CN111455076B - 用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物 - Google Patents

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Abstract

本申请提供用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物中，通过采用口腔拭子对孤独症患儿和健康儿童分别进行采样口腔菌群并提取基因组DNA，通过Illumina Hiseq平台进行高通量测序；通过QIIME软件对所得到的数据进行分析，通过LEfSe分析找到细菌的分子标志物，应用于孤独症的分子诊断；降噪优化后的数据与健康儿童口腔菌群数据进行对比，得到金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属、草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属具有较高的特异性和敏感性，可以作为特征菌属来评估儿童孤独症。

Description

用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物
技术领域
本申请涉及生物医学技术领域，尤其涉及一种用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物。
背景技术
近年来，孤独症又称自闭症，是一种广泛性发育障碍的代表性疾病，其主要表现为：社会交往障碍、交流障碍或兴趣狭窄等行为方式；孤独症早期诊断对孤独症患儿的康复至关重要，早发现早治疗对患儿的康复具有非常重要的作用。
目前，孤独症的诊断只能依靠临床医生的临床经验、ABC量表、Cars量表等调查问卷进行孤独症的评估和诊断，但是这种方式缺少临床客观指标，不能进行精准诊断，容易误诊、漏诊。
为了依靠临床客观指标评估孤独症，目前肠道菌群的分子标志物已经成为孤独症评估和诊断的实验室手段之一，但是由于孤独症患儿具有语言交流障碍，采样沟通较为困难，采样实施起来比较困难。
发明内容
本申请提供了用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物，以寻找可以用来评估儿童孤独症状况的微生物标志物。
为了解决上述技术问题，本申请实施例公开了如下技术方案：
本申请提供了一种用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物，所述微生物包括特征菌属，用于评估儿童孤独症，其中：
所述特征菌属包括：金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属。
可选的，所述特征菌属还包括：草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属。
可选的，所述金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属的相对丰度上升。
可选的，所述草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的相对丰度下降。
可选的，所述特征菌属源于口腔菌群。
与现有技术相比，本申请的有益效果为：
本申请提供了用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物中，通过采用口腔拭子对孤独症患儿和健康儿童分别进行采样，只需用棉签伸进口腔，无创快捷，基本不需要与患儿进行沟通；然后对口腔菌群提取基因组DNA，通过Illumina Hiseq平台进行高通量测序；通过QIIME软件对所得到的数据进行分析，通过LEfSe分析找到细菌的分子标志物，应用于孤独症的分子诊断；降噪优化后的数据与健康儿童口腔菌群数据进行对比，重点分析金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属、草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的相对丰度，其中，所述金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属的相对丰度上升；所述草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的相对丰度下降。因此，金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属、草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属具有较高的特异性和敏感性，在评估儿童孤独症过程中，将检测与研究结果相比较，来评估儿童口腔菌群微生物的水平变化，根据口腔菌群微生物的水平变化来判断是否存在孤独症的风险。
应当理解的是，以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的，并不能限制本申请。
附图说明
为了更清楚地说明本申请的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，对于本领域普通技术人员而言，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为本申请实施例中提供的用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物的相对丰度比照示意图。
具体实施方式
为了使本技术领域的人员更好地理解本申请中的技术方案，下面将结合本申请实施例中的附图，对本申请实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本申请一部分实施例，而不是全部实施例。基于本申请中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都应当属于本申请保护的范围。
本申请提供了用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物中，通过采用口腔拭子对孤独症患儿和健康儿童分别进行采样，只需用棉签伸进口腔，无创快捷，基本不需要与患儿进行沟通；然后对口腔菌群提取基因组DNA，通过Illumina Hiseq平台进行高通量测序；通过QIIME软件对所得到的数据进行分析，通过LEfSe分析找到细菌的分子标志物，应用于孤独症的分子诊断；降噪优化后的数据与健康儿童口腔菌群数据进行对比，重点分析金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属、草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的相对丰度，其中，所述金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属的相对丰度上升；所述草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的相对丰度下降。具体如下：
在一实施例中，本申请提供了一种用于儿童孤独症评估的口腔菌群微生物，所述微生物包括特征菌属，用于评估儿童孤独症，其中：
所述特征菌属包括：金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属。
进一步地，所述特征菌属还包括：草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属。
进一步地，所述金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属的相对丰度上升。所述草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的相对丰度下降。
在本实施例中通过采用口腔拭子对孤独症患儿和健康儿童分别进行采样，只需用棉签伸进口腔，无创快捷，基本不需要与患儿进行沟通；然后对口腔菌群提取基因组DNA，通过Illumina Hiseq平台进行高通量测序；通过QIIME软件对所得到的数据进行分析，通过LEfSe分析找到细菌的分子标志物，应用于孤独症的分子诊断在本实施例中，相对丰度下降或上升是指丰度差异，而丰度差异是指与正常或对照组体内水平相比，在孤独症儿童的患者体内得到更高或更低水平的微生物，从本申请的目的出发，本申请中选用正常儿童与孤独症儿童作对比，具体选取正常儿童与孤独症儿童中的粪便作为样本。
具体分析结果参考图1，图1为本申请实施例中提供的健康儿童和孤独症儿童的口腔菌群微生物的相对丰度比照示意图，图1中竖轴的左侧为孤独症儿童的口腔菌群微生物的样本数据，右侧为健康儿童的口腔菌群微生物的样本数据，图1示出所述金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属的相对丰度上升；所述草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的相对丰度下降。
由上述可见，金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属、草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属的特异性和敏感性较高，故在本申请实施例中选取这几个菌属为孤独症儿童口腔菌群评估的特征菌，因此为评估体系的关键。
因此，可以将检测与研究结果相比较，来评估儿童口腔菌群微生物中上述特征菌的水平变化，根据口腔菌群微生物的水平变化来判断是否存在孤独症的风险。
本申请发现了特征菌群在孤独症儿童中的水平变化，通过检测特征菌群的变化，可以实现孤独症儿童的评估，使用本发明的特征微生物作为标志物进行诊断，特异性高、敏感性强，应用于儿童孤独症评估具有较高的准确性。
在又一实施例中，通过比较患有孤独症的儿童的母亲和健康儿童的母亲之间的口腔菌群，同样发现差异：对比健康儿童的母亲，在患有孤独症的儿童的母亲中不动杆菌、不动杆菌属、丛毛单胞菌属、溶杆菌属、鞘氨醇杆菌属、海杆菌属、明串珠菌属、皮杆菌属、拉氏杆菌属、特吕珀菌属、丁酸弧菌属、甲基杆菌属、丙酸杆菌属、弗莱德门菌属、纤毛菌属、沃斯菌属的相对丰度显著增加，而金黄杆菌属、草螺菌属、鞘脂单胞菌属、希瓦氏菌属、鞘脂菌属和梭菌属的相对丰度显著减少；这些潜在的生物标志物表明，患有孤独症的儿童的母亲和健康儿童的母亲的口腔菌群存在差异。
由于以上实施方式均是在其他方式之上引用结合进行说明，不同实施例之间均具有相同的部分，本说明书中各个实施例之间相同、相似的部分互相参见即可。在此不再详细阐述。
本领域技术人员在考虑说明书及实践这里发明的公开后，将容易想到本申请的其他实施方案。本申请旨在涵盖本发明的任何变型、用途或者适应性变化，这些变型、用途或者适应性变化遵循本申请的一般性原理并包括本申请未公开的本技术领域中的公知常识或惯用技术手段。说明书和实施例仅被视为示例性的，本申请的真正范围和精神由权利要求的内容指出。
以上所述的本申请实施方式并不构成对本申请保护范围的限定。

Claims (2)

1.一种检测口腔菌群微生物丰度的试剂在制备用于儿童孤独症诊断产品中的应用，其特征在于，所述微生物包括特征菌属，其中：
所述特征菌属包括：金黄杆菌属、丛毛单胞菌属、韦荣氏球菌属、鞘氨醇杆菌属、纤毛菌属、马赛菌属、寡养单胞菌属、丙酸杆菌属及梭杆菌属。
2.根据权利要求1所述的检测口腔菌群微生物丰度的试剂在制备用于儿童孤独症诊断产品中的应用，其特征在于，所述特征菌属还包括：草螺菌属、拟杆菌属、劳特罗普氏菌属、营养缺陷菌属、芽单胞菌属及费氏中华根瘤菌属。
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