CN111018991B

CN111018991B - 一种抗ca50的抗体及其应用

Info

Publication number: CN111018991B
Application number: CN201811183023.5A
Authority: CN
Inventors: 孟媛; 钟冬梅; 游辉; 范凌云
Original assignee: Dongguan Pengzhi Biotechnology Co Ltd
Current assignee: Dongguan Pengzhi Biotechnology Co Ltd
Priority date: 2018-10-10
Filing date: 2018-10-10
Publication date: 2022-11-04
Anticipated expiration: 2038-10-10
Also published as: CN111018991A

Abstract

本发明涉及一种新颖的包含CA50抗原结合结构域的分离的结合蛋白，并对该结合蛋白的制备、应用等方面进行研究。所述结合蛋白活性强，与人CA50具有很高的亲和力，可广泛应用于CA50的检测领域。

Description

一种抗CA50的抗体及其应用

技术领域

本发明涉及生物技术和医学技术领域，尤其是涉及一种抗CA50的抗体及其应用。

背景技术

CA50是一种非特异性的广谱肿瘤标志物(Tumor Marker)。是一种唾液酸酯和唾液酸糖蛋白，是反映肿瘤存在的化学类物质。它们或不存在于正常成人组织而仅见于胚胎组织，或在肿瘤组织中的含量大大超过在正常组织里的含量，它们的存在或量变可以提示肿瘤的性质，借以了解肿瘤的组织发生、细胞分化、细胞功能，以帮助肿瘤的诊断、分类、预后判断以及治疗指导。

CA50是一种唾液酸酯和唾液酸糖蛋白，正常组织中一般不存在,但CA50广泛分布于结肠、直肠、肺、胰、胆囊、子宫和肝等多种肿瘤组织中。癌症时因癌细胞糖酵解不完全和酸性产物堆积，使CA50产生过多，释放于血液中。消化道肿瘤时血清CA50浓度升高最多见，尤其以胰腺癌和胆囊癌阳性率最高，在80％以上，结肠癌和直肠癌为60％～70％，肝癌时也为60％～70％，肺癌为60％，对肺癌的鉴别诊断优CEA，在溃疡性肠炎、肺炎、胃炎时CEA均可升高，而CA50无此现象。卵巢癌、肺癌、子宫颈癌、乳腺癌患者血清CA50浓度也可升高。癌症患者血清CA50值与病程进展相关，CA50值越高，预后越差。恶性胸、腹腔积液中CA50阳性率很高，良性胸腔积液中极少阳性，提示用胸、腹腔积液进行鉴别诊断比血清更有意义。慢性胰腺炎、结肠炎、胆囊炎和肺炎时也有CA50量升高，但随着炎症消除而下降。肝硬化时CA50阳性率达50％，肝炎25％，未透析的肾功能不全患者约37％阳性，应引起临床注意。CA50与CA19-9相关性极高，因此CA50检测对消化道肿瘤诊断价值与CA19-9相似，但部分Lewisab的结肠癌、胰腺癌患者CA19-9检测阴性时，CA50可为阳性。

CA50(CA50)是一种非特异性的广谱肿瘤标志物，与癌抗原19-9有一定的交叉抗原性，主要用于胰腺癌、结肠/直肠癌、胃癌的辅助诊断，其中胰腺癌病人增高最明显。

CA50目前常用免疫检测法检测，都需要用到针对CA50的单克隆抗体，而目前国内用于检测CA50的单克隆抗体原料极少，且灵敏度、特异性上都存在缺陷，还有较大的改善空间。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明涉及一种新颖的包含CA50抗原结合结构域的分离的结合蛋白，灵敏度和特异性相较之现有的CA50的单克隆抗体都有明显优势，本发明还对该结合蛋白的制备、应用等方面进行研究。

所述抗原结合结构域包括选自下述氨基酸序列的至少一个互补决定区，或与下述氨基酸序列的互补决定区具有至少80％的序列同一性且与CA50具有K_D≤8.75×10^-8mol/L的亲和力；

互补决定区CDR-VH1为G-X1-T-F-X2-D-A-X3-M-D，其中，

X1是I、V或L，X2是S或T，X3是F或M；

互补决定区CDR-VH2为I-G-X1-N-G-N-X2-H-A-T-Y-X3-A-E-S-V，其中，

X1是Q或N，X2是D、E或N，X3是Y、F或W；

互补决定区CDR-VH3为T-X1-R-F-X2-Y，其中，

X1是I、L或V，X2是P或A；

互补决定区CDR-VL1为Q-X1-X2-N-S-Y-X3-S，其中，

X1是E或D，X2是L或I，X3是I或L；

互补决定区CDR-VL2为R-X1-K-X2-L-X3-D，其中，

X1是A或P，X2是K或R，X3是I、V或L；

互补决定区CDR-VL3为L-X1-Y-D-X2-X3-P-R-T，其中，

X1是Q或N，X2是D或E，X3是I或L。

一个重要优点在于，所述结合蛋白活性强，与人CA50具有很高的亲和力。

附图说明

为了更清楚地说明本发明具体实施方式或现有技术中的技术方案，下面将对具体实施方式或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图是本发明的一些实施方式，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。

图1为本发明抗CA50的重组抗体的单克隆抗体电泳图。

具体实施方式

本发明可通过后续对于本发明一些实施方案描述以及其中所包括的实施例的详细内容而更容易被了解。

在进一步叙述本发明之前，应明了本发明不会被局限于所述特定实施方案中，因为这些实施方案必然是多样的。亦应明了本说明书中所使用的用语仅是为了阐述特定实施方案，而非作为限制，因为本发明的范围将会被仅仅界定在所附的权利要求中。

除非本文另有定义，连同本发明使用的科学和技术术语应具有本领域普通技术人员通常理解的含义。术语的含义和范围应当清晰，然而，在任何潜在不明确性的情况下，本文提供的定义优先于任何字典或外来定义。在本申请中，除非另有说明，“或”的使用意味着“和/或”。此外，术语“包括”及其他形式的使用是非限制性的。

一般地，连同本文描述的细胞和组织培养、分子生物学、免疫学、微生物学、遗传学以及蛋白和核酸化学和杂交使用的命名法和其技术是本领域众所周知和通常使用的那些。除非另有说明，本发明的方法和技术一般根据本领域众所周知，且如各种一般和更具体的参考文献中所述的常规方法来进行，所述参考文献在本说明书自始至终引用和讨论。酶促反应和纯化技术根据制造商的说明书、如本领域通常实现的或如本文所述来进行。连同本文描述的分析化学、合成有机化学以及医学和药物化学使用的命名法、以及其实验室程序和技术是本领域众所周知和通常使用的那些。

为了本发明可以更容易地理解，选择的术语在下文定义。

术语“氨基酸”表示天然存在或非天然存在的梭基α-氨基酸。术语“氨基酸”用在本申请中可以包括天然存在的氨基酸和非天然存在的氨基酸。天然存在的氨基酸包括丙氨酸(三字母密码：A1a，单字母密码：A)，精氨酸(Arg，R)，天冬酰胺(Asn，N)，天冬氨酸(Asp，D)，半胱氨酸(Cys，c)，谷氨酰胺(G1n，Q)，谷氨酸(G1u，E)，甘氨酸(G1y，G)，组氨酸(His，H)，异亮氨酸(I1e，I)，亮氨酸(Leu，L)，赖氨酸(Lys，K)，甲硫氨酸(Met，M)，苯丙氨酸(Phe，F)，脯氨酸(Pro，P)，丝氨酸(Ser，S)，苏氨酸(Thr，T)，色氨酸(Trp，W)，酪氨酸(Tyr，Y)，和缬氨酸(Va1，V)。非天然存在的氨基酸包括但不限于α-氨基己二酸，氨基丁酸，瓜氨酸，高瓜氨酸，高亮氨酸，高精氨酸，羟基脯氨酸，正亮氨酸，吡啶基丙氨酸，肌氨酸等等。

术语“分离的结合蛋白”是这样的蛋白，其由于衍生起源或来源不与天然结合的组分结合，所述天然结合的组分在其天然状态下与其伴随；基本上不含来自相同物种的其他蛋白；由来自不同物种的细胞表达；或在自然界中不存在。因此，化学合成或在不同于其天然起源的细胞的细胞系统中合成的蛋白将是与其天然结合的组分“分离的”。还可以通过分离，使用本领域众所周知的蛋白纯化技术，使得蛋白基本上不含大然结合的组分。

术语“包括抗原结合结构域的分离的结合蛋白”泛指包含CDR区的一切蛋白/蛋白片段。“抗体”此用语包括多克隆抗体及单克隆抗体以及这些抗体的抗原化合物结合片段，包括Fab、F(ab’)2、Fd、Fv、scFv、双特异抗体和抗体最小识别单位，以及这些抗体和片段的单链衍生物。抗体的类型可以选择IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE、IgD。此外，“抗体”此用语包括天然发生的抗体以及非天然发生的抗体，包括例如嵌合型(chimeric)、双功能型(bifunctional)和人源化(humanized)抗体，以及相关的合成异构形式(isoforms)。“抗体”此用语可和“免疫球蛋白”互换使用。

抗体的“可变区”或“可变结构域”是指抗体的重链或轻链的氨基端结构域。重链的可变结构域可以被称为“VH”。轻链的可变结构域可以被称为“VL”。这些结构域通常是抗体的最可变的部分，并含有抗原结合位点。轻链或重链可变区由被三个称为“互补决定区”或“CDR”的高变区打断的构架区构成。抗体的构架区，即构成要件轻链和重链的组合的构架区，起到定位和对齐CDR的作用，所述CDR主要负责与抗原的结合。

当在本文中使用时，“构架”或“FR”区意味着抗体可变结构域的排除被定义为CDR的那些区域之外的区域。每个抗体可变结构域构架可以被进一步细分成被CDR分隔开的毗邻区域(FR1、FR2、FR3和FR4)。

通常情况下，重链和轻链的可变区VL/VH可由以下编号的CDR与FR按如下组合排列连接获得：FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4。

当在本文中使用时，与多肽或核酸相关联的术语“纯化的”或“分离的”是指多肽或核酸不是处于其天然介质中或天然形式下。因此，术语“分离的”包括从其原始环境，例如如果它是天然存在的，从天然环境取出的多肽或核酸。例如，分离的多肽通常不含通常与其结合或通常与其混合或在溶液中的至少某些蛋白质或其他细胞组分。分离的多肽包括细胞裂解物中包含的天然生产的所述多肽，纯化或部分纯化形式的所述多肽，重组多肽，被细胞表达或分泌的所述多肽，以及在异源宿主细胞或培养物中的所述多肽。与核酸相关联，术语分离的或纯化的指示例如所述核酸不在其天然的基因组背景中(例如在载体中，作为表达盒，连接到启动子，或人工引入到异源宿主细胞中)。

本发明提供的一种包含抗原结合结构域的分离的结合蛋白，所述抗原结合结构域包括选自下述氨基酸序列的至少一个互补决定区，或与下述氨基酸序列的互补决定区具有至少80％的序列同一性且与CA50具有K_D≤8.75×10^-8mol/L的亲和力；

互补决定区CDR-VH1为G-X1-T-F-X2-D-A-X3-M-D，其中，

X1是I、V或L，X2是S或T，X3是F或M；

互补决定区CDR-VH2为I-G-X1-N-G-N-X2-H-A-T-Y-X3-A-E-S-V，其中，

X1是Q或N，X2是D、E或N，X3是Y、F或W；

互补决定区CDR-VH3为T-X1-R-F-X2-Y，其中，

X1是I、L或V，X2是P或A；

互补决定区CDR-VL1为Q-X1-X2-N-S-Y-X3-S，其中，

X1是E或D，X2是L或I，X3是I或L；

互补决定区CDR-VL2为R-X1-K-X2-L-X3-D，其中，

X1是A或P，X2是K或R，X3是I、V或L；

互补决定区CDR-VL3为L-X1-Y-D-X2-X3-P-R-T，其中，

X1是Q或N，X2是D或E，X3是I或L。

本领域公知，抗体的结合特异性及亲合力均主要由CDR序列决定，根据成熟、公知的现有各项技术可轻易地将非CDR区域的氨基酸序列改变而获得具有相类似的生物活性的变体。因此，本发明也包括该结合蛋白的“功能性衍生物”。“功能性衍生物”是指氨基酸替换的变体，一个功能性衍生物保留有可检测的结合蛋白活性，优选为能结合CA50的抗体的活性。“功能性衍生物”可以包含“变体”和“片段”，因其具有与本发明所述的结合蛋白完全相同的CDR序列，因此具有相类似的生物活性。

在一些实施方式中，所述抗原结合结构域与下述氨基酸序列的互补决定区具有至少85％，或90％，或91％，或92％，或93％，或94％，或95％，或96％，或97％，或98％，或99％的序列同一性且与CA50具有KD≤8.75×10^-8mol/L，KD值也可以选择6.46×10^-8mol/L、2.70×10^-8mol/L、1.60×10^-8mol/L、9.11×10^-9mol/L、7.54×10^-9mol/L、6.32×10^-9mol/L、3.42×10^-9mol/L、9.76×10^-10mol/L、7.54×10^-10mol/L、5.71×10^-10mol/L、5.03×10^-10mol/L、1.95×10^-10mol/L、或者1.95×10^-10mol/L≤KD≤8.75×10^-8mol/L，或者1.95×10^-10mol/L≤KD≤9.79×10^-9mol/L。

其中，亲和力按照本发明说明书中的方法测定。

在一些实施方式中，

所述互补决定区CDR-VH1中，X3是M；

所述互补决定区CDR-VH2中，X3是Y；

所述互补决定区CDR-VH3中，X2是A；

所述互补决定区CDR-VL1中，X1是D；

所述互补决定区CDR-VL2中，X1是A；

所述互补决定区CDR-VL3中，X2是E。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH1中，X1是I，X2是S。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH1中，X1是I，X2是T。在一些实施方式中，

所述互补决定区CDR-VH1中，X1是V，X2是S。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH1中，X1是V，X2是T。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH1中，X1是L，X2是S。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH1中，X1是L，X2是T。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X1是Q，X2是D。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X1是Q，X2是E。在一些实施方式中，

所述互补决定区CDR-VH2中，X1是Q，X2是N。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X1是N，X2是D。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X1是N，X2是E。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH2中，X1是N，X2是N。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是I。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是L。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VH3中，X1是V。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X2是L，X3是I。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X2是I，X3是I。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X2是L，X3是L。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL1中，X2是I，X3是L。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是K，X3是I。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是K，X3是V。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是K，X3是L。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是R，X3是I。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是R，X3是V。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL2中，X2是R，X3是L。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是Q，X3是I。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是Q，X3是L。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是N，X3是I。

在一些实施方式中，所述互补决定区CDR-VL3中，X1是N，X3是L。

在一些实施方式中，各互补决定区的突变位点选自下述突变组合中的任一种：

在一些实施方式中，所述结合蛋白中包括至少3个CDRs；或者，所述结合蛋白包括至少6个CDRs。

在一些实施方式中，所述结合蛋白为包含可变区和恒定区的完整抗体。

在一些实施方式中，所述结合蛋白为纳米抗体、F(ab’)2、Fab’、Fab、Fv、scFv、双特异抗体和抗体最小识别单位中的一种。

在一些实施方式中，所述结合蛋白包括序列依次如SEQ ID NO:1-4所示的轻链骨架区FR-L1、FR-L2、FR-L3及FR-L4，和/或，序列依次如SEQ ID NO:5-8所示的重链骨架区FR-H1、FR-H2、FR-H3及FR-H4。

在一些实施方式中，所述结合蛋白还包含抗体恒定区序列。

在一些实施方式中，所述恒定区序列选自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE、IgD任何其中之一恒定区的序列。

在一些实施方式中，所述恒定区的种属来源为牛、马、乳牛、猪、绵羊、山羊、大鼠、小鼠、狗、猫、兔、骆驼、驴、鹿、貂、鸡、鸭、鹅、火鸡、斗鸡或人。

在一些实施方式中，所述恒定区来源于小鼠；

轻链恒定区序列如SEQ ID NO:9所示；

重链恒定区序列如SEQ ID NO:10所示。

本发明还提供了一种分离的核酸，所述核酸编码上述的结合蛋白。

在本文中，核酸包含其保守置换的变体(例如简并密码子的置换)和互补序列。术语“核酸”和“多核苷酸”是同义的，包含基因、cDNA分子、mRNA分子以及它们的片段例如寡核苷酸。

本发明还提供了一种载体，所述载体包含上述的核酸。

其中的核酸序列与至少一种调节序列可操作连接。“可操作连接”指的是编码序列以允许编码序列的表达的方式与调节序列连接。调节序列选择用来在合适的宿主细胞中指导目的蛋白质的表达，包含启动子、增强子和其它的表达调控元件。

在本文中，载体可以指包含本发明的核酸或其片段的、能够携带遗传信息并且可以将遗传信息递送到细胞中的分子或试剂。典型的载体包括质粒、病毒、噬菌体、黏粒和微型染色体。载体可以是克隆载体(即用于将遗传信息转移到细胞中的载体，可以繁殖所述细胞并且可以选择存在或不存在所述遗传信息的所述细胞)或表达载体(即包含必要的遗传元件从而允许所述载体的遗传信息在细胞中表达的载体)。因此，克隆载体可以包含选择标记，以及与所述克隆载体所指定的细胞类型相匹配的复制起点，而表达载体则包含对于影响指定靶细胞中的表达必要的调节元件。

本发明的核酸或其片段可以插入到合适的载体中以形成携带本发明核酸片段的克隆载体或表达载体。这种新载体也是本发明的一部分。所述载体可以包括质粒、噬菌体、黏粒、微型染色体或病毒，也包括只在特定细胞中瞬时表达的裸DNA。本发明克隆载体和表达载体能够自发的复制，因此能够为用于随后克隆的高水平表达或高水平复制目的提供高拷贝数。表达载体可以包括用于驱动本发明的核酸片段表达的启动子，可选的编码使所述肽表达产物分泌或整合到膜上的信号肽的核酸序列，本发明的核酸片段，以及可选的编码终止子的核酸序列。当在生产菌株或细胞系中操作表达载体时，载体引入到宿主细胞中时可以整合到宿主细胞的基因组中，也可以不能被整合到宿主细胞基因组中。载体通常携带复制位点，以及能够在转化细胞中提供表型选择的标记序列。

本发明的表达载体用于转化宿主细胞。这种转化细胞也是本发明的一部分，可以是用于增殖本发明的核酸片段和载体、或用于重组制备本发明的多肽的培养细胞或细胞系。本发明的转化细胞包括微生物如细菌(如大肠杆菌、芽抱杆菌等)。宿主细胞也包括来自多细胞生物如真菌、昆虫细胞、植物细胞或哺乳动物细胞，优选来自哺乳动物的细胞，例如CHO细胞。所述转化细胞能够复制本发明的核酸片段。当重组制备本发明的肽组合时，所述表达产物可以输出到培养基中或携带在所述转化细胞的表面。

本发明还提供了一种生产上述结合蛋白的方法，包括如下步骤：

在培养基中培养上述的宿主细胞，从培养基中或从所培养的宿主细胞中回收产生的结合蛋白。

所述方法可以是例如，用编码至少一部分结合蛋白的核酸载体转染宿主细胞，在合适的条件下培养该宿主细胞使其表达该结合蛋白。宿主细胞也可以用一个或多个表达载体转染，该表达载体可以单独或结合地包含编码至少一部分结合蛋白的DNA。利用常规的纯化蛋白质和肽的技术可从培养基或细胞裂解物中分离结合蛋白，所述技术包括硫酸铵沉淀，层析(如离子交换，凝胶过滤，亲合层析等)和/或电泳。

构建合适的含有目的编码和调控序列的载体可以使用本领域公知的标准连接和限制技术进行。将分离的质粒、DNA序列或合成的寡核苷酸按需要的形式切割、加尾和再连接。可以用任何方法向编码序列中引入突变以产生本发明的变体，这些突变可以包含缺失或插入或置换等。

本发明也提供抗体，能与CA50的表位发生反应，包含单克隆的和多克隆的抗体。该抗体可以含有完整的结合蛋白，或其片段或衍生物。优选的抗体含有全部或部分的结合蛋白。

本发明还提供了上述的结合蛋白在制备用于诊断胰腺癌、结肠癌、直肠癌、胃癌的诊断剂或试剂盒中的应用。

本发明还提供了一种试剂盒，所述试剂盒包括上述的结合蛋白、上述的分离的核酸或上述的载体中的一种或多种。

优选地，所述试剂盒还包括用于标记所述结合蛋白的标记物。

根据本发明的一方面，本发明还涉及一种检测测试样品中的CA50抗原的方法，其包括：

a)在足以发生抗体/抗原结合反应的条件下，使所述测试样品中的CA50抗原与权利要求如上所述的结合蛋白接触以形成免疫复合物；和

b)检测所述免疫复合物的存在，所述复合物的存在指示所述测试样品中所述CA50抗原的存在；

在此实施方式中，所述结合蛋白可以标记由显示信号强度的指示剂，以使得所述复合物容易被检测。

在一些实施方式中，在步骤a)中，所述免疫复合物中还包括第二抗体，所述第二抗体与所述结合蛋白结合；

在此实施方式中，所述结合蛋白以第一抗体的形式与所述第二抗体形成配对抗体，用于结合CA50的不同抗原表位；

所述的第二抗体可以标记由显示信号强度的指示剂，以使得所述复合物容易被检测。

在一些实施方式中，在步骤a)中，所述免疫复合物中还包括第二抗体，所述第二抗体与所述CA50抗原结合；

在此实施方式中，所述结合蛋白作为所述第二抗体的抗原，所述的第二抗体可以标记由显示信号强度的指示剂，以使得所述复合物容易被检测。

在一些实施方式中，所述显示信号强度的指示剂包括荧光物质、量子点、地高辛标记探针、生物素、放射性同位素、放射性造影剂、顺磁离子荧光微球、电子致密物质、化学发光标记物、超声造影剂、光敏剂、胶体金或酶中的任一种。

在一些实施方式中，所述荧光物质包括Alexa 350、Alexa 405、Alexa 430、Alexa488、Alexa 555、Alexa 647、AMCA、氨基吖啶、BODIPY 630/650、BODIPY 650/665、BODIPY-FL、BODIPY-R6G、BODIPY-TMR、BODIPY-TRX、5-羧基-4′，5′-二氯-2′，7′-二甲氧基荧光素、5-羧基-2′，4′，5′，7′-四氯荧光素、5-羧基荧光素、5-羧基罗丹明、6-羧基罗丹明、6-羧基四甲基罗丹明、Cascade Blue、Cy2、Cy3、Cy5、Cy7、6-FAM、丹磺酰氯、荧光素、HEX、6-JOE、NBD(7-硝基苯并-2-氧杂-1，3-二唑)、Oregon Green 488、Oregon Green 500、Oregon Green514、Pacific Blue、邻苯二甲酸、对苯二甲酸、间苯二甲酸、甲酚固紫、甲酚蓝紫、亮甲酚蓝、对氨基苯甲酸、赤藓红、酞菁、偶氮甲碱、花青、黄嘌呤、琥珀酰荧光素、稀土金属穴状化合物、三双吡啶基二胺铕、铕穴状化合物或螯合物、二胺、双花青苷、La Jolla蓝染料、别藻蓝蛋白、allococyanin B、藻蓝蛋白C、藻蓝蛋白R、硫胺、藻红青蛋白、藻红蛋白R、REG、罗丹明绿、罗丹明异硫氰酸酯、罗丹明红、ROX、TAMRA、TET、TRIT(四甲基罗丹明异硫醇)、四甲基罗丹明和德克萨斯红中的任一种。

在一些实施方式中，所述放射性同位素包括¹¹⁰In、¹¹¹In、¹⁷⁷Lu、¹⁸F、⁵²Fe、⁶²Cu、⁶⁴Cu、⁶⁷Cu、⁶⁷Ga、⁶⁸Ga、⁸⁶Y、⁹⁰Y、⁸⁹Zr、⁹⁴mTc、⁹⁴Tc、⁹⁹mTc、¹²⁰I、¹²³I、¹²⁴I、¹²⁵I、¹³¹I、^154-158Gd、³²P、¹¹C、¹³N、¹⁵O、¹⁸⁶Re、¹⁸⁸Re、⁵¹Mn、⁵²mMn、⁵⁵Co、⁷²As、⁷⁵Br、⁷⁶Br、⁸²mRb和⁸³Sr中的任一种。

在一些实施方式中，所述酶包括辣根过氧化酶、碱性磷酸酶和葡萄糖氧化酶中的任一种。

在一些实施方式中，所述荧光微球为：聚苯乙烯荧光微球，内部包裹有稀土荧光离子铕。

如在一些实施方案中，本发明提供用于确定例如直肠癌的受试者中的CA50存在的试剂盒，所述试剂盒包含至少一种本发明提供的结合蛋白，相关的缓冲剂，用于使液体样品与所述结合蛋白反应所需的试剂，以及用于确定CA50和结合蛋白之间存在阳性或阴性结合反应的试剂。为了确定CA50的存在，所述试剂盒可以例如利用带有标记的结合蛋白作为抗体，其中所述标记可以是任何合适的标记，如胶体金标记。

下文提供了一些实例用于示例性说明本发明，而不是限制本发明的范围。

实施例1

本实施例中限制性内切酶、Prime Star DNA聚合酶购自Takara公司。MagExtractor-RNA提取试剂盒购自TOYOBO公司。BD SMART^TM RACE cDNA AmplificationKit试剂盒购自Takara公司。pMD-18T载体购自Takara公司。质粒提取试剂盒购自天根公司。引物合成和基因测序由Invitrogen公司完成。分泌Anti-CA50 8D10单克隆抗体的杂交瘤细胞株为本申请人已有的杂交瘤细胞株，复苏备用。

1、引物

扩增Heavy Chain和Light Chain 5’RACE引物：

SMARTER II A Oligonucleotide：

5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGTACXXXXX-3’；

5'-RACE CDS Primer(5'-CDS)：5'-(T)₂₅VN-3’(N＝A,C,G,orT；V＝A,G,orC)；

Universal Primer A Mix(UPM)：5’-

CTAATACGACTCACTATAGGGCAAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’；

Nested Universal Primer A(NUP)：5’-AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT-3’；

mIg-KR：5’-CTAACACTCATTCCTGTTGAAGCTCTTGACAAT-3’；

mIg-HR：5’-GGGGAATTCTCATTAATAACAGGTGCCGCCTGTATC-3’。

2、抗体可变区基因克隆及测序

从分泌Anti-CA50 8D10单克隆抗体的杂交瘤细胞株中提取中RNA，用SMARTERTMRACEcDNA Amplification Kit试剂盒及试剂盒中的SMARTER II A Oligonucleotide和5'-CDS引物进行第一链cDNA合成，获得的第一链cDNA产物作为PCR扩增模板。Light Chain基因以Universal Primer AMix(UPM)、Nested Universal Primer A(NUP)和mIg-KR引物进行扩增，Heavy Chain基因以UniversalPrimer A Mix(UPM)、Nested Universal Primer A(NUP)和mIg-HR引物进行扩增。其中Light Chain的引物对扩增出0.8KB左右的目的条带，HeavyChain的引物对扩增出1.8 KB左右的目的条带。用琼脂糖凝胶电泳纯化回收，产物用rTaqDNA聚合酶进行加A反应后插入到pMD-18T载体中，转化到DH5α感受态细胞中，长出菌落后分别取Heavy Chain及Light Chain基因克隆4个克隆送Invitrogen公司进行测序。

3、Anti-CA50 8D10抗体可变区基因的序列分析

将上述测序得到的基因序列放在IMGT抗体数据库中进行分析，并利用VNTI11.5软件进行分析确定重链和轻链引物对扩增出的基因都是正确的，其中Light Chain扩增出的基因片段中，VL基因序列为342bp，属于VkII基因家族，其前方有57bp的前导肽序列；HeavyChain引物对扩增出的基因片段中，VH基因序列为345 bp，属于VH1基因家族，其前方有57bp的前导肽序列。

4、重组抗体表达质粒的构建

pcDNA^TM 3.4

vector为构建的重组抗体真核表达载体，该表达载体已经引入HindIII、BamHI、EcoRI等多克隆酶切位点，并命名为pcDNA 3.4A表达载体，后续简称3.4A表达载体；据上述pMD-18T中抗体可变区基因测序结果，设计Anti-CA50 8D10抗体的VL和VH基因特异性引物，两端分别带有HindIII、EcoRI酶切位点和保护碱基，引物如下：CA50-8D10-HF：5’>CCCAAGCTTGCCGCCACCATGGAATGGAGCTGTGTAATGCTCTTCTTG<3’；

CA50-8D10-HR:

5’>GGGGAATTCTCATTAATAACAGGTGCCGCCTGTATC<3’；

CA50-8D10-LF:

5’>CCCAAGCTTGCCGCCACCATGGTATTCACACCTCATATCC<3’；

CA50-8D10-LR:

5’>CCCGAATTCCTAACACTCATTCCTGTTGAAGCTCTTGACAA<3’。

通过PCR扩增方法扩出0.72KB的Light Chain基因片段和1.8KB的Heavy Chain基因片段。HeavyChain和Light Chain基因片段分别采用HindIII/EcoRI双酶切，3.4A载体采用HindIII/EcoRI双酶切，将片段和载体纯化回收后Heavy Chain基因和Light Chain基因分别连接3.4A表达载体中，分别得到Heavy Chain和Light Chain的重组表达质粒。

5、筛选稳定细胞株

5.1重组抗体表达质粒瞬时转染CHO细胞，确定表达质粒活性

质粒用超纯水稀释至400ng/ml，调节CHO细胞1.43×10⁷cells/ml于离心管中，100μl质粒与700μl细胞混合，转入电转杯，电转，第3、5、7天取样计数，第7天收样检测。

包被液稀释CA50蛋白(fitzgerald,30R-AP039)到指定浓度，每孔100μL，4℃过夜；次日，洗涤液清洗2次，拍干；加入封闭液(20％BSA+80％PBS)，每孔120μL，37℃，1h，拍干；加入稀释后的细胞上清，100μL/孔，37℃,30min(部分上清1h)；洗涤液清洗5次，拍干；加入羊抗鼠IgG-HRP，每孔100μL，37℃,30min；洗涤液清洗5次，拍干；加入显色液A液(50μL/孔)，加入显色液B液(50μL/孔)，10min；加入终止液，50μL/孔；酶标仪上450nm(参考630nm)处读OD值。结果显示细胞上清稀释1000倍后反应OD仍大于1.0，未加细胞上清孔反应OD小于0.1，表明质粒瞬转后产生的抗体对CA50蛋白都有活性。

5.2重组抗体表达质粒线性化

准备下述试剂：Buffer 50μl、DNA 100μg/管、PuvⅠ酶10μl、无菌水补至500μl，37℃水浴酶切过夜；先用等体积酚/氯仿/异戊醇(下层)25:24:1，再用氯仿(水相)依次进行抽提；0.1倍体积(水相)3M醋酸钠和2倍体积乙醇冰上沉淀，70％乙醇漂洗沉淀，去除有机溶剂，待乙醇挥发完全用适量的灭菌水进行复融，最后进行浓度的测定。

5.3重组抗体表达质粒稳定转染，加压筛选稳定细胞株：

质粒用超纯水稀释至400ng/ml，调节CHO细胞1.43×10⁷cells/ml于离心管中，100μl质粒与700μl细胞混合，转入电转杯，电转，次日计数；25μmol/L MSX 96孔加压培养约25天。

显微镜下观察标记长有细胞的克隆孔,并记录汇合度；取培养上清，送样检测；挑选抗体浓度、相对浓度高的细胞株转24孔，3天左右转6孔；3天后保种批培，调整细胞密度0.5×10⁶cells/ml，2.2ml进行批培养，细胞密度0.3×10⁶cells/ml，2ml进行保种；7天6孔批培上清送样检测，挑选抗体浓度及细胞直径较小的细胞株转TPP保种传代。

6、生产重组抗体

6.1细胞扩培

细胞复苏之后先在125ml规格的摇瓶中培养，接种体积为30ml，培养基为100％Dynamis培养基，放置于转速120r/min，温度为37℃，二氧化碳为8％的摇床中。培养72h，以50万cells/ml接种密度接种扩培，扩培体积根据生产需求进行计算，培养基为100％Dynamis培养基。之后每72h扩培一次。当细胞量满足生产需求时，严格控制接种密度为50万cells/ml左右进行生产。

6.2摇瓶生产及纯化

摇瓶参数：转速120r/min，温度为37℃，二氧化碳为8％。流加补料：在摇瓶中培养至72h时开始每天补料，HyCloneTM Cell BoostTM Feed 7a每天流加初始培养体积的3％，Feed 7b每天流加量为初始培养体积的千分之一，一直补到第12天(第12天补料)。葡萄糖在第六天补加3g/L。第13天收样。用proteinA亲和层析柱进行亲和纯化。取4μg纯化的抗体进行还原性SDS-PAGE，4μg外来对照抗体作为对照，电泳图如图1所示。在还原性SDS-PAGE后显示两条带，1条为25KD左右的轻链(序列如SEQ ID NO:11所示)，另一条为60KD左右的重链(序列如SEQ ID NO:12所示)。

实施例2

实施例1得到的抗体(具有序列如SEQ ID NO:11以及12所示的轻链和重链)虽然具备结合CA50的能力，但亲和力和抗体活性均不够理想，因而申请人通过对该抗体的轻链CDR及重链CDR进行突变。

经分析，重链的互补决定区(WT)：

CDR-VH1为G-I(X1)-T-F-S(X2)-D-A-F(X3)-M-D；

CDR-VH2为I-G-Q(X1)-N-G-N-D(X2)-H-A-T-Y-F(X3)-A-E-S-V；

CDR-VH3为T-L(X1)-R-F-P(X2)-Y；

轻链的互补决定区：

CDR-VL1为Q-E(X1)-L(X2)-N-S-Y-L(X3)-S；

CDR-VL2为R-P(X1)-K-K(X2)-L-I(X3)-D；

CDR-VL3为L-N(X1)-Y-D-D(X2)-I(X3)-P-R-T；

其中，X1、X2、X3均为突变位点。

表1与抗体活性有关的突变位点

在突变后对抗体活性进行检测，包被液稀释HCA50(fitzgerald,30R-AP039)到3μg/ml进行微孔板包被，每孔100μL，4℃过夜；次日，洗涤液清洗2次，拍干；加入封闭液(20％BSA+80％PBS)，每孔120μL，37℃，1h，拍干；加入稀释后的HCA50单克隆抗体，100μL/孔，37℃,30min(部分上清1h)；洗涤液清洗5次，拍干；加入羊抗鼠IgG-HRP，每孔100μL，37℃,30min；洗涤液清洗5次，拍干；加入显色液A液(50μL/孔)，加入显色液B液(50μL/孔)，10min；加入终止液，50μL/孔；酶标仪上450nm(参考630nm)处读OD值。

部分结果如下：

表2抗体活性分析数据

浓度(ng/ml)	WT	突变1	突变2	突变3	突变4	突变5
							37.037	1.992	2.227	2.179	2.134	1.547	1.604
12.346	1.727	2.242	1.969	1.898	0.845	0.798
							4.115	0.837	1.938	1.373	1.067	0.304	0.287
1.372	0.308	1.299	0.607	0.416	0.105	0.097
							0	0	0.021	0.049	0.014	0.021	0.011

亲和力分析

利用AMC传感器，纯化出来的抗体用PBST稀释到10μg/ml，CA50腹水标本(8.2KU/ml)用PBST进行梯度稀释：200U/ml、100U/ml、50U/ml、25U/ml、12.5U/ml、6.25U/ml、3.13U/ml、0U/ml。

运行流程：缓冲液1(PBST)中平衡60s，抗体溶液中固化抗体300s，缓冲液2(PBST)中孵育180s，抗原溶液中结合420s，缓冲液2中解离1200s，用10mM pH 1.69GLY溶液及缓冲液3进行传感器再生，输出数据。KD表示平衡解离常数即亲和力；Kon表示结合速率；Kdis表示解离速率。计算时假定CA50腹水标本1U/ml相当于1nmol/ml。

表3亲和力分析数据

从表2和表3可知，突变1的活性效果和亲和力最佳，因而以突变1作为骨架序列筛选效价较好的突变位点(保证筛选得到的抗体活性与突变1相近，抗体活性±10％)，部分结果如下。

表4与抗体亲和力有关的突变位点

亲和力分析，方法同上，结果如表5所示。

表5亲和力分析数据

从表5可以看出，表4中列出的突变位点对抗体的亲和力影响不大。

为验证上述结果，以WT作为骨架序列重复上述实验，进行突变位点的亲和力验证，部分结果如下。

表6以WT为骨架进行的突变

表7亲和力分析数据

不同突变	KD(M)	Kon(1/Ms)	Kdis(1/S)
				WT	3.41E-08	2.59E+04	8.83E-04
WT 1-1	5.55E-08	5.06E+04	2.81E-03
				WT 1-2	6.46E-08	3.70E+04	2.39E-03
WT 1-3	1.60E-08	6.31E+04	1.01E-03
				WT 1-4	2.70E-08	5.09E+04	1.37E-03
WT 1-5	8.75E-08	4.28E+04	3.75E-03
				WT 1-6	5.08E-08	3.44E+04	1.75E-03

从表6和表7分析，表6中列出的突变位点对抗体的亲和力影响也不大。

最后应说明的是：以上各实施例仅用以说明本发明的技术方案，而非对其限制；尽管参照前述各实施例对本发明进行了详细的说明，本领域的普通技术人员应当理解：其依然可以对前述各实施例所记载的技术方案进行修改，或者对其中部分或者全部技术特征进行等同替换；而这些修改或者替换，并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围。

SEQUENCE LISTING

<110> 东莞市朋志生物科技有限公司

<120> 一种抗CA50的抗体及其应用

<130> 2010

<160> 12

<170> PatentIn version 3.3

<210> 1

<211> 26

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 1

Asp Ile Lys Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Met Tyr Ala Ser Leu Gly

1 5 10 15

Glu Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser

20 25

<210> 2

<211> 15

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 2

Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Lys Thr Leu Ile Tyr

1 5 10 15

<210> 3

<211> 32

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 3

Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Gln Asp Tyr Ser

1 5 10 15

Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Tyr Glu Asp Met Gly Ile Tyr Tyr Cys

20 25 30

<210> 4

<211> 10

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 4

Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Val Lys

1 5 10

<210> 5

<211> 25

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 5

Glu Val Lys Leu Glu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Met Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser

20 25

<210> 6

<211> 15

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 6

Trp Val Arg Gln Ser Pro Glu Lys Gly Leu Glu Trp Val Ala Glu

1 5 10 15

<210> 7

<211> 32

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 7

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Ser Ser Val Tyr

1 5 10 15

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Gly Ile Tyr Tyr Cys

20 25 30

<210> 8

<211> 11

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 8

Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ala

1 5 10

<210> 9

<211> 107

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 9

Arg Ala Asp Ala Ala Pro Thr Val Ser Ile Phe Pro Pro Ser Ser Glu

1 5 10 15

Gln Leu Thr Ser Gly Gly Ala Ser Val Val Cys Phe Leu Asn Asn Phe

20 25 30

Tyr Pro Lys Asp Ile Asn Val Lys Trp Lys Ile Asp Gly Ser Glu Arg

35 40 45

Gln Asn Gly Val Leu Asn Ser Trp Thr Asp Gln Asp Ser Lys Asp Ser

50 55 60

Thr Tyr Ser Met Ser Ser Thr Leu Thr Leu Thr Lys Asp Glu Tyr Glu

65 70 75 80

Arg His Asn Ser Tyr Thr Cys Glu Ala Thr His Lys Thr Ser Thr Ser

85 90 95

Pro Ile Val Lys Ser Phe Asn Arg Asn Glu Cys

100 105

<210> 10

<211> 455

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 10

Glu Ser Gln Ser Phe Pro Asn Val Phe Pro Leu Val Ser Cys Glu Ser

1 5 10 15

Pro Leu Ser Asp Lys Asn Leu Val Ala Met Gly Cys Leu Ala Arg Asp

20 25 30

Phe Leu Pro Ser Thr Ile Ser Phe Thr Trp Asn Tyr Gln Asn Asn Thr

35 40 45

Glu Val Ile Gln Gly Ile Arg Thr Phe Pro Thr Leu Arg Thr Gly Gly

50 55 60

Lys Tyr Leu Ala Thr Ser Gln Val Leu Leu Ser Pro Lys Ser Ile Leu

65 70 75 80

Glu Gly Ser Asp Glu Tyr Leu Val Cys Lys Ile His Tyr Gly Gly Lys

85 90 95

Asn Arg Asp Leu His Val Pro Ile Pro Ala Val Ala Glu Met Asn Pro

100 105 110

Asn Val Asn Val Phe Val Pro Pro Arg Asp Gly Phe Ser Gly Pro Ala

115 120 125

Pro Arg Lys Ser Lys Leu Ile Cys Glu Ala Thr Asn Phe Thr Pro Lys

130 135 140

Pro Ile Thr Val Ser Trp Leu Lys Asp Gly Lys Leu Val Glu Ser Gly

145 150 155 160

Phe Thr Thr Asp Pro Val Thr Ile Glu Asn Lys Gly Ser Thr Pro Gln

165 170 175

Thr Tyr Lys Val Ile Ser Thr Leu Thr Ile Ser Glu Ile Asp Trp Leu

180 185 190

Asn Leu Asn Val Tyr Thr Cys Arg Val Asp His Arg Gly Leu Thr Phe

195 200 205

Leu Lys Asn Val Ser Ser Thr Cys Ala Ala Ser Pro Ser Thr Asp Ile

210 215 220

Leu Thr Phe Thr Ile Pro Pro Ser Phe Ala Asp Ile Phe Leu Ser Lys

225 230 235 240

Ser Ala Asn Leu Thr Cys Leu Val Ser Asn Leu Ala Thr Tyr Glu Thr

245 250 255

Leu Asn Ile Ser Trp Ala Ser Gln Ser Gly Glu Pro Leu Glu Thr Lys

260 265 270

Ile Lys Ile Met Glu Ser His Pro Asn Gly Thr Phe Ser Ala Lys Gly

275 280 285

Val Ala Ser Val Cys Val Glu Asp Trp Asn Asn Arg Lys Glu Phe Val

290 295 300

Cys Thr Val Thr His Arg Asp Leu Pro Ser Pro Gln Lys Lys Phe Ile

305 310 315 320

Ser Lys Pro Asn Glu Val His Lys His Pro Pro Ala Val Tyr Leu Leu

325 330 335

Pro Pro Ala Arg Glu Gln Leu Asn Leu Arg Glu Ser Ala Thr Val Thr

340 345 350

Cys Leu Val Lys Gly Phe Ser Pro Ala Asp Ile Ser Val Gln Trp Leu

355 360 365

Gln Arg Gly Gln Leu Leu Pro Gln Glu Lys Tyr Val Thr Ser Ala Pro

370 375 380

Met Pro Glu Pro Gly Ala Pro Gly Phe Tyr Phe Thr His Ser Ile Leu

385 390 395 400

Thr Val Thr Glu Glu Glu Trp Asn Ser Gly Glu Thr Tyr Thr Cys Val

405 410 415

Val Gly His Glu Ala Leu Pro His Leu Val Thr Glu Arg Thr Val Asp

420 425 430

Lys Ser Thr Gly Lys Pro Thr Leu Tyr Asn Val Ser Leu Ile Met Ser

435 440 445

Asp Thr Gly Gly Thr Cys Tyr

450 455

<210> 11

<211> 214

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 11

Asp Ile Lys Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Met Tyr Ala Ser Leu Gly

1 5 10 15

Glu Arg Val Thr Ile Thr Cys Lys Ala Ser Gln Glu Leu Asn Ser Tyr

20 25 30

Leu Ser Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ser Pro Lys Thr Leu Ile

35 40 45

Tyr Arg Pro Lys Lys Leu Ile Asp Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Gln Asp Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Ser Leu Glu Tyr

65 70 75 80

Glu Asp Met Gly Ile Tyr Tyr Cys Leu Asn Tyr Asp Asp Ile Pro Arg

85 90 95

Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Val Lys Arg Ala Asp Ala Ala

100 105 110

Pro Thr Val Ser Ile Phe Pro Pro Ser Ser Glu Gln Leu Thr Ser Gly

115 120 125

Gly Ala Ser Val Val Cys Phe Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Lys Asp Ile

130 135 140

Asn Val Lys Trp Lys Ile Asp Gly Ser Glu Arg Gln Asn Gly Val Leu

145 150 155 160

Asn Ser Trp Thr Asp Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Met Ser

165 170 175

Ser Thr Leu Thr Leu Thr Lys Asp Glu Tyr Glu Arg His Asn Ser Tyr

180 185 190

Thr Cys Glu Ala Thr His Lys Thr Ser Thr Ser Pro Ile Val Lys Ser

195 200 205

Phe Asn Arg Asn Glu Cys

210

<210> 12

<211> 570

<212> PRT

<213> Mus musculus

<400> 12

Glu Val Lys Leu Glu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly

1 5 10 15

Ser Met Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Ile Thr Phe Ser Asp Ala

20 25 30

Phe Met Asp Trp Val Arg Gln Ser Pro Glu Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ala Glu Ile Gly Gln Asn Gly Asn Asp His Ala Thr Tyr Phe Ala Glu

50 55 60

Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Ser Ser

65 70 75 80

Val Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Gly Ile Tyr

85 90 95

Tyr Cys Thr Leu Arg Phe Pro Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr

100 105 110

Val Ser Ala Glu Ser Gln Ser Phe Pro Asn Val Phe Pro Leu Val Ser

115 120 125

Cys Glu Ser Pro Leu Ser Asp Lys Asn Leu Val Ala Met Gly Cys Leu

130 135 140

Ala Arg Asp Phe Leu Pro Ser Thr Ile Ser Phe Thr Trp Asn Tyr Gln

145 150 155 160

Asn Asn Thr Glu Val Ile Gln Gly Ile Arg Thr Phe Pro Thr Leu Arg

165 170 175

Thr Gly Gly Lys Tyr Leu Ala Thr Ser Gln Val Leu Leu Ser Pro Lys

180 185 190

Ser Ile Leu Glu Gly Ser Asp Glu Tyr Leu Val Cys Lys Ile His Tyr

195 200 205

Gly Gly Lys Asn Arg Asp Leu His Val Pro Ile Pro Ala Val Ala Glu

210 215 220

Met Asn Pro Asn Val Asn Val Phe Val Pro Pro Arg Asp Gly Phe Ser

225 230 235 240

Gly Pro Ala Pro Arg Lys Ser Lys Leu Ile Cys Glu Ala Thr Asn Phe

245 250 255

Thr Pro Lys Pro Ile Thr Val Ser Trp Leu Lys Asp Gly Lys Leu Val

260 265 270

Glu Ser Gly Phe Thr Thr Asp Pro Val Thr Ile Glu Asn Lys Gly Ser

275 280 285

Thr Pro Gln Thr Tyr Lys Val Ile Ser Thr Leu Thr Ile Ser Glu Ile

290 295 300

Asp Trp Leu Asn Leu Asn Val Tyr Thr Cys Arg Val Asp His Arg Gly

305 310 315 320

Leu Thr Phe Leu Lys Asn Val Ser Ser Thr Cys Ala Ala Ser Pro Ser

325 330 335

Thr Asp Ile Leu Thr Phe Thr Ile Pro Pro Ser Phe Ala Asp Ile Phe

340 345 350

Leu Ser Lys Ser Ala Asn Leu Thr Cys Leu Val Ser Asn Leu Ala Thr

355 360 365

Tyr Glu Thr Leu Asn Ile Ser Trp Ala Ser Gln Ser Gly Glu Pro Leu

370 375 380

Glu Thr Lys Ile Lys Ile Met Glu Ser His Pro Asn Gly Thr Phe Ser

385 390 395 400

Ala Lys Gly Val Ala Ser Val Cys Val Glu Asp Trp Asn Asn Arg Lys

405 410 415

Glu Phe Val Cys Thr Val Thr His Arg Asp Leu Pro Ser Pro Gln Lys

420 425 430

Lys Phe Ile Ser Lys Pro Asn Glu Val His Lys His Pro Pro Ala Val

435 440 445

Tyr Leu Leu Pro Pro Ala Arg Glu Gln Leu Asn Leu Arg Glu Ser Ala

450 455 460

Thr Val Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Ser Pro Ala Asp Ile Ser Val

465 470 475 480

Gln Trp Leu Gln Arg Gly Gln Leu Leu Pro Gln Glu Lys Tyr Val Thr

485 490 495

Ser Ala Pro Met Pro Glu Pro Gly Ala Pro Gly Phe Tyr Phe Thr His

500 505 510

Ser Ile Leu Thr Val Thr Glu Glu Glu Trp Asn Ser Gly Glu Thr Tyr

515 520 525

Thr Cys Val Val Gly His Glu Ala Leu Pro His Leu Val Thr Glu Arg

530 535 540

Thr Val Asp Lys Ser Thr Gly Lys Pro Thr Leu Tyr Asn Val Ser Leu

545 550 555 560

Ile Met Ser Asp Thr Gly Gly Thr Cys Tyr

565 570

Claims

1.一种包含抗原结合结构域的分离的结合蛋白，其特征在于，所述抗原结合结构域包括互补决定区CDR-VH1、互补决定区CDR-VH2、互补决定区CDR-VH3、互补决定区CDR-VL1、互补决定区CDR-VL2和互补决定区CDR-VL3，所述抗原为CA50；

互补决定区CDR-VH1为G-X1-T-F-X2-D-A-M-M-D，其中，X1是I、V或L，X2是S或T；

互补决定区CDR-VH2为I-G-X1-N-G-N-X2-H-A-T-Y-Y-A-E-S-V，其中，X1是Q或N，X2是D、E或N；

互补决定区CDR-VH3为T-X1-R-F-A-Y，其中，X1是I、L或V；

互补决定区CDR-VL1为Q-D-X2-N-S-Y-X3-S，其中，X2是L或I，X3是I或L；

互补决定区CDR-VL2为R-A-K-X2-L-X3-D，其中，X2是K或R，X3是I、V或L；

互补决定区CDR-VL3为L-X1-Y-D-E-X3-P-R-T，其中，X1是Q或N，X3是I或L；

各互补决定区的突变位点选自下述突变组合中的任一种：

位点 CDR-VH1 X 1 / X 2 CDR-VH2 X 1 / X 2 CDR-VH3 X 1 CDR-VL1 X 2 / X 3 CDR-VL2 X 2 / X 3 CDR-VL3 X 1 / X 3 突变组合 1 I/S Q/D L L/L K/I N/I 突变组合 2 I/T Q/E I L/I K/V N/L 突变组合 3 V/S Q/N V I/L K/L Q/ L 突变组合 4 V/T N/D L I/I R/I Q/ I 突变组合 5 L/S N/E I L/L R/V N/ L 突变组合 6 L/T N/N V L/I R/L N/ I 突变组合 7 I/S Q/E L I/L K/I Q/ L 突变组合 8 I/T Q/N I I/I K/V Q/ I 突变组合 9 V/S Q /D V L/L K/L N/ L 突变组合 10 V/T N/E L L/I R/I N/ I 突变组合 11 L/S N/N I I/L R/V Q/ L 突变组合 12 L/T N /D V I/I R/L Q/ I 突变组合 13 I/S Q/N L L/I K/I N/ L 突变组合 14 I/T Q /D I I/L K/V N/ I 突变组合 15 V/S Q /E V I/I K/L Q/ L 突变组合 16 V/T N/N L L/L R/I Q/ I 突变组合 17 L/S N /D I L/I R/V N/ L 突变组合 18 L/T N /E V I/L R/L N/ I 突变组合 19 I/S Q /D L I/I K/I Q/ L 突变组合 20 I/T Q /E I L/L K/V Q/ I 突变组合 21 V/S Q /N V L/I K/L N/ L 突变组合 22 V/T N /D L I/L R/I N/ I 突变组合 23 L/S N /E I I/I R/V Q/ L 突变组合 24 L/T N /N V I/L R/L Q/ I 突变组合 25 I/S Q /E L I/I K/I N/ L 突变组合 26 I/T Q /N I L/L K/V N/ I 突变组合 27 V/S Q/D V L/I K/L Q/ L 突变组合 28 V/T N /E L I/L R/I Q/ I 突变组合 29 L/S N /N I I/I R/V N/ L 突变组合 30 L/T N/D V L/L R/L N/ I 突变组合 31 I/S Q /N L L/I K/V Q/ L 突变组合 32 I/T Q/D I I/L K/L Q/ I 突变组合 33 V/S Q/E V I/I R/I N/ L 突变组合 34 V/T Q/N L L/I R/V N/ I 突变组合 35 L/S N/D I I/L R/L Q/ L 突变组合 36 L/T N/E V I/I K/I Q/ I 突变组合 37 I/S N/E L L/I K/V N/ L 突变组合 38 I/T Q /N I I/L K/L N/ I 突变组合 39 V/S Q/D V I/I R/I Q/ L 突变组合 40 V/T Q/N L L/L R/V Q/ I 突变组合 41 L/S N/D I L/I R/L N/ L 突变组合 42 L/T N/E V I/L K/I N/ I 突变组合 43 I/S N/N L I/I K/L Q/ L 突变组合 44 I/T Q/D I L/I R/I Q/ I 突变组合 45 V/S Q/E V I/L R/V N/ L 突变组合 46 V/T Q /D L I/I R/L N/ I 突变组合 47 L/S N/E I L/I K/I Q/ L 突变组合 48 L/T N/N V I/L K/V Q/ I 突变组合 49 I/S N /D L L/L K/I N/ L

。

2.一种包含抗原结合结构域的分离的结合蛋白，其特征在于，所述抗原结合结构域包括互补决定区CDR-VH1、互补决定区CDR-VH2、互补决定区CDR-VH3、互补决定区CDR-VL1、互补决定区CDR-VL2和互补决定区CDR-VL3，所述抗原为CA50；

互补决定区CDR-VH1为G-X1-T-F-X2-D-A-F-M-D，其中，X1是I、V或L，X2是S或T；

互补决定区CDR-VH2为I-G-X1-N-G-N-X2-H-A-T-Y-F-A-E-S-V，其中，X1是Q或N，X2是D、E或N；

互补决定区CDR-VH3为T-X1-R-F-P-Y，其中，X1是I、L或V；

互补决定区CDR-VL1为Q-E-X2-N-S-Y-X3-S，其中，X2是L或I，X3是I或L；

互补决定区CDR-VL2为R-P-K-X2-L-X3-D，其中，X2是K或R，X3是I、V或L；

互补决定区CDR-VL3为L-X1-Y-D-D-X3-P-R-T，其中，X1是Q或N，X3是I或L；

各互补决定区的突变位点选自下述突变组合中的任一种：

位点 CDR-VH1 X 1 / X 2 CDR-VH2 X 1 / X 2 CDR-VH3 X 1 CDR-VL1 X 2 / X 3 CDR-VL2 X 2 / X 3 CDR-VL3 X 1 / X 3 WT I/S Q/D L L/L K/I N/I WT 1-1 I/T Q/E I L/I K/V N/L WT 1- 2 V/S Q/N V I/L K/L Q/ L WT 1- 3 V/T N/D L I/I R/I Q/ I WT 1- 4 L/S N/E I L/L R/V N/ L WT 1- 5 L/T N/N V L/I R/L N/ I WT 1- 6 I/S Q/E L I/L K/I Q/ L

。

3.根据权利要求1-2任一项所述的结合蛋白，其特征在于，所述结合蛋白为F(ab’)2、Fab’、Fab、Fv、scFv和双特异抗体中的一种。

4.根据权利要求1-2任一项所述的结合蛋白，其特征在于，所述结合蛋白包括序列依次如SEQ ID NO:1-4所示的轻链骨架区FR-L1、FR-L2、FR-L3及FR-L4，和/或，序列依次如SEQID NO:5-8所示的重链骨架区FR-H1、FR-H2、FR-H3及FR-H4。

5.根据权利要求4所述的结合蛋白，其特征在于，所述结合蛋白还包含抗体恒定区序列。

6.根据权利要求5所述的结合蛋白，其特征在于，所述恒定区序列选自IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA、IgM、IgE、IgD任何其中之一恒定区的序列。

7.根据权利要求5所述的结合蛋白，其特征在于，所述恒定区的种属来源为牛、马、猪、绵羊、山羊、大鼠、小鼠、狗、猫、兔、驴、鹿、貂、鸡、鸭、鹅、或人。

8.根据权利要求7所述的结合蛋白，其特征在于，所述牛选自乳牛；所述鸡选自火鸡或斗鸡。

9.根据权利要求7所述的结合蛋白，其特征在于，所述恒定区来源于小鼠；

轻链恒定区序列如SEQ ID NO:9所示；

重链恒定区序列如SEQ ID NO:10所示。

10.一种分离的核酸，其特征在于，所述核酸编码权利要求1-9任一项所述的结合蛋白。

11.一种载体，其特征在于，其包含权利要求10所述的核酸。

12.一种宿主细胞，其特征在于，所述宿主细胞包括权利要求10所述的核酸或权利要求11所述的载体。

13.一种生产权利要求1-9任一项所述的结合蛋白的方法，其特征在于，包括如下步骤：

在培养基中培养权利要求12所述的宿主细胞，从培养基中或从所培养的宿主细胞中回收产生的结合蛋白。

14.一种试剂盒，其特征在于，所述试剂盒包括权利要求1-9任一项所述的结合蛋白、权利要求10所述的分离的核酸或权利要求11所述的载体中的一种或多种。

15.根据权利要求14所述的试剂盒，其特征在于，所述试剂盒还包括用于标记所述结合蛋白的标记物。