CN108753968A - 一种用于检测宫颈癌pax1基因甲基化的试剂盒 - Google Patents
一种用于检测宫颈癌pax1基因甲基化的试剂盒 Download PDFInfo
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Abstract
本发明提供了一种用于检测宫颈癌PAX1基因甲基化的试剂盒,其内设有裂解试剂;裂解试剂包括:裂解修饰液,其包括亚硫酸氢铵、亚硫酸铵、盐酸胍、氢氧化钠和对苯二酚;结合增强剂,其包括异丙醇和氯化钠。本发明可将核酸的提取和扩增检测在全封闭环境下一体化整合,高效简便,结果准确。
Description
技术领域
本发明涉及一种用于检测宫颈癌PAX1基因甲基化的试剂盒。
背景技术
以PCR技术为基础的核酸诊断分析方法是分子诊断中的核心技术。将核酸自动提取过程与PCR扩增检测过程相互集成,构建一体化的核酸提取与扩增检测系统,对于进一步提高核酸诊断分析效率,实现整个核酸诊断分析过程的自动化具有重要的现实意义。
中国专利申请201610266982.8公开了一种基于硼掺杂石墨烯量子点的宫颈癌细胞检测试剂盒,属于生物检测领域。所述宫颈癌细胞检测试剂盒包括试剂A、B和C,试剂A为硼掺杂石墨烯量子点溶液,试剂B为硝酸铈溶液,试剂C为腺苷三磷酸溶液。
中国专利申请201510608996.9公开了一种宫颈癌预后检测方法,依次包括以下步骤:组织芯片的处理、结果评判、判定等步骤,该方法通过免疫组化和定量PCR方法检查SETD4表达水平,发现相对正常组织,宫颈炎症组织SETD4轻度升高,肿瘤组织中显著升高,SETD4的表达水平在可用来预测宫颈癌预后,并可作为预测宫颈癌治疗效果的预后指标。
中国专利申请201710064368.8公开了一种宫颈癌的筛查试剂盒,它包括任选的用于检测血液中SPARCL1表达水平的试剂。本发明还公开了检测血液中SPARCL1表达水平的试剂在制备宫颈癌筛查用试剂中的用途。
上述技术方案的缺陷在于:
检测过程繁琐,多个环节需要增加手工操作;核酸提取、核酸亚硫酸转化、核酸甲基化检测分为三部分操作,不能同时进行,步骤繁多,操作复杂;核酸提取和核酸亚硫酸转化不能和核酸甲基化检测试剂一体化,检测过程开放,容易引起外部环境与检测试剂交叉污染;检测时间长。
因此,如何提供一种核酸提取、亚硫酸转化和甲基化检测一体化进行、操作快捷的试剂盒成为了业界需要解决的问题。
发明内容
针对现有技术的缺点,本发明的目的是提供一种用于检测宫颈癌PAX1基因甲基化的试剂盒,其结构简单,高效准确,核酸提取、亚硫酸转化和甲基化检测一体化进行,检测过程封闭、可有效避免外部环境与检测试剂交叉污染。
为了实现上述目的,本发明提供了一种用于检测宫颈癌PAX1基因甲基化的试剂盒,试剂盒内设有裂解试剂;裂解试剂包括:
裂解修饰液,裂解修饰液包括亚硫酸氢铵、亚硫酸铵、盐酸胍、氢氧化钠和对苯二酚;
结合增强剂,结合增强剂包括异丙醇和氯化钠。
本发明中,各试剂的溶剂均为水。
裂解修饰液配方为:
亚硫酸氢铵3mol/L、亚硫酸铵2mol/L、盐酸胍2.5mol/L、
氢氧化钠0.5mol/L、对苯二酚0.5mmol/L。
结合增强剂配方为:异丙醇70%(体积分数)、氯化钠0.3mol/L。
样本在裂解修饰液中会被裂解,释放出核酸;核酸会被转化修饰,未甲基化的胞嘧啶转变为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不受影响。
本发明解决了核酸提取和核酸扩增检测不能一体化、核酸提取和核酸扩增检测过程操作繁杂的技术问题,高效简便,结果准确。
根据本发明另一具体实施方式,试剂盒包括:
提取仓,提取仓包括按照样本流向依次分布的裂解机构、洗涤机构和洗脱机构;裂解机构内设有裂解试剂和磁性物质;洗涤机构包括第一油槽和洗涤槽,洗涤槽内设有洗涤液;第一油槽位于裂解机构和洗涤槽之间;洗脱机构包括第二油槽和洗脱槽,洗脱槽内设有洗脱液;第二油槽位于洗涤槽和洗脱槽之间;第一油槽和第二油槽内均设有油相;相邻两槽之间设有可活动的隔断;裂解机构与第一油槽之间设有可活动的隔断;
驱动机构,驱动机构包括可按照样本流向滑移的滑块;滑块上设有磁铁;
扩增管,扩增管位于洗脱机构下游;扩增管与洗脱槽连通。
本方案中,提取仓可以由弹性材料制成。
提取仓中,槽的数量根据所承载试剂或固体物质所需而定,容量可不尽相同。
磁铁位于滑块中心,其为永磁铁或电磁铁;磁性物质可为磁珠。
驱动机构进一步包括用于驱动滑块运行的动力部件,动力部件可为电机或气缸。
样本裂解后产生的核酸附着在磁性物质上;滑块运动时,通过磁铁带动磁性物质运动,从而带动核酸运动。
各槽沿直线分布;在使用过程中,提取仓可以水平放置、竖直放置或者倾斜放置。
当滑块经过隔断时,驱动机构会使隔断失效,隔断两侧的槽相通;部分隔断永久失效,部分隔断在滑块经过后再度恢复。
洗涤液配方为:异丙醇70%(体积分数)、氯化钠0.3mol/L。
洗脱液配方为:Tris-HCl(pH8.8)50mmol/L、EDTA 0.3mol/L;Tris-HCl为缓冲液。
根据本发明另一具体实施方式,裂解机构包括按照样本流向依次分布的修饰槽、结合槽和磁性槽;裂解机构内,相邻两槽之间设有可活动的隔断;磁性槽与第一油槽之间设有可活动的隔断。
根据本发明另一具体实施方式,裂解机构进一步包括位于修饰槽上游的样本槽,样本位于样本槽中;裂解修饰液和结合增强剂分别设于修饰槽和结合槽内;磁性物质设于磁性槽内。
本方案中,样本槽上设有用于添加样本的进料口,进料口上设有样本盖,用于样本添加后封闭样本槽。
根据本发明另一具体实施方式,提取仓进一步包括缓冲液槽,缓冲液槽位于洗脱槽下游,且与洗脱槽之间设有可活动的隔断;缓冲液槽位于扩增管上游,且与扩增管相通。
本方案中,缓冲液槽与扩增管通过连接头相连,连接头上设有出料口;样本通过出料口从缓冲液槽流入扩增管。
此外,也可以不设扩增管,而在缓冲液槽内进行扩增反应;此时,无需设置连接头,在缓冲液槽上直接设置出料口,用于扩增反应后样本的流出。
根据本发明另一具体实施方式,第一油槽和洗涤槽之间设有可上下移动的密封片;第二油槽和洗脱槽之间设有可上下移动的密封片。
根据本发明另一具体实施方式,裂解机构内,相邻两槽之间设有可脱落的固定卡片;磁性槽与第一油槽之间设有可脱落的固定卡片;洗涤槽和第二油槽之间设有可脱落的固定卡片;洗脱槽与缓冲液槽之间设有可脱落的固定卡片。
根据本发明另一具体实施方式,提取仓进一步包括弹性密封膜,弹性密封膜位于密封片与固定卡片下方,且被密封片与固定卡片压紧。
根据本发明另一具体实施方式,滑块上设有用于顶起密封片或使固定卡片脱落的楔形块。
本方案中,试剂盒进一步包括上盖、支架和底盖;支架固定在提取仓上,二者通过粘接、胶结、热粘结等方式结合;上盖和底盖可拆卸地连接,二者围成一个空腔,提取仓和支架位于空腔内;支架上设有上盖安装孔,用于与上盖连接。
提取仓底部采用封膜密封,封膜可封住装于提取仓中各个槽内的液体或固体;封膜与提取仓可以通过粘接、胶结、热粘结等方式结合;弹性密封膜位于封膜上方,其在固定卡片及密封片的压紧作用下,与封膜贴合,对各槽之间的液体或固体形成隔离。
固定卡片用于试剂封堵,防止相邻两槽中的试剂相混,其数量根据反应要求而定;固定卡片两侧分别通过弱支撑连接上盖底部;弱支撑用于连接固定卡片和上盖,其很容易被切断。
支架上设有用于限制密封片自由度的限位槽,限位槽与密封片对应设置;密封片用于防止相邻两槽中的试剂相混;上盖内侧顶部设有弹簧安装孔,其与密封片对应设置;密封片包括用于压紧弹性密封膜的突起和用于与弹簧配合的销轴,突起位于密封片底部,销轴位于密封片顶部;弹簧一侧安装于弹簧安装孔内,另一侧套在销轴上。
楔形块的数目为两个,分别位于磁铁两侧;滑块位于底盖外侧。
底盖中部设有用于磁铁移动的驱动槽,两侧设有用于楔形块移动的滑道;滑块运动时,提取仓位于两个楔形块之间;楔形块可切断弱支撑,使固定卡片脱落;或者通过其顶部的斜面顶起密封片。
上盖上设有挤出孔,挤出孔位于缓冲液槽上方;挤出孔上连有可开合的压板,压板向下移动时可挤压洗脱槽和缓冲液槽。
根据本发明另一具体实施方式,相邻两槽之间设有可旋转的密封轴,密封轴上设有通道。
根据本发明另一具体实施方式,相邻两槽之间设有与密封轴配合的密封槽,密封槽与密封轴对应设置。
本方案中,试剂盒进一步包括顶盖,顶盖可拆卸地连接提取仓顶端,并封闭提取仓各槽;提取仓各槽的大小和形状可按需定制,数量根据反应需求而定。
密封轴上设有旋钮,旋钮位于通道上方;顶盖设有若干旋转孔,其与密封轴对应设置;旋钮穿过对应的旋转孔。
顶盖进一步包括两个活塞孔,分别位于洗脱槽和缓冲液槽上方;每一个活塞孔均有一个活塞穿过。
根据本发明另一具体实施方式,扩增管内设有用于实现核酸增量扩增的扩增试剂,扩增试剂为PCR平台试剂或恒温扩增试剂。
本方案中,扩增试剂配方为:
Tris-HCl(pH8.8)70mmol/L、KCl 65mmol/L、
(NH4)2SO4 25mmol/L、MgCl2 6mmol/L、PEG8000 3%(质量分数)、海藻糖10%(质量分数)、
目的上游引物F1 10μmol/L、目的下游引物R1 10μmol/L、
目的探针P1 3μmol/L、内对照上游引物F2 10μmol/L、
内对照下游引物R2 10μmol/L、内对照探针P2 3μmol/L。
其中,引物探针序列如下(F1、R1、R1为PAX1目的检测基因甲基化的引物探针;F2、R2、R2为检测Beta-actin基因的的内对照引物探针):
F1:5'-TATTTTGGGTTTGGGGGTC-3';
R1:5'-CCCGAAAACCGAAAACCGC-3';
P1:5'FAM-CCAACCGCGAACTAAAAACGCG-3'BHQ1;
F2:5'-GTAGTGGAGGAGGTTTAGTAAGT-3';
R2:5'HEX-ACCACCCAACACATAACAATAACAAACACA-3'BHQ1;
P2:5'-CAATAAAACCTACTCCTCCCTTAA-3'。
本发明中,扩增试剂原料各组分混合在一起,呈液态;经过冻干工艺处理后得到干粉状的扩增试剂。
根据本发明另一具体实施方式,扩增试剂原料通过冻干工艺处理,得到扩增试剂:冻干工艺包括:
步骤S1:将所述扩增试剂原料在-58℃环境下放置5h;
步骤S2:将所述扩增试剂原料在-40℃环境下放置8h;
步骤S3:将所述扩增试剂原料在-20℃环境下放置6h;
步骤S4:将所述扩增试剂原料在20℃环境下放置5h。
本方案中,扩增试剂需保存于2-8℃环境中。
本发明的操作原理如下(磁铁为电磁铁):
1、将样本加入样本槽,封闭进料口;同时,滑块置于样本槽下方;此时,磁铁尚未通电,不具有磁性;2、滑块向扩增管方向移动,隔断失效,液体流入修饰槽;样本被裂解,释放出核酸;核酸同时被转化修饰,未甲基化的胞嘧啶转变为尿嘧啶,甲基化的胞嘧啶不受影响;3、滑块继续移动,隔断失效,液体流入结合槽;4、滑块继续移动,隔断失效,液体流入磁性槽;5、磁性物质均匀扩散到结合增强剂中,核酸跟磁性物质结合在一起;6、磁铁通电,开始具有磁性;滑块继续移动,隔断失效,磁性物质流入第一油槽;7、滑块继续移动,隔断暂时失效,磁性物质流入洗涤槽;当滑块位于洗涤槽下方时,第一油槽与洗涤槽之间的隔断恢复,继续隔开第一油槽与洗涤槽;8、磁铁断电,磁性物质均匀扩散到洗涤液中;磁性物质上的杂质被洗掉,并转移到洗涤液中;9、磁铁通电,滑块继续移动,隔断失效,磁性物质流入第二油槽;10、滑块继续移动,隔断暂时失效,磁性物质流入洗脱槽;当滑块位于洗脱槽下方时,第二油槽与洗脱槽之间的隔断恢复,继续隔开第二油槽与洗脱槽;11、磁铁断电,磁性物质均匀扩散到洗脱液中;磁性物质上的核酸被洗掉,并转移到洗脱液中;12、磁铁通电,滑块继续移动,隔断失效,液体流入缓冲液槽;滑块往回运动,停在洗脱槽下方,使磁性物质保留在洗脱槽中;核酸留在缓冲液槽中;13、在外界挤压下,缓冲液槽内的液体流入扩增管,并在扩增管内进行核酸扩增。
与现有技术相比,本发明具备如下有益效果:
本发明可将核酸提取和核酸扩增检测无缝联合,仅需加入样本,1小时内即可得到结果;整个过程无需再增加操作步骤,且均在全封闭环境下进行,可有效避免外部环境与检测试剂交叉污染;裂解试剂、洗涤液、洗脱液分别固定在单独的液体储存腔,且用油相将液体两两隔开,液体之间不会相互直接接触,避免交叉污染;扩增管也是单独设置,更有利于进行扩增反应;核酸提取、亚硫酸转化和甲基化检测一体化设置,全封闭反应,人手操作时间仅需3分钟。
下面结合附图对本发明作进一步的详细说明。
附图说明
图1是实施例1的试剂盒的爆炸图;
图2是实施例1的试剂盒的剖视图;
图3是实施例1的支架的结构示意图;
图4是实施例1的上盖的结构示意图;
图5是实施例1的滑块的结构示意图;
图6是实施例1的密封片的结构示意图;
图7是实施例1的试剂盒的整体结构示意图;
图8是实施例2的试剂盒的爆炸图;
图9是实施例2的试剂盒的剖视图;
图10是实施例2的提取仓的结构示意图;
图11是实施例2的顶盖的结构示意图;
图12是实施例2的滑块的结构示意图;
图13是实施例2的密封轴的结构示意图;
图14是实施例2的试剂盒的整体结构示意图;
图15是实施例1的灵敏度检测结果图;
图16是实施例1的阴性样本检测结果图。
具体实施方式
实施例1
本实施例提供了一种用于检测宫颈癌PAX1基因甲基化的试剂盒,如图1-7所示,其包括提取仓1、裂解机构2、洗涤机构3、洗脱机构4、驱动机构5、扩增管6、上盖7、支架8和底盖9。
其中,提取仓1由弹性材料制成,其包括按照样本流向依次分布的裂解机构2、洗涤机构3、洗脱机构4、缓冲液槽101和弹性密封膜104;支架8固定在提取仓1上,二者通过黏结剂粘合;上盖7和底盖9可拆卸地连接,二者围成一个空腔,提取仓1和支架8位于空腔内;支架8上设有上盖安装孔801,用于与上盖7连接。
裂解机构2内设有裂解试剂和磁性物质;磁性物质为磁珠。
洗涤机构3包括第一油槽301和洗涤槽302,洗涤槽302内设有洗涤液;第一油槽301位于裂解机构2和洗涤槽302之间。
洗脱机构4包括第二油槽401和洗脱槽402,洗脱槽402内设有洗脱液;第二油槽401位于洗涤槽302和洗脱槽402之间;第一油槽301和第二油槽401内均设有油相;相邻两槽之间设有可活动的隔断;裂解机构2与第一油槽301之间设有可活动的隔断。
裂解机构2包括按照样本流向依次分布的样本槽201、修饰槽202、结合槽203和磁性槽204;裂解机构2内,相邻两槽之间设有可活动的隔断;磁性槽204与第一油槽301之间设有可活动的隔断;样本槽201上设有用于添加样本的进料口205,进料口205上设有样本盖206,用于样本添加后封闭样本槽201。
裂解试剂包括裂解修饰液和结合增强剂,分别设于修饰槽202和结合槽203内;磁性物质设于磁性槽204内。
驱动机构5包括可按照样本流向滑移的滑块501和用于驱动滑块501运行的动力部件(图中未示),动力部件为电机;滑块501上设有磁铁502;磁铁502位于滑块501中心,其为电磁铁。
扩增管6位于洗脱机构4下游;扩增管6与洗脱槽402连通;扩增管内设有用于实现核酸增量扩增的扩增试剂,扩增试剂为PCR平台试剂。
本实施例中,扩增试剂原料各组分混合在一起,呈液态;经过冻干工艺处理后得到干粉状的扩增试剂。
缓冲液槽101位于洗脱槽402下游,且与洗脱槽402之间设有可活动的隔断;缓冲液槽101位于扩增管6上游,且与扩增管6相通;缓冲液槽101与扩增管6通过连接头102相连,连接头102上设有出料口103;样本通过出料口103从缓冲液槽101流入扩增管6;上盖7上设有挤出孔701,挤出孔701位于缓冲液槽101上方;挤出孔701上连有可开合的压板702,压板702向下移动时可挤压洗脱槽402和缓冲液槽101。
第一油槽301和洗涤槽302之间设有可上下移动的密封片11;第二油槽401和洗脱槽402之间设有可上下移动的密封片11;支架8上设有用于限制密封片11自由度的限位槽802,限位槽802与密封片11对应设置;密封片11用于防止相邻两槽中的试剂相混;上盖7内侧顶部设有弹簧安装孔703,其与密封片11对应设置;密封片11包括用于压紧弹性密封膜104的突起1101和用于与弹簧13配合的销轴1102,突起1101位于密封片11底部,销轴1102位于密封片11顶部;弹簧13一侧安装于弹簧安装孔703内,另一侧套在销轴1102上。
裂解机构2内,相邻两槽之间设有可脱落的固定卡片12;磁性槽204与第一油槽301之间设有可脱落的固定卡片12;洗涤槽302和第二油槽401之间设有可脱落的固定卡片12;洗脱槽402与缓冲液槽101之间设有可脱落的固定卡片12;固定卡片12用于试剂封堵,防止相邻两槽中的试剂相混;固定卡片12两侧分别通过弱支撑1201连接上盖7底部。
弹性密封膜104位于密封片11与固定卡片12下方,且被密封片11与固定卡片12压紧。
滑块501上设有用于顶起密封片11或使固定卡片12脱落的楔形块503;楔形块503的数目为两个,分别位于磁铁502两侧;滑块501位于底盖9外侧;底盖9中部设有用于磁铁502移动的驱动槽901,两侧设有用于楔形块503移动的滑道902;滑块501运动时,提取仓1位于两个楔形块503之间;楔形块503可切断弱支撑1201,使固定卡片12脱落;或者通过其顶部的斜面顶起密封片11。
本实施例中,提取仓1底部采用封膜105密封,封膜105可封住装于提取仓1中各个槽内的液体或固体;封膜105与提取仓1通过黏结剂粘合;弹性密封膜104位于封膜105上方,其在固定卡片12及密封片11的压紧作用下,与封膜105贴合,对各槽之间的液体或固体形成隔离。
本实施例的使用方法如下:
1、取下样本盖206,向样本槽201加入样本,盖上样本盖206;
2、在动力部件驱动下,滑块501往扩增管6方向移动;当滑块501经过固定卡片12时,楔形块503切断固定卡片12两侧的弱支撑1201;固定卡片12脱落,密封作用失效;被固定卡片12顶紧密封的弹性密封膜104在自身弹性作用下弹起,且永不恢复密封状态;此时形成通路,位于通路两侧槽内的液体连通;
3、样本流入修饰槽202,磁性物质携带样本信息;在磁铁502作用下,携带样本信息的磁性物质随滑块501继续移动;经过固定卡片12时,重复步骤2;
4、当滑块501经过密封片11时,密封片11在楔形块503经过时弹起,被密封片11顶紧密封的弹性密封膜104在自身弹性作用下弹起;磁性物质随滑块501通过;在楔形块503通过后,密封片11在弹簧13作用下再次压紧弹性密封膜104,重新阻断其两侧液体;
5、当磁性物质保留在洗脱槽402中,而核酸留在缓冲液槽101中时,压板702向下移动,挤压洗脱槽402和缓冲液槽101;缓冲液槽101内的液体流入扩增管6,并在扩增管6内进行PCR扩增。
裂解修饰液配方为:
亚硫酸氢铵3mol/L、亚硫酸铵2mol/L、盐酸胍2.5mol/L、
氢氧化钠0.5mol/L、对苯二酚0.5mmol/L。
结合增强剂配方为:异丙醇70%(体积分数)、氯化钠0.3mol/L。
洗涤液配方为:异丙醇70%(体积分数)、氯化钠0.3mol/L。
洗脱液配方为:Tris-HCl(pH8.8)50mmol/L、EDTA 0.3mol/L。
扩增试剂配方为:
Tris-HCl(pH8.8)70mmol/L、KCl 65mmol/L、
(NH4)2SO4 25mmol/L、MgCl2 6mmol/L、PEG8000 3%(质量分数)、海藻糖10%(质量分数)、
目的上游引物F1 10μmol/L、目的下游引物R1 10μmol/L、
目的探针P1 3μmol/L、内对照上游引物F2 10μmol/L、
内对照下游引物R2 10μmol/L、内对照探针P2 3μmol/L。
其中,引物探针序列如下(F1、R1、R1为PAX1目的检测基因甲基化的引物探针;F2、R2、R2为检测Beta-actin基因的的内对照引物探针):
F1:5'-TATTTTGGGTTTGGGGGTC-3';
R1:5'-CCCGAAAACCGAAAACCGC-3';
P1:5'FAM-CCAACCGCGAACTAAAAACGCG-3'BHQ1;
F2:5'-GTAGTGGAGGAGGTTTAGTAAGT-3';
R2:5'HEX-ACCACCCAACACATAACAATAACAAACACA-3'BHQ1;
P2:5'-CAATAAAACCTACTCCTCCCTTAA-3'。
本发明中,扩增试剂原料各组分混合在一起,呈液态;经过冻干工艺处理后得到干粉状的扩增试剂。
根据本发明另一具体实施方式,扩增试剂原料通过冻干工艺处理,得到扩增试剂:冻干工艺包括:
步骤S1:将所述扩增试剂原料在-58℃环境下放置5h;
步骤S2:将所述扩增试剂原料在-40℃环境下放置8h;
步骤S3:将所述扩增试剂原料在-20℃环境下放置6h;
步骤S4:将所述扩增试剂原料在20℃环境下放置5h。
本方案中,扩增试剂需保存于2-8℃环境中。
为验证裂解试剂的效果,进行灵敏度检测:
以PAX1基因完全甲基化的细胞为样本,分别取10、102、103、104个细胞进行提取、修饰、检测;其FAM通道结果如图15所示:10个细胞的检测结果是阴性,102、103、104个细胞的检测结果都是PAX1甲基化阳性;裂解试剂盒灵敏度可至102个细胞。
同时,还需进行阴性样本检测:
以PAX1基因完全没有甲基化的细胞为样本,取104个细胞,进行提取、修饰、检测;其结果如图16所示,为PAX1甲基化阴性。
实施例2
本实施例提供了一种用于检测宫颈癌PAX1基因甲基化的试剂盒,如图8-14所示,其包括提取仓21、裂解机构22、洗涤机构23、洗脱机构24、驱动机构25、扩增管26和顶盖27。
其中,提取仓21包括按照样本流向依次分布的裂解机构22、洗涤机构23、洗脱机构24和缓冲液槽2101。
裂解机构22内设有裂解试剂和磁性物质;磁性物质为磁珠。
洗涤机构23包括第一油槽2301和洗涤槽2302,洗涤槽2302内设有洗涤液;第一油槽2301位于裂解机构22和洗涤槽2302之间。
洗脱机构24包括第二油槽2401和洗脱槽2402,洗脱槽2402内设有洗脱液;第二油槽2401位于洗涤槽2302和洗脱槽2402之间;第一油槽2301和第二油槽2401内均设有油相;相邻两槽之间设有可活动的隔断;裂解机构22与第一油槽2301之间设有可活动的隔断。
裂解机构22包括按照样本流向依次分布的样本槽2201、修饰槽2202、结合槽2203和磁性槽2204;裂解机构22内,相邻两槽之间设有可活动的隔断;磁性槽2204与第一油槽2301之间设有可活动的隔断;样本槽2201上设有用于添加样本的进料口2205,进料口2205上设有样本盖2206,用于样本添加后封闭样本槽2201。
裂解试剂包括裂解修饰液和结合增强剂,分别设于修饰槽2202和结合槽2203内;磁性物质设于磁性槽2204内。
驱动机构25包括可按照样本流向滑移的滑块2501和用于驱动滑块2501运行的动力部件(图中未示),动力部件为电机;滑块2501上设有磁铁2502;磁铁2502位于滑块2501中心,其为电磁铁。
扩增管26位于洗脱机构24下游;扩增管26与洗脱槽2402连通;扩增管内设有用于实现核酸增量扩增的扩增试剂,扩增试剂为恒温扩增试剂。
缓冲液槽2101位于洗脱槽2402下游,且与洗脱槽2402之间设有可活动的隔断;缓冲液槽2101位于扩增管26上游,且与扩增管26相通;缓冲液槽2101与扩增管26通过连接头2102相连,连接头2102上设有出料口2103;样本通过出料口2103从缓冲液槽2101流入扩增管26。
本实施例中,相邻两槽之间设有可旋转的密封轴28,密封轴28上设有通道2801和旋钮2802,旋钮2802位于通道2801上方;顶盖27可拆卸地连接提取仓21顶端,并封闭提取仓21各槽;相邻两槽之间设有与密封轴28配合的密封槽29,密封槽29与密封轴28对应设置。
顶盖27设有若干旋转孔2701和两个活塞孔2702,其与密封轴28对应设置;旋钮2802穿过对应的旋转孔2701;两个活塞孔2702分别位于洗脱槽2402和缓冲液槽2101上方;每一个活塞孔2702均有一个活塞2703穿过。
本实施例的使用方法如下:
1、取下样本盖2206,加入样本,盖上样本盖2206;此时,通道2801与其两侧槽之间的连线垂直,防止两槽内的物质流通,起到隔离的作用;
2、在动力部件驱动下,滑块2501往扩增管26方向移动;当滑块2501经过密封轴28时,密封轴28旋转90°,通道2801将相邻两槽连通;
3、样本经通道2801流入修饰槽2202,磁性物质携带样本信息;在磁铁2502作用下,携带样本信息的磁性物质随滑块2501继续移动;经过密封轴28时,重复步骤2;第一油槽2301和洗涤槽2302之间的密封轴28以及第二油槽2401和洗脱槽2402之间的密封轴28在滑块2501经过后,旋转90°,重新封闭两侧槽;其余密封轴28不再旋转;
4、当磁性物质保留在洗脱槽2402中,而核酸留在缓冲液槽2101中时,向下推动活塞2703,挤压缓冲液槽2101;缓冲液槽2101内的液体流入扩增管26,并在扩增管26内进行PCR扩增。
实施例3
本实施例与实施例1的区别在于:不设扩增管,而在缓冲液槽内进行扩增反应;此时,无需设置连接头,在缓冲液槽上直接设置出料口,用于扩增反应后样本的流出。
实施例4
本实施例与实施例2的区别在于:提取仓竖直放置。
实施例5
本实施例与实施例1的区别在于:缓冲液槽和扩增管之间设有第三油槽,第三油槽内设有油相;缓冲液槽与第三油槽之间设有可脱落的固定卡片,扩增管与第三油槽之间设有可脱落的固定卡片。
虽然本发明以较佳实施例揭露如上,但并非用以限定本发明实施的范围。任何本领域的普通技术人员,在不脱离本发明的发明范围内,当可作些许的改进,即凡是依照本发明所做的同等改进,应为本发明的范围所涵盖。
Claims (10)
1.一种用于检测宫颈癌PAX1基因甲基化的试剂盒,其中,所述试剂盒内设有裂解试剂;所述裂解试剂包括:
裂解修饰液,所述裂解修饰液包括亚硫酸氢铵、亚硫酸铵、盐酸胍、氢氧化钠和对苯二酚;
结合增强剂,所述结合增强剂包括异丙醇和氯化钠。
2.如权利要求1所述的试剂盒,其中,所述裂解修饰液中,各组分浓度为:
亚硫酸氢铵3mol/L、亚硫酸铵2mol/L、盐酸胍2.5mol/L、
氢氧化钠0.5mol/L、对苯二酚0.5mmol/L。
3.如权利要求1所述的试剂盒,其中,所述结合增强剂中,各组分浓度为:
异丙醇70%(体积分数)、氯化钠0.3mol/L。
4.如权利要求1所述的试剂盒,其中,所述试剂盒包括:
提取仓,所述提取仓包括按照样本流向依次分布的裂解机构、洗涤机构和洗脱机构;所述裂解机构内设有所述裂解试剂和磁性物质;所述洗涤机构包括第一油槽和洗涤槽,所述洗涤槽内设有洗涤液;所述第一油槽位于所述裂解机构和所述洗涤槽之间;所述洗脱机构包括第二油槽和洗脱槽,所述洗脱槽内设有洗脱液;所述第二油槽位于所述洗涤槽和所述洗脱槽之间;所述第一油槽和所述第二油槽内均设有油相;相邻两槽之间设有可活动的隔断;所述裂解机构与所述第一油槽之间设有可活动的隔断;
驱动机构,所述驱动机构包括可按照样本流向滑移的滑块;所述滑块上设有磁铁;
扩增管,所述扩增管位于所述洗脱机构下游;所述扩增管与所述洗脱槽连通。
5.如权利要求4所述的试剂盒,其中,所述裂解机构包括按照样本流向依次分布的修饰槽、结合槽和磁性槽;所述裂解机构内,相邻两槽之间设有可活动的隔断;所述磁性槽与所述第一油槽之间设有可活动的隔断。
6.如权利要求5所述的试剂盒,其中,所述裂解机构进一步包括位于所述修饰槽上游的样本槽,样本位于所述样本槽中;所述裂解修饰液和所述结合增强剂分别设于所述修饰槽和所述结合槽内;所述磁性物质设于所述磁性槽内。
7.如权利要求6所述的试剂盒,其中,所述提取仓进一步包括缓冲液槽,所述缓冲液槽位于所述洗脱槽下游,且与所述洗脱槽之间设有可活动的隔断;所述缓冲液槽位于所述扩增管上游,且与所述扩增管相通。
8.如权利要求7所述的试剂盒,其中,所述第一油槽和所述洗涤槽之间设有可上下移动的密封片;所述第二油槽和所述洗脱槽之间设有可上下移动的密封片;所述裂解机构内,相邻两槽之间设有可脱落的固定卡片;所述磁性槽与所述第一油槽之间设有可脱落的固定卡片;所述洗涤槽和所述第二油槽之间设有可脱落的固定卡片;所述洗脱槽与所述缓冲液槽之间设有可脱落的固定卡片;所述提取仓进一步包括弹性密封膜,所述弹性密封膜位于所述密封片与所述固定卡片下方,且被所述密封片与所述固定卡片压紧;所述滑块上设有用于顶起所述密封片或使所述固定卡片脱落的楔形块。
9.如权利要求7所述的试剂盒,其中,相邻两槽之间设有可旋转的密封轴,所述密封轴上设有通道;相邻两槽之间设有与所述密封轴配合的密封槽,所述密封槽与所述密封轴对应设置;所述扩增管内设有用于实现核酸增量扩增的扩增试剂。
10.如权利要求1-9之一所述的试剂盒,其中,所述扩增试剂原料通过冻干工艺处理,得到所述扩增试剂:所述冻干工艺包括:
步骤S1:将所述扩增试剂原料在-58℃环境下放置5h;
步骤S2:将所述扩增试剂原料在-40℃环境下放置8h;
步骤S3:将所述扩增试剂原料在-20℃环境下放置6h;
步骤S4:将所述扩增试剂原料在20℃环境下放置5h。
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Cited By (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111269963A (zh) * | 2019-12-31 | 2020-06-12 | 广东凯普生物科技股份有限公司 | 一步法核酸提取转化试剂盒及其使用方法 |
CN112322736A (zh) * | 2020-11-17 | 2021-02-05 | 圣湘生物科技股份有限公司 | 一种用于检测肝癌的试剂组合,试剂盒及其用途 |
CN112538423A (zh) * | 2020-12-23 | 2021-03-23 | 广州和实生物技术有限公司 | 一种整体式的核酸提取检测装置及其使用方法 |
CN112680340A (zh) * | 2020-12-23 | 2021-04-20 | 广州和实生物技术有限公司 | 一种全自动的核酸检测装置及其检测方法 |
CN113201542A (zh) * | 2021-04-29 | 2021-08-03 | 天津医科大学 | 单链向导rna在制备治疗宫颈癌等靶向药物上的用途 |
Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101285096A (zh) * | 2008-06-03 | 2008-10-15 | 中国人民解放军第二军医大学 | 一种快速检测dna甲基化的方法 |
CN103627784A (zh) * | 2012-08-28 | 2014-03-12 | 日祥医事管理顾问股份有限公司 | 一种癌症筛检的检验套组 |
CN103966323A (zh) * | 2014-04-25 | 2014-08-06 | 广州迪澳生物科技有限公司 | 可常温运输的干粉化恒温扩增检测试剂及其制备方法 |
CN104673621A (zh) * | 2013-11-29 | 2015-06-03 | 精工爱普生株式会社 | 核酸扩增反应用容器、核酸扩增反应用筒及核酸扩增反应用筒试剂盒 |
CN106636064A (zh) * | 2016-12-09 | 2017-05-10 | 洛阳吉恩特生物科技有限公司 | 一种全血基因组dna高通量板式提取试剂盒及提取方法 |
CN106893777A (zh) * | 2017-03-02 | 2017-06-27 | 武汉艾米森生命科技有限公司 | 用于检测结直肠癌相关基因多位点甲基化试剂盒及应用 |
CN107151700A (zh) * | 2017-06-08 | 2017-09-12 | 杭州遂真生物技术有限公司 | 一种基因检测方法及基因检测试剂盒和基因检测设备 |
WO2017198863A1 (en) * | 2016-05-20 | 2017-11-23 | Roche Diagnostics Gmbh | Cell surface marker-depletion in a sample processing device |
CN107828633A (zh) * | 2017-12-14 | 2018-03-23 | 苏州天隆生物科技有限公司 | 一种核酸提取和检测的试剂装置、试剂及方法 |
-
2018
- 2018-06-12 CN CN201810599476.XA patent/CN108753968B/zh active Active
Patent Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN101285096A (zh) * | 2008-06-03 | 2008-10-15 | 中国人民解放军第二军医大学 | 一种快速检测dna甲基化的方法 |
CN103627784A (zh) * | 2012-08-28 | 2014-03-12 | 日祥医事管理顾问股份有限公司 | 一种癌症筛检的检验套组 |
CN104673621A (zh) * | 2013-11-29 | 2015-06-03 | 精工爱普生株式会社 | 核酸扩增反应用容器、核酸扩增反应用筒及核酸扩增反应用筒试剂盒 |
CN103966323A (zh) * | 2014-04-25 | 2014-08-06 | 广州迪澳生物科技有限公司 | 可常温运输的干粉化恒温扩增检测试剂及其制备方法 |
WO2017198863A1 (en) * | 2016-05-20 | 2017-11-23 | Roche Diagnostics Gmbh | Cell surface marker-depletion in a sample processing device |
CN106636064A (zh) * | 2016-12-09 | 2017-05-10 | 洛阳吉恩特生物科技有限公司 | 一种全血基因组dna高通量板式提取试剂盒及提取方法 |
CN106893777A (zh) * | 2017-03-02 | 2017-06-27 | 武汉艾米森生命科技有限公司 | 用于检测结直肠癌相关基因多位点甲基化试剂盒及应用 |
CN107151700A (zh) * | 2017-06-08 | 2017-09-12 | 杭州遂真生物技术有限公司 | 一种基因检测方法及基因检测试剂盒和基因检测设备 |
CN107828633A (zh) * | 2017-12-14 | 2018-03-23 | 苏州天隆生物科技有限公司 | 一种核酸提取和检测的试剂装置、试剂及方法 |
Cited By (6)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111269963A (zh) * | 2019-12-31 | 2020-06-12 | 广东凯普生物科技股份有限公司 | 一步法核酸提取转化试剂盒及其使用方法 |
CN112322736A (zh) * | 2020-11-17 | 2021-02-05 | 圣湘生物科技股份有限公司 | 一种用于检测肝癌的试剂组合,试剂盒及其用途 |
CN112322736B (zh) * | 2020-11-17 | 2022-06-14 | 圣湘生物科技股份有限公司 | 一种用于检测肝癌的试剂组合,试剂盒及其用途 |
CN112538423A (zh) * | 2020-12-23 | 2021-03-23 | 广州和实生物技术有限公司 | 一种整体式的核酸提取检测装置及其使用方法 |
CN112680340A (zh) * | 2020-12-23 | 2021-04-20 | 广州和实生物技术有限公司 | 一种全自动的核酸检测装置及其检测方法 |
CN113201542A (zh) * | 2021-04-29 | 2021-08-03 | 天津医科大学 | 单链向导rna在制备治疗宫颈癌等靶向药物上的用途 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
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Legal Events
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