CN110684752A - 一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用 - Google Patents

一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用,本发明所述的一种突变型Taq DNA聚合酶,其是对如SEQ ID NO.1所示的Taq DNA聚合酶的氨基酸序列中插入、取代、或缺失1个或多个氨基酸,且与SEQ ID NO.1所示的Taq DNA聚合酶相比,其杂质耐受性显著增强的氨基酸序列。本发明的重组型Taq DNA聚合酶突变体对血液、荧光染料及高离子强度的耐受性明显增强,能够直接进行血液样品的PCR反应检测,节约时间,避免假阴性。

Description

一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和 应用
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体涉及一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用。
背景技术
DNA聚合酶是一类使用单链DNA作为模板来合成互补DNA链的酶。DNA聚合酶可以将游离核苷酸添加到新形成链的3'末端,使新链以5'-3'方向延伸。大多数DNA聚合酶是具有聚合和核酸外切活性的多功能蛋白质(例如,3'-5'外切核酸酶或5'-3'外切核酸酶活性)。
与其他天然酶一样,DNA聚合酶已经发展了数百万年,以在其天然细胞环境中发挥作用。其中许多几乎完全适应在该环境中工作。但当DNA聚合酶从其天然环境中提取并用于工业或研究时,酶的运行环境和条件不可避免地与其进化的环境和条件大不相同,天然环境进化的限制因素也大多消除,因此,用于工业或研究应用的DNA聚合酶的改进具有巨大的潜力。Taq DNA聚合酶作为第一种被发现的可用于PCR反应的酶,已经进行了非常密集的改造研究,并且有很多生物化学和结构数据可供使用。一些突变位点对于酶的保真度很关键(US6395524,US6602695和US5614365),一些突变能提高其加A效率(CN201611196755.9),使酶低温敏感(Barnes和Kermekchiev,2000),或能增加聚合酶对不同PCR抑制剂的抗性(Kermekchiev MB,Tzekov A and Barnes WM.Cold-sensitive mutants of Taq DNApolymeraseprovide a hot start for PCR.Nucleic Acids Research,2003,31:6139-6147)。
这种Taq DNA聚合酶突变体可用于临床和环境样品中的病原体或特定物质检测,这些样品中通常含有PCR抑制剂(染料,血液,土壤),这是需要样品处理的主要原因。然而,样品纯化过程非常低效,且劳动密集,同时可能引入新的杂质或造成误差。无需样品处理,直接进行PCR或定量PCR检测是一种更加简便、高效的方案,但这就需要TaqDNA聚合酶能够耐受检测过程中所涉及的抑制剂成分,如血液、荧光染料,高离子强度等,高效获得单一精确的目的条带。例如,SYBR Green嵌入染料用于qPCR,这将抑制Taq DNA聚合酶,并降低PCR效率和灵敏度。对SYBR Green染料的抗性增加,可能与对来自血液和其他PCR抑制剂的酶抗性增加有关(Kermekchiev MB,Kirilova LI,Vail EE,Barnes WM.Mutants of Taq DNApolymerase resistant to PCR inhibitors allow DNA amplification from wholeblood and crude soil samples.Nucleic Acids Research,2009,37:e40.)。
目前,PCR代表了分子生物学应用市场中增长最快的部分之一。正在开发和引入PCR的新应用和PCR的新变体用于研究和诊断应用,例如快速qPCR,数字PCR和需要新型酶特性的直接样品到PCR。因此,工业上需要具有新颖,改进性质的Taq DNA聚合酶衍生物。
血液对于PCR有显著抑制效果,目前已经开发了各种DNA提取方法以降低血液组分对PCR的抑制作用,这些预处理步骤通常是耗时,劳动密集,并且只能适应于特定的样品,并非通用方法。此外,即使在使用DNA提取试剂盒后,仍可能存在一些PCR抑制剂。例如,使用血液DNA纯化试剂盒进行样品提纯,进行人类乙型肝炎病毒测试,其中大约14%可能是假阴性(KramvisA.,BukovzerS.and KewM.C.Comparison ofhepatitis B virus DNAextractions from serum by the QIAampblood kit,Genereleaser,and the phenol-chloroform method.J.Clin.Microbiol.,1996,34,2731–2733.)。SYBR Green荧光染料是qPCR的常用染料,但Taq DNA聚合酶对其耐受程度很低。
发明内容
为解决上述技术问题,本发明的目的是提供一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用,本发明的重组型Taq DNA聚合酶突变体对血液、荧光染料及高离子强度的耐受性明显增强,能够直接进行血液样品的PCR反应检测,节约时间,避免假阴性。
本发明提供了一种突变型Taq DNA聚合酶,其是对如SEQ ID NO.1所示的Taq DNA聚合酶的氨基酸序列中插入、取代、或缺失1个或多个氨基酸,且与SEQ ID NO.1所示的TaqDNA聚合酶相比,其杂质耐受性显著增强的氨基酸序列。
在本发明的一个实施例中,本发明所述的突变型Taq DNA聚合酶(以Taq-Mut表示),所述突变体在SEQ ID NO.1所示的序列中,具有下述的一个或多个氨基酸位置上的氨基酸取代,各取代用三联体表示:字母-数字-字母,其中数字表示突变氨基酸的位置,数字前的字母对应突变涉及的氨基酸,数字后的字母表示用于置换数字前氨基酸的氨基酸:R266F,A293N,A414F,E466Q,E507K,D732E。
本发明所述的R266F表示第226位氨基酸由精氨酸变成了苯丙氨酸;A293N表示其第293位氨基酸由丙氨酸变成了天冬酰胺;A414F表示其第414位氨基酸由丙氨酸变成了苯丙氨酸;E466Q表示其第466位氨基酸由谷氨酸变成了谷氨酰胺;E507K表示第507位氨基酸由谷氨酸变成了赖氨酸;D732E表示第732位氨基酸由天冬氨酸变成了谷氨酸。
在本发明的一种实施例中,本发明所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut,氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,或与SEQ ID NO.3所示序列具有80%同一性的具有Taq DNA聚合酶活性的氨基酸序列;优选的具有85%同一性,更优选的具有90%同一性,最优选的,具有95%同一性,进一步优选,具有99%同一性。
另一方面,本发明提供了基于本文所述的各种突变来工程化修饰Taq DNA聚合酶的方法。
在本发明的一种实施例中,本发明还提供编码本发明所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列。需要说明的是,由于同一氨基酸可能有多种不同的密码子来决定,所以编码上述突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列可以是由SEQ ID NO.2所示野生型Taq DNA聚合酶核苷酸序列突变一个或多个核苷酸形成同义突变得到同样可编码SEQ ID NO.3中氨基酸序列的核苷酸序列。在一种具体的实施例中,编码本发明所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
本发明还提供一种包含编码本发明所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列的重组载体。在一种具体的实施例中,所述重组载体包含如SEQ ID NO.4所示的核苷酸序列。
本发明还包含一种重组细胞,包含可编码所属突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列,或包含可编码所属突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列的载体。
进一步的,所述重组细胞所使用的宿主细胞为BL21。
本发明还提供了一种所述可提高杂质耐受性的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的制备方法,其包括如下步骤:
1)构建含有编码突变型Taq酶的核苷酸序列的载体:利用含有突变位点信息的引物,对含有野生型Taq DNA聚合酶基因的质粒进行PCR扩增,得到目的条带后利用同源重组得到充足质粒或直接转化得到突变质粒,测序验证核苷酸序列正确;
2)将步骤1)中得到的载体转化宿主细胞得到重组细胞;将含有正确核苷酸序列的载体转化到宿主细胞中,利用抗生素筛选得到正确的重组细胞;
3)培养、表达并收集重组细胞,提取纯化突变型Taq酶。
进一步的,步骤1)中,所述引物的具体序列如下:
R266F-1:CGGGAGCCCGACTTCGAGAGGCTTAGGGCCTTTCTG(SEQ ID NO.5);
R266F-2:CCTAAGCCTCTCGAAGTCGGGCTCCCGCCTTTTGGC(SEQ ID NO.6);
A293N-1:GAAAGCCCCAAGAACCTGGAGGAGGCCCCCTGGCCC(SEQ ID NO.7);
A293N-2:GGCCTCCTCCAGGTTCTTGGGGCTTTCCAGAAGGCC(SEQ ID NO.8);
A414F-1:GAGAGGCTCTTCTTCAACCTGTGGGGGAGGCTTGAG(SEQ ID NO.9);
A414F-2:CCCCCACAGGTTGAAGAAGAGCCTCTCGGAAAGGGC(SEQ ID NO.10);
E466Q-1:GAGGTGGCCGAGCAGATCGCCCGCCTCGAGGCCGAG(SEQ ID NO.11);
E466Q-2:GAGGCGGGCGATCTGCTCGGCCACCTCCAGGGACAA(SEQ ID NO.12);
E507K-1:ATCGGCAAGACGAAGAAGACCGGCAAGCGCTCCACC(SEQ ID NO.13);
E507K-2:CTTGCCGGTCTTCTTCGTCTTGCCGATGGCGGGAAG(SEQ ID NO.14);
D732E-1:CGCTACGTGCCAGAGCTAGAGGCCCGGGTGAAGAGC(SEQ ID NO.15);
D732E-2:CCGGGCCTCTAGCTCTGGCACGTAGCGGCGGCGGCC(SEQ ID NO.16)。
本发明上述引物中包含了所需突变的位点和替换后的核苷酸。
本发明还提供本发明所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut在生物技术领域中的应用。更具体优选的,是在PCR领域中的应用。具体的,在一些实施方案中,本发明涉及的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut在包含血液的样品、包含SYBR Green的样品或/和含盐样品的PCR领域中的应用。
本发明的有益效果:
(1)本发明对现有的野生型Taq DNA聚合酶进行提高杂质耐受性的定向改造,构建突变型Taq DNA聚合酶,其能够耐受更高的血液样品浓度、SYBR Green浓度以及盐离子浓度,表现出更高的聚合扩增能力及更低的假阴性率。该突变型Taq DNA聚合酶的杂质耐受度得到提升。
(2)突变型Taq DNA聚合酶可在含有20%血液的PCR体系中进行扩增,产物扩增与无血情况无显著差异,省去了血液样本检测的纯化步骤,可应用于大量未提纯样本的快速扩增,且所需酶的用量比野生型Taq DNA聚合酶下降至少3倍。
(3)突变型Taq DNA聚合酶对于SYBR Green染料的耐受性是野生型Taq DNA聚合酶的至少4倍,与野生型酶相比能够更快和/或更有效地进行DNA扩增的突变体。
(4)突变型Taq DNA聚合酶对于PCR体系中KCl浓度的耐受比野生型Taq DNA聚合酶至少提高3倍,至少在含有150mM KCl的扩增体系中,扩增不受影响。
附图说明
图1为本发明实施例3扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测结果。其中1-3道为Taq DNA聚合酶的扩增结果,其中加入酶量依次分别为60ng、40ng和20ng;4-6道为突变型Taq DNA聚合酶的扩增结果,其中加入酶量依次分别为60ng、40ng和20ng;
图2为本发明实施例4扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测结果。其中1-2道为Taq DNA聚合酶的扩增结果,其中KCl终浓度依次分别为50mM和150mM;3-4道为突变型Taq DNA聚合酶的扩增结果,其中KCl终浓度依次分别为50mM和150mM;
图3为本发明实施例5扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测结果。其中1-5道为Taq DNA聚合酶的扩增结果,其中SYBR Green染料终浓度依次分别为0×、1×、3×、4×和5×;6-10道为突变型Taq DNA聚合酶的扩增结果,其中SYBR Green染料终浓度依次分别为0×、1×、3×、4×和5×。
具体实施方式
下面结合实施例对本发明做进一步说明,应当理解,此处所描述的具体实施例仅用以解释本发明,并不用于限定本发明,凡在本发明的构思前提下对本发明制备方法的简单改进都属于本发明的保护范围之内。下面实施例未注明具体条件的实验方法,通常按照本领域的公知手段,例如Sambrook等人编著的《分子克隆:实验室手册》(New York:ColdSpring Harbor Laboratory Press,1989)中所述的条件,或按照制造厂商所建议的条件。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。
实施例1:构建含有编码突变型Taq DNA聚合酶的核苷酸序列的载体
利用基因合成的方法,合成引物序列如下:
R266F-1:CGGGAGCCCGACTTCGAGAGGCTTAGGGCCTTTCTG(SEQ ID NO.5);
R266F-2:CCTAAGCCTCTCGAAGTCGGGCTCCCGCCTTTTGGC(SEQ ID NO.6);
A293N-1:GAAAGCCCCAAGAACCTGGAGGAGGCCCCCTGGCCC(SEQ ID NO.7);
A293N-2:GGCCTCCTCCAGGTTCTTGGGGCTTTCCAGAAGGCC(SEQ ID NO.8);
A414F-1:GAGAGGCTCTTCTTCAACCTGTGGGGGAGGCTTGAG(SEQ ID NO.9);
A414F-2:CCCCCACAGGTTGAAGAAGAGCCTCTCGGAAAGGGC(SEQ ID NO.10);
E466Q-1:GAGGTGGCCGAGCAGATCGCCCGCCTCGAGGCCGAG(SEQ ID NO.11);
E466Q-2:GAGGCGGGCGATCTGCTCGGCCACCTCCAGGGACAA(SEQ ID NO.12);
E507K-1:ATCGGCAAGACGAAGAAGACCGGCAAGCGCTCCACC(SEQ ID NO.13);
E507K-2:CTTGCCGGTCTTCTTCGTCTTGCCGATGGCGGGAAG(SEQ ID NO.14);
D732E-1:CGCTACGTGCCAGAGCTAGAGGCCCGGGTGAAGAGC(SEQ ID NO.15);
D732E-2:CCGGGCCTCTAGCTCTGGCACGTAGCGGCGGCGGCC(SEQ ID NO.16)。
以包含野生型Taq DNA聚合酶核苷酸序列的质粒为模板,利用PCR对野生型TaqDNA聚合酶(其序列如SEQ ID NO.2所示)进行扩增。PCR扩增分为6个反应,分别以R266F-1和A293N-2,A293N-1和A414F-2,A414F-1和E466Q-2,E466Q-1和E507K-2,E507K-1和D732E-2,E732E-1和R266F-2为引物,在50μL反应体系中,10uM的引物各加入2μL,以Phanta MaxSuper-Figelity DNA Polymerase(由南京诺唯赞生物科技有限公司生产,Vazyme,货号P505)为DNA聚合酶。扩增条件为95℃30s;95℃15s;60℃15s;72℃4min;72℃5min,共30个循环。
扩增结束后,在50μL反应体系中直接加入1μL DpnI(由NEB公司生产,货号#R0176L),37℃恒温孵育2小时,消化原始质粒模板。以1%-1.5%(w/v)琼脂糖凝胶电泳,得到目的条带后切胶回收。将回收产物利用Mut Express MμLtiS Fast Mutagenesis Kit V2(由南京诺唯赞生物科技有限公司生产,Vazyme,货号C215)进行重组反应,37℃恒温孵育0.5小时。
取20μL冷却重组反应液,加入到100μL DH5a感受态细胞(由南京诺唯赞生物科技有限公司生产,Vazyme,货号C502)中,轻弹管壁数下混匀,在冰上放置30min。42℃热激90秒,冰水浴孵育2min。加入500μL LB培养基,37℃摇菌45min。取100μL菌液均匀涂布在含有质粒对应抗性抗生素的平板上。将平板倒置,于37℃过夜培养。第二天挑取单克隆,测序鉴定。测序结果表明:本发明合成的突变性Taq DNA聚合酶的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示。
实施例2获得突变型Taq DNA聚合酶
取10ng测序验证无误的载体以同样的转化方法转化到BL21(DE3)感受态细胞(由南京诺唯赞生物科技有限公司生产,Vazyme,货号C504)中,涂布在含有质粒对应抗性抗生素的LB平板上,37℃过夜培养。第二天挑取单克隆。经液体培养基培养、诱导表达后,纯化得到突变型Taq DNA聚合酶纯酶。所述突变型Taq DNA聚合酶命名为Taq-Mut,由832个氨基酸组成,其具体序列见SEQ ID NO.3。
实施例3血液耐受性能
使用新鲜采集的人全血在PCR反应中测试Taq-Mut扩增320bp PCR扩增子的能力。在含有20mM Tris-HCl(pH 8.4)和20mM KCl的缓冲液中进行反应。示例性反应组分显示在表1中,其中Taq DNA聚合酶的加入量分别为60、40和20ng。该测定的示例性循环过程显示在表2中。
示例性引物序列如下:
Primer-L:TAGTGGTGGCTGACCTGTTCTCT(SEQ ID NO.17)
Primer-R:TCGTCGATCTCCTGTTGGACA(SEQ ID NO.18)
表1 PCR检测体系示例。总体积为50μL
Figure BDA0002225189000000081
表2 PCR循环过程示例
Figure BDA0002225189000000082
将反应产物在琼脂糖凝胶上电泳,并评估产物是否存在,以及正确片段大小的条带强度。示例性结果显示在图1中。仅需要20ng Taq-Mut即可产生与加入60ng Taq DNA聚合酶相当的产物量。
实施例4高盐耐受性能
在存在高或低浓度KCl的情况下,在PCR反应中以lambda DNA(购买自ThermoFisher,货号为#SD0011)为模板测试Taq-Mut和Taq DNA聚合酶扩增1.46kb PCR扩增子的能力。反应在含有20mM Tris-HCl(pH8.4)的缓冲液中进行。示例性反应组分显示在表3中。该测定的示例性循环过程显示在表4中。
示例性引物序列如下:
Primer-1:TACACGAACCTGATGAACA(SEQ ID NO.19)
Primer-2:TCTAACTATTACCTGCGAACT(SEQ ID NO.20)
表3 PCR检测体系示例。总体积为50μL
Figure BDA0002225189000000083
表4 PCR循环过程示例
Figure BDA0002225189000000092
将反应产物在琼脂糖凝胶上电泳,并评估产物是否存在,以及正确片段大小的条带强度。示例性结果显示在图2中。Taq在含有50mM KCl的10mM Tris-HCl缓冲液中可以扩增,但产量低于Taq-Mut。Taq DNA聚合酶在含有150mM KCl的PCR体系中没有扩增,而Taq-Mut可以扩增,且产物量相较于50mM KCl体系没有明显变化,表明Taq-Mut比Taq更耐盐。
实施例5SYBR Green耐受性能
在存在不同浓度SYBR Green的情况下,在PCR反应中以lambda DNA(购买自ThermoFisher,货号为#SD0011)为模板测试Taq-Mut和Taq DNA聚合酶扩增1.46kb PCR扩增子的能力。反应在含有20mM Tris-HCl(pH 8.4)的缓冲液中进行。示例性反应组分显示在表5中。该测定的示例性循环过程同表5。
示例性引物序列如下:
Primer-1:TACACGAACCTGATGAACA(SEQ ID NO.19)
Primer-2:TCTAACTATTACCTGCGAACT(SEQ ID NO.20)
表5 PCR检测体系示例。总体积为50μL
Figure BDA0002225189000000093
Figure BDA0002225189000000101
将反应产物在琼脂糖凝胶上电泳,并评估产物是否存在,以及正确片段大小的条带强度。示例性结果显示在图3中。Taq DNA聚合酶可耐受1×浓度的SYBR Green,而Taq-Mut可耐受4×浓度,表明Taq-Mut比Taq更耐SYBR Green。
序列表
<110> 南京诺唯赞生物科技有限公司
<120> 一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用
<160> 20
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 832
<212> PRT
<213> 水生嗜热菌(Thermus aquaticus)
<400> 1
Met Arg Gly Met Leu Pro Leu Phe Glu Pro Lys Gly Arg Val Leu Leu
1 5 10 15
Val Asp Gly His His Leu Ala Tyr Arg Thr Phe His Ala Leu Lys Gly
20 25 30
Leu Thr Thr Ser Arg Gly Glu Pro Val Gln Ala Val Tyr Gly Phe Ala
35 40 45
Lys Ser Leu Leu Lys Ala Leu Lys Glu Asp Gly Asp Ala Val Ile Val
50 55 60
Val Phe Asp Ala Lys Ala Pro Ser Phe Arg His Glu Ala Tyr Gly Gly
65 70 75 80
Tyr Lys Ala Gly Arg Ala Pro Thr Pro Glu Asp Phe Pro Arg Gln Leu
85 90 95
Ala Leu Ile Lys Glu Leu Val Asp Leu Leu Gly Leu Ala Arg Leu Glu
100 105 110
Val Pro Gly Tyr Glu Ala Asp Asp Val Leu Ala Ser Leu Ala Lys Lys
115 120 125
Ala Glu Lys Glu Gly Tyr Glu Val Arg Ile Leu Thr Ala Asp Lys Asp
130 135 140
Leu Tyr Gln Leu Leu Ser Asp Arg Ile His Val Leu His Pro Glu Gly
145 150 155 160
Tyr Leu Ile Thr Pro Ala Trp Leu Trp Glu Lys Tyr Gly Leu Arg Pro
165 170 175
Asp Gln Trp Ala Asp Tyr Arg Ala Leu Thr Gly Asp Glu Ser Asp Asn
180 185 190
Leu Pro Gly Val Lys Gly Ile Gly Glu Lys Thr Ala Arg Lys Leu Leu
195 200 205
Glu Glu Trp Gly Ser Leu Glu Ala Leu Leu Lys Asn Leu Asp Arg Leu
210 215 220
Lys Pro Ala Ile Arg Glu Lys Ile Leu Ala His Met Asp Asp Leu Lys
225 230 235 240
Leu Ser Trp Asp Leu Ala Lys Val Arg Thr Asp Leu Pro Leu Glu Val
245 250 255
Asp Phe Ala Lys Arg Arg Glu Pro Asp Arg Glu Arg Leu Arg Ala Phe
260 265 270
Leu Glu Arg Leu Glu Phe Gly Ser Leu Leu His Glu Phe Gly Leu Leu
275 280 285
Glu Ser Pro Lys Ala Leu Glu Glu Ala Pro Trp Pro Pro Pro Glu Gly
290 295 300
Ala Phe Val Gly Phe Val Leu Ser Arg Lys Glu Pro Met Trp Ala Asp
305 310 315 320
Leu Leu Ala Leu Ala Ala Ala Arg Gly Gly Arg Val His Arg Ala Pro
325 330 335
Glu Pro Tyr Lys Ala Leu Arg Asp Leu Lys Glu Ala Arg Gly Leu Leu
340 345 350
Ala Lys Asp Leu Ser Val Leu Ala Leu Arg Glu Gly Leu Gly Leu Pro
355 360 365
Pro Gly Asp Asp Pro Met Leu Leu Ala Tyr Leu Leu Asp Pro Ser Asn
370 375 380
Thr Thr Pro Glu Gly Val Ala Arg Arg Tyr Gly Gly Glu Trp Thr Glu
385 390 395 400
Glu Ala Gly Glu Arg Ala Ala Leu Ser Glu Arg Leu Phe Ala Asn Leu
405 410 415
Trp Gly Arg Leu Glu Gly Glu Glu Arg Leu Leu Trp Leu Tyr Arg Glu
420 425 430
Val Glu Arg Pro Leu Ser Ala Val Leu Ala His Met Glu Ala Thr Gly
435 440 445
Val Arg Leu Asp Val Ala Tyr Leu Arg Ala Leu Ser Leu Glu Val Ala
450 455 460
Glu Glu Ile Ala Arg Leu Glu Ala Glu Val Phe Arg Leu Ala Gly His
465 470 475 480
Pro Phe Asn Leu Asn Ser Arg Asp Gln Leu Glu Arg Val Leu Phe Asp
485 490 495
Glu Leu Gly Leu Pro Ala Ile Gly Lys Thr Glu Lys Thr Gly Lys Arg
500 505 510
Ser Thr Ser Ala Ala Val Leu Glu Ala Leu Arg Glu Ala His Pro Ile
515 520 525
Val Glu Lys Ile Leu Gln Tyr Arg Glu Leu Thr Lys Leu Lys Ser Thr
530 535 540
Tyr Ile Asp Pro Leu Pro Asp Leu Ile His Pro Arg Thr Gly Arg Leu
545 550 555 560
His Thr Arg Phe Asn Gln Thr Ala Thr Ala Thr Gly Arg Leu Ser Ser
565 570 575
Ser Asp Pro Asn Leu Gln Asn Ile Pro Val Arg Thr Pro Leu Gly Gln
580 585 590
Arg Ile Arg Arg Ala Phe Ile Ala Glu Glu Gly Trp Leu Leu Val Ala
595 600 605
Leu Asp Tyr Ser Gln Ile Glu Leu Arg Val Leu Ala His Leu Ser Gly
610 615 620
Asp Glu Asn Leu Ile Arg Val Phe Gln Glu Gly Arg Asp Ile His Thr
625 630 635 640
Glu Thr Ala Ser Trp Met Phe Gly Val Pro Arg Glu Ala Val Asp Pro
645 650 655
Leu Met Arg Arg Ala Ala Lys Thr Ile Asn Phe Gly Val Leu Tyr Gly
660 665 670
Met Ser Ala His Arg Leu Ser Gln Glu Leu Ala Ile Pro Tyr Glu Glu
675 680 685
Ala Gln Ala Phe Ile Glu Arg Tyr Phe Gln Ser Phe Pro Lys Val Arg
690 695 700
Ala Trp Ile Glu Lys Thr Leu Glu Glu Gly Arg Arg Arg Gly Tyr Val
705 710 715 720
Glu Thr Leu Phe Gly Arg Arg Arg Tyr Val Pro Asp Leu Glu Ala Arg
725 730 735
Val Lys Ser Val Arg Glu Ala Ala Glu Arg Met Ala Phe Asn Met Pro
740 745 750
Val Gln Gly Thr Ala Ala Asp Leu Met Lys Leu Ala Met Val Lys Leu
755 760 765
Phe Pro Arg Leu Glu Glu Met Gly Ala Arg Met Leu Leu Gln Val His
770 775 780
Asp Glu Leu Val Leu Glu Ala Pro Lys Glu Arg Ala Glu Ala Val Ala
785 790 795 800
Arg Leu Ala Lys Glu Val Met Glu Gly Val Tyr Pro Leu Ala Val Pro
805 810 815
Leu Glu Val Glu Val Gly Ile Gly Glu Asp Trp Leu Ser Ala Lys Glu
820 825 830
<210> 2
<211> 2496
<212> DNA
<213> 水生嗜热菌(Thermus aquaticus)
<400> 2
atgaggggga tgctgcccct ctttgagccc aagggccggg tcctcctggt ggacggccac 60
cacctggcct accgcacctt ccacgccctg aagggcctca ccaccagccg gggggagccg 120
gtgcaggcgg tctacggctt cgccaagagc ctcctcaagg ccctcaagga ggacggggac 180
gcggtgatcg tggtctttga cgccaaggcc ccctccttcc gccacgaggc ctacgggggg 240
tacaaggcgg gccgggcccc cacgccggag gactttcccc ggcaactcgc cctcatcaag 300
gagctggtgg acctcctggg gctggcgcgc ctcgaggtcc cgggctacga ggcggacgac 360
gtcctggcca gcctggccaa gaaggcggaa aaggagggct acgaggtccg catcctcacc 420
gccgacaaag acctttacca gctcctttcc gaccgcatcc acgccctcca ccccgagggg 480
tacctcatca ccccggcctg gctttgggaa aagtacggcc tgaggcccga ccagtgggcc 540
gactaccggg ccctgaccgg ggacgagtcc gacaaccttc ccggggtcaa gggcatcggg 600
gagaagacgg cgaggaagct tctggaggag tgggggagcc tggaagccct cctcaagaac 660
ctggaccggc tgaagcccgc catccgggag aagatcctgg cccacatgga cgatctgaag 720
ctctcctggg acctggccaa ggtgcgcacc gacctgcccc tggaggtgga cttcgccaaa 780
aggcgggagc ccgaccggga gaggcttagg gcctttctgg agaggcttga gtttggcagc 840
ctcctccacg agttcggcct tctggaaagc cccaaggccc tggaggaggc cccctggccc 900
ccgccggaag gggccttcgt gggctttgtg ctttcccgca aggagcccat gtgggccgat 960
cttctggccc tggccgccgc cagggggggc cgggtccacc gggcccccga gccttataaa 1020
gccctcaggg acctgaagga ggcgcggggg cttctcgcca aagacctgag cgttctggcc 1080
ctgagggaag gccttggcct cccgcccggc gacgacccca tgctcctcgc ctacctcctg 1140
gacccttcca acaccacccc cgagggggtg gcccggcgct acggcgggga gtggacggag 1200
gaggcggggg agcgggccgc cctttccgag aggctcttcg ccaacctgtg ggggaggctt 1260
gagggggagg agaggctcct ttggctttac cgggaggtgg agaggcccct ttccgctgtc 1320
ctggcccaca tggaggccac gggggtgcgc ctggacgtgg cctatctcag ggccttgtcc 1380
ctggaggtgg ccgaggagat cgcccgcctc gaggccgagg tcttccgcct ggccggccac 1440
cccttcaacc tcaactcccg ggaccagctg gaaagggtcc tctttgacga gctagggctt 1500
cccgccatcg gcaagacgga gaagaccggc aagcgctcca ccagcgccgc cgtcctggag 1560
gccctccgcg aggcccaccc catcgtggag aagatcctgc agtaccggga gctcaccaag 1620
ctgaagagca cctacattga ccccttgccg gacctcatcc accccaggac gggccgcctc 1680
cacacccgct tcaaccagac ggccacggcc acgggcaggc taagtagctc cgatcccaac 1740
ctccagaaca tccccgtccg caccccgctt gggcagagga tccgccgggc cttcatcgcc 1800
gaggaggggt ggctattggt ggccctggac tatagccaga tagagctcag ggtgctggcc 1860
cacctctccg gcgacgagaa cctgatccgg gtcttccagg aggggcggga catccacacg 1920
gagaccgcca gctggatgtt cggcgtcccc cgggaggccg tggaccccct gatgcgccgg 1980
gcggccaaga ccatcaactt cggggtcctc tacggcatgt cggcccaccg cctctcccag 2040
gagctagcca tcccttacga ggaggcccag gccttcattg agcgctactt tcagagcttc 2100
cccaaggtgc gggcctggat tgagaagacc ctggaggagg gcaggaggcg ggggtacgtg 2160
gagaccctct tcggccgccg ccgctacgtg ccagacctag aggcccgggt gaagagcgtg 2220
cgggaggcgg ccgagcgcat ggccttcaac atgcccgtcc agggcaccgc cgccgacctc 2280
atgaagctgg ctatggtgaa gctcttcccc aggctggagg aaatgggggc caggatgctc 2340
cttcaggtcc acgacgagct ggtcctcgag gccccaaaag agagggcgga ggccgtggcc 2400
cggctggcca aggaggtcat ggagggggtg tatcccctgg ccgtgcccct ggaggtggag 2460
gtggggatag gggaggactg gctctccgcc aaggag 2496
<210> 3
<211> 832
<212> PRT
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
Met Arg Gly Met Leu Pro Leu Phe Glu Pro Lys Gly Arg Val Leu Leu
1 5 10 15
Val Asp Gly His His Leu Ala Tyr Arg Thr Phe His Ala Leu Lys Gly
20 25 30
Leu Thr Thr Ser Arg Gly Glu Pro Val Gln Ala Val Tyr Gly Phe Ala
35 40 45
Lys Ser Leu Leu Lys Ala Leu Lys Glu Asp Gly Asp Ala Val Ile Val
50 55 60
Val Phe Asp Ala Lys Ala Pro Ser Phe Arg His Glu Ala Tyr Gly Gly
65 70 75 80
Tyr Lys Ala Gly Arg Ala Pro Thr Pro Glu Asp Phe Pro Arg Gln Leu
85 90 95
Ala Leu Ile Lys Glu Leu Val Asp Leu Leu Gly Leu Ala Arg Leu Glu
100 105 110
Val Pro Gly Tyr Glu Ala Asp Asp Val Leu Ala Ser Leu Ala Lys Lys
115 120 125
Ala Glu Lys Glu Gly Tyr Glu Val Arg Ile Leu Thr Ala Asp Lys Asp
130 135 140
Leu Tyr Gln Leu Leu Ser Asp Arg Ile His Val Leu His Pro Glu Gly
145 150 155 160
Tyr Leu Ile Thr Pro Ala Trp Leu Trp Glu Lys Tyr Gly Leu Arg Pro
165 170 175
Asp Gln Trp Ala Asp Tyr Arg Ala Leu Thr Gly Asp Glu Ser Asp Asn
180 185 190
Leu Pro Gly Val Lys Gly Ile Gly Glu Lys Thr Ala Arg Lys Leu Leu
195 200 205
Glu Glu Trp Gly Ser Leu Glu Ala Leu Leu Lys Asn Leu Asp Arg Leu
210 215 220
Lys Pro Ala Ile Arg Glu Lys Ile Leu Ala His Met Asp Asp Leu Lys
225 230 235 240
Leu Ser Trp Asp Leu Ala Lys Val Arg Thr Asp Leu Pro Leu Glu Val
245 250 255
Asp Phe Ala Lys Arg Arg Glu Pro Asp Phe Glu Arg Leu Arg Ala Phe
260 265 270
Leu Glu Arg Leu Glu Phe Gly Ser Leu Leu His Glu Phe Gly Leu Leu
275 280 285
Glu Ser Pro Lys Asn Leu Glu Glu Ala Pro Trp Pro Pro Pro Glu Gly
290 295 300
Ala Phe Val Gly Phe Val Leu Ser Arg Lys Glu Pro Met Trp Ala Asp
305 310 315 320
Leu Leu Ala Leu Ala Ala Ala Arg Gly Gly Arg Val His Arg Ala Pro
325 330 335
Glu Pro Tyr Lys Ala Leu Arg Asp Leu Lys Glu Ala Arg Gly Leu Leu
340 345 350
Ala Lys Asp Leu Ser Val Leu Ala Leu Arg Glu Gly Leu Gly Leu Pro
355 360 365
Pro Gly Asp Asp Pro Met Leu Leu Ala Tyr Leu Leu Asp Pro Ser Asn
370 375 380
Thr Thr Pro Glu Gly Val Ala Arg Arg Tyr Gly Gly Glu Trp Thr Glu
385 390 395 400
Glu Ala Gly Glu Arg Ala Ala Leu Ser Glu Arg Leu Phe Phe Asn Leu
405 410 415
Trp Gly Arg Leu Glu Gly Glu Glu Arg Leu Leu Trp Leu Tyr Arg Glu
420 425 430
Val Glu Arg Pro Leu Ser Ala Val Leu Ala His Met Glu Ala Thr Gly
435 440 445
Val Arg Leu Asp Val Ala Tyr Leu Arg Ala Leu Ser Leu Glu Val Ala
450 455 460
Glu Gln Ile Ala Arg Leu Glu Ala Glu Val Phe Arg Leu Ala Gly His
465 470 475 480
Pro Phe Asn Leu Asn Ser Arg Asp Gln Leu Glu Arg Val Leu Phe Asp
485 490 495
Glu Leu Gly Leu Pro Ala Ile Gly Lys Thr Lys Lys Thr Gly Lys Arg
500 505 510
Ser Thr Ser Ala Ala Val Leu Glu Ala Leu Arg Glu Ala His Pro Ile
515 520 525
Val Glu Lys Ile Leu Gln Tyr Arg Glu Leu Thr Lys Leu Lys Ser Thr
530 535 540
Tyr Ile Asp Pro Leu Pro Asp Leu Ile His Pro Arg Thr Gly Arg Leu
545 550 555 560
His Thr Arg Phe Asn Gln Thr Ala Thr Ala Thr Gly Arg Leu Ser Ser
565 570 575
Ser Asp Pro Asn Leu Gln Asn Ile Pro Val Arg Thr Pro Leu Gly Gln
580 585 590
Arg Ile Arg Arg Ala Phe Ile Ala Glu Glu Gly Trp Leu Leu Val Ala
595 600 605
Leu Asp Tyr Ser Gln Ile Glu Leu Arg Val Leu Ala His Leu Ser Gly
610 615 620
Asp Glu Asn Leu Ile Arg Val Phe Gln Glu Gly Arg Asp Ile His Thr
625 630 635 640
Glu Thr Ala Ser Trp Met Phe Gly Val Pro Arg Glu Ala Val Asp Pro
645 650 655
Leu Met Arg Arg Ala Ala Lys Thr Ile Asn Phe Gly Val Leu Tyr Gly
660 665 670
Met Ser Ala His Arg Leu Ser Gln Glu Leu Ala Ile Pro Tyr Glu Glu
675 680 685
Ala Gln Ala Phe Ile Glu Arg Tyr Phe Gln Ser Phe Pro Lys Val Arg
690 695 700
Ala Trp Ile Glu Lys Thr Leu Glu Glu Gly Arg Arg Arg Gly Tyr Val
705 710 715 720
Glu Thr Leu Phe Gly Arg Arg Arg Tyr Val Pro Glu Leu Glu Ala Arg
725 730 735
Val Lys Ser Val Arg Glu Ala Ala Glu Arg Met Ala Phe Asn Met Pro
740 745 750
Val Gln Gly Thr Ala Ala Asp Leu Met Lys Leu Ala Met Val Lys Leu
755 760 765
Phe Pro Arg Leu Glu Glu Met Gly Ala Arg Met Leu Leu Gln Val His
770 775 780
Asp Glu Leu Val Leu Glu Ala Pro Lys Glu Arg Ala Glu Ala Val Ala
785 790 795 800
Arg Leu Ala Lys Glu Val Met Glu Gly Val Tyr Pro Leu Ala Val Pro
805 810 815
Leu Glu Val Glu Val Gly Ile Gly Glu Asp Trp Leu Ser Ala Lys Glu
820 825 830
<210> 4
<211> 2496
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
atgaggggga tgctgcccct ctttgagccc aagggccggg tcctcctggt ggacggccac 60
cacctggcct accgcacctt ccacgccctg aagggcctca ccaccagccg gggggagccg 120
gtgcaggcgg tctacggctt cgccaagagc ctcctcaagg ccctcaagga ggacggggac 180
gcggtgatcg tggtctttga cgccaaggcc ccctccttcc gccacgaggc ctacgggggg 240
tacaaggcgg gccgggcccc cacgccggag gactttcccc ggcaactcgc cctcatcaag 300
gagctggtgg acctcctggg gctggcgcgc ctcgaggtcc cgggctacga ggcggacgac 360
gtcctggcca gcctggccaa gaaggcggaa aaggagggct acgaggtccg catcctcacc 420
gccgacaaag acctttacca gctcctttcc gaccgcatcc acgccctcca ccccgagggg 480
tacctcatca ccccggcctg gctttgggaa aagtacggcc tgaggcccga ccagtgggcc 540
gactaccggg ccctgaccgg ggacgagtcc gacaaccttc ccggggtcaa gggcatcggg 600
gagaagacgg cgaggaagct tctggaggag tgggggagcc tggaagccct cctcaagaac 660
ctggaccggc tgaagcccgc catccgggag aagatcctgg cccacatgga cgatctgaag 720
ctctcctggg acctggccaa ggtgcgcacc gacctgcccc tggaggtgga cttcgccaaa 780
aggcgggagc ccgacttcga gaggcttagg gcctttctgg agaggcttga gtttggcagc 840
ctcctccacg agttcggcct tctggaaagc cccaagaacc tggaggaggc cccctggccc 900
ccgccggaag gggccttcgt gggctttgtg ctttcccgca aggagcccat gtgggccgat 960
cttctggccc tggccgccgc cagggggggc cgggtccacc gggcccccga gccttataaa 1020
gccctcaggg acctgaagga ggcgcggggg cttctcgcca aagacctgag cgttctggcc 1080
ctgagggaag gccttggcct cccgcccggc gacgacccca tgctcctcgc ctacctcctg 1140
gacccttcca acaccacccc cgagggggtg gcccggcgct acggcgggga gtggacggag 1200
gaggcggggg agcgggccgc cctttccgag aggctcttct tcaacctgtg ggggaggctt 1260
gagggggagg agaggctcct ttggctttac cgggaggtgg agaggcccct ttccgctgtc 1320
ctggcccaca tggaggccac gggggtgcgc ctggacgtgg cctatctcag ggccttgtcc 1380
ctggaggtgg ccgagcagat cgcccgcctc gaggccgagg tcttccgcct ggccggccac 1440
cccttcaacc tcaactcccg ggaccagctg gaaagggtcc tctttgacga gctagggctt 1500
cccgccatcg gcaagacgaa gaagaccggc aagcgctcca ccagcgccgc cgtcctggag 1560
gccctccgcg aggcccaccc catcgtggag aagatcctgc agtaccggga gctcaccaag 1620
ctgaagagca cctacattga ccccttgccg gacctcatcc accccaggac gggccgcctc 1680
cacacccgct tcaaccagac ggccacggcc acgggcaggc taagtagctc cgatcccaac 1740
ctccagaaca tccccgtccg caccccgctt gggcagagga tccgccgggc cttcatcgcc 1800
gaggaggggt ggctattggt ggccctggac tatagccaga tagagctcag ggtgctggcc 1860
cacctctccg gcgacgagaa cctgatccgg gtcttccagg aggggcggga catccacacg 1920
gagaccgcca gctggatgtt cggcgtcccc cgggaggccg tggaccccct gatgcgccgg 1980
gcggccaaga ccatcaactt cggggtcctc tacggcatgt cggcccaccg cctctcccag 2040
gagctagcca tcccttacga ggaggcccag gccttcattg agcgctactt tcagagcttc 2100
cccaaggtgc gggcctggat tgagaagacc ctggaggagg gcaggaggcg ggggtacgtg 2160
gagaccctct tcggccgccg ccgctacgtg ccagagctag aggcccgggt gaagagcgtg 2220
cgggaggcgg ccgagcgcat ggccttcaac atgcccgtcc agggcaccgc cgccgacctc 2280
atgaagctgg ctatggtgaa gctcttcccc aggctggagg aaatgggggc caggatgctc 2340
cttcaggtcc acgacgagct ggtcctcgag gccccaaaag agagggcgga ggccgtggcc 2400
cggctggcca aggaggtcat ggagggggtg tatcccctgg ccgtgcccct ggaggtggag 2460
gtggggatag gggaggactg gctctccgcc aaggag 2496
<210> 5
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
cgggagcccg acttcgagag gcttagggcc tttctg 36
<210> 6
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
cctaagcctc tcgaagtcgg gctcccgcct tttggc 36
<210> 7
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
gaaagcccca agaacctgga ggaggccccc tggccc 36
<210> 8
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
ggcctcctcc aggttcttgg ggctttccag aaggcc 36
<210> 9
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
gagaggctct tcttcaacct gtgggggagg cttgag 36
<210> 10
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 10
cccccacagg ttgaagaaga gcctctcgga aagggc 36
<210> 11
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 11
gaggtggccg agcagatcgc ccgcctcgag gccgag 36
<210> 12
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 12
gaggcgggcg atctgctcgg ccacctccag ggacaa 36
<210> 13
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 13
atcggcaaga cgaagaagac cggcaagcgc tccacc 36
<210> 14
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 14
cttgccggtc ttcttcgtct tgccgatggc gggaag 36
<210> 15
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 15
cgctacgtgc cagagctaga ggcccgggtg aagagc 36
<210> 16
<211> 36
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 16
ccgggcctct agctctggca cgtagcggcg gcggcc 36
<210> 17
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 17
tagtggtggc tgacctgttc tct 23
<210> 18
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 18
tcgtcgatct cctgttggac a 21
<210> 19
<211> 19
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 19
tacacgaacc tgatgaaca 19
<210> 20
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 20
tctaactatt acctgcgaac t 21

Claims (10)

1.一种突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut,其特征在于,所述突变体在SEQ ID NO.1所示的序列中,具有下述的一个或多个氨基酸位置上的氨基酸取代,各取代用三联体表示:字母-数字-字母,其中数字表示突变氨基酸的位置,数字前的字母对应突变涉及的氨基酸,数字后的字母表示用于置换数字前氨基酸的氨基酸:R266F,A293N,A414F,E466Q,E507K,D732E。
2.根据权利要求1所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut,其特征在于,氨基酸序列如SEQ ID NO.3所示,或与SEQ ID NO.3所示序列具有80%同一性的具有Taq DNA聚合酶活性的氨基酸序列;优选的具有85%同一性,更优选的具有90%同一性,最优选的,具有95%同一性,进一步优选,具有99%同一性。
3.编码权利要求1所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列。
4.编码权利要求1所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut的核苷酸序列,如SEQ ID NO.4所示。
5.一种包含权利要求3或4所述的核苷酸序列的重组载体。
6.一种重组细胞,包含权利要求3或4所述的核苷酸序列或权利要求5所述的重组载体。
7.根据权利要求6所述的重组细胞,其特征在于,所述重组细胞所使用的宿主细胞为BL21。
8.权利要求1或2所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut、权利要求3或4所述的核苷酸序列、权利要求5所述的重组载体、权利要求6或7所述的重组细胞在生物技术领域中的应用。
9.权利要求1或2所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut、权利要求3或4所述的核苷酸序列、权利要求5所述的重组载体、权利要求6或7所述的重组细胞在PCR领域中的应用。
10.权利要求1或2所述的突变型Taq DNA聚合酶Taq-Mut、权利要求3或4所述的核苷酸序列、权利要求5所述的重组载体、权利要求6或7所述的重组细胞在包含血液的样品、包含SYBR Green的样品或/和含盐样品的PCR领域中的应用。
CN201910949628.9A 2019-10-08 2019-10-08 一种耐受性提高的突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用 Active CN110684752B (zh)

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Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111690626A (zh) * 2020-07-02 2020-09-22 南京诺唯赞生物科技股份有限公司 一种融合型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用
CN112725299A (zh) * 2020-12-30 2021-04-30 苏州白垩纪生物科技有限公司 改善Taq DNA聚合酶耐受性的突变体及制备方法和应用
CN112725301A (zh) * 2021-03-30 2021-04-30 中国农业科学院生物技术研究所 Taq DNA 聚合酶突变体及其应用
CN113186175A (zh) * 2021-06-04 2021-07-30 翌圣生物科技(上海)股份有限公司 突变型Taq DNA聚合酶、编码DNA序列、重组载体、重组表达细胞及其应用
WO2022198849A1 (zh) * 2021-03-25 2022-09-29 山东大学 高特异性Taq DNA聚合酶变体及其在基因组编辑和基因突变检测中的应用
CN115261351A (zh) * 2022-06-08 2022-11-01 厦门通灵生物医药科技有限公司 一种逆转录-聚合双功能酶及其制备方法、应用
WO2023098035A1 (zh) * 2021-11-30 2023-06-08 广州达安基因股份有限公司 Taq酶突变体及其制备方法和用途
WO2023098036A1 (zh) * 2021-11-30 2023-06-08 广州达安基因股份有限公司 Taq酶突变体、其制备方法和应用

Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2010062779A2 (en) * 2008-11-03 2010-06-03 Kapabiosystems Modified dna polymerases
CN102245761A (zh) * 2008-11-03 2011-11-16 卡帕生物系统 修饰a型dna聚合酶
US20130034879A1 (en) * 2011-08-03 2013-02-07 Fermentas Uab DNA Polymerases
CN105039278A (zh) * 2015-06-17 2015-11-11 菲鹏生物股份有限公司 突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用
CN105765082A (zh) * 2013-09-30 2016-07-13 生命技术公司 聚合酶组合物、制得和使用其的方法
CN106754812A (zh) * 2016-12-21 2017-05-31 南京诺唯赞生物科技有限公司 一种可提高加A效率的突变型Taq酶及其制备方法和应用
CN108130318A (zh) * 2018-02-28 2018-06-08 深圳市草履虫生物科技有限公司 突变型Taq DNA聚合酶、免核酸提取直接PCR扩增的试剂盒及其应用
CN109402082A (zh) * 2018-11-26 2019-03-01 南京诺唯赞生物科技有限公司 一种Taq DNA聚合酶突变体及其应用

Patent Citations (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2010062779A2 (en) * 2008-11-03 2010-06-03 Kapabiosystems Modified dna polymerases
CN102245761A (zh) * 2008-11-03 2011-11-16 卡帕生物系统 修饰a型dna聚合酶
US20130034879A1 (en) * 2011-08-03 2013-02-07 Fermentas Uab DNA Polymerases
CN105765082A (zh) * 2013-09-30 2016-07-13 生命技术公司 聚合酶组合物、制得和使用其的方法
CN105039278A (zh) * 2015-06-17 2015-11-11 菲鹏生物股份有限公司 突变型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用
CN106754812A (zh) * 2016-12-21 2017-05-31 南京诺唯赞生物科技有限公司 一种可提高加A效率的突变型Taq酶及其制备方法和应用
CN108130318A (zh) * 2018-02-28 2018-06-08 深圳市草履虫生物科技有限公司 突变型Taq DNA聚合酶、免核酸提取直接PCR扩增的试剂盒及其应用
CN109402082A (zh) * 2018-11-26 2019-03-01 南京诺唯赞生物科技有限公司 一种Taq DNA聚合酶突变体及其应用

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
MARTA ŚPIBIDA1 ET AL.: ""Modified DNA polymerases for PCR troubleshooting"", 《JOURNAL OF APPLIED GENETICS》 *
MILKO B. KERMEKCHIEV ET AL.: ""Mutants of Taq DNA polymerase resistant to PCR inhibitors allow DNA amplification from whole blood and crude soil samples"", 《NUCLEIC ACIDS RESEARCH》 *
郭佳: ""Taq DNA聚合酶的结构修饰与表征"", 《中国优秀硕士学位论文全文数据库 基础科学辑》 *

Cited By (12)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111690626A (zh) * 2020-07-02 2020-09-22 南京诺唯赞生物科技股份有限公司 一种融合型Taq DNA聚合酶及其制备方法和应用
CN112725299A (zh) * 2020-12-30 2021-04-30 苏州白垩纪生物科技有限公司 改善Taq DNA聚合酶耐受性的突变体及制备方法和应用
CN112725299B (zh) * 2020-12-30 2023-10-10 苏州白垩纪生物科技有限公司 改善Taq DNA聚合酶耐受性的突变体及制备方法和应用
WO2022198849A1 (zh) * 2021-03-25 2022-09-29 山东大学 高特异性Taq DNA聚合酶变体及其在基因组编辑和基因突变检测中的应用
CN112725301A (zh) * 2021-03-30 2021-04-30 中国农业科学院生物技术研究所 Taq DNA 聚合酶突变体及其应用
CN112725301B (zh) * 2021-03-30 2021-06-25 中国农业科学院生物技术研究所 Taq DNA聚合酶突变体及其应用
CN113186175A (zh) * 2021-06-04 2021-07-30 翌圣生物科技(上海)股份有限公司 突变型Taq DNA聚合酶、编码DNA序列、重组载体、重组表达细胞及其应用
CN113186175B (zh) * 2021-06-04 2023-08-04 翌圣生物科技(上海)股份有限公司 突变型Taq DNA聚合酶、编码DNA序列、重组载体、重组表达细胞及其应用
WO2023098035A1 (zh) * 2021-11-30 2023-06-08 广州达安基因股份有限公司 Taq酶突变体及其制备方法和用途
WO2023098036A1 (zh) * 2021-11-30 2023-06-08 广州达安基因股份有限公司 Taq酶突变体、其制备方法和应用
CN115261351A (zh) * 2022-06-08 2022-11-01 厦门通灵生物医药科技有限公司 一种逆转录-聚合双功能酶及其制备方法、应用
CN115261351B (zh) * 2022-06-08 2024-03-29 厦门通灵生物医药科技有限公司 一种逆转录-聚合双功能酶及其制备方法、应用

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