CN108333179A - Dna液晶生物传感器及其制备方法和检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种DNA液晶生物传感器包括捕获探针和隔离探针混合固定于表面镀有一层纳米级厚度金膜的玻片上而制成的工作片基,所述捕获探针由含有m个腺嘌呤A和与待检测物特异性识别结合的一段碱基序列P组成,并标记为AmP1;所述隔离探针含有n个腺嘌呤A的多聚腺嘌呤,并标记为An,所述m为正整数,所述n为自然数。同时公开了该DNA液晶生物传感器的制备方法和检测方法。本发明一种DNA液晶生物传感器及其制备方法和检测方法,得到的DNA液晶生物传感器除具有液晶传感器相同的优点,探针无需任何化学修饰,高效识别被测物,简化制备步骤;降低制作成本;本发明还可应用于基于核酸杂交以及核酸适配体分子识别机理为基础的生物分子检测。
Description
技术领域
本发明属于生物传感器技术领域,具体的说,涉及一种DNA液晶生物传感器及其制备方法和检测方法。
背景技术
脱氧核糖核酸(DNA),一种内含遗传信息的生物大分子,控制着生物发育及生命机能运作,能直接影响人类遗传和健康。因此,DNA的检测在许多领域如:临床诊断、医药研究、农业生产、食品安全、环境监护等中扮演着极其重要的角色。
传统DNA检测技术有:PCR、化学发光分析、电泳相关技术等。然而这些技术操作繁琐、步骤繁多,且必须有昂贵专业仪器设备或专业人员的配置,难以进行远离实验室的原位、实时检测。
DNA生物传感器是近年来新发展出的一种分析检测技术,其基本原理源于DNA分子碱基间的互补配对,并将这一杂交信息转变为光、电、声等易于检测信号。与传统的检测技术相比,DNA生物传感检测方法具有快速、灵敏、操作简便等优点。
目前普遍采用的DNA生物传感器主要包括以下几种类型:电化学型、荧光型、压电晶体型等。压电晶体型DNA生物传感器由于其自身的结构特点,存在着不易微型化、阵列化,检测下限偏高等问题;电化学的DNA生物传感器具有高灵敏度及成熟的电极理论,但该类传感器也存在难于阵列化的缺点,不适于开发下一代高通量DNA传感器;荧光DNA生物传感器具有高灵敏、易微型化、易阵列化等优点,但存在DNA探针需要荧光标记,荧光标记不但提高了传感器的制造成本,还会影响DNA杂交效率存在着荧光猝灭、光致漂白等问题。另外,荧光DNA生物传感器需昂贵的荧光读取装置。
液晶传感器由于具有无需标记,灵敏度高,构造简单,易于微型化与阵列化。无需复杂读取装置肉眼可直接观察光学信号变化等优势。近年来,引发了科学家的广泛关注。
DNA生物传感器的构建中,DNA捕获探针固定方法的选取会直接影响传感器的检测性能、制作成本等。目前研究报道的DNA液晶生物传感器中,为将DNA探针固定于传感器基底,需要分别对DNA探针和基底进行一定的化学基团修饰(如在DNA探针末端修饰上巯基、氨基、亲和素等,在基底上修饰APTES、TEA等),通过DNA探针上修饰基团与基底上修饰基团的反应,实现DNA探针的固定。上述针对DNA的基团修饰不仅提高了传感器制作成本,DNA探针的杂交效率还会受到其上修饰基团的影响。同时,这类固定方式步骤繁多,会影响传感器的可重复性。
发明内容
为解决以上技术问题,本发明的目的在于提供一种DNA液晶生物传感器及其制备方法和检测方法,得到的DNA液晶生物传感器除具有液晶传感器相同的优点外,还具有以下优点:发明中捕获探针无需采用任何化学修饰,既能保证捕获探针高效识别被测物,又可以简化传感器制备步骤;另外,捕获探针既充当液晶的取向分子又作为待测物的识别分子,进一步简化了传感器制作成本和制备步骤;本发明还可应用于基于核酸杂交以及核酸适配体分子识别机理为基础的生物分子检测。
本发明目的是这样实现的:一种DNA液晶生物传感器,其关键在于:包括捕获探针和隔离探针混合固定于表面镀有一层纳米级厚度金膜的玻片上而制成的工作片基,所述捕获探针由含有m个腺嘌呤A和与待检测物特异性识别结合的一段碱基序列P组成,并标记为AmP1;所述隔离探针含有n个腺嘌呤A的多聚腺嘌呤,并标记为An,所述m为正整数,所述n为自然数。捕获探针和隔离探针在使用前均不作任何修饰处理。能与捕获探针发生适配体-配体反应的生物分子,如凝血酶、ATP、肿瘤标志物等。
优选地,上述捕获探针和隔离探针的总浓度x为3μmol/L。
优选地,上述捕获探针与隔离探针的浓度比y为1:(0~5)。
优选地,上述捕获探针与隔离探针的浓度比y为7:5。
优选地,上述m为15,n为15,所述碱基序列P的碱基数量为10~30个。
优选地,上述金膜包括3nm的铬粘附层和10nm金膜层。
一种DNA液晶生物传感器的制备方法,包括工作片基的制备、取向片基的制备,其关键在于所述工作片基的制备为:
a、玻片镀金处理:在清洗后的玻片表面镀上一层厚度均匀的金膜得到镀金基底;
b、配制DNA探针固定液并制成工作片基:将捕获探针AmP1和隔离探针An溶于缓冲液中并混合制成DNA探针固定液,然后利用聚腺嘌呤Am和An与金膜间较强的特异性吸附能力,将DNA探针固定液固定于所述镀金基底上,制成工作片基;所述捕获探针AmP1的面密度通过所述DNA探针固定液的浓度、捕获探针与隔离探针的浓度比、m和n的值所述捕获探针AmP1的面密度。其中缓冲液为:1mol/L的CaCl2-TE,pH=7。
优选地,上述取向片基的制备为:将另一玻片清洗后并浸泡于液晶取向剂溶液中孵育,反应后经超纯水冲洗后吹干,再于烘箱中高温烘烤交联反应,经表面硅烷偶联处理后的液晶分子垂直取向,制成取向片基。所述液晶取向剂优选DMOAP、OTS等硅烷偶联剂。
进一步地,上述步骤a中玻片的清洗过程为①将玻片浸泡在80℃的按体积比为70%H2SO4:30%H2O2制成的水虎鱼溶液中约1h;②取出玻片,并用超纯水冲洗至少5遍;③在乙醇中超声10min;④重复步骤②,然后在甲醇中超声10min;⑤重复步骤②,然后将玻片置于氮气气氛中干燥待用。
进一步地,上述镀金基底的清洗过程为①用超纯水将镀金基底冲洗5遍;②在乙醇中超声10min;③超纯水冲洗5遍,然后氮气吹干;④镀金基底置于紫外清洗机中照射25min;⑤依次重复步骤①②③④,2次;⑥重复①②③,待用。
一种DNA液晶生物传感器的检测方法,其关键在于:采用滴涂法将一定量的待测液滴加在所述工作片基表面,捕获探针与待测液中的目标检测物在室温下进行孵育反应,2h后用缓冲液、超纯水顺序冲洗,氮气吹干,再在所述取向片基上放置一铜载网,注入液晶,然后盖上经分子识别反应后的工作片基,最后,将取向片基和工作片基夹具固定,组成三明治结构的液晶盒,将所述液晶盒于偏光显微镜下观察并采集图像,通过图像的明暗程度及验收实现对待测的的半定量检测。
优选地,上述液晶为向列相液晶,包括5CB或E7。
有益效果:
本发明是一种DNA液晶生物传感器及其制备方法和检测方法,采用新颖的DNA探针固定方法,即通过DNA探针末端聚腺嘌呤与金膜间较强的特异性吸附将探针固定于镀金玻片表面,免于对DNA探针功能化修饰,既简化了传感器的制作步骤,又避免了修饰基团的引入影响固定化捕获探针与目标检测物之间的分子识别。另外,本发明构建的液晶生物传感器中,捕获探针既充当液晶分子的取向分子又作为目标检测物的识别分子,使得该传感器制作简便、成本较低,且具有良好的选择性和灵敏度。还有,选取特定适配体DNA序列作为DNA捕获探针,利用适配体-配体反应,还可以实现其他有机小分子、RNA、蛋白质等的检测。
附图说明
图1为液晶盒结构示意图;
图2为捕获探针与隔离探针的浓度比y对DNA液晶生物传感器的影响;图中:a、DNA探针固定液中捕获探针AmP1与隔离探针摩尔数比值y=1:0,b、y=2:1,c、y=7:5,d、y=1:1,e、y=5:7,f、y=1:2;
图3为DNA液晶生物传感器检测不同浓度的目标DNA序列的检测结果;图中a为待检测液中目标DNA浓度为0;b为待检测液中目标DNA浓度为100nmol/L;c为待检测液中目标DNA浓度为1nmol/L;d为待检测液中目标DNA浓度为10pmol/L;e为待检测液中目标DNA浓度为0.1pmol/L;
图4为目标DNA检测的特异性的检测结果;图中a为待检测液中为500nmol/L互补DNA序列;b为待检测液中为500nmol/L单碱基错配DNA序列;c为待检测液中为500nmol/L双碱基错配DNA序列;
图5为液晶生物传感器检测凝血酶的检测结果;图中a为待检测液中凝血酶浓度为10nmol/L;b为待检测液中凝血酶浓度为100nmol/L;c为待检测液中凝血酶浓度为1μmol/L;d为待检测液中凝血酶浓度为0;
具体实施方式
下面结合实施例和附图对本发明作进一步说明。
实施例1:一种DNA液晶生物传感器的制备方法及检测:
(1)玻片镀金处理
1.1、玻片清洗:①将12mm×12mm的玻片浸泡在由体积比为70%H2SO4:30%H2O2制成的水虎鱼溶液中,80℃反应1h;②用超纯水冲洗5遍;③在乙醇中超声10min;④重复②,然后在甲醇中超声10min;⑤重复②,然后将玻片置于氮气气氛中干燥待用;
1.2、采用真空蒸镀法在所述玻片的表面镀上镀一层纳米级厚度均匀金膜得到镀金基底;该金膜由3nm铬粘附层和10nm金膜层组成,制得的镀金玻片具有较好的透光性;按以下步骤将所述镀金基底进行清洗:①将镀金基底用超纯水冲洗5遍;②在乙醇中超声10min;③超纯水冲洗5遍,然后氮气吹干;④镀金基底置于紫外清洗机中照射25min;⑤依次重复步骤①②③④,2次;⑥重复①②③,待用;
(2)DNA探针固定液的配制
DNA探针固定液由两种探针组成,即捕获探针和隔离探针。捕获探针碱基序列记为AmP1:Am为含m个腺嘌呤A的多聚腺嘌呤;P1为能与目标分析物特异性结合的一段碱基序列;隔离探针碱基序列记为An:An为含n个腺嘌呤A的多聚腺嘌呤。捕获探针和隔离探针在使用前均不作任何修饰处理。将AmP1与An按浓度比y比例溶于的1mol/L的CaCl2-TE(pH=7)缓冲液中充分混匀,制得到浓度x为3μmol/L的DNA探针固定液。
(3)工作片基制备
将步骤(1)-1.2清洗后的所述镀金基底浸泡于适量步骤(2)所述DNA探针固定液中,于37℃下进行探针固定化处理,利用聚腺嘌呤Am和An与金膜间较强的特异性吸附能力,将AmP1与An混合固定于镀金基底,镀金基底上捕获探针AmP1的面密度由步骤(2)所述DNA探针固定液参数x、y、m、n及探针固定化反应的条件进行调节,反应结束后,用去离子水洗涤3-5次,以除去玻片上吸附的离子及未固定的探针,制备成工作片基。然后按以下步骤对工作片基进行清洗并备用:①超纯水中振洗5min;②1mol/L pH=7的NaCl-TE缓冲液中振洗5min;③0.1mol/L NaOH稀溶液中振洗5min;④重复①,然后氮气吹干,待用。
(4)取向片基的制备
另取一张12mm×24mm玻片并清洗,清洗过程同步骤(1)-1.1中玻片清洗,清洗的玻片浸泡于液晶取向剂溶液,即浓度为0.1%的水溶液DMOAP中孵育5min,反应后经超纯水冲洗5次、氮气吹干后于烘箱中110℃高温烘烤交联反应1h,经表面硅烷偶联处理后的玻片能使液晶分子垂直取向,制作成取向片基。
(5)分子识别及液晶盒组装
采用滴涂法将一定量的待测液滴加在所述工作片基表面,捕获探针与待测液中的目标分析物在室温下(25℃)进行孵育反应,2h后用含0.1mol/L氯化钠的10mmol/L磷酸盐缓冲液、超纯水依次冲洗,氮气吹干。如图1所示,将一片铜载网放置于所述取向片基上,然后,在铜载网上注入0.5μL的列相液晶,然后盖上经分子识别反应后的工作片基,最后,用长尾夹固定,组成三明治结构的液晶盒。
(6)偏光检测
将步骤(5)所述的液晶盒置于偏光显微镜下,调节上下偏振片呈90°,观察并采集图像,通过图像的明暗程度及颜色变化,实现对待测物的半定量检测。
所述DNA液晶生物传感器检测原理具体如下:由于液晶盒取向片基上的液晶分子始终垂直取向。当采用优选方式及参数固定DNA探针,工作片基上的捕获探针将以最佳密度固定,此时工作片基上的捕获探针也能诱导液晶垂直取向。当步骤(5)所述待测溶液中含有一定浓度目标检测物,经孵育反应与工作片基上的捕获探针结合,显著改变传感基底表面形貌,从而使液晶取向发生变化,导致液晶盒中的液晶分子出现双折射效应,相应的偏光显微图像出现亮度和色彩的变化。待测液中目标分析物浓度越高,液晶盒内的液晶取向变化越大,偏光显微镜下图像亮度和色彩的变化越大。而当步骤(5)所述待测溶液中不含目标分析物,孵育反应后传感基底表面形貌不发生改变,液晶仍保持垂直取向,液晶盒中的液晶分子无双折射现象,偏光显微镜采集到黑色消光图像。通过观察液晶盒在偏光显微镜下图像亮度和色彩达到半定量检测目的。
实施例2:传感器背景噪声控制
由于在本申请方案中,液晶盒内液晶分子的取向由工作片基表面决定,更具体地说液晶分子的取向主要受该基底上捕获探针固定化密度的影响:当捕获探针固定化密度较低,液晶分子能嵌入单链捕获分子之间的空隙,此时单链DNA有助于诱导液晶分子垂直排列;而当捕获探针固定化密度过高,液晶分子因无法嵌入单链DNA间的空隙,导致此时的单链DNA无法诱导液晶垂直排列。为考察所述新型DNA液晶生物传感器的背景噪声,通过调节实施例1中所述DNA生物传感器制备过程中DNA探针固定液中AmP1与An的比例值y,m和n优选取值15,制得一系列固定有不同捕获探针密度的工作片基,并用该工作片基直接组装液晶盒,置于偏光显微镜下采集图像,结果如图2。由图2可以发现:当y值大于7:5,图像背景噪声较大,不为均一的黑色消光图像;而当比例y小于7:5,图像背景噪声较小,为均一的黑色消光图像。因此捕获探针与隔离探针的浓度比y优选为7:5。
实施例3:目标DNA序列检测
采用新型DNA液晶生物传感器检测目标DNA序列。采用优选参数m和n优选取值15,y=7:5的固定液制备一系列工作片基,分别在片基上滴加不同目标DNA浓度的待测液进行分子识别反应,按前述步骤组装液晶盒并置于偏光显微镜下采集图像。结果如图3所示。可见随着待检测液中目标DNA浓度的增大,图像依次有黑色-灰色-黄色-粉红-绿色的色彩变化。这是由于当待测液中目标DNA浓度越大,结合到工作片基上的目标DNA越多,基底上液晶取向受到的干扰越大,液晶分子相对工作片基的倾角越大,根据液晶层双折射干涉原理,偏光显微图像便会出现黑色-灰色-黄色-粉红-绿色的色彩变化。因此本申请DNA液晶生物传感器检测限可达1pmol/L。
实施例4:目标DNA检测的特异性
通过探针序列与不同错配序列的杂交检测来研究专利所述DNA液晶传感器的特异性。采用优选参数m和n优选取值15,y=7:5,分别在工作片基上滴加500nmol/L互补DNA序列、单碱基错配DNA序列和双碱基错配DNA序列的待检测溶液进行分子识别反应,按前述步骤组装液晶盒并置于偏光显微镜下观察。结果如图4所示。由图可见加入相同浓度的互补链和错配链,所得图像完全不一样,互补链得到的图像为明显的绿色(图4a);错配序列的图像几乎为黑色(图4b和4c),说明传感器对DNA的互补识别特异性好。
实施例5:凝血酶的检测
采用专利所述液晶生物传感器检测凝血酶。采用优选参数m和n优选取值15,y=7:5的固定液制备一系列工作片基,其中固定于工作片基上的捕获探针中P1序列选用凝血酶的适配体序列(CTTACGGTGGGGCAATT),分别在传感基底上滴加不同浓度凝血酶待测液进行分子识别反应,按前述步骤组装液晶盒并置于偏光显微镜下观察、采集图像。结果如图5所示。可见随着待检测液中凝血酶浓度的增大,图像依次有黑色-灰色-黄色-粉红-绿色的色彩变化。
最后需要说明的是,上述描述仅仅为本发明的优选实施例,本领域的普通技术人员在本发明的启示下,在不违背本发明宗旨及权利要求的前提下,可以做出多种类似的表示,这样的变换均落入本发明的保护范围之内。
Claims (10)
1.一种DNA液晶生物传感器,其特征在于:包括捕获探针和隔离探针混合固定于表面镀有一层纳米级厚度金膜的玻片上而制成的工作片基,所述捕获探针由含有m个腺嘌呤A和与待检测物特异性识别结合的一段碱基序列P组成,并标记为AmP1;所述隔离探针含有n个腺嘌呤A的多聚腺嘌呤,并标记为An,所述m为正整数,所述n为自然数。
2.根据权利要求1所述的DNA液晶生物传感器,其特征在于:所述捕获探针和隔离探针的总浓度x为3μmol/L。
3.根据权利要求1或2所述的DNA液晶生物传感器及其制备方法和检测方法,其特征在于:所述捕获探针与隔离探针的浓度比y为1:(0~5)。
4.根据权利要求3所述的DNA液晶生物传感器及其制备方法和检测方法,其特征在于:所述捕获探针与隔离探针的浓度比y为7:5。
5.根据权利要求1所述的DNA液晶生物传感器及其制备方法和检测方法,其特征在于:所述m为15,n为15,所述碱基序列P的碱基数量为10~30个。
6.根据权利要求1所述的DNA液晶生物传感器的制备方法,其特征在于:所述金膜包括3nm的铬粘附层和10nm金膜层。
7.一种权利要求1~6任一项所述的DNA液晶生物传感器的制备方法,包括工作片基的制备、取向片基的制备,其特征在于所述工作片基的制备为:
a、玻片镀金处理:在清洗后的玻片表面镀上一层厚度均匀的金膜得到镀金基底;
b、配制DNA探针固定液并制成工作片基:将捕获探针AmP1和隔离探针An溶于缓冲液中并混合制成DNA探针固定液,然后将DNA探针固定液固定于所述镀金基底上,制成工作片基;所述捕获探针AmP1的面密度通过所述DNA探针固定液的浓度、捕获探针与隔离探针的浓度比、m和n的值所述捕获探针AmP1的面密度。
8.根据权利要求7所述的DNA液晶生物传感器的制备方法,其特征在于所述取向片基的制备为:将另一玻片清洗后并浸泡于液晶取向剂溶液中孵育,反应后经超纯水冲洗后吹干,再于烘箱中高温烘烤交联反应,经表面硅烷偶联处理后的液晶分子垂直取向,制成取向片基。
9.一种权利要求1~8任一项所述的DNA液晶生物传感器的检测方法,其特征在于:采用滴涂法将一定量的待测液滴加在所述工作片基表面,捕获探针与待测液中的目标检测物在室温下进行孵育反应,2h后用缓冲液、超纯水顺序冲洗,氮气吹干,再在所述取向片基上放置一铜载网,注入液晶,然后盖上经分子识别反应后的工作片基,最后,将取向片基和工作片基夹具固定,组成三明治结构的液晶盒,将所述液晶盒于偏光显微镜下观察并采集图像,通过图像的明暗程度及验收实现对待测的的半定量检测。
10.根据权利要求9所述的DNA液晶生物传感器的检测方法,其特征在于:所述液晶为向列相液晶,包括5CB、E7。
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