CN108018312A - 一种t淋巴细胞白血病的car-t治疗载体及其构建方法和应用 - Google Patents

一种t淋巴细胞白血病的car-t治疗载体及其构建方法和应用 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种T淋巴细胞白血病的CAR‑T治疗载体,包括慢病毒骨架质粒、人EF1α启动子、CAR嵌合受体结构域;CAR嵌合受体结构域包括:CD8 leader嵌合受体信号肽、CD7单链抗体轻链VL、CD7单链抗体重链VH、抗体内铰链UC Linker、CD8 Hinge嵌合受体铰链、CD8 Transmembrane嵌合受体跨膜区、TCR嵌合受体T细胞激活域以及嵌合受体共刺激因子区域。此外,本发明还公开了该载体的构建方法及其在制备治疗T淋巴细胞白血病的药物中的应用。

Description

一种T淋巴细胞白血病的CAR-T治疗载体及其构建方法和应用
技术领域
本发明属于医学生物领域,具体涉及一种载体,尤其涉及一种T淋巴细胞白血病的CAR-T治疗载体。此外,本发明还涉及该载体的构建方法和应用。
背景技术
肿瘤免疫治疗的理论基础是免疫系统具有识别肿瘤相关抗原、调控机体攻击肿瘤细胞(高度特异性的细胞溶解)的能力。1950年代,Burnet和Thomas提出了“免疫监视”理论,认为机体中经常会出现的突变的肿瘤细胞可被免疫系统所识别而清除,为肿瘤免疫治疗奠定了理论基础[Burnet FM.Immunological aspects of malignant disease.Lancet,1967;1:1171-4]。随后,各种肿瘤免疫疗法包括细胞因子疗法、单克隆抗体疗法、过继免疫疗法、疫苗疗法等相继应用于临床。
2013年一种更先进的肿瘤免疫疗法---CAR-T疗法成功用于临床,并表现了前所未有的临床疗效。CAR-T,全称是Chimeric Antigen Receptor T-Cell Immunotherapy,嵌合抗原受体T细胞免疫疗法。该疗法是通过转基因的手段,将启动子、抗原识别区、共刺激因子、效应区等共同组成的嵌合分子,导入T细胞基因组内,从而使T细胞对靶细胞的识别、信号转导、杀伤等功能融为一体,实现了对靶细胞的特异性杀伤[Eleanor J.Cheadle,etal.CAR T cells:driving the road from the laboratory to theclinic.Immunological Reviews 2014.Vol.257:91–106]。
北京时间2017年8月31日凌晨,美国食品药品监督管理局(FDA)批准诺华的CAR-T疗法Kymriah (tisagenlecleucel)上市,用于治疗急性淋巴细胞白血病(ALL),一次治疗的定价为47.5万美元。这是FDA批准的首款基因治疗药物,标志着CAR-T疗法终于走向市场。作为美国儿童中最常见的一种癌症,ALL是一种起源于淋巴细胞(多见于B细胞),在骨髓内恶性增生的骨髓及血液肿瘤。患者的正常造血功能受到抑制,进而出现贫血、发热、感染、出血等症状。虽然目前已经有针对ALL的有效疗法,但15%~20%的患者在接受治疗后效果不佳,或出现复发。而此次批准的Kymriah,针对的正是病情难治或出现复发的25岁以下ALL患者。在此前的临床试验中,63名病情难治或出现复发的儿童及青年ALL患者接受了Kymriah治疗,其3个月的缓解率达到83%[http://www.cn-healthcare.com/article/20170831/content-495313.html]。
北京时间2017年10月19日,美国食品和药物管理局(FDA)宣称批准了第二款癌症基因疗法,这是一种订制化基因治疗,面向淋巴癌成年患者该疗法采用与今年8月美国批准第一款基因疗法的相同技术—CAR-T疗法,这项治疗方案称为“Yescarta”,每位患者的费用为37.3万美元。在这项关键性测试中,Yescarta疗法治疗了101位患者,大约72%的患者表示其肿瘤萎缩,大约50%的患者在治疗8个月之后没有任何疾病迹象[http://finance.sina.com.cn/stock/usstock/c/2017-10-19/doc-ifymzzpv6386094.shtml]。
总部位于中国上海的上海优卡迪生物医药科技有限公司与国内知名医院开展广泛的合作,截止到2017年12月,共治疗复发难治的急性淋巴细胞白血病、多发性骨髓瘤、淋巴瘤等多种类型癌症患者共217例,其中完全缓解146例,完全缓解比例达到67%。这是抗癌研究的颠覆性突破。CAR-T细胞疗法正在成为最有可能治愈癌症的手段之一,并被《Science》杂志评为2013年度十大科技突破之首。
最常见的T细胞白血病是前T细胞性白血病/淋巴瘤(T-ALL),占据了大约15%的青少年急性白血病和40%的青少年淋巴瘤。这种疾病好发于青少年男性,形态学诊断等同于前B细胞性白血病,细胞表面标记包含TdT,CD2,CD7等。这种疾病的发生与NOTCH1基因的突变高度相关[Mitchell,Richard Sheppard;Kumar,Vinay;Abbas,Abul K.;Fausto,Nelson.Robbins Basic Pathology.Philadelphia:Saunders.ISBN 1-4160-2973-7.8thedition.]。
根据文献报道,人T细胞白血病病毒1(Human T-cell leukemia virus type 1,HTLV-1)感染人群的人存在于世界上大部分地区,尤其是在某些地区(包含日本西南地区,加勒比海地区,非洲赤道地区,南美部分地区,中东地区以及西南太平洋群岛部分地区)成为地域性传染病。全球估计现有1000-2000万HTLV-1的携带者,其中约5%会发展成为成人T细胞性白血病(ATL),成人T细胞性白血病包含四种亚型:郁积型成人T细胞性白血病、慢性成人T细胞性白血病、急性成人T细胞性白血病和成人T细胞性淋巴瘤(如图1所示)。病人的生存期在4个月到5年之间,目前没有特别有效的治疗方案[Amanda R Panfil,et al.HumanT-cellleukemia virus-associated malignancy.Current Opinion in Virology 2016,20:40–46]。
CD7又称T-cell leukemia antigen或者T-cell surface antigen Leu-9,分子量大约25kd,属于免疫球蛋白超家族的一员。主要存在于胸腺细胞和成熟T细胞表面。在白血病免疫分型间期作为T系早期的一个良好标志用于T淋巴细胞白血病的诊断及其亚型的划分。
目前,尚未有针对CD7的CAR-T细胞治疗的相关报道。
发明内容
本发明要解决的技术问题之一是提供一种T淋巴细胞白血病的CAR-T治疗载体。
本发明要解决的技术问题之二是提供该载体的构建方法。
本发明要解决的技术问题之三是提供该载体的应用。
为解决上述技术问题,本发明采用如下技术方案:
在本发明的一方面,提供一种T淋巴细胞白血病的CAR-T治疗载体,包括慢病毒骨架质粒、人EF1α启动子、CAR嵌合受体结构域;
所述慢病毒骨架质粒包括:用于目的菌株大量扩增的含氨苄青霉素抗性基因AmpR序列,如SEQ ID NO.1所示;用于质粒复制的原核复制子pUC Ori序列,如SEQ ID NO.2所示;用于增强真核细胞内的复制的病毒复制子SV40Ori序列,如SEQ ID NO.3所示;用于慢病毒包装的慢病毒包装顺式元件;ZsGreen1绿色荧光蛋白,如SEQ ID NO.11所示;IRES核糖体结合序列,如SEQ ID NO.12所示;用于增强转基因的表达效率的eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件,如SEQ ID NO.13所示;
所述人EF1α启动子的序列如SEQ ID NO.14所示;
所述CAR嵌合受体结构域包括:如SEQ ID NO.15所示的CD8leader嵌合受体信号肽、如SEQ ID NO.16所示的CD7单链抗体轻链VL、如SEQ ID NO.17所示的CD7单链抗体重链VH、如SEQ ID NO.18所示的抗体内铰链UC Linker、如SEQ ID NO.19所示的CD8Hinge嵌合受体铰链、如SEQ ID NO.20所示的CD8 Transmembrane嵌合受体跨膜区、如SEQ ID NO.24所示的TCR嵌合受体T细胞激活域以及嵌合受体共刺激因子区域;所述嵌合受体共刺激因子区域选自CD137(4-1BB)、ICOS、CD27、CD134(OX40)、CD28、MYD88、IL1R1、CD70、TNFRSF19L、TNFRSF27、TNFRSF1OD、TNFRSF13B、TNFRSF18等肿瘤坏死因子超家族(tumor necrosisfactor receptor superfamily,TNFRSF)中的任意一种或多种的组合。
所述慢病毒包装顺式元件可以采用第二代慢病毒载体,也可以采用第三代慢病毒载体。所述第二代慢病毒载体包括:如SEQ ID NO.5所示的慢病毒5 terminal LTR、如SEQID NO.6所示的慢病毒3 terminal Self-Inactivating LTR、如SEQ ID NO.7所示的Gag顺式元件、如SEQ ID NO.8所示的RRE顺式元件、如SEQ ID NO.9所示的env顺式元件、如SEQ IDNO.10所示的cPPT顺式元件;所述第三代慢病毒载体包括:如SEQ ID NO.5所示的慢病毒5terminal LTR、如SEQ ID NO.6所示的慢病毒3 terminal Self-Inactivating LTR、如SEQID NO.7所示的Gag顺式元件、如SEQ ID NO.8所示的RRE顺式元件、如SEQ ID NO.9所示的env顺式元件、如SEQ ID NO.10所示的cPPT顺式元件,以及如SEQ ID NO.4所示的RSV启动子。本发明优选采用第三代慢病毒载体。
优选的,所述嵌合受体共刺激因子区域采用如SEQ ID NO.21所示的CD28嵌合受体共刺激因子、如SEQ ID NO.22所示的CD134嵌合受体共刺激因子组合、如SEQ ID NO.23所示的CD137嵌合受体共刺激因子的任意一种或两种或三种组合。最优的,所述嵌合受体共刺激因子区域采用如SEQ ID NO.21所示的CD28嵌合受体共刺激因子和如SEQ ID NO.22所示的CD134嵌合受体共刺激因子的组合。
优选的,所述eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件有6个核苷酸的增强突变,具体为:g.396G>A、g.397C>T、g.398T>C、g.399G>A、g.400A>T、g.411A>T。
优选的,由所述人EF1α启动子启动整个CAR结构基因表达,所述CD8 leader嵌合受体信号肽位于CAR编码序列的N端,用于引导CAR蛋白定位于细胞膜;所述的CD7单链抗体轻链VL、CD7单链抗体重链VH以及抗体内铰链UC Linker构成抗原识别区,用于识别相应靶抗原CD7;所述CD8 Hinge嵌合受体铰链用于将scFv锚定于细胞膜外侧;所述CD8Transmembrane嵌合受体跨膜区用于将整个嵌合受体固定于细胞膜上;所述CD28嵌合受体共刺激因子用于刺激T淋巴细胞体外激活和体内肿瘤细胞杀伤作用;所述CD137嵌合受体共刺激因子被证明在T细胞中可增加TCR激活引起的增殖、生存和细胞因子分泌功能,从而促进细胞杀伤功能;所述CD134嵌合受体共刺激因子用于促进T淋巴细胞增殖和因子分泌,增强肿瘤免疫,有利于记忆T细胞的长期存活;所述TCR嵌合受体T细胞激活域用于激活下游信号通路的表达;当抗原识别区域与靶抗原结合时,信号通过嵌合受体传递至细胞内,从而产生T细胞增殖、细胞因子分泌增加、抗细胞凋亡蛋白分泌增加、细胞死亡延迟、裂解靶细胞一系列生物学效应。
优选的,所述的CD7单链抗体轻链VL、CD7单链抗体重链VH均经过人源化改造。
在本发明的第二方面,提供一种上述CAR-T治疗载体的构建方法,包括以下步骤:
(1)将如SEQ ID NO.1所示的含氨苄青霉素抗性基因AmpR序列、如SEQ ID NO.2所示的原核复制子pUC Ori序列、如SEQ ID NO.3所示的病毒复制子SV40Ori序列、用于慢病毒包装的慢病毒包装顺式元件、如SEQ ID NO.11所示的ZsGreen1绿色荧光蛋白、如SEQ IDNO.12所示的IRES核糖体结合序列、如SEQ IDNO.13所示的eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件存储于慢病毒骨架质粒上;
(2)将如SEQ ID NO.14所示的人EF1α启动子、所述CAR嵌合受体结构域组合成CAR嵌合抗原受体设计方案,经过酶切、连接、重组反应克隆至慢病毒骨架质粒中,得到第三代的重组慢病毒质粒;
(3)将得到的重组慢病毒质粒分别与慢病毒包装质粒pPac-GP、pPac-R以及膜蛋白质粒pEnv-G共同转染HEK293T/17细胞,在HEK293T/17细胞中进行基因转录表达后,包装成功重组慢病毒载体会释放到细胞培养上清中,收集包含的重组慢病毒载体的上清液;
(4)将得到的重组慢病毒上清采用抽滤、吸附、洗脱的柱纯化方式进行纯化,分别得到重组慢病毒载体。
优选的,步骤(4)中,所述抽滤步骤要控制上清体积在200ml~2000ml,控制真空度在-0.5MPA~-0.9MPA,防止由于堵孔带来的载体损失;所述吸附步骤要控制溶液的PH值在6~8,防止PH的变化导致载体失活;所述洗脱步骤要控制洗脱液的离子强度在0.5M~1.0M,防止离子强度的变化导致洗脱不完全或者载体失活。
在本发明的第三方面,提供所述的载体在制备治疗T淋巴细胞白血病的药物中的应用。本发明载体可以实现在人T淋巴细胞上表达靶向CD7的嵌合抗原受体,引导并激活T淋巴细胞对CD7等阳性细胞的杀伤作用,在临床上可用于T细胞白血病(T cell leukemias)包含前T细胞性白血病/淋巴瘤(Precursor T cell leukemia/lymphoma,T-ALL)、T慢性淋巴细胞白血病(Large granular lymphocytic leukemia,LGLL)、成人T细胞性白血病/淋巴瘤(Adult T-cell leukemia/lymphoma,ATL or ATLL)、T-细胞幼淋巴细胞性白血病(T-cellprolymphocytic leukemia,T-PLL)以及部分急性髓细胞性白血病(Acute myeloidleukemia,AML)等CD7阳性恶性肿瘤的治疗。
本发明所采用的靶向CD7的CAR-T技术,通过对嵌合抗原受体(CAR)结构的设计,使得嵌合抗原受体能够识别CD7抗原阳性的细胞,同时激活CAR-T细胞的增殖以及杀伤功能,使得CAR-T能够以MHC非依赖的方式特异杀伤靶细胞,深层清除患者体内的肿瘤细胞,达到病情缓解乃至痊愈的目的。
嵌合抗原受体(CAR)是CAR的核心部件(如图2所示),赋予免疫细胞HLA非依赖的方式识别肿瘤抗原的能力,这使得经过CAR改造的免疫细胞相较于天然免疫细胞表面受体TCR能够识别更广泛的目标。CAR的基础设计中包括一个肿瘤相关抗原(tμmor-associatedantigen,TAA)结合区(通常来源于单克隆抗体抗原结合区域的scFv段),一个胞外铰链区,一个跨膜区和一个胞内信号转导区。scFv段的设计对于CAR的特异性、有效性以及基因改造免疫细胞自身的安全性来是关键的决定因素。
图3B是第二代和第三代慢病毒载体结构比较示意图。本发明所采用的载体骨架为第三代慢病毒载体(如图3A所示),3’SIN LTR去除了U3区域,消除了慢病毒载体自我复制的可能性,大大提高了安全性;增加了cPPT和WPRE元件,提高了转导效率和转基因的表达效率;采用RSV启动子保证了慢病毒载体包装时核心RNA的持续高效转录;采用人自身的EF1α启动子,使CAR基因能够在人体内长时间持续表达。
本发明所采用的靶向CD7的CAR-T技术,是一种综合了肿瘤单克隆抗体的免疫治疗和肿瘤的过继免疫治疗优点的靶向治疗新技术。CD7在T淋巴细胞白血病中有着非常高的表达并且参与肿瘤的进展和增殖,因而是一个非常有潜力的治疗性靶标。在体外实验中,CAR7-T细胞在培养过程中没有表现相互攻击的倾向,具有安全,灵活的特点和潜在的抗肿瘤活性,因而是最有前景的T淋巴细胞白血病治疗方式,为将来彻底根治T淋巴细胞白血病提供了有力武器。
与现有技术相比,本发明具有如下有益效果:
申请人设计了多对CD7单链可变区(CD7scFv)及多条UC linker,经过对比试验筛选得到最优的单链抗体和便于示踪的抗体内铰链,即如SEQ ID NO.16所示的CD7单链抗体轻链VL、如SEQ ID NO.17所示的CD7单链抗体重链VH、如SEQ ID NO.18所示的抗体内铰链UCLinker。经试验验证,优选的单链抗体和便于示踪的抗体内铰链的细胞杀伤效率出乎意料得好,最高接近70%(见图11),达到了预料不到的技术效果。
本发明所述的CD7单链抗体轻链VL、CD7单链抗体重链VH、均经过人源化改造,能有有效减少体内人抗鼠抗(Human anti-mouse antibodies,HAMA)的产生,延长scFv的半衰期和作用效果,增加CAR-T细胞的存在时间。
本发明所述的抗体内铰链UC Linker,是一种创新型的铰链,它不仅能让所连接的结构域各自天然折叠,发挥生物学功能,并且同时携带strep tag II的追踪标签,可以为追踪靶标的位置提供了优秀的示踪工具。
本发明中,核酸序列经过独特的密码子优化设计,通过对RSCU,CAI,Fop和Nc等指标进行分析,既保证原代细胞的密码子偏好性,提高表达效率。又避免了GC含量过高、重复序列多、转录后mRNA二级结构形成、多个核糖体绑定位点等等影响构建效率、表达效率的缺点。
本发明采用的转基因载体是重组后的复制缺陷型慢病毒载体,能将外源片段整合入宿主基因,一次性使用,无法复制和增殖,安全可靠。
本发明中使用的共刺激因子的一种或若干种组合,能够增加转导后细胞的增殖速率、存活时间、杀伤效率、免疫记忆等特性。
本发明采用的CAR7-T细胞由GMP级别的车间生产后,可用于人体临床实验。
可见,本发明所述的CAR-T细胞将给肿瘤细胞治疗提供可靠的保障。
附图说明
图1是T淋巴细胞白血病患者数量、分布、类型和生存情况示意图;
图2是本发明嵌合抗原受体(CAR)的结构特征示意图;
图3是本发明所述的慢病毒载体结构示意图;其中图3A是本发明采用的第三代慢病毒载体结构示意图,图3B是第二代和第三代慢病毒载体结构比较示意图;
图4为构建本发明所述的重组慢病毒载体的构建流程图。其中,(A)图是慢病毒骨架质粒pLenti-3G basic的结构示意图;(B)图是7个CAR质粒的示意图;(C)图是pPac-GP质粒的结构示意图;(D)图是pPac-R质粒的结构示意图;(E)图是pEnv-G包装质粒的结构示意图;
图5是重组慢病毒质粒pCAR7-1~pCAR7-7的酶切预测及酶切琼脂糖凝胶电泳图;其中图5A是pCAR7-1的酶切预测示意图,图5B是pCAR7-1的酶切琼脂糖凝胶电泳图;图5C是pCAR7-2的酶切预测示意图,图5D是pCAR7-2的酶切琼脂糖凝胶电泳图;图5E是pCAR7-3的酶切预测示意图,图5F是pCAR7-3的酶切琼脂糖凝胶电泳图;图5G是pCAR7-4的酶切预测示意图,图5H是pCAR7-4的酶切琼脂糖凝胶电泳图;图5I是pCAR7-5的酶切预测示意图,图5J是pCAR7-5的酶切琼脂糖凝胶电泳图;图5K是pCAR7-6的酶切预测示意图,图5L是pCAR7-6的酶切琼脂糖凝胶电泳图;图5M是pCAR7-7的酶切预测示意图,图5N是pCAR7-7的酶切琼脂糖凝胶电泳图;其中,图5A中lane1是1kb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp;图5A中lane2是pCAR7-1的ApaLI酶切预测:条带从上到下依次为:5441bp、2175bp、1723bp、1241bp、497bp;图5B中lane1是1kb DNA ladder Marker的电泳结果;图5B中lane2是pCAR7-1的ApaLI酶切电泳结果;图5C中lane1是1kb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp;图5C中lane2是pCAR7-2的PvuI酶切预测:条带从上到下依次为:9938bp、889bp、244bp;图5D中lane1是1kb DNAladder Marker的电泳结果;图5D中lane2是pCAR7-2的Pvu I酶切电泳结果;图5E中lane1是1kb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp;图5E中lane2是pCAR7-3的BamH I酶切预测:条带从上到下依次为:11107bp;图5F中lane1是1kb DNA ladder Marker的电泳结果;图5F中lane2是pCAR7-3的BamH I酶切电泳结果;图5G中lane1是1kb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp;图5G中lane2是pCAR7-4的Pvu II酶切预测:条带从上到下依次为:4533bp、3335bp、2351bp、811bp;图5H中lane1是1kb DNA ladder Marker的电泳结果;图5H中lane2是pCAR7-4的Pvu II酶切电泳结果;图5I中lane1是1kb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp;图5I中lane2是pCAR7-5的Sal I酶切预测:条带从上到下依次为:8635bp、2117bp、338bp;图5J中lane1是1kb DNA ladder Marker的电泳结果;图5J中lane2是pCAR7-5的Sal I酶切电泳结果;图5K lane1是1kb DNA ladder Marker:条带从上到下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp;图5K中lane2是pCAR7-6的Xho I酶切预测:条带从上到下依次为:6845bp、3817bp、361bp;图5L中lane1是1kb DNA ladderMarker的电泳结果;图5L中lane2是pCAR7-6的Xho I酶切电泳结果;图5M中lane1是1kb DNAladder Marker:条带从上到下依次为:10kb、8kb、6kb、5kb、4kb、3.5kb、3kb、2.5kb、2kb、1.5kb、1kb、750bp、500bp、250bp;图5M中lane2是pCAR7-7的Pvu I酶切预测:条带从上到下依次为:9955bp、886bp、246bp;图5N中lane1是1kb DNA ladder Marker的电泳结果;图5N中lane2是pCAR7-7的Pvu I酶切电泳结果;
图6是本发明实施例1中重组慢病毒载体的滴度检测结果示意图;
图7为本发明实施例1中所述的CAR7-T细胞构建的步骤流程图,包含分离培养、激活、基因转导、CAR7-T细胞鉴定等阶段;
图8是本发明实施例2中CAR-T细胞的支原体检测结果示意图,图中,lane1为DL2000marker,从上到下条带条带从上到下依次为:2kb、1kb、750bp、500bp、250bp、100bp;lane2为阳性对照;lane3为阴性对照;lane4为PBS;lane5为裂解液;lane6为CAR7-1-T细胞;lane7为CAR7-2-T细胞;lane8为CAR7-3-T细胞;lane9为CAR7-4-T细胞;lane10为CAR7-5-T细胞;lane11为CAR7-6-T细胞;lane12为CAR7-7-T细胞;
图9为本发明实施例2中流式检测CAR-T细胞的转导效率以及免疫分型结果;其中,图9A表示CAR7-1-T细胞的转导效率结果;图9B表示CAR7-1-T细胞的免疫分型结果;图9C表示CAR7-2-T细胞的转导效率结果;图9D表示CAR7-2-T细胞的免疫分型结果;图9E表示CAR7-3-T细胞的转导效率结果;图9F表示CAR7-3-T细胞的免疫分型结果;图9G表示CAR7-4-T细胞的转导效率结果;图9H表示CAR7-4-T细胞的免疫分型结果;图9I表示CAR7-5-T细胞的转导效率结果;图9J表示CAR7-5-T细胞的免疫分型结果;图9K表示CAR7-6-T细胞的转导效率结果;图9L表示CAR7-6-T细胞的免疫分型结果;图9M表示CAR7-7-T细胞的转导效率结果;图9N表示CAR7-7-T细胞的免疫分型结果;
图10为本发明实施例3中不同效靶比条件下,CAR7-1-T~CAR7-7-T细胞对靶细胞杀伤效率的比较示意图。
图11为本发明实施例4中OCAR7-A-T~OCAR7-F-T的细胞杀伤效率比较示意图。
具体实施方式
下面结合具体实施例进一步阐述此发明。应理解的是,在此描述的特定实施方式通过举例的方式来表示,并不作为对本发明的限制。在不偏离本发明范围的情况下,本发明的主要特征可以用于各种实施方式。材料
1、慢病毒骨架质粒pLenti-3G basic,慢病毒包装质粒pPac-GP、pPac-R以及膜蛋白质粒pEnv-G,HEK293T/17细胞,同源重组酶,Oligo Annealing Buffer,支原体检测试剂盒,内毒素检测试剂盒,CD7+K562、K562细胞购自世翱(上海)生物医药科技有限公司;慢病毒骨架质粒pLenti-3G basic的具体制备方法已经公开在发明名称为“一种基于复制缺陷性重组慢病毒的CAR-T转基因载体及其构建方法和应用”,专利申请号为201610008360.5的专利申请说明书中;
2、人新鲜外周血由健康供者提供;
3、CAR7-1~CAR7-7DNA序列组合由上海优卡迪生物医药科技有限公司设计(参见表1),交给上海捷瑞生物工程有限公司合成,并以寡核苷酸干粉或者质粒形式保存;
4、工具酶Cla I、EcoR I、Sac II、T4DNA连接酶均购自NEB公司;
5、0.22μm-0.8μm PES滤器购自millipore公司;
6、D-PBS(-)、0.4%台盼蓝、筛网、各类型细胞培养皿、培养袋、培养板均购自corning公司;
7、Opti-MEM、Pen-Srep、Hepes、FBS、AIM-V、RPMI 1640、DMEM、lipofectamine 3000购自invitrogen公司;
8、Biotinylated protein L购自GeneScript公司;
9、LDH检测试剂盒购自promega公司;
10、Ficoll淋巴细胞分离液购自GE公司;
11、20%人血白蛋白注射液购自杰特贝林公司;
12、CryoPremium冻存液、分选缓冲液来自上海优卡迪公司;
13、rIL-2,rIL-7,,rIL-15,rIL-21购自peprotech公司;
14、CD3单克隆抗体,CD28单克隆抗体,CD3/CD28磁珠CD4/CD8磁珠购自德国Miltenyi公司;
15、冷冻离心机(美国ThermoScientific公司;
16、FACS流式细胞仪购自Thermo公司;
17、荧光倒置显微镜购自Olympus公司;
18、CD4-FITC、CD8-APC购自BioLegend公司;
19、0.9%生理盐水购自今迈公司;
20、ProteinL Magnetic Beads购自BioVision公司;
21、PrimeSTAR、RetroNectin购自Takara公司;
22、phycoerythrin(PE)-conjugated streptavidin购自BD Bioscience公司;
23、质粒抽提试剂盒、琼脂糖凝胶回收试剂盒均购自MN公司;
24、感受态细胞TOP10购自tiangen公司;
25、NaCl、KCl、Na2HPO4.12H2O、KH2PO4、Trypsin、EDTA、CaCl2、NaOH、PEG6000均购自上海生工;26、DNeasy试剂盒购自上海捷瑞公司;
27、SA-HRP购自上海翊圣公司;
28、引物:根据引物设计原则设计扩增DNA片段和靶位点所需的引物,该引物由上海生物公司合成,
具体为:
EF1α-F:5’-ATTCAAAATTTTATCGATGCTCCGGTGCCCGTCAGT-3’(SEQ ID NO.25)
EF1α-R:5’-TCACGACACCTGAAATGGAAGA-3’(SEQ ID NO.26)
CAR-F:CATTTCAGGTGTCGTGAGGATCCGCCACCATGGCGCTGCCGGTGAC(SEQ ID NO.27)
CAR-R:GGGGAGGGAGAGGGGCTTAGCGCGGCGGCAGCG(SEQ ID NO.28)
WPRE-QPCR-F:5’-CCTTTCCGGGACTTTCGCTTT-3’(SEQ ID NO.29)
WPRE-QPCR-R:5’-GCAGAATCCAGGTGGCAACA-3’(SEQ ID NO.30)
Actin-QPCR-F:5’-CATGTACGTTGCTATCCAGGC-3’(SEQ ID NO.31)
Actin-QPCR-R:5’-CTCCTTAATGTCACGCACGAT-3’(SEQ ID NO.32)
实施例1CAR-T细胞构建
一、重组慢病毒载体lvCAR7-1~lvCAR7-7的构建、纯化、检测方法。
参见图3,本发明所述重组慢病毒载体的构建方法如下:
1、将人EF1α启动子、CAR结构【CAR7-1~CAR7-7】、克隆至慢病毒骨架质粒pLenti-3G basic,分别得到重组慢病毒质粒pCAR7-1~pCAR7-7。元件顺序和编号如表1所示;
表1
(1)将慢病毒骨架质粒pLenti-3G basic使用Cla I和EcoR I限制性内切酶进行双酶切,产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认5823bp的片段V1,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
表2琼脂糖凝胶回收步骤
(2)用引物EF1α-F和EF1α-R以合成的SEQ ID NO.14为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃2min)*35cycle,72℃10min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1208bp的片段a,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
试剂 体积(μl)
H2O 32.5
5×Buffer(with Mg2+) 10
dNTP(各2.5mM) 4
Primer1(+)(10μM) 1
Primer2(-)(10μM) 1
Template 1
PrimeSTAR 0.5
表3 50μl PCR反应体系
(3)用引物CAR-F和CAR-R以合成的CAR7-1为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃30sec)*35cycle,72℃5min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1503bp的片段b,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
(4)用引物CAR-F和CAR-R以合成的CAR7-2为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃30sec)*35cycle,72℃5min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1521bp的片段c,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
(4)用引物CAR-F和CAR-R以合成的CAR7-3为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃30sec)*35cycle,72℃5min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1491bp的片段d,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
(4)用引物CAR-F和CAR-R以合成的CAR7-4为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃30sec)*35cycle,72℃5min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1644bp的片段e,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
(4)用引物CAR-F和CAR-R以合成的CAR7-5为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃30sec)*35cycle,72℃5min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1614bp的片段f,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
(4)用引物CAR-F和CAR-R以合成的CAR7-6为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃30sec)*35cycle,72℃5min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1632bp的片段g,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
(4)用引物CAR-F和CAR-R以合成的CAR7-7为模板,使用表3中的体系,PCR循环条件为:98℃3min,(98℃10sec,55℃15sec,72℃30sec)*35cycle,72℃5min。产物经过1.5%的琼脂糖凝胶电泳,确认1755bp的片段h,并割胶回收置于Eppendorf管内,用MN公司的琼脂糖凝胶回收试剂盒回收相应的片段(见表2),并测定产物的纯度和浓度;
(7)将重组慢病毒质粒DNA片段组合(见表4)以5μl总体积且摩尔比1:1:1:1的比例加入Eppendorf管内,加入同源重组酶反应液15μl,混匀后在42℃孵育30分钟,转移至冰上放置2-3分钟,将反应液加入50μl TOP10中,轻轻旋转以混匀内容物,在冰中放置30分钟,将管放到预加温到42℃的恒温水浴锅中热激90秒,快速将管转移到冰浴中,使细胞冷却2-3分钟,每管加900μl LB培养液,然后将管转移到37℃摇床上,温育1小时使细菌复苏,取100μl的转化菌液涂布于Amp LB琼脂平板上,倒置平皿,于恒温培养箱中37℃培养,16小时。
重组慢病毒质粒 片段组合
pCAR7-1 V1、a、b
pCAR7-2 V1、a、c
pCAR7-3 V1、a、d
pCAR7-4 V1、a、e
pCAR7-5 V1、a、f
pCAR7-6 V1、a、g
pCAR7-7 V1、a、h
表4重组慢病毒质粒DNA片段组合
挑取克隆进行菌落PCR鉴定,鉴定正确的克隆即为重组慢病毒质粒pCAR7-1~pCAR7-7,对正确的克隆进行酶切鉴定(见图5),并送测序复核结果。
2、重组慢病毒载体lvCAR7-1~lvCAR7-7的包装。
(1)完全培养基:取出预热好的新鲜培养基,加入10%FBS+5ml Pen-Srep,上下颠倒混匀即可;
(2)1XPBS溶液:称量NaCl 8g,KCl 0.2,Na2HPO4.12H2O 3.58g,KH2PO4 0.24g
置于1000ml烧杯中,加入900ml Milli-Q grade超纯水溶解,溶解完成后,使用1000ml量筒定容至1000ml,121℃高温湿热灭菌20min;
(3)0.25%Trypsin溶液:称量Trypsin 2.5g,EDTA 0.19729g置于1000ml烧杯中,加入900ml 1XPBS溶解,溶解完成后,使用1000ml量筒定容至1000ml,0.22μM过滤除菌,长期使用可保存至-20℃冰箱;
(4)0.5M CaCl2溶液:称量36.75g CaCl2用400ml Milli-Q grade超纯水溶解;用Milli-Q grade超纯水将总体积定容至500ml,混匀;0.22μm过滤除菌,分装保存到50ml离心管中,每管45ml左右,4℃保存。
(5)2XHBS溶液:称量4.09g NaCl,0.269g Na2HPO4,5.96g Hepes,用400ml Milli-Q grade超纯水溶解;校准pH仪后,用2M NaOH溶液将HBS溶液的pH调到7.05。调整每瓶HBS的PH消耗2M NaOH为3ml左右;
(6)从液氮罐中取出冻存的HEK293T/17细胞,迅速转移到37℃水浴中,1~2min后转移到超净台中,无菌操作将冻存管中的液体全部转移至10cm2培养皿中,补足含10%FBS的DMEM至8mL/10cm2dish,24h后显微镜观察细胞,细胞汇合的程度大于80%进行传代;
(7)选择细胞状态良好、无污染的HEK293T/17细胞,每2-6个培养皿为一组,将细胞胰酶消化后,用电动移液器吸取4-12ml完全培养基,向每个消化后的培养皿中加2ml,避免培养皿变干;使用1ml移液器将所有细胞吹打成单细胞悬液,转移到培养基瓶中;
(8)将上述2-6个培养皿中的剩余细胞转移到培养基瓶中,并用培养基再冲洗一便培养皿;
(9)盖紧培养基瓶盖,上下颠倒10次左右充分混匀细胞悬液,将细胞传到8-24个10cm2培养皿中,每皿的细胞密度应当约4×106个/10ml完全培养基左右。如果细胞密度和预期的相差较大,则需要对细胞进行计数,然后按照4×106个/皿的量接种;
(10)每6个培养皿整理为一摞,注意保持上下皿之间的配合。将培养皿左右,前后晃动数次,使细胞充分铺开,然后放入5%CO2培养箱。剩余细胞做同样处理;
(11)检查所传代细胞,细胞汇合度应当为70-80%,轮廓饱满,贴壁良好,在细胞培养皿中均匀分布;
(12)为细胞换液,将培养基替换为新鲜完全培养基,每皿9ml,并将培养箱的CO2浓度设定值提高到8%;
(13)按照N+0.5配DNA/CaCl2溶液。每皿HEK293T/17细胞转染质粒量按照下列比例使用:重组慢病毒质粒(20μg),pPac-GP(15μg),pPac-R(10μg),pEnv-G(7.5μg)。取一个新的5ml离心管,加入0.5M CaCl2:0.25ml,重组慢病毒质粒20μg:pPac-GP 15μg:pPac-R 10μg:pEnv-G 7.5μg,补充超纯水至0.5ml盖上盖子,充分混匀;
(14)另取一支5ml离心管,加入0.5ml DNA/CaCl2溶液。打开涡旋振荡器,一只手拿住5ml离心管的上端,使管底接触振荡头,使液体在管壁上散开流动,另一只手拿一把1mL移液枪,吸取0.5mL 2×HBS溶液,缓慢滴加进入离心管,控制流速,以半分钟滴完为宜。2×HBS加入后,继续振荡5秒钟,停止振荡,可直接加入需要转染的细胞中;
(15)取一皿细胞,将离心管中的1mL钙转液滴加进去,尽可能使钙转试剂分布到整个培养皿中;
(16)钙转液加入后,在皿盖上做好标记,将培养皿放还到另一个5%CO2培养箱中。确保培养皿水平放置,每摞培养皿不要超过6个。在5%CO2培养箱中放置(6–8h);
(17)将第一个培养箱的CO2浓度设定值调回到5%;
(18)24小时后,检查细胞状态。细胞汇合度应当为80–85%左右,状态良好。将培养基吸走,更换10ml新鲜的DMEM完全培养基;
(19)48小时后,观察转染效率。绝大多数细胞仍然是贴壁的。可以看到超过95%细胞都会带有绿色荧光。将同一个病毒包装上清液收集到一起,并向培养皿中继续添加10mL新鲜培养基;
(20)72小时后,再次将同一个病毒上清液收集到一起,两次收集的病毒可以放在一起,丢弃培养皿;此时收集的上清里包含了重组慢病毒载体lvCAR7-1~lvCAR7-7。
3、离子交换色谱法纯化重组慢病毒载体;
(1)将收集的上清液使用Thermo真空泵,经0.22μm-0.8μm的PES滤器抽滤,除去杂质;
(2)按1:1~1:10的比例往上清中加入1.5M NaCl 250mM Tris-HCl(pH 6-8);
(3)将2个离子交换柱串联放置,用4ml 1M NaOH、4ml 1M NaCl、5ml 0.15M NaCl25mM Tris-HCl(pH6-8)溶液依次过柱;
(4)将步骤2中获得的溶液通过蠕动泵以1-10ml/min的速度给离子交换柱上样;
(5)全部上清液过柱后,使用10ml 0.15M NaCl 25mM Tris-HCl(pH 6-8)溶液清洗一遍;
(6)根据上样量使用1-5ml 1.5M NaCl 25mM Tris-HCl(pH 6-8)进行洗脱,收集洗脱液;
(7)将洗脱液分成25到50μl一管,冻存到-80℃冰箱,进行长期保存;
4、重组慢病毒载体滴度测定;
(1)取24孔板接种293T细胞。每孔细胞为5×104个,所加培养基体积为500ul,不同种类的细胞生长速度有所差异,进行病毒感染时的细胞融合率为40%-60%;
(2)准备3个无菌EP管,在每个管中加入90ul的新鲜完全培养基(高糖DMEM+10%FBS)接种细胞24小时后,取两个孔的细胞用血球计数板计数,确定感染时细胞的实际数目,记为N;
(3)取待测定的病毒原液10ul加入到第一个管中,轻轻混匀后,取10ul加入到第二个管中,然后依次操作直到最后一管;在每管中加入410ul完全培养基(高糖DMEM+10%FBS),终体积为500ul;
(4)感染开始后20小时,除去培养上清,更换为500μl完全培养基(高糖DMEM+10%FBS),5%CO2继续培养48小时;
(5)72小时后,观察荧光表达情况,正常情况下,荧光细胞数随稀释倍数增加而相应减少,并拍照;
(6)用0.2ml 0.25%胰酶-EDTA溶液消化细胞,在37℃放置1分钟。用培养基吹洗整个细胞面,离心收集细胞。按照DNeasy试剂盒的说明抽提基因组DNA。每个样品管中加入200μl洗脱液洗下DNA并定量;
(7)准备目的DNA检测qPCRmix总管Ⅰ(QPCR引物序列为SEQ ID NO.29---SEQ IDNO.30):
n=number of reactions.例如:总反应数为40,将1ml 2×TaqMan UniversalPCR Master Mix,4μl forwardprimer,4μl reverse primer,4μl probe和788μl H2O混和。震荡后放在冰上;
(8)准备内参DNA检测qPCRmix管Ⅱ(QPCR引物序列为SEQ ID NO.31---SEQ IDNO.32):
2×TaqMan Master Mix 25μl×n
10×RNaseP primer/probe mix 2.5μl×n
H2O 17.5μl×n
n=number of reactions.例如:总反应数为40,将1ml 2×TaqMan UniversalPCR Master Mix,100μl 10×RNaseP primer/probe mix和700μl H2O混和。震荡后放在冰上;
(9)在预冷的96孔PCR板上完成PCR体系建立。从总管Ⅰ中各取45μl加入到A-D各行的孔中,从总管Ⅱ中各取45μl加入到E-G各行的孔中。
(10)分别取5μl质粒标准品和待测样品基因组DNA加入到A-D行中,每个样品重复1次。另留1个孔加入5μl的水做为无模板对照(no-template control)。
(11)分别取5μl基因组标准品和待测样品基因组DNA加入到E-G行中,每个样品重复1次。另留1个孔加入5μl的水做为无模板对照(no-template control)。
(12)所使用定量PCR仪为ABI PRISM 7500定量系统。循环条件设定为:50℃2分钟,95℃10分钟,然后是95℃15秒,60℃1分钟的40个循环。
数据分析:测得的DNA样品中整合的慢病毒载体拷贝数用基因组数加以标定,得到每基因组整合的病毒拷贝数。
滴度(integration units per ml,IU ml-1)的计算公式如下:
IU ml-1=(C×N×D×1000)/V
其中:C=平均每基因组整合的病毒拷贝数
N=感染时细胞的数目(约为1×105)
D=病毒载体的稀释倍数
V=加入的稀释病毒的体积数
(13)重组慢病毒载体lvCAR7-1~lvCAR7-7的滴度结果(如图6所示);
二、CAR-T细胞构建
参见图7,本发明所述CAR-T细胞的构建方法如下:
1、分离PBMC。
(1)抽取健康供者新鲜外周血50ml;
(2)将采血袋喷拭酒精两遍,并擦干。
(3)用50ml注射器将袋中的血细胞吸出来移至新50ml管中。
(4)400g,20℃离心10min。
(5)将上层血浆移到新的50ml离心管中,56℃,30min灭活血浆,恢复至室温,2000g,离心30min,取上清到50ml离心管中待用。
(6)用D-PBS(-)补至50ml,拧紧盖子,颠倒混匀。
(7)取2个新50ml离心管,每管加入15ml Ficoll淋巴细胞分离液。
(8)向每管Ficoll上小心加入血细胞稀释液25ml。800g,20℃离心20min。
(9)离心管中液体分为四层,从上至下分别为:黄色的血浆层(回收待用)、白膜层、无色透明的Ficoll层、红黑色的混合细胞层。
(10)小心吸取白膜层到新50ml离心管中,补加D-PBS(-)至50ml,颠倒混匀后500g,20℃离心10min。
(11)加入25ml 5%人血白蛋白并重悬细胞,400g,20℃离心10min。
(12)弃上清,加入25ml 5%人血白蛋白重悬细胞沉淀,并过70um筛网,计数。
(13)取1份含1.25x108cells用于激活;剩余细胞悬液400g,20℃离心10min,加CryoPremium并冻存。
2、CD4/CD8阳性T细胞分选。
(1)将获得的PBMC计数,以80ul/107cells的比例加入分选缓冲液,重悬细胞沉淀。
(2)再以20ul/107cells的比例加入CD4/CD8磁珠,吹打混匀后放入4℃中孵育15min。
(3)取出磁珠-细胞混合液,以2ml/107cells的比例加入分选缓冲液,颠倒混匀后,250g,4℃离心10min。
(4)以500ul/108cells的比例加入分选缓冲液,重悬细胞沉淀。
(5)用镊子夹取LS分离柱到磁力架上。
(6)同时准备2个15ml离心管,分别标记:CD4-/CD8-细胞液(A管)、CD4+/CD8+细胞液(B管)。
(7)用3ml分离缓冲液润洗LS,并用A管接缓冲液。
(8)加入细胞-磁珠混合液,滴完后加入3ml缓冲液冲洗柱子(每次无液体残留时再加入新的液体),总共三次,收集得到CD4/CD8-细胞。
(9)LS分离柱与磁力架分离,用B管接细胞悬液,加入5ml缓冲液,将并用柱子内塞稍用力冲洗,收集为CD4+/CD8+细胞,取样计数。
(10)按1x106/ml-4x106/ml的细胞密度用AIM-V培养基重悬细胞沉淀,并加入2×105~1×106U/L IFN-γ因子。
3、T细胞激活。
(1)提前一天将1×103ug/L~1×104ug/L CD3单克隆抗体和1×103ug/L~1×104ug/L CD28单克隆抗体加入24孔板,封口膜封口,4℃过夜包被。
(2)取出包被的T75瓶,倒掉包被液,用D-PBS(-)洗涤一次,并将分选得到的细胞悬液接种到T75瓶中,摇匀,放入37℃、5%CO2培养箱中培养。
4、CAR基因转导及CAR-T细胞诱导培养。
(1)提前一天包被1×103ug/L~1×104ug/L RetroNectin于24孔板内,封口膜封口,4℃过夜包被。
(2)往24孔板中,根据每孔5×105细胞量,按MOI=5~20的量,分别加入lvCAR7-1~lvCAR7-7慢病毒转基因载体,同时添加含2×105~5×105U/L rIL-2,5×103ng/L~1×104ng/L rIL-7,5×103ng/L~1×104ng/L rIL-15,5×103ng/L~1×104ng/L rIL-21和含10%自体血清的AIM-V培养基37℃、5%CO2继续培养。
5、CAR-T细胞体外扩增。
(1)每2天等量补加含2×105~5×105U/L rIL-2,5×103ng/L~1×104ng/L rIL-7,5×103ng/L~1×104ng/L rIL-15,5×103ng/L~1×104ng/L rIL-21和含10%自体血清的AIM-V培养基,使PH值维持在6.5~7.5之间,细胞密度维持在5×105~2×106/ml之间,37℃、5%CO2继续培养10-14天。
(2)第7天左右,冻存培养的CAR-T细胞用于后续检测。
实施例2
CAR-T细胞病原检测和表达检测。
一、内毒素检测;
(1)、内毒素工作标准品为15EU/支;
(2)、鲎试剂灵敏度λ=0.25EU/ml,0.5ml/管
(3)、内毒素标准品稀释:取内毒素标准品一支,分别用BET水按比例稀释成4λ和2λ的溶解,封口膜封口,震荡溶解15min;稀释时每稀释一步均应在漩涡混合器上混匀30s;
(4)、加样:取鲎试剂若干支,每支加入BET水0.5ml溶解,分装至若干支无内毒素试管中,每管0.1ml。其中2支为阴性对照管,加入BET水0.1ml;
2支为阳性对照管,加入2λ浓度的内毒素工作标准品溶液0.1ml;
2支为样品阳性对照管,加入0.1ml含2λ内毒素标准品的样品溶液(稀释20倍的待测样品1ml+4λ的内毒素标准品溶液1ml=2ml含2λ内毒素标准品的稀释40倍样品)。
样品管中加入0.1ml样品,稀释比例见表5,37±1℃水浴(或培养箱)保温60±1min;
表5内毒素稀释比例及对应内毒素含量
(5)、CAR7-1-T~CAR7-7-T细胞的内毒素检测结果(如表6所示),所有细胞的内毒素含量均小于2.5EU/ml,符合《中华人民共和国药典》中小于10EU/ml的标准;
稀释倍数 原液 5 10 20 40 80 160
对应EU/ml 0.25 1.25 2.5 5 10 20 40
CAR7-1-T (+) (-) (-) (-) (-) (-) (-)
CAR7-2-T (+) (-) (-) (-) (-) (-) (-)
CAR7-3-T (+) (-) (-) (-) (-) (-) (-)
CAR7-4-T (+) (+) (-) (-) (-) (-) (-)
CAR7-5-T (+) (+) (-) (-) (-) (-) (-)
CAR7-6-T (+) (-) (-) (-) (-) (-) (-)
CAR7-7-T (+) (-) (-) (-) (-) (-) (-)
表6是CAR-T细胞的内毒素检测结果
二、支原体检测;
(1)在实验前三日,细胞样品用无抗生素培养基进行培养;
(2)收集1ml细胞悬浮液(细胞数大于1*105),置于1.5ml离心管中;
(3)13000g离心1min,收集沉淀,弃去培养基;
(4)加入500ul PBS用枪头吹吸或涡旋振荡,重悬沉淀。13000g离心5min;
(5)步骤4重复一次;
(6)加入50μl Cell Lysis Buffer,用枪头吹吸,充分混匀后,在55℃水浴中孵育20min;
(7)将样品置于95℃中加热5min;
(8)13000g离心5min后,取5μl上清作为模板,25μl PCR反应体系为:ddH20 6.5μl、Myco Mix 1μl、2x Taq Plus Mix Master(Dye Plus)12.5μl、模板5μl;PCR循环条件为:95℃30sec,(95℃30sec,56℃30sec,72℃30sec)*30cycle,72℃5min。
(9)支原体检测结果显示(如图8所示),CAR-T细胞中均不含支原体。
三、CAR基因转导效率检测及免疫分型检测;
(1)收集经病毒转导后的T细胞,用含1~4%人血白蛋白的D-PBS(-)溶液重悬细胞并调整为1×106/ml。
(2)向离心管中加入含1~4%人血白蛋白的D-PBS(-)溶液1ml并混匀,350g离心5min,弃上清。
(3)重复步骤2一次。
(4)用0.2ml的含1~4%人血白蛋白的D-PBS(-)溶液重悬细胞,并向离心管中加入1ul的1mg/ul protein L,5ul CD4-FITC,5ul CD8-APC,混匀,4℃孵育45min。
(5)向离心管中加入1ml含1~4%人血白蛋白的D-PBS(-)溶液并混匀,350g离心5min,弃上清。
(6)重复步骤5两次。
(7)用0.2ml含1~4%人血白蛋白的D-PBS(-)溶液重悬细胞,并向离心管中加入0.2ul PE-SA,混匀,37℃避光孵育15min。
(8)向离心管中加入1ml含1~4%人血白蛋白的D-PBS(-)溶液重并混匀,350g离心5min,弃上清。
(9)用1ml D-PBS(-)溶液重悬细胞沉淀,350g离心5min,弃上清。
(10)重复步骤9两次。
(11)用0.4ml D-PBS(-)溶液重悬细胞沉淀,流式细胞仪进行检测。
(12)CAR基因转导效率及免疫分型检测检测结果如图9所示,制备的CAR-T细胞的感染效率均位于40%以上,CD4阳性细胞和CD8阳性细胞的比例位于1:5~5:1之间,可以进行后续功能检测。
实施例3CAR-T细胞的功能检测。
一、靶细胞杀伤效果评估。
(1)分别培养靶细胞[CD7+K562、K562细胞]和效应细胞[CAR-T细胞];
(2)收集靶细胞4x105cells和CAR-T细胞2.8x106cells,800g,6min离心,弃上清;
(3)用1ml D-PBS(-)溶液分别重悬靶细胞和效应细胞,800g,6min离心,弃上清;
(4)重复步骤3一次;
(5)用700ul培养基(AIM-V培养基+1~10%FBS)重悬效应细胞,用2ml培养基(AIM-V培养基+1~10%FBS)重悬靶细胞;
(6)设置效靶比为1:1、5:1、10:1的实验孔,分组情况如图11所示,并设置对照组(K562细胞),每组3个复孔;
(7)250g,5min平板离心;
(8)37℃,5%CO2培养箱中培养4小时;
(9)250g,5min平板离心;
(10)取每个孔的50ul上清到新96孔板中,并且每孔加入50ul底物溶液(避光操作);
(11)避光孵育25min;
(12)每孔加入50ul终止液;
(13)酶标仪检测490nm吸光度;
(14)将3个复孔取平均值;将所有实验孔、靶细胞孔和效应细胞孔的吸光值减去培养基背景吸光值的均值;将靶细胞最大值的吸光值减去体积校正对照吸光值的均值。
(15)将步骤14中获得的经过校正的值带入下面公式,计算每个效靶比所产生的细胞毒性百分比。
结果如图10所示,CAR7-1-T~CAR7-7-T对靶细胞均有较好的杀伤效果,其中CAR7-5-T细胞的杀伤效率最高;
杀伤效率=(实验孔-效应细胞孔-靶细胞孔)/(靶细胞最大孔-靶细胞孔)X100%
(16)上述实验结果表明,通过对不同共刺激域组合的CAR7-T细胞对CD7+K562靶细胞均有显著的杀伤效果,其中CAR7-5-T的杀伤效果最为突出,因此CAR-T细胞将在未来的对T细胞白血病(T cell leukemias)包含前T细胞性白血病/淋巴瘤(Precursor T cellleukemia/lymphoma,T-ALL)、T慢性淋巴细胞白血病(Large granular lymphocyticleukemia,LGLL)、成人T细胞性白血病/淋巴瘤(Adult T-cell leukemia/lymphoma,ATLorATLL)、T-细胞幼淋巴细胞性白血病(T-cell prolymphocytic leukemia,T-PLL)以及部分急性髓细胞性白血病(Acute myeloid leukemia,AML)等CD7阳性恶性肿瘤的细胞治疗中发挥巨大的作用。
实施例4CD7单链可变区(CD7scFv)及UC linker优选实验。
为了选取最优的单链抗体和便于示踪的抗体内铰链,设计了优化实验,具体分组见下表7,
表7
CD7单链抗体轻链VL(SEQ ID NO.16)、CD7单链抗体重链VH(SEQ ID NO.17)、CD7单链抗体轻链VL2(SEQ ID NO.33)、CD7单链抗体重链VH2(SEQ ID NO.34)、CD7单链抗体轻链VL3(SEQ ID NO.35)、CD7单链抗体重链VH3(SEQ ID NO.36)、抗体内铰链UC Linker(SEQ IDNO.18)、Optimal Linker C(SEQ ID NO.37)、CD8Hinge嵌合受体铰链(SEQ ID NO.19)、CD8Transmembrane嵌合受体跨膜区(SEQ ID NO.20)、CD137嵌合受体共刺激因子(SEQ IDNO.23)、TCR嵌合受体T细胞激活域(SEQ ID NO.24),按上表7的元件顺序进行CAR-T细胞制备、CAR-T细胞病原检测和表达检测和CAR-T细胞的功能检测,由pOCAR7-A~pOCAR7-F质粒载体开始,到制备出OCAR7-A-T~OCAR7-F-T细胞,具体步骤分别参照实施例1、2、3.
如图11所示,结果分析如下:
OCAR7-A-T对比OCAR7-B-T和OCAR7-C-T细胞,在效靶比1:1、5:1、10:1三个比例上的杀伤效率最高。
OCAR7-D-T对比OCAR7-E-T和OCAR7-F-T细胞,在效靶比1:1、5:1、10:1三个比例上的杀伤效率最高。
由此得出结论,CD7单链抗体轻链VL(SEQ ID NO.16)、CD7单链抗体重链VH(SEQ IDNO.17)组合成的单链抗体可变区(scFv)的识别效果最好,作为优选的靶向CD7的CAR7-T细胞的抗原识别区。
OCAR7-A-T对比OCAR7-D-T细胞,在效靶比1:1、5:1、10:1三个比例上的杀伤效率接近。
OCAR7-B-T对比OCAR7-E-T细胞,在效靶比1:1、5:1、10:1三个比例上的杀伤效率接近。
OCAR7-C-T对比OCAR7-F-T细胞,在效靶比1:1、5:1、10:1三个比例上的杀伤效率接近。
由此得出结论,抗体内铰链UC Linker(SEQ ID NO.18)对比Optimal Linker C(SEQ ID NO.37)并不影响CAR7-T细胞的杀伤效率,并且还增加了标签和示踪的功能,因此作为优选的靶向CD7的CAR7-T细胞的单链抗体可变区(scFv)的铰链。
综上所述,申请人设计了多对CD7单链可变区(CD7scFv)及多条UC linker,经过对比试验筛选得到最优的单链抗体和便于示踪的抗体内铰链,即CD7单链抗体轻链VL(SEQ IDNO.16)、CD7单链抗体重链VH(SEQ ID NO.17)、抗体内铰链UC Linker(SEQ ID NO.18)的组合作为优选的靶向CD7的CAR7-T细胞的抗原识别区以及铰链。经试验验证,优选的单链抗体和便于示踪的抗体内铰链的细胞杀伤效率出乎意料得好,最高接近70%(见图11),达到了预料不到的技术效果。
序列表
<110>上海优卡迪生物医药科技有限公司
<120>一种T淋巴细胞白血病的CAR-T治疗载体及其构建方法和应用
<130> HJ17-14540
<160> 37
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 861
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 1
atgagtattc aacatttccg tgtcgccctt attccctttt ttgcggcatt ttgccttcct 60
gtttttgctc acccagaaac gctggtgaaa gtaaaagatg ctgaagatca gttgggtgca 120
cgagtgggtt acatcgaact ggatctcaac agcggtaaga tccttgagag ttttcgcccc 180
gaagaacgtt ttccaatgat gagcactttt aaagttctgc tatgtggcgc ggtattatcc 240
cgtattgacg ccgggcaaga gcaactcggt cgccgcatac actattctca gaatgacttg 300
gttgagtact caccagtcac agaaaagcat cttacggatg gcatgacagt aagagaatta 360
tgcagtgctg ccataaccat gagtgataac actgcggcca acttacttct gacaacgatc 420
ggaggaccga aggagctaac cgcttttttg cacaacatgg gggatcatgt aactcgcctt 480
gatcgttggg aaccggagct gaatgaagcc ataccaaacg acgagcgtga caccacgatg 540
cctgtagcaa tggcaacaac gttgcgcaaa ctattaactg gcgaactact tactctagct 600
tcccggcaac aattaataga ctggatggag gcggataaag ttgcaggacc acttctgcgc 660
tcggcccttc cggctggctg gtttattgct gataaatctg gagccggtga gcgtgggtct 720
cgcggtatca ttgcagcact ggggccagat ggtaagccct cccgtatcgt agttatctac 780
acgacgggga gtcaggcaac tatggatgaa cgaaatagac agatcgctga gataggtgcc 840
tcactgatta agcattggta a 861
<210> 2
<211> 674
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 2
cccgtagaaa agatcaaagg atcttcttga gatccttttt ttctgcgcgt aatctgctgc 60
ttgcaaacaa aaaaaccacc gctaccagcg gtggtttgtt tgccggatca agagctacca 120
actctttttc cgaaggtaac tggcttcagc agagcgcaga taccaaatac tgtccttcta 180
gtgtagccgt agttaggcca ccacttcaag aactctgtag caccgcctac atacctcgct 240
ctgctaatcc tgttaccagt ggctgctgcc agtggcgata agtcgtgtct taccgggttg 300
gactcaagac gatagttacc ggataaggcg cagcggtcgg gctgaacggg gggttcgtgc 360
acacagccca gcttggagcg aacgacctac accgaactga gatacctaca gcgtgagcta 420
tgagaaagcg ccacgcttcc cgaagggaga aaggcggaca ggtatccggt aagcggcagg 480
gtcggaacag gagagcgcac gagggagctt ccagggggaa acgcctggta tctttatagt 540
cctgtcgggt ttcgccacct ctgacttgag cgtcgatttt tgtgatgctc gtcagggggg 600
cggagcctat ggaaaaacgc cagcaacgcg gcctttttac ggttcctggc cttttgctgg 660
ccttttgctc acat 674
<210> 3
<211> 147
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 3
atcccgcccc taactccgcc cagttccgcc cattctccgc cccatggctg actaattttt 60
tttatttatg cagaggccga ggccgcctcg gcctctgagc tattccagaa gtagtgagga 120
ggcttttttg gaggcctaga cttttgc 147
<210> 4
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<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 4
gtagtcttat gcaatactct tgtagtcttg caacatggta acgatgagtt agcaacatgc 60
cttacaagga gagaaaaagc accgtgcatg ccgattggtg gaagtaaggt ggtacgatcg 120
tgccttatta ggaaggcaac agacgggtct gacatggatt ggacgaacca ctgaattgcc 180
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<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 5
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<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 6
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acaacagacg ggcacacact acttgaagca ctcaaggcaa gctttattga ggcttaagca 120
gtgggttccc tagttagcca gagagctccc aggctcagat ctggtctaac cagagagacc 180
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<213>人工序列(未知)
<400> 7
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ggttaaggcc agggggaaag aaaaaatata aattaaaaca tatagtatgg gcaagcaggg 120
agctagaacg attcgcagtt aatcctggcc tgttagaaac atcagaaggc tgtagacaaa 180
tactgggaca gctacaacca tcccttcaga caggatcaga agaacttaga tcattatata 240
atacagtagc aaccctctat tgtgtgcatc aaaggataga gataaaagac accaaggaag 300
ctttagacaa gatagaggaa gagcaaaaca aaagtaagac caccgcacag caa 353
<210> 8
<211> 233
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 8
aggagctttg ttccttgggt tcttgggagc agcaggaagc actatgggcg cagcctcaat 60
gacgctgacg gtacaggcca gacaattatt gtctggtata gtgcagcagc agaacaattt 120
gctgagggct attgaggcgc aacagcatct gttgcaactc acagtctggg gcatcaagca 180
gctccaggca agaatcctgg ctgtggaaag atacctaaag gatcaacagc tcc 233
<210> 9
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<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 9
tggggatttg gggttgctct ggaaaactca tttgcaccac tgctgtgcct tggaatgcta 60
gttggagtaa taaatctctg gaacagattg gaatcacacg acctggatgg agtgggacag 120
agaaattaac aattacacaa gcttaataca ctccttaatt gaagaatcgc aaaaccagca 180
agaaaagaat gaacaagaat tattggaatt agataaatgg gcaagtttgt ggaattggtt 240
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aggtttaaga atagtttttg ctgtactttc tatagtgaat agagttaggc agggatattc 360
accattatcg tttcagaccc acctcccaac cccgagggga cccgacaggc ccgaaggaat 420
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acggttaac 489
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<212> DNA
<213>人工序列(未知)
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ttttaaaaga aaagggggga ttggggggta cagtgcaggg gaaagaatag tagacataat 60
agcaacagac atacaaacta aagaattaca aaaacaaatt acaaaaattc aaaatttta 119
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<400> 11
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ttgaagggcg acgtgagcat gtacctgctg ctgaaggacg gtggccgctt gcgctgccag 540
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cagcacaagc tgacccgcga ggaccgcagc gacgccaaga accagaagtg gcacctgacc 660
gagcacgcca tcgcctccgg ctccgccttg ccctga 696
<210> 12
<211> 575
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 12
gcccctctcc ctcccccccc cctaacgtta ctggccgaag ccgcttggaa taaggccggt 60
gtgcgtttgt ctatatgtta ttttccacca tattgccgtc ttttggcaat gtgagggccc 120
ggaaacctgg ccctgtcttc ttgacgagca ttcctagggg tctttcccct ctcgccaaag 180
gaatgcaagg tctgttgaat gtcgtgaagg aagcagttcc tctggaagct tcttgaagac 240
aaacaacgtc tgtagcgacc ctttgcaggc agcggaaccc cccacctggc gacaggtgcc 300
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<211> 592
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 13
aatcaacctc tggattacaa aatttgtgaa agattgactg gtattcttaa ctatgttgct 60
ccttttacgc tatgtggata cgctgcttta atgcctttgt atcatgctat tgcttcccgt 120
atggctttca ttttctcctc cttgtataaa tcctggttgc tgtctcttta tgaggagttg 180
tggcccgttg tcaggcaacg tggcgtggtg tgcactgtgt ttgctgacgc aacccccact 240
ggttggggca ttgccaccac ctgtcagctc ctttccggga ctttcgcttt ccccctccct 300
attgccacgg cggaactcat cgccgcctgc cttgcccgct gctggacagg ggctcggctg 360
ttgggcactg acaattccgt ggtgttgtcg gggaaatcat cgtcctttcc ttggctgctc 420
gcctgtgttg ccacctggat tctgcgcggg acgtccttct gctacgtccc ttcggccctc 480
aatccagcgg accttccttc ccgcggcctg ctgccggctc tgcggcctct tccgcgtctt 540
cgccttcgcc ctcagacgag tcggatctcc ctttgggccg cctccccgcc tg 592
<210> 14
<211> 1178
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 14
gctccggtgc ccgtcagtgg gcagagcgca catcgcccac agtccccgag aagttggggg 60
gaggggtcgg caattgaacc ggtgcctaga gaaggtggcg cggggtaaac tgggaaagtg 120
atgtcgtgta ctggctccgc ctttttcccg agggtggggg agaaccgtat ataagtgcag 180
tagtcgccgt gaacgttctt tttcgcaacg ggtttgccgc cagaacacag gtaagtgccg 240
tgtgtggttc ccgcgggcct ggcctcttta cgggttatgg cccttgcgtg ccttgaatta 300
cttccacctg gctgcagtac gtgattcttg atcccgagct tcgggttgga agtgggtggg 360
agagttcgag gccttgcgct taaggagccc cttcgcctcg tgcttgagtt gaggcctggc 420
ctgggcgctg gggccgccgc gtgcgaatct ggtggcacct tcgcgcctgt ctcgctgctt 480
tcgataagtc tctagccatt taaaattttt gatgacctgc tgcgacgctt tttttctggc 540
aagatagtct tgtaaatgcg ggccaagatc tgcacactgg tatttcggtt tttggggccg 600
cgggcggcga cggggcccgt gcgtcccagc gcacatgttc ggcgaggcgg ggcctgcgag 660
cgcggccacc gagaatcgga cgggggtagt ctcaagctgg ccggcctgct ctggtgcctg 720
gcctcgcgcc gccgtgtatc gccccgccct gggcggcaag gctggcccgg tcggcaccag 780
ttgcgtgagc ggaaagatgg ccgcttcccg gccctgctgc agggagctca aaatggagga 840
cgcggcgctc gggagagcgg gcgggtgagt cacccacaca aaggaaaagg gcctttccgt 900
cctcagccgt cgcttcatgt gactccactg agtaccgggc gccgtccagg cacctcgatt 960
agttctcgag cttttggagt acgtcgtctt taggttgggg ggaggggttt tatgcgatgg 1020
agtttcccca cactgagtgg gtggagactg aagttaggcc agcttggcac ttgatgtaat 1080
tctccttgga atttgccctt tttgagtttg gatcttggtt cattctcaag cctcagacag 1140
tggttcaaag tttttttctt ccatttcagg tgtcgtga 1178
<210> 15
<211> 63
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 15
atggccttac cagtgaccgc cttgctcctg ccgctggcct tgctgctcca cgccgccagg 60
ccg 63
<210> 16
<211> 315
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 16
gacatcgagc tcactcagtc tccagcaatc atgtctgcat ctctagggga ggagatcacc 60
ctaacctgca gtgccagctc gagtgtaagt tacatgcact ggtaccagca gaagtcaggc 120
acttctccca aactcttgat ttatagcaca tccaacctgg cttctggagt cccttctcgc 180
ttcagtggca gtgggtctgg gaccttttat tctctcacaa tcagcagtgt ggaggctgaa 240
gatgctgccg attattactg ccatcagtgg agtagttaca cgttcggagg gggcaccaag 300
ctggaaatca aacgg 315
<210> 17
<211> 360
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 17
caggtgaagc tgcaggagtc agggggaggc ttagtgaagc ctggagggtc cctgaaactc 60
tcctgtgcag cctctggatt cactttcagt agctatgcca tgtcttgggt tcgccagact 120
ccggagaaga ggctggagtg ggtcgcaacc attagtagtg gtggtagtta cacctactat 180
ccagacagtg tgaaggggcg attcaccatc tccagagaca atgccaagaa caccctgtac 240
ctgcaaatga gcagtctgag gtctgaggac acggccatgt attactgtgc aagacaggat 300
ggttactacc cgggctggtt tgctaactgg gggcaaggga ccacggtcac cgtctcctca 360
<210> 18
<211> 56
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 18
ggtggcggtg gctcgaactg gagccatccg cagtttgaaa aaggtggcgg cggatc 56
<210> 19
<211> 141
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 19
accacgacgc cagcgccgcg accaccaaca ccggcgccca ccatcgcgtc gcagcccctg 60
tccctgcgcc cagaggcgtg ccggccagcg gcggggggcg cagtgcacac gagggggctg 120
gacttcgcct gtgatatcta c 141
<210> 20
<211> 66
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 20
atctgggcgc ccttggccgg gacttgtggg gtccttctcc tgtcactggt tatcaccctt 60
tactgc 66
<210> 21
<211> 123
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 21
aggagtaaga ggagcaggct cctgcacagt gactacatga acatgactcc ccgccgcccc 60
gggcccaccc gcaagcatta ccagccctat gccccaccac gcgacttcgc agcctatcgc 120
tcc 123
<210> 22
<211> 111
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 22
cgccgcgatc agcgcctgcc gccggatgcg cataaaccgc cgggcggcgg cagctttcgc 60
accccgattc aggaagaaca ggcggatgcg catagcaccc tggcgaaaat t 111
<210> 23
<211> 126
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 23
aaacggggca gaaagaaact cctgtatata ttcaaacaac catttatgag accagtacaa 60
actactcaag aggaagatgg ctgtagctgc cgatttccag aagaagaaga aggaggatgt 120
gaactg 126
<210> 24
<211> 336
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 24
agagtgaagt tcagcaggag cgcagacgcc cccgcgtaca agcagggcca gaaccagctc 60
tataacgagc tcaatctagg acgaagagag gagtacgatg ttttggacaa gagacgtggc 120
cgggaccctg agatgggggg aaagccgaga aggaagaacc ctcaggaagg cctgtacaat 180
gaactgcaga aagataagat ggcggaggcc tacagtgaga ttgggatgaa aggcgagcgc 240
cggaggggca aggggcacga tggcctttac cagggtctca gtacagccac caaggacacc 300
tacgacgccc ttcacatgca ggccctgccc cctcgc 336
<210> 25
<211> 36
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 25
attcaaaatt ttatcgatgc tccggtgccc gtcagt 36
<210> 26
<211> 22
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 26
tcacgacacc tgaaatggaa ga 22
<210> 27
<211> 46
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 27
catttcaggt gtcgtgagga tccgccacca tggcgctgcc ggtgac 46
<210> 28
<211> 33
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 28
ggggagggag aggggcttag cgcggcggca gcg 33
<210> 29
<211> 21
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 29
cctttccggg actttcgctt t 21
<210> 30
<211> 20
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 30
gcagaatcca ggtggcaaca 20
<210> 31
<211> 21
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 31
catgtacgtt gctatccagg c 21
<210> 32
<211> 21
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223>引物
<400> 32
ctccttaatg tcacgcacga t 21
<210> 33
<211> 324
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 33
gacatcgagc tcactcagtc tccagccacc ctgtctgtga ctccaggaga tagcgtcagt 60
ctttcctgca gggccagcca aagtattagc aacaacctac actggtatca acaaaaatca 120
catgagtctc caaggcttct catcaagtct gcttcccagt ccatctctgg gatcccctcc 180
aggttcagtg gcagtggatc agggacagat ttcactctca gtatcaacag tgtggagact 240
gaagattttg gaatgtattt ctgtcaacag agtaacagct ggccgtacac gttcggaggg 300
gggacaaagt tggaaataaa acgg 324
<210> 34
<211> 369
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 34
caggtccagc tgcaggagtc tggggctgaa ctggtgaagc ctggggcttc agtgaagctg 60
tcctgcaagg cttctggcta caccttcacc agctactgga tgcactgggt gaagcagagg 120
cctggacaag gccttgagtg gattggaaag attaatccta gcaacggtcg tactaactac 180
aatgagaagt tcaagagcaa ggccacactg actgtagaca aatcctccag cacagcctac 240
atgcaactca gcagcctgac atctgaggac tctgcggtct attactgtgc aagaggggga 300
gtctactatg acctttatta ctatgctctg gactactggg gccaaggcac cacggtcacc 360
gtctcctca 369
<210> 35
<211> 324
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 35
gacatccaga tgacccagag ccccgccagc ctgagcgcca gcgtgggcga gaccgtgacc 60
atcacctgcc gggccagcgg caacatccac aactacctgg cctggtacca gcagaagcag 120
ggcaagagcc cccagctgct ggtgtacaac gccaagaccc tggccgacgg cgtgcccagc 180
cggttcagcg gcagcggcag cggcacccag tacagcctga agatcaacag cctgcagccc 240
gaggacttcg gcagctacta ctgccagcac ttctggacca cccccccctg gaccttcggc 300
ggcggcacca agctggagat caag 324
<210> 36
<211> 369
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 36
cagatccagc tggtgcagag cggccccgag ctgaagaagc ccggcgagac cgtgaagatc 60
agctgcaagg ccagcggcta caccttcacc aactacggca tgaactgggt gaagcaggcc 120
cccggcaagg gcctgaagtg gatgggctgg atcaacacct acaacggcga gcccacctac 180
gccgacgact tcaagggccg gttcgacttc agcctggaga ccagcgccag caccgcctac 240
ctgcagatca acaacctgaa gaacgaggac accgccacct acttctgcgc ccggcggggc 300
tactactacg gcagccggta cggcgccatg gactactggg gccagggcac cagcgtgacc 360
gtgagcagc 369
<210> 37
<211> 45
<212> DNA
<213>人工序列(未知)
<400> 37
ggtggcggtg gctcgggcgg tggtgggtcg ggtggcggcg gatct 45

Claims (10)

1.一种T淋巴细胞白血病的CAR-T治疗载体,其特征在于,包括慢病毒骨架质粒、人EF1α启动子、CAR嵌合受体结构域;
所述慢病毒骨架质粒包括:用于目的菌株大量扩增的含氨苄青霉素抗性基因AmpR序列,如SEQ ID NO.1所示;用于质粒复制的原核复制子pUC Ori序列,如SEQ ID NO.2所示;用于增强真核细胞内的复制的病毒复制子SV40Ori序列,如SEQ ID NO.3所示;用于慢病毒包装的慢病毒包装顺式元件;ZsGreen1绿色荧光蛋白,如SEQ ID NO.11所示;IRES核糖体结合序列,如SEQ ID NO.12所示;用于增强转基因的表达效率的eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件,如SEQ ID NO.13所示;
所述人EF1α启动子的序列如SEQ ID NO.14所示;
所述CAR嵌合受体结构域包括:如SEQ ID NO.15所示的CD8leader嵌合受体信号肽、如SEQ ID NO.16所示的CD7单链抗体轻链VL、如SEQ ID NO.17所示的CD7单链抗体重链VH、如SEQ ID NO.18所示的抗体内铰链UC Linker、如SEQ ID NO.19所示的CD8Hinge嵌合受体铰链、如SEQ ID NO.20所示的CD8 Transmembrane嵌合受体跨膜区、如SEQ ID NO.24所示的TCR嵌合受体T细胞激活域以及嵌合受体共刺激因子区域;所述嵌合受体共刺激因子区域选自CD137、ICOS、CD27、CD134、CD28、MYD88、IL1R1、CD70、TNFRSF19L、TNFRSF27、TNFRSF1OD、TNFRSF13B、TNFRSF18等肿瘤坏死因子超家族中的任意一种或多种的组合。
2.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述慢病毒包装顺式元件采用第二代慢病毒载体或第三代慢病毒载体;所述第二代慢病毒载体包括:如SEQ ID NO.5所示的慢病毒5terminal LTR、如SEQ ID NO.6所示的慢病毒3terminal Self-Inactivating LTR、如SEQID NO.7所示的Gag顺式元件、如SEQ ID NO.8所示的RRE顺式元件、如SEQ ID NO.9所示的env顺式元件、如SEQ ID NO.10所示的cPPT顺式元件;所述第三代慢病毒载体包括:如SEQID NO.5所示的慢病毒5terminal LTR、如SEQ ID NO.6所示的慢病毒3terminal Self-Inactivating LTR、如SEQ ID NO.7所示的Gag顺式元件、如SEQ ID NO.8所示的RRE顺式元件、如SEQ ID NO.9所示的env顺式元件、如SEQ ID NO.10所示的cPPT顺式元件,以及如SEQID NO.4所示的RSV启动子。
3.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述嵌合受体共刺激因子区域采用如SEQ IDNO.21所示的CD28嵌合受体共刺激因子、如SEQ ID NO.22所示的CD134嵌合受体共刺激因子组合、如SEQ ID NO.23所示的CD137嵌合受体共刺激因子的任意一种或两种或三种组合。
4.如权利要求3所述的载体,其特征在于,所述嵌合受体共刺激因子区域采用如SEQ IDNO.21所示的CD28嵌合受体共刺激因子和如SEQ ID NO.22所示的CD134嵌合受体共刺激因子的组合。
5.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件有6个核苷酸的增强突变,具体为:g.396G>A、g.397C>T、g.398T>C、g.399G>A、g.400A>T、g.411A>T。
6.如权利要求3所述的载体,其特征在于,由所述人EF1α启动子启动整个CAR结构基因表达,所述CD8 leader嵌合受体信号肽位于CAR编码序列的N端,用于引导CAR蛋白定位于细胞膜;所述的CD7单链抗体轻链VL、CD7单链抗体重链VH以及抗体内铰链UC Linker构成抗原识别区,用于识别相应靶抗原CD7;所述CD8 Hinge嵌合受体铰链用于将scFv锚定于细胞膜外侧;所述CD8Transmembrane嵌合受体跨膜区用于将整个嵌合受体固定于细胞膜上;所述CD28嵌合受体共刺激因子用于刺激T淋巴细胞体外激活和体内肿瘤细胞杀伤作用;所述CD137嵌合受体共刺激因子被证明在T细胞中可增加TCR激活引起的增殖、生存和细胞因子分泌功能,从而促进细胞杀伤功能;所述CD134嵌合受体共刺激因子用于促进T淋巴细胞增殖和因子分泌,增强肿瘤免疫,有利于记忆T细胞的长期存活;所述TCR嵌合受体T细胞激活域用于激活下游信号通路的表达;当抗原识别区域与靶抗原结合时,信号通过嵌合受体传递至细胞内,从而产生T细胞增殖、细胞因子分泌增加、抗细胞凋亡蛋白分泌增加、细胞死亡延迟、裂解靶细胞一系列生物学效应。
7.如权利要求1所述的载体,其特征在于,所述的CD7单链抗体轻链VL、CD7单链抗体重链VH均经过人源化改造。
8.一种如权利要求1-7任一项所述的CAR-T治疗载体的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)将如SEQ ID NO.1所示的含氨苄青霉素抗性基因AmpR序列、如SEQ ID NO.2所示的原核复制子pUC Ori序列、如SEQ ID NO.3所示的病毒复制子SV40Ori序列、用于慢病毒包装的慢病毒包装顺式元件、如SEQ ID NO.11所示的ZsGreen1绿色荧光蛋白、如SEQ ID NO.12所示的IRES核糖体结合序列、如SEQ ID NO.13所示的eWPRE增强型土拨鼠乙肝病毒转录后调控元件存储于慢病毒骨架质粒上;
(2)将如SEQ ID NO.14所示的人EF1α启动子、所述CAR嵌合受体结构域组合成CAR嵌合抗原受体设计方案,经过酶切、连接、重组反应克隆至慢病毒骨架质粒中,得到第三代的重组慢病毒质粒;
(3)将得到的重组慢病毒质粒分别与慢病毒包装质粒pPac-GP、pPac-R以及膜蛋白质粒pEnv-G共同转染HEK293T/17细胞,在HEK293T/17细胞中进行基因转录表达后,包装成功重组慢病毒载体会释放到细胞培养上清中,收集包含的重组慢病毒载体的上清液;
(4)将得到的重组慢病毒上清采用抽滤、吸附、洗脱的柱纯化方式进行纯化,分别得到重组慢病毒载体。
9.如权利要求8所述的方法,其特征在于,步骤(4)中,所述抽滤步骤要控制上清体积在200ml~2000ml,控制真空度在-0.5MPA~-0.9MPA,防止由于堵孔带来的载体损失;所述吸附步骤要控制溶液的PH值在6~8,防止PH的变化导致载体失活;所述洗脱步骤要控制洗脱液的离子强度在0.5M~1.0M,防止离子强度的变化导致洗脱不完全或者载体失活。
10.如权利要求1-7任一项所述的载体在制备治疗T淋巴细胞白血病的药物中的应用。
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