CN111269973A - 用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物 - Google Patents
用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物 Download PDFInfo
- Publication number
- CN111269973A CN111269973A CN202010105224.4A CN202010105224A CN111269973A CN 111269973 A CN111269973 A CN 111269973A CN 202010105224 A CN202010105224 A CN 202010105224A CN 111269973 A CN111269973 A CN 111269973A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- children
- assessment
- microorganisms
- sexual precocity
- intestinal flora
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Withdrawn
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6869—Methods for sequencing
Landscapes
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本申请提供的用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物中，通过将对象肠道菌群与健康儿童肠道菌群数据进行对比，重点分析链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属、巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属的相对丰度，其中，所述链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属的相对丰度下降，所述巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属的相对丰度上升。因此，链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属、巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属具有较高的特异性和敏感性，在评估儿童性早熟过程中，将检测与研究结果相比较，来评估儿童肠道菌群微生物的水平变化，根据肠道菌群微生物的水平变化来判断是否存在性早熟的风险。
Description
技术领域
本申请涉及生物医学技术领域，尤其涉及一种用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物。
背景技术
近年来，随着我国居民生活水平的提高，饮食结构的改变和环境等因素，越来越多的儿童出现与真实年龄不符的第二性征，性早熟成为儿童最常见的内分泌疾病之一，并且发病频率有逐年升高的趋势，已经在全球范围内引起儿科专家的重视。目前我国普遍认为，女孩在8岁前、男孩在9岁前表现出第二性征的发育即可定义为性早熟，以女孩居多。根据中国健康促进与教育协会2018年公布的调查数据显示，我国儿童性早熟患病率为0.43％，全国约有53万名患儿，性早熟已经成为仅次于肥胖的第二大儿童内分泌疾病。中枢性性早熟是下丘脑-垂体-性腺轴功能提前启动，造成第二性征提早发育，占性早熟病例的80％左右。
大脑与胃肠道之间可以相互影响，相互作用，近些年研究发现，肠道通透性发生改变后，肠道微生物或代谢产物可进入血液，从而影响神经系统和宿主的健康，大脑和肠道双向的互动反应通过迷走神经相互联系，肠道菌群可以通过脑-肠轴影响神经系统的功能，脑-肠轴功能的变化也会改变肠道菌群结构，进而形成了细菌-脑-肠轴这一新的概念体系。
人体肠道中的微生物群落与宿主之间的关系记为密切，肠道菌群失调与多种临床疾病密切相关；肠道菌群在儿童性早熟过程中的作用并不明确，寻找可用来进行儿童性早熟评估的微生物标志物对探究肠道菌群在儿童性早熟过程中的作用机制具有重要的意义；且目前评估儿童性早熟的发生，除了出现肉眼可见的第二性征之外，还需要抽取静脉血进行性激素指标的检测，儿童对抽血时的刺痛感十分恐惧并反感，配合度较低。
发明内容
本申请提供了用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，以寻找可以用来评估儿童性早熟状况的微生物标志物。
为了解决上述技术问题，本申请实施例公开了如下技术方案：
本申请提供了用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，所述微生物包括特征菌属，用于评估儿童性早熟，其中：
所述特征菌属包括：链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属。
可选的，所述特征菌属还包括：巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属。
可选的，所述链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属的相对丰度下降。
可选的，所述巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属的相对丰度上升。
可选的，采用试剂盒检测肠道菌群微生物。
可选的，所述采用试剂盒检测肠道菌群微生物，包括：
从对象粪便中提取DNA样本；
针对DNA样本构建测序文库；
对测序文库进行高通量测序，获得测序结果；
根据测序结果获得肠道菌群微生物的相对丰度。
与现有技术相比，本申请的有益效果为：
本申请提供了用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物中，通过将对象粪便排入一个清洁干燥的容器内，用采样勺从粪便内部挖取约500mg粪便，置于保存管中，用粪便菌群试剂盒提取微生物组总DNA，设计含有barcode序列的特异引物，PCR扩增16SrRNA的V1-V2区，建立扩增子文库，illumina HiSeq2500测序平台进行测序；降噪优化后的数据与健康儿童肠道菌群数据进行对比，重点分析链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属、巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属的相对丰度，其中，所述链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属的相对丰度下降，所述巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属的相对丰度上升。因此，链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属、巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属具有较高的特异性和敏感性，在评估儿童性早熟过程中，将检测与研究结果相比较，来评估儿童肠道菌群微生物的水平变化，根据肠道菌群微生物的水平变化来判断是否存在性早熟的风险。
应当理解的是，以上的一般描述和后文的细节描述仅是示例性和解释性的，并不能限制本申请。
附图说明
为了更清楚地说明本申请的技术方案，下面将对实施例中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，对于本领域普通技术人员而言，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1为本申请实施例中提供的健康儿童和性早熟儿童的肠道菌群微生物的相对丰度比照示意图。
具体实施方式
为了使本技术领域的人员更好地理解本申请中的技术方案，下面将结合本申请实施例中的附图，对本申请实施例中的技术方案进行清楚、完整地描述，显然，所描述的实施例仅仅是本申请一部分实施例，而不是全部实施例。基于本申请中的实施例，本领域普通技术人员在没有做出创造性劳动前提下所获得的所有其他实施例，都应当属于本申请保护的范围。
本申请提供了一种用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物中，通过将对象粪便排入一个清洁干燥的容器内，用采样勺从粪便内部挖取约500mg粪便，置于保存管中，用粪便菌群试剂盒提取微生物组总DNA，设计含有barcode序列的特异引物，PCR扩增16SrRNA的V1-V2区，建立扩增子文库，illumina HiSeq2500测序平台进行测序；降噪优化后的数据与健康儿童肠道菌群数据进行对比，重点分析链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属、巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属的相对丰度，其中，所述链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属的相对丰度下降，所述巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属的相对丰度上升，具体结果如下：
本申请提供的用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，所述微生物包括特征菌属，用于评估儿童性早熟，其中：
所述特征菌属包括：链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属。
所述特征菌属还包括：巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属。
在本实施例中，采用试剂盒检测肠道菌群微生物，试剂盒为基于检测链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属、巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属丰度的诊断儿童性早熟的试剂盒，试剂盒组分如下：DNA提取试剂、特异性检测链球菌属(Streptococcus)、奈瑟菌属(Neisseria)、嗜血杆菌属(Haemophilus)、卟啉单胞菌属(Porphyromonas)、巨型球菌属(Megasphaera)、考拉杆菌属(Phascolarctobacterium)、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属(16SrRNAde引物对、反应缓冲液、、三磷酸碱基脱氧核苷酸(dNTPs)、Taq-聚合酶逆转录酶、DNase、RNAse抑制剂、DEPC-水、无菌水。
所述采用试剂盒检测肠道菌群微生物，包括：
从对象粪便中提取DNA样本；
具体包括：通过将对象粪便排入一个清洁干燥的容器内，用采样勺从粪便内部挖取约500mg粪便，置于保存管中。
针对DNA样本构建测序文库；
对测序文库进行高通量测序，获得测序结果；
具体包括：用粪便菌群试剂盒提取微生物组总DNA，设计含有barcode序列的特异引物，PCR扩增16SrRNA的V1-V2区，建立扩增子文库，illumina HiSeq2500测序平台进行测序，每个样本均产生相应的高质量测序结果。
根据测序结果获得肠道菌群微生物的相对丰度。
具体为：测序原始数据用FLASH软件进行拼接合成。利用QIIME软件对序列进行过滤，过滤后的数据进行16S rRNA基因的分析。高质量的核苷酸序列根据Greengenes数据库进行聚类，相似度>96％的核苷酸序列作为一个可操作性分类单元(OTU)，之后根据QIIME软件中的RDP分类和Greengenes软件中的参考数据集，将每一个OTU进行细菌种属的分类鉴定，并计算其相对丰度。根据相对丰度，挑选两组存在显著差异的菌属。
在本实施例中，相对丰度下降或上升是指丰度差异，而丰度差异是指与正常或对照组体内水平相比，在性早熟儿童的患者体内得到更高或更低水平的微生物，从本申请的目的出发，本申请中选用正常儿童与性早熟儿童作对比，具体选取正常儿童与性早熟儿童中的粪便作为样本。
具体分析结果参考图1，图1为本申请实施例中提供的健康儿童和性早熟儿童的肠道菌群微生物的相对丰度比照示意图，图1示出所述链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属的相对丰度下降，所述巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属的相对丰度上升。
由上述可见，链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属、巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属特异性和敏感性较高，故在本申请实施例中选取这几个菌属为性早熟儿童肠道菌群评估的特征菌，因此为评估体系的关键。
因此，可以将检测与研究结果相比较，来评估儿童肠道菌群微生物中上述特征菌的水平变化，根据肠道菌群微生物的水平变化来判断是否存在性早熟的风险。
本申请发现了特征菌群在性早熟儿童中的水平变化，通过检测特征菌群的变化，可以实现性早熟儿童的评估，使用本发明的特征微生物作为标志物进行诊断，特异性高、敏感性强，应用于儿童性早熟评估具有较高的准确性。
由于以上实施方式均是在其他方式之上引用结合进行说明，不同实施例之间均具有相同的部分，本说明书中各个实施例之间相同、相似的部分互相参见即可。在此不再详细阐述。
本领域技术人员在考虑说明书及实践这里发明的公开后，将容易想到本申请的其他实施方案。本申请旨在涵盖本发明的任何变型、用途或者适应性变化，这些变型、用途或者适应性变化遵循本申请的一般性原理并包括本申请未公开的本技术领域中的公知常识或惯用技术手段。说明书和实施例仅被视为示例性的，本申请的真正范围和精神由权利要求的内容指出。
以上所述的本申请实施方式并不构成对本申请保护范围的限定。
Claims (6)
1.一种用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，其特征在于，所述微生物包括特征菌属，用于评估儿童性早熟，其中：
所述特征菌属包括：链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属。
2.根据权利要求1所述的用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，其特征在于，所述特征菌属还包括：巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属、粪球菌属及副普氏菌属。
3.根据权利要求1所述的用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，其特征在于，所述链球菌属、奈瑟菌属、嗜血杆菌属及卟啉单胞菌属的相对丰度下降。
4.根据权利要求2所述的用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，其特征在于，所述巨型球菌属、考拉杆菌属、梭菌属的相对丰度上升。
5.根据权利要求1所述的用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，其特征在于，采用试剂盒检测肠道菌群微生物。
6.根据权利要求5所述的用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物，其特征在于，所述采用试剂盒检测肠道菌群微生物，包括：
从对象粪便中提取DNA样本；
针对DNA样本构建测序文库；
对测序文库进行高通量测序，获得测序结果；
根据测序结果获得肠道菌群微生物的相对丰度。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202010105224.4A CN111269973A (zh) | 2020-02-20 | 2020-02-20 | 用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN202010105224.4A CN111269973A (zh) | 2020-02-20 | 2020-02-20 | 用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN111269973A true CN111269973A (zh) | 2020-06-12 |
Family
ID=70997207
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN202010105224.4A Withdrawn CN111269973A (zh) | 2020-02-20 | 2020-02-20 | 用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN111269973A (zh) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN112342161A (zh) * | 2020-11-09 | 2021-02-09 | 浙江省立同德医院 | 一种用于表征肺腺癌气虚痰湿证的肠道菌群组合的筛选方法及肠道菌群组合及模型建立方法 |
-
2020
- 2020-02-20 CN CN202010105224.4A patent/CN111269973A/zh not_active Withdrawn
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN112342161A (zh) * | 2020-11-09 | 2021-02-09 | 浙江省立同德医院 | 一种用于表征肺腺癌气虚痰湿证的肠道菌群组合的筛选方法及肠道菌群组合及模型建立方法 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| CN109852714B (zh) | 一种肠癌早期诊断和腺瘤诊断标志物及用途 | |
| CN109943636B (zh) | 一种结直肠癌微生物标志物及其应用 | |
| US20200157632A1 (en) | Method of diagnosing gastric cancer through bacterial metagenome analysis | |
| CN105296590B (zh) | 大肠癌标志物及其应用 | |
| US20140179726A1 (en) | Gut microflora as biomarkers for the prognosis of cirrhosis and brain dysfunction | |
| CN107217089B (zh) | 确定个体状态的方法及装置 | |
| WO2020244017A1 (zh) | 一种基于肠道菌群的精神分裂症生物标志物组合、其应用及mOTU筛选方法 | |
| CN110904213B (zh) | 一种基于肠道菌群的溃疡性结肠炎生物标志物及其应用 | |
| Boland et al. | Persistent diarrhea in patients with Crohn’s disease after mucosal healing is associated with lower diversity of the intestinal microbiome and increased dysbiosis | |
| CN112852916A (zh) | 肠道微生态的标志物组合、辅助诊断模型及其应用 | |
| CN105603101A (zh) | 检测8个miRNA表达量的系统在制备诊断或辅助诊断肝细胞癌产品中的应用 | |
| CN111727263A (zh) | 通过细菌性宏基因组分析来诊断中风的方法 | |
| CN107217088B (zh) | 强直性脊柱炎微生物标志物 | |
| Rolling et al. | Customization of a DADA2-based pipeline for fungal internal transcribed spacer 1 (ITS1) amplicon data sets | |
| CN113913333B (zh) | 一种肺癌诊断标志物及用途 | |
| CN113380396A (zh) | 一种基于粪便微生物标志物和人dna含量的多种肠道疾病风险评估的方法及应用 | |
| CN111269973A (zh) | 用于儿童性早熟评估的肠道菌群微生物 | |
| CN112553351A (zh) | 基于肠道微生物相对丰度的胆管癌非侵入性标志物、筛选方法及应用 | |
| CN111363803A (zh) | 用于儿童过敏性紫癜评估的肠道菌群微生物 | |
| CN114480636B (zh) | 胆汁细菌作为肝门部胆管癌诊断及预后标志物的用途 | |
| CN115873956A (zh) | 用于预测受试者患有结直肠癌风险的试剂盒、系统、应用和预测模型的建模方法 | |
| CN112384634A (zh) | 骨质疏松生物标志物及其用途 | |
| CN113684242A (zh) | 一种基于淋巴结微生物菌群的头颈癌预后生物标志物及其应用 | |
| CN111235211A (zh) | 肠道菌群微生物在儿童性早熟评估中的应用 | |
| US20200354795A1 (en) | Method for diagnosing pancreatic cancer via bacterial metagenomic analysis |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| PB01 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| WW01 | Invention patent application withdrawn after publication | ||
| WW01 | Invention patent application withdrawn after publication |
Application publication date: 20200612 |