CN114591423A - 新冠病毒n蛋白的特异性抗体及其制备方法与应用 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及一种用SARS‑Cov‑2的N蛋白免疫骆驼科动物所得的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。本发明依靠骆驼科动物的免疫系统筛选、鉴定并制备特异性识别、结合新冠病毒N蛋白的抗体，所得到的抗体特异性强，可用于开展新冠病毒快速检测，有潜在临床诊断和治疗价值，且容易进行基因工程改造和人源化。本发明提供的抗体稳定性高，能避免常规抗体需要低温储存和运输的要求，有利于大规模普及应用，有利于降低生产成本、实现规模化生产。

Description

新冠病毒N蛋白的特异性抗体及其制备方法与应用
技术领域
本发明涉及生物技术领域，具体涉及新冠病毒N蛋白的特异性抗体及其制备方法与应用。
背景技术
抗体是一种主要由浆细胞分泌，被免疫系统用来鉴别与中和外来物质如细菌、病毒等外来物的蛋白质，该外来物被称为抗原。抗体和抗原的结合完全依靠非共价键的相互作用，这种特异性的结合机制使得抗体可以捕获外来微生物以及受感染的细胞，进一步诱导其他免疫机制对其进行攻击，或直接中和其目标。抗体及抗体相关产品已经被广泛应用于生命科学与医学等研究领域，基于抗原-抗体特异性结合而衍生的诸多实验技术奠定了科学研究与临床治疗的重要基础，例如免疫诊断、免疫印迹、酶联免疫吸附、流式细胞分析等等。
新型冠状病毒引发的疫情在世界范围内加速蔓延。在研究新冠病毒的过程中，抗体是一个非常重要的研究工具，对于患者诊断、病毒分析与研究等都具有重大的价值和意义。自疫情爆发初始，世界各地均开始着手开发新冠病毒特异性的抗体。目前，科学研究或临床诊断检测新冠病毒N蛋白主要是依赖于抗体，市面上已有多种N蛋白的单克隆抗体公开或销售，制备这些抗体的技术方案是：(1)组织提取或重组表达N蛋白抗原；(2)将抗原注射至鼠、兔、猴等动物体内，依靠动物的免疫系统产生抗体；(3)采集动物的血液并分离、提取出血清，再进一步分离出含有特异性抗体的成分。
然而，上述基于鼠等动物的免疫系统产生N蛋白的抗体并分离提取的技术，有以下缺点：(1)抗体的稳定性较差，需要在低温(4摄氏度)下进行储藏、运输、测试与验证等工作才能维持抗体的浓度、特异性等特征，不利于长途运输和普及检测；(2)规模化批量生产成品高。上述单克隆抗体是全长的免疫球蛋白(IgG)，需要反复免疫注射动物并从动物体液中欧给分离提纯抗体，或是在哺乳动物细胞等成本较为高昂的表达系统中进行重组表达后进行分离、纯化提取，操作复杂、成本昂贵，不利于规模化批量生产。
发明内容
本发明克服现有技术的缺陷，设计并实施有效、可行的抗体筛选与制备技术方案，获得能够特异性识别并结合新冠病毒表面N蛋白的抗体，进行批量生产制备并对其应用。
本发明的上述目的通过以下具体方案实现。
第一方面，本发明提供用SARS-Cov-2的N蛋白免疫骆驼科动物所得的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
在一些实施方案中，所述骆驼科动物选自单峰驼、双峰驼、美洲驼、骆马、羊驼和小羊驼，优选为羊驼。
在一些实施方案中，所述抗体为纳米抗体，所述抗体活性片段为纳米抗体活性片段。
在一些实施方案中，所述抗体为单克隆抗体或者多克隆抗体。
在一些实施方案中，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段与所述SARS-Cov-2的N蛋白结合的kd值在150nM以下，优选在100nM以下，更优选在50nM以下，更优选在15nM以下，更优选在10nM以下。
在一些实施方案中，所述SARS-Cov-2的N蛋白具有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列。进一步优选地，所述SARS-Cov-2的N蛋白由包括如下步骤的方法制备而成：将编码所述SARS-Cov-2的N蛋白的核苷酸序列构建至载体质粒；将所述载体质粒转染至真核细胞系中表达，纯化。
第二方面，本发明提供一种构建抗体文库的方法，所述方法包括如下步骤：
(1)将SARS-Cov-2的N蛋白作为抗原免疫骆驼科动物，采集被免疫动物的静脉外周血，分离得到淋巴细胞；
(2)提取所述淋巴细胞的总mRNA，反转录为cDNA并进行扩增；
(3)将所述扩增得到的DNA插入病毒表达载体，转化入细菌，收集菌落，得抗体文库。
在一些实施方案中，所述骆驼科动物选自单峰驼、双峰驼、美洲驼、骆马、羊驼和小羊驼，优选为羊驼。
在一些实施方案中，步骤(1)所述免疫采用皮下注射方式。所述免疫的次数优选为3～5次。所述静脉外周血优选在最后一次免疫之前和之后分别采集。
在一些实施方案中，步骤(3)所述病毒表达载体为噬菌体表达载体。
在一些实施方案中，步骤(3)所述细菌为大肠杆菌。
第三方面，本发明提供上述构建抗体文库的方法获得的抗体文库，或由所述抗体文库表达产生的多克隆抗体。
第四方面，本发明提供一种构建抗原特异性抗体文库的方法，所述方法包括如下步骤：对第三方面所述的抗体文库进行筛选，获得抗原特异性抗体文库。
在一些实施方案中，所述构建抗原特异性抗体文库的方法包括如下步骤：
(i)对所述抗体文库进行培养，释放病毒；
(ii)将所述病毒与抗原进行孵育，去掉与抗原非特异性结合的病毒，保留与抗原特异性结合的病毒；
(iii)用所述与抗原特异性结合的病毒侵染细菌，收集菌落，获得抗原特异性抗体文库。
在一些实施方案中，步骤(iii)所述细菌为大肠杆菌。
第五方面，本发明提供上述构建抗原特异性抗体文库的方法获得的抗原特异性抗体文库，或由所述抗原特异性抗体文库表达产生的与抗原特异性结合的多克隆抗体。
第六方面，本发明提供一种制备抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的方法，所述方法包括如下步骤：对第三方面所述的抗体文库进行筛选，获得与抗原特异性结合的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
在一些实施方案中，所述制备抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的方法包括如下步骤：
(a)对所述抗体文库进行培养，释放病毒；
(b)将所述病毒与抗原进行孵育，去掉与抗原非特异性结合的病毒，保留与抗原特异性结合的病毒；
(c)用所述与抗原特异性结合的病毒侵染细菌，将被侵染的细菌涂抹至平板培养基培养，挑选单一菌落。
在一些实施方案中，步骤(c)所述细菌为大肠杆菌。
在一些实施方案中，可以对所述单一菌落进行扩大培养，之后进行抗原特异性结合鉴定。
在一些实施方案中，可以对所述单一菌落进行扩大培养，然后进行步骤(d)：提取DNA，转化至宿主细胞并表达，以获得单克隆抗体。
第七方面，本发明提供采用上述制备抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的方法获得的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
第八方面，本发明提供特异性识别和/或结合SARS-Cov-2的N蛋白的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段；所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含至少一个重链可变区；所述重链可变区具有：
如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示的CDR1；
如SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:7所示的CDR2；和
如SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10所示的CDR3。
在一些实施方案中，所述重链可变区具有：如SEQ ID NO:2所示的CDR1、如SEQ IDNO:5所示的CDR2和如SEQ ID NO:8所示的CDR3。
在一些实施方案中，所述重链可变区具有：如SEQ ID NO:3所示的CDR1、如SEQ IDNO:6所示的CDR2和如SEQ ID NO:9所示的CDR3。
在一些实施方案中，所述重链可变区具有：如SEQ ID NO:4所示的CDR1、如SEQ IDNO:7所示的CDR2和如SEQ ID NO:10所示的CDR3。
在一些实施方案中，所述重链可变区具有：如SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列，或SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列经过一个或多个氨基酸添加、删除、替换或修饰获得的保守性变异体。
在一些实施方案中，所述重链可变区具有：如SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，或SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列经过一个或多个氨基酸添加、删除、替换或修饰获得的保守性变异体。
在一些实施方案中，所述重链可变区具有：如SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，或SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列经过一个或多个氨基酸添加、删除、替换或修饰获得的保守性变异体。
在一些实施方案中，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含一个所述重链可变区且缺失轻链。
在一些实施方案中，所述抗体为纳米抗体，所述抗体活性片段为纳米抗体活性片段。
第九方面，本发明提供编码SEQ ID NO:2～SEQ ID NO:13任意一条序列所示氨基酸序列或上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的核苷酸序列。
在一些实施方案中，编码所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:14所示。
在一些实施方案中，编码所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:15所示。
在一些实施方案中，编码所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的核苷酸序列如SEQ ID NO:16所示。
第十方面，本发明提供含有上文所述核苷酸序列的表达载体。
在一些实施方案中，所述表达载体为噬菌体表达载体，优选为噬菌体表面展示筛选载体。
在一些实施方案中，所述表达载体中还含有编码噬菌体包膜蛋白pIII的核苷酸序列。
第十一方面，本发明提供外源转入了上文所述表达载体的病毒。
在一些实施方案中，所述病毒为噬菌体。
第十二方面，本发明提供外源转入了上文所述表达载体的宿主细胞，或者被上文所述病毒侵染的宿主细胞。
在一些实施方案中，所述宿主细胞为大肠杆菌。
第十三方面，本发明提供利用上文所述宿主细胞表达抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的方法。
第十四方面，本发明提供利用上文所述宿主细胞表达获得的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
第十五方面，本发明提供所述上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段经人源化后获得的人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
第十六方面，本发明提供一种蛋白偶联物，其包含上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或者上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段以及配体。
在一些实施方案中，所述配体选自放射性同位素、荧光基团和递送载体。
第十七方面，本发明提供一种药物组合物，其包含上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或者上文所述蛋白偶联物。
在一些实施方案中，所述药物组合物中还含有其它活性成分和/或辅料。
第十八方面，本发明提供嵌合抗原受体，其包含上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
第十九方面，本发明提供表达上文所述嵌合抗原受体的嵌合抗原受体T细胞。
第二十方面，本发明提供上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述抗体文库或多克隆抗体、上文所述抗原特异性抗体文库或与抗原特异性结合的多克隆抗体、上文所述核苷酸序列、上文所述表达载体、上文所述病毒、上文所述宿主细胞、上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述蛋白偶联物、上文所述药物组合物、上文所述嵌合抗原受体或者上文所述嵌合抗原受体T细胞在制备预防SARS-Cov-2感染和/或治疗由SARS-Cov-2感染引起疾病的药物中的应用。
第二十一方面，本发明提供体外检测SARS-Cov-2或SARS-Cov-2的N蛋白的试剂盒，其包含上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或者上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
在一些实施方案中，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段经标记物标记。优选地，所述标记物选自酶、化学发光基团和同位素基团。
第二十二方面，本发明提供上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述蛋白偶联物或者上文所述试剂盒在体外检测SARS-Cov-2或SARS-Cov-2的N蛋白中的应用。
第二十三方面，本发明提供利用上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、上文所述蛋白偶联物或者上文所述试剂盒检测样品中SARS-Cov-2或SARS-Cov-2的N蛋白的方法。
第二十四方面，本发明提供检测SARS-Cov-2感染的造影剂，其包含上文所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或者上文所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
与现有技术相比，本发明提供的技术方案具有如下显著优势：本发明提供的抗体可用于开展新冠病毒快速检测，有潜在临床诊断和治疗价值；本发明提供的抗体结构简单，容易进行基因工程改造，具有成熟的优化策略用于增强纳米抗体亲和力、延长体内半衰期以及与其它分子偶联用于药物开发，如连接放射性同位素，偶联传递药物、CART和荧光标记高分辨成像等；本发明提供的抗体序列与人IgG的VH区域序列同源性高，少数氨基酸突变即可以实现单域抗体的人源化，人源化更简单；本发明提供的抗体稳定性高，耐酸碱pH，耐高温，能避免常规抗体需要低温储存和运输的要求，有利于大规模普及应用；本发明提供的抗体在成本低廉的大肠杆菌表达系统就可以很好的重组表达，量产成本低、产量可以高达数十毫克/升大肠杆菌，而大肠杆菌重组表达系统技术成熟，质量控制简单，有利于降低生产成本、实现规模化生产。
附图说明
图1为单抗N_6B7与抗原亲和力检测结果示意图；
图2为单抗N_7A6与抗原亲和力检测结果示意图；
图3为单抗N_7D4与抗原亲和力检测结果示意图。
具体实施方式
以下实施例用于说明本发明，但不用来限制本发明的范围。
定义
SARS-Cov-2：国际病毒分类委员会对新型冠状病毒(简称新冠病毒)的命名。
N蛋白：Nucleocapsid蛋白(简称N蛋白)是新冠病毒的核衣壳蛋白，它与病毒基因组RNA相互缠绕形成病毒核衣壳，依靠其RNA结合结构域在病毒RNA的合成过程中发挥重要作用。N蛋白在新冠病毒的结构蛋白中所占比例较大，适宜于开发特异性抗体建立快速的血清学检测体系。
kd值：解离常数(dissociation constant，kd)是一种特定类型的平衡常数，用于衡量一较大物体与另一较小组分分开(解离)的倾向，是缔合常数的倒数，单位为mol/L(M)或nmol/L(nM)。kd值越小说明两个物质的结合能力越强。
纳米抗体：在骆驼科动物外周血液中存在的天然缺失轻链的抗体，该抗体只包含一个重链可变区(VHH)和两个常规的CH2与CH3区，但却不像人工改造的单链抗体片段那样容易相互沾粘，甚至聚集成块；单独克隆并表达出来的VHH结构具有与原重链抗体相当的结构稳定性以及与抗原的结合活性，是已知的可结合目标抗原的最小单位；VHH晶体为2.5nm，长4nm，分子量只有15KDa，因此也被称作纳米抗体(Nanobody，Nb)。相比于传统的鼠、兔等动物仅能识别抗原表面平展的多肽，骆驼科动物体内的免疫系统能够识别抗原表面复杂的空间结构，能够产生高度特异性、高亲和力的纳米抗体。
根据本发明的技术方案，在不改变蛋白的活性或功能的情况下，可以对氨基酸序列中的某些氨基酸进行保守取代，参见下表1：
表1
Figure BDA0002821289760000091
Figure BDA0002821289760000101
此外，因为碱基的简并性，在不改变多核苷酸序列的活性或功能的情况下，可以对多核苷酸序列的碱基进行取代，参见下表2：
表2
Figure BDA0002821289760000102
Figure BDA0002821289760000111
实施例1：抗原的制备
将编码N蛋白RBD区域的DNA序列构建至Pet-28a表达载体，于大肠杆菌中重组表达带有组氨酸标签(6*His-tag)的N蛋白RBD结构域，再提取、纯化作为抗原。
所述抗原如有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列，具体为：NNTASWFTALTQHGKEDLKFPRGQGVPINTNSSPDDQIGYYRRATRRIRGGDGKMKDLSPRWYFYYLGTGPEAGLPYGANKDGIIWVATEGALNTPKDHIGTRNPANNAAIVLQLPQGTTLPKGFYAEG
实施例2：羊驼免疫注射
本实施例将实施例1制备得到的抗原免疫羊驼。具体步骤如下：
(1)将实施例1中制备好的抗原平均分装成4份，每份约0.25mg；
(2)累计对羊驼进行4次免疫，将抗原经皮下注射至动物体内，记第一次免疫为第一天，后续的免疫分别于第10天、第19天、第28天；其中，第28天，于第四次免疫注射前，采集约200mL羊驼静脉外周血液，且第42天，即第四次免疫之后14天，采集约300mL羊驼静脉外周血液。
相比于传统鼠、兔等动物抗体的免疫技术方案，本实施例提供的方法采集大量的羊驼静脉外周血液，有利于后续筛选得到高度多样性的纳米抗体。
实施例3：抗体文库的构建
以实施例2中采集的两批次羊驼静脉外周血液为原料，构建高多样性的纳米抗体文库。两批次羊驼静脉外周血液的处理方法相同，具体为：
(1)使用密度梯度离心法，从羊驼静脉外周血液中分离得到淋巴细胞；
(2)提取淋巴细胞的总mRNA，并反转录为cDNA；
(3)使用适当的DNA引物，以上述cDNA为模板，经聚合酶链式反应(PCR)扩增得到羊驼免疫球蛋白IgG2和IgG3的VHH片段，即纳米抗体的DNA片段；
(4)将VHH的DNA连接至噬菌体表面展示筛选载体，构成VHH-pIII融合蛋白表达载体质粒库；其中，pIII是存在于噬菌体表面鞭毛上的蛋白质；
(5)将DNA连接产物经电转化方法，转化至TG1感受态细菌，适当培养后收集全部菌落，即为羊驼的纳米抗体文库。
相比于传统的从鼠、兔等动物血清或淋巴细胞中分离得到抗体的方法，本实施例能够获得并长期保存持有羊驼的全部纳米抗体片段(即文库)，能够持续地支撑后续不断地进行纳米抗体的筛选与开发。
实施例4：噬菌体表面展示筛选特异性纳米抗体
本实施例以实施例3得到的纳米抗体文库为来源，经噬菌体表面展示筛选得到抗原特异性的纳米抗体。具体步骤如下：
(1)取适量冻存的实施例3获得的纳米抗体文库，接种至细菌培养基，经适当培养后加入适量的辅助噬菌体，继续于适量条件下培养；
(2)以PEG-NaC法提取细菌培养上清中扩增的噬菌体；
(3)将实施例1获得的抗原固定于免疫试管，取噬菌体与抗原孵育；
(4)淘洗：弃去噬菌体，再用PBS缓冲液润洗抗原适当次数，淘洗、除去与抗原非特异性结合的噬菌体，保留与抗原特异性结合的噬菌体；
(5)洗脱：采用酸性甘氨酸溶液处理与抗原特异性结合的噬菌体，使噬菌体与抗原解离并保留。
至此，即得到了表达有特异性纳米抗体的噬菌体。
实施例5：抗原特异性抗体文库的构建
本实施例利用实施例4所得的噬菌体构建抗原特异性纳米抗体文库。具体步骤为：
(1)将所述表达有特异性纳米抗体的噬菌体侵染培养至合适状态的大肠杆菌，但不再加入辅助噬菌体；
(2)待噬菌体侵染完全后，特异性的纳米抗体即以DNA质粒的形式存在于大肠杆菌中，收集这些全部的大肠杆菌，即成为抗原特异性的纳米抗体文库。
本实施例所得的文库可以作为原料返回实施例4进行噬菌体表面展示筛选。
实施例6：单克隆抗体菌落的获得
本实施例利用实施例4所得的噬菌体获得单克隆纳米抗体菌落。具体步骤为：
(1)将所述表达有特异性纳米抗体的噬菌体侵染培养至合适状态的大肠杆菌，但不再加入辅助噬菌体；
(2)待噬菌体侵染完全后，将这些大肠杆菌均匀涂抹于细菌培养皿培养，即可得到含有纳米抗体DNA质粒的单克隆菌落。
实施例7：阳性单克隆抗体的鉴定
本实施例对实施例6获得的单克隆菌落进行鉴定。具体步骤如下：
(1)挑取3组所述单克隆菌落于微孔板分别进行培养；
(2)加入IPTG诱导VHH-pIII(即含有纳米抗体的融合蛋白质)表达；
(3)收集含有纳米抗体的细菌培养上清，与抗原孵育；
(4)采用酶联免疫吸附分析(ELISA)法，检测单克隆纳米抗体是否与新馆病毒N蛋白抗原结合，并依据结合强度检测抗体与抗原的亲和力大小。
上述3组单克隆菌落对应抗体与N蛋白抗原的亲和力大小的检测结果如图1～3所示，亲和力数值kd的结果如下表3所示。
表3：亲和力测试结果
kd(nM)
N_6B7 8.26
N_7A6 15.00
N_7D4 127.50
由以上结果可知，本实施例挑选得到单克隆菌落所得抗体与所述SARS-Cov-2的N蛋白结合的kd值在150nM以下，优选在100nM以下，更优选在50nM以下，更优选在15nM以下，更优选在10nM以下。
分别对上述3组单克隆菌落进行扩大培养后，提取DNA质粒并进行DNA测序获得抗体的核苷酸序列，翻译后得到完整氨基酸序列。具体而言，3组单克隆抗体微生物菌落对应的氨基酸序列以及核苷酸序列具体如下表4～表6所示：
表4：单抗N_6B7的氨基酸序列和核苷酸序列
Figure BDA0002821289760000141
表5：单抗N_7A6的氨基酸序列和核苷酸序列
Figure BDA0002821289760000142
Figure BDA0002821289760000151
表6：单抗N_7D4的氨基酸序列和核苷酸序列
Figure BDA0002821289760000152
实施例8：小批量抗体生产与制备
将实施例7所得纳米抗体的DNA质粒转化至BL21(DE3)感受态细胞，借助大肠杆菌表达系统小批量表达、纯化单克隆纳米抗体，批产能约数毫克。
虽然，上文中已经用一般性说明、具体实施方式及试验，对本发明作了详尽的描述，但在本发明基础上，可以对之作一些修改或改进，这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此，在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进，均属于本发明要求保护的范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 生物岛实验室；华中科技大学
<120> 新冠病毒N蛋白的特异性抗体及其制备方法与应用
<130> RYP2010957.4
<160> 16
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 129
<212> PRT
<213> SARS-Cov-2
<400> 1
Asn Asn Thr Ala Ser Trp Phe Thr Ala Leu Thr Gln His Gly Lys Glu
1 5 10 15
Asp Leu Lys Phe Pro Arg Gly Gln Gly Val Pro Ile Asn Thr Asn Ser
20 25 30
Ser Pro Asp Asp Gln Ile Gly Tyr Tyr Arg Arg Ala Thr Arg Arg Ile
35 40 45
Arg Gly Gly Asp Gly Lys Met Lys Asp Leu Ser Pro Arg Trp Tyr Phe
50 55 60
Tyr Tyr Leu Gly Thr Gly Pro Glu Ala Gly Leu Pro Tyr Gly Ala Asn
65 70 75 80
Lys Asp Gly Ile Ile Trp Val Ala Thr Glu Gly Ala Leu Asn Thr Pro
85 90 95
Lys Asp His Ile Gly Thr Arg Asn Pro Ala Asn Asn Ala Ala Ile Val
100 105 110
Leu Gln Leu Pro Gln Gly Thr Thr Leu Pro Lys Gly Phe Tyr Ala Glu
115 120 125
Gly
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<220>
<223> 单抗N_6B7的氨基酸序列
<400> 11
Gln Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Glu Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Leu Phe Phe Ala Val Tyr
20 25 30
Pro Met Ala Trp Tyr Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gln Arg Glu Leu Val
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Ala Ile Ile Thr Thr Asp Gly Arg Ile Asn His Ala Asp Ser Val Lys
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Gly Arg Phe Ala Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr Leu
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Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Thr
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Leu Thr Arg Thr Phe Leu Leu Arg Pro Val Ser Tyr Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
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<220>
<223> 单抗N_7A6的氨基酸序列
<400> 12
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Ala Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Gly Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Arg Thr Phe Ser Asn Trp
20 25 30
Ala Met Ala Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Glu Arg Glu Phe Ala
35 40 45
Ala Val Ile Asn Trp Ser Gly Asn Thr Thr Tyr Tyr Ala Asp Phe Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Lys Asn Asn Ala Lys Asn Thr Val Tyr
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Pro Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Ala Ser Glu Arg Gly Gly Asp Ser Trp Ala Val Pro Asp Tyr Trp
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Gly Pro Gly Thr Gln Val Thr Val Ser Ser
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<220>
<223> 单抗N_7D4的氨基酸序列
<400> 13
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Trp
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Ala Ser Gly Phe Ala Phe Arg Phe Ala Thr Met Ala Trp Tyr Arg Gln
20 25 30
Ala Pro Gly Glu Gln Arg Glu Leu Val Ala Thr Ile Ser Arg Ala Gly
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Ala Ile Asn Tyr Ala Asp Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg
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Asn Arg Ala Glu Asn Ser Val Thr Leu Glu Met Asn Asn Leu Lys Pro
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Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Val Ala Ala Pro Thr Ile Ala Ala
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Met Glu Arg Arg Gly Phe Trp Gly Pro Gly Thr Gln Val Thr Val Ser
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Ser
<210> 14
<211> 357
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 单抗N_6B7的核苷酸序列
<400> 14
caggtgcagc tgcaggagtc ggggggaggc ttggtggagc ctggggggtc tctgagactc 60
tcctgtgcag cctctggatt attcttcgct gtctatccca tggcctggta ccgccaggct 120
ccagggaagc agcgcgagtt ggtcgcgatt attactactg atggtaggat aaatcatgca 180
gactccgtga agggccgatt cgccatctcc agagacaacg ccaagaacac ggtgtatctg 240
caaatgaaca gcctgaaacc tgaggatacg gccgtctatt actgtacctt gacgcgtacg 300
tttcttctcc gtccggtttc gtattggggc caggggaccc aggtcactgt ctcctca 357
<210> 15
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<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 单抗N_7A6的核苷酸序列
<400> 15
gaggtgcagc tggtggagtc tgggggagga ttggtgcagg ctgggggctc tctgggactc 60
tcctgtgcag cctctggacg caccttcagt aactgggcca tggcctggat ccgccaggct 120
ccagggaagg agcgtgagtt tgcagcagtt attaactgga gtggtaatac tacatactat 180
gcagatttcg tgaagggccg attcaccatc tccaaaaaca acgccaaaaa cacggtgtat 240
ctgcaaatga acagcctgaa acctgaggac acggccgttt attactgtgc agccagcgaa 300
aggggtggtg atagctgggc ggtcccagat tactggggcc cggggaccca ggtcaccgtc 360
tcctca 366
<210> 16
<211> 339
<212> DNA
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> 单抗N_7D4的核苷酸序列
<400> 16
gaggtgcagc tggtggagtc tggggggtct ctgagactct cctgttgggc ctctggattt 60
gccttcagat tcgctaccat ggcctggtac cgtcaggctc caggagaaca gcgcgagttg 120
gtcgcaacta tttcgcgcgc tggtgccata aactatgcag actccgtgaa ggggcgattc 180
accatttcca gaaaccgcgc cgagaactcc gtgactctgg aaatgaacaa cctgaaacct 240
gaggacacgg ccgtatatta ttgtgtagca gcccctacta tcgccgccat ggagcggagg 300
ggcttctggg gccccgggac ccaggtcact gtctcctca 339

Claims (30)

1.用SARS-Cov-2的N蛋白免疫骆驼科动物所得的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
2.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段，其特征在于，所述骆驼科动物选自单峰驼、双峰驼、美洲驼、骆马、羊驼和小羊驼。
3.根据权利要求1所述的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段，其特征在于，所述抗体为纳米抗体，所述抗体活性片段为纳米抗体活性片段；
和/或，所述抗体为单克隆抗体或多克隆抗体。
4.根据权利要求1～3任意一项所述的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段，其特征在于，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段与所述SARS-Cov-2的N蛋白结合的kd值在150nM以下，优选在100nM以下，更优选在50nM以下，更优选在15nM以下，更优选在10nM以下。
5.根据权利要求1或4所述的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段，其特征在于，所述SARS-Cov-2的N蛋白具有如SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列；
优选地，所述SARS-Cov-2的N蛋白由包括如下步骤的方法制备而成：将编码所述SARS-Cov-2的N蛋白的核苷酸序列构建至载体质粒；将所述载体质粒转染至真核细胞系中表达，纯化。
6.一种构建抗体文库的方法，其特征在于，包括如下步骤：
(1)将SARS-Cov-2的N蛋白作为抗原免疫骆驼科动物，采集被免疫动物的静脉外周血，分离得到淋巴细胞；
(2)提取所述淋巴细胞的总mRNA，反转录为cDNA并进行扩增；
(3)将所述扩增得到的DNA插入病毒表达载体、优选为噬菌体表达载体，转化入细菌、优选为大肠杆菌，收集菌落，得抗体文库；
优选地，所述步骤(1)中，所述骆驼科动物为羊驼，和/或所述免疫采用皮下注射方式，和/或所述免疫的次数为3～5次，和/或在最后一次免疫之前和之后分别采集被免疫动物的静脉外周血。
7.权利要求6所述方法获得的抗体文库，或由所述抗体文库表达产生的多克隆抗体。
8.一种构建抗原特异性抗体文库的方法，其特征在于，包括如下步骤：对权利要求7所述抗体文库进行筛选，获得抗原特异性抗体文库；
优选地，包括如下步骤：
(i)对所述抗体文库进行培养，释放病毒；
(ii)将所述病毒与抗原进行孵育，去掉与抗原非特异性结合的病毒，保留与抗原特异性结合的病毒；
(iii)用所述与抗原特异性结合的病毒侵染细菌、优选为大肠杆菌，收集菌落，获得抗原特异性抗体文库。
9.权利要求8所述方法获得的抗原特异性抗体文库，或由所述抗原特异性抗体文库表达产生的与抗原特异性结合的多克隆抗体。
10.一种制备抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的方法，其特征在于，包括如下步骤：对权利要求7所述抗体文库进行筛选，获得与抗原特异性结合的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段；
优选地，包括如下步骤：
(a)对所述抗体文库进行培养，释放病毒；
(b)将所述病毒与抗原进行孵育，去掉与抗原非特异性结合的病毒，保留与抗原特异性结合的病毒；
(c)用所述与抗原特异性结合的病毒侵染细菌、优选为大肠杆菌，将被侵染的细菌涂抹至平板培养基培养，挑选单一菌落，可选择地对所述单一菌落进行抗原特异性结合鉴定；
更优选地，还包括：(d)提取所述单一菌落的DNA，转化至宿主细胞并表达。
11.权利要求10所述方法获得的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
12.特异性识别和/或结合SARS-Cov-2的N蛋白的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段，其特征在于，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含至少一个重链可变区；所述重链可变区具有：
如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4所示的CDR1；
如SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6或SEQ ID NO:7所示的CDR2；和
如SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:9或SEQ ID NO:10所示的CDR3；
优选地，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含一个所述重链可变区且缺失轻链。
13.特异性识别和/或结合SARS-Cov-2的N蛋白的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段，其特征在于，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含至少一个重链可变区；所述重链可变区具有：
如SEQ ID NO:2所示的CDR1、如SEQ ID NO:5所示的CDR2和如SEQ ID NO:8所示的CDR3；
或，如SEQ ID NO:3所示的CDR1、如SEQ ID NO:6所示的CDR2和如SEQ ID NO:9所示的CDR3；
或，如SEQ ID NO:4所示的CDR1、如SEQ ID NO:7所示的CDR2和如SEQ ID NO:10所示的CDR3；
优选地，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含一个所述重链可变区且缺失轻链。
14.特异性识别和/或结合SARS-Cov-2的N蛋白的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段，其特征在于，其特征在于，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含至少一个重链可变区；所述重链可变区具有：
如SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列，或SEQ ID NO:11所示的氨基酸序列经过一个或多个氨基酸添加、删除、替换或修饰获得的保守性变异体；
或，如SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列，或SEQ ID NO:12所示的氨基酸序列经过一个或多个氨基酸添加、删除、替换或修饰获得的保守性变异体；
或，如SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列，或SEQ ID NO:13所示的氨基酸序列经过一个或多个氨基酸添加、删除、替换或修饰获得的保守性变异体；
优选地，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段包含一个所述重链可变区且缺失轻链。
15.编码SEQ ID NO:2～SEQ ID NO:13任意一条序列所示氨基酸序列或权利要求1～5或11～14任意一项所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的核苷酸序列；
优选地，编码所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的核苷酸序列选自如下序列：SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15和SEQ ID NO:16。
16.含有权利要求15所述核苷酸序列的表达载体；
优选地，所述表达载体为噬菌体表达载体，优选为噬菌体表面展示筛选载体；
更优选地，所述表达载体中还含有编码噬菌体包膜蛋白pIII的核苷酸序列。
17.外源转入了权利要求16所述表达载体的病毒；所述病毒优选为噬菌体。
18.外源转入了权利要求8所述表达载体或被权利要求9所述病毒侵染的宿主细胞，优选为大肠杆菌。
19.利用所述权利要求18所述宿主细胞表达抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段的方法。
20.利用权利要求18所述所述宿主细胞表达获得的抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
21.权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段经人源化后获得的人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
22.蛋白偶联物，其特征在于，包含权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段和配体；
优选地，所述配体选自放射性同位素、荧光基团和递送载体。
23.药物组合物，其特征在于，包含权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或权利要求22所述蛋白偶联物；
优选地，所述药物组合物中还含有其它活性成分和/或辅料。
24.嵌合抗原受体，其特征在于，包含权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
25.表达权利要求24所述的嵌合抗原受体的嵌合抗原受体T细胞。
26.权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、权利要求7所述抗体文库或多克隆抗体、权利要求9所述抗原特异性抗体文库或与抗原特异性结合的多克隆抗体、权利要求15所述核苷酸序列、权利要求16所述表达载体、权利要求17所述病毒、权利要求18所述宿主细胞、权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、权利要求22所述蛋白偶联物、权利要求23所述药物组合物、权利要求24所述嵌合抗原受体或权利要求25所述嵌合抗原受体T细胞在制备预防SARS-Cov-2感染和/或治疗由SARS-Cov-2感染引起疾病的药物中的应用。
27.体外检测SARS-Cov-2或SARS-Cov-2的N蛋白的试剂盒，其特征在于，包含权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段；
优选地，所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段经标记物标记；
更优选地，所述标记物选自酶、化学发光基团和同位素基团。
28.权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、权利要求22所述蛋白偶联物或权利要求27所述试剂盒在体外检测SARS-Cov-2或SARS-Cov-2的N蛋白中的应用。
29.利用权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段、权利要求22所述蛋白偶联物或权利要求27所述试剂盒检测样品中SARS-Cov-2或SARS-Cov-2的N蛋白的方法。
30.检测SARS-Cov-2感染的造影剂，其特征在于，包含权利要求1～5、11～14或20所述抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段或权利要求21所述人源化抗原结合蛋白、抗体或抗体活性片段。
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