CN110791553A - 一种检测dna碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒 - Google Patents

一种检测dna碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒 Download PDF

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Abstract

本发明提供了一种检测DNA碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒，所述探针库由SEQ ID NO.1～263所示探针组成，将该探针库制备成检测试剂盒可用于与DNA碱基切除修复通路相关的基因的检测。使用该探针库对待分析的目标DNA片段进行富集，然后再对富集后的DNA片段通过测序手段进行测序，从而实现对基因检测的有效性。与DNA碱基切除修复通路相关的基因可用于预测肿瘤发生的倾向性、评估肿瘤恶性程度和临床预后、指导新药筛选与研发，因此，本发明对基因功能性的研究方向起到重要的指导意义。

Description

一种检测DNA碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和 试剂盒
技术领域
本发明属于基因检测技术领域，具体涉及一种检测DNA碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒。
背景技术
异常的DNA损伤修复通路与肿瘤发生倾向性及诱导DNA损伤类抗肿瘤药物对细胞的敏感性关系密切。DNA碱基切除修复通路主要修复内源性氧自由基损伤的DNA碱基，以及TMZ等烷化剂类抗肿瘤药物引起的DNA损伤，是DNA修复机制中最重要的途径之一。修复过程具体分为两种通路：单核苷酸切除修复（Single-nucleotide BER, SN-BER）和长片段切除修复（Long-patch BER, LP-BER）。当碱基发生损伤时，两种通路都起始于DNA糖基化酶对损伤的识别，接着切除损伤碱基与脱氧核糖磷酸骨架之间的糖苷键，形成脱碱基（Apurinic/Apyrimidinic, AP）位点。所有的脱碱基位点都通过APE1内切酶剪切磷酸二酯键，留下3’羟基（3’-OH）和5’脱氧核糖磷酸（5’-dRP）部分。此后，DNA聚合酶β（Pol β）被招募过去。正常情况下，Pol β的水解酶活性切除脱氧磷酸骨架部分，聚合酶活性紧接着合成单核苷酸填补缺口，形成的缺口结构由DNA连接酶 III (DNA Ligase III)进行缝合并完成修复，这个通路称为SN-BER。但是，当Pol β的水解酶活性被抑制或脱氧核糖磷酸骨架被氧化时，Pol β只能持续合成核苷酸，使脱氧核糖磷酸骨架所在的下游序列被替换并形成分枝结构，类似于polδ在冈崎片段成熟时候的替代合成。这样，LP-BER修复通路就开始了。Polβ替代合成形成的分枝结构是FEN1的理想底物，经过FEN1的剪切后DNA形成一个缺口，紧接着DNA Lig I或XRCC1/DNA Lig III复合体对其缝合完成修复。除此之外，Pol β与FEN1也可能通过接力合作机制（Hit-and-Run model）进行修复，这种修复方式中，2-11个核苷酸会被替换合成。
合成致死（Synthetic Lethality）的策略近年来在肿瘤的研究中得到广泛应用。合成致死在肿瘤研究中的概念为：当将两个不在同一修复通路中的重要基因的功能抑制掉其中之一时，细胞不会致死，但是将这两个基因的功能都抑制掉后，细胞死亡。在临床上，如果肿瘤细胞中存在其中之一的突变，而正常细胞中该基因正常，我们可以将另外一个基因作为靶点，并将其功能抑制住，达到特异性杀死肿瘤细胞，个体化治疗的目的。
前期研究发现，DNA碱基切除修复通路参与的基因发生胚系遗传突变、特异组织中体细胞突变与肿瘤的发生、治疗效果高度相关。其中，OGG1基因R46Q、S326C等变异体酶活性降低，罹患肾癌、肺癌的几率增大；XRCC1基因R194W变异体增强了DNA碱基切除修复通路的效率，增强了抵抗肿瘤发生的能力，而XRCC1基因R399Q变异体导致DNA碱基切除修复通路的效率降低，增大了罹患肿瘤的风险；PARP1基因V762A变异体酶活性降低，导致罹患各种肿瘤的比率增大；另外，DNA聚合酶Polβ在大约30%的肿瘤中发生突变，包括移码突变，片段删除，以及点突变等。这些基因的突变导致DNA碱基切除修复通路有效性的改变（增强、减弱或缺失），对肿瘤的发生、预后、治疗策略的制定都具有重要意义。
发明内容
本发明的目的在于提供一种检测DNA碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒。
为了实现上述目的，本发明提供以下技术方案：
一种用于检测DNA碱基切除修复通路有效性的试剂盒，所述的试剂盒包括针对与DNA碱基切除修复通路相关基因的如SEQ ID NO . 1～263所示探针组成的探针库。
进一步的，与DNA碱基切除修复通路相关的基因包括APLF、APTX、LIG1、LIG3、PARG、PARP1、PARP3、PNKP、POLB、POLL、XRCC1、HMGB1、PCNA、POLD1、POLD2、POLD3、POLD4、RFC1、RFC2、RFC3、RFC4、RFC5、ALKBH1、APEX1、APEX2、FEN1、HMGB2、MBD4、MPG、MUTYH、NEIL1、NEIL2、NEIL3、NTHL1、OGG1、PARP2、PARP4、POLE、POLE2、POLE3、POLE4、POLK、SMUG1、TDG、TDP1、UNG和WRN。
进一步的，所述基因APLF对应的探针序列如SEQ ID NO . 1～4所示，所述基因APTX对应的探针序列如SEQ ID NO . 5～7所示，所述基因LIG1对应的探针序列如SEQ IDNO . 8～18所示，所述基因LIG3对应的探针序列如SEQ ID NO . 19～27所示，所述基因PARG对应的探针序列如SEQ ID NO . 28～33所示，所述基因PARP1对应的探针序列如SEQID NO . 34～44所示，所述基因PARP3对应的探针序列如SEQ ID NO . 45～49所示，所述基因PNKP对应的探针序列如SEQ ID NO . 50～56所示，所述基因POLB对应的探针序列如SEQID NO . 57～59所示，所述基因POLL对应的探针序列如SEQ ID NO . 60～63所示，所述基因XRCC1对应的探针序列如SEQ ID NO . 64～70所示，所述基因HMGB1对应的探针序列如SEQ ID NO . 71所示，所述基因PCNA对应的探针序列如SEQ ID NO . 72～75所示，所述基因POLD1对应的探针序列如SEQ ID NO . 76～88所示，所述基因POLD2对应的探针序列如SEQ ID NO . 89～93所示，所述基因POLD3对应的探针序列如SEQ ID NO . 94～97所示，所述基因POLD4对应的探针序列如SEQ ID NO . 98～100所示，所述基因RFC1对应的探针序列如SEQ ID NO . 101～110所示，所述基因RFC2对应的探针序列如SEQ ID NO . 111～114所示，所述基因RFC3对应的探针序列如SEQ ID NO . 115～118所示，所述基因RFC4对应的探针序列如SEQ ID NO . 119～122所示，所述基因RFC5对应的探针序列如SEQ ID NO . 123～125所示，所述基因ALKBH1对应的探针序列如SEQ ID NO . 126～129所示，所述基因APEX1对应的探针序列如SEQ ID NO . 130～133所示，所述基因APEX2对应的探针序列如SEQ ID NO . 134～137所示，所述基因FEN1对应的探针序列如SEQ ID NO . 138～140所示，所述基因HMGB2对应的探针序列如SEQ ID NO . 141～144所示，所述基因MBD4对应的探针序列如SEQ ID NO . 145～148所示，所述基因MPG对应的探针序列如SEQ ID NO . 149～152所示，所述基因MUTYH对应的探针序列如SEQ ID NO . 153～158所示，所述基因NEIL1对应的探针序列如SEQ ID NO . 159～161所示，所述基因NEIL2对应的探针序列如SEQ ID NO. 162～165所示，所述基因NEIL3对应的探针序列如SEQ ID NO . 166～169所示，所述基因NTHL1对应的探针序列如SEQ ID NO . 170～172所示，所述基因OGG1对应的探针序列如SEQID NO. 173～176所示，所述基因PARP2对应的探针序列如SEQ ID NO . 177～182所示，所述基因PARP4对应的探针序列如SEQ ID NO . 183～197所示，所述基因POLE对应的探针序列如SEQ ID NO . 198～220所示，所述基因POLE2对应的探针序列如SEQ ID NO . 221～224所示，所述基因POLE3对应的探针序列如SEQ ID NO . 225～227所示，所述基因POLE4对应的探针序列如SEQ ID NO . 228～229所示，所述基因POLK对应的探针序列如SEQ ID NO. 230～235所示，所述基因SMUG1对应的探针序列如SEQ ID NO . 236～238所示，所述基因TDG对应的探针序列如SEQ ID NO . 239～242所示，所述基因TDP1对应的探针序列如SEQID NO . 243～247所示，所述基因UNG对应的探针序列如SEQ ID NO . 248～250所示，所述基因WRN对应的探针序列如SEQ ID NO . 251～263所示。
一种检测与DNA碱基切除修复通路相关的基因的方法，包括以下步骤：
（1）获得受试者的DNA样本库；
（2）将试剂盒中SEQ ID NO . 1～263所示的全部探针与所述DNA样本库进行杂交；
（3）分离步骤（2）的杂交产物，并释放出与试剂盒中探针杂交的基因片段，采用测序技术对分离出的基因片段进行测序从而检测基因的突变情况。
进一步的，所述步骤（1）中的DNA样本库由双链DNA片段组成；
所述步骤（1）包括以下步骤：提取全基因组DNA，然后将其片段化；或者提取mRNA，将其片段化，然后以该经片段化的mRNA为模板合成双链cDNA。
进一步的，所述步骤（2）中的探针进行选择性标记。
优选的，所述步骤（2）中的探针进行生物素标记。
有益效果：本发明开发了一种检测DNA碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒，其主要具有以下几方面的意义：
1. 通过对DNA碱基切除修复通路参与基因的变异情况分析，评估人体组织或细胞中DNA碱基切除修复通路的有效性（增强、减弱或缺失），预测肿瘤发生的倾向性，并指导患者采取相应的预防措施。
2. 通过对DNA碱基切除修复通路参与基因的变异情况分析，评估肿瘤患者细胞中DNA碱基切除修复通路的有效性（增强、减弱或缺失），对肿瘤恶性程度、临床预后的评估具有重要的指导意义。
3. 通过对DNA碱基切除修复通路参与基因的变异情况分析，评估肿瘤患者细胞中DNA碱基切除修复通路的有效性（增强、减弱或缺失），对放射、化疗药物选择及治疗策略的制定（如，合成致死方案等）具有重要指导意义。
4. 通过对DNA碱基切除修复通路参与基因的变异情况分析，评估肿瘤患者细胞中DNA碱基切除修复通路的有效性（增强、减弱或缺失），对新的治疗靶点选择、靶向药物研发等具有重要指导意义。
附图说明
图1 为本发明所述检测方法的流程图。
具体实施方式
下面结合具体实施例来进一步描述本发明，但实施例仅是范例性的，并不对本发明的范围构成任何限制。本领域技术人员应该理解的是，在不偏离本发明的精神和范围下可以对本发明技术方案的细节和形式进行修改或替换，但这些修改和替换均落入本发明的保护范围内。
本发明提供了一种与DNA碱基切除修复通路相关的基因的方法，主要包括以下步骤：
（1）获得受试者的DNA样本库；提取全基因组DNA，然后将其片段化；或者提取mRNA，将其片段化，然后以该经片段化的mRNA为模板合成双链cDNA；
（2）针对要检测的基因片段设计与该基因杂交的DNA探针，从中筛选出多个探针作为DNA探针库；
（3）将DNA探针库与DNA样本库进行杂交，从DNA样本库中富集得到待检测基因的DNA片段；
（4）分离步骤（3）的杂交产物，并释放出与试剂盒中探针杂交的基因片段，采用测序技术对分离出的基因片段进行测序从而检测基因的突变情况。
在实施过程中，可以先将DNA探针库中的各个探针进行生物素标记，然后在杂交后用标记有链霉亲和素的磁珠吸附杂交产物，从磁珠上释放出富集的待检测基因片段，再对基因片段进行测序分析。
具体实验过程如下：
一、准备cDNA/DNA样本库
1. 制备DNA样本库
1.1 DNA提取
采用商品化DNA提取试剂盒提取人的基因组DNA，对提取的DNA使用分光光度定量仪以及凝胶电泳系统检测DNA模板质量和浓度。DNA模板260nm吸光率大于0.05以上，吸光率A260/A280比值在1 .8到2之间为合格。
1.2 DNA片段化
将10μg合格的基因组DNA用TE缓冲液稀释至100μL。使用组织匀浆机将DNA片段化，片段长度为150～200碱基。
采用商品化纯化试剂盒对DNA进行纯化。
1.3 DNA样本库质量检测
用生物分析仪进行DNA定性定量分析，确认DNA片段长度峰值合理。
2. 制备cDNA样本库
2.1 mRNA提取
采用商品化mRNA提取试剂盒提取人的mRNA，对提取的mRNA使用分光光度定量仪以及凝胶电泳系统检测mRNA质量和浓度。吸光率A260/A280比值在1 .8到2之间为合格。
2.2 mRNA片段化
采用商品化试剂盒对mRNA进行片段化；再用商品化试剂盒对mRNA进行过柱纯化。
2.3 用商品化试剂cDNA合成试剂盒合成mRNA的第一链以及第二链cDNA
再用商品化试剂盒对cDNA过柱纯化。
3. cDNA/DNA末端修复
利用Klenow片段、T4 DNA聚合酶和T4多核苷酸激酶对DNA片段进行末端修复，由于Klenow片段具有5’-3’聚合酶活性和3’-5’聚合酶活性，但缺少5’-3’外切酶活性。由此，能够方便准确地对DNA片段进行末端修复。将修复后的DNA片段进行过柱纯化。
利用T4聚合酶及Klenow大肠杆菌聚合酶片断，对于cDNA/DNA 5 '突出粘末端补平以及3 ‘突出粘末端打平，产生平末端，用于后续的平端连接。反应在PCR扩增仪中进行，20℃，30min。
表1
Figure 758521DEST_PATH_IMAGE001
4. 在cDNA/DNA样本3'末端加上碱基A
采用具有3’-5’外切酶活性的Klenow，在经末端修复的DNA片段的3’末端添加碱基A，以便获得具有粘性末端A的DNA片段，反应在PCR扩增仪中进行，37℃，30min。将处理后的DNA片段进行过柱纯化。
表2
Figure 49826DEST_PATH_IMAGE002
5. 在cDNA/DNA两端加上接头
表3
Figure DEST_PATH_IMAGE003
如使用mRNA→cDNA，进行步骤6和7的操作；如果是用基因组DNA，直接进行步骤8。
6. 分离出合适长度的cDNA片段
使用电泳凝胶对DNA片段进行分离，对照DNA分子量，在凝胶上剪切出150-250碱基的cDNA片段。
采用商品化试剂盒将含有cDNA样本库的凝胶样本过柱纯化。
7. cDNA片段样本库质量检测
使用生物分析仪，进行cDNA定性定量分析，并确认分离出的cDNA片断长度峰值合理。
PCR条件：置于PCR扩增仪中，95℃预变性10秒，95℃变性30秒，65℃退火30秒，72℃延伸1min，共循环20次（cDNA样本库）或者5-8次（DNA样本库），最后在72℃延伸5分钟。
采用商品化试剂盒对PCR扩增产物过柱纯化。
8. 扩增DNA模板
采用PCR扩增仪对处理后的DNA样本进行聚合酶链反应增加DNA的含量，以满足与探针进行杂交的需求。
表4
Figure 267924DEST_PATH_IMAGE004
PCR条件：置于PCR扩增仪中，95℃预变性10秒，95℃变性30秒，65℃退火30秒，72℃延伸1min，共循环20次（cDNA样本库）或者5-8次（DNA样本库），最后在72℃延伸5分钟。
采用商品化试剂盒对PCR扩增产物过柱纯化。
9. 扩增后cDNA/DNA样本库质量检测
使用生物分析仪，进行cDNA/DNA定性定量分析，并确认纯化后片段长度峰值合理，约200bp。
二、探针的设计原则
根据人类参考基因组HG19，结合Ensembl、CCDS、Gencode、 VEGA、SNP以及CytoBand数据库，获取本发明所述的与DNA碱基切除修复通路相关的基因及其所有编码序列。
探针的设计主要有以下几个考虑因素：
（1）特异性
严格的特异性参数可以有效的降低非目标区域上的探针结合，但也限制了部分外显子上有较低程度重复性的区域，导致探针设计的覆盖率降低。过于宽松的特异性参数会直接降低目标区域上的数据量，导致捕获效率降低，测序成本上升。因此，一个合理的特异性参数是平衡覆盖率和捕获效率的关键。我们认为一条探针在基因组上的相似性序列不超过3是最佳的特异性参数阈值。
（2）结合稳定性
探针与模板结合能力的指标是最小自由能（ΔG）和解链温度（Tm），由于这两个参数计算起来稍显复杂，一般用更为直接和简便的GC含量来间接表示探针与模板的结合能力。一般来说，GC含量越大，结合稳定性越高。实际上，GC含量越接近50%的探针，其捕获效果越好。GC含量越高，虽然探针与目标DNA片段的结合能力很好，但是与目标DNA片段结合能力最好的是其原始的互补片段（一方面长度一致，另一方面是无突变错配），因此，探针需要更高的浓度来促使其在与DNA互补片段结合的竞争中取得一定优势。
我们会优先设计GC含量接近50% 的探针，对于无法避免的GC极端情况下的探针设计，我们会在探针上增加修饰碱基从而改变GC极端情况。
（3）探针浓度
由上面的结合稳定性可知，不同结合能力的探针，其捕获效果有较大的差异。结合能力太高和太低都不利于捕获，因此，为了达到捕获效率最大程度的均一，需要对于不同GC含量的探针设定不同的浓度。通过对历史捕获数据的归纳总结，我们对不同GC含量的探针设定了不同的探针浓度参数，设定GC含量在40-60%的探针浓度基数为1，那么GC含量在30-40%和60-70%的探针，其浓度基数为1 x 22，GC含量在20-30%和70-80%的探针，其浓度基数为1 x24。
（4）探针位置
1、最佳的探针摆放位置是和目标区域100%重合，但是由于随机打断的文库、序列重复性、GC含量、突变类型等的影响，实际的探针设计策略如下：
2、由于文库一般是通过随机打断的方式产生的，为了最大限度的捕获目标文库，一般会采取tiling的方式来设计探针；
3、如果目标区域上有重复序列区域，那么设计时会在保证目标区域覆盖的情况下，向两侧延伸搜索特异性更好的区域设计探针；
4、如果目标区域上是极端GC区域，那么设计时会在保证目标区域覆盖的情况下，向两侧延伸搜索GC含量更合适的区域设计探针；
对于不同的突变类型，也需要有不同的设计思路：
1、对于超过60bp的插入或者缺失，除了需要覆盖其上的探针之外，还需要在突变断点两侧设计探针，越接近断点越好；
2、对于超过10k bp的CNV区域，最佳的探针设计策略是间隔放置稀疏探针，这样做一方面可检测CNV，另外一方可以降低测序成本；
3、对于融合发生的内含子区域，如果融合位点不确定，那么需要整个内含子全部覆盖；如果融合位点确定，那么需要在融合位点两侧设计探针。
4、对于MSI，STR等短串重复区域，除了覆盖其上的探针之外，还需要在其两侧延伸60bp设计探针。
三、DNA捕获探针杂交
1. 将DNA样本库与生物素化的DNA探针库杂交
将cDNA/DNA样本库与杂交缓冲液混合，反应条件为95℃ 5分钟，之后保持在65℃。反应在PCR扩增仪中进行。
然后将该混合物与探针库混合，反应条件为65℃ 5分钟。将杂交反应置于PCR扩增仪中，65℃孵育24小时。
四、得到经杂交的基因片段
1. 准备链霉亲和素磁珠
使用Dynabeads链霉亲和素磁珠进行杂交产物的分离。将磁珠置于混匀仪上混匀，每个样本需要50μL磁珠。
磁珠洗涤：将混合50μL磁珠和200μL结合缓冲液在混匀仪上混匀，通过外界磁场将磁珠与缓冲液分离纯化，弃掉缓冲液，重复三次。
2. 分离杂交产物
将杂交产物与链霉亲和素磁珠进行充分混合，在室温下振摇30分钟。通过外界磁场将磁珠分离纯化。
向磁珠中加入500μL洗涤缓冲液，在65℃孵育10分钟，通过外界磁场将磁珠分离纯化。以上步骤重复三次。
3. cDNA/DNA富集样本释放
将磁珠与50μL洗脱缓冲液混合，室温孵化10分钟，通过外界磁场将磁珠分离弃掉，收集上清液，上清液即为富集的与DNA碱基切除修复通路相关的基因片段。
五、PCR扩增与纯化
将富集的基因片段进行进一步扩增，为测序仪器上样做准备。
表5
反应材料 体积（μL）
加上接头后cDNA/DNA样本库 20
10×DNA聚合酶缓冲液 5
DNA聚合酶 1
接头正引物 1
接头反引物 1
超纯水 总体积补至50μL
PCR条件：置于PCR扩增仪中，95℃预变性10秒，95℃变性30秒，65℃退火30秒，72℃延伸1min，共循环20次（cDNA样本库）或者5-8次（DNA样本库），最后在72℃延伸5分钟。
采用商品化试剂盒对PCR扩增产物过柱纯化。
六、采用下一代测序技术检测基因的突变
使用下一代商业化的测序仪器进行测序，测序结果用已有的测序软件分析包进行分析。
实施例1 检测APE1、PARP1、OGG1、FEN1基因的突变
一、构建样本库
1. DNA的提取
按照常规的组织样本的DNA提取方法采用商品化试剂盒提取样本DNA。
2. DNA片段化
使用DNA破碎仪将DNA样本片段化，使片段长度为150-200bp。
3. DNA样本库质量检测
用生物分析仪进行DNA定性定量分析，确认DNA片段长度峰值合理。
4. DNA末端修补
利用T4聚合酶及Klenow大肠杆菌聚合酶片断，对于DNA 5 '突出粘末端补平以及3 '突出粘末端打平，产生平末端，用于后续的平端连接。反应体系见表1所示，反应在PCR扩增仪中进行，20℃，30min。
5. 在DNA样本3 '末端加上碱基A
反应在PCR扩增仪中进行，37℃，30分钟，反应体系见表2所示。
6. 在DNA两端加上接头
反应体系见表3所示。
7. 扩增获得的DNA片段样本库
聚合酶链反应（PCR），在PCR扩增仪中进行，反应体系见表4所示。
PCR条件：置于PCR扩增仪中，95℃预变性10秒，95℃变性30秒，65℃退火30秒，72℃延伸1min，共循环20次（cDNA样本库）或者5-8次（DNA样本库），最后在72℃延伸5分钟。
8. 扩增后DNA样本库的质量检测
使用生物分析仪，进行DNA定性定量分析，并确认纯化后片段长度峰值合理，约200bp。
若得到的DNA样本库的浓度较低，须将样品经过真空浓缩机低温干燥（低于45℃），再用无核酸酶水溶解至所需浓度。
二、制备APE1、PARP1、OGG1、FEN1基因的DNA探针库
根据上述的探针设计方法和思路，设计并合成探针进行试验，在5’端有生物素（Biotin）。
三、将DNA样本库与生物素化的DNA探针库杂交
将DNA样本库与杂交缓冲液（10mM Tris-HCl , 2%牛血清白蛋白, pH8.0）混合（混合后，DNA样本库浓度至多不超过50ng/μL），反应条件为95℃ 5分钟，之后保持在65℃。反应在PCR扩增仪中进行。
然后以DNA样本库：探针库为1:100的摩尔比，将探针库加入上述混合物，反应条件为65℃ 5分钟。将杂交反应置于PCR扩增仪中，65℃孵育24小时。
四、得到经杂交富集的APE1、PARP1、OGG1、FEN1基因片段
1. 准备链霉亲和素磁珠
使用Dynabeads链霉亲和素磁珠置于混匀仪上混匀，混合50μL磁珠和200μL结合缓冲液（10mM Tris-HCl，2%牛血清白蛋白，pH8.0），在混匀仪上混匀，使用外界磁场将磁珠与缓冲液分离纯化，弃掉缓冲液，重复三次，每次加入200μL结合缓冲液。
2. 分离杂交产物
将步骤三中的杂交反应混合物与步骤四的处理后的链霉亲和素磁珠进行混合，在室温下振摇30分钟。使用外界磁场将磁珠与缓冲液分离纯化，然后向磁珠中加入500微升洗涤缓冲液（磷酸缓冲液，0.1% Tween-20，0.1% SDS，pH7.4），在65℃孵育10分钟，每隔5分钟混匀一次。使用外界磁场将磁珠与缓冲液分离纯化，以上步骤重复三次。
3. 释放富集的DNA样本
将磁珠与50微升洗脱缓冲液（10mM氢氧化钠溶液）混合，室温孵化10分钟，每隔5分钟混匀一次。使用外界磁场将磁珠与缓冲液分离纯化，保留上清液，弃掉磁珠，上清液中即含有富集过的APE1、PARP1、OGG1、FEN1基因片段DNA样本库。
五、PCR扩增与纯化
将富集DNA样本库进一步扩增，为测序仪器上样做准备，反应体系见表5所示。
PCR条件：置于PCR扩增仪中，95℃预变性10秒，95℃变性30秒，65℃退火30秒，72℃延伸1min，共循环20次（cDNA样本库）或者5-8次（DNA样本库），最后在72℃延伸5分钟。
六、检测灵敏度的验证
针对通路中APE1（c.40A>T）、PARP1（c.370A>G）、OGG1（c.137G>C）、FEN1（c.1071G>T）突变构建了突变型和野生型的质粒，按照突变型在野生型中拷贝数比例混合而不同丰度的样品，采用上述的探针库进行捕获、测序考察灵敏性，每个样本重复测试3次，结果如下：
表6
待测基因 5%质粒 1%质粒 0.5%质粒
APE1 4.96% 1.23% 0.89%
PARP1 4.75% 1.07% 0.66%
OGG1 5.66% 0.91% 0.41%
FEN1 5.99% 0.87% 0.64%
从表中可以看出，本发明提供的检测探针库和检测方法能够对低丰度的样本也具有较好的检测灵敏度，能够达到0.5%左右的检测灵敏度水平。
采用优化后的探针库对10例肺癌患者肿瘤样本进行47个通路相关基因的检测，其中8例患者在至少1个通路相关基因中发生外显子区域错义突变（80%），其中2例患者在大于5个通路相关基因中发生外显子区域错义突变（20%）。
序列表
<110> 苏州卫生职业技术学院
<120> 一种检测DNA碱基切除修复通路有效性的探针库、检测方法和试剂盒
<141> 2019-11-29
<160> 263
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 1
tggagacagc ttttctttgt tagttgacaa atacattttc cgcattctct ctataccctc 60
tgaagtggaa atgcaatgta ccttaaggta agtgcctgat 100
<210> 2
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 2
ccagcaatca gtggaggtag gtttttgttt ctactaatgc tgactttaaa ggaaacatta 60
aacagaattt gaaagctttt ctgaagaaaa actataaact 100
<210> 3
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 3
ttgttcgagt gcccagggcg actcacttca ggatgagtct caagggtctc attctgagtc 60
cagctctaat ccctccaatc ctgaaacttt gcatgcaaag 100
<210> 4
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 4
aagatgtgga agagcttttg aaagaagcaa aaaggtttat gaaaagaaaa tagtaactaa 60
cttctgtagt catatctgcc ttacatttac tttttctttg 100
<210> 5
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 5
tcacatgaag atgtacatgg ctagttgaaa gaaaaaaaaa ctgagcatta aactctttaa 60
caactatggc ttaatcaaaa tgacaaagag tatgagtaca 100
<210> 6
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 6
aaactctaca atatatggat aaagttcatt caccatgtgg agaacctggc caggctgcag 60
cttcacctct tggtccttcc caattacgac tgagtcaatg 100
<210> 7
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 7
agcacacccg catcatcact ctaagggaca aaacaaaaga atcactagaa aaacagatcc 60
actagcacga gtcctccagg gccacacccg gtgccaccac 100
<210> 8
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 8
cgaataaacc gagggaagcg aagggagatg cccttgtcac tatccacctg cggaagcggg 60
atggagactc ctgcggtcca gccccagcga ccccctgctc 100
<210> 9
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 9
cgatcaccac caggtccagg gtgtcaccca cgccatcaag gtagtccttc ttcagctggg 60
agaaggggag gcaagagatg agaaggggga gcgcccaagg 100
<210> 10
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 10
ggaaaggggc tcacgtacca gggactgcag ggccggcagg gagaagagag atgagacatc 60
tttgtgagaa taaagacaat aagccctaaa tgtgaggcga 100
<210> 11
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 11
cttccagggc gtggatctgt cacgatggga gaagggaggg gaaatcagct gagtcccctc 60
atgtggcctc agctttctct tctgacccca cctgcactgg 100
<210> 12
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 12
cgggaacctc gctggggtgg cgggtgagaa caagataggg gaagcctttc tagaactcac 60
acagtttgga aagagagctc ggcctgctcc cagaagcctg 100
<210> 13
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 13
gtccgctcag ggacctgggg agagagcagg ccagggaagg gggcttgtct gcacctcccc 60
aatcttgcct cctcccttct ctgatctcct cgaccttgat 100
<210> 14
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 14
ctgaggtaga ggacagggag gaggtctgga ggcgacaggg ccaccacgga gcgcagcaag 60
ttgctcagcg tctccaccat ccggagcctg gaggagggga 100
<210> 15
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 15
tccctccttt cctggagccc ctggctcctc ttccttcact tcttttttga ctgctggctt 60
ccggggggct aggaatgaag acagaaaaca gtgggtcttt 100
<210> 16
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 16
ctttctttcg gggtctcctc ttctgacgat agacagaacg gtcagatggc aaaaaaatcc 60
cattgaacct acaagggcat tttgactctg gagacagtct 100
<210> 17
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 17
gtccagggca ggcttctgga agaggaaaga acagttctag agtgagcggg ggaaggaggg 60
actccatttt ccaaaagttg agagtagagg ggactgaaac 100
<210> 18
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 18
gtggaaaaat gacctagagg agcataaaag ggggtaaaaa aaggagaata acagcaccaa 60
taccctgcct atctatgctg tatcctataa cttccttttt 100
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 19
agagctggaa gataatgaga aggaacagat aacccagcac attgcaggta aggtagagaa 60
cactgctttc tcatcttact ggtgctgaga gaaaaaggga 100
<210> 20
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<212> DNA
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atgcgccatg gtggccgata atcctagcta caacacgaag acccagatca tccaggactt 60
ccttcggaaa ggctcagcag gaggtgtggc atgagcatcc 100
<210> 21
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<213> 人工序列(化学合成)
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tacaggacat tgcctccagg tgggggagct gcctccgtca aaccatgccc atagagagat 60
gaactctctt gggaagggaa ggttcccttg gggttccaga 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 22
cgcgcaggag gtggagaagg agccgggcca gagacgagct ctgagcgtcc aggcctcgct 60
gatgacacct gtgcagccca tgttggtgag gagtgctccc 100
<210> 23
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 23
acaacaagac aggcaaacca ctgccctttg ggactctggg agtacacaag gtactagctc 60
agggccatat gtgcaagaat gaatgagtgt gagtgagtat 100
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 24
ccgggtgatc caggagggat tggaggggct ggtgctgaag gatgtgaagg taaagtggcc 60
tcgcttggct tctcctgtcg actcactcgc agccctctcc 100
<210> 25
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 25
tagacatggt gaagatcagc aaggtgagga agggacctgg ttggccatgg cctctggact 60
ggccgccatc actgagacag aggctgtgct ttggggacta 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 26
gtgtcccgca aggcccccag caagccctca gccagtacca agaaagcaga agggaagctg 60
agtaactcca acagcaaaga tggtaaggat agggaggggg 100
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 27
agagtggatt tgggcatgta tccggaaacg gagactggta gctccctgct aggtttgctg 60
tcttccctct ccctcaggcc atactctcct ttaccatact 100
<210> 28
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 28
aatatctgta ttaaggctga ggcaaagaga aaagacacgg ctatatcatg acattttcca 60
cctagatacc tttagctctt taccagctgg tgtgccacag 100
<210> 29
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 29
gaagtgaaga gcatcgatgg caacgatctc agtgcagcgc cgctgccagt cgtccctggg 60
acaggaagga aaggggagaa aagataagga acaggtagtc 100
<210> 30
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 30
gacattgtga tggaatgatt catcttctgt ttcaggagtg gtattggctg ataaaagaaa 60
caaaaaaata cagacgagaa gagcaataat tagtttagca 100
<210> 31
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 31
cttttggaaa aaagaaaaac atatgaggaa gctattctaa gttgttttgc atcacagaat 60
caaaggtcaa acaagcaagt accaaaccat ttttcagaga 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 32
tctggagaaa ggtgaggcgg aacgtattta gggatcttcc tttctgttct ttgatgtttg 60
gtttcccatt gttcttttct aaggtcaaga caaatgtatt 100
<210> 33
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 33
tatctgtgtc actgtgatca tcattttgag gtgaccgatc aatgttagca ttactaaact 60
gctctggtac cagggttact gtttgaggtt cactttccaa 100
<210> 34
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 34
tgcccaaacc tgaaaaacag aagtcacaag tgacatgaac tgtgagtaca gatgtggcaa 60
agcttccagg gagatgagct ctatttgatg ttgggtccat 100
<210> 35
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 35
ggagaccatg tcagcgaaat agatcccttt accaaacatg tagcctgtct ggaaggtcgg 60
aaaagggaga gctgagaatc ttctgatggg aaattaggag 100
<210> 36
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 36
gaatctctgt caaccacctg gataaacaga atcttgggat tagcacaaaa gagacccagg 60
agagctacag aggaggaatg ctcaggctca gtcaatgcat 100
<210> 37
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 37
cctgagacac cgcctggaga ggaggggaca gaaggaatgc aagactgagg gagcagctcc 60
aagcccccgg ccaggctttc tcttttagca ggtgggtgct 100
<210> 38
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 38
tcactgcctc ttcatccttc aggaaaaaag cacattgcta agagacccaa atcaacaact 60
caagcaaggt atctgcgtct gtggggctgg actgcagaca 100
<210> 39
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 39
gcgcagagtg ttccagtcct gtcccagagg aaaagcacct acagttttct ctccccttga 60
ggtgctagca ctctcacgga gaagggatct gcaggcctga 100
<210> 40
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 40
ttcatgttgg ataatggctt atctgggatg aaaggagaga atcattcagc aaggccagct 60
ctggtgctgc tccccagtaa ggggaggtgg aggagcaggt 100
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 41
gcatcgctct tgaagaccag ctgacccgag cattcctcgc agggaaggag ggcaccgaac 60
accatgccat cagctactcg gtccaagatc tgcagccagt 100
<210> 42
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 42
ttcatccact ccatccacct catcgccttt tctctttctg aaggagacac aggatatgag 60
agacagccag agccattaaa agtctgacac ccaatgactt 100
<210> 43
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 43
gagtcttctc tgccttgcta ccaattccat cctggccttt gcctggagaa tcaaacagac 60
agcaatgctc atctcaacag ccccaaaatg cagctcagag 100
<210> 44
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 44
ttggcgtact cgactcgata gagcttatcc gaagactccg ccatcctccc ctagctgccg 60
ccaaagctcc ggaagcccga cgccacgacc tagaaacacg 100
<210> 45
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 45
ccactggggc cgtgtggtga gtgccctgcc tgctctgcac atactcccca gggtcctcaa 60
aaggccacag ctactgactt gggggggcac ctcccaactg 100
<210> 46
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 46
agaacaccat ggccctcatg gacctgggtg aggggtgaga ggcaggcagg gtggcagggg 60
cctcagggtg gcagggctgt ggggctgagt ctccccactc 100
<210> 47
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 47
gtgccagctg cagctgctag actctggagc acctgagtac aaggtgagtt gggccccaca 60
gaggggccag gctatcagtg ggcactgtcc ctctgcccac 100
<210> 48
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 48
ggcgtgttgg caagggcatc tactttgcct cagagaacag caagtcagct ggatatggtg 60
aggtgcccct ctgggccaag ccctgggagg gttggcacta 100
<210> 49
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 49
tctaccagga gagccagtgt cgcctgcgct acctgctgga ggtccacctc tgagtgcccg 60
ccctgtcccc cggggtcctg caaggctgga ctgtgatctt 100
<210> 50
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 50
cgtcatctct cgaaactgtg gggaacatca gaggggcggc aggcccaggg gtcaggggag 60
gaggggggtc agggggtgca gcccgggggg tgtccgggct 100
<210> 51
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 51
tgcttcaggg ctgtctcaca cgtggtcaca cagcgctgcc aggagcctag cgtgtcctgg 60
ggacacgaga ggtcacaaac agatcggcag acccaggggg 100
<210> 52
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 52
gcagagaggc cctgagcggg agacagtcct ctgcgagggg cgggggacac gcgtgagatg 60
ccgtccccat ccccgggagc cctcccatcc ccacccccac 100
<210> 53
<211> 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 53
gttggccggg cgtccggctg cgtctggaac acacgggaca ccccgttccc accagctcgg 60
agggaggcgt cccagcccac cctcagcagc ctccaggccc 100
<210> 54
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 54
gggaatctct gggtacaaga tcctacggca ggtatgaagc ggcaggggtg acccggggcc 60
agaggtggac tccaggcctc actcactccc ttgttttgcc 100
<210> 55
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 55
agcgcagggt cagtgggtgg aggccattga ccaaatacag tgtgtccccc acccccagag 60
agccctccaa ccccggcttc aactcctggg tcccggtagt 100
<210> 56
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 56
agggcaggaa gatggggggc gctcccccag gggggctctc gagccacaag cggcccgggg 60
cctccacctc gcccatcctg ggtgccggcc tggggagcag 100
<210> 57
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 57
agtggattct gaatacattg ctacagtctg tggcagtttc agaagaggta acatacttcc 60
taatcttggg ttatttttgc cctgatgtta aaattgccta 100
<210> 58
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 58
tagaaaaggg tttcacaatc aatgagtaca ccatccgtcc cttgggagtc actggtgagt 60
gtccatgtgt gtattagaga tcatctctca tctggagaga 100
<210> 59
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 59
ccggagcgaa tgaggcctgt atcctccctg gcagacacaa cccaatagga gtcttaattt 60
atttcttaac ctttgctatg taagggtctt tggtgttttt 100
<210> 60
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 60
caccacaggt cgcctttccc cgtcggtatg aaccacatgc cacacacagc agcccagagt 60
taaaggcctg ggctgctttc tggacctggg aaagagagcg 100
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<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 61
ccgcaaatgc ccgctctcca ggatctctat gattttctca gccatccgct tcccaatccc 60
agggatactg caggcctcct agaggaggag gaggcagagg 100
<210> 62
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 62
tgtctgaagc agggcctcat gggtgccagg aggaatagaa gcatcctgct ctgccttgct 60
gggctgtgga tggtccaagt acctgtgggg atggtgatgg 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 63
aggaatcttt gcaagtactt ttgatgatgc atcagcatga attttctgcc gcttgggaaa 60
tgccttcaag atacccctgg gatccattga agtatggctg 100
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<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 64
gtgctgtgat cacaaactga acccggtcac tcatattgtc ctcgagctcc ctggcgggag 60
agaagaaaag aggtagaagg cacatcaggg aatcagcact 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 65
ctgctctgcc accctggggg tgccaagagg agtagagagt gagcatgcag agcagcctcc 60
cctacaccca aggccaggga caccccaacc cccagcccca 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 66
cctgccatga ggtacctagg ggacaaatcg ggcctcagac aaacaggccc aagggaagtg 60
gggagggcgt tcaggaggca acagccattg gcatttacta 100
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<213> 人工序列(化学合成)
<400> 67
ctcctcgggg tttgcctgtc actgccccct gtgctcgggc agggactggg gctgtggctg 60
gggtacgagt tggagctggc actggagaag acaaagagta 100
<210> 68
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 68
ctggagggta gcagctgcat agctaggtcc tgctgggtcg ctggctgtga ctatgaaggg 60
agaaagtgga tccaggatga gagggctgag ccccaagacc 100
<210> 69
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 69
ggggggctat gaaaccgtac aaaactcaag ccaaaggggg agtcctggga aaggaggggt 60
gggagtcagg gagtctggcc caaggacaga ggccagggcc 100
<210> 70
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 70
aaagctgagc catcattccc aatgtccaca ctgtgtatct gctcctcctt ctccaactgt 60
gggcagagag agaggccact gtcagtgcct gctctgcctc 100
<210> 71
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 71
cctttctctt tagcagacat ggtctacaaa ataattattt gtaagtttaa gttgtaacat 60
ttaagtaaat tatcctcaaa accaatgtct tttgctatgt 100
<210> 72
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 72
ctcagtgcaa aagttagttg aactggttca ttcatctcta tggtaaccta caaaacaaaa 60
gattcatcat tgaaaaacat caagaaagtt gcaatctatt 100
<210> 73
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 73
atagtctgaa actttctcct ggtctaccaa aagaaagcag atgcttttga gaaatactga 60
cacagagttt tgattttctg tagcttcgtg actcggtaaa 100
<210> 74
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 74
gtgtaatgat atcttcattg ccggcgcatt ttagtatttt ggacatacta gaagacagga 60
gacacatgct ttaaaatcaa cgccgtctgc tgaagggctg 100
<210> 75
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 75
ggcctcgttg atgaggtcct tgagtgcctc caacaccttc ttgaggatgg agccctggac 60
caggcgcgcc tcgaacatgg tggcggagtg gcaacaacgc 100
<210> 76
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 76
gcccctcatc ttccaacagt tggagattga ccattatgtg ggtgagttta ggggttatgg 60
gtgagtgctg gggccctgcg ctcctggggc agaggccggg 100
<210> 77
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 77
gagtgagtgc tcccccagga tcagcgggtt ggagggtccc ctcgggaggc cattggctgg 60
tcccagcttc ttccatccac aggcatgttt gggtaccacg 100
<210> 78
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 78
cggacatcgt cggctgcaac tggctggagc tcccagctgg gaaatacgcc ctgaggctga 60
aggagaaggt gcagggcttc ccagggcagg gctgggtggg 100
<210> 79
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 79
cgcctggcgc tcaccctgcg gccctgtgcc cccatcctgg gtgccaaggt gcagagctac 60
gagaaggagg aggacctgct gcaggtagct ctcgctccac 100
<210> 80
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 80
cgcgtgcaga tggacatgct gcaggtatgg gcgggaggtg gggtgtgtcc ctgtccttgg 60
aaggccactg cccaggcccg cagcccacca gcccacccac 100
<210> 81
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 81
cgagggtcac tggcgtgccc ctcagctacc tgctcagtcg tggccagcag gtcaaggtcg 60
tatcccagct gttgcggcag gtcagtagcc gagacttgtc 100
<210> 82
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 82
acctgtgtta caccacgctc cttcggcccg ggactgcaca gaaactgggg tatagtgccc 60
aattcagcat gtgtcccccg aggcccatct gggccttccc 100
<210> 83
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 83
ggcgcccagg tgggcaagtt gccgtgcctg gagatctcac aggtgggcac tcgggcccct 60
ggaaggcaac tgggggcagg tgggccccct gtgtaggaga 100
<210> 84
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 84
cggactgggt gtcaggtcac ttcccgtcgc ccatccggct ggagtttgag aaggtgcgtg 60
gctgggtcag gggctctgca tttaggtgcc ctcatcaggg 100
<210> 85
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 85
atcaccaagg agctgacccg cgcggcctcc gactatgccg gcaagcaggc ccacgtggag 60
ctggccgaga ggtcctgcgc ggggcgggtg gcctggccag 100
<210> 86
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 86
tgccgaggct gtgctactgc gtacgggggc accaggggac tgggggcacc ctgggggggc 60
agaggagatc accggcccac cacctgcctc ctctcctgca 100
<210> 87
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 87
gaaggaggtg agagggccgg gaggtgagga ggggccaggt ggggaggcgg gggcgccctg 60
ctcagccgct gccgtcccca ggtatcccat ctgaatgccc 100
<210> 88
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 88
cctggacctg aggcctggtg accttgcaag catcccatgg ggcgggggcg ggaccaggga 60
gaattaataa agttctggac ttttgctata tggtgctttg 100
<210> 89
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 89
ttgtagaagg ggtaacaacc tggaggagaa ggggcagctc tgaggagggt tccgcctcag 60
cactagcact ctgcacagga tgtggggctg cagcccctcc 100
<210> 90
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 90
ttggtgggat caaactcgcc tggcatcacg tccacgggca ctgaggcctg gaaggcacag 60
ggcagggaga gctcacaggg ccccgaagga gccccctaca 100
<210> 91
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 91
gacaccagta gcacaaacct gcgggagaag gtggggtcct ccagggtgcc gagaagggag 60
gcagcccctc ctaggtgcaa ctcaaagatt ccactgacca 100
<210> 92
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 92
ctgggtgtat gtatttactc cgaggaggct gggggagcag gttgtgctgg aatgcagaga 60
caggaggtat aatcttgggg ccagagccca ccaaagctct 100
<210> 93
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 93
tgtgggccct ctgggcagcc tgctcagaaa acatggccac actcctgact tgcttggtcc 60
acacagcttc gcccaggcca aggaggttca ctgcgaaaac 100
<210> 94
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 94
cttgcagaac tgcagcaagt aagcgtctta atgttccttg tgggcttctt tacgaattga 60
ttttgtaaga tgtttacaca gtggctgcct cttaagagtg 100
<210> 95
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 95
atccagcaaa aaagcagagc ctgttaaggt gctgcagaag gaaaaaaaaa ggtaggaaaa 60
ttttgttgct tattggggaa gagtctttac tgggggtgag 100
<210> 96
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 96
ccgtctccac ctcttgaacc agtgccaaag actgagcctg aacctccttc tgtcaaggta 60
aaattatact gggattcttg catgtccatg catcctttgt 100
<210> 97
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 97
tgggcaaagc caacagacag gtgtccatta ctggcttctt ccagaggaaa taaactgcca 60
tctctggtag atcagagact tggagtggtc aagggagaag 100
<210> 98
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 98
accagcgctg cagccgtgtg atccctgcca gggtgggaag aagactctgg agacttgtgg 60
ggggtggggt agagtctgag ctggagaatg tgtgtgttgg 100
<210> 99
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 99
tggggctcct cccctgcaat gacagctgct cttcagtacg aggttggctt cagtctcctg 60
cccctcacct cccagccttc ctcaccaccg ctttgcctct 100
<210> 100
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 100
tccctcctct tcacaaccgg gtaggaatca gtgatgagcc gcttccggcc catggcggcc 60
acccaggcag gcagagaagg aggcaactgc ggggaagagg 100
<210> 101
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 101
ctgtgtctag atgcctttat agcttgaagt gagtatggag taaggtgggc ttccttattg 60
taagctcttg tgaaggctgc tttcacctat atgaaaggag 100
<210> 102
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 102
aaactgggtc atgtaccccc tcatcaactc tccaggaaga acactggcat aaatggcctg 60
aaaaaaaatc aattgcagtc cagaatttat gttccgtaca 100
<210> 103
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 103
atctgacttg tccacaagtg acatgtgagc agtctcctct ccagctgcaa acactttccg 60
ggcaacatca aatgggccct gaaaaaagag agggacacac 100
<210> 104
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 104
cttctttaaa tgcaatagac atcatagcac cctgaaattg acaagggagg agtcctcaat 60
gatttttaac tcatataatc aggtatttta aaaatattta 100
<210> 105
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 105
agaggctgct ccatctgacc caggttgagg agcaatggga tgagacaaaa acaaaataac 60
aattgctcaa aaactgctgc tctgtagaaa attatgtaac 100
<210> 106
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 106
acgctgcttt aaaactagag ccatcatctt tgccggaaaa tttaccaaac tttgctgcta 60
ggaaaaaaga agttccagag tgtcaaccta tatcacctaa 100
<210> 107
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 107
atcagattca acaggccatc ttcatcaata atttttgtcc ccaaggctgc ggcctgttga 60
ttaaaaatgt aaaccatcaa aactgcatcc tgcatcctac 100
<210> 108
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 108
cagaatcttc aggacttaca gactttggga acagggaaag gaaaatgaac aaagtcatac 60
agaattcatg caaaatttaa aatacatatc tagaaataaa 100
<210> 109
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 109
gtcctttcga gcctaaacaa attttaaaag tgtcaaatgt gacaaataat agaaaaacta 60
ttaccataaa atctgttgtt aaaatccatc aaaattttaa 100
<210> 110
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 110
ccaggtttag aagatactgg cagtttttct ggtggctttt tggcattttt tacctgcaac 60
gtctcctctg actctgaatc tgtatgtgag agaaaaataa 100
<210> 111
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 111
tcttctggtg agtagcccag atgccacaag tgagcaagaa tctagacaaa ggagacagaa 60
aaggctgctt accactttaa actgtaagaa gacatgtgat 100
<210> 112
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 112
ggtcagcttt gtgtaccgga ggactgcaca gcgggactga atgggctctg aacagagacg 60
ggacagtagt gaggcttccc tgcagaggcc ggcatcatcc 100
<210> 113
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 113
cctcacaacg tcaatgcccc tgaaagaatg acaggttttt actggcacct tctgagacca 60
attcagttgc cttcacaagg acttttaaac aatcggtata 100
<210> 114
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 114
tgttgggcac atttccttcc cttgcaaaga cctacggcga aaatgatcat taaaaccggt 60
taaaacttgc ttctggatga ctacataaaa aagatagaaa 100
<210> 115
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 115
aactttatgg tgttggagtg gaaaaattga gaattgaaca tcagaccatc acagtaagca 60
tttcactttg aggccctgaa agtaatttat agcggggact 100
<210> 116
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 116
tctacatcta aagtgatccc acctattcgt agtaggtgct tggcggttcg tgtgcctgct 60
cccagcattg aagatgtagg tcaagttaca cttttctgaa 100
<210> 117
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 117
tatctgaggg agactgcaaa tgctattgtc agtcagcaaa ctccacaaag gtaccagtat 60
aaaatgatga cagtaaagct ttcattatca ggatatcata 100
<210> 118
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 118
acttggaagc gtttgtggcc aaattcatgg cactttataa gaagttcatg gaggatggat 60
tggaaggcat gatgttctga cttctgtcag ttattcttgc 100
<210> 119
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 119
aatcctataa taaaaaaaac ttttggtatg atgacttaat attcctttcc ccaaagttag 60
taagctgact ttaccttgac cacagcttct agtttgtcaa 100
<210> 120
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 120
gcttttctta agtctccttc tgacacttta acaagataag ctattccctg aagagaaaag 60
agttgttttt aacctatgat ggccaattaa ggatttataa 100
<210> 121
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 121
tcatagaatc tgcttcatcc agaatcacaa tcttaaaagg cggacacggc ttcccactga 60
ttcagagaaa cacataagag ttgaacatta atatgtatat 100
<210> 122
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 122
ttaagaaatg cttgcatggt acttcaccct ggtcaggtgc aagacagaaa aaaaaagctt 60
ttattgaaac ttttattgcg aatcagcacc ataggaaagc 100
<210> 123
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 123
tcctgaactc atggttcccc gcctggaaca tgtcgtggaa gaagagaagt gagtattttg 60
cgggcctttg gggatggagt gtagtagaaa caggcttgtg 100
<210> 124
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 124
aacatcctgg actggatgtt gaatcaagat ttcaccacag cctacagaag tatcctttct 60
catgacctcc tggccaccga gacctgaagg tggccccagg 100
<210> 125
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 125
cattgctgca tttcaagtca ccagagacct gattgttgca gaggcctaga tgctctgagg 60
gccattcaca attctcaggg ctcagcagtg atgggagaac 100
<210> 126
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 126
aaatccacag gcagcggcta cttgctctga gaggaaaccc aggtcagaag ggaaaggtgt 60
gtaatgatct gctgagtatt tctttggtaa atgtagagag 100
<210> 127
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 127
ttctgggaat ataacttaag gcactgtttc acccagtgcc actggtaacc tgggaggaag 60
gggtttggga taaaaataaa ccctatacaa aagatgggtg 100
<210> 128
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 128
ctctatatgc attctgctca ctgacagaag acacatttag ctgagatttg atcacctggc 60
aggaaggaaa cagaagttaa aggactaaat ctattttgca 100
<210> 129
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 129
ccagagtcgc cacagagccc acggccgctg ccatcttccc catctcgcgg cctataccct 60
ctgatccgga agcagattct ctcgtgttcc ggatccggaa 100
<210> 130
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 130
gctcaggaca ggtaagggaa tgaaatcagc ccttcttcct agaagctgcg gcgggggtgt 60
ttgtcattcc cttgatgtac ggtaagtacg ggccgactca 100
<210> 131
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 131
gcaaacctgc cacactcaag atctgctctt ggaatgtgga tgggcttcga gcctggatta 60
agaagaaagg attagatgtg agtggaattt gagggaaaga 100
<210> 132
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 132
tgggcctgct ttcccgccag tgcccactca aagtttctta cggcataggt gagaccctat 60
tgatgcctaa tgcctgaact cttcaaaacc aattgctaat 100
<210> 133
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 133
ttgtgctgtg tggagacctc aatgtggcac atgaagaaat tgaccttcgc aaccccaagg 60
ggaacaaaaa gaatgctggc ttcacgccac aagagcgcca 100
<210> 134
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 134
ggctattctg gtaaatgggg ctttctgtgg actttaaatt agtgagggag gcagataggg 60
gaaaagggtt tccaatattt gatgagaggg taataagaaa 100
<210> 135
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 135
gagcggctag tctttaagat gcgcttctat cgtttgctgc aaatccgagc agaagccctc 60
ctggcggcag gcaggtactg caagcctggg cagtaaggct 100
<210> 136
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 136
tatggctccc ggcttgacta tgtgctgggg gacaggaccc tggtcataga cacctttcag 60
gcctctttcc tgctgcctga ggtgatgggc tctgaccact 100
<210> 137
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 137
aaggggcagg ccaagacttc agaagccaaa gatgagaagg agttacggac ctcattctgg 60
aagtctgtgc tggcggggcc cttgcgcaca cccctctgtg 100
<210> 138
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 138
acctgatggg catgttctac cgcaccattc gcatgatgga gaacggcatc aagcccgtgt 60
atgtctttga tggcaagccg ccacagctca agtcaggcga 100
<210> 139
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 139
tcctgctagg cagtgactac tgtgagagta tccggggtat tgggcccaag cgggctgtgg 60
acctcatcca gaagcacaag agcatcgagg agatcgtgcg 100
<210> 140
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 140
ccaagggatc cactaagaag aaggcaaaga ctggggcagc agggaagttt aaaaggggaa 60
aataaatgtg tttccccatt atacctcctt caccccagaa 100
<210> 141
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 141
ttcttctttg agcctgttgg cctgccaggg cccttctttc ctgcttcact tttgcccttg 60
gcacgatatg cagcaatatc ctgaaatatt gtcaaaaaaa 100
<210> 142
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 142
gttcagagca aaacaggaag aaggcagatc tgaaaggaag caacagagtt taataaactg 60
aaggaaaaat ccaaggagca atttgggtta ttttaaactt 100
<210> 143
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 143
tcactttttg ccatatcttc aaacttcgac ttctcctttg cagacatggt ctgtggacat 60
aaaataagag ccaaaaatac agcaaaattg ttacctataa 100
<210> 144
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 144
aggacatttt gccccgcggc ttgttggggt ctcctttacc catgttgaca gatccgcgtc 60
cacctgacgg ggccgagggg ggagagggga agccggaggg 100
<210> 145
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 145
tacttctcca gaaacttcca aagcacaggt attgccattt tgcctgggaa gtaaaagtaa 60
ctgaatgatt acaagactcc aggtgggctg atttcatgtt 100
<210> 146
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 146
aggcttgttt tccttctttc tatctgtgtt cgtgggatgg tatcttctga aaaggaaaag 60
taaacacttt atggagtcta tggtttagct taaagcaata 100
<210> 147
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 147
ctttttgcac ttgcttcggg tcctgaggtt ccagtttgaa ttgttacttt ggttttgtag 60
atgggatgtc agggctgcca tgctgcagtc tttatatctt 100
<210> 148
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 148
tccagcccag tcgtgcccat cgagcagggt ccggctgcag caacgagccc agcgccgcaa 60
cgcccagggt gtggggcgga gtaagatgtg aaacctcttc 100
<210> 149
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 149
aagaaaccaa agcaggtggt cagatccagt ccttgcactt cctgagcctg accttaccac 60
acagctgtct cctattcgga tgcttattta ttttttttcc 100
<210> 150
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 150
ttctcaagcc caaagggcca ccttacccga ctggggttgg agttcttcga ccagccggca 60
gtccccctgg cccgggcatt tctgggacag gtaatgtgaa 100
<210> 151
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 151
tgtacgtgta catcatttac ggcatgtact tctgcatgaa catctccagc cagggtgagc 60
agtgctgggg cacggggggt tggagggccg gcagagccct 100
<210> 152
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 152
ggcacaggat gaagctgtat ggctggagcg tggtcccctg gagcccagtg agccggctgt 60
agtggcagca gcccgggtgg gcgtcggcca tgcaggggag 100
<210> 153
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 153
gtggacaacc tggaggaagg gtcaaggggt tcaaataggc ctgtggatat agcctcaaaa 60
gccaacatcc ttggctattc cgctgctcac ttacctcccc 100
<210> 154
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 154
gcacaggtgg cactgtccag tgttgggagc tgggaacgga gatccccgaa ccctactcaa 60
gccaagaggg ctttaggggc caacctagag agtgggcttt 100
<210> 155
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 155
gacccctaaa agaagggaac actgctgtga agcagagctc ctttgcagac acccctgaag 60
cacccttgtt accccaacat cctaccagag ctgctgggaa 100
<210> 156
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 156
cccctagctc ctctaccacc tgattggagt gcaagactca agattataag acacccaaga 60
ctcctgggtt cctaccctcc tgccatcccc ttaccttccg 100
<210> 157
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 157
gcatgacctc tgagacccac actgggggaa aggggttggc atgaggacac tgctgacctg 60
cccctacctg gcccacagcc cccagaccca agggcctcga 100
<210> 158
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 158
ggctgcctgg ccaggcctgc tggggcccca ggacactcag caatcatccc tgcacaggct 60
gtgcatcagg gtcttgggac acagcagcct gtggcagtat 100
<210> 159
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 159
gcggcaagga gctgcgcctg atactgagcc ctctgcctgg ggcccagccc caacaggagc 60
cactggccct ggtcttccgc ttcggcatgt ccggctcttt 100
<210> 160
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 160
tttgagaagg cccgctcggt cctggaggcc ctgcagcagc acaggccggt aagcccagag 60
agggatggag cacacgtgct ggcacactgg tgtccacatg 100
<210> 161
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 161
ggcatgagct ccctgcagga ccggcatggc cgtaccatct ggttccaggt tgggccctac 60
tgttcacaca ggcagagacc ccaggaggct gatgggtgga 100
<210> 162
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 162
tggctccagg acacccaggt gaggtaatac tcctctgaag ggttggctct gtcgcccatc 60
ctgcgcctcc cctaggatct atccccatat gtctcagggt 100
<210> 163
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 163
cagagctcgt cccccagggc gaggatgatt ctgagtattt ggagagagac gcccctgcag 60
gagatgctgg gaggtggctg cgtgtcagct ttggtttgtt 100
<210> 164
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 164
tcagcctgtc tgctatacac tgctggacca gagatacttc tcagggctag gtatgactca 60
tgggaaaggg gtgagtccac agagttgctt catggaaaag 100
<210> 165
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 165
tgctggccac caggtcatga aggaggcgtt tgggcccgaa gatgggttac agaggctcac 60
ctggtggtgc ccgcagtgcc agccccagtt gtcagaggag 100
<210> 166
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 166
tttggggaag gagctcttta tgtactttgg accaaaagct ttacggtaag ataagcctgt 60
acgatacatc ttatctctct atatttaaag atgcgtagaa 100
<210> 167
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 167
aatgaagctc tctttgacag tggtctccac ccagctgtta aagtaagttt taagtatttt 60
tttaattatc tgttgatttt tcggtactgt gaaggaacca 100
<210> 168
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 168
caataagccc tcttctaagg catgtgatgc ttgcttgacc tcaaggccta ttggtaagac 60
tgaattttga ttttgagttt gttacatttc taagagggtt 100
<210> 169
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 169
ccgagttgtg gggaaggatg gggaaaacaa gggcaggcag ttttatgcct gtcctctacc 60
tagagaagca caatgtggat tttttgaagt atgtgtaaga 100
<210> 170
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 170
acctcagcct gttggcgatt ctgtgcacat gcgtgtccac tgctgctggg aggccaagcg 60
gggtgaacag gggcacactc caccagccta gcccgtgccc 100
<210> 171
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 171
cgcagtcgct gcatggcgcc cgccgtcacc tggtctttgg tttggctgga gagcatcagt 60
gacagcagca cctggtacct gcgtacctgc ttgtgcagtg 100
<210> 172
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 172
ggtcagcatc ctcgcgctca aggcggtcat gccggactcc tgcggactac acatcccggc 60
ggcccatgcg gccccgtcac gtgatgcaag gatcgccggc 100
<210> 173
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 173
gttaccctgg ctcaactgta tcaccactgg ggttccgtgg actcccactt ccaagaggtg 60
gctcagaaat tccaaggtga gtacaggacc tgggctgggg 100
<210> 174
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 174
ctgcagcagc tacgagagtc ctcatatgag gaggcccaca aggccctctg catcctgcct 60
ggagtgggca ccaaggtgag gccccagggg gtaggagctg 100
<210> 175
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 175
tccccaccca gtctcatgtt ggggaggggc ctccctgtga ctacctcaaa ggccaggcac 60
ccccaaatca agcagtcagt ttgcacaaca agatggggtg 100
<210> 176
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 176
ggttctgtga ccactgctgg accaaggacg tggatgaccc tcccctagtc actcatccat 60
cccctggctc cagagatggt cacatgaccc aggcctggcc 100
<210> 177
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 177
gaagatgatg cccagaggaa cttcagtgtt tggatgagat ggggccgagg taatgatttt 60
tattgagatt ttatgagttg gcattcagaa agtcagaagc 100
<210> 178
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 178
ttaataaagt tgatctgtaa tgttcaggcc atggaagaaa tgatgatgga aatgaagtat 60
aataccaaga aagccccact tggtaggact tcacattttc 100
<210> 179
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 179
tactagaggt gagatatgta tgatttgaga agtattatat cccttatacc agtgtcctcc 60
cacattgatt ctatatctca tcttctcagg ctttgggaga 100
<210> 180
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 180
ggagaaggat ggtgagaaag aagccttcag agaggacctt cataacaggt ctgagtctag 60
ctttgcgttt ggaaagacac tccttgcccg aaagtacagc 100
<210> 181
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 181
actgctttgc ctctcgccta aagaatacag gactgctgct cttatcagag gtgagacagg 60
agtatgtctg tgatctctag tttattaatt ccagtttttt 100
<210> 182
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 182
gtccgtatgc ggtacctttt aaaggttcag tttaatttcc ttcagctgtg gtgaatgttg 60
atattaaata aaccagagat ctgatcttca agcaagaaaa 100
<210> 183
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 183
attctcttcc ttttacacct aaaaggaaaa aaactccgtt aagtctgttg gaaactctgc 60
atctcaaact gtgcctgttt ataaaattct cattaaagaa 100
<210> 184
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 184
tttgaaaagc aaagacagga catcgacttc cttcgagact gcctactgat tcttctagaa 60
gacagagatc tactggggta gtccgggact gactgcaaag 100
<210> 185
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 185
atggaatttt cctatgtttt cgtttggata aacgtaattc tggccactca gaggatgcta 60
aaagagactg cccagaagac agaattatta acgtaagggg 100
<210> 186
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 186
aggtttgttt tttcatctag gatagaataa aacataaatc atgtcctgtt ttatttctat 60
ttcgctatgt cagtaaatca ttttaagatt cgtatttcag 100
<210> 187
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 187
gtacgaaatt ctttctcttg aattagtgca cacagagttg cctgaaatgg ggaaaaaaat 60
aaattcctca ttagcctttc cactctgcag tgtcttggtt 100
<210> 188
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 188
tgacgatttg ctgtagaact gatcacattt cacatgtttt aattttgaag acattagaaa 60
tatttttgaa gtacatgtta acagtgttga gaaagctcac 100
<210> 189
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 189
caagacaaat aatcacttcg ctctcactgg ctaggtcagg gaggtcgaca tcgagatcgg 60
gttgaaagac aagcatgcaa gcctgaaagg agaaagaagg 100
<210> 190
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 190
atgctgagtt ctgtgatgta ggtaattttt ataagaacct tagccttagg gggtaagttt 60
ccaacactta cagtaaaaac gtcctgaaac agaaacatat 100
<210> 191
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 191
gcctcaatgg gcacgtgact tttatttgtg tatgtctgaa aaacaatgac ctgaagaaga 60
aaaaaaatcc atacaattga tgagaccaca tggactacat 100
<210> 192
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 192
ataatatatt tcattttaac ctgattggtt ttatagacaa caaattcatc atcctagagc 60
aaacagaaat cagtaggtga ttaacaacag aagcaacaaa 100
<210> 193
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 193
gggtaaaagc aaccctctga aaagagaagg gcaggataag gtgtaagccc aacactgact 60
gcatctcttc cttgctcaga attttggcag gttcctactg 100
<210> 194
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 194
caaagctcgg tatttggcca gggatggtgg gttgggtttg gacaaattag tttcacagac 60
attaaccatg tctcttatta gctgtaggtg gaaataatac 100
<210> 195
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 195
tcgctcacct cttggctcag agtgcttgaa ttcatgactt cctccaaaag caactacaat 60
aataaaatag aaatgccacc aaaaagtcat catgtgtgag 100
<210> 196
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 196
agctccacca ccacagcttc ctggcctccc tccattccca cctggaaaac aggatgtgct 60
ttcagaagct gcactcggga aacatcaaac tacatgtgcc 100
<210> 197
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 197
tacttcactt tcaaacagaa gatacaattt gcaaagattc ccatcaccat cctgtaggaa 60
aaaaagtttt taaggaccct ctcttaagtc aatatgacag 100
<210> 198
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 198
gcagtacaca ggcatgctgg tctccttcac cccgcggcac ttcaggcaga cctgaaaggg 60
agcagccccg atgggcgcca gccctcccgc gctggccaga 100
<210> 199
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 199
ctcggttcag cttattcacc tggtttgtga tgttggtgtc cagggacagc acctgcagag 60
accacagccc acatcgggaa ggagctcccg gggcctccct 100
<210> 200
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 200
actgcgcctc agcccgtcct tcatgcagtg gtacacggcc acgatgtacg ctgtggagag 60
gcacacacac cacaggccct gagtcgggct gctgcaaaca 100
<210> 201
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 201
gtctcctttg aatggatgct gcagaggaag cattgaagac gctgcttcag tgaaatcgac 60
cttgttctca actttccttt atttcccctt gtatctatct 100
<210> 202
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 202
gttgtggtac tgggtgatct ccttcaccca gcccacgacc atgctcttca ggatcctgaa 60
agagaaggtg cacgacaccc tcgtaccctc agcctcccac 100
<210> 203
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 203
tgtggagatg tcctctggta ggttcccaat gggaatgtga aagtacctgc accagggcac 60
aggtcagcac cggggcacat cgccgggtca cagagaccac 100
<210> 204
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 204
gtgctctgct gagtacaggg cgccaaggct gggcatctgg ttgctgcgca cctagaccaa 60
cgcaggccac gtcagcctcc ccctgcgcag gaggaagtgg 100
<210> 205
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 205
attgaccaca cacacacagc ccaggtgcac cagggcccgg aacagtaacg gaacctggaa 60
gaatcgggca gacaggccgg caagggctgg atggtggggg 100
<210> 206
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 206
gtcactgcca acgagcgccc acagcctgaa caggccggcc tggctggtct cgctgatctg 60
aaaggccaca cggacataca gcacatcaca ggacacactg 100
<210> 207
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 207
cctccatgtc aggagcactt ggcctcggac tgtcttctga ggcctcggcc atcgtgacct 60
ggaaagaccc agtgaagcct taaatctcag gatctcgggc 100
<210> 208
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 208
tctggatggc gcttcccagc cgctcaatgt agtagtccca atccagaatc tgcatgtgca 60
ggaaacgggc acagagaaca gcaggtggca gcagccaaga 100
<210> 209
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 209
atcttccagc ttccgagaca tggaacggtt ctcagagatg agctcgaata gctcagagtc 60
aggcatgttg gctgcctaga gaaagacaat gggtaaaaca 100
<210> 210
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 210
gaggacggct cagccagctc ctggtactgg tcattggtga agccttcctg agaaacaaga 60
gtgaagaggg ggcagcttca ctcatgatgg cccaaacctg 100
<210> 211
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 211
ctgtgaagca gacgatgcca gccatctcca tggagtacca gcgagccctg agaggacacc 60
acaaactggt gggtggggct ggcatggctc ctccaggggg 100
<210> 212
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 212
tgagacgctc ttccaccttg gtgatgtgga tcttcttgta ggctttccgg cagtaatcta 60
agcacgacgg agatgggcag agcaggtggg tgagatctcc 100
<210> 213
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 213
gtccaccatg gcagagggct gggaggggtg agaaagcact tagggctggg cagagagagc 60
tccgactctg acacgggaag taaagtctca cctgcaggcg 100
<210> 214
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 214
ggaagtcaaa ggcggcagga ttctagcaca acagtgagac gacggggtca gaggggaaac 60
acacccacac tagcctgcct caggtttgac gctgtggctg 100
<210> 215
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 215
taagtggcga cagcatctga cacagaatac gtggccagag tctgaggaga gaacgccaga 60
gagcagggcc atcaaaaatc aagagcccag ggtcaagtgt 100
<210> 216
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 216
gcatgctcag accgtggact gctgcccggg cctccacaaa tggcctgggt tggaaagagg 60
acagacaagc aagtgggcag gtcaggctct aatgcccctt 100
<210> 217
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 217
aactcaaaat cttcaatatc ttctgaaaca atctccctgt tggtgatgag gtagccctag 60
ccaagttcat tagcaatcag cacaagtcag aggctgcaaa 100
<210> 218
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 218
ggaaaagcat ttcctcggta tctgacattg taccaatgag cctgcaaaac acacagtgtg 60
ctaactagag ttctacatcc aggaaagtct attcttctgt 100
<210> 219
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 219
cctcactttg acaagatcct ccacagtgtg gaaggacagc ctgatgtaat ttcgcttcaa 60
acccaccaag tgatttggct ataatgcgaa gagatcacgc 100
<210> 220
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 220
actgcactgc ctaagcgctt atcttcatct aaaatctcgg tctacaagag aatcagtcaa 60
cacagacaca agaccatcct ctacacagtt agagaaactt 100
<210> 221
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 221
tttatttact aagtcttcac ggaagacagt aatttcctgt gtacagtact gaattctgaa 60
atgaaaacag tagttgaatt tgacttctca gaaaaaaatg 100
<210> 222
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 222
gctggtgaat aacctaaaca ataaaagagt aaatgaacaa tacttttcta gtctacaaat 60
caagttaaaa accctttaac catgactttc taataataaa 100
<210> 223
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 223
ttggtcatta acagactaga aaaagagaat gcctattttt gactatcata atacacaaag 60
gtgagccaaa agtgaagcaa gagactatac cttctgaaaa 100
<210> 224
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 224
aattatcttt tccagtttat cttcaagctc taattcactg atagactgaa gagcttctgt 60
gaggtactta atagcttcac taagaaaagg aaaggaaaaa 100
<210> 225
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 225
cttgctcttc cgagtctgtt tttttgtctt tgtccttctt cttttgctct gaggcctcct 60
tcttgccttt ctgctcccgc ctatatgctg taaggacgga 100
<210> 226
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 226
agttgttagc actgagagaa gagaaaggct gtcagactcc ctcttgtttg taaggcgtga 60
gtgggaaaag gagcacccag aggtggaacg ggaaagcctg 100
<210> 227
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 227
ctgcgaggag accgggggtg agcaaagctg ccgttccagc acctgcttcc ctcctgcccg 60
ttcgtccgcc ccccccgagc tgctcaccgc ctccttgatg 100
<210> 228
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 228
agatcccgac gtgacgctag cgggacagga agccatcttc attctggcac gagccgcggt 60
gcgcctgcag cgcgagggca tgcgggagtg ggggaggtgg 100
<210> 229
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 229
gctcagcagg gaaaaaggaa aacccttcag aggagagact tgggtagagt ggcactgcag 60
tgtctgggga cagacaaggg agggctgggc tggtttcccc 100
<210> 230
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 230
aagctcaaat caccagccaa cagctaagaa aagcacaatt acaggtatta attaaattgt 60
taaataaagt ggaagctggt agaatagtaa ttgacagtta 100
<210> 231
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 231
ttataatagt gccccccaac tttgacaaat accgagctgt gagtaaagag gtaagttaat 60
gtctcacccc tactttaggc tttcactgag ttcctgtcac 100
<210> 232
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 232
gtaaaggaaa ttcgtttcag aattgagcag aaaacaacac tgacagccag tgcaggtatt 60
taaaagagta ttgatggcca ctgtagttat aattttcaga 100
<210> 233
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 233
attgctttct ctccttttct ctgaaacatc ttggcattat ttccttcata tctccttggg 60
tctaggttca acacacctga cgaggtatct atatgtattg 100
<210> 234
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 234
taaaaacaga aattgatgct gattttccac atcccttgag attaaggctt atgggtatga 60
ctttttcatt tttttgtttt tccttaaatc tgctagattt 100
<210> 235
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 235
agtcttttaa tattgaacac tgtcatcaga attcttcttc tactgtttca ttggaaaacg 60
aagatgttgg atcatttaga caagaatacc gccagcctta 100
<210> 236
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 236
tgctttgtct tggtccctgt gaggaaaggg gtcagctaaa ggtaactgtt ctataaggat 60
gggtaggtat cctggcaaga tatttcctct gaaatagtaa 100
<210> 237
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 237
ccaccaccag ccgcaccccc agcagctgca cctgccggca gagggctgca tcacagatcc 60
caagaagctg ttctcgctgc ttggcaggca gctcagcagg 100
<210> 238
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 238
cgaagctcct cctccaggaa gctctcagcc aagcttccag ggcagggctg gggctccatg 60
agggcacctg caggctcatg gatggacccc agcaggaaag 100
<210> 239
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 239
atggtgtttc agaagctgaa cttctgacca agactctccc cgatattttg accttcaatc 60
tggacattgt cattgtaaga tctttgtcct cgttggattt 100
<210> 240
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 240
cgtgaaggag gacgtattct agtacagaaa ttacagaaat atcagccacg aatagcagtg 60
tttaatggaa aatgtaagat ttacttttaa attttttttt 100
<210> 241
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 241
gaaatatgga cgttcaagag gtgcaatata catttgacct acagcttgcc caaggtatgt 60
tactgtcctc attcctttta ttcattttgt gtgtgtatat 100
<210> 242
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 242
aggaagaaga aagccatgct taagaatggt gcttctcagc tctgcttaaa tgctgcagtt 60
ttaatgcagt tgtcaacaag tagaacctca gtttgctaac 100
<210> 243
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 243
gagtctctgg agttaagcca aagtataact ctggagccct ccacatcaag ggtaagagga 60
tgctgggtgt caaggagctg ttgaattgcc cttgagagtc 100
<210> 244
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 244
cacacctcca acctcatcca tgctgactgg caccagaaaa ctcaagggtt cgtaggggcc 60
tgctcacttc ctggcagtgt gtgtgttgat aaaggtcaaa 100
<210> 245
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 245
ctgagtttaa agagagcatg ctgacactgg ggaaggaaag caagactcca ggaaaaagct 60
ctgttcctct ttacttggtg agttctcgtc ctcattgagg 100
<210> 246
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 246
gctgatgatc cgctcctacg agctcggggt ccttttcctc ccttcagcat ttgtaagttt 60
acacttccaa ctgcacagtg ggtcacatgg gagatgaatt 100
<210> 247
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 247
gcatgggaac atgtgggtgc cctcctgaga atcttgaggc actgtgaaat ttaagtgtaa 60
gacattgagc cacaaacatg gaatctcttc tttgtactgg 100
<210> 248
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 248
ccggatccag aggaacaagg ccgcggccct gctcagactc gcggcccgca acgtgcccgt 60
gggctttgga gagagctgga agaagcacct cagcggggag 100
<210> 249
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 249
gttccgcctc cgcccaggta cagttgcttt acaggtgact gcagtccaga catgattcct 60
ttcagatgtg tacttagctt attacaagtg ggactatctg 100
<210> 250
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 250
atgagctgct gcagaagtct ggcaagaagc ccattgactg gaaggagctg tgatcatcag 60
ctgaggggtg gcctttgaga agctgctgtt aacgtatttg 100
<210> 251
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 251
atccattgtg tatagttacg atgctagtga ttgctctttc ctgtcagaag atattaggta 60
agtgatttga atttcctgat tttatttgaa tttggaccct 100
<210> 252
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 252
gagatcagtg gaaacttcta cgtgactttg atatcaaatt gaagaatttt gtggagttga 60
cagatgttgc caataaaaag gtaaaagcaa tatatatata 100
<210> 253
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 253
ttcaatctct gaggaagtga tggatctggc taagcatctt cctcatgctt tcagtaaatt 60
ggaaaaccca cggaggttaa atattacctt tttttttttt 100
<210> 254
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 254
taattgagag tgatgaagat ttagaaatgg agatgcttaa ggtatgttta caattataaa 60
aatattactt caagttcttt ccaaaggaca tttaattaag 100
<210> 255
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 255
agaagaagaa gatgatgaaa atgaagctaa tgaaggggaa gaagatgatg ataagggtaa 60
gcactgaagt atgtttgaaa tgactcacct gtgataccta 100
<210> 256
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 256
caggtaacat gggcctgctc cagcaacttg aggctgatat tggtaagtga taaagaaaga 60
tctctgtaaa tacttactga gttaatattt aaagttaaac 100
<210> 257
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 257
cagggaatat ccttcaggat ctgcagccat ttcttgtcaa aacaaggtaa ggatttaatg 60
gttgatgaat tttggtaatg atttcctttt ttttttttta 100
<210> 258
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 258
gattggtaga gctggtcgtg atggacttca aagttcttgt cacgtcctct gggctcctgc 60
agacattaac ttaaataggt aaaaaaaatt tattgttttt 100
<210> 259
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 259
ttgggaatta tgggaactga aaaatgctgt gataattgca ggtccaggta aagatttctt 60
attatagatg gacattctaa aagtctttct ttctcttcct 100
<210> 260
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 260
cgcccttacg aaaaaggtaa acggtgtagg agtctgcctg tttgacttaa ttttgtttcc 60
cactccacat taaaagatcc tttttgcttt taatagggta 100
<210> 261
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 261
tgttccccca gctattctgg caacaaacaa gatactggtg gatatggcca aaatgaggta 60
aactatcttt tgcatgtgtt ctatttattt ccttctaaca 100
<210> 262
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 262
agtctatggc catcacatac tctttattcc aagaaaagaa gatgcctttg gtaagtgtga 60
ctttcatgtt acagggaatt tttttagttt acttaaactt 100
<210> 263
<211> 100
<212> DNA
<213> 人工序列(化学合成)
<400> 263
aagagatctg ttcaagttct aagagaagca aggaagaagt aggcatcaat actgaggtat 60
taattatata tagaattttc ataaagtgtc agtttgttca 100

Claims (7)

1. 一种用于检测DNA碱基切除修复通路有效性的试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒包括针对与DNA碱基切除修复通路相关基因的如SEQ ID NO . 1～263所示探针组成的探针库。
2. 根据权利要求1所述的一种用于检测DNA碱基切除修复通路有效性的试剂盒，其特征在于，与DNA碱基切除修复通路相关的基因包括APLF、APTX、LIG1、LIG3、PARG、PARP1、PARP3、PNKP、POLB、POLL、XRCC1、HMGB1、PCNA、POLD1、POLD2、POLD3、POLD4、RFC1、RFC2、RFC3、RFC4、RFC5、ALKBH1、APEX1、APEX2、FEN1、HMGB2、MBD4、MPG、MUTYH、NEIL1、NEIL2、NEIL3、NTHL1、OGG1、PARP2、PARP4、POLE、POLE2、POLE3、POLE4、POLK、SMUG1、TDG、TDP1、UNG和WRN。
3. 根据权利要求1所述的一种用于检测DNA碱基切除修复通路有效性的试剂盒，其特征在于，所述基因APLF对应的探针序列如SEQ ID NO . 1～4所示，所述基因APTX对应的探针序列如SEQ ID NO . 5～7所示，所述基因LIG1对应的探针序列如SEQ ID NO . 8～18所示，所述基因LIG3对应的探针序列如SEQ ID NO . 19～27所示，所述基因PARG对应的探针序列如SEQ ID NO . 28～33所示，所述基因PARP1对应的探针序列如SEQ ID NO . 34～44所示，所述基因PARP3对应的探针序列如SEQ ID NO . 45～49所示，所述基因PNKP对应的探针序列如SEQ ID NO . 50～56所示，所述基因POLB对应的探针序列如SEQ ID NO . 57～59所示，所述基因POLL对应的探针序列如SEQ ID NO . 60～63所示，所述基因XRCC1对应的探针序列如SEQ ID NO . 64～70所示，所述基因HMGB1对应的探针序列如SEQ ID NO . 71所示，所述基因PCNA对应的探针序列如SEQ ID NO . 72～75所示，所述基因POLD1对应的探针序列如SEQ ID NO . 76～88所示，所述基因POLD2对应的探针序列如SEQ ID NO . 89～93所示，所述基因POLD3对应的探针序列如SEQ ID NO . 94～97所示，所述基因POLD4对应的探针序列如SEQ ID NO . 98～100所示，所述基因RFC1对应的探针序列如SEQ ID NO . 101～110所示，所述基因RFC2对应的探针序列如SEQ ID NO . 111～114所示，所述基因RFC3对应的探针序列如SEQ ID NO . 115～118所示，所述基因RFC4对应的探针序列如SEQ ID NO. 119～122所示，所述基因RFC5对应的探针序列如SEQ ID NO . 123～125所示，所述基因ALKBH1对应的探针序列如SEQ ID NO . 126～129所示，所述基因APEX1对应的探针序列如SEQ ID NO . 130～133所示，所述基因APEX2对应的探针序列如SEQ ID NO . 134～137所示，所述基因FEN1对应的探针序列如SEQ ID NO . 138～140所示，所述基因HMGB2对应的探针序列如SEQ ID NO . 141～144所示，所述基因MBD4对应的探针序列如SEQ ID NO . 145～148所示，所述基因MPG对应的探针序列如SEQ ID NO . 149～152所示，所述基因MUTYH对应的探针序列如SEQ ID NO . 153～158所示，所述基因NEIL1对应的探针序列如SEQ ID NO. 159～161所示，所述基因NEIL2对应的探针序列如SEQ ID NO . 162～165所示，所述基因NEIL3对应的探针序列如SEQ ID NO . 166～169所示，所述基因NTHL1对应的探针序列如SEQ ID NO . 170～172所示，所述基因OGG1对应的探针序列如SEQ ID NO. 173～176所示，所述基因PARP2对应的探针序列如SEQ ID NO . 177～182所示，所述基因PARP4对应的探针序列如SEQ ID NO . 183～197所示，所述基因POLE对应的探针序列如SEQ ID NO . 198～220所示，所述基因POLE2对应的探针序列如SEQ ID NO . 221～224所示，所述基因POLE3对应的探针序列如SEQ ID NO . 225～227所示，所述基因POLE4对应的探针序列如SEQ ID NO. 228～229所示，所述基因POLK对应的探针序列如SEQ ID NO . 230～235所示，所述基因SMUG1对应的探针序列如SEQ ID NO . 236～238所示，所述基因TDG对应的探针序列如SEQID NO . 239～242所示，所述基因TDP1对应的探针序列如SEQ ID NO . 243～247所示，所述基因UNG对应的探针序列如SEQ ID NO . 248～250所示，所述基因WRN对应的探针序列如SEQ ID NO . 251～263所示。
4.一种检测与DNA碱基切除修复通路相关的基因的方法，其特征在于，包括以下步骤：
（1）获得受试者的DNA样本库；
（2）将权利要求1所述的试剂盒中SEQ ID NO . 1～263所示的全部探针与所述DNA样本库进行杂交；
（3）分离步骤（2）的杂交产物，并释放出与试剂盒中探针杂交的基因片段，采用测序技术对分离出的基因片段进行测序从而检测基因的突变情况。
5.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤（1）中的DNA样本库由双链DNA片段组成；
所述步骤（1）包括以下步骤：提取全基因组DNA，然后将其片段化；或者提取mRNA，将其片段化，然后以经片段化的mRNA为模板合成双链cDNA。
6.根据权利要求4所述的方法，其特征在于，所述步骤（2）中的探针进行选择性标记。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于，所述步骤（2）中的探针进行生物素标记。
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