CN114276995A - 一种表达ctla-4阻遏分子的多能干细胞及其衍生物 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种表达CTLA‑4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物。所述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有CTLA‑4阻遏分子的表达序列,其可在受体体内表达CTLA‑4阻遏分子,从而阻断T细胞表面负性共刺激分子CTLA‑4的作用,从而解除免疫抑制,激活免疫系统,并恢复T细胞活性。
Description
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞及其衍生物。
背景技术
细胞毒T淋巴细胞相关抗原(4cytotoxic T lymphocyte-associated antigen-4,CTLA-4)又名CD152,是由CTLA-4基因编码的一种跨膜蛋白质,表达于活化的T细胞,与T细胞表面的协同刺激分子受体(CD28)具有高度的同源性,共同享有B7分子配体(B7-1/CD80,B7-2/CD86),而CTLA-4与B7分子结合后能负下调T细胞的反应活性,参与免疫反应的负向调节,因此是一种免疫共抑制分子。其机制,一是与CD28竞争性的结合B7或者招募磷酸酶到CTLA-4的胞内结构域部分从而降解T细胞受体(TCR)和CD28的信号,二是降低CD80/CD86在APC的表达水平或者通过转胞吞作用将它们从APC上移除,这样就减少了CD28参与激活T细胞。此外,CTLA-4还会介导树突细胞结合CD80/CD86并诱导色氨酸降解酶IDO的表达,从而导致TCR的抑制。伴随外源性抗原或肿瘤特异性靶抗原的刺激,T细胞被激活,CTLA-4表达水平上升抑制T细胞的免疫反应。因此阻断CTLA-4的免疫效应可刺激T细胞增殖,从而诱导或增强抗肿瘤免疫反应。基因重组的CTLA-4Ig可在体内外有效、特异地抑制细胞和体液免疫反应,对移植排斥反应及各种自身免疫性疾病有显著的治疗作用,毒副作用极低,是目前被认为较有希望的新的免疫抑制药物。
干细胞是一类具备自我更新能力及向特定功能体细胞分化能力的“种子”细胞,具有再生为各种组织器官和人体的潜力,在免疫应答、衰老、肿瘤发生等重大生物学活动中发挥着核心且不可替代的作用。依据干细胞特性的程度差异,主要将干细胞分为:全能干细胞(Totipotent stem cells)、多能干细胞(Pluripotent stem cells,PSCs)和成体干细胞(adult stem cell)。其中,多能干细胞PSCs具备几近无限的自我更新能力,以及在正常发育条件下向胚内所有胚层的器官、组织、细胞发育分化的潜能,典型的PSCs主要包括胚胎干细胞(embryonic stem cells,ESCs)、胚胎生殖细胞(embryonic germ cells,EGCs)、胚胎癌细胞(embryonic carcinoma cells,ECCs),以及诱导多能干细胞(induced pluripotentstem cells,iPSCs)等,这类细胞由于其强大的功能,并且可以一定程度地通过伦理限制,因此具有十分深远和广泛的应用前景。
目前,在细胞治疗领域,同种异体的免疫兼容问题依然是一大难题。近年已有许多报道通过敲除B2M、CIITA等基因,实现HLA-I和HLA-II细胞表面或本身基因的缺失表达,进而使细胞具备免疫耐受或逃逸T/B细胞特异性免疫应答,产生免疫兼容的通用型PSCs,为更广泛的通用型PSCs源细胞、组织、器官应用奠定了重要的基础。也有报道细胞过表达CTLA4-Ig、PD-L1从而抑制同种异的免疫排斥。最近又有报道,在敲除B2M、CIITA的同时,敲入CD47,从而使细胞获得了逃逸除特异性免疫应答外,还具备免疫耐受或逃逸NK等细胞的固有免疫应答,从而使细胞具备了更加全面更强的免疫兼容特性。然而,这些方案要么免疫兼容不彻底,仍有通过其他途径发生同种异体的免疫排斥;要么彻底消除同种异体免疫排斥应答,但使供体源移植物的细胞本身同时丧失了抗原提呈的能力,这给受体带来了极大的致瘤性和病毒感染等疾病的风险。
为此,也有报道,不直接敲除B2M,而敲除HLA-A、HLA-B或一并敲除CIITA的同时,保留HLA-C,并构建12个覆盖人群超过90%的HLA-C免疫配型抗原,以此达到移植物的细胞仍具备一定程度的抗原提呈功能,并且同时能够通过HLA-C抑制NK细胞的固有免疫应答。但这类细胞,一来,HLA-I类抗原提呈的抗原类型缩小了三分之二以上,能够提呈的抗原完整性极大地不可逆的缩小,对于各种肿瘤、病毒以及其他疾病抗原的提呈具有极大的偏向性,仍然保留了相当程度的致瘤和病毒感染等疾病的风险,在CIITA同时敲除的情况下其致病风险更高;二来,12种高频率免疫配型的HLA-C抗原种族差异很大,通过我们核实计算部分地区仅能占到70%的比例,而中国、印度等人口大国目前尚未有权威的大样本量的HLA数据展示,这样制备出来的通用型PSCs使用仍受到巨大的配型空缺考验;第三,这种方法会经历数次反复的基因编辑工作,按每次基因编辑至少两轮单细胞分离培养计,整个过程至少需要六轮以上的单细胞分离培养,这些流程不可避免且极大概率地因多次基因编辑脱靶或染色质不稳定或因大量单细胞传代增殖造成细胞各种不可预测的突变,进而诱发致癌、代谢疾病等各种问题。由此可见,这类免疫兼容方案亦为“过渡时期”的权宜之计,仍有许多问题没有更好的解决。
此外,还有人设计通过诱导自杀基因在供体组织、细胞致病后诱导杀死,这样做的后果将产生严重的组织坏死、细胞因子风暴等不可预知的疾病风险问题,并且这类设计的细胞杀死后将不复存在合适的供体细胞、组织和器官又是一大难题。
发明内容
为了克服现有技术所存在的不足,本发明的第一个目的,在于提供一种可表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物。
本发明的第二个目的,在于提供一种免疫兼容的表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物
本发明的第三个目的,在于提供一种免疫兼容可逆的表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物。
本发明的第四个目的,在于提供上述多能干细胞或其衍生物在制备CTLA-4高表达肿瘤治疗药物中的应用。
本发明的第五个目的,在于提供一种制剂,包含上述多能干细胞或其衍生物。
本发明所采取的技术方案是:
本发明的第一个方面:提供一种多能干细胞或其衍生物,所述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有CTLA-4阻遏分子的表达序列。
所述CTLA-4阻遏分子为抗CTLA-4抗体,优选为人源化的封闭抗体。
本发明的第二个方面:提供一种多能干细胞或其衍生物,所述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有CTLA-4阻遏分子的表达序列;所述CTLA-4阻遏分子为抗CTLA-4抗体,优选为人源化的封闭抗体。
所述多能干细胞或其衍生物基因组的B2M基因和/或CIITA基因被敲除。
本发明的第三个方面:提供一种多能干细胞或其衍生物,所述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有CTLA-4阻遏分子的表达序列;所述CTLA-4阻遏分子为抗CTLA-4抗体,优选为人源化的封闭抗体。
所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入至少一种免疫兼容分子的表达序列,所述免疫兼容分子用于调控多能干细胞细胞或其衍生物中与免疫应答相关的基因的表达。
本发明的第四个方面:提供一种多能干细胞或其衍生物,所述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有CTLA-4阻遏分子的表达序列;所述CTLA-4阻遏分子为抗CTLA-4抗体,优选为人源化的封闭抗体。
所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入至少一种免疫兼容分子的表达序列,所述免疫兼容分子用于调控多能干细胞细胞或其衍生物中与免疫应答相关的基因的表达。
所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入诱导型基因表达系统,用于调控免疫兼容分子的表达。
作为优选的:所述诱导型基因表达系统包括Tet-Off系统、二聚体诱导表达系统中的至少一种。
关于本发明的第三个方面或第四个方面:
所述与免疫应答相关的基因包括:
(1)主要组织相容性复合体基因,包括HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRA、HLA-DRB1、HLA-DRB3、HLA-DRB4、HLA-DRB5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DPA1和HLA-DPB1中的至少一种;
(2)主要组织相容性复合体相关基因,包括B2M和CIITA中的至少一种。
所述免疫兼容分子包括以下的至少一种:
(1)免疫耐受相关基因,包括CD47和HLA-G中的至少一种;
(2)HLA-C类分子,包括人群中比例合计超过90%的HLA-C复等位基因,或者超过90%的HLA-C复等位基因与B2M构成的融合蛋白基因;
(3)靶向主要组织相容性复合体基因的shRNA和/或shRNA-miR,所述主要组织相容性复合体基因包括HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRA、HLA-DRB1、HLA-DRB3、HLA-DRB4、HLA-DRB5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DPA1和HLA-DPB1中的至少一种;
(4)靶向主要组织相容性复合体相关基因的shRNA和/或shRNA-miR,所述主要组织相容性复合体相关基因包括B2M和CIITA中的至少一种。
作为优选的:
所述B2M的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.3~SEQ ID NO.5中的至少一种;
所述CIITA的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.6~SEQ ID NO.15中的至少一种;
所述HLA-A的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.16~SEQ ID NO.18中的至少一种;
所述HLA-B的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.19~SEQ ID NO.24中的至少一种;
所述HLA-C的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.25~SEQ ID NO.30中的至少一种;
所述HLA-DRA的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.31~SEQ ID NO.40中的至少一种;
所述HLA-DRB1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.41~SEQ ID NO.45中的至少一种;
所述HLA-DRB3的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.46~SEQ ID NO.47中的至少一种;
所述HLA-DRB4的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.48~SEQ ID NO.57中的至少一种;
所述HLA-DRB5的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.58~SEQ ID NO.66中的至少一种;
所述HLA-DQA1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.67~SEQ ID NO.73中的至少一种;
所述HLA-DQB1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.74~SEQ ID NO.83中的至少一种;
所述HLA-DPA1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.84~SEQ ID NO.93中的至少一种;
所述HLA-DPB1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.94~SEQ IDNO.103中的至少一种。
关于本发明的第三个方面或第四个方面:
作为优选的,所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因和/或抗干扰素效应分子,其中:shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因包括Drosha、Ago1、Ago2、Dicer1、Exportin-5、TRBP(TARBP2)、PACT(PRKRA)、DGCR8中的至少一种;所述抗干扰素效应分子为靶向PKR、2-5As、IRF-3或IRF-7的shRNA和/或shRNA-miR中的至少一种。
所述PKR的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.104~SEQ ID NO.113中的至少一种;
所述2-5As的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.114~SEQ ID NO.143中的至少一种;
所述IRF-3的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.144~SEQ ID NO.153中的至少一种;
所述IRF-7的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.154~SEQ ID NO.163中的至少一种。。
关于本发明的第三个方面或第四个方面:所述主要组织相容性复合体基因、主要组织相容性复合体相关基因、靶向PKR、2-5As、IRF-3或IRF-7的shRNA和/或shRNA-miR的表达框架如下所示:
(1)shRNA表达框架:由5’到3’依次包括shRNA靶序列、茎环序列、shRNA靶序列的反向互补序列、Poly T;两个反向互补靶序列由中间一茎环序列分隔组成发夹结构,最后连上Poly T作为RNA聚合酶III的转录终止子。
(2)shRNA-miR表达框架:将主要组织相容性复合体基因、主要组织相容性复合体相关基因、靶向PKR、2-5As、IRF-3或IRF-7的shRNA-miR靶序列替换microRNA-30或者microRNA-155中的靶序列得到。
所述环序列长度为3~9个碱基;所述poly T长度为5~6个碱基。
关于本发明的第一至第四方面:
作为优选的:所述CTLA-4阻遏分子的表达序列、免疫兼容分子的表达序列、shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因、抗干扰素效应分子、诱导型基因表达系统的导入采用病毒载体干扰、非病毒载体转染或基因编辑的方法,所述基因编辑的方法包括基因敲入。
作为优选的:所述CTLA-4阻遏分子的表达序列、免疫兼容分子的表达序列、shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因、抗干扰素效应分子、诱导型基因表达系统的导入位点为多能干细胞或其衍生物的基因组安全位点。
进一步优选的:所述基因组安全位点包括AAVS1安全位点、eGSH安全位点、H11安全位点中的一种或多种。
关于本发明的第一至第四方面:
所述抗CTLA-4抗体的重链序列如SEQ ID NO.1所示,轻链序列如SEQ ID NO.2所示。本领域技术人员可以理解,采用其他的CTLA-4抗体表达序列同样可以实现本发明的目的。
关于本发明的第一至第四方面:
所述多能干细胞包括胚胎干细胞、胚胎生殖细胞、胚胎癌细胞、或者诱导多能干细胞;
所述多能干细胞衍生物包括多能干细胞所分化的成体干细胞、各胚层细胞或组织;所述成体干细胞包括间充质干细胞或者神经干细胞。
本发明的第五个方面:提供第一至第四方面任一所述的多能干细胞或其衍生物在制备CTLA-4高表达肿瘤治疗药物中的应用。
本发明的第六个方面:提供一种制剂,包含以上所述的表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物。所述制剂还可以包含药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。
本发明的有益效果是:
本发明提供了一种可表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物,其可在受体体内表达CTLA-4阻遏分子,从而阻断T细胞表面负性共刺激分子CTLA-4的作用,从而解除抑制,激活免疫系统,并恢复T细胞活性。
本发明还提供了一种表达CTLA-4阻遏分子的免疫兼容多能干细胞或其衍生物,由于多能干细胞或其衍生物中的B2M、CIITA基因被敲除,或者其基因组中导入了免疫兼容分子表达序列,因而此类多能干细胞或其衍生物的免疫源性低,将其移植到受体中时,可以克服供体细胞和受体之间的同种异体免疫排斥问题,使得供体细胞能够在受体内长时间持续表达CTLA-4阻遏分子。
本发明还提供了一种表达CTLA-4阻遏分子的免疫兼容可逆的多能干细胞或其衍生物,导入干细胞或其衍生物中的免疫兼容分子受诱导型基因表达系统的调控,当免疫兼容分子正常表达时,多能干细胞或其衍生物中与免疫应答相关的基因的表达被抑制或过表达,可以消除或降低供体细胞和受体之间的同种异体免疫排斥应答,使得供体细胞能够长时间在受体中持续表达CTLA-4阻遏分子。而当供体细胞发生病变时,可通过外源诱导物诱导关闭免疫兼容分子的表达,从而可逆地使供体细胞表面重新表达HLAⅠ类分子,恢复供体细胞的抗原提呈能力,使受体能够清除病变的细胞,从而提高了这类通用型多能干细胞或其衍生物的临床安全性,极大地扩展其在临床应用的价值。
此外,还可以通过调整外源诱导物的添加量、持续作用时间,让供体细胞逐步表达低浓度的HLA分子来刺激受体,使得受体对供体细胞逐步产生耐受,最终达到稳定的耐受。此时,即使供体细胞表面表达不匹配的HLAⅠ类分子,也能够被受体免疫系统兼容,这样可以使得在诱导关闭供体细胞中免疫兼容分子的表达后,受体免疫系统一方面能够重新识别供体细胞中HLAⅠ类分子提呈的有基因突变的细胞,清除病变细胞;另一方面,未发生突变的部分由于被上述诱导物训练产生同种异体HLA Ⅰ类分子耐受而不会被受体免疫系统清除。由外源诱导物介导的移植物免疫耐受程序还可以在受体彻底耐受后,植入无诱导或其他方式诱导开启或关闭HLAⅠ类分子表面表达的移植物。
附图说明
图1,AAVS1 KI Vector(shRNA,组成型)质粒图谱。
图2,AAVS1 KI Vector(shRNA,诱导型)质粒图谱。
图3,AAVS1 KI Vector(shRNA-miR,组成型)质粒图谱。
图4,AAVS1 KI Vector(shRNA-miR,诱导型)质粒图谱。
图5,sgRNA clone B2M-1质粒图谱。
图6,sgRNA clone B2M-2质粒图谱。
图7,sgRNA clone CIITA-1质粒图谱。
图8,sgRNA clone CIITA-2质粒图谱。
图9,Cas9(D10A)质粒图谱。
图10,sgRNA Clone AAVS1-1质粒图谱。
图11,sgRNA Clone AAVS1-2质粒图谱。
具体实施方式
下面结合实施例和附图对本发明作进一步的说明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。
1实验材料
1.1抗CTLA-4抗体
抗CTLA-4抗体的重链序列如SEQ ID NO.1所示,轻链序列如SEQ ID NO.2所示。
1.2干细胞或其衍生物
多能干细胞可选自胚胎干细胞(ESCs)、诱导多能干细胞(iPSCs)以及其他形式的多能干细胞,例如hPSCs-MSCs、NSCs、EBs细胞。其中:
iPSCs:使用我们所建立的第三代高效安全的episomal-iPSCs诱导系统(6F/BM1-4C),pE3.1-OG--KS和pE3.1-L-Myc--hmiR302 cluster经电转进入体细胞中,RM1培养2天,含2uM Parnate的BioCISO-BM1培养2天,含2uM Parnate、0.25mM sodium butyrate、3uMCHIR99021和0.5uM PD03254901的BioCISO-BM1培养2天,在用干细胞培养基BioCISO培养到17天左右即可挑取iPSCs克隆,所挑取的iPSCs克隆经纯化、消化、传代以获得稳定的iPSCs。具体构建方法参见:Stem Cell Res Ther.2017Nov 2;8(1):245。
hPSCs-MSCs:将iPSCs使用干细胞培养基(BioCISO,含10uM TGFβ抑制剂SB431542)培养25天,期间80-90汇合度进行消化传代(2mg/mL Dispase消化),1:3传代到Matrigel包被的培养板中,接着ESC-MSC培养基(knockout DMEM培养基,含10%KSR、NEAA、双抗、谷氨酰胺、β-巯基乙醇、10ng/mL bFGF和SB-431542)进行培养,每天换液,80-90汇合度进行传代(1:3传代),连续培养20天即可。具体构建方法参见:Proc Natl Acad Sci U S A.2015;112(2):530-535。
NSCs:将iPSCs使用诱导培养基(knockout DMEM培养基,含10%KSR,含TGF-β抑制剂,BMP4抑制剂)培养14天,挑取玫瑰花环状的神经细胞到低粘附培养板中进行培养,培养基使用比例为1:1的DMEM/F12(含1%N2,Invitrogen)和Neurobasal培养基(含2%B27,Invitrogen),还含有20ng/ml bFGF和20ng/ml EGF,进行培养,消化使用Accutase进行消化传代即可。具体构建方法参见:FASEB J.2014;28(11):4642-4656。
EBs细胞:将汇合度达到95%的iPSCs使用BioC-PDE1消化6min后使用机械刮传法将细胞刮成块状,沉降降细胞团块,沉降的细胞团块转移到低粘附培养板中使用BioCISO-EB1培养7天,隔天换液。7天后转移到Matrigel包被的培养板中继续使用BioCISO进行贴壁培养,7天后即可获得具有内、中、外三胚层结构的拟胚体(EBs)。具体构建方法参见:StemCell Res Ther.2017Nov 2;8(1):245。
所述多能干细胞衍生物包括多能干细胞所分化的成体干细胞、各胚层细胞或组织。
1.3基因组安全位点
本发明技术方案中,基因敲入的基因组安全位点可选自AAVS1安全位点、eGSH安全位点,或者其它安全位点:
(1)AAVS1安全位点
AAVS1位点(别名“PPP1R2C位点”)位于人类基因组第19号染色体上,是一个经过验证、能够确保转入DNA片段预期功能的“安全港”位点。该位点是一个开放的染色体结构,能保证转入基因能被正常转录,且该位点插入外源目的片段对细胞无已知的副作用。
(2)eGSH安全位点
eGSH安全位点位于人类基因组第1号染色体上,是一个经过论文验证、能够确保转入DNA片段预期功能的另一个“安全港”位点。
(3)其它安全位点
H11安全位点(也叫Hipp11),位于人的22号染色体,是Eif4enif1与Drg1这两个基因之间的一个位点,由Simon Hippenmeyer于2010年发现并命名,由于H11位点位于两个基因之间,故外源基因插入后影响內源基因表达的风险很小。H11位点被验证是一个基因间的安全的转录激活区域,是AAVS1、eGSH位点之外的一个新的“安全港”位点。
1.4诱导型基因表达系统
本发明技术方案中,诱导型基因表达系统可选自:tet-Off系统或者二聚体关闭表达系统:
(1)tet-Off系统
在没有四环素存在时,tTA蛋白持续作用在tet启动子上,使基因持续表达。在需要转基因保持在一个持续表达状态下,该系统是非常有用。加入四环素时,四环素可使tTA蛋白的结构变化,使其不能与启动子结合,从而使其驱动的基因表达水平下降。为了使该系统保持“关闭”状态,必须连续添加四环素。
本发明将tet-Off系统以及一种或多种免疫兼容分子的序列敲入多能干细胞的基因组安全位点处,通过四环素的添加与否精准开启或关闭免疫兼容分子的表达,从而可逆调控多能干细胞或其衍生物中主要组织相容性复合体相关基因的表达。
(2)二聚体关闭表达系统
二聚体介导的基因表达调控系统:化学调控靶基因转录的方法有很多种,最常见的是利用影响转录因子活性的别构调节物进行调控。其中的一个方法是运用二聚化的诱导剂或者二聚体在无活性的融合蛋白上重组有活性的转录因子。最常用的体系是将天然产物雷帕霉素(rapamydn)或者无生物活性的类似物作为二聚化的药物。雷帕霉素(或类似物)同胞质蛋白FKBP12(FKBP与FK506结合的蛋白)和一种大的丝-苏氨酸蛋白激酶,称为FRAP【FRBP-雷帕霉素相关蛋白,即mTOR(哺乳动物的雷帕霉素靶点)】有高度亲和性,又与这两种蛋白质相结合的功能,因此作为异源性二聚体将这两种蛋白质聚到一起。为调控靶基因转录,将DNA结合区域融合到一个或多个FKBP结构域,将转录抑制域融合到FRAP的93位氨基酸部位,称为FRB,这样足以结合FKBP-雷帕霉素复合物。只有在雷帕霉素存在的情况下,这两种融合蛋白才能发生二聚化。因而抑制具有与DNA结合区域相结合的位点的基因进行转录。
1.5免疫兼容分子的选择
所述免疫兼容分子可以调控多能干细胞或其衍生物中同种异体免疫排斥相关基因的表达。具体免疫兼容分子的种类及序列如表1所示:
表1免疫兼容分子
以上shRNA或shRNA-miR免疫兼容分子的靶序列如表2所示:
表2 shRNA或shRNA-miR的靶序列
下面表5-表6的免疫兼容分子敲入方案中,各实验组别的shRNA或shRNA-miR序列均为采用表2中的靶序列1构建得到的shRNA或shRNA-miR免疫兼容分子。本领域的技术人员可以理解:以其他靶序列构建得到的shRNA或shRNA-miR免疫兼容分子同样可以实现本发明的技术效果,均落入本发明权利要求的保护范围。
1.6 shRNA/miRNA加工复合体基因和抗干扰素效应分子
在细胞核内的初级miRNA(pri-miRNA)经过复合物Drosha-DGCR8进行微处理,将pri-miRNA裂解成前体miRNA(pre-miRNA),这时会形成发夹结构。接着,经Exportin-5-Ran-GTP复合物将pre-miRNA转运出核。在胞浆中与双链RNA结合蛋白TRBP(TARBP2)结合的RNaseDicer酶将pre-miRNA分解成成熟的长度,miRNA在这时还处于双链状态。最后被转运进AGO2,形成RISC(RNA诱导沉默复合体)。最终miRNA双链的一条链保留在RISC复合物中,另外一条则排出被迅速降解掉。而DGCR8作为Drosha的主要结合蛋白,可以通过其C末端的两个双链RNA结合区域与pri-miRNA结合,招募并指导Drosha在pri-miRNA的正确位置剪切,生产pre-miRNA,pre-miRNA进一步被Dicer和TRBP/PACT加工剪切,形成成熟的miRNA。DGCR8的缺失或异常表达会影响Drosha的剪切活性,进而影响miRNA的活性,导致疾病的发生。TRBP能够招募Dicer复合体miRNA形成RISC Ago2。
本发明利用基因敲入技术,在基因组安全位点敲入可诱导关闭表达的针对HLA I类分子和HLA II类分子等的shRNA-miR表达序列时,优选同时敲入可诱导关闭表达的shRNA和/或miRNA加工机器包括Drosha(Accession number:NM_001100412)、Ago1(Accessionnumber:NM_012199)、Ago2(Accession number:NM_001164623)、Dicer1(Accessionnumber:NM_001195573)、Exportin-5(Accession number:NM_020750)、TRBP(Accessionnumber:NM_134323)、PACT(Accession number:NM_003690)和DGCR8(Accession number:NM_022720),以便细胞不占用其他miRNA的加工,影响细胞功能。
此外,在IFN诱生的过程中,双链RNA所依赖的蛋白激酶(double-stranded RNA-dependent Protein Kinase,PKR),它是整个细胞信号转导通路的关键因子,同时还有2’,5’寡腺苷酸合成酶(2,5-Oligoadenylate Synthetase,2-5As),这两种酶与dsRNA诱生IFN密切相关。PKR能通过磷酸化真核细胞转录因子,从而抑制蛋白质合成,使细胞停滞于G0/G1和G2/M期,并诱导凋亡,而dsRNA可以促进2-5As合成,结果导致RNase即RNaseL的非特异性活化,降解细胞内所有的mRNA,致细胞死亡。I型干扰素的诱导特异性是通过IRF转录因子家族成员实现的,在细胞缺乏IRF-3和IRF-7的表达下,在很多病毒感染情况下I型干扰素是不能被诱导分泌的。缺乏IFN的应答,要使其恢复,需要上述两种蛋白质的共表达才行。
本发明利用基因敲入技术,在基因组安全位点处敲入免疫兼容分子shRNA-miR表达序列时,优选同时敲入可诱导关闭表达的针对抑制PKR、2-5As、IRF-3和IRF-7基因的shRNA和/或shRNA-miR表达序列,降低dsRNA诱发的干扰素反应,从而避免产生细胞毒性。
shRNA/miRNA加工复合体相关基因、抗干扰素效应分子、免疫兼容分子在基因组安全位点的插入位置顺序没有限定,它们之间可以以任何次序排列,而不会相互干扰或者影响基因组其它基因的结构和功能。
具体的抗干扰素效应分子的靶序列如表3所示。
表3抗干扰素效应分子的靶序列
下面表5-表6的抗干扰素效应分子敲入方案中,各实验组别的shRNA或shRNA-miR序列均为采用表3中的靶序列1构建得到的shRNA或shRNA-miR免疫兼容分子。本领域的技术人员可以理解:以其他靶序列构建得到的shRNA或shRNA-miR免疫兼容分子同样可以实现本发明的技术效果,均落入本发明权利要求的保护范围。
1.7免疫兼容分子、抗干扰素效应分子shRNA或shRNA-miR的通用框架
免疫兼容分子、抗干扰素效应分子shRNA或shRNA-miR的通用框架序列如下所示:
(1)shRNA组成型表达框架为:
GAGGGCCTATTTCCCATGATTCCTTCATATTTGCATATACGATACAAGGCTGTTAGAGAGATAATTGGAATTAATTTGACTGTAAACACAAAGATATTAGTACAAAATACGTGACGTAGAAAGTAATAATTTCTTGGGTAGTTTGCAGTTTTAAAATTATGTTTTAAAATGGACTATCATATGCTTACCGTAACTTGAAAGTATTTCGATTTCTTGGCTTTATATATCTTGTGGAAAGGACGCTAGCGCCACC(SEQ ID NO.164)N1...N21TTCAAGAGA(SEQ IDNO.165)N22...N42TTTTTT
其中:
a、N1...N21为对应基因的shRNA靶序列,N22...N42为对应基因的shRNA靶序列的反向互补序列;
b、如果质粒需要表达多个基因的shRNA,则每个基因分对应一个shRNA表达框架,然后无缝连接起来;
c、带不同抗性基因的组成型shRNA质粒,只有抗性基因不同,其它序列一样;
d、N表示A、T、G、C碱基;
e、SEQ ID NO.164为U6启动子序列;
f、SEQ ID NO.165为茎环序列。
(2)shRNA诱导型表达框架为:
GAGGGCCTATTTCCCATGATTCCTTCATATTTGCATATACGATACAAGGCTGTTAGAGAGATAATTGGAATTAATTTGACTGTAAACACAAAGATATTAGTACAAAATACGTGACGTAGAAAGTAATAATTTCTTGGGTAGTTTGCAGTTTTAAAATTATGTTTTAAAATGGACTATCATATGCTTACCGTAACTTGAAAGTATTTCGATTTCTTGGCTTTATATATCTTGTGGAAAGGACTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAAAGTCGAGCTCGGTACCCGGGTCGAGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGCCTATATAAGCAGAGCTCGTTTAGTGAACCGTCAGATCGCCTGGAGACGCCATCCACGCTGTTTTGACCTCCATAGAAGACACCGGGACCGATCCAGCCTGCTAGCGCCACC(SEQ ID NO.166)N1...N21TTCAAGAGA(SEQ ID NO.167)N22...N42TTTTTT
其中:
a、N1...N21为对应基因的shRNA靶序列,N22...N42为对应基因的shRNA靶序列的反向互补序列;
b、如果质粒需要表达多个基因的shRNA,则每个基因分对应一个shRNA表达框架,然后无缝连接起来;
c、带不同抗性基因的组成型shRNA质粒,只有抗性基因不同,其它序列一样;
d、N表示A、T、G、C碱基;
e、SEQ ID NO.166为H1 TO启动子序列;
f、SEQ ID NO.167为茎环序列。
(3)shRNA-miR组成型或诱导型表达框架为:
以shRNA-miR靶序列替换microRNA-30中的靶序列得到,具体序列如下:
GAGGCTTCAGTACTTTACAGAATCGTTGCCTGCACATCTTGGAAACACTTGCTGGGATTACTTCTTCAGGTTAACCCAACAGAAGGCTAAAGAAGGTATATTGCTGTTGACAGTGAGCG(SEQ ID NO.168)M1N1...N21TAGTGAAGCCACAGATGTA(SEQ ID NO.169)N22...N42M2TGCCTACTGCCTCGGACTTCAAGGGGCTACTTTAGGAGCAATTATCTTGTTTACTAAAACTGAATACCTTGCTATCTCTTTGATACATTTTTACAAAGCTGAATTAAAATGGTATAAAT(SEQ ID NO.170)
其中:
a、N1...N21为对应基因的shRNA-miR靶序列,N22...N42为对应基因的shRNA-miR靶序列的反向互补序列;
b、如果质粒需要表达多个基因的shRNA-miR,则每个基因分对应一个shRNA-miR表达框架,然后无缝连接起来;
c、带不同抗性基因的组成型shRNA-miR质粒,只有抗性基因不同,其它序列一样;
d、M碱基表示A或C碱基,N表示A、T、G、C碱基;
e、如果N1为G碱基,则M1为A碱基;否则M1为C碱基;
f、M1碱基与M2碱基互补。
2实验方法
2.1构建表达CTLA-4阻遏分子的肿瘤治疗细胞
2.1.1 KI(Knock-in,下同)质粒构建方法:
a.获取质粒基本骨架:设计引物,通过PCR的方法从pUC18(Takara,Code No.3218)质粒获取Amp(R)-pUC origin片段,然后回收产物。
b.重组臂的获取:设计引物,以人细胞的基因组DNA为模板,扩增AAVS1-HR-L(SEQID NO.171),AAVS1-HR-R(SEQ ID NO.172),然后回收产物。
c.其它质粒元件的获取:设计引物,直接对含该质粒元件的质粒进行亚克隆,然后回收产物。
d.质粒组装:把前面步骤获取的各种产物通过overlap PCR或者使用重组酶(南京诺唯赞生物,C113-01)通过重组的方法连接起来组成一个环状质粒。各分组的抗体、免疫兼容分子插入KI质粒的操作参加实验方案部分。
2.1.2 2.肿瘤治疗细胞的构建
(一)sgRNA构建
1、质粒
外源基因的敲入采用Cas9(D10A)质粒和sgRNA质粒系统。Cas9(D10A)质粒图谱如图3所示,AAVS1安全位点的sgRNA质粒图谱如图4、图5所示,eGSH安全位点的sgRNA质粒图谱如图6、图7所示。
2、同源臂
(1)、AAVS1同源臂AAVS1-HR-L和AAVS1-HR-R的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.170和SEQ ID NO.171所示。
(2)、eGSH同源臂eGSH-HR-L和eGSH-HR-R的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.173和SEQ ID NO.174所示。
3、sgRNA序列
sgRNA-AAVS1-1:5’-TATAAGGTGGTCCCAGCTCGGGG-3’(SEQ ID NO.175);
sgRNA-AAVS1-2:5’-AGGGCCGGTTAATGTGGCTCTGG-3’(SEQ ID NO.176)。
sgRNA-eGSH-1:5’-GGTGGAAGCTTCATTCCAGATGG-3’(SEQ ID NO.177);
sgRNA-eGSH-2:5’-GACCTGCCTCATTAAATATCAGG-3’(SEQ ID NO.178)。
4、质粒构建方法
(1)使用限制性内切酶BbsI酶切sgRNA空载体,然后回收。
(2)合成sgRNA引物(含载体黏性末端)。
(3)引物加水稀释成10uM,配反应体系于沸水煮5min,后冷却至室温,获得退火产物。
反应体系:上游引物:2uL,下游引物:2uL,水:12.8uL
(4)使用DNA连接反应试剂盒(TaKaRa,6022)把前面步骤载体和退火产物连接起来,获得包含基因靶序列的sgRNA质粒。
(二)基因编辑过程
1.AAVS1基因敲入的单细胞克隆操作步骤
(1)电转程序:
供体细胞准备:人多能干细胞
仪器:电转仪
培养基:BioCISO
诱导质粒:Cas9D10A、sgRNA clone AAVS1-1、sgRNA clone AAVS1-2、AAVS1 neoVectoⅠ、AAVS1 neo VectorⅡ
注:eGSH基因敲入使用的诱导质粒:Cas9D10A、sgRNA clone eGSH-1、sgRNA cloneeGSH-2、eGSH-neo/eGSH-puro(donor)这里的donor质粒与AAVS1的比较,只有左右重组臂不一样,其它元件都一样。由于eGSH的基因编辑过程与AAVS1的相同,后面就不再重复列举。
(2)电转后的人多能干细胞进行含G418和puro的双抗生素培养基进行筛选
(3)进行单细胞克隆筛选及培养,获得单细胞克隆株。
2.AAVS1基因敲入的单细胞克隆株培养试剂
(1)培养基:BioCISO+300μg/ml G418+0.5μg/ml puro
(应提前置于室温,避光条件放置30~60分钟,直至恢复到室温。注意:不应将BioCISO置于37℃进行预热,避免生物分子活性降低。)
(2)基质胶:hESC级Matrigel
(传代或复苏细胞前,将Matrigel工作液加入细胞培养瓶皿中并摇匀,确保Matrigel完全没过培养瓶皿底部,且在使用前任意一处Matrigel都不能干掉。为保证细胞能够更好的贴壁和存活,Matrigel放入37℃培养箱包被时间:1:100X Matrigel不能低于0.5小时;1:200X Matrigel不能低于2小时。)
(3)消化液:使用DPBS溶解EDTA至终浓度为0.5mM,pH7.4
(注意:EDTA不能使用水稀释,否则细胞会因渗透压降低而死亡。)
(4)冻存液:60%BioCISO+30%ESCs级FBS+10%DMSO
(冻存液最好现配现用。)
3.常规维持传代培养过程
(1)传代的最佳时刻以及传代比例
a.传代最佳时刻:细胞整体汇合度达80%~90%。
b.传代最佳比例:1:4~1:7传代,次日最佳汇合度应维持在20%~30%。
(2)传代过程
a.事先将包被好的细胞培养瓶皿中的Matrigel吸走弃掉,加入适量培养基(BioCISO+300μg/ml G418+0.5μg/ml puro),并放入37℃、5%CO2培养箱中孵育;
b.待细胞符合传代的要求,吸掉培养基上清,加入适量的0.5mM EDTA消化液到细胞瓶皿中;
c.将细胞放入37℃、5%CO2培养箱中孵育5~10分钟(消化至镜下观察到大部分细胞收缩变圆但还未漂浮即可,轻柔吹打细胞使其从壁上脱离,将细胞悬液吸到离心管内,200g离心5分钟;
d.离心后,弃上清,用培养基重悬细胞,轻柔反复吹打细胞数次至混匀,然后将细胞转移至事先准备好包被Matrigel的瓶皿中;
e.细胞转移至细胞瓶皿后,前后左右水平摇匀,镜下观察无异常后,摇匀置于37℃、5%CO2培养箱中进行培养;
f.次日观察细胞贴壁存活状态,吸掉培养基每天正常按时换液。
4.细胞冻存
(1)按照常规传代的操作步骤,使用0.5mM EDTA消化细胞至大部分细胞收缩变圆但尚未漂浮,轻柔吹打细胞,收集细胞悬液,200g离心5分钟,弃上清,加入适量冻存液重悬细胞,将细胞转移至冻存管(建议六孔板汇合度80%冻存一支,冻存液体积为0.5ml/支);
(2)将冻存管置于程序降温盒中,立即放入-80℃过夜(需保证冻存管每分钟温度下降1℃);
(3)次日立即将细胞转移入液氮。
5.细胞复苏
(1)提前准备好Matrigel包被的细胞瓶皿,复苏细胞前,吸掉Matrigel,向细胞瓶皿中加入适量的BioCISO,置于37℃、5%CO2培养箱中孵育;
(2)将冻存管从液氮中快速取出,立即放入37℃水浴锅中快速摇晃,使细胞快速融解,仔细观察待冰晶完全消失停止摇晃,将细胞转移至生物安全柜;
(3)提前加入10ml DMEM/F12(1:1)基础培养基至15ml离心管,并平衡至室温,使用巴氏吸管吸取1ml DMEM/F12(1:1)缓慢加入冻存管中,轻柔混匀,将细胞悬液转移到准备好的含有DMEM/F12(1:1)的15ml离心管中,200g离心5分钟;
(4)小心弃掉上清,加入适量BioCISO,轻轻混匀细胞,种到提前准备好的细胞瓶皿中,水平前后左右摇匀后,镜下观察无异常后,摇匀置于37℃、5%CO2培养箱中培养;
(5)次日观察细胞贴壁存活状态,每天正常按时换液。若贴壁良好,则BioCISO更换为BioCISO+300μg/ml G418+0.5μg/ml puro。
(三)AAVS1基因敲入检测方法
1.单细胞克隆AAVS1基因敲入检测
(1)AAVS1基因敲入检测说明
a.试验目的:PCR检测经过基因敲入处理的细胞,测试该细胞是否为纯合子。由于两个Donor片段只有抗性基因的序列具有差异性,因此要判断该细胞是否为纯合子(两条染色体分别敲入不同抗性基因的Donor片段),就需要检测该细胞的基因组是否含有两种抗性基因的Donor片段,只有双敲入的细胞才有可能是正确的纯合子;
b.试验方法:首先在Donor质粒内部(非重组臂部分)设计一条引物,然后在基因组PPP1R12C(非重组臂部分)设计另一条引物。如果Donor片段在基因组能够正确插入,就会有目的条带出现,否则无目的条带出现);
c.试验方案引物序列及PCR方案如表4所示:
表4试验方案引物序列及PCR方案
注:eGSH基因敲入的检测方法跟AAVS1基因敲入检测原理和方法一样,这里不再描述。
2.2检测方法
2.2.1多能干细胞表达CTLA-4抗体的测定方法
使用ELISA(竞争法)对多能干细胞表达的CTLA-4抗体进行检测。收集表达CTLA-4抗体的多能干细胞培养上清,并与酶标的抗CTLA-4抗体混合(1:1),再在已经包被CTLA-4抗原的酶标板上进行上样,对照组则加不表达CTLA-4抗体的多能干细胞培养上清,轻轻混匀。封板后置于37℃温育30min,洗涤5次后加入显色液显色15min,加入终止液50ul,读数测量450nm吸光度值。(CTLA-4抗体的表达量与颜色深浅成负相关)。
2.2.2 51Cr释放法检测CTLA-4抗体对T细胞杀伤肿瘤的影响
(1)效应细胞的准备:
T细胞分离:使用Ficoll密度梯度离心法(ficoll-hypaque density gradientcentrifugation)分离人外周血单个核细胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC),再使用DynabeadsTMCD3(InvitrogenTM,货号:11151D)试剂盒分离出T细胞。将细胞重悬在含10%FBS的RPMI1640培养基中,通过台盼蓝染色计数细胞,并浓缩至1×107细胞/mL。
(2)靶细胞的准备
肿瘤(RCC肾癌)细胞,将其消化重悬,通过台盼蓝染色计数细胞,配成1×107细胞/mL的细胞悬液。
(3)51Cr释放试验
T细胞先用表达抗CTLA-4抗体的多能干细胞的培养基上清孵育30分钟,再与肿瘤细胞接触时,T就会攻击肿瘤细胞造成细胞裂解死亡。而未经表达抗CTLA-4抗体的多能干细胞的培养基上清孵育的会发生肿瘤细胞不易被T细胞所识别,会发生免疫逃逸。所以通过检测培养基中51Cr的量,即可反应出T细胞杀伤肿瘤的能力。51Cr的释放到培养液中的量越少,肿瘤细胞越容易发生免疫逃逸。
定量检测细胞介导的细胞毒作用,以放射性同位素51Cr标记靶细胞,与效应分子或细胞共孵育,根据靶细胞裂解所释放的51Cr放射脉冲数(cpm)而判断细胞毒活性。
a.将靶细胞用100μCi(Ci,放射性活度单位)的Na51CrO4在37℃标记120min,每15分钟震摇一次,标记后再用清洗液离心清洗5次,最后重悬于培养液中,配成1×106细胞/mL备用。
b.将靶细胞及T细胞加入96孔培养板中,每孔加100μl靶细胞(2.5×103个)及100μl效应细胞(E/T=1:2、1:5、1:10,E/T为靶细胞与效应细胞T的比),同时设立自然释放对照孔(100μl靶细胞+100ul培养基)和最大释放孔(100μl靶细胞+100ul 2%SDS)。放置37℃,5%CO2培养孵育4h。取出后用移液器吸出各孔上清液后,离心取上清液100μl,用γ计数仪测量cpm值。
注:一般要求51Cr自然释放率<10%
c.结果计算:根据公式计算51Cr自然释放率和T细胞的活性:
2.2.3小鼠肿瘤治疗方法
在人源化NSG小鼠(The Jackson Laboratory(JAX))中,对其右腋下皮下注射5×106肿瘤细胞(RCC肾癌,MC结肠癌,HCC肝癌)细胞,待肿瘤长到60mm3大小时,进行尾静脉注射200uLPBS(含人免疫细胞和1×106的表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞衍生物)进行肿瘤治疗,其中只注射含人免疫细胞的组作为对照组。20天后处死小鼠,然后比较各组之间肿瘤大小,并进行差异性统计分析。
3实验方案
首先,将表达CTLA-4阻遏分子(抗CTLA-4抗体)的基因敲入基因组安全位点(safeharbour)以实现多能干细胞衍生物表达CTLA-4阻遏分子。从而使多能干细胞或其衍生物能在肿瘤治疗上进行应用。接着,我们还可以通过基因编辑技术对其进行改造,改造成组成型免疫兼容的通用型多能干细胞或其衍生物和免疫兼容可逆的通用型多能干细胞或其衍生物,进而能在同种异体中进行肿瘤治疗。
注:CTLA-4阻遏分子(抗CTLA-4抗体)可以单独敲入一种细胞,也可以与免疫兼容分子同时敲入一种细胞。表5和表6中的“+”号表示基因或核酸序列的敲入,“-”号表示基因敲除。
表5组成型表达实验方案
各分组的抗体、免疫兼容分子插入KI质粒的操作如下:
总体原则:CTLA-4抗体序列放入对应质粒的MCS2的位置,shRNA放入对应质粒的shRNA表达框架内,shRNA-miR放入对应质粒的shRNA-miR表达框架内,其它基因放入对应质粒的MCS1的位置。各质粒的图谱如图1-图11所示。
抗体的LC轻链、HC重链前面均添加有IL-2sig信号肽,末端添加终止子TGA,轻链和重链中间通过EMCV IRESwt连接起来,具体结构为:IL-2sig信号肽-CTLA-4抗体的LC轻链(含终止密码子)-EMCV IRESwt-IL-2sig信号肽-CTLA-4抗体的HC重链(含终止密码子)。
EMCV IRESwt的序列如SEQ ID NO.187所示;
IL-2sig信号肽的序列如SEQ ID NO.188所示。
sgRNA clone B2M质粒包含sgRNAclone B2M-1和sgRNA clone B2M-2质粒。sgRNAclone CIITA质粒包含sgRNA clone CIITA-1和sgRNA clone CIITA-2质粒。
(1)A1分组
AAVS1 KI Vector(shRNA,组成型)质粒的MCS2放入CTLA-4抗体序列。MCS1放入其他基因序列(若存在多个基因则使用EMCV IRESwt连接起来)。
(2)A2分组
AAVS1 KI Vector(shRNA,组成型)质粒的MCS2放入CTLA-4抗体序列。shRNA表达框架放入shRNA靶序列(若存在多个shRNA则无缝连接起来)。MCS1放入其他基因序列(若存在多个基因则使用EMCV IRESwt连接起来)。
(3)A3分组
AAVS1 KI Vector(shRNA-miR,组成型)质粒的MCS2放入CTLA-4抗体序列。shRNA-miR表达框架放入shRNA-miR靶序列(若存在多个shRNA-miR则无缝连接起来)。MCS1放入其他基因序列(若存在多个基因则使用EMCV IRESwt连接起来)。
(4)A4分组
AAVS1 KI Vector(shRNA,组成型)质粒的MCS2放入CTLA-4抗体序列。MCS1放入其他基因序列(若存在多个基因则使用EMCV IRESwt连接起来)。
sgRNA clone B2M质粒的靶序列放入B2M的sgRNA靶序列,
sgRNA clone CIITA质粒的靶序列放入CIITA的sgRNA靶序列。
(4)A5分组:(同A2分组的方法)。
(6)A6分组(同A3分组的方法)。
表6诱导型表达(免疫兼容可逆)实验方案
各分组的抗体、免疫兼容分子插入KI质粒的操作如下:
(1)B1分组
AAVS1 KI Vector(shRNA,诱导型)质粒的MCS2放入CTLA-4抗体序列。shRNA表达框架放入shRNA靶序列(若存在多个shRNA则无缝连接起来)。MCS1放入其他基因序列(若存在多个基因则使用EMCV IRESwt连接起来)。
(2)B2分组
AAVS1 KI Vector(shRNA-miR,诱导型)质粒的MCS2放入CTLA-4抗体序列。shRNA-miR表达框架放入shRNA-miR靶序列(若存在多个shRNA-miR则无缝连接起来)。MCS1放入其他基因序列(若存在多个基因则使用EMCV IRESwt连接起来)。
(3)B3分组(同B1分组的方法)。
(4)B4分组(同B2分组的方法)。
3实验结果
3.1干细胞或其衍生物表达的CTLA-4抗体的阻断效果检测
将表5和表6各实验组方案敲入iPSCs、MSCs、NSCs、EBs细胞的基因组安全位点AAVS1,37℃,0.5%CO2培养箱培养,收集培养基上清,并与酶标的抗CTLA-4抗体混合(1:1),再在已经包被CTLA-4抗原的酶标板上进行上样,对照组(N)则加不表达CTLA-4抗体的多能干细胞培养上清,轻轻混匀。封板后置于37℃温育30min,洗涤5次后加入显色液显色15min,加入终止液50ul,读数测量450nm吸光度值。(CTLA-4抗体的表达量与颜色深浅成负相关)各实验组的检测结果如表7所示。
表7各实验组表达的CTLA-4抗体对CTLA-4的阻断效果
从上表可以看出,本发明的多能干细胞或其衍生物所表达的CTLA-4抗体能够有效阻断CTLA-4抗体与细胞表面CTLA-4的结合。而且其表达量在各组中表达相对恒定,所以多能干细胞或其衍生物所表达的CTLA-4抗体不受细胞分化形态及其他外源基因(免疫兼容改造)所影响。
3.2表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物的抗肿瘤效果
将表5和表6各实验组方案敲入iPSCs、MSCs、NSCs、EBs细胞的基因组安全位点AAVS1,得到表达CTLA-4阻遏分子细胞。使用51Cr释放试验检验其抗肿瘤效果,结果见表8。
对照组(N)为不表达CTLA-4抗体的多能干细胞培养上清。
表8各实验组表达的CTLA-4抗体对T细胞杀伤肿瘤细胞的影响
通过以上实验,可以证明本发明制备的表达CTLA-4阻遏分子的干细胞或其衍生物能有效阻断激活T细胞而起到抗肿瘤作用。
3.3表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞或其衍生物的抗肿瘤效果
在人源化NSG小鼠肿瘤模型中,我们对其进行注射能够表达CTLA-4抗体的hPSCs及hPSCs源衍生物(hPSCs-MSCs、hPSCs-NSCs、hPSCs-EBs),观察其RCC肾癌,MC结肠癌,HCC肝癌的肿瘤治疗的效果,只注射含人免疫细胞的组作为对照组。注:为避免免疫兼容问题,我们所使用的免疫细胞与hPSCs及hPSCs源衍生物均来源于同一人的,且采用B2M和CIITA基因敲除的免疫兼容方案。
表9表达抗CTLA-4抗体的多能干细胞或其衍生物的肿瘤治疗
通过以上实验,可以证明本发明制备的表达CTLA-4阻遏分子的干细胞或其衍生物能有效起到抑制多种肿瘤的作用。
3.4免疫兼容分子诱导型表达组的可逆性表达测试
通过上述实施例,表达CTLA-4阻遏分子的hPSCs及hPSCs源衍生物能有效起到抗肿瘤作用。我们还必须考虑hPSCs及hPSCs源衍生物的免疫兼容问题。因此我们选取一个合适的组合对免疫兼容进行测试。
我们利用MSCs的低免疫源性的特点,在人源化NSG小鼠肿瘤模型中,对其进行注射能够表达CTLA-4阻遏分子(抗CTLA-4抗体)的hPSCs源免疫兼容MSCs,观察其肿瘤(RCC肾癌)治疗的效果。注:所使用的免疫细胞与hPSCs源MSCs来源于为非同一人。
对照组是指未注射MSCs细胞的NSG小鼠肿瘤模型。
加Dox组别的处理是:在小鼠饮食中添加0.5mg/mL的Dox,进行饲养小鼠,从注射表达阻遏分子细胞开始,一直使用,直到试验结束。
表10免疫兼容分子诱导型表达组的可逆性表达测试结果
以上实验表明:仅表达阻遏分子的MSCs(组2),其具有低免疫源性,可以在异体内存在一定时间,所以其能够发挥一定的肿瘤治疗效果,而进行免疫兼容改造的(组3-11,包括组成型和可逆诱导型免疫兼容),其免疫兼容效果更佳,比没有经免疫兼容改造的MSCs在体内存在时间更长(或能做到长期共存),其发挥肿瘤治疗效果更佳,而组5为B2M和CIITA基因敲除组,其完全消除HLA-I和HLA-II类分子产生的影响,因此其肿瘤治疗效果最佳。但由于其组成型免疫兼容改造(基因敲入/敲除),无法在移植物产生变异或不需要时进行清除,从而有组8-15方案设定。组12-15中在进行注射表达阻遏分子细胞进入小鼠的同时,对小鼠使用Dox诱导剂(一直使用),注射表达阻遏分子细胞的小鼠的免疫兼容效果将被消除,其在体内存在时间与未经免疫兼容改造的MSCs相当,其肿瘤治疗效果也与未经免疫兼容改造的MSCs相当。
SEQUENCE LISTING
<110> 未来智人再生医学研究院(广州)有限公司;王淋立
<120> 一种表达CTLA-4阻遏分子的多能干细胞及其衍生物
<130>
<160> 188
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1344
<212> DNA
<213> human
<400> 1
caggtgcagc tggtggagag cggcggcggc gtggtgcagc ccggcaggag cctgaggctg 60
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cccggcaagg gcctggagtg ggtgaccttc atcagctacg acggcaacaa caagtactac 180
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gagatcgtgc tgacccagag ccccggcacc ctgagcctga gccccggcga gagggccacc 60
ctgagctgca gggccagcca gagcgtgggc agcagctacc tggcctggta ccagcagaag 120
cccggccagg cccccaggct gctgatctac ggcgccttca gcagggccac cggcatcccc 180
gacaggttca gcggcagcgg cagcggcacc gacttcaccc tgaccatcag caggctggag 240
cccgaggact tcgccgtgta ctactgccag cagtacggca gcagcccctg gaccttcggc 300
cagggcacca aggtggagat caagaggacc gtggccgccc ccagcgtgtt catcttcccc 360
cccagcgacg agcagctgaa gagcggcacc gccagcgtgg tgtgcctgct gaacaacttc 420
taccccaggg aggccaaggt gcagtggaag gtggacaacg ccctgcagag cggcaacagc 480
caggagagcg tgaccgagca ggacagcaag gacagcacct acagcctgag cagcaccctg 540
accctgagca aggccgacta cgagaagcac aaggtgtacg cctgcgaggt gacccaccag 600
ggcctgagca gccccgtgac caagagcttc aacaggggcg agtgc 645
<210> 3
<211> 21
<212> DNA
<213> human
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gggagcagag aattctctta t 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 4
ggagcagaga attctcttat c 21
<210> 5
<211> 21
<212> DNA
<213> human
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gagcagagaa ttctcttatc c 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
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gctacctgga gcttcttaac a 21
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<212> DNA
<213> human
<400> 7
ggagcttctt aacagcgatg c 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 8
gggtctccag tatattcatc t 21
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<213> human
<400> 9
gcctcctgat gcacatgtac t 21
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<212> DNA
<213> human
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ggaagacctg ggaaagcttg t 21
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<213> human
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ggctaagctt gtacaataac t 21
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gcggaatgaa ccacatcttg c 21
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<213> human
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ggccttctct gaaggacatt g 21
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<213> human
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ggactcaatg cactgacatt g 21
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<212> DNA
<213> human
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ggtacccact gctctggtta t 21
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<213> human
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gctcccactc catgaggtat t 21
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<213> human
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ggtatttctt cacatccgtg t 21
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<213> human
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aggagacacg gaatgtgaag g 21
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<213> human
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gctcccactc catgaggtat t 21
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<213> human
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ggtatttcta cacctccgtg t 21
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<213> human
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ggaccggaac acacagatct a 21
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<213> human
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accggaacac acagatctac a 21
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<213> human
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ggaacacaca gatctacaag g 21
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<213> human
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gaacacacag atctacaagg c 21
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<213> human
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ttcttacttc cctaatgaag t 21
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<213> human
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aagttaagaa cctgaatata a 21
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aacctgaata taaatttgtg t 21
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<213> human
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acctgaatat aaatttgtgt t 21
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aagcgttgat ggattaatta a 21
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agcgttgatg gattaattaa a 21
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gggtctggtg ggcatcatta t 21
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ggtctggtgg gcatcattat t 21
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<213> human
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gcatcattat tgggaccatc t 21
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gcacatggag gtgatggtgt t 21
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ggaggtgatg gtgtttctta g 21
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gagaagatca ctgaagaaac t 21
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gctttaatgg ctttacaaag c 21
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<213> human
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ggctttacaa agctggcaat a 21
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<213> human
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gctttacaaa gctggcaata t 21
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<213> human
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gctccgtact ctaacatcta g 21
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gatgaccaca ttcaaggaag a 21
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<213> human
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gaccacattc aaggaagaac t 21
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gcgtaagtct gagtgtcatt t 21
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gacaatttaa ggaagaatct t 21
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ggccatagtt ctccctgatt g 21
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gccatagttc tccctgattg a 21
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gatgaccaca ttcaaggaag a 21
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<213> human
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gaccacattc aaggaagaac c 21
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gctttgtcag gaccaggttg t 21
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<212> DNA
<213> human
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gaccaggttg ttactggttc a 21
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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gagacatcta taaccaagag g 21
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<213> human
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gagtactgga acagccagaa g 21
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<213> human
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gctcttattc ttccacaaga g 21
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<213> human
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agccaactgt attgcctatt t 21
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<213> human
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<213> human
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gacatatata gtgatccttg g 21
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<213> human
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gctcacagtc atcaattata g 21
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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gctggctaac attgctatat t 21
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<213> human
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ggaccaggtc acatgtgaat a 21
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<212> DNA
<213> human
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gccagtgaac acttaccata g 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
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gcttctctga agtctcattg a 21
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<212> DNA
<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
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<213> human
<400> 109
gctctggaga agatatattt g 21
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<213> human
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<212> DNA
<213> human
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gggacggcat taatgtattc a 21
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<212> DNA
<213> human
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ggacaaacat gcaaactata g 21
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<212> DNA
<213> human
<400> 113
gcagcaacca gctaccattc t 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
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gcagttctgt tgccactctc t 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 115
gggagagttc atccaggaaa t 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
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ggagagttca tccaggaaat t 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 117
gagagttcat ccaggaaatt a 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 118
gcctgtcaaa gagagagagc a 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 119
gctcagcttc gtactgagtt c 21
<210> 120
<211> 21
<212> DNA
<213> human
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gcttcacaga actacagaga g 21
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<212> DNA
<213> human
<400> 121
gcatctactg gacaaagtat t 21
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<213> human
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ggctgaatta cccatgcttt a 21
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<212> DNA
<213> human
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gctgaattac ccatgcttta a 21
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<212> DNA
<213> human
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gggttggttt atccaggaat a 21
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<212> DNA
<213> human
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ggatcagaag agaagccaac g 21
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<212> DNA
<213> human
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ggttcaccat ccaggtgttc a 21
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<213> human
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gctctcttct ctggaactaa c 21
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<213> human
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gctagagtga ctccatctta a 21
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<211> 21
<212> DNA
<213> human
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gctgaccacc aattataatt g 21
<210> 130
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 130
gcagaatatt taaggccata c 21
<210> 131
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 131
gcccacttaa aggcagcatt a 21
<210> 132
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 132
ggtcatcaat accactgtta a 21
<210> 133
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 133
gcattcctcc ttctcctttc t 21
<210> 134
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 134
ggaggaactt tgtgaacatt c 21
<210> 135
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 135
gctgtaagaa ggatgctttc a 21
<210> 136
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 136
gctgcaggca ggattgtttc a 21
<210> 137
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 137
gcagttcgag gtcaagtttg a 21
<210> 138
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 138
gccaattagc tgagaagaat t 21
<210> 139
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 139
gcaggtttac agtgtatatg t 21
<210> 140
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 140
gcctacagag actagagtag g 21
<210> 141
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 141
gcagttgggt accttccatt c 21
<210> 142
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 142
gcaactcagg tgcatgatac a 21
<210> 143
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 143
gcatggcgct ggtacgtaaa t 21
<210> 144
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 144
gcctcgagtt tgagagcta 19
<210> 145
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 145
agacattctg gatgagtta 19
<210> 146
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 146
gggtctgtta cccaaagaa 19
<210> 147
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 147
ggtctgttac ccaaagaat 19
<210> 148
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 148
ggaaggaagc ggacgctca 19
<210> 149
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 149
ggaggcagta cttctgata 19
<210> 150
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 150
cgctctagag ctcagctga 19
<210> 151
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 151
ccaccacctc aaccaataa 19
<210> 152
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 152
atttcaagaa gtcgatcaa 19
<210> 153
<211> 19
<212> DNA
<213> human
<400> 153
gaagatctga ttaccttca 19
<210> 154
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 154
ggacactggt tcaacacctg t 21
<210> 155
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 155
ggttcaacac ctgtgacttc a 21
<210> 156
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 156
acctgtgact tcatgtgtgc g 21
<210> 157
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 157
gctggacgtg accatcatgt a 21
<210> 158
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 158
ggacgtgacc atcatgtaca a 21
<210> 159
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 159
gacgtgacca tcatgtacaa g 21
<210> 160
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 160
acgtgaccat catgtacaag g 21
<210> 161
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 161
acgctatacc atctacctgg g 21
<210> 162
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 162
gcctctatga cgacatcgag t 21
<210> 163
<211> 21
<212> DNA
<213> human
<400> 163
gacatcgagt gcttccttat g 21
<210> 164
<211> 253
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 164
gagggcctat ttcccatgat tccttcatat ttgcatatac gatacaaggc tgttagagag 60
ataattggaa ttaatttgac tgtaaacaca aagatattag tacaaaatac gtgacgtaga 120
aagtaataat ttcttgggta gtttgcagtt ttaaaattat gttttaaaat ggactatcat 180
atgcttaccg taacttgaaa gtatttcgat ttcttggctt tatatatctt gtggaaagga 240
cgctagcgcc acc 253
<210> 165
<211> 9
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 165
ttcaagaga 9
<210> 166
<211> 686
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 166
gagggcctat ttcccatgat tccttcatat ttgcatatac gatacaaggc tgttagagag 60
ataattggaa ttaatttgac tgtaaacaca aagatattag tacaaaatac gtgacgtaga 120
aagtaataat ttcttgggta gtttgcagtt ttaaaattat gttttaaaat ggactatcat 180
atgcttaccg taacttgaaa gtatttcgat ttcttggctt tatatatctt gtggaaagga 240
ctttaccact ccctatcagt gatagagaaa agtgaaagtc gagtttacca ctccctatca 300
gtgatagaga aaagtgaaag tcgagtttac cactccctat cagtgataga gaaaagtgaa 360
agtcgagttt accactccct atcagtgata gagaaaagtg aaagtcgagt ttaccactcc 420
ctatcagtga tagagaaaag tgaaagtcga gtttaccact ccctatcagt gatagagaaa 480
agtgaaagtc gagtttacca ctccctatca gtgatagaga aaagtgaaag tcgagctcgg 540
tacccgggtc gaggtaggcg tgtacggtgg gaggcctata taagcagagc tcgtttagtg 600
aaccgtcaga tcgcctggag acgccatcca cgctgttttg acctccatag aagacaccgg 660
gaccgatcca gcctgctagc gccacc 686
<210> 167
<211> 9
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 167
ttcaagaga 9
<210> 168
<211> 119
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 168
gaggcttcag tactttacag aatcgttgcc tgcacatctt ggaaacactt gctgggatta 60
cttcttcagg ttaacccaac agaaggctaa agaaggtata ttgctgttga cagtgagcg 119
<210> 169
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 169
tagtgaagcc acagatgta 19
<210> 170
<211> 119
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 170
tgcctactgc ctcggacttc aaggggctac tttaggagca attatcttgt ttactaaaac 60
tgaatacctt gctatctctt tgatacattt ttacaaagct gaattaaaat ggtataaat 119
<210> 171
<211> 804
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 171
tgctttctct gacctgcatt ctctcccctg ggcctgtgcc gctttctgtc tgcagcttgt 60
ggcctgggtc acctctacgg ctggcccaga tccttccctg ccgcctcctt caggttccgt 120
cttcctccac tccctcttcc ccttgctctc tgctgtgttg ctgcccaagg atgctctttc 180
cggagcactt ccttctcggc gctgcaccac gtgatgtcct ctgagcggat cctccccgtg 240
tctgggtcct ctccgggcat ctctcctccc tcacccaacc ccatgccgtc ttcactcgct 300
gggttccctt ttccttctcc ttctggggcc tgtgccatct ctcgtttctt aggatggcct 360
tctccgacgg atgtctccct tgcgtcccgc ctccccttct tgtaggcctg catcatcacc 420
gtttttctgg acaaccccaa agtaccccgt ctccctggct ttagccacct ctccatcctc 480
ttgctttctt tgcctggaca ccccgttctc ctgtggattc gggtcacctc tcactccttt 540
catttgggca gctcccctac cccccttacc tctctagtct gtgctagctc ttccagcccc 600
ctgtcatggc atcttccagg ggtccgagag ctcagctagt cttcttcctc caacccgggc 660
ccctatgtcc acttcaggac agcatgtttg ctgcctccag ggatcctgtg tccccgagct 720
gggaccacct tatattccca gggccggtta atgtggctct ggttctgggt acttttatct 780
gtcccctcca ccccacagtg gggc 804
<210> 172
<211> 837
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 172
actagggaca ggattggtga cagaaaagcc ccatccttag gcctcctcct tcctagtctc 60
ctgatattgg gtctaacccc cacctcctgt taggcagatt ccttatctgg tgacacaccc 120
ccatttcctg gagccatctc tctccttgcc agaacctcta aggtttgctt acgatggagc 180
cagagaggat cctgggaggg agagcttggc agggggtggg agggaagggg gggatgcgtg 240
acctgcccgg ttctcagtgg ccaccctgcg ctaccctctc ccagaacctg agctgctctg 300
acgcggccgt ctggtgcgtt tcactgatcc tggtgctgca gcttccttac acttcccaag 360
aggagaagca gtttggaaaa acaaaatcag aataagttgg tcctgagttc taactttggc 420
tcttcacctt tctagtcccc aatttatatt gttcctccgt gcgtcagttt tacctgtgag 480
ataaggccag tagccagccc cgtcctggca gggctgtggt gaggaggggg gtgtccgtgt 540
ggaaaactcc ctttgtgaga atggtgcgtc ctaggtgttc accaggtcgt ggccgcctct 600
actccctttc tctttctcca tccttctttc cttaaagagt ccccagtgct atctgggaca 660
tattcctccg cccagagcag ggtcccgctt ccctaaggcc ctgctctggg cttctgggtt 720
tgagtccttg gcaagcccag gagaggcgct caggcttccc tgtccccctt cctcgtccac 780
catctcatgc ccctggctct cctgcccctt ccctacaggg gttcctggct ctgctct 837
<210> 173
<211> 1000
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 173
catttaaaaa tatcagaaac atttttaaga caatttttca aaagctacac aataatgctt 60
atattcataa tttaggtatt tgtcttggca taaagattaa catctctcta tataatttct 120
tctcattatt tcctacaaaa ttgaagaaat aaagtatttg gtatttcatt tatttagatc 180
ttctttcacc cagaaattat tgaaagtgag ggtaaataaa tagtttaatt taaaattcac 240
atactgcagt ataacataag gttcttgttt gaattttact gtttgccatg cattaaaaag 300
cactcatttt aaggctatgg aagatgctca cgtagtatct ctaagcacct atttttcaga 360
aggatttgtg gcttctgtgc cacagatgat aaggaatttt attgttctgg cttccatact 420
cagcttgacc tattccatcc taaataagct aatcctggag agagttttgc ttcaagtgta 480
aaatgatcaa cacaagaatg gaaagtaaat ctaccaccac acatgtaaat actgatatat 540
aggccatagt agagccttat attcatataa ataaagtttc agatcatact tctccctaaa 600
atcaagacat ccaattttaa gaacttctgt cctcatcatt ggtaacgagt accagaaact 660
gatgttacag catataaaat agttcttttt aaatatcatg caactcttac caatgttttg 720
attcagtgat aaaattatgg agcttcataa taaccaggaa aatgcagtgt taaaaacaac 780
aataaaaggc tagcaagaaa ttataaatat gttgttaagg gcattggctt ctttagggct 840
tgctctcgta actgatacca aatgggaatt cagagtctaa aaatatcttc tttggtaaaa 900
ggaaagtctt ggccaggaag taaataagct tttcccttaa ttcagcacat ctccctaaat 960
acactattat cacctaccat ctggaatgaa gcttccacca 1000
<210> 174
<211> 1000
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 174
actaatgacc tgcctcatta aatatcagga agcaaaatcc acattcctaa gaccaccctg 60
agctggaatc aatcctgttc taaaaaccat caacttttaa taagagatac atctaacata 120
gggcttacag tcataccagc ctagttataa gtacaaaata gccaatatca aagttgtttt 180
gtatgaatat agatacattg gtatagagaa atagaagaac acttggcaca caaacattgg 240
gttgcttcat tagcatttct ttttacttta agcaagattt cttgagggac atcttttcta 300
cgttggagta aaaaatacgt tatttaaact tgaatttttt tttcagtaag tgaaacctat 360
attattcagc caaatcctta agcttgagtt aaataattga aacagaaatt taaaagttat 420
aactaatgga tattcagaca ttatacattt cttacccaag tgttataata gggacctact 480
attttaagtg acacttaaac atttatagtt gacttataga ccataaattt taatgatcat 540
aaattttgat ttacacaatt attgagttaa caagtcacaa agttagtcta tttttataaa 600
ggtaaaaatt aggaatcaga tcaaaacatt gtgaggtgcc ttctcagatg ttatacccat 660
actttctatt cttaagttta gaaaataaat aaaattctta ctaaatctct tctcacttta 720
tcaaaaatat tttgcaggtt gtcctgatag gaaattgagg gaataatagc tgttcctttg 780
gacgaggatc attggtgcta ttcattccaa atgtgacttt atgtaattaa ttatcaactt 840
caaaccactg ccattggaat cctcttttgt tgcactttgt ccagtatcaa gtcagtggga 900
gaatggtgga gatctgtggg gactgaagca aacatacatg gcttttgagg aagagcactt 960
tagattttaa actgattaac attaaacatc tactgctttt 1000
<210> 175
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 175
tataaggtgg tcccagctcg ggg 23
<210> 176
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 176
agggccggtt aatgtggctc tgg 23
<210> 177
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 177
ggtggaagct tcattccaga tgg 23
<210> 178
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 178
gacctgcctc attaaatatc agg 23
<210> 179
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 179
ccatagctca gtctggtcta tc 22
<210> 180
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 180
tcaggatgat ctggacgaag ag 22
<210> 181
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 181
ccggtcctgg actttgtctc 20
<210> 182
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 182
ctcgacatcg gcaaggtgtg 20
<210> 183
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 183
cgcattggag tcgctttaac 20
<210> 184
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 184
cgagctgcaa gaactcttcc tcac 24
<210> 185
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 185
cacggcactt acctgtgttc tgg 23
<210> 186
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 186
cagtacaggc atccctgtga aag 23
<210> 187
<211> 590
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 187
cccctctccc tccccccccc ctaacgttac tggccgaagc cgcttggaat aaggccggtg 60
tgcgtttgtc tatatgttat tttccaccat attgccgtct tttggcaatg tgagggcccg 120
gaaacctggc cctgtcttct tgacgagcat tcctaggggt ctttcccctc tcgccaaagg 180
aatgcaaggt ctgttgaatg tcgtgaagga agcagttcct ctggaagctt cttgaagaca 240
aacaacgtct gtagcgaccc tttgcaggca gcggaacccc ccacctggcg acaggtgcct 300
ctgcggccaa aagccacgtg tataagatac acctgcaaag gcggcacaac cccagtgcca 360
cgttgtgagt tggatagttg tggaaagagt caaatggctc tcctcaagcg tattcaacaa 420
ggggctgaag gatgcccaga aggtacccca ttgtatggga tctgatctgg ggcctcggtg 480
cacatgcttt acatgtgttt agtcgaggtt aaaaaaacgt ctaggccccc cgaaccacgg 540
ggacgtggtt ttcctttgaa aaacacgatg ataatatggc cacaaccatg 590
<210> 188
<211> 60
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 188
atgtacagga tgcaactcct gtcttgcatt gcactaagtc ttgcacttgt cacgaattcg 60
Claims (20)
1.一种多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述多能干细胞或其衍生物的基因组中导入有CTLA-4阻遏分子的表达序列。
2.根据权利要求1所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述CTLA-4阻遏分子为抗CTLA-4抗体,优选为人源化的封闭抗体。
3.根据权利要求1或2所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述多能干细胞或其衍生物基因组的B2M基因和/或CIITA基因被敲除。
4.根据权利要求1或2所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入至少一种免疫兼容分子的表达序列,所述免疫兼容分子用于调控多能干细胞细胞或其衍生物中与免疫应答相关的基因的表达。
5.根据权利要求4所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述与免疫应答相关的基因包括:
(1)主要组织相容性复合体基因,包括HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRA、HLA-DRB1、HLA-DRB3、HLA-DRB4、HLA-DRB5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DPA1和HLA-DPB1中的至少一种;
(2)主要组织相容性复合体相关基因,包括B2M和CIITA中的至少一种。
6.根据权利要求4所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述免疫兼容分子包括以下的至少一种:
(1)免疫耐受相关基因,包括CD47和HLA-G中的至少一种;
(2)HLA-C类分子,包括人群中比例合计超过90%的HLA-C复等位基因,或者超过90%的HLA-C复等位基因与B2M构成的融合蛋白基因;
(3)靶向主要组织相容性复合体基因的shRNA和/或shRNA-miR,所述主要组织相容性复合体基因包括HLA-A、HLA-B、HLA-C、HLA-DRA、HLA-DRB1、HLA-DRB3、HLA-DRB4、HLA-DRB5、HLA-DQA1、HLA-DQB1、HLA-DPA1和HLA-DPB1中的至少一种;
(4)靶向主要组织相容性复合体相关基因的shRNA和/或shRNA-miR,所述主要组织相容性复合体相关基因包括B2M和CIITA中的至少一种。
7.根据权利要求6所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:
所述B2M的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.3~SEQ ID NO.5中的至少一种;
所述CIITA的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.6~SEQ ID NO.15中的至少一种;
所述HLA-A的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.16~SEQ ID NO.18中的至少一种;
所述HLA-B的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.19~SEQ ID NO.24中的至少一种;
所述HLA-C的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.25~SEQ ID NO.30中的至少一种;
所述HLA-DRA的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.31~SEQ ID NO.40中的至少一种;
所述HLA-DRB1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.41~SEQ ID NO.45中的至少一种;
所述HLA-DRB3的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.46~SEQ ID NO.47中的至少一种;
所述HLA-DRB4的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.48~SEQ ID NO.57中的至少一种;
所述HLA-DRB5的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.58~SEQ ID NO.66中的至少一种;
所述HLA-DQA1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.67~SEQ ID NO.73中的至少一种;
所述HLA-DQB1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.74~SEQ ID NO.83中的至少一种;
所述HLA-DPA1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.84~SEQ ID NO.93中的至少一种;
所述HLA-DPB1的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.94~SEQ ID NO.103中的至少一种。
8.根据权利要求4所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因和/或抗干扰素效应分子,其中:shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因包括Drosha、Ago1、Ago2、Dicer1、Exportin-5、TRBP(TARBP2)、PACT(PRKRA)、DGCR8中的至少一种;所述抗干扰素效应分子为靶向PKR、2-5As、IRF-3或IRF-7的shRNA和/或shRNA-miR中的至少一种。
9.根据权利要求8所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述PKR的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.104~SEQ ID NO.113中的至少一种;
所述2-5As的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.114~SEQ ID NO.143中的至少一种;
所述IRF-3的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.144~SEQ ID NO.153中的至少一种;
所述IRF-7的shRNA和/或shRNA-miR的靶序列为SEQ ID NO.154~SEQ ID NO.163中的至少一种。
10.根据权利要求7或9所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述主要组织相容性复合体基因、主要组织相容性复合体相关基因、靶向PKR、2-5As、IRF-3或IRF-7的shRNA和/或shRNA-miR的表达框架如下所示:
(1)shRNA表达框架:由5’到3’依次包括shRNA靶序列、茎环序列、shRNA靶序列的反向互补序列、Poly T,所述shRNA靶序列如权利要求8或10所述;
(2)shRNA-miR表达框架:使用权利要求8或10所述的shRNA-miR靶序列替换microRNA-30或者microRNA-155中的靶序列得到。
11.根据权利要求10所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述环序列长度为3~9个碱基;所述poly T长度为5~6个碱基。
12.根据权利要求4或8所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述多能干细胞或其衍生物的基因组中还导入诱导型基因表达系统,用于调控免疫兼容分子和/或shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因和/或抗干扰素效应分子的表达。
13.根据权利要求12所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述诱导型基因表达系统包括Tet-Off系统、二聚体诱导表达系统中的至少一种。
14.根据权利要求1-13任一项所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述CTLA-4阻遏分子的表达序列、免疫兼容分子的表达序列、shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因、抗干扰素效应分子、诱导型基因表达系统的导入采用病毒载体干扰、非病毒载体转染或基因编辑的方法,所述基因编辑的方法包括基因敲入。
15.根据权利要求1-14任一项所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:CTLA-4阻遏分子的表达序列、免疫兼容分子的表达序列、shRNA和/或miRNA加工复合体相关基因、抗干扰素效应分子、诱导型基因表达系统的导入位点为多能干细胞或其衍生物的基因组安全位点。
16.根据权利要求15所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述基因组安全位点包括AAVS1安全位点、eGSH安全位点、H11安全位点中的一种或多种。
17.根据权利要求1-16任一项所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:
所述多能干细胞包括胚胎干细胞、胚胎生殖细胞、胚胎癌细胞、或者诱导多能干细胞;
所述多能干细胞衍生物包括多能干细胞所分化的成体干细胞、各胚层细胞或组织;所述成体干细胞包括间充质干细胞或者神经干细胞。
18.根据权利要求2所述的多能干细胞或其衍生物,其特征在于:所述抗CTLA-4抗体的重链序列如SEQ ID NO.1所示,轻链序列如SEQ ID NO.2所示。
19.权利要求1-18任一项所述的多能干细胞或其衍生物在制备CTLA-4高表达肿瘤治疗药物中的应用。
20.一种制剂,包含权利要求1-18任一项所述的多能干细胞或其衍生物。
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