CN112940092A - 玉米ZmbHLH124蛋白质及其编码基因在调控植物耐旱性中的应用 - Google Patents

玉米ZmbHLH124蛋白质及其编码基因在调控植物耐旱性中的应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了玉米ZmbHLH124蛋白质及其编码基因在调控植物耐旱性中的应用。所述ZmbHLH124蛋白质是如下a)或b)或c)或d)的蛋白质:a)氨基酸序列是序列2所示的蛋白质;b)在序列2所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白质;c)将序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的具有相同功能的蛋白质;d)与序列2所示的氨基酸序列具有75%或75%以上的同源性且具有相同功能的蛋白质。本发明通过将ZmbHLH124基因分别导入单子叶受体植物玉米、水稻和双子叶受体植物拟南芥中发现,ZmbHLH124基因过表达可以提高植物耐旱性。

Description

玉米ZmbHLH124蛋白质及其编码基因在调控植物耐旱性中的 应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及玉米ZmbHLH124蛋白质及其编码基因在调控植物耐旱性中的应用。
背景技术
植物生长在一个不断变化的环境之中,与动物可以主动逃避不利环境不同,植物因固着生长的特性不可避免地直接面对环境的改变,这其中包括各种非生物胁迫的影响,例如干旱、炎热、低温、营养缺失、土壤盐碱化以及重金属胁迫等等。而对于各种谷物来说,干旱是限制生长发育和产量增长的最主要因素,严重时甚至会导致植株死亡,最终造成减产或绝收,威胁世界粮食安全。近年来,全球人口急剧增加,加剧了气候变化和淡水资源的紧缺,严重影响到全球农业的发展,尤其是作物产量的提高。因此,提高作物的耐旱性刻不容缓。
玉米(Zea mays L.)与小麦、水稻并称为世界三大粮食作物。虽然玉米种植面积位居全球第三,但却是产量最高的作物,不仅可以用作饲料,还是重要的工业原料,每年大概有10亿吨的产出,在美洲、亚洲、非洲以及欧洲有着极其广泛的种植。中国拥有世界三大黄金玉米带之一,玉米的播种面积在3500万公顷,年产量在2.15亿吨左右。维持玉米种植面积和保证产量稳中有升,对我国农业可持续发展和保护粮食安全具有举足轻重的作用。而适宜玉米种植的区域多数属于雨养区,易受干旱影响,而玉米在生长过程中需水量较大且对干旱的耐受程度偏低,缺水会严重制约玉米的正常生长发育过程,尤其是生殖生长发育阶段的水分缺失(即开花前后的水分胁迫)会严重影响玉米的各种生理特性,最终造成产量的损失,缺水严重时,甚至可导致玉米绝收,因此提高玉米耐旱性势在必行。寻找玉米中与耐旱相关的基因,研究其响应干旱的遗传机制,对玉米耐旱性的遗传改良具有重要的指导意义。
发明内容
本发明的目的是如何调控植物耐旱性。
为了实现上述目的,本发明首先提供了一种蛋白质。
本发明提供的蛋白质来源于玉米(Zea mays L.),名称为ZmbHLH124蛋白质,是如下a)或b)或c)或d)所示的蛋白质:
a)氨基酸序列是序列2所示的蛋白质;
b)在序列2所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白质;
c)将序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的具有相同功能的蛋白质;
d)与序列2所示的氨基酸序列具有75%或75%以上的同源性且具有相同功能的蛋白质。
所述b)中的ZmbHLH124蛋白质,所述标签是指利用DNA体外重组技术,与目的蛋白一起融合表达的一种多肽或者蛋白质,以便于目的蛋白的表达、检测、示踪和/或纯化。所述标签可为Flag标签、His标签、MBP标签、HA标签、myc标签、GST标签和/或SUMO标签等。
上述c)中的ZmbHLH124蛋白质,所述一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加为不超过10个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加。
上述c)中的ZmbHLH124蛋白质可人工合成,也可先合成其编码基因,再进行生物表达得到。
上述c)中的ZmbHLH124蛋白质的编码基因可通过将序列1所示的DNA序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子,和/或进行一个或几个碱基对的错义突变,和/或在其5′端和/或3′端连接上述标签的编码序列得到。
为了实现上述目的,本发明又提供了与ZmbHLH124蛋白质相关的生物材料。
本发明提供的与ZmbHLH124蛋白质相关的生物材料为下述A1)至A12)中的任一种:
A1)编码ZmbHLH124蛋白质的核酸分子;
A2)含有A1)所述核酸分子的表达盒;
A3)含有A1)所述核酸分子的重组载体;
A4)含有A2)所述表达盒的重组载体;
A5)含有A1)所述核酸分子的重组微生物;
A6)含有A2)所述表达盒的重组微生物;
A7)含有A3)所述重组载体的重组微生物;
A8)含有A4)所述重组载体的重组微生物;
A9)含有A1)所述核酸分子的转基因植物细胞系;
A10)含有A2)所述表达盒的转基因植物细胞系;
A11)含有A3)所述重组载体的转基因植物细胞系;
A12)含有A4)所述重组载体的转基因植物细胞系。
上述生物材料中,A1)所述核酸分子为如下1)或2)或3)所示的基因:
1)其编码序列是序列1所示的cDNA分子或序列3所示的基因组DNA分子;
2)与1)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且编码ZmbHLH124蛋白质的cDNA分子或基因组DNA分子;
3)在严格条件下与1)或2)限定的核苷酸序列杂交,且编码ZmbHLH124蛋白质的cDNA分子或基因组DNA分子。
其中,所述核酸分子可以是DNA,如cDNA、基因组DNA或重组DNA;所述核酸分子也可以是RNA,如mRNA或hnRNA等。
本领域普通技术人员可以很容易地采用已知的方法,例如定向进化和点突变的方法,对本发明的编码ZmbHLH124蛋白质的核苷酸序列进行突变。那些经过人工修饰的,具有与本发明分离得到的ZmbHLH124核苷酸序列75%或者更高同一性的核苷酸,只要编码ZmbHLH124蛋白质且具有相同功能,均是衍生于本发明的核苷酸序列并且等同于本发明的序列。
这里使用的术语“同一性”是指与天然核酸序列的序列相似性。“同一性”包括与本发明的编码序列2所示的氨基酸序列组成的蛋白质的核苷酸序列具有75%或更高,或80%或更高,或85%或更高,或90%或更高,或95%或更高同一性的核苷酸序列。同一性可以用肉眼或计算机软件进行评价。使用计算机软件,两个或多个序列之间的同一性可以用百分比(%)表示,其可以用来评价相关序列之间的同一性。
上述生物材料中,A2)所述的含有编码ZmbHLH124蛋白质的核酸分子的表达盒(ZmbHLH124基因表达盒),是指能够在宿主细胞中表达ZmbHLH124的DNA,该DNA不但可包括启动ZmbHLH124转录的启动子,还可包括终止ZmbHLH124转录的终止子。进一步的,所述表达盒还可包括增强子序列。可用于本发明的启动子包括但不限于:组成型启动子;组织、器官和发育特异的启动子及诱导型启动子(如proAtRD29A)。合适的转录终止子包括但不限于:农杆菌胭脂碱合成酶终止子(NOS终止子)、花椰菜花叶病毒CaMV 35S终止子、tml终止子及豌豆rbcS E9终止子。
可用现有的表达载体构建含有所述ZmbHLH124基因表达盒的重组载体。所述植物表达载体包括双元农杆菌载体和可用于植物微弹轰击的载体等。如pAHC25、pBin438、pCAMBIA1302、pCAMBIA2300、pCAMBIA2301、pCAMBIA1301、pCAMBIA1300、pBI121、pCAMBIA1391-Xa或pCAMBIA1391-Xb(CAMBIA公司)等。所述植物表达载体还可包含外源基因的3′端非翻译区域,即包含聚腺苷酸信号和任何其它参与mRNA加工或基因表达的DNA片段。所述聚腺苷酸信号可引导聚腺苷酸加入到mRNA前体的3′端,如农杆菌冠瘿瘤诱导(Ti)质粒基因(如胭脂碱合成酶基因Nos)、植物基因(如大豆贮存蛋白基因)3′端转录的非翻译区均具有类似功能。使用本发明的基因构建植物表达载体时,还可使用增强子,包括翻译增强子或转录增强子,这些增强子区域可以是ATG起始密码子或邻接区域起始密码子等,但必需与编码序列的阅读框相同,以保证整个序列的正确翻译。所述翻译控制信号和起始密码子的来源是广泛的,可以是天然的,也可以是合成的。翻译起始区域可以来自转录起始区域或结构基因。为了便于对转基因植物细胞或植物进行鉴定及筛选,可对所用植物表达载体进行加工,如加入可在植物中表达的编码可产生颜色变化的酶或发光化合物的基因(GUS基因、萤光素酶基因等)、抗生素的标记基因(如赋予对卡那霉素和相关抗生素抗性的nptII基因,赋予对除草剂膦丝菌素抗性的bar基因,赋予对抗生素潮霉素抗性的hph基因,和赋予对氨甲喋呤抗性的dhfr基因,赋予对草甘磷抗性的EPSPS基因)或是抗化学试剂标记基因等(如抗除莠剂基因)、提供代谢甘露糖能力的甘露糖-6-磷酸异构酶基因。从转基因植物的安全性考虑,可不加任何选择性标记基因,直接以逆境筛选转化植株。
上述生物材料中,所述载体可为质粒、黏粒、噬菌体或病毒载体。所述载体具体可为pCambia2300-Ubi-OCS载体、pZZ00026-Ubi-OCS载体或pCambia1300-221载体。
上述生物材料中,所述微生物可为酵母、细菌、藻或真菌;所述细菌可为农杆菌;所述农杆菌具体可为EHA105菌株或GV3101菌株。
上述生物材料中,所述转基因植物细胞系均不包括繁殖材料。
为了实现上述目的,本发明还提供了上述ZmbHLH124蛋白质或相关生物材料的新用途。
本发明提供了上述ZmbHLH124蛋白质或相关生物材料在调控植物耐旱性中的应用。
本发明还提供了上述ZmbHLH124蛋白质或相关生物材料在培育耐旱性提高的转基因植物中的应用。
本发明还提供了上述ZmbHLH124蛋白质或相关生物材料在植物育种中的应用。
上述应用中,所述调控植物耐旱性为提高植物耐旱性;植物中ZmbHLH124蛋白质的表达量和/或活性越高,所述植物的耐旱性越强。在本发明中,具体体现在如下1):或2):1)在干旱处理后,转ZmbHLH124基因植物的存活率高于受体植物;2)转ZmbHLH124基因植物的离体叶片失水速率慢于受体植物。
所述植物育种的目的为提高植物耐旱性。
为了实现上述目的,本发明最后还提供了一种培育耐旱性提高的转基因植物的方法。
本发明提供的培育耐旱性提高的转基因植物的方法包括提高受体植物中ZmbHLH124蛋白质的表达量和/或活性,得到转基因植物的步骤;所述转基因植物的耐旱性高于所述受体植物。
进一步的,所述转基因植物的耐旱性高于所述受体植物体现在转基因植物的存活率大于受体植物和/或转基因植物的离体叶片失水速率慢于受体植物。
更进一步的,所述提高受体植物中ZmbHLH124蛋白质的表达量和/或活性的方法为在受体植物中过表达ZmbHLH124蛋白质;
所述过表达的方法为将ZmbHLH124蛋白质的编码基因导入受体植物。
所述ZmbHLH124蛋白质的编码基因的核苷酸序列如序列表中序列1所示。
在本发明的一个具体实施例中,所述ZmbHLH124蛋白质的编码基因通过重组表达载体pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS导入受体植物。所述重组表达载体pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS为将序列1所示的ZmbHLH124蛋白质的编码基因插入pZZ00026-Ubi-OCS载体的SacI和BamHI酶切位点间,且保持pZZ00026-Ubi-OCS载体的其他序列不变后得到的载体。
在本发明的另一个具体实施例中,所述ZmbHLH124蛋白质的编码基因通过重组表达载体pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS导入受体植物。所述重组表达载体pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS为将序列1所示的ZmbHLH124蛋白质的编码基因插入pCambia2300-Ubi-OCS载体的SacI和BamHI酶切位点间,且保持pCambia2300-Ubi-OCS载体的其他序列不变后得到的载体。
在本发明的另一个具体实施例中,所述ZmbHLH124蛋白质的编码基因通过重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124导入受体植物。所述重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124为将序列3所示的ZmbHLH124蛋白质的编码基因插入pCambia1300-221-ZmbHLH124载体的XbaI和HindIII酶切位点间,且将所述pCambia1300-221-ZmbHLH124载体的XbaI和HindIII酶切位点间的DNA片段替换为序列4所示的proAtRD29A启动子,且保持pCambia1300-221-ZmbHLH124载体的其他序列不变后得到的载体。重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124的核苷酸序列如序列表中的序列5所示。
上述任一所述的应用或方法中,所述转基因植物理解为不仅包含将所述ZmbHLH124基因转化受体植物得到的第一代转基因植物,也包括其子代。对于转基因植物,可以在该物种中繁殖该基因,也可用常规育种技术将该基因转移进入相同物种的其它品种,特别包括商业品种中。所述转基因植物包括种子、愈伤组织、完整植株和细胞。
上述任一所述的应用或方法中,所述植物可为单子叶植物或双子叶植物。进一步的,所述双子叶植物可为拟南芥;所述单子叶植物可为玉米或水稻。更进一步的,所述拟南芥为野生型拟南芥Col-0;所述玉米为野生型玉米自交系C01;所述水稻为野生型水稻日本晴。
本发明提供了一种与植物耐旱性相关的ZmbHLH124基因,通过分别在单子叶植物玉米、水稻和双子叶植物拟南芥中过表达ZmbHLH124基因发现,ZmbHLH124基因过表达可以提高植物耐旱性。本发明提供的ZmbHLH124基因将在培育耐旱植物品种中发挥重要的作用。
附图说明
图1为重组表达载体pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS的结构示意图。
图2为重组表达载体pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS的结构示意图。
图3为重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124的结构示意图。
图4为转ZmbHLH124基因玉米植株耐旱性分析。图4A为转ZmbHLH124基因玉米表型分析。图4B为转ZmbHLH124基因玉米离体叶片失水速率分析。图4C为正常生长条件下玉米中ZmbHLH124基因的相对表达量分析。
图5为转ZmbHLH124基因水稻植株耐旱性分析。图5A为转ZmbHLH124基因水稻表型分析。图5B为转ZmbHLH124基因水稻离体叶片失水速率分析。图5C为正常生长条件下水稻中ZmbHLH124基因的相对表达量分析。
图6为转ZmbHLH124基因拟南芥植株耐旱性分析。图6A为转ZmbHLH124基因拟南芥表型分析。图6B为转ZmbHLH124基因拟南芥离体叶片失水速率分析。图6C为正常生长条件下拟南芥中ZmbHLH124基因的相对表达量分析。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
下述实施例中的野生型玉米自交系C01是中国种子集团有限公司的产品。
下述实施例中的野生型水稻日本晴是武汉伯远生物科技有限公司的产品。
下述实施例中的野生型拟南芥Col-0是拟南芥信息资源网站(The ArabidopsisInformation Resources,TAIR)的产品。
下述实施例中的pZZ00026载体是中国种子集团有限公司的产品。
下述实施例中的pCambia2300-Ubi-OCS载体、pCambia1300-221载体、EHA105菌株和GV3101菌株均记载于文献:Ting Gao,Yaorong Wu,Yiyue Zhang,Lijing Liu,YueseNing,Dongjiang Wang,Hongning Tong,Shouyi Chen,Chengcai Chu,Qi Xie.(2011)PlantMol Biol.76:145–156中;公众可以从中国科学院遗传与发育生物学研究所获得。
实施例1、玉米ZmbHLH124蛋白及其编码基因的获得
一、ZmbHLH124-PH4CV的获得
1、提取玉米自交系PH4CV的基因组DNA。
2、以步骤1得到的基因组DNA为模板,采用bHLHG1-F和bHLHG1-R组成的引物对使用KOD FX Neo酶进行PCR扩增,引物序列如下:
bHLHG1-F:5’-GCCCAGTTCCTAGCACTCCACA-3’;
bHLHG1-R:5’-GGTTGCGTTCAATCTCCTTCCAT-3’。
PCR反应体系如下:25μL 2×KOD FX Neo Buffer、5μL 2mM dNTPs、1μL KOD FXNeo、正反向引物(10μM)各1.5μL、1μL模板、15μL去离子水。
PCR反应条件如下:预变性94℃3min;变性98℃10s、退火62℃30s、延伸68℃30s/kb,10个循环,每个一个循环退火温度降1℃;变性98℃10s、退火Tm 20s、延伸68℃25s/kb,30个循环;68℃7min;4-10℃保存。
3、回收扩增产物后送测序公司进行测序验证。测序验证正确的片段命名为ZmbHLH124-PH4CV。
二、ZmbHLH124编码序列的获得
1、提取玉米自交系PH4CV叶片中的总RNA,反转录得到cDNA第I链。
2、以步骤1得到的cDNA第I链为模板,采用ZmbHLH-S-Psc和ZmbHLH-A-Psc(小写字母为载体片段)组成的引物对进行PCR扩增,得到扩增产物。通过PCR扩增反应获得PH4CV中ZmbHLH124基因的编码序列。引物序列如下:
ZmbHLH-S-Psc:5’-cgactctagaggatcaattcgagctccATGGATGGTTGCAGAGCTG-3’;
ZmbHLH-A-Psc:5’-gcctgcaggtcgactctagaggatccTTACGGCAATGGTCCTCC-3’。
3、扩增产物经过纯化后,克隆到pEASY-Blunt Simple载体上,经菌落PCR检测后送测序公司进行测序验证。测序结果表明,玉米PH4CV中ZmbHLH124基因的编码序列全长为888bp,其核苷酸序列如序列表中的序列1所示,编码由295个氨基酸组成的ZmbHLH124蛋白质,ZmbHLH124蛋白质的氨基酸序列如序列表中的序列2所示。
实施例2、转ZmbHLH124基因植株的获得
一、转ZmbHLH124基因单子叶植物(玉米、水稻)的获得
1、以pCambia2300-Ubi-OCS载体为模板,采用Ubi-Fsc和OSC-Rsc(小写字母为pZZ00026载体片段)组成的引物对,使用KOD FX Neo酶进行PCR扩增,获得ubiquitin启动子与OCS终止子之间的片段Ubi-OCS。引物序列如下:
Ubi-Fsc:5’-ggaaacagctatgacatgattacgAATTAGCTTGCATGCCTGCAGT-3’;
OCS-Rsc:5’-cgacggccagtgccaagcttgcatTCAATCAGTAAATTGAACGGAG-3’。
以pZZ00026载体为模板,采用26-F和26-R组成的引物对,使用KOD FX Neo酶进行PCR扩增,获得线性载体骨架pZZ00026。引物序列如下:
26-F:5’-tacgttcgaaccgtgaccggcagcaaaatgttgcag-3’;
26-R:5’-gcattagtacagtatcgacaaaggacacactttaac-3’。
将纯化后的Ubi-OCS片段和线性载体骨架pZZ00026以摩尔比2:1的比例混合,使用全式金无缝克隆试剂盒连接,得到pZZ00026-Ubi-OCS载体用于转基因玉米重组载体的构建。
2、用限制性内切酶SacI和BamHI双酶切步骤1得到的pZZ00026-Ubi-OCS载体成线性片段,回收载体骨架pZZ00026-Ubi-OCS。将实施例1步骤二的2中得到的测序正确的扩增产物和载体骨架pZZ00026-Ubi-OCS以摩尔比2:1的比例混合,使用全式金无缝克隆试剂盒连接,得到重组表达载体pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS,载体结构示意图如图1所示。
用限制性内切酶SacI和BamHI双酶切pCambia2300-Ubi-OCS载体成线性片段,回收载体骨架pCambia2300-Ubi-OCS。将实施例1步骤二的2中得到的测序正确的扩增产物和载体骨架pCambia2300-Ubi-OCS以摩尔比2:1的比例混合,使用全式金无缝克隆试剂盒连接,得到重组表达载体pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS,载体结构示意图如图2所示。
重组表达载体pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS为将序列1所示的ZmbHLH124蛋白质的编码基因插入pZZ00026-Ubi-OCS载体的SacI和BamHI酶切位点间,且保持pZZ00026-Ubi-OCS载体的其他序列不变后得到的载体。
重组表达载体pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS为将序列1所示的ZmbHLH124蛋白质的编码基因插入pCambia2300-Ubi-OCS载体的SacI和BamHI酶切位点间,且保持pCambia2300-Ubi-OCS载体的其他序列不变后得到的载体。
3、利用电击法将带有ZmbHLH124基因编码序列的质粒(重组表达载体pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS)转化农杆菌EHA105菌株,经鉴定,得到含有重组表达载体pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS的农杆菌EHA105/pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS。
利用电击法将带有ZmbHLH124基因编码序列的质粒(重组表达载体pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS)转化农杆菌EHA105菌株,经鉴定,得到含有重组表达载体pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS的农杆菌EHA105/pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS。
4、利用转基因技术将农杆菌EHA105/pZZ00026-Ubi-bHLH124-OCS转化野生型玉米自交系C01,获得转ZmbHLH124基因玉米纯合株系OE1和OE2。玉米遗传转化的具体步骤由中国种子集团有限公司完成。
利用转基因技术将农杆菌EHA105/pCambia2300-Ubi-bHLH124-OCS转化野生型水稻日本晴,获得转ZmbHLH124基因水稻纯合株系OE1和OE2。水稻遗传转化的具体步骤由武汉伯远生物科技有限公司完成。
选取T2代阳性转ZmbHLH124基因玉米纯合株系OE1和OE2、T2代阳性转ZmbHLH124基因水稻纯合株系OE1和OE2用于ZmbHLH124基因相对表达量检测与耐旱性鉴定分析。
二、转ZmbHLH124基因双子叶植物(拟南芥)的获得
1、以实施例1步骤一的3中得到的测序正确的扩增产物ZmbHLH124-PH4CV为模板,采用ZmbHLH-Fsc和ZmbHLH-Rsc(小写字母为载体片段)组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物后送测序公司进行测序验证,测序正确的片段的核苷酸序列如序列表中的序列3所示。引物序列如下:
ZmbHLH-Fsc:5’-ttggagagaacacgggggactctagaGATCTCGCCATGGATGGTTG-3’;
ZmbHLH-Rsc:5’-gaacgatcggggaaattcgagctcTTAGGGTGTCTCTATCTCTGAC-3’。
2、用限制性内切酶XbaI和SacI双酶切pCambia1300-221载体成线性片段,回收载体骨架pCambia1300-221。
3、将步骤1得到的测序正确的扩增产物和步骤2得到的载体骨架pCambia1300-221以摩尔比2:1的比例混合,使用全式金无缝克隆试剂盒连接,得到重组表达载体pCambia1300-221-ZmbHLH124。
4、利用电击法将带有ZmbHLH124基因组序列的质粒(重组表达载体pCambia1300-221-ZmbHLH124)转化农杆菌GV3101菌株,得到含有重组表达载体pCambia1300-221-ZmbHLH124的农杆菌GV3101/pCambia1300-221-ZmbHLH124。
5、通过农杆菌介导法利用农杆菌GV3101/pCambia1300-221-ZmbHLH124将ZmbHLH124基因转化到野生型拟南芥植株(Col-0)中,对目标植物转基因T2代阳性纯合植株进行筛选及抗逆分析表明:与野生型相比,转ZmbHLH124基因拟南芥明显生长迟滞和矮小,推测在拟南芥中组成型过表达ZmbHLH124基因会对拟南芥生长造成负面影响,故选用胁迫诱导的AtRD29A启动子驱动ZmbHLH124基因在拟南芥中过表达。
6、提取野生型拟南芥Col-0的基因组DNA,以基因组DNA为模板,采用AtRD29APHindIII-F和AtRD29APXbaI-R(下划线为酶切位点)组成的引物对进行PCR扩增,回收扩增产物后送测序公司进行测序验证。测序验证正确的片段命名为proAtRD29A,proAtRD29A启动子的核苷酸序列如序列表中的序列4所示。引物序列如下:
AtRD29APHindIII-F:5’-CCCaagcttGCCATAGATGCAATTCAATC-3’;
AtRD29APXbaI-R:5’-GCtctagaTTTCCAAAGATTTTTTTCTTTCCAA-3’。
7、用限制性内切酶XbaI和HindIII双酶切pCambia1300-221-ZmbHLH124成线性片段,回收载体骨架pCambia1300-221-ZmbHLH124。
8、将步骤6得到的测序正确的扩增产物和步骤7得到的载体骨架pCambia1300-221-ZmbHLH124以摩尔比7:1的比例混合,使用T4连接酶连接,最终得到重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124,载体结构示意图如图3所示。
重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124为将序列3所示的ZmbHLH124蛋白质的编码基因插入pCambia1300-221-ZmbHLH124载体的XbaI和HindIII酶切位点间,且将所述pCambia1300-221-ZmbHLH124载体的XbaI和HindIII酶切位点间的DNA片段替换为序列4所示的proAtRD29A启动子,且保持pCambia1300-221-ZmbHLH124载体的其他序列不变后得到的载体。重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124的核苷酸序列如序列表中的序列5所示。
9、利用电击法将带有ZmbHLH124基因组序列的质粒(重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124)转化农杆菌GV3101菌株,得到含有重组表达载体pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124的农杆菌GV3101/pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124。
10、通过农杆菌介导法利用农杆菌GV3101/pCambia1300-RD29A-ZmbHLH124将ZmbHLH124基因转化到野生型拟南芥植株(Col-0)中,获得转ZmbHLH124基因拟南芥纯合株系OE17和OE19。选取T3代阳性转ZmbHLH124基因拟南芥纯合株系OE17和OE19用于ZmbHLH124基因表达量检测与耐旱性鉴定分析。
实施例3、ZmbHLH124基因表达量检测
以实施例2得到的不同转基因自交系为试验材料进行ZmbHLH124基因相对表达量检测:T2代阳性转ZmbHLH124基因玉米纯合株系OE1和OE2、T2代阳性转ZmbHLH124基因水稻纯合株系OE1和OE2、T3代阳性转ZmbHLH124基因拟南芥纯合株系OE17和OE19。具体步骤如下:
采用荧光定量PCR方法检测ZmbHLH124基因在实施例2得到的不同转基因自交系中的相对表达量。在玉米中,以ZmEF1A(GRMZM2G153541)为内参基因。在水稻中,以OsActin1(LOC_Os03g50885)为内参基因。在拟南芥中,以AtACTIN2(AT3G18780)为内参基因。根据基因序列设计如下荧光定量PCR检测引物:
ZmbHLH124qRT-F:5’-GCGACTCTGATCATCTTC-3’;
ZmbHLH124qRT-R:5’-TCTAGCTCCATGTCCATC-3’;
ZmEF1A qF:5’-TGGGCCTACTGGTCTTACTACTGA-3’;
ZmEF1A qR:5’-ACATACCCACGCTTCAGATCCT-3’;
OsActin1-qRT-F:5’-TGGTCGTACCACAGGTATTGTGTT-3’;
OsActin1-qRT-R:5’-AAGGTCGAGACGAAGGATAGCAT-3’;
qRT-AtACTIN2-F:5’-GCACCACCTGAAAGGAAGTACA-3’;
qRT-ATACTIN2-R:5’-CGATTCCTGGACCTGCCTCATC-3’。
使用BioRad公司的CFX-96荧光定量PCR仪进行荧光定量PCR,反应程序为:预变性95℃3min;变性95℃10s,退火/延伸60℃15s,45个循环;熔解曲线分析为65℃ to 95℃,每0.5℃读取荧光,每次4s;结束。ZmbHLH124基因的相对表达量采用公式Qt=2-Ct(Reference gene)-Ct(ZmbHLH124)计算,Ct表示每个反应管内的荧光信号到达设定的域值时所经历的循环数。结果如图4C、图5C和图6C所示。
实施例4、转ZmbHLH124基因植株的耐旱性鉴定
以实施例2得到的不同转基因自交系为试验材料进行耐旱性鉴定:T2代阳性转ZmbHLH124基因玉米纯合株系OE1和OE2、T2代阳性转ZmbHLH124基因水稻纯合株系OE1和OE2、T3代阳性转ZmbHLH124基因拟南芥纯合株系OE17和OE19。具体步骤如下:
一、转ZmbHLH124基因玉米的耐旱性鉴定
1、干旱处理后存活率测定
对转ZmbHLH124基因玉米进行干旱处理,具体步骤如下:转基因玉米苗期干旱实验所用穴盘的长×宽×高为5.5cm×5.5cm×5cm,所用的土壤配方是普通花卉土与蛭石的比例约为1:1,每个穴盆装体积一致的混合土,每个穴盘播种6-9粒玉米。培养温度为白天28-32℃,夜晚20-23℃,光照为16h光照/8h黑暗。待播种的玉米幼苗长至10-12cm时,大约10天左右,剪去每个穴盘多余的幼苗,每个穴盘只留4棵大小均匀一致的玉米幼苗,然后浇灌过量的水分,使每个穴盘的土壤水分过饱和,之后放置在平台上进行干旱处理。干旱处理过程中,每天调整穴盘的位置,以减弱位置效应。干旱9-11天后,根据植物的状态进行复水,复水3天后统计植株的存活率。同时以野生型玉米自交系C01(WT)作为对照。
存活率统计结果如图4A所示。结果表明:T2代阳性转ZmbHLH124基因玉米纯合株系OE1和OE2的存活率分别为94.4%和88.9%,与野生型玉米自交系C01(38.9%)相比,转ZmbHLH124基因玉米的存活率显著提高。
2、离体叶片失水速率测定
测定转ZmbHLH124基因玉米的离体叶片失水速率,具体步骤如下:用剪刀迅速剪取完全展开的植物叶片,叶片要大小相同,位置相近,然后放置于干净的称量纸上,剪取完成后迅速用分析天平称量,同时用计时器计时,每隔两分钟剪取一种样品进行称量。第一次称量记为0h,第一小时内每隔半小时测一次鲜重,以后每一小时测一次鲜重,持续6h。计算各个时间点的失水率时,应先减去称量纸的量,得到各个时间点的鲜重,再用0h鲜重减去各时间点的鲜重得到各时间点失水量,各时间点失水量在除以0h鲜重即为各时间点失水率。玉米为V1至V2期的幼苗,即2叶1心至3叶1心期的幼苗,称量时应避免叶片之间相互遮挡,称量环境为温度26℃,湿度在55%左右。
离体叶片失水速率的测定结果如图4B所示。结果表明:与野生型玉米自交系C01离体叶片的失水速率相比,T2代阳性转ZmbHLH124基因玉米纯合株系OE1和OE2离体叶片的失水速率更慢。
上述结果说明过表达ZmbHLH124基因可以提供玉米植株的耐旱性。
二、转ZmbHLH124基因水稻的耐旱性鉴定
1、干旱处理后存活率测定
对转ZmbHLH124基因水稻进行干旱处理,具体步骤如下:将水稻种子放入种子萌发袋中,然后将种子浸没到3%H2O2溶液中,随后将萌发袋放在28℃培养箱里黑暗培养24h左右,然后将3%H2O2溶液倒掉,加入蒸馏水直至种子萌发后再播种于花卉土中。本实验所用双色花盆的高×底径为170mm×150mm,每个花盆装体积一致的普通田地黄土,插入在花卉土中生长15-20天并且大小均匀一致的水稻苗15棵,5棵幼苗一簇,总共3簇,均匀分开。培养温度为白天28-32℃,夜晚20-23℃,光照为16h光照/8h黑暗。继续培养20-25天,期间浇充足的水分,待植物长出新叶并完全恢复生长后,停水进行干旱处理。干旱处理过程中,每天调整穴盘的位置,以减弱位置效应。干旱10-12d后,根据植物的状态进行复水,复水3天后统计植株的存活率。同时以野生型水稻日本晴(WT)作为对照。
存活率统计结果如图5A所示。结果表明:T2代阳性转ZmbHLH124基因水稻纯合株系OE1和OE2的存活率分别为46.7%和58.9%,与野生型水稻日本晴(11.1%)相比,转ZmbHLH124基因水稻的存活率显著提高。
2、离体叶片失水速率测定
测定转ZmbHLH124基因水稻的离体叶片失水速率,具体步骤如下:用剪刀迅速剪取完全展开的植物叶片,叶片要大小相同,位置相近,然后放置于干净的称量纸上,剪取完成后迅速用分析天平称量,同时用计时器计时,每隔两分钟剪取一种样品进行称量。第一次称量记为0h,第一小时内每隔半小时测一次鲜重,以后每一小时测一次鲜重,持续5h。计算各个时间点的失水率时,应先减去称量纸的量,得到各个时间点的鲜重,再用0h鲜重减去各时间点的鲜重得到各时间点失水量,各时间点失水量在除以0h鲜重即为各时间点失水率。水稻材料为5至7叶期的幼苗,将叶片剪短称量,片段大小应该大小相近,位置相同,称量环境为温度22℃,湿度在45%左右。
离体叶片失水速率的测定结果如图5B所示。结果表明:与野生型水稻日本晴离体叶片的失水速率相比,T2代阳性转ZmbHLH124基因水稻纯合株系OE1和OE2离体叶片的失水速率更慢。
上述结果说明过表达ZmbHLH124基因可以提供水稻植株的耐旱性。
三、转ZmbHLH124基因拟南芥的耐旱性鉴定
1、干旱处理后存活率测定
对转ZmbHLH124基因拟南芥进行干旱处理,具体步骤如下:本实验所用黑色穴盘的长×宽×高为12cm×12cm×5cm,每个黑色穴盘装土50-60g,所用的土壤配方是进口营养土与蛭石的比例约为1:1,移苗株数为16棵。培养间和温室光照条件是16h光照/8h黑暗,温度为22℃。将在1/2MS培养基上培养10-14天的幼苗移植到穴盘后,继续见光生长14-21天,期间浇灌充足的水分,待植物长出10-14片莲座叶后,停水进行干旱处理。干旱处理前,确保每个穴盘内的每个植株都处于正常状态,如有必要,可除去生长不正常的植株,同时保证每个穴盘的质量(可用水补齐)和植株都保持一致。干旱处理过程中,每天固定时间调整穴盘的位置,以减弱位置效应。干旱10-14天后,根据植物的状态进行复水,复水3天后统计植株的存活率。同时以野生型拟南芥Col-0(WT)作为对照。
存活率统计结果如图6A所示。结果表明:T3代阳性转ZmbHLH124基因拟南芥纯合株系OE17和OE19的存活率分别为74.4%和57.8%,与野生型拟南芥Col-0(13.3%)相比,转ZmbHLH124基因拟南芥的存活率显著提高。当野生型拟南芥Col-0绝大多数植株死亡的时候,仍有50%以上的转ZmbHLH124基因保持膨压,吸水后可以存活下来。
2、离体叶片失水速率测定
测定转ZmbHLH124基因拟南芥的离体叶片失水速率,具体步骤如下:用剪刀迅速剪取完全展开的植物叶片,叶片要大小相同,位置相近,然后放置于干净的称量纸上,剪取完成后迅速用分析天平称量,同时用计时器计时,每隔两分钟剪取一种样品进行称量。第一次称量记为0h,第一小时内每隔半小时测一次鲜重,以后每一小时测一次鲜重,持续6h。计算各个时间点的失水率时,应先减去称量纸的量,得到各个时间点的鲜重,再用0h鲜重减去各时间点的鲜重得到各时间点失水量,各时间点失水量在除以0h鲜重即为各时间点失水率。用于分析离体叶片失水率的拟南芥与进行干旱表型分析的大小一致,均为开花前的幼苗,称量时需将整个莲座叶剪下,平铺于称量纸上,称量环境为温度22℃,湿度在45%左右。
离体叶片失水速率的测定结果如图6B所示。结果表明:与野生型拟南芥Col-0离体叶片的失水速率相比,T3代阳性转ZmbHLH124基因拟南芥纯合株系OE17和OE19离体叶片的失水速率更慢。
上述结果说明过表达ZmbHLH124基因可以提高拟南芥植株的耐旱性。
综上所述,过表达ZmbHLH124基因可以提高植物(包括双子叶植物和单子叶植物)的耐旱性,本发明的ZmbHLH124基因可用于培育耐旱植物品种。
虽然,上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述,但在本发明基础上,可以对之作一些修改或改进,这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此,在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进,均属于本发明要求保护的范围。
序列表
<110>中国科学院遗传与发育生物学研究所
<120>玉米ZmbHLH124蛋白质及其编码基因在调控植物耐旱性中的应用
<160>5
<170>PatentIn version 3.5
<210>1
<211>888
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>1
atggatggtt gcagagctgt ccttactgga gacatgcaat ggcacgaggt gacgatgagt 60
aacagcagcc gcgactctga tcatcttcag aggggagagc aaggcttgag cagctcgcag 120
cttcagcagc agctggaaca gatctacatg ctgatggaca tggagctaga gcatgagctg 180
cacctgcacc acaacgtgcc accgcagggc tctagccagc agcagctgtc gtcggcgttc 240
ctgcctttcg ccgtcagctc cgatgtgacc tcgtcgcccg tgctcacgtc gtcgagcacc 300
acagcctttt gtcaacagcc agtcgaggcc tcaccctcac ccctggacac gccattttcc 360
ccactcccct acagctactc tgacacgatc ccggacctgg aagaaatcat gagccgacca 420
cggcacatgg acggccatgc ggagtccggc accagtgcat tcaggcagta cgtccggcac 480
ctccgcccca agaagaagct aaagcagggc ggctgcggcc agagggcgat caagacggcc 540
atgtcggtct tggcgagaat gcacagctct aggctttccc agtggcagat gcagatctcc 600
tcgacggaga tggcggcggc agtgccgtcc gacgagagca aaaacatcca gcttctgcac 660
gtccggtcgg agcgcaagcg ccgtgagaag attaacgaca gcttcgaggc tctcaagaat 720
gcgttgcccc cttcctgctg caagcgagat aaaacatcca tactgatgag ggcaagggac 780
tacataaact ctctcaagtc cagggtgtct gagcttgagg agaacggcaa ggtactagaa 840
tcacagctat gcagtagccg aggagacaac ggaggaccat tgccgtaa 888
<210>2
<211>295
<212>PRT
<213>Artificial Sequence
<400>2
Met Asp Gly Cys Arg Ala Val Leu Thr Gly Asp Met Gln Trp His Glu
1 5 10 15
Val Thr Met Ser Asn Ser Ser Arg Asp Ser Asp His Leu Gln Arg Gly
20 25 30
Glu Gln Gly Leu Ser Ser Ser Gln Leu Gln Gln Gln Leu Glu Gln Ile
35 40 45
Tyr Met Leu Met Asp Met Glu Leu Glu His Glu Leu His Leu His His
50 55 60
Asn Val Pro Pro Gln Gly Ser Ser Gln Gln Gln Leu Ser Ser Ala Phe
65 70 75 80
Leu Pro Phe Ala Val Ser Ser Asp Val Thr Ser Ser Pro Val Leu Thr
85 90 95
Ser Ser Ser Thr Thr Ala Phe Cys Gln Gln Pro Val Glu Ala Ser Pro
100 105 110
Ser Pro Leu Asp Thr Pro Phe Ser Pro Leu Pro Tyr Ser Tyr Ser Asp
115 120 125
Thr Ile Pro Asp Leu Glu Glu Ile Met Ser Arg Pro Arg His Met Asp
130 135 140
Gly His Ala Glu Ser Gly Thr Ser Ala Phe Arg Gln Tyr Val Arg His
145 150 155 160
Leu Arg Pro Lys Lys Lys Leu Lys Gln Gly Gly Cys Gly Gln Arg Ala
165 170 175
Ile Lys Thr Ala Met Ser Val Leu Ala Arg Met His Ser Ser Arg Leu
180 185 190
Ser Gln Trp Gln Met Gln Ile Ser Ser Thr Glu Met Ala Ala Ala Val
195 200 205
Pro Ser Asp Glu Ser Lys Asn Ile Gln Leu Leu His Val Arg Ser Glu
210 215 220
Arg Lys Arg Arg Glu Lys Ile Asn Asp Ser Phe Glu Ala Leu Lys Asn
225 230 235 240
Ala Leu Pro Pro Ser Cys Cys Lys Arg Asp Lys Thr Ser Ile Leu Met
245 250 255
Arg Ala Arg Asp Tyr Ile Asn Ser Leu Lys Ser Arg Val Ser Glu Leu
260 265 270
Glu Glu Asn Gly Lys Val Leu Glu Ser Gln Leu Cys Ser Ser Arg Gly
275 280 285
Asp Asn Gly Gly Pro Leu Pro
290 295
<210>3
<211>2329
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>3
gatctcgcca tggatggttg cagagctgtc cttactggag acatgcaatg gcacgaggtg 60
acgatgaggt acggtgcggt cggctgtgtt tcagatcaat actcccagct acatagttaa 120
tgccaggcgt catcatgatc gctggaataa tccgttaatc ttaaccccag tttctggttg 180
tcgttgtgtg cagtaacagc agccgcgact ctgatcatct tcagagggga gagcaaggct 240
tgagcagctc gcagcttcag cagcagctgg aacaggcaat gaactttaca tgttattgac 300
aatatgagat caacttctat actaatatat gtcgttcttg cattgcatcc ttggttgttg 360
cgcgcagatc tacatgctga tggacatgga gctagagcat gagctgcacc tgcaccacaa 420
cgtgccaccg cagggctcta gccagcagca gctgtcgtcg gcgttcctgc ctttcgccgt 480
cagctccgat gtgacctcgt cgcccgtgct cacgtcgtcg agcaccacag ccttttgtca 540
acagccagtc gaggcctcac cctcacccct ggacacgcca ttttccccac tcccctacag 600
ctactctgac acgatcccgg acctggaaga aatcatgagc cgaccacggc acatggacgg 660
ccatgcggag tccggcacca gtgcattcag gcagtacgtc cggcacctcc gccccaagaa 720
gaagctaaag cagggcggct gcggccagag ggcgatcaag acggccatgt cggtcttggc 780
gagaatgcac agctctaggc tttcccagtg gcagatgcag atctcctcga cggagatggc 840
ggcggcagtg ccgtccgacg agagcaaaaa catccagctt ctgcacgtcc ggtcggagcg 900
caagcgccgt gagaagatta acgacagctt cgaggctctc aagaatgcgt tgcccccttc 960
ctgctgcaag gtaaggatta tatgcgttcg tcaaaaggtt atctcattct ccaactggta 1020
gcaagcacct agcagtttta atctgacaat gtttatttct aatctcccat gccagcgaga 1080
taaaacatcc atactgatga gggcaaggga ctacataaac tctctcaagt ccagggtgtc 1140
tgagcttgag gagaacggca aggtactaga atcacagcta tgcagtagcc gaggagacaa 1200
cggaggacca ttgccgtaat gccatggatg ctggagctag taccctgcag cgtctgaaac 1260
aggtatatat ggacacagat tgctccagga aaggcttctc aataatccac cataacgttg 1320
cagttgaaga aaatgttttg gtctaataga gtaaattaga catacatgtg ccatttaaat 1380
ttgaaggtat ctttgtaaaa tgtattatta ctttcttttt aaatgccaat gaaagataca 1440
attcaaggtt ttcaagtcga taagtcgagt caacaaggta ccgacttggt gactagtcga 1500
taagtcagtc gactagtcgt cgacttacca atatagtgac tgttttgcct atataatggc 1560
ttcatataaa caatatagca tttatatatg aagaaagagc atgttttacc tcatttggag 1620
cctgaaattg tactaactga aataaacagc aagtcttacc acatttgaaa cctcaaactg 1680
aaccaaatca gcgataagtc aaactcataa ctcataacaa ccatatagtt caaattggaa 1740
aacaaatagc aagaaaacat agttcaaact tgaaaggaaa taagctccat tagatagcta 1800
agctgctgct gcagctaaat agatactaga tagtacccta aatatctcct aaatcaagat 1860
catccattgt attttctacc aaatcaagaa aatatgttgt gtaatgggcc tttgggctga 1920
attggggcac aagtcggccg acttgccgga ccaagtcgat gactaatcga ctgagaattt 1980
ccagtcattg acaagtcgcc caacttgcca gaaaagtcga gccgggtccc aagtcgagct 2040
cccagaccga ccggatgact agtcgacgac ttgaaaacag ggatacaatt aactttcgct 2100
gcctggaaag gaaatattgg gctaactgaa aactacactt ggcgtctatg acttgagcaa 2160
ctatcagcca ctcgtattgt ttttcggaat gtcaatatct gaaatttcgt ctgatgttct 2220
gttgatgctt caatgcacag catgtgatga caacaatttc gtgaagcagt ctgtgtctgt 2280
gatacagact gtcaaaggca cgatgcagtc agagatagag acaccctaa 2329
<210>4
<211>941
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>4
gccatagatg caattcaatc aaactgaaat ttctgcaaga atctcaaaca cggagatctc 60
aaagtttgaa agaaaattta tttcttcgac tcaaaacaaa cttacgaaat ttaggtagaa 120
cttatataca ttatattgta attttttgta acaaaatgtt tttattatta ttatagaatt 180
ttactggtta aattaaaaat gaatagaaaa ggtgaattaa gaggagagag gaggtaaaca 240
ttttcttcta ttttttcata ttttcaggat aaattattgt aaaagtttac aagatttcca 300
tttgactagt gtaaatgagg aatattctct agtaagatca ttatttcatc tacttctttt 360
atcttctacc agtagaggaa taaacaatat ttagctcctt tgtaaataca aattaatttt 420
cgttcttgac atcattcaat tttaatttta cgtataaaat aaaagatcat acctattaga 480
acgattaagg agaaatacaa ttcgaatgag aaggatgtgc cgtttgttat aataaacagc 540
cacacgacgt aaacgtaaaa tgaccacatg atgggccaat agacatggac cgactactaa 600
taatagtaag ttacatttta ggatggaata aatatcatac cgacatcagt ttgaaagaaa 660
agggaaaaaa agaaaaaata aataaaagat atactaccga catgagttcc aaaaagcaaa 720
aaaaaagatc aagccgacac agacacgcgt agagagcaaa atgactttga cgtcacacca 780
cgaaaacaga cgcttcatac gtgtcccttt atctctctca gtctctctat aaacttagtg 840
agaccctcct ctgttttact cacaaatatg caaactagaa aacaatcatc aggaataaag 900
ggtttgatta cttctattgg aaagaaaaaa atctttggaa a 941
<210>5
<211>12465
<212>DNA
<213>Artificial Sequence
<400>5
gaattcccga tctagtaaca tagatgacac cgcgcgcgat aatttatcct agtttgcgcg 60
ctatattttg ttttctatcg cgtattaaat gtataattgc gggactctaa tcataaaaac 120
ccatctcata aataacgtca tgcattacat gttaattatt acatgcttaa cgtaattcaa 180
cagaaattat atgataatca tcgcaagacc ggcaacagga ttcaatctta agaaacttta 240
ttgccaaatg tttgaacgat cggggaaatt cgagctctta gggtgtctct atctctgact 300
gcatcgtgcc tttgacagtc tgtatcacag acacagactg cttcacgaaa ttgttgtcat 360
cacatgctgt gcattgaagc atcaacagaa catcagacga aatttcagat attgacattc 420
cgaaaaacaa tacgagtggc tgatagttgc tcaagtcata gacgccaagt gtagttttca 480
gttagcccaa tatttccttt ccaggcagcg aaagttaatt gtatccctgt tttcaagtcg 540
tcgactagtc atccggtcgg tctgggagct cgacttggga cccggctcga cttttctggc 600
aagttgggcg acttgtcaat gactggaaat tctcagtcga ttagtcatcg acttggtccg 660
gcaagtcggc cgacttgtgc cccaattcag cccaaaggcc cattacacaa catattttct 720
tgatttggta gaaaatacaa tggatgatct tgatttagga gatatttagg gtactatcta 780
gtatctattt agctgcagca gcagcttagc tatctaatgg agcttatttc ctttcaagtt 840
tgaactatgt tttcttgcta tttgttttcc aatttgaact atatggttgt tatgagttat 900
gagtttgact tatcgctgat ttggttcagt ttgaggtttc aaatgtggta agacttgctg 960
tttatttcag ttagtacaat ttcaggctcc aaatgaggta aaacatgctc tttcttcata 1020
tataaatgct atattgttta tatgaagcca ttatataggc aaaacagtca ctatattggt 1080
aagtcgacga ctagtcgact gacttatcga ctagtcacca agtcggtacc ttgttgactc 1140
gacttatcga cttgaaaacc ttgaattgta tctttcattg gcatttaaaa agaaagtaat 1200
aatacatttt acaaagatac cttcaaattt aaatggcaca tgtatgtcta atttactcta 1260
ttagaccaaa acattttctt caactgcaac gttatggtgg attattgaga agcctttcct 1320
ggagcaatct gtgtccatat atacctgttt cagacgctgc agggtactag ctccagcatc 1380
catggcatta cggcaatggt cctccgttgt ctcctcggct actgcatagc tgtgattcta 1440
gtaccttgcc gttctcctca agctcagaca ccctggactt gagagagttt atgtagtccc 1500
ttgccctcat cagtatggat gttttatctc gctggcatgg gagattagaa ataaacattg 1560
tcagattaaa actgctaggt gcttgctacc agttggagaa tgagataacc ttttgacgaa 1620
cgcatataat ccttaccttg cagcaggaag ggggcaacgc attcttgaga gcctcgaagc 1680
tgtcgttaat cttctcacgg cgcttgcgct ccgaccggac gtgcagaagc tggatgtttt 1740
tgctctcgtc ggacggcact gccgccgcca tctccgtcga ggagatctgc atctgccact 1800
gggaaagcct agagctgtgc attctcgcca agaccgacat ggccgtcttg atcgccctct 1860
ggccgcagcc gccctgcttt agcttcttct tggggcggag gtgccggacg tactgcctga 1920
atgcactggt gccggactcc gcatggccgt ccatgtgccg tggtcggctc atgatttctt 1980
ccaggtccgg gatcgtgtca gagtagctgt aggggagtgg ggaaaatggc gtgtccaggg 2040
gtgagggtga ggcctcgact ggctgttgac aaaaggctgt ggtgctcgac gacgtgagca 2100
cgggcgacga ggtcacatcg gagctgacgg cgaaaggcag gaacgccgac gacagctgct 2160
gctggctaga gccctgcggt ggcacgttgt ggtgcaggtg cagctcatgc tctagctcca 2220
tgtccatcag catgtagatc tgcgcgcaac aaccaaggat gcaatgcaag aacgacatat 2280
attagtatag aagttgatct catattgtca ataacatgta aagttcattg cctgttccag 2340
ctgctgctga agctgcgagc tgctcaagcc ttgctctccc ctctgaagat gatcagagtc 2400
gcggctgctg ttactgcaca caacgacaac cagaaactgg ggttaagatt aacggattat 2460
tccagcgatc atgatgacgc ctggcattaa ctatgtagct gggagtattg atctgaaaca 2520
cagccgaccg caccgtacct catcgtcacc tcgtgccatt gcatgtctcc agtaaggaca 2580
gctctgcaac catccatggc gagatctcta gatttccaaa gatttttttc tttccaatag 2640
aagtaatcaa accctttatt cctgatgatt gttttctagt ttgcatattt gtgagtaaaa 2700
cagaggaggg tctcactaag tttatagaga gactgagaga gataaaggga cacgtatgaa 2760
gcgtctgttt tcgtggtgtg acgtcaaagt cattttgctc tctacgcgtg tctgtgtcgg 2820
cttgatcttt ttttttgctt tttggaactc atgtcggtag tatatctttt atttattttt 2880
tctttttttc ccttttcttt caaactgatg tcggtatgat atttattcca tcctaaaatg 2940
taacttacta ttattagtag tcggtccatg tctattggcc catcatgtgg tcattttacg 3000
tttacgtcgt gtggctgttt attataacaa acggcacatc cttctcattc gaattgtatt 3060
tctccttaat cgttctaata ggtatgatct tttattttat acgtaaaatt aaaattgaat 3120
gatgtcaaga acgaaaatta atttgtattt acaaaggagc taaatattgt ttattcctct 3180
actggtagaa gataaaagaa gtagatgaaa taatgatctt actagagaat attcctcatt 3240
tacactagtc aaatggaaat cttgtaaact tttacaataa tttatcctga aaatatgaaa 3300
aaatagaaga aaatgtttac ctcctctctc ctcttaattc accttttcta ttcattttta 3360
atttaaccag taaaattcta taataataat aaaaacattt tgttacaaaa aattacaata 3420
taatgtatat aagttctacc taaatttcgt aagtttgttt tgagtcgaag aaataaattt 3480
tctttcaaac tttgagatct ccgtgtttga gattcttgca gaaatttcag tttgattgaa 3540
ttgcatctat ggcaagctta gcttggcact ggccgtcgtt ttacaacgtc gtgactggga 3600
aaaccctggc gttacccaac ttaatcgcct tgcagcacat ccccctttcg ccagctggcg 3660
taatagcgaa gaggcccgca ccgatcgccc ttcccaacag ttgcgcagcc tgaatggcga 3720
atgctagagc agcttgagct tggatcagat tgtcgtttcc cgccttcagt ttaaactatc 3780
agtgtttgac aggatatatt ggcgggtaaa cctaagagaa aagagcgttt attagaataa 3840
cggatattta aaagggcgtg aaaaggttta tccgttcgtc catttgtatg tgcatgccaa 3900
ccacagggtt cccctcggga tcaaagtact ttgatccaac ccctccgctg ctatagtgca 3960
gtcggcttct gacgttcagt gcagccgtct tctgaaaacg acatgtcgca caagtcctaa 4020
gttacgcgac aggctgccgc cctgcccttt tcctggcgtt ttcttgtcgc gtgttttagt 4080
cgcataaagt agaatacttg cgactagaac cggagacatt acgccatgaa caagagcgcc 4140
gccgctggcc tgctgggcta tgcccgcgtc agcaccgacg accaggactt gaccaaccaa 4200
cgggccgaac tgcacgcggc cggctgcacc aagctgtttt ccgagaagat caccggcacc 4260
aggcgcgacc gcccggagct ggccaggatg cttgaccacc tacgccctgg cgacgttgtg 4320
acagtgacca ggctagaccg cctggcccgc agcacccgcg acctactgga cattgccgag 4380
cgcatccagg aggccggcgc gggcctgcgt agcctggcag agccgtgggc cgacaccacc 4440
acgccggccg gccgcatggt gttgaccgtg ttcgccggca ttgccgagtt cgagcgttcc 4500
ctaatcatcg accgcacccg gagcgggcgc gaggccgcca aggcccgagg cgtgaagttt 4560
ggcccccgcc ctaccctcac cccggcacag atcgcgcacg cccgcgagct gatcgaccag 4620
gaaggccgca ccgtgaaaga ggcggctgca ctgcttggcg tgcatcgctc gaccctgtac 4680
cgcgcacttg agcgcagcga ggaagtgacg cccaccgagg ccaggcggcg cggtgccttc 4740
cgtgaggacg cattgaccga ggccgacgcc ctggcggccg ccgagaatga acgccaagag 4800
gaacaagcat gaaaccgcac caggacggcc aggacgaacc gtttttcatt accgaagaga 4860
tcgaggcgga gatgatcgcg gccgggtacg tgttcgagcc gcccgcgcac gtctcaaccg 4920
tgcggctgca tgaaatcctg gccggtttgt ctgatgccaa gctggcggcc tggccggcca 4980
gcttggccgc tgaagaaacc gagcgccgcc gtctaaaaag gtgatgtgta tttgagtaaa 5040
acagcttgcg tcatgcggtc gctgcgtata tgatgcgatg agtaaataaa caaatacgca 5100
aggggaacgc atgaaggtta tcgctgtact taaccagaaa ggcgggtcag gcaagacgac 5160
catcgcaacc catctagccc gcgccctgca actcgccggg gccgatgttc tgttagtcga 5220
ttccgatccc cagggcagtg cccgcgattg ggcggccgtg cgggaagatc aaccgctaac 5280
cgttgtcggc atcgaccgcc cgacgattga ccgcgacgtg aaggccatcg gccggcgcga 5340
cttcgtagtg atcgacggag cgccccaggc ggcggacttg gctgtgtccg cgatcaaggc 5400
agccgacttc gtgctgattc cggtgcagcc aagcccttac gacatatggg ccaccgccga 5460
cctggtggag ctggttaagc agcgcattga ggtcacggat ggaaggctac aagcggcctt 5520
tgtcgtgtcg cgggcgatca aaggcacgcg catcggcggt gaggttgccg aggcgctggc 5580
cgggtacgag ctgcccattc ttgagtcccg tatcacgcag cgcgtgagct acccaggcac 5640
tgccgccgcc ggcacaaccg ttcttgaatc agaacccgag ggcgacgctg cccgcgaggt 5700
ccaggcgctg gccgctgaaa ttaaatcaaa actcatttga gttaatgagg taaagagaaa 5760
atgagcaaaa gcacaaacac gctaagtgcc ggccgtccga gcgcacgcag cagcaaggct 5820
gcaacgttgg ccagcctggc agacacgcca gccatgaagc gggtcaactt tcagttgccg 5880
gcggaggatc acaccaagct gaagatgtac gcggtacgcc aaggcaagac cattaccgag 5940
ctgctatctg aatacatcgc gcagctacca gagtaaatga gcaaatgaat aaatgagtag 6000
atgaatttta gcggctaaag gaggcggcat ggaaaatcaa gaacaaccag gcaccgacgc 6060
cgtggaatgc cccatgtgtg gaggaacggg cggttggcca ggcgtaagcg gctgggttgt 6120
ctgccggccc tgcaatggca ctggaacccc caagcccgag gaatcggcgt gacggtcgca 6180
aaccatccgg cccggtacaa atcggcgcgg cgctgggtga tgacctggtg gagaagttga 6240
aggccgcgca ggccgcccag cggcaacgca tcgaggcaga agcacgcccc ggtgaatcgt 6300
ggcaagcggc cgctgatcga atccgcaaag aatcccggca accgccggca gccggtgcgc 6360
cgtcgattag gaagccgccc aagggcgacg agcaaccaga ttttttcgtt ccgatgctct 6420
atgacgtggg cacccgcgat agtcgcagca tcatggacgt ggccgttttc cgtctgtcga 6480
agcgtgaccg acgagctggc gaggtgatcc gctacgagct tccagacggg cacgtagagg 6540
tttccgcagg gccggccggc atggccagtg tgtgggatta cgacctggta ctgatggcgg 6600
tttcccatct aaccgaatcc atgaaccgat accgggaagg gaagggagac aagcccggcc 6660
gcgtgttccg tccacacgtt gcggacgtac tcaagttctg ccggcgagcc gatggcggaa 6720
agcagaaaga cgacctggta gaaacctgca ttcggttaaa caccacgcac gttgccatgc 6780
agcgtacgaa gaaggccaag aacggccgcc tggtgacggt atccgagggt gaagccttga 6840
ttagccgcta caagatcgta aagagcgaaa ccgggcggcc ggagtacatc gagatcgagc 6900
tagctgattg gatgtaccgc gagatcacag aaggcaagaa cccggacgtg ctgacggttc 6960
accccgatta ctttttgatc gatcccggca tcggccgttt tctctaccgc ctggcacgcc 7020
gcgccgcagg caaggcagaa gccagatggt tgttcaagac gatctacgaa cgcagtggca 7080
gcgccggaga gttcaagaag ttctgtttca ccgtgcgcaa gctgatcggg tcaaatgacc 7140
tgccggagta cgatttgaag gaggaggcgg ggcaggctgg cccgatccta gtcatgcgct 7200
accgcaacct gatcgagggc gaagcatccg ccggttccta atgtacggag cagatgctag 7260
ggcaaattgc cctagcaggg gaaaaaggtc gaaaaggtct ctttcctgtg gatagcacgt 7320
acattgggaa cccaaagccg tacattggga accggaaccc gtacattggg aacccaaagc 7380
cgtacattgg gaaccggtca cacatgtaag tgactgatat aaaagagaaa aaaggcgatt 7440
tttccgccta aaactcttta aaacttatta aaactcttaa aacccgcctg gcctgtgcat 7500
aactgtctgg ccagcgcaca gccgaagagc tgcaaaaagc gcctaccctt cggtcgctgc 7560
gctccctacg ccccgccgct tcgcgtcggc ctatcgcggc cgctggccgc tcaaaaatgg 7620
ctggcctacg gccaggcaat ctaccagggc gcggacaagc cgcgccgtcg ccactcgacc 7680
gccggcgccc acatcaaggc accctgcctc gcgcgtttcg gtgatgacgg tgaaaacctc 7740
tgacacatgc agctcccgga gacggtcaca gcttgtctgt aagcggatgc cgggagcaga 7800
caagcccgtc agggcgcgtc agcgggtgtt ggcgggtgtc ggggcgcagc catgacccag 7860
tcacgtagcg atagcggagt gtatactggc ttaactatgc ggcatcagag cagattgtac 7920
tgagagtgca ccatatgcgg tgtgaaatac cgcacagatg cgtaaggaga aaataccgca 7980
tcaggcgctc ttccgcttcc tcgctcactg actcgctgcg ctcggtcgtt cggctgcggc 8040
gagcggtatc agctcactca aaggcggtaa tacggttatc cacagaatca ggggataacg 8100
caggaaagaa catgtgagca aaaggccagc aaaaggccag gaaccgtaaa aaggccgcgt 8160
tgctggcgtt tttccatagg ctccgccccc ctgacgagca tcacaaaaat cgacgctcaa 8220
gtcagaggtg gcgaaacccg acaggactat aaagatacca ggcgtttccc cctggaagct 8280
ccctcgtgcg ctctcctgtt ccgaccctgc cgcttaccgg atacctgtcc gcctttctcc 8340
cttcgggaag cgtggcgctt tctcatagct cacgctgtag gtatctcagt tcggtgtagg 8400
tcgttcgctc caagctgggc tgtgtgcacg aaccccccgt tcagcccgac cgctgcgcct 8460
tatccggtaa ctatcgtctt gagtccaacc cggtaagaca cgacttatcg ccactggcag 8520
cagccactgg taacaggatt agcagagcga ggtatgtagg cggtgctaca gagttcttga 8580
agtggtggcc taactacggc tacactagaa ggacagtatt tggtatctgc gctctgctga 8640
agccagttac cttcggaaaa agagttggta gctcttgatc cggcaaacaa accaccgctg 8700
gtagcggtgg tttttttgtt tgcaagcagc agattacgcg cagaaaaaaa ggatctcaag 8760
aagatccttt gatcttttct acggggtctg acgctcagtg gaacgaaaac tcacgttaag 8820
ggattttggt catgcattct aggtactaaa acaattcatc cagtaaaata taatatttta 8880
ttttctccca atcaggcttg atccccagta agtcaaaaaa tagctcgaca tactgttctt 8940
ccccgatatc ctccctgatc gaccggacgc agaaggcaat gtcataccac ttgtccgccc 9000
tgccgcttct cccaagatca ataaagccac ttactttgcc atctttcaca aagatgttgc 9060
tgtctcccag gtcgccgtgg gaaaagacaa gttcctcttc gggcttttcc gtctttaaaa 9120
aatcatacag ctcgcgcgga tctttaaatg gagtgtcttc ttcccagttt tcgcaatcca 9180
catcggccag atcgttattc agtaagtaat ccaattcggc taagcggctg tctaagctat 9240
tcgtataggg acaatccgat atgtcgatgg agtgaaagag cctgatgcac tccgcataca 9300
gctcgataat cttttcaggg ctttgttcat cttcatactc ttccgagcaa aggacgccat 9360
cggcctcact catgagcaga ttgctccagc catcatgccg ttcaaagtgc aggacctttg 9420
gaacaggcag ctttccttcc agccatagca tcatgtcctt ttcccgttcc acatcatagg 9480
tggtcccttt ataccggctg tccgtcattt ttaaatatag gttttcattt tctcccacca 9540
gcttatatac cttagcagga gacattcctt ccgtatcttt tacgcagcgg tatttttcga 9600
tcagtttttt caattccggt gatattctca ttttagccat ttattatttc cttcctcttt 9660
tctacagtat ttaaagatac cccaagaagc taattataac aagacgaact ccaattcact 9720
gttccttgca ttctaaaacc ttaaatacca gaaaacagct ttttcaaagt tgttttcaaa 9780
gttggcgtat aacatagtat cgacggagcc gattttgaaa ccgcggtgat cacaggcagc 9840
aacgctctgt catcgttaca atcaacatgc taccctccgc gagatcatcc gtgtttcaaa 9900
cccggcagct tagttgccgt tcttccgaat agcatcggta acatgagcaa agtctgccgc 9960
cttacaacgg ctctcccgct gacgccgtcc cggactgatg ggctgcctgt atcgagtggt 10020
gattttgtgc cgagctgccg gtcggggagc tgttggctgg ctggtggcag gatatattgt 10080
ggtgtaaaca aattgacgct tagacaactt aataacacat tgcggacgtt tttaatgtac 10140
tgaattaacg ccgaattaat tcgggggatc tggattttag tactggattt tggttttagg 10200
aattagaaat tttattgata gaagtatttt acaaatacaa atacatacta agggtttctt 10260
atatgctcaa cacatgagcg aaaccctata ggaaccctaa ttcccttatc tgggaactac 10320
tcacacatta ttatggagaa actcgagctt gtcgatcgac agatccggtc ggcatctact 10380
ctatttcttt gccctcggac gagtgctggg gcgtcggttt ccactatcgg cgagtacttc 10440
tacacagcca tcggtccaga cggccgcgct tctgcgggcg atttgtgtac gcccgacagt 10500
cccggctccg gatcggacga ttgcgtcgca tcgaccctgc gcccaagctg catcatcgaa 10560
attgccgtca accaagctct gatagagttg gtcaagacca atgcggagca tatacgcccg 10620
gagtcgtggc gatcctgcaa gctccggatg cctccgctcg aagtagcgcg tctgctgctc 10680
catacaagcc aaccacggcc tccagaagaa gatgttggcg acctcgtatt gggaatcccc 10740
gaacatcgcc tcgctccagt caatgaccgc tgttatgcgg ccattgtccg tcaggacatt 10800
gttggagccg aaatccgcgt gcacgaggtg ccggacttcg gggcagtcct cggcccaaag 10860
catcagctca tcgagagcct gcgcgacgga cgcactgacg gtgtcgtcca tcacagtttg 10920
ccagtgatac acatggggat cagcaatcgc gcatatgaaa tcacgccatg tagtgtattg 10980
accgattcct tgcggtccga atgggccgaa cccgctcgtc tggctaagat cggccgcagc 11040
gatcgcatcc atagcctccg cgaccggttg tagaacagcg ggcagttcgg tttcaggcag 11100
gtcttgcaac gtgacaccct gtgcacggcg ggagatgcaa taggtcaggc tctcgctaaa 11160
ctccccaatg tcaagcactt ccggaatcgg gagcgcggcc gatgcaaagt gccgataaac 11220
ataacgatct ttgtagaaac catcggcgca gctatttacc cgcaggacat atccacgccc 11280
tcctacatcg aagctgaaag cacgagattc ttcgccctcc gagagctgca tcaggtcgga 11340
gacgctgtcg aacttttcga tcagaaactt ctcgacagac gtcgcggtga gttcaggctt 11400
tttcatatct cattgccccc cgggatctgc gaaagctcga gagagataga tttgtagaga 11460
gagactggtg atttcagcgt gtcctctcca aatgaaatga acttccttat atagaggaag 11520
gtcttgcgaa ggatagtggg attgtgcgtc atcccttacg tcagtggaga tatcacatca 11580
atccacttgc tttgaagacg tggttggaac gtcttctttt tccacgatgc tcctcgtggg 11640
tgggggtcca tctttgggac cactgtcggc agaggcatct tgaacgatag cctttccttt 11700
atcgcaatga tggcatttgt aggtgccacc ttccttttct actgtccttt tgatgaagtg 11760
acagatagct gggcaatgga atccgaggag gtttcccgat attacccttt gttgaaaagt 11820
ctcaatagcc ctttggtctt ctgagactgt atctttgata ttcttggagt agacgagagt 11880
gtcgtgctcc accatgttat cacatcaatc cacttgcttt gaagacgtgg ttggaacgtc 11940
ttctttttcc acgatgctcc tcgtgggtgg gggtccatct ttgggaccac tgtcggcaga 12000
ggcatcttga acgatagcct ttcctttatc gcaatgatgg catttgtagg tgccaccttc 12060
cttttctact gtccttttga tgaagtgaca gatagctggg caatggaatc cgaggaggtt 12120
tcccgatatt accctttgtt gaaaagtctc aatagccctt tggtcttctg agactgtatc 12180
tttgatattc ttggagtaga cgagagtgtc gtgctccacc atgttggcaa gctgctctag 12240
ccaatacgca aaccgcctct ccccgcgcgt tggccgattc attaatgcag ctggcacgac 12300
aggtttcccg actggaaagc gggcagtgag cgcaacgcaa ttaatgtgag ttagctcact 12360
cattaggcac cccaggcttt acactttatg cttccggctc gtatgttgtg tggaattgtg 12420
agcggataac aatttcacac aggaaacagc tatgaccatg attac 12465

Claims (10)

1.蛋白质,是如下a)或b)或c)或d)所示的蛋白质:
a)氨基酸序列是序列2所示的蛋白质;
b)在序列2所示的蛋白质的N端和/或C端连接标签得到的融合蛋白质;
c)将序列2所示的氨基酸序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加得到的具有相同功能的蛋白质;
d)与序列2所示的氨基酸序列具有75%或75%以上的同源性且具有相同功能的蛋白质。
2.与权利要求1所述的蛋白质相关的生物材料,为下述A1)至A12)中的任一种:
A1)编码权利要求1所述的蛋白质的核酸分子;
A2)含有A1)所述核酸分子的表达盒;
A3)含有A1)所述核酸分子的重组载体;
A4)含有A2)所述表达盒的重组载体;
A5)含有A1)所述核酸分子的重组微生物;
A6)含有A2)所述表达盒的重组微生物;
A7)含有A3)所述重组载体的重组微生物;
A8)含有A4)所述重组载体的重组微生物;
A9)含有A1)所述核酸分子的转基因植物细胞系;
A10)含有A2)所述表达盒的转基因植物细胞系;
A11)含有A3)所述重组载体的转基因植物细胞系;
A12)含有A4)所述重组载体的转基因植物细胞系。
3.根据权利要求2所述的相关生物材料,其特征在于:A1)所述核酸分子为如下1)或2)或3)所示的基因:
1)其编码序列是序列1所示的cDNA分子或序列3所示的基因组DNA分子;
2)与1)限定的核苷酸序列具有75%或75%以上同一性,且编码权利要求1所述的蛋白质的cDNA分子或基因组DNA分子;
3)在严格条件下与1)或2)限定的核苷酸序列杂交,且编码权利要求1所述的蛋白质的cDNA分子或基因组DNA分子。
4.权利要求1所述的蛋白质或权利要求2或3所述的相关生物材料在调控植物耐旱性中的应用。
5.权利要求1所述的蛋白质或权利要求2或3所述的相关生物材料在培育耐旱性提高的转基因植物中的应用。
6.权利要求1所述的蛋白质或权利要求2或3所述的相关生物材料在植物育种中的应用。
7.一种培育耐旱性提高的转基因植物的方法,包括提高受体植物中权利要求1所述的蛋白质的表达量和/或活性,得到转基因植物的步骤;所述转基因植物的耐旱性高于所述受体植物。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于:所述转基因植物的耐旱性高于所述受体植物体现在转基因植物的存活率大于受体植物和/或转基因植物的离体叶片失水速率慢于受体植物。
9.根据权利要求7或8所述的方法,其特征在于:所述提高受体植物中权利要求1所述的蛋白质的表达量和/或活性的方法为在受体植物中过表达权利要求1所述的蛋白质;
或,所述过表达的方法为将权利要求1所述的蛋白质的编码基因导入受体植物。
10.根据权利要求4-6任一所述的应用或权利要求7-9任一所述的方法,其特征在于:所述植物为单子叶植物或双子叶植物;
或,所述单子叶植物为玉米或水稻;
或,所述双子叶植物为拟南芥。
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Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20040214272A1 (en) * 1999-05-06 2004-10-28 La Rosa Thomas J Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants
CN101432431A (zh) * 2006-03-07 2009-05-13 先锋高级育种国际公司 用于增加植物对高群体密度的耐受性的组合物和方法
CN101802202A (zh) * 2007-05-03 2010-08-11 巴斯夫植物科学有限公司 具有增强的产量相关性状的植物和用于制备该植物的方法
CN104178495A (zh) * 2013-05-21 2014-12-03 中国科学院遗传与发育生物学研究所 耐盐抗旱基因及其编码的蛋白和应用
US20150315605A1 (en) * 2014-02-21 2015-11-05 E I Du Pont De Nemours And Company Novel transcripts and uses thereof for improvement of agronomic characteristics in crop plants

Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20040214272A1 (en) * 1999-05-06 2004-10-28 La Rosa Thomas J Nucleic acid molecules and other molecules associated with plants
CN101432431A (zh) * 2006-03-07 2009-05-13 先锋高级育种国际公司 用于增加植物对高群体密度的耐受性的组合物和方法
CN101802202A (zh) * 2007-05-03 2010-08-11 巴斯夫植物科学有限公司 具有增强的产量相关性状的植物和用于制备该植物的方法
CN104178495A (zh) * 2013-05-21 2014-12-03 中国科学院遗传与发育生物学研究所 耐盐抗旱基因及其编码的蛋白和应用
US20150315605A1 (en) * 2014-02-21 2015-11-05 E I Du Pont De Nemours And Company Novel transcripts and uses thereof for improvement of agronomic characteristics in crop plants

Non-Patent Citations (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
NCBI: ""PREDICTED: Zea mays putative transcription factor bHLH041 (LOC103630140), mRNA"", 《GENBANK》 *
SHAOWEI WEI 等: ""ZmbHLH124 identified in maize recombinant inbred lines contributes to drought tolerance in crops"", 《PLANT BIOTECHNOL J》 *
SUN,S 等: ""putative transcription factor bHLH041 [Zea mays]"", 《GENBANK》 *
吴耀荣 等: ""植物响应非生物胁迫机制的研究进展及趋势"", 《中国基础科学》 *
郝怀庆 等: ""分子模块设计育种技术在玉米育种中的应用及前景展望"", 《中国科学院院刊》 *

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