CN114667923B - 大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用 - Google Patents
大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN114667923B CN114667923B CN202210332186.5A CN202210332186A CN114667923B CN 114667923 B CN114667923 B CN 114667923B CN 202210332186 A CN202210332186 A CN 202210332186A CN 114667923 B CN114667923 B CN 114667923B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- chinese cabbage
- dna
- tumv
- artificial sequence
- background
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 235000010149 Brassica rapa subsp chinensis Nutrition 0.000 title claims abstract description 60
- 235000000536 Brassica rapa subsp pekinensis Nutrition 0.000 title claims abstract description 60
- 241000499436 Brassica rapa subsp. pekinensis Species 0.000 title claims abstract description 60
- 241000723838 Turnip mosaic virus Species 0.000 title claims abstract description 49
- 238000010276 construction Methods 0.000 title abstract description 11
- 241000196324 Embryophyta Species 0.000 claims abstract description 45
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims abstract description 37
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims abstract description 24
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims abstract description 24
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 23
- 238000012216 screening Methods 0.000 claims abstract description 19
- 210000000349 chromosome Anatomy 0.000 claims abstract description 6
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims abstract description 5
- 239000000463 material Substances 0.000 claims description 30
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 26
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 8
- 230000000306 recurrent effect Effects 0.000 claims description 8
- 241000700605 Viruses Species 0.000 claims description 7
- 238000011160 research Methods 0.000 claims description 7
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 claims description 6
- 238000009395 breeding Methods 0.000 abstract description 13
- 230000001488 breeding effect Effects 0.000 abstract description 13
- 235000013311 vegetables Nutrition 0.000 abstract description 2
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 108
- 239000003147 molecular marker Substances 0.000 description 8
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 3
- 241000724252 Cucumber mosaic virus Species 0.000 description 2
- 241000723873 Tobacco mosaic virus Species 0.000 description 2
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 2
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 2
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 2
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 description 2
- 238000010187 selection method Methods 0.000 description 2
- 108700028369 Alleles Proteins 0.000 description 1
- 235000011331 Brassica Nutrition 0.000 description 1
- 241000219198 Brassica Species 0.000 description 1
- 240000007124 Brassica oleracea Species 0.000 description 1
- 235000003899 Brassica oleracea var acephala Nutrition 0.000 description 1
- 235000011301 Brassica oleracea var capitata Nutrition 0.000 description 1
- 235000001169 Brassica oleracea var oleracea Nutrition 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 208000035240 Disease Resistance Diseases 0.000 description 1
- 241000756137 Hemerocallis Species 0.000 description 1
- 208000005652 acute fatty liver of pregnancy Diseases 0.000 description 1
- 230000009418 agronomic effect Effects 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004873 anchoring Methods 0.000 description 1
- 230000000840 anti-viral effect Effects 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 101150075158 crb gene Proteins 0.000 description 1
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 1
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 1
- 230000002349 favourable effect Effects 0.000 description 1
- 238000012268 genome sequencing Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 1
- 230000024121 nodulation Effects 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 210000004940 nucleus Anatomy 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 230000008121 plant development Effects 0.000 description 1
- 231100000241 scar Toxicity 0.000 description 1
- 238000005204 segregation Methods 0.000 description 1
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 238000012546 transfer Methods 0.000 description 1
- 238000011426 transformation method Methods 0.000 description 1
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 description 1
- 238000012070 whole genome sequencing analysis Methods 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6888—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
- C12Q1/6895—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
- A01H1/00—Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
- A01H1/02—Methods or apparatus for hybridisation; Artificial pollination ; Fertility
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
- A01H—NEW PLANTS OR NON-TRANSGENIC PROCESSES FOR OBTAINING THEM; PLANT REPRODUCTION BY TISSUE CULTURE TECHNIQUES
- A01H1/00—Processes for modifying genotypes ; Plants characterised by associated natural traits
- A01H1/04—Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection
- A01H1/045—Processes of selection involving genotypic or phenotypic markers; Methods of using phenotypic markers for selection using molecular markers
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/18—Testing for antimicrobial activity of a material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/13—Plant traits
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Botany (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Environmental Sciences (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Mycology (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明涉及蔬菜遗传学技术领域,为了解决现有技术中没有大白菜抗TuMV近等基因系的问题,本发明提出大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用,包括以大白菜TuMV抗病材料和感病材料为亲本,杂交构建F1代;对BC2群体进行前景选择,同时从白菜基因组上挑选均匀分布在10条染色体上的若干个标记,选择在两亲本中有多态性的N个标记作为背景标记,用于背景选择;再对BC3群体进行前景和背景选择,筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的几株,自交构建BC3F2群体;利用前景选择标记筛选在两标记位点均扩增为纯合抗病条带的单株,再对这些单株进行背景选择,利用杂合位点标记进行背景检测。本发明选育近等基因系,具有快速、准确的优点。
Description
技术领域
本发明属于蔬菜遗传学技术领域,具体涉及大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用。
背景技术
公开该背景技术部分的信息仅仅旨在增加对本发明的总体背景的理解,而不必然被视为承认或以任何形式暗示该信息构成已经成为本领域一般技术人员所公知的现有技术。
病毒病是危害我国大白菜生产的重要病害。我国大白菜病毒病主要是由三种病毒单独或复合浸染所致,即芜菁花叶病毒病(Turnip mosaic virus, 简称TuMV)、黄瓜花叶病毒病(Cucumber mosaic virus,简称CMV)和烟草花叶病毒病(Tobacco mosaic virus,简称TMV)。其中,TuMV是主要病原。因此,建立高效大白菜TuMV抗性基因转育和鉴定技术体系,对大白菜种质创新和抗病育种具有重要意义。
‘冠291’是珍贵的大白菜育种材料,广义配合力好、杂交优势强、制种纯度高,利用它先后育成了鲁白一号、山东四号、山东六号、鲁白六号和丰抗70等多个在全国各地大面积推广的优良品种,其中有些品种目前仍在大面积种植。但是,该材料易感病毒病,使其应用受到了很大的限制。因此,通过遗传改良,提高抗病毒病能力,是‘冠291’继续在大白菜育种中发挥核心种质作用的必然选择。常规的改良方法是将‘冠291’与抗源材料进行杂交,然后在自交分离后代中筛选抗病毒病材料。这种方法不仅周期长、效率低,而且由于基因间的互作以及外界环境条件等因素的影响选择准确性差,入选单株无论生物学性状还是遗产背景均与“冠291”存在较大差异,有无真正的利用价值需重新评估。分子标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS),可在植物发育的任何时期从DNA分子水平上进行,具有快速、准确且不受环境条件的限制等优点。以抗源材料为供体亲本,‘冠291’为轮回亲本,借助分子标记逐代筛选抗TuMV且遗传背景最接近‘冠291’的个体,能大大提高选择效率。因此,开展该研究对迅速获得抗TuMV的‘冠291’近等基因系,继续发挥其在大白菜育种中的核心种质作用具有重要意义。
分子标记辅助选择是在DNA标记基础上的育种策略,利用与目标性状紧密连锁的DNA标记对研究对象进行选择,包括对目标基因跟踪的前景选择(foreground selection)和对非目标基因的遗传背景选择(background selection)。前景选择是标记辅助选择的主要方面,可靠性取决于标记与目标基因间连锁的紧密程度。若只用一个标记对目标基因进行选择,则标记与目标基因间的连锁必须非常紧密,而利用位于目标基因两侧的标记,更容易获得较高的准确率。根据扩增产物的带型差异,用于前景选择的标记有显性和共显性之分。显性标记只能区分目标性状的有无,而共显性标记则能判别性状的杂合与否,因而具有更高的应用价值。本研究室前期的研究,以‘8407’(抗TuMV,开黄花)和‘冠291’(感TuMV,开白花)为亲本,利用其BC1(F1ב冠291’)代分离群体157个单株,采用BSA法,将大白菜TuMV抗性基因TuRBCS01定位在两个共显性标记BrID10723(1.3cM)和mBr4055(0.6cM)之间,为开展大白菜抗TuMV前景选择提供了可靠的标记支持。
背景选择是利用覆盖全基因组的分子标记对分离群体的单株进行全基因组扫描,构建每个单株在所有标记位点上图示基因型,利用数学统计方法,选择尽量多的标记位点上与优良受体亲本同型且纯合的单株。进行背景选择离不开遗传图谱,在过去二十年的时间里,白菜类遗传图谱的构建在国内外都取得了一定的进展,已有三十多张图谱被陆续报道。现有技术中构建的芸薹属A基因组的参照图谱,曾作为多国白菜基因组测序计划锚定序列的骨架。2011年,由我国科学家主导的白菜全基因组测序结果发表(http://brassicadb.org/brad/),同时也发表了一张目前最有参考价值的白菜物理图谱。近十年来报道的白菜遗传图谱多以AFLP、SSR等通用标记为主,尤其是SSR标记,因其操作简单、成本低,更适于用于背景选择。在网站http://brassicadb.org/brad/上发表的白菜物理图谱中的分子标记,可提供充足的背景标记。
关于大白菜分子标记用于辅助选择成功的例子已有报道。现有技术中有以含不育基因Ms的大白菜细胞核复等位基因型雄性不育两用系“AB01”的可育株(MsfMs)为供体亲本,以高代自交系‘a20’(msms)为轮回亲本,采用杂交和连续回交转育方法,利用与不育基因Ms连锁的SCAR标记syau_scr01(0.8 cM)辅助不育基因Ms选择,成功地将不育基因转育到可育品系‘a20’中,育成了不育度和不育株率均为100%,植物学性状与自交系‘a20’相近的新核不育系GMS4。现有技术中以具有抗根肿病基因CRb的大白菜‘CR Shinkii DH’系为抗源,通过CRb基因侧翼标记TCR01(1.97 cM)和TCR09(0.43 cM)的前景选择,以及51个SSR标记的基因组背景选择,选育出大白菜优良自交系‘BJN3’的9份抗根肿病近等基因系。这些近等基因系的结球相关性状与‘BJN3’无显著差异。关于大白菜抗TuMV近等基因系的构建,目前尚未见报道。
发明内容
为了解决现有技术中没有大白菜抗TuMV近等基因系的问题,本发明提出大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用,可以快速获得大白菜TuMV抗性基因TuRBCS01的种质改良,为更好地利用相关种质提供途径。
具体地,本发明通过以下技术方案实现:
本发明第一方面,提供一种用于构建大白菜抗TuMV近等基因系的方法,包括如下步骤:
(1)分别以大白菜TuMV抗病材料和感病材料为亲本,杂交构建F1代;
(2)利用感病亲本材料作为轮回亲本,首先与F1回交构建BC1代分离群体;
(3)利用大白菜TuMV抗性基因两侧紧密连锁的分子标记为前景标记,筛选两侧分子标记均扩增为杂合条带且开白花的单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC2代分离群体;
(4)对BC2群体进行前景选择,同时从白菜基因组上挑选均匀分布在 10条染色体上的若干个标记,选择在两亲本中有多态性的N个标记作为背景标记,用于背景选择;
(5)筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的BC2单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC3代分离群体;
(6)再对BC3群体进行前景和背景选择,筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的几株,自交构建BC3F2群体;
(7)利用前景选择标记筛选在两标记位点均扩增为纯合抗病条带的单株,再对这些单株进行背景选择,选择开白花、在少数位点上表现杂合的单株自交构建BC3F3群体,
(8)利用杂合位点标记进行背景检测,获得全部恢复感病亲本基因组的纯合抗病近等基因系。
本发明第二方面,提供上述的方法获得的大白菜抗TuMV近等基因系。
本发明第三方面,提供上述的方法在大白菜抗病毒病研究方面的应用。
本发明一个或多个实施例具有以下有益效果:
(1)本发明利用分子标记辅助选择的方法选育近等基因系,具有快速、准确的优点;
(2)运用本发明的方法,可快速获得大白菜TuMV抗性基因TuRBCS01的种质改良,为更好地利用相关种质提供途径。
附图说明
构成本发明的一部分的说明书附图用来提供对本发明的进一步理解,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。
图1为本发明实施例1中部分BC1单株的mBr4055(图1中A)和BrID10723(图1中B)前景选择图,M:Marker,P1:8407,P2:冠291,1-15:BC1群体的不同单株。
图2为本发明实施例1中引物BrID10321的背景选择图,M:Marker,P1:8407,P2:冠291,1-28:BC2群体的不同单株。
图3为冠291及其近等基因系接种TuMV后的抗性表现图,图3中A为冠291接种TuMV后,图3中B为抗TuMV冠291近等基因系接种后。
具体实施方式
下面结合具体实施例,进一步阐述本发明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按照常规条件或按照制造厂商所建议的条件。
除非另行定义,文中所使用的所有专业与科学用语与本领域熟练人员所熟悉的意义相同。此外,任何与所记载内容相似或均等的方法及材料皆可应用于本发明方法中。文中所述的较佳实施方法与材料仅作示范之用。
为了解决这些问题,本发明构建了大白菜核心种质‘冠291’的抗TuMV近等基因系,并公开了其构建方法。具有重要的理论和实用价值。
本发明所采用的技术方案如下:
本发明第一方面,提供一种用于构建大白菜抗TuMV近等基因系的方法,包括如下步骤:
(1)分别以大白菜TuMV抗病材料和感病材料为亲本,杂交构建F1代;
(2)利用感病亲本材料作为轮回亲本,首先与F1回交构建BC1代分离群体;
(3)利用大白菜TuMV抗性基因两侧紧密连锁的分子标记为前景标记,筛选两侧分子标记均扩增为杂合条带且开白花的单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC2代分离群体;
(4)对BC2群体进行前景选择,同时从白菜基因组网站http://brassicadb.org/brad/上挑选均匀分布在10条染色体上的若干个标记,选择在两亲本中有多态性的N个标记作为背景标记,用于背景选择;
(5)筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的BC2单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC3代分离群体;
(6)再对BC3群体进行前景和背景选择,筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的几株,自交构建BC3F2群体;
(7)利用前景选择标记筛选在两标记位点均扩增为纯合抗病条带的单株,再对这些单株进行背景选择,选择开白花且在少数位点上表现杂合的单株自交构建BC3F3群体;
(8)利用杂合位点标记进行背景检测,获得全部恢复感病亲本基因组的纯合抗病近等基因系。
在一些实施例中,所述构建方法包括:
(1)利用大白菜TuMV抗病材料及感病的核心种质材料为亲本,构建F1代;
(2)利用感病材料作为轮回亲本,首先与F1回交构建BC1代分离群体;
(3)利用大白菜TuMV抗性基因TuRBCS01两侧紧密连锁的分子标记标记BrID10723和mBr4055为前景标记,筛选两侧分子标记均扩增为杂合条带且开白花的单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC2代分离群体;
(4)对BC2群体进行前景选择,同时从白菜基因组网站http://brassicadb.org/brad/上挑选均匀分布在10条染色体上的200个SSR标记,选择在两亲本中有多态性的49个标记作为背景标记用于背景选择;
(5)筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的BC2单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC3代分离群体;
(6)再对BC3群体进行前景和背景选择,筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的几株,自交构建BC3F2群体;
(7)利用前景选择标记筛选在两标记位点均扩增为纯合抗病条带的单株,再对这些单株进行背景选择,选择开白花、在少数位点上表现杂合的单株自交构建BC3F3群体;
(8)利用杂合位点标记进行背景检测,获得全部恢复感病亲本基因组的纯合抗病近等基因系。
本发明利用分子标记辅助选择的方法进行种质改良,与常规改良方法相比,具有快速、准确且不受环境条件的限制等优点。
在一些实施例中,所述TuMV抗性基因为显性单基因。
在一些实施例中,背景标记为SSR或InDel标记。
在一些实施例中,前景标记与目标基因的遗传距离为2cM左右。
在一些实施例中,所述回交及自交5-7代。
在一些实施例中,利用标记BrID10723和mBr4055进行前景选择。
在一些实施例中,步骤(1)中感病材料为‘冠291’。本发明可以提供一种大白菜核心种质冠291的抗TuMV近等基因系及其构建方法。
在一些实施例中,所述近等基因系为大白菜核心种质冠291的抗TuMV近等基因系。
本发明第二方面,提供上述的方法获得的大白菜抗TuMV近等基因系。
本发明第三方面,提供上述的方法在大白菜抗病毒病研究方面的应用。
实施例1:
抗TuMV的冠291近等基因系的选育。
(1)分别以大白菜TuMV国家级抗源材料‘8407’和感病的核心种质材料‘冠291’为亲本,杂交构建F1代;
(2)利用感病亲本材料‘冠291’作为轮回亲本,首先与F1回交构建BC1代分离群体,以含有157个单株的BC1群体为研究对象,继续开展下一步的研究;
(3)利用大白菜TuMV抗性基因两侧紧密连锁的分子标记BrID10723和mBr4055为前景标记,筛选两侧分子标记均扩增为杂合条带且开白花的单株10株,与轮回亲本‘冠291’回交构建BC2群体;
(4)从白菜基因组网站上均匀选择10条染色体上的SSR或InDel标记204个,以两亲本基因组DNA为模板进行扩增,有49个标记在两亲本间扩增多态性,用于背景分析;
(5)选取BC2群体311个单株,利用标记BrID10723和mBr4055进行前景选择,从上述49个多态性标记中,均匀选择29个进行背景选择,结合抗病性鉴定和白花性状选择,选取一株在两标记位点均扩增为杂合抗病条带且开白花的‘冠291’基因组含量最高的抗病单株,回交构建BC3群体;
(6)对BC3群体103个单株进行前景选择,利用BC2扩增为杂合条带的标记及剩余的20个标记进行背景选择,结合TuMV抗性鉴定和白花性状的选择,筛选2株前景选择为杂合抗病条带‘冠291’基因组含量最高的开白花抗病单株,分别自交构建BC3F2群体;
(7)对两个BC3F2群体各56株和68株进行TuMV抗性鉴定、前景选择及杂合标记的背景选择,筛选‘冠291’基因组含量最高的纯合抗病单株8株自交构建BC3F3群体;
(8)利用杂合位点标记对167株BC3F3群体进行背景分析,筛选获得3个全部恢复‘冠291’基因组的纯合抗病近等基因系,编号为TR‘冠291-1’-TR‘冠291-3’。
本发明大白菜抗TuMV近等基因系的创制,是将原来感病的核心种质材料冠291通过分子标记辅助选择结合白花性状的选择,获得了抗TuMV的冠291育种材料,有利于更好地发挥该材料的育种价值。
本发明获得了骨干系大白菜育种材料‘冠291’的3个抗TuMV近等基因系,分别编号为TR‘冠291-1’、TR‘冠291-2’和 TR‘冠291-3’,为该材料更好地发挥在大白菜育种中的核心种质作用奠定了基础。
表1:49对多态性引物序列信息
mBr4055引物序列为:GGGTTCTCGGCTACTGGACT(SEQ ID No.99)、TCATCATGAGACACATCCTCTCC(SEQ ID No.100);
BrID10723引物序列为:GCTTTCCTCGTGTCATTAGA(SEQ ID No.101)、CTTTCCGAGTTTCCATAGTG(SEQ ID No.102);
BrID10321引物序列为:TGTGTTTCCTAGTGTGTTGG(SEQ ID No.103)、ATCAGTCTGAGGGTTCATCA(SEQ ID No.104)。
实施例2 冠291及其近等基因系结球性状对比
试验在2020年秋季开展,冠291及其近等基因系TR‘冠291-1’、TR‘冠291-2’和 TR‘冠291-3’各播种25株,分别选取6株,调查其毛重、球重、外叶数、内叶数、球高、球粗、短缩茎长和短缩茎宽,以冠291为对照,利用WPS软件分析其差异显著性,结果表明,三个近等基因系的各项性状指标与对照冠291之间均无显著差异。表明近等基因系TR‘冠291-1’、TR‘冠291-2’和 TR‘冠291-3’恢复了冠291的主要农艺性状。
表2:‘冠291’及其近等基因系结球性状对比
以上所揭露的仅为本发明的优选实施例而已,当然不能以此来限定本发明之权利范围,因此依本发明申请专利范围所作的等同变化,仍属本发明所涵盖的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 山东省农业科学院
<120> 大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用
<130> 2022100102
<160> 104
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
atctcatggt tggttcaccg 20
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
atttccaaaa cacacacgca 20
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
acagcaagga tgtgttgacg 20
<210> 4
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
gatgagcctc tggttcaagc 20
<210> 5
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
ggcgtttagc acataaaaac 20
<210> 6
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
agggaaggaa aggtcataaa 20
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
cctgagttct ttgcttttgt 20
<210> 8
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
cgaaccgggt aataatttct 20
<210> 9
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
ccctcctatg atttggagtt 20
<210> 10
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
ttgggtcaag aaagatatgg 20
<210> 11
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
acctgctcag gagtatttt 19
<210> 12
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
atttgactgc agatgtcacc 20
<210> 13
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
gcacttggaa gtacgagtta 20
<210> 14
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
tagttatggg ttggagatgc 20
<210> 15
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
cctcttgatg tttcgtaaag cc 22
<210> 16
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 16
ctgattcagc atcacgagga 20
<210> 17
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 17
tttttggcta acaaagtgta agg 23
<210> 18
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 18
ttgagaaagc ttaaaattgc cac 23
<210> 19
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 19
ttcaagaacg atcaagaagc aa 22
<210> 20
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 20
aaatgcagcg ttttagggg 19
<210> 21
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 21
agctgtttcg aagacgaagg 20
<210> 22
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 22
gttcaatggt tttgatcggg 20
<210> 23
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 23
ggactccaag tattgtatct gcat 24
<210> 24
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 24
agttttacga tacgagattg tgc 23
<210> 25
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 25
gcgatgtttt ttcttcagtg tc 22
<210> 26
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 26
ttaatcccta cccacaattt cc 22
<210> 27
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 27
tgggagagag agagagagaa 20
<210> 28
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 28
cttctgtttg tccatgtggt 20
<210> 29
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 29
caatttggga agacagttct 20
<210> 30
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 30
gattcgttga tataaggcca 20
<210> 31
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 31
tgtgtttcct agtgtgttgg 20
<210> 32
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 32
atcagtctga gggttcatca 20
<210> 33
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 33
tgaaacaaaa tgaaaaattc acga 24
<210> 34
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 34
caggaacgca ttaacgtgat ta 22
<210> 35
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 35
aaagatgtca tgaacaaccc 20
<210> 36
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 36
agcctcaaag tttagcacaa 20
<210> 37
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 37
cagagaaacc cgtttttga 19
<210> 38
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 38
tgtgaatgcg acgatgac 18
<210> 39
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 39
tggcagaaac aaccaaagag 20
<210> 40
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 40
tgtggatagc aaaggctgag 20
<210> 41
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 41
tcgtggaagt acatttcagt 20
<210> 42
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 42
ccctccaatt catatctcat 20
<210> 43
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 43
tcattcaacc ttatttgcca ga 22
<210> 44
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 44
cactaaaagt ttcgaagtgg aaca 24
<210> 45
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 45
cttacaggat gaagctcggc 20
<210> 46
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 46
ggtcccaatg gaatcatcaa 20
<210> 47
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 47
gaaatactac acattttcca aaacaaa 27
<210> 48
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 48
tcgataggta gggtgcattt tc 22
<210> 49
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 49
gctgacatgt accttttgaa 20
<210> 50
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 50
catctaagac cgagtcaagc 20
<210> 51
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 51
atcaccaaaa cggacaaaaa 20
<210> 52
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 52
aaattaagaa ccgaacacca ctg 23
<210> 53
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 53
aaggagaaca ctttgaatcg 20
<210> 54
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 54
tctcgctaac agatacgtcc 20
<210> 55
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 55
cagaacatac aacaaagcca 20
<210> 56
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 56
tggatgtcga ttggtgtta 19
<210> 57
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 57
aaccaaccaa aactgtgttc 20
<210> 58
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 58
agtatgatga ggctcgatgt 20
<210> 59
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 59
ctcgtcttct tcacctacaa c 21
<210> 60
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 60
ctgacatctt tctcacccac 20
<210> 61
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 61
ttcaaaggat aagggcatcg 20
<210> 62
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 62
tcttcttctt ttgttgtctt ccg 23
<210> 63
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 63
tttgactgaa tgaaagactt ttgc 24
<210> 64
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 64
cgggaaaacg ataaacgaaa 20
<210> 65
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 65
tgcataagat aagctcccac 20
<210> 66
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 66
ggaagctttt tgtggtgtag 20
<210> 67
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 67
taacccatca aatctagcca 20
<210> 68
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 68
tatatccaca acccaaaacc 20
<210> 69
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 69
gaagcgttcg tagcaaaata 20
<210> 70
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 70
agatgcgtag ctttttcaag 20
<210> 71
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 71
ggaagcaagt tgggttagca 20
<210> 72
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 72
tgtgttgccc aaaaagaaaa 20
<210> 73
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 73
ctagaggctg atggataatt g 21
<210> 74
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 74
gcacaacaac acgatcatta 20
<210> 75
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 75
gatgagcttt gatttactgc 20
<210> 76
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 76
gagactgatt ttgccatcat 20
<210> 77
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 77
aagagatgca atcactaggc 20
<210> 78
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 78
gccaagagtg gatgagttt 19
<210> 79
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 79
aacagccaca cgctctaacc 20
<210> 80
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 80
gctcagatcc gaaggagatg 20
<210> 81
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 81
gccataagtt aggcaaaaag 20
<210> 82
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 82
cacgtgattt ggtaaattcc 20
<210> 83
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 83
gaatcaaacc gaaatcgac 19
<210> 84
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 84
ccagaattac gctgtgtttt 20
<210> 85
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 85
aaaggacaaa gaggaagggc 20
<210> 86
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 86
ttgaaatcaa atgagagtga cg 22
<210> 87
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 87
tttcacactc tctctctccc tctt 24
<210> 88
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 88
cggaacttgg aaacgaagac 20
<210> 89
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 89
catgagttga gcttgtgaac 20
<210> 90
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 90
cctcacggtt gtttcattat 20
<210> 91
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 91
atgataagca aaaagggtcc 20
<210> 92
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 92
cgactgacaa aaccgataat 20
<210> 93
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 93
gattgattcc tcttttgcct 20
<210> 94
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 94
aagcacataa acaccattcc 20
<210> 95
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 95
cccttggagg gacacttta 19
<210> 96
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 96
ggaatacgat attgtgtagc tg 22
<210> 97
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 97
gatcaaataa cgaacggaga ga 22
<210> 98
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 98
gagccaagaa aggacctaag at 22
<210> 99
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 99
gggttctcgg ctactggact 20
<210> 100
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 100
tcatcatgag acacatcctc tcc 23
<210> 101
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 101
gctttcctcg tgtcattaga 20
<210> 102
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 102
ctttccgagt ttccatagtg 20
<210> 103
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 103
tgtgtttcct agtgtgttgg 20
<210> 104
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 104
atcagtctga gggttcatca 20
Claims (7)
1.用于构建大白菜抗TuMV近等基因系的方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)分别以大白菜TuMV抗病材料和感病材料为亲本,杂交构建F1代;
(2)利用感病亲本材料作为轮回亲本,首先与F1回交构建BC1代分离群体;
(3)利用大白菜TuMV抗性基因TuRBCS01两侧紧密连锁的分子标记BrID10723和mBr4055为前景标记,筛选两侧分子标记均扩增为杂合条带且开白花的单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC2代分离群体;
(4)对BC2群体进行前景选择,同时从白菜基因组网站http://brassicadb.org/brad/上挑选均匀分布在10条染色体上的200个SSR标记,选择在两亲本中有多态性的49个标记作为背景标记用于背景选择;
(5)筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的BC2单株,利用感病亲本与上述单株进行回交构建BC3代分离群体;
(6)再对BC3群体进行前景和背景选择,筛选开白花、前景选择为杂合条带且感病亲本背景基因组含量高的几株,自交构建BC3F2群体;
(7)利用前景选择标记筛选在两标记位点均扩增为纯合抗病条带的单株,再对这些单株进行背景选择,选择开白花、在少数位点上表现杂合的单株自交构建BC3F3群体;
(8)利用杂合位点标记进行背景检测,获得全部恢复感病亲本基因组的纯合抗病近等基因系。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述TuMV抗性基因为显性单基因。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(1)中感病材料为‘冠291’。
4.根据权利要求1或2所述的方法,其特征在于,前景标记与目标基因的遗传距离为2cM左右。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述回交及自交5-7代。
6.采用权利要求1-5任一所述的方法获得的大白菜抗TuMV近等基因系。
7.权利要求1-5任一所述的方法在大白菜抗病毒病研究方面的应用。
Priority Applications (2)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202210332186.5A CN114667923B (zh) | 2022-03-31 | 2022-03-31 | 大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用 |
KR1020230038274A KR20230142346A (ko) | 2022-03-31 | 2023-03-23 | 배추 TuMV 저항성 근동질 유전자 계통 및 이의 구축 방법과 응용 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN202210332186.5A CN114667923B (zh) | 2022-03-31 | 2022-03-31 | 大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用 |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN114667923A CN114667923A (zh) | 2022-06-28 |
CN114667923B true CN114667923B (zh) | 2023-03-17 |
Family
ID=82075693
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN202210332186.5A Active CN114667923B (zh) | 2022-03-31 | 2022-03-31 | 大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR20230142346A (zh) |
CN (1) | CN114667923B (zh) |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
EP2308285A1 (en) * | 2009-09-22 | 2011-04-13 | Syngenta Participations AG | Brassica oleracea plants resistant to Albugo candida |
CN103571832B (zh) * | 2013-10-17 | 2015-04-22 | 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所 | 与大白菜TuMV抗性基因TuRBCS01紧密连锁的分子标记 |
CN108624706B (zh) * | 2018-02-14 | 2021-04-27 | 北京市农林科学院 | 分子标记辅助快速选育玉米无叶舌自交系的方法 |
CN110373494B (zh) * | 2019-08-19 | 2020-05-22 | 山东省农业科学院蔬菜花卉研究所 | 与大白菜芜菁花叶病毒病抗性基因retrcs03紧密连锁的分子标记及其应用 |
-
2022
- 2022-03-31 CN CN202210332186.5A patent/CN114667923B/zh active Active
-
2023
- 2023-03-23 KR KR1020230038274A patent/KR20230142346A/ko unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN114667923A (zh) | 2022-06-28 |
KR20230142346A (ko) | 2023-10-11 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Jena et al. | High-resolution mapping of a new brown planthopper (BPH) resistance gene, Bph18 (t), and marker-assisted selection for BPH resistance in rice (Oryza sativa L.) | |
Kelly et al. | Tagging and mapping of genes and QTL and molecular marker-assisted selection for traits of economic importance in bean and cowpea | |
JP6059979B2 (ja) | 稔性のカプシクム(Capsicum)植物 | |
Liu et al. | Improving the resistance of eggplant (Solanum melongena) to Verticillium wilt using wild species Solanum linnaeanum | |
Haggard et al. | Linkage relationships among multiple QTL for horticultural traits and late blight (P. infestans) resistance on chromosome 5 introgressed from wild tomato Solanum habrochaites | |
CN111197101B (zh) | 一种与烟草多叶基因mLN紧密连锁的共显性SSR标记及其应用 | |
US20220400638A1 (en) | Corn plants with improved disease resistance | |
US11832572B2 (en) | TolCNDV resistant melon plants | |
Blenda et al. | Construction of a genetic linkage map and identification of molecular markers in peach rootstocks for response to peach tree short life syndrome | |
Zhang et al. | Identification of stably expressed QTL for resistance to black shank disease in tobacco (Nicotiana tabacum L.) line Beinhart 1000-1 | |
Takeuchi | Developing isogenic lines of Japanese rice cultivar ‘Koshihikari’with early and late heading | |
Case et al. | Mapping adult plant stem rust resistance in barley accessions Hietpas-5 and GAW-79 | |
Heuer et al. | Increasing biodiversity of irrigated rice in Africa by interspecific crossing of Oryza glaberrima (Steud.)× O. sativa indica (L.) | |
CN114667923B (zh) | 大白菜抗TuMV近等基因系及其构建方法和应用 | |
CN109475098B (zh) | ToLCNDV抗性甜瓜植物 | |
US10947557B2 (en) | ToLCNDV resistant melon plants | |
US11591611B2 (en) | TolCNDV resistant melon plants | |
CN106048033B (zh) | 一种棉花陆海渐渗系的评价方法 | |
CN116640768B (zh) | 小麦抗白粉病基因PmTR1及其应用 | |
US8492615B2 (en) | Brassica oleracea plants with a resistance to mycosphaerella brassicicola | |
US20190100768A1 (en) | Tospovirus Resistant Plants and Methods Thereof | |
Bovill | Mapping spot blotch & common root rot (causal agent: bipolaris sorokiniana) resistance genes in barley | |
Prehn | Analysis of genetic resistance to barley stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. hordei) | |
Eckermann et al. | Blackleg resistance in rapeseed: phenotypic screen, molecular markers and genome wide linkage and association mapping | |
OSBORN et al. | 8. Molecular maps of alfalfa |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
GR01 | Patent grant | ||
GR01 | Patent grant |