CN109369788B

CN109369788B - 一种来自烟草的钾转运蛋白tpk1-1及其编码基因与应用

Info

Publication number: CN109369788B
Application number: CN201811339679.1A
Authority: CN
Inventors: 王仁刚; 任学良; 李立芹; 鲁黎明; 郭玉双; 张洁; 王自力; 林世锋
Original assignee: Guizhou Institute of Tobacco Science
Current assignee: Guizhou Institute of Tobacco Science
Priority date: 2018-11-12
Filing date: 2018-11-12
Publication date: 2021-08-27
Anticipated expiration: 2038-11-12
Also published as: CN109369788A

Abstract

本发明涉及基因工程领域，具体公开了一种来自烟草的钾转运蛋白TPK1‑1及其编码基因与应用。本发明首次提供了分离自烟草的TPK1‑1基因，所述TPK1‑1基因全长1287bp，经功能验证，本发明提供的TPK1‑1基因转入钾吸收缺陷型酵母突变株R5421后，表达所述TPK1‑1基因的重组酵母重新具有了钾离子吸收和转运的功能。因此，本发明提供的TPK1‑1基因具有促进钾离子吸收和转运的功能。

Description

一种来自烟草的钾转运蛋白TPK1-1及其编码基因与应用

技术领域

本发明涉及基因工程领域，具体地说，涉及一种来自烟草的钾转运蛋白TPK1-1及其编码基因与应用。

背景技术

钾离子通道是允许钾离子特异通透质膜的离子通道，而阻碍其他离子通透-特别是钠离子。这些通道一般由两部分组成：一部分是通道区，选择并允许钾离子通过，而阻碍钠离子；另一部分是门控开关，根据环境中的信号而开关通道。

现有技术对于钾离子通道基因的研究在模式植物拟南芥中比较广泛，例如，研究表明模式植物拟南芥中TPK/KCO通道包括两孔钾通道TPK(也称串联孔通道)和一个Kir-型通道。拟南芥基因组中具有5个这样的基因(TPK1-5，为串联孔钾，K⁺，命名为，AtTPKs)来编码两孔钾通道，植物两孔钾通道由信号分子如细胞内的H+与钙以及物理因素如温度与压力来调节(Hermann et al.,2005；Dunkel et al.,2010；Wendy et al.,2015)；在拟南芥中TPK1研究最清楚，它具有一个Ca²⁺结合的EF手型结构域，在拟南芥中TPK1，2，3，5定位在液泡膜上，而TPK4则定位在质膜上，液泡膜上通道与14-3-3蛋白(称为一般调控因子，GRFs)相互作用，表明在蛋白与蛋白相互作用水平的调节。GUS染色的结果表明，At TKPK1在有丝分裂旺盛的组织中也有表达，At TPK1在根及叶中有强烈的表达(Dunkel et al.,2008；Voelkeret al.,2010；Schonknecht et al.,2002)。

烟草是一种耗钾量很大的作物，烟叶钾含量是衡量烟叶品质的的重要指标，目前，对于烟草中钾离子通道的研究较少，烟草TPK的功能未知。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的是提供一种来自烟草的钾转运蛋白TPK1-1及其编码基因与应用。

为了实现本发明目的，本发明的技术方案如下：

本发明首先提供一种钾转运蛋白，获自烟草，命名为TPK1-1蛋白，是如下(a)或(b)

(a)其氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示；

(b)SEQ ID NO.1所示序列经过一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加且与植物钾离子吸收和转运调控相关的由(a)衍生的蛋白质。

上述(b)中的TPK1-1蛋白可人工合成，也可先合成其编码基因，再进行生物表达得到。上述(b)中的TPK1-1蛋白的编码基因可通过将SEQ ID NO.2所示的DNA序列中缺失一个或几个氨基酸残基的密码子，和/或进行一个或几个碱基对的错义突变而得到。

编码所述TPK1-1蛋白的基因(TPK1-1基因)也属于本发明的保护范围。

所述基因具体可为如下1)或2)或3)的DNA分子：

1)编码区如SEQ ID NO.2所示的DNA分子；

2)在严格条件下与1)限定的DNA序列杂交且编码与植物钾离子吸收和转运调控相关蛋白的DNA分子；

3)与1)或2)限定的DNA序列具有90％以上同源性且编码与植物钾离子吸收和转运调控相关蛋白的DNA分子。

上述严格条件可为用0.1×SSPE(或0.1×SSC)，0.1％SDS的溶液，在DNA或者RNA杂交实验中65℃下杂交并洗膜。

经研究发现，所述TPK1-1基因在促进钾离子吸收和转运方面发挥明显作用。

进一步地，本发明所述TPK1-1基因由以下步骤制备得到：

(1)设计PCR扩增引物，所述PCR扩增引物包括正向引物和反向引物：

正向引物：5’-ATGGAGAAAGAGCCTCTTCT-3’，

反向引物：5’-TCAATGGTGGTGGCTTTCCA-3’；

(2)提取烟草细胞总RNA，合成烟草细胞cDNA，以烟草细胞cDNA为模板进行TPK1-1基因的PCR扩增，得到目的片段，测序。

本发明的一个实施例中所述的PCR扩增的体系为20μL体系，包括Premix ExTaq 10μL，10μM的正向引物0.5μL，10μM的反向引物0.5μL，烟草细胞cDNA 1μL，ddH₂O 8μL。

优选的，所述的PCR扩增的反应程序为：95℃预变性5min；95℃变性30s；55℃退火30s；72℃延伸2min；35个循环。

优选的，所述的目的片段在测序之前还包括，将所述目的片段导入大肠杆菌DH5α感受态细胞中进行菌落PCR验证，验证为阳性克隆后进行测序。

优选的，所述菌落PCR验证使用的正向引物核苷酸序列为：5’-ATGGAGAAAGAGCCTCTTCT-3’，菌落PCR验证使用的反向引物核苷酸序列为：5’-TCAATGGTGGTGGCTTTCCA-3’。

优选的，所述菌落PCR验证的体系为10μL，包括Premix ExTaq5μL，10μM的正向引物0.5μL，10μM的反向引物0.5μL，ddH₂O 4μL。

进一步地，含有所述TPK1-1基因的重组表达载体、表达盒、转基因细胞系或重组菌等生物材料均属于本发明的保护范围。

所述重组表达载体可用现有的植物表达载体进行构建。所述重组表达载体例如可以是双元农杆菌载体和可用于植物微弹轰击的载体等。使用TPK1-1基因构建重组表达载体时，可在其转录起始核苷酸前加上任何一种增强型、组成型、组织特异型或诱导型启动子，它们可单独使用或与其它的植物启动子结合使用；此外，使用TPK1-1基因构建重组表达载体时，还可使用增强子，包括翻译增强子或转录增强子，这些增强子区域可以是ATG起始密码子或邻接区域起始密码子等，但必需与编码序列的阅读框相同，以保证整个序列的正确翻译。所述翻译控制信号和起始密码子的来源是广泛的，可以是天然的，也可以是合成的。翻译起始区域可以来自转录起始区域或结构基因。

携带有所述TPK1-1基因的重组表达载体可通过Ti质粒、Ri质粒、植物病毒载体、直接DNA转化、显微注射、电导、农杆菌介导等常规生物学方法转化到植物细胞或组织中。

进一步地，本发明还保护所述TPK1-1蛋白、所述TPK1-1基因和含有该基因的所述生物材料在促进植物或微生物钾离子吸收和转运中的应用。

所述植物包括烟草、拟南芥，所述微生物包括酵母菌。

例如，在本发明的具体实施方式中，将所述TPK1-1基因转入钾吸收缺陷型酵母突变株R5421后，表达所述TPK1-1基因的重组酵母重新具有了钾离子吸收和转运的功能；将烟草植株中所述TPK1-1基因进行超量表达后，可显著提高烟草植株的烟叶中钾离子的含量。

所述应用可选为，将前述烟草TPK1-1基因转入到烟草植株中，使TPK1-1基因超量表达以提高烟草植株的烟叶中钾离子的含量。

进一步地，本发明还保护所述TPK1-1蛋白、所述TPK1-1基因和含有该基因的所述生物材料在制备转基因植物中的应用。

进一步地，本发明还保护所述TPK1-1蛋白、所述TPK1-1基因和含有该基因的所述生物材料在植物育种中的应用。

所述育种的目的为促进植物钾离子吸收和转运，优选为提高烟草植株的烟叶中钾离子的含量。

所述植物为单子叶植物或双子叶植物。例如烟草或拟南芥TPK1-1突变株。

本发明的有益效果在于：

本发明首次提供了分离自烟草的TPK1-1基因，所述TPK1-1基因全长1287bp，经功能验证，本发明提供的TPK1-1基因转入钾吸收缺陷型酵母突变株R5421后，表达所述TPK1-1基因的重组酵母重新具有了钾离子吸收和转运的功能。因此，本发明提供的TPK1-1基因具有促进钾离子吸收和转运的功能。

附图说明

图1为本发明实施例2中酵母功能互补实验结果。其中，A为钾离子浓度为20uM的培养基上的生长情况，B为钾离子浓度为2mM的培养基上的生长情况；图中，1为转入TPK1-1基因的重组酵母，2为阴性对照(转入空载体)，3为阳性对照转入拟南芥TPK基因的酵母菌；从左到右依次为原液、10倍稀释液、100倍稀释液在培养基上的生长结果。

具体实施方式

下面将结合实施例对本发明的优选实施方式进行详细说明。需要理解的是以下实施例的给出仅是为了起到说明的目的，并不是用于对本发明的范围进行限制。本领域的技术人员在不背离本发明的宗旨和精神的情况下，可以对本发明进行各种修改和替换。

下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。

本发明的钾吸收缺陷型酵母突变株R5421记载于Maathuis F J M and Sanders D1996Mechanisms of potassium absorption by higher plantroots.Physiol.Plant.96,158–168。P416酵母游离型穿梭表达载体,TEF组成型启动子,CYC1终止子,CEN6ARSH4复制起点,酵母中筛选标记为URA3,大肠杆菌中筛选标记为Amp。记载于Functional Expression of aω-3Fatty Acid Desaturase Gene from Glycine maxin Saccharomyces cerevisiae。

实施例1 TPK1-1基因的获得

取0.5g烟草新鲜叶片，采用Trizol法提取烟草细胞的总RNA，然后采用TaKaRa公司的cDNA合成试剂盒合成cDNA，进一步采用Primer5.0软件设计并经过人工优化得到引物，所述引物包括正向引物和反向引物，所述的正向引物核苷酸序列为：5’-ATGGAGAAAGAGCCTCTTCT-3’；所述反向引物的核苷酸序列为5’-TCAATGGTGGTGGCTTTCCA-3’，以合成的cDNA为模板，进行PCR扩增。

PCR扩增体系为20μL体系，包括：Premix ExTaq 10μL，10μM的正向引物0.5μL，10μM的反向引物0.5μL，烟草细胞cDNA 1μL，ddH₂O8μL。

PCR扩增反应程序为：95℃预变性5min；95℃变性30s，55℃退火30s，72℃延伸2min，35个循环。

PCR扩增完成后，使用DNA纯化试剂盒进行目的片段的纯化，将纯化后的目的片段与pMD19-T载体16℃连接12h得到连接产物，将所述得到的连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞得到转化后的大肠杆菌DH5α，将所述的转化后的大肠杆菌DH5α接种于涂有氨苄青霉素的LB平板上进行筛选培养得到阳性克隆。在得到阳性克隆后，采用菌落PCR的方法来验证阳性克隆，所述菌落PCR的正向引物为：5’-ATGGAGAAAGAGCCTCTTCT-3’，反向引物为：5’-TCAATGGTGGTGGCTTTCCA-3’；所述菌落PCR的体系为10μL，包括Premix ExTaq 5μL，10μM的正向引物0.5μL，10μM的反向引物0.5μL，ddH₂O 4μL。然后从已验证的阳性克隆中随机选取3个独立的阳性克隆送到生物技术公司进行测序，本发明在测序后得到所述的TPK1-1基因的序列，如SEQ ID NO.2所示。

实施例2 TPK1-1基因在促进钾离子吸收和转运方面的作用

将连接有实施例1中所述的TPK1-1基因的T-载体与表达载体P416分别进行双酶切(酶切位点为：SmaⅠ和XhoⅠ)，回收目的基因和表达载体P416，然后用连接酶连接，将连接后的重组酵母表达载体转入大肠杆菌DH5α的感受态细胞，对转化后的大肠杆菌单菌落进行PCR扩增、酶切来验证是否构建成功，将构建成功的重组酵母表达载体转入到R5421中。

具体步骤如下：用接菌环取保存的R5421酵母菌划线于固体培养基YPDA上，28℃培养12h；挑取R5421酵母单菌落于Ep管中，加1mL YPDA培养液涡旋；将上述菌液全部转入装有YPDA培养液的三角瓶中，于30℃，250rpm摇菌至OD600＝1.2；按1:10转接，摇至OD600＝1.0～1.2；于28℃，1000rpm离心5min集菌，用1/2体积的灭菌超纯水重悬；于28℃，1000rpm离心5min集菌，吸干上清；依次加入下列成分(每5mL原始菌液)：

涡旋1min，使转化体系完全混匀；放于30℃的水浴中温育30min；再放入42℃的水浴中热击28min，冰上冷却10min；7000rpm离心15s，弃上清；用1mL的无菌水轻轻重悬沉淀；取200μL转化混合物铺于营养缺陷型平板上；30℃培养3天。提取酵母质粒并鉴定结果。

挑取鉴定过的酵母单菌落在营养缺陷平板上划线，30℃培养3天；用牙签在营养缺陷平板上蘸取少量菌体于2mL营养缺陷液中培养12h；8000rpm离心1min收集菌体；弃上清，用1mL双蒸水悬浮菌体，8000rpm离心1min；

弃上清，用1mL双蒸水重悬浮，调OD₆₀₀为0.8；将未稀释菌液及分别稀释10倍、100倍后的菌液，分别取5uL在钾离子浓度为20uM，2mM的培养基上，30℃培养3天观察结果。

实验结果如图1所示，在钾离子浓度为20uM、2mM培养基(AP培养基(1L)：磷酸546μL，L-精氨酸1.742g，1000×维生素溶液1mL，1000×微量元素溶液1mL，尿嘧啶0.77g，100×Ura 10mL，葡萄糖20g，琼脂粉15g)上，阴性对照组酵母菌(转入P416空载体)几乎不生长，转入烟草TPK1-1基因的重组酵母和阳性对照组(转入拟南芥TPK基因)的重组酵母菌均可以生长。随着稀释倍数的增加，转入烟草TPK1-1基因的重组酵母和阳性对照组的重组酵母菌仍然可以生长。

上述结果证明，本发明所述的TPK1-1基因具有钾吸收和转运功能。

虽然，上文中已经用一般性说明及具体实施方案对本发明作了详尽的描述，但在本发明基础上，可以对之作一些修改或改进，这对本领域技术人员而言是显而易见的。因此，在不偏离本发明精神的基础上所做的这些修改或改进，均属于本发明要求保护的范围。

序列表

<110> 贵州省烟草科学研究院

<120> 一种来自烟草的钾转运蛋白TPK1-1及其编码基因与应用

<130> KHP171117845.5

<160> 4

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 428

<212> PRT

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 1

Met Glu Lys Glu Pro Leu Leu Pro Tyr Val Ser Thr Arg Thr Pro Pro

1 5 10 15

His Pro Pro Ser Tyr Pro Ala Pro Ile Ser Leu Cys Pro Leu Pro Glu

20 25 30

Asp Asn Glu Ile Ser Ile Pro Pro Pro Leu Thr Pro Ser Glu Leu Lys

35 40 45

Glu Arg Leu Ile Phe Gly Thr Ser Glu Ala Ser Ala Thr Ala Leu Asp

50 55 60

Ala Phe Thr Phe Asn Asn Phe Thr Ser Pro Glu Leu Ser Ala Ser Ser

65 70 75 80

Ser Ser Ser Ala Gln Lys Ser Asn Leu Glu Asn Thr Asp Ile His Asn

85 90 95

Ser Trp Leu Leu Asp Pro Asn Tyr Pro Ser Trp Thr Lys Ser Asn Leu

100 105 110

His Arg Ser Lys Thr Ala Pro Ala Met Ala Thr Ile Asn Asp Ile Asp

115 120 125

His Ser Pro Asp Pro Lys Pro Pro Gln Phe Gly Lys Asn Thr Ile Val

130 135 140

Gly Gln Gly Val Val Leu Leu Ile Leu Tyr Leu Thr Leu Gly Val Gly

145 150 155 160

Ile Tyr Ser Leu Phe Arg Asp His Phe Lys Ala Thr Glu Thr His Pro

165 170 175

Val Val Asp Ala Leu Tyr Phe Cys Ile Val Thr Met Cys Thr Ile Gly

180 185 190

Tyr Gly Asp Ile Thr Pro Asp Ser Thr Pro Thr Lys Leu Phe Ser Ile

195 200 205

Leu Phe Val Leu Val Gly Phe Gly Phe Ile Asp Ile Leu Leu Thr Gly

210 215 220

Met Val Ser Tyr Val Leu Asp Leu Gln Glu Asn Tyr Leu Leu Arg Ser

225 230 235 240

Ile Lys Ser Gly Ser Val His Asp Ala Arg Ser Tyr Ile Ile Asp Val

245 250 255

Lys Lys Gly Arg Met Arg Ile Arg Met Lys Val Ala Leu Ala Leu Gly

260 265 270

Val Val Val Leu Cys Ile Gly Ile Gly Val Ala Val Met His Phe Val

275 280 285

Glu Lys Leu Gly Trp Leu Asp Ala Phe Tyr Leu Ser Val Met Ser Val

290 295 300

Thr Thr Val Gly Tyr Gly Asp Arg Ala Phe Asn Ser Met Ala Gly Arg

305 310 315 320

Ile Phe Ala Ser Ile Trp Leu Leu Val Ser Thr Leu Ala Val Ala Arg

325 330 335

Ala Phe Leu Tyr Leu Ala Glu Ala Arg Val Asp Lys Arg His Arg Lys

340 345 350

Met Ala Lys Trp Val Leu Asp Gln Asp Leu Thr Val Ser Gln Phe Leu

355 360 365

Ala Ala Asp Ile Asp Asn Asn Gly Phe Val Ser Lys Ala Glu Tyr Val

370 375 380

Ile Tyr Lys Leu Lys Glu Met Gly Lys Ile Ser Asp Lys Asp Val Met

385 390 395 400

Leu Ile Cys Lys Gln Phe Glu Arg Leu Asp Ala Gly Asn Cys Gly Arg

405 410 415

Ile Thr Leu Ala Asp Leu Met Glu Ser His His His

420 425

<210> 2

<211> 1287

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 2

atggagaaag agcctcttct cccttatgtc agcaccagaa caccacccca cccaccctca 60

tacccagccc ctatttccct ttgcccttta cctgaagaca atgaaatctc aatccctccc 120

cctcttaccc cttctgaact caaagaacgc cttatctttg gtacctctga agcttctgcc 180

actgctcttg acgctttcac ctttaacaat ttcacctctc ctgagctctc tgcttcttct 240

tcttcttctg cccaaaaatc caatcttgaa aacactgata ttcacaattc ttggttgctt 300

gacccaaatt atccttcttg gaccaagagt aatcttcata ggtccaaaac tgctccagct 360

atggctacta ttaatgatat tgaccattca ccagatccta agccacccca gtttggtaaa 420

aacacaattg taggacaagg tgttgtgctt ttgattcttt acttgactct tggtgtgggt 480

atttattctt tatttaggga tcattttaag gctactgaga ctcaccctgt tgttgatgct 540

ttgtattttt gcattgttac tatgtgtact attggttatg gtgatataac tcctgatagt 600

acacctacca agttgttttc catcttgttt gtgcttgtgg ggttcgggtt tatcgatatt 660

ttgcttactg ggatggttag ttatgtgctt gatttgcaag agaactatct gttgaggagt 720

attaaaagtg ggagcgtaca tgatgctagg tcttatatta ttgatgtgaa gaaggggaga 780

atgaggataa gaatgaaagt ggctctggca ttgggtgttg tggtcctgtg tattggaatt 840

ggggttgcgg ttatgcattt tgttgagaag cttgggtggt tggatgcatt ttatttgtca 900

gttatgtcgg ttaccactgt ggggtatggc gatagagcgt tcaattcaat ggccggtcgt 960

atctttgcat ccatttggtt gcttgtgtct acacttgcag ttgctcgagc ctttctttat 1020

ttggctgagg ccagagtaga taaacgtcat aggaaaatgg caaaatgggt gctcgatcag 1080

gatttgactg tttcacaatt tcttgctgcg gacattgata ataatggatt cgtgagtaaa 1140

gcagaatatg tgatatacaa actgaaggag atggggaaga tctcagacaa ggatgtaatg 1200

ctgatttgca aacagtttga acggctggac gctggcaact gtggaaggat tactcttgct 1260

gatctaatgg aaagccacca ccattga 1287

<210> 3

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 3

atggagaaag agcctcttct 20

<210> 4

<211> 20

<212> DNA

<213> 人工序列(Artificial Sequence)

<400> 4

tcaatggtgg tggctttcca 20

Claims

1.一种来自烟草的TPK1-1蛋白质在促进酵母菌钾离子吸收和转运中的应用；所述TPK1-1蛋白质的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。

2.一种编码来自烟草的蛋白质TPK1-1的基因在促进酵母菌钾离子吸收和转运中的应用，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示。

3.含有编码来自烟草的蛋白质TPK1-1的基因的生物材料在促进酵母菌钾离子吸收和转运中的应用，所述基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示，所述生物材料为重组表达载体、表达盒或重组菌。