CN111235244A - 测序内标分子及其制备方法和应用 - Google Patents

Abstract

本发明涉及一种测序内标分子及其制备方法和应用，属于基因检测技术领域。该测序内标分子的制备方法包括以下步骤：S1：以1000±200bp为窗口，获得与待测样本中基因序列非同源的unique植源性序列；S2：挑选出GC含量为35％‑70％的序列；S3：筛选出无微卫星的序列；S4：筛选出连续碱基序列数小于8的序列；S5：以测序读长±5bp为窗口进行两两比对，对筛选出的序列做同源性筛查，获得序列相似性低的序列，即为筛选序列；S6：以所述筛选序列为内标分子的基础序列进行PCR扩增，即得获得测序内标分子。上述测序内标分子经过严格的系统筛选后得出，不仅具有较低的成本，还能够在跟踪样本和监控样品间交叉污染的同时不影响病原微生物的检出和测序数据量。

Description

测序内标分子及其制备方法和应用

技术领域

本发明涉及基因检测技术领域，特别是涉及一种测序内标分子及其制备方法和应用。

背景技术

二代测序(又称下一代测序，NGS)技术在发现和转化研究的诸多方面已逐渐成为一种被广泛采用的技术，二代测序由于无偏倚性和高通量的特点，在急难危重感染性疾病的病原检测分析中有重要应用，且能够同时对多个样本进行测序。而在同时进行建库操作的过程中，因操作失误、气溶胶或index hopping导致的同批次样本的互换或交叉污染对检测结果有很大的误导性，而样品跟踪和样本间交叉污染监控的方法就是运用内标分子掺入(unique molecule spike-in，UMSI)进行实现。

对于内标分子，目前大多采用化学合成自然界不存在的序列作为内标分子，但是化学合成序列成本高，在进行大规模样本建库测序的时候就需要更多数量的内标分子。并且，内标分子必须参与建库全程，对于不同的样本类型，需考虑不同的掺入量，掺入量太低，不能起到监测污染的功能；掺入量太高，则成本增加，降低有效数据量。而对于宏转录组检测，内标分子需以RNA形式掺入，合成单链RNA成本更高。

发明内容

基于此，有必要针对上述化学合成内标分子成本高的问题，提供一种测序内标分子及其制备方法和应用，这些内标分子经过严格的系统筛选后得出，不仅具有较低的成本，还能够在样品跟踪及样本间交叉污染监控的同时不影响病原微生物的检出和测序数据量。

一种测序内标分子的制备方法，包括以下步骤：

S1：以1000±200bp为窗口，获得与待测样本中基因序列非同源的unique植源性序列；

S2：从上述unique植源性序列中挑选出GC含量为35％-70％的序列；

S3：从上述序列中筛选出无微卫星的序列；

S4：从上述序列中筛选出连续碱基序列数小于8的序列；

S5：在上述序列中，以测序读长±5bp为窗口进行两两比对，对筛选出的序列做同源性筛查，获得序列相似性低的序列，即为筛选序列；

S6：以所述筛选序列为内标分子的基础序列，设计合成扩增引物，以所述植源性基因组为模板，进行PCR扩增，即得测序内标分子。

上述测序内标分子的制备方法，包括序列筛选和扩增两部分，在序列筛选中，考虑到大部分临床检测的目标主要是针对人源和微生物基因组特异序列进行鉴定，因此，选择植物源性核酸序列作为内标分子的来源。且植物源性基因组中包含叶绿素、光合作用、花和果实的特殊基因序列，可获得大量与人和微生物无同源性的序列。

在上述基础上，本发明人对植源性的序列进行了筛选，首先将植源性基因组序列分割为1000±200bp的序列集，便于后续使用PCR方法获得片段序列；对上述分割获得的序列集与本地数据库中人和微生物的序列进行比对，获得无同源性的序列集；对无同源性序列集进行GC含量过滤，挑选出GC含量为35％-70％的序列集；对符合GC含量的序列集进行微卫星过滤，剔除含微卫星的序列；后续进行连续碱基的过滤，筛选出连续碱基序列数小于8的序列集；对经过系列严格筛选后获得的序列集进行两两比对，获得低同源性的唯一序列集，作为内标分子序列集。

上述内标分子序列集具有非常高的经济价值，如：相对于化学合成1.5元/碱基，为了能长期稳定使用内参分子，将一个与UMSI类似的内标分子克隆至常用载体上，需要4700-5000元的合成费用，78个内标分子需要36.6-39万元合成费。合成之后的内标分子并不能直接应用，需要将内标分子从载体上酶切或设计特异性引物扩增纯化后才可以使用。而UMSI的合成方法只需要合成扩增引物，对扩增产物进行纯化后即可应用，节约几十万元的合成费用。

在其中一个实施例中，所述S1中，所述待测样本中基因序列的类型为人源和微生物基因组；所述植源性序列来源于拟南芥。通常，植物基因组中包含大量的重复元件，且基因组普遍较大，对植物的基因组测序和组装存在挑战。

本发明人经过筛选对比后发现，拟南芥是目前已完成测序的植物中，基因组较小的植物之一，且是最早研究和完成基因组测序和组装的植物，基因组拼接质量较好。另外，拟南芥的可获得性较好，选择拟南芥基因组为内标分子的基础序列，具有较好的实用价值。

在其中一个实施例中，所述S5中，所述序列相似性低的序列指：两条序列之间具有连续相同碱基的长度低于15bp。

在其中一个实施例中，所述S6中，进行二次PCR扩增。为避免拟南芥基因组的本底污染，对PCR产物进行割胶纯化，以纯化的核酸作为模板，按上述程序进行二次PCR扩增。

在其中一个实施例中，所述测序内标分子长度为400bp-800bp。在二代测序文库构建过程中会对核酸进行机械或酶切的片段化过程，如果片段太短，存在内标分子在片段化过程中片段化为小片段分子，导致不能同步进入后续的建库过程，丧失内标功能，或所建文库片段太小，在后续分选过程中被分选而不能进入测序环节或与测序目标(人源和微生物)片段在芯片内争抢成簇的机会和空间，导致有效数据量降低。但如片段过长，又会产生资源浪费等问题，本发明人从设计理论结合实践操作的综合考虑后，将测序内标分子长度控制在400bp-800bp，可兼顾上述多方面要求。

在其中一个实施例中，扩增获得测序内标分子后，进行体外转录为单链RNA，即得转录组内标分子。可以理解的，上述转录组内标分子用于宏基因组测序时即为宏转录组内标分子。

在其中一个实施例中，进行体外转录RNA时，在上游引物的5＇端添加TAATACGACTCACTATAGGG(T7启动子)序列。

本发明还公开了上述的测序内标分子的制备方法制备得到的筛选序列和/或测序内标分子。

在其中一个实施例中，所述筛选序列选自：SEQ ID NO.1所示序列～SEQ ID NO.78所示序列。

本发明还公开了上述的测序内标分子在宏基因组病原微生物检测污染监控中的应用。

在其中一个实施例中，将测序内标分子按核酸提取量的1±0.2‰掺入到样本中。

在其中一个实施例中，测序内标分子掺入样本中与样本同时进行核酸提取或在样本核酸定量后掺入，再进行文库构建，然后在Illumina NEXTSEQ 550进行测序。

在其中一个实施例中，将宏转录组内标分子按核酸提取量的

掺入到样品中。

在其中一个实施例中，将宏转录组内标分子掺入样本中与样本同时进行核酸提取或在样本核酸定量后掺入，再进行文库构建，然后在Illumina NEXTSEQ 550进行测序。

可以理解的，以上加入量也可以根据实际应用进行调整。而对于监控方式，为将测序内标分子掺入样本后，按照常规方式处理样本即可，对于后续测序所用的文库或设备等均不做限定。

与现有技术相比，本发明具有以下有益效果：

本发明的一种测序内标分子，以拟南芥基因组为内标分子的基础序列，经过严格的系统筛选后得出，不仅具有较低的成本，相对于化学合成内标，每组内标分子可节约几十万的合成费用，还能够在样品跟踪及样本间交叉污染监控的同时不影响病原微生物的检出和测序数据量。

附图说明

图1为实施例中测序内标分子的制备流程及在宏基因组病原微生物检测污染监控中的应用流程图；

图2为实施例3中内参分子冻融稳定性试验结果。

具体实施方式

为了便于理解本发明，下面将参照相关附图对本发明进行更全面的描述。附图中给出了本发明的较佳实施例。但是，本发明可以以许多不同的形式来实现，并不限于本文所描述的实施例。相反地，提供这些实施例的目的是使对本发明的公开内容的理解更加透彻全面。

除非另有定义，本文所使用的所有的技术和科学术语与属于本发明的技术领域的技术人员通常理解的含义相同。本文中在本发明的说明书中所使用的术语只是为了描述具体的实施例的目的，不是旨在于限制本发明。本文所使用的术语“和/或”包括一个或多个相关的所列项目的任意的和所有的组合。

实施例1

一种测序内标分子，通过以下方法制备：

S1：以1000±200bp为窗口，获得与人源和微生物基因组序列非同源的unique拟南芥序列。

S2：从上述unique拟南芥序列中挑选出GC含量为35％-70％的序列。

S3：从上述序列中筛选出无微卫星的序列。

S4：从上述序列中筛选出连续碱基序列数小于8的序列。

S5：在上述序列中，以测序读长(如75bp)±5bp为窗口进行两两比对，对筛选出的序列做同源性筛查，获得两条序列之间具有连续相同碱基的长度低于15bp的序列相似性低的序列，即为筛选序列。

上述筛选序列的序列如SEQ ID NO.1所示序列～SEQ ID NO.80所示。

S6：以所述筛选序列为内标分子的基础序列，设计合成扩增产物为600bp-800bp的扩增引物，以拟南芥基因组为模板，进行2次PCR扩增，即得获得测序内标分子；具体步骤如下：

S61：设计合成扩增引物。

设计合成如下表所述引物，并稀释成10μM。

表1.引物表

S62：扩增。

提取拟南芥基因组DNA，按95℃预变性2min，35个循环的95℃预变性30s，55℃退火30s，72℃延伸30s；以及最后的72℃延伸10min进行目的片段的扩增。

为避免拟南芥基因组的本底污染，对PCR产物进行割胶纯化，以纯化的核酸作为模板，按上述程序进行二次PCR扩增，对PCR产物进行纯化后定量。

S63：转录。

对于IDR系列引物(对应宏转录组内标分子)扩增所获得的模板，在上游引物的5＇端添加TAATACGACTCACTATAGGG(T7启动子)序列，使用T7转录酶进行体外转录，在PCR仪上37℃孵育4h，纯化回收转录产物后定量，注意在操作过程和保存中添加RNA酶抑制剂，防止RNA的降解。

通过上述方法制备得到测序内标分子，备用。

实施例2

以上述实施例1制备得到的测序内标分子进行宏基因组病原微生物检测污染监控实验。

1、样本提取。

提取不同样本类型的DNA和RNA,用Qubit 3.0荧光定量仪准确定量核酸浓度，如下表所示。

表2.各样本情况

2、检测。

用常规建库试剂盒分别进行DNA和RNA文库构建后在Illumina NEXTSEQ 550上机。

上机数据结果质控如下表。

表3.质控数据

注：上述内标ID1指引物对IDF1和IDR1扩增得到的内标分子，其它内标分子名称以此类推。

从上述结果可以看出，常规条件下，DNA和RNA样本在建库过程中，样本间的交叉污染可以通过测序内标分子对检测过程中的交叉污染情况进行监控。

实施例3

对本发明的测序内标分子进行方法学评价。

内标分子评价指标包括序列特异性、无交叉污染和稳定性。

1、特异性。

特异性要求内标分子序列之间必须无同源性，本发明测序内标分子在设计筛选时，已通过同源性筛查，通过两两比对，剔除了序列相似性高的序列，达到特异性要求。

2、无交叉污染。

通过两两比对无同源性的序列，在质检过程中如出现未掺入而又有检出的内标分子，经2次以上验证仍存在上述现象时，可视为内标分子本身的污染。

3、稳定性。

通过本发明的方法，一次生产可获得较多的内参分子，有时可达1μg，而内参分子的使用量较少，一次生产可使用1-3个月，因此必须保证内标分子在3个月内的有效性。对于样本量为每天20-30个的实验室，80个内参可轮换使用2-3天，内标分子在生产后均匀分装为多份，每份可供使用15天，即包含7-8次的掺入总量。

图2为分装的内标分子在每2天冻融1次的频率下，冻融1次、5次、10次和冻融15次之后的检测结果。

结果表明，分装的内标分子在反复冻融15次，历时1个月的条件下仍可以保持检出。

实施例4

本实施例采用本发明的测序内标分子进行实际应用，应用流程如图1所示。并对其中部分数据进行了统计，具体见下表。

表4.芯片1测序数据

表5芯片2测序数据

#SampleID	Total reads	Clean reads	掺入内标/序列数	其它内标/序列数
					M5396D	17,584,900	17,490,226	U96/520
M5397D	20,105,920	19,973,826	U97/444
					M5398D	20,136,223	19,987,281	U98/8177
M5399D	21,117,537	20,980,303	U99/26
					M5400D	16,517,794	16,407,544	U101/15
M5401D	17,838,624	17,688,995	U102/31622
					M5402D	11,657,005	11,595,537	U103/1108
M5403D	23,396,848	23,254,500	U104/140096
					M5404D	14,524,869	14,408,303	U105/1368
M5405D	16,982,672	16,883,559	U106/157406
					M5406D	17,292,007	17,185,763	U107/9961
M5407D	14,705,753	14,622,989	U108/90
					M5408D	8,724,738	8,671,240	U109/405
M5409D	17,417,682	17,309,164	U110/446
					M5410D	17,125,722	17,001,597	U111/35
M5411D	10,410,290	10,338,745	U112/2395
					M5412D	6,672,229	6,513,289	U113/0	U114/3132
M5413D	16,555,306	16,453,840	U114/0	U113/316000
					B1840D	12,607,074	12,517,832	U143/16560	U146/63
B1846D	9,202,044	9,114,069	U144/33507
					B1847D	13,110,879	12,972,118	U145/17152
B1848D	13,420,105	13,321,266	U146/53439	U147/1
					B1849D	12,162,997	12,037,079	U147/79519	U146/1；U12/1
B1850D	9,872,279	9,780,425	U148/132181	U78/53；U147/3

表6芯片3测序数据

注：以上“掺入内标/序列数”中，“/”前为掺入内标编号，“/”后为测序得到的序列数。

上表中体现了各内标分子的可起到样本跟踪以及样本交叉污染的监控作用。例如：样本M5416D中检出U118编号内标160条reads，表明M5417D样本的检测结果会对M5416D产生影响，两个样本间有交叉污染，污染率为1.3‰。如果M5417D样本检出病原体A序列数为10,000条，那么M5416D中检出病原体A的序列数应大于13条reads才可以考虑报告为疑似病原体A阳性。例如样本M5412D样本中应对应检出U113内标，M5413D样本中应对应检出U114内标，但是两个样本间检出内标的编号发生调换，提示M5412D和M5413D在实验操作过程中可能存在样本互换，需要重新取样进行检测确认。内标需要具备监控交叉污染或提示样本互换的功能，需要具备大于批操作样本量的独特的内标，因此，对于批次操作样本量较大的实验室，需要具备较多的内标个数，而内标个数越多，成本也越高。

以上所述实施例的各技术特征可以进行任意的组合，为使描述简洁，未对上述实施例中的各个技术特征所有可能的组合都进行描述，然而，只要这些技术特征的组合不存在矛盾，都应当认为是本说明书记载的范围。

以上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式，其描述较为具体和详细，但并不能因此而理解为对发明专利范围的限制。应当指出的是，对于本领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明构思的前提下，还可以做出若干变形和改进，这些都属于本发明的保护范围。因此，本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。

序列表

<110> 广州微远基因科技有限公司

<120> 测序内标分子及其制备方法和应用

<160> 90

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 2

<211> 631

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 2

attcccataa ccatacccta cgaactcttg acgctgggtg ttataatagg aacgttggtg 60

atttccgatg tttaagcccc ggtgaatcgg gacggagtta tattctggca atggatgaaa 120

tctgttggaa tattgagaag tggtcgggaa attgaaattg aaaccaaaat taccaaactg 180

atgtgcttga acgaggctca tgtcgggtct atgcctccaa tctatgtaaa gtttggatct 240

ttctgactca tctccgatgc ctcgttggaa agagacaatg tctcctgcat cgagcttttt 300

ctctttgacg aaacggctcc atcctttggt cataacgtag ctctggctag agttccaata 360

cgagtaacgg aatctccaca tcttgccgtt tctgtcttgg aagttcaaaa gcgtgccgtt 420

ttggttgttt gaggagtcta gagggaaata cctctcagcg tgttgtttag ggatcacgag 480

tctgttgagt tttccgacgt cgcttggtgt taccactttg tcgaacatgt gttctttctc 540

cggaggtgga atcatcatca tcggaaggtt gttgttgttt ccgctgggac cggagctgct 600

gcttgctccg atgttggagg ttaattcttg g 631

<210> 2

<211> 699

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 2

ttccgtgctt accacgacag cgtaagaatt agggtttgct ttgaggagat tgttagcgag 60

atcgattgag attaatccgg cggagcaacc cattcctccg aggttgtaac ttttgatgtc 120

ttctctcatc ttgtaatggt tcacgatcat cgctgataga gacggcgtcg gattgaataa 180

gctgcagttt actatcaaga ttccgacttc ggccggttta attccggttt tctcgaagag 240

ggaatctaag gctccaaaca taacggcttc agcttcggca cgtgcctctg acatatttag 300

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gttcgagatt ctttgctgga actgaaccgt gtcatcggtg aatgatccat tttcctcagt 420

catcgtcaag aacgaatcta ctgatatttt acgctcgtct tccggtttgt agcaggagaa 480

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gaaaaccaag caggtaagtc tcgtcgccgt gtcgagttga accgcctggt tagaccaaag 600

ctcagagaac gtatcgaacg ttagaccggt tagctgaacc agcacggttc cggttaaagg 660

aagaataatt aagaagaaga gaatggtggt cacgttgca 699

<210> 3

<211> 605

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 3

tcctcgacac tcaactcctt ctattctcca aggcccataa ctttgataat agcaaaagcc 60

caaaggccca aatatgaaaa gctcgcttat cttttattgg cgtgaggact gaactgattg 120

atggatcatc tcctctgtct ctttgcctct gccaattttg aaagtttctt cttttgcaat 180

cttcttagag tttgttttac cattgcaaat ttagcagatc ctttatgtac tctgcttctt 240

tctgtctgct caagagtttc tgtattcgat ataattttgg aatgttgtgc aaagttttaa 300

tctttgaggt gaagcaaatt gatctggttt aagattcagt attgagacga cgacgtattt 360

attaattgca ttggtatttg actttgatct gaacaaaact tacttcttct tctccctctt 420

cctctgttca cctaaccttt aggctccaga ttttaatttc tcacatttct tcgtctttgt 480

agcaagaaga tgtctaagca gaggaagaaa gctgacttag ccaccgtttt gcgcaagtca 540

tggtaccact taaggctctc ggtgcgccat cccactcggg tcccgacttg ggatgcgatt 600

gtgct 605

<210> 4

<211> 593

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 4

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gaagtggtca ggaaattgtt gctaacgtta cgatcgtttt cacagtagag gaatttcata 120

ttacaacctt ttgtcttctc gcatgcctct tgccagcatc tgtcttctcg ttctactgag 180

attaagtacc ataaagctcc aaacacctga ataagtaagt ttaacatata acctttaata 240

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atcattgaca ttttgaacaa gtaatcaaac tagtcattta cctgtgggag agg 593

<210> 5

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<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 5

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cttctacagg gtctttcctc tgggaaagct tactggcaag cttaccagca gcaggtcctt 120

gtcctctctc tctctctctc acactcagta cagtgttgaa atagttaagc tgtgtctgac 180

ctagttatct ccacggacgc agatgatatg gattcagggg cacctcagga ggacaagtgc 240

ggcgagatgg gtgaacctgc cttgctttgt gagcaatgca gatttactgt ccaaggcttt 300

gaaaacttct ccacgcatct caagagtgaa gaacatgcac atgaagtaag catcctagcc 360

aaaaacgcag acttgttgtg tccatttgag tcaacaacct cttaccgcga gtttcccttt 420

ctcacttaat tcttccagtt atgttttgcc taaatttgac cccatatttt gttttgtcaa 480

tgagcagtct caatactacc gtaacgaaga tgatgaaacc gatggagacg actacgtacg 540

agactctgaa gacgacgaag aagagtagta agagttgtgt gtgtgttaat 590

<210> 6

<211> 574

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 6

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gtggaaggtg catacaggta tatataccgc tgctcgtatc tcttttccgg tgttacaaaa 120

gcgatgtcgt gacctaatgc tgggttcgtt actataggat gctcgtgtat gactttgtcg 180

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<210> 7

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<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

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cctagttcca ctgatttcct acggtaattc acttaaatca caaacagaga agttcaacat 180

tctgtttctt ccgacacaag taacattgat gctctgtttt tcttccaaca caagtaaaat 240

gctctgtttt tctttaagtg cagacatgaa tctctggtga tggtgagtgg aggcagtgga 300

attacaccgt ttatctccat agtccgcgac ctattctaca tgagttcaac gcacaaatgt 360

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aatatcatca aaacccgaca tttcaaacca aa 572

<210> 8

<211> 443

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 8

gggtccacgt gtctggcctc tgttgggtag tcttcctggt ctgatagagc aacgtgacag 60

gatgcatgaa tggatcaccg agaaccttcg tgcgtgcggc ggcacttacc agacttgtat 120

ctttgccgtg cctttcttgg ctaagaagca aggtctcgtg actgtcacgt gtgaccctaa 180

gaatctcgaa cacatgctca agacccggtt cgataactac cctaaaggtc ctacatggca 240

atccgtcttc cacgatctcc tgggtcaagg tattttcaac tccgacggtg acacctggct 300

cttccaacgc aaaaccgccg ctcttgaatt cacaacaagg tacctaaccg ctcggtttaa 360

tcccttgagt gaatttcacg gttttaatta ttacatttga cccaatcgaa ttggtaaatt 420

gctccggttt attaatactt ata 443

<210> 9

<211> 568

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 9

atttcggatt tgctggcaag ctgttcttta taaggactct ctcagccaaa ttaatgttat 60

acggtttttt aggaaactta agcttttccc atttatctct cttttctgtg tttttaggaa 120

ctaccctttg ttcggtatcg agctgctaag tccactgctt cgagggactt ggttccatca 180

aagcttgctg ctgcaatttg ggactgtatc tcaaaatata aagccattcc caacttcccc 240

cagaccgaaa catgtgagct gctcattgtg gatagatcag tggatcaggt tttaaggctc 300

atctactaca tttactcctc aagtccatat tgatagttta tttctctaaa cgattgaggt 360

gtaactgtag atcgctccta tcatacacga atggacctat gatgctatgt gccatgattt 420

gcttgacatg gaggggaata aacatgtcat tgaggtaatt ctatttttct ttcttatcct 480

tcaacttttt tccgtttctg aaaggccccg atccggactg cctaaagtcc ggtcgagaga 540

agtcctagcc aacgatccta ttgaggat 568

<210> 10

<211> 569

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 10

atgtcattga actccatcga ctcatcgcca gcctttccca tcagcttctt gcagaactct 60

tctatgttct cctctatctt ctgcgggagg tctcgtccaa gcttgaagtt tatgccttcc 120

tcagtcaacc tcccctcgat cacgttctgt gtccccggca agaactgctg aaccgcatag 180

tgcagctcca tgaaaggagc ttcacactct ctcgggtcag ctccgatgat cacagcagct 240

gcaccatctc caaacagagc agctccaact aggtcgtacg gacgcgcttt gtttggtggc 300

cgaaatccga gaatggtggt ttcagaggtt gtgagcagaa cacggcttcc ggggttgttc 360

tcagcaatgt ctttggccac acggaggcca gtcacacctc cgtagcatcc cagaaaatac 420

agcatcactc tgttcacgtc attcctcagg cctagctttg ctgagaggta aaggtcacca 480

ccgggtaaac ggatctcgct tgaggaaacg tagacaatgt gagtgatgtc ttccactggc 540

cttccccatt ccttgatgca acctaaact 569

<210> 11

<211> 577

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 11

ttttaaaaag ggacctttaa gagagatggt gggagagaga gcaatagaga gagaaggaaa 60

tccaccccca caaatagaaa gttagggttt attggaaaaa aagaaagaga gtgtgtctct 120

gtgtgtgatt ctaatagagg tgtagtacgt cgctttgctt tcagtccatt aaaaccattc 180

cataacctat tccgcaccga catgtctcct ccccctttcc tttattagcc tctctctctc 240

tttttcacta ctccgtcttg attttataaa caaaagaaag aaagagagag agatcttcct 300

cgggattgca acatgttgga ctacgaatgg gataatcctt cctccatcgt tctctccgga 360

gatgaaagaa acccggactc tgacccgacc cggtcatcct tctccttttt cgaccccatc 420

tcccattaca acaacgacca ccgtcacatc accatttctc ctcccctcct ctcttccttc 480

tctaaccaac aacaacagca tcacctcacc ctctacggtc agaccaacag caacaaccag 540

tttcttcatc atcaccatca ccaccactcc ttgtacg 577

<210> 12

<211> 587

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 12

ccgagtactt cgaacgcaaa gctcgccaga accacaagca ccgtcctcct tccgactacg 60

acgccgaaac tgaaagatcc gaccacgatt actgccactc acggagagat gccgccgagg 120

aagttcactg cagcgagtgg ggcgacgacc acgaccgttt cactgccacc tcttcgtccg 180

acggagatgg ggaggtcgaa actcacgttt ccagatccgg tattgaagaa gagcctgtga 240

aacaaccaca tcaagaccca aatggcaaag agcactctga ccatgttacc acttcttccg 300

actgctacaa gaccaaattg gtggtaaggc acaagaattt gaaggagatc cttgacgccg 360

ttcaagacta cttcgacaag gctgcctccg ctggggacca ggtctccgcc atgcttgaga 420

tcggccgggc tgagctcgac cgcagcttca gcaagctgag gagtaagtct cacactctac 480

taactagatg tagatgatga tgcattgaaa cccatctcat tctcttactc tctctatatt 540

tgttgtctgc agagacggtg tatcattcaa gcagtgtgtt cagcaac 587

<210> 13

<211> 575

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 13

accatgggct gtccatagca catacaggtt tgtgacagat gatccagaga agagggatct 60

cgggtacttc cttgtgttcc cattcttgct cttcagaatt ctgcacaacc aggtttggat 120

ctctctgtcc cgttactata cgtcctcggg aaagagacgc atcgtcgaca agggaatcga 180

cttcaatcag gtcgacaggg agaccaactg gtgcgctttt ctaaattttt aactacctgc 240

gtgcctcgtg agtatatgta atcaacgtaa ctaatgaaat cctgatatat gcgcagggat 300

gaccaaatat tgttcaacgg agtgctgttc tatataggca tcaacctatt gccggaggcc 360

aaacaacttc cctggtggag aactgacgga gtgttgatgg cagcgcttat tcacaccgga 420

ccggtggagt tcctctatta ttggctccac aaagctctcc accatcactt tctttattcc 480

cgctaccatt cccaccacca ctcctctatc gtcactgagc ccatcacttg taactattgt 540

ttcttacctt gatttttacg ctgcctatat ttccg 575

<210> 14

<211> 600

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 14

tgaagaaaaa tttaaatatc gtctgtagat attttatggg atgctttgag aatgggcttc 60

gttttaatgg gcctcctctg caatcattgt ccagagtcga gaaaccacct cttcttctct 120

tgttctttct ccaaatcgat ttggtcccaa ctctcttcaa gcaaaggaga gatatgaaaa 180

tgaaagctct tacggcgaac aagtttttcc gattgaagaa gagaagaatc tagaagatga 240

agacaacact agtgcaccaa acagttttgc gcgtcttgag aggaaacaaa aaactattca 300

gagttcagag agagtcaacc cccaaacgag acttaaacga tgagcccact ataattttat 360

aatttatggg ccatcaggcc caaatgatca gtagtagtta ttatttgact tttgacatgg 420

tggatttggt ttaaccacca aaccgaacga gtaaaacact attggattgg gtgatgatat 480

cccggtttta tttggttaaa atcacaaaat cctgattttg gttcgcggct tgattctgcc 540

gctctctcgt ctttaaccta actaaagacg tagaatgatt ctggttattg aattagtttg 600

<210> 15

<211> 588

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 15

tcttcgtttt ctctagatac aatgctttat attctcggta gaaatcgaaa gttcgatcaa 60

atttgggagc ttttgattga gactaagcgt aaggatcgat ctttgatatc tccaaggacg 120

atgcaagttg tgttaggtag agttgctaag ttgtgttccg ttagacaaac tgttgaatct 180

ttctggaagt ttaagagatt ggttcctgat ttctttgaca cggcttgttt caatgctctc 240

ttgagaactc tttgccaaga gaagagtatg actgatgcta ggaatgtgta tcatagcttg 300

aagcatcagt ttcagcctga tttgcagact tttaatatac ttttatcggg ttggaaatca 360

tcggaagaag cggaagcttt cttcgaggaa atgaagggaa aggggctaaa acctgatgtg 420

gttacgtata actctttgat tgatgtgtat tgcaaggata gagagattga gaaagcttat 480

aagttgatag ataagatgcg agaggaggag gaaactcccg atgttataac ttatacaact 540

gttataggtg ggttggggtt aatcggtcag cctgataaag ctagagaa 588

<210> 16

<211> 580

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 16

tatgccactg atgaaacccc tgagttaatg cccctgagcc atgttcttgc caccaagctc 60

ggtgctcgcc taacagaagt cagaaagaat ggtacttgcg cctggctaag acctgacggc 120

aaaacccaag tcactgttga gtactacaat gacaagggtg ccatggtccc aatccgtgtc 180

cacacagtcc tcatctccac ccaacacgat gaaactgtga ccaacgacga aattgcccgt 240

gaccttaagg agcatgtcat caagccagtc atcccagaga agtacctaga cgagaaaacc 300

atcttccact tgaacccttc aggccgattc gtcatcggtg gaccccatgg agacgctggt 360

ctcaccgggc gtaagatcat catcgacact tacggtggat ggggagctca cggaggcggt 420

gcattctcag gtaaagaccc aaccaaggtc gacagaagcg gagcctacat tgtgagacaa 480

gcagctaaga gcgttgtggc taacgggatg gctcgtaggg ctcttgttca ggtctcatac 540

gccattggag tccctgagcc attgtctgtc tttgtggaca 580

<210> 17

<211> 591

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 17

aagcaagcaa taaacagcta caagaagtac ataacatcgg cttataaatc aagcattcaa 60

caaggtttct ccactggttt aggacttgga gtaatgatct atgtgttctt cagcagctat 120

gctttggcta tttggtttgg tgggaagatg atactcgaaa aagggtatac cggtggctct 180

gtgatcaacg tgatcatcat tgtggttgcg ggttcaatgt aaatgcctag atcattggtt 240

ctatatatac atcagattat gtcttcttct ttgtttataa atgtgagatt cctaagagtt 300

gtgttctgtt ttgtttttct ttaggtcgct tgggcaaaca tctccatgtg taaccgcatt 360

tgcagcaggt caagctgcag catataagat gtttgagacg atcaaaagaa agcctttgat 420

tgatgcttat gacgtaaatg gaaaggttct tggagatatc cgaggagaca ttgaactgaa 480

agatgtgcat ttcagttacc ccgcgaggcc agacgaggag atatttgatg gattctctct 540

gtttatcccg agcggtgcaa cagcagcact ggtaggagaa agtggaagtg g 591

<210> 18

<211> 644

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 18

caataacaaa atttcagatt aaaaattcct actaacatac acatcttagc ttttatgatt 60

acgttgattt tattttgtta aatttgatta cgttgattag tgtatatatt aaattaaaat 120

cattgaaagg ataatgataa cactaataaa aaaaagaaga agaaggttac ggtctcgtaa 180

agctttcaaa agtccgcaac gatcacacac gtctttctcc gaaactcgtc tgagagaggc 240

tctgagattc gatgtcgttc gaggaagaag aagaggagga aacattcgag catacacttc 300

tcgtggtgcg tgaggtctcc gtttacaaga tcccgccgcg aaccacatcc ggcggataca 360

agtgcggcga atggcttcaa tccgataaga tctggtctgg tagactccgc gtcgtatcgt 420

gcaaggatcg atgcgagatc cgcctcgagg attcgaattc cggtgatctt ttcgcagctt 480

gttttgtgga tcctggacgt agagagaact ctgtagagcc gtctctcgat tcgtctaggt 540

atttcgttct caggatcgat gacgggagag ggaagtatgc gtttatcggg ctaggattcg 600

ctgagaggaa cgaagcgttt gatttcaatg ttgcgttatc ggat 644

<210> 19

<211> 620

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 19

ggtattgaaa attcgacatt tacctttgag tattatgatt agttttacct ttgatgactt 60

acctttgatg tgaagaacag gtcttgtgta aaaatcaacc gtctgagttt gtttcgtact 120

ttcgttactg ccggtctcta cggtttgatg acaaacctga ttactcttac cttaagaggc 180

tattccgcga cttgtttatt cgagaaggtt cttattgcac atttcttact caagcaaata 240

atctctgtcc caccgacttc ataattctta ttttcattct caatggcagg ttatcagttt 300

gattatgtat ttgactggac agttctgaag tatcctcaga ttggttccag ctctggttct 360

agttcacgga cacgggtagt ttatgctgct ttctcttttg gttcttaagt ttctctctat 420

tcaagcctaa aaatgtgtaa aacacttttt tgtttcagaa tcatacaact gcaaacccgg 480

gcttaactgc aggagcttct ctcgaaaaac aggagaggat tgctggtaaa ctgtttgttc 540

cttttgtttt gaaacacaat ccgattccca cgttgactgg tttttcttta aacttttgca 600

ggaaaggaga ctcgcgagaa 620

<210> 20

<211> 632

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 20

cacattgatc atcaagtgaa atacttcatc cttgtcttcc tcgttggcct ttgtttcact 60

gtcttgtaca agtgtcttga tcaagcttac ccaaatgaaa gctagagtca ccacgaaggt 120

agaaacagga gattgattct cagactgctc tgtaacccaa ctttttagat tatctatctg 180

cttccggctc aatgtaaaag tggctctgac catgttctca ggcgtaacat gtgaactgtg 240

ttttgcagag ttttggctcc aaaaccgctc caaatgtcct gcgcctacct cgcctgggtc 300

cttgatcatg tttctgcagc tgtgaatagg cagagagggt agaagaaccg tggcgggatc 360

tttaccgctg gatttggtca atgacatcca atacttcatg aaatgactga aggtgactcc 420

atctgctaca acatgtgtag ctgagttgcc tatacagatt ccagctccag ggaagatggt 480

gacttgcata gccattattg gtcgcatctg aattccttcc ggagagacgt gaggaggagg 540

taacttgggc aagacgccat gcaacacact gatatcttta ggggaatcag acttcagttg 600

gtcgaagtcg gtttcagtag actctgctac gg 632

<210> 21

<211> 621

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 21

cgaattttga atttctcgat tttcccggcg cttttgttac gattcaagga gtttgaacaa 60

gtagggcttc tcgttgcgga gatcatggat attgacggag tagacgacga tcttcatatt 120

ttagatcctg agctcttgca gctccccggt ttgtctcctt ctcccctcaa accaacctct 180

cttattgctg atgacctctt ctctcagtgg ctctcactcc ctgaaactgc cacattggta 240

gccaccttct tatttctaca cttccttcct tggcctctct tttacacaag tgtgttccat 300

gaccttggtt tcccattttt catgtttctg taggtcaagt ctttgattga tgatgctaaa 360

tctggaacac caactaataa atccaagaat ttgccttctg tgtttctgag cagcagcact 420

cccccactat ctccacgaag ctcctctggt tcccctcgtt tctccaggca aaggactagc 480

cctccttctc tccactctcc tcttagatca ctcaaggagc caaagcgcca actcattcct 540

caggtttgtt ctcatttcct gcctctggac ctgtgatttt ggtctagtat ctatgttcac 600

tggattggtc gttgaaacag a 621

<210> 22

<211> 594

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 22

ccttatagta tagttgatag aaggtgcaag tcacgcgttt aatgtgcgcg tgattagtta 60

attaaacttg tatatagaga gtaagcgcgt ggttacattg caaaacacta gagataaccc 120

tagaaagatc tctctcgatc tctggttcga agaaaatcca ccatttccga ttgttctttc 180

tctttgacaa aacccagata gataaaaatt cgttccaatt ccagtgagct ccggaaatgg 240

cgtccttcaa gttgatgtct tcttccaatt ccgacttgtc tcgccgtaat tcttcttctg 300

cttcatcttc cccttctata agatcatcgc accatctccg accaaatcct cacgccgatc 360

actccagaat cagtttcgct tacggcggag gagtcaacga ttacactttc gcgtctgatt 420

caaagccctt cgagatggcg attgatgttg atcggagtat cggagatcgg aacagcgtta 480

acaacggaaa gagtgttgac gatgtttgga aagagattgt atctggagag caaaagacga 540

tcatgatgaa ggaagaagaa ccagaagata taatgacact tgaggatttc ttag 594

<210> 23

<211> 631

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 23

agcggagtat ctcagcggaa acagtgtgtt ggcagaaccg ccgtggttgc agtacatgag 60

agaatgggga ccaaaggttg tgtacgattc aagagaggag atagagagat tggtgaatcg 120

atttccgagg acggttaggg tttcgcttgc cacagtgctt agaaaacttc cggtggaatt 180

atccggcgag gaaggtccta caggaccaaa ggagaagaac aattggtatg gcgatgaaag 240

atgttgaaat tctcactgtt gggaaacaga tgtggtgaga ttaccatcgg agccctaact 300

gtgtaacttg taaaggaaga tgaagctttg attgcgcaag agattaatta cacaattagc 360

gtaggattaa cgtaaaactt gtcgttagaa gtgtatacaa gtgggtccca tcatgtattt 420

aattaaaata ataaagttat atagacgaac aaacctccac caaacgcaac gcacacattc 480

gtgtaccgtt tccgattttt cgttcctcca atttcattct ctctctcttt aagaaaaatt 540

ccttgttttt gatccgagaa tcgaagtcgc cctcgaatca agattaaaac ctcgtttagt 600

tctcaatttc agttctgtgg atccgtgcgt g 631

<210> 24

<211> 584

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 24

aggtaacaag aaaaacaatt ggaagtagca cttacgattc tttttccaga gaatacacac 60

gaagttcata catgacttga tgtgctgtga caggatgtcg agtaggggaa gttgcaagcc 120

ctgagtcttg ttggaccagt gtctgcaaac ttggatctgt ctcagcatga ggaataacgc 180

atgcaacaca ggctgctaaa tatctcccac atggagaaaa atgggctccc atctcactgc 240

aacgataaac acacacatca tgtatctcca tcaaaaggag aaatattata tagcatcacg 300

atcatctaag atcgtacaac gatataagga gaaattttac ctgcaaagaa cagcatgatg 360

tattgttaat cgacatttgt cagacttcag tattgaacat gggtctttga tgtcatgtga 420

ccacactctc agtttgacag tacaaggcaa ctctgcagca gcaattgaac tagccagttc 480

agaagggatt ctgtttacca caggttgagc atcagctcct tcatgttgag tgttacgaga 540

ggaacgacct tctgctaaac cagatcctgc gaagcgggac tgta 584

<210> 25

<211> 574

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 25

ttctaacatc atgtttacaa ctgttaaaac gaagtgaaat agcttaacca gttcttgttt 60

gcatttctgg tctggagatt ttatttcctt ttgacaccct ttctttcctg caggttgcta 120

ccttcaaccc tgcagttggg tcccatgtgt gggtggagga ccccgatgaa gcatggttag 180

atggtgaagt tgtagagatc aacggtgacc agatcaaagt tctctgcgct tcaggaaaac 240

aagtatgtgc tctattatcc tgctatttca cttgaaaggc ttgccagttg ttcctctgca 300

atctgtgttt gactttggaa gcacgagaag cttttacgaa aacctttttt ttttctttgg 360

aaaccacagg tcgttgttaa agattccaat atttatccaa aagatgttga agcgcccgca 420

tctggggtgg aagatatgac aaggctggct tatttacatg aacctggagt ccttcagaat 480

ttgcaatcaa gatatgatat aaatgagatt tatgtgagta acttcactga gatttatctt 540

cttgtgtggg tagaaacaca tgtactgtat atgt 574

<210> 26

<211> 583

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 26

actagcgggc tatggagggt tagaacaacc tcagacggag aggagatgga atatatttgc 60

cggtggttgg tggtggcgac gggagaaaac gccgaacgtg ttgtcccaga gattaatggt 120

cttatgacgg agtttgacgg agaagtgatt cacgcttgtg agtataagtc cggcgagaaa 180

ttcagaggaa agagagttct tgtcgtcgga tgtggaaact caggcatgga agtctctctt 240

gatcttgcta accacaatgc aattacttcc atggtcgtta gaagctcggt aagcaaaaca 300

aaactgataa ttctgttttt aaacaaagca taacttttgt atgaaacttt atagctaata 360

gtgttcttgt gttttttaat tcgaccaggt tcatgtttta ccgagggaga ttatggggaa 420

atcaacattt ggaatctcag tgatgatgat gaagtggcta cctttatggc tcgtagacaa 480

gcttctgctt atcttatcgt ggttggttct agggagctta tcaaactatg ggcttaaaag 540

gcctgacatc ggcccaatgg agcttaaaag catgacagga aag 583

<210> 27

<211> 607

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 27

gaagatcgtg agtggctcct cgcgagcgaa gtagaggaag aaccaagcta agccaacggc 60

tataaacgcg aggatggcga ttggacgtgt gattagggtt agacctagga ggatagagag 120

aatgatactg tagttgatgc ggaagtgagt caggttctga gttacgcgag ttgttgcatc 180

ggcgatggag gaagggaagc tgaaggcgga aagatcgagg aaatcgcccc atggacgagc 240

cgctccagta attgactgag ctgtttcttt gattccggtg atcacttgat tcgccattgc 300

cgattggatc tctcctcgat ttcagaaacc ctagaatttc tcaggaacaa tcttttgtta 360

aagttagagg gaacacaagt caactggtta agggagactt ataactgaca aaggcccatg 420

tccatatact taaaggccca ttaatctgtt gtcgtgaagt ggactaattt gagtatctgg 480

tttttgcagt gggtacgatt tctatcctct gttatgagat tttagatgta tgttgttact 540

cttaacaaaa gtgtaatgtt aagcagagtc ctaataacaa ggaaaacaac aatacccatg 600

tttgagc 607

<210> 28

<211> 590

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 28

aggcaccgtc atgctgacat aagttccagt cccaatcaac aaaaccggac atacgttttt 60

gatcaagcta gagcagaatc aattgatcaa gaaccaaact aaaccagcag caaaacagga 120

cgtacgtttt tcaaccatac aattctcaaa ttgtcgtttc tatcttgtct tctctcacca 180

caagaatgca aaaacataaa tccatttttc ttgataacct tcttcttctt ctttttgtat 240

atgtatgaag cagctttttg tgaatgaatc ttcgaaatag gttaaagaaa caaaaatgga 300

gaccaaagaa ttcgactctt acagtgagcg caaagctttc gacgagacga aaacaggtgt 360

gaaaggtctc attgatgctc acatcactga gattcctcga attttctgtc tccctcaagg 420

ttccttatcc gacaagaaac cttttgtttc taccactgat tttgcgatcc ctatcatcga 480

cttcgaaggc ctccacgtct cccgtgaaga tatcgttggg aagatcaaag acgctgcatc 540

gaattgggga ttcttccagg tgatcaatca tggtgttcct ttaaacgttc 590

<210> 29

<211> 559

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 29

tagggttttc cgtagccgag tgtcactctg ttctgtcacc ttcatttgct gcctcatgat 60

ttctgcagag gttaacggtc gtcgaggccg agcaggcggg actgtaaaaa acccagcccc 120

agggctaaag tgtcctgaac cacttcctat gcttccatta ttacctgggg atgaaggagc 180

tgagacggcc cctacaactg tccctactgt cgacattcgc ctagaaggag atcgtttaag 240

catctttaac cctagcgccc gttttactcg gcttgttggt gttgtcaaca cttcttttct 300

tcctaaagac ccgaatccag agccgttaga tgatccagat cctcctcctc ctcctattcc 360

atccccttga tggtcaccag cattgtgctt ggagtagaat gtgagagcat ttctacctcc 420

aaatccaggt gatgatcgac atgcggcgaa aaagatctca tacgcggttt cacggatttc 480

atcccgatca agaccatcaa gcttcccgaa tggccaaaga agatcggtat caggacaaac 540

ctcaaagcca accatgtcg 559

<210> 30

<211> 624

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 30

tggttcacca aattcatcat tctttgcaaa tcttcctcta actcttggac gactatctgc 60

caacgtcttc ctacatgcat actacaacaa aatataacaa aaaaaacatg tgaacaaatc 120

ggtatatgga taaccactgg tttaatccgg ttatgatggt taagcacaaa gaccttgatt 180

ttcttgctga aattcctctc gttcctcttc ttcatatacc tatgaatctt ctcttttctc 240

tgctctgccg agagttttcc gactttgttg aaactcgggt cgtctaaacc ggttatctcc 300

gtccctaact gcgggagaac cggctgtgcc accatgtggt tctggttctc gacaccgtca 360

agtccctatt aagaaaacaa accccataac cggttagtat cagaccggtt tactaatctg 420

gtttcattac acaatttgtt tgccagcaat acctttcatt atttatatat aaggtttgga 480

atatatacct ggagatgatg atctcctgga ttaaagatgg gtttaatcgg atctggacag 540

aacaatccac cattatcagc ttgaatttcc atcaattgat catgtgatgg tttgaaatca 600

gaaccgagat ggatattccc ggag 624

<210> 31

<211> 618

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 31

tttatactca caagctctct ctgctatgtt cggctcattg gtctctcagt ctactaaaac 60

cagattctac aagaccacaa caggaacaag cacaaccaca atcactggtc tgttccagtg 120

tagaggagat ttaagtaacc atgactgtta caactgtgtt agtcgtcttc ctgttctctc 180

cgacaagcta tgtggcaaaa ccattgcttc aagagttcaa ctttccggct gttatcttct 240

ctatgaagtt tctggctttt ctcaaatttc aggtaaaccc tttctttctt ctcttccgtg 300

gcttcttcaa tcgaaccgga aattcaattc ctcgggttcc tcgaaacctt aaccagatca 360

caatcaaagg gttttctctg gtttaattga accggtaatt tgatttttgg ttttggttta 420

gccgaacccc aaaaattcat aatttttttc tccagttttc cggtttggtt tgaattgaat 480

tggttcattc aacacctttg gtcagaggtg aagtagggag ctttcaattt aggtttaaaa 540

ctattaaccg attttagacc ggtttggttc tcttacacat aaatttccgg ttaaattatt 600

acagggatgg agatgctg 618

<210> 32

<211> 589

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 32

ggcacaaggt gcatgaagca caaaggtgcc agagctgcta gagactgtat gagaatccct 60

gaagacaagt ttgaatagtt acttgatgtt ataccgatca gattagccaa tccgacgcct 120

aagaatgcac taactatttg tgatagacac agagttgaag caagaaaaga tgtgactgat 180

ccttcacacc cctgtggaca catacttgct aatctgactg caaatggaag gatcttaaac 240

tgtgctagga tttctgctag gctggaaaaa cacagcacat aaacctcgtt ggagattcca 300

aatccgagat ttatttgctt caccaagatg taatcgagga gaatcgataa accgtacaag 360

agttggatga tatggatcag tggtctcatg ggaagtgtct tcaagtatcg atcatagacc 420

acggttagac aaagaagcat caactgtcca atcactttcg acattccaat aaccgaagga 480

tcaagattca gaacttgagt ttggtaacag aagactgatc ctgagagaag agggaccatt 540

gcaatggata ctactgccca aatcagaggc tgggagattt catctgcct 589

<210> 33

<211> 593

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 33

atgagattca cctcactcgc tccaactcca tagttgagat attctgcaga agaggactct 60

ggcttataaa aggttcgagc tgataggtcc acagattgag cattcgcctg cagtttcaca 120

tatggagata tttccttgaa atctggatca atataaggag aattatccag tttagttata 180

cctgttgaat gagcatgtcc catgtcacgg atcgagcatt ctccagaatc tgattcatgg 240

taggtctcag cctctccacc aagataccgc agcaaagcct cactgcttca caacagttct 300

ctgatgttgt gctacccgca gtgtaactgc tttgagacat actgagcgtg tcagtctgaa 360

gaagccgtat tctttcaagc agatcatcac ttccctcgca ttttatcata ccaagaccat 420

aagcaaccat ctgttgtacc tttgtccata acccttgtcc cacctcaatc cctgcaacct 480

caaccgcaac tgaaccatca ttcaaaatgc ttacttttcc tggagttggc ctatgtataa 540

ctagatggat gattggtact cgagaaatcc cccttttgcg ccatatgtta cat 593

<210> 34

<211> 610

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 34

caacctgaaa tcatcttcag cagcattagt atcaaatcac aaaggacttt tattcagaga 60

agaaactatt acttacaggc atagacttta tagcttttcc accaaagcca cctccaactc 120

ttctggtgat gactcgaacg ttatgctccg ggattccaag acatgtagca attactgttt 180

gtgtgaactc gggtgcttga gttgaactgt aaaccactaa acagttgtct tcatctggca 240

aggcaagtgc tgtttgtgtc tccatataga agaagtactg tgacccaagt ctcaactgca 300

taaccaaaat caacagcaaa catagtgtaa gaatgtattt ttttttattt ttttttaata 360

tatcaaagat taagagagag aaagagaatt ttaatacctc tactgagcgt atcttgcgat 420

cagcttcagc cattcctttt gaaatatcgc caacaggttc gggctgatac tcgggaggaa 480

cctcaaaaag gctggacctt ttgactgcat cctccacaga taatactggt gttcctatat 540

tccttgaatc gtactcaact actgcaaggt gtgctgccat atctgcatgc ttttgtgtgt 600

ctgcaacctg 610

<210> 35

<211> 592

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 35

aattggtgtc acatttcctg agaaaccaac gctctttatc caagccaatg gctttgtgct 60

ataaatgaat gctccatgta gacaatgggg taaggatgga atatcatcaa cgtaaacagc 120

ttcacctgga aagataaacg ctcctgtaag gtctgatatt acttagctaa ataagcatat 180

gactaaagaa ctaaaagcat tgctgcttga gccttttcac agcattgaaa atataaaggt 240

atttaaaaac gatccaacga aaaatatagt actaaccaga agcctgcatt tcagctccaa 300

atttgataat ggcttcacca acagggtgat attctttact ttcaaacacc tgctgcgcag 360

atgacagcaa aggtagacat attgttggat cgatgtgccc atcgatatgc tttccttcgg 420

aatcccaact gccactctcg atcagaggat agagaaaatc aaagagaaac ccaacggcca 480

agcttttctt atactcagaa tatgaggtat ctatgctggg aactatgatc cctttaagta 540

acctcacagc ttcatataaa acactgtggc tgagtatttt acccgtcaag aa 592

<210> 36

<211> 726

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 36

tgagtttctg ataaaatggt tagccacctt ctccatatgg acaccgattt tcttgaaaac 60

ataagcagat gtattttcct ccatcaaagc atcaataact ttagatatgg taacaactgc 120

tccaatttca atttctctgt catctttctt gatcattgac atctctggaa tgtggctaat 180

atcaatatat ctaccatatt gtttctcttc tttgtagtaa cctgttcccg tgttgccaac 240

aactaatttt atcaaacctc tatctttgcc agggttggtt gttgccaata tttcctgaag 300

ctctgcgacg ctaccaggag tgctccaatg atacctcgtc tgatccaaaa cattgtgttg 360

acacttaatc ttttccttca agaaatccgg aaaagtgata agatctttct cagggttgta 420

aggaggcaat ttctttaaca tctcttctct gctttctcct ttcctccaaa aagagttgaa 480

gcccaaatcc tctatatcga catcggaagc aaaactctta caagcatcag caatgggacg 540

atacccggtg cagcgacaaa gatttccagc aatggacttc tctgctgcaa gagcagtcag 600

gtagtctgga gaagattgtg agttatgggc ttttgaaaga gcggagtaga gagagatgca 660

catccctggg gtacagaaac cacattgaga ggcatggaac cccgcaaatc tcttgtgaat 720

tgggtg 726

<210> 37

<211> 585

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 37

tgacgtcgac ttgtttgaga ttaacgaggt ttaagataat agaacaactc ttcttccttt 60

acatttactc cagctcatag tctattactt ataggcctta tattctttgt ctaaaatcct 120

actgtgtgtt caggcatttg catctcagtt tgtttattgt cggaacaagc tcgggctaga 180

cgcggaaaag atcaatgtca atggaggagc catagccatt ggacatccct tgggcgctac 240

aggtatgctt cctctttgtt cacatatcat taatttcctt cctcatctaa caactacaca 300

ttctcaggag ccagatgcgt tgcgacgctg ctgcatgaga tgaaacgacg tggtaaagac 360

tgtcgttttg gcgtagtgtc aatgtgtata ggtatgtaat atgttcactc tcactctcct 420

tttgactccc actctctcgt acacactaac actctcactg tgactgggaa accgcacagg 480

ttcgggaatg ggagcagccg ctgtgtttga gagaggaggc ggtgtggatg agctctgtga 540

tgtccggaaa gtctaatgac aataaggcct tttgaccaag gaccc 585

<210> 38

<211> 600

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 38

ctttggcatc attgtcgctt tgattctcat catcattttg tcggtttgcc atggcttcaa 60

gtgtacttaa gaactcgatt ccggtggatc agaccaccca catagctact aagctaatta 120

gaaccatccc ggtatagtta tcccctttta tccttctctt ttgtattttt ccttcttctt 180

ttatttaggc aaacaaaaat tgacgtggta cccagaatga tccttaggaa atcaactgtt 240

tggaagagag atttaagctt tttcttgtgt ttacttatta tataggttag gcctttatgc 300

tcttgtaatc tacaagtcta atgatcggtt ttatattcct ccaaccaact tgacacatta 360

tctgatagtg ttatatctat ggatataaca tcaactactt ttggaattac ttttggaatg 420

agatcatttg acattgcggt aataacagac aacgacaccc gaaaaagctt acaagaggta 480

aactctattc actcactaca ttcttctacc caaaaaggtt cctattcagt attcaaacat 540

caatccaaac acacagagaa tcatcaacaa gccaattgat ctctcagtgg taagatctct 600

<210> 39

<211> 609

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 39

aggtggtggc gggagtcctt attccgaagg gggtgcttta tatgctctcg gccttattca 60

tgcaaaccat ggtgagggaa tcaagcaatt tcttcgtgat agtctacgca gcactagtgt 120

tgaggtgatt tgctatatct ttcttctgga tagtcttccg ttatatcacc aaaaagatag 180

tcttttgttt agaatgattt tcattaaaaa aatatggttg caggttattc aacacggagc 240

ttgtttaggt cttggtttgg ctgctcttgg gacagctgat gaagacatat atgatgatat 300

caaaagtgtg ctttacactg acagtgctgt tgctggtgaa gctgccggca taagcatggg 360

tctattgttg gttggaacag caactgataa ggcaagtgag atgctcgctt atgctcacga 420

gactcagcat gagaagataa taaggtaact aaagtctgga atatattttt ggctatgtgt 480

gtgggtgcat ggtaatttat ttcaatgttt taagtaacca acatctggtt ttgtgtttag 540

gggattggct ctaggaatag ctctcacagt atatggaaga gaagagggag cagatacttt 600

gattgagca 609

<210> 40

<211> 609

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 40

ttggtttgga actcagtgac atcaacattt aaggcaccat caaacctcag agaagcagtc 60

aaggaagaaa taacctgaaa acaaaatagg aaaataacat tagatgagcc caagaaaatg 120

taacagcaaa aagactggtt gaggctggct acaatacctg agagacgagg cggttgaggt 180

tggtgtaggt tggtctctca atgcttaggg agcgtctgca gatgtcatag atagcttcat 240

tgtcgaggag gatggagaca tcagtgtgtt ccaagagaga gtgagtggag aggacactgt 300

tgtaaggctc aacaacggag gtagagacct gtggagatgg gtaaactgtg aaacccaact 360

tggacttttt cccgtagtca acagaaagtc tctcaaggag gagagatcca agaccagatc 420

cagtccctcc accaacagcg ttgaagacga ggaatccttg gagaccagta cagttatcag 480

caagctttct gatacggtct aagcacaggt caacaatctc tttcccaatg gtgtaatgac 540

cacgggcgaa attgttagct gcatcttctt taccgctgat gagttgttca gggtggaaaa 600

gctgacggt 609

<210> 41

<211> 462

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 41

agtagtttgg tatggacgga tctggtaaac cggtttcggt acgattgtct ggttattttt 60

ggttaaaatt gattgggtat gttgcagaag ctttgcctca gatggcaggt ctctccaaat 120

tgctcatcct tcgatattat tattgataca gaggaggaag actcagaatc ttcatcctca 180

aaccctagat tccttaacga aatggcgatg gagatctcgg tagatctgat aaaccaactc 240

aaggtctcgc ttcgaaagga ggccaagctc acctccgtcg acgattgctc ggactcatcc 300

ttccccagcc ttcccacatc cgaggaggca atcgcagaac ttgatgcttc agctccgtac 360

cttcgttgcc gaaactgcaa aggaaaactt ttacgaggaa tcgagtctct gatctgtgtc 420

ttctgtggaa atcagcaacg cacgagtgat aatcctcctg at 462

<210> 42

<211> 619

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 42

aagaaccata cctgggagaa cttttgaaac cttacttact tttgacacat tctttgggac 60

tctcttaggt ggaagcttag ctttttttgc tcgagaaaca ggttgtggtt ttttaggagg 120

gcttttcttg aatggtacgg gtaaggagag atccaaaaat ggttcataga cttttgagga 180

atgcccgcac tccatacaac taacaatgct cgacgtttcg cctccaaata cagattctat 240

gagagtagta gatttctcat cattatcaga aacaccacgc ttctttctca aggccgattc 300

ttcggtgctc aacgaatcta gcaaacagcg tagcaactcg tggctatcat gctggtcata 360

tccccggaac tggggtgcct tagaacagaa agacccaaaa aaggctctag gatttatcac 420

actcttcaag cctgcctctg gtttcgtttc agtgaataat ttcctcaggg aagacgcaag 480

aggcccaccg accccagacc cattctcttt caagaagtga tcgcgtaacc gatccaaaga 540

aagaagattc tgcattatcg aattaaagaa acatgtgttc ccaaggttaa ctaaacctcg 600

cacaacataa ccatctctt 619

<210> 43

<211> 588

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 43

ctaccggaat acgatacagg aacatcattg tctctcatct cctttcgtac agcctccaca 60

tcgcatttcc caagccttgt aaccctctga aaggctctaa tttgaagggc tgtggctaaa 120

tccggcctca aagtcgtctt ctcacccaca gtcttgaact tggaaggttc cacgacgatg 180

aacggacctt ctccaccatt accatttcca ttgtttttac cctttttctt ctgcaaatgt 240

ttcaaatgag atattgcatc atgcaattca acccggtttg tcagtttgag tgcttcctta 300

agcgctcgtt tagcttcttc ggtctctcca gcacctaaca aagaaaccgc cttgttaagc 360

tgagcacgcc aatggttagg ccataccgtt aagaccctag tgtacatctc cgaagctctc 420

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<210> 44

<211> 590

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 44

aggtatccgt gtgagtaaat tcgcgatagg gtttggtccg attctagcta aattcaattc 60

caacaatgtc gaatactctc ttagggcctt tccattaggt ggatttgttg gattccctga 120

taatgatccc gacagtgata tccctgtaga cgacagaaat cttctcaaga atcgaccgat 180

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tataatcttt actcaagtgg tatctgttgg attaccagtt caagaatctt ttcctggagt 300

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cggtgttcag ttatcaccga atgttagatt cggtaaggtg agaccgaaga 590

<210> 45

<211> 549

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 45

attgttattg ttattatcag ctttcaattt tccatctttc tcctgtttcg acttcaatct 60

cttcaccaga atctccaaat catcaactaa cttccacgtc tcgtcaaaaa cgattccgtg 120

attcggcgaa acagcccaag cagctgttct ctgtttcttc tgcgcttcaa cagctctctc 180

atcagtaatc gaagaagacg aagccgcctc agacccttta atcgtcgtct catcagcgtt 240

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acgtaggaga ccgtcgtagg tcaaaccctt gtttggatcg atgaattcag cgtaagttcg 360

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agctacgaca agagccgcca tctcttcacg gttaagccca ccatcatgat tcccgtcgaa 480

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<210> 46

<211> 592

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 46

tactgcttct ccttcttctt ctctcttact actgtggcca actttttaac tcagaactag 60

tttgtgaaaa tgcccccaaa gaatgagtga tgattatgtt tcatcttatg gtgtagcttt 120

gcagctgatg gaaaacaaag tggttgcagc cattggtcca caatcttcag ggattgctca 180

catgatctcc tatgtagcta atgagcttca tgtacctctc ttgtcatttg gagcaacgga 240

tccgactctc tcctctctgc aatttcctta tttcctccgc accacgcaga atgattactt 300

ccaaatgcat gcgatcgcag attttctatc atattccgga tggagacaag tcattgcgat 360

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gaaacgctcg aggatctctt acaaggctgc aattactcct ggtgcagatt ctagctccat 480

cagagacttg ttggtttctg ttaatctgat ggaatctcgg gtttttgttg tccatgtgaa 540

tcctgactct ggtttaaacg ttttttctgt ggctaaatct cttggaatga tg 592

<210> 47

<211> 581

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 47

aaacacatct acagcaaacc agcgtcttaa aggaatcata tatccaggag aagtaactaa 60

gcctcctcgt ggttgggtgt ttcctaataa tggaaaaccg ctcagaatcg gggtgcctaa 120

ccgtgtgagc tatacagatt acgtttctaa ggataaaaac ccgcctggcg ttagaggcta 180

ctgcattgat gtctttgaag ccgctattga attgcttcca tatcctgttc cacgtactta 240

tatactatat ggagacggga agagaaatcc ttcttatgat aacctcgtca atgaagttgt 300

tgcggatgtg agtagctaca ttactcaatc aagttcacaa ctttcagaag atgctaacct 360

gtcttttctc atgtttcctc ttcagaattt tgatgtagct gtaggagata tcacaatcgt 420

cacaaacaga acaagatatg tagatttcac acaaccgttt atagaatcag ggcttgtggt 480

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agagatgtgg gctgtcactg gaggcttctt tctctttgtg g 581

<210> 48

<211> 541

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 48

atctgtaggc gggcactttc tcttcaattc cctcacgtag ctagggttca tggatgggtc 60

agaatcgccc tttcctgtga agttgtagag acgactgttg acgagagcgc aactagagat 120

tccaatggtg tgacccccta ctcaagaaac catttttgtt cagctttcaa attgataact 180

cttttgagaa ttgcacatca taaggtgcca gctgcagaca tacctgagag aaccacaagg 240

tctttagcgt taagaccctt gttggcaaag ttcttcttca gcgtctttat gtcggcgaaa 300

ggagatggta aatttagcaa tgcatcgttc aatttcgaga tgcgtccatc cctgcggccc 360

aatggaaccg gccaccatgg tcccccgatc tgttcaaaga caattaataa gttatataca 420

tactatagtc ttcagttttg gaatgacaaa atcactagtc cattgcgaaa atggaatgtt 480

accactgcca cggcatctct ggcgaccaag gcaagaacat cagcgcaaga aatgagatta 540

g 541

<210> 49

<211> 620

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 49

actgtcgcac aagtaagaga tgcgaaaagg aagagaacct tcgatcacgt ccccagagga 60

acaagggaac ctcacgcata ccttcgcaat gatccagcgc ctcaagttgc ttctgtcccc 120

aagagtgtcc cagaagagaa agatgtgata ttggatagaa tcttgagtaa cgtccccaga 180

agaaaaaaga ctacttctta cgaattcgtc ccaccaaaac acccacaaga accgcaatgg 240

cttctccagg ttatgagtcg catgaacggc gctggtgatc cgaagctaat catagagaag 300

aatctggact cgaacgatgt tgatccacgt caaaaccgac tctcaatccc tatcaatacc 360

gtaatccaaa acgatttctt gacgcttgac gagtcaaggt tgattgatga agacgaaatc 420

actaacgaag ggaatatggg tgttgcagcg tttcttgttg atcagcgaac taagaagtgg 480

aacatgggtt ttaaacaatg gtttatgacg actgattcag ggagcagtta ctggagtttt 540

gtgttgcgag gtgaatggag caacgtcgtt gagactaatg gactgaaaga aggcgacaaa 600

atcagccttt ggtctttcag 620

<210> 50

<211> 587

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 50

ctaggatttc tttcatctct cttttaacac tttgtcgggt ttttgagttt ctaggattgt 60

ttaaaatgca ggaggcttag cacagtctct gtttcatgct taatacaata cactctctaa 120

ataatgcttt caagaaaaga aaaagaaaag attatacctt tagagttatt ataagaggaa 180

aacgaagtaa atcagaacgg attaacgaac tatataaaac aacaaagtca ctcttttcag 240

ttttcattca caacaaaatc ttaatggggc ttccacttct tcttcatcgc ctttttcttt 300

aaccttcttc aaaactacat tgccgagtcc aagaagactc catctttgtg tctaacggga 360

gaccacgagc cccaagaggc gtgtggtgtc accgagaggg gtaaatcaga aagacatcag 420

tctttggtct ttcaggtggc gtggaatcct ctgttttgct cttgttcctc ctcttacatt 480

gagacagagt agctcttcca atgctcgccg tctctgctaa gcttcttgtc tctgtggaga 540

ttgatcttca tttgtacagc cggctaagtt ggggcaattc tagaggg 587

<210> 51

<211> 578

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 51

cgataaagga gcaagaaccg cactcgcttt tgtgactctg cgttctgacg gagaacgaga 60

gtttatgttt taccggaatc ccagcgccga tatgcttctc cggccagatg aactcaacct 120

cgaactaatc agatccgtac gtaaaatctt tatgatctct gttttcaaga tttcaagatt 180

ttacttgttt tggagatttg atgaatattt ttctttattt ggcaggcgaa agtgtttcac 240

tatggatcaa taagtttgat tacagagcca tgtagatcag ctcacatgaa ggcgatggag 300

gtggcgaaag aagctggagc tcttctttcc tacgatccaa acctcaggga acctctgtgg 360

ccatcccctg aagaagctag gaaacagatc atgagtatct gggacaaggc tgacattatt 420

aaggtcagtg acgtcgagct tgagttcttg acaggaaaca aaacgattga tgatgagaca 480

gctatgtctc tgtggcatcc taatttgaag ctcttgcttg ttacacttgg cgaaaatgga 540

tgtcgttact acactaaggt aatgtacaac aaacattc 578

<210> 52

<211> 597

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 52

ctctggtgat tagcagatcg agaattagcc acgtggatgg attcatcgca gtccctgcaa 60

agcagagctc tatcctctac acagaaaatg aaagctgcct tctcctacaa gtcataagaa 120

cataatgagc aaaccctagt cttaaacaac aaggcataca tacaacagtt gctacaagat 180

ctataaaatc acaactttgc aacagagcag attcaaacta acgaatccat aaaatatttg 240

acaagatcta atgagatctg tagagaaact tacttggcag atatcgcaac gagggaattt 300

ggtggagagg gaattaagat gaagacgttg gtgcttgcta gcgagtttgt tagcggcgtg 360

aatctcgatg tcgcattgag gacagagagc agcttcgtcg gcgcaacaaa tcaccgtcgc 420

cggagctttc tcacacacat cacactgtat cttcatcacc ggatacaaga aaccaaaata 480

tctaggtttc tcaagaagga aacagaatgc ttaaaatgaa gggtttattg ctagtctggc 540

ttctcttaga atagcttagc agaagcgtag gttcagagaa agagcttaga gaagatg 597

<210> 53

<211> 575

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 53

atctctgcaa catctctcca cctgttttgt tctgcataca tgctaactaa aaggaaataa 60

tacccactat tcatcggctc caaaaccatc agtttgttaa acgctatttc agctatcacg 120

agattcttgt gaattctgca cccatcaagc aaggcccccc agataaccgc atttggttca 180

aattccatat ttccaatcaa ttcaagagcc tcatagatca acccagcttt gctgaataga 240

tgaaccatgc ctccgtaatg ttcaacatta gagacaatgg aatagtcatc aatcatgctg 300

cgatatatcc tccgaccttc gtcaacaaga cctgcgtgag tacacgcagt aaaaacactc 360

acaaaagtga ctgcgttagg tttcaccgac tccatctcca tcttggcaaa cattttcagt 420

gcttcttgtg caaaaccatg agccgccagt ccttcaatga tcgaattcca acaaaataga 480

ttctttttgg gcaaattgaa gaacaccaga agcgcccgct ctaagctacc acatttggaa 540

tacatatcta ccagtgcaga accaatgtag acatc 575

<210> 54

<211> 573

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 54

tgctacgttg tctgctcatc taacttttgt cattttcctt aacaaatgtc tatggaatat 60

ggattgagtt atgagtatct cctggtttac attattgttt ccttggatat atgtgcttaa 120

agtgaaattg acaggacagt gataagtaat aggtttatat atattatggt tacaggacga 180

tctaacggtt agcctgatgg agaaatgcaa gcaatcgcag ccattgattc aaatgatcat 240

agagagtaca acagacgacg agggagtcct gttcgaggct ctgcatctga atgatgagct 300

ccaacaagtt ttatctagtt acaagaagcc tgatgaaacc gaaaagaaag cctccattgt 360

ggaacaagaa tcatcaggaa gcaaagatac tggtccgaaa ccaacagaac aagaagaaca 420

agagcctgta aagaaaacgg gtgctgatga tgacaaaaaa cattcagaag catcaggatc 480

ctccaacaaa accgtcaaag aagagaagca ggccgtgaaa atagaactgg ggctttcgag 540

tgatgaagat gaaaaataag cagtctgtgt ttg 573

<210> 55

<211> 517

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 55

gcttgacctt tgctttttgt caattttttt cccccaacag gttgacaggc tcataactga 60

gctcaaacta cctccaaggg atgcttacta caagctgagg catacaattg aagtcattaa 120

taaccacata tctgctgctt caacaactgc tggagactta cctcttatag accctgcagc 180

tggaaatgta tgttttgcca gtggtacagc cggatggtcc ttcacattac aatcttttgc 240

taaaatgtat gccaagcttc atggtgtggc catggacgtg gataagtttg catctcgact 300

ttggggagat gtatattatc actctgatac tagggtattc aagagaagtc ctccagtagg 360

tggtggagaa agagcatttg ttcagtttat tctggagccc ctatacaaga tatacagcca 420

agtgataggt gaacataaga agagtgtaga gaccaccctt gcagaattag gagtgactct 480

gagtaatagt gcatataagc tgaacgtcag acctcta 517

<210> 56

<211> 579

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 56

cttaggttag cctgtagttc agtgtttggt tcggcatcag ggttcactga tatgttggta 60

aagcacattc cttcacccag agaggctgca gctaggaagg tcgaccattc atataccgga 120

accaaagatt cccccattta tgaatcaatg gtagaatgtg atccatctgg acctctcatg 180

gttaatgtga caaagttgta ccccaaatca gatactagtg tttttgatgt gtttggaaga 240

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cctgaggatg aggaggacat gactataaaa gaagtgacga agctatggat atatcaagct 360

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<210> 57

<211> 590

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 57

attactttgt gaaaaatctg atatctgttt catgctaaag attgcagagc cattggatag 60

aggacttgca gaggacattg agaatggcgt tgtaagcatt gactggaaca gaaaacaact 120

tggtgacttc ttcaggacga aatatgactg ggatttactt gctgcacgtt ccatctgggc 180

ttttggccct gacaaacagg tgaaatgctt gtattcttaa aacactgcaa tctggggttt 240

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ttttcgactg atcaggggcc aaacatatta ttggatgaca cccttccaac tgaggtggac 360

aggaacttga tgatggcagt gaaagactcc attgttcaag ggtaatcatc tttcttctgt 420

tacacttttc ttttactcga ttttgttggc tttagctaag tggcttcgtt ttattcctct 480

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<210> 58

<211> 605

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 58

agggtattta tgtaatctca ccaccgttac taattttata aaattaagga aactatcgtt 60

gaaacttctt catcttcctt aaaacaacca caacgtcact ttcttcccgg ataattgaaa 120

tcggtgatcg gaatccctag aaatgtcgga taatcgtgca ctccgacgag ctcatgttct 180

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caatcagacg atggagcagc agcgtgagat cacaatgaaa cggatctggt acttgcttga 480

gaatggggtt ttcaaaggat ggttgacgga gacaggtcct gaggccgagc tcaggaaatt 540

agctctgctt gaggtttgcg ggatttatga tcactccgtc tccatcaaag ttggtgtgca 600

tttct 605

<210> 59

<211> 593

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 59

gactcaactc acatcatcaa ccctcagatg cagccaattc caggtcatat gcctcctcat 60

taactatttt cctacttatc atttatttag atgaattttc aactcttaaa catgttcttg 120

tattttgtcc ctaacagaca aatgtgttct gcttaagaga gcgagatctt ctggagcaat 180

ttacttctga agttgcacag cttcaaggga gaggagaaag tcgagaattc tctttcctcc 240

tggtaaagca tttttttcac ctaaaatttg cttccttttc tgttctccga cctttaggat 300

tcagtaatag ttttcttctc ctttccatcc gtacttgcag agtcatcaac ttgctgaaga 360

cttaggtaaa gctttcacag agaaagcaat acttcaaacc attttggatg ctgaggcaaa 420

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tattcagttg aatcatggtt gttttgctag ctctagggat cacggatggt acttcaggct 540

tccatgtcat atgattagcc attagcgtgc agagtaattg attttaaact ata 593

<210> 60

<211> 585

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 60

tcacatcttt attttctcat ttttagagat aagtagagag atgttgttca aaatgaggat 60

ttggaaagtt caggggtaat gctgttaagt tctttgggac aaagcgtcac catgaaaagt 120

ggctgaaaga cactgaagat tatgttgtca agggctgctt tgcaatgact gagctaggcc 180

atggaactaa tgtaggcata ttgcagtgtc attttgcatt tatccagact atatatgtat 240

tggtgatctt tgatttggtg gctttcaggt acggggaatt gaaacagtga ctacttatga 300

cccaacaact gaagagtttg tgataaatac tccttgtgaa tctgctcaga agtattggat 360

cggtgaggca gctaacgtaa gtagtcacta tgcttaactc ccacactcat ctgctatcta 420

ctgacttgtt gatatacttt ggttgttcag catgcaaacc atgcaattgt gatttctcag 480

cttagtatga atgggaccaa ccaggggatt catgtcttta ttgctcaaat cagagatcat 540

gatggcaaca catgtcctaa cgtccgcata gctgactgtg gacac 585

<210> 61

<211> 603

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 61

cgtcataaaa catataatat aagaaaatga gagatatcta tacgttacat taccttgtat 60

ttgatgtatt gggtgtcaaa tatccacaag atatggctga acaataatcc ttctttaggg 120

ctatgtgggt cgcggtccga atctgtgaac tggtgatgga acctatgtat gctcacccaa 180

tccattggat caccctgaaa atatattttt tcttctctaa tcatatactt gggaaaaaga 240

aagaaaagca tttgacatgg tggtaacact tagttagatt ctcaaaacgc tggtgttaac 300

ctgaagagcg aaaacagcag aataagccca aggatattcg agccattttg gtatcttgaa 360

gctacggtga gacaagttcc tatggaatga gaatgtgatg ctgagtgtag tcaacgcgaa 420

gagcaccaaa ccgaaccgta aagcttccca tttgaagtta aacggcgcca agagacacaa 480

aaagtgcaca atcacaacga ctgacgctct tacgacatcg accaacggcc attgtctctg 540

aaaatacgcc ctcttttgca tagtactcac cactctgctt cggctggagc catcgtctct 600

agt 603

<210> 62

<211> 585

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 62

aattcagata ggattgctcg gaattcatcg cctgacatag tctctttctc aagaagtatt 60

tcaacaatct tgtccatggc ttcacgattg tttctaatct ggctcaaagc tatctcgtac 120

gctttgtctg ataatgtctt caccgctgta tcaatatcat ttgcaagctt ctcagacatt 180

gagtttcttg ccatcatcct cataatgaca tcgctttgct ccgatgaatc cattagcgac 240

catggtccga tttcagacat cccaaatgtt gtcaccatct gcaagtaaat gatgatatac 300

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agagatacct gcttagccaa accggtgatc tgttgcaagt cactaactgc accagtagtc 420

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<210> 63

<211> 583

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 63

ttctttgcaa cctaaggccc atataccatt aaagctctga atgtgatggg cttattcatt 60

gcaacccaag gcccatctgt cattaaagct ctgaatgata tgggcttatt ctttgcaacc 120

caaggcccat ctaccattaa agctctgaat gagatgggct tattcattgc aacccaaggc 180

ccatctacta ttaaagctct gaatgatatg ggcttattca ttgcaaccca aggcccatac 240

accattaaag ctctgaatga tatgggctta ttcattgcaa cccatggccc atctaccatt 300

aaagctctaa aaaggtaaaa acccaagaag tttcttccct tgaagaagct ctctctatct 360

ctccagtctc cttccacctt gaatgagtaa agcgagggtt ctgctaaaac cctcttccct 420

caccacttgc ttaaccagag ccaaggcctt cttctcctct gtttctcagt cacgctctat 480

ctctcatcag atggagatgg gtccttccga ttcggagcgt tactgttatg atccggtact 540

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<210> 64

<211> 613

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 64

catagattaa gcacggtaag aaatgcggat atgattgcag taattcacag cggaaaaatg 60

gtggaaaaag gttcgcattc tgagttgttg aaagattccg tgggagctta ttcgcagctc 120

attcggtgtc aagagataaa caagggtcat gatgcaaaac catcagacat ggcttcggga 180

tcatctttcc ggaattcgaa tttgaacata tcaagagagg gatcggttat cagtggtgga 240

acctcgtctt ttggaaatag cagtcgtcat cattctttga atgtccttgg tttattcgct 300

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ccgtctcaaa tgt 613

<210> 65

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<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 65

aagcaatgtg aaggtccgat aaaagatgga gtaaagcaag gtttcatcag cggattaggg 60

tttggattct ccttcttcat tctgttttgt gtctacgcga caagcttcta cgcggcagct 120

agattggttg aagatggcaa aactactttc attgatgttt tccaggtgaa ttgatgtcct 180

cgtctactgt cattgatggc aagactaaaa tatttttgga aatctcggtg cctagtaatg 240

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ttggaatttc tcagtcgagt actttcgctc cagattcaag caaagccaag gtcgcagctg 360

cttcaatctt cgcgatcatc gatagaaaat caaagataga ctcgagcgat gagacaggga 420

cagtgttgga gaacgttaag ggagatattg agcttcgtca cttaagcttc acttatccag 480

caagaccagg cattcagatc tttcgtgatc tttgcttaac cattcgcgca ggaaaggtaa 540

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gatcaagttc tgtctttttt ttttcagacg gttgctttgg t 641

<210> 66

<211> 603

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 66

ttcagttatc aggaggacag aaacagcggg tagctatagc acgtgccatc gtgaaagagc 60

cgaagatatt gcttttggac gaagcaacga gtgctcttga tgcagaatca gagcgactgg 120

ttcaggatgc gcttgaccga gtgattgtaa accgaaccac ggttgtggtg gctcaccggt 180

tatcgaccat taaaaacgct gacgtcattg ccatcgttaa gaacggtgtg atcgctgaga 240

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tccactacca aatacagaga taatatgtac aaacacactc aaacaacgaa aaataacgag 540

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atc 603

<210> 67

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<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 67

gtccatcagc cggctgtgtt catcgatgag caaataaatg aaaattagtg ggttttacat 60

tagaaaaaat ctggacaatt ttaattaaat atatgtatag tagattaaga aaataaagga 120

ataagaaagg aacctttgta gctagacgac catagacgtg gttgccaaac acactttctt 180

aaagctttat atacatcttt cttacttcct ctgtttcttc tcattcaagc aacagtctct 240

tcccattttt tcttcttctt ctccctctac ctcttctttg ccaattaaga tggaacatga 300

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cattagcctt cttagtcttc ttgtccctct ctctttcctc ttcctttcac gtctctccgt 420

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<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 68

atacctcctc aactccggtc accgtctccg gcgtttcctc tgttattcac caggcagatg 60

tcggagtctt atacacgatc ttgtttctca tcatcgtctt cactttaatc cacagtctct 120

caggaaaacc agaatgctct gttctccatt cccatctcta catctgctgg atcgttctct 180

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atccagacaa aaacttgttt cttgcgacac atgaaagatg gatgttggtt agggttttgt 300

tctttttggg gctacacgaa gtgatgctga tgtggtttag agtcgtggtt aagcctgtgg 360

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cagtgacctt tggtataatg tggtggtgga ggctaagaga tgaggtagaa agtcttgtgg 480

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<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

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ccgtaacgcc gaacaatgca gatcttccgg cgaagattcc ggcgtctgta accctaatct 60

cgtccacgta gccatcactc tcgacatcga ttacctccgt ggctcaatcg cagccgtcaa 120

ttcgatcctc cagcactcaa tgtgccctca aagcgtcttc ttccacttcc tcgtctcctc 180

cgagtctcaa aacctagaat ctctgattcg ttctactttc cccaaattga cgaatctcaa 240

aatttactat tttgcccctg agaccgtaca gtctttgatt tcatcttccg tgagacaagc 300

cctagagcaa ccgttgaatt acgccagaaa ttacttggcg gatctgctcg agccttgcgt 360

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gaaaacgggt ttaggccaga gaacaatcgg agctccggag tattgtcacg cgaatttcac 480

gaaatacttc accggaggtt tttggtcaga taagaggttt aacgggacgt tcaaagggag 540

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<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 70

tgctttcttg ttgtggtcat aacccggacg cttctctctc gacacataga ccagcattgg 60

tagcctgatg tcaacgtctg ttgtatcaat taagttctca gcatctgctt cagctccata 120

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gtgtttcctg c 611

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<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 71

gcaaacaatc cacaacacat aagaatctct gatcaaaatt aaaaaaaaac tttataaagt 60

ttgtaagaag ttaagctctg accttagcta aacgctcctc tctcctagca tgcttccttt 120

ctcggctagc cttgttcttc gccctcttag cctcaaactg atcagacaga gtcttctccc 180

tagccttctc agcctttgac ttgtggatac tctccatcaa gacacgcttg ttcttgaaca 240

cattaccctt aacacgcatg tacatgtcat ggtacatgtg cttgtcaatc ttcttcgtct 300

ctctgtattt cttcaacaga cgcctaagaa cacgcatcct acgcatccac agtacctttg 360

ttggcaacct agcttcacgg gtacccttcc tcttacctat ttaatcataa acacaggaaa 420

aaaggcaaga gtaaacaacg ctaatcattc ttcaaaatca cgattaaata gagggatttt 480

cagagttgtg aagtatatac cgtatccaga gtgacgaccc ttcatcttgg caatcttcat 540

tttgcgagct ctggaacgag agtgaatctt ggttggcttc ctgatgatga aaccatcctt 600

cacaagcttc ctgatg 616

<210> 72

<211> 601

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 72

gacctacctc atcctcatta atcatcacca cacttatata aaccacttaa cctaaagttt 60

gtattcacat aaaactttcc agtaccaatg gaatctccaa tattcattct catcacacta 120

tcattctttc ttcaatcagt tcttgcttct tctcaaactc tatcaaactc ttcaacaatc 180

tgcaaaacga cgccggatcc aaagtattgc aaatccgttt ttccacatag ccaaggcaat 240

gttcaacaat acggctgttt ctctatccgc aaatcgctat cgcaatcgcg aaaatttatt 300

cgcaccgtcg atagatatat caaacgcaac gctcatttat ctcaacctgc cgttatcaga 360

gctctccaag attgccgttt tctcgccggt ctaacaatgg attacctctt aacgtcgttc 420

gaaaccgtta acgacacgtc agcaaaaacc tctttcaaac cgctgtcgtt tcccaaagcc 480

gacgacatcc aaacgcttct ttccgcggcg ctgactaatg agcagacgtg tcttgaagga 540

cttaccacgg ccgcttctta ttccgccacg tggactgtaa gaaccggcgt cgctttgcct 600

c 601

<210> 73

<211> 659

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 73

aagctgactt tcctgtgaat tgtgatcttt tcattgttgt gtttaatatt ttgtttcata 60

tctctttagg ttagagaata tgattcaagg aaggattcta ggagtcctag ccggggaaga 120

tcctattcta agagccgcag ccgcagccgt ggacgaagcg tgagccgaag caggagcaga 180

agcaggagca ggagcagaag tcccaaggca aagtcttcac gtaggtcccc tgcaaaatct 240

acatcaagat ctcctggccc ccgctcgaag tcaaggtcac cgtctccaag aaggtaatga 300

tttgattcct tttcagaatg caccaggcaa cattacttag tcggtagatt ttcctgtgaa 360

gtttatgaaa atctgattag aaaagtcatt gttgatgctc aaagttcttg ttgattgagc 420

atatactggt tttttgttga cacctgctgt ttgctcgtca ttattgtccc ttcttactcc 480

atccttatat ttagatgctt agcccttttc tggttaagat ttgcgagatt ggccttacat 540

ttttagcatt tttaaatatg ctcttttctt tcctgagaag aaaatggttt tgtttcatag 600

atatggattt acatacgact agaaaatgga aattaatatc tggatggaaa ttgattgtt 659

<210> 74

<211> 576

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 74

tattcgacct cggtggtcga gaattctggg tcgactgtga ccaaggctac gtctccacca 60

cttaccgctc tcctcgctgc aactccgctg tctgctcacg cgccggctcc atcgcctgcg 120

gcacatgctt ctctcctccg agacctggct gtagtaacaa cacttgcggc gcttttccag 180

ataactccat caccggatgg gcaacctcgg gcgaatttgc tttagacgtt gtgtctatcc 240

agtccactaa cggatccaat ccgggtcggt tcgttaaaat ccccaatcta atattcagtt 300

gcggatcaac gtctcttctt aaaggactcg ctaaaggagc cgttggtatg gctggaatgg 360

gacgtcacaa catcggctta ccgttgcagt tcgccgccgc gtttagcttc aaccgcaaat 420

tcgccgtgtg tcttacttcc ggtagaggcg tcgccttctt cggcaacgga ccttacgttt 480

tcctccccgg gatccagatc tcaaggcttc aaaagacacc gcttctcatc aatccaggga 540

ccactgtttt tgagttttca aaaggcgaga agtcgc 576

<210> 75

<211> 647

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 75

tcctcgtact cttcgccgga ataatgtcgg gtctcacact cggactaatg tcccttggtc 60

tcgttgagct cgagattctc caacagagtg gttcctccgc cgagaaaaaa caggccggta 120

cgcctcttta atttttttcg actttcgata tctgtgtgtt gttggctcaa aattacatac 180

ctgacttgtt caattcgtaa tggctataga atttcttaaa acttgatttc taatttctta 240

ttctgtaatt tttgttaaaa gcagagtgat agagtctcta tttttactct tgacggagtt 300

acttgaattg tttttggata ttgcagctgc aatcttacca gtggtaaaga agcagcatca 360

acttcttgtg actctacttc tttgcaatgc agctgctatg gaggttaatt attgttgatt 420

tgttacccta gtttttctga tttacaacga taaattactg tctttgtgca cctcagaatc 480

agtgaatttt gttcttggat cttttgtctc aggctcttcc tatatgcctg gataagatat 540

tccatccttt tgtggctgtt ttactctcag ttacttttgt tcttgctttt ggagaggtaa 600

cttactttac atatcttctt ggtatcaaat tgtgttctct tcagtta 647

<210> 76

<211> 569

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 76

ataagaacgt cctcagatgg ccacaagact caagtacaaa gaaagagaag ggtgatggta 60

aaaacttgtc aagcgaggaa aatggtggta aaaacttgcc aagcgagaaa aatggtgtga 120

acccgccgcc gccttgttac accgctcaac cgatgatgta ccatggtgga cacaatcctt 180

tacaccggtg gcccatatcc gcagcctcga gaagccatta tcccccgttt tcgatggggg 240

caatgcatgg accatatggt ggttgtggac cttgtggtgg tccaattgat ccataccaat 300

ccatgcctcg acccagaatg ttcgatggtg ttcacatttc acaatatccg cctatggctg 360

cagcatatcc gtatatggct gcagctggtc ctttccccta ttggcaaacc agaccgtaca 420

tggatgcaaa tcctatgaag cgttacacta cctatgcaga aaattactcc tatttttatt 480

catgagtcta tgtttttcct ctgtttgctt catctcagaa ataagaaact aaattaatga 540

caagagttaa ggtcctattg ctgctatgc 569

<210> 77

<211> 601

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 77

ttcagtcact gaatctgcac ttgtcacttc atcttgcgtg ctcactttag ccactgaata 60

tgtactttcc acttcatctt tcacagtttc actcacatct ccaccaccca taccatcatt 120

cccttcaagt ttcaaccttg aaacatcttt ggtagcttca acaactttct cgctgctctc 180

ctcttcatca tcaatatccc agctcaattc ttcttcatca tccagagaga tggctcgttt 240

cacaagatta gcccttaaat cctcagcttg cttgagcttg ttaaccctat agaaatacct 300

aaaccagaag gtctcgtgat caaccatact cggaacgacc cttttataca ctcctttcat 360

atcaccattt tcctccaaca atttctccat ctcctcagct tttccatcca gagaaaacgc 420

agattcccac tttttgtaat catctgaatc ctcaggctct tcacagtaag tgttgagatc 480

tccttgaaca gcacgaatct gagcatcgaa acgactatat ggtttcgaac tgaagctatc 540

acgacgacca aaactctgac tactattgtt atcagaagaa tcagattcat taccagcggc 600

t 601

<210> 78

<211> 601

<212> DNA

<213> 拟南芥(Arabidopsis thaliana)

<400> 78

agatgaatgg atgtggtctc aatgttgaca aagtagaagc ctttacagtg tcacctcagg 60

aaaaaggaag gaaaaacaag agaaagttag ctgatccttc tcaaccaaat gcttcttccc 120

tcactgaatt ccctccatat gagttacctt cgttgaaacc tcagaaccat ttgagcggaa 180

atggatcggt tggggaagtt tctaatcagc tgcaagttga agtgtctgaa tctgtcgaat 240

gggatgaccc atttgcctgt catcttgaag aattgttgtc gtcaaatttg ctcacgctct 300

tccttgatac aatgaagcag cttattgatt taggctacac cgatgacgaa gttctgaaag 360

ctgtatcacg ctgtaggctg tactgtggag gcaataatct tttgtcaaac attgtcaata 420

acaccttgag tgctctcaag actggagacg aaggtgctgg ttcaggagac tatgtgtttg 480

aggatttaca acagcttgtt tcctatacgt tggtagaaat gataagtctt attaaggagg 540

tcaggccgtc cctatcaaca gttgaagcta tgtggaggct tttgatgtgc gacttgaatg 600

t 601

<210> 79

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 79

attcccataa ccatacccta c 21

<210> 80

<211> 21

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 80

ccaagaatta acctccaaca t 21

<210> 81

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 81

ttccgtgctt accacgacag 20

<210> 82

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 82

tgcaacgtga ccaccattct 20

<210> 83

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 83

tcctcgacac tcaactcctt 20

<210> 84

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 84

agcacaatcg catcccaagt 20

<210> 85

<211> 41

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 85

taatacgact cactataggc atagattaag cacggtaaga a 41

<210> 86

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 86

acatttgaga cggtgagaca 20

<210> 87

<211> 41

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 87

taatacgact cactatagga agcaatgtga aggtccgata a 41

<210> 88

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 88

accaaagcaa ccgtctgaaa 20

<210> 89

<211> 39

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 89

taatacgact cactataggt tcagttatca ggaggacag 39

<210> 90

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 90

gatttatctt ggtatggtgc 20

Claims (10)

1.一种测序内标分子的制备方法，其特征在于，包括以下步骤：

S1：以1000±200bp为窗口，获得与待测样本中基因序列非同源的unique植源性序列；

S2：从上述unique植源性序列中挑选出GC含量为35％-70％的序列；

S3：从上述序列中筛选出无微卫星的序列；

S4：从上述序列中筛选出连续碱基序列数小于8的序列；

S5：在上述序列中，以测序读长±5bp为窗口进行两两比对，对筛选出的序列做同源性筛查，获得序列相似性低的序列，即为筛选序列；

S6：以所述筛选序列为内标分子的基础序列，设计合成扩增引物，以所述植源性基因组为模板，进行PCR扩增，即得测序内标分子。

2.根据权利要求1所述的测序内标分子的制备方法，其特征在于，所述S1中，所述待测样本中基因序列的类型为人源和微生物基因组；所述植源性序列来源于拟南芥。

3.根据权利要求1所述的测序内标分子的制备方法，其特征在于，所述S5中，所述序列相似性低的序列指：两条序列之间具有连续相同碱基的长度低于15bp。

4.根据权利要求1所述的测序内标分子的制备方法，其特征在于，所述S6中，进行二次PCR扩增。

5.根据权利要求1所述的测序内标分子的制备方法，其特征在于，所述测序内标分子长度为400bp-800bp。

6.根据权利要求1-5任一项所述的测序内标分子的制备方法，其特征在于，扩增获得测序内标分子后，进行体外转录为单链RNA，即得转录组内标分子。

7.根据权利要求6所述的测序内标分子的制备方法，其特征在于，进行体外转录RNA时，在上游引物的5＇端添加TAATACGACTCACTATAGGG序列。

8.权利要求1-7任一项所述的测序内标分子的制备方法制备得到的筛选序列和/或测序内标分子。

9.根据权利要求8所述的测序内标分子，其特征在于，所述筛选序列选自：SEQ ID NO.1所示序列～SEQ ID NO.78所示序列。

10.权利要求8所述的测序内标分子在宏基因组病原微生物检测污染监控中的应用。

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