CN113061181A

CN113061181A - Gii.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备及鉴定方法

Info

Publication number: CN113061181A
Application number: CN202110244770.0A
Authority: CN
Inventors: 戴迎春; 侯玉珍; 王璐; 张绪富
Original assignee: Southern Medical University
Current assignee: Southern Medical University
Priority date: 2021-03-05
Filing date: 2021-03-05
Publication date: 2021-07-02

Abstract

本发明提供的一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备及鉴定方法，包括：S1：利用GII.17NoV目标对象恢复期外周血和合成人抗体基因的引物制备得到scFv基因，构建重组质粒pCANTAB‑5E‑scFv电转化后培养获得初级全人源噬菌体单链抗体库。S2：采用甘氨酸‑盐酸洗脱法富集淘筛并以GII.17NoV P颗粒为固相抗原，制备得特异性GII.17NoV噬菌体单链抗体库，离心制备噬菌体上清，Phage‑ELISA鉴定噬菌体上清的特异性。S3：设计原核表达引物，以步骤S2的阳性噬菌体上清的菌液为模板，扩增scFv片段，构建pGEX‑scFv重组质粒，利用大肠杆菌表达系统表达pGEX‑scFv重组质粒，再用GST‑resin亲和层析柱纯化，加入凝血酶去除融合标签蛋白GST‑tag后获得scFv纯蛋白。该方法制备出的GII.17NoV全人源单链抗体有效库容大，且重组率和多样性好。

Description

GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备及鉴定方法

技术领域

本发明涉及生物医学领域，特别是涉及一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备及鉴定方法。

背景技术

诺如病毒(norovirus，NoV)是引起全球各年龄段人群急性胃肠炎(acutegastroenteritis，AGE)暴发流行及散发的主要病原体，由NoV引起的AGE占全球AGE发病总数的近五分之一。由于NoV的低感染剂量及传播途径的多样化，导致NoV能够在医院、学校、餐厅等半封闭的环境中迅速传播。在全球范围内，NoV感染每年可致约6.99亿AGE病例和22万人死亡。在中国，NoV一年可引起80万人感染AGE，年均发病率为6.0/100人年，特别是小于5岁的儿童，年均发病率约为15.6/100人年。由此可见，NoV的暴发流行及散发是我国及世界范围内的一个重要公共卫生问题。

NoV属杯状病毒科，是单股正链小RNA病毒，直径为27～38nm，基因组全长为7.4～7.7kb。基于VP1氨基酸序列的多样性，可将NoV分为GI～GX共10个基因组，49个基因型。10个基因组中GI、GII和GIV基因组可感染人类。GII.4NoV是自1996年以来暴发流行及散发最主要的基因型，占所有NoV相关胃肠炎暴发的70％-80％。然而2014年以来，中国、日本等亚洲国家均报道了由GII.P7-GII.17新变异株引起的NoV相关胃肠炎暴发。在2014-2015年间，这一变异株在NoV暴发中占76.9％，并取代GII.4/2012Sydney株，成为我国2014～2015和2015～2016NoV流行季的主要流行株。

病毒受体是公认的引发病毒感染宿主细胞的起始步骤和关键因素之一，病原体往往为了适应不同的受体表型选择性进化。研究发现，人类组织血型抗原(Histo-bloodinggroup antigen，HBGA)是NoV的病毒受体或病毒附着因子，是研究NoV易感性和致病性的重要因素。

目前，NoV缺乏成熟的细胞培养系统及小动物感染模型，其疫苗和特异性抗病毒药物研究进展仍较缓慢。在过去30年中GII.4NoV一直是全球范围内的优势流行株，因此，现阶段NoV疫苗和特异性抗体药物的开发及研制主要集中在GII.4，然而GII.4抗体免疫对与GII.17感染不存在交叉保护作用。GII.17感染造成急性胃肠炎的问题仍然没有被解决，继续危害人类健康。

因此，针对现有技术不足，提供一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体制备及鉴定方法料以克服现有技术不足甚为必要。

发明内容

本发明的目的在于避免现有技术的不足之处而提供一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，制备的GII.17 NoV全人源单链抗体的有效库容大，且重组率和多样性好，为NoV的临床防治及相关疫苗的研制奠定了基础。

本发明的目的通过以下技术措施实现：

提供一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，包括下列步骤：

S1：构建初级全人源噬菌体单链抗体库。

具体是，采集GII.17 NoV目标对象恢复期外周血，利用密度梯度离心法分离出PBMC，利用Trozil法提取PBMC的总RNA，逆转录合成cDNA。

设计合成人抗体基因的引物，并以cDNA为模板，扩增抗体重链可变区基因V_H和轻链可变区基因V_L，重叠延伸PCR拼接V_H和V_L形成scFv基因。

线性化噬菌粒载体pCANTAB-5E，构建重组质粒pCANTAB-5E-scFv，将重组质粒pCANTAB-5E-scFv电转化至E.coli TG1感受态细胞后加入辅助噬菌体M13K07培养，得到全人源噬菌体单链抗体库，并挑取抗体库中单克隆做菌液PCR且对阳性克隆进行测序分析。

S2：对初级全人源噬菌体单链抗体库进行淘筛及特异性鉴定。

具体是，以GII.17 NoV P颗粒为固相抗原，对全人源噬菌体单链抗体库进行富集性筛选获得与GII.17 NoV结合的噬菌体并扩增，得到特异性GII.17 NoV噬菌体单链抗体库。

将特异性GII.17 NoV噬菌体单链抗体库铺到氨苄抗性琼脂板上挑取单克隆，补加辅助噬菌体M13K07拯救，离心制备噬菌体上清，用Phage-ELISA鉴定噬菌体上清的特异性，并选取阳性克隆进行测序分析。

S3：制备GII.17 NoV全人源单链抗体。

具体是，设计原核表达引物，以步骤S2所得阳性噬菌体上清的菌液为模板，扩增scFv片段，使用限制性内切酶BamH I和Not I双酶切载体pGEX-4T-1，并将scFv片段重组克隆至载体pGEX-4T-1上，将产物转化至E.coli T0P10感受态细胞中，挑取单克隆做菌液PCR，鉴定重组质粒是否插入目的片段，并对阳性克隆进行测序分析后提取获得pGEX-scFv重组质粒。

利用大肠杆菌表达系统表达pGEX-scFv重组质粒，然后用GST-resin亲和层析柱纯化，加入凝血酶去除融合蛋白GST-scFv的蛋白标签GST后获得scFv，即GII.17 NoV全人源中和性单链抗体。

优选的，步骤S1中GII.17型NoV目标对象恢复期外周血来自由GII.17 NoV引起的急性胃肠炎暴发目标对象。

优选的，步骤S1中人抗体基因的引物包括6对VH家族基因、用于连接抗体重轻链的氨基酸序列为GGGGSGGGGSGGGGS的两条互补连接肽、12对VL家族基因以及Sfi I和Not I酶切位点的scFv上下游引物。

优选的，步骤S1中构建重组质粒pCANTAB 5E-scFv的具体过程为，分别使用限制性内切酶Sfi I和Not I对scFv基因和噬菌粒载体pCANTAB 5E双酶切，然后用T4连接酶连接构建形成重组质粒pCANTAB 5E-scFv。

辅助噬菌体M13K07与E.coli TG1感受态细胞的MOI＝100：1，辅助噬菌体M13K07的滴度为10～12pfu/mL。

优选的，步骤S2中富集性筛选具体为将GII.17 NoV P颗粒包被免疫管，吸附噬菌体单链抗体库，然后采用甘氨酸-盐酸洗脱法进行富集性淘选，重复进行4轮吸附-洗涤-洗脱-感染-拯救的过程，获得与GII.17 NoV P颗粒结合的噬菌体，然后将与GII.17 NoV P颗粒结合的噬菌体洗脱下来用于扩增。

优选的，步骤S2中用Phage-ELISA鉴定噬菌体上清的特异性的具体过程为将GII.17 NoV P颗粒、作为对照抗原的轮状病毒VP8*和作为空白对照PBS包被于96孔酶标板，以噬菌体上清为一抗，同时以无噬菌体上清的培养基为阴性对照，HRP-鼠抗M13作为二抗，用Phage-ELISA鉴定特异性，若包被P颗粒的OD₄₅₀值大于包被VP8*对应孔2倍以上，则判定为阳性噬菌体上清。

优选的，步骤S3中所述原核表达引物根据步骤S2中阳性克隆测序分析结果设计，并在上下游引物中分别引入载体pGEX-4T-1的两末端同源序列、BamH I酶切位点和Not I酶切位点。

优选的，步骤S4中利用大肠杆菌表达系统表达pGEX-scFv重组质粒的具体过程为将插入目的片段的重组质粒转化至E.coli BL21感受态细胞中，挑取单克隆放置于37℃下以220rpm的转速振荡培养12h～16h，然后按体积比为1:100的比例转接至新鲜LB液体培养基中，在37℃下以220rpm振荡培养至细菌对数期，加入IPTG于22℃以200rpm转速振荡12h诱导表达。

将诱导表达获得的菌液于4℃以5000rpm的转速离心12min，弃上清，收集菌体，然后用PBS重悬菌体，并将菌液于冰浴中进行超声破碎，然后将菌液放置于4℃下以12000rpm的转度离心75min。

本发明同时还提供一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的鉴定方法，用于鉴定GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法制备的scFv。

优选的，所述鉴定步骤包括：

特异性鉴定，具体为将scFv包被于96孔酶标板，同时以GST蛋白为阴性对照，PBS为空白对照，封闭后加入GII.17 NoV P颗粒，以鼠抗GII.17血清为一抗，HRP-羊抗鼠IgG为二抗，ELISA鉴定scFv的特异性，若实验孔的OD₄₅₀大于阴性组的2倍以上，则判定scFv具有特异性。

中和性鉴定，具体为包被分泌型B型唾液于96孔酶标板，封闭后加入GII.17 NoV P颗粒与scFv的混合液，同时阳性对照用未加scFv的P颗粒，阴性对照用确定没有阻断能力的血浆和P颗粒的混合液，空白对照用1％脱脂奶粉-PBS代替scFv和P颗粒的混合液，并以小鼠抗GII.17血清为一抗，HRP-羊抗鼠IgG为二抗，体外HBGA受体阻断实验鉴定scFv的中和性，测定各孔的OD₄₅₀值，若阻断率>50％，则判定scFv具有阻断能力。

本发明的一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，包括以下步骤：S1：构建初级全人源噬菌体单链抗体库，利用GII.17 NoV目标对象恢复期外周血得到PBMC，逆转得到cDNA，用人抗体基因的引物从中扩增出抗体重轻链，再将两者拼接形成scFv基因，构建出重组质粒pCANTAB-5E-scFv电转化后培养获得全人源噬菌体单链抗体库。S2：对全人源噬菌体单链抗体库进行淘筛及特异性鉴定，以GII.17 NoV P颗粒为固相抗原，用甘氨酸-盐酸洗脱法对抗体库进行富集淘筛，制备得到特异性GII.17 NoV噬菌体单链抗体库，离心制备噬菌体上清，用Phage-ELISA鉴定噬菌体上清的特异性。S3：制备GII.17 NoV全人源单链抗体，设计原核表达引物，以步骤S2所得阳性噬菌体上清的菌液为模板，扩增scFv片段，构建pGEX-scFv重组质粒，利用大肠杆菌表达系统表达pGEX-scFv重组质粒，然后用GST-resin亲和层析柱纯化，加入凝血酶去除融合蛋白GST-scFv的蛋白标签GST后获得scFv。该方法制备出的抗体的有效库容大且重组率和多样性好，对NoV抗原表位的研究及相关抗体药物研发具有重要意义。

附图说明

利用附图对本发明作进一步的说明，但附图中的内容不构成对本发明的任何限制。

图1是本发明实施例2中V_H和V_L基因PCR产物琼脂糖凝胶电泳图。

图2是本发明实施例2中scFv片段PCR产物琼脂糖凝胶电泳图。

图3是本发明实施例2中噬菌体抗体库菌落PCR产物琼脂糖凝胶电泳图。

图4是本发明实施例2中噬菌体阳性克隆的Phage-ELISA鉴定柱状图。

图5是本发明实施例2中scFv高保真酶扩增产物琼脂糖凝胶电泳图，其中M指代DL5000，1～9指代scFv的扩增产物。

图6是本发明实施例2中全人源单链抗体scFv的SDS-PAGE图，其中M指代蛋白Marker，1～9分别指代4A01、6D09、5A03、5F01、5F08、6A09、1A06、1H04和3F08。

图7是本发明实施例4中scFv特异性的ELISA鉴定柱状图。

图8是本发明实施例4中scFv阻断GII.17 PP-HBGA结合能力的ELISA鉴定柱状图。

具体实施方式

结合以下实施例对本发明作进一步说明。

实施例1。

一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，包括以下步骤：

S1：构建初级全人源噬菌体单链抗体库。

具体是，采集GII.17 NoV目标对象恢复期外周血，利用密度梯度离心法分离出PBMC，利用Trozil法提取PBMC的总RNA，逆转录合成cDNA。GII.17型NoV目标对象恢复期外周血来自由GII.17 NoV引起的急性胃肠炎暴发的目标对象。

设计合成人抗体基因的引物，并以cDNA为模板，扩增抗体重链可变区基因V_H和轻链可变区基因V_L，重叠延伸PCR拼接V_H和V_L形成scFv基因。人抗体基因的引物包括6对VH家族基因、用于连接抗体重轻链的氨基酸序列为GGGGSGGGGSGGGGS的两条互补连接肽、12对VL家族基因以及Sfi I和Not I酶切位点的scFv上下游引物。

使用限制性内切酶Sfi I和Not I对scFv基因和噬菌粒载体pCANTAB-5E双酶切，然后用T4连接酶连接构建形成重组质粒pCANTAB-5E-scFv，将重组质粒pCANTAB-5E-scFv电转化至E.coli TG1感受态细胞后加入辅助噬菌体M13K07培养，得到全人源噬菌体单链抗体库并挑取抗体库中单克隆做菌液PCR且对阳性克隆进行测序分析。其中，辅助噬菌体M13K07与E.coli TG1感受态细胞的MOI＝100：1，辅助噬菌体M13K07的滴度约为10¹²CFU/mL。全人源噬菌体单链抗体具有亲和力强、特异性高的特点，且不存在种属异源性。本实施例中将含有初级全人源噬菌体单链抗体库的菌液稀释涂布2×YT-A平板，挑选单克隆做菌液PCR，以分析scFv基因是否成功插入到pCANTAB-5E上，鉴定抗体库的重组率。将阳性克隆送测序，以分析抗体库的多样性。

具体是，以GII.17 NoV P颗粒为固相抗原，对全人源噬菌体单链抗体库进行富集性筛选获得与GII.17 NoV P颗粒结合的噬菌体并扩增，得到特异性GII.17 NoV噬菌体单链抗体库。富集性筛选具体为将GII.17 NoV P颗粒包被免疫管，吸附噬菌体单链抗体库，然后采用甘氨酸-盐酸洗脱法进行富集性淘选，重复进行4轮吸附-洗涤-洗脱-感染-拯救的过程，使得与GII.17 NoV P颗粒结合的噬菌体有效富集，具有高效、快捷、经济等优势，所得到的抗体库也易于进行高通量筛选。

将第4轮洗脱后的产出铺到氨苄抗性琼脂板上挑取单克隆，补加辅助噬菌体M13K07拯救，离心制备噬菌体上清，用Phage-ELISA鉴定噬菌体上清的特异性，并选取阳性克隆进行测序分析。用Phage-ELISA鉴定噬菌体上清的特异性的具体过程为将GII.17 NoVP颗粒、作为对照抗原的轮状病毒VP8*和作为空白对照PBS包被于96孔酶标板，以噬菌体上清为一抗，同时以无噬菌体上清的培养基为阴性对照，HRP-鼠抗M13作为二抗，Phage-ELISA鉴定特异性，若包被P颗粒的OD₄₅₀值大于包被VP8*对应孔2倍以上，则判定为阳性噬菌体上清。

S3：制备GII.17 NoV全人源单链抗体。

具体是，设计原核表达引物，以步骤S2所得阳性噬菌体上清的菌液为模板，扩增scFv片段，使用限制性内切酶BamH I和Not I双酶切载体pGEX-4T-1，并将scFv片段重组克隆至载体pGEX-4T-1上，将产物转化至E.coli T0P10感受态细胞中，挑取单克隆做菌液PCR，鉴定重组质粒是否插入目的片段，并对阳性克隆进行测序分析后提取获得pGEX-scFv重组质粒。原核表达引物根据步骤S2中阳性克隆测序分析结果设计，并在上下游引物中分别引入载体pGEX-4T-1的两末端同源序列、BamH I酶切位点和Not I酶切位点。

利用大肠杆菌表达系统表达pGEX-scFv重组质粒，然后用GST-resin亲和层析柱纯化，加入凝血酶去除融合蛋白GST-scFv的蛋白标签GST后获得scFv，即GII.17 NoV全人源中和性单链抗体。利用大肠杆菌表达系统表达pGEX-scFv重组质粒的具体过程为将插入目的片段的重组质粒转化至E.coli BL21感受态细胞中，挑取单克隆放置于37℃下以220rpm的转速振荡培养12h～16h，然后按体积比为1:100的比例转接至新鲜LB液体培养基中，在37℃下以220rpm振荡培养至细菌对数期，加入IPTG于22℃以200rpm转速振荡12h诱导表达。

该GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，能够制备得到GII.17NoV全人源单链抗体，为诺如病毒感染病的防治和疫苗研究奠定了基础，制备出的抗体亲和力强，特异性高，且制备过程具有快捷、经济和高效的优势。

实施例2。

一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其它特征与实施例1相同，不同之处在于，包括以下步骤：

S1：构建初级全人源噬菌体单链抗体库。

(1)采集GII.17 NoV患者恢复期外周血13份，用密度梯度离心法分离PBMC，用Trizol法提前PBMC的总RNA。具体过程如下：

分离PBMC：用Ficoll-Paque^TMPLUS Media淋巴细胞分离液利用密度梯度离心法从NoV患者恢复期外周血中分离PBMC和血浆。将采集的5mL外周血缓慢加入5mL淋巴细胞分离液中，室温400g离心30min。吸取第一层血浆于-80℃保存，取第二层乳白色单个核细胞于新的离心管中，用10mL PBS重悬洗涤，1500rpm离心10min，弃上清，重复2次。取少许细胞稀释，在细胞计数板上计数，每10⁷个细胞加1mL的Trizol并于-80℃保存。

提取总RNA：取出冻存的含有裂解细胞的Trizol，室温融化平衡5min。每1mL的Trizol试剂加200μL氯仿，涡旋震荡混匀，使氯仿和Trizol不分层，室温孵育5min。取12000g于4℃离心15min，混合物分离为红色下层(酚-氯仿相)、中间相以及上层的无色水相。RNA存在于水相，水相约600μL转移至RNase-free离心管中，加入等体积的异丙醇，颠倒混匀30s，室温静置10min，取12000g于4℃离心10min，弃上清，干燥RNA沉淀，加入50μL RNase-freeddH₂O溶解RNA。

(2)RT-PCR合成cDNA第一链。具体过程如下：

以提取的总RNA为模板，用特异性引物或随机引物合成cDNA第一链。在冰上配制以下逆转录反应体系,配置过程为：先加入RNA 4μL，随机引物或特异性引物1μL，RNase-freeddH₂O 7μL，于65℃孵育5min后置于冰上2min，再加入RiboLock RNase Inhibitor(20U/μL)1μL，10mM dNTPs Mix 2μL，RevertAid M-MuLV RT(200U/μL)1μL，于25℃反应5min，于42℃反应60min，于70℃反应5min。反应结束后于-80℃保存。

(3)PCR扩增V_H和V_L片段。具体过程如下：

如表1所示，设计的引物中共包括了6对V_H家族基因，用于连接抗体重、轻链的两条互补连接肽、12对V_L家族基因以及包含了酶切位点(Sfi I和Not I)的scFv上下游引物。以cDNA第一链为模板，以等比例混合后的抗体重、轻链的上下游引物分别扩增V_H和V_L片段。PCR反应体系为：

Green Master Mix 50μL，上游混合引物(10μM)4μL，下游混合引物(10μM)4μL，cDNA第一链2μL，ddH₂O 40μL。反应条件为：95℃变性5min；然后95℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸30s，进行30个循环；然后72℃再延伸10min；最后于4℃保存。如图1和图2所示，PCR产物经1.2％琼脂糖凝胶电泳分离目的片段，V_H条带大小约为400bp，V_L条带大小为300-400bp，成功拼接scFv片段，大小约750bp，按照Promega胶回收试剂盒说明书进行纯化回收。

表1噬菌体单链抗体库的引物汇总表

(4)重叠延伸PCR构建与扩增scFv片段

按照正常人抗体胚系可变区基因频率，其中轻链kappa亚型占60％，轻链lambda链占40％，将轻链2亚型可变区基因以该比例混合作为下一步PCR模板(V_L)。以等量的V_H和V_L片段互为模板和引物，通过重叠延伸PCR反应，将重链、轻链随机拼接形成scFv片段。反应体系为：10×SA Buffer 5μL，50×dNTPs Mix(10mM)1μL，V_H片段(100ng)XμL，V_L片段(100ng)XμL，50×Advantage 2 Polymerase Mix 1μL，ddH₂O XμL，总体积为50μL。PCR反应程序：95℃变性2min；然后95℃变性1min，68℃退火1min，68℃延伸2min，进行7个循环。PCR反应结束后，每管再加入预配含scFv双向引物(5’Sfi I与3’Not I)的混合体系：10×SABuffer 5μL，50×dNTPs Mix(10mM)1μL，5’Sfi I(10μM)4μL，3’Not I(10μM)4μL，50×Advantage 2Polymerase Mix 1μL，ddH₂O 37μL。PCR反应程序：95℃变性2min，95℃变性1min，68℃退火2min，进行35个循环。PCR产物经1.2％琼脂糖凝胶电泳分离目的片段，切取750bp左右的scFv片段，按照Promega胶回收试剂盒说明书进行纯化回收。

(5)双酶切scFv片段和噬菌粒载体pCANTAB-5E

用限制性内切酶Not I和Sfi I双酶切scFv片段，反应体系为：10×Green Buffer5μL，Not I 2.5μL，scFv(3μg)XμL，ddH₂O XμL，总体积50μL。用限制性内切酶Not I和Sfi I双酶切pCANTAB-5E，反应体系为：10×Green Buffer 5μL，Not I 2.5μL，pCANTAB-5E(3μg)XμL，ddH₂O XμL，总体积50μL。以上体系经37℃反应5h后，加入2μLSfi I，混匀后离心，50℃反应5h。程序结束后，用Promega胶回收试剂盒纯化回收双酶切后的scFv片段和pCANTAB-5E。

(6)构建表达载体pCANTAB-5E-scFv

将酶切并纯化回收后的scFv片段和pCANTAB-5E以摩尔比为3:1的比率连接，T4连接酶16℃反应16h，反应体系如下：10×T4 ligase Buffer 5μL，T4 DNA ligase 2.5μL，pCANTAB-5E(300ng)XμL，scFv(150ng)XμL，ddH₂O XμL，总体积50μL。程序结束后，用Promega胶回收试剂盒纯化回收连接产物。

(7)构建噬菌体单链抗体库。具体过程如下：

a.取出一管TG1电感受态细胞300μL于冰上融化，加入240ng scFv-pCANTAB-5E连接产物，轻柔混匀；b.将上述混合物缓慢加入至预冷的电转杯(0.2cm)，2.5kV电击；c.立即加入1mL 37℃预热的SOC培养液，轻柔冲洗，转移至细菌培养瓶，补加19mL SOC培养基，37℃180rpm 45min；d.取10μL菌液，梯度稀释后铺氨苄抗性琼脂板，30℃过夜培养，计菌落数算库容，库容约为2.4×10⁷CFU/mL，并挑取单菌落做菌落PCR，以鉴定抗体库的重组率及多样性；e.以MOI＝100：1的比例向剩余菌液中加入辅助噬菌体M13K07(2×10¹¹CFU/mL)，并加入氨苄青霉素，37℃静止孵育30min，37℃180rpm 1h；f.1000g离心10min，弃上清，将菌液重悬于100mL 2×YT-AK液体培养基中，37℃250rpm振荡培养过夜；g.次日，4℃1000g离心15min，收集上清。加10mL PEG/NaCl至上清，混匀后冰上孵育30min；h.4℃10000g离心30min，弃上清，所得沉淀即为初级噬菌体单链抗体库，用5mL 1％BSA重悬沉淀；i.4℃10000g离心5min，取上清。梯度稀释后，分别加入200μL的新鲜对数期TG1，室温孵育15min后，铺氨苄抗性琼脂板，过夜培养后数克隆数，计算重组噬菌体滴度。

S2：对全人源噬菌体单链抗体库进行淘筛及特异性鉴定。

(1)噬菌体单链抗体库的淘筛。具体过程如下：

a.包被：用PBS将GII.17 NoV P颗粒稀释至终浓度为5μg/mL，加1mL至免疫管，4℃孵育过夜；b.封闭：用PBS洗2次后，用5％脱脂奶加满免疫管，37℃封闭2h，弃去封闭液，用PBS洗2次；c.抗体库的吸附：加入1mL噬菌体抗体库，37℃孵育2h，期间振荡数次；d.洗涤：弃上清，加入2mL 0.05％PBST，上下颠倒30次后弃去，此为洗一遍，第一轮重复洗9遍，以后每轮重复洗15遍；e.直接感染：加1mL对数期TG1，37℃孵育15min。将菌液转移至培养瓶中，补加2×YT培养基7mL；f.甘氨酸-盐酸洗脱后感染：加1mL pH2.20.1M甘氨酸-盐酸洗脱液，37℃孵育10min，期间振荡数次。加入17μL 2M Tris中和液快速混匀，再加入1mL对数期TG1，37℃孵育15min。将菌液转移至上述培养瓶中。取10μL菌液(即稀释1000倍)铺氨苄抗性琼脂板，隔日计算产出量；g.扩增：将培养瓶于37℃，220rpm振荡培养1h，补加90mL 2×YT-A培养基；h.拯救：培养至细菌对数期，加入2mL辅助噬菌体M13K07。30℃220rpm振荡培养过夜；i.PEG/NaCl沉淀噬菌体：次日收集菌液，4℃8000rpm离心15min。取上清，加入1/5体积的PEG/NaCl，充分混匀后，冰浴30min。4℃8000rpm离心30min。弃上清，加2mL 1％BSA重悬沉淀。4℃10000g离心5min，取上清；j.测滴度：取10μL上一步获得的噬菌体上清，梯度稀释后感染200μL对数期TG1，铺氨苄抗性琼脂板。隔日计数并计算滴度，确定下一轮的噬菌体抗体的投入量。“吸附-洗涤-洗脱-感染-拯救”的过程重复4轮，富集与GII.17P颗粒特异性结合的噬菌体。噬菌体单链抗体库的4轮淘筛结果如表2所示。

表2噬菌体抗体库的4轮淘筛结果

(2)GII.17 NoV特异性噬菌体单链抗体的鉴定。本步骤使用Phage-ELISA进行，具体过程如下：

a.重组scFv噬菌体单克隆的拯救：在第4轮洗脱后铺的氨苄抗性琼脂板上挑取单克隆于1.5mL2×YT-A液体培养基中，37℃200rpm8h，每管补加30μL M13K07，30℃200rpm振荡培养过夜；b.包被：用PBS将GII.17P颗粒和轮状病毒VP8*(对照抗原)稀释至终浓度为0.1μg/mL，100μL/孔，包被96孔酶标板，4℃孵育过夜；c.次日，将过夜菌液于室温1000rpm离心5min，取上清备用；d.封闭：0.05％PBST洗2次，加入5％脱脂奶300μL/孔，37℃2h；e.一抗：0.05％PBST洗5次，加入噬菌体上清100μL/孔，37℃2h；f.二抗：0.05％PBST洗5次，加入HRP-鼠抗M13抗体(1：5000)100μL/孔，37℃1h；g.显色：0.05％PBST洗5次后，加入TMB 100μL/孔，避光显色10min；h.终止显色：加入2M磷酸100μL/孔。测定各孔的OD₄₅₀值，若包被P颗粒的OD₄₅₀大于包被VP8*对应孔的2倍以上，则判定为阳性噬菌体上清，并将阳性克隆送测序分析。噬菌体阳性克隆的Phage-ELISA鉴定结果如图3所示。

S3：制备GII.17 NoV全人源单链抗体。

(1)高保真酶扩增scFv片段。具体过程如下：

根据实施例2的步骤(2)中阳性克隆的测序结果，分别设计scFv原核表达克隆引物，scFv原核表达克隆引物如表3所示。在scFv上下游引物的5’端引入线性化载体两末端同源序列，且在上游引物插入BamH I酶切位点，下游引物插入Not I酶切位点。以阳性菌液为模板，用对应的引物分别扩增scFv片段。PCR反应体系为：阳性克隆(菌液)0.5μL，上游引物(10mM)1μL，下游引物(10mM)1μL，2×Phanta Max Master Mix10μL，ddH₂O7.5μL。反应程序：95℃变性5min；然后95℃变性30s，60℃退火30s，72℃延伸30s，进行30个循环；72℃再延伸10min；最后于4℃保存。PCR完成后，1.2％琼脂糖凝胶电泳，切取750bp左右的scFv片段，按照Promega胶回收试剂盒说明书进行纯化回收。琼脂糖凝胶电泳结果如图4所示。

表3 scFv原核表达克隆引物

(2)双酶切载体pGEX-4T-1。具体过程如下：

用限制性内切酶BamH I和Not I双酶切pGEX-4T-1，使其线性化，反应体系为：10×Green Buffer5μL，BamH I 2μL，Not I1μL，pGEX-4T-1(3μg)XμL，ddH₂OXμL，总体积50μL。37℃反应5h，切取5kb左右的载体片段，按照Promega胶回收试剂盒说明书进行纯化回收。

(3)构建原核表达载体pGEX-scFv。具体过程如下：

将scFv重组克隆至线性化载体pGEX-4T-1，反应体系为：5×CEII Buffer4μL，pGEX-4T-1(0.03pmol)XμL，scFv(0.06pmol)XμL，

II重组酶2μL，ddH₂OXμL，总体积20μL。37℃反应30min；降至4℃后立即置于冰上5min。取5μL同源重组产物转化至感受态细胞TOP10中，菌液涂于氨苄抗性的琼脂板，于37℃培养过夜。次日，挑取单克隆做菌落PCR，鉴定有无插入目的片段，将阳性克隆送测序分析。将完全正确的克隆大量扩增后，用ThermoFisher Scientific提质粒试剂盒提取重组质粒pGEX-scFv。

(4)表达和纯化单链抗体scFv。具体过程如下：

将重组质粒pGEX-scFv转化至E.coli BL21感受态细胞中，菌液涂于氨苄抗性的琼脂板，37℃培养过夜。次日，挑取单菌落于5mL LB-A液体培养基中，37℃220rpm12-16h。将菌液以1：100的比例接种于新鲜LB液体培养基中，37℃200rpm震荡培养至细菌对数期，加入IPTG至终浓度为0.4mM，22℃200rpm震荡培养12-16h。次日，将菌液于4℃5000rpm离心12min，弃上清，用PBS充分重悬菌体，并将菌液于冰浴中对其进行超声破碎。超声后于4℃12000rpm离心75min，将上清液和GST-resin室温结合1h。用PBS洗去杂蛋白后，加入凝血酶于22℃酶切过夜。次日收集滤液即获得抗体scFv，纯化后的样品进行SDS-PAGE电泳检测，检测结果如图5所示。

对上述整个制备过程进行分析：从图1和图2可看出，成功扩增出V_H和V_L片段，大小均在300-500bp之间，并成功拼接scFv片段，大小约750bp。在噬菌体抗体库中随机选取单克隆做菌落PCR，从图3可以看出，该抗体库的重组率良好，并将阳性克隆送测序，经分析各序列之间互不相同，说明该抗体库的多样性良好。从表2可以看出，以GII.17 NoV P颗粒为固相抗原，对噬菌体抗体库进行了4轮富集，噬菌体的产出率从第一轮的2.8×10^-7提升至第四轮的2.9×10^-5，说明抗GII.17 NoV特异性噬菌体单链抗体得到了有效富集。从图4可看出，通过Phage-ELISA鉴定，表明有11株序列不同的与GII.17 NoV P颗粒特异性结合的单链抗体scFv。其中，图4中的Control代表无噬菌体上清的培养基，为阴性对照。从图5和图6可看出，在与GII.17具有良好亲和力的阳性克隆中成功扩增出scFv，并在大肠杆菌系统中成功表达，可见9个约27kDa的目的蛋白，与scFv大小相符，成功获得9株全人源单链抗体scFv。该GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，获得的抗体库有效库容大，且重组率和多样性好。另外，该方法制备的抗体具有中和能力，能够阻断GII.17 NoV与HBGA受体的结合，为后续中和抗原表位的筛选及抗体药物研发具有重要意义。

实施例3。

一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的鉴定方法，用于鉴定GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法制备的scFv。鉴定步骤包括：

特异性鉴定，具体为将scFv包被于96孔酶标板，同时以GST蛋白为阴性对照，PBS为空白对照，封闭后加入GII.17 NoV P颗粒，以鼠抗GII.17血清为一抗，HRP-羊抗鼠IgG为二抗，ELISA鉴定scFv的特异性。

中和性鉴定，具体为包被分泌型B型唾液于96孔酶标板，封闭后加入GII.17 NoV P颗粒与scFv的混合液，同时阳性对照用未加scFv的P颗粒，阴性对照用确定没有阻断能力的血浆和P颗粒的混合液，空白对照用1％脱脂奶粉-PBS代替scFv和P颗粒的混合液，并以小鼠抗GII.17血清为一抗，HRP-羊抗鼠IgG为二抗，体外HBGA受体阻断实验鉴定scFv的中和性。

该GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的鉴定方法，能够鉴定出GII.17 NoV全人源单链抗体的特异性和中和性。

实施例4。

一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的鉴定方法，其它特征与实施例3相同，不同之处在于：本实施例的鉴定过程具体为：

(1)鉴定scFv抗体的特异性

用PBS将scFv抗体稀释至终浓度为1μg/mL，100μL/孔，包被96孔酶标板，同时以GST蛋白为阴性对照，4℃过夜；0.05％PBST洗板1次，加入5％脱脂奶，300μL/孔，37℃1h；0.05％PBST洗板1次，加入0.02μg/mLGII.17 NoV P颗粒，100μL/孔，37℃1h；0.05％PBST洗板5次，加入鼠抗GII.17血清(1：5000)，100μL/孔，37℃1h；0.05％PBST洗板5次，加入HRP-羊抗鼠IgG(1：5000)，100μL/孔，37℃1h；0.05％PBST洗板5次，加入TMB，100μL/孔，避光显色10min；加入2M磷酸终止反应，100μL/孔，测定各孔的OD₄₅₀值。OD₄₅₀是指各样本显色后在主波长450nm处的吸光值，是ELISA常用的指标。当实验孔的OD₄₅₀大于阴性样本OD₄₅₀的2倍及以上时，则判定为该scFv抗体实验样本为阳性。

(2)鉴定scFv抗体的中和能力

用HBGA受体结合实验确定所用GII.17 NoV P颗粒的浓度，并用结合力强和稳定性高的分泌型B型抗原作为HBGA受体与梯度稀释的GII.17 NoV P颗粒结合，使其OD₄₅₀在0.7-1.3之间。用PBS将B型唾液稀释至终浓度为1：1000，100μL/孔，包被96孔酶标板，4℃孵育过夜；0.05％PBST洗板1次，加入5％脱脂奶，300μL/孔，同时将GII.17 NoV P颗粒与梯度稀释的scFv混匀后，阳性对照用未加scFv的P颗粒、阴性对照用确定没有阻断能力的血浆代替scFv、空白对照用1％脱脂奶代替scFv和P颗粒的混合液，37℃1h；0.05％PBST洗板1次，将上一步的混合液分别加入酶标板中，37℃1h；0.05％PBST洗板5次，加入鼠抗GII.17血清(1：5000)，100μL/孔，37℃1h；0.05％PBST洗板5次，加入HRP-羊抗鼠IgG(1：5000)，100μL/孔，37℃1h；0.05％PBST洗板5次，加入TMB，100μL/孔，避光显色10min；加入2M磷酸终止反应，100μL/孔，测定各孔的OD₄₅₀值，当阻断率>50％时，则判定该scFv抗体实验样本具有中和能力。

鉴定结果如图7和图8所示，从图7和图8可看出，9株抗体能与GII.17 NoV P颗粒结合，均具有良好反应性，且有7株能明显阻断GII.17 NoV P颗粒与HBGA受体的结合，是具有中和能力的全人源单链抗体。其中，图7中GST是阴性对照，图8中control是阴性对照，是没有阻断能力的血浆和P颗粒的混合液。

该GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的鉴定方法，能够鉴定出GII.17NoV全人源单链抗体的特异性和中和性，且鉴定方法快捷准确。

最后应当说明的是，以上实施例仅用以说明本发明的技术方案而非对本发明保护范围的限制，尽管参照较佳实施例对本发明作了详细说明，本领域的普通技术人员应当理解，可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换，而不脱离本发明技术方案的实质和范围。

序列表

<110> 南方医科大学

<120> GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备及鉴定方法

<130> GZZRH0504-20-1-1003

<160> 49

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 1

gcggcccagc cggccatggc ccaggtgcag ctggtgcagt ctgg 44

<210> 2

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 2

gcggcccagc cggccatggc ccaggtcaac ttaagggagt ctgg 44

<210> 3

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 3

gcggcccagc cggccatggc cgaggtgcag ctggtggagt ctgg 44

<210> 4

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 4

gcggcccagc cggccatggc ccaggtgcag ctgcaggagt cggg 44

<210> 5

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 5

gcggcccagc cggccatggc cgaggtgcag ctgttgcagt ctgc 44

<210> 6

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 6

gcggcccagc cggccatggc ccaggtacag ctgcagcagt cagg 44

<210> 7

<211> 57

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 7

gccagaacca cctccgcctg aaccgcctcc acctgaggag acggtgacca gggtgcc 57

<210> 8

<211> 57

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 8

gccagaacca cctccgcctg aaccgcctcc acctgaagag acggtgacca ttgtccc 57

<210> 9

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 9

gccagaacca cctccgcctg aaccgcctcc acctgaggag acggtgacca gggttcc 57

<210> 10

<211> 57

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

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gccagaacca cctccgcctg aaccgcctcc acctgaggag acggtgaccg tggtccc 57

<210> 11

<211> 56

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 11

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcggacatcc agatgaccca gtctcc 56

<210> 12

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 12

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcggatgttg tgatgactca gtctcc 56

<210> 13

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 13

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcggaaattg tgttgacgca gtctcc 56

<210> 14

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 14

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcggacatcg tgatgaccca gtctcc 56

<210> 15

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

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tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcggaaacga cactcacgca gtctcc 56

<210> 16

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

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tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcggaaattg tgctgactca gtctcc 56

<210> 17

<211> 48

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 17

gagtcattct cgacttgcgg ccgcacgttt gatttccacc ttggtccc 48

<210> 18

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 18

gagtcattct cgacttgcgg ccgcacgttt gatctccagc ttggtccc 48

<210> 19

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

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gagtcattct cgacttgcgg ccgcacgttt gatatccact ttggtccc 48

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<212> DNA

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gagtcattct cgacttgcgg ccgcacgttt gatctccacc ttggtccc 48

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<212> DNA

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gagtcattct cgacttgcgg ccgcacgttt aatctccagt cgtgtccc 48

<210> 22

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

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tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcgcagtctg tgttgacgca gccgcc 56

<210> 23

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 23

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcgcagtctg ccctgactca gcctgc 56

<210> 24

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 24

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcgtcctatg tgctgactca gccacc 56

<210> 25

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 25

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcgtcttctg agctgactca ggaccc 56

<210> 26

<211> 56

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 26

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcgcacgtta tactgactca accgcc 56

<210> 27

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 27

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcgcaggctg tgctcactca gccgtc 56

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 28

tcaggcggag gtggttctgg cagtggcgga tcgaatttta tgctgactca gcccca 56

<210> 29

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<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 29

gagtcattct cgacttgcgg ccgcacctag gacggtgacc ttggtccc 48

<210> 30

<211> 48

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 30

gagtcattct cgacttgcgg ccgcacctag gacggtcagc ttggtccc 48

<210> 31

<211> 48

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 31

gagtcattct cgacttgcgg ccgcacctaa aacggtgagc tgggtccc 48

<210> 32

<211> 33

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 32

gtcctcgcaa ctgcggccca gccggccatg gcc 33

<210> 33

<211> 26

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 33

gagtcattct cgacttgcgg ccgcac 26

<210> 34

<211> 753

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 34

gaggtgcagc tggtggagtc tggggctgag gtgaagaggc ctggggcctc agtgaaggtc 60

tcctgcaagg cttctggtta cacctttacc agctatggta tcagctgggt gcgacaggcc 120

cctggacaag ggcttgagtg gatgggatgg atcagcgctt acaatggtaa cacaaactat 180

gcacagaagc tccagggcag agtcaccatg accacagaca catccacgag cacagcctac 240

atggagctga ggagcctgag atctgacgac acggccgtgt attactgtgc gagagagcct 300

ttttcggggt ggctacgatt ggtgtttgac tactggggcc agggaaccct ggtcaccgtc 360

tcctcaggtg gaggcggttc aggcggaggt ggttctggag gtggcggatc ggacatcgtg 420

atgacccagt ctccactctc cctgcccgtc acccttggac agccggcctc catctcctgc 480

agatctagtc aaagcctcgt acacagtgat ggaaacacct acttgaattg gtttcagcag 540

aggccaggcc aatctccaag gcgcctaatt tataaggttt ctaaccggga ctctggggtc 600

ccagacagat tcagcggcag tgggtcaggc actgatttca cactgaaaat cagcagggtg 660

gaggctgagg atgttggggt ttattactgc atgcaaggta cacactggcc tccgcatact 720

tttggccagg ggaccaaggt ggaaatcaaa cgt 753

<210> 35

<211> 738

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 35

gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc ttggtccagc ctggggtgta cctgagactc 60

tcctgttcag cctctcgatt caccttcagt aactatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120

ccagggaagg gactggaata tgtttcaact attagtagta atggcgatag cacatacttc 180

gcagactcag tgaagggcag attcaccatc tccagagaca attccaagaa cactctgtat 240

cttcgaatga gcagtctgag aactgaggac acggctatat attactgtgt gaaagatagg 300

aagttagcag tgactggtac tggtgctttt gatatctggg gccaagggac aatggtcacc 360

gtctcttcag gtggaggcgg ttcaggcgga ggtggttctg gaggtggcgg atcggacatc 420

gtgatgaccc agtctccgtc caccctgtct gcatctgtag gagacagagt tgtcatcact 480

tgccgggcaa gtcaggccat tataaatgat ttcggctggt atcagctgaa accagggaaa 540

gcccctaacc tcctgatcta tgctgcatcc attttgcaaa gtggggtccc atcaaggttc 600

agtggcagtg gatctgggac agacttcact ctcaccatca ccggtctgca gcctgaagat 660

tttgcaactt actactgtca acagagttac aatagtcttt ggactttcgg ccaagggacc 720

aaagtggata tcaaacgt 738

<210> 36

<211> 744

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 36

gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gtggtccagc ctgggaggtc cctgagactc 60

tcctgtgcag cctctggatt caccttcagt agctatgcta tgcactgggt ccgccaggct 120

ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtt atatcatatg atggaagtaa taaatactac 180

gcagactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca attccaagaa cacgctgtat 240

ctgcaaatga acagcctgag agctgaggac acggccgtat attactgtgc gagagtacgg 300

agtatgacta cagtaaccta ctactactac tacggtatgg acgtctgggg ccaagggaca 360

atggtcaccg tctcttcagg tggaggcggt tcaggcggag gtggttctgg aggtggcgga 420

tcggaaattg tgctgactca gtctccatct tccgtgtctg catctgtagg agacagagtc 480

accctcactt gtcgggcgag tcaggatatt agtaattggt tagcctggta tcagcagaga 540

ccagggaaag cccctagact cttgatcttt gctgcatcta ctttgcaaag tggggtccca 600

tccaggttca gcggcagtgg atctggggcg gatttcactc tcaccatcag cagcctgcaa 660

cctgatgatt ttgcaactta ttactgccaa cattattata gttattctgg tttcggccct 720

gggaccaaag tggaaatcaa acgt 744

<210> 37

<211> 720

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 37

caggtacagc tgcagcagtc agggggaggc ttggtacagc ctggcaggtc cctgagactc 60

tcctgtgcag cctctggatt cacctttgat gattatgcca tgcactgggt ccggcaagct 120

ccagggaagg gcctggagtg ggtctcaggt attagttgga atagtggtag cataggctat 180

gcggactctg tgaagggccg attcaccatc tccagagaca acgccaagaa ctccctgtat 240

ctgcaaatga acagtctgag agctgaggac acggccttgt attaccgacc caaatagcat 300

tggctggttc ttgactactg gggccagggc accctggtca ccgtctcctc aggtggaggc 360

ggttcaggcg gaggtggttc tggaggtggc ggatcggatg ttgtgatgac tcactctcca 420

tcctccctgt ctgcatctgt aggagacaga gtcaccatca cttgccgggc gagtcagggc 480

attagcaatt atttagcctg gtatcagcag aaaccagggg aagttcctaa ggtcctgatc 540

tatgctgcat ccactttgca atcaggggtc ccatctcgat tcagcggcag tggatctggg 600

acagatttca ctctcatcat cagcagcctg cagcctgaag atgttggaac ttattactgt 660

caaaagtaca gcaatgcccc attcactctc ggccctggga ccaacgtgga aatcaaacgt 720

<210> 38

<211> 732

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 38

caggtacagc tgcagcagtc aggcccagga ctggtgaagt cttcgaggac cctgtccctc 60

agttgcattg tctctggtgg ctccatcagc agcaattact actgggcctg gatccgccag 120

cccccaggga agggactgga gtggattggg agtatctctt atagtgggag cacctactac 180

aactcgtccc tcaagaatcg tgtcaccata tttatagaca cgtccaaaaa ccagttctcc 240

ctgaagctga agtctttgac cgccgcagac acggctgtgt attattgtgc gagacggttc 300

gtctttggtc gggggctcgg gttcgacccc tggggccagg gcaccctggt caccgtctcc 360

tcaggtggag gcggttcagg cggaggtggt tctggaggtg gcggatcgga aattgtgatg 420

acccagtctc catcttctgt gtctgcatct gtaggtgaca gagtcaccat cacttgtcgg 480

gcgagtcagg gtattggcag ctggttagcc tggtatcagc agaaaccagg gcaagcccct 540

aagctcctga tttatgctgc atccagtttg caaagtgggg tcccgtcaag gttcagcggc 600

agtggatctg ggacagattt cactctcact atcaccagcc tgcagcctga agattttgca 660

acttactatt gtcaacaggc taacagtttc ccattcactt tcggccctgg gaccaaagtg 720

gatatcaaac gt 732

<210> 39

<211> 768

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 39

gaggtgcagc tggtggagtc tgggtctgag gtgaagaagc ctgggtcctc ggtgaaggtc 60

tcctgcaagg cttctggagg caccttcagc agctatgcta tcagctgggt gcgacaggcc 120

cctggacaag ggcttgagtg gatgggaagg atcatcccta tccttggtat agcaaactac 180

gcacagaagt tccagggcag agtcacgatt accgcggaca aatccacgag cacagcctac 240

atggagctga gcagcctgag atctgaggac acggccgtgt attactgtgc gagagatcgc 300

ccgtattact atggttcggg gagttcccca ctcgcttatt actactacta ctactacatg 360

gacgtctggg gcaaagggac aatggtcacc gtctcttcag gtggaggcgg ttcaggcgga 420

ggtggttctg gaggtggcgg atcggaaatt gtgctgactc agtctccatc ttccgtgtct 480

gcatctgtag gagacagagt caccatcgct tgtcgggcga gtcagggtat tagcagctgg 540

ttagcctggt accagcagaa accagggaaa gcccctaacc tcctgatcta tgctgcatcc 600

actctgcaaa ctggggtccc atcaaggttc agcggcagtg gatctgggac agattacact 660

ctcaccatca gcagcctgca gcctgaagat cttgcaactt acttttgtca acaggctagc 720

agtttcccct tcactttcgg cggagggacc aaagtggata tcaaacgt 768

<210> 40

<211> 762

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 40

caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagc cttcacagac cctgtccctc 60

acctgcactg tctctggtgg ctccatcaac agtggttctt actattggag ctggatccgg 120

cagcccgccg ggaagggact ggagtggatt gggcgtatct ttaccagtgg gagcaccaac 180

tacaacccct ccctcaagag tcgagtcacc atttcactag acaagttcga gaaccagttc 240

tccctgaagt tgagctctgt gaccgccgca gacacggccg tgtattactg tgcgagagga 300

cgccccgtgg atccagctct ggggtactgg tacttcgatc tctggggccg tggcaccctg 360

gtcaccgtct cctcaggtgg aggcggttca ggcggaggtg gttctggagg tggcggatcg 420

gaaactgtgc tgactcagtc tccagactcc ctggctgtgt ctctgggcga gagggccacc 480

atcaactgca agtccagcca gagcgtttta tacagctcca acaataagaa ctacttagct 540

tggtaccagc agaaaccagg acagcctcct aagctgctca tttactgggc atctacccgg 600

gaatccgggg tccctgaccg attcagtggc agcgggtctg ggacagattt cactctcacc 660

atcagcagcc tgcaggctga agatgtggca gtttattact gtcagcaata ttataatact 720

cctccgacgt tcggccaagg gaccaaggtg gaaatcaaac gt 762

<210> 41

<211> 735

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 41

caggtgcagc tgcaggagtc gggcccagga ctggtgaagg cttcggagac cctgtccctc 60

acgtgcattg tccctggtgg ttccatcaag aattacttct ggacctggat tcggctgccc 120

ccagggaagg ggctggaatg ggttgggtct gtcgatcacg atggcaatac cgactacaac 180

ccctccctca agagtcgagt caccatatcg ctagacacgt ccaggagcca gttctccctg 240

aaggtatact ctgtgaccgc tgcggacacg gccgtgtatt actgtgcgag aggccacccg 300

ccggggagtt cgctcgccct cgcctttgac tcctggggcc agggcaccct ggtcaccgtc 360

tcctcaggtg gaggcggttc aggcggaggt ggttctggag gtggcggatc ggacatcgtg 420

atgacccagt ctccatcctc cctgtctgca tctgtaggag acagagtcac catcacttgc 480

cgggcaagtc agagcattag cagctattta aattggtatc agcagaaacc agggaaagcc 540

cctaagctcc tgatctatgc tgcatccagt ttgcaaagtg gggtcccatc aaggttcagt 600

ggcagtggat ctgggacaga tttcactctc accatcagca gtctgcaacc tgaagatttt 660

gcaacttact actgtcaaca gagttacagt accccgtgga cgttcggcca agggaccaaa 720

gtggatatca aacgt 735

<210> 42

<211> 747

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 42

caggtgcagc tggtgtagtc tggggcagag gtgaaaaagc ccggggagtc tctgaagatc 60

tcctgtaagg gttctggata caactttgcc aactactgga tcggctgggt gcgccagatg 120

cccgggagag gcctggagtg gatgggaatt atctatcctg gtgactctga caccagatac 180

agcccgtcct ccctaggcca ggtcaccatc tcagccgaca agtctatcgg cacctccttc 240

ctgcagtgga acaccctgaa gccctcggac gccgccatgt attactgtgc gagagcacca 300

gttctccagt tactgtatcc tgactctttt gatctgtggg gccaaggcac cctggtcacc 360

gtctcctcag gtggaggcgg ttcaggcgga ggtggttctg gaggtggcgg atcggatgtt 420

gtgatgactc agtctccctc agcgtctggg acccccgggc agcgggtcac catctcttct 480

tctggaagca actccaacat cggaagtaat tctgtacact ggtaccagca cctcccagga 540

acggccccca aactcctcat ctataatact aatcagcgac cctcaggggt ccctgaccga 600

ttctctgcct ccaagtctgg cacctcagcc tccctggcca tcagtggcct ccagtctgaa 660

gatgaggctg attattactg tgcagcatgg gatgacagcc tgggtgacta tgtcttcgga 720

cctgggacca aggtggaaat caaacgt 747

<210> 43

<211> 741

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 43

gaggtgcagc tggtggagtc tgggggaggc gttgtccacc ctgggaggtc cctgagactc 60

tcctgtgcag cctctggatt caccttcaat agttatggca tgcactgggt ccgccagtct 120

ccaggcaagg ggctggagtg ggtggcagtc atatcatatg atggcactga tcaatactat 180

gcggactccg tgaagggccg attcaccatc tccagagaga attccaagaa ctcactgtat 240

ctgcaaatga acagcctgag agccgaagac acggctcttt attactgtgc gagagatagg 300

gattactata gtagtagtta tcgatactac tttgactact ggggcctggg aaccctggtc 360

accgtctcct caggtggagg cggttcaggc ggaggtggtt ctggaggtgg cggatcggac 420

atccagatga cccagtctcc atctttcctg tctgcatctg agggagacag agtcaccatc 480

acttgccggg caagtcagag cataagggat tacttaaatt ggtatcagca gaaaccaggg 540

aaagccccta aactcctgat ctacactgca tccagtttgc aaagtggggt cccatcaagg 600

ttcagtggca gtggatctgg gaccgatttc actctcacca tcagcagtct gcaacctgaa 660

gattttgcaa cttactactg tcaccaggct tacatctccc ctcctacttt cggcgggggg 720

accaaagtgg atatcaaacg t 741

<210> 44

<211> 729

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 44

gaggtgcagc tggtggagtc tggcccagga ctggtgaagc cttcggagac cctgtccctc 60

acctgcactg tctctggtgg ctccatcagt agttactact ggagctggat ccggcagccc 120

ccagggaagg gactggagtg gattgggtat atctattaca ctgggagtcc cgactacaat 180

ccctccctca agagtcgagt cgccatctca atagacacgt ccaagaacca gttctccctg 240

aagctgacct ctgtgaccgc cgctgacacg gccgtgtatt actgtgcgag acggacgctt 300

atggcaggag ctcggaactt cgatctctgg ggccgtggca ccctggtcac cgtctcctca 360

ggtggaggcg gttcaggcgg aggtggttct ggaggtggcg gatcggacat ccagatgacc 420

cagtctccac cctccctgtc tgcttctgtt ggagacagag tcaccatcac ttgccaggcg 480

agtcaacaca ttagcaagta tttgaattgg tatcaacaaa agccagggaa agcccctaaa 540

ctcctgatct acgacgcatc cactttggaa acaggggtcc catcaaggtt cagtggaagt 600

ggatctggga cagattttac tttcaccatc agcagcctgc agcctgaaga tattgcaaca 660

tattactgtc aacagtatga taatctccct ttcactttcg gccctgggac caaggtggaa 720

atcaaacgt 729

<210> 45

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 45

tcggatctgg ttccgcgtgg atccgaggtg cagctggtgg agtc 44

<210> 46

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 46

tcggatctgg ttccgcgtgg atcccaggtg cagctgcagg agtc 44

<210> 47

<211> 44

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 47

tcggatctgg ttccgcgtgg atcccaggta cagctgcagc agtc 44

<210> 48

<211> 45

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 48

tcagtcagtc acgatgcggc cgcacgtttg atttccacct tggtc 45

<210> 49

<211> 45

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 49

tcagtcagtc acgatgcggc cgcacgtttg atatccactt tggtc 45

Claims

1.一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，包括下列步骤：

S1：构建全人源噬菌体单链抗体库；

具体是，采集GII.17NoV目标对象恢复期外周血，利用密度梯度离心法分离出PBMC，利用Trozil法提取PBMC的总RNA，逆转录合成cDNA；

设计合成人抗体基因的引物，并以cDNA为模板，扩增抗体重链可变区基因V_H和轻链可变区基因V_L，重叠延伸PCR拼接V_H和V_L形成scFv基因；

线性化噬菌粒载体pCANTAB-5E，构建重组质粒pCANTAB-5E-scFv，将重组质粒pCANTAB-5E-scFv电转化至E.coli TG1感受态细胞后加入辅助噬菌体M13K07培养，得到全人源噬菌体单链抗体库，并挑取抗体库中单克隆做菌液PCR且对阳性克隆进行测序分析；

S2：对全人源噬菌体单链抗体库进行淘筛及特异性鉴定；

具体是，以GII.17NoV P颗粒为固相抗原，对全人源噬菌体单链抗体库进行富集性筛选获得与GII.17NoV结合的噬菌体并扩增，得到特异性GII.17NoV噬菌体单链抗体库；

将特异性GII.17NoV噬菌体单链抗体库铺到氨苄抗性琼脂板上挑取单克隆，补加辅助噬菌体M13K07拯救，离心制备噬菌体上清，用Phage-ELISA鉴定噬菌体上清的特异性，并选取阳性克隆进行测序分析；

S3：制备GII.17NoV全人源单链抗体；

具体是，设计原核表达引物，以步骤S2所得阳性噬菌体上清的菌液为模板，扩增scFv片段，使用限制性内切酶BamH I和Not I双酶切载体pGEX-4T-1，并将scFv片段重组克隆至载体pGEX-4T-1上，将产物转化至E.coli T0P10感受态细胞中，挑取单克隆做菌液PCR，鉴定重组质粒是否插入目的片段，并对阳性克隆进行测序分析后提取获得pGEX-scFv重组质粒；

利用大肠杆菌表达系统表达pGEX-scFv重组质粒，然后用GST-resin亲和层析柱纯化，加入凝血酶去除融合蛋白GST-scFv的蛋白标签GST后获得scFv，即GII.17NoV全人源中和性单链抗体。

2.根据权利要求1所述的GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，步骤S1中GII.17型NoV目标对象恢复期外周血来自由GII.17NoV引起的急性胃肠炎暴发目标对象。

3.根据权利要求1所述的GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，步骤S1中人抗体基因的引物包括6对VH家族基因、用于连接抗体重轻链的氨基酸序列为GGGGSGGGGSGGGGS的两条互补连接肽、12对VL家族基因以及Sfi I和Not I酶切位点的scFv上下游引物。

4.根据权利要求1所述的GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，步骤S1中构建重组质粒pCANTAB-5E-scFv的具体过程为，分别使用限制性内切酶Sfi I和Not I对scFv基因和噬菌粒载体pCANTAB-5E双酶切，然后用T4连接酶连接构建形成重组质粒pCANTAB-5E-scFv；

辅助噬菌体M13K07与E.coliTG1感受态细胞的MOI＝100：1，辅助噬菌体M13K07的滴度为10～12pfu/mL。

5.根据权利要求1或4所述的GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，步骤S2中富集性筛选具体为将GII.17NoV P颗粒包被免疫管，吸附噬菌体单链抗体库，然后采用甘氨酸-盐酸洗脱法进行富集性淘选，重复进行4轮吸附-洗涤-洗脱-感染-拯救的过程，获得与GII.17NoV P颗粒结合的噬菌体，然后将与GII.17NoV P颗粒结合的噬菌体洗脱下来用于扩增。

6.根据权利要求1所述的GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，步骤S2中用Phage-ELISA鉴定噬菌体上清的特异性的具体过程为将GII.17NoV P颗粒、作为对照抗原的轮状病毒VP8*和作为空白对照PBS包被于96孔酶标板，以噬菌体上清为一抗，同时以无噬菌体上清的培养基为阴性对照，HRP-鼠抗M13作为二抗，用Phage-ELISA鉴定特异性，若包被P颗粒的OD₄₅₀值大于包被VP8*对应孔2倍以上，则判定为阳性噬菌体上清。

7.根据权利要求2所述的GII17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，步骤S3中所述原核表达引物根据步骤S2中阳性克隆测序分析结果设计，并在上下游引物中分别引入载体pGEX-4T-1的两末端同源序列、BamH I酶切位点和Not I酶切位点。

8.根据权利要求3所述的GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法，其特征在于，步骤S4中利用大肠杆菌表达系统表达pGEX-scFv重组质粒的具体过程为将插入目的片段的重组质粒转化至E.coli BL21感受态细胞中，挑取单克隆放置于37℃下以220rpm的转速振荡培养12h～16h，然后按为1:100的比例转接至新鲜LB液体培养基中，在37℃下以220rpm振荡培养至细菌对数期，加入IPTG于22℃以200rpm转速振荡12h诱导表达；

9.一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的鉴定方法，其特征在于，用于鉴定权利要求1至8任意一项所述的GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的制备方法制备的scFv。

10.一种GII.17型诺如病毒全人源中和性单链抗体的鉴定方法，其特征在于，所述鉴定步骤包括：

特异性鉴定，具体为将scFv包被于96孔酶标板，同时以GST蛋白为阴性对照，PBS为空白对照，封闭后加入GII.17NoV P颗粒，以鼠抗GII.17血清为一抗，HRP-羊抗鼠IgG为二抗，用ELISA鉴定scFv的特异性，若实验孔的OD₄₅₀大于阴性组的2倍以上，则判定scFv具有特异性；

中和性鉴定，具体为包被分泌型B型唾液于96孔酶标板，封闭后加入GII.17NoV P颗粒与scFv的混合液，同时阳性对照用未加scFv的P颗粒，阴性对照用确定没有阻断能力的血浆和P颗粒的混合液，空白对照用1％脱脂奶粉-PBS代替scFv和P颗粒的混合液，并以小鼠抗GII.17血清为一抗，HRP-羊抗鼠IgG为二抗，体外HBGA受体阻断实验鉴定scFv的中和性，测定各孔的OD₄₅₀值，若阻断率>50％，则判定scFv具有阻断能力。