CN112322624A - 一种玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro及其应用 - Google Patents

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刘琳
赵俊伊
何娟
莫蓓莘
陈雪梅
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Shenzhen University
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    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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Abstract

本发明涉及一种玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1‑pro及其应用,启动子ZmREG1‑pro的核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,或为具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列互补的核苷酸序列,或为与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有75%以上同源性且同样具有启动功能的DNA分子。本发明的玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1‑pro能够启动目的基因在植物根部进行特异性地表达,对于玉米作物基因的改良具有重要意义和广泛的应用价值。

Description

一种玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro及其应用
技术领域
本发明涉及基因工程技术领域,具体涉及一种玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro及其应用。
背景技术
组织特异性的启动子在某个特异的组织中表达。就植物而言,组织特异性的启动子可以在植物的特定组织如叶片、种子、根或生殖器官等启动目的基因的表达。这对于转基因作物的生物安全性以及遗传改造具有重要意义。
目前,大多数组织特异性启动子的研究主要集中在植物的地上部分,根部特异性启动子的研究及应用相对较少,目前尚没有关于玉米根部特异性表达的启动子的相关研究。根系对植物生长发育至关重要,植物主要靠根系吸取土壤中的养分及水分,起到运输营养物质、贮存营养、支撑与固定等作用。此外根部受环境的变化的影响较大,它能感知自然环境的胁迫因素如干旱、高温、高湿、盐碱及重金属离子等,并迅速做出反应。
玉米的根具有药用价值,它对人类的胆囊炎和结石以及黄疸型肝炎都有很好的治疗作用。因此,玉米根部特异性基因的研究对培育抗干旱、盐碱等逆境因素的作物,提高和改良作物产量与品质具有重要意义,故根特异性启动子就成为研究根基因表达非常必要的基因工程元件,具有广泛的应用价值。
发明内容
本发明的目的是提供一种玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro及其应用,解决现有技术中无法对玉米根部组织特异表达育种的问题。
本发明解决技术问题所采用的技术方案是:一种玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro,其核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,或为具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列互补的核苷酸序列,或为与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有75%以上同源性且同样具有启动功能的DNA分子。
一种根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro,其核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列,或为具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列互补的核苷酸序列,或为与SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列具有90%以上同源性且同样具有启动功能的DNA分子。
需要说明的是,凡是经过人工修饰的,与本发明得到的启动子ZmREG1-pro的SEQID NO:1所示的核苷酸序列具有75%或者更高同一性且具有启动功能的DNA分子,均是衍生于本发明的启动子ZmREG1-pro的核苷酸序列并且等同于该核苷酸序列。
本发明还提供一种含有上述的启动子pCAMBIA3301-ZmREG1-pro::GUS的重组载体。
本发明还提供了上述的启动子ZmREG1-pro在根部组织特异表达育种中的应用,其中根部组织是单子叶作物的根部组织,优选是玉米的根部组织;启动子ZmREG1-pro通过启动目的基因在根部组织特异表达育种中的应用,尤其是启动子ZmREG1-pro通过启动目的基因在玉米根部组织特异表达育种中的应用。
本发明通过采集玉米的V6时期和R1时期(V6时期即第六叶完全展开,雄穗生长锥开始伸长,即拔节;R1时期即雌穗的花丝开始露出苞叶,即吐丝期)6个不同组织的样品,每组设立3次生物学重复,进行RNA提取。利用RNA Seq高通量测序,分析特异性表达基因,如图1所示。
实施本发明的玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro及其应用,具有以下有益效果:本发明的玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro能够启动外源基因在植物根部进行特异性地表达,对于玉米作物基因的改良具有重要意义和广泛的应用价值。
附图说明
图1是本发明的玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro驱动REG1基因在不同组织中RNA Seq中的表达值的柱状图。
图2是ZmREG1-pro启动子驱动REG1基因在玉米不同组织中荧光定量PCR基因表达柱状图。
图3是含有上述启动子ZmREG1-pro重组载体pCAMBIA3301-ZmREG1pro::GUS的图谱。
具体实施方式
下面结合附图和实施例,对本发明的玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro及其应用作进一步说明:
本发明的玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro中的调控元件的分析参见表1。
表1:利用PlantCARE预测ZmREG1-pro序列中调控元件
Figure BDA0002829386840000041
实施例1
1材料
1.1植物材料
本发明使用的玉米品种为B73(Zea mays ssp.mays L.)栽培品种B73植物,在22-26℃,65%相对湿度和14小时光周期的人工植物培养箱中培养。需要说明的是,其培养方法是现有技术中常用的培养方法,这里不再进行详细赘述。
2方法
2.1 RNA的提取
将玉米培育至V6时期和R1时期(V6时期即第六叶完全展开,雄穗生长锥开始伸长,即拔节;R1时期即雌穗的花丝开始露出苞叶,即吐丝期),分别取V6时期的叶子、茎和根,R1时期的叶、雌穗和雄穗,采用TRIzol法进行RNA的提取,其中取上述不同组织的样品,每个样品设立3次生物学重复。进行RNA Seq构建文库工作和高通量测序。如图1-3所示,测序结果分析得出V6时期的玉米根部ZmREG1基因表达量最高。
需要说明的是,TRIzol法是现有技术中提取RNA常用的方法,这里不再进行详细赘述。
2.2启动子信息分析
通过在线分析启动子软件PlantCARE(Bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)对启动子ZmREG1的序列进行分析。其中,G-box在很多植物启动子中都有发现,它是很多应激响应启动子行使功能所必须的元件,在植物启动子对光、无氧环境和植物激素的影响过程中起到很重要的作用。
应当理解的是,对本领域普通技术人员来说,可以根据上述说明加以改进或变换,所有这些改进或变换都应属于本发明所附权利要求的保护范围之内。
Figure BDA0002829386840000061
Figure BDA0002829386840000071
序列表
<110> 深圳大学
<120> 一种玉米根部特异性表达的启动子ZmCCD-pro及其应用
<160> 1
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 2000
<212> DNA
<213> 玉米(Zea mays Linn. Sp.)
<400> 1
ctagttagtc caattatttg tgttgggcaa ttcaaccacc aaaatcaatt aggaaaaaaa 60
gtgtaagcct aattcccttt cagtagcagc gaagggtaag gaggagtaag tcctgccagc 120
gtgcgtagca cggcgattct ggctccagga cgacatgaat catgaagcga atgttctgga 180
cactcccagc ctgaaggtgg agctgagcca cgagcgggtc agtcgggtca tgccagagca 240
tcgtggggat ggtgcggggc ccgggtccga cggtcggtgc ggtcgggacg ctgtacacgc 300
cgcccacggt gtcagaggag gtggccccgc cgtcgtgggc cgcaggcgag gcgaggagct 360
gtttcgccgc agcaatctga gcagcatagc gtcggtggcc tcgcgctcgc gctcccacac 420
gagggccgct tcccgcagac gtgcctgtcg cgccgcgtgc tccacgcggg cagcagtgag 480
ggcggcgacg gtgtagccct agtgggcaac cggcggagga ggcggcggat cgacgacagg 540
atgtggatcg acgaccagcg acggggggag tggcggggga gggtcctccg gatctgcaac 600
ccccgcggga accacagtcg ccacagcagt aagggcagag gcggtgctcg cggcggtgag 660
ggccccaccg gcggcgctag gtcctgaccc ccacgccggc ccgagcgcag gggagaccgg 720
ggagcgcgtg cgacgtaggg ggcgttcctc acaccgacgg cagcggtagc tccagtgccc 780
gcgggtctgg gagaaccagc acggggtgga gcagcagcgg tggcgcgcgc gccaggggcg 840
acggcgcggg gccaagagga ggaggaggag gagaggggag ggaagacgtg gaagtaggag 900
ggggaggagg aggcggctgc tcggccatgg ggccggcgct atccaccaga gaggggcgga 960
ggaagatggt ggcgcggagc agggggcgcg accggcgcgc aggaagatgc agagaggggt 1020
cgacggcggt gaggggcgga cgaagcaggg ggcgcgacgc ggagtaggga gcgcggcgcg 1080
cgcggaggaa gatggtggcg cggtctgcca gagagaggcc gacggcggtg agtggcggac 1140
ggagcagggg cgcggccggc gctgagggag acgatgggcg cggccgcgcg ggccgtggcc 1200
gacggcgatg ggtgcggccg gatgcacagg tcgcgggccg tgcggggctg gggcggcggc 1260
ggccagcaaa gggcgcctgg cggcgcctgg agggagcaga ggggcggcgt cctggcggcg 1320
cctggagaga gcaggggaaa ccctagccgg cggcggctga ggggtgaggg aggagcgaaa 1380
ccctaatctg ataccatgtt agaggaataa cccttggatt aattggacca accctagagg 1440
gtggctatat atagagttta tacatgggct tagcctcatg ggcctaatcc atatattcta 1500
acacgaatta ccccaaaatt ggtgtctgag atgttccttt caatgcaatg ctgttcctta 1560
aaaaaacgtt tcgatgctaa acaaaagcat aggaaatata aaaagttttt gctggtatac 1620
cataccagca tcatgcgtcc gtgctattcc tctgcaggcc ttggtcttgt gcgtacatgc 1680
ctatggatga tcacaggcac gccacatttc attcttaatc actacttaat tgacatctaa 1740
tgccctctgc tcaacttgcg cacgctacgc accgtataaa aacaagtgtc agtgcgagcc 1800
agcccatgca tgcgcagcga tcttggccat ttgcggagcc aagccaaccc aagccgagcg 1860
agcagaaaat atgcgatacc gtatgaggga aaacactagt tattatacga ggtagctagc 1920
aataatacag atcggactct tcgcaaccgg cttcacatgc acatcatatg atggccgcgc 1980
cgggttcaca tgaacgctcc 2000

Claims (5)

1.一种玉米根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro,其特征在于,其核苷酸序列为SEQID NO:1所示的核苷酸序列,或为具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列互补的核苷酸序列,或为与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有75%以上同源性且同样具有启动功能的DNA分子。
2.一种根部特异性表达的启动子ZmREG1-pro,其特征在于,其核苷酸序列为SEQ IDNO:1所示的核苷酸序列,或为具有与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列互补的核苷酸序列,或为与SEQ ID NO:1所示的核苷酸序列具有90%以上同源性且同样具有启动功能的DNA分子。
3.一种含有权利要求1或2所述的启动子pCAMBIA3301-ZmREG1-pro::GUS的重组载体。
4.一种权利要求1或2所述的启动子ZmREG1-pro在根部组织特异表达育种中的应用。
5.一种权利要求1或2所述的启动子ZmREG1-pro在玉米根部组织特异表达育种中的应用。
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