CN108728535A - hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用 - Google Patents
hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN108728535A CN108728535A CN201810516628.5A CN201810516628A CN108728535A CN 108728535 A CN108728535 A CN 108728535A CN 201810516628 A CN201810516628 A CN 201810516628A CN 108728535 A CN108728535 A CN 108728535A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- prostate cancer
- circ
- hsa
- molecular target
- drug
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
- C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/178—Oligonucleotides characterized by their use miRNA, siRNA or ncRNA
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Zoology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Hospice & Palliative Care (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明属于生物技术领域,具体为hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和诊断试剂盒中的应用。hsa_circ_0049154的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。本发明包括该前列腺癌分子靶标在筛选预防、缓解和/或治疗前列腺癌的药物中的应用;包括该前列腺癌分子靶标的抑制剂,以及该抑制剂在制备预防、缓解和/或治疗前列腺癌的药物中的应用;包括含有前列腺癌分子靶标的前列腺癌诊断试剂盒;还包括该前列腺癌分子靶标和诊断试剂盒在前列腺癌高危人群筛选、诊断、治疗及状况监测、预后监测中的应用等。使用该分子靶标及含有该分子靶标的诊断试剂盒诊断前列腺癌,操作简单、取材方便、安全无创伤,且具有较高的特异性和灵敏度及易于大量筛查的特点。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体涉及一种前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154在制备药物和诊断试剂盒中的应用,包括通过该生物分子靶标在前列腺癌高危人群的筛选、前列腺癌的诊断、前列腺癌治疗及状况的监测、前列腺癌指导用药的监测及前列腺癌预后检测等领域的应用。
背景技术
根据《ASCO年度报告:2015临床肿瘤学进展》中相关内容,液体活检技术被列为肿瘤治疗领域下一个十年趋势之一。血液中的一些分子标志物已经被应用于一些疾病的诊断,如谷丙转氨酶用于肝炎的诊断,白细胞数目用于判断炎症。血液循环肿瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是一种无细胞状态的胞外游离DNA,存在于血液、滑膜液和脑脊液等体液中,体细胞DNA经脱落或者当细胞凋亡后释放进入循环系统,其主要是由短的单链或双链DNA以及单链与双链DNA的混合物组成,以DNA蛋白质复合物或游离DNA两种形式存在。ctDNA来自肿瘤细胞的体细胞突变,因此,ctDNA是一种特征性的新的肿瘤生物标记物,并且还可以被定性、定量和追踪,将成为临床肿瘤的早期诊断、预后判定及跟踪随访等提供一系列方便、快捷、特异、无创或微创和分子生物学检测手段,尤其对于一些不具有典型临床症状、检查无特异性和诊断困难的肿瘤可避免复杂的、具有创伤性的活检。结合新一代测序技术(NGS)将变成“液体活检”,并替代侵入组织性活检。
hsa_circ_0049154属于circRNA(Circular RNA,环状RNA),是一类环状的非编码RNA,近年研究发现它是一类具有重要生物学功能的RNA,参与基因组印记、染色体沉默、染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程,在细胞分化和发育、基因转录和翻译、遗传和表观遗传等生命活动中均发挥重要的调控作用。近年来,越来越多的权威研究证实circRNA在肿瘤的发生发展中起着抑制或促进肿瘤的作用,在调控肿瘤细胞增殖、凋亡、细胞周期、侵袭转移能力等方面,均具有十分重要作用。目前己有较多circRNA被证实在包括乳腺癌、前列腺、黑色素瘤、肝癌、结肠癌、膀胱癌等在内的人类多种肿瘤中存在差异表达并执行重要的调控功能。早期有效检测肿瘤的发生、发展及提高抗癌药物的疗效对于癌症的治疗尤为重要,发明新型肿瘤标志物作为诊断与治疗的靶点一直是肿瘤研究的热点。
前列腺癌是常见的男性生殖系统恶性肿瘤之一。世界范围内,前列腺癌发病率在男性所有恶性肿瘤中位居第二,在美国前列腺癌的发病率已经超过肺癌,成为第一位危害男性健康的肿瘤。亚洲前列腺癌的发病率远远低于欧美国家,但近年来呈现上升趋势,且增长比欧美发达国家更加迅速。前列腺癌患者主要是老年男性,一般在50岁以后发病,95%发生于60岁以上的老年男性,发生率持续地随着年龄增长而增加。前列腺癌早期多无任何症状,即使有所不适,也不足以引起病人的重视,当肿瘤增大压迫尿道时,又往往与前列腺增生相混淆。在我国约80%的病人首先发现远处转移病灶才发现前列腺癌。此时,病变已达晚期,预后不良。
前列腺癌的临床诊断方式目前主要有直肠指检、血清前列腺特异性抗原(PSA)检测、直肠超声波检测、活组织病理检查等。直肠指检是最简单、最经济实用的方法,主要通过医生的食指触摸前列腺,用以发现很多无症状的前列腺癌患者,有可能获得早期诊断及根治的机会。但以上的方法都存在局限性。例如直肠指检的局限性主要在4个方面:(1)患者前列腺肿块不大时,易漏诊;(2)部分患者前列腺癌肿大不明显,但已属于晚期,不易根治;(3)患者直肠有疾患时不能使用此检测;(4)医生经验不足时可能有漏诊或者误诊的可能。正常情况下血液中的PSA不高(不高于4ng/ml),当处于前列腺癌及其他前列腺疾病患病状态时,PSA升高成为目前筛查前列腺癌最敏感的瘤标,但其也存在一定局限性:(1)需要取血检测,对患者有一定的损伤;(2)PSA增高也常见与非前列腺癌疾病,如前列腺炎症、前列腺肥大等,因此不易确诊;(3)PSA增高确诊前列腺癌时,往往患者已经属于中后期,达不到早期诊断的目的。前列腺超声波检测操作简单直观、无损伤,通过显示肿块的大小、数目、位置、密度、边缘、形体、有无钙化及钙化的形态、大小、数目、分布以及周围的晕环、皮肤改变等提供定位及定性征象并判断病变的性质;其局限性是:(1)对致密性的小癌灶容易漏诊;(2)有时候不能提供明确的定性诊断;(3)因其不能显示肿瘤的内部结构及周围组织所以诊断符合率很低;(4)对一些缺乏典型征象的实性良恶性肿块有较高的误诊率。活组织病理检查因其创伤性、复杂性不能作为初筛的手段,但它是前列腺癌确诊的金标准,一般与其他方法技术连用。
近年来的研究表明,circRNA与前列腺癌密切相关,它们可能参与肿瘤的发生、发展和转移,所以对肿瘤的发病机制、早期诊断、个体化治疗、转移的检测和预后等可能有相应的作用。
发明内容
本发明的目的在于提供一种与前列腺癌相关的新的前列腺癌分子靶标,以及其在制备药物和前列腺癌诊断试剂盒中的应用。
本发明经研究发现hsa_circ_0049154在前列腺癌组织和血浆样本中的含量比前列腺正常组织、血浆样本中的含量低,显示hsa_circ_0049154与前列腺癌的肿瘤发生、发展存在着密切的相关性。因此,本发明提出hsa_circ_0049154作为与前列腺癌相关的新的前列腺癌分子靶标,并提供含有该前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154(作为标志物)的诊断试剂盒,以及该分子靶标或诊断试剂盒在前列腺癌高危人群筛选、诊断、治疗及状况监测、预后监测中的应用。
本发明提供的前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154,是一种circRNA,全长319bp,其核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。
前述的前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154,可用于筛选预防、缓解和/或治疗前列腺癌的药物。
前述的前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154,其抑制剂可用于制备预防、缓解和/或治疗前列腺癌的药物。
本发明还提供诊断前列腺癌的诊断试剂盒,该诊断试剂盒含有前述前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154。
本发明还提供诊断前列腺癌的诊断试剂盒,具体包括:
(1)组织样本、血液和尿液中总RNA提取试剂;
(2)反转录试剂;
(3)定量PCR试剂;
所用对照为β-ACTIN,其引物序列如下:
β-ACTIN上游引物序列:5'- CCTCTCCCAAGTCCACACAG -3'(SEQ ID NO.2)
β-ACTIN下游引物序列:5'- GGGCACGAAGGCTCATCATT -3'(SEQ ID NO.3);
前述检测试剂盒所检测hsa_circ_0049154,其引物序列如下:
hsa_circ_0049154上游引物序列:5'-GGGAACCAATCTGCCCTTTT-3'(SEQ ID NO.4)
hsa_circ_0049154下游引物序列:5'- ATGGCGGTCTGATAACCACTT-3'(SEQ ID NO.5)。
本发明提供的诊断试剂盒可用于前列腺癌高危人群筛选、诊断、治疗状况监测、预后监测等。
前述的前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154作为标志物在制备前列腺癌高危人群筛选、诊断、治疗状况监测、预后监测的试剂盒中的应用,是通过检测被试者组织样本、血液和尿液中的hsa_circ_0049154的含量,并与正常水平hsa_circ_0049154含量相比较,以进行前列腺癌高危人群筛选、诊断、治疗状况监测、预后监测。
前述的前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154作为标志物在制备前列腺癌高危人群筛选、诊断、药物设计、治疗及状况监测、预后监测的试剂盒中的应用,可把被试者血清、尿液和组织样本中hsa_circ_0049154的含量通过总RNA提取、反转录、定量PCR进行检测。
具体来说,前述的诊断前列腺癌的诊断试剂盒包括:
(1)组织样本、血浆和尿液中总RNA提取试剂;
每50mg组织或200ul血液或200ul尿液使用
(2)反转录试剂;
(3)定量PCR试剂;
引物包括hsa_circ_0049154和对照β-ACTIN两对引物;
(4)正常前列腺组织cDNA
作为阴性对照与检测样本cDNA共同定量PCR检测,每个反应体系使用与检测样本cDNA相同量。
前述的诊断前列腺癌的诊断试剂盒结果分析检测样本和阴性对照间比较采用t检验,P<0.05为差异显著,判为标本检测阳性。
前述检测试剂盒所用对照为β-ACTIN,其引物序列如下:
β-ACTIN上游引物序列:5'-CCTCTCCCAAGTCCACACAG-3'(SEQ ID NO.2)
β-ACTIN下游引物序列:5'-GGGCACGAAGGCTCATCATT-3'(SEQ ID NO.3)。
前述检测试剂盒所检测hsa_circ_0049154,其引物序列如下:
hsa_circ_0049154上游引物序列:5'-GGGAACCAATCTGCCCTTTT-3'(SEQ ID NO.4)
hsa_circ_0049154下游引物序列:5'- ATGGCGGTCTGATAACCACTT-3'(SEQ ID NO.5)。
本发明为前列腺癌的诊断和治疗提供了一种新的分子靶标hsa_circ_0049154。该分子靶标的抑制剂可用于制备预防、缓解和/或治疗前列腺癌的药物。使用该分子靶标及含有该分子靶标的诊断试剂盒诊断前列腺癌,操作简单、取材方便、安全无创伤,且具有较高的特异性、灵敏性和方便大量筛查的特点。该分子靶标适合应用于前列腺癌高危人群的筛选、前列腺癌的鉴定、前列腺癌治疗及状况的监测、前列腺癌指导用药的监测和前列腺癌预后监测等领域。
附图说明
图1. hsa_circ_0049154在前列腺癌组织样本中和正常组织样本中的含量检测。
图2. hsa_circ_0049154在前列腺癌血浆样本中和正常血浆样本中的含量检测。
图3.前列腺癌PC-3细胞系中hsa_circ_0049154抑制剂对hsa_circ_0049154抑制效率。
图4. hsa_circ_0049154的抑制剂显著抑制前列腺癌细胞的周期。
图5. hsa_circ_0049154的抑制剂显著促进前列腺癌细胞的凋亡。
图6. hsa_circ_0049154的抑制剂显著抑制前列腺癌细胞的增殖。
具体实施方式
为使本发明更加容易理解,下面结合具体实施例进一步阐述本发明,但下述实施例仅用于说明本发明而不限制本发明的范围,下面实施例中未提及的具体实验方法,按照常规实验方法进行。
实施例1:hsa_circ_0049154在前列腺癌组织样本中和正常组织样本中的含量检测。
本实施例中使用的hsa_circ_0049154检测引物序列为:
hsa_circ_0049154上游引物序列:5'- GGGAACCAATCTGCCCTTTT-3'(SEQ ID NO.4)
hsa_circ_0049154下游引物序列:5'- ATGGCGGTCTGATAACCACTT-3'(SEQ ID NO.5)。
本实施例主要步骤如下:
1、组织样本中总RNA的提取
获得前列腺癌根治术患者手术后的组织样本,同时获得淋巴结清扫术的患者
切除的组织样本作为对照。提取前述组织样本的总RNA于无DNA和无RNA酶污染的1.5毫升离心管中。
组织样本中提取总RNA的试剂盒购自北京康为世纪生物科技有限公司。提取的总RNA通过使用Therm NanoDrop2000c分光光度计,测定260/280nm紫外波长的比值进行的浓度测定。
2、定量检测组织样本中的circRNA
(1)反转录RNA得到cDNA单链
按照下表1配置反转录体系,配置过程在冰上进行。配置好的体系在PCR仪
上进行反转录。反应条件为 38摄氏度15分钟,85摄氏度5秒;
表1
表1中X表示加入的RNA体积由RNA浓度来确定,本实验中为X=500纳克/RNA浓度。前述反转录试剂盒购自大连宝生物有限公司(Takara);
(1)qPCR定量检测
以cDNA稀释液为实时定量PCR模板,引物终浓度为200nM,反应总体积为10μl。实时定量PCR仪器使用Roche LightCycler480 Ⅱ,用384孔板完成。每个样本重复二到三次。在溶解曲线基本符合要求无非特异性扩增的情况下,参考操作手册,采用threshold cycle (Ct)方法获得相对表达量,以β-ACTIN为内参。具体程序参看表2;
表2
;
3、采用Array Tools 4.1.0 进行数据分析
用前述方法可测得样品中目标circRNA和参照circRNA的Ct值水平求得目标circRNA在组织中的相对含量。用β-ACTIN为参照矫正circRNA的量,通过qPCR检测中经典的2-ΔΔCt的方法表示组织样本中circRNA的水平(-ΔCt为目标circRNA与对照的Ct值之差);
4、组织样本中hsa_circ_0049154水平诊断前列腺癌
如图1,与正常对照组织样本中hsa_circ_0049154的高含量相比,前列腺癌患者组织样本中的hsa_circ_0049154含量相对较低,且普遍低于正常组织样本的平均值,差异有统计学意义。
实施例2:hsa_circ_0049154在前列腺癌血浆样本中和正常血浆样本中的含量检测。
本实施例中使用的hsa_circ_0049154检测引物序列为:
hsa_circ_0049154上游引物序列:5'- GGGAACCAATCTGCCCTTTT-3'(SEQ ID NO.4)
hsa_circ_0049154下游引物序列:5'- ATGGCGGTCTGATAACCACTT-3'(SEQ ID NO.5)。
本实施例主要步骤如下:
1、血浆样本中总RNA的提取
获得26例前列腺癌患者的血浆样本,同时获得19例正常人血浆样本作为对照。提取前述组织样本的总RNA于无DNA和无RNA酶污染的1.5毫升离心管中;
血浆样本中提取总RNA的试剂盒购自QIAGEN公司。提取的总RNA通过使用ThermNanoDrop2000c分光光度计,测定260/280nm紫外波长的比值进行的浓度测定;
2、定量检测血浆样本中的circRNA
(1)反转录RNA得到cDNA单链
按照下表3配置反转录体系,配置过程在冰上进行。配置好的体系在PCR仪
上进行反转录。反应条件为 38摄氏度15分钟,85摄氏度5秒;
表3
表3中X表示加入的RNA体积由RNA浓度来确定,本实验中为X=500纳克/RNA浓度;前述反转录试剂盒购自大连宝生物有限公司(Takara);
(2)qPCR定量检测
以cDNA稀释液为实时定量PCR模板,引物终浓度为200nM,反应总体积为10μl。实时定量PCR仪器使用Roche LightCycler480 Ⅱ,用384孔板完成。每个样本重复二到三次。在溶解曲线基本符合要求无非特异性扩增的情况下,参考操作手册,采用threshold cycle (Ct)方法获得相对表达量,以β-ACTIN为内参。具体程序参看表4;
表4
;
3、采用Array Tools 4.1.0 进行数据分析
用前述方法可测得样品中目标circRNA和参照circRNA的Ct值水平求得目标circRNA在组织中的相对含量。用β-ACTIN为参照矫正circRNA的量,通过qPCR检测中经典的2-ΔΔCt的方法表示组织样本中circRNA的水平(-ΔCt为目标circRNA与对照的Ct值之差);
4、组织样本中hsa_circ_0049154水平诊断前列腺癌
如图2,与正常对照血浆样本中hsa_circ_0049154的高含量相比,前列腺癌患者血浆样本中的hsa_circ_0049154含量相对较低,且普遍低于正常血浆样本的平均值,差异有统计学意义。
实施例3:前列腺癌细胞系中hsa_circ_0049154 siRNA对hsa_circ_0049154沉默效率检测。
本实施例中使用的前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154的siRNA序列为:
hsa_circ_0049154siRNA正义链序列:5'- GCAAGUGGUUAUCAGACCG -3'(SEQ ID NO.6)
hsa_circ_0049154siRNA反义链序列:5'- CGGUCUGAUAACCACUUGC-3'(SEQ ID NO.7)
使用的阴性对照(NC)的siRNA序列为
NC siRNA正义链序列:5'- UUCUCCGAACGUGUCACGU -3'(SEQ ID NO.8)
NC siRNA反义链序列:5'- ACGUGACACGUUCGGAGAA -3'(SEQ ID NO.9)。
本实施例主要步骤如下:
1、细胞的siRNA转染(以六孔板为例)
将前列腺癌PC-3细胞系接种到六孔板中,使得次日的细胞汇合度约40-50%,将5μL的Lipofectamine2000和250μLOpti-MEM混合孵育,同时将5ul 20uM/L的siRNA与250μL Opti-MEM混合孵育。静置5min后将两者混合。同时将细胞用PBS洗一遍,换成1.5 ml的Opti-MEM。转染混合物静置20min后,均匀滴加到六孔板中,siRNA的终浓度为50uM/ml。4-6小时后更换成完全培养基继续培养;
2、细胞中总RNA的提取
细胞转染并培养48h后,收集细胞并提取其总RNA,提取方法同实施例1;
3、定量检测细胞中的circRNA并进行数据分析
定量检测及数据分析方法同同实施例1;
4、hsa_circ_0049154 siRNA对hsa_circ_0049154沉默效率
如图3,在PC-3转染hsa_circ_0049154 siRNA之后,hsa_circ_0049154的表达量下降了40%以上。证明hsa_circ_0049154 siRNA可以有效敲减hsa_circ_0049154在前列腺癌PC-3细胞系中的表达。
实施例4: hsa_circ_0049154 siRNA显著抑制前列腺癌细胞的周期。
本实施例主要步骤如下:
1、细胞的siRNA转染(以六孔板为例)
转染方法同实施例3;
2、细胞周期实验
细胞消化后重悬,接种于六孔中,培养48h后,收集细胞,流式细胞仪检测细胞周期;
3、hsa_circ_0049154 siRNA影响前列腺癌细胞的周期情况
如图4,hsa_circ_0049154 siRNA显著抑制前列腺癌细胞的周期。
实施例5:hsa_circ_0049154 siRNA显著促进前列腺癌细胞的凋亡。
本实施例主要步骤如下:
1、细胞的siRNA转染(以六孔板为例)
转染方法同实施例3;
2、细胞凋亡实验
转染后的细胞继续培养48h后,收集细胞,流式细胞仪检测细胞凋亡;
3、hsa_circ_0049154 siRNA影响前列腺癌细胞的凋亡情况
如图5,hsa_circ_0049154 siRNA显著促进前列腺癌细胞的凋亡。
实施例6: hsa_circ_0049154 siRNA显著抑制前列腺癌细胞的增殖。
本实施例主要步骤如下:
1、细胞的siRNA转染(以六孔板为例);
2、细胞增殖实验
细胞消化后重悬,接种于96孔中,并设置只加100μL 1640培养基的对照孔。接种0h、24h、48h后,每孔分别加入10ul CKK-8试剂后,细胞培养箱中继续孵育2小时。使用在酶标仪检测波长450nm处各孔的光吸收值(OD),参比波长615nm(600-650nm)。以各孔光吸收值减去空白孔光吸收值的平均值作为实际光吸收值,取平均值,以0h、24h、48h时间点光吸收值作曲线,反映细胞的增殖情况;
3、hsa_circ_0049154-siRNA影响前列腺癌细胞的增殖情况
如图3,hsa_circ_0049154-siRNA显著抑制前列腺癌细胞的增殖。
实施例7:本前列腺癌的诊断试剂盒的应用。
本实施例主要步骤如下:
1、组织样本、血液、尿液中总RNA的提取
按照每50mg组织或200ul血液或200ul尿液使用1mL的Trizol试剂的量处理组织样本、血液、尿液,吹打均匀后转移到无RNA酶的1.5ml Ep管中;向匀浆中加入1/5体积的氯仿,振荡离心管至溶液乳化成乳白状,无分相,12000 rpm 4℃离心15min;吸取上清至新管,加入等体积异丙醇,轻轻混匀,-20℃ 2h沉淀; 12000 rpm 4℃离心10min;弃上清,沿管壁轻轻加入1ml 75%乙醇,轻洗EP管,12000 rpm 4℃离心2min;弃上清,短暂离心,用枪吸去剩余上清,置于通风橱内晾干;加入适量DEPC水,用枪吹打使沉淀溶解;定量:电泳检测抽提质量,紫外分光光度计检测OD260/OD280和样品浓度;得到组织样本、血液、尿液中总RNA,放置-80℃保存;
2、检测组织样本、血液、尿液中的hsa_circ_0049154相对前列腺正常组织表达量变化
使用试剂盒中试剂,按照实施例1中反应体系与条件,使用试剂盒中前列腺正常组织cDNA作为QPCR定量检测中的对照cDNA,检测组织样本、血液、尿液中的hsa_circ_0049154相对前列腺正常组织表达量变化,分析检测结果,样本和对照间比较采用t检验,P<0.05为差异显著,判为检测样本阳性。
以上显示和描述了本发明不受上述实施例的限制,上述实施例和本发明的优点。本发明不受上述实施例的限制,上述实施例和说明书中描述的只是说明本发明的原理,在不脱离本发明精神和范围的前提下,本发明还会有各种变化和改进,这些变化和改进都落入要求保护的本发明范围内。本发明要求保护范围由所附的权利要求书及其等效物界定。
序列表
<110> 复旦大学
<120> hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用
<130> 001
<160> 9
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 516
<212> RNA
<213> 智人种(Homo sapiens)
<400> 1
agauucaagu caaucugaaa gucccagcca gccaagugac gcugacauua aggaccagcc 60
agaaaaugga cauuugggcu uccaggacag uuuugucaca ucagguguuu uuagugucac 120
ugagcuagua agagugucac agacaccaau agcugcagga acuggcccaa auuuuucucu 180
cucagauuug gaaaguucuu cauacuacag caugagucca ggagcaauga ggaggucuuu 240
acccagcaca uccucuacga gcuccacaaa gcgccucaag ucuguggagg augaaaugga 300
caguccuggu gaggagccau uuuauacagg ccaagggcgc uccccaggaa guggcaguca 360
gucaagugga uggcaugaag uggagccagg aaugccaucu ccaaccacac ugaagaaguc 420
ggagaagucu gguuucagca gccccucccc uucacagacc uccucccugg gaacggcguu 480
cacacagcau caccgaccug ucauuacagg acccag 516
<210> 2
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 2
cctctcccaa gtccacacag 20
<210> 3
<211> 20
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 3
gggcacgaag gctcatcatt 20
<210> 4
<211> 18
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 4
ggtttcagca gcccctcc 18
<210> 5
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 5
ccttaatgtc agcgtcactt gg 22
<210> 6
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 6
cccagagauu caagucaau 19
<210> 7
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 7
auugacuuga aucucuggg 19
<210> 8
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 8
uucuccgaac gugucacgu 19
<210> 9
<211> 19
<212> RNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 9
acgugacacg uucggagaa 19
Claims (9)
1. hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标,在制备筛选预防、缓解和/或治疗前列腺癌的药物中的应用,所述hsa_circ_0049154的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。
2. 一种hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标的抑制剂,所述hsa_circ_0049154的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。
3.如权利要求2所述的抑制剂在制备预防、缓解和/或治疗前列腺癌的药物中的应用。
4.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述抑制剂制备的药物包括hsa_circ_0049154的抑制剂。
5.一种前列腺癌诊断试剂盒,其特征在于,含有前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154,所述hsa_circ_0049154的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示。
6.根据权利要求5所述的前列腺癌诊断试剂盒,其特征在于,包括:
(1)组织样本、血液和尿液中总RNA提取试剂;
(2)反转录试剂;
(3)定量PCR试剂;
前述检测试剂盒所用对照为β-ACTIN,其引物序列如下:
β-ACTIN上游引物序列:5'- CCTCTCCCAAGTCCACACAG -3'
β-ACTIN下游引物序列:5'- GGGCACGAAGGCTCATCATT -3'。
7.前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154作为标志物,在制备前列腺癌高危人群筛选、诊断、药物设计、治疗及状况监测、预后监测的试剂盒中的应用,是通过检测被试者血清、尿液和组织样本中hsa_circ_0049154的含量,并与正常水平hsa_circ_0049154含量相比较,以进行前列腺癌高危人群筛选、诊断、治疗及状况监测、预后监测。
8.前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154作为标志物,在制备前列腺癌高危人群筛选、诊断、药物设计、治疗及状况监测、预后监测的试剂盒中及药物中的应用,将所述被试者血清、尿液和组织样本中hsa_circ_0049154的含量通过总RNA提取、反转录、定量PCR进行检测。
9. 一种用于检测前列腺癌分子靶标hsa_circ_0049154的引物序列:
上游引物序列:5'- GGGAACCAATCTGCCCTTTT -3'
下游引物序列:5'- ATGGCGGTCTGATAACCACTT-3'。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201810516628.5A CN108728535A (zh) | 2018-05-26 | 2018-05-26 | hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201810516628.5A CN108728535A (zh) | 2018-05-26 | 2018-05-26 | hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN108728535A true CN108728535A (zh) | 2018-11-02 |
Family
ID=63935443
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201810516628.5A Pending CN108728535A (zh) | 2018-05-26 | 2018-05-26 | hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN108728535A (zh) |
Cited By (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111118011A (zh) * | 2020-02-11 | 2020-05-08 | 昆明医科大学 | 一种抑制hsa_circ_0027478表达的siRNA及其应用 |
CN111893187A (zh) * | 2020-08-20 | 2020-11-06 | 广州医科大学附属第二医院 | circ AMOTL1在前列腺癌骨转移中的用途 |
CN111910006A (zh) * | 2020-08-20 | 2020-11-10 | 广州医科大学附属第二医院 | 前列腺癌及骨转移的诊疗靶点circ PLCL2 |
CN112226511A (zh) * | 2020-10-19 | 2021-01-15 | 南方医科大学珠江医院 | 一种前列腺癌circRNA标志物及其应用 |
CN112458170A (zh) * | 2020-11-26 | 2021-03-09 | 南方医科大学珠江医院 | 用于检测circCSPP1靶标的检测试剂及应用 |
CN113174436A (zh) * | 2021-04-29 | 2021-07-27 | 江汉大学 | 外泌体环状rna 0001359在防治良性前列腺增生中的应用 |
CN113278698A (zh) * | 2021-05-27 | 2021-08-20 | 清远市人民医院 | 环状RNAcirc0001610及其表达产物在诊断和治疗膀胱癌药物中的应用 |
CN114457081A (zh) * | 2022-03-03 | 2022-05-10 | 广州市番禺区中心医院 | 环状RNA hsa_circ_0000745的新应用 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103205423A (zh) * | 2013-04-11 | 2013-07-17 | 百瑞德(南京)生物科技有限公司 | 一种前列腺癌生物标志物miR-126-5P、诊断试剂盒及应用 |
CN105154448A (zh) * | 2015-09-16 | 2015-12-16 | 复旦大学 | Rp11-1023l17.1作为前列腺癌分子靶标及其在诊断试剂盒中的应用 |
-
2018
- 2018-05-26 CN CN201810516628.5A patent/CN108728535A/zh active Pending
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN103205423A (zh) * | 2013-04-11 | 2013-07-17 | 百瑞德(南京)生物科技有限公司 | 一种前列腺癌生物标志物miR-126-5P、诊断试剂盒及应用 |
CN105154448A (zh) * | 2015-09-16 | 2015-12-16 | 复旦大学 | Rp11-1023l17.1作为前列腺癌分子靶标及其在诊断试剂盒中的应用 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
CIRCBASE: "has_circ_0049154 & has_circ_0012755", 《CIRCBASE》 * |
ZHE KONG等: "Androgen-responsive circular RNA circSMARCA5 is up-regulated and promotes cell proliferation in prostate cancer", 《BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS》 * |
Cited By (13)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN111118011A (zh) * | 2020-02-11 | 2020-05-08 | 昆明医科大学 | 一种抑制hsa_circ_0027478表达的siRNA及其应用 |
CN111118011B (zh) * | 2020-02-11 | 2022-09-06 | 昆明医科大学 | 一种抑制hsa_circ_0027478表达的siRNA及其应用 |
CN111893187A (zh) * | 2020-08-20 | 2020-11-06 | 广州医科大学附属第二医院 | circ AMOTL1在前列腺癌骨转移中的用途 |
CN111910006A (zh) * | 2020-08-20 | 2020-11-10 | 广州医科大学附属第二医院 | 前列腺癌及骨转移的诊疗靶点circ PLCL2 |
CN111893187B (zh) * | 2020-08-20 | 2023-09-05 | 广州医科大学附属第二医院 | circ AMOTL1在前列腺癌骨转移中的用途 |
CN112226511B (zh) * | 2020-10-19 | 2022-06-07 | 南方医科大学珠江医院 | 一种前列腺癌circRNA标志物及其应用 |
CN112226511A (zh) * | 2020-10-19 | 2021-01-15 | 南方医科大学珠江医院 | 一种前列腺癌circRNA标志物及其应用 |
CN112458170A (zh) * | 2020-11-26 | 2021-03-09 | 南方医科大学珠江医院 | 用于检测circCSPP1靶标的检测试剂及应用 |
CN113174436B (zh) * | 2021-04-29 | 2022-04-08 | 江汉大学 | 外泌体环状rna 0001359在防治良性前列腺增生中的应用 |
CN113174436A (zh) * | 2021-04-29 | 2021-07-27 | 江汉大学 | 外泌体环状rna 0001359在防治良性前列腺增生中的应用 |
CN113278698A (zh) * | 2021-05-27 | 2021-08-20 | 清远市人民医院 | 环状RNAcirc0001610及其表达产物在诊断和治疗膀胱癌药物中的应用 |
CN114457081A (zh) * | 2022-03-03 | 2022-05-10 | 广州市番禺区中心医院 | 环状RNA hsa_circ_0000745的新应用 |
CN114457081B (zh) * | 2022-03-03 | 2023-12-26 | 广州市番禺区中心医院 | 环状RNA hsa_circ_0000745的新应用 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN108728535A (zh) | hsa_circ_0049154作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用 | |
CN108624688A (zh) | hsa_circ_0012755作为前列腺癌分子靶标在制备药物和试剂盒中的应用 | |
Day et al. | PCA3: from basic molecular science to the clinical lab | |
CN105154447B (zh) | Ac016745.3作为前列腺癌分子靶标及其在诊断试剂盒中的应用 | |
CN118813801A (zh) | 大肠癌的检测试剂盒或装置以及检测方法 | |
CN105154448A (zh) | Rp11-1023l17.1作为前列腺癌分子靶标及其在诊断试剂盒中的应用 | |
CN108103198B (zh) | 一种与胰腺癌辅助诊断相关的血浆miRNA标志物及其应用 | |
CN105316340A (zh) | Mir27a-3p作为前列腺癌分子标志物及其在诊断试剂盒中的应用 | |
CN104004840A (zh) | 用于早期筛查与诊断前列腺癌的试剂盒 | |
CN106897579A (zh) | 基于染色体变异指数的新型早期肿瘤标记物及应用 | |
CN107177683A (zh) | 一种膀胱癌筛选检测试剂盒 | |
CN109929932A (zh) | 血液中两种长链非编码rna联合诊断食管鳞状细胞癌中的应用 | |
CN102534008A (zh) | 一种与非贲门癌辅助诊断相关的snp标志物及其应用 | |
Bustos et al. | Diagnostic miRNA signatures in paired tumor, plasma, and urine specimens from renal cell carcinoma patients | |
CN107312865A (zh) | Loc100130111在制备骨肉瘤诊断产品、治疗药物中的用途 | |
CN107312778B (zh) | 一种癌症诊断试剂盒以及治疗用药物组合物 | |
CN109536612A (zh) | 一种与鼻咽癌辅助诊断相关的血浆miRNA标志物及其应用 | |
CN109182528A (zh) | 一种基于itgb5基因的胶质母细胞瘤辅助诊断、预后评价试剂盒及其使用方法 | |
CN106282366A (zh) | 一种与前列腺癌相关的分子标记物及其应用 | |
CN106367526A (zh) | 一种诊断前列腺癌的产品及其应用 | |
CN106498062A (zh) | 一种诊断前列腺癌的产品及其应用 | |
CN106367477A (zh) | 一种与结直肠癌辅助诊断相关的血清miRNA标志物及其应用 | |
CN106367509A (zh) | Loc100128675作为检测前列腺癌的分子标记物及其在诊断试剂盒中的应用 | |
CN107723365B (zh) | 一种与肺鳞癌辅助诊断相关的血浆miRNA标志物及其应用 | |
CN108064273A (zh) | 结直肠癌相关疾病的生物标志物 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication | ||
WD01 | Invention patent application deemed withdrawn after publication |
Application publication date: 20181102 |