CN105925563A - 制备固定相核酸试剂的方法 - Google Patents

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刘小芳
李丙亮
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
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    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
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Abstract

本发明涉及一种制备固定相核酸试剂的方法,所述方法包括步骤:I.提供包含核酸的储备液原料或干粉状原料,其中当提供干粉状原料时,先将所述干粉状原料溶解处理,以获得适于核酸检测的储备液;II.将所述储备液用核酸干燥保护液稀释并分装至包含固定相的容器内;III.脱干所述容器,以获得固定在所述容器内的核酸试剂。所述方法便于核酸试剂的储存、运输和使用,使用时只需按照试验所需浓度将复溶溶剂和/或各种试剂加入包含固定相的容器内即可。

Description

制备固定相核酸试剂的方法
技术领域
本发明属于核酸检测领域,具体涉及一种固定相核酸试剂的方法,以及包括该固定相核酸试剂的试剂盒。
背景技术
干粉试剂是将各组分溶于液体中进行分装干燥存放,使用前加入指定量的缓冲液复溶的一类试剂。这类试剂由于能够在-20摄氏度下存放5年以上、在室温下存放12个月以上、并且运输和使用方便而被广泛使用。聚合酶链式反应(PCR)当中,引物、探针或/和模板都可以采用干粉试剂的形式。
核酸干粉试剂通常是定量封装的,使用时通常先加入TE缓冲液或水复溶即可。它是由浓度较高的储备液(如100pmol/ul~500pmol/ul)为原料,取一定量的储备液用TE缓冲液或超纯水稀释成工作液(如1pmol/ul~50pmol/ul),剩余的储备液分装保存于-20℃的冰箱中。然而,由于核酸的特殊性,在液相中,其储存有效期较短,一般为几周至十几个月不等,与核酸浓度、长度和反复冻融有关。因而,无论在科学研究领域,还是应用中,得到稳定可靠的核酸原料都是必需的且是实验结果可靠的基础。
为此,提供一种使用起来方便且存放时间长的核酸试剂是本领域所需的。
发明内容
本发明的的目的在于克服上述缺点,提供一种成本低、效率高且简单方便的干粉状核酸的固定制备技术。
本发明的目的和优点一部分将在下面的描述中列出,另一部分对于本领域普通技术人员来说容易基于下面的描述而想到。
本发明的一个目的是提供一种制备固定相核酸试剂的方法,所述方法包括步骤:I.提供包含核酸的储备液原料或干粉状原料,其中当提供干粉状原料时,先将所述干粉状原料溶解处理,以获得适于核酸检测的储备液;II.将所述储备液用核酸干燥保护液稀释并分装至包含固定相的容器内;III.脱干所述容器,以获得固定在所述容器内的核酸试剂。
优选地,所述核酸试剂为引物、探针或/和模板。
优选地,当所述核酸试剂为引物时,所述步骤I与步骤II之间进一步包括对所述引物的修饰处理步骤,所述修饰处理包括但不限于在所述引物的3’端和/或5’端分别修饰荧光标记基团和荧光淬灭基团。
优选地,所述步骤I中干粉状原料采用TE缓冲液或超纯水进行溶解,获得储备液。
优选地,所述步骤I所提供或获得的储备液中核酸试剂的浓度为100pmol/ul~500pmol/ul。
优选地,所述步骤II中的核酸干燥保护液为易挥发且与所述核酸试剂兼容的溶剂,包括但不限于无水乙醇、乙腈、乙醚,其中最优选为无水乙醇,优选无水乙醇的浓度为30%~80%,其余体积用超纯水补足。
优选地,所述步骤II中储备液稀释至核酸试剂浓度为10pmol/ul~50pmol/ul。
优选地,所述步骤II中包含固定相的容器为多孔板或PCR反应管。
优选地,所述步骤III的脱干在15摄氏度至80摄氏度下进行,优选在25摄氏度至50摄氏度下进行,更优选在室温下进行。
本发明的另一个目的是提供一种试剂盒,所述试剂盒包含任一种上述方法所制备的固定相核酸试剂。
本发明具有以下优点:
1、将干粉状核酸试剂(通常经过商业途径购得)制备成固定相核酸试剂,或者将储备液进行固定处理,便于核酸试剂的储存、运输和使用,使用时只需按照试验所需浓度将复溶溶剂和/或各种试剂加入包含固定相的容器内即可。
2、本申请优选采用易挥发且环境友好的无水乙醇来稀释储备液,与采用TE或超纯水来稀释相比,脱干所需时间大大缩短,并且不产生有害废物。值得一提的是,传统认为在核酸检测当中,乙醇由于是PCR反应的抑制剂,而不希望存在,但本发明人经试验证实,采用乙醇作为干燥保护液,由于在脱干过程中乙醇几乎完全挥发并带走大量水分,不仅干燥效率高,也不会对后续试验产生可察觉的影响。
3、本申请所采用的脱干条件无需特定设备,且室温下即可完成,便于工业化生产和工艺设定。
具体实施方式
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚,以下结合具体实施方式,对本发明进行进一步详细说明。应当理解,此处所描述的具体实施方式仅仅用以解释本发明,并不用于限定本发明。
实施例1.PCR反应中引物的脱干:
PCR的具体步骤条件可参考《分子克隆实验指南(第三版)》(第8章“聚合酶链式反应体外扩增DNA”,597-701页,科学出版社,2002年8月)的记载。
1.1.引物获得:
引物委托给专业的合成公司合成,一次合成1OD以上。合成公司提供的引物为干粉,且可提供修饰引物。引物3’端和/或5’端分别修饰荧光标记基团和荧光淬灭基团。荧光基团包括但不限于FAM、HEX、VIC、JOE、Taxas Red、ROX、CY3、CY5、delight 680等;荧光淬灭基团包括但不限于BHQ1、BHQ2、BHQ3、MGB、Dabcyl、TAMRA等。
引物用时需溶解至100pmol/ul~500pmol/ul。按照PCR要求量10pmol/反应~50pmol/反应加入到PCR反应管中。
1.2.配液:
用pH8.0的TE或超纯水溶解引物至500pmol/ul,取所需引物与无水乙醇、超纯水混合,混合后引物浓度为10pmol/~50pmol/ul,乙醇为80%。
1.3.分装:
用0.1ul/反应~3ul/反应分装引物至PCR反应管,本次分装三个浓度,分别为10pmol/ul、25pmol/ul、50pmol/ul,分装体积为1ul。
1.4.脱干:
室温放置10分钟~30分钟,至液体挥发、引物脱干。
1.5.结果:
取其中脱干的反应管,取同体积水复溶,用微量分光光度计测试其浓度是否与分装前一致,具体数据如下:
试验证实,各样品检测数值均与分装前接近,在误差范围内。用上述引物进行PCR试验,证明脱干的PCR反应管含有实验所需引物。
实施例2.PCR反应中核酸片段的脱干:
PCR的具体步骤条件可参考《分子克隆实验指南(第三版)》(第8章“聚合酶链式反应体外扩增DNA”,597-701页,科学出版社,2002年8月)的记载。
1.1.核酸片段的获得:
核酸片段委托给专业的合成公司合成,一次合成1OD以上。合成公司提供的核酸片段为干粉,用时需复溶至需要浓度的10倍~30倍。按照PCR要求量加入到PCR反应管中,作为PCR反应的模板。
1.2.配液:
用pH8.0的TE或超纯水溶解核酸片段至500pmol/ul,取所需引物与无水乙醇、超纯水混合,混合后核酸片段浓度为3拷贝/ul、30拷贝/ul、300拷贝/ul、3000拷贝/ul、3×104拷贝/ul、3×105拷贝/ul、3×106拷贝/ul、3×107拷贝/ul、3×108拷贝/ul,乙醇为80%。
1.3.分装:
用0.1ul/反应~3ul/反应分装引物至PCR反应管,本次分装体积为1ul。
1.4.脱干:
室温放置10分钟~30分钟,至液体挥发、核酸片段脱干。
1.5.结果:
取其中脱干的反应管,加入PCR反应液、以核酸片段序列设计的PCR引物和探针,配成标准的荧光定量PCR反应,反应参数为:
95℃,10分钟;(95℃,25秒钟;60℃,25秒钟;72℃,45秒钟),40个循环。
具体Ct数据如下:
试验证实,各样品检测数值均与分装前接近,在误差范围内。且脱干的PCR反应管含有实验所需模板,该反应管可作为PCR反应的阳性对照、阴性对照、定量标准品,并能长期放置在室温,便于储存和运输。
以上所述仅为本发明的优选实施方式,并不用以限制本发明,本发明要求保护的范围由权利要求书以及其等同替换方式所限定,凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等,均应包含在本发明的保护范围之内。

Claims (10)

1.一种制备固定相核酸试剂的方法,所述方法包括步骤:
I.提供包含核酸的储备液原料或干粉状原料,其中当提供干粉状原料时,先将所述干粉状原料溶解处理,以获得适于核酸检测的储备液;
II.将所述储备液用核酸干燥保护液稀释并分装至包含固定相的容器内;
III.脱干所述容器,以获得固定在所述容器内的核酸试剂。
2.根据权利要求1所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中所述核酸试剂为引物、探针或/和模板。
3.根据权利要求2所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中当所述核酸试剂为引物时,所述步骤I与步骤II之间进一步包括对所述引物的修饰处理步骤,优选所述修饰处理步骤为在所述引物的3’端和/或5’端分别修饰荧光标记基团和荧光淬灭基团。
4.根据权利要求1所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中所述步骤I中干粉状原料采用TE缓冲液或超纯水进行溶解,获得储备液。
5.根据权利要求1所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中所述步骤I所提供或获得的储备液中核酸试剂的浓度为100pmol/ul~500pmol/ul。
6.根据权利要求1-5之一所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中所述步骤II中的核酸干燥保护液为易挥发且与所述核酸试剂兼容的溶剂,优选为无水乙醇、乙腈或乙醚,更优选为无水乙醇,所述无水乙醇的浓度优选为30%~80%,其余体积用超纯水补足。
7.根据权利要求1所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中所述步骤II中储备液稀释至核酸试剂浓度为10pmol/ul~50pmol/ul。
8.根据权利要求1所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中所述步骤II中包含固定相的容器为多孔板或PCR反应管。
9.根据权利要求1所述的制备固定相核酸试剂的方法,其中所述步骤III的脱干在15摄氏度至80摄氏度下进行,优选在25摄氏度至50摄氏度下进行,更优选在室温下进行。
10.一种试剂盒,所述试剂盒包含权利要求1-9之一所述方法制备的固定相核酸试剂。
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