具体实施方式
下面结合实施例对本发明做进一步说明,下述实施例中试验方法如无特殊说明,均为 常规试验方法,下述实施例中所述的实验试剂及耗材如无特殊说明,均来自常规生化试剂 公司。
实施例1:构建紫心甘薯酵母单杂交cDNA文库
(1)用Trizol法从紫心甘薯(品系A5)块根提取RNA,用SMART技术逆转录合成 双链的cDNA。
(2)扩增得到的cDNA要用TaKaRa MiniBEST DNA Fragment Purification Kit进行纯 化处理,使dH2O溶出。
(3)对用限制性内切酶SfiI酶切后cDNA进行过柱处理,再经过PCI/CI净化处理,最终使ddH2O溶出。
(4)将pGADT7-SfiI vector(clontech,货号630490)与适量过柱后cDNA用DNAligation Kit连接。纯化精制连接液,得到初级cDNA文库。
(5)通过电转化的方法将少量初级文库连接液转入感受态细胞E.coli HST08;鉴定正 确后,取适量的菌液涂布在含Amp抗性的LB平板上,37℃培养12h;通过平板上生长的菌落个数,计算初级文库库容。
(6)将扩增菌落进行过夜培养,然后进行质粒提取,得到文库质粒。
实施例2:构建pAbAi-PIbMYB1诱饵载体
(1)以紫心甘薯块根DNA为模板,用TaKaRa高保真酶
Max DNAPolymerase扩增两端带有不同酶切位点末端的IbMYB1的启动子DNA片段,扩增IbMYB1 的启动子DNA片段的PCR引物对的序列为PIbMYB1-F:5'-TATTGCTCTCAATGTGCAAG AATCA-3'和PIbMYB1-R:5'-TTTGATACGCATACCTTATGCCTAA-3'。反应体系(20μL) 如下:
PCR反应条件为:
(2)将启动子IbMYB1(序列如SEQ ID NO.3所示)构建到pAbAi载体(柯蕾生物科 技有限公司,货号kl-zl-0879),步骤为:使用TaKaRa限制性内切酶QuickCutTM Hind III 和QuickCutTM SmaⅠ对pAbAi质粒进行双酶切,合成引物序列见表2中的PM1-F/PM1-R, 反应条件为37℃,酶切3h以上,反应体系如下:
经电泳检测正确的酶切产物进行切胶回收。
使用Clon Express II One Step Cloning Kit试剂盒(Vazyme)将目的片段和表达载体进 行连接,反应条件为37℃,连接30min。反应体系如下:
(3)连接产物用于后续转化大肠杆菌DH5α感受态细胞。
大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备(CaCl2法):
(1)接种大肠杆菌DH5α到5mL的LB液体培养基中,在37℃下220rpm振荡培养 过夜。
(2)转移过夜培养的2mL菌液到100mL的LB液体培养基中,继续振荡培养至OD600到0.5左右,冰上放置30min。
(3)取1mL菌液到到新的1.5mL离心管中,4℃,4000rpm离心10min,用移液枪 吸走上清液。
(4)用移液枪吸取1mL预冷的0.1M CaCl2悬浮沉淀,轻吹混匀,冰上放置30min。
(5)4℃,4000rpm离心10min,用移液枪吸走上清液,用移液枪吸取0.2mL预冷的0.1M CaCl2悬浮沉淀,冰上放置5h即可用于转化。
连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞:
(1)取上述制备的大肠杆菌DH5α感受态细胞100μL到新的1.5mL离心管,于超净 工作台中加入10μL的DNA连接产物,轻弹混匀后在冰上放置30min。
(2)将转化产物于42℃水浴锅中热激90s,取出立刻至于冰上5min。
(3)加入1mL不含抗性的LB液体培养基,37℃下180rpm振荡培养60~90min。
(4)室温5000rpm离心4min,在无菌条件下用移液枪吸走900μL上清液,轻吹重悬剩余200μL液体。
(5)将菌液均匀涂布于含有Amp的LB固体培养基中,放置30min晾干。
(6)37℃培养箱倒置培养12~16h。
阳性克隆的筛选与测序鉴定:
从培养皿上用无菌小枪头挑取抗性单菌落于含抗性的LB液体培养基中,37℃,220rpm 振荡培养4h,取2μL上述菌液作为模板进行菌落PCR检测。取PCR反应中扩增得到与目 的片段大小一致的阳性菌种的菌液200μL,送至上海生工生物有限公司进行测序。测序正 确的菌液中加入20%的灭菌甘油于1.5mL离心管中,于-80℃冰箱保存。
实施例3:pAbAi-PIbMYB1诱饵菌株自激活检测
将pAbAi-PIbMYB1诱饵质粒转化Y1H酵母菌,得到诱饵菌株。采用自激活试验测试抑制诱饵菌株的最低AbA浓度,观察它们在SD/-Ura固体培养基上的生长情况,诱饵菌株 自激活检测及最低AbA浓度的确定方法如下:
(1)AbA母液的配制:1mL无水乙醇溶解1mg AbA,配制成1mg/mL的AbA母液, 于4℃下避光保存。
(2)从Y1H[pAbAi-prey]和Y1H[p53AbAi]的培养皿中挑取较大的单克隆菌落, 用10μL的0.9%NaCl溶液重悬菌液,将重悬溶液稀释成10-1、10-2和10-3浓度梯度。
(3)吸取10μL重悬菌液点在SD/-Ura,SD/-Ura/AbA(100ng/mL~1000ng/mL)培养基上。
(4)若在某一浓度下菌落Y1H[pAbAi-prey]不生长,而对照组Y1H[p53AbAi]正 常生长,则此浓度为抑制该重组酵母菌株的最低AbA浓度,可用于后续实验。
注:pAbAi-prey即为pAbAi-PIbMYB1。
经检测,确定pAbAi-PIbMYB1诱饵菌株的自激活AbA最低抑制浓度为300ng/mL。
实施例4:酵母单杂交文库筛选
酵母单杂交文库筛选方法按照Clontech公司Matchmaker Gold Yeast One-Hybrid Library Screening System说明书进行。酵母单杂交文库筛选方法如下:
(1)取25μL Yeastmaker Carrier DNA于95℃水浴5min使其变性,快速置于冰上数分 钟,待温度降至4℃(重复一次)。
(2)在已经预冷的10mL离心管中依次加入:2.5mL PEG/LiAc,25μL变性的Yeastmaker Carrier DNA,15μg文库质粒(实施例1得到),600μL Y1HGold感受态细胞 (含诱饵表达载体pAbAi-PIbMYB1),涡旋混匀。
(3)将离心管置于30℃水浴锅中水浴45min,期间每隔15min轻轻倒混数次。
(4)加入160μL DMSO,轻柔混匀。
(5)在42℃水浴中温浴20min,期间每隔10min轻轻倒混数次。
(6)12000rpm离心30s,收集菌液,弃上清,加入8mL 0.9%NaCl溶液,重悬菌体。
(7)吸取200μL转化后的酵母菌液,均匀涂布于SD/-Leu、SD/-Leu/AbA培养皿上,AbA浓度为抑制自激活最低浓度(即300ng/mL)。
(8)30℃培养箱中倒置培养48~96h。
挑取单菌落进行菌落PCR鉴定,鉴定方法参考实施例2,选用通用引物pGADT7F/R对菌液进行PCR检测,pGADT7F/R引物序列见表1,选取电泳后较亮且条带单一的样品送 上海生工生物有限公司测序,测序的结果在NCBI数据库进行BLAST,对测序结果进行分 析。
表1 主要载体通用引物
通过酵母单杂交的方法筛选得到了紫心甘薯IbMYB1基因表达的上游调控因子为IbWRKY1,该上游调控因子IbWRKY1的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示,核苷酸序列如 SEQID NO.2所示。并设计了上游调控因子IbWRKY1的扩增引物为IbWRKY1-F:5'-ATGGCTGTAGAGTTGTTGTCTAGTTACAGG-3'和IbWRKY1-R:5'-TTAATGGTTGTGTTCTCCTT CGTAGG-3'。
实施例5:上游调控因子IbWRKY1与启动子IbMYB1结合的验证
将IbWRKY1构建到pGADT7酵母重组表达载体(上海联迈生物工程有限公司,货号LM-1639),选择载体中EcoRⅠ和BamHⅠ作为目的片段插入的酶切位点,合成引物序 列见表2中的IbWRKY1-ADF/IbWRKY1-ADR,构建方法参考实施例2。将pGADT7- IbWRKY1酵母重组表达载体质粒与pAbAi-PIbMYB1诱饵载体共同转化Y1HGold单杂交酵 母菌株中进行酵母单杂交实验。
酵母单杂交文库筛选方法按照Clontech公司Matchmaker Gold Yeast One-Hybrid Library Screening System说明书进行。酵母单杂交文库筛选方法如下:
(1)取25μL Yeastmaker Carrier DNA于95℃水浴5min使其变性,快速置于冰上数分 钟,待温度降至4℃(重复一次)。
(2)在已经预冷的10mL离心管中依次加入:2.5mL PEG/LiAc,25μL变性的Yeastmaker Carrier DNA,15μg文库质粒,600μL Y1HGold感受态细胞,涡旋混匀。
(3)将离心管置于30℃水浴锅中水浴45min,期间每隔15min轻轻倒混数次。
(4)加入160μL DMSO,轻柔混匀。
(5)在42℃水浴中温浴20min,期间每隔10min轻轻倒混数次。
(6)12000rpm离心30s,收集菌液,弃上清,加入8mL 0.9%NaCl溶液,重悬菌体。
(7)吸取200μL转化后的酵母菌液,均匀涂布于SD/-Leu、SD/-Leu/AbA培养皿上,AbA浓度为抑制自激活最低浓度(即300ng/mL)。
(8)30℃培养箱中倒置培养48~96h。
挑取单菌落进行菌落PCR鉴定,选用通用引物pGADT7F/R(序列见表1),选取电泳后较亮且条带单一的样品送上海生工生物有限公司测序,测序的结果在NCBI数据库进行BLAST,对测序结果进行分析。
结果发现:阳性对照p53AbAi+AD-53(即在pAbAi载体插入阳性对照53基因序列得到p53AbAi,在pGADT7载体插入阳性对照53基因序列得到AD-53,构建方法参考实施例 2)转化的菌株能够在SD/-Leu/AbA培养基上生长;而阴性对照pAbAi-PIbMYB1+pGADT7 空载转化的菌株不能在SD/-Leu/AbA培养基上生长;说明该酵母单杂交实验能够有效检测 蛋白是否结合在启动子上。pAbAi-PIbMYB1+pGADT7-IbWRKY1能够在SD/-Leu/AbA培 养基上生长(图1),说明IbWRKY1蛋白能结合在启动子IbMYB1上。
实施例6:检测上游调控因子IbWRKY1的自激活活性
将IbWRKY1导入pGBKT7质粒(上海联迈生物工程有限公司,货号LM-8123)中, 构建pGBKT7-IbWRKY1融合表达载体,选择载体中EcoRⅠ和BamHⅠ作为目的片段插 入的酶切位点,合成引物序列见表2中的IbWRKY1-BDF/IbWRKY1-BDR,构建方法参考 实施例2。构建成功后将融合表达载体转入Y2HGold酵母菌株,将转化后的菌液均匀涂布 在色氨酸缺陷培养基(Takara Cat#630413)上生长,挑取阳性单克隆点在含GAL和3AT 的组氨酸缺陷培养基(即SD/-His/-3AT-a-Gal plus培养基,该培养基是在组氨酸缺陷培养基 (Takara Cat#630415)和SD基础培养基(Takara Cat#630411)混合基础上添加GAL显色 剂和3AT抑制剂制备得到的)上培养,结果显示pGBKT7-IbWRKY1转化的酵母菌株能在 含卡那霉素抗性和3AT的组氨酸缺陷培养基上生长,并能使X-α-Gal显现蓝色(图2)。以 上结果说明IbWRKY1蛋白具有自激活活性。
实施例7:双荧光素酶报告系统载体的构建
将上游调控因子IbWRKY1的基因序列构建到过表达载体pGreenII 0029 62-SK(上海钦 城生物科技有限公司,货号QCP0465)上,称之为效应质粒,将PIbMYB1插入到载体pGreenII 0800-LUC(柯蕾生物科技有限公司,货号kl-zl-0808)荧光素酶的前端作为报告质粒。选择 pGreenII 0029 62-SK载体中Sac I和Xho I及pGreenII 0800-LUC载体中的KpnI和Nco I作 为插入目的片段的酶切位点,构建载体引物序列见表2中的IbPM1-0800F/IbPM1-0800R以 及IbWRKY1-62-SKF/IbWRKY1-62-SKR,构建方法参考实施例2。
实施例8:拟南芥原生质体的制备及转化
1、拟南芥原生质体的制备步骤如下:
(1)配制酶解液于55℃水浴锅中预热。
(2)选择四周后抽苔前的野生型拟南芥叶片,将叶片下表皮撕掉后迅速放入酶解液中。
(3)25℃,50rpm避光振荡酶解50min,至叶肉细胞酶解完全,可在显微镜下观察原生质体的形态,当细胞较圆、透亮时状态比较好。
(4)用等体积的W5溶液稀释酶液,轻轻混匀,用清水洗干净75μm的尼龙网布,然 后将其用W5溶液浸湿后过滤原生质体。
W5溶液的配制(100mL):
(5)800rpm离心2min,尽量吸去上清,用1mL W5溶液重悬原生质体(重复此步 骤三次)。
(6)将原生质体重悬于1mL W5溶液中,然后冰上放置30min备用。
2、拟南芥原生质体的转化步骤如下:
(1)2mL EP管中加入10~20μg的目的质粒(实施例7构建的IbWRKY1-pGreenII0029 62-SK重组质粒和PIbMYB1-pGreenII 0800-LUC重组质粒),加入100μL的拟南芥原生质 体,轻轻混匀,加完后立即放冰上。
(2)加入110μL PEG/CaCl2,轻弹离心管使之混匀,室温孵育10min。
(3)在冰上加入220μL W5溶液,颠倒离心管使其混匀,冰上放置1min。
(4)再次向离心管加440μL W5溶液,轻轻颠倒,冰上放置1min。
(5)最后向离心管加880μL W5溶液,颠倒混匀,冰上放置1min。
(6)4℃800rpm离心3min,吸去上清。
(7)原生质体用500μL W5溶液重悬,22℃黑暗条件下培养16~20h。
实施例9:双荧光素酶报告系统的检测
使用
Reporter Assay(Promega)检测LUC和REN两种荧光素酶活性, 具体步骤如下:
(1)100μL 1×PLB裂解液的制备:20μL 5×Passive Lysis Buffer加水至100μL。10mL LAR II的制备:吸取10mL冰上融化的Luciferase Assay Buffer II加入到Luciferase Assay Substrate中,轻轻摇晃使之溶解(-20℃可放置一个月,–70℃可放置一年)。100μL Stop&
Reagent的制备:吸取100μL Stop&
Buffer,加入2μL 50×Stop&
Substrate, 可稍微涡旋使其混匀(在-20℃可放置15d)。
(2)取实施例8转化后的拟南芥原生质体溶液,4℃,13200rpm离心90s,除去W5 溶液。
(3)加入100μL 1×PLB裂解液,轻轻吹打混匀后转移至24孔板中,置于水平摇床,室温低速晃动15min。
(4)收集裂解液,转移至1.5mL离心管中,4℃13200rpm离心10min,取上清液60 μL置冰上待测荧光素酶。
(5)避光条件下,在黑色的96孔酶标板中加入100μL LAR II,然后加入20μL细胞裂解液,用枪头轻轻混匀2~3次,避免产生气泡。
(6)放入酶标仪中检测LUC的酶活性,并记录数据。
(7)取出96孔板,在同一孔中加入100μL Stop&
Reagent,用枪头轻轻混匀2~3次,整个操作过程要避免强光照射。
(8)放入酶标仪中检测REN的酶活性并记录数据。
(9)实验重复3次,取平均值,通过对比不同样品的LUC/REN的比值,检测转录因 子对启动子的激活作用。
结果显示:IbWRKY1能够提高IbMYB1启动子的活性(图3),说明IbWRKY1能够 促进IbMYB1的表达。
实施例10:明确上游调控因子IbWRKY1的功能
构建了IbWRKY1与绿色荧光蛋白(GFP)的融合蛋白,对IbWRKY1的作用场所进行 定位。亚细胞定位载体是C17GFP(BioVector NTCC典型培养物保藏中心,货号:BiovectorC17GFP),根据载体和互作蛋白的关键位点选择限制性内切酶,用SmaI进行单 酶切。设计包含起始密码子而去掉终止密码子的特定引物,将IbWRKY1构建到C17GFP 亚细胞表达载体上,并通过转化拟南芥原生质体瞬时表达蛋白,观察目的基因蛋白的亚细 胞定位。合成引物序列见表2中的IbWRKY1-GFPF/IbWRKY1-GFPR。结果显示:空载中的 GFP蛋白能够在拟南芥原生质体的各个结构中表达,IbWRKY1蛋白在细胞核中表达(图4), 表明IbWRKY1是一个典型的转录因子。
表2 构建载体使用引物序列(下划线为酶切位点)
实施例11:IbEBF2和IbWRKY1的相互作用研究
1、毒性检测
将上游调控因子IbEBF2、IbWRKY1分别与pGBKT-7载体(上海联迈生物工程有限公司,货号LM-8123)连接,构建pGBKT-7-上游调控因子载体(即pGBKT-7-IbEBF2和 pGBKT-7-IbWRKY1),选择载体中EcoRⅠ和BamHⅠ作为目的片段插入的酶切位点, 合成引物序列见表2中的IbWRKY1-BDF/IbWRKY1-BDR,构建方法参考实施例2。以 pGBKT-7空载载体作为对照组,将pGBKT-7-上游调控因子载体和pGBKT-7空载载体分别 转化Y2H酵母菌,将转化后的菌液均匀涂布在SD/-Trp培养基上生长,进行毒性检测,观 察pGBKT-7-上游调控因子载体与pGBKT-7空载载体在SD/-Trp培养基上单克隆菌落的生长 情况,结果显示实验组和对照组单克隆菌落在数量和大小上无明显差异(图5),说明 pGBKT-7-上游调控因子载体对酵母菌没有毒性。
2、酵母双杂交检测IbEBF2和IbWRKY1之间的相互作用
运用酵母双杂交检测上游调控因子IbEBF2和IbWRKY1之间的相互作用,将具有自激 活活性的上游转录调控因子IbEBF2与pGADT-7连接构建重组载体(pGADT7-IbEBF2),IbWRKY1的与pGBKT-7连接构建重组载体(pGBKT7-IbWRKY1),以pGADT7+pGBKT7-53 (AD-T+BK-53)作为阳性对照,以pGADT7+pGBKT7-Lam(AD-T+BK-Lam)作为阴性对 照,进行酵母双杂交实验检测其相互作用,具体步骤为:
(1)酵母感受态细胞的制备
使用Yeastmaker Yeast Transformation System 2进行酵母感受态细胞的制备,具体步骤 如下:
①将Y2HGold酵母菌株在YPDA固体培养基上划线活化,30℃倒置培养3d。
②从YPDA固体培养基中挑取单菌落于30mL液体YPDA培养基中,30℃、220rpm 振荡培养8~12h,使其OD600达到1.4~1.5之间。
③吸取酵母菌液接种于100mL的液体YPDA培养基中,调OD600至0.1~0.2之间,30℃250rpm培养2~3h,使其OD600达到0.5。
④将上述菌液用2个50mL离心管分装,室温下5000rpm离心5min后弃上清。
⑤加入25mL无菌水重悬菌体,5000rpm离心5min后弃上清,重复该步骤两次。
⑥加入600μL 1.1×TE/LiAc重悬菌体,置于冰上备用。
(1)Y2HGold酵母转化
酵母转化参照Yeastmaker Yeast Transformation System 2进行,具体步骤如下:
①取5μL Yeastmaker Carrier DNA于95℃水浴5min使其变性,快速置于冰上数分钟, 待温度降至4℃(重复一次)。
②在已预冷的1.5mL离心管中依次加入:500μL PEG/LiAc(50μL TE,50μL LiAc和400μL PEG4000),5μL变性的Yeastmaker Carrier DNA,100ng重组融合表达质粒,50μLY2HGold感受态细胞,涡旋混匀,置于30℃恒温培养箱中孵化30min(期间每隔10min轻 轻倒混数次)。
③加入20μL DMSO,轻柔混匀,置于42℃水浴中15min(期间每隔5min轻轻倒 混数次)。
④12000rpm离心30s,弃上清,加入0.9%NaCl溶液1mL,重悬菌体。
⑤吸取200μL转化后的酵母菌液,涂布于SD/-Trp培养皿上。
⑥30℃培养箱中倒置培养48~96h。
结果显示,IbEBF2与IbWRKY1存在相互作用(图6)。
3、双分子荧光互补实验检测IbEBF2和IbWRKY1之间的相互作用
运用双分子荧光互补实验对酵母双杂交检测结果进行验证,以检测上述蛋白在植物细 胞中是否存在相互作用。以pSAT6-cEYFP-C1(上海海吉浩格生物科技有限公司, HH-ZW-006)作为融合载体,将IbEBF2与EYFP蛋白N端融合,IbWRKY1与EYFP蛋白 C端融合,然后将带EYFP蛋白N端的融合质粒和带EYFP蛋白C端的融合质粒共转化到 拟南芥原生质体中进行表达。
GFP荧光蛋白在拟南芥原生质体里面呈现组成型表达,在整个原生质体中都有表达, IbEBF2-nYFP+cYFP和nYFP+IbWRKY1-cYF分别转到拟南芥原生质体中都没有检测到荧光信号,说明这2个蛋白与空载并没有相互作用,而共转到拟南芥原生质体后能够检测到明显的荧光信号,IbEBF2-nYFP+IbWRKY1-cYFP荧光信号在细胞核内(图7),说明在细 胞核中IbEBF2蛋白与IbWRKY1蛋白可发生相互作用,两者可以形成复合物共同调控基因 的表达。
以上仅是本发明的优选实施方式,应当指出的是,上述优选实施方式不应视为对本发 明的限制,本发明的保护范围应当以权利要求所限定的范围为准。对于本技术领域的普通 技术人员来说,在不脱离本发明的精神和范围内,还可以做出若干改进和润饰,这些改进 和润饰也应视为本发明的保护范围。
序列表
<110> 广东省科学院南繁种业研究所
<120> 上游调控因子IbWRKY1及其在调控紫心甘薯IbMYB1表达中的应用
<160> 5
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 363
<212> PRT
<213> 甘薯(Ipomoea batatas)
<400> 1
Met Glu Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp Tyr Ala His Met Ala Met Glu
1 5 10 15
Ala Ser Glu Phe Met Ala Val Glu Leu Leu Ser Ser Tyr Arg Asn Ser
20 25 30
Gly Phe Ala Ala Lys Met Glu Glu Asn Ala Val Gln Glu Ala Ala Ala
35 40 45
Ala Gly Phe Gln Ser Val Glu Lys Leu Ile Arg Leu Leu Ser Gln Ser
50 55 60
Gln Pro Gln Val Ser Gly Phe Ser Ser Pro Pro Pro Ala Thr Ala Ala
65 70 75 80
Gly Glu Gly Ser Ala Asp His Gln Ala Val Ala Asp Val Ala Val Ser
85 90 95
Lys Phe Lys Lys Phe Ile Ser Leu Leu Asp Arg Thr Arg Thr Gly His
100 105 110
Ala Arg Phe Arg Arg Gly Pro Ile Cys Asn Pro Pro His Ala Pro Gln
115 120 125
Pro Gln Arg Lys Met Asp Gln Glu Ser Glu Pro Val Ala Ser Gly Gln
130 135 140
Thr Arg Val Val Glu Asn Ser Glu Asn Pro His Thr Gly Ala Ser Lys
145 150 155 160
Met Tyr Ser Pro Pro Pro Ile Gln Arg Leu Pro Pro Leu Pro His Asn
165 170 175
His His His Met Leu Lys Asn Val Pro Ala Pro Pro Ala Pro Asp Arg
180 185 190
Lys Glu Ser Ser Thr Thr Ile Asn Phe Ser Ala Ser Gln Ala Thr Ser
195 200 205
Ser Pro Gly Ser Phe Ile Ser Ser Leu Thr Gly Asp Thr Glu Ser Leu
210 215 220
Gln Pro Ser Leu Ser Ser Gly Phe Gln Ile Thr Asn Leu Ser Gln Val
225 230 235 240
Ser Ser Ala Gly Arg Pro Pro Leu Ser Thr Ser Ser Phe Lys Arg Lys
245 250 255
Cys Asn Ser Met Asp Asp Ser Ser Leu Lys Cys Ser Ser Ala Gly Gly
260 265 270
Ser Ala Ser Gly Arg Cys His Cys Pro Lys Lys Arg Lys Ser Arg Val
275 280 285
Lys Arg Val Val Arg Ile Pro Ala Ile Ser Met Lys Met Ala Asp Ile
290 295 300
Pro Pro Asp Asp Phe Ser Trp Arg Lys Tyr Gly Gln Lys Pro Ile Lys
305 310 315 320
Gly Ser Pro His Pro Arg Gly Tyr Tyr Lys Cys Ser Ser Val Arg Gly
325 330 335
Cys Pro Ala Arg Lys His Val Glu Arg Ala Leu Asp Asp Pro Thr Met
340 345 350
Leu Thr Val Thr Tyr Glu Gly Glu His Asn His
355 360
<210> 2
<211> 1092
<212> DNA
<213> 甘薯(Ipomoea batatas)
<400> 2
atggagtacc catacgacgt accagattac gctcatatgg ccatggaggc cagtgaattc 60
atggctgtag agttgttgtc tagttacagg aacagcggtt tcgccgctaa gatggaggaa 120
aacgccgtcc aggaggcggc cgcggctggg tttcagagcg ttgagaagct tatcagattg 180
ctttctcaat cgcagccgca agttagtggg ttttcgtcgc cgccgccggc gacggcggcc 240
ggggaaggct ccgcggatca ccaggcggtg gcggacgtgg cggtgagtaa gtttaagaag 300
tttatttcgt tgctggatcg gacccggacg ggtcacgccc ggttccggag gggcccgatt 360
tgtaaccctc ctcatgctcc gcaaccgcag aggaaaatgg atcaggaatc ggagcccgtg 420
gcgtcgggtc aaacccgggt cgtcgagaac tccgagaatc cgcacacggg cgcctccaaa 480
atgtattctc cgccgccgat tcaacgattg ccgccgctcc cgcacaacca ccaccacatg 540
ctgaagaatg ttccggcgcc gccggcgccg gaccggaaag aatcgtcgac caccatcaat 600
ttctccgcct cccaggccac atcctcgccg ggctctttca tctcatcgct tacaggcgac 660
acagagagct tacaaccttc actttcctcc ggtttccaga taaccaatct ctcccaggtc 720
tcgtcggccg gccgtccccc tctgtccacg tcatcgttca aacggaagtg caattcaatg 780
gacgattcgt ccctaaagtg cagtagtgct ggtgggtcag cctcaggacg ttgccattgc 840
cccaagaaaa ggaaatcaag agtcaaaaga gtggttagaa tccccgctat cagcatgaag 900
atggctgata ttcccccaga cgatttctcc tggcgaaaat atggccaaaa gcccatcaaa 960
ggctccccac atcctagggg atattataag tgtagtagcg tacgaggatg tccggcgagg 1020
aagcatgtgg aacgggcact ggatgatccg acgatgttaa ctgtaaccta cgaaggagaa 1080
cacaaccatt aa 1092
<210> 3
<211> 2183
<212> DNA
<213> 甘薯(Ipomoea batatas)
<400> 3
tattgctctc aatgtgcaag aatcaaatga agtatcaatc agaagtttaa ttgggacata 60
tttattggta gcaaataaaa acaaacttgt taactctatt actaagtcaa aaaccttgtg 120
gtctagtgac acccgattgc acccccacat gggaagggtg agttcgagct tcagtaaatg 180
tgatattggc tctatgtgct tcatttggtt gagaaaatag ctataaacat atactacatt 240
gtaatggagt caatagttct caaaaaaaaa aaaaaagtct tcgaccgttt gcctactaac 300
ctagtattaa tgggagtttc tctcatacat tttataaaaa tttaaaaaga gtaatgctat 360
ttctctctaa aaaaaattct tctcaaaatt tcccgtaaca ttatttgatt ggccactttt 420
ctttttcatt aagggtccat ctgaaaaaca ggaaggatgt gtttggttgg ggggtttagg 480
cataaggtat gcgtatcaaa gtgattgtta gtgtttggtt gataggtttt gtgaatgtta 540
ctatgggttt ggaatacccc attaatggca aaacccatac ccttattaaa taagggtttc 600
atctcccttc atcatttttt ccccaattat taataaccat tcccattcca cccaactacc 660
aaacatgcta aatacttcca ccaaaaccca ttacccttac caagtatttg atacccattc 720
cgattccgat tccgattccc acgtgcgaac caaacgcacc cgaaaatgtc ttctgaaaaa 780
tgagtacaat tgtttaatta aacattttaa ttattttatt taaaatataa aaaattattt 840
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ttattacatc aagctaaata aatacgattt gtattaaatt aatacaataa taataataat 1560
caaggacaat ttagtcattt tctttgtttg ttcttttttc aagatgcatt aaattctaat 1620
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<212> PRT
<213> 甘薯(Ipomoea batatas)
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1 5 10 15
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Asp Cys Phe Val Arg Arg Pro Asp Gln Ala Glu Arg Val Ile Gly Thr
35 40 45
Leu Leu Gly Ser Val Leu Pro Asp Gly Thr Val Asp Ile Arg Asn Ser
50 55 60
Tyr Ala Val Pro His Asn Glu Ser Gln Asp Gln Val Ala Leu Asp Ile
65 70 75 80
Asp Tyr His His Asn Met Leu Ala Ser His Gln Lys Val Asn Pro Lys
85 90 95
Glu Val Ile Val Gly Trp Phe Ser Thr Gly Phe Gly Val Ser Gly Gly
100 105 110
Ser Ala Leu Ile His Asp Phe Tyr Thr Arg Glu Val Thr Asn Pro Ile
115 120 125
His Leu Thr Val Asp Thr Gly Phe Thr Asn Gly Glu Ala Thr Ile Lys
130 135 140
Ala Phe Ile Ser Val Asn Leu Ser Leu Gly Asp Gln Pro Leu Ala Ala
145 150 155 160
Gln Phe Gln Glu Ile Pro Leu Asp Leu Arg Met Ile Glu Ala Glu Arg
165 170 175
Val Gly Phe Asp Met Leu Lys Thr Thr Val Val Asp Lys Leu Pro Asn
180 185 190
Asp Leu Glu Gly Met Glu Ala Ser Met Glu Arg Leu Leu Ala Leu Ile
195 200 205
Asn Asp Val His Lys His Val Asp Asp Val Val Glu Gly Arg Val Pro
210 215 220
Ala Asp Asn Asn Leu Gly Arg Leu Ile Ser Glu Thr Val Asn Ser Ile
225 230 235 240
Pro Lys Leu Ser Pro Gln Glu Phe Asp Lys Leu Val Asn Asp Ser Leu
245 250 255
Gln Asp Gln Leu Leu Leu Leu Tyr Leu Ser Ser Ile Thr Arg Thr Gln
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<211> 861
<212> DNA
<213> 甘薯(Ipomoea batatas)
<400> 5
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gctagggttc acccgctggt gattttcaac atctgcgact gctttgtccg gcgacccgac 120
caagccgagc gcgtcattgg tacgcttctc ggatccgtct tacccgacgg caccgtcgat 180
attcgcaact cctatgccgt tcctcacaac gagtcccaag atcaggttgc tttggatatt 240
gattatcatc ataacatgtt ggcatcccat cagaaagtga atcctaagga agtcattgtt 300
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actagagaag ttacaaatcc tatccatttg actgttgaca ctggattcac aaatggggag 420
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actgctgctc agatcctgta a 861