CN109355374A - 前庭导水管扩大/Pendred综合征致病基因SLC26A4突变检测试剂盒 - Google Patents

前庭导水管扩大/Pendred综合征致病基因SLC26A4突变检测试剂盒 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种前庭导水管扩大/Pendred综合征致病基因SLC26A4突变检测试剂盒。试剂盒包括从待测样品中提取DNA的试剂、用于扩增样本DNA的PCR反应试剂、对PCR扩增产物进行测序的试剂;所述扩增样本DNA的PCR反应试剂包括PCR引物。使用本发明所述试剂盒检测患者是否存在SLC26A4基因c.368C>T突变,从而诊断前庭导水管扩大/Pendred综合征发生的原因,该试剂盒将有利于临床上开展前庭导水管扩大/Pendred综合征患者的SLC26A4突变筛查工作,为前庭导水管扩大/Pendred综合征患者的诊断提供依据。

Description

前庭导水管扩大/Pendred综合征致病基因SLC26A4突变检测 试剂盒
技术领域
本发明涉及基因检测领域,具体涉及在临床诊断前庭导水管扩大/Pendred综合征中应用的SLC26A4基因单个突变位点c.368C>T(p.P123L)分型检测试剂盒。
背景技术
1997年Everett首先报道Pendred综合征的致病基因为SLC26A4基因。Pendred综合征表现为先天性的感音神经性耳聋,耳蜗畸形(前庭导水管扩大或Mondini畸形)合并甲状腺肿大,它的遗传方式为常染色体隐性遗传。1999年Usami在6个单纯前庭导水管扩大家庭(无甲状腺肿,无Mondini畸形)内进行SLC26A4基因全序列筛查,发现有4名患者为SLC26A4基因纯合或复合杂合突变,认为SLC26A4基因同样可以导致单纯前庭导水管扩大。2001年Campbell在6个前庭导水管扩大家系和5个Mondini畸形家系中各发现5名和4名患者存在SLC26A4基因突变,认为SLC26A4基因是颞骨畸形最主要的致病原因。由此,学者普遍认为SLC26A4基因突变可以导致Pendred综合征、单纯前庭导水管扩大或者合并内耳畸形的前庭导水管扩大。前庭导水管扩大是最常见的内耳畸形。临床表现为学语前感音神经性或混合型耳聋,有时呈波动性或渐进性。其波动性常与头部外伤、感冒有关,可伴有或不伴有眩晕。
SLC26A4基因mRNA全长4930bp,含有21个外显子,开放阅读框起始于2号外显子,全长2343bp,编码780个氨基酸的蛋白质Pendrin,主要分布于甲状腺、内耳和肾脏。Pendrin相对分子量86000,具有11个跨膜区域,5个细胞外环,5个细胞内环,胞内氨基末端和胞外羧基末端。主要由疏水性氨基酸组成,属于离子转运体家族,研究表明其功能主要与碘/氯离子转运有关。Yang J等学者认为,SLC26A4基因突变可引起Pendrin蛋白功能障碍,氯离子转运障碍,导致内耳淋巴液流动异常,结果使前庭水管扩大,内淋巴管内压上升,内耳毛细胞受损和听神经萎缩,最终影响听力。还有研究表明Pendrin蛋白参与协调内耳的发育,在基因水平上,它均有连接同源异形盒与转录因子的功能。
SLC26A4基因目前发现的突变达120多种,遍布于各个外显子或其侧翼序列;其中错义突变占了绝大部分,此外还有剪接位点突变与框移突变。而且患者的基因型也多种多样,可以表现为一致的纯合状态,也可以是任意两种突变的组合,即表现为复合杂合状态,充分体现了突变类型的个体化,也提高了发现新的突变位点的难度。
由于SLC26A4基因突变种类多样,且在不同种族间呈现出明显的多样性,不同地域、种族的优势等位基因有所不同,所以发现不同地域人种各自所特有的突变位点显得尤为重要,但目前,尚缺乏此类针对特定人种的SLC26A4基因突变位点的报道。
发明内容
本发明的目的在于提供一种前庭导水管扩大/Pendred综合征致病基因SLC26A4突变检测试剂盒。
为达到上述目的,本发明采用了以下技术方案:
一种用于检测SLC26A4基因c.368C>T(p.P123L)突变的试剂盒,该试剂盒包括用于扩增DNA片段的PCR反应试剂,所述PCR反应试剂包括PCR引物,该PCR引物扩增的目标片段包含人SLC26A4基因(参考序列基因ID:5172)编码区第368位所对应的碱基。
优选的,所述试剂盒还包括用于从待测个体中提取PCR扩增所需的模板DNA的试剂。
优选的,所述试剂盒还包括用于对PCR扩增的目标片段进行测序的试剂。
优选的,所述PCR引物选自引物对P1,引物对P1的序列为:
SLC26A4-F1:5’-CCATTGTAAGTTGAGGACTTTCTG-3’;
SLC26A4-R1:5’-CCAACCTAATAGAGGTATAATGCAC-3’。
优选的,所述PCR引物选自引物对P2,引物对P2的序列为:
SLC26A4-F2:5’-ACTGTAACTTTGGTTTGTGAATG-3’;
SLC26A4-R2:5’-TCCCATTTCCCTGACAACAT-3’。
利用上述试剂盒检测SLC26A4基因c.368C>T(p.P123L)突变的方法,包括以下步骤:
1)采集待测个体的血液、体液或组织,然后提取DNA;
2)以步骤1)提取的DNA为模板,以上述PCR引物进行PCR反应,得到PCR反应产物;从PCR反应产物中分离PCR反应扩增的目标片段,并对该目标片段所包含的对应于人SLC26A4基因(参考序列基因ID:5172)编码区第368位的碱基进行分型鉴定。
优选的,所述分型鉴定采用对所述目标片段进行直接测序的方法,通过将测序结果与所述参考序列进行比对,确定待测个体对应于人SLC26A4基因(参考序列基因ID:5172)编码区第368位的基因型或等位基因类型。
优选的,根据比对确定的基因型包括野生纯合型C/C、突变杂合型C/T或纯合突变型T/T。
上述试剂盒在前庭导水管扩大/Pendred综合征病因学分析中的应用。使用该试剂盒并通过检测待测样本(来自于患者的SLC26A4基因片段)中对应于人SLC26A4基因(参考序列基因ID:5172)编码区第368位是否存在c.368C>T突变,从而判断该患者前庭导水管扩大/Pendred综合征发生的遗传性原因。其中,SLC26A4基因的c.368C>T突变引起位于Pendrin蛋白第二跨膜区第123位脯氨酸变成了亮氨酸(p.P123L)。
本发明的有益效果体现在:
本发明所提出的试剂盒可用于快速地检测SLC26A4基因特定突变位点,通过检测来自患者的DNA样本中是否存在SLC26A4基因c.368C>T突变,可以判断该患者的前庭导水管扩大/Pendred综合征发生原因,进而为临床诊断提供依据。
本发明将为在前庭导水管扩大/Pendred综合征患者中开展易感基因筛查提供方便确实的方法;同时,可以通过产前诊断筛查及新生儿SLC26A4基因突变的普遍筛查,降低前庭导水管扩大患儿的出生率,为社会和家庭减轻负担。
本发明针对420名前庭导水管扩大患者开展了SLC26A4基因的筛查,发现中国人特有的c.368C>T突变(同源氨基酸序列的进化研究结果表明,该突变位点具有高度保守性,100名听力正常人的筛查中未检测到该突变,说明这一突变与前庭导水管扩大相关),进而提供检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂盒。该试剂盒将有助于快速、高效地在更大范围的前庭导水管扩大/Pendred综合征患者人群中进行突变位点的检测,为前庭导水管扩大/Pendred综合征开展临床干预提供重要的指导。
附图说明
图1为SLC26A4基因编码区核苷酸与氨基酸的对照:突变位于SLC26A4基因第368位(C碱基),突变后的碱基序列使第123位(方框内)氨基酸由脯氨酸突变为亮氨酸。
图2为PCR反应过程示意图:示出了反应温度和时间,↓表示每个循环降低0.5℃。
图3A为SLC26A4基因测序结果图:杂合突变序列(患者序列,CT),箭头表示突变位点位置。
图3B为SLC26A4基因测序结果图:野生型序列(CC),箭头表示突变位点位置。
图4为突变位点处氨基酸物种保守性分析:突变位点为箭头所标识位置。
图5为扩增产物的电泳图谱:泳道1为Marker,泳道2为扩增的目标序列。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明作详细说明,以下实施例用于解释本发明,而非对本发明保护范围的限制。
SLC26A4基因突变相关的前庭导水管扩大/Pendred综合征以常染色体隐性遗传的方式传递。本发明应用候选基因筛查的方法对420例前庭导水管扩大患者和100例听力正常且无家族史的对照进行筛查,在一例前庭导水管扩大患者中发现SLC26A4基因存在c.368C>T杂合突变,SLC26A4基因突变与前庭导水管扩大共分离(且存在与已报道的另一突变位点形成复合杂合突变的情况),导致前庭导水管扩大。目前报道的SLC26A4基因突变有120余种,尚无c.368C>T突变的报道。
参见图1,上述突变(c.368C>T)使位于SLC26A4基因编码区的第368位碱基发生由C到T的转换(Pendrin蛋白第二跨膜区,野生型SLC26A4基因的标准序列可以参考,例如基因ID:5172),使得第123位脯氨酸变成了亮氨酸(p.P123L)。参见图4,该位点在各个物种之间是高度保守的。
检测上述突变(c.368C>T)可采用多种检测点突变的方法来进行,例如PCR(聚合酶链反应)-测序法、标记的SLC26A4基因DNA探针杂交法、限制性片段长度多态性方法或序列特异性引物的方法等。其中,采用PCR扩增-直接测序法来检测样本,包括下述步骤:
1)采集待测个体的样本,例如血液,提取基因组DNA;
2)以该DNA为模板,以针对SLC26A4基因编码区第368位碱基附近设计的PCR引物进行PCR反应,得到PCR扩增产物;
3)将得到的PCR扩增产物进行直接测序分析,将测序所得到的序列与SLC26A4正常基因的序列(基因ID:5172)进行比较,确定待测个体SLC26A4基因是否存在c.368C>T突变;
4)根据以上结果判断待测个体是否为SLC26A4基因突变c.368C>T导致的前庭导水管扩大/Pendred综合征。
在上述步骤2)中使用的PCR引物可以依据已知的引物核苷酸序列设计:通常为15~30个碱基,GC含量为45~50%左右,在适当的温度下与末端特异性结合。引物可以利用现有的计算机程序设计。
上述步骤2)所得到的PCR反应产物若使用杂交探针来检测,所用的杂交探针可以是与正常的SLC26A4核苷酸序列杂交,或与突变的核苷酸序列杂交,或与它们的互补序列杂交的探针。这些探针可以用放射性同位素、发色物质或荧光物质标记,尤其是可利用等位基因特异探针。
根据检测方法的不同,用于检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂盒中,除了包括PCR反应试剂,还包括检测PCR扩增产物的试剂,其具体选自测序检测试剂、限制性长度多态性检测试剂、序列特异性引物检测试剂、探针杂交检测试剂。
试剂盒容器内装有用以检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂成分,与之同时提供的还有经政府药物管理机构审核的、有关药品或生物制品的制造、使用及销售信息。对于PCR反应试剂,例如,可含有扩增引物、dNTPs、用于PCR反应的DNA聚合酶及其缓冲液等。
实例1
通过聋病门诊收集各种感音神经性耳聋患者,建立耳聋样本资源库。在患者自愿的前提下,签署知情同意书后,留取3~5mL血样,并建立门诊病历资料库,详细记录患者病情、家系中的发病情况以及联系方式。然后,应用试剂盒提取基因组DNA,定量后入库,-20℃保存,每份DNA样品均详细对应于登记的患者临床资料。然后,应用在线引物设计软件Primer3设计引物(包含SLC26A4整个编码区以及外显子侧翼序列),以基因组DNA为模板,PCR扩增目标片段。PCR扩增产物直接测序:测序引物与PCR扩增引物相同,正反向测序,应用ABI公司3730DNA测序仪。测序得到的序列与Genbank中的序列(基因ID:5172)比较确定SLC26A4基因突变位点。具体如下:
(一)待测血样提取与SLC26A4基因编码区的PCR扩增
1、待测对象血样DNA的制备
1.1研究对象
对就诊于西京医院(陕西省西安市)耳鼻咽喉头颈外科门诊的100例散发前庭导水管扩大患者和100名无家族史的听力正常对照按照下述方法进行SLC26A4基因的筛查。
对所有参加者详细调查其病史以及家族史,并对其进行体格检查,耳科检查包括耳镜检查、听力学评估。在签署知情同意书以后每人采集血样3~5mL(2014年1月)。
1.2基因组DNA提取
1.2.1实验前准备及重要注意事项
(1)所有离心操作均在室温下完成。
(2)血样样品的储存:已加入抗凝剂的血液样品可在2~8℃储存最多10天,对于某些实验例如Southern杂交等,需要得到完整全长的基因组DNA,请将血液样品在2~8℃储存不超过3天,此时基因组DNA的降解程度较轻。
1.2.2操作步骤
1)低速离心至血样分层,用移液枪去除上层血清,注意不要吸取或损坏中间层的黄膜层。
2)将全部血细胞转移至5mL离心管中,加入红细胞裂解液至总体积为4mL,上下颠倒混匀20次至沉淀充分分散。
3)6500g离心10min,弃去上清。
4)加入3mL红细胞裂解液,涡漩振荡15s,使沉淀充分分散。
5)6500g离心10min,弃去上清,将离心管倒扣在干净的吸水纸上,吸干水分。
6)配制DNA提取液与蛋白酶K的混合液,混合比例为DNA提取:蛋白酶K=100:1,混合后涡漩振荡15s充分混匀,按需配制,现配现用。
7)向样品中加入配制好DNA提取液与蛋白酶K的混合液1mL,立即充分涡漩振荡1min,直至溶液无团块。
8)将样品置于65℃水浴锅中温育15min,其间颠倒混匀3次,至样品颜色从红色变成淡绿色,说明蛋白完全消化。
9)向样品中加入2mL异丙醇,颠倒混匀10次至可见白色絮状沉淀。
10)取干净无菌的1.5mL离心管,做好标记,加入500μL预冷的75%乙醇。
11)用干净无菌的1mL移液器tip头挑取步骤9)中的白色絮状沉淀转移至步骤10)中准备好的75%乙醇中,颠倒混匀10次,缓慢倒掉上清,注意不要倒掉白色絮状沉淀。
11)再次加入500μL预冷的75%乙醇,颠倒混匀10次,缓慢倒掉上清,吸干。
12)打开管盖,室温干燥15min,至所有液体完全挥发。
13)加入380μL DNA溶解液,置于65℃水浴/金属浴中温育2h,同时进行振荡使DNA充分溶解。
14)分光光度计定量及检测纯度。
15)-20℃保存DNA。
2、SLC26A4基因编码区的PCR扩增
2.1引物序列(使用Primer3在线设计软件,参考序列基因ID:5172,序列合成后用于此检测,引物设计完成时间为2018年1月)
上游引物SLC26A4-F1:5’-CCATTGTAAGTTGAGGACTTTCTG-3’
下游引物SLC26A4-R1:5’-CCAACCTAATAGAGGTATAATGCAC-3’
使用该引物进行PCR扩增所获得的片段大小为272bp。
2.2PCR反应体系的建立(表1)
表1.SLC26A4基因的PCR反应体系
其中,PCR扩增使用天根生化科技有限公司PCR Mix(Taq酶、缓冲液、dNTP)。
反应条件:PCR反应在BIORAD My Cycle热循环仪上进行,反应过程(包括温度和时间)如图2所示:
1)94℃预变性4分钟;
2)94℃变性30秒,61℃(起始退火温度,后每个循环降低0.5℃)退火30秒,72℃延伸40秒,12个循环;
3)再94℃变性30秒,55℃退火30秒,72℃延伸40秒,30个循环;
4)反应结束后再72℃延伸5分钟,4℃保存。
PCR产物电泳流程:
1)配胶(1%琼脂糖):称取0.4g琼脂糖,悬浮于40mL×TAE中(500mL锥形瓶)。
2)溶胶:微波炉中高火加热至沸,持续沸腾数分钟,注意不要沸出,其间取出混匀。
3)凉胶:待胶完全溶解,从微波炉中取出,凉至60℃左右,加入1滴EB(约10μL,10mg/mL),摇匀。
4)铺胶:平板两端用胶布封严,把250ml胶液全部倒入平板,插入梳尺。
5)上胶:将平板放入已盛有电泳液(0.5×TAE,液面距胶面1至2mm)的电泳槽中,拔下梳尺。
6)加样:用移液器按规定格式加样,最后加入MarkerDL2000。
7)走胶:盖上电泳槽盖,检查正负级,开启电泳仪,调节电泳电压。
8)定量:当溴酚蓝走离加样孔1.5至2cm处,关闭电泳仪,小心取胶,放入摄相仪照相。经过电泳后,有6条带可见,MarkerDL2000(TaKaRa)片段长度分别是2000bp、1000bp、750bp、500bp、250bp、100bp。取5μL DL2000和5μL PCR产物进行电泳。根据PCR产物电泳后的条带位置与DL2000条带位置的比较,判断PCR产物的大小,参见图5。
(二)SLC26A4基因编码区PCR扩增产物的纯化和定量
PCR扩增产物的纯化(96孔板法):
1)PCR扩增产物电泳结束后,在长波365nm紫外透射仪下,用手术刀切下目的条带,切取的胶块质量应小于3g,将其放入对应的板孔号中。
2)4000rpm离心1min,加入500μL溶胶液,盖上封口膜,65℃水浴15min。
3)检查每孔胶块是否完全溶解,若没有完全溶解再次65℃水浴3min,揭开封口膜,用连续加液器每孔加入10μL混匀的磁珠,盖上硅胶垫,漩涡震荡30s,转入水平震荡仪600~800rpm震荡5min。
4)将96孔板卡入磁力架中,磁吸30s,将磁力架和样品正反轻微颠倒3次,再次静置磁吸1min。
5)弃废液,吸水纸上轻磕,用50~1200μL 8道电动移液器向每孔移入500μL洗液,盖上硅胶垫漩涡震荡30s,将96孔板卡入磁力架中,磁吸30s,将磁力架和样品正反轻微颠倒3次,再次静置磁吸1min。
6)弃废液,重复步骤5)。
7)弃废液,吸水纸上轻磕,倒离心至600rpm水平震荡5min。
8)离心至1000rpm,将96孔板卡入磁力架中,磁吸1min。
9)2μL样品加6μL 1.4X溴酚蓝混合后点入0.8%的鉴定胶中,marker DL2000取5μL,300V电泳11min。
10)将鉴定胶放入凝胶成像仪中采集图像,图像必须保证marker条带清晰。DL2000的总浓度是300ng/5μL,经过电泳后,有6条带可见,片段长度分别是2000bp,1000bp,750bp,500bp,250bp和100bp,每条带的含量为50ng。根据PCR产物电泳后的灰度值与DL2000的灰度值的比较判断PCR纯化产物的含量。
(三)纯化的SLC26A4基因编码区PCR扩增产物的直接测序
1、纯化的PCR扩增片段的纯度与用量要求
DNA纯度:OD260/OD280=1.6~2.0。
DNA浓度:PCR产物10ng/μL。
DNA用量与PCR产物长度对应关系如表2所示:
表2.DNA用量
PCR产物长度(bp) 测序加入量(ng)
100~200 1~3
200~500 3~10
500~1000 5~20
1000~2000 10~40
>2000 40~100
2、测序反应
1)测序反应所需试剂应为新鲜配制,需要经高压灭菌的试剂必须灭菌后方可使用。测序反应所需的器材(如96孔板、tip头等)同样应为洁净无菌的。
2)为了保证测序样本及反应试剂的新鲜,加样时应在冰上操作。
3)目前的反应体系为5μL,各种试剂加入量如表3所示。
表3.SLC26A4基因PCR扩增产物的测序反应体系
其中,BDT为美国应用生物系统公司(ABI)生产的一种用于测序反应的荧光染料。
4)样品放于BIORAD My Cycle热循环仪上,所作反应的过程见表4。
表4.SLC26A4基因PCR扩增产物的测序反应过程
5)反应完的样品要及时从PCR仪(热循环仪)上取下,短时间内要进行纯化的样品放置于4℃冰箱中,超过一天以上才能纯化的样品放置于-20℃冰箱冷冻。
3、测序反应物的纯化和测序
1)向每孔中加入20μL 80%乙醇,4000rpm离心30min;将样品板放在折好的纸巾上,在离心机中倒甩,倒甩时速率不能超过1000rpm;
2)在每孔中加入30μL 70%乙醇,4000rpm离心10min,倒甩;
3)重复步骤2)再两次;
4)将样品板放于干净的抽屉中,避光干燥30min;
5)加入5μL甲酰胺,封膜,离心后置于-20℃冰箱中;
6)上机前95℃变性5min,放置冰上2min,离心后上ABI 3730测序仪。
测序结果如图3A、图3B所示。
(四)检测耳聋相关基因SLC26A4突变位点(c.368C>T)试剂盒及其应用
1、试剂盒的组成
(1)扩增用引物:
上游引物SLC26A4-F1:5’-CCATTGTAAGTTGAGGACTTTCTG-3’
下游引物SLC26A4-R1:5’-CCAACCTAATAGAGGTATAATGCAC-3’
(2)PCR扩增用Taq酶5U/μL
(3)10×缓冲液(含15mL MgCl2)
(4)dNTP 2.5mM
(5)BDT(美国应用生物系统公司)
2、使用方法
主要包括如下步骤:
1)PCR扩增
利用软件Primer 3对SLC26A4基因的编码区设计的PCR引物进行PCR反应,反应条件见图2。
2)PCR产物纯化
PCR产物电泳,凝胶纯化及电泳定量。
3)测序反应及验证
以PCR引物作为测序引物进行测序反应,在BIORAD My Cycle热循环仪上进行测序反应。反应结束后,产物上样于ABI 3730DNA序列分析仪。将所得到的测序图谱进行分析,与NCBI网站检索到的SLC26A4基因标准序列(基因ID:5172)比较,以确定突变是否存在。
100例患者中,1例前庭导水管扩大患者的SLC26A4基因检测发现患者为c368C>T杂合突变。对100名听力正常者的筛查中未发现c.368C>T突变者。
实例2
扩增引物(设计完成时间2018年1月)如下,其他同实例1:
上游引物SLC26A4-F2:-ACTGTAACTTTGGTTTGTGAATG-3’;
下游引物SLC26A4-R2:5’-TCCCATTTCCCTGACAACAT-3’。
<110> 中国人民解放军第四军医大学
<120> 前庭导水管扩大/Pendred综合征致病基因SLC26A4突变检测试剂盒
<160> 4
<210> 1
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 1
ccattgtaag ttgaggactt tctg 24
<210> 2
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 2
ccaacctaat agaggtataa tgcac 25
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 3
actgtaactt tggtttgtga atg 23
<210> 4
<211>20
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 4
tcccatttcc ctgacaacat 20

Claims (9)

1.一种用于检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂盒,其特征在于:该试剂盒包括用于扩增DNA片段的PCR反应试剂,所述PCR反应试剂包括PCR引物,该PCR引物扩增的目标片段包含SLC26A4基因编码区第368位所对应的碱基。
2.根据权利要求1所述一种用于检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括用于从待测个体中提取PCR扩增所需的模板DNA的试剂。
3.根据权利要求1所述一种用于检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂盒,其特征在于:所述试剂盒还包括用于对PCR扩增的目标片段进行测序的试剂。
4.根据权利要求1所述一种用于检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂盒,其特征在于:所述PCR引物选自引物对P1,引物对P1的序列为:
SLC26A4-F1:5’-CCATTGTAAGTTGAGGACTTTCTG-3’;
SLC26A4-R1:5’-CCAACCTAATAGAGGTATAATGCAC-3’。
5.根据权利要求1所述一种用于检测SLC26A4基因c.368C>T突变的试剂盒,其特征在于:所述PCR引物选自引物对P2,引物对P2的序列为:
SLC26A4-F2:5’-ACTGTAACTTTGGTTTGTGAATG-3’;
SLC26A4-R2:5’-TCCCATTTCCCTGACAACAT-3’。
6.一种检测SLC26A4基因c.368C>T突变的方法,其特征在于:包括以下步骤:
1)采集待测个体的血液、体液或组织,然后提取DNA;
2)以步骤1)提取的DNA为模板,以PCR引物进行PCR反应,得到PCR反应产物;从PCR反应产物中分离PCR反应扩增的目标片段,并对该目标片段所包含的对应于SLC26A4基因编码区第368位的碱基进行分型鉴定。
7.根据权利要求6所述一种检测SLC26A4基因c.368C>T突变的方法,其特征在于:所述分型鉴定采用对所述目标片段进行直接测序的方法,通过将测序结果与参考序列进行比对,确定待测个体对应于SLC26A4基因编码区第368位的基因型或等位基因类型。
8.根据权利要求6所述一种检测SLC26A4基因c.368C>T突变的方法,其特征在于:根据比对确定的基因型包括野生纯合型C/C、突变杂合型C/T或纯合突变型T/T。
9.一种如权利要求1所述的试剂盒在前庭导水管扩大/Pendred综合征病因学分析中的应用。
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