CN114032228B - 一种酸性纤维素酶Cel-Bi及其基因和应用 - Google Patents

一种酸性纤维素酶Cel-Bi及其基因和应用 Download PDF

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Abstract

本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种酸性纤维素酶Cel‑Bi及其基因和应用。本发明提供的这种酸性纤维素酶Cel‑Bi最适pH为4.0,最适温度为70℃,能够有效降解可溶性纤维素底物,作为一种新型的酶制剂,可广泛用于饲料、食品、生物能源、纺织和造纸工业等领域。此外,本发明在不改变酸性纤维素酶氨基酸序列的前提下,综合考虑密码子偏好性,密码子适应指数,不稳定序列的删除,mRNA二级结构等因素,对编码酸性纤维素酶的基因进行改造,得到三条编码酸性纤维素酶的基因序列,其中将经密码子优化的cel‑Bi‑m1基因转入到里氏木霉中进行表达,酸性纤维素酶Cel‑Bi的分泌表达量显著提高、酶活力显著增强。

Description

一种酸性纤维素酶Cel-Bi及其基因和应用
技术领域
本发明属于基因工程技术领域,具体涉及一种酸性纤维素酶Cel-Bi及其基因和应用。
背景技术
纤维素多糖是世界上分部最广、含量最丰富的可再生生物质,广泛存在于绿色植物的细胞壁中,少量存在于细菌和海藻等物种中。天然的纤维素分子是由葡萄糖残基通过糖苷键相连形成的线性大分子聚合物,其中相邻的两个葡萄糖残基相互旋转180°构成一分子的纤维二糖,其作为形成纤维素的最小单元。植物细胞壁是由50%的纤维素分子、半纤维素、木质素以及少量的果胶等构成。据统计,目前每年至少生产7×1011吨来源于植物细胞壁的纤维素多糖,并且被广泛应用于饲料、化工原料、纺织和生物能源等领域。
发明内容
本发明提供了一种酸性纤维素酶Cel-Bi,其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。
SEQ ID NO.1:
MKAVLFTITAAAGSAYAAQSAWYVAQCGGQNWSGGTACVSGYTCTTYNPYYAQCIPGTSTDGPSTATSVKPMTTTVHTTSVKQTTSTSSAAASTAAASSVSSDSTSTSSGHVKYGGVNIAGFDFGCSTDGTCTLSSTDPPGETGIAQMNHFVKNDGLNAFRLPVAWQYLVNNNLGGTLDSANFAEYNDLVQGCLSAGAEMCIIDIHNYARWNGGIIGQGGPTNAQFASLWSQLATKFKSNSKVTFGLMNEPHDLDMTEWAESVQAAVTAIRKAGATSQKILLPGTGYTSAQDFGTNSGQYLLKVTNLDGSTDNLIFDVHKYLDADNSGTSTECVTNNSAVFVQLAEWLRANKRQAMLTETGGGNTASCETDVCEELAVLNAHSDVLLGWTGWAAGMFDTSYALSETPTESGSTWTDQPLVKKCIAGMFKK
该酶全长430个氨基酸(SEQ ID NO.1),N端22个氨基酸为其信号肽序列“MKAVLFTITAAAGSAYAAQSAW”。成熟的酸性纤维素酶的理论分子量为42.9kDa,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
SEQ ID NO.2:
YVAQCGGQNWSGGTACVSGYTCTTYNPYYAQCIPGTSTDGPSTATSVKPMTTTVHTTSVKQTTSTSSAAASTAAASSVSSDSTSTSSGHVKYGGVNIAGFDFGCSTDGTCTLSSTDPPGETGIAQMNHFVKNDGLNAFRLPVAWQYLVNNNLGGTLDSANFAEYNDLVQGCLSAGAEMCIIDIHNYARWNGGIIGQGGPTNAQFASLWSQLATKFKSNSKVTFGLMNEPHDLDMTEWAESVQAAVTAIRKAGATSQKILLPGTGYTSAQDFGTNSGQYLLKVTNLDGSTDNLIFDVHKYLDADNSGTSTECVTNNSAVFVQLAEWLRANKRQAMLTETGGGNTASCETDVCEELAVLNAHSDVLLGWTGWAAGMFDTSYALSETPTESGSTWTDQPLVKKCIAGMFKK
本发明还提供了编码上述酸性纤维素酶Cel-Bi的基因Cel-Bi-m0,该基因序列如SEQ ID NO.3所示。
SEQ ID NO.3:
TACGTCGCTCAGTGCGGTGGCCAAAACTGGTCCGGCGGCACCGCCTGCGTCTCCGGCTATACCTGCACCACCTACAACCCCTACTACGCCCAATGTATCCCCGGCACCTCCACCGACGGCCCGTCCACCGCCACCTCCGTCAAGCCGATGACCACGACCGTCCACACCACGTCCGTCAAGCAAACCACCTCCACGTCCTCCGCCGCTGCTTCCACCGCCGCTGCCTCCTCCGTCTCCTCCGACTCCACGTCCACGTCCTCCGGCCACGTCAAGTACGGCGGCGTCAACATCGCCGGCTTCGACTTCGGCTGCTCCACGGACGGCACCTGCACCCTCTCCTCCACGGATCCCCCCGGCGAGACCGGCATCGCTCAGATGAACCACTTCGTCAAGAACGACGGCCTCAACGCCTTCCGCCTCCCCGTCGCCTGGCAGTACCTCGTCAACAATAACCTCGGCGGCACCCTCGACTCCGCCAACTTCGCCGAGTACAACGACCTCGTCCAAGGCTGCCTCTCCGCCGGCGCCGAGATGTGCATCATCGACATCCACAATTACGCCCGCTGGAACGGCGGCATCATCGGCCAAGGCGGTCCCACCAACGCTCAGTTCGCCTCCCTCTGGTCCCAACTCGCCACCAAGTTCAAGTCCAACTCCAAGGTCACCTTCGGCCTCATGAACGAGCCCCACGACCTCGACATGACCGAGTGGGCCGAGTCCGTCCAAGCCGCCGTCACCGCCATCCGCAAGGCCGGCGCCACCTCCCAAAAGATCCTCCTCCCCGGCACCGGCTACACCTCCGCCCAAGACTTCGGCACCAACTCCGGTCAGTATCTCCTCAAGGTCACCAACCTCGACGGCTCCACCGACAACCTCATCTTCGACGTCCACAAGTACCTCGACGCCGACAACTCCGGTACCTCCACCGAGTGCGTCACCAACAACTCCGCCGTCTTCGTGCAGCTCGCCGAGTGGCTCCGCGCCAACAAGCGCCAAGCCATGCTGACCGAGACCGGTGGCGGCAACACCGCCTCCTGCGAGACCGACGTCTGCGAGGAGCTCGCCGTCCTCAACGCCCATAGCGACGTCCTCCTCGGTTGGACCGGCTGGGCCGCTGGCATGTTCGACACGTCCTACGCCCTCTCCGAGACCCCCACCGAGTCCGGCTCCACCTGGACCGATCAGCCCCTCGTCAAGAAGTGCATCGCCGGCATGTTCAAAAAG
本发明在不改变酸性纤维素酶氨基酸序列的前提下,对Cel-Bi-m0进行了改造,得到编码酸性纤维素酶Cel-Bi的优化基因Cel-Bi-m1、Cel-Bi-m2、cel-Bi-m3,其基因序列依次如SEQ ID NO.4、SEQ ID NO.5、SEQ ID NO.6所示。
SEQ ID NO.4:
TACGTCGCTCAGTGTGGCGGCCAGAACTGGTCTGGCGGCACCGCTTGCGTCAGCGGCTACACCTGCACCACCTACAACCCCTACTACGCCCAGTGCATCCCTGGCACCAGCACCGACGGCCCTTCTACCGCTACCAGCGTCAAGCCTATGACCACCACCGTCCACACCACCAGCGTCAAGCAGACCACCTCCACCAGCTCCGCTGCTGCTAGCACCGCTGCTGCTTCTAGCGTCTCCTCTGACTCCACCTCTACCAGCTCCGGCCACGTCAAGTACGGCGGCGTCAACATCGCCGGCTTCGACTTCGGCTGCAGCACCGACGGCACCTGCACCCTCTCTAGCACCGACCCTCCTGGCGAGACCGGCATCGCTCAGATGAACCACTTCGTCAAGAACGACGGCCTCAACGCTTTCCGACTGCCTGTCGCTTGGCAGTACCTGGTCAACAACAACCTCGGCGGCACCCTGGACAGCGCTAACTTCGCCGAGTACAACGACCTCGTCCAGGGCTGCCTGTCCGCTGGCGCCGAGATGTGCATCATCGACATCCACAACTACGCCCGCTGGAACGGCGGCATCATCGGCCAGGGCGGCCCTACCAACGCTCAGTTCGCTTCCCTCTGGTCTCAGCTGGCCACCAAGTTCAAGAGCAACTCCAAGGTCACCTTCGGCCTCATGAACGAGCCCCACGACCTGGACATGACCGAGTGGGCTGAGTCTGTCCAGGCTGCTGTCACCGCTATCCGAAAGGCTGGCGCCACCAGCCAGAAGATCCTCCTGCCTGGCACCGGCTACACCTCCGCCCAGGACTTCGGCACCAACTCTGGCCAGTACCTCCTGAAGGTCACCAACCTCGACGGCAGCACCGACAACCTGATCTTCGACGTCCACAAGTACCTCGACGCCGACAACAGCGGCACCTCCACCGAGTGCGTCACCAACAACTCCGCTGTCTTCGTCCAGCTCGCTGAGTGGCTGCGAGCTAACAAGCGACAGGCTATGCTGACCGAGACCGGCGGCGGCAACACCGCTTCCTGCGAGACCGACGTCTGCGAGGAGCTCGCTGTCCTGAACGCCCACTCTGACGTCCTCCTGGGCTGGACCGGCTGGGCTGCTGGCATGTTCGACACCTCCTACGCCCTCTCTGAGACCCCTACCGAGTCTGGCAGCACCTGGACCGACCAGCCTCTGGTCAAGAAGTGCATCGCCGGCATGTTCAAGAAG
SEQ ID NO.5:
TACGTCGCCCAGTGCGGCGGTCAGAACTGGAGCGGCGGCACCGCTTGCGTCAGCGGTTACACCTGCACCACCTACAACCCCTACTACGCCCAGTGCATCCCTGGCACCAGCACCGACGGCCCCAGCACTGCTACCAGCGTCAAGCCTATGACCACCACCGTCCACACCACCAGCGTCAAGCAGACCACCAGCACCAGCAGCGCCGCCGCTAGCACCGCTGCTGCTAGCAGCGTCAGCAGCGACAGCACCAGCACCTCCAGCGGCCACGTCAAGTACGGCGGCGTCAACATCGCCGGCTTCGACTTCGGCTGCAGCACCGACGGTACCTGCACCCTCAGCAGCACCGACCCCCCTGGCGAGACCGGTATCGCCCAGATGAACCACTTCGTCAAGAACGACGGCCTGAACGCCTTCCGCCTCCCTGTCGCCTGGCAGTACCTGGTCAACAACAACCTCGGCGGCACCCTCGACAGCGCCAACTTCGCCGAGTACAACGACCTGGTCCAGGGCTGCCTCAGCGCCGGTGCTGAGATGTGCATCATCGACATCCACAACTACGCCCGCTGGAACGGCGGCATCATCGGCCAGGGCGGCCCTACTAACGCCCAGTTCGCCAGCCTCTGGAGCCAGCTCGCCACCAAGTTCAAGAGCAACAGCAAGGTCACCTTCGGCCTGATGAACGAGCCCCACGACCTCGACATGACCGAGTGGGCCGAGAGCGTCCAGGCCGCTGTCACCGCTATCCGCAAGGCCGGCGCCACCAGCCAGAAGATCCTGCTCCCCGGCACCGGCTACACCAGCGCTCAGGACTTCGGCACCAACAGCGGCCAGTACCTGCTCAAGGTCACCAACCTCGACGGCAGCACCGACAACCTGATCTTCGACGTCCACAAGTACCTCGACGCCGACAACAGCGGCACCAGCACTGAGTGCGTCACCAACAACAGCGCCGTCTTCGTCCAGCTCGCCGAGTGGCTGCGCGCCAACAAGCGCCAGGCCATGCTCACCGAGACCGGCGGTGGCAACACCGCCAGCTGCGAGACCGACGTCTGCGAGGAGCTCGCCGTCCTCAACGCCCACAGCGACGTCCTGCTGGGCTGGACCGGCTGGGCTGCTGGTATGTTCGACACCAGCTACGCCCTGAGCGAGACCCCCACCGAGAGCGGTAGCACCTGGACCGACCAGCCTCTGGTCAAGAAGTGCATCGCCGGCATGTTCAAGAAG
SEQ ID NO.6
TACGTCGCCCAGTGCGGCGGTCAGAACTGGAGCGGCGGCACCGCTTGCGTCAGCGGTTACACCTGCACCACCTACAACCCCTACTACGCCCAGTGCATCCCCGGCACCAGCACCGACGGCCCTAGCACTGCCACCAGCGTCAAGCCTATGACCACCACCGTCCACACCACCAGCGTCAAGCAGACCACCAGCACCAGCAGCGCCGCCGCTAGCACCGCTGCTGCTAGCAGCGTCAGCAGCGACAGCACCAGCACCTCCAGCGGCCACGTCAAGTACGGCGGCGTCAACATCGCCGGCTTCGACTTCGGCTGCAGCACCGACGGTACCTGCACCCTGAGCAGCACCGACCCCCCCGGTGAGACCGGTATCGCCCAGATGAACCACTTCGTCAAGAACGACGGCCTGAACGCCTTCCGCCTGCCCGTCGCTTGGCAGTACCTGGTCAACAACAACCTGGGCGGCACCCTGGACAGCGCCAACTTCGCCGAGTACAACGACCTCGTCCAGGGCTGCCTGAGCGCCGGTGCTGAGATGTGCATCATCGACATCCACAACTACGCCCGCTGGAACGGCGGCATCATCGGCCAGGGCGGCCCTACTAACGCCCAGTTCGCCAGCCTGTGGAGCCAGCTGGCCACCAAGTTCAAGAGCAACAGCAAGGTCACCTTCGGCCTGATGAACGAGCCTCACGACCTGGACATGACCGAGTGGGCCGAGAGCGTCCAGGCCGCTGTCACCGCTATCCGCAAGGCCGGCGCCACCAGCCAGAAGATCCTCCTGCCCGGCACCGGCTACACCAGCGCTCAGGACTTCGGCACCAACAGCGGCCAGTACCTGCTGAAGGTCACCAACCTGGACGGCAGCACCGACAACCTGATCTTCGACGTCCACAAGTACCTCGACGCCGACAACAGCGGCACCAGCACTGAGTGCGTCACCAACAACAGCGCCGTCTTCGTCCAGCTGGCCGAGTGGCTCCGCGCCAACAAGCGCCAGGCCATGCTGACCGAGACCGGCGGTGGCAACACCGCCAGCTGCGAGACCGACGTCTGCGAGGAGCTCGCCGTCCTGAACGCCCACAGCGACGTCCTCCTGGGCTGGACCGGCTGGGCTGCTGGTATGTTCGACACCAGCTACGCCCTGAGCGAGACCCCCACCGAGAGCGGTAGCACCTGGACCGACCAGCCCCTGGTCAAGAAGTGCATCGCCGGCATGTTCAAGAAG
本发明还提供了包含上述酸性纤维素酶基因的重组载体。
具体的,上述重组载体为pCbh1-Cel-Bi,其中,将编码本发明提供的所述酸性纤维素酶Cel-Bi的基因插入到表达载体合适的限制性酶切位点之间,使其核苷酸序列可操作地与表达调控序列相连。优选的,将编码纤维素酶Cel-Bi的基因插入pCbh1的SnaBI和EcoRI限制性酶切位点之间,使该基因位于pCbh1启动子的下游并受其调控,得到重组载体pCbh1-Cel-Bi。
本发明还提供了包含上述酸性纤维素酶基因的重组菌株,优选为重组里氏木霉菌株。
本发明还提供了一种制备酸性纤维素酶Cel-Bi的方法,包括以下步骤:
(1)使用上述重组载体转化宿主细胞,得到重组菌株;
(2)培养重组菌株,诱导重组纤维素酶表达;
(3)回收并纯化所表达的酸性纤维素酶Cel-Bi。
与现有技术相比,本发明具有以下优点和有益效果:
(1)本发明提供的这种酸性纤维素酶Cel-Bi最适pH为4.0,最适温度为70℃,能够有效降解可溶性纤维素底物,作为一种新型的酶制剂,可广泛用于饲料、食品、生物能源、纺织和造纸工业等领域。
(2)本发明在不改变酸性纤维素酶氨基酸序列的前提下,综合考虑密码子偏好性,密码子适应指数(CAI),不稳定序列的删除,mRNA二级结构等因素,对编码酸性纤维素酶的基因进行多种策略的改造,得到三条编码酸性纤维素酶的基因序列,其中cel-Bi-m1基因转入到里氏木霉中进行表达时,酸性纤维素酶Cel-Bi的分泌表达量显著提高、酶活力显著增强。
以下将结合附图对本发明做进一步详细说明。
附图说明
图1是本发明实施例2中Cel-Bi-m0密码子使用频率统计图。
图2是本发明实施例2中Cel-Bi-m1密码子使用频率统计图。
图3是本发明实施例2中Cel-Bi-m2密码子使用频率统计图。
图4是本发明实施例2中Cel-Bi-m3密码子使用频率统计图。
图5是本发明实施例2中Cel-Bi-m0(A)、Cel-Bi-m1(B)、Cel-Bi-m2(C)和Cel-Bi-m3(D)基因的mRNA二级结构预测图。
图6是本发明实施例4中酸性纤维素酶活力测定结果图。
图7是本发明实施例5中以CMC-Na为底物时重组Cel-Bi的酶学性质结果图;其中,A为pH对酶活力的影响;B为pH稳定性;C为温度对酶活力的影响;D为不同温度下的热稳定性。
具体实施方式
下面将结合实施例对本发明中的技术方案进行清楚、完整地描述,显然,所描述的实施例仅仅是本发明一部分实施例,而不是全部的实施例。尽管已经详细描述了本发明的代表性实施例,但是本发明所属技术领域的普通技术人员将理解,在不脱离本发明范围的情况下可以对本发明进行各种修改和改变。因此,本发明的范围不应局限于实施方案,而应由所附权利要求及其等同物来限定。
Bispora sp.MEY-1作为一种高效降解纤维素的真菌,是重要的生物资源。本发明从Bispora sp.MEY-1菌株中得到一个新的酸性纤维素酶基因,通过基因优化后,以异源表达的方式在里氏木霉中得到重组酸性纤维素酶Cel-Bi,研究了其最适pH、温度及pH稳定性和热稳定性,为进一步将其应用于更多的工业领域提供可靠的理论依据。
下面通过具体实施例对本发明的酸性纤维素酶Cel-Bi及其基因的效果进行研究。
实验材料和试剂
1、菌株及载体:Bispora sp.MEY-1菌株由本实验室分离,保存在中国普通微生物菌种保藏管理中心,登记号为CGMCC No.250027;自行构建里氏木霉表达载体pCbh1;里氏木霉菌株TU-6购自美国菌种保藏中心,保藏编号为ATCC MYA-256。
2、培养基:
(1)Bispora sp.MEY-1产酶培养基:20g/L的葡萄糖,2.5g/L的酵母提取物,1g/L的KH2PO4,0.05g/L的Na2HPO4·12H2O,0.5g/L的MgSO4·7H2O,0.01g/L的CaCl2,0.01g/L的FeSO4·7H2O,0.001g/L的MnSO4·H2O,0.001g/L的ZnSO4·7H2O,0.002g/L的CuSO4
(2)里氏木霉产酶培养基:葡萄糖20g,玉米浆54mL,KH2PO428g,乳清粉148g,MgSO46g,(NH4)2SO416g,CaCl22g,麸皮20g,微晶纤维素1g,微量元素0.8mL,配制药品后定容至3.5L,调节pH 5.5。
3、酶及生化试剂:内切酶购自Fermentas公司;连接酶购自Invitrogen公司;羧甲基纤维素钠(CMC)购自Sigma公司;其它都为市售普通生化试剂。
实施例中未作具体说明的分子生物学实验方法,均参照《分子克隆实验指南》(第三版)J.萨姆布鲁克一书中所列的具体方法进行,或者按照试剂盒和产品说明书进行。
实施例1:Bispora sp.MEY-1酸性纤维素酶基因Cel-Bi的克隆
提取Bispora sp.MEY-1的总RNA:收集液体培养5天的Bispora sp.MEY-1菌丝体,在滤纸上压干,液氮中彻底研磨成粉末;将800μl的Trizol试剂加入到100mg菌丝中,吹打混匀,室温放置5min;加入200μl氯仿,剧烈振摇15s,室温放置3min,于4℃,12000rpm离心15min;吸取上清,加入等体积异丙醇,混匀,室温放置10min,于4℃,12000rpm离心10min;弃上清,沉淀用70%乙醇洗涤1次,沉淀在空气中干燥5min;加入适量RNase-Free去离子水溶解RNA,在NanoDrop微量核酸蛋白测定仪上测定RNA浓度;1%琼脂糖凝胶电泳鉴定其完整性。
根据酶基因编码序列设计合成特异性引物,引物序列为:
Cel-Bi-F:5’-GCGTACGTATACGTCGCTCAGTGCGGTGG-3’,
Cel-Bi-R:5’-GCCGAATTCTTACTTTTTGAACATGCCGGCGATG-3’。
以Bispora sp.MEY-1总RNA反转录的cDNA为模板进行PCR扩增。PCR反应参数为:95℃变性5min;然后94℃变性30sec,55℃退火30sec,72℃延伸1min,35个循环后72℃保温10min。得到与预期大小相符合的目的片段,将该片段回收后与pEASY-Blunt载体相连送睿博生物技术有限公司测序。
测序及序列分析结果显示,Cel-Bi的cDNA序列(Cel-Bi-m0,SEQ ID NO.3)编码430个氨基酸(SEQ ID NO.1),N端22个氨基酸为其信号肽序列“MKAVLFTITAAAGSAYAAQSAW”。成熟的酸性纤维素酶Cel-Bi的理论分子量为42.9kDa,其氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
实施例2:酸性纤维素酶基因的优化
在不改变纤维素酶基因Cel-Bi所编码的氨基酸序列的前提下,对从Bisporasp.MEY-1中克隆获得的酸性纤维素酶Cel-Bi野生型基因Cel-Bi-m0序列进行优化,根据表达宿主密码子使用偏好性,尽可能减少稀有密码子串联的概率,改变其CAI值分布范围;控制基因序列中GC含量和分布区域,避免高GC和连续AT区域的出现;对mRNA的茎环结构(能量)进行优化以延长mRNA的半衰期。通过优化设计,得到3条序列Cel-Bi-m1(SEQ ID NO.4)、Cel-Bi-m2(SEQ ID NO.5)和Cel-Bi-m3(SEQ ID NO.6)。如图1-5所示,优化后基因的碱基组成、密码子使用频率及mRNA二级结构与野生型基因相比都具有明显差异。
实施例3:制备包含酸性纤维素酶基因的重组载体和重组菌株
将表达载体pCbh1进行SnaBI和EcoRI双酶切,同时将编码酸性纤维素酶Cel-Bi的Cel-Bi-m0、Cel-Bi-m1、Cel-Bi-m2和Cel-Bi-m3基因序列进行SnaBI和EcoRI双酶切,切出编码成熟酸性纤维素酶的基因片段,分别插入到表达载体pCbh1的SnaBI和EcoRI限制性酶切位点之间,使该基因位于pCbh1启动子的下游并受其调控,得到重组载体pCbh1-Cel-Bi-m0,pCbh1-Cel-Bi-m1,pCbh1-Cel-Bi-m2和pCbh1-Cel-Bi-m3。
使用pCbh1-Cel-Bi-m0,pCbh1-Cel-Bi-m1,pCbh1-Cel-Bi-m2和pCbh1-Cel-Bi-m3分别转化里氏木霉,获得对应的重组里氏木霉菌株。
实施例4:重组里氏木霉菌株的上罐发酵
使用实施例3中获得的重组里氏木霉菌进行发酵:
将里氏木霉菌株涂布于PDA平板上,置于28℃培养箱中培养产孢;用无菌棉签刮取1/6孢子于无菌水中混匀并过200目筛。将滤液接种于PDB液体培养基中,28℃,220rpm摇床中培养两天,为“一级种子液”;将“一级种子液”转入200mLPDB液体培养基中,接种量为40mL/瓶。于28℃,220rpm摇瓶中培养24h;配制上罐培养基。称取6L的组分量并加入5mL消泡剂,用水定容至4L,调整pH=5.5,121℃灭菌30min;接种三瓶200mL“二级种子液”。培养温度设定为28℃,转速为300rpm进行菌体培养;开始补料后,定时取样测定酸性纤维素酶的酶活。
酶活性分析方法为:取1000mg羧甲基纤维素钠,以pH为5.0的0.05M柠檬酸—磷酸氢二钠缓冲液定容至50ml,得到2%的羧甲基纤维素钠溶液,在4℃下避光保存,有效期为3天(羧甲基纤维素钠溶液应立即使用,使用前适当摇匀)。取酶液做适当稀释,在各试管中加入2%的羧甲基纤维素钠溶液和柠檬酸—磷酸氢二钠缓冲液(0.05M、pH 5.0)各0.45ml,50℃水浴平衡后,加入已经稀释的酶液0.1ml(空白先不加),振荡混合均匀。50℃水浴保温30min,迅速冷却。向各试管中加入1.5ml DNS试剂,再向空白中加酶液0.1ml,混合均匀。在沸水中煮10min,迅速冷却。以0号管为参比,测定540nm的吸光度。1ml液体酶,在50℃、pH5.0的条件下,每小时水解羧甲基纤维素钠,产生1μmol还原糖(以葡萄糖计)所需要的酶量定义为一个酶活力单位(U)。
如图6所示,Cel-Bi-m0及其突变体基因Cel-Bi-m1、Cel-Bi-m2和Cel-Bi-m3在里氏木霉中均成功实现了高效表达(图6),其中Cel-Bi-m0表达菌株发酵165小时后的未浓缩粗酶液中酸性纤维素酶活力为4580U/mL,优化基因Cel-Bi-m1、Cel-Bi-m2和Cel-Bi-m3表达菌株发酵165小时未浓缩粗酶液中酸性纤维素酶活力分别为9060U/mL、2865U/mL、4399U/mL。结果表明,Bispora sp.MEY-1来源酸性纤维素酶基因Cel-Bi-m0经多种策略改造后得到的3个基因均能转入到里氏木霉中实现酸性纤维素酶Cel-Bi的表达。
实施例5:酸性纤维素酶Cel-Bi的性质测定
将实施例3获得的重组里氏木霉菌株接种于300mL的一级培养基,30℃,200rpm摇床培养120h;将培养菌液5500rpm离心5min,取上清,得到纯化的酸性纤维素酶Cel-Bi。
1、酸性纤维素酶Cel-Bi的最适pH和pH稳定性
25℃下,在不同pH的缓冲液中进行酶促反应测定酸性纤维素酶Cel-Bi活力,结果如图7A所示,酸性纤维素酶Cel-Bi的最适pH为4.0。
将酸性纤维素酶Cel-Bi于不同pH的缓冲液中30℃处理60min,再在pH4.0缓冲液体系中于55℃下测定酶活性,以研究酶的pH耐性。结果如图7B所示,酸性纤维素酶Cel-Bi在pH2.0-10.0之间均很稳定,在此pH范围内处理60min后剩余酶活性在80%左右,表明此酶在酸性偏中性范围内具有较好的pH稳定性。
2、酸性纤维素酶Cel-Bi的最适温度及热稳定性
不同温度下,使用酸性纤维素酶Cel-Bi在pH为4.0的柠檬酸-磷酸氢二钠缓冲液体系中进行酶促反应,最适温度测定结果如图7C所示,Cel-Bi最适温度为70℃。
将酸性纤维素酶Cel-Bi在不同温度下处理不同时间后,再在55℃、pH4.0下进行酶活性测定。热稳定性试验结果如图7D所示,在里氏木霉中表达的重组酸性纤维素酶Cel-Bi在65℃处理10min后仍具有约90%的残余活性。
以上例举仅仅是对本发明的举例说明,并不构成对本发明的保护范围的限制,凡是与本发明相同或相似的设计均属于本发明的保护范围之内。
序列表
<110> 武汉新华扬生物股份有限公司
<120> 一种酸性纤维素酶Cel-Bi及其基因和应用
<160> 6
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 430
<212> PRT
<213> Bispora sp. MEY-1
<400> 1
Met Lys Ala Val Leu Phe Thr Ile Thr Ala Ala Ala Gly Ser Ala Tyr
1 5 10 15
Ala Ala Gln Ser Ala Trp Tyr Val Ala Gln Cys Gly Gly Gln Asn Trp
20 25 30
Ser Gly Gly Thr Ala Cys Val Ser Gly Tyr Thr Cys Thr Thr Tyr Asn
35 40 45
Pro Tyr Tyr Ala Gln Cys Ile Pro Gly Thr Ser Thr Asp Gly Pro Ser
50 55 60
Thr Ala Thr Ser Val Lys Pro Met Thr Thr Thr Val His Thr Thr Ser
65 70 75 80
Val Lys Gln Thr Thr Ser Thr Ser Ser Ala Ala Ala Ser Thr Ala Ala
85 90 95
Ala Ser Ser Val Ser Ser Asp Ser Thr Ser Thr Ser Ser Gly His Val
100 105 110
Lys Tyr Gly Gly Val Asn Ile Ala Gly Phe Asp Phe Gly Cys Ser Thr
115 120 125
Asp Gly Thr Cys Thr Leu Ser Ser Thr Asp Pro Pro Gly Glu Thr Gly
130 135 140
Ile Ala Gln Met Asn His Phe Val Lys Asn Asp Gly Leu Asn Ala Phe
145 150 155 160
Arg Leu Pro Val Ala Trp Gln Tyr Leu Val Asn Asn Asn Leu Gly Gly
165 170 175
Thr Leu Asp Ser Ala Asn Phe Ala Glu Tyr Asn Asp Leu Val Gln Gly
180 185 190
Cys Leu Ser Ala Gly Ala Glu Met Cys Ile Ile Asp Ile His Asn Tyr
195 200 205
Ala Arg Trp Asn Gly Gly Ile Ile Gly Gln Gly Gly Pro Thr Asn Ala
210 215 220
Gln Phe Ala Ser Leu Trp Ser Gln Leu Ala Thr Lys Phe Lys Ser Asn
225 230 235 240
Ser Lys Val Thr Phe Gly Leu Met Asn Glu Pro His Asp Leu Asp Met
245 250 255
Thr Glu Trp Ala Glu Ser Val Gln Ala Ala Val Thr Ala Ile Arg Lys
260 265 270
Ala Gly Ala Thr Ser Gln Lys Ile Leu Leu Pro Gly Thr Gly Tyr Thr
275 280 285
Ser Ala Gln Asp Phe Gly Thr Asn Ser Gly Gln Tyr Leu Leu Lys Val
290 295 300
Thr Asn Leu Asp Gly Ser Thr Asp Asn Leu Ile Phe Asp Val His Lys
305 310 315 320
Tyr Leu Asp Ala Asp Asn Ser Gly Thr Ser Thr Glu Cys Val Thr Asn
325 330 335
Asn Ser Ala Val Phe Val Gln Leu Ala Glu Trp Leu Arg Ala Asn Lys
340 345 350
Arg Gln Ala Met Leu Thr Glu Thr Gly Gly Gly Asn Thr Ala Ser Cys
355 360 365
Glu Thr Asp Val Cys Glu Glu Leu Ala Val Leu Asn Ala His Ser Asp
370 375 380
Val Leu Leu Gly Trp Thr Gly Trp Ala Ala Gly Met Phe Asp Thr Ser
385 390 395 400
Tyr Ala Leu Ser Glu Thr Pro Thr Glu Ser Gly Ser Thr Trp Thr Asp
405 410 415
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420 425 430
<210> 2
<211> 408
<212> PRT
<213> Bispora sp. MEY-1
<400> 2
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50 55 60
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65 70 75 80
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245 250 255
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405
<210> 3
<211> 1224
<212> DNA
<213> Bispora sp. MEY-1
<400> 3
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acctgcacca cctacaaccc ctactacgcc caatgtatcc ccggcacctc caccgacggc 120
ccgtccaccg ccacctccgt caagccgatg accacgaccg tccacaccac gtccgtcaag 180
caaaccacct ccacgtcctc cgccgctgct tccaccgccg ctgcctcctc cgtctcctcc 240
gactccacgt ccacgtcctc cggccacgtc aagtacggcg gcgtcaacat cgccggcttc 300
gacttcggct gctccacgga cggcacctgc accctctcct ccacggatcc ccccggcgag 360
accggcatcg ctcagatgaa ccacttcgtc aagaacgacg gcctcaacgc cttccgcctc 420
cccgtcgcct ggcagtacct cgtcaacaat aacctcggcg gcaccctcga ctccgccaac 480
ttcgccgagt acaacgacct cgtccaaggc tgcctctccg ccggcgccga gatgtgcatc 540
atcgacatcc acaattacgc ccgctggaac ggcggcatca tcggccaagg cggtcccacc 600
aacgctcagt tcgcctccct ctggtcccaa ctcgccacca agttcaagtc caactccaag 660
gtcaccttcg gcctcatgaa cgagccccac gacctcgaca tgaccgagtg ggccgagtcc 720
gtccaagccg ccgtcaccgc catccgcaag gccggcgcca cctcccaaaa gatcctcctc 780
cccggcaccg gctacacctc cgcccaagac ttcggcacca actccggtca gtatctcctc 840
aaggtcacca acctcgacgg ctccaccgac aacctcatct tcgacgtcca caagtacctc 900
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cagctcgccg agtggctccg cgccaacaag cgccaagcca tgctgaccga gaccggtggc 1020
ggcaacaccg cctcctgcga gaccgacgtc tgcgaggagc tcgccgtcct caacgcccat 1080
agcgacgtcc tcctcggttg gaccggctgg gccgctggca tgttcgacac gtcctacgcc 1140
ctctccgaga cccccaccga gtccggctcc acctggaccg atcagcccct cgtcaagaag 1200
tgcatcgccg gcatgttcaa aaag 1224
<210> 4
<211> 1224
<212> DNA
<213> Bispora sp. MEY-1
<400> 4
tacgtcgctc agtgtggcgg ccagaactgg tctggcggca ccgcttgcgt cagcggctac 60
acctgcacca cctacaaccc ctactacgcc cagtgcatcc ctggcaccag caccgacggc 120
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cagaccacct ccaccagctc cgctgctgct agcaccgctg ctgcttctag cgtctcctct 240
gactccacct ctaccagctc cggccacgtc aagtacggcg gcgtcaacat cgccggcttc 300
gacttcggct gcagcaccga cggcacctgc accctctcta gcaccgaccc tcctggcgag 360
accggcatcg ctcagatgaa ccacttcgtc aagaacgacg gcctcaacgc tttccgactg 420
cctgtcgctt ggcagtacct ggtcaacaac aacctcggcg gcaccctgga cagcgctaac 480
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cctggcaccg gctacacctc cgcccaggac ttcggcacca actctggcca gtacctcctg 840
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tgcatcgccg gcatgttcaa gaag 1224

Claims (6)

1.一种酸性纤维素酶基因,其特征在于:所述酸性纤维素酶基因的核苷酸序列如SEQID NO.4所示。
2.一种包含如权利要求1所述酸性纤维素酶基因的重组载体。
3.如权利要求2所述的重组载体,其特征在于,所述重组载体为pCbh1-Cel-Bi,其中,将酸性纤维素酶基因插入到表达载体pCbh1的SnaBI和EcoRI限制性酶切位点之间,使该基因位于pCbh1启动子的下游并受其调控,得到重组载体pCbh1-Cel-Bi。
4.一种包含如权利要求1所述酸性纤维素酶基因的重组菌株。
5.如权利要求4所述的重组菌株,其特征在于,所述重组菌株为里氏木霉。
6.一种制备酸性纤维素酶Cel-Bi的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)使用权利要求2或3中任意一项所述的重组载体转化里氏木霉,得到重组菌株;
(2)培养重组菌株,诱导重组纤维素酶表达;
(3)回收并纯化所表达的酸性纤维素酶Cel-Bi。
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