CN112646796A - 耐热β-半乳糖苷酶的制备 - Google Patents
耐热β-半乳糖苷酶的制备 Download PDFInfo
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Abstract
本发明涉及耐热β‑半乳糖苷酶的制备,酶基因序列(β‑galactosidase,GenBank:NT_166518.1)在第2010位上发生突变,由原来的A分别突变为C,其有益效果在于,获得的突变β‑半乳糖苷酶最适反应温度大大提高。
Description
技术领域
本发明属于基因工程与酶工程领域,具体涉及耐热β-半乳糖苷酶的制备。
背景技术
乳糖不耐症是一种乳糖消化不良疾病,主要原因是生物体内缺乏乳糖酶或其活性较低,乳糖不能被乳糖酶水解成单糖,人体无法吸收,我国成年人乳糖吸收不良的发病率高达86.7%。
乳糖酶又称为β-D-半乳糖苷半乳糖水解酶,可将乳糖水解为葡萄糖和半乳糖,乳糖酶的应用领域很广,在医药、乳制品、免疫分析检测、化学合成、生物、环保领域都有应用。目前公认制备乳糖酶比较安全的菌株主要有益生菌、乳酸克鲁维酵母、米曲霉、黑曲霉、脆壁克鲁维酵母。
国内外已经对乳糖酶进行了大量的研究工作,但尚未得到广泛应用,主要原因有:1.乳糖酶的单位产量较低;2.市场上的乳糖酶多为胞内酶,需破碎细胞才能得到,提取纯化工艺复杂,成本高;3.酶的作用温度低、耐热性差,工业生产中容易染杂菌,适用范围窄。本研究主要通过提高乳糖酶的酶活,解决乳糖酶的成本问题。
发明内容
本发明的目的是提供一种耐热β-半乳糖苷酶的制备方法,使得β-半乳糖苷酶的最佳作用温度有很大的提高,其具有更高的应用潜力和经济价值。
本发明的制备过程如下:
1.从NCBI上获得β-半乳糖苷酶序列(β-galactosidase,GenBank:NT_166518.1),交生物公司合成,设计PCR引物F:5'-AATTAATTCGGATCCGAATTCCTGAACTCTCGCGGAATTTGA-3',5'-GTGGTGGTGGTGGTGCTCGAGTTTCATGTAGCATCTCAATATGATTAACT-3',PCR反应结束后,加20μlCloning Enhancer到PCR体系中,37℃孵育15min,80℃孵育15min,采用EcoRⅠ、XhoⅠ酶切pET20b(+)质粒,酶切产物经过0.75%琼脂糖凝胶电泳后回收,溶于灭菌双蒸水中,将孵育后的PCR产物与纯化的线性载体混合均匀,加入In-Fusion酶,50℃反应15min,转化E.coliJM109,挑取阳性克隆,送生物公司测序,将鉴定正确的质粒转化宿主E.coli BL21进行表达,得到含有野生型序列质粒的基因工程菌;
2.质粒DNA的提取
将携带有质粒pET20b(+)/β-galactosidase的E.coli BL21基因工程菌接种于LB/Am p(Amp终浓度100μg/mL)液体培养基中,于37℃,200r/min过夜培养后,使用质粒小量提取试剂盒抽提质粒,具体操作按照说明书进行;
3.易错PCR扩增与突变文库的构建
以步骤2获得的质粒为模板,用NotⅠ酶切使质粒线性化,用引物序列5'-AATTAATTCGGATCCGAATTCCTGAACTCTCGCGGAATTTGA-3',5'-GTGGTGGTGGTGGTGCTCGAGTTTCATGTAGCATCTCAATATGATTAACT-3',进行易错PCR扩增基因,易错PCR扩增体系(50μl)为10×TaKaRa TaqBuffer,dNTPs Mixture,引物各0.2μmol/L,模板DNA 200ng,Taq DNA聚合酶2.5U,5mmol/LMn2+,0.5U/μl的Taq DNA聚合酶2.5μl,7mmol/L的Mg2+,PCR反应条件:95℃5min,94℃1min,55℃1min,72℃2min,35个循环,72℃10min,加20μl Cloning Enhancer到PCR体系中,37℃孵育15min,80℃孵育15min,将pET20b(+)质粒用EcoRⅠ、XhoⅠ酶切线性化,酶切产物经过0.75%琼脂糖凝胶电泳后回收,溶于灭菌双蒸水中,将孵育后的PCR产物与纯化的线性载体混合均匀,加入In-Fusion酶,50℃反应15min,转化E.coli BL21;
4.突变文库的高通量筛选
将步骤3得到的转化E.coli BL21,37℃孵育1h后收集菌体涂布氨苄青霉素抗性培养基(100μg/mL),37℃温育12h,将平板上菌落分别刮取,接种至含100μg/mL氨苄青霉素的100mL LB培养基中,37℃振荡培养14h后提取混合质粒,混合质粒经XbaⅠ酶切后电击转化毕赤酵母GS115,涂布MD平板,待MD平板上出现菌落后,将菌落挑至涂有X-gal的MM培养基上,使X-gal变蓝的菌株即为阳性突变体,挑取阳性菌株接种于48孔培养板中,每孔加入YPD培养基500μL、2%接种量,于28℃、200r/min培养48h,离心收集菌体以500μL BMMY培养基重悬菌体,28℃、200r/min培养48h,每12h补加甲醇至终浓度为0.5%,诱导结束后离心取上清即为粗酶液;
5.酶蛋白纯化
配制AKTA使用的缓冲液,其中A液:20mmol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液(pH7.5),B液:1mol/L氯化钠溶液(20mmol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液,pH7.5),以5倍柱床体积的A液平衡柱子后,粗酶液经A液流入captorQ(1mL)阴离子柱中,通过B液进行梯度洗脱:以5倍柱床体积的11%的B液洗脱杂蛋白,再以5%B液洗脱目的蛋白;
6.粗酶液中蛋白含量的测定
标准曲线绘制:以牛血清蛋白(BSA)为标准品,配置10mg/mL BSA母液,稀释为以下几个梯度:10.0mg/mL、8.0mg/mL、6.0mg/mL、4.0mg/mL、2.0mg/mL、1.0mg/mL、0.5mg/mL,取不同浓度BSA溶液或超纯水40μL,加入5倍稀释后的Bio-Rad考马斯亮蓝蛋白染液260μL,震荡混匀后室温静置15min,取200μL加入酶标板中,于595nm下测定吸光度,记录数值,绘制标准曲线,取粗酶液或纯化后的酶液40μL,加入稀释后染液260μL,混匀后室温静置15min,取200μL加入酶标板中于595nm下测定吸光度,记录数值,根据标准曲线计算酶液的蛋白浓度;
7.酶活及比活力测定
配制不同浓度对硝基苯酚溶液(浓度分别为0.01mmol/L、0.02mmol/L、0.03mmol/L、0.04mmol/L、0.05mmol/L、0.06mmol/L、0.07mmol/L、0.08mmol/L、0.09mmol/L和0.1mmol/L),定容至10mL,各取2mL,加入2mL 1mol/L Na2CO3溶液显色,420nm波长下测定吸光度值,做对硝基苯酚-光密度标准曲线;
将200μL稀释的酶液加入到800μL2.5g/L经预热的ONPG(pH6.5,1mM磷酸钾缓冲液)溶液中,在20℃、30℃、40℃、50℃、60℃、70℃下反应10min,加入1mL 10%Na2CO3溶液终止反应,于420nm测定吸光值,空白以灭活的酶液代替有活性酶液,假设标准曲线为Y=aX+b;
E:酶活,单位U/mL
t:反应时间
N:酶液稀释倍数
V2:反应终体积
V1:酶液添加量
8.将比活最高的突变子,送生物公司测序。
本发明的有益效果是:
获得的突变β-半乳糖苷酶最适反应温度大大提高
附图说明
图1易错PCR电泳图
图2蛋白标准曲线
图3对硝基苯酚-光密度标准曲线
具体实施方式
下面通过实施例对本发明做进一步详细说明,实施例仅用来说明本发明,并不限制本发明的范围。
实施例1
本实施例涉及的材料和试剂见表1,实验仪器见表2;
表1实验材料和试剂
E.coli T-A克隆载体pET20b(+) | 上海联迈生物工程有限公司 |
质粒小提试剂盒 | 天根生化科技有限公司 |
氨苄青霉素 | 上海通蔚生物有限公司 |
考马斯亮蓝R-250 | 北京索莱宝科技有限公司 |
琼脂糖凝胶DNA回收试剂盒 | 大连宝生物工程有限公司 |
限制性内切酶 | 大连宝生物工程有限公司 |
Taq酶 | 大连宝生物工程有限公司 |
In-Fusion Cloning试剂盒 | 大连宝生生物工程有限公司 |
酵母粉 | Dxoid Ltd.England |
胰蛋白胨 | Dxoid Ltd.England |
酵母氮源 | NEB |
巴斯德毕赤酵母GS115 | Invitrogen公司 |
邻硝基苯酚-β-D-半乳糖苷 | Applichem公司 |
表2实验仪器设备
LB培养基配方:胰蛋白胨10g/l,酵母粉5g/l,NaCl 10g/l,pH7.0;
固体LB培养基:每100mL液体LB培养基加2g琼脂粉,高压灭菌;
YPD培养基:1%酵母提取物,2%蛋白胨,2%葡萄糖,pH6.0;
MD固体培养基:0.00004%Biotin,1.34%YNB,2%葡萄糖,1.5%琼脂糖;
MM固体培养基:0.00004%Biotin,1.34%YNB,0.5%甲醇,1.5%琼脂糖;
BMMY培养基:2%蛋白胨,1%酵母提取物,0.3%K2HPO4,1.18%KH2PO4,1.34%YNB,0.5%甲醇(V/V),0.00004%Biotin;
PTM微量盐:0.6%CuSO4,0.008%NaI2,0.3%MnSO4,0.02%Na2MoO4,0.002%H3BO3,0.05%CoCl2,2%ZnCl2,6.5%FeSO4,0.5%硫酸(V/V);
酵母发酵基础盐培养基:0.5%KH2PO4,5%NH4H2PO4,1.485%MgSO4,1.82%K2SO4,0.093%CaSO4,0.15%KOH,0.00011%Biotin,0.44%PTM微量盐,2%葡萄糖;
酵母发酵基础盐诱导培养基:0.5%KH2PO4,5%NH4H2PO4,1.485%MgSO4,1.82%K2SO4,0.093%CaSO4,0.15%KOH,0.00011%Biotin,0.44%PTM微量盐,0.5%甲醇;
IPTG储存液(200mg/mL):用去离子水配制成200mg/mL异丙基硫代-β-D-半乳糖苷,用0.22μm过滤器过滤除菌,分装成每管1mL,贮存于-20℃;
氨苄青霉素储存液(200mg/mL):用去离子水配制成200mg/mL的氨苄青霉素(Amp)贮存液,用0.22μm过滤器过滤除菌,分装成每管1mL,贮存于-20℃;
50×TAE电泳缓冲液:Tris 242g,冰乙酸57.1mL,0.5mol/L EDTA(pH8.0)100mL,用蒸馏水定容至1L;
琼脂糖溶液(1.2%):称取0.60g琼脂糖,溶解于50mL巴比妥钠-HCl缓冲液中;
1.从NCBI上获得β-半乳糖苷酶序列(β-galactosidase,GenBank:NT_166518.1),交生物公司合成,设计PCR引物F:5'-AATTAATTCGGATCCGAATTCCTGAACTCTCGCGGAATTTGA-3',5'-GTGGTGGTGGTGGTGCTCGAGTTTCATGTAGCATCTCAATATGATTAACT-3',PCR反应结束后,加20μlCloning Enhancer到PCR体系中,37℃孵育15min,80℃孵育15min,采用EcoRⅠ、XhoⅠ酶切pET20b(+)质粒,酶切产物经过0.75%琼脂糖凝胶电泳后回收,溶于灭菌双蒸水中,将孵育后的PCR产物与纯化的线性载体混合均匀,加入In-Fusion酶,50℃反应15min,转化E.coliJM109,挑取阳性克隆,送生物公司测序,将鉴定正确的质粒转化宿主E.coli BL21进行表达,得到含有野生型序列质粒的基因工程菌;
2.质粒DNA的提取
将携带有质粒pET20b(+)/β-galactosidase的E.coli BL21基因工程菌接种于LB/Amp(Amp终浓度100μg/mL)液体培养基中,于37℃,200r/min过夜培养后,使用质粒小量提取试剂盒抽提质粒,具体操作按照说明书进行;
3.易错PCR扩增与突变文库的构建
以步骤2获得的质粒为模板,用NotⅠ酶切使质粒线性化,用引物序列5'-AATTAATTCGGATCCGAATTCCTGAACTCTCGCGGAATTTGA-3',5'-GTGGTGGTGGTGGTGCTCGAGTTTCATGTAGCATCTCAATATGATTAACT-3',进行易错PCR扩增基因(见图1),易错PCR扩增体系(50μl)为10×TaKaRa Taq Buffer,dNTPs Mixture,引物各0.2μmol/L,模板DNA 200ng,Taq DNA聚合酶2.5U,5mmol/L Mn2+,0.5U/μl的Taq DNA聚合酶2.5μl,7mmol/L的Mg2+,PCR反应条件:95℃5min,94℃1min,55℃1min,72℃2min,35个循环,72℃10min,加20μl Cloning Enhancer到PCR体系中,37℃孵育15min,80℃孵育15min,将pET20b(+)质粒用EcoRⅠ、XhoⅠ酶切线性化,酶切产物经过0.75%琼脂糖凝胶电泳后回收,溶于灭菌双蒸水中,将孵育后的PCR产物与纯化的线性载体混合均匀,加入In-Fusion酶,50℃反应15min,转化E.coli BL21;
4.突变文库的高通量筛选
将步骤3得到的转化E.coli BL21,37℃孵育1h后收集菌体涂布氨苄青霉素抗性培养基(100μg/mL),37℃温育12h,将平板上菌落分别刮取,接种至含100μg/mL氨苄青霉素的100mL LB培养基中,37℃振荡培养14h后提取混合质粒,混合质粒经XbaⅠ酶切后电击转化毕赤酵母GS115,涂布MD平板,待MD平板上出现菌落后,将菌落挑至涂有X-gal的MM培养基上,使X-gal变蓝的菌株即为阳性突变体,挑取阳性菌株接种于48孔培养板中,每孔加入YPD培养基500μL、2%接种量,于28℃、200r/min培养48h,离心收集菌体以500μL BMMY培养基重悬菌体,28℃、200r/min培养48h,每12h补加甲醇至终浓度为0.5%,诱导结束后离心取上清即为粗酶液;
5.酶蛋白纯化
配制AKTA使用的缓冲液,其中A液:20mmol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液(pH7.5),B液:1mol/L氯化钠溶液(20mmol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液,pH7.5),以5倍柱床体积的A液平衡柱子后,粗酶液经A液流入captorQ(1mL)阴离子柱中,通过B液进行梯度洗脱:以5倍柱床体积的11%的B液洗脱杂蛋白,再以5%B液洗脱目的蛋白;
6.粗酶液中蛋白含量的测定
标准曲线绘制:以牛血清蛋白(BSA)为标准品,配置10mg/mL BSA母液,稀释为以下几个梯度:10.0mg/mL、8.0mg/mL、6.0mg/mL、4.0mg/mL、2.0mg/mL、1.0mg/mL、0.5mg/mL,取不同浓度BSA溶液或超纯水40μL,加入5倍稀释后的Bio-Rad考马斯亮蓝蛋白染液260μL,震荡混匀后室温静置15min,取200μL加入酶标板中,于595nm下测定吸光度,记录数值,绘制标准曲线(见图2),取粗酶液或纯化后的酶液40μL,加入稀释后染液260μL,混匀后室温静置15min,取200μL加入酶标板中于595n m下测定吸光度,记录数值,根据标准曲线计算酶液的蛋白浓度(见表3);
表3酶液蛋白浓度(mg/mL)
7.酶活及比活力测定
配制不同浓度对硝基苯酚溶液(浓度分别为0.01mmol/L、0.02mmol/L、0.03mmol/L、0.04mmol/L、0.05mmol/L、0.06mmol/L、0.07mmol/L、0.08mmol/L、0.09mmol/L和0.1mmol/L),定容至10mL,各取2mL,加入2mL 1mol/L Na2CO3溶液显色,420nm波长下测定吸光度值,做对硝基苯酚-光密度标准曲线(图3),酶活标准曲线为y=0.0498x-0.0505R2=0.9991;
将200μL稀释的酶液加入到800μL2.5g/L经预热的ONPG(pH6.5,1mM磷酸钾缓冲液)溶液中,在20℃、30℃、40℃、50℃、60℃、70℃下反应10min,加入1mL 10%Na2CO3溶液终止反应,于420nm测定吸光值,空白以灭活的酶液代替有活性酶液;
E:酶活,单位U/mL
t:反应时间
N:酶液稀释倍数
V2:反应终体积
V1:酶液添加量
表4乳糖酶比酶活
8.将比酶活最高的突变子,送生物公司测序(见表5)。
表5比酶活最高突变子序列与野生型序列对比
本发明获得了突变体最适温度提高了20℃,具有更好的工业应用价值。
Claims (2)
1.耐热β-半乳糖苷酶的制备,其特征在于,所述酶基因序列(β-galactosidase,GenBank:NT_166518.1)在第2010位,由原来的A分别突变为C,构建方法包括以下步骤:
1)从NCBI上获得β-半乳糖苷酶序列(β-galactosidase,GenBank:NT_166518.1),交生物公司合成,设计PCR引物F:5'-AATTAATTCGGATCCGAATTCCTGAACTCTCGCGGAATTTGA-3',5'-GTGGTGGTGGTGGTGCTCGAGTTTCATGTAGCATCTCAATATGATTAACT-3',PCR反应结束后,加20μlCloning Enhancer到PCR体系中,37℃孵育15min,80℃孵育15min,采用EcoRⅠ、XhoⅠ酶切pET20b(+)质粒,酶切产物经过0.75%琼脂糖凝胶电泳后回收,溶于灭菌双蒸水中,将孵育后的PCR产物与纯化的线性载体混合均匀,加入In-Fusion酶,50℃反应15min,转化E.coliJM109,挑取阳性克隆,送生物公司测序,将鉴定正确的质粒转化宿主E.coli BL21进行表达,得到含有野生型序列质粒的基因工程菌;
2)质粒DNA的提取
将携带有质粒pET20b(+)/β-galactosidase的E.coli BL21基因工程菌接种于LB/Amp(Amp终浓度100μg/mL)液体培养基中,于37℃,200r/min过夜培养后,使用质粒小量提取试剂盒抽提质粒,具体操作按照说明书进行;
3)易错PCR扩增与突变文库的构建
以步骤2获得的质粒为模板,用NotⅠ酶切使质粒线性化,用引物序列5'-AATTAATTCGGATCCGAATTCCTGAACTCTCGCGGAATTTGA-3',5'-GTGGTGGTGGTGGTGCTCGAGTTTCATGTAGCATCTCAATATGATTAACT-3',进行易错PCR扩增基因,易错PCR扩增体系(50μl)为10×TaKaRa TaqBuffer,dNTPs Mixture,引物各0.2μmol/L,模板DNA 200ng,Taq DNA聚合酶2.5U,5mmol/LMn2+,0.5U/μl的Taq DNA聚合酶2.5μl,7mmol/L的Mg2+,PCR反应条件:95℃5min,94℃1min,55℃1min,72℃2min,35个循环,72℃10min,加20μl Cloning Enhancer到PCR体系中,37℃孵育15min,80℃孵育15min,将pET20b(+)质粒用EcoRⅠ、XhoⅠ酶切线性化,酶切产物经过0.75%琼脂糖凝胶电泳后回收,溶于灭菌双蒸水中,将孵育后的PCR产物与纯化的线性载体混合均匀,加入In-Fusion酶,50℃反应15min,转化E.coli BL21;
4)突变文库的高通量筛选
将步骤3得到的转化E.coli BL21,37℃孵育1h后收集菌体涂布氨苄青霉素抗性培养基(100μg/mL),37℃温育12h,将平板上菌落分别刮取,接种至含100μg/mL氨苄青霉素的100mLLB培养基中,37℃振荡培养14h后提取混合质粒,混合质粒经XbaⅠ酶切后电击转化毕赤酵母GS115,涂布MD平板,待MD平板上出现菌落后,将菌落挑至涂有X-gal的MM培养基上,使X-gal变蓝的菌株即为阳性突变体,挑取阳性菌株接种于48孔培养板中,每孔加入YPD培养基500μL、2%接种量,于28℃、200r/min培养48h,离心收集菌体以500μL BMMY培养基重悬菌体,28℃、200r/min培养48h,每12h补加甲醇至终浓度为0.5%,诱导结束后离心取上清即为粗酶液;
5)酶蛋白纯化
配制AKTA使用的缓冲液,其中A液:20mmol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液(pH7.5),B液:1mol/L氯化钠溶液(20mmol/L磷酸氢二钠-柠檬酸缓冲液,pH 7.5),以5倍柱床体积的A液平衡柱子后,粗酶液经A液流入captorQ(1mL)阴离子柱中,通过B液进行梯度洗脱:以5倍柱床体积的11%的B液洗脱杂蛋白,再以5%B液洗脱目的蛋白;
6)粗酶液中蛋白含量的测定
标准曲线绘制:以牛血清蛋白(BSA)为标准品,配置10mg/mL BSA母液,稀释为以下几个梯度:10.0mg/mL、8.0mg/mL、6.0mg/mL、4.0mg/mL、2.0mg/mL、1.0mg/mL、0.5mg/mL,取不同浓度BSA溶液或超纯水40μL,加入5倍稀释后的Bio-Rad考马斯亮蓝蛋白染液260μL,震荡混匀后室温静置15min,取200μL加入酶标板中,于595nm下测定吸光度,记录数值,绘制标准曲线,取粗酶液或纯化后的酶液40μL,加入稀释后染液260μL,混匀后室温静置15min,取200μL加入酶标板中于595nm下测定吸光度,记录数值,根据标准曲线计算酶液的蛋白浓度;
7)酶活及比活力测定
配制不同浓度对硝基苯酚溶液(浓度分别为0.01mmol/L、0.02mmol/L、0.03mmol/L、0.04mmol/L、0.05mmol/L、0.06mmol/L、0.07mmol/L、0.08mmol/L、0.09mmol/L和0.1mmol/L),定容至10mL,各取2mL,加入2mL 1mol/L Na2CO3溶液显色,420nm波长下测定吸光度值,做对硝基苯酚-光密度标准曲线;
将200μL稀释的酶液加入到800μL2.5g/L经预热的ONPG(pH6.5,1mM磷酸钾缓冲液)溶液中,在20℃、25℃、30℃、35℃、40℃、45℃、50℃、55℃、60℃、65℃、70℃下反应10min,加入1mL 10%Na2CO3溶液终止反应,于420nm测定吸光值,空白以灭活的酶液代替有活性酶液,假设标准曲线为Y=aX+b;
E:酶活,单位U/mL
t:反应时间
N:酶液稀释倍数
V2:反应终体积
V1:酶液添加量
8)将比活最高的突变子,送生物公司测序。
2.根据权利要求1所述的耐热β-半乳糖苷酶的应用,其特征在于,所述的耐热β-半乳糖苷酶应用于医药、乳制品、免疫分析检测、化学合成、生物、环保领域。
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