聚合酶链式反应检测装置及方法
技术领域
本发明涉及聚合酶链式反应检测技术领域,特别是涉及一种聚合酶链式反应检测装置及方法。
背景技术
聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)是一种体外扩增特定核酸的分子生物学技术,具有特异性强、灵敏度高、高效快捷、操作简单等突出优点。数字PCR是将含有引物、模板、荧光探针及聚合酶等组份的PCR反应体系分成众多微小的、独立的反应单元。经过PCR扩增反应后,对每个反应单元的荧光信号进行检测,有目标DNA片段的微滴在扩增后会发出较强荧光,即阳性微滴;无目标DNA片段的微滴在扩增后只有微弱的本底荧光,即阴性微滴;将阳性微滴记为1,阴性微滴则记为0,再根据泊松分布原理,计算得出目标DNA的起始拷贝数或浓度。
传统技术中数字PCR是通过荧光法对阳性微滴和阴性微滴进行分析检测。但是其中阴性微滴的荧光非常弱,通过荧光法检测分析时经常出现漏检或错检的情况。此外,通过荧光法检测分析微滴时对其特征参数识别度不高,且存在荧光染料泄露、管路较难清洗及易受环境干扰等问题,易将一些异常的强荧光信号干扰误判为阳性微滴,造成阳性微滴的错检。因此,基于荧光法检测的数字PCR的准确性和灵敏度都较低。
发明内容
基于此,有必要提供一种准确性和灵敏度高的聚合酶链式反应检测装置及方法。
一种聚合酶链式反应检测装置,用于检测样品微滴,包括样品传送机构、激发光光源机构、光学检测机构、阻抗检测机构及控制机构;
所述样品传送机构具有用于传送所述样品微滴的传送微通道以及仅供单排所述样品微滴通过的检测微通道,所述检测微通道设于所述传送微通道的一端且与所述传送微通道连通,所述样品传送机构在检测微通道段设有光学检测窗口;
所述激发光光源机构具有用于激发所述样品微滴产生荧光信号的激发光光源;
所述光学检测机构具有用于收集和转换所述样品微滴中荧光信号的荧光探测器;
所述阻抗检测机构包括激励电源、电极及阻抗分析仪,所述电极至少有两个,分别为第一电极和第二电极,所述激励电源、所述第一电极、所述第二电极与所述阻抗分析仪相连接形成回路,所述第一电极与所述第二电极设在所述检测微通道的表面并均与所述检测微通道交叉接触,所述第一电极与所述第二电极之间形成能够容纳至少一个所述样品微滴的检测区域,所述阻抗分析仪用于收集所述样品微滴通过所述检测区域产生的阻抗信号;
所述控制机构用于分析所述荧光探测器收集的荧光信号及所述阻抗分析仪收集的阻抗信号;
所述样品微滴经所述传送微通道依次逐个进入到所述检测微通道,所述光学检测机构和所述阻抗检测机构对所述检测微通道中的同一个所述样品微滴分别进行荧光信号和阻抗信号收集,其中,所述激发光光源通过所述光学检测窗口照射所述检测微通道中的所述样品微滴,激发所述样品微滴产生荧光信号,所述荧光探测器通过所述光学检测窗口收集所述荧光信号并将收集到的所述荧光信号转换为数字信号传输到所述控制机构;所述阻抗分析仪收集所述样品微滴通过所述检测区域产生的阻抗信号并将收集到的所述阻抗信号传输到所述控制机构,所述控制机构同步分析所述荧光信号和所述阻抗信号得到所述样品微滴的有效数据。
在其中一个实施例中,所述样品传送机构还包括稀释微通道,所述稀释微通道有两个,分别为第一稀释微通道和第二稀释微通道,所述第一稀释微通道和所述第二稀释微通道分别设所述传送微通道的两侧,所述第一稀释微通道、所述第二稀释微通道和所述传送微通道在其与所述检测微通道连通的一端处交叉连通,且所述第一稀释微通道和所述第二稀释微通道与所述检测微通道相连通。
在其中一个实施例中,所述第一稀释微通道和所述第二稀释微通道的另一端设有用于供所述样品微滴稀释液进入的第一进液微通道和第二进液微通道,所述传送微通道的另一端设有用于供所述样品微滴进入的进样微通道,所述第一稀释微通道与第一进液微通道、所述第二稀释微通道与第二进液微通道及所述传送微通道与所述进样微通道的连接处分别设有用于封闭的密封圈和夹具。
在其中一个实施例中,所述第一电极与所述第二电极平行设置。
在其中一个实施例中,所述第一电极与所述第二电极分别设在所述光学检测窗口的两侧。
在其中一个实施例中,所述第一电极与所述第二电极垂直于所述检测微通道中所述样品微滴的流动方向。
在其中一个实施例中,所述第一电极与所述第二电极宽度均为10μm-20μm。
在其中一个实施例中,所述检测区域的长度为1.5-2个所述样品微滴的粒径。
在其中一个实施例中,所述第一电极与所述第二电极的端部均位于所述样品传送机构的外部且外接于PCB板上。
本发明中聚合酶链式反应检测装置通过使用光学检测机构和阻抗检测机构共同检测样品微滴,将阻抗检测法和荧光检测法结合使用,从多个维度对样品微滴进行检测分析。本发明同时检测每个样品微滴的荧光信号和阻抗信号,对于荧光量很低的阴性微滴,通过阻抗信号能够准确区分是否是样品微滴;对于荧光量较高的阳性微滴,通过阻抗信号识别出微滴大小,并判断是否真的是阳性微滴,降低阳性微滴的错检率。利用阻抗数据对荧光数据进行修正,可以减少外界环境的干扰,避免了只通过荧光信号对样品微滴检测出现的错检或漏检的情况,该聚合酶链式反应检测装置准确性和灵敏度较高。
此外,采用阻抗检测机构辅助进行样品微滴有无的检测,提高了该装置对阴性微滴的检测灵敏度和准确性,并降低了对控制机构信噪比的要求。该聚合酶链式反应检测装置的系统设计简便,制造成本低。
此外,还有必要提供一种聚合酶链式反应检测方法。
一种聚合酶链式反应检测方法,使用上述任一项所述聚合酶链式反应检测装置检测所述样品微滴,所述聚合酶链式反应检测方法包括如下步骤:
将含有所述样品微滴的样品溶液泵入所述传送微通道,所述样品微滴经所述传送微通道依次逐个通过所述检测微通道的光学检测窗口;
控制所述激发光光源通过所述光学检测窗口照射所述检测微通道中的所述样品微滴,激发所述样品微滴产生荧光信号,所述荧光探测器通过所述光学检测窗口收集所述荧光信号并将收集到的所述荧光信号转换为数字信号传输到所述控制机构;
同时控制所述阻抗分析仪收集所述样品微滴通过所述第一电极与所述第二电极之间的所述检测区域产生的阻抗信号并将收集到的所述阻抗信号传输到所述控制机构;
所述控制机构同步分析所述荧光信号和所述阻抗信号,通过所述荧光信号提取所述样品微滴的荧光幅值和第一脉宽,通过所述阻抗信号提取所述样品微滴的阻抗幅值和第二脉宽,同步分析所述荧光信号和所述阻抗信号的数据信息得到所述样品微滴的有效数据。
本发明中聚合酶链式反应检测方法通过将阻抗检测法和荧光检测法结合使用,从多个维度对样品微滴进行检测分析,得到样品微滴的数量以及微滴荧光强度的准确性和灵敏度高。
附图说明
图1为一实施方式的聚合酶链式反应光学检测装置的结构示意图;
图2为一实施方式的聚合酶链式反应光学检测装置中阻抗检测机构中三个电极的位置示意图;
图3为一实施方式的聚合酶链式反应光学检测装置中阻抗检测机构的结构示意图;
图4为一实施方式的聚合酶链式反应光学检测装置中阻抗检测机构和光学检测窗口的位置示意图;
图5为一实施方式的聚合酶链式反应光学检测方法的流程示意图;
图6为一实施方式的聚合酶链式反应光学检测方法中控制结构同步分析的流程示意图。
具体实施方式
为了便于理解本发明,下面将参照相关附图对本发明进行更全面的描述。附图中给出了本发明的较佳实施例。但是,本发明可以以许多不同的形式来实现,并不限于本文所描述的实施例。相反地,提供这些实施例的目的是使对本发明的公开内容的理解更加透彻全面。
需要说明的是,当元件被称为“固定于”另一个元件,它可以直接在另一个元件上或者也可以存在居中的元件。当一个元件被认为是“连接”另一个元件,它可以是直接连接到另一个元件或者可能同时存在居中元件。
除非另有定义,本文所使用的所有的技术和科学术语与属于本发明的技术领域的技术人员通常理解的含义相同。本文中在本发明的说明书中所使用的术语只是为了描述具体的实施例的目的,不是旨在于限制本发明。本文所使用的术语“和/或”包括一个或多个相关的所列项目的任意的和所有的组合。
如图1所示,一实施方式的聚合酶链式反应检测装置10,用于检测样品微滴20,包括样品传送机构100、激发光光源机构200、光学检测机构300、阻抗检测机构400及控制机构500。
该样品传送机构100具有用于传送该样品微滴20的传送微通道102以及仅供单排该样品微滴20通过的检测微通道101,该检测微通道101设于该传送微通道102的一端且与该传送微通道102连通,该样品传送机构100在检测微通道段设有光学检测窗口(图未示),激发光光源机构200可以通过光学检测窗口照射检测微通道101中的激发该样品微滴20产生荧光信号,光学检测机构300也可以通过光学检测窗口收集检测微通道101中的该样品微滴20产生的荧光信号。
在其中一个实施方式中,该样品传送机构100还包括稀释微通道,用于传送稀释液冲洗样品微滴20。该稀释微通道有两个,分别为第一稀释微通道103和第二稀释微通道104,该第一稀释微通道103和该第二稀释微通道104分别设在该传送微通道102的两侧,该第一稀释微通道103、该第二稀释微通道104和该传送微通道102在其与该检测微通道101连通的一端处交叉连通,且该第一稀释微通道103和该第二稀释微通道104与该检测微通道101相连通。
样品微滴20在传送微通道102内聚集流动,到达与检测微通道101相连通的一端处时,与第一稀释微通道103和第二稀释微通道104中流出的稀释液交汇,样品微滴20在稀释液的作用下逐个分开进入到检测微通道101中。可选地,通过调整第一稀释微通道103和第二稀释微通道104中稀释液的流速,控制每个样品微滴20之间的距离至少三倍于单个样品微滴20的粒径。
在其中一个实施方式中,该第一稀释微通道103和该第二稀释微通道104的另一端(相对于该第一稀释微通道103、该第二稀释微通道104与该传送微通道102交汇连通端的一端)设有用于供该样品微滴20稀释液进入的第一进液微通道113和第二进液微通道114,该传送微通道102的另一端设有用于供该样品微滴20进入的进样微通道112,该第一稀释微通道103与第一进液微通道113、该第二稀释微通道104与第二进液微通道114及该传送微通道102与该进样微通道112的连接处分别设有密封圈110和夹具111。
第一稀释微通道103、该第二稀释微通道104及该传送微通道102在夹具111和密封圈110的作用下与第一进液微通道113、第二进液微通道114及进样微通道112的端口对齐,并在密封圈110和夹具111的作用下达到密封效果。
该激发光光源机构200具有用于激发该样品微滴20产生荧光信号的激发光光源(图未示),该激发光光源通过该光学检测窗口照射该检测微通道中的该样品微滴20,激发该样品微滴20产生荧光信号。
在其中一个实施方式中,该激发光光源机构200还包括聚焦透镜(图未示),聚焦透镜用于对光束进行聚焦处理。可选地,激发光光源照射出的光束先进行准直整形处理,再通过聚焦透镜聚焦,聚焦后的光斑从阻抗检测机构400之间穿过通过光学检测窗口照射到样品微滴20。
光学检测机构300具有用于收集和转换该样品微滴20中荧光信号的荧光探测器(图未示),该荧光探测器通过该光学检测窗口收集该样品微滴20的荧光信号并将收集到的该荧光信号转换为电信号,再经信号放大电路放大,由采样电路完成数字信号的采样并传输到控制机构400。
阻抗检测机构400包括激励电源401、电极及阻抗分析仪404。在电极的一侧通过导线接入激励电源401,在电极的另一侧通过导线接入阻抗采集仪404。激励电源401用于提供阻抗;电极至少有两个,用于检测样品微滴20的阻抗信号;阻抗分析仪404的激励信号可以是电流激励,也可以是电压激励,用于收集样品微滴20的阻抗信号。
激发光光源照射样品微滴20的光学检测窗口可以位于多个电极之间,也可以位于多个电极的一侧,只要确保多个电极之间形成的最大检测区域每一次检测的样品微滴20与激发光光源照射的样品微滴20是同一个即可。
在其中一个实施方式中该电极有两个,分别为第一电极402和第二电极403。该激励电源401、该第一电极402、该第二电极403与该阻抗分析仪404相连接形成回路,该第一电极402与该第二电极403设在该检测微通道101的表面并均与该检测微通道101交叉接触,该第一电极402与该第二电极403之间形成能够容纳至少一个该样品微滴20的检测区域,该阻抗分析仪404用于收集该样品微滴20通过该检测区域产生的阻抗信号。可选地,该第一电极402与该第二电极403宽度均为10μm-20μm。该检测区域的长度为1.5-2个该样品微滴的粒径。进一步可选地,第一电极402和第二电极403的材料是金。
在其中一个实施方式中,该第一电极402与该第二电极403平行设置。该第一电极402与该第二电极403分别设在该光学检测窗口的两侧。可选地,该第一电极402与该第二电极403位于检测微通道101的下表面且垂直于该检测微通道中该样品微滴的流动方向。
第一电极402通过导线与激励电源401及阻抗分析仪404相连接,第二电极403通过导线与激励电源401及阻抗分析仪404相连接,且其共同连接形成回路。激发光光源照射出的光束从第一电极402与该第二电极403之间穿过经光学检测窗口照射到样品微滴20,保证第一电极402与该第二电极403形成的检测区域每一次检测的样品微滴20与激发光光源照射的样品微滴20是同一个。
如图2所示的一个实施方式中,电极有三个,其中第一电极402和第二电极403之间设有公共电极405,第一电极402和第二电极403之间的距离至少可以容纳一个样品微滴20。第一电极402、第二电极403和公共电极405之间形成差分信号,第一电极402、第二电极403和公共电极405的一端通过导线与激励电源401连接,另一端通过导线与阻抗分析仪404相连接。通过设置第一电极402、第二电极403和公共电极405可以提高收集的阻抗信号的准确性。
如图3所示的一个实施方式中,由于位于检测微通道101表面的电极尺寸较小,很难外接到外部电路上,该第一电极402与该第二电极403的端部均延伸于该样品传送机构100的外部且外接于PCB板30上。检测微通道101表面的电极与PCB板30上的电极通过焊锡或金属涂层连接在一起。外接于PCB板30上的该第一电极402与该第二电极403的宽度可以为1.27mm、2.0mm或2.54mm等,该宽度只要适用于连接PCB板30的通用管脚即可。可选地,外接于PCB板30上的该第一电极402与该第二电极403的宽度均为1.27mm,便于外接外围电路。
如图4所示的一个实施方式中,激发光光源照射出的光束可以紧挨着电极的位置从电极的侧面通过,只要保证每次电极之间形成的检测区域检测到的样品微滴20与激发光光源照射的样品微滴20时同一个即可。
控制机构500用于分析该荧光探测器收集的荧光信号及该阻抗分析仪404收集的阻抗信号,其中荧光探测器收集的荧光信号及该阻抗分析仪404收集的阻抗信号属于同一个样品微滴20。
该样品微滴20经该传送微通道102依次逐个进入到该检测微通道101,该光学检测机构300和该阻抗检测机构400对该检测微通道101中的同一个该样品微滴20分别进行荧光信号和阻抗信号收集,其中,该激发光光源通过该光学检测窗口照射该检测微通道中101的该样品微滴20,激发该样品微滴20产生荧光信号,该荧光探测器通过该光学检测窗口收集该荧光信号并将收集到的该荧光信号转换为数字信号传输到该控制机构500;该阻抗分析仪404收集该样品微滴20通过该检测区域产生的阻抗信号并将收集到的该阻抗信号传输到该控制机构500,该控制机构500同步分析该荧光信号和该阻抗信号得到该样品微滴20的有效数据,如是否为所测样品微滴、样品微滴的信号波形脉宽及样品微滴的荧光数据等所需数据信息。
本发明中的聚合酶链式反应检测装置10通过使用光学检测机构300和阻抗检测机构400共同检测样品微滴20,将阻抗检测法和荧光检测法结合使用,从多个维度对样品微滴20进行检测分析。本发明同时检测每个样品微滴20的荧光信号和阻抗信号,对于荧光量很低的阴性微滴,通过阻抗信号能够准确区分是否是样品微滴20;对于荧光量较高的阳性微滴,通过阻抗信号识别出微滴大小,并判断是否真的是阳性微滴,降低阳性微滴的错检率。利用阻抗数据对荧光数据进行修正,可以减少受到环境的干扰,避免了只通过荧光信号对样品微滴20检测出现的错检或漏检的情况,该聚合酶链式反应检测装置准确性和灵敏度较高。
此外,采用阻抗检测机构400辅助进行样品微滴20有无的检测,提高了该装置对阴性微滴的检测灵敏度和准确性,并降低了对控制机构500信噪比的要求。该聚合酶链式反应检测装置的系统设计简便,制造成本低。
此外,还有必要提供一种聚合酶链式反应检测方法。
一种聚合酶链式反应检测方法,使用上述任一项该聚合酶链式反应检测装置10检测该样品微滴20,该聚合酶链式反应检测方法如图5所示包括如下步骤:
该样品微滴20经该传送微通道102依次逐个通过该检测微通道101的光学检测窗口,可选地,在检测微通道101中每个样品微滴20的间距至少三倍于单个微滴样品的粒径。
该激发光光源通过该光学检测窗口照射该检测微通道101中的该样品微滴20,激发该样品微滴20产生荧光信号,该荧光探测器通过该光学检测窗口收集该荧光信号并将收集到的该荧光信号转换为数字信号传输到该控制机构500;
同时该阻抗分析仪404收集该样品微滴20通过该第一电极402与该第二电极403之间的该检测区域产生的阻抗信号并将收集到的该阻抗信号传输到该控制机构500;
该控制机构500同步分析该荧光信号和该阻抗信号,通过该荧光信号提取该样品微滴20的荧光幅值和第一脉宽,通过该阻抗信号提取该样品微滴20的阻抗幅值和第二脉宽,同步分析该荧光信号和该阻抗信号的数据信息得到该样品微滴20的有效数据,如是否为所测样品微滴、样品微滴的信号波形脉宽及样品微滴的荧光数据等所需数据信息。
控制机构500同步分析该荧光信号和该阻抗信号的流程如图6所示,根据所述阻抗信号提取的阻抗幅值和第二脉宽的阈值判断该信号是否是样品微滴20,如果所述阻抗信号判断是样品微滴20则再根据所述荧光信号提取所述样品微滴20的荧光幅值和第一脉宽判断是否是样品微滴20,如果所述荧光信号也判断是样品微滴20则记录样品微滴20的激发光数值作为荧光数据,并根据所述荧光幅值范围判断所述荧光数据是否正常,如果荧光信号判断不是样品微滴20则认为是荧光信号判断出现偏差,仍然判断该信号为样品微滴20,并取该样品微滴20的激发光数值的平均值作为该样品微滴20的荧光数据,如果阻抗信号判断不是样品微滴20则认为该信号不是样品微滴20,不记录该样品微滴20的荧光数据,综上得到所述样品微滴20的有效数据,如是否为所测样品微滴、样品微滴的信号波形脉宽及样品微滴的荧光数据等所需数据信息。
根据信号提取的脉宽灵敏度,荧光信号的灵敏度低于阻抗信号的灵敏度,所以荧光信号对于第二脉宽的阈值判断要比阻抗信号对于第一脉宽的阈值判断要大一些。
本发明中聚合酶链式反应检测方法通过将阻抗检测法和荧光检测法结合使用,从多个维度对样品微滴20进行检测分析,得到样品微滴的数量以及微滴荧光强度的准确性和灵敏度高。
本发明提到的聚合酶链式反应检测方法中的荧光信号,包括但不仅限于一维,也可以为二维及以上的多路荧光信号。如本发明也可以适用于现在常用的FAM和VIC的二维荧光系统。
以上所述实施例的各技术特征可以进行任意的组合,为使描述简洁,未对上述实施例中的各个技术特征所有可能的组合都进行描述,然而,只要这些技术特征的组合不存在矛盾,都应当认为是本说明书记载的范围。
以上所述实施例仅表达了本发明的几种实施方式,其描述较为具体和详细,但并不能因此而理解为对发明专利范围的限制。应当指出的是,对于本领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明构思的前提下,还可以做出若干变形和改进,这些都属于本发明的保护范围。因此,本发明专利的保护范围应以所附权利要求为准。