CN109266755A

CN109266755A - 一种用于检测鼠源性成分的试剂盒和方法

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Publication number: CN109266755A
Application number: CN201710582319.3A
Authority: CN
Inventors: 尚柯; 唐卓; 梁恒兴; 陈浩东; 段庆梓; 杜凤; 王巍; 董娟; 吴文林; 黄春燕; 张彪; 张玉
Original assignee: Chengdu Food And Drug Inspection Institute; Chengdu Institute of Biology of CAS
Current assignee: Chengdu Food And Drug Inspection Institute; Chengdu Institute of Biology of CAS
Priority date: 2017-07-17
Filing date: 2017-07-17
Publication date: 2019-01-25
Anticipated expiration: 2037-07-17
Also published as: CN109266755B

Abstract

本发明涉及包含SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.2所示引物对和SEQ ID NO.3所示探针的用于鼠源性成分检测的试剂盒，还涉及用于检测鼠源性成分的方法。本发明试剂盒及方法可以准确检测肉及肉制品中的鼠源性成分，检测快速、准确，成本低，特异性好，灵敏度高，有广泛的应用前景。

Description

一种用于检测鼠源性成分的试剂盒和方法

技术领域

本发明属于分子生物学领域，具体涉及一种用于检测鼠源性成分的试剂盒和方法。

背景技术

近年来,食品安全问题日益突出，其中肉制品掺假现象十分严重，成为人们日益关注的焦点。一些不法商贩将相对廉价的肉类原料掺入到价格昂贵的肉制品中进行销售以谋取不当利益，从而严重侵犯了消费者的合法权益。更为严重的是，市面上出现的用来源不明的鼠肉冒充牛羊肉或掺杂到肉制品中出售，不仅影响肉类产品市场的正常运行，而且威胁消费者的身体健康和生命安全。老鼠多生活于潮湿脏乱的环境中，携带多种细菌病毒。死鼠肉极易腐烂而滋生细菌，一些死鼠体内还含有老鼠药等强力毒药成分。因此，一旦老鼠肉被混掺入食用肉类及肉制品，食用后会造成人体中毒，轻则恶心、呕吐，重则可能导致死亡。

目前，肉类掺假常见的检测技术有ELISA法、显微判定法、电子鼻法、质谱法等，但都存在灵敏度低、周期长、不能检测熟肉等缺点而未被广泛使用。PCR技术具有灵敏度高、操作简便、抗干扰能力强等优势，越来越多被用于动物源性成分检测。但至今尚没有鼠源性成分检测的国家标准或者行业标准，使得消费者乃至检验机构无标可依，无法可循，难以快速有效的进行检测。

公开号为CN 101768640 A的专利报道了一种鉴定食品中鼠源性成分的试剂盒，其仅能检测实验大鼠、小鼠及野生小鼠，无法检测其它常见鼠类，例如海狸鼠。

周如华(周如华等，实时荧光定量PCR检测羊肉制品中鼠源性成分[J]，中国法医学杂志，2014，6:534-537)报道了一种检测羊肉制品中鼠源性成分的方法，仅能检测小家鼠、褐家鼠、黄胸鼠，无法检测其它常见鼠类，而且检出限仅为1％。

发明内容

本发明的目的在于提供一种用于检测鼠源性成分的试剂盒和方法。

本发明提供了SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的引物对、SEQ ID NO.3 所示的探针。

本发明还提供了SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的引物对和SEQ ID NO.3所示的探针在制备检测鼠源性成分的试剂中的用途。

其中，所述试剂是检测肉及肉制品中鼠源性成分的试剂；所述鼠源性成分为海狸鼠、大鼠、小鼠、豚鼠、竹鼠和/或白腹鼠源性成分。

其中，它包括SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的引物对和SEQ ID NO.3 所示的探针。

其中，它还包括实时荧光PCR预混液。

其中，它还包括Taq DNA聚合酶、MgCl₂、dNTP和反应缓冲液。

其中，所述试剂盒的组成为：

PCR反应总体积为20μL时，

其余为无菌双蒸水；

其中，模板DNA的浓度为1ng/μL～100ng/μL；引物的浓度为10μmol/L；探针的浓度为10μmol/L。

本发明还提供了上述试剂盒在用于检测肉及肉制品中鼠源性成分中的用途。

本发明还提供了一种检测鼠源性成分的方法，它包括如下步骤：

(1)提取样本DNA：取待检样品，提取其中的DNA；

(2)基因扩增：用上述试剂盒对待检样品中的DNA进行扩增；

(3)结果检测：对DNA扩增结果进行检测。

其中，所述待检组织为肉及肉制品。

本发明的“鼠”包含海狸鼠、大鼠、小鼠、豚鼠、竹鼠和/或白腹鼠。

综上，本发明试剂盒及方法可以准确检测鼠源性成分，特别适用于肉及肉制品中的鼠源性成分检测，一次性可以检测多种常见鼠类，例如大鼠、小鼠、海狸鼠、豚鼠、竹鼠和/或白腹鼠等；检测快速、准确，成本低，特异性好，灵敏度高，有广泛的应用前景。

显然，根据本发明的上述内容，按照本领域的普通技术知识和惯用手段，在不脱离本发明上述基本技术思想前提下，还可以做出其它多种形式的修改、替换或变更。

以下通过实施例形式的具体实施方式，对本发明的上述内容再作进一步的详细说明。但不应将此理解为本发明上述主题的范围仅限于以下的实例。凡基于本发明上述内容所实现的技术均属于本发明的范围。

附图说明

图1鼠源性成分的特异性验证图。

图2鼠源性成分的适用性验证图。

图3鼠源性成分DNA浓度与Ct值关系图。

图4鼠源性成分灵敏度验证图。

图5鼠源性检出限验证图。

具体实施方式

下面以实施例作进一步说明，但本发明不局限于这些实施例。

本发明所用的实验试剂与仪器，均可通过商业途径购买得到。

具体试剂如下：

(1)CTAB裂解液：2％(w/v)CTAB，1.4mol/L NaCl，20mmol/L EDTA， 100mmol/LTris，用10％盐酸调节pH至8.0，121℃高压灭菌20min，备用。

(2)蛋白酶K：20mg/mL。

(3)苯酚：氯仿：异戊醇(体积比25：24：1)。

(4)异丙醇。

(5)70％乙醇。

(6)实时荧光PCR预混液(以2×预混液为例)：PCR缓冲液(终浓度1×)，氯化镁(终浓度2.5mmol/L)，dNTP(终浓度0.2mmol/L)，Taq DNA聚合酶(终浓度1U)。

(7)TE缓冲液(Tris-HCl、EDTA缓冲液)：10mmol/L Tris-HCl(pH 8.0)， 1mmol/LEDTA(pH 8.0)。

具体仪器如下：

(1)电子天平(Sartorius CPA225D)，感量0.01g。

(2)组织捣碎器(Retsch MM400)。

(3)恒温水浴锅(精宏XMTD-8222)。

(4)离心机(Eppendorf Centrifuge 5810R)，最大离心力≥12 000g。

(5)微量移液器(Eppendorf Research plus)，量程分别为0.1μL～2.5μL、 0.5μL～10μL、10μL～100μL、20μL～200μL、100μL～1000μL。

(6)pH计(Mettler Toledo FE20)。

(7)核酸蛋白分析仪(Implen P330)。

(8)实时荧光PCR仪(Bio-Rad CFX96)。

实施例1 本发明检测鼠源性成分的试剂盒和检测方法

一、本发明试剂盒成分

包含SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的引物对和SEQ ID NO.3所示的探针；如表1所示：

表1 本发明引物及探针

注：F为5’端引物，R为3’端引物，P为探针。

二、采用本发明试剂盒检测鼠源性成分

1、DNA提取

将样品均质后称取0.1g～0.2g，置于2mL离心管中，加入600μL CTAB 裂解液和20μL蛋白酶K，振荡混匀，65℃孵育1h～2h，期间每隔10min振荡混匀；加入500μL的苯酚：氯仿：异戊醇(25：24：1)，充分振荡混匀，12000g离心5min；小心吸取上清液至洁净的1.5mL离心管内，加入等体积的异丙醇，振荡混匀，12 000g离心5min；弃去上清液，500μL 70％乙醇洗涤2次， 12 000g离心5min，弃上清液，晾干；加入50μL～100μL TE缓冲液或无菌双蒸水，溶解DNA，-20℃保存备用。

也可用等效商品化试剂盒提取DNA。

2、DNA浓度和纯度的测定

使用核酸蛋白分析仪检测DNA浓度及纯度，DNA浓度在1ng/μL～100 ng/μL之间，A260/A280值在1.7～2.0之间时，适宜于本方法。

3、实时荧光PCR扩增

鼠源性成分PCR扩增采用20μL的反应体系：包括PCR反应预混液(2 ×)10μL，5’端、3’端引物(10μmol/L)各0.2μL，探针(10μmol/L) 0.1μL，DNA模板(1ng/μL～100ng/μL)1μL，用无菌双蒸水补足20μL。每个样品设置两个平行反应体系。

PCR扩增反应程序为：95℃5min；35个循环反应(95℃15s，58℃ 1min，收集荧光)。

也可用等效的商品化试剂盒进行扩增。

4、实验对照

实验过程分别设阳性对照、阴性对照、空白对照。用含有鼠源性成分的样品作为阳性对照，用鼠源性成分的样品作为阴性对照，用等体积的无菌双蒸水代替模板DNA作为空白对照。

5、结果判断与表述：

5.1质量控制

以下条件有一条不满足时，实验视为无效：

(a)空白对照：无FAM荧光信号检出；

(b)阴性对照：无FAM荧光信号检出；

(c)阳性对照：有FAM荧光信号检出，且出现典型的扩增曲线，Ct值≤30.0。

5.2结果判定

(a)如有FAM荧光信号检出，Ct值≤30.0，且出现典型的扩增曲线，则判定为被检样品阳性；

(b)如Ct值≥35.0或无Ct值，则判定为被检样品阴性；

(c)如有FAM荧光信号检出，且30.0＜Ct值＜35.0，则重新进行实验。如再次扩增后Ct值仍＜35.0，且有典型的扩增曲线，则判定被检样品阳性；否则判定被检样品阴性。

5.3结果表述

结果为阳性者，表述为“检出大鼠、小鼠、海狸鼠、豚鼠、竹鼠和/或白腹鼠源性成分”。

结果为阴性者，表述为“未检出大鼠、小鼠、海狸鼠、豚鼠、竹鼠和/或白腹鼠源性成分”。

以下通过试验例具体说明本发明的有益效果：

试验例1 本发明试剂盒及方法的特异性检测

分别以小鼠、海狸鼠、竹鼠、豚鼠、大鼠、猫、鸡、鸭、鹅、鹌鹑、水牛、黄牛、牦牛、马、狐狸、貂、貉、兔、猪、山羊、绵羊、驴、鹿共计23 种物种的基因组DNA为模板，用实施例1的试剂盒及方法，进行实时荧光PCR 扩增。

扩增结束后，通过观察对不同模板DNA的扩增曲线及Ct值来判定其特异性。检测结果为2个平行样品的平均Ct值。若有FAM荧光信号检出，Ct 值≤30.0，且出现典型的扩增曲线，则判定为被检样品阳性。若有FAM荧光信号检出，且30.0＜Ct值＜35.0，则重新进行实验。如再次扩增后Ct值仍＜ 35.0，且有典型的扩增曲线，则判定被检样品阳性；否则判定被检样品阴性。若Ct值≥35.0或无Ct值，判定被检样品为阴性。

实验结果见图1。结果显示，鼠源性检测体系中，23种动物源性成分检测仅有五种源性样品有Ct值，有典型扩增曲线且平均Ct值分别为：小鼠源性20.89，竹鼠源性22.86，海狸鼠源性17.51，大鼠源性21.60，豚鼠源性23.55，均小于30，判定为含有鼠源性成分，其它物种均未检出，特异性验证结果理想，实验结果均能达到检测要求。。

可见，本发明方法和试剂盒的检测结果与样本的实际情况一致，说明本发明方法和试剂盒特异性好，可以准确检测鼠源性成分。

试验例2 本发明试剂盒及方法的适用性检测

对不同产地、不同基质的肉及肉制品(样品信息见表2和图2)进行DNA 提取，按照本发明试剂盒及方法对其进行检测，确定方法的适用性。

表2 样品具体信息、测序结果及实时荧光判定结果

样品编号	样品名称	产地	测序比对结果	判定结果	实时荧光结果
						SS 01	海狸鼠肉	河南安阳	JF318985.1	海狸鼠	鼠
SS 02	小鼠肉	四川成都	AP014941.1	小鼠	鼠
						SS 03	豚鼠肉	四川成都	KP100656.1	豚鼠	鼠
SS 04	大鼠肉	四川成都	KT279110.1	大鼠	鼠
						SS 05	竹鼠肉	广西柳州	KC789518.1	竹鼠	鼠
SS 06	山鼠肉干	福建南平	EF053026.1	白腹鼠	鼠
						SS 07	海狸鼠肉(压)	河南安阳	JF318985.1	海狸鼠	鼠
SS 08	海狸鼠肉(煮)	河南安阳	JF318985.1	海狸鼠	鼠

注：(压)为高温高压处理样品；(煮)为高温高压后煮30分钟样品。

结果显示，鼠源性检测的8个样品在3个浓度水平上Ct值均小于30，且扩增曲线理想，判定为含有鼠源性成分，判定结果与实际样本测序结果相符合，适用性试验结果符合预期，满足检测要求。

可见，本发明方法和试剂盒的检测结果与样本的实际情况一致，说明本发明方法和试剂盒适用性好，可以准确检测不同基质肉类的鼠源性成分。

试验例3 本发明试剂盒及方法的灵敏度检测

对海狸鼠源性DNA进行倍比稀释(模板DNA浓度设定：10^-4ng/μL、10^-3 ng/μL、10^- ²ng/μL、10^-1ng/μL、10⁰ng/μL、10¹ng/μL)，用实施例1的试剂盒及方法，进行扩增反应。确定模板DNA浓度范围与Ct值线性关系，同时根据扩增效率计算公式，计算检测方法的扩增效率，以确定模板DNA的灵敏度。

扩增效率计算公式为：

当灵敏度达到或低于1ng/μL，线性范围内R²>0.99，扩增效率在80％～120％之间时，可满足检测要求(结果见表3和图4)。

表3 不同浓度模板的Ct值

模板浓度	10<sup>-4</sup>ng/μL	10<sup>-3</sup>ng/μL	10<sup>-2</sup>ng/μL	10<sup>-1</sup>ng/μL	10<sup>0</sup>ng/μL	10<sup>1</sup>ng/μL
							Ct值	34.68	31.22	27.51	24.21	20.82	17.32

结果显示，当模板DNA浓度在10¹ng/μL至10^-4ng/μL间时，模板DNA 浓度和获得的Ct值之间线性关系好(相关系数99.9％)，扩增效率为96.3％。当阈值设为30个循环时，DNA检测的灵敏度为10^-2ng/μL。

可见，本发明方法在线性范围均有良好的线性关系，R²>0.99；在线性范围内，扩增效率均在80％～120％之间，扩增效率满足检测要求；灵敏度可达到10^-2ng/μL，满足检测要求。

试验例4 本发明试剂盒及方法的检出限检测

分别将鼠源性样品以1％、0.1％、0.01％三个水平掺入鸡肉样品中，充分混匀后，提取混合样品基因组DNA，作为检测模板，用实施例1的试剂盒及方法，进行检出限实验(结果见表4和图5)。

表4 混合肉样检出限验证及检测结果

试验结果显示，鼠源性实时荧光PCR检测体系能准确检测0.1％鼠肉，而在掺入0.01％鼠肉试验时，相应Ct值接近甚至超过30个循环，对其判定会出现偏差，为了统一检测方法的检出限，规定本方法的检出限为0.1％。

综上，本发明试剂盒及方法可以准确检测海狸鼠、大鼠、小鼠、豚鼠、竹鼠和/或白腹鼠源性成分，检测快速、准确，成本低，特异性好，灵敏度高，有广泛的应用前景。

SEQUENCE LISTING

<110> 成都市食品药品检验研究院中国科学院成都生物研究所

<120> 一种用于检测鼠源性成分的试剂盒和方法

<130> GY392-17P1278

<160> 3

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 38

<212> DNA

<213> 鼠源性检测的5'端引物

<400> 1

ctccacgaga caggatcaaa caacccatca ggactaaa 38

<210> 2

<211> 30

<212> DNA

<213> 鼠源性检测的3'端引物

<400> 2

tcattctggt ttgatgtggg gtggggtatt 30

<210> 3

<211> 35

<212> DNA

<213> 猪源性检测的探针序列

<400> 3

tagtgggtta gcaggtgtgt agttgtctgg gtctc 35

Claims

1.SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的引物对。

2.SEQ ID NO.3所示的探针。

3.SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的引物对和SEQ ID NO.3所示探针在制备检测鼠源性成分的试剂中的用途。

4.根据权利要求3所示的用途，其特征在于：所述试剂是检测肉及肉制品中鼠源性成分的试剂；所述鼠源性成分为海狸鼠、大鼠、小鼠、豚鼠、竹鼠和/或白腹鼠源性成分。

5.一种用于检测鼠源性成分的试剂盒，其特征在于：它包括SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2所示的引物对和SEQ ID NO.3所示的探针。

6.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：它还包括实时荧光PCR预混液。

7.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：它还包括Taq DNA聚合酶、MgCl₂、dNTP和反应缓冲液。

8.根据权利要求5所述的试剂盒，其特征在于：所述试剂盒的组成为：

PCR反应总体积为20μL时，

9.权利要求5～权利要求8所述的任意一项试剂盒在用于检测肉及肉制品中鼠源性成分中的用途。

10.一种检测鼠源性成分的方法，其特征在于：它包括如下步骤：

(1)提取样本DNA：取待检组织，提取其中的DNA；

(2)基因扩增：用权利要求5～权利要求8任意一项所述的试剂盒对待检样本中的DNA进行扩增；

(3)结果检测：对DNA扩增结果进行检测；

其中，所述待检组织为肉及肉制品。