CN114414704B - 评估甲状腺结节恶性程度或概率的系统、模型及试剂盒 - Google Patents

评估甲状腺结节恶性程度或概率的系统、模型及试剂盒 Download PDF

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Abstract

本发明涉及一种评估甲状腺结节恶性程度或概率的系统、模型及试剂盒。本发明的方法包括采用压力循环技术对细针穿刺组织活检样本进行处理，通过高效液相色谱方法和质谱方法检测所得到的样本中目标蛋白或多肽的蛋白质组学数据，通过质谱数据的肽段峰面积信息进行处理和AI建模后，得到最终的评估结果（恶性概率），能够为临床提供甲状腺结节恶性程度的参考，其中，对于现有临床无法鉴定的甲状腺结节，亦能够同时提供第二个评估结果（恶性概率）供医生参考。本发明还提供相应的试剂盒、系统、评估模型及相关用途。

Description

评估甲状腺结节恶性程度或概率的系统、模型及试剂盒
技术领域
本发明涉及医学检测领域，并具体涉及一种基于靶向检测蛋白或多肽与机器学习对甲状腺结节恶性程度评估的方法。
背景技术
甲状腺结节（Thyroid Nodules）是一种常见的临床病症，根据尸检报告显示，甲状腺结节在普通人群中发病率约50%至60%，多发于女性人群。绝大多数甲状腺结节患者没有临床症状，常常是通过体检或自身触摸发现。在通过病理检查发现的甲状腺结节中，只有5%至15%的结节为恶性结节，即甲状腺癌。
目前临床指南推荐的甲状腺结节的评估主要基于以下三点：一是高分辨率的超声探查，二是血生化指标，三是细针穿刺组织活检（Fine needle aspiration biopsy, FNAB或FNA）。在以上三种检查中，FNA被认为是对可疑甲状腺结节患者的临床管理中最敏感、最经济的可靠检测方法。然而，FNA结果符合率的高与低通常需要取决于穿刺操作者、细胞病理医生的技术和经验，并且仍有15%至30%的甲状腺结节不能通过FNA和细胞病理学得到清楚地评估。针对不确定性甲状腺结节的处理方式，主流观点是进行甲状腺全切或近半切。但大多数术后病理证实为良性结节，这显然会导致过度诊断和过度治疗。
因此目前临床上的诊断标准和治疗方案对无症状的甲状腺结节患者并无益处。患者将支付高昂的手术费用以及甲状腺切除后需终身服用替代激素，甚至承担手术可能会带来的甲状腺危象及术后复发等风险。
近年来，随着分子技术的发展，为了提高对不确定性甲状腺结节的精准诊断，基于甲状腺组织DNA与RNA的分子诊断方法应运而生。在美国，目前已有两个基于基因检测的用于划分此类结节的类别检查推向临床，一个是Afirma，另一个是ThyroSeq。虽然二者具有很高NPV（Negative Predictive Value），但其PPV（Positive Predictive Value）很低。换言之，这两种方法仅对部分的良性结节有很好的分类，对于是否有恶性嫌疑则无法精准确定，因此这两种方法对可能的过度治疗并无明显改善。
蛋白质是生命活动的执行者，是生命表型的最终体现。定量蛋白质组学研究可从蛋白质组层面阐释某种生物现象的发生发展原因与规律，对生命科学以及人类自身疾病诊疗有重大意义。对于肿瘤组织和非肿瘤组织的定量蛋白质组研究，可能发现某种或某些肿瘤特异的蛋白质作为疾病的标志物，可用于肿瘤的早期诊断、确诊与分型。
发明内容
本发明涉及一种新型检测方法——基于靶向检测蛋白（多肽）与机器学习对甲状腺结节恶性程度评估的方法。
在一个方面，本发明提供一种基于靶向检测蛋白或多肽与机器学习对受试者的甲状腺结节恶性程度或恶性概率进行评估的非诊断方法，包括：
a）提供受试者的细针穿刺组织活检即FNA样本；
b）采用压力循环技术（Pressure Cycling Technology, PCT）对样本进行前处理；
c）检测所得到的样本中目标蛋白或多肽的蛋白质组学数据，其中所述目标蛋白或多肽包括选自表1的蛋白或多肽，并且所述蛋白质组学数据通过高效液相色谱方法和质谱方法获得；
d）分析所得到的蛋白质组学数据，其中所述分析包括将所得到的蛋白质组学数据输入AI模型；以及
e）输出结果，其中对于临床上不确定或者难以评判的甲状腺结节，提供恶性概率结果，
其中所述蛋白质组学数据包括MRM离子对和峰面积。
本发明所涉及的质谱多反应监测（Multiple Reaction Monitoring，MRM）技术即质谱MRM技术，是一种基于已知信息或假定信息有针对性地获取数据从而进行质谱信号采集的技术。对于MRM技术而言关键在于首先要能够检测到具有特异性的母离子，然后只将选定的特异性母离子进行碰撞诱导（collision-induced），最后去除其他子离子的干扰，只对选定的特异子离子进行质谱信号的采集。由于三重四级杆质谱（triple quadrupolesystem, TQS）是进行单一质荷比扫描最灵敏的质谱系统，因此是最适合MRM分析的质谱仪器。
MRM技术能够在三重四级杆第一极（Q1）和第三极（Q3）中分别选择检测特定母离子和子离子，在母离子和子离子两个水平排除干扰，增强检测特异性。因此，本发明还涉及相应蛋白或多肽的母子离子对。
本发明所涉及的保留时间是指肽段通过色谱柱后出峰的时间。
本发明所涉及的碰撞电压是指母离子在质谱碰撞室中发生碎裂时的电压。
本发明所涉及的峰面积是指母子离子对色谱峰面积。
在一个实施方案中，该实施方案的评估方法中的d）步骤的分析包括建立AI模型，所述建立AI模型包括将回顾性数据集分为训练集、验证集和独立测试集，其中对于每个提供样本的单位，如果该单位的送样批次M≥2，则从该M批数据中随机选出一个批次的数据划分至独立测试集，而剩余M-1个批次的数据划分至训练集和验证集；
任选地，其中建立AI模型还包括将划分至训练集和验证集的数据根据质谱产生的时间顺序划分为约70%的训练集和约30%的验证集；
进一步任选地，其中建立AI模型还包括将前瞻性数据集作为第二独立测试集，该前瞻性数据集的样本批次和质谱时间均严格独立于回顾性数据集。
在另一个实施方案中，该实施方案的评估方法中的建立AI模型还包括计算样本中三种噪声蛋白HBB、THYG和H4的单个蛋白峰面积占总蛋白峰面积和以及这三种蛋白峰面积和占总蛋白峰面积和的比例，其中当单个蛋白的比例>70%或这三种蛋白峰面积和的比例>95%时，确定该样本为不合格样本；
任选地，其中建立的AI模型，还包括使用了去除包含极高峰度的蛋白或多肽的样本，其中去除的蛋白或多肽包括VNVDEVGGEALGR、EFTPPVQAAYQK、LALQFTTNPK、LAAQSTLSFYQR、LEDIPVASLPDLHDIER、FLQGDHFGTSPR、QVDQFLGVPYAAPPLAERR、GGADVASIHLLTAR、RISGLIYEETR、ISGLIYEETR和VFLENVIR。
在又一个实施方案中，该实施方案的评估方法中的质谱方法包括将从色谱柱流出的蛋白或多肽在三重四级杆质谱仪上使用正离子模式下的Scheduled MRM™模式进行数据采集，任选地Schedule窗口为2.5分钟。
在另一个方面，本发明提供目标蛋白或多肽作为检测靶标在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于基于靶向检测蛋白或多肽与机器学习对受试者的甲状腺结节恶性程度或恶性概率进行评估，其中所述试剂盒包含检测目标蛋白或多肽的工具，并且其中所述目标蛋白或多肽包括选自表1的蛋白或多肽。
在一个实施方案中，该实施方案的用途所涉及的评估包括：
a）提供受试者的细针穿刺组织活检即FNA样本；
b）采用压力循环技术即PCT技术对样本进行前处理；
c）检测所得到的样本中目标蛋白或多肽的蛋白质组学数据，其中所述目标蛋白或多肽包括选自表1的蛋白或多肽，并且所述蛋白质组学数据通过高效液相色谱方法和质谱方法获得；
d）分析所得到的蛋白质组学数据，其中所述分析包括将所得到的蛋白质组学数据输入AI模型；以及
e）输出结果，其中对于临床上不确定或者难以评判的甲状腺结节，提供恶性概率结果，
其中所述蛋白质组学数据包括母子离子对、保留时间、碰撞电压（CE）和峰面积。
在另一个实施方案中，该实施方案的用途的评估的d）步骤的分析包括建立AI模型，所述建立AI模型包括将回顾性数据集分为训练集、验证集和独立测试集，其中对于每个提供样本的单位，如果该单位的送样批次M≥2，则从该M批数据中随机选出一个批次的数据划分至独立测试集，而剩余M-1个批次的数据划分至训练集和验证集；
任选地，其中建立AI模型还包括将划分至训练集和验证集的数据根据质谱产生的时间顺序划分为约70%的训练集和约30%的验证集；
进一步任选地，其中建立AI模型还包括将前瞻性数据集作为第二独立测试集，该前瞻性数据集的样本批次和质谱时间均严格独立于回顾性数据集。
在又一个实施方案中，该实施方案的用途中的建立AI模型还包括计算样本中三种噪声蛋白HBB、THYG和H4的单个蛋白峰面积占总蛋白峰面积和以及这三种蛋白峰面积和占总蛋白峰面积和的比例，其中当单个蛋白的比例>70%或这三种蛋白峰面积和的比例>95%时，确定该样本为不合格样本；
任选地，其中建立AI模型还包括去除包含极高峰度的蛋白或多肽的样本，其中去除的蛋白或多肽包括VNVDEVGGEALGR、EFTPPVQAAYQK、LALQFTTNPK、LAAQSTLSFYQR、LEDIPVASLPDLHDIER、FLQGDHFGTSPR、QVDQFLGVPYAAPPLAERR、GGADVASIHLLTAR、RISGLIYEETR、ISGLIYEETR和VFLENVIR。
在另一个实施方案中，该实施方案的用途的评估所涉及的质谱方法包括将从色谱柱流出的蛋白或多肽在三重四级杆质谱仪上使用正离子模式下的Scheduled MRM™模式进行数据采集，任选地Schedule窗口为2.5分钟。
在又一个方面，本发明还提供一种系统，其用于基于靶向检测蛋白或多肽与机器学习对受试者的甲状腺结节恶性程度或恶性概率进行评估，所述系统包含：
i）采集装置，其采集受试者的细针穿刺组织活检即FNA样本；
ii）样本前处理装置，其采用压力循环技术即PCT技术对样本进行前处理；
iii）检测装置，其检测所得到的样本中目标蛋白或多肽的蛋白质组学数据，其中所述目标蛋白或多肽包括选自表1的蛋白或多肽，并且所述蛋白质组学数据通过高效液相色谱方法和质谱方法获得；
iv）分析装置，其分析所得到的蛋白质组学数据，其中所述分析包括将所得到的蛋白质组学数据输入AI模型；以及
v）输出装置，其输出结果，其中对于临床上不确定或者难以评判的甲状腺结节，提供恶性概率结果，
其中所述蛋白质组学数据包括母子离子对、保留时间、碰撞电压（CE）和峰面积。
在一个实施方案中，该实施方案的iv）的分析包括建立AI模型，所述建立AI模型包括将回顾性数据集分为训练集、验证集和独立测试集，其中对于每个提供样本的单位，如果该单位的送样批次M≥2，则从该M批数据中随机选出一个批次的数据划分至独立测试集，而剩余M-1个批次的数据划分至训练集和验证集；
任选地，其中建立AI模型还包括将划分至训练集和验证集的数据根据质谱产生的时间顺序划分为约70%的训练集和约30%的验证集；
进一步任选地，其中建立AI模型还包括将前瞻性数据集作为第二独立测试集，该前瞻性数据集的样本批次和质谱时间均严格独立于回顾性数据集。
在又一个实施方案中，该实施方案涉及的建立AI模型还包括计算样本中三种噪声蛋白HBB、THYG和H4的单个蛋白峰面积占总蛋白峰面积和以及这三种蛋白峰面积和占总蛋白峰面积和的比例，其中当单个蛋白的比例>70%或这三种蛋白峰面积和的比例>95%时，确定该样本为不合格样本；
任选地，其中建立AI模型还包括去除包含极高峰度的蛋白或多肽的样本，其中去除的蛋白或多肽包括VNVDEVGGEALGR、EFTPPVQAAYQK、LALQFTTNPK、LAAQSTLSFYQR、LEDIPVASLPDLHDIER、FLQGDHFGTSPR、QVDQFLGVPYAAPPLAERR、GGADVASIHLLTAR、RISGLIYEETR、ISGLIYEETR和VFLENVIR。
在另一个实施方案中，该实施方案所涉及的质谱方法包括将从色谱柱流出的蛋白或多肽在三重四极杆质谱仪上使用正离子模式下的Scheduled MRM™模式进行数据采集，任选地Schedule窗口为2.5分钟。
在另一个方面，本发明还提供一种对受试者的甲状腺结节恶性程度或恶性概率进行评估的评估模型，其中通过将具有甲状腺结节不同恶性程度的受试者的细针穿刺组织活检即FNA样本的目标蛋白或多肽的蛋白质组学数据作为训练数据训练机器学习模型而得到该评估模型，其中所述目标蛋白或多肽包括选自表1的蛋白或多肽，并且其中对于临床上不确定或者难以评判的甲状腺结节，提供恶性概率结果，
其中所述蛋白质组学数据包括母子离子对、保留时间、碰撞电压（CE）和峰面积。
在一个实施方案中，该实施方案的评估模型所涉及的评估包括建立AI模型，所述建立AI模型包括将回顾性数据集分为训练集、验证集和独立测试集，其中对于每个提供样本的单位，如果该单位的送样批次M≥2，则从该M批数据中随机选出一个批次的数据划分至独立测试集，而剩余M-1个批次的数据划分至训练集和验证集；
任选地，其中建立AI模型还包括将划分至训练集和验证集的数据根据质谱产生的时间顺序划分为约70%的训练集和约30%的验证集；
进一步任选地，其中建立AI模型还包括将前瞻性数据集作为第二独立测试集，该前瞻性数据集的样本批次和质谱时间均严格独立于回顾性数据集。
在另一个实施方案中，该实施方案的评估模型中的评估所涉及的建立AI模型还包括计算样本中三种噪声蛋白HBB、THYG和H4的单个蛋白峰面积占总蛋白峰面积和以及这三种蛋白峰面积和占总蛋白峰面积和的比例，其中当单个蛋白的比例>70%或这三种蛋白峰面积和的比例>95%时，确定该样本为不合格样本；
任选地，其中建立AI模型还包括去除包含极高峰度的蛋白或多肽的样本，其中去除的蛋白或多肽包括VNVDEVGGEALGR、EFTPPVQAAYQK、LALQFTTNPK、LAAQSTLSFYQR、LEDIPVASLPDLHDIER、FLQGDHFGTSPR、QVDQFLGVPYAAPPLAERR、GGADVASIHLLTAR、RISGLIYEETR、ISGLIYEETR和VFLENVIR。
本发明通过高效液相色谱方法和质谱方法检测所得到的样本中目标蛋白或多肽的蛋白质组学数据，通过质谱数据的肽段峰面积信息进行处理和AI建模后，得到最终的评估结果（恶性概率），能够为临床提供甲状腺结节恶性程度的参考，其中，对于现有临床无法鉴定的甲状腺结节，亦能够同时提供第二个评估结果（恶性概率）供医生参考。
附图说明
图1显示的是本发明的AI流程图。
图2显示的是本发明建立训练数据集和测试集的示意图。
图3显示的是本发明的一个实施例中的第一比较实验的结果。
图4显示的是本发明的一个实施例中的第二比较实验的结果。
图5显示的是本发明的模型预测的ROC图。
具体实施方式
以下通过实施例来示例性展示本发明的具体实施方式，但是，应当理解的是，本发明并不局限于此。
除非明确指明，否则本发明所用到的试剂、仪器、装置等均为市售可获得的产品。
实施例
实施例1——建立临床多中心前瞻性队列。
首先建立一个全国多中心临床试验进行样本采集。
纳入标准：
（1）年龄≥18岁，≤70岁；
（2）未经药物治疗的甲状腺结节初治患者；
（3）甲状腺结节≥5mm，甲状腺细针穿刺，Bethesda III/IV；
（4）行甲状腺全/部分切除术，并有对应细胞病理穿刺结节的组织学报告；
（5）患者知情同意后自愿参与研究。
排除标准：
（1）未经手术患者；
（2）样本量不足；
本研究共计采集3120例样本，排除不符合标准的样本后剩余2450样本进行样本前处理与数据采集。
实施例2——压力循环系统辅助的FNA样本处理方法。
FNA穿刺样本通过超声引导或术中使用19-27 g注射器针头进行反复抽吸穿刺获取。穿刺样本首先通过0.5 mL红细胞裂解液进行低温4 ℃进行裂解，反应5 min后放入离心机，300 g离心10 min。离心后，弃除溶液，保留离心后剩余的细胞。
随后，采用PCT技术样本进行前处理。
PCT是一项新兴的半自动化组织裂解和蛋白质、多肽提取的样本制备技术，在小体积（150微升）的容器内，通过超高压（最高达45k psi）和标准大气压循环促进组织和细胞的溶解，加速蛋白质水解和酶解。PCT的主要特点是半自动化处理微量样本（约0.1 mg组织/千余个细胞），保证了样本制备过程的稳定性和可重复性，在众多生物学领域得到广泛应用。
作为一个实例，PCT样本制备系统是一套基于压力循环技术的完整工作流程，由Barocycler 2320EXT设备（可同时处理16个样本）和MicroTube、MicroPestle、MicroCaps等耗材组成，如应用于蛋白质组学，可在4-5小时内从组织中提取出可用于质谱分析的肽段。
在本实施例中，去除红细胞后的甲状腺穿刺样本，加入裂解液（6 M尿素，2 M硫脲）、还原剂（tris (2-carboxyethyl) phosphine，TCEP）、烷基化试剂碘乙酰胺（iodoacetamide，IAA）在PCT管中进行反应，反应时仪器参数设置：90 cycles, 每个cycle包括45,000 psi, 30 s， 以及10 s off-time。反应结束后，加入0.75-1.5 μg LysC和2.5-5 μg Trypsin两种酶在PCT中加速反应，反应条件为：120 cycles, 每个cycle包括20,000psi, 50 s，以及10 s off-time。消化结束后，多肽通过C18柱进行脱盐。最后，洁净干燥的多肽进行后续分析。
实施例3——候选蛋白挑选。
本实施例筛选出有利于甲状腺结节良性恶性判定的候选肽段及相应的母子离子。
i）前期研究中发现的14个蛋白组合和20个蛋白组合；
ii）前期研究中的模型挑选出诊断滤泡癌与滤泡腺瘤的49个蛋白；
iii）前期研究中的数据里获取的滤泡癌与滤泡腺瘤的差异蛋白；
iv）临床中免疫组织化学染色的47个蛋白；
v）文献中报道的与甲状腺癌相关的76个蛋白；
本发明人将以上渠道获取的蛋白进行合并后，初始侯选池共涵盖212个蛋白。
接下来，本发明人筛选出121个蛋白及537个母子离子对作为后续构建模型的母子离子对数据库（表1）。
表1 候选蛋白及相应母子离子对（第1－3栏）：
编号 Accession name 肽段氨基酸序列
1 ANXA1_HUMAN GLGTDEDTLIEILASR
2 ANXA1_HUMAN GLGTDEDTLIEILASR
3 ANXA1_HUMAN GLGTDEDTLIEILASR
4 ANXA1_HUMAN GTDVNVFNTILTTR
5 ANXA1_HUMAN GTDVNVFNTILTTR
6 ANXA1_HUMAN GTDVNVFNTILTTR
7 H4_HUMAN RISGLIYEETR
8 H4_HUMAN RISGLIYEETR
9 H4_HUMAN RISGLIYEETR
10 H4_HUMAN ISGLIYEETR
11 H4_HUMAN ISGLIYEETR
12 H4_HUMAN ISGLIYEETR
13 H4_HUMAN VFLENVIR
14 H4_HUMAN VFLENVIR
15 H4_HUMAN VFLENVIR
16 THYG_HUMAN LALQFTTNPK
17 THYG_HUMAN LALQFTTNPK
18 THYG_HUMAN LALQFTTNPK
19 THYG_HUMAN LAAQSTLSFYQR
20 THYG_HUMAN LAAQSTLSFYQR
21 THYG_HUMAN LAAQSTLSFYQR
22 THYG_HUMAN LEDIPVASLPDLHDIER
23 THYG_HUMAN LEDIPVASLPDLHDIER
24 THYG_HUMAN LEDIPVASLPDLHDIER
25 THYG_HUMAN FLQGDHFGTSPR
26 THYG_HUMAN FLQGDHFGTSPR
27 THYG_HUMAN FLQGDHFGTSPR
28 THYG_HUMAN QVDQFLGVPYAAPPLAERR
29 THYG_HUMAN QVDQFLGVPYAAPPLAERR
30 THYG_HUMAN QVDQFLGVPYAAPPLAERR
31 THYG_HUMAN GGADVASIHLLTAR
32 THYG_HUMAN GGADVASIHLLTAR
33 THYG_HUMAN GGADVASIHLLTAR
34 ROA2_HUMAN GFGFVTFSSMAEVDAAMAARPHSIDGR
35 ROA2_HUMAN GFGFVTFSSMAEVDAAMAARPHSIDGR
36 ROA2_HUMAN GFGFVTFSSMAEVDAAMAARPHSIDGR
37 ROA2_HUMAN GFGFVTFDDHDPVDK
38 ROA2_HUMAN GFGFVTFDDHDPVDK
39 ROA2_HUMAN GFGFVTFDDHDPVDK
40 TAGL2_HUMAN YGINTTDIFQTVDLWEGK
41 TAGL2_HUMAN YGINTTDIFQTVDLWEGK
42 TAGL2_HUMAN YGINTTDIFQTVDLWEGK
43 TAGL2_HUMAN NVIGLQMGTNR
44 TAGL2_HUMAN NVIGLQMGTNR
45 TAGL2_HUMAN NVIGLQMGTNR
46 DDX1_HUMAN GIDIHGVPYVINVTLPDEK
47 DDX1_HUMAN GIDIHGVPYVINVTLPDEK
48 DDX1_HUMAN GIDIHGVPYVINVTLPDEK
49 U2AF2_HUMAN LGGLTQAPGNPVLAVQINQDK
50 U2AF2_HUMAN LGGLTQAPGNPVLAVQINQDK
51 U2AF2_HUMAN LGGLTQAPGNPVLAVQINQDK
52 U2AF2_HUMAN ELLTSFGPLK
53 U2AF2_HUMAN ELLTSFGPLK
54 U2AF2_HUMAN ELLTSFGPLK
55 PRDX1_HUMAN ATAVMPDGQFK
56 PRDX1_HUMAN ATAVMPDGQFK
57 PRDX1_HUMAN ATAVMPDGQFK
58 PRDX1_HUMAN LVQAFQFTDK
59 PRDX1_HUMAN LVQAFQFTDK
60 PRDX1_HUMAN LVQAFQFTDK
61 HNRPD_HUMAN MFIGGLSWDTTK
62 HNRPD_HUMAN MFIGGLSWDTTK
63 HNRPD_HUMAN MFIGGLSWDTTK
64 HNRPD_HUMAN IFVGGLSPDTPEEK
65 HNRPD_HUMAN IFVGGLSPDTPEEK
66 HNRPD_HUMAN IFVGGLSPDTPEEK
67 DUT_HUMAN ARPAEVGGMQLR
68 DUT_HUMAN ARPAEVGGMQLR
69 DUT_HUMAN ARPAEVGGMQLR
70 DUT_HUMAN GNVGVVLFNFGK
71 DUT_HUMAN GNVGVVLFNFGK
72 DUT_HUMAN GNVGVVLFNFGK
73 RPN2_HUMAN SIVEEIEDLVAR
74 RPN2_HUMAN SIVEEIEDLVAR
75 RPN2_HUMAN SIVEEIEDLVAR
76 RPN2_HUMAN LQVTNVLSQPLTQATVK
77 RPN2_HUMAN LQVTNVLSQPLTQATVK
78 RPN2_HUMAN LQVTNVLSQPLTQATVK
79 PRAF2_HUMAN ALDDFVLGSAR
80 PRAF2_HUMAN ALDDFVLGSAR
81 PRAF2_HUMAN ALDDFVLGSAR
82 ETHE1_HUMAN GGSGAPILLR
83 ETHE1_HUMAN GGSGAPILLR
84 ETHE1_HUMAN EAVLIDPVLETAPR
85 ETHE1_HUMAN EAVLIDPVLETAPR
86 ETHE1_HUMAN EAVLIDPVLETAPR
87 CLUS_HUMAN ELDESLQVAER
88 CLUS_HUMAN ELDESLQVAER
89 CLUS_HUMAN ELDESLQVAER
90 CLUS_HUMAN LFDSDPITVTVPVEVSR
91 CLUS_HUMAN LFDSDPITVTVPVEVSR
92 CLUS_HUMAN LFDSDPITVTVPVEVSR
93 VIME_HUMAN EEAENTLQSFR
94 VIME_HUMAN EEAENTLQSFR
95 VIME_HUMAN EEAENTLQSFR
96 VIME_HUMAN EMEENFAVEAANYQDTIGR
97 VIME_HUMAN EMEENFAVEAANYQDTIGR
98 VIME_HUMAN EMEENFAVEAANYQDTIGR
99 ACADM_HUMAN LLVEHQAISFMLAEMAMK
100 ACADM_HUMAN LLVEHQAISFMLAEMAMK
101 ACADM_HUMAN LLVEHQAISFMLAEMAMK
102 LAMB1_HUMAN TFRPAAMLIER
103 LAMB1_HUMAN TFRPAAMLIER
104 LAMB1_HUMAN TFRPAAMLIER
105 CATB_HUMAN NGPVEGAFSVYSDFLLYK
106 CATB_HUMAN NGPVEGAFSVYSDFLLYK
107 CATB_HUMAN NGPVEGAFSVYSDFLLYK
108 CATB_HUMAN SGVYQHVTGEMMGGHAIR
109 CATB_HUMAN SGVYQHVTGEMMGGHAIR
110 CATB_HUMAN SGVYQHVTGEMMGGHAIR
111 LDHB_HUMAN MVVESAYEVIK
112 LDHB_HUMAN MVVESAYEVIK
113 LDHB_HUMAN MVVESAYEVIK
114 LDHB_HUMAN SADTLWDIQK
115 LDHB_HUMAN SADTLWDIQK
116 LDHB_HUMAN SADTLWDIQK
117 NUCL_HUMAN EVFEDAAEIR
118 NUCL_HUMAN EVFEDAAEIR
119 NUCL_HUMAN EVFEDAAEIR
120 NUCL_HUMAN GFGFVDFNSEEDAK
121 NUCL_HUMAN GFGFVDFNSEEDAK
122 NUCL_HUMAN GFGFVDFNSEEDAK
123 ELAV1_HUMAN VLVDQTTGLSR
124 ELAV1_HUMAN VLVDQTTGLSR
125 ELAV1_HUMAN VLVDQTTGLSR
126 DHB4_HUMAN GALVVVNDLGGDFK
127 DHB4_HUMAN GALVVVNDLGGDFK
128 DHB4_HUMAN GALVVVNDLGGDFK
129 DHB4_HUMAN LGLLGLANSLAIEGR
130 DHB4_HUMAN LGLLGLANSLAIEGR
131 DHB4_HUMAN LGLLGLANSLAIEGR
132 SYWC_HUMAN ALIEVLQPLIAEHQAR
133 SYWC_HUMAN ALIEVLQPLIAEHQAR
134 SYWC_HUMAN ALIEVLQPLIAEHQAR
135 DSG2_HUMAN AWITAPVALR
136 DSG2_HUMAN AWITAPVALR
137 DSG2_HUMAN AWITAPVALR
138 PHB2_HUMAN IPWFQYPIIYDIR
139 PHB2_HUMAN IPWFQYPIIYDIR
140 PHB2_HUMAN IPWFQYPIIYDIR
141 PHB2_HUMAN IVQAEGEAEAAK
142 PHB2_HUMAN IVQAEGEAEAAK
143 PHB2_HUMAN IVQAEGEAEAAK
144 GELS_HUMAN EVQGFESATFLGYFK
145 GELS_HUMAN EVQGFESATFLGYFK
146 GELS_HUMAN EVQGFESATFLGYFK
147 GELS_HUMAN TGAQELLR
148 GELS_HUMAN TGAQELLR
149 GELS_HUMAN TGAQELLR
150 PARK7_HUMAN GPGTSFEFALAIVEALNGK
151 PARK7_HUMAN GPGTSFEFALAIVEALNGK
152 PARK7_HUMAN GPGTSFEFALAIVEALNGK
153 TALDO_HUMAN WLHNEDQMAVEK
154 TALDO_HUMAN WLHNEDQMAVEK
155 TALDO_HUMAN WLHNEDQMAVEK
156 DDX5_HUMAN QVSDLISVLR
157 DDX5_HUMAN QVSDLISVLR
158 DDX5_HUMAN QVSDLISVLR
159 SRSF1_HUMAN EDMTYAVR
160 SRSF1_HUMAN EDMTYAVR
161 SRSF1_HUMAN EDMTYAVR
162 PRDX5_HUMAN VNLAELFK
163 PRDX5_HUMAN VNLAELFK
164 PRDX5_HUMAN VNLAELFK
165 PRDX5_HUMAN FSMVVQDGIVK
166 PRDX5_HUMAN FSMVVQDGIVK
167 PRDX5_HUMAN FSMVVQDGIVK
168 MVP_HUMAN DAQGLVLFDVTGQVR
169 MVP_HUMAN DAQGLVLFDVTGQVR
170 MVP_HUMAN DAQGLVLFDVTGQVR
171 SDHA_HUMAN LGANSLLDLVVFGR
172 SDHA_HUMAN LGANSLLDLVVFGR
173 SDHA_HUMAN LGANSLLDLVVFGR
174 HDGF_HUMAN IDEMPEAAVK
175 HDGF_HUMAN IDEMPEAAVK
176 HDGF_HUMAN IDEMPEAAVK
177 PARP1_HUMAN SLQELFLAHILSPWGAEVK
178 PARP1_HUMAN SLQELFLAHILSPWGAEVK
179 PARP1_HUMAN SLQELFLAHILSPWGAEVK
180 CALR_HUMAN FYALSASFEPFSNK
181 CALR_HUMAN FYALSASFEPFSNK
182 CALR_HUMAN FYALSASFEPFSNK
183 CALR_HUMAN GQTLVVQFTVK
184 CALR_HUMAN GQTLVVQFTVK
185 CALR_HUMAN GQTLVVQFTVK
186 PEBP1_HUMAN WSGPLSLQEVDEQPQHPLHVTYAGAAVDELGK
187 PEBP1_HUMAN WSGPLSLQEVDEQPQHPLHVTYAGAAVDELGK
188 PEBP1_HUMAN WSGPLSLQEVDEQPQHPLHVTYAGAAVDELGK
189 PEBP1_HUMAN GNDISSGTVLSDYVGSGPPK
190 PEBP1_HUMAN GNDISSGTVLSDYVGSGPPK
191 PEBP1_HUMAN GNDISSGTVLSDYVGSGPPK
192 S10A4_HUMAN ALDVMVSTFHK
193 S10A4_HUMAN ALDVMVSTFHK
194 S10A4_HUMAN ALDVMVSTFHK
195 S10A4_HUMAN ELPSFLGK
196 S10A4_HUMAN ELPSFLGK
197 S10A4_HUMAN ELPSFLGK
198 TBCA_HUMAN LEAAYLDLQR
199 TBCA_HUMAN LEAAYLDLQR
200 TBCA_HUMAN LEAAYLDLQR
201 LMNA_HUMAN MQQQLDEYQELLDIK
202 LMNA_HUMAN MQQQLDEYQELLDIK
203 LMNA_HUMAN MQQQLDEYQELLDIK
204 LMNA_HUMAN LALDMEIHAYR
205 LMNA_HUMAN LALDMEIHAYR
206 LMNA_HUMAN LALDMEIHAYR
207 ACTN4_HUMAN ISIEMNGTLEDQLSHLK
208 ACTN4_HUMAN ISIEMNGTLEDQLSHLK
209 ACTN4_HUMAN ISIEMNGTLEDQLSHLK
210 PHB_HUMAN DLQNVNITLR
211 PHB_HUMAN DLQNVNITLR
212 PHB_HUMAN DLQNVNITLR
213 PHB_HUMAN IFTSIGEDYDER
214 PHB_HUMAN IFTSIGEDYDER
215 PHB_HUMAN IFTSIGEDYDER
216 VDAC3_HUMAN LSQNNFALGYK
217 VDAC3_HUMAN LSQNNFALGYK
218 VDAC3_HUMAN LSQNNFALGYK
219 VDAC3_HUMAN VNNASLIGLGYTQTLRPGVK
220 VDAC3_HUMAN VNNASLIGLGYTQTLRPGVK
221 VDAC3_HUMAN VNNASLIGLGYTQTLRPGVK
222 EMD_HUMAN YNIPHGPVVGSTR
223 EMD_HUMAN YNIPHGPVVGSTR
224 EMD_HUMAN YNIPHGPVVGSTR
225 HNRPU_HUMAN LSASSLTMESFAFLWAGGR
226 HNRPU_HUMAN LSASSLTMESFAFLWAGGR
227 HNRPU_HUMAN LSASSLTMESFAFLWAGGR
228 PGK1_HUMAN AHSSMVGVNLPQK
229 PGK1_HUMAN AHSSMVGVNLPQK
230 PGK1_HUMAN AHSSMVGVNLPQK
231 PGK1_HUMAN VLNNMEIGTSLFDEEGAK
232 PGK1_HUMAN VLNNMEIGTSLFDEEGAK
233 PGK1_HUMAN VLNNMEIGTSLFDEEGAK
234 NONO_HUMAN FGQAATMEGIGAIGGTPPAFNR
235 NONO_HUMAN FGQAATMEGIGAIGGTPPAFNR
236 NONO_HUMAN FGQAATMEGIGAIGGTPPAFNR
237 AOFA_HUMAN ASIAGHMFDVVVIGGGISGLSAAK
238 AOFA_HUMAN ASIAGHMFDVVVIGGGISGLSAAK
239 AOFA_HUMAN ASIAGHMFDVVVIGGGISGLSAAK
240 AOFA_HUMAN LLTEYGVSVLVLEAR
241 AOFA_HUMAN LLTEYGVSVLVLEAR
242 AOFA_HUMAN LLTEYGVSVLVLEAR
243 HNRPL_HUMAN AITHLNNNFMFGQK
244 HNRPL_HUMAN AITHLNNNFMFGQK
245 HNRPL_HUMAN AITHLNNNFMFGQK
246 HNRPL_HUMAN SDALETLGFLNHYQMK
247 HNRPL_HUMAN SDALETLGFLNHYQMK
248 HNRPL_HUMAN SDALETLGFLNHYQMK
249 APEX1_HUMAN QGFGELLQAVPLADSFR
250 APEX1_HUMAN QGFGELLQAVPLADSFR
251 APEX1_HUMAN QGFGELLQAVPLADSFR
252 CO1A1_HUMAN GESGPSGPAGPTGAR
253 CO1A1_HUMAN GESGPSGPAGPTGAR
254 CO1A1_HUMAN GESGPSGPAGPTGAR
255 XRCC5_HUMAN HLMLPDFDLLEDIESK
256 XRCC5_HUMAN HLMLPDFDLLEDIESK
257 XRCC5_HUMAN HLMLPDFDLLEDIESK
258 FINC_HUMAN IYLYTLNDNAR
259 FINC_HUMAN IYLYTLNDNAR
260 FINC_HUMAN IYLYTLNDNAR
261 FINC_HUMAN SSPVVIDASTAIDAPSNLR
262 FINC_HUMAN SSPVVIDASTAIDAPSNLR
263 FINC_HUMAN SSPVVIDASTAIDAPSNLR
264 CD44_HUMAN YGFIEGHVVIPR
265 CD44_HUMAN YGFIEGHVVIPR
266 CD44_HUMAN YGFIEGHVVIPR
267 H15_HUMAN ALAAGGYDVEK
268 H15_HUMAN ALAAGGYDVEK
269 H15_HUMAN ALAAGGYDVEK
270 S10A6_HUMAN LQDAEIAR
271 S10A6_HUMAN LQDAEIAR
272 S10A6_HUMAN LQDAEIAR
273 S10A6_HUMAN LMEDLDR
274 S10A6_HUMAN LMEDLDR
275 S10A6_HUMAN LMEDLDR
276 HBB_HUMAN VNVDEVGGEALGR
277 HBB_HUMAN VNVDEVGGEALGR
278 HBB_HUMAN VNVDEVGGEALGR
279 HBB_HUMAN EFTPPVQAAYQK
280 HBB_HUMAN EFTPPVQAAYQK
281 HBB_HUMAN EFTPPVQAAYQK
282 DNS2A_HUMAN ALINSPEGAVGR
283 DNS2A_HUMAN ALINSPEGAVGR
284 DNS2A_HUMAN ALINSPEGAVGR
285 FETUA_HUMAN HTLNQIDEVK
286 FETUA_HUMAN HTLNQIDEVK
287 FETUA_HUMAN HTLNQIDEVK
288 FETUA_HUMAN FSVVYAK
289 FETUA_HUMAN FSVVYAK
290 FETUA_HUMAN FSVVYAK
291 CBX5_HUMAN GQVEYLLK
292 CBX5_HUMAN GQVEYLLK
293 CBX5_HUMAN GQVEYLLK
294 SIAE_HUMAN FFPFGLVQLSSDLSK
295 SIAE_HUMAN FFPFGLVQLSSDLSK
296 SIAE_HUMAN FFPFGLVQLSSDLSK
297 PSME1_HUMAN NAYAVLYDIILK
298 PSME1_HUMAN NAYAVLYDIILK
299 PSME1_HUMAN NAYAVLYDIILK
300 PRDX3_HUMAN DYGVLLEGSGLALR
301 PRDX3_HUMAN DYGVLLEGSGLALR
302 PRDX3_HUMAN DYGVLLEGSGLALR
303 PRDX3_HUMAN GLFIIDPNGVIK
304 PRDX3_HUMAN GLFIIDPNGVIK
305 PRDX3_HUMAN GLFIIDPNGVIK
306 CAH2_HUMAN AVQQPDGLAVLGIFLK
307 CAH2_HUMAN AVQQPDGLAVLGIFLK
308 CAH2_HUMAN AVQQPDGLAVLGIFLK
309 RAB7A_HUMAN VIILGDSGVGK
310 RAB7A_HUMAN VIILGDSGVGK
311 RAB7A_HUMAN VIILGDSGVGK
312 RAB7A_HUMAN EAINVEQAFQTIAR
313 RAB7A_HUMAN EAINVEQAFQTIAR
314 RAB7A_HUMAN EAINVEQAFQTIAR
315 CO1A2_HUMAN GETGPSGPVGPAGAVGPR
316 CO1A2_HUMAN GETGPSGPVGPAGAVGPR
317 CO1A2_HUMAN GETGPSGPVGPAGAVGPR
318 CO1A2_HUMAN GETGPSGPVGPAGAVGPR
319 CRYAB_HUMAN HFSPEELK
320 CRYAB_HUMAN HFSPEELK
321 CRYAB_HUMAN HFSPEELK
322 KPYM_HUMAN LAPITSDPTEATAVGAVEASFK
323 KPYM_HUMAN LAPITSDPTEATAVGAVEASFK
324 KPYM_HUMAN LAPITSDPTEATAVGAVEASFK
325 PDIA3_HUMAN GFPTIYFSPANK
326 PDIA3_HUMAN GFPTIYFSPANK
327 PDIA3_HUMAN GFPTIYFSPANK
328 PDIA3_HUMAN ELSDFISYLQR
329 PDIA3_HUMAN ELSDFISYLQR
330 PDIA3_HUMAN ELSDFISYLQR
331 LDHA_HUMAN QVVESAYEVIK
332 LDHA_HUMAN QVVESAYEVIK
333 LDHA_HUMAN QVVESAYEVIK
334 LDHA_HUMAN VTLTSEEEAR
335 LDHA_HUMAN VTLTSEEEAR
336 LDHA_HUMAN VTLTSEEEAR
337 RPN1_HUMAN ATSFLLALEPELEAR
338 RPN1_HUMAN ATSFLLALEPELEAR
339 RPN1_HUMAN ATSFLLALEPELEAR
340 S10AD_HUMAN SLDVNQDSELK
341 S10AD_HUMAN SLDVNQDSELK
342 S10AD_HUMAN SLDVNQDSELK
343 ACADS_HUMAN LADMALALESAR
344 ACADS_HUMAN LADMALALESAR
345 ACADS_HUMAN LADMALALESAR
346 ACADS_HUMAN LAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAER
347 ACADS_HUMAN LAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAER
348 ACADS_HUMAN LAASEAATAISHQAIQILGGMGYVTEMPAER
349 KAD1_HUMAN IIFVVGGPGSGK
350 KAD1_HUMAN IIFVVGGPGSGK
351 KAD1_HUMAN IIFVVGGPGSGK
352 ANXA1_HUMAN ALTGHLEEVVLALLK
353 ANXA1_HUMAN ALTGHLEEVVLALLK
354 ANXA1_HUMAN ALTGHLEEVVLALLK
355 HSPB1_HUMAN LFDQAFGLPR
356 HSPB1_HUMAN LFDQAFGLPR
357 HSPB1_HUMAN LFDQAFGLPR
358 HSPB1_HUMAN LPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPPAAIESPAVAAPAYSR
359 HSPB1_HUMAN LPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPPAAIESPAVAAPAYSR
360 HSPB1_HUMAN LPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPPAAIESPAVAAPAYSR
361 G3P_HUMAN VIISAPSADAPMFVMGVNHEK
362 G3P_HUMAN VIISAPSADAPMFVMGVNHEK
363 G3P_HUMAN VIISAPSADAPMFVMGVNHEK
364 G3P_HUMAN VIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQK
365 G3P_HUMAN VIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQK
366 G3P_HUMAN VIHDNFGIVEGLMTTVHAITATQK
367 HEXB_HUMAN LAPGTIVEVWK
368 HEXB_HUMAN LAPGTIVEVWK
369 HEXB_HUMAN LAPGTIVEVWK
370 SNX5_HUMAN NFLINYYNR
371 SNX5_HUMAN NFLINYYNR
372 SNX5_HUMAN NFLINYYNR
373 S10A1_HUMAN ELLQTELSGFLDAQK
374 S10A1_HUMAN ELLQTELSGFLDAQK
375 S10A1_HUMAN ELLQTELSGFLDAQK
376 PURA_HUMAN NSITVPYK
377 PURA_HUMAN NSITVPYK
378 PURA_HUMAN NSITVPYK
379 ANXA2_HUMAN GVDEVTIVNILTNR
380 ANXA2_HUMAN GVDEVTIVNILTNR
381 ANXA2_HUMAN GVDEVTIVNILTNR
382 ANXA2_HUMAN QDIAFAYQR
383 ANXA2_HUMAN QDIAFAYQR
384 ANXA2_HUMAN QDIAFAYQR
385 POSTN_HUMAN VLTQIGTSIQDFIEAEDDLSSFR
386 POSTN_HUMAN VLTQIGTSIQDFIEAEDDLSSFR
387 POSTN_HUMAN VLTQIGTSIQDFIEAEDDLSSFR
388 H2AY_HUMAN QTAAQLILK
389 H2AY_HUMAN QTAAQLILK
390 H2AY_HUMAN QTAAQLILK
391 HINT1_HUMAN IIFEDDR
392 HINT1_HUMAN IIFEDDR
393 HINT1_HUMAN IIFEDDR
394 GSTP1_HUMAN FQDGDLTLYQSNTILR
395 GSTP1_HUMAN FQDGDLTLYQSNTILR
396 GSTP1_HUMAN FQDGDLTLYQSNTILR
397 GSTP1_HUMAN ALPGQLKPFETLLSQNQGGK
398 GSTP1_HUMAN ALPGQLKPFETLLSQNQGGK
399 GSTP1_HUMAN ALPGQLKPFETLLSQNQGGK
400 RL27A_HUMAN LWTLVSEQTR
401 RL27A_HUMAN LWTLVSEQTR
402 RL27A_HUMAN LWTLVSEQTR
403 RL27A_HUMAN TGAAPIIDVVR
404 RL27A_HUMAN TGAAPIIDVVR
405 RL27A_HUMAN TGAAPIIDVVR
406 PDIA6_HUMAN HHSLGGQYGVQGFPTIK
407 PDIA6_HUMAN HHSLGGQYGVQGFPTIK
408 PDIA6_HUMAN HHSLGGQYGVQGFPTIK
409 PDIA6_HUMAN GSFSEQGINEFLR
410 PDIA6_HUMAN GSFSEQGINEFLR
411 PDIA6_HUMAN GSFSEQGINEFLR
412 RTRAF_HUMAN HILGFDTGDAVLNEAAQILR
413 RTRAF_HUMAN HILGFDTGDAVLNEAAQILR
414 RTRAF_HUMAN HILGFDTGDAVLNEAAQILR
415 TPM3_HUMAN AADAEAEVASLNR
416 TPM3_HUMAN AADAEAEVASLNR
417 TPM3_HUMAN AADAEAEVASLNR
418 XRCC6_HUMAN FTVPMLK
419 XRCC6_HUMAN FTVPMLK
420 XRCC6_HUMAN FTVPMLK
421 THOC4_HUMAN MDMSLDDIIK
422 THOC4_HUMAN MDMSLDDIIK
423 THOC4_HUMAN MDMSLDDIIK
424 PRDX2_HUMAN ATAVVDGAFK
425 PRDX2_HUMAN ATAVVDGAFK
426 PRDX2_HUMAN ATAVVDGAFK
427 APOE_HUMAN LAVYQAGAR
428 APOE_HUMAN LAVYQAGAR
429 APOE_HUMAN LAVYQAGAR
430 APOE_HUMAN LGPLVEQGR
431 APOE_HUMAN LGPLVEQGR
432 APOE_HUMAN LGPLVEQGR
433 MOES_HUMAN ISQLEMAR
434 MOES_HUMAN ISQLEMAR
435 MOES_HUMAN ISQLEMAR
436 CBR1_HUMAN VVNVSSIMSVR
437 CBR1_HUMAN VVNVSSIMSVR
438 CBR1_HUMAN VVNVSSIMSVR
439 CYTB_HUMAN SQVVAGTNYFIK
440 CYTB_HUMAN SQVVAGTNYFIK
441 CYTB_HUMAN SQVVAGTNYFIK
442 SODM_HUMAN GDVTAQIALQPALK
443 SODM_HUMAN GDVTAQIALQPALK
444 SODM_HUMAN GDVTAQIALQPALK
445 SODM_HUMAN AIWNVINWENVTER
446 SODM_HUMAN AIWNVINWENVTER
447 SODM_HUMAN AIWNVINWENVTER
448 THY1_HUMAN VLYLSAFTSK
449 THY1_HUMAN VLYLSAFTSK
450 THY1_HUMAN VLYLSAFTSK
451 LEG3_HUMAN IALDFQR
452 LEG3_HUMAN IALDFQR
453 LEG3_HUMAN IALDFQR
454 LEG3_HUMAN IQVLVEPDHFK
455 LEG3_HUMAN IQVLVEPDHFK
456 LEG3_HUMAN IQVLVEPDHFK
457 LEMD2_HUMAN AVEFLASNESR
458 LEMD2_HUMAN AVEFLASNESR
459 LEMD2_HUMAN AVEFLASNESR
460 SMD3_HUMAN VAQLEQVYIR
461 SMD3_HUMAN VAQLEQVYIR
462 SMD3_HUMAN VAQLEQVYIR
463 SMD3_HUMAN FLILPDMLK
464 SMD3_HUMAN FLILPDMLK
465 SMD3_HUMAN FLILPDMLK
466 IGKC_HUMAN TVAAPSVFIFPPSDEQLK
467 IGKC_HUMAN TVAAPSVFIFPPSDEQLK
468 IGKC_HUMAN TVAAPSVFIFPPSDEQLK
469 PPIA_HUMAN FEDENFILK
470 PPIA_HUMAN FEDENFILK
471 PPIA_HUMAN FEDENFILK
472 PPIA_HUMAN EGMNIVEAMER
473 PPIA_HUMAN EGMNIVEAMER
474 PPIA_HUMAN EGMNIVEAMER
475 LEG1_HUMAN SFVLNLGK
476 LEG1_HUMAN SFVLNLGK
477 LEG1_HUMAN SFVLNLGK
478 LEG1_HUMAN LNLEAINYMAADGDFK
479 LEG1_HUMAN LNLEAINYMAADGDFK
480 LEG1_HUMAN LNLEAINYMAADGDFK
481 S10AB_HUMAN DGYNYTLSK
482 S10AB_HUMAN DGYNYTLSK
483 S10AB_HUMAN DGYNYTLSK
484 S10AB_HUMAN TEFLSFMNTELAAFTK
485 S10AB_HUMAN TEFLSFMNTELAAFTK
486 S10AB_HUMAN TEFLSFMNTELAAFTK
487 DPYL3_HUMAN SAADLISQAR
488 DPYL3_HUMAN SAADLISQAR
489 DPYL3_HUMAN SAADLISQAR
490 VDAC2_HUMAN YQLDPTASISAK
491 VDAC2_HUMAN YQLDPTASISAK
492 VDAC2_HUMAN YQLDPTASISAK
493 VDAC2_HUMAN LTLSALVDGK
494 VDAC2_HUMAN LTLSALVDGK
495 VDAC2_HUMAN LTLSALVDGK
496 BDH2_HUMAN VIILTAAAQGIGQAAALAFAR
497 BDH2_HUMAN VIILTAAAQGIGQAAALAFAR
498 BDH2_HUMAN VIILTAAAQGIGQAAALAFAR
499 ERP29_HUMAN ESYPVFYLFR
500 ERP29_HUMAN ESYPVFYLFR
501 ERP29_HUMAN ESYPVFYLFR
502 A2AP_HUMAN DFLQSLK
503 A2AP_HUMAN DFLQSLK
504 A2AP_HUMAN DFLQSLK
505 PGAM1_HUMAN HGESAWNLENR
506 PGAM1_HUMAN HGESAWNLENR
507 PGAM1_HUMAN HGESAWNLENR
508 CHMP3_HUMAN IPEIQATMR
509 CHMP3_HUMAN IPEIQATMR
510 CHMP3_HUMAN IPEIQATMR
511 MTAP_HUMAN SLLLTTIPQIGSTEWSETLHNLK
512 MTAP_HUMAN SLLLTTIPQIGSTEWSETLHNLK
513 MTAP_HUMAN SLLLTTIPQIGSTEWSETLHNLK
514 SRPRB_HUMAN LIQQQLEK
515 SRPRB_HUMAN LIQQQLEK
516 SRPRB_HUMAN LIQQQLEK
517 MYH9_HUMAN IMGIPEEEQMGLLR
518 MYH9_HUMAN IMGIPEEEQMGLLR
519 MYH9_HUMAN IMGIPEEEQMGLLR
520 LIPE_HUMAN MLDWLQEK
521 LIPE_HUMAN MLDWLQEK
522 LIPE_HUMAN MLDWLQEK
523 BCAM_HUMAN EASGLLSLTSTLYLR
524 BCAM_HUMAN EASGLLSLTSTLYLR
525 BCAM_HUMAN EASGLLSLTSTLYLR
526 SF3B1_HUMAN ILVVIEPLLIDEDYYAR
527 SF3B1_HUMAN ILVVIEPLLIDEDYYAR
528 SF3B1_HUMAN ILVVIEPLLIDEDYYAR
529 PEPL_HUMAN NQLLQEELEALQLQLR
530 PEPL_HUMAN NQLLQEELEALQLQLR
531 PEPL_HUMAN NQLLQEELEALQLQLR
532 ANXA7_HUMAN EFSGYVESGLK
533 ANXA7_HUMAN EFSGYVESGLK
534 ANXA7_HUMAN EFSGYVESGLK
535 C1QBP_HUMAN MSGGWELELNGTEAK
536 C1QBP_HUMAN MSGGWELELNGTEAK
537 C1QBP_HUMAN MSGGWELELNGTEAK
续表1（第1栏和第4-6栏）
编号 Q1 Q3 保留时间(min)
1 851.947 1015.615 17.33
2 851.947 801.483 17.33
3 851.947 688.399 17.33
4 775.912 1178.653 15.62
5 775.912 965.541 15.62
6 775.912 377.214 15.62
7 446.245 697.315 10.11
8 446.245 527.33 10.11
9 446.245 640.414 10.11
10 590.814 980.505 10.99
11 590.814 810.399 10.99
12 590.814 697.315 10.99
13 495.293 743.441 13.4
14 495.293 630.357 13.4
15 495.293 501.314 13.4
16 566.822 835.431 12.06
17 566.822 707.372 12.06
18 566.822 474.761 12.06
19 692.865 1001.505 11.56
20 692.865 914.473 11.56
21 692.865 700.341 11.56
22 644.674 994.495 14.82
23 644.674 731.388 14.82
24 644.674 358.161 14.82
25 681.333 1101.507 8.94
26 681.333 973.449 8.94
27 681.333 801.4 8.94
28 709.716 755.43 14.17
29 709.716 698.888 14.17
30 709.716 620.844 14.17
31 690.883 981.584 12.19
32 690.883 910.547 12.19
33 690.883 710.431 12.19
34 943.115 1160.544 15.9
35 943.115 1110.02 15.9
36 943.115 1036.486 15.9
37 848.386 1188.517 13.56
38 848.386 458.261 13.56
39 848.386 409.187 13.56
40 1050.518 1222.61 17.85
41 1050.518 747.367 17.85
42 1050.518 519.256 17.85
43 601.819 989.52 11.3
44 601.819 876.436 11.3
45 601.819 706.33 11.3
46 693.709 915.478 15.39
47 693.709 702.367 15.39
48 693.709 488.235 15.39
49 711.727 1028.573 13.78
50 711.727 915.489 13.78
51 711.727 909.479 13.78
52 552.819 862.503 14.32
53 552.819 749.419 14.32
54 552.819 648.372 14.32
55 582.79 822.381 9.68
56 582.79 691.341 9.68
57 582.79 343.198 9.68
58 598.819 984.479 12.32
59 598.819 856.42 12.32
60 598.819 785.383 12.32
61 678.337 1077.557 14.89
62 678.337 964.473 14.89
63 678.337 737.346 14.89
64 744.883 1129.537 12.02
65 744.883 902.41 12.02
66 744.883 815.378 12.02
67 428.9 661.345 8.47
68 428.9 604.324 8.47
69 428.9 525.278 8.47
70 625.848 980.556 15.3
71 625.848 725.398 15.3
72 625.848 612.314 15.3
73 686.87 1073.547 18.23
74 686.87 944.505 18.23
75 686.87 702.378 18.23
76 920.531 1185.684 14.17
77 920.531 1072.6 14.17
78 920.531 857.509 14.17
79 582.306 979.484 13.43
80 582.306 602.362 13.43
81 582.306 503.294 13.43
82 470.782 611.424 11.36
83 470.782 330.141 11.36
84 761.927 1110.615 14.59
85 761.927 997.531 14.59
86 761.927 882.504 14.59
87 644.823 1046.511 10.02
88 644.823 802.442 10.02
89 644.823 602.326 10.02
90 937.499 1086.615 15.33
91 937.499 985.568 15.33
92 937.499 686.383 15.33
93 662.312 1065.532 9.74
94 662.312 865.453 9.74
95 662.312 537.278 9.74
96 729.66 966.464 12.78
97 729.66 689.358 12.78
98 729.66 561.299 12.78
99 688.023 924.435 17.27
100 688.023 793.395 17.27
101 688.023 680.311 17.27
102 435.576 530.33 12.15
103 435.576 644.352 12.15
104 435.576 775.392 12.15
105 1003.499 1234.635 17.5
106 1003.499 1048.535 17.5
107 1003.499 917.967 17.5
108 965.457 1159.535 9.82
109 965.457 1058.487 9.82
110 965.457 771.378 9.82
111 634.334 1037.551 12.19
112 634.334 938.483 12.19
113 634.334 809.44 12.19
114 588.798 1018.52 12.23
115 588.798 802.446 12.23
116 588.798 689.362 12.23
117 589.788 950.458 10.73
118 589.788 674.347 10.73
119 589.788 488.283 10.73
120 781.344 1153.501 13.84
121 781.344 1054.432 13.84
122 781.344 792.337 13.84
123 594.833 976.506 9.24
124 594.833 877.437 9.24
125 594.833 634.352 9.24
126 702.38 1063.542 14.28
127 702.38 964.473 14.28
128 702.38 865.405 14.28
129 748.943 1100.606 17.13
130 748.943 930.5 17.13
131 748.943 638.424 17.13
132 601.016 1034.574 15.71
133 601.016 808.96 15.71
134 601.016 687.896 15.71
135 549.327 840.53 14.13
136 549.327 727.446 14.13
137 549.327 555.361 14.13
138 575.312 679.377 18.29
139 575.312 672.35 18.29
140 575.312 835.414 18.29
141 608.314 1003.469 6.13
142 608.314 875.411 6.13
143 608.314 675.331 6.13
144 861.922 1162.578 16.27
145 861.922 1033.535 16.27
146 861.922 774.419 16.27
147 444.251 729.425 8.89
148 444.251 658.388 8.89
149 444.251 530.33 8.89
150 641.007 730.409 20.95
151 641.007 894.399 20.95
152 641.007 1078.52 20.95
153 500.57 705.36 8.51
154 500.57 577.301 8.51
155 500.57 446.261 8.51
156 565.332 902.531 14.61
157 565.332 587.388 14.61
158 565.332 474.303 14.61
159 492.726 609.336 8.05
160 492.726 508.288 8.05
161 492.726 345.224 8.05
162 467.274 720.429 15.28
163 467.274 607.345 15.28
164 467.274 536.308 15.28
165 611.829 988.55 12.72
166 611.829 857.509 12.72
167 611.829 758.441 12.72
168 809.433 1133.631 15.96
169 809.433 1034.563 15.96
170 809.433 921.479 15.96
171 737.425 918.541 19.05
172 737.425 805.457 19.05
173 737.425 577.346 19.05
174 551.776 989.461 8.98
175 551.776 874.434 8.98
176 551.776 614.351 8.98
177 713.393 873.446 18.74
178 713.393 969.528 18.74
179 713.393 458.225 18.74
180 804.391 955.452 15.17
181 804.391 592.309 15.17
182 804.391 382.176 15.17
183 610.356 1034.625 13.25
184 610.356 820.493 13.25
185 610.356 721.424 13.25
186 868.685 930.489 13.88
187 868.685 859.452 13.88
188 868.685 1002.021 13.88
189 650.653 1006.484 12.47
190 650.653 542.293 12.47
191 650.653 400.183 12.47
192 416.553 718.388 11.83
193 416.553 619.32 11.83
194 416.553 532.288 11.83
195 445.753 648.372 12.83
196 445.753 551.319 12.83
197 445.753 464.287 12.83
198 596.322 949.51 12.08
199 596.322 807.436 12.08
200 596.322 314.171 12.08
201 631.98 858.493 14.89
202 631.98 730.435 14.89
203 631.98 629.308 14.89
204 666.342 1034.472 12.36
205 666.342 919.445 12.36
206 666.342 409.219 12.36
207 643.331 907.951 14.28
208 643.331 864.435 14.28
209 643.331 807.893 14.28
210 593.333 829.489 12.11
211 593.333 616.378 12.11
212 593.333 570.288 12.11
213 722.833 1184.507 11.17
214 722.833 1083.459 11.17
215 722.833 883.343 11.17
216 627.828 926.473 10.94
217 627.828 367.198 10.94
218 627.828 571.285 10.94
219 701.064 944.536 13.03
220 701.064 851.996 13.03
221 701.064 751.938 13.03
222 466.249 560.317 9.19
223 466.249 503.775 9.19
224 466.249 455.249 9.19
225 1016.004 1240.611 19.09
226 1016.004 1111.568 19.09
227 1016.004 1024.536 19.09
228 456.575 599.351 9.1
229 456.575 514.208 9.1
230 456.575 670.298 9.1
231 983.975 1153.537 14.67
232 983.975 795.352 14.67
233 983.975 701.329 14.67
234 721.693 916.464 14.05
235 721.693 859.442 14.05
236 721.693 701.373 14.05
237 753.072 1030.589 16.24
238 753.072 917.505 16.24
239 753.072 746.441 16.24
240 554.654 700.435 16.55
241 554.654 587.351 16.55
242 554.654 488.283 16.55
243 545.608 610.302 11.83
244 545.608 479.261 11.83
245 545.608 878.448 11.83
246 622.973 569.275 14.85
247 622.973 832.927 14.85
248 622.973 569.279 14.85
249 924.486 1103.584 17.85
250 924.486 975.526 17.85
251 924.486 805.42 17.85
252 649.31 967.496 5.82
253 649.31 726.389 5.82
254 649.31 484.251 5.82
255 638.989 720.341 17.85
256 638.989 969.45 17.85
257 638.989 720.347 17.85
258 678.351 1079.548 12.34
259 678.351 966.464 12.34
260 678.351 803.401 12.34
261 957.002 1144.596 13.15
262 957.002 772.395 13.15
263 957.002 657.368 13.15
264 462.922 583.393 12.43
265 462.922 612.348 12.43
266 462.922 510.303 12.43
267 547.28 909.431 8.21
268 547.28 838.394 8.21
269 547.28 767.357 8.21
270 458.248 802.405 7.04
271 458.248 674.347 7.04
272 458.248 559.32 7.04
273 446.216 778.34 8.61
274 446.216 647.299 8.61
275 446.216 518.257 8.61
276 657.836 1002.485 10.7
277 657.836 758.416 10.7
278 657.836 659.347 10.7
279 460.238 708.367 10.8
280 460.238 580.309 10.8
281 460.238 501.274 10.8
282 592.325 886.438 9.82
283 592.325 772.395 9.82
284 592.325 685.363 9.82
285 598.817 1059.568 7.58
286 598.817 958.52 7.58
287 598.817 951.453 7.58
288 407.229 666.382 9.81
289 407.229 579.35 9.81
290 407.229 480.282 9.81
291 475.271 764.455 11.07
292 475.271 665.387 11.07
293 475.271 536.344 11.07
294 562.303 749.404 18.87
295 562.303 636.32 18.87
296 562.303 695.882 18.87
297 698.398 1210.708 17.87
298 698.398 976.608 17.87
299 698.398 877.539 17.87
300 731.899 1028.61 15.39
301 731.899 915.526 15.39
302 731.899 336.119 15.39
303 643.379 855.493 16.2
304 643.379 742.409 16.2
305 643.379 627.382 16.2
306 556.994 789.523 19.16
307 556.994 577.371 19.16
308 556.994 880.452 19.16
309 529.316 845.473 11.53
310 529.316 732.389 11.53
311 529.316 619.305 11.53
312 795.418 1063.553 15.24
313 795.418 934.51 15.24
314 795.418 806.452 15.24
315 781.9 977.553 8.81
316 781.9 688.868 8.81
317 781.9 638.344 8.81
318 781.9 609.833 8.81
319 493.751 849.435 8
320 493.751 615.335 8
321 493.751 727.305 8
322 725.711 907.488 14.91
323 725.711 808.42 14.91
324 725.711 680.361 14.91
325 671.346 826.409 14.13
326 671.346 569.301 14.13
327 671.346 826.413 14.13
328 685.851 1128.568 15.58
329 685.851 779.441 15.58
330 685.851 666.357 15.58
331 632.843 1037.551 11.13
332 632.843 938.483 11.13
333 632.843 809.44 11.13
334 567.786 934.448 7.33
335 567.786 821.364 7.33
336 567.786 720.316 7.33
337 830.451 956.505 17.17
338 830.451 843.421 17.17
339 830.451 714.378 17.17
340 624.309 1047.495 8.56
341 624.309 833.4 8.56
342 624.309 316.15 8.56
343 630.834 830.473 13.39
344 630.834 759.436 13.39
345 630.834 646.352 13.39
346 797.404 833.382 18.08
347 797.404 732.334 18.08
348 797.404 472.251 18.08
349 565.832 904.489 12.81
350 565.832 658.352 12.81
351 565.832 559.283 12.81
352 803.482 1126.708 18.64
353 803.482 1013.624 18.64
354 803.482 711.422 18.64
355 582.314 903.468 14.21
356 582.314 660.383 14.21
357 582.314 525.772 14.21
358 1024.021 1002.537 17.33
359 1024.021 735.378 17.33
360 1024.021 593.304 17.33
361 738.375 1000.982 14.34
362 738.375 944.44 14.34
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364 865.792 1069.6 17.94
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366 865.792 1181.595 17.94
367 606.853 931.525 14.13
368 606.853 773.456 14.13
369 606.853 514.792 14.13
370 608.809 955.5 12.72
371 608.809 842.416 12.72
372 608.809 729.331 12.72
373 564.633 865.441 16.12
374 564.633 778.409 16.12
375 564.633 714.367 16.12
376 461.256 720.429 8.98
377 461.256 607.345 8.98
378 461.256 407.229 8.98
379 771.928 1043.621 16.41
380 771.928 829.489 16.41
381 771.928 730.421 16.41
382 556.28 755.383 10.3
383 556.28 684.346 10.3
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385 862.097 1168.512 18.95
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388 493.306 756.498 11.55
389 493.306 614.424 11.55
390 493.306 486.365 11.55
391 454.23 794.368 9.87
392 454.23 681.284 9.87
393 454.23 534.215 9.87
394 942.479 1208.663 13.91
395 942.479 994.532 13.91
396 942.479 831.468 13.91
397 709.392 831.432 14.67
398 709.392 718.348 14.67
399 709.392 648.372 14.67
400 616.835 933.5 12.9
401 616.835 719.368 12.9
402 616.835 620.3 12.9
403 556.327 882.541 12.72
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405 556.327 301.187 12.72
406 457.239 790.446 10.99
407 457.239 662.387 10.99
408 457.239 458.297 10.99
409 742.362 1105.564 13.74
410 742.362 976.521 13.74
411 742.362 848.462 13.74
412 718.383 1027.589 17.9
413 718.383 914.505 17.9
414 718.383 1027.484 17.9
415 658.826 1059.543 8.39
416 658.826 788.426 8.39
417 658.826 489.278 8.39
418 418.241 688.406 13.52
419 418.241 587.359 13.52
420 418.241 488.29 13.52
421 590.783 1049.518 14.85
422 590.783 934.491 14.85
423 590.783 803.451 14.85
424 489.766 806.441 9.26
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427 474.767 764.405 7.95
428 474.767 665.337 7.95
429 474.767 502.273 7.95
430 484.78 588.31 9.28
431 484.78 489.242 9.28
432 484.78 399.727 9.28
433 474.253 834.414 8.65
434 474.253 747.382 8.65
435 474.253 619.323 8.65
436 595.832 992.519 13.1
437 595.832 779.408 13.1
438 595.832 313.187 13.1
439 663.856 1012.546 11.79
440 663.856 913.478 11.79
441 663.856 842.441 11.79
442 712.909 853.551 12.65
443 712.909 740.466 12.65
444 712.909 428.287 12.65
445 872.444 1160.569 16.4
446 872.444 1047.485 16.4
447 872.444 933.442 16.4
448 564.819 916.477 13.86
449 564.819 753.414 13.86
450 564.819 640.33 13.86
451 431.743 749.394 11.47
452 431.743 678.357 11.47
453 431.743 565.273 11.47
454 662.867 1083.583 11.58
455 662.867 984.515 11.58
456 662.867 871.431 11.58
457 611.807 776.39 10.53
458 611.807 663.306 10.53
459 611.807 592.269 10.53
460 609.846 920.52 11.41
461 609.846 807.436 11.41
462 609.846 678.393 11.41
463 545.322 829.485 17.13
464 545.322 716.401 17.13
465 545.322 603.317 17.13
466 973.517 1173.615 15.94
467 973.517 1060.531 15.94
468 973.517 913.463 15.94
469 577.79 1007.504 12.78
470 577.79 878.462 12.78
471 577.79 634.392 12.78
472 639.794 734.35 13.06
473 639.794 635.282 13.06
474 639.794 506.239 13.06
475 439.261 643.414 13.1
476 439.261 544.345 13.1
477 439.261 431.261 13.1
478 892.93 1244.562 15.15
479 892.93 1131.478 15.15
480 892.93 541.298 15.15
481 530.751 725.383 8.26
482 530.751 611.34 8.26
483 530.751 448.277 8.26
484 925.456 1125.561 18.53
485 925.456 994.52 18.53
486 925.456 378.166 18.53
487 516.278 687.415 9.46
488 516.278 574.331 9.46
489 516.278 461.247 9.46
490 647.338 1002.547 10.79
491 647.338 889.463 10.79
492 647.338 774.436 10.79
493 508.803 903.515 13.72
494 508.803 802.467 13.72
495 508.803 689.383 13.72
496 676.065 975.537 18.9
497 676.065 719.42 18.9
498 676.065 648.383 18.9
499 660.835 941.524 17.07
500 660.835 745.403 17.07
501 660.835 552.797 17.07
502 425.737 588.372 12.65
503 425.737 475.287 12.65
504 425.737 347.229 12.65
505 438.206 645.331 8.41
506 438.206 531.289 8.41
507 438.206 482.199 8.41
508 529.787 848.429 10.73
509 529.787 478.244 10.73
510 529.787 473.245 10.73
511 861.134 1078.055 17.36
512 861.134 920.465 17.36
513 861.134 314.207 17.36
514 500.295 773.415 8.24
515 500.295 645.357 8.24
516 500.295 517.298 8.24
517 539.278 458.309 14.68
518 539.278 601.298 14.68
519 539.278 415.237 14.68
520 531.768 931.488 13.49
521 531.768 818.404 13.49
522 531.768 703.377 13.49
523 812.451 1166.678 17.22
524 812.451 1053.594 17.22
525 812.451 853.478 17.22
526 678.71 1044.463 18.69
527 678.71 931.379 18.69
528 678.71 877.576 18.69
529 646.693 970.568 17.7
530 646.693 841.525 17.7
531 646.693 657.404 17.7
532 608.298 939.478 10.66
533 608.298 632.361 10.66
534 608.298 533.293 10.66
535 811.38 1103.558 12.91
536 811.38 974.515 12.91
537 811.38 861.431 12.91
续表1（第1栏和第7-8栏）
编号 ID CE
1 sp|P04083|ANXA1_HUMAN.GLGTDEDTLIEILASR.+2y9.light 40.7
2 sp|P04083|ANXA1_HUMAN.GLGTDEDTLIEILASR.+2y7.light 40.7
3 sp|P04083|ANXA1_HUMAN.GLGTDEDTLIEILASR.+2y6.light 37.7
4 sp|P04083|ANXA1_HUMAN.GTDVNVFNTILTTR.+2y10.light 37
5 sp|P04083|ANXA1_HUMAN.GTDVNVFNTILTTR.+2y8.light 37
6 sp|P04083|ANXA1_HUMAN.GTDVNVFNTILTTR.+2y3.light 37
7 sp|P62805|H4_HUMAN.RISGLIYEETR.+3y5.light 19.4
8 sp|P62805|H4_HUMAN.RISGLIYEETR.+3b5.light 19.4
9 sp|P62805|H4_HUMAN.RISGLIYEETR.+3b6.light 19.4
10 sp|P62805|H4_HUMAN.ISGLIYEETR.+2y8.light 27.9
11 sp|P62805|H4_HUMAN.ISGLIYEETR.+2y6.light 27.9
12 sp|P62805|H4_HUMAN.ISGLIYEETR.+2y5.light 24.9
13 sp|P62805|H4_HUMAN.VFLENVIR.+2y6.light 23.3
14 sp|P62805|H4_HUMAN.VFLENVIR.+2y5.light 23.3
15 sp|P62805|H4_HUMAN.VFLENVIR.+2y4.light 23.3
16 sp|P01266|THYG_HUMAN.LALQFTTNPK.+2y7.light 26.8
17 sp|P01266|THYG_HUMAN.LALQFTTNPK.+2y6.light 26.8
18 sp|P01266|THYG_HUMAN.LALQFTTNPK.+2y8+2.light 26.8
19 sp|P01266|THYG_HUMAN.LAAQSTLSFYQR.+2y8.light 33
20 sp|P01266|THYG_HUMAN.LAAQSTLSFYQR.+2y7.light 33
21 sp|P01266|THYG_HUMAN.LAAQSTLSFYQR.+2y5.light 33
22 sp|P01266|THYG_HUMAN.LEDIPVASLPDLHDIER.+3y8.light 28.9
23 sp|P01266|THYG_HUMAN.LEDIPVASLPDLHDIER.+3y13+2.light 28.9
24 sp|P01266|THYG_HUMAN.LEDIPVASLPDLHDIER.+3b3.light 28.9
25 sp|P01266|THYG_HUMAN.FLQGDHFGTSPR.+2y10.light 32.4
26 sp|P01266|THYG_HUMAN.FLQGDHFGTSPR.+2y9.light 32.4
27 sp|P01266|THYG_HUMAN.FLQGDHFGTSPR.+2y7.light 32.4
28 sp|P01266|THYG_HUMAN.QVDQFLGVPYAAPPLAERR.+3y14+2.light 32.1
29 sp|P01266|THYG_HUMAN.QVDQFLGVPYAAPPLAERR.+3y13+2.light 32.1
30 sp|P01266|THYG_HUMAN.QVDQFLGVPYAAPPLAERR.+3y11+2.light 32.1
31 sp|P01266|THYG_HUMAN.GGADVASIHLLTAR.+2y9.light 32.9
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454 sp|P17931|LEG3_HUMAN.IQVLVEPDHFK.+2y9.light 31.5
455 sp|P17931|LEG3_HUMAN.IQVLVEPDHFK.+2y8.light 31.5
456 sp|P17931|LEG3_HUMAN.IQVLVEPDHFK.+2y7.light 37.5
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489 sp|Q14195|DPYL3_HUMAN.SAADLISQAR.+2y4.light 24.3
490 sp|P45880|VDAC2_HUMAN.YQLDPTASISAK.+2y10.light 27.7
491 sp|P45880|VDAC2_HUMAN.YQLDPTASISAK.+2y9.light 27.7
492 sp|P45880|VDAC2_HUMAN.YQLDPTASISAK.+2y8.light 36.7
493 sp|P45880|VDAC2_HUMAN.LTLSALVDGK.+2y9.light 29.9
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495 sp|P45880|VDAC2_HUMAN.LTLSALVDGK.+2y7.light 23.9
496 sp|Q9BUT1|BDH2_HUMAN.VIILTAAAQGIGQAAALAFAR.+3y10.light 33.5
497 sp|Q9BUT1|BDH2_HUMAN.VIILTAAAQGIGQAAALAFAR.+3y7.light 27.5
498 sp|Q9BUT1|BDH2_HUMAN.VIILTAAAQGIGQAAALAFAR.+3y6.light 30.5
499 sp|P30040|ERP29_HUMAN.ESYPVFYLFR.+2y7.light 37.4
500 sp|P30040|ERP29_HUMAN.ESYPVFYLFR.+2y5.light 31.4
501 sp|P30040|ERP29_HUMAN.ESYPVFYLFR.+2y8+2.light 25.4
502 sp|P08697|A2AP_HUMAN.DFLQSLK.+2y5.light 25.9
503 sp|P08697|A2AP_HUMAN.DFLQSLK.+2y4.light 19.9
504 sp|P08697|A2AP_HUMAN.DFLQSLK.+2y3.light 28.9
505 sp|P18669|PGAM1_HUMAN.HGESAWNLENR.+3y5.light 28
506 sp|P18669|PGAM1_HUMAN.HGESAWNLENR.+3y4.light 22
507 sp|P18669|PGAM1_HUMAN.HGESAWNLENR.+3b5.light 19
508 sp|Q9Y3E7|CHMP3_HUMAN.IPEIQATMR.+2y7.light 28
509 sp|Q9Y3E7|CHMP3_HUMAN.IPEIQATMR.+2y4.light 25
510 sp|Q9Y3E7|CHMP3_HUMAN.IPEIQATMR.+2y8+2.light 31
511 sp|Q13126|MTAP_HUMAN.SLLLTTIPQIGSTEWSETLHNLK.+3y19+2.light 30.3
512 sp|Q13126|MTAP_HUMAN.SLLLTTIPQIGSTEWSETLHNLK.+3y16+2.light 39.3
513 sp|Q13126|MTAP_HUMAN.SLLLTTIPQIGSTEWSETLHNLK.+3b3.light 36.3
514 sp|Q9Y5M8|SRPRB_HUMAN.LIQQQLEK.+2y6.light 23.5
515 sp|Q9Y5M8|SRPRB_HUMAN.LIQQQLEK.+2y5.light 23.5
516 sp|Q9Y5M8|SRPRB_HUMAN.LIQQQLEK.+2y4.light 29.5
517 sp|P35579|MYH9_HUMAN.IMGIPEEEQMGLLR.+3y4.light 23.9
518 sp|P35579|MYH9_HUMAN.IMGIPEEEQMGLLR.+3y10+2.light 23.9
519 sp|P35579|MYH9_HUMAN.IMGIPEEEQMGLLR.+3b4.light 23.9
520 sp|Q9Y5X9|LIPE_HUMAN.MLDWLQEK.+2y7.light 25.1
521 sp|Q9Y5X9|LIPE_HUMAN.MLDWLQEK.+2y6.light 25.1
522 sp|Q9Y5X9|LIPE_HUMAN.MLDWLQEK.+2y5.light 25.1
523 sp|P50895|BCAM_HUMAN.EASGLLSLTSTLYLR.+2y10.light 44.8
524 sp|P50895|BCAM_HUMAN.EASGLLSLTSTLYLR.+2y9.light 41.8
525 sp|P50895|BCAM_HUMAN.EASGLLSLTSTLYLR.+2y7.light 32.8
526 sp|O75533|SF3B1_HUMAN.ILVVIEPLLIDEDYYAR.+3y8.light 30.6
527 sp|O75533|SF3B1_HUMAN.ILVVIEPLLIDEDYYAR.+3y7.light 30.6
528 sp|O75533|SF3B1_HUMAN.ILVVIEPLLIDEDYYAR.+3b8.light 21.6
529 sp|O60437|PEPL_HUMAN.NQLLQEELEALQLQLR.+3y8.light 38
530 sp|O60437|PEPL_HUMAN.NQLLQEELEALQLQLR.+3y7.light 35
531 sp|O60437|PEPL_HUMAN.NQLLQEELEALQLQLR.+3y5.light 29
532 sp|P20073|ANXA7_HUMAN.EFSGYVESGLK.+2y9.light 34.8
533 sp|P20073|ANXA7_HUMAN.EFSGYVESGLK.+2y6.light 22.8
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537 sp|Q07021|C1QBP_HUMAN.MSGGWELELNGTEAK.+2y8.light 38.8
实施例4——靶向蛋白质组学方法检测目标蛋白（肽段）。
本实施例涉及多肽的靶向蛋白质组检测，分为液相方法优化及质谱参数优化。通过优化，可以在10-25分钟内完成快速检测。
液相方法优化：高效液相：色谱柱类型（C18，极性封端，长度100 mm；粒径1.9 μm），使用流动相A（含0.1% (v/v) 甲酸的水溶液）及流动相B（含0.1% (v/v) 甲酸的乙腈溶液）进行梯度洗脱，流速0.2 ml/min：0-1分钟：3 % B，1-20分钟：3% B至40% B；20-20.1分钟：40% B-80% B；20.1-22分钟：80% B；22.1-25 分钟：3% B。柱温箱温度50 °C。
质谱参数优化：流出肽段将在三重四级杆质谱仪上使用正离子模式下的MRM模式进行数据采集以确定保留时间。确定保留时间之后，使用ramp的方法优化每一个MRM离子对的碰撞能量CE，最终整合保留时间和优化的CE，生成Scheduled MRMTM采集方法（Schedule窗口为2.5分钟）。数据采集母子离子对、保留时间及优化后碰撞电压（CE），结果见表1。
本发明人还通过合成含有稳定同位素标记的肽段，混合后掺入到样本中，进行MRM采集。本发明引入同位素标记的肽段的目的为目标肽段的确证，排除假阳性信号。
实施例5——质谱数据的处理和AI建模。
5.1 原理概要
本实施例通过对质谱数据的肽段峰面积信息进行处理和AI建模后，得到最终的评估结果（恶性概率），能够为临床提供甲状腺结节恶性程度的参考，其中，对于现有临床无法鉴定的甲状腺结节，亦能够同时提供第二个评估结果（恶性概率）供医生参考。对于本实施例中建议的不同肽段组合，本发明的AI算法都能够提供上述两个结果。
本实施例的AI流程图如图1所示。
5.2 建立训练数据集和测试集
为了验证本发明的AI模型的有效性、稳定性和泛化性，本实施例将回顾性数据集分为三份：1.训练集，2.验证集，和3.不同批次独立测试集，具体流程如图2所示。
首先从现有样本中，根据不同的医院信息和送样信息划分出一个不同批次的独立测试集：对于每个医院，若送样批次M≥2，则从中随机选出一个批次的数据归属于该独立测试集（以证明本发明的AI模型能够克服批次效应，对于不同样本批次都有高表现），剩余M-1个批次的数据归属于训练集和验证集。
将剩余数据根据质谱产生的时间顺序划分为约70%的训练集和30%的验证集，以训练出对质谱时间不敏感的模型。
为了进一步验证本发明的AI模型的泛化性，将收集的一批前瞻性的样本作为独立测试集，该样本的样本批次和质谱时间均为严格独立，从而证明本发明的AI模型对于前瞻性数据集也有高表现。
由图2可见不同测试集的区别，蓝色数据会根据时间进一步划分为训练集和内部测试集（训练时用5.5.i的方式确定五组模型和参数，然后分别在内部测试集和两个独立测试集进行测试），T0、T1、T2为进行质谱的时间，建模时间为T1时间点，因此T1之前的数据为回顾性数据，之后的数据为前瞻性数据。
5.3 数据清洗
i.计算样本中三种噪声蛋白：HBB、THYG、H4的单个蛋白峰面积占总蛋白峰面积和的比例，当单个蛋白的比例>70%或这三种蛋白峰面积和的比例>95%时，确定该样本为不合格样本，从而大大提升模型分类效果（有ROC图的对比，在质控阈值为70%、80%、90%、100%的比较，此处进行了两个比较实验，第一比较实验如图3所示，第二比较实验如图4所示。第一比较实验，应用了相同训练和测试数据，不同的是一组对所有数据进行70%质控且去除高峰度蛋白，一组不进行处理，测试结果明显是质控比较好；还进行了第二比较实验，即固定70%质控训练出的模型，在另一组数据70%、80%、90%和100%质控数据上测试，结果分别为0.91，0.9，0.87和0.82）；
ii.分类时去除极高峰度蛋白及相应肽段（这些肽段不适合加入模型，是用于质控的肽段。VNVDEVGGEALGR，EFTPPVQAAYQK，LALQFTTNPK，LAAQSTLSFYQR，LEDIPVASLPDLHDIER，FLQGDHFGTSPR，QVDQFLGVPYAAPPLAERR，GGADVASIHLLTAR，RISGLIYEETR，ISGLIYEETR，VFLENVIR共11条肽段需要去除。若不去除这些肽段，则模型结果受到这些肽段的影响，尤其是在不同批次样本中，这些肽段的浓度影响不同，使得内部测试集AUC从1下降到0.99，而不同批次独立测试集AUC从0.923下降到0.845）。
5.4 数据预处理
对数据归一化（除以中位数）或对肽段归一化（z-score）均能达到效果，其中对肽段归一化（z-score）包括对每个肽段（特征）的定量在训练集上进行z-score归一化处理，并记录每个肽段的平均值和标准差，在测试新数据的时候对新数据的每个肽段执行z-score
5.5 模型训练
i. 将训练集中的两类数据按比例分为五份，每份含有20%的正样本和20%的负样本，每次将其中4份组合为训练数据，利用XGBoost模型进行AI建模，在剩余1份上（validation 1）和之前提到的内部测试集上（validation 2）进行验证，这样可以有5个不同的训练集得到五个XGBoost模型，以增加模型的多样性，为后面的模型融合做准备。该操作的有益之处在于：1）训练集少量不同而validation 1完全不同能够得到不同的参数和模型，训练效果比较好；2）由于上述不同，五个模型直接具有一定独立性；3）由于独立性，五个模型融合时具有一定互补性，这样融合后能达到非常好的效果。需要说明的是，本发明的模型可以扩展为其他模型，包括但不限于逻辑回归，决策树，随机森林，SVM，神经网络等模型
ii. 用网格搜索或遗传算法对于每个模型分别进行搜参：对于每个格点的参数，首先对i中的训练集按该参数建模并进行重要性排序，然后以该参数为基础，按特征的重要性从大到小加入模型进行建模，评估函数为在validation 1上的AUC值和validation 2上的AUC值的和，且两个AUC应均不低于0.9，单个模型的总特征不超过10，以便于最终试剂盒产品化应用。当评估函数取得最高值时的参数和对应的特征为最终决定的参数和特征。本实施例能够取得训练集表现最优的模型，且有一定的泛化性（两个AUC均大于0.9）
iii. 对训练集进行不同划分产生更多的模型和特征组合（可选）
5.6 模型测试/预测
使用如上训练好的模型对新数据进行测试/预测。
i. 将从穿刺样本获得的新的质谱数据如前所述进行数据处理
ii. 使用MRMTransitionGroupPicker或MRMMapper（OpenMS）算法在谱图中挑选目标母离子的全部峰，使用mProphet算法对数据进行质量控制（错误发现率估计），得到精准的定性定量分析，或者使用Skyline软件进行定性定量，该步实现从质谱数据到肽段定量数据
iii. 对数据进行归一化处理，包括获得之前记录的平均值和方差后进行z-score变换
iv. 在由5个训练集产生的五个XGBoost模型上进行测试，获得预测值（0~1的一个概率值）
v. 模型融合（可选）：由于单模型的鲁棒性和稳定性受限，因此本发明对于五个XGBoost模型的结果进行融合，融合方式为pred=(pred1+pred2+pred3+pred4+pred5)/5。本实施例训练出五个模型，可以采取任意一个模型及其肽段组合包装进试剂盒，也可以把五个模型及其肽段组合包装进试剂盒
vi. iii或iv的结果通过阈值进行二分类预测，大于阈值预测为1（恶性），小于阈值预测为0（良性），阈值定义为(P1/S1+P2/S2)/2，其中P1、P2分别为70%、30%数据集的正样本数量，S1、S2分别为70%、30%数据集的样本数量
vii. 总体结果展示（敏感度、特异度和AUC）；在临床中难以分辨的III/IV类结果展示；泛化性展示1（两个验证集和两个独立测试集）；泛化性展示2（两个独立测试集上的多中心数据展示）。结果示于表2和表3中：
表2 总体结果展示（第1－3栏）
质控后数据训练 J(4th) S(11th)
数据(恶+良) 26+0 39+3
AUC 88.03
敏感度 65.3% 92.3%
特异度 66.7%
续表2（第4－6栏）
H(4th) I(1st) Z(9th)
9+0 4+2 81+9
75 98.8
77.8% 75% 95.1%
50% 100%
续表2（第7－8栏）
独立测试集整体 随机划分测试集-参考
159+14 103+8
92.3 100
88.1% 90.3%
85.7% 100%
表3多中心结果展示
质控后数据训练 J S 独立测试集2整体
数据(恶+良) 25+0 43+3 68+3
AUC 83 76.9
敏感度 64% 90.7% 80.9%
特异度 66.7% 66.7%
注：第二个独立测试集由于良性测试样本量偏少，结果不太稳定，其他测试都能达到预期效果。
实施例6——本发明与现有技术的比较。
6.1 与临床细胞病理学医生评估结果比较
Bethesda III/IV类临床细胞病理学医生无法评估的甲状腺结节，也无法确切知晓是良性还是恶性（III类不代表良性，而IV类也不代表恶性）。甲状腺TBSRTC各诊断分级的恶性风险及临床管理方法见表4。
表4：甲状腺TBSRTC各诊断分级的恶性风险及临床管理
诊断分级 恶性风险 临床管理
不能诊断/不满意 (I) 5%～10% 重复FNA
良性 (II) 0～3% 随诊
意义不明的非典型细胞/意义不明的滤泡性病变 (III) 10%～30% 重复FNA/分子检测/手术
滤泡性肿瘤/可疑滤泡性肿瘤(IV) 25%～40% 分子检测/手术
可疑恶性 (II) 50%～75% 手术
恶性 97%～99% 手术
本研究方法对于III/IV类的评价准确率为77%，模型AUC为0.90。
由于III/IV类数据较少，本发明人将内部测试集和两个独立测试集的数据合并预测展示结果（5个良性，21个恶性，分别见表5和表6）：
Figure 500683DEST_PATH_IMAGE001
Figure 791725DEST_PATH_IMAGE002
本发明的模型预测的ROC图见图5，模型AUC为0.90。
6.2 与现有技术中的方法的比较
本发明人在此还将本发明的方法与两篇参考文献（Patel et al., Performanceof a Genomic Sequencing Classifier for the Preoperative Diagnosis ofCytologically Indeterminate Thyroid Nodules，JAMA Surg. 2018;153(9):817-824和Livhits et al., Effectiveness of Molecular Testing Techniques for Diagnosisof Indeterminate Thyroid Nodules: A Randomized Clinical Trial，JAMA Oncol.2021 Jan 1;7(1):70-77）中的方法就敏感性、特异性等进行了比较，比较结果见表7。
表7：本发明的方法与两篇参考文献中的方法的比较（第1－3栏）
方法类型 Bethesda评分 样本数量
GSC<sup>a</sup> III, IV 190
ThyroSeq v3 III, IV 60
本发明的方法<sup>b</sup> III, IV 26
aGSC是Genomic Sequencing Classifier的缩写
b仅纳入了有明确手术结果的样本
续表7（第4－6栏）
敏感性 特异性 阳性预测值
91.1% 68.3% 47.1%
96.9 35.7 63.3
71.4% 100% 100%
续表7（第7－8栏）
阴性预测值 参考文献
96.1% (Patel et al., 2018)
90.9 (Livhits et al., 2021)
45.5%
结果显示，本发明的方法的特异性和阳性预测值均显著高于参考文献中所用的方法。
为了降低临床上对甲状腺结节恶性程度或恶性概率的误诊，即减少假阳性判断，因此本发明人有限选择特异性更高的模型。
以上所描述的技术方案仅为本发明的具体示例实施方案，本领域技术人员理解的是，并不能因此而限制本发明的范围。凡是利用本发明的说明书所公开的内容所作出的等效结构或等效流程上变换而获得的技术方案，或者将本发明的说明书所公开的内容直接或间接运用在其它相关的技术领域而获得的技术方案，均包括在本发明的范围内。本发明的范围由所附权利要求书确定。

Claims (18)

1.一种系统，其用于基于靶向检测多肽与机器学习对受试者的甲状腺结节恶性程度或恶性概率进行评估，所述系统包含：
i）采集装置，其采集受试者的细针穿刺组织活检样本；
ii）样本前处理装置，其采用压力循环技术对样本进行前处理；
iii）检测装置，其检测所得到的样本中目标多肽的蛋白质组学数据，所述蛋白质组学数据是通过高效液相色谱方法和质谱方法获得的目标多肽的母子离子对、保留时间、碰撞电压（CE）和峰面积，其中目标多肽由表1的多肽组成，目标多肽的母子离子对、保留时间、碰撞电压（CE）如表1所示，其中表1如下：
编号 所属蛋白名称 多肽序列 母离子 子离子 保留时间 碰撞电压（CE）
1 ANXA1_HUMAN GLGTDEDTLIEILASR 851.947 1015.615 17.33 40.7
2 ANXA1_HUMAN GLGTDEDTLIEILASR 851.947 801.483 17.33 40.7
3 ANXA1_HUMAN GLGTDEDTLIEILASR 851.947 688.399 17.33 37.7
4 ANXA1_HUMAN GTDVNVFNTILTTR 775.912 1178.653 15.62 37
5 ANXA1_HUMAN GTDVNVFNTILTTR 775.912 965.541 15.62 37
6 ANXA1_HUMAN GTDVNVFNTILTTR 775.912 377.214 15.62 37
7 H4_HUMAN RISGLIYEETR 446.245 697.315 10.11 19.4
8 H4_HUMAN RISGLIYEETR 446.245 527.33 10.11 19.4
9 H4_HUMAN RISGLIYEETR 446.245 640.414 10.11 19.4
10 H4_HUMAN ISGLIYEETR 590.814 980.505 10.99 27.9
11 H4_HUMAN ISGLIYEETR 590.814 810.399 10.99 27.9
12 H4_HUMAN ISGLIYEETR 590.814 697.315 10.99 24.9
13 H4_HUMAN VFLENVIR 495.293 743.441 13.4 23.3
14 H4_HUMAN VFLENVIR 495.293 630.357 13.4 23.3
15 H4_HUMAN VFLENVIR 495.293 501.314 13.4 23.3
16 THYG_HUMAN LALQFTTNPK 566.822 835.431 12.06 26.8
17 THYG_HUMAN LALQFTTNPK 566.822 707.372 12.06 26.8
18 THYG_HUMAN LALQFTTNPK 566.822 474.761 12.06 26.8
19 THYG_HUMAN LAAQSTLSFYQR 692.865 1001.505 11.56 33
20 THYG_HUMAN LAAQSTLSFYQR 692.865 914.473 11.56 33
21 THYG_HUMAN LAAQSTLSFYQR 692.865 700.341 11.56 33
22 THYG_HUMAN LEDIPVASLPDLHDIER 644.674 994.495 14.82 28.9
23 THYG_HUMAN LEDIPVASLPDLHDIER 644.674 731.388 14.82 28.9
24 THYG_HUMAN LEDIPVASLPDLHDIER 644.674 358.161 14.82 28.9
25 THYG_HUMAN FLQGDHFGTSPR 681.333 1101.507 8.94 32.4
26 THYG_HUMAN FLQGDHFGTSPR 681.333 973.449 8.94 32.4
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395 GSTP1_HUMAN FQDGDLTLYQSNTILR 942.479 994.532 13.91 51.2
396 GSTP1_HUMAN FQDGDLTLYQSNTILR 942.479 831.468 13.91 54.2
397 GSTP1_HUMAN ALPGQLKPFETLLSQNQGGK 709.392 831.432 14.67 35.1
398 GSTP1_HUMAN ALPGQLKPFETLLSQNQGGK 709.392 718.348 14.67 35.1
399 GSTP1_HUMAN ALPGQLKPFETLLSQNQGGK 709.392 648.372 14.67 26.1
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532 ANXA7_HUMAN EFSGYVESGLK 608.298 939.478 10.66 34.8
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535 C1QBP_HUMAN MSGGWELELNGTEAK 811.38 1103.558 12.91 41.8
536 C1QBP_HUMAN MSGGWELELNGTEAK 811.38 974.515 12.91 47.8
537 C1QBP_HUMAN MSGGWELELNGTEAK 811.38 861.431 12.91 38.8
iv）分析装置，其分析所述蛋白质组学数据，其中所述分析包括将所得到的蛋白质组学数据输入AI模型；以及
v）输出装置，其输出结果，其中对于临床上不确定或者难以评判的甲状腺结节，提供恶性概率结果。
2.根据权利要求1所述的系统，其中iv）的分析包括建立AI模型，所述建立AI模型包括将回顾性数据集分为训练集、验证集和独立测试集，其中对于每个提供样本的单位，如果该单位的送样批次M≥2，则从该M批数据中随机选出一个批次的数据划分至独立测试集，而剩余M-1个批次的数据划分至训练集和验证集。
3.根据权利要求2所述的系统，其中建立AI模型还包括将划分至训练集和验证集的数据根据质谱产生的时间顺序划分为约70%的训练集和约30%的验证集。
4.根据权利要求3所述的系统，其中建立AI模型还包括将前瞻性数据集作为第二独立测试集，该前瞻性数据集的样本批次和质谱时间均严格独立于回顾性数据集。
5.根据权利要求2所述的系统，其中建立AI模型还包括计算样本中三种噪声蛋白HBB、THYG和H4的单个蛋白峰面积占总蛋白峰面积和以及这三种蛋白峰面积和占总蛋白峰面积和的比例，其中当单个蛋白的比例>70%或这三种蛋白峰面积和的比例>95%时，确定该样本为不合格样本。
6.根据权利要求5所述的系统，其中建立AI模型还包括去除包含极高峰度的多肽的样本，其中去除的多肽包括VNVDEVGGEALGR、EFTPPVQAAYQK、LALQFTTNPK、LAAQSTLSFYQR、LEDIPVASLPDLHDIER、FLQGDHFGTSPR、QVDQFLGVPYAAPPLAERR、GGADVASIHLLTAR、RISGLIYEETR、ISGLIYEETR和VFLENVIR。
7.根据权利要求1或2所述的系统，其中质谱方法包括将从色谱柱流出的多肽在三重四极杆质谱仪上使用正离子模式下的Scheduled MRMTM模式进行数据采集。
8.根据权利要求7所述的系统，其中Schedule窗口为2.5分钟。
9.权利要求1-8中任一项所述的系统在制备基于靶向检测多肽与机器学习对受试者的甲状腺结节恶性程度或恶性概率进行评估的装置中的用途。
10.目标多肽作为检测靶标在制备试剂盒中的用途，所述试剂盒用于基于靶向检测多肽与机器学习对受试者的甲状腺结节恶性程度或恶性概率进行评估，其中所述试剂盒包含检测目标多肽的工具，并且其中所述目标多肽由根据权利要求1所述的表1的多肽组成。
11.根据权利要求10所述的用途，其中所述评估包括：
a）提供受试者的细针穿刺组织活检样本；
b）采用压力循环技术对样本进行前处理；
c）检测所得到的样本中目标多肽的蛋白质组学数据，其中所述目标多肽由根据权利要求1所述的表1的多肽组成，并且所述蛋白质组学数据是通过高效液相色谱方法和质谱方法获得的目标多肽的母子离子对、保留时间、碰撞电压（CE）和峰面积，其中目标多肽的母子离子对、保留时间、碰撞电压（CE）如表1所示；
d）分析所述蛋白质组学数据，其中所述分析包括将所得到的蛋白质组学数据输入AI模型；以及
e）输出结果，其中对于临床上不确定或者难以评判的甲状腺结节，提供恶性概率结果。
12.根据权利要求11所述的用途，其中d）步骤的分析包括建立AI模型，所述建立AI模型包括将回顾性数据集分为训练集、验证集和独立测试集，其中对于每个提供样本的单位，如果该单位的送样批次M≥2，则从该M批数据中随机选出一个批次的数据划分至独立测试集，而剩余M-1个批次的数据划分至训练集和验证集。
13.根据权利要求12所述的用途，其中建立AI模型还包括将划分至训练集和验证集的数据根据质谱产生的时间顺序划分为约70%的训练集和约30%的验证集。
14.根据权利要求13所述的用途，其中建立AI模型还包括将前瞻性数据集作为第二独立测试集，该前瞻性数据集的样本批次和质谱时间均严格独立于回顾性数据集。
15.根据权利要求12所述的用途，其中建立AI模型还包括计算样本中三种噪声蛋白HBB、THYG和H4的单个蛋白峰面积占总蛋白峰面积和以及这三种蛋白峰面积和占总蛋白峰面积和的比例，其中当单个蛋白的比例>70%或这三种蛋白峰面积和的比例>95%时，确定该样本为不合格样本。
16.根据权利要求12所述的用途，其中建立AI模型还包括去除包含极高峰度的多肽的样本，其中去除的多肽包括VNVDEVGGEALGR、EFTPPVQAAYQK、LALQFTTNPK、LAAQSTLSFYQR、LEDIPVASLPDLHDIER、FLQGDHFGTSPR、QVDQFLGVPYAAPPLAERR、GGADVASIHLLTAR、RISGLIYEETR、ISGLIYEETR和VFLENVIR。
17.根据权利要求10-16中任一项所述的用途，其中质谱方法包括将从色谱柱流出的多肽在三重四级杆质谱仪上使用正离子模式下的Scheduled MRMTM模式进行数据采集。
18.根据权利要求17所述的用途，其中Schedule窗口为2.5分钟。
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