CN110461870B - 改进的血清白蛋白结合物 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及可与血清白蛋白结合的氨基酸序列。特别地,本发明涉及可与血清白蛋白结合的免疫球蛋白单可变结构域,且特别是重链免疫球蛋白单可变结构域。本发明还涉及包含至少一种本文所述的与血清白蛋白结合的免疫球蛋白单可变结构域的蛋白质、多肽和其他构建体、化合物、分子或化学实体。
Description
本发明涉及可与血清白蛋白结合的氨基酸序列。
特别地,本发明涉及可与血清白蛋白结合的免疫球蛋白单可变结构域,特别是重链免疫球蛋白单可变结构域。
如本文所述,本发明提供的免疫球蛋白单可变结构域优选使得它们(至少)可以与人血清白蛋白结合(且特别是特异性结合)。更优选地,如本文进一步所述,这些免疫球蛋白单可变结构域进一步优选使得它们在人血清白蛋白和来自至少一种其他哺乳动物物种的血清白蛋白之间交叉反应(如本文所述)。
本发明还涉及包含至少一种本文所述的与血清白蛋白结合的免疫球蛋白单可变结构域的蛋白质、多肽和其他构建体、化合物、分子或化学实体。
免疫球蛋白单可变结构域通常也通过缩写“ISV”或“ISVD”(本文中可互换使用)在本文中提及。
本文所述的与血清白蛋白结合的免疫球蛋白单可变结构域在本文中也称为“本发明的氨基酸序列”或“本发明的血清白蛋白结合物”。如本文进一步所述,本发明的白蛋白结合物特别地可以是纳米抗体(如本文进一步所述)。
包含至少一种本发明的血清白蛋白结合物的蛋白质、多肽和其他构建体、化合物、分子或化学实体在本文中也称为“本发明的化合物”或“本发明的多肽”。优选地,本发明的化合物是蛋白质或多肽,并且特别地可以是融合蛋白。
基于本文的公开内容,本领域技术人员将清楚本发明的其他方面、实施方案、特征、用途和优点。
在本申请中,免疫球蛋白重链可变结构域中的氨基酸残基/位置将以根据Kabat的编号表示。为方便起见,附图1给出了表格,其列出了本文将具体提及的一些氨基酸位置和根据一些备选编号系统(例如Aho和IMGT。注意:对于本说明书和权利要求,Kabat编号是决定性的,除非另有明确说明;其他编号系统仅供参考)的它们的编号。
关于CDR,如本领域众所周知的,存在多种规则以定义和描述VH或VHH片段的CDR,例如Kabat定义(其基于序列可变性并且是最常用的)和Chothia定义(其基于结构环区域的位置)。例如,参考网站http://www.bioinf.org.uk/abs/。为了本说明书和权利要求的目的,即便根据Kabat也可提及CDR,但是CDR最优选基于Abm定义(其基于Oxford Molecular的AbM抗体建模软件)而被定义,因为这被认为是Kabat和Chothia定义之间的最优折衷。再次参考网站http://www.bioinf.org.uk/abs/。
因此,在本说明书和权利要求中,所有CDR均根据Abm规则来定义,除非本文另有明确说明。
可以与血清白蛋白结合的ISVD(特别是纳米抗体)及其用途是本领域公知的,例如来自WO 2004/041865、WO 2006/122787、WO 2012/175400、WO 2015/173325和PCT/EP2016/077973,其描述了血清白蛋白结合ISVD及其用于延长治疗化合物、结构部分和实体的血清半衰期(如这些申请中所定义)的用途。例如,WO 2006/122787公开了被称为Alb-8的人源化血清白蛋白结合纳米抗体作为SEQ ID NO:62(参见本文SEQ ID NO:1)。WO 2012/175400公开了被称为Alb-23D的人源化血清白蛋白结合纳米抗体作为SEQ ID NO:6(参见本文SEQ IDNO:2)。Alb-8和Alb-23D的氨基酸序列及其CDR(其对于Alb-8和Alb-23D是相同的)在下表A中分别以SEQ ID NO:1、2和3至8示出。
公开针对血清白蛋白的ISVD的一些其他参考文献包括WO 2003/035694、WO 2004/003019、EP 2 139 918、WO 2011/006915和WO 2014/111550。
附图3A和3B显示了Alb-8(参考文献)、Alb-23D(参考文献)、SEQ ID NO:18(本发明)和SEQ ID NO:19(本发明)的比对。
本发明旨在提供改进的血清白蛋白结合物,特别是与本领域已知的血清白蛋白结合物相比具有改进的性能的血清白蛋白结合物。特别地,本发明旨在提供血清白蛋白结合物,其可以与犬血清白蛋白结合和/或具有改善的人血清白蛋白和犬血清白蛋白之间的交叉反应性(即与现有技术的血清白蛋白结合物如Alb-8和/或Alb-23D相比)。
表A:Alb-8、Alb-23D及其CDR
表B:SEQ ID NO:18和19及其CDR
通常,本发明提供的血清白蛋白结合ISVD是SEQ ID NO:18和19的序列的变体,因为:
-它们具有与SEQ ID NO:18的序列或SEQ ID NO:19的序列相同的CDR(或基本上相同的CDR);和
-它们与SEQ ID NO:18和/或19的序列具有一定程度的序列同一性(序列同一性程度如本文进一步描述)。
特别地,与SEQ ID NO:18和/或19的序列相比,本发明提供的血清白蛋白结合ISVD通常具有(有限的)数量的“氨基酸差异”(如本文所述)。这些氨基酸差异可存在于CDR中(只要所得的氨基酸序列使它们保留本文所列的本发明氨基酸序列的其他的性质即可)和/或存在于构架区中,且可特别地存在于构架区中(根据Kabat和/或根据Abm定义)。例如但不限于,这些氨基酸差异可以是例如人源化取代,改善在所需宿主细胞或宿主生物体中表达的取代,改善稳定性和/或对降解和/或蛋白酶抗性的取代,减少预先存在的抗体的结合的突变,和/或旨在优化本发明氨基酸序列的序列的其他突变;或这些氨基酸差异的任何适当组合。参考本文的进一步公开内容。
在第一方面,本发明涉及可以与人血清白蛋白结合(且特别是特异性结合)的ISVD,其具有:
-CDR1(根据Kabat),其是氨基酸序列SYVMG(SEQ ID NO:9)或与SEQ ID NO:9的氨基酸序列具有2个或1个氨基酸差异(如本文所定义)的氨基酸序列;和
-CDR2(根据Kabat),其是氨基酸序列AISRSGGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:10)或与SEQID NO:10的氨基酸序列具有3个、2个或1个氨基酸差异(如本文所定义)的氨基酸序列;和
-CDR3(根据Kabat),其是氨基酸序列GRYSAWYSQSYEYDY(SEQ ID NO:14)或与SEQID NO:14的氨基酸序列具有3个、2个或1个氨基酸差异(如本文所定义)的氨基酸序列。
特别地,根据本发明该方面的血清白蛋白结合物可以是(和优选是)如本文进一步描述的。
在更具体的方面,本发明涉及可以与人血清白蛋白结合(且特别是特异性结合)的ISVD,其具有:
-CDR1(根据Kabat),其是氨基酸序列SYVMG(SEQ ID NO:9);和
-CDR2(根据Kabat),其是氨基酸序列AISRSGGYTYYADSVKG(SEQ ID NO:10);和
-CDR3(根据Kabat),其是氨基酸序列GRYSAWYSQSYEYDY(SEQ ID NO:14)。
此外,根据本发明该方面的血清白蛋白结合物可以是(和优选是)如本文进一步描述的。
另一方面,本发明涉及可以与人血清白蛋白结合(且特别是特异性结合)的ISVD,其具有:
-CDR1(根据Abm),其是氨基酸序列GSNISSYVMG(SEQ ID NO:11)或GSTISSYVMG(SEQID NO:12)或与SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12的氨基酸序列具有2个或1个氨基酸差异(如本文所定义)的氨基酸序列;和
-CDR2(根据Abm),其是氨基酸序列AISRSGGYTY(SEQ ID NO:13)
或与SEQ ID NO:13的氨基酸序列具有3个、2个或1个氨基酸差异(如本文所定义)的氨基酸序列;和
-CDR3(根据Abm),其是氨基酸序列GRYSAWYSQSYEYDY(SEQ ID NO:14)或与SEQ IDNO:14的氨基酸序列具有3个、2个或1个氨基酸差异(如本文所定义)的氨基酸序列。
特别地,根据本发明该方面的血清白蛋白结合物可以是(并且优选是)如本文进一步描述的。
在更具体的方面,本发明涉及可以与人血清白蛋白结合(且特别是特异性结合)的ISVD,其具有:
-CDR1(根据Abm),其是氨基酸序列GSNISSYVMG(SEQ ID NO:11)或GSTISSYVMG(SEQID NO:12);和
-CDR2(根据Abm),其是氨基酸序列AISRSGGYTY(SEQ ID NO:13);和
-CDR3(根据Abm),其是氨基酸序列GRYSAWYSQSYEYDY(SEQ ID NO:14)。
此外,根据本发明该方面的血清白蛋白结合物可以是(并且优选是)如本文进一步描述的。
通常,根据本发明的不同方面的血清白蛋白结合物优选使得它们具有:
-至少85%,优选至少90%,更优选至少95%的与SEQ ID NO:18和/或19的序列的序列同一性程度(其中CDR和可能存在的任何C-端延伸不被考虑用于确定序列同一性程度);
和/或使它们具有:
-与SEQ ID NO:18和/或19的序列不超过7个,优选不超过5个,例如仅3个、2个或1个“氨基酸差异”(如本文所定义,且未考虑CDR和可能存在的任何C-端延伸)。
根据本发明的不同方面的血清白蛋白结合物通常优选使得它们以10-5至10-12摩尔/升或更低,和优选10-7至10-12摩尔/升或更低,和更优选10-8至10-12摩尔/升的解离常数(KD)结合人血清白蛋白,和/或以至少107M-1,优选至少108M-1,更优选至少109M-1,例如至少1012M-1的结合亲和力结合人血清白蛋白,如使用ProteOn所测定(参考实施例1)。优选地,本发明的血清白蛋白结合物将以小于500nM,优选小于200nM,更优选小于10nM,例如小于500pM的亲和力与所需抗原结合,再次如使用ProteOn所测定(再次参考实施例1)。
根据本发明的不同方面的血清白蛋白结合物优选还使得它们与SEQ ID NO:18的氨基酸序列竞争结合(人)血清白蛋白和/或它们“交叉阻断”(如本文所定义)SEQ ID NO:18的氨基酸序列与(人)血清白蛋白的结合。
优选地,本发明的白蛋白结合物使得它们结合至人血清白蛋白上的与SEQ ID NO:18基本上相同的氨基酸残基和/或表位,甚至更优选使得它们共享与SEQ ID NO:18基本上相同的氨基酸相互作用。为此目的,根据具体但非限制性的方面,本发明的白蛋白结合物优选地具有与序列SEQ ID NO:18相同的CDR,或者与SEQ ID NO:18的序列相比,优选地在其CDR中仅包含这样的突变(例如保守的氨基酸取代),所述突变仍然允许它们进行与SEQ IDNO:18相同的或基本上相同的与人血清白蛋白的氨基酸相互作用。
根据本发明的不同方面的血清白蛋白结合物通常优选还使得它们在人血清白蛋白和来自于至少一种、优选来自于至少两种、更优选来自于至少三种以及直至基本上所有下列哺乳动物物种的血清白蛋白之间交叉反应:犬、大鼠、小鼠、兔、豚鼠、猪、绵羊、奶牛和食蟹猴。特别地,根据本发明的不同方面的血清白蛋白结合物可使得它们(至少)在人血清白蛋白和犬血清白蛋白之间,并且优选地在一方面也在人血清白蛋白和/或犬血清白蛋白之间,另一方面,并且在大鼠血清白蛋白、小鼠血清白蛋白和来自于食蟹猴的血清白蛋白中的至少一种、优选至少两种、更优选所有三种之间交叉反应。在这方面,与具有和Alb-11和/或Alb-23D(基本上)相同的CDR的血清白蛋白结合物相比,本发明的血清白蛋白结合物可以具有改善的交叉反应性(特别地,在一方面人血清白蛋白和另一方面犬血清白蛋白之间)。参考下面实验部分中的数据。
为了便于参考,图5给出了来自不同哺乳动物物种的血清白蛋白的比对(来源:http://macromoleculeinsights.com/albumin.php,图5中的氨基酸编号是所述网页上使用的编号)。为方便起见,在人血清白蛋白的序列中,突出显示了被认为是本发明氨基酸序列的推定表位的一部分的氨基酸区段。不受任何特定机制或假设的限制,假定本发明的氨基酸序列(基本上)能够结合氨基酸残基的相应区段(内的一个或更多个氨基酸残基),其中所述氨基酸残基存在于与本发明的氨基酸序列发生交叉反应的那些哺乳动物血清白蛋白的氨基酸序列内。
通常,当本发明的血清白蛋白结合物可以以小于500nM,优选小于200nM,更优选小于10nM的亲和力结合人血清白蛋白,并且还以小于500nM,优选小于200nM,更优选小于10nM的亲和力结合来自所述物种的血清白蛋白时,则可认为本发明的血清白蛋白结合物在人血清白蛋白和来自于这些物种之一的血清白蛋白之间交叉反应,再次地二者均如使用ProteOn所测定(再次参考实施例1)。
根据本发明的不同方面的血清白蛋白结合物优选还使得:
-它们具有超过6小时,优选超过12小时,更优选超过24小时,甚至更优选超过72小时的人血清半衰期(表示为t1/2β);例如,约一周、两周和直至人血清白蛋白的半衰期(估计约为19天);
和/或使得:
-当其与治疗结构部分或实体连接时,其赋予本发明所得的多肽超过6小时,优选超过12小时,更优选超过24小时,甚至更优选超过72小时的人血清半衰期(表示为t1/2β);例如,约一周、两周和直至人血清白蛋白的半衰期(估计约为19天)。
在其他因素中,在除人之外的哺乳动物物种中的半衰期主要取决于本发明白蛋白结合物对来自所述哺乳动物物种的血清白蛋白的结合性能(例如亲和力)以及所述物种中的初始血清白蛋白的半衰期。根据本发明的一个优选的实施方案,当本发明的血清白蛋白结合物在人血清白蛋白和来自另一哺乳动物物种的血清白蛋白之间交叉反应(如本文所定义)时,则在所述物种中测定的本发明的血清白蛋白结合物(和/或包含所述血清白蛋白结合物的本发明的化合物)的半衰期优选为所述物种中初始血清白蛋白的半衰期的至少5%,例如至少10%,更优选至少25%,例如约50%,和可能高达100%。
与SEQ ID NO:18的序列相比,本发明的血清白蛋白结合物优选还含有(至少):
-一个或更多个人源化取代;
和/或
-降低预先存在的抗体的结合的一个或更多个突变(即氨基酸取代、缺失或添加,且特别是取代);
并且可任选地含有一种或更多种如本文所述的另外的突变。
对于适当的人源化取代(及其适当的组合),例如参考WO 09/138519(或在WO 09/138519中引用的现有技术)和WO 08/020079(或在WO 08/020079中引用的现有技术),以及来自WO 08/020079的表A-3至A-8(其为展示可能的人源化取代的列表)。此类人源化取代的一些优选但非限制性实例是Q108L和A14P或其适当的组合。此类人源化取代也可适当地与如本文所述的一个或更多个其他突变(例如与一个或更多个降低预先存在的抗体的结合的突变)组合。
对于可降低预先存在的抗体结合的适当的突变(以及这些突变的适当的组合),例如参考WO 2012/175741和WO 2015/173325并且例如还参考WO 2013/024059和WO 2016/118733。如其中所述,这种突变可包含一个或更多个氨基酸取代、缺失或添加(特别是取代)(的适当的组合),这些突变通常位于ISV的所谓C端区域。例如,这些突变可包含位置11、13、14、15、40、41、42、82、82a、82b、83、84、85、87、88、89、103、108中的一个或更多个位置的突变(并且特别是取代),和/或在C-端VTVSS序列中一个或更多个位置的突变(即位置109、110、111、112和113),在位置11、89、110和/或112处的一个或更多个突变是特别优选的。这种突变的一些优选但非限制性的实例是在突变后,在指定位置,存在以下氨基酸残基之一的适当的取代(如果需要):11L、11K、11V、14A、14P、41A、41L、41P、41S、41T、42E、42G、87A、87T、89A、89L、89T、108L、110K、110Q、112K和/或112Q(11L、89A、89L、89T、110K、110Q、112K和112Q是特别优选的);或这些取代的任何适当的组合,例如但不限于:11V与89L或89T组合;11V与110K或110Q组合;或11V与89L和110K或110Q组合。降低预先存在的抗体结合的此类突变也可以适当地与本文所述的一个或更多个其他突变(例如与一个或更多个人源化取代)组合。
为了降低预先存在的抗体的结合,本发明的血清白蛋白结合物(和如本文进一步所述,本发明的化合物)适当时(如本文进一步所述,特别是当本发明的血清白蛋白结合物存在于和/或形成其存在其中的本发明化合物的C-端末端时)还可包含C-端延伸(例如C-端丙氨酸残基)。如WO 2012/175741中所述,这种C-端延伸降低预先存在的抗体的结合。合适的C-端延伸可通常在本文中被进一步描述,且可特别地具有式-(X)n,其中X可以是任何天然存在的氨基酸(但优选不是半胱氨酸),且n可以是1、2、3、4或5。再次参考WO 2012/175741,也可参考例如WO 2015/173325、WO 2013/024059和WO 2016/118733。这种C-端延伸的存在也可适当地与本文描述的一个或更多个其他的突变(例如与一个或更多个人源化取代和/或一个或更多个降低预先存在的抗体的结合的突变)组合。
可存在于本发明血清白蛋白结合物中的其他突变例如但不限于包括提高在所需宿主细胞或宿主生物体中的表达的一个或更多个突变(特别是取代),提高稳定性和/或对降解和/或蛋白酶的抗性的一个或更多个突变(特别是取代),和/或旨在优化本发明氨基酸序列的序列的一个或更多个其他突变(例如但不限于,(进一步)降低白蛋白结合物形成二聚体的任何倾向的一个或更多个突变);或这些突变的任何适当的组合。
这种突变的一些非限制性的实例是适当的取代(如果需要),使得在突变后,在指定位置,存在以下氨基酸残基之一:28T、39Q、74S、76N、78L和83R;或这些取代的任何适当的组合(例如以便在位置74-76形成SKN基序)。此外,在适当的情况下(如本文进一步所述),本发明的血清白蛋白结合物可以在位置1具有D(即与SEQ ID NO:18和/或19的序列相比,E1D突变),特别是当本发明的血清白蛋白结合物存在于和/或形成其存在其中的本发明的化合物的N-端末端时。这种突变也可以再次适当地与本文描述的一个或更多个其他突变(例如与一个或更多个人源化取代和/或一个或更多个降低预先存在的抗体结合的突变)组合。
基于本文公开的内容,技术人员将清楚可存在于本发明氨基酸序列中的其他突变。
单突变(或突变的适当组合)也可能提供多种功能或优点。例如但不限于,人源化Q108L取代也可以降低预先存在的抗体结合。
可存在于本发明的氨基酸序列(即它们自身或以适当的组合)中的氨基酸残基的一些优选但非限制性实例(即与SEQ ID NO:18的氨基酸序列相比的突变)包括:11V(即L11V)、14P(即A14P)、28T(即N28T)、39Q(即R39Q)、74S(即A74S)、76N(即K76N)、78L(即A78L)、83R(即E83R)、89L(即V89L)、89T(即V89T)、110K(如T110K)或110Q(如T110Q);以及在适当的情况下(如本文进一步描述的),1D(如E1D)和/或如本文定义的C-端延伸(X)n(例如114A)。又参考附图4中所示的序列和突变。例如,这些氨基酸残基的适当组合的一些优选但非限制性的实例(即与SEQ ID NO:18的氨基酸序列相比的突变)包括:
-L11V、A14P、N28T、R39Q、A74S、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、A74S、K76N、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、A74S、A78V、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、R39Q、A74S、K76N、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、R39Q、A74S、K76N、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、R39Q、A74S、A78V、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、A74S、K76N、A78V、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、R39Q、A74S、K76N、A78V、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、A74S、A78L、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、R39Q、A74S、A78L、E83R、V89L;
-L11V、A14P、N28T、A74S、K76N、A78L、E83R、V89L;和
-L11V、A14P、N28T、R39Q、A74S、K76N、A78L、E83R、V89L;
基于本文的公开内容,技术人员将清楚其他适当的组合。
本发明的一些优选但非限制性的氨基酸序列是其中(i)位置11是V且位置89是L;(ii)位置89是T;(iii)位置74-76形成SKN基序;(iv)位置11是V,位置89是L且位置74-76形成SKN基序;和(iv)位置89是T且位置74-76形成SKN基序的氨基酸序列;本发明的氨基酸序列如本文进一步描述的(因此还可适当地含有如本文所述的一个或多个另外的氨基酸突变)。
本发明的氨基酸序列的一些优选但非限制性的实例在附图2中给出如下:
-SEQ ID NO:18至31,其是不具有C-端丙氨酸延伸的本发明氨基酸序列的实例;
-SEQ ID NO:32至45,其是具有C端延伸的本发明氨基酸序列的实例(在每种情况下,通过C-端丙氨酸延伸示例,其通常是优选的C-端延伸);和
-SEQ ID NO:46至59,其是具有N端E1D突变的本发明氨基酸序列的实例。
基于本文的进一步公开,在实践中的技术人员将清楚:
-具有C端延伸的本发明的白蛋白结合物(例如SEQ ID NO:32至45的那些)通常将被用作/存在于其存在于其中的本发明的多肽(如本文所定义)的C-端末端;
-具有E1D突变的本发明的白蛋白结合物(例如SEQ ID NO:46至59的那些)通常将被用作/存在于其存在于其中的本发明多肽的N-端末端;
-不具有C-端延伸且不具有E1D突变的本发明的白蛋白结合物(例如SEQ ID NO:18至31的那些)通常将存在于本发明多肽的“中间”某处。
SEQ ID NO:18至59的每个氨基酸序列以及包含其的蛋白质、多肽和其他化合物和构建体(如本文进一步描述的)形成本发明的其他方面。
在其他方面,本发明涉及氨基酸序列,其是SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ IDNO:20、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ IDNO:26、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ IDNO:32、SEQ ID NO:33、SEQ ID NO:34、SEQ ID NO:35、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ IDNO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:43、SEQ IDNO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ IDNO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55、SEQ IDNO:56、SEQ ID NO:57、SEQ ID NO:58或SEQ ID NO:59的氨基酸序列之一;且本发明的这些氨基酸序列(以及如本文所定义,包含本发明的这种氨基酸序列的本发明的多肽)中的每个形成本发明的其他方面。
如本文进一步所述,本发明提供的氨基酸序列是可以与人血清白蛋白结合,特别是可以特异性地(如本文所述)结合的蛋白质。因此,它们可以用作结合单元或结合结构域,用于结合(人)血清白蛋白,例如以赋予治疗化合物、结构部分或实体半衰期(如本文所定义)的增加。对于利用血清白蛋白结合结构域以增加治疗化合物、结构部分或实体的半衰期,参考例如WO 2004/041865、WO 2006/122787、EP 2 139 918、WO 2011/006915、WO 2012/175400和/或WO 2014/111550。本发明的血清白蛋白结合物通常可以与这些参考文献中描述的血清白蛋白结合物以相同的方式和以相同的目的使用。
在一些进一步的非限制性方面,本发明还涉及:
-蛋白质、多肽和其他构建体、分子或化学实体,其包含或基本上由至少一种如本文所述的本发明的血清白蛋白结合物组成(在本文中也称为“本发明的化合物”或“本发明的多肽”);
-表达/产生本发明的血清白蛋白结合物和/或本发明的化合物的方法;
-宿主细胞,宿主生物体或其他(表达)系统,其可表达或产生本发明的血清白蛋白结合物和/或本发明的化合物;
-包含本发明的血清白蛋白结合物和/或本发明的化合物的组合物和产品(例如药物组合物和产品);
-编码本发明的血清白蛋白结合物和/或本发明的化合物的核苷酸序列和核酸,例如(表达)载体;
-本发明的化合物的用途和/或本发明的化合物,例如本发明的化合物用于增加治疗化合物、结构部分或实体的(血清)半衰期的用途,和本发明的化合物的治疗和/或预防用途。
根据本文的进一步描述,本发明的这些和其他方面、实施方案、优点,应用和用途将变得清楚。
在本说明书中:
-术语“免疫球蛋白单可变结构域”(也称为“ISV”或“ISVD”)通常用于指可形成功能性抗原结合位点而不与另一个可变结构域相互作用(例如,不具有在常规4-链单克隆抗体的VH和VL结构域之间所需的VH/VL相互作用)的免疫球蛋白可变结构域(其可以是重链或轻链结构域,包括VH、VHH或VL结构域)。ISVD的实例对于技术人员是清楚的,并且例如包括纳米抗体(包括VHH、人源化的VHH和/或骆驼源化的VH,例如骆驼源化的人VH),IgNAR,结构域,为VH结构域或衍生自VH结构域的(单结构域)抗体(例如dAbsTM),和为VL结构域或衍生自VL结构域的(单结构域)抗体(例如dAbsTM)。除非本文另有明确说明,通常优选基于和/或衍生自重链可变结构域的ISVD(例如VH或VHH结构域)。最优选地,除非本文另有明确说明,ISVD将是纳米抗体。
-术语“纳米抗体”通常如在WO 2008/020079或WO 2009/138519中所定义,并且因此在具体方面中通常指VHH、人源化的VHH或骆驼源化的VH(例如骆驼源化的人VH)或通常指序列优化的VHH(如例如为化学稳定性和/或溶解性、与已知人框架区的最大重叠和最大表达而优化)。注意术语纳米抗体(Nanobody)或纳米抗体(Nanobodies)是Ablynx N.V.的注册商标,并且因此也可称为和/或/>
-通常,除非本文另有说明,本文提及的ISVD、纳米抗体、多肽、蛋白质和其他化合物和构建体旨在用于预防或治疗人类疾病或病症(和/或任选地也用于温血动物,且特别是哺乳动物)。因此,通常,本文所述的ISVD、纳米抗体、多肽、蛋白质和其他化合物和构建体优选使得它们可以被用作(生物)药物或其他药学或治疗活性化合物和/或药物产品或组合物,和/或可以适当地作为其一部分。这种药物、化合物或产品优选使得其适合于对人类给药,例如用于需要这种预防或治疗的受试者的预防或治疗或例如作为临床试验的一部分。如本文进一步所述,为此目的,除了本发明提供的ISVD之外,这种药物或化合物可以含有其他结构部分、实体或结合单元(如本文所述,其可以是例如一个或更多个其他另外的治疗结构部分和/或影响基于ISVD或基于纳米抗体的生物制品的药代动力学或药效学性质如其半衰期的一个或更多个其他结构部分)。这些另外的治疗剂或其他结构部分的适当的实例对于技术人员是清楚的,并且例如一般可包括任何治疗活性的蛋白质、多肽或其他结合结构域或结合单元,以及例如修饰如在WO 2009/138159的第149-152页上所述的那些。基于ISVD的生物制品或基于纳米抗体的生物制品优选是治疗剂或旨在用作治疗剂(其包括预防和诊断),并且为此目的优选地包含至少一种针对治疗相关靶标(如例如RANK-L、vWF、IgE、RSV、CXCR4、IL-23或其他白细胞介素等)的ISVD。对于这种基于ISVD或基于纳米抗体的生物制品的一些具体但非限制性的实例,参考实施例8至18,并且还例如参考Ablynx N.V.的各个申请(如例如但不限于WO 2004/062551、WO 2006/122825、WO 2008/020079和WO 2009/068627),以及例如(并且不限于)申请例如WO 2006/038027、WO 2006/059108、WO 2007/063308、WO 2007/063311、WO 2007/066016和WO 2007/085814。此外,如本文进一步描述的,另外的结构部分可以是如本文所述的针对(人)血清蛋白例如(人)血清白蛋白的ISVD或纳米抗体,并且这样的ISVD或纳米抗体也可特别地在和/或用于延长本文所述TNF结合物的半衰期中具有治疗用途。例如,参考WO 2004/041865、WO 2006/122787和WO 2012/175400,其通常描述血清白蛋白结合纳米抗体用于延长半衰期的用途。此外,在本说明书中,除非本文另有明确说明,本文提及的所有术语具有WO 2009/138519(或WO 2009/138519中引用的现有技术)或WO 2008/020079(或WO 2008/020079中引用的现有技术)中给出的含义。此外,在本文未具体描述方法或技术的情况下,可以如WO 2009/138519(或在WO 2009/138519中引用的现有技术)或WO 2008/020079(或在WO 2008/020079引用的现有技术)中所述的进行。此外,如本文所述,包含任何ISVD或本发明化合物的任何药物产品或组合物还可包含一种或更多种本身已知的用于药物产品或组合物的另外组分(即取决于预期的药物形式)和/或例如一种或更多种旨在用于治疗用途的其他化合物或活性成分(即提供组合产品)。
此外,当在本说明书或权利要求中使用时,以下术语具有与在WO 2009/138519的第62-75页上给出的含义相同的含义,和/或如果适用时可以以在所述页上所述的方式进行确定:“激动剂”、“拮抗剂”、“逆激动剂”、“非极性、不带电荷的氨基酸残基”、“极性不带电荷的氨基酸残基”、“极性、带电荷的氨基酸残基”、“序列同一性”、“精确相同”和“氨基酸差异”(当提及两个氨基酸序列的序列比较时)、“(以)基本分离的(形式)”、“结构域”、“结合结构域”、“抗原决定簇”、“表位”、“针对”或“针对”(抗原)、“特异性”和“半衰期”。此外,术语“调节(modulating)”和“待调节(to modulate)”、“相互作用位点”、“特异于”、“交叉阻断(cross-block)”、“交叉阻断(cross-blocked)”和“交叉阻断(cross-blocking)”和“基本上独立于pH”,如在Ablynx N.V.的WO 2010/130832的第74-79页上所定义(和/或可如在所述页上所述确定的)。此外,当提及本发明的构建体、化合物、蛋白质或多肽时,术语如“单价”、“二价”(或“多价”)、“双特异性”(或“多特异性”)和“双互补位”(或“多互补位”)可以具有在WO 2009/138519、WO 2010/130832或WO 2008/020079中给出的含义。
在本文使用的关于本文提及的ISVD、纳米抗体、基于ISVD的生物制品、基于纳米抗体的生物制品或任何其他氨基酸序列、化合物或多肽的术语“半衰期”一般可以如WO 2008/020079的第57页上的段落o)中所述定义,并且如本文提及时,指在体内例如由于通过天然机制降解序列或化合物和/或清除或隔离序列或化合物而使氨基酸序列、化合物或多肽的血清浓度减少50%所需的时间。本发明的氨基酸序列、化合物或多肽的体内半衰期可以以任何本身已知的方式测定,例如通过药代动力学分析。适当的技术对于本领域技术人员是清楚的,并且可以例如通常如WO 2008/020079的第57页上的段落o)中所述。也如在WO2008/020079的第57页上的段落o)中所提及,可以使用参数例如t1/2-α、t1/2-β和曲线下面积(AUC)表示半衰期。在该方面,应该注意术语“半衰期”在本文中使用时特别指t1/2-β或终末半衰期(其中t1/2-α和/或AUC都可不予考虑)。例如,参考以下的实验部分及标准手册,如Kenneth,A等人:Chemical Stability of Pharmaceuticals:A Handbook forPharmacists和Peters等人,Pharmacokinetic analysis:A Practical Approach(1996)。还参考“Pharmacokinetics”,MGibaldi和D Perron,由Marcel Dekker出版,第2版(1982)。类似地,术语“半衰期增加”或“增加的半衰期”也如WO 2008/020079的第57页上的段落o)中所定义,并且特别是指t1/2-β的增加,或者具有或不具有t1/2-α和/或AUC或两者的增加。
当术语未在本文中具体定义时,它具有本领域的通常含义,这对技术人员来说是清楚的。例如,参考标准手册,如Sambrook等人,“Molecular Cloning:A LaboratoryManual”(第2版),Vols.1-3,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989);F.Ausubel等编辑,“Current protocols in molecular biology”,Green Publishing and WileyInterscience,New York(1987);Lewin,“Genes II”,John Wiley&Sons,New York,N.Y.,(1985);Old等,“Principles of Gene Manipulation:An Introduction to GeneticEngineering”,第2版,University of California Press,Berkeley,CA(1981);Roitt等人,“Immunology”(第6版),Mosby/Elsevier,Edinburgh(2001);Roitt等人,Roitt’sEssential Immunology,第10版.Blackwell Publishing,UK(2001);和Janeway等人,“Immunobiology”(第6版),Garland Science Publishing/Churchill Livingstone,NewYork(2005),以及本文引用的一般背景技术。
此外,如本文已经指出的,纳米抗体的氨基酸残基根据Kabat等人给出的VH的一般编号进行编号。(“Sequence of proteins of immunological interest”,US PublicHealth Services,NIH Bethesda,MD,Publication No.91),如Riechmann和Muyldermans,J.Immunol.Methods 2000Jun 23;240(1-2):185-195文章中应用于来自骆驼科动物的VHH结构域;或在本文提及的。根据该编号,纳米抗体的FR1包含在位置1-30的氨基酸残基,纳米抗体的CDR1包含在位置31-35的氨基酸残基,纳米抗体的FR2包含在位置36-49的氨基酸,纳米抗体的CDR2包含在位置50-65的氨基酸残基,纳米抗体的FR3包含在位置66-94的氨基酸残基,纳米抗体的CDR3包含在位置95-102的氨基酸残基,并且纳米抗体的FR4包含在位置103-113的氨基酸残基。[在这方面中,应该注意,如本领域所熟知的,对于VH结构域和对于VHH结构域,每个CDR中的氨基酸残基的总数可以变化,并且可以不对应于由Kabat编号表示的氨基酸残基的总数(即,根据Kabat编号的一个或更多个位置可以不由实际序列占据,或者实际序列可包含多于Kabat编号所允许数目的氨基酸残基)。一般地,这意思是指,根据Kabat的编号可以对应于或可以不对应于实际序列中氨基酸残基的实际编号。然而,通常一般来说,根据Kabat的编号并且不考虑CDR中氨基酸残基的数目,根据Kabat编号的位置1对应于FR1的开始并且反之亦然,根据Kabat编号的位置36对应于FR2的开始并且反之亦然,根据Kabat编号的位置66对应于FR3的开始并且反之亦然,根据Kabat编号的位置103对应于FR4的开始并且反之亦然]。
用于对VH结构域的氨基酸残基进行编号的备选方法是Chothia等人(Nature 342,877-883(1989))描述的方法,该方法也可以以类似方式应用于来自骆驼科动物的VHH结构域和纳米抗体,所谓的“AbM定义”和所谓的“接触定义”。然而,在本说明书、方面和附图中,除非另有说明,将遵循由Riechmann和Muyldermans应用于VHH结构域的根据Kabat的编号。
还应当注意提供附图、任何序列表和实验部分/实施例仅用于进一步举例说明本发明,不应以任何方式被解释或理解为限制本发明和/或所附权利要求的范围,除非本文另有明确说明。
如本文进一步所述,本发明的血清白蛋白结合物可有利地用作结构部分、结合单元或融合配偶体以增加治疗化合物、结构部分或实体例如多肽、蛋白质、化合物(包括但不限于小分子)或其他治疗实体的半衰期。
因此,另一方面,本发明提供了多肽、蛋白质、构建体、化合物或其他化学实体,其包含或基本上由本发明的血清白蛋白结合物和一种或更多种其他氨基酸序列、(结合)结构域、结合单元或其他结构部分或化学实体组成。
特别地,本发明提供多肽、蛋白质、构建体、化合物或其他化学实体,其包含适当地彼此直接连接或通过一个或更多个合适的接头或间隔物连接的本发明的血清白蛋白结合物和一种或更多种(例如一种或两种)治疗结构部分(其可以是相同或不同的,并且可以是例如针对相同的靶标或针对不同的靶标,并且当它们针对相同的靶标时,可以针对所述靶标的相同或不同的表位、部分、结构域或亚基)。此类多肽、蛋白质或构建体可以是例如但不限于融合蛋白,如本文进一步描述的。
本发明进一步涉及此类多肽、蛋白质、构建体或化合物的治疗用途,并涉及包含此类多肽、蛋白质、构建体或化合物的药物组合物。
在一个方面,所述至少一种治疗结构部分包含或基本上由治疗蛋白质、多肽、化合物、因子或其他实体组成。在一个优选的实施方案中,治疗结构部分针对所需的抗原或靶标,能够结合所需的抗原(且特别是能够特异性结合所需的抗原),和/或能够与所需的靶标相互作用。在另一个实施方案中,至少一种治疗结构部分包含或基本上由治疗蛋白或多肽组成。在另一种实施方案中,所述至少一种治疗结构部分包含或基本上由结合结构域或结合单元组成,例如免疫球蛋白或免疫球蛋白序列(包括但不限于免疫球蛋白的片段),例如抗体或抗体片段(包括但不限于ScFv片段),或由另一适当的蛋白质支架组成,例如蛋白A结构域(例如AffibodiesTM)、淀粉酶抑肽、纤连蛋白、脂质运载蛋白、CTLA-4、T细胞受体、设计的锚蛋白重复、高亲和性多聚体(avimers)和PDZ结构域(Binz等,Nat.Biotech 2005,Vol23:1257),和基于DNA或RNA的结合结构部分,其包括但不限于DNA或RNA适配体(Ulrich等,Comb Chem High Throughput Screen 2006 9(8):619-32)。
在另一方面,所述至少一种治疗结构部分包含或基本上由抗体可变结构域,例如重链可变结构域或轻链可变结构域组成。
在一个优选的方面,所述至少一种治疗结构部分包含或基本上由至少一种免疫球蛋白单可变结构域组成,例如结构域抗体、单结构域抗体、“dAb”或纳米抗体(例如VHH、人源化的VHH或骆驼源化的VH)或IgNAR结构域。
在一个具体的实施方案中,所述至少一种治疗结构部分包含或基本上由至少一种单价纳米抗体或二价、多价、双特异性或多特异性纳米抗体构建体组成。
包含本发明的血清白蛋白结合物和一种或更多种治疗结构部分的多肽、(融合)蛋白、构建体或化合物通常可以如上文引用的现有技术中所述(制备和使用)(例如WO 04/041865、WO 06/122787、WO 2012/175400和WO 2015/173325;还可参考例如WO 2004/003019、EP 2 139 918、WO 2011/006915和WO 2014/111550),用本发明的血清白蛋白结合物代替所述描述的半衰期延长的结构部分。
与治疗结构部分或结构部分本身相比,包含本发明的血清白蛋白结合物和一种或更多种治疗结构部分的多肽、(融合)蛋白、构建体或化合物通常并且优选具有增加的半衰期(如本文所述,并且优选表示为t1/2-β)。
通常,本文所述的化合物、多肽、构建体或融合蛋白优选具有半衰期(再次,如本文所述,并且优选表示为t1/2-β),所述半衰期是相应的治疗结构部分本身的半衰期的至少1.5倍,优选至少2倍,例如至少5倍,例如至少10倍或大于20倍(在人或适当的动物,例如小鼠或食蟹猴中测量)。
此外,优选地,任何这种化合物、多肽、融合蛋白或构建体在人体中
具有与相应治疗结构部分本身的半衰期相比增加多于1小时,优选多于2小时,更优选多于6小时,例如多于12小时的半衰期(再次,如本文所述,并且优选表示为t1/2-β)。
此外,优选地,本发明的化合物或多肽在人体中具有超过1小时,优选超过2小时,更优选超过6小时,例如超过12小时,和例如约一天、两天、一周、两周,直至人体中血清白蛋白的半衰期(估计约为19天)的半衰期(再次,如本文所述,并且优选表示为t1/2-β)。
如上所述,在一个方面,本发明的血清白蛋白结合物用于增加(一种或更多种)例如结构域抗体、单结构域抗体、“dAb”、VHH或纳米抗体(例如VHH、人源化的VHH或例如骆驼源化人VH的骆驼源化VH)的免疫球蛋白单可变结构域的半衰期。
因此,本发明的一个实施方案涉及多肽、构建体或融合蛋白,其包含本发明的血清白蛋白结合物和一种或更多种(例如一种或两种)免疫球蛋白单可变结构域序列,它们适当地彼此直接地或任选地通过一个或更多个适当的接头或间隔物连接。如本文所述,存在于这种多肽、构建体或融合蛋白中的每个这样的免疫球蛋白单可变结构域可以独立地是结构域抗体、单结构域抗体,“dAb”或纳米抗体(例如VHH、人源化VHH或例如骆驼源化人VH的骆驼源化VH);且根据一个具体但非限制性的方面,这些免疫球蛋白单可变结构域中的至少一个(和直至全部)包含两个或三个二硫桥。优选地,存在于本发明的这种化合物中的所有ISVD都是纳米抗体。
当本发明的化合物在其C-端末端具有一个ISVD(例如本发明的血清白蛋白结合物或针对治疗靶标的ISVD)时,则所述C-端ISVD(并且因此,引申开来,本发明的整个化合物)优选在其C-端末端具有C-端延伸。该C-端延伸将直接与ISVD的最终C端氨基酸残基相连,其通常是根据Kabat在位置113的氨基酸残基(除非ISVD含有一个或更多个氨基酸缺失,使得ISVD的序列在位置113之前结束)。因此,通常,C-端延伸将直接与C-端ISV的C-端VTVSS序列(SEQ ID NO:15)(并且因此,引申开来,本发明化合物的C-端TVTSS序列)或对应于C-端ISVD序列的C-端ISVD的C-端序列(例如,与常规的VTVSS序列相比,所述C-端ISVD的C-端序列含有一个或更多个取代或缺失,如T110K、T110Q、S112K或S112K)连接。
技术人员还清楚,在本发明化合物在其C-端末端具有本发明的血清白蛋白结合物的情况下,则本发明的所述血清白蛋白结合物将携带所述C-端延伸。
通常,本文中所用的任何C-端延伸(即在本发明化合物的C-端末端和/或本发明的血清白蛋白结合物的C-端末端)通常如WO 2012/174741或WO 2015/173325中所述(还可参考例如WO 2103/024059和WO 2016/118733)。特别地,C-端延伸可能具有式(X)n,其中n为1至10,优选1至5,例如1、2、3、4或5(并且优选1或2,例如1);且每个X是(优选天然存在的)氨基酸残基,其独立地选自天然存在的氨基酸残基(尽管根据优选的一个方面,它不包含任何半胱氨酸残基),并且优选独立地选自由丙氨酸(A)、甘氨酸(G)、缬氨酸(V)、亮氨酸(L)或异亮氨酸(I)组成的组。
根据这种C-端延伸X(n)的一些优选但非限制性的方面,X和n可以如下:
(a)n=1且X=Ala;
(b)n=2且每个X=Ala;
(c)n=3且每个X=Ala;
(d)n=2且至少一个X=Ala(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);
(e)n=3且至少一个X=Ala(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);
(f)n=3且至少两个X=Ala(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);
(g)n=1且X=Gly;
(h)n=2且每个X=Gly;
(i)n=3且每个X=Gly;
(j)n=2且至少一个X=Gly(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);
(k)n=3且至少一个X=Gly(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);
(l)n=3且至少两个X=Gly(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);
(m)n=2且每个X=Ala或Gly;
(n)n=3且每个X=Ala或Gly;
(o)n=3且至少一个X=Ala或Gly(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);或者
(p)n=3且至少两个X=Ala或Gly(剩余的氨基酸残基X为独立地选自任何天然存在的氨基酸,但优选独立地选自Val、Leu和/或Ile);
方面(a)、(b)、(c)、(g)、(h)、(i)、(m)和(n)是特别优选的,其中n=1或2是优选的方面和n=1是特别优选的方面。
还应注意,优选地,存在于本发明的血清白蛋白结合物中的任何C-端延伸不包含(游离的)半胱氨酸残基(除非所述半胱氨酸残基用于或旨在用于进一步官能化,例如用于聚乙二醇化)。
有用的C-端延伸的一些具体但非限制性的实例是以下氨基酸序列:A、AA、AAA、G、GG、GGG、AG、GA、AAG、AGG、AGA、GGA、GAA或GAG。
还优选地,当本发明的化合物在其C-端末端具有ISVD(例如本发明的血清白蛋白结合物或针对治疗靶标的ISVD)时,则(至少)所述C-端ISVD优选地,甚至更优选地,除了如本文所述的C-端延伸之外,含有一个或更多个降低预先存在的抗体结合的突变(即如本文所述的本发明的血清白蛋白结合物,并且更普遍地如WO 2012/175741和WO 2015/173325以及又例如在WO 2013/024059和WO 2016/118733中所述)。在这方面,技术人员清楚的是,在本发明的化合物在其C-端末端具有本发明的血清白蛋白结合物的情况下,则(至少)本发明的所述血清白蛋白结合物优选将包含这种突变(即优选地除了C-端延伸之外)。
更一般地,根据本发明的一个具体方面,当本发明的化合物含有两个或更多个ISVD(例如本发明的血清白蛋白结合物和一个或更多个针对治疗靶标的ISVD)时,则优选所有这些ISVD含有降低与预先存在的抗体结合的突变(再次,如果本发明的化合物在其C-端末端具有ISVD,则优选地除了与C-端ISVD连接的C-端延伸之外)。
当本发明化合物在其N-端末端具有ISVD(例如本发明的血清白蛋白结合物或针对治疗靶标的ISVD)时,则所述N-端ISVD(并且因此,引申开来,本发明的整个化合物)优选在位置1含有D。在这方面,技术人员再次清楚,在本发明化合物在其N-端末端具有本发明的血清白蛋白结合物的情况下,则本发明的所述血清白蛋白结合物在位置1处优选具有D(例如,与如SEQ ID NO:18和/或19的序列相比的E1D突变,如在SEQ ID NO:46至59的本发明的氨基酸序列之中)。
在一些另外的方面,本发明涉及蛋白质、多肽或其他化合物或构建体,其包含或基本上由至少一种(并且优选仅一种)本发明的血清白蛋白结合物和至少一种(例如一种、两种或两种)治疗结构部分或实体组成(其中所述血清白蛋白结合物和一种或更多种治疗结构部分或实体任选地通过一个或更多个适当的接头适当地连接),该蛋白质、多肽、化合物、构建体使得:
-当其在C-端末端具有ISVD时,则所述蛋白质、多肽、化合物、构建体(的C-端ISVD)在其C-端末端具有C-端延伸(X)n(如本文进一步描述的);和/或
-当其在C-端末端具有ISVD时,则至少所述C-端ISVD含有一个或更多个降低预先存在的抗体结合的突变(如本文进一步描述的);
-当其在N-端末端具有ISVD时,则所述蛋白质、多肽、化合物、构建体(的N-端ISVD)优选在位置1含有D;和/或
-其中所述ISVD,其蛋白质、多肽或其他化合物在其N-端末端也可具有ISVD,在这种情况下,所述N-端ISVD末端优选在位置1具有D或E1D;
-优选地,存在于所述蛋白质、多肽、化合物、构建体中的基本上所有的ISVD含有一个或更多个降低预先存在的抗体结合的突变(如本文进一步描述的)。
根据本发明的一个具体方面,存在于本发明的化合物中的所有治疗结构部分是ISVD(即针对治疗靶标的ISVD),且特别是重链ISVD,且更特别是纳米抗体(即针对治疗靶标的纳米抗体)。
例如但不限于,本发明的此类化合物可包含:
-本发明的血清白蛋白结合物的一个拷贝和一个针对治疗靶标的ISVD(并且优选纳米抗体);或
-本发明的血清白蛋白结合物的一个拷贝和两个针对治疗靶标的ISVD(并且优选两个纳米抗体)(该ISVD可以相同或不同,并且当不同时可针对相同靶标,针对相同靶标上的不同表位或针对不同治疗靶标);或
-本发明的血清白蛋白结合物的一个拷贝和三个针对治疗靶标的ISVD(并且优选三个纳米抗体)(所述ISVD可以相同或不同,并且当不同时可针对相同靶标,针对相同靶标上的不同表位或针对不同的治疗靶标)。
本发明的构建体、融合蛋白或多肽的一些非限制性实例可以示意性地表示如下,其中“[Alb]”代表本发明的血清白蛋白结合物,“[治疗结构部分1]”和“[治疗结构部分2]”代表治疗结构部分(如上所述,其可各自独立地为免疫球蛋白单可变结构域),“-”代表适当的接头(其是任选的;适当的实例是9GS和35GS接头)并且N-端位于左手侧,且C端位于右手侧:
[Alb]-[治疗结构部分1]
[治疗结构部分1]-[Alb]-X(n)
[Alb]-[治疗结构部分1]-[治疗结构部分1]
[治疗结构部分1]-[治疗结构部分1]-[Alb]-X(n)
[治疗结构部分1]-[Alb]-[治疗结构部分1]
[Alb]-[治疗结构部分1]-[治疗结构部分2]
[治疗结构部分1]-[治疗结构部分2]-[Alb]-X(n)
[治疗结构部分1]-[Alb]-[治疗结构部分2]
当治疗结构部分是针对治疗靶标的ISVD(并且优选纳米抗体)时,本发明的优选但非限制性的构建体、融合蛋白或多肽可以示意性地表示如下,其中“[Alb]”代表本发明的血清白蛋白结合物,“[治疗ISVD 1]”和“[治疗ISVD 2]”代表针对治疗靶标的ISVD(该ISVD可以是相同的或不同的,并且当不同时可针对相同靶标,针对相同靶标上的不同表位或针对不同治疗靶标),“-”代表适当的接头(其是任选的),X(n)代表如本文所述的C-端延伸,并且N-端位于左手侧,且C-端位于右手侧:
[Alb]-[治疗ISVD 1]-X(n)
[治疗ISVD 1]-[Alb]-X(n)
[Alb]-[治疗ISVD 1]-[治疗ISVD 1]-X(n)
[治疗ISVD 1]-[治疗ISVD 1]-[Alb]-X(n)
[治疗ISVD 1]-[Alb]-[治疗ISVD 1]-X(n)
[Alb]-[治疗ISVD 1]-[治疗ISVD 2]-X(n)
[治疗ISVD 1]-[治疗ISVD 2]-[Alb]-X(n)
[治疗ISVD 1]-[Alb]-[治疗ISVD 2]-X(n)
因此,另一方面,本发明涉及多特异性(而且特别是双特异性)纳米抗体构建体,其包含本发明的血清白蛋白结合物和至少一个其他的纳米抗体(例如一个或两个其他的纳米抗体,其可以是相同的或不同的),其中所述至少一个其他的纳米抗体优选针对所需的靶标(其优选为治疗靶标)和/或另一个有用的或适于治疗、预防和/或诊断目的的纳米抗体。再次,本发明的血清白蛋白结合物和其他纳米抗体可以适当的彼此直接连接或任选地通过一个或更多个适当的接头或间隔物连接。
对于含有一个或更多个纳米抗体的多价和多特异性多肽及其制备的一般描述,还参考Conrath等,J.Biol.Chem.,Vol.276,10.7346-7350,2001;Muyldermans,Reviews inMolecular Biotechnology 74(2001),277-302;以及例如WO 96/34103、WO 99/23221、WO04/041862、WO 2006/122786、WO 2008/020079、WO 2008/142164或WO 2009/068627。
通过举例说明,本发明化合物的一些实例在SEQ ID NO:61至67中给出,使用SEQID NO:60的抗HER2-纳米抗体作为抗靶标纳米抗体的代表性实例,并且构成纳米抗体在本发明的化合物中处于不同的位置。SEQ ID NO:61至64的化合物是说明本发明的二价双特异性化合物的实例,并且SEQ ID NO:65至67的化合物是说明本发明的三价双特异性化合物的实例。在每种情况下,化合物含有E1D突变和C-端丙氨酸残基,且含有使用适当的接头的代表性但非限制性的实例(即SEQ ID NO:62和63中的15GS接头和或SEQ ID NO:61和64至67中的35GS接头)。
本发明的一些具体的多特异性和/或多价多肽的一些其他实例可以在本文提及的Ablynx N.V.的申请中找到。特别地,对于包含至少一种用于增加半衰期的针对血清蛋白的纳米抗体的多价和多特异性构建体、编码其的核酸、包含其的组合物、上述的制剂和上述的应用的一般描述,参考上述国际申请WO 04/041865和WO 06/122787(本文所述的本发明的血清白蛋白结合物通常可类似地用于本文描述的半衰期增加的纳米抗体,例如Alb-8),以及参考在例如WO 04/041862、WO 2006/122786、WO 2008/020079、WO 2008/142164或WO2009/068627中给出的此种构建体的一般描述和具体实例。
本发明还涉及编码本发明的白蛋白结合物、化合物或多肽的核苷酸序列或核酸。本发明还包括遗传构建体,其包括前述核苷酸序列或核酸和用于本身已知的遗传构建体的一种或更多种元件。遗传构建体可以是质粒或载体的形式。同样,此类构建体通常可如Ablynx N.V.的已公开专利申请中所述,例如WO 04/041862、WO 2006/122786、WO 2008/020079、WO 2008/142164或WO 2009/068627。
本发明还涉及含有此类核苷酸序列或核酸,和/或表达(或能够表达)本发明的白蛋白结合物、化合物或多肽的宿主或宿主细胞。同样,此类宿主细胞通常可如Ablynx N.V.的已公开专利申请中所述,例如WO 04/041862、WO 2006/122786、WO 2008/020079、WO2008/142164或WO 2009/068627。
本发明还涉及制备本发明的白蛋白结合物、化合物或多肽的方法,该方法包含在使得所述宿主细胞产生或表达本发明的白蛋白结合物、化合物或多肽的条件下培养或维持如本文所述的宿主细胞,并且任选地进一步包含分离如此产生的本发明的白蛋白结合物、化合物或多肽。同样,可以如Ablynx N.V.的已公开专利申请例如WO 04/041862、WO 2006/122786、WO 2008/020079、WO 2008/142164或WO 2009/068627中一般描述的进行此类方法。
本发明还涉及药物组合物,其包含至少一种本发明的化合物或多肽,和任选地至少一种药学上可接受的载体、稀释剂或赋形剂。此类制剂、载体、赋形剂和稀释剂通常可如Ablynx N.V.的已公开专利申请例如WO 04/041862、WO 2006/122786、WO 2008/020079、WO2008/142164或WO 2009/068627中所述。
然而,由于本发明的化合物或多肽具有增加的半衰期,优选将它们施用于循环。因此,它们可以以允许本发明化合物或多肽进入循环的任何适当的方式施用,例如静脉内,通过注射或输液,或以任何其它适当的方式(包括口服给药、皮下给药、肌肉内给药、通过皮肤给药、鼻内给药、通过肺部给药等)。适当的给药方法和途径对于技术人员而言是清楚的,再次例如也可以从Ablynx N.V.的已公开专利申请如WO 04/041862、WO 2006/122786、WO2008/020079、WO 2008/142164或WO 2009/068627的教导中获知。
因此,在另一方面,本发明涉及用于至少一种疾病或病症的预防和/或治疗的方法,其中所述疾病或病症可通过使用本发明的化合物或多肽被预防或治疗,该方法包含向有需要的受试者施用药学活性量的本发明的化合物或多肽,和/或包含其的药物组合物。可通过使用本文所述的本发明的化合物或多肽被预防或治疗的疾病和病症通常与可通过使用存在于本发明的化合物或多肽中的一种或多种治疗结构部分而被预防或治疗的疾病和病症相同。
在本发明的上下文中,术语“预防和/或治疗”不仅包含预防和/或治疗疾病,而且通常包含预防疾病的发作,减缓或逆转疾病的进展,预防或减缓与疾病相关的一种或更多种症状的发作,降低和/或减轻与疾病相关的一种或更多种症状,降低疾病和/或与其相关的任何症状的严重性和/或持续时间,和/或预防疾病和/或与其相关的任何症状的严重性的进一步增加,预防、降低或逆转由疾病引起的任何生理损害,以及通常对受治疗的患者有益的任何药理作用。
待治疗的受试者可以是任何温血动物,但特别是哺乳动物,且更特别是人。如技术人员所清楚的,待治疗的受试者特别是患有本文所述的疾病和病症或处于其风险中的人。
在另一个实施方案中,本发明涉及用于免疫治疗,且特别是用于被动免疫治疗的方法,该方法包含向患有本文所述的疾病和病症或处于其风险的受试者施用药学活性量的本发明的化合物或多肽,和/或包含本发明的化合物或多肽的药物组合物。
根据适于预防和/或治疗待预防或治疗的疾病或病症的治疗方案,施用本发明的化合物或多肽和/或包含其的组合物。临床医生通常能够确定合适的治疗方案,这取决于诸如待预防或治疗的疾病或病症,待治疗疾病的严重性和/或其症状的严重性,待使用的本发明的具体的多肽,待使用的具体给药途径和药物制剂或组合物,患者的年龄、性别、体重、饮食、一般状况和临床医生熟知的类似因素的因素。
通常,治疗方案包含以一种或更多种药学有效量或剂量施用一种或更多种本发明化合物或多肽,或一种或更多种包含其的组合物。临床医生可以再次基于上述因素确定待施用的具体量或剂量。
通常,为了预防和/或治疗本文所述的疾病和病症,并且取决于待治疗的具体的疾病或病症、待使用的本发明的化合物或多肽的效力和/或半衰期、具体的给药途径和所用的具体的药物制剂或组合物,本发明的化合物或多肽通常以每千克体重每日1克和0.01微克之间的量给药,优选每千克体重每日0.1克和0.1微克之间给药,例如每千克体重每日约1、10、100或1000微克,作为单日剂量连续地(例如通过输液),或作为日间多个分份剂量。临床医生通常能够根据本文所述的因素确定适当的日剂量。还将清楚在具体情况下,临床医生可以选择偏离这些量,例如基于上面引用的因素和其专家判断。通常,从通过基本上相同的途径施用的针对相同靶标的可比的常规抗体或抗体片段通常施用的量,然而考虑亲和力/亲合力、功效、生物分布、半衰期的差异和技术人员熟知的类似因素,可以获得关于待施用量的一些指导。
而且,由于本发明的化合物含有半衰期增加的本发明的血清白蛋白结合物,它们不需要基本上连续施用(例如通过输液),但它们可以以适当的间隔施用(由技术人员决定)。例如,它们可以每两天施用一次(以适当的剂量)、每四天施用一次、每周施用一次、每两周施用一次、和在一些情况下每四周一次或甚至更不频繁地施用,例如通过注射或输液施用。
本发明的一个方面涉及包含至少一种本发明的化合物或多肽的药物组合物,其中所述组合物旨在以每周一次至每四周一次的间隔给药,且特别是每7天一次至每21天一次的间隔,如每7天一次或每14天一次。
通常,在上述方法中,将使用本发明的单一多肽。然而,组合使用两种或更多种本发明的多肽也在本发明的范围内。
本发明的多肽还可以与一种或更多种另外的药学活性化合物或组成部分组合使用,即作为组合治疗方案,其可以产生或可以不产生协同效应。再次,临床医生将能够基于上面引用的因素和其专家判断选择这些另外的化合物或组成部分,以及适当的组合治疗方案。
特别地,本发明的多肽可用于与用于或能够用于预防和/或治疗疾病和病症的另外的药学活性化合物或组成部分组合使用,其中所述疾病和病症可利用本发明的融合蛋白或构建体而被预防或治疗,结果是,可以获得或不可以获得协同效应。
根据本发明使用的治疗方案的有效性可以由所涉及的疾病或病症本身已知的任何方式确定和/或遵循,如临床医生将清楚的。临床医生还可以在适当的情况下,或根据具体情况,改变或修改特定的治疗方案,以达到期望的治疗效果,以避免、限制或减少不需要的副作用,和/或以便在一方面实现期望的治疗效果和另一方面避免、限制或减少不期望的副作用之间实现适当的平衡。
通常,遵循治疗方案直至达到期望的治疗效果和/或只要保持期望的治疗效果。再次,这可以由临床医生确定。
根据本文的进一步描述,本发明的其他方面、实施方案、优点和应用将变得清楚。
现在将通过以下非限制性优选方面、实施例和附图进一步描述本发明,其中:
-图1是列出本文将具体提及的一些氨基酸位置及其根据一些备选编号系统(例如Aho和IMGT)编号的表格;
-图2列出了本文提及的氨基酸序列;
-图3A和3B展示了SEQ ID NO:18和19(本发明)的序列与SEQ ID NO:1和2的现有技术序列的比对;
-图4展示了SEQ ID NO:18至59的比对;
-图5给出了来自不同哺乳动物物种的血清白蛋白的比对;
-图6是展示在SEQ ID NO:20(本发明)的血清白蛋白结合物存在下SEQ ID NO:1(参考)-cMycHis6与包被的HSA结合的图。将1.5nMSEQ ID NO:1-cMycHis6和His6Flag3-SEQID NO:1(参考)、Flag3His6-SEQ ID NO:20(本发明)或cAblys3-Flag3His6(参考)的浓度系列在包被的HSA上温育。用山羊抗cMyc和HRP标记的兔抗山羊抗体检测结合的SEQ ID NO:1-cMycHis6。
-图7图示了在存在SEQ ID NO:20(本发明)的血清白蛋白结合物的情况下,HSA与FcRn的结合。将人FcRn-人β2微球蛋白异二聚体固定在CM5芯片上。在50mM NaPO 4+150mMNaCl+0.05%Tween-20pH 6.0中不存在或存在2μM纳米抗体的情况下,在Biacore T100仪器上监测1μM HSA的结合。
在本申请中引用的所有参考文献(包括文献参考、发布的专利、公开的专利申请和待决的专利申请)的全部内容通过引用明确地并入本文,特别是用于上文引用的教导。
实验部分
实施例1:血清白蛋白的亲和力
在ProteOn XPR36(BioRad)仪器上,通过表面等离振子共振(SPR)测量SEQ ID NO:19(本发明)的血清白蛋白结合物对人(Sigma-Aldrich A3782)、食蟹猴(内部产生)、小鼠(Albumin Bioscience 2601)、大鼠(Sigma-Aldrich A4538)、兔(Sigma-Aldrich A0764)、豚鼠(Gentaur GPSA62)、猪(Sigma-Aldrich A4414)、绵羊(Sigma-Aldrich A3264)、犬(Abcam 119814)和牛(Sigma-Aldrich A3059)血清白蛋白(SA)的亲和力。使用ProteOn胺偶联试剂盒(BioRad)通过胺偶联将血清白蛋白固定在GLC ProteOn芯片上。将不同浓度(300nM、100nM、33.3nM、11.1nM、3.7nM和1.23nM)的SEQ ID NO:19(本发明)的血清白蛋白结合物以45μL/min注射到HBS-P+pH 7.4缓冲液(GE Healthcare)中持续120s,然后解离900s。在绵羊和牛SA上,对于SEQ ID NO:19没有观察到结合或观察到非常低的结合。SEQ ID NO:19对人、食蟹猴、大鼠、小鼠和豚鼠SA的亲和力在pM范围内(表1)。此外,SEQ ID NO:19与犬SA交叉反应,并且还以弱亲和力与猪和兔SA结合。
表1:SEQ ID NO:19(本发明)的血清白蛋白结合物在来自不同物种的SA上的结合的动力学参数。
白蛋白在血液中的长半衰期主要由两个特征驱动:(i)白蛋白的大尺寸(65kDa)限制其肾小球过滤和(ii)白蛋白在低pH(pH6)下与FcRn结合,其通过从早期内体再循环至细胞外环境,保护白蛋白在内皮细胞和上皮细胞中被动内吞作用后免于溶酶体中降解。对于通过白蛋白结合和随后的再循环导致长血清半衰期的白蛋白结合纳米抗体,它们应在5.0至7.4的pH范围内保持与白蛋白结合。如上所述,在ProteOn仪器上测量在pH 5、pH 6和pH7.4下SEQ ID NO:19(本发明)的血清白蛋白结合物自HSA的解离速率,包括SEQ ID NO:1作为参考。在HBS-P+pH 7.4缓冲液中分别以500nM和300nM注射SEQ ID NO:19(本发明)和SEQID NO:1的血清白蛋白结合物。解离缓冲液分别为50mM NaOAc/HOAc+150mM NaCl+0.05%Tween-20pH 5.0、50mM NaOAc/HOAc+150mM NaCl+0.05%Tween-20pH 6.0和HBS-P+pH 7.4。解离进行分析2700s。SEQ ID NO:19的解离速率在5.0至7.4的pH范围内没有显著差异(表2)。
表2:在不同pH下,SEQ ID NO:19(本发明)的血清白蛋白结合物自HSA的解离速率。
实施例2:表位
在竞争ELISA中分析表位分类。将人血清白蛋白以125ng/ml包被在PBS中于4℃过夜。在用PBS+1%酪蛋白封闭后,加入1.5nM SEQ ID NO:1-cMycHis6和一系列浓度的竞争试剂(His6Flag3-SEQ ID NO:20、His6Flag3-SEQ ID NO:1作为阳性对照,或鸡蛋溶菌酶结合单结构域抗体cAblys3-Flag3His6作为阴性对照)。用山羊抗cMyc(Abcam ab19234)和HRP标记的兔抗山羊(Genway 18-511-244226)抗体检测结合的SEQ ID NO:1-cMycHis6。SEQ IDNO:20和SEQ ID NO:1的白蛋白结合物不结合HSA上的相同表位(图6)。
实施例3:干扰SA和FcRn之间的相互作用
对于通过白蛋白结合和随后的再循环提供长的半衰期的SEQ ID NO:19(本发明)的血清白蛋白结合物,其不应干扰白蛋白与FcRn的结合。这在Biacore T100(GEHealthcare)仪器上以SPR进行分析。通过标准胺偶联(Biacore胺偶联试剂盒)将人FcRn-人β2微球蛋白异二聚体(Sino Biological CT009-H08H)固定在CM5芯片上。将1μM HSA和2μM纳米抗体(His6Flag3-SEQ ID NO:20、His6Flag3-SEQ ID NO:1或cAblys3-Flag3His6)在50mM NaPO4+150mM NaCl+0.05%Tween-20pH 6.0中的混合物以10μl/min注射120s,然后解离600s。将结合曲线与不存在纳米抗体的1μMHSA的结合曲线进行定性比较。SEQ ID NO:20(本发明)的白蛋白结合物不干扰HSA与FcRn的结合(图7)。
实施例4:犬中的PK图谱
在犬中研究三价纳米抗体构建体(SEQ ID NO:68)在单次静脉注射(i.v.)剂量后的药代动力学。该三价构建体在毕赤酵母中产生,并且包含针对呼吸道合胞病毒(RSV)的两个纳米抗体,其在C端末端具有SEQ ID NO:19的白蛋白结合纳米抗体(其中三个纳米抗体使用(Gly4Ser)7接头彼此连接)。
在12只禁食的健康雄性Beagle犬(通过研究前健康检查确定为健康)的药代动力学研究(非交叉,单剂量)中评估构建体的药代动力学图谱。该构建体是静脉内给药。
动物在给药前,并且在给药前、给药后24小时、168小时和336小时在采集血样前禁食(不间断获取水)过夜(总禁食时间不超过24小时)。剂量后4小时或在24、168和336小时采血后立即恢复食物。在研究期间还记录和跟踪体重。
在给药前和初始剂量后5、15、30分钟和1、4、8、12、24、72、168、240、336、504和672小时从外周血管收集1ml全血(或剂量前和24、168和336小时2-3ml)用于血浆。将用于血清处理的收集样品保持在室温下并使其凝块。使用冷冻离心机(设定为保持4℃)将血液以10,000rpm离心2分钟。样品在收集后30分钟内冷冻,直到它们被提交用于分析(包括相关纳米抗体构建体的浓度的测量)。
Claims (15)
1.能够结合人血清白蛋白的免疫球蛋白单可变结构域,其具有:
-根据Abm的CDR1,其是氨基酸序列SEQ ID NO:11:GSNISSYVMG或SEQ ID NO:12:GSTISSYVMG;和
-根据Abm的CDR2,其是氨基酸序列SEQ ID NO:13:AISRSGGYTY;和
-根据Abm的CDR3,其是氨基酸序列SEQ ID NO:14:
GRYSAWYSQSYEYDY。
2.根据权利要求1所述的免疫球蛋白单可变结构域,其可以以优于100nM的亲和力与人血清白蛋白结合,使用ProteOn测定。
3.根据权利要求1所述的免疫球蛋白单可变结构域,其为重链免疫球蛋白单可变结构域。
4.根据权利要求1所述的免疫球蛋白单可变结构域,其为VHH、人源化的VHH或骆驼源化的VH。
5.根据权利要求4所述的免疫球蛋白单可变结构域,其为骆驼源化的人VH。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的免疫球蛋白单可变结构域,其具有:
-至少85%的与SEQ ID NO:19的序列的序列同一性程度,其中CDR和可能存在的任何C-端延伸不被考虑用于确定序列同一性程度;
和/或:
-与SEQ ID NO:19的序列具有不超过7个“氨基酸差异”,所述“氨基酸差异”不考虑CDR和可能存在的任何C-端延伸。
7.能够结合人血清白蛋白的免疫球蛋白单可变结构域,其选自SEQ ID NO:19和20。
8.构建体,其包含至少一种根据权利要求1至7中任一项所述的免疫球蛋白单可变结构域。
9.根据权利要求8所述的构建体,其包含至少一种治疗结构部分或实体。
10.根据权利要求8所述的构建体,其为融合蛋白。
11.药物组合物,其包含根据权利要求8至10中任一项所述的构建体。
12.编码根据权利要求1至7中任一项所述的免疫球蛋白单可变结构域或根据权利要求8-10中任一项所述的构建体的核酸,其任选地包括在遗传构建体中。
13.宿主或宿主细胞,其含有根据权利要求12所述的核酸和/或表达根据权利要求1至7中任一项所述的免疫球蛋白单可变结构域或根据权利要求8至10中任一项所述的构建体。
14.用于制备根据权利要求1至7中任一项所述的免疫球蛋白单可变结构域或根据权利要求8至10中任一项所述的构建体的方法,所述方法包括在使得宿主细胞产生或表达根据权利要求1至7中任一项所述的免疫球蛋白单可变结构域或根据权利要求8至10中任一项所述的构建体的条件下培养或维持根据权利要求13所述的宿主细胞,并且任选地进一步包括分离如此产生的根据权利要求1至7中任一项所述的免疫球蛋白单可变结构域或根据权利要求8至10中任一项所述的构建体。
15.根据权利要求8至10中任一项所述的构建体,其用于至少一种疾病或病症的预防和/或治疗的方法,所述疾病或病症可通过使用根据权利要求8至10中任一项所述的构建体被预防或治疗。
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