CN110691793A - 黏结蛋白聚糖-1（cd138）结合剂及其用 - Google Patents

Abstract

在某些实施方案中，本文提供了包含特异性结合黏结蛋白聚糖‑1的结合剂的组合物及其用途。

Description

黏结蛋白聚糖-1（CD138）结合剂及其用

技术领域

相关专利申请

本专利申请要求2017年4月26日提交的名称为“SYNDECAN-1 (CD138)BINDINGAGENTS AND USES THEREOF”的美国临时专利申请号62/490,463的权益，该申请指定JuliaCoronella、Robyn Richardson、Anjuli Timmer和Roland Newman为发明人，并由代理人案号057774-0445246指定。上述专利申请的全部内容通过引用并入本文，包括全文、表格和附图。发明领域

本发明的实施方案涉及包含特异性结合黏结蛋白聚糖-1(CD138)或其一部分的结合剂的组合物，及其用途。

背景技术

引言

黏结蛋白聚糖(syndecan)家族由主要存在于细胞表面的四种跨膜硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(heparan sulfate proteoglycan，HSPG)组成。这些不同的黏结蛋白聚糖的结构在脊椎动物和无脊椎动物中显示出高度同源性。所有四种黏结蛋白聚糖都由装饰有不同数量的糖胺聚糖(GAG)侧链的核心蛋白构成。黏结蛋白聚糖主要通过这些GAG链发挥其功能，但核心蛋白的不同结构域也具有独特的作用。黏结蛋白聚糖-1和黏结蛋白聚糖-3 携带硫酸乙酰肝素(HS)和硫酸软骨素(CS)链二者，而黏结蛋白聚糖 -2和黏结蛋白聚糖-4仅携带HS链。黏结蛋白聚糖参与广泛的生物过程，包括生长和分化、细胞扩散、细胞黏附、细胞迁移、细胞骨架组织、浸润和血管生成。

黏结蛋白聚糖-1是跨膜(1型)硫酸乙酰肝素蛋白聚糖，其包含N端细胞外结构域、跨膜结构域和C端细胞内信号传导结构域。在人中，黏结蛋白聚糖-1(CD138)包含长度为310个氨基酸的核心蛋白，并且由SDC1 基因编码。SDC1基因由5个外显子组成，并且位于人类2号染色体上。第一个外显子编码信号肽，第二个外显子编码硫酸乙酰肝素的附着位点，第三个和第四个外显子编码硫酸软骨素结合位点，并且第五个外显子编码跨膜和胞质结构域。

黏结蛋白聚糖-1在成体组织中的上皮细胞的基底外侧(basolateral) 表面上，发育期间在间充质细胞上，并且在分化的不同阶段中在淋巴样细胞上表达。黏结蛋白聚糖-1可以结合肝细胞生长因子(HGF)，可以与多种生长因子相互作用并充当共同受体，导致影响细胞迁移、细胞-基质相互作用、生长、增殖和存活的多种信号传导途径。多项研究涉及黏结蛋白聚糖-1在多种恶性肿瘤中的关键作用，包括肺癌、乳腺癌、头颈癌、胃肠道恶性肿瘤、骨髓瘤和恶性间皮瘤(一种高度侵袭性的间充质肿瘤)。

本文提供了特异性结合黏结蛋白聚糖-1的新结合剂、单克隆抗体及其结合部分，其药物组合物及其使用方法。

发明内容

在一些方面，本文提供了特异性结合黏结蛋白聚糖-1、黏结蛋白聚糖 -1的细胞外结构域或其一部分的结合剂。在一些实施方案中，本文所述的结合剂特异性结合包含黏结蛋白聚糖-1、黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域或其一部分的蛋白质或多肽。在某些实施方案中，结合剂特异性结合选自以下的一种或更多种哺乳动物黏结蛋白聚糖-1多肽：人黏结蛋白聚糖-1、非人灵长类动物黏结蛋白聚糖-1(例如，猴黏结蛋白聚糖-1)、大鼠黏结蛋白聚糖-1和小鼠黏结蛋白聚糖-1。在某些实施方案中，结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1的变体和/或包含一种或更多种天然存在的变体的人黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域。

在一些方面，本文提供了黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含选自 CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3的一个或更多个轻链互补决定区，其中 CDR-L1包含与选自表1的CDR-L1的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，CDR-L2包含与选自表2的CDR-L2的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，并且CDR-L3包含与选自表3的CDR-L3的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1 结合剂包含CDR-L3和任选的CDR-L2。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3。

在一些方面，本文提供了黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含选自 CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3的一个或更多个重链互补决定区，其中 CDR-H1包含与选自表6的CDR-H1的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，CDR-H2包含与选自表7的CDR-H2的氨基酸序列具有至少 80％同一性的多肽序列，并且CDR-H3包含与选自表8的CDR-H3的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含CDR-H3。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3。

在一些方面，本文提供了黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含选自 CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3的一个或更多个轻链互补决定区，其中 CDR-L1包含与选自表1的CDR-L1的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，CDR-L2包含与选自表2的CDR-L2的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，并且CDR-L3包含与选自表3的CDR-L3的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列。

在本文提供的黏结蛋白聚糖-1结合剂的某些实施方案中，CDR-L1包含与选自表1的CDR-L1的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列， CDR-L2包含与选自表2的CDR-L2的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列，并且CDR-L3包含与选自表3的CDR-L3的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列。在一些实施方案中，CDR-L1包含选自表1的多肽序列，CDR-L2包含选自表2的多肽序列，并且CDR-L3包含选自表 3的多肽序列。

在本文提供的黏结蛋白聚糖-1结合剂的某些实施方案中，CDR-H1包含与选自表6的CDR-H1的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列， CDR-H2包含与选自表7的CDR-H2的氨基酸序列具有至少90％的同一性的多肽序列，并且CDR-H3包含与选自表8的CDR-H3的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列。在一些实施方案中，CDR-H1包含选自表6 的多肽序列，CDR-H2包含选自表7的多肽序列，并且CDR-H3包含选自表8的多肽序列。

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含CDR-H3，或由其组成。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含CDR-H3和CDR-L3，或由其组成。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含CDR-H3、 CDR-L3和CDR-H2或CDR-L2，或由其组成。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含CDR-H3、CDR-L3、CDR-H2、CDR-L2和CDR-H1 和/或CDR-L1，或由其组成。在一些实施方案中，CDR区选自表1-10中的一个或更多个。

在一些方面，本文提供了黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含为轻链互补决定区(CDR-L)的三个多肽序列的CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3，其中CDR-L1选自表1，CDR-L2选自表2，CDR-L3选自表3，并且其中黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

在一些方面，本文提供了黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含为重链互补决定区(CDR-H)的三个多肽序列的CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3，其中CDR-H1选自表6，CDR-H2选自表7，CDR-H3选自表8，并且其中黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

在一些方面，本文提供了黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含选自表1 的CDR-L1、选自表2的CDR-L2、选自表3的CDR-L3、选自表6的 CDR-H1、选自表7的CDR-H2、和选自表8的CDR-H3，其中黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂是抗体或其结合片段。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂是单克隆抗体或其结合片段。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含IgG、IgD、IgE、IgA或IgM 的恒定区。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含IgG₁、IgG₂、 IgG₃或IgG₄的恒定区。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂选自 Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、Fd、单链Fv(scFv)、二硫化物连接的Fvs(sdFv)、 VL、VH、双抗体((VL-VH)2或(VH-VL)2)、三抗体(三价)、四抗体(四价)、微抗体((scFV-CH3)2)、IgGδCH2、scFv-Fc、(scFv)2-Fc，及其结合片段。

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂是人源化的或包含至少一个人恒定区或其一部分。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含一个、两个或至少三个人或人源化框架区。

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂以50nM 或更小的结合亲和力(KD)特异性结合人黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合包含氨基酸序列GX₁KEX₂EAX₃VLP(SEQ ID NO：91)的多肽，其中X₁、X₂和X₃选自任意氨基酸。在某些实施方案中，X₁选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₂选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₃选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和苯丙氨酸。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合包含氨基酸序列AGEGPKEGEAVVLP(SEQ IDNO：89)或 GPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：90)的多肽。

在一些方面，本文提供了包含黏结蛋白聚糖-1结合剂的药物组合物。在一些实施方案中，药物组合物被配制成适合于向哺乳动物静脉内施用的无菌组合物。在一些实施方案中，药物组合物被配制用于选自以下的施用途径：外用、局部、透皮、皮肤、皮下、结膜下、玻璃体内、球后、前房内、鼻内、透黏膜、肠内、经口、舌下、直肠、肠胃外、全身、静脉内、动脉内、肌内、腹膜内、腔内、颅内、子宫内、阴道内和膀胱内输注。

在以下描述、实施例、权利要求和附图中进一步描述了本技术的某些方面。

附图说明

附图示出了本技术的实施例，并且不是限制性的。为了清楚和便于示出，附图未按比例绘制，并且在一些情况下，可扩大或放大地示出多个方面以便于理解特定实施方案。

[图1]图1示出了来自人、食蟹猴(cyno)和小鼠的CD138蛋白的比对。用于免疫接种的肽来自加框区域。

[图2]图2示出了F12P16F6(图2A)和另一种阳性杂交瘤克隆 F12P16G3(图2B)与H929细胞结合的FACS直方图。

[图3]图3示出了代表性杂交瘤(即F12P16F6)在167nM(L1A1) 至10.4nM(L1A4)下与人CD138(上图)结合的动力学结合分析(即 SPR声波图)的结果。

[图4]图4示出了代表性嵌合抗体12P16F6 hIgG1(chF6，图4A)和 13P30A7 hIgG1(chP30A7，图4B)与人CD138表达细胞(人)和食蟹猴 CD138表达细胞(cyno)的结合。对照抗体(Sec)显示很少或没有与CD138 特异性结合。

[图5A]图5A示出了与亲本F12P16F6(P16F6)相比的人源化重链。标识cdr表示CDR移植方法，标识abb表示简化CDR移植方法，标识sdr 表示SDR转移方法，标识fra表示Frankenstein方法，而标识ven表示饰面(Veneering)方法。标识修复(repair)表明可变区经历第二轮人源化。

[图5B]图5B示出了与亲本F12P16F6(P16F6)相比的人源化轻链。标识 cdr、abb、sdr、fra、ven和修复表示与图5A相同的方法。

[图6]图6示出了在还原条件下运行的SDS-PAGE凝胶的照片，说明了11种代表性人源化抗体的分子量(kDa)和纯度。泳道1＝12P16F6 hIgG1，泳道2＝hF6 aka-rep，泳道3＝hF6 aks-rep，泳道4＝hF6 akf-rep，泳道5＝hF6 cka-rep，泳道6＝hF6 ckf-rep，泳道7＝hF6 f2ka-rep，泳道8＝hF6 f2ks-rep，泳道9＝hF6 f2kf-rep，泳道10＝hF6 f1ka-rep，泳道11＝hF6 f1ks-rep，泳道 12＝hF6 f1kf-rep，并且MW＝分子量标志。分子量标志标记在凝胶的右侧。

[图7]图7示出了11种代表性人源化抗体与多发性骨髓瘤细胞系 KMS-11(图7B)和膀胱癌细胞系RT112/84(图7A)的表面上的人CD138 的细胞表面结合的FACS分析。苏金单抗(Secukinumab)用作阴性对照。

[图8]图8示出了来自在

分辨率下解析的与抗体Fab片段复合的人黏结蛋白聚糖-1肽的X射线晶体结构的图示。每个不对称单元具有黏结蛋白聚糖-1肽和Fab各一拷贝。图8示出了黏结蛋白聚糖-1-Fab结合界面。Fab重链以图中左侧的带状侧链碳原子的形式示出。Fab轻链以图中右侧的带状侧链碳原子的形式示出。黏结蛋白聚糖-1肽碳原子显示为夹在Fab重链和轻链之间。黏结蛋白聚糖-1肽的某些氨基酸和Fab片段的某些侧链用其相应的3字母氨基酸缩写和位置标记。

具体实施方式

在一些实施方案中，本文提供了结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的单克隆结合剂，以及其组合物和用途。人黏结蛋白聚糖-1(例如，SEQ ID NO： 1)通常包含310个氨基酸的未成熟多肽序列，从N端到C端编号，其包含第1-22位氨基酸的N端单序列，约第23-254位氨基酸的细胞外结构域，约第255至275位氨基酸的跨膜结构域和约第276至310位氨基酸的胞质结构域。鉴定黏结蛋白聚糖-1受体的前导序列、细胞外结构域、跨膜结构域和胞质结构域的方法是已知的，并且任何合适的方法可用于鉴定来自合适哺乳动物物种的黏结蛋白聚糖-1多肽序列内的这样的结构域或区域。

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1是哺乳动物黏结蛋白聚糖-1。黏结蛋白聚糖-1可来自任何哺乳动物物种。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1多肽是人黏结蛋白聚糖-1。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域包含黏结蛋白聚糖-1多肽的N端部分，其通常在完整哺乳动物细胞的细胞表面上表达。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域以缺少胞质和/或跨膜结构域的可溶性或非膜结合形式表达。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1和/或黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域包含一个或更多个氨基酸添加、缺失或替换。黏结蛋白聚糖-1多肽可包含与黏结蛋白聚糖-1多肽具有至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少98％或100％同一性的氨基酸序列。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1多肽包含黏结蛋白聚糖-1蛋白质的一部分(例如，子序列)。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1的一部分包含黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域或其一部分。

在一些实施方案中，本文提供了包含一种或更多种特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂的组合物(例如，药物组合物)。在一些实施方案中，本文提供的结合剂用于治疗、预防和/或诊断受试者中的肿瘤性疾病和/或癌症。

术语“受试者”是指哺乳动物。可以通过本文描述的方法或组合物治疗任何合适的哺乳动物。哺乳动物的非限制性实例包括人、非人灵长类动物 (例如，猿、长臂猿、黑猩猩、猩猩、猴、猕猴等)、家畜(例如，狗和猫)、农场动物(例如，马、牛、山羊、绵羊和猪)和实验动物(例如，小鼠、大鼠、兔和豚鼠)。在一些实施方案中，哺乳动物是人。哺乳动物可以是任何年龄或处于任何发育阶段(例如，成年、青少年、儿童、婴儿或子宫内的哺乳动物)。哺乳动物可以是雄性或雌性。在一些实施方案中，有需要的受试者是患有或怀疑患有肿瘤性疾病或癌症的受试者。

在某些实施方案中，结合剂包含与至少一种抗原(例如，黏结蛋白聚糖-1或其一部分)特异性结合的一种或更多种多肽或一种或更多种蛋白质，或由其组成。结合剂通常包含至少一个抗原结合部分(即结合部分)。结合剂的抗原结合部分是与抗原特异性结合的部分。在某些实施方案中，结合剂的结合部分包含单个多肽(例如，单链抗体)，或由其组成。在一些实施方案中，结合剂的结合部分包含两个多肽，或由其组成。在一些实施方案中，结合剂的结合部分包含2、3、4或更多个多肽，或由其组成。在一些实施方案中，结合剂包含一个或更多个结构部分(例如，支架、结构多肽、恒定区和/或框架区)。在一些实施方案中，结合剂或其结合部分附着于基底(例如，聚合物、非有机材料、硅、珠等)。

结合剂可包含一个抗原结合部分或多个抗原结合部分。例如，包含一个结合部分的结合剂有时被称为单价的。包含两个结合部分的结合剂有时被称为二价的。在一些实施方案中，结合剂包含1、2、3、4、5、6、7、 8、9或10个或更多个结合部分。在某些实施方案中，多价结合剂的所有结合部分结合相同的抗原。在某些实施方案中，多价结合剂的所有结合部分包含具有至少90％、至少95％、至少99％或100％同一性的一个或更多个多肽序列。

在一些实施方案中，结合剂包含抗体或其一部分(例如，其结合部分)。在某些实施方案中，结合剂包含抗体、抗体片段和/或抗体的抗原结合部分(例如，结合片段，即其结合部分)，或由其组成。在一些实施方案中，结合剂是抗体(例如，单克隆抗体和/或重组抗体)。结合剂或抗体可以通过合适的方法产生、制造或生产。在一些实施方案中，结合剂是单克隆的。在一些实施方案中，结合剂是来自合适物种的单克隆抗体。结合剂的某些非限制性实例包括单克隆抗体、嵌合抗体、抗体结合片段(例如，抗体的抗原结合部分)、CDR-移植抗体、人源化抗体和人抗体，或其一部分。人抗体可通过任何合适的方法获得。例如，人抗体可以从经改造以产生完全人抗体的转染色体动物中获得。在某些实施方案中，结合剂不是多克隆的，和/或不是多克隆抗体。

在一些实施方案中，结合剂从合适的物种中得到、产生、获得、分离和/或纯化。在一些实施方案中，结合剂从例如兔、山羊、马、牛、大鼠、小鼠、鱼、鸟或美洲驼中得到、产生、获得、分离和/或纯化。在一些实施方案中，结合剂从鸟(例如，鸡或鸟蛋)中得到、产生、获得、分离和 /或纯化。在一些实施方案中，结合剂从植物中得到、产生、获得、分离和/或纯化(例如，由经遗传改造的植物产生的重组结合剂)。在一些实施方案中，结合剂从合适的哺乳动物中得到、产生、获得、分离和/或纯化。在某些实施方案中，合适的哺乳动物是经遗传改变的哺乳动物(例如，转染色体或转基因哺乳动物)，其被改造以产生包含人重链和/或人轻链或其一部分的抗体。在一些实施方案中，结合剂从原核或真核细胞中产生、获得、分离或纯化(例如，由经遗传改造的细胞产生的重组结合剂)。在一些实施方案中，结合剂从病毒中产生、获得、分离或纯化(例如，由经遗传改造的病毒产生的重组结合剂)。

结合剂可以从合适的表达系统中表达、分离和/或纯化，表达系统的非限制性实例包括合适的细菌、噬菌体、昆虫、病毒、植物或哺乳动物表达系统。例如，可以将编码结合剂的核酸引入合适的哺乳动物细胞系中，该细胞系表达结合剂并分泌到细胞培养基中。可以使用任何合适的哺乳动物细胞系。在某些实施方案中，哺乳动物细胞系是中国仓鼠卵巢(CHO) 细胞系。产生结合剂(例如，黏结蛋白聚糖-1结合剂)的方法可包括以下一种或更多种：(i)将一种或更多种核酸引入合适的细胞系中，其中所述核酸指导结合剂的表达；(ii)使用合适的培养方法培养细胞系一段时间，其允许结合剂的表达；(iii)收获细胞系(例如，通过产生裂解物)或收获来自细胞系的条件化培养基(例如，当分泌结合剂时)；以及(iv)使用合适的方法分离和/或纯化结合剂。

在某些实施方案中，结合剂未见于自然界中并且不是天然存在的。例如，在某些实施方案中，结合剂通过以下在动物中人工地产生：施用包含外来重组抗原、强效佐剂和通常矿物油和/或洗涤剂的乳化混合物 (emulsified cocktail)，从而诱导针对该外来重组抗原(例如，黏结蛋白聚糖-1、黏结蛋白聚糖-1-Fc)的人工免疫应答。

在某些实施方案中，单克隆抗体或单克隆结合剂是结合剂或其结合片段的基本上同质的群体，其中除了在单克隆结合剂的生产过程中可能出现的变体外，群体中的每种个体结合剂基本上相同和/或结合相同的表位。在一些实施方案中，这样的变体通常不存在或可以少量存在。与通常包含针对不同决定簇(表位)的不同抗体的群体的多克隆抗体制剂相反，单克隆结合剂群体的每种结合剂通常结合抗原上的单一决定簇。单克隆结合剂通常不被其他免疫球蛋白污染。尽管可以有目的地将一种或更多种不同的单克隆结合剂添加到组合物中以形成混合物。

修饰语“单克隆”不应被解释为需要通过任何特定方法产生结合剂。单克隆结合剂可以通过任何合适的方法产生。例如，在某些实施方案中，通过杂交瘤方法(例如，如Kohleret al，Nature，256：495(1975)所述)或其变化形式制备单克隆抗体。在一些实施方案中，通过重组DNA方法制备单克隆结合剂。例如，可以通过使用合适的表达系统(例如噬菌体展示表达系统)筛选重组文库来制备单克隆结合剂。在一些实施方案中，从结合剂的噬菌体文库中分离单克隆结合剂，例如通过使用Clackson et al，Nature， 352：624-628(1991)和/或Marks et al，J.Mol Biol，222：581-597(1991)描述的技术，或其变化形式。

在某些实施方案中，结合剂包含一个或更多个结构或骨架部分，有时称为支架(scaffold)。结合剂可包含支架，其非限制性实例包括来自以下的支架：抗体、蛋白A的Z结构域、γ-B晶体、泛素、半胱氨酸蛋白酶抑制剂(cystatin)、Sac7d、三螺旋卷曲螺旋、脂质运载蛋白、锚蛋白重复基序、合适的蛋白酶抑制剂的Kunitz结构域、纤连蛋白结构域、核酸聚合物等，其一部分或其组合。在一些实施方案中，结合剂不包含支架。在某些实施方案中，结合剂包含哺乳动物抗体的一个或更多个结构部分。

在某些实施方案中，结合剂包含一个或更多个恒定区(例如，来源于抗体(例如哺乳动物抗体)的恒定区)。结合剂可包含抗体的任何合适的恒定区，或其一个或更多个部分。在某些实施方案中，结合剂包含抗体轻链的恒定区和/或抗体重链的恒定区。在一些实施方案中，结合剂包含λ (lambda)轻链恒定区或其一部分。在一些实施方案中，结合剂包含κ(kappa)轻链恒定区或其一部分。在一些实施方案中，结合剂包含与哺乳动物抗体的轻链恒定区或其一部分的多肽序列具有至少75％、至少 80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％同一性的多肽。在一些实施方案中，结合剂包含与人抗体的轻链恒定区的多肽序列具有至少 75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％或至少99％同一性的多肽。在一些实施方案中，结合剂不包含轻链恒定区。

在某些实施方案中，结合剂包含抗体重链的恒定区。结合剂可包含任何合适的重链恒定区或其一部分。在哺乳动物中，抗体可以具有至少五种类型/类别的Ig重链，表示为IgA、IgD、IgE、IgG和IgM，其通过独特的重链恒定区或其一部分(例如，CH1、CL、CH2、CH3结构域)的存在来确定。在一些实施方案中，结合剂包含IgM、IgD、IgA或IgE同种型的一个或更多个重链恒定区，或其一部分。在一些实施方案中，结合剂包含 IgG₁、IgG₂、IgG₃或IgG₄的重链恒定区，或其一个或更多个部分。在一些实施方案中，结合剂包含与哺乳动物抗体重链恒定区的多肽具有至少 75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少99％同一性或100％同一性的多肽。在一些实施方案中，结合剂包含与人抗体重链恒定区的多肽具有至少75％、至少80％、至少85％、至少90％、至少95％、至少99％同一性或100％同一性的多肽。在一些实施方案中，结合剂包含恒定区的一个或更多个添加、缺失和/或修饰。结合剂有时被修饰以改变抗体类别或结合剂的同种型。在一些实施方案中，结合剂包含一个或更多个添加、缺失和/或修饰(一个或更多个氨基酸替换、缺失或添加)以改变结合剂的一种或更多种功能，例如消除、增强或降低血清半衰期、Fc 受体结合、补体结合(例如，C1q结合)、糖基化、唾液酸化、细胞毒性、抗体依赖性细胞介导的吞噬作用(ADCP)、抗体依赖性细胞毒性(ADCC)等。在一些实施方案中，结合剂不包含重链恒定区或轻链恒定区的一个或更多个部分。在一些实施方案中，结合剂不包含重链恒定区。

在一些实施方案中，结合剂包含抗体的一个或更多个可变区或其一部分，或由其组成。在一些实施方案中，结合剂包含一个或更多个轻链可变区或其一部分。在一些实施方案中，结合剂包含一个或更多个重链可变区或其一部分。在某些实施方案中，结合剂包含至少一个轻链可变区和至少一个重链可变区。轻链可变区和重链可变区可以在相同或不同的多肽上。

在某些实施方案中，结合剂是非天然存在的结合剂。非天然存在的结合剂的非限制性实例包括单克隆结合剂(例如，单克隆抗体)、嵌合抗体、 CDR-移植的抗体、人源化抗体、单链抗体、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、单链Fv(scFv)、scFv-Fc、(scFv)2-Fc、二硫化物连接的Fvs(sdFv)、VL、 VH、双抗体(Dab)、三抗体(三价)、四抗体(四价)、微抗体((scFV-CH3)2)、 IgGδCH2、合成抗体(synbody)、双特异性抗体(fynomer)、亲合抗体 (affibody)、亲合蛋白(affilin)、affimer、affitin、α抗体(alphabody)、 anticalin、亲和聚体(avimer)、DARPin、Kunitz结构域肽、单抗体 (monobody)、TandAb、纳米抗体(nanobody)、BiTE、SMIP、DNL、Duocalin、 adnectin、Albu-dab、DART、DVD-IG、Covx-body、肽抗体(peptibody)、 scFv-Ig、SVD-Ig、dAb-Ig、杵臼结构抗体(Knob-in-Hole)、triomAb，其组合，及其抗原结合部分。

在一些实施方案中，结合剂包含Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、单链 Fv(scFv)、双抗体(Dab)、合成抗体等和/或其组合或部分，或由其组成。在一些实施方案中，结合剂是Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv片段、单链Fv(scFv)、双抗体(Dab)、合成抗体等和/或其组合或部分(参见，例如美国专利号 6,099,842和5,990,296)。在一些实施方案中，结合剂包含含有一个或更多个抗原结合部分的单链多肽。例如，可以使用重组分子生物学方法通过利用接头(例如，氨基酸、多肽接头)将重链可变区或其抗原结合部分与轻链可变区或其抗原结合部分连接来构建单链结合剂。这样的单链结合剂通常表现出与亲本双链单克隆结合剂相似的对抗原的特异性和亲和力。结合剂通常包含经改造的区域，例如CDR移植或人源化部分。在某些实施方案中，结合剂是完整的双链免疫球蛋白，并且在另一些实施方案中，结合剂是Fab单体或Fab二聚体。

编码结合剂多肽的核酸或其一部分可以通过合适的克隆方法克隆、亚克隆、重排或修饰用于重组表达，并且随后通过本领域技术人员已知的方法使用合适的表达系统表达(例如，参见Maniatis et al.，Molecular Cloning： A Laboratory Manual，Cold SpringHarbor Laboratory，1982；Antibody Engineering：Methods and Protocols，Vol.248 ofMethods in molecular biology，edited by Benny K.C.Lo，Springer Science &Business Media， 2004；Antibody Engineering，Vol.1，Roland E.Kontermann，StefanDuebel， Edition 2，Publisher Springer Science & Business Media，2010；AntibodyPhage Display：Methods and Protocols，Biomed Protocols，Vol.178 of Methods inmolecular biology，Editors Philippa M.O’Brien，Robert Aitken， Springer Science& Business Media，2004)。

在哺乳动物中，抗体的重链可变区和轻链可变区各自贡献三个CDR (互补决定区)，通常称为CDR1、CDR2和CDR3，其被框架区分开和/ 或侧接框架区(例如，FR1、FR2、FR3和FR4)。如本文所用的术语“CDR”是指被鉴定为互补决定区的多肽的氨基酸序列。在某些实施方案中，CDR 多肽序列的限定性描绘和包含结合剂的结合位点的残基的鉴定通过解决结合剂的结构和/或解决结合剂-抗原复合物的结构来实现。在某些实施方案中，这可通过任何合适的方法(例如X-射线晶体学和/或计算机建模) 来实现。在某些实施方案中，可使用多种分析方法来鉴定或接近于结合剂或抗体的CDR序列。例如，可使用合适的方法来鉴定结合剂、抗体、其结合部分或其可变区的多肽序列中CDR的氨基酸序列和/或位置，所述合适的方法的一些非限制性实例包括Kabat系统(例如，参见Kabat，E.A.，et al.，1991；Sequencesof Proteins of Immunological Interest，Fifth Edition，NIH Publication No.91-3242，以及Johnson，G.and Wu，T.T.2000，Nucleic Acids Research)，和/或Chothia编号方案(例如Chothia & Lesk，(1987)J.Mol.Biol， 196：901-917；Chothia et al，Nature，(1989)342：878-883；和Al-Lazikani et al.， (1997)JMB 273，927-948)。在一些实施方案中，可使用AbM方法和/或接触方法来鉴定抗体的CDR的氨基序列和/或位置。“AbM”限定(definition) 使用由Oxford Molecular Group生产的对抗体结构进行建模的一套集成计算机程序(参见例如Martin et al，Proc.Natl.Acad.Sci.(USA)，86：9268-9272 (1989)；“AbM(Trademark)，A Computer Program for Modeling Variable Regions ofAntibodies，”Oxford，UK；Oxford Molecular，Ltd.)。AbM限定使用知识数据库和从头计算法的组合来由一级序列对抗体的三级结构进行建模，例如Samudrala et al.，“Ab InitioProtein Structure Prediction Using a Combined Hierarchical Approach，”inPROTEINS，Structure，Function and Genetics Suppl，3：194-198(1999)的描述。在某些实施方案中，接触限定基于对可用的复杂晶体结构的分析(参见例如MacCallum et ah，J.Mol.Biol， 5：732-45(1996))。

在一些实施方案中，结合剂和/或结合剂的抗原结合部分包含至少2 个、至少3个、至少4个、至少5个或至少6个CDR。在一些实施方案中，结合剂包含3至60个CDR(例如，对于具有多个抗原结合部分的结合剂)。在一些实施方案中，结合剂包含3至12个CDR。在一些实施方案中，结合剂的抗原结合部分包含1至6个CDR多肽序列。

在某些实施方案中，结合剂和/或结合剂的抗原结合部分包含轻链可变区的一个、两个或三个CDR。在一些实施方案中，结合剂的轻链可变区包含一个或更多个CDR(例如，一个、两个、三个或更多个CDR)。代表抗体或结合剂的轻链可变区中的CDR的氨基酸序列称为CDR-L1、 CDR-L2和CDR-L3，其按照从轻链可变区的氨基端(N端)到羧基端(C 端)的方向顺序编号(即，L1、L2和L3)。例如，在代表结合剂的轻链可变区的多肽中，CDR-L1(当存在时)是最N端轻链CDR；CDR-L3(当存在时)是最C端轻链CDR；并且CDR-L2(当存在时)位于结合剂的轻链可变区或结合部分的(i)CDR-L1和CDR-L3之间，(ii)CDR-L3的N 端侧或(iii)CDR-L1的C端侧。术语“CDR-L1”、“CDR-L2”和“CDR-L3”部分地指鉴定为或在本文中公开为结合剂的互补决定区的多肽的氨基酸序列(例如，轻链可变区的CDR)。CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3的氨基酸序列的非限制性实例分别在表1-3中提供。本文所述的结合剂的轻链可变区或抗原结合部分可包含本文公开的CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3的任何组合，其中结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。在某些实施方案中，本文所述的结合剂的轻链可变区或抗原结合部分包含单个轻链CDR，其包含与选自表3的CDR-L3具有至少70％同一性的氨基酸序列。在某些实施方案中，本文所述的结合剂的轻链可变区或抗原结合部分包含与选自表3的CDR-L3具有至少70％同一性的氨基酸序列，以及任何其他合适的CDR-L2和/或CDR-L1多肽序列，其中结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。在某些实施方案中，结合剂的轻链可变区或抗原结合部分的轻链CDR由CDR-L3和CDR-L2组成，其中CDR-L3包含与选自表3的CDR-L3具有至少70％同一性的氨基酸序列，并且CDR-L2包含与选自表2的CDR-L2具有至少70％同一性的氨基酸序列。在某些实施方案中，本文所述的结合剂的轻链可变区或抗原结合部分包含与选自表3的CDR-L3具有至少70％同一性的氨基酸序列和与选自表2的CDR-L2具有至少70％同一性的氨基酸序列，以及任何其他合适的 CDR-L1多肽序列，其中结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。在某些实施方案中，本文所述的结合剂的轻链可变区或抗原结合部分包含三个轻链CDR，其由与选自表3的CDR-L3具有至少70％同一性的氨基酸序列、与选自表2的CDR-L2具有至少70％同一性的氨基酸序列和与选自表1的CDR-L1具有至少70％同一性的氨基酸序列组成。在某些实施方案中，本文所述的结合剂的轻链可变区或抗原结合部分包含与选自表3的CDR-L3具有至少70％同一性的氨基酸序列、与选自表2的 CDR-L2具有至少70％同一性的氨基酸序列和与选自表1的CDR-L1具有至少70％同一性的氨基酸序列，其中结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。

在一些实施方案中，结合剂包含与表1、2或3中列出的任一个CDR 序列具有至少70％、75％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、 92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的一个或更多个轻链CDR。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含与表1中所示的任一个序列具有至少70％、75％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的CDR-L1。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含表1中所示的任一个序列的CDR-L1。

表1：CDR-L1序列

SEQ ID	杂交瘤克隆/抗体名称	氨基酸序列
			SEQ ID NO：2	F12P16F6	KSSQSLLASDGKTYLN
SEQ ID NO：3	F12P16F6	QSLLASDGKTY
			SEQ ID NO：4	F13P30A7	KASENVGNYVS
SEQ ID NO：5	F13P30A7	ENVGNY
			SEQ ID NO：6	F13P18D8	KASENVGTYVS
SEQ ID NO：7	F13P18D8	ASENVGTY
			SEQ ID NO：8	F12P7G11	RASSSVNYMH
SEQ ID NO：9	F12P7G11	ASSSVNY
			SEQ ID NO：10	F13P14D3	KASENVGSYVS
SEQ ID NO：11	F13P14D3	ASENVGSY
			SEQ ID NO：12	F11AP11E5	KSGQSLLYSNGKTYLT
SEQ ID NO：13	F11AP11E5	KSGQSLLYSNG
			SEQ ID NO：14	F12P18D4.a	KSSQSLLYSNGKTYLN
SEQ ID NO：15	F12P18D4.a	KSSQSLLYSNG

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表2中所示的任一个序列具有至少70％、75％、 85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、 97％、98％、或至少99％同一性的CDR-L2。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表2中所示的任一个序列的CDR-L2。

表2：CDR-L2序列

SEQ ID	杂交瘤克隆/抗体名称	氨基酸序列
			SEQ ID NO：16	F12P16F6	YLVSKLDS
SEQ ID NO：17	F12P16F6	LVSKLDS
			SEQ ID NO：18	F12P16F6	LVSKLD
SEQ ID NO：19	F13P30A7	YGASYRYT
			SEQ ID NO：20	F13P30A7	GASYRYT
SEQ ID NO：21	F13P30A7	GASYRY
			SEQ ID NO：22	F13P18D8	GASNRYT
SEQ ID NO：23	F12P7G11	ATSYLAS
			SEQ ID NO：24	F13P14D3	GASNRNT
SEQ ID NO：25	F11AP11E5	QVSKLDP
			SEQ ID NO：26	F12P18D4.a	LVSKVDS

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表3中所示的任一个序列具有至少70％、75％、 85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、 97％、98％、或至少99％同一性的CDR-L3。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表3中所示的任一个序列的CDR-L3。

表3：CDR-L3序列

SEQ ID	杂交瘤克隆/抗体名称	氨基酸序列
			SEQ ID NO：27	F12P16F6	WQGAHFPFT
SEQ ID NO：28	F12P16F6	QGAHFPF
			SEQ ID NO：29	F13P30A7/F13P14D3	GQSSRYPLT
SEQ ID NO：30	F13P30A7/F13P14D3	QSSRYPL
			SEQ ID NO：31	F13P18D8	GQSSRYPLT
SEQ ID NO：32	F12P7G11	QQWSSDPLT
			SEQ ID NO：33	F11AP11E5	LQNTYYPHT
SEQ ID NO：34	F12P18D4.a	VQGTHFPLT

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表4的氨基酸序列具有至少70％、75％、85％、86％、 87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的轻链可变区。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1 结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表4的轻链可变区序列。

表4.可变轻链序列

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表5的序列具有至少70％、75％、85％、86％、87％、 88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的人源化轻链可变区。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖 -1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表5的人源化轻链可变区序列。

表5：人源化轻链可变区

在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂和/或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含重链可变区的一个、两个或三个CDR。在一些实施方案中，重链可变区包含一个或更多个CDR(例如，一个、两个、三个或更多个CDR)。代表抗体或结合剂的重链可变区中的CDR的氨基酸序列称为CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3，其按照从重链可变区的氨基端(N端)到羧基端(C端)的方向顺序编号(即，H1、H2和H3)。例如，在代表黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区的多肽中，CDR-H1(当存在时)是最N端CDR；CDR-H3(当存在时)是最C端CDR；并且CDR-H2 (当存在时)位于重链可变区的(i)CDR-H1和CDR-H3之间，(ii)CDR-H3 的N端侧或(iii)CDR-H的C端侧。术语“CDR-H1”、“CDR-H2”和“CDR-H3”部分地指鉴定为或在本文中公开为黏结蛋白聚糖-1结合剂的互补决定区的多肽的氨基酸序列(例如，黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区的 CDR)。CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3的氨基酸序列的非限制性实例分别在表6-8中提供。本文所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区或抗原结合部分可包含本文公开的CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3的任何组合，其中黏结蛋白聚糖-1结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。在某些实施方案中，本文所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区或抗原结合部分包含单个重链CDR，其由与选自表8的CDR-H3具有至少70％同一性的氨基酸序列组成。在某些实施方案中，本文所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区或抗原结合部分包含与选自表8的 CDR-H3具有至少70％同一性的氨基酸序列，以及任何其他合适的 CDR-H2和/或CDR-H1多肽序列，其中黏结蛋白聚糖-1结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区或抗原结合部分的重链CDR由CDR-H3和 CDR-H2组成，其中CDR-H3包含与选自表8的CDR-H3具有至少70％同一性的氨基酸序列，并且CDR-H2包含与选自表7的CDR-H2具有至少 70％同一性的氨基酸序列。在某些实施方案中，本文所述的黏结蛋白聚糖 -1结合剂的重链可变区或抗原结合部分包含与选自表8的CDR-H3具有至少70％同一性的氨基酸序列和与选自表7的CDR-H2具有至少70％同一性的氨基酸序列，以及任何其他合适的CDR-H1多肽序列，其中黏结蛋白聚糖-1结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。在某些实施方案中，本文所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区或抗原结合部分包含三个重链CDR，其由与选自表8的CDR-H3具有至少70％同一性的氨基酸序列、与选自表7的CDR-H2具有至少70％同一性的氨基酸序列和与选自表6的CDR-H1具有至少70％同一性的氨基酸序列组成。在某些实施方案中，本文所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的重链可变区或抗原结合部分包含与选自表8的CDR-H3具有至少70％同一性的氨基酸序列、与选自表7的CDR-H2具有至少70％同一性的氨基酸序列和与选自表6的 CDR-H1具有至少70％同一性的氨基酸序列，其中黏结蛋白聚糖-1结合剂保持与黏结蛋白聚糖-1或其一部分的特异性结合。

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂包含与表6、7或8的任一个CDR具有至少70％、75％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、 91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的一个或更多个重链CDR。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表6中所示的任一个序列具有至少70％、75％、85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、 93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的CDR-H1。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表6中所示的任一个序列的CDR-H1。

表6.CDR-H1序列

SEQ ID	杂交瘤克隆/抗体名称	氨基酸序列
			SEQ ID NO：46	F12P16F6	KASGYTFTSYYLY
SEQ ID NO：47	F12P16F6	GYTFTSYYLY
			SEQ ID NO：48	F13P30A7	AASGFTFNTYAMN
SEQ ID NO：49	F13P30A7	ASGFTFNTYAM
			SEQ ID NO：50	F13P18D8	GFAFNTYAMN
SEQ ID NO：51	F12P7G11	GYTFSSHWMQ
			SEQ ID NO：52	F13P14D3	GFTFNTYAMN
SEQ ID NO：53	F11AP11E5	KASGYTFTNYYMY
			SEQ ID NO：54	F12P18D4.a	YTFAD
SEQ ID NO：55	F12P18D4.a	YTEADYYMK

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表7中所示的任一个序列具有至少70％、75％、 85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的CDR-H2。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表2中所示的任一个序列的CDR-H2。

表7：CDR-H2序列

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表8中所示的任一个序列具有至少70％、75％、 85％、86％、87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、 97％、98％、或至少99％同一性的CDR-H3。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表8中所示的任一个序列的CDR-H3。

表8：CDR-H3序列

SEQ ID	杂交瘤克隆/抗体名称	氨基酸序列
			SEQ ID NO：68	F12P16F6	TRSLLY
SEQ ID NO：69	F12P16F6	SLLY
			SEQ ID NO：70	F13P30A7	VTDYGYVYFDA
SEQ ID NO：71	F13P30A7	DYGYVYFDA
			SEQ ID NO：72	F13P18D8	DYYYVYFDV
SEQ ID NO：73	F12P7G11	GIYYDRSRAMDY
			SEQ ID NO：74	F13P14D3	VTDYGHVYFDV
SEQ ID NO：75	F11AP11E5	RFAY
			SEQ ID NO：76	F12P18D4.a	TYYDY

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表9的氨基酸序列具有至少70％、75％、85％、86％、 87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的重链可变区。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1 结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表9的重链可变区序列。

表9.可变重链序列

在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含与表10的序列具有至少70％、75％、85％、86％、87％、 88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％、95％、96％、97％、98％、或至少99％同一性的人源化重链可变区。在一些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1结合剂或黏结蛋白聚糖-1结合剂的抗原结合部分包含表10的人源化重链可变区序列。

表10：人源化重链

在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-L3，所述CDR-L3包含与SEQ ID NO：27至34的任一个氨基酸序列(例如，选自表3的CDR-L3序列)具有至少70％、至少75％、至少85％、至少86％、至少87％、至少88％、至少89％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少 97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H3，所述CDR-H3包含与SEQ ID NO：68至76的任一个氨基酸序列(例如，选自表8的CDR-H3序列)具有至少70％、至少75％、至少85％、至少 86％、至少87％、至少88％、至少89％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含：CDR-L3，所述CDR-L3包含与SEQ ID NO：27、 28、29或30的氨基酸序列具有至少70％、至少90％、至少95％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H3，所述CDR-H3 包含与SEQ ID NO：68、69、70或71的氨基酸序列具有至少70％、至少 90％、至少95％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。

在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-L3，所述CDR-L3包含与SEQ ID NO：27至34的任一个氨基酸序列(例如，选自表3的CDR-L3序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ ID NO： 16至26的任一个氨基酸序列(例如，选自表2的CDR-L2序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H3，所述CDR-H3 包含与SEQ ID NO：68至76的任一个氨基酸序列(例如，选自表8的 CDR-H3序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQ ID NO：56至67的任一个氨基酸序列(例如，选自表7的CDR-H2序列)具有至少70％、至少90％或 100％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含：CDR-L3，所述CDR-L3包含与SEQ ID NO：27或29的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ ID NO：16或19的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H3，所述CDR-H3包含与 SEQ ID NO：68或70的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQ ID NO：56或58的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列。

在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-L3，所述CDR-L3包含与SEQ ID NO：27至34的任一个氨基酸序列(例如，选自表3的CDR-L3序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ ID NO： 16至26的任一个氨基酸序列(例如，选自表2的CDR-L2序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L1，所述CDR-L1 包含与SEQ ID NO：2至15的任一个氨基酸序列(例如，选自表1的 CDR-L1序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列； CDR-H3，所述CDR-H3包含与SEQ ID NO：68至76的任一个氨基酸序列 (例如，选自表8的CDR-H3序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQ ID NO：56至67 的任一个氨基酸序列(例如，选自表7的CDR-H2序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H1，所述CDR-H1包含与SEQ IDNO：46至55的任一个氨基酸序列(例如，选自表6的CDR-H1 序列)具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含：CDR-L3，所述CDR-L3 包含与SEQ ID NO：27或29的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ ID NO：16 或19的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L1，所述CDR-L1包含与SEQ IDNO：2或5的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H3，所述CDR-H3 包含与SEQ ID NO：68或70的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或 100％同一性的氨基酸序列；CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQ ID NO：56 或58的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H1，所述CDR-H1包含与SEQ ID NO：46或48的氨基酸序列具有至少70％、至少90％或100％同一性的氨基酸序列。

在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-L1，所述CDR-L1包含与SEQ ID NO：2或3的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ ID NO：16、17 或18的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-L3，所述CDR-L3包含与SEQ ID NO：27或28的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。

一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-L1，所述CDR-L1包含与SEQ ID NO：4或5的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ IDNO：19、20 或21的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-L3，所述CDR-L3包含与SEQ ID NO：29或31的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。

一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-H1，所述CDR-H1包含与SEQ ID NO：46或47的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQID NO：56或 57的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H3，所述CDR-H3包含与SEQ ID NO：68或69的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。

一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-H1，所述CDR-H1包含与SEQ ID NO：48或49的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQID NO：58、 59或60的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少 98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H3，所述CDR-H3 包含与SEQ ID NO：70或71的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少 96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。

在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-L1，所述CDR-L1包含与SEQ ID NO：2或3的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ ID NO：16、17 或18的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L3，所述CDR-L3包含与 SEQ ID NO：27或28的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序；CDR-H1，所述CDR-H1包含与SEQ ID NO：46或47的任一个氨基酸序列具有至少 95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQ ID NO：56或57的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或 100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H3，所述CDR-H3包含与SEQ ID NO：68或69的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。

一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：CDR-L1，所述CDR-L1包含与SEQ ID NO：4或5的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L2，所述CDR-L2包含与SEQ IDNO：19、20 或21的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-L3，所述CDR-L3包含与 SEQ ID NO：29或30的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H1，所述CDR-H1包含与SEQ ID NO：48或49的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；CDR-H2，所述CDR-H2包含与SEQ ID NO：58、59或60的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；以及CDR-H3，所述CDR-H3包含与SEQ ID NO：70或71的任一个氨基酸序列具有至少95％、至少96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。

在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含以下或由以下组成：重链可变区，所述重链可变区包含与SEQ ID NO：77至88的任一个氨基酸序列(例如，选自表9和10的重链可变区)具有至少70％、至少75％、至少85％、至少86％、至少87％、至少88％、至少89％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少 96％、至少97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列；和/ 或轻链可变区，所述轻链可变区包含与SEQ ID NO：34至45的任一个氨基酸序列(例如，选自表4和5的轻链可变区)具有至少70％、至少75％、至少85％、至少86％、至少87％、至少88％、至少89％、至少90％、至少91％、至少92％、至少93％、至少94％、至少95％、至少96％、至少 97％、至少98％、至少99％或100％同一性的氨基酸序列。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含：重链可变区，所述重链可变区包含与SEQ ID NO：84至88的任一个氨基酸序列(例如，选自表10的重链可变区)具有至少90％同一性的氨基酸序列；和轻链可变区，所述轻链可变区包含与SEQ ID NO：42至45的任一个氨基酸序列(例如，选自表5的轻链可变区)具有至少90％同一性的氨基酸序列。

术语“百分比同一”或“百分比同一性”是指两个氨基酸序列之间的序列同一性。可通过比较每个序列中的位置来确定同一性，所述位置可以为了比较的目的而进行比对。当所比较的序列中的等同位置被相同的氨基酸占据时，则分子在该位置是相同的。当等同位点被相同或类似的氨基酸残基(例如，在空间性质和/或电子性质方面类似)占据时，则该分子可被称为在该位置同源(类似)。表达为同源性、类似性或同一性的百分比是指在所比较的序列共有的位置处的相同或类似氨基酸的数目的函数。表达为同源性、类似性或同一性的百分比是指在所比较的序列共有的位置处的相同或类似氨基酸的数目的函数。可使用多种比对算法和/或程序，包括 FASTA、BLAST或ENTREZ。FASTA和BLAST可作为GCG序列分析包(University of Wisconsin，Madison，Wis.)的一部分获得，并且可与例如缺省设置一起使用。ENTREZ可通过国家生物技术信息中心(National Center for BiotechnologyInformation)、国家医学图书馆(National Library of Medicine)、国家卫生研究院(National Institutes of Health)(Bethesda，Md) 获得。在一个实施方案中，两个序列的百分比同一性可通过缺口权重为1 的GCG程序确定，例如，每个氨基酸缺口被加权，如同其是两个序列之间的单个氨基酸或核苷酸错配。

用于比对的其他技术描述于以下：Methods in Enzymology，vol.266： ComputerMethods for Macromolecular Sequence Analysis(1996)，ed. Doolittle，AcademicPress，Inc.，a division of Harcourt Brace & Co.，San Diego， Calif.，USA。在一些实施方案中，利用允许序列中缺口的比对程序来比对序列。Smith-Waterman是一种类型的允许序列比对中缺口的算法。参见 Meth.Mol.Biol.70：173-187(1997)。此外，使用Needleman和Wunsch比对方法的GAP程序可用于比对序列。一种替代检索策略使用MPSRCH软件，其在MASPAR计算机上运行。MPSRCH使用Smith-Waterman算法在大规模并行的计算机上对序列进行评分。这种方法提高了获取远距离相关匹配的能力，并且对小的缺口和核苷酸序列错误尤其耐受。核酸编码的氨基酸序列可用于检索蛋白质和DNA数据库二者。

在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含选自表4和 5的轻链可变区的一个或更多个CDR。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含选自表9和10的重链可变区的一个或更多个CDR。在一些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含选自表4和5的轻链可变区的一个或更多个CDR和选自表9和10的重链可变区的一个或更多个CDR。在某些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含： CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3，其各自选自表4和5的任一轻链可变区；以及CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3，其各自选自表9和10的任一重链可变区。CDR(例如，CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3、CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3)的氨基酸序列可通过本文中所述的或本领域技术人员已知的任何合适的方法在本文中公开的重链或轻链可变区内鉴定。

在一些实施方案中，结合剂包含选自表1-10的一个或更多个合适的序列，其中所选择的多肽序列包含0至5个、1至5个、0至10个、1至 10个、0至15个或1至12个氨基酸修饰，其中氨基酸修饰可以是氨基酸添加、氨基酸缺失和/或氨基酸替换。在一些实施方案中，本文公开的结合剂包含一个或更多个氨基酸类似物、非天然氨基酸或氨基酸衍生物。

在某些实施方案中，结合剂或结合剂的抗原结合部分包含一个或更多个框架区(FR)。框架区通常位于抗体或结合剂的重链或轻链可变区的 CDR之间和/或CDR序列侧翼。在哺乳动物中，重链可变区通常包含四个框架区，并且轻链可变区通常包含四个框架区。可以使用任何合适的方法鉴定抗体、抗体可变区或结合剂中的一个或更多个框架区。结合剂可包含未经修饰或经修饰(例如，优化)的合成或天然存在的框架区，如以下所讨论的。

在一些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分是嵌合、移植和/或人源化的。嵌合、移植和/或人源化的结合剂通常包含经修饰或经替换的恒定区和/或框架区，同时保持对黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合特异性。在一些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分包含来源于人抗体的恒定区、框架区或其一部分。在一些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分包含未在天然抗体分子中存在的完全合成部分、一个或更多个氨基酸、或氨基酸的序列。

天然存在的框架区或其一部分可以从任何合适的物种获得。在某些实施方案中，将结合剂或其抗原结合部分的轻链和重链可变区的互补决定区 (CDR)移植到来自相同物种或其他物种的框架区中。例如，结合剂的一个或更多个框架区可以来源于啮齿动物物种(例如，小鼠或大鼠)或灵长类物种(例如，人)。

在某些实施方案中，可以将结合剂或其抗原结合部分的轻链和/或重链可变区的CDR移植到共有序列人框架区中。在某些实施方案中，为了产生共有序列人框架区，可以比对来自多个人重链或轻链氨基酸序列的框架区以鉴定共有序列。在某些实施方案中，将抗体或结合剂的重链或轻链框架区替换为来自不同的重链或轻链可变区的一个或更多个框架区或其一部分。在一些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分包含一个或更多个人框架区。在某些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分包含至少1、2、 3、4、5、6、7、8、9或10个人框架区。在一些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分包含一个或更多个小鼠框架区。在某些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分包含至少1、2、3、4、5、6、7、8、9或10个小鼠框架区。在某些实施方案中，结合剂或其抗原结合部分包含一个或更多个人框架区和一个或更多个小鼠框架区。

通过例如框架区或其一部分的修饰、替换或缺失来产生嵌合、人源化和/或优化的抗体或结合剂的方法是已知的。CDR移植的非限制性实例描述于例如以下中：美国专利号6,180,370、6,054,297、5,693,762、5,859,205、 5,693,761、5,565,332、5,585,089和5,530,101以及Jones et al，Nature， 321：522-525(1986)；Verhoeyen et al，Science，239：1534-1536(1988)，和 Winter，FEBS Letts.，430：92-94(1998)。产生嵌合、移植和/或人源化的结合剂的其他非限制性实例包括美国专利号5,530,101；美国专利号5,707,622；美国专利号5,994,524；美国专利号6,245,894；Queen et al.，(1988)PNAS 86：10029-10033；Riechmann et al.，Nature(1988)332：323-327；Antibody Engineering：Methods andProtocols，Vol.248 of Methods in molecular biology，edited by Benny K.C.Lo，Springer Science & Business Media， (2004)；以及Antibody Engineering，Vol.1，Roland E.Kontermann，Stefan Duebel，Edition 2，Publisher Springer Science &Business Media，(2010)。在一些实施方案中，可以通过将一个或更多个框架区或其一部分(例如，一个或更多个氨基酸)交换为来自人抗体的一个或更多个框架区或其一部分来使结合剂人源化。在某些实施方案中，可以通过将来自供体结合剂(例如，小鼠单克隆抗体)的一个或更多个CDR(例如，1、2、3、4、5或全部6 个CDR)转移到接纳体结合剂(例如人抗体)同时保持供体结合剂的结合特异性来将抗体或结合剂人源化或移植。在某些实施方案中，制备嵌合、移植或人源化的结合剂的方法包括在结合剂的恒定区或框架区中进行一个或更多个氨基酸替换、添加或缺失。在某些实施方案中，可以使用诸如“再成形”、“超嵌合”或“饰面/表面重塑”的技术产生人源化结合剂。(例如，参见Vaswami et al，Annals of Allergy，Asthma，& Immunol.81：105(1998)； Roguska et al，Prot.Engin.，9：895-904(1996)；和美国专利号6,072,035)。在一些方面，通过上文讨论的方法或通过另一种合适的方法修饰结合剂以降低免疫原性(例如，参见Gilliland et al，J.Immunol，62(6)：3663-71(1999))。

在某些实施方案中，结合剂的氨基酸序列被修饰以优化对靶标(例如，黏结蛋白聚糖-1)的结合亲和力、物种交叉反应性、溶解度和/或功能(例如，激动剂活性，或其缺乏)。在一些实施方案中，本文公开的CDR的特定组合可以优化用于与黏结蛋白聚糖-1的结合，和/或优化本文公开的结合剂的功能或特征。例如，可以使用合适的表达系统使本文公开的特征性轻链可变区(例如，SEQ ID NO：35-45中任一个的轻链可变区)与包含特征性重链可变区(例如，选自表6或7的重链可变区)的CDR-H1和CDR-H2 的重链可变区文库共表达，其中CDR-H3被CDR-H3序列文库替换，后者可包含例如表8的一个或更多个CDR-H3区。可以筛选所得的轻链/重链结合剂与黏结蛋白聚糖-1的结合和/或特定功能。可以鉴定优化的结合剂，并且可以通过合适的方法鉴定CDR-H3的氨基酸序列。上述筛选方法可用于鉴定包含CDR的特定组合或特定优化的CDR序列(例如，包含氨基酸替换、添加或缺失的CDR序列)的结合剂，其提供具有改善的结合特异性、结合亲和力和/或功能的结合剂。这种筛选和优化结合剂的方法是已知的(例如，参见Portolano et al.，(1993)Journal of Immunology 150：880-887；和Clarkson et al.，(1991)Nature 352：624-628)。这样的参考文献教导了通过使用已知的可变轻链、已知的可变重链、或其一部分(例如，其CDR)，通过筛选互补性可变区的文库来产生结合特定抗原之抗体的方法。

在某些实施方案中，结合剂被修饰以消除或添加糖基化位点，以优化结合剂的亲和力和/或功能(例如，参见Co et al，Mol.Immunol， 30：1361-1367(1993))。在一些实施方案中，修饰或改变结合剂中糖基化位点的数目和/或类型。N-连接的糖基化位点通常以序列Asn-X-Ser或 Asn-X-Thr为特征，其中称为X的氨基酸残基可以是除脯氨酸之外的任意氨基酸残基。产生该序列的氨基酸残基的替换提供了用于添加N-连接的碳水化合物链的潜在新位点。或者，消除该序列的替换将除去现有的N- 连接的碳水化合物链。在某些实施方案中，还提供了N-连接的碳水化合物链的重排，其中一个或更多个N-连接的糖基化位点(通常是天然存在的那些)被消除并且产生了一个或更多个新的N-连接位点。在一些实施方案中，与未经修饰的结合剂相比，通过缺失一个或更多个半胱氨酸残基或将一个或更多个半胱氨酸残基替换成其他氨基酸(例如，丝氨酸)来修饰结合剂。在某些实施方案中，半胱氨酸变体可用于优化表达、分泌和/ 或溶解度。

在某些实施方案中，结合剂被修饰以包含某些氨基酸添加、替换或缺失，其被设计或预期例如以降低结合剂对蛋白水解的敏感性、降低结合剂对氧化的敏感性、延长血清半衰期、和/或赋予或改变结合剂的其他物理化学、药代动力学或功能特性。

在一些实施方案中，结合剂特异性结合哺乳动物黏结蛋白聚糖-1或其一部分。在某些实施方案中，本文所述的结合剂特异性结合哺乳动物黏结蛋白聚糖-1或其一部分，其结合亲和力(KD)为10^-5M或更小，10^-6M 或更小，10^-7M或更小，10^-8M或更小，50nM或更小，10nM或更小，或1nM或更小。在某些实施方案中，本文所述的结合剂特异性结合哺乳动物黏结蛋白聚糖-1或其一部分，其结合亲和力(KD)为约10^-5至10^-15M， 10^-6至10^-15M，10^-7至10^-15M，10^-9至10^-15M，10^-9至10^-14M，10^-9至10^-13 M，或10^-9至约10^-12M。结合剂特异性结合哺乳动物黏结蛋白聚糖-1或其一部分的细胞外结构域或细胞外区域。在某些方面，结合剂特异性结合存在于自然界中的未改变的(非遗传修饰的)哺乳动物的细胞产生的野生型黏结蛋白聚糖-1。在某些方面，结合剂特异性结合天然存在的黏结蛋白聚糖-1变体。在某些方面，结合剂特异性结合包含一个或更多个氨基酸替换、添加或缺失的黏结蛋白聚糖-1。在某些实施方案中，结合剂特异性结合在人、非人灵长类动物、狗、猫或啮齿动物(例如小鼠或大鼠)的细胞表面上产生和/或表达的黏结蛋白聚糖-1。在某些实施方案中，结合剂特异性结合包含SEQ ID NO：1和99至102中任一个的氨基酸序列的一个或更多个黏结蛋白聚糖-1多肽或其一部分(例如，细胞外结构域)。在某些实施方案中，本文所述的结合剂特异性结合具有SEQ ID NO：1和99至102中任一个氨基酸序列的黏结蛋白聚糖-1多肽或其一部分，结合亲和力(KD) 为50nM或更小，10nM或更小，或1nM或更小。在某些实施方案中，结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1。在某些实施方案中，结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域。在某些实施方案中，结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1和/或其细胞外结构域。

在某些实施方案中，结合剂特异性结合包含氨基酸序列 AGEGPKEGEAVVLP(SEQ IDNO：89)或GPKEGEAVVLP(SEQ ID NO： 90)或由其组成的多肽序列。在某些实施方案中，本文所述的结合剂特异性结合包含氨基酸序列AGEGPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：89)或GPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：90)或由其组成的多肽序列，其结合亲和力(KD)为10^-5M或更小，10^-6M或更小，10^-7M或更小，10^-8M或更小，50nM或更小，10nM或更小，或1nM或更小。在某些实施方案中，结合剂特异性结合包含氨基酸序列GX₁KEX₂EAX₃VLP(SEQ ID NO：91) 或由其组成的多肽序列，其中X₁、X₂和X₃选自任意氨基酸。在一些实施方案中，X₁选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₂选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₃选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和苯丙氨酸。在某些实施方案中，本文所述的结合剂特异性结合包含氨基酸序列 GX₁KEX₂EAX₃VLP(SEQ ID NO：91)或由其组成的多肽序列，其结合亲和力(KD)为50nM或更小，10nM或更小，或者1nM或更小，其中X₁选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸， X₂选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，并且X₃选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和苯丙氨酸。在某些实施方案中，X₁是脯氨酸，X₂选自丙氨酸、甘氨酸或丝氨酸，并且X₃选自丙氨酸、甘氨酸和缬氨酸。

术语“特异性结合”是指如所确定的，例如如通过合适的体外测定(例如，Elisa、免疫印迹、流式细胞术等)确定的，相对于与其他分子或其他肽的结合优先与靶肽结合的结合剂。特异性结合相互作用区别于非特异性结合相互作用约2倍或更多、通常约10倍或更多、并且有时约100倍或更多、1000倍或更多、10,000倍或更多、100,000倍或更多、或1,000,000倍或更多。

在一些实施方案中，特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂是以以下结合亲和力常数(KD)结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分(例如，黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域)的结合剂：等于或小于100nM，等于或小于50nM，等于或小于25nM，等于或小于10nM，等于或小于5nM，等于或小于1nM，等于或小于900pM，等于或小于800pM，等于或小于 750pM，等于或小于700pM，等于或小于600pM，等于或小于500pM，等于或小于400pM，等于或小于300pM，等于或小于200pM，或等于或小于100pM。在一些实施方案中，特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂是以以下结合亲和力常数(KD)结合人黏结蛋白聚糖-1或其一部分(例如，人黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域)的结合剂：等于或小于100nM，等于或小于50nM，等于或小于25nM，等于或小于10nM，等于或小于5nM，等于或小于1nM，等于或小于900pM，等于或小于 800pM，等于或小于750pM，等于或小于700pM，等于或小于600pM，等于或小于500pM，等于或小于400pM，等于或小于300pM，等于或小于200pM，或等于或小于100pM。在一些实施方案中，特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂是以以下结合亲和力常数(KD)结合来源于非人物种(例如，非人灵长类动物或啮齿动物；例如，小鼠或大鼠) 的黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂：等于或小于100nM，等于或小于50nM，等于或小于25nM，等于或小于10nM，等于或小于5nM，等于或小于1nM，等于或小于900pM，等于或小于800pM，等于或小于750pM，等于或小于700pM，等于或小于600pM，等于或小于500pM，等于或小于400pM，等于或小于300pM，等于或小于200pM，或等于或小于100pM。在某些实施方案中，本文公开的结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1或其一部分，并且特异性结合来源于非人灵长类动物的黏结蛋白聚糖-1或其一部分。在某些实施方案中，本文公开的结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1或其一部分，并且特异性结合来源于啮齿动物(例如小鼠或大鼠)的黏结蛋白聚糖-1或其一部分。在某些实施方案中，结合剂(i) 特异性结合人黏结蛋白聚糖-1或其一部分(例如人黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域)，其结合亲和力(KD)为10nM或更小，或1nM或更小；并且(ii)特异性结合大鼠或小鼠黏结蛋白聚糖-1或其一部分，其结合亲和力(KD)为100nM或更小，90nM或更小，80nM或更小，70nM或更小，60nM或更小，50nM或更小，40nM或更小，30nM或更小，20nM 或更小或10nM或更小。

在某些实施方案中，第二结合剂(例如，第二黏结蛋白聚糖-1结合剂) 是与第一黏结蛋白聚糖-1结合剂竞争与黏结蛋白聚糖-1、其一部分或其表位的结合的结合剂，其中第一黏结蛋白聚糖-1结合剂是包含表1-10中所示的一个或更多个CDR或者与表1-10中所示的那些基本相似的一个或更多个CDR的结合剂。在某些实施方案中，黏结蛋白聚糖-1的表位包含含有SEQ ID NO：89、90或91的氨基酸序列的多肽。在某些实施方案中，第二结合剂与本文所述的第一结合剂竞争与包含氨基酸序列SEQ ID NO： 89、90或91或由其组成的多肽的结合。在一些实施方案中，第二结合剂可具有与本文所述的第一结合剂不同和/或区别的氨基酸序列。例如，与本文所述结合剂竞争结合的第二黏结蛋白聚糖-1结合剂通常不包含表1-2或6-8中所示的CDR序列。第二黏结蛋白聚糖-1结合剂可以具有与表3 和4中所示的轻链可变区基本上不同的轻链可变区序列。第二黏结蛋白聚糖-1结合剂可以具有与表9和10中所示的重链可变区基本上不同的重链可变区序列。

鉴定竞争与抗原结合的结合剂的方法是已知的。可以使用任何合适的方法来确定第二黏结蛋白聚糖-1结合剂是否与第一黏结蛋白聚糖-1结合剂竞争与黏结蛋白聚糖-1抗原的结合。例如，可以使用基于ELISA的方法，其中将黏结蛋白聚糖-1抗原或其一部分包被在96孔板上。添加第二黏结蛋白聚糖-1结合剂并使其与包被的抗原结合。然后洗涤板，并将本文所述的第一结合剂(例如，本文所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂)添加至板并使其结合。在存在或不存在第二黏结蛋白聚糖-1结合剂的情况下测量第一结合剂的结合量，以确定第一结合剂和第二结合是否竞争与板包被的抗原的结合。

在一些实施方案中，结合剂包含标记。本文中使用的术语“标记”或“经标记的”是指并入可检测的标志物，例如，通过并入经标记的氨基酸，或与生物素部分的多肽连接，其可通过经标记的亲和素(例如，包含可通过光学或比色方法检测的荧光标志物或酶活性的链霉亲和素)进行检测。在某些实施方案中，标记或标志物可与结合剂连接以产生诊断剂。结合剂可与任何合适的标记或标志物共价或非共价连接。标记多肽和糖蛋白的多种方法是本领域技术人员已知的并且可被使用。用于多肽的标记的一些非限制性实例包括但不限于以下：放射性同位素或放射性核素、荧光标记、酶标记(例如，辣根过氧化物酶、β-半乳糖苷酶、萤光素酶、碱性磷酸酶)、化学发光标记、金属标记、生色团、电化学发光标记、磷光标记、猝灭剂 (例如，荧光团猝灭剂)、荧光共振能量转移(fluorescence resonance energytransfer，FRET)对(例如，供体和接纳体)、染料、酶底物、小分子、质量标签、量子点、纳米粒、生物素基团、由第二报道子识别的预定多肽表位(例如，亮氨酸拉链对序列、二抗的结合位点、金属结合结构域、表位标签)等，或其组合。

在一些实施方案中，结合剂包含合适的载体。结合剂可与合适的载体共价或非共价连接。载体的一些非限制性实例包括改变或延长结合剂的体内半衰期的试剂或分子、聚乙二醇、糖原(例如，通过结合剂的糖基化)、葡聚糖、美国专利No.6,660,843中描述的载体或载剂等，或其组合。

在一些实施方案中，通过使用合适的接头将标记或载体与结合剂结合。合适的接头的一些非限制性实例包括硅烷、硫醇、膦酸、聚乙二醇 (polyethylene glycol，PEG)、氨基酸和肽、其聚合物、其衍生物等、及其组合。使用接头将两个或更多个分子连接的方法是本领域技术人员知晓的，并且有时被称为“交联”。

在一些实施方案中，标记、载体或接头与结合剂的合适巯基(例如，半胱氨酸残基的巯基)连接。出于连接标记、载体或接头的目的，结合剂的恒定区或框架区的任何合适的氨基酸残基可用包含巯基的氨基酸残基 (例如，半胱氨酸)替换。可用包含硫醇的氨基酸残基替换的氨基酸的一些非限制性实例包括IgG2的A118、S119、S239、V282、T289、N361和V422，IgG1的S115、S252、V289、T306和N384，或IgG1、IgG2、IgG3 或IgG4中的相应位置。将标记、载体和/或接头与结合剂连接的另一些非限制性实例包括：使胺与N-羟基琥珀酰亚胺(N-hydroxysuccinimide，NHS) 酯、亚氨酸酯、五氟苯基(pentafluorophenyl，PFP)酯、羟基甲基膦、环氧乙烷或任何其他羰基化合物反应；使羧基与碳二亚胺反应；使巯基与马来酰亚胺、卤代乙酰基、吡啶基二硫化物和/或乙烯基砜反应；使醛与肼反应；使任何非选择性基团与双吖丙啶(diazirine)和/或芳基叠氮化物反应；使羟基与异氰酸酯反应；使羟胺与羰基化合物反应；等，及其组合。

在一些实施方案中，本文提供了包含特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分(例如，黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域，或其一部分)的一种或更多种结合剂的组合物或药物组合物。

可将药物组合物配制用于合适的施用途径。在一些实施方案中，药物组合物被配制用于皮下(subcutaneous，s.c.)、皮内、肌内、腹膜内和/或静脉内(intravenous，i.v.)施用。在某些实施方案中，药物组合物可包含用于改变、维持或保持组合物的例如pH、渗量(osmolarity)、黏度、澄清度、颜色、等张性、气味、无菌性、稳定性、溶出或释放率、吸附或渗透的配制材料。在某些实施方案中，合适的配制材料包括但不限于：氨基酸(例如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸)；抗微生物剂；抗氧化剂(例如抗坏血酸、亚硫酸钠或亚硫酸氢钠)；缓冲剂(例如硼酸盐、碳酸氢盐、Tris-HCl、柠檬酸盐、磷酸盐(例如，磷酸缓冲盐水)或合适的有机酸)；填充剂(例如甘露糖醇或甘氨酸)；螯合剂(例如乙二胺四乙酸(ethylenediamine tetraacetic acid，EDTA))；复合剂(complexing agent)(例如咖啡因、聚乙烯吡咯烷酮、β-环糊精或羟丙基-β-环糊精)；蛋白质(例如血清白蛋白、明胶或免疫球蛋白)；着色剂、矫味剂和稀释剂；乳化剂；亲水性聚合物(例如聚乙烯吡咯烷酮)；低分子量多肽；成盐反荷离子(例如钠)；溶剂(例如甘油、丙二醇或聚乙二醇)；稀释剂；赋形剂和/或药用辅料(Remington’s Pharmaceutical Sciences，18th Ed.，A.R. Gennaro，ed.，MackPublishing Company(1995))。

在某些实施方案中，药物组合物包含合适的赋形剂，其一些非限制性实例包括抗黏剂(例如，硬脂酸镁)、黏合剂(binder)、填充剂、单糖、二糖、其他碳水化合物(例如，葡萄糖、甘露糖或糊精)、糖醇(例如，甘露糖醇或山梨糖醇)、包衣(例如，纤维素、羟丙基甲基纤维素 (hydroxypropyl methylcellulose，HPMC)、微晶纤维素、合成聚合物、虫胶(shellac)、明胶、玉米蛋白玉米醇溶蛋白、肠溶物(enteric)或其他多糖)、淀粉(例如，马铃薯、玉蜀黍或小麦淀粉)、二氧化硅、颜料、崩解剂、香料、润滑剂、防腐剂、吸着剂、甜味剂、载剂、助悬剂、表面活性剂和/或润湿剂(例如，普朗尼克类(pluronic)、PEG、脱水山梨糖醇酯、聚山梨酯(例如聚山梨酯20、聚山梨酯80)、triton、氨丁三醇、卵磷脂、胆固醇、泰洛沙泊(tyloxapal))、稳定性增强剂(例如蔗糖或山梨糖醇) 和张力增强剂(例如碱金属卤化物、氯化钠或氯化钾、甘露糖醇、山梨糖醇)、和/或Remington’s Pharmaceutical Sciences，第18版，A.R.Gennaro，编辑，Mack Publishing Company(1995)中公开的任何赋形剂。本文中使用的术语“黏合剂”是指有助于使药物混合物保持合并的化合物或成分。用于制备药物制剂并且通常用于制备药物片剂、胶囊剂和颗粒剂的合适黏合剂是本领域技术人员已知的。为清楚起见，本文中使用的术语“结合剂 (binding agent)”不是指在某些药物制剂中使用的“黏合剂”。但是在某些实施方案中，药物组合物可包含特异性结合黏结蛋白聚糖-1的结合剂以及黏合剂。

在一些实施方案中，药物组合物包含合适的可药用的添加剂和/或载体。合适的添加剂的一些非限制性实例包括合适的pH调节剂、抚慰剂(soothing agent)、缓冲剂、含硫还原剂、抗氧化剂等。含硫还原剂的一些非限制性实例包括具有巯基的那些，例如N-乙酰基半胱氨酸、N-乙酰基高半胱氨酸、硫辛酸、硫代二甘醇、硫代乙醇胺、硫代甘油、硫代山梨糖醇、硫代乙醇酸及其盐、硫代硫酸钠、谷胱甘肽、以及C1至C7硫代烷酸。抗氧化剂的一些非限制性实例包括异抗坏血酸、二丁基羟基甲苯、丁基羟基茴香醚、α-生育酚、生育酚乙酸酯、L-抗坏血酸及其盐、L-抗坏血酸棕榈酸酯、L-抗坏血酸硬脂酸酯、亚硫酸氢钠、亚硫酸钠、没食子酸三戊酯和没食子酸丙酯、以及螯合剂例如乙二胺四乙酸(EDTA)二钠、焦磷酸钠和偏磷酸钠。此外，稀释剂、添加剂和赋形剂可包含其他常用成分，例如，无机盐例如氯化钠、氯化钾、氯化钙、磷酸钠、磷酸钾和碳酸氢钠，以及有机盐例如柠檬酸钠、柠檬酸钾和乙酸钠。

本文中使用的药物组合物可以是长时间(例如约数月或数年)稳定的。在一些实施方案中，药物组合物包含一种或更多种合适的防腐剂。防腐剂的一些非限制性实例包括苯扎氯铵、苯甲酸、水杨酸、硫柳汞、苯乙醇、对羟基苯甲酸甲酯、对羟基苯甲酸丙酯、氯己定、山梨酸、过氧化氢等、和/或其组合。例如苯扎氯铵(benzalkonium chloride)、苯佐氯铵(benzoxonium chloride)、苄索氯铵(benzethonium chloride)、西曲溴铵 (cetrimide)、氯化三苯唑(sepazonium chloride)、氯化十六烷基吡啶 (cetylpyridinium chloride)或溴化度米芬(domiphen bromide) (BRADOSOL(注册商标))。防腐剂可包含硫代水杨酸的烷基汞盐，例如硫柳汞、硝酸苯汞、乙酸苯汞或硼酸苯汞。防腐剂可包含对羟基苯甲酸酯，例如对羟基苯甲酸甲酯或对羟基苯甲酸丙酯。防腐剂可包含醇，例如氯丁醇、苄醇或苯乙醇。防腐剂可包含双胍衍生物，例如氯己定或聚六亚甲基双胍。防腐剂可包含过硼酸钠、咪唑烷基脲和/或山梨酸。防腐剂可包含稳定化氧氯复合物，例如以商品名PURITE(注册商标)已知和市售的。防腐剂可包含聚乙二醇-聚胺缩合树脂，例如来自Henkel KGaA的以商品名POLYQUART(注册商标)已知和市售的。防腐剂可包含稳定化过氧化氢。防腐剂可以是苯扎氯铵。在一些实施方案中，药物组合物不含防腐剂。

在一些实施方案中，组合物、药物组合物或结合剂基本上没有血液或血液制品污染物(例如，血细胞、血小板、多肽、矿物质、血液携带的化合物或化学品等)。在一些实施方案中，组合物、药物组合物或结合剂基本上没有血清和血清污染物(例如，血清蛋白、血清脂质、血清碳水化合物、血清抗原等)。在一些实施方案中，组合物、药物组合物或结合剂基本上没有病原体(例如，病毒、寄生物或细菌)。在一些实施方案中，组合物、药物组合物或结合剂基本上没有内毒素。在一些实施方案中，组合物、药物组合物或结合剂是无菌的。在某些实施方案中，组合物或药物组合物包含特异性结合黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域的结合剂、以及稀释剂(例如，磷酸缓冲盐水)。在某些实施方案中，组合物或药物组合物包含特异性结合黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域的结合剂、以及赋形剂(例如，脱水柠檬酸钠，或聚氧乙烯-脱水山梨糖醇-20单油酸酯(聚山梨酯 80))。

本文中所述的药物组合物可被配置成用于根据使用它们的治疗以任何合适的形式和/或量施用至受试者。例如，被配置成用于肠胃外施用(例如，通过注射或输注)的药物组合物可采用在油性或水性载剂中的混悬剂、溶液剂或乳剂的形式，并且其可包含配制剂、赋形剂、添加剂和/或稀释剂，例如水性或非水性溶剂、共溶剂、助悬溶液、防腐剂、稳定剂和/或分散剂。在一些实施方案中，适于肠胃外施用的药物组合物可包含一种或更多种赋形剂。在一些实施方案中，将药物组合物冻干成干粉形式。在一些实施方案中，将药物组合物冻干成干粉形式，其适用于用合适的药用溶剂(例如，水、盐水、等张缓冲溶液(例如，PBS)等)进行重构。在某些实施方案中，冻干的药物组合物的重构形式适用于肠胃外施用(例如，静脉内施用)于哺乳动物。

在某些实施方案中，药物组合物被配置成用于经口施用，并且可配制成片剂、微片、迷你片、微丸、粉末颗粒、胶囊剂(例如，填充有微片、微丸、粉末或颗粒的胶囊)、乳剂或溶液剂。配置成用于经口施用的药物组合物可包含合适的包衣以延迟或持续释放活性成分(例如，结合剂)，其非限制性实例包括肠溶包衣，例如脂肪酸、蜡、虫胶、塑料、丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、乙酸邻苯二甲酸纤维素(CAP)、乙酸琥珀酸纤维素、邻苯二甲酸羟丙基甲基纤维素、乙酸琥珀酸羟丙基甲基纤维素(乙酸琥珀酸羟丙甲纤维素)、聚乙酸乙烯邻苯二甲酸酯(PVAP)、甲基丙烯酸甲酯-甲基丙烯酸共聚物、偏苯三酸乙酸纤维素、藻酸钠、玉米醇溶蛋白、植物纤维等及其组合。

在一些实施方案中，本文中所述的药物组合物可被配置成用于表面施用，并且可包含结合剂和/或润滑剂、聚合二醇、明胶、可可脂或其他合适的蜡或脂肪中的一种或更多种。在一些实施方案中，将本文中所述的药物组合物并入到包含通常适于表面药物施用的表面载体并且包含本领域技术人员已知的任何合适材料的表面制剂中。在某些实施方案中，药物组合物的表面制剂配制用于从表面贴剂施用结合剂。

在某些实施方案中，最佳的药物组合物将由本领域技术人员根据例如预期的施用途径、递送形式和期望剂量来确定(参见例如，Remington’s Pharmaceutical Sciences，同上)。在某些实施方案中，这样的组合物可影响本发明抗体的物理状态、稳定性、体内释放率和体内清除率。

在一些实施方案中，本文所述的组合物、药物组合物或结合剂用于治疗患有或怀疑患有肿瘤性疾病或癌症的受试者。在某些实施方案中，本文所述的结合剂或药物组合物用于治疗受试者中的肿瘤性疾病或癌症，其中所述结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域。在一些实施方案中，本文提供了治疗患有或怀疑患有肿瘤性疾病或癌症的受试者的方法。在某些实施方案中，治疗患有或怀疑患有肿瘤性疾病或癌症的受试者的方法包括向受试者施用治疗有效量的本文所述的组合物、药物组合物或结合剂。在某些实施方案中，治疗方法包括使受试者的细胞(例如，一种或更多种细胞)与治疗有效量的本文所述的组合物、药物组合物或结合剂接触。在某些实施方案中，治疗方法包括使受试者的细胞(例如，一种或更多种细胞)与治疗有效量的特异性结合人黏结蛋白聚糖-1或其变体的细胞外部分的结合剂接触。受试者的细胞通常是表达黏结蛋白聚糖-1的细胞外部分的细胞。受试者的细胞可在受试者内部(例如体内)或受试者外部 (例如体外或离体)存在。

本文公开的组合物、药物组合物或结合剂可用于治疗涉及表达黏结蛋白聚糖-1的细胞类型的合适的肿瘤性疾病或癌症。可通过本文方法治疗的肿瘤性疾病或癌症的非限制性实例包括肺癌、乳腺癌、卵巢癌、肾癌、结直肠癌、胃癌、甲状腺癌、胰腺癌、神经母细胞瘤、或头颈部鳞状细胞癌、宫颈癌、肝细胞癌、肉瘤、间皮瘤、胶质母细胞瘤、多发性骨髓瘤、黑素瘤、前列腺癌和食管癌。在某些实施方案中，可通过使用合适的方法(例如，全细胞ELISA、FACS、任何合适的免疫测定等)使用合适的抗黏结蛋白聚糖-1结合剂或本文所述的新结合剂快速测定癌症或肿瘤性病症的肿瘤细胞的黏结蛋白聚糖-1表达。

可以使用向受试者施用组合物、药物组合物或结合剂的任何合适方法。根据本文所述的本发明方法使用的组合物的确切制剂和施用途径可由个体医师根据患者的病情选择。参见，例如，Fingl et al.1975，in“The Pharmacological Basis of Therapeutics，”Ch.1，p.1；其通过引用整体并入本文。任何合适的施用途径都可用于施用本文中所述的药物组合物或结合剂。施用途径的一些非限制性实例包括表面或局部(例如，透皮或经皮肤，(例如，在皮肤或表皮上)、在眼内或眼上、鼻内、经黏膜、在耳中、在耳内(例如，在鼓膜(eardrum)后面))、肠内(例如，通过胃肠道递送，例如，经口(例如，作为片剂、胶囊剂、颗粒剂、液体剂、乳化作用、锭剂、或其组合)、舌下、通过胃饲管、经直肠等)、通过肠胃外施用(例如，肠胃外，例如，静脉内、动脉内、肌内、腹膜内、皮内、皮下、腔内、颅内、关节内、进入关节间隙、心内(进入心脏)、海绵体内注射(intracavernous injection)、病灶内(进入皮肤病灶)、骨内输注(进入骨髓)、鞘内(进入椎管)、子宫内、阴道内、膀胱内输注、玻璃体内)等、或其组合。

在一些实施方案中，向受试者提供本文中的组合物。有时将向受试者提供的组合物提供给受试者用于自施用或用于通过他人(例如，非医疗专业人员)施用至受试者。例如，本文中所述的组合物可按照由医务人员书写的指示(例如，处方)提供，该指示允许向患者提供本文中所述的组合物或治疗。在另一实例中，可向受试者提供组合物，其中所述受试者例如经口、静脉内或通过吸入器自施用组合物。

或者，可以以局部方式而非全身方式施用根据本发明方法使用的组合物，例如，通过直接施用于皮肤、黏膜或目标治疗区域，包括使用贮库或持续释放制剂。

在一些实施方案中，包含结合剂的药物组合物可单独施用(例如，作为单一活性成分(AI(active ingredient)或例如作为单一活性药物成分(active pharmaceuticalingredient，API))。在另一些实施方案中，包含结合剂的药物组合物可与一种或更多种另外的AI/API组合施用，例如，作为两种独立的组合物或作为其中一种或更多种另外的AI/API与结合剂一起在药物组合物中混合或配制的单一组合物。

在某些实施方案中，将黏结蛋白聚糖-1结合剂递送至细胞(例如哺乳动物细胞)。可以使用任何合适的方法将黏结蛋白聚糖-1结合剂递送至细胞。在某些实施方案中，将黏结蛋白聚糖-1结合剂递送至细胞包括在允许结合剂与细胞结合的条件下，使哺乳动物细胞在体外或体内与包含黏结蛋白聚糖-1结合剂的组合物接触。

药物组合物可通过任何合适的方式制备，包括例如，通过常规的混合、溶解、制粒、制备糖衣丸、磨细、乳化、包封、包埋或制片过程。

在一些实施方案中，根据需要以合适的频率或间隔施用包含结合剂的药物组合物以获得有效的治疗结果。有效的治疗结果可通过监测受肿瘤性病症或癌症影响的受试者中肿瘤细胞或癌细胞的数目、生存力、生长、有丝分裂或转移来确定。因此，在某些实施方案中，认为受试者中肿瘤细胞或癌细胞的数目、生存力、生长、有丝分裂或转移的降低是有效的治疗结果。在一些实施方案中，包含结合剂的药物组合物可如下施用：每小时、一天一次、一天两次、一天三次、一天四次、一天五次、和/或以规则的间隔，例如每天、每隔一天、每周三次、每周、每隔一周、每月一次和/ 或简单地按照需要或医务人员推荐的频率或间隔。

在一些实施方案中，组合物中结合剂的量是获得有效的治疗结果所需的量。在某些实施方案中，组合物(例如，药物组合物)中结合剂的量是足以预防、治疗、降低本文中考虑的肿瘤性病症或癌症的严重程度、延迟其发作和/或减轻其症状的量。

“治疗有效量”意指足以获得有效的治疗结果的量和/或足以预防、治疗、降低肿瘤性病症或癌症的严重程度、延迟其发作和/或减轻其症状所必需的量。在某些实施方案中，“治疗有效量”意指足以终止肿瘤或癌症生长和/或减慢其生长的量。在某些实施方案中，“治疗有效量”意指足以抑制一种或更多种肿瘤细胞的复制和/或诱导其死亡的量。治疗有效量的确定完全在本领域技术人员的能力范围内，尤其是根据本文中提供的详细公开内容。

在一些实施方案中，组合物中结合剂的量是作为至少治疗有效量的量和足够低以使不期望的不良反应最小化的量。所需的结合剂或活性剂组合的确切量将因受试者而异，这取决于受试者的年龄、体重和一般状况，所治疗病症的严重程度以及所施用药物的特定组合。因此，并不总是可在受试者的不同组群中指定治疗肿瘤性病症的确切治疗有效量。公知的是，用于特定条件下给定患者和用于特定疾病的具体剂量将常规地变化，但在每种情况下最佳量的确定可通过简单的常规操作容易地完成。因此，用于治疗肿瘤性病症的结合剂的治疗有效量可由本领域普通技术人员使用常规实验来确定。

在某些实施方案中，组合物中结合剂的量以合适的治疗有效量或剂量施用(例如，以合适的体积和浓度施用，其有时部分取决于特定的施用途径)。在某些实施方案中，结合剂(例如组合物中的结合剂)可以按照以下剂量施用：约0.01mg/kg(例如，每千克受试者体重)至500mg/kg、 0.1mg/kg至500mg/kg、0.1mg/kg至400mg/kg、0.01mg/kg至300mg/kg、0.1mg/kg至300mg/kg、0.1mg/kg至200mg/kg、0.1mg/kg至150mg/kg、 0.1mg/kg至100mg/kg、0.1mg/kg至75mg/kg、0.1mg/kg至50mg/kg、 0.1mg/kg至25mg/kg、0.1mg/kg至10mg/kg、0.1mg/kg至5mg/kg或0.1 mg/kg至1mg/kg。在一些方面，结合剂的量可以为约10mg/kg、9mg/kg、 8mg/kg、7mg/kg、6mg/kg、5mg/kg、4mg/kg、3mg/kg、2mg/kg、1mg/kg、 0.9mg/kg、0.8mg/kg、0.7mg/kg、0.6mg/kg、0.5mg/kg、0.4mg/kg、0.3 mg/kg、0.2mg/kg、或0.1mg/kg。在一些实施方案中，结合剂的治疗有效量为约0.1mg/kg至500mg/kg，或约1mg/kg至约300mg/kg。适用于静脉内施用的体积是公知的。

在一些实施方案中，结合剂用于检测体外或体内的黏结蛋白聚糖-1。在一些实施方案中，结合剂用于检测细胞表面上的黏结蛋白聚糖-1和/或确定肿瘤细胞(例如，恶性细胞)的存在或不存在，其中所述细胞表达黏结蛋白聚糖-1。在一些实施方案中，结合剂用于确定受试者是否患有肿瘤性疾病或癌症。在一些实施方案中，检测黏结蛋白聚糖-1的方法包括确定样品中细胞上黏结蛋白聚糖-1的存在或不存在(例如，从受试者直接或间接获得的样品)。在一些实施方案中，鉴定表达黏结蛋白聚糖-1的细胞的方法包括(i)使细胞与黏结蛋白聚糖-1结合剂接触和/或(ii)检测包含黏结蛋白聚糖-1结合剂和细胞的结合复合物的存在或不存在，其中结合复合物的存在表明细胞表达黏结蛋白聚糖-1。

可以使用任何合适的方法来检测和/或量化特异性结合于黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂的存在、不存在和/或量，这样的方法的非限制性实例可以在以下中找到：Immunology，Werner Luttmann；Academic Press， 2006 and/or Medical Detection andQuantification of Antibodies to Biopharmaceuticals：Practical and AppliedConsiderations，Michael G.Tovey； John Wiley & Sons，July 12，2011。可用于检测和/或量化特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂的存在、不存在和/或量的方法的其他非限制性实例包括使用竞争性免疫测定、非竞争性免疫测定、western印迹、放射免疫测定、ELISA(酶联免疫吸附测定)、竞争或夹心ELISA、夹心免疫测定、免疫沉淀测定、免疫放射测定、荧光免疫测定、蛋白A免疫测定、沉淀素反应、凝胶扩散沉淀素反应、免疫扩散测定、凝集测定、补体结合测定(complement fixation assay)、免疫组织化学测定、Western印迹测定、免疫组织学测定、免疫细胞化学测定、斑点印迹测定、荧光偏振测定、闪烁亲近测定(scintillation proximity assay)、均相时间分辨荧光测定、 IAsys分析、BIAcore分析等、或其组合。

如果期望的话，包含一定量或剂量的结合剂的药物组合物可在药盒 (kit)、包装或分配装置中提供，其可包含一个或更多个剂量的结合剂。包装可例如包含金属或塑料箔，例如泡罩包装。包装或分配器装置可附有施用说明。包装或分配器可还附有由政府机构管理药品的制造、使用或销售规定的形式的与容器相关的通告，该通告反映了该机构批准该药物形式用于人或兽医施用。这样的通告例如可以是美国食品和药品管理局(U.S. Foodand Drug Administration)批准的用于处方药的标签或批准的产品插页。

在一些实施方案中，药盒或包装包含足以治疗患者1天至1年、1天至180天、1天至120天、1天至90天、1天至60天、1天至30天、或其间的任何天或天数、1至4小时、1至12小时、或1至24小时的结合剂的量。

药盒任选地包括产品标签或包装插页，其包含对其中组分的描述或用于组分在体外、体内或离体使用的说明。示例性的说明包括用于诊断方法、处理方案或治疗方案的说明。在某些实施方案中，药盒包含包装材料，其是指容纳药盒组分的物理结构。包装材料可使组分维持无菌，并且可由通常用于这样的目的的材料制成(例如，纸、瓦楞纤维(corrugated fiber)、玻璃、塑料、箔、安瓿、小瓶、管等)。产品标签或插页包括“印刷物”，例如，纸或纸板，或单独的或固定于组分、药盒或包装材料(例如，盒)，或贴附于包含药盒组分的安瓿、管或小瓶。标签或插页可另外包括计算机可读介质、光盘(例如CD-或DVD-ROM/RAM、DVD)、MP3、磁带、或电子存储介质(例如RAM和ROM)或这些的混杂体(例如磁性/光学存储介质)、FLASH介质或记忆型卡。产品标签或插页可包含其中一种或更多种组分、剂量、活性成分的临床药理学(包括作用机制、药动学 (pharmacokinetics，PK)和药效学(pharmacodynamics，PD))的标示信息。产品标签或插页可包含标示制造商信息、批号、制造商位置、日期、关于可使用药盒组分的指定病症、障碍、疾病或症状的信息的信息。产品标签或插页可包含用于临床医生或用于受试者在方法、处理方案或治疗方案中使用一种或更多种药盒组分的说明。说明可包含剂量、频率或持续时间、以及用于实施本文中所述的任何方法、处理方案或治疗方案的说明。因此，本发明的药盒可另外地包含用于实施本文中所述的本发明的任何方法和用途的标记或说明。产品标签或插页可包含有关潜在不良副作用和/或警告的信息。

在某些实施方案中，药盒包含一种或更多种具有已知量的黏结蛋白聚糖-1的对照。在一些实施方案中，药盒包含表达黏结蛋白聚糖-1的细胞。药盒中的细胞可在适当的储存条件下维持，直至准备好使用细胞。

在一些实施方案中，药盒是包含结合剂的诊断试剂盒(diagnostic kit)。包含在诊断试剂盒中的结合剂可采用任何合适的形式。在一些实施方案中，诊断剂包含结合剂和可检测标记。在某些实施方案中，例如，诊断试剂盒包含棒测试(stick test)或由其组成，其包括进行本发明的方法和产生例如可与彩色图表或标准曲线进行比较的比色结果所必需的试剂。诊断试剂盒可还包含用于检测与黏结蛋白聚糖-1特异性结合的结合剂所必需的组分(例如二抗)。

实施例1

实施例

实施例1-抗CD138抗体的产生

产生针对人CD138的单克隆抗体，其(i)以高亲和力和特异性结合， (ii)表现出快速内化，(iii)显示与食蟹猴来源的CD138的交叉反应性。为了产生抗体，用CD138肽1-3(融合12)或肽4-6(融合13)的混合物对小鼠(dBalb/C小鼠；雌性6-8周龄)进行免疫和加强，参见表11。

这些肽被设计为远离糖基化位点，并且位于在人和小鼠之间较不保守但是在人和食蟹猴物种之间非常保守的区域中。根据免疫接种方案用与 KLH载体蛋白缀合的指示的肽对小鼠进行免疫，初次注射使用完全弗氏佐剂(CFA)，并且所有后续加强使用不完全弗氏佐剂。通过人CD138和 CD138-Fc结合ELISA评估免疫小鼠的抗体血清滴度的结合。选择具有高滴度的小鼠用于融合。使用优化的方法通过小鼠B细胞和SP2/O骨髓瘤细胞的电融合产生杂交瘤。

表11：用于免疫接种的CD138肽

肽1	AGEGPKEGEAVVLPEVEPG	SEQ ID NO：92
			肽2	KEGEAVVLPEVEPGLTARE	SEQ ID NO：93
肽3	VVLPEVEPGLTAREQEATP	SEQ ID NO：94
			肽4	PEPTGLEATTASTSTLP	SEQ ID NO：95
肽5	ETTQLPTTHQA	SEQ ID NO：96
			肽6	ATTAQEPATSHPHRDMQPGHHETS	SEQ ID NO：97

与传统方法不同，在单个步骤中同时进行杂交瘤的克隆，其中通过 HAT选择选择融合细胞，并将单细胞集落转移到含有HT培养基的96孔板中，在有限的选择下生长并筛选上清液的抗原结合。将阳性杂交瘤扩增至更大的体积，并将细胞冷冻储存。

CD138阳性细胞(H929)上的初次杂交瘤FACS筛选

使用每孔含有20,000个H929细胞的96孔板通过荧光激活细胞分选 (FACS)筛选来自融合12(板12-19)的杂交瘤上清液。H929细胞是在其细胞表面表达CD138的人B淋巴细胞细胞系。将杂交瘤上清液添加到 H929细胞中，在4℃下持续1小时。洗涤细胞，然后添加AlexaFluro 647 抗小鼠抗体，并且再次洗涤以除去未结合的抗体。通过FACS分析细胞以检测结合。通过Flowjo软件分析FACS数据。如果上清液抗体以高于板平均信号≥3个标准偏差的水平与细胞结合，则选择它们用于确认FACS 和进一步表征。来自融合12的总共5013个杂交瘤经历了该初次FACS筛选，具有134个阳性命中；初次筛选中的总命中率为2.7％。来自融合12 板16的阳性杂交瘤克隆的样品示出在下表12中。两个代表性阳性杂交瘤克隆的FACS直方图示出在图2中。

表12：来自代表性H929FACS筛选的示出来自融合12板16的代表性阳性杂交瘤的表格

*Geom.Mean表示图2中所示的指示象限内细胞的平均荧光强度；Q1表示抗体与H929细胞的阳性结合，而Q4表示未结合的细胞。

融合12杂交瘤的二次FACS筛选

选择在初次FACS筛选中显示阳性结合的杂交瘤进行进一步表征。对于二次筛选，通过FACS测定杂交瘤上清液与H929(表达CD138)的阳性结合和与ARH-77(阴性CD138表达)细胞的阴性结合。对阴性细胞进行CSFE染色以帮助更好地区分阳性和阴性细胞系。然后将非特异性结合对比于特异性CD138结合的上清液进行比较。代表性二次FACS筛选的结果总结在表13中。

表13：在CD138阳性H292细胞上显示阳性结合且在CD138阴性ARH77 细胞上显示阴性结合的代表性杂交瘤克隆F12P16F6(12P16F6)的FACS 数据总结

*Geom.Mean表示细胞的平均荧光强度；Q1％表示被抗体结合的H929细胞的百分比。

融合12杂交瘤的二次ELISA筛选

在二次筛选后还进行CD138和IgG1同种型ELISA，以帮助确认结合特异性和IgG类型。使用重组CD138-Flag进行CD138结合ELISA。数据表明所有FACS阳性杂交瘤通过ELISA也结合CD138。IgG ELISA鉴定 IgG阳性抗体。从进一步的研究中消除了IgM抗体。到目前为止的选择过程的总结如表14所示。

表14：初次和二次筛选结果总结

筛选表征	杂交瘤克隆数
		筛选的总杂交瘤	5013
初次筛选命中	134
		未表达	39
IgM阳性	23
		无二次结合	60
IgG阳性	72
		二次FACS结合	12

实验6：通过SPR的代表性抗体的动力学结合

从杂交瘤上清液中纯化鼠IgG，并对IgG进行SPR(表面等离振子共振)以进行动力学结合测量。将人或小鼠CD138His在BioRad Proteon上以50μg/mL固定在GLM芯片上。使167nM至10.4nM的浓度的抗体以 30μl/分钟的速率流过结合的芯片以检测动力学结合。使用二价分析物拟合测量KD。动力学结果示出在表15和图3中。

表15：代表性抗体的SPR动力学测量

*NB＝未结合；NA＝未分析。

**那些标记的NA未通过SPR进行分析，但通过ELISA结合测定显示不与小鼠CD138交叉反应(数据未示出)

表16：抗体的CDR

抗体表达

评估两种代表性嵌合抗体的表达以确定扩大生产的可能性。用指导 12P16F6hIgG1(也称为chF6)或13P30A7 hIgG1(也称为chP30a7)表达的载体瞬时转染Expi293细胞(250mL)。嵌合抗体12P16F6 hIgG1包含 F12P16F6的鼠重链可变区(SEQ ID NO：77)和轻链可变区(SEQ ID NO： 35)以及人IgG1κ同种型的恒定区。嵌合抗体13P30A7 hIgG1包含F13P30A7的鼠重链可变区(SEQ ID NO：78)和轻链可变区(SEQ ID NO： 36)以及人IgG1κ同种型的恒定区。结果总结在下表17中。还通过 SDS-PAGE和尺寸排阻色谱分析表达的抗体(数据未示出)。

表17

代表性抗体的食蟹猴交叉反应性。

测试12P16F6 hIgG1或13P30A7 hIgG1与食蟹猴CD138的交叉反应性。与来自食蟹猴(cyno)的CD138交叉反应的抗体具有以下优点：可以在进行效力试验之前在非人灵长类动物的该品系中测试毒性。简单地说，在Expi293细胞中转染指导人CD138或食蟹猴CD138的细胞表面表达的载体。在从33.3μg/ml开始的3倍稀释下测试12P16F6 hIgG1和 13P30A7hIgG1与经转染的Expi293细胞的结合。使用苏金单抗(Sec)作为阴性对照以确保经转染的细胞不具有任何背景结合。代表性抗体 12P16F6 hIgG1和13P30A7 hIgG1显示出与人和食蟹猴CD138两者的特异性结合(图4)。

表18：代表性CD138来源杂交瘤的数据总结

实施例1中使用的某些试剂和材料的定义

注意，这里的杂交瘤克隆的名称可以指杂交瘤细胞或由杂交瘤细胞产生的抗体，这取决于使用该名称的上下文。杂交瘤克隆的名称通常是指融合(例如，融合#12或#13，分别缩写为F12和F13)，接着是前面带有字母“P”的板编号和孔编号。例如，杂交瘤克隆F12P16F6(在本文中也称为 12P16F6或P16F6)是指从来自融合12、板16和孔F6的杂交瘤获得的抗体。mBT-062是IgG1，CD138结合对照抗体。

实施例2

实施例2-人源化

开发了策略以设计和产生本文所述的鼠抗CD138抗体的人源化形式，其中抗体的人源化形式保留了亲本单克隆抗体的特性。本文提供了使命名为F12P16F6的小鼠单克隆抗CD138抗体人源化的实例。

本文产生的F12P16F6的人源化形式通常相对于嵌合抗体12P16F6 IgG1进行基准测试。在适当的情况下也使用其他阳性和阴性对照。

平行使用五种人源化策略，其导致产生三种人源化F12P16F6轻链序列和四种人源化F12P16F6重链序列。通常，该方法涉及将鼠互补决定区 (CDR)移植到人框架和恒定区上。三种轻链和四种重链中的每一种彼此组合表达，并纯化，产生总共十二种人源化抗CD138单克隆抗体。分析人源化抗体的表达/纯化谱、生物物理学性质、与CD138肽抗原的结合、与天然CD138的结合和特异性。还评估了代表性的人源化抗体的其他生物物理特性。

方法

chP16F6的表达和纯化

使用EXPIFECTAMINE(商标)293转染试剂盒将指导嵌合抗体 chP16F6表达的载体以250ml的体积转染到Expi293细胞中。使用pH依赖性蛋白A纯化来纯化上清液。使用HiTrapMabSelect SuRe 5ml纯化嵌合抗体。纯化后，使用zeba旋转柱将抗体缓冲液交换到1×DPBS中。 chP16F6的回收率为7.1mg，2.21mg/mL。

F12P16F6的人源化。

使用选自以下的方法进行重链和轻链可变结构域的人源化：(i)CDR 移植(CDRgrafting)(称为cdr)，其根据Jones et al.(1986)″Replacing the complementaritydetermining regions in a human antibody with those from a mouse″Nature 321：522-525和Verhoeyen et al.(1988)″Reshaping human antibodies：grafting an anti-lysozyme activity″Science 239：1534-1536进行，其中将Kabat et al.(1991)″Sequences of Proteins of Immunological Interest″ 5th ed.US Department ofHealth and Human Services，Public Health Service， National Institutes ofHealth(NIH公开号91-3242)中定义的CDR移植到合适的人支架上，同时保留了关键的框架残基；(ii)简化CDR的移植 (Grafting of abbreviated CDR)(称为abb)，其根据Padlan etal.(1995) ″Identification of specificity-determining residues in antibodies″FASEB J 9：133-139进行，其中将定义为轻链中的残基27D-34、50-55和89-96以及重链中的31-35B、50-58和95-101的简化CDR移植到合适的人支架上，同时保留了关键的框架残基；(iii)SDR-转移(SDR-transfer)(称为sdr)，其根据Padlan et al.(1995)″Identificationof specificity determining residues in antibodies″FASEB J 9：133-139进行，其中将可能参与抗原结合的残基移植到合适的人序列中，同时保留了关键的框架残基；(iv)Frankenstein方法(称为fra)，其根据Wu and Kabat(1992)″Possible use of similarframework region amino acid sequences between human and mouse immunoglobulinsfor humanizing mouse antibodies″Mol Immunol 29：1141-1146进行，其中将CDR移植到由来自合适的人抗体的个体框架区构成的人支架上，同时保留关键框架残基；以及(v)饰面(Veneering) (称为ven)，其根据Padlan(1991)″A possible procedure for reducingthe immunogenicity of antibody variable domains while preserving theirligand-binding properties″Mol Immunol 28：489-498进行，其中将非人抗体 (如果结构已知)中或同源分子(如果结构未知)中暴露的残基更换为来自合适的人抗体的相应残基，同时保留CDR和关键骨架残基。在所有描述的方法中，“合适的人抗体”用于表示最接近的人序列(可在GenBank 中获得)。术语“关键框架残基”用于表示被认为对于维持三维结构必不可少的残基(来自PDB中相关的高分辨率X射线结构的分析)。有时进行人源化的第二轮“修复”以改善抗体的SEC谱。在第二轮中产生的人源化抗体由标识rep或修复(repair)指示。所得人源化重链和轻链可变区的氨基酸序列分别如图10A和10B所示。

人源化P16F6修复构建体的表达和纯化

将四种人源化重链中的每一种与3种轻链中的每一种配对以产生12 种不同的抗体(表19)。使用EXPIFECTAMINE(商标)293转染试剂盒在Expi293细胞中表达12种人源化P16F6抗体。除了F6 cks-rep(需要更多用于另外的研究)和375ml的F6 f2ka-rep(由于低蛋白质表达)之外，所有构建体都以125ml的体积转染。将上清液通过0.22μm过滤器过滤，并用蛋白酶抑制剂处理。选择在缓冲液交换后提供＞5mg/L的表达水平并且能够浓缩高于≥1mg/mL的抗体用于进一步分析。

表19

*F6和P16F6表示人源化抗体链来源于F12P16F6。

使用pH依赖性蛋白A纯化(HiTrap MabSelect SuRe 5mL)纯化抗体。纯化后，使用zeba旋转柱将抗体缓冲液交换到1×DPBS中。通过尺寸排阻色谱(SEC)分析测定的回收率和相对稳定性在人源化抗体之间变化 (SEC谱未示出)。表20总结了通过SEC测定的回收率、浓度和百分比单体。图6示出了11种代表性人源化抗体的SDS-PAGE分析。命名法有时采用hF6xky-rep的形式，其中h代表人源化，F6代表F12P16F6来源的，x代表用于产生人源化重链序列的第一个程序的第一个字母(a＝abb， s＝sdr，f＝fra，c＝cdr)，k代表κ轻链，并且y代表用于产生人源化轻链序列的第一个程序的第一个字母(a＝abb，s＝sdr，f＝fra，c＝cdr)。术语“rep”代表“修复的”，表示进行了至少第二轮人源化，通常使用不同的方法。

表20

通过FACS的人源化P16F6修复构建体的CD138结合

通过FACS对9种代表性的人源化抗CD138抗体进行与人CD138的细胞表面结合的分析(图7)。使用苏金单抗作为阴性对照。使用表达中等水平CD138的两种细胞系测试结合：多发性骨髓瘤细胞系KMS-11和膀胱癌细胞系RT112/84。在先前的实验中，12P16F6 hIgG1在RT-122/84 细胞中显示出约9nM的EC50，在KMS-11细胞中显示约3nM的EC50。使用四个参数拟合曲线计算EC50(表21)。还用CD138阴性淋巴母细胞 ARH-77细胞测试了构建体。NB表示未观察到特异性结合。

表21：计算的与内源CD138结合的EC50

抗体名称	KMS-11	RT-112	ARH-77
				F6 akf-rep	1.09	1.88	NB
F6 aks-rep	1.36	2.13	NB
				F6 cka-rep	1.30	2.44	NB
F6 ckf-rep	1.64	2.09	NB
				F6 cks-rep	1.2	2.2	NB
F6 f1ka-rep	0.83	1.39	NB
				F6 f1kf-rep	0.94	1.93	NB
F6 f1ks-rep	0.97	2.73	NB
				F6 f2kf-rep	1.81	2.46	NB
苏金单抗	NB	NB	-

人源化P16F6修复构建体的CD138结合ELISA。

用9种代表性的人源化抗体进行CD138结合ELISA，以确定与用于免疫接种的线性CD138肽部分的结合(图7)。用hCD138肽 (AGEGPKEGEAVVLP；SEQ ID NO：89)和阴性对照肽(QAAVTSHPHGGMQPGLHETSA；SEQ ID NO：98)或F12P16F6不结合的小鼠CD138肽包被板。将包被的板与9种代表性抗体中每一种的多种稀释液一起孵育过夜，并用山羊抗人IgG(H+L)-HRP检测结合。使用四个参数拟合曲线确定EC50(表22)。还进行ELISA以检测与板包被的人CD138-Fc蛋白的结合(表22)。分析和结果类似。

表22

选择的研究结果总结

表23示出了13种代表性人源化抗CD138单克隆抗体的分析结果的总结。

[表23]

表23：代表性人源化抗体的生物物理学特性的总结

实施例3

实施例3-晶体结构的测定

以

的分辨率解析与人源化抗CD138抗体Fab片段复合的人黏结蛋白聚糖-1肽的X射线晶体结构。该结构每个不对称单元包含黏结蛋白聚糖-1肽和Fab各一个拷贝(图8)。

结构描述

人源化抗体Fab包含人源化重链可变区(SEQ ID NO：84)和人源化轻链可变区(SEQID NO：42)。根据PyIgClassify数据库分析CDR典型结构。重链CDR分类如下：H1-13-1(CDR长度簇)、H2-10-1和H3-6-1。轻链CDR分类如下：L1-16-1、L2-8-1和L3-9-cis7-1。黏结蛋白聚糖-1肽与单个Fab结合，并且复合物形成掩埋了黏结蛋白聚糖-1肽和Fab的

的溶剂可及表面区域(

链A和H；

链A和L)。

98-108的所有可见的黏结蛋白聚糖-1肽残基参与与Fab的直接接触 (图8)。参与界面的具体Fab残基是来自链H的31-33、35、47、50、52、 58、94-96和101-102，以及来自链L的27-28、32、34、46、49-50、89-94 和96。这意味着来自CDR H1的四个残基以及来自CDR H2的三个残基和来自CDR H3的五个残基参与界面。另外，来自CDR L1的四个残基、来自CDR L2的两个残基和来自CDR L3的七个残基参与界面。

将5.88mg/mL(约125μM)Fab的1mL等份试样与250μM黏结蛋白聚糖-1肽(AGEGPKEGEAVVLP；SEQ ID NO：89)混合，并在4℃下孵育2小时。将该复合物在S200尺寸排阻柱上分级分离，该柱已经用含有 20mM Tris pH 7.5和150mM NaCl的缓冲液预平衡。合并峰值级分并浓缩用于结晶。通过Bradford测定确定的最终蛋白质浓度为3mg/mL。

使用蚊式机器人(TTP Labtech)通过96孔格式的蒸汽扩散的悬滴法筛选大约400个结晶条件。在20℃下在两种条件下观察到晶体生长：2.1M DL-苹果酸pH 7.0和60％Tacsimate pH 7.0。以24孔格式进一步优化结晶。晶体冷却和数据收集

利用含有1.7M DL-苹果酸pH7.0的沉淀剂溶液在24孔板中，使用蒸汽扩散的悬滴法使所述晶体生长。内部X射线衍射筛选表明，通过将晶体预先浸泡在含有3.0M DL-苹果酸pH7.0的溶液中24小时，可以提高分辨率。通过将晶体直接从浸泡液滴中捕获到环中并放入液氮中来将晶体低温冷却。在ESRF光束线ID30A-1处收集同步加速器数据集。

结构解析和细化

MOSFLM(CCP4)和AIMLESS(CCP4)中的数据处理表明最可能的空间群是P212121，晶胞尺寸

并且

总晶胞体积为

计算Matthews系数(

和42.7％溶剂含量)表明每个不对称单元最可能有一个完整的Fab-黏结蛋白聚糖-1 复合物。通过在PDB中的每种组分(Fab重链和轻链)的BLAST搜索来选择用于分子置换(MR)的模型。具有最高序列同一性的模型是3sqo(Fab 重链)和4ojf(Fab轻链)。存储在PDB中的大量Fab晶体结构揭示了存在于可变和恒定结构域之间的广泛多种肘角。肘角的这种变化可导致两个本来高度同源的Fab片段的整体三级结构显著不同，这又导致MR失败。为此，移除重链和轻链的可变区和恒定区之间的铰链区以产生四个单独的 MR搜索集合(VH、VL、CH和CL)。在COOT中目视检查后，从重和轻可变结构域模型的CDR中修剪氨基酸残基，以防止也可能导致MR失败的任何潜在冲突。构建完整Fab所需的所有四个输入搜索集合(VH、 VL、CH和CL)使用PHASER(McCoy et al.，2007)(CCP4)通过MR 正确定位。MR输出模型给出了使用REFMAC5(CCP4)的果冻体细化(jelly body refinement)的20个循环。使用CHAINSAW(CCP4)使蛋白质序列突变以匹配Fab的蛋白质序列。通过模型构建和细化的连续循环迭代地改进模型，直到在电子密度图中可见的Fab的所有有序区域完成。根据Kabat抗体编号惯例对重链和轻链氨基酸重新编号。对应于黏结蛋白聚糖-1肽的电子密度清晰可见。在COOT中手动添加黏结蛋白聚糖-1氨基酸残基并应用正确的编号。使用COOT中的水放置选项添加水分子，并使用 REFMAC5(CCP4)细化完整模型。最终的Fab模型包含重链残基1-216 (链H)和轻链残基1-212(链L)，并且在任一链中没有断裂。最终的黏结蛋白聚糖-1模型包含残基98-108(链A)。最终模型还包含205个水分子。最终Rwork＝21.2％，Rfree＝26.1％。

表24：数据收集、处理和细化统计

数据收集和统计学处理

实施例4

实施例4-某些代表性的黏结蛋白聚糖-1(CD138)序列

人黏结蛋白聚糖-1(黏结蛋白聚糖-1)-UniProtKB-P18827

小鼠黏结蛋白聚糖-1(黏结蛋白聚糖-1)-UniProtKB-P18828

大鼠黏结蛋白聚糖-1(黏结蛋白聚糖-1)-UniProtKB-P26260

猕猴(Rhesus macaque)黏结蛋白聚糖-1-UniProtKB-A0A1D5RIX8

家犬(狗)(Canis familiaris)黏结蛋白聚糖-1-UniProtKB-E2RT70

食蟹猴(Cynomolgus Monkey)黏结蛋白聚糖-1

实施例5

实施例5-某些实施方案

A1.特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂，其中所述结合剂包含CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3，其各自独立地选自选自表1、表2 和表3的轻链可变结构域。

A2.特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂，其中所述结合剂包含CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3，其各自独立地选自选自表6、表7 和表8的重链可变结构域。

A3.特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂，其中所述结合剂包含(i)CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3，其各自独立地选自选自表图4 或表5的轻链可变结构域，和(ii)CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3，其各自独立地选自选自表9或表10的重链可变结构域。

A4.特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂，其中所述结合剂包含选自表1、2和3的CDR的轻链可变结构域的三个CDR，和选自表6、7和8的CDR的重链可变结构域的三个CDR。

A5.特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分的结合剂，其中所述结合剂包含选自表1的CDR-L1、选自表2的CDR-L2、选自表3的CDR-L3、选自表6的CDR-H1、选自表7的CDR-H2和选自表8的CDR-H3。

A6.实施方案A3至A5中任一项所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：27或28的氨基酸序列的CDR-L3；包含SEQ ID NO：16、17或18的氨基酸序列的CDR-L2，包含SEQ ID NO：2或3的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQ ID NO：68或69的氨基酸序列的CDR-H3；包含SEQ IDNO：56 或57的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQ ID NO：46或47的氨基酸序列的CDR-H1。

A7.A6所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：27的氨基酸序列的 CDR-L3；包含SEQ ID NO：16的氨基酸序列的CDR-L2，包含SEQ ID NO： 2的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQID NO：69的氨基酸序列的CDR-H3，包含SEQ ID NO：57的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQID NO：46的氨基酸序列的CDR-H1。

A8.实施方案A3至A5中任一项所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：29或30的氨基酸序列的CDR-L3；包含SEQ ID NO：19、20或21的氨基酸序列的CDR-L2，包含SEQ ID NO：4或5的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQ ID NO：70或71的氨基酸序列的CDR-H3；包含SEQ IDNO：58、 59或60的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQ ID NO：48或49的氨基酸序列的CDR-H1。

A9.实施方案A3至A5中任一项所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：31的氨基酸序列的CDR-L3；包含SEQ ID NO：22的氨基酸序列的 CDR-L2，包含SEQ ID NO：6或7的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQ ID NO：72的氨基酸序列的CDR-H3；包含SEQ ID NO：58、59或60的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQ ID NO：50的氨基酸序列的CDR-H1。

A10.实施方案A3至A5中任一项所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：32的氨基酸序列的CDR-L3；包含SEQ ID NO：23的氨基酸序列的 CDR-L2，包含SEQ ID NO：8或9的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQ ID NO：73的氨基酸序列的CDR-H3，包含SEQ ID NO：61或62的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQ ID NO：51的氨基酸序列的CDR-H1。

A11.实施方案A3至A5中任一项所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：29或30的氨基酸序列的CDR-L3；包含SEQ ID NO：24的氨基酸序列的CDR-L2，包含SEQ ID NO：10或11的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQ ID NO：74的氨基酸序列的CDR-H3；包含SEQ ID NO：58、60或 63的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQ ID NO：52的氨基酸序列的 CDR-H1。

A12.实施方案A3至A5中任一项所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：33的氨基酸序列的CDR-L3；包含SEQ ID NO：25的氨基酸序列的 CDR-L2，包含SEQ ID NO：12或13的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQ ID NO：75的氨基酸序列的CDR-H3；包含SEQ ID NO：64或65的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQ ID NO：53的氨基酸序列的CDR-H1。

A13.实施方案A3至A5中任一项所述的结合剂，其包含：包含SEQ ID NO：34的氨基酸序列的CDR-L3；包含SEQ ID NO：26的氨基酸序列的 CDR-L2，包含SEQ ID NO：14或15的氨基酸序列的CDR-L1；包含SEQ ID NO：76的氨基酸序列的CDR-H3；包含SEQ ID NO：66或67的氨基酸序列的CDR-H2；和包含SEQ ID NO：54或55的氨基酸序列的CDR-H1。

A14.实施方案A6或A7所述的结合剂，其包含：重链可变区，所述重链可变区包含与选自SEQ ID NO：84-88的氨基酸序列具有至少80％或至少90％同一性的氨基酸序列；和轻链可变区，所述轻链可变区包含与选自SEQ ID NO：42-45的氨基酸序列具有至少80％或至少90％同一性的氨基酸序列。

A15.实施方案A14所述的结合剂，其包含：重链可变区，所述重链可变区包含选自SEQ ID NO：84-88的氨基酸序列；和轻链可变区，所述轻链可变区包含选自SEQ ID NO：42-45的氨基酸序列。

A16.实施方案A14所述的结合剂，其包含：重链可变区，所述重链可变区包含与SEQID NO：85的氨基酸序列具有至少80％或至少90％同一性的氨基酸序列；和轻链可变区，所述轻链可变区包含与SEQ ID NO：42 的氨基酸序列具有至少80％或至少90％同一性的氨基酸序列。

A17.实施方案A16所述的结合剂，其包含：重链可变区，所述重链可变区包含SEQID NO：85的氨基酸序列；和轻链可变区，所述轻链可变区包含SEQ ID NO：42的氨基酸序列。

A18.实施方案A1至A17中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂是单克隆抗体。

A19.实施方案A1至A18中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂包含IgD、IgE、IgA或IgM的恒定区。

A20.实施方案A1至A19中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂包含IgG₁、IgG₂、IgG₃或IgG₄的恒定区。

A21.实施方案A1至A20中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂是人源化的、嵌合的或CDR移植的。

A22.实施方案A1至A21中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂是人源化的。

A23.药物组合物，包含：

实施方案A1至A22中任一项所述的结合剂，和

可药用赋形剂、稀释剂、添加剂或载体。

本文中引用的每篇专利、专利申请、出版物或任何其他参考文献或文件的全部内容均在此通过引用并入。在发生冲突的情况下，以说明书(包括定义)为准。

任何专利、专利申请、出版物或任何其他文件的引用并不是承认任何前述内容是相关的现有技术，其也不构成对这些出版物或文件的内容或日期的任何承认。

除非另外定义，否则本文中使用的所有技术和科学术语都具有与本发明所属领域的普通技术人员通常理解的相同的含义。尽管与本文中描述的那些类似或等同的方法和材料可用于本发明的实施或测试，但本文中描述了合适的方法和材料。

本文中公开的所有特征可以以任意组合进行组合。说明书中公开的每个特征可由用于相同、等同或类似目的的替代特征代替。因此，除非另有明确说明，否则所公开的特征(例如，抗体)是一类等同或类似特征的一个实例。

除非上下文另有明确说明，否则本文中使用的所有数值或数值范围包括在这样的范围内的整数和在范围内的值或整数的分数。此外，当本文中描述值的列表(例如，约50％、60％、70％、80％、85％或86％)时，该列表包括其所有中间值和分数值(例如，54％、85.4％)。因此，为了举例说明，提及80％或更高的同一性包括81％、82％、83％、84％、85％、86％、 87％、88％、89％、90％、91％、92％、93％、94％等，以及81.1％、81.2％、 81.3％、81.4％、81.5％等，82.1％、82.2％、82.3％、82.4％、82.5％等，等等。

对带有多于(大于)或小于的整数的提及分别包括大于或小于所提及的数的任何数。因此，例如，提及小于100包括99、98、97等，一直向下至数一(1)；并且小于10包括9、8、7等，一直向下至数一(1)。

除非上下文另有明确说明，否则本文中使用的所有数值或范围包括在这样的范围内的整数和值的分数，以及在这样的范围内的整数的分数。因此，为了举例说明，提及数值范围，例如1至10，包括1、2、3、4、5、 6、7、8、9、10，以及1.1、1.2、1.3、1.4、1.5等，等等。因此，提及1 至50的范围包括1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、 16、17、18、19、20等，直至50并且包括50，以及1.1、1.2、1.3、1.4、 1.5等，2.1、2.2、2.3、2.4、2.5等，等等。

提及一系列范围包括将该系列内不同范围的边界的值组合的范围。因此，为了举例说明，提及一系列范围，例如，1至10、10至20、20至30、 30至40、40至50、50至60、60至75、75至100、100至150、150至 200、200至250、250至300、300至400、400至500、500至750、750至1,000、1,000至1,500、1,500至2,000、2,000至2,500、2,500至3,000、 3,000至3,500、3,500至4,000、4,000至4,500、4,500至5,000、5,500至 6,000、6,000至7,000、7,000至8,000或8,000至9,000，包括范围10至 50、50至100、100至1,000、1,000至3,000、2,000至4,000等。

可对前述内容进行修改而不脱离本技术的基本方面。尽管已经参考一个或更多个具体实施方案相当详细地描述了本技术，但是本领域普通技术人员将认识到可对本申请中具体公开的实施方案进行改变，而这些修改和改进都在本技术的范围和精神内。

本文中使用肯定语言描述多个实施方案和方面来一般性地公开本发明。本发明还特别地包括其中排除特定主题(全部或部分地)(例如物质或材料、方法步骤和条件、方案或操作)的实施方案。例如，在本发明的某些实施方案或方面中，排除了材料和/或方法步骤。因此，即使本文中未在本发明不包含的内容方面对本发明进行一般性表述，本文中也仍公开了在本发明中未明确排除的方面。

本文中举例说明性描述的技术适当地可在不存在本文中未具体公开的任何要素的情况下实施。因此，例如，在本文中的每种情况下，术语“包含/包括”、“基本上由......组成”和“由...组成”中任一个可用其他两个术语中的任一个替换。已经使用的术语和表达用作描述性术语而不是限制性的，并且这样的术语和表达的使用不排除所示和所描述特征或其一部分的任何等同物，并且可在要求保护的技术的范围内进行多种修改。没有数量词修饰的名词可指其修饰的要素的一个/种或多个/种(例如，“试剂”可意指一种或更多种试剂)，除非其在上下文中清楚，否则描述任一个要素或多于一个要素。本文中使用的术语“约”是指在基础参数的10％内的值(即，加或减10％)，并且在一串值的开始使用的术语“约”修饰每个值(即，“约1、2和3”是指约1、约2和约3)。例如，“约100克”的重量可包括90克至110克的重量。本文中使用的术语“基本上”是指值修饰语，意指“至少95％”、“至少96％”、“至少97％”、“至少98％”或“至少99％”并且可包括100％。例如，基本上没有X的组合物可包含少于5％、少于 4％、少于3％、少于2％或少于1％的X，和/或X可在该组合物中不存在或检测不到。

因此，应理解，尽管已经通过代一些表性实施方案和任选的特征具体公开了本发明技术，但是本领域技术人员可获取本文中公开的概念的修改和变化，并且这样的修改和变化被认为在该技术的范围内。

Claims (82)

1.黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含：

选自CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3的一个或更多个轻链互补决定区，其中所述CDR-L1包含与选自SEQ ID NO：2-15的CDR-L1的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，所述CDR-L2包含与选自SEQ ID NO：16-26的CDR-L2的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，并且所述CDR-L3包含与选自SEQ ID NO：27-34的CDR-L3的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

2.权利要求1所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含所述CDR-L3和任选的所述CDR-L2。

3.权利要求1所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含所述CDR-L1、所述CDR-L2和所述CDR-L3。

4.黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含

选自CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3的一个或更多个重链互补决定区，其中所述CDR-H1包含与选自SEQ ID NO：46-55的CDR-H1的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，所述CDR-H2包含与选自SEQ ID NO：56-67的CDR-H2的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，并且所述CDR-H3包含与选自SEQ ID NO：68-76的CDR-H3的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，

其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

5.权利要求4所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含所述CDR-H3。

6.权利要求4所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含所述CDR-H1、所述CDR-H2和所述CDR-H3。

7.权利要求4至6中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含：

选自CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3的一个或更多个轻链互补决定区，其中所述CDR-L1包含与选自SEQ ID NO：2-15的CDR-L1的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，所述CDR-L2包含与选自SEQ ID NO：16-26的CDR-L2的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列，并且所述CDR-L3包含与选自SEQ ID NO：27-34的CDR-L3的氨基酸序列具有至少80％同一性的多肽序列。

8.权利要求1至3或7中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述CDR-L1包含与选自SEQ ID NO：2-15的CDR-L1的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列，所述CDR-L2包含与选自SEQ ID NO：16-26的CDR-L2的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列，并且所述CDR-L3包含与选自SEQ ID NO：27-34的CDR-L3的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列。

9.权利要求1至3或7中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述CDR-L1包含选自SEQ ID NO：2-15的多肽序列，所述CDR-L2包含选自SEQ ID NO：16-26的多肽序列，并且所述CDR-L3包含选自SEQ ID NO：27-34的多肽序列。

10.权利要求4至7中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述CDR-H1包含与选自SEQ ID NO：46-55的CDR-H1的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列，所述CDR-H2包含与选自SEQ ID NO：56-67的CDR-H2的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列，并且所述CDR-H3包含与选自SEQ ID NO：68-76的CDR-H3的氨基酸序列具有至少90％同一性的多肽序列。

11.权利要求4至7中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述CDR-H1包含选自SEQ ID NO：46-55的多肽序列，所述CDR-H2包含选自SEQ ID NO：56-67多肽序列，并且所述CDR-H3包含选自SEQ ID NO：68-76的多肽序列。

12.权利要求7所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含所述CDR-H3和任选的所述CDR-L3。

13.权利要求12所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其还包含所述CDR-H2和任选的所述CDR-L2。

14.权利要求12或13所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其还包含所述CDR-H1和任选的所述CDR-L1。

15.权利要求1至14中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述CDR-L3选自SEQID NO：27或SEQ ID NO：29；所述CDR-L2选自SEQ ID NO：16或SEQ ID NO：19；并且所述CDR-L1选自SEQ ID NO：2或SEQ ID NO：4。

16.权利要求4至15中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述CDR-H3选自SEQID NO：68或SEQ ID NO：70；所述CDR-H2选自SEQ ID NO：56或SEQ ID NO：58；并且所述CDR-H1选自SEQ ID NO：46或SEQ ID NO：48。

17.权利要求7所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含SEQ ID NO：2的CDR-L 1、SEQ IDNO：16的CDR-L2、SEQ ID NO：27的CDR-L3、SEQ ID NO：46的CDR-H1、SEQ ID NO：56的CDR-H2、和SEQ ID NO：68的CDR-H3。

18.权利要求7所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含SEQ ID NO：4的CDR-L1、SEQ IDNO：19的CDR-L2、SEQ ID NO：29的CDR-L3、SEQ ID NO：48的CDR-H1、SEQ ID NO：58的CDR-H2、和SEQ ID NO：70的CDR-H3。

19.黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含：

CDR-L1、CDR-L2和CDR-L3，其为轻链互补决定区(CDR-L)的三个多肽序列，

其中所述CDR-L1选自SEQ ID NO：2-15，所述CDR-L2选自SEQ ID NO：16-26，并且所述CDR-L3选自SEQ ID NO：27-34，并且

其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

20.黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含：

CDR-H1、CDR-H2和CDR-H3，其为重链互补决定区(CDR-H)的三个多肽序列，

其中所述CDR-H1选自SEQ ID NO：46-55，所述CDR-H2选自SEQ ID NO：56-67，并且所述CDR-H3选自SEQ ID NO：68-76，并且

其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

21.黏结蛋白聚糖-1结合剂，其包含：

选自SEQ ID NO：2-15的CDR-L1、选自SEQ ID NO：16-26的CDR-L2、选自SEQ ID NO：27-34的CDR-L3、选自SEQ ID NO：46-55的CDR-H1、选自SEQ ID NO：56-67的CDR-H2、和选自SEQID NO：68-76的CDR-H3，

其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

22.权利要求1至21中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂是抗体或其结合片段。

23.权利要求1至22中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂是单克隆抗体或其结合片段。

24.权利要求1至23中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含IgG、IgD、IgE、IgA或IgM的恒定区。

25.权利要求24所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含IgG₁、IgG₂、IgG₃或IgG₄的恒定区。

26.权利要求1至25中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂是人源化的。

27.权利要求1至26中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含至少一个人恒定区或其一部分。

28.权利要求1至27中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含一个、两个或至少三个人或人源化框架区。

29.权利要求1至28中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含至少一个小鼠框架区。

30.权利要求1至29中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含至少三个小鼠框架区。

31.权利要求1至30中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂是Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、Fd、单链Fv(scFv)、二硫化物连接的Fvs(sdFv)、VL、VH、双抗体((VL-VH)2或(VH-VL)2)、三抗体(三价)、四抗体(四价)、微抗体((scFV-CH3)2)、IgGδCH2、scFv-Fc或(scFv)2-Fc，或其结合片段。

32.权利要求1至31中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂由单链多肽组成。

33.权利要求1至32中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含轻链可变区，所述轻链可变区具有与选自SEQ ID NO：35-41或SEQ ID NO：42-45的轻链可变区的氨基酸序列具有至少80％或至少90％同一性的氨基酸序列。

34.权利要求1至33中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含选自SEQ ID NO：35-41或SEQ ID NO：42-45的轻链可变区。

35.权利要求1至34中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含重链可变区，所述重链可变区具有与选自SEQ ID NO：77-83或SEQ ID NO：84-88的重链可变区的氨基酸序列具有至少80％或至少90％同一性的氨基酸序列。

36.权利要求1至35中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂包含选自SEQ ID NO：77-83或SEQ ID NO：84-88的重链可变区。

37.权利要求1至36中任一项的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中选自SEQ ID NO：35-45的轻链可变区或选自SEQ ID NO：77-88的重链可变区包含一至五个氨基酸修饰，所述氨基酸修饰选自氨基酸添加、氨基酸缺失和氨基酸替换。

38.权利要求37所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述重链可变区的框架区或所述轻链可变区的框架区包含一至五个氨基酸修饰。

39.权利要求37所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中一个或更多个所述轻链互补决定区或一个或更多个所述重链互补决定区包含所述一至五个氨基酸修饰中的一个或更多个。

40.权利要求37所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述一至五个氨基酸修饰不在轻链互补决定区中或重链互补决定区中。

41.权利要求1至40中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合哺乳动物黏结蛋白聚糖-1。

42.权利要求41所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述哺乳动物黏结蛋白聚糖-1是人黏结蛋白聚糖-1、猴黏结蛋白聚糖-1或大鼠黏结蛋白聚糖-1。

43.权利要求40所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合人黏结蛋白聚糖-1。

44.权利要求1至43中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合黏结蛋白聚糖-1的细胞外结构域。

45.权利要求1至44中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂以50nM或更小的结合亲和力(KD)特异性结合人黏结蛋白聚糖-1或其一部分。

46.权利要求45所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂以1nM或更小的结合亲和力(KD)特异性结合。

47.权利要求1至46中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合包含氨基酸序列GX₁KEX₂EAX₃VLP(SEQ ID NO：91)的多肽，其中X₁、X₂和X₃选自任意氨基酸。

48.权利要求47所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中X₁选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₂选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₃选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和苯丙氨酸。

49.权利要求47至48中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述黏结蛋白聚糖-1结合剂特异性结合包含氨基酸序列AGEGPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：89)或GPKEGEAVVLP(SEQID NO：90)或由其组成的多肽。

50.结合剂，其特异性结合包含氨基酸序列GX₁KEX₂EAX₃VLP(SEQ ID NO：91)或由其组成的多肽，其中X₁、X₂和X₃选自任意氨基酸。

51.权利要求50所述的结合剂，其中X₁选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₂选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸和缬氨酸，和/或X₃选自脯氨酸、丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、缬氨酸、甲硫氨酸、亮氨酸、异亮氨酸和苯丙氨酸。

52.权利要求50或51所述的结合剂，其中所述结合剂特异性结合包含氨基酸序列AGEGPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：89)或GPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：90)或由其组成的多肽。

53.权利要求50至52中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂以约10^-5M至约10^-15M的结合亲和力(KD)特异性结合所述多肽。

54.权利要求50至53中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂是单克隆抗体或其抗原结合片段。

55.权利要求50至54中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂是非天然存在的结合剂。

56.权利要求50至55中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂是人抗体、人源化抗体、嵌合抗体或其抗原结合片段。

57.权利要求50至56中任一项所述的结合剂，其中所述结合剂选自Fab、Fab’、F(ab’)2、Fv、Fd、单链Fv(scFv)、二硫化物连接的Fvs(sdFv)、VL、VH、双抗体((VL-VH)2或(VH-VL)2)、三抗体(三价)、四抗体(四价)、微抗体((scFV-CH3)2)、IgGδCH2、scFv-Fc或(scFv)2-Fc，及其结合片段。

58.与权利要求1至49中任一项所述黏结蛋白聚糖-1结合剂竞争与黏结蛋白聚糖-1、其一部分或其表位之结合的第二黏结蛋白聚糖-1结合剂，或者与权利要求50至57中任一项所述结合剂竞争与50至57中任一项所述多肽之结合的第二黏结蛋白聚糖-1结合剂。

59.权利要求58的所述第二黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述表位是包含氨基酸序列GX₁KEX₂EAX₃VLP(SEQ ID NO：91)或由其组成的多肽，其中X₁、X₂和X₃选自任意氨基酸。

60.权利要求58或59所述的第二黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述表位是包含氨基酸序列AGEGPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：89)或GPKEGEAVVLP(SEQ ID NO：90)或由其组成的多肽。

61.权利要求58至60中任一项的第二黏结蛋白聚糖-1结合剂，其中所述第二黏结蛋白聚糖-1结合剂具有不同于权利要求1至49中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的氨基酸序列。

62.药物组合物，其包含权利要求1至49中任一项的黏结蛋白聚糖-1结合剂。

63.权利要求62所述的药物组合物，其中所述药物组合物被配制成用于选自以下的施用途径：外用、局部、透皮、皮肤、皮下、结膜下、玻璃体内、球后、前房内、鼻内、透黏膜、肠内、经口、舌下、直肠、肠胃外、全身、静脉内、动脉内、肌内、腹膜内、腔内、颅内、子宫内、阴道内和膀胱内输注。

64.权利要求62所述的药物组合物，其中所述药物组合物被配制成适合于向哺乳动物静脉内施用的无菌组合物。

65.权利要求62至64中任一项所述的药物组合物，其中所述药物组合物被配制成片剂、微片剂、微丸剂、散剂、胶囊剂、颗粒剂、乳剂或溶液剂。

66.细胞或细胞培养物，其表达、分泌和/或产生权利要求1至61中任一项所述的结合剂。

67.权利要求66所述的细胞，其中所述细胞是哺乳动物细胞。

68.产生黏结蛋白聚糖-1结合剂的方法，其包括培养表达权利要求1至49中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的细胞系，以及从所述细胞系或从由所述细胞系产生的条件化培养基中分离所述黏结蛋白聚糖-1结合剂。

69.权利要求68所述的方法，其中所述细胞系包含编码所述黏结蛋白聚糖-1结合剂或其结合部分的核酸。

70.鉴定表达黏结蛋白聚糖-1的细胞的方法，其包括(i)使一种或更多种细胞与权利要求1至49中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂接触。

71.权利要求70所述的方法，其还包括(ii)检测包含所述黏结蛋白聚糖-1结合剂与所述一种或更多种细胞中的至少一种的结合复合物的存在与否，其中所述结合复合物的存在表明存在表达黏结蛋白聚糖-1的细胞。

72.将黏结蛋白聚糖-1结合剂递送至细胞的方法，其包括在允许所述黏结蛋白聚糖-1结合剂与所述细胞结合的条件下使哺乳动物细胞在体外或体内与包含权利要求1至49中任一项所述的黏结蛋白聚糖-1结合剂的组合物接触。

73.权利要求72所述的方法，其中所述递送包括向受试者施用包含所述黏结蛋白聚糖-1结合剂的组合物。

74.权利要求62至65中任一项所述的药物组合物，其用于治疗肿瘤性疾病或癌症。

75.权利要求74所述的药物组合物，其中所述肿瘤性疾病或癌症包含表达黏结蛋白聚糖-1的细胞。

76.权利要求74或75所述的药物组合物，其中所述肿瘤性疾病或癌症选自肺癌、乳腺癌、卵巢癌、肾癌、结直肠癌、胃癌、甲状腺癌、胰腺癌、神经母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、宫颈癌、肝细胞癌、肉瘤、间皮瘤、胶质母细胞瘤、多发性骨髓瘤、黑素瘤、前列腺癌和食管癌。

77.治疗患有或怀疑患有肿瘤性疾病或癌症之受试者的方法，其包括向有此需要的受试者施用治疗量的权利要求62至65中任一项所述的药物组合物。

78.权利要求77所述的方法，其中所述肿瘤性疾病或癌症包含表达黏结蛋白聚糖-1的细胞。

79.权利要求77或78所述的方法，其中所述肿瘤性疾病或癌症选自肺癌、乳腺癌、卵巢癌、肾癌、结直肠癌、胃癌、甲状腺癌、胰腺癌、神经母细胞瘤、头颈部鳞状细胞癌、宫颈癌、肝细胞癌、肉瘤、间皮瘤、胶质母细胞瘤、多发性骨髓瘤、黑素瘤、前列腺癌和食管癌。

80.权利要求77至79中任一项所述的方法，其中所述受试者是哺乳动物。

81.权利要求77至80中任一项所述的方法，其中所述受试者是人。

82.权利要求77至81中任一项所述的方法，其中所述治疗量包含0.1mg/kg至300mg/kg所述受试者体重的黏结蛋白聚糖-1结合剂的量。

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