获得呈浅黄色油状物的4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(7g,16.38mmol)。
步骤4
Figure BDA0003676261880005622
向的溶液中4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(4g,9.36mmol,1当量)在盐酸盐/甲醇(4M,25mL,10.68当量)中的溶液在25℃下搅拌10分钟。将反应溶液在真空下浓缩得到粗产物。将粗产物直接用于下一步,无需任何进一步纯化。获得呈浅黄色油状物的4-溴-2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]吡啶盐酸盐(3.2g,8.80mmol)。
步骤5
Figure BDA0003676261880005631
向4-溴-2-[3-(4-哌啶基氧基)环丁氧基]吡啶(3.2g,8.80mmol,1当量,盐酸盐)在N,N-二甲基甲酰胺(40mL)的溶液中添加三乙胺(5.34g,52.79mmol,7.4mL,6当量)和1-叔-丁氧基羰基哌啶-4-羧酸(2.42g,10.56mmol,1.2当量)。在添加之后,将混合物在20℃下搅拌2分钟。然后在0℃下向混合物中添加O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N,N,,N′,N′-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(4.01g,10.56mmol,1.2当量)at 0℃,然后在氮气氛下,将混合物在20℃下搅拌1小时。将反应混合物用水(40mL)稀释,并用乙酸乙酯(100mL×2)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(柱:Phenomenex luna c18250mm*100mm*10um;流动相:[水(0.225%FA)-ACN];B%:40%-70%,20min)纯化。获得呈白色固体的化合物4-[4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(4.5g,8.36mmol)。
步骤6
Figure BDA0003676261880005632
在-20℃下,向4-[4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]哌啶-1-羰基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(3.5g,6.50mmol,1当量)在四氢呋喃(70mL)的溶液中添加氯化锆(IV)(3.03g,13.0mmol,1.1mL,2当量),并将混合物在-20℃下搅拌1小时。然后在-10℃下将甲基溴化镁(3M,13mL,6当量)混合物中。将混合物在30℃下搅拌12小时。将反应混合物用饱和氯化铵溶液(100mL)稀释,并用乙酸乙酯(200mL×2)萃取。将合并的有机相用饱和盐水(100mL)洗涤,经无水硫酸钠干燥,过滤并真空浓缩。将残余物通过制备型HPLC(柱:Phenomenex SynergiMax-RP 250*50mm*10um;流动相:[水(0.1%TFA)-ACN];B%:25%-50%,20min)纯化。获得呈浅黄色油状物的化合物4-[1-[4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]-1-甲基-乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯(1g,1.81mmol,27%收率)。
根据以下方案使用类似于针对示例性化合物143、示例性化合物616和其他实施例所述的那些程序,将4-[1-[4-[3-[(4-溴-2-吡啶基)氧基]环丁氧基]-1-哌啶基]-1-甲基-乙基]哌啶-1-羧酸叔丁酯转化为标题化合物。
Figure BDA0003676261880005641
示例性化合物698的示例性合成
根据以下方案使用与针对示例性化合物638和示例性化合物640描述的那些类似的程序制备。
Figure BDA0003676261880005642
示例性化合物707的示例性合成
根据以下方案使用针对以上其他实施例描述的程序制备。
Figure BDA0003676261880005651
蛋白质水平控制
本说明书还提供了通过细胞控制蛋白质水平的方法。这基于使用如本文所述的化合物,已知所述化合物与特定靶蛋白相互作用,使得体内靶蛋白的降解将导致控制生物系统中蛋白质的量,优选地实现特定目标蛋白质治疗有益效果。
以下实施方案用于帮助描述本公开,但不应视为以任何方式限制本公开。
本公开的具体实施方案
本公开涵盖以下具体实施方案。如所指出的那些,以下这些实施方案可包括前述实施方案中所述的所有特征。当适用时,下述实施方案还可以包括在任何前述实施方案中包含或交替叙述的特征(例如,第八实施方案可以包括如所述的第一实施方案中所述的特征,和/或第二实施方案到第七实施方案中任一的特征)。
在某些实施方案中,本说明书提供了下述示例性SMARCA2(即,BRAHMA或BRM)PROTAC分子(表1A、表1B、表1C、表1D、表2A、表2B、表2C和表2D中的化合物1-765),包括其盐、前药、多晶型物、类似物、衍生物和氘代形式。在某些实施方案中,本说明书提供了具有以下化学结构的双官能化合物:PTM-L-ULM或其药学上可接受的盐、对映体、立体异构体、溶剂化物、多晶型物或前药,其中:ULM是结合希佩尔-林道E3泛素连接酶的小分子E3泛素连接酶结合部分;L是连接ULM和PTM的键或化学连接部分;PTM是包含具有由式I、II、III、IVa或IVb表示的化学结构的SMARCA2蛋白质靶向部分的小分子:
Figure BDA0003676261880005671
其中:
WPTM1是任选被取代的5-6元芳基环或杂芳基环(例如,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-6元芳基环或杂芳基环);
WPTM2是任选被取代的5-6元芳基环或杂芳基环(例如,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-6元芳基环或杂芳基环);
WPTM3不存在或是任选被取代的5-6元芳基环或杂芳基环(例如,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-6元芳基环或杂芳基环),或任选被取代的4-9环烷基或杂环基,任选被取代的桥联双环烷基和桥联双杂环基(例如被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的4-9环烷基或杂环基);
WPTM4是与WPTM2环稠合的任选被取代的5-7环烷基或杂环基(例如,被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-7环烷基或杂环基);
WPTM5不存在或是任选被取代的5-6元芳基环或杂芳基环(例如,被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的5-6元芳基环或杂芳基环);
WPTM6和WPTM7独立地是任选的4-7环烷基或杂环基(例如,各自独立地是被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基和氰基的取代基取代的4-7环烷基或杂环基),并且WPTM6和WPTM7的环稠合或经由螺环连接而连接;并且
Figure BDA0003676261880005681
是至接头、ULM基团、ULM’基团、VLM基团VLM’基团的附接点。在本文所述的实施方案的任何方面,PTM由式I表示:
Figure BDA0003676261880005682
或其药学上可接受的盐,其中:
WPTM1是任选被取代的苯基或吡啶基(例如,如本文所述被取代,诸如被羟基取代基取代,其具有或不具有如本文所述选择的另外的任选取代基的苯基);
WPTM2是任选被取代的6元杂芳基环(例如,如本文所述被取代,诸如被氨基取代的哒嗪);
WPTM3不存在或是任选被取代的5-6元杂芳基(例如,吡唑、吡咯、咪唑、噁唑、噁二唑或三唑)或任选被取代的4-9环烷基或杂环基环、任选被取代的桥联双环烷基和桥联双杂环基环。
在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM由下式表示:
Figure BDA0003676261880005691
或其药学上可接受的盐,其中:
WPTM3不存在或是任选被取代的5-6元杂芳基、任选被取代的4-9环烷基或杂环基环、任选被取代的桥联双环烷基和桥联双杂环基环;并且
WPTM5是任选被取代的5-6元杂芳基。
在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM由下式表示:
Figure BDA0003676261880005692
或其药学上可接受的盐,其中:
WPTM5是苯基或吡啶基。
在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM由下式表示:
Figure BDA0003676261880005701
或其药学上可接受的盐。
在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM由式III表示:
Figure BDA0003676261880005702
或其药学上可接受的盐,其中:
WPTM1是被羟基取代基取代的苯基,其具有或不具有另外的任选取代基;
WPTM2是被氨基取代的哒嗪;并且
WPTM6和WPTM7是螺环体系(例如,选自下列的螺环:
Figure BDA0003676261880005711
在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM由式IVa或IVb表示:
Figure BDA0003676261880005712
或其药学上可接受的盐,其中:
WPTM1是被羟基取代基取代的苯基,其具有或不具有如本文所述的另外的任选取代基;
WPTM2是被氨基取代的哒嗪;
WPTM5不存在、是吡唑环或吡啶环。
在本文所述的任何方面或实施方案中,PTM选自:
Figure BDA0003676261880005721
Figure BDA0003676261880005731
Figure BDA0003676261880005741
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM是由以下表示的化学结构:
Figure BDA0003676261880005742
其中:
W3选自任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基或
Figure BDA0003676261880005751
R9和R10独立地是氢、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基,或者R9、R10以及它们所附接的碳原子形成任选被取代的环烷基;
R11选自任选被取代的杂环基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、
Figure BDA0003676261880005752
Figure BDA0003676261880005753
R12选自H或任选被取代的烷基;
R13选自H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基;
R14a、R14b,各自独立地选自H、卤代烷基(例如,氟代烷基)、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
W5是任选被取代的苯基、任选被取代的萘基或任选被取代的5-10元杂芳基;
R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、NR27aR27b、OR27a、CONR27aR27b、NR27aCOR27b、SO2NR27aR27b、NR27aSO2R27b,任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基(例如,任选被取代的氟代烷基)、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基;
每个R16独立地选自卤代、CN、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、羟基或任选被取代的卤代烷氧基;
o是0、1、2、3或4;
R18独立地选自H、卤代、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头;
每个R26独立地选自H、任选被取代的烷基或NR27aR27b
每个R27a和R27b独立地是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基(e.g、任选被取代的3至5元环烷基),或者R27a和R27b与它们所附接的氮原子一起形成4至6元杂环基;并且
p是0、1、2、3或4,并且其中虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM′或两者与ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM具有选自以下的化学结构:
Figure BDA0003676261880005771
其中:
R1是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基;
R14a是H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基;
R15选自H、卤素、CN、OH、NO2、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基(例如任选被取代的氟代烷基)、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基;
X是C、CH2或C=O;
R3不存在或是任选被取代的5或6元杂芳基;并且
虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM’或两者与所述ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM包含根据以下化学结构的基团:
Figure BDA0003676261880005781
或其药学上可接受的盐,其中:
ULM-g的R1’是任选被取代的C1-C6烷基、任选被取代的-(CH2)nOH、任选被取代的-(CH2)nSH、任选被取代的(CH2)n-O-(C1-C6)烷基、任选被取代的(CH2)n-WCOCW-(C0-C6)烷基,其含有环氧化物部分WCOCW,其中每个W独立地是H或C1-C3烷基、任选被取代的-(CH2)nCOOH、任选被取代的-(CH2)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2)nNHC(O)-R″、任选被取代的-(CH2)nC(O)-N(R″)2、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-N(R″)2、-(CH2O)nH、任选被取代的-(CH2)nOC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2)nC(O)-O-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2O)nCOOH、任选被取代的-(OCH2)nO-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2O)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(OCH2)nNHC(O)-R″、任选被取代的-(CH2O)nC(O)-N(R″)2、-(CH2CH2O)nH、任选被取代的-(CH2CH2O)nCOOH、任选被取代的-(OCH2CH2)nO-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(CH2CH2O)nC(O)-(C1-C6烷基)、任选被取代的-(OCH2CH2)nNHC(O)-R″、任选被取代的-(CH2CH2O)nC(O)-N(R″)2、任选被取代的-SO2RS、任选被取代的S(O)RS、NO2、CN或卤素(F、Cl、Br、I,优选F或Cl);
ULM-g的每个R″独立地是H或可任选被一个或两个羟基或至多三个卤素基团(优选氟)取代的C1-C6烷基;
ULM-g的RS是C1-C6烷基、任选被取代的芳基、杂芳基或杂环基或-(CH2)mN(R″)2基团;
ULM-g的X和X’各自独立地是C=O、C=S、-S(O)、S(O)2,(优选地X和X’均为C=O);
ULM-g的R2’是任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v,(SO2)w烷基、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)wNR1NR2N基团、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-(C=O)vNR″(SO2)w-杂环基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基或任选被取代的-NR″-(CH2)n-(C=O)vNR″(SO2)w-杂环基、任选被取代的-XR2’-烷基;任选被取代的-XR2’-芳基;任选被取代的-XR2’-杂芳基;任选被取代的-XR2’-杂环基;
ULM-g的R3’是任选被取代的烷基、任选被取代的-(CH2)n-(O)u(NR″)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-C(O)(R″)2、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂环基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-NR″-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基、任选被取代的-NR1-(CH2)n-C(O)u(NR″)v(SO2)w-杂环基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-烷基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-NR1NR2N、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-NR″C(O)R1N、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-芳基、任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂芳基或任选被取代的-O-(CH2)n-(C=O)u(NR″)v(SO2)w-杂环基;-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-烷基、任选被取代的-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-芳基、任选被取代的-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-(V)n’-(CH2)n-(V)n’-杂环基’基团、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-烷基、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-芳基、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-杂芳基、任选被取代的-(CH2)n-N(R1’)(C=O)m’-(V)n’-杂环基、任选被取代的-XR3’-烷基;任选被取代的-XR3’-芳基;任选被取代的-XR3’-杂芳基;任选被取代的-XR3’-杂环基;
ULM-g的R1N和R2N各自独立地是H、任选被一个或两个羟基和至多三个卤素基团取代的C1-C6烷基或任选被取代的-(CH2)n-芳基、-(CH2)n-杂芳基或-(CH2)n-杂环基;
ULM-g的V是O、S或NR1
ULM-g的每个R1’独立地是H或C1-C3烷基;
ULM-g的XR2’和XR3’各自独立地任选被取代的-CH2)n-、-CH2)n-CH(Xv)=CH(Xv)-(顺式或反式)、-CH2)n-CH≡CH-、-(CH2CH2O)n-或C3-C6环烷基,其中Xv是H、卤代或任选被取代的C1-C3烷基;
ULM-g的每个m独立地是0、1、2、3、4、5、6;
ULM-g的每个m′独立地是0或1;
ULM-g的每个n独立地是0、1、2、3、4、5、6;
ULM-g的每个n′独立地是0或1;
ULM-g的每个u独立地是0或1;
ULM-g的每个v独立地是0或1;
ULM-g的每个w独立地是0或1;并且
当PTM不是ULM’时,ULM-g的R1’、R2’、R3’、X和X’中的任何一个或多个被任选地修饰为通过接头基团共价结合至PTM基团,或当PTM是ULM’时,ULM和ULM’中每一者的R1’、R2’、R3’、X和X’中的任何一个或多个被任选地修饰为直接或通过其接头基团彼此共价结合。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM具有式:
Figure BDA0003676261880005811
或其药学上可接受的盐,其中:
R1是H、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基;
R3是任选被取代的5-6元杂芳基;
W5是任选被取代的苯基、任选被取代的萘基或任选被取代的吡啶基;
R14a和R14b中的一者是H、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
R15是CN、任选被取代的氟代烷基、
Figure BDA0003676261880005821
Figure BDA0003676261880005822
任选被取代的
Figure BDA0003676261880005823
(例如
Figure BDA0003676261880005824
其中R28a是卤代、任选被取代的烷基或氟代烷基)或
Figure BDA0003676261880005825
每个R16独立地选自卤代、CN、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、羟基或卤代烷氧基;
每个R26独立地是H、任选被取代的烷基或NR27aR27b
每个R27a和R27b独立地是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基(例如,任选被取代的3至5元环烷基),或者R27a和R27b与它们所附接的氮原子一起形成4至6元杂环基;
R28是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的羟烷基、胺、任选被取代的炔基或任选被取代的环烷基;并且
o是0、1或2。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM具有式:
Figure BDA0003676261880005831
其中;
X4、X5和X6各自选自CH和N,其中不超过2者是N;
R1是C1-6烷基;
R14a和R14b中的一者是H、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一个是H;或者R14a和R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮丙啶;
每个R27a和R27b独立地是H或C1-6烷基或环烷基(例如,3至5元环烷基);
q是1、2、3或4;
R15
Figure BDA0003676261880005832
或CN;
R28是H、甲基、CH2N(Me)2、CH2OH、CH2O(C1-4烷基)、CH2NHC(O)C1-4烷基、NH2
Figure BDA0003676261880005833
R28C是H、甲基、氟或氯;并且
R16是H、C1-4烷基、氟、氯、CN或C1-4烷氧基。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b选自:H、C1-4烷基、C1-4环烷基、C1-4卤代烷基、C1-4羟烷基、C1-4烷氧基烷基、C1-4烷基-NR27aR27b和CONR27aR27b
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的至少一个是H(例如,R14a和R14b都是H)。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的至少一个是任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26。可替代地,在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的至少一个是任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一个是H。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b与它们所附接的碳原子一起形成
Figure BDA0003676261880005841
其中R23选自H、C1-4烷基、-C(O)C1-4烷基。在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM具有式:
Figure BDA0003676261880005851
或其药学上可接受的盐,其中ULM-q和ULM-r的R1、R3、R14a、R14b和R15如本文所述;并且X是CH或N。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R1是C1-6烷基。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的一者是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、任选被取代的C1-4烷基胺、C1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基-C3-C7杂环烷基、(CH2)qOH、(CH2)qNR27aR27b、(CH2)qNHCOC1-6烷基、C3-6环烷基或NR27aR27b;每个R26独立地是H、C1-6烷基或NR27aR27b;每个R27a和R27b独立地是H或C1-6烷基;并且q是1、2、3或4。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R14a和R14b中的一者是H、C1-4烷基、C1-4卤代烷基、C1-4烷氧基、任选被取代的C1-4烷基胺、(CH2)qC1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基-C3-C7杂环烷基、(CH2)qOH、(CH2)qNR27aR27b、(CH2)qNHCOC1-6烷基、C3-6环烷基或NR27aR27b;每个R26独立地是H、C1-4烷基或NR27aR27b;每个R27a和R27b独立地是H或C1-4烷基;并且q是1或2。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R28是C1-6烷基、C3-6环烷基、C1-6卤代烷基、(CH2)qOC1-6烷基、(CH2)qOH、(CH2)qNR27aR27b、(CH2)qNHCOC1-6烷基或
Figure BDA0003676261880005852
R29是H、C1-6烷基、NR27aR27bqNHCOC1-6烷基;并且
其中q是1或2。
在本文所述的任何方面或实施方案中,R3是异噁唑基、4-氯异噁唑基、4-氟异噁唑基或吡唑基。在本文所述的任何方面或实施方案中,X是CH。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM根据下式:
Figure BDA0003676261880005861
或其药学上可接受的盐,
其中:
R1、R14a和R14b如本文所述;
X是CH或N;
R30是H、F或Cl;
R16是H、C1-4烷基、氟、氯、CN或C1-4烷氧基;并且
R28是H、甲基、CH2N(Me)2、CH2OH、CH2O(C1-4烷基)、CH2NHC(O)C1-4烷基、NH2
Figure BDA0003676261880005862
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM根据下式:
Figure BDA0003676261880005871
或其药学上可接受的盐,其中R1、R14a和R14b如本文所述;并且R30是H、F或Cl。
在本文所述的任何方面或实施方案中,ULM是如表1A、表1B、表1C、表1D、表2A、表2B、表2C或表2D中提供的ULM。
在本文所述的任何方面或实施方案中,所述化合物包括如本文所述的接头(L)。
在本文所述的任何方面或实施方案中,接头(L)是包含1至10个乙二醇单元的任选被芳基或苯基取代的聚乙烯氧基基团。
在本文所述的任何方面或实施方案中,所述化合物选自表1A、表1B、表1C、表1D、表2A、表2B、表2C和表2D的化合物(例如,选自化合物1-765)。
在本文所述的任何方面或实施方案中,所述化合物的Dmax大于或等于80%。
在另一方面,本说明书提供了一种组合物,其包含有效量的如本文所述的双官能化合物和药学上可接受的载体。
在本文所述的任何方面或实施方案中,如本文所述的组合物还包含权利要求1-32中任一项的另外的生物活性剂或另一种双官能化合物中的至少一种。
在本文所述的任何方面或实施方案中,所述另外的生物活性剂是抗癌剂。
在本文所述的任何方面或实施方案中,如本文所述的组合物包含药学上可接受的载体和有效量的如本文所述的至少一种化合物,该组合物用于治疗受试者的疾病或病症,方法包括将该组合物施用于有此需要的受试者,其中所述化合物能够有效治疗或改善所述疾病或病症的至少一种症状。
在本文所述的任何方面或实施方案中,所述疾病或病症与SMARCA1、BRAHMA或BRM的累积和聚集相关。在本文所述的任何方面或实施方案中,所述疾病或病症是癌症。在本文所述的任何方面或实施方案中,所述癌症是SWI/SNF相关癌症或具有SMARCA4突变的癌症(例如,肺癌或非小细胞肺癌)。在本文所述的任何方面或实施方案中,所述癌症是SMARCA4缺陷性癌症或SMARCA4表达相对于正常SMARCA4表达降低(例如,相对于具有野生型SMARCA4的类似位置的非癌细胞中的非突变SMARCA4或SMARCA4的表达)的癌症,诸如肺癌或非小细胞肺癌。
实施例
测定和降解数据
SW1573细胞中BRM降解的Western印记筛选
为了评估BRM降解(Dmax和DC50),将细胞以8000/孔接种于96孔黑色/透明底板中,每孔180·L DMEM生长培养基(含有1%Pen-Strep、1%HEPES和10%FBS)。将板孵育过夜以允许粘附。第二天早上,通过向适当的孔中添加20·L 10X目标化合物浓度(1%DMSO)来处理细胞,然后将其放回培养箱过夜(18-20小时)。DMSO的最终浓度为0.1%。
为了裂解,将所粘附的细胞用100·L DPBS洗涤一次。将细胞在冰上40·L 1XRIPA+HALT蛋白酶抑制剂中裂解10分钟,然后冷冻直至在-80·C使用。解冻的裂解物通过在1.2·m滤板中过滤来清洁,或者在4·C下以2300g旋转清洁30分钟。
对于印迹,对于每个Western样品,将30·L裂解物添加到10·L 4X LDS样品缓冲液中,然后在热循环仪中于95·C变性5分钟并置于冰上。将样品上样于4%-15%Tris/甘氨酸凝胶上,并在1X Tris/甘氨酸缓冲液中以250恒压运行25分钟,其中对于每个印迹,上样4·L梯和12·L每个样品。使用Turbo/midi默认程序,使用BioRad Turbo干转移单元将蛋白质从凝胶转移到NC。将所有印迹用ddH2O冲洗,并在室温下在含5%BSA的TBST(0.1%)中在振荡器上封闭1小时。将印迹暴露于TBST 5%BSA(0.1%)中的一抗,在振荡器上于4·C过夜(对于BRM,1∶1000(Cell Signaling Tech.目录号11966)并且对于α-微管蛋白1∶2000(CellSignaling Tech.目录号3873),对照蛋白。在室温下用TBST(0.1%)洗涤印迹三次,每次5分钟。加入二抗,将印迹在室温振荡器上与1∶18,000的抗兔-HRP和/或抗鼠-HRP在5%TBSTBSA(0.1%)中孵育1小时。在室温下在振荡器上用TBST(0.1%)洗涤印迹三次,每次5分钟。使用FemtoMaximum Sensitivity底物将Signal显影4分钟,并在ChemiDoc.上读取印迹。
SW1573细胞中BRM降解的细胞内Western筛选
为了评估BRM降解(Dmax和DC50),将细胞以8000/孔接种于96孔黑色/透明底板中,每孔180·L DMEM生长培养基(含有1%Pen-Strep、1%HEPES和10%FBS)。将板孵育过夜以允许粘附。第二天早上,通过向适当的孔中添加20·L 10X化合物(1%DMSO)来处理细胞,然后将其放回培养箱过夜(18-20小时)。DMSO的最终浓度为0.1%。
为了进行处理,将板从培养箱中取出,除去培养基,然后立即向所有孔中添加200μL冷(4·C)DPBS添加。然后除去DPBS,并向所有孔中添加50μL4%多聚甲醛(PFA)的DPBS(4·C)溶液,并将板在室温下温育20分钟。然后除去PFA,并向所有孔中添加200μL含0.5%Triton X-100的TBS-T,并将板在室温下温育30分钟。然后除去含有0.5%Triton X-100的TBS-T,添加50μL Li-Cor封闭溶液,并将板在室温下温育至少一小时。除去封闭溶液,并添加50μL含一抗混合物的Li-Cor封闭溶液(对于BRM(Cell Signaling Tech,目录号11966)为1∶1000,并且对于α-微管蛋白(Sigma,目录号T6074)(一种对照蛋白)为1∶2000)。然后将板置于冷室中直至第二天。
第二天,将板用TBS-T洗涤三次,每孔200·L。将五十(50)·L第二抗体混合物的LI-COR封闭溶液(抗兔_800nm和抗小鼠680nm)添加到所有孔中(按1∶5000稀释)。将板在室温下温育至少一小时,同时避光。将板用TBS-T洗涤两次,每孔200·L。
为了读取每个板,除去TBS-T,并将每个板倒扣在纸巾上轻拍。在LI-COR Odyssey上读取板,两个通道的默认强度设置为5.0。使用Image StudioLite的单元内Western特征分析LI-COR图像。
以下化合物在上述条件下测试时证明了靶蛋白质降解:
表1A.本公开的示例性双官能降解化合物
Figure BDA0003676261880005901
Figure BDA0003676261880005911
Figure BDA0003676261880005921
Figure BDA0003676261880005931
Figure BDA0003676261880005941
Figure BDA0003676261880005951
Figure BDA0003676261880005961
Figure BDA0003676261880005971
Figure BDA0003676261880005981
Figure BDA0003676261880005991
Figure BDA0003676261880006001
Figure BDA0003676261880006011
Figure BDA0003676261880006021
Figure BDA0003676261880006031
Figure BDA0003676261880006041
Figure BDA0003676261880006051
Figure BDA0003676261880006061
Figure BDA0003676261880006071
Figure BDA0003676261880006081
Figure BDA0003676261880006091
Figure BDA0003676261880006101
Figure BDA0003676261880006111
Figure BDA0003676261880006121
Figure BDA0003676261880006131
Figure BDA0003676261880006141
Figure BDA0003676261880006151
Figure BDA0003676261880006161
Figure BDA0003676261880006171
Figure BDA0003676261880006181
表1B.本公开的示例性双官能降解化合物
Figure BDA0003676261880006182
Figure BDA0003676261880006191
Figure BDA0003676261880006201
Figure BDA0003676261880006211
Figure BDA0003676261880006221
Figure BDA0003676261880006231
Figure BDA0003676261880006241
Figure BDA0003676261880006251
Figure BDA0003676261880006261
Figure BDA0003676261880006271
Figure BDA0003676261880006281
Figure BDA0003676261880006291
Figure BDA0003676261880006301
Figure BDA0003676261880006311
Figure BDA0003676261880006321
Figure BDA0003676261880006331
Figure BDA0003676261880006341
Figure BDA0003676261880006351
Figure BDA0003676261880006361
Figure BDA0003676261880006371
Figure BDA0003676261880006381
Figure BDA0003676261880006391
Figure BDA0003676261880006401
Figure BDA0003676261880006411
Figure BDA0003676261880006421
Figure BDA0003676261880006431
Figure BDA0003676261880006441
Figure BDA0003676261880006451
Figure BDA0003676261880006461
Figure BDA0003676261880006471
Figure BDA0003676261880006481
Figure BDA0003676261880006491
Figure BDA0003676261880006501
Figure BDA0003676261880006511
Figure BDA0003676261880006521
Figure BDA0003676261880006531
表1C.本公开的示例性双官能降解化合物
Figure BDA0003676261880006532
Figure BDA0003676261880006541
Figure BDA0003676261880006551
Figure BDA0003676261880006561
Figure BDA0003676261880006571
Figure BDA0003676261880006581
Figure BDA0003676261880006591
Figure BDA0003676261880006601
Figure BDA0003676261880006611
Figure BDA0003676261880006621
Figure BDA0003676261880006631
Figure BDA0003676261880006641
Figure BDA0003676261880006651
Figure BDA0003676261880006661
Figure BDA0003676261880006671
Figure BDA0003676261880006681
Figure BDA0003676261880006691
Figure BDA0003676261880006701
Figure BDA0003676261880006711
Figure BDA0003676261880006721
Figure BDA0003676261880006731
Figure BDA0003676261880006741
Figure BDA0003676261880006751
Figure BDA0003676261880006761
Figure BDA0003676261880006771
Figure BDA0003676261880006781
Figure BDA0003676261880006791
Figure BDA0003676261880006801
Figure BDA0003676261880006811
Figure BDA0003676261880006821
Figure BDA0003676261880006831
Figure BDA0003676261880006841
Figure BDA0003676261880006851
Figure BDA0003676261880006861
Figure BDA0003676261880006871
Figure BDA0003676261880006881
Figure BDA0003676261880006891
Figure BDA0003676261880006901
Figure BDA0003676261880006911
Figure BDA0003676261880006921
Figure BDA0003676261880006931
Figure BDA0003676261880006941
Figure BDA0003676261880006951
Figure BDA0003676261880006961
表1D.本公开的示例性双官能降解化合物
Figure BDA0003676261880006971
Figure BDA0003676261880006981
Figure BDA0003676261880006991
Figure BDA0003676261880007001
Figure BDA0003676261880007011
Figure BDA0003676261880007021
Figure BDA0003676261880007031
Figure BDA0003676261880007041
Figure BDA0003676261880007051
Figure BDA0003676261880007061
Figure BDA0003676261880007071
Figure BDA0003676261880007081
Figure BDA0003676261880007091
Figure BDA0003676261880007101
Figure BDA0003676261880007111
Figure BDA0003676261880007121
Figure BDA0003676261880007131
Figure BDA0003676261880007141
Figure BDA0003676261880007151
Figure BDA0003676261880007161
Figure BDA0003676261880007171
Figure BDA0003676261880007181
Figure BDA0003676261880007191
Figure BDA0003676261880007201
Figure BDA0003676261880007211
Figure BDA0003676261880007221
Figure BDA0003676261880007231
Figure BDA0003676261880007241
Figure BDA0003676261880007251
Figure BDA0003676261880007261
Figure BDA0003676261880007271
Figure BDA0003676261880007281
Figure BDA0003676261880007291
Figure BDA0003676261880007301
Figure BDA0003676261880007311
Figure BDA0003676261880007321
Figure BDA0003676261880007331
Figure BDA0003676261880007341
Figure BDA0003676261880007351
Figure BDA0003676261880007361
&1立体化学标志指示在标记的原子中相同的相对构型(如所的),但存在等量的相反立体异构体(在标记的原子处相反的绝对构型)。
表2A.通过表1A的示例性双官能降解化合物的靶蛋白降解
Figure BDA0003676261880007362
Figure BDA0003676261880007371
Figure BDA0003676261880007381
Figure BDA0003676261880007391
Figure BDA0003676261880007401
Figure BDA0003676261880007411
Figure BDA0003676261880007421
Figure BDA0003676261880007431
Figure BDA0003676261880007441
Figure BDA0003676261880007451
Figure BDA0003676261880007461
Figure BDA0003676261880007471
Figure BDA0003676261880007481
Figure BDA0003676261880007491
Figure BDA0003676261880007501
Figure BDA0003676261880007511
Figure BDA0003676261880007521
Figure BDA0003676261880007531
Figure BDA0003676261880007533
当在0.3至10·M的最高浓度下测试时
*DC50(nM)
A<2.5
2.5≤B<10
10≤C<30
D≥30
**Dmax(降解%)
A>75
50<B≤75
C≤50
表2B.通过表1B的示例性双官能降解化合物的靶蛋白降解
Figure BDA0003676261880007532
Figure BDA0003676261880007541
Figure BDA0003676261880007551
Figure BDA0003676261880007561
Figure BDA0003676261880007571
Figure BDA0003676261880007581
Figure BDA0003676261880007591
Figure BDA0003676261880007601
Figure BDA0003676261880007611
Figure BDA0003676261880007621
Figure BDA0003676261880007631
Figure BDA0003676261880007641
Figure BDA0003676261880007651
Figure BDA0003676261880007661
Figure BDA0003676261880007671
Figure BDA0003676261880007681
Figure BDA0003676261880007691
Figure BDA0003676261880007701
Figure BDA0003676261880007711
Figure BDA0003676261880007721
Figure BDA0003676261880007731
Figure BDA0003676261880007733
当在0.3至10·M的最高浓度下测试时
*DC50(nM)
A<2.5
2.5≤B<10
10≤C<30
D≥30
NA未计算/未曲线拟合
**Dmax(降解%)
A>75
50<B≤75
C≤50
NA未计算/未曲线拟合
表2C.通过表1C的示例性双官能降解化合物的靶蛋白降解
Figure BDA0003676261880007732
Figure BDA0003676261880007741
Figure BDA0003676261880007751
Figure BDA0003676261880007761
Figure BDA0003676261880007771
Figure BDA0003676261880007781
Figure BDA0003676261880007791
Figure BDA0003676261880007801
Figure BDA0003676261880007811
Figure BDA0003676261880007821
Figure BDA0003676261880007831
Figure BDA0003676261880007841
Figure BDA0003676261880007851
Figure BDA0003676261880007861
Figure BDA0003676261880007871
Figure BDA0003676261880007881
Figure BDA0003676261880007891
Figure BDA0003676261880007901
Figure BDA0003676261880007911
Figure BDA0003676261880007921
Figure BDA0003676261880007931
Figure BDA0003676261880007941
Figure BDA0003676261880007951
Figure BDA0003676261880007961
Figure BDA0003676261880007971
Figure BDA0003676261880007981
Figure BDA0003676261880007991
Figure BDA0003676261880008001
Figure BDA0003676261880008011
Figure BDA0003676261880008021
Figure BDA0003676261880008031
Figure BDA0003676261880008041
Figure BDA0003676261880008051
Figure BDA0003676261880008061
Figure BDA0003676261880008071
Figure BDA0003676261880008081
Figure BDA0003676261880008091
Figure BDA0003676261880008101
Figure BDA0003676261880008111
Figure BDA0003676261880008121
Figure BDA0003676261880008131
Figure BDA0003676261880008141
Figure BDA0003676261880008151
Figure BDA0003676261880008161
Figure BDA0003676261880008171
Figure BDA0003676261880008181
Figure BDA0003676261880008191
Figure BDA0003676261880008201
Figure BDA0003676261880008211
Figure BDA0003676261880008221
Figure BDA0003676261880008231
Figure BDA0003676261880008241
Figure BDA0003676261880008251
Figure BDA0003676261880008261
Figure BDA0003676261880008271
Figure BDA0003676261880008281
Figure BDA0003676261880008291
Figure BDA0003676261880008301
Figure BDA0003676261880008311
Figure BDA0003676261880008321
Figure BDA0003676261880008331
Figure BDA0003676261880008341
Figure BDA0003676261880008351
Figure BDA0003676261880008361
Figure BDA0003676261880008371
Figure BDA0003676261880008381
Figure BDA0003676261880008391
Figure BDA0003676261880008401
Figure BDA0003676261880008411
Figure BDA0003676261880008421
Figure BDA0003676261880008431
Figure BDA0003676261880008441
Figure BDA0003676261880008451
Figure BDA0003676261880008461
Figure BDA0003676261880008471
Figure BDA0003676261880008481
Figure BDA0003676261880008491
Figure BDA0003676261880008501
Figure BDA0003676261880008511
Figure BDA0003676261880008521
Figure BDA0003676261880008531
Figure BDA0003676261880008541
Figure BDA0003676261880008551
Figure BDA0003676261880008561
Figure BDA0003676261880008571
Figure BDA0003676261880008581
Figure BDA0003676261880008591
Figure BDA0003676261880008592
当在0.3至10μM的最高浓度下测试时
*DC50(nM)
A<2.5
2.5≤B<10
10≤C<30
D≥30
NA未计算/未曲线拟合
**Dmax(降解%)
A>75
50<B≤75
C≤50
NA未计算/未曲线拟合
表2D.通过表1D的示例性双官能降解化合物的靶蛋白降解
Figure BDA0003676261880008601
Figure BDA0003676261880008611
Figure BDA0003676261880008621
Figure BDA0003676261880008631
Figure BDA0003676261880008641
Figure BDA0003676261880008651
Figure BDA0003676261880008661
Figure BDA0003676261880008671
Figure BDA0003676261880008681
Figure BDA0003676261880008691
Figure BDA0003676261880008701
Figure BDA0003676261880008711
Figure BDA0003676261880008721
Figure BDA0003676261880008731
Figure BDA0003676261880008741
Figure BDA0003676261880008751
Figure BDA0003676261880008761
Figure BDA0003676261880008771
Figure BDA0003676261880008781
Figure BDA0003676261880008791
Figure BDA0003676261880008801
Figure BDA0003676261880008811
Figure BDA0003676261880008821
Figure BDA0003676261880008831
Figure BDA0003676261880008841
Figure BDA0003676261880008851
Figure BDA0003676261880008861
Figure BDA0003676261880008871
Figure BDA0003676261880008881
Figure BDA0003676261880008891
Figure BDA0003676261880008901
*DC50(nM)
A<2.5
2.5≤B<10
10≤C<30
D≥30
NA未计算/未曲线拟合
**Dmax(降解%)
A>75
50<B≤75
C≤50
NA未计算/未曲线拟合
描述了通过PROTAC技术含有SMARCA2、BRAHMA或BRM蛋白质募集部分和E3连接酶募集部分的新型双官能分子。本公开的双官能分子主动降解SMARCA2,导致强大的细胞增殖抑制和凋亡诱导。PROTAC介导的蛋白质降解为通过传统方法靶向“无成药性”病理蛋白质提供了有效策略。
本申请中通篇引用的所有参考文献、专利、待决专利申请和已公布专利的内容以引用方式明确并入本文。
本领域技术人员将认识到或只使用常规实验便能够确定本文所述的本公开的具体实施方案的许多等同物。此类等效物旨在被所附权利要求书涵盖。应当理解,本文所述的详细实施例和实施方案仅为了举例说明目的而给出,且决不视为对本公开的限制。根据其的各种修改或变化将被所属领域的技术人员考虑到,并且包含在本申请的实质和范围内且被视为在所附权利要求书的范围内。例如,可以改变成分的相对数量以优化所期望的效应,可以添加其他成分,且/或可以用类似成分取代一种或多种所述成分。与本公开的系统、方法和工艺相关的其他有利特点和功能从所附权利要求书将显而易见。此外,所属领域的技术人员仅使用常规实验就认识到或能够确定本文所述的本公开的特定实施方案的许多等效物。此类等效物旨在被所附权利要求书涵盖。

Claims (28)

1.一种具有以下化学结构的双官能化合物:
PTM―L―ULM,
或其药学上可接受的盐、对映体、立体异构体、溶剂化物、多晶型物或前药,
其中:
所述ULM是结合希佩尔-林道E3泛素连接酶的小分子E3泛素连接酶结合部分;
所述L是连接所述ULM和所述PTM的化学连接部分;并且
所述PTM是包含SMARCA2蛋白靶向部分的小分子,所述SMARCA2蛋白靶向部分具有由式IVb或VII表示的化学结构:
Figure FDA0003676261870000011
其中:
WPTM1是任选被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、磷酸根、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的5-6元芳基或杂芳基环;
WPTM2是任选被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的56元芳基或杂芳基环;
WPTM3不存在或是任选被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的3-9元芳基或杂芳基环,任选被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的3-9元环烷基或杂环基,或是任选被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的桥联双环烷基或桥联双杂环基;
WPTM4是任选被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、磷酸根、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的3-7元环烷基或杂环基;
LPTM是C1-C6烷基,其任选被C1-C4烷基或C1-C3烷氧基取代;
RPTM1和RPTM2各自为卤代、HO、C1-C3烷基、C1-C3卤代醇或C1-C3烷氧基;并且
Figure FDA0003676261870000021
是与所述接头或ULM基团的附接点。
2.根据权利要求1所述的化合物,其中所述PTM具有式(VII)的化学结构,其中:
WPTM1是任选被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、磷酸根、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的5-6元芳基或杂芳基环;
WPTM2是任选被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的56元芳基或杂芳基环;
WPTM3是任选被0、1、2或3个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的4-7元芳基或杂芳基环,或是任选被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的桥联双环烷基或桥联双杂环基;
WPTM4是任选被0、1或2个选自羟基、卤素、烷氧基、烷基、卤代烷基、氨基、磷酸根、烷基氨基、氰基或它们的组合的取代基取代的5-7元环烷基或杂环基;
LPTM是C1-C6烷基,其任选被C1-C2烷基或C1-C2烷氧基取代。
3.根据权利要求1或2所述的化合物,其中所述PTM选自:
Figure FDA0003676261870000022
Figure FDA0003676261870000031
4.根据权利要求1至3中任一项所述的化合物,其中ULM是由以下表示的化学结构:
Figure FDA0003676261870000032
其中:
W3选自任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基或
Figure FDA0003676261870000033
R9和R10独立地是氢、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基,或者R9、R10以及它们所附接的碳原子形成任选被取代的环烷基;
R11选自任选被取代的杂环基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、
Figure FDA0003676261870000041
Figure FDA0003676261870000042
R12选自H或任选被取代的烷基;
R13选自H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基羰基、任选被取代的(环烷基)烷基羰基、任选被取代的芳烷基羰基、任选被取代的芳基羰基、任选被取代的(杂环基)羰基或任选被取代的芳烷基;
R14a、R14b,各自独立地选自H、胺、卤代烷基、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的酰胺、任选被取代的烷基-酰胺、任选被取代的烷基-氰基、任选被取代的烷基-磷酸根、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、烷基-COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26,并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
W5是任选被取代的苯基、任选被取代的萘基或任选被取代的5-10元杂芳基;
R15选自H、卤素、CN、C·CH、OH、NO2、NR27aR27b、OR27a、CONR27aR27b、NR27aCOR27b、SO2NR27aR27b、NR27aSO2R27b,任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的芳基、任选被取代的杂芳基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基;
每个R16独立地选自卤代、CN、任选被取代的烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的卤代烷基、羟基或任选被取代的卤代烷氧基;
o是0、1、2、3或4;
R18独立地选自H、卤代、任选被取代的烷氧基、氰基、任选被取代的烷基、卤代烷基、卤代烷氧基或接头;
每个R26独立地选自H、OH、任选被取代的烷基或NR27aR27b
每个R27a和R27b独立地是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基,或者R27a和R27b与它们所附接的氮原子一起形成4-6元杂环基;并且
p是0、1、2、3或4,并且其中虚线指示至少一个PTM的附接位点或将至少一个PTM偶联至ULM的化学接头部分。
5.根据权利要求4所述的化合物,其中所述ULM具有选自以下的化学结构:
Figure FDA0003676261870000051
其中:
R1是H、任选被取代的烷基、任选被取代的环烷基、任选被取代的羟烷基、任选被取代的杂芳基或卤代烷基;
R14a是H、卤代烷基、任选被取代的烷基、甲基、氟甲基、羟甲基、乙基、异丙基或环丙基;
R15选自H、卤素、CN、C·CH,OH,NO2,、任选被取代的杂芳基、任选被取代的芳基、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的卤代烷氧基、任选被取代的环烷基或任选被取代的杂环基;
X是C、CH2或C=O;
R3不存在或是任选被取代的5或6元杂芳基;并且
虚线指示至少一个PTM、另一个ULM(ULM’)或者将至少一个PTM或ULM’或两者与所述ULM偶联的化学接头部分的附接位点。
6.根据权利要求5所述的化合物,其中所述ULM具有式:
Figure FDA0003676261870000061
或其药学上可接受的盐,其中:
R1是H、任选被取代的烷基或任选被取代的环烷基;
R3是任选被取代的5-6元杂芳基;
W5是任选被取代的苯基、任选被取代的萘基或任选被取代的吡啶基;
R14a和R14b中的一者是H、任选被取代的烷基、卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的酰胺、任选被取代的烷基-酰胺、任选被取代的烷基-氰基、任选被取代的烷基-磷酸根、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、烷基-COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a、R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
R15是CN、C·CH、氟代烷基、
Figure FDA0003676261870000062
Figure FDA0003676261870000063
或任选被取代的
Figure FDA0003676261870000064
(例如
Figure FDA0003676261870000065
其中R28a是卤代、任选被取代的烷基或氟代烷基);
每个R16独立地选自卤代、CN、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、羟基或卤代烷氧基;
每个R26独立地是H、OH、任选被取代的烷基或NR27aR27b
每个R27a和R27b独立地是H、任选被取代的烷基、任选被取代的3至5元环烷基,或者R27a和R27b与它们所连接的氮原子一起形成4至6元杂环基;
R28是H、任选被取代的烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的羟烷基、胺、任选被取代的炔基或任选被取代的环烷基;并且
o是0、1或2。
7.根据权利要求6所述的化合物,其中所述ULM具有式:
Figure FDA0003676261870000071
其中:
o是0、1或2;
X4、X5和X6各自选自CH和N,其中不超过2者是N;
R1是C1-6烷基;
R14a和R14b中的一者是H、任选被取代的烷基、任选被取代的卤代烷基、任选被取代的烷氧基、任选被取代的羟基烷基、任选被取代的烷基胺、任选被取代的酰胺、任选被取代的烷基-酰胺、任选被取代的烷基-氰基、任选被取代的烷基-磷酸根、任选被取代的杂烷基、任选被取代的烷基-杂环烷基、任选被取代的烷氧基-杂环烷基、COR26、CONR27aR27b、NHCOR26或NHCH3COR26;并且R14a和R14b中的另一者是H;或者R14a和R14b与它们所附接的碳原子一起形成任选被取代的3至5元环烷基、杂环烷基、螺环烷基或螺杂环基,其中所述螺杂环基不是环氧化物或氮杂环丙烷;
R26各自独立地是H、C1-6烷基或NR27aR27b
每个R27a和R27b各自独立地是H或C1-6烷基或3-5元环烷基;
R15
Figure FDA0003676261870000072
或CN;
R28是H、甲基、CH2N(Me)2、CH2OH、CH2O(C1-4烷基)、CH2NHC(O)C1-4烷基、NH2
Figure FDA0003676261870000073
R28C是H、甲基、氟或氯;并且
R16是H、C1-4烷基、氟、氯、CN或C1-4烷氧基。
8.根据权利要求7所述的化合物,其中满足以下中的至少一种情况:
R14a和R14b中的一者选自:H、C1-4烷基、C1-4环烷基、C1-4卤代烷基、C1-4羟基烷基、C1-4烷氧基烷基、C1-4烷基-NR27aR27b和CONR27aR27b;并且
R14a和R14b中的一者是H。
9.根据权利要求8所述的化合物,其中R14a和R14b与它们所附接的碳原子一起形成
Figure FDA0003676261870000081
其中R23选自H、C1-4烷基、-C(O)C1-4烷基。
10.根据权利要求7所述的化合物,其中所述ULM具有式:
Figure FDA0003676261870000082
或其药学上可接受的盐,其中:
X是CH或N;并且
满足以下中的至少一种情况:R14a和R14b中的一者是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、任选被取代的C1-4烷基胺、C1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基-C3-7杂环烷基、(CH2)qOH、(CH2)qNR27aR27b、(CH2)qNHCOC1-6烷基、C3-6环烷基,或者NR27aR27b;并且R14a和R14b中的一者是H。
11.根据权利要求10所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其中R1是C1-6烷基。
12.根据权利要求1至10中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其中:
满足以下中的至少一种情况:R14a和R14b中的一者是H、C1-6烷基、C1-6卤代烷基、任选被取代的C1-4烷基胺、C1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基-C3-7杂环烷基、(CH2)qOH、(CH2)qNR27aR27b、(CH2)qNHCOC1-6烷基、C3-6环烷基,或者NR27aR27b;并且R14a和R14b中的一者是H;
R26各自独立地是H、C1-6烷基或NR27aR27b
R27a和R27b各自独立地是H或C1-6烷基;并且
q是1、2、3或4。
13.根据权利要求1至10中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其中:
满足以下中的至少一种情况:R14a和R14b中的一者是H、C1-4烷基、C1-4卤代烷基、C1-4烷氧基、任选被取代的1-4烷基胺、(CH2)qC1-6烷氧基、(CH2)qC1-6烷氧基-C3-7杂环烷基、(CH2)qOH、(CH2)qNR27aR27b、(CH2)qNHCOC1-6烷基、C3-6环烷基、或NR27aR27b;并且R14a和R14b中的一者是H;
R26各自独立地是H、C1-4烷基或NR27aR27b
R27a和R27b各自独立地是H或C1-4烷基;并且
q是1或2。
14.根据权利要求1至13中任一项所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其中:
R28是C1-6烷基、C3-6环烷基、C1-6卤代烷基、(CH2)qOC1-6烷基、(CH2)qOH、(CH2)qNR27aR27b、(CH2)qNHCOC1-6烷基或
Figure FDA0003676261870000091
R29是H、C1-6烷基、NR27aR27bqNHCOC1-6烷基;并且
q是1或2。
15.根据权利要求7所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其中R3是异噁唑基、4-氯异噁唑基、4-氟异噁唑基或吡唑基。
16.根据权利要求15所述的化合物,或其药学上可接受的盐,其中X是CH。
17.根据权利要求16所述的化合物,其中所述ULM具有下式:
Figure FDA0003676261870000101
Figure FDA0003676261870000102
或其药学上可接受的盐,
其中:
X是CH或N;
R30是H、F或Cl;
R16是H、C1-4烷基、氟、氯、CN或C1-4烷氧基;并且
R28是H、甲基、CH2N(Me)2、CH2OH、CH2O(C1-4烷基)、CH2NHC(O)C1-4烷基、NH2
Figure FDA0003676261870000103
18.根据权利要求10或17所述的化合物,其中所述ULM具有下式:
Figure FDA0003676261870000111
或其药学上可接受的盐,其中R30是H、F或Cl。
19.如权利要求1至18中任一项所述的化合物,其中所述接头(L)包含由下式表示的化学结构单元:
-(AL)q-,
其中:
(AL)q是连接到ULM、PTM或两者中的至少一个的基团;
q是大于或等于1的整数;
每个AL独立地选自键、CRL1RL2、O、S、SO、SO2、NRL3、SO2NRL3、SONRL3、CONRL3、NRL3CONRL4、NRL3SO2NRL4、CO、CRL1=CRL2、C≡C、SiRL1RL2、P(O)RL1、P(O)ORL1、NRL3C(=NCN)NRL4、NRL3C(=NCN)、NRL3C(=CNO2)NRL4、任选被1-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11环烷基、任选被1-6个RL1和/或RL2基团取代的C3-11杂环基、任选被1-6个RL1和/或RL2基团取代的芳基,以及任选被1-6个RL1和/或RL2基团取代的杂芳基,其中RL1或RL2各自独立地任选连接至其他基团而形成任选被1-4个RL5基团取代的环烷基和/或杂环基部分;并且
RL1、RL2、RL3、RL4和RL5各自独立地是卤代、C1-8烷基、OC1-8烷基、SC1-8烷基、NHC1-8烷基、N(C1-8烷基)2、C3-11环烷基、芳基、杂芳基、C3-11杂环基、OC3-8环烷基、SC3-8环烷基、NHC3-8环烷基、N(C3-8环烷基)2、N(C3-8环烷基)(C1-8烷基)、OH、NH2、SH、SO2C1-8烷基、P(O)(OC1-8烷基)(C1-8烷基)、P(O)(OC1-8烷基)2、CC-C1-8烷基、CCH、CH=CH(C1-8烷基)、C(C1-8烷基)=CH(C1-8烷基)C(C1-8烷基)=C(C1-8烷基)2、Si(OH)3、Si(C1-8烷基)3、Si(OH)(C1-8烷基)2、COC1-8烷基、CO2H、卤素、CN、CF3、CHF2、CH2F、NO2、SF5、SO2NHC1-8烷基、SO2N(C1-8烷基)2、SONHC1-8烷基、SON(C1-8烷基)2、CONHC1-8烷基、CON(C1-8烷基)2、N(C1-8烷基)CONH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)CON(C1-8烷基)2、NHCONH(C1-8烷基)、NHCON(C1-8烷基)2、NHCONH2、N(C1-8烷基)SO2NH(C1-8烷基)、N(C1-8烷基)SO2N(C1-8烷基)2、NHSO2NH(C1-8烷基)、NHSO2N(C1-8烷基)2、或NHSO2NH2
20.根据权利要求1至19中任一项所述的化合物;
(a)接头(L)包含以下化学结构:
Figure FDA0003676261870000121
其中:
WL1和WL2各自独立地是具有0-4个杂原子的4-8元环,任选地被RQ取代,每个RQ独立地是H、卤代、OH、CN、CF3、任选被取代的直链或支链C1-C6烷基、任选被取代的直链或支链C1-C6烷氧基,或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环系;
YL1各自独立地是键,任选被取代的直链或支链C1-C6烷基,并且任选地一个或多个C原子替换为O;或任选被取代的直链或支链C1-C6烷氧基;
n是0-10;并且
Figure FDA0003676261870000122
线指示与所述PTM或所述ULM部分的附接点;或
(b)接头(L)包含以下化学结构:
Figure FDA0003676261870000123
其中:
WL1和WL2各自独立地是芳基、杂芳基、环基、杂环基、C1-6烷基、双环基、联芳基、联杂芳基或联杂环基,各自任选被RQ取代,每个RQ独立地是H、卤代、NH2、NRY1RY2、OH、CN、CF3、羟基、硝基、C≡CH、C2-6烯基、C2-6炔基、任选被取代的直链或支链C1-C6烷基、任选被取代的直链或支链C1-C6烷氧基、任选地被1个或多个–F取代的OC1-3烷基,或者两个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-4个杂原子的4-8元环系;
YL1各自独立地是键、NRYL1;O;S;NRYL2;CRYL1RYL2;C=O;C=S;SO;SO2;任选被取代的直链或支链C1-C6烷基,并且任选地一个或多个C原子被替换为O;或任选被取代的直链或支链C1-C6烷氧基;
QL是具有0-4个杂原子的3-6元脂环或芳环,任选桥连,任选被0-6个RQ取代,每个RQ独立地是:H;任选被1个或多个卤代或C1-6烷氧基取代的直链或支链C1-6烷基;或者2个RQ基团与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环系;
RYL1和RYL2各自独立地是:H;OH;任选被1个或多个卤代或C1-6烷氧基取代的直链或支链C1-6烷基;或者R1、R2与它们所附接的原子一起形成含有0-2个杂原子的3-8元环系;
n是0-10;并且
Figure FDA0003676261870000131
线指示与所述PTM或所述ULM部分的附接点。
21.根据权利要求1至19中任一项所述的化合物,其中所述接头(L)包含由选自以下的结构表示的基团:
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O(CH2)t-、
-O-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O-、
-(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O(CH2)t-、
-CH=CH(CH2)m-O(CH2)n-O(CH2)o-O(CH2)p-O(CH2)q-O(CH2)r-O(CH2)s-O(CH2)t-
-O(CH2)nNCH3C(=O)(CH2)m-;
Figure FDA0003676261870000132
Figure FDA0003676261870000141
Figure FDA0003676261870000151
Figure FDA0003676261870000161
Figure FDA0003676261870000171
Figure FDA0003676261870000181
Figure FDA0003676261870000182
其中m、n、o、p、q、r、s和t各自独立地选自整数0、1、2、3和4。
22.根据权利要求1至19中任一项所述的化合物,其中所述接头(L)选自:
Figure FDA0003676261870000183
Figure FDA0003676261870000191
Figure FDA0003676261870000201
Figure FDA0003676261870000211
Figure FDA0003676261870000221
Figure FDA0003676261870000231
Figure FDA0003676261870000241
Figure FDA0003676261870000251
Figure FDA0003676261870000261
23.一种化合物,其选自表1D的化合物。
24.根据权利要求23所述的化合物,其中所述化合物的Dmax大于或等于80%。
25.一种组合物,其包含有效量的如权利要求1至24中任一项所述的双官能化合物、药学上可接受的载体和抗癌剂。
26.一种包含药学上可接受的载体和有效量的至少一种如权利要求1至24中任一项所述的化合物的组合物,所述组合物用于治疗受试者中的疾病或病症,所述方法包括将所述组合物施用于有需要的受试者,其中所述化合物有效治疗或改善所述疾病或病症的至少一种症状,其中所述疾病或病症与SMARCA1、BRAHMA或BRM的累积和聚集相关。
27.根据权利要求26所述的组合物,其中所述疾病或病症是癌症。
28.根据权利要求27所述的组合物,其中满足以下中的至少一种情况:
所述癌症是SWI/SNF相关癌症或具有SMARCA4突变的癌症(例如,肺癌或非小细胞肺癌);并且
所述癌症是SMARCA4缺陷性癌症或SMARCA4表达相对于正常SMARCA4表达降低(例如,相对于具有野生型SMARCA4的类似位置的非癌细胞中的非突变SMARCA4或SMARCA4的所述表达)的癌症,诸如肺癌或非小细胞肺癌。
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