CN112955748A - 治疗癌症的方法 - Google Patents

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Abstract

本发明涉及在有此需要的患者中,例如在人受试者中治疗癌症的方法,包括在来自患者的样品中测定可溶性BCMA(sBCMA)的水平,并对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白,从而治疗患者中的癌症。还提供了用于治疗癌症的试剂盒,其包含用于测定来自患者的样品中sBCMA水平的手段。

Description

治疗癌症的方法
发明领域
本发明一般涉及人疾病的治疗,例如涉及治疗癌症。更具体地,本发明涉及血清中可溶性BCMA(sBCMA)水平鉴定患者在治疗癌症中更可能响应BCMA抗原结合蛋白的用途。
发明背景
有效治疗高度增殖性疾病(包括癌症)是肿瘤学领域的持续目标。一般来说,癌症源自控制细胞分裂、分化和凋亡细胞死亡的正常过程的脱调节,并且特征为恶性细胞的增殖,所述恶性细胞具有无限生长、局部扩充和全身转移的潜力。正常过程的脱调节包括信号转导途径的异常和响应与正常细胞中发现的因子不同的因子。
B细胞成熟抗原(BCMA)是浆细胞存活所需的肿瘤坏死超家族细胞表面受体。BCMA的正常功能是促进B细胞在较晚的分化阶段的存活,包括浆细胞。缺乏BCMA表达的小鼠表明减少数目的长寿命的骨髓浆细胞,但具有其它方面正常的表型。BCMA膜表达存在于正常晚期B细胞的子集上,并且在正常和恶性浆细胞,包括多发性骨髓瘤(MM)细胞上被普遍检出。
癌症治疗的靶向疗法的扩张的开发和使用反映了对关键致癌途径,以及对这些途径的靶向扰动如何对应于临床响应的不断了解。预测针对靶向疗法的疗效的困难可能是途径脱调节的原因机制(例如激活突变,扩增)的有限全局知识的后果。治疗选定的患者群体可能有助于最大化疗法的潜力。仍然需要确定患有B细胞病症,例如多发性骨髓瘤的患者的预后,以便为个体患者选择最佳治疗计划。
发明概述
本发明提供了诊断癌症患者,确定癌症患者的预后,或者为癌症患者优化治疗计划的方法,其通过测定患者样品中可溶性BCMA表达的存在或量来进行。已经发现可溶性BCMA的表达可以用作生物标志物,以诊断或确定癌症患者中的预后。此外,已经发现癌症患者中的可溶性BCMA的存在或表达水平可用于选择某些患者群体以用BCMA抗原结合蛋白治疗,以及通过临床医生通知给药和治疗方案。
在一个实施方案中,本发明提供了诊断患者中的癌症的方法,包括:(a)从患者获得样品;并且(b)对样品测试可溶性BCMA表达的存在,其中若患者以高水平表达可溶性BCMA或表达sBCMA,则确定患者患有癌症。
在一个实施方案中,本发明提供了用于确定患者中癌症预后的方法,包括:(a)从患者获得样品;并且(b)对样品测试可溶性BCMA表达的存在;其中若患者具有可溶性BCMA的表达,则患者的预后是差的。
在另一个实施方案中,本发明提供了用于确定患者中癌症预后的方法,包括:(a)从患者获得样品;并且(b)对样品测试可溶性BCMA表达水平;其中若患者具有高水平的可溶性BCMA表达,则患者的预后是差的。
在一个实施方案中,本发明提供了预测患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法,包括:(a)从患者获得样品;并且(b)对样品测试可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达高水平的可溶性BCMA,则预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
在另一个实施方案中,本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括:(a)从患者获得样品;并且(b)测试样品的可溶性BCMA表达;并且(c)若受试者表达可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
在又一个实施方案中,本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括:(a)从患者获得样品;并且(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平;(c)若患者具有高水平的可溶性BCMA表达,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
还提供了用于选择BCMA抗原结合蛋白剂量以在有此需要的患者中治疗癌症的方法,其包括:(a)从所述患者获得样品;(b)测试所述样品的可溶性;并且MA表达水平;并且
并且(c)若所述患者具有低水平的可溶性BCMA表达,则用低剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者;或者,若所述患者具有高水平的可溶性BCMA表达,则用高剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者。
在一个实施方案中,患者是人患者或人受试者。
在本发明的一个方面,癌症选自下组:多发性骨髓瘤、淋巴瘤、慢性淋巴细胞性白血病、非何杰金氏淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤。
在本发明的另一方面,从患者获得的样品是血清样品或血液样品。
本发明提供了BCMA抗原结合蛋白,其选自抗体、抗体片段、双特异性抗体、抗体-药物-缀合物、双特异性T细胞结合剂(BITE)或嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)。
在本发明的一个方面,BCMA抗原结合蛋白是单克隆抗体,其包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH;和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中所述抗体与MMAF缀合。
在某些方面,除了BCMA抗原结合蛋白外,还用至少一种另外的抗肿瘤剂进一步治疗患者。在一个实施方案中,至少一种另外的肿瘤剂选自下组:抗PD1抗体(例如纳武单抗(nivolumab)或派姆单抗(pembrolizumab)),抗ICOS抗体和抗OX40抗体,抗CD38抗体(例如达雷妥尤单抗(daratumumab)),蛋白酶体抑制剂(例如硼替佐米,卡非佐米(carfilzomib)或艾沙佐米(ixazomib)),沙立度胺类似物(例如来那度胺(lenalidomide)或泊马度胺(pomalidomide))和地塞米松。
本发明还提供了BCMA抗原结合蛋白,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者以来自所述患者的样品中的高水平可溶性BCMA表达为特征。在另一个实施方案中,本发明提供了BCMA抗原结合蛋白,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者在来自所述患者的样品中表达可溶性BCMA。
在另一个实施方案中,本发明考虑了药物组合物,其包含BCMA抗原结合蛋白和至少一种药学上可接受的赋形剂,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者以来自所述患者的样品中的高水平可溶性BCMA表达为特征。在另一个实施方案中,本发明提供了药物组合物,其包含BCMA抗原结合蛋白和至少一种药学上可接受的赋形剂,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者在来自所述患者的样品中表达可溶性BCMA。
本发明提供了用于在患者中用BCMA抗原结合蛋白治疗癌症的试剂盒,其包含用于测定来自所述患者的样品中可溶性BCMA水平的手段(means)。
本发明还提供了BCMA抗原结合蛋白在制备用于治疗患者中的癌症的药物中的用途,其中确定从所述患者获得的样品表达可溶性BCMA。在另一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白在制备用于治疗患者中的癌症的药物中的用途,其中确定从所述患者获得的样品具有高水平的可溶性BCMA表达。
附图简述
图1显示了用于检测sBCMA的示例性测定法。图1a表明用于检测游离sBCMA(sBCMA不与BCMA抗原结合蛋白结合)的一种示例性方法。图1b表明用于检测结合的sBCMA(sBCMA与J6M0-MMAF-BCMA抗原结合蛋白结合)的一种示例性方法。
图2表明健康患者、多发性骨髓瘤患者和临床研究中登记的患者中的基线可溶性BCMA水平。
图3表明相对于sBCMA的基线测量用BCMA抗原结合蛋白治疗的每位患者获得的最佳确认响应。
图4表明相对于施用的BCMA抗原结合蛋白的剂量水平的游离sBCMA的减少。
发明详述
本发明提供了诊断癌症患者,确定癌症患者的预后,或者为癌症患者优化治疗计划的方法,其通过测定患者样品中可溶性BCMA表达的存在或量来进行。已经发现可溶性BCMA的表达可以用作生物标志物,以诊断或确定癌症患者中的预后。此外,已经发现癌症患者中的可溶性BCMA的存在或表达水平可用于选择某些患者群体以用BCMA抗原结合蛋白治疗,以及通过临床医生通知给药和治疗方案。
在一个实施方案中,患者是人患者或人受试者。
不受理论的束缚,认为sBCMA可以结合并抑制治疗性BCMA抗原结合蛋白的作用,所述治疗性BCMA抗原结合蛋白旨在靶向与肿瘤细胞结合的BCMA受体。
B细胞成熟抗原(BCMA)
B细胞成熟抗原(“BCMA”或“TNFRSF17”)是浆细胞表达的II型跨膜受体,其是肿瘤坏死因子受体超家族(TNFRSF)的成员。它负责将B细胞的成熟驱动到长寿命的浆细胞,并且是活化B细胞的核因子Kappa轻链增强物(NFKB)的有效活化物。NFKB是由促炎细胞因子或细胞结合配体,如BCMA活化的转录因子家族。此因子的激活与B细胞增殖、存活、分化和细胞凋亡有关(Bossen and Schneider,2006)。BCMA信号传导已经暗示为支持恶性浆细胞的长寿命特性的因素。这导致了BCMA是各种浆细胞癌,例如多发性骨髓瘤的潜在靶标。
人BCMA含有Genbank登录号Q02223.2(SEQ ID NO:11)的氨基酸序列,或编码与SEQID NO:11具有至少90%同源性或至少90%同一性的人BCMA的基因:
MLQMAGQCSQNEYFDSLLHACIPCQLRCSSNTPPLTCQRYCNASVTNSVKGTNAILWTCLGLSLIISLAVFVLMFLLRKINSEPLKDEFKNTGSGLLGMANIDLEKSRTGDEIILPRGLEYTVEECTCEDCIKSKPKVDSDHCFPLPAMEEGATILVTTKTNDYCKSLPAALSATEIEKSISAR
可溶性BCMA
BCMA可以形成可溶性或分泌形式(“可溶性BCMA”或“sBCMA”)(Rennert2000)。不受理论的束缚,认为BCMA受体的细胞外部分通过酶诸如β-分泌酶从浆细胞表面的膜切割(Laurent 2015)。可以在人血液样品中容易地检测到可溶形式的BCMA。如本文所述,已经发现sBCMA可以用作预测患者结果,确定预后和优化癌症患者的治疗计划的生物标志物(例如B细胞癌,诸如多发性骨髓瘤和各种淋巴瘤)。
在一个实施方案中,本发明提供可溶性BCMA,其用作诊断方法中的生物标志物,所述诊断方法包括(a)从患者获得样品;并且(b)对样品测试可溶性BCMA表达的存在。在一个实施方案中,若患者以高水平表达可溶性BCMA或表达sBCMA,则确定患者患有癌症。在另一个实施方案中,当sBCMA的量高于约10ng/ml时,患者表达高水平的BCMA。
癌症
如本文所用,术语“癌症”、“赘生物”和“肿瘤”可以可互换使用,并且呈单数或复数形式,是指已经历使其变为对宿主生物体具有病理性的恶性转化的细胞。可以通过良好确立的技术,尤其是组织学检查,容易地将原发性癌细胞与非癌细胞区分开。如本文所用的癌细胞的定义不仅包括原发性癌细胞,还包括衍生自癌细胞祖先的任何细胞。这包括转移的癌细胞,以及衍生自癌细胞的体外培养物和细胞系。当提及通常表现为实体瘤的癌症类型时,“临床可检测”的肿瘤是基于肿瘤块可检测到的肿瘤;例如,通过程序诸如计算机断层摄影(CT)扫描、磁共振成像(MRI)、X-射线、超声或身体检查时触诊,和/或其由于从患者可获得的样品中的一种或多种癌症特异性抗原的表达而可检测到。肿瘤可能是造血性(或血液学或血液或血液相关的)癌症,例如衍生自血细胞或免疫细胞的癌症,其可被称为“液体肿瘤”。基于血液肿瘤的临床病况的具体实例包括:白血病,诸如慢性粒细胞性白血病、急性粒细胞性白血病、慢性淋巴细胞性白血病和急性淋巴细胞性白血病;浆细胞恶性,诸如多发性骨髓瘤、MGUS和瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(Waldenstrom’s macroglobulinemia);淋巴瘤,诸如非何杰金氏淋巴瘤、何杰金氏淋巴瘤;等。
在一个方面,癌症可以是其中存在异常数目的母细胞或不希望的细胞增殖或被诊断为血液癌症(包括淋巴样和骨髓样恶性)的任何癌症。骨髓样恶性包括但不限于:急性髓样(或粒细胞性或髓性或成髓细胞性)白血病(未分化或分化的)、急性前髓样(或早幼粒细胞性或前髓性或前髓母细胞性)白血病、急性骨髓单核细胞性(或骨髓单核母细胞性)白血病、急性单核细胞性(或单核母细胞性)白血病、红细胞白血病和巨核细胞性(或巨核母细胞性)白血病。这些白血病可以一起称为急性髓样(或粒细胞性或髓性)白血病(AML)。髓样恶性还包括骨髓增殖性病症(MPD),其包括但不限于:慢性髓性(或髓样)白血病(CML)、慢性骨髓单核细胞性白血病(CMML)、原发性血小板增多症(essential thrombocythemia)(或血小板增多)和真性红细胞增多症(polcythemia vera,PCV)。骨髓恶性还包括脊髓发育不良(或骨髓增生异常综合征或MDS),其可被称为难治性贫血(RA)、具有过量母细胞的难治性贫血(RAEB)以及具有过量转化中的母细胞的难治性贫血(RAEBT);以及伴有或不伴有原因不明性髓样化生的骨髓纤维化(MFS)。
在一个方面,造血癌症还包括淋巴样恶性,其可影响淋巴结、脾脏、骨髓、外周血和/或结外部位。淋巴样癌包括B-细胞恶性,其包括但不限于B-细胞非何杰金氏淋巴瘤(B-NHL)。B-NHL可以是惰性的(或低度)、中度(或侵袭性)或高度(高侵袭性)。惰性B细胞淋巴瘤包括:滤泡性淋巴瘤(FL);小淋巴细胞性淋巴瘤(SLL);边缘区淋巴瘤(MZL),包括结节MZL、结外MZL、脾MZL和具有绒毛状淋巴细胞的脾MZL;淋巴浆细胞性淋巴瘤(LPL);以及粘膜相关淋巴样组织(MALT或结外边缘区)淋巴瘤。中度B-NHL包括:涉及或不涉及白血病的套细胞淋巴瘤(MCL)、弥漫性大细胞淋巴瘤(DLBCL)、滤泡性大细胞(或3级或3B级)淋巴瘤和原发性纵隔淋巴瘤(PML)。高度B-NHL包括伯基特淋巴瘤(BL)、伯基特样淋巴瘤、小无裂解细胞淋巴瘤(SNCCL)和成淋巴细胞性淋巴瘤。其他B-NHL包括免疫母细胞性淋巴瘤(或免疫细胞瘤)、原发性渗出性淋巴瘤、HIV相关(或AIDS相关)的淋巴瘤和移植后淋巴增殖性病症(PTLD)或淋巴瘤。B细胞恶性还包括但不限于:慢性淋巴细胞性白血病(CLL)、幼淋巴细胞性白血病(PLL)、瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症(WM)、毛细胞白血病(HCL)、大颗粒淋巴细胞性(LGL)白血病、急性淋巴样(或淋巴细胞性或成淋巴母细胞性)白血病和卡斯尔曼氏病(Castleman’s disease)。NHL还可包括:T-细胞非何杰金淋巴瘤(T-NHL),其包括但不限于未另作说明(NOS)的T-细胞非何杰金淋巴瘤、外周T-细胞淋巴瘤(PTCL)、间变性大细胞淋巴瘤(ALCL)、血管免疫母细胞性淋巴样病症(AILD)、鼻自然杀伤(NK)细胞/T-细胞淋巴瘤、gamma/delta淋巴瘤、皮肤型T细胞淋巴瘤、蕈样肉芽肿和塞扎里综合征(Sezarysyndrome)。
在一个方面,造血癌还包括何杰金氏淋巴瘤(或疾病),其包括典型何杰金氏淋巴瘤,结节硬化型何杰金氏淋巴瘤,混合细胞型何杰金氏淋巴瘤,淋巴细胞主型(LP)何杰金氏淋巴瘤,结节LP何杰金氏淋巴瘤和淋巴细胞衰竭型何杰金氏淋巴瘤。造血癌症还包括浆细胞疾病或癌症,诸如多发性骨髓瘤(MM),包括郁积型MM,意义未确定(或未知或未明)的单克隆丙种球蛋白病(MGUS),浆细胞瘤(骨,髓外),淋巴浆细胞性淋巴瘤(LPL),瓦尔登斯特伦氏巨球蛋白血症,浆细胞白血病和原发性淀粉样变性病(AL)。造血癌症还可包括额外造血细胞的其他癌症,包括多形核白细胞(或中性粒细胞),嗜碱性粒细胞,嗜酸性粒细胞,树突状细胞,血小板,红细胞和自然杀伤细胞。包括造血细胞的组织,在本发明中被称为“造血细胞组织”,包括骨髓;外周血;胸腺;和外周淋巴组织,诸如脾脏、淋巴结、与粘膜相关的淋巴样组织(例如与肠相关的淋巴样组织)、扁桃体,派伊尔淋巴集结(Peyer's patches)和阑尾,以及与其他粘膜相关的淋巴样组织,例如支气管内衬。
在一个方面,癌症选自头颈癌、乳腺癌、肺癌、结肠癌、卵巢癌、前列腺癌、神经胶质瘤、成胶质细胞瘤、星型细胞瘤、多形性成胶质细胞瘤、Bannayan-Zonana综合征、考登病(Cowden disease)、Lhermitte-Duclos病、炎性乳腺癌、威尔姆氏肿瘤(Wilm's tumor)、尤因氏肉瘤(Ewing's sarcoma)、横纹肌肉瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、肾癌、肝癌、黑素瘤、胰腺癌、肉瘤、骨肉瘤、骨巨细胞肿瘤、甲状腺癌、成淋巴细胞性T细胞白血病、慢性髓性白血病、慢性淋巴细胞性白血病、毛细胞白血病、急性成淋巴细胞性白血病、急性髓性白血病、AML、慢性中性粒细胞性白血病、急性成淋巴细胞性T细胞白血病、浆细胞瘤、免疫母细胞性大细胞白血病、套细胞白血病、多发性骨髓瘤原巨核细胞白血病、多发性骨髓瘤、急性巨核细胞白血病、早幼粒细胞性白血病、红细胞白血病、恶性淋巴瘤、何杰金淋巴瘤、非何杰金淋巴瘤、成淋巴细胞型T细胞淋巴瘤、伯基特氏淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、神经母细胞瘤、膀胱癌、泌尿道上皮癌、外阴癌、子宫颈癌、子宫内膜癌、肾癌、间皮瘤、食管癌、唾液腺癌、肝细胞癌、胃癌、鼻咽癌、口腔癌、口部癌症、GIST(胃肠间质瘤)和睾丸癌。
在一个方面,人有一个实体瘤。在一个方面,肿瘤选自头颈癌、胃癌、黑素瘤、肾细胞癌(RCC)、食道癌、非小细胞肺癌、前列腺癌、结肠直肠癌、卵巢癌和胰腺癌。在另一方面,人具有液体肿瘤,例如弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)、多发性骨髓瘤、慢性淋巴母细胞性白血病(CLL)、滤泡淋巴瘤、急性髓样白血病和慢性髓性白血病。
本公开还涉及治疗或减轻选自以下的癌症的严重性的方法:脑癌(神经胶质瘤)、成胶质细胞瘤、Bannayan-Zonana综合征、考登病、Lhermitte-Duclos病、乳腺癌、炎性乳腺癌、威尔姆氏肿瘤、尤因氏肉瘤、横纹肌肉瘤、室管膜瘤、髓母细胞瘤、结肠癌、头颈癌、肾癌、肺癌、肝癌、黑素瘤、卵巢癌、胰腺癌、前列腺癌、肉瘤、骨肉瘤、骨巨细胞瘤、甲状腺癌、成淋巴细胞性T-细胞白血病、慢性髓性白血病、慢性淋巴细胞性白血病、毛细胞白血病、急性成淋巴细胞性白血病、急性髓性白血病、慢性中性粒细胞性白血病、急性成淋巴细胞性T-细胞白血病、浆细胞瘤、免疫母细胞性大细胞白血病、套细胞白血病、多发性骨髓瘤原巨核细胞白血病、多发性骨髓瘤、急性巨核细胞白血病、早幼粒细胞性白血病、红细胞白血病、恶性淋巴瘤、何杰金淋巴瘤、非何杰金淋巴瘤、成淋巴细胞型T细胞淋巴瘤、伯基特氏淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤、神经母细胞瘤、膀胱癌、泌尿道上皮癌、肺癌、外阴癌、子宫颈癌、子宫内膜癌、肾癌、间皮瘤、食管癌、唾液腺癌、肝细胞癌、胃癌、鼻咽癌、口腔癌、口部癌症、GIST(胃肠间质瘤)和睾丸癌。
在本文所述方法的一个实施方案中,癌症包括多发性骨髓瘤、淋巴瘤、慢性淋巴细胞性白血病、非何杰金氏淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤。
在本文描述的方法的一个实施方案中,癌症是多发性骨髓瘤。
治疗和预防
如本文所用的术语“治疗”及其语法变型是指治疗性治疗。在提到特定病况时,治疗意味着(1)改善病况或该病况的一种或多种生物临床表现;(2)干扰(a)导致或造成该病况的生物级联中的一个或多个点或(b)病况的一种或多种生物临床表现;(3)缓解与病况或其治疗相关的一种或多种症状、效应或副作用;或(4)减缓病况的发展或该病况的一种或多种生物临床表现。本文还考虑预防性治疗。技术人员将理解,“预防”不是绝对的术语。在医学中,“预防”被理解为是指药物的预防性施用,以显著降低病况或其生物临床表现的可能性或严重程度,或延迟该病况或其生物临床表现的发生。例如当认为受试者处于发展癌症的高风险中时,诸如当受试者具有强烈的癌症家族史或当受试者暴露于致癌物质时,预防性治疗是适当的。
样品
样品,例如用于测试或确定可溶性BCMA水平的生物样品可以是任何体液或组织,包括但不限于血清,血液,血液成分,尿液,腹水液,骨髓吸气和唾液。可以通过本领域已知的和/或本文所述的几种技术进行sBCMA水平的测试。在一些实施方案中,样品是血清。
BCMA抗原结合蛋白
本文所述的BCMA抗原结合蛋白可用于治疗或预防癌症。“BCMA抗原结合蛋白”是指能够结合和/或中和人BCMA的任何蛋白质构建体。
如本文所用的术语“抗原结合蛋白”是指能够与人BCMA结合的蛋白质,蛋白质片段,抗体,单克隆抗体,多克隆抗体,多特异性抗体(例如三种特异性和双特异性抗体),抗体片段和其他蛋白质构建体。
如本文所用的术语“单克隆抗体”是指从基本上均质的抗体群体获得的抗体,即,除了可能以少量存在的天然存在的突变之外,构成群体的个体抗体是相同的。单克隆抗体对单一抗原性结合位点是高度特异性的。此外,与通常包括针对不同决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制剂相反,每种单克隆抗体针对抗原上的单个决定簇。
本发明的抗原结合蛋白可包括本发明的重链可变区和轻链可变区,其可以设计为天然抗体或其功能片段或等同物的结构。因此,本发明的抗原结合蛋白可以包括当与合适的轻链配对时设计成全长抗体、(Fab')2片段、Fab片段或其等同物(例如scFV,二抗体(bibodies)、三抗体(tribodies)或四抗体等)的VH区域。抗体可以是IgG1,IgG2,IgG3,或IgG4;或IgM;IgA,IgE or IgD或其修饰变体。可以相应地选择抗体重链的恒定域。轻链恒定域可以是kappa或lambda恒定域。此外,抗原结合蛋白可包括所有类别的修饰,例如,IgG二聚体,不再结合Fc受体或介导C1Q结合的Fc突变体。抗原结合蛋白也可以是WO86/01533中描述的类型的嵌合抗体,其包含抗原结合区域和非免疫球蛋白区域。
如本文所用的术语“变体”是指与参考氨基酸序列相比具有至少一个氨基酸变化的氨基酸序列,并且可以包括例如缺失,添加,插入,易位,截短和/或取代。
在本发明的一个方面,抗原结合蛋白包含mAbdAb,dAbmAb,dAb,ScFv,Fab,Fab',F(ab')2,Fv,Fc,Fd,二抗体(diabody),affibody,三抗体(triabody),四抗体(tetrabody),微型抗体(miniantibody)或微型体(minibody)。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是双特异性或三特异性抗体。
在一个实施方案中,BCMA抗原蛋白与药物或细胞毒素缀合。在另一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是抗体药物缀合物(ADC)。
在本发明的一个方面,BCMA抗原结合蛋白是双特异性T细胞结合剂(BiTE)。在另一个实施方案中,BiTE包含由不同抗体的两个单链可变片段(scFV)组成的融合蛋白。
在本发明的一个方面,BCMA抗原结合蛋白是CAR-T(嵌合抗原受体T细胞治疗剂)。在另一方面,CAR包括结合域,跨膜域和细胞内效应物域。嵌合抗原受体(CAR)已被开发为人工T细胞受体,以在T细胞中产生新的特异性,而不需要与MHC-抗原肽复合物结合。这些合成受体含有靶结合域,其通过柔性接头在单一融合分子中与一个或多个信号传导域相关联。靶结合域用于将T细胞靶向到病理细胞表面上的特定靶标,并且信号传导域含有用于T细胞活化和增殖的分子机械。穿过T细胞膜(即形成跨膜域)的柔性接头允许CAR的靶结合域的细胞膜表现。CAR已经成功地允许针对从各种恶性(包括淋巴瘤和实体瘤)的肿瘤细胞表面处表达的抗原重定向T细胞。
在本发明的一个方面,抗原结合蛋白是人源化或嵌合抗体,在另一方面,抗体是人源化的。在一个方面,抗体是单克隆抗体。
“嵌合抗体”是指重链和/或轻链的一部分与从特定供体抗体类或亚类衍生的抗体中的相应序列相同或同源,而链的其余部分与从另一种物种衍生或属于另一种抗体类或亚类的抗体中的相应序列相同或同源的工程化抗体,以及此类抗体的片段,只要它们表现出所需的生物活性。
“人源化抗体”是指一种类型的工程化改造的抗体,其具有衍生自非人供体免疫球蛋白的其CDR,该分子的剩余免疫球蛋白衍生部分衍生自一种(或多种)人免疫球蛋白。另外,可以改变框架支持残基以保留结合亲和力。合适的人受体抗体可以是通过与供体抗体的核苷酸和氨基酸序列的同源性选自常规数据库,例如KABATS数据库、Los Alamos数据库和Swiss Protein数据库的抗体。特征在于与供体抗体的框架区同源性(基于氨基酸)的人抗体可以合适于提供重链恒定区和/或重链可变框架区用于插入供体CDR。可以类似的方式选择能够提供轻链恒定或可变框架区的合适的受体抗体。应注意,受体抗体重和轻链不需要源自相同的受体抗体。
在国际公开号WO2012/163805中公开了示例性BCMA抗原结合蛋白及其制备方法,其通过引用整体并入本文。附加的示例性BCMA抗原结合蛋白包括WO2016/014789,WO2016/090320,WO2016/090327,WO2016/020332,WO2016/079177,WO2014/122143,WO2014/122144,WO2017/021450,WO2016/014565,WO2014/068079,WO2015/166649,WO2015/158671,WO2015/052536,WO2014/140248,WO2013/072415,WO2013/072406,WO2014/089335,US2017/165373,WO2013/154760,和WO2017/051068中描述的那些,每篇通过引用整体并入本文。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白具有增强的抗体依赖性细胞介导的细胞毒性活性(ADCC)效应器功能。如本文所用的术语“效应器功能”是指以下一种或多种:抗体依赖性细胞介导的细胞毒性活性(ADCC),补体依赖性细胞毒性活性(CDC)介导的应答,Fc介导的吞噬作用和通过FcRn受体的抗体再循环。对于IgG抗体,包括ADCC和ADCP的效应器功能性是通过重链恒定区与存在于免疫细胞表面上存在的Fcgamma受体家族的相互作用介导的。在人中,这些包括FcgammaRI(CD64),FcgammaRII(CD32)和FcgammaRIII(CD16)。与抗原结合的抗原结合蛋白与Fc/Fcgamma复合物的形成之间的相互作用诱导一系列效应,包括细胞毒性,免疫细胞活化,吞噬作用和炎性细胞因子的释放。
在另一个实施方案中,本文所述的BCMA抗原结合蛋白抑制BAFF和/或4月至BCMA受体的结合。在另一个实施方案中,本文所述的BCMA抗原结合蛋白能够与FcgammaRIIIA结合或能够具有FcgammaRIIIA介导的效应器功能。
“CDR”定义为抗体的互补决定区氨基酸序列,其是免疫球蛋白重链和轻链的高变域。免疫球蛋白的可变部分中有三个重链和三个轻链CDR(或CDR区)。因此,如本文所用的“CDR”可以指所有三个重链CDR,或所有三个轻链CDR(或所有重链和所有轻链CDR两者,若合适的话)。
CDR为抗体与抗原或表位的结合提供了大多数接触残基。本发明中感兴趣的CDR衍生自供体抗体可变重和轻链序列,并包括天然存在的CDR的类似物,所述类似物也与衍生它们的供体抗体共享或保持相同的抗原结合特异性和/或中和能力。抗体的CDR序列可以通过Kabat编号系统确定。
术语“VH”和“VL”在本文中用于分别指抗体的重链可变域和轻链可变域。
示例性BCMA抗原结合蛋白描述于WO2012/163805中,其公开内容整体并入本文。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含重链可变区CDR1(“CDRH1”)的抗体,所述重链可变区CDR1包含与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列NYWMH具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,重链可变区CDR1(“CDRH1”)包含与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列具有一个氨基酸变化(变体)的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含重链可变区CDR2(“CDRH2”)的抗体,所述重链可变区CDR2包含与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列ATYRGHSDTYYNQKFKG具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,重链可变区CDR2(“CDRH2”)包含与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列具有一个氨基酸变化(变体)的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含重链可变区CDR3(“CDRH3”)的抗体,所述重链可变区CDR3包含与SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列GAIYDGYDVLDN具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,重链可变区CDR3(“CDRH3”)包含与SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列具有一个氨基酸变化(变体)的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含轻链可变区CDR1(“CDRL1”)的抗体,所述轻链可变区CDR1包含与SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列SASQDISNYLN具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,轻链可变区CDL1(“CDR1”)包含与SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列具有一个氨基酸变化(变体)的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含轻链可变区CDR2(“CDRL2”)的抗体,所述轻链可变区CDR2包含与SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列YTSNLHS具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,轻链可变区CDL2(“CDR2”)包含与SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列具有一个氨基酸变化(变体)的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含轻链可变区CDR3(“CDRL3”)的抗体,所述轻链可变区CDR3包含与SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列QQYRKLPWT具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,轻链可变区CDL3(“CDR3”)包含与SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列具有一个氨基酸变化(变体)的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是抗体,其包含CDRH1,所述CDRH1包含与SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列;CDRH2,所述CDRH2包含与SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列;CDRH3,所述CDRH3包含与SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列;CDRL1,所述CDRL1包含与SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列;CDRL2,所述CDRL2包含与SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列;和/或CDRL3,所述CDRL3包含与SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是抗体,其包含含有SEQ ID NO:1所示的氨基酸序列的CDRH1;含有SEQ ID NO:2所示的氨基酸序列的CDRH2;含有SEQ ID NO:3所示的氨基酸序列的CDRH3;含有SEQ ID NO:4所示的氨基酸序列的CDRL1;含有SEQ ID NO:5所示的氨基酸序列的CDRL2;和含有SEQ ID NO:6所示的氨基酸序列的CDRL3。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含重链可变区(“VH”)的抗体,所述重链可变区包含与SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%序列同一性的氨基酸序列:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSNYWMHWVRQAPGQGLEWMGATYRGHSDTYYNQKFKGRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGAIYDGYDVLDNWGQGTLVTVSS。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含轻链可变区(“VL”)的抗体,所述轻链可变区包含与SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%序列同一性的氨基酸序列:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSNLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYRKLPWTFGQGTKLEIKR。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是抗体,其包含与SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%序列同一性的氨基酸序列的VH抗体;和与SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%序列同一性的氨基酸序列的VL。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是抗体,其包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH;和含有SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL。(本文称为“J6M0”)。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含重链区(“HC”)的抗体,所述重链区包含与SEQ ID NO:9所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%序列同一性的氨基酸序列:
QVQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGGTFSNYWMHWVRQAPGQGLEWMGATYRGHSDTYYNQKFKGRVTITADKSTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGAIYDGYDVLDNWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含轻链区(“LC”)的抗体,所述轻链区包含与SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列:
DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCSASQDISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSNLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYRKLPWTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含HC和LC的抗体,所述HC包含与SEQID NO:9所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%序列同一性的氨基酸序列,所述LC包含与SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列具有至少90%,91%,92%,93%,94%,95%,96%,97%,98%,99%或100%的序列同一性的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含HC和LC的抗体,所述HC包含SEQ IDNO:9所示的氨基酸序列,所述LC包含SEQ ID NO:10所示的氨基酸序列。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白与药物或细胞毒素缀合。在另一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是抗体-药物-缀合物(ADC或免疫缀合物)。ADC可以包括与一种或多种细胞毒剂,例如化学治疗剂,药物,生长抑制剂,毒素(例如,蛋白质毒素,细菌,真菌,植物或动物来源的酶活性毒素,或其片段),或放射性同位素(即,放射性缀合物)缀合的本文所述的任何BCMA抗原结合蛋白。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是具有以下一般结构的免疫缀合物:
ABP-((接头)n-Ctx)m
其中
ABP是抗原结合蛋白
接头是不存在的或任何可切割或不可切割的接头
Ctx是本文所述的任何细胞毒剂
n是0,1,2或3;和
M是1,2,3,4,5,6,7,8,9或10。
示例性的细胞毒剂包括澳瑞他汀类(auristatins)(例如,单甲基澳瑞他汀E(MMAE)或单甲基澳瑞他汀F(MMAF));序列选择性DNA小槽结合交联剂(例如,吡咯并苯二氮杂卓(PBD));美登素类化合物(maytansinoids)(例如DM1或DM4);和alpha-鹅膏蕈碱环肽。
示例性接头包括蛋白酶可切割的接头,6-马来酰亚胺己酰基(6-maleimidocaproyl)(MC),马来酰亚胺丙酰基(maleimidopropanoyl,MP),缬氨酸-瓜氨酸(val-cit),丙氨酸-苯丙氨酸(ala-phe),对氨基苯并氧基羰基(PAB),N-琥珀酰亚胺基4-(2-吡啶基硫基)戊酸酯(N-Succinimidyl 4-(2-pyridylthio)pentanoate)(SPP),N-琥珀酰亚胺4-(N-马来酰亚胺甲基)环己烷-1羧酸酯(N-succinimidyl 4-(N-maleimidomethyl)cyclohexane-1carboxylate)(SMCC),4-(N-马来酰亚胺甲基)环己烷-1-羧酸酯(MCC)和N-琥珀酰亚胺(4-碘-乙酰基)氨基苯甲酸酯(SIAB)。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是含有与MMAE或MMAF连接的单克隆抗体的免疫缀合物。在另一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是含有通过MC接头与MMAE或MMAF连接的单克隆抗体的免疫缀合物,如以下结构所示:
Figure BDA0003037628250000171
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白是包含VH和VL的单克隆抗体,所述VH包含SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列,所述VL包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列,其中抗体与MMAF(本文称为“J6M0-MMAF”)。
示例性CAR-T治疗剂包括Bb2121或Bb2127(Celgene/Bluebird),JCARH125或FCARH143(Celgene/Juno),LCAR-B38M(Nanjing/Janssen/Genscript),MCARH171/ET140(Celgene/Juno/Eureka),DESCARTES-08(Cartesian),KITE-585(Gilead/Kite),和P-BCMA-101(Poseida)。
示例性单克隆抗体,双特异性抗体,三特异性抗体,Duobodies或BiTes包括CC-93269/EM801(Celgene/EngMab),AMG 701或AMG 420(Amgen),JNJ-64007957(Janssen),SEA-BCMA(Seattle Genetics),和PF-06863135(Pfizer)。
示例性ADC包括MEDI2228(Medimmune),AMG 224(Amgen)和HDP-101(HeidelbergMax Eder)。
本领域技术人员可容易地确定适当的治疗有效剂量的BCMA抗原结合蛋白。如本文所用,术语“有效剂量”是指引起由例如研究人员或临床医生寻求的组织,系统,动物或人的生物或医疗响应的药物或药剂剂量。此外,术语“治疗有效剂量”是指与尚未接受此类剂量的相应受试者相比导致疾病,疾病或副作用的改善的治疗,治愈,预防或改善,或者疾病或病症的进展速率降低的任何剂量。该术语在其范围内还包括有效增强正常的生理功能的剂量。
本文所述的BCMA抗原结合蛋白的合适剂量可以针对患者根据其重量计算,例如合适的剂量可以在约0.1至约20mg/kg的范围内,例如约1至约20mg/kg,例如,约10至约20mg/kg或例如约1至约15mg/kg,例如约10至约15mg/kg。
在一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白的治疗有效剂量在约0.03mg/kg至约4.6mg/kg的范围内。在又一个实施方案中,BCMA抗原结合蛋白的治疗有效剂量为0.03mg/kg,0.06mg/kg,0.12mg/kg,0.24mg/kg,0.48mg/kg,0.96mg/kg,1.92mg/kg,2.5mg/kg,3.4mg/kg,或4.6mg/kg。在另一个实施方案中,治疗有效剂量的抗BCMA抗原结合蛋白为1.9mg/kg,2.5mg/kg或3.4mg/kg。
本发明的一方面提供了用于治疗患者的癌症的BCMA抗原结合蛋白,其中患者的特征在于来自患者的样品中表达可溶性BCMA。
本发明的一方面提供了用于治疗患者的癌症的BCMA抗原结合蛋白,其中患者的特征在于来自患者的样品中的高水平可溶性BCMA表达。
另一方面,本发明提供了用于治疗鉴定为具有高水平可溶性BCMA的患者的BCMA抗原结合蛋白。另一方面,本发明提供了用于治疗鉴定为具有高水平可溶性BCMA的患者的BCMA抗原结合蛋白;SBCMA的水平高于10ng/ml,且其中BCMA抗原结合蛋白为每人剂量的浓度/至少约1.92mg/kg的量。
药物组合物
本发明的一个方面提供了用于治疗患者中的癌症的药物组合物,其包含BCMA抗原结合蛋白和至少一种药学上可接受的赋形剂,其中患者的特征在于在来自患者的样品中表达可溶性BCMA。
本发明的一个方面提供了用于治疗患者中的癌症的药物组合物,其包含BCMA抗原结合蛋白,至少一种药学上可接受的赋形剂,其中患者的特征在于在来自患者的样品中高水平的可溶性BCMA表达。
方法和用途
本发明提供了一种诊断患者中的癌症的方法,包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达的存在。在一个实施方案中,若患者以高水平表达可溶性BCMA或表达sBCMA,则确定患者患有癌症。
在另一个实施方案中,诊断患者中的癌症的方法包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达的存在,其中若患者以高水平表达sBCMA,则确定患者患有癌症,其中高水平的sBCMA高于约5ng/ml,高于约10ng/ml,高于约20ng/ml,高于约30ng/ml,高于约40ng/ml,高于约50ng/ml,高于约60ng/ml,高于约70ng/ml,高于约80ng/ml,高于约90ng/ml,高于约100ng/ml,高于约200ng/ml,高于约300ng/ml,高于约400ng/ml,高于约500ng/ml,高于约600ng/ml,高于约700ng/ml,高于约800ng/ml,或高于约900ng/ml。
本发明还提供了确定患者(例如人受试者)中的癌症预后的方法,其包含(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平。在一个实施方案中,若患者表达可溶性BCMA,则预后或结果是差的。在另一个实施方案中,若患者表达高水平的可溶性BCMA,则预后或结果是差的。
癌症预后通常使用存活率测量。癌症统计学通常使用总体五年存活率。无疾病存活率是治疗后没有癌症证据的人数。无进展存活率是已经对癌症治疗并且没有癌症复发的体征或患有已经保持稳定而不生长的癌症的体征的人的数目。在另一个实施方案中,当使用本领域技术人员已知的癌症预后统计学,患者具有小于约70%,约60%,小于约50%,小于约40%,小于约30%,小于约20%,小于约15%,小于约10%,或小于约5%的存活机会时,预后是差的。
在一个实施方案中,当患者表达任何量的sBCMA时,患者的预后是差的。在一个实施方案中,当患者与参考样品相比表达任何量的sBCMA时,患者的预后是差的。
在一个实施方案中,当患者表达高水平的可溶性BCMA时,患者的预后是差的,其中高水平的sBCMA高于约5ng/ml,高于约10ng/ml,高于约20ng/ml,高于约30ng/ml,高于约40ng/ml,高于约50ng/ml,高于约60ng/ml,高于约70ng/ml,高于约80ng/ml,高于约90ng/ml,高于约100ng/ml,高于约200ng/ml,高于约300ng/ml,高于约400ng/ml,高于约500ng/ml,高于约600ng/ml,高于约700ng/ml,高于约800ng/ml,或高于约900ng/ml。
在另一个实施方案中,当患者表达大于约10ng/ml可溶性BCMA时,患者的预后是差的。在另一个实施方案中,当患者表达大于约10ng/ml可溶性BCMA时,患者的多发性骨髓瘤的预后是差的。
本发明的一方面提供了预测患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法,所述方法包括:(a)从患者获得样品;并且(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达可溶性BCMA,则预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
本发明的一方面提供了预测患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法,所述方法包含:(a)从患者获得样品;并且(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达高水平的可溶性BCMA,则预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
术语“响应”是本领域技术人员已知的。特定癌症领域的指导文件是本领域技术人员已知的,并为给定癌症类型提供“响应”的定义。例如,“响应”可以包括严格的完整缓解(sCR),完全缓解(CR),接近完全缓解(nCR),非常好的部分响应(VGPR),部分响应(PR)和/或稳定疾病(SD)。用于定义多发性骨髓瘤患者中对治疗的响应的示例性指导由国际血液和骨髓中心移植研究组(Center for International Blood&Marrow transplant Researchgroup)(CIBMTR)提供(见https://www.cibmtr.org/manuals/fim/1/en/topic/multiple-myeloma-response-criteria,2018,其公开内容完整并入本文)。在一个实施方案中,多发性骨髓瘤患者中对治疗的响应定义为严格的完全缓解(sCR),完全缓解(CR),接近完全缓解(nCR),非常好的部分响应(VGPR)或部分响应(PR)。
在另一方面,预测多发性骨髓瘤患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法包括:(a)从患者获得样品;并且(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达小于约100ng/ml,小于约90ng/ml,小于约80ng/ml,小于约70ng/ml,小于约60ng/ml,小于约50ng/ml,小于约40ng/ml,小于约30ng/ml,小于约20ng/ml,小于约10ng/ml,或小于约5ng/ml可溶性BCMA,则预测患者响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
在另一方面,预测多发性骨髓瘤患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法包括:(a)从患者获得样品;并且(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达小于约50ng/ml可溶性BCMA,则预测患者响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
在另一方面,预测多发性骨髓瘤患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中患者表达大于约10ng/ml,大于约20ng/ml,大于约30ng/ml,大于约40ng/ml,大约50ng/ml,大于约60ng/ml,大于约70ng/ml,大于约80ng/ml,大于约90ng/ml,或大于约100ng/ml可溶性BCMA,预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
在另一方面,预测多发性骨髓瘤患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达大于约50ng/ml可溶性BCMA,则预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
在另一方面,预测多发性骨髓瘤患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达大于约40ng/ml可溶性BCMA,则预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
在另一方面,预测多发性骨髓瘤患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达大于约50ng/ml可溶性BCMA,则预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
在另一方面,预测多发性骨髓瘤患者对用BCMA抗原结合蛋白治疗的响应的方法包括:(a)从患者获得样品;并且(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平,其中若患者表达大于约40ng/ml可溶性BCMA,则预测患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗,所述BCMA抗原结合蛋白包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH和含有SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中抗体与MMAF缀合。
本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括:(a)确定患者是否在从患者获得的样品中表达可溶性BCMA,并且(b)若患者表达可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
在一个实施方案中,本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括确定患者是否表达可溶性BCMA,其中若确定患者表达可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
在一个实施方案中,本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括确定患者是否表达高水平的可溶性BCMA,其中若确定患者表达高水平的可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括:(a)确定患者是否在从患者获得的样品中表达可溶性BCMA,并且(b)若患者表达可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白,其中确定患者具有多发性骨髓瘤,淋巴瘤,慢性淋巴细胞白血病,非何杰金淋巴瘤,滤泡性淋巴瘤或弥漫性大B细胞淋巴瘤,并且其中抗原结合包含含有SEQ IDNO:7所示的氨基酸序列的VH和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中抗体与MMAF缀合。
本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括:(a)确定患者是否在从患者获得的样品中表达高水平可溶性BCMA,并且(B)若患者表达高水平可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括:(a)确定患者是否在从患者获得的样品中表达可溶性BCMA,并且(b)若患者表达高水平的可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白,其中确定患者具有多发性骨髓瘤,淋巴瘤,慢性淋巴细胞白血病,非何杰金淋巴瘤,滤泡性淋巴瘤或弥漫性大B细胞淋巴瘤,其中其中抗原结合包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中抗体与MMAF缀合,并且在sBMCA水平为至少约10ng/mL时,sBCMA表达是高的。
本发明提供了治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括:(a)确定从患者获得的样品中可溶性BCMA的水平,并且若可溶性BCMA的水平是高的,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。在一个实施方案中,sBCMA的水平是高的。
本发明还提供了用于治疗患者(例如人患者或受试者)中癌症的方法,其包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达;并且(c)若患者表达可溶性BCMA,或表达高水平的可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
在一个实施方案中,当患者在样品中表达任何量的sBCMA时,患者表达可溶性BCMA。在一个实施方案中,当患者与参考样品相比在样品中表达任何量的sBCMA时,患者表达可溶性BCMA。
在另一个实施方案中,本发明还提供了治疗患者(例如人患者或受试者)中的癌症的方法,其包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达;并且(c)若患者表达高水平的可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白,其中当样品中的sBCMA的量高于约5ng/ml,高于约10ng/ml,高于约20ng/ml,高于约30ng/ml,高于约40ng/ml,高于约50ng/ml,高于约60ng/ml,高于约70ng/ml,高于约80ng/ml,高于约90ng/ml,高于约100ng/ml,高于约200ng/ml,高于约300ng/ml,高于约400ng/ml,高于约500ng/ml,高于约600ng/ml,高于约700ng/ml,高于约800ng/ml,或高于约900ng/ml时,患者表达高水平的可溶性BCMA。
在另一个实施方案中,本发明还提供了治疗患者(例如人患者或受试者)中的癌症的方法,其包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达;并且(c)若患者表达高水平的可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白,其中当样品中的sBCMA的量高于约10ng/ml时,患者表达高水平的可溶性BCMA。
在另一个实施方案中,本发明还提供了治疗患者(例如人患者或受试者)中的癌症的方法,其包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达;并且(c)若患者表达高水平的可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白,其中当样品中的sBCMA的量高于约10ng/ml时,患者表达高水平的可溶性BCMA;其中癌症选自多发性骨髓瘤,淋巴瘤,慢性淋巴细胞白血病,非何杰金淋巴瘤,滤泡性淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤。
在另一个实施方案中,本发明还提供了治疗患者(例如人患者或受试者)中的癌症的方法,其包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达;并且(c)若患者表达高水平的可溶性BCMA,则对患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白,其中当样品中的sBCMA的量高于约10ng/ml时,患者表达高水平的可溶性BCMA;其中癌症选自多发性骨髓瘤,淋巴瘤,慢性淋巴细胞白血病,非何杰金淋巴瘤,滤泡性淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤;并且其中抗原结合包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中抗体与MMAF缀合。
本发明提供了选择用于治疗有此需要的患者的BCMA抗原结合蛋白的剂量的方法,包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平;(c)若患者的可溶性BCMA表达低,则用低剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗患者;或者,若患者具有高可溶性BCMA表达,则用高剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗患者。
在一个实施方案中,本发明提供了选择用于治疗有此需要的患者的BCMA抗原结合蛋白的剂量的方法,包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平;(c)若患者具有低可溶性BCMA表达,则用低剂量的BCMA抗原结合蛋白处理患者,其中当样品中可溶性BCMA的量低于约300ng/时,患者具有低可溶性BCMA表达。ml,低于约200ng/ml,低于约100ng/ml,低于约90ng/ml,低于约80ng/ml,低于约70ng/ml,低于约60ng/ml,低于约50ng/ml,低于约40ng/ml,低于约30ng/ml,低于约20ng/ml,低于约10ng/ml,或低于约5ng/ml。
在一个实施方案中,本发明提供了选择用于治疗有此需要的患者的BCMA抗原结合蛋白的剂量的方法,包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平;(c)若患者的可溶性BCMA表达低,用低剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗患者,其中当样品中可溶性BCMA的量低于约10ng/时,患者具有低可溶性BCMA表达。ml。
在一个实施方案中,本发明提供了选择用于治疗有此需要的患者的BCMA抗原结合蛋白的剂量的方法,包括:(a)从患者获得样品;(b)测试样品的可溶性BCMA表达水平;(c)若患者具有高可溶性BCMA表达,则用高剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗患者,其中当样品中可溶性BCMA的量高于约5ng/时,患者具有高可溶性BCMA表达。m1,高于约10ng/ml,高于约20ng/ml,高于约30ng/ml,高于约40ng/ml,高于约50ng/ml,高于约60ng/ml,高于约70ng/ml,高于约80ng/ml,高于约90ng/ml,高于约100ng/ml,高于约200ng/ml,高于约300ng/ml,高于约400ng/ml,高于约500ng/ml,高于约600ng/ml,高于约700ng/ml,高于约800ng/ml,或高于约900ng/ml。
在一个实施方案中,本发明提供了用于选择BCMA抗原结合蛋白剂量以在有此需要的患者中治疗癌症的方法,其包括:(a)从所述患者获得样品;(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;并且(c)若所述患者具有低的可溶性BCMA表达,则用低剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者;或者,若所述患者具有高的可溶性BCMA表达,则用高剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者。
在一个实施方案中,本发明提供了用于选择BCMA抗原结合蛋白剂量以在有此需要的患者中治疗癌症的方法,其包括:(a)从所述患者获得样品;(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;并且(c)若所述患者具有低的可溶性BCMA表达,则用低剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者,其中当样品中可溶性BCMA的量低于约300ng/ml,低于约200ng/ml,低于约100ng/ml,低于约90ng/ml,低于约80ng/ml,低于约70ng/ml,低于约60ng/ml,低于约50ng/ml,低于约40ng/ml,低于约30ng/ml,低于约20ng/ml,低于约10ng/ml或低于约5ng/ml时,患者具有低可溶性BCMA表达。
在一个实施方案中,本发明提供了用于选择BCMA抗原结合蛋白剂量以在有此需要的患者中治疗癌症的方法,其包括:(a)从所述患者获得样品;(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;并且(c)若所述患者具有低的可溶性BCMA表达,则用低剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者,其中当样品中可溶性BCMA的量低于约10ng/ml时,患者具有低可溶性BCMA表达。
在一个实施方案中,本发明提供了用于选择BCMA抗原结合蛋白剂量以在有此需要的患者中治疗癌症的方法,其包括:(a)从所述患者获得样品;(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;并且(c)若患者具有高可溶性BCMA表达,则用高剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗患者,其中当样品中可溶性BCMA的量高于约5ng/ml,高于约10ng/ml,高于约20ng/ml,高于约30ng/ml,高于约40ng/ml,高于约50ng/ml,高于约60ng/ml,高于约70ng/ml,高于约80ng/ml,高于约90ng/ml,高于约100ng/ml,高于约200ng/ml,高于约300ng/ml,高于约400ng/ml,高于约500ng/ml,高于约600ng/ml,高于约700ng/ml,高于约800ng/ml或高于约900ng/ml时,患者具有高可溶性BCMA表达。
在一个实施方案中,本发明提供了用于选择BCMA抗原结合蛋白剂量以在有此需要的患者中治疗癌症的方法,其包括:(a)从所述患者获得样品;(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;并且(c)若患者具有高可溶性BCMA表达,则用高剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗患者,其中当样品中可溶性BCMA的量大于约10ng/ml时,患者具有高可溶性BCMA表达。
在一个实施方案中,低剂量的BCMA抗原结合蛋白小于4.6mg/kg。在另一个实施方案中,低剂量的BCMA抗原结合蛋白是0.03mg/kg,0.06mg/kg,0.12mg/kg,0.24mg/kg,0.48mg/kg,0.96mg/kg,1.92mg/kg,2.5mg/kg或3.4mg/kg。
在一个实施方案中,高剂量的BCMA抗原结合蛋白大于0.96mg/kg。在另一个实施方案中,高剂量的BCMA抗原结合蛋白为0.96mg/kg,1.92mg/kg,2.5mg/kg,3.4mg/kg或4.6mg/kg。
本发明的一方面提供了BCMA抗原结合蛋白在制备用于治疗患者中的癌症的药物中的用途,其中确定从患者受试者获得的样品表达可溶性BCMA。本发明的另一方面提供了BCMA抗原结合蛋白在制备用于治疗患者中的癌症的药物中的用途,其中确定从患者获得的样品具有高水平的可溶性BCMA表达。
在一个实施方案中,当患者在样品中表达任何量的sBCMA时,患者表达可溶性BCMA。在另一个实施方案中,当样品中的sBCMA的量高于约5ng/ml,高于约20ng/ml,高于约30ng/mL,高于约40ng/ml,高于约50ng/ml,高于约60ng/ml,高于约70ng/ml,高于约80ng/ml,高于约90ng/ml,高于约100ng/ml,高于约200ng/ml,高于约300ng/ml,高于约400ng/ml,高于约500ng/ml,高于约600ng/ml,高于约700ng/ml,高于约800ng/ml,或高于约900ng/ml时,患者表达高水平的可溶性BCMA。
本发明的一方面提供了BCMA抗原结合蛋白在制备用于治疗患者中的癌症的药物中的用途,其中确定从患者受试者获得的样品表达可溶性BCMA;并且其中确定患者具有多发性骨髓瘤,淋巴瘤,慢性淋巴细胞白血病,非何杰金淋巴瘤,滤泡性淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤;并且其中患者表达至少约10ng/ml的sBCMA。
在本文所述的任何实施方案中,当患者以高于约5ng/ml,高于约10ng/ml,高于约20ng/ml,高于约30ng/ml,高于约40ng/ml,高于约50ng/ml,高于约60ng/ml,高于约70ng/ml,高于约80ng/ml,高于约90ng/ml,高于约100ng/ml,高于约200ng/ml,高于约300ng/ml,高于约400ng/ml,高于约500ng/ml,高于约600ng/ml,高于约700ng/ml,高于约800ng/ml,或高于约900ng/ml的水平表达可溶性BCMA时,患者表达高水平的可溶性BCMA。
在一些实施方案中,除了用BCMA抗原结合蛋白的治疗外,还可以用一种或多种另外的癌症治疗剂或抗肿瘤剂进一步治疗患者。通常,可以在本发明中的癌症治疗中共施用对所治疗的易感性肿瘤具有活性的任何抗肿瘤剂。本领域普通技术人员将能够基于药物的特定特征和所涉及的癌症辨别哪些药剂的组合会是有用的。
可用于本发明的典型的抗肿瘤剂包括但不限于抗微管剂或抗有丝分裂剂,例如二萜类化合物和长春花生物碱类;铂配位络合物;沙立度胺类似物(IMiDs);免疫治疗性抗体(例如抗PD1,抗PDL1,抗CD38,抗ICOS,抗OX40);烷基化剂如氮芥,氧氮磷环类(oxazaphosphorines),烷基磺酸盐,亚硝基脲和三氮烯;抗生素如放线菌素,蒽环类药物和博来霉素;拓扑异构酶I抑制剂,如喜树碱;拓扑异构酶II抑制剂,如表鬼臼毒素;抗代谢物如嘌呤和嘧啶类似物和抗叶酸化合物;激素和激素类似物;信号转导途径抑制剂;非受体酪氨酸激酶血管发生抑制剂;免疫治疗剂;促凋亡剂;细胞周期信号传导抑制剂;蛋白酶体抑制剂;热休克蛋白抑制剂;癌代谢抑制剂;化学治疗剂;类固醇(例如地塞米松);免疫调节剂;免疫调节剂;免疫调节物;和免疫刺激性佐剂。
在一个实施方案中,另外的抗肿瘤剂是选自抗PD1抗体,抗ICOS抗体和抗OX40抗体,抗CD38抗体,蛋白酶体抑制剂,沙立度胺类似物和地塞米松的至少一种。
本领域技术人员可容易地确定另外的癌症治疗剂或抗肿瘤剂的适当的治疗有效剂量。如本文所用,另外的癌症治疗剂或抗肿瘤剂的术语“有效剂量”是指将引起由例如研究人员或临床医生寻求的组织,系统,动物或人的生物或医疗响应的药物或药剂剂量。此外,另外的癌症治疗剂或抗肿瘤剂的术语“治疗有效剂量”是指与尚未接受此类剂量的相应受试者相比导致疾病,疾病或副作用的改善的治疗,治愈,预防或改善,或者疾病或病症的进展速率降低的任何剂量。该术语在其范围内还包括有效增强正常的生理功能的剂量。
测量可溶性BCMA
样品中可溶性BCMA可以通过本领域已知的各种技术来测量。测定法对于检测游离循环可溶性BCMA以及与BCMA抗原结合蛋白结合的可溶性BCMA可以是特异性的。例如,可以使用酶联免疫吸附测定法(ELISA),Western印迹测定法,质谱法,meso scale discovery(MSD),免疫组织化学(IHC),免疫沉淀,免疫荧光,流式细胞术或其他基于抗体的捕获/检测方法来测量样品中的sBCMA水平。各种检测部分可包括生物素/链霉抗生物素蛋白结合,比色测定,紫外,荧光,电化学或本领域技术人员已知的其他检测方法。
可以通过将目的样品与参考样品或对照样品进行比较来确定sBCMA存在或表达水平。例如,参考样品或对照样品可以是:1)已知不含sBCMA的样品(例如缓冲剂对照或来自健康供体的样品);2)阴性对照样品,其中不有意包含特定的测定试剂以获得阴性信号;3)几个样品,其含有不同量的sBCMA,以用于定量感兴趣样品中的sBCMA量的标准曲线;或4)作为本领域技术人员的常见做法的其他对照或参考样品。
在一个实施方案中,使用用于检测的手段在样品中检测sBCMA,所述手段包括捕获抗体和/或检测抗体,其结合样品中的sBCMA(游离或与BCMA抗原结合蛋白结合),其中所述手段包括检测部分。
在图1中演示了用于检测sBCMA的示例性测定法。这些测定法在本文和实施例1中进一步描述。
图1a演示了用于检测游离sBCMA(不与BCMA抗原结合蛋白结合的sBCMA)的示例性方法。在一个示例性实施方案中,使用实施例1中描述的方法检测游离sBCMA。
图1b演示了用于检测与BCMA抗原结合蛋白结合的sBCMA的示例性方法。在一个示例性实施方案中,使用实施例1中描述的方法检测与BCMA抗原结合蛋白结合的sBCMA。
试剂盒
在一个实施方案中,提供用于治疗癌症的试剂盒,其包含用于测定来自患者的样品,例如人血清样品中sBCMA水平的手段(例如,试剂)。在一个实施方案中,用于测定样品中sBCMA水平的手段包括捕获抗体和/或检测抗体,其结合样品中的sBCMA并且含有检测部分。试剂盒可以包括本文描述的任何手段,用于检测样品中的sBCMA。
序列列表
Figure BDA0003037628250000281
Figure BDA0003037628250000291
实施例
以下实施例说明了本发明的各种非限制性方面。
方法:
在剂量升级临床研究中,用J6M0-MMAF治疗38个受试者(部分1)。剂量范围为0.03mg/kg直至4.60mg/kg(0.03mg/kg,0.06mg/kg,0.24mg/kg,0.48mg/kg,0.96mg/kg,1.92mg/kg,2.5mg/kg,3.4mg/kg和4.6mg/kg)。35个受试者的扩充分组以剂量3.40mg/kg跟随(部分2)。证明了根据IMWG标准的60%(21/35;95%CI 42.1-76.1)的总体响应率(ORR)。在这些研究期间,遵循循环可溶性BCMA(sBCMA)的水平。在J6M0-MMAF的输注前和输注后收集的血清样品中测量可溶性BCMA。使用免疫测定法(图1)测定游离sBCMA(图1a)和J6M0-MMAF结合的sBCMA(图1b)的水平。
游离sBCMA测定方案(图1a)
1.1.抗BCMA抗体包被板(3μg/ml)的制备
1.制备合适体积(约3mL/板)捕获包被抗体-DPBS中3μg/mL的抗BCMA抗体(J6M0)
2.将25μL包被溶液分配到96孔高结合MSD板(MSD标准链霉抗生物素蛋白包被的96孔板-Meso Scale Discovery Cat#L11SA)的每个孔。
3.用板密封器覆盖MSD板,并在平表面上在2-8℃冷冻器中温育过夜(18Hr±3Hr)。
1.2.huBCMA标准曲线的制备
1.在测定当天,在BCMA消减的血清中制备范围为1000ng/ml至0ng/ml的已知量BCMA的12点标准曲线。
1.3.将样品转移到板上
1.用洗涤缓冲液(1xPBST)洗涤MSD板3次。
2.将25μL稀释标准曲线和测试样品转移到MSD测定板上。所有样品一式两份测试。
3.将样品以约600rpm的速度在振荡器上温育1小时(±5min)。
1.4.检测抗体和报告物的制备
1.在样品温育结束前10分钟,检测抗体(生物素化抗BCMA pAB-R&Dsystems#BAF193)在抗体稀释剂中以3μg/mL如下制备:
将180μL BAF193(50μg/mL)加入18μL链霉抗生物素蛋白Sulfo TAG(0.5mg/mL)(Meso Scale Discovery#R32AD-1)+2802μL的抗体稀释剂(1%BSA/1XDPBS)。
2.用洗涤缓冲液(1xPBST)洗涤MSD板3次。
3.将25μL检测抗体溶液加入到测定板的每个孔中。
4.将板覆盖,并在室温下在约600rpm的振动器上放置1小时(±5min)。
1.5.读取缓冲液
1.如下制备1x MSD读取缓冲液:
5ml 4x MSD读取缓冲液T(Meso Scale Discovery#R92TC-1)加15ml Milli-Q水。
2.用洗涤缓冲液(1xPBST)洗涤MSD板3次。
3.将150μL的1x读取缓冲液转移到测定板的每个孔中。
4.通过使用MSD Sector Imager 6000(Meso Scale Discovery)立即读取MSD测定板。
结合的sBCMA测定方案(与J6M0-MMAF结合的sBCMA)(图1b)
2.1板包被
1.将生物素化的抗BCMA pAb(R&D Systems#BAF193)在1X PBS中稀释至50μg/mL的浓度。
2.将180μL的生物素-BAF193(50μg/mL)加入5820μl包被缓冲液(25mM Hepes/0.015%Triton X-100)中。
3.将50μl包被溶液分配到MSD标准链霉抗生物素蛋白包被的96孔板(Meso ScaleDiscovery Cat#L11SA)的每个孔中。
4.覆盖板并在2-8℃冷冻器中温育过夜。
2.2.对板进行封闭
1.用洗涤缓冲液(0.1%DPBST)洗涤MSD板。
2.将150μl 3%封闭缓冲液(MSD Blocker A–Meso Scale Discovery#R93BA-4)转移到板上的每个孔中。
3.将板覆盖并在室温下放置在板式振荡器(约600rpm)上1-2小时。
2.3.制备标准曲线,样品和QCS进行分析
1.在BCMA消减的血清中制备已知量的BCMA/J6M0-MMAF的9点标准曲线,范围为200ng/ml BCMA/20μg/mL J6M0-MMAF至0ng/ml BCMA/0μg/mL J6M0-MMAF。
2.4.将样品转移到测定板上
1.用洗涤缓冲液(0.1%DPBST)洗涤MSD板。
2.将25μL稀释标准曲线和测试样品转移到MSD测定板上。所有样品一式两份测试。
3.将测定板覆盖并在室温下放置在板振荡器(约600rpm)上,并且温育2小时±5分钟。
2.5.检测抗体(sTag抗澳瑞他汀MMAF抗体)
1.在抗体稀释剂(1%BSA/1X DPBS)中将sTag-钌抗澳瑞他汀MMAF抗体稀释至1μg/ml。(将12μl sTag抗澳瑞他汀MMAF(0.5mg/ml)加入5988ml抗体稀释剂)。
2.用洗涤缓冲液(0.1%DPBST)洗涤MSD板。
3.将25μl sTag抗澳瑞他汀溶液加入到板上的每个孔中。
4.将板覆盖并在室温下振动(600rpm)温育1小时±5分钟。
2.6.板读取
1.在约1小时后,用洗涤缓冲液(0.1%DPBST)洗涤板。
2.将150μl的2倍MSD读取缓冲液T(Meso Scale Discovery#R92TC-1)添加到板的每个孔中。
3.在MSD SECTOR Imager 6000(Meso Scale Discovery)上10分钟内读取板。
实施例1
在来自健康供体(n=10),来自多发性骨髓瘤(MM)患者(n=10)的血清中,以及从本文所述的临床研究中登记的患者的样品测量可溶性BCMA。来自临床研究的样品中观察到的基线sBCMA水平与在多发性骨髓瘤患者中观察到的水平相当,并且比在健康供体血清中观察到的水平显示更高的水平(图2)。循环的sBCMA检查揭示了高的sBCMA水平,在所有剂量上具有58ng/ml的游离sBCMA的基线中值浓度(n=68;范围4ng/ml至>1000ng/ml)。
实施例2
在来自剂量扩充分组(部分2)的受试者的基线(在输注前)测量可溶性BCMA。图3表明相对于sBCMA的基线测量对每位患者获得的最佳确认响应。基线sBCMA的水平通常在非响应患者中较低(81ng/ml,n=12;与43ng/ml,n=19相比)。在响应者中也发现高基线sBCMA水平,水平高达262ng/mL。
通过比较输注开始后60分钟测量的游离sBCMA的输注后水平与输注前发现的水平测量J6M0-MMAF与sBCMA的结合。图4表明,游离sBCMA的减少似乎与施用的剂量水平有关,并且高于1.92mg/kg的剂量始终实现大于90%的游离sBMCA减少(自基线的百分比变化)。点根据患者具有PR或更好(R)的最佳临床响应,还是非响应者(NR)着色。每个剂量组的平均百分比降低显示为水平黑线。部分1是剂量升级分组,并且部分2是剂量扩充分组。
在更高的剂量水平,发现J6M0-MMAF结合大部分sBCMA,并在60%的具有低或高基线sBCMA的剂量扩充受试者中观察到对J6M0-MMAF的响应。与响应者相比非响应者中基线sBCMA更高,因为J6M0-MMAF被可溶性BCMA结合,如高于1.92mg/kg的剂量证明的,实现游离sBCMA的大于90%减少。
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<400> 1
Asn Tyr Trp Met His
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<211> 17
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成序列
<400> 2
Ala Thr Tyr Arg Gly His Ser Asp Thr Tyr Tyr Asn Gln Lys Phe Lys
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Gly
<210> 3
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<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成序列
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Gly Ala Ile Tyr Asp Gly Tyr Asp Val Leu Asp Asn
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<211> 11
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成序列
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Ser Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr Leu Asn
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<220>
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<220>
<223> 人工合成序列
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<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成序列
<400> 7
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Asn Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ala Thr Tyr Arg Gly His Ser Asp Thr Tyr Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Ala Ile Tyr Asp Gly Tyr Asp Val Leu Asp Asn Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120
<210> 8
<211> 108
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成序列
<400> 8
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Tyr Thr Ser Asn Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Arg Lys Leu Pro Trp
85 90 95
Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
100 105
<210> 9
<211> 451
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成序列
<400> 9
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Asn Tyr
20 25 30
Trp Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Ala Thr Tyr Arg Gly His Ser Asp Thr Tyr Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Lys Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Gly Ala Ile Tyr Asp Gly Tyr Asp Val Leu Asp Asn Trp Gly
100 105 110
Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135 140
Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
180 185 190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
210 215 220
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
225 230 235 240
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
260 265 270
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
290 295 300
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
370 375 380
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
405 410 415
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
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435 440 445
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450
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<211> 214
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人工合成序列
<400> 10
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Ser Ala Ser Gln Asp Ile Ser Asn Tyr
20 25 30
Leu Asn Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu Ile
35 40 45
Tyr Tyr Thr Ser Asn Leu His Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly
50 55 60
Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro
65 70 75 80
Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Arg Lys Leu Pro Trp
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Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala
100 105 110
Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly
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Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala
130 135 140
Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln
145 150 155 160
Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser
165 170 175
Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr
180 185 190
Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser
195 200 205
Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 11
<211> 184
<212> PRT
<213> 智人
<400> 11
Met Leu Gln Met Ala Gly Gln Cys Ser Gln Asn Glu Tyr Phe Asp Ser
1 5 10 15
Leu Leu His Ala Cys Ile Pro Cys Gln Leu Arg Cys Ser Ser Asn Thr
20 25 30
Pro Pro Leu Thr Cys Gln Arg Tyr Cys Asn Ala Ser Val Thr Asn Ser
35 40 45
Val Lys Gly Thr Asn Ala Ile Leu Trp Thr Cys Leu Gly Leu Ser Leu
50 55 60
Ile Ile Ser Leu Ala Val Phe Val Leu Met Phe Leu Leu Arg Lys Ile
65 70 75 80
Asn Ser Glu Pro Leu Lys Asp Glu Phe Lys Asn Thr Gly Ser Gly Leu
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Leu Gly Met Ala Asn Ile Asp Leu Glu Lys Ser Arg Thr Gly Asp Glu
100 105 110
Ile Ile Leu Pro Arg Gly Leu Glu Tyr Thr Val Glu Glu Cys Thr Cys
115 120 125
Glu Asp Cys Ile Lys Ser Lys Pro Lys Val Asp Ser Asp His Cys Phe
130 135 140
Pro Leu Pro Ala Met Glu Glu Gly Ala Thr Ile Leu Val Thr Thr Lys
145 150 155 160
Thr Asn Asp Tyr Cys Lys Ser Leu Pro Ala Ala Leu Ser Ala Thr Glu
165 170 175
Ile Glu Lys Ser Ile Ser Ala Arg
180

Claims (33)

1.用于确定患者中的癌症预后的方法,其包括:
(a)从所述患者获得样品;并且
(b)对所述样品测试可溶性BCMA表达的存在;
其中若所述患者具有可溶性BCMA的表达,则所述患者的预后是差的。
2.用于确定患者中的癌症预后的方法,其包括:
(a)从所述患者获得样品;并且
(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;
其中若所述患者具有高水平的可溶性BCMA表达,则所述患者的预后是差的。
3.预测患者对用BCMA抗原结合蛋白的治疗的响应的方法,其包括:(a)从患者获得样品;并且(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平,其中若所述患者表达高水平的可溶性BCMA,则预测所述患者不响应用BCMA抗原结合蛋白的治疗。
4.权利要求3的方法,其中所述患者是多发性骨髓瘤患者,并且其中在可溶性BCMA表达水平大于约40ng/ml或大于50ng/ml时,所述可溶性BCMA表达是高的。
5.权利要求4的方法,其中预测所述多发性骨髓瘤患者不响应BCMA抗原结合蛋白的治疗,所述BCMA抗原结合蛋白包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH;包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,并且其中所述抗体与MMAF缀合。
6.用于治疗有此需要的患者中的癌症的方法,其包括:
(a)从所述患者获得样品;并且
(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达;并且
(c)若所述受试者表达可溶性BCMA,则对所述患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
7.用于治疗有此需要的患者中的癌症的方法,其包括:
(a)从所述患者获得样品;并且
(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;并且
(c)若所述患者具有高水平的可溶性BCMA表达,则对所述患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
8.权利要求7的方法,其中当可溶性BCMA水平高于约10ng/ml时,所述样品中可溶性BCMA表达的水平是高的。
9.用于选择BCMA抗原结合蛋白剂量以在有此需要的患者中治疗癌症的方法,其包括:
(a)从所述患者获得样品;
(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达水平;并且
(c)若所述患者具有低水平的可溶性BCMA表达,则用低剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者;或者,若所述患者具有高水平的可溶性BCMA表达,则用高剂量的BCMA抗原结合蛋白治疗所述患者。
10.诊断患者中的癌症的方法,其包括:(a)从所述患者获得样品;并且(b)测试所述样品的可溶性BCMA表达的存在。
11.前述权利要求中任一项的方法,其中所述患者是人患者。
12.权利要求1-3和6-10的方法,其中所述癌症选自下组:多发性骨髓瘤、淋巴瘤、慢性淋巴细胞性白血病、非何杰金氏淋巴瘤、滤泡性淋巴瘤和弥漫性大B细胞淋巴瘤。
13.权利要求1-3和6-10的方法,其中所述癌症是多发性骨髓瘤,淋巴瘤。
14.前述权利要求中任一项的方法,其中所述样品是血清或血液样品。
15.权利要求3、4、6-9的方法,其中所述BCMA抗原结合蛋白是抗体、抗体片段、双特异性抗体、抗体-药物-缀合物、双特异性T细胞结合剂(BITE)或嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)。
16.权利要求15的方法,其中所述BCMA抗原结合蛋白是单克隆抗体,其包含含有SEQ IDNO:7所示的氨基酸序列的VH;和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中所述抗体与MMAF缀合。
17.权利要求6-9的方法,其中用至少一种另外的抗肿瘤剂进一步治疗所述患者。
18.权利要求17的方法,其中所述至少一种另外的肿瘤剂选自下组:抗PD1抗体、抗-ICOS抗体和抗OX40抗体、抗CD38抗体、蛋白酶体抑制剂、沙立度胺类似物和地塞米松。
19.BCMA抗原结合蛋白,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者以来自所述患者的样品中的高水平可溶性BCMA表达为特征。
20.BCMA抗原结合蛋白,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者在来自所述患者的样品中表达可溶性BCMA。
21.权利要求19或20的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白是抗体、抗体片段、双特异性抗体、抗体-药物-缀合物、双特异性T细胞结合剂(BITE)或嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)。
22.权利要求21的抗原结合蛋白,其中所述抗原结合蛋白是单克隆抗体,其包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH;和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中所述抗体与MMAF缀合。
23.药物组合物,其包含BCMA抗原结合蛋白和至少一种药学上可接受的赋形剂,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者以来自所述患者的样品中的高水平可溶性BCMA表达为特征。
24.药物组合物,其包含BCMA抗原结合蛋白和至少一种药学上可接受的赋形剂,用于在治疗患者中的癌症中使用,其中所述患者在来自所述患者的样品中表达可溶性BCMA。
25.权利要求23或24的药物组合物,其中所述抗原结合蛋白是抗体、抗体片段、双特异性抗体、抗体-药物-缀合物、双特异性T细胞结合剂(BITE)或嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)。
26.权利要求25的药物组合物,其中所述抗原结合蛋白是单克隆抗体,其包含含有SEQID NO:7所示的氨基酸序列的VH;和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中所述抗体与MMAF缀合。
27.用于在患者中用BCMA抗原结合蛋白治疗癌症的试剂盒,其包含用于测定来自所述患者的样品中可溶性BCMA水平的手段。
28.BCMA抗原结合蛋白在制备用于治疗患者中的癌症的药物中的用途,其中确定从所述患者获得的样品表达可溶性BCMA。
29.BCMA抗原结合蛋白在制备用于治疗患者中的癌症的药物中的用途,其中确定从所述患者获得的样品具有高水平的可溶性BCMA表达。
30.权利要求28或29的用途,其中所述抗原结合蛋白是抗体、抗体片段、双特异性抗体、抗体-药物-缀合物、双特异性T细胞结合剂(BITE)或嵌合抗原受体T细胞(CAR-T)。
31.权利要求30的用途,其中所述抗原结合蛋白是单克隆抗体,其包含含有SEQ ID NO:7所示的氨基酸序列的VH;和包含SEQ ID NO:8所示的氨基酸序列的VL,其中所述抗体与MMAF缀合。
32.用于治疗有此需要的患者中的癌症的方法,其包括确定所述患者是否表达可溶性BCMA,其中若确定所述患者表达可溶性BCMA,则对所述患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
33.用于治疗有此需要的患者中的癌症的方法,包括确定所述患者是否表达高水平的可溶性BCMA,其中若确定所述患者表达高水平的可溶性BCMA,则对所述患者施用有效量的BCMA抗原结合蛋白。
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