CN107988434A - 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用 - Google Patents
基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN107988434A CN107988434A CN201711399874.9A CN201711399874A CN107988434A CN 107988434 A CN107988434 A CN 107988434A CN 201711399874 A CN201711399874 A CN 201711399874A CN 107988434 A CN107988434 A CN 107988434A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- infectious bovine
- pipe
- bovine rhinotrachetis
- rhinotrachetis virus
- prepared
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/70—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving virus or bacteriophage
- C12Q1/701—Specific hybridization probes
- C12Q1/705—Specific hybridization probes for herpetoviridae, e.g. herpes simplex, varicella zoster
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
- C12Q1/6851—Quantitative amplification
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Immunology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Virology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用,由反应缓冲液、荧光定量PCR反应液冻干管、阳性对照品和阴性对照品冻干管组成。荧光定量PCR反应液冻干管由Taq酶、检测用引物、探针和dNTPs混合冻干而成。本发明试剂盒检测时间短(反应时间仅42分钟)、特异性强、灵敏度高、便于储存(4℃保存),配合恒温隔绝式PCR仪使用,非常适合对牦牛轮状病毒的现场快速检测,可以在基层广泛推广。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域,具体地说,涉及一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用。
背景技术
1955年Miller首次报道了出现在美国科罗拉多育肥牛群中以传染性鼻气管炎症状为特征的病例(Miller JM,Whetstone CA,Vander Maaten MJ.Abortfacient propertyof bovine herpesvirus type a isolates that represent three sub-typesdetermined by restriction endonuclease analysis of viral DNA.AM.J Vet Res,1955,52:458-461.)。随后在洛杉矶和加利福尼亚等地也相继出现相关报道。1956年Madin首次从病牛体内分离到了牛传染性鼻气管炎病毒(Madin S H,et al.Isolation ofinfections bovine rhinotracheitis virus[J].Science,1956,124:721-722.)。1964年Huck确认了牛传染性鼻气管炎病毒在分类地位上归属于疱疹病毒科(Herpesviridae),α-疱疹病毒亚科(Alpha herpesvirinae)(Fehier,F,J.M.Herrmann,A.Saalmuller,etal.Glycoprotein IV of bovine herpesvirus 1expressing cell line complementsand rescues a conditionally lethal viral mutant[J].J.Virol,1992,66:831-839.)。1980年9我国从新西兰进口奶牛中检测到牛传染性鼻气管炎病毒的存在,并随后分离到牛传染性鼻气管炎病毒(封启民.我国牛传染性鼻气营炎血清抗体普査报告[J].动物检疫,1982(1):36-39.)。牛传染性鼻气管炎病毒的组织嗜性广,对呼吸系统、生殖系统、神经系统、黏膜系统等均可致病。牛传染性鼻气管炎病毒可感染所有年龄和品种的牛,其感染呼吸道引起牛传染性鼻气管炎,感染牛生殖道引起传染性脓疱性外阴-阴道炎和传染性脓胞性包皮龟头炎,也可导致结膜炎和以胚胎、胎儿和新生儿死亡为特征的生殖障碍,同时牛传染性鼻气管炎病毒是引起牛呼吸道综合征的常见病源之一。在临床上,牛传染性鼻气管炎病毒的潜伏感染是很难准确判断的,潜伏感染的牛随时能向外界排毒,同时潜伏感染的公牛也能通过精液向外界排泄病原(Wang,J.,OKeefe,J.,Orr,D.,et al.Validation of areal-time PCR assay for the detection of bovine herpesvirus 1in bovine semen[J].Virol.Methods.2007,14:103–108.),所以牛传染性鼻气管炎病毒的潜伏感染给牛传染性鼻气管炎的防治带来很大的困难(Jones C.Herpes simplex virus type 1andbovine herpesvirus l latencyl[J].Clin Microbiol Rev,2003,16:79-95.)。由于目前人工授精的应用与前景,活牛的引进,使得在人工授精和引进活牛之前快速有效地筛选是否存在牛传染性鼻气管炎病毒非常必要的。病原学诊断是最直接可靠的诊断手段,可为病毒的潜伏感染提供直接证据。PCR、荧光定量PCR是最为常用的病原学检测手段,尤其荧光定量PCR具有灵敏度高、特异性强、稳定性好等优点,已经成为动物疫病诊断的主流手段。但是普通的荧光定量PCR方法由于需要大型设备、操作复杂、反应时间长等因素制约了其在现场快速检测方面的应用。因此针对牛传染性鼻气管炎病毒建立一种快速、敏感、特异、适用于现场的检测方法迫在眉睫。
发明内容
有鉴于此,本发明针对上述的问题,提供了一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用,本发明是基于恒温隔绝式荧光PCR的一种简单、快速、灵敏度高和特异强的检测方法,可以现场对牛传染性鼻气管炎病毒的检测提供科学依据,对保障牛养殖业健康发展具有重要意义。
为了解决上述技术问题,本发明公开了一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测的引物和探针,所述引物和探针包括:牛传染性鼻气管炎病毒上游引物和牛传染性鼻气管炎病毒下游引物和牛传染性鼻气管炎病毒探针,其中,
所述牛传染性鼻气管炎病毒上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述牛传染性鼻气管炎病毒下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述牛传染性鼻气管炎病毒探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;牛传染性鼻气管炎病毒探针的核苷酸序列的5'端连接有6-FAM标记,3'端连接有非荧光淬灭基团和BHQ1。
本发明还公开了一种上述的引物和探针在制备牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒方面的应用。
本发明还公开了一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,包括反应缓冲液、荧光定量PCR反应液冻干管、阳性对照品冻干管和阴性对照品冻干管;
所述荧光定量PCR反应液冻干管包括Taq酶1.25μL、上述的牛传染性鼻气管炎病毒上游引物、牛传染性鼻气管炎病毒下游引物各4μL和牛传染性鼻气管炎病毒探针0.35μL、dNTPs 4.25μL。
进一步地,所述Taq酶的终浓度为5U·μL-1,牛传染性鼻气管炎病毒上游引物和牛传染性鼻气管炎病毒下游引物的终浓度均为10μmol·μL-1,牛传染性鼻气管炎病毒探针的终浓度为10μmol·μL-1,dNTPs的终浓度为2.5mM。
进一步地,所述荧光定量PCR反应液冻干管通过以下方法制备得到:将上述的Taq酶、牛传染性鼻气管炎病毒上游引物、牛传染性鼻气管炎病毒下游引物和牛传染性鼻气管炎病毒探针、dNTPs混合加入0.5ml的PCR管中降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管,制得荧光定量PCR反应液冻干管。
进一步地,所述荧光定量PCR反应液冻干管设置有48管。
进一步地,所述反应缓冲液由以下组分构成:500mM KCl,pH 8.3、100mM Tris-HCl,15mM MgCl2,余量为ddH2O,以上体积总量为3ml。
进一步地,阳性对照品冻干管通过以下方法制备得到:将含有牛传染性鼻气管炎病毒DNA片段的DNA样品100μL装入PCR管内,降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管制备而成;阴性对照品冻干管通过以下方法制备得到:将无牛传染性鼻气管炎病毒DNA片段的样品100μL装入PCR管内,降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管制备而成。
进一步地,该试剂盒保存于4℃下。
本发明还公开了一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒的使用方法,包括以下步骤:
1)制备DNA模板:取样本上清液200μL,参考金瑞泓捷(厦门)生物科技有限公司的PetNAD试剂盒提取说明书提取被检样本上清总DNA,制备得到DNA模板;
2)荧光PCR反应体系的制备:荧光PCR反应体系的制备于冰上操作;取100μL反应缓冲液加入到阳性对照品冻干管中混合,制备得到阳性对照品,然后取50μL反应缓冲液和5μL阳性对照品加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到阳性对照反应体系;取100μL反应缓冲液加入阴性对照品冻干管中,制备得到阴性对照品,然后取50μL反应缓冲液和5μL阴性对照品加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到阴性对照反应体系;取50μL反应缓冲液和5μL检测样本DNA加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到检测样本DNA反应体系;然后分别从各个反应体系中取50μL混合物移入恒温隔绝式荧光PCR反应管中;加样时注意避光操作;将制备好的荧光定量PCR反应管瞬时高速离心5s,避免出现气泡;
3)扩增检测:把PCR反应管放置于恒温隔绝式荧光PCR仪器内,按运行键,即开始反应;
4)检测结果判定:“+”表示阳性,“-”表示阴性。
与现有技术相比,本发明可以获得包括以下技术效果:
1)本发明提供了一种牛传染性鼻气管炎病毒的荧光PCR检测试剂盒,其优点是特异性强、灵敏度高、检测时间短、无污染、无需电泳,可在现场快速检测。
2)本发明能快速、准确地检测出被检样本中的普通牛传染性鼻气管炎病毒DNA,同时也可以检出牦牛传染性鼻气管炎病毒的DNA,用于牛传染性鼻气管炎病毒的分子流行病学调查。
3)本发明荧光定量PCR反应液、阳性和阴性对照品均采用冻干方式制备,降低了试剂盒的保存条件,可4℃保存一年时间,便于运输,方便储存,同时提高了试剂的稳定性。
当然,实施本发明的任一产品并不一定需要同时达到以上所述的所有技术效果。
附图说明
此处所说明的附图用来提供对本发明的进一步理解,构成本发明的一部分,本发明的示意性实施例及其说明用于解释本发明,并不构成对本发明的不当限定。在附图中:
图1是本发明POCKIT Micro仪器的结构图;
图2是本发明阳性样本灵敏度检测结果,其中,1:2.22×103copies/μL;2:2.22×102copies/μL;3:2.22×101copies/μL;4:2.22×100copies/μL。
具体实施方式
以下将配合实施例来详细说明本发明的实施方式,藉此对本发明如何应用技术手段来解决技术问题并达成技术功效的实现过程能充分理解并据以实施。
实施例1基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒
一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,包括以下组分:
(1)反应缓冲液:3ml,由500mM KCl、100mM Tris-HCl(pH 8.3)、15mM MgCl2和ddH2O(余量)组成。
(2)荧光定量PCR反应液冻干管(48管),在临床上,生成一盒本发明中该病原检测试剂盒的量,一盒中有六个包装袋,每个包装袋中有8管荧光定量PCR反应液冻干管:
荧光定量PCR反应液包括Taq酶1.25μL/管(5U·μL-1)、检测用上下游引物各4μL/管(10μmol·μL-1)和探针0.35μL/管(10μmol·μL-1)、dNTPs4.25μL/管(2.5mM);将以上混合物加入0.5ml的PCR管中降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管,制得荧光定量PCR反应液冻干管。其中,检测牛传染性鼻气管炎病毒的上下游引物和探针共3条,扩增出牛传染性鼻气管炎病毒gB基因的长度为127bp,其核苷酸序列如SEQ ID NO:4所示。上游引物序列:5’-GCACGGGCACCTCTGT-3’,其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;下游引物序列:5’-CCCGTAAAAGGGCGAC-3’,其核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;探针序列:6-FAM-CTCGGTGTACCCGTACGACTCG-BHQ1,其核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。
其中,荧光定量PCR反应液是针对本发明中病原检测的反应体系优化后的结果,本发明中病原为DNA,故PCR反应液中不需添加反转录成分。
(3)阳性对照品冻干管(1管):将含有牛传染性鼻气管炎病毒DNA片段的DNA样品100μL装入PCR管内,降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管制备而成;其中,牛传染性鼻气管炎病毒DNA的序列如SEQ ID NO:4所示。
(4)阴性对照品冻干管(1管):将无牛传染性鼻气管炎病毒DNA片段的样品100μL装入PCR管内,降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管制备而成。
本试剂盒保存于4℃,运输需加冰袋。
实施例2基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒的使用方法
该方法包括以下步骤:
1)DNA模板:取样本上清液200μL,参考金瑞泓捷(厦门)生物科技有限公司的PetNAD试剂盒提取说明书提取被检样本上清总DNA,制备得到DNA模板;
2)荧光PCR反应体系的制备:荧光PCR反应体系的制备于冰上操作;
取100μL反应缓冲液加入到阳性对照品冻干管中混合,制备得到阳性对照品,然后取50μL反应缓冲液和5μL阳性对照品加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到阳性对照反应体系;取100μL反应缓冲液加入阴性对照品冻干管中,制备得到阴性对照品,然后取50μL反应缓冲液和5μL阴性对照品加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到阴性对照反应体系;取50μL反应缓冲液和5μL检测样本DNA加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到检测样本DNA反应体系;然后分别从各个反应体系中取50μL混合物移入恒温隔绝式荧光PCR反应管中。加样时注意避光操作。将制备好的荧光定量PCR反应管瞬时高速离心5s,避免出现气泡。
3)扩增检测:把PCR反应管放置于恒温隔绝式荧光PCR仪器内(POCKIT Micro)(如图1所示),按运行键,即开始反应;
4)检测结果判定:“+”表示阳性,“-”表示阴性。
实施例3标准品制备和灵敏度的测定
取样本上清液200μL,参考金瑞泓捷(厦门)生物科技有限公司的PetNAD试剂盒提取说明书提取被检样本上清总DNA。
用牛传染性鼻气管炎病毒的引物分别对上述制备的DNA进行PCR扩增,以相应病原DNA为阳性对照,无模板为阴性对照。反应体系为:DNA 2.0μL,2×Taq PCR Master Mix12.5μL,上、下游引物各1.25μL,ddH2O 8.0μL,总体积共25μL。PCR扩增条件为:95℃5min,95℃30s,54℃30s,72℃30s,35次循环,72℃10min。PCR产物经3%琼脂糖凝胶电泳鉴定,用胶回收试剂盒回收目的片段,并将其克隆至pMD19-T载体(宝生物工程有限公司),并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,筛选出阳性克隆接入含氨苄青霉素的LB液体培养基中,37℃培养8h,用质粒提取试剂盒提取重组质粒,送生工生物有限公司测序。测序正确的阳性质粒作为牛传染性鼻气管炎病毒阳性标准品,核酸蛋白检测仪测定其浓度,按照下述公式计算核酸浓度:阳性标准品浓度(copies/μL)=(6.02×1023copies/mol)×(73.66ng/μl)/(2.0*106g/mol)=2.22×1010copies/μL。将阳性标准品10倍梯度稀释(10-1~10-10),对103、102、101和100四个稀释度样本进行检测,各反应管放入POCKIT Micro反应孔,按“运行键”即可,42分钟后反应结束,阳性结果为“+”,阴性结果为“-”,结果如图2所示,其中103、102、101、100结果为“+”,说明本试剂盒的最低检测限为2.22copies/μL。
实施例4特异性和稳定性检验
用本发明研制的试剂盒对20份牛传染性鼻气管炎病毒阳性样本、10份阴性样本以及6种相关病原牛冠状病毒、牛副流感三型、牛合胞体病毒、牛病毒性腹泻-黏膜病毒、牛轮状病毒、牛支原体进行检测,并设立牛传染性鼻气管炎病毒阳性标准品作为对照,以评价试剂盒的特异性,结果显示对20份牛传染性鼻气管炎病毒阳性核酸样本的检测为阳性,10份阴性样本、和6种相关病原检测结果为阴性,证明该方法特异性好。
用研制的试剂盒对牛传染性鼻气管炎病毒的8个稀释度的阳性标准品分别检测3次,以评价该试剂盒的稳定性,结果显示3次检测结果一致,表明试剂盒的稳定性良好。
实施例5试剂盒的临床应用及与普通荧光定量PCR方法比较
用本发明试剂盒和Pawar等(Pawar SS,Meshram CD1,Singh NK,et al.EvaGreen-based Multiplex Real-time PCR Assay for Rapid Differentiation of Wild-Typeand Glycoprotein E-Deleted Bovine Herpesvirus-1Strains[J].Anim Biotechnol,2017,28(4):248-252.)报道的荧光定量PCR方法对提取的20份牛传染性鼻气管炎病毒阳性样本和10份阴性样本核酸进行检测,比较两种PCR方法的符合率。结果显示20份牛传染性鼻气管炎病毒阳性样本中,本发明试剂盒检出的阳性样本数为20个,符合率为100%;而Pawar等报道的荧光定量PCR方法对总DNA检出的阳性样本数为15个,符合率为75%。两种方法对10份阴性样本检出结果均为阴性,符合率为100%。将荧光定量PCR未检出的而试剂盒检出为阳性的PCR产物测序,测序结果证实为牛传染性鼻气管炎病毒GB基因的特异序列。证明该试剂盒对于牛传染性鼻气管炎病毒的检出效果优于现有的荧光定量PCR方法,同时又比现有PCR方法操作简单、便携,更适用于现场检测诊断,为牛传染性鼻气管炎病毒的诊断和流行病学调查提供了一种有力便捷的工具。
本试剂盒与POCKIT Micro仪器配合使用,操作简单,便携,适用于临床检出,目前还没有市售的试剂盒。
本发明对反应试剂进行了冻干,降低了试剂盒保存条件,便于运输和临床应用。
由于青藏高原恶劣的自然环境,导致部分病原发生了变异,从而导致部分PCR方法的检出率降低,本发明的引物针对青藏高原变异毒株以及未变异毒株的中的保守序列设计引物和探针,大大提高了方法的检出率。
上述说明示出并描述了发明的若干优选实施例,但如前所述,应当理解发明并非局限于本文所披露的形式,不应看作是对其他实施例的排除,而可用于各种其他组合、修改和环境,并能够在本文所述发明构想范围内,通过上述教导或相关领域的技术或知识进行改动。而本领域人员所进行的改动和变化不脱离发明的精神和范围,则都应在发明所附权利要求的保护范围内。
序列表
<110> 西南民族大学
<120> 基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用
<130> 2017
<141> 2017-12-22
<160> 4
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<400> 1
gcacgggcac ctctgt 16
<210> 2
<211> 16
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<400> 2
cccgtaaaag ggcgac 16
<210> 3
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial sequence)
<400> 3
ctcggtgtac ccgtacgact cg 22
<210> 4
<211> 127
<212> DNA
<213> 牛传染性鼻气管炎病毒(Bovine coital exanthema virus)
<400> 4
gcacgggcac ctctgtgaac tgcatcgtgg aagaagtgga ggcgcgctcg gtgtacccgt 60
acgactcgtt cgcgttctcg accggggaca ttatctacat gtcgcccttt tacgggctgc 120
gcgaggg 127
Claims (10)
1.一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测的引物和探针,其特征在于,所述引物和探针包括:牛传染性鼻气管炎病毒上游引物、牛传染性鼻气管炎病毒下游引物和牛传染性鼻气管炎病毒探针,其中,
所述牛传染性鼻气管炎病毒上游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;所述牛传染性鼻气管炎病毒下游引物的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述牛传染性鼻气管炎病毒探针的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示;牛传染性鼻气管炎病毒探针的核苷酸序列的5'端连接有6-FAM标记,3'端连接有非荧光淬灭基团和BHQ1。
2.权利要求1所述的引物和探针在制备牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒方面的应用。
3.一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,其特征在于,包括反应缓冲液、荧光定量PCR反应液冻干管、阳性对照品冻干管和阴性对照品冻干管;
所述荧光定量PCR反应液冻干管包括Taq酶1.25μL、权利要求1所述的牛传染性鼻气管炎病毒上游引物、牛传染性鼻气管炎病毒下游引物各4μL和牛传染性鼻气管炎病毒探针0.35μL、dNTPs 4.25μL。
4.根据权利要求3所述的基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,其特征在于,所述Taq酶的终浓度为5U·μL-1,牛传染性鼻气管炎病毒上游引物和牛传染性鼻气管炎病毒下游引物的终浓度均为10μmol·μL-1,牛传染性鼻气管炎病毒探针的终浓度为10μmol·μL-1,dNTPs的终浓度为2.5mM。
5.根据权利要求3或4所述的基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,其特征在于,所述荧光定量PCR反应液冻干管通过以下方法制备得到:将权利要求3或4所述的Taq酶、牛传染性鼻气管炎病毒上游引物、牛传染性鼻气管炎病毒下游引物和牛传染性鼻气管炎病毒探针、dNTPs混合加入0.5ml的PCR管中降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管,制得荧光定量PCR反应液冻干管。
6.根据权利要求5所述的基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,其特征在于,所述荧光定量PCR反应液冻干管设置有48管。
7.根据权利要求3所述的基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,其特征在于,所述反应缓冲液由以下组分构成:500mM KCl,pH 8.3、100mM Tris-HCl,15mM MgCl2,余量为ddH2O,以上体积总量为3ml。
8.根据权利要求3所述的基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,其特征在于,阳性对照品冻干管通过以下方法制备得到:将含有牛传染性鼻气管炎病毒DNA片段的DNA样品100μL装入PCR管内,降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管制备而成;阴性对照品冻干管通过以下方法制备得到:将无牛传染性鼻气管炎病毒DNA片段的样品100μL装入PCR管内,降至-50℃,然后在10pa气压下冻干24h,形成干粉状后闭管制备而成。
9.根据权利要求3所述的基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒,其特征在于,该试剂盒保存于4℃下。
10.一种基于恒温隔绝式荧光PCR平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒的使用方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)制备DNA模板:取样本上清液200μL,参考金瑞泓捷(厦门)生物科技有限公司的PetNAD试剂盒提取说明书提取被检样本上清总DNA,制备得到DNA模板;
2)荧光PCR反应体系的制备:荧光PCR反应体系的制备于冰上操作;取100μL反应缓冲液加入到阳性对照品冻干管中混合,制备得到阳性对照品,然后取50μL反应缓冲液和5μL阳性对照品加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到阳性对照反应体系;取100μL反应缓冲液加入阴性对照品冻干管中,制备得到阴性对照品,然后取50μL反应缓冲液和5μL阴性对照品加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到阴性对照反应体系;取50μL反应缓冲液和5μL检测样本DNA加入荧光定量PCR反应液冻干管中,制备得到检测样本DNA反应体系;然后分别从各个反应体系中取50μL混合物移入恒温隔绝式荧光PCR反应管中;加样时注意避光操作;将制备好的荧光定量PCR反应管瞬时高速离心5s,避免出现气泡;
3)扩增检测:把PCR反应管放置于恒温隔绝式荧光PCR仪器内,按运行键,即开始反应;
4)检测结果判定:“+”表示阳性,“-”表示阴性。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201711399874.9A CN107988434A (zh) | 2017-12-22 | 2017-12-22 | 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用 |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201711399874.9A CN107988434A (zh) | 2017-12-22 | 2017-12-22 | 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN107988434A true CN107988434A (zh) | 2018-05-04 |
Family
ID=62039502
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201711399874.9A Pending CN107988434A (zh) | 2017-12-22 | 2017-12-22 | 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用 |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
CN (1) | CN107988434A (zh) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108707696A (zh) * | 2018-06-07 | 2018-10-26 | 西南民族大学 | 一种基于恒温隔绝式荧光pcr平台的基因c型鸭甲肝病毒检测试剂盒及应用 |
Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1952174A (zh) * | 2006-03-07 | 2007-04-25 | 广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 特异检测牛疱疹病毒ⅰ型的lux荧光引物和核酸扩增方法 |
CN101701265A (zh) * | 2009-11-17 | 2010-05-05 | 新疆出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 一种牛传染性鼻气管炎病毒的检测方法及应用 |
CN104862419A (zh) * | 2015-06-01 | 2015-08-26 | 山东省农业科学院奶牛研究中心 | 一种检测牛传染性鼻气管炎病毒的引物、探针及试剂盒 |
CN106521038A (zh) * | 2016-12-26 | 2017-03-22 | 中国科学院北京基因组研究所 | 一种高灵敏度的bhv‑2实时荧光定量pcr检测方法及试剂盒 |
CN106868227A (zh) * | 2017-04-27 | 2017-06-20 | 西南民族大学 | 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牦牛轮状病毒检测试剂盒及应用 |
CN106868153A (zh) * | 2017-03-14 | 2017-06-20 | 西南民族大学 | 基于POCKIT Micro荧光PCR平台的牛羊细粒棘球蚴病的检测试剂盒及应用 |
CN107022650A (zh) * | 2017-04-27 | 2017-08-08 | 西南民族大学 | 基于恒温隔绝式荧光PCR平台的猪Delta冠状病毒检测试剂盒及应用 |
-
2017
- 2017-12-22 CN CN201711399874.9A patent/CN107988434A/zh active Pending
Patent Citations (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1952174A (zh) * | 2006-03-07 | 2007-04-25 | 广东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 特异检测牛疱疹病毒ⅰ型的lux荧光引物和核酸扩增方法 |
CN101701265A (zh) * | 2009-11-17 | 2010-05-05 | 新疆出入境检验检疫局检验检疫技术中心 | 一种牛传染性鼻气管炎病毒的检测方法及应用 |
CN104862419A (zh) * | 2015-06-01 | 2015-08-26 | 山东省农业科学院奶牛研究中心 | 一种检测牛传染性鼻气管炎病毒的引物、探针及试剂盒 |
CN106521038A (zh) * | 2016-12-26 | 2017-03-22 | 中国科学院北京基因组研究所 | 一种高灵敏度的bhv‑2实时荧光定量pcr检测方法及试剂盒 |
CN106868153A (zh) * | 2017-03-14 | 2017-06-20 | 西南民族大学 | 基于POCKIT Micro荧光PCR平台的牛羊细粒棘球蚴病的检测试剂盒及应用 |
CN106868227A (zh) * | 2017-04-27 | 2017-06-20 | 西南民族大学 | 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牦牛轮状病毒检测试剂盒及应用 |
CN107022650A (zh) * | 2017-04-27 | 2017-08-08 | 西南民族大学 | 基于恒温隔绝式荧光PCR平台的猪Delta冠状病毒检测试剂盒及应用 |
Non-Patent Citations (5)
Title |
---|
ZHANG J 等: "Evaluation of two singleplex reverse transcription-Insulated isothermal PCR tests and a duplex real-time RT-PCR test for the detection of porcine epidemic diarrhea virus and porcine deltacoronavirus", 《JOURNAL OF VIROLOGICAL METHODS》 * |
张喜喜等: "牛传染性鼻气管炎gB基因Taq Man探针及SYBR Green 1荧光定量PCR方法的建立与比较", 《中国兽医杂志》 * |
张颖慧等: "牛传染性鼻气管炎病毒恒温隔绝式荧光PCR", 《中国预防兽医学报》 * |
王海军等: "牛传染性鼻气管炎病毒gB基因荧光定量", 《中国动物传染病学报》 * |
邓碧华等: "牛传染性鼻气管炎病毒实时荧光定量PCR检测方法的建立", 《动物医学进展》 * |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN108707696A (zh) * | 2018-06-07 | 2018-10-26 | 西南民族大学 | 一种基于恒温隔绝式荧光pcr平台的基因c型鸭甲肝病毒检测试剂盒及应用 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Longjam et al. | A brief review on diagnosis of foot‐and‐mouth disease of livestock: Conventional to molecular tools | |
CN107513584B (zh) | 一种检测肠道病毒的五重荧光定量试剂盒 | |
CN104263853B (zh) | 荧光定量pcr检测猪主要病毒的试剂盒 | |
CN106868227A (zh) | 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牦牛轮状病毒检测试剂盒及应用 | |
CN105695631B (zh) | 人免疫缺陷病毒、乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒快速联检试剂盒及其制备和应用 | |
CN106244725B (zh) | 一种诊断猪脐带血伪狂犬病毒野毒株的Taqman实时荧光PCR试剂盒及其用途 | |
CN103031386B (zh) | 一种检测人杯状病毒的三重荧光定量rt-pcr试剂盒 | |
CN107022650A (zh) | 基于恒温隔绝式荧光PCR平台的猪Delta冠状病毒检测试剂盒及应用 | |
CN104946795B (zh) | 用于现场检测多种血清型口蹄疫病毒的引物、探针及试剂盒 | |
CN103789451A (zh) | 一种检测柯萨奇病毒a6、a10型的荧光定量试剂盒 | |
Gilbert et al. | Detection of equine arteritis virus in the semen of carrier stallions by using a sensitive nested PCR assay | |
Guan et al. | Epidemiological investigation of feline infectious peritonitis in cats living in Harbin, Northeast China from 2017 to 2019 using a combination of an EvaGreen-based real-time RT-PCR and serum chemistry assays | |
CN104774953B (zh) | 非洲猪瘟病毒cp530r基因的荧光pcr检测试剂及其制备方法与用途 | |
CN106350607B (zh) | 一种检测猪脐带血中猪流行性腹泻病毒野毒株的Taqman实时荧光PCR试剂盒及其用途 | |
CN101144108B (zh) | 一种用于检测高致病性猪蓝耳病病毒核苷酸片段的引物和探针序列 | |
CN107988434A (zh) | 基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牛传染性鼻气管炎病毒检测试剂盒及应用 | |
CN108085417A (zh) | 一种基于恒温隔绝式荧光pcr平台的牦牛冠状病毒检测试剂盒及应用 | |
CN103045762B (zh) | 一种检测牛白血病病毒前dna的试剂盒及其应用 | |
CN102337352B (zh) | 一种pcr微阵列检测多种流感病毒的试剂盒 | |
CN103215389B (zh) | 猪繁殖与呼吸综合症和猪乙型脑炎双重一步法rt-pcr诊断试剂盒 | |
CN102071261A (zh) | 一种单纯疱疹病毒核酸检测方法及试剂盒 | |
CN103131797B (zh) | 一种博卡病毒实时荧光pcr检测试剂盒及其应用 | |
CN102071262A (zh) | 一种单纯疱疹病毒基因分型检测方法及试剂盒 | |
CN103205510A (zh) | 鉴别猪瘟病毒强毒株和疫苗弱毒株的rt-pcr检测试剂盒 | |
CN103757137A (zh) | 同步检测三种猪病毒的共有引物核酸扩增方法与试剂盒 |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination |