CN107630094A - 能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记和应用 - Google Patents

能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记和应用 Download PDF

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Abstract

本发明涉及动物分子标记和应用技术领域,是一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记和其在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用,该能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记,其位于FAT3基因21号染色体的第23外显子处。本发明首次公开了将rs601824181 SNP位点作为同时能预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度的分子标记,首次公开将rs601824181 SNP位点应用于同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度的选择中,能够实现绵羊羊毛细度支数和弯曲度优良品种种羊的早期选种,出生后即可进行选留。

Description

能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标 记和应用
技术领域
本发明涉及动物分子标记和应用技术领域,是一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记及其特异性引物对,所述特异性引物对作为制备体外检测能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的制剂或试剂盒中的应用,所述分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用。
背景技术
随着国内外毛纺行业不断更新毛料、布艺的加工,对原材料的羊毛要求更加严格,产品趋势已经向轻薄、柔软的方向发展,世界羊毛品质方面也出现了新的里程碑,毛纺行业对细型和超细型羊毛的需求呈逐步递增趋势。细毛羊在我国畜牧产业中占有重要地位,细毛羊的主要产品是羊毛。细羊毛作为重要的纺织原料,有较高的经济价值。细毛羊的生产不仅关系到产区的经济发展和社会稳定,而且关系到我国毛纺行业的发展以及进出口贸易平衡。目前,我国细毛羊生产面临的一个主要问题就是国内细毛羊品种老化,缺少适应当前市场变化需求的新品种。绵羊早期选育是通过表型选择优秀个体,然而传统的表型选择法效果不佳,而且生产管理环节的差异变化较大,具有很大的局限性。因此寻求一种有效、便捷,并且能够在短时间内加速绵羊育种进程的育种手段便显得尤为重要。单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)作为目前最具发展潜力的分子标记,因其在基因组中数量多、分布广,已经广泛应用于动物遗传育种、疾病相关性分析、群体遗传学及药物研究等众多领域。
传统的动物遗传育种均是基于表型的选择,例如,在筛选具有优良羊毛细度支数和弯曲度性状的绵羊用于育种时,通过测量该绵羊的羊毛细度支数和弯曲度来决定其是否属于优质种羊,其期望通过表型的直接选择从而间接实现对有利基因型的选择。然而,羊毛重要经济性状为数量性状,是由微效多基因控制的,并受到环境因素的共同影响,鉴于其表型难以度量,遗传基础复杂,很难通过这种传统育种方式取得显著的成效。随着分子生物学、分子遗传学以及生物信息学的发展,以及最新生物技术在遗传育种的各个领域的应用,通过对与毛用性状密切相关的且与QTL(数量性状基因座)紧密连锁的分子标记的选择和主校基因的筛选,达到育种值得提高和早期选种的目的,从而获得较大的遗传进展。
细度支数、弯曲度是是衡量羊毛品质的关键物理指标,细度支数越多、弯曲度越小的绵羊属于该物理指标最优的绵羊品种。在绵羊品种的选育过程中,羊毛细度支数和弯曲度是其选育的关键指标。然而,在测量羊毛细度支数、弯曲度时,需要等到绵羊成长数月后,才能对其羊毛细度支数、弯曲度测量,此时才能确定其品种的优劣,不能实现早期、快速选种。
发明内容
本发明提供了一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记及其特异性引物对,所述特异性引物对作为制备体外检测能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的制剂或试剂盒中的应用,所述分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用,克服了上述现有技术之不足,其能有效解决现有选育具有羊毛细度支数多和弯曲度小的绵羊优质品种的过程中,其存在不能早期选种和快速选种的问题;本发明首次公开将rs601824181 SNP位点应用于同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状的选择中。
本发明的技术方案之一是通过以下措施来实现的:一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记,其位于FAT3基因21号染色体的第23外显子处,第23外显子的核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1所示。
本发明的技术方案之二是通过以下措施来实现的:一种用于扩增能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的特异性引物对,包括两个等位基因特异性引物、一个基因座特异性引物以及一个特异性靶向扩增引物,两个等位基因特异性引物的序列分别如序列表SEQ ID No.2和序列表SEQ ID No.3所示,基因座特异性引物的序列如序列表SEQ ID No.4所示,特异性靶向扩增引物的序列如序列表SEQ ID No.5所示。
本发明的技术方案之三是通过以下措施来实现的:一种技术方案之二所述的特异性引物对作为制备体外检测能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的制剂或试剂盒中的应用。
本发明的技术方案之四是通过以下措施来实现的:一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用。
下面是对上述发明技术方案之四的进一步优化或/和改进:
上述中国美利奴羊为新疆型中国美利奴羊。
上述能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用,包括如下步骤:第一步,取待检测新疆型中国美利奴羊的基因组DNA;第二步,以基因组DNA为模板,利用特异性引物对进行PCR扩增,获得新疆型中国美利奴羊基于rs601824181 SNP位点的目的片段,将PCR扩增产物进行测序,根据测序结果进行基因分型,当基因型为GC型时,待测绵羊属于细度支数最多且弯曲度大的新疆型中国美利奴羊优势品种,当基因型为GG型或CC型时,待测绵羊属于细度支数少于GC基因型绵羊细度支数且弯曲度小于GC基因型绵羊弯曲度的新疆型中国美利奴羊非优势品种;
其中,特异性引物对包括两个等位基因特异性引物、一个基因座特异性引物、一个特异性靶向扩增引物,两个等位基因特异性引物的序列分别如序列表SEQ ID No.2和序列表SEQ ID No.3所示,基因座特异性引物的序列如序列表SEQ ID No.4所示,特异性靶向扩增引物的序列如序列表SEQ ID No.5所示。
本发明首次公开了将rs601824181SNP位点作为同时能预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记,首次公开将rs601824181SNP位点应用于同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状的选择中;采用与能预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记对中国美利奴羊(新疆型)进行绵羊羊毛细度支数和弯曲度优质性状绵羊品种甄选时,具有简单高效的优点,并且由于其从分子标记检测层面着手,因此其能够提高品种甄选的准确度,提高检测效率,并且可自动化检测;另外,能够实现绵羊羊毛细度支数和弯曲度优良品种种羊的早期选种,出生后即可进行选留,从而降低选育成本,加速高品质细毛羊的育种进程。
附图说明
附图1为DNA混池测序结果图;基因型为CC型。
附图2为DNA混池测序结果图;基因型为GC型。
附图3为DNA混池测序结果图;基因型为GG型。
附图4为Fluidigm测序分型图结果图:分别为CC型、GC型和GG型;其中,横坐标为FAM的荧光信号,纵坐标为HEX的荧光信号。
具体实施方式
本发明不受下述实施例的限制,可根据本发明的技术方案与实际情况来确定具体的实施方式。本发明中所提到各种化学试剂和化学用品如无特殊说明,均为现有技术中公知公用的化学试剂和化学用品;本发明中的常温、室温一般指15℃到25℃的温度,一般定义为25℃。
下面结合实施例对本发明作进一步描述:
实施例1:一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记,其位于FAT3基因21号染色体(物理位置1501292)的第23外显子处,第23外显子的核苷酸序列如序列表SEQ ID No.1所示。
实施例2:上述实施例所述的用于扩增能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的特异性引物对,包括两个等位基因特异性引物(ASP1/ASP2)、一个基因座特异性引物(LSP)和一个特异性靶向扩增引物(STA),一个等位基因特异性引物(ASP1)的序列如序列表SEQ ID No.2所示,另一个等位基因特异性引物(ASP2)的序列如序列表SEQID No.3所示,基因座特异性引物的序列如序列表SEQ ID No.4所示,特异性靶向扩增引物的序列如序列表SEQ ID No.5所示。
实施例3:上述实施例2所述的特异性引物对作为制备体外检测能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的制剂或试剂盒中的应用。
实施例4:上述实施例的所述能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用。
实施例5:作为实施例4的优化,中国美利奴羊为新疆型中国美利奴羊。新疆型中国美利奴羊即为中国美利奴羊(新疆型)。
实施例6:作为实施例5的优化,能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用,包括如下步骤:第一步,取待检测新疆型中国美利奴羊的基因组DNA;第二步,以基因组DNA为模板,利用特异性引物对进行PCR扩增,获得新疆型中国美利奴羊基于rs601824181SNP位点的目的片段,将PCR扩增产物进行测序,根据测序结果进行基因分型,当基因型为GC型时,待测绵羊属于细度支数最多且弯曲度大的新疆型中国美利奴羊优势品种,当基因型为GG型或CC型时,待测绵羊属于细度支数少于GC基因型绵羊细度支数且弯曲度小于GC基因型绵羊弯曲度的新疆型中国美利奴羊非优势品种;
其中,特异性引物对包括两个等位基因特异性引物、一个基因座特异性引物、一个特异性靶向扩增引物,两个等位基因特异性引物的序列分别如序列表SEQ ID No.2和序列表SEQ ID No.3所示,基因座特异性引物的序列如序列表SEQ ID No.4所示,特异性靶向扩增引物的序列如序列表SEQ ID No.5所示。
本实施例所述的方法具有操作简单,并且由于其从分子标记检测层面着手,因此可实现种羊的早期选种,出生后即可进行选留,从而降低选育成本,加速高品质细毛羊的育种进程。
本发明中,所述序列(SEQ ID No.1至SEQ ID No.8)参考绵羊基因组3.1版本。
实施例7:于新疆巩乃斯种羊场(473只)和拜城种羊场(440只)采集913只周岁健康的细毛羊母羊,品种为中国美利奴羊(新疆型)。颈静脉采血3至5mL,采用含EDTA抗凝冻存,采用常规酚-氯仿抽提法提取血样中基因组DNA。
1DNA的提取
1.1 取800μL的绵羊(中国美利奴羊,新疆型)血样加入灭菌后的2mL离心管中,再加入1000μL的T10E10溶液,上下翻动约10分钟,使红细胞破碎,然后8000r/min低温离心6分钟,使得白细胞沉淀。
1.2 弃去上清液,加入800μL的T10E1溶液上下翻动冲洗沉淀,然后放入低温离心机中8000r/min低温离心6分钟。
1.3 弃去上清液,加入500μL的USSTE溶液裂解悬浮,在涡旋机上剧烈震荡5分钟(2000r/min),再上下翻动10分钟使白细胞破裂。
1.4 加入400μL(等体积)的Tris平衡酚,抽打混匀,上下翻动10分钟,然后放入低温离心机中10000r/min离心10分钟。
1.5 吸取400μL的上清液加入新的离心管中,再加入400μL(等体积)的氯仿:异戊醇(24:1),上下摇动5分钟,直到看不到白色的界面,然后放入低温离心机中10000r/min离心10分钟。
1.6 吸取300μL的上清液加入新的离心管中,再加入600μL(2倍体积)的冷无水乙醇,上下摇动2分钟,然后放入低温离心机中12000r/min离心10分钟。
1.7 弃去上清液,加入500μL的70%乙醇浸洗,上下轻翻动2分钟,然后放入低温离心机中12000r/min离心10分钟,弃去液体。
1.8 重复第7步。
1.9 弃去上清液,无菌台内室温干燥40-60分钟,待离心管中无任何液体后加入70μL的T10E1溶液,在涡旋仪上振荡两次后放入4℃冰箱中过夜使其充分溶于液体当中,然后放入-20℃的冰箱长期保存。
2 基因组DNA浓度及纯度的检测
所提取的DNA溶液取2μL,使用NanoDrop 2000分光光度仪检测所提DNA的浓度及纯度,DNA的样本浓度需大于50ng/μL,纯度OD260/OD280值在1.6至1.8之间且OD260/OD230在1.8至2.1之间的DNA样本为合格的样本。为了确保DNA样本浓度的准确性,每个样本需要连续测定两次,若两次测定的值相差不大则表明样本合格可以留用,不合格的DNA样本则需要重新提取,直到样本的浓度以及纯度全部达到实验所需要的标准为止。
3 基因组DNA完整性的检测
所有提取的DNA样本各取3μL与2μL的6×Loading buffer混匀,加入含有核酸染料的1%的琼脂糖凝胶电泳,以D2000作为Marker标记产物片段大小进行检测,0.5×TBE电泳缓冲液,110V,25分钟,电泳结果在凝胶电泳成像仪中检测。
4 rs601824181 SNP位点及基因分型
4.1 rs601824181 SNP位点
针对绵羊FAT3基因的各个外显子、绵羊FAT3基因上游1000bp的调控区以及绵羊FAT3基因下游1000bp的调控区设计若干引物对,分别对各个绵羊群体中的每个个体进行PCR扩增并测序,发掘SNP位点并对SNP位点与细毛羊羊毛细度支数和弯曲度性状进行关联分析。
通过上述大量试验,得到特异引物对如下:
F(序列如序列表SEQ ID No.6所示):5’-gctactgccc atcattcgag a-3’;
R(序列表如序列表SEQ ID No.7所示):5’-tgttgcgaac tgcccatgaa-3’。
在913只中国美利奴羊(新疆型)试验群体中,选取其中30个个体的血液DNA样本,以相同浓度组成混池DNA,采用F和R组成的引物对进行PCR扩增,将PCR扩增产物进行测序。对测序峰图进行分析,结合细毛羊毛用性状全基因组关联分析,找到一个与细毛羊细度支数和弯曲度显著相关SNP位点(rs601824181),如图1至图3所示。
rs601824181SNP位点位于FAT3基因21号染色体(物理位置1501292)第23外显子处。中国美利奴羊(新疆型)基因组中rs601824181 SNP位点周边的核苷酸序列如序列表SEQID No.8所示,该SNP位点由G突变C,发生错义突变。
4.2基因分型
(1)Fluidigm的SNP检测技术步骤
将上述选择的SNP序列(rs601824181)提交给Fluidigm SNP Type Assay Design网站设计合成探针和引物,为SNP设计了四个引物,包括两个等位基因特异性引物和一个基因座特异性引物和一个特异性靶向扩增引物,两个等位基因特异性引物的序列分别如序列表SEQ ID No.2和序列表SEQ ID No.3所示,基因座特异性引物的序列如序列表SEQ IDNo.4所示,特异性靶向扩增引物的序列如序列表SEQ ID No.5所示。(2)基因分型检测:步骤一:准备SNPtype Assay Mixes。将3μL SNPtype Assay ASP1/ASP2和8μL SNPtype AssayLSP预混合并用29μL DNA悬浮液稀释以制备40μL的SNPtype Assay Mixes。
步骤二:准备10X Assays(用于192*24芯片)。每个反应3μL,包含0.6μL的SNPtypeAssay Mixes,1.5μL的2X Assay Loading Reagent和0.9μL ddH2O水。
步骤三:准备Sample Mix(用于192*24芯片)。每个样品3μL,包含1.492μL的Biotium 2X Fast Probe Master Mix,0.149μL的20X SNPtype Sample Loading Reagent,0.05μL的60X SNPtype Reagent,0.018μL的ROX,0.032μL ddH2O水和1.26μL DNA。
步骤四:分装3μL Assay mix和3μL Sample mix到对应的孔中。
PCR反应条件为:95℃预变性5min,95℃变性15s,60℃退火45s,72℃延伸15s,共38个循环并收集荧光信号,冷却至20℃30s。
基因分型检测仪器采用Fluidigm BioMark HD基因分析系统,导出原始数据,用“Fluidigm SNP Genotyping Analysis”软件进行基因分型分析。试剂和耗材见表1,分型结果如图4所示,红色为CC型,蓝色为GC型,绿色为GG型。
(3)本发明中的913只中国美利奴羊均为新疆型周岁母羊,共检测到3种基因型,由表2可知,GG型为优势基因型,G等位基因为优势等位基因。χ2检验表明,该SNP位点在群体中处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。
(4)对绵羊基于rs601824181SNP位点G/C单碱基突变的3种基因型与中国美利奴羊(新疆型)试验群体913个个体的细度支数和弯曲度进行最小二乘分析。
根据中国美利奴羊(新疆型)实验群体的特点,运用SAS 9.1软件的GLM过程进行基因型与细度支数和弯曲度之间的关联分析,模型如下:Yijl=μ+gi+cj+ql+eijl,其中,Yijl为性状的观测值;μ为群体均值;gi为基因型效应;cj为场效应;ql为群别效应;eijl为随机残差。
表3中,均值比较时,同行不同大写字母表示差异极显著,即P<0.01;同行不同小写字母表示差异极显著,即P<0.05。
细度支数、弯曲度依据中华人民共和国农业行业标准NY-1-2004《细毛羊鉴定项目、符号、术语》执行。
细度支数:在鉴定现场由技术人员凭经验用目测或与细度标样对比评定羊毛纤维细度。我国基层畜牧工作者通常用支数表示羊毛细度。支数:在公定回潮率下,1磅(453.5克)重纱线长度的840码(一码等于0.9144米)的倍数,也就是说,1磅重纱线正好840码长,为1支纱。例:1磅重纱线长度为21×840码长,纱线的细度为21支,写为21s。支数越多质量越好,纱就越细。
弯曲:在自然状态下,羊毛纤维沿着它的纵轴方向有规则的卷曲,通常称为羊毛弯曲。弯曲分大、中、小三种类型。以羊毛长度每一厘米内的弯曲数来判断,大弯曲是指3个弯曲以下;中弯曲是指4~5个弯曲;小的弯曲是指6个以上。弯曲用汉语拼音W记,弯曲的明显度用3、2、1表示:W3——毛丛顶部到根部弯曲明显、大小均匀,即小弯曲。W2——毛丛顶部到根部弯曲欠明显、大小均匀,即中弯曲。W1——弯曲不明显或非正常弯曲,即大弯曲。
表3结果显示,基于rs601824181SNP位点不同基因型多态性对中国美利奴羊(新疆型)试验群体的羊毛细度支数和弯曲度均有极显著影响,P值分别为0.0013和0.0026;再对3种基因型间的最小二乘均值进行多重比较,结果表明GC基因型群体的羊毛细度支数极显著高于CC基因型群体和GG基因型群体(P<0.01),GC基因型群体的羊毛弯曲度显著高于CC基因型群体和GG基因型群体(P<0.05),GC基因型可以作为绵羊早期分子育种的分子标记。
综上所述,本发明首次公开了将rs601824181 SNP位点作为同时能预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记,首次公开将rs601824181 SNP位点应用于同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状的选择中;采用与能预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记对中国美利奴羊(新疆型)进行绵羊羊毛细度支数和弯曲度优质性状绵羊品种甄选时,具有简单高效的优点,并且由于其从分子标记检测层面着手,因此其能够提高品种甄选的准确度,提高检测效率,并且可自动化检测;另外,能够实现绵羊羊毛细度支数和弯曲度优良品种种羊的早期选种,出生后即可进行选留,从而降低选育成本,加速高品质细毛羊的育种进程。
以上技术特征构成了本发明的实施例,其具有较强的适应性和实施效果,可根据实际需要增减非必要的技术特征,来满足不同情况的需求。
表1 试剂和耗材
表2 SNP基因型在所研究群体中的基因频率及等位基因频率
表3 基于rs601824181 SNP位点不同基因型与羊毛细度支数和弯曲度的关联分析
基因型 细度支数 弯曲度
CC 66.288±0.267Bb 1.661±0.068Bc
GC 67.358±0.203Aa 1.951±0.052Aa
GG 66.636±0.092Bb 1.814±0.023Ab
P值 0.0013** 0.0026**
   序列表
<110>新疆畜牧科学院畜牧研究院 新疆农业大学
<120>能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记和应用
<130>
<160>8
<170>
<210> 1
<211>65
<212> DNA
<213> 绵羊
<400> 1
gttgagacag cagaaatctc cccccagggc atgtggccct cggtgcggca gtaacatcgg 60
caagc 65
<210> 2
<211>18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
cgatgttact gccgcacc 18
<210> 3
<211>18
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
cgatgttact gccgcacg 18
<210> 4
<211>20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
agcagaaatc tccccccagg 20
<210> 5
<211>24
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
gccaaacact gaagttattt aggc 24
<210> 6
<211>21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
gctactgccc atcattcgag a 21
<210> 7
<211>20
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
tgttgcgaac tgcccatgaa 20
<210> 8
<211>65
<212> DNA
<213> 绵羊
<400> 1
tttggctggt gaaaaactgg ccatgacttg tcataatagg ctggtttata gaaccactga 60
agtatagcta ctgcccatca ttcgagaatt atggcaccat aacaaccctt tatttacata 120
tactgctgag acagtaaaaa aagcaaatag atttcttaag ttgagacagc agaaatctcc 180
ccccagggca tgtggccctc ggtgcggcag taacatcggc aagcctaaat aacttcagtg 240
tttggcgtct gtgtttcagc aacacatcat ttcatgggca gttcgcaaca ttctaataat 300
aaaatggagt ctaaatttgg agttgggctt caccaacagt agatggtaat gtacacagcg 360
gaatctctat gtgatttgtg aggaaggttt aaatttgc 398

Claims (6)

1.一种能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记,其特征在于其位于FAT3基因21号染色体的第23外显子处,第23外显子的核苷酸序列如序列表SEQ IDNo.1所示。
2.一种用于扩增根据权利要求1所述的能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的特异性引物对,其特征在于包括两个等位基因特异性引物、一个基因座特异性引物以及一个特异性靶向扩增引物,两个等位基因特异性引物的序列分别如序列表SEQ ID No.2和序列表SEQ ID No.3所示,基因座特异性引物的序列如序列表SEQ ID No.4所示,特异性靶向扩增引物的序列如序列表SEQ ID No.5所示。
3.一种根据权利要求2所述的特异性引物对作为制备体外检测能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记的制剂或试剂盒中的应用。
4.一种根据权利要求1所述的能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用。
5.根据权利要求4所述的能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用,其特征在于中国美利奴羊为新疆型中国美利奴羊。
6.根据权利要求5所述的能同时预示和鉴定绵羊羊毛细度支数和弯曲度性状的分子标记在同时预示和鉴定中国美利奴羊羊毛细度支数和弯曲度性状中的应用,其特征在于包括如下步骤:第一步,取待检测新疆型中国美利奴羊的基因组DNA;第二步,以基因组DNA为模板,利用特异性引物对进行PCR扩增,获得新疆型中国美利奴羊基于rs601824181 SNP位点的目的片段,将PCR扩增产物进行测序,根据测序结果进行基因分型,当基因型为GC型时,待测绵羊属于细度支数最多且弯曲度大的新疆型中国美利奴羊优势品种,当基因型为GG型或CC型时,待测绵羊属于细度支数少于GC基因型绵羊细度支数且弯曲度小于GC基因型绵羊弯曲度的新疆型中国美利奴羊非优势品种;
其中,特异性引物对包括两个等位基因特异性引物、一个基因座特异性引物、一个特异性靶向扩增引物,两个等位基因特异性引物的序列分别如序列表SEQ ID No.2和序列表SEQID No.3所示,基因座特异性引物的序列如序列表SEQ ID No.4所示,特异性靶向扩增引物的序列如序列表SEQ ID No.5所示。
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CN109825598A (zh) * 2018-11-01 2019-05-31 天津奥群牧业有限公司 一种与澳洲白绵羊毛发粗细极显著相关的snp标记、分子标记及应用
WO2022062520A1 (zh) * 2020-09-22 2022-03-31 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 一种与细毛羊羊毛性状相关的snp标记及其检测引物组、试剂盒、检测方法和应用

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* Cited by examiner, † Cited by third party
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