CN108411021A - 一种大豆百粒重相关的分子标记方法及其标记组合 - Google Patents

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张礼凤
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Abstract

本发明涉及一种大豆百粒重相关的分子标记方法，包括以下步骤：1）大豆RIL群体百粒重的分布：对滑皮豆和齐黄26的高世代RIL群体进行连续两年的种植，统计其百粒重；2）大豆百粒重的QTL定位：利用SLAF‑seq技术构建的高密度遗传图谱对大豆RIL群体的百粒重进行QTL定位，获得10个大豆百粒重相关的QTL位点。利用该发明所提出的标记组合对育种材料进行低世代的标记选择，有助于在低世代对育种材料中的大粒型优异基因聚集，降低高世代育种选择工作量，缩小育种规模，缩短育种年限。

Description

一种大豆百粒重相关的分子标记方法及其标记组合
技术领域
本发明涉及分子标记辅助育种技术领域，尤其涉及一种大豆百粒重相关的分子标记方法及其标记组合。
背景技术
大豆是我国重要的粮油饲兼用作物，在国民经济发展中具有重要的战略地位。大豆籽粒重是大豆产量的重要构成因子，在前人的研究中与大豆产量呈显著正相关，是选育高产大豆品种的重要目标。然而大豆籽粒重受不同遗传背景的影响，在年际间波动较大，是高产大豆育种进展缓慢的主要原因之一。
目前，SoyBase数据库收录的与大豆粒重相关QTL共计265个。但是，由于百粒重等数量性状由微效多基因控制，这些标记存在着群体间的特异性，不能用于特定育种群体的分子标记辅助选择育种。
发明内容
为了解决上述技术问题，本发明提供，本发明提供一种大豆百粒重相关的分子标记方法及其标记组合。利用该发明所提出的标记组合对育种材料进行低世代的标记选择，有助于在低世代对育种材料中的大粒型优异基因聚集，降低高世代育种选择工作量，缩小育种规模，缩短育种年限。
本发明是通过如下技术方案实现的，本发明提供一种大豆百粒重相关的分子标记方法，包括以下步骤：
1）大豆RIL群体百粒重的分布：对滑皮豆和齐黄26的高世代RIL（重组自交系）群体进行连续两年的种植，统计其百粒重；
2）大豆百粒重的QTL定位：利用SLAF-seq技术（大规模基因分型高通量策略技术）构建的高密度遗传图谱对大豆RIL群体的百粒重进行QTL定位，获得10个大豆百粒重相关的QTL位点。
作为优选，齐黄26号由山东省农业科学院作物研究所选育。
齐黄26是山东农科院作物所育成的一个大粒型高蛋白大豆品种，滑皮豆是山东农科院作物所搜集的一个小粒型的优异大豆种质，在大豆育种与生产中得到广泛的应用。本发明构建了齐黄26和滑皮豆的RIL群体，利用SLAF-seq技术对百粒重相关基因进行定位，获得10个QTL位点，表型贡献率达93.81%。这些QTL位点将在基于齐黄26和滑皮豆的分子标记辅助育种中起着重要作用。
一种大豆百粒重相关的分子标记方法获得的标记组合，为获得10个大豆百粒重相关的QTL位点，且10个大豆百粒重相关的QTL位点分别位于5号、5号、9号、11号、11号、12号、13号、15号、20号和20号染色体。
本发明的有益效果为：
1. 在以齐黄26作为亲本进行大粒型大豆育种时，利用该发明所提出的标记组合对育种材料进行低世代的标记选择，有助于在低世代对育种材料中的大粒型优异基因聚集，降低高世代育种选择工作量，缩小育种规模，缩短育种年限。
2. 在以滑皮豆作为亲本进行小粒型大豆（芽豆）育种时，利用该发明所提出的标记组合对育种材料进行低世代的标记选择，有助于在低世代对育种材料中的小粒型优异基因聚集，降低高世代育种选择工作量，缩小育种规模，缩短育种年限。
3. 本发明所获得的部分标记位点物理区间较短，实现了粒重基因的精细定位，有助于粒重相关基因的分子克隆。
附图说明
为了更清楚地说明本发明实施例或现有技术中的技术方案，下面将对实施例或现有技术描述中所需要使用的附图作简单地介绍，显而易见地，下面描述中的附图仅仅是本发明的一些实施例，对于本领域普通技术人员来讲，在不付出创造性劳动的前提下，还可以根据这些附图获得其他的附图。
图1 为2013年大豆RIL群体百粒重的分布；
图2 为2014年大豆RIL群体百粒重的分布；
图3 为大豆百粒重的QTL定位。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合实施例，对本发明进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明，并不用于限定本发明。
下面结合附图及具体实施例对本发明的应用原理作进一步描述。
实施例1，一种大豆百粒重相关的分子标记方法，包括以下步骤：
1）大豆RIL群体的百粒重分布：对滑皮豆和齐黄26的高世代RIL群体进行连续两年的种植，统计其百粒重，发现RIL群体的百粒重基本呈正态分布。如图1-2所示。
2）大豆百粒重的QTL定位：利用基于SLAF-seq技术构建的高密度遗传图谱对大豆RIL群体的百粒重进行QTL定位，采用完备区间作图（ICIM）共获得10个大豆百粒重相关的QTL位点（图3），分别位于5号、5号、9号、11号、11号、12号、13号、15号、20号和20号染色体（表1），共解释93.81%的表型变异。如图3所示。
表1 大豆百粒重相关的QTL位点
当然，上述说明也并不仅限于上述举例，本发明未经描述的技术特征可以通过或采用现有技术实现，在此不再赘述；以上实施例及附图仅用于说明本发明的技术方案并非是对本发明的限制，参照优选的实施方式对本发明进行了详细说明，本领域的普通技术人员应当理解，本技术领域的普通技术人员在本发明的实质范围内所做出的变化、改型、添加或替换都不脱离本发明的宗旨，也应属于本发明的权利要求保护范围。

Claims (3)

1.一种大豆百粒重相关的分子标记方法，其特征在于：包括以下步骤：
大豆RIL群体百粒重的分布：对滑皮豆和齐黄26的高世代RIL群体进行连续两年的种植，统计其百粒重；
大豆百粒重的QTL定位：利用SLAF-seq技术构建的高密度遗传图谱对大豆RIL群体的百粒重进行QTL定位，获得10个大豆百粒重相关的QTL位点。
2.根据权利要求1所述的一种大豆百粒重相关的分子标记方法，其特征在于：齐黄26号由山东省农业科学院作物研究所选育。
3.根据权利要求1所述的一种大豆百粒重相关的分子标记方法获得的标记组合，其特征在于：为获得10个大豆百粒重相关的QTL位点，且10个大豆百粒重相关的QTL位点分别位于5号、5号、9号、11号、11号、12号、13号、15号、20号和20号染色体。
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