CN113272016A - 关于治疗实体肿瘤的工程化和非工程化γδ-T细胞的组合物和方法 - Google Patents

关于治疗实体肿瘤的工程化和非工程化γδ-T细胞的组合物和方法 Download PDF

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Abstract

本发明的方面包括用工程化或非工程化γδ‑T细胞治疗实体肿瘤的组合物和方法。在一些实施方案中，所述γδ‑T细胞包含嵌合抗原受体(CAR)构建体。所述CAR构建体可以包含抗TryD结合结构域、CD8α铰链和跨膜结构域、共刺激结构域、CD3ζ信号传导结构域、其组合或全部。所述CAR构建体可以包含抗GPC3结合结构域、CD8α铰链和跨膜结构域、共刺激结构域、CD3ζ信号传导结构域、其组合或全部。所述CAR构建体可以包含编码分泌的共用γ链细胞因子的结构域，诸如sIL15结构域。

Description

关于治疗实体肿瘤的工程化和非工程化γδ-T细胞的组合物 和方法
相关申请的交叉引用
本申请要求2018年10月1日提交的美国临时专利申请号62/739,826的优先权权益，所述临时专利申请的内容特此出于任何和所有目的并入。
序列表
本申请含有序列表，所述序列表以ASCII格式通过电子方式提交并且在此以引用的方式整体并入。所述ASCII副本于2020年1月8日创建，名为ADC-0006-PCT_SL.txt，大小为48,406字节。
背景技术
从早期专注于基本淋巴因子活化和/或肿瘤浸润发展到改造这些免疫细胞以表达遗传工程化抗原受体(诸如嵌合抗原受体)的最新策略，过继细胞疗法已经经历了超过三十(30)年的不断迭代。尽管在此过程中已经有一些暗示和迹象表明了这些方法的治愈潜力，但仍有许多工作要做。特别是，CAR-T淋巴细胞能否成功根除肿瘤取决于CAR-T细胞的持久性和效应功能，但其中任何一种过量都会触发患者的移植物抗宿主效应。另外，实体组织特别存在因缺乏可用的正向刺激和存在抑制性环境而造成的问题。因此，本领域正在测试T细胞和NK细胞，特别是αβT细胞中的多种共刺激策略，以平衡功效与安全性。值得注意的是，鉴于与αβT细胞相比，目前对γδT细胞的共刺激要求缺乏了解，因此将这些各种方法中的任何一种实际转化至γδT细胞充其量是不确定的。参见例如Ribot等,“Searching for“signal2”:costimulation requirements ofγδT cells”,Cell.Mol.Life Sci.(2011)68:2345-2355。
因此，仍然需要改进的策略以提高细胞的特异性或选择性，以便例如通过减少或避免移植物抗宿主(GVH)作用来提高细胞的安全性，以便例如通过避免抑制效应功能来提高细胞抵抗实体肿瘤细胞的效力，并在施用于受试者后改善细胞的活性和/或存活。提供满足此类需求的方法、细胞、组合物、试剂盒和系统。
发明内容
本发明的方面包括一种编码嵌合抗原受体(CAR)的分离的核酸序列，其中所述CAR包含与包含肿瘤相关抗原(TAA)肽和MHC蛋白的蛋白-肽复合物特异性结合的结合结构域，其中所述复合物在实体肿瘤细胞表面上表达，任选地其中所述结合结构域以HLA限制的方式结合所述复合物；CD8α铰链结构域；CD8α跨膜结构域；共刺激信号传导区，所述共刺激信号传导区选自4-1BB共刺激信号传导区和CD27共刺激信号传导区；以及CD3ζ信号传导结构域。本发明的方面还包括本文所述的非工程化的γδT细胞以及包含编码本文所述的CAR构建体的核酸的工程化的γδT细胞，其中所述γδT细胞在γδT细胞的表面上功能性表达核酸编码的CAR。
本发明的方面还包括本文所述的多个γδT细胞。本发明的方面还包括制备本文所述的γδT细胞或多个γδT细胞的方法。本发明的方面还包括药物组合物，其包含药学上可接受的赋形剂以及如本文所述的γδT细胞或多个γδT细胞。本发明的方面还包括使实体肿瘤细胞与肿瘤细胞杀伤有效量的如本文所述的γδT细胞或本文所述的多个γδT细胞接触。
在一方面，本发明提供了一种编码嵌合抗原受体(CAR)的分离的核酸序列，其中所述CAR包含(a)与包含肿瘤相关抗原(TAA)肽和MHC蛋白的蛋白-肽复合物特异性结合的结合结构域，其中所述复合物在实体肿瘤细胞表面上表达，任选地其中所述结合结构域以HLA限制的方式结合所述复合物；(b)铰链结构域，诸如CD8α铰链结构域；(c)跨膜结构域，诸如CD8α跨膜结构域；(d)共刺激信号传导区或共刺激信号传导区的组合，任选地其中所述共刺激信号传导区选自4-1BB(CD137)共刺激信号传导区和CD27共刺激信号传导区；以及(e)信号传导结构域，诸如CD3ζ信号传导结构域。在一些实施方案中，前述元件(a)-(e)以5'至3'的顺序被编码在分离的核酸的有义链上。
在一些实施方案中，所述TAA包含TyrD的连续区。在一些实施方案中，所述TyrD的连续区包含至少或至少约4个且不超过或不超过约12个TyrD连续氨基酸，优选地或优选地约7、8或9个TyrD连续氨基酸。在一些实施方案中，所述TyrD的连续区是TyrD369-377。在一些实施方案中，所述特异性结合所述TAA肽MHC复合物的结合结构域特异性结合HLA-A2/TyrD369-377。
在一些实施方案中，所述结合结构域与被以下抗体结合的表位特异性结合或与以下抗体竞争，所述抗体包含：CDRH1，其包含TSGMGVS(SEQ ID NO:33)；CDRH2，其包含HIYWDDDKRYNPSLKS(SEQ ID NO:34)；CDRH3，其包含KDYGSSFYAMHY(SEQ ID NO:35)；CDRL1，其包含KASQDIHNYIA(SEQ ID NO:36)；CDRL1，其包含YTSTLQP(SEQ ID NO:37)；以及CDRL2，其包含LQYDNLWT(SEQ ID NO:38)。
在另一方面，所述结合结构域与在实体肿瘤细胞表面上表达的肿瘤相关抗原(TAA)特异性结合，任选地其中所述抗原是蛋白-肽复合物，其中所述蛋白是MHC蛋白，其中所述结合结构域以HLA限制的方式结合所述蛋白-肽复合物，并且所述分离的核酸序列的编码的CAR包含(b)铰链结构域，诸如CD8α铰链结构域；(c)跨膜结构域，诸如CD8α跨膜结构域；(d)共刺激信号传导区或共刺激信号传导区的组合，任选地其中所述共刺激信号传导区选自4-1BB(CD137)共刺激信号传导区和CD27共刺激信号传导区；以及(e)信号传导结构域，诸如CD3ζ信号传导结构域。在一些实施方案中，前述元件(a)-(e)以5'至3'的顺序被编码在分离的核酸的有义链上。
在一些实施方案中，所述结合结构域特异性结合在实体肿瘤细胞表面上表达的GPC3内的表位。在一些实施方案中，所述结合结构域包含以下互补决定区(CDR)，与包含以下CDR的抗体结合相同的GPC3表位，和/或与包含以下CDR的抗体竞争结合GPC3表位：CDRH1，其包含序列DYEMH(SEQ ID NO:39)(或GYTFTDYEMH(SEQ ID NO:40))；CDRH2，其包含序列ALDPKTGDTAYSQKFKG(SEQ ID NO:41)；CDRH3，其包含序列FYSYTY(SEQ ID NO:42)；CDRL1，其包含序列RSSQSLVHSNRNTYLH(SEQ ID NO:43)；CDRL2，其包含序列KVSNRFS(SEQ ID NO:44)；和/或CDRL3，其包含序列SQNTHVPPT(SEQ ID NO:45)。
在前述方面或实施方案中的任一者或本文所述的编码CAR的核酸的任一者的一些实施方案中，所述编码的CAR包含：CD8α铰链结构域，所述CD8α铰链结构域包含SEQ ID NO:1(PTPAPTIASQPLSLRPE ACRPAAGGAVHTRGLDFACDIY)或SEQ ID NO:2(TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLR PEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIY)；或CD8α跨膜结构域，所述CD8α跨膜结构域包含SEQ ID NO:3(IWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC)；和/或CD3ζ信号传导结构域。在一些情况下，所述CD3ζ信号传导结构域包含序列SEQ ID NO:4(RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)；或SEQ ID NO:5(RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)。
在一些实施方案中，所述CAR包含含有SEQ ID NO:6(KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL)的4-1BB共刺激信号传导区；或含有SEQ ID NO:7(QRRKYRSNKGESPVEPAEPCHYSCPREEEGSTIPIQEDYRKPEPACSP)的CD27共刺激信号传导区，或者所述分离的核酸编码包含SEQ ID NO:6的4-1BB共刺激信号传导区以及包含SEQ ID NO:7的CD27共刺激信号传导区。
在前述任一项或本文所述的一些实施方案中，所述分离的核酸进一步编码分泌的细胞因子；或分泌的共用γ链白介素；或分泌的共用γ链白介素诸如IL-15，优选地其中所述分泌的共用γ链白介素诸如IL-15包含可操作地连接到分泌信号序列(例如SEQ ID NO:12或26的分泌信号)的白介素多肽序列。在一些实施方案中，所述分离的核酸编码分泌的IL-15，优选地其中所述IL-15包含序列SEQ ID NO:14，更优选地其中所述IL-15包含可操作地连接到分泌信号序列SEQ ID NO:12的序列14，或者其中所述IL-15包含可操作地连接到分泌信号序列SEQ ID NO:26的序列SEQ ID NO:14。在一些情况下，分泌的细胞因子、共用γ链白介素和/或IL-15在结合区、铰链和跨膜结构域、信号传导结构域和/或共刺激内结构域的羧基末端被编码。在一些情况下，分泌细胞因子、共用γ链白介素和/或IL-15在编码结合区、铰链和跨膜结构域、信号传导结构域和/或共刺激内结构域的区域的有义链3'上被编码。
在一些实施方案中，所述核酸编码多顺反子接头区，其被配置为促进CAR和作为单独的多肽的分泌的细胞因子、共用γ链细胞因子或IL-15的翻译。在一些实施方案中，所述多顺反子接头区编码自切割和/或切割多肽序列。在一些情况下，所述自切割序列是P2A、F2A、T2A或E2A自切割序列。在一些情况下，所述切割序列是弗林蛋白酶切割序列。在一些情况下，所述切割序列(例如弗林蛋白酶切割序列)为自切割序列的氨基末端。在一些实施方案中，所述多顺反子接头区编码内部核糖体进入位点。在一些实施方案中，所述核酸编码白介素或细胞因子或白介素或细胞因子分泌信号的氨基末端的多顺反子接头区，优选地其中所述多顺反子接头区包含SEQ ID NO:15-17、25或27-30中任一者的序列或其组合，或编码内部核糖体进入位点，例如SEQ ID NO:31或32。
在一些实施方案中，分泌信号包含序列SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:26，优选地SEQID NO:12；和/或sIL15结构域包含序列SEQ ID NO:14；和/或P2A切割序列包含序列SEQ IDNO:15或SEQ ID NO:25；和/或弗林蛋白酶切割序列包含序列SEQ ID NO:16；和/或CAR以氨基至羧基顺序包含序列SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:14。
在一些实施方案中，所述结合结构域与HLA-A2/TyrD369-377特异性结合并且所述核酸编码SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:18。在一些实施方案中，所述结合结构域与GPC3特异性结合并且所述核酸编码SEQ ID NO:20或22。在一些实施方案中，所述核酸包含序列SEQ IDNO:9、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:21、23或24。
在另一方面，本发明提供了一种包含CAR结合结构域的多肽，诸如由前述核酸中的任一者编码的多肽中的一种，或本文所述的多肽。
在另一方面，本发明提供了例如γδ，T细胞，其包含前述多肽或包含编码本文所述的CAR的核酸，其中所述细胞在所述细胞的表面上功能性表达所述多肽或所述核酸编码的CAR的结合结构域。在一些实施方案中，所述细胞针对实体肿瘤细胞表现出体外和/或体内细胞杀伤活性，所述实体肿瘤细胞表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达。在一些实施方案中，所述细胞的实体肿瘤细胞杀伤活性大于不包含CAR构建体的对照细胞的体外和/或体内实体肿瘤细胞杀伤活性的先天性水平。在一些实施方案中，细胞表现出针对HLA I+类实体肿瘤细胞的增加的实体肿瘤细胞杀伤活性。在一些实施方案中，实体肿瘤细胞杀伤活性或增加的实体肿瘤细胞杀伤活性在与实体肿瘤细胞第一次接触后持续、持续约、至少或至少约6天至180天。
在一些实施方案中，细胞响应于与表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达的实体肿瘤细胞的接触而增殖。在一些实施方案中，与在细胞的表面上没有功能性表达核酸编码的CAR的对照细胞相比，细胞响应于与表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达的实体肿瘤细胞接触而表现出增加的增殖。在一些实施方案中，细胞在宿主生物体中增殖，所述宿主生物体包含表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达的实体肿瘤细胞。在一些实施方案中，细胞增殖或增加的细胞增殖在与实体肿瘤细胞第一次接触后持续、持续约、至少或至少约6天至180天。在一些实施方案中，细胞在与实体肿瘤细胞接触后表达一种或多种促炎细胞因子，任选地其中所述一种或多种促炎细胞因子包含肿瘤坏死因子α或干扰素γ，优选地其表达量大于在细胞表面上没有功能性表达核酸编码的CAR的对照细胞。
在一些实施方案中，与施用至同种异体宿主的αβT细胞表现出的移植物抗宿主反应相比，当引入到同种异体宿主中时，细胞表现出减少、实质上减少、基本上没有或没有移植物抗宿主反应。在一些实施方案中，与施用至同种异体宿主的αβT细胞表现出的移植物抗宿主反应相比，当引入到同种异体宿主中时，例如γδT细胞表现出减少、实质上减少、基本上没有或没有移植物抗宿主反应。在一些实施方案中，所述T细胞是γT细胞。在一些实施方案中，所述T细胞是δT细胞。在一些实施方案中，所述T细胞是γδT细胞。在一些实施方案中，所述T细胞是δ1、δ2、δ3或δ4T细胞，优选地是δ2-δT细胞，更优选地是δ1δT细胞。在一些实施方案中，所述T细胞是δ1、δ2、δ3、或δ4γδT细胞，优选地是δ2-γδT细胞，更优选地是δ1γδT细胞。
在另一方面，本发明提供本文所述的多个前述细胞诸如例如γδT细胞的任何一个，或多个细胞诸如例如γδT细胞。在一些实施方案中，多个包含至少约108个细胞诸如108个例如γδT细胞，优选地约108个细胞例如γδT细胞至约1011个细胞例如γδT细胞。在一些实施方案中，多个包含至少60％、80％或约60％或80％至约90％或95％的δ1、δ2、δ3或δ4细胞诸如例如γδT细胞，优选地δ1或δ2γδT细胞，更优选地δ2-γδT细胞，最优选地δ1γδT细胞的组合物。
在一些实施方案中，本发明提供了一种制备本文所述的细胞诸如例如γδT细胞或本文所述的多个细胞诸如例如γδT细胞的方法，其中所述方法包括用包含本文所述的分离的核酸序列的构建体来转染细胞。在一些情况下，所述方法包括例如γ逆转录病毒转导。在一些情况下，所述方法包括离体扩增细胞，其中所述离体扩增在所述分离的核酸序列转染前和/或转染后进行。在一些情况下，所述方法包括离体扩增细胞，其中所述离体扩增在所述分离的核酸序列转染前和转染后进行。在一些情况下，所述方法包括离体扩增细胞，其中所述离体扩增在所述分离的核酸序列转染后进行。在一些实施方案中，所述方法包括在转染的约30天内产生功能性表达本文所述的CAR的约108个细胞诸如例如γδT细胞至约1011个细胞诸如例如γδT细胞。
在另一方面，本发明提供了一种药物组合物，其包含药学上可接受的赋形剂和本文描述的细胞或多个细胞，诸如例如γδT细胞。
在另一方面，本发明提供了一种杀伤实体肿瘤细胞的方法，所述方法包括使所述实体肿瘤细胞与肿瘤细胞杀伤有效量的前述细胞或多个细胞或药物组合物中的任一者或本文所述的细胞或多个细胞或药物组合物接触。在一些情况下，所述细胞或多个细胞是例如γδT细胞。
在一些实施方案中，所述方法包括将治疗有效量的细胞诸如例如γδT细胞或所述药物组合物引入到包含所述实体肿瘤细胞的宿主生物体中。在一些实施方案中，所述方法包括将治疗有效量的细胞诸如例如γδT细胞或其药物组合物引入到包含所述实体肿瘤细胞的宿主生物体中，并且同时或依序施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法。
在一些实施方案中，施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括与引入细胞同时或依序施用有效增加引入的细胞的增殖、细胞毒性活性、持久性或其组合的量的共用γ链细胞因子，优选地其中所述方法包括施用IL-2，更优选地其中所述方法包括施用IL-15。在一些实施方案中，所述一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括在引入所述细胞之前和/或之后施用有效增加引入的细胞的增殖、细胞毒性活性、持久性或其组合的量的共用γ链细胞因子。
在一些实施方案中，所述一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括在引入所述γδT细胞之前的淋巴细胞耗竭(lymphodepletion)。在一些实施方案中，所述一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括从引入的细胞中分泌一种或多种共用γ链细胞因子。在一些实施方案中，与对照生物体相比，所述方法减少所述宿主生物体中的体内肿瘤负荷，和/或增加所述宿主生物体的平均存活时间，其中所述对照生物体没有用所述细胞或所述药物组合物治疗。在一些实施方案中，所述方法是治疗有需要的受试者中的癌症的方法。
在另一方面，本发明提供了肿瘤细胞杀伤有效量的前述细胞中的任一者或本文所述的细胞(诸如例如γδT细胞)、多个此类细胞或包含此类细胞的药物组合物在制造用于治疗有需要的受试者中的实体肿瘤细胞癌症的药物中的用途。在另一方面，本发明提供了治疗有需要的受试者中的癌症的方法，所述方法包括施用治疗有效量的细胞，其中所述癌症包括表现出TyrD或GPC3的细胞表面表达的实体肿瘤细胞。
在一些实施方案中，所述方法包括与细胞的施用同时或依序地施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法。在一些实施方案中，所述方法包括进行细胞的多次施用，其中所述多次施用之间的时间间隔为至少约一周，优选地至少约2、3、4、5、6、7、8或12周，和/或每6或12个月不超过一次。
在另一方面，本发明提供了一种用于前述方法中的任一种或本文所述的方法中的药物组合物。
以引用的方式并入
本说明书中提及的所有出版物、专利和专利申请以引用的方式并入本文，其程度如同每个单独的出版物、专利或专利申请具体和单独地指出以引用方式并入。
附图说明
图1是含有一个共刺激信号传导内结构域(左)或两个共刺激信号传导内结构域(右)的嵌合抗原受体(CAR)的实施方案的示意图。如本文所用，共刺激信号传导内结构域也称为共刺激(costimulation)内结构域或共刺激(costimulatory)内结构域。在示例性CAR中有用的示例性共刺激信号传导内结构域包括但不限于CD28；CD137(4-1BB)；CD278(ICOS)；CD27；CD134(OX40)；TLR2及其组合。
图2示出了本文所述的工程化和非工程化γδT细胞对526和WM266.1-Luc黑色素瘤细胞系的体外细胞毒性。
图3示出了本文所述的γδT细胞在皮下WM266.4细胞NOD scidγ(NSG)小鼠模型中的体内治疗功效。
图4示出了用于生产工程化的γδCAR-T细胞和非工程化的γδCAR-T细胞例如以用于实体肿瘤治疗的制造过程。
图5示出了用对照CAR构建体或靶向酪氨酸酶多肽的构建体转导的Vδ1T细胞的细胞毒性活性。
图6示出了用包括可溶性IL-15(sIL15)(SEQ ID NO:14)和密码子优化(WO 2007/037780A2)sIL15的抗蛋白多糖(glypican)3(GPC3)CAR构建体对Vδ1细胞的转导效率。
图7示出了未转导的或用抗GPC3 CAR构建体转导的Vδ1T细胞对一组具有不同GPC3表达水平的肝癌细胞系的细胞毒性活性。
具体实施方式
定义：
出于解释本说明书的目的，将应用以下定义，并且在任何适当的时候，以单数形式使用的术语也将包括复数形式且反之亦然。在所示出的任何定义与以引用方式并入本文的任何文件相矛盾时，应以下文示出的定义为准。除非另有定义，否则本文中使用的所有技术和科学术语具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的含义相同的含义。
当涉及诸如量、持续时间等的可测量值时，如本文所用，“约”意指涵盖指定值的±20％或±10％，更优选地±5％，甚至更优选地±1％，并且还更优选地±0.1％的变化，因为此类变化适合于进行所公开的方法。
如本文所用，术语“γδT细胞(gamma delta T细胞)”是指在其表面上表达不同的T细胞受体(TCR)即γδTCR的T细胞的子集，所述T细胞受体由一条γ链和一条δ链组成。术语“γδT细胞”具体包括γδT细胞的所有子集，包括但不限于Vδ1和Vδ2、Vδ3γδT细胞，以及初始、效应记忆、中央记忆和终末分化γδT细胞。作为另一个实例，术语“γδT细胞”包括Vδ4、Vδ5、Vδ7和Vδ8γδT细胞，以及Vγ2、Vγ3、Vγ5、Vγ8、Vγ9、Vγ10和Vγ11γδT细胞。在一些实施方案中，γδT细胞是Vδ1-、Vδ2-或Vδ1-和Vδ2-。用于制备和使用工程化和非工程化γδT细胞和/或其亚型的组合物和方法包括但不限于US 2016/0175358；WO 2017/197347；US9499788；US 2018/0169147；US 9907820；US 2018/0125889和US 2017/0196910中描述的那些，所述专利各自的内容出于所有目的以引用的方式并入，包括用于制备和使用工程化和非工程化γδT细胞和/或其亚型的所述组合物和方法。本申请进一步考虑表达一条γ链或一条δ链的T细胞或其他工程化白细胞或淋巴细胞，任选地与第二多肽组合以形成功能性TCR。表达一条γ链或一条δ链的此类工程化白细胞或淋巴细胞可用于本文描述的方法中或存在于本文描述的组合物中。
如本文所用，术语“T淋巴细胞”或“T细胞”是指表达或已表达CD3(CD3+)和T细胞受体(TCR+)的免疫细胞。T细胞在细胞介导的免疫中起着核心作用。“已表达”CD3和TCR的T细胞经过工程化以消除CD3和/或TCR细胞表面表达。
如本文所用，术语“TCR”或“T细胞受体”是指形成α-β或γ-δ受体或其组合的二聚体异源细胞表面信号传导蛋白。αβTCR识别由MHC分子呈递的抗原，而γδTCR可以独立于MHC呈递而识别抗原。
术语“MHC”(主要组织相容性复合体)是指编码细胞表面抗原呈递蛋白的基因的子集。在人中，这些基因称为人白细胞抗原(HLA)基因。在本文中，缩写MHC或HLA可互换使用。
如本文所用，“活化”是指已经被充分刺激以诱导可检测的细胞增殖的T细胞的状态。活化还可以与诱导的细胞因子产生和可检测的效应子功能相关联。术语“活化的T细胞”除其他情况之外是指正经历细胞分裂的T细胞。
如本文所用，术语“抗体”是指与抗原特异性结合的免疫球蛋白分子。抗体可以是衍生自天然来源或重组来源的完整免疫球蛋白，并且可以是完整免疫球蛋白的免疫反应性部分。抗体通常是免疫球蛋白分子的四聚体。本发明中的抗体可以各种形式存在，包括例如多克隆抗体、单克隆抗体、Fv、Fab和F(ab)2以及单链抗体和人源化抗体(Harlow等,1999,In:Using Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,NY；Harlow等,1989,In:Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor,N.Y.；Houston等,1988,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-5883；Bird等,1988,Science 242:423-426)。
术语“抗体片段”是指完整抗体的一部分，并且是指完整抗体的抗原决定可变区。抗体片段的实例包括但不限于Fab、Fab'、F(ab')2和Fv片段、线性抗体、scFv抗体以及由抗体片段形成的多特异性抗体。
如本文所用，“抗体重链”是指以其天然存在构象存在于抗体分子中的两种类型的多肽链中的较大者。
如本文所用，“抗体轻链”是指以其天然存在构象存在于抗体分子中的两种类型的多肽链中的较小者。κ轻链和λ轻链是指两种主要的抗体轻链同种型。
如本文所用，术语“合成抗体”意指使用重组DNA技术产生的抗体，例如像如本文所述由噬菌体表达的抗体。所述术语还应被解释为意指一种抗体，所述抗体通过合成编码所述抗体的DNA分子来生成，并且所述DNA分子表达抗体蛋白或指定所述抗体的氨基酸序列，其中所述DNA或氨基酸序列使用本领域中可得到的且众所周知的合成DNA或氨基酸序列技术来获得。
如本文所用，术语“抗原”或“Ag”被定义为引起免疫反应的分子。这种免疫反应可能涉及抗体产生，或者特定免疫感受态细胞的活化，或者这两者。技术人员将理解，任何大分子(包含蛋白质或肽)都可以用作抗原。此外，抗原可以衍生自重组DNA或基因组DNA。技术人员将理解，包含编码引发免疫反应的蛋白质的核苷酸序列或部分核苷酸序列的任何DNA均因此编码本文所使用的术语“抗原”。此外，本领域技术人员将理解抗原不必仅由基因的全长核苷酸序列编码。显而易见的是，本发明包括但不限于使用一个以上基因的部分核苷酸序列，并且这些核苷酸序列以各种组合排列以引发所需的免疫反应。此外，技术人员将理解，抗原根本不需要由“基因”编码。显而易见的是，抗原可以产生、合成或可以衍生自生物样品。此类生物样品可以包括但不限于组织样品、肿瘤样品、细胞或生物流体。
术语“表位”包括能够与免疫球蛋白或T细胞受体特异性结合的任何蛋白决定簇、脂质或碳水化合物决定簇。表位决定簇通常由分子(诸如氨基酸、脂质或糖侧链)的活性表面基团组成并且通常具有特定的三维结构特征以及特定的电荷特征。当平衡解离常数(KD)在10-6–10-12M的范围内时，抗体被称为特异性结合抗原。
如本文所用，术语“嵌合抗原受体(CAR)”可以指例如人工T细胞受体、T小体(T-body)、单链免疫受体、嵌合T细胞受体或嵌合免疫受体，并且涵盖将人工特异性移植到特定的免疫效应细胞上的工程化受体。可使用CAR赋予T细胞单克隆抗体特异性，从而允许产生大量特异性T细胞，例如用于过继细胞疗法。在具体的实施方案中，例如，CAR指导细胞对肿瘤相关抗原的特异性。在一些实施方案中，CAR包含细胞内活化结构域(允许T细胞在靶向部分与靶细胞(诸如靶肿瘤细胞)接合后活化)、跨膜结构域以及长度可以变化并且包含与疾病或病症相关的例如肿瘤抗原结合区的细胞外结构域。在特定方面，CAR包含衍生自单克隆抗体的单链可变片段(scFv)的融合体，其融合至CD3-ζ、跨膜结构域和内结构域。其他CAR设计的特异性可以衍生自受体(例如肽)的配体或模式识别受体(诸如树突状细胞相关C型凝集素(Dectin))。在某些情况下，可以修改抗原识别结构域的间隔以减少活化诱导的细胞死亡。在某些情况下，CAR包含用于额外共刺激信号传导的结构域，诸如CD3ζ、FcR、CD27、CD28、CD137、DAP 10/12和/或OX40、ICOS、TLR(例如TLR2)等。在一些情况下，分子可以与CAR共表达，包括共刺激分子、用于成像(例如，用于正电子发射断层扫描)的报告基因、在添加前药后有条件消融T细胞的基因产物、归巢受体、趋化因子、趋化因子受体、细胞因子和细胞因子受体。此外，本领域技术人员将理解共刺激结构域不需要仅由基因的全长核苷酸序列编码。显而易见的是，本发明包括但不限于使用一个以上基因的部分核苷酸序列，并且这些核苷酸序列以各种组合排列以引发所需的免疫反应。
如本文所用，术语“抗肿瘤作用”是指可以通过肿瘤体积减小、肿瘤细胞数量降低、转移瘤的数量降低、预期寿命增加或与癌性病状相关联的各种生理症状改善表现出来的生物作用。“抗肿瘤作用”还可通过本发明的肽、多核苷酸、细胞和抗体最初预防肿瘤发生的能力表现出来。
根据本发明，术语“自身抗原”意指被免疫系统错误地识别为外来的任何自身抗原。自身抗原包括但不限于细胞蛋白、磷蛋白、细胞表面蛋白、细胞脂质、核酸、糖蛋白(包括细胞表面受体)。
如本文所用，术语“自体的”是指衍生自个体的任何材料，其随后将被重新引入同一个体中。
如本文所用，术语“同种异体的”是指衍生自动物的材料，其随后被引入相同物种的不同动物中。
术语“治疗有效量”是指由研究员、兽医、医学博士或其他临床医师来探寻的将引发组织、系统或受试者的生物或医学反应的组合物的量。术语“治疗有效量”包括当施用时足以防止正治疗的病症或疾病(例如实体肿瘤)的一种或多种体征或症状的发展或在某种程度上减轻所述体征或症状的组合物的量。治疗有效量将根据组合物、疾病及其严重性以及待治疗受试者的年龄、体重等而变化。
如本文所使用的术语“治疗”疾病意指降低受试者所经受的疾病或病症的至少一种体征或症状的频率或严重性。
“与一种或多种另外的治疗剂组合”施用包括同时(并行)施用和以任何顺序依序施用。
如本文所用，术语“药学上可接受的”是指材料(包括但不限于盐、载剂或稀释剂)不消除化合物的生物活性或特性，并且是相对无毒的，即材料可施用至个体而不引起非期望的生物作用或不以有害方式与组合物中含有的任何组分相互作用。
“编码”是指多核苷酸(诸如基因、cDNA或mRNA)中的核苷酸的特定序列充当在生物过程中合成具有限定的核苷酸序列(即rRNA、tRNA和mRNA)或限定的氨基酸序列的其他聚合物和大分子的模板的固有特性和由此产生的生物特性。因此，如果对应于基因的mRNA的转录和翻译在细胞或其他生物系统中产生蛋白质，则所述基因编码所述蛋白质。核苷酸序列与mRNA序列相同并且通常提供在序列表中的编码链以及用作基因或cDNA的转录模板的非编码链两者均可称为编码所述基因或cDNA的蛋白质或其他产物。
“分离的”意指从天然状态改变或去除。例如，在活体动物中天然存在的核酸或肽不是“分离的”，但部分地或完全地与其天然状态的共存材料分离的相同核酸或肽是“分离的”。分离的核酸或蛋白质可以实质上纯的形式存在，或者可存在于非天然环境(例如像宿主细胞)中。
除非另外说明，否则“编码氨基酸序列的核苷酸序列”包括彼此是简并型式并且编码相同氨基酸序列的所有核苷酸序列。编码蛋白质和RNA的核苷酸序列可包含内含子。
术语“患者”、“受试者”、“个体”等在本文中可互换使用，并且是指可顺从本文所述方法的任何动物。在某些非限制性实施方案中，患者、受试者或个体是人。
如本文所用，关于抗体，术语“特异性结合”意指识别特异性抗原但实质上不识别或结合样品中的其他分子的抗体。例如，与来自一个物种的抗体特异性结合的抗体还可与来自一个或多个物种的所述抗原结合。但是，此类跨物种反应性本身并不改变抗体分类为特异性的。在另一个实例中，与抗原特异性结合的抗体还可与所述抗原的不同等位形式结合。然而，此类交叉反应性本身并不改变抗体分类为特异性的。在一些情况下，术语“特异性结合(specific binding/specifically binding)”可关于抗体、蛋白质或肽与第二化学物种的相互作用来使用，以意指所述相互作用依赖于化学物种上特定结构(例如抗原决定簇或表位)的存在；例如，抗体识别并与特定的蛋白质结构结合，而不是与蛋白质一般地结合。如果抗体对表位“A”是特异性的，则在含标记的“A”和抗体的反应中，含表位A(或游离的未标记A)的分子的存在将降低结合到所述抗体的标记的A的量。
在一些实施方案中，特异性结合可通过至少约1×10-8M或更小的平衡解离常数来表征(例如较小KD表示较紧密结合)。用于确定两个分子是否特异性结合的方法是本领域众所周知的，并且包括例如平衡透析、表面等离子体共振等。此外，与第一抗原和一个或多个另外的抗原结合的多特异性抗体或与抗原的两个不同区域结合的双特异性抗体仍然被认为是如本文所用的“特异性地结合”的抗体。
实体肿瘤是包含至少约10个或至少约100个肿瘤细胞的肿瘤。实体肿瘤可以是软组织肿瘤、原发实体肿瘤或转移病灶。
实体肿瘤的实例包括各种器官系统，诸如影响肝脏、肺、乳腺、淋巴、胃肠道(例如结肠)、泌尿生殖道(例如肾、尿路上皮细胞)、前列腺和咽部的肉瘤、腺癌和癌。腺癌包括诸如大多数结肠癌、直肠癌、肾细胞癌、肝癌、肺非小细胞癌、小肠癌和食道癌等恶性肿瘤。在一个实施方案中，癌症是黑色素瘤，例如晚期黑色素瘤。上述癌症的转移病灶也可采用本发明的方法和组合物进行治疗或预防。其他可治疗的癌症包括骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头颈部癌、皮肤或眼内恶性黑色素瘤、宫颈癌、卵巢癌、直肠癌、肛门区癌、胃癌、睾丸癌、宫颈癌、输卵管癌、子宫内膜癌、宫颈癌、阴道癌、外阴癌、食道癌、小肠癌、内分泌系统癌、甲状腺癌、甲状旁腺癌、肾上腺癌、软组织肉瘤、尿道癌、阴茎癌、儿童实体肿瘤、膀胱癌、肾或输尿管癌、肾盂癌、中枢神经系统(CNS)赘生物、原发性CNS淋巴瘤、脊柱轴肿瘤、脑干胶质瘤、垂体腺瘤、卡波西肉瘤、表皮样癌、鳞状细胞癌、环境诱发的癌症，包括石棉诱发的癌症，以及这些癌症的组合。在优选的实施方案中，实体肿瘤细胞表达或过表达TyrD或其片段。在一些实施方案中，实体肿瘤细胞表达或过表达含有TyrD片段的HLA:肽复合物。在一些实施方案中，TyrD片段是TyrD369-377。在一些实施方案中，HLA是I类HLA，诸如HLA-A2。在一些实施方案中，实体肿瘤细胞表达或过表达HLA-A2/TyrD369-377。
在一些实施方案中，实体肿瘤细胞表达或过表达抗蛋白多糖3(GPC3)。在一些实施方案中，实体肿瘤细胞表达或过表达被抗GPC3抗体特异性结合的GPC3的表位、T细胞受体或嵌合抗原受体，所述嵌合抗原受体描述于以下参考中：U.S.7,919,086；WO 2014/180306；WO2018/019772；WO 2016/049459；WO 2003/000883；WO 2006/046751；WO 2007/047291；WO2016/086813；WO 2016/047722；WO 2016/036973；Cancer Res.2008；68:9832-9838；ProcNatl Acad Sci U S A.2013Mar 19；110(12):E1083-91，每个参考的内容针对所有目的并且特别是针对其中描述的结合结构域、抗体、抗体片段、互补决定区、含有所述互补决定区的多肽、编码所述互补决定区的核酸以及表位特异性和用于确定表位特异性的测定以引用的方式整体并入。在一些实施方案中，实体肿瘤细胞表达或过表达被抗GPC3抗体GC33特异性结合的抗蛋白多糖3的表位。在一些实施方案中，实体肿瘤表达或过表达含有GPC3片段的HLA:肽复合物。在一些实施方案中，HLA是I类HLA，诸如HLA-A2。在一些实施方案中，实体肿瘤表达或过表达含有GPC3144–152肽的HLA:肽复合物。在一些实施方案中，实体肿瘤表达或过表达含有GPC3298-306肽的HLA:肽复合物。参见Oncoimmunology.2012年11月1日；1(8):1448–1450。
“表达盒”是指包含表达控制序列的核酸，所述表达控制序列可操作地连接到编码待表达的转录物或多肽的核酸。表达盒包含足够的顺式作用表达元件；其他表达元件可由宿主细胞或在体外表达系统中提供。表达盒可以是载体诸如粘粒、质粒(例如裸露或包含在脂质体中)或病毒(例如慢病毒、逆转录病毒、腺病毒和腺相关病毒)的组分。表达盒可以在宿主细胞(诸如γδT细胞)中。
范围：贯穿本公开，本发明的各个方面可以范围形式呈现。应理解，呈范围形式的描述仅仅是为了方便和简洁，并且不应解释为对本发明范围的不可改变的限制。因此，范围的描述应被认为已经确切地公开所有可能的子范围以及所述范围内的单独数值。例如，诸如1至6的范围描述应当被认为具有特定公开的子范围，诸如1至3、1至4、1至5、2至4、2至6、3至6等，以及所述范围内的单独数字，例如1、2、2.7、3、4、5、5.3和6。无论范围的广度如何，这都适用。
嵌合抗原受体构建体：
本发明的方面包括编码CAR的核酸，以及包含此类核酸的构建体和载体。在一些情况下，所述核酸是例如表达盒的异源组分。在一些实施方案中，所述核酸是例如逆转录病毒载体的异源组分。在一些实施方案中，所述核酸是例如αβ或γδT细胞，并且优选地γδT细胞的异源组分。在一些实施方案中，所述核酸是例如γ+T细胞和/或δ+T细胞的异源组分。在一些实施方案中，所述核酸是例如α-T细胞和/或β-T细胞的异源组分。
本文描述了编码CAR结合结构域的核酸，所述CAR结合结构域与实体肿瘤细胞表面上表达的肿瘤相关抗原(TAA)特异性结合。示例性TAA是酪氨酸酶(TyrD)或其肽片段。在一些情况下，TAA是抗蛋白多糖3或其肽片段。在一些情况下，TAA是与HLA分子诸如I类HLA分子结合的肽。与I类HLA分子结合的酪氨酸酶肽(本文也可互换地称为HLA限制性酪氨酸酶表位、HLA限制性酪氨酸酶表位和MHC限制性酪氨酸酶抗原)衍生自酪氨酸酶(Genebank登录号：NP_000363.1)并且典型地长8-10个氨基酸、通过与HLA分子中对应的结合口袋相互作用的两个或三个锚残基与重链α1-α2沟结合。
酪氨酸酶是一种膜相关的N-连接糖蛋白，并且是黑色素合成的关键酶。它在所有健康黑素细胞和几乎所有黑色素瘤肿瘤样品中均有表达(H.Takeuchi等人,2003；S.Reinke等人,2005)。由该酶衍生的肽呈现在MHC I类分子上，并被黑色素瘤患者的自体溶细胞性T淋巴细胞识别[T.Wolfel等人,1994；Brichard等人,1993；Renkvist等人,Cancerimmunology immunotherapy 2001 50:3-15；Novellino L等人,March 2004update.CancerImmunol Immunotherapy.54:187-207,2005]。衍生自肿瘤相关抗原(TAA)的另外的肿瘤酪氨酸酶HLA限制性肽可见于Istituto Nazionale per lo Studio e la Cura dei Tumori的网页www.istitutotumori.mi.it。
在WO2008/120202中，例如WO2008/120202的表139中提供了MHC I类限制性酪氨酸酶抗原肽的非限制性实例，该参考以引用的方式以其整体完全地并入。根据本发明的一些实施方案，酪氨酸酶抗原肽为TyrD369-377肽。特异性结合TyrD、TyrD内的表位的结合结构域，包括但不限于以HLA(例如I类HLA)限制方式结合的那些结合结构域，包括但不限于描述于以下参考中的那些结合结构域：WO 2016/199140；WO 2016/199141；US 9688739；以及共同待决的申请PCT/IB2017/053539，每个参考的内容针对所有目的，包括但不限于用于鉴别、制备和使用例如以HLA限制或HLA非依赖方式特异性结合TyrD或TyrD内的表位的结合结构域的组合物和方法，以引用的方式整体并入。
与I类HLA分子结合的GPC3肽(本文也可互换地称为HLA限制性GPC3表位、HLA限制性GPC3表位和MHC限制性GPC3抗原)衍生自抗蛋白多糖3蛋白(Genebank登录号：No:NM_001164617.2)并且典型地长8-10个氨基酸、通过与HLA分子中对应的结合口袋相互作用的两个或三个锚残基与重链α1-α2沟结合。
如本文所用，特异性结合Tyr D和/或特异性结合Tyr D内表位的结合结构域、CAR或CAR T细胞非限制地包括特异性结合Tyr D肽片段的结合结构域、CAR或CAR T细胞。特异性结合TyrD肽片段的结合结构域、CAR或CAR T细胞可以HLA限制方式特异性结合提及的TyrD肽片段。相似地，如本文所用，在细胞表面上表达TyrD的细胞包括在细胞表面上表达或过表达TyrD肽片段的细胞，诸如在肽:HLA复合物中。
如本文所用，特异性结合GPC3和/或特异性结合GPC3内表位的结合结构域、CAR或CAR T细胞非限制地包括特异性结合GPC3肽片段的结合结构域、CAR或CAR T细胞。特异性结合GPC3肽片段的结合结构域、CAR或CAR T细胞可以HLA限制方式特异性结合提及的GPC3肽片段。相似地，如本文所用，在细胞表面上表达TyrD的细胞包括在细胞表面上表达或过表达GPC3肽片段的细胞，诸如在肽:HLA复合物中。
在一些实施方案中，所述结合结构域结合如在细胞表面上的全长功能多肽中表达的抗原。在一些实施方案中，所述结合结构域结合如MHC:抗原复合物中所呈递的抗原。在一些实施方案中，所述结合结构域以HLA限制的方式结合所述抗原。对MHC:抗原复合物表现出特异性的结合结构域描述于例如WO/2016/199140和WO/2016/199141中。
在一些实施方案中，分离的核酸编码具有包含TSGMGVS(SEQ ID NO:33)的CDRH1、包含HIYWDDDKRYNPSLKS(SEQ ID NO:34)的CDRH2、包含KDYGSSFYAMHY(SEQ ID NO:35)的CDRH3、包含KASQDIHNYIA(SEQ ID NO:36)的CDRL1、包含YTSTLQP(SEQ ID NO:37)的CDRL1和/或包含LQYDNLWT(SEQ ID NO:38)的CDRL2的抗TyrD结合结构域。
在一些实施方案中，分离的核酸编码具有包含DYEMH(SEQ ID NO:39)(或GYTFTDYEMH(SEQ ID NO:40))的CDRH1、包含ALDPKTGDTAYSQKFKG(SEQ ID NO:41)的CDRH2、包含FYSYTY(SEQ ID NO:42)的CDRH3、包含RSSQSLVHSNRNTYLH(SEQ ID NO:43)的CDRL1、包含KVSNRFS(SEQ ID NO:44)的CDRL2和/或包含SQNTHVPPT(SEQ ID NO:45)的CDRL3的抗GPC3结合结构域。
本公开还考虑了与本文提供的序列竞争结合的抗TyrD或抗GPC3结合结构域。通过使用已知方法，可以确定抗TyrD结合结构域是否与参考抗体或结合结构域结合相同的表位，或与参考抗体或结合结构域竞争结合。例如，为了确定测试抗体是否与参考结合结构域结合相同的表位，可以使所述参考结合结构域与TyrD在饱和条件下结合。接着，可以评估测试结合结构域与TyrD分子结合的能力。如果在与参考结合结构域饱和结合后，测试结合结构域能够与TyrD结合，则可得出结论：测试结合结构域与参考结合结构域结合不同的表位。另一方面，如果在与参考结合结构域饱和结合后，测试结合结构域不能与TyrD结合，则测试结合结构域可结合与由参考结合结构域所结合的表位相同的表位。
为了确定结合结构域是否与参考结合结构域竞争结合，上述结合方法在两个定向中进行：在第一定向中，允许参考结合结构域在饱和条件下与TyrD结合，随后评估测试结合结构域与TyrD分子的结合。在第二定向中，允许测试结合结构域在饱和条件下与TyrD分子结合，随后评估参考结合结构域与TyrD分子的结合。如果在两个定向中，仅第一(饱和)结合结构域能够与TyrD分子结合，则得出的结论是测试结合结构域和参考结合结构域竞争与TyrD结合。如本领域普通技术人员将理解的，与参考结合结构域竞争结合的结合结构域可能不一定与参考结合结构域结合相同的表位，但可通过结合重叠或相邻的表位来空间上阻断参考结合结构域的结合。上述确定竞争和与抗TyrD结合结构域表位结合的方法同样可以应用于抗TyrD结合结构域。
如果两种结合结构域各自竞争性抑制(阻断)另一种结合结构域与抗原的结合，则这两种结合结构域与相同或重叠表位结合。也就是说，1倍、5倍、10倍、20倍或100倍过量的一种结合结构域抑制另一种结合结构域的结合达至少50％，例如75％、90％或甚至99％，如竞争结合测定中所测量(参见例如Junghans等,Cancer Res.199050:1495-1502)。可替代地，如果抗原中的减少或消除一种结合结构域的结合的基本上所有氨基酸突变减少或消除另一种结合结构域的结合，则两种结合结构域具有相同表位。如果减少或消除一种结合结构域的结合的一些氨基酸突变减少或消除另一种结合结构域的结合，则两种结合结构域具有重叠表位。
然后可进行额外的常规实验(例如肽突变和结合测定)，以确认所观察到的缺乏测试结合结构域的结合是否事实上由于与参考结合结构域结合相同表位所致，或是否因空间阻断(或另一现象)造成缺乏观察到的结合。这类实验可使用ELISA、RIA、表面等离子体共振、流式细胞术或本领域中可用的任何其他定量或定性结合测定来进行。
本公开提供了与CDR或框架区中本文提供的序列具有“实质同一性”或“实质相似性”的抗体和CAR。当提及核酸或其片段时，术语“实质同一性”或“实质上相同”表示当与另一种核酸(或另一种核酸的互补链)最佳比对时，核苷酸序列同一性为％，例如至少80％、至少81％、至少82％、至少83％、至少84％、至少85％、至少86％、至少87％、至少88％、至少89％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99.5％或100％的核苷酸碱基，如下文讨论的任何众所周知的序列同一性算法诸如FASTA、BLAST或GAP所测量。在某些情况下，与参考核酸分子具有实质同一性的核酸分子可编码与由参考核酸分子所编码的多肽具有相同或实质上类似氨基酸序列的多肽。
应用于多肽时，术语“实质相似性”或“实质上类似”意指两个肽序列在诸如通过使用默认空位权重的程序GAP或BESTFIT进行最佳比对时，共享至少80％、至少81％、至少82％、至少83％、至少84％、至少85％、至少86％、至少87％、至少88％、至少89％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99.5％或100％的序列同一性。在一些方面，不相同的残基位置相差了保守氨基酸取代。“保守氨基酸取代”是一种氨基酸残基被具有带类似化学特性(例如电荷或疏水性)的侧链(R基)的另一氨基酸残基取代的取代。一般来说，保守氨基酸取代实质上将不会改变蛋白的功能特性。在两个或更多个氨基酸序列彼此相差保守取代的情况中，可向上调整类似性的百分比或程度以校正取代的保守性质。进行这种调整的手段是本领域技术人员众所周知的。参见例如Pearson(1994)Methods Mol.Biol.24:307-331，所述参考以引用的方式并入本文。具有类似化学特性的侧链的氨基酸组的实例包括1)脂族侧链：甘氨酸、丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸；2)脂族-羟基侧链：丝氨酸和苏氨酸；3)含酰胺的侧链：天冬酰胺和谷氨酰胺；4)芳族侧链：苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸；5)碱性侧链：赖氨酸、精氨酸和组氨酸；6)酸性侧链：天冬氨酸和谷氨酸；以及7)含硫侧链：半胱氨酸和甲硫氨酸。优选的保守氨基酸取代组是：缬氨酸-亮氨酸-异亮氨酸、苯丙氨酸-酪氨酸、赖氨酸-精氨酸、丙氨酸-缬氨酸、谷氨酸-天冬氨酸以及天冬酰胺-谷氨酰胺。可替代地，保守置换是在Gonnet等(1992)Science256:1443 45(以引用的方式并入本文)中公开的PAM250对数似然矩阵中具有正值的任何变化。“中度保守”置换是在PAM250对数似然矩阵中具有非负值的任何变化。
多肽的序列同一性和/或类似性通常使用序列分析软件来测量。蛋白分析软件使用分配至各种取代、缺失和其他修饰(包括保守氨基酸取代)的类似性度量来匹配类似的序列。例如，GCG软件含有诸如GAP和BESTFIT的程序，所述程序可使用默认参数来确定密切相关多肽(诸如来自不同生物体物种的同源多肽)之间，或野生型蛋白与其突变蛋白之间的序列同源性或序列同一性。参见例如GCG 6.1版。多肽序列还可使用利用默认或推荐参数的FASTA(GCG 6.1版内的程序)进行比较。FASTA(例如FASTA2和FASTA3)提供查询序列和检索序列之间的最佳重叠区的比对和序列同一性百分比(Pearson(2000)同上)。序列还可使用Smith-Waterman同源性检索算法使用具有空位开放罚分(gap open penalty)为12，且空位扩展罚分(gap extension penalty)为2，BLOSUM矩阵为62的仿射空位检索来进行比较。当将本文公开的序列与含有大量来自不同生物体的序列的数据库进行比较时，另一优选的算法是使用默认参数的计算机程序BLAST，特别是BLASTP或TBLASTN。参见例如Altschul等.(1990)J.Mol.Biol.215:403-410和(1997)Nucleic Acids Res.25:3389-3402，所述参考各自以引用的方式并入本文。
本文提供的是抗TyrD或抗GPC3 CAR，其包含具有一个或多个取代(例如保守取代)的本文公开的HCVR、LCVR和/或CDR氨基酸序列中任一者的变体。例如，本公开包含具有HCVR、LCVR和/或CDR氨基酸序列的抗TyrD CAR，相对于本文公开的HCVR、LCVR和/或CDR(例如HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2或LCDR3)氨基酸序列中的任一者，所述抗TyrD CAR具有例如20个或更少、19个或更少、18个或更少、17个或更少、16个或更少、15个或更少、14个或更少、13个或更少、12个或更少、11个或更少、10个或更少、9个或更少、8个或更少、7个或更少、6个或更少、5个或更少、4个或更少、3个或更少、2个或更少或1个氨基酸取代。例如，相对于本文公开的HCVR、LCVR和/或CDR(例如HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2或LCDR3)氨基酸序列中的任一者，抗TyrD CAR可包含20、19、18、17、16、15、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸取代(例如保守氨基酸取代)。
类似地，本公开包含具有HCVR、LCVR和/或CDR氨基酸序列的抗GPC3 CAR，相对于本文公开的HCVR、LCVR和/或CDR(例如HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2或LCDR3)氨基酸序列中的任一者，所述抗GPC3 CAR具有例如20个或更少、19个或更少、18个或更少、17个或更少、16个或更少、15个或更少、14个或更少、13个或更少、12个或更少、11个或更少、10个或更少、9个或更少、8个或更少、7个或更少、6个或更少、5个或更少、4个或更少、3个或更少、2个或更少或1个氨基酸取代。例如，相对于本文公开的HCVR、LCVR和/或CDR(例如HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2或LCDR3)氨基酸序列中的任一者，抗GPC3 CAR可包含20、19、18、17、16、15、14 13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、2或1个氨基酸取代(例如保守氨基酸取代)。
本文描述的示例性结合结构域通常从氨基末端至羧基末端依次包含重链区，随后是轻链区(VH-VL)。在显式或隐式描述结合结构域中的VH和VL区的某些顺序的情况下，本公开还应理解为描述VH和VL区的顺序被颠倒(例如在包含scFv结合结构域的scFV或CAR中)的替代实施方案。因此，例如在包含scFv结合结构域的scFV或CAR中，VH-VL顺序的描述还描述了替代的VL-VH顺序。此外，例如在包含scFv结合结构域的scFV或CAR中，VL-VH顺序的描述还描述了替代的VH-VL顺序。
通常，本文描述的CAR编码核酸包含细胞外接头部分，所述接头部分编码将结合结构域连接到跨膜结构域的肽接头。示例性接头部分包括但不限于编码CD8α铰链结构域的接头部分，例如SEQ ID NO:1(PTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIY)或SEQ ID NO:2(TTTPAPRP PTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVH TRGLDFACDIY)。通常，编码肽接头(例如CD8α铰链结构域)的区域是编码结合结构域的区域的3'和编码跨膜结构域的区域的5'。
本文描述的CAR编码核酸包含跨膜结构域。跨膜结构域可以将细胞外抗原结合结构域例如和铰链连接到一种或多种细胞内信号传导组分。例如，跨膜结构域可以将抗原结合结构域例如和铰链连接到CD3ζ信号传导结构域，并任选地具有一个或两个共刺激内结构域。示例性跨膜结构域包括但不限于CD8α跨膜结构域，例如SEQ ID NO:3(IWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC)。通常，编码跨膜结构域(例如CD8α跨膜结构域)的区域是编码肽接头(例如CD8α铰链结构域)的区域的3'和编码一个或多个胞质结构域的区域的5'。
在一些实施方案中，所述分离的核酸编码包含一个或多个胞质结构域的胞质区。编码胞质区的区域通常是编码跨膜结构域的区域的3'。胞质结构域通常是信号传导结构域，其为γδT细胞增殖、细胞毒性活性和/或促炎细胞因子表达(例如TNF-α或IFNγ)提供活化信号。示例性胞质结构域是CD3ζ信号传导结构域。在一些实施方案中，CD3ζ信号传导结构域为或包含SEQ ID NO:4(RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGR REEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)。在一些实施方案中，CD3ζ信号传导结构域为或包含SEQ ID NO:5(RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)。在一些实施方案中，胞质区包含多个(例如2、3、4、5或6个)信号传导结构域，诸如多个(例如2、3、4、5或6个)CD3ζ信号传导结构域，例如每个独立地选自SEQ ID NO:4和5。在一些实施方案中，胞质区包含多个(例如2、3、4、5或6个)非CD3ζ信号传导结构域和CD3ζ信号传导结构域。在一些实施方案中，胞质区包含非CD3ζ信号传导结构域和多个(例如2、3、4、5或6个)CD3ζ信号传导结构域。另外或替代的信号传导结构域包括但不限于.
胞质区可包含一个或多个共刺激内结构域。编码一个或多个共刺激内结构域的区域可以是编码信号传导结构域的区域的5'或3'。在一些实施方案中，编码一个或多个共刺激内结构域的区域是编码信号传导结构域的区域的5'。在一些实施方案中，编码一个或多个共刺激内结构域的区域是信号传导结构域的5'，并且编码一个或多个共刺激内结构域的额外的区域是信号传导结构域的3'。示例性共刺激内结构域包括但不限于CD28；CD137(4-1BB)；CD278(ICOS)；CD27；CD134(OX40)；和TLR2共刺激内结构域及其组合。
在一些实施方案中，可以包括另外的信号传导方式来增加本文所述γδ-T细胞的增殖、持久性和/或细胞毒性活性。例如，在一些实施方案中，CAR构建体可以在分离的核酸的3’端编码可溶性共用γ链细胞因子。共用γ链细胞因子编码区可以通过T2A接头编码区与CAR构建体的5’部分相连，使得共用γ链细胞因子从CAR多肽中切割并由细胞分泌。
在一些实施方案中，构建体编码至少一个4-1BB共刺激内结构域，并且任选地编码选自4-1BB、ICOS、CD28和CD27共刺激内结构域的第二共刺激内结构域。在一些实施方案中，构建体编码至少两个4-1BB共刺激内结构域，或两个4-1BB共刺激内结构域与选自4-1BB、ICOS、CD28和CD27的一个、两个、三个或四个或更多个共刺激内结构域组合。在一些实施方案中，4-1BB共刺激内结构域包含SEQ ID NO:6(KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL)。
在一些实施方案中，构建体编码一个CD27共刺激内结构域，并且任选地编码选自4-1BB、ICOS、CD28和CD27共刺激内结构域的第二共刺激内结构域。在一些实施方案中，构建体编码CD27共刺激内结构域和4-1BB共刺激内结构域。在一些实施方案中，构建体编码两个CD27共刺激内结构域。在一些实施方案中，CD27共刺激内结构域包含SEQ ID NO:7(QRRKYRSNKGESPVEPAEPCHYSCPREEEGSTIPIQED YRKPEPACSP)。
在一些实施方案中，构建体编码分泌信号，例如SEQ ID NO:12(MALPVTALLLPLALLLHAARP)，所述分泌信号可操作地连接以促进C末端多肽诸如支持T细胞(例如CAR-T细胞)的活化、细胞毒性和/或持久性的细胞因子的分泌。在一些实施方案中，分泌信号是SEQ ID NO:26(MRISKPHLRSISIQCYLCLLLNSHFLTEAGIHVFILGCFSAGLPKTEA)的分泌信号。在一些实施方案中，构建体编码分泌信号例如SEQ ID NO:12，所述分泌信号可操作地连接以促进共用γ链细胞因子诸如IL-15或其活性片段，例如SEQ ID NO:14(NWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYT ESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS)的分泌。其他IL-15序列，包括编码sIL15的密码子优化的核酸序列公开于WO 2007/037780。示例性共用γ链细胞因子包括IL-2和IL-15。在一些实施方案中，共用γ链细胞因子选自IL-2、IL-7和IL-15。
在一些实施方案中，构建体编码一个或多个多顺反子接头区，例如在信号传导结构域和/或共刺激内结构域与可操作地连接以促进细胞因子分泌的分泌信号之间。多顺反子接头区是多肽序列或RNA序列的区域，其促进由单个转录产物产生多个离散多肽。在一些实施方案中，多顺反子接头区编码切割序列。合适的切割序列包括自切割序列，诸如P2A、F2A、E2A或T2A切割序列和/或被内源蛋白酶诸如弗林蛋白酶切割的序列。
在一些实施方案中，切割序列是P2A切割序列。在一些实施方案中，切割序列是弗林蛋白酶切割序列。在一些实施方案中，切割序列是P2A和弗林蛋白酶切割序列。在一些实施方案中，切割序列是P2A切割序列SEQ ID NO:15(SGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP)。在一些实施方案中，切割序列是弗林蛋白酶切割序列SEQ ID NO:16(RAKR)。在一些实施方案中，切割序列是P2A+弗林蛋白酶切割序列SEQ ID NO:17(RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENP GP)。在一些实施方案中，切割序列是SEQ ID NO:25(GSGATNFSLLKQAGDVEENPGP)的P2A切割序列。
在一些实施方案中，切割序列为或包含P2A切割序列SEQ ID NO:27(ATNFSLLKQAGDVEENPGP)。在一些实施方案中，切割序列为或包含F2A切割序列SEQ ID NO:28(VKQTLNNFDLLKLAGDVESNPGP)。在一些实施方案中，切割序列为或包含E2A切割序列SEQID NO:29(QCTNYALLKLAGDVESNPGP)。在一些实施方案中，切割序列为或包含T2A切割序列SEQ ID NO:30(EGRSLLTCGDVEENPGP)。在某些方面，多个自切割序列可以在信号传导和/或共刺激结构域的羧基末端以及编码的分泌的细胞因子(例如共用γ链细胞因子，诸如IL-15)的氨基末端被编码，优选地其中所述多个自切割序列独立地选自由P2A切割序列、T2A切割序列、E2A切割序列和F2A切割序列组成的组。在某些方面，在本文描述的构建体中编码一个或多个自切割序列和被内源蛋白酶切割的一个或多个序列。在某些实施方案中，内源蛋白酶识别位点在自切割序列的氨基末端被编码。
在一些实施方案中，多顺反子接头区编码内部核糖体进入位点。示例性内部核糖体进入位点由SEQ ID NO:31(CTAACGTTACTGGCCGAAGCCGCTTGGAATAAGGCCGGTGTGCGTTTGTCTATATGTTATTTTCCACCATATTGCCGTCTTTTGGCAATGTGAGGGCCCGGAAACCTGGCCCTGTCTTCTTGACGAGCATTCCTAGGGGTCTTTCCCCTCTCGCCAAAGGAATGCAAGGTCTGTTGAATGTCGTGAAGGAAGCAGTTCCTCTGGAAGCTTCTTGAAGACAAACAACGTCTGTAGCGACCCTTTGCAGGCAGCGGAACCCCCCACCTGGCGACAGGTGCCTCTGCGGCCAAAAGCCACGTGTATAAGATACACCTGCAAAGGCGGCACAACCCCAGTGCCACGTTGTGAGTTGGATAGTTGTGGAAAGAGTCAAATGGCTCTCCTCAAGCGTATTCAACAAGGGGCTGAAGGATGCCCAGAAGGTACCCCATTGTATGGGATCTGATCTGGGGCCTCGGTGCACATGCTTTACATGTGTTTAGTCGAGGTTAAAAAAACGTCTAGGCCCCCCGAACCACGGGGACGTGGTTTTCCTTTGAAAAACACGATGATA)编码。
另一种示例性内部核糖体进入位点由SEQ ID NO:32(AGCAGGTTTCCCCAACTGACACAAAACGTGCAACTTGAAACTCCGCCTGGTCTTTCCAGGTCTAGAGGGGTAACACTTTGTACTGCGTTTGGCTCCACGCTCGATCCACTGGCGAGTGTTAGTAACAGCACTGTTGCTTCGTAGCGGAGCATGACGGCCGTGGGAACTCCTCCTTGGTAACAAGGACCCACGGGGCCAAAAGCCACGCCCACACGGGCCCGTCATGTGTGCAACCCCAGCACGGCGACTTTACTGCGAAACCCACTTTAAAGTGACATTGAAACTGGTACCCACACACTGGTGACAGGCTAAGGATGCCCTTCAGGTACCCCGAGGTAACACGCGACACTCGGGATCTGAGAAGGGGACTGGGGCTTCTATAAAAGCGCTCGGTTTAAAAAGCTTCTATGCCTGAATAGGTGACCGGAGGTCGGCACCTTTCCTTTGCAATTACTGACCAC)编码。
其他合适的内部核糖体进入位点包括但不限于Nucleic Acids Res.2010年1月；38(数据库期):D131-6.doi:10.1093/nar/gkp981.Epub 2009年11月16日中描述的那些、iresite.org处描述的那些、WO2018/215787中描述的那些、GenBank登录号KP019382.1中描述的序列以及GenBank登录号LT727339.1中公开的IRES元件，所述参考的内容整体并且针对所有目的、特别是内部核糖体进入位点及其中所述的用途而并入。
在US 2018/0360992和U.S.8,865,467中公开了额外的多顺反子接头区，包括切割自切割和IRES元件。
在一些实施方案中，所述分离的核酸编码SEQ ID NO:8(MSVPTQVLGLLLLWLTDARCDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDIHNYIAWYQQKPGKAPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCLQYDNLWTFGQGTKVEIKRGGGGSGGGGSGGGGQITLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTSGMGVSWIRQPPGKALEWLAHIYWDDDKRYNPSLKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARKDYGSSFYAMHYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)hD11-CD8-BBz多肽，其包含hD11抗TyrD结合结构域(抗TyrD369-377)、CD8α铰链和跨膜区、4-1BB共刺激内结构域和CD3ζ信号传导结构域。
在一些实施方案中，编码抗TyrD369-377-CD8-BBz多肽的分离的核酸包含序列SEQID NO:9(ATGTCCGTGCCTACCCAGGTGCTGGGCCTGCTGCTGCTGTGGCTGACCGACGCCAGATGCGACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCGAGTCAGGACATTCACAACTATATAGCTTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCCACTATACATCCACTTTGCAACCAGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGAAGTGGATCTGGGACAGATTTTACTTTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATATTGCAACATATTACTGTCTACAGTATGATAATCTCTGGACGTTCGGTCAAGGCACCAAGGTGGAAATCAAACGGGGTGGAGGTGGATCTGGAGGAGGAGGATCCGGTGGAGGAGGTCAGATCACCTTGAAGGAGTCTGGTCCTACGCTGGTGAAACCCACACAGACCCTCACGCTGACCTGCACCTTCTCTGGGTTCTCACTCAGCACTAGTGGAATGGGTGTGTCCTGGATCCGTCAGCCCCCAGGAAAGGCCCTGGAGTGGCTTGCACACATTTATTGGGATGATGATAAGCGCTACAACCCATCTCTGAAGAGCAGGCTCACCATCACCAAGGACACCTCCAAAAACCAGGTGGTCCTTACAATGACCAACATGGACCCTGTGGACACAGCCACATATTACTGTGCACGAAAGGACTACGGTAGTAGCTTCTATGCTATGCACTACTGGGGTCAAGGAACCCTAGTCACCGTGTCGAGTACCACGACGCCAGCGCCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGATATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGCAAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTGAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGCAGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCTAA)。
在一些实施方案中，所述分离的核酸包含编码CD8α铰链区的密码子优化的序列。示例性密码子优化的CD8α铰链区核酸序列包括但不限于SEQ ID NO:10(ACCACCACCCCTGCACCAAGGCCCCCGACTCCCGCGCCCACCATCGCGTCACA GCCTCTTAGCCTGCGACCGGAAGCATGCAGACCAGCTGCCGGGGGGGCCGTGCATACGAGAGGTTTGGACTTCGCCTGCGAT)。在一些实施方案中，CD8α铰链区由以下序列SEQ ID NO:11(ACCACGACGCCAGCG CCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGAT)编码。
在一些实施方案中，所述分离的核酸编码SEQ ID NO:18(MSVPTQVLGLLLLWLTDARCDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCKASQDIHNYIAWYQQKPGKAPKLLIHYTSTLQPGVPSRFSGSGSGTDFTFTISSLQPEDIATYYCLQYDNLWTFGQGTKVEIKRGGGGSGGGGSGGGGQITLKESGPTLVKPTQTLTLTCTFSGFSLSTSGMGVSWIRQPPGKALEWLAHIYWDDDKRYNPSLKSRLTITKDTSKNQVVLTMTNMDPVDTATYYCARKDYGSSFYAMHYWGQGTLVTVSSTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRRAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGPMALPVTALLLPLALLLHAARPNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS*)hD11-CD8-BBz-sIL15多肽，其包含：抗TyrD hD11(抗TyrD369-377)结合结构域、CD8α铰链和跨膜区、4-1BB共刺激内结构域、CD3ζ信号传导结构域、弗林蛋白酶-P2A切割序列和可操作地连接至IL-15结构域的分泌信号。
在一些实施方案中，编码hD11-CD8-BBz-sIL15多肽的分离的核酸包含序列SEQ IDNO:19(ATGTCCGTGCCTACCCAGGTGCTGGGCCTGCTGCTGCTGTGGCTGACCGACGCCAGATGCGACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCCTGTCTGCATCTGTAGGAGACAGAGTCACCATCACTTGCAAGGCGAGTCAGGACATTCACAACTATATAGCTTGGTATCAGCAGAAACCAGGGAAAGCCCCTAAGCTCCTGATCCACTATACATCCACTTTGCAACCAGGGGTCCCATCAAGGTTCAGTGGAAGTGGATCTGGGACAGATTTTACTTTCACCATCAGCAGCCTGCAGCCTGAAGATATTGCAACATATTACTGTCTACAGTATGATAATCTCTGGACGTTCGGTCAAGGCACCAAGGTGGAAATCAAACGGGGTGGAGGTGGATCTGGAGGAGGAGGATCCGGTGGAGGAGGTCAGATCACCTTGAAGGAGTCTGGTCCTACGCTGGTGAAACCCACACAGACCCTCACGCTGACCTGCACCTTCTCTGGGTTCTCACTCAGCACTAGTGGAATGGGTGTGTCCTGGATCCGTCAGCCCCCAGGAAAGGCCCTGGAGTGGCTTGCACACATTTATTGGGATGATGATAAGCGCTACAACCCATCTCTGAAGAGCAGGCTCACCATCACCAAGGACACCTCCAAAAACCAGGTGGTCCTTACAATGACCAACATGGACCCTGTGGACACAGCCACATATTACTGTGCACGAAAGGACTACGGTAGTAGCTTCTATGCTATGCACTACTGGGGTCAAGGAACCCTAGTCACCGTGTCGAGTACCACCACCCCTGCACCAAGGCCCCCGACTCCCGCGCCCACCATCGCGTCACAGCCTCTTAGCCTGCGACCGGAAGCATGCAGACCAGCTGCCGGGGGGGCCGTGCATACGAGAGGTTTGGACTTCGCCTGCGATATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGCAAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTGAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGCAGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCCGCGCGAAGCGATCAGGCAGCGGGGCGACAAATTTCAGCCTTCTGAAACAAGCAGGCGACGTGGAAGAAAACCCCGGTCCAATGGCCTTACCAGTGACCGCCTTGCTCCTGCCGCTGGCCTTGCTGCTCCACGCCGCCAGGCCGAACTGGGTGAATGTAATAAGTGATTTGAAAAAAATTGAAGATCTTATTCAATCTATGCATATTGATGCTACTTTATATACGGAAAGTGATGTTCACCCCAGTTGCAAAGTAACAGCAATGAAGTGCTTTCTCTTGGAGTTACAAGTTATTTCACTTGAGTCCGGAGATGCAAGTATTCATGATACAGTAGAAAATCTGATCATCCTAGCAAACAACAGTTTGTCTTCTAATGGGAATGTAACAGAATCTGGATGCAAAGAATGTGAGGAACTGGAGGAAAAAAATATTAAAGAATTTTTGCAGAGTTTTGTACATATTGTCCAAATGTTCATCAACACTTCTTGA)。
在一些实施方案中，所述分离的核酸编码SEQ ID NO:20(MSVPTQVLGLLLLWLTDARCQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTDYEMHWVRQAPGQGLEWMGALDPKTGDTAYSQKFKGRVTLTADKSTSTAYMELSSLTSEDTAVYYCTRFYSYTYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGDVVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLVHSNRNTYLHWYLQKPGQSPQLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCSQNTHVPPTFGQGTKLEIKTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR*)多肽，其包含GC33抗GPC3结合结构域、CD8α铰链和跨膜区、4-1BB共刺激内结构域和CD3ζ信号传导结构域。
在一些实施方案中，编码GC33-CD8-BBz多肽的分离的核酸包含序列SEQ ID NO:21(ATGTCCGTGCCTACCCAGGTGCTGGGCCTGCTGCTGCTGTGGCTGACCGACGCCAGATGCCAAGTGCAGCTGGTCCAGAGCGGCGCCGAGGTGAAAAAGCCTGGCGCCAGCGTGAAGGTGTCCTGCAAGGCCTCTGGCTACACCTTCACCGACTACGAGATGCACTGGGTGCGGCAGGCCCCTGGACAGGGCCTGGAATGGATGGGCGCTCTGGACCCCAAGACCGGCGACACCGCTTATAGCCAGAAGTTCAAGGGCAGAGTGACCCTGACAGCTGATAAGAGCACAAGCACCGCCTACATGGAACTGAGCAGCCTGACCAGCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCACCAGATTCTACAGCTACACCTACTGGGGCCAGGGGACCCTGGTGACAGTGTCTAGCGGTGGAGGTGGATCTGGAGGAGGAGGATCCGGTGGAGGAGGTGATGTGGTGATGACCCAGAGCCCTCTGAGCCTGCCTGTGACCCCTGGAGAGCCTGCCAGCATCAGCTGCAGAAGCAGCCAATCTCTGGTGCACAGCAACCGGAACACATACCTGCACTGGTACCTGCAGAAACCTGGCCAGAGCCCCCAGCTGCTGATCTACAAGGTGTCCAACAGATTCAGCGGCGTGCCTGATAGATTCAGCGGATCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGAAGATCTCTAGAGTGGAAGCCGAGGACGTGGGCGTGTACTACTGCAGCCAGAACACCCACGTGCCCCCCACCTTCGGCCAGGGCACAAAGCTGGAAATCAAGACCACGACGCCAGCGCCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGATATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGCAAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTGAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGCAGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCTAA)。
在一些实施方案中，所述分离的核酸编码SEQ ID NO:22(MSVPTQVLGLLLLWLTDARCQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTDYEMHWVRQAPGQGLEWMGALDPKTGDTAYSQKFKGRVTLTADKSTSTAYMELSSLTSEDTAVYYCTRFYSYTYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGDVVMTQSPLSLPVTPGEPASISCRSSQSLVHSNRNTYLHWYLQKPGQSPQLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCSQNTHVPPTFGQGTKLEIKTTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIYIWAPLAGTCGVLLLSLVITLYCKRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCELRVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPRGSGATNFSLLKQAGDVEENPGPMALPVTALLLPLALLLHAARPNWVNVISDLKKIEDLIQSMHIDATLYTESDVHPSCKVTAMKCFLLELQVISLESGDASIHDTVENLIILANNSLSSNGNVTESGCKECEELEEKNIKEFLQSFVHIVQMFINTS*)多肽，其包含GC33抗GPC3结合结构域、CD8α铰链和跨膜区、4-1BB共刺激内结构域、CD3ζ信号传导结构域、弗林蛋白酶与P2A切割区和可操作地连接至IL-15结构域的分泌信号。
在一些实施方案中，编码GC33-CD8-BBz-sIL15多肽的分离的核酸包含序列SEQ IDNO:23(ATGTCCGTGCCTACCCAGGTGCTGGGCCTGCTGCTGCTGTGGCTGACCGACGCCAGATGCCAAGTGCAGCTGGTCCAGAGCGGCGCCGAGGTGAAAAAGCCTGGCGCCAGCGTGAAGGTGTCCTGCAAGGCCTCTGGCTACACCTTCACCGACTACGAGATGCACTGGGTGCGGCAGGCCCCTGGACAGGGCCTGGAATGGATGGGCGCTCTGGACCCCAAGACCGGCGACACCGCTTATAGCCAGAAGTTCAAGGGCAGAGTGACCCTGACAGCTGATAAGAGCACAAGCACCGCCTACATGGAACTGAGCAGCCTGACCAGCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCACCAGATTCTACAGCTACACCTACTGGGGCCAGGGGACCCTGGTGACAGTGTCTAGCGGTGGAGGTGGATCTGGAGGAGGAGGATCCGGTGGAGGAGGTGATGTGGTGATGACCCAGAGCCCTCTGAGCCTGCCTGTGACCCCTGGAGAGCCTGCCAGCATCAGCTGCAGAAGCAGCCAATCTCTGGTGCACAGCAACCGGAACACATACCTGCACTGGTACCTGCAGAAACCTGGCCAGAGCCCCCAGCTGCTGATCTACAAGGTGTCCAACAGATTCAGCGGCGTGCCTGATAGATTCAGCGGATCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGAAGATCTCTAGAGTGGAAGCCGAGGACGTGGGCGTGTACTACTGCAGCCAGAACACCCACGTGCCCCCCACCTTCGGCCAGGGCACAAAGCTGGAAATCAAGACCACGACGCCAGCGCCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGATATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGCAAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTGAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGCAGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGTAGCGGGGCTACGAACTTCTCCCTTCTTAAACAAGCGGGAGACGTGGAAGAAAATCCCGGACCTATGGCCTTACCAGTGACCGCCTTGCTCCTGCCGCTGGCCTTGCTGCTCCACGCCGCCAGGCCGAACTGGGTGAATGTAATAAGTGATTTGAAAAAAATTGAAGATCTTATTCAATCTATGCATATTGATGCTACTTTATATACGGAAAGTGATGTTCACCCCAGTTGCAAAGTAACAGCAATGAAGTGCTTTCTCTTGGAGTTACAAGTTATTTCACTTGAGTCCGGAGATGCAAGTATTCATGATACAGTAGAAAATCTGATCATCCTAGCAAACAACAGTTTGTCTTCTAATGGGAATGTAACAGAATCTGGATGCAAAGAATGTGAGGAACTGGAGGAAAAAAATATTAAAGAATTTTTGCAGAGTTTTGTACATATTGTCCAAATGTTCATCAACACTTCTTGA)。
在一些实施方案中，编码GC33-CD8-BBz-sIL15多肽的分离的核酸包含序列SEQ IDNO:24(ATGTCCGTGCCTACCCAGGTGCTGGGCCTGCTGCTGCTGTGGCTGACCGACGCCAGATGCCAAGTGCAGCTGGTCCAGAGCGGCGCCGAGGTGAAAAAGCCTGGCGCCAGCGTGAAGGTGTCCTGCAAGGCCTCTGGCTACACCTTCACCGACTACGAGATGCACTGGGTGCGGCAGGCCCCTGGACAGGGCCTGGAATGGATGGGCGCTCTGGACCCCAAGACCGGCGACACCGCTTATAGCCAGAAGTTCAAGGGCAGAGTGACCCTGACAGCTGATAAGAGCACAAGCACCGCCTACATGGAACTGAGCAGCCTGACCAGCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCACCAGATTCTACAGCTACACCTACTGGGGCCAGGGGACCCTGGTGACAGTGTCTAGCGGTGGAGGTGGATCTGGAGGAGGAGGATCCGGTGGAGGAGGTGATGTGGTGATGACCCAGAGCCCTCTGAGCCTGCCTGTGACCCCTGGAGAGCCTGCCAGCATCAGCTGCAGAAGCAGCCAATCTCTGGTGCACAGCAACCGGAACACATACCTGCACTGGTACCTGCAGAAACCTGGCCAGAGCCCCCAGCTGCTGATCTACAAGGTGTCCAACAGATTCAGCGGCGTGCCTGATAGATTCAGCGGATCTGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGAAGATCTCTAGAGTGGAAGCCGAGGACGTGGGCGTGTACTACTGCAGCCAGAACACCCACGTGCCCCCCACCTTCGGCCAGGGCACAAAGCTGGAAATCAAGACCACGACGCCAGCGCCGCGACCACCAACACCGGCGCCCACCATCGCGTCGCAGCCCCTGTCCCTGCGCCCAGAGGCGTGCCGGCCAGCGGCGGGGGGCGCAGTGCACACGAGGGGGCTGGACTTCGCCTGTGATATCTACATCTGGGCGCCCTTGGCCGGGACTTGTGGGGTCCTTCTCCTGTCACTGGTTATCACCCTTTACTGCAAACGGGGCAGAAAGAAACTCCTGTATATATTCAAACAACCATTTATGAGACCAGTACAAACTACTCAAGAGGAAGATGGCTGTAGCTGCCGATTTCCAGAAGAAGAAGAAGGAGGATGTGAACTGAGAGTGAAGTTCAGCAGGAGCGCAGACGCCCCCGCGTACCAGCAGGGCCAGAACCAGCTCTATAACGAGCTCAATCTAGGACGAAGAGAGGAGTACGATGTTTTGGACAAGAGACGTGGCCGGGACCCTGAGATGGGGGGAAAGCCGCAGAGAAGGAAGAACCCTCAGGAAGGCCTGTACAATGAACTGCAGAAAGATAAGATGGCGGAGGCCTACAGTGAGATTGGGATGAAAGGCGAGCGCCGGAGGGGCAAGGGGCACGATGGCCTTTACCAGGGTCTCAGTACAGCCACCAAGGACACCTACGACGCCCTTCACATGCAGGCCCTGCCCCCTCGCGGTAGCGGGGCTACGAACTTCTCCCTTCTTAAACAAGCGGGAGACGTGGAAGAAAATCCCGGACCTATGGCCTTACCAGTGACCGCCTTGCTCCTGCCGCTGGCCTTGCTGCTCCACGCCGCCAGGCCGAACTGGGTGAATGTGATCAGCGATCTGAAGAAGATCGAGGATCTGATCCAGTCCATGCACATCGATGCCACCCTGTATACCGAGAGCGATGTGCACCCCAGCTGCAAGGTGACCGCCATGAAGTGCTTTCTGCTGGAGCTGCAGGTGATCTCCCTGGAGTCCGGAGATGCCAGCATCCACGATACCGTGGAGAATCTGATCATCCTGGCCAACAACAGCCTGTCCTCCAATGGCAATGTGACCGAGTCGGGATGCAAGGAGTGCGAGGAGCTGGAGGAGAAGAATATCAAGGAGTTTCTGCAGAGCTTTGTACATATTGTCCAAATGTTCATCAACACTTCTTGA)。
在一些实施方案中，所述分离的核酸是线性核酸。在一些实施方案中，所述分离的核酸是载体，诸如质粒载体、腺病毒载体、腺相关病毒载体、病毒载体、逆转录病毒载体(例如γ逆转录病毒载体)或慢病毒载体。在一些实施方案中，所述分离的核酸或例如其包含结合结构域跨膜结构域以及一个或多个信号传导和/或共刺激内结构域的连续部分，被整合到宿主细胞(诸如宿主γδT细胞)的基因组中。在示例性实施方案中，所述分离的核酸是逆转录病毒载体。
γδT细胞：
本发明的方面包括γδT细胞，其功能性表达本文所述的分离的核酸并由此在所述γδT细胞表面上表达CAR。
本发明的方面可以另外地或可替代地包括针对实体肿瘤细胞具有体外或体内细胞毒活性的γδT细胞，所述实体肿瘤细胞表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达。在一些情况下，细胞毒性活性是先天性活性。在一些情况下，细胞毒性至少部分地、显著地(>约25％)或完全地由于存在具有特异性结合实体肿瘤细胞表面上表达的TAA的结合结构域的CAR构建体。在一些情况下，所述γδT细胞表现出所述γδT细胞的实体肿瘤细胞杀伤活性大于对照γδT细胞中的体外和/或体内实体肿瘤细胞杀伤活性的先天性水平。在一些情况下，所述对照γδT细胞不包含CAR构建体。在一些情况下，所述对照γδT细胞包含缺乏本文描述的结合结构域、本文描述的铰链区、本文描述的跨膜结构域、本文描述的信号传导结构域和/或本文描述的共刺激内结构域的CAR构建体。
在一些情况下，细胞毒性至少部分地、显著地(>约25％)或完全地由于存在具有特异性结合TyrD或TyrD内的表位诸如TyrD369-377的结合结构域的CAR构建体。在一些情况下，细胞毒性至少部分地、显著地(>约25％)或完全地由于存在具有以HLA限制的(例如，I类HLA限制的)方式特异性结合TyrD或TyrD内的表位诸如TyrD369-377的结合结构域的CAR构建体。在一些情况下，细胞毒性至少部分地、显著地(>约25％)或完全地由于存在具有特异性结合HLA-A2/TyrD369-377的结合结构域的CAR构建体。在一些情况下，所述γδT细胞功能性表达特异性结合TyrD或其肽片段的由本文描述的分离的核酸编码的CAR。
在一些实施方案中，本文描述的γδT细胞可表现出HLA限制的(例如HLA I类限制的)细胞毒性。在其他实施方案中，大多数(>50％)、实质上所有(>90％)或所有细胞毒性活性不是HLA限制的(例如HLA I类限制的)。HLA限制的细胞毒性活性可以通过比较针对HLA(例如HLA I类)(null)肿瘤细胞系的体外细胞毒性对针对HLA+(例如HLA I+类)肿瘤细胞系的体外细胞毒性来评估。在一些实施方案中，HLA限制的细胞毒性活性至少部分地、显著地(>25％)或完全地通过使用T细胞受体样结合结构域来提供。T细胞受体样结合结构域是特异性识别与MHC分子复合呈递在细胞表面上时的抗原的结合结构域。T细胞受体样结合结构域进一步描述于例如WO 2016/199141中。
本文描述的γδT细胞可表现出稳健的和/或持续的实体肿瘤细胞杀伤活性。在一些情况下，从第一次接触实体肿瘤细胞起，实体肿瘤细胞杀伤活性可以持续至少约6天至120天，或至少约6天至180天。在一些情况下，从第一次接触实体肿瘤细胞起，或从施用本文描述的γδT细胞起，本文描述的γδT细胞或其后代的实体肿瘤细胞杀伤活性可以持续至少约6天至120天，或至少约6天至180天。这种持续的实体肿瘤细胞杀伤活性可以在体外、体内或在体外和体内同时表现。
本发明的方面可以另外地或可替代地包括响应于与表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达或过表达的细胞接触而增殖的γδT细胞。表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达的细胞可以是正常的细胞，诸如正常的内皮细胞。表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达或过表达的细胞可以是实体肿瘤细胞。在一些情况下，增殖是先天性活动。在一些情况下，增殖至少部分地、显著地(>约20％或>约25％)或完全地由于存在具有特异性结合细胞表面上表达的TAA的结合结构域的CAR构建体。在一些情况下，与对照γδT细胞相比，所述γδT细胞表现出更高水平的体外和/或体内增殖。在一些情况下，所述对照γδT细胞不包含CAR构建体。在一些情况下，所述对照γδT细胞包含缺乏本文描述的结合结构域、本文描述的铰链区、本文描述的跨膜结构域、本文描述的信号传导结构域和/或本文描述的共刺激内结构域的CAR构建体。
在一些情况下，增殖至少部分地、显著地(>约20或>约25％)或完全地由于存在具有特异性结合TyrD或TyrD内的表位的结合结构域的CAR构建体。在一些情况下，响应于与表现出TyrD的细胞表面表达的细胞接触而表现出增殖的γδT细胞，功能性表达由本文描述的分离的核酸编码的TyrD特异性CAR。
本文描述的γδT细胞可在包含细胞的宿主生物体中表现出稳健的和/或持续的增殖，所述细胞表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达或过表达。在一些情况下，从第一次接触表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达或过表达的细胞起，或从向所述宿主生物体施用所述γδT细胞之日起，增殖可以持续至少约6天至120天，或至少约6天至180天。在一些情况下，从第一次接触细胞起或从第一次向宿主生物体施用γδT细胞之日起，包含表现出肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达或过表达的细胞的所述宿主生物体中的本文描述的γδT细胞或其后代的增殖可持续至少约6天至120天，或至少约6天至180天。在一些情况下，宿主生物体中的增殖至少部分地、显著地(>约20％或>约25％)或完全地由于存在具有特异性结合TyrD或TyrD内的表位的结合结构域的CAR构建体。在一些情况下，宿主生物体中表现出增殖的γδT细胞功能性表达由本文描述的分离的核酸编码的TyrD特异性CAR，所述宿主生物体包含表现出TyrD的细胞表面表达的细胞。
在一些实施方案中，本文描述的γδT细胞在与在细胞表面上表达或过表达TyrD或其肽片段的细胞接触后表达或持续表达促炎细胞因子，诸如肿瘤坏死因子α或干扰素γ。在一些实施方案中，本文描述的γδT细胞或其后代在与在细胞表面上表达或过表达TyrD或其肽片段的细胞接触后，例如在包含在细胞表面上表达或过表达TyrD或其肽片段的细胞的宿主生物体中，表达或持续表达促炎细胞因子，诸如肿瘤坏死因子α或干扰素γ。
在一些实施方案中，当引入到同种异体宿主中时，所述γδT细胞或含有所述γδT细胞的药物组合物基本上不表现或不表现移植物抗宿主反应。在一些实施方案中，当引入到同种异体宿主中时，所述γδT细胞或含有所述γδT细胞的药物组合物表现出临床上可接受的移植物抗宿主反应水平。在一些实施方案中，临床上可接受的水平是不需要停止γδT细胞治疗以实现治疗上有效治疗的移植物抗宿主反应的量。在一些实施方案中，根据适用的IBMTR分级量表，临床上可接受水平的移植物抗宿主反应(GvHD)是不如C级严重的急性反应。急性移植物抗宿主反应的严重性通过评估皮肤、肝脏和胃肠道的累及程度来确定。各个器官累及的阶段相组合以产生总体分数，这具有预后意义。I(A)级GvHD表征为轻度疾病，II(B)级GvHD表征为中度，III(C)级表征为重度，并且IV(D)级危及生命。IBMTR分级系统定义了急性GvHD的严重性，如下(Rowlings等,Br J Haematol 1997；97:855)：
·A级–仅第1阶段皮肤累及(斑丘疹在<25％的身体上)，无肝脏或胃肠道累及
·B级–第2阶段皮肤累及；第1至2阶段肠道或肝脏累及
·C级–任何器官系统累及的第3阶段(全身性红皮病；胆红素6.1至15.0mg/dL；腹泻1500至2000mL/天)
·D级–任何器官系统累及的第4阶段(全身性红皮病伴大疱形成；胆红素>15mg/dL；腹泻>2000mL/天或疼痛或肠梗阻)
还参见Schoemans等,Bone Marrow Transplantation第53卷,第1401–1415页(2018)，例如在表1和表2处，所述参考公开了用于评估和分级急性GvHD的标准。
在一些实施方案中，与施用至同种异体宿主的对照αβT细胞或包含所述对照αβT细胞的对照药物组合物表现出的移植物抗宿主反应相比，当引入到同种异体宿主中时，所述γδT细胞或含有所述γδT细胞的药物组合物表现出减少的或显著减少的移植物抗宿主反应。在一些情况下，对照αβT细胞是同种异体非工程化对照αβT细胞。在一些情况下，对照αβT细胞不包含CAR或不包含与参考γδT细胞相同的CAR。
本文描述的γδT细胞可以是δ1、δ2、δ3或δ4γδT细胞或其组合。在一些情况下，γδT细胞主要是(>50％)、实质上(>90％)、基本上全部或完全是δ2-γδT细胞。在一些情况下，γδT细胞主要是(>50％)、实质上(>90％)、基本上全部或完全是δ1γδT细胞。
γδT细胞可获自同种异体或自体供体。γδT细胞可以部分或完全纯化，或者不纯化，并且离体扩增。用于离体扩增的方法和组合物包括但不限于WO 2017/197347中描述的那些。可以在将CAR构建体引入到γδT细胞中之前或之后或之前和之后进行扩增。
本文描述的γδT细胞可以被储存，例如冷冻保存，以用于过继细胞转移。
抑制或杀伤肿瘤细胞的方法
具有针对实体肿瘤细胞的细胞毒性活性的一种或多种非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物可以任何顺序或同时施用至受试者。如果同时施用，则本发明的多种非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物可以单一、统一形式(诸如静脉内注射)提供，或以多种形式(例如作为多种静脉内输注、皮下注射或丸剂)提供。本发明的非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物可以一起或分开包装于单个包装中或多个包装中。本发明的一种或全部非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物可以多次剂量给予。如果不同时施用，则多次剂量之间的时间安排可变化至多达约一周、一个月、两个月、三个月、四个月、五个月、六个月或约一年。在一些情况下，在施用至受试者之后，本发明的非工程化富集的γδT细胞群、工程化富集的γδT细胞群和/或其混合物可以在受试者身体内进行体内增殖。可以冷冻一种或多种非工程化γδT细胞群、一种或多种工程化γδT细胞群和/或其混合物，以提供用于使用相同的细胞制剂进行的多次治疗的细胞。本公开的一种或多种非工程化γδT细胞群、一种或多种工程化γδT细胞群和/或其混合物，以及包含它们的药物组合物可以包装为试剂盒。试剂盒可包括非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物，以及包含它们的组合物的使用说明书(例如书面说明书)。
在一些情况下，治疗实体癌症的方法包括向受试者施用治疗有效量的非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物，其中所述施用治疗实体癌症。在一些实施方案中，施用治疗有效量的非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物，持续至少约10秒、30秒、1分钟、10分钟、30分钟、1小时、2小时、3小时、4小时、5小时、δ小时、12小时、24小时、2天、3天、4天、5天、δ天、1周、2周、3周、1个月、2个月、3个月、4个月、5个月、6个月或1年。在一些实施方案中，施用治疗有效量的非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物，持续至少一周。在一些实施方案中，施用治疗有效量的非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物，持续至少两周。
本文描述的非工程化γδT细胞群、工程化γδT细胞群和/或其混合物可以在疾病或病状发生之前、期间或之后施用，并且施用含有所述γδT细胞群的药物组合物的时间安排可以变化。例如，所述γδT细胞群可以用作预防剂，并且可以连续地施用至具有病状或疾病倾向的受试者，以便减少疾病或病状发生的可能性。初始施用可以经由任何实用途径进行，诸如使用本文描述的任何制剂通过本文描述的任何途径进行。在一些实例中，本公开的γδT细胞群的施用是静脉内施用。一次或多次剂量的所述γδT细胞群可以在实体癌症发作之后可行地尽快施用，并且持续治疗免疫疾病所需的时间长度，例如像约24小时至约48小时、约48小时至约1周、约1周至约2周、约2周至约1个月、约1个月至约3个月。在一些实施方案中，可以在所述癌症发作后数年以及在其他治疗之前或之后施用一次或多次剂量的所述γδT细胞群。
在一些实施方案中，与一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法同时或依序地施用所述γδT细胞群。如本文所用，“一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法”是指改变受试者的生理状态，使得受试者中至少一种共用γ链细胞因子水平升高的方法或方法的组合。在一些实施方案中，所述方法升高选自由IL-2、IL-7和IL-15组成的组的一种或多种共用γ链细胞因子的水平，优选地其中所述方法升高受试者中IL-15的水平。在一些实施方案中，所述方法包括淋巴细胞耗竭。在一些实施方案中，所述方法包括向所述受试者施用一种或多种共用γ链细胞因子。在一些情况下，施用IL-2、IL-7和/或IL-15，优选地IL-15。在一些实施方案中，所述方法包括从施用的例如γδT细胞中分泌共用γ链细胞因子。在一些情况下，分泌IL-2、IL-7和/或IL-15，优选地IL-15。
在一些实施方案中，施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括在引入所述γδT细胞之前的淋巴细胞耗竭。在一些实施方案中，施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括与引入所述γδT细胞同时或依序施用有效增加引入的γδT细胞的增殖、细胞毒性活性、持久性或其组合的量的共用γ链细胞因子，优选地其中所述方法包括施用IL-2或其一种或多种模拟物，更优选地其中所述方法包括施用IL-15或其一种或多种模拟物。施用的共用γ链细胞因子的量可以是在引入γδT细胞之前和/或之后有效增加引入的γδT细胞的增殖、细胞毒性活性、持久性或其组合的量。IL-15的示例性量包括但不限于每24小时0.01-10μg/kg/剂量之间。IL-2的示例性量包括但不限于每8-48小时约3×106至约22×106个单位。例如，RCC中IL2的给药方案为600,000个国际单位/kg(0.037mg/kg)IV q8hr在15分钟内输注，持续最多14个剂量。
在一些实施方案中，施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括在施用γδT细胞之前以及与引入γδT细胞同时或依序施用有效增加引入的γδT细胞的增殖、细胞毒活性、持久性或其组合的量的共用γ链细胞因子的淋巴细胞耗竭。
实施例
实施例1
在24孔板(Costar)中，在IL-2(100U/mL)存在的情况下，将1×106/mL的人PBMC在修饰的培养基中在抗Vδ1抗体D1-08或D1-35预涂布下活化5天。在第5天，在纤维连接蛋白(retronectin)存在的情况下，用编码抗TyrD嵌合抗原受体(SEQ ID NO:8)的γ-逆转录病毒构建体转导细胞培养物。在第6天，将细胞返回到修饰的培养基中，并根据需要用进料和IL-2置换进一步扩增。在第17、18或19天，收获细胞，并使用
Figure BDA0003082159400000491
试剂盒(Miltenyi Biotec)耗竭剩余的αβT细胞。通过FACS评估γδ细胞群的纯度和转导效率。平行地，未转导的细胞培养物以相同的方式扩增，而无需添加逆转录病毒上清液。如图2所示，未转导的扩增的Vδ1细胞引发针对已知表达酪氨酸酶并呈递Tyr369-377肽的526和WM266.1-Luc黑色素瘤细胞系的一定程度的细胞毒性。通过引入抗TyrD CAR来增强这种细胞毒性。通过在以指示的E/T比率共孵育18小时后添加发光底物D-荧光素(Perkin Elmer)，在96孔板中通过总发光测量来确定细胞毒性。
实施例2
将WM266.4-Luc细胞(4x106个/动物)皮下植入到NSG小鼠(Jackson Labs)中。当肿瘤达到100-200mm3大小时，将动物用6x106个抗TyrD CAR+Vδ1细胞治疗。在整个研究中对动物伴随给药IL-2(60,000U/剂量)每周3次。结果在图3中说明。如图3所示，施用抗TyrD CAR+Vδ1细胞的动物表现出对肿瘤负荷的强健控制。
实施例3
如上所述将Tyr CAR构建体引入到Vδ1T细胞中并且针对WM266.4-Luc细胞在细胞毒性测定中对细胞进行扩增和测试。将对照，即非TyrD靶向CAR构建体用作对照。结果在图5中说明并且显示出抗TyrD CAR构建体提供的增加的细胞毒性。
实施例4
在IL-2(100U/mL)存在的情况下，将生长培养基中的1×106/mL人PBMC在用抗Vδ1抗体D1-08或D1-35预涂布的24孔板(Costar)中活化5天。在第5天，在纤维连接蛋白存在的情况下，用编码抗GPC3嵌合抗原受体(SEQ ID NO:20(GC33 CAR)或SEQ ID NO:22(GC33 CAR+sIL15和GC33 CAR+CO sIL15))的γ-逆转录病毒构建体转导细胞培养物。GC33 CAR由核酸序列SEQ ID NO:21编码；GC33 CAR+sIL15由核酸序列SEQ ID NO:23编码；GC33 CAR+COsIL15包括密码子优化的sIL15编码区并且由核酸序列SEQ ID NO:24编码。在第6天，将细胞返回到生长培养基中，并根据需要用进料和IL-2置换进一步扩增。在第17、18或19天，收获细胞，并使用
Figure BDA0003082159400000501
试剂盒(Miltenyi Biotec)耗竭剩余的αβT细胞。通过FACS评估γδ细胞群的纯度和转导效率(图6)。简而言之，通过将细胞与1μg/mL的可溶性重组生物素化GPC3(R&D Systems)一起孵育，对CAR-T细胞进行染色。使用链霉亲和素-PE以制造商建议的1:500稀释度进行结合的检测。
平行地，未转导的细胞培养物以相同的方式扩增，而无需添加逆转录病毒上清液。将扩增的细胞在对GPC3阳性(HepG2、Hep3B、PLC/PRF/5)的体外细胞毒性测定中进行测试。如图7所示，未转导的扩增的Vδ1细胞引发针对已知表达GPC3的肝癌细胞系的一定程度的细胞毒性。通过引入GPC3 CAR且存在或不存在经工程化以串联表达的sIL15细胞因子来增强这种细胞毒性。通过在以指示的E/T比率共孵育18小时后添加发光底物D-荧光素(PerkinElmer)，在96孔板中通过总发光测量来确定细胞毒性。
***
前述内容仅说明本发明的原理。应理解，本领域技术人员将能够设计各种布置，这些布置尽管未在本文中明确描述或示出，但是它们体现本发明的原理并且包括在其精神和范围内。此外，本文所叙述的所有实施例和条件语言主要意图帮助读者理解本发明的原理和由发明人提供的促进技术的构想，并且应解释为不对此类具体叙述的实施例和条件构成限制。此外，本文中叙述本发明的原理和方面以及其具体实施例的所有陈述都意图涵盖其结构等效物和功能等效物两者。另外，意图是此类等效物包括目前已知的等效物和未来开发的等效物，即不管结构如何，开发的执行相同功能的任何元件。因此，本发明的范围不意图限于本文所示和描述的示例性方面。相反，本发明的范围和精神由所附权利要求体现。

Claims (50)

1.一种编码嵌合抗原受体(CAR)的分离的核酸序列，其中所述CAR包含
a.与包含肿瘤相关抗原(TAA)肽和MHC蛋白的蛋白-肽复合物特异性结合的结合结构域，其中所述复合物在实体肿瘤细胞表面上表达，任选地其中所述结合结构域以HLA限制的方式结合所述复合物；
b.CD8α铰链结构域；
c.CD8α跨膜结构域；
d.共刺激信号传导区，所述共刺激信号传导区选自4-1BB共刺激信号传导区和CD27共刺激信号传导区；以及
e.CD3ζ信号传导结构域。
2.如权利要求1所述的分离的核酸序列，其中所述(a)-(e)呈5'至3'的顺序。
3.如权利要求1或2所述的分离的核酸序列，其中所述TAA包含TyrD的连续区。
4.如权利要求3所述的分离的核酸序列，其中所述TyrD的连续区包含至少或至少约4个且不超过或不超过约12个TyrD连续氨基酸，优选地或优选地约7、8或9个TyrD连续氨基酸。
5.如权利要求4所述的分离的核酸序列，其中所述TyrD的连续区是TyrD369-377。
6.如权利要求1至5中任一项所述的分离的核酸序列，其中所述特异性结合所述TAA肽MHC复合物的结合结构域特异性结合HLA-A2/TyrD369-377。
7.如权利要求1至6中任一项所述的分离的核酸序列，其中所述结合结构域与被以下抗体结合的表位特异性结合或与以下抗体竞争，所述抗体包含：
a.CDRH1，其包含TSGMGVS(SEQ ID NO:33)；
b.CDRH2，其包含HIYWDDDKRYNPSLKS(SEQ ID NO:34)；
c.CDRH3，其包含KDYGSSFYAMHY(SEQ ID NO:35)；
d.CDRL1，其包含KASQDIHNYIA(SEQ ID NO:36)；
e.CDRL1，其包含YTSTLQP(SEQ ID NO:37)；以及
f.CDRL2，其包含LQYDNLWT(SEQ ID NO:38)。
8.一种编码嵌合抗原受体(CAR)的分离的核酸序列，其中所述CAR包含
a.与在实体肿瘤细胞表面上表达的肿瘤相关抗原(TAA)特异性结合的结合结构域，任选地其中所述抗原是蛋白-肽复合物，其中所述蛋白是MHC蛋白，其中所述结合结构域以HLA限制的方式结合所述蛋白-肽复合物；
b.CD8α铰链结构域；
c.CD8α跨膜结构域；
d.共刺激信号传导区，所述共刺激信号传导区选自4-1BB共刺激信号传导区和CD27共刺激信号传导区；以及
e.CD3ζ信号传导结构域。
9.如权利要求8所述的分离的核酸序列，其中所述结合结构域特异性结合在实体肿瘤细胞表面上表达的GPC3内的表位。
10.如权利要求9所述的分离的核酸序列，其中所述结合结构域包含以下互补决定区(CDR)，与包含以下CDR的抗体结合相同的GPC3表位，和/或与包含以下CDR的抗体竞争结合GPC3表位：
a.CDRH1，其包含序列DYEMH(SEQ ID NO:39)(或GYTFTDYEMH(SEQ ID NO:40))；
b.CDRH2，其包含序列ALDPKTGDTAYSQKFKG(SEQ ID NO:41)；
c.CDRH3，其包含序列FYSYTY(SEQ ID NO:42)；
d.CDRL1，其包含序列RSSQSLVHSNRNTYLH(SEQ ID NO:43)；
e.CDRL2，其包含序列KVSNRFS(SEQ ID NO:44)；和/或
f.CDRL3，其包含序列SQNTHVPPT(SEQ ID NO:45)。
11.如权利要求1至10中任一项所述的分离的核酸序列，其中所述CAR包含：
a.CD8α铰链结构域，所述CD8α铰链结构域包含SEQ ID NO:1(PTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIY)；或SEQ ID NO:2(TTTPAPRPPTPAPTIASQPLSLRPEACRPAAGGAVHTRGLDFACDIY)；
b.CD8α跨膜结构域，所述CD8α跨膜结构域包含SEQ ID NO:3(IWAPLAGTCGVLLLSLVITLYC)；和/或
c.CD3ζ信号传导结构域，所述CD3ζ信号传导结构域包含：
(i)SEQ ID NO:4(RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPQRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)；或
(ii)SEQ ID NO:5(RVKFSRSADAPAYQQGQNQLYNELNLGRREEYDVLDKRRGRDPEMGGKPRRKNPQEGLYNELQKDKMAEAYSEIGMKGERRRGKGHDGLYQGLSTATKDTYDALHMQALPPR)。
12.如权利要求11所述的分离的核酸序列，其中所述CAR包含：
a.含有SEQ ID NO:6(KRGRKKLLYIFKQPFMRPVQTTQEEDGCSCRFPEEEEGGCEL)的4-1BB共刺激信号传导区；或
b.含有SEQ ID NO:7(QRRKYRSNKGESPVEPAEPCHYSCPREEEGSTIPIQEDYRKPEPACSP)的CD27共刺激信号传导区，或者
其中所述分离的核酸编码包含SEQ ID NO:6的4-1BB共刺激信号传导区以及包含SEQID NO:7的CD27共刺激信号传导区。
13.如权利要求1至12中任一项所述的分离的核酸序列，其中所述核酸进一步编码：
a.分泌的细胞因子；或
b.分泌的共用γ链白介素；或
c.分泌的IL-15，优选地其中所述IL-15包含序列SEQ ID NO:14，更优选地其中所述IL-15包含可操作地连接到分泌信号序列SEQ ID NO:12的序列SEQ ID NO:14，或者其中所述IL-15包含可操作地连接到分泌信号序列SEQ ID NO:26的序列SEQ ID NO:14；或
d.分泌的共用γ链白介素，优选地IL-15，以及白介素或白介素分泌信号的氨基末端的多顺反子接头区，优选地其中所述多顺反子接头区包含SEQ ID NO:15-17、25或27-30中任一者的序列或其组合，或编码内部核糖体进入位点，例如SEQ ID NO:31或32。
14.如权利要求13所述的分离的核酸序列，其中：
a.分泌信号包含序列SEQ ID NO:12或SEQ ID NO:26，优选地SEQ ID NO:12；和/或
b.sIL15结构域包含序列SEQ ID NO:14；和/或
c.P2A切割序列包含序列SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:25；和/或
d.弗林蛋白酶切割序列包含序列SEQ ID NO:16；和/或
e.CAR以氨基至羧基顺序包含序列SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:12和SEQ ID NO:14。
15.如权利要求1至14中任一项所述的分离的核酸序列，其中：
a.所述结合结构域与HLA-A2/TyrD369-377特异性结合并且所述核酸编码SEQ ID NO:8或SEQ ID NO:18；
b.所述结合结构域与GPC3特异性结合并且所述核酸编码SEQ ID NO:20或22。
16.如权利要求15所述的分离的核酸序列，其中所述核酸包含序列SEQ ID NO:9、SEQID NO:19、SEQ ID NO:21、23或24。
17.一种多肽，其包含嵌合抗原受体，所述嵌合抗原受体包含由前述权利要求1至16中任一项所述的分离的核酸编码的氨基酸序列。
18.一种γδT细胞，其包含如权利要求17所述的多肽或包含编码如权利要求1至16中任一项所述的CAR构建体的核酸，其中所述γδT细胞在所述γδT细胞的表面上功能性表达所述多肽或所述核酸编码的CAR的结合结构域。
19.如权利要求18所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞针对实体肿瘤细胞表现出体外和/或体内细胞杀伤活性，所述实体肿瘤细胞表现出所述肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达。
20.如权利要求19所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞的所述实体肿瘤细胞杀伤活性大于不包含CAR构建体的对照γδT细胞中的体外和/或体内实体肿瘤细胞杀伤活性的先天性水平。
21.如权利要求20所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞表现出针对HLA I+类实体肿瘤细胞的增加的实体肿瘤细胞杀伤活性。
22.如权利要求19至21中任一项所述的γδT细胞，其中所述实体肿瘤细胞杀伤活性或增加的实体肿瘤细胞杀伤活性在与所述实体肿瘤细胞第一次接触后持续、持续约、至少或至少约6天至180天。
23.如权利要求18至22中任一项所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞响应于与表现出所述肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达的实体肿瘤细胞的接触而增殖。
24.如权利要求18至22中任一项所述的γδT细胞，其中与在所述γδT细胞的表面上没有功能性表达所述核酸编码的CAR的对照γδT细胞相比，所述γδT细胞响应于与表现出所述肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达的实体肿瘤细胞接触而表现出增加的增殖。
25.如权利要求18至24中任一项所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞在宿主生物体中增殖，所述宿主生物体包含表现出所述肿瘤相关抗原(TAA)的细胞表面表达的所述实体肿瘤细胞。
26.如权利要求18至25中任一项所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞增殖或增加的γδT细胞增殖在与所述实体肿瘤细胞第一次接触后持续、持续约、至少或至少约6天至180天。
27.如权利要求18至26中任一项所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞在与所述实体肿瘤细胞接触后表达促炎细胞因子，所述促炎细胞因子包含肿瘤坏死因子α或干扰素γ。
28.如权利要求18至27中任一项所述的γδT细胞，其中与施用至同种异体宿主的αβT细胞表现出的移植物抗宿主反应相比，当引入到同种异体宿主中时，所述γδT细胞表现出减少、实质上减少、基本上没有或没有移植物抗宿主反应。
29.如权利要求18至28中任一项所述的γδT细胞，其中所述γδT细胞是δ1、δ2、δ3或δ4γδT细胞，优选地δ2-γδT细胞，更优选地δ1γδT细胞。
30.如权利要求18至29中任一项所述的多个γδT细胞。
31.如权利要求30所述的多个γδT细胞，其中所述多个包含至少约108个γδT细胞，优选地约108个γδT细胞至约1011个γδT细胞。
32.如权利要求30或31所述的多个γδT细胞，其中所述多个包含至少60％、80％或约60％或80％至约90％或95％的δ1、δ2、δ3或δ4γδT细胞，优选地δ1或δ2γδT细胞，更优选地δ2-γδT细胞，最优选地δ1γδT细胞的组合物。
33.一种制备如权利要求18至29中任一项所述的γδT细胞或如权利要求30至32中任一项所述的多个γδT细胞的方法，其中所述方法包括用包含如权利要求1至16中任一项所述的分离的核酸序列的构建体来转染γδT细胞。
34.如权利要求33所述的方法，其中所述方法包括逆转录病毒转导，优选地γ逆转录病毒转导。
35.如权利要求33或34所述的方法，其中所述方法包括离体扩增所述γδT细胞，其中所述离体扩增在所述分离的核酸序列转染前和/或转染后进行。
36.一种药物组合物，其包含药学上可接受的赋形剂以及如权利要求18至29中任一项所述的γδT细胞或如权利要求30至32中任一项所述的多个γδT细胞。
37.一种杀伤实体肿瘤细胞的方法，所述方法包括使所述实体肿瘤细胞与肿瘤细胞杀伤有效量的如权利要求18至29中任一项所述的γδT细胞；如权利要求30至32中任一项所述的多个γδT细胞；或如权利要求36所述的药物组合物接触。
38.如权利要求37所述的方法，其中所述方法包括将治疗有效量的所述γδT细胞或所述药物组合物引入到包含所述实体肿瘤细胞的宿主生物体中。
39.如权利要求38所述的方法，其中所述方法包括将治疗有效量的所述γδT细胞或所述药物组合物引入到包含所述实体肿瘤细胞的宿主生物体中，并且同时或依序施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法。
40.如权利要求39所述的方法，其中所述施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括与引入所述γδT细胞同时或依序施用有效增加所述引入的γδT细胞的增殖、细胞毒性活性、持久性或其组合的量的共用γ链细胞因子，优选地其中所述方法包括施用IL-2，更优选地其中所述方法包括施用IL-15。
41.如权利要求40所述的方法，其中所述一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括在引入所述γδT细胞之前和/或之后施用有效增加所述引入的γδT细胞的增殖、细胞毒性活性、持久性或其组合的量的共用γ链细胞因子。
42.如权利要求39至41中任一项所述的方法，其中所述一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括在引入所述γδT细胞之前的淋巴细胞耗竭。
43.如权利要求39至41中任一项所述的方法，其中所述一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法包括从所述引入的γδT细胞中分泌一种或多种共用γ链细胞因子。
44.如权利要求38至43中任一项所述的方法，其中与对照生物体相比，所述方法减少所述宿主生物体中的体内肿瘤负荷，和/或增加所述宿主生物体的平均存活时间，其中所述对照生物体没有用所述γδT细胞或所述药物组合物治疗。
45.如权利要求37至44中任一项所述的方法，其中所述方法是治疗有需要的受试者中的癌症的方法。
46.肿瘤细胞杀伤有效量的如权利要求18至29中任一项所述的γδT细胞；如权利要求30至32中任一项所述的多个γδT细胞；或如权利要求36所述的药物组合物在制造用于治疗有需要的受试者中的实体肿瘤细胞癌症的药物中的用途。
47.一种治疗有需要的受试者中的癌症的方法，所述方法包括施用治疗有效量的γδT细胞，其中所述癌症包括表现出TyrD或GPC3的细胞表面表达的实体肿瘤细胞。
48.如权利要求47所述的方法，其中所述方法包括与γδT细胞的施用同时或依序地施用一种或多种升高共用γ链细胞因子的方法。
49.如权利要求47或48所述的方法，其中所述方法包括进行所述γδT细胞的多次施用，其中所述多次施用之间的时间间隔为至少约一周，优选地至少约2、3、4、5、6、7、8或12周，和/或每6或12个月不超过一次。
50.一种用于如权利要求47至49中任一项所述的方法的药物组合物。
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